EA032403B1 - Лентивирусные векторы, псевдотипированные гликопротеином оболочки вируса синдбис - Google Patents

Лентивирусные векторы, псевдотипированные гликопротеином оболочки вируса синдбис Download PDF

Info

Publication number
EA032403B1
EA032403B1 EA201270191A EA201270191A EA032403B1 EA 032403 B1 EA032403 B1 EA 032403B1 EA 201270191 A EA201270191 A EA 201270191A EA 201270191 A EA201270191 A EA 201270191A EA 032403 B1 EA032403 B1 EA 032403B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
antigen
lentiviral vector
virus
residue
cells
Prior art date
Application number
EA201270191A
Other languages
English (en)
Other versions
EA201270191A1 (ru
Inventor
Джеймс М. Аллен
Нил С. Ван Хувен
Цзинь Чжун Ли
Дерек Д. Слоан
Томас У. мл. Дубенски
Original Assignee
Иммьюн Дизайн Корп.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=42727669&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=EA032403(B1) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Иммьюн Дизайн Корп. filed Critical Иммьюн Дизайн Корп.
Publication of EA201270191A1 publication Critical patent/EA201270191A1/ru
Publication of EA032403B1 publication Critical patent/EA032403B1/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/86Viral vectors
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K2239/00Indexing codes associated with cellular immunotherapy of group A61K39/46
    • A61K2239/46Indexing codes associated with cellular immunotherapy of group A61K39/46 characterised by the cancer treated
    • A61K2239/50Colon
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0011Cancer antigens
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0011Cancer antigens
    • A61K39/001154Enzymes
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0011Cancer antigens
    • A61K39/001154Enzymes
    • A61K39/001156Tyrosinase and tyrosinase related proteinases [TRP-1 or TRP-2]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0011Cancer antigens
    • A61K39/001184Cancer testis antigens, e.g. SSX, BAGE, GAGE or SAGE
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0011Cancer antigens
    • A61K39/001184Cancer testis antigens, e.g. SSX, BAGE, GAGE or SAGE
    • A61K39/001186MAGE
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0011Cancer antigens
    • A61K39/001184Cancer testis antigens, e.g. SSX, BAGE, GAGE or SAGE
    • A61K39/001188NY-ESO
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0011Cancer antigens
    • A61K39/00119Melanoma antigens
    • A61K39/001191Melan-A/MART
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0011Cancer antigens
    • A61K39/00119Melanoma antigens
    • A61K39/001192Glycoprotein 100 [Gp100]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0011Cancer antigens
    • A61K39/001193Prostate associated antigens e.g. Prostate stem cell antigen [PSCA]; Prostate carcinoma tumor antigen [PCTA]; PAP or PSGR
    • A61K39/001194Prostate specific antigen [PSA]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/0005Vertebrate antigens
    • A61K39/0011Cancer antigens
    • A61K39/001193Prostate associated antigens e.g. Prostate stem cell antigen [PSCA]; Prostate carcinoma tumor antigen [PCTA]; PAP or PSGR
    • A61K39/001195Prostate specific membrane antigen [PSMA]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/461Cellular immunotherapy characterised by the cell type used
    • A61K39/4615Dendritic cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/462Cellular immunotherapy characterized by the effect or the function of the cells
    • A61K39/4622Antigen presenting cells
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/46Cellular immunotherapy
    • A61K39/464Cellular immunotherapy characterised by the antigen targeted or presented
    • A61K39/4643Vertebrate antigens
    • A61K39/4644Cancer antigens
    • A61K39/464499Undefined tumor antigens, e.g. tumor lysate or antigens targeted by cells isolated from tumor
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/14Antivirals for RNA viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/14Antivirals for RNA viruses
    • A61P31/16Antivirals for RNA viruses for influenza or rhinoviruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/14Antivirals for RNA viruses
    • A61P31/18Antivirals for RNA viruses for HIV
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/20Antivirals for DNA viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A61P31/12Antivirals
    • A61P31/20Antivirals for DNA viruses
    • A61P31/22Antivirals for DNA viruses for herpes viruses
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • A61P35/02Antineoplastic agents specific for leukemia
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • A61P37/04Immunostimulants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N7/00Viruses; Bacteriophages; Compositions thereof; Preparation or purification thereof
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/51Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
    • A61K2039/525Virus
    • A61K2039/5256Virus expressing foreign proteins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011Details
    • C12N2740/10011Retroviridae
    • C12N2740/15011Lentivirus, not HIV, e.g. FIV, SIV
    • C12N2740/15022New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2740/00Reverse transcribing RNA viruses
    • C12N2740/00011Details
    • C12N2740/10011Retroviridae
    • C12N2740/15011Lentivirus, not HIV, e.g. FIV, SIV
    • C12N2740/15041Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2740/15043Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2770/00MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssRNA viruses positive-sense
    • C12N2770/00011Details
    • C12N2770/36011Togaviridae
    • C12N2770/36111Alphavirus, e.g. Sindbis virus, VEE, EEE, WEE, Semliki
    • C12N2770/36141Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2770/36145Special targeting system for viral vectors
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Communicable Diseases (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • AIDS & HIV (AREA)
  • Pulmonology (AREA)
  • Hematology (AREA)

Abstract

Представлены лентивирусные векторные частицы, способные инфицировать дендритные клетки, включающие оболочку, содержащую вариант гликопротеина E2 вируса Синдбис, и лентивирусный векторный геном, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую антиген. Кроме того, представлены фармацевтические композиции для иммунизации указанным антигеном, содержащие указанные лентивирусные частицы и фармацевтически приемлемый носитель.

