EA031876B1 - Применения конъюгата, содержащего полипептид var2csa и эффекторную молекулу, для лечения и диагностики злокачественного новообразования - Google Patents

Применения конъюгата, содержащего полипептид var2csa и эффекторную молекулу, для лечения и диагностики злокачественного новообразования Download PDF

Info

Publication number
EA031876B1
EA031876B1 EA201491494A EA201491494A EA031876B1 EA 031876 B1 EA031876 B1 EA 031876B1 EA 201491494 A EA201491494 A EA 201491494A EA 201491494 A EA201491494 A EA 201491494A EA 031876 B1 EA031876 B1 EA 031876B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
seq
var2csa
protein
cells
present
Prior art date
Application number
EA201491494A
Other languages
English (en)
Other versions
EA201491494A1 (ru
Inventor
Али Саланти
Тор Грунттвиг Теаннер
Мадс Даугорд
Мортен Нильсен
Маделейне Дальбек
Томас Маннель Клаусен
Original Assignee
Вар2 Фармасьютикалз Апс
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Вар2 Фармасьютикалз Апс filed Critical Вар2 Фармасьютикалз Апс
Publication of EA201491494A1 publication Critical patent/EA201491494A1/ru
Publication of EA031876B1 publication Critical patent/EA031876B1/ru

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/44Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from protozoa
    • C07K14/445Plasmodium
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K35/00Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
    • A61K35/66Microorganisms or materials therefrom
    • A61K35/68Protozoa, e.g. flagella, amoebas, sporozoans, plasmodium or toxoplasma
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • A61K38/16Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • A61K38/43Enzymes; Proenzymes; Derivatives thereof
    • A61K38/45Transferases (2)
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K39/002Protozoa antigens
    • A61K39/015Hemosporidia antigens, e.g. Plasmodium antigens
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K49/00Preparations for testing in vivo
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K49/00Preparations for testing in vivo
    • A61K49/001Preparation for luminescence or biological staining
    • A61K49/0013Luminescence
    • A61K49/0017Fluorescence in vivo
    • A61K49/005Fluorescence in vivo characterised by the carrier molecule carrying the fluorescent agent
    • A61K49/0056Peptides, proteins, polyamino acids
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K51/00Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo
    • A61K51/02Preparations containing radioactive substances for use in therapy or testing in vivo characterised by the carrier, i.e. characterised by the agent or material covalently linked or complexing the radioactive nucleus
    • A61K51/04Organic compounds
    • A61K51/08Peptides, e.g. proteins, carriers being peptides, polyamino acids, proteins
    • A61K51/088Peptides, e.g. proteins, carriers being peptides, polyamino acids, proteins conjugates with carriers being peptides, polyamino acids or proteins
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00Drugs for dermatological disorders
    • A61P17/02Drugs for dermatological disorders for treating wounds, ulcers, burns, scars, keloids, or the like
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P17/00Drugs for dermatological disorders
    • A61P17/06Antipsoriatics
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P19/00Drugs for skeletal disorders
    • A61P19/02Drugs for skeletal disorders for joint disorders, e.g. arthritis, arthrosis
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P25/00Drugs for disorders of the nervous system
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • A61P35/02Antineoplastic agents specific for leukemia
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P37/00Drugs for immunological or allergic disorders
    • A61P37/02Immunomodulators
    • A61P37/04Immunostimulants
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/21Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Pseudomonadaceae (F)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/34Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Corynebacterium (G)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K19/00Hybrid peptides, i.e. peptides covalently bound to nucleic acids, or non-covalently bound protein-protein complexes
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57484Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer involving compounds serving as markers for tumor, cancer, neoplasia, e.g. cellular determinants, receptors, heat shock/stress proteins, A-protein, oligosaccharides, metabolites
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61KPREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K38/00Medicinal preparations containing peptides
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide
    • C07K2319/33Fusion polypeptide fusions for targeting to specific cell types, e.g. tissue specific targeting, targeting of a bacterial subspecies
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y204/00Glycosyltransferases (2.4)
    • C12Y204/02Pentosyltransferases (2.4.2)
    • C12Y204/02036NAD(+)--diphthamide ADP-ribosyltransferase (2.4.2.36)
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/46Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans from vertebrates
    • G01N2333/47Assays involving proteins of known structure or function as defined in the subgroups
    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2333/00Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
    • G01N2333/435Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature from animals; from humans
    • G01N2333/705Assays involving receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • G01N2333/70585CD44
    • YGENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
    • Y02TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
    • Y02ATECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
    • Y02A50/00TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE in human health protection, e.g. against extreme weather
    • Y02A50/30Against vector-borne diseases, e.g. mosquito-borne, fly-borne, tick-borne or waterborne diseases whose impact is exacerbated by climate change

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Epidemiology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Rheumatology (AREA)

Abstract

Изобретение относится к применению конъюгата или слитого белка, содержащего полипептид VAR2CSA или его фрагмент и терапевтическую или диагностическую эффекторную молекулу, для лечения или диагностики злокачественного новообразования соответственно. Также изобретение относится к применению фармацевтической композиции, включающей указанный конъюгат или слитый белок, в качестве лекарственного средства для лечения злокачественного новообразования.

Description

Область изобретения
Настоящее изобретение относится к конъюгатам и слитым белкам полипептидов VAR2CSA, содержащим минимальные связывающие фрагменты, и к их применению, в частности, для лечения злокачественных новообразований.
Уровень техники
Протеогликаны представляют собой белки, конъюгированные с одним или несколькими цепями гликозаминогликанов (GAG). Указанные белки распределяются внутри клеток, на клеточной мембране и во внеклеточном матриксе, выполняя ряд функций: образуют матрикс хряща, осуществление структурной организации тканей; организации базальных мембран; регулируют роль секреторных везикул; связывают цитокины, хемокины, факторы роста и морфогены, рецепторы протеиназ и ингибиторы протеиназ, корецепторы, рецепторы фактора роста типа тирозин-киназы, эндоцитозные рецепторы; облегчают прикрепления клеток, межклеточные взаимодействия и подвижность клеток, а также миграцию клеток.
Малярийный паразит Plasmodium falciparum использует протеогликаны клеток хозяина почти на всех стадиях своего сложного жизненного цикла. Спорозоит инфицирует гепатоциты печени посредством белка циркумспорозоита, экспрессируемого на поверхности и взаимодействующего с высокосульфатированными гепарансульфатпротеогликанами (HSPG). Инфицирование эритроцитов мерозоитами опосредуется связыванием ЕВА-175 с сиаловой кислотой на гликофорине А. Кроме того, ряд мембранных белков 1 эритроцитарной мембраны Plasmodium falciparum (PfEMP1), опосредующих эндотелиальную адгезию хозяина, описаны как связывающиеся с гликанами. Одним из них является VAR2CSA, который является уникальным членом семейства белков PfEMP1. VAR2CSA с высокой аффинностью связывается с необычной низкосульфатированной формой хондроитинсульфата A (CSA), прикрепленной к протеогликанам, так называемым протеогликаном хондроитинсульфатом (CSPG), в межворсинчатых пространствах плаценты. VAR2CSA представляет собой большой мультидоменный белок (350 кДа), экспрессируемый на поверхности эритроцитов, инфицированных P. falciparum (IE), и взаимодействие VAR2CSACSA ответственно за плацентарную специфичную секвестрацию при плацентарной малярии (РМ). Важно, рекомбинантный полноразмерный эктодомен VAR2CSA из паразитов типа FCR3 и 3D7 показал аффинность в отношении CSA на низком наномолярном уровне.
CSA принадлежит семейству гликозаминогликанов (GAG), которые представляют собой линейные полимеры из чередующихся аминосахаров и остатков гексуроновой кислоты, прикрепленных к протеогликанам. Существует несколько типов GAG, включая хондроитинсульфат (CS), дерматансульфат (DS или CSB), гепарансульфат (HS) и гепарин. В то время как полисахаридный скелет указанных GAG является простым, значительное разнообразие проявляется в модификациях, таких как сульфатирование и уронатная эпимеризация. Они являются основой для широкого разнообразия структуры домена и биологической активности различных GAG.
CS взаимодействует с многими важными факторами, такими как гормоны роста, цитокины, хемокины и молекулы адгезии, и, как полагают, участвует в структурной стабилизации, цитокинезе, клеточной пролиферации, дифференцировке, клеточной миграции, тканевом морфогенезе, органогенезе, инфекции и заживлении ран. Цепи CS состоят из чередующихся единиц №ацетилЮ-галактозамина (GalNAc) и остатков глюкуроновой кислоты. Глюкуроновая кислота может быть сульфатированной на позиции С2, a GalNAc может быть сульфатированным на позиции С4 и/или C6, в результате чего возникают различные дисахаридные единицы. Различающиеся модификации сахарного скелета обеспечивают структурную и функциональную гетерогенность цепей CS. Обладающие адгезией к плаценте паразиты P. falciparum специфичным образом связаны с низкосульфатированным CSA с сульфатированием только по С4 GalNAc.
Более ранние исследования указывали на CSA как ответственного за секвестрацию IE в плаценте. Специфичный рецептор, однако, не был известен. В результате дополнительных исследований было установлено, что плацента человека содержит три различных типа протеогликанов хондроитинсульфатов (CSPG), но что IE обладают специфичной адгезией к низкосульфатированным CSPG в межворсинчатых пространствах. Что является особенным для указанного типа CSPG, так это то, что только 2-8% дисахаридных единиц являются сульфатированными по С4. В сопутствующем исследовании, цель которого состояла в идентификации специфических структурных требований для CSA, было установлено, что адгезия паразитов к CSPG ингибируется CSA, содержащим 30-50% сульфатирования по С4, при этом остальные 50-70% дисахаридных единиц являются несульфатированными. Требования для CSA по минимальному ингибированию, как было показано, представляют собой додекасахарид (шесть дисахаридов), содержащий минимум 2-3 или 4-5 дисахаридных единиц, сульфатированных по С4.
Протеогликан хондроитинсульфат 4 (CSPG4), также известный как меланомасвязанный антиген с высокой молекулярной массой (HMW-MAA) или меланомасвязанный протеогликан хондроитинсульфат (MSCP), представляет собой протеогликан клеточной поверхности, который, как было показано, экспрессируется клетками меланомы.
CSPG4/MSCP/HMW-MAA представляет собой большой протеогликан, который характеризуется тем, что имеет цепи CS на белковом скелете. Сульфатирование указанных цепей CS, как представляется, происходит, главным образом, по С4 GalNAc (CSA), хотя степень сульфатирования не известна.
- 1 031876
Цель изобретения
Целью настоящего изобретения является получение минимальных функциональных связывающих фрагментов VAR2CSA, подходящих для нацеливания и/или обнаружения гликанов хондроитинсульфатов. Другими целями настоящего изобретения являются способы лечения состояний, связанных с экспрессией, например патологической экспрессией гликанов хондроитинсульфатов, таких как CSA, в которых полипептиды VAR2CSA или их фрагменты по отдельности или как часть конъюгатов или слитых белков используются для нацеливания и/или обнаружения ткани или клеток с экспрессией, такой как патологическая экспрессия гликанов хондроитинсульфатов.
Сущность изобретения
Авторы изобретение обнаружили, что VAR2CSA сохраняет свою способность к связыванию с высокой аффинностью и специфичностью в отношении определенных протеогликанов хондроитинсульфатов с минимальными структурными элементами полипептидной последовательности. Более важно, авторы обнаружили, что полипептиды VAR2CSA связываются с высокой и специфичной аффинностью с клетками злокачественных новоообразований и тканями злокачественных новоообразований, где связывание, как полагают авторы изобретения, происходит посредством специфичного взаимодействия с протеогликанами хондроитинсульфатов, экспрессируемыми на поверхности злокачественных клеток или в окружающем внеклеточном матриксе. Соответственно авторы изобретения предлагают использовать указанное специфичное и высокоаффинное связывание для нацеливания злокачественных клеток или других тканей или клеток с высокой или иной экспрессией, такой как патологическая экспрессия указанного конкретного типа протеогликанов хондроитинсульфатов.
Таким образом, в первом аспекте настоящее изобретение связано с выделенным фрагментом белка VAR2CSA, где фрагмент состоит из последовательной аминокислотной последовательности
a) ID1,
b) DBL2Xb и необязательно,
c) ID2a.
В некоторых вариантах выделенный фрагмент белка VAR2CSA содержит ID2a.
В еще одном аспекте настоящее изобретение связано с конъюгатом или слитым белком, содержащим полипептид VAR2CSA и терапевтическую или диагностическую эффекторную молекулу, такую как цитотоксическая молекула, флуоресцентная метка и/или радиоактивная метка.
Следует понимать, что для конъюгата, слитого или химерного белка, содержащего полипептид VAR2CSA, можно использовать любой полипептид VAR2CSA, как определено в настоящем документе. Соответственно указанный аспект не ограничивается использованием минимальных связывающих фрагментов. Это относится ко всем случаям использования термина полипептид VAR2CSA, и соответственно они в равной степени подходят для лечения, нацеливания или диагностики.
В еще одном аспекте настоящее изобретение связано с композицией, содержащей фрагмент белка, как определено в настоящем документе, антитело по настоящему изобретению или конъюгат по настоящему изобретению.
В еще одном аспекте настоящее изобретение относится к слитому полипептиду VAR2CSA или конъюгату по настоящему изобретению для применения в качестве лекарственного средства или диагностического средства.
В еще одном аспекте настоящее изобретение относится к слитому полипептиду VAR2CSA или конъюгату по настоящему изобретению для применения в диагностике.
В еще одном аспекте настоящее изобретение относится к слитому полипептиду VAR2CSA или конъюгату по настоящему изобретению для лечения при любых показаниях, связанных с состоянием, в которое вовлечена экспрессия, такая как патологическая экспрессия CSA, например злокачественное новообразование.
В еще одном аспекте настоящее изобретение относится к применению слитого полипептида VAR2CSA или конъюгата по настоящему изобретению в качестве биомаркера, такого как инструмент для обнаружения экспрессии, такой как патологическая экспрессия CSA, в жидкостях тела, таких как кровь, плазма, моча, слюна, фекалии, цереброспинальная жидкость, лимфа, желудочный сок, плевральная жидкость, синовиальная жидкость, сперма, и/или в ткани для диагностики и/или прогнозирования показания или состояния, связанного с экспрессией, такой как патологическая экспрессия CSA, например злокачественное новообразование, артрит, артроз, патологические состояния, вызванные повреждением нервной системы, состояния хряща и рубцовой ткани, такие как при ревматизме или заживлении ран, или псориаз, злокачественное заболевание, такое как опухоли головного мозга, опухоли печени и опухоли репродуктивной системы.
Следует понимать, что используемый в настоящем документе термин биомаркер относится к применению конъюгатов и слитых белков VAR2CSA по настоящему изобретению, если он вводится в организм для обнаружения экспрессии CSA как средство для диагностики и/или прогнозирования показания или состояния, связанного с экспрессией CSA, такой как патологическая экспрессия CSA.
В еще одном аспекте настоящее изобретение относится к диагностическому способу обнаружения повышенных уровней CSA в жидкости тела, такой как кровь, плазма, моча, цереброспинальная жид
- 2 031876 кость, плевральные выпоты, синовиальная жидкость, костный мозг, желудочный сок, фекалии, сперма, простатическая жидкость, слюна, слезная жидкость, легочный аспират и лимфа, в ответ на злокачественное новообразование или другие состояния, связанные с патологической экспрессией CSA, где способ включает стадии приведения указанной жидкости тела в контакт с фрагментом белка, как определено в настоящем документе, полипептидом VAR2CSA или конъюгатом по настоящему изобретению и обнаружения комплексов, образованных с CSA в указанной жидкости тела.
В еще одном аспекте настоящее изобретение относится к слитому полипептиду VAR2CSA или конъюгату по настоящему изобретению или фармацевтической композиции по настоящему изобретению в комбинации с любым другим подходящим противораковым средством.
Подробное описание изобретения
Настоящее изобретение основано на том факте, что часть малярийного белка, так называемого VAR2CSA, может связываться с специфическим антигеном злокачественных клеток и внеклеточным CSPG с очень высокой специфичностью и очень высокой силой связывания.
VAR2CSA опосредует адгезию паразитов исключительно в отношении низкосульфатированного хондроитинсульфата A (CSA), прикрепленного к протеогликанам (CSPG) в плаценте беременных женщин. Было показано, что рекомбинантный белок связывается с CSA с беспрецедентно высокой аффинностью и специфичностью. Это может происходить благодаря взаимодействию с CSA, которое зависит не только от заряженных сульфатов, но также и от скелета CS. Авторы изобретения предполагают, что CS, присутствующий в плаценте, является очень сходным с CS, представленным на различных злокачественных клетках, включая злокачественные стволовые клетки. Это подтверждается тем фактом, что экспрессирующие VAR2CSA малярийные паразиты обладают специфичной адгезией к CSA на клетках меланомы С32 и к злокачественным клеткам головного мозга человека.
Соответственно настоящее изобретение основано на высокой аффинности и специфичности между рекомбинантными белками VAR2CSA и низкосульфатированным CSA. Благодаря нанесению метки на белок изобретение можно использовать для обширного ряда применений, включая отслеживание метастазов in vivo и диагностику метастатического заболевания. Путем прикрепления VAR2CSA к апоптотическому или цитотоксическому реагенту изобретение можно использовать для специфичного нацеливания и уничтожения злокачественных клеток и злокачественных стволовых клеток. Путем простой терапии с использованием рекомбинантного белка VAR2CSA будет возможной нейтрализация активности CSA, что ингибирует онкогенез и/или метастазирование экпрессирующих CSA злокачественных клеток. CSA может присутствовать на ряде скелетов белка, например CSPG4, CD44, бигликане, декорине, версикане, аггрекане (главном CSPG в хряще), перлекане, синдекане и других, перечисленных в табл. 1.
Таблица 1
Белок ID 1 Белок ID 2 Название гена
NG2 CSPG4 Cspg4
Нейрогликан и CSPG5 ngc
нейрогликан-С
Нейропилин-1 CS NRP-1-CS NRP1
APLP2 и АРР (а когда добавлен CSA, белки называются Appicans) предшественник амилоида - как белок 2 APLP2
Snore Snore
Томорегулин-2 TENB2 TMEFF2
Тромбомодулин CD141 THBD
Бетагликан Бета-рецептор III трансформирующего фактора роста TGFBR3
Синдекан 1 CD138 SDC1
Синдекан 2 CD362 SDC2
Синдекан 3 SDC3
Синдекан 4 Амфигликан SDC4
CSPG8 CSPG8 Cd44
Глипикан-6 (kun 1 од 5) GPC1-6
Бревикан CSPG7 bean
Лубрицин Протеогликан 4 PRG4
Белок 1 дентинного матрикса DMP1
Нейрокан CSPG3 ncan
Версикан CSPG2 vean
Аггрекан CSPG1 acan
Бамекан CSPG6 smc3
SRPX2 Белок, содержащий повтор sushi SRPX2
Серглицин Ядерный белок гематопоэтического протеогликана SRGN
- 3 031876
Настоящее изобретение, как полагают, особенно важно в случае злокачественной меланомы, включая кожную, глазную и конъюнктивальную меланому, имеющую CSPG4 с цепями CSA на поверхности клеток меланомы. Указанная цепь GAG, как полагают, участвует в митозе и метастазировании. Однако, CSPG4 является специфичным не только для меланомы. Совокупность микро- и тканевых анализов, проведенная авторами изобретения по данным из больших наборов тканевых и клеточных линий человека, предполагает, что CSPG4 и другие типы содержащих CSA протеогликанов могут присутствовать в широком ряде типов злокачественных новообразований, происходящих из всех трех клеточных зародышевых слоев. Указанные типы злокачественных новообразований включают карциному (рак молочной железы, рак поджелудочной железы, рак яичника, рак эндометрия, печеночно-клеточный рак, рак легкого, рак толстого кишечника, рак предстательной железы, рак шейки матки, рак яичка, базально-клеточный рак кожи, светлоклеточный рак почки, кератинизированный плоскоклеточный рак головы и шеи, плоскоклеточный рак кожи, кератинизированный плоскоклеточный рак вульвы и базально-клеточный рак вульвы), саркому (липосаркому молочной железы, фибросаркому, дедифференцированную хондро- и липосаркому, лейомиосаркому, миксоидную липосаркому, лейомиосаркому тела матки, остеосаркому, саркому Эвинга и рабдомиосаркому), рак системы кроветворения (хронический лимфолейкоз (CLL), острый лимфолейкоз (ALL), острый миелолейкоз (AML), В-клеточную, Т-клеточную и большую гранулярную лимфому), опухоли нейроэпителиальной ткани, такие как астроцитома (плеоморфная ксантоастроцитома, фибриллярные астроцитомы, анапластическая астроцитома, мультиформная глиобластома), олигодендроглиому, эпендимому, опухоль хороидного сплетения, олигоастроцитому, глиосаркому, ганглиоглиому, ретинобластому, нейроцитому, нейробластомы (эстезионейробластому и ганглионейробластому), медуллобластому, атипичные тератоидные рабдоидные опухоли и все типы нейроэндокринного рака.
Протеогликаны хондроитинсульфаты (CSPG) также составляют важный компонент внеклеточного матрикса центральной нервной системы (ЦНС), включая глаз и суставной хрящ. Внеклеточный CSPG критичным образом участвует в патогенезе артрита и отсутствии регенерации после повреждения нервной системы. Утрата внеклеточного CSPG является критичной для развития артрита и артроза, а высокие локальные концентрации внеклеточного CSPG предотвращают рост нервной ткани после повреждения нервной системы.
Рекомбинантные белки VAR2CSA могут использоваться для лечения при показаниях, связанных со злокачественным ростом, например при злокачественных новообразованиях. Для указанных стратегий заявители предполагают, что VAR2CSA можно использовать в качестве прямого ингибитора или в качестве молекулы, нацеливающейся и поддерживающей лекарственные средства, изменяющие метаболизм
- 4 031876
CSPG в отношении пораженных тканей.
Заявители идентифицировали малярийный белок, который связывается с CSA в межворсинчатых пространствах плаценты с аффинностью ниже 10 нМ. Были получены рекомбинантные части VAR2CSA меньших размеров с высокими выходами, которые связывают CSA с характеристиками, сходными с таковыми полноразмерного белка VAR2CSA и нативной природы. Рекомбинантный белок VAR2CSA не связывает другой CS, такой как хондроитинсульфат С (C6S) или высокосульфатированные GAG, такие как гепарансульфат (HS). Рекомбинантные белки могут быть получены для связывания CSA с высокой аффинностью в различных экспрессионных системах, таких как, среди прочих, клетки S2, клетки T.Ni, клетки СНО и штаммы Е. Coli, включая клетки BL21 и Snuffle (tm Lifetechnologies).
Заявители также идентифицировали единственный малый (75 кДа) антиген, который связывается с CSA с очень высокой аффинностью (нМ) и высокой специфичностью. В табл. 3 (см. пример 2) представлена аффинность в отношении CSA всех проанализированных белков VAR2CSA с использованием биосенсорной методики.
Заявители показали, что указанный рекомбинантный белок VAR2CSA прочно связывается при низких концентрациях с обширным рядом злокачественных клеточных линий, включая кожную меланому (С32, MeWo), рак легкого (А549), рак молочной железы (НСС1395), остеосаркому (U2OS, MNNG/HOS), рабдомиосаркому (RH30) и кожную Т-клеточную лимфому (табл. 4 и 5). В качестве контрольной молекулы использовали другой белок VAR2CSA, который является идентичным минимальной связывающей конструкции VAR2CSA, за исключением усечения 151 аминокислоты в С-концевой части молекулы. Указанное усечение устраняет связывание CSA. Рекомбинантный VAR2CSA связывается со всеми экспрессирующими CSPG4 клеточными линиями и злокачественными клеточными линиями, экспрессирующими другие молекулы CSPG, имеющие цепи CSA (например, с Т-клеточной лимфомой). Рекомбинантный белок VAR2CSA не способен взаимодействовать с красными кровяными клетками и мононуклеарными клетками периферической крови (РВМС) человека (табл. 4).
Заявители показали, что малярийные паразиты обладают адгезией в отношении клеток меланомы С32, возможно, посредством специфичного взаимодействия между CSPG4 и VAR2CSA. Таким образом, можно предположить, что рекомбинантный VAR2CSA и его конъюгаты можно использовать в качестве терапевтического соединения, нацеленного на CSA на различных злокачественных клетках.
Преимущества нацеливания CSA на злокачественных клетках с использованием VAR2CSA по сравнению с другими современными лекарственными средствами являются многочисленными:
1) Взаимодействие между VAR2CSA и CSA является беспрецедентно высокоаффинным и высокоспецифичным.
2) VAR2CSA является эволюционно усовершенствованным малярийным белком, и, таким образом, маловероятно, что терапия нарушит толерантность и вызовет аутоиммунные реакции у пациента.
3) VAR2CSA является стабильным белком, свойства которого хорошо известны и который может экспрессироваться в больших количествах в организмах, подходящих для получения белка в промышленных масштабах.
4) VAR2CSA является полиморфным белком, имеющим ряд серовариантов. Повторная терапия может быть предложена с использованием отличающихся серовариантов, чтобы избежать проблем с нейтрализующими антителами.
5) VAR2CSA в природе располагается внеклеточно на инфицированных P. falciparum эритроцитах и является, таким образом, по своей природе стабильным белком в сыворотке человека и, как было показано, является высокорезистентным к протеиназам.
Настоящее изобретение фокусируется на взаимодействии между VAR2CSA и CSA. Указанное взаимодействие представляет собой высокоаффинное взаимодействие, и его основным применением является нацеливание злокачественных клеток, экспрессирующих CSA.
CSA также может принимать участие в других заболеваниях и патологических состояниях, таких как, например, артрит, артроз, рассеянный склероз и восстановление после повреждения нервной системы, восстановление хряща, заживление ран и псориаз. Кроме того, взаимодействие между VAR2CSA и CSA можно использовать в качестве биотехнологического инструмента.
Соответственно заявители рассматривают несколько вариантов использования настоящего изобретения:
1) Отслеживаемые рекомбинантные полипептиды или конъюгаты VAR2CSA можно использовать для наблюдения за опухолями и метастазами у пациентов с заболеванием раком.
2) Рекомбинантные полипептиды или конъюгаты VAR2CSA можно использовать для прямого нацеливания и нейтрализации активности CSA в злокачественных клетках.
3) Рекомбинантные полипептиды или конъюгаты VAR2CSA, такие как полипептиды VAR2CSA, конъюгированные с цитотоксическими молекулами, можно использовать для нацеливания злокачественных клеток с минимальной неблагоприятной токсичностью для CSA-отрицательных тканей.
4) Меченые рекомбинантные полипептиды или конъюгаты VAR2CSA можно использовать в качестве исследовательского или клинического экспериментального инструмента для изучения CSA на злокачественных клетках.
- 5 031876
Определения.
Термин полипептид VAR2CSA, используемый в настоящем документе, относится к внеклеточной части специфического белка эритроцитарной мембраны 1 (PfEMPl), белка, экспрессируемого Plasmodium falciparum, взаимодействующей с протеогликанами хондроитинсульфатами (CSPG) и характеризующейся последовательностью SEQ ID NO:55 или SEQ ID NO:56, или к ее фрагментам или вариантам, обладающим способностью связываться с хондроитинсульфатом A (CSA), который может быть представлен на протеогликанах (CSPG).
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения полипептид VAR2CSA по настоящему изобретению, по меньшей мере, содержит фрагмент белка VAR2CSA, который состоит из последовательной аминокислотной последовательности a) ID1 и b) DBL2Xb.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения полипептид VAR2CSA по настоящему изобретению, по меньшей мере, содержит фрагмент белка VAR2CSA, который состоит из последовательной аминокислотной последовательности a) ID1, b) DBL2Xb и с) ID2a.
В определение полипептида VAR2CSA входят полипептиды, описанные в Salanti A. et al., Mol. Micro. 2003, Jul; 49(1): 179-91, Khunrae P. et al., J. Mol. Biol., 2010 Apr. 2; 397(3):826-34, Srivastava A. et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2010 Mar. 16; 107 (11):4884-9, Dahlback M. et al., J. Biol. Chem., 2001 May 6; 286(18): 15908-17 или Srivastava A. et al., PLoS One., 2011; 6(5):e20270.
Термин ID1 относится к домену VAR2CSA, который характеризуется тем, что имеет аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 70% идентична аминокислотной последовательности 1-152 SEQ ID NO:1.
Термин DBL2Xb относится к домену VAR2CSA, который характеризуется тем, что имеет аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 70% идентична аминокислотной последовательности 153-577 SEQ ID NO:1.
Термин ID2a относится к домену VAR2CSA, который характеризуется тем, что имеет аминокислотную последовательность из по меньшей мере 20, по меньшей мере 21, по меньшей мере 22, по меньшей мере 23, по меньшей мере 24, по меньшей мере 25, по меньшей мере 26, по меньшей мере 27, по меньшей мере 28, по меньшей мере 29, по меньшей мере 30, по меньшей мере 31, по меньшей мере 32, по меньшей мере 33, по меньшей мере 34, по меньшей мере 35, по меньшей мере 36, по меньшей мере 37, по меньшей мере 38, по меньшей мере 39, по меньшей мере 40, по меньшей мере 41, по меньшей мере 42, по меньшей мере 43, по меньшей мере 44, по меньшей мере 45, по меньшей мере 46, по меньшей мере 47, по меньшей мере 48, по меньшей мере 49, по меньшей мере 50, по меньшей мере 51, по меньшей мере 52, по меньшей мере 53, по меньшей мере 54, по меньшей мере 55, по меньшей мере 56, по меньшей мере 57, по меньшей мере 58, по меньшей мере 59, по меньшей мере 60, по меньшей мере 61 или по меньшей мере 62, такую как 63 последовательных аминокислот, из N-концевых аминокислот 578640 SEQ ID NO:1 и меньшей мере с 70% идентичностью указанной последовательности последовательных аминокислот.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения аминокислотная последовательность, указанная в настоящем документе, по меньшей мере на 70% идентична любой последовательности SEQ ID NO:1-75 или ее фрагменту, относится к последовательности по меньшей мере с 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичностью указанной последовательности.
Термин вариант или варианты, используемый в настоящем документе, относится к полипептиду VAR2CSA, имеющему аминокислотную последовательность SEQ ID NO:55 или SEQ ID NO:56, или к фрагментам полипептида VAR2CSA, содержащим аминокислотную последовательность SEQ ID NO:154; указанные фрагменты или варианты сохраняют способность связываться с хондроитинсульфатом A (CSA) на протеогликанах (CSPG), в которых одна или несколько аминокислот заменены на другую аминокислоту, и/или в которых одна или несколько аминокислот опущены, и/или в которых одна или несколько аминокислот введены в полипептид, и/или в которых одна или несколько аминокислот добавлены в полипептид. Указанное добавление может иметь место на N-конце, или на С-конце, или на обоих. Вариант или варианты в рамках настоящего определения все еще обладают функциональной активностью с точки зрения способности связываться с хондроитинсульфатом A (CSA). В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения вариант имеет по меньшей мере 70%, такую как 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84, 85, 86, 87, 88, 89, 90, 91, 92, 93 94, 95, 96, 97, 98 или 99% идентичность последовательности SEQ ID NO:1-75, такой как последовательность SEQ ID NO:1, 3-5, 10, 11, 29, 34, 36-38, 41, 43-45, 48, 53-56, 60-70, 72-75.
Фразы функциональный вариант, функциональный фрагмент и функциональные производные, используемые в настоящем документе, относятся к вариантам, фрагментам, усеченным версиям, а также к производным SEQ ID NO:55 или SEQ ID NO:56, таким как SEQ ID NO:1, 3-5, 10, 11, 29, 34, 3638, 41, 43-45, 48, 53-56, 60-70, 72-75, где полипептиды содержат главные связывающие части последовательности SEQ ID NO:55 или SEQ ID NO:56 и, по меньшей мере, обладают способностью связываться с хондроитинсульфатом A (CSA). Следует понимать, что функциональный вариант или функциональный фрагмент VAR2CSA может иметь два или три признака, выбранные из существования в форме варианта,
- 6 031876 и/или фрагмента, и/или производного.
Функциональный вариант или фрагмент полипептида VAR2CSA заключает такой вариант или полипептид, который демонстрирует по меньшей мере приблизительно 25%, такую как по меньшей мере 50%, такую как по меньшей мере 75%, такую как по меньшей мере 90% аффинность связывания полипептида VAR2CSA дикого типа, который был получен тем же клеточным типом, по результатам испытаний с помощью анализов, как описано в настоящем документе.
Термин иммунологический фрагмент, используемый в настоящем документе, относится к фрагменту с аминокислотной последовательностью, обладающей практически той же функциональной активностью и той же пространственной ориентацией, которая позволяет антителу его распознавать. Соответственно специфичное антитело будет связываться как с полипептидами, так и с его иммунологическими фрагментами.
Термин другая аминокислота, используемый в настоящем документе, обозначает аминокислоту, которая отличается от той аминокислоты, которая в природе присутствует на данной позиции. Она включает, но ими не ограничивается, аминокислоты, которые могут кодироваться полинуклеотидом. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения отличающаяся аминокислота представляет собой природную L-форму и может кодироваться полинуклеотидом.
Термин производное, используемый в настоящем документе, предназначен для обозначения полипептида VAR2CSA, демонстрирующего такую же или улучшенную биологическую активность по сравнению с VAR2CSA дикого типа, идентифицируемого последовательностью SEQ ID N0:55 или SEQ ID NO:56, или его фрагмента, в котором одна или более аминокислот родительского пептида были химически модифицированы, например, алкилированием, пегилированием, ацилированием, образованием сложного эфира или образованием амида и т.п.
Термин конструкция, используемый в настоящем документе, предназначен для обозначения полинуклеотидного сегмента, который может быть основан на полной или частичной природной нуклеотидной последовательности, кодирующей полипептид, представляющий интерес. Конструкция может, необязательно, содержать другие полинуклеотидные сегменты. Сходным образом, термин аминокислоты, которые могут кодироваться полинуклеотидными конструкциями, включает аминокислоты, которые могут кодироваться полинуклеотидными конструкциями, определенными выше, т.е. такие аминокислоты как Ala, Val, Leu, Ile, Met, Phe, Trp, Pro, Gly, Ser, Thr, Cys, Tyr, Asn, Glu, Lys, Arg, His, Asp и Gln.
Термин вектор, используемый в настоящем документе, означает любую нуклеиновую кислоту, которая способна к амплификации в клетке-хозяине. Так вектор может представлять собой автономно реплицирующийся вектор, т.е. вектор, который существует в качестве внехромосомного объекта, репликация которого не зависит от хромосомной репликации, например плазмиду. Альтернативно, вектор может представлять собой объект, который, будучи введенными в клетку-хозяина, встраивается в геном клетки-хозяина и реплицируется вместе с хромосомой (хромосомами), в которую он встроился. Выбор вектора часто будет зависеть от клетки-хозяина, в которую он будет введен. Векторы включают, но ими не ограничиваются, плазмидные векторы, фаговые векторы, вирусы или космидные векторы. Векторы обычно содержат источник репликации и по меньшей мере один ген селекции, т.е. ген, который кодирует продукт, который легко обнаруживается, или присутствие которого является существенным для клеточного роста.
Используемый в настоящем документе термин подходящая питательная среда означает среду, содержащую питательный вещества и другие компоненты, требующиеся для роста клеток и экспрессии последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид VAR2CSA по настоящему изобретению.
В контексте настоящей заявки термин лечение включает профилактику, лечение и облегчение симптомов заболевания, расстройства или состояния, в которые вовлечена экспрессия, такая как патологическая экспрессия CSA, такого как рак. Профилактическое или терапевтическое введение полипептида, конъюгата или производного VAR2CSA по настоящему изобретению, таким образом, включено в термин лечение.
Термин индивид, используемый в настоящем документе, означает любое животное, в частности млекопитающих, таких как люди, и может, где это необходимо, использоваться взаимозаменяемым образом с термином пациент.
Термин идентичность последовательности, известный специалистам, относится к взаимоотношениям между последовательностями двух или более полипептидных молекул или двух или более молекул нуклеиновой кислоты в результате сравнения последовательностей. В данной области идентичность также означает степень родства между молекулами нуклеиновой кислоты или между полипептидами в зависимости от обстоятельства, что определяется количеством спариваний между цепочками из двух или нескольких нуклеотидных остатков или из двух или нескольких аминокислотных остатков. Идентичность измеряет процентную долю идентичных спариваний между меньшей из двух или более последовательностей с выравниваниями с гэпами (если они есть), что осуществляется с использованием особой математической модели или компьютерной программы (т.е. алгоритмы).
Термин сходство представляет собой родственное понятие, но в отличие от идентичности отно
- 7 031876 сится к взаимоотношениям последовательностей, которые включают как идентичные спаривания, так и спаривания консервативных замен. Если две полипептидные последовательности имеют, например, (фракция 10/20)) идентичные аминокислоты, а все остальные являются неконсервативными заменами, то процент и идентичности, и сходства будет составлять 50%. Если, в том же примере, имеют место еще 5 позиций, где есть консервативные замены, то процент идентичности остается 50%, но процент сходства составит 75% ((фракция (15/20))). Таким образом, в тех случаях, когда имеют место консервативные замены, степень сходства между двумя полипептидами будет выше, чем процент идентичности между данными двумя полипептидами.
Путем консервативных модификаций аминокислотной последовательности SEQ ID N0:1-56, 60-70 и 72-75 (и соответствующие модификации кодирующих нуклеотидов) можно получать полипептиды VAR2CSA, имеющие функциональные и химические характеристики, сходные с таковыми полипептидов VAR2CSA, встречающихся в природе. В противоположность этому существенные модификации функциональных и/или химических характеристик полипептида VAR2CSA можно осуществить путем выбора замен в аминокислотной последовательности SEQ ID NO:1-56, 60-70 и 72-75, которые значительно отличаются по своему влиянию на сохранение (а) структуры молекулярного скелета в области замены, например, как плоской или спиральной конформации, (b) заряда или гидрофобности молекулы в области сайта-мишени или (с) массы боковой цепи.
Например, консервативная аминокислотная замена может включать замену остатка нативной аминокислоты ненативным остатком, таким образом, что наблюдается небольшое влияние или не наблюдается влияния на полярность или заряд аминокислотного остатка на данной позиции. Кроме того, любой нативный остаток в полипептиде также может быть заменен аланином, как было ранее описано для аланинсканирующего мутагенеза (см., например, источники MacLennan et al., 1998, Acta Physiol. Scand. Suppl., 643:55-67; Sasaki et al., 1998, Adv. Biophys., 35:1-24, в которых обсуждается аланинсканирующий мутагенез).
Желательные аминокислотные замены (как консервативные, так и неконсервативные) могут быть определены специалистом, если указанные замены являются желательными. Например, аминокислотные замены можно использовать для идентификации важных остатков полипептида VAR2CSA или для увеличения или уменьшения аффинности полипептида VAR2CSA, описанной в настоящем документе.
Природные остатки можно разделить на классы на основе свойств общей боковой цепи:
1) гидрофобные: норлейцин, Met, Ala, Val, Leu, Ile;
2) нейтральные гидрофильные: Cys, Ser, Thr, Asn, Gin;
3) кислые: Asp, Glu;
4) основные: His, Lys, Arg;
5) остатки, которые влияют на ориентацию цепи: Gly, Pro и
6) ароматические: Trp, Tyr, Phe.
Например, неконсервативные замены могут включать обмен члена одного из указанных классов на член другого класса. Указанные замещенные остатки можно вводить в области полипептида VAR2CSA Plasmodium falciparum, которые являются гомологичными полипептидам VAR2CSA не из Plasmodium falciparum, или в негомологичные области молекулы.
При осуществлении указанных изменений можно принимать во внимание гидропатический индекс аминокислот. Для каждой аминокислоты определен гидропатический индекс на основании их характеристик гидрофобности и заряда, а именно изолейцин (+4,5); валин (+4,2); лейцин (+3,8); фенилаланин (+2,8); цистеин/цистин (+2,5); метионин (+1,9); аланин (+1,8); глицин (-0,4); треонин (-0,7); серии (-0,8); триптофан (-0,9); тирозин (-1,3); пролин (-1,6); гистидин (-3,2); глутамат (-3,5); глутамин (-3,5); аспартат (-3,5); аспарагин (-3,5); лизин (-3,9) и аргинин (-4,5).
Важность гидропатического индекса аминокислот для придания белку интерактивной биологической функции понятна специалистам в данной области. Kyte et al., J. Mol. Biol., 157:105-131 (1982). Известно, что определенные аминокислоты можно замещать на другие аминокислоты, имеющие сходный гидропатический индекс или балльную оценку и все еще сохраняющие сходную биологическую активность. При осуществлении изменений, основанных на гидропатическом индексе, замена аминокислот, гидропатические индексы которых находятся в пределах ±2, является предпочтительной, гидропатические индексы, находящиеся в пределах ±1, являются особенно предпочтительными, а в пределах ±0,5, являются еще более предпочтительными.
Также следует понимать, что замены сходных аминокислот можно эффективно осуществить на основании гидрофильности особенно, когда биологически и функционально эквивалентный белок или пептид, созданный таким способом, предназначен для использования в иммунологических вариантах осуществления настоящего изобретения, как в настоящем случае. Наибольшая локальная средняя гидрофильность белка, определяемая гидрофильностью его располагающихся рядом аминокислот, коррелирует с его иммуногенностью и антигенностью, т.е. с биологическим свойством белка.
Следующие величины гидрофильности были определены для аминокислотных остатков: аргинин (+3,0); лизин ('3,0); аспартат (+3,0±1); глутамат (+3,0±1); серин (+0,3); аспарагин (+0,2); глутамин (+0,2); глицин (0); треонин (-0,4); пролин (-0,5±1); аланин (-0,5); гистидин (-0,5); цистеин (-1,0); метионин (-1,3);
- 8 031876 валин (-1,5); лейцин (-1,8); изолейцин (-1,8); тирозин (-2,3); фенилаланин (-2,5); триптофан (-3,4). При осуществлении изменений, основанных на сходных величинах гидрофильности, замена аминокислот, величины гидрофильности которых находятся в пределах ±2, является предпочтительной, величины гидрофильности, находящиеся в пределах ±1, являются особенно предпочтительными, а в пределах ±0,5 являются еще более предпочтительными. Можно также идентифицировать эпитопы из основных аминокислотных последовательностей на основе гидрофильности. Указанные области также называют эпитопными областями ядра.
Специалист в данной области без труда определит подходящие варианты полипептида SEQ ID N0:1-75, используя хорошо известные методы. Для идентификации подходящих областей молекулы, которые могут быть изменены без устранения активности, специалист может выбрать мишенью области, которые не считаются важными для активности. Например, если сходные полипептиды, обладающие сходной активностью, от одних и тех же видов или от разных видов известны, то специалист может сравнить аминокислотную последовательность полипептида VAR2CSA с указанными сходными полипептидами. Благодаря указанному сравнению можно идентифицировать остатки и части молекул, которые являются консервативными у сходных полипептидов. Следует оценить тот факт, что изменения в областях полипептида VAR2CSA, которые являются не консервативными по сравнению с указанными сходными полипептидами, не будут с меньшей вероятностью благоприятно влиять на биологическую активность и/или структуру полипептида VAR2CSA. Специалисту также следует знать, что даже в относительно консервативных областях можно заменять химически сходные аминокислоты на природные остатки с сохранением активности (консервативные аминокислотные замены). Таким образом, даже в областях, которые могут быть важными для биологической активности или для структуры, могут быть сделаны консервативные аминокислотные замены, не устраняя биологическую активность и не получая неблагоприятного влияния на структуру полипептида.
Кроме того, специалист может ознакомиться с исследованиями структуры-функции, идентифицирующими остатки в сходных полипептидах, которые являются важными для активности или структуры. Принимая во внимание указанное сравнение, можно предсказать важность аминокислотных остатков в полипептиде VAR2CSA, которые соответствуют аминокислотным остаткам, которые являются важными для активности или структуры в сходных полипептидах. Специалист может выбрать сходные аминокислотные замены для указанных предсказанных важных аминокислотных остатков полипептидов VAR2CSA и других полипептидов по настоящему изобретению.
Специалист также может проанализировать пространственную структуру и аминокислотную последовательность в отношении указанной структуры сходных полипептидов. С учетом указанной информации специалист может предсказать последовательное расположение аминокислотных остатков полипептида VAR2CSA с точки зрения его пространственной структуры. Специалист в данной области может выбрать отказ от радикальных изменений аминокислотных остатков, которые, как было предсказано, будут находиться на поверхности белка, поскольку указанные остатки могут участвовать в важных взаимодействиях с другими молекулами. Более того, специалист в данной области может генерировать тест-варианты, содержащие единственную аминокислотную замену по каждому желательному аминокислотному остатку. Варианты затем можно подвергнуть скринингу с использованием исследования активности, как описано в настоящем документе. Указанные варианты можно было бы использовать для получения информации о подходящих вариантах. Например, если установлено, что изменение конкретного аминокислотного остатка приводит к устранению, нежелательному уменьшению или непригодности активности, вариантов с указанным изменением следует избегать. Иными словами, на основе информации, собранной в результате указанных рутинных экспериментов, специалист в данной области может легко определить аминокислоты, в отношении которых следует избегать дальнейших замен, как в отдельности, так и в комбинации с другими мутациями.
Ряд научных публикаций был посвящен прогнозированию вторичной структуры (см. Moult J., Curr. Op. in Biotech., 7(4):422-427 (1996); Chou et al., Biochemistry, 13 (2):222-245 (1974); Chou et al., Biochemistry, 113 (2):211-222 (1974); Chou et al., Adv. Enzymol. Relat. Areas Mol. Biol., 47:45-148 (1978); Chou et al., Ann. Rev. Biochem., 47:251-276 и Chou et al., Biophys. J., 26:367-384 (1979)). Кроме того, в настоящее время доступны компьютерные программы, помогающие прогнозировать вторичную структуру. Один способ прогнозирования вторичной структуры основан на моделировании гомологичности. Например, два полипептида или белка, которые имеют идентичность последовательности более 30% или сходство более 40%, часто имеют сходные структурные топологии. Недавнее увеличение базы данных по структуре белков (PDB) обеспечивает улучшение прогнозируемости вторичной структуры, включая возможное количество изгибов внутри структуры полипептида или белка (см. Holm et al., Nucl. Acid. Res., 27(1):244247 (1999)). Было сделано предположение (Brenner et al., Curr. Op. Struct. Biol., 7(3):369-376 (1997)) о том, что существует ограниченное количество складок в данном полипептиде или белке и что после решения о критическом количестве структур точность прогнозирования структуры резко возрастет.
Дополнительные способы прогнозирования вторичной структуры включают threading (Jones D., Curr. Op. Struct. Biol., 7(3):377-87 (1997); Sippl et al., Structure, 4(l):15-9 (1996)), профильный анализ (Bowie et al., Science, 253:164-170 (1991); Gribskov et al., Meth. Enzymol., 183:146-159 (1990); Gribskov et
- 9 031876 al., Proc. Natl. Acad. Sci., 84(13):4355-4358 (1987)) и эволюционную взаимосвязь (см. Home, выше, и
Brenner, выше).
Идентичность и сходство родственных полипептидов можно легко рассчитать известными способами. Указанные способы включают, но ими не ограничиваются, способы, описанные в Computational Molecular Biology, Lesk A.M., ed., Oxford University Press, New York, 1988; Biocomputing: Informatics and Genome Projects, Smith D.W., ed., Academic Press, New York, 1993; Computer Analysis of Sequence Data, Part 1, Griffin A.M. and Griffin H.G., ed., Humana Press, Jersey, 1994; Sequence Analysis in Molecular Biology, von Heinje G., Academic Press, 1987; Sequence Analysis Primer, Gribskov M. and Devereux J., ed., M. Stockton Press, New York, 1991; и Carillo et al., SIAM J. Applied Math., 48:1073 (1988).
Предпочтительные способы определения идентичности и/или сходства выстроены таким образом, чтобы обеспечить наибольшее количество совпадений между исследуемыми последовательностями. Способы определения идентичности и сходства описаны в общедоступных компьютерных программах. Предпочтительные компьютерные способы определения идентичности и сходства между двумя последовательностями включают, но ими не ограничиваются, программный пакет GCG, включая GAP (Devereux et al., Nucl. Acid. Res., 12:387 (1984); Genetic Computer Group, University of Wisconsin, Madison, Wis.), BLASTP, BLASTN и FASTA (Altschul et al., J. Mol. Biol., 215:402-410 (1990)). Программа BLASTX имеется в общем доступе в Национальном Центре Биотехнологической Информации (NCBI) и в других источниках (BLAST Manual, Altschul et al., NCB/NLM/NIH Bethesda, Md. 20894; Altschul et al., выше). Хорошо известный алгоритм Смита-Ватермана также можно использовать для определения идентичности.
Определенные схемы выравнивания двух аминокислотных последовательностей могут привести к спариванию только очень короткого участка двух последовательностей, и указанный короткий участок выравнивания может иметь очень высокую идентичность последовательностей, даже если нет значительного родства между двумя полноразмерными последовательностями. Соответственно в предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения выбранный способ выравнивания (программа GAP) даст выравнивание, которое охватывает по меньшей мере 50 последовательных аминокислот полипептида-мишени.
Например, с использованием компьютерного алгоритма GAP (Genetic Cmputer Group, University of Wisconsin, Madison, Wis.) два полипептида, для которых необходимо определить процент идентичности последовательностей, выравниваются для оптимального спаривания их соответствующих аминокислот (совпадающий промежуток по определению алгоритма). Штраф за гэп открывающий (который рассчитан как трехкратная средняя диагональ; средняя диагональ представляет собой среднюю величину диагонали используемой сравнительной матрицы; диагональ представляет собой балльную оценку или число, определенное для каждого истинного спаривания аминокислот конкретной сравнительной матрицей) и штраф за гэп продолжающий (который обычно в {фракция (1/10)} раз превышает штраф за гэп открывающий), а также сравнительную матрицу, такую как РАМ 250 или BLOSUM 62, используют в сочетании с алгоритмом. Стандартная сравнительная матрица (см. Dayhoff et al., Atlas of Protein Sequence and Structure, vol. 5, sup. 3 (1978) для сравнительной матрицы РАМ 250; Henikoff et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:10915-10919 (1992) для сравнительной матрицы BLOSUM 62) также используется алгоритмом.
Предпочтительные параметры для сравнения полипептидных последовательностей включают следующие:
Алгоритм: Needleman et al., J. Mol. Biol., 48:443-453 (1970)); сравнительная матрица: BLOSUM 62 от Henikoff et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 89:10915-10919 (1992); штраф за вставку гэпов: 12, штраф за длину гэпа: 4, порог сходства: 0.
Программа GAP является эффективной с приведенными выше параметрами. Приведенные выше параметры являются параметрами по умолчанию для сравнения полипептидов (вместе с отсутствием штрафа за концевые гэпы) с использованием алгоритма GAP.
Предпочтительные параметры для сравнения последовательностей молекул нуклеиновой кислоты включают следующие:
Алгоритм: Needleman et al., J. Mol. Biol., 48:443-453 (1970); сравнительная матрица: спаривания=+10, ошибочное спаривание=0; штраф за вставку гэпов: 50, штраф за длину гэпа: 3.
Программа GAP также является эффективной с приведенными выше параметрами. Приведенные выше параметры являются параметрами по умолчанию для сравнения молекул нуклеиновой кислоты.
Другие показательные алгоритмы, штрафы за гэп открывающий, штрафы за гэп продолжающий, сравнительные матрицы, порог сходства и т.п. можно использовать, включая те, которые представлены в Program Manual, Wisconsin Package, Version 9, September, 1997. Конкретный выбор будет очевиден для специалиста в данной области и будет зависеть от конкретного сравнения, которое предстоит сделать, такого как ДНК с ДНК, белка с белком, белка с ДНК; и, кроме того, производится ли сравнение между данными парами последовательностей (в этом случае GAP или BestFit обычно являются предпочтительными) или между одной последовательностью и большой базой данных последовательностей (в этом случае FASTA или BLASTA являются предпочтительными).
Перед авторами настоящего изобретения стояли следующие вопросы, на которые были найдены от- 10 031876 веты, связанные с молекулярным механизмом, лежащим в основе плацентарной адгезии при РМ:
1) связана ли описанная дифференциальная адгезия CSA с последовательностью VAR2CSA? 2) каковы точные минимальные структурные требования для связывания VAR2CSA с CSA? 3) какой тип химического взаимодействия существует между VAR2CSA и CSA? и, наконец, 4) можно ли использовать данную информацию для конструирования оптимального вакцинного антигена?
Путем экспрессирования идентичных усечений VAR2CSA FCR3 и 3d7 заявители показали, что VAR2CSA связывается с CSA со сходной аффинностью и специфичностью независимо от происхождения штамма паразита. Указанные две последовательности имеют идентичность последовательности 79,6%. Заявители также показали, что высокая аффинность связывания с CSA сохраняется у нескольких более коротких фрагментов, и что DBL2X, включая малые области из фланкирующих интердоменов, образуют компактное ядро, которое содержит сайт связывания с CSA высокой аффинности. С помощью компьютерных технологий заявители определили в VAR2CSA предполагаемые сайты связывания с GAG, и путем делеции и замены заявители показали, что мутации в указанных сайтах не оказывают воздействия на связывание с CSPG. Используя теорию полиэлектролитных-белковых взаимодействий, заявители показали, что взаимодействие VAR2CSA-CSA может не зависеть, единственно, от ионных взаимодействий. И наконец, заявители показали, что несколько коротких фрагментов VAR2CSA способны индуцировать продукцию блокирующих адгезию антител, и что антиадгезионные антитела нацелены на предполагаемую область связывания с CSA. Указанные данные дают первое подробное ознакомление с биохимической природой взаимодействия между молекулой PfEMP1 и ее лигандом.
Получение полипептидов VAR2CSA и других полипептидов по настоящему изобретению.
Изобретение также связано с получением полипептидов VAR2CSA и других полипептидов по настоящему изобретению, как указано выше. Полипептиды VAR2CSA и другие полипептиды по настоящему изобретению, описанные в настоящем документе, могут быть получены посредством методики рекомбинантных нуклеиновых кислот. Обычно клонированную последовательность нуклеиновой кислоты VAR2CSA дикого типа модифицируют для кодирования желательного белка. Указанную модифицированную последовательность затем вводят в вектор экспрессии, который, в свою очередь, трансформируют или трансфицируют в клетки-хозяев. Высшие эукариотические клетки, в частности культивированные клетки млекопитающих можно использовать в качестве клеток-хозяев. Прокариотические клетки, такие как Lactococcus lactis или E.coli, также можно использовать для экспрессирования полипептидов, если только эти прокариоты способны продуцировать дисульфидные связи или белок вновь укладывается или может вновь укладываться корректно. Кроме того, дрожжевые штаммы также можно использовать для экспрессирования белка, например, среди прочих, Saccharomyces cerevisiae и P. Pichia.
Изменение аминокислотных последовательностей можно осуществлять с использованием ряда методик. Модификацию последовательностей нуклеиновой кислоты можно осуществлять путем сайтспецифического мутагенеза. Методики сайт-специфического мутагенеза хорошо известны и описаны, например, в Zoller and Smith (DNA 3:479-488, 1984) или в Splicing by extension overlap, Horton et al., Gene 77, 1989, pp. 61-68. Таким образом, с использованием нуклеотидных и аминокислотных последовательностей VAR2CSA можно вводить изменение (изменения) по своему выбору. Подобно этому способы для получения конструкции ДНК с использованием полимеразной цепной реакции со специфическими праймерами хорошо известны специалистам в данной области (см. PCR Protocols, 1990, Academic Press, San Diego, California, USA).
Полипептиды по настоящему изобретению также могут содержать неприродные аминокислотные остатки. Неприродные аминокислоты включают, но ими не ограничиваются, бета-аланин, дезаминогистидин, транс-3-метилпролин, 2,4-метанопролин, цис-4-гидроксипролин, транс-4-гидроксипролин, Nметилглицин, алло-треонин, метилтреонин, гидроксиэтилцистеин, гидроксиэтилгомоцистеин, нитроглутамин, гомоглутамин, пипеколиновую кислоту, тиазолидинкарбоновую кислоту, дегидропролин, 3- и 4метилпролин, 3,3-диметилпролин, трет-лейцин, норвалин, 2-азафенилаланин, 3-азафенилаланин, 4азафенилаланин и 4-фторфенилаланин. Несколько способов известны специалистам в данной области для инкорпорации неприродных аминокислотных остатков в полипептиды. Например, можно использовать систему in vitro, в которой нонсенс-мутации подавляются с использованием химически аминоацилированного супрессора тРНК. Способы синтеза аминокислот и аминоацилирования тРНК известны специалистам в данной области. Транскрипцию и трансляцию плазмид, содержащих нонсенс-мутации, осуществляют в бесклеточной системе, содержащей экстракт E.coli S30 и имеющиеся в продаже ферменты и другие реагенты. Полипептиды очищают посредством хроматографии (см., например, Robertson et al., J. Am. Chem. Soc. 113:2722, 1991; Ellman et al., Methods Enzymol. 202:301, 1991; Chung et al., Science 259:806-9, 1993; and Chung et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:10145-9, 1993)). Во втором способе трансляцию осуществляют а ооцитах Xenopus путем микроинъекции мутированной мРНК и химически аминоацилированного супрессора тРНК (Turcatti et al., J. Biol. Chem. 271:19991-8, 1996). В третьем способе клетки E.coli культивируют в отсутствие натуральной аминокислоты, подлежащей замене (например, фенилаланина), и в присутствии желательной неприродной аминокислоты (аминокислот) (например, 2азафенилаланина, 3-азафенилаланина, 4-азафенилаланина или 4-фторфенилаланина). Неприродную аминокислоту вводят в полипептид на место его натурального аналога (см. Koide et al., Biochem. 33:7470-6,
- 11 031876
1994). Остатки природных аминокислот можно конвертировать в неприродные виды путем химической модификации in vitro. Химическую модификацию можно комбинировать с сайт-направленным мутагенезом для дальнейшего расширения ряда замен (Wynn and Richards, Protein Sci. 2:395-403, 1993).
Конструкция нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептиды VAR2CSA или другие полипептиды по настоящему изобретению, может быть геномного или кДНК происхождения, например может быть получена созданием геномной или кДНК библиотеки и скринингом на последовательности ДНК, кодирующие все или часть полипептидов, путем гибридизации с использованием синтетических олигонуклеотидных зондов в соответствии со стандартными методиками (см. Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd. Ed. Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, New York, 1989).
Конструкция нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептиды VAR2CSA по настоящему изобретению, также может быть получена синтетически с использованием принятых стандартных способов, например фосфоамидитным способом, описанным Beaucage and Caruthers, Tetrahedron Letters 22 (1981), 1859-1869, или способом, описанным Matthes et al., EMBO Journal 3 (1984), 801-8 05. Согласно фосфоамидитному способу синтезируют олигонуклеотиды, например, в автоматическом ДНК-синтезаторе, очищают, отжигают, сшивают и клонируют в подходящих векторах. Последовательности ДНК, кодирующие полипептиды VAR2CSA Plasmodium falciparum и другие полипептиды по настоящему изобретению, также можно получать полимеразной цепной реакцией с использованием специфических праймеров, например, как описано в US 4683202, Saiki et al., Science 239 (1988), 487-491 или Sambrook et al., выше.
Кроме того, конструкция нуклеиновой кислоты может быть смешанного синтетического и геномного, смешанного синтетического и кДНК или смешанного геномного и кДНК происхождения, полученная сшивкой фрагментов синтетического, геномного или кДНК происхождения (при необходимости), фрагментов, соответствующих различным частям всей конструкции нуклеиновой кислоты, в соответствии со стандартными методиками.
Конструкция нуклеиновой кислоты предпочтительно представляет собой ДНК-конструкцию. Последовательности ДНК для использования при получении полипептидов VAR2CSA и других полипептидов по настоящему изобретению обычно будут кодировать пре-про полипептид на аминоконце VAR2CSA для обеспечения правильного посттрансляционного процессинга и секреции из клеткихозяина.
Последовательности ДНК, кодирующие полипептиды VAR2CSA Plasmodium falciparum и другие полипептиды по настоящему изобретению, обычно вводят в рекомбинантный вектор, который может представлять собой любой вектор, который удобно можно подвергать способам рекомбинантной ДНК, и выбор вектора часто будет зависеть от клетки-хозяина, в которую его будут вводить. Так вектор может представлять собой автономно реплицирующийся вектор, т.е. вектор, который существует в качестве внехромосомного объекта, репликация которого не зависит от хромосомной репликации, например, плазмиду. Альтернативно, вектор может представлять собой объект, который, будучи введенным в клетку-хозяина, встраивается в геном клетки-хозяина и реплицируется вместе с хромосомой (хромосомами), в которую он встроился.
Вектор предпочтительно представляет собой вектор экспрессии, в котором последовательность ДНК, кодирующая полипептиды VAR2CSA Plasmodium falciparum и другие полипептиды по настоящему изобретению, функционально связана с дополнительными сегментами, требующимися для транскрипции ДНК. Обычно вектор экспрессии получают из плазмиды или вирусной ДНК или он может содержать элементы обоих. Термин функционально связанный означает, что сегменты располагаются в таком порядке, который позволяет им функционировать в соответствии с целями, для которых они предназначены, например транскрипция инициируется в промоторе и продолжается через последовательность ДНК, кодирующую полипептид.
Векторы экспрессии для применения для экспрессии полипептидов VAR2CSA и других полипептидов по настоящему изобретению будут содержать промотор, способный контролировать транскрипцию клонированного гена или кДНК. Промотор может представлять собой любую последовательность ДНК, которая демонстрирует транскрипционную активность в выбранной клетке-хозяине, и может быть получен из генов, кодирующих белки, которые являются как гомологичными, так и гетерологичными в отношении клетки-хозяина.
Примерами подходящих промоторов для контроля транскрипции ДНК, кодирующей полипептид VAR2CSA Plasmodium falciparum в клетках млекопитающих, являются промотор SV40 (Subramani et al., Mol. Cell Biol. 1 (1981), 854-864, промотор МТ-1 (ген металлотионеина) (Palmiter et al., Science 222 (1983), 809-814), промотор CMV (Boshart et al., Cell 41:521-530, 1985) или главный поздний промотор аденовируса 2 (Kaufman and Sharp, Mol. Cell. Biol., 2:1304-1319, 1982).
Примером подходящего промотора для применения в клетках насекомых является полихедриновый промотор (Us 4745051; Vasuvedan et al., FEbS Lett., 311 (1992) 7-11), промотор Р10 (J.M. Vlak et al., J. Gen. Virology 69, 1988, pp. 765-776), промотор основного белка вируса полигедроза Autographa californica (EP 397485), промотор немедленно-раннего гена 1 бакуловируса (US 5155037; US 5162222) или промотор задержанно-раннего гена бакуловируса 39К (US 5155037; US 5162222).
- 12 031876
Примеры подходящих промоторов для применения в клетках-хозяевах дрожжей включают промоторы из гликолитических генов дрожжей (Hitzeman et al., J. Biol. Chem. 255 (1980), 12073-12080; Alber and Kawasaki, J. Mol. Appl. Gen. 1 (1982), 419-434) или генов алкогольдегидрогеназы (Young et al., в Genetic Engineering of Microorganisms for Chemicals (Hollaender et al., eds.), Plenum Press, New York, 1982) или промоторы ТРИ (US 4599311) или ADH2-4c (Russel et al., Nature 304 (1983), 652-654).
Примерами подходящих промоторов для применения в клетках-хозяевах мицелиальных грибов являются, например, промотор ADH3 (McKnight et al., The EMBO J. 4 (1985), 2093-2099) или промотор tpiA. Примерами других подходящих промоторов являются промоторы, полученные из гена, кодирующего ТАКА-амилазу A.oryzae, аспартат-протеиназу Rhizomucor miehei, нейтральную альфа-амилазу A.niger, кислую стабильную альфа-амилазу A.niger, глюкоамилазу (gluA) A.niger или A.awamori, липазу Rhizomucor miehei, щелочную протеиназу A. oryzae, триозофосфатизомеразу A.oryzae или ацетамидазу A.nidulans. Предпочтительными являются промоторы TAKA-амилазы и gluA. Подходящие промоторы упоминаются, например, в ЕР 238023 и ЕР 383779.
Последовательности ДНК, кодирующие полипептиды VAR2CSA Plasmodium falciparum и другие полипептиды по настоящему изобретению, могут также, если необходимо, функционально соединяться с подходящим терминатором, таким как терминатор гормона роста человека (Palmiter et al., Science 222, 1983, 99. 809-814) или терминаторы ТРИ (Alber and Kawasaki, J. Mol. Appl. Gen. 1 (1982), pp. 419-434) или ADH3 (McKnight et al., The EMBO J. 4, 1985, pp. 2093-2099). Векторы экспрессии также могут содержать ряд сайтов сплайсинга РНК, расположенных ниже от промотора и выше от сайта инсерции самой последовательности VAR2CSA. Предпочтительные сайты сплайсинга РНК могут быть получены из аденовируса и/или генов иммуноглобулинов. В векторах экспрессии также содержится сигнал полиаденилирования, расположенный ниже сайта инсерции. Особенно предпочтительные сигналы полиаденилирования включают ранний или поздний сигнал полиаденилирования из SV40 (Kaufman and Sharp, там же), сигнал полиаденилирования из области Elb аденовируса 5, терминатор гена гормона роста человека (DeNoto et al., Nucl. Acids Res. 9:3719-3730, 1981) или сигнал полиаденилирования из Plasmodium falciparum, генов человека или крупного рогатого скота. Векторы экспрессии могут также содержать некодирующую вирусную лидерную последовательность, такую как тройной лидер аденовируса 2, располагающуюся между промотором и сайтами сплайсинга РНК; и энхансерные последовательности, такие как энхансер SV40.
Для направления полипептидов VAR2CSA Plasmodium falciparum и других полипептидов по настоящему изобретению на секреторный путь клеток-хозяев секреторную сигнальную последовательность (также известную как лидерная последовательность, препро-последовательность или препоследовательность) можно поместить в рекомбинантный вектор. Секреторную сигнальную последовательность присоединяют к последовательностям ДНК, кодирующим полипептиды VAR2CSA Plasmodium falciparum и другие полипептиды по настоящему изобретению, в корректной рамке считывания. Секреторные сигнальные последовательности обычно позиционируют на 5' по отношению к последовательности ДНК, кодирующей пептид. Секреторная сигнальная последовательность может представлять собой последовательность, обычно связанную с белком, или может происходить из гена, кодирующего другой секретируемый белок.
Для секреции из клеток дрожжей секреторная сигнальная последовательность может кодировать любой сигнальный пептид, который гарантирует эффективное направление экспрессированных полипептидов VAR2CSA Plasmodium falciparum и других полипептидов по настоящему изобретению на секреторный путь клетки. Сигнальный пептид может представлять собой природный сигнальный пептид или его функциональную часть или он может представлять собой синтетический пептид. Установлено, что подходящими сигнальными пептидами является сигнальный пептид альфа-фактора (см. US 4870008), сигнальный пептид амилазы слюны мыши (см. О. Hagenbuchle et al., Nature 289, 1981, pp. 643-646), модифицированный сигнальный пептид карбоксипептидазы (см. L.A. Valls et al., Cell 48, 1987, pp. 887-897), сигнальный пептид дрожжей BAR1 (см. WO 87/02670) или сигнальный пептид аспартат-протеиназы дрожжей 3 (YAP3) (см. М. Egel-Mitani et al., Yeast 6, 1990, pp. 127-137).
Для эффективной секреции в дрожжах последовательность, кодирующую лидерный пептид, также можно вводить ниже по отношению к сигнальной последовательности и выше по отношению к последовательности ДНК, кодирующей полипептиды VAR2CSA Plasmodium falciparum и другие полипептиды по настоящему изобретению. Функция лидерного пептида заключается в том, чтобы обеспечить транспорт экспрессированного пептида из эндоплазматической сети в аппарат Гольджи и далее в секреторную везикулу для секреции в культуральную среду (т.е. в экспорте полипептидов VAR2CSA Plasmodium falciparum и других полипептидов по настоящему изобретению через клеточную стенку или, по меньшей мере, через клеточную мембрану в периплазматическое пространство дрожжевой клетки). Лидерный пептид может представлять собой лидер альфа-фактора дрожжей (использование которого описано, например, в US 4546082, US 4870008, ЕР 16201, ЕР 123294, ЕР 123544 и ЕР 163529). Альтернативно, лидерный пептид может представлять собой синтетический лидерный пептид, т.е. лидерный пептид, не имеющийся в природе. Синтетические лидерные пептиды можно конструировать, например, как описано в WO 89/02463 или WO 92/11378.
- 13 031876
Для применения в мицелиальных грибах сигнальный пептид можно получать из гена, кодирующего амилазу или глюкоамилазу Aspergillus sp., гена, кодирующего липазу или протеиназу Rhizomucor miehei, или липазу Humicola lanuginose. Сигнальный пептид предпочтительно получают из гена, кодирующего ТАКА-амилазу A.oryzae, нейтральную альфа-амилазу A.niger, кислую стабильную альфа-амилазу A.niger или глюкоамилазу A.niger. Подходящие сигнальные пептиды описаны, например, в ЕР 238023 и ЕР 215594.
Для применения в клетках насекомых сигнальный пептид можно получать из гена насекомого (см. WO 90/05783), такого как сигнальный пептид предшественника адипокинетического гормона Manduca sexta (см. US 5023328).
Способы, используемые для лигирования последовательностей ДНК, кодирующих полипептиды VAR2CSA Plasmodium falciparum и другие полипептиды по настоящему изобретению, промотор и, необязательно, терминатор и/или секреторную сигнальную последовательность соответственно, и для их ввода в подходящие векторы, содержащие информацию, необходимую для репликации, хорошо известны специалистам (см., например, Sambrook et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor, New York, 1989).
Способы трансфекции клеток млекопитающих и экспрессии последовательностей ДНК, введенных в клетки, описаны, например, в Kaufman and Sharp, J. Mol. Biol. 159 (1982), 601-621; Southern and Berg. J. Mol. Appl. Genet. 1 (1982), 327-341; Loyter et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 79 (1982), 422-426; Wigler et al., Cell 14 (1978), 725; Corsaro and Pearson, Somatic Cell Genetics 7 (1981), 603; Graham and van der Eb, Virology 52 (1973), 456 и Neumann et al., EMBO J. 1 (1982), 841-845).
Клонированные последовательности ДНК вводят в культивируемые клетки млекопитающих посредством, например, кальций-фосфатной трансфекции (Wigler et al., Cell 14:725-732, 1978; Corsaro and Pearson, Somatic Cell Genetics 7:603-616, 1981; Graham and van der Eb, Virology 52d:456-467,1973) или электропорации (Neumann et al., EMBO J. 1:841-845, 1982). Для идентификации и отбора клеток, которые экспрессируют экзогенную ДНК, ген, который дает фенотип селекции (маркер селекции), обычно вводят в клетки вместе с геном или кДНК, представляющими интерес. Предпочтительные маркеры селекции включают гены, которые придают резистентность к лекарственным средствам, таким как неомицин, гидромицин и метотрексат. Маркер селекции может представлять собой поддающийся амплификации маркер селекции. Предпочтительным поддающимся амплификации маркером селекции является последовательность дигидрофолат-редуктазы (DHFR). Обзор маркеров селекции осуществлен Thilly (Mammalian Cell Technology, Butterworth Publishers, Stoneham, MA; включено в настоящий документ в качестве ссылки). Специалист без труда сможет выбрать подходящие маркеры селекции.
Маркеры селекции могут быть введены в клетку с помощью отдельной плазмиды в то же самое время, что и ген, представляющий интерес, или они могут быть введены с помощью одной и той же плазмиды. В случае введения с помощью одной и той же плазмиды маркер селекции и ген, представляющий интерес, могут находиться под контролем разных промоторов или одного и того же промотора; в последнем случае возникает дицистроновый месседж. Конструкции указанного типа известны в данной области (например, Levinson and Siminsen, US 4713339). Также может быть предпочтительно добавлять дополнительную ДНК, известную как ДНК-носитель, в смесь, которую вводят в клетки.
После того как в клетки ввели ДНК, их выращивали в подходящей питательной среде, обычно 1-2 дня, после чего они экспрессировали ген, представляющий интерес. Используемый в настоящем документе термин подходящая питательная среда обозначает среду, содержащую питательные вещества и другие компоненты, требующиеся для роста клеток и экспрессии полипептида VAR2CSA Plasmodium falciparum, представляющего интерес. Среды обычно содержат источник углерода, источник азота, незаменимые аминокислоты, незаменимые сахара, витамины, соли, фосфолипиды, белок и факторы роста. Затем осуществляют выбор лекарственных средств для роста клеток, которые стабильно экспрессируют маркер селекции. Для клеток, которые были трансфицированы поддающимся амплификации маркером селекции, концентрацию лекарственного средства можно увеличить для отбора повышенного количества копий клонированных последовательностей, увеличивая, таким образом, уровни экспрессии. Клоны стабильно трансфицированных клеток затем подвергают скринингу на предмет экспрессии полипептида VAR2CSA Plasmodium falciparum, представляющего интерес.