Description

Настоящее изобретение относится к лентивирусной векторной частице, способной инфицировать дендритные клетки, включающей:
(a) оболочку, содержащую вариант гликопротеина Е2 вируса Синдбис, идентичный по меньшей мере на 90% аминокислотной последовательности 8ЕС ГО N0: 1, в которой: (1) остаток в положении 160 отсутствует или является остатком аминокислоты, отличной от глутаминовой кислоты, (и) остаток в положении 70 является неосновным остатком, причем вариант гликопротеина Е2 не является частью гибридного белка с гликопротеином Е3 вируса Синдбис; и (b) лентивирусный векторный геном, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую антиген.
В одном из вариантов осуществления изобретения указанный вариант гликопротеина Е2 связывается с ПС-81СК
Еще один вариант осуществления изобретения относится к лентивирусной векторной частице, в которой остаток в положении 160 является остатком глицина, аланина, валина, лейцина или изолейцина, предпочтительно, где остаток в положении 160 является остатком глицина.
В следующем варианте осуществления изобретения аминокислотная последовательность указанного варианта гликопротеина Е2 состоит из аминокислотных остатков 66-488 последовательности 8ЕС ГО N0: 3, аминокислотных остатков 66-488 последовательности 8ЕС ГО N0: 4 или аминокислотных остатков 66-486 последовательности 8 ЕС ГО N0: 5, или идентична указанным аминокислотным остаткам по меньшей на мере на 95%.
В одном из вариантов осуществления изобретения указанный антиген представляет собой опухолеспецифичный антиген или вирусный антиген, в частности опухолеспецифичный антиген представляет собой карбоангидразу IX, N¥^80-1, МАСЕ, ВАСЕ, ВАСЕ, МАК.Т-1/Ме1ап-Л. др100, др75, тба-7, тирозиназу, тирозиназа-связанный белок, 5Т4, 8М22-а, карбоангидразу I, ΗΙΡ-1α, ΗΙΡ-2α, Р8МА, Р8А, 8ТЕАР или НКХ3.1, а вирусный антиген представляет собой антиген Ηΐν, антиген 8ΐν, антиген аденовируса, антиген энтеровируса, антиген коронавируса, антиген калицивируса, антиген вируса собачьей чумки, антиген вируса Эбола, антиген флавивируса, антиген вируса гепатита, антиген вируса герпеса, антиген вируса инфекционного перитонита, антиген вируса гриппа, антиген вируса лейкемии, антиген вируса марбургской болезни, антиген ортомиксовируса, антиген вируса папилломы, антиген вируса парагриппа, антиген парамиксовируса, антиген парвовируса, антиген пестивируса, антиген пикорнавируса, антиген полиовируса, антиген поксвируса, антиген вируса бешенства, антиген реовируса, антиген ретровируса или антиген ротавируса.
В следующем варианте изобретения лентивирусный векторный геном лентивирусной векторной частицы имеет инактивированный 3' длинный терминальный повтор (ЬТВ) или самоинактивирующийся 3' длинный терминальный повтор (ЬТВ), в частности, лентивирусный векторный геном содержит И3 элемент, не имеющий энхансерной последовательности, ТАТА-бокса, сайта 8р1, сайта НК-кВ и/или полипуринового тракта (РРТ).
Настоящее изобретение также относится к лентивирусной векторной частице, в которой лентивирусный векторный геном содержит И3 элемент, не имеющий энхансерной последовательности, ТАТАбокса, сайта 8р1, сайта ПК-кВ и/или полипуринового тракта (РРТ), или в которой лентивирусный векторный геном содержит любую из нуклеотидных последовательностей 8ЕС ГО N0: 21, 22 или 23. Кроме того, лентивирусный векторный геном может дополнительно содержать нуклеотидную последовательность, кодирующую фактор созревания/стимуляции дендритных клеток, при этом, в частности, фактор созревания/стимуляции дендритных клеток представляет собой СМ-С8Е, 1Ь-2, 1Ь-4, 1Ь-6, 1Ь-7, 1Ь-15, 1Ь21, 1Ь-23, ТМ% В7.1, В7.2, 4-1ВВ, СЭ40-лиганд или индуцируемый лекарствами СЭ40.
Кроме того, лентивирусная векторная частица по изобретению характеризуется тем, что экспрессия нуклеотидной последовательности, кодирующей антиген, контролируется промотором, который представляет собой промотор Убиквитина-С человека (ЦЫС), немедленно-ранний промотор цитомегаловируса (СМ’У), промотор вируса саркомы Рауса (Β8ν) и реагирующий на тетрациклин промотор.
В одном из вариантов изобретения лентивирусная векторная частица характеризуется тем, что лентивирусный векторный геном дополнительно содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую второй антиген.
В другом варианте изобретения лентивирусная векторная частица характеризуется тем, что остаток
- 4 032403 в положении 76 является неосновным остатком, или остаток в положении 159 является неосновным остатком или отсутствует.
В следующем аспекте настоящее изобретение относится к лентивирусной векторной частице, способной инфицировать дендритные клетки, включающей:
(a) оболочку, содержащую вариант гликопротеина Е2 вируса Синдбис, идентичный по меньшей мере на 90% аминокислотной последовательности 8ЕЭ ΙΌ N0: 1, в которой:
(ί) остаток в положении 160 отсутствует или является остатком аминокислоты, отличной от глутаминовой кислоты, (ίί) остаток в положении 70 заменен остатком глутаминовой кислоты или аспарагиновой кислоты, (ΐϊϊ) остаток в положении 159 заменен остатком глутаминовой кислоты или аспарагиновой кислоты;
(ίν) остатки в положениях 71-75 являются неизмененными; причем вариант гликопротеина Е2 не является частью гибридного белка с гликопротеином Е3 вируса Синдбис; и (b) лентивирусный векторный геном, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую антиген, в частности, где остаток в положении 160 заменен остатком глицина, остаток в положении 159 заменен остатком глутаминовой кислоты, остаток в положении 70 заменен остатком глутаминовой кислоты, причем лентивирусный векторный геном содержит ЬТВ, не имеющий полипуринового тракта (РРТ).
В следующем аспекте настоящее изобретение относится к лентивирусной векторной частице, способной инфицировать дендритные клетки, содержащей:
(a) оболочку, содержащую вариант гликопротеина Е2 вируса Синдбис, образованный остатками 66488 аминокислотной последовательности 8ЕЭ ΙΌ N0: 3, причем вариант гликопротеина Е2 не является частью гибридного белка с гликопротеином Е3 вируса Синдбис; и (b) лентивирусный векторный геном, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую антиген.
В одном варианте осуществления изобретения лентивирусный векторный геном лентивирусной векторной частицы содержит нуклеотидную последовательность 8ЕЭ ΙΌ N0: 21, или нуклеотидную последовательность 8ЕЭ ΙΌ N0: 22, или нуклеотидную последовательность 8ЕЭ ΙΌ N0: 23.
В следующем аспекте настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции для иммунизации антигеном, содержащей лентивирусные частицы по изобретению, которые кодируют указанный антиген, и фармацевтически приемлемый носитель.
В одном из вариантов осуществления изобретения фармацевтическая композиция содержит лентивирусные частицы, имеющие МЕ по меньшей мере 105/мл.
В следующем варианте осуществления изобретения фармацевтическая композиция дополнительно содержащая иммуностимулирующий агент или адъювант.
Эти и другие аспекты настоящего изобретения станут очевидными после ссылки на последующее детальное описание и прилагаемые фигуры. Кроме того, заявка на патент США № 61/228491, поданная на регистрацию 24 июля 2009 г., включена сюда в качестве ссылки в полном объеме для всех целей.
Краткое описание фигур
На фиг. 1 представлена последовательность белка оболочки из четырех оболочек вируса Синдбиса, БУСти, БШ-УагЕ БШ-Уаг2 и БШ-Уаг3. Последовательность показана в сравнении с 8У6ши, описанной ранее оболочки Синдбиса. Основные отличия от БУСти включают регенерацию фуриноподобной протеазы сайта расщепления (К8КК; БЕЭ ΙΌ N0: 27) между Е3 и Е2, удаление НА эпитопной метки и серии замен лизина для уменьшения связывания гепарина.
Фиг. 2 является схемой приведенных в качестве примера векторов, используемых для упаковки вирусных частиц.
На фиг. 3 представлен график титров неочищенного супернатанта препаратов лентивирусных векторных частиц, в которых векторный геном был псевдотипирован тремя различными белками оболочки вируса Синдбиса, БУСти и БШ-НЕ. Супернатанты вируса были получены путем транзиентной трансфекции с использованием стандартных методов и собраны через 48 ч после трансфекции. Титры определялись на клетках 293Т, экспрессирующих человеческий ЭС-БЮН (293Т-ОС-8ЮН). Титры выражаются как число СЕР-экспрессирующих единиц на 1 мл супернатанта и являются средними величинами трех независимых трансфекций. Планки погрешностей представляют стандартное отклонение от среднего.
Фиг. 4А, 4В и 4С являются графиками, показывающими иммунологический ответ Т-клеток мышей, следующий за введением псевдотипированных лентивирусных векторных частиц. (А) Мыши С57ВЬ/6 были иммунизированы подкожно одной или двумя дозами (показано на ид р24) лентивирусного вектора с интеграционным дефектом, кодирующего 0УА. Число и функция 0УА257-специфичных СЭ8 Т-клеток в селезенке определялись на 9 день с помощью МНСЧ/пептидного мультиметра и внутриклеточного окрашивания цитокинов. (В) Мыши С57ВЬ/6 были иммунизированы подкожно различными дозами лентивирусного вектора с интеграционным дефектом, кодирующего 0УА. Процент 0УА257-специфичных СЭ8 Т-клеток в селезенке определялся на 11 день с помощью окрашивания МНСЧ/пепдидного мультиметра. (С) Мыши С57ВЬ/6 были иммунизированы подкожно различными дозами лентивирусного вектора с интеграционным дефектом, кодирующего 0УА. Процент 0УА257-специфичных С.П8 Т-клеток в
- 5 032403 селезенке определялся на 9 день с помощью внутриклеточного окрашивания цитокинов.
На фиг. 5А представлены изображения приведенных в качестве примера лентивирусных геномов. Фиг. 5В представляет последовательности региона ИЗ трех векторных конструктов. (А) Элементы, содержащиеся во всех лентивирусных векторах, показаны сверху в приведенном в качестве примера векторном геноме. Использованные промоторы включают промотор Убиквитина-С человека (ЦЫС), цитомегаловируса немедленно-ранний промотор (СМУ) или промотор вируса саркомы Рауса (ВЕУ). В дополнение к стандартному региону ИЗ ΕΙΝ показаны серии обширных делеций. Выравнивания последовательностей регионов ИЗ из всех 3 векторов показаны на (В). Показанная последовательность включает полипуриновый участок (РРТ), который удален в конструкте 704, и обширную делецию ИЗ, представленную как в 703, так и в 704 конструктах.
Фиг. 6А и 6В показывают экспрессию СВР из лентивирусного вектора, следующую за трансдукцией клеток 293Т. На фиг. 6А СВР был оперативно связан с ИЫС промотором, и на фиг. 6В, СВР был оперативно связан с СМУ промотором. Уровни экспрессии СВР были определены по лентивирусным векторам с дефицитом интегразы через 48 ч после трансдукции клеток 293Т, экспрессирующих ЭС-ЕИСМ СВР экспрессия в трансдуцированных клетках определялась по стандартным цитометрическим проточным методам; с каждого пула трансдуцированных клеток было собрано 50000 единиц для определения средних уровней экспрессии.
Фиг. 7 показывает число СВР позитивных клеток за пять проходов. Клетки были трансдуцированы различными векторными препаратами, и каждый проход длился 72 ч. Относительные СВР титры определялись в культурах клеток 293Т, трансдуцированных различными МГУ конструктами. Векторы были упакованы с использованием или интегразы дикого типа (ΙΝ+), или Э64У мутантной интегразы (ΙΝ-), и использованы для трансдуцирования 293 клеток, экспрессирующих ЭС-ЕЮМ Трансдуцированные клеточные культуры затем анализировались каждые 72 ч в течение 15 дней. На каждом проходе число СВР+ клеток в культуре определялось с использованием стандартных методов проточной цитометрии. Исчезновение СВР экспрессии во время прохода указывает на исчезновение векторных эписом за это время.
Фиг. 8 показывает реакцию СЭ8 Т-клеток, следующую за введением интегрированного (ΙηΓ1) или неинтегрированного (1пГ64У) лентивирусных векторов. Мыши С57ВЬ/6 были иммунизированы подкожно 2,5*1010 геномами интегрированных (ΙηΓ4) или неинтегрированных (Ιηΐϋ64ν) лентивирусных векторов, кодирующих Сад антиген из вируса иммунодефицита обезьян (ВИО). Число антиген-специфичных Тклеток в селезенке и их профиль цитокиновой секреции определялись на 10 день путем внутриклеточного окрашивания цитокинов.
Фиг. 9 представляет график, показывающий размер опухоли у мышей, получивших или пустой наполнитель, или вирусные частицы, кодирующие опухолевый антигент (левый график) и процент выживаемости (правый график). Мышам ВАЬВ/е было введено подкожно 2Л04 клеток СТ26 карциномы кишечника. Через день мышам подкожно ввели или наполнитель, или 3,2 мкг (р24 капсул) ДК-нацеленного неинтегрирующегося лентивирусного вектора (ПС-МЬУ), кодирующего пептид АН1А5 (8Р8УАУНОВ; 8ЕО ΙΌ ΝΟ: 25), модифицированный эпитоп Т-клеток СЭ8 СТ26. Изображены первичный рост опухоли и долговременное выживание вакцинированных мышей по сравнению с контрольными.
Детальное описание
Настоящее раскрытие сущности изобретения представляет способы и композиции для проникновения в дендритные клетки (ДКл) с использованием лентивирусных векторных частиц (например, вирион, лентивирусная частица) для доставки целевой последовательности в ДКл. Лентивирусная векторная частица содержит вариант гликопротеина оболочки, полученный из Е2 вируса Синдбис, и геном, который содержит целевую последовательность, и необязательно другие компоненты. Вариант гликопротеина показывает уменьшенное связывание гепарансульфата по сравнению с НВ, референсным штаммом вируса Синдбис. Гликопротеин оболочки облегчает инфицирование дендритных клеток лентивирусными векторными частицами. Облегченное инфицирование при использовании в настоящем документе означает то же самое, что и облегченная трансдукция, и относится к роли гликопротеина оболочки, действующему в одиночку или во взаимодействии с другими молекулами, способствуя или улучшая рецепторопосредованный вход псевдотипированного ретровируса или лентивирусной частицы в клетку-мишень.
Как правило, лентивирусные векторные частицы вырабатываются клеточной линией, которая содержит один или более плазмидных векторов и/или интегрированных элементов, которые вместе кодируют компоненты, необходимые для производства функциональных векторных частиц. Эти лентивирусные векторные частицы обычно не являются компетентными к репликации, то есть они способны лишь к одному циклу инфицирования. Чаще всего множественные плазмидные векторы или отдельные кассеты экспрессии, стабильно интегрированные в хромосомы клетки-продуцента, используются для отделения различных генетических компонентов, которые вырабатывают лентивирусные векторные частицы, однако можно использовать один плазмидный вектор, имеющий все лентивирусные компоненты. В одном иллюстративном примере упаковочная клеточная линия трансфицируется одной или более плазмидой, содержащей вирусный векторный геном, включая ЬТВк, действующую в цис-положении упаковочную последовательность и целевую(ые) последовательность(и), по меньшей мере одну плазмиду, кодирующую энзимные и структурные компоненты вируса (например, дад и ро1), и по меньшей мере одну плаз
- 6 032403 миду, кодирующую гликопротеин оболочки арбовируса. Вирусные частицы проникают сквозь клеточную мембрану и содержат ядро, которое обычно включает два РНК-генома, содержащие целевую последовательность, и гликопротеин оболочки арбовируса, который связывается с дендритными клетками. Если гликопротеин арбовируса является гликопротеином Е2 вируса Синдбис, гликопротеин конструируется так, чтобы он обладал пониженным связыванием с гепарансульфатом по сравнению с референсным штаммом НВ. Это обычно включает по меньшей мере одну аминокислотную замену по сравнению с последовательностью гликопротеина Е2 НВ.
Не ограничиваясь теорией, считается, что связывание вирусной частицы с клеточной поверхностью вызывает эндоцитоз, доставку вируса в эндосому, запуск слияния с мембраной и дает возможность ядру вируса войти в цитозоль. В определенных вариантах воплощения изобретения, в которых используются интегрированные лентивирусные векторные частицы, с последующей реверсной транскрипцией и миграцией продукта в ядро, геном вируса интегрируется с геномом клетки-мишени, встраивая целевую последовательность(и) в геном клетки-мишени. Однако, чтобы снизить вероятность инсерционного мутагенеза и содействовать транзиентной экспрессии определенного(ых) антигена(ов), в других вариантах воплощения изобретения используются неинтегрирующие векторные частицы, которые не интегрирутся с геномом клетки-мишени, но, напротив, экспрессируют целевые последовательность(и) из эписомы. Так или иначе, инфицированная ДК затем экспрессирует целевую(ые) последовательность(и), например, антиген, стимулирующую молекулу.
Антиген затем может обрабатываться дендритными клетками и презентироваться Т- и В-клеткам, вызывая антиген-специфичный иммунный ответ. Специфичный путь, описанный выше, не требуется, пока дендритная клетка способна стимулировать антиген-зависимый иммунный ответ.
Вирусные частицы могут вводиться пациенту для того, чтобы обеспечить профилактический или терапевтический эффект. Продукт целевой последовательности обычно является антигеном к вызывающему болезнь агенту или больной клетке (например, опухолевой клетке). Вслед за инфицированием дендритных клеток и экспрессией продукта вырабатывается иммунная реакция на продукт. Иммунная реакция может быть гуморальной, или клеточной, или и той, и другой.
А. Оболочка вирусного вектора.
Переносимые членистоногими вирусы (арбовирусы) - это вирусы, которые передаются хозяину, такому как люди, лошади или птицы, путем инфицирования членистоногим-переносчиком, таким как москит. Арбовирусы подразделяются на подсемейства вирусов, включая альфавирусы и флавивирусы, которые имеют однонитевый РНК-геном позитивной полярности и гликопротеинсодержащую оболочку. Например, вирус лихорадки Денге, вирус желтой лихорадки и вирус Западного Нила относятся к семейству флавивирусов, а вирус Синдбис, вирус леса Семлики и вирус венесуэльского энцефалита лошадей являются членами семейства альфавирусов (Шаид с1 а1. Т У1го1. 66, 4992 (1992)). Оболочка вируса Синдбис включает два трансмембранных гликопротеина (Микйорабйуау с1 а1. №1игс Веу. МкгоЫо. 3, 13 (2005)): Е1, который, как считается, отвечает за гибридизацию, и Е2, который, как считается, отвечает за связывание клеток. Известно, что гликопротеины оболочки вируса Синдбис псевдотипируют другие ретровирусы, включая онкоретровирусы и лентивирусы.
Как обсуждалось выше, гликопротеин оболочки арбовируса может быть использован для псевдотипирования векторного генома на лентивирусной основе. Псевдотипированный лентивирус является лентивирусной частицей, имеющей один или более гликопротеинов оболочки, которые кодируются вирусом, отличным от лентивирусного генома. Гликопротеин оболочки может быть модифицирован, мутирован или сконструирован, как описано в настоящем документе.
Оболочка вируса Синдбис и других альфавирусов встроена в липидный бислой мембраны вирусной частицы и обычно включает множественные копии двух гликопротеинов, Е1 и Е2. Каждый гликопротеин имеет проникающие через мембрану регионы; Е2 имеет цитоплазматический домен из около 33 остатков, тогда как цитоплазматический хвост Е1 очень короткий (около 2 остатков). Как Е1, так и Е2 имеют пальмовые кислоты, присоединенные в проникаюшем через мембрану регионе или около него. Е2 первоначально синтезируется как белок-предшественник, который расщепляется фурином или другой Са2+зависимой сериновой протеиназой на Е2 и маленький гликопротеин, называемый Е3. Между последовательностями, кодирующими Е2 и Е1, расположена последовательность, кодирующая белок, называемый 6К. Е3 и 6К являются сигнальными последовательностями, которые служат для транслокации Е2 и Е1 гликопротеинов, соответственно, в мембрану. В геноме вируса Синдбис кодирующий регион для белков оболочки Синдбис включает последовательность, кодирующую Е3, Е2, 6К и Е1. При использовании в настоящем документе оболочка вируса арбовируса обязательно включает Е2 и может также включать Е1, 6К и Е3. Служащая примером последовательность гликопротеинов оболочки вируса Синдбис, штамм НВ, представлена как ЗЕО Ш N0: 17. Последовательности гликопротеинов оболочки для других арбовирусов могут быть найдены, например, в ОеиВаик. Например, последовательность, кодирующую гликопротеины вируса Денге, можно найти в поступлении 00252677 (в числе прочих в ОеиВаик) и в базе данных вариаций вирусов в NСВI (поступления в ОеиВаик и вариации вирусов включены посредством ссылки на последовательности гликопротеинов оболочки) и последовательность, кодирующую гликопротеин оболочки вируса энцефалита лошадей в поступлении ΝΡ 040824 (включенный посредством
- 7 032403 ссылки на последовательности гликопротеинов оболочки).
Хотя клеточный(е) рецептор(ы) дендритных клеток для альфавирусов и вируса Синдбис в первую очередь к настоящему времени точно не определены, один рецептор, по-видимому, является ΌΟ-8ΙΟΝ (К11т81та е! а1., 1. νίτοί. 77: 12022, 2003). Термины присоединение, связывание, нацеливание и т.п. используются взаимозаменяемо, и не подразумевается, что они указывают на механизм взаимодействия между гликопротеином оболочки вируса Синдбис и клеточным компонентом. ΌΟ-8ΙΟΝ (специфичные для дендритных клеток 1САМ-3 (молекулы внутриклеточной адгезии 3)-захватывающий неинтегрин; также известен как СЭ209 является лектин-подобным рецептором С-типа, способным к быстрому связыванию и эндоцитозу материалов (6еу1епЬеек, Т.В., е! а1. Аппи. Веу. 1ттипо1. 22: 33-54, 2004). Видимо, Е2 нацеливает вирус на дендритные клетки благодаря ИС-БЮХ Как показано в настоящем документе, клетки, экспрессирующие ИС-Б1СХ трансдуцируются вирусными векторными частицами, псевдотипированными Е2 вируса Синдбис, лучше (по меньшей мере в 2 раза, по меньшей мере в 3 раза, по меньшей мере в 4 раза, по меньшей мере в 5 раз, по меньшей мере в 6 раз, по меньшей мере в 7 раз, по меньшей мере в 8 раз, по меньшей мере в 9 раз или по меньшей мере в 10 раз лучше) чем изогенные клетки, которые не экспрессируют ИС-БЮХ Видимо, механизм того, как Е2 гликопротеин способствует вирусному проникновению, включает ИС-Б1СХ возможно благодаря прямому связыванию с ί.'-8Ι6Ν или из-за изменения в конформации, или по какому-то другому механизму. Вне зависимости от действительного механизма лучше связываются с Е2 клетки, экспрессирующие ИС-БЮ^ называемые дендритными клетками.
По-видимому, вирус Синдбис также связывается с клетками посредством гепарансульфата (К11т81та е! а1., 1. νίτο1. 72: 7357, 1998; Вигтек апб Спйш, 1. νίτο1. 72: 7349, 1998). Поскольку гепарансульфат и другие глюкозамингликаны клеточной поверхности обнаруживаются на поверхности большинства типов клеток, желательно уменьшить взаимодействие между гепарансульфатом и гликопротеинами оболочки Синдбис. Этого можно достигнуть путем уменьшения связывания оболочки вируса Синдбис с гепарансульфатом или путем усиления связывания, например, усиления авидности, оболочки вируса Синдбис с дендритными клетками или обоими способами. В результате уменьшается неспецифичное связывание с другими молекулами, которое может проявляться другими типами клеток и которое может происходить даже если оболочка специфична для ИС-БЮ^ и усиленная специфичность может служить во избежание нежелательных побочных эффектов, таких как побочные эффекты, которые могут уменьшить желательный иммунный ответ, или побочных эффектов, связанных с ненацеленной трансдукцией других клеточных типов. Альтернативно или в дополнение к преимуществам сравнительно специфичной трансдукции клеток, экспрессирующих ИС-БЮ^ вирусные частицы, псевдотипированные Е2 гликопротеином оболочки вируса Синдбис, могут давать другие преимущества перед вирусными частицами, псевдотипированными гликопротеинами, такими как VБVС. Примеры таких преимуществ включают уменьшенный комплимент-опосредованный лизис и/или уменьшенное связывание с нейрональными клетками, и предполагается, что и то, и другое связано с введением VБV-С псевдотипированных вирусных частиц.
В различных иллюстративных примерах лентивирусные векторные частицы специфически связываются с клетками, экспрессирующими ИС-Б1СХ и обладают уменьшенным или отсутствующим связыванием с гепарансульфатом. Таким образом, Е2 гликопротеин оболочки вируса Синдбис может быть модифицирован предпочтительно для направления вируса к дендритным клеткам, которые экспрессируют ИС-БЮ^ по сравнению с другими клеточными типами. Основываясь на информации, полученной из структурных исследований, и молекулярном моделировании, различные последовательности белков оболочки, особенно Е2 и Е1 гликопротеины, были разработаны и произведены таким образом, чтобы гликопротеин сохранил свои функции белка оболочки, но имел заданную специфичность связывания, авидности или уровня связывания. Возможные варианты последовательностей могут быть созданы для каждого белка и исследованы с использованием способов, описанных ниже, или других способов, известных специалистам в данной области для идентификации гликопротеинов оболочки с наиболее желательными характеристиками.
Определенные варианты последовательностей Синдбис Е2 имеют по меньшей мере одно аминокислотное изменение в остатке 160 по сравнению с БЕО 1И ΝΟ: 1. Остаток 160 удален или заменен на аминокислоту, отличную от глютаминовой кислоты. Изменение чаще всего является заменой по меньшей мере одной аминокислоты, но альтернативно может быть добавлением или делецией одной или более аминокислот. Предпочтительно любые дополнительные аминокислоты немногочисленны и не содержат антигенный эпитоп (например, гематогглютина маркерная последовательность), что может быть небезопасным. Если есть два или более изменения, они оба могут быть или одинакового типа (например, замена), или различных типов (например, замена и делеция). Множественные изменения могут быть разбросаны по последовательности белка или расположены рядом.
В первом случае варианты последовательностей содержат по меньшей мере одно аминокислотное изменение в участке примерно от 50 до 180 остатка. Внутри этого участка есть аминокислоты, которые участвуют в связывании с гепарансульфатом. Можно уменьшить электростатическое взаимодействие с гепарансульфатом путем уменьшения положительного заряда Е2, что приводит к уменьшению связывания с гепарансульфатом. Возможные положительно заряженные аминокислоты в этом участке включают
- 8 032403 лизин в остатках 63, 70, 76, 84, 97, 104, 129, 131, 133, 139, 148, 149, 159 и аргинин в остатках 65, 92, 128, 137, 157, 170, 172 (Веаг е! а1., У1го1о§у 347: 183-190, 2006). По меньшей мере, несколько из этих аминокислот непосредственно участвуют в связывании Е2 с гепарансульфатом. Положительный заряд может быть уменьшен путем делеции лизина или аргинина или замены лизина или аргинина на нейтрально или отрицательно заряженную аминокислоту. Например, один или более из этих лизинов или аргининов может быть заменен глютаминовой или аспарагиновой кислотами. Некоторые варианты воплощения изобретения имеют по меньшей мере одну замену лизина 70, 76 или 159. В случаях, когда Е2 экспрессируется как полипротеин с Е3, лизин, расположенный рядом с природным сайтом расщепления Е3/Е2, сохраняется, таким образом, последовательность распознавания и сайт расщепления остается неизменным. Альтернативно, природная последовательность сайта расщепления эндопептидазы заменяется на последовательность распознавания для другой эндопептидазы.
Определенные варианты Е2 также модифицируются способом, который положительно влияет на связывание с дендритными клетками. Изменение в глютаминовой кислоте, обнаруживаемое в остатке 160 в референсной НК последовательности, может улучшить связывание с дендритными клетками (см. публикацию Сагбпег е! а1., 1. У1го1. 74, 11849, 2000, включенную сюда в полном объеме). Изменения, такие как делеция остатка 160 или замена остатка 160, обнаруживаются в некоторых вариантах. В определенных вариантах незаряженная аминокислота заменяется на С1и. в других вариантах некислая аминокислота заменяется на С1и. Обычно С1и160 заменяется на одну из маленьких или алифатических аминокислот, включая глицин, аланин, валин, лейцин или изолейцин.
Другие варианты включают два или более аминокислотных изменения. Обычно в этих вариантах одним из изменений является 61и160, а оставшееся(иеся) изменение(я) - изменения в одном или более лизинов и аргининов в участке проникающих оснований примерно от 50 до 180. Определенные варианты включают изменение С1и160 на некислый остаток или делецию и одно или более изменений в лизине 70, лизине 76 или лизине 159 на неосновную аминокислоту. Некоторые специфические варианты включают замену 61и160 на 61у, Ьу§ 70 на 61и и Ьу§ 159 на 61и; 61и 160 на 61у, Ьу§ 70, 76 и 159 на 61и; делецию 61и 160 и замену Ьу§ 70 и 159 на 61и и делецию 61и 160 и замену Ьу§ 70, 76, и 159 на 61и.
В некоторых случаях Е2 белок вначале экспрессируется как полипротеин в соединении, по меньшей мере, с Е3 или в соединении с лидирующей последовательностью. Безотносительно того, является ли лидирующая последовательность Е3 или другой лидирующей последовательностью, Е2 в вирусной оболочке должен быть свободен от Е3 или другой лидирующей последовательности. Другими словами, Е2 предпочтительно не является белком слияния Е3/Е2 (например, белком слияния Е3/Е2, называемым 8У6ти). В некоторых вариантах воплощения Е2 экспрессируется как часть полипротеина Е3-Е2-6К-Е1. Вирус Синдбис в природе экспрессирует Е2 как часть полипротеина, и участки связывания для Е3/Е2, Е2/6К и 6К/Е1 имеют последовательности, распознаваемые и расщепляемые эндопептидазами. Обычно соединение Е3/Е2 расщепляется фурином или фуриноподобной сериновой эндопептидазой между остатками 65 и 66. Фурин обладает специфичностью к парным аргининовым остаткам, разделенным двумя аминокислотами. Чтобы сохранить расщепление Е3/Е2 фурином, остатки 62-66 (К8КК8; 8ЕЦ Ш N0: 26) должны сохранять два аргининовых остатка с двумя разделенными аминокислотами и сериновым остатком. Альтернативно, другая расщепляемая последовательность может быть использована вместо Е3/Е2 расщепляемой фурином последовательности или любых других расщепляемых последовательностей. Могут быть вставлены сайты распознавания и расщепления для эндопептидаз, включая, но не ограничиваясь, эндопептидазы аспарагиновой кислоты (например, катепсин И, химозин, ВИЧ протеаза), эндопептидазы цистеина (бромелаины, папаин, кальпаин), металлоэндопептидазы, (например, коллагеназа, термолизин), сериновые эндопептидазы (например, химотрипсин, фактор 1Ха, фактор X, тромбин, трипсин), стрептокиназы. Последовательности сайтов распознавания и расщепления для этих энзимов хорошо известны.
Могут быть также изменены другие аминокислоты в Е2, отличные от уже упомянутых. Как правило, вариант последовательности Е2 будет иметь последовательность аминокислот, по меньшей мере на 80% идентичную референсаной Е2 последовательности, или может иметь последовательность, идентичную по меньшей мере на 82%, по меньшей мере на 85%, по меньшей мере на 87%, по меньшей мере на 90%, по меньшей мере на 92%, по меньшей мере на 95% или по меньшей мере на 98%. Вариант гликопротеина должен демонстрировать биологическую функцию, такую как способность облегчать инфицирование дендритных клеток вирусной частицей, имеющей оболочку, содержащую Е2. Эксперименты идентифицировали участки в гликопротеинах оболочки, которые, по видимости, играют важную роль в различных аспектах вирусной сборки, присоединения к клеточной поверхности и инфицирования. При создании вариантов в качестве руководства может использоваться следующая информация. Цитоплазматический хвост Е2 - остатки приблизительно от 408 до 415 - важен для вирусной сборки (^е§! е! а1. 1. У1го1. 80: 4458-4468, 2006; включен в полном объеме). Другие участки задействованы в формировании вторичной структуры (приблизительно остатки 33-53) и участвуют в транспортировке и стабильности белка (приблизительно остатки 86-119) (№уага1тага)а11 е! а1., 1. У1го1. 363: 124-147, 2007; включен в полном объеме). Вариант может сохранять гидрофобный характер участка, который проникает через мембрану, приблизительно остатки 370-380. Вариант может сохранять один или оба Ν-связанных сайта гли
- 9 032403 колизации ΝΙΤ (остатки 196-198) и ΝΕΤ (остатки 318-320) и может сохранять один или более пальмитоилированных сайтов (С-396, С416 и С417) (§1гаи88 аий 81гаи55 МюгоЬю1 Ксу 58, 491-562, 1994; с. 499-509 включены). С другой стороны, многие участки Е2 могут быть изменены без какого-либо вреда. Например, после вставок транспозонов во многие различные районы Е2 вирусы сохраняют жизнеспособность Щауага1тага)ай, там же).
В некоторых вариантах воплощения в Е3, 6К или Е1 белки может быть вставлен маркерный пептид. Для определенных целей маркер может быть вставлен в Е2, но маркер нежелателен для использования в продукте, предназначенном для введения людям. Маркерный пептид, который является короткой последовательностью (например, 5-30 аминокислот), может быть использован для улучшения детекции экспрессии оболочки и ее наличия в вирусных частицах. Для целей детекции маркерная последовательность обычно обнаруживается антителами или химическими реагентами. Другое использование маркера улучшение очистки вирусных частиц. Для абсорбции вируса может использоваться субстрат, содержащий связывающий партнер для маркера. Элюция вируса может быть выполнена обоработкой частицами, которые замещают маркер от связывающего партнера, или если маркерная последовательность находится в связи с расщепляемой последовательностью, то воздействие соответствующей эндопептидазой позволит удобно высвободить вирус (см., например, О|;щсп са1а1од. Рас1ог Ха Рго1са5С Зуйет). Удаление маркерного пептида в основном желательно для целей безопасности использования вирусных частиц у пациентов, являющихся животными. Если маркер не удалять, может появиться иммунный ответ на маркер.
Подходящие маркеры включают, не ограничиваясь, ЕЬАС (ΌΎΚΌΌΌΌΚ) (И.8. Ра1еШ № 4703004, включен в полном объеме), антитела для которого доступны в продаже, хитинсвязывающий белок, мальтозасвязывающий белок, глютатион-8-трансфераза, поли(Нк) (патент США № 4569794, включен в полном объеме), тиоредоксин, НА (гемагглютинин)-маркер, в числе прочего. Поли(Нк) можно адсорбировать на аффинную среду, содержащую связанные ионы металла, например никеля или кобальта, и элюировать средой с низким рН.
Вирусные частицы могут быть измерены для определения специфичности гликопротеина оболочки, встроенного в вирус, к целевым дендритным клеткам. Например, смешанная популяция клеток костного мозга может быть извлечена из пациента и культивироваться ίη уйго. Альтернативно, могут быть получены и использованы изогенные клеточные линии, которые экспрессируют или не экспрессируют ЭС8ΙΟΝ. Рекомбинантный вирус может вводиться в смешанную популяцию клеток костного мозга или изогенных клеточных линий, и экспрессия репортерного гена, встроенного в вирус, может быть оценена в культивируемых клетках. В некоторых вариантах воплощения изобретения могут использоваться анализы с предельным разведением, в которых смешанная популяция клеток разделяется на отдельные части, которые затем раздельно инкубируются с уменьшающимися количествами вируса (например, 2-кратное, 5-кратное, 10-кратное разведение вируса в каждой части). В некоторых вариантах воплощений изобретения по меньшей мере около 50%, более предпочтительно по меньшей мере около 60, 70, 80 или 90%, еще более предпочтительно по меньшей мере около 95% инфицированных клеток в смешанной клеточной популяции являются дендритными клетками, которые экспрессируют ΌΟ-8ΙΟΝ. В некоторых вариантах воплощения изобретения соотношение инфицированных дендритных клеток к инфицированным недендритным клеткам (или не ΌΟ-8ΙΟΝ экспрессирующим клеткам) составляет по меньшей мере около 2:1, по меньшей мере около 3:1, по меньшей мере около 4:1, по меньшей мере около 5:1, по меньшей мере около 6:1, по меньшей мере около 7:1, по меньшей мере около 8:1, по меньшей мере около 9:1, по меньшей мере около 10:1, по меньшей мере около 20:1, по меньшей мере около 30:1, по меньшей мере около 40:1, по меньшей мере около 50:1, по меньшей мере около 100:1, по меньшей мере около 200:1, по меньшей мере около 500:1, по меньшей мере около 1000:1, по меньшей мере около 5000:1, по меньшей мере около 10000:1 или более. Для предельного разведения обычно наблюдается более высокая избирательность у более сильных разведений (например, более низкие количества) внесенного вируса.
Активность псевдотипированных вирусных частиц может определяться по любому из возможных способов. Например, предпочитаемым способом оценки инфекционной эффективности (МЕ, инфекционные единицы) является введение вирусных частиц в клетки и оценка экспрессии продукта, кодируемого в векторном геноме. Может использоваться любой продукт, который можно оценить. Одним подходящим типом продукта является флюоресцентный белок, такой как зеленый флюоресцентный белок (ОЕР). СЕР и анализ приведены в примерах, таких как пример 3. Другие продукты, которые можно использовать, включают белки, экспрессируемые на клеточной поверхности (например, детекция путем присоединения антител), энзимы и тому подобное. Если продукт является антигеном, и клетки являются дендритными клетками, инфекционность/активность могут оцениваться путем определения иммунного ответа. Более того, возможно обнаружить побочный эффект у млекопитающих. Способность специфично поражать дендритные клетки также может быть тестирована напрямую, например, в клеточной культуре, как описано ниже.
Вирусные частицы могут также быть приготовлены и тестированы по их селективности и/или по их способности улучшать проникновение в мембрану целевых клеток. Вирусные частицы, которые имеют оболочку с немодифицированными гликопротеинами, могут использоваться как контроль для сравнения.
- 10 032403
Коротко говоря, клетки, экспрессирующие рецептор для гликопротеина оболочки, инфицируются вирусом с использованием стандартного инфекционного исследования. После определенного времени, например через 48 ч после инфицирования, клетки могут быть собраны и процент клеток, инфицированных вирусом, можно определить, например, проточной цитометрией. Селективность может быть оценена путем подсчета процента клеток, инфицированных вирусом. Подобным образом действие варианта гликопротеина оболочки на вирусный титр может быть подсчитано путем сравнения процента клеток, инфицированных вирусом, содержащим вариант оболочки, с процентом клеток, инфицированных вирусом, содержащим соответствующий дикий тип (немодифицированный) гликопротеина оболочки. Особенно подходящий вариант будет иметь лучшую комбинацию селективного и инфекционного титра. Когда вариант выбран, может быть осуществлен анализ концентрации вируса для подтверждения того, что эти вирусы можно концентрировать без потери активности. Вирусные супернатанты собираются и концентрируются ультрацентрифугированием. Титры вирусов можно определять предельным разведением вирусного маточного раствора и инфицированием клеток, экспрессирующих рецептор для гликопротеина оболочки, подсчитывая экспрессию продукта, экспрессируемого вирусами, как описано выше.
Вход лентивирусной векторной частицы в целевую клетку является другим типом подсчета активности. В1аМ-Ург (β-лактамазе Ург) гибридный белок используется для оценки ШУ-1 вирусного проникновения; гибридизация В1аМ и гликопротеина оболочки вируса Синдбис, такого как гибридный белок Е1 или Е2/Е1, может использоваться для оценки эффективности белка оболочки в облегчении гибридизации и проникновения в целевую клетку. Вирусные частицы могут быть приготовлены, например, путем транзиентной трансфекции упакованных клеток с одним или более векторами, содержащими вирусные элементы, В1аМ-Ург, и вариантом интересующей оболочки (и аффинной молекулы, если это соответствует). Получившийся в результате вирус может использоваться для инфицирования клеток, экспрессирующих целевую молекулу (или аффинную молекулу), специфично связывающуюся в отсутствие или в присутствии свободного ингибитора связывания (такого как антитело). Клетки затем можно промыть С02независимой средой и окрасить ССЕ2 красителем (Аигога Вюктепсе). После инкубации при комнатной температуре для того, чтобы реакция расщепления прошла полностью, клетки можно фиксировать параформальдегидом и анализировать путем проточной цитометрии и микроскопии. Процент голубых клеток указывает на проникновение вирусов в цитоплазму; малое количество голубых клеток будет ожидаться при добавлении блокирующего антитела (С’аугоД е1 а1. Вю1ес11по1 20: 1151-1154, 2002; включен в полном объеме).
Чтобы исследовать, зависит ли пенетрация от низкого рН, и идентифицировать гликопротеины оболочки с желаемой рН-зависимостью, можно добавить на этапе инфицирования МН4С1 или другие компоненты, которые изменяют рН (N4^1 нейтрализует кислые компартменты эндосом). В случае N4^0 отсутствие голубых клеток будет указывать на то, что пенетрация вирусами имеет низкую рН-зависимость. Кроме того, для подтверждения того, что активность является рН-зависимой, лизосомотрофные агенты, такие как аммония хлорид, хлорохин, конканамицин, бафиломицин А1, моненсин, нигерицин и т. д., могут быть добавлены в инкубационный буфер. Эти агенты повышают рН внутри эндосомальных компартментов (например, Эгоке апй АНепйогЕ Т Ехр. Вю1. 200, 1-8, 1997). Ингибирующее действие этих агентов будет показывать действие рН на вирусную гибридизацию и проникновение. Можно сравнить различную кинетику проникновения между вирусами, демонстрирующими различные фузогенные молекулы, и наиболее подходящие выбрать для определенного применения.
РСК-основанный анализ проникновения можно использовать для мониторинга обратной транскрипции и оценки кинетики синтеза вирусной ДНК как показателя кинетики вирусного проникновения. Например, вирусные частицы, содержащие определенную белковую молекулу оболочки, инкубируются с целевыми клетками, такими как 293Т клетки, ДКл, или любыми другими клетками, которые сконструированы для экспрессирования, или которые естественным образом экспрессируют подходящий связывающий партнер (рецептор) для белковой молекулы оболочки. Либо немедленно, либо через некоторое время (чтобы дать инфекции возможность проявиться) несвязавшиеся вирусы удаляются и аликвоты клеток анализируются на вирусные нуклеиновые кислоты. ДНК экстрагируется из этих аликвот и подвергается анализу амплификации, обычно полуколичественным методом, с затравкой ЬТКспецифичными праймерами. Появление ЬТК-специфичного ДНК-продукта показывает успешность вирусного проникновения.
В. Лентивирусный векторный геном.
Вирусная векторная частица содержит геном, который содержит интересующую(ие) последовательность(и). Могут включаться другие последовательности, такие как последовательности, которые позволяют геному упаковываться в вирусную частицу, и последовательности, которые активизируют экспрессию интересующей(их) последовательности(ей), после чего следует трансдукция целевой клетки. Геном может быть получен из любого из множества подходящих доступных основанных на лентивирусном геноме векторов, включая идентифицированные для применения в генной терапии человека, такие как описаны в публикации РГейсг апй Уегта (Аппи. Кеу. Сепот1С5 Нит. Сепе1. 2:177-211, 2001; включена путем ссылки в полном объеме). С целью упрощения такой геном также называется вирусным векторным геномом или векторным геномом.
- 11 032403
1. Основная цепь.
Подходящие лентивирусные векторные геномы включают основанные на вирусе иммунодефицита человека (ВИЧ-1), ВИЧ-2, вирус иммунодефицита кошачьих (ВИК), вирус инфекционной анемии у лошадей, вирус иммунодефицита обезьян (ВИО) и вирус меди-висна. Желаемой характеристикой лентивирусов является их способность инфицировать как делящиеся, так и неделящиеся клетки, и для целевых клеток не является необходимым состояние деления (или стимуляция целевых клеток к делению). В основном, геном и гликопротеины оболочки базируются на различных вирусах, и получившаяся в результате вирусная векторная частица является псевдотипированной. Желательно включить в векторный геном свойства, обеспечивающие безопасность. Свойства, обеспечивающие безопасность, включают самоинактивацию ЬТК и неинтеграцию в геном. Векторы, приведенные в качестве примера, обсуждаются в дальнейшем в примере 5 и на фиг. 5, и такие векторы можно использовать в воплощениях изобретения для экспрессии интересующих антигенов.
В некоторых примерах воплощений вирусный векторный геном содержит последовательности из лентивирусного генома, такие как ВИЧ-1 геном или ВИО геном. Конструкт вирусного генома может содержать последовательности из 5' и 3' ЬТК лентивируса, и в особенности может содержать Я и И5 последовательности из 5' ЬТЯ лентивируса и инактивированных или самоинактивированных 3' ЬТЯ из лентивируса. ЬТЯ последовательности могут быть ЬТЯ последовательностями из любого лентивируса любого вида. Например, они могут быть ЬТЯ последовательностями из ВИЧ, ВИО, ВИК или БВИ. Обычно ЬТЯ последовательности являются ВИЧ ЬТЯ последовательностями.
Векторный геном может содержать инактивированные или самоинактивированные 3' ЬТЯ (ΖιιΓίοϊΌν е! а1. 1. У1го1. 72: 9873, 1998; М1уо§Ы е! а1., 1. У1го1. 72:8150, 1998; и то, и другое включено в полном объеме). Самоинактивирующийся вектор обычно имеет делецию энхансерной и промотерной последовательностей из 3' длинного терминального повтора (ЬТЯ), который копируется в 5' ЬТЯ во время векторной интеграции. В одном случае, И3 элемент 3' ЬТЯ содержит делецию в энхансерной последовательности, ТАТА-бокс, Зр1 и ΝΡ-кВ сайтах. В результате самоинактивации 3' ЬТЯ провирус, который образуется после проникновения и обратной транскрипции, будет содержать инактивированную 5' ЬТЯ. Рационально повышать безопасность путем уменьшения риска мобилизации векторного генома и влияния ЬТЯ на соседние клеточные промоторы. Самоинактивация 3' ЬТЯ может быть создана по любому способу, известному специалистам в данной области.
Необязательно, И3 последовательность из лентивирусной 5' ЬТЯ может быть замещена промоторной последовательностью в вирусном конструкте, таком как гетерологичная промоторная последовательность. Это может повышать титр вируса, полученного из упаковочной клеточной линии. Также может быть включена энхансерная последовательность. Может быть использована любая комбинация энхансер/промотор, которая повышает экспрессию вирусного РНК генома. В одном примере используется СМУ последовательность энхансер/промотор (ИЗ 5385839 и ИЗ 5168062, каждый из которых включен в полном объеме).
В некоторых воплощениях риск инсерционного мутагенеза минимизируется путем конструирования лентивирусного векторного генома с интеграционным дефектом. Для производства неинтегрирующегося векторного генома могут использоваться различные подходы. Эти подходы включают разработку мутации(й) в интегразном энзимном компоненте ро1 гена, такие как кодировку белка с инактивной интегразой. Сам векторный геном может быть модифицирован для предотвращения интеграции, например, путем мутации или делеции одного или обоих сайтов присоединения, или путем создания нефункционального 3' ЬТЯ-проксимального полипуринового тракта (РРТ) благодаря делеции или модификации. Кроме того, возможны негенетические подходы; они включают фармакологические агенты, которые ингибируют одну или более функций интегразы. Подходы не исключают друг друга, то есть одновременно может быть использован более чем один. Например, и интеграза, и сайты присоединения могут быть нефункциональны, или интеграза и РРТ сайт могут быть нефункциональны, или сайты присоединения и РРТ сайт могут быть нефункциональны, или все они могут быть нефункциональны.
Как утверждалось выше, в одном подходе создается и используется нефункциональная интеграза. Интеграза задействована в расщеплении вирусной двунитевой ДНК без липких концов и присоединении концов к 5'-фосфатазам в двух нитях хромосомного целевого домена: Ν-терминального домена, который содержит цинксвязывающий мотив (ННСС), сердцевину центрального домена, которая содержит каталитическое ядро и консервативный ЭЭ35Е мотив (Ό64, Ό116, Е152 в ВИЧ-1), и С-концевой домен, который обладает ДНК-связывающими свойствами. Точечных мутаций, вставленных в интегразу, достаточно для разрушения нормальной функции. Многие мутации в интегразе созданы и охарактеризованы (см., Р1н1ро(( апб Тйгакйег, Нитап Сепе Тйегару 18:483, 2007; Аро1оша, Тйеык 8иЬтй!еб !о ишуегебу Со11еде Ьопбоп, Аргй 2009, с. 82-97; Епде1тап е! а1. 1. У1го1. 69: 2729, 1995; №дйбпда1е е! а1. Мо1. Тйегару, 13: 1121, 2006; все включены в полном объеме). Последовательность, кодирующая интегразный белок, может быть удалена или мутирована для возмещения белковой неактивности, предпочтительно без значительно ослабленной активности обратной транскриптазы или нуклеиновой нацеленности, тем самым предотвращая интеграцию провируса в геном целевой клетки. Приемлемые мутации могут уменьшать интегразный катализ, перенос цепи, связывание с а!! сайтами, связывание с хромосомальной ДНК хозяи
- 12 032403 на и другие функции. Например, одна аспарагиновая кислота для аспарагинового замещения в остатке 35 у ВИЧ или ВИО интегразы полностью аннулирует вирусную ДНК-интеграцию. Делеции в интегразе обычно подтверждаются С-концевым доменом. Делеция кодирующей последовательности для остатков 235-288 дает в результате пригодную нефункциональную интегразу. (Епде1тап с1 а1. 1. У1го1. 69:2729, 1995). В дальнейших примерах мутации могут быть сделаны, например, Азр64 (номера остатков даются для ВИЧ-1, соответствующие номера остатков для интегразы из других лентивирусов или ретровирусов могут быть легко определены специалистами в данной области) (например, И64Е, И64У), Азр116 (например, И116Щ, Ази120 (например, Ш20К), С1и152, С1п148 (например, Р148А), Ьув156, Ьув159, Тгр235 (например, \У235Е). Ьуз264 (например, К264Е), Ьуз266 (например, К266Е), Ьуз273 (например, К273Е). Другие мутации могут быть созданы и протестированы в отношении интеграции, трансгенной экспрессии и любого другого желаемого параметра. Анализы этих функций хорошо известны. Мутации могут быть созданы при помощи любой из множества техник, включая сайт-направленный мутагенез и химический синтез нуклеиновой последовательности. Может быть произведена одна мутация, или же в интегразе может присутствовать больше одной из подобных мутаций. Например, в интегразе могут быть мутации по двум аминокислотам, трем аминокислотам, четырем аминокислотам и так далее.
Альтернативно или в комбинации с использованием мутанта(ов) по интегразе, сайты присоединения (ай) в И3 и И5 также могут быть мутированы. Интеграза связывает эти сайты, и 3'-терминальный динуклеотид расщепляется на обоих концах векторного генома. СА динуклеотид локализуется в 3' конце; СА требуется для процессинга, мутация нуклеотидов блокирует интегацию в хромосомы хозяина. А в СА динуклеотиде является самым критичным нуклеотидом для интеграции, и мутации на обоих концах генома дадут лучшие результаты. (Вго^и е1 а1. 1. Уйо1. 73:9011 (1999). В одном примере СА на каждом конце изменяется на ТС. В других примерах СА на каждом конце изменяется на ТС на одном конце и на СТ на другом конце. В других примерах СА на каждом конце удаляется; в других примерах А в СА удаляется на каждом конце.
Интеграция также может ингибироваться путем мутации или делеции полипуринового тракта (РРТ) (\У0 2009/076524; включен в полном объеме), локализованного проксимально к 3' ЬТК. РРТ является полипуриновой последовательностью из около 15 нуклеотидов, которая может служить связывающим праймер сайтом для плюс-нити ДНК-синтеза. В этом случае мутации или делеции РРТ нацелены на процесс обратной транскрипции. Не привязываясь к определенному механизму, мутации или делеции РРТ, образование линейной ДНК радикально уменьшается и образуются практически только 1-ЬТК ДНКкольца. Интеграция требует линейного двухнитевого ДНК векторного генома, и интеграция практически исчезает без него. Как утверждалось выше, РРТ может быть создан нефункциональным путем мутации или делеции. Обычно осуществляется делеция всей 15 п1 РРТ, хотя в некоторых вариантах воплощения могут быть сделаны более короткие делеции 14 пк 13, пк 12 пк 11 пк 10 пк, 9 пк, 8 пк, 7 пк, 6 пк, 5 пк, 4 пк, 3 пк и 2 пк. При осуществлении мутаций обычно осуществляются множественные мутации, обычно в 5' половине РРТ (Мс^1Шат8 ек а1., I. Уйо1. 77:11150, 2003), хотя одиночные и двойные мутации в первых четырех основаниях тоже уменьшают транскрипцию. Мутации, сделанные на 3'-конце РРТ, обычно имеют более выраженный эффект (Ро\уе11 аи4 Бетт 1. У1го1. 70:5288, 1996).
Такие различные подходы к созданию неинтегрирующегося векторного генома могут использоваться по отдельности или в комбинации. Применение более чем одного подхода может быть использовано для конструирования надежного безопасного вектора с помощью избыточного механизма. Таким образом, РРТ мутации или делеции могут комбинироваться с мутациями или делециями акк сайта или с мутацией интегразы или РРТ мутации или делеции можно комбинировать с мутациями акк сайта или делециями и мутациями интегразы. Подобным образом, мутации акк сайта или делеции и мутации интегразы могут комбинироваться друг с другом или с РРТ мутациями или делециями.
2. Регуляторные элементы.
Как обсуждалось в настоящем документе, вирусный векторный геном содержит интересующую последовательность, экспрессия которой желаема в клетках-мишенях. Обычно интересующая последовательность локализуется между 5' ЬТК и 3' ЬТК последовательностями. Далее интересующая последовательность предпочтительно находится в функциональном родстве с другими генетическими элементами, например, последовательностями, регулирующими транскрипцию, включая промоторы или энхансеры, для регуляции экспрессии интересующей последовательности особым образом. В некоторых случаях используемыми транскрипционными регуляторными последовательностями являются те, которые высокорегулируемы при сохранении активности как во времени, так и в пространстве. Контролирующие экспрессию элементы, которые могут быть использованы для регуляции экспрессии компонентов, известны специалистам и включают, не ограничиваясь, индуцируемые промоторы, конститутивные промоторы, секреционные сигналы, энхансеры и другие регуляторные элементы.
Интересующая последовательность и любые другие экспрессируемые последовательности обычно состоят в функциональном родстве с внутренними промоторными/энхансерными регуляторными последовательностями. Внутренним промотором/энхансером является тот, который локализован между 5' ЬТК и 3' ЬТК последовательностями в вирусном векторном конструкте и функционально связан с интересующей последовательностью. Внутренним промотором/энхансером может быть любой промотор,
- 13 032403 энхансер или комбинация промотор/энхансер, известная как увеличивающая экспрессию гена, с которым есть функциональное родство. Функциональное родство и функционально связана означают, не ограничиваясь этим, что последовательность находится в правильном местоположении и ориентации по отношению к промотору и/или энхансеру таким образом, что интересующая последовательность будет экспрессироваться, когда промотор и/или энхансер контактирует с соответствующими молекулами.
Выбор внутреннего промотора/энхансера основан на желаемом способе экспрессии интересующей последовательности и на специфических свойствах известных промоторов/энхансеров. Таким образом, внутренний промотор может быть конститутивно активным. Неограничивающие примеры конститутивных промоторов, которые могут быть использованы, включают промотор для убиквитина (публикации и8 5510474; \У0 98/32869, каждая из которых включена в настоящий документ в полном объеме путем ссылки), СМV (публикации Тйоткеп е! а1., РNА8 81:659, 1984; И8 5168062, каждая из которых включена в настоящий документ в полном объеме путем ссылки), β-актин (публикация Сипшпд е! а1. 1989 Ргос. №И. Асаб. 8с1. И8А 84:4831-4835, включена в настоящий документ в полном объеме путем ссылки) и рдк (см., например, публикации Абга е! а1. 1987 Сепе 60:65-74; 8тдег-8ат е! а1. 1984 Сепе 32:409-417; и ЭоЬкоп е! а1. 1982 №.1с1е1с Ас1бк Век. 10:2 635-2 637, все вышеперечисленные публикации включены в настоящий документ в полном объеме путем ссылки).
Альтернативно промотор может быть тканеспецифичным промотором. В некоторых предпочтительных вариантах воплощения промотор является целевым тканеспецифичным промотором. Например, промотор может происходить из любого продукта, экспрессируемого дендритными клетками, включая СЮ 11с, СВ103, ТЬВк, ОС^КА', ВВСА-3, ВЕС-205, ВС1В2, рецептор маннозы, Весбп-1, С1ес9А, МНС с1аккП. Кроме того, промоторы могут быть избраны для допущения индуцируемой экспрессии интересующей последовательности. Число систем для индуцируемой экспрессии, известных специалистам в данной области, включают систему тетрациклиновой реакции, систему 1ас оператор-репрессор, а также промоторы, реагирующие на множество внешних или физиологических изменений, включая тепловой шок, ионы металлов, такие как металлотионеина промотор, интерфероны, гипоксию, стероиды, такие как промотор рецептора к прогестерону или глюкокортикоиду, излучение, такой как АЕСЕ промотор. Комбинация промоторов также может быть использована для получения желаемой экспрессии интересующего гена. Специалист со стандартным набором навыком может выбрать промотор, основываясь на желаемом способе экспрессии гена в организме или целевой клетке.
Вирусный геном может содержать по меньшей мере один промотор, реагирующий на РНК полимеразу II или III. Этот промотор может быть функционально связан с интересующей последовательностью и может также быть связан с терминальной последовательностью. Кроме того, может быть встроен более чем один промотор РНК полимерезы II или III. Промоторы РНК полимеразы II и III хорошо известны специалистам в данной области. Список подходящих промоторов РНК полимеразы III можно найти, например, в публикации Раи1е апб ХУййе, М.1с1е1с Аабк Векеагсй., νο1. 28, рр. 1283-1298 (2000), которая включена в настоящий документ путем ссылки в полном объеме. Промоторы РНК полимеразы II или III также включают любые синтетические или сконструрованные фрагменты ДНК, которые могут направлять РНК полимеразу II или III транскрибировать правосторонние РНК-кодирующие последовательности. Затем могут индуцироваться промотор или промоторы РНК-полимеразы II или III (Ро1 II или III), используемые как часть вирусного векторного генома. Любой подходящий индуцируемый промотор Ро1 II или III может использоваться со способами настоящего изобретения. Особенно пригодные промоторы Ро1 II или III включают реагирующие на тетрациклин промоторы, представленные в публикациях 0йка\\'а апб Тапа, Нитап Сепе Тйегару, ^1. 11, с. 577-585 (2000) и Ме1ккпег е! а1. М.1с1е1с Ас1бк Векеагсй, Vο1. 29, с. 1672-1682 (2001), каждая из которых включена в настоящий документ путем ссылки в полном объеме.
Внутренний энхансер может также быть представлен в вирусном конструкте для увеличения экспрессии интересующего гена. Например, может быть использован СМV энхансер (публикация Вокйай е! а1. Се11, 41:521, 1985; включена в настоящий документ путем ссылки в полном объеме). Многие энхансеры в вирусных геномах, таких как ВИЧ, СМV, и геномах млекопитающих идентифицированы и охарактеризованы (см. СепВапк). Энхансер может быть использован в комбинации с гетерологичным промотором. Специалист в данной области может выбрать подходящий энхансер, основываясь на желаемом способе экспрессии.
Вирусный геном будет обычно содержать промотор, который распознается целевой клеткой и который функционально связан с интересующей последовательностью, вирусными компонентами и другими последовательностями, обсуждаемыми в настоящем документе. Промотор является контролирующим экспрессию элементом, образуемым последовательностью нуклеиновой кислоты, которая запрещает связывание РНК-полимеразы и транскрипцию. Промоторы могут быть индуцируемыми, конститутивными, временно активными или тканеспецифичными. Активность индуцируемых промоторов вызывается присутствием или отсутствием биотических или абиотических факторов. Индуцируемые промоторы могут быть полезным инструментом в генной инженерии, поскольку экспрессия генов, с которыми они функционально связаны, может включаться или выключаться на определенных стадиях развития организма, его создания, ил в определенных тканях. Индуцируемые промоторы могут группироваться как химиче
- 14 032403 ски регулируемые промоторы или физически регулируемые промоторы. Обычные химически регулируемые промоторы включают, не ограничиваясь, алкогольрегулируемые промоторы (например, промотор гена алкогольдегидрогеназы I (а1сА)), тетрациклинрегулируемые промоторы (например, промотор тетрациклинового ответа), стрероидрегулируемые промоторы (например, промотор на основе крысиного глюкокортикоидного рецептора (ОВ), промотор на основе рецептора к эстрогену человека (ЕВ), промотор на основе рецептора к экдизону моли и промоторы на основе суперсемейства рецепторов стероидов/ретиноидов/тироидов), металлрегулируемые промоторы (например, промоторы на основе гена металлотионеина), и связанные с патогенезом промоторы (напримр, АгаЬ1бор818 и кукурузы патогенсвзанные (РВ) промоторы на основе белка). Типичные физически регулируемые промоторы включают, но не ограничиваясь этим, температурорегулируемые промоторы (например, промоторы теплового шока), и светорегулируемые промоторы (например, 88И промотор соевых бобов). Другие служащие примером промоторы описаны в других источниках, например в публикации Ргото1егз изеб 1о геди1а1е депе ехргеззюп на веб-сайте Ра1еШ Ьепз, добавленной 18 мая 2009 г. (включена в настоящий документ путем ссылки в полном объеме).
Специалист в данной области может выбрать подходящий промотор, основываясь на специфических условиях. Многие различные промоторы хорошо известны специалистам, так же как способы для функциональной связи промотора с экспрессируемым геном. Как естественные промоторные последовательности, так и многие гетерологичные промоторы могут использоваться для прямой экспрессии в упаковочных клетках и целевых клетках. Однако гетерологичные промоторы предпочтительней, поскольку они обычно не допускают повышенную транскрипцию и повышенные уровни желаемого белка по сравнению с естественными промоторами.
Промотор может быть получен, например, из геномов вирусов, таких как вирус полиомы, вирус оспы кур, аденовирус, бычий вирус папилломы, вирус саркомы птиц, цитомегаловирус, ретровирус, вирус гепатита В и вирус обезьян 40 (8У40). Промотор также может быть, например, гетерологичным промотором млекопитающих, напр., промотором актина или промотором иммуноглобулина, промотором теплового шока или промотором, обычно связанным с естественной последовательностью, если такие промоторы совместимы с клеткой-мишенью. В одном варианте воплощения промотор является естественным вирусным промотором, присутствующим в вирусной системе экспрессии. В некоторых вариантах воплощения промотор является специфичным для дендритных клеток промотором. Специфичный для дендритных клеток промотор может быть, например, СЭ11с промотором.
Транскрипция может возрастать благодаря вставке энхансерной последовательности в вектор(ы). Энхансеры являются типичными цис-активными элементами ДНК, обычно примерно от 10 до 300 300 Ьр в длину, которые действуют на промотор, повышая его транскрипцию. В настоящее время известны многие энхансерные последовательности из генов млекопитающих (глобин, эластаза, альбумин, афетопротеин и инсулин) и из вирусов эукариотных клеток. примеры включают 8У40 энхансер на поздней стороне точки начала репликации (Ьр 100-270), энхансер раннего промотора цитомегаловируса, энхансер полиомы на поздней стороне точки начала репликации, и энхансер аденовируса. Энхансер может быть соединен в вектор в положении 5' или 3' с антиген-специфичной полинуклеотидной последовательностью, но предпочтительно локалиузется в положении 5' от промотора.
Векторы экспрессии также могут содержать последовательности, необходимые для терминации транскрипции и для стабилизации мРНК. Эти последовательности часто обнаруживаются в 5' и иногда 3' нетранслируемых регионах эукариотной или вирусной ДНК или кДНК и хорошо известны специалистам в данной области.
Вирусный векторный геном также может содержать добавочные генетические элементы. Типы элементов, которые могут быть включены в конструкт, не ограничиваются никаким образом и могут быть выбраны для достижения определенного результата. Например, может быть включен сигнал, который способствует нуклеотидному вхождению вирусного генома в клетку-мишень. примером такого сигнала является ВИЧ-1 флап-сигнал. Кроме того, могут быть включены элементы, облегчающие характеристику провирусного интеграционного сайта в клетке-мишени. Например, в конструкт может быть включена тРНК последовательности амбер-супрессора. В вирусный геномный конструкт может быть также включена инсуляторная последовательность, например, из куриного β-глобина. Этот элемент снижает вероятность молчания интегрированного в клетке-мишени провируса вследствие эффектов метилирования и гетерохроматинизации. Кроме того, инсулятор может защищать внутренний энхансер, промотер и экзогенный ген от позитивных и негативных позициональных эффектов из окружающей ДНК интеграционного сайта хромосомы. Кроме того, векторный геном может содержать один или более генетических элементов, разработанных для усиления экспрессии интересующего гена. Например, в конструкт может быть помещен элемент, реагирующий на вирус гепатита сурков (ШВЕ) (публикации ХиГГегеу е1 а1. 1999. 1. У1го1. 74:3668-3681; Эед1оп е! а1. 2000. Нит. Оепе Тйег. 11:179-190, каждая их которых включена в настоящий документ путем ссылки в полном объеме).
Вирусный векторный геном обычно конструируется в форме плазмиды, которую можно трансфицировать в упаковочную или производящую клеточную линии. Плазмида обычно содержит последовательности, полезные для репликации плазмиды в бактерии. Такие плазмиды хорошо известны специали
- 15 032403 стам в данной области. Кроме того, векторы, которые включают прокариотическую точку начала репликации, также могут включаться в ген, экспрессия которого подтверждается детектирующим или селектирующим маркером, таким как устойчивость к лекарствам. Типичные продукты, устойчивые к бактериальным к лекарствам, подтверждают резистентность к ампициллину или тетрациклину.
Плазмиды, содержащие один или более из компонентов, описанных в настоящем документе, легко конструируются с использованием стандартных техник, известных специалистам в данной области. Для анализа, подтверждающего правильность последовательности в сконструированной плазмиде, плазмиду можно реплицировать в Е. сой, очистить и анализировать путем рестрикционного эндонуклеазного расщепления, или же ДНК-последовательность подтверждается стандартными способами.
Можно также использовать векторы, сконструированные для транзиентной экспрессии в клетках млекопитающих. Транзиентная экспрессия включает использование вектора экспрессии, который способен эффективно реплицироваться в клетках хозяина, таким образом, в клетке хозяина аккумулируется множество копий вектора экспрессии и, в свою очередь, синтезируются высокие уровни полипептидов, кодируемых антиген-специфичным полинуклеотидом в векторе экспрессии. См. ЕатЬгоок с! а1., кирга, с. 16.17-16.22. Другие векторы и способы, подходящие для адаптации к экспрессии полипепдидов, хорошо известны специалистам в данной области и легко адаптируются к специфическим условиям.
С использованием представленных в настоящем документе техник, специалисту в данной области понятно, что эффективность определенной системы экспрессии может быть протестирована путем трансфекции упаковочных клеток в вектор, содержащий ген, кодирующий репортерный белок и оценки экспрессии с использованием подходящей техники, например, подсчета флюоресценции конъюгата белка с зеленым флюоресцентом. Подходящие репортерные гены хорошо известны специалистам в данной области.
3. Типы интересующих последовательностей.
Интересующая последовательность не имеет никаких ограничений и включает любую нуклеиновую кислоту, которую специалист желает интегрировать, транскрибировать и использовать в целевой клетке. Продукт может быть белком или нуклеиновой кислотой. Интересующая последовательность может кодировать белок или молекулу нуклеиновой кислоты, включая миРНК, микроРНК, самокомплементарную двунитевую РНК, в которой комплементарный регион больше чем 20 рибонуклеотидов в длину, или РНК, которая комплементарна смысловой РНК, где связывание вышеупомянутой комплементарной (антисмысловой) РНК со смысловой РНК блокирует ее способность транслироваться в белок. В отдельных случаях интересующая последовательность может кодировать антиген, против которого желателен иммунный ответ. В особенности желательны опухолевые антигены и антигены инфекционных болезней из таких агентов, как ВИЧ, ВПГ, НСУ, НРУ, малярия или туберкулез.
В определенных случаях интересующая последовательность может быть геном, кодирующим малую ингибирующую РНК (миРНК) или микроРНК, которые отрицательно регулируют экспрессию молекулы. Например, ген, кодирующий миРНК или микроРНК, может использоваться для отрицательного регулирования экспрессии негативных регуляторов в клетке, включая те, которые ингибируют активацию или созревание дендритных клеток. миРНК и микроРНК хорошо известны специалистам в данной области (В1ге с! а1., №11игс 391:806, 1998; см. также ТНс Κ.ΝΛ [п1сгГсгспсс Вскоигсе в Аррйсб ВюкукВтк, Тгапд с! а1., Опсодспе Еирр1 2:Е52, 2008; Тадапоу, К., с! а1. 2007. Iттишίу 26:133-137; ПаЫЬсгд, ВЕ. апб Е. Ьипб. 2007. Ес1. ЕТКЕ 387:рс25; Т1стапп апб Во881, ЕМВО Мо1. Меб. 1: 142, 2009). Альтернативно, интересующая последовательность может кодировать самокомплементарную двунитевую РНК, в которой комплементарный регион больше чем около 20 рибонуклеотидов в длину, или антисмысловую РНК, которая больше чем около 20 рибонуклеотидов в длину. Специалистам в данной области понятно, что молекулы миРНК, микроРНК, дсРНК и антисмысловой РНК могут экспрессироваться от промотора РНК полимеразы ΙΙΙ или, альтернативно, могут быть компонентом некодирующей РНК, которая транскрибируется от промотора РНК полимеразы ΙΙ.
Кроме того, интересующая последовательность может кодировать более одного продукта. В некоторых конфигурациях поставляемая последовательность может включать множество генов, кодирующих по меньшей мере один белок, по меньшей мере одну миВNА, по меньшей мере одну микроВNА, по меньшей мере одну днНВNА или по меньшей мере одну антисмысловую РНК молекулу или их комбинации. Например, поставляемая последовательность может включать один или более генов, которые кодируют один или более антигенов, на которые желателен иммунный ответ. Один или более антигенов может быть связан с одной болезнью или заболеванием, или они могут быть связаны со многими болезнями. В некоторых случаях ген, кодирующий иммунный регуляторный протеин, может быть включен в ген, кодирующий антиген, на который желателен иммунный ответ, и комбинация может вызывать и регулировать иммунный ответ в желаемом направлении и размере. В других случаях последовательность, кодирующая миРНК, микроРНК, днРНК или антисмысловые РНК молекулы, может быть сконструирована с геном, кодирующим антиген, на который желателен иммунный ответ, и комбинация может регулировать границы иммунной реакции. Продукты могут быть изготовлены как инициирующий гибридизацию продукт, в котором кодирующая последовательность находится в функциональном родстве с одним промотором. Альтернативно продукты могут кодироваться раздельно, и каждая кодирующая после
- 16 032403 довательность находится в функциональном родстве с промотором. Промоторы могут быть одинаковыми или разными.
В определенных конфигурациях векторы содержат полинуклеотидные последовательности, которые кодируют факторы созревания/стимуляции дендритных клеток. примеры стимулирующих молекул включают СМ-С8Р, Ш-2, Ш-4, Ш-6, Ш-7, Ш-15, Ш-21, Ш-23, ΤΝΡα, В7.1, В7.2, 4-1ВВ, СЭ40 лиганд (СО40Б). индуцируемый лекарствами СЭ40 (1СО40), и тому подобные. Эти полинуклеотиды обычно находятся под контролем одного или более регуляторных элементов, которые направляют экспрессию кодирующей последовательности в дендритных клетках. Созревание дендритных клеток способствует успешной вакцинации (Вапсйегеаи, 1. апб Ра1иска, А.К. Ναι. Реу. Iттиηο1. 5:296-306 (2005); 8ски1ег, С. е1 а1. Сигг. Ορίη. Iттипο1. 15:138-147 (2003); Ндбог, С.С. е1 а1. №к Меб. 10:475-480 (2004)). Созревание может трансформировать ДКл из клеток, активно включенных в антигенный захват, в клетки, специализирующиеся на стимулировании Τ-клеток. Например, встреча СЭ40 с СЭ40Б на СЭ4-хелпере Τ-клеток является ключевым сигналом для ДК созревания, приводящим к мощной активации СЭ8 Τ-клеток. Такие стимулирующие молекулы также относятся к факторам созревания или факторам, стимулирующим созревание. Иммунные контрольные точки представляют собой важный барьер для активации функционального клеточного иммунитета при раке, и антагонистические антитела, специфичные для ингибиторных лигандов Τ-клеток, включая С'ГЬА4 и программируемую гибель-1 (ΡΌ-1), являются примерами нацеленных агентов, получивших оценку в клинической практике. Важным механизмом толерантности при хронических инфекциях и раке является функциональное истощение Ад-специфичных Τ-клеток, которые экспрессируют высокие уровни ΡΌ-1. Поскольку показано, что потенциал терапевтической иммунизации значительно усиливается при комбинации с иммунной контрольной точкой, в качестве не ограничивающего примера специалистам в данной области понятно, что альтернативным подходом к ингибирования иммунной контрольной точке является ингибирование экспрессии лигандов программируемой гибели (ΡΌ) - первого и второго (Р0-Б1/Б2). Один путь выполнить ингибицию заключается в экпрессии РНКмолекул, таких как описанные в настоящем документе, которые подавляют экспрессию Р0-Б1/Б2 в ДКл, трансдуцированных лентивирусным вектором, кодирующим одну или более РНК-молекул. Созревание ДКл или экспрессия определенных элементов, таких как иммунные контрольные точки, например ΡΌ-1 лиганды, может быть охарактеризовано анализом проточной цитометрии на положительную регуляцию поверхностных маркеров, таких как МНС ΙΙ, и профиля экспрессируемых хемокинов и цитокинов.
Последовательность, кодирующая детектируемый продукт, обычно являющаяся белком, может быть включена для идентификации клеток, которые экспрессируют желаемый продукт. Например, флюоресцирующий маркерный белок, такой как зеленый флюоресцентный белок (СРР), включен в конструкт вместе с интересующей последовательностью (например, кодирующей антиген). В других случаях белок может детектироваться антителом или же белок может быть энзимом, который действует на субстрат, вырабатывая детектируемый продукт, или продукт, который позволяет провести селекцию трансфектной или трансдуцированной целевой клетки, например подтверждает устойчивость к лекарствам, такую как устойчивость к гигромицину. Обычные селекционные гены кодируют белки, которые подтверждают устойчивость к антибиотикам или другим токсинам, подходящим для использования в эукариотических клетках, например, неомицину, метотрексалу, бластицидину и другим, известным специалистам, или дополнительным ауксотрофным дефицитам, или важным пищевым добавкам, отсутствующим в среде. Селектирующие маркеры могут необязательно быть представлены на отдельной плазмиде и интродуцированы путем котрансфекции.
Может быть использована одна или более мультицистронных единиц экспрессии, которые включают два или более элементов (например, интересующая(ие) последовательность(и), молекулы оболочки, факторы созревания ДК), необходимых для образования желаемого вируса в упаковочных клетках. Использование мультицистронных векторов уменьшает общее число требуемых молекул нуклеиновых кислот и таким образом препятствует возникновению возможных трудностей, связанных с координацией экспрессии из множественных векторных геномов. В мультицистронном векторе различные экспрессируемые элементы функционально связаны с одним или более промоторами (и при необходимости другими контрольными элементами экспрессии). В некоторых конфигурациях мультицистронный вектор содержит интересующую последовательность, последовательность, кодирующую репортерный продукт, и вирусные элементы. Интересующая последовательность обычно кодирует антиген и, необязательно, фактор созревания ДК. Иногда мультицистронный вектор содержит ген, кодирующий антиген, ген, кодирующий фактор созревания ДК и вирусные элементы.
Каждый компонент, экспрессирующийся в мультицистронном векторе экспрессии, может быть отделен, например, внутренним рибосомальным элементом сайта входа (ШЕ8) или вирусным 2А элементом, что допускает раздельную экспрессию различных белков с одного промотора. ШЕ8 элементы и 2А элементы известны специалистам в данной области (патент США № 4937190; бе Ребре е1 а1. 2004. ΤπιΓίΓ 5: 616-626, каждый из которых включен в настоящий документ путем ссылки в полном объеме). В одном варианте воплощения олигонуклеотиды, кодирующие сайт фуринового расщепления последовательности (ВАКЕ) (публикация Рапд е1 а1. 2005. №к Вю1есб 23: 584-590, которая включена в настоящий документ путем ссылки в полном объеме), связанные с 2А-подобными последовательностями из вируса ящу
- 17 032403 ра (ΕΜΌν), вируса А ринита лошадей (ЕКАУ), и вируса бюкеа ак1дпа (ТаУ) (публикация Бхутсхак е! а1. 2004. №11. Вю1ее11по1. 22: 589-594, включенная в настоящий документ путем ссылки в полном объеме), используются для разделения генетических элементов в мультицистронном векторе. Эффективность определенного мультицистронного вектора легко может быть протестирована путем определения экспрессии каждого из генов с использованием стандартных протоколов.
В отдельном примере вирусный векторный геном содержит цитомегаловируса (СМУ) энхансерную/промоторную последовательность; К и И5 последовательности из ВИЧ 5' ЬТК; упаковочную последовательность (ψ); ВИЧ-1 флап-сигнал; внутренний энхансер; внутренний промотор; интересующий ген; ответный элемент вируса гепатита сурка; тРНК последовательности амбер-супрессора; И3 элемент с делецией в своей энхансерной последовательности; инсулятор куриного β-глобина; и К и И5 последовательности 3' ВИЧ ЬТК. В некоторых примерах векторный геном содержит интактную лентивирусную 5' ЬТК и самоинактивирующуюся 3' ЬТК (публикация Гетакита е! а1. νίΐΌ1ο§\· 15:120, 1999, включена путем ссылки в полном объеме).
Конструкция векторного генома может быть осуществлена с использованием любой подходящей техники генной инженерии, известной специалистам в данной области, включая, но не ограничиваясь ими, стандартные техники рестрикционного эндонуклеазного расщепления, лигации, трансформации, плазмидной очистки, и ДНК-секвенирования, например, как описано в публикациях БатЬ^οοк е! а1. (1989, ΜοΚοιι1ιγ Οοππ^: А ^аЬο^аΐο^у Мапиа1. ^16 Брппд ΗηώοΓ ^аЬο^аΐο^у Ргекк, Ν.Υ.), ^йт е! а1. (Ке1гоу1ги8е8. ^16 Брппд ΗιΛογ Ьа^гаЮгу Ргекк, Ν.Υ. (1997)) и ΡΝΛ Мгикек: А РгасДса1 Арргоасй (А1ап 1. Сапп, Еб., Охйгб Ишуегкйу Ргекк, (2000), каждая из вышеупомянутых публикаций включена в настоящий документ путем ссылки в полном объеме.
4. Производство вирусных частиц.
Любой из множества способов, уже известных специалистам в данной области, может быть использован для создания инфекционных лентивирусных частиц, геном которых содержит РНК копию вирусного векторного генома. В одном способе вирусный векторный геном вводится в упаковочную клеточную линию, которая содержит все компоненты, необходимые для упаковки вирусной геномной РНК, транскрибируемой из вирусного векторного генома в вирусные частицы. Альтернативно, вирусный векторный геном может содержать один или более генов, кодирующих вирусные компоненты в добавление к одной или более интересующим последовательностям. Однако для того чтобы предотвратить репликацию генома в целевой клетке, эндогенные вирусные гены, необходимые для репликации, обычно удаляются и доставляются отдельно в упаковочную клеточную линию.
Обычно лентивирусные векторные частицы вырабатываются клеточной линией, которая трансфицируется одной или более плазмидными векторами, содержащими компоненты, необходимые для образования частиц. Такие лентивирусные векторные частицы обычно не являются компетентными к репликации, т. е. они способны лишь к одному циклу инфицирования. Чаще всего множественные плазмидные векторы используются для разделения различных генетических компонентов, которые образуют лентивирусные векторные частицы, прежде всего для уменьшения вероятности рекомбинации, которая может иным образом генерировать репликацию компетентных вирусов. Однако при желании может использоваться единственный плазмидный вектор, имеющий все лентивирусные компоненты. примером системы, в которой используются множественные плазмидные векторы, является клеточная линия, трансфицированная по меньшей мере одной плазмидой, содержащей вирусный векторный геном (т.е. векторный геном плазмиды), включая ЬТКк, цис-активную упаковочную последовательность и интересующую(ие) последовательность(и), которые часто рабочим образом связаны с гетерологичным промотором, как минимум одной плазмидой, кодирующей вирусные энзимные и структурные компоненты (т.е. упаковочную плазмиду, которая кодирует компоненты, такие как Сад и Рο1), и по меньшей мере одну плазмиду, кодирующую гликопротеин оболочки Арбовируса. Для усиления образования ретровирусных частиц могут быть использованы дополнительные плазмиды, например, Кеу-экспрессии плазмиды, как описано в настоящем документе и известно специалистам в данной области. Вирусные частицы проникают через клеточную мембрану и содержат сердцевину, которая включает геном, содержащий интересующую последовательность и гликопротеин оболочки Арбовируса, мишенью для которого являются дендритные клетки. Если гликопротеин Арбовируса является гликопротеином Е2 вируса Синдбис, гликопротеин конструируется так, чтобы иметь ослабленное связывание с гепарансульфатом по сравнению с референсным штаммом НК.
Трансфекция упаковочных клеток плазмидными векторами настоящего изобретения может быть проведена хорошо известными способами, и используемый способ ничем не ограничен. Специалистам в данной области известно множество невирусных систем доставки, включая, например, электропорацию, основанные на липидах системы доставки, включая липосомы, доставку оголенной ДНК, и доставку с использованием полициклодекстриновых компонентов, таких как описанные в публикации Бс11а!х1ет АС (2001, Νοι·ι-νίη1 УгсЮгк ш Сапсег Сепе Тйегару: Рппар1е8 апб Ргодгеккек. Апбсапсег Игцдк, включена в настоящий документ путем ссылки в полном объеме). Обычно используются способы воздействия с помощью катионных липидов или солей, см., например, публикацию Сгайат е! а1. (1973. νίτο1. 52:456; ^1д1ег е! а1. (1979. Ргас. Νη!1. Асаб. Бс1. ИБА 76:1373-76), все вышеперечисленные публикации включены
- 18 032403 в настоящий документ путем ссылки в полном объеме. Чаще всего используется способ осаждения фосфата кальция. Однако могут также использоваться другие способы для введения вектора в клетку, включая ядерную микроинъекцию и бактериальное слияние протопластов.
Упаковочная клеточная линия представляет компоненты, включая вирусные регуляторные и структурные белки, которые требуются в !гаи8 для упаковки вирусной геномной РНК в лентивирусные векторные частицы. Упаковочной клеточной линией может быть любая клеточная линия, которая способна экспрессировать лентивирусные белки и образовывать функциональные лентивирусные векторные частицы. Некоторые подходящие упаковочные клеточные линии включают 293 (АТСС ССЬ X), 293Т, НеЬа (АТСС ССЬ 2), Ό17 (АТСС ССЬ 183), МОСК (АТСС ССЬ 34), ВНК (АТСС ССЬ-10) и СТ2Т11 (АТСС СКЬ 1430) клетки. Упаковочная клеточная линия может стабильно экспрессировать необходимый вирусный белок. Такая упаковочная линия описана, например, в патенте США № 6218181, который включен в настоящий документ путем ссылки в полном объеме. Альтернативно, упаковочная клеточная линия может быть транзиентно трансфицирована молекулами нуклеиновой кислоты, кодирующими один или более необходимых вирусных белков по вирусному векторному геному. Получившиеся в результате вирусные частицы собираются и используются для инфицирования целевых клеток. Ген(ы), кодирующий^) гликопротеин(ы) оболочки, обычно клонируется в вектор экспрессии, такой как ροΟΝΛ3 (ΙηνίΙΐΌдеп, СА И8А). Эукариотные векторы клеточной экспрессии хорошо известны специалистам в данной области и доступны во множестве коммерческих источников. Упаковочные клетки, такие как 293Т клетки, затем котрансфектируются вирусным векторным геномом, кодирующим интересующую последовательность (обычно кодирующую антиген), по меньшей мере одной плазмидой, кодирующей вирусные упаковочные компоненты, и вектором для экспрессии целевой молекулы. Оболочка экспрессируется на мембране упаковочной клетки и встраивается в вирусный вектор.
По одному сценарию один или более векторов используются для введения полинуклеотидных последовательностей в упаковочную клеточную линию для производства лентивирусных векторных частиц, псевдотипированных гликопротеином оболочки вируса Синдбис, таким как Е2, как описано в настоящем документе. Векторы могут содержать полинуклеотидные последовательности, кодирующие различные компоненты вируса, включая оболочку вируса Синдбис, интересующую(ие) последовательность(и) (обычно кодирующую антиген), и любые компоненты, необходимые для производства вируса, которые не предоставляются упаковочной клеткой.
По другим сценариям упаковочные клетки котрансфектируются вирусным векторным геномом, кодирующим антиген и один или более дополнительных векторов. Например, в дополнение к вирусному вектору, кодирующему антиген, второй вектор предпочтительно несет гены, кодирующие модифицированную (также называемую вариантом) оболочку вируса Синдбис. В некоторых ситуациях вирусный векторный геном, кодирующий антиген, также включает полинуклеотидную последовательность, кодирующую избранный иммуномодулирующий фактор, включая не ограничивающие примеры хемокинов, цитокинов, фактора созревания ДК или фактора, который регулирует механизм иммунной контрольной точки. В других ситуациях полинуклеотидная последовательность, кодирующая избранный иммуномодулирующий фактор, содержится в третьем векторе, который котрансфектируется вирусным вектором, кодирующим антиген, и одним или более дополнительных векторов в упаковочной клетке.
Продукция вируса измеряется так, как описано в настоящем документе, и выражается в МЕ на объем. МЕ является инфекционной единицей или альтернативной единицей трансдукции (ТЕ); МЕ и ТЕ могут использоваться взаимозаменяемо как количественная оценка титра препарата, содержащего вирусный вектор. Как описано в настоящем документе, в произведенном вирусе геном может экспрессировать продукт, который легко количественно оценить. Предпочтителен флюоресцентный белок, зеленый флюоресцентный белок. Лентивирусный вектор обычно является не интегрирующимся. Вирус затем вводится в целевые клетки и определяется число целевых клеток, которые экспрессируют СЕР, например, методом проточной цитометрии (см. пример 3). Титр затем расчитывается. Предпочтителен как можно более высокий титр, но не менее 1*105 МЕ/мл, не менее 3*105 МЕ/мл, не менее 1χ106 МЕ/мл, не менее 3*106 МЕ/мл или не менее 1*107 МЕ/мл клеточного супернатанта (до какого-либо концентрирования). Альтернативно, титр составляет по меньшей мере 80%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95%, по меньшей мере 100% от титра того же лентивирусного вектора, псевдотипированного в тех же клетках оболочкой У8У-С.
С. Доставка вируса.
Вирус может быть доставлен в целевую клетку любым образом, который позволяет вирусу контактировать с целевыми дендритными клетками (ДКл), в которые желательно доставить интересующий полинуклеотид. Иногда подходящее количество вируса вводится человеку или другому животному напрямую (ίη У1уо), например, путем инъкции в организм. Подходящие животные включают, не ограничиваясь, лошадей, собак, кошек, коров, свиней, овец, кроликов, кур и других птиц. Вирусные частицы могут инъецироваться множеством способов, таких как внутривенно, внутрикожно, подкожно, внутрибрюшинно или внутримышечно. Вирус может быть доставлен с использованием субдермальных инъекционных приспособлений, таких как приспособления, раскрытые в патентах США №№ 7241275, 7115108, 7108679, 7083599, 7083592, 7047070, 6971999, 6808506, 6780171, 6776776, 6689118, 6670349, 6569143,
- 19 032403
6494865, 5997501, 5848991, 5328483, 5279552, 4886499, все из которых включены путем ссылки в полном объеме. Также пригодны другие места для инъекций, такие как напрямую в орган, содержащий целевые клетки. Например, может быть использована инъекция внутрь лимфоузла, инъекция внутрь селезенки или инъекция внутрь костного мозга для доставки вируса в лимфоузел, селезенку и костный мозг соответственно. В зависимости от определенных условий и природы целевых клеток введение может быть осуществлено другими способами, включая, например, ингаляцию или прямой контакт с эпителиальными тканями, например, такими как в глазах, ротовой полости или коже.
Альтернативно, целевые клетки представляются и контактируют с вирусом ίη νίίΐΌ, например, в культуральных планшетах. Целевые клетки обычно являются популяцией клеток, содержащих дендритные клетки, полученные от здорового субъекта или субъекта, нуждающегося в лечении, или у которого желательно стимулировать иммунный ответ на антиген. Способы получения клеток из организма субъекта хорошо известны специалистам в данной области и включают кровоизвлечение из вены, хирургическое иссечение и биопсию. Человеческие ДКл также могут быть произведены путем получения ΟΌ34α+ предшественников гемопоэза человека и использованы в культуральном способе ίη νίίΐΌ, как описано в других источниках (например, публикации ВапсНегеаи е1 а1. Се11. 106, 271-274 (2001), включенной путем ссылки в полном объеме).
Вирус может быть суспендирован в среде и помещен в лунки культуральной чашки, фалькона или другого контейнера. Среда, содержащая вирус, может быть добавлена перед посадкой клеток или после посадки клеток. Клетки обычно инкубируются в соответствующем количестве среды, подходящем для нормальной жизнедеятельности и достижения подходящей концентрации вируса в среде, такой, которая пригодная для трансдукции в клетки хозяина. Клетки предпочтительно инкубируются с вирусом в течение времени, достаточного для того, чтобы вирус инфицировал клетки. Предпочтительно клетки инкубируются с вирусом по меньшей мере 1 ч, по меньшей мере 5 ч или по меньшей мере 10 ч.
При доставке как ίη νίνΌ, так и ίη νίΐΐΌ, может быть использована аликвота вирусных частиц, содержащая достаточное количество для инфицирования желаемых целевых клеток. Если культивируются целевые клетки, то концентрация вирусных частиц обычно составляет по меньшей мере 1 МЕ/мкл, более предпочтительно по меньшей мере 10 МЕ/мкл, еще более предпочтительно по меньшей мере 300 МЕ/мкл, еще более предпочтительно по меньшей мере 1*104 МЕ/мкл, еще более предпочтительно по меньшей мере 1*105 МЕ/мкл, еще более предпочтительно по меньшей мере Ιχ106 МЕ/мкл или еще более предпочтительно по меньшей мере 1*107 МЕ/мкл.
После инфицирования вирусами ίη νίΟΌ, целевые клетки можно ввести (или повторно ввести) в организм человека или животного. Клетки могут быть введины в кожу, под кожу или в периферийный кровоток. Клетки, введенные животному, предпочтительно являются клетками, извлеченными из этого животного, чтобы предотвратить вредоносную иммунную реакцию. Также могут быть использованы клетки, извлеченные из донора, имеющего схожий иммунный фон. Также могут быть использованы другие клетки, включая те, которые разработаны для предотвращения вредоносной иммунной реакции.
Целевые клетки могут быть анализированы для изучения, например, интеграции, транскрипции и/или экспрессии интересующей последовательности или гена(ов), числа копий интегрированного гена и локализации интеграции. Такие анализы могут произведены в любое время и могут быть произведены любым способом, известным специалистам в данной области.
Субъекты, которым введен вирус или инфицированные вирусом дендритные клетки, могут быть проанализированы для изучения локализации инфецированых клеток, экспрессии доставляющих вирус полинуклеотидов или интересующего гена, стимуляции иммунного ответа и мониторинга симптомов, связанных с болезнью, любым способом, известным специалистам в данной области.
Способы инфицирования клеток, раскрытые в настоящем документе, не зависят от индивидуальных специфических свойств клеток. Следовательно, они легко распространяются на множество видов животных. В некоторых случаях вирусные частицы доставляются человеку или в дендритные клетки человека, а в других случаях они доставляются животным, таким как мыши, лошади, собаки, кошки, или птицы. Как обсуждалось в настоящем документе, вирусный векторный геном псевдотипируется так, чтобы предоставить широкий диапазон хозяинов, а также характеристик целевых клеток. Специалисту в данной области также хорошо известны подходящие внутренние промоторы и другие элементы для достижения желаемой экспрессии интересующей последовательности у определенных видов животных. Таким образом, специалист в данной области сможет модифицировать метод инфицирования дендритных клеток для любого вида.
Ό. Терапевтическая и профилактическая иммунизация.
Дендритные клетки могут быть инфицированы лентивирусной векторной частицей, как описано в настоящем документе, для предотвращения или лечения болезни или расстройства здоровья, особенно тех, для лечения или предотвращения которых полезна активация иммунного ответа у пациента. Многие такие болезни хорошо известны. Например, болезни или расстройства здоровья, которые поддаются лечению или предотвращению способами настоящего изобретения, включают, не ограничиваясь, раковые заболевания, аутоиммунные расстройства и инфекции, включая вирусные, бактериальные, грибковые и паразитические инфекции. В одном способе заболевание лечится вирусными частицами, описанными в
- 20 032403 настоящем документе, которые доставляют интересующую последовательность в дендритные клетки, где экспрессия интересующей последовательности продуцирует специфический для заболевания антиген и приводит к стимуляции антиген-специфичной клеточной иммунной реакции и гуморальной иммунной реакции. В основном интересующая последовательность кодирует антиген, на который желательна иммунная реакция, но он в норме не экспрессируется в дендритных клетках. Антиген экспрессируется и предоставляется дендритными клетками. Вирусный векторный геном может впоследствии кодировать фактор созревания ДК.
При типичном использовании вирусные частицы доставляют к дендритным клеткам последовательности, кодирующие антиген, на который желательна иммунная реакция. Доставка может быть достигнута путем контакта дендритных клеток с вирусом ш νίίΓΟ, когда инфицированные дендритные клетки вводятся пациенту. В других случаях доставка может быть достигнута путем доставки вируса субъекту для инфицирования дендритных клеток ш νίνο. Дендритные клетки затем стимулируют антигенспецифичные Т-клетки или В-клетки у пациента для индукции клеточной и гуморальной реакции на экспрессируемый антиген. В таких случаях пациент, который подвержен болезни или расстройству здоровья, получает лечение путем образования иммунных клеток с заданной специфичностью.
Любой антиген, который связан с болезнью или расстройством здоровья, может быть доставлен в дендритные клетки при использовании вирусных частиц, как описано в настоящем документе. Антиген, который связан с болезнью или расстройством, идентифицируется для приготовления вирусной частицы, которая поражает дендритные клетки. Антигены, связанные со многими болезнями и расстройствами здоровья, хорошо известны специалистам в данной области. Про антиген может быть предварительно известно, что он связан с болезнью или расстройством, или может быть идентифицирован любым способом, известным специалистам в данной области. Например, может быть известен антиген для того типа рака, которым страдает пациент, такого как связанный с опухолью антиген, или может быть идентифицирован из самой опухоли с помощью любого из множества способов, известных специалистам в данной области.
Связанные с опухолью антигены известны для множества видов рака, включая, например, почечноклеточную карциному, рак простаты, меланому и рак молочной железы. Например, при некоторых видах рака молочной железы рецептор Нег-2 сверхэкспресируется на поверхности раковых клеток. Являющиеся примером опухолевые антигены включают, но не ограничиваясь этим, МАСЕ, ВАСЕ, КАСЕ и NΥЕБ0-1, которые являются невидоизмененными антигенами, экспрессируемыми в иммунопривилегированных областях семенников и во множестве опухолевых клеток; линиеспецифические опухолевые антигены, такие как антигены линии меланоцит-меланомы МАКТ-1/Ме1ап-А, др100, др75, т4а7, тирозиназа и тирозиназасвязанный белок, почечноклеточная карцинома - 5Т4, 8М22-а, карбоангидразы Ι и ΙΧ (также известные как С250), гипоксия-индуцируемые факторы (например, ΗΙΡ-1α и ΗΙΡ-2α), УЕСЕ или простатоспецифичный мембранный антиген (Р8МА), простатоспецифичный антиген (Р8А), кислые фосфаты простаты и трансмембранный эпителиальный антиген простаты (8ТЕАР), ИКХ3.1, где антигены, экспрессируемые в нормальных и опухолевых клетках, происходят из одной и той же ткани; эпитопные белки/пептиды, происходящие от генов, мутировавших в опухолевых клетках, или генов, транскрибированных в различных уровнях опухоли по сравнению с нормальными клетками, такие как энзим теломераза, сурвивин, мезотелин, мутировавший гак, реорганизованный Ьсг/аЬ1, Нег2/пеи, мутировавший или дикого типа р53, цитохром Р450 1В1 и анормально экспрессирующиеся интронные последовательности, такие как №ацетилглюкозаминилтрансфераза-У; клональные перестройки иммуноглобулиновых генов, генерирующие уникальные идиотипы в миеломе и В-клеточных лимфомах; эпитопные белки/пептиды, получающиеся в результате онковирусных процессов, такие как белки вируса папилломы человека Е6 и Е7; немутировавшие онкофетальные белки с опухоле-избирательной экспрессией, такие как карциноэмбриональный антиген и α-фетопротеин. Описано множество связанных с опухолями антигенов (см., например, публикации Титог-АиЕдеик Кесодшхей Ву Т-Еутрйосукек, Вооп Т., СегокИш ЕС., Уап4епеуп4е В., УапйегЬгиддеп Р., Уапре1 А., Аппиа1 Кет1е\\· 0£ Iттипο1οду 12: 337-365, 1994; А Нкктд о£ Нитап китог апЕдепк гесодшхе4 Ьу Т се11к, Кепкт181 К, СаккеШ С., КоЬЫпк Р.Е., Рагт1аш С. Сапсег [ттипо1оду [ттипоШегару 50: (1) 3-15 МАК 2001, каждая из которых включена в настоящий документ путем ссылки в полном объеме).