Клетка-хозяин, в которую были введены последовательности ДНК, кодирующие полипептиды VAR2CSA Plasmodium falciparum и другие полипептиды по настоящему изобретению, может представлять собой любую клетку, которая способна продуцировать посттрансляционно модифицированные полипептиды и включает дрожжи, грибы и высшие эукариотические клетки.
Примерами клеточных линий млекопитающих для применения в настоящем изобретении являются клеточные линии COS-1 (ATCC CRL 1650), почки новорожденного сирийского хомячка (ВНК) и 293 (ATCC CRL 1573; Graham et al., J. Gen. Virol. 36:59-72, 1977). Предпочтительной клеточной линией ВНК является клеточная линия ВНК tk-tsl3 (Waechter and Baserga, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 79:1106-1110, 1982; включено в настоящий документ в качестве ссылки), далее в настоящем документе называемая клетками ВНК 570. Клеточная линия ВНК 570 хранится в Американской коллекции типовых культур 12301 Parklawn Dr., Rockville, Md. 20852, под номером ATCC CRL 10314. Клеточная линия ВНК tk-tsl3
- 14 031876 также доступна из АТСС под номером CRL 1632. Кроме того, ряд других клеточных линий можно использовать в настоящем изобретении, включая клетки Rat Hep I (гепатома крысы; ATCC CRL 1600), Rat
Hep II (гепатома крысы; ATCC CRL 1548), TCMK (ATCC CCL 139), легкого человека (ATCC HB 8065),
NCTC 1469 (ATCC CCL 9.1), CHO (ATCC CCL 61) и DUKX (Urlaub and Chasm, Proc. Natl. Acad. Sci. USA
77:4216-4220, 1980).
Примеры подходящих клеток дрожжей включают клетки Saccharomyces spp. или Schizosaccharomyces spp., в частности штаммы Saccharomyces cerevisiae или Saccharomyces kluyveri. Способы трансформации дрожжевых клеток гетерологичной ДНК и продукции из них гетерологичных полипептидов описаны, например, в US 4599311, US 4931373, US 4870008, US 5037743 и US 4845075, которые включены в настоящий документ в качестве ссылок. Трансформированные клетки отбирают по фенотипу, определяемому маркером селекции, обычно по лекарственной резистентности или способности расти в отсутствии определенного питательного вещества, например лейцина. Предпочтительным вектором для использования в дрожжах является вектор РОТ1, описанный в US 4931373. Последовательностям ДНК, кодирующим полипептиды VAR2CSA Plasmodium falciparum и другие полипептиды по настоящему изобретению, может предшествовать сигнальная последовательность и, необязательно, лидерная последовательность, например, как описано выше. Дополнительными примерами подходящих дрожжевых клеток являются штаммы Kluyveromyces, такие как K.lactis, Hansenula, например Hpolymorpha. или Pichia, например P.pastoris (см. Gleeson et al., J. Gen. Microbiol. 132, 1986, pp. 3459-3465; US 4882279).
Примерами других клеток грибов являются клетки мицелиальных грибов, например Aspergillus spp., Neurospora spp. , Fusarium spp. или Trichoderma spp., в частности штаммы A.oryzae, A. nidulans или A.niger. Использование Aspergillus spp. для экспрессии белков описано, например, в ЕР 272277, ЕР 238 02 3, ЕР 184438. Трансформацию F.oxysporum можно осуществлять, например, как описано Malardier et al., 1989, Gene 78: 147-156. Трансформацию Trichoderma spp. можно осуществлять, например, как описано в ЕР 244234.
В случае, если в качестве клетки-хозяина используется мицелиальный гриб, то он может быть трансформирован конструкцией ДНК по настоящему изобретению удобно путем введения конструкции ДНК в хромосому хозяина для получения рекомбинантной клетки-хозяина. Указанная интеграция обычно считается имеющей преимущества, поскольку последовательность ДНК, наиболее вероятно, будет стабильно поддерживаться в клетке. Введение конструкций ДНК в хромосому хозяина можно осуществлять с использованием стандартных способов, например путем гомологичной или гетерологичной рекомбинации.
Трансформацию клеток насекомых и продукцию ими гетерологичных полипептидов можно осуществлять, например, как описано в US 4745051; US 4879236; US 5155037; 5162222; ЕР 397485; все они включены в настоящий документ в качестве ссылок. Подходящей линией клеток насекомых в качестве хозяина может быть клеточная линия Lepidoptera, такая как клетки Spodoptera frugiperda или клетки Trichoplusia ni (см. US 5077214). Подходящими условиями культивирования могут быть условия, описанные, например, в WO 89/01029, или WO 89/01028, или в любой из упомянутых выше ссылок.
Трансформированную или трансфицированную клетку затем культивируют в подходящей питательной среде в условиях, обеспечивающих экспрессию полипептида VAR2CSA Plasmodium falciparum, после чего весь или часть полученного пептида можно выделить из культуры. Средой для культивирования клеток может быть любая обычная среда, подходящая для выращивания клеток-хозяев, такая как минимальные или комплексные среды, содержащие необходимые добавки. Подходящие среды могут быть приобретены у коммерческих поставщиков или могут быть получены в соответствии с опубликованными рецептурами (например, в каталоге Американской коллекции типовых культур). Полипептиды VAR2CSA Plasmodium falciparum, продуцированные клетками, затем можно выделить из культуральной среды с использованием обычных методик, включая отделение клеток-хозяев от среды центрифугированием или фильтрованием, осаждение белковых компонентов надосадочной жидкости или фильтрата с использованием соли, например сульфата аммония, очистку с использованием разнообразных хроматографических методик, например ионообменной хроматографии, гель-хроматографии, аффинной хроматографии и т.п., в зависимости от типа полипептида, о котором идет речь.
Методики трансгенных животных можно использовать для получения полипептидов VAR2CSA и других полипептидов по настоящему изобретению. Предпочтительно продуцировать белки в молочных железах самки млекопитающего-хозяина. Экспрессия в молочной железе и последующая секреция белка, представляющего интерес, в молоко позволяет исключить многие трудности, с которыми сталкиваются при выделении белков из других источников. Молоко легко собирать, оно доступно в больших количествах и хорошо охарактеризовано биохимически. Кроме того, основные белки молока присутствуют в нем в высоких концентрациях (обычно приблизительно от 1 до 15 г/л).
С коммерческой точки зрения совершенно ясно, что предпочтительно использовать в качестве хозяина вид, который имеет большие надои молока. В то время как животные меньших размеров, такие как мыши и крысы, могут использоваться (и являются предпочтительными для испытаний на принципиальной стадии), предпочтительно использовать сельскохозяйственных животных, включая, но ими не ограничиваясь, свиней, коз, овец и крупный рогатый скот. Овцы являются особенно предпочтительными бла- 15 031876 годаря таким факторам как более ранняя история трансгенеза у данного вида, надои молока, стоимость и доступность оборудования для сбора овечьего молока (см., например, WO 88/00239 для сравнения факторов, влияющих на выбор вида-хозяина). Обычно желательно выбрать породу животного-хозяина, которая была выведена для доения, такую как восточно-фризская овца, или позднее организовать молочное стадо путем разведения трансгенной линии. В любом случае следует использовать животных с известным хорошим состоянием здоровья.
Для получения экспрессии в молочной железе используют промотор транскрипции из гена молочного белка. Гены молочных белков включают гены, кодирующие казеины (см. US 5304489), беталактоглобулин, лактальбумин и кислый сывороточный белок. Промотор бета-лактоглобулина является предпочтительным. В случае использования гена овечьего бета-лактоглобулина обычно будет использоваться область по меньшей мере из проксимальных 406 пн 5' фланкирующей последовательности гена, хотя более длинные части 5' фланкирующей последовательности, приблизительно до 5 тыс. пн, являются предпочтительными, такие как сегмент ДНК из ~4,25 тыс. пн, охватывающий 5' фланкирующий промотор и некодирующую часть гена бета-лактоглобулина (см. Whitelaw et al., Biochem. J. 286: 31-39 (1992)). Также подходящими являются сходные фрагменты ДНК промотора других видов.
Другие области гена бета-лактоглобулина также можно вводить в конструкции, также как геномные области гена, подлежащего экспрессии. В целом, специалистами в данной области принято, что конструкции, не имеющие интронов, например, плохо экспрессируют по сравнению с конструкциями, которые содержат указанные последовательности ДНК (см. Brinster et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85: 836-840 (1988); Palmiter et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88: 478-482 (1991); Whitelaw et al., Transgenic Res. 1: 3-13 (1991); WO 89/01343 и WO 91/02318, которые включены в настоящий документ в качестве ссылок). Учитывая это, обычно предпочтительно, когда это возможно, использовать геномные последовательности, содержащие все или некоторые из нативных интронов гена, кодирующего белок или полипептид, представляющий интерес; так дополнительное включение в состав, по меньшей мере, некоторых интронов, например, из гена бета-лактоглобулина, является предпочтительным. Одна указанная область представляет собой сегмент ДНК, который предусматривает сплайсинг интронов и полиаденилирование РНК из 3' некодирующей области овечьего гена бета-лактоглобулина. После замены натуральными 3' некодирующими последовательностями гена указанный сегмент бета-лактоглобулина овцы может как усиливать, так и стабилизировать уровни экспрессии белка или полипептида, представляющего интерес. В других вариантах осуществления настоящего изобретения область, окружающую инициирующий ATG последовательности VAR2CSA, заменяют соответствующими последовательностями из гена специфического молочного белка. Указанная замена обеспечивает окружение предполагаемой тканеспецифической инициации для усиления экспрессии. Удобно заменять полные препро- и 5' некодирующие последовательности VAR2CSA последовательностями, например, гена BLG, хотя можно заменять и более короткие области.
Для экспрессии полипептидов VAR2CSA и других полипептидов по настоящему изобретению у трансгенных животных сегмент ДНК, кодирующий VAR2CSA, функционально связывают с дополнительными сегментами ДНК, требующимися для его экспрессии, с получением единиц экспрессии. Указанные дополнительные сегменты включают упомянутый выше промотор, а также последовательности, которые предусматривают терминацию транскрипции и полиаденилирование мРНК. Единицы экспрессии будут дополнительно включать сегмент ДНК, кодирующий секреторную сигнальную последовательность, функционально связанную с сегментом, кодирующим модифицированный VAR2CSA. Секреторная сигнальная последовательность может представлять собой нативную секреторную сигнальную последовательность или может представлять собой последовательность другого белка, такого как молочный белок (см., например, von Heijne, Nucl. Acids Res. 14:4683-4690 (1986) и Meade et al., US 4873316, которые включены в настоящий документ в качестве ссылок).
Конструирование единиц экспрессии для применения у трансгенных животных удобно осуществлять введением последовательности VAR2CSA в плазмиду или фаговый вектор, содержащие дополнительные сегменты ДНК, хотя единицу экспрессии можно сконструировать практически любой последовательностью сшивок. Особенно удобно создавать вектор, содержащий сегмент ДНК, кодирующий молочный белок, и заменять кодирующую последовательность для молочного белка последовательностью варианта VAR2CSA, обеспечивая, таким образом, слияние генов, которое включает последовательности контроля экспрессии гена молочного белка. В любом случае клонирование единиц экспрессии в плазмидах или других векторах облегчает амплификацию последовательности VAR2CSA. Амплификацию удобно осуществлять в бактериальных клетках-хозяевах (например, E.coli), таким образом, векторы обычно будут включать репликатор и маркер селекции, функциональный в бактериальных клеткаххозяевах. Единицу экспрессии затем вводят в оплодотворенные яйца (включая эмбрионы на ранних стадиях развития) выбранного вида-хозяина. Введение гетерологичной ДНК можно осуществлять одним из нескольких путей, включая микроинъекцию (например, патент США № 4873191), ретровирусную инфекцию (Jaenish, Science 240: 1468-1474 (1988)) или сайт-направленную интеграцию с использованием эмбриональных стволовых (ES) клеток (обзор Bradley et al., Bio/Technology 10: 534-539 (1992)). Яйца затем импланитируют в фаллопиевы трубы или матку псевдобеременных самок и позволяют им развивать
- 16 031876 ся до сроков. Потомок, несущий введенную ДНК в своей зародышевой линии, может передавать ДНК своему потомству нормальным менделевским наследованием, что позволяет развиваться трансгенным стадам. Основные способы получения трансгенных животных известны в данной области (см., например, Hogan et al., Manipulating the Mouse Embryo: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, 1986; Simons et al., Bio/Technology 6: 179-183 (1988); Wall et al., Biol. Reprod. 32: 645-651 (1985); Buhler et al., Bio/Technology 8: 140-143 (1990); Ebert et al., Bio/Technology 9: 835-838 (1991); Krimpenfort et al., Bio/Technology 9: 844-847 (1991); Wall et al., J. Cell. Biochem. 49: 113-120 (1992); US 4873191; US 4873316; WO 88/00239, WO 90/05188, WO 92/11757 и GB 87/00458). Методики введения последовательностей чужеродной ДНК в организм млекопитающих и их зародышевые клетки первоначально были разработаны на мышах (см., например, Gordon et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77: 7380-7384 (1980); Gordon and Ruddle, Science 214: 1244-1246 (1981); Palmiter and Brinster, Cell 41: 343-345 (1985); Brinster et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82: 4438-4442 (1985) и Hogan et al. (там же)). Указанные методики впоследствии были адаптированы для использования у более крупных животных, включая виды домашнего скота (см., например, WO 88/00239, WO 90/05188 и WO 92/11757 и Simons et al., Bio/Technology 6: 179-183 (1988)). Суммируя, можно сказать, что при наиболее эффективном пути, используемом в настоящее время для генерации трансгенных мышей или сельскохозяйственных животных несколько сотен линейных молекул ДНК, представляющей интерес, инъецируют в одно из пронуклеусов оплодотворенного яйца согласно разработанной методике. Можно осуществлять также инъекцию ДНК в цитоплазму зиготы.
Также можно использовать продукцию в трансгенных растениях. Экспрессия может быть генерализована или направлена в конкретный орган, такой как клубень (см. Hiatt, Nature 344: 469-479 (1990); Edelbaum et al., J. Interferon Res. 12: 449-453 (1992); Simons et al., Bio/Technology 8: 217-221 (1990) и ЕР 0255378).
Очистка VAR2CSA.
Полипептиды VAR2CSA и другие полипептиды могут быть выделены из клеточной культуральной среды или молока. Полипептиды VAR2CSA и другие полипептиды по настоящему изобретению могут быть очищены с использованием разнообразных методик, известных в данной области, включая, но ими не ограничиваясь, хроматографию (например, ионообменную, аффинную, гидрофобную, хроматофокусирующую и вытеснительную), электрофоретические методы (например, препаративное изоэлектрическое фокусирование (IEF), различающуюся растворимость (например, осаждение сульфатом аммония) или экстракцию (см., например, Protein Purification, J.-C. Janson and Lars Ryden, editors, VCH Publishers, New York, 1989). Предпочтительно они могут быть очищены аффинной хроматографией на колонке с антителами против VAR2CSA. Дополнительную очистку можно осуществлять обычными средствами химической очистки, такими как высокоэффективная жидкостная хроматография. Другие способы очистки, включая осаждение цитратом бария, известны специалистам и могут применяться для очистки новых полипептидов VAR2CSA и других полипептидов, описанных в настоящем документе (см., например, Scopes, R., Protein Purification. Springer-Verlag, N.Y., 1982).
Для терапевтических целей предпочтительно, чтобы полипептиды VAR2CSA и другие полипептиды по настоящему изобретению были практически чистыми. Так в предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения полипептиды VAR2CSA и другие полипептиды по настоящему изобретению очищают по меньшей мере приблизительно до 90-95% гомогенности, предпочтительно по меньшей мере приблизительно до 98% гомогенности. Чистоту можно оценить, например, электрофорезом в геле и аминотерминальным аминокислотных секвенированием.
Термин выделенный полипептид относится к полипептиду по настоящему изобретению, который (1) был выделен по меньшей мере из приблизительно 50% полинуклеотидов, липидов, углеводов или других материалов (т.е. загрязнений), с которыми он связан в природе. Предпочтительно выделенный полипептид практически не содержит никаких других загрязняющих полипептидов или других загрязнений, которые наблюдаются в его естественном окружении и которые могли бы препятствовать его терапевтическому, диагностическому, профилактическому или исследовательскому применению.
Термин микроорганизм, использующийся в настоящем документе, относится к бактериям, грибам, археям, протистам; микроскопическим растениям и животным (таким как зеленые водоросли или планктон), плоским червям и амебам. В данное определение включены и патогенные микроорганизмы.
Введение и фармацевтические композиции. Комбинированные лекарственные средства.
Слитый полипептид или конъюгат VAR2CSA, как определено в настоящем описании, можно вводить одновременно или последовательно с одним или более других противораковых средств или использовать в комбинированном лечении с другими известными лекарственными средствами. Факторы могут поставляться в единой лекарственной форме, которая содержит оба соединения, или в форме комплекта, содержащего препарат полипептида VAR2CSA в качестве первой стандартной лекарственной формы и препарат одного или нескольких других соединений в качестве второй стандартной лекарственной формы. Когда бы не упоминалась первая, или вторая, или третья и т.п. стандартная лекарственная форма в настоящем описании, это не указывает на предпочтительный порядок введения, но делается лишь ради удобства.
- 17 031876
Подходящие другие противораковые средства или лекарственные средства, которые можно использовать в комбинации с полипептидом VAR2CSA, включают уже имеющиеся в продаже или находящиеся на стадии разработки антитела, включая Vemurafenib (Hoffmann-La Roche), моноклональные антитела человека против MCSP, терапевтические (Micromet Inc) анти-MCSP с использованием методик антител
BITE и адоптивный перенос цитотоксических Т-клеток со специфичностью в отношении MCSP.
Под одновременным введением препарата полипептида VAR2CSA и препарата одного или нескольких других соединений подразумевается введение соединений в виде единой лекарственной формы или введение первого средства с последующим введением второго средства с интервалом времени между введениями не более 15 мин, предпочтительно 10 мин, более предпочтительно 5 мин, еще более предпочтительно 2 мин. Любой из факторов можно вводить первым.
Под последовательным введением подразумевается введение первого средства с последующим введением второго средства с интервалом времени между введениями более 15 мин. Любую из двух дозированных лекарственных форм можно вводить первой. Предпочтительно оба продукта инъецируют с использованием одного и того же внутривенного доступа.
Другой целью настоящего изобретения является создание фармацевтической композиции, содержащей полипептид VAR2CSA, который присутствует в концентрации в сыворотке/плазме от 0 до 1 мг/мл, и в которой величина pH составляет от 2,0 до 10,0. Композиция может дополнительно содержать буферную систему, консервант (консерванты), средство (средства), обеспечивающее изотоничность, хелатирующее средство (средство), стабилизаторы и поверхностно-активные средства. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения фармацевтическая композиция является водной, т.е. композицией, содержащей воду. Указанная композиция обычно представляет собой раствор или суспензию. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения фармацевтическая композиция представляет собой водный раствор. Термин водная композиция определяется как композиция, содержащая по меньшей мере 50 мас.% воды. Подобно этому водный раствор определяется как раствор, содержащий по меньшей мере 50 мас.% воды, а термин водная суспензия определяется как суспензия, содержащая по меньшей мере 50 мас.% воды.
В других вариантах осуществления настоящего изобретения фармацевтическая композиция представляет собой лиофилизированную композицию, в которую врач или пациент перед использованием добавляет растворители и/или разбавители.
В других вариантах осуществления настоящего изобретения фармацевтическая композиция представляет собой высушенную композицию (например, лиофилизированную или высушенную распылением), готовую для использования без предварительного растворения.
В еще одном аспекте изобретение относится к фармацевтической композиции, содержащей водный раствор полипептида VAR2CSA и буфер, в которой полипептид VAR2CSA присутствует в концентрации в сыворотке/плазме от 0 до 1 мг/мл или выше, и в которой величина pH составляет от 2,0 до 10,0.
В других вариантах осуществления настоящего изобретения величина pH композиции выбрана из перечня, состоящего из 2,0, 2,1, 2,2, 2,3, 2,4, 2,5, 2,6, 2,7, 2,8, 2,9, 3,0, 3,1, 3,2, 3,3, 3,4, 3,5, 3,6, 3,7, 3,8, 3,9, 4,0, 4,1, 4,2, 4,3, 4,4, 4,5, 4,6, 4,7, 4,8, 4,9, 5,0, 5,1, 5,2, 5,3, 5,4, 5,5, 5,6, 5,7, 5,8, 5,9, 6,0, 6,1, 6,2, 6,3, 6,4, 6,5, 6,6, 6,7, 6,8, 6,9, 7,0, 7,1, 7,2, 7,3, 7,4, 7,5, 7,6, 7,7, 7,8, 7,9, 8,0, 8,1, 8,2, 8,3, 8,4, 8,5, 8,6, 8,7, 8,8, 8,9, 9,0, 9,1, 9,2, 9,3, 9,4, 9,5, 9,6, 9,7, 9,8, 9,9 и 10,0.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения буфер выбран из группы, состоящей из ацетата натрия, карбоната натрия, цитрата, глицилглицина, гистидина, глицина, лизина, аргинина, дигидрофосфата натрия, гидрофосфата натрия, фосфата натрия и трис(гидроксиметил)аминометана, бицина, трицина, яблочной кислоты, сукцината, малеиновой кислоты, фумаровой кислоты, винной кислоты, аспарагиновой кислоты или их смесей. Каждый из указанных специфических буферов представляет собой альтернативный вариант осуществления настоящего изобретения.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения композиция дополнительно содержит фармацевтически приемлемый консервант. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения консервант выбран из группы, состоящей из фенола, о-крезола, м-крезола, п-крезола, метил-пгидроксибензоата, пропил-п-гидроксибензоата, 2-феноксиэтанола, бутил-п-гидроксибензоата, 2фенилэтанола, бензилового спирта, хлорбутанола и тиомеросала, бронопола, бензойной кислоты, имидомочевины, хлоргексидина, дегидроацетата натрия, хлоркрезола, этил-п-гидроксибензоата, хлорида бензетония, хлорфенезина (3п-хлорфеноксипропан-1,2-диола) или их смесей. В дополнительном варианте осуществления настоящего изобретения консервант присутствует в концентрации от 0,1 до 20 мг/мл. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения консервант присутствует в концентрации от 0,1 до 5 мг/мл. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения консервант присутствует в концентрации от 5 до 10 мг/мл. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения консервант присутствует в концентрации от 10 до 20 мг/мл. Каждый из указанных специфических консервантов представляет собой альтернативный вариант осуществления настоящего изобретения. Применение консерванта в фармацевтических композициях хорошо известно специалистам. Для удобства приводится ссылка: Remington, The Science and Practice of Pharmacy, 19-е издание, 1995 г.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения композиция дополнительно содер- 18 031876 жит изотоническое средство. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения изотоническое средство выбрано из группы, состоящей из соли (например, хлорида натрия), сахара или сахарного спирта, аминокислоты (например, L-глицина, L-гистидина, аргинина, лизина, изолейцина, аспарагиновой кислоты, триптофана, треонина), алдитола (например, глицерола (глицерина), 1,2-пропандиола (пропиленгликоля), 1,3-пропандиола, 1,3-бутандиола), полиэтиленгликоля (например, PEG400) или их смесей. Можно использовать любой сахар, такой как моно-, ди- или полисахариды, или водорастворимые глюканы, включая, например, фруктозу, глюкозу, маннозу, сорбозу, ксилозу, мальтозу, лактозу, сахарозу, трегалозу, декстран, пуллулан, декстрин, циклодекстрин, растворимый крахмал, гидроксиэтилкрахмал и карбоксиметилцеллюлозу-Na. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения сахар представляет собой сахарозу. Сахарный спирт определяется как С4-С8 углеводород, имеющий по меньшей мере одну группу -ОН, и включает, например, маннит, сорбит, инозит, галактит, дульцит, ксилит и арабит. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения сахарный спирт представляет собой маннит. Сахара или сахарные спирты, упомянутые выше, можно использовать в отдельности или в комбинации. Для использующегося количества фиксированного лимита не существует, если только сахар или сахарный спирт растворяется в жидком препарате и не оказывает неблагоприятного действия на стабилизирующие эффекты, достигнутые с использованием способов по настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения концентрация сахара или сахарного спирта находится в пределах приблизительно от 1 мг/мл до приблизительно 150 мг/мл. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения изотоническое средство присутствует в концентрации от до 50 мг/мл. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения изотоническое средство присутствует в концентрации от 1 до 7 мг/мл. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения изотоническое средство присутствует в концентрации от 8 до 24 мг/мл. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения изотоническое средство присутствует в концентрации от 25 до 50 мг/мл. Каждый из указанных специфических изотонических средств представляет собой альтернативный вариант осуществления настоящего изобретения. Применение изотонического средства в фармацевтических композициях хорошо известно специалистам. Для удобства приводится ссылка: Remington, The Science and Practice of Pharmacy, 19-е издание, 1995 г.
В еще одном варианте композиция дополнительно содержит хелатирующее средство. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения хелатирующее средство выбрано из солей этилендиаминтетрауксусной кислоты (EDTA), лимонной кислоты и аспарагиновой кислоты и их смесей. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения хелатирующее средство присутствует в концентрации от 0,1 до 5 мг/мл. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения хелатирующее средство присутствует в концентрации от 0,1 до 2 мг/мл. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения хелатирующее средство присутствует в концентрации от 2 до 5 мг/мл. Каждый из указанных специфических хелатирующих средств представляет собой альтернативный вариант осуществления настоящего изобретения. Применение хелатирующего средства в фармацевтических композициях хорошо известно специалистам. Для удобства приводится ссылка: Remington, The Science and Practice of Pharmacy, 19-е издание, 1995 г.
В еще одном варианте композиция дополнительно содержит стабилизатор. Применение стабилизатора в фармацевтических композициях хорошо известно специалистам. Для удобства приводится ссылка: Remington, The Science and Practice of Pharmacy, 19-е издание, 1995 г.
Более конкретно, композиции по настоящему изобретению представляют собой стабилизированные жидкие фармацевтические композиции, в которых их терапевтически активные компоненты содержат полипептид, который, возможно, образует агрегаты во время хранения в форме жидких фармацевтических композиций. Под образованием агрегатов подразумевается физическое взаимодействие между молекулами полипептида, результатом которого является образование олигомеров, которые могут оставаться растворимыми, или больших видимых агрегатов, которые выпадают из раствора в осадок. Под термином во время хранения подразумевается, что полученная жидкая фармацевтическая композиция не вводится индивиду немедленно. После получения ее упаковывают для хранения, или в жидкой форме, или в замороженном состоянии, или в высушенной форме для растворения позднее с получением жидкой формы или другой формы, удобной для введения индивиду. Под высушенной формой подразумевается, что жидкую фармацевтическую композицию сушат замораживанием (т.е. лиофилизацией; см., например, Williams and Polli (1984) J. Parenteral Sci. Technol. 38: 48-59), распылительной сушкой (см. Masters (1991) в Spray-Drying Handbook (5-е изд.; Longman Scientific and Technical, Essez, U.K.), с. 491-676; Broadhead et al. (1992) Drug Devel. Ind. Pharm. 18:1169-1206 и Mumenthaler et al. (1994) Pharm. Res. 11:1220) или воздушной сушкой (Carpenter and Crowe (1988) Cryobiology 25: 459-470 и Roser (1991) Biopharm. 4:47-53). Образование агрегатов полипептидом во время хранения жидкой фармацевтической композиции может неблагоприятно влиять на биологическую активность указанного полипептида, что приводит к потере терапевтической эффективности фармацевтической композиции. Кроме того, образование агрегатов может вызывать другие проблемы, такие как закупорка трубок, мембран или насосов, когда содержащую полипептид фармацевтическую композицию вводят с помощью инфузионной системы.
Фармацевтическая композиция по настоящему изобретению может дополнительно содержать ами
- 19 031876 нокислотное основание в количестве, достаточном для уменьшения образования агрегатов полипептидом во время хранения композиции. Под аминокислотным основанием подразумевается аминокислота или комбинация аминокислот, в которой каждая данная аминокислота присутствует в форме ее свободного основания или в форме ее соли. В случае использования комбинации аминокислот все аминокислоты могут присутствовать в форме их свободных оснований, все могут присутствовать в форме их солей или некоторые могут присутствовать в форме их свободных оснований, в то время как остальные - в форме их солей. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения аминокислоты для использования при получении композиций по настоящему изобретению представляют собой аминокислоты, несущие заряженную боковую цепь, такие как аргинин, лизин, аспрагиновая кислота и глутаминовая кислота. Любой стереоизомер (т.е. изомер L, D или DL) конкретной аминокислоты (например, глицина, метионина, гистидина, имидазола, аргинина, лизина, изолейцина, аспарагиновой кислоты, триптофана, треонина и их смесей) или комбинации указанных стереоизомеров могут присутствовать в фармацевтических композициях по настоящему изобретению, если только конкретная аминокислота присутствует в форме ее свободного основания или в форме ее соли. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения используется L-стереоизомер. Композиции по настоящему изобретению также можно получать с использованием аналогов указанных аминокислот. Под аналогом аминокислоты подразумевается производное природной аминокислоты, которое вызывает желаемый эффект уменьшения образования агрегатов полипептидом во время хранения жидких фармацевтических композиций по настоящему изобретению. Подходящие аналоги аргинина включают, например, аминогуанидин, орнитин и N-моноэтилL-аргинин, подходящие аналоги метионина включают этионин и бутионин, а подходящие аналоги цистеина включают S-метил-Е-цистеин. Как и другие аминокислоты, аналоги аминокислот включают в состав композиций как в форме их свободных оснований, так и в форме их солей. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения аминокислоты или аналоги аминокислот используют в концентрации, которая является достаточной для предотвращения или задержки агрегации белка.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения метионин (или другие серосодержащие аминокислоты или аналоги аминокислот) можно добавлять, чтобы ингибировать окисление остатков метионина до сульфоксида метионина, в случае, когда полипептид, действующий как терапевтическое средство, представляет собой полипептид, содержащий по меньшей мере один остаток метионина, склонный к указанному окислению. Под ингибированием подразумевается минимальное накопление видов окисленного метионина в течение времени. Ингибирование окисления метионина приводит к более продолжительному сохранению полипептида в его правильной молекулярной форме. Можно использовать любой стереоизомер метионина (изомер L, D или DL) или их комбинации. Добавлять следует такое количество, которое достаточно для ингибирования окисления остатков метионина, таким образом, чтобы количество сульфоксида метионина было приемлемым для регулирующих учреждений. Обычно это означает, что композиция содержит не более приблизительно от 10% до приблизительно 30% сульфоксида метионина. В целом, этого можно достигать добавлением метионина таким образом, чтобы соотношение добавленного метионина и остатков метионина находилось в пределах приблизительно от 1:1 до приблизительно 1000:1, таких как от 10:1 до приблизительно 100:1.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения композиция дополнительно содержит стабилизатор, выбранный из группы высокомолекулярных полимеров или низкомолекулярных соединений. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения стабилизатор выбран из полиэтиленгликоля (например, PEG 3350), поливинилового спирта (PVA), поливинилпирролидона, карбокси/гидроксицеллюлозы или их производных (например, НРС, HPC-SL, HPC-L и НРМС), циклодекстринов, серосодержащих веществ, таких как монотиоглицерин, тиогликолевая кислота и 2-метилтиоэтанол, и различных солей (например, хлорида натрия). Каждый из указанных специфических стабилизаторов представляет собой альтернативный вариант осуществления настоящего изобретения.
Фармацевтические композиции могут также содержать дополнительные стабилизирующие средства, которые еще более увеличивают стабильность содержащегося в композициях терапевтически активного полипептида. Стабилизирующие средства, представляющие особенный интерес для настоящего изобретения, включают, но ими не ограничиваются, метионин и EDTA, которые защищают полипептид от окисления метионина, и неионогенное поверхностно-активное вещество, которое защищает полипептид от агрегации, связанной с замораживанием-оттаиванием или механическими сдвигами.
В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения композиция дополнительно содержит поверхностно-активное вещество. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения поверхностно-активное вещество выбрано из детергента, этоксилированного касторового масла, полигликозилированных глицеридов, ацетилированных моноглицеридов, эфиров сорбитана и жирных кислот, блок-полимеров полиоксипропилен-полиоксиэтилен (например, полоксамеров, таких как Pluronic® F68, полоксамер 188 и 407, Triton X-100), эфиров полиоксиэтиленсорбитана и жирных кислот, производных полиоксиэтилена и полиэтилена, таких как алкилированные и алкоксилированные производные (твины, например, Tween-20, Tween-40 Tween-80 и Brij-35), моноглицеридов или их этоксилированных производных, диглицеридов или их полиоксиэтиленовых производных, спиртов, глицерина, лектинов и фосфолипидов (например, фосфатидилсерина, фосфатидилхолина, фосфатидилэтаноламина, фосфатидили
- 20 031876 нозита, дифосфатидилглицерина и сфингомиелина), производных фосфолипидов (например, дипальмитоил фосфатидной кислоты) и лизофосфолипидов (например, пальмитоиллизофосфатидил-Ь-серина и 1ацил-8и-глицеро-3-фосфатных эфиров этаноламина), холина, серина или треонина) и алкильных, алкоксильных (алкильный сложный эфир), алкокси- (алкильный простой эфир) производных лизофосфатидила и фосфатидилхолинов, например лауроильных и миристоильных производных лизофосфатидилхолина, дипальмитоилфосфатидилхолина и модификаций группы полярной головки, т.е. холинов, этаноламинов, фосфатидной кислоты, серинов, треонинов, глицерина, инозита и положительно заряженных DODAC, DOTMA, DCP, BISHOP, лизофосфатидилсерина и лизофосфатидилтреонина, и глицерофосфолипидов (например, кефалинов, глицерогликолипидов (например, галактопиранозоида), сфингогликолипидов (например, церамидов, ганглиозидов), додецилфисфохолина, лизолецитина куриных яиц, производных фусидовой кислоты (например, тауродигидрофузидата и т.п.), длинноцепочечных жирных кислот и их солей С6-С12 (например, олеиновой кислоты и каприловой кислоты), ацилкарнитинов и производных, Naацилированных производных лизина, аргинина или гистидина, или ацилированных по боковой цепи производных лизина или аргинина, Na-ацилированных производных дипептидов, содержащих любую комбинацию лизина, аргинина или гистидина и нейтральной или кислой аминокислоты, Naацилированного производного трипептида, содержащего любую комбинацию нейтральной аминокислоты и двух заряженных аминокислот, DSS (докузата натрия, регистрационный № CAS [577-11-7]), докузата кальция, регистрационный № CAS [128-49-4], докузата калия, регистрационный № CAS [7491-09-0], SDS (додецилсульфата натрия или лаурилсульфата натрия), каприлата натрия, холевой кислоты или ее производных, желчных кислот и их солей и глициновых или тауриновых конъюгатов, урсодезоксихолиновой кислоты, холата натрия, дезоксихолата натрия, таурохолата натрия, гликохолата натрия, Nгексадецил-Ы,№диметил-3-аммоний-1-пропансульфоната, анионогенных (алкиларилсульфонатов) одновалентных поверхностно-активных веществ, цвиттерионогенных поверхностно-активных веществ (например, №алкил-Ы,№диметиламмоний-1 -пропансульфонатов, 3-холамид-1 -пропилдиметиламмоний-1 пропансульфоната), катионогенных поверхностно-активных веществ (четвертичных аммониевых оснований) (например, бромида цетилтриметиламмония, хлорида цетилпиридиния), неоиногенных поверхностно-активных веществ (например, додецил-Р-Э-глюкопиранозида), полоксаминов (например, Tetronic's), которые представляют собой тетрафункциональные блок-сополимеры, полученные последовательным добавлением пропиленоксида и этиленоксида к этилендиамину, или поверхностно-активное вещество можно выбрать из группы производных имидазолина или их смесей. Каждое из указанных специфических поверхностно-активных веществ представляет собой альтернативный вариант осуществления настоящего изобретения.
Применение поверхностно-активных веществ в фармацевтических композициях хорошо известно специалистам в данной области. Для удобства приводится ссылка: Remington, The Science and Practice of Pharmacy, 19-е издание, 1995 г.
Возможно присутствие и других ингредиентов в пептидной фармацевтической композиции по настоящему изобретению. Указанные дополнительные ингредиенты могут включать увлажняющие средства, эмульгаторы, антиоксиданты, средства, придающие объем, модификаторы тоничности, хелатирующие средства, ионы металлов, масляные носители, белки (например, сывороточный альбумин человека, желатин или белки) и цвиттерион (например, аминокислоту, такую как бетаин, таурин, аргинин, глицин, лизин и гистидин). Указанные дополнительные ингредиенты, разумеется, не должны неблагоприятным образом влиять на общую стабильность фармацевтической композиции по настоящему изобретению.
Фармацевтические композиции, содержащие полипептид VAR2CSA, по настоящему изобретению можно вводить пациенту, который нуждается в указанном лечении, в несколько областей, например в локальные участки, например кожу и участки слизистой оболочки, в области, которые обходят всасывание, например вводить в артерию, вену, сердце, и в области, которые предусматривают всасывание, например вводить в кожу, под кожу, в мышцу или брюшную полость.
Местное введение может иметь особенные преимущества для лечения состояний, связанных с локальным воспалением, такого как лечение воспаления, связанного с ожогом, или других состояний, связанных с кожей. Соответственно, в некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения введение осуществляют местно.
В некоторых особенных вариантах осуществления настоящего изобретения можно использовать глазные капли при состояниях, связанных с глазом, таких как кератит, такой как диффузный ламеллярный кератит (DLK).
Введение фармацевтических композиций по настоящему изобретению можно осуществлять нескольким путями, например лингвальным, сублингвальным, буккальным, в рот, пероральным, в желудок и кишечник, назальным, легочным, например через бронхиолы и альвеолы или их комбинации, эпидермальным, дермальным, трансдермальным, вагинальным, ректальным, окулярным, например через конъюнктиву, уретральным и парентеральным, пациентам, которые нуждаются в указанном лечении.
Композиции по настоящему изобретению можно вводить в виде нескольких лекарственных форм, например в виде растворов, суспензий, эмульсий, микроэмульсий, двойной эмульсии, пенок, бальзамов,
- 21 031876 паст, пластырей, мазей, таблеток, таблеток в оболочке, средств для промывания, капсул, например твердых желатиновых капсул и мягких желатиновых капсул, суппозиториев, ректальных капсул, капель, гелей, спреев, порошка, аэрозолей, средств для ингаляции, глазных капель, глазных мазей, средств для промывания глаз, вагинальных пессариев, вагинальных колец, вагинальных мазей, раствора для инъекций, in situ трансформирующихся растворов, например in situ, превращающихся в гель, in situ затвердевающих, in situ осаждающихся, in situ кристаллизующихся, раствора для инфузий и имплантатов.
Композиции по настоящему изобретению также можно смешивать или присоединять, например, посредством ковалентных, гидрофобных и электростатических взаимодействий, с носителем лекарственного средства, системой доставки лекарственного средства и усовершенствованной системой доставки лекарственного средства, с целью еще большего повышения стабильности, полипептида VAR2CSA, повышения биодоступности, повышения растворимости, уменьшения неблагоприятных эффектов, достижения хронотерапии, хорошо известной специалистам в данной области, и улучшения соблюдения пациентом режима и схемы лечения или любых их комбинаций. Примеры носителей, систем доставки лекарственного средства и усовершенствованных систем доставки лекарственного средства включают, но ими не ограничиваются, полимеры, например целлюлозу и производные, полисахариды, например декстран и производные, крахмалы и производные, поли(виниловый спирт), акрилатные и метакрилатные полимеры, полимолочную и полигликолевую кислоту и их блок-сополимеры, полиэтиленгликоли, белкиносители, например альбумин, гели, например термогелеобразующие системы, например блоксополимерные системы, хорошо известные специалистам, мицеллы, липосомы, микросферы, наночастицы, вирусоподобные частицы, частицы, подобные бактериям, жидкие кристаллы и их дисперсии, L2 фазу и ее дисперсии, хорошо известные специалистам в данной области поведения фаз в системах жир-вода, полимерные мицеллы, двойные эмульсии, самоэмульгирующиеся, самомикроэмультирующиеся циклодекстрины и их производные и дендримеры.
Композиции по настоящему изобретению являются подходящими для получения твердых средств, полутвердых средств, порошка и растворов для легочного введения полипептида VAR2CSA с использованием, например, ингалятора с отмеренной дозой, ингалятора сухого порошка и небулайзера; все указанные устройства хорошо известны специалистам в данной области.
Композиции по настоящему изобретению являются особенно подходящими для получения систем доставки с контролируемым, замедленным, пролонгированным, отсроченным и медленным высвобождением лекарственного средства. Более конкретно, без ограничения, композиции являются подходящими для получения парентеральных систем доставки с контролируемым и замедленным высвобождением лекарственного средства (обе системы обеспечивают многократное уменьшение количества введений), хорошо известных специалистам в данной области. Еще более предпочтительно системы с контролируемым и замедленным высвобождением лекарственного средства вводят подкожно. Без ограничения объема настоящего изобретения примерами подходящих систем и композиций с контролируемым высвобождением лекарственного средства являются гидрогели, масляные гели, жидкие кристаллы, полимерные мицеллы, микросферы, наночастицы.
Способы получения систем с контролируемым высвобождением лекарственного средства, подходящие для композиций по настоящему изобретению, включают, но ими не ограничиваются, кристаллизацию, конденсацию, сокристаллизацию, приципитацию, сопреципитацию, эмульгирование, диспергирование, гомогенизация под высоким давлением, инкапсуляцию, распылительную сушку, микроинкапсулирование, коацервацию, фазовое разделение, выпаривание растворителя для получения микросфер, экструзию и сверхкритические флюидные методики. Общая ссылка сделана на Handbook of Pharmaceutical Controlled Release (Wise D.L., ed. Marcel Dekker, New York, 2000) и Drug and the Pharmaceutical Sciences vol. 99: Protein Formulation and Delivery (MacNally E.J., ed. Marcel Dekker, New York, 2000).
Парентеральное введение можно осуществлять подкожной, внутримышечной, интраперитонеальной или внутривенной инъекцией с помощью шприца, необязательно, с помощью шприца-ручки. Альтернативно, парентеральное введение можно осуществлять с помощью инфузионной помпы. Еще одним вариантом является композиция, которая может представлять собой раствор или суспензию для введения полипептида VAR2CSA в форме назального или легочного спрея. В качестве еще одного варианта фармацевтические композиции, содержащие полипептид VAR2CSA по настоящему изобретению, также могут быть адаптированы для чрескожного введения, например, посредством безыгольной инъекции или из накладки, необязательно, ионофоретической накладки, или чресслизистого, например, буккального, введения.
Термин стабилизированная композиция относится к композиции с повышенной физической стабильностью, повышенной химической стабильностью или повышенной физической и химической стабильностью.
Термин физическая стабильность белковой композиции, используемый в настоящем документе, относится к тенденции белка образовывать биологически неактивные и/или нерастворимые агрегаты белка в результате воздействия на белок термомеханических стрессов и/или взаимодействия с границами раздела и поверхностями, которые являются дестабилизирующими, такими как гидрофобные поверхности и границы раздела. Физическую стабильность водных белковых композиций оценивают посредством
- 22 031876 визуального осмотра и/или измерений мутности после воздействия на композицию, помещенную в подходящие контейнеры (например, картриджи или флаконы), механического/физического стресса (например, взбалтывания) при различных температурах в течение различных периодов времени. Визуальный осмотр композиций осуществляют при резком сфокусированном свете на темном фоне. Мутность композиции характеризуют посредством визуальной оценки баллов степени мутности, например, по шкале от 0 до 3 (композиция без мутности соответствует визуальному баллу 0, а композиция, демонстрирующая визуальную мутность, соответствует визуальному баллу 3). Композицию классифицируют на физически нестабильную с точки зрения агрегации белка, если она демонстрирует визуальную мутность при дневном свете. Альтернативно, мутность композиции можно оценивать простыми измерениями мутности, хорошо известными специалистам. Физическую стабильность водных белковых композиций также можно оценивать с использованием спектроскопического агента или зонда конформационного состояния белка. Зонд предпочтительно представляет собой малую молекулу, которая предпочтительно связывается с ненативным конформером белка. Одним примером малого молекулярного спектроскопического зонда структуры белка является тиофлавин Т. Тиофлавин Т представляет собой флюоресцентную краску, которая широко используется для обнаружения фибрилл амилоида. В присутствии фибрилл и, возможно, также других конфигураций белка, тиофлавин Т вызывает новый максимум возбуждения приблизительно на 450 нм и усиленную эмиссию приблизительно на 482 нм, когда связывается с фибриллярной формой белка. Несвязанный тиофлавин Т является практически нефлюоресцентным при указанных длинах волн.
Другие малые молекулы можно использовать в качестве зондов изменений в структуре белка из нативного в ненативное состояние. Например, зонды гидрофобное пятно, которые предпочтительно связываются с гидрофобными пятнами белка. Гидрофобные пятна обычно спрятаны внутри третичной структуры белка в его нативном состоянии, но становятся доступными для воздействия, когда белок начинает развертываться или денатурировать. Примерами указанных малых молекулярных спектроскопических зондов являются ароматические гидрофобные краски, такие как антрацен, акридин, фенантролин или т.п. Другие спектроскопические зонды представляют собой металлоаминокислотные комплексы, такие как комплексы металла кобальта с гидрофобными аминокислотами, такими как фенилаланин, лейцин, изолейцин, метионин и валин или т.п.
Термин химическая стабильность белковой композиции, используемый в настоящем документе, относится к химическим ковалентным изменениям в структуре белка, ведущим к образованию продуктов химической деградации, с потенциальным уменьшением биологической потенции и/или потенциальным возрастанием иммуногенных свойств по сравнению с нативной структурой белка. Различные продукты химической деградации могут образовываться в зависимости от типа и природы нативного белка и окружения, которое воздействовало на белок. Устранения химической деградации, наиболее вероятно, невозможно полностью избежать, и возрастание количества продуктов химической деградации часто наблюдается во время хранения и использования белковой композиции, что хорошо известно специалистам. Большинство белков склонно к деамидированию, процессу, при котором амидная группа боковой цепи в глутаминильных или аспарагинильных остатках гидролизуется с образованием свободной карбоновой кислоты. Другие пути деградации включают образование продуктов высокомолекулярной трансформации, когда две или несколько молекулы белка ковалентно связываются друг с другом через трансамидирование и/или дисульфидные взаимодействия, приводящие к образованию ковалентно связанных димерных, олигомерных и полимерных продуктов деградации (Stability of Protein Pharmaceuticals, Ahern. T.J. & Manning M.C., Plenum Press, New York 1992). Окисление (например, остатков метионина) можно упомянуть как другой вариант химической деградации. Химическую стабильность белковой композиции можно оценивать измерением количества продуктов химической деградации в различные временные точки после воздействия различных условий окружающей среды (образование продуктов деградации часто может быть ускорено, например, повышением температуры). Количество каждого отдельного продукта деградации часто определяют отделением продуктов деградации по размеру молекул и/или заряду с использованием различных методик хроматографии (например, SEC-HPLC и/или RP-HPLC).
Следовательно, как подчеркнуто выше, стабилизированная композиция относится к композиции с увеличенной физической стабильностью, увеличенной химической стабильностью или увеличенной физической и химической стабильностью. В целом, композиция должна быть стабильной во время использования и хранения (при соблюдении рекомендованных условий использования и хранения) до указанного срока годности.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения фармацевтическая композиция, содержащая полипептид VAR2CSA, является стабильной в течение более чем 6 недель использования и в течение более чем 3 лет хранения. В других вариантах осуществления настоящего изобретения фармацевтическая композиция, содержащая полипептид VAR2CSA, является стабильной в течение более чем 4 недель использования и в течение более чем 3 лет хранения. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения фармацевтическая композиция, содержащая полипептид VAR2CSA, является стабильной в течение более чем 4 недель использования и в течение более чем двух лет хранения. В еще одном варианте осуществления настоящего изобретения фармацевтическая композиция, содержащая
- 23 031876 полипептид VAR2CSA, является стабильной в течение более чем 2 недель использования и в течение более чем двух лет хранения.
Показания к применению полипептида VAR2CSA и его конъюгатов.
Полипептиды VAR2CSA или их конъюгаты можно использовать при широком ряде показаний, связанных с экспрессией, такой как патологическая экспрессия CSA, как при различных злокачественных новообразованиях, таких как метастатический рак, включая меланомы, такие как меланома С32, саркомы, рак легких, олигодендроцитомы, опухоли головного мозга человека, включая глиомы, лейкоз, такой как лимфобластный лейкоз и острый миелолейкоз, и рак, такой как плоскоклеточный рак и рак молочной железы, почечно-клеточный рак, хондросаркома и рак поджелудочной железы. Полипептиды VAR2CSA или их конъюгаты также можно использовать для стволовых злокачественных клеток и соответственно нацеливать на указанные клетки еще до развития их в злокачественное новообразование. Полипептиды VAR2CSA или их конъюгаты можно использовать для идентификации, отслеживания и нацеливания отдаленных микрометастазов in vivo. Практически все первичные опухоли, включая рак гематопоэтической системы, имеют потенциал развития в метастатическое заболевание, которое в большой степени связано с плохим терапевтическим исходом для пациентов.
Полипептиды VAR2CSA или их конъюгаты можно использовать для нацеливания соединений, которые предотвращают деградацию или восстанавливают внеклеточный CSPG, таких как гормоны роста, противовоспалительные соединения или ингибиторы белков, в хрящевой ткани, суставах и нервной ткани.
Полипептиды VAR2CSA или их конъюгаты можно использовать для нацеливания соединений, которые усиливают деградацию или предотвращают продукцию внеклеточного CSPG, таких как хондроитиназа ABC, которая пересекает сахарные цепи ядра белка молекул CSPG. Ксилоциды, которые уменьшают продукцию CSPG, или лекарственные средства, которые ингибируют ферменты, важные для продукции CSPG, такие как хондроитин-синтетаза или хондроитин-полимеризующий фактор (такой как 4фторглюкозамин, п-нитрофенил-бета-Э-ксилоксид, 4-метилумбеллиферил-бета-О-ксилопиранозид), в поврежденной нервной ткани.
VAR2CSA, конъюгированный с нуклеиновой кислотой, среди которых малая интерферирующая РНК (siPHK), антисмысловые пептидные нуклеиновые кислоты (PNA), малая РНК-шпилька (shPHK) и недоступные нуклеиновые кислоты (LNA™), можно использовать для удаления РНК, кодирующей CSAпрезентирующие молекулы.
Конъюгаты полипептида VAR2CSA.
Терапевтическая или диагностическая эффекторная молекула, такая как цитотоксические и обнаруживающие молекулы.
Некоторые аспекты настоящего изобретения связаны с слитым полипептидом VAR2CSA или конъюгатом, как определено в настоящем описании, дополнительно содержащим терапевтическую эффекторную молекулу, такую как противовоспалительное средство, стероидный гормон, цитотоксическое или обнаруживающее средство или молекула, такую как органическая молекула, радионуклид или цитотоксический фермент.
В некоторых аспектах настоящего изобретения слитый белок VAR2CSA по настоящему изобретению содержит последовательность, как определено одной или более последовательностей, выбранных из SEQ ID NO:57-59 и 71, или ее функциональный вариант или фрагмент.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения слитый белок VAR2CSA по настоящему изобретению может содержать ингибитор протеиназ, такой как ингибитор основного панкреатического трипсина (BPTI), на конце, таком как N-конец, белковой последовательности, такой как последовательность, определенная SEQ ID NO:57.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения слитый белок VAR2CSA по настоящему изобретению может содержать белковую последовательность токсина, как определено одной или более последовательностей, выбранных из SEQ ID NO:58, 59 и 71, такую как белковая последовательность токсина, которая была оптимизирована для меньшей иммуногенности, такую как последовательность, определенная SEQ ID NO:59. В некоторых вариантах осуществления сигнальная последовательность KDEL SEQ ID NO:58 или 59 присутствует в слитом белке VAR2CSA по настоящему изобретению, а в некоторых вариантах осуществления сигнальная последовательность KDEL SEQ ID NO:58 или 59 отсутствует в слитом белке VAR2CSA по настоящему изобретению. Соответственно сигнальная последовательность KDEL может быть оптимальной для конструкций по настоящему изобретению.
Неограничивающими примерами цитотоксических частей, которые могут быть слиты или конъюгированы с полипептидами VAR2CSA по настоящему изобретению, являются химиотерапевтические средства, выбранные из калихеамицина, цисплатина, адриамицина, ауристатина, доксорубицина, майтанзиноида, таксола, эктеинасцидина, гелданамицина, метотрексата и их производных и их комбинаций и т.п., подходящих для противораковой терапии. Примерами цитотоксических белков, слитых с полипептидами VAR2CSA, являются экзотоксин A. Pseudomonas, дифтерийный токсин, токсин рицин, противовирусный белок фитолакки американской, сапорин, гелонин и их варианты.
Описаны конъюгаты альбумина с доксорубицином для использования при злокачественном ново- 24 031876 образовании (Kratz et al., J. Med. Chem. 45: 5523-33, 2002) и с метотрексатом - при ревматоидном артрите (Wunder et al., J. Immunol. 170: 4793-4801, 2003). Соединения, которые увеличивают количество активных форм кислорода, т.е. пиперлонгумин, также были описаны (Raj et al., Nature 475: 231-234, 2011).
Также можно использовать терапевтические ферменты, средства, которые индуцируют апоптоз, и т.п. с целью получения нацеленной цитотоксичности, т.е. убийства опухолевых клеток.
Полипептиды VAR2CSA, описанные в настоящем документе, могут опосредовать убийство клеток, индуцируя лизис, опосредованный комплементзависимой цитотоксичностью (CDC), лизис, опосредованный антителозависимой клеточной цитотоксичностью (ADCC), апоптоз, гомотипическую адгезию или фагоцитоз, например индуцируя CDC опосредованный лизис или ADCC опосредованный лизис. Полипептиды VAR2CSA, описанные в настоящем документе, могут взаимодействовать с компонентами иммунной системы предпочтительно через ADCC или CDC. Однако полипептиды VAR2CSA по настоящему изобретению могут также оказывать действие, просто связываясь с опухолевыми антигенами на клеточной поверхности, таким образом, например, блокируя пролиферацию клеток.
Согласно настоящему изобретению термин терапевтически эффективная молекула обозначает любую молекулу, которая может оказывать терапевтическое действие. Согласно настоящему изобретению терапевтическую эффекторную молекулу предпочтительно селективно направляют к клетке, которая экспрессирует CSA, и она включает противораковые средства, радиоизотопы, токсины, цитостатические или цитолитические лекарственные средства и т.п. Противораковые средства включают, например, антрациклины (доксорубицин, даунорубицин, эпирубицин, идарубицин, валрубицин, митоксантрон), алкилирующие средства на основе платины и не на основе платины (цисплатин, карбоплатин, оксалиплатин, мехлортамин, циклофосфамид, хлорамбуцил, ифосфамид, бусульфан, кармустин, дакарбазин, ломустин, прокарбазин), алкалоиды барвинка (винкристин, винбластин, винорелбин, виндезин), таксаны (таксол и децетаксел), ингибиторы топоизомеразы I (камптотецин, иринотекан, топотекан), ингибиторы топоизомеразы II (амсакрин, этопозид, этопозида фосфат, тенипозид или другие алкалоидные производные, встречающиеся в природе в корне американского подофилла (Podophyllum peltatum), неантрациклиновые цитотоксические антибиотики (дактиномицин, блеомицин, пликамицин и митомицины), антистероиды (такие как аминоглютетимид), аналоги нуклеозидов (цитарабидин, фторурацил и меркаптопурин), антиметаболиты (метотрексат и тиогуанин), аналоги дихлордифенилтрихлорэтана (такие как митотан) и соединения, индуцирующие активные формы кислорода (ROS) (включая, без ограничения, пиперлонгумин и бета-фенилэтилизотиоцианат). Другие противораковые средства описаны, например, в Goodman and Gilman, The Pharmacological Basis of Therapeutics, 8-е издание, 1990, McGraw-Hill, Inc., в частности, в главе 52 (Antineoplastic Agents) (Paul Calabresi and Bruce A. Chabner). Токсины могут представлять собой белки, такие как противовирусный белок фитолакки американской, холерный токсин, коклюшный токсин, рицин, гелонин, абрин, дифтерийный экзотоксин или экзотоксин Pseudomonas. Остатки токсинов могут также представлять собой радионуклиды с высокой энергией эмиссии, такие как кобальт-60. Полипептид VAR2CSA можно использовать вместе с проникающими в клетку пептидами (СРР) для облегчения транспорта полипептида VAR2CSA и любой присоединенной к ним молекулы через плазматические мембраны клеток. Проникающие в клетку пептиды могут иметь многочисленные применения в медицине в качестве средств, доставляющих лекарственные средства, для лечения различных заболеваний, включая злокачественные новообразования, и в качестве ингибиторов вирусов. Примеры СРР включают, но ими не ограничиваются, трансдействующий активатор транскрипции (Tat) из вируса иммунодефицита человека; рер-1 (ChariotTM); R8, azo-R8; SMoC (Okuyama M. Et al. Nat. Methods 2007 Feb; 4(2): 153-9M; Soane L. and Fiskum G.J. Neurochem. 2005 Oct; 95(1): 230-43; Loudet A. et al. Org. Biomol. Chem. 2008 Dec. 21; 6(24): 4516-22).
Радионуклиды.
Полипептиды VAR2CSA, слитый белок или конъюгат согласно аспектам, описанным в настоящем документе, соединенные с полиаминополикарбоксилатным хелатирующим средством, можно использовать для получения радиоактивно меченого полипептида, состоящего из радиоактивного хелата полипептида, слитого белка или конъюгата VAR2CSA, соединенного с хелатирующим средством, и радионуклида, подходящего для медицинских визуализирующих методик; радионуклид выбран из группы, состоящей из 61Cu, 64Cu, 66Ga, 68Ga, 110In, 'In. 44Sc, 89Zr и 86Y, или радионуклида, подходящего для лечения, радионуклид выбран из группы, состоящей из 225Ас, 212Bi, 213Bi, 67Cu, 166Ho, 177Lu, 212Pb, 149Pm, 153Sm, 227Th и 90Y, в котором радионуклид комплексирован с полипептидом VAR2CSA, например, через хелатирующее средство.
Соответственно полипептиды VAR2CSA, слитый белок или конъюгат согласно аспектам, описанным в настоящем документе, можно использовать для радиоактивной визуализации злокачественных клеток, включая солидные опухоли или метастазы, например, у пациентов с меланомой.
В некоторых вариантах на полипептид также можно наносить радиоактивную метку неметаллическими радиоактивными изотопами с использованием так называемого непрямого мечения. Так для мечения, например, 18F, 76Br, различными изотопами йода и 211At используют промежуточные линкерные молекулы. Указанная линкерная молекула должна содержать две функциональные части, одну, обеспечивающую быстрое и эффективное радиоактивное мечение, и другую, делающую возможным быстрое и
- 25 031876 эффективное присоединение к белкам, например к аминогруппам или предпочтительно к тиоловой группе уникального цистеина. Например, малемидная группа взаимодействует с тиоловыми группами с образованием стабильной тиоэфирной связи. Линкерная молекула сначала может взаимодействовать с радиоактивной меткой, а впоследствии с тиоловой или селентиоловой группой белка.
Другие альтернативные обнаруживающие части включают флюорофоры или флюорохромы, такие как любой, выбранный из гидроксикумарина, аминокумарина, метоксикумарина, каскадного голубого, пасифик голубого, пасифик оранжевого, люцифер желтого, NBD, R-фикоэритрина (РЕ), конъюгатов РЕСу5, конъюгатов РЕ-Су7, красного 613, PerCP, TruRed, FluorX, флюоросцеина, BODIPY-FL, Х-родамина, TRITC, Lissamin родамина В, техасского красного, аллофикоцианина (АРС) и конъюгатов АРС-Су7.
Указанные конъюгаты с обнаруживающими частями включают флюорофоры или флюорохромы и могут использоваться для визуализации злокачественных клеток или опухолей.
Конъюгаты с CSPG4.
Нацеливание CD44 или других протеогликанов.
Для целей применения конъюгатов полипептидов VAR2CSA для лечения злокачественного новообразования предполагается, что конъюгаты по настоящему изобретению можно использовать для нацеливания не только на опухолевые клетки, экспрессирующие CSPG4, но также на клетки, экспрессирующие CD44, такие как злокачественные стволовые клетки; примеры клеток, экспрессирующих протеогликаны, представлены, без ограничения, в табл. 1. Указанное нацеливание опосредуется через связывание с CSA на антигене CD44. Соответственно конъюгаты по настоящему изобретению можно использовать для нацеливания на CSPG4-отрицательные, но CD44-положительные клетки. Это можно использовать в качестве альтернативы или одновременно с нацеливанием опухолевых клеток, экспрессирующих CSPG4.
Применение для выделения или обнаружения циркулирующих опухолевых клеток (СТС) через связывание с CSA-содержащими протеогликанами.
Специфичное и высокоаффинное связывание полипептидов VAR2CSA по настоящему изобретению, таких как в форме конъюгатов полипептидов VAR2CSA, можно использовать для выделения или обнаружения СТС эпителиального и неэпителиального происхождения, которые экспрессируют один или более CSA-содержащих протеогликанов, таких, которые представлены в табл. 1.
Конкретные варианты осуществления настоящего изобретения.
Как описано в настоящем документе, изобретение связано с выделенным фрагментом белка VAR2CSA, где фрагмент состоит из последовательной аминокислотной последовательности:
a) ID1,
b) DBL2Xb и необязательно
c) ID2a.
В некоторых вариантах выделенный фрагмент белка VAR2CSA по настоящему изобретению содержит ID2a.
В некоторых вариантах выделенный фрагмент белка VAR2CSA по настоящему изобретению не содержит ID2a.
В некоторых вариантах фрагмент белка по настоящему изобретению содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 70% идентична любой аминокислотной последовательности 1-577 SEQ ID NO:1, 1-592 SEQ ID NO:3, 1-579 SEQ ID NO:4, 1-576 SEQ ID NO:5, 1-586 SEQ ID NO:10, 1-579 SEQ ID NO:11, 1-565 SEQ ID NO:29, 1-584 SEQ ID NO:34, 1-569 SEQ ID NO:36, 1-575 SEQ ID NO:37, 1-592 SEQ ID NO:38, 1-603 SEQ ID NO:41, 1-588 SEQ ID NO:43, 1-565 SEQ ID NO:44, 1-589 SEQ ID NO:45, 1-573 SEQ ID NO:48, 1-583 SEQ ID NO:53 или 1-569 SEQ ID NO:54.
В некоторых вариантах фрагмент белка по настоящему изобретению содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 70% идентична аминокислотной последовательности 578-640 SEQ ID NO:1, 593-656 SEQ ID NO:3, 580-643 SEQ ID NO:4, 577-640 SEQ ID NO:5, 587-650 SEQ ID NO:10, 580-643 SEQ ID NO:11, 566-628 SEQ ID NO:29, 585-647 SEQ ID NO:34, 570-632 SEQ ID NO:36, 576-639 SEQ ID NO:37, 593-655 SEQ ID NO:38, 604-667 SEQ ID NO:41, 589-652 SEQ ID NO:43, 566-628 SEQ ID NO:44, 590-653 SEQ ID NO:45, 574-637 SEQ ID NO:48, 584-646 SEQ ID NO:53 или 570-632 SEQ ID NO:54.
В некоторых вариантах фрагмент белка по настоящему изобретению содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 70% идентична аминокислотной последовательности из SEQ ID NO:2, 6, 8, 9, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 30, 31, 32, 33, 35, 39, 40, 42, 46, 47, 49, 50, 51 или 52.
В некоторых вариантах фрагмент белка по настоящему изобретению состоит из аминокислотной последовательности, которая по меньшей мере на 70% идентична любой аминокислотной последовательности 1-577 SEQ ID NO:1, 1-592 SEQ ID NO:3, 1-579 SEQ ID NO:4, 1-576 SEQ ID NO:5, 1-586 SEQ ID NO:10, 1-579 SEQ ID NO:11, 1-565 SEQ ID NO:29, 1-584 SEQ ID NO:34, 1-569 SEQ ID NO:36, 1-575 SEQ ID NO:37, 1-592 SEQ ID NO:38, 1-603 SEQ ID NO:41, 1-588 SEQ ID NO:43, 1-565 SEQ ID NO:44, 1-589 SEQ ID NO:45, 1-573 SEQ ID NO:48, 1-583 SEQ ID NO:53 или 1-569 SEQ ID NO:54.
В некоторых вариантах фрагмент белка по настоящему изобретению состоит из аминокислотной последовательности из перечня, состоящего из SEQ ID NO:1, 3-5, 10, 11, 29, 34, 36-38, 41, 43-45, 48, 53 и
- 26 031876
54.
В некоторых вариантах фрагмент белка по настоящему изобретению состоит из аминокислотной последовательности, имеющей длину менее 700 аминокислот, такой как менее 690 аминокислот, такой как менее 680 аминокислот, такой менее 670 аминокислот, такой как менее 660 аминокислот, такой как менее 650 аминокислот, такой как менее 640 аминокислот, такой как менее 630 аминокислот, такой как менее 620 аминокислот, такой как менее 610 аминокислот, такой как менее 600 аминокислот, такой как менее 590 аминокислот, такой как менее 580 аминокислот, такой как менее 570 аминокислот.
В некоторых вариантах фрагмент белка по настоящему изобретению имеет молекулярную массу менее приблизительно 100 кДа в невосстанавливающих условиях по результатам SDS-PAGE.
В некоторых вариантах фрагмент белка по настоящему изобретению представляет собой рекомбинантный белок.
В некоторых вариантах фрагмент белка по настоящему изобретению является негликозилированным.
Изобретение также связано с фрагментом белка, как определено в настоящем документе, слитым полипептидом VAR2CSA или конъюгатом по настоящему изобретению для лечения по любым показаниям, связанным с состоянием, в которое вовлечена экспрессия, такая как патологическая экспрессия CSA, например злокачественное новообразование.
В некоторых вариантах настоящего изобретения конъюгат или слитый белок VAR2CSA является фрагментом белка VAR2CSA по настоящему изобретению или содержит его.
Соответственно конъюгат или слитый белок VAR2CSA по настоящему изобретению может содержать аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 70% идентична аминокислотной последовательности, идентифицированной любой последовательностью из SEQ ID NO:1-75.
В некоторых вариантах полипептид VAR2CSA по настоящему изобретению состоит из аминокислотной последовательности, выбранной из SEQ ID NO:60-70, 72-75.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения злокачественное новообразование выбрано из кожной, окулярной или конъюнктивальной меланомы, рака (тройной негативный и метапластический рак молочной железы, рак поджелудочной железы, рак яичника, рак эндометрия, печеночноклеточный рак, рак легкого, рак толстого кишечника, рак предстательной железы, рак шейки матки, рак яичка, базально-клеточный рак кожи, светлоклеточный рак почки, кератинизированный плоскоклеточный рак головы и шеи, плоскоклеточный рак кожи, кератинизированный плоскоклеточный рак вульвы и базально-клеточный рак вульвы), сарком (липосаркома молочной железы, фибросаркома, дедифференцированная хондро- и липосаркома, лейомиосаркома, миксоидная липосаркома, лейомиосаркома тела матки, остеосаркома, саркома Эвинга и рабдомиосаркома), рака системы кроветворения (хронический лимфолейкоз (CLL), острый лимфолейкоз (ALL), острый миелолейкоз (AML), В-клеточная, Т-клеточная и большая гранулярная лимфома), опухолей нейроэпителиальной ткани, таких как астроцитомы (плеоморфная ксантоастроцитома, фибриллярные астроцитомы, анапластическая астроцитома, мультиформная глиобластома), олигодендроглиома, эпендимома, опухоль хороидного сплетения, олигоастроцитома, глиосаркома, ганглиоглиома, ретинобластома, нейроцитома, нейробластомы (эстезионейробластома и ганглионейробластома), медуллобластомы и атипичных тератоидных рабдоидных опухолей и любых других CSA-экспрессирующих типов злокачественных новообразований.
В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения злокачественное новообразование выбрано из CSA-экспрессирующих злокачественных новообразований, включая злокачественное новообразование (включая, но ими не ограничиваясь, рак молочной железы, рак поджелудочной железы, рак яичника, рак эндометрия, печеночно-клеточный рак, рак легкого, рак толстого кишечника, рак предстательной железы, рак шейки матки, рак яичка, базально-клеточный рак кожи, светлоклеточный рак почки, плоскоклеточный рак головы и шеи, плоскоклеточный рак кожи, кератинизированный плоскоклеточный рак вульвы и базально-клеточный рак вульвы), саркому (включая, но ими не ограничиваясь, фибросаркому, дедифференцированную хондро- и липосаркому, лейомиосаркому, липосаркому, миксоидную липосаркому, лейомиосаркому тела матки, остеосаркому, саркому Эвинга и рабдомиосаркому, синовиальную саркому, солитарную фиброзную опухоль), рак системы кроветворения (включая, но ими не ограничиваясь, хронический лимфолейкоз (CLL), острый лимфолейкоз (ALL), острый миелолейкоз (AML), Вклеточную, Т-клеточную и большую гранулярную лимфому), опухоли нейроэпителиальной ткани, такие как, но ими не ограничиваясь, астроцитома (плеоморфная ксантоастроцитома, фибриллярные астроцитомы, анапластическая астроцитома, мультиформная глиобластома), олигодендроглиома, эпендимома, опухоль хороидного сплетения, олигоастроцитома, глиосаркома, ганглиоглиома, ретинобластома, нейроцитома, нейробластомы (эстезионейробластома и ганглионейробластома), медуллобластома, атипичные тератоидные рабдоидные опухоли и все типы нейроэндокринного рака.