Антиген также может быть антигеном, связанным с инфекционной болезнью, такой как, например, ВИЧ/СПИД. Антиген может быть, например, др120 (публикация КИтккга, ^.В., ек а1. 2003. 1. У1го1. 77:12022-12032; Ветаг4, К.А., ек а1. 2000. У1го1оду 276:93-103; Вугпек, А.Р., ек а1. 1998. I. У1го1. 72: 73497356, каждая из которых включена в настоящий документ путем ссылки в полном объеме). Другие являющиеся примером антигены включают, но не ограничиваясь этим, дад, ро1, епт, как, пе£ и гет (публикации Е1еЬегтап, I. ек а1. 1997. АГО8 Кек Нит Кекготиикек 13(5): 383-392; Мепеп4е7-Апак, Ь. ек а1. 1998. У1га1. Тттипок 11(4): 167-181, каждая из которых включена в настоящий документ путем ссылки в полном объеме).
Примеры вирусных антигенов включают, но не ограничиваясь этим, полипептиды аденовируса, полипептиды альфавируса, полипептиды калицивируса, например, антиген капсида калицивируса, поли
- 21 032403 пептиды коронавируса, полипептиды вируса собачьей чумки, полипептиды вируса Эбола, полипептиды энтеровируса, полипептиды флавивируса, полипептиды вируса гепатита (АЕ), например, гепатита В ядерный или поверхностный антиген, или гликопротеины Е1 или Е2 вируса гепатита С, ядерные или неструктурные белки, полипептиды вируса герпеса, например, гликопротеин вируса простого герпеса или вируса ветряной оспы, полипептиды вируса иммунодефицита, например, оболочка или протеаза вируса иммунодефицита человека, полипептиды вируса инфекционного перитонита, полипептиды вируса гриппа, например, гемагглютинин, нейраминидаза или нуклеопротеин гриппа А, полипептиды вируса лейкемии, полипептиды вируса марбургской болезни, полипептиды ортомиксовируса, полипептиды вируса папилломы, полипептиды вируса парагриппа, например, гемагглютинин/нейраминидаза, полипептиды парамиксовируса, полипептиды парвовируса, полипептиды пестивируса, полипептиды пикорнавируса, например, полипептид капсида полиовируса, полипептиды поксвируса, например, полипептид вируса коровьей оспы, полипептиды вируса бешенства, например, гликопротеин С вируса бешенства, полипептиды реовируса, полипептиды ретровируса и полипептиды ротавируса.
Примеры бактериальных антигенов включают, но не ограничиваясь этим, полипептиды АсОпотусек, полипептиды ВасШик, полипептиды Вас1его14ек, полипептиды Вогйе1е11а, полипептиды Ваг1оие11а, полипептиды Воггейа, например, полипептиды В. ЬигдйогГел 0крА, Вгисе11а, полипептиды Сатру1оЬас1ег, полипептиды СарпосутрНада, полипептиды СЫату&а, полипептиды С1ок1п4шт, полипептиды СогупеЬасегшт, полипептиды Сох1е11а, полипептиды Пегта1орЫ1ик, полипептиды Ейегососсик, полипептиды ЕНгйсЫа, полипептиды ЕксйепсШа, полипептиды Егапс1ке11а, полипептиды ЕикоЬас1егшт, полипептиды НаетоЬа^ιоие11а. полипептиды НаеторШик, например, белок, проникающий сквозь мембрану гемофильной палочки типа Ь, полипептиды Не1юоЬас1ег, полипептиды К1еЬк1е11а, полипептиды бактерий Ь-формы, полипептиды ЬерФкрпа, полипептиды □Чела, полипептиды МусоЬас1епа, полипептиды Мусор1акта, полипептиды Шакела, полипептиды №опскейк1а, полипептиды ШсагФа, полипептиды Рак1еиге11а, полипептиды РерЮсоссик, полипептиды Рер1ок1гер1ососсик, полипептиды РпеитососсиБ, полипептиды Рго1еик, полипептиды Ркеийотопак, полипептиды КюкеИыа, полипептиды Коскайтаеа, полипептиды 8а1тоие11а, полипептиды 8Ыде11а, полипептиды 81арку1ососсик, полипептиды 81гер1ососсик, например, белки 8. руодепек М, полипептиды Тгеропета, и полипептиды Уегаша, например, антигены Υ. рекйк Е1 и У.
Примеры грибковых антигенов включают, но не ограничиваясь этим, полипептиды ЛЬДЛа, полипептиды Асгетотит, полипептиды Айетайа, полипептиды АкрегдШик, полипептиды ВакИюЬо1ик, полипептиды В1ро1апк, полипептиды В1ак1отусек, полипептиды СапйИа, полипептиды Соссйюйек, полипептиды СошйюЬо1ик, полипептиды СгурФсоссик, полипептиды Сигуа1апа, полипептиды Бр^ел^рНуЮ!! полипептиды ЕхорЫа1а, полипептиды беойтсйит, полипептиды Н1к1ор1акта, полипептиды Майигейа, полипептиды Ма1акке/1а, полипептиды Мюгокрогит, полипептиды Мошйе11а, полипептиды Могйеге11а, полипептиды Мисог, полипептиды Раесйотусек, полипептиды Решсййит, полипептиды РЫа1етотит, полипептиды РЫа1орйога, полипептиды Рго1о1йеса, полипептиды Ркеийа11ексйепа, полипептиды РкеийотюгойосЫит, полипептиды РуНит, полипептиды Кйтокропйтт, полипептиды КН1хорик, полипептиды 8со1есоЬак1йшт, полипептиды 8рого1Нпх, полипептиды 81етрйуйит, полипептиды ТлсНорНуЮп, полипептиды ТлсНокрогоп, и полипептиды Ху1оНурНа.
Примеры антигенов одноклеточных паразитов включают, но не ограничиваясь этим, полипептиды ВаЬек1а, полипептиды Вак-тЕйтт, полипептиды ВекпоШа, полипептиды СгурЮкроййшт, Еипела полипептиды, полипептиды ЕисерНа1^ιоζоои. полипептиды ЕпатоеЬа, полипептиды С1агй1а, полипептиды НаттопФа, полипептиды НераЮ/ооп, полипептиды [кокрога, полипептиды Ее1кйташа, полипептиды МюгокройФа, полипептиды Шокрога, полипептиды Шкета, полипептиды РепЕилсНотопак, полипептиды Р1актой1ит, например, Р. Га1арагит циркумспорозоит (РГС8Р), спорозоита поверхностный белок 2 (РГ88Р2), карбоксильный конец антигена 1 печени 1 (РГЕ8А1 сйегт), и экспортируемый белок 1 (РГЕхр1), полипептиды Риеитосукΐ^к, полипептиды 8агсосукйк, полипептиды 8сЫк1окота, полипептиды ТНейепа, полипептиды Тохор1акта и полипептиды Тгурапокота.
Примеры антигенов паразитов-гельминтов включают, но не ограничиваясь этим, полипептиды ΛсаиιНосНе^1оиета. полипептиды Ае1и^окΐ^оиду1ик, полипептиды Апсукйота, полипептиды Апд^окΐ^оиду1ик, полипептиды Аксапк, полипептиды Вгид1а, полипептиды ВипобЮтит, полипептиды СарП1апа, полипептиды СйаЬегйа, полипептиды Соорела, полипептиды Сгепокота, полипептиды Ою1уосаи1ик, полипептиды Пюс1орйуте, полипептиды ^^реΐа1оиета, полипептиды П1рйу11оЬо1йпит, полипептиды П1р1уйшт, полипептиды ОйоШапа, полипептиды □гасипсЫик, полипептиды ЕпегоЬшк, полипептиды Ейаго1йек, полипептиды НаетопсНик, полипептиды ЬадосШаксапк, полипептиды Ьоа, полипептиды Маикоие11а, полипептиды Мие11егшк, полипептиды ШпорНуеШк, полипептиды №са1ог, полипептиды №та1ой1гик, полипептиды 0екорНадок1отит, полипептиды ОисНосе^са. полипептиды 0р1к1йогсЫк, полипептиды 0к1ег1ад1а, полипептиды РагаГйала, полипептиды Рагадоштик, полипептиды Рагаксапк, полипептиды РНука1ор1ега, полипептиды Р^оΐокΐ^оиду1ик, полипептиды 8е(аг1а, полипептиды 8р1госегса, полипептиды 8рйоте1га, полипептиды 81ерНапоП1аг1а, полипептиды 8ΐ^оиду1о^йек, полипептиды 8ΐ^оиду1ик, полипептиды ТНеЕ-Ша, полипептиды Тохаксапк, полипептиды Тохосага, полипептиды ТлсНтеПа, полипептиды Т^^сНокι^оиду1ик. полипептиды ТлсНилк, полипептиды ипстапа и полипептиды ХУисНегела.
- 22 032403
Примеры антигенов эктопаразитов включают, но не ограничиваясь этим, полипептиды (включая защитные антигены, а также аллергены) из блох; клещей, включая твердых клещей и мягких клещей; мух, таких как мошки, комары, москиты, слепни, жигалки малые, мухи це-це, жигалки обыкновенные, вызывающие миаз мухи и кровососущий гнус-муравьи; пауки, вши; клещи; и клопы, такие как постельные клопы и поцелуйные клопы.
После того как антиген идентифицирован и выбран, идентифицируется последовательность, которая кодирует желаемый антиген. Предпочтительно последовательность содержит кДНК. После вирусной инфекции интересующая последовательность (например, кодирующая антиген) экспрессируется целевыми дендритными клетками. При контакте ех у1уо целевые дендритные клетки затем трансферрируются обратно пациенту, например путем инъекции, где они взаимодействуют с иммунными клетками, которые способны генерировать иммунный ответ на заданный антиген. В предпочтительных вариантах воплощения рекомбинантный вирус инъецируется в организм пациента, где он трансдуцируется целевыми дендритными клетками ίη δίΐιι. Дендритные клетки затем экспрессируют определенный антиген, связанный с болезнью или расстройством здоровья, которую подвергают лечению, и организм пациента способен усилить эффективную иммунную реакцию на болезнь или расстройство здоровья.
Вирусный векторный геном может содержать полинуклеотидную последовательность, кодирующую более чем один антиген, и после трансдукции целевой дендритной клетки генерирует иммунный ответ на множесто антигенов, доставленных в клетку. В некоторых вариантах воплощения антигены связаны с одной болезнью или расстройством здоровья. В других вариантах воплощения антигены связаны с множеством болезней или расстройств здоровья.
В некоторых вирусах факторы созревания ДК, которые активируют и/или стимулируют созревание ДКл, доставляются вместе с интересующей последовательностью. В альтернативных вариантах ДКл предварительно активируются при доставке факторов созревания ДК, одновременно или после доставки вируса. Факторы созревания ДК могут быть предоставлены отдельно от введения вируса.
Как описано в настоящем документе, одна или более иммунных модуляций или факторов созревания ДК могут кодироваться одной или боле последовательностями, которые содержатся в вирусном геноме и экспрессируются после инфицирования вируса в дендритную клетку. Последовательности, кодирующие факторы иммуномодуляции, также могут быть предоставлены в отдельном векторе, который котрансфицируется с вирусным вектором, кодирующим один или более антигенов в упаковочной клеточной линии.
Способы, описанные в настоящем документе, могут быть использованы для адаптивной иммунотерапии у пациента. Как описано выше, идентифицируется антиген, против которого желателен иммунный ответ. Получают и упаковывают в рекомбинантный вирус полинуклеотид, кодирующий желаемый антиген. Целевые дендритные клетки получают из организма пациента и трансдуцируют с рекомбинантным вирусом, содержащим полинуклеотид, который кодирует заданный антиген. Дендритные клетки затем трансфицируются обратно в организм пациента.
Вирусные частицы могут инъецироваться ίη у1уо, когда они инфицируют ДКл и доставляют интересующую последовательность, обычно кодирующую антиген. Число вирусных частиц составляет по меньшей мере 3*106 МЕ и может быть по меньшей мере 1*107 МЕ, по меньшей мере 3*107 МЕ, по меньшей мере 1*108 МЕ, по меньшей мере 3*108 МЕ, по меньшей мере 1*109 МЕ или по меньшей мере 3*109 МЕ. В выбранных интервалах ДКл из лимфоидных органов реципиента может быть использовано для оценки экспрессии, например, при наблюдении маркера экспрессии, такого как ОЕР или люцифераза. Техники мониторинга нуклеиновых кислот и оценки активности реверсной транскриптазы (РТ) также могут быть использованы для анализа биораспределения вирусных частиц. Т-клетки из периферийных кровяных мононуклеарных клеток, лимфоузлов, селезенки или злокачественной или целевой патогенинфицированной ткани реципиентов, подвергнутых лечению лентивирусными векторными частицами, может быть подсчитано по величине и продолжительности реакции на антигенную стимуляцию. Тканевые клетки, отличные от ДКл, такие как эпителиальные клетки и лимфоидные клетки, могут быть проанализированы на специфичность генной доставки ίη у1уо.
Принято считать, что наиболее эффективным потенциальным способом для прекращения эпидемии СПИД (и других вирусных болезней) является эффективная превентивная вакцина. На сегодняшний день ни один способ вакцинации против ВИЧ успешно не прошел фазу III клинического исследования. Таким образом, имеется неотложная потребность в новых эффективных стратегиях вакцинации. Одной стратегией является вакцинация ДКл. Для ее осуществления последовательность, кодирующая вирусный белок, такая как описана выше, клонируется в вирусный вектор. Пациенты инфицируются вирусами, сконструированными так, как описано в настоящем документе. На животной модели молекулярно клонированные ВИЧ-репортерные вирусы (№№2-г-Н8А§, ^-г-Н8А8) и клинические изоляты могут быть использованы для введения животному путем инъекции в хвостовую вену. Признаки инфицирования можно контролировать во времени в спленоцитах, лимфоузлах и периферийной крови. ПЦР-амплификация для ВИЧ-дад белка и проточная цитометрия для НА8 в репортерных вирусах могут быть использованы в качестве теста на вирусную интеграцию и репликацию. Продуктивная вакцинация ДК ίη δίΐιι может увеличить резистентность к введению ВИЧ.
- 23 032403
Вакцины часто включают вспомогательное вещество.
Лентивирусные векторные частицы, описанные в настоящем документе, также могут быть введены вместе со вспомогательным веществом. Вспомогательное вещество может быть введено с рекомбинантными вирусными частицами, до рекомбинантных вирусных частиц или после рекомбинантных вирусных частиц. Если вводить вместе с вирусными частицами, желаемые вспомогательные вещества не должны значительно разрушать цельность вирусной частицы, например, разрушая вирусную мембрану, содержащую гликопротеины оболочки.
Различные вспомогательные вещества могут быть использованы в комбинации с вирусом для вызова иммунной реакции на антиген, кодируемый в вирусном векторном геноме. Предпочтительные вспомогательные вещества усиливают реакцию на антиген, не вызывая конформационных изменений в антигене, которые действуют на качественную форму реакции. Предпочтительные вспомогательные вещества включают квасцы, 3 де-0-ацилированный монофосфорилированный липид А (МРЬ) (см. СВ 2220211). 0821 является гликозидом тритерпена или сапонином, выделенным из коры килайи 8аропапа Мой па дерева, растущего в Южной Америке (см. КепкП е! а1., ш Vасс^пе Оекщп: Тйе 8иЬипй апб Абщуап! Арргоасй (ебк. Ро\хе11 апб Ке^тап, Р1епит Ргекк, ΧΥ, 1995); патент США № 5057540). Другими вспомогательными веществами являются эмульсии масло-в-воде (такие как скваленовое или арахисовое масло), необязательно в комбинации с иммунными стимуляторами, такими как монофосфорилированный липид А (см. 81ои1е е! а1., N. Епд1. 1. Меб. 336, 86-91 (1997)). Другим вспомогательным веществом является СрС (Вю\уог1б Тобау, №у. 15, 1998). Альтернативно, А1!ета!1уе1у, Ав может быть связан со вспомогательным веществом. Например, липопептидная версия Ав может быть приготовлена путем связывания пальмитиловой кислоты или других липидов прямо с ^концом Ав, как описано для вакцинации антигеном гепатита В (Ь1утдк!оп, 1. Iттипο1. 159, 1383-1392 (1997)). Однако такое связывание не должно значительно менять конформацию Ав, так чтобы это тем самым влияло на природу иммунного ответа. Вспомогательные вещества могут быть введены как компонент терапевтической композиции с активным агентом или могут быть введены отдельно, до, одновременно с или после введения терапевтического средства.
Одним классом вспомогательных веществ являются соли алюминия (квасцы), такие как алюминия гидроксид, алюминия фосфат, алюминия сульфат. Такие вспомогательные вещества могут быть использованы со специальными специальными иммуностимулирующими агентами или без них, такими как МРЬ или 3-ЭМР, 0821, полимерных или мономерных аминокислот, таких как полиглютаминовая кислота или полилизин. Другим классом вспомогательных веществ являются формулы эмульсий масло-в-воде. Такие вспомогательные вещества могут быть использованы со специальными иммуностимулирующими агентами или без них, такими как мурамилпептиды (например, N-ацетилмурамил-^-треонил-^изоглютамин (1йг-МЭР), N-ацетил-нормурамил-^-аланил-Ο-изоглютамин (пог-МЭР), N-ацетилмурамилЕ-аланил-О-изоглютаминил-Е-аланин-2-( 1 '-2'-дипальмитол-кп-глицеро-3 -гидроксифосфорилокси)этиламин (МТР-РЕ), N-ацетилглютаминил-N-ацетилмурамил-^-А1-^-изоглю-^-А1а-дипальмитоксипропиламид (ОТР-ЭРР) терамид™), или другие компоненты бактериальной клеточной стенки. Эмульсии масло-в-воде включают: (а) МЕ59 (\У0 90/14837), содержащую 5% 8дпа1епе, 0,5% Т\уееп 80 и 0,5% 8рап 85 (необязательно содержащие различные количества МТР-РЕ), произведенные в виде субмикронных частиц с использованием микрофлюидайзера, такого как Модель 110Υ микрофлюидайзер (Мюгойшбюк, №\\1оп Макк.), (Ь) 8АЕ, содержащий 10% 8циа1апе, 0,4% Т\уееп 80, 5% блокирующий поверхностноактивные вещества полимер Ь121 и 1йг-МЭР, так же микрофлюидизированный в сумбикронную эмульсию или размешанный на вортексе для создания эмульсии с частицами большего размера, и (с) В1Ь1 вспомогательная система (ВА8), (В1Ь1 [ттипосйет, Нат1Йоп, Моп!.), содержащая 2% 8циа1епе, 0,2% Тетееп 80 и один или более компонентов бактериальной клеточной стенки из группы, состоящей из монофосфорилипида А (МРЬ), трегалозы димиколата (ТОМ) и каркаса клеточной стенки (СУ8), предпочтительно МРЙ+С\У8 (Ое!ох™). Другим классом предпочтительных вспомогательных веществ являются сапониновые вспомогательные вещества, такие как 8!1ти1оп™ (0821, Ацийа, Уогсек!ег, Макк.) или частицы, произведенные из таких соединений, как КС0Мк (иммуностимулирующие комплексы) и Αί,ΌМАТВРХ. Другие вспомогательные вещества включают Сотр1е!е Егеипб'к Абщуап! (СЕА) и Й1сотр1е1е Егеипб'к Абщуап! (ГЕА). Другие вспомогательные вещества включают цитокины, такие как интерлейкины (Ш-1, Ш-2 и Ш-12), колониестимулирующий фактор макрофагов (М-С8Е), фактор некроза опухолей (ЮТ).
Другое вспомогательное вещество, которое можно использовать с приведенными в настоящем документе композициями, идентифицируется по химической формуле (I)
- 24 032403
где группы А1 и А2 независимо избираются из группы, состоящей из водорода, фосфата и фосфатных солей. Натрий и калий являются примерами противоионов для фосфатных солей. Группы К1, К2, К3, К4, К5 и К6 независимо выбираются из группы углеводородных радикалов, имеющих от 3 до 23 атомов углерода, обозначенных как С323. Для ясности, это следует объяснить следующим образом: когда функциональная группа независимо выбирается из определенной группы, имеющей много членов, это следует понимать так, что член, выбираемый для первой функциональной группы, никаким образом не влияет или ограничивает выбор члена, избираемого для второй функциональной группы. Атомы углерода, к которым присоединяются К1, К3, К5 и К6, являются асимметричными, и таким образом могут существовать или в К-, или в З-стереохимии. В одном варианте воплощения все эти атомы углерода существуют в К-стереохимии, тогда как в другом варианте воплощения все эти атомы углерода существуют в Зстереохимии.
Углеводородный радикал относится к химической группе, образованной только из водорода и углерода, где атомы углерода могут быть организованы в прямую или разветвленную цепь, нециклическую или циклическую, и где связи между соседними атомами углерода могут быть только одинарными связями, то есть с образованием насыщенного углеводородного радикала, или могут присутствовать двойные или тройные связи между любыми двумя соседними атомами углерода, то есть с образованием ненасыщенного углеводородного радикала, и число атомов углерода в углеводородном радикале составляет от 3 до 24 атомов углерода. Углеводородный радикал может быть алкилом, где типичные алкилы прямого строения включают метил, этил, н-пропил, н-бутил, н-пентил, н-гексил и тому подобное, включая ундецил, додецил, тридецил, тетрадецил, пентадецил, гексадецил, гептадецил, октадецил и т.д.; разветвленные алкилы включают изопропил, втор-бутил, изобутил, трет-бутил, изопентил и тому подобные. Типичные насыщенные циклические углеводородные радикалы включают цикропропил, циклобутил, циклопентил, циклогексил и тому подобные; ненасыщенные циклические углеводородные радикалы включают циклопентенил и циклогексенил и тому подобные. Ненасыщенные углеводородные радикалы содержат по меньшей мере одну двойную или тройную связь между соседними атомами углерода (обозначаются как алкенил или алкинил соответственно, если углеводородный радикал является нециклическим, и циклоалкенил и циклоалкинил соответственно, если углеводородный радикал, по меньшей мере частично, является циклическим). Типичные алкенилы прямого и разветвленного строения включают этиленил, пропиленил, 1-бутенил, 2-бутенил, изобутенил, 1-пентенил, 2-пентенил, 3-метил-1бутенил, 2-метил-2-бутенил, 2,3-диметил-2-бутенил и тому подобные; типичные прямого и разветвленного строения включают ацетиленил, пропинил, 1-бутинил, 2-бутинил, 1-пентинил, 2-пентинил, 3-метил1-бутинил и тому подобные.
Вспомогательное вещество формулы (Ι) может быть получено синтетическими способами, известными специалистам в данной области, например по синтетической методике, раскрытой в международной публикации РСТ № АО 2009/035528, которая включена в настоящий документ путем ссылки, а также публикациями, идентифицированными в АО 2009/035528, где каждая из этих публикаций также включена в настоящий документ путем ссылки. Некоторые вспомогательные вещества также могут быть получены коммерческим путем. Предпочтительным вспомогательным веществом является продукт № 699800, как указано в каталоге ΛνηπΙι Ро1аг Ь1р1бз, А1аЬазХег АЬ, см. Е1 в комбинации с Е10 ниже.
В различных вариантах воплощения изобретения вспомогательное вещество имеет химическую структуру формулы (Ι), но группы А1, А2, К1, К2, К3, К4, К5 и К6 выбираются из подмножества вариантов, ранее предоставленных для этих групп, где эти подмножества обозначаются ниже как Е1, Е2 и т.д.
Е1: А1 является фосфатом или солью фосфата, а А2 является водородом.
Е2: К1, К3, К5 и К6 являются С3-С21 алкилом; а К2 и К4 являются С5-С23 углеводородным радикалом. Е3: К1, К3, К5 и К6 являются С5-С17 алкилом; а К2 и К4 являются С7-С19 углеводородным радикалом. Е4: К1, К3, К5 и К6 являются С7-С15 алкилом; а К2 и К4 являются С9-С17 углеводородным радикалом. Е5: К1, К3, К5 и К6 являются С9-С13 алкилом; а К2 и К4 являются С11-С15 углеводородным радикалом. Е6: К1, К3, К5 и К6 являются С9-С15 алкилом; а К2 и К4 являются С11-С17 углеводородным радикалом.
Е7: В1, В3, В5 и В6 являются С7-С13 алкилом; а В2 и В4 являются С9-С15 углеводородным радикалом.
Е8: В1, В3, В5 и В6 являются Сц-С20 алкилом; а В2 и В4 являются С32-С20 углеводородным радикалом.
Е9: В1, В3, В5 и В6 являются Си алкилом; а В2 и В4 являются С13 углеводородным радикалом.
Е10: В1, В3, В5 и В6 являются ундецилом, а В2 и В4 являются тридецилом.
В некоторых вариантах каждый компонент от Е2 до Е10 комбинируется с вариантом Е1, и/или углеводородные группы от Е2 до Е9 являются алкильными группами, предпочтительно алкильными группами прямого строения.
Вспомогательное вещество формулы (Ι) может быть создано в виде фармацевтической композиции, необязательно вместе с дополнительными вспомогательными веществами, каждое из которых обсуждается ниже. В этом отношении делается ссылка на публикацию патента США № 2008/0131466, в которой представлены композиции, например водные композиции (АВ) и композиции стабильных эмульсий (ЕЕ) для вспомогательного вещества СЬА, где эти композиции могут быть использованы для любого из вспомогательных веществ формулы (Ι).
Вспомогательное вещество может быть введено с вирусом изобретения как единая композиция или может быть введено до, совместно или после введения рекомбинантного вируса настоящего изобретения. Иммуноген и вспомогательное вещество могут быть упакованы и доставлены в одной упаковке или могут быть упакованы в раздельных упаковках и смешаны перед использованием. Иммуноген и вспомогательное вещество обычно упаковываются с этикеткой, указывающей предполагаемое терапевтическое применение. Если иммуноген и вспомогательное вещество упакованы раздельно, упаковка обычно включает инструкции по смешиванию перед использованием. Выбор вспомогательного вещества и/или носителя зависит от стабильности вакцины, содержащей вспомогательное вещество, пути введения, схемы дозирования, действия вспомогательного вещества на виды, подвергаемые вакцинированию, и, у людей, фармацевтически приемлемым вспомогательным веществом является то, которое подходит или приемлемо для введения людям по соответствующим регулирующим предписаниям. Например, вспомогательное вещество Сотр1с!с Вгсипб не подходит для введения людям. Предпочтительны квасцы, МРЬ и 0821. Необязательно, два или более различных вспомогательных вещества могут быть использованы одновременно, такие как квасцы с МРЬ, квасцы с 0821, МРЬ с 0821 и квасцы, 0821 и МРЬ вместе. Также может быть использовано вспомогательное вещество ШсотрШе Вгсипб (СЕапд с! а1., Абуапсеб Эгид ОсПуегу Всу1с^8 32, 173-186 (1998)), необязательно в комбинации с любым из квасцов, 0821 и МРЬ и всеми их комбинациями.
Е. Фармацевтические композиции и наборы.
Также рассмотренные в настоящем документе фармацевтические композиции и наборы содержат вирус, предоставленный в настоящем документе, и один или более компонентов. Фармацевтические композиции могут включать вирусные векторные частицы, как предоставлено в настоящем документе, и фармацевтический носитель. Наборы могут включать фармацевтические композиции и/или комбинации, представленные в настоящем документе, и один или более компонентов, таких как инструкции по использованию и приспособление для введения состава пациенту.
Представленные в настоящем документе фармацевтические композиции содержат вирусные частицы, как представлено в настоящем документе, и подходящий фармацевтический носитель.
Фармацевтические составы, представленные в настоящем документе, могут быть в различных формах, например в твердой, жидкой, порошковой, водной или лиофилизированной формах. Примеры подходящих фармацевтических носителей известны специалистам в данной области. Формулы таких носителей и/или добавок могут быть разработаны стандартными способами, и их можно вводить пациенту в подходящей дозировке. Стабилизирующие агенты, такие как липиды, нуклеазные ингибиторы, полимеры и хелатирующие агенты могут предохранять составы от разрушения внутри организма.
Вирусные векторные частицы, представленные в настоящем документе, могут быть упакованы в наборы. Наборы могут необязательно включать один или более компонентов, таких как инструкции по использованию, приспособления и дополнительные реагенты, и компоненты, такие как пробирки, контейнеры и пипетки для осуществления способов. Примеры наборов могут включать вирусы, представленные в настоящем документе, и могут необязательно включать инструкции по использованию, приспособление для детекции вируса у пациента, приспособление для введения вируса пациенту, и приспособление для введения соединения пациенту.
Наборы, включающие полинуклеотиды, кодирующие интересующий ген (обычно антиген), также рассмотрены в настоящем документе. Наборы могут включать не менее одной плазмиды, кодирующей компоненты, упаковывающие вирус, и вектор, кодирующий вариант вируса Синдбиса гликопротеина Е2. Некоторые наборы содержат не менее одной плазмиды, кодирующей компоненты, упаковывающие вирус, вектор, кодирующий вариант вируса Синдбиса гликопротеина Е2, и вектор, кодирующий, по меньшей мере, один фактор созревания ДК.
Наборы, содержащие вирусный вектор, кодирующий интересующую последовательность (обычно антиген) и необязательно полинуклеотидную последовательность, кодирующую фактор созревания ДК, также упомянуты в настоящем документе. В некоторых наборах набор включает по меньшей мере одну
- 26 032403 плазмиду, кодирующую компоненты, упаковывающие вирус, и вектор, кодирующий вариант вируса Синдбиса гликопротеина Е2.
Набор может также содержать инструкции. Инструкции обычно включают фактические выражения, описывающие вирус, и, необязательно, другие компоненты, включенные в набор, и способы для введения, включая способы для определения подходящего состояния пациента, подходящей количественной дозировки и подходящего способа введения вируса. Инструкции могут также включать руководство по мониторингу пациента во время лечения.
Наборы, представленные в настоящем документе, также могут влючать приспособление для введения вируса пациенту. Любое из множества известных специалистам приспособлений для введения лекарств или вакцин может быть включено в набор, представленный в настоящем документе. примеры приспособлений включают, но не ограничиваясь этим, внутривенную иглу, катетер, безигловое приспособление для инъекции, ингалятор и диспенсер жидкостей, такой как глазная пипетка. Обычно приспособление для введения вируса в наборе будет совместимо с вирусом набора; например, безигловое приспособление для инъекции, такое как приспособление для инъекции под высоким давлением, может быть включено в наборы с вирусами, которые не повреждаются при инъекции высоким давлением, но обычно не включается в наборы с вирусами, которые повреждаются при инъекции высоким давлением.
Наборы, представленные в настоящем документе, также могут включать приспособление для введения компонента, такого как ДК-активатор или стимулятор, пациенту. Любое из множества известных специалистам в данной области приспособлений для введения лекарств пациенту может быть включено в наборы, представленные в настоящем документе. примеры приспособлений включают, но не ограничиваясь этим, гиподермические иглы, внутривенные иглы, катетер, безигловые инъекции, ингаляторы и жидкостные диспенсеры, такие как глазная пипетка. Обычно приспособление для введения состава кита будет совместимо с желаемым способом введения состава.
Следующие примеры предлагаются для иллюстрации, но не являются ограничивающими.
Примеры
Пример 1. Конструирование варианта оболочки вируса Синдбис.
Вирус Синдбис (8У) - представитель рода А1рЬау1ги8 и семейства Τодаν^^^бае - способен инфицировать ДКл, возможно благодаря Οί.’-8^Ν (публикация КИткВа, А.В., е! а1. 2003. 1. Упо1. 77: 12022-12032, включенная в настоящую заявку путем ссылки в полном объеме). Однако канонический вирусный рецептор лабораторного штамма 8У является поверхностным гепарансульфатом (Н8), который обнаружен во многих типах клеток (публикации 81гаи55, 1.Н., е! а1. 1994. Агсб. У1го1. 9: 473-484; Вугпек, А.Р., и О.Е. СпШп. 1998. 1. Упо1. 72: 7349-7356, каждая из которых включена в настоящую заявку путем ссылки в полном объеме). Для того чтобы уменьшить связывание с гепарансульфатом, измененный Е2 оболочки (называемый 8УСти) был сконструирован Аапд е! а1. (публикация И8 2008/0019998, включенная в полном объеме). Часть этой стратегии включала делецию четырех аминокислот соединения пробелка Е3/Е2 и делецию двух аминокислот с последующим добавлением 10-аминокислотной последовательности из гемагглютинина (см. фиг. 1А и 1В). Получившийся в результате Е2 белок экспрессируется как соединение Е3 и Е2 (также известное как рЕ2), поскольку природная последовательность расщепления была нарушена, и он также проявляет свойства чужеродного эпитопа (гемагглютинин). Как показано ниже, 8УСти, помимо других проблем, испытывает недостаток экспрессии.
Используя другую стратегию, изобретатели сконструировали Е2 гликопротеин вируса Синдбис для уменьшения связывания с гепарансульфатом, увеличения специфичности к дендритным клеткам и усиления экспрессии. Основной подход к достижению этих характеристик - повышение инфективности дендритных клеток путем изменения остатка 160 в Е2 (остатки 233 на фиг. 1) на некислую аминокислоту, особенно на аминокислоту, отличную от аланина, или удаления его, для уменьшения связывания с гепарином путем понижения положительного заряда белка, удаления НА (гемагглютинин) эпитопа и восстановления сайта расщепления на Ν-конце Е2, в этом случае сайта расщепления фурином. Как часть вирусной оболочки, эти Е2 гликопротеины способны опосредовать инъекцию ДКл, а также уменьшать или прекращать инфицирование других клеточных типов.
Следуя этим принципам, несколько вариативных последовательностей Е2 были разработаны и показаны в следующей таблице. Полужирный шрифт указывает на изменение в НВ цепи последовательности оболочки вируса Синдбис (СепВапк NС 001547.1).
- 27 032403
ЗЕО ΙΌ Νο: 70 76 159 160
3 Е К Е с
4 Е Е Е с
5 Е К Δ Δ
6 Е Е Е Δ
7 К К Е с
8 К К Е Δ
9 К Е Е с
10 к Е Е Δ
11 к Е К с
12 к Е К Δ
13 Е К К с
14 Е К к Δ
15 Е Е к с
16 Е Е к Δ
Были синтезированы последовательности нуклеиновых кислот, кодирующие некоторые из вариантов (см. также фиг. 1), включая последовательности нуклеиновых кислот, которые были кодоноптимизированы для человека. ДНК для вариантов клонировалась в экпрессионном векторе, таком как рсДНК3.
Пример 2. Приготовление вирусной векторной частицы, содержащей вариант гликопротеина Е2 оболочки вируса Синдбис.
Псевдотипированный по оболочке вирус Синдбис приготовлялся путем стандартной опосредованной фосфатом кальция транзиентной трансфекции 293Т клеток лентивирусным вектором, таким как НКЛУ или его производные, упаковочными плазмидами, кодирующими дад, ро1 и ΐΌν, и вариантом последовательности оболочки вируса Синдбис. ЕИОШ - это самоинактивирующийся лентивирусный вектор, несущий промотор иммуноглобулина-С человека, который усиливает экспрессию ОЕР репортерного гена (публикация ЬоЕ, С., е! а1. 2002. Зае^е 295:868-872, которая включена в настоящий документ путем ссылки в полном объеме). Лентивирусные трансфертные векторы (ЕИОШ и его производные) являются третьим поколением лентивирусных векторов на основе ВИЧ (см., главным образом, публикацию Соскге11 аηά Кайт Мо1. В^ес^оЕ 36: 184, 2007), в которых большая часть и3 региона 3' Ι.ΤΙΚ отсутствует, что приводит к самоинактивации 3'-ЬТК.
Образование рекомбинантных лентивирусных векторов было завершено при опосредованной фосфатом кальция (СаРО4) транзиентной трансфекции 293Τ клеток (293ЬТУ клеточная линия; СЕЛЬ ΒΙΟЬАВЗ ШС, ЬТУ-100). 293Τ клетки были трансфектированы четырьмя плазмидами, осажденными СаРО4. Следующие четыре плазмиды, использованные для образования препаратов лентивирусного вектора, показаны схематически на фиг. 3 и соответствуют следующему: 1) лентивирусный вектор; ίί) ВИЧ Кет кодирующая плазмида; ΐΐΐ) ВИЧ Оад/Ро1 кодирующая плазмида; и ΐν) кодирующая оболочку плазмида. Лентивирусные векторы могут кодировать желаемые антигены или иммуномодуляторные элементы и содержать определенные целевые делеции для предотвращения интеграции в хромосому хозяина в инфицированных клетках. Дальнейшие примеры альтернативных плазмид, которые можно использовать для транзиентной трансфекции, включают кодирующие холоэнзим Полимеразу, которая соответствует дефективной мутации в интегразе, такой как Э64У мутация, описанная в настоящем документе. Для определенных целей кодирующая оболочку плазмида может кодировать ненацеленную на ДК пантропическую оболочку, такую как УЗУ-О.
Для экспериментов, описанных в настоящем документе, СаРО4 препараты, содержащие 20 мкг вектора и по 60 мкг Оад/Ро1 и Кет плазмид и 240 мкг плазмиды оболочки, были профильтрованы через фильтр с порами размером 0,45 мкм и были добавлены к примерно 6*107 клеткам 293Т, выращенным в цилиндрических флаконах, содержащих 75 мл среды ЭМЕМ с добавкой 10% эмбриональной телячьей сыворотки. Через 6 ч после трансфекции среда была замещена 100 мл свежей среды и собрана через 36 ч после трансфекции. Культуральные супернатанты были центрифугированы при низкой скорости (1200 об/мин) для удаления разрушенных клеток, затем следовала фильтрация через 0,45 мкм фильтры. Фильтрат, содержащий препарат лентивирусного вектора, был необязательно концентрирован путем центрифугирования при 17,700*г в течение 5 ч при 20°С. Отобранный пипеткой лентивирусный вектор был затем ресуспендирован в РВЗ в заданном объеме. Этот процесс типично дает >5*105 МЕ/мл с использованием гликопротеина оболочки вируса Синдбис, описанного в настоящем документе, или всего 5*107 МЕ на каждый цилиндрический флакон, содержащий культуру. Более типично этот процесс дает по меньшей мере всего 1*108 МЕ на каждый цилиндрический флакон, содержащий культуру.
Более подробно, на день -4 150 мл среды клеточной культуры добавляли к цилиндрическим флаконам (ΚΒ), которые помещаются в цилиндрический инкубатор на подставке при 37°С (0,2 об/мин) на ~1 ч.
- 28 032403
В каждый КВ помещался конфлюэнт 15 см на планшет. На день -2 среда отбиралась из КВ и замещалась 100 мл предварительно нагретой среды. На день -1 клетки были собраны в препараты для трансфекции. КВ предварительно нагревались со 100 мл клеточной культуральной среды в течение ~1 ч. Среда отбиралась и добавлялось 10-12 мл РВЗ. КВ помещались на свои места и прокручивались дважды, чтобы покрыть клетки. РВЗ отбирался, и добавлялось 10-12 мл раствора трипсина. КВ снова помещались на свои места и прокручивались дважды, чтобы покрыть клетки. Раствор трипсина отбирался, и КВ помещались в инкубатор на 5 мин. К КВ добавлялось 10 мл теплой среды, и КВ интенсивно прокручивались один раз, чтобы отделить клетки. Используя 10 мл пипетку, клетки отбирались пипеткой и сливались обратно, например, 10 раз, чтобы получить суспензию одной клетки. Клетки удалялись в новый контейнер и разводились средой (40 мл среды на КВ). Клетки подсчитывались и пересаживались в свежие КВ в количестве 7*107/мл и помещались в инкубатор на ночь.
В день 0 приблизительно через 22 ч после пересадки раствор плазмид был приготовлен следующим образом.
Для каждой КВ смешивался вместе раствор плазмид (120 мкг вектора, 60 мкг Сад/Ро1, 60 мкг Кеу, 60 мкг оболочки), 2,5 мл 1,25М СаС12 и фильтрованная стерильная вода до 12,5 мл конечного объема. Добавлялось 2,7 мл 2*НВЗ (50 мМ НЕРЕЗ, 10 мМ КС1, 12 мМ декстрозы, 280 мМ №С1, 1,5 мМ №2НР04-7Н20, рН 7,0, стерильно профильтрованный) буфер к 50 мл тубе (одна туба/КВ). Добавлялось по каплям 12,7 мл смеси вода-СаС12-ДНК к 12,7 мл 2*НВЗ на вортексе со средней скоростью. Пробирки закрывались и размешивание на вортексе продолжалось с максимальной скоростью в течение 5-10 с. Удалялось 25 мл среды из КВ и добавлялся осадок (25 мл) к КВ. Инкубировались 6 ч, затем среда аспирировалась и добавлялось 100 мл свежей, предварительно нагретой среды клеточной культуры. Помещались обратно в инкубатор при 37°.
Через 36-48 ч после трансфекции супернатанты из КВ были собраны в 250 мл конический фалькон и обработаны следующим образом. Супернатант центрифугировался в течение 10 мин при 2000 об/мин. Супернатант фильтровался через 0,45 мкм фильтр. Супернатант центрифугировался в 500 мл фальконе в течение 5 ч при 10,000 об/мин при 20°С. Вектор ресуспендировался в РВЗ или НВЗЗ до заданной концентрации и хранился при -80°С.
Получившиеся в результате псевдотипированные вирусные векторы затем назывались ЕИС^/У1, ЕИС№/У2 и так далее. Вирусные векторные геномы с оболочкой, содержащей УЗУ-С гликопротеин, затем назывались ЕИСЖУЗУ-С.
Пример 3. Производство лентивирусных векторных частиц, содержащих гликопротеины оболочки вируса Синдбис.
В этом примере определялись титры для лентивирусных векторов, псевдотипированных различными оболочками вируса Синдбис. Использовались следующие гликопротеины: Е2: ЗШ-Уаг1 (ЗЕЦ ΙΌ N0: 3), ЗШ-Уаг2 (ЗЕО ΙΌ N0: 4), ЗШ-Уаг3 (ЗЕО ΙΌ N0: 5), ЗУСти (ЗЕО ΙΌ N0: 2), НК (ЗЕО ΙΌ N0: 18).
Гликопротеины вируса Синдбис, псевдотипированные лентивирусными векторными частицами, были получены путем трансфекции клеток 293Т, как описано в примере 2. Необработанные супернатанты были собраны через 48 ч после трансфекции и использованы для трансдукции 293Т клеток, экспрессирующих человеческий ^С-ЗIСN (293-ОС8ЮЦ), помещенных в 6-луночные планшеты за день до этого в количестве 2Е5 клеток на лунку. Титр определялся через 72 ч после инкубации при 37°С путем анализа трансдуцированных клеток на цитометре Спаса Еа§у-Су!е (М1Шроге). Было подсчитано всего 25000 точек для определения процента СЕР+ трансдуцированных клеток, который в свою очередь использовался для подсчета титра СЕР (МЕ, инфекционная единица) для каждого вируса.
Для облегчения изучения целевой трансдукции были сконструированы клеточные линии, экспрессирующие человеческий ЭС-ЗЮН Клеточные линии генерируются путем стабильной трансдукции родительских клеток 293Т с УЗУС-псевдотипированным лентивектором, содержащим кодирующую последовательность для человеческого ОС-ЗЮК кДНК для человеческой ^С-ЗIСN амплифицировалась из плазмид рυN0-й^С8IСN1Аа (ЧпсЕ'оСепе) и клонировалась с правой стороны промотора убиквитина-С человека в лентивирусной плазмиде ЕИ^ для образования Еυ^-й^СЗIСN. Альтернативно клеточные линии образуются путем стабильной трансдукции родительских клеток 293Т с УЗУСпсевдотипированным амфотрофным (нелентивирусным) вектором, содержащим кодирующую последовательность для ОС-ЗЮ^ для лучшего содействия основанному на нуклеиновых кислотах анализу трансдукции лентивирусными векторными частицами. Лентивекторы или амфотрофные векторы затем псевдотипируются УЗУС и используются для трансдукции клеток 293Т. Альтернативно, клеточные линии образуются путем стабильной трансдукции родительских клеток 293Т плазмидой, кодирующей человеческий ОС-ЗЮК Получившиеся в результате клетки окрашиваются антителами (антитело к ^С-ЗIСN человека (ВО Вюкшепсек)) и клетки сортируются для получения однородной популяции ОС^С^ клеточных линий.
В трех независимых экспериментах лентивирусный вектор, псевдотипированный ЗШ-Уаг1 оболочкой, имел титры приблизительно в 10 раз более высокие, чем титры псевдотипированного ЗУСти или НК штамма вируса Синдбис (фиг. 3, нижний график). В последующем исследовании сравнивалась продуктивность трех вариантов оболочки Синдбис. Показан типичный результат. Зт-Уаг1, Зт-Уаг2 и ЗШ
- 29 032403
Уаг3 оболочки производят векторные частицы с практически одинаковыми титрами.
Специфичность вирусных векторных частиц, содержащих вариант вируса Синдбис гликопротеина Е2, оценивалась по трансдукции 293Т.й^С-8IОN или родительских клеток 293Т и оценке экспрессии видимого маркера (например, ОЕР) внутри клеточных линий.
Целевые клетки (293Т.111)С-МО№ или клетки 293Т) пересаживались в 24-луночный культуральный планшет (0,2*106 клеток на лунку) и трансдуцировались вирусными супернатантами (1 мл на лунку) путем центрифугирования планшетов при 2,500 об/мин и при 30°С в течение 90 мин. Затем супернатанты перемещались в свежую культуральную среду и культивировались в течение 3 дней при 37°С. Процент клеток, экспрессирующих маркер, оценивался проточной цитометрией.
Как показано в таблице ниже, как Е2 вариант 1, так и Е2 вариант 3 предпочтительно поражают клетки (специфичны для клеток), экспрессирующие ЬОС-ЗЮК
Таблица 1
Оболочка Клеточный тип ски/мл Соотношение
УЗУ-С ΗϋΟ-3ΙΟΝ 1,35Ε+08 1,19
293Т 1,13Ε+08
31п-УагЗ (Эксп. 1) 293-НЭС-3ΙΟΝ 4,2Ε+07 35, 4
293Т 1,2Ε+06
31п-УагЗ (Эксп. 2) ΗϋΟ-3ΙΟΝ 8,12Ε+07 11, 09
293Т 7,33Ε+06
З1п-Уаг2 293-НОС-3ΙΟΝ 1,7Ε+08 18,2
293Τ 9,1Ε+06
3ίη-νΑΚ-1 ΗϋΟ-3ΙΟΝ 2,93Ε+08 13,75
293Τ 2,13Ε+07
3ίη-ΗΚ 293-ΗϋΟ-3ΙΟΝ 6,4Ε+06 9,4
293Τ 6,8Ε+05
ЗУСши (Эксп. 1) 293-ΗϋΟ-3ΙΟΝ 3,4Ε+06 27,0
293Τ 1,3Ε+05
ЗУСши (Эксп. 2) ΗϋΟ-3ΙΟΝ 4,65Ε+ 0 6 12,24
293Τ 3,80Ε+05
Пример 4. Иммуногенетичность лентивирусных векторных частиц, содержащих гликопротеины оболочки вируса Синдбис.
В этом примере оценивалась иммуногенность для лентивирусных векторов, псевдотипированных различными оболочками вируса Синдбис. Более конкретно, определялось количество антигенспецифичных СО8 Т-клеток и их профилей цитокиновой секреции. Использованными Е2 гликопротеинами были 8Ш-Уаг1 (^ ГО N0: 3), 8Ш-Уаг2 (^ ГО N0: 4), 8Ш-Уаг3 (^ ГО N0: 5), 8УОти (^ ГО N0: 2).
Вирусный геном содержал последовательность, кодирующую яичный альбумин (0УА). Лентивирусные векторные частицы образовывались путем трансфектирования 293Т клеток, как описано в примере 2. Супернатанты собирались, и количество р24 определялось с использованием набора ЕЕТ8А (Абуапсеб ВюЖепсе ЕаЬз, Кеп§тд1оп МП). Белок р24 является белком ядра ВИЧ, обнаруживаемым в псевдотипированных вирионах и продуктом дад гена. С57ВЕ/6 мыши (5 мышей на группу) были иммунизированы подкожно не способным к интеграции лентивектором, кодирующим яичный альбумин 0УА. Число и функции 0УА2 57 (МГЛЕЕКЕ) (8Е^ ГО N0: 24) пептид-специфичных СО8 Т-клеток и профилей цитокиновой секреции в селезенке определялось на 9 день при помощи МНС-1/пептидного мультиметра и внутриклеточного цитокинового окрашивания.
Вкратце, селезенки извлекались и гомогенизировались путем продавливания через 70 мкм нейлоновый фильтр. Красные кровяные клетки лизировались гипотоническим шоком путем короткой выдержки в дистиллированной воде и немедленно перемещались в изотоническую среду с добавлением 10* РВ8. примерно 5*106 спленоцитов на пробу окрашивались РЕ-меченым Н-2КЬ/0УА257 пентамером (Рго1ттипе) при 25°С в РВ8 с 2% ЕС8 и 2 мМ ЭДТА (ЕАС8 буфер). Клетки затем промывались дважды и окрашивались прижизненным красителем Е!УЕГОЕА1) Nеа^-Iηί^а^ес1 (Е/П МВ; ЕпуЕгодеп) и затем метились флуорохромными антителами: СО44 ΕΠΌ, СО19 РегСР-Су5.5 и СО8 РасШс В1ие (еВюЖепсе) при 4°С. Данные собирались на ВО Е8В II проточном цитометре (50,000 СО8+ точек) и анализировались с помощью программы ЕЕжЗо (Тгее81аг). Стратегия пропуска для идентификации СО8 Т-клеток была следующей: лимфоциты (нижняя медиана переднего рассеяния, боковое рассеяние нижнее), одиночные клетки (область бокового рассеяния = высота бокового рассеяния), живые клетки (Е/Ό МВ-), СО8 Т-клетки (СО8+ СО19-). Определялся процент клеток, экспрессирующих №N-7 внутри СО8+ ворот, и был представлен на фиг. 4А и 4В. Горизонтальная линия показывает средние значения. Неспецифическое ГОМу окрашивание определялось в клетках селезенки у мышей, которым инъецировали пустой носитель (НВ88), у которых клетки стимулировались т уЕго пептидом. ГОМу окрашивание было ниже 0,2% для всех проб, культивируемых без белка (не показано). В дополнение к фракции СО8 Т-клеток, образующих ГОМу, также изображается фракция ^N-7+ клеток, также образующих Т\Е(/. и/или ГО-2, как показано в легенде.
В одной серии экспериментов количество используемого вируса содержало или 2500 нг, или 125 нг
- 30 032403 р24. Фиг. 4А иллюстрирует, что лентивекторы, псевдотипированные вариантом оболочек Синдбис, имеют схожую активность ш νί\Ό. Как показано на крайней левой панели, среднее значение антигенспецифичных Т-клеток практически такое же, как при двух отличных дозировках. Кроме того, средний процент ГЕИ-у клеток также одинаков. Паттерны цитокиновой секреции, особенно фракции ГЕ^-уположительных клеток, также экспрессирующих ΙΕ-2 или ТХЕ-а, также похожи, с более высоким процентом ΙΕΧ-γ клеток, негативных для ΙΕ-2 и ТЫЕ-ц.
В другой серии экспериментов группы из 5 мышей получили дозировку серийным разведением вируса или носителем. Вирус был псевдотипирован или БшУаг1, или БУСти. Процент клеток с СИ44Ы Н2КЬ/0УА257 пентамер+ фенотип обозначен на фиг. 4В. Соответствующая линия показывает средние значения. Как показано на фиг. 4В, БшУаг1-псевдотипированный ЬУ вызывал значительно более сильную экспансию антиген-специфичных СИ8 Т-клеток, чем БУСти. Больше того, БшУаг1псевдотипированные лентивекторы вызывали более сильную функциональную реакцию СИ8 Т-клеток, чем БУСти (фиг. 4С). Неспецифическое окрашивание определялось в НВББ-инъецированных (носитель) мышах, рестимулированных пептидом. ΙΕ^γ окрашивание было ниже 0,2% для всех проб, культивируемых без пептида (не показано).
Пример 5. Конструкция неинтегрирующих лентивирусных векторов (МЕУ).
Было сконструировано множество неинтегрирующих лентивирусных векторов. Схема примеров лентивирусных векторов показана на фиг. 5А. Верхний рисунок показывает вектор в провирусной форме. Все векторы содержат донор сплайсируемого фрагмента, упаковочный сигнал (рк1), реагирующий на Кет элемент (ККЕ), донор сплайсируемого фрагмента, акцептор сплайсируемого фрагмента, центральный полипуриновый путь (сРРТ) и ^РКЕ элемент. Кроме того, все векторные конструкты содержат промотор для экспрессии в клетках млекопитающих и интересующую последовательность, меченную антиген в конструкте-примере. Промоторы, использованные в примерах, включают промотор человеческого убиквитина С (ИЬ1С), цитомегаловируса немедленно-ранний промотор (СМУ) и промотор вируса саркомы Рауса (КБУ).
Просмотр в увеличенном масштабе И3 региона показан ниже как открытый участок с последовательностью РРТ (полипуринового пути) сразу же перед ним. Ниже показаны три различных И3 региона в схематической форме; их последовательности показаны на фиг. 5В и БЕР ΙΌ N0: 21-23. Конструкты содержат делеции в И3 регионах. БЕЫ конструкт имеет делецию около 130 нуклеотидов в И3 (М1уокЫ, ек а1. I. У1го1. 72: 8150, 1998; Уи ек а1. РNАБ 83: 3194, 1986), которая удаляет ТАТА-бокс, делая невозможной активность ЬТК промотора. Делеции в конструктах 703 и 704 повышают экспрессию из лентивирусных векторов (публикация Вауег ек а1. Мо1. Тйегару 16: 1968, 2008, включена в полном объеме). Кроме того, конструкт 704 содержит делецию 3' РРТ, которая уменьшает интеграцию вектора (публикация \У0 2009/076524, включена в полном объеме). Последовательности И3 региона всех конструктов показаны на фиг. 5В. 3' РРТ начинается в позиции 3, и показаны распространенные делеции, относящиеся к вектору с делециями БШ.
Пример 6. Экспрессия в дендритных клетках, за которой следует трансдукция лентивирусными векторными частицами.
Этот пример показывает уровень экспрессии СЕР (зеленого флюоресцирующего белка) в дендритных клетках, образованных векторами с распространенными делециями И3.
Серии вирусов были созданы путем трансфекции 293Т клеток, как описано выше. Все вирусы содержали оболочку БЕН-УаИ, векторный геном, содержащий ЦЬ1С или СМУ промотор, функционально связанный с СЕР трансгеном, и дефектную интегразу в силу содержания Э64У мутации. Необработанные супернатанты были собраны через 48 ч после трансдукции, и эквивалентные объемы каждого супернатанта использовались для трансдукции 293Т-^СБIСN клеток. СЕР экспрессия определялась через 72 ч после трансдукции с использованием СИАУА Еаку-Суке проточного цитометра. 50000 точек были подсчитаны для каждой трансдуцированной популяции клеток. Данные анализировались с использованием аналитической программы для цитометрии Е1о\\7о.
Такие же результаты были получены как с ИЬ1С (фиг. 6, панель А), так и СМУ (фиг. 6, панель В) промоторами. Показано, что у лентивирусных векторов, содержащих распространенные делеции И3 (703 и 704), выше трансгенная экспрессия, связанная с векторами с делецией по БIN. Делеция РРТ в конструкте 704 слабо уменьшает экспрессию по сравнению с конструктом 703.
Пример 7. Векторы с большими делециями в И3 являются неинтегрирующимися.
Этот пример демонстрирует сравнительную интеграционную эффективность БШ-УаН псевдотипированных векторов, содержащих комбинации различных векторных делеций с дефектной или дикого типа интегразой после трансдукции 293-^С-БIСN клеток.
Стоки векторов были созданы из множества различных комбинаций интегразных генов и И3 делеций. Векторы с делециями И3 (см. фиг. 5А и 5В), БIN, 703 и 704 были трансфектированы, как описано выше, или геном интегразы дикого типа, или геном мутантной интегразы. Векторы в этих экспериментах содержали СЕР-2А-№о трансген, который кодирует устойчивость как к СЕР, так и к С418. Рамки считывания связаны посредством 2А саморасщепляющегося белка для образования отдельных белков. Титры СЕР для всех векторных стоков определялись с использованием стандартных методов проточной цито
- 31 032403 метрии. Векторные стоки затем использовались для инфицирования 293-ОС-З1СН клеток, помещенных за день до этого в 6-луночные планшеты по 5*105 клеток на лунку. После трансдукции клетки обрабатывались трипсином каждые 72 ч. На каждом проходе 2*105 клетки были перенесены в 6-луночные планшеты с 2 мл ЭМЕМ + 10% ЕВЗ. Оставшиеся клетки были использованы для определения числа СЕР+ клеток путем проточной цитометрии.
На фиг. 7 представлен соответствующий СЕР титр как фракция титра, наблюдаемого в одном проходе. Отсутствие СЕР экспрессии отражает отсутствие СЕР трансгена, что является результатом отсутствия интеграции на первичном этапе транскрипции. Как и ожидалось, было обнаружено, все вирусы, содержащие Э64У мутантную интегразу (ΙΝ-), являлись неинтегрирующимися. Кроме того, было обнаружено, что вирусы, содержащие РРТ делецию (704), являются дефектными в отношении интеграции даже в присутствии дикого типа ΙΝ гена. Это показывает, что делеция 3' РРТ предоставляет избыточный механизм безопасности в комбинации с интегразной мутацией.
Пример 8. Интегрирующиеся и неинтегрирующиеся лентивирусные векторы являются иммуногенетически эквивалентными.
В этом примере реакции СЭ8 Т-клеток оценивались после иммунизации интегрирующимися или неинтегрирующимися вирусами.
С57ВБ/6 мыши иммунизировались подкожно 2,5*1010 геномами интегрирующихся (Ιΐ'ΐ(“') или неинтегрирующихся (ΙπΙ1564'''') лентивирусов, кодирующих Сад антиген из вируса иммунодефицита обезьян (ВИО). Число и функции ВИО Сад-специфичных СЭ8 Т-клеток в селезенке определялось на 10 день внутриклеточным цитокиновым окрашиванием, как описано выше, с тем исключением, что для рестимуляции использовался ВИО Сад-производный пептид ААУКЖУМТОТЕ. Фиг. 8 иллюстрирует, что неинтегрирующиеся лентивекторы могут вызывать СЭ8 Т-клеточный ответ, эквивалентный интегрирующимся лентивекторам. Более того, паттерн цитокиновой экспрессии был таким же.
Пример 9. Иммунизация ОС-МТУ обеспечивает терапевтический эффект.
В этом примере мыши, которые получили опухолевые клетки, прошли лечение иммунизацией ОСМЬУ, экспрессирующими опухолевый антиген.
ВАЬВ/с мышам инъецировали подкожно 2*104 СТ26 клеток карциномы кишечника. Через один день мышам подкожно ввели или пустой носитель, или препарат ЗШУаг1 псевдотипированных лентивирусных векторных частиц, содержащий 3,2 мкг р24 капсидного белка. Вирусная векторная оболочка содержала вариант вируса Синдбис Е2, как описано выше, и вектор являлся неинтегрирующим и кодировал АН1А5 пептид (ЗРЗУАУНОЕ; ЗЕО ΙΌ NΟ: 25), модифицированный ММТУ др70 СЭ8 Т-клеток эпитоп, который является трансплантационным антигеном, соответствующим СТ26 опухолевым клеткам. Определялся первичный рост опухоли, а также долгосрочное выживание иммунизированных мышей по сравнению с контрольными. Фиг. 9 показывает, что опухолевый рост медленней у мышей, получивших ОС-МЬУ, и, более того, долгосрочное выживание (оценивавшееся в течение 75 дней) было значительно лучше (60% выживания по сравнению с 20%). Следовательно, ЭС-нацеленные неинтегрирующиеся лентивекторы (ОС-МЕУ) являются эффективными в терапевтическом лечении опухолей.
Список последовательностей <110> 1ттипе Безтдп СогрогаЫоп <120> ЛЕНТИВИРУСНЫЕ ВЕКТОРЫ, ПСЕВДОТИПИРОВАННЫЕ ГЛИКОПРОТЕИНОМ ОБОЛОЧКИ ВИРУСА СИНДБИС <130> ΣΏΟ 203РС <160> 27 <170> Патентная Версия 3.5 <210> 1 <211> 423 <212> белок <213> Вирус Синдбис <220>
<221> разное <222> (160)..(160) <223> Xаа может быть любая аминокислота, встречающаяся в природе
- 32 032403 <400> 1
Зег 1 Уа1 11е Азр Азр 5 РНе ТНг Ьеи ТНг Зег 10 Рго Туг Ьеи С1у ТНг 15 Суз
Зег Туг Суз Η13 Н1з ТЬг Уа1 Рго Суз РНе Зег Рго Уа1 Ьуз 11е С1и
20 25 30
С1п Уа1 Тгр Азр С1и А1а Азр Азр Азп ТНг 11е Агд 11е С1п ТНг Зег
35 40 45
А1а С1п РЬе С1у Туг Азр С1п Зег С1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз Туг
50 55 60
Агд Туг Мек Зег Ьеи Ьуз С1п Азр Н1з ТНг Уа1 Ьуз С1и С1у ТНг Мек
65 70 75 80
Азр Азр 11е Ьуз 11е Зег ТЬг Зег С1у Рго Суз Агд Агд Ьеи Зег Туг
85 90 95
Ьуз С1у Туг РЬе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго С1у Азр Зег Уа1 ТНг
100 105 110
Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТНг Зег Суз ТНг Ьеи А1а Агд
115 120 125
Ьуз 11е Ьуз Рго Ьуз РЬе Уа1 С1у Агд С1и Ьуз Туг Азр Ьеи Рго Рго
130 135 140
Уа1 Η1Ξ С1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТНг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи Ьуз Хаа
145 150 155 160
ТЬг ТЬг А1а С1у Туг 11е ТЬг Мек Н1з Агд Рго Агд Рго Н1з А1а Туг
165 170 175
ТЬг Зег Туг Ьеи С1и С1и Зег Зег С1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго Рго
180 185 190
Зег С1у Ьуз Азп 11е ТЬг Туг С1и Суз Ьуз Суз С1у Азр Туг Ьуз ТНг
195 200 205
С1у ТЬг Уа1 Зег ТЬг Агд ТЬг С1и 11е ТНг С1у Суз ТНг А1а 11е Ьуз
210 215 220
С1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр С1п ТНг Ьуз Тгр Уа1 РНе Азп Зег
225 230 235 240
- 33 032403
Рго Азр Ьеи 11е Агд 245 Ηίδ Азр Азр Η^з ТЬг А1а 250 С1п С1у Ьуз Ьеи 255 Η^з
Ьеи Рго РЬе Ьуз Ьеи 11е Рго Зег ТЬг Суз Меб Уа1 Рго Уа1 А1а Η^з
260 265 270
А1а Рго Азп Уа1 11е Ηίδ С1у РЬе Ьуз Η^з 11е Зег Ьеи С1п Ьеи Азр
275 280 285
ТЬг Азр Ηίδ Ьеи ТЬг Ьеи Ьеи ТЬг ТЬг Агд Агд Ьеи С1у А1а Азп Рго
290 295 300
Б1и Рго ТЬг ТЬг С1и Тгр 11е Уа1 С1у Ьуз ТЬг Уа1 Агд Азп РЬе ТЬг
305 310 315 320
Уа1 Азр Агд Азр С1у Ьеи С1и Туг 11е Тгр С1у Азп Η^з С1и Рго Уа1
325 330 335
Агд Уа1 Туг А1а С1п С1и Зег А1а Рго С1у Азр Рго Η^з С1у Тгр Рго
340 345 350
Η1Ξ С1и 11е Уа1 С1п Η^з Туг Туг Η^з Агд Η^з Рго Уа1 Туг ТЬг 11е
355 360 365
Ьеи А1а Уа1 А1а Зег А1а ТЬг Уа1 А1а Меб Меб 11е С1у Уа1 ТЬг Уа1
370 375 380
А1а Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и Суз Ьеи ТЬг Рго Туг
385 390 395 400
А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТЬг Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи Суз
405 410 415
Суз Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а
420
<210> 2
<211> 986
<212> белок
<213> Вирус Синдбис
<400> 2
Меб Зег А1а А1а Рго Ьеи Уа1 ТЬг А1а Меб Суз Ьеи Ьеи С1у Азп Уа1
1 5 10 15
- 34 032403
Зег РИе Рго Суз 20 Азр Агд Рго Рго ТИг 25 Суз Туг ТИг Агд С1и 30 Рго Зег
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 Азп Н1з С1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТИг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Зег Уа1 11е
50 55 60
Азр Азр РИе ТИг Ьеи ТИг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТИг Суз Зег Туг Суз
65 70 75 80
Η1Ξ Η13 ТИг Уа1 Рго Суз РИе Зег Рго Уа1 Ьуз 11е С1и С1п Уа1 Тгр
85 90 95
Азр С1и А1а Азр Азр Азп ТИг 11е Агд 11е С1п ТИг Зег А1а С1п РИе
100 105 110
С1у Туг Азр С1п Зег С1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз Туг Агд Туг МеЕ
115 120 125
Зег Ьеи Ьуз С1п МеЕ Туг Рго Туг Азр Уа1 Рго Азр Туг А1а ТИг Уа1
130 135 140
Ьуз С1и С1у ТИг МеЕ Азр Азр 11е Ьуз 11е Зег ТИг Зег С1у Рго Суз
145 150 155 160
Агд Агд Ьеи Зег Туг Ьуз С1у Туг РИе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго
165 170 175
С1у Азр Зег Уа1 ТИг Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТИг Зег
180 185 190
Суз ТИг Ьеи А1а Агд Ьуз 11е Ьуз Рго Ьуз РИе Уа1 С1у Агд С1и Ьуз
195 200 205
Туг Азр Ьеи Рго Рго Уа1 Н15 С1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТИг Уа1 Туг
210 215 220
Азр Агд Ьеи А1а А1а ТИг ТИг А1а С1у Туг 11е ТИг МеЕ Н1з Агд Рго
225 230 235 240
Агд Рго Η13 А1а Туг ТИг Зег Туг Ьеи С1и С1и Зег Зег С1у Ьуз Уа1
245 250 255
- 35 032403
Туг А1а Ьуз Рго 260 Рго Зег С1у Ьуз Азп 265 11е ТЬг Туг С1и Суз 270 Ьуз Суз
С1у Азр Туг Ьуз ТЬг С1у ТЬг Уа1 Зег ТЬг Агд ТЬг С1и 11е ТЬг С1у
275 280 285
Суз ТЬг А1а 11е Ьуз С1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр С1п ТЬг Ьуз
290 295 300
Тгр Уа1 РЬе Азп Зег Рго Азр Ьеи 11е Агд Η^з Азр Азр Η^з ТЬг А1а
305 310 315 320
С1п С1у Ьуз Ьеи Ηίδ Ьеи Рго РЬе Ьуз Ьеи 11е Рго Зег ТЬг Суз МеЬ
325 330 335
Уа1 Рго Уа1 А1а Ηίδ А1а Рго Азп Уа1 11е Η^з С1у РЬе Ьуз Η^з 11е
340 345 350
Зег Ьеи С1п Ьеи Азр ТЬг Азр Η^з Ьеи ТЬг Ьеи Ьеи ТЬг ТЬг Агд Агд
355 360 365
Ьеи С1у А1а Азп Рго С1и Рго ТЬг ТЬг С1и Тгр 11е Уа1 С1у Ьуз ТЬг
370 375 380
Уа1 Агд Азп РЬе ТЬг Уа1 Азр Агд Азр С1у Ьеи С1и Туг 11е Тгр С1у
385 390 395 400
Азп ΗΪ3 С1и Рго Уа1 Агд Уа1 Туг А1а С1п С1и Зег А1а Рго С1у Азр
405 410 415
Рго ΗΪ3 С1у Тгр Рго Η^з С1и 11е Уа1 С1п Η^з Туг Туг Η^з Агд Η^з
420 425 430
Рго Уа1 Туг ТЬг 11е Ьеи А1а Уа1 А1а Зег А1а ТЬг Уа1 А1а МеЬ МеЬ
435 440 445
11е С1у Уа1 ТЬг Уа1 А1а Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и
450 455 460
Суз Ьеи ТЬг Рго Туг А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТЬг Зег
465 470 475 480
Ьеи А1а Ьеи Ьеи Суз Суз Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а С1и ТЬг РЬе ТЬг
485 490 495
- 36 032403
Б1и ТЬг Меб Зег 500 Туг Ьеи Тгр Зег Азп 505 Зег С1п Рго РЬе РЬе 510 Тгр Уа1
Б1п Ьеи Суз 11е Рго Ьеи А1а А1а РЬе 11е Уа1 Ьеи Меб Агд Суз Суз
515 520 525
Зег Суз Суз Ьеи Рго РЬе Ьеи Уа1 Уа1 А1а С1у А1а Туг Ьеи А1а Ьуз
530 535 540
Уа1 Азр А1а Туг Б1и Н1з А1а ТЬг ТЬг Уа1 Рго Азп Уа1 Рго С1п 11е
545 550 555 560
Рго Туг Ьуз А1а Ьеи Уа1 С1и Агд А1а С1у Туг А1а Рго Ьеи Азп Ьеи
565 570 575
С1и 11е ТЬг Уа1 Меб Зег Зег С1и Уа1 Ьеи Рго Зег ТЬг Азп С1п С1и
580 585 590
Туг 11е ТЬг Суз Ьуз РЬе ТЬг ТЬг Уа1 Уа1 Рго Зег Рго Ьуз 11е Ьуз
595 600 605
Суз Суз С1у Зег Ьеи С1и Суз С1п Рго А1а А1а Н1з А1а С1у Туг ТЬг
610 615 620
Суз Ьуз Уа1 РЬе Б1у С1у Уа1 Туг Рго РЬе Меб Тгр С1у С1у А1а С1п
625 630 635 640
Суз РЬе Суз Азр Зег С1и Азп Зег С1п Меб Зег С1и А1а Туг Уа1 С1и
645 650 655
Ьеи Зег А1а Азр Суз А1а Зег Азр Н1з А1а С1п А1а 11е Ьуз Уа1 Н1з
660 665 670
ТЬг А1а А1а Меб Ьуз Уа1 С1у Ьеи Агд 11е Уа1 Туг С1у Азп ТЬг ТЬг
675 680 685
Зег РЬе Ьеи Азр Уа1 Туг Уа1 Азп С1у Уа1 ТЬг Рго С1у ТЬг Зег Ьуз
690 695 700
Азр Ьеи Ьуз Уа1 11е А1а С1у Рго 11е Зег А1а Зег РЬе ТЬг Рго РЬе
705 710 715 720
Азр Н1з Ьуз Уа1 Уа1 11е Н1з Агд С1у Ьеи Уа1 Туг Азп Туг Азр РЬе
725 730 735
- 37 032403
Рго С1и Туг С1у А1а Ме5 Ьуз Рго С1у 745 А1а РЬе С1у Азр 11е 750 С1п А1а
740
ТЬг Зег Ьеи ТЬг Зег Ьуз Азр Ьеи 11е А1а Зег ТЬг Азр 11е Агд Ьеи
755 760 765
Ьеи Ьуз Рго Зег А1а Ьуз Азп Уа1 Н1з Уа1 Рго Туг ТЬг С1п А1а Зег
770 775 780
Зег С1у РЬе С1и Ме5 Тгр Ьуз Азп Азп Зег С1у Агд Рго Ьеи С1п С1и
785 790 795 800
ТЬг А1а Рго РЬе С1у Суз Ьуз 11е А1а Уа1 Азп Рго Ьеи Агд А1а Уа1
805 810 815
Азр Суз Зег Туг С1у Азп 11е Рго 11е Зег 11е Азр 11е Рго Азп А1а
820 825 830
А1а РЬе 11е Агд ТЬг Зег Азр А1а Рго Ьеи Уа1 Зег ТЬг Уа1 Ьуз Суз
835 840 845
С1и Уа1 Зег С1и Суз ТЬг Туг Зег А1а Азр РЬе С1у С1у Ме5 А1а ТЬг
850 855 860
Ьеи С1п Туг Уа1 Зег Азр Агд С1и С1у С1п Суз Рго Уа1 Н1з Зег Н1з
865 870 875 880
Зег Зег ТЬг А1а ТЬг Ьеи С1п С1и Зег ТЬг Уа1 Н1з Уа1 Ьеи С1и Ьуз
885 890 895
С1у А1а Уа1 ТЬг Уа1 Н13 РЬе Зег ТЬг А1а Зег Рго С1п А1а Азп РЬе
900 905 910
11е Уа1 Зег Ьеи Суз С1у Ьуз Ьуз ТЬг ТЬг Суз Азп А1а С1и Суз Ьуз
915 920 925
Рго Рго А1а Азр Н13 11е Уа1 Зег ТЬг Рго Н1з Ьуз Азп Азр С1п С1и
930 935 940
РЬе С1п А1а А1а 11е Зег Ьуз ТЬг Зег Тгр Зег Тгр Ьеи РЬе А1а Ьеи
945 950 955 960
РЬе С1у С1у А1а Зег Зег Ьеи Ьеи 11е 11е С1у Ьеи Ме5 11е РЬе А1а
965 970 975
- 38 032403
Суз
Зег МеЕ МеЕ Ьеи ТИг
980
Зег ТИг Агд Агд
985 <210>3 <211>982 <212> белок <213> Вирус Синдбис <400>3
МеЕ 1 Зег А1а А1а Рго 5 Ьеи Уа1 ТИг А1а МеЕ 10 Суз Ьеи Ьеи С1у Азп 15 Уа1
Зег РИе Рго Суз Азр Агд Рго Рго ТИг Суз Туг ТИг Агд С1и Рго Зег
20 25 30
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 Азп Ηίδ С1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТИг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд Зег Уа1 11е Азр Азр РИе ТИг Ьеи ТИг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТИг
65 70 75 80
Суз Зег Туг Суз ΗΪ3 Η13 ТИг Уа1 Рго Суз РИе Зег Рго Уа1 Ьуз 11е
85 90 95
С1и С1п Уа1 Тгр Азр С1и А1а Азр Азр Азп ТИг 11е Агд 11е С1п ТИг
100 105 110
Зег А1а С1п РИе С1у Туг Азр С1п Зег С1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз
115 120 125
Туг Агд Туг МеЕ Зег Ьеи С1и С1п Азр Η15 ТИг Уа1 Ьуз С1и С1у ТИг
130 135 140
МеЕ Азр Азр 11е Ьуз 11е Зег ТИг Зег С1у Рго Суз Агд Агд Ьеи Зег
145 150 155 160
Туг Ьуз С1у Туг РИе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго С1у Азр Зег Уа1
165 170 175
ТИг Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТИг Зег Суз ТИг Ьеи А1а
180 185 190
- 39 032403
Агд Ьуз 11е 195 Ьуз Рго Ьуз РЬе Уа1 200 С1у Агд С1и Ьуз Туг 205 Азр Ьеи Рго
Рго Уа1 Η13 С1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТЬг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи С1и
210 215 220
С1у ТЬг ТЬг А1а С1у Туг 11е ТЬг МеЬ Η^з Агд Рго Агд Рго Η^з А1а
225 230 235 240
Туг ТЬг Зег Туг Ьеи С1и С1и Зег Зег С1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго
245 250 255
Рго Зег С1у Ьуз Азп 11е ТЬг Туг С1и Суз Ьуз Суз С1у Азр Туг Ьуз
260 265 270
ТЬг С1у ТЬг Уа1 Зег ТЬг Агд ТЬг С1и 11е ТЬг С1у Суз ТЬг А1а 11е
275 280 285
Ьуз С1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр С1п ТЬг Ьуз Тгр Уа1 РЬе Азп
290 295 300
Зег Рго Азр Ьеи 11е Агд Η^з Азр Азр Η^з ТЬг А1а С1п С1у Ьуз Ьеи
305 310 315 320
ΗΪ3 Ьеи Рго РЬе Ьуз Ьеи 11е Рго Зег ТЬг Суз МеЬ Уа1 Рго Уа1 А1а
325 330 335
Η13 А1а Рго Азп Уа1 11е Η^з С1у РЬе Ьуз Η^з 11е Зег Ьеи С1п Ьеи
340 345 350
Азр ТЬг Азр Η^з Ьеи ТЬг Ьеи Ьеи ТЬг ТЬг Агд Агд Ьеи С1у А1а Азп
355 360 365
Рго С1и Рго ТЬг ТЬг С1и Тгр 11е Уа1 С1у Ьуз ТЬг Уа1 Агд Азп РЬе
370 375 380
ТЬг Уа1 Азр Агд Азр С1у Ьеи С1и Туг 11е Тгр С1у Азп Η^з С1и Рго
385 390 395 400
Уа1 Агд Уа1 Туг А1а С1п С1и Зег А1а Рго С1у Азр Рго Η^з С1у Тгр
405 410 415
Рго Η13 С1и 11е Уа1 С1п Η^з Туг Туг Η^з Агд Η^з Рго Уа1 Туг ТЬг
420 425 430
- 40 032403
11е Ьеи А1а Уа1 435 А1а Зег А1а ТЬг 440 Уа1 А1а Мек Мек 11е 445 С1у Уа1 ТЬг
Уа1 А1а Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и Суз Ьеи ТЬг Рго
450 455 460
Туг А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТЬг Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи
465 470 475 480
Суз Суз Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а С1и ТЬг РЬе ТЬг С1и ТЬг Мек Зег
485 490 495
Туг Ьеи Тгр Зег Азп Зег С1п Рго РЬе РЬе Тгр Уа1 С1п Ьеи Суз 11е
500 505 510
Рго Ьеи А1а А1а РЬе 11е Уа1 Ьеи Мек Агд Суз Суз Зег Суз Суз Ьеи
515 520 525
Рго РЬе Ьеи Уа1 Уа1 А1а С1у А1а Туг Ьеи А1а Ьуз Уа1 Азр А1а Туг
530 535 540
С1и ΗΪ3 А1а ТЬг ТЬг Уа1 Рго Азп Уа1 Рго С1п 11е Рго Туг Ьуз А1а
545 550 555 560
Ьеи Уа1 С1и Агд А1а С1у Туг А1а Рго Ьеи Азп Ьеи С1и 11е ТЬг Уа1
565 570 575
Мек Зег Зег С1и Уа1 Ьеи Рго Зег ТЬг Азп С1п С1и Туг 11е ТЬг Суз
580 585 590
Ьуз РЬе ТЬг ТЬг Уа1 Уа1 Рго Зег Рго Ьуз 11е Ьуз Суз Суз С1у Зег
595 600 605
Ьеи С1и Суз С1п Рго А1а А1а Ηίδ А1а Азр Туг ТЬг Суз Ьуз Уа1 РЬе
610 615 620
С1у С1у Уа1 Туг Рго РЬе Мек Тгр С1у С1у А1а С1п Суз РЬе Суз Азр
625 630 635 640
Зег С1и Азп Зег С1п Мек Зег С1и А1а Туг Уа1 С1и Ьеи Зег А1а Азр
645 650 655
Суз А1а Зег Азр Η13 А1а С1п А1а 11е Ьуз Уа1 Ηίδ ТЬг А1а А1а Мек
660 665 670
- 41 032403
Ьуз Уа1 Б1у 675 Ьеи Агд 11е Уа1 Туг 680 Б1у Азп ТЬг ТЬг Зег 685 РЬе Ьеи Азр
Уа1 Туг Уа1 Азп Б1у Уа1 ТЬг Рго Б1у ТЬг Зег Ьуз Азр Ьеи Ьуз Уа1
690 695 700
11е А1а Б1у Рго 11е Зег А1а Зег РЬе ТЬг Рго РЬе Азр Η^з Ьуз Уа1
705 710 715 720
Уа1 11е Η^з Агд Б1у Ьеи Уа1 Туг Азп Туг Азр РЬе Рго Б1и Туг Б1у
725 730 735
А1а Меб Ьуз Рго Б1у А1а РЬе Б1у Азр 11е С1п А1а ТЬг Зег Ьеи ТЬг
740 745 750
Зег Ьуз Азр Ьеи 11е А1а Зег ТЬг Азр 11е Агд Ьеи Ьеи Ьуз Рго Зег
755 760 765
А1а Ьуз Азп Уа1 Η^з Уа1 Рго Туг ТЬг С1п А1а Зег Зег Б1у РЬе Б1и
770 775 780
Меб Тгр Ьуз Азп Азп Зег Б1у Агд Рго Ьеи С1п Б1и ТЬг А1а Рго РЬе
785 790 795 800
Б1у Суз Ьуз 11е А1а Уа1 Азп Рго Ьеи Агд А1а Уа1 Азр Суз Зег Туг
805 810 815
Б1у Азп 11е Рго 11е Зег 11е Азр 11е Рго Азп А1а А1а РЬе 11е Агд
820 825 830
ТЬг Зег Азр А1а Рго Ьеи Уа1 Зег ТЬг Уа1 Ьуз Суз Б1и Уа1 Зег Б1и
835 840 845
Суз ТЬг Туг Зег А1а Азр РЬе Б1у Б1у Меб А1а ТЬг Ьеи С1п Туг Уа1
850 855 860
Зег Азр Агд Б1и Б1у Б1п Суз Рго Уа1 Η^з Зег Η^3 Зег Зег ТЬг А1а
865 870 875 880
ТЬг Ьеи Б1п Б1и Зег ТЬг Уа1 Η^3 Уа1 Ьеи Б1и Ьуз Б1у А1а Уа1 ТЬг
885 890 895
Уа1 Η^з РЬе Зег ТЬг А1а Зег Рго С1п А1а Азп РЬе 11е Уа1 Зег Ьеи
900 905 910
- 42 032403
Суз С1у Ьуз 915 Ьуз ТЬг ТЬг Суз Азп 920 А1а С1и Суз Ьуз Рго 925 Рго А1а Азр
ΗΪ3 11е Уа1 Зег ТЬг Рго Η13 Ьуз Азп Азр С1п С1и РЬе С1п А1а А1а
930 935 940
11е Зег Ьуз ТЬг Зег Тгр Зег Тгр Ьеи РЬе А1а Ьеи РЬе С1у С1у А1а
945 950 955 960
Зег Зег Ьеи Ьеи 11е 11е С1у Ьеи Меб 11е РЬе А1а Суз Зег Меб Меб
965 970 975
Ьеи ТЬг Зег ТЬг Агд Агд
980
<210>4 <211>982 <212> белок <213> Вирус Синдбис <400>4
Меб 1 Зег А1а А1а Рго 5 Ьеи Уа1 ТЬг А1а Меб 10 Суз Ьеи Ьеи С1у Азп 15 Уа1
Зег РЬе Рго Суз Азр Агд Рго Рго ТЬг Суз Туг ТЬг Агд С1и Рго Зег
20 25 30
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 Азп Н1з С1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТЬг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд Зег Уа1 11е Азр Азр РЬе ТЬг Ьеи ТЬг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТЬг
65 70 75 80
Суз Зег Туг Суз Н1з Н1з ТЬг Уа1 Рго Суз РЬе Зег Рго Уа1 Ьуз 11е
85 90 95
С1и С1п Уа1 Тгр Азр С1и А1а Азр Азр Азп ТЬг 11е Агд 11е С1п ТЬг
100 105 110
Зег А1а С1п РЬе С1у Туг Азр С1п Зег С1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз
115 120 125
Туг Агд Туг Меб Зег Ьеи С1и С1п Азр Н1з ТЬг Уа1 С1и С1и С1у ТЬг
- 43 032403
130
135
140
Мек 145 Азр Азр 11е Ьуз 11е 150 Зег ТНг Зег С1у Рго 155 Суз Агд Агд Ьеи Зег 160
Туг Ьуз С1у Туг РНе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго С1у Азр Зег Уа1
165 170 175
ТНг Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТНг Зег Суз ТНг Ьеи А1а
180 185 190
Агд Ьуз 11е Ьуз Рго Ьуз РНе Уа1 С1у Агд С1и Ьуз Туг Азр Ьеи Рго
195 200 205
Рго Уа1 Н13 С1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТНг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи С1и
210 215 220
С1у ТНг ТНг А1а С1у Туг 11е ТНг Мек Н13 Агд Рго Агд Рго Н13 А1а
225 230 235 240
Туг ТНг Зег Туг Ьеи С1и С1и Зег Зег С1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго
245 250 255
Рго Зег С1у Ьуз Азп 11е ТНг Туг С1и Суз Ьуз Суз С1у Азр Туг Ьуз
260 265 270
ТНг С1у ТНг Уа1 Зег ТНг Агд ТНг С1и 11е ТНг С1у Суз ТНг А1а 11е
275 280 285
Ьуз С1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр С1п ТНг Ьуз Тгр Уа1 РНе Азп
290 295 300
Зег Рго Азр Ьеи 11е Агд Н13 Азр Азр Н13 ТНг А1а С1п С1у Ьуз Ьеи
305 310 315 320
Н1з Ьеи Рго РНе Ьуз Ьеи 11е Рго Зег ТНг Суз Мек Уа1 Рго Уа1 А1а
325 330 335
Н13 А1а Рго Азп Уа1 11е Н13 С1у РНе Ьуз Н13 11е Зег Ьеи С1п Ьеи
340 345 350
Азр ТНг Азр Н13 Ьеи ТНг Ьеи Ьеи ТНг ТНг Агд Агд Ьеи С1у А1а Азп
355 360 365
Рго С1и Рго ТНг ТНг С1и Тгр 11е Уа1 С1у Ьуз ТНг Уа1 Агд Азп РНе
- 44 032403
370
375
380
тнг ναι 385 Азр Агд Азр С1у 390 Ьеи С1и Туг 11е Тгр С1у 395 Азп Ηίδ С1и Рго 400
νβΐ Агд νβ1 Туг А1а С1п С1и Зег А1а Рго С1у Азр Рго Ηίδ С1у Тгр
405 410 415
Рго ΗΪ3 С1и 11е Уа1 С1п Η13 Туг Туг Ηίδ Агд Ηίδ Рго Уа1 Туг ТЙГ
420 425 430
11е Ьеи А1а Уа1 А1а Зег А1а ТЙГ Уа1 А1а Мек Мек 11е С1у Уа1 ТЙГ
435 440 445
Уа1 А1а Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и Суз Ьеи ТЙГ Рго
450 455 460
Туг А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТЙГ Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи
465 470 475 480
Суз Суз Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а С1и ТЙГ Рке ТЙГ С1и ТЙГ Мек Зег
485 490 495
Туг Ьеи Тгр Зег Азп Зег С1п Рго Рке Рке Тгр Уа1 С1п Ьеи Суз 11е
500 505 510
Рго Ьеи А1а А1а Рке 11е Уа1 Ьеи Мек Агд Суз Суз Зег Суз Суз Ьеи
515 520 525
Рго Рке Ьеи Уа1 Уа1 А1а С1у А1а Туг Ьеи А1а Ьуз Уа1 Азр А1а Туг
530 535 540
С1и Η13 А1а ТЙГ ТЙГ Уа1 Рго Азп Уа1 Рго С1п 11е Рго Туг Ьуз А1а
545 550 555 560
Ьеи Уа1 С1и Агд А1а С1у Туг А1а Рго Ьеи Азп Ьеи С1и 11е ТЙГ Уа1
565 570 575
Мек Зег Зег С1и Уа1 Ьеи Рго Зег ТЙГ Азп С1п С1и Туг 11е ТЙГ Суз
580 585 590
Ьуз Рке ТЙГ ТЙГ Уа1 Уа1 Рго Зег Рго Ьуз 11е Ьуз Суз Суз С1у Зег
595 600 605
Ьеи С1и Суз С1п Рго А1а А1а Ηίδ А1а Азр Туг ТЙГ Суз Ьуз Уа1 Рке
- 45 032403
610
615
620
С1у 625 С1у Уа1 Туг Рго РИе 630 МеЕ Тгр С1у С1у А1а 635 С1п Суз РИе Суз Азр 640
Зег С1и Азп Зег С1п МеЕ Зег С1и А1а Туг Уа1 С1и Ьеи Зег А1а Азр
645 650 655
Суз А1а Зег Азр Н1з А1а С1п А1а 11е Ьуз Уа1 Н1з ТИг А1а А1а МеЕ
660 665 670
Ьуз Уа1 С1у Ьеи Агд 11е Уа1 Туг С1у Азп ТИг ТИг Зег РИе Ьеи Азр
675 680 685
Уа1 Туг Уа1 Азп С1у Уа1 ТИг Рго С1у ТИг Зег Ьуз Азр Ьеи Ьуз Уа1
690 695 700
11е А1а С1у Рго 11е Зег А1а Зег РИе ТИг Рго РИе Азр Н1з Ьуз Уа1
705 710 715 720
Уа1 11е Н1з Агд С1у Ьеи Уа1 Туг Азп Туг Азр РИе Рго С1и Туг С1у
725 730 735
А1а МеЕ Ьуз Рго С1у А1а РИе С1у Азр 11е С1п А1а ТИг Зег Ьеи ТИг
740 745 750
Зег Ьуз Азр Ьеи 11е А1а Зег ТИг Азр 11е Агд Ьеи Ьеи Ьуз Рго Зег
755 760 765
А1а Ьуз Азп Уа1 Н1з Уа1 Рго Туг ТИг С1п А1а Зег Зег С1у РИе С1и
770 775 780
МеЕ Тгр Ьуз Азп Азп Зег С1у Агд Рго Ьеи С1п С1и ТИг А1а Рго РИе
785 790 795 800
С1у Суз Ьуз 11е А1а Уа1 Азп Рго Ьеи Агд А1а Уа1 Азр Суз Зег Туг
805 810 815
С1у Азп 11е Рго 11е Зег 11е Азр 11е Рго Азп А1а А1а РИе 11е Агд
820 825 830
ТИг Зег Азр А1а Рго Ьеи Уа1 Зег ТИг Уа1 Ьуз Суз С1и Уа1 Зег С1и
835 840 845
Суз ТИг Туг Зег А1а Азр РИе С1у С1у МеЕ А1а ТИг Ьеи С1п Туг Уа1
- 46 032403
850
855
860
Зег 865 Азр Агд С1и С1у С1п Суз 870 Рго Уа1 Η^з Зег 875 Η^з Зег Зег ТЬг А1а 880
ТЬг Ьеи С1п С1и Зег ТЬг Уа1 Η^3 Уа1 Ьеи С1и Ьуз С1у А1а Уа1 ТЬг
885 890 895
Уа1 Η^з РЬе Зег ТЬг А1а Зег Рго С1п А1а Азп РЬе 11е Уа1 Зег Ьеи
900 905 910
Суз С1у Ьуз Ьуз ТЬг ТЬг Суз Азп А1а С1и Суз Ьуз Рго Рго А1а Азр
915 920 925
Η^з 11е Уа1 Зег ТЬг Рго Η^з Ьуз Азп Азр С1п С1и РЬе С1п А1а А1а
930 935 940
11е Зег Ьуз ТЬг Зег Тгр Зег Тгр Ьеи РЬе А1а Ьеи РЬе С1у С1у А1а
945 950 955 960
Зег Зег Ьеи Ьеи 11е 11е С1у Ьеи Меб 11е РЬе А1а Суз Зег Меб Меб
965 970 975
Ьеи ТЬг Зег ТЬг Агд Агд
980
<210>5 <211>980 <212> белок <213> Вирус Синдбис <400>5
Меб 1 Зег А1а А1а Рго 5 Ьеи Уа1 ТЬг А1а Меб 10 Суз Ьеи Ьеи С1у Азп 15 Уа1
Зег РЬе Рго Суз Азр Агд Рго Рго ТЬг Суз Туг ТЬг Агд С1и Рго Зег
20 25 30
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 Азп Η^з С1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТЬг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд Зег Уа1 11е Азр Азр РЬе ТЬг Ьеи ТЬг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТЬг
65 70 75 80
- 47 032403
Суз Зег Туг Суз Н1з 85 Н13 ТЬг Уа1 Рго Суз 90 РЬе Зег Рго Уа1 Ьуз 95 11е
Б1и Б1п Уа1 Тгр Азр Б1и А1а Азр Азр Азп ТЬг 11е Агд 11е Б1п ТЬг
100 105 110
Зег А1а Б1п РЬе Б1у Туг Азр Б1п Зег Б1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз
115 120 125
Туг Агд Туг Меб Зег Ьеи Б1и Б1п Азр Н1з ТЬг Уа1 Ьуз Б1и Б1у ТЬг
130 135 140
Меб Азр Азр 11е Ьуз 11е Зег ТЬг Зег Б1у Рго Суз Агд Агд Ьеи Зег
145 150 155 160
Туг Ьуз Б1у Туг РЬе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго Б1у Азр Зег Уа1
165 170 175
ТЬг Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТЬг Зег Суз ТЬг Ьеи А1а
180 185 190
Агд Ьуз 11е Ьуз Рго Ьуз РЬе Уа1 Б1у Агд Б1и Ьуз Туг Азр Ьеи Рго
195 200 205
Рго Уа1 Н1з Б1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТЬг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи ТЬг
210 215 220
ТЬг А1а Б1у Туг 11е ТЬг Меб Н1з Агд Рго Агд Рго Н13 А1а Туг ТЬг
225 230 235 240
Зег Туг Ьеи Б1и Б1и Зег Зег Б1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго Рго Зег
245 250 255
Б1у Ьуз Азп 11е ТЬг Туг Б1и Суз Ьуз Суз Б1у Азр Туг Ьуз ТЬг Б1у
260 265 270
ТЬг Уа1 Зег ТЬг Агд ТЬг Б1и 11е ТЬг Б1у Суз ТЬг А1а 11е Ьуз Б1п
275 280 285
Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр Б1п ТЬг Ьуз Тгр Уа1 РЬе Азп Зег Рго
290 295 300
Азр Ьеи 11е Агд Н1з Азр Азр Н1з ТЬг А1а Б1п Б1у Ьуз Ьеи Н1з Ьеи
305 310 315 320
- 48 032403
Рго РЬе Ьуз Ьеи 11е 325 Рго Зег ТЬг Суз МеЬ 330 Уа1 Рго Уа1 А1а Η^з 335 А1а
Рго Азп Уа1 11е Η^з С1у РЬе Ьуз Η^з 11е Зег Ьеи С1п Ьеи Азр ТЬг
340 345 350
Азр Η^з Ьеи ТЬг Ьеи Ьеи ТЬг ТЬг Агд Агд Ьеи С1у А1а Азп Рго С1и
355 360 365
Рго ТЬг ТЬг С1и Тгр 11е Уа1 С1у Ьуз ТЬг Уа1 Агд Азп РЬе ТЬг Уа1
370 375 380
Азр Агд Азр С1у Ьеи С1и Туг 11е Тгр С1у Азп Η^з С1и Рго Уа1 Агд
385 390 395 400
Уа1 Туг А1а С1п С1и Зег А1а Рго С1у Азр Рго Η^3 С1у Тгр Рго Η^з
405 410 415
С1и 11е Уа1 С1п Η^з Туг Туг Η^з Агд Η^з Рго Уа1 Туг ТЬг 11е Ьеи
420 425 430
А1а Уа1 А1а Зег А1а ТЬг Уа1 А1а МеЬ МеЬ 11е С1у Уа1 ТЬг Уа1 А1а
435 440 445
Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и Суз Ьеи ТЬг Рго Туг А1а
450 455 460
Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТЬг Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи Суз Суз
465 470 475 480
Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а С1и ТЬг РЬе ТЬг С1и ТЬг МеЬ Зег Туг Ьеи
485 490 495
Тгр Зег Азп Зег С1п Рго РЬе РЬе Тгр Уа1 С1п Ьеи Суз 11е Рго Ьеи
500 505 510
А1а А1а РЬе 11е Уа1 Ьеи МеЬ Агд Суз Суз Зег Суз Суз Ьеи Рго РЬе
515 520 525
Ьеи Уа1 Уа1 А1а С1у А1а Туг Ьеи А1а Ьуз Уа1 Азр А1а Туг С1и Η^з
530 535 540
А1а ТЬг ТЬг Уа1 Рго Азп Уа1 Рго С1п 11е Рго Туг Ьуз А1а Ьеи Уа1
545 550 555 560
- 49 032403
С1и Агд А1а С1у Туг 565 А1а Рго Ьеи Азп Ьеи 570 С1и 11е ТИг Уа1 МеЕ 575 Зег
Зег С1и Уа1 Ьеи Рго Зег ТИг Азп С1п С1и Туг 11е ТИг Суз Ьуз РИе
580 585 590
ТИг ТИг Уа1 Уа1 Рго Зег Рго Ьуз 11е Ьуз Суз Суз С1у Зег Ьеи С1и
595 600 605
Суз С1п Рго А1а А1а Η^з А1а Азр Туг ТИг Суз Ьуз Уа1 РИе С1у С1у
610 615 620
Уа1 Туг Рго РИе МеЕ Тгр С1у С1у А1а С1п Суз РИе Суз Азр Зег С1и
625 630 635 640
Азп Зег С1п МеЕ Зег С1и А1а Туг Уа1 С1и Ьеи Зег А1а Азр Суз А1а
645 650 655
Зег Азр Η^з А1а С1п А1а 11е Ьуз Уа1 Η^з ТИг А1а А1а МеЕ Ьуз Уа1
660 665 670
С1у Ьеи Агд 11е Уа1 Туг С1у Азп ТИг ТИг Зег РИе Ьеи Азр Уа1 Туг
675 680 685
Уа1 Азп С1у Уа1 ТИг Рго С1у ТИг Зег Ьуз Азр Ьеи Ьуз Уа1 11е А1а
690 695 700
С1у Рго 11е Зег А1а Зег РИе ТИг Рго РИе Азр Η^з Ьуз Уа1 Уа1 11е
705 710 715 720
Η^з Агд С1у Ьеи Уа1 Туг Азп Туг Азр РИе Рго С1и Туг С1у А1а МеЕ
725 730 735
Ьуз Рго С1у А1а РИе С1у Азр 11е С1п А1а ТИг Зег Ьеи ТИг Зег Ьуз
740 745 750
Азр Ьеи 11е А1а Зег ТИг Азр 11е Агд Ьеи Ьеи Ьуз Рго Зег А1а Ьуз
755 760 765
Азп Уа1 Η^з Уа1 Рго Туг ТИг С1п А1а Зег Зег С1у РИе С1и МеЕ Тгр
770 775 780
Ьуз Азп Азп Зег С1у Агд Рго Ьеи С1п С1и ТИг А1а Рго РИе С1у Суз
785 790 795 800
- 50 032403
Ьуз 11е А1а Уа1 Азп 805 Рго Ьеи Агд А1а Уа1 810 Азр Суз Зег Туг С1у 815 Азп
11е Рго 11е Зег 11е Азр 11е Рго Азп А1а А1а РЬе 11е Агд ТЬг Зег
820 825 830
Азр А1а Рго Ьеи Уа1 Зег ТЬг Уа1 Ьуз Суз С1и Уа1 Зег С1и Суз ТЬг
835 840 845
Туг Зег А1а Азр РЬе С1у С1у Мек А1а ТЬг Ьеи С1п Туг Уа1 Зег Азр
850 855 860
Агд С1и С1у С1п Суз Рго Уа1 Η^з Зег Η^з Зег Зег ТЬг А1а ТЬг Ьеи
865 870 875 880
С1п С1и Зег ТЬг Уа1 Η^3 Уа1 Ьеи С1и Ьуз С1у А1а Уа1 ТЬг Уа1 Η^з
885 890 895
РЬе Зег ТЬг А1а Зег Рго С1п А1а Азп РЬе 11е Уа1 Зег Ьеи Суз С1у
900 905 910
Ьуз Ьуз ТЬг ТЬг Суз Азп А1а С1и Суз Ьуз Рго Рго А1а Азр Η^з 11е
915 920 925
Уа1 Зег ТЬг Рго Η^з Ьуз Азп Азр С1п С1и РЬе С1п А1а А1а 11е Зег
930 935 940
Ьуз ТЬг Зег Тгр Зег Тгр Ьеи РЬе А1а Ьеи РЬе С1у С1у А1а Зег Зег
945 950 955 960
Ьеи Ьеи 11е 11е С1у Ьеи Мек 11е РЬе А1а Суз Зег Мек Мек Ьеи ТЬг
965 970 975
Зег ТЬг Агд Агд
980
<210> 6
<211> 981
<212> белок
<213> Вирус Синдбис
<400> 6
Мек Зег А1а А1а Рго Ьеи Уа1 ТЬг А1а Мек Суз Ьеи Ьеи С1у Азп Уа1
1 5 10 15
- 51 032403
Зег РЬе Рго Суз 20 Азр Агд Рго Рго ТЬг 25 Суз Туг ТЬг Агд С1и 30 Рго Зег
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 Азп Н1з С1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТЬг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд Зег Уа1 11е Азр Азр РЬе ТЬг Ьеи ТЬг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТЬг
65 70 75 80
Суз Зег Туг Суз Н1з Н1з ТЬг Уа1 Рго Суз РЬе Зег Рго Уа1 Ьуз 11е
85 90 95
С1и С1п Уа1 Тгр Азр С1и А1а Азр Азр Азп ТЬг 11е Агд 11е С1п ТЬг
100 105 110
Зег А1а С1п РЬе С1у Туг Азр С1п Зег С1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз
115 120 125
Туг Агд Туг Ме5 Зег Ьеи С1и С1п Азр Н1з ТЬг Уа1 С1и С1и С1у ТЬг
130 135 140
Ме5 Азр Азр 11е Ьуз 11е Зег ТЬг Зег С1у Рго Суз Агд Агд Ьеи Зег
145 150 155 160
Туг Ьуз С1у Туг РЬе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго С1у Азр Зег Уа1
165 170 175
ТЬг Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТЬг Зег Суз ТЬг Ьеи А1а
180 185 190
Агд Ьуз 11е Ьуз Рго Ьуз РЬе Уа1 С1у Агд С1и Ьуз Туг Азр Ьеи Рго
195 200 205
Рго Уа1 Н1з С1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТЬг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи С1и
210 215 220
ТЬг ТЬг А1а С1у Туг 11е ТЬг Ме5 Н1з Агд Рго Агд Рго Н1з А1а Туг
225 230 235 240
ТЬг Зег Туг Ьеи С1и С1и Зег Зег С1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго Рго
245 250 255
- 52 032403
Зег Б1у Ьуз Азп 260 11е ТЬг Туг Б1и Суз 265 Ьуз Суз Б1у Азр Туг 270 Ьуз ТЬг
Б1у ТЬг Уа1 Зег ТЬг Агд ТЬг Б1и 11е ТЬг Б1у Суз ТЬг А1а 11е Ьуз
275 280 285
С1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр С1п ТЬг Ьуз Тгр Уа1 РЬе Азп Зег
290 295 300
Рго Азр Ьеи 11е Агд Η^з Азр Азр Η^з ТЬг А1а С1п Б1у Ьуз Ьеи Η^з
305 310 315 320
Ьеи Рго РЬе Ьуз Ьеи 11е Рго Зег ТЬг Суз Меб Уа1 Рго Уа1 А1а Η^з
325 330 335
А1а Рго Азп Уа1 11е Η^з Б1у РЬе Ьуз Η^з 11е Зег Ьеи С1п Ьеи Азр
340 345 350
ТЬг Азр Η^з Ьеи ТЬг Ьеи Ьеи ТЬг ТЬг Агд Агд Ьеи Б1у А1а Азп Рго
355 360 365
Б1и Рго ТЬг ТЬг Б1и Тгр 11е Уа1 Б1у Ьуз ТЬг Уа1 Агд Азп РЬе ТЬг
370 375 380
Уа1 Азр Агд Азр Б1у Ьеи Б1и Туг 11е Тгр Б1у Азп Η^з Б1и Рго Уа1
385 390 395 400
Агд Уа1 Туг А1а С1п Б1и Зег А1а Рго Б1у Азр Рго Η^з Б1у Тгр Рго
405 410 415
Η^з Б1и 11е Уа1 С1п Η^з Туг Туг Η^з Агд Η^з Рго Уа1 Туг ТЬг 11е
420 425 430
Ьеи А1а Уа1 А1а Зег А1а ТЬг Уа1 А1а Меб Меб 11е Б1у Уа1 ТЬг Уа1
435 440 445
А1а Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд Б1и Суз Ьеи ТЬг Рго Туг
450 455 460
А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТЬг Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи Суз
465 470 475 480
Суз Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а Б1и ТЬг РЬе ТЬг Б1и ТЬг Меб Зег Туг
485 490 495
- 53 032403
Ьеи Тгр Зег Азп 500 Зег С1п Рго РЬе РЬе Тгр 505 Уа1 С1п Ьеи Суз 510 11е Рго
Ьеи А1а А1а РЬе 11е Уа1 Ьеи Меб Агд Суз Суз Зег Суз Суз Ьеи Рго
515 520 525
РЬе Ьеи Уа1 Уа1 А1а С1у А1а Туг Ьеи А1а Ьуз Уа1 Азр А1а Туг С1и
530 535 540
Η^з А1а ТЬг ТЬг Уа1 Рго Азп Уа1 Рго С1п 11е Рго Туг Ьуз А1а Ьеи
545 550 555 560
Уа1 С1и Агд А1а С1у Туг А1а Рго Ьеи Азп Ьеи С1и 11е ТЬг Уа1 Меб
565 570 575
Зег Зег С1и Уа1 Ьеи Рго Зег ТЬг Азп С1п С1и Туг 11е ТЬг Суз Ьуз
580 585 590
РЬе ТЬг ТЬг Уа1 Уа1 Рго Зег Рго Ьуз 11е Ьуз Суз Суз С1у Зег Ьеи
595 600 605
С1и Суз С1п Рго А1а А1а Η^з А1а Азр Туг ТЬг Суз Ьуз Уа1 РЬе С1у
610 615 620
С1у Уа1 Туг Рго РЬе Меб Тгр С1у С1у А1а С1п Суз РЬе Суз Азр Зег
625 630 635 640
С1и Азп Зег С1п Меб Зег С1и А1а Туг Уа1 С1и Ьеи Зег А1а Азр Суз
645 650 655
А1а Зег Азр Η^з А1а С1п А1а 11е Ьуз Уа1 Η^з ТЬг А1а А1а Меб Ьуз
660 665 670
Уа1 С1у Ьеи Агд 11е Уа1 Туг С1у Азп ТЬг ТЬг Зег РЬе Ьеи Азр Уа1
675 680 685
Туг Уа1 Азп С1у Уа1 ТЬг Рго С1у ТЬг Зег Ьуз Азр Ьеи Ьуз Уа1 11е
690 695 700
А1а С1у Рго 11е Зег А1а Зег РЬе ТЬг Рго РЬе Азр Η^з Ьуз Уа1 Уа1
705 710 715 720
11е Η^з Агд С1у Ьеи Уа1 Туг Азп Туг Азр РЬе Рго С1и Туг С1у А1а
725 730 735
- 54 032403
Меб Ьуз Рго С1у А1а 740 РЬе С1у Азр 11е С1п 745 А1а ТЬг Зег Ьеи 750 ТЬг Зег
Ьуз Азр Ьеи 11е А1а Зег ТЬг Азр 11е Агд Ьеи Ьеи Ьуз Рго Зег А1а
755 760 765
Ьуз Азп Уа1 Н1з Уа1 Рго Туг ТЬг С1п А1а Зег Зег С1у РЬе С1и Меб
770 775 780
Тгр Ьуз Азп Азп Зег С1у Агд Рго Ьеи С1п С1и ТЬг А1а Рго РЬе С1у
785 790 795 800
Суз Ьуз 11е А1а Уа1 Азп Рго Ьеи Агд А1а Уа1 Азр Суз Зег Туг С1у
805 810 815
Азп 11е Рго 11е Зег 11е Азр 11е Рго Азп А1а А1а РЬе 11е Агд ТЬг
820 825 830
Зег Азр А1а Рго Ьеи Уа1 Зег ТЬг Уа1 Ьуз Суз С1и Уа1 Зег С1и Суз
835 840 845
ТЬг Туг Зег А1а Азр РЬе С1у С1у Меб А1а ТЬг Ьеи С1п Туг Уа1 Зег
850 855 860
Азр Агд С1и С1у С1п Суз Рго Уа1 Н1з Зег Н1з Зег Зег ТЬг А1а ТЬг
865 870 875 880
Ьеи С1п С1и Зег ТЬг Уа1 Н1з Уа1 Ьеи С1и Ьуз С1у А1а Уа1 ТЬг Уа1
885 890 895
Н1з РЬе Зег ТЬг А1а Зег Рго С1п А1а Азп РЬе 11е Уа1 Зег Ьеи Суз
900 905 910
С1у Ьуз Ьуз ТЬг ТЬг Суз Азп А1а С1и Суз Ьуз Рго Рго А1а Азр Н1з
915 920 925
11е Уа1 Зег ТЬг Рго Н1з Ьуз Азп Азр С1п С1и РЬе С1п А1а А1а 11е
930 935 940
Зег Ьуз ТЬг Зег Тгр Зег Тгр Ьеи РЬе А1а Ьеи РЬе С1у С1у А1а Зег
945 950 955 960
Зег Ьеи Ьеи 11е 11е С1у Ьеи Меб 11е РЬе А1а Суз Зег Меб Меб Ьеи
965 970 975
- 55 032403
ТНг Зег ТНг Агд Агд
980 <210>7 <211>982 <212> белок <213> Вирус Синдбис <400>7
Мек 1 Зег А1а А1а Рго 5 Ьеи Уа1 ТНг А1а Мек 10 Суз Ьеи Ьеи С1у Азп 15 Уа1
Зег РНе Рго Суз Азр Агд Рго Рго ТНг Суз Туг ТНг Агд С1и Рго Зег
20 25 30
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 Азп Н1з С1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТНг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд Зег Уа1 11е Азр Азр РНе ТНг Ьеи ТНг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТНг
65 70 75 80
Суз Зег Туг Суз Н1з Н1з ТНг Уа1 Рго Суз РНе Зег Рго Уа1 Ьуз 11е
85 90 95
С1и С1п Уа1 Тгр Азр С1и А1а Азр Азр Азп ТНг 11е Агд 11е С1п ТНг
100 105 110
Зег А1а С1п РНе С1у Туг Азр С1п Зег С1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз
115 120 125
Туг Агд Туг Мек Зег Ьеи Ьуз С1п Азр Н1з ТНг Уа1 Ьуз С1и С1у ТНг
130 135 140
Мек Азр Азр 11е Ьуз 11е Зег ТНг Зег С1у Рго Суз Агд Агд Ьеи Зег
145 150 155 160
Туг Ьуз С1у Туг РНе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго С1у Азр Зег Уа1
165 170 175
ТНг Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТНг Зег Суз ТНг Ьеи А1а
180 185 190
- 56 032403
Агд Ьуз 11е 195 Ьуз Рго Ьуз РЬе Уа1 200 С1у Агд С1и Ьуз Туг 205 Азр Ьеи Рго
Рго Уа1 Η15 С1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТЙГ Уа1 Туг Азр Агд Ьеи С1и
210 215 220
С1у Тйг Тйг А1а С1у Туг 11е ТЙГ Мек Η15 Агд Рго Агд Рго Η15 А1а
225 230 235 240
Туг Тйг Зег Туг Ьеи С1и С1и Зег Зег С1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго
245 250 255
Рго Зег С1у Ьуз Азп 11е ТЙГ Туг С1и Суз Ьуз Суз С1у Азр Туг Ьуз
260 265 270
Тйг С1у Тйг Уа1 Зег ТЙГ Агд ТЙГ С1и 11е ТЙГ С1у Суз ТЙГ А1а 11е
275 280 285
Ьуз С1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр С1п ТЙГ Ьуз Тгр Уа1 Рке Азп
290 295 300
Зег Рго Азр Ьеи 11е Агд Η15 Азр Азр Η15 ТЙГ А1а С1п С1у Ьуз Ьеи
305 310 315 320
Η15 Ьеи Рго Рке Ьуз Ьеи 11е Рго Зег ТЙГ Суз Мек Уа1 Рго Уа1 А1а
325 330 335
Η15 А1а Рго Азп Уа1 11е Η15 С1у Рке Ьуз Η15 11е Зег Ьеи С1п Ьеи
340 345 350
Азр Тйг Азр Η15 Ьеи ТЙГ Ьеи Ьеи ТЙГ ТЙГ Агд Агд Ьеи С1у А1а Азп
355 360 365
Рго С1и Рго ТЙГ ТЙГ С1и Тгр 11е Уа1 С1у Ьуз ТЙГ Уа1 Агд Азп Рке
370 375 380
Тйг Уа1 Азр Агд Азр С1у Ьеи С1и Туг 11е Тгр С1у Азп Η15 С1и Рго
385 390 395 400
Уа1 Агд Уа1 Туг А1а С1п С1и Зег А1а Рго С1у Азр Рго Η15 С1у Тгр
405 410 415
Рго Η15 С1и 11е Уа1 С1п Η15 Туг Туг Η15 Агд Η15 Рго Уа1 Туг ТЙГ
420 425 430
- 57 032403
11е Ьеи А1а Уа1 435 А1а Зег А1а ТИг 440 Уа1 А1а МеЕ МеЕ 11е 445 С1у Уа1 ТИг
Уа1 А1а Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и Суз Ьеи ТИг Рго
450 455 460
Туг А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТИг Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи
465 470 475 480
Суз Суз Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а С1и ТИг РИе ТИг С1и ТИг МеЕ Зег
485 490 495
Туг Ьеи Тгр Зег Азп Зег С1п Рго РИе РИе Тгр Уа1 С1п Ьеи Суз 11е
500 505 510
Рго Ьеи А1а А1а РИе 11е Уа1 Ьеи МеЕ Агд Суз Суз Зег Суз Суз Ьеи
515 520 525
Рго РИе Ьеи Уа1 Уа1 А1а С1у А1а Туг Ьеи А1а Ьуз Уа1 Азр А1а Туг
530 535 540
С1и Н1з А1а ТИг ТИг Уа1 Рго Азп Уа1 Рго С1п 11е Рго Туг Ьуз А1а
545 550 555 560
Ьеи Уа1 С1и Агд А1а С1у Туг А1а Рго Ьеи Азп Ьеи С1и 11е ТИг Уа1
565 570 575
МеЕ Зег Зег С1и Уа1 Ьеи Рго Зег ТИг Азп С1п С1и Туг 11е ТИг Суз
580 585 590
Ьуз РИе ТИг ТИг Уа1 Уа1 Рго Зег Рго Ьуз 11е Ьуз Суз Суз С1у Зег
595 600 605
Ьеи С1и Суз С1п Рго А1а А1а Н1з А1а Азр Туг ТИг Суз Ьуз Уа1 РИе
610 615 620
С1у С1у Уа1 Туг Рго РИе МеЕ Тгр С1у С1у А1а С1п Суз РИе Суз Азр
625 630 635 640
Зег С1и Азп Зег С1п МеЕ Зег С1и А1а Туг Уа1 С1и Ьеи Зег А1а Азр
645 650 655
Суз А1а Зег Азр Н1з А1а С1п А1а 11е Ьуз Уа1 Н1з ТИг А1а А1а МеЕ
660 665 670
- 58 032403
Ьуз Уа1 Б1у 675 Ьеи Агд 11е Уа1 Туг 680 С1у Азп ТЬг ТЬг Зег 685 РЬе Ьеи Азр
Уа1 Туг Уа1 Азп Б1у Уа1 ТЬг Рго Б1у ТЬг Зег Ьуз Азр Ьеи Ьуз Уа1
690 695 700
11е А1а Б1у Рго 11е Зег А1а Зег РЬе ТЬг Рго РЬе Азр Н1з Ьуз Уа1
705 710 715 720
Уа1 11е Н1з Агд Б1у Ьеи Уа1 Туг Азп Туг Азр РЬе Рго Б1и Туг Б1у
725 730 735
А1а Меб Ьуз Рго Б1у А1а РЬе Б1у Азр 11е Б1п А1а ТЬг Зег Ьеи ТЬг
740 745 750
Зег Ьуз Азр Ьеи 11е А1а Зег ТЬг Азр 11е Агд Ьеи Ьеи Ьуз Рго Зег
755 760 765
А1а Ьуз Азп Уа1 Н1з Уа1 Рго Туг ТЬг Б1п А1а Зег Зег Б1у РЬе Б1и
770 775 780
Меб Тгр Ьуз Азп Азп Зег Б1у Агд Рго Ьеи Б1п Б1и ТЬг А1а Рго РЬе
785 790 795 800
Б1у Суз Ьуз 11е А1а Уа1 Азп Рго Ьеи Агд А1а Уа1 Азр Суз Зег Туг
805 810 815
Б1у Азп 11е Рго 11е Зег 11е Азр 11е Рго Азп А1а А1а РЬе 11е Агд
820 825 830
ТЬг Зег Азр А1а Рго Ьеи Уа1 Зег ТЬг Уа1 Ьуз Суз Б1и Уа1 Зег Б1и
835 840 845
Суз ТЬг Туг Зег А1а Азр РЬе Б1у Б1у Меб А1а ТЬг Ьеи Б1п Туг Уа1
850 855 860
Зег Азр Агд Б1и Б1у Б1п Суз Рго Уа1 Н1з Зег Н1з Зег Зег ТЬг А1а
865 870 875 880
ТЬг Ьеи Б1п Б1и Зег ТЬг Уа1 Н1з Уа1 Ьеи Б1и Ьуз Б1у А1а Уа1 ТЬг
885 890 895
Уа1 Н1з РЬе Зег ТЬг А1а Зег Рго Б1п А1а Азп РЬе 11е Уа1 Зег Ьеи
900 905 910
- 59 032403
Суз С1у Ьуз 915 Ьуз ТЬг ТЬг Суз Азп 920 А1а С1и Суз Ьуз Рго 925 Рго А1а Азр
Η^3 11е Уа1 Зег ТЬг Рго Η^з Ьуз Азп Азр С1п С1и РЬе С1п А1а А1а
930 935 940
11е Зег Ьуз ТЬг Зег Тгр Зег Тгр Ьеи РЬе А1а Ьеи РЬе С1у С1у А1а
945 950 955 960
Зег Зег Ьеи Ьеи 11е 11е С1у Ьеи Мек 11е РЬе А1а Суз Зег Мек Мек
965 970 975
Ьеи ТЬг Зег ТЬг Агд Агд
980
<210> 8 <211> 981 <212> белок <213> Вирус Синдбис <400> 8
Мек 1 Зег А1а А1а Рго 5 Ьеи Уа1 ТЬг А1а Мек 10 Суз Ьеи Ьеи С1у Азп 15 Уа1
Зег РЬе Рго Суз Азр Агд Рго Рго ТЬг Суз Туг ТЬг Агд С1и Рго Зег
20 25 30
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 Азп Η^з С1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТЬг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд Зег Уа1 11е Азр Азр РЬе ТЬг Ьеи ТЬг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТЬг
65 70 75 80
Суз Зег Туг Суз Η^з Η^з ТЬг Уа1 Рго Суз РЬе Зег Рго Уа1 Ьуз 11е
85 90 95
С1и С1п Уа1 Тгр Азр С1и А1а Азр Азр Азп ТЬг 11е Агд 11е С1п ТЬг
100 105 110
Зег А1а С1п РЬе С1у Туг Азр С1п Зег С1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз
115 120 125
Туг Агд Туг Мек Зег Ьеи Ьуз С1п Азр Η^з ТЬг Уа1 Ьуз С1и С1у ТЬг
- 60 032403
130
135
140
МеБ 145 Азр Азр 11е Ьуз 11е 150 Зег ТЬг Зег С1у Рго 155 Суз Агд Агд Ьеи Зег 160
Туг Ьуз С1у Туг РЬе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго С1у Азр Зег Уа1
165 170 175
ТЬг Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТЬг Зег Суз ТЬг Ьеи А1а
180 185 190
Агд Ьуз 11е Ьуз Рго Ьуз РЬе Уа1 С1у Агд С1и Ьуз Туг Азр Ьеи Рго
195 200 205
Рго Уа1 Η^з С1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТЬг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи С1и
210 215 220
ТЬг ТЬг А1а С1у Туг 11е ТЬг МеБ Η^з Агд Рго Агд Рго Η^з А1а Туг
225 230 235 240
ТЬг Зег Туг Ьеи С1и С1и Зег Зег С1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго Рго
245 250 255
Зег С1у Ьуз Азп 11е ТЬг Туг С1и Суз Ьуз Суз С1у Азр Туг Ьуз ТЬг
260 265 270
С1у ТЬг Уа1 Зег ТЬг Агд ТЬг С1и 11е ТЬг С1у Суз ТЬг А1а 11е Ьуз
275 280 285
С1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр С1п ТЬг Ьуз Тгр Уа1 РЬе Азп Зег
290 295 300
Рго Азр Ьеи 11е Агд Η^з Азр Азр Η^з ТЬг А1а С1п С1у Ьуз Ьеи Η^з
305 310 315 320
Ьеи Рго РЬе Ьуз Ьеи 11е Рго Зег ТЬг Суз МеБ Уа1 Рго Уа1 А1а Η^з
325 330 335
А1а Рго Азп Уа1 11е Η^з С1у РЬе Ьуз Η^3 11е Зег Ьеи С1п Ьеи Азр
340 345 350
ТЬг Азр Η^з Ьеи ТЬг Ьеи Ьеи ТЬг ТЬг Агд Агд Ьеи С1у А1а Азп Рго
355 360 365
С1и Рго ТЬг ТЬг С1и Тгр 11е Уа1 С1у Ьуз ТЬг Уа1 Агд Азп РЬе ТЬг
- 61 032403
370
375
380
Уа1 385 Азр Агд Азр С1у Ьеи 390 С1и Туг 11е Тгр С1у Азп 395 Η^з С1и Рго Уа1 400
Агд Уа1 Туг А1а С1п С1и Зег А1а Рго С1у Азр Рго Η^з С1у Тгр Рго
405 410 415
Η^з С1и 11е Уа1 С1п Η^з Туг Туг Η^з Агд Η^з Рго Уа1 Туг ТИг 11е
420 425 430
Ьеи А1а Уа1 А1а Зег А1а ТИг Уа1 А1а МеЕ МеЕ 11е С1у Уа1 ТИг Уа1
435 440 445
А1а Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и Суз Ьеи ТИг Рго Туг
450 455 460
А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТИг Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи Суз
465 470 475 480
Суз Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а С1и ТИг РИе ТИг С1и ТИг МеЕ Зег Туг
485 490 495
Ьеи Тгр Зег Азп Зег С1п Рго РИе РИе Тгр Уа1 С1п Ьеи Суз 11е Рго
500 505 510
Ьеи А1а А1а РИе 11е Уа1 Ьеи МеЕ Агд Суз Суз Зег Суз Суз Ьеи Рго
515 520 525
РИе Ьеи Уа1 Уа1 А1а С1у А1а Туг Ьеи А1а Ьуз Уа1 Азр А1а Туг С1и
530 535 540
Η^з А1а ТИг ТИг Уа1 Рго Азп Уа1 Рго С1п 11е Рго Туг Ьуз А1а Ьеи
545 550 555 560
Уа1 С1и Агд А1а С1у Туг А1а Рго Ьеи Азп Ьеи С1и 11е ТИг Уа1 МеЕ
565 570 575
Зег Зег С1и Уа1 Ьеи Рго Зег ТИг Азп С1п С1и Туг 11е ТИг Суз Ьуз
580 585 590
РИе ТИг ТИг Уа1 Уа1 Рго Зег Рго Ьуз 11е Ьуз Суз Суз С1у Зег Ьеи
595 600 605
С1и Суз С1п Рго А1а А1а Η^з А1а Азр Туг ТИг Суз Ьуз Уа1 РИе С1у
- 62 032403
610
615
620
О1у Уа1 625 Туг Рго РЬе Меб 630 Тгр С1у С1у А1а С1п 635 Суз РЬе Суз Азр Зег 640
С1и Азп Зег С1п Меб Зег С1и А1а Туг Уа1 С1и Ьеи Зег А1а Азр Суз
645 650 655
А1а Зег Азр Η^з А1а С1п А1а 11е Ьуз Уа1 Η^з ТЬг А1а А1а Меб Ьуз
660 665 670
Уа1 С1у Ьеи Агд 11е Уа1 Туг С1у Азп ТЬг ТЬг Зег РЬе Ьеи Азр Уа1
675 680 685
Туг Уа1 Азп С1у Уа1 ТЬг Рго С1у ТЬг Зег Ьуз Азр Ьеи Ьуз Уа1 11е
690 695 700
А1а С1у Рго 11е Зег А1а Зег РЬе ТЬг Рго РЬе Азр Η^з Ьуз Уа1 Уа1
705 710 715 720
11е Η^з Агд С1у Ьеи Уа1 Туг Азп Туг Азр РЬе Рго С1и Туг С1у А1а
725 730 735
Меб Ьуз Рго С1у А1а РЬе С1у Азр 11е С1п А1а ТЬг Зег Ьеи ТЬг Зег
740 745 750
Ьуз Азр Ьеи 11е А1а Зег ТЬг Азр 11е Агд Ьеи Ьеи Ьуз Рго Зег А1а
755 760 765
Ьуз Азп Уа1 Η^з Уа1 Рго Туг ТЬг С1п А1а Зег Зег С1у РЬе С1и Меб
770 775 780
Тгр Ьуз Азп Азп Зег С1у Агд Рго Ьеи С1п С1и ТЬг А1а Рго РЬе С1у
785 790 795 800
Суз Ьуз 11е А1а Уа1 Азп Рго Ьеи Агд А1а Уа1 Азр Суз Зег Туг С1у
805 810 815
Азп 11е Рго 11е Зег 11е Азр 11е Рго Азп А1а А1а РЬе 11е Агд ТЬг
820 825 830
Зег Азр А1а Рго Ьеи Уа1 Зег ТЬг Уа1 Ьуз Суз С1и Уа1 Зег С1и Суз
835 840 845
ТЬг Туг Зег А1а Азр РЬе С1у С1у Меб А1а ТЬг Ьеи С1п Туг Уа1 Зег
- 63 032403
850
855
860
Азр 865 Агд С1и С1у С1п Суз 870 Рго Уа1 Н1з Зег Н1з 875 Зег Зег ТНг А1а ТНг 880
Ьеи С1п С1и Зег ТНг Уа1 Н1з Уа1 Ьеи С1и Ьуз С1у А1а Уа1 ТНг Уа1
885 890 895
Н15 РНе Зег ТНг А1а Зег Рго С1п А1а Азп РНе 11е Уа1 Зег Ьеи Суз
900 905 910
С1у Ьуз Ьуз ТНг ТНг Суз Азп А1а С1и Суз Ьуз Рго Рго А1а Азр Н1з
915 920 925
11е Уа1 Зег ТНг Рго Н1з Ьуз Азп Азр С1п С1и РНе С1п А1а А1а 11е
930 935 940
Зег Ьуз ТНг Зег Тгр Зег Тгр Ьеи РНе А1а Ьеи РНе С1у С1у А1а Зег
945 950 955 960
Зег Ьеи Ьеи 11е 11е С1у Ьеи Мек 11е РНе А1а Суз Зег Мек Мек Ьеи
965 970 975
ТНг Зег ТНг Агд Агд
980
<210>9 <211>982 <212> белок <213> Вирус Синдбис <400>9
Мек 1 Зег А1а А1а Рго 5 Ьеи Уа1 ТНг А1а Мек 10 Суз Ьеи Ьеи С1у Азп 15 Уа1
Зег РНе Рго Суз Азр Агд Рго Рго ТНг Суз Туг ТНг Агд С1и Рго Зег
20 25 30
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 Азп Н1з С1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТНг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд Зег Уа1 11е Азр Азр РНе ТНг Ьеи ТНг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТНг
65 70 75 80
- 64 032403
Суз Зег Туг Суз Η^з 85 Η^з ТЬг Уа1 Рго Суз 90 РЬе Зег Рго Уа1 Ьуз 95 11е
Б1и С1п Уа1 Тгр Азр Б1и А1а Азр Азр Азп ТЬг 11е Агд 11е С1п ТЬг
100 105 110
Зег А1а С1п РЬе Б1у Туг Азр С1п Зег Б1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз
115 120 125
Туг Агд Туг Меб Зег Ьеи Ьуз С1п Азр Η^з ТЬг Уа1 Б1и Б1и Б1у ТЬг
130 135 140
Меб Азр Азр 11е Ьуз 11е Зег ТЬг Зег Б1у Рго Суз Агд Агд Ьеи Зег
145 150 155 160
Туг Ьуз Б1у Туг РЬе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго Б1у Азр Зег Уа1
165 170 175
ТЬг Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТЬг Зег Суз ТЬг Ьеи А1а
180 185 190
Агд Ьуз 11е Ьуз Рго Ьуз РЬе Уа1 Б1у Агд Б1и Ьуз Туг Азр Ьеи Рго
195 200 205
Рго Уа1 Η^з Б1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТЬг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи Б1и
210 215 220
Б1у ТЬг ТЬг А1а Б1у Туг 11е ТЬг Меб Η^з Агд Рго Агд Рго Η^з А1а
225 230 235 240
Туг ТЬг Зег Туг Ьеи Б1и Б1и Зег Зег Б1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго
245 250 255
Рго Зег Б1у Ьуз Азп 11е ТЬг Туг Б1и Суз Ьуз Суз Б1у Азр Туг Ьуз
260 265 270
ТЬг Б1у ТЬг Уа1 Зег ТЬг Агд ТЬг Б1и 11е ТЬг Б1у Суз ТЬг А1а 11е
275 280 285
Ьуз С1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр С1п ТЬг Ьуз Тгр Уа1 РЬе Азп
290 295 300
Зег Рго Азр Ьеи 11е Агд Η^з Азр Азр Η^з ТЬг А1а С1п Б1у Ьуз Ьеи
305 310 315 320
- 65 032403
Н1з Ьеи Рго РЬе Ьуз 325 Ьеи 11е Рго Зег ТЬг 330 Суз Ме5 Уа1 Рго Уа1 335 А1а
Н13 А1а Рго Азп Уа1 11е Н13 С1у РЬе Ьуз Н13 11е Зег Ьеи С1п Ьеи
340 345 350
Азр ТЬг Азр Н13 Ьеи ТЬг Ьеи Ьеи ТЬг ТЬг Агд Агд Ьеи С1у А1а Азп
355 360 365
Рго С1и Рго ТЬг ТЬг С1и Тгр 11е Уа1 С1у Ьуз ТЬг Уа1 Агд Азп РЬе
370 375 380
ТЬг Уа1 Азр Агд Азр С1у Ьеи С1и Туг 11е Тгр С1у Азп Н13 С1и Рго
385 390 395 400
Уа1 Агд Уа1 Туг А1а С1п С1и Зег А1а Рго С1у Азр Рго Н13 С1у Тгр
405 410 415
Рго Н13 С1и 11е Уа1 С1п Н13 Туг Туг Н13 Агд Н13 Рго Уа1 Туг ТЬг
420 425 430
11е Ьеи А1а Уа1 А1а Зег А1а ТЬг Уа1 А1а Ме5 Ме5 11е С1у Уа1 ТЬг
435 440 445
Уа1 А1а Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и Суз Ьеи ТЬг Рго
450 455 460
Туг А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТЬг Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи
465 470 475 480
Суз Суз Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а С1и ТЬг РЬе ТЬг С1и ТЬг Ме5 Зег
485 490 495
Туг Ьеи Тгр Зег Азп Зег С1п Рго РЬе РЬе Тгр Уа1 С1п Ьеи Суз 11е
500 505 510
Рго Ьеи А1а А1а РЬе 11е Уа1 Ьеи Ме5 Агд Суз Суз Зег Суз Суз Ьеи
515 520 525
Рго РЬе Ьеи Уа1 Уа1 А1а С1у А1а Туг Ьеи А1а Ьуз Уа1 Азр А1а Туг
530 535 540
С1и Н13 А1а ТЬг ТЬг Уа1 Рго Азп Уа1 Рго С1п 11е Рго Туг Ьуз А1а
545 550 555 560
- 66 032403
Ьеи Уа1 С1и Агд А1а С1у 565 Туг А1а Рго Ьеи Азп Ьеи 570 С1и 11е ТЬг 575 Уа1
Меб Зег Зег С1и Уа1 Ьеи Рго Зег ТЬг Азп С1п С1и Туг 11е ТЬг Суз
580 585 590
Ьуз РЬе ТЬг ТЬг Уа1 Уа1 Рго Зег Рго Ьуз 11е Ьуз Суз Суз С1у Зег
595 600 605
Ьеи С1и Суз С1п Рго А1а А1а Н1з А1а Азр Туг ТЬг Суз Ьуз Уа1 РЬе
610 615 620
С1у С1у Уа1 Туг Рго РЬе Меб Тгр С1у С1у А1а С1п Суз РЬе Суз Азр
625 630 635 640
Зег С1и Азп Зег С1п Меб Зег С1и А1а Туг Уа1 С1и Ьеи Зег А1а Азр
645 650 655
Суз А1а Зег Азр Н1з А1а С1п А1а 11е Ьуз Уа1 Н1з ТЬг А1а А1а Меб
660 665 670
Ьуз Уа1 С1у Ьеи Агд 11е Уа1 Туг С1у Азп ТЬг ТЬг Зег РЬе Ьеи Азр
675 680 685
Уа1 Туг Уа1 Азп С1у Уа1 ТЬг Рго С1у ТЬг Зег Ьуз Азр Ьеи Ьуз Уа1
690 695 700
11е А1а С1у Рго 11е Зег А1а Зег РЬе ТЬг Рго РЬе Азр Н1з Ьуз Уа1
705 710 715 720
Уа1 11е Н1з Агд С1у Ьеи Уа1 Туг Азп Туг Азр РЬе Рго С1и Туг С1у
725 730 735
А1а Меб Ьуз Рго С1у А1а РЬе С1у Азр 11е С1п А1а ТЬг Зег Ьеи ТЬг
740 745 750
Зег Ьуз Азр Ьеи 11е А1а Зег ТЬг Азр 11е Агд Ьеи Ьеи Ьуз Рго Зег
755 760 765
А1а Ьуз Азп Уа1 Н1з Уа1 Рго Туг ТЬг С1п А1а Зег Зег С1у РЬе С1и
770 775 780
Меб Тгр Ьуз Азп Азп Зег С1у Агд Рго Ьеи С1п С1и ТЬг А1а Рго РЬе
785 790 795 800
- 67 032403
С1у Суз Ьуз 11е А1а 805 Уа1 Азп Рго Ьеи Агд 810 А1а Уа1 Азр Суз Зег 815 Туг
С1у Азп 11е Рго 11е Зег 11е Азр 11е Рго Азп А1а А1а Рке 11е Агд
820 825 830
Тйг Зег Азр А1а Рго Ьеи Уа1 Зег ТЙГ Уа1 Ьуз Суз С1и Уа1 Зег С1и
835 840 845
Суз Тйг Туг Зег А1а Азр Рке С1у С1у Мек А1а ТЙГ Ьеи С1п Туг Уа1
850 855 860
Зег Азр Агд С1и С1у С1п Суз Рго Уа1 Η15 Зег Η15 Зег Зег ТЙГ А1а
865 870 875 880
Тйг Ьеи С1п С1и Зег ТЙГ Уа1 Η15 Уа1 Ьеи С1и Ьуз С1у А1а Уа1 ТЙГ
885 890 895
Уа1 Η15 Рке Зег ТЙГ А1а Зег Рго С1п А1а Азп Рке 11е Уа1 Зег Ьеи
900 905 910
Суз С1у Ьуз Ьуз ТЙГ ТЙГ Суз Азп А1а С1и Суз Ьуз Рго Рго А1а Азр
915 920 925
Η15 11е Уа1 Зег ТЙГ Рго Η15 Ьуз Азп Азр С1п С1и Рке С1п А1а А1а
930 935 940
11е Зег Ьуз ТЙГ Зег Тгр Зег Тгр Ьеи Рке А1а Ьеи Рке С1у С1у А1а
945 950 955 960
Зег Зег Ьеи Ьеи 11е 11е С1у Ьеи Мек 11е Рке А1а Суз Зег Мек Мек
965 970 975