Последовательности, включая последовательности полипептидов VAR2CSA:
- 27 031876 >fcr3 745 аминокислот | 640 a/к; подчеркнутая последовательность соответствует ID1 домену FCR3, выделенная жирным шрифтом последовательность соответствует DBL2Xb домену FCR3. Оставшаяся последовательность представляет собой ID2a (SEQ ID N0:1)
NYIKGDPYFAEYATKLSFILNPSDANNPSGETANHNDEACNCNESGISSVGQAQTSGPSSNKT CITHSSIKTNKKKECKDVKLGVRENDKDLKICVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGILQENCSDNKR GSSSNDSCDNKNQDECOKKLEKVFASLTNGYKCDKCKSGTSRSKKKWIWKKSSGNEEGLOEEY ANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCEDVKDINFDTKEKFLAGCLIVSFHEGKNLKKRYPQNKN SGNKENLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQNNFGKLFGKYIKKNNTAEQDTS YSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNITTCNADGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFL QEWVENFCEQRQAKVKDVITNCKSCKESGNKCKTECKTKCKDECEKYKKFIEACGTAGGGIGT AGSPWSKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAASTDENKCVQSDIDSFFKHL IDIGLTTPSSYLSNVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTTEKCNKERDKSKSQSSDTLVWNVPSP
LGNTPYRYKYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDNYELCKYNGVDVKPT TVRSNSSKLD >giI 254952610 IgbIACT97135.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 341 а/к (SEQ ID N0:2) KCDKCKSGTSRSRKIWTWRKSSGNKEGLQEEYANTIGLSPRTQLLYLGNLRKLENVCEDVTDI NFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKKRYLEKKKGDNNSKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDND FTKDLELNLQQIFGKLFRKYIKKKNISTEQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAGMN STTCSCSGDSSSGENQTNSCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCEQRQAKVKDVITNCNSCKE SGGTCNSDCEKKCKNKCDAYKTFIEDCKGVGGTGTAGSSWVKRWYQIYMRYSKYIEDAKRNRK AGTKSCGTSSTTNVSVSTDENKCVQS>M2 4 745 аминокислот | 656 а/к (SEQ ID N0:3)
DYIKGDPYFAEYATKLSFILNSSDANNPSGETANHNDEVCNPNESEISSVGQAQTSDPSSNKT CNTHSSIKANKKKVGKHVKLGINNNDKVTjRVCVIEDTSLSGVENCCFKDLLGILQENCSDNKS GSSSNGSCNNKNQEACEKNLEKVbASLTNCYKCDKCKSGTSTVNKNWIWKKSSGNKEGLQKEY ANTIGLPPRTHSLYLGNLPKLENVCEDVKDINFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKKRYPQNKN DDNNSKLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQQIFGKLFRKYIKKNISTEQDTL YSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAGMNITTCCGDGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFL QEWVEHFCKQRQEKVKDVINSCNSCKNTSSKTKLGDTCNSDCEKKCKIECEKYKKFIEECRTA VGGTAGSSWSKRWDQIYKMYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGITTGTISGESSGANSGVTTTENKC VQSDIDSFFKHLIDIGLTTPSSYLSIVLDDNICGDDKAPWTTYTTYTTYTTTEKCNKERDKSK
SQQSNTSVWNVPSPLGNTPHGYKYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWISDTSKNPKGSGSTN NDYELYTYNGVKETKLPKKLNSPKLD >KMWII 745 аминокислот | 643 а/к (SEQ ID N0:4)
DYIKDDPYSKEYTTKLSFILNSSDANTSSGETANHNDEACNCNESEISSVGQAQTSGPSSNKT CITHSFIKANKKKVCKDVKLGVRENDKVLRVCVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGILQENCSDNKR GSSSNGSCNNKNQDECQKKLEKV’FVSLTNGYKCDKCKSGTSTVNKKWIWKKSSGNEKGLQKEY ANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLGNVCEDVTDINFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKISHEKKKG DNGKKLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQKAFGKLFGKYIKKNIASDENTSY SSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNSTMCNADGSVTGSGSSCDDIPTTDFIPQYLRFLQ EWVEHFCKQRQEKVNAVIENCNSCKNTSGERKIGGTCNGDCKTECKNKCEAYKNFIEDCKGGD GTAGSSWVKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKSCGPSSITNASVSTDENKCVQSDIDSFFK HLIDIGLTTPSSYLSIVLDENNCGEDNAPWTTYTTYTTTEKCNKDKKKSKSQSCNTAVWNVP
SPLGNTPHEYKYACQCKIPTTEETCDDRKEYMNQWISDTSKKQKGSGSTNNDYELYTYTGVKE TKLPKKLNSPKLD >1248 745 аминокислот | 640 а/к (SEQ ID N0:5)
SYVKNDPYSKEYVTKLSFILNPSDANNPSGETANHNDEACNPNESEIASVGQAQTSDRLSQKA CITHSFIGANKKIVCKDVKLGVREKDKDLKICVIEDDSLRGVENCCFKDLLGILQENCSDNKS GSSSNGSCNNKNQDECQKKLDEALASLHNGYKCDKCKSGTSRSKKIWTWRKFPGNGEGLQKEY ANTIGLPPRTQSLYLGNLRKLENVCKGVTDINFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKISNKKKND DNGKKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNIASDENTLY SSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGTTCSSGSGDNGDGSVTGSGSSCDDMSTIDLIPQYLRFL QEWVEHFCKQRQEKVKDVIENCKSCKNTSGERIIGGTCGSDCKTKCKGECDAYKNFIEECKRG DGTAGSPWSKRWDQIYMRYSKYIEDAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAENKCVQSDIDSFFKHLI DIGLTTPSSYLSIVLDENICGDDKAPWTTYTTYTTTEKCNKETDKSKSQSCNTAVWNVPSPL
GNTPHGYKYACECKIPTTEETCDDRKEYMNQWISDTSKKPKGGRSTNNDYELYTYNGVKETKL PKKSSSSKLD >giI 254952618 IgbIACT97139.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 358 а/к (SEQ ID NO:6)
KCEKCKSEQSKKNNNIWIWRKFPGNGEGLQKEYANTIGLPPRTHSLYLGNLPKLENVCKDVKD
- 28 031876
INFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKTTYPQNKNADNNSKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDN DFTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNIASDENTLYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAEMN STMCNGDGSVTGSSDSGSTTCSGDNGSISCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQEKVKP VIENCKSCKNTSGERIIGGTCGSDCEKKCKGECDAYKKFIEECKGGGGGTGTAGSPWSKRWDQ IYKRYSKYIEDAKRNRKAGTKSCGPSSTTNAAASTTESKCVQS >giI 254952592 IgbIACT97126.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 333 а/к (SEQ ID N0:7)
KCDKCKSEQSKKNNKNWIWKQFPGNGEGLQKEYANTIGLPPRTHSLYLGNLPKLENVCKGVTD INFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKTSHEKKKGDNGKKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDND FTKDLELNLQQIFGKLFRKYIKKNISAEQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGTTCSS GSGDNGDGSVTGSGSSCDDMPTTDFIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQEKVNAVITNCKSCKESGG TCNSDCEKKCKDECEKYKKFIEECRTAADGTAGSSWSKRWDQIYKMYSKHIEDAKRNRKAGTK NCGTSSTTNAAENKCVQS >giI 90193467 IgbIABD92329.1I белок эритроцитарной мембраны 1 [Plasmodium falciparum] | 269 а/к (SEQ ID N0:8)
DYIKDDPYSKEYTTKLSFILNSSDANTSSGETANHNDEACNCNESEIASVEQASISDRSSQKA YITHSSIKTNKKKVCKYVKLGINNNDKVLRVCVIEDTSLSGVENCCFKDLLGILQENCSDNKR GSSFNDSCNNNNEEACQKKLEKVLASLTNGYKCEKCKSGTSRSKKKWIWKKSSGKEGGLQKEY ANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCKGVTDINFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKPSHQNKND DNNSKLCKDLKYS EADY >giI 254952616 IgbIACT97138.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] |
333 а/к (SEQ ID N0:9)
KCDKCKSGTSRSKKKWTWRKSSGNKEGLQKEYANTIGLPPRTHSLYLGNLRKLENVCEDVTDI NFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKTTYPQNKNDDNNSKLCKALKYSFADYGDLIKGTSIWDND FTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNISTEQHTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAEMNG TTCSCSGDSSDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQAKVNAVINSCNSCKNTSGERKLGGT CGSECKTECKNKCDAYKEFIDGTGSGGGTGTAGSSWVKRWDQIYKRYSKYIEDAKRNRKAGSK NCGTSSTTNAAESKCVQS >hb31 745 аминокислот | 650 а/к (SEQ ID N0:10)
SYVKNNPYSAEYVTKLSFILNSSDANTSSETPSKYYDEVCNCNESEISSVGQAQTSGPSSNKT CITHSSIKTNKKKVCKDVKLGINNNDKVLRVCVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGILQENCSDKNQ SGSSSNGSCNNKNQDECQKKLEKVFASLTNGYKCDKCKSGTSRSKKKWIWRKSSGNEEGLQKE YANTIGLPPRTQSLYLGNLRKLENVCKGVTDINFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKTTYPQNK KKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQKAFGKLFRKYIKKNISTEQHTLYSSL DELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAGMNSTTCCGDGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWV EHFCKQRQEKVNAVIENCNSCKECGDTCNGECKTECEKKCKIECEKYKTFIEECVTAVGGTSG SPWSKRWDQIYKRYSKYIEDAKRNRKAGTKNCGITTGTISGESSGANSGVTTTENKCVQSDID SFFKHLIDIGLTTPSSYLSIVLDDNICGADNAPWTTYTTYTTYTTTKNCDIKKKTPKSQPINT SVWNVPSPLGNTPHGYKYACQCKIPTTEESCDDRKEYMNQWIIDTSKKQKGSGSTNNDYELY TYNGVKETKLPKKSSSSKLD >hb32 745 аминокислот | 643 а/к (SEQ ID N0:11)
SYVKDDPYSAEYVTKLSFILNSSDANTSSETPSKYYDEVCNCNESEISSVGQAQTSGPSSNKT CITHSSIKTNKKKVCKDVKLGINNNDKVLRVCVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGILQENCSDKNQ SGSSSNGSCNNKNQDECQKKLEKVFASLTNGYKCDKCKSGTSRSKKKWIWRKSSGNEEGLQKE YANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCKGVTDIIYDTKEKFLSGCLIAAFHEGKNLKTSHEKKN DDNGKKLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNDFTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQDTS YSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAGMNSTTCSGDGSVTGSGSSCDDMPTIDLIPQYLRFL QEWVE HFCKQRQE KVKDVITNCNSCKE CGD TCNGE CKTE CKTKCKGE CEKYKNFIEE CNGTAD GGTSGSSWSKRWDQIYKRYSKYIEDAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAASTTENKCVQSDIDSFF KHLIDIGLTTPSSYLSNVLDDNICGEDKAPWTTYTTYTTKNCDIQKKTPKPQSCDTLVWNVP SPLGNTPHGYKYVCECKIPTTEETCDDRKEYMNQWIIDTSKKQKGSGSTNNDYELYTYNGVQI KQAAGTLKNSKLD >giI 90193475 IgbIABD92333.1I белок эритроцитарной мембраны 1 [Plasmodium falciparum] | 269 а/к (SEQ ID N0:12)
NYIKGDPYSAEYATKLSFILNSSDTENASEKIQKNNDEVCNCNESEIASVEQAPISDRSSQKA CITHSSIKANKKKVCKHVKLGVRENDKDLKICVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGILQENCSDNKS GSSSNGSCNNNNEEICQKKLEKVLASLTNGYKCDKCKSGTSTVNKNWIWKKYSGKEGGLQEEY ANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCEDVKDINFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKTSNKKKND DNNSKLCKALKYS EADY >giI 254952600 IgbIACT97130.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 344 а/к (SEQ ID N0:13)
KCDKCKSGTSTVNKKWIWKKYSGTEGGLQEEYANTIALPPRTQSLYLGNLPKLENVCKDVTDI NFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKTTYLEKKKGDNGKKNDDNNSKLCKALKYSFADYGDLIKG TSIWDNDFTKDLELNLQQIFGKLFRKYIKKNIASDENTLYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMK HGAGMNS TMCNADGSVTGS GS S ODDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQAKVKDVITNCNS CKECGGTCNGECKTECEKKCKGECDAYKKFIEECKGKADEGTSGSSWSKRWDQIYKRYSKYIE DAKRNRKAG TKNCGPSSTTS T AE S КСVQ S >giI 254952598 IgbIACT97129.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] |
334 а/к (SEQ ID N0:14)
KCDKCKSEQSKKNNNIWIWKKSSGTEGGLQKEYANTIALPPRTQSLYLGNLRKLENVCEDVKD INFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKKRYLEKKNGDNNSKLCKALKYSFADYGDLIKGTSIWDN EYTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQHTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGTTCS
- 29 031876
SGSGDNGSISCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCEQRQGKVNAVIENCNSCKNTSSKTKLGG TCNGECKTECKGECDAYKEFIEKCKGTAAEGTSGSSWVKRWYQIYMRYSKYIEDAKRNRKAGT KNCGTSSTTSTAESKCVQS >giI 254952596 IgbIACT97128.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] |
332 а/к (SEQ ID N0:15)
KCDKCKSEQSKKNNNIWIWKKSSGTEGGLQKEYANTIALPPRTQSLYLGNLRKLENVCEDVKD INFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKKRYLEKKNGDNNSKLCKALKYSFADYGDLIKGTSIWDN EYTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGTTCS SGSGDNGSISCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCEQRQEKVKDVIKNCNSCKECGGTCNGEC KTECKNKCKDECDAYKKFIEECEGKAAEGTSGSSWSKRWDQIYKRYSKYIEDAKRNRKAGTKN CGTSSTTSTAENKCVQS >giI 90193465 IgbIABD92328.1I белок эритроцитарной мембраны 1 [Plasmodium falciparum] | 267 а/к (SEQ ID N0:16)
NYIKDDPYSAEYTTKLSFILNSSDTENASEKIQKNNDEVCNPNESGIACVELAQTSGSSSNKT CNTHSFIKANKKKVCKDVKLGINKKDKDLKICVIEDDSLRGVDNCCCQDLLGILQENCSDKNQ SGSSSNGSCNNKNQEACQKKLENVFASLTNGYKCEKCKSEQSKKNNKNWIWKKYSVKEEGLQK EYANTIALPPRTQSLYLGNLPKLGNVCKGVTDINFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKTTYLQN KKKLCKALKYS EADY >giI 90193477 IgbIABD92334.1I белок эритроцитарной мембраны 1 [Plasmodium falciparum] | 263 а/к (SEQ ID N0:17)
DYIKGDPYFAEYATKLSFILNSSDANTSSGETANHNDEACNPNESEIASVEQASISDRSSQKA CNTHSSIKANKKKECKHVKLGVRENDKDLKICVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGILQENCSDNKR GSSSNGSCDKNSEEICQKKLDEALASLHNGYKNQKCKSEQSKKNKNKWIWKKSSGNEKGLQKE YANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCEDVTDINFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKTTYPQNK NDDNGKKLCKD >giI 254952594 IgbIACT97127.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] |
338 а/к (SEQ ID N0:18)
KCDKCKSEQSKKNNNIWIWKKSSGNKKGLQKEYANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCKDVTD INFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKISNEKKNDDNGKKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDNE YTKDLELNLQNNFGKLFRKYIKKNNTAEQHTLYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGTTCSS GSGDNGDGSVTGSGSSCDDMSTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQEKVNAVIENCNSCKNTSS KTKLGGTCNGECKTECEKKCKDECEKYKEFIEECKRGDGTAGSPWVKRWDQIYMRYSKYIEDA KRNRKAGTKSCGTSAAENKCVQS >giI 254952602 IgbIACT97131.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] |
341 а/к (SEQ ID N0:19)
KCDKCKSEQSKKNNNIWIWKKSSGDEKGLQKEYANTIALPPRTQSLYLGNLPKLENVCKDVTD
INFDTKEKFLAGCLIAAFHEGKNLKTSHQNKNADNGKKNDDNGKKLCKALKYSFADYGDLIKG TSIWDNEYTKDLELNLQQIFGKLFRKYIKRNNTAEQHTLYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMK HGTTCSSGSGDNGDGSVTGSGSSCDDMSTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQEKVKDVITNCN SCKECGGTCGSDCKTKCEAYKKFIEECNGTADGGTSGSSWSKRWDQIYKRYSKYIEDAKRNRK AGTKNCGPSSGANSGVTTTENKCVQS >giI 254952660 IgbIACT97160.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] |
352 а/к (SEQ ID N0:20)
KCEKCESEQSKKNNKYWIWKKSSGNGEGLQEEYANTIALPPRTHSLCLVCLHEKEGKKTQELK NIRTNSELLKERIIAAFHEGKNLKTSPQNKNDNGKKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDNEYT KDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQHTLYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAGMNSTM CNADGSVTGSSDSGSTTCCGDNGSISCDDMPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCEQRQEKVNAVIT NCKSCKECGGTCNSDCEKKCKAYKEFIEKCKGGGTEGTSGSSWSKRWDQIYKRHSKHIEDAKR NRKAGTKNCGITTGTISGESSGANSGVTTTENKCVQS >giI 254952652 IgbIACT97156.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] |
344 а/к (SEQ ID N0:21)
KCDKCKSGTSRSRKIWTWRKFRGNGEGLQKEYANTIGLSPRTQLLYLVCLHEKGKKTQELKNI STNSELLKEWIIAAFHEGKNLKTTYPQKKNDDNGKKLCKALKYSFADYGDLIKGTSIWDNDFT KDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNIASDENTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAGMNGTT CCGDGSVTGSSDSGSTTCCGDGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCEQRQEKVK DVITNCKSCKESEKKCKNKCDAYKEFIDGTGSGGGTGTAGSSWSKRWDQIYMRYSKYIEDAKR NRKAGTKNCGTSSGANSGVTTTENKCVQS >giI 254952622 IgbIACT97141.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] |
350 а/к (SEQ ID N0:22)
KCEKCKSEQSKKNNKIWTWRKFPGNGEGLQKEYANTIGLSPRTQLLYLVCLHEKGKKTQHKTI STNSELLKEWIIAAFHEGKNLKKRYLEKKKGDNNSKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDNDFT KDLELNLQQIFGKLFRKYIKKNIASDENTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAGMNSTM CNGDGSVTGSSDSGSTTCSGDNGSISCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCEQRQEKVKDVIK NCNSCKECGGTCNGECKTECKNKCKDECEKYKNFIEVCTGGDGTAGSPWSKRWYQIYMRYSKY IEDAKRNRKAGTKSCGTSSGANSGVTTTESKCVQS >giI 254952626 IgbIACT97143.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] |
359 а/к (SEQ ID N0:23)
KCEKCKSEQSKKNNKNWIWRKFPGNGEGLQKEYANTIGLPPRTHSLYLVCLHEKGKKTQELKN IRTNSELLKEWIIAAFHEGKNLKKRYHQNNNSGNKKKLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEY TKDLELNLQQIFGKLFRKYIKKNISTEQDTLYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAGMNST TCCGDGSVTGSSDSGSTTCSGDNGSISCDDMPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCEQRQEKVKDVI ENCKSCKNTSGERIIGGTCNGECKTECEKKCKAACEAYKTFIEECEGKAAEGTSGSSWSKRWY
- 30 031876
QIYMRYS КYIE DAKRNRKAGTKNCGKS S GANSGVT T TENKCVQS >giI 90193469|gbIABD92330.1| белок эритроцитарной мембраны 1 [Plasmodium falciparum] | 270 а/к (SEQ ID N0:24)
NYIKDDPYSKEYVTKLSFIPNSSDANNPSGETANHNDEVCNPNESEISSVEHAQTSVLLSQKA YITHSSIKANKKKVCKYVKLGVRENDKDLKICVIEDDSLRGVENCCFKDFLRILQENCSDNKR ESSSNGSCNNNNEEACEKNLDEALASLTNCYKNQKCKSGTSTVNNNKWIWKKSSGKEGGLQKE YANTIGLPPRTQSLCLVVCLDEKEGKTQELKNIRTNSELLKEWIIAAFHEGKNLKKRYHQNKN DDNNSKLCKALKYS EADY >giI 254952644 IgbIACT97152.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 334 а/к (SEQ ID N0:25)
KCDKCKSEQSKKNNKYWIWKKYSVKEGGLQKEYANTIALPPRTQSLCLWCLDEKEGKTQELK NIRTNSELLKERIIAAFHEGKNLKTYHEKKKGDDGKKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDNDF TKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQHTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNGT TCSCSGDSSNDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCEQRQAKVNAVIKNCKSCKECGGTCNGECKT ECKTKCKGECEKYKEFIEKCEGQAAEGTSGSSWSKRWYQIYMRYSKYIEDAKRNRKAGTKNCG TSSGANSGVTTTENKCVQS >giI 254952642 IgbIACT97151.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 351 а/к (SEQ ID N0:26)
KCDKCKSEQSKKNNKNWIWKKYSGTEGGLQKEYANTIALPPRTQSLYLVCLHEKEEKTQELKN ISTNSELLKEWIIAAFHEGKNLKISPQNKNDNGKNLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDNDFTK DLELNLQQIFGKLFRKYIKKNNTAEQDTLYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAGMNGTTC CGDGSVTGSSDSGSTTCCGDGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCEQRQAKVKD VIKNCNSCKECGGTCNGECKTECEKKCKGECEAYKKFIEKCNGGGGEGTSGSSWSKRWDQIYM RY S КYIE DAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAENKCVQS >giI 254952658 IgbIACT97159.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 353 а/к (SEQ ID N0:27) KCDKCKSGTSTVNKKWIWKKFPGKEGGLQEEYANTIALPPRTQSLCLWCLDEKEGKTQHKTI STNSELLKEWIIAAFHEGKNLKISNKKKNDENNSKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDNDFTK DLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGTTCSSGSG DNGDGSVTGSSDSGSTTCCGDGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQAKVK DVIENCKSCKNTSSKTKLGDTCNSDCKTKCKVACEKYKEFIEKCVSAAGGTSGSSWVKRWDQI YMRY S КYIE DAKRNRKAGTKNCGPSSTTS TAE S KGVQS >giI 254952640 IgbIACT97150.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 327 а/к (SEQ ID N0:28)
KCDKCKSGTSTVNKKWIWKKYSGKEGGLQKEYANTIGLPPRTQSLCLVCLHEKEGKTQELKNI STNSELLKEWIIAAFHEGKNLKISNKKKNDDNGKKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDNDFTK DLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQDTLYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAGMNSTTC SCSGDSSNDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQEKVNAVITNCKSCKESGGTCNSDCEKKC KIECEKYKNFIEKCVTAAGGTSGSSWSKRWDQIYKMYSKYIEDAKRNRKAGTKNCGPSSTTNA AASTDENKCVQS >dd2full 745 аминокислот | 628 а/к (SEQ ID N0:29)
NYIKGDPYFAEYATKLSFILNSSDTENASETPSKYYDEACNCNESEIASVGQAQTSGPSSNKT CITHSSIKTNKKKECKDVKLGINNNDKVLRVCVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGILQENCSDNKR GSSSNGSCDKNSEEICQKKLEKVFASLTNGYKCDKCKSGTSRSKKKWIWKKSSGNEEGLQKEY ANTIGLPPRTQSLCLVCLHEKE GKTQHKTIS TNSE LLKEWIIAAFHE GKNLKTSHEKKNDDNG KKLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQHTSYSSL DELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAGMNGTTCSCSGDSSNDMPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCKQ RQEKVNAVIENCNSCKESGGTCNSDCKTECKNKCEAYKEFIEDCKGGGTGTAGSPWSKRWDQI YKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAASTDENKCVQSDVDSFFKHLIDIGLTTPSSYL SNVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTTKNCDIQKKTPKSQSCDTLVWNVPSPLGNTPHEYKYAC
ECKIPTTEETCDDRKEYMNQWSCGSAQTVRGRSGKDDYELYTYNGVKETKPLGTLKNSKLD >giI 254952636 IgbIACT97148.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 350 а/к (SEQ ID N0:30)
KCEKCKSEQSKKNNKNWIWRKFRGTEGGLQEEYANTIGLPPRTQSLCLWCLDEKGKKTQELK NIRTNSELLKEWIIAAFHEGKNLKPSHQNKNSGNKENLCKALKYSFADYGDLIKGTSIWDNDF TKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQHTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNGT TCNADGSVTGSSDSGSTTCSGDNGSISCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQEKVNAVI NSCNSCKNTSSKTKLGDTCNSDCKTKCKIECEKYKTFIEKCVTAAGGTSGSPWSKRWDQIYKR YSKYIEDAKRNRKAGTKNCGPSSTTSTAESKCVQS >giI 254952638 IgbIACT97149.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 330 а/к (SEQ ID N0:31)
KCDKCKSEQSKKNNKNWIWRKYSGNGEGLQKEYANTIGLPPRTHSLYLVCLHEKEGKTQELKN IRTNSELLKEWIIAAFHEGKNLKTTYLENKNDENKKKLCKALKYSFADYGDLIKGTSIWDNDF TKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNIASDENTLYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNGT TCSSGSGDNGSISCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVGHFCKQRQEKVNAVITNCNSCKESGGTCN SDCEKKCKIECEKYKKFIEECRTAAGGTSGSPWSKRWDQIYKMYSKYIEDAKRNRKAGTKNCG PSSTTSTAESKCVQS >giI 254952628 IgbIACT97144.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 334 а/к (SEQ ID N0:32)
KCDKCKSEQSKKNNKNWIWRKYSGNGEGLQKEYANTIGLPPRTHSLYLVCLHEKEGKTQHKTI STNSELLKEWIIAAFHEGKNLKKRYPQNNNSGNKKKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDNEYT KDLELNLQKAFGKLFRKYIKKNIASDENTLYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAEMNGTM
- 31 031876
CNADGSVTGSGSSCDDMSTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCEQRQAKVKDVINSCKSCKESGDTCN SDCEKKCKNKCDAYKTFIEEFCTADGGTAGSPWSKRWDQIYKRYSKYIEDAKRNRKAGTKNCG TSSGANSGVTTTENKCVQS >giI 254952630 IgbIACT97145.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 350 а/к (SEQ ID N0:33)
KCDKCKSGTSTVNKNWIWKKYSGKEEGLQKEYANTIALPPRTHSLYLVCLHEKGKKTQELKNI RTNSELLKEWIIAAFHEGKNLKTSPQNNNSGNKKKLCKALKYSFADYGDLIKGTSIWDNDFTK DLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQHTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAEMNGTTC CGDGSVTGSSDSGSTTCSGDNGSISCDDMPTTDFIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQEKVKHVMES CKSCKECGDTCNGECKTECEKKCKNKCEAYKTFIEKCVSADGGTSGSSWSKRWDQIYMRYSKY IE DAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAAS TAENKCVQS >P13 745 аминокислот | 647 а/к (SEQ ID N0:34)
DYIKDDPYSAEYATKLSFILNPSDANTSSGETANHNDEVCNCNESEIASVELAPISDSSSNKT CITHSFIGANKKKECKDVKLGVREKDKDLKICVIEDDSLRGVENCCCQDLLGILQENCSDNKS GSSSNGSCDKNSEDECQKKLENVFASLKNGYKCDKCKSGTSTVNKKWIWRKYSGNGEGLQKEY ANTIGLPPRTHSLYLVCLHEKEGKTQHKTISTNSELLKEWIIAAFHEGKNLKTSHQNNNSGNK KKLCKALKYSFADYGDLIKGTSIWDNDFTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNIASDENTSYSSL DELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAEMNSTMCNGDGSVTGSSDSGSTTCSGDNGSISCDDIPTID LIPQYLRFLQEWVE HFCKQRQEKVKDVITNCKSCKE SGD TCNSDCEKKCKNKCEAYKKFIEER RTAAQGTAE S SWVKRWDQIYMRYSKYIEDAKRNRKAGTKSCGPS S TTNAAAS TAENKCVQSDI DSFFKHLIDIGLTTPSSYLSIVLDDNICGADNAPWTTYTTYTTTKNCDIKKKTPKPQSCDTLV WNVPSPLGNTPHEYKYACQCRTPNKQESCDDRKEYMNQWSSGSAQTVRGRSTNNDYELYTYN GVKETKPLGTLKNSKLD >giI 254952608 IgbIACT97134.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 341 а/к (SEQ ID N0:35)
KCDKCKSGTSTVNKKWIWRKSSGNKEGLQKEYANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCEDVKDI NFDTKEKFLAGCLIVSFHEGKNLKTSHEKKNDDNGKKLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEY TKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAGMNIT TCCGDGSSGENQTNSCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQEKVNAWTNCKSCKESGGT CNGECKTKCKNKCEVYKTFIDNVGDGTAGSPWVKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGI TTGTISGESSGATSGVTTTENKCVQS >7g8 745 аминокислот | 632 а/к (SEQ ID N0:36)
NYIKDDPYSKEYVTKLSFIPNSSDANTSSEKIQKNNDEVCNPNESGISSVEQAQTSGPSSNKT СITHSSIKANKKKECKDVKLGVRENDKDLKICVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGILQENCSDNKR GSSSNDSCDNKNQDECQKKLDEALESLHNGYKNQKCKSGTSTVNKKWIWKKSSGNKEGLQKEY ANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVSKGVTDIIYDTKEKFLAGCLIVSFHEGKNLKTSHEKKND
DNGKKLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQKAFGKLFRKYIKKNISAEQDTSY SSLDELRESWWNTNKKYIWIAMKHGAGMNGTTCCGDGSSGENQTNSCDDIPTIDLIPQYLRFL QEWVEHFCEQRQAKVKDVITNCKSCKNTSGERKIGGTCNGECKTKCKNKCEAYKTFIEHCKGG DGTAGSSWVKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKSCGTSTAENKCVQSDIDSFFKHLIDIGL TTPSSYLSIVLDENNCGEDKAPWTTYTTTKNCDIQKDKSKSQSSDTLVWNVPSPLGNTPHGY KYACQCKIPTTEETCDDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDNYELCKYNGVDVKPTTVRSSSTK LD >Indo 745 аминокислот | 639 а/к (SEQ ID N0:37)
DYIKGDPYSAEYVTKLSFIPNSSDANNPSEKIQKNNDEVCNCNESEISSVGQASISDPSSNKT CNTHSSIKANKKKVCKDVKLGVRENDKVLKICVIEHTSLRGVDNCCFKDLLGILQEPRIDKNQ SGSSSNGSCDKNSEEACEKNLEKVLASLTNGYKCDKCKSGTSRSKKKWIWKKYSGKEGGLQEE YANTIGLPPRTQSLCLWCLDEKEGKTQE LKNIS TNSE LLKEWIIAAFPE GKNLKPSPEKKKG DNGKKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNIASDENTLY SSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAGMNSTMCNADGSVTGSGSSCDDMPTIDLIPQYLRFLQ EWVEHFCKQRQEKVKPVIENCNSCKNTSSERKIGGTCNSDCKTECKNKCEVYKKFIEDCKGGD GTAGSSWSKRWDQIYKRYSKYIEDAKRNRKAGTKNCGPSSTTNAAENKCVQSDIDSFFKHLID IGLTTPSSYLSTVLDDNICGEDNAPWTTYTTYTTTKNCDKDKKKSKSQSCDTLVWNVPSPLG NTPHEYKYACECRTPNKQESCDDRKEYMNQWISDNTKNPKGSGSGKDYYELYTYNGVDVKPTT VRSSSTKLD >MC 745 аминокислот | 655 а/к (SEQ ID N0:38)
DYIKGDPYFAEYATKLSFILNSSDANTSSGETANHNDEACNCNESEISSVEHASISDPSSNKT CNTHSSIKANKKKVCKHVKLGVRENDKDLRVCVIEHTSLSGVENCCFKDFLRILQENCSDNKS GS S SNGSCDKNNE EACE KNLE KVFASLTNCYKCEKCKSE QSKKNNKKWTWRKS SGNKGGLQEE YANTIGLPPRTQSLCLWCLDE KEGKKTQE LKNIRTNSE LLKEWIIAAFHE GKNLKPSHEKKN DDNGKKNDDNNSKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNI ASDENTLYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAEMNGTTCNADGSVTGSGSSCDDIPTIDLI PQYLRFLQEWVEHFCKQRQAKVKDVIENCKSCKESGNKCKTECKNKCEAYKKFIENCKGGDGT AGS SWVKRWDQIYMRYSKYIEDAKRNRKAGTKNCGPSSITNVSAS TDENKCVQSDIDSFFKHL IDIGLTTPSSYLSIVLDDNICGDDKAPWTTYTTYTTYTTYTTYTTYTTYTTTKNCDKERDKSK
SQSCNTAVWNVPSPLGNTPHEYKYACECRTPSNKELCDDRKEYMNQWSSGSAQTVRDRSGKD YYELYTYNGVKETKLPKKLNSSKLD >giI 254952650 IgbIACT97155.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 347 а/к (SEQ ID N0:39)
KCDKCKSEQSKKNNKYWIWKKSSVKEEGLQKEYANTIALPPRTHSLCLWCLDEKGKKTQELK NISTNSELLKERIIAAFHEGKNLKTTYLEKKNADNNSKLCKALKYSFADYGDLIKGTSIWDNE YTKDLELNLQQIFGKLFRKYIKKNNTAEQHTLYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAGMNG
- 32 031876
TTCCGDGSVTGSSDSGSTTCSGDNGSISCDDMPTTDFIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQEKVKDV IENCNSCKNNLGKTEINEKCKTECKNKCEAYKNFIEKFCTADGGTSGSPWSKRWDQIYKRYSK ΥΙΕ DAKRNRKAG TKNCGTSSTTS TAENKCVQ S >giI 254952648 IgbIACT97154.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 335 а/к (SEQ ID N0:40)
KCEKCKSGTSTVNKYWIWRKSSGNKEGLQKEYANTIALPPRTHSLCLWCLDEKEGKTQELKN ISTNSELLKERIIAAFHEGENLKTSHEKKKGDDGKKNADNNSKLCKALKYSFADYGDLIKGTS IWDNEYTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNIASDENTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHG AGMNGTTCSCSGDSSDDMPTTDFIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQENVNAVIENCNSCKECGGTC NSDCEKKCKTECKNKCEAYKNFIEKFCTADGGTSGYSWSKRWDQIYKRYSKYIEDAKRNRKAG TKSCGTSSTTSTAESKCVQS >ghana2 745 аминокислот | 667 а/к (SEQ ID N0:41)
SYVKNNPYSKEYVTKLSFILNPSDANNPSETPSKYYDEVCNCNESGIACVGQAQTSGPSSNKT CITHSFIGANKKKVCKDVKLGVREKDKDLKICVIEDTYLSGVDNCCFKDFLGMLQENCSDNKS GSSSNGSCNNKNQDECEKNLDEALASLTNGYKCEKCKSGTSTVNKYWIWRKSSGNKEGLQKEY ANTIALPPRTHSLCLWCLDEKEGKTQHKTIS TNSE LLKEWIIAAFHE GKNLKTSHEKKKGDD GKKNADNNSKLCKALKYSFADYGDLIKGTSIWDNDFTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNIASD ENTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAGMNSTTCCGDGSVTGSSDSGSTTCCGDGSVTG SGSSCDDMPTTDFIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQENVNAVIENCNSCKECGGTCNSDCEKKCKT ECKGECDAYKEFIEKCNGGAAEGTSGSSWSKRWDQIYKRYSKYIEDAKRNRKAGTKNCGTSST TSTAESKCVQSDIDSFFKHLIDIGLTTPSSYLSIVLDENICGADNAPWTTYTTYTTYTTYTTT EKCNKETDKSKLQQCNTSVWNVPSPLGNTPHGYKYVCECRTPNKQETCDDRKEYMNQWISDN TKNPKGSRSTNNDYELYTYNGVQIKPTTVRSNSTKLD >giI 254952634 IgbIACT97147.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 348 а/к (SEQ ID N0:42)
KCDKCKSEQSKKNNKNWIWKKSSGNEKGLQKEYANTIGLPPRTQSLCLWCLDEKEGKTQELK NIRTNSELLKEWIIAAFHEGKNLKTSHEKKKGDNNSKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDNEY TKDLELNLQNNFGKLFRKYIKKNIASDENTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAGMNST TCSSGSGSTTCSSGSGSTTCSSGSGDSCDDMPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQEKVNAVI KNCNSCKESGGTCNGECKTECKNKCEAYKTFIEEFCTADGGTSGSPWSKRWDQIYKMYSKHIE DAKRNRKAGTKNCGPS S T TNVSVS TDENKCVQS >ghanal 745 аминокислот | 652 а/к (SEQ ID N0:43)
DYIKDDPYFAEYVTKLSFILNSSDANNPSGETANHNDEVCNPNESGIASVEQAQTSDPSSNKT CNTHSSIKANKKKVCKHVKLGVRENDKDLKICVIEHTSLSGVENCCCQDFLRILQENCSDNKS GSSSNGSCNNKNQEACEKNLEKVLASLTNCYKCDKCKSEQSKKNNKNWIWKKSSGNEKGLQKE YANTIGLPPRTQSLCLWCLDEKE GKTQE LKNIRTNSE LLKEWIIAAFHE GKNLKKRYPQNKN DDNNSKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQNNFGKLFRKYIKKNISTEQDTL YSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAGMNSTTCSSGSGSTTCSSGSGSTTCSSGSGDSCDDM PTTDFIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQEKVNAVIKNCNSCKESGGTCNGECKTECKNKCEAYKTF IEEFCTADGGTSGSPWSKRWDQIYKMYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGPSSTTNVSVSTDENKCV QSDIDSFFKHLIDIGLTTPSSYLSIVLDDNICGEDKAPWTTYTTYTTTKKCNKETDKSKSQSC NTAVWNVPSPLGNTPHGYKYACECKIPTTEETCDDRKEYMNQWIIDTSKKQKGSGSGKDDYE LYTYNGVDVKPTTVRSNSTKLD >V1S1 745 аминокислот | 628 а/к (SEQ ID N0:44)
DYIKDDPYSAQYTTKLSFILNPSDANTSSEKIQKNNDEACNCNESGISSVGQAQTSGPSSNKT CITHSSIKANKKKVCKDVKLGINNNDKVLRVCVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGILQENCSDNKR GSSSNGSCNNNNEEACEKNLDEAPASLHNGYKNQKCKSGTSRSKKKWIWKKSSGNEKGLQEEY ANTIGLPPRTQSLCLVCLHEKE GKTQHKTIS TNSE LLKEWIIAAFHE GKNLKTSHEKKNDDNG KKLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQKAFGKLFRKYIKKNNTAEQDTSYSSL DELRESWWNTNKKYIWIAMKHGAGMNGTTCSCSGDSSNDMPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCEQ RQAKVKDVITNCKSCKESGNKCKTECKTKCKDECEKYKTFIEDCNGGGTGTAGSSWVKRWDQI YKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGPSSITNAAASTDENKCVQSDIDSFFKHLIDIGLTTPSSYL SNVLDENSCGDDKAPWTTYTTYTTTKNCDIQKDKSKSQPINTSVWNVPSPLGNTPYRYKYAC ECKIPTTEESCDDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDNYELCKYNGVDVKPTTVRSNSSKLD >raj116_var25 745 аминокислот | 653 а/к (SEQ ID N0:45)
DYIKGDPYFAEYATKLSFILNPSDTENASETPSKYYDEACNPNESEIASVEQAQTSGPSSNKT CITHSSIKTNKKKECKDVKLGVRENDKDLKICVIEDTSLSGVDNCCFKDLLGILQENCSDNKR GSSSNDSCNNNNEEACEKNLDEALASLTNGYKCDKCKSGTSTVNKKWTWRKSSGNEEGLQKEY ANTIGLPPRTQSLCLVCLHEKE GKTKHKTIS TNSE LLKEWIIAAFHE GKNLKTSHEKKNDDNG KKLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQKAFGKLFRKYIKKNNTAEQDTSYSSL DELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNGTTCSSGSGDNGDSSITGSSDSGSTTCSGDNGSISCD DIPTTDFIPQYLRFLQEWVEHFCEQRQAKVKDVINSCNSCNESGGTCNGECKTKCKDECEKYK KFIEDCNGGDGTAGSSWVKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGPSSITNAAASTDENKC VQSDVDSFFKHLIDIGLTTPSSYLSIVLDENSCGDDKAPWTTYTTYTTTEKCNKERDKSKSQS
SDTLVWNVPSPLGNTPHEYKYACECKIPTNEETCDDRKDYMNQWISDTSKKQKGSGSGKDYY ELYTYNGVQIKQAAGRSSSTKLD >giI 31323048 IgbIAAP37940.1 I var2csa [Plasmodium falciparum] | 490 а/к (SEQ ID N0:46)
KCDKCKSEQSKKNNNKWIWKKYSGNGEGLQKEYANTIGLPPRTQSLCLVCLHEKEGKTQHKTI STNSELLKEWIIAAFHEGKNLKKRYPQNKNDDNNSKLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYT KDLELNLQKAFGKLFRKYIKKNNTAEQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNGTT CSSGSGDNGDSSCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQAKVKDVINSCNSCKNTSGERKI
- 33 031876
GGTCNSDCEKKCKVACDAYKTFIEECRTAVGGTAGSSWVKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAG TKNCGPSSTTNAAENKCVQSDIDSFFKHLIDIGLTTPSSYLSNVLDENSCGADKAPWTTYTTY TTYTTYTTYTTTEKCNKERDKSKSQQSNTSVWNVPSPLGNTPHEYKYACECKIPTTEETCDD RKEYMNQW11DNTKNPKGS GS TDNDYELYTYNGVQIKQAAGRSS S TKLD >giI 254952620 IgbIACT97140.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 335 а/к (SEQ ID N0:47)
KCEKCKSGTSTVNNKWIWRKSSGKEGGLQKEYANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCKGVTDI IYDTKEKFLSGCLIAAFHEGKNLKTTYLEKKNDDNGKKLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNE YTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWIAMKHGAGMNG TTCSSGSGDSSNDIPTTDFIPQYLRFLQEWVENFCEQRQAKVKPVIENCNSCKESGGTCNGEC KTKCKVACDAYKKFIDGTGSGGGSRPTGIAGSSWSKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNC GPSSITNVSVSTDENKCVQS >T2C6 745 аминокислот | 637 а/к (SEQ ID N0:48)
NYIKDDPYSKEYVTKLSFIPNSSDANTSSEKIQKNNDEVCNPNESGISSVEQAQTSDPSSNKT CITHSSIKANKKKECKDVKLGVRENDKDLKICVIEHTSLSGVDNCCFKDFLRMLQEPRIDKNQ RGSSSNGSCDKNSEEACEKNLDEALASLTNGYKCDKCKSEQSKKNNNKWIWKKFPGKEGGLQE EYANTIGLPPRTQYLCLWCLDEKEGKTQE LKNIRTNSE LLKEWIIAAFHE GKNLKTTYPQKK NDDNGKKLCKDLKYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKNVELNLQNNFGKLFRKYIKKNNTAEQDT SYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAEMNSTTCCGDGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRF LQEWVEHFCKQRQAKVKDVITNCNSCKESGNKCKTECKNKCKDECEKYKKFIEACGTAVGGTG TAGS PWSKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGPS S TTNAAENKCVQSDIDSFFKHLIDI GLTTPSSYLSIVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTENCDIQKKTPKSQSCDTLVWNVPSPLGNT PHGYKYACQCRTPNKQESCDDRKEYMNQWIIDNTKNPKGSGSGKDYYELCKYNGVKETKPLGT LKNSKLD >giI 254952632 IgbIACT97146.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 330 а/к (SEQ ID N0:49)
KCDKCKSEQSKKNNNKWIWRKFPGKEGGLQKEYANTIGLPPRTQSLCLVCLHEKEGKTQHKTI STNSELLKEWIIAAFHEGKNLKTTYLEKKNAENKKKLCKALKYSFADYGDLIKGTSIWDNEYT KDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAGMNGTM CNADGSVTGSGSSCDDMPTTDFIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQAKVKDVIENCKSCKESGNKCK TECKNKCDAYKTFIEECGTAVGGTAGSSWVKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGTSST TNAAAS TAENKCVQS >giI 90193487 IgbIABD92339.1I белок эритроцитарной мембраны 1 [Plasmodium falciparum] | 269 а/к (SEQ ID N0:50)
NYIKDDPYSKEYVTKLSFILNSSDAENASETPSKYYDEACNCNESGISSVEQASISDRSSQKA CNTHSFIGANKKKVCKHVKLGVRENDKDLKICVIEDDSLRGVENCCFKDFLRMLQEPRIDKNQ
RGSSSNDSCNNNNEEACEKNLDEALASLHNGYKNQKCKSEQSKKNNNKWIWKKSSGKEGGLQK EYANTIGLPPRTQSLCLVCLHEKEGKTQHKTISTNSELLKEWIIDAFHEGKNLKTTYLEKKKG DNGKKLCKALKYS EADY >giI 254952646 IgbIACT97153.1 I VAR2CSA [Plasmodium falciparum] | 347 а/к (SEQ ID N0:51)
KCDKCKSEQSKKNNKNWIWKKSSGKEGGLQKEYANTIALPPRTQSLCLWCLHEKEGKTQHKT ISTNSELLKEWIIDAFHEGKNLKTTYLEKQNADNGKKNADNNSKLCKDLKYSFADYGDLIKGT SIWDNEYTKDLELNLQQIFGKLFRKYIKKNIASDENTLYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKH GAEMNGTTCSSGSGDSSSGENQTNSCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCEQRQAKVKDVITN CKSCKESGGTCNSDCKTKCKGECEKYKKFIEKCKGGGTEGTSGSSWVKRWYQIYMRYSKYIED AKRNRKAGTKSCGTSSGANSGVTTTESKCVQS >giI 90193485 IgbIABD92338.1I белок эритроцитарной мембраны 1 [Plasmodium falciparum] | 269 а/к (SEQ ID N0:52)
DYIKDDPYSKEYTTKLSFILNSSDANTSSEKIQKNNDEVCNPNESEISSVEQAQTSRPSSNKT CITHSSIKANKKKVCKDVKLGVRENDKVLRVCVIEHTSLSGVENCCCQDLLGILQENCSDNKR GSSSNGSCDKNSEEACEKNLDEALASLTNCYKNQKCKSEQSKKNNNKWIWKKSSGNEKGLQKE YANTIGLPPRTQSLCLVCLHEKEGKTQELKNISTNSELLKEWIIAAFHEGKNLKTTYPQNKND DNGKKLFKDLKYSFADY >MTS1 745 аминокислот | 646 а/к (SEQ ID N0:53)
DYIKDDPYSKEYTTKLSFILNSSDANTSSEKIQKNNDEVCNPNESEISSVEQAQTSRPSSNKT CITHSSIKANKKKVGKDVKLGVRENDKVLRVCVIEHTSLSGVENCCCQDLLGILQENCSDNKR GSSSNGSCDKNSEEACEKNLDEALASLTNCYKNQKCKSEQSKKNNNKWIWKKSSGKEGGLQKE YANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCKGVTDINFD TKEKFLAGCLIAAFHE GKNLKTTYLEKK NDDNGKKLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQKAFGKLFRKYIKKNNTAEQDT SYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAGMNGTTCSSGSGDSSNDIPTTDFIPQYLRFLQEWV ENFCEQRQAKVKDVIENCNSCKNTSGERKIGDTCNSDCEKKCKDECEKYKKFIEDCKGGDGTA GSSWVKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGITTGTISGESSGATSGVTTTENKCVQSDI DSFFKHLIDIGLTTPSSYLSNVLDDNICGEDNAPWTTYTTYTTEKCNKETDKSKSQQSNTAW
VNVPSPLGNTPHGYKYACECKIPTTEETCDDRKEYMNQWSCGSAQTVRDRSGKDDYELCKYNG VQIKQAAGTLKNSKLD >Q8I639 (Q81639_PLAF7) Plasmodium falciparum (изолят 3D7), 632 а/к внеклеточная часть (SEQ ID N0:54)
NYIKGDPYFAEYATKLSFILNSSDANNPSEKIQKNNDEVCNCNESGIASVEQEQISDPSSNKT CITHSSIKANKKKVCKHVKLGVRENDKDLRVCVIEHTSLSGVENCCCQDFLRILQENCSDNKS GSSSNGSCNNKNQEACEKNLEKVLASLTNCYKCDKCKSEQSKKNNKNWIWKKSSGKEGGLQKE YANTIGLPPRTQSLCLWCLDEKGKKTQELKNIRTNSE LLKEWIIAAFHE GKNLKPSHEKKND
- 34 031876
DNGKKLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQDTSY SSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAGMNSTTCCGDGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFLQ EWVEHFCKQRQEKVKPVIENCKSCKESGGTCNGECKTECKNKCEVYKKFIEDCKGGDGTAGSS WVKRWDQIYKRYSKYIEDAKRNRKAGTKNCGPSSTTNAAENKCVQSDIDSFFKHLIDIGLTTP S S YLSIVLDDNICGADKAPWT TY T TY T T ТЕ KCNKE TDKSKLQQCNTAVWNVPS PLGNTPHGY KYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDNYELCKYNGVDVKPTTVRSNSSK LD >Q8I639 (Q8I639_PLAF7) Plasmodium falciparum (изолят 3D7), полноразмерная 2730 a/к внеклеточная часть (SEQ ID N0:55)
MDKSSIANKIEAYLGAKSDDSKIDQSLKADPSEVQYYGSGGDGYYLRKNICKITVNHSDSGTN DPCDRIPPPYGDNDQWKCAIILSKVSEKPENVFVPPRRQRMCINNLEKLNVDKIRDKHAFLAD VLLTARNEGERIVQNHPDTNSSNVCNALERSFADIADIIRGTDLWKGTNSNLEQNLKQMFAKI RENDKVLQDKYPKDQNYRKLREDWWNANRQKVWEVITCGARSNDLLIKRGWRTSGKSNGDNKL ELCRKCGHYEEKVPTKLDYVPQFLRWLTEWIEDFYREKQNLIDDMERHREECTSEDHKSKEGT SYCSTCKDKCKKYCECVKKWKSEWENQKNKYTELYQQNKNETSQKNTSRYDDYVKDFFKKLEA NYSSLENYIKGDPYFAEYATKLSFILNSSDANNPSEKIQKNNDEVCNCNESGIASVEQEQISD PSSNKTCITHSSIKANKKKVCKHVKLGVRENDKDLRVCVIEHTSLSGVENCCCQDFLRILQEN CSDNKSGSSSNGSCNNKNQEACEKNLEKVLASLTNCYKCDKCKSEQSKKNNKNWIWKKSSGKE GGLQKEYANTIGLPPRTQSLCLVVCLDEKGKKTQELKNIRTNSELLKEWIIAAFHEGKNLKPS HEKKNDDNGKKLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTA EQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAGMNSTTCCGDGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQ YLRFLQEWVEHFCKQRQEKVKPVIENCKSCKESGGTCNGECKTECKNKCEVYKKFIEDCKGGD GTAGSSWVKRWDQIYKRYSKYIEDAKRNRKAGTKNCGPSSTTNAAENKCVQSDIDSFFKHLID IGLTTPSSYLSIVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTTEKCNKETDKSKLQQCNTAVWNVPSPLG NTPHGYKYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDNYELCKYNGVDVKPTTV RSNSSKLDDKDVTFFNLFEQWNKEIQYQIEQYMTNTKISCNNEKNVLSRVSDEAAQPKFSDNE RDRNSITHEDKNCKEKCKCYSLWIEKINDQWDKQKDNYNKFQRKQIYDANKGSQNKKWSLSN FLFFSCWEEYIQKYFNGDWSKIKNIGSDTFEFLIKKCGNDSGDGETIFSEKLNNAEKKCKENE STNNKMKSSETSCDCSEPIYIRGCQPKIYDGKIFPGKGGEKQWICKDTIIHGDTNGACIPPRT QNLCVGELWDKRYGGRSNIKNDTKESLKQKIKNAIQKETELLYEYHDKGTAIISRNPMKGQKE KEEKNNDSNGLPKGFCHAVQRSFIDYKNMILGTSVNIYEYIGKLQEDIKKIIEKGTTKQNGKT VGSGAENVNAWWKGIEGEMWDAVRCAITKINKKQKKNGTFSIDECGIFPPTGNDEDQSVSWFK EWSEQFCIERLQYEKNIRDACTNNGQGDKIQGDCKRKCEEYKKYISEKKQEWDKQKTKYENKY VGKSASDLLKENYPECISANFDFIFNDNIEYKTYYPYGDYSSICSCEQVKYYEYNNAEKKNNK SLCHEKGNDRTWSKKYIKKLENGRTLEGVYVPPRRQQLCLYELFPIIIKNKNDITNAKKELLE TLQIVAEREAYYLWKQYHAHNDTTYLAHKKACCAIRGSFYDLEDIIKGNDLVHDEYTKYIDSK
LNEIFDSSNKNDIETKRARTDWWENEAIAVPNITGANKSDPKTIRQLVWDAMQSGVRKAIDEE KEKKKPNENFPPCMGVQHIGIAKPQFIRWLEEWTNEFCEKYTKYFEDMKSNCNLRKGADDCDD NSNIECKKACANYTNWLNPKRIEWNGMSNYYNKIYRKSNKESEDGKDYSMIMEPTVIDYLNKR CNGEINGNYICCSCKNIGENSTSGTVNKKLQKKETQCEDNKGPLDLMNKVLNKMDPKYSEHKM KCTEVYLEHVEEQLKEIDNAIKDYKLYPLDRCFDDKSKMKVCDLIGDAIGCKHKTKLDELDEW NDVDMRDPYNKYKGVLIPPRRRQLCFSRIVRGPANLRNLKEFKEEILKGAQSEGKFLGNYYNE DKDKEKALEAMKNSFYDYEYIIKGSDMLTNIQFKDIKRKLDRLLEKETNNTEKVDDWWETNKK SIWNAMLCGYKKSGNKIIDPSWCTIPTTETPPQFLRWIKEWGTNVCIQKEEHKEYVKSKCSNV TNLGAQESESKNCTSEIKKYQEWSRKRSIQWEAISEGYKKYKGMDEFKNTFKNIKEPDANEPN ANEYLKKHCSKCPCGFNDMQEITKYTNIGNEAFKQIKEQVDIPAELEDVIYRLKHHEYDKGND YICNKYKNINVNMKKNNDDTWTDLVKNSSDINKGVLLPPRRKNLFLKIDESDICKYKRDPKLF KDFIYSSAISEVERLKKVYGEAKTKVVHAMKYSFADIGSIIKGDDMMENNSSDKIGKILGDGV GQNEKRKKWWDMNKYHIWESMLCGYKHAYGNISENDRKMLDIPNNDDEHQFLRWFQEWTENFC TKRNELYENMVTACNSAKCNTSNGSVDKKECTEACKNYSNFILIKKKEYQSLNSQYDMNYKET KAEKKESPEYFKDKCNGECSCLSEYFKDETRWKNPYETLDDTEVKNNCMCKPPPPASNNTSDI LQKTIPFGIALALGSIAFLFMKKKPKTPVDLLRVLDIPKGDYGIPTPKSSNRYIPYASDRYKG KTYIYMEGDTSGDDDKYIWDL >FCR3 (SEQ ID N0:56) полноразмерная 2734 a/к внеклеточная часть (577 a/к выделенное соотв. IDl-DBL2b)
MDSTSTIANKIEEYLGAKSDDSKIDELLKADPSEVEYYRSGGDGDYLKNNICKITVNHSDSGK YDPCEKKLPPYDDNDQWKCQQNSSDGSGKPENICVPPRRERLCTYNLENLKFDKIRDNNAFLA DVLLTARNEGEKIVQNHPDTNSSNVCNALERSFADLADIIRGTDQWKGTNSNLEKNLKQMFAK IRENDKVLQDKYPKDQKYTKLREAWWNANRQKVWEVITCGARSNDLLIKRGWRTSGKSDRKKN FELCRKCGHYEKEVPTKLDYVPQFLRWLTEWIEDFYREKQNLIDDMERHREECTREDHKSKEG TSYCSTCKDKCKKYCECVKKWKTEWENQENKYKDLYEQNKNKTSQKNTSRYDDYVKDFFEKLE ANYSSLENYIKGDPYFAEYATKLSFILNPSDANNPSGETANHNDEACNCNESGISSVGQAQTS GPSSNKTCITHSSIKTNKKKECKDVKLGVRENDKDLKICVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGILQE NCSDNKRGSSSNDSCDNKNQDECQKKLEKVFASLTNGYKCDKCKSGTSRSKKKWIWKKSSGNE EGLQEEYANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCEDVKDINFDTKEKFLAGCLIVSFHEGKNLKK RYPQNKNSGNKENLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQNNFGKLFGKYIKKNN TAEQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNITTCNADGSVTGSGSSCDDIPTIDLI PQYLRFLQEWVENFCEQRQAKVKDVITNCKSCKESGNKCKTECKTKCKDECEKYKKFIEACGT AGGGIGTAGSPWSKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAASTDENKCVQSDI DSFFKHLIDIGLTTPSSYLSNVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTTEKCNKERDKSKSQSSDTLV WNVPSPLGNTPYRYKYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDNYELCKYN GVDVKPTTVRSNSSKLDGNDVTFFNLFEQWNKEIQYQIEQYMTNANISCIDEKEVLDSVSDEG
- 35 031876
TPKVRGGYEDGRNNNTDQGTNCKEKCKCYKLWIEKINDQWGKQKDNYNKFRSKQIYDANKGSQ NKKWSLSNFLFFSCWEEYIQKYFNGDWSKIKNIGSDTFEFLIKKCGNNSAHGEEIFNEKLKN AEKKCKENESTDTNINKSETSCDLNATNYIRGCQSKTYDGKIFPGKGGEKQWICKDTIIHGDT NGACIPPRTQNLCVGELWDKSYGGRSNIKNDTKELLKEKIKNAIHKETELLYEYHDTGTAIIS KNDKKGQKGKNDPNGLPKGFCHAVQRSFIDYKNMILGTSVNIYEHIGKLQEDIKKIIEKGTPQ QKDKIGGVGSSTENVNAWWKGIEREMWDAVRCAITKINKKNNNSIFNGDECGVSPPTGNDEDQ SVSWFKEWGEQFCIERLRYEQNIREACTINGKNEKKCINSKSGQGDKIQGACKRKCEKYKKYI SEKKQEWDKQKTKYENKYVGKSASDLLKENYPECISANFDFIFNDNIEYKTYYPYGDYSSICS CEQVKYYKYNNAEKKNNKSLCYEKDNDMTWSKKYIKKLENGRSLEGVYVPPRRQQLCLYELFP IIIKNEEGMEKAKEELLETLQIVAEREAYYLWKQYNPTGKGIDDANKKACCAIRGSFYDLEDI IKGNDLVHDEYTKYIDSKLNEIFGSSDTNDIDTKRARTDWWENETITNGTDRKTIRQLVWDAM QSGVRYAVEEKNENFPLCMGVEHIGIAKPQFIRWLEEWTNEFCEKYTKYFEDMKSKCDPPKRA DTCGDNSNIECKKACANYTNWLNPKRIEWNGMSNYYNKIYRKSNKESEGGKDYSMIMAPTVID YLNKRCHGEINGNYICCSCKNIGAYNTTSGTVNKKLQKKETECEEEKGPLDLMNEVLNKMDKK YSAHKMKCTEVYLEHVEEQLNEIDNAIKDYKLYPLDRCFDDQTKMKVCDLIADAIGCKDKTKL DELDEWNDMDLRGTYNKHKGVLIPPRRRQLCFSRIVRGPANLRSLNEFKEEILKGAQSEGKFL GNYYKEHKDKEKALEAMKNSFYDYEDIIKGTDMLTNIEFKDIKIKLDRLLEKETNNTKKAEDW WKTNKKSIWNAMLCGYKKSGNKIIDPSWCTIPTTETPPQFLRWIKEWGTNVCIQKQEHKEYVK SKCSNVTNLGAQASESNNCTSEIKKYQEWSRKRSIRWETISKRYKKYKRMDILKDVKEPDANT YLREHCSKCPCGFNDMEEMNNNEDNEKEAFKQIKEQVKIPAELEDVIYRIKHHEYDKGNDYIC NKYKNIHDRMKKNNGNFVTDNFVKKSWEISNGVLIPPRRKNLFLYIDPSKICEYKKDPKLFKD FIYWSAFTEVERLKKAYGGARAKWHAMKYSFTDIGSIIKGDDMMEKNSSDKIGKILGDTDGQ NEKRKKWWDMNKYHIWESMLCGYREAEGDTETNENCRFPDIESVPQFLRWFQEWSENFCDRRQ KLYDKLNSECISAECTNGSVDNSKCTHACVNYKNYILTKKTEYEIQTNKYDNEFKNKNSNDKD APDYLKEKCNDNKCECLNKHIDDKNKTWKNPYETLEDTFKSKCDCPKPLPSPIKPDDLPPQAD EPFDPTILQTTIPFGIALALGSIAFL FMKVIYIYIYVCСICMYVCMYVCMYVCMYVCMYVCMH VCML СVYVIYVEKIСIYIEKEKRKK >BPTI, ингибитор протеиназ (SEQ ID N0:57)
RPDFCLEPPYTGPCKARIIRYFYNAKAGLCQTFVYGGCRAKRNNFKSAEDCMRTCGGA >PE38, Pseudomonas exotoxin A (SEQ ID N0:58), (подчеркнутое KDEL представляет сигнальную последовательность, которая может быть необязательной для конструкций по настоящему изобретению) RHRQPRGWEQLEQCGYPVQRLVALYLAARLSWNQVDQVIRNALASPGSGGDLGEAIREQPEQA RLALTLAAAESERFVRQGTGNDEAGAANGPADSGDALLERNYPTGAEFLGDGGDISFSTRGTQ NWTVERLLQAHRQLEERGYVFVGYHGTFLEAAQSIVFGGVRARSQDLDAIWRGFYIAGDPALA YGYAQDQEPDARGRIRNGALLRVYVPRSSLPGFYRTSLTLAAPEAAGEVERLIGHPLPLRLDA ITGPEEEGGRLETILGWPLAERTWIPSAIPTDPRNVGGDLDPSSIPDKEQAISALPDYASQP GKPPRKDEL >PE38LR, вариант РЕ38 (SEQ ID N0:59) (подчеркнутое KDEL представляет сигнальную последовательность, которая может быть необязательной для конструкций по настоящему изобретению) RHRQPRGWEQLYPTGAEFLGDGGDISFSTRGTQNWTVERLLQAHRQLEERGYVFVGYHGTFLE AAQSIVFGGVRARSQDLDAIWRGFYIAGDPALAYGYAQDQEPDARGRIRNGALLRVYVPRSSL PGFYRTSLTLAAPEAAGEVERLIGHPLPLRLDAITGPEEEGGRLETILGWPLAERTWIPSAI PTDPRNVGGDLDPSSIPDKEOAISALPDYASOPGKPPRKDEL
Последовательности полипептидов VAR2CSA, гибридизированные с усеченными фрагментами экзотоксина Pseudomonas (РЕ38)
Слитые белки VAR2CSA-PE38 могут иметь модификации, такие
как ингибитор протеиназ (BPTI) на N-конце, и/или
оптимизированная последовательность РЕ38, которая является
менее иммуногенной (PE38LR) >BPTI-IDl-ID2aFCR3-PE38LR, (SEQ ID N0:60) подчеркнутая последовательность соответствует ID1 домену FCR3, выделенная жирным шрифтом последовательность соответствует DBL2Xb домену FCR3, подчеркнутая и выделенная жирным шрифтом последовательность представляет собой ID2a
RPDFCLEPPYTGPCKARIIRYFYNAKAGLCQTFVYGGCRAKRNNFKSAEDCMRTCGGANYIKG DPYFAEYATKLSFILNPSDANNPSGETANHNDEACNCNESGISSVGQAQTSGPSSNKTCITHS SIKTNKKKECKDVKLGVRENDKDLKICVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGILQENCSDNKRGSSSN DSCDNKNQDECOKKLEKVFASLTNGYKCDKCKSGTSRSKKKWIWKKSSGNEEGLOEEYANTIG LPPRTQSLYLGNLPKLENVCEDVKDINFDTKEKFLAGCLIVSFHEGKNLKKRYPQNKNSGNKE NLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQNNFGKLFGKYIKKNNTAEQDTSYSSLD ELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNITTCNADGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVE NFCEQRQAKVKDVITNCKSCKESGNKCKTECKTKCKDECEKYKKFIE ACGTAGGGIGTAGS PW SKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAASTDENKCVQSDIDSFFKHLIDIGL TTPSSYLSNVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTTEKCNKERDKSKSQSSDTLVWNVPSPLGNTP YRYKYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDNYELCKYNGVDVKPTTVRSN SSKLDRHROPRGWEOLYPTGAEFLGDGGDISFSTRGTONWTVERLLOAHROLEERGYVFVGYH GTFLEAAQSIVFGGVRARSQDLDAIWRGFYIAGDPALAYGYAQDQEPDARGRIRNGALLRVYV PRSSLPGFYRTSLTLAAPEAAGEVERLIGHPLPLRLDAITGPEEEGGRLETILGWPLAERTW IPSAIPTDPRNVGGDLDPS SIPDKEQAISALPDYASQPGKPPRKDEL >BPTI-IDl-ID2aFCR3-PE38 (SEQ ID N0:61)
- 36 031876
RPDFCLEPPYTGPCKARIIRYFYNAKAGLCQTFVYGGCRAKRNNFKSAEDCMRTCGGANYIKG DPYFAEYATKLSFILNPSDANNPSGETANHNDEACNCNESGISSVGQAQTSGPSSNKTCITHS SIKTNKKKECKDVKLGVRENDKDLKICVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGILQENCSDNKRGSSSN DSCDNKNQDECQKKLEKVFASLTNGYKCDKCKSGTSRSKKKWIWKKSSGNEEGLQEEYANTIG LPPRTQSLYLGNLPKLENVCEDVKDINFDTKEKFLAGCLIVSFHEGKNLKKRYPQNKNSGNKE NLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQNNFGKLFGKYIKKNNTAEQDTSYSSLD ELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNITTCNADGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVE NFCEQRQAKVKDVITNCKSCKESGNKCKTECKTKCKDECEKYKKFIEACGTAGGGIGTAGSPW SKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAASTDENKCVQSDIDSFFKHLIDIGL TTPSSYLSNVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTTEKCNKERDKSKSQSSDTLVWNVPSPLGNTP YRYKYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDNYELCKYNGVDVKPTTVRSN SSKLDPEGGSLAALTAHQACHLPLETFTRHRQPRGWEQLEQCGYPVQRLVALYLAARLSWNQV DQVIRNALASPGSGGDLGEAIREQPEQARLALTLAAAESERFVRQGTGNDEAGAANGPADSGD ALLERNYPTGAEFLGDGGDISFSTRGTQNWTVERLLQAHRQLEERGYVFVGYHGTFLEAAQSI VFGGVRARSQDLDAIWRGFYIAGDPALAYGYAQDQEPDARGRIRNGALLRVYVPRSSLPGFYR TSLTLAAPEAAGEVERLIGHPLPLRLDAITGPEEEGGRLETILGWPLAERTWIPSAIPTDPR NVGGDLDPS SIPDKEQAISALPDYASQPGKPPRKDEL >IDl-ID2aFCR3-PE38 (SEQ ID N0:62)
NYIKGDPYFAEYATKLSFILNPSDANNPSGETANHNDEACNCNESGISSVGQAQTSGPSSNKT CITHSSIKTNKKKECKDVKLGVRENDKDLKICVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGILQENCSDNKR GSSSNDSCDNKNQDECQKKLEKVFASLTNGYKCDKCKSGTSRSKKKWIWKKSSGNEEGLQEEY ANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCEDVKDINFDTKEKFLAGCLIVSFHEGKNLKKRYPQNKN SGNKENLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQNNFGKLFGKYIKKNNTAEQDTS YSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNITTCNADGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFL QEWVENFCEQRQAKVKDVITNCKSCKESGNKCKTECKTKCKDECEKYKKFIEACGTAGGGIGT AGSPWSKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAASTDENKCVQSDIDSFFKHL IDIGLTTPSSYLSNVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTTEKCNKERDKSKSQSSDTLVWNVPSP LGNTPYRYKYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDNYELCKYNGVDVKPT TVRSNSSKLDPEGGSLAALTAHQACHLPLETFTRHRQPRGWEQLEQCGYPVQRLVALYLAARL SWNQVDQVIRNALASPGSGGDLGEAIREQPEQARLALTLAAAESERFVRQGTGNDEAGAANGP ADSGDALLERNYPTGAEFLGDGGDISFSTRGTQNWTVERLLQAHRQLEERGYVFVGYHGTFLE AAQSIVFGGVRARSQDLDAIWRGFYIAGDPALAYGYAQDQEPDARGRIRNGALLRVYVPRSSL PGFYRTSLTLAAPEAAGEVERLIGHPLPLRLDAITGPEEEGGRLETILGWPLAERTWIPSAI PTDPRNVGGDLDPSSIPDKEQAISALPDYASQPGKPPRKDEL >IDl-ID2aFCR3-PE38LR (SEQ ID N0:63)
NYIKGDPYFAEYATKLSFILNPSDANNPSGETANHNDEACNCNESGISSVGQAQTSGPSSNKT
CITHSSIKTNKKKECKDVKLGVRENDKDLKICVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGILQENCSDNKR GSSSNDSCDNKNQDECQKKLEKVFASLTNGYKCDKCKSGTSRSKKKWIWKKSSGNEEGLQEEY ANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCEDVKDINFDTKEKFLAGCLIVSFHEGKNLKKRYPQNKN SGNKENLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQNNFGKLFGKYIKKNNTAEQDTS YSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNITTCNADGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFL QEWVENFCEQRQAKVKDVITNCKSCKESGNKCKTECKTKCKDECEKYKKFIEACGTAGGGIGT AGSPWSKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAASTDENKCVQSDIDSFFKHL IDIGLTTPSSYLSNVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTTEKCNKERDKSKSQSSDTLVWNVPSP LGNTPYRYKYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDNYELCKYNGVDVKPT TVRSNSSKLDRHRQPRGWEQLYPTGAEFLGDGGDISFSTRGTQNWTVERLLQAHRQLEERGYV FVGYHGTFLEAAQSIVFGGVRARSQDLDAIWRGFYIAGDPALAYGYAQDQEPDARGRIRNGAL LRVYVPRSSLPGFYRTSLTLAAPEAAGEVERLIGHPLPLRLDAITGPEEEGGRLETILGWPLA ERTWIPSAIPTDPRNVGGDLDPSSIPDKEQAISALPDYASQPGKPPRKDEL >BPTI-DBLl-ID2aFCR3-PE38LR (SEQ ID N0:64)
RPDFCLEPPYTGPCKARIIRYFYNAKAGLCQTFVYGGCRAKRNNFKSAEDCMRTCGGANHSDS GKYDPCEKKLPPYDDNDQWKCQQNSSDGSGKPENICVPPRRERLCTYNLENLKFDKIRDNNAF LADVLLTARNEGEKIVQNHPDTNSSNVCNALERSFADLADIIRGTDQWKGTNSNLEKNLKQMF AKIRENDKVLQDKYPKDQKYTKLREAWWNANRQKVWEVITCGARSNDLLIKRGWRTSGKSDRK KNFELCRKCGHYEKEVPTKLDYVPQFLRWLTEWIEDFYREKQNLIDDMERHREECTREDHKSK EGTSYCSTCKDKCKKYCECVKKWKTEWENQENKYKDLYEQNKNKTSQKNTSRYDDYVKDFFEK LEANYSSLENYIKGDPYFAEYATKLSFILNPSDANNPSGETANHNDEACNCNESGISSVGQAQ TSGPSSNKTCITHSSIKTNKKKECKDVKLGVRENDKDLKICVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGIL QENCSDNKRGSSSNDSCDNKNQDECQKKLEKVFASLTNGYKCDKCKSGTSRSKKKWIWKKSSG NEEGLQEEYANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCEDVKDINFDTKEKFLAGCLIVSFHEGKNL KKRYPQNKNSGNKENLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQNNFGKLFGKYIKK NNTAEQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNITTCNADGSVTGSGSSCDDIPTID LIPQYLRFLQEWVENFCEQRQAKVKDVITNCKSCKESGNKCKTECKTKCKDECEKYKKFIEAC GTAGGGIGTAGSPWSKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAASTDENKCVQS DIDSFFKHLIDIGLTTPSSYLSNVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTTEKCNKERDKSKSQSSDT LVWNVPSPLGNTPYRYKYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDNYELCK YNGVDVKPTTVRSNSSKLDRHRQPRGWEQLYPTGAEFLGDGGDISFSTRGTQNWTVERLLQAH RQLEERGYVFVGYHGTFLEAAQSIVFGGVRARSQDLDAIWRGFYIAGDPALAYGYAQDQEPDA RGRIRNGALLRVYVPRSSLPGFYRTSLTLAAPEAAGEVERLIGHPLPLRLDAITGPEEEGGRL ETILGWPLAERTWIPSAIPTDPRNVGGDLDPSSIPDKEQAISALPDYASQPGKPPRKDEL >BPTI-DBLl-ID2aFCR3-PE38 (SEQ ID N0:65)
RPDFCLEPPYTGPCKARIIRYFYNAKAGLCQTFVYGGCRAKRNNFKSAEDCMRTCGGANHSDS
- 37 031876
GKYDPCEKKLPPYDDNDQWKCQQNSSDGSGKPENICVPPRRERLCTYNLENLKFDKIRDNNAF LADVLLTARNEGEKIVQNHPDTNSSNVCNALERSFADLADIIRGTDQWKGTNSNLEKNLKQMF AKIRENDKVLQDKYPKDQKYTKLREAWWNANRQKVWEVITCGARSNDLLIKRGWRTSGKSDRK KNFELCRKCGHYEKEVPTKLDYVPQFLRWLTEWIEDFYREKQNLIDDMERHREECTREDHKSK EGTSYCSTCKDKCKKYCECVKKWKTEWENQENKYKDLYEQNKNKTSQKNTSRYDDYVKDFFEK LEANYS S LENYIKGDPY FAEYATKL S FILNP S DANNP S GE TANHNDEACNCNE S GIS SVGQAQ TSGPSSNKTCITHSSIKTNKKKECKDVKLGVRENDKDLKICVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGIL QENCSDNKRGSSSNDSCDNKNQDECQKKLEKVFASLTNGYKCDKCKSGTSRSKKKWIWKKSSG NEEGLQEEYANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCEDVKDINFDTKEKFLAGCLIVSFHEGKNL KKRYPQNKNSGNKENLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQNNFGKLFGKYIKK NNTAEQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNITTCNADGSVTGSGSSCDDIPTID LIPQYLRFLQEWVENFCEQRQAKVKDVITNCKSCKESGNKCKTECKTKCKDECEKYKKFIEAC GTAGGGIGTAGSPWSKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAASTDENKCVQS DIDSFFKHLIDIGLTTPSSYLSNVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTTEKCNKERDKSKSQSSDT LVWNVPSPLGNTPYRYKYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDNYELCK YNGVDVKPTTVRSNSSKLDPEGGSLAALTAHQACHLPLETFTRHRQPRGWEQLEQCGYPVQRL VALYLAARLSWNQVDQVIRNALASPGSGGDLGEAIREQPEQARLALTLAAAESERFVRQGTGN DEAGAAnGPADSGDALLERNYPTGAEFLGDGGDISFSTRGTQNWTVERLLQAHRQLEERGYVF VGYHGTFLEAAQSIVFGGVRARSQDLDAIWRGFYIAGDPALAYGYAQDQEPDARGRIRNGALL RVYVPRSSLPGFYRTsLTLAAPEAAGEVERLIGHPLPLRLDAITGPEEEGGRLETILGWPLAE RTWIPSAIPTDPRNVGGDLDPS SIPDKEQAISALPDYASQPGKPPRKDEL >DBLl-ID2aFCR3-PE38LR (SEQ ID N0:66)
NHSDSGKYDPCEKKLPPYDDNDQWKCQQNSSDGSGKPENICVPPRRERLCTYNLENLKFDKIR DNNAFLADVLLTARNEGEKIVQNHPDTNSSNVCNALERSFADLADIIRGTDQWKGTNSNLEKN LKQMFAKIRENDKVLQDKYPKDQKYTKLREAWWNANRQKVWEVITCGARSNDLLIKRGWRTSG KSDRKKNFELCRKCGHYEKEVPTKLDYVPQFLRWLTEWIEDFYREKQNLIDDMERHREECTRE DHKSKEGTSYCSTCKDKCKKYCECVKKWKTEWENQENKYKDLYEQNKNKTSQKNTSRYDDYVK DFFEKLEANYSSLENYIKGDPYFAEYATKLSFILNPSDANNPSGETANHNDEACNCNESGISS VGQAQTSGPSSNKTCITHSSIKTNKKKECKDVKLGVRENDKDLKICVIEDTSLSGVDNCCCQD LLGILQENCSDNKRGSSSNDSCDNKNQDECQKKLEKVFASLTNGYKCDKCKSGTSRSKKKWIW KKSSGNEEGLQEEYANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCEDVKDINFDTKEKFLAGCLIVSFH EGKNLKKRYPQNKNSGNKENLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQNNFGKLFG KYIKKNNTAEQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNITTCNADGSVTGSGSSCDD IPTIDLIPQYLRFLQEWVENFCEQRQAKVKDVITNCKSCKESGNKCKTECKTKCKDECEKYKK FIEACGTAGGGIGTAGSPWSKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAASTDEN KCVQSDIDSFFKHLIDIGLTTPSSYLSNVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTTEKCNKERDKSKS QSSDTLVWNVPSPLGNTPYRYKYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDN YELCKYNGVDVKPTTVRSNSSKLDRHRQPRGWEQLYPTGAEFLGDGGDISFSTRGTQNWTVER LLQAHRQLEERGYVFVGYHGTFLEAAQSIVFGGVRARSQDLDAIWRGFYIAGDPALAYGYAQD QEPDARGRIRNGALLRVYVPRSSLPGFYRTSLTLAAPEAAGEVERLIGHPLPLRLDAITGPEE EGGRLETILGWPLAERTWIPSAIPTDPRNVGGDLDPS SIPDKEQAISALPDYASQPGKPPRK DEL >DBLl-ID2aFCR3-PE38 (SEQ ID N0:67)
NHSDSGKYDPCEKKLPPYDDNDQWKCQQNSSDGSGKPENICVPPRRERLCTYNLENLKFDKIR DNNAFLADVLLTARNEGEKIVQNHPDTNSSNVCNALERSFADLADIIRGTDQWKGTNSNLEKN LKQMFAKIRENDKVLQDKYPKDQKYTKLREAWWNANRQKVWEVITCGARSNDLLIKRGWRTSG KSDRKKNFELCRKCGHYEKEVPTKLDYVPQFLRWLTEWIEDFYREKQNLIDDMERHREECTRE DHKSKEGTSYCSTCKDKCKKYCECVKKWKTEWENQENKYKDLYEQNKNKTSQKNTSRYDDYVK DFFEKLEANYSSLENYIKGDPYFAEYATKLSFILNPSDANNPSGETANHNDEACNCNESGISS VGQAQTSGPSSNKTCITHSSIKTNKKKECKDVKLGVRENDKDLKICVIEDTSLSGVDNCCCQD LLGILQENCSDNKRGSSSNDSCDNKNQDECQKKLEKVFASLTNGYKCDKCKSGTSRSKKKWIW KKSSGNEEGLQEEYANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCEDVKDINFDTKEKFLAGCLIVSFH EGKNLKKRYPQNKNSGNKENLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQNNFGKLFG KYIKKNNTAEQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNITTCNADGSVTGSGSSCDD IPTIDLIPQYLRFLQEWVENFCEQRQAKVKDVITNCKSCKESGNKCKTECKTKCKDECEKYKK FIEACGTAGGGIGTAGSPWSKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAASTDEN KCVQSDIDSFFKHLIDIGLTTPSSYLSNVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTTEKCNKERDKSKS QSSDTLVWNVPSPLGNTPYRYKYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDN YELCKYNGVDVKPTTVRSNSSKLDPEGGSLAALTAHQACHLPLETFTRHRQPRGWEQLEQCGY PVQRLVALYLAARLSWNQVDQVIRNALASPGSGGDLGEAIREQPEQARLALTLAAAESERFVR QGTGNDEAGAANGPADSGDALLERNYPTGAEFLGDGGDISFSTRGTQNWTVERLLQAHRQLEE RGYVFVGYHGTFLEAAQSIVFGGVRARSQDLDAIWRGFYIAGDPALAYGYAQDQEPDARGRIR NGALLRVYVPRSSLPGFYRTSLTLAAPEAAGEVERLIGHPLPLRLDAITGPEEEGGRLETILG WPLAERTWIPSAIPTDPRNVGGDLDPS SIPDKEQAISALPDYASQPGKPPRKDEL >IDl-ID2a3D7-PE38 (SEQ ID N0:68)
LSFILNSSDANNPSEKIQKNNDEVCNCNESGIASVEQEQISDPSSNKTCITHSSIKANKKKVC KHVKLGVRENDKDLRVCVIEHTSLSGVENCCCQDFLRILQENCSDNKSGSSSNGSCNNKNQEA CEKNLEKVLASLTNCYKCDKCKSEQSKKNNKNWIWKKSSGKEGGLQKEYANTIGLPPRTQSLC LWCLDEKGKKTQELKNIRTNSELLKEWIIAAFHEGKNLKPSHEKKNDDNGKKLCKALEYSFA DYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQDTSYSSLDELRESWWNTNK KYIWLAMKHGAGMNSTTCCGDGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQEKVK PVIENCKSCKESGGTCNGECKTECKNKCEVYKKFIEDCKGGDGTAGSSWVKRWDQIYKRYSKY
- 38 031876
IEDAKRNRKAGTKNCGPSSTTNAAENKCVQSDIDSFFKHLIDIGLTTPSSYLSIVLDDNICGA DKAPWTTYTTYTTTEKCNKETDKSKLQQCNTAVWNVPSPLGNTPHGYKYACQCKIPTNEETC DDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDNYELCKYNGVDVKPTTVRSNSSKLDPEGGSLAALTAHQ ACHLPLETFTRHRQPRGWEQLEQCGYPVQRLVALYLAARLSWNQVDQVIRNALASPGSGGDLG EAIREQPEQARLALTLAAAESERFVRQGTGNDEAGAANGPADSGDALLERNYPTGAEFLGDGG DISFSTRGTQNWTVERLLQAHRQLEERGYVFVGYHGTFLEAAQSIVFGGVRARSQDLDAIWRG FYIAGDPALAYGYAQDQEPDARGRIRNGALLRVYVPRSSLPGFYRTSLTLAAPEAAGEVERLI GHPLPLRLDAITGPEEEGGRLETILGWPLAERTWIPSAIPTDPRNVGGDLDPSSIPDKEQAI SALPDYASQPGKPPRKDEL >IDl-ID2a3D7-PE38LR (SEQ ID N0:69)
LSFILNSSDANNPSEKIQKNNDEVCNCNESGIASVEQEQISDPSSNKTCITHSSIKANKKKVC KHVKLGVRENDKDLRVCVIEHTSLSGVENCCCQDFLRILQENCSDNKSGSSSNGSCNNKNQEA CEKNLEKVLASLTNCYKCDKCKSEQSKKNNKNWIWKKSSGKEGGLQKEYANTIGLPPRTQSLC LWCLDEKGKKTQELKNIRTNSELLKEWIIAAFHEGKNLKPSHEKKNDDNGKKLCKALEYSFA DYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQDTSYSSLDELRESWWNTNK KYIWLAMKHGAGMNSTTCCGDGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQEKVK PVIENCKSCKESGGTCNGECKTECKNKCEVYKKFIEDCKGGDGTAGSSWVKRWDQIYKRYSKY IEDAKRNRKAGTKNCGPSSTTNAAENKCVQSDIDSFFKHLIDIGLTTPSSYLSIVLDDNICGA DKAPWTTYTTYTTTEKCNKETDKSKLQQCNTAVWNVPSPLGNTPHGYKYACQCKIPTNEETC DDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDNYELCKYNGVDVKPTTVRSNSSKLDRHRQPRGWEQLYP TGAEFLGDGGDISFSTRGTQNWTVERLLQAHRQLEERGYVFVGYHGTFLEAAQSIVFGGVRAR SQDLDAIWRGFYIAGDPALAYGYAQDQEPDARGRIRNGALLRVYVPRSSLPGFYRTSLTLAAP EAAGEVERLIGHPLPLRLDAITGPEEEGGRLETILGWPLAERTWIPSAIPTDPRNVGGDLDP SSIPDKEQAISALPDYASQPGKPPRKDEL >IDl-DBL2bFCR3-PE38LR (SEQ ID N0:70)
NYIKGDPYFAEYATKLSFILNPSDANNPSGETANHNDEACNCNESGISSVGQAQTSGPSSNKT CITHSSIKTNKKKECKDVKLGVRENDKDLKICVIEDTSLSGVDNCCCQDLLGILQENCSDNKR GSSSNDSCDNKNQDECQKKLEKVFASLTNGYKCDKCKSGTSRSKKKWIWKKSSGNEEGLQEEY ANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCEDVKDINFDTKEKFLAGCLIVSFHEGKNLKKRYPQNKN SGNKENLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQNNFGKLFGKYIKKNNTAEQDTS YSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNITTCNADGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFL QEWVENFCEQRQAKVKDVITNCKSCKESGNKCKTECKTKCKDECEKYKKFIEACGTAGGGIGT AGSPWSKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAASTDENKCVQSDIDSFFKHL IDIGLTTPSSYLSNVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTTEKCNKERDKSKSQSSDTLVWNVPSP LGNTPYRYKYRHRQPRGWEQLYPTGAEFLGDGGDISFSTRGTQNWTVERLLQAHRQLEERGYV FVGYHGTFLEAAQSIVFGGVRARSQDLDAIWRGFYIAGDPALAYGYAQDQEPDARGRIRNGAL
LRVYVPRSSLPGFYRTSLTLAAPEAAGEVERLIGHPLPLRLDAITGPEEEGGRLETILGWPLA ERTWIPSAIPTDPRNVGGDLDPS SIPDKEQAISALPDYASQPGKPPRKDEL >DT388, последовательность дифтерийного токсина (SEQ ID N0:71) MGADDWDSSKSFVMENFSSYHGTKPGYVDSIQKGIQKPKSGTQGNYDDDWKGFYSTDNKYDA AGYSVDNENPLSGKAGGWKVTYPGLTKVLALKVDNAETIKKELGLSLTEPLMEQVGTEEFIK RFGDGASRWLSLPFAEGSSSVEYINNWEQAKALSVELEINFETRGKRGQDAMYEYMAQACAG NRVRRSVGSSLSCINLDWDVIRDKTKTKIESLKEHGPIKNKMSESPNKTVSEEKAKQYLEEFH QTALEHPELSELKTVTGTNPVFAGANYAAWAVNVAQVIDSETADNLEKTTAALSILPGIGSVM GIADGAVHHNTEEIVAQSIALSSLMVAQAIPLVGELVDIGFAAYNFVESIINLFQWHNSYNR PAYSPGHKTQPMHEF
Последовательности полипептидов VAR2CSA, гибридизированные с усеченными фрагментами дифтерийного токсина >DT388-DBLl-ID2a 3D7 (SEQ ID N0:72)
MGADDWDSSKSFVMENFSSYHGTKPGYVDSIQKGIQKPKSGTQGNYDDDWKGFYSTDNKYDA AGYSVDNENPLSGKAGGWKVTYPGLTKVLALKVDNAETIKKELGLSLTEPLMEQVGTEEFIK RFGDGASRWLSLPFAEGSSSVEYINNWEQAKALSVELEINFETRGKRGQDAMYEYMAQACAG NRVRRSVGSSLSCINLDWDVIRDKTKTKIESLKEHGPIKNKMSESPNKTVSEEKAKQYLEEFH QTALEHPELSELKTVTGTNPVFAGANYAAWAVNVAQVIDSETADNLEKTTAALSILPGIGSVM GIADGAVHHNTEEIVAQSIALSSLMVAQAIPLVGELVDIGFAAYNFVESIINLFQWHNSYNR PAYSPGHKTQPMHEFHSDSGTNDPCDRIPPPYGDNDQWKCAIILSKVSEKPENVFVPPRRQRM CINNLEKLNVDKIRDKHAFLADVLLTARNEGERIVQNHPDTNSSNVCNALERSFADIADIIRG TDLWKGTNSNLEQNLKQMFAKIRENDKVLQDKYPKDQNYRKLREDWWNANRQKVWEVITCGAR SNDLLIKRGWRTSGKSNGDNKLELCRKCGHYEEKVPTKLDYVPQFLRWLTEWIEDFYREKQNL IDDMERHREECTSEDHKSKEGTSYCSTCKDKCKKYCECVKKWKSEWENQKNKYTELYQQNKNE TSQKNTSRYDDYVKDFFKKLEANYSSLENYIKGDPYFAEYATKLSFILNSSDANNPSEKIQKN NDEVCNCNESGIASVEQEQISDPSSNKTCITHSSIKANKKKVCKHVKLGVRENDKDLRVCVIE HTSLSGVENCCCQDFLRILQENCSDNKSGSSSNGSCNNKNQEACEKNLEKVLASLTNCYKCDK CKSEQSKKNNKNWIWKKSSGKEGGLQKEYANTIGLPPRTQSLCLWCLDEKGKKTQELKNIRT NSELLKEWIIAAFHEGKNLKPSHEKKNDDNGKKLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDL ELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAGMNSTTCCG DGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVEHFCKQRQEKVKPVIENCKSCKESGGTCNGEC KTECKNKCEVYKKFIEDCKGGDGTAGSSWVKRWDQIYKRYSKYIEDAKRNRKAGTKNCGPSST TNAAENKCVQSDIDSFFKHLIDIGLTTPSSYLSIVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTTEKCNKE TDKSKLQQCNTAVWNVPSPLGNTPHGYKYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWSCGSARTMKR GYKNDNYELCKYNGVDVKPTTVRSNSSKLDSGR >DT388-DBLl-ID2a FCR3 (SEQ ID N0:73)
- 39 031876
MGADDWDSSKSFVMENFSSYHGTKPGYVDSIQKGIQKPKSGTQGNYDDDWKGFYSTDNKYDA AGYSVDNENPLSGKAGGVVKVTYPGLTKVLALKVDNAETIKKELGLSLTEPLMEQVGTEEFIK RFGDGASRWLSLPFAEGSSSVEYINNWEQAKALSVELEINFETRGKRGQDAMYEYMAQACAG NRVRRSVGSSLSCINLDWDVIRDKTKTKIESLKEHGPIKNKMSESPNKTVSEEKAKQYLEEFH QTALEHPELSELKTVTGTNPVFAGANYAAWAVNVAQVIDSETADNLEKTTAALSILPGIGSVM GIADGAVHHNTEEIVAQSIALSSLMVAQAIPLVGELVDIGFAAYNFVESIINLFQWHNSYNR PAYSPGHKTQPMHEFHSDSGKYDPCEKKLPPYDDNDQWKCQQNSSDGSGKPENICVPPRRERL CTYNLENLKFDKIRDNNAFLADVLLTARNEGEKIVQNHPDTNSSNVCNALERSFADLADIIRG TDQWKGTNSNLEKNLKQMFAKIRENDKVLQDKYPKDQKYTKLREAWWNANRQKVWEVITCGAR SNDLLIKRGWRTSGKSDRKKNFELCRKCGHYEKEVPTKLDYVPQFLRWLTEWIEDFYREKQNL IDDMERHREECTREDHKSKEGTSYCSTCKDKCKKYCECVKKWKTEWENQENKYKDLYEQNKNK TSQKNTSRYDDYVKDFFEKLEANYSSLENYIKGDPYFAEYATKLSFILNPSDANNPSGETANH NDEACNCNESGISSVGQAQTSGPSSNKTCITHSSIKTNKKKECKDVKLGVRENDKDLKICVIE DTSLSGVDNCCCQDLLGILQENCSDNKRGSSSNDSCDNKNQDECQKKLEKVFASLTNGYKCDK CKSGTSRSKKKWIWKKSSGNEEGLQEEYANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCEDVKDINFDT KEKFLAGCLIVSFHEGKNLKKRYPQNKNSGNKENLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKD LELNLQNNFGKLFGKYIKKNNTAEQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNITTCN ADGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFLQEWVENFCEQRQAKVKDVITNCKSCKESGNKCKTE CKTKCKDECEKYKKFIEACGTAGGGIGTAGSPWSKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCG TSSTTNAAASTDENKCVQSDIDSFFKHLIDIGLTTPSSYLSNVLDDNICGADKAPWTTYTTYT TTEKCNKERDKSKSQSSDTLVWNVPSPLGNTPYRYKYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWSC GSARTMKRGYKNDNYELCKYNGVDVKPTTVRSNSSKLDSGR >DT388-IDl-ID2a 3D7 (SEQ ID N0:74)
MGADDWDSSKSFVMENFSSYHGTKPGYVDSIQKGIQKPKSGTQGNYDDDWKGFYSTDNKYDA AGYSVDNENPLSGKAGGWKVTYPGLTKVLALKVDNAETIKKELGLSLTEPLMEQVGTEEFIK RFGDGASRWLSLPFAEGSSSVEYINNWEQAKALSVELEINFETRGKRGQDAMYEYMAQACAG NRVRRSVGSSLSCINLDWDVIRDKTKTKIESLKEHGPIKNKMSESPNKTVSEEKAKQYLEEFH QTALEHPELSELKTVTGTNPVFAGANYAAWAVNVAQVIDSETADNLEKTTAALSILPGIGSVM GIADGAVHHNTEEIVAQSIALSSLMVAQAIPLVGELVDIGFAAYNFVESIINLFQWHNSYNR PAYSPGHKTQPMHEFLSFILNSSDANNPSEKIQKNNDEVCNCNESGIASVEQEQISDPSSNKT CITHSSIKANKKKVCKHVKLGVRENDKDLRVCVIEHTSLSGVENCCCQDFLRILQENCSDNKS GSSSNGSCNNKNQEACEKNLEKVLASLTNCYKCDKCKSEQSKKNNKNWIWKKSSGKEGGLQKE YANTIGLPPRTQSLCLWCLDEKGKKTQELKNIRTNSELLKEWIIAAFHEGKNLKPSHEKKND DNGKKLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQKIFGKLFRKYIKKNNTAEQDTSY SSLDELRESWWNTNKKYIWLAMKHGAGMNSTTCCGDGSVTGSGSSCDDIPTIDLIPQYLRFLQ EWVEHFCKQRQEKVKPVIENCKSCKESGGTCNGECKTECKNKCEVYKKFIEDCKGGDGTAGSS
WVKRWDQIYKRYSKYIEDAKRNRKAGTKNCGPSSTTNAAENKCVQSDIDSFFKHLIDIGLTTP
SSYLSIVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTTEKCNKETDKSKLQQCNTAVWNVPSPLGNTPHGY KYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKNDNYELCKYNGVDVKPTTVRSNSSK LDSGR >DT388-IDl-ID2a FCR3 (SEQ ID N0:75)
MGADDWDSSKSFVMENFSSYHGTKPGYVDSIQKGIQKPKSGTQGNYDDDWKGFYSTDNKYDA AGYSVDNENPLSGKAGGWKVTYPGLTKVLALKVDNAETIKKELGLSLTEPLMEQVGTEEFIK RFGDGASRWLSLPFAEGSSSVEYINNWEQAKALSVELEINFETRGKRGQDAMYEYMAQACAG NRVRRSVGSSLSCINLDWDVIRDKTKTKIESLKEHGPIKNKMSESPNKTVSEEKAKQYLEEFH QTALEHPELSELKTVTGTNPVFAGANYAAWAVNVAQVIDSETADNLEKTTAALSILPGIGSVM GIADGAVHHNTEEIVAQSIALSSLMVAQAIPLVGELVDIGFAAYNFVESIINLFQWHNSYNR PAYSPGHKTQPMHEFNYIKGDPYFAEYATKLSFILNPSDANNPSGETANHNDEACNCNESGIS SVGQAQTSGPSSNKTCITHSSIKTNKKKECKDVKLGVRENDKDLKICVIEDTSLSGVDNCCCQ DLLGILQENCSDNKRGSSSNDSCDNKNQDECQKKLEKVFASLTNGYKCDKCKSGTSRSKKKWI WKKSSGNEEGLQEEYANTIGLPPRTQSLYLGNLPKLENVCEDVKDINFDTKEKFLAGCLIVSF HEGKNLKKRYPQNKNSGNKENLCKALEYSFADYGDLIKGTSIWDNEYTKDLELNLQNNFGKLF GKYIKKNNTAEQDTSYSSLDELRESWWNTNKKYIWTAMKHGAEMNITTCNADGSVTGSGSSCD DIPTIDLIPQYLRFLQEWVENFCEQRQAKVKDVITNCKSCKESGNKCKTECKTKCKDECEKYK KFIEACGTAGGGIGTAGSPWSKRWDQIYKRYSKHIEDAKRNRKAGTKNCGTSSTTNAAASTDE NKCVQSDIDSFFKHLIDIGLTTPSSYLSNVLDDNICGADKAPWTTYTTYTTTEKCNKERDKSK SQSSDTLVWNVPSPLGNTPYRYKYACQCKIPTNEETCDDRKEYMNQWSCGSARTMKRGYKND NYELCKYNGVDVKPTTVRSNSSKLDSGR
Примеры
Пример 1. Продукция усеченных рекомбинантных белков VAR2CSA.