Ьеи ТЙГ Зег ТЙГ Агд Агд
980
<210> 10
<211> 981
<212> белок
<213> Вирус Синдбис
<400> 10
Мек Зег А1а А1а Рго Ьеи Уа1 ТЬг А1а Мек Суз Ьеи Ьеи С1у Азп Уа1
1 5 10 15
- 68 032403
Зег РЬе Рго Суз 20 Азр Агд Рго Рго ТЬг 25 Суз Туг ТЬг Агд Б1и 30 Рго Зег
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи Б1и Б1и Азп Уа1 Азп Н1з Б1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТЬг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз Б1у Зег Зег Б1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд Зег Уа1 11е Азр Азр РЬе ТЬг Ьеи ТЬг Зег Рго Туг Ьеи Б1у ТЬг
65 70 75 80
Суз Зег Туг Суз Н1з Нбз ТЬг Уа1 Рго Суз РЬе Зег Рго Уа1 Ьуз 11е
85 90 95
Б1и Б1п Уа1 Тгр Азр Б1и А1а Азр Азр Азп ТЬг 11е Агд 11е Б1п ТЬг
100 105 110
Зег А1а Б1п РЬе Б1у Туг Азр Б1п Зег Б1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз
115 120 125
Туг Агд Туг Меб Зег Ьеи Ьуз Б1п Азр Н1з ТЬг Уа1 Б1и Б1и Б1у ТЬг
130 135 140
Меб Азр Азр 11е Ьуз 11е Зег ТЬг Зег Б1у Рго Суз Агд Агд Ьеи Зег
145 150 155 160
Туг Ьуз Б1у Туг РЬе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго Б1у Азр Зег Уа1
165 170 175
ТЬг Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТЬг Зег Суз ТЬг Ьеи А1а
180 185 190
Агд Ьуз 11е Ьуз Рго Ьуз РЬе Уа1 Б1у Агд Б1и Ьуз Туг Азр Ьеи Рго
195 200 205
Рго Уа1 Н1з Б1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТЬг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи Б1и
210 215 220
ТЬг ТЬг А1а Б1у Туг 11е ТЬг Меб Н1з Агд Рго Агд Рго Н1з А1а Туг
225 230 235 240
ТЬг Зег Туг Ьеи Б1и Б1и Зег Зег Б1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго Рго
245 250 255
- 69 032403
Зег С1у Ьуз Азп 260 11е ТИг Туг С1и Суз 265 Ьуз Суз С1у Азр Туг 270 Ьуз ТИг
С1у ТИг Уа1 Зег ТИг Агд ТИг С1и 11е ТИг С1у Суз ТИг А1а 11е Ьуз
275 280 285
С1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр С1п ТИг Ьуз Тгр Уа1 РИе Азп Зег
290 295 300
Рго Азр Ьеи 11е Агд Н1з Азр Азр Н1з ТИг А1а С1п С1у Ьуз Ьеи Н1з
305 310 315 320
Ьеи Рго РИе Ьуз Ьеи 11е Рго Зег ТИг Суз МеЕ Уа1 Рго Уа1 А1а Н1з
325 330 335
А1а Рго Азп Уа1 11е Н1з С1у РИе Ьуз Н1з 11е Зег Ьеи С1п Ьеи Азр
340 345 350
ТИг Азр Н1з Ьеи ТИг Ьеи Ьеи ТИг ТИг Агд Агд Ьеи С1у А1а Азп Рго
355 360 365
С1и Рго ТИг ТИг С1и Тгр 11е Уа1 С1у Ьуз ТИг Уа1 Агд Азп РИе ТИг
370 375 380
Уа1 Азр Агд Азр С1у Ьеи С1и Туг 11е Тгр С1у Азп Н1з С1и Рго Уа1
385 390 395 400
Агд Уа1 Туг А1а С1п С1и Зег А1а Рго С1у Азр Рго Н1з С1у Тгр Рго
405 410 415
Н1з С1и 11е Уа1 С1п Н1з Туг Туг Н1з Агд Н1з Рго Уа1 Туг ТИг 11е
420 425 430
Ьеи А1а Уа1 А1а Зег А1а ТИг Уа1 А1а МеЕ МеЕ 11е С1у Уа1 ТИг Уа1
435 440 445
А1а Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и Суз Ьеи ТИг Рго Туг
450 455 460
А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТИг Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи Суз
465 470 475 480
Суз Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а С1и ТИг РИе ТИг С1и ТИг МеЕ Зег Туг
485 490 495
- 70 032403
Ьеи Тгр Зег Азп 500 Зег С1п Рго РЬе РЬе Тгр 505 Уа1 С1п Ьеи Суз 510 11е Рго
Ьеи А1а А1а РЬе 11е Уа1 Ьеи Мек Агд Суз Суз Зег Суз Суз Ьеи Рго
515 520 525
РЬе Ьеи Уа1 Уа1 А1а С1у А1а Туг Ьеи А1а Ьуз Уа1 Азр А1а Туг С1и
530 535 540
Η^з А1а ТЬг ТЬг Уа1 Рго Азп Уа1 Рго С1п 11е Рго Туг Ьуз А1а Ьеи
545 550 555 560
Уа1 С1и Агд А1а С1у Туг А1а Рго Ьеи Азп Ьеи С1и 11е ТЬг Уа1 Мек
565 570 575
Зег Зег С1и Уа1 Ьеи Рго Зег ТЬг Азп С1п С1и Туг 11е ТЬг Суз Ьуз
580 585 590
РЬе ТЬг ТЬг Уа1 Уа1 Рго Зег Рго Ьуз 11е Ьуз Суз Суз С1у Зег Ьеи
595 600 605
С1и Суз С1п Рго А1а А1а Η^з А1а Азр Туг ТЬг Суз Ьуз Уа1 РЬе С1у
610 615 620
С1у Уа1 Туг Рго РЬе Мек Тгр С1у С1у А1а С1п Суз РЬе Суз Азр Зег
625 630 635 640
С1и Азп Зег С1п Мек Зег С1и А1а Туг Уа1 С1и Ьеи Зег А1а Азр Суз
645 650 655
А1а Зег Азр Η^з А1а С1п А1а 11е Ьуз Уа1 Η^з ТЬг А1а А1а Мек Ьуз
660 665 670
Уа1 С1у Ьеи Агд 11е Уа1 Туг С1у Азп ТЬг ТЬг Зег РЬе Ьеи Азр Уа1
675 680 685
Туг Уа1 Азп С1у Уа1 ТЬг Рго С1у ТЬг Зег Ьуз Азр Ьеи Ьуз Уа1 11е
690 695 700
А1а С1у Рго 11е Зег А1а Зег РЬе ТЬг Рго РЬе Азр Η^з Ьуз Уа1 Уа1
705 710 715 720
11е Η^з Агд С1у Ьеи Уа1 Туг Азп Туг Азр РЬе Рго С1и Туг С1у А1а
725 730 735
- 71 032403
Меб Ьуз Рго С1у А1а 740 РЬе С1у Азр 11е С1п 745 А1а ТЬг Зег Ьеи 750 ТЬг Зег
Ьуз Азр Ьеи 11е А1а Зег ТЬг Азр 11е Агд Ьеи Ьеи Ьуз Рго Зег А1а
755 760 765
Ьуз Азп Уа1 Η^з Уа1 Рго Туг ТЬг С1п А1а Зег Зег С1у РЬе С1и Меб
770 775 780
Тгр Ьуз Азп Азп Зег С1у Агд Рго Ьеи С1п С1и ТЬг А1а Рго РЬе С1у
785 790 795 800
Суз Ьуз 11е А1а Уа1 Азп Рго Ьеи Агд А1а Уа1 Азр Суз Зег Туг С1у
805 810 815
Азп 11е Рго 11е Зег 11е Азр 11е Рго Азп А1а А1а РЬе 11е Агд ТЬг
820 825 830
Зег Азр А1а Рго Ьеи Уа1 Зег ТЬг Уа1 Ьуз Суз С1и Уа1 Зег С1и Суз
835 840 845
ТЬг Туг Зег А1а Азр РЬе С1у С1у Меб А1а ТЬг Ьеи С1п Туг Уа1 Зег
850 855 860
Азр Агд С1и С1у С1п Суз Рго Уа1 Η^з Зег Η^з Зег Зег ТЬг А1а ТЬг
865 870 875 880
Ьеи С1п С1и Зег ТЬг Уа1 Η^3 Уа1 Ьеи С1и Ьуз С1у А1а Уа1 ТЬг Уа1
885 890 895
Η^з РЬе Зег ТЬг А1а Зег Рго С1п А1а Азп РЬе 11е Уа1 Зег Ьеи Суз
900 905 910
С1у Ьуз Ьуз ТЬг ТЬг Суз Азп А1а С1и Суз Ьуз Рго Рго А1а Азр Η^з
915 920 925
11е Уа1 Зег ТЬг Рго Η^з Ьуз Азп Азр С1п С1и РЬе С1п А1а А1а 11е
930 935 940
Зег Ьуз ТЬг Зег Тгр Зег Тгр Ьеи РЬе А1а Ьеи РЬе С1у С1у А1а Зег
945 950 955 960
Зег Ьеи Ьеи 11е 11е С1у Ьеи Меб 11е РЬе А1а Суз Зег Меб Меб Ьеи
965 970 975
- 72 032403
ТНг Зег ТНг Агд Агд
980 <210> 11 <211> 982 <212> белок <213> Вирус Синдбис <400> 11
Мек 1 Зег А1а А1а Рго 5 Ьеи Уа1 ТНг А1а Мек 10 Суз Ьеи Ьеи С1у Азп 15 Уа1
Зег РНе Рго Суз Азр Агд Рго Рго ТНг Суз Туг ТНг Агд С1и Рго Зег
20 25 30
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 Азп Н1з С1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТНг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд Зег Уа1 11е Азр Азр РНе ТНг Ьеи ТНг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТНг
65 70 75 80
Суз Зег Туг Суз Н1з Н1з ТНг Уа1 Рго Суз РНе Зег Рго Уа1 Ьуз 11е
85 90 95
С1и С1п Уа1 Тгр Азр С1и А1а Азр Азр Азп ТНг 11е Агд 11е С1п ТНг
100 105 110
Зег А1а С1п РНе С1у Туг Азр С1п Зег С1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз
115 120 125
Туг Агд Туг Мек Зег Ьеи Ьуз С1п Азр Н1з ТНг Уа1 С1и С1и С1у ТНг
130 135 140
Мек Азр Азр 11е Ьуз 11е Зег ТНг Зег С1у Рго Суз Агд Агд Ьеи Зег
145 150 155 160
Туг Ьуз С1у Туг РНе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго С1у Азр Зег Уа1
165 170 175
ТНг Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТНг Зег Суз ТНг Ьеи А1а
180 185 190
- 73 032403
Агд Ьуз 11е 195 Ьуз Рго Ьуз РЬе Уа1 200 С1у Агд С1и Ьуз Туг 205 Азр Ьеи Рго
Рго Уа1 Η^з С1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТЬг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи Ьуз
210 215 220
С1у ТЬг ТЬг А1а С1у Туг 11е ТЬг МеБ Η^з Агд Рго Агд Рго Η^з А1а
225 230 235 240
Туг ТЬг Зег Туг Ьеи С1и С1и Зег Зег С1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго
245 250 255
Рго Зег С1у Ьуз Азп 11е ТЬг Туг С1и Суз Ьуз Суз С1у Азр Туг Ьуз
260 265 270
ТЬг С1у ТЬг Уа1 Зег ТЬг Агд ТЬг С1и 11е ТЬг С1у Суз ТЬг А1а 11е
275 280 285
Ьуз С1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр С1п ТЬг Ьуз Тгр Уа1 РЬе Азп
290 295 300
Зег Рго Азр Ьеи 11е Агд Η^з Азр Азр Η^з ТЬг А1а С1п С1у Ьуз Ьеи
305 310 315 320
Η^з Ьеи Рго РЬе Ьуз Ьеи 11е Рго Зег ТЬг Суз МеБ Уа1 Рго Уа1 А1а
325 330 335
Η^з А1а Рго Азп Уа1 11е Η^з С1у РЬе Ьуз Η^з 11е Зег Ьеи С1п Ьеи
340 345 350
Азр ТЬг Азр Η^з Ьеи ТЬг Ьеи Ьеи ТЬг ТЬг Агд Агд Ьеи С1у А1а Азп
355 360 365
Рго С1и Рго ТЬг ТЬг С1и Тгр 11е Уа1 С1у Ьуз ТЬг Уа1 Агд Азп РЬе
370 375 380
ТЬг Уа1 Азр Агд Азр С1у Ьеи С1и Туг 11е Тгр С1у Азп Η^з С1и Рго
385 390 395 400
Уа1 Агд Уа1 Туг А1а С1п С1и Зег А1а Рго С1у Азр Рго Η^з С1у Тгр
405 410 415
Рго Η^з С1и 11е Уа1 С1п Η^з Туг Туг Η^з Агд Η^з Рго Уа1 Туг ТЬг
420 425 430
- 74 032403
11е Ьеи А1а Уа1 435 А1а Зег А1а ТИг 440 Уа1 А1а МеЕ МеЕ 11е 445 С1у Уа1 ТИг
Уа1 А1а Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и Суз Ьеи ТИг Рго
450 455 460
Туг А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТИг Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи
465 470 475 480
Суз Суз Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а С1и ТИг РИе ТИг С1и ТИг МеЕ Зег
485 490 495
Туг Ьеи Тгр Зег Азп Зег С1п Рго РИе РИе Тгр Уа1 С1п Ьеи Суз 11е
500 505 510
Рго Ьеи А1а А1а РИе 11е Уа1 Ьеи МеЕ Агд Суз Суз Зег Суз Суз Ьеи
515 520 525
Рго РИе Ьеи Уа1 Уа1 А1а С1у А1а Туг Ьеи А1а Ьуз Уа1 Азр А1а Туг
530 535 540
С1и Η^з А1а ТИг ТИг Уа1 Рго Азп Уа1 Рго С1п 11е Рго Туг Ьуз А1а
545 550 555 560
Ьеи Уа1 С1и Агд А1а С1у Туг А1а Рго Ьеи Азп Ьеи С1и 11е ТИг Уа1
565 570 575
МеЕ Зег Зег С1и Уа1 Ьеи Рго Зег ТИг Азп С1п С1и Туг 11е ТИг Суз
580 585 590
Ьуз РИе ТИг ТИг Уа1 Уа1 Рго Зег Рго Ьуз 11е Ьуз Суз Суз С1у Зег
595 600 605
Ьеи С1и Суз С1п Рго А1а А1а Η^з А1а Азр Туг ТИг Суз Ьуз Уа1 РИе
610 615 620
С1у С1у Уа1 Туг Рго РИе МеЕ Тгр С1у С1у А1а С1п Суз РИе Суз Азр
625 630 635 640
Зег С1и Азп Зег С1п МеЕ Зег С1и А1а Туг Уа1 С1и Ьеи Зег А1а Азр
645 650 655
Суз А1а Зег Азр Η^з А1а С1п А1а 11е Ьуз Уа1 Η^з ТИг А1а А1а МеЕ
660 665 670
- 75 032403
Ьуз Уа1 Б1у 675 Ьеи Агд 11е Уа1 Туг 680 Б1у Азп ТЬг ТЬг Зег 685 РЬе Ьеи Азр
Уа1 Туг Уа1 Азп Б1у Уа1 ТЬг Рго Б1у ТЬг Зег Ьуз Азр Ьеи Ьуз Уа1
690 695 700
11е А1а Б1у Рго 11е Зег А1а Зег РЬе ТЬг Рго РЬе Азр Η^з Ьуз Уа1
705 710 715 720
Уа1 11е Η^з Агд Б1у Ьеи Уа1 Туг Азп Туг Азр РЬе Рго Б1и Туг Б1у
725 730 735
А1а Меб Ьуз Рго Б1у А1а РЬе Б1у Азр 11е С1п А1а ТЬг Зег Ьеи ТЬг
740 745 750
Зег Ьуз Азр Ьеи 11е А1а Зег ТЬг Азр 11е Агд Ьеи Ьеи Ьуз Рго Зег
755 760 765
А1а Ьуз Азп Уа1 Η^з Уа1 Рго Туг ТЬг С1п А1а Зег Зег Б1у РЬе Б1и
770 775 780
Меб Тгр Ьуз Азп Азп Зег Б1у Агд Рго Ьеи С1п Б1и ТЬг А1а Рго РЬе
785 790 795 800
Б1у Суз Ьуз 11е А1а Уа1 Азп Рго Ьеи Агд А1а Уа1 Азр Суз Зег Туг
805 810 815
Б1у Азп 11е Рго 11е Зег 11е Азр 11е Рго Азп А1а А1а РЬе 11е Агд
820 825 830
ТЬг Зег Азр А1а Рго Ьеи Уа1 Зег ТЬг Уа1 Ьуз Суз Б1и Уа1 Зег Б1и
835 840 845
Суз ТЬг Туг Зег А1а Азр РЬе Б1у Б1у Меб А1а ТЬг Ьеи С1п Туг Уа1
850 855 860
Зег Азр Агд Б1и Б1у С1п Суз Рго Уа1 Η^з Зег Η^3 Зег Зег ТЬг А1а
865 870 875 880
ТЬг Ьеи С1п Б1и Зег ТЬг Уа1 Η^3 Уа1 Ьеи Б1и Ьуз Б1у А1а Уа1 ТЬг
885 890 895
Уа1 Η^з РЬе Зег ТЬг А1а Зег Рго С1п А1а Азп РЬе 11е Уа1 Зег Ьеи
900 905 910
- 76 032403
Суз С1у Ьуз 915 Ьуз ТЬг ТЬг Суз Азп 920 А1а С1и Суз Ьуз Рго 925 Рго А1а Азр
Н1з 11е Уа1 Зег ТЬг Рго Н1з Ьуз Азп Азр С1п С1и РЬе С1п А1а А1а
930 935 940
11е Зег Ьуз ТЬг Зег Тгр Зег Тгр Ьеи РЬе А1а Ьеи РЬе С1у С1у А1а
945 950 955 960
Зег Зег Ьеи Ьеи 11е 11е С1у Ьеи Меб 11е РЬе А1а Суз Зег Меб Меб
965 970 975
Ьеи ТЬг Зег ТЬг Агд Агд
980
<210> 12 <211> 981 <212> белок <213> Вирус Синдбис <400> 12
Меб 1 Зег А1а А1а Рго 5 Ьеи Уа1 ТЬг А1а Меб 10 Суз Ьеи Ьеи С1у Азп 15 Уа1
Зег РЬе Рго Суз Азр Агд Рго Рго ТЬг Суз Туг ТЬг Агд С1и Рго Зег
20 25 30
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 Азп Н1з С1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТЬг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд Зег Уа1 11е Азр Азр РЬе ТЬг Ьеи ТЬг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТЬг
65 70 75 80
Суз Зег Туг Суз Н1з Н1з ТЬг Уа1 Рго Суз РЬе Зег Рго Уа1 Ьуз 11е
85 90 95
С1и С1п Уа1 Тгр Азр С1и А1а Азр Азр Азп ТЬг 11е Агд 11е С1п ТЬг
100 105 110
Зег А1а С1п РЬе С1у Туг Азр С1п Зег С1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз
115 120 125
Туг Агд Туг Меб Зег Ьеи Ьуз С1п Азр Н1з ТЬг Уа1 С1и С1и С1у ТЬг
- 77 032403
130
135
140
Меб 145 Азр Азр 11е Ьуз 11е 150 Зег ТЬг Зег С1у Рго 155 Суз Агд Агд Ьеи Зег 160
Туг Ьуз С1у Туг РЬе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго С1у Азр Зег Уа1
165 170 175
ТЬг Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТЬг Зег Суз ТЬг Ьеи А1а
180 185 190
Агд Ьуз 11е Ьуз Рго Ьуз РЬе Уа1 С1у Агд С1и Ьуз Туг Азр Ьеи Рго
195 200 205
Рго Уа1 Н1з С1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТЬг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи Ьуз
210 215 220
ТЬг ТЬг А1а С1у Туг 11е ТЬг Меб Н1з Агд Рго Агд Рго Н1з А1а Туг
225 230 235 240
ТЬг Зег Туг Ьеи С1и С1и Зег Зег С1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго Рго
245 250 255
Зег С1у Ьуз Азп 11е ТЬг Туг С1и Суз Ьуз Суз С1у Азр Туг Ьуз ТЬг
260 265 270
С1у ТЬг Уа1 Зег ТЬг Агд ТЬг С1и 11е ТЬг С1у Суз ТЬг А1а 11е Ьуз
275 280 285
С1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр С1п ТЬг Ьуз Тгр Уа1 РЬе Азп Зег
290 295 300
Рго Азр Ьеи 11е Агд Н1з Азр Азр Н1з ТЬг А1а С1п С1у Ьуз Ьеи Н1з
305 310 315 320
Ьеи Рго РЬе Ьуз Ьеи 11е Рго Зег ТЬг Суз Меб Уа1 Рго Уа1 А1а Н1з
325 330 335
А1а Рго Азп Уа1 11е Н1з С1у РЬе Ьуз Н1з 11е Зег Ьеи С1п Ьеи Азр
340 345 350
ТЬг Азр Н1з Ьеи ТЬг Ьеи Ьеи ТЬг ТЬг Агд Агд Ьеи С1у А1а Азп Рго
355 360 365
С1и Рго ТЬг ТЬг С1и Тгр 11е Уа1 С1у Ьуз ТЬг Уа1 Агд Азп РЬе ТЬг
- 78 032403
370
375
380
Уй1 385 Азр Агд Азр С1у Ьеи 390 С1и Туг 11е Тгр С1у Азп 395 Η15 С1и Рго Уй1 400
Агд Уй1 Туг А1а С1п С1и Зег А1а Рго С1у Азр Рго Η15 С1у Тгр Рго
405 410 415
Η15 С1и 11е Уй1 С1п Η15 Туг Туг Η15 Агд Η15 Рго Уй1 Туг ТЙГ 11е
420 425 430
Ьеи А1а Уй1 А1а Зег А1а ТЙГ Уй1 А1а Мек Мек 11е С1у Уй1 ТЙГ Уй1
435 440 445
А1а Уй1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и Суз Ьеи Тйг Рго Туг
450 455 460
А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уй1 11е Рго ТЙГ Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи Суз
465 470 475 480
Суз Уй1 Агд Зег А1а Азп А1а С1и ТЙГ Рке ТЙГ С1и ТЙГ Мек Зег Туг
485 490 495
Ьеи Тгр Зег Азп Зег С1п Рго Рке Рке Тгр Уй1 С1п Ьеи Суз 11е Рго
500 505 510
Ьеи А1а А1а Рке 11е Уй1 Ьеи Мек Агд Суз Суз Зег Суз Суз Ьеи Рго
515 520 525
Рке Ьеи Уй1 Уй1 А1а С1у А1а Туг Ьеи А1а Ьуз Уй1 Азр А1а Туг С1и
530 535 540
Η15 А1а Тйг Тйг Уй1 Рго Азп Уй1 Рго С1п 11е Рго Туг Ьуз А1а Ьеи
545 550 555 560
Уй1 С1и Агд А1а С1у Туг А1а Рго Ьеи Азп Ьеи С1и 11е ТЙГ Уй1 Мек
565 570 575
Зег Зег С1и Уй1 Ьеи Рго Зег ТЙГ Азп С1п С1и Туг 11е ТЙГ Суз Ьуз
580 585 590
Рке ТЙГ ТЙГ Уй1 Уй1 Рго Зег Рго Ьуз 11е Ьуз Суз Суз С1у Зег Ьеи
595 600 605
С1и Суз С1п Рго А1а А1а Η15 А1а Азр Туг ТЙГ Суз Ьуз Уй1 Рке С1у
- 79 032403
610
615
620
О1у Уа1 625 Туг Рго РЬе Меб 630 Тгр С1у С1у А1а С1п 635 Суз РЬе Суз Азр Зег 640
С1и Азп Зег С1п Меб Зег С1и А1а Туг Уа1 С1и Ьеи Зег А1а Азр Суз
645 650 655
А1а Зег Азр Η^з А1а С1п А1а 11е Ьуз Уа1 Η^з ТЬг А1а А1а Меб Ьуз
660 665 670
Уа1 С1у Ьеи Агд 11е Уа1 Туг С1у Азп ТЬг ТЬг Зег РЬе Ьеи Азр Уа1
675 680 685
Туг Уа1 Азп С1у Уа1 ТЬг Рго С1у ТЬг Зег Ьуз Азр Ьеи Ьуз Уа1 11е
690 695 700
А1а С1у Рго 11е Зег А1а Зег РЬе ТЬг Рго РЬе Азр Η^з Ьуз Уа1 Уа1
705 710 715 720
11е Η^з Агд С1у Ьеи Уа1 Туг Азп Туг Азр РЬе Рго С1и Туг С1у А1а
725 730 735
Меб Ьуз Рго С1у А1а РЬе С1у Азр 11е С1п А1а ТЬг Зег Ьеи ТЬг Зег
740 745 750
Ьуз Азр Ьеи 11е А1а Зег ТЬг Азр 11е Агд Ьеи Ьеи Ьуз Рго Зег А1а
755 760 765
Ьуз Азп Уа1 Η^з Уа1 Рго Туг ТЬг С1п А1а Зег Зег С1у РЬе С1и Меб
770 775 780
Тгр Ьуз Азп Азп Зег С1у Агд Рго Ьеи С1п С1и ТЬг А1а Рго РЬе С1у
785 790 795 800
Суз Ьуз 11е А1а Уа1 Азп Рго Ьеи Агд А1а Уа1 Азр Суз Зег Туг С1у
805 810 815
Азп 11е Рго 11е Зег 11е Азр 11е Рго Азп А1а А1а РЬе 11е Агд ТЬг
820 825 830
Зег Азр А1а Рго Ьеи Уа1 Зег ТЬг Уа1 Ьуз Суз С1и Уа1 Зег С1и Суз
835 840 845
ТЬг Туг Зег А1а Азр РЬе С1у С1у Меб А1а ТЬг Ьеи С1п Туг Уа1 Зег
- 80 032403
850
855
860
Азр 865 Агд С1и С1у С1п Суз 870 Рго Уа1 Н1з Зег Н1з 875 Зег Зег ТЬг А1а ТЬг 880
Ьеи С1п С1и Зег ТЬг Уа1 Н1з Уа1 Ьеи С1и Ьуз С1у А1а Уа1 ТЬг Уа1
885 890 895
Н15 РЬе Зег ТЬг А1а Зег Рго С1п А1а Азп РЬе 11е Уа1 Зег Ьеи Суз
900 905 910
С1у Ьуз Ьуз ТЬг ТЬг Суз Азп А1а С1и Суз Ьуз Рго Рго А1а Азр Н1з
915 920 925
11е Уа1 Зег ТЬг Рго Н1з Ьуз Азп Азр С1п С1и РЬе С1п А1а А1а 11е
930 935 940
Зег Ьуз ТЬг Зег Тгр Зег Тгр Ьеи РЬе А1а Ьеи РЬе С1у С1у А1а Зег
945 950 955 960
Зег Ьеи Ьеи 11е 11е С1у Ьеи Меб 11е РЬе А1а Суз Зег Меб Меб Ьеи
965 970 975
ТЬг Зег ТЬг Агд Агд
980
<210>13 <211>982 <212> белок <213> Вирус Синдбис <400>13
Меб 1 Зег А1а А1а Рго 5 Ьеи Уа1 ТЬг А1а Меб 10 Суз Ьеи Ьеи С1у Азп 15 Уа1
Зег РЬе Рго Суз Азр Агд Рго Рго ТЬг Суз Туг ТЬг Агд С1и Рго Зег
20 25 30
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 Азп Н1з С1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТЬг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд Зег Уа1 11е Азр Азр РЬе ТЬг Ьеи ТЬг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТЬг
65 70 75 80
- 81 032403
Суз Зег Туг Суз Н1з 85 Н1з ТНг Уа1 Рго Суз 90 РНе Зег Рго Уа1 Ьуз 95 11е
С1и С1п Уа1 Тгр Азр С1и А1а Азр Азр Азп ТНг 11е Агд 11е С1п ТНг
100 105 110
Зег А1а С1п РНе С1у Туг Азр С1п Зег С1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз
115 120 125
Туг Агд Туг Мек Зег Ьеи С1и С1п Азр Н1з ТНг Уа1 Ьуз С1и С1у ТНг
130 135 140
Мек Азр Азр 11е Ьуз 11е Зег ТНг Зег С1у Рго Суз Агд Агд Ьеи Зег
145 150 155 160
Туг Ьуз С1у Туг РНе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго С1у Азр Зег Уа1
165 170 175
ТНг Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТНг Зег Суз ТНг Ьеи А1а
180 185 190
Агд Ьуз 11е Ьуз Рго Ьуз РНе Уа1 С1у Агд С1и Ьуз Туг Азр Ьеи Рго
195 200 205
Рго Уа1 Н1з С1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТНг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи Ьуз
210 215 220
С1у ТНг ТНг А1а С1у Туг 11е ТНг Мек Н1з Агд Рго Агд Рго Н1з А1а
225 230 235 240
Туг ТНг Зег Туг Ьеи С1и С1и Зег Зег С1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго
245 250 255
Рго Зег С1у Ьуз Азп 11е ТНг Туг С1и Суз Ьуз Суз С1у Азр Туг Ьуз
260 265 270
ТНг С1у ТНг Уа1 Зег ТНг Агд ТНг С1и 11е ТНг С1у Суз ТНг А1а 11е
275 280 285
Ьуз С1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр С1п ТНг Ьуз Тгр Уа1 РНе Азп
290 295 300
Зег Рго Азр Ьеи 11е Агд Н1з Азр Азр Н1з ТНг А1а С1п С1у Ьуз Ьеи
305 310 315 320
- 82 032403
Η^3 Ьеи Рго РЬе Ьуз 325 Ьеи 11е Рго Зег ТЬг 330 Суз Мек Уа1 Рго Уа1 335 А1а
Η^3 А1а Рго Азп Уа1 11е Η^з С1у РЬе Ьуз Η^з 11е Зег Ьеи С1п Ьеи
340 345 350
Азр ТЬг Азр Η^з Ьеи ТЬг Ьеи Ьеи ТЬг ТЬг Агд Агд Ьеи С1у А1а Азп
355 360 365
Рго С1и Рго ТЬг ТЬг С1и Тгр 11е Уа1 С1у Ьуз ТЬг Уа1 Агд Азп РЬе
370 375 380
ТЬг Уа1 Азр Агд Азр С1у Ьеи С1и Туг 11е Тгр С1у Азп Η^з С1и Рго
385 390 395 400
Уа1 Агд Уа1 Туг А1а С1п С1и Зег А1а Рго С1у Азр Рго Η^з С1у Тгр
405 410 415
Рго Η^з С1и 11е Уа1 С1п Η^з Туг Туг Η^з Агд Η^з Рго Уа1 Туг ТЬг
420 425 430
11е Ьеи А1а Уа1 А1а Зег А1а ТЬг Уа1 А1а Мек Мек 11е С1у Уа1 ТЬг
435 440 445
Уа1 А1а Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и Суз Ьеи ТЬг Рго
450 455 460
Туг А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТЬг Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи
465 470 475 480
Суз Суз Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а С1и ТЬг РЬе ТЬг С1и ТЬг Мек Зег
485 490 495
Туг Ьеи Тгр Зег Азп Зег С1п Рго РЬе РЬе Тгр Уа1 С1п Ьеи Суз 11е
500 505 510
Рго Ьеи А1а А1а РЬе 11е Уа1 Ьеи Мек Агд Суз Суз Зег Суз Суз Ьеи
515 520 525
Рго РЬе Ьеи Уа1 Уа1 А1а С1у А1а Туг Ьеи А1а Ьуз Уа1 Азр А1а Туг
530 535 540
С1и Η^з А1а ТЬг ТЬг Уа1 Рго Азп Уа1 Рго С1п 11е Рго Туг Ьуз А1а
545 550 555 560
- 83 032403
Ьеи Уа1 С1и Агд А1а С1у 565 Туг А1а Рго Ьеи Азп Ьеи 570 С1и 11е ТИг 575 Уа1
МеЕ Зег Зег С1и Уа1 Ьеи Рго Зег ТИг Азп С1п С1и Туг 11е ТИг Суз
580 585 590
Ьуз РИе ТИг ТИг Уа1 Уа1 Рго Зег Рго Ьуз 11е Ьуз Суз Суз С1у Зег
595 600 605
Ьеи С1и Суз С1п Рго А1а А1а Н1з А1а Азр Туг ТИг Суз Ьуз Уа1 РИе
610 615 620
С1у С1у Уа1 Туг Рго РИе МеЕ Тгр С1у С1у А1а С1п Суз РИе Суз Азр
625 630 635 640
Зег С1и Азп Зег С1п МеЕ Зег С1и А1а Туг Уа1 С1и Ьеи Зег А1а Азр
645 650 655
Суз А1а Зег Азр Н1з А1а С1п А1а 11е Ьуз Уа1 Н1з ТИг А1а А1а МеЕ
660 665 670
Ьуз Уа1 С1у Ьеи Агд 11е Уа1 Туг С1у Азп ТИг ТИг Зег РИе Ьеи Азр
675 680 685
Уа1 Туг Уа1 Азп С1у Уа1 ТИг Рго С1у ТИг Зег Ьуз Азр Ьеи Ьуз Уа1
690 695 700
11е А1а С1у Рго 11е Зег А1а Зег РИе ТИг Рго РИе Азр Н1з Ьуз Уа1
705 710 715 720
Уа1 11е Н1з Агд С1у Ьеи Уа1 Туг Азп Туг Азр РИе Рго С1и Туг С1у
725 730 735
А1а МеЕ Ьуз Рго С1у А1а РИе С1у Азр 11е С1п А1а ТИг Зег Ьеи ТИг
740 745 750
Зег Ьуз Азр Ьеи 11е А1а Зег ТИг Азр 11е Агд Ьеи Ьеи Ьуз Рго Зег
755 760 765
А1а Ьуз Азп Уа1 Н1з Уа1 Рго Туг ТИг С1п А1а Зег Зег С1у РИе С1и
770 775 780
МеЕ Тгр Ьуз Азп Азп Зег С1у Агд Рго Ьеи С1п С1и ТИг А1а Рго РИе
785 790 795 800
- 84 032403
С1у Суз Ьуз 11е А1а 805 Уа1 Азп Рго Ьеи Агд 810 А1а Уа1 Азр Суз Зег 815 Туг
С1у Азп 11е Рго 11е Зег 11е Азр 11е Рго Азп А1а А1а РИе 11е Агд
820 825 830
ТИг Зег Азр А1а Рго Ьеи Уа1 Зег ТИг Уа1 Ьуз Суз С1и Уа1 Зег С1и
835 840 845
Суз ТИг Туг Зег А1а Азр РИе С1у С1у МеЕ А1а ТИг Ьеи С1п Туг Уа1
850 855 860
Зег Азр Агд С1и С1у С1п Суз Рго Уа1 Η^з Зег Η^з Зег Зег ТИг А1а
865 870 875 880
ТИг Ьеи С1п С1и Зег ТИг Уа1 Η^3 Уа1 Ьеи С1и Ьуз С1у А1а Уа1 ТИг
885 890 895
Уа1 Η^з РИе Зег ТИг А1а Зег Рго С1п А1а Азп РИе 11е Уа1 Зег Ьеи
900 905 910
Суз С1у Ьуз Ьуз ТИг ТИг Суз Азп А1а С1и Суз Ьуз Рго Рго А1а Азр
915 920 925
Η^з 11е Уа1 Зег ТИг Рго Η^з Ьуз Азп Азр С1п С1и РИе С1п А1а А1а
930 935 940
11е Зег Ьуз ТИг Зег Тгр Зег Тгр Ьеи РИе А1а Ьеи РИе С1у С1у А1а
945 950 955 960
Зег Зег Ьеи Ьеи 11е 11е С1у Ьеи МеЕ 11е РИе А1а Суз Зег МеЕ МеЕ
965 970 975
Ьеи ТИг Зег ТИг Агд Агд
980
<210> 14
<211> 981
<212> белок
<213> Вирус Синдбис
<400> 14
МеЕ Зег А1а А1а Рго Ьеи Уа1 ТИг А1а МеЕ Суз Ьеи Ьеи С1у Азп Уа1
1 5 10 15
- 85 032403
Зег РЬе Рго Суз 20 Азр Агд Рго Рго ТЬг 25 Суз Туг ТЬг Агд С1и 30 Рго Зег
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 Азп Η^з С1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТЬг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд Зег Уа1 11е Азр Азр РЬе ТЬг Ьеи ТЬг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТЬг
65 70 75 80
Суз Зег Туг Суз Η^з Η^з ТЬг Уа1 Рго Суз РЬе Зег Рго Уа1 Ьуз 11е
85 90 95
С1и С1п Уа1 Тгр Азр С1и А1а Азр Азр Азп ТЬг 11е Агд 11е С1п ТЬг
100 105 110
Зег А1а С1п РЬе С1у Туг Азр С1п Зег С1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз
115 120 125
Туг Агд Туг МеБ Зег Ьеи С1и С1п Азр Η^з ТЬг Уа1 Ьуз С1и С1у ТЬг
130 135 140
МеБ Азр Азр 11е Ьуз 11е Зег ТЬг Зег С1у Рго Суз Агд Агд Ьеи Зег
145 150 155 160
Туг Ьуз С1у Туг РЬе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго С1у Азр Зег Уа1
165 170 175
ТЬг Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТЬг Зег Суз ТЬг Ьеи А1а
180 185 190
Агд Ьуз 11е Ьуз Рго Ьуз РЬе Уа1 С1у Агд С1и Ьуз Туг Азр Ьеи Рго
195 200 205
Рго Уа1 Η^з С1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТЬг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи Ьуз
210 215 220
ТЬг ТЬг А1а С1у Туг 11е ТЬг МеБ Η^з Агд Рго Агд Рго Η^з А1а Туг
225 230 235 240
ТЬг Зег Туг Ьеи С1и С1и Зег Зег С1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго Рго
245 250 255
- 86 032403
Зег Б1у Ьуз Азп 260 11е ТЬг Туг Б1и Суз 265 Ьуз Суз Б1у Азр Туг 270 Ьуз ТЬг
Б1у ТЬг Уа1 Зег ТЬг Агд ТЬг Б1и 11е ТЬг Б1у Суз ТЬг А1а 11е Ьуз
275 280 285
С1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр С1п ТЬг Ьуз Тгр Уа1 РЬе Азп Зег
290 295 300
Рго Азр Ьеи 11е Агд Η^з Азр Азр Η^з ТЬг А1а С1п Б1у Ьуз Ьеи Η^з
305 310 315 320
Ьеи Рго РЬе Ьуз Ьеи 11е Рго Зег ТЬг Суз Меб Уа1 Рго Уа1 А1а Η^з
325 330 335
А1а Рго Азп Уа1 11е Η^з Б1у РЬе Ьуз Η^з 11е Зег Ьеи С1п Ьеи Азр
340 345 350
ТЬг Азр Η^з Ьеи ТЬг Ьеи Ьеи ТЬг ТЬг Агд Агд Ьеи Б1у А1а Азп Рго
355 360 365
Б1и Рго ТЬг ТЬг Б1и Тгр 11е Уа1 Б1у Ьуз ТЬг Уа1 Агд Азп РЬе ТЬг
370 375 380
Уа1 Азр Агд Азр Б1у Ьеи Б1и Туг 11е Тгр Б1у Азп Η^з Б1и Рго Уа1
385 390 395 400
Агд Уа1 Туг А1а С1п Б1и Зег А1а Рго Б1у Азр Рго Η^з Б1у Тгр Рго
405 410 415
Η^з Б1и 11е Уа1 С1п Η^з Туг Туг Η^з Агд Η^з Рго Уа1 Туг ТЬг 11е
420 425 430
Ьеи А1а Уа1 А1а Зег А1а ТЬг Уа1 А1а Меб Меб 11е Б1у Уа1 ТЬг Уа1
435 440 445
А1а Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд Б1и Суз Ьеи ТЬг Рго Туг
450 455 460
А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТЬг Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи Суз
465 470 475 480
Суз Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а Б1и ТЬг РЬе ТЬг Б1и ТЬг Меб Зег Туг
485 490 495
- 87 032403
Ьеи Тгр Зег Азп 500 Зег С1п Рго РЬе РЬе Тгр 505 Уа1 С1п Ьеи Суз 510 11е Рго
Ьеи А1а А1а РЬе 11е Уа1 Ьеи Меб Агд Суз Суз Зег Суз Суз Ьеи Рго
515 520 525
РЬе Ьеи Уа1 Уа1 А1а С1у А1а Туг Ьеи А1а Ьуз Уа1 Азр А1а Туг С1и
530 535 540
Η^з А1а ТЬг ТЬг Уа1 Рго Азп Уа1 Рго С1п 11е Рго Туг Ьуз А1а Ьеи
545 550 555 560
Уа1 С1и Агд А1а С1у Туг А1а Рго Ьеи Азп Ьеи С1и 11е ТЬг Уа1 Меб
565 570 575
Зег Зег С1и Уа1 Ьеи Рго Зег ТЬг Азп С1п С1и Туг 11е ТЬг Суз Ьуз
580 585 590
РЬе ТЬг ТЬг Уа1 Уа1 Рго Зег Рго Ьуз 11е Ьуз Суз Суз С1у Зег Ьеи
595 600 605
С1и Суз С1п Рго А1а А1а Η^з А1а Азр Туг ТЬг Суз Ьуз Уа1 РЬе С1у
610 615 620
С1у Уа1 Туг Рго РЬе Меб Тгр С1у С1у А1а С1п Суз РЬе Суз Азр Зег
625 630 635 640
С1и Азп Зег С1п Меб Зег С1и А1а Туг Уа1 С1и Ьеи Зег А1а Азр Суз
645 650 655
А1а Зег Азр Η^з А1а С1п А1а 11е Ьуз Уа1 Η^з ТЬг А1а А1а Меб Ьуз
660 665 670
Уа1 С1у Ьеи Агд 11е Уа1 Туг С1у Азп ТЬг ТЬг Зег РЬе Ьеи Азр Уа1
675 680 685
Туг Уа1 Азп С1у Уа1 ТЬг Рго С1у ТЬг Зег Ьуз Азр Ьеи Ьуз Уа1 11е
690 695 700
А1а С1у Рго 11е Зег А1а Зег РЬе ТЬг Рго РЬе Азр Η^з Ьуз Уа1 Уа1
705 710 715 720
11е Η^з Агд С1у Ьеи Уа1 Туг Азп Туг Азр РЬе Рго С1и Туг С1у А1а
725 730 735
- 88 032403
Мек Ьуз Рго С1у А1а 740 Рке С1у Азр 11е С1п 745 А1а ТЙГ Зег Ьеи 750 ТЙГ Зег
Ьуз Азр Ьеи 11е А1а Зег ТЙГ Азр 11е Агд Ьеи Ьеи Ьуз Рго Зег А1а
755 760 765
Ьуз Азп Vа1 Η15 Vа1 Рго Туг ТЙГ С1п А1а Зег Зег С1у Рке С1и Мек
770 775 780
Тгр Ьуз Азп Азп Зег С1у Агд Рго Ьеи С1п С1и ТЙГ А1а Рго Рке С1у
785 790 795 800
Суз Ьуз 11е А1а Vа1 Азп Рго Ьеи Агд А1а Vа1 Азр Суз Зег Туг С1у
805 810 815
Азп 11е Рго 11е Зег 11е Азр 11е Рго Азп А1а А1а Рке 11е Агд ТЙГ
820 825 830
Зег Азр А1а Рго Ьеи Vа1 Зег ТЙГ Vа1 Ьуз Суз С1и Vа1 Зег С1и Суз
835 840 845
Тйг Туг Зег А1а Азр Рке С1у С1у Мек А1а ТЙГ Ьеи С1п Туг Vа1 Зег
850 855 860
Азр Агд С1и С1у С1п Суз Рго Vа1 Η15 Зег Η15 Зег Зег ТЙГ А1а ТЙГ
865 870 875 880
Ьеи С1п С1и Зег ТЙГ Vа1 Η15 Vа1 Ьеи С1и Ьуз С1у А1а Vа1 ТЙГ Vа1
885 890 895
Η15 Рйе Зег ТЙГ А1а Зег Рго С1п А1а Азп Рке 11е Vа1 Зег Ьеи Суз
900 905 910
С1у Ьуз Ьуз ТЙГ ТЙГ Суз Азп А1а С1и Суз Ьуз Рго Рго А1а Азр Η15
915 920 925
11е Уй1 Зег ТЙГ Рго Η15 Ьуз Азп Азр С1п С1и Рке С1п А1а А1а 11е
930 935 940
Зег Ьуз ТЙГ Зег Тгр Зег Тгр Ьеи Рке А1а Ьеи Рке С1у С1у А1а Зег
945 950 955 960
Зег Ьеи Ьеи 11е 11е С1у Ьеи Мек 11е Рке А1а Суз Зег Мек Мек Ьеи
965 970 975
- 89 032403
ТЬг Зег ТЬг Агд Агд
980 <210>15 <211>982 <212> белок <213> Вирус Синдбис <400>15
Меб 1 Зег А1а А1а Рго 5 Ьеи Уа1 ТЬг А1а Меб 10 Суз Ьеи Ьеи С1у Азп 15 Уа1
Зег РЬе Рго Суз Азр Агд Рго Рго ТЬг Суз Туг ТЬг Агд С1и Рго Зег
20 25 30
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 Азп Н1з С1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТЬг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд Зег Уа1 11е Азр Азр РЬе ТЬг Ьеи ТЬг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТЬг
65 70 75 80
Суз Зег Туг Суз Н1з Н1з ТЬг Уа1 Рго Суз РЬе Зег Рго Уа1 Ьуз 11е
85 90 95
С1и С1п Уа1 Тгр Азр С1и А1а Азр Азр Азп ТЬг 11е Агд 11е С1п ТЬг
100 105 110
Зег А1а С1п РЬе С1у Туг Азр С1п Зег С1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз
115 120 125
Туг Агд Туг Меб Зег Ьеи С1и С1п Азр Н1з ТЬг Уа1 С1и С1и С1у ТЬг
130 135 140
Меб Азр Азр 11е Ьуз 11е Зег ТЬг Зег С1у Рго Суз Агд Агд Ьеи Зег
145 150 155 160
Туг Ьуз С1у Туг РЬе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго С1у Азр Зег Уа1
165 170 175
ТЬг Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТЬг Зег Суз ТЬг Ьеи А1а
180 185 190
- 90 032403
Агд Ьуз 11е 195 Ьуз Рго Ьуз РЬе Уа1 200 С1у Агд Б1и Ьуз Туг 205 Азр Ьеи Рго
Рго Уа1 Н13 Б1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТЬг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи Ьуз
210 215 220
Б1у ТЬг ТЬг А1а Б1у Туг 11е ТЬг Меб Н13 Агд Рго Агд Рго Н13 А1а
225 230 235 240
Туг ТЬг Зег Туг Ьеи Б1и Б1и Зег Зег Б1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго
245 250 255
Рго Зег Б1у Ьуз Азп 11е ТЬг Туг Б1и Суз Ьуз Суз Б1у Азр Туг Ьуз
260 265 270
ТЬг Б1у ТЬг Уа1 Зег ТЬг Агд ТЬг Б1и 11е ТЬг Б1у Суз ТЬг А1а 11е
275 280 285
Ьуз Б1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр Б1п ТЬг Ьуз Тгр Уа1 РЬе Азп
290 295 300
Зег Рго Азр Ьеи 11е Агд Н13 Азр Азр Н13 ТЬг А1а Б1п Б1у Ьуз Ьеи
305 310 315 320
Н1з Ьеи Рго РЬе Ьуз Ьеи 11е Рго Зег ТЬг Суз Меб Уа1 Рго Уа1 А1а
325 330 335
Н13 А1а Рго Азп Уа1 11е Н13 Б1у РЬе Ьуз Н13 11е Зег Ьеи Б1п Ьеи
340 345 350
Азр ТЬг Азр Н13 Ьеи ТЬг Ьеи Ьеи ТЬг ТЬг Агд Агд Ьеи Б1у А1а Азп
355 360 365
Рго Б1и Рго ТЬг ТЬг Б1и Тгр 11е Уа1 Б1у Ьуз ТЬг Уа1 Агд Азп РЬе
370 375 380
ТЬг Уа1 Азр Агд Азр Б1у Ьеи Б1и Туг 11е Тгр Б1у Азп Н13 Б1и Рго
385 390 395 400
Уа1 Агд Уа1 Туг А1а Б1п Б1и Зег А1а Рго Б1у Азр Рго Н13 Б1у Тгр
405 410 415
Рго Н13 Б1и 11е Уа1 Б1п Н13 Туг Туг Н13 Агд Н13 Рго Уа1 Туг ТЬг
420 425 430
- 91 032403
11е Ьеи А1а Уа1 435 А1а Зег А1а ТНг 440 Уа1 А1а Мек Мек 11е 445 С1у Уа1 ТНг
Уа1 А1а Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и Суз Ьеи ТНг Рго
450 455 460
Туг А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТНг Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи
465 470 475 480
Суз Суз Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а С1и ТНг РНе ТНг С1и ТНг Мек Зег
485 490 495
Туг Ьеи Тгр Зег Азп Зег С1п Рго РНе РНе Тгр Уа1 С1п Ьеи Суз 11е
500 505 510
Рго Ьеи А1а А1а РНе 11е Уа1 Ьеи Мек Агд Суз Суз Зег Суз Суз Ьеи
515 520 525
Рго РНе Ьеи Уа1 Уа1 А1а С1у А1а Туг Ьеи А1а Ьуз Уа1 Азр А1а Туг
530 535 540
С1и Н1з А1а ТНг ТНг Уа1 Рго Азп Уа1 Рго С1п 11е Рго Туг Ьуз А1а
545 550 555 560
Ьеи Уа1 С1и Агд А1а С1у Туг А1а Рго Ьеи Азп Ьеи С1и 11е ТНг Уа1
565 570 575
Мек Зег Зег С1и Уа1 Ьеи Рго Зег ТНг Азп С1п С1и Туг 11е ТНг Суз
580 585 590
Ьуз РНе ТНг ТНг Уа1 Уа1 Рго Зег Рго Ьуз 11е Ьуз Суз Суз С1у Зег
595 600 605
Ьеи С1и Суз С1п Рго А1а А1а Н1з А1а Азр Туг ТНг Суз Ьуз Уа1 РНе
610 615 620
С1у С1у Уа1 Туг Рго РНе Мек Тгр С1у С1у А1а С1п Суз РНе Суз Азр
625 630 635 640
Зег С1и Азп Зег С1п Мек Зег С1и А1а Туг Уа1 С1и Ьеи Зег А1а Азр
645 650 655
Суз А1а Зег Азр Н1з А1а С1п А1а 11е Ьуз Уа1 Н1з ТНг А1а А1а Мек
660 665 670
- 92 032403
Ьуз Уа1 С1у 675 Ьеи Агд 11е Уа1 Туг 680 С1у Азп ТЬг ТЬг Зег 685 РЬе Ьеи Азр
Уа1 Туг Уа1 Азп С1у Уа1 ТЬг Рго С1у ТЬг Зег Ьуз Азр Ьеи Ьуз Уа1
690 695 700
11е А1а С1у Рго 11е Зег А1а Зег РЬе ТЬг Рго РЬе Азр Н1з Ьуз Уа1
705 710 715 720
Уа1 11е Н1з Агд С1у Ьеи Уа1 Туг Азп Туг Азр РЬе Рго С1и Туг С1у
725 730 735
А1а Меб Ьуз Рго С1у А1а РЬе С1у Азр 11е С1п А1а ТЬг Зег Ьеи ТЬг
740 745 750
Зег Ьуз Азр Ьеи 11е А1а Зег ТЬг Азр 11е Агд Ьеи Ьеи Ьуз Рго Зег
755 760 765
А1а Ьуз Азп Уа1 Н1з Уа1 Рго Туг ТЬг С1п А1а Зег Зег С1у РЬе С1и
770 775 780
Меб Тгр Ьуз Азп Азп Зег С1у Агд Рго Ьеи С1п С1и ТЬг А1а Рго РЬе
785 790 795 800
С1у Суз Ьуз 11е А1а Уа1 Азп Рго Ьеи Агд А1а Уа1 Азр Суз Зег Туг
805 810 815
С1у Азп 11е Рго 11е Зег 11е Азр 11е Рго Азп А1а А1а РЬе 11е Агд
820 825 830
ТЬг Зег Азр А1а Рго Ьеи Уа1 Зег ТЬг Уа1 Ьуз Суз С1и Уа1 Зег С1и
835 840 845
Суз ТЬг Туг Зег А1а Азр РЬе С1у С1у Меб А1а ТЬг Ьеи С1п Туг Уа1
850 855 860
Зег Азр Агд С1и С1у С1п Суз Рго Уа1 Н1з Зег Н1з Зег Зег ТЬг А1а
865 870 875 880
ТЬг Ьеи С1п С1и Зег ТЬг Уа1 Н1з Уа1 Ьеи С1и Ьуз С1у А1а Уа1 ТЬг
885 890 895
Уа1 Н1з РЬе Зег ТЬг А1а Зег Рго С1п А1а Азп РЬе 11е Уа1 Зег Ьеи
900 905 910
- 93 032403
Суз С1у Ьуз 915 Ьуз ТЬг ТЬг Суз Азп 920 А1а С1и Суз Ьуз Рго 925 Рго А1а Азр
Η^3 11е Уа1 Зег ТЬг Рго Η^з Ьуз Азп Азр С1п С1и РЬе С1п А1а А1а
930 935 940
11е Зег Ьуз ТЬг Зег Тгр Зег Тгр Ьеи РЬе А1а Ьеи РЬе С1у С1у А1а
945 950 955 960
Зег Зег Ьеи Ьеи 11е 11е С1у Ьеи Мек 11е РЬе А1а Суз Зег Мек Мек
965 970 975
Ьеи ТЬг Зег ТЬг Агд Агд
980
<210> 16 <211> 981 <212> белок <213> Вирус Синдбис <400> 16
Мек 1 Зег А1а А1а Рго 5 Ьеи Уа1 ТЬг А1а Мек 10 Суз Ьеи Ьеи С1у Азп 15 Уа1
Зег РЬе Рго Суз Азр Агд Рго Рго ТЬг Суз Туг ТЬг Агд С1и Рго Зег
20 25 30
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 Азп Η^з С1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТЬг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд Зег Уа1 11е Азр Азр РЬе ТЬг Ьеи ТЬг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТЬг
65 70 75 80
Суз Зег Туг Суз Η^з Η^з ТЬг Уа1 Рго Суз РЬе Зег Рго Уа1 Ьуз 11е
85 90 95
С1и С1п Уа1 Тгр Азр С1и А1а Азр Азр Азп ТЬг 11е Агд 11е С1п ТЬг
100 105 110
Зег А1а С1п РЬе С1у Туг Азр С1п Зег С1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз
115 120 125
Туг Агд Туг Мек Зег Ьеи С1и С1п Азр Η^з ТЬг Уа1 С1и С1и С1у ТЬг
- 94 032403
130
135
140
МеЕ 145 Азр Азр 11е Ьуз 11е 150 Зег ТИг Зег С1у Рго 155 Суз Агд Агд Ьеи Зег 160
Туг Ьуз С1у Туг РИе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго С1у Азр Зег Уа1
165 170 175
ТИг Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТИг Зег Суз ТИг Ьеи А1а
180 185 190
Агд Ьуз 11е Ьуз Рго Ьуз РИе Уа1 С1у Агд С1и Ьуз Туг Азр Ьеи Рго
195 200 205
Рго Уа1 Η^з С1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТИг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи Ьуз
210 215 220
ТИг ТИг А1а С1у Туг 11е ТИг МеЕ Η^з Агд Рго Агд Рго Η^з А1а Туг
225 230 235 240
ТИг Зег Туг Ьеи С1и С1и Зег Зег С1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго Рго
245 250 255
Зег С1у Ьуз Азп 11е ТИг Туг С1и Суз Ьуз Суз С1у Азр Туг Ьуз ТИг
260 265 270
С1у ТИг Уа1 Зег ТИг Агд ТИг С1и 11е ТИг С1у Суз ТИг А1а 11е Ьуз
275 280 285
С1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр С1п ТИг Ьуз Тгр Уа1 РИе Азп Зег
290 295 300
Рго Азр Ьеи 11е Агд Η^з Азр Азр Η^з ТИг А1а С1п С1у Ьуз Ьеи Η^з
305 310 315 320
Ьеи Рго РИе Ьуз Ьеи 11е Рго Зег ТИг Суз МеЕ Уа1 Рго Уа1 А1а Η^з
325 330 335
А1а Рго Азп Уа1 11е Η^з С1у РИе Ьуз Η^з 11е Зег Ьеи С1п Ьеи Азр
340 345 350
ТИг Азр Η^з Ьеи ТИг Ьеи Ьеи ТИг ТИг Агд Агд Ьеи С1у А1а Азп Рго
355 360 365
С1и Рго ТИг ТИг С1и Тгр 11е Уа1 С1у Ьуз ТИг Уа1 Агд Азп РИе ТИг
- 95 032403
370
375
380
Уа1 385 Азр Агд Азр 01у Ьеи 390 С1и Туг 11е Тгр С1у Азп 395 Η^з С1и Рго Уа1 400
Агд Уа1 Туг А1а С1п С1и Зег А1а Рго С1у Азр Рго Η^з С1у Тгр Рго
405 410 415
Η15 С1и 11е Уа1 С1п Η13 Туг Туг Η^з Агд Η^з Рго Уа1 Туг ТЬг 11е
420 425 430
Ьеи А1а Уа1 А1а Зег А1а ТЬг Уа1 А1а Меб Меб 11е С1у Уа1 ТЬг Уа1
435 440 445
А1а Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и Суз Ьеи ТЬг Рго Туг
450 455 460
А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТЬг Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи Суз
465 470 475 480
Суз Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а С1и ТЬг РЬе ТЬг С1и ТЬг Меб Зег Туг
485 490 495
Ьеи Тгр Зег Азп Зег С1п Рго РЬе РЬе Тгр Уа1 С1п Ьеи Суз 11е Рго
500 505 510
Ьеи А1а А1а РЬе 11е Уа1 Ьеи Меб Агд Суз Суз Зег Суз Суз Ьеи Рго
515 520 525
РЬе Ьеи Уа1 Уа1 А1а С1у А1а Туг Ьеи А1а Ьуз Уа1 Азр А1а Туг С1и
530 535 540
Η13 А1а ТЬг ТЬг Уа1 Рго Азп Уа1 Рго С1п 11е Рго Туг Ьуз А1а Ьеи
545 550 555 560
Уа1 С1и Агд А1а С1у Туг А1а Рго Ьеи Азп Ьеи С1и 11е ТЬг Уа1 Меб
565 570 575
Зег Зег С1и Уа1 Ьеи Рго Зег ТЬг Азп С1п С1и Туг 11е ТЬг Суз Ьуз
580 585 590
РЬе ТЬг ТЬг Уа1 Уа1 Рго Зег Рго Ьуз 11е Ьуз Суз Суз С1у Зег Ьеи
595 600 605
С1и Суз С1п Рго А1а А1а Η13 А1а Азр Туг ТЬг Суз Ьуз Уа1 РЬе С1у
- 96 032403
610
615
620
С1у Уа1 625 Туг Рго РИе МеЕ 630 Тгр С1у С1у А1а С1п 635 Суз РИе Суз Азр Зег 640
С1и Азп Зег С1п МеЕ Зег С1и А1а Туг Уа1 С1и Ьеи Зег А1а Азр Суз
645 650 655
А1а Зег Азр Н1з А1а С1п А1а 11е Ьуз Уа1 Н1з ТИг А1а А1а МеЕ Ьуз
660 665 670
Уа1 С1у Ьеи Агд 11е Уа1 Туг С1у Азп ТИг ТИг Зег РИе Ьеи Азр Уа1
675 680 685
Туг Уа1 Азп С1у Уа1 ТИг Рго С1у ТИг Зег Ьуз Азр Ьеи Ьуз Уа1 11е
690 695 700
А1а С1у Рго 11е Зег А1а Зег РИе ТИг Рго РИе Азр Н1з Ьуз Уа1 Уа1
705 710 715 720
11е Н1з Агд С1у Ьеи Уа1 Туг Азп Туг Азр РИе Рго С1и Туг С1у А1а
725 730 735
МеЕ Ьуз Рго С1у А1а РИе С1у Азр 11е С1п А1а ТИг Зег Ьеи ТИг Зег
740 745 750
Ьуз Азр Ьеи 11е А1а Зег ТИг Азр 11е Агд Ьеи Ьеи Ьуз Рго Зег А1а
755 760 765
Ьуз Азп Уа1 Н1з Уа1 Рго Туг ТИг С1п А1а Зег Зег С1у РИе С1и МеЕ
770 775 780
Тгр Ьуз Азп Азп Зег С1у Агд Рго Ьеи С1п С1и ТИг А1а Рго РИе С1у
785 790 795 800
Суз Ьуз 11е А1а Уа1 Азп Рго Ьеи Агд А1а Уа1 Азр Суз Зег Туг С1у
805 810 815
Азп 11е Рго 11е Зег 11е Азр 11е Рго Азп А1а А1а РИе 11е Агд ТИг
820 825 830
Зег Азр А1а Рго Ьеи Уа1 Зег ТИг Уа1 Ьуз Суз С1и Уа1 Зег С1и Суз
835 840 845
ТИг Туг Зег А1а Азр РИе С1у С1у МеЕ А1а ТИг Ьеи С1п Туг Уа1 Зег
- 97 032403
850
855
860
Азр 865 Агд С1и С1у С1п Суз 870 Рго Уа1 Η^з Зег Η^з 875 Зег Зег ТЬг А1а ТЬг 880
Ьеи С1п С1и Зег ТЬг Уа1 Η^3 Уа1 Ьеи С1и Ьуз С1у А1а Уа1 ТЬг Уа1
885 890 895
Η^з РЬе Зег ТЬг А1а Зег Рго С1п А1а Азп РЬе 11е Уа1 Зег Ьеи Суз
900 905 910
С1у Ьуз Ьуз ТЬг ТЬг Суз Азп А1а С1и Суз Ьуз Рго Рго А1а Азр Η^з
915 920 925
11е Уа1 Зег ТЬг Рго Η^з Ьуз Азп Азр С1п С1и РЬе С1п А1а А1а 11е
930 935 940
Зег Ьуз ТЬг Зег Тгр Зег Тгр Ьеи РЬе А1а Ьеи РЬе С1у С1у А1а Зег
945 950 955 960
Зег Ьеи Ьеи 11е 11е С1у Ьеи МеБ 11е РЬе А1а Суз Зег МеБ МеБ Ьеи
965 970 975
ТЬг Зег ТЬг Агд Агд
980
<210>17 <211>982 <212> белок <213> Вирус Синдбис <400>17
МеБ 1 Зег А1а А1а Рго 5 Ьеи Уа1 ТЬг А1а МеБ 10 Суз Ьеи Ьеи С1у Азп 15 Уа1
Зег РЬе Рго Суз Азр Агд Рго Рго ТЬг Суз Туг ТЬг Агд С1и Рго Зег
20 25 30
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 Азп Η^з С1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТЬг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд Зег Уа1 11е Азр Азр РЬе ТЬг Ьеи ТЬг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТЬг
65 70 75 80
- 98 032403
Суз Зег Туг Суз Η^з 85 Η^з ТЬг Уа1 Рго Суз 90 РЬе Зег Рго Уа1 Ьуз 95 11е
Б1и С1п Уа1 Тгр Азр Б1и А1а Азр Азр Азп ТЬг 11е Агд 11е С1п ТЬг
100 105 110
Зег А1а С1п РЬе Б1у Туг Азр С1п Зег Б1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз
115 120 125
Туг Агд Туг Меб Зег Ьеи Ьуз С1п Азр Η^з ТЬг Уа1 Ьуз Б1и Б1у ТЬг
130 135 140
Меб Азр Азр 11е Ьуз 11е Зег ТЬг Зег Б1у Рго Суз Агд Агд Ьеи Зег
145 150 155 160
Туг Ьуз Б1у Туг РЬе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго Б1у Азр Зег Уа1
165 170 175
ТЬг Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТЬг Зег Суз ТЬг Ьеи А1а
180 185 190
Агд Ьуз 11е Ьуз Рго Ьуз РЬе Уа1 Б1у Агд Б1и Ьуз Туг Азр Ьеи Рго
195 200 205
Рго Уа1 Η^з Б1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТЬг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи Ьуз
210 215 220
Б1и ТЬг ТЬг А1а Б1у Туг 11е ТЬг Меб Η^з Агд Рго Агд Рго Η^з А1а
225 230 235 240
Туг ТЬг Зег Туг Ьеи Б1и Б1и Зег Зег Б1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго
245 250 255
Рго Зег Б1у Ьуз Азп 11е ТЬг Туг Б1и Суз Ьуз Суз Б1у Азр Туг Ьуз
260 265 270
ТЬг Б1у ТЬг Уа1 Зег ТЬг Агд ТЬг Б1и 11е ТЬг Б1у Суз ТЬг А1а 11е
275 280 285
Ьуз С1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр С1п ТЬг Ьуз Тгр Уа1 РЬе Азп
290 295 300
Зег Рго Азр Ьеи 11е Агд Η^з Азр Азр Η^з ТЬг А1а С1п Б1у Ьуз Ьеи
305 310 315 320
- 99 032403
Ηίδ Ьеи Рго Рке Ьуз 325 Ьеи 11е Рго Зег Тйг 330 Суз Мек Уй1 Рго Уй1 335 А1а
Ηίδ А1а Рго Азп Уй1 11е Н1з С1у Рке Ьуз Н1з 11е Зег Ьеи С1п Ьеи
340 345 350
Азр Тйг Азр Н1з Ьеи ТЙГ Ьеи Ьеи ТЙГ ТЙГ Агд Агд Ьеи С1у А1а Азп
355 360 365
Рго С1и Рго ТЙГ ТЙГ С1и Тгр 11е Уй1 С1у Ьуз ТЙГ Уй1 Агд Азп Рке
370 375 380
Тйг Уй1 Азр Агд Азр С1у Ьеи С1и Туг 11е Тгр С1у Азп Н1з С1и Рго
385 390 395 400
Уй1 Агд Уй1 Туг А1а С1п С1и Зег А1а Рго С1у Азр Рго Н1з С1у Тгр
405 410 415
Рго Н1з С1и 11е Уй1 С1п Н1з Туг Туг Н1з Агд Н1з Рго Уй1 Туг ТЙГ
420 425 430
11е Ьеи А1а Уй1 А1а Зег А1а ТЙГ Уй1 А1а Мек Мек 11е С1у Уй1 ТЙГ
435 440 445
Уй1 А1а Уй1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и Суз Ьеи Тйг Рго
450 455 460
Туг А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уй1 11е Рго ТЙГ Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи
465 470 475 480
Суз Суз Уй1 Агд Зег А1а Азп А1а С1и ТЙГ Рке ТЙГ С1и ТЙГ Мек Зег
485 490 495
Туг Ьеи Тгр Зег Азп Зег С1п Рго Рке Рке Тгр Уй1 С1п Ьеи Суз 11е
500 505 510
Рго Ьеи А1а А1а Рке 11е Уй1 Ьеи Мек Агд Суз Суз Зег Суз Суз Ьеи
515 520 525
Рго Рке Ьеи Уй1 Уй1 А1а С1у А1а Туг Ьеи А1а Ьуз Уй1 Азр А1а Туг
530 535 540
С1и Н1з А1а Тйг Тйг Уй1 Рго Азп Уй1 Рго С1п 11е Рго Туг Ьуз А1а
545 550 555 560
- 100 032403
Ьеи Уа1 С1и Агд А1а С1у 565 Туг А1а Рго Ьеи Азп Ьеи 570 С1и 11е ТНг 575 Уа1
Меб Зег Зег С1и Уа1 Ьеи Рго Зег ТНг Азп С1п С1и Туг 11е ТНг Суз
580 585 590
Ьуз РНе ТНг ТНг Уа1 Уа1 Рго Зег Рго Ьуз 11е Ьуз Суз Суз С1у Зег
595 600 605
Ьеи С1и Суз С1п Рго А1а А1а Н1з А1а Азр Туг ТНг Суз Ьуз Уа1 РНе
610 615 620
С1у С1у Уа1 Туг Рго РНе Меб Тгр С1у С1у А1а С1п Суз РНе Суз Азр
625 630 635 640
Зег С1и Азп Зег С1п Меб Зег С1и А1а Туг Уа1 С1и Ьеи Зег А1а Азр
645 650 655
Суз А1а Зег Азр Н1з А1а С1п А1а 11е Ьуз Уа1 Н1з ТНг А1а А1а Меб
660 665 670
Ьуз Уа1 С1у Ьеи Агд 11е Уа1 Туг С1у Азп ТНг ТНг Зег РНе Ьеи Азр
675 680 685
Уа1 Туг Уа1 Азп С1у Уа1 ТНг Рго С1у ТНг Зег Ьуз Азр Ьеи Ьуз Уа1
690 695 700
11е А1а С1у Рго 11е Зег А1а Зег РНе ТНг Рго РНе Азр Н1з Ьуз Уа1
705 710 715 720
Уа1 11е Н1з Агд С1у Ьеи Уа1 Туг Азп Туг Азр РНе Рго С1и Туг С1у
725 730 735
А1а Меб Ьуз Рго С1у А1а РНе С1у Азр 11е С1п А1а ТНг Зег Ьеи ТНг
740 745 750
Зег Ьуз Азр Ьеи 11е А1а Зег ТНг Азр 11е Агд Ьеи Ьеи Ьуз Рго Зег
755 760 765
А1а Ьуз Азп Уа1 Н1з Уа1 Рго Туг ТНг С1п А1а Зег Зег С1у РНе С1и
770 775 780
Меб Тгр Ьуз Азп Азп Зег С1у Агд Рго Ьеи С1п С1и ТНг А1а Рго РНе
785 790 795 800
- 101 032403
С1у Суз Ьуз 11е А1а 805 Уа1 Азп Рго Ьеи Агд 810 А1а Уа1 Азр Суз Зег 815 Туг
С1у Азп 11е Рго 11е Зег 11е Азр 11е Рго Азп А1а А1а РЬе 11е Агд
820 825 830
ТЬг Зег Азр А1а Рго Ьеи Уа1 Зег ТЬг Уа1 Ьуз Суз С1и Уа1 Зег С1и
835 840 845
Суз ТЬг Туг Зег А1а Азр РЬе С1у С1у Меб А1а ТЬг Ьеи С1п Туг Уа1
850 855 860
Зег Азр Агд С1и С1у С1п Суз Рго Уа1 Н13 Зег Н13 Зег Зег ТЬг А1а
865 870 875 880
ТЬг Ьеи С1п С1и Зег ТЬг Уа1 Н13 Уа1 Ьеи С1и Ьуз С1у А1а Уа1 ТЬг
885 890 895
Уа1 Н13 РЬе Зег ТЬг А1а Зег Рго С1п А1а Азп РЬе 11е Уа1 Зег Ьеи
900 905 910
Суз С1у Ьуз Ьуз ТЬг ТЬг Суз Азп А1а С1и Суз Ьуз Рго Рго А1а Азр
915 920 925
Н15 11е Уа1 Зег ТЬг Рго Н13 Ьуз Азп Азр С1п С1и РЬе С1п А1а А1а
930 935 940
11е Зег Ьуз ТЬг Зег Тгр Зег Тгр Ьеи РЬе А1а Ьеи РЬе С1у С1у А1а
945 950 955 960
Зег Зег Ьеи Ьеи 11е 11е С1у Ьеи Меб 11е РЬе А1а Суз Зег Меб Меб
965 970 975
Ьеи ТЬг Зег ТЬг Агд Агд
980
<210> 18
<211> 423
<212> белок
<213> Вирус Синдбис
<400> 18
Зег Уа1 11е Азр Азр РЬе ТЬг Ьеи ТЬг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТЬг Суз
1 5 10 15
- 102 032403
Зег Туг Суз Н1з 20 Нбз ТЬг Уа1 Рго Суз 25 РЬе Зег Рго Уа1 Ьуз 30 11е Б1и
Б1п Уа1 Тгр Азр Б1и А1а Азр Азр Азп ТЬг 11е Агд 11е Б1п ТЬг Зег
35 40 45
А1а Б1п РЬе Б1у Туг Азр Б1п Зег Б1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз Туг
50 55 60
Агд Туг Меб Зег Ьеи Ьуз Б1п Азр Н1з ТЬг Уа1 Ьуз Б1и Б1у ТЬг Меб
65 70 75 80
Азр Азр 11е Ьуз 11е Зег ТЬг Зег Б1у Рго Суз Агд Агд Ьеи Зег Туг
85 90 95
Ьуз Б1у Туг РЬе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго Б1у Азр Зег Уа1 ТЬг
100 105 110
Уа1 Зег 11е Уа1 Зег Зег Азп Зег А1а ТЬг Зег Суз ТЬг Ьеи А1а Агд
115 120 125
Ьуз 11е Ьуз Рго Ьуз РЬе Уа1 Б1у Агд Б1и Ьуз Туг Азр Ьеи Рго Рго
130 135 140
Уа1 Н1з Б1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТЬг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи Ьуз Б1и
145 150 155 160
ТЬг ТЬг А1а Б1у Туг 11е ТЬг Меб Н1з Агд Рго Агд Рго Н1з А1а Туг
165 170 175
ТЬг Зег Туг Ьеи Б1и Б1и Зег Зег Б1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго Рго
180 185 190
Зег Б1у Ьуз Азп 11е ТЬг Туг Б1и Суз Ьуз Суз Б1у Азр Туг Ьуз ТЬг
195 200 205
Б1у ТЬг Уа1 Зег ТЬг Агд ТЬг Б1и 11е ТЬг Б1у Суз ТЬг А1а 11е Ьуз
210 215 220
Б1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр Б1п ТЬг Ьуз Тгр Уа1 РЬе Азп Зег
225 230 235 240
Рго Азр Ьеи 11е Агд Н1з Азр Азр Н1з ТЬг А1а Б1п Б1у Ьуз Ьеи Н1з
245 250 255
- 103 032403
Ьеи Рго РЬе Ьуз 260 Ьеи 11е Рго Зег ТЬг 265 Суз Мек Уа1 Рго Уа1 270 А1а Η^з
А1а Рго Азп Уа1 11е Η^з С1у РЬе Ьуз Η^з 11е Зег Ьеи С1п Ьеи Азр
275 280 285
ТЬг Азр Η^з Ьеи ТЬг Ьеи Ьеи ТЬг ТЬг Агд Агд Ьеи С1у А1а Азп Рго
290 295 300
С1и Рго ТЬг ТЬг С1и Тгр 11е Уа1 С1у Ьуз ТЬг Уа1 Агд Азп РЬе ТЬг
305 310 315 320
Уа1 Азр Агд Азр С1у Ьеи С1и Туг 11е Тгр С1у Азп Η^з С1и Рго Уа1
325 330 335
Агд Уа1 Туг А1а С1п С1и Зег А1а Рго С1у Азр Рго Η^з С1у Тгр Рго
340 345 350
Η^з С1и 11е Уа1 С1п Η^з Туг Туг Η^з Агд Η^з Рго Уа1 Туг ТЬг 11е
355 360 365
Ьеи А1а Уа1 А1а Зег А1а ТЬг Уа1 А1а Мек Мек 11е С1у Уа1 ТЬг Уа1
370 375 380
А1а Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и Суз Ьеи ТЬг Рго Туг
385 390 395 400
А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТЬг Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи Суз
405 410 415
Суз Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а
420
<210> <211> <212> <213> 19 65 белок Вирус Синдбис
<400> 19
Мек Зег А1а А1а Рго Ьеи Уа1 ТЬг А1а Мек Суз
5 10
Ьеи Ьеи С1у Азп Уа1
Зег РЬе Рго Суз Азр Агд Рго Рго
ТЬг Суз
Туг ТЬг Агд С1и Рго Зег
- 104 032403
Агд А1а Ьеи Азр 35 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 40 Азп Н15 С1и 45 А1а Туг Азр
ТЬг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд <210> 20 <211> 488 <212> белок <213> Вирус Синдбис <400> 20
Меб 1 Зег А1а А1а Рго 5 Ьеи Уа1 ТЬг А1а Меб 10 Суз Ьеи Ьеи С1у Азп 15 Уа1
Зег РЬе Рго Суз Азр Агд Рго Рго ТЬг Суз Туг ТЬг Агд С1и Рго Зег
20 25 30
Агд А1а Ьеи Азр 11е Ьеи С1и С1и Азп Уа1 Азп Н1з С1и А1а Туг Азр
35 40 45
ТЬг Ьеи Ьеи Азп А1а 11е Ьеи Агд Суз С1у Зег Зег С1у Агд Зег Ьуз
50 55 60
Агд Зег Уа1 11е Азр Азр РЬе ТЬг Ьеи ТЬг Зег Рго Туг Ьеи С1у ТЬг
65 70 75 80
Суз Зег Туг Суз Н1з Н1з ТЬг Уа1 Рго Суз РЬе Зег Рго Уа1 Ьуз 11е
85 90 95
С1и С1п Уа1 Тгр Азр С1и А1а Азр Азр Азп ТЬг 11е Агд 11е С1п ТЬг
100 105 110
Зег А1а С1п РЬе С1у Туг Азр С1п Зег С1у А1а А1а Зег А1а Азп Ьуз
115 120 125
Туг Агд Туг Меб Зег Ьеи Ьуз С1п Азр Н1з ТЬг Уа1 Ьуз С1и С1у ТЬг
130 135 140
Меб Азр Азр 11е Ьуз 11е Зег ТЬг Зег С1у Рго Суз Агд Агд Ьеи Зег
145 150 155 160
Туг Ьуз С1у Туг РЬе Ьеи Ьеи А1а Ьуз Суз Рго Рго С1у Азр Зег Уа1
- 105 032403
165
170
175
ТЬг Уа1 Зег 11е Уа1 180 Зег Зег Азп Зег 185 А1а ТЬг Зег Суз ТЬг 190 Ьеи А1а
Агд Ьуз 11е Ьуз Рго Ьуз РЬе Уа1 С1у Агд С1и Ьуз Туг Азр Ьеи Рго
195 200 205
Рго Уа1 Η^з С1у Ьуз Ьуз 11е Рго Суз ТЬг Уа1 Туг Азр Агд Ьеи Ьуз
210 215 220
С1и ТЬг ТЬг А1а С1у Туг 11е ТЬг Меб Η^з Агд Рго Агд Рго Η^з А1а
225 230 235 240
Туг ТЬг Зег Туг Ьеи С1и С1и Зег Зег С1у Ьуз Уа1 Туг А1а Ьуз Рго
245 250 255
Рго Зег С1у Ьуз Азп 11е ТЬг Туг С1и Суз Ьуз Суз С1у Азр Туг Ьуз
260 265 270
ТЬг С1у ТЬг Уа1 Зег ТЬг Агд ТЬг С1и 11е ТЬг С1у Суз ТЬг А1а 11е
275 280 285
Ьуз С1п Суз Уа1 А1а Туг Ьуз Зег Азр С1п ТЬг Ьуз Тгр Уа1 РЬе Азп
290 295 300
Зег Рго Азр Ьеи 11е Агд Η^з Азр Азр Η^з ТЬг А1а С1п С1у Ьуз Ьеи
305 310 315 320
Η^з Ьеи Рго РЬе Ьуз Ьеи 11е Рго Зег ТЬг Суз Меб Уа1 Рго Уа1 А1а
325 330 335
Η^з А1а Рго Азп Уа1 11е Η^з С1у РЬе Ьуз Η^з 11е Зег Ьеи С1п Ьеи
340 345 350
Азр ТЬг Азр Η^з Ьеи ТЬг Ьеи Ьеи ТЬг ТЬг Агд Агд Ьеи С1у А1а Азп
355 360 365
Рго С1и Рго ТЬг ТЬг С1и Тгр 11е Уа1 С1у Ьуз ТЬг Уа1 Агд Азп РЬе
370 375 380
ТЬг Уа1 Азр Агд Азр С1у Ьеи С1и Туг 11е Тгр С1у Азп Η^з С1и Рго
385 390 395 400
Уа1 Агд Уа1 Туг А1а С1п С1и Зег А1а Рго С1у Азр Рго Η^з С1у Тгр
- 106 032403
405 410 415
Рго Η^з С1и 11е 420 Уа1 С1п Η^з Туг Туг 425 Η^з Агд Η^з Рго Уа1 430 Туг ТИг
11е Ьеи А1а Уа1 А1а Зег А1а ТИг Уа1 А1а МеЕ МеЕ 11е С1у Уа1 ТИг
435 440 445
Уа1 А1а Уа1 Ьеи Суз А1а Суз Ьуз А1а Агд Агд С1и Суз Ьеи ТИг Рго
450 455 460
Туг А1а Ьеи А1а Рго Азп А1а Уа1 11е Рго ТИг Зег Ьеи А1а Ьеи Ьеи
465 470 475 480
Суз Суз Уа1 Агд Зег А1а Азп А1а
485
<210> 21 <211> 683 <212> ДНК <213> ВИЧ типа 1
<400> 21 ссЕадааааа 60 саЕддадсаа ЕсасаадЕад сааЕасадса дсЕассааЕд сЕдаЕЕдЕдс
сЕддсЕадаа 120 дсасаададд аддаддаддЕ дддЕЕЕЕсса дЕсасассЕс аддЕассЕЕЕ
аадассааЕд 180 асЕЕасаадд садсЕдЕада ЕсЕЕадссас ЕЕЕЕЕаааад аааадддддд
асЕддааддд 240 сЕааЕЕсасЕ сссаасдаад асаадаЕаЕс сЕЕдаЕсЕдЕ ддаЕсЕасса
сасасааддс 300 ЕасЕЕсссЕд аЕЕддсадаа сЕасасасса дддссаддда ЕсадаЕаЕсс
асЕдассЕЕЕ 360 ддаЕддЕдсЕ асаадсЕадЕ ассадЕЕдад саададаадд Еадаадаадс
сааЕдаадда 420 дадаасассс дсЕЕдЕЕаса сссЕдЕдадс сЕдсаЕддда ЕддаЕдассс
ддадададаа 480 дЕаЕЕададЕ ддаддЕЕЕда садссдссЕа дсаЕЕЕсаЕс асаЕддсссд
ададсЕдсаЕ 540 ссддасЕдЕа сЕдддЕсЕсЕ сЕддЕЕадас садаЕсЕдад ссЕдддадсЕ
сЕсЕддсЕаа 600 сЕадддаасс сасЕдсЕЕаа дссЕсааЕаа адсЕЕдссЕЕ дадЕдсЕЕса
- 107 032403
адБадБдБдБ 660 дБсадБдБдд 683 дсссдБсБдБ ааааБсБсБа БдБдБдасБс дса БддБаасБад адаБсссБса дасссББББа
<210> 22 <211> 416 <212> ДНК <213> ВИЧ <400> 22 типа 1
ссБадааааа 60 саБддадсаа БсасаадБад сааБасадса дсБассааБд сБдаББдБдс
сБддсБадаа 120 дсасаададд аддаддаддБ дддББББсса дБсасассБс аддБассБББ
аадассааБд 180 асББасаадд садсБдБада БсББадссас БББББаааад аааадддддд
асБддааддд 240 сБааББсасБ сссаасдаад асаадаБсБд сБББББдссБ дБасБдддБс
БсБсБддББа 300 дассадаБсБ дадссБддда дсБсБсБддс БаасБаддда асссасБдсБ
БаадссБсаа 360 БааадсББдс сББдадБдсБ БсаадБадБд БдБдсссдБс БдББдБдБда
сБсБддБаас 416 БададаБссс БсадасссББ ББадБсадБд БддааааБсБ сБадса
<210> 23 <211> 401 <212> ДНК <213> ВИЧ типа 1
<400> 23 ссБадааааа 60 саБддадсаа БсасаадБад сааБасадса дсБассааБд сБдаББдБдс
сБддсБадаа 120 дсасаададд аддаддаддБ дддББББсса дБсасассБс аддБассБББ
аадассааБд 180 асББасаадд садсБдБада БсББадссас БББББасБдд аадддсБааБ
БсасБсссаа 240 сдаадасаад аБсБдсББББ БдссБдБасБ дддБсБсБсБ ддББадасса
даБсБдадсс 300 БдддадсБсБ сБддсБаасБ адддаассса сБдсББаадс сБсааБааад
сББдссББда 360 дБдсББсаад БадБдБдБдс ссдБсБдББд БдБдасБсБд дБаасБадад
аБсссБсада 401 сссББББадБ садБдБддаа ааБсБсБадс а
- 108 032403 <210>24 <211> 8 <212> белок <213> Са11из да11из <400>24
Зег 11е 11е Азп РЬе Б1и Ьуз Ьеи
<210> <211> <212> <213> 25 9 белок Миз тизси1из
<400> 25
Зег Рго Зег Туг А1а Туг Нтз С1п РЬе
<210> 26
<211> 5
<212> белок
<213> Вирус Синдбис
<400> 26
Агд Зег Ьуз Агд Зег <210>27 <211>4 <212> белок <213> Вирус Синдбис <400>27
Агд Зег Ьуз Агд

Claims (31)

  1. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Лентивирусная векторная частица, способная инфицировать дендритные клетки, включающая:
    (a) оболочку, содержащую вариант гликопротеина Е2 вируса Синдбис, идентичный по меньшей мере на 90% аминокислотной последовательности 8ЕО ΙΌ N0: 1, в которой: (1) остаток в положении 160 отсутствует или является остатком аминокислоты, отличной от глутаминовой кислоты, (и) остаток в положении 70 является неосновным остатком, причем вариант гликопротеина Е2 не является частью гибридного белка с гликопротеином Е3 вируса Синдбис; и (b) лентивирусный векторный геном, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую антиген.
  2. 2. Лентивирусная векторная частица по п.1, в которой вариант гликопротеина Е2 связывается с ИС8ΙΟΝ.
  3. 3. Лентивирусная векторная частица по п.1, отличающаяся тем, что остаток в положении 160 является остатком глицина, аланина, валина, лейцина или изолейцина.
  4. 4. Лентивирусная векторная частица по п.3, отличающаяся тем, что остаток в положении 160 явля
    - 109 032403 ется остатком глицина.
  5. 5. Лентивирусная векторная частица по п.1, отличающаяся тем, что аминокислотная последовательность варианта гликопротеина Е2 состоит из аминокислотных остатков 66-488 последовательности 8ЕО ΙΌ N0: 3, аминокислотных остатков 66-488 последовательности 8ЕС ΙΌ N0: 4 или аминокислотных остатков 66-486 последовательности 8ЕС ΙΌ N0: 5 или идентична указанным аминокислотным остаткам по меньшей мере на 95%.
  6. 6. Лентивирусная векторная частица по п.1, отличающаяся тем, что указанный антиген представляет собой опухолеспецифичный антиген или вирусный антиген.
  7. 7. Лентивирусная векторная частица по п.6, отличающаяся тем, что опухолеспецифичный антиген представляет собой карбоангидразу IX, ΝΥ-Ε80-1, МАСЕ, ВАСЕ, ВАСЕ, МАК.Т-1/Ме1ап-А, др 100, др75, шба-7, тирозиназу, тирозиназа-связанный белок, 5Т4, 8М22-а, карбоангидразу I, ΗΙΕ-1α, ΗΙΕ-2α, Р8МА, Р8А, 8ТЕАР или ΝΚΧ3.1.
  8. 8. Лентивирусная векторная частица по п.6, отличающаяся тем, что вирусный антиген представляет собой антиген ΗΙν, антиген 8Ιν, антиген аденовируса, антиген энтеровируса, антиген коронавируса, антиген калицивируса, антиген вируса собачьей чумки, антиген вируса Эбола, антиген флавивируса, антиген вируса гепатита, антиген вируса герпеса, антиген вируса инфекционного перитонита, антиген вируса гриппа, антиген вируса лейкемии, антиген вируса марбургской болезни, антиген ортомиксовируса, антиген вируса папилломы, антиген вируса парагриппа, антиген парамиксовируса, антиген парвовируса, антиген пестивируса, антиген пикорнавируса, антиген полиовируса, антиген поксвируса, антиген вируса бешенства, антиген реовируса, антиген ретровируса или антиген ротавируса.
  9. 9. Лентивирусная векторная частица по п.1, отличающаяся тем, что лентивирусный векторный геном имеет инактивированный 3' длинный терминальный повтор (ЬТК.) или самоинактивирующийся 3' длинный терминальный повтор (ЬТВ).
  10. 10. Лентивирусная векторная частица по п.9, отличающаяся тем, что лентивирусный векторный геном содержит И3 элемент, не имеющий энхансерной последовательности, ТАТА-бокса, сайта 8р1, сайта ΝΚ-кВ и/или полипуринового тракта (РРТ).
  11. 11. Лентивирусная векторная частица по п.1, отличающаяся тем, что лентивирусный векторный геном содержит И3 элемент, не имеющий энхансерной последовательности, ТАТА-бокса, сайта 8р1, сайта ΝΚ-кВ и/или полипуринового тракта (РРТ).
  12. 12. Лентивирусная векторная частица по п.1, отличающаяся тем, что лентивирусный векторный геном содержит любую из нуклеотидных последовательностей 8ЕС ΙΌ N0: 21, 22 или 23.
  13. 13. Лентивирусная векторная частица по п.1, отличающаяся тем, что лентивирусный векторный геном дополнительно содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую фактор созревания/стимуляции дендритных клеток.
  14. 14. Лентивирусная векторная частица по п.13, отличающаяся тем, что фактор созревания/стимуляции дендритных клеток представляет собой СМ-С8Е, ΙΕ-2, ГЬ-4, ГЬ-6, ΙΕ-7, ГЬ-15, ГЬ-21, ГЬ23, Т>а, В7.1, В7.2, 4-1ВВ, СЭ40-лигаид или индуцируемый лекарствами СЭ40.
  15. 15. Лентивирусная векторная частица по п.1, отличающаяся тем, что экспрессия нуклеотидной последовательности, кодирующей антиген, контролируется промотором, который представляет собой промотор Убиквитина-С человека (ИЫС), немедленно-ранний промотор цитомегаловируса (СМУ), промотор вируса саркомы Рауса (Κδν) и реагирующий на тетрациклин промотор.
  16. 16. Лентивирусная векторная частица по п.1, отличающаяся тем, что лентивирусный векторный геном дополнительно содержит нуклеотидную последовательность, кодирующую второй антиген.
  17. 17. Лентивирусная векторная частица по п.1, отличающаяся тем, что остаток в положении 76 является неосновным остатком.
  18. 18. Лентивирусная векторная частица по п.1, отличающаяся тем, что остаток в положении 159 является неосновным остатком или отсутствует.
  19. 19. Лентивирусная векторная частица по п.17, отличающаяся тем, что остаток в положении 159 является неосновным остатком или отсутствует.
  20. 20. Лентивирусная векторная частица, способная инфицировать дендритные клетки, включающая:
    (a) оболочку, содержащую вариант гликопротеина Е2 вируса Синдбис, идентичный по меньшей мере на 90% аминокислотной последовательности 8ЕС ΙΌ N0: 1, в которой:
    (ί) остаток в положении 160 отсутствует или является остатком аминокислоты, отличной от глутаминовой кислоты, (ίί) остаток в положении 70 заменен остатком глутаминовой кислоты или аспарагиновой кислоты, (ΐϊϊ) остаток в положении 159 заменен остатком глутаминовой кислоты или аспарагиновой кислоты;
    (ίν) остатки в положениях 71-75 являются неизмененными;
    причем вариант гликопротеина Е2 не является частью гибридного белка с гликопротеином Е3 вируса Синдбис; и (b) лентивирусный векторный геном, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую антиген.
    - 110 032403
  21. 21. Лентивирусная векторная частица по п.20, отличающаяся тем, что остаток в положении 160 заменен остатком глицина, остаток в положении 159 заменен остатком глутаминовой кислоты, остаток в положении 70 заменен остатком глутаминовой кислоты, причем лентивирусный векторный геном содержит ЬТК, не имеющий полипуринового тракта (РРТ).
  22. 22. Лентивирусная векторная частица, способная инфицировать дендритные клетки, содержащая:
    (a) оболочку, содержащую вариант гликопротеина Е2 вируса Синдбис, образованный остатками 66488 аминокислотной последовательности ВЕС ΙΌ N0: 3, причем вариант гликопротеина Е2 не является частью гибридного белка с гликопротеином Е3 вируса Синдбис; и (b) лентивирусный векторный геном, содержащий нуклеотидную последовательность, кодирующую антиген.
  23. 23. Лентивирусная векторная частица по п.20, отличающаяся тем, что лентивирусный векторный геном содержит нуклеотидную последовательность ВЕС) ΙΌ N0: 21.
  24. 24. Лентивирусная векторная частица по п.20, отличающаяся тем, что лентивирусный векторный геном содержит нуклеотидную последовательность ВЕР ΙΌ N0: 22.
  25. 25. Лентивирусная векторная частица по п.20, отличающаяся тем, что лентивирусный векторный геном содержит нуклеотидную последовательность ВЕР ΙΌ N0: 23.
  26. 26. Фармацевтическая композиция для иммунизации антигеном, содержащая лентивирусные частицы по п.1, которые кодируют указанный антиген, и фармацевтически приемлемый носитель.
  27. 27. Фармацевтическая композиция по п.26, отличающаяся тем, что лентивирусные частицы имеют МЕ по меньшей мере 105/мл.
  28. 28. Фармацевтическая композиция по п.26, дополнительно содержащая иммуностимулирующий агент.
  29. 29. Фармацевтическая композиция по п.26, дополнительно содержащая адъювант.
  30. 30. Фармацевтическая композиция для иммунизации антигеном, содержащая лентивирусные частицы по п.20, которые кодируют указанный антиген, и фармацевтически приемлемый носитель.
    <.....Ё·3.
    10 .... 1 .... 1 .... 1 20 30 1_____1 .... 1 40 1_____1 .... 1 50 60 70 1 . . . . 1 - . . . 1 . . 1 . . 11 . . . 1 . 1 80 ! . . I ЗУСгаи М8АА₽1.УТАМСЫЛНУ8Р₽С0ВРРТСУТНЕР8НА1.01ЬЕЕКУМНЕАУ0ТЫЛА11.НСС88е-—- ЗУХ00ЕТ1.ТЗРУЬСТ 8ХН-Уаг1 81И-Уаг2 .................К8КК.......... 31Н-УахЗ .............. ЙВКП.......... 90 .... 1 ... .1 .... 1 100 ....1,...1 110 1....1....1 120 1 .... I .... 1 130 140 150 ί .... 1 .... ί .... 1 ... .1 160 . I 8У6ти С5УСННТУРСГЗРУК1Е0УТОЕАПОНТ1«10ТЗА0Г6УО08СААЗАНК¥АУМЗЕК0МУР¥0УРОУАТУКЕСТМПО1К18Т 51М-Уах1 .........Ε.--------ОН......... 81Н-Уаг2 .........Ε.--------ОН. .Ε......
    51К-УагЗ ......................................................Е.---------ОН..Е
    170 180 190 200 210 220 230 240
    I .... I .... I .... I .... 1 .... I ....1 .... I .... I .... 1 .... I .... I .... I ... .1 .... I .... I
    5У(5гаи 8ΟΡσΚΚΧ5ΥΚεϊίΙ.1ΑΚΟΡΡδ05ντν5Χν55Η6ΑΤ8εΤΙΑΚΚΙΚ₽Κ1Γν(3Μ:ΚΥ0Ι.₽ΡνΗ6ΚΚΙΡΟΤνΥ0ΐαΑΑΤΤΑ6ΪΙΤ 31К-Уаг1 .......ЕС. . 81Я-Уаг2 .......ЕС..< δΙΝ-УагЗ 250 .... 1 .. ..1 .... 1 260 1 .... 1.... 270 1 1 280 1....1....1 290 1 .... 1 .... 1 300 1 .... 1... . 310 1 .... 1 .... 1. 320 .... 1
    ЗУОти МНК₽КРНАХТ8ХМ:Е335КУГАКРгзеКМ1ТУЕСКС6ОГКТ6ТУ8ТКТЕ1Т<ЗСТА1К<2СУАУК8ОеТКНУЕ№РПЫКЯ0 31И-Уаг1 ................................................................................
    8Ш-Уах2 ................................................................................
    ЗПЯ-УагЗ ................................................................................
    330 340 350 36С 370 380 390 400
    .... I .... I .... I .... I .... I .... I .... I ....ί .... II .... I .... I .... I .... I .... |
    ЗУбгаи ОНТАОСКЬНЬРЕКЫРЗТСМУРУАНАРКУ1НСЕКН13ЬОЬОТОНЬТЫ.ТТННЬеАКРЕРТТЕИ1УСКТУ1ЖГГУОНОЗЬЕ
    8ΧΝ-νβε1 .................. . . ...........
  31. 31Н-Уаг2 ................................................................................
    31Ы-УагЗ ................................................................................
    410 420 430 440 450 400 470 480 | I .... I .... I .... I .... I ||I .... I .... I |I .... I .... I .... I ЗУОгаи ΪΙΗδΝΗΕΡνκνΎΑβΕδΑΡαϋΡΗΟΗΡΗΕΐνΰΗϊΥΗΗΗΡνϊΤΙΙΛνΑΕΑΤνΑΜΜΙΟντνΑνΕΟΑαυΛΡΕείΤΡΥΜΛΡΝΑν ЗШ-Уаг1 ................................................................................
    ЗШ-Уаг2 ................................................................................
    ЗШ-УагЗ ................................................................................
EA201270191A 2009-07-24 2010-07-22 Лентивирусные векторы, псевдотипированные гликопротеином оболочки вируса синдбис EA032403B1 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US22849109P 2009-07-24 2009-07-24
PCT/US2010/042870 WO2011011584A1 (en) 2009-07-24 2010-07-22 Lentiviral vectors pseudotyped with a sindbis virus envelope glycoprotein