Все усечения белков осуществляли согласно ранее определенным границам доменов (Dahlback M., Jorgensen L.M., Nielsen M.A., Clausen T.M., Ditlev S.B., et al., J. Biol. Chem. 286:15908-15917). Для упрощения заявители разделили домен CIDRPAM на два домена ID2a и ID2b, где ID2a представляет собой Nконцевую часть CIDRPAM, не содержащую CIDR-подобную последовательность, a ID2b соответствует CIDR-подобной последовательности. Заявители также использовали новую границу DBL2X, содержащую 93 аминокислоты ID2a. Для упрощения заявители назвали указанную границу DBL2Xb, в то время как старая граница будет называться DBL2Xa. Праймеры, использованные для клонирования, перечислены в табл. 2. Фрагменты экспрессировались клетками насекомых, зараженных бакуловирусом, в форме растворимых белков, как описано в способе 1. Большинство белков продуцировались на основе генотипа FCR3. Некоторые фрагменты FCR3 не экспрессировались, и вместо них использовалась основа генотипа
- 40 031876
3D7. Белки использовали в анализе взаимозаменяемым образом, поскольку заявители показали, что рекомбинантный VAR2CSA из обоих генотипов в равной степени связывается с CSA. Все белки показали сдвиг мобильности в геле по сравнению с восстановленными и невосстановленными образцами по результатам SDS-PAGE (способ 2). Это согласуется с образованием интрамолекулярных дисульфидных мостиков. Некоторые белки образовывали высокомолекулярные комплексы, обнаруживаемые SDSPAGE в невосстанавливающих условиях. Это происходит, возможно, благодаря образованию интрамолекулярных дисульфидных мостиков между неспаренными цистеинами. Это было подтверждено путем восстановления комплексов до мономерного белка с использованием DDT.
Таблица 2
Праймеры для клонирования.
Праймеры FCR3
Белок Прямой праймер Обратный праймер
IDl-ID2b AACTACATCAAGGGCGAC (SEQ ID N0:76) CTTGTTGATATTGGTGTCGGT (SEQ ID N0:77)
DBLlX-ID2a CACAGCGATAGCGGCAAG (SEQ ID N0:78) GTCCAGCTTGCTGGAGTT (SEQ ID N0:79)
IDl-ID2a AACTACATCAAGGGCGAC (SEQ ID N0:80) GTCCAGCTTGCTGGAGTT (SEQ ID N0:81)
IDl-DBL2Xa AACTACATCAAGGGCGAC (SEQ ID N0:82) AGCGGCGTTGGTGGTGGA (SEQ ID N0:83)
IDl-DBL2Xb AACTACATCAAGGGCGAC (SEQ ID N0:84) GTACTTGTACCGGTAGGG (SEQ ID N0:85)
DBLlX-DBL2Xb CACAGCGATAGCGGCAAG (SEQ ID N0:86) GTACTTGTACCGGTAGGG (SEQ ID N0:87)
Праймеры 3d7
Белок Прямой праймер Обратный праймер
DBL2X-DBL4e CTGACCAACTGCTACAAG (SEQ ID N0:88) GGTCCAGAGGGTACAGCTT (SEQ ID N0:89)
IDl-DBL3e CTGTCCTTCATCCTGAAC (SEQ ID N0:90) TTCAGCGTTGTTGTACTCGTA (SEQ ID N0:91)
IDl-DBL4e CTGTCCTTCATCCTGAAC (SEQ ID N0:92) GTCCAGAGGGTACAGCTT (SEQ ID N0:93)
DBLlX-ID2b CACTCTGACTCTGGCACC (SEQ ID N0:94) AGAGGACTTCATCTTGTTGTTGGT (SEQ ID N0:95)
IDl-ID2b CTGTCCTTCATCCTGAAC (SEQ ID N0:96) AGAGGACTTCATCTTGTTGTTGGT (SEQ ID N0:97)
DBLlX-ID2a CACTCTGACTCTGGCACC (SEQ ID N0:98) GTCCAGCTTAGAGGAGTT (SEQ ID N0:99)
IDl-ID2a CTGTCCTTCATCCTGAAC (SEQ ID N0:100) GTCCAGCTTAGAGGAGTT (SEQ ID N0:101)
DBLlX-DBL2Xa CACTCTGACTCTGGCACC (SEQ ID N0:102) GGCGGCGTTGGTGGTAGA (SEQ ID N0:103)
IDl-DBL2Xa CTGTCCTTCATCCTGAAC (SEQ ID N0:104) GGCGGCGTTGGTGGTAGA (SEQ ID N0:105)
DBLlX-DBL2Xb CACTCTGACTCTGGCACC (SEQ ID N0:106) GTACTTGTATCCGTGGGG (SEQ ID N0:107)
IDl-DBL2Xb CTGTCCTTCATCCTGAAC (SEQ ID N0:108) GTACTTGTATCCGTGGGG (SEQ ID N0:109)
сайты связывания с CSA
PCR1
Фрагмент 1
Белок Прямой Обратный
DBLlX-ID2a (DSM GGTGTCGAAGTTGATGTCGGGCAGATTGCCCAGGTA
делеция) CACAGCGATAGCGGCAAG (SEQ ID N0:110) (SEQ ID N0:111)
Аланин зам. K(626, 629, 630) , AGCTGCGGCCAGATTAGCGCCCTCGTGGAAGGACAC
R(631) CACAGCGATAGCGGCAAG (SEQ ID N0:112) (SEQ ID N0:113)
Аланин зам. AGCGCATTCAGCTGCGGCGTTGGTCTTGATGGAGCT
К(459,460,461,464) CACAGCGATAGCGGCAAG (SEQ ID N0:114) (SEQ ID N0:115)
Фрагмент 2
Белок Прямой Обратный
DBLlX-ID2a (DSM делеция) CACAGCGATAGCGGCAAG (SEQ ID N0:116) GTCCAGCTTGCTGGAGTT (SEQ ID N0:117)
Аланин зам. К(626, 629, 630) , GCTAATCTGGCCGCAGCTTACCCCCAGAATAAGAAC
R(631) (SEQ ID N0:118) GTCCAGCTTGCTGGAGTT (SEQ ID N0:119)
Аланин зам. GCCGCAGCTGAATGCGCTGACGTGAAGCTGGGCGTG
К(459,460,461,464) (SEQ ID N0:120) GTCCAGCTTGCTGGAGTT (SEQ ID N0:121)
PCR2
Конечная конструкция
Белок Прямой Обратный
DBLlX-ID2a (DSM
делеция) CACAGCGATAGCGGCAAG (SEQ ID N0:122) GTCCAGCTTGCTGGAGTT (SEQ ID N0:123)
Аланин зам.
K(626, 629, 630) ,
R(631) CACAGCGATAGCGGCAAG (SEQ ID N0:124) GTCCAGCTTGCTGGAGTT (SEQ ID N0:125)
Аланин зам.
К(459,460,461,464) CACAGCGATAGCGGCAAG (SEQ ID N0:126) GTCCAGCTTGCTGGAGTT (SEQ ID N0:127)
Пример 2. VAR2CSA из FCR3 и 3D7 связывается с CSA со сходной аффинностью и специфичностью.
Инфицированные FCR3 эритроциты (IE) обладают гораздо более сильной адгезией к CSA in vitro по сравнению с 3D7 или NF54 (IE). Если различия связаны с различиями последовательностей экспрессиро- 41 031876 ванного VAR2CSA, информацию можно было бы использовать для определения остатков, вовлеченных в процесс адгезии. Для того чтобы это проверить, заявители получили ряд перекрывающихся 3D7 фрагментов VAR2CSA, идентичных тем, которые ранее заявители испытывали для FCR3.
Сначала белки подвергали скринингу на предмет специфичного связывания с CSPG с использованием твердофазного иммуноферментного анализа (ELISA) (описан в разделе Способ 3). Белки, которые специфичным образом связывались с CSPG, затем дополнительно очищали с использованием вытеснительной хроматографии с получением чистого мономерного белка и подвергали кинетическому анализу с использованием Quartz Crystal Microbalance (Attana A100) (способы 2 и 4 соответственно). 3D7 фрагменты VAR2CSA показали характеристики связывания, весьма сходные с характеристиками их аналогами в FCR3, по результатам твердофазного иммуноферментного анализа. То же самое верно и в отношении кинетического анализа (табл. 3). Сенсограммы показывают данные по ассоциации и диссоциации, полученные при разных концентрациях белка. Это позволяет определить константу скорости ассоциации (Kon), константу скорости диссоциации (Koff) и константу равновесия (KD). Вместе с уровнями пиковых ответов указанные параметры дают оценку аффинности связывания с CSPG. He существует очевидной разницы между фрагментами 3D7 и FCR3. Некоторые фрагменты показывают более низкую аффинность, но указанная характеристика сохраняется у аналогичных фрагментов. Этот факт указывает на то, что у белков VAR2CSA 3D7 и FCR3 фолдинг и функция одинаковые.
Таблица 3
Аффинность связывания с CSA полученных белков VAR2CSA.
Аффинность приводится как величина KD (нМ), определенная в кинетических экспериментах с использованием биосенсора кварцевого кристаллического микробаланса (Attana A100). N/A: белки, KD которых невозможно было определить из-за отсутствия связывания с CSA
FCR3 3D7
Фрагмент VAR2CSA Бакуловирус E. coll Бакуловирус
FV2 5, 2* 8,2
IDl-DBL4e 8, 6* 9, 4
IDl-DBL3e 0,3* 8,5
DBL2X-DBL4e 2,4* 1,2
DBLl-ID2b 1,5*
DBLl-ID2a 8,0 3,5 29, 5
IDl-ID2a 7, 6 18,3 5, 7
DBLlX-DBL2Xb 14, 6
DBLlX-DBL2Xa N/A
IDl-DBL2Xb 21,8
IDl-DBL2Xa N/A
* - белки опубликованы в Dahlback et al., JBC, 2011.
Пример 3. Сайт связывания с CSA ядра лежит в пределах домена DBL2X.
Было высказано предположение о том, что минимальная область связывания с CSA в VAR2CSA лежит в пределах домена DBL2X-ID2b с необходимостью фланкирующих доменов для полного аффинного связывания (Dahlback M., Jorgensen L.M., Nielsen М.А., Clausen T.M., Ditlev S.B., et al., J. Biol. Chem. 286:15908-15917). Заявители подвергли анализу более короткие фрагменты VAR2CSA для дальнейшего составления карты областей, требующихся для связывания с CSA.
Усеченные белки сначала подвергали скринингу на предмет связывания с протеогликаном CSA (CSPG) с использованием ELISA, а затем очищали с получением мономеров для изучения с использованием кварцевого кристаллического микробаланса (способы 3, 2 и 4 соответственно). Минимальной областью связывания является ID1-DBL2Xb (табл. 3). Указанная область показала аффинность связывания 21,8 нМ, что сравнимо с аффинностью связывания полноразмерного белка VAR2CSA.
Плацентарные IE являются высокоселективными в отношении низкосульфатированного плацентарного CSPG. Они не показывают адгезии ни к каким другим гликозаминогликанам (GAG), таким как гепарансульфат (HS). Последнее верно и для рекомбинантного полноразмерного белка VAR2CSA. Анализ твердофазного связывания показал, что фрагменты VAR2CSA, содержащие минимальную область связывания с CSA, специфичным образом связываются с CSA. Для подтверждения данного факта минимальные связывающие фрагменты далее изучались на предмет связывания с протеогликаном гепарансульфатом (HSPG) с использованием кварцевого кристаллического микробаланса (способ 4). Ни один из фрагментов не связывался с HSPG.
Пример 4. Антитела, индуцированные против новых минимальных областей связывания, индуцируют мощный антиадгезивный иммунный ответ в отношении паразитов.
Вакцина против РМ на основе VAR2CSA должна быть способна индуцировать сильный защитный иммунный ответ. Для этого наиболее важным аспектом является образование анти-VAR2CSA антител IgG, способных ингибировать плацентарную секвестрацию. Заявители изучили молекулярный механизм,
- 42 031876 лежащий в основе взаимодействия VAR2CSA-CSA, с целью создания оптимальных вакцинных антигенов. Чтобы изучить, показывают ли полученные заявителями рекомбинантные фрагменты VAR2CSA способность индуцировать блокирующий адгезию иммунный ответ, использовали иммунизацию крыс (способ 6).
Сыворотку, специфичную в отношении фрагмента VAR2CSA, изучали на предмет способности ингибировать адгезию IE к CSPG (способ 11). Антитела, образованные против всех CSA-связывающих фрагментов, представляли собой весьма мощные ингибиторы связывания. Фактически, связывание ингибировалось почти на 100% во всех случаях. DBL1X-DBL2Xa и ID1-DBL2Xa не были хорошими ингибиторами, что согласуется с отсутствием связывания с CSA у указанных фрагментов (табл. 3). Данные предполагают, что CSA-связывающие белки имеют должный фолдинг и поддерживают локализацию определенной выше минимальной области связывания.
Пример 5. Эпитопы, ответственные за индукцию антиадгезивных антител, лежат в пределах минимальной области связывания.
Для того чтобы изучить, направлен ли ингибирующий анти-FV2 ответ на минимальную область связывания, заявители аффинно очищали FV2 антитела на четырех ранее описанных фрагментах VAR2CSA (способ 7). Фрагментспецифичные антитела затем изучали на предмет способности ингибировать связывание экспрессирующих VAR2CSA паразитов с CSPG (способ 11). Антитела, очищенные на иммобилизованных ID1-DBL4e, DBL1X-ID2a и ID1-ID2a, полностью ингибировали адгезию паразитов. Кроме того, истощенные образцы FV2 утрачивают значительную часть своей ингибирующей способности. Это указывает на то, что эпитопы, индуцирующие антиадгезивные антитела, присутствуют в пределах указанных фрагментов. Антитела, очищенные на DBL1X-DBL2Xa, демонстрируют уменьшенную ингибирующую способность, что согласуется с отсутствием связывания с CSA у данного фрагмента (табл. 3). Данные предполагают, что эпитопы, ответственные за индукцию ингибирующих антител, расположены в пределах минимальной области связывания (здесь проиллюстрировано на примере ID1ID2a).
Пример 6. Мутирующие предполагаемые сайты связывания с GAG в минимальной области связывания не оказывают влияния на связывание с CSPG.
Изучение природы взаимодействия между VAR2CSA и CSA является важным для разработки поливалентных вакцин против РМ. Для этого главной частью является идентификация специфичного сайта связывания с CSA и изучение лежащих в основе химических взаимодействий. Анализ последовательности минимальной области связывания с CSA выявил два консервативных предполагаемых сайта связывания с GAG. Один из них расположен в области ID1 и имеет классический мотив Кардена-Вейнтрауба ХВВВХХВХ (Cardin A.D. and Weintraub H.J. (1989) Arteriosclerosis 9, 21-32 (458-NKKKECKD-465). Другой, в DBL2X, имеет тот же обратный мотив (625-GKNLKKRY-632). Также была выдвинута гипотеза о том, что диморфический мотив последовательности (DSM), обнаруженный в N-концевой части DBL2X, участвует в связывании с CSA (Sander A.F., Salanti A., Lavstsen Т., Nielsen M.A., Magistrado P., Lusingu J., Ndam N.T. and Arnot D.E. (2009) PLoS One 4, e6667). Для того чтобы определить, имеют ли указанные предполагаемые сайты функцию связывания с CSA, заявители заменили основные аминокислоты в классических сайтах связывания с GAG аланинами и осуществили делецию десяти аминокислот (590KLENVCEDVK-603) в середине представленной на поверхности петли в пределах области DSM. Все мутации осуществляли во фрагменте DBL1X-ID2a.
Замена основных аминокислот в предполагаемых сайтах связывания с GAG ID1 и DBL2X на аланины не оказала влияния на связывание с CSPG. По результатам ELISA не наблюдалось уменьшения связывания с CSPG по сравнению с белком дикого типа (способ 3). Конструкция с четырьмя заменами на аланины, алании зам. K (459, 460, 461, 464) показал значительное связывание с HSPG, которое могло быть вызвано изменение структуры белка в ответ на мутацию. Два мутанта, аланин зам. K (626, 629, 630), R(631) и аланин зам. K (459, 460, 461, 464), показали кинетику связывания с CSPG, сходную с положительным контролем (способ 4). Это ясно по сходным величинам KD и пиковых ответов.
Делеция области DSM не уменьшала связывания с CSPG (способы 3 и 4). Мутант с нокаутом DSM показывает значительное связывание с HSPG по результатам ELISA. Это, вероятно, вызвано ошибочным клонированием, при котором было утрачено 100 аминокислот DBL1X. Важно, что связывание с CSPG не пострадало.
Пример 7. Связывание VAR2CSA с CSPG не зависит от ионных взаимодействий.
Мутация классических мотивов связывания с GAG Кардена-Вейнтрауба не оказывала влияния на связывание с CSPG. Это указывает на то, что механизм связывания VAR2CSA-CSA отличается от обычного способа связывания сульфата в классических моделях связывания с GAG. Существуют примеры связывающихся с GAG белков, демонстрирующие малую зависимость от ионных взаимодействий с сульфатированной структурой GAG. Для того чтобы определить, так ли это, заявители изучили ионную зависимость в соответствии с полиэлектролитной теорией (Record М.Т., Jr., Lohman M.L. and De Haseth P. (1976) J. Mol. Biol. 107, 145-158).
Гликозаминогликаны, как и ДНК, представляют собой полимеры с высоким зарядом, часто называемые полиэлектролитами. Отрицательно заряженные группы подвергаются высокой степени энергии
- 43 031876 отталкивания внутри каждого полимера. Одновалентные катионы, такие как Na+, взаимодействуют с отрицательно заряженными группами для минимизации энергии отталкивания. Связывание основных аминокислот с сульфатными группами вытесняет связанные катионы и приводит к высвобождению свободной энергии. Благоприятное высвобождение связанных ионов Na+ называется полиэлектролитным эффектом.
Теория гласит, что связывание белка с GAG можно описать следующим образом:
Белок+GAG (m сайтов) θБелок-GAG+m(1-f)Na+, где m представляет собой количество ионов Na+, высвобожденных в результате связывания с одним белком, a f представляет собой фракцию анионов, не экранированных ионами Na+. Согласно теории наблюдающаяся величина KD связана с ионными и неионными вкладами следующим образом:
LogKD,на6людающаяся=LogKD,неионная+m(1-f)Log[Na ]?
где Кпнеионная представляет собой константу диссоциации в отсутствии ионных взаимодействий. График ЬодК^наблюдающаяся против Log[Na+] является линейным с наклоном m(1-f). Так, если фракция неэкранированных анионов (f) известна, можно определить количество ионных взаимодействий, участвующих в связывании. Для гепарина (1-f) составляет 0,8 (Olson S.T., Halvorson H.R. and Bjork I. (1991) J. Biol. Chem. 266, 6342-6352). Данная величина для CSA не известна, но (1-f) не должна превышать 1. Заявители могут, таким образом, установить максимальное количество вовлеченных ионных взаимодействий. Кроме того, когда |№'|=1М. Log[Na+]=0, что означает, что при указанной концентрации Na+ LogKD ,наблюдающаяся’ =LogKD ,неионная.
Заявители изучили связывание FV2, DBL1X-ID2a и ID1-ID2a с CSPG с использованием анализа связывания в твердом состоянии при различных концентрациях NaCl (150 мМ, 200 мМ, 250 мМ, 300 мМ), осуществляя титрование связывания белка 400-1,65 нМ в ряде разведений 1:2 (способ 5). Наблюдающиеся величины KD определяли как концентрацию белка, дающую половину максимального ответа (Bmax). Это осуществляли с использованием нелинейной регрессии (метод наименьших квадратов с наклоном Hill) в Graphpad Prism. Более высокие концентрации соли не включали в анализ, поскольку связывание почти полностью ингибировалось. Это происходило, возможно, вследствие изменения структуры белка. Данное наблюдение подтверждает тот факт, что график LogKD на6людающаяся против Log[Na+] был линейным только между 150 и 300 мМ, что предполагает, что при более высоких концентрациях NaCl играют роль другие факторы.
LogKD на6людающаяся против Log[Na+] демонстрирует линейные взаимоотношения. Наклон m(1-f) находится в пределах от 2,7 для ID1-ID2a до 3,4 для полной длины (FV2). Заявителям не известна величина для f, но максимальное количество ионных взаимодействий, вовлеченных в связывание, должно быть в пределах между 2 и 3. Интересно, что величина для полноразмерного белка выше, чем для коротких фрагментов, что указывает на то, что данный белок осуществляет дополнительное ионное взаимодействие с CSPG. Величины KD при 150 мМ NaCl служат заявителям базисной точкой, поскольку это физиологическая концентрация NaCl. Путем экстраполяции линейного взаимоотношения и нахождения пересечения с у заявители установили, что ^,^^^=5,9 мкМ для FV2, ^^^^=3,4 мкМ для DBL1X-ID2a и KD> неионная=0,7 мкМ для ID1-ID2a. Сравнивая логарифмические величины указанных параметров и базисной точки (150 мМ NaCl), заявители установили, что 25-35% связывания VAR2CSA может быть отнесено на счет ионных взаимодействий. Это предполагает, что высокую аффинность CSA в отношении VAR2CSA нельзя объяснить только ионными взаимодействиями со структурой сульфатированного GAG. Высокая аффинность может достигаться посредством комплексного сайта связывания, осуществляющего поливалентное взаимодействие с углеводным скелетом CSA.
Пример 8. Минимальная область связывания с CSA в VAR2CSA специфичным образом связывается с обширным рядом злокачественных клеток.
Множество различных злокачественных клеток связаны с высокой экспрессией протеогликана CSPG4. Указанную молекулу исходно описывали как маркер меланомы, однако недавно ее обнаружили при многих формах рака, включая злокачественные стволовые клетки. Цепь (цепи) CS, присоединенные к CSPG4, известна как первичный CSA. Один из самых маленьких фрагментов VAR2CSA (ID1-ID2a) изучали на предмет связывания с обширным рядом различных злокачественных клеточных линий посредством проточной цитометрии (способы 12а и 12b). Белок ID1-DBL2Xa, не связывающийся с CSA, использовали в качестве отрицательного контроля. Рекомбинантный белок VAR2CSA (ID1-ID2a) при 75 нМ прочно связывается со всеми злокачественными клеточными линиями, транскрибирующими CSPG4 (данные микроматрицы), включая кожную меланому (С32, MeWo), рак легкого (А549), рак молочной железы (НСС1395), остеосаркому (U2OS, MNNG/HOS), рабдомиосаркому (RH30) (табл. 4 и 5). Указанный белок также прочно связывается с кожной Т-клеточной лимфомой, которая не экспрессирует CSPG4 (табл. 4). Отрицательный контроль ID1-DBL2Xa не связывался ни с одной из тестированных линий (табл. 4). Кроме того, ID1-ID2a не взаимодействовал с красными кровяными клетками человека, которые использовались в качестве контрольных клеток. Клетки яичника китайского хомячка (СНО) дикого типа и с дефицитом GAG также изучали на предмет взаимодействия с ID1-ID2a. Выраженное взаимодействие ID1-ID2a, наблюдавшееся с клетками СНО дикого типа, полностью устранялось при изучении клеточной линии СНО-745, в которой синтез GAG нарушен. CSA-специфичность взаимодействия также была под- 44 031876 тверждена ингибированием связывания VAR2CSA с клетками путем предварительного смешивания
VAR2CSA с CSA, CSC или HS. CSC и HS не оказывали никакого влияния на связывание, в то время как
CSA эффективно устранял связывание VAR2CSA со злокачественными клетками.
После получения указанных результатов более обширный ряд злокачественных клеток был подвергнут скринингу с использованием проточной цитометрии (табл. 6 и 7) с использованием фрагмента VAR2CSA DBL1-ID2a или ID1-ID2a. Главной целью указанного скрининга была идентификация клеточных линий, подходящих для моделирования ксенотрансплантата in vivo.
Таблица 4
Окрашивание злокачественных клеточных линий и клеток отрицательного контроля с использованием минимального домена связывания VAR2CSA (ID 1 -ID2a)
Тип клеток Контроль IDl-DBL2Xa IDl-ID2a
С32 5, 77 6, 94 63, 81
MyLa 2059 5, 61 5, 61 145,35
MyLa 1850 5, 87 5, 6 137,86
Cho WT 3, 09 4,35 34,79
Cho 745 4,24 4,29 4,38
PBMC 1,34 1,36 1, 67
Эритроциты 1,11 1,17 1,07
Клетки инкубировали только со средой (контроль) или с рекомбинантными белками (ID1-DBL2 или ID1-ID2a) при 75 нМ в течение 30 мин с последующей инкубацией с анти-У5-ЕТГС (Invitrogen) при 1:800, клетки трижды промывали перед каждой инкубацией. Показаны средние величины флюоресценции FITC, от минимум 5000 клеток с использованием флоуцитометра FC500 (Becton Dickinson)
Таблица 5
Окрашивание злокачественных клеточных линий с использованием
+ - слабое;
++ - среднее;
+++ - сильное;
++++ - очень сильное.
Клетки инкубировали только со средой (контроль) или с рекомбинантными белками (DBL1-ID2a или ID1-ID2a) при 75 нМ в течение 30 мин с последующей инкубацией с анти-V5-FITC (Invitrogen) при 1:800, клетки трижды промывали перед каждой инкубацией. Показаны средние величины оценки интенсивности флюоресценции FITC, зарегистрированные минимум от 4 изображений полей большой мощности с помощью микроскопа HAL100 Zeiss.
- 45 031876
Таблица 6
Скрининг разных злокачественных клеточных линий человека на предмет связывания с рекомбинантным VAR2CSA (с использованием DBLl-ID2a или ID 1-ID2a)
Тип клеток Контроль VAR2CSA 7 5 нМ VAR2CSA 150 нМ Комментарии
MeWo НО + + + + + + + Меланома
(фибробластная морфология, получено из лимфоузла)
А549 НО + + + + + + Аденокарцинома легкого (K-RasG12S)
НСС1395 НО Инвазивный рак протоков молочной железы TNM стадия 1 степень 3, без метастазов в лимфоузлах; Нег2нег., ER-нег., PRнег. (тройной негативный)
RH3 0 НО Рабдомиосаркома (ТРр53 негативная; гибрид PAX7-FOXO1A позитивная; высокая геномная нестабильность (> 50 хромосомных реаранжировок))
MNNG НО Остеосаркома от 13летней белой девочки (TPR-Met позитивная)
U2OS НО Остеосаркома от 15летней белой девочки (IGF-R1 и IGFR-II позитивная; ТРр53 wt, pRb wt, р16-нег.; высокая анеуплоидность)
Н1792 НО ++ ++ Аденокарцинома
легкого (К— RasG12S:TPp53het)))
MDA-MD-435 НО + + Рак молочной железы меланоцитарного происхождения (ERнег., Нег2-поз., PR-поз.)
MG63 НО +++ ++++ Остеосаркома
ТС32 НО + + ++ Саркома Эвинга
CHLA9 НО ++ + + Саркома Эвинга
CHLA10 НО ++ + + Саркома Эвинга
ТС71 но ++ ++ Саркома Эвинга
HOS но +++ ++++ Остеосаркома
РСЗ но + + ++ Рак предстательной железы
SKNMC но ++ +++ Саркома Эвинга
MCF-7 но + ++ Рак молочной железы
НО - нет окрашивания;
+ - слабое;
++ - среднее;
+++ - сильное;
++++ - очень сильное.
Связывание измеряли проточной цитометрией, как описано в способе 12.
- 46 031876
Таблица 7
Скрининг дополнительных злокачественных клеточных линий человека на предмет связывания с рекомбинантным VAR2CSA (с использованием DBLl-ID2a или ID1-ID2a)
Связывание измеряли проточной цитометрией, как описано в способе 12. Показаны средние величины интенсивности флюоресценции при концентрации белка 200 нМ.
Пример 9. Рекомбинантный VAR2CSA связывается со злокачественными клетками с высокой аффинностью.
Аффинность связывания рекомбинантного фрагмента VAR2CSA DBL1-ID2a со злокачественными клеточными линиями, меланомой С32 и двумя клеточными линиями Cho (описанными в примере 8), изучали с использованием биосенсора кварцевого кристаллического микробаланса (Attana Cell200). Серии двукратных разведений (25-400 нМ) белка анализировали на предмет связывания с клеточной поверхностью, с регенерацией связывающей поверхности перед каждой новой инъекцией белка. Аффинность связывания была определена как лежащая в наномолярных пределах (табл. 8), что сходно с аффинностью связывания с чистым рецептором (табл. 3).
- 47 031876
Таблица 8 Установленная аффинность связывания (KD) рекомбинантного DBL1-ID2a (E.coli) со злокачественными клетками, экспрессирующими CSA (C32 и Cho WT), и отсутствие связывания с CSA-отрицательной клеточной линией (Cho 745) N/A: KD невозмо^о было определить из-за отсутствия связывания с клетками
Тип клеток KD (нМ)
Клетки меланомы С32 13
Cho WT 1,4
Cho 745 N/A
Пример 10. Рекомбинантный белок VAR2CSA связывается со злокачественной тканью с высокой специфичностью.
Связывание рекомбинантного VAR2CSA с первичной злокачественной тканью, полученной от пациентов-людей, изучали с использованием иммуногистохимии (IHC). Способ был разработан с использованием ткани плаценты человека в качестве положительного контроля и ткани миндалины и печени в качестве отрицательного контроля. Протокол окрашивания был оптимизирован на платформе Ventana Discovery XT без восстановления эпитопов. Залитую парафином ткань, помещенную на предметные стекла, инкубировали с 0,1-500 нМ V5-VAR2CSA (ID1-ID2a) или V5-контрольного белка (DBL4) в течение 1 ч при комнатной температуре, промывали в течение 8 мин. Связанные анти-У5 затем выявляли с использованием антимышиных HRP UltraMap. V5-VAR2CSA окрашивает плаценту человека при концентрациях 0,5 нМ, при отсутствии окрашивания миндалины или нормальной печени. Окрашивание можно полностью блокировать добавлением 200 мкг/мкл CSA в реакционный буфер. V5-контрольный белок не окрашивает плаценту человека ни в каких изученных концентрациях. Мультиорганная тканевая микроматрица (ТМА), представляющая 24 нормальных органа, показала слабое окрашивание или отсутствие окрашивания при использовании 1 нМ V5-VAR2CSA, в то время как злокачественные образцы молочной железы, толстой кишки, прямой кишки, предстательной железы, почки, печени, мочевого пузыря, поджелудочной железы, плоских клеток, легкого, желчного пузыря, желудка, семенника, яичника, матки, надпочечника, щитовидной железы и тимуса, гематопоэтической системы и соединительной ткани (саркомы) окрашивались положительно с интенсивностью, равной или более высокой, чем ткань плаценты человека, служившая положительным контролем (табл.9).
Таблица 9 Обнаружение CSA на образцах первичных опухолей человека с использованием рекомбинантного VAR2CSA. Таблица показывает количество положительных/общее количество случаев, окрашенных, как описано в примере 10, для основных групп рака. Положительное окрашивание определяют как интенсивность, равную или превышающую интенсивность, которая наблюдалась в ткани плаценты
Рак предстательной железы 71/76
Рак молочной железы 64/75
Меланома 5/6
Саркома 23/25
Плоскоклеточный рак пищевода 2/3
Аденокарцинома желудка 3/3
Рак толстой кишки 2/3
Аденокарцинома прямой кишки 3/3
Рак печени 3/3
Рак почки 3/3
Рак легкого 2/3
Рак шейки матки 3/3
Рак яичника 2/3
Диффузная В-клеточная лимфома 1/3
Астроцитома 3/3
Рак поджелудочной железы 3/3
Пример 11. Ингибирование параметров трансформации in vitro рекомбинантными белками VAR2CSA.
Ингибирующее действие неприсоединенного VAR2CSA на морфологию опухолевых клеток in vitro изучали тремя различными способами:
i) Анализ колониеобразования на мягком агаре определяет, может ли VAR2CSA ингибировать способность злокачественных клеток пролиферировать в трехмерном матриксе.
ii) Анализ миграции определяет, может ли VAR2CSA ингибировать способность злокачественных
- 48 031876 клеток мигрировать вертикально в направлении хемоаттрактанта в камере Бойдена.
iii) Анализ инвазии определяет, может ли VAR2CSA ингибировать способность злокачественных клеток проникать через искусственную базальную мембрану.
Анализ колониеобразования на мягком агаре: Клетки обрабатывают 25-100 нМ VAR2CSA в течение 24 ч перед засеванием на матрикс из мягкого агара и оставляют на 10-12 дней при 37°C. Изображения фиксируют с помощью фазово-контрастного микроскопа и дают ему количественную оценку с использованием компьютерной программы ImageJ. Рекомбинантный VAR2CSA ингибирует образование на мягком агаре колоний клетками остеосаркомы MG63 и рабдомиосаркомы RH30 в концентрациях от 75 до 150 нМ.
Анализ инвазии клеток с использованием покрытия из экстракта базальной мембраны (ВМЕ).
Для моделирования инвазивного процесса заявители использовали 24-луночную платформу для клеточной инвазии с покрытием ВМЕ CultreCoat® (Cedarlane) в соответствии с инструкциями производителя и со следующими модификациями. Клетки лишали сыворотки на один день до проведения анализов в присутствии или отсутствие 25-100 нМ VAR2CSA. На второй день клетки, поддерживавшиеся в описанных выше условиях, высевали на верхние камеры (1х105 клеток на лунку) планшетов, среды с добавлением 10% ФБС, в то время как нижние камеры содержали или среды, лишенные сыворотки, в качестве отрицательного контроля, или среды с добавлением 10% ФБС. Клетки затем инкубировали в течение еще 18 ч. Клетки, проникшие через ВМЕ, собирали с использованием буфера диссоциации, содержавшего кальцеин AM, который в живых клетках превращается в соединение с сильной флюоресценцией. Испускаемую флюоресценцию измеряли с использованием планшет-ридера флюоресценции, анализировали с использованием компьютерной программы FLUOStar, совмещали со стандартной кривой и конвертировали в соответствующее количество клеток.
Анализ миграции.
Анализ миграции представляет собой практически ту же методику, что и анализ инвазии клеток с использованием покрытия из экстракта базальной мембраны (ВМЕ), но без ВМЕ.
Миграцию и инвазивную способность клеток остеосаркомы MG63, рабдомиосаркомы RH30 и тройного негативного рака молочной железы MDA-MB-2 31 ингибировал рекомбинантный VAR2CSA в концентрациях 75-150 нМ.
Пример 12. Анализ внутриклеточных сигнальных явлений, контролирующих параметры трансформации злокачественных клеток, регулируемых CSA-содержащими протеогликанами.
CSPG4 облегчает пролиферацию, миграцию и инвазию посредством Ras-, Rac1- и PI3киназазависимого механизма. На основе результатов, полученных в примере 10, заявители будут изучать внутриклеточные сигнальные явления, ведущие к потенциальному VAR2CSA-опосредуемому ингибированию пролиферации, миграции и инвазии. Это сделано с использованием новейших методов биохимии и молекулярной биологии, включая, без ограничения, анализы активности Rac1, иммуноблоттинг компонентов пути и внутриклеточные измерения генерации активных форм кислорода (ROS). Указанная линейка экспериментов прояснит сигнальные пути, на которые влияет связывание VAR2CSA с CSAсодержащими протеогликанами.
Анализ активности Rac1.
Анализы активности Rac1 осуществляют на подходящих линиях злокачественных клеток человека, необработанных или обработанных рекомбинантным VAR2CSA, согласно протоколам производителей (Thermo Scientific).
Анализы активных форм кислорода (ROS).
Исходные уровни ROS измеряют посредством CM-H2DCFDA (Invitrogen) в соответствии с инструкциями производителя. Уровни супероксида будут измеряться с использованием дигидроэтидия (DHE). В присутствии супероксид-аниона O2- дигидроэтидий быстро окисляется до оксиэтидия, который связывается с ДНК и испускает свет в диапазонах 570-580 нм, когда возбуждается при 488 нм. Для клеточной культуры после соответствующих обработок клетки промывают в сбалансированном солевом растворе Хенкса (HBSS), инкубируют в течение 30-60 мин в HBSS, содержащем 10 мкМ DHE, промывают в HBSS и непосредственно анализируют на предмет флюоресценции оксиэтидия с использованием эпифлюоресцентного микроскопа HAL100 (Zeiss). Для получения срезов опухолей мгновенно замороженные опухоли нарезают на 20 мкм секции с использованием криостата, промывают и обрабатывают DHE, как описано для клеточных линий, помещают на покровные стекла и анализируют, как описано для клеточных линий. Эмиссию оксиэтидия анализируют и подвергают количественной оценке с использованием компьютерной программы ImageJ. Для всех образцов опухолей осуществляли окрашивание гематоксилин-эозином (Н&Е) рядами для верификации целостности и патологии тканей с использованием стандартных методик. Предварительные данные показывают, что рекомбинантный VAR2CSA ингибирует генерацию ROS в клетках MG63 и U2OS.
Иммунодетекция.
Для иммуноблоттинга белки, разделенные с использованием SDS-PAGE и перенесенные на мембрану из нитроцеллюлозы, обнаруживали с использованием соответствующих первичных и подходящих
- 49 031876 вторичных антител, реагентов для вестерн-блоттинга ECL (Thermo Scientific) и пленки (Kodak и Covance (НА). Для микроскопии клетки фиксируют в 4%-ном формальдегиде, инкубируют с соответствующими вторичными FITC-конъюгированными антителами и анализируют под микроскопом, как описано в примере 9. Злокачественные клеточные линии человека (MDA-MB-231, MG63, U2OS, ТС32, ТС71 и RH30) были лишены сыворотки на 24 ч с рекомбинантным VAR2CSA (ID1-ID2a) или контрольным белком (DBL4) и лизатами, полученными через 0, 1, 2, 3, 4, 5, 5 и 12 ч после повторного добавления сыворотки к клеткам. При использовании указанного подхода 100 нМ VAR2CSA эффективно ингибировал фосфорилирование протоонкогенной тирозиновой протеинкиназы Src на Т416, фосфорилирование киназы фокальной адгезии (FAK) на Т397, 1- и 2-фосфорилирование внеклеточной сигнал-регулируемой киназы (ERK) на Thr202/Tyr204 для ERK1 человека и на Thrl85/Tyrl87 для ERK2 человека. Это предполагает, что рекомбинантный VAR2CSA ингибирует канонический сигналинг ERK в злокачественных клетках.
Пример 13. Несмещенный анализ событий внутриклеточного сигналинга, модифицированных рекомбинантным VAR2CSA.
Обширное влияние VAR2CSA на события внутриклеточного сигналинга можно анализировать с использованием способа микроматрицы экспрессии. Клетки остеосаркомы MG63 были лишены сыворотки на 24 ч без обработки с VAR2CSA или с контролем (DBL4), и РНК собирали через 1 ч после добавления сыворотки. Общую РНК подвергали качественной оценке (RIN<8), использовали в качестве матрицы для зондовой конструкции Affymetrix® и гибридизировали с системой чипов Affymetrix U133Aplus2.0®. Указанное считывание показаний обеспечивает моментальное изображение активированных или неактивированных сигнальных путей через 1 ч после повторного добавления сыворотки. Предварительные данные подтвердили ингибирующее действие на сигналинг ERK.
Пример 14. Ингибирование роста злокачественных клеток in vivo рекомбинантными белками VAR2CSA.
На основе результатов анализа in vitro будут отобраны подходящие клеточные линии для in vivo подкожных и метастатических трансплантационных моделей у иммунокомпрометированных мышей. Перед исследованием in vivo ставятся следующие вопросы:
i) Может ли в/в или и/п введенный рекомбинантный VAR2CSA обнаружить и связаться со злокачественными клетками человека in vivo?
ii) Может ли в/в или и/п введение рекомбинантного VAR2CSA ингибировать образование опухолей in vivo?
iii) Может ли в/в или и/п введение рекомбинантного VAR2CSA ингибировать рост уже имеющихся опухолей in vivo?
iv) Может ли в/в или и/п введение рекомбинантного VAR2CSA ингибировать метастатическое распространение злокачественных клеток человека in vivo?
v) Изменяет ли в/в или и/п введение рекомбинантного VAR2CSA события сигналинга, управляемые CSA-содержащими протеогликанами, в злокачественных клетках человека in vivo (посмертную патологию и биохимию)?
Модели in vivo.
Отобранные злокачественные клеточные линии человека, представляющие типы злокачественных новообразований, демонстрирующие сильное связывание с VAR2CSA, инокулируют подкожно иммунокомпрометированным мышам Rag2m или SCID в количестве приблизительно 5х106 клеток на животное. Когда опухоль разовьется, мыши получают первую инъекцию носителя (физиологический раствор) и рекомбинантного VAR2CSA (1 мг/кг). Лечение повторяют один раз в неделю в течение экспериментального периода продолжительностью приблизительно 30 дней. Массу тела животных и объемы опухолей измеряют каждый второй или третий день, и по завершении опухоли удаляют и разделяют на две половины, одну из которых мгновенно замораживают в жидком азоте, а другую половину фиксируют в парафине. Мгновенно замороженные опухоли обрабатывают для детекции супероксида (DHE), как описано в примере 11 (вместе с соответствующим окрашиванием тех же образцов опухолей гематоксилин-эозином [Н&Е]).
Пример 15. Отслеживание микрометастазов in vivo пептидами рекомбинантного VAR2CSA с прикрепленным индикатором.
Рекомбинантный VAR2CSA будет прикрепляться к различным подходящим молекуламиндикаторам при сотрудничестве с зарубежными партнерами или в другом учреждении на контрактной основе. Отслеживаемые молекулы рекомбинантного VAR2CSA анализируют на способность обнаруживать и сообщать о микрометастазах у мышей с ксенотрансплантатами и у трансгенных мышей. In vivo модели получали, как описано в примере 12. Для тестирования VAR2CSA с прикрепленным индикатором in vivo мышей с метастатическим раком обследовали с использованием визуализации in vivo на способность VAR2CSA обнаруживать и связываться с микрометастазами.
Пример 16. Интернализация рекомбинантных белков VAR2CSA.
Рекомбинантный VAR2CSA интернализируется злокачественными клетками. Это было показано сначала конъюгированием фрагмента VAR2CSA (DBL1-ID2a) с флюорофором, а затем изучением захва
- 50 031876 та VAR2CSA как при прижизненной визуализации, так и на фиксированных клетках. Злокачественные клеточные линии (меланому С32 и MDA-MB-231) засевали и выращивали в течение ночи до 60-80% конфлюэнтности. Клетки инкубировали с флюорофор-конъюгированным VAR2CSA в течение 10-15 мин при 4°C для связывания VAR2CSA на поверхности. Клетки затем промывали для удаления несвязанного VAR2CSA, а затем инкубировали при 37°C для того, чтобы инициировать интернализацию, в течение 10 мин, 1, 2, 4 ч и до 22 ч. Флюорофорконъюгированный трансферрин использовали для следующего классического клатринзависимого захвата трансферрина, оказывающегося в лизосомах. Кроме того, в некоторых экспериментах флюорофорконъюгированный декстран использовали для детекции лизосом. Анализ прижизненной визуализации показал, что VAR2CSA начинает достигать лизосом приблизительно через 4 ч, а через 22 ч весь VAR2CSA может локализоваться в лизосомальных компартментах. Однако совместная локализация VAR2CSA и трансферрина наблюдалась редко, и VAR2CSA захватывался гораздо медленнее, чем трансферрин. Тот факт, что рекомбинантный VAR2CSA захватывается злокачественными клетками, позволяет заявителям гибридизировать или конъюгировать VAR2CSA с цитотоксическими соединениями, которые становятся активными внутри злокачественной клетки. В табл. 10 суммированы результаты по указанным злокачественным клеточным линиям, тестированным на интернализацию рекомбинантного VAR2CSA.
Система оценки:
+ - слабая;
++ - средняя;
+++ - сильная;
++++ - очень сильная.
Клетки инкубировали только со средой (контроль) или с рекомбинантными белками (DBL1-ID2a или ID1-ID2a) в концентрации 75 нМ в течение 1ч с последующей инкубацией с анти-V5-FITC (Invitrogen) в разведении 1:800, перед каждой инкубацией клетки трижды промывали. Показаны средние величины оценки интенсивности флюоресценции FITC на плазматической мембране или во внутриклеточных структурах, зарегистрированные минимум от 4 изображений полей большой мощности с помощью микроскопа HAL100 Zeiss.
Пример 17. Слитый белок VARZCSA-токсин убивает злокачественные клетки.
Фрагменты гена VAR2CSA DBL1-ID2a и ID1-ID2a сливали с экзотоксином A. Pseudomonas и дифтерийным токсином в качестве различных конструкций (SEQ ID NO:60-70, 72). Указанные слитые белки VARZCSA-токсин экспрессировались в E.coli. Конструкция белка, названная BPTI-ID1-ID2aFCR3PE38LR (SEQ ID NO:60), которая основана на ID1-ID2a из VAR2CSA и РЕ38, была успешно получена и изучена на предмет связывания со злокачественными клетками (табл. 11), а также на предмет цитотоксичности, как описано в способе 13.
Предварительные данные показывают, что указанный слитый белок VAR2CSA-токсин связывается с экспрессирующими CSA злокачественными клетками и способен вызвать смерть клетки (IC50 для клеточной линии U20S составляет менее 1 нМ).
Таблица 11
Связывание VAR2CSA-PE38 со злокачественными клетками, проанализированное с использованием проточной цитометрии
DBLl-ID2a IDl-ID2a-PE38 Контроль
Связывание с клетками 24,7 12,4 2,3
Связывание с обработанными клеткамиа 4,4 2,5 2,5
Ингибирование связывания13 3,2 2,1 -
- 51 031876
Связывание DBL1-ID2a (голого белка) и ID1-ID2a-PE38 в концентрации 200 нМ с клетками Myla2059 (Т-клеточной лимфомы) обнаруживали с помощью анти-PENTA HIS антитела и антимышиного-FITC антитела и анализировали с использованием проточной цитометрии. Связывание приводится как средняя интенсивность флюоресценции (MFI). а) клетки обрабатывали хондроитиназой ABC для удаления цепей CS с клеточной поверхности, b) белок смешивали с растворимым CSA (400 мкг/м) перед добавлением к клеткам, с) контроль равен клеткам, окрашенным только первым и вторым слоями антител.
Пример 18. Изучение противоопухолевого эффекта цитотоксических соединений, прикрепленных к рекомбинантному VAR2CSA.
На основе результатов примера 14, рекомбинантный VAR2CSA попытаются прикрепить к соответствующим цитотоксическим соединениям и испытать его действие in vivo. Прикрепление соответствующих соединений к VAR2CSA будет осуществляться при сотрудничестве с зарубежными партнерами или в другом учреждении на контрактной основе. В частности, заявители изучают, могут ли указанные гибриды VAR2CSA-соединение:
i) доставляться специфичным образом в окружении опухоли in vivo;
ii) концентрироваться и сохранять специфичность в окружении опухоли in vivo;
iii) специфичным образом убивать опухолевые клетки с минимальным повреждением нормальных тканей in vivo.
In vivo модели получали, как описано в примере 12. Мышей лечили цитотоксическими конъюгатами VAR2CSA, а эффект изучали, как описано для неконъюгированного белка в примере 12.
Пример 19. Выделение CSA-экспрессирующих стволовых клеток из гетерогенных клеточных популяций.
Плюрипотентные стволовые клетки, как сообщается, экспрессируют высокие уровни CSPG4. Стволовые клетки также экспрессируют другие содержащие CSA протеогликаны, такие как CD44, с которым может связываться VAR2CSA. Соответственно рекомбинантный VAR2CSA будет конъюгирован с подходящей смолой (гранулами), смешан с гетерогенными, но состоящими из стволовых клеток или содержащими злокачественные стволовые клетки клеточными популяциями, и очищен с использованием обычных протоколов центрифугирования. Выделенные клетки будут изучаться на предмет экспрессии разнообразных маркеров стволовых клеток, включая CD44, CD31, CD4, ОСТ4, SOX2, Nestin и Nanog, с использованием иммуноблоттинга (как в примере 11), микроскопии и FACS (как в примере 9). Характерной чертой злокачественных стволовых клеток является высокая экспрессия альдегиддегидрогеназы 1А (ALDH1 High). Ее можно удобно измерить с использованием набора AldeFluor® (Stem Cell Technologies). Связывание рекомбинантного VAR2CSA с MDA-MB-2 31 выявляет субпопуляцию клеток ALDH1 High, что предполагает, что VAR2CSA может связываться со злокачественными стволовыми клетками человека.
Пример 20. Идентификация и нацеливание CD44-экспрессирующих злокачественных стволовых клеток.
CD44 в настоящее время является наиболее популярным маркером злокачественных стволовых клеток, и именно с CSA-содержащим протеогликаном может связываться рекомбинантный VAR2CSA. С использованием тех же подходов, что и в примерах 12-15, будет изучено, могут ли немодифицированные и модифицированные пептиды VAR2CSA локализовываться, связываться, выделять и потенциально убивать высокорезистентные CD-44-положительные злокачественные стволовые клетки.
Пример 21. Детекция циркулирующих опухолевых клеток.
Заявители будут изучать, можно ли использовать рекомбинантный VAR2CSA в качестве прогностического маркера рецидивов рака. Злокачественные клетки распространяются посредством кровеносной системы после отсоединения от первичной опухоли. Последующим риском циркулирующих опухолевых клеток (СТС) является экстравазация и метастазирование. Современные анализы, используемые для обнаружения СТС, имеют низкую чувствительность и не могут непосредственно коррелироваться с риском появления метастазов. Используя магнитные гранулы с прикрепленным VAR2CSA и проточную цитометрию, заявители будут изучать прогностическую ценность детекции CS-экспрессирующих злокачественных клеток в кровотоке. Указанный способ можно было бы использовать в качестве быстрого и безболезненного обследования пациентов.
Пример 22. Идентификация потенциальных молекул CSPG, на которые был нацелен VAR2CSA.
Рекомбинантный белок VAR2CSA (DBL1-ID2a) с меткой V5 подвергался скринингу на связывание с панелью трансфицированных клеток HEK293, экспрессирующих >3000 мембранных рецепторов человека. Ряд из 25 рецепторов был идентифицирован как потенциальные мишени VAR2CSA (табл. 12). Взаимодействие между VAR2CSA и указанными рецепторами будет дополнительно подтверждено анализом специфичности связывания, через ингибирование CSA и HS, оба в системе HEK293 и в ELISA.