Publications (2)

Publication Number Publication Date
EA201270191A1 EA201270191A1 (ru) 2012-12-28
EA032403B1 true EA032403B1 (ru) 2019-05-31

Family

ID=42727669

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA201270191A EA032403B1 (ru) 2009-07-24 2010-07-22 Лентивирусные векторы, псевдотипированные гликопротеином оболочки вируса синдбис

Country Status (28)

Country Link
US (3) US20110064763A1 (ru)
EP (2) EP2770061B1 (ru)
JP (4) JP2013500015A (ru)
KR (1) KR101790187B1 (ru)
CN (1) CN102482329B (ru)
AU (1) AU2010276194B2 (ru)
BR (1) BR112012001653A2 (ru)
CA (1) CA2768938C (ru)
CY (1) CY1121159T1 (ru)
DK (2) DK2770061T3 (ru)
EA (1) EA032403B1 (ru)
ES (2) ES2455544T5 (ru)
HK (1) HK1201557A1 (ru)
HR (2) HRP20140327T4 (ru)
HU (1) HUE043032T2 (ru)
IL (1) IL217679A (ru)
LT (1) LT2770061T (ru)
ME (1) ME01720B (ru)
MX (1) MX2012001075A (ru)
NZ (1) NZ597804A (ru)
PL (2) PL2456786T5 (ru)
PT (2) PT2770061T (ru)
RS (2) RS58042B1 (ru)
SG (1) SG177744A1 (ru)
SI (2) SI2770061T1 (ru)
SM (1) SMT201400041B (ru)
TR (1) TR201819229T4 (ru)
WO (1) WO2011011584A1 (ru)

Families Citing this family (47)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2657737T3 (es) * 2009-07-15 2018-03-06 Calimmune Inc. Vector dual para la inhibición del virus de la inmunodeficiencia humana
BR112013020875A2 (pt) * 2011-02-15 2019-09-24 Immune Design Corp método para indução de uma resposta imune específica para um imunógeno em um indivíduo.
JP6054942B2 (ja) * 2011-04-08 2016-12-27 イミューン デザイン コーポレイション 免疫原性組成物、ならびに体液性および細胞性免疫応答を誘発するための該組成物の使用方法
WO2013116656A1 (en) * 2012-02-03 2013-08-08 Emory University Immunostimulatory compositions, particles, and uses related thereto
US9486539B2 (en) 2012-03-26 2016-11-08 The Regents Of The University Of California Nipah virus envelope pseudotyped lentiviruses and methods of their use
US8323662B1 (en) * 2012-03-30 2012-12-04 Immune Design Corp. Methods useful for generating highly mannosylated pseudotyped lentiviral vector particles comprising a Vpx protein
US9713635B2 (en) 2012-03-30 2017-07-25 Immune Design Corp. Materials and methods for producing improved lentiviral vector particles
AU2013237900B2 (en) * 2012-03-30 2017-07-27 Immune Design Corp. Lentiviral vector particles having improved transduction efficiency for cells expressing DC- SIGN
CN107540730B (zh) 2012-05-16 2021-07-16 免疫设计公司 用于hsv-2的疫苗
EP2943203A4 (en) * 2013-01-11 2016-08-24 Scripps Research Inst METHOD AND COMPOSITIONS FOR INCREASING THE TRANSDUCTION EFFICIENCY OF RETROVIRAL VECTORS
GB201308772D0 (en) * 2013-05-15 2013-06-26 Imp Innovations Ltd Vectors
PL3116900T3 (pl) 2014-03-09 2021-03-08 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Kompozycje użyteczne w leczeniu niedoboru transkarbamylazy ornitynowej (otc)
JP2017522312A (ja) 2014-07-15 2017-08-10 イミューン デザイン コーポレイション Tlr4アゴニストアジュバント及びレンチウイルスベクターを用いたプライム・ブーストレジメン
EP3838296A1 (en) * 2015-01-21 2021-06-23 Cornell University Viral vectors for prophylaxis and therapy of hemoglobinopathies
CN112481211B (zh) * 2015-01-26 2024-07-05 儿童医院公司 免疫调节性提高的细胞及其使用和生产方法
BR112017019776B1 (pt) * 2015-03-18 2020-07-28 Omnicyte proteínas de fusão que compreendem glicoproteínas de superfície de alfavírus modificadas e antígeno associado a tumor e métodos dos mesmos
DK3283658T3 (da) 2015-05-18 2020-05-18 Calimmune Inc Fremgangsmåder til at diskriminere mellem HIV-1 og lentivirus-vektorer
EP3347374A1 (en) 2015-09-09 2018-07-18 Immune Design Corp. Ny-eso-1 specific tcrs and methods of use thereof
BR112018008911A2 (pt) * 2015-11-09 2018-11-27 Immune Design Corp composições compreendendo vetores lentivirais que expressam il-12 e métodos de uso das mesmas
WO2017083356A1 (en) 2015-11-09 2017-05-18 Immune Design Corp. A retroviral vector for the administration and expression of replicon rna expressing heterologous nucleic acids
WO2017147119A1 (en) * 2016-02-23 2017-08-31 Immune Design Corp. Multigenome retroviral vector preparations and methods and systems for producing and using same
BR112018067565A2 (pt) * 2016-03-04 2019-02-05 Univ New York vetores de vírus que expressam múltiplos epítopos de antígenos associados a tumor para induzir imunidade antitumor
US11078282B2 (en) 2016-04-15 2021-08-03 Alpine Immune Sciences, Inc. CD80 variant immunomodulatory proteins and uses thereof
AU2017250358B2 (en) 2016-04-15 2023-06-01 Alpine Immune Sciences, Inc. ICOS ligand variant immunomodulatory proteins and uses thereof
EP3235828A1 (en) * 2016-04-21 2017-10-25 Genethon Stable pseudotyped lentiviral particles and uses thereof
EP3235908A1 (en) 2016-04-21 2017-10-25 Ecole Normale Superieure De Lyon Methods for selectively modulating the activity of distinct subtypes of cells
US11471488B2 (en) 2016-07-28 2022-10-18 Alpine Immune Sciences, Inc. CD155 variant immunomodulatory proteins and uses thereof
CA3032120A1 (en) 2016-07-28 2018-02-01 Alpine Immune Sciences, Inc. Cd155 variant immunomodulatory proteins and uses thereof
US11834490B2 (en) 2016-07-28 2023-12-05 Alpine Immune Sciences, Inc. CD112 variant immunomodulatory proteins and uses thereof
EP3872180A1 (en) 2016-10-20 2021-09-01 Alpine Immune Sciences, Inc. Secretable variant immunomodulatory proteins and engineered cell therapy
WO2018148180A2 (en) 2017-02-07 2018-08-16 Immune Design Corp. Materials and methods for identifying and treating cancer patients
EP3596116B1 (en) 2017-03-16 2023-09-06 Alpine Immune Sciences, Inc. Pd-l1 variant immunomodulatory proteins and uses thereof
CA3054068A1 (en) 2017-03-16 2018-09-20 Alpine Immune Sciences, Inc. Cd80 variant immunomodulatory proteins and uses thereof
JP2020511144A (ja) 2017-03-16 2020-04-16 アルパイン イミューン サイエンシズ インコーポレイテッド Pd−l2バリアント免疫調節タンパク質及びその使用
CN110869507A (zh) 2017-05-08 2020-03-06 旗舰先锋创新V股份有限公司 促进膜融合的组合物和其用途
TW201925223A (zh) 2017-10-18 2019-07-01 美商艾爾潘免疫科學有限公司 變異型icos 配位體免疫調節蛋白及相關組合物及方法
US11116833B2 (en) * 2018-02-08 2021-09-14 George Mason University Method and system for inactivating virus infectivity for producing live-attenuated vaccines
WO2019241758A1 (en) 2018-06-15 2019-12-19 Alpine Immune Sciences, Inc. Pd-1 variant immunomodulatory proteins and uses thereof
CN113348244A (zh) * 2018-11-23 2021-09-03 维拉治疗有限公司 Vsv嵌合载体
CA3120868A1 (en) 2018-11-30 2020-06-04 Alpine Immune Sciences, Inc. Cd86 variant immunomodulatory proteins and uses thereof
JP7495435B2 (ja) 2019-06-14 2024-06-04 ザ ジェイ. デビッド グラッドストーン インスティテューツ、 ア テスタメンタリー トラスト エスタブリッシュド アンダー ザ ウィル オブ ジェイ. デビッド グラッドストーン 治療用干渉粒子による免疫不全ウイルス感染を処置するための組成物及び方法
US20220307050A1 (en) * 2019-08-01 2022-09-29 The Regents Of The University Of California Non-viral transgenesis
CN110982842B (zh) * 2019-12-31 2023-04-18 山西大学 一种慢病毒表达载体的设计及应用
KR20240028975A (ko) 2021-04-08 2024-03-05 사나 바이오테크놀로지, 인크. Cd8-특이적 항체 구조체들 및 이의 조성물
US20230340627A1 (en) * 2022-04-05 2023-10-26 Bio-Rad Laboratories, Inc. Analysis of viral particles by digital assay
WO2023220603A1 (en) 2022-05-09 2023-11-16 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Vectors and methods for in vivo antibody production
WO2023240124A1 (en) 2022-06-07 2023-12-14 Regeneron Pharmaceuticals, Inc. Pseudotyped viral particles for targeting tcr-expressing cells

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2008011636A2 (en) * 2006-07-21 2008-01-24 California Institute Of Technology Targeted gene delivery for dendritic cell vaccination
RU2007134371A (ru) * 2005-02-16 2009-03-27 Лентиджен Корпорейшн (Us) Лентивирусные векторы и их применение
WO2009076524A2 (en) * 2007-12-11 2009-06-18 The University Of North Carolina At Chapel Hill Polypurine tract modified retroviral vectors

Family Cites Families (66)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4703004A (en) 1984-01-24 1987-10-27 Immunex Corporation Synthesis of protein with an identification peptide
US4569794A (en) 1984-12-05 1986-02-11 Eli Lilly And Company Process for purifying proteins and compounds useful in such process
US5168062A (en) 1985-01-30 1992-12-01 University Of Iowa Research Foundation Transfer vectors and microorganisms containing human cytomegalovirus immediate-early promoter-regulatory DNA sequence
CA1283827C (en) 1986-12-18 1991-05-07 Giorgio Cirelli Appliance for injection of liquid formulations
US5057540A (en) 1987-05-29 1991-10-15 Cambridge Biotech Corporation Saponin adjuvant
US4937190A (en) 1987-10-15 1990-06-26 Wisconsin Alumni Research Foundation Translation enhancer
CA1339684C (en) 1988-05-17 1998-02-24 Peter H. Quail Plant ubquitin promoter system
US4912094B1 (en) 1988-06-29 1994-02-15 Ribi Immunochem Research Inc. Modified lipopolysaccharides and process of preparation
HU212924B (en) 1989-05-25 1996-12-30 Chiron Corp Adjuvant formulation comprising a submicron oil droplet emulsion
US5298420A (en) 1990-08-03 1994-03-29 Tanox Biosystems, Inc. Antibodies specific for isotype specific domains of human IgM and human IgG expressed or the B cell surface
TW279133B (ru) 1990-12-13 1996-06-21 Elan Med Tech
US5328483A (en) 1992-02-27 1994-07-12 Jacoby Richard M Intradermal injection device with medication and needle guard
JPH08504091A (ja) 1992-09-22 1996-05-07 メディカル・リサーチ・カウンシル 外部表面に非ウィルス性ポリペプチドを提示する組換えウィルス
US6534051B1 (en) 1992-11-20 2003-03-18 University Of Medicine And Dentistry Of New Jersey Cell type specific gene transfer using retroviral vectors containing antibody-envelope fusion proteins and wild-type envelope fusion proteins
US5279552A (en) 1993-01-11 1994-01-18 Anton Magnet Intradermal injection device
US5997501A (en) 1993-11-18 1999-12-07 Elan Corporation, Plc Intradermal drug delivery device
WO1996017072A2 (en) 1994-11-30 1996-06-06 Chiron Viagene, Inc. Recombinant alphavirus vectors
US5660835A (en) 1995-02-24 1997-08-26 East Carolina University Method of treating adenosine depletion
WO1997005266A1 (en) 1995-07-25 1997-02-13 Introgene B.V. Methods and means for targeted gene delivery
US6013516A (en) 1995-10-06 2000-01-11 The Salk Institute For Biological Studies Vector and method of use for nucleic acid delivery to non-dividing cells
US5910434A (en) 1995-12-15 1999-06-08 Systemix, Inc. Method for obtaining retroviral packaging cell lines producing high transducing efficiency retroviral supernatant
FR2747046B1 (fr) 1996-04-05 1998-06-19 Univ Paris Curie Nouveaux vaccins issus de plasmovirus
EP0961830A1 (en) 1997-01-29 1999-12-08 Neurosearch A/S EXPRESSION VECTORS AND METHODS FOR $i(IN VIVO) EXPRESSION OF THERAPEUTIC POLYPEPTIDES
US6432699B1 (en) * 1997-03-28 2002-08-13 New York University Viral vectors having chimeric envelope proteins containing the IgG-binding domain of protein A
US6531123B1 (en) 1997-05-01 2003-03-11 Lung-Ji Chang Lentiviral vectors
ZA988446B (en) 1997-09-18 2000-03-22 Res Dev Foundation Production of vaccines using arthropod vectored viruses.
WO1999013905A1 (en) 1997-09-18 1999-03-25 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Receptor-binding pocket mutants of influenza a virus hemagglutinin for use in targeted gene delivery
US6218181B1 (en) 1998-03-18 2001-04-17 The Salk Institute For Biological Studies Retroviral packaging cell line
US7078483B2 (en) 1998-04-29 2006-07-18 University Of Southern California Retroviral vectors including modified envelope escort proteins
AU763007B2 (en) * 1998-05-22 2003-07-10 Oxford Biomedica (Uk) Limited Retroviral delivery system
EP1165842A4 (en) * 1999-03-16 2004-07-07 Dana Farber Cancer Inst Inc LENTIVIRAL VECTOR SYSTEMS FOR SCREENING LARGE QUANTITIES
DK1175497T3 (da) 1999-04-14 2010-05-31 Novartis Vaccines & Diagnostic Præparater og fremgangsmåder til generering af et immunrespons ved udnyttelse af alfavirusbaserede vektorsystemer
EP1046651A1 (en) 1999-04-19 2000-10-25 Koninklijke Universiteit Nijmegen Composition and method for modulating dendritic cell-T interaction
CA2392010A1 (en) 1999-08-27 2001-03-08 Regents Of The University Of California Use of lentiviral vectors for antigen presentation in dendritic cells
CA2388676A1 (en) 1999-10-13 2001-04-19 Chiron Corporation Method of obtaining cellular immune responses from proteins
US7241275B2 (en) 1999-10-14 2007-07-10 Becton, Dickinson And Company Intradermal needle
US6776776B2 (en) 1999-10-14 2004-08-17 Becton, Dickinson And Company Prefillable intradermal delivery device
US6494865B1 (en) 1999-10-14 2002-12-17 Becton Dickinson And Company Intradermal delivery device including a needle assembly
US20020193740A1 (en) 1999-10-14 2002-12-19 Alchas Paul G. Method of intradermally injecting substances
US6569143B2 (en) 1999-10-14 2003-05-27 Becton, Dickinson And Company Method of intradermally injecting substances
US6627442B1 (en) * 2000-08-31 2003-09-30 Virxsys Corporation Methods for stable transduction of cells with hiv-derived viral vectors
US20040091853A1 (en) * 2001-03-02 2004-05-13 Hazuda Daria J. Viral reporter particles
WO2002101057A1 (fr) * 2001-06-08 2002-12-19 Dnavec Research Inc. Transfert genique dans des cellules souches embryonnaires de primate a l'aide d'un virus de l'immunodeficience simienne de pseudo type vsv-g utilise comme vecteur
US7737124B2 (en) 2001-09-13 2010-06-15 California Institute Of Technology Method for expression of small antiviral RNA molecules with reduced cytotoxicity within a cell
AU2002336517B2 (en) 2001-09-13 2008-09-11 California Institute Of Technology Method for producing transgenic animals
US7195916B2 (en) 2001-09-13 2007-03-27 California Institute Of Technology Method for expression of small antiviral RNA molecules within a cell
ATE439041T1 (de) 2001-09-13 2009-08-15 California Inst Of Techn Verfahren zur expression von kleinen antiviralen rna-molekülen innerhalb einer zelle
US6971999B2 (en) 2001-11-14 2005-12-06 Medical Instill Technologies, Inc. Intradermal delivery device and method
ES2374042T3 (es) 2002-02-04 2012-02-13 Becton, Dickinson And Company Dispositivo y método para suministrar o extraer una sustancia a través de la piel.
US7115108B2 (en) 2002-04-02 2006-10-03 Becton, Dickinson And Company Method and device for intradermally delivering a substance
US7047070B2 (en) 2002-04-02 2006-05-16 Becton, Dickinson And Company Valved intradermal delivery device and method of intradermally delivering a substance to a patient
US6780171B2 (en) 2002-04-02 2004-08-24 Becton, Dickinson And Company Intradermal delivery device
KR101002955B1 (ko) * 2002-04-26 2010-12-21 인스티튜트 클레이톤 드 라 리쎄르셰 개선된 키메라 당단백질 및 슈도타입 렌티바이러스 벡터
US7455833B2 (en) 2002-07-15 2008-11-25 Board Of Regents, The University Of Texas System Methods and compositions for treating viral infections using antibodies and immunoconjugates to aminophospholipids
JP5145492B2 (ja) 2002-08-16 2013-02-20 独立行政法人科学技術振興機構 組換えbcgワクチン
AU2003297474A1 (en) 2002-12-18 2004-07-14 Salk Institute For Biological Studies Methods of inhibiting gene expression by rna interference
US7090837B2 (en) 2003-01-21 2006-08-15 The Salk Institute For Biological Studies Compositions and methods for tissue specific targeting of lentivirus vectors
US7556814B2 (en) 2003-10-23 2009-07-07 Karp Nelson M Immunogenic compositions comprising UV-irradiated, psoralen-inactivated, desialated human immunodeficiency virus (HIV) devoid of CD55 and CD59 in the viral membrane
US7108679B2 (en) 2004-03-11 2006-09-19 Becton, Dickinson And Company Intradermal syringe and needle assembly
US20070275873A1 (en) * 2004-04-29 2007-11-29 Heidner Hans W Methods and Compositions Comprising Protein L Immunoglobulin Binding Domains for Cell-Specific Targeting
US20080227736A1 (en) * 2004-06-03 2008-09-18 Regents Of The University Of California, Targeting Pseudotyped Retroviral Vectors
GB0417494D0 (en) 2004-08-05 2004-09-08 Glaxosmithkline Biolog Sa Vaccine
WO2006031996A2 (en) * 2004-09-14 2006-03-23 University Of Pittsburgh Of The Commonwealth System Of Higher Education Targeting viruses using a modified sindbis glycoprotein
US20070020238A1 (en) 2005-06-01 2007-01-25 David Baltimore Method of targeted gene delivery using viral vectors
DK2068918T4 (da) 2006-09-26 2024-09-02 Access To Advanced Health Inst Vaccinesammensætning omfattende syntetisk adjuvant
CA2698668A1 (en) 2007-09-07 2009-03-19 University Of Georgia Research Foundation, Inc. Synthetic lipid a derivative

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
RU2007134371A (ru) * 2005-02-16 2009-03-27 Лентиджен Корпорейшн (Us) Лентивирусные векторы и их применение
WO2008011636A2 (en) * 2006-07-21 2008-01-24 California Institute Of Technology Targeted gene delivery for dendritic cell vaccination
US20080019998A1 (en) * 2006-07-21 2008-01-24 California Institue Of Technology Targeted gene delivery for dendritic cell vaccination
WO2009076524A2 (en) * 2007-12-11 2009-06-18 The University Of North Carolina At Chapel Hill Polypurine tract modified retroviral vectors

Non-Patent Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
APOLONIA LUIS, ET AL: "Stable gene transfer to muscle using non-integrating lentiviral vectors.", MOLECULAR THERAPY, NATURE PUBLISHING GROUP, GB, vol. 15, no. 11, 1 November 2007 (2007-11-01), GB, pages 1947 - 1954, XP002518476, ISSN: 1525-0016, DOI: 10.1038/sj.mt.6300281 *
BAYER Matthew et al. A Large U3 Deletion Causes Increased In Vivo Expression from a Nonintegrating Lentiviral Vector. Mol. Ther., 2008 December; 16(12): pp. 1968-1976. doi: 10.1038/mt.2008.199, p. 1-16, особенно реферат, с. 2-4, фиг. 1 *
BYRNES Andrew P. et al. Large-Plaque Mutants of Sinbis Virus Show Reduced Binding to Heparan Sulfate, Heightened Viremia, and Slower Clearance from the Circulation. Journal of Virology, Jan. 2000, Vol. 74, No. 2, pp. 644-651, особенно с. 646, 648 *
GARDNER J P,ET AL: "Infection of human dendritic cells by a Sindbis virus replicon vector is determined by a single amino acid substitution in the E2 glycoprotein", JOURNAL OF VIROLOGY., THE AMERICAN SOCIETY FOR MICROBIOLOGY., US, vol. 74, no. 24, 1 December 2000 (2000-12-01), US, pages 11849 - 11857, XP002314008, ISSN: 0022-538X, DOI: 10.1128/JVI.74.24.11849-11857.2000 *
GARDNER Jason P. et al. Infection of Human Dendritic Cells by a Sindbis Virus Replicon Vector Is Determined by a Single Amino Acid Substitution in the E2 Glycoprotein. Journal of Virology, Dec. 2000, Vol. 74, No. 24, pp. 11849-11857, особенно с. 11850-11851 *
RUSSELL Darcy L. et al. Sinbis Virus Mutations Which Coordinately Affect Glycoprotein Processing, Penetration, and Virulence in Mice. Journal of Virology, Apr. 1989, Vol. 63, No. 4, pp. 1619-1629, особенно с. 1620-1621, фиг. 1 *
YANG LILI, ET AL: "Engineered lentivector targeting of dendritic cells for in vivo immunization.", NATURE BIOTECHNOLOGY, GALE GROUP INC., NEW YORK, vol. 26, no. 3, 1 March 2008 (2008-03-01), New York, pages 326 - 334, XP002598156, ISSN: 1087-0156 *

Also Published As

Publication number Publication date
JP6170952B2 (ja) 2017-07-26
CN102482329B (zh) 2017-11-14
DK2770061T3 (en) 2019-01-07
KR101790187B1 (ko) 2017-10-25
ES2455544T3 (es) 2014-04-16
US20110064763A1 (en) 2011-03-17
ES2702274T3 (es) 2019-02-28
PT2456786E (pt) 2014-03-25
CA2768938A1 (en) 2011-01-27
ME01720B (me) 2014-09-20
HRP20181996T1 (hr) 2019-03-22
HUE043032T2 (hu) 2019-07-29
CY1121159T1 (el) 2020-05-29
EP2456786A1 (en) 2012-05-30
MX2012001075A (es) 2012-05-22
ES2455544T5 (es) 2017-08-16
EP2456786B2 (en) 2017-04-19
DK2456786T4 (en) 2017-08-07
US20160076055A1 (en) 2016-03-17
HRP20140327T1 (hr) 2014-05-09
EP2770061A1 (en) 2014-08-27
SG177744A1 (en) 2012-02-28
PL2456786T3 (pl) 2014-06-30
RS53257B2 (sr) 2018-06-29
PT2770061T (pt) 2018-12-24
US20120039932A1 (en) 2012-02-16
EP2770061B1 (en) 2018-10-24
PL2770061T3 (pl) 2019-02-28
US8187872B2 (en) 2012-05-29
DK2456786T3 (en) 2014-03-24
PL2456786T5 (pl) 2017-10-31
SI2456786T2 (sl) 2017-08-31
RS58042B1 (sr) 2019-02-28
WO2011011584A1 (en) 2011-01-27
HK1201557A1 (en) 2015-09-04
AU2010276194A1 (en) 2011-11-24
JP2017060535A (ja) 2017-03-30
HRP20140327T4 (hr) 2017-11-03
LT2770061T (lt) 2018-12-27
SMT201400041B (it) 2014-05-07
TR201819229T4 (tr) 2019-01-21
EP2456786B1 (en) 2014-01-08
JP6701280B2 (ja) 2020-05-27
RS53257B (en) 2014-08-29
IL217679A (en) 2016-09-29
BR112012001653A2 (pt) 2016-11-08
JP2015109853A (ja) 2015-06-18
JP2013500015A (ja) 2013-01-07
NZ597804A (en) 2013-10-25
EA201270191A1 (ru) 2012-12-28
KR20120068838A (ko) 2012-06-27
SI2456786T1 (sl) 2014-05-30
JP2018198616A (ja) 2018-12-20
AU2010276194B2 (en) 2012-02-02
SI2770061T1 (sl) 2019-02-28
CA2768938C (en) 2019-05-14
CN102482329A (zh) 2012-05-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EA032403B1 (ru) Лентивирусные векторы, псевдотипированные гликопротеином оболочки вируса синдбис
ES2459192T3 (es) Introducción selectiva de genes para la vacunación con células dendríticas
FI113476B (fi) Menetelmä yhdistelmäretroviruksen valmistamiseksi
JP2008029348A (ja) 標的細胞にベクター構造体を運搬する組換レトロウイルス
JP2018526007A (ja) 2aペプチドを含む組換えベクター
US8323662B1 (en) Methods useful for generating highly mannosylated pseudotyped lentiviral vector particles comprising a Vpx protein
EP0827547B1 (en) Retrovirus vectors derived from avian sarcoma leukosis viruses permitting transfer of genes into mammalian cells and therapeutic uses thereof
Lee et al. Systemic delivery of CRISPR/Cas9 to hepatic tumors for cancer treatment using altered tropism of lentiviral vector
JP2020072720A (ja) Vlp−レプリコンを用いたクラスii mhc抗原の送達による癌免疫療法
Rabinovich et al. A novel, live-attenuated vesicular stomatitis virus vector displaying conformationally intact, functional HIV-1 envelope trimers that elicits potent cellular and humoral responses in mice
Zhang et al. Mucin-like domain of Ebola virus glycoprotein enhances selective oncolytic actions against brain tumors
CZ2003784A3 (cs) Zlepšené podmíněně se replikující vektory, způsoby jejich produkce a jejich použití
JPH10512243A (ja) 遺伝子送達ビヒクルの非外傷性投与
DE69527544T2 (de) Kombinationsvektoren zum austragen von genmaterial
JP2022551753A (ja) レトロウイルスをin situで生成させるための生産者ウイルス
US20240075140A1 (en) Engineered nk cells and methods of treating cancer
Budzik Generation and Characterization of a Foamy Virus-Based Replicating Retroviral Vector System for Cancer Therapy
WO2023150647A1 (en) Methods of repeat dosing and administration of lipid particles or viral vectors and related systems and uses
US20070264281A1 (en) Vaccination Vectors Derived From Lymphotropic Human Herpes Viruses 6 and 7
Strayer et al. Virus-based vectors for gene expression in mammalian cells: SV40

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s)

Designated state(s): AM AZ BY KZ KG MD TJ TM