- 52 031876
Таблица 12
Рецепторы, которые были экспериментально идентифицированы в качестве потенциальных мишеней VAR2CSA
Ген ID Название UniProt/SwissProt
В CAN Бревикан PGCB HUMAN, Q96GW7
BDKRB2 Брадикининовый рецептор В2 BKRB2 HUMAN, P30411
СА9 Угольная ангидраза IX CAH9 HUMAN, Q16790
CCR10 Хемокиновый (мотив С-С) рецептор 10 CCR10 HUMAN, P46092
CD44 Молекула CD44 (индийская группа крови) CD44 HUMAN, P16070
CDH8 Кадхерин 8, тип 2 CADH8 HUMAN, P55286
CFB Фактор комплемента В CFAB HUMAN, P00751
GABBR2 Рецептор гамма- аминомасляной кислоты В (GABA), 2 GABR2 HUMAN, 075899
GPC3 Глипикан 3 GPC3 HUMAN, P51654
GPC5 Глипикан 5 GPC5 HUMAN, P78333
GPR65 Рецептор, соединенный с Gбелком, 65 PSYR HUMAN, Q8IYL9
GPRC5B Рецептор, соединенный с G- белком, семейство С, группа 5, член В GPC5B HUMAN, Q9NZH0
KCNA2 Калиевый потенциалозависимый канал, подсемейство shaker-related, член 2 KCNA2 HUMAN, P16389
PKD2 Поликистозная болезнь почек 2 (аутосомная доминанта) PKD2 HUMAN, Q13563
PODXL2 Подокаликсин- подобный 2 PDXL2 HUMAN, Q9NZ53
PTPRG Протеин тирозин фосфатаза, тип рецептора, G PTPRG HUMAN, P23470
S100A9 S100 кальций- связывающий белок А9 S10A9 HUMAN, P06702
SDC1 Синдекан 1 SDC1 HUMAN, P18827
SDC4 Синдекан 4 SDC4 HUMAN, P31431
STX2 Синтаксин 2 STX2 HUMAN, P32856
STXBP5 Синтаксин- связывающий белок 5 (томозин) STXB5 HUMAN, Q5T5C0
TGFBR3 Трансформирующий фактор роста, бета рецептор III TGBR3 HUMAN, Q03167
TMEFF1 Трансмембранный белок с EGF-подобным и двумя фоллистатинподобными доменами 1 TEFF1 HUMAN, Q8IYR6
TMEFF2/TENB2 Трансмембранный белок с EGF-подобным и двумя фоллистатинподобными доменами 2 TEFF2 HUMAN, Q9UIK5
ТМЕМ154 Трансмембранный белок 154 (Нет)
- 53 031876
Ген ID Название UniProt/SwissProt
BCAN Бревикан PGCB HUMAN, Q96GW7
BDKRB2 Брадикининовый рецептор В2 BKRB2 HUMAN, P30411
CA9 CCR10 CD44 CDH8 CFB GABBR2 GPC3 GPC5 GPR65 Угольная ангидраза IX Хемокиновый (мотив С-С) рецептор 10 Молекула CD44 (индийская группа крови) Кадхерин 8, тип 2 Фактор комплемента В Рецептор гамма- аминомасляной кислоты В (GABA), 2 Глипикан 3 Глипикан 5 Рецептор, соединенный с G- белком, 65 CAH9 HUMAN, Q16790 CCR10 HUMAN, P46092 CD44 HUMAN, P16070 CADH8 HUMAN, P55286 CFAB HUMAN, P00751 GABR2 HUMAN, 075899 GPC3 HUMAN, P51654 GPC5 HUMAN, P78333 PSYR HUMAN, Q8IYL9
GPRC5B Рецептор, соединенный с G- белком, семейство С, группа 5, член В GPC5B HUMAN, Q9NZH0
KCNA2 Калиевый потенциалезависимый канал, подсемейство shaker-related, член 2 KCNA2 HUMAN, Pl 6389
PKD2 Поликистозная болезнь почек 2 (аутосомная доминанта) PKD2 HUMAN, Q13563
P0DXL2 Подокаликсин- подобный 2 PDXL2 HUMAN, Q9NZ53
PTPRG Протеин тирозин фосфатаза, тип рецептора, G PTPRG HUMAN, P23470
S100A9 S100 кальций- связывающий белок А9 S10A9 HUMAN, P06702
SDC1 Синдекан 1 SDC1 HUMAN, P18827
SDC4 Синдекан 4 SDC4 HUMAN, P31431
STX2 Синтаксин 2 STX2 HUMAN, P32856
STXBP5 Синтаксин- связывающий белок 5 (томозин) STXBP5 HUMAN, Q5T5C0
TGFBR3 Трансформирующий фактор роста, рецептор бета III TGBR3 HUMAN, Q03167
TMEFF1 Трансмембранный белок с EGF-подобным и двумя фоллистатин- TEFF1 HUMAN, Q8IYR6
подобными доменами 1
TMEFF2/TENB2 Трансмембранный белок с EGF-подобным и двумя фоллистатинподобными доменами 2 TEFF2 HUMAN, Q9UIK5
TMEM154 Трансмембранный белок 154 (Нет )
THBD Тромбомодулин TRBM HUMAN, P07204
CSPG5 Протеогликан хондроитинсульфат 5 (нейрогликан С) CSPG5 HUMAN, 095196
STXBP5 Синтаксин- связывающий белок 5 (томозин) STXB5 HUMAN, Q5T5C0
- 54 031876
Обсуждение.
Малярия представляет собой одно из наиболее распространенных инфекционных заболеваний и одну из самых больших глобальных проблем здоровья. Беременные женщины особенно чувствительны к инфекции, несмотря на ранее приобретенный иммунитет. В данном исследовании заявители поставили ключевые вопросы, связанные с молекулярным механизмом, лежащим в основе взаимодействия VAR2CSA-CSA при РМ.
Предыдущая работа предполагала, что минимальной областью связывания с CSA в VAR2CSA является DBL2X-ID2b с потребностью в DBL1X или DBL3X полного аффинного связывания (Dahlback M., Jorgensen L.M., Nielsen M.A., Clausen T.M., Ditlev S.B., Resende M., Pinto V.V., Arnot D.E., Theander T.G., and Salanti A.J. Biol. Chem. 286, 15908-15917). Как продолжение указанной работы заявители осуществили дальнейшие усечения VAR2CSA, фокусируясь на область DBL2X. Заявители показали, что ядерный CSA-связывающий сайт лежит в пределах домена DBL2X, содержащего малые части фланкирующих междоменных областей. Связывание не зависит от области ID2b или от DBL1X или от фланкирующих доменов DBL3X, как предполагалось ранее. Это является очевидным из специфичного CSPG-связывания ID1-ID2a и ID1-DBL2Xb (табл. 3). Минимальной областью связывания является ID1-DBL2Xb, которая связывается с CSPG с характеристиками, сравнимыми с характеристиками полноразмерного VAR2CSA.
Интересно, что указанные новые данные помещают ядерный сайт связывания с CSA в одиночный домен. Связывание DBL2X (и любого другого одиночного домена DBL) с CSA, как было показано ранее, является неспецифичным и имеет слабую аффинность (Resende M., Ditlev S.B., Nielsen M.A., Bodevin S., Bruun S., Pinto V.V., Clausen H., Turner L., Theander T.G., Salanti A. and Dahlback M. (2009) Int. J. Parasitol. 39, 1195-1204). Понятно, что ID1 и части ID2a интердоменов являются существенными для связывания с CSA. DBL1X-DBL2Xa и ID1-DBL2Xa не связываются с CSPG. Две С-концевых границы DBL2X (DBL2Xa и DBL2Xb) отличаются между собой 93 аминокислотами. Поскольку делеция указанных аминокислот устраняет связывание, они должны быть важными для связывания с CSA.
Минимальная область связывания ID1-DBL2Xb гораздо меньше полноразмерного VAR2CSA и имеет молекулярную массу лишь 62 кДа. Маловероятно, что дальнейшие существенные усечения VAR2CSA будут функциональными в смысле связывания с CSA. Данные заявителей повторно определяют DBL2X как более длинный функциональный домен, содержащий части фланкирующих интердоменов ID1 и ID2a.
Вакцина против РМ на основе VAR2CSA должна обладать способностью индуцировать мощный защитный иммунный ответ. В данном вопросе наиболее важным аспектом является генерация антител IgG, способных ингибировать специфичную в отношении плаценты адгезию паразитов. Для изучения иммуногенных характеристик полученных фрагментов заявители использовали их для иммунизации крыс. Сыворотки, полученные против всех фрагментов, содержащих сайт связывания с CSA, ингибировали адгезию паразитов к CSA. Важно, что сыворотки, полученные против ID1-ID2a, демонстрировали почти полное ингибирование. Это предполагает, что минимальные CSA-связывающие фрагменты сохраняют способность индуцировать мощный антиадгезионный иммунный ответ. Данное заключение было дополнительно подтверждено тем фактом, что антитела, выделенные из анти-FV2 сыворотки на ID1ID2a, сохраняли большую часть блокирующей адгезию активности, и что анти-FV2 образец с истощением анти-ID1-ID2a антител утрачивал большую часть своей активности. Это указывает на то, что эпитопы, требующиеся для индукции блокирующих адгезию антител, располагаются в пределах указанной области.
В данном исследовании заявители изучали анти-VAR2CSA сыворотки на предмет гомологичного ингибирования связывания паразитов FCR3 с CSA. Важно, что вакцина является способной ингибировать плацентарную адгезию вне зависимости от происхождения штамма паразита. Главной проблемой при разработке вакцины, таким образом, является высокое межклональное разнообразие среди вариантов паразитов. В то время как полноразмерный VAR2CSA является очень иммуногенным, полученные антитела не являются перекрестно ингибирующими (Avril M., Hathaway M.J., Srivastava A., Dechavanne S., Hommel M., Beeson J.G., Smith J.D. and Gamain, B. PLoS One 6, el6622). Недавнее исследование показало, что ДНК-вакцинация с использованием ID1-DBL2X из FCR3 индуцирует антитела, которые являются перекрестно ингибирующими, ингибируя CSA-адгезию других лабораторных штаммов, а также паразитов, выделенных в полевых условиях (Bordbar В., Tuikue-Ndam N., Bigey P., Doritchamou J., Scherman D. and Deloron P., Vaccine). Это поддерживает использование указанного малого фрагмента в вакцине против РМ.
Cardin и Weintraub предсказали, что сайт связывания с GAG будет принимать одну из двух форм (Cardin A.D. and Weintraub H.J. (1989) Arteriosclerosis 9, 21-32). Это Х-В-В-Х-В-Х и Х-В-В-В-Х-Х-В-Х, где X представляет собой любой гидропатический остаток, а В представляет собой любой основной остаток, с предпочтительным аргинином. Обе указанные схемы описывают сайт связывания для сульфатированного дисахарида. В то время как может наблюдаться множество взаимодействий, ионное взаимодействие между отрицательно заряженными сульфатами и основными аминокислотами, как представляется, является наиболее важным. Заявители подвергли мутации два указанных сайта в пределах минимальной области связывания; 625-GKNLKKRY-632 в DBL2X и 458-NKKKECKD-465 в ID1. Заявители
- 55 031876 также осуществили делецию большой области в пределах мотива диморфной последовательности (DSM), расположенного в N-концевой части DBL2X, поскольку предполагалось, что она имеет свою функцию в связывании. Делеция области DSM не оказало влияния на связывание с CSA. Также не оказали никакого влияния замены в предполагаемых GAG-связывающих сайтах. Это является очевидным показателем того, что указанные сайты имеют малую функцию в связывании с CSA или не имеют ее.
Было показано, что минимальным требованием связывания для рецептора CSA человека является додекасахарид с 2-4 С4 сульфатированными GalNAc моносахаридами (Alkhalil A., Achur R.N., Valiyaveettil M., Ockenhouse C.F. and Gowda D. С. (2000) J. Biol. Chem. 275, 40357-40364). Достойно внимания, что паразиты, экспрессирующие VAR2CSA in vivo, являются очень специфичными в отношении CSA, несущего только 2-8% С4 сульфатированных дисахаридных единиц. Для того чтобы установить, зависит ли образование комплекса VAR2CSA-CSA от ионных взаимодействий, заявители изучили связывание при различных концентрациях соли. Связывание ID1-ID2a, DBL1X-ID2a и FV2 при концентрациях NaCl 150-300 нМ показало линейные отношения при построении графика зависимости Log (KD>наблюдающаяся) от Log[Na+]. Заявители установили, что связывание зависит от максимум 2-3 ионных взаимодействий. Интересно, что величина для полноразмерного белка выше, чем величина для более коротких фрагментов, что указывает на то, что указанный белок осуществляет дополнительное ионное взаимодействие с CSA. В данном исследовании заявители осуществляли скрининг для поиска фрагментов, содержащих CSA-специфичную область связывания высокой аффинности. Возможно, что больше взаимодействий наблюдается в нижележащих областях белка, но что ядерный сайт лежит в пределах DBL2X. Экстраполяция и установление Y отрезка ([Na+]=1M, Log [Na+]=0) показывает нам, что Кднеионная =5,9 мкМ для FV2, ^,^»^<.=3.4 мкМ для DBL1X-ID2a и 14...,,.....,.0.7 мкМ для ID1-ID2a. Это показывает, что только 25-30% связывания VAR2CSA-CSA может быть отнесено на счет ионных взаимодействий. В противоположность другим белкам, связывающимся с GAG, которые показали 80-90% зависимость от ионных взаимодействий в аналогичных исследованиях (Faller В., Mely Y., Gerard D. and Bieth J.G. (1992) Biochemistry 31, 8285-8290; Hileman R.E., Fromm J.R., Weiler J.M. and Linhardt R.J. (1998) Bioessays 20, 156-167).
Данные заявителей предполагают, что взаимодействие VAR2CSA-CSA не соответствует обычным взаимодействиям GAG-белок. Заявители выдвинули гипотезу, которая гласит, что высокая аффинность CSA достигается посредством поливалентного взаимодействия, которое может включать множество сайтов связывания, осуществляющих неионные взаимодействия с углеводородным скелетом CSA. Некоторые из взаимодействий являются ионными, и некоторая степень сульфатирования необходима для связывания с VAR2CSA. Таким образом, вероятным является то, что имеет место взаимодействие между основными аминокислотами и сульфатами, но что оно не является определяющим фактором аффинности.
В данном исследовании заявители определили малый однодоменный фрагмент VAR2CSA, который может продуцироваться эукариотическими клетками как функциональный CSA-связывающий белок, и обладает способностью индуцировать антитела с выраженным свойством блокировать адгезию. Указанный фрагмент потенциально является мощным кандидатом для вакцины против РМ.
Данные идентифицируют малую рекомбинантную часть VAR2CSA, которая специфичным образом связывается с CSA, опосредуя, таким образом, плацентарное связывание инфицированных эритроцитов. Заявители показывают, что указанный фрагмент VAR2CSA также специфичным образом связывается со злокачественными клетками, хотя взаимодействие с CSA, презентированного на CSPG4 или других скелетах белка, которые были идентифицированы в данном исследовании. Кроме того, заявители обнаружили, что связывание полипептидов VAR2CSA, основанное на указанном малом фрагменте, со злокачественными клетками ингибирует миграцию и инвазию клеток. Указанные полипептиды VAR2CSA также ингибируют канонический сигналинг ERK, и заявители установили, что полипептиды VAR2CSA, которые были слиты с токсином, эффективно убивают злокачественные клетки.
Способы.
Способ 1. Клонирование и экспрессия белков в клетках насекомых.
Фрагменты последовательности VAR2CSA были амплифицированы из кодоноптимизированного FCR3 (инвентарный номер в GeneBank GU249598) или 3D7 (инвентарный номер в GeneBank JQ247428) генов VAR2CSA с использованием специфических праймеров (табл. 2). Простые фрагменты амплифицировали одностадийной ПЦР. Конструкции с замеными аминокислот осуществляли двухстадийной ПЦР. Первая ПЦР амплифицировала два фрагмента из кодоноптимизированной матрицы FCR3, содержащей перекрывающиеся комплементарные концы. Вторая ПЦР амплифицировала полную конструкцию с использованием двух перекрывающихся фрагментов в качестве матрицы с праймерами, специфическими в отношении внешних границ. Все фрагменты секвенировали с целью верификации. Фрагменты клонировали в бакуловирусный вектор pAcGP67-A (BD Biosciences), модифицировали таким образом, чтобы они содержали V5 и метку His на С-конце. Белки экспрессировали инфицированные бакуловирусом клетки насекомых в качестве растворимого белка, секретируемого в надосадок клеточной культуры. Кратко, линеаризованную бакуловирусную ДНК Вакракб (BD Biosciences) сотрансфицировали с использованием плазмид pAcGP67-A в клетки насекомых Sf9 для генерации рекомбинантных вирусных частиц. 10 мл
- 56 031876 продукта второй амплификации использовали для инфицирования клеток High-Five в 400 мл не содержащей сыворотки среды (10486, GIBCO) с плотностью 1х106 клеток на мл. Секретированный рекомбинантный белок собирали из надосадка через 3 дня после первоначального инфицирования. Надосадок фильтровали (0,2 мкм), подвергали диализу и концентрировали перед выделением белка.
Способ 2. Выделение белка и SDS-PAGE.
Отфильтрованный надосадок, содержащий секретированный рекомбинантный белок, подвергали диализу с использованием поперечного потока АСТА (GE Healthcare). Диализ осуществляли в 10 мМ NaH2PO4 (pH 7,4, Sigma-Aldrich) и 500 мМ NaCl. Полученный раствор фильтровали (0,2 мкм), и добавляли имидиазол до конечной концентрации 15 мМ. Белок затем очищали на 1-мл колонке HisSelect (H8286, Sigma-Aldrich). Связанный белок элюировали с использованием 10 мМ NaH2PO4 (pH 7,4), 500 мМ NaCl и 500 мМ имидиазола. Белки, необходимые для измерений кварцевого кристаллического микробаланса и SAXS, подвергали дальнейшей очистке для получения мономеров путем вытеснительной хроматографии с использованием колонки HiLoad 16/60 Superdex 200 (GE Healthcare) в 20 мМ Tris (pH 8) и 200 мМ NaCl. Чистоту и структурную целостность белка проверяли с помощью SDS-PAGE.
Способ 3. ELISA.
Микротитрационные планшеты Falcon (351172, BD Biosciences) инкубировали при концентрации 3 мкг/мл для CSPG (бычий) (D8428, Sigma) или HSPG (H4777, Sigma) и 100 мкг/мл для CSA (C9819, Sigma), CSC (400675, Seikagaku) и CSB (C3788, Sigma) в течение ночи при 4°C. Планшеты затем блокировали связывающим буфером ТСМ (20 мМ Tris, 150 мМ NaCl, 2 мМ CaCl2, 0,05% Tween-20, 1% BSA, pH 7,4 при 25°C) в течение 2 ч при 37°C на шейкере. Получали серии двукратных разведений (1,56-100 мМ) белка в связывающем буфере ТСМ и добавляли в планшеты, которые инкубировали в течение 1 ч при 37°C на шейкере. Все измерения повторяли трижды. Планшеты промывали три раза в связывающем буфере ТСМ (20 мМ Tris, 150 мМ NaCl, 2 мМ CaCl2, 0,05% Tween-20, pH 7,4 при 25°C). Планшеты затем инкубировали с анти-V5-HRP антителом 1:3000 (R96125, Invitrogen) в связывающем буфере ТСМ в течение 1 ч при 37°C на шейкере. Планшеты промывали три раза в связывающем буфере ТСМ. В конце планшеты проявляли о-фенилендиаминовым субстратом (DAKO) в течение 15 мин. Реакцию гасили 2,5 М H2SO4. Поглощение измеряли на 490 нм.
Способ 4. Кварцевый кристаллический микробаланс (Attana А100).
Эксперименты осуществляли на Attana A100 (Attana AB) с использованием золотого покрытия 10 МГц, АТ-среза кварцевого кристалла, полистироловых чипов (3611-3101 Attana AB). Все буферы и реагенты фильтровали до 0,2 мкм. Лигандом служил CSPG (бычий) (D8428, Sigma) или HSPG (H4777, Sigma), нанесенный в концентрации 100 мкм/мл. Покрытие было получено в стационарном состоянии добавлением раствора лиганда и инкубацией в течение 30 мин при комнатной температуре. Затем планшет блокировали с использованием PBS, содержащего 0,1% BSA без Ig (BSA-50, Rockland), в течение 30 мин при комнатной температуре. Attana А100 промывали 1% SDS перед каждым экспериментом с использованием встроенной производителем программы ежедневного промывания. После промывания подвижный буфер был подключен к PBS со скоростью потока 25 мкл/мин при 25°C, и машину оставляли стабилизироваться на максимальном изменении частоты 0,5 Гц/мин. Стабилизированный PBS инъецировали множество раз, чтобы показать, что процесс инъекции минимально влияет на исходный уровень. Перед инъекцией образца в качестве контроля инъецировали PBS. Аналит инъецировали сериями разведений 1:3 (0,25-60 мкг/мл), начиная с самой низкой концентрации. Время ассоциации было установлено 84 с, а время диссоциации - 5 мин. В силу высокой аффинности связывания было невозможно регенерировать поверхность связывания после инъекций. Собранные данные обрабатывали с использованием компьютерной программы Attester Evaluation (Attana AB). Кривые вычерчивали по простой модели 1:1. kon и kof определяли подбором кривой, a KD рассчитывали на основе KD=koff/kon.
Способ 5. Анализ титрования соли.
Ионную зависимость связывания VAR2CSA-CSA изучали в анализе связывания на основе ELISA. Покрытие CSPG наносили в концентрации 3 мкг/мл. Серии 1:2 разведений белка (400-1,56 нМ) добавляли в несколько разных концентраций NaCl (150, 200, 250 и 300 мМ). Все эксперименты повторяли трижды. Величины KD рассчитывали для каждой серии титрований в Graphpad Prism с использованием нелинейной регрессии (метод наименьших квадратов с наклоном hill).
Способ 6. Иммунизация животных и извлечение сыворотки.
Иммунизацию животных осуществляли в соответствии с национальными и Европейскими протоколами. Крысам Wistar подкожно инъецировали 30 мкг рекомбинантного белка в полном адъюванте Фрейнда (F5881, Sigma-Aldrich). Иммунизацию повторяли три раза с 3-недельными интервалами с использованием 15 мкг белка в полном адъюванте Фрейнда (F5881, Sigma-Aldrich). Образцы крови брали спустя неделю после каждого буста, и сыворотку извлекали центрифугированием.
Способ 7. Аффинная очистка IqG.
Пулы сывороток от крыс, иммунизированных FCR3 полноразмерного VAR2CSA (FV2), подвергали аффинной очистке на 1-мл NHS-активированной колонке HP (HiTrap NHS-activated HP, 17-0716-01, GE Healthcare), содержащей иммобилизованные мультидоменные белки FCR3 (DBL1X-DBL2Xa, DBL1X- 57 031876
ID2a, ID1-ID2a или ID1-DBL4e) и полноразмерного FV2. Очистку осуществляли в соответствии с протоколом производителя. Кратко, прикрепление лиганда к колонке осуществляли добавлением в колонку 1 мл 1:1 раствора буфера для иммобилизации (0,2М NaHCO3, 0,5М NaCl, pH 8,3) и лиганда (концентрация 0,5-10 мг/мл). Колонку запечатывали и инкубировали в течение 30 мин при комнатной температуре с последующей инкубацией при 4°C в течение ночи. Колонку промывали 6 мл буфера А (0,5М этаноламин, 0,5М NaCl, pH 8,3), 6 мл буфера В (0,1М ацетат, 0,5М NaCl, pH 4) и, наконец, еще 6 мл буфера А. После периода инкубации 30 мин при комнатной температуре промывание повторяли в обратном порядке (буфер В, А, В). 8-10 мл PBS инъецировали для регулирования pH перед очисткой сыворотки. Образец пропускали через колонку 3-5 раз. Колонку промывали 10 мл PBS перед элюированием антител с использованием 10 мл элюирующего буфера (0,1М лимонная кислота, pH 2,7).
Способ 8. Культуры паразита P.falciparum.
Паразитов F.falciparum типа FCR3 культивировали с использованием 5%-ного гематокрита (группа крови человека 0 Rh+) в паразитарной среде RPMI-1640 (BE12115F, Lonza) с добавлением 25 мМ NaHCO3, 0,125 мкг/мл гентамицина сульфата (ВЕ02012Е, Lonza), 0,125 мкг/мл AlbuMAX II (11021029, Invitrogen) и 2%-ной нормальной сыворотки человека. IE повторно сортировали на клетках BeWo (CCL98, АТСС) для поддержания фенотипа с адгезией к CSA. Кроме того, изоляты тестировали на микоплазма-отрицательность и регулярно генотипировали с помощью ПЦР с использованием вложенных праймеров GLURP (белка с высоким содержанием глутамата) и MSP-2 (поверхностного белка мерозоитов 2).
Способ 9. Выделение трофозоитов поздней стадии.
Культуры паразитов обогащали поздними трофозоитами и стадией шизонта в сильном магнитном поле с использованием CS-колонки MACS (130-041-305, Miltenyi Biotec) и магнита Vario-MACS (Miltenyi Biotec). Кратко, суспензию паразитарной культуры наносили на колонку. Колонку затем промывали 2% фетальной бычьей сывороткой (F6178, Sigma-Aldrich) в PBS. Инфицированные эритроциты поздней стадии элюировали из колонки после отделения от магнита, откручивали и ресуспендировали в 2%-ной фетальной бычьей сыворотке в PBS и разбавляли до концентрации 2х106 1Е/мл.
Способ 10. Проточная цитометрия (FCM).
Связывание антител с нативным VAR2CSA на выделенных эритроцитах, инфицированных трофозоитами поздней стадии, измеряли проточной цитометрией (FCM). 100 мкл выделенных паразитов поздней стадии в концентрации 2х105 IE/мл с 2% FCS были помечены сывороткой (лишенной неспецифичного связывания предварительной инкубацией с неинфицированными эритроцитами) в конечной концентрации 1:10. Клетки трижды промывали в PBS с 2% FCS. Клетки затем дополнительно метили бромидом этидия (15585011, Invitrogen) в конечной концентрации 2 мкг/мл и 1:100 разведением FITC-меченным вторичным антикрысиным-IgG антителом (62-9511, Invitrogen). В качестве отрицательных контролей паразитов поздней стадии также инкубировали с сывороткой от крыс, иммунизированных антигеном, не являющимся VAR2CSA, и только с вторичными антителами. Данные от 5000 положительных по бромиду этидия IE с использованием проточного цитометра FC500 (Beckmann Coulter). В конечном итоге определяли медианную интенсивность флюоресценции с использованием компьютерной программы WinList 5.0 (Verify Software House).
Способ 11. Ингибирование связывания паразитов с CSPG.
Сывороточные антитела анализировали на предмет их способности ингибировать связывание IE с CSPG. Это осуществляли в формате 96-луночных планшетов с использованием роботстандартизированного промывочного метода. На лунки наносили покрытие из 2 мкг/мл CSPG (D8428, Sigma-Aldrich). Всего 2х105 меченных тритием (моногидрохлорид гипоксантина, PerkinElmer, NET177005MC) IE поздней стадии в 100 мкл добавляли в трех повторностях в лунки. Меченые IE затем инкубировали с сывороткой в течение 90 мин при 37°C. Несвязанные IE смывали с использованием пипетирующего робота (Beckmann Coulter). Пропорцию IE, осуществивших адгезию, определяли жидкостным сцинтилляционным подсчетом на Topcount NXT (Perkin Elmer).
Способ 12а. Анализы связывания со злокачественными клетками.
Проточную цитометрию (FCM) использовали для изучения реактивности минимального связывающего полипептида VAR2CSA по отношению к CSPG, экспрессированному на поверхности различных клеточных линий. Клетки культивировали в RPMI с добавлением 10%-ной фетальной бычьей сыворотки (клетки СНО, С32), Hams F12 (BeWo), содержали в 5%-ном диоксиде углерода при 37°C или выделяли из образца крови человека в буфере CPD (красные кровяные клетки). Аликвоты клеток (1х105) последовательно подвергали воздействию минимального связывающего полипептида VAR2CSA (150, 75 или 37 нМ) и a-V5-FITC (1:800) (Invitrogen), разведенных в FACS2 (PBS+2% FCS) в течение 30 мин при +4°C в темноте при умеренном перемешивании. В качестве отрицательных контролей использовали усеченную версию минимального связывающего полипептида и буфер FACS2. Интактные клетки пропускали на основе сигнала переменной связи и сигнала бокового рассеяния. Данные получали с использованием проточного цитометра FC500 (Beckman Coulter) минимум от 5000 клеток. Все образцы, относящиеся к конкретной клеточной линии, обрабатывались и анализировались в одном исследовании.
- 58 031876
Способ 12b. Анализы связывания со злокачественными клетками.
В качестве альтернативы анализу проточной цитометрии, описанному выше, клетки инкубировали с минимальным связывающим полипептидом VAR2CSA и a-V5-FITC (1:500) (Invitrogen), разведенными в HBSS. Полипептид VAR2CSA использовали в тех же концентрациях, как написано выше. После окрашивания a-V5-FITC клетки промывали 3 раза в HBSS, собирали в не содержащий ферментов буфер для открепления клеток (Invitrogen) и анализировали с использованием FACS Calibur (BD Biosciences) на интенсивность сигнала FL-1.
Сокращения: CIDR - междоменная область с высоким содержанием цистеина; CSA - хондроитинсульфат A; CSPG - протеогликан хондроитинсульфат; DBL - домен, подобный Duffy-связыванию; FCM проточная цитометрия; FV2 - полноразмерный эктодомен белка VAR2CSA без N-концевого сегмента; HSPG - протеогликан гепарансульфат; ID - интер-домен; IE - эритроцит, инфицированный F.falciparum; NTC - N-концевой сегмент; РМ - плацентарная малярия; PfEMP1 - белок 1 эритроцитарной мембраны Plasmodium falciparum; PM - плацентарная малярия.
Способ 13. Тест на цитотоксичность in vitro слитых белков VAR2CSA-токсин.
Злокачественные клеточные линии засевали на 96-луночный планшет, 500 клеток на лунку, за один день до эксперимента. В день эксперимента в отдельные лунки добавляли серии 10-кратных разведений (от 10 мкг/мл до 0,01 нг/мл) слитого VAR2CSA-токсин и контрольного белка (VAR2CSA без токсина). Аналогичные серии разведений, которые содержали также 400 мкг/мл CSA, получали для обоих белков и добавляли в отдельные лунки. Клетки с белками инкубировали в течение 72 ч при 37°C. Смерть клеток анализировали с использованием анализа пролиферации клеток МТТ, где считывание данных представляет собой поглощение на 570 нм.
Способ 14. Окрашивание залитых в парафин образцов тканей человека.
Связывание рекомбинантного VAR2CSA с первичной злокачественной тканью, полученной от пациентов-людей, изучали с использованием иммуногистохимии (IHC). Залитую в парафин ткань, помещенную на предметные стекла, не подвергавшуются antigen retrieval, инкубировали с 0,1-500 нМ V5VAR2CSA или V5-контрольного белка (DBL4) в течение 1 ч при комнатной температуре, промывали в течение 8 мин, инкубировали с 1:700 антитело мыши против V5 в течение 30 мин, промывали в течение 5 мин. Связанные анти-У5 впоследствии обнаруживали с использованием антимышиных HRP UltraMap на платформе Ventana Discovery XT.
СПИСОК ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ <110> VAR2 Pharmaceuticals ApS <120> ПРИМЕНЕНИЯ КОНЪЮГАТА, СОДЕРЖАЩЕГО ПОЛИПЕПТИД VAR2CSA И
ЭФФЕКТОРНУЮ МОЛЕКУЛУ, ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ И ДИАГНОСТИКИ
ЗЛОКАЧЕСТВЕННОГО НОВООБРАЗОВАНИЯ <130> 19034PCT00 <160>127 <170> PatentIn version 3.5 <210>1 <211>640 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 1
Asn Tyr Ile Lys Gly Asp Pro Tyr Phe Ala Glu Tyr Ala Thr Lys Leu
5 10 15
Ser Phe Ile
Leu
Asn Pro Ser Asp Ala
Asn Asn Pro
Ser
Gly
Glu
Thr
- 59 031876
Ala
Ser
Ile
Val
Ile
Leu
Ser
Lys
145
Lys
Lys
Ile
Lys
Lys
225
Lys
Glu
Leu
Asn His Asn Asp Glu Ala Cys 40 Asn Cys Asn Glu Ser 45 Gly Ile Ser
35
Val Gly Gln Ala Gln Thr Ser Gly Pro Ser Ser Asn Lys Thr Cys
50 55 60
Thr His Ser Ser Ile Lys Thr Asn Lys Lys Lys Glu Cys Lys Asp
70 75 80
Lys Leu Gly Val Arg Glu Asn Asp Lys Asp Leu Lys Ile Cys Val
85 90 95
Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln Asp
100 105 110
Leu Gly 115 Ile Leu Gln Glu Asn Cys 120 Ser Asp Asn Lys 125 Arg Gly Ser
Ser Asn Asp Ser Cys Asp Asn Lys Asn Gln Asp Glu Cys Gln Lys
130 135 140
Leu Glu Lys Val Phe Ala Ser Leu Thr Asn Gly Tyr Lys Cys Asp
150 155 160
Cys Lys Ser Gly Thr Ser Arg Ser Lys Lys Lys Trp Ile Trp Lys
165 170 175
Ser Ser Gly Asn Glu Glu Gly Leu Gln Glu Glu Tyr Ala Asn Thr
180 185 190
Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu Gly Asn Leu Pro
195 200 205
Leu Glu Asn Val Cys Glu Asp Val Lys Asp Ile Asn Phe Asp Thr
210 215 220
Glu Lys Phe Leu Ala 230 Gly Cys Leu Ile Val 235 Ser Phe His Glu Gly 240
Asn Leu Lys Lys Arg Tyr Pro Gln Asn Lys Asn Ser Gly Asn Lys
245 250 255
Asn Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp
260 265 270
Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu
275 280 285
- 60 031876
Glu Leu Asn Leu Gln Asn Asn Phe Gly 295 Lys Leu Phe 300 Gly Lys Tyr Ile
290
Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp
305 310 315 320
Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Thr
325 330 335
Ala Met Lys His Gly Ala Glu Met Asn Ile Thr Thr Cys Asn Ala Asp
340 345 350
Gly Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile
355 360 365
Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu Asn
370 375 380
Phe Cys Glu Gln Arg Gln Ala Lys Val Lys Asp Val Ile Thr Asn Cys
385 390 395 400
Lys Ser Cys Lys Glu Ser Gly Asn Lys Cys Lys Thr Glu Cys Lys Thr
405 410 415
Lys Cys Lys Asp Glu Cys Glu Lys Tyr Lys Lys Phe Ile Glu Ala Cys
420 425 430
Gly Thr Ala Gly Gly Gly Ile Gly Thr Ala Gly Ser Pro Trp Ser Lys
435 440 445
Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys His Ile Glu Asp Ala
450 455 460
Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Thr Ser Ser Thr
465 470 475 480
Thr Asn Ala Ala Ala 485 Ser Thr Asp Glu Asn 490 Lys Cys Val Gln Ser 495 Asp
Ile Asp Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro
500 505 510
Ser Ser Tyr Leu Ser Asn Val Leu Asp Asp Asn Ile Cys Gly Ala Asp
515 520 525
Lys Ala Pro Trp Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys Cys
530 535 540
- 61 031876
Asn Lys 545 Glu Arg Asp Lys 550 Ser Lys Ser Gln Ser 555 Ser Asp Thr Leu Val 560
Val Val Asn Val Pro Ser Pro Leu Gly Asn Thr Pro Tyr Arg Tyr Lys
565 570 575
Tyr Ala Cys Gln Cys Lys Ile Pro Thr Asn Glu Glu Thr Cys Asp Asp
580 585 590
Arg Lys Glu Tyr Met Asn Gln Trp Ser Cys Gly Ser Ala Arg Thr Met
595 600 605
Lys Arg Gly Tyr Lys Asn Asp Asn Tyr Glu Leu Cys Lys Tyr Asn Gly
610 615 620
Val Asp Val Lys Pro Thr Thr Val Arg Ser Asn Ser Ser Lys Leu Asp
625 630 635 640
<210>2 <211>341 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>2
Lys 1 Cys Asp Lys Cys 5 Lys Ser Gly Thr Ser 10 Arg Ser Arg Lys Ile 15 Trp
Thr Trp Arg Lys Ser Ser Gly Asn Lys Glu Gly Leu Gln Glu Glu Tyr
20 25 30
Ala Asn Thr Ile Gly Leu Ser Pro Arg Thr Gln Leu Leu Tyr Leu Gly
35 40 45
Asn Leu Arg Lys Leu Glu Asn Val Cys Glu Asp Val Thr Asp Ile Asn
50 55 60
Phe Asp Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Ala Ala Phe
65 70 75 80
His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Lys Arg Tyr Leu Glu Lys Lys Lys Gly
85 90 95
Asp Asn Asn Ser Lys Leu Cys Lys Asp Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp
100 105 110
Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Asp Phe Thr
115 120 125
- 62 031876
Lys Asp 130 Leu Glu Leu Asn Leu 135 Gln Gln Ile Phe Gly 140 Lys Leu Phe Arg
Lys Tyr Ile Lys Lys Lys Asn Ile Ser Thr Glu Gln Asp Thr Ser Tyr
145 150 155 160
Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys
165 170 175
Tyr Ile Trp Leu Ala Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Ser Thr Thr
180 185 190
Cys Ser Cys Ser Gly Asp Ser Ser Ser Gly Glu Asn Gln Thr Asn Ser
195 200 205
Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe
210 215 220
Leu Gln Glu Trp Val Glu His Phe Cys Glu Gln Arg Gln Ala Lys Val
225 230 235 240
Lys Asp Val Ile Thr Asn Cys Asn Ser Cys Lys Glu Ser Gly Gly Thr
245 250 255
Cys Asn Ser Asp Cys Glu Lys Lys Cys Lys Asn Lys Cys Asp Ala Tyr
260 265 270
Lys Thr Phe Ile Glu Asp Cys Lys Gly Val Gly Gly Thr Gly Thr Ala
275 280 285
Gly Ser Ser Trp Val Lys Arg Trp Tyr Gln Ile Tyr Met Arg Tyr Ser
290 295 300
Lys Tyr Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Ser
305 310 315 320
Cys Gly Thr Ser Ser Thr Thr Asn Val Ser Val Ser Thr Asp Glu Asn
325 330 335
Lys Cys Val Gln Ser
340 <210> 3 <211>
<212>
<213>
656
Белок
Искусственная
- 63 031876 <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 3
Asp 1 Tyr Ile Lys Gly 5 Asp Pro Tyr Phe Ala 10 Glu Tyr Ala Thr Lys 15 Leu
Ser Phe Ile Leu Asn Ser Ser Asp Ala Asn Asn Pro Ser Gly Glu Thr
20 25 30
Ala Asn His Asn Asp Glu Val Cys Asn Pro Asn Glu Ser Glu Ile Ser
35 40 45
Ser Val Gly Gln Ala Gln Thr Ser Asp Pro Ser Ser Asn Lys Thr Cys
50 55 60
Asn Thr His Ser Ser Ile Lys Ala Asn Lys Lys Lys Val Cys Lys His
65 70 75 80
Val Lys Leu Gly Ile Asn Asn Asn Asp Lys Val Leu Arg Val Cys Val
85 90 95
Ile Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Glu Asn Cys Cys Phe Lys Asp
100 105 110
Leu Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Ser Gly Ser
115 120 125
Ser Ser Asn Gly Ser Cys Asn Asn Lys Asn Gln Glu Ala Cys Glu Lys
130 135 140
Asn Leu Glu Lys Val Leu Ala Ser Leu Thr Asn Cys Tyr Lys Cys Asp
145 150 155 160
Lys Cys Lys Ser Gly Thr Ser Thr Val Asn Lys Asn Trp Ile Trp Lys
165 170 175
Lys Ser Ser Gly Asn Lys Glu Gly Leu Gln Lys Glu Tyr Ala Asn Thr
180 185 190
Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr His Ser Leu Tyr Leu Gly Asn Leu Pro
195 200 205
Lys Leu Glu Asn Val Cys Glu Asp Val Lys Asp Ile Asn Phe Asp Thr
210 215 220
Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Ala Ala Phe His Glu Gly
225 230 235 240
- 64 031876
Lys Asn Leu Lys Lys 245 Arg Tyr Pro Gln Asn 250 Lys Asn Asp Asp Asn 255 Asn
Ser Lys Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp
260 265 270
Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu
275 280 285
Glu Leu Asn Leu Gln Gln Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr Ile
290 295 300
Lys Lys Asn Ile Ser Thr Glu Gln Asp Thr Leu Tyr Ser Ser Leu Asp
305 310 315 320
Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Leu
325 330 335
Ala Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Ile Thr Thr Cys Cys Gly Asp
340 345 350
Gly Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile
355 360 365
Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His
370 375 380
Phe Cys Lys Gln Arg Gln Glu Lys Val Lys Asp Val Ile Asn Ser Cys
385 390 395 400
Asn Ser Cys Lys Asn Thr Ser Ser Lys Thr Lys Leu Gly Asp Thr Cys
405 410 415
Asn Ser Asp Cys Glu Lys Lys Cys Lys Ile Glu Cys Glu Lys Tyr Lys
420 425 430
Lys Phe Ile Glu Glu Cys Arg Thr Ala Val Gly Gly Thr Ala Gly Ser
435 440 445
Ser Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Met Tyr Ser Lys His
450 455 460
Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly
465 470 475 480
Ile Thr Thr Gly Thr Ile Ser Gly Glu Ser Ser Gly Ala Asn Ser Gly
- 65 031876
485
490
495
Val Thr Thr Thr 500 Glu Asn Lys Cys Val 505 Gln Ser Asp Ile Asp 510 Ser
Phe Lys His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro Ser Ser Tyr
515 520 525
Ser Ile Val Leu Asp Asp Asn Ile Cys Gly Asp Asp Lys Ala Pro
530 535 540
Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys Cys
545 550 555
Lys Glu Arg Asp Lys Ser Lys Ser Gln Gln Ser Asn Thr Ser Val
565 570 575
Val Asn Val Pro 580 Ser Pro Leu Gly Asn 585 Thr Pro His Gly Tyr 590 Lys
Ala Cys Gln Cys Lys Ile Pro Thr Asn Glu Glu Thr Cys Asp Asp
595 600 605
Lys Glu Tyr Met Asn Gln Trp Ile Ser Asp Thr Ser Lys Asn Pro
610 615 620
Gly Ser Gly Ser Thr Asn Asn Asp Tyr Glu Leu Tyr Thr Tyr Asn
625 630 635
Val Lys Glu Thr Lys Leu Pro Lys Lys Leu Asn Ser Pro Lys Leu
645 650 655
Phe
Leu
Trp
Asn
560
Val
Tyr
Arg
Lys
Gly
640
Asp <210> 4 <211> 643 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 4
Asp
Tyr
Ile
Lys
Asp
Asp
Pro
Tyr
Ser
Lys
Glu
Tyr
Thr
Thr
Lys
Ser
Phe
Ile
Leu
Asn
Ser
Ser
Asp
Ala
Asn
Thr
Ser
Ser
Gly
Glu
Ala
Asn
His
Asn
Asp
Glu
Ala
Cys
Asn
Cys
Asn
Glu
Ser
Glu
Ile
Leu
Thr
Ser
- 66 031876
Ser Val 50 Gly Gln Ala Gln Thr 55 Ser Gly Pro Ser Ser 60 Asn Lys Thr Cys
Ile Thr His Ser Phe Ile Lys Ala Asn Lys Lys Lys Val Cys Lys Asp
65 70 75 80
Val Lys Leu Gly Val Arg Glu Asn Asp Lys Val Leu Arg Val Cys Val
85 90 95
Ile Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln Asp
100 105 110
Leu Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Arg Gly Ser
115 120 125
Ser Ser Asn Gly Ser Cys Asn Asn Lys Asn Gln Asp Glu Cys Gln Lys
130 135 140
Lys Leu Glu Lys Val Phe Val Ser Leu Thr Asn Gly Tyr Lys Cys Asp
145 150 155 160
Lys Cys Lys Ser Gly Thr Ser Thr Val Asn Lys Lys Trp Ile Trp Lys
165 170 175
Lys Ser Ser Gly Asn Glu Lys Gly Leu Gln Lys Glu Tyr Ala Asn Thr
180 185 190
Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu Gly Asn Leu Pro
195 200 205
Lys Leu Gly Asn Val Cys Glu Asp Val Thr Asp Ile Asn Phe Asp Thr
210 215 220
Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Ala Ala Phe His Glu Gly
225 230 235 240
Lys Asn Leu Lys Ile Ser His Glu Lys Lys Lys Gly Asp Asn Gly Lys
245 250 255
Lys Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp Leu
260 265 270
Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu Glu
275 280 285
Leu Asn Leu Gln Lys Ala Phe Gly Lys Leu Phe Gly Lys Tyr Ile Lys
- 67 031876
290
295
300
Lys
305
Leu
Met
Ser
Phe
Cys
385
Ser
Gly
Phe
Val
Asp
465
Ser
Ser
Thr
Glu
Asn Ile Ala Ser Asp 310 Glu Asn Thr Ser Tyr 315 Ser Ser Leu Asp Glu 320
Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Thr Ala
325 330 335
Lys His Gly Ala Glu Met Asn Ser Thr Met Cys Asn Ala Asp Gly
340 345 350
Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Thr Asp
355 360 365
Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His Phe
370 375 380
Lys Gln Arg Gln Glu Lys Val Asn Ala Val Ile Glu Asn Cys Asn
390 395 400
Cys Lys Asn Thr Ser Gly Glu Arg Lys Ile Gly Gly Thr Cys Asn
405 410 415
Asp Cys Lys Thr Glu Cys Lys Asn Lys Cys Glu Ala Tyr Lys Asn
420 425 430
Ile Glu Asp Cys Lys Gly Gly Asp Gly Thr Ala Gly Ser Ser Trp
435 440 445
Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys His Ile Glu
450 455 460
Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Ser Cys Gly Pro Ser
470 475 480
Ile Thr Asn Ala Ser Val Ser Thr Asp Glu Asn Lys Cys Val Gln
485 490 495
Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr
500 505 510
Pro
Ser
515
Ser
Tyr
Leu
Ser
Ile
520
Val
Leu
Asp
Glu
Asn
525
Asn
Cys
Gly
Asp
530
Asn
Ala
Pro
Trp
Thr
535
Thr
Tyr
Thr
Thr
Tyr
540
Thr
Thr
Thr
Glu
- 68 031876
Lys 545 Cys Asn Lys Asp Lys 550 Lys Lys Ser Lys Ser 555 Gln Ser Cys Asn Thr 560
Ala Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro Leu Gly Asn Thr Pro His Glu
565 570 575
Tyr Lys Tyr Ala Cys Gln Cys Lys Ile Pro Thr Thr Glu Glu Thr Cys
580 585 590
Asp Asp Arg Lys Glu Tyr Met Asn Gln Trp Ile Ser Asp Thr Ser Lys
595 600 605
Lys Gln Lys Gly Ser Gly Ser Thr Asn Asn Asp Tyr Glu Leu Tyr Thr
610 615 620
Tyr Thr Gly Val Lys Glu Thr Lys Leu Pro Lys Lys Leu Asn Ser Pro
625 630 635 640
Lys Leu Asp <210> 5 <211> 640 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 5
Ser Tyr Val Lys Asn Asp Pro Tyr
5
Ser Lys Glu Tyr Val Thr Lys Leu
15
Ser Phe Ile Leu Asn 20 Pro Ser Asp Ala 25 Asn Asn Pro Ser Gly 30 Glu Thr
Ala Asn His 35 Asn Asp Glu Ala Cys 40 Asn Pro Asn Glu Ser 45 Glu Ile Ala
Ser Val 50 Gly Gln Ala Gln Thr 55 Ser Asp Arg Leu Ser 60 Gln Lys Ala Cys
Ile 65 Thr His Ser Phe Ile 70 Gly Ala Asn Lys Lys 75 Ile Val Cys Lys Asp 80
Val Lys Leu Gly Val 85 Arg Glu Lys Asp Lys 90 Asp Leu Lys Ile Cys 95 Val
Ile Glu Asp Asp Ser Leu Arg Gly Val Glu Asn Cys Cys Phe Lys Asp
- 69 031876
100 105
Leu Leu Gly 115 Ile Leu Gln Glu Asn 120 Cys
Ser Ser 130 Asn Gly Ser Cys Asn 135 Asn Lys
Lys 145 Leu Asp Glu Ala Leu 150 Ala Ser Leu
Lys Cys Lys Ser Gly 165 Thr Ser Arg Ser
Lys Phe Pro Gly 180 Asn Gly Glu Gly Leu 185
Ile Gly Leu 195 Pro Pro Arg Thr Gln 200 Ser
Lys Leu 210 Glu Asn Val Cys Lys 215 Gly Val
Lys 225 Glu Lys Phe Leu Ala 230 Gly Cys Leu
Lys Asn Leu Lys Ile 245 Ser Asn Lys Lys
Lys Leu Cys Lys 260 Asp Leu Lys Tyr Ser 265
Ile Lys Gly 275 Thr Ser Ile Trp Asp 280 Asn
Leu Asn 290 Leu Gln Lys Ile Phe 295 Gly Lys
Lys 305 Asn Ile Ala Ser Asp 310 Glu Asn Thr
Leu Arg Glu Ser Trp 325 Trp Asn Thr Asn
Met Lys His Gly Thr Thr Cys Ser Ser
340 345
110
Asp Asn Lys 125 Ser Gly Ser
Gln Asp 140 Glu Cys Gln Lys
Asn 155 Gly Tyr Lys Cys Asp 160
Lys Ile Trp Thr Trp 175 Arg
Lys Glu Tyr Ala 190 Asn Thr
Tyr Leu Gly 205 Asn Leu Arg
Asp Ile 220 Asn Phe Asp Thr
Ala 235 Ala Phe His Glu Gly 240
Asn Asp Asp Asn Gly 255 Lys
Ala Asp Tyr Gly 270 Asp Leu
Tyr Thr Lys 285 Asp Leu Glu
Phe Arg 300 Lys Tyr Ile Lys
Tyr 315 Ser Ser Leu Asp Glu 320
Lys Tyr Ile Trp Leu 335 Ala
Ser Gly Asp Asn 350 Gly Asp
- 70 031876
Gly
Asp
Phe
385
Lys
Gly
Asn
Trp
Glu
465
Ser
Asp
Ser
Ala
Lys
545
Val
Ala
Lys
Ser Val 355 Thr Gly Ser Gly Ser 360 Ser Cys Asp Asp Met 365 Ser Thr
Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu
370 375 380
Cys Lys Gln Arg Gln Glu Lys Val Lys Asp Val Ile Glu Asn
390 395
Ser Cys Lys Asn Thr Ser Gly Glu Arg Ile Ile Gly Gly Thr
405 410 415
Ser Asp Cys Lys Thr Lys Cys Lys Gly Glu Cys Asp Ala Tyr
420 425 430
Phe Ile Glu Glu Cys Lys Arg Gly Asp Gly Thr Ala Gly Ser
435 440 445
Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Met Arg Tyr Ser Lys Tyr
450 455 460
Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly
470 475
Ser Thr Thr Asn Ala Ala Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser Asp
485 490 495
Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro
500 505 510
Tyr Leu Ser Ile Val Leu Asp Glu Asn Ile Cys Gly Asp Asp
515 520 525
Pro Trp Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys Cys
530 535 540
Glu Thr Asp Lys Ser Lys Ser Gln Ser Cys Asn Thr Ala Val
550 555
Asn Val Pro Ser Pro Leu Gly Asn Thr Pro His Gly Tyr Lys
565 570 575
Cys Glu Cys Lys Ile Pro Thr Thr Glu Glu Thr Cys Asp Asp
580 585 590
Glu Tyr Met Asn Gln Trp Ile Ser Asp Thr Ser Lys Lys Pro
595 600 605
Ile
His
Cys
400
Cys
Lys
Pro
Ile
Thr
480
Ile
Ser
Lys
Asn
Val
560
Tyr
Arg
Lys
- 71 031876
Gly Gly Arg Ser Thr Asn Asn Asp
610 615
Tyr Glu Leu Tyr Thr Tyr Asn
620
Val
625
Lys Glu Thr Lys Leu Pro Lys
630
Lys
Ser Ser Ser Ser Lys Leu
635
<210> 6
<211> 358
<212> Белок
<213> Plasmodium falciparum
<400> 6
Lys 1 Cys Glu Lys Cys 5 Lys Ser Glu Gln Ser 10 Lys Lys Asn Asn Asn 15
Trp Ile Trp Arg Lys Phe Pro Gly Asn Gly Glu Gly Leu Gln Lys
20 25 30
Tyr Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr His Ser Leu Tyr
35 40 45
Gly Asn Leu Pro Lys Leu Glu Asn Val Cys Lys Asp Val Lys Asp
50 55 60
Asn Phe Asp Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Ala
65 70 75
Phe His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Thr Thr Tyr Pro Gln Asn Lys
85 90 95
Ala Asp Asn Asn Ser Lys Leu Cys Lys Asp Leu Lys Tyr Ser Phe
100 105 110
Asp Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Asp
115 120 125
Thr Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe Gly Lys Leu
130 135 140
Arg Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Ile Ala Ser Asp Glu Asn Thr Leu
145 150 155
Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys
165 170 175
Tyr Ile Trp Leu Ala Met Lys His Gly Ala Glu Met Asn Ser Thr
180 185 190
Gly
Asp
640
Ile
Glu
Leu
Ile
Ala
Asn
Ala
Phe
Phe
Tyr
160
Lys
Met
- 72 031876
Cys
Asn
Gly
195
Asp
Gly
Ser
Val
Thr
200
Gly
Ser
Ser
Asp
Ser
205
Gly
Ser
Thr
Thr Cys Ser Gly Asp Asn Gly 215 Ser Ile Ser Cys Asp 220 Asp Ile Pro Thr
210
Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu
225 230 235 240
His Phe Cys Lys Gln Arg Gln Glu Lys Val Lys Pro Val Ile Glu Asn
245 250 255
Cys Lys Ser Cys Lys Asn Thr Ser Gly Glu Arg Ile Ile Gly Gly Thr
260 265 270
Cys Gly Ser Asp Cys Glu Lys Lys Cys Lys Gly Glu Cys Asp Ala Tyr
275 280 285
Lys Lys Phe Ile Glu Glu Cys Lys Gly Gly Gly Gly Gly Thr Gly Thr
290 295 300
Ala Gly Ser Pro Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr
305 310 315 320
Ser Lys Tyr Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys
325 330 335
Ser Cys Gly Pro Ser Ser Thr Thr Asn Ala Ala Ala Ser Thr Thr Glu
340 345 350
Ser Lys Cys Val Gln Ser
355 <210>7 <211>333 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>7
Lys Cys Asp Lys Cys Lys
Ser Glu Gln Ser Lys
Lys Asn Asn Lys Asn
Trp
Ile
Trp
Lys
Gln
Phe
Pro
Gly
Asn
Gly
Glu
Gly
Leu
Gln
Lys
Glu
Tyr
Ala
Asn
Thr
Ile
Gly
Leu
Pro
Pro
Arg
Thr
His
Ser
Leu
Tyr
Leu
- 73 031876
Gly Asn 50 Leu Pro Lys Leu Glu 55 Asn Val Cys Lys Gly 60 Val Thr Asp Ile
Asn Phe Asp Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Ala Ala
65 70 75 80
Phe His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Thr Ser His Glu Lys Lys Lys Gly
85 90 95
Asp Asn Gly Lys Lys Leu Cys Lys Asp Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp
100 105 110
Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Asp Phe Thr
115 120 125
Lys Asp 130 Leu Glu Leu Asn Leu Gln 135 Gln Ile Phe Gly 140 Lys Leu Phe Arg
Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Ile Ser Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser
145 150 155 160
Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr
165 170 175
Ile Trp Leu Ala Met Lys His Gly Thr Thr Cys Ser Ser Gly Ser Gly
180 185 190
Asp Asn Gly Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp
195 200 205
Met Pro Thr Thr Asp Phe Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu
210 215 220
Trp Val Glu His Phe Cys Lys Gln Arg Gln Glu Lys Val Asn Ala Val
225 230 235 240
Ile Thr Asn Cys Lys 245 Ser Cys Lys Glu Ser Gly Gly 250 Thr Cys Asn 255 Ser
Asp Cys Glu Lys Lys Cys Lys Asp Glu Cys Glu Lys Tyr Lys Lys Phe
260 265 270
Ile Glu Glu Cys Arg Thr Ala Ala Asp Gly Thr Ala Gly Ser Ser Trp
275 280 285
Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Met Tyr Ser Lys His Ile Glu
290 295 300
- 74 031876
Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala
305
310
Gly Thr Lys
315
Asn Cys Gly Thr Ser
320
Ser Thr Thr Asn Ala Ala Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser 325 330
<210> 8
<211> 269
<212> Белок
<213> Plasmodium falciparum
<400> 8
Asp 1 Tyr Ile Lys Asp 5 Asp Pro Tyr Ser Lys 10 Glu Tyr Thr Thr Lys 15 Leu
Ser Phe Ile Leu Asn Ser Ser Asp Ala Asn Thr Ser Ser Gly Glu Thr
20 25 30
Ala Asn His Asn Asp Glu Ala Cys Asn Cys Asn Glu Ser Glu Ile Ala
35 40 45
Ser Val Glu Gln Ala Ser Ile Ser Asp Arg Ser Ser Gln Lys Ala Tyr
50 55 60
Ile Thr His Ser Ser Ile Lys Thr Asn Lys Lys Lys Val Cys Lys Tyr
65 70 75 80
Val Lys Leu Gly Ile Asn Asn Asn Asp Lys Val Leu Arg Val Cys Val
85 90 95
Ile Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Glu Asn Cys Cys Phe Lys Asp
100 105 110
Leu Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Arg Gly Ser
115 120 125
Ser Phe Asn Asp Ser Cys Asn Asn Asn Asn Glu Glu Ala Cys Gln Lys
130 135 140
Lys Leu Glu Lys Val Leu Ala Ser Leu Thr Asn Gly Tyr Lys Cys Glu
145 150 155 160
Lys Cys Lys Ser Gly Thr Ser Arg Ser Lys Lys Lys Trp Ile Trp Lys
165 170 175
Lys Ser Ser Gly Lys Glu Gly Gly Leu Gln Lys Glu Tyr Ala Asn Thr
180 185 190
- 75 031876
Ile Gly Leu 195 Pro Pro Arg Thr Gln 200 Ser Leu Tyr Leu Gly 205 Asn Leu Pro
Lys Leu Glu Asn Val Cys Lys Gly Val Thr Asp Ile Asn Phe Asp Thr
210 215 220
Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Ala Ala Phe His Glu Gly
225 230 235 240
Lys Asn Leu Lys Pro Ser His Gln Asn Lys Asn Asp Asp Asn Asn Ser
245 250 255
Lys Leu Cys Lys Asp Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr
260 265
<210>9 <211>333 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>9
Lys 1 Cys Asp Lys Cys 5 Lys Ser Gly Thr Ser 10 Arg Ser Lys Lys Lys 15 Trp
Thr Trp Arg Lys Ser Ser Gly Asn Lys Glu Gly Leu Gln Lys Glu Tyr
20 25 30
Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr His Ser Leu Tyr Leu Gly
35 40 45
Asn Leu Arg Lys Leu Glu Asn Val Cys Glu Asp Val Thr Asp Ile Asn
50 55 60
Phe Asp Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Ala Ala Phe
65 70 75 80
His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Thr Thr Tyr Pro Gln Asn Lys Asn Asp
85 90 95
Asp Asn Asn Ser Lys Leu Cys Lys Ala Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp
100 105 110
Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Asp Phe Thr
115 120 125
Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg
130 135 140
- 76 031876
Lys 145 Tyr Ile Lys Lys Asn 150 Ile Ser Thr Glu Gln 155 His Thr Ser Tyr
Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys
165 170 175
Ile Trp Leu Ala Met Lys His Gly Ala Glu Met Asn Gly Thr Thr
180 185 190
Ser Cys Ser Gly Asp Ser Ser Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu
195 200 205
Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His Phe Cys
210 215 220
Gln Arg Gln Ala Lys Val Asn Ala Val Ile Asn Ser Cys Asn Ser
225 230 235
Lys Asn Thr Ser Gly Glu Arg Lys Leu Gly Gly Thr Cys Gly Ser
245 250 255
Cys Lys Thr Glu Cys Lys Asn Lys Cys Asp Ala Tyr Lys Glu Phe
260 265 270
Asp Gly Thr Gly Ser Gly Gly Gly Thr Gly Thr Ala Gly Ser Ser
275 280 285
Val Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys Tyr Ile
290 295 300
Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Ser Lys Asn Cys Gly Thr
305 310 315
Ser Thr Thr Asn Ala Ala Glu Ser Lys Cys Val Gln Ser
325 330
Ser
160
Tyr
Cys
Ile
Lys
Cys
240
Glu
Ile
Trp
Glu
Ser
320
<210> 10
<211> 650
<212> Белок
<213> Искусственная
<220>
<223> Искусственная конструкция
<400> 10
Ser Tyr Val Lys Asn Asn Pro Tyr Ser Ala Glu Tyr Val Thr Lys
5 10 15
Leu
- 77 031876
Ser
Ser
Ser
Ile
Val
Ile
Leu
Ser
Lys
145
Asp
Arg
Thr
Arg
Thr
225
Gly
Lys
Phe Ile Leu 20 Asn Ser Ser Asp Ala 25 Asn Thr Ser Ser Glu 30 Thr
Lys Tyr Tyr Asp Glu Val Cys Asn Cys Asn Glu Ser Glu Ile
35 40 45
Val Gly Gln Ala Gln Thr Ser Gly Pro Ser Ser Asn Lys Thr
50 55 60
Thr His Ser Ser Ile Lys Thr Asn Lys Lys Lys Val Cys Lys
70 75
Lys Leu Gly Ile Asn Asn Asn Asp Lys Val Leu Arg Val Cys
85 90 95
Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln
100 105 110
Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Lys Asn Gln Ser
115 120 125
Ser Ser Asn Gly Ser Cys Asn Asn Lys Asn Gln Asp Glu Cys
130 135 140
Lys Leu Glu Lys Val Phe Ala Ser Leu Thr Asn Gly Tyr Lys
150 155
Lys Cys Lys Ser Gly Thr Ser Arg Ser Lys Lys Lys Trp Ile
165 170 175
Lys Ser Ser Gly Asn Glu Glu Gly Leu Gln Lys Glu Tyr Ala
180 185 190
Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu Gly Asn
195 200 205
Lys Leu Glu Asn Val Cys Lys Gly Val Thr Asp Ile Asn Phe
210 215 220
Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Ala Ala Phe His
230 235
Lys Asn Leu Lys Thr Thr Tyr Pro Gln Asn Lys Lys Lys Leu
245 250 255
Asp Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp Leu Ile Lys
260 265 270
Pro
Ser
Cys
Asp
Val
Asp
Gly
Gln
Cys
160
Trp
Asn
Leu
Asp
Glu
240
Cys
Gly
- 78 031876
Thr Ser Ile 275 Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys 280 Asp Leu Glu 285 Leu Asn Leu
Gln Lys Ala Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Ile
290 295 300
Ser Thr Glu Gln His Thr Leu Tyr Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu
305 310 315 320
Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Leu Ala Met Lys His
325 330 335
Gly Ala Gly Met Asn Ser Thr Thr Cys Cys Gly Asp Gly Ser Val Thr
340 345 350
Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro
355 360 365
Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His Phe Cys Lys Gln
370 375 380
Arg Gln Glu Lys Val Asn Ala Val Ile Glu Asn Cys Asn Ser Cys Lys
385 390 395 400
Glu Cys Gly Asp Thr Cys Asn Gly Glu Cys Lys Thr Glu Cys Glu Lys
405 410 415
Lys Cys Lys Ile Glu Cys Glu Lys Tyr Lys Thr Phe Ile Glu Glu Cys
420 425 430
Val Thr Ala Val Gly Gly Thr Ser Gly Ser Pro Trp Ser Lys Arg Trp
435 440 445
Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys Tyr Ile Glu Asp Ala Lys Arg
450 455 460
Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Ile Thr Thr Gly Thr Ile
465 470 475 480
Ser Gly Glu Ser Ser Gly Ala Asn Ser Gly Val Thr Thr Thr Glu Asn
485 490 495
Lys Cys Val Gln Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp
500 505 510
Ile Gly Leu Thr Thr Pro Ser Ser Tyr Leu Ser Ile Val Leu Asp Asp
- 79 031876
515
520
525
Asn Ile 530 Cys Gly Ala Asp Asn 535 Ala Pro Trp Thr Thr 540 Tyr Thr Thr
Thr Thr Tyr Thr Thr Thr Lys Asn Cys Asp Ile Lys Lys Lys Thr
545 550 555
Lys Ser Gln Pro Ile Asn Thr Ser Val Val Val Asn Val Pro Ser
565 570 575
Leu Gly Asn Thr Pro His Gly Tyr Lys Tyr Ala Cys Gln Cys Lys
580 585 590
Pro Thr Thr 595 Glu Glu Ser Cys Asp 600 Asp Arg Lys Glu Tyr 605 Met Asn
Trp Ile Ile Asp Thr Ser Lys Lys Gln Lys Gly Ser Gly Ser Thr
610 615 620
Asn Asp Tyr Glu Leu Tyr Thr Tyr Asn Gly Val Lys Glu Thr Lys
625 630 635
Asn
Leu
640
Tyr
Pro
560
Pro
Ile
Gln
Pro
Lys
Lys
Ser
Ser
645
Ser
Ser
Lys
Leu
Asp
650 <210> 11 <211> 643 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 11
Ser 1 Tyr Val Lys Asp Asp 5 Pro Tyr Ser Ala 10 Glu Tyr Val Thr Lys 15
Ser Phe Ile Leu 20 Asn Ser Ser Asp Ala 25 Asn Thr Ser Ser Glu 30 Thr
Ser Lys Tyr 35 Tyr Asp Glu Val Cys 40 Asn Cys Asn Glu Ser 45 Glu Ile
Ser Val 50 Gly Gln Ala Gln Thr 55 Ser Gly Pro Ser Ser 60 Asn Lys Thr
Ile 65 Thr His Ser Ser Ile 70 Lys Thr Asn Lys Lys 75 Lys Val Cys Lys
Leu
Pro
Ser
Cys
Asp
- 80 031876
Val Lys Leu Gly Ile Asn 85 Asn Asn Asp Lys 90 Val Leu Arg Val Cys 95
Ile Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln
100 105 110
Leu Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Lys Asn Gln Ser
115 120 125
Ser Ser Ser Asn Gly Ser Cys Asn Asn Lys Asn Gln Asp Glu Cys
130 135 140
Lys Lys Leu Glu Lys Val Phe Ala Ser Leu Thr Asn Gly Tyr Lys
145 150 155
Asp Lys Cys Lys Ser Gly Thr Ser Arg Ser Lys Lys Lys Trp Ile
165 170 175
Arg Lys Ser Ser Gly Asn Glu Glu Gly Leu Gln Lys Glu Tyr Ala
180 185 190
Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu Gly Asn
195 200 205
Pro Lys Leu Glu Asn Val Cys Lys Gly Val Thr Asp Ile Ile Tyr
210 215 220
Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ser Gly Cys Leu Ile Ala Ala Phe His
225 230 235
Gly Lys Asn Leu Lys Thr Ser His Glu Lys Lys Asn Asp Asp Asn
245 250 255
Lys Lys Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly
260 265 270
Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Asp Phe Thr Lys Asp
275 280 285
Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr
290 295 300
Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu
305 310 315
Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp
Val
Asp
Gly
Gln
Cys
160
Trp
Asn
Leu
Asp
Glu
240
Gly
Asp
Leu
Ile
Asp
320
Thr
- 81 031876
325
Ala Met Lys His 340 Gly Ala Gly Met Asn 345
Gly Ser Val 355 Thr Gly Ser Gly Ser 360 Ser
Asp Leu 370 Ile Pro Gln Tyr Leu 375 Arg Phe
Phe 385 Cys Lys Gln Arg Gln 390 Glu Lys Val
Asn Ser Cys Lys Glu 405 Cys Gly Asp Thr
Glu Cys Lys Thr 420 Lys Cys Lys Gly Glu 425
Ile Glu Glu 435 Cys Asn Gly Thr Ala 440 Asp
Trp Ser 450 Lys Arg Trp Asp Gln 455 Ile Tyr
Glu 465 Asp Ala Lys Arg Asn 470 Arg Lys Ala
Ser Ser Thr Thr Asn 485 Ala Ala Ala Ser
Gln Ser Asp Ile 500 Asp Ser Phe Phe Lys 505
Thr Thr Pro 515 Ser Ser Tyr Leu Ser 520 Asn
Gly Glu 530 Asp Lys Ala Pro Trp 535 Thr Thr
Asn 545 Cys Asp Ile Gln Lys 550 Lys Thr Pro
Leu Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro
565
335
Thr Thr Cys Ser 350 Gly Asp
Asp Asp Met 365 Pro Thr Ile
Gln Glu 380 Trp Val Glu His
Asp 395 Val Ile Thr Asn Cys 400
Asn Gly Glu Cys Lys 415 Thr
Glu Lys Tyr Lys 430 Asn Phe
Gly Thr Ser 445 Gly Ser Ser
Arg Tyr 460 Ser Lys Tyr Ile
Thr 475 Lys Asn Cys Gly Thr 480
Thr Glu Asn Lys Cys 495 Val
Leu Ile Asp Ile 510 Gly Leu
Leu Asp Asp 525 Asn Ile Cys
Thr Thr 540 Tyr Thr Thr Lys
Pro 555 Gln Ser Cys Asp Thr 560
Gly Asn Thr Pro His 575 Gly
- 82 031876
Tyr Lys Tyr Val 580 Cys Glu Cys Lys Ile 585 Pro Thr Thr Glu Glu 590 Thr Cys
Asp Asp Arg Lys Glu Tyr Met Asn Gln Trp Ile Ile Asp Thr Ser Lys
595 600 605
Lys Gln Lys Gly Ser Gly Ser Thr Asn Asn Asp Tyr Glu Leu Tyr Thr
610 615 620
Tyr Asn Gly Val Gln Ile Lys Gln Ala Ala Gly Thr Leu Lys Asn Ser
625 630 635 640
Lys Leu Asp
<210> 12
<211> 269
<212> Белок
<213> Plasmodium falciparum
<400> 12
Asn 1 Tyr Ile Lys Gly 5 Asp Pro Tyr Ser Ala 10 Glu Tyr Ala Thr Lys 15 Leu
Ser Phe Ile Leu Asn Ser Ser Asp Thr Glu Asn Ala Ser Glu Lys Ile
20 25 30
Gln Lys Asn Asn Asp Glu Val Cys Asn Cys Asn Glu Ser Glu Ile Ala
35 40 45
Ser Val Glu Gln Ala Pro Ile Ser Asp Arg Ser Ser Gln Lys Ala Cys
50 55 60
Ile Thr His Ser Ser Ile Lys Ala Asn Lys Lys Lys Val Cys Lys His
65 70 75 80
Val Lys Leu Gly Val Arg Glu Asn Asp Lys Asp Leu Lys Ile Cys Val
85 90 95
Ile Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln Asp
100 105 110
Leu Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Ser Gly Ser
115 120 125
Ser Ser Asn Gly Ser Cys
Asn Asn Asn Asn Glu
130
135
Glu
140
Ile Cys
Gln Lys
- 83 031876
Lys 145 Leu Glu Lys Val Leu Ala 150 Ser Leu Thr Asn 155 Gly Tyr Lys Cys
Lys Cys Lys Ser Gly Thr Ser Thr Val Asn Lys Asn Trp Ile Trp
165 170 175
Lys Tyr Ser Gly Lys Glu Gly Gly Leu Gln Glu Glu Tyr Ala Asn
180 185 190
Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu Gly Asn Leu
195 200 205
Lys Leu Glu Asn Val Cys Glu Asp Val Lys Asp Ile Asn Phe Asp
210 215 220
Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Ala Ala Phe His Glu
225 230 235
Lys Asn Leu Lys Thr Ser Asn Lys Lys Lys Asn Asp Asp Asn Asn
245 250 255
Lys Leu Cys Lys Ala Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr
260 265
Asp
160
Lys
Thr
Pro
Thr
Gly
240
Ser <210>13 <211>344 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>13
Lys 1 Cys Asp Lys Cys 5 Lys Ser Gly Thr Ser Thr 10 Val Asn Lys Lys 15
Ile Trp Lys Lys 20 Tyr Ser Gly Thr Glu 25 Gly Gly Leu Gln Glu 30 Glu
Ala Asn Thr 35 Ile Ala Leu Pro Pro 40 Arg Thr Gln Ser Leu 45 Tyr Leu
Asn Leu 50 Pro Lys Leu Glu Asn 55 Val Cys Lys Asp Val 60 Thr Asp Ile
Phe 65 Asp Thr Lys Glu Lys 70 Phe Leu Ala Gly Cys 75 Leu Ile Ala Ala
His Glu Gly Lys Asn 85 Leu Lys Thr Thr Tyr 90 Leu Glu Lys Lys Lys 95
Trp
Tyr
Gly
Asn
Phe
Gly
- 84 031876
Asp Asn Gly Lys 100 Lys Asn Asp Asp Asn 105 Asn Ser Lys Leu Cys 110 Lys
Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr
115 120 125
Ile Trp Asp Asn Asp Phe Thr Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln
130 135 140
Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Ile Ala
145 150 155
Asp Glu Asn Thr Leu Tyr Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser
165 170 175
Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Leu Ala Met Lys His Gly
180 185 190
Gly Met Asn Ser Thr Met Cys Asn Ala Asp Gly Ser Val Thr Gly
195 200 205
Gly Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln
210 215 220
Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His Phe Cys Lys Gln Arg
225 230 235
Ala Lys Val Lys Asp Val Ile Thr Asn Cys Asn Ser Cys Lys Glu
245 250 255
Gly Gly Thr Cys Asn Gly Glu Cys Lys Thr Glu Cys Glu Lys Lys
260 265 270
Lys Gly Glu Cys Asp Ala Tyr Lys Lys Phe Ile Glu Glu Cys Lys
275 280 285
Lys Ala Asp Glu Gly Thr Ser Gly Ser Ser Trp Ser Lys Arg Trp
290 295 300
Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys Tyr Ile Glu Asp Ala Lys Arg
305 310 315
Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Pro Ser Ser Thr Thr Ser
325 330 335
Ala
Ser
Gln
Ser
160
Trp
Ala
Ser
Tyr
Gln
240
Cys
Cys
Gly
Asp
Asn
320
Thr
Ala Glu Ser Lys Cys Val Gln Ser
340
- 85 031876 <210>14 <211>334 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>14
Lys 1 Cys Asp Lys Cys 5 Lys Ser Glu Gln Ser Lys 10 Lys Asn Asn Asn 15 Ile
Trp Ile Trp Lys Lys Ser Ser Gly Thr Glu Gly Gly Leu Gln Lys Glu
20 25 30
Tyr Ala Asn Thr Ile Ala Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu
35 40 45
Gly Asn Leu Arg Lys Leu Glu Asn Val Cys Glu Asp Val Lys Asp Ile
50 55 60
Asn Phe Asp Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Ala Ala
65 70 75 80
Phe His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Lys Arg Tyr Leu Glu Lys Lys Asn
85 90 95
Gly Asp Asn Asn Ser Lys Leu Cys Lys Ala Leu Lys Tyr Ser Phe Ala
100 105 110
Asp Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr
115 120 125
Thr Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe Gly Lys Leu Phe
130 135 140
Arg Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln His Thr Ser Tyr
145 150 155 160
Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys
165 170 175
Tyr Ile Trp Leu Ala Met Lys His Gly Thr Thr Cys Ser Ser Gly Ser
180 185 190
Gly Asp Asn Gly Ser Ile Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu
195 200 205
Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His Phe Cys
210 215 220
- 86 031876
Glu 225 Gln Arg Gln Gly Lys 230 Val Asn Ala Val Ile Glu Asn 235 Cys Asn Ser 240
Cys Lys Asn Thr Ser Ser Lys Thr Lys Leu Gly Gly Thr Cys Asn Gly
245 250 255
Glu Cys Lys Thr Glu Cys Lys Gly Glu Cys Asp Ala Tyr Lys Glu Phe
260 265 270
Ile Glu Lys Cys Lys Gly Thr Ala Ala Glu Gly Thr Ser Gly Ser Ser
275 280 285
Trp Val Lys Arg Trp Tyr Gln Ile Tyr Met Arg Tyr Ser Lys Tyr Ile
290 295 300
Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Thr
305 310 315 320
Ser Ser Thr Thr Ser Thr Ala Glu Ser Lys Cys Val Gln Ser
325 330
<210>15 <211>332 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>15
Lys 1 Cys Asp Lys Cys 5 Lys Ser Glu Gln Ser Lys 10 Lys Asn Asn Asn 15 Ile
Trp Ile Trp Lys 20 Lys Ser Ser Gly Thr 25 Glu Gly Gly Leu Gln 30 Lys Glu
Tyr Ala Asn 35 Thr Ile Ala Leu Pro 40 Pro Arg Thr Gln Ser 45 Leu Tyr Leu
Gly Asn 50 Leu Arg Lys Leu Glu 55 Asn Val Cys Glu Asp 60 Val Lys Asp Ile
Asn 65 Phe Asp Thr Lys Glu 70 Lys Phe Leu Ala Gly 75 Cys Leu Ile Ala Ala 80
Phe His Glu Gly Lys 85 Asn Leu Lys Lys Arg 90 Tyr Leu Glu Lys Lys 95 Asn
Gly Asp Asn Asn 100 Ser Lys Leu Cys Lys 105 Ala Leu Lys Tyr Ser 110 Phe Ala
- 87 031876
Asp Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu 115 120 125
Thr Lys 130 Asp Leu Glu Leu Asn 135 Leu Gln Lys Ile Phe 140 Gly Lys Leu
Arg Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser
145 150 155
Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys
165 170 175
Tyr Ile Trp Thr Ala Met Lys His Gly Thr Thr Cys Ser Ser Gly
180 185 190
Gly Asp Asn Gly Ser Ile Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp
195 200 205
Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His Phe
210 215 220
Glu Gln Arg Gln Glu Lys Val Lys Asp Val Ile Lys Asn Cys Asn
225 230 235
Cys Lys Glu Cys Gly Gly Thr Cys Asn Gly Glu Cys Lys Thr Glu
245 250 255
Lys Asn Lys Cys Lys Asp Glu Cys Asp Ala Tyr Lys Lys Phe Ile
260 265 270
Glu Cys Glu Gly Lys Ala Ala Glu Gly Thr Ser Gly Ser Ser Trp
275 280 285
Lys
Arg
290
Trp
Asp
Gln
Ile
Tyr
295
Lys
Arg
Tyr
Ser
Lys
300
Tyr
Ile
Glu
Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Thr Ser 305 310 315
Tyr
Phe
Tyr
160
Lys
Ser
Leu
Cys
Ser
240
Cys
Glu
Ser
Asp
Ser
320
Thr Thr Ser Thr Ala Glu Asn Lys
Cys Val Gln Ser
325
330
<210> 16
<211> 267
<212> Белок
<213> Plasmodium falciparum
<400> 16
- 88 031876
Asn
Ser
Gln
Cys
Asn
Val
Ile
Leu
Ser
Lys
145
Glu
Trp
Asn
Leu
Asp
225
Glu
Tyr Ile Lys Asp 5 Asp Pro Tyr Ser Ala 10 Glu Tyr Thr Thr Lys 15
Phe Ile Leu Asn Ser Ser Asp Thr Glu Asn Ala Ser Glu Lys
20 25 30
Lys Asn Asn Asp Glu Val Cys Asn Pro Asn Glu Ser Gly Ile
35 40 45
Val Glu Leu Ala Gln Thr Ser Gly Ser Ser Ser Asn Lys Thr
50 55 60
Thr His Ser Phe Ile Lys Ala Asn Lys Lys Lys Val Cys Lys
70 75
Lys Leu Gly Ile Asn Lys Lys Asp Lys Asp Leu Lys Ile Cys
85 90 95
Glu Asp Asp Ser Leu Arg Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln
100 105 110
Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Lys Asn Gln Ser
115 120 125
Ser Ser Asn Gly Ser Cys Asn Asn Lys Asn Gln Glu Ala Cys
130 135 140
Lys Leu Glu Asn Val Phe Ala Ser Leu Thr Asn Gly Tyr Lys
150 155
Lys Cys Lys Ser Glu Gln Ser Lys Lys Asn Asn Lys Asn Trp
165 170 175
Lys Lys Tyr Ser Val Lys Glu Glu Gly Leu Gln Lys Glu Tyr
180 185 190
Thr Ile Ala Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu Gly
195 200 205
Pro Lys Leu Gly Asn Val Cys Lys Gly Val Thr Asp Ile Asn
210 215 220
Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Ala Ala Phe
230 235
Gly Lys Asn Leu Lys Thr Thr Tyr Leu Gln Asn Lys Lys Lys
245 250 255
Leu Ile Ala
Cys
Asp
Val
Asp
Gly
Gln Cys
160
Ile Ala Asn
Phe His
240
Leu
- 89 031876
Cys Lys Ala Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr
260 265
<210> 17
<211> 263
<212> Белок
<213> Plasmodium falciparum
<400> 17
Asp 1 Tyr Ile Lys Gly 5 Asp Pro Tyr Phe Ala 10 Glu Tyr Ala Thr Lys 15 Leu
Ser Phe Ile Leu Asn Ser Ser Asp Ala Asn Thr Ser Ser Gly Glu Thr
20 25 30
Ala Asn His Asn Asp Glu Ala Cys Asn Pro Asn Glu Ser Glu Ile Ala
35 40 45
Ser Val Glu Gln Ala Ser Ile Ser Asp Arg Ser Ser Gln Lys Ala Cys
50 55 60
Asn Thr His Ser Ser Ile Lys Ala Asn Lys Lys Lys Glu Cys Lys His
65 70 75 80
Val Lys Leu Gly Val Arg Glu Asn Asp Lys Asp Leu Lys Ile Cys Val
85 90 95
Ile Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln Asp
100 105 110
Leu Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Arg Gly Ser
115 120 125
Ser Ser Asn Gly Ser Cys Asp Lys Asn Ser Glu Glu Ile Cys Gln Lys
130 135 140
Lys Leu Asp Glu Ala Leu Ala Ser Leu His Asn Gly Tyr Lys Asn Gln
145 150 155 160
Lys Cys Lys Ser Glu Gln Ser Lys Lys Asn Lys Asn Lys Trp Ile Trp
165 170 175
Lys Lys Ser Ser Gly Asn Glu Lys Gly Leu Gln Lys Glu Tyr Ala Asn
180 185 190
Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu Gly Asn Leu
195 200 205
- 90 031876
Pro Lys 210 Leu Glu Asn Val Cys 215 Glu Asp Val Thr Asp 220 Ile Asn Phe Asp
Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Ala Ala Phe His Glu
225 230 235 240
Gly Lys Asn Leu Lys Thr Thr Tyr Pro Gln Asn Lys Asn Asp Asp Asn
245 250 255
Gly Lys Lys Leu Cys Lys Asp
260
<210>18 <211>338 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>18
Lys 1 Cys Asp Lys Cys 5 Lys Ser Glu Gln Ser 10 Lys Lys Asn Asn Asn 15 Ile
Trp Ile Trp Lys Lys Ser Ser Gly Asn Lys Lys Gly Leu Gln Lys Glu
20 25 30
Tyr Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu
35 40 45
Gly Asn Leu Pro Lys Leu Glu Asn Val Cys Lys Asp Val Thr Asp Ile
50 55 60
Asn Phe Asp Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Ala Ala
65 70 75 80
Phe His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Ile Ser Asn Glu Lys Lys Asn Asp
85 90 95
Asp Asn Gly Lys Lys Leu Cys Lys Asp Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp
100 105 110
Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr
115 120 125
Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Asn Asn Phe Gly Lys Leu Phe Arg
130 135 140
Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln His Thr Leu Tyr Ser
145 150 155 160
- 91 031876
Ser
Leu
Asp
Glu
Leu
165
Arg
Glu
Ser
Trp
Trp
170
Asn
Thr
Asn
Lys
Lys
175
Ile
Trp
Leu
Ala
180
Met
Lys
His
Gly
Thr
185
Thr
Cys
Ser
Ser
Gly
190
Ser
Asp
Asn
Gly
195
Asp
Gly
Ser
Val
Thr
200
Gly
Ser
Gly
Ser
Ser
205
Cys
Asp
Met
Ser
210
Thr
Ile
Asp
Leu
Ile
215
Pro
Gln
Tyr
Leu
Arg
220
Phe
Leu
Gln
Trp
225
Val
Glu
His
Phe
Cys
230
Lys
Gln
Arg
Gln
Glu
235
Lys
Val
Asn
Ala
Ile
Glu
Asn
Cys
Asn
245
Ser
Cys
Lys
Asn
Thr
250
Ser
Ser
Lys
Thr
Lys
255
Gly
Gly
Thr
Cys
260
Asn
Gly
Glu
Cys
Lys
265
Thr
Glu
Cys
Glu
Lys
270
Lys
Lys
Asp
Glu
275
Cys
Glu
Lys
Tyr
Lys
280
Glu
Phe
Ile
Glu
Glu
285
Cys
Lys
Gly
Asp
290
Gly
Thr
Ala
Gly
Ser
295
Pro
Trp
Val
Lys
Arg
300
Trp
Asp
Gln
Tyr
305
Met
Arg
Tyr
Ser
Lys
310
Tyr
Ile
Glu
Asp
Ala
315
Lys
Arg
Asn
Arg
Ala
Gly
Thr
Lys
Ser
325
Cys
Gly
Thr
Ser
Ala
330
Ala
Glu
Asn
Lys
Cys
335
Tyr
Gly
Asp
Glu
Val
240
Leu
Cys
Arg
Ile
Lys
320
Val
Gln
Ser <210>
<211>
<212>
<213>
341
Белок
Plasmodium falciparum <400>
Lys Cys Asp
Lys
Cys Lys Ser Glu
Gln
Ser
Lys
Lys
Asn
Asn
Asn
Trp Ile Trp
Lys
Lys Ser Ser Gly
Asp
Glu
Lys
Gly
Leu
Gln
Lys
Ile
Glu
- 92 031876
Tyr Ala Asn 35 Thr Ile Ala Leu Pro 40 Pro Arg Thr Gln Ser 45 Leu Tyr Leu
Gly Asn Leu Pro Lys Leu Glu Asn Val Cys Lys Asp Val Thr Asp Ile
50 55 60
Asn Phe Asp Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Ala Ala
65 70 75 80
Phe His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Thr Ser His Gln Asn Lys Asn Ala
85 90 95
Asp Asn Gly Lys Lys Asn Asp Asp Asn Gly Lys Lys Leu Cys Lys Ala
100 105 110
Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser
115 120 125
Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Gln
130 135 140
Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr Ile Lys Arg Asn Asn Thr Ala
145 150 155 160
Glu Gln His Thr Leu Tyr Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp
165 170 175
Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Leu Ala Met Lys His Gly Thr
180 185 190
Thr Cys Ser Ser Gly Ser Gly Asp Asn Gly Asp Gly Ser Val Thr Gly
195 200 205
Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp Met Ser Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln
210 215 220
Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His Phe Cys Lys Gln Arg
225 230 235 240
Gln Glu Lys Val Lys Asp Val Ile Thr Asn Cys Asn Ser Cys Lys Glu
245 250 255
Cys Gly Gly Thr Cys Gly Ser Asp Cys Lys Thr Lys Cys Glu Ala Tyr
260 265 270
Lys Lys Phe Ile Glu Glu Cys Asn Gly Thr Ala Asp Gly Gly Thr Ser
- 93 031876
275
280
285
Gly Ser Ser Trp Ser Lys Arg 295 Trp Asp Gln Ile Tyr 300 Lys Arg Tyr Ser
290
Lys Tyr Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn
305 310 315 320
Cys Gly Pro Ser Ser Gly Ala Asn Ser Gly Val Thr Thr Thr Glu Asn
325 330 335
Lys Cys Val Gln Ser
340 <210>20 <211>352 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>20
Lys 1 Cys Glu Lys Cys 5 Glu Ser Glu Gln Ser 10 Lys Lys Asn Asn Lys 15 Tyr
Trp Ile Trp Lys Lys Ser Ser Gly Asn Gly Glu Gly Leu Gln Glu Glu
20 25 30
Tyr Ala Asn Thr Ile Ala Leu Pro Pro Arg Thr His Ser Leu Cys Leu
35 40 45
Val Cys Leu His Glu Lys Glu Gly Lys Lys Thr Gln Glu Leu Lys Asn
50 55 60
Ile Arg Thr Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Arg Ile Ile Ala Ala Phe
65 70 75 80
His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Thr Ser Pro Gln Asn Lys Asn Asp Asn
85 90 95
Gly Lys Lys Leu Cys Lys Asp Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly
100 105 110
Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp
115 120 125
Leu Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr
130 135 140
Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln His Thr Leu Tyr Ser Ser Leu
- 94 031876
145
150
155
Asp Glu Leu Arg Glu 165 Ser Trp Trp Asn Thr 170 Asn Lys Lys Tyr Ile 175
Leu Ala Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Ser Thr Met Cys Asn
180 185 190
Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser Ser Asp Ser Gly Ser Thr Thr Cys
195 200 205
Gly Asp Asn Gly Ser Ile Ser Cys Asp Asp Met Pro Thr Ile Asp
210 215 220
Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His Phe
225 230 235
Glu Gln Arg Gln Glu Lys Val Asn Ala Val Ile Thr Asn Cys Lys
245 250 255
Cys Lys Glu Cys Gly Gly Thr Cys Asn Ser Asp Cys Glu Lys Lys
260 265 270
Lys Ala Tyr Lys Glu Phe Ile Glu Lys Cys Lys Gly Gly Gly Thr
275 280 285
Gly Thr Ser Gly Ser Ser Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr
290 295 300
Arg His Ser Lys His Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala
305 310 315
Thr Lys Asn Cys Gly Ile Thr Thr Gly Thr Ile Ser Gly Glu Ser
325 330 335
Gly Ala Asn Ser Gly Val Thr Thr Thr Glu Asn Lys Cys Val Gln
340 345 350
160
Trp
Ala
Cys
Leu
Cys
240
Ser
Cys
Glu
Lys
Gly
320
Ser
Ser
<210> 21
<211> 344
<212> Белок
<213> Plasmodium falciparum
<400> 21
Lys Cys Asp Lys Cys Lys Ser Gly Thr Ser Arg Ser Arg Lys Ile
5 10 15
Thr Trp Arg Lys
Phe Arg Gly Asn Gly Glu Gly Leu Gln Lys
Glu
Trp
Tyr
- 95 031876
Ala
Cys
Thr
Gly
Gly
Asp
Leu
Ile
145
Asp
Thr
Asp
Gly
Thr
225
Glu
Asn
Asn Thr 35 Ile Gly Leu Ser Pro 40 Arg Thr Gln Leu Leu 45 Tyr Leu Val
Leu His Glu Lys Gly Lys Lys Thr Gln Glu Leu Lys Asn Ile Ser
50 55 60
Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu
70 75 80
Lys Asn Leu Lys Thr Thr Tyr Pro Gln Lys Lys Asn Asp Asp Asn
85 90 95
Lys Lys Leu Cys Lys Ala Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly
100 105 110
Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Asp Phe Thr Lys Asp
115 120 125
Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr
130 135 140
Lys Lys Asn Ile Ala Ser Asp Glu Asn Thr Ser Tyr Ser Ser Leu
150 155 160
Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp
165 170 175
Ala Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Gly Thr Thr Cys Cys Gly
180 185 190
Gly Ser Val Thr Gly Ser Ser Asp Ser Gly Ser Thr Thr Cys Cys
195 200 205
Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro
210 215 220
Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val
230 235 240
His Phe Cys Glu Gln Arg Gln Glu Lys Val Lys Asp Val Ile Thr
245 250 255
Cys Lys Ser Cys Lys Glu Ser Glu Lys Lys Cys Lys Asn Lys Cys
260 265 270
- 96 031876
Asp Ala Tyr Lys Glu Phe Ile Asp 280 Gly Thr Gly Ser Gly Gly Gly 285 Thr
275
Gly Thr Ala Gly Ser Ser Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Met
290 295 300
Arg Tyr Ser Lys Tyr Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly
305 310 315 320
Thr Lys Asn Cys Gly Thr Ser Ser Gly Ala Asn Ser Gly Val Thr Thr
325 330 335
Thr Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser
340
<210>22 <211>350 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>22
Lys 1 Cys Glu Lys Cys 5 Lys Ser Glu Gln Ser 10 Lys Lys Asn Asn Lys 15 Ile
Trp Thr Trp Arg Lys Phe Pro Gly Asn Gly Glu Gly Leu Gln Lys Glu
20 25 30
Tyr Ala Asn Thr Ile Gly Leu Ser Pro Arg Thr Gln Leu Leu Tyr Leu
35 40 45
Val Cys Leu His Glu Lys Gly Lys Lys Thr Gln His Lys Thr Ile Ser
50 55 60
Thr Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu
65 70 75 80
Gly Lys Asn Leu Lys Lys Arg Tyr Leu Glu Lys Lys Lys Gly Asp Asn
85 90 95
Asn Ser Lys Leu Cys Lys Asp Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly
100 105 110
Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Asp Phe Thr Lys Asp
115 120 125
Leu Glu Leu Asn Leu Gln Gln Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr
130 135 140
- 97 031876
Ile 145 Lys Lys Asn Ile Ala 150 Ser Asp Glu Asn Thr 155 Ser Tyr Ser Ser
Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile
165 170 175
Thr Ala Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Ser Thr Met Cys Asn
180 185 190
Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser Ser Asp Ser Gly Ser Thr Thr Cys
195 200 205
Gly Asp Asn Gly Ser Ile Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp
210 215 220
Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His Phe
225 230 235
Glu Gln Arg Gln Glu Lys Val Lys Asp Val Ile Lys Asn Cys Asn
245 250 255
Cys Lys Glu Cys Gly Gly Thr Cys Asn Gly Glu Cys Lys Thr Glu
260 265 270
Lys Asn Lys Cys Lys Asp Glu Cys Glu Lys Tyr Lys Asn Phe Ile
275 280 285
Val Cys Thr Gly Gly Asp Gly Thr Ala Gly Ser Pro Trp Ser Lys
290 295 300
Trp Tyr Gln Ile Tyr Met Arg Tyr Ser Lys Tyr Ile Glu Asp Ala
305 310 315
Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Ser Cys Gly Thr Ser Ser Gly
325 330 335
Asn Ser Gly Val Thr Thr Thr Glu Ser Lys Cys Val Gln Ser
340 345 350
Leu
160
Trp
Gly
Ser
Leu
Cys
240
Ser
Cys
Glu
Arg
Lys
320
Ala
<210> 23
<211> 359
<212> Белок
<213> Plasmodium falciparum
<400> 23
Lys Cys Glu Lys Cys Lys Ser Glu
5
Gln
Ser
Lys
Lys
Asn
Asn
Lys
Asn
- 98 031876
Trp Ile Trp Arg 20 Lys Phe Pro Gly Asn 25 Gly Glu Gly Leu Gln 30 Lys
Tyr Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr His Ser Leu Tyr
35 40 45
Val Cys Leu His Glu Lys Gly Lys Lys Thr Gln Glu Leu Lys Asn
50 55 60
Arg Thr Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe
65 70 75
Glu Gly Lys Asn Leu Lys Lys Arg Tyr His Gln Asn Asn Asn Ser
85 90 95
Asn Lys Lys Lys Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp
100 105 110
Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr
115 120 125
Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Gln Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg
130 135 140
Tyr Ile Lys Lys Asn Ile Ser Thr Glu Gln Asp Thr Leu Tyr Ser
145 150 155
Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr
165 170 175
Trp Leu Ala Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Ser Thr Thr Cys
180 185 190
Gly Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser Ser Asp Ser Gly Ser Thr Thr
195 200 205
Ser Gly Asp Asn Gly Ser Ile Ser Cys Asp Asp Met Pro Thr Ile
210 215 220
Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His
225 230 235
Cys Glu Gln Arg Gln Glu Lys Val Lys Asp Val Ile Glu Asn Cys
245 250 255
Ser Cys Lys Asn Thr Ser Gly Glu Arg Ile Ile Gly Gly Thr Cys
260 265 270
Glu
Leu
Ile
His
Gly
Tyr
Lys
Lys
Ser
160
Ile
Cys
Cys
Asp
Phe
240
Lys
Asn
- 99 031876
Gly Glu Cys Lys Thr Glu Cys Glu 280 Lys Lys Cys Lys Ala 285 Ala Cys
275
Ala Tyr Lys Thr Phe Ile Glu Glu Cys Glu Gly Lys Ala Ala Glu
290 295 300
Thr Ser Gly Ser Ser Trp Ser Lys Arg Trp Tyr Gln Ile Tyr Met
305 310 315
Tyr Ser Lys Tyr Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly
325 330 335
Lys Asn Cys Gly Lys Ser Ser Gly Ala Asn Ser Gly Val Thr Thr
340 345 350
Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser
355
Glu
Gly
Arg
320
Thr
Thr
<210> 24
<211> 270
<212> Белок
<213> Plasmodium falciparum
<400> 24
Asn 1 Tyr Ile Lys Asp 5 Asp Pro Tyr Ser Lys 10 Glu Tyr Val Thr Lys 15
Ser Phe Ile Pro Asn Ser Ser Asp Ala Asn Asn Pro Ser Gly Glu
20 25 30
Ala Asn His Asn Asp Glu Val Cys 40 Asn Pro Asn Glu Ser 45 Glu Ile
35
Ser Val 50 Glu His Ala Gln Thr 55 Ser Val Leu Leu Ser 60 Gln Lys Ala
Ile 65 Thr His Ser Ser Ile 70 Lys Ala Asn Lys Lys 75 Lys Val Cys Lys
Val Lys Leu Gly Val 85 Arg Glu Asn Asp Lys 90 Asp Leu Lys Ile Cys 95
Ile Glu Asp Asp 100 Ser Leu Arg Gly Val 105 Glu Asn Cys Cys Phe 110 Lys
Phe Leu Arg Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Arg Glu
115 120 125
Leu
Thr
Ser
Tyr
Tyr
Val
Asp
Ser
- 100 031876
Ser Ser 130 Asn Gly Ser Cys Asn 135 Asn Asn
Asn 145 Leu Asp Glu Ala Leu 150 Ala Ser Leu
Lys Cys Lys Ser Gly 165 Thr Ser Thr Val
Lys Lys Ser Ser 180 Gly Lys Glu Gly Gly 185
Thr Ile Gly 195 Leu Pro Pro Arg Thr 200 Gln
Leu Asp 210 Glu Lys Glu Gly Lys 215 Thr Gln
Asn 225 Ser Glu Leu Leu Lys 230 Glu Trp Ile
Lys Asn Leu Lys Lys 245 Arg Tyr His Gln
Ser Lys Leu Cys 260 Lys Ala Leu Lys Tyr 265
<210>25 <211>334 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>25
Lys 1 Cys Asp Lys Cys 5 Lys Ser Glu Gln
Trp Ile Trp Lys 20 Lys Tyr Ser Val Lys 25
Tyr Ala Asn 35 Thr Ile Ala Leu Pro 40 Pro
Val Val 50 Cys Leu Asp Glu Lys 55 Glu Gly
Ile 65 Arg Thr Asn Ser Glu 70 Leu Leu Lys
Glu Glu Ala Cys Glu Lys
140
Asn Cys Tyr Lys Asn Gln
155 160
Asn Asn Lys Trp Ile Trp
175
Gln Lys Glu Tyr Ala Asn
190
Leu Cys Leu Val Val Cys
205
Leu Lys Asn Ile Arg Thr
220
Ala Ala Phe His Glu Gly
235 240
Lys Asn Asp Asp Asn Asn
255
Phe Ala Asp Tyr
270
Lys Lys Asn Asn Lys Tyr
Gly Gly Leu Gln Lys Glu
Thr Gln Ser Leu Cys Leu
Thr Gln Glu Leu Lys Asn
Arg Ile Ile Ala Ala Phe
80
- 101 031876
His
Asp
Gly
Asp
Tyr
145
Leu
Trp
Cys
Gln
Arg
225
Glu
Lys
Glu
Trp
Arg
305
Asn
Glu Gly Lys Asn 85 Leu Lys Thr Tyr His 90 Glu Lys Lys Lys Gly 95 Asp
Gly Lys Lys Leu Cys Lys Asp Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr
100 105 110
Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Asp Phe Thr Lys
115 120 125
Leu Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys
130 135 140
Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln His Thr Ser Tyr Ser Ser
150 155 160
Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile
165 170 175
Thr Ala Met Lys His Gly Ala Glu Met Asn Gly Thr Thr Cys Ser
180 185 190
Ser Gly Asp Ser Ser Asn Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro
195 200 205
Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His Phe Cys Glu Gln
210 215 220
Gln Ala Lys Val Asn 230 Ala Val Ile Lys Asn 235 Cys Lys Ser Cys Lys 240
Cys Gly Gly Thr Cys Asn Gly Glu Cys Lys Thr Glu Cys Lys Thr
245 250 255
Cys Lys Gly Glu Cys Glu Lys Tyr Lys Glu Phe Ile Glu Lys Cys
260 265 270
Gly Gln Ala Ala Glu Gly Thr Ser Gly Ser Ser Trp Ser Lys Arg
275 280 285
Tyr Gln Ile Tyr Met Arg Tyr Ser Lys Tyr Ile Glu Asp Ala Lys
290 295 300
Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Thr Ser Ser Gly Ala
310 315 320
Ser Gly Val Thr Thr Thr Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser
325 330
- 102 031876 <210>26 <211>351 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>26
Lys 1 Cys Asp Lys Cys 5 Lys Ser Glu Gln
Trp Ile Trp Lys 20 Lys Tyr Ser Gly Thr 25
Tyr Ala Asn 35 Thr Ile Ala Leu Pro 40 Pro
Val Cys 50 Leu His Glu Lys Glu 55 Glu Lys
Ser 65 Thr Asn Ser Glu Leu 70 Leu Lys Glu
Glu Gly Lys Asn Leu 85 Lys Ile Ser Pro
Lys Asn Leu Cys 100 Lys Asp Leu Lys Tyr 105
Leu Ile Lys 115 Gly Thr Ser Ile Trp 120 Asp
Glu Leu 130 Asn Leu Gln Gln Ile 135 Phe Gly
Lys 145 Lys Asn Asn Thr Ala 150 Glu Gln Asp
Glu Leu Arg Glu Ser 165 Trp Trp Asn Thr
Ala Met Lys His 180 Gly Ala Gly Met Asn 185
Gly Ser Val 195 Thr Gly Ser Ser Asp 200 Ser
Asp Gly 210 Ser Val Thr Gly Ser 215 Gly Ser
Lys Lys Asn Asn Lys 15 Asn
Gly Gly Leu Gln 30 Lys Glu
Thr Gln Ser 45 Leu Tyr Leu
Gln Glu 60 Leu Lys Asn Ile
Ile 75 Ile Ala Ala Phe His 80
Asn Lys Asn Asp Asn 95 Gly
Phe Ala Asp Tyr 110 Gly Asp
Asp Phe Thr 125 Lys Asp Leu
Leu Phe 140 Arg Lys Tyr Ile
Leu 155 Tyr Ser Ser Leu Asp 160
Lys Lys Tyr Ile Trp 175 Thr
Thr Thr Cys Cys 190 Gly Asp
Ser Thr Thr 205 Cys Cys Gly
Cys Asp 220 Asp Ile Pro Thr
- 103 031876
Ile Asp 225 Leu Ile Pro Gln Tyr 230 Leu Arg Phe Leu Gln 235 Glu Trp Val Glu 240
His Phe Cys Glu Gln Arg Gln Ala Lys Val Lys Asp Val Ile Lys Asn
245 250 255
Cys Asn Ser Cys Lys Glu Cys Gly Gly Thr Cys Asn Gly Glu Cys Lys
260 265 270
Thr Glu Cys Glu Lys Lys Cys Lys Gly Glu Cys Glu Ala Tyr Lys Lys
275 280 285
Phe Ile Glu Lys Cys Asn Gly Gly Gly Gly Glu Gly Thr Ser Gly Ser
290 295 300
Ser Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Met Arg Tyr Ser Lys Tyr
305 310 315 320
Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly
325 330 335
Thr Ser Ser Thr Thr Asn Ala Ala Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser
340 345 350
<210>27 <211>353 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>27
Lys 1 Cys Asp Lys Cys 5 Lys Ser Gly Thr Ser 10 Thr Val Asn Lys Lys 15 Trp
Ile Trp Lys Lys 20 Phe Pro Gly Lys Glu 25 Gly Gly Leu Gln Glu 30 Glu Tyr
Ala Asn Thr 35 Ile Ala Leu Pro Pro 40 Arg Thr Gln Ser Leu 45 Cys Leu Val
Val Cys 50 Leu Asp Glu Lys Glu 55 Gly Lys Thr Gln His 60 Lys Thr Ile Ser
Thr 65 Asn Ser Glu Leu Leu 70 Lys Glu Trp Ile Ile 75 Ala Ala Phe His Glu 80
Gly Lys Asn Leu Lys Ile Ser Asn Lys 85
Lys Lys Asn Asp Glu Asn Asn
95
- 104 031876
Ser
Leu
Glu
Lys
145
Glu
Ala
Asp
Gly
Thr
225
Glu
Asn
Thr
Tyr
Gly
305
Lys
Cys
Lys Leu Cys 100 Lys Asp Leu Lys Tyr 105 Ser Phe Ala Asp Tyr 110 Gly Asp
Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Asp Phe Thr Lys Asp Leu
115 120 125
Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr Ile
130 135 140
Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp
150 155 160
Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Leu
165 170 175
Met Lys His Gly Thr Thr Cys Ser Ser Gly Ser Gly Asp Asn Gly
180 185 190
Gly Ser Val Thr Gly Ser Ser Asp Ser Gly Ser Thr Thr Cys Cys
195 200 205
Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro
210 215 220
Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val
230 235 240
His Phe Cys Lys Gln Arg Gln Ala Lys Val Lys Asp Val Ile Glu
245 250 255
Cys Lys Ser Cys Lys Asn Thr Ser Ser Lys Thr Lys Leu Gly Asp
260 265 270
Cys Asn Ser Asp Cys Lys Thr Lys Cys Lys Val Ala Cys Glu Lys
275 280 285
Lys Glu Phe Ile Glu Lys Cys Val Ser Ala Ala Gly Gly Thr Ser
290 295 300
Ser Ser Trp Val Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Met Arg Tyr Ser
310 315 320
Tyr Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn
325 330 335
Gly Pro Ser Ser Thr Thr Ser Thr Ala Glu Ser Lys Cys Val Gln
- 105 031876
340 345
350
Ser <210>28 <211>327 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>28
Lys 1 Cys Asp Lys Cys 5 Lys Ser Gly Thr Ser 10 Thr Val Asn Lys Lys 15 Trp
Ile Trp Lys Lys Tyr Ser Gly Lys Glu Gly Gly Leu Gln Lys Glu Tyr
20 25 30
Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Cys Leu Val
35 40 45
Cys Leu His Glu Lys Glu Gly Lys Thr Gln Glu Leu Lys Asn Ile Ser
50 55 60
Thr Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu
65 70 75 80
Gly Lys Asn Leu Lys Ile Ser Asn Lys Lys Lys Asn Asp Asp Asn Gly
85 90 95
Lys Lys Leu Cys Lys Asp Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp
100 105 110
Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Asp Phe Thr Lys Asp Leu
115 120 125
Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr Ile
130 135 140
Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Leu Tyr Ser Ser Leu Asp
145 150 155 160
Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Thr
165 170 175
Ala Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Ser Thr Thr Cys Ser Cys Ser
180 185 190
Gly Asp Ser Ser Asn Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr
- 106 031876
195
200
205
Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp 215 Val Glu His Phe Cys 220 Lys Gln Arg
210
Glu Lys Val Asn Ala Val Ile Thr Asn Cys Lys Ser Cys Lys Glu
225 230 235
Gly Gly Thr Cys Asn 245 Ser Asp Cys Glu Lys 250 Lys Cys Lys Ile Glu 255
Glu Lys Tyr Lys Asn Phe Ile Glu Lys Cys Val Thr Ala Ala Gly
260 265 270
Thr Ser Gly Ser Ser Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys
275 280 285
Tyr Ser Lys Tyr Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly
290 295 300
Lys Asn Cys Gly Pro Ser Ser Thr Thr Asn Ala Ala Ala Ser Thr
305 310 315
Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser
325
Thr
Asp
320
Gln
Ser
240
Cys
Gly
Met
<210> 29
<211> 628
<212> Белок
<213> Искусственная
<220>
<223> Искусственная конструкция
<400> 29
Asn Tyr Ile Lys Gly Asp Pro Tyr Phe Ala Glu Tyr Ala Thr Lys
1 5 10 15
Leu
Ser Phe Ile Leu Asn 20 Ser Ser Asp Thr 25 Glu Asn Ala Ser Glu 30 Thr
Ser Lys Tyr 35 Tyr Asp Glu Ala Cys 40 Asn Cys Asn Glu Ser 45 Glu Ile
Ser Val 50 Gly Gln Ala Gln Thr 55 Ser Gly Pro Ser Ser 60 Asn Lys Thr
Ile Thr His Ser Ser Ile Lys Thr Asn Lys Lys Lys Glu Cys Lys
70 75
Pro
Ala
Cys
Asp
- 107 031876
Val
Ile
Leu
Ser
Lys
145
Lys
Lys
Ile
Glu
Leu
225
Lys
Lys
Thr
Gln
Thr
305
Ser
Lys Leu Gly Ile 85 Asn Asn Asn Asp Lys 90 Val Leu Arg Val Cys 95 Val
Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln Asp
100 105 110
Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Arg Gly Ser
115 120 125
Ser Asn Gly Ser Cys Asp Lys Asn Ser Glu Glu Ile Cys Gln Lys
130 135 140
Leu Glu Lys Val Phe Ala Ser Leu Thr Asn Gly Tyr Lys Cys Asp
150 155 160
Cys Lys Ser Gly Thr Ser Arg Ser Lys Lys Lys Trp Ile Trp Lys
165 170 175
Ser Ser Gly Asn Glu Glu Gly Leu Gln Lys Glu Tyr Ala Asn Thr
180 185 190
Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Cys Leu Val Cys Leu His
195 200 205
Lys Glu Gly Lys Thr Gln His Lys Thr Ile Ser Thr Asn Ser Glu
210 215 220
Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu Gly Lys Asn Leu
230 235 240
Thr Ser His Glu Lys Lys Asn Asp Asp Asn Gly Lys Lys Leu Cys
245 250 255
Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly
260 265 270
Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu
275 280 285
Lys Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Asn
290 295 300
Ala Glu Gln His Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu
310 315 320
Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Thr Ala Met Lys His
- 108 031876
325
330
335
Gly
Asn
Gln
Ala
385
Asn
Glu
Pro
Ile
Thr
465
Val
Leu
Cys
Thr
Asp
545
His
Ala Gly Met Asn 340 Gly Thr Thr Cys 345 Ser Cys Ser Gly Asp 350 Ser Ser
Asp Met Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu
355 360 365
Glu Trp Val Glu His Phe Cys Lys Gln Arg Gln Glu Lys Val Asn
370 375 380
Val Ile Glu Asn Cys Asn Ser Cys Lys Glu Ser Gly Gly Thr Cys
390 395 400
Ser Asp Cys Lys Thr Glu Cys Lys Asn Lys Cys Glu Ala Tyr Lys
405 410 415
Phe Ile Glu Asp 420 Cys Lys Gly Gly 425 Gly Thr Gly Thr Ala 430 Gly Ser
Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys His
435 440 445
Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly
450 455 460
Ser Ser Thr Thr Asn Ala Ala Ala Ser Thr Asp Glu Asn Lys Cys
470 475 480
Gln Ser Asp Val Asp Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp Ile Gly
485 490 495
Thr Thr Pro Ser Ser Tyr Leu Ser Asn Val Leu Asp Asp Asn Ile
500 505 510
Gly Ala Asp Lys Ala Pro Trp Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr
515 520 525
Lys Asn Cys Asp Ile Gln Lys Lys Thr Pro Lys Ser Gln Ser Cys
530 535 540
Thr Leu Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro Leu Gly Asn Thr Pro
550 555 560
Glu Tyr Lys Tyr Ala Cys Glu Cys
565
Lys Ile Pro Thr Thr Glu Glu
570 575
- 109 031876
Thr Cys Asp Asp 580 Arg Lys Glu Tyr Met Asn Gln 585 Trp Ser Cys 590 Gly
Ala Gln Thr Val Arg Gly Arg Ser Gly Lys Asp Asp Tyr Glu Leu
595 600 605
Thr Tyr Asn Gly Val Lys Glu Thr Lys Pro Leu Gly Thr Leu Lys
610 615 620
Ser Lys Leu Asp
625
<210> 30
<211> 350
<212> Белок
<213> Plasmodium falciparum
<400> 30
Lys Cys Glu Lys Cys Lys Ser Glu Gln Ser Lys Lys Asn Asn Lys
1 5 10 15
Trp Ile Trp Arg Lys Phe Arg Gly Thr Glu Gly Gly Leu Gln Glu
20 25 30
Tyr Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Cys
35 40 45
Val Val Cys Leu Asp Glu Lys Gly Lys Lys Thr Gln Glu Leu Lys
50 55 60
Ile Arg Thr Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala
65 70 75
His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Pro Ser His Gln Asn Lys Asn Ser
85 90 95
Asn Lys Glu Asn Leu Cys Lys Ala Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp
100 105 110
Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Asp Phe Thr
115 120 125
Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg
130 135 140
Tyr Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln His Thr Ser Tyr Ser
145 150 155
Ser
Tyr
Asn
Asn
Glu
Leu
Asn
Phe
Gly
Tyr
Lys
Lys
Ser
160
- 110 031876
Leu Asp Glu Leu Arg 165 Glu Ser Trp Trp Asn Thr 170 Asn Lys Lys Tyr 175
Trp Thr Ala Met Lys His Gly Ala Glu Met Asn Gly Thr Thr Cys
180 185 190
Ala Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser Ser Asp Ser Gly Ser Thr Thr
195 200 205
Ser Gly Asp Asn Gly Ser Ile Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile
210 215 220
Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His
225 230 235
Cys Lys Gln Arg Gln 245 Glu Lys Val Asn Ala Val 250 Ile Asn Ser Cys 255
Ser Cys Lys Asn Thr Ser Ser Lys Thr Lys Leu Gly Asp Thr Cys
260 265 270
Ser Asp Cys Lys Thr Lys Cys Lys Ile Glu Cys Glu Lys Tyr Lys
275 280 285
Phe Ile Glu Lys Cys Val Thr Ala Ala Gly Gly Thr Ser Gly Ser
290 295 300
Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys Tyr
305 310 315
Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly
325 330 335
Ser Ser Thr Thr Ser Thr Ala Glu Ser Lys Cys Val Gln Ser
340 345 350
Ile
Asn
Cys
Asp
Phe
240
Asn
Asn
Thr
Pro
Ile
320
Pro
<210> 31
<211> 330
<212> Белок
<213> Plasmodium falciparum
<400> 31
Lys Cys Asp Lys Cys Lys Ser Glu Gln Ser Lys Lys Asn Asn Lys
1 5 10 15
Trp Ile Trp Arg Lys Tyr Ser Gly Asn Gly Glu Gly Leu Gln Lys
20 25 30
Asn
Glu
- 111 031876
Tyr Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro 40 Pro Arg Thr His Ser 45 Leu Tyr
35
Val Cys Leu His Glu Lys Glu Gly Lys Thr Gln Glu Leu Lys Asn
50 55 60
Arg Thr Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe
65 70 75
Glu Gly Lys Asn Leu Lys Thr Thr Tyr Leu Glu Asn Lys Asn Asp
85 90 95
Asn Lys Lys Lys Leu Cys Lys Ala Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp
100 105 110
Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Asp Phe Thr
115 120 125
Asp Leu 130 Glu Leu Asn Leu Gln Lys 135 Ile Phe Gly Lys 140 Leu Phe Arg
Tyr Ile Lys Lys Asn Ile Ala Ser Asp Glu Asn Thr Leu Tyr Ser
145 150 155
Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr
165 170 175
Trp Thr Ala Met Lys His Gly Ala Glu Met Asn Gly Thr Thr Cys
180 185 190
Ser Gly Ser 195 Gly Asp Asn Gly Ser 200 Ile Ser Cys Asp Asp 205 Ile Pro
Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val
210 215 220
His Phe Cys Lys Gln Arg Gln Glu Lys Val Asn Ala Val Ile Thr
225 230 235
Cys Asn Ser Cys Lys 245 Glu Ser Gly Gly Thr Cys 250 Asn Ser Asp Cys 255
Lys Lys Cys Lys Ile Glu Cys Glu Lys Tyr Lys Lys Phe Ile Glu
260 265 270
Cys Arg Thr Ala Ala Gly Gly Thr Ser Gly Ser Pro Trp Ser Lys
275 280 285
Leu
Ile
His
Glu
Tyr
Lys
Lys
Ser
160
Ile
Ser
Thr
Gly
Asn
240
Glu
Glu
Arg
- 112 031876
Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Met Tyr
290 295
Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys
305 310
Ser Thr Ala Glu Ser Lys Cys Val 325
Ser Lys Tyr Ile Glu Asp Ala Lys
300
Asn Cys Gly Pro Ser Ser Thr Thr
315 320
Gln Ser
330 <210>32 <211>334 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>32
Lys Cys Asp Lys Cys Lys
Ser Glu Gln Ser Lys
Lys Asn Asn Lys Asn
Trp
Ile
Trp
Arg
Lys
Tyr
Ser
Gly
Asn
Gly
Glu
Gly
Leu
Gln
Lys
Glu
Tyr Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro 40 Pro Arg Thr His Ser 45 Leu Tyr Leu
35
Val Cys Leu His Glu Lys Glu Gly Lys Thr Gln His Lys Thr Ile Ser
50 55 60
Thr Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu
65 70 75 80
Gly Lys Asn Leu Lys Lys Arg Tyr Pro Gln Asn Asn Asn Ser Gly Asn
85 90 95
Lys Lys Lys Leu Cys Lys Asp Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly
100 105 110
Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp
115 120 125
Leu Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ala Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr
130 135 140
Ile Lys Lys Asn Ile Ala Ser Asp Glu Asn Thr Leu Tyr Ser
145 150 155
Ser Leu
160
Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn 165
Thr Asn
170
Lys
Lys
Tyr Ile Trp
175
- 113 031876
Leu Ala Met Lys 180 His Gly Ala Glu Met 185 Asn Gly Thr Met Cys 190 Asn Ala
Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp Met Ser Thr
195 200 205
Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu
210 215 220
His Phe Cys Glu Gln Arg Gln Ala Lys Val Lys Asp Val Ile Asn Ser
225 230 235 240
Cys Lys Ser Cys Lys 245 Glu Ser Gly Asp Thr 250 Cys Asn Ser Asp Cys 255 Glu
Lys Lys Cys Lys Asn Lys Cys Asp Ala Tyr Lys Thr Phe Ile Glu Glu
260 265 270
Phe Cys Thr Ala Asp Gly Gly Thr Ala Gly Ser Pro Trp Ser Lys Arg
275 280 285
Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys Tyr Ile Glu Asp Ala Lys
290 295 300
Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Thr Ser Ser Gly Ala
305 310 315 320
Asn Ser Gly Val Thr Thr Thr Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser
325 330
<210>33 <211>350 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>33
Lys 1 Cys Asp Lys Cys 5 Lys Ser Gly Thr Ser 10 Thr Val Asn Lys Asn 15 Trp
Ile Trp Lys Lys 20 Tyr Ser Gly Lys Glu 25 Glu Gly Leu Gln Lys 30 Glu Tyr
Ala Asn Thr 35 Ile Ala Leu Pro Pro 40 Arg Thr His Ser Leu 45 Tyr Leu Val
Cys Leu 50 His Glu Lys Gly Lys 55 Lys Thr Gln Glu Leu 60 Lys Asn Ile Arg
- 114 031876
Thr
Gly
Lys
Leu
Glu
Lys
145
Glu
Ala
Gly
Asp
Pro
225
Gln
Lys
Lys
Cys
Trp
305
Asn Ser Glu Leu Leu 70 Lys Glu Trp Ile Ile 75 Ala Ala Phe His Glu 80
Lys Asn Leu Lys Thr Ser Pro Gln Asn Asn Asn Ser Gly Asn Lys
85 90 95
Lys Leu Cys Lys Ala Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp
100 105 110
Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Asp Phe Thr Lys Asp Leu
115 120 125
Leu 130 Asn Leu Gln Lys Ile 135 Phe Gly Lys Leu Phe 140 Arg Lys Tyr Ile
Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln His Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp
150 155 160
Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Leu
165 170 175
Met Lys His Gly Ala Glu Met Asn Gly Thr Thr Cys Cys Gly Asp
180 185 190
Ser Val Thr Gly Ser Ser Asp Ser Gly Ser Thr Thr Cys Ser Gly
195 200 205
Asn Gly Ser Ile Ser Cys Asp Asp Met Pro Thr Thr Asp Phe Ile
210 215 220
Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His Phe Cys Lys
230 235 240
Arg
Gln
Glu
Lys
245
Val
Lys
His
Val
Met
250
Glu
Ser
Cys
Lys
Ser Cys
255
Glu Cys Gly 260 Asp Thr Cys Asn Gly 265 Glu Cys Lys Thr Glu 270 Cys Glu
Lys Cys Lys Asn Lys Cys Glu Ala Tyr Lys Thr Phe Ile Glu Lys
275 280 285
Val Ser Ala Asp Gly Gly Thr Ser Gly Ser Ser Trp Ser Lys Arg
290 295 300
Asp Gln Ile Tyr Met Arg Tyr Ser Lys Tyr Ile Glu Asp Ala Lys
310 315 320
- 115 031876
Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn 325
Asn Ala Ala Ala Ser Thr Ala Glu Asn
340 345 <210> 34 <211> 647 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 34
Asp 1 Tyr Ile Lys Asp 5 Asp Pro Tyr Ser
Ser Phe Ile Leu 20 Asn Pro Ser Asp Ala 25
Ala Asn His 35 Asn Asp Glu Val Cys 40 Asn
Ser Val 50 Glu Leu Ala Pro Ile 55 Ser Asp
Ile 65 Thr His Ser Phe Ile 70 Gly Ala Asn
Val Lys Leu Gly Val 85 Arg Glu Lys Asp
Ile Glu Asp Asp 100 Ser Leu Arg Gly Val 105
Leu Leu Gly 115 Ile Leu Gln Glu Asn 120 Cys
Ser Ser 130 Asn Gly Ser Cys Asp 135 Lys Asn
Lys 145 Leu Glu Asn Val Phe 150 Ala Ser Leu
Lys Cys Lys Ser Gly 165 Thr Ser Thr Val
Gly Thr Ser Ser Thr Thr
335
Cys Val Gln Ser
350
Glu Tyr Ala Thr Lys Leu
Thr Ser Ser Gly Glu Thr
Asn Glu Ser Glu Ile Ala
Ser Ser Asn Lys Thr Cys
Lys Lys Glu Cys Lys Asp
80
Asp Leu Lys Ile Cys Val
Asn Cys Cys Cys Gln Asp
110
Asp Asn Lys Ser Gly Ser
125
Glu Asp Glu Cys Gln Lys
140
Asn Gly Tyr Lys Cys Asp
155 160
Lys Lys Trp Ile Trp Arg
175
- 116 031876
Lys Tyr Ser Gly 180 Asn Gly Glu Gly Leu 185
Ile Gly Leu 195 Pro Pro Arg Thr His 200 Ser
Glu Lys 210 Glu Gly Lys Thr Gln 215 His Lys
Leu 225 Leu Lys Glu Trp Ile 230 Ile Ala Ala
Lys Thr Ser His Gln 245 Asn Asn Asn Ser
Lys Ala Leu Lys 260 Tyr Ser Phe Ala Asp 265
Thr Ser Ile 275 Trp Asp Asn Asp Phe 280 Thr
Gln Lys 290 Ile Phe Gly Lys Leu 295 Phe Arg
Ala 305 Ser Asp Glu Asn Thr 310 Ser Tyr Ser
Ser Trp Trp Asn Thr 325 Asn Lys Lys Tyr
Gly Ala Glu Met 340 Asn Ser Thr Met Cys 345
Gly Ser Ser 355 Asp Ser Gly Ser Thr 360 Thr
Ile Ser 370 Cys Asp Asp Ile Pro 375 Thr Ile
Arg 385 Phe Leu Gln Glu Trp 390 Val Glu His
Lys Val Lys Asp Val 405 Ile Thr Asn Cys
Asp Thr Cys Asn Ser Asp Cys Glu Lys
420 425
Lys Glu Tyr Ala 190 Asn Thr
Tyr Leu Val 205 Cys Leu His
Ile Ser 220 Thr Asn Ser Glu
His 235 Glu Gly Lys Asn Leu 240
Asn Lys Lys Lys Leu 255 Cys
Gly Asp Leu Ile 270 Lys Gly
Asp Leu Glu 285 Leu Asn Leu
Tyr Ile 300 Lys Lys Asn Ile
Leu 315 Asp Glu Leu Arg Glu 320
Trp Leu Ala Met Lys 335 His
Gly Asp Gly Ser 350 Val Thr
Ser Gly Asp 365 Asn Gly Ser
Leu Ile 380 Pro Gln Tyr Leu
Cys 395 Lys Gln Arg Gln Glu 400
Ser Cys Lys Glu Ser 415 Gly
Cys Lys Asn Lys 430 Cys Glu
- 117 031876
Ala Tyr Lys Lys Phe Ile Glu
435
Glu Arg Arg Thr Ala Ala Gln Gly
440 445
Ala Glu Ser Ser Trp Val Lys
450 455
Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Met Arg 460
Ser Lys Tyr Ile Glu Asp Ala
465 470
Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr
475
Ser Cys Gly Pro Ser 485 Ser Thr Thr Asn Ala 490 Ala Ala Ser Thr Ala 495
Asn Lys Cys Val Gln Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His Leu
500 505 510
Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro Ser Ser Tyr Leu Ser Ile Val Leu
515 520 525
Asp Asn Ile Cys Gly Ala Asp Asn Ala Pro Trp Thr Thr Tyr Thr
530 535 540
Tyr Thr Thr Thr Lys Asn Cys Asp Ile Lys Lys Lys Thr Pro Lys
545 550 555
Gln Ser Cys Asp Thr Leu Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro Leu
565 570 575
Asn Thr Pro His Glu Tyr Lys Tyr Ala Cys Gln Cys Arg Thr Pro
580 585 590
Lys Gln Glu Ser Cys Asp Asp Arg Lys Glu Tyr Met Asn Gln Trp
595 600 605
Ser Gly Ser Ala Gln Thr Val Arg Gly Arg Ser Thr Asn Asn Asp
610 615 620
Glu Leu Tyr Thr Tyr Asn Gly Val Lys Glu Thr Lys Pro Leu Gly
625 630 635
Thr
Tyr
Lys
480
Glu
Ile
Asp
Thr
Pro
560
Gly
Asn
Ser
Tyr
Thr
640
Leu Lys Asn Ser Lys Leu Asp
645 <210> 35 <211> 341 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum
- 118 031876 <400> 35
Lys 1 Cys Asp Lys Cys 5 Lys Ser Gly Thr Ser 10 Thr Val Asn Lys Lys 15 Trp
Ile Trp Arg Lys Ser Ser Gly Asn Lys Glu Gly Leu Gln Lys Glu Tyr
20 25 30
Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu Gly
35 40 45
Asn Leu Pro Lys Leu Glu Asn Val Cys Glu Asp Val Lys Asp Ile Asn
50 55 60
Phe Asp Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Val Ser Phe
65 70 75 80
His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Thr Ser His Glu Lys Lys Asn Asp Asp
85 90 95
Asn Gly Lys Lys Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr
100 105 110
Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys
115 120 125
Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys
130 135 140
Tyr Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser
145 150 155 160
Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile
165 170 175
Trp Thr Ala Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Ile Thr Thr Cys Cys
180 185 190
Gly Asp Gly Ser Ser Gly Glu Asn Gln Thr Asn Ser Cys Asp Asp Ile
195 200 205
Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp
210 215 220
Val Glu His Phe Cys Lys Gln Arg Gln Glu Lys Val Asn Ala Val Val
225 230 235 240
Thr Asn Cys Lys Ser Cys Lys Glu Ser Gly Gly Thr Cys Asn Gly Glu
- 119 031876
245
250
255
Cys Lys Thr Lys 260 Cys Lys Asn Lys Cys 265 Glu Val Tyr Lys Thr 270 Phe
Asp Asn Val Gly Asp Gly Thr Ala Gly Ser Pro Trp Val Lys Arg
275 280 285
Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys His Ile Glu Asp Ala Lys
290 295 300
Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Ile Thr Thr Gly Thr
305 310 315
Ser Gly Glu Ser Ser Gly Ala Thr Ser Gly Val Thr Thr Thr Glu
325 330 335
Ile
Trp
Arg
Ile
320
Asn
Lys Cys Val Gln Ser
340 <210> 36 <211> 632 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 36
Asn 1 Tyr Ile Lys Asp 5 Asp Pro Tyr Ser Lys 10 Glu Tyr Val Thr Lys 15
Ser Phe Ile Pro Asn Ser Ser Asp Ala Asn Thr Ser Ser Glu Lys
20 25 30
Gln Lys Asn Asn Asp Glu Val Cys Asn Pro Asn Glu Ser Gly Ile
35 40 45
Ser Val Glu Gln Ala Gln Thr Ser Gly Pro Ser Ser Asn Lys Thr
50 55 60
Ile Thr His Ser Ser Ile Lys Ala Asn Lys Lys Lys Glu Cys Lys
65 70 75
Val Lys Leu Gly Val Arg Glu Asn Asp Lys Asp Leu Lys Ile Cys
85 90 95
Ile Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln
100 105 110
Leu
Ile
Ser
Cys
Asp
Val
Asp
- 120 031876
Leu Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys 120 Ser Asp Asn Lys 125 Arg Gly Ser
115
Ser Ser Asn Asp Ser Cys Asp Asn Lys Asn Gln Asp Glu Cys Gln Lys
130 135 140
Lys Leu Asp Glu Ala Leu Glu Ser Leu His Asn Gly Tyr Lys Asn Gln
145 150 155 160
Lys Cys Lys Ser Gly Thr Ser Thr Val Asn Lys Lys Trp Ile Trp Lys
165 170 175
Lys Ser Ser Gly Asn Lys Glu Gly Leu Gln Lys Glu Tyr Ala Asn Thr
180 185 190
Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu Gly Asn Leu Pro
195 200 205
Lys Leu Glu Asn Val Ser Lys Gly Val Thr Asp Ile Ile Tyr Asp Thr
210 215 220
Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Val Ser Phe His Glu Gly
225 230 235 240
Lys Asn Leu Lys Thr Ser His Glu Lys Lys Asn Asp Asp Asn Gly Lys
245 250 255
Lys Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp Leu
260 265 270
Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu Glu
275 280 285
Leu Asn Leu Gln Lys Ala Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr Ile Lys
290 295 300
Lys Asn Ile Ser Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp Glu
305 310 315 320
Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Ile Ala
325 330 335
Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Gly Thr Thr Cys Cys Gly Asp Gly
340 345 350
Ser Ser Gly Glu Asn Gln Thr Asn Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile
- 121 031876
355
360
365
Asp
Phe
385
Lys
Asn
Thr
Trp
Glu
465
Ser
Lys
Ile
Thr
Ser
545
Gly
Thr
Ser
Leu 370 Ile Pro Gln Tyr Leu 375 Arg Phe Leu Gln Glu 380 Trp Val Glu His
Cys Glu Gln Arg Gln Ala Lys Val Lys Asp Val Ile Thr Asn Cys
390 395 400
Ser Cys Lys Asn Thr Ser Gly Glu Arg Lys Ile Gly Gly Thr Cys
405 410 415
Gly Glu Cys Lys Thr Lys Cys Lys Asn Lys Cys Glu Ala Tyr Lys
420 425 430
Phe Ile 435 Glu His Cys Lys Gly 440 Gly Asp Gly Thr Ala 445 Gly Ser Ser
Val Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys His Ile
450 455 460
Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Ser Cys Gly Thr
470 475 480
Thr Ala Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe
485 490 495
His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro Ser Ser Tyr Leu Ser
500 505 510
Val Leu Asp Glu Asn Asn Cys Gly Glu Asp Lys Ala Pro Trp Thr
515 520 525
Tyr 530 Thr Thr Thr Lys Asn 535 Cys Asp Ile Gln Lys 540 Asp Lys Ser Lys
Gln Ser Ser Asp Thr Leu Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro Leu
550 555 560
Asn Thr Pro His 565 Gly Tyr Lys Tyr Ala 570 Cys Gln Cys Lys Ile 575 Pro
Thr Glu Glu Thr Cys Asp Asp Arg Lys Glu Tyr Met Asn Gln Trp
580 585 590
Cys Gly Ser Ala Arg Thr Met Lys Arg Gly Tyr Lys Asn Asp Asn
595 600 605
- 122 031876
Tyr
Glu Leu Cys
610
Lys Tyr Asn Gly Val
615
Asp
Val
Lys
620
Pro
Thr
Thr
Val
Arg Ser Ser Ser Thr Lys Leu Asp
625 630 <210> 37 <211> 639 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 37
Asp
Tyr
Ile
Lys
Gly
Asp
Pro
Tyr
Ser
Ala
Glu
Tyr
Val
Thr
Lys
Ser
Phe
Ile
Pro
Asn
Ser
Ser
Asp
Ala
Asn
Asn
Pro
Ser
Glu
Lys
Gln Lys Asn Asn Asp Glu Val
Cys Asn Cys Asn Glu Ser Glu Ile
Ser
Val
Gly
Gln
Ala
Ser
Ile
Ser
Asp
Pro
Ser
Ser
Asn
Lys
Thr
Asn
Thr
His
Ser
Ser
Ile
Lys
Ala
Asn
Lys
Lys
Lys
Val
Cys
Lys
Val Lys Leu Gly Val 85 Arg Glu Asn Asp Lys 90 Val Leu Lys Ile Cys 95
Ile Glu His Thr Ser Leu Arg Gly Val Asp Asn Cys Cys Phe Lys
100 105 110
Leu Leu Gly Ile Leu Gln Glu Pro Arg Ile Asp Lys Asn Gln Ser
115 120 125
Ser Ser Ser Asn Gly Ser Cys Asp Lys Asn Ser Glu Glu Ala Cys
130 135 140
Lys 145 Asn Leu Glu Lys Val 150 Leu Ala Ser Leu Thr Asn 155 Gly Tyr Lys
Asp Lys Cys Lys Ser Gly Thr Ser Arg Ser Lys Lys Lys Trp Ile
165 170 175
Lys Lys Tyr Ser Gly Lys Glu Gly Gly Leu Gln Glu Glu Tyr Ala
Leu
Ile
Ser
Cys
Asp
Val
Asp
Gly
Glu
Cys
160
Trp
Asn
- 123 031876
180 185
Thr Ile Gly 195 Leu Pro Pro Arg Thr 200 Gln
Leu Asp 210 Glu Lys Glu Gly Lys 215 Thr Gln
Asn 225 Ser Glu Leu Leu Lys 230 Glu Trp Ile
Lys Asn Leu Lys Pro 245 Ser Pro Glu Lys
Lys Leu Cys Lys 260 Asp Leu Lys Tyr Ser 265
Ile Lys Gly 275 Thr Ser Ile Trp Asp 280 Asn
Leu Asn 290 Leu Gln Lys Ile Phe 295 Gly Lys
Lys 305 Asn Ile Ala Ser Asp 310 Glu Asn Thr
Leu Arg Glu Ser Trp 325 Trp Asn Thr Asn
Met Lys His Gly 340 Ala Gly Met Asn Ser 345
Ser Val Thr 355 Gly Ser Gly Ser Ser 360 Cys
Leu Ile 370 Pro Gln Tyr Leu Arg 375 Phe Leu
Cys 385 Lys Gln Arg Gln Glu 390 Lys Val Lys
Ser Cys Lys Asn Thr 405 Ser Ser Glu Arg
Ser Asp Cys Lys Thr Glu Cys Lys Asn
420 425
190
Leu Cys Leu 205 Val Val Cys
Leu Lys 220 Asn Ile Ser Thr
Ala 235 Ala Phe Pro Glu Gly 240
Lys Gly Asp Asn Gly 255 Lys
Ala Asp Tyr Gly 270 Asp Leu
Tyr Thr Lys 285 Asp Leu Glu
Phe Arg 300 Lys Tyr Ile Lys
Tyr 315 Ser Ser Leu Asp Glu 320
Lys Tyr Ile Trp Leu 335 Ala
Met Cys Asn Ala 350 Asp Gly
Asp Met Pro 365 Thr Ile Asp
Glu Trp 380 Val Glu His Phe
Val 395 Ile Glu Asn Cys Asn 400
Ile Gly Gly Thr Cys 415 Asn
Cys Glu Val Tyr 430 Lys Lys
- 124 031876
Phe Ile Glu 435 Asp Cys Lys Gly Gly Asp Gly Thr Ala Gly Ser Ser Trp
440 445
Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys Tyr Ile Glu
450 455 460
Asp 465 Ala Lys Arg Asn Arg 470 Lys Ala Gly Thr Lys 475 Asn Cys Gly Pro Ser 480
Ser Thr Thr Asn Ala Ala Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser Asp Ile Asp
485 490 495
Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro Ser Ser
500 505 510
Tyr Leu Ser Thr Val Leu Asp Asp Asn Ile Cys Gly Glu Asp Asn Ala
515 520 525
Pro
Trp
530
Thr
Thr
Tyr
Thr
Thr
535
Tyr
Thr
Thr
Thr
Lys
540
Asn
Cys
Asp
Lys
Asp 545 Lys Lys Lys Ser Lys 550 Ser Gln Ser Cys Asp 555 Thr Leu Val Val Val 560
Asn Val Pro Ser Pro Leu Gly Asn Thr Pro His Glu Tyr Lys Tyr Ala
565 570 575
Cys Glu Cys Arg Thr Pro Asn Lys Gln Glu Ser Cys Asp Asp Arg Lys
580 585 590
Glu Tyr Met 595 Asn Gln Trp Ile Ser 600 Asp Asn Thr Lys Asn 605 Pro Lys Gly
Ser Gly Ser Gly Lys Asp Tyr Tyr Glu Leu Tyr Thr Tyr Asn Gly Val
610 615 620
Asp Val Lys Pro Thr Thr Val Arg Ser Ser Ser Thr Lys Leu Asp
625 630 635
<210> 38 <211> 655 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 38
Asp Tyr Ile Lys Gly Asp Pro Tyr Phe Ala Glu Tyr Ala Thr Lys Leu
- 125 031876
Ser
Ala
Ser
Asn
Val
Ile
Phe
Ser
Asn
145
Lys
Arg
Thr
Leu
Thr
225
Gly
Phe Ile Leu Asn 20 Ser Ser Asp Ala 25 Asn Thr Ser Ser Gly 30 Glu Thr
Asn His Asn Asp Glu Ala Cys Asn Cys Asn Glu Ser Glu Ile Ser
35 40 45
Val Glu His Ala Ser Ile Ser Asp Pro Ser Ser Asn Lys Thr Cys
50 55 60
Thr His Ser Ser Ile Lys Ala Asn Lys Lys Lys Val Cys Lys His
70 75 80
Lys Leu Gly Val Arg Glu Asn Asp Lys Asp Leu Arg Val Cys Val
85 90 95
Glu His Thr Ser Leu Ser Gly Val Glu Asn Cys Cys Phe Lys Asp
100 105 110
Leu Arg Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Ser Gly Ser
115 120 125
Ser 130 Asn Gly Ser Cys Asp 135 Lys Asn Asn Glu Glu 140 Ala Cys Glu Lys
Leu Glu Lys Val Phe Ala Ser Leu Thr Asn Cys Tyr Lys Cys Glu
150 155 160
Cys Lys Ser Glu Gln Ser Lys Lys Asn Asn Lys Lys Trp Thr Trp
165 170 175
Lys Ser Ser Gly Asn Lys Gly Gly Leu Gln Glu Glu Tyr Ala Asn
180 185 190
Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Cys Leu Val Val Cys
195 200 205
Asp Glu Lys Glu Gly Lys Lys Thr Gln Glu Leu Lys Asn Ile Arg
210 215 220
Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu
230 235 240
Lys Asn Leu Lys Pro Ser His Glu Lys Lys Asn Asp Asp Asn Gly
245 250 255
- 126 031876
Lys
Ser
Asn
Lys
305
Thr
Asn
Gly
Cys
Leu
385
Lys
Cys
Glu
Arg
Lys
465
Thr
Ile
Lys Asn Asp Asp Asn Asn Ser Lys Leu Cys Lys Asp Leu 270 Lys
260 265
Phe Ala Asp Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp
275 280 285
Glu Tyr Thr Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe
290 295 300
Leu Phe Arg Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Ile Ala Ser Asp Glu
310 315
Leu Tyr Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn
325 330 335
Lys Lys Tyr Ile Trp Leu Ala Met Lys His Gly Ala Glu Met
340 345 350
Thr Thr Cys Asn Ala Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser
355 360 365
Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg
370 375 380
Gln Glu Trp Val Glu His Phe Cys Lys Gln Arg Gln Ala Lys
390 395
Asp Val Ile Glu Asn Cys Lys Ser Cys Lys Glu Ser Gly Asn
405 410 415
Lys Thr Glu Cys Lys Asn Lys Cys Glu Ala Tyr Lys Lys Phe
420 425 430
Asn Cys 435 Lys Gly Gly Asp Gly 440 Thr Ala Gly Ser Ser 445 Trp Val
Trp Asp Gln Ile Tyr Met Arg Tyr Ser Lys Tyr Ile Glu Asp
450 455 460
Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Pro Ser Ser
470 475
Asn Val Ser Ala Ser Thr Asp Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser
485 490 495
Asp Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr
500 505 510
Tyr
Asp
Gly
Asn
320
Thr
Asn
Ser
Phe
Val
400
Lys
Ile
Lys
Ala
Ile
480
Asp
Pro
- 127 031876
Ser Ser Tyr Leu 515 Ser Ile Val Leu Asp 520 Asp Asn Ile Cys 525 Gly Asp Asp
Lys Ala Pro Trp Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr
530 535 540
Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Thr Lys Asn Cys Asp
545 550 555 560
Lys Glu Arg Asp Lys Ser Lys Ser Gln Ser Cys Asn Thr Ala Val Val
565 570 575
Val Asn Val Pro Ser Pro Leu Gly Asn Thr Pro His Glu Tyr Lys Tyr
580 585 590
Ala Cys Glu Cys Arg Thr Pro Ser Asn Lys Glu Leu Cys Asp Asp Arg
595 600 605
Lys Glu Tyr Met Asn Gln Trp Ser Ser Gly Ser Ala Gln Thr Val Arg
610 615 620
Asp Arg Ser Gly Lys Asp Tyr Tyr Glu Leu Tyr Thr Tyr Asn Gly Val
625 630 635 640
Lys Glu Thr Lys Leu Pro Lys Lys Leu Asn Ser Ser Lys Leu Asp
645 650 655
<210>39 <211>347 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>39
Lys Cys Asp Lys Cys Lys Ser Glu Gln Ser Lys Lys Asn Asn Lys Tyr
1 5 10 15
Trp
Ile
Trp
Lys
Lys
Ser
Ser
Val
Lys
Glu
Glu
Gly
Leu
Gln
Lys
Glu
Tyr Ala Asn 35 Thr Ile Ala Leu Pro 40 Pro Arg Thr His Ser 45 Leu Cys Leu
Val Val Cys Leu Asp Glu Lys Gly Lys Lys Thr Gln Glu Leu Lys Asn
50 55 60
Ile Ser Thr Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Arg Ile Ile Ala Ala Phe
65 70 75 80
- 128 031876
His Glu Gly Lys Asn 85 Leu Lys Thr Thr
Asp Asn Asn Ser 100 Lys Leu Cys Lys Ala 105
Tyr Gly Asp 115 Leu Ile Lys Gly Thr 120 Ser
Lys Asp 130 Leu Glu Leu Asn Leu 135 Gln Gln
Lys 145 Tyr Ile Lys Lys Asn 150 Asn Thr Ala
Ser Leu Asp Glu Leu 165 Arg Glu Ser Trp
Ile Trp Leu Ala 180 Met Lys His Gly Ala 185
Cys Gly Asp 195 Gly Ser Val Thr Gly 200 Ser
Cys Ser 210 Gly Asp Asn Gly Ser 215 Ile Ser
Asp 225 Phe Ile Pro Gln Tyr 230 Leu Arg Phe
Phe Cys Lys Gln Arg 245 Gln Glu Lys Val
Asn Ser Cys Lys 260 Asn Asn Leu Gly Lys 265
Lys Thr Glu 275 Cys Lys Asn Lys Cys 280 Glu
Lys Phe 290 Cys Thr Ala Asp Gly 295 Gly Thr
Arg 305 Trp Asp Gln Ile Tyr 310 Lys Arg Tyr
Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys
Leu Glu Lys Lys Asn 95 Ala
Lys Tyr Ser Phe 110 Ala Asp
Trp Asp Asn 125 Glu Tyr Thr
Phe Gly 140 Lys Leu Phe Arg
Gln 155 His Thr Leu Tyr Ser 160
Asn Thr Asn Lys Lys 175 Tyr
Met Asn Gly Thr 190 Thr Cys
Asp Ser Gly 205 Ser Thr Thr
Asp Asp 220 Met Pro Thr Thr
Gln 235 Glu Trp Val Glu His 240
Asp Val Ile Glu Asn 255 Cys
Glu Ile Asn Glu 270 Lys Cys
Tyr Lys Asn 285 Phe Ile Glu
Gly Ser 300 Pro Trp Ser Lys
Lys 315 Tyr Ile Glu Asp Ala 320
Cys Gly Thr Ser Ser 335 Thr
325
- 129 031876
Thr Ser Thr Ala Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser
340345 <210>40 <211>335 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>40
Lys 1 Cys Glu Lys Cys 5 Lys Ser Gly Thr Ser 10 Thr Val Asn Lys Tyr 15 Trp
Ile Trp Arg Lys Ser Ser Gly Asn Lys Glu Gly Leu Gln Lys Glu Tyr
20 25 30
Ala Asn Thr Ile Ala Leu Pro Pro Arg Thr His Ser Leu Cys Leu Val
35 40 45
Val Cys Leu Asp Glu Lys Glu Gly Lys Thr Gln Glu Leu Lys Asn Ile
50 55 60
Ser Thr Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Arg Ile Ile Ala Ala Phe His
65 70 75 80
Glu Gly Glu Asn Leu Lys Thr Ser His Glu Lys Lys Lys Gly Asp Asp
85 90 95
Gly Lys Lys Asn Ala Asp Asn Asn Ser Lys Leu Cys Lys Ala Leu Lys
100 105 110
Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp
115 120 125
Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe
130 135 140
Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Ile Ala Ser Asp Glu
145 150 155 160
Asn Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn
165 170 175
Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Leu Ala Met Lys His Gly Ala Gly Met
180 185 190
Asn Gly Thr Thr Cys Ser Cys Ser Gly Asp Ser Ser Asp Asp Met Pro
195 200 205
- 130 031876
Thr Thr Asp Phe Ile Pro Gln 215 Tyr Leu Arg Phe Leu 220 Gln Glu Trp Val
210
Glu His Phe Cys Lys Gln Arg Gln Glu Asn Val Asn Ala Val Ile Glu
225 230 235 240
Asn Cys Asn Ser Cys Lys Glu Cys Gly Gly Thr Cys Asn Ser Asp Cys
245 250 255
Glu Lys Lys Cys Lys Thr Glu Cys Lys Asn Lys Cys Glu Ala Tyr Lys
260 265 270
Asn Phe Ile Glu Lys Phe Cys Thr Ala Asp Gly Gly Thr Ser Gly Tyr
275 280 285
Ser Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys Tyr
290 295 300
Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Ser Cys Gly
305 310 315 320
Thr Ser Ser Thr Thr Ser Thr Ala Glu Ser Lys Cys Val Gln Ser
325 330 335 <210> 41 <211> 667 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция
<400> 41
Ser Tyr Val Lys Asn Asn Pro Tyr Ser Lys Glu Tyr Val Thr Lys Leu
1 5 10 15
Ser Phe Ile Leu Asn Pro Ser Asp Ala Asn Asn Pro Ser Glu Thr Pro
20 25 30
Ser Lys Tyr Tyr Asp Glu Val Cys Asn Cys Asn Glu Ser Gly Ile Ala
35 40 45
Cys Val Gly Gln Ala Gln Thr Ser Gly Pro Ser Ser Asn Lys Thr Cys
50 55 60
Ile Thr His Ser Phe Ile Gly Ala Asn Lys Lys Lys Val Cys Lys Asp
70 75 80
- 131 031876
Val
Ile
Phe
Ser
Asn
145
Lys
Lys
Ile
Asp
Glu
225
Leu
Ala
Asp
Thr
Arg
305
Ser
Lys Leu Gly Val 85 Arg Glu Lys Asp Lys 90 Asp Leu Lys Ile Cys 95 Val
Glu Asp Thr Tyr Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys Cys Phe Lys Asp
100 105 110
Leu Gly Met Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Ser Gly Ser
115 120 125
Ser Asn Gly Ser Cys Asn Asn Lys Asn Gln Asp Glu Cys Glu Lys
130 135 140
Leu Asp Glu Ala Leu Ala Ser Leu Thr Asn Gly Tyr Lys Cys Glu
150 155 160
Cys Lys Ser Gly Thr Ser Thr Val Asn Lys Tyr Trp Ile Trp Arg
165 170 175
Ser Ser Gly Asn Lys Glu Gly Leu Gln Lys Glu Tyr Ala Asn Thr
180 185 190
Ala Leu Pro Pro Arg Thr His Ser Leu Cys Leu Val Val Cys Leu
195 200 205
Glu Lys Glu Gly Lys Thr Gln His Lys Thr Ile Ser Thr Asn Ser
210 215 220
Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu Gly Lys Asn
230 235 240
Lys Thr Ser His Glu Lys Lys Lys Gly Asp Asp Gly Lys Lys Asn
245 250 255
Asp Asn Asn Ser Lys Leu Cys Lys Ala Leu Lys Tyr Ser Phe Ala
260 265 270
Tyr Gly Asp 275 Leu Ile Lys Gly 280 Thr Ser Ile Trp Asp 285 Asn Asp Phe
Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe Gly Lys Leu Phe
290 295 300
Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Ile Ala Ser Asp Glu Asn Thr Ser Tyr
310 315 320
Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys
325 330 335
- 132 031876
Tyr
Cys
Thr
Asp
385
Glu
Val
Ser
Ala
Thr
465
Tyr
Lys
Val
Leu
Cys
545
Tyr
Ser
Ile Trp Leu Ala Met 340 Lys His Gly 345 Ala Gly Met Asn Ser 350 Thr Thr
Cys Gly Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser Ser Asp Ser Gly Ser Thr
355 360 365
Cys Cys Gly Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp
370 375 380
Met Pro Thr Thr Asp Phe Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln
390 395 400
Trp Val Glu His Phe Cys Lys Gln Arg Gln Glu Asn Val Asn Ala
405 410 415
Ile Glu Asn Cys Asn Ser Cys Lys Glu Cys Gly Gly Thr Cys Asn
420 425 430
Asp Cys Glu Lys Lys Cys Lys Thr Glu Cys Lys Gly Glu Cys Asp
435 440 445
Tyr Lys Glu Phe Ile Glu Lys Cys Asn Gly Gly Ala Ala Glu Gly
450 455 460
Ser Gly Ser Ser Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg
470 475 480
Ser Lys Tyr Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr
485 490 495
Asn Cys Gly Thr Ser Ser Thr Thr Ser Thr Ala Glu Ser Lys Cys
500 505 510
Gln Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp Ile Gly
515 520 525
Thr Thr Pro Ser Ser Tyr Leu Ser Ile Val Leu Asp Glu Asn Ile
530 535 540
Gly Ala Asp Asn Ala Pro Trp Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr
550 555 560
Thr Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys Cys Asn Lys Glu Thr Asp Lys
565 570 575
Lys Leu Gln Gln Cys Asn Thr Ser Val Val Val Asn Val Pro Ser
- 133 031876
580
585
590
Pro Leu Gly 595 Asn Thr Pro His Gly 600 Tyr Lys Tyr Val Cys 605 Glu Cys
Thr Pro Asn Lys Gln Glu Thr Cys Asp Asp Arg Lys Glu Tyr Met
610 615 620
Gln Trp Ile Ser Asp Asn Thr Lys Asn Pro Lys Gly Ser Arg Ser
625 630 635
Asn Asn Asp Tyr Glu Leu Tyr Thr Tyr Asn Gly Val Gln Ile Lys
645 650 655
Thr Thr Val Arg Ser Asn Ser Thr Lys Leu Asp
660 665
Arg
Asn
Thr
640
Pro <210>42 <211>348 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>42
Lys
Cys
Asp
Lys
Cys
Lys
Ser
Glu
Gln
Ser
Lys
Lys
Asn
Asn
Lys
Trp
Ile
Trp
Lys
Lys
Ser
Ser
Gly
Asn
Glu
Lys
Gly
Leu
Gln
Lys
Tyr Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro 40 Pro Arg Thr Gln Ser 45 Leu Cys
35
Val Val Cys Leu Asp Glu Lys Glu Gly Lys Thr Gln Glu Leu Lys
50 55 60
Ile Arg Thr Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala
65 70 75
His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Thr Ser His Glu Lys Lys Lys Gly
85 90 95
Asn Asn Ser Lys Leu Cys Lys Asp Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp
100 105 110
Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr
115 120 125
Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Asn Asn Phe Gly Lys Leu Phe Arg
Asn
Glu
Leu
Asn
Phe
Asp
Tyr
Lys
Lys
- 134 031876
130
135
140
Tyr 145 Ile Lys Lys Asn Ile 150 Ala Ser Asp Glu Asn 155 Thr Ser Tyr Ser
Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr
165 170 175
Trp Leu Ala Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Ser Thr Thr Cys
180 185 190
Ser Gly Ser Gly Ser Thr Thr Cys Ser Ser Gly Ser Gly Ser Thr
195 200 205
Cys Ser Ser Gly Ser Gly Asp Ser Cys Asp Asp Met Pro Thr Ile
210 215 220
Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His
225 230 235
Cys Lys Gln Arg Gln Glu 245 Lys Val Asn Ala 250 Val Ile Lys Asn Cys 255
Ser Cys Lys Glu Ser Gly Gly Thr Cys Asn Gly Glu Cys Lys Thr
260 265 270
Cys Lys Asn Lys Cys Glu Ala Tyr Lys Thr Phe Ile Glu Glu Phe
275 280 285
Thr Ala Asp Gly Gly Thr Ser Gly Ser Pro Trp Ser Lys Arg Trp
290 295 300
Gln Ile Tyr Lys Met Tyr Ser Lys His Ile Glu Asp Ala Lys Arg
305 310 315
Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Pro Ser Ser Thr Thr Asn
325 330 335
Ser
160
Ile
Ser
Thr
Asp
Phe
240
Asn
Glu
Cys
Asp
Asn
320
Val
Ser Val Ser Thr Asp Glu Asn Lys
Cys Val Gln Ser
340
345
<210> 43
<211> 652
<212> Белок
<213> Искусственная
<220>
<223> Искусственная конструкция
- 135 031876 <400> 43
Asp 1 Tyr Ile Lys Asp 5 Asp Pro Tyr Phe Ala 10 Glu Tyr Val Thr Lys 15 Leu
Ser Phe Ile Leu Asn Ser Ser Asp Ala Asn Asn Pro Ser Gly Glu Thr
20 25 30
Ala Asn His Asn Asp Glu Val Cys Asn Pro Asn Glu Ser Gly Ile Ala
35 40 45
Ser Val Glu Gln Ala Gln Thr Ser Asp Pro Ser Ser Asn Lys Thr Cys
50 55 60
Asn Thr His Ser Ser Ile Lys Ala Asn Lys Lys Lys Val Cys Lys His
65 70 75 80
Val Lys Leu Gly Val Arg Glu Asn Asp Lys Asp Leu Lys Ile Cys Val
85 90 95
Ile Glu His Thr Ser Leu Ser Gly Val Glu Asn Cys Cys Cys Gln Asp
100 105 110
Phe Leu Arg Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Ser Gly Ser
115 120 125
Ser Ser Asn Gly Ser Cys Asn Asn Lys Asn Gln Glu Ala Cys Glu Lys
130 135 140
Asn Leu Glu Lys Val Leu Ala Ser Leu Thr Asn Cys Tyr Lys Cys Asp
145 150 155 160
Lys Cys Lys Ser Glu Gln Ser Lys Lys Asn Asn Lys Asn Trp Ile Trp
165 170 175
Lys Lys Ser Ser 180 Gly Asn Glu Lys Gly 185 Leu Gln Lys Glu Tyr Ala 190 Asn
Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Cys Leu Val Val Cys
195 200 205
Leu Asp Glu Lys Glu Gly Lys Thr Gln Glu Leu Lys Asn Ile Arg Thr
210 215 220
Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu Gly
225 230 235 240
Lys Asn Leu Lys Lys Arg Tyr Pro Gln Asn Lys Asn Asp Asp Asn Asn
- 136 031876
245
250
255
Ser
Leu
Glu
Lys
305
Glu
Ala
Ser
Ser
Pro
385
Gln
Lys
Asn
Asp
Tyr
465
Ala
Lys Leu Cys 260 Lys Asp Leu Lys Tyr 265 Ser Phe Ala Asp Tyr 270 Gly Asp
Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu
275 280 285
Leu 290 Asn Leu Gln Asn Asn 295 Phe Gly Lys Leu Phe 300 Arg Lys Tyr Ile
Lys Asn Ile Ser Thr Glu Gln Asp Thr Leu Tyr Ser Ser Leu Asp
310 315 320
Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Leu
325 330 335
Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Ser Thr Thr Cys Ser Ser Gly
340 345 350
Gly Ser Thr Thr Cys Ser Ser Gly Ser Gly Ser Thr Thr Cys Ser
355 360 365
Gly Ser Gly Asp
Ser Cys Asp Asp Met
Pro Thr Thr Asp Phe
Ile
370
375
380
Gln Tyr Leu Arg Phe 390 Leu Gln Glu Trp Val 395 Glu His Phe Cys Lys 400
Arg Gln Glu Lys Val Asn Ala Val Ile Lys Asn Cys Asn Ser Cys
405 410 415
Glu Ser Gly Gly Thr Cys Asn Gly Glu Cys Lys Thr Glu Cys Lys
420 425 430
Lys Cys Glu Ala Tyr Lys Thr Phe Ile Glu Glu Phe Cys Thr Ala
435 440 445
Gly Gly Thr Ser Gly Ser Pro Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile
450 455 460
Lys Met Tyr Ser Lys His Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys
470 475 480
Gly Thr Lys Asn Cys Gly Pro Ser Ser Thr Thr Asn Val Ser Val
485 490 495
- 137 031876
Ser Thr Asp Glu 500 Asn Lys Cys Val Gln 505 Ser Asp Ile Asp Ser 510 Phe
Lys His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro Ser Ser Tyr Leu
515 520 525
Ile Val Leu Asp Asp Asn Ile Cys Gly Glu Asp Lys Ala Pro Trp
530 535 540
Thr 545 Tyr Thr Thr Tyr Thr 550 Thr Thr Lys Lys Cys 555 Asn Lys Glu Thr
Lys Ser Lys Ser Gln Ser Cys Asn Thr Ala Val Val Val Asn Val
565 570 575
Ser Pro Leu Gly Asn Thr Pro His Gly Tyr Lys Tyr Ala Cys Glu
580 585 590
Lys Ile Pro Thr Thr Glu Glu Thr Cys Asp Asp Arg Lys Glu Tyr
595 600 605
Asn Gln Trp Ile Ile Asp Thr Ser Lys Lys Gln Lys Gly Ser Gly
610 615 620
Gly Lys Asp Asp Tyr Glu Leu Tyr Thr Tyr Asn Gly Val Asp Val
625 630 635
Pro Thr Thr Val Arg Ser Asn Ser Thr Lys Leu Asp
645 650
Phe
Ser
Thr
Asp
560
Pro
Cys
Met
Ser
Lys
640 <210> 44 <211> 628 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 44
Asp 1 Tyr Ile Lys Asp 5 Asp Pro Tyr Ser Ala 10 Gln Tyr Thr Thr Lys 15
Ser Phe Ile Leu 20 Asn Pro Ser Asp Ala 25 Asn Thr Ser Ser Glu 30 Lys
Gln Lys Asn 35 Asn Asp Glu Ala Cys 40 Asn Cys Asn Glu Ser 45 Gly Ile
Ser Val Gly Gln Ala Gln Thr Ser Gly Pro Ser Ser Asn Lys Thr
Leu
Ile
Ser
Cys
- 138 031876
Ile 65 Thr His Ser Ser Ile 70 Lys Ala Asn Lys Lys 75 Lys Val Cys Lys
Val Lys Leu Gly Ile Asn Asn Asn Asp Lys Val Leu Arg Val Cys
85 90 95
Ile Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln
100 105 110
Leu Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Arg Gly
115 120 125
Ser Ser Asn Gly Ser Cys
Asn Asn Asn Asn Glu Glu Ala Cys
Glu
130
135
140
Asn Leu 145 Asp Glu Ala Pro 150 Ala Ser Leu His Asn 155 Gly Tyr Lys Asn
Lys Cys Lys Ser Gly Thr Ser Arg Ser Lys Lys Lys Trp Ile Trp
165 170 175
Lys Ser Ser Gly Asn Glu Lys Gly Leu Gln Glu Glu Tyr Ala Asn
180 185 190
Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Cys Leu Val Cys Leu
195 200 205
Glu Lys Glu Gly Lys Thr Gln His Lys Thr Ile Ser Thr Asn Ser
210 215 220
Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu Gly Lys Asn
225 230 235
Lys Thr Ser His Glu 245 Lys Lys Asn Asp Asp 250 Asn Gly Lys Lys Leu 255
Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp Leu Ile Lys
260 265 270
Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu Glu Leu Asn
275 280 285
Gln Lys Ala Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr Ile Lys Lys Asn
290 295 300
Asp
Val
Asp
Ser
Lys
Gln
160
Lys
Thr
His
Glu
Leu
240
Cys
Gly
Leu
Asn
- 139 031876
Thr 305 Ala Glu Gln Asp Thr 310 Ser Tyr Ser Ser Leu 315 Asp Glu Leu Arg
Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Ile Ala Met Lys
325 330 335
Gly Ala Gly Met Asn Gly Thr Thr Cys Ser Cys Ser Gly Asp Ser
340 345 350
Asn Asp Met Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe
355 360 365
Gln Glu Trp Val Glu His Phe Cys Glu Gln Arg Gln Ala Lys Val
370 375 380
Asp Val Ile Thr Asn Cys Lys Ser Cys Lys Glu Ser Gly Asn Lys
385 390 395
Lys Thr Glu Cys Lys Thr Lys Cys Lys Asp Glu Cys Glu Lys Tyr
405 410 415
Thr Phe Ile Glu Asp 420 Cys Asn Gly Gly 425 Gly Thr Gly Thr Ala 430 Gly
Ser Trp Val Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys
435 440 445
Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys
450 455 460
Pro Ser Ser Ile Thr Asn Ala Ala Ala Ser Thr Asp Glu Asn Lys
465 470 475
Val Gln Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp Ile
485 490 495
Leu Thr Thr Pro Ser Ser Tyr Leu Ser Asn Val Leu Asp Glu Asn
500 505 510
Cys Gly Asp Asp Lys Ala Pro Trp Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr
515 520 525
Thr Lys Asn Cys Asp Ile Gln Lys Asp Lys Ser Lys Ser Gln Pro
530 535 540
Asn Thr Ser Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro Leu Gly Asn Thr
545 550 555
Glu
320
His
Ser
Leu
Lys
Cys
400
Lys
Ser
His
Gly
Cys 480
Gly
Ser
Thr
Ile
Pro
560
- 140 031876
Tyr Arg Tyr Lys Tyr 565 Ala Cys Glu Cys
Ser Cys Asp Asp Arg Lys Glu Tyr Met
580 585
Ala Arg Thr Met Lys Arg Gly Tyr Lys
595 600
Lys Tyr Asn Gly Val Asp Val Lys Pro
610 615
Ser Lys Leu Asp
625 <210> 45 <211> 653 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 45
Asp 1 Tyr Ile Lys Gly 5 Asp Pro Tyr Phe
Ser Phe Ile Leu 20 Asn Pro Ser Asp Thr 25
Ser Lys Tyr 35 Tyr Asp Glu Ala Cys 40 Asn
Ser Val 50 Glu Gln Ala Gln Thr 55 Ser Gly
Ile 65 Thr His Ser Ser Ile 70 Lys Thr Asn
Val Lys Leu Gly Val 85 Arg Glu Asn Asp
Ile Glu Asp Thr 100 Ser Leu Ser Gly Val 105
Leu Leu Gly 115 Ile Leu Gln Glu Asn 120 Cys
Ile Pro Thr Thr Glu Glu
575
Gln Trp Ser Cys Gly Ser
590
Asp Asn Tyr Glu Leu Cys
605
Thr Val Arg Ser Asn Ser
620
Glu Tyr Ala Thr Lys Leu
Asn Ala Ser Glu Thr Pro
Asn Glu Ser Glu Ile Ala
Ser Ser Asn Lys Thr Cys
Lys Lys Glu Cys Lys Asp
80
Asp Leu Lys Ile Cys Val
Asn Cys Cys Phe Lys Asp
110
Asp Asn Lys Arg Gly Ser
125
- 141 031876
Ser
Asn
145
Lys
Lys
Ile
Glu
Leu
225
Lys
Lys
Thr
Gln
Thr
305
Ser
Gly
Gly
Ser
Ser Asn Asp 130 Ser Cys Asn 135 Asn Asn Asn Glu Glu 140 Ala Cys Glu
Leu Asp Glu Ala Leu Ala Ser Leu Thr Asn Gly Tyr Lys Cys
150 155
Cys Lys Ser Gly Thr Ser Thr Val Asn Lys Lys Trp Thr Trp
165 170 175
Ser Ser Gly Asn Glu Glu Gly Leu Gln Lys Glu Tyr Ala Asn
180 185 190
Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Cys Leu Val Cys Leu
195 200 205
Lys Glu Gly Lys Thr Lys His Lys Thr Ile Ser Thr Asn Ser
210 215 220
Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu Gly Lys Asn
230 235
Thr Ser His Glu Lys 245 Lys Asn Asp Asp 250 Asn Gly Lys Lys Leu 255
Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp Leu Ile Lys
260 265 270
Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu Glu Leu Asn
275 280 285
Lys Ala Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr Ile Lys Lys Asn
290 295 300
Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg
310 315
Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Thr Ala Met Lys
325 330 335
Ala Glu Met Asn Gly Thr Thr Cys Ser Ser Gly Ser Gly Asp
340 345 350
Asp Ser 355 Ser Ile Thr Gly Ser 360 Ser Asp Ser Gly Ser 365 Thr Thr
Gly Asp Asn Gly Ser Ile Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Thr
370 375 380
Lys
Asp
160
Arg
Thr
His
Glu
Leu
240
Cys
Gly
Leu
Asn
Glu
320
His
Asn
Cys
Asp
- 142 031876
Phe
385
Cys
Ser
Cys
Gly
Ile
465
Lys
Ala
Phe
Ser
Thr
545
Asp
Pro
Cys
Met
Ser
625
Ile Pro Gln Tyr Leu 390 Arg Phe Leu Gln Glu Trp 395 Val Glu His Phe 400
Glu Gln Arg Gln Ala Lys Val Lys Asp Val Ile Asn Ser Cys Asn
405 410 415
Cys Asn Glu Ser Gly Gly Thr Cys Asn Gly Glu Cys Lys Thr Lys
420 425 430
Lys Asp 435 Glu Cys Glu Lys Tyr 440 Lys Lys Phe Ile Glu 445 Asp Cys Asn
Gly Asp Gly Thr Ala Gly Ser Ser Trp Val Lys Arg Trp Asp Gln
450 455 460
Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys His Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg
470 475 480
Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Pro Ser Ser Ile Thr Asn Ala Ala
485 490 495
Ser Thr Asp 500 Glu Asn Lys Cys Val 505 Gln Ser Asp Val Asp 510 Ser Phe
Lys His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro Ser Ser Tyr Leu
515 520 525
Ile Val Leu Asp Glu Asn Ser Cys Gly Asp Asp Lys Ala Pro Trp
530 535 540
Thr
Tyr
Thr
Thr
Tyr
550
Thr
Thr
Thr
Glu
Lys
555
Cys Asn Lys Glu Arg
560
Lys Ser Lys Ser Gln 565 Ser Ser Asp Thr 570 Leu Val Val Val Asn 575 Val
Ser Pro Leu Gly Asn Thr Pro His Glu Tyr Lys Tyr Ala Cys Glu
580 585 590
Lys Ile Pro Thr Asn Glu Glu Thr Cys Asp Asp Arg Lys Asp Tyr
595 600 605
Asn Gln Trp Ile Ser Asp Thr Ser Lys Lys Gln Lys Gly Ser Gly
610 615 620
Gly Lys Asp Tyr Tyr Glu Leu Tyr Thr Tyr Asn Gly Val Gln Ile
630 635 640
- 143 031876
Lys Gln Ala Ala Gly Arg Ser Ser Ser Thr Lys Leu Asp 645650 <210>46 <211>490 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>46
Lys 1 Cys Asp Lys Cys 5 Lys Ser Glu Gln Ser Lys 10 Lys Asn Asn Asn 15 Lys
Trp Ile Trp Lys Lys Tyr Ser Gly Asn Gly Glu Gly Leu Gln Lys Glu
20 25 30
Tyr Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Cys Leu
35 40 45
Val Cys Leu His Glu Lys Glu Gly Lys Thr Gln His Lys Thr Ile Ser
50 55 60
Thr Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu
65 70 75 80
Gly Lys Asn Leu Lys Lys Arg Tyr Pro Gln Asn Lys Asn Asp Asp Asn
85 90 95
Asn Ser Lys Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly
100 105 110
Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp
115 120 125
Leu Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ala Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr
130 135 140
Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu
145 150 155 160
Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp
165 170 175
Thr Ala Met Lys His Gly Ala Glu Met Asn Gly Thr Thr Cys Ser Ser
180 185 190
Gly Ser Gly Asp Asn Gly Asp Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile
195 200 205
- 144 031876
Asp
Phe
225
Asn
Asn
Thr
Ser
Ile
305
Pro
Ile
Ser
Lys
Thr
385
Lys
Leu
Pro
Trp
Leu 210 Ile Pro Gln Tyr Leu 215 Arg Phe Leu Gln Glu Trp 220 Val Glu His
Cys Lys Gln Arg Gln Ala Lys Val Lys Asp Val Ile Asn Ser Cys
230 235 240
Ser Cys Lys Asn Thr Ser Gly Glu Arg Lys Ile Gly Gly Thr Cys
245 250 255
Ser Asp Cys Glu Lys Lys Cys Lys Val Ala Cys Asp Ala Tyr Lys
260 265 270
Phe Ile Glu Glu Cys Arg Thr Ala Val Gly Gly Thr Ala Gly Ser
275 280 285
Trp Val Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys His
290 295 300
Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly
310 315 320
Ser Ser Thr Thr 325 Asn Ala Ala Glu Asn 330 Lys Cys Val Gln Ser 335 Asp
Asp Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro
340 345 350
Ser Tyr Leu Ser Asn Val Leu Asp Glu Asn Ser Cys Gly Ala Asp
355 360 365
Ala Pro Trp Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr
370 375 380
Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys Cys Asn Lys Glu Arg Asp Lys Ser
390 395 400
Ser Gln Gln Ser Asn Thr Ser Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro
405 410 415
Gly Asn Thr Pro His Glu Tyr Lys Tyr Ala Cys Glu Cys Lys Ile
420 425 430
Thr Thr Glu Glu Thr Cys Asp Asp Arg Lys Glu Tyr Met Asn Gln
435 440 445
Ile Ile Asp Asn Thr Lys Asn Pro Lys Gly Ser Gly Ser Thr Asp
- 145 031876
450
455
460
Asn
465
Asp Tyr
Glu Leu
Tyr
470
Thr Tyr
Asn
Gly
Val
475
Gln
Ile
Lys
Gln
Ala
480
Ala
Gly Arg
Ser Ser
485
Ser
Thr Lys
Leu
Asp
490 <210>47 <211>335 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>47
Lys 1 Cys Glu Lys Cys 5 Lys Ser Gly Thr Ser Thr Val 10 Asn Asn Lys 15 Trp
Ile Trp Arg Lys Ser Ser Gly Lys Glu Gly Gly Leu Gln Lys Glu Tyr
20 25 30
Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu Gly
35 40 45
Asn Leu Pro Lys Leu Glu Asn Val Cys Lys Gly Val Thr Asp Ile Ile
50 55 60
Tyr Asp Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ser Gly Cys Leu Ile Ala Ala Phe
65 70 75 80
His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Thr Thr Tyr Leu Glu Lys Lys Asn Asp
85 90 95
Asp Asn Gly Lys Lys Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp
100 105 110
Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr
115 120 125
Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg
130 135 140
Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser
145 150 155 160
Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr
165 170 175
Ile Trp Ile Ala Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Gly Thr Thr Cys
- 146 031876
180
185
190
Ser Ser Gly 195 Ser Gly Asp Ser Ser Asn 200 Asp Ile Pro Thr 205 Thr Asp
Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu Asn Phe
210 215 220
Glu Gln Arg Gln Ala Lys Val Lys Pro Val Ile Glu Asn Cys Asn
225 230 235
Cys Lys Glu Ser Gly 245 Gly Thr Cys Asn Gly 250 Glu Cys Lys Thr Lys 255
Lys Val Ala Cys Asp Ala Tyr Lys Lys Phe Ile Asp Gly Thr Gly
260 265 270
Gly Gly Gly Ser Arg Pro Thr Gly Ile Ala Gly Ser Ser Trp Ser
275 280 285
Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys His Ile Glu Asp
290 295 300
Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Pro Ser Ser
305 310 315
Thr Asn Val Ser Val Ser Thr Asp Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser
325 330 335
Phe
Cys
Ser
240
Cys
Ser
Lys
Ala
Ile
320
<210> 48
<211> 637
<212> Белок
<213> Искусственная
<220> <223> Искусственная
<400> 48 конструкция
Asn 1 Tyr Ile Lys Asp 5 Asp Pro Tyr Ser Lys 10 Glu Tyr Val Thr Lys 15
Ser Phe Ile Pro 20 Asn Ser Ser Asp Ala 25 Asn Thr Ser Ser Glu 30 Lys
Gln Lys Asn 35 Asn Asp Glu Val Cys 40 Asn Pro Asn Glu Ser 45 Gly Ile
Ser Val Glu Gln Ala Gln Thr Ser Asp Pro Ser Ser Asn Lys Thr
55 60
Leu
Ile
Ser
Cys
- 147 031876
Ile 65 Thr His Ser Ser Ile 70 Lys Ala Asn Lys Lys 75 Lys Glu Cys Lys
Val Lys Leu Gly Val Arg Glu Asn Asp Lys Asp Leu Lys Ile Cys
85 90 95
Ile Glu His Thr Ser Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys Cys Phe Lys
100 105 110
Phe Leu Arg Met Leu Gln Glu Pro Arg Ile Asp Lys Asn Gln Arg
115 120 125
Ser Ser Ser Asn Gly Ser Cys Asp Lys Asn Ser Glu Glu Ala Cys
130 135 140
Lys Asn Leu Asp Glu Ala Leu Ala Ser Leu Thr Asn Gly Tyr Lys
145 150 155
Asp Lys Cys Lys Ser Glu Gln Ser Lys Lys Asn Asn Asn Lys Trp
165 170 175
Trp Lys Lys Phe Pro Gly Lys Glu Gly Gly Leu Gln Glu Glu Tyr
180 185 190
Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Tyr Leu Cys Leu Val
195 200 205
Cys Leu Asp Glu Lys Glu Gly Lys Thr Gln Glu Leu Lys Asn Ile
210 215 220
Thr Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His
225 230 235
Gly Lys Asn Leu Lys Thr Thr Tyr Pro Gln Lys Lys Asn Asp Asp
245 250 255
Gly Lys Lys Leu Cys Lys Asp Leu Lys Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr
260 265 270
Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys
275 280 285
Val Glu Leu Asn Leu Gln Asn Asn Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys
290 295 300
Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser
Asp
Val
Asp
Gly
Glu
Cys
160
Ile
Ala
Val
Arg
Glu
240
Asn
Gly
Asn
Tyr
Leu
- 148 031876
305
Asp
Leu
Asp
Ile
His
385
Cys
Asn
Cys
Lys
Ala
465
Thr
Phe
Leu
Trp
Lys
545
310
315
320
Glu Leu Arg Glu 325 Ser Trp Trp Asn Thr 330 Asn Lys Lys Tyr Ile 335 Trp
Ala Met Lys His Gly Ala Glu Met Asn Ser Thr Thr Cys Cys Gly
340 345 350
Gly Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr
355 360 365
Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu
370 375 380
Phe Cys Lys Gln Arg Gln Ala Lys Val Lys Asp Val Ile Thr Asn
390 395 400
Asn Ser Cys Lys 405 Glu Ser Gly Asn Lys 410 Cys Lys Thr Glu Cys 415 Lys
Lys Cys Lys Asp Glu Cys Glu Lys Tyr Lys Lys Phe Ile Glu Ala
420 425 430
Gly Thr Ala Val Gly Gly Thr Gly Thr Ala Gly Ser Pro Trp Ser
435 440 445
Arg 450 Trp Asp Gln Ile Tyr Lys 455 Arg Tyr Ser Lys 460 His Ile Glu Asp
Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Pro Ser Ser
470 475 480
Thr Asn Ala Ala Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser Asp Ile Asp Ser
485 490 495
Phe Lys His 500 Leu Ile Asp Ile Gly 505 Leu Thr Thr Pro Ser 510 Ser Tyr
Ser Ile Val Leu Asp Asp Asn Ile Cys Gly Ala Asp Lys Ala Pro
515 520 525
Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Glu Asn Cys Asp Ile Gln Lys
530 535 540
Thr
Pro
Lys
Ser
Gln
550
Ser
Cys
Asp
Thr
Leu
555
Val
Val
Val
Asn
Val
560
- 149 031876
Pro Ser Pro Leu Gly 565 Asn Thr Pro His
Cys Arg Thr Pro Asn Lys Gln Glu Ser
580 585
Met Asn Gln Trp Ile Ile Asp Asn Thr
595 600
Ser Gly Lys Asp Tyr Tyr Glu Leu Cys
610 615
Thr Lys Pro Leu Gly Thr Leu Lys Asn
625 630
<210>49 <211>330 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>49
Lys 1 Cys Asp Lys Cys 5 Lys Ser Glu Gln
Trp Ile Trp Arg 20 Lys Phe Pro Gly Lys 25
Tyr Ala Asn 35 Thr Ile Gly Leu Pro 40 Pro
Val Cys 50 Leu His Glu Lys Glu 55 Gly Lys
Thr 65 Asn Ser Glu Leu Leu 70 Lys Glu Trp
Gly Lys Asn Leu Lys 85 Thr Thr Tyr Leu
Lys Lys Lys Leu 100 Cys Lys Ala Leu Lys 105
Asp Leu Ile 115 Lys Gly Thr Ser Ile 120 Trp
Leu Glu 130 Leu Asn Leu Gln Lys 135 Ile Phe
Tyr Lys Tyr Ala Cys Gln
575
Asp Asp Arg Lys Glu Tyr
590
Asn Pro Lys Gly Ser Gly
605
Tyr Asn Gly Val Lys Glu
620
Lys Leu Asp
635
Lys Lys Asn Asn Asn Lys
Gly Gly Leu Gln Lys Glu
Thr Gln Ser Leu Cys Leu
Gln His Lys Thr Ile Ser
Ile Ala Ala Phe His Glu
80
Lys Lys Asn Ala Glu Asn
Ser Phe Ala Asp Tyr Gly
110
Asn Glu Tyr Thr Lys Asp
125
Lys Leu Phe Arg Lys Tyr
140
- 150 031876
Ile 145 Lys Lys Asn Asn Thr 150 Ala Glu Gln
Asp Glu Leu Arg Glu 165 Ser Trp Trp Asn
Thr Ala Met Lys 180 His Gly Ala Gly Met 185
Asp Gly Ser 195 Val Thr Gly Ser Gly 200 Ser
Thr Asp 210 Phe Ile Pro Gln Tyr 215 Leu Arg
His 225 Phe Cys Lys Gln Arg 230 Gln Ala Lys
Cys Lys Ser Cys Lys 245 Glu Ser Gly Asn
Asn Lys Cys Asp 260 Ala Tyr Lys Thr Phe 265
Val Gly Gly 275 Thr Ala Gly Ser Ser 280 Trp
Tyr Lys 290 Arg Tyr Ser Lys His 295 Ile Glu
Ala 305 Gly Thr Lys Asn Cys 310 Gly Thr Ser
Ser Thr Ala Glu Asn 325 Lys Cys Val Gln
<210>50 <211>269 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>50
Asn Tyr Ile Lys Asp Asp Pro Tyr Ser
Ser Phe Ile Leu Asn Ser Ser Asp Ala
25
Thr 155 Ser Tyr Ser Ser Leu 160
Asn Lys Lys Tyr Ile 175 Trp
Gly Thr Met Cys 190 Asn Ala
Cys Asp Asp 205 Met Pro Thr
Leu Gln 220 Glu Trp Val Glu
Lys 235 Asp Val Ile Glu Asn 240
Cys Lys Thr Glu Cys 255 Lys
Glu Glu Cys Gly 270 Thr Ala
Lys Arg Trp 285 Asp Gln Ile
Ala Lys 300 Arg Asn Arg Lys
Thr Thr Asn Ala Ala Ala
315 320
Glu Tyr Val Thr Lys 15 Leu
Asn Ala Ser Glu 30 Thr Pro
- 151 031876
Ser Lys Tyr 35 Tyr Asp Glu Ala Cys 40 Asn
Ser Val 50 Glu Gln Ala Ser Ile 55 Ser Asp
Asn 65 Thr His Ser Phe Ile 70 Gly Ala Asn
Val Lys Leu Gly Val 85 Arg Glu Asn Asp
Ile Glu Asp Asp 100 Ser Leu Arg Gly Val 105
Phe Leu Arg 115 Met Leu Gln Glu Pro 120 Arg
Ser Ser 130 Ser Asn Asp Ser Cys 135 Asn Asn
Lys 145 Asn Leu Asp Glu Ala 150 Leu Ala Ser
Gln Lys Cys Lys Ser 165 Glu Gln Ser Lys
Trp Lys Lys Ser 180 Ser Gly Lys Glu Gly 185
Asn Thr Ile 195 Gly Leu Pro Pro Arg 200 Thr
Leu His 210 Glu Lys Glu Gly Lys 215 Thr Gln
Ser 225 Glu Leu Leu Lys Glu 230 Trp Ile Ile
Asn Leu Lys Thr Thr 245 Tyr Leu Glu Lys
Lys Leu Cys Lys 260 Ala Leu Lys Tyr Ser 265
Asn Glu Ser 45 Gly Ile Ser
Ser Ser 60 Gln Lys Ala Cys
Lys 75 Lys Val Cys Lys His 80
Asp Leu Lys Ile Cys 95 Val
Asn Cys Cys Phe 110 Lys Asp
Asp Lys Asn 125 Gln Arg Gly
Asn Glu 140 Glu Ala Cys Glu
His 155 Asn Gly Tyr Lys Asn 160
Asn Asn Asn Lys Trp 175 Ile
Leu Gln Lys Glu 190 Tyr Ala
Ser Leu Cys 205 Leu Val Cys
Lys Thr 220 Ile Ser Thr Asn
Ala 235 Phe His Glu Gly Lys 240
Lys Gly Asp Asn Gly 255 Lys
Ala Asp Tyr
<210> 51 <211> 347 <212> Белок
- 152 031876 <213> Plasmodium falciparum <400> 51
Lys 1 Cys Asp Lys Cys 5 Lys Ser Glu Gln Ser 10 Lys Lys Asn Asn Lys 15
Trp Ile Trp Lys 20 Lys Ser Ser Gly Lys 25 Glu Gly Gly Leu Gln 30 Lys
Tyr Ala Asn 35 Thr Ile Ala Leu Pro 40 Pro Arg Thr Gln Ser 45 Leu Cys
Val Val 50 Cys Leu His Glu Lys 55 Glu Gly Lys Thr Gln 60 His Lys Thr
Ser Thr Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Asp Ala Phe
65 70 75
Glu Gly Lys Asn Leu Lys Thr Thr Tyr Leu Glu Lys Gln Asn Ala
85 90 95
Asn Gly Lys Lys Asn Ala Asp Asn Asn Ser Lys Leu Cys Lys Asp
100 105 110
Lys Tyr Ser 115 Phe Ala Asp Tyr Gly Asp 120 Leu Ile Lys Gly 125 Thr Ser
Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Gln
130 135 140
Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Ile Ala Ser
145 150 155
Glu Asn Thr Leu Tyr Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp
165 170 175
Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Thr Ala Met Lys His Gly Ala
180 185 190
Met Asn Gly 195 Thr Thr Cys Ser Ser 200 Gly Ser Gly Asp Ser 205 Ser Ser
Glu Asn Gln Thr Asn Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu
210 215 220
Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His Phe Cys
225 230 235
Asn
Glu
Leu
Ile
His
Asp
Leu
Ile
Ile
Asp
160
Trp
Glu
Gly
Ile
Glu
240
- 153 031876
Gln Arg Gln Ala Lys 245 Val Lys Asp Val
Lys Glu Ser Gly 260 Gly Thr Cys Asn Ser 265
Gly Glu Cys 275 Glu Lys Tyr Lys Lys 280 Phe
Gly Thr 290 Glu Gly Thr Ser Gly 295 Ser Ser
Ile 305 Tyr Met Arg Tyr Ser 310 Lys Tyr Ile
Lys Ala Gly Thr Lys 325 Ser Cys Gly Thr
Val Thr Thr Thr 340 Glu Ser Lys Cys Val 345
<210>52 <211>269 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>52
Asp 1 Tyr Ile Lys Asp 5 Asp Pro Tyr Ser
Ser Phe Ile Leu 20 Asn Ser Ser Asp Ala 25
Gln Lys Asn 35 Asn Asp Glu Val Cys 40 Asn
Ser Val 50 Glu Gln Ala Gln Thr 55 Ser Arg
Ile 65 Thr His Ser Ser Ile 70 Lys Ala Asn
Val Lys Leu Gly Val 85 Arg Glu Asn Asp
Ile Glu His Thr 100 Ser Leu Ser Gly Val 105
Thr Asn Cys Lys Ser 255 Cys
Cys Lys Thr Lys 270 Cys Lys
Glu Lys Cys 285 Lys Gly Gly
Val Lys 300 Arg Trp Tyr Gln
Asp 315 Ala Lys Arg Asn Arg 320
Ser Gly Ala Asn Ser Gly
335
Ser
Glu Tyr Thr Thr Lys 15 Leu
Thr Ser Ser Glu 30 Lys Ile
Asn Glu Ser 45 Glu Ile Ser
Ser Ser 60 Asn Lys Thr Cys
Lys 75 Lys Val Cys Lys Asp 80
Val Leu Arg Val Cys 95 Val
Asn Cys Cys Cys 110 Gln Asp
- 154 031876
Leu Leu Gly 115 Ile Leu Gln Glu Asn 120 Cys
Ser Ser 130 Asn Gly Ser Cys Asp 135 Lys Asn
Asn 145 Leu Asp Glu Ala Leu 150 Ala Ser Leu
Lys Cys Lys Ser Glu 165 Gln Ser Lys Lys
Lys Lys Ser Ser 180 Gly Asn Glu Lys Gly 185
Thr Ile Gly 195 Leu Pro Pro Arg Thr 200 Gln
His Glu 210 Lys Glu Gly Lys Thr 215 Gln Glu
Ser 225 Glu Leu Leu Lys Glu 230 Trp Ile Ile
Asn Leu Lys Thr Thr 245 Tyr Pro Gln Asn
Lys Leu Phe Lys 260 Asp Leu Lys Tyr Ser 265
<210> 53
<211> 646
<212> Белок
<213> Искусственная
<220>
<223> Искусственная конструкция
<400> 53
Asp Tyr Ile Lys Asp Asp Pro Tyr Ser
1 5
Ser Phe Ile Leu Asn Ser Ser Asp Ala
25
Gln Lys Asn Asn Asp Glu Val Cys Asn
40
Asp Asn Lys 125 Arg Gly Ser
Glu Glu 140 Ala Cys Glu Lys
Asn 155 Cys Tyr Lys Asn Gln 160
Asn Asn Lys Trp Ile 175 Trp
Gln Lys Glu Tyr 190 Ala Asn
Leu Cys Leu 205 Val Cys Leu
Lys Asn 220 Ile Ser Thr Asn
Ala 235 Phe His Glu Gly Lys 240
Asn Asp Asp Asn Gly Lys
255
Ala Asp Tyr
Glu Tyr Thr Thr Lys Leu
Thr Ser Ser Glu Lys Ile
Asn Glu Ser Glu Ile Ser
- 155 031876
Ser
Ile
Val
Ile
Leu
Ser
Asn
145
Lys
Lys
Thr
Pro
Thr
225
Gly
Gly
Asp
Leu
Val 50 Glu Gln Ala Gln Thr 55 Ser Arg Pro Ser Ser 60 Asn Lys Thr
Thr His Ser Ser Ile Lys Ala Asn Lys Lys Lys Val Cys Lys
70 75
Lys Leu Gly Val Arg Glu Asn Asp Lys Val Leu Arg Val Cys
85 90 95
Glu His Thr Ser Leu Ser Gly Val Glu Asn Cys Cys Cys Gln
100 105 110
Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Arg Gly
115 120 125
Ser Asn Gly Ser Cys Asp Lys Asn Ser Glu Glu Ala Cys Glu
130 135 140
Leu Asp Glu Ala Leu Ala Ser Leu Thr Asn Cys Tyr Lys Asn
150 155
Cys Lys Ser Glu Gln Ser Lys Lys Asn Asn Asn Lys Trp Ile
165 170 175
Lys Ser Ser Gly Lys Glu Gly Gly Leu Gln Lys Glu Tyr Ala
180 185 190
Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu Gly Asn
195 200 205
Lys 210 Leu Glu Asn Val Cys 215 Lys Gly Val Thr Asp 220 Ile Asn Phe
Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Ala Ala Phe His
230 235
Lys Asn Leu Lys Thr Thr Tyr Leu Glu Lys Lys Asn Asp Asp
245 250 255
Lys Lys Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr
260 265 270
Leu Ile 275 Lys Gly Thr Ser Ile 280 Trp Asp Asn Glu Tyr 285 Thr Lys
Glu Leu Asn Leu Gln Lys Ala Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys
290 295 300
Cys
Asp
Val
Asp
Ser
Lys
Gln
160
Trp
Asn
Leu
Asp
Glu
240
Asn
Gly
Asp
Tyr
- 156 031876
Ile 305 Lys Lys Asn Asn Thr 310 Ala Glu Gln Asp Thr 315 Ser Tyr Ser Ser
Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile
325 330 335
Thr Ala Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Gly Thr Thr Cys Ser
340 345 350
Gly Ser Gly Asp Ser Ser Asn Asp Ile Pro Thr Thr Asp Phe Ile
355 360 365
Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu Asn Phe Cys Glu
370 375 380
Arg Gln Ala Lys Val Lys Asp Val Ile Glu Asn Cys Asn Ser Cys
385 390 395
Asn Thr Ser Gly Glu 405 Arg Lys Ile Gly Asp Thr 410 Cys Asn Ser Asp 415
Glu Lys Lys Cys Lys Asp Glu Cys Glu Lys Tyr Lys Lys Phe Ile
420 425 430
Asp Cys Lys Gly Gly Asp Gly Thr Ala Gly Ser Ser Trp Val Lys
435 440 445
Trp Asp Gln 450 Ile Tyr Lys Arg Tyr 455 Ser Lys His Ile Glu 460 Asp Ala
Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Ile Thr Thr Gly
465 470 475
Ile Ser Gly Glu Ser Ser Gly Ala Thr Ser Gly Val Thr Thr Thr
485 490 495
Asn Lys Cys Val Gln Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His Leu
500 505 510
Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro Ser Ser Tyr Leu Ser Asn Val Leu
515 520 525
Asp Asn Ile Cys Gly Glu Asp Asn Ala Pro Trp Thr Thr Tyr Thr
530 535 540
Tyr Thr Thr Glu Lys Cys Asn Lys Glu Thr Asp Lys Ser Lys Ser 545 550 555
Leu
320
Trp
Ser
Pro
Gln
Lys
400
Cys
Glu
Arg
Lys
Thr
480
Glu
Ile
Asp
Thr
Gln
560
- 157 031876
Gln Ser Asn Thr Ala 565 Val Val Val Asn
Thr Pro His Gly Tyr Lys Tyr Ala Cys
580 585
Glu Glu Thr Cys Asp Asp Arg Lys Glu
595 600
Gly Ser Ala Gln Thr Val Arg Asp Arg
610 615
Leu Cys Lys Tyr Asn Gly Val Gln Ile
625 630
Lys Asn Ser Lys Leu Asp
645
<210>54 <211>632 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>54
Asn 1 Tyr Ile Lys Gly 5 Asp Pro Tyr Phe
Ser Phe Ile Leu 20 Asn Ser Ser Asp Ala 25
Gln Lys Asn 35 Asn Asp Glu Val Cys 40 Asn
Ser Val 50 Glu Gln Glu Gln Ile 55 Ser Asp
Ile 65 Thr His Ser Ser Ile 70 Lys Ala Asn
Val Lys Leu Gly Val 85 Arg Glu Asn Asp
Ile Glu His Thr 100 Ser Leu Ser Gly Val 105
Phe Leu Arg 115 Ile Leu Gln Glu Asn 120 Cys
Pro Ser Pro Leu Gly 575 Asn
Cys Lys Ile Pro 590 Thr Thr
Met Asn Gln 605 Trp Ser Cys
Gly Lys 620 Asp Asp Tyr Glu
Gln 635 Ala Ala Gly Thr Leu 640
Glu Tyr Ala Thr Lys 15 Leu
Asn Pro Ser Glu 30 Lys Ile
Asn Glu Ser 45 Gly Ile Ala
Ser Ser 60 Asn Lys Thr Cys
Lys 75 Lys Val Cys Lys His 80
Asp Leu Arg Val Cys 95 Val
Asn Cys Cys Cys 110 Gln Asp
Asp Asn Lys 125 Ser Gly Ser
- 158 031876
Ser Ser 130 Asn Gly Ser Cys Asn 135 Asn Lys Asn Gln Glu 140 Ala Cys Glu
Asn Leu Glu Lys Val Leu Ala Ser Leu Thr Asn Cys Tyr Lys Cys
145 150 155
Lys Cys Lys Ser Glu Gln Ser Lys Lys Asn Asn Lys Asn Trp Ile
165 170 175
Lys Lys Ser Ser Gly Lys Glu Gly Gly Leu Gln Lys Glu Tyr Ala
180 185 190
Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Cys Leu Val Val
195 200 205
Leu Asp Glu Lys Gly Lys Lys Thr Gln Glu Leu Lys Asn Ile Arg
210 215 220
Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu
225 230 235
Lys Asn Leu Lys Pro Ser His Glu Lys Lys Asn Asp Asp Asn Gly
245 250 255
Lys Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp
260 265 270
Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu
275 280 285
Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr Ile
290 295 300
Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp
305 310 315
Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Leu
325 330 335
Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Ser Thr Thr Cys Cys Gly Asp
340 345 350
Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile
355 360 365
Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His
Lys
Asp
160
Trp
Asn
Cys
Thr
Gly
240
Lys
Leu
Glu
Lys
Glu
320
Ala
Gly
Asp
Phe
- 159 031876
370
375
380
Cys 385 Lys Gln Arg Gln Glu 390 Lys Val Lys Pro Val 395 Ile Glu Asn Cys
Ser Cys Lys Glu Ser Gly Gly Thr Cys Asn Gly Glu Cys Lys Thr
405 410 415
Cys Lys Asn Lys Cys Glu Val Tyr Lys Lys Phe Ile Glu Asp Cys
420 425 430
Gly Gly Asp Gly Thr Ala Gly Ser Ser Trp Val Lys Arg Trp Asp
435 440 445
Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys Tyr Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn
450 455 460
Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Pro Ser Ser Thr Thr Asn Ala
465 470 475
Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His
485 490 495
Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro Ser Ser Tyr Leu Ser Ile Val
500 505 510
Asp Asp Asn Ile Cys Gly Ala Asp Lys Ala Pro Trp Thr Thr Tyr
515 520 525
Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys 535 Cys Asn Lys Glu Thr 540 Asp Lys Ser
530
Leu Gln Gln Cys Asn Thr Ala Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro
545 550 555
Gly Asn Thr Pro His Gly Tyr Lys Tyr Ala Cys Gln Cys Lys Ile
565 570 575
Thr Asn Glu Glu Thr Cys Asp Asp Arg Lys Glu Tyr Met Asn Gln
580 585 590
Ser Cys Gly Ser Ala Arg Thr Met Lys Arg Gly Tyr Lys Asn Asp
595 600 605
Tyr
Glu
610
Leu
Cys
Lys
Tyr
Asn
615
Gly
Val
Asp
Val
Lys
620
Pro
Thr
Thr
Lys
400
Glu
Lys
Gln
Arg
Ala
480
Leu
Leu
Thr
Lys
Leu
560
Pro
Trp
Asn
Val
- 160 031876
Arg Ser Asn Ser Ser Lys Leu Asp
625630 <210>55 <211>2730 <212> Белок <213> Plasmodium falciparum <400>55
Met 1 Asp Lys Ser Ser 5 Ile Ala Asn Lys Ile Glu Ala Tyr 10 Leu Gly 15 Ala
Lys Ser Asp Asp Ser Lys Ile Asp Gln Ser Leu Lys Ala Asp Pro Ser
20 25 30
Glu Val Gln Tyr Tyr Gly Ser Gly Gly Asp Gly Tyr Tyr Leu Arg Lys
35 40 45
Asn Ile Cys Lys Ile Thr Val Asn His Ser Asp Ser Gly Thr Asn Asp
50 55 60
Pro Cys Asp Arg Ile Pro Pro Pro Tyr Gly Asp Asn Asp Gln Trp Lys
65 70 75 80
Cys Ala Ile Ile Leu Ser Lys Val Ser Glu Lys Pro Glu Asn Val Phe
85 90 95
Val Pro Pro Arg Arg Gln Arg Met Cys Ile Asn Asn Leu Glu Lys Leu
100 105 110
Asn Val Asp Lys Ile Arg Asp Lys His Ala Phe Leu Ala Asp Val Leu
115 120 125
Leu Thr Ala Arg Asn Glu Gly Glu Arg Ile Val Gln Asn His Pro Asp
130 135 140
Thr Asn Ser Ser Asn Val Cys Asn Ala Leu Glu Arg Ser Phe Ala Asp
145 150 155 160
Ile Ala Asp Ile Ile Arg Gly Thr Asp Leu Trp Lys Gly Thr Asn Ser
165 170 175
Asn Leu Glu Gln Asn Leu Lys Gln Met Phe Ala Lys Ile Arg Glu Asn
180 185 190
Asp Lys Val Leu Gln Asp Lys Tyr Pro Lys Asp Gln Asn Tyr Arg Lys
195 200 205
- 161 031876
Leu
Ile
225
Arg
Lys
Pro
Glu
Thr
305
Cys
Ser
Asn
Val
Asn
385
Ser
Gln
Ser
Ile
Arg Glu 210 Asp Trp Trp Asn Ala Asn Arg 215 Gln Lys 220 Val Trp Glu
Thr Cys Gly Ala Arg Ser Asn Asp Leu Leu Ile Lys Arg Gly
230 235
Thr Ser Gly Lys Ser Asn Gly Asp Asn Lys Leu Glu Leu Cys
245 250 255
Cys Gly His Tyr Glu Glu Lys Val Pro Thr Lys Leu Asp Tyr
260 265 270
Gln Phe Leu Arg Trp Leu Thr Glu Trp Ile Glu Asp Phe Tyr
275 280 285
Lys Gln Asn Leu Ile Asp Asp Met Glu Arg His Arg Glu Glu
290 295 300
Ser Glu Asp His Lys Ser Lys Glu Gly Thr Ser Tyr Cys Ser
310 315
Lys Asp Lys Cys Lys Lys Tyr Cys Glu Cys Val Lys Lys Trp
325 330 335
Glu Trp Glu Asn Gln Lys Asn Lys Tyr Thr Glu Leu Tyr Gln
340 345 350
Lys Asn Glu Thr Ser Gln Lys Asn Thr Ser Arg Tyr Asp Asp
355 360 365
Lys 370 Asp Phe Phe Lys Lys 375 Leu Glu Ala Asn Tyr 380 Ser Ser Leu
Tyr Ile Lys Gly Asp Pro Tyr Phe Ala Glu Tyr Ala Thr Lys
390 395
Phe Ile Leu Asn Ser Ser Asp Ala Asn Asn Pro Ser Glu Lys
405 410 415
Lys Asn Asn 420 Asp Glu Val Cys Asn 425 Cys Asn Glu Ser Gly 430 Ile
Val Glu Gln Glu Gln Ile Ser Asp Pro Ser Ser Asn Lys Thr
435 440 445
Thr His Ser Ser Ile Lys Ala Asn Lys Lys Lys Val Cys Lys
450 455 460
Val
Trp
240
Arg
Val
Arg
Cys
Thr
320
Lys
Gln
Tyr
Glu
Leu
400
Ile
Ala
Cys
His
- 162 031876
Val
465
Ile
Phe
Ser
Asn
Lys
545
Lys
Thr
Leu
Asn
Lys
625
Lys
Ile
Leu
Lys
Leu
705
Lys Leu Gly Val Arg 470 Glu Asn Asp Lys Asp 475 Leu Arg Val Cys
Glu His Thr Ser Leu Ser Gly Val Glu Asn Cys Cys Cys Gln
485 490 495
Leu Arg Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Ser Gly
500 505 510
Ser Asn Gly Ser Cys Asn Asn Lys Asn Gln Glu Ala Cys Glu
515 520 525
Leu Glu Lys Val Leu Ala Ser Leu Thr Asn Cys Tyr Lys Cys
530 535 540
Cys Lys Ser Glu Gln Ser Lys Lys Asn Asn Lys Asn Trp Ile
550 555
Lys Ser Ser Gly Lys 565 Glu Gly Gly Leu 570 Gln Lys Glu Tyr Ala 575
Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Cys Leu Val Val
580 585 590
Asp Glu Lys Gly Lys Lys Thr Gln Glu Leu Lys Asn Ile Arg
595 600 605
Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu
610 615 620
Asn Leu Lys Pro Ser His Glu Lys Lys Asn Asp Asp Asn Gly
630 635
Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp
645 650 655
Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu
660 665 670
Asn Leu Gln Lys Ile Phe Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr Ile
675 680 685
Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp
690 695 700
Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Leu
710 715
Val
480
Asp
Ser
Lys
Asp
Trp
560
Asn
Cys
Thr
Gly
Lys
640
Leu
Glu
Lys
Glu
Ala
720
- 163 031876
Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Ser Thr Thr Cys Cys Gly Asp 735 Gly
725 730
Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp
740 745 750
Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu His Phe
755 760 765
Cys Lys Gln Arg Gln Glu Lys Val Lys Pro Val Ile Glu Asn Cys Lys
770 775 780
Ser Cys Lys Glu Ser Gly Gly Thr Cys Asn Gly Glu Cys Lys Thr Glu
785 790 795 800
Cys Lys Asn Lys Cys Glu Val Tyr Lys Lys Phe Ile Glu Asp Cys Lys
805 810 815
Gly Gly Asp Gly Thr Ala Gly Ser Ser Trp Val Lys Arg Trp Asp Gln
820 825 830
Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys Tyr Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg
835 840 845
Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Pro Ser Ser Thr Thr Asn Ala Ala
850 855 860
Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His Leu
865 870 875 880
Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro Ser Ser Tyr Leu Ser Ile Val Leu
885 890 895
Asp Asp Asn Ile Cys Gly Ala Asp Lys Ala Pro Trp Thr Thr Tyr Thr
900 905 910
Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys Cys Asn Lys Glu Thr Asp Lys Ser Lys
915 920 925
Leu Gln Gln Cys Asn Thr Ala Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro Leu
930 935 940
Gly Asn Thr Pro His Gly Tyr Lys Tyr Ala Cys Gln Cys Lys Ile Pro
945 950 955 960
Thr Asn Glu Glu Thr Cys Asp Asp Arg Lys Glu Tyr Met Asn Gln Trp
- 164 031876
965
970
975
Ser Cys Gly Ser Ala Arg
980
Thr Met Lys Arg Gly Tyr Lys Asn Asp Asn
985 990
Tyr
Glu
Leu
995
Cys
Lys Tyr
Asn Gly Val Asp Val Lys Pro Thr Thr Val 1000
1005
Arg Ser 1010 Asn Ser Ser Lys Leu 1015 Asp Asp Lys Asp Val 1020 Thr Phe Phe
Asn Leu Phe Glu Gln Trp Asn Lys Glu Ile Gln Tyr Gln Ile Glu
1025 1030 1035
Gln Tyr Met Thr Asn Thr Lys Ile Ser Cys Asn Asn Glu Lys Asn
1040 1045 1050
Val Leu Ser Arg Val Ser Asp Glu Ala Ala Gln Pro Lys Phe Ser
1055 1060 1065
Asp Asn Glu Arg Asp Arg Asn Ser Ile Thr His Glu Asp Lys Asn
1070 1075 1080
Cys Lys Glu Lys Cys Lys Cys Tyr Ser Leu Trp Ile Glu Lys Ile
1085 1090 1095
Asn Asp Gln Trp Asp Lys Gln Lys Asp Asn Tyr Asn Lys Phe Gln
1100 1105 1110
Arg Lys Gln Ile Tyr Asp Ala Asn Lys Gly Ser Gln Asn Lys Lys
1115 1120 1125
Val Val Ser Leu Ser Asn Phe Leu Phe Phe Ser Cys Trp Glu Glu
1130 1135 1140
Tyr Ile Gln Lys Tyr Phe Asn Gly Asp Trp Ser Lys Ile Lys Asn
1145 1150 1155
Ile Gly Ser Asp Thr Phe Glu Phe Leu Ile Lys Lys Cys Gly Asn
1160 1165 1170
Asp Ser Gly Asp Gly Glu Thr Ile Phe Ser Glu Lys Leu Asn Asn
1175 1180 1185
Ala Glu Lys Lys Cys Lys Glu Asn Glu Ser Thr Asn Asn Lys Met
1190 1195 1200
- 165 031876
Lys Ser 1205 Ser Glu Thr Ser Cys 1210 Asp Cys Ser Glu Pro 1215 Ile Tyr Ile
Arg Gly Cys Gln Pro Lys Ile Tyr Asp Gly Lys Ile Phe Pro Gly
1220 1225 1230
Lys Gly Gly Glu Lys Gln Trp Ile Cys Lys Asp Thr Ile Ile His
1235 1240 1245
Gly Asp Thr Asn Gly Ala Cys Ile Pro Pro Arg Thr Gln Asn Leu
1250 1255 1260
Cys Val Gly Glu Leu Trp Asp Lys Arg Tyr Gly Gly Arg Ser Asn
1265 1270 1275
Ile Lys Asn Asp Thr Lys Glu Ser Leu Lys Gln Lys Ile Lys Asn
1280 1285 1290
Ala Ile Gln Lys Glu Thr Glu Leu Leu Tyr Glu Tyr His Asp Lys
1295 1300 1305
Gly Thr Ala Ile Ile Ser Arg Asn Pro Met Lys Gly Gln Lys Glu
1310 1315 1320
Lys Glu Glu Lys Asn Asn Asp Ser Asn Gly Leu Pro Lys Gly Phe
1325 1330 1335
Cys His Ala Val Gln Arg Ser Phe Ile Asp Tyr Lys Asn Met Ile
1340 1345 1350
Leu Gly Thr Ser Val Asn Ile Tyr Glu Tyr Ile Gly Lys Leu Gln
1355 1360 1365
Glu Asp Ile Lys Lys Ile Ile Glu Lys Gly Thr Thr Lys Gln Asn
1370 1375 1380
Gly Lys Thr Val Gly Ser Gly Ala Glu Asn Val Asn Ala Trp Trp
1385 1390 1395
Lys Gly Ile Glu Gly Glu Met Trp Asp Ala Val Arg Cys Ala Ile
1400 1405 1410
Thr Lys Ile Asn Lys Lys Gln Lys Lys Asn Gly Thr Phe Ser Ile
1415 1420 1425
Asp Glu Cys Gly Ile Phe Pro Pro Thr Gly Asn Asp Glu Asp Gln
1430 1435 1440
- 166 031876
Ser Val Ser Trp Phe Lys Glu Trp
1445 1450
Ser Glu Gln Phe Cys Ile Glu
1455
Arg Leu 1460 Gln Tyr Glu Lys Asn 1465 Ile Arg Asp Ala Cys 1470 Thr Asn Asn
Gly Gln Gly Asp Lys Ile Gln Gly Asp Cys Lys Arg Lys Cys Glu
1475 1480 1485
Glu Tyr Lys Lys Tyr Ile Ser Glu Lys Lys Gln Glu Trp Asp Lys
1490 1495 1500
Gln Lys Thr Lys Tyr Glu Asn Lys Tyr Val Gly Lys Ser Ala Ser
1505 1510 1515
Asp Leu Leu Lys Glu Asn Tyr Pro Glu Cys Ile Ser Ala Asn Phe
1520 1525 1530
Asp Phe Ile Phe Asn Asp Asn Ile Glu Tyr Lys Thr Tyr Tyr Pro
1535 1540 1545
Tyr Gly Asp Tyr Ser Ser Ile Cys Ser Cys Glu Gln Val Lys Tyr
1550 1555 1560
Tyr Glu Tyr Asn Asn Ala Glu Lys Lys Asn Asn Lys Ser Leu Cys
1565 1570 1575
His Glu Lys Gly Asn Asp Arg Thr Trp Ser Lys Lys Tyr Ile Lys
1580 1585 1590
Lys Leu Glu Asn Gly Arg Thr Leu Glu Gly Val Tyr Val Pro Pro
1595 1600 1605
Arg Arg Gln Gln Leu Cys Leu Tyr Glu Leu Phe Pro Ile Ile Ile
1610 1615 1620
Lys Asn Lys Asn Asp Ile Thr Asn Ala Lys Lys Glu Leu Leu Glu
1625 1630 1635
Thr Leu Gln Ile Val Ala Glu Arg Glu Ala Tyr Tyr Leu Trp Lys
1640 1645 1650
Gln Tyr His Ala His Asn Asp Thr Thr Tyr Leu Ala His Lys Lys
1655 1660 1665
Ala Cys Cys Ala Ile Arg Gly Ser Phe Tyr Asp Leu Glu Asp Ile
1670 1675 1680
- 167 031876
Ile Lys 1685 Gly Asn Asp Leu Val 1690 His Asp Glu Tyr Thr 1695 Lys Tyr Ile
Asp Ser Lys Leu Asn Glu Ile Phe Asp Ser Ser Asn Lys Asn Asp
1700 1705 1710
Ile Glu Thr Lys Arg Ala Arg Thr Asp Trp Trp Glu Asn Glu Ala
1715 1720 1725
Ile Ala Val Pro Asn Ile Thr Gly Ala Asn Lys Ser Asp Pro Lys
1730 1735 1740
Thr Ile Arg Gln Leu Val Trp Asp Ala Met Gln Ser Gly Val Arg
1745 1750 1755
Lys Ala Ile Asp Glu Glu Lys Glu Lys Lys Lys Pro Asn Glu Asn
1760 1765 1770
Phe Pro Pro Cys Met Gly Val Gln His Ile Gly Ile Ala Lys Pro
1775 1780 1785
Gln Phe Ile Arg Trp Leu Glu Glu Trp Thr Asn Glu Phe Cys Glu
1790 1795 1800
Lys Tyr Thr Lys Tyr Phe Glu Asp Met Lys Ser Asn Cys Asn Leu
1805 1810 1815
Arg Lys Gly Ala Asp Asp Cys Asp Asp Asn Ser Asn Ile Glu Cys
1820 1825 1830
Lys Lys Ala Cys Ala Asn Tyr Thr Asn Trp Leu Asn Pro Lys Arg
1835 1840 1845
Ile Glu Trp Asn Gly Met Ser Asn Tyr Tyr Asn Lys Ile Tyr Arg
1850 1855 1860
Lys Ser Asn Lys Glu Ser Glu Asp Gly Lys Asp Tyr Ser Met Ile
1865 1870 1875
Met Glu Pro Thr Val Ile Asp Tyr Leu Asn Lys Arg Cys Asn Gly
1880 1885 1890
Glu Ile Asn Gly Asn Tyr Ile Cys Cys Ser Cys Lys Asn Ile Gly
1895 1900 1905
Glu Asn Ser Thr Ser Gly Thr Val Asn Lys Lys Leu Gln Lys Lys
- 168 031876
1910
1915
1920
Glu Thr 1925 Gln Cys Glu Asp Asn 1930 Lys Gly Pro Leu Asp 1935 Leu Met Asn
Lys Val Leu Asn Lys Met Asp Pro Lys Tyr Ser Glu His Lys Met
1940 1945 1950
Lys Cys Thr Glu Val Tyr Leu Glu His Val Glu Glu Gln Leu Lys
1955 1960 1965
Glu Ile Asp Asn Ala Ile Lys Asp Tyr Lys Leu Tyr Pro Leu Asp
1970 1975 1980
Arg Cys Phe Asp Asp Lys Ser Lys Met Lys Val Cys Asp Leu Ile
1985 1990 1995
Gly Asp Ala Ile Gly Cys Lys His Lys Thr Lys Leu Asp Glu Leu
2000 2005 2010
Asp Glu Trp Asn Asp Val Asp Met Arg Asp Pro Tyr Asn Lys Tyr
2015 2020 2025
Lys Gly Val Leu Ile Pro Pro Arg Arg Arg Gln Leu Cys Phe Ser
2030 2035 2040
Arg Ile Val Arg Gly Pro Ala Asn Leu Arg Asn Leu Lys Glu Phe
2045 2050 2055
Lys Glu Glu Ile Leu Lys Gly Ala Gln Ser Glu Gly Lys Phe Leu
2060 2065 2070
Gly Asn Tyr Tyr Asn Glu Asp Lys Asp Lys Glu Lys Ala Leu Glu
2075 2080 2085
Ala Met Lys Asn Ser Phe Tyr Asp Tyr Glu Tyr Ile Ile Lys Gly
2090 2095 2100
Ser Asp Met Leu Thr Asn Ile Gln Phe Lys Asp Ile Lys Arg Lys
2105 2110 2115
Leu Asp Arg Leu Leu Glu Lys Glu Thr Asn Asn Thr Glu Lys Val
2120 2125 2130
Asp Asp Trp Trp Glu Thr Asn Lys Lys Ser Ile Trp Asn Ala Met
2135 2140 2145
- 169 031876
Leu Cys 2150 Gly Tyr Lys Lys Ser 2155 Gly Asn Lys Ile Ile 2160 Asp Pro Ser
Trp Cys Thr Ile Pro Thr Thr Glu Thr Pro Pro Gln Phe Leu Arg
2165 2170 2175
Trp Ile Lys Glu Trp Gly Thr Asn Val Cys Ile Gln Lys Glu Glu
2180 2185 2190
His Lys Glu Tyr Val Lys Ser Lys Cys Ser Asn Val Thr Asn Leu
2195 2200 2205
Gly Ala Gln Glu Ser Glu Ser Lys Asn Cys Thr Ser Glu Ile Lys
2210 2215 2220
Lys Tyr Gln Glu Trp Ser Arg Lys Arg Ser Ile Gln Trp Glu Ala
2225 2230 2235
Ile Ser Glu Gly Tyr Lys Lys Tyr Lys Gly Met Asp Glu Phe Lys
2240 2245 2250
Asn Thr Phe Lys Asn Ile Lys Glu Pro Asp Ala Asn Glu Pro Asn
2255 2260 2265
Ala Asn Glu Tyr Leu Lys Lys His Cys Ser Lys Cys Pro Cys Gly
2270 2275 2280
Phe Asn Asp Met Gln Glu Ile Thr Lys Tyr Thr Asn Ile Gly Asn
2285 2290 2295
Glu Ala Phe Lys Gln Ile Lys Glu Gln Val Asp Ile Pro Ala Glu
2300 2305 2310
Leu Glu Asp Val Ile Tyr Arg Leu Lys His His Glu Tyr Asp Lys
2315 2320 2325
Gly Asn Asp Tyr Ile Cys Asn Lys Tyr Lys Asn Ile Asn Val Asn
2330 2335 2340
Met Lys Lys Asn Asn Asp Asp Thr Trp Thr Asp Leu Val Lys Asn
2345 2350 2355
Ser Ser Asp Ile Asn Lys Gly Val Leu Leu Pro Pro Arg Arg Lys
2360 2365 2370
Asn
Leu
2375
Phe
Leu
Lys
Ile
Asp
2380
Glu
Ser
Asp
Ile
Cys
2385
Lys
Tyr
Lys
- 170 031876
Arg Asp 2390 Pro Lys Leu Phe Lys 2395 Asp Phe Ile Tyr Ser 2400 Ser Ala Ile
Ser Glu Val Glu Arg Leu Lys Lys Val Tyr Gly Glu Ala Lys Thr
2405 2410 2415
Lys Val Val His Ala Met Lys Tyr Ser Phe Ala Asp Ile Gly Ser
2420 2425 2430
Ile Ile Lys Gly Asp Asp Met Met Glu Asn Asn Ser Ser Asp Lys
2435 2440 2445
Ile Gly Lys Ile Leu Gly Asp Gly Val Gly Gln Asn Glu Lys Arg
2450 2455 2460
Lys Lys Trp Trp Asp Met Asn Lys Tyr His Ile Trp Glu Ser Met
2465 2470 2475
Leu Cys Gly Tyr Lys His Ala Tyr Gly Asn Ile Ser Glu Asn Asp
2480 2485 2490
Arg Lys Met Leu Asp Ile Pro Asn Asn Asp Asp Glu His Gln Phe
2495 2500 2505
Leu Arg Trp Phe Gln Glu Trp Thr Glu Asn Phe Cys Thr Lys Arg
2510 2515 2520
Asn Glu Leu Tyr Glu Asn Met Val Thr Ala Cys Asn Ser Ala Lys
2525 2530 2535
Cys Asn Thr Ser Asn Gly Ser Val Asp Lys Lys Glu Cys Thr Glu
2540 2545 2550
Ala Cys Lys Asn Tyr Ser Asn Phe Ile Leu Ile Lys Lys Lys Glu
2555 2560 2565
Tyr Gln Ser Leu Asn Ser Gln Tyr Asp Met Asn Tyr Lys Glu Thr
2570 2575 2580
Lys Ala Glu Lys Lys Glu Ser Pro Glu Tyr Phe Lys Asp Lys Cys
2585 2590 2595
Asn Gly Glu Cys Ser Cys Leu Ser Glu Tyr Phe Lys Asp Glu Thr
2600 2605 2610
Arg
Trp
2615
Lys
Asn
Pro
Tyr
Glu
2620
Thr
Leu
Asp
Asp
Thr
2625
Glu
Val
Lys
- 171 031876
Asn Asn 2630 Cys Met Cys Lys Pro 2635 Pro Pro Pro Ala Ser 2640 Asn Asn Thr
Ser Asp Ile Leu Gln Lys Thr Ile Pro Phe Gly Ile Ala Leu Ala
2645 2650 2655
Leu Gly Ser Ile Ala Phe Leu Phe Met Lys Lys Lys Pro Lys Thr
2660 2665 2670
Pro Val Asp Leu Leu Arg Val Leu Asp Ile Pro Lys Gly Asp Tyr
2675 2680 2685
Gly Ile Pro Thr Pro Lys Ser Ser Asn Arg Tyr Ile Pro Tyr Ala
2690 2695 2700
Ser Asp Arg Tyr Lys Gly Lys Thr Tyr Ile Tyr Met Glu Gly Asp
2705 2710 2715
Thr Ser Gly Asp Asp Asp Lys Tyr Ile Trp Asp Leu
2720 2725 2730
<210> 56 <211> 2734 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 56
Met Asp Ser Thr Ser Thr Ile Ala
5
Asn Lys Ile Glu Glu Tyr Leu Gly
15
Ala Lys Ser Asp Asp Ser Lys Ile
Asp Glu Leu Leu Lys Ala Asp Pro
30
Ser Glu Val Glu Tyr Tyr Arg Ser
40
Gly Gly Asp Gly Asp Tyr Leu Lys 45
Asn Asn Ile Cys Lys Ile Thr Val
55
Asn His Ser Asp Ser Gly Lys Tyr
Asp Pro Cys Glu Lys Lys Leu Pro
70
Pro Tyr Asp Asp Asn Asp Gln Trp
80
Lys Cys Gln Gln Asn Ser Ser Asp 85
Gly Ser Gly Lys Pro Glu Asn Ile
95
- 172 031876
Cys
Leu
Leu
Asp
145
Asp
Ser
Asn
Lys
Val
225
Trp
Arg
Val
Arg
Cys
305
Thr
Lys
Val Pro Pro Arg Arg 100 Glu Arg Leu 105 Cys Thr Tyr Asn Leu 110 Glu Asn
Lys Phe Asp Lys Ile Arg Asp Asn Asn Ala Phe Leu Ala Asp Val
115 120 125
Leu Thr Ala Arg Asn Glu Gly Glu Lys Ile Val Gln Asn His Pro
130 135 140
Thr Asn Ser Ser Asn Val Cys Asn Ala Leu Glu Arg Ser Phe Ala
150 155 160
Leu Ala Asp Ile Ile Arg Gly Thr Asp Gln Trp Lys Gly Thr Asn
165 170 175
Asn Leu Glu Lys Asn Leu Lys Gln Met Phe Ala Lys Ile Arg Glu
180 185 190
Asp Lys Val Leu Gln Asp Lys Tyr Pro Lys Asp Gln Lys Tyr Thr
195 200 205
Leu 210 Arg Glu Ala Trp Trp Asn 215 Ala Asn Arg Gln 220 Lys Val Trp Glu
Ile Thr Cys Gly Ala Arg Ser Asn Asp Leu Leu Ile Lys Arg Gly
230 235 240
Arg Thr Ser Gly Lys Ser Asp Arg Lys Lys Asn Phe Glu Leu Cys
245 250 255
Lys Cys Gly His Tyr Glu Lys Glu Val Pro Thr Lys Leu Asp Tyr
260 265 270
Pro Gln Phe Leu Arg Trp Leu Thr Glu Trp Ile Glu Asp Phe Tyr
275 280 285
Glu Lys Gln Asn Leu Ile Asp Asp Met Glu Arg His Arg Glu Glu
290 295 300
Thr Arg Glu Asp His 310 Lys Ser Lys Glu Gly 315 Thr Ser Tyr Cys Ser 320
Cys Lys Asp Lys Cys Lys Lys Tyr Cys Glu Cys Val Lys Lys Trp
325 330 335
Thr Glu Trp Glu Asn Gln Glu Asn Lys Tyr Lys Asp Leu Tyr Glu
340 345 350
- 173 031876
Gln Asn Lys Asn Lys Thr Ser Gln Lys 360 Asn Thr Ser Arg 365 Tyr Asp Asp
355
Tyr Val Lys Asp Phe Phe Glu Lys Leu Glu Ala Asn Tyr Ser Ser Leu
370 375 380
Glu Asn Tyr Ile Lys Gly Asp Pro Tyr Phe Ala Glu Tyr Ala Thr Lys
385 390 395 400
Leu Ser Phe Ile Leu Asn Pro Ser Asp Ala Asn Asn Pro Ser Gly Glu
405 410 415
Thr Ala Asn His Asn Asp Glu Ala Cys Asn Cys Asn Glu Ser Gly Ile
420 425 430
Ser Ser Val Gly Gln Ala Gln Thr Ser Gly Pro Ser Ser Asn Lys Thr
435 440 445
Cys Ile Thr His Ser Ser Ile Lys Thr Asn Lys Lys Lys Glu Cys Lys
450 455 460
Asp Val Lys Leu Gly Val Arg Glu Asn Asp Lys Asp Leu Lys Ile Cys
465 470 475 480
Val Ile Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln
485 490 495
Asp Leu Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Arg Gly
500 505 510
Ser Ser Ser Asn Asp Ser Cys Asp Asn Lys Asn Gln Asp Glu Cys Gln
515 520 525
Lys Lys Leu Glu Lys Val Phe Ala Ser Leu Thr Asn Gly Tyr Lys Cys
530 535 540
Asp Lys Cys Lys Ser Gly Thr Ser Arg Ser Lys Lys Lys Trp Ile Trp
545 550 555 560
Lys Lys Ser Ser Gly Asn Glu Glu Gly Leu Gln Glu Glu Tyr Ala Asn
565 570 575
Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu Gly Asn Leu
580 585 590
Pro Lys Leu Glu Asn Val Cys Glu Asp Val Lys Asp Ile Asn Phe Asp
- 174 031876
595
600
605
Thr
Gly
625
Lys
Asp
Leu
Ile
Asp
705
Thr
Asp
Ile
Asn
Cys
785
Thr
Cys
Lys
Lys 610 Glu Lys Phe Leu Ala 615 Gly Cys Leu Ile Val 620 Ser Phe His Glu
Lys Asn Leu Lys Lys Arg Tyr Pro Gln Asn Lys Asn Ser Gly Asn
630 635 640
Glu Asn Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly
645 650 655
Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp
660 665 670
Glu Leu Asn Leu Gln Asn Asn Phe Gly Lys Leu Phe Gly Lys Tyr
675 680 685
Lys 690 Lys Asn Asn Thr Ala 695 Glu Gln Asp Thr Ser 700 Tyr Ser Ser Leu
Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp
710 715 720
Ala Met Lys His Gly Ala Glu Met Asn Ile Thr Thr Cys Asn Ala
725 730 735
Gly Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr
740 745 750
Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu
755 760 765
Phe Cys Glu Gln Arg Gln Ala Lys Val Lys Asp Val Ile Thr Asn
770 775 780
Lys Ser Cys Lys Glu 790 Ser Gly Asn Lys Cys 795 Lys Thr Glu Cys Lys 800
Lys Cys Lys Asp Glu Cys Glu Lys Tyr Lys Lys Phe Ile Glu Ala
805 810 815
Gly Thr Ala Gly Gly Gly Ile Gly Thr Ala Gly Ser Pro Trp Ser
820 825 830
Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys His Ile Glu Asp
835 840 845
- 175 031876
Ala Lys 850 Arg Asn Arg Lys Ala 855 Gly Thr Lys Asn Cys 860 Gly Thr Ser Ser
Thr Thr Asn Ala Ala Ala Ser Thr Asp Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser
865 870 875 880
Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr
885 890 895
Pro Ser Ser Tyr Leu Ser Asn Val Leu Asp Asp Asn Ile Cys Gly Ala
900 905 910
Asp Lys Ala Pro Trp Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys
915 920 925
Cys Asn Lys Glu Arg Asp Lys Ser Lys Ser Gln Ser Ser Asp Thr Leu
930 935 940
Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro Leu Gly Asn Thr Pro Tyr Arg Tyr
945 950 955 960
Lys Tyr Ala Cys Gln Cys Lys Ile Pro Thr Asn Glu Glu Thr Cys Asp
965 970 975
Asp Arg Lys Glu Tyr Met Asn Gln Trp Ser Cys Gly Ser Ala Arg Thr
980 985 990
Met Lys Arg Gly Tyr Lys
995
Asn Asp Asn Tyr Glu Leu Cys Lys
1000 1005
Tyr Asn
Gly Val Asp Val Lys Pro Thr 1015 Thr Val Arg Ser Asn 1020 Ser Ser Lys
1010
Leu Asp Gly Asn Asp Val Thr Phe Phe Asn Leu Phe Glu Gln Trp
1025 1030 1035
Asn Lys Glu Ile Gln Tyr Gln Ile Glu Gln Tyr Met Thr Asn Ala
1040 1045 1050
Asn Ile Ser Cys Ile Asp Glu Lys Glu Val Leu Asp Ser Val Ser
1055 1060 1065
Asp Glu Gly Thr Pro Lys Val Arg Gly Gly Tyr Glu Asp Gly Arg
1070 1075 1080
Asn Asn Asn Thr Asp Gln Gly Thr Asn Cys Lys Glu Lys Cys Lys
1085 1090 1095
- 176 031876
Cys Tyr 1100 Lys Leu Trp Ile Glu 1105 Lys Ile Asn Asp Gln 1110 Trp Gly Lys
Gln Lys Asp Asn Tyr Asn Lys Phe Arg Ser Lys Gln Ile Tyr Asp
1115 1120 1125
Ala Asn Lys Gly Ser Gln Asn Lys Lys Val Val Ser Leu Ser Asn
1130 1135 1140
Phe Leu Phe Phe Ser Cys Trp Glu Glu Tyr Ile Gln Lys Tyr Phe
1145 1150 1155
Asn Gly Asp Trp Ser Lys Ile Lys Asn Ile Gly Ser Asp Thr Phe
1160 1165 1170
Glu Phe Leu Ile Lys Lys Cys Gly Asn Asn Ser Ala His Gly Glu
1175 1180 1185
Glu Ile Phe Asn Glu Lys Leu Lys Asn Ala Glu Lys Lys Cys Lys
1190 1195 1200
Glu Asn Glu Ser Thr Asp Thr Asn Ile Asn Lys Ser Glu Thr Ser
1205 1210 1215
Cys Asp Leu Asn Ala Thr Asn Tyr Ile Arg Gly Cys Gln Ser Lys
1220 1225 1230
Thr Tyr Asp Gly Lys Ile Phe Pro Gly Lys Gly Gly Glu Lys Gln
1235 1240 1245
Trp Ile Cys Lys Asp Thr Ile Ile His Gly Asp Thr Asn Gly Ala
1250 1255 1260
Cys Ile Pro Pro Arg Thr Gln Asn Leu Cys Val Gly Glu Leu Trp
1265 1270 1275
Asp Lys Ser Tyr Gly Gly Arg Ser Asn Ile Lys Asn Asp Thr Lys
1280 1285 1290
Glu Leu Leu Lys Glu Lys Ile Lys Asn Ala Ile His Lys Glu Thr
1295 1300 1305
Glu Leu Leu Tyr Glu Tyr His Asp Thr Gly Thr Ala Ile Ile Ser
1310 1315 1320
Lys
Asn
1325
Asp
Lys
Lys
Gly
Gln
1330
Lys
Gly
Lys
Asn
Asp
1335
Pro
Asn
Gly
- 177 031876
Leu Pro 1340 Lys Gly Phe Cys His 1345 Ala Val Gln Arg Ser 1350 Phe Ile Asp
Tyr Lys Asn Met Ile Leu Gly Thr Ser Val Asn Ile Tyr Glu His
1355 1360 1365
Ile Gly Lys Leu Gln Glu Asp Ile Lys Lys Ile Ile Glu Lys Gly
1370 1375 1380
Thr Pro Gln Gln Lys Asp Lys Ile Gly Gly Val Gly Ser Ser Thr
1385 1390 1395
Glu Asn Val Asn Ala Trp Trp Lys Gly Ile Glu Arg Glu Met Trp
1400 1405 1410
Asp Ala Val Arg Cys Ala Ile Thr Lys Ile Asn Lys Lys Asn Asn
1415 1420 1425
Asn Ser Ile Phe Asn Gly Asp Glu Cys Gly Val Ser Pro Pro Thr
1430 1435 1440
Gly Asn Asp Glu Asp Gln Ser Val Ser Trp Phe Lys Glu Trp Gly
1445 1450 1455
Glu Gln Phe Cys Ile Glu Arg Leu Arg Tyr Glu Gln Asn Ile Arg
1460 1465 1470
Glu Ala Cys Thr Ile Asn Gly Lys Asn Glu Lys Lys Cys Ile Asn
1475 1480 1485
Ser Lys Ser Gly Gln Gly Asp Lys Ile Gln Gly Ala Cys Lys Arg
1490 1495 1500
Lys Cys Glu Lys Tyr Lys Lys Tyr Ile Ser Glu Lys Lys Gln Glu
1505 1510 1515
Trp Asp Lys Gln Lys Thr Lys Tyr Glu Asn Lys Tyr Val Gly Lys
1520 1525 1530
Ser Ala Ser Asp Leu Leu Lys Glu Asn Tyr Pro Glu Cys Ile Ser
1535 1540 1545
Ala Asn Phe Asp Phe Ile Phe Asn Asp Asn Ile Glu Tyr Lys Thr
1550 1555 1560
Tyr Tyr Pro Tyr Gly Asp Tyr Ser Ser Ile Cys Ser Cys Glu Gln
- 178 031876
1565 1570 1575
Val Lys 1580 Tyr Tyr Lys Tyr Asn 1585 Asn Ala Glu Lys Lys 1590 Asn Asn Lys
Ser Leu Cys Tyr Glu Lys Asp Asn Asp Met Thr Trp Ser Lys Lys
1595 1600 1605
Tyr Ile Lys Lys Leu Glu Asn Gly Arg Ser Leu Glu Gly Val Tyr
1610 1615 1620
Val Pro Pro Arg Arg Gln Gln Leu Cys Leu Tyr Glu Leu Phe Pro
1625 1630 1635
Ile Ile Ile Lys Asn Glu Glu Gly Met Glu Lys Ala Lys Glu Glu
1640 1645 1650
Leu Leu Glu Thr Leu Gln Ile Val Ala Glu Arg Glu Ala Tyr Tyr
1655 1660 1665
Leu Trp Lys Gln Tyr Asn Pro Thr Gly Lys Gly Ile Asp Asp Ala
1670 1675 1680
Asn Lys Lys Ala Cys Cys Ala Ile Arg Gly Ser Phe Tyr Asp Leu
1685 1690 1695
Glu Asp Ile Ile Lys Gly Asn Asp Leu Val His Asp Glu Tyr Thr
1700 1705 1710
Lys Tyr Ile Asp Ser Lys Leu Asn Glu Ile Phe Gly Ser Ser Asp
1715 1720 1725
Thr Asn Asp Ile Asp Thr Lys Arg Ala Arg Thr Asp Trp Trp Glu
1730 1735 1740
Asn Glu Thr Ile Thr Asn Gly Thr Asp Arg Lys Thr Ile Arg Gln
1745 1750 1755
Leu Val Trp Asp Ala Met Gln Ser Gly Val Arg Tyr Ala Val Glu
1760 1765 1770
Glu Lys Asn Glu Asn Phe Pro Leu Cys Met Gly Val Glu His Ile
1775 1780 1785
Gly Ile Ala Lys Pro Gln Phe Ile Arg Trp Leu Glu Glu Trp Thr
1790 1795 1800
- 179 031876
Asn Glu 1805 Phe Cys Glu Lys Tyr 1810 Thr Lys Tyr Phe Glu 1815 Asp Met Lys
Ser Lys Cys Asp Pro Pro Lys Arg Ala Asp Thr Cys Gly Asp Asn
1820 1825 1830
Ser Asn Ile Glu Cys Lys Lys Ala Cys Ala Asn Tyr Thr Asn Trp
1835 1840 1845
Leu Asn Pro Lys Arg Ile Glu Trp Asn Gly Met Ser Asn Tyr Tyr
1850 1855 1860
Asn Lys Ile Tyr Arg Lys Ser 1870 Asn Lys Glu Ser Glu 1875 Gly Gly Lys
1865
Asp Tyr Ser Met Ile Met Ala Pro Thr Val Ile Asp Tyr Leu Asn
1880 1885 1890
Lys Arg Cys His Gly Glu Ile Asn Gly Asn Tyr Ile Cys Cys Ser
1895 1900 1905
Cys Lys Asn Ile Gly Ala Tyr Asn Thr Thr Ser Gly Thr Val Asn
1910 1915 1920
Lys Lys Leu Gln Lys Lys Glu Thr Glu Cys Glu Glu Glu Lys Gly
1925 1930 1935
Pro Leu Asp Leu Met Asn Glu Val Leu Asn Lys Met Asp Lys Lys
1940 1945 1950
Tyr Ser Ala His Lys Met Lys Cys Thr Glu Val Tyr Leu Glu His
1955 1960 1965
Val Glu Glu Gln Leu Asn Glu Ile Asp Asn Ala Ile Lys Asp Tyr
1970 1975 1980
Lys Leu Tyr Pro Leu Asp Arg Cys Phe Asp Asp Gln Thr Lys Met
1985 1990 1995
Lys Val Cys Asp Leu Ile Ala Asp Ala Ile Gly Cys Lys Asp Lys
2000 2005 2010
Thr Lys Leu Asp Glu Leu Asp Glu Trp Asn Asp Met Asp Leu Arg
2015 2020 2025
Gly Thr Tyr Asn Lys His Lys Gly Val Leu Ile Pro Pro Arg Arg
2030 2035 2040
- 180 031876
Arg Gln 2045 Leu Cys Phe Ser Arg 2050 Ile Val Arg Gly Pro 2055 Ala Asn Leu
Arg Ser Leu Asn Glu Phe Lys Glu Glu Ile Leu Lys Gly Ala Gln
2060 2065 2070
Ser Glu Gly Lys Phe Leu Gly Asn Tyr Tyr Lys Glu His Lys Asp
2075 2080 2085
Lys Glu Lys Ala Leu Glu Ala Met Lys Asn Ser Phe Tyr Asp Tyr
2090 2095 2100
Glu Asp Ile Ile Lys Gly Thr Asp Met Leu Thr Asn Ile Glu Phe
2105 2110 2115
Lys Asp Ile Lys Ile Lys Leu Asp Arg Leu Leu Glu Lys Glu Thr
2120 2125 2130
Asn Asn Thr Lys Lys Ala Glu Asp Trp Trp Lys Thr Asn Lys Lys
2135 2140 2145
Ser Ile Trp Asn Ala Met Leu Cys Gly Tyr Lys Lys Ser Gly Asn
2150 2155 2160
Lys Ile Ile Asp Pro Ser Trp Cys Thr Ile Pro Thr Thr Glu Thr
2165 2170 2175
Pro Pro Gln Phe Leu Arg Trp Ile Lys Glu Trp Gly Thr Asn Val
2180 2185 2190
Cys Ile Gln Lys Gln Glu His Lys Glu Tyr Val Lys Ser Lys Cys
2195 2200 2205
Ser Asn Val Thr Asn Leu Gly Ala Gln Ala Ser Glu Ser Asn Asn
2210 2215 2220
Cys Thr Ser Glu Ile Lys Lys Tyr Gln Glu Trp Ser Arg Lys Arg
2225 2230 2235
Ser Ile Arg Trp Glu Thr Ile Ser Lys Arg Tyr Lys Lys Tyr Lys
2240 2245 2250
Arg Met Asp Ile Leu Lys Asp Val Lys Glu Pro Asp Ala Asn Thr
2255 2260 2265
Tyr Leu Arg Glu His Cys Ser Lys Cys Pro Cys Gly Phe Asn Asp
2270 2275 2280
- 181 031876
Met Glu 2285 Glu Met Asn Asn Asn 2290 Glu Asp Asn Glu Lys 2295 Glu Ala Phe
Lys Gln Ile Lys Glu Gln Val Lys Ile Pro Ala Glu Leu Glu Asp
2300 2305 2310
Val Ile Tyr Arg Ile Lys His His Glu Tyr Asp Lys Gly Asn Asp
2315 2320 2325
Tyr Ile Cys Asn Lys Tyr Lys Asn Ile His Asp Arg Met Lys Lys
2330 2335 2340
Asn Asn Gly Asn Phe Val Thr Asp Asn Phe Val Lys Lys Ser Trp
2345 2350 2355
Glu Ile Ser Asn Gly Val Leu Ile Pro Pro Arg Arg Lys Asn Leu
2360 2365 2370
Phe Leu Tyr Ile Asp Pro Ser Lys Ile Cys Glu Tyr Lys Lys Asp
2375 2380 2385
Pro Lys Leu Phe Lys Asp Phe Ile Tyr Trp Ser Ala Phe Thr Glu
2390 2395 2400
Val Glu Arg Leu Lys Lys Ala Tyr Gly Gly Ala Arg Ala Lys Val
2405 2410 2415
Val His Ala Met Lys Tyr Ser Phe Thr Asp Ile Gly Ser Ile Ile
2420 2425 2430
Lys Gly Asp Asp Met Met Glu Lys Asn Ser Ser Asp Lys Ile Gly
2435 2440 2445
Lys Ile Leu Gly Asp Thr Asp Gly Gln Asn Glu Lys Arg Lys Lys
2450 2455 2460
Trp Trp Asp Met Asn Lys Tyr His Ile Trp Glu Ser Met Leu Cys
2465 2470 2475
Gly Tyr Arg Glu Ala Glu Gly Asp Thr Glu Thr Asn Glu Asn Cys
2480 2485 2490
Arg Phe Pro Asp Ile Glu Ser Val Pro Gln Phe Leu Arg Trp Phe
2495 2500 2505
Gln Glu Trp Ser Glu Asn Phe Cys Asp Arg Arg Gln Lys Leu Tyr
- 182 031876
2510
2515
2520
Asp Lys 2525 Leu Asn Ser Glu Cys 2530 Ile Ser Ala Glu Cys 2535 Thr Asn Gly
Ser Val Asp Asn Ser Lys Cys Thr His Ala Cys Val Asn Tyr Lys
2540 2545 2550
Asn Tyr Ile Leu Thr Lys Lys Thr Glu Tyr Glu Ile Gln Thr Asn
2555 2560 2565
Lys Tyr Asp Asn Glu Phe Lys Asn Lys Asn Ser Asn Asp Lys Asp
2570 2575 2580
Ala Pro Asp Tyr Leu Lys Glu Lys Cys Asn Asp Asn Lys Cys Glu
2585 2590 2595
Cys Leu Asn Lys His Ile Asp Asp Lys Asn Lys Thr Trp Lys Asn
2600 2605 2610
Pro Tyr Glu Thr Leu Glu Asp Thr Phe Lys Ser Lys Cys Asp Cys
2615 2620 2625
Pro Lys Pro Leu Pro Ser Pro Ile Lys Pro Asp Asp Leu Pro Pro
2630 2635 2640
Gln Ala Asp Glu Pro Phe Asp Pro Thr Ile Leu Gln Thr Thr Ile
2645 2650 2655
Pro Phe Gly Ile Ala Leu Ala Leu Gly Ser Ile Ala Phe Leu Phe
2660 2665 2670
Met Lys Val Ile Tyr Ile Tyr Ile Tyr Val Cys Cys Ile Cys Met
2675 2680 2685
Tyr Val Cys Met Tyr Val Cys Met Tyr Val Cys Met Tyr Val Cys
2690 2695 2700
Met Tyr Val Cys Met His Val Cys Met Leu Cys Val Tyr Val Ile
2705 2710 2715
Tyr Val Phe Lys Ile Cys Ile Tyr Ile Glu Lys Glu Lys Arg Lys
2720 2725 2730
Lys
- 183 031876 <210> 57 <211> 58 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400>57
Arg 1 Pro Asp Phe Cys 5 Leu Glu Pro Pro Tyr 10 Thr Gly Pro Cys Lys 15 Ala
Arg Ile Ile Arg Tyr Phe Tyr Asn Ala Lys Ala Gly Leu Cys Gln Thr
20 25 30
Phe Val Tyr Gly Gly Cys Arg Ala Lys Arg Asn Asn Phe Lys Ser Ala
35 40 45
Glu Asp Cys Met Arg Thr Cys Gly Gly Ala
55 <210>58 <211>324 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция
<400> ! 58
Arg 1 His Arg Gln Pro 5 Arg Gly Trp Glu Gln 10 Leu Glu Gln Cys Gly 15 Tyr
Pro Val Gln Arg 20 Leu Val Ala Leu Tyr 25 Leu Ala Ala Arg Leu 30 Ser Trp
Asn Gln Val 35 Asp Gln Val Ile Arg 40 Asn Ala Leu Ala Ser 45 Pro Gly Ser
Gly Gly 50 Asp Leu Gly Glu Ala 55 Ile Arg Glu Gln Pro 60 Glu Gln Ala Arg
Leu 65 Ala Leu Thr Leu Ala 70 Ala Ala Glu Ser Glu 75 Arg Phe Val Arg Gln 80
Gly Thr Gly Asn Asp 85 Glu Ala Gly Ala Ala 90 Asn Gly Pro Ala Asp 95 Ser
Gly Asp Ala Leu 100 Leu Glu Arg Asn Tyr 105 Pro Thr Gly Ala Glu 110 Phe Leu
- 184 031876
Gly Asp Gly Gly Asp Ile Ser Phe Ser Thr Arg Gly Thr Gln Asn Trp
115 120 125
Thr Val Glu Arg Leu Leu Gln Ala His Arg Gln Leu Glu Glu Arg Gly
130 135 140
Tyr Val 145 Phe Val Gly Tyr 150 His Gly Thr Phe Leu Glu 155 Ala Ala Gln Ser 160
Ile Val Phe Gly Gly Val Arg Ala Arg Ser Gln Asp Leu Asp Ala Ile
165 170 175
Trp Arg Gly Phe Tyr Ile Ala Gly Asp Pro Ala Leu Ala Tyr Gly Tyr
180 185 190
Ala Gln Asp Gln Glu Pro Asp Ala Arg Gly Arg Ile Arg Asn Gly Ala
195 200 205
Leu Leu Arg Val Tyr Val Pro Arg Ser Ser Leu Pro Gly Phe Tyr Arg
210 215 220
Thr Ser Leu Thr Leu Ala Ala Pro Glu Ala Ala Gly Glu Val Glu Arg
225 230 235 240
Leu Ile Gly His Pro Leu Pro Leu Arg Leu Asp Ala Ile Thr Gly Pro
245 250 255
Glu Glu Glu Gly Gly Arg Leu Glu Thr Ile Leu Gly Trp Pro Leu Ala
260 265 270
Glu Arg Thr Val Val Ile Pro Ser Ala Ile Pro Thr Asp Pro Arg Asn
275 280 285
Val Gly Gly Asp Leu Asp Pro Ser Ser Ile Pro Asp Lys Glu Gln Ala
290 295 300
Ile Ser Ala Leu Pro Asp Tyr Ala Ser Gln Pro Gly Lys Pro Pro Arg
305 310 315 320
Lys Asp Glu Leu <210> 59 <211> 231 <212> Белок <213> Искусственная <220>
- 185 031876 <223> Искусственная конструкция <400> 59
Arg His 1 Arg Gln Pro 5 Arg Gly Trp Glu
Glu Phe Leu Gly Asp Gly Gly Asp Ile
20 25
Gln Asn Trp Thr Val Glu Arg Leu Leu
35 40
Glu Arg Gly Tyr Val Phe Val Gly Tyr
50 55
Ala Gln Ser Ile Val Phe Gly Gly Val
65 70
Asp Ala Ile Trp Arg Gly Phe Tyr Ile
85
Tyr Gly Tyr Ala Gln Asp Gln Glu Pro
100 105
Asn Gly Ala Leu Leu Arg Val Tyr Val
115 120
Phe Tyr Arg Thr Ser Leu Thr Leu Ala
130 135
Val Glu Arg Leu Ile Gly His Pro Leu
145 150
Thr Gly Pro Glu Glu Glu Gly Gly Arg
165
Pro Leu Ala Glu Arg Thr Val Val Ile
180 185
Pro Arg Asn Val Gly Gly Asp Leu Asp
195 200
Glu Gln Ala Ile Ser Ala Leu Pro Asp
210 215
Pro Pro Arg Lys Asp Glu Leu
225 230
Leu Tyr Pro Thr Gly 15 Ala
Phe Ser Thr Arg 30 Gly Thr
Ala His Arg 45 Gln Leu Glu
Gly Thr 60 Phe Leu Glu Ala
Ala 75 Arg Ser Gln Asp Leu 80
Gly Asp Pro Ala Leu 95 Ala
Ala Arg Gly Arg 110 Ile Arg
Arg Ser Ser 125 Leu Pro Gly
Pro Glu 140 Ala Ala Gly Glu
Leu 155 Arg Leu Asp Ala Ile 160
Glu Thr Ile Leu Gly 175 Trp
Ser Ala Ile Pro 190 Thr Asp
Ser Ser Ile 205 Pro Asp Lys
Ala Ser 220 Gln Pro Gly Lys
- 186 031876 <210> 60 <211> 929 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 60
Arg 1 Pro Asp Phe Cys 5 Leu Glu Pro Pro Tyr 10 Thr Gly Pro Cys Lys 15
Arg Ile Ile Arg Tyr Phe Tyr Asn Ala Lys Ala Gly Leu Cys Gln
20 25 30
Phe Val Tyr Gly Gly Cys Arg Ala Lys Arg Asn Asn Phe Lys Ser
35 40 45
Glu Asp Cys Met Arg Thr Cys Gly Gly Ala Asn Tyr Ile Lys Gly
50 55 60
Pro Tyr Phe Ala Glu Tyr Ala Thr Lys Leu Ser Phe Ile Leu Asn
65 70 75
Ser Asp Ala Asn Asn Pro Ser Gly Glu Thr Ala Asn His Asn Asp
85 90 95
Ala Cys Asn Cys Asn Glu Ser Gly Ile Ser Ser Val Gly Gln Ala
100 105 110
Thr Ser Gly Pro Ser Ser Asn Lys Thr Cys Ile Thr His Ser Ser
115 120 125
Lys Thr Asn Lys Lys Lys Glu Cys Lys Asp Val Lys Leu Gly Val
130 135 140
Glu Asn Asp Lys Asp Leu Lys Ile Cys Val Ile Glu Asp Thr Ser
145 150 155
Ser Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln Asp Leu Leu Gly Ile Leu
165 170 175
Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Arg Gly Ser Ser Ser Asn Asp Ser
180 185 190
Asp Asn Lys Asn Gln Asp Glu Cys Gln Lys Lys Leu Glu Lys Val
195 200 205
Ala
Thr
Ala
Asp
Pro
Glu
Gln
Ile
Arg
Leu
160
Gln
Cys
Phe
- 187 031876
Ala
Ser
225
Glu
Thr
Glu
Gly
Tyr
305
Leu
Ile
Asn
Glu
Trp
385
Glu
Gly
Leu
Ala
Ser Leu Thr Asn Gly Tyr Lys Cys Asp Lys
210 215
Cys Lys Ser Gly
220
Arg Ser Lys Lys Lys 230 Trp Ile Trp Lys Lys 235 Ser Ser Gly Asn
Gly Leu Gln Glu Glu Tyr Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro
245 250 255
Gln Ser Leu Tyr Leu Gly Asn Leu Pro Lys Leu Glu Asn Val
260 265 270
Asp Val Lys Asp Ile Asn Phe Asp Thr Lys Glu Lys Phe Leu
275 280 285
Cys Leu Ile Val Ser Phe His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Lys
290 295 300
Pro Gln Asn Lys Asn Ser Gly Asn Lys 310
Glu Asn Leu Cys
Lys
315
Glu Tyr Ser Phe 325 Ala Asp Tyr Gly Asp 330 Leu Ile Lys Gly Thr 335
Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln
340 345 350
Phe Gly Lys Leu Phe Gly Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Asn Thr
355 360 365
Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser
370 375 380
Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Thr Ala Met Lys His Gly
390 395
Met Asn Ile Thr Thr Cys Asn Ala Asp Gly Ser Val Thr Gly
405 410 415
Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln
420 425 430
Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu Asn Phe Cys Glu Gln Arg
435 440 445
Lys Val Lys Asp Val Ile Thr Asn Cys Lys
450 455
Ser Cys Lys Glu
460
Thr
Glu
240
Arg
Cys
Ala
Arg
Ala
320
Ser
Asn
Ala
Trp
Ala
400
Ser
Tyr
Gln
Ser
- 188 031876
Gly 465 Asn Lys Cys Lys Thr 470 Glu Cys Lys Thr Lys 475 Cys Lys Asp Glu Cys 480
Glu Lys Tyr Lys Lys Phe Ile Glu Ala Cys Gly Thr Ala Gly Gly Gly
485 490 495
Ile Gly Thr Ala Gly Ser Pro Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr
500 505 510
Lys Arg Tyr Ser Lys His Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala
515 520 525
Gly Thr Lys Asn Cys Gly Thr Ser Ser Thr Thr Asn Ala Ala Ala Ser
530 535 540
Thr Asp Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys
545 550 555 560
His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro Ser Ser Tyr Leu Ser Asn
565 570 575
Val Leu Asp Asp Asn Ile Cys Gly Ala Asp Lys Ala Pro Trp Thr Thr
580 585 590
Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys Cys Asn Lys Glu Arg Asp Lys
595 600 605
Ser Lys Ser Gln Ser Ser Asp Thr Leu Val Val Val Asn Val Pro Ser
610 615 620
Pro Leu Gly Asn Thr Pro Tyr Arg Tyr Lys Tyr Ala Cys Gln Cys Lys
625 630 635 640
Ile Pro Thr Asn Glu Glu Thr Cys Asp Asp Arg Lys Glu Tyr Met Asn
645 650 655
Gln Trp Ser Cys Gly Ser Ala Arg Thr Met Lys Arg Gly Tyr Lys Asn
660 665 670
Asp
Asn
Tyr
675
Glu
Leu
Cys
Lys
Tyr
680
Asn
Gly
Val
Asp
Val
685
Lys
Pro
Thr
Thr
Val
690
Arg
Ser
Asn
Ser
Ser
695
Lys
Leu
Asp
Arg
His
700
Arg
Gln
Pro
Arg
Gly Trp Glu Gln Leu Tyr Pro Thr Gly Ala Glu Phe Leu Gly Asp Gly
705 710 715 720
- 189 031876
Gly Asp Ile Ser Phe 725 Ser Thr Arg Gly
Arg Leu Leu Gln Ala His Arg Gln Leu
740 745
Val Gly Tyr His Gly Thr Phe Leu Glu
755 760
Gly Gly Val Arg Ala Arg Ser Gln Asp
770 775
Phe Tyr Ile Ala Gly Asp Pro Ala Leu
785 790
Gln Glu Pro Asp Ala Arg Gly Arg Ile
805
Val Tyr Val Pro Arg Ser Ser Leu Pro
820 825
Thr Leu Ala Ala Pro Glu Ala Ala Gly
835 840
His Pro Leu Pro Leu Arg Leu Asp Ala
850 855
Gly Gly Arg Leu Glu Thr Ile Leu Gly
865 870
Val Val Ile Pro Ser Ala Ile Pro Thr
885
Asp Leu Asp Pro Ser Ser Ile Pro Asp
900 905
Leu Pro Asp Tyr Ala Ser Gln Pro Gly
915 920
Gln Asn Trp Thr Val 735 Glu
Glu Arg Gly Tyr 750 Val Phe
Ala Gln Ser 765 Ile Val Phe
Asp Ala 780 Ile Trp Arg Gly
Tyr 795 Gly Tyr Ala Gln Asp 800
Asn Gly Ala Leu Leu 815 Arg
Phe Tyr Arg Thr 830 Ser Leu
Val Glu Arg 845 Leu Ile Gly
Thr Gly 860 Pro Glu Glu Glu
Pro 875 Leu Ala Glu Arg Thr 880
Pro Arg Asn Val Gly 895 Gly
Glu Gln Ala Ile 910 Ser Ala
Pro Pro Arg 925 Lys Asp Glu
Leu <210> 61 <211> 1045 <212> Белок <213> Искусственная
- 190 031876 <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 61
Arg 1 Pro Asp Phe Cys 5 Leu Glu Pro Pro Tyr 10 Thr Gly Pro Cys Lys 15
Arg Ile Ile Arg Tyr Phe Tyr Asn Ala Lys Ala Gly Leu Cys Gln
20 25 30
Phe Val Tyr Gly Gly Cys Arg Ala Lys Arg Asn Asn Phe Lys Ser
35 40 45
Glu Asp Cys Met Arg Thr Cys Gly Gly Ala Asn Tyr Ile Lys Gly
50 55 60
Pro Tyr Phe Ala Glu Tyr Ala Thr Lys Leu Ser Phe Ile Leu Asn
65 70 75
Ser Asp Ala Asn Asn Pro Ser Gly Glu Thr Ala Asn His Asn Asp
85 90 95
Ala Cys Asn Cys Asn Glu Ser Gly Ile Ser Ser Val Gly Gln Ala
100 105 110
Thr Ser Gly Pro Ser Ser Asn Lys Thr Cys Ile Thr His Ser Ser
115 120 125
Lys Thr Asn Lys Lys Lys Glu Cys Lys Asp Val Lys Leu Gly Val
130 135 140
Glu Asn Asp Lys Asp Leu Lys Ile Cys Val Ile Glu Asp Thr Ser
145 150 155
Ser Gly Val Asp Asn 165 Cys Cys Cys Gln Asp 170 Leu Leu Gly Ile Leu 175
Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Arg Gly Ser Ser Ser Asn Asp Ser
180 185 190
Asp Asn Lys Asn Gln Asp Glu Cys Gln Lys Lys Leu Glu Lys Val
195 200 205
Ala Ser Leu Thr Asn Gly Tyr Lys Cys Asp Lys Cys Lys Ser Gly
210 215 220
Ser Arg Ser Lys Lys Lys Trp Ile Trp Lys Lys Ser Ser Gly Asn
225 230 235
Ala
Thr
Ala
Asp
Pro
Glu
Gln
Ile
Arg
Leu
160
Gln
Cys
Phe
Thr
Glu
240
- 191 031876
Glu
Gly
Leu
Gln
Glu
245
Glu
Tyr
Ala
Asn
Thr
250
Ile
Gly
Leu
Pro
Pro
255
Thr
Gln
Ser
Leu
260
Tyr
Leu
Gly
Asn
Leu
265
Pro
Lys
Leu
Glu
Asn
270
Val
Glu Asp Val 275 Lys Asp Ile Asn Phe 280 Asp Thr Lys Glu Lys 285 Phe Leu
Gly Cys Leu Ile Val Ser Phe His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Lys
290 295 300
Tyr Pro Gln Asn Lys Asn Ser Gly Asn Lys Glu Asn Leu Cys Lys
305 310 315
Leu Glu Tyr Ser Phe 325 Ala Asp Tyr Gly Asp 330 Leu Ile Lys Gly Thr 335
Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln
340 345 350
Asn Phe Gly Lys Leu Phe Gly Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Asn Thr
355 360 365
Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser
370 375 380
Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Thr Ala Met Lys His Gly
385 390 395
Glu Met Asn Ile Thr Thr Cys Asn Ala Asp Gly Ser Val Thr Gly
405 410 415
Gly Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln
420 425 430
Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu Asn Phe Cys Glu Gln Arg
435 440 445
Ala Lys Val 450 Lys Asp Val Ile 455 Thr Asn Cys Lys Ser 460 Cys Lys Glu
Gly Asn Lys Cys Lys Thr Glu Cys Lys Thr Lys Cys Lys Asp Glu
465 470 475
Glu Lys Tyr Lys Lys Phe Ile Glu Ala Cys Gly Thr Ala Gly Gly
Arg
Cys
Ala
Arg
Ala
320
Ser
Asn
Ala
Trp
Ala
400
Ser
Tyr
Gln
Ser
Cys
480
Gly
- 192 031876
485
Ile Gly Thr Ala 500 Gly Ser Pro Trp Ser 505
Lys Arg Tyr Ser Lys His Ile Glu Asp
515 520
Gly Thr Lys Asn Cys Gly Thr Ser Ser
530 535
Thr Asp Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser
545 550
His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr
565
Val Leu Asp Asp Asn Ile Cys Gly Ala
580 585
Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys
595 600
Ser Lys Ser Gln Ser Ser Asp Thr Leu
610 615
Pro Leu Gly Asn Thr Pro Tyr Arg Tyr
625 630
Ile Pro Thr Asn Glu Glu Thr Cys Asp
645
Gln Trp Ser Cys Gly Ser Ala Arg Thr
660 665
Asp Asn Tyr Glu Leu Cys Lys Tyr Asn
675 680
Thr Val Arg Ser Asn Ser Ser Lys Leu
690 695
Ala Ala Leu Thr Ala His Gln Ala Cys
705 710
Thr Arg His Arg Gln Pro Arg Gly Trp
725
495
Arg Trp Asp Gln 510 Ile Tyr
Lys Arg Asn 525 Arg Lys Ala
Thr Asn 540 Ala Ala Ala Ser
Ile 555 Asp Ser Phe Phe Lys 560
Ser Ser Tyr Leu Ser 575 Asn
Lys Ala Pro Trp 590 Thr Thr
Asn Lys Glu 605 Arg Asp Lys
Val Val 620 Asn Val Pro Ser
Tyr 635 Ala Cys Gln Cys Lys 640
Arg Lys Glu Tyr Met 655 Asn
Lys Arg Gly Tyr 670 Lys Asn
Val Asp Val 685 Lys Pro Thr
Pro Glu 700 Gly Gly Ser Leu
Leu 715 Pro Leu Glu Thr Phe 720
Gln Leu Glu Gln Cys 735 Gly
- 193 031876
Tyr Pro Val Gln 740 Arg Leu Val Ala Leu 745 Tyr Leu Ala Ala Arg 750 Leu
Trp Asn Gln Val Asp Gln Val Ile Arg Asn Ala Leu Ala Ser Pro
755 760 765
Ser Gly Gly Asp Leu Gly Glu Ala Ile Arg Glu Gln Pro Glu Gln
770 775 780
Arg Leu Ala Leu Thr Leu Ala Ala Ala Glu Ser Glu Arg Phe Val
785 790 795
Gln Gly Thr Gly Asn Asp Glu Ala Gly Ala Ala Asn Gly Pro Ala
805 810 815
Ser Gly Asp Ala Leu Leu Glu Arg Asn Tyr Pro Thr Gly Ala Glu
820 825 830
Leu Gly Asp Gly Gly Asp Ile Ser Phe Ser Thr Arg Gly Thr Gln
835 840 845
Trp Thr Val Glu Arg Leu Leu Gln Ala His Arg Gln Leu Glu Glu
850 855 860
Gly Tyr Val Phe Val Gly Tyr His Gly Thr Phe Leu Glu Ala Ala
865 870 875
Ser Ile Val Phe Gly 885 Gly Val Arg Ala Arg 890 Ser Gln Asp Leu Asp 895
Ile Trp Arg Gly Phe Tyr Ile Ala Gly Asp Pro Ala Leu Ala Tyr
900 905 910
Tyr Ala Gln Asp Gln Glu Pro Asp Ala Arg Gly Arg Ile Arg Asn
915 920 925
Ala Leu Leu Arg Val Tyr Val Pro Arg Ser Ser Leu Pro Gly Phe
930 935 940
Arg Thr Ser Leu Thr Leu Ala Ala Pro Glu Ala Ala Gly Glu Val
945 950 955
Arg Leu Ile Gly His 965 Pro Leu Pro Leu Arg 970 Leu Asp Ala Ile Thr 975
Pro Glu Glu Glu Gly Gly Arg Leu Glu Thr Ile Leu Gly Trp Pro
980 985 990
Ser
Gly
Ala
Arg
800
Asp
Phe
Asn
Arg
Gln
880
Ala
Gly
Gly
Tyr
Glu
960
Gly
Leu
- 194 031876
Ala Glu Arg Thr Val Val Ile Pro Ser Ala Ile Pro Thr Asp Pro Arg
995 1000 1005
Asn
Val
1010
Gly
Gly
Asp
Leu
Asp Pro Ser Ser Ile Pro Asp Lys Glu 1015 1020
Gln Ala Ile Ser Ala Leu
1025
Pro Asp Tyr Ala Ser Gln
1030 1035
Pro Gly Lys
Pro Pro Arg Lys Asp Glu Leu
1040
1045 <210> 62 <211> 987 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 62
Asn 1 Tyr Ile Lys Gly 5 Asp Pro Tyr Phe Ala 10 Glu Tyr Ala Thr Lys 15 Leu
Ser Phe Ile Leu Asn Pro Ser Asp Ala Asn Asn Pro Ser Gly Glu Thr
20 25 30
Ala Asn His Asn Asp Glu Ala Cys Asn Cys Asn Glu Ser Gly Ile Ser
35 40 45
Ser Val Gly Gln Ala Gln Thr Ser Gly Pro Ser Ser Asn Lys Thr Cys
50 55 60
Ile Thr His Ser Ser Ile Lys Thr Asn Lys Lys Lys Glu Cys Lys Asp
65 70 75 80
Val Lys Leu Gly Val Arg Glu Asn Asp Lys Asp Leu Lys Ile Cys Val
85 90 95
Ile Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln Asp
100 105 110
Leu Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Arg Gly Ser
115 120 125
Ser Ser Asn Asp Ser Cys Asp Asn Lys Asn Gln Asp Glu Cys Gln Lys
130 135 140
- 195 031876
Lys 145 Leu Glu Lys Val Phe 150 Ala Ser Leu Thr Asn Gly 155 Tyr Lys Cys
Lys Cys Lys Ser Gly Thr Ser Arg Ser Lys Lys Lys Trp Ile Trp
165 170 175
Lys Ser Ser Gly Asn Glu Glu Gly Leu Gln Glu Glu Tyr Ala Asn
180 185 190
Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu Gly Asn Leu
195 200 205
Lys Leu Glu Asn Val Cys Glu Asp Val Lys Asp Ile Asn Phe Asp
210 215 220
Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Val Ser Phe His Glu
225 230 235
Lys Asn Leu Lys Lys 245 Arg Tyr Pro Gln Asn 250 Lys Asn Ser Gly Asn 255
Glu Asn Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly
260 265 270
Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp
275 280 285
Glu Leu 290 Asn Leu Gln Asn Asn 295 Phe Gly Lys Leu Phe 300 Gly Lys Tyr
Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu
305 310 315
Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp
325 330 335
Ala Met Lys His Gly Ala Glu Met Asn Ile Thr Thr Cys Asn Ala
340 345 350
Gly Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr
355 360 365
Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu
370 375 380
Phe Cys Glu Gln Arg Gln Ala Lys Val Lys Asp Val Ile Thr Asn
385 390 395
Asp
160
Lys
Thr
Pro
Thr
Gly
240
Lys
Asp
Leu
Ile
Asp
320
Thr
Asp
Ile
Asn
Cys
400
- 196 031876
Lys Ser Cys Lys Glu 405 Ser Gly Asn Lys Cys 410 Lys Thr Glu Cys Lys 415 Thr
Lys Cys Lys Asp Glu Cys Glu Lys Tyr Lys Lys Phe Ile Glu Ala Cys
420 425 430
Gly Thr Ala Gly Gly Gly Ile Gly Thr Ala Gly Ser Pro Trp Ser Lys
435 440 445
Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys His Ile Glu Asp Ala
450 455 460
Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Thr Ser Ser Thr
465 470 475 480
Thr Asn Ala Ala Ala Ser Thr Asp Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser Asp
485 490 495
Ile Asp Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro
500 505 510
Ser Ser Tyr 515 Leu Ser Asn Val Leu 520 Asp Asp Asn Ile Cys 525 Gly Ala Asp
Lys Ala Pro Trp Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys Cys
530 535 540
Asn Lys Glu Arg Asp Lys Ser Lys Ser Gln Ser Ser Asp Thr Leu Val
545 550 555 560
Val Val Asn Val Pro 565 Ser Pro Leu Gly Asn Thr 570 Pro Tyr Arg Tyr 575 Lys
Tyr Ala Cys Gln Cys Lys Ile Pro Thr Asn Glu Glu Thr Cys Asp Asp
580 585 590
Arg Lys Glu Tyr Met Asn Gln Trp Ser Cys Gly Ser Ala Arg Thr Met
595 600 605
Lys Arg Gly Tyr Lys Asn Asp Asn Tyr Glu Leu Cys Lys Tyr Asn Gly
610 615 620
Val Asp Val Lys Pro Thr Thr Val Arg Ser Asn Ser Ser Lys Leu Asp
625 630 635 640
Pro Glu Gly Gly Ser Leu Ala Ala Leu Thr Ala His Gln Ala Cys His
645 650 655
- 197 031876
Leu
Gln
Leu
Ala
705
Glu
Ser
Ala
Pro
Thr
785
Arg
Phe
Ser
Pro
Gly
865
Ser
Ala
Pro Leu Glu 660 Thr Phe Thr Arg His 665 Arg Gln Pro Arg Gly 670 Trp Glu
Leu Glu Gln Cys Gly Tyr Pro Val Gln Arg Leu Val Ala Leu Tyr
675 680 685
Ala Ala Arg Leu Ser Trp Asn Gln Val Asp Gln Val Ile Arg Asn
690 695 700
Leu Ala Ser Pro Gly Ser Gly Gly Asp Leu Gly Glu Ala Ile Arg
710 715 720
Gln Pro Glu Gln Ala Arg Leu Ala Leu Thr Leu Ala Ala Ala Glu
725 730 735
Glu Arg Phe Val Arg Gln Gly Thr Gly Asn Asp Glu Ala Gly Ala
740 745 750
Asn Gly Pro Ala Asp Ser Gly Asp Ala Leu Leu Glu Arg Asn Tyr
755 760 765
Thr Gly Ala Glu Phe Leu Gly Asp Gly Gly Asp Ile Ser Phe Ser
770 775 780
Arg Gly Thr Gln Asn Trp Thr Val Glu Arg Leu Leu Gln Ala His
790 795 800
Gln Leu Glu Glu Arg Gly Tyr Val Phe Val Gly Tyr His Gly Thr
805 810 815
Leu Glu Ala Ala Gln Ser Ile Val Phe Gly Gly Val Arg Ala Arg
820 825 830
Gln Asp Leu Asp Ala Ile Trp Arg Gly Phe Tyr Ile Ala Gly Asp
835 840 845
Ala Leu Ala Tyr Gly Tyr Ala Gln Asp Gln Glu Pro Asp Ala Arg
850 855 860
Arg Ile Arg Asn Gly Ala Leu Leu Arg Val Tyr Val Pro Arg Ser
870 875 880
Leu Pro Gly Phe Tyr Arg Thr Ser Leu Thr Leu Ala Ala Pro Glu
885 890 895
Ala Gly Glu Val Glu Arg Leu Ile Gly His Pro Leu Pro Leu Arg
- 198 031876
900
905
910
Leu Asp Ala 915 Ile Thr Gly Pro Glu 920 Glu Glu Gly Gly Arg 925 Leu Glu
Ile Leu Gly Trp Pro Leu Ala Glu Arg Thr Val Val Ile Pro Ser
930 935 940
Ile Pro Thr Asp Pro Arg Asn Val Gly Gly Asp Leu Asp Pro Ser
945 950 955
Ile
Pro
Asp
Lys
Glu
965
Gln
Ala
Ile
Ser
Ala
970
Leu
Pro
Asp
Tyr
Ala
975
Thr
Ala
Ser
960
Ser
Gln
Pro
Gly
Lys
980
Pro
Pro
Arg
Lys
Asp
985
Glu
Leu <210> 63 <211> 871 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 63
Asn
Tyr
Ile
Lys
Gly
Asp
Pro
Tyr
Phe
Ala
Glu
Tyr
Ala
Thr
Lys
Ser
Phe
Ile
Leu
Asn
Pro
Ser
Asp
Ala
Asn
Asn
Pro
Ser
Gly
Glu
Ala Asn His Asn Asp Glu Ala Cys 40 Asn Cys Asn Glu Ser 45 Gly Ile
35
Ser Val 50 Gly Gln Ala Gln Thr 55 Ser Gly Pro Ser Ser 60 Asn Lys Thr
Ile 65 Thr His Ser Ser Ile 70 Lys Thr Asn Lys Lys 75 Lys Glu Cys Lys
Val Lys Leu Gly Val 85 Arg Glu Asn Asp Lys 90 Asp Leu Lys Ile Cys 95
Ile
Glu
Asp
Thr
100
Ser
Leu
Ser
Gly
Val
105
Asp
Asn
Cys
Cys
Cys
110
Gln
Leu
Leu
Gly
115
Ile
Leu
Gln
Glu
Asn
120
Cys
Ser
Asp
Asn
Lys
125
Arg
Gly
Leu
Thr
Ser
Cys
Asp
Val
Asp
Ser
- 199 031876
Ser Ser Asn 130 Asp Ser Cys Asp 135 Asn Lys Asn Gln Asp 140 Glu Cys Gln
Lys Leu Glu Lys Val Phe Ala Ser Leu Thr Asn Gly Tyr Lys Cys
145 150 155
Lys Cys Lys Ser Gly Thr Ser Arg Ser Lys Lys Lys Trp Ile Trp
165 170 175
Lys Ser Ser Gly Asn Glu Glu Gly Leu Gln Glu Glu Tyr Ala Asn
180 185 190
Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu Gly Asn Leu
195 200 205
Lys Leu Glu Asn Val Cys Glu Asp Val Lys Asp Ile Asn Phe Asp
210 215 220
Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Val Ser Phe His Glu
225 230 235
Lys Asn Leu Lys Lys Arg Tyr Pro Gln Asn Lys Asn Ser Gly Asn
245 250 255
Glu Asn Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly
260 265 270
Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp
275 280 285
Glu Leu Asn Leu Gln Asn Asn Phe Gly Lys Leu Phe Gly Lys Tyr
290 295 300
Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu
305 310 315
Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp
325 330 335
Ala Met Lys His Gly Ala Glu Met Asn Ile Thr Thr Cys Asn Ala
340 345 350
Gly Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr
355 360 365
Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu
Lys
Asp
160
Lys
Thr
Pro
Thr
Gly
240
Lys
Asp
Leu
Ile
Asp
320
Thr
Asp
Ile
Asn
- 200 031876
370 375
Phe 385 Cys Glu Gln Arg Gln 390 Ala Lys Val
Lys Ser Cys Lys Glu 405 Ser Gly Asn Lys
Lys Cys Lys Asp 420 Glu Cys Glu Lys Tyr 425
Gly Thr Ala 435 Gly Gly Gly Ile Gly 440 Thr
Arg Trp 450 Asp Gln Ile Tyr Lys 455 Arg Tyr
Lys 465 Arg Asn Arg Lys Ala 470 Gly Thr Lys
Thr Asn Ala Ala Ala 485 Ser Thr Asp Glu
Ile Asp Ser Phe 500 Phe Lys His Leu Ile 505
Ser Ser Tyr 515 Leu Ser Asn Val Leu 520 Asp
Lys Ala 530 Pro Trp Thr Thr Tyr 535 Thr Thr
Asn 545 Lys Glu Arg Asp Lys 550 Ser Lys Ser
Val Val Asn Val Pro 565 Ser Pro Leu Gly
Tyr Ala Cys Gln 580 Cys Lys Ile Pro Thr 585
Arg Lys Glu 595 Tyr Met Asn Gln Trp 600 Ser
Lys Arg 610 Gly Tyr Lys Asn Asp 615 Asn Tyr
380
Asp 395 Val Ile Thr Asn Cys 400
Lys Thr Glu Cys Lys 415 Thr
Lys Phe Ile Glu 430 Ala Cys
Gly Ser Pro 445 Trp Ser Lys
Lys His 460 Ile Glu Asp Ala
Cys 475 Gly Thr Ser Ser Thr 480
Lys Cys Val Gln Ser 495 Asp
Ile Gly Leu Thr 510 Thr Pro
Asn Ile Cys 525 Gly Ala Asp
Thr Thr 540 Thr Glu Lys Cys
Ser 555 Ser Asp Thr Leu Val 560
Thr Pro Tyr Arg Tyr 575 Lys
Glu Glu Thr Cys 590 Asp Asp
Gly Ser Ala 605 Arg Thr Met
Leu Cys Lys Tyr Asn Gly
620
- 201 031876
Val
625
Arg
Glu
Gln
Glu
Ala
705
Asp
Tyr
Asn
Phe
Val
785
Thr
Pro
Pro
Glu
Pro
865
Asp Val Lys Pro Thr 630 Thr Val Arg Ser Asn 635 Ser Ser Lys Leu Asp 640
His Arg Gln Pro Arg Gly Trp Glu Gln Leu Tyr Pro Thr Gly Ala
645 650 655
Phe Leu Gly Asp Gly Gly Asp Ile Ser Phe Ser Thr Arg Gly Thr
660 665 670
Asn Trp Thr Val Glu Arg Leu Leu Gln Ala His Arg Gln Leu Glu
675 680 685
Arg Gly Tyr Val Phe Val Gly Tyr His Gly Thr Phe Leu Glu Ala
690 695 700
Gln Ser Ile Val Phe Gly Gly Val Arg Ala Arg Ser Gln Asp Leu
710 715 720
Ala Ile Trp Arg Gly Phe Tyr Ile Ala Gly Asp Pro Ala Leu Ala
725 730 735
Gly Tyr Ala Gln Asp Gln Glu Pro Asp Ala Arg Gly Arg Ile Arg
740 745 750
Gly Ala Leu Leu Arg Val Tyr Val Pro Arg Ser Ser Leu Pro Gly
755 760 765
Tyr Arg Thr
770
Ser Leu Thr Leu Ala Ala
Pro Glu Ala Ala Gly Glu
775
780
Glu Arg Leu Ile Gly 790 His Pro Leu Pro Leu 795 Arg Leu Asp Ala Ile 800
Gly Pro Glu Glu Glu Gly Gly Arg Leu Glu Thr Ile Leu Gly Trp
805 810 815
Leu Ala Glu Arg Thr Val Val Ile Pro Ser Ala Ile Pro Thr Asp
820 825 830
Arg Asn Val Gly Gly Asp Leu Asp Pro Ser Ser Ile Pro Asp Lys
835 840 845
Gln Ala Ile Ser Ala Leu Pro Asp Tyr Ala Ser Gln Pro Gly Lys
850 855 860
Pro Arg Lys Asp Glu Leu
870
- 202 031876 <210> 64 <211> 1258 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 64
Arg Pro Asp Phe Cys Leu Glu Pro Pro Tyr Thr Gly Pro Cys Lys Ala
5 10 15
Arg Ile Ile Arg 20 Tyr Phe Tyr Asn Ala 25 Lys Ala Gly Leu Cys 30 Gln Thr
Phe Val Tyr Gly Gly Cys Arg Ala Lys Arg Asn Asn Phe Lys Ser Ala
35 40 45
Glu Asp Cys Met Arg Thr Cys Gly Gly Ala Asn His Ser Asp Ser Gly
50 55 60
Lys Tyr Asp Pro Cys Glu Lys Lys Leu Pro Pro Tyr Asp Asp Asn Asp
65 70 75 80
Gln Trp Lys Cys Gln Gln Asn Ser Ser Asp Gly Ser Gly Lys Pro Glu
85 90 95
Asn Ile Cys Val Pro Pro Arg Arg Glu Arg Leu Cys Thr Tyr Asn Leu
100 105 110
Glu Asn Leu Lys Phe Asp Lys Ile Arg Asp Asn Asn Ala Phe Leu Ala
115 120 125
Asp Val Leu Leu Thr Ala Arg Asn Glu Gly Glu Lys Ile Val Gln Asn
130 135 140
His Pro Asp Thr Asn Ser Ser Asn Val Cys Asn Ala Leu Glu Arg Ser
145 150 155 160
Phe Ala Asp Leu Ala Asp Ile Ile Arg Gly Thr Asp Gln Trp Lys Gly
165 170 175
Thr Asn Ser Asn Leu Glu Lys Asn Leu Lys Gln Met Phe Ala Lys Ile
180 185 190
Arg Glu Asn Asp Lys Val Leu Gln Asp Lys Tyr Pro Lys Asp Gln Lys
195 200 205
- 203 031876
Tyr Thr Lys Leu Arg Glu Ala 215 Trp Trp
210
Trp 225 Glu Val Ile Thr Cys 230 Gly Ala Arg
Arg Gly Trp Arg Thr 245 Ser Gly Lys Ser
Leu Cys Arg Lys 260 Cys Gly His Tyr Glu 265
Asp Tyr Val 275 Pro Gln Phe Leu Arg 280 Trp
Phe Tyr 290 Arg Glu Lys Gln Asn 295 Leu Ile
Glu 305 Glu Cys Thr Arg Glu 310 Asp His Lys
Cys Ser Thr Cys Lys 325 Asp Lys Cys Lys
Lys Trp Lys Thr 340 Glu Trp Glu Asn Gln 345
Tyr Glu Gln 355 Asn Lys Asn Lys Thr 360 Ser
Asp Asp 370 Tyr Val Lys Asp Phe 375 Phe Glu
Ser 385 Leu Glu Asn Tyr Ile 390 Lys Gly Asp
Thr Lys Leu Ser Phe 405 Ile Leu Asn Pro
Gly Glu Thr Ala 420 Asn His Asn Asp Glu 425
Gly Ile Ser 435 Ser Val Gly Gln Ala 440 Gln
Lys Thr 450 Cys Ile Thr His Ser 455 Ser Ile
Ala Asn 220 Arg Gln Lys Val
Asn 235 Asp Leu Leu Ile Lys 240
Arg Lys Lys Asn Phe 255 Glu
Glu Val Pro Thr 270 Lys Leu
Thr Glu Trp 285 Ile Glu Asp
Asp Met 300 Glu Arg His Arg
Lys 315 Glu Gly Thr Ser Tyr 320
Tyr Cys Glu Cys Val 335 Lys
Asn Lys Tyr Lys 350 Asp Leu
Lys Asn Thr 365 Ser Arg Tyr
Leu Glu 380 Ala Asn Tyr Ser
Tyr 395 Phe Ala Glu Tyr Ala 400
Asp Ala Asn Asn Pro 415 Ser
Cys Asn Cys Asn 430 Glu Ser
Ser Gly Pro 445 Ser Ser Asn
Thr Asn 460 Lys Lys Lys Glu
- 204 031876
Cys
465
Ile
Cys
Arg
Cys
Lys
545
Ile
Ala Asn Phe
His
625
Gly
Tyr
Lys
Lys
Ser
705
Lys Asp Val Lys Leu 470 Gly Val Arg Glu Asn 475 Asp Lys Asp Leu
Cys Val Ile Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys
485 490 495
Gln Asp Leu Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn
500 505 510
Gly Ser Ser Ser Asn Asp Ser Cys 520 Asp Asn Lys Asn 525 Gln Asp
515
Gln Lys Lys Leu Glu Lys Val Phe Ala Ser Leu Thr Asn Gly
530 535 540
Cys Asp Lys Cys Lys Ser Gly Thr Ser Arg Ser Lys Lys Lys
550 555
Trp Lys Lys Ser Ser Gly Asn Glu Glu Gly Leu Gln Glu Glu
565 570 575
Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu
580 585 590
Leu Pro Lys Leu Glu Asn Val Cys Glu Asp Val Lys Asp Ile
595 600 605
Asp Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Val Ser
610 615 620
Glu Gly Lys Asn Leu Lys Lys Arg Tyr Pro Gln Asn Lys Asn
630 635
Asn Lys Glu Asn Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala
645 650 655
Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr
660 665 670
Asp Leu 675 Glu Leu Asn Leu Gln 680 Asn Asn Phe Gly Lys 685 Leu Phe
Tyr Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr
690 695 700
Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys
710 715
Lys
480
Cys
Lys
Glu
Tyr
Trp
560
Tyr
Gly
Asn
Phe
Ser
640
Asp
Thr
Gly
Ser
Tyr
720
- 205 031876
Ile Asn
Pro
Val
Thr
785
Cys
Glu
Trp
Glu
Ser
865
Gln
Thr
Gly
Glu
Thr
945
Arg
Trp Thr Ala Met 725 Lys His Gly Ala Glu 730 Met Asn Ile Thr Thr 735
Ala Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp
740 745 750
Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu Gln Glu
755 760 765
Glu Asn Phe Cys Glu Gln Arg Gln Ala Lys Val Lys Asp Val
770 775 780
Asn Cys Lys Ser Cys Lys Glu Ser Gly Asn Lys Cys Lys Thr
790 795
Lys Thr Lys Cys Lys Asp Glu Cys Glu Lys Tyr Lys Lys Phe
805 810 815
Ala Cys Gly Thr Ala Gly Gly Gly Ile Gly Thr Ala Gly Ser
820 825 830
Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys His
835 840 845
Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly
850 855 860
Ser Thr Thr Asn Ala Ala Ala Ser Thr Asp Glu Asn Lys Cys
870 875
Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp Ile Gly
885 890 895
Thr Pro Ser Ser Tyr Leu Ser Asn Val Leu Asp Asp Asn Ile
900 905 910
Ala Asp Lys Ala Pro Trp Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr
915 920 925
Lys Cys Asn Lys Glu Arg Asp Lys Ser Lys Ser Gln Ser Ser
930 935 940
Leu Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro Leu Gly Asn Thr Pro
950 955
Tyr Lys Tyr Ala Cys Gln Cys Lys Ile Pro Thr Asn Glu Glu
Cys
Ile
Trp
Ile
Glu
800
Ile
Pro
Ile
Thr
Val
880
Leu
Cys
Thr
Asp
Tyr
960
Thr
- 206 031876
965
970
975
Cys Asp Asp Arg Lys Glu
980
Tyr Met Asn Gln Trp Ser Cys Gly Ser Ala
985 990
Arg
Thr
Met
995
Lys
Arg Gly
Tyr Lys Asn Asp Asn Tyr Glu Leu Cys Lys 1000
1005
Tyr Asn Gly Val Asp Val Lys 1015 Pro Thr Thr Val Arg 1020 Ser Asn Ser
1010
Ser Lys Leu Asp Arg His Arg Gln Pro Arg Gly Trp Glu Gln Leu
1025 1030 1035
Tyr Pro Thr Gly Ala Glu Phe Leu Gly Asp Gly Gly Asp Ile Ser
1040 1045 1050
Phe Ser Thr Arg Gly Thr Gln Asn Trp Thr Val Glu Arg Leu Leu
1055 1060 1065
Gln Ala His Arg Gln Leu Glu Glu Arg Gly Tyr Val Phe Val Gly
1070 1075 1080
Tyr His Gly Thr Phe Leu Glu Ala Ala Gln Ser Ile Val Phe Gly
1085 1090 1095
Gly Val Arg Ala Arg Ser Gln Asp Leu Asp Ala Ile Trp Arg Gly
1100 1105 1110
Phe Tyr Ile Ala Gly Asp Pro Ala Leu Ala Tyr Gly Tyr Ala Gln
1115 1120 1125
Asp Gln Glu Pro Asp Ala Arg Gly Arg Ile Arg Asn Gly Ala Leu
1130 1135 1140
Leu Arg Val Tyr Val Pro Arg Ser Ser Leu Pro Gly Phe Tyr Arg
1145 1150 1155
Thr Ser Leu Thr Leu Ala Ala Pro Glu Ala Ala Gly Glu Val Glu
1160 1165 1170
Arg Leu Ile Gly His Pro Leu Pro Leu Arg Leu Asp Ala Ile Thr
1175 1180 1185
Gly Pro Glu Glu Glu Gly Gly Arg Leu Glu Thr Ile Leu Gly Trp
1190 1195 1200
- 207 031876
Pro Leu Ala Glu Arg Thr Val Val
1205 1210
Ile Pro Ser Ala Ile Pro Thr
1215
Asp Pro Arg Asn Val
Gly Gly Asp Leu Asp
Pro
1220
1225
Ser
1230
Ser Ile Pro
Asp Lys Glu Gln Ala Ile Ser
Ala Leu Pro Asp Tyr Ala Ser Gln
1235
1240
1245
Pro Gly Lys Pro Pro Arg Lys Asp Glu Leu 1255
125 .0
<210> 65
<211> 1374
<212> Белок
<213> Искусственная
<220>
<223> Искусственная конструкция
<400> 65
Arg 1 Pro Asp Phe Cys 5 Leu Glu Pro Pro Tyr 10 Thr Gly Pro Cys Lys 15 Ala
Arg Ile Ile Arg 20 Tyr Phe Tyr Asn Ala 25 Lys Ala Gly Leu Cys 30 Gln Thr
Phe Val Tyr 35 Gly Gly Cys Arg Ala 40 Lys Arg Asn Asn Phe 45 Lys Ser Ala
Glu Asp 50 Cys Met Arg Thr Cys 55 Gly Gly Ala Asn His 60 Ser Asp Ser Gly
Lys 65 Tyr Asp Pro Cys Glu 70 Lys Lys Leu Pro Pro 75 Tyr Asp Asp Asn Asp 80
Gln Trp Lys Cys Gln 85 Gln Asn Ser Ser Asp 90 Gly Ser Gly Lys Pro 95 Glu
Asn Ile Cys Val 100 Pro Pro Arg Arg Glu 105 Arg Leu Cys Thr Tyr 110 Asn Leu
Glu Asn Leu 115 Lys Phe Asp Lys Ile 120 Arg Asp Asn Asn Ala 125 Phe Leu Ala
Asp Val 130 Leu Leu Thr Ala Arg 135 Asn Glu Gly Glu Lys 140 Ile Val Gln Asn
His Pro Asp Thr Asn Ser Ser Asn Val Cys Asn Ala Leu Glu Arg Ser
- 208 031876
145
Phe
Thr
Arg
Tyr
Trp
225
Arg
Leu
Asp
Phe
Glu
305
Cys
Lys
Tyr
Asp
Ser
385
150
155
Ala Asp Leu Ala Asp 165 Ile Ile Arg Gly Thr 170 Asp Gln Trp Lys 175
Asn Ser Asn Leu Glu Lys Asn Leu Lys Gln Met Phe Ala Lys
180 185 190
Glu Asn Asp Lys Val Leu Gln Asp Lys Tyr Pro Lys Asp Gln
195 200 205
Thr Lys Leu Arg Glu Ala Trp Trp Asn Ala Asn Arg Gln Lys
210 215 220
Glu Val Ile Thr Cys Gly Ala Arg Ser Asn Asp Leu Leu Ile
230 235
Gly Trp Arg Thr Ser Gly Lys Ser Asp Arg Lys Lys Asn Phe
245 250 255
Cys Arg Lys Cys Gly His Tyr Glu Lys Glu Val Pro Thr Lys
260 265 270
Tyr Val Pro Gln Phe Leu Arg Trp Leu Thr Glu Trp Ile Glu
275 280 285
Tyr Arg Glu Lys Gln Asn Leu Ile Asp Asp Met Glu Arg His
290 295 300
Glu Cys Thr Arg Glu 310 Asp His Lys Ser Lys 315 Glu Gly Thr Ser
Ser Thr Cys Lys Asp Lys Cys Lys Lys Tyr Cys Glu Cys Val
325 330 335
Trp Lys Thr Glu Trp Glu Asn Gln Glu Asn Lys Tyr Lys Asp
340 345 350
Glu Gln Asn Lys Asn Lys Thr Ser Gln Lys Asn Thr Ser Arg
355 360 365
Asp Tyr Val Lys Asp Phe Phe Glu Lys Leu Glu Ala Asn Tyr
370 375 380
Leu Glu Asn Tyr Ile Lys Gly Asp Pro Tyr Phe Ala Glu Tyr
390 395
160
Gly
Ile
Lys
Val
Lys
240
Glu
Leu
Asp
Arg
Tyr
320
Lys
Leu
Tyr
Ser
Ala
400
- 209 031876
Thr
Gly
Gly
Lys
Cys
465
Ile
Cys
Arg
Cys
Lys
545
Ile
Ala Asn Phe
His
625
Gly
Lys
Leu
Ser
Phe
405
Ile
Leu
Asn
Pro
Ser
410
Asp
Ala
Asn
Asn
Pro
415
Glu
Thr
Ala
420
Asn
His
Asn
Asp
Glu
425
Ala
Cys
Asn
Cys
Asn
430
Glu
Ile Ser 435 Ser Val Gly Gln Ala 440 Gln Thr Ser Gly Pro 445 Ser Ser
Thr Cys Ile Thr His Ser Ser Ile Lys Thr Asn Lys Lys Lys
450 455 460
Lys Asp Val Lys Leu Gly Val Arg Glu Asn Asp Lys Asp Leu
470 475
Cys Val Ile Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys
485 490 495
Gln Asp Leu Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn
500 505 510
Gly
Gln
530
Ser
515
Ser
Ser
Asn
Asp
Ser
520
Cys
Asp
Asn
Lys
Asn
525
Gln
Asp
Lys
Lys
Leu
Glu
Lys
535
Val
Phe
Ala
Ser
Leu
540
Thr
Asn
Gly
Cys Asp Lys Cys Lys 550 Ser Gly Thr Ser Arg 555 Ser Lys Lys Lys
Trp Lys Lys Ser Ser Gly Asn Glu Glu Gly Leu Gln Glu Glu
565 570 575
Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu
580 585 590
Leu Pro Lys Leu Glu Asn Val Cys Glu Asp Val Lys Asp Ile
595 600 605
Asp Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Val Ser
610 615 620
Glu Gly Lys Asn Leu Lys Lys Arg Tyr Pro Gln Asn Lys Asn
630 635
Asn Lys Glu Asn Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala
645 650 655
Ser
Ser
Asn
Glu
Lys
480
Cys
Lys
Glu
Tyr
Trp
560
Tyr
Gly
Asn
Phe
Ser
640
Asp
- 210 031876
Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr
Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr
660
665
670
Lys Asp Leu
675
Lys Tyr Ile
690
Ser Leu Asp
705
Ile Trp Thr
Asn Ala Asp
Pro Thr Ile
755
Glu Leu Asn
Lys Lys Asn
Glu Leu Arg
710
Ala Met Lys
725
Gly Ser Val
740
Asp Leu Ile
Leu Gln Asn
680
Asn Thr Ala
695
Glu Ser Trp
His Gly Ala
Thr Gly Ser
745
Pro Gln Tyr
760
Asn Phe Gly
Glu Gln Asp
700
Trp Asn Thr
715
Glu Met Asn
730
Gly Ser Ser
Leu Arg Phe
Lys Leu Phe
685
Thr Ser Tyr
Asn Lys Lys
Ile Thr Thr
735
Cys Asp Asp
750
Leu Gln Glu
765
Val
Glu
770
Asn
Phe
Cys
Glu
Gln
775
Arg
Gln
Ala
Lys
Val
780
Lys
Asp
Val
Thr 785 Asn Cys Lys Ser Cys 790 Lys Glu Ser Gly Asn 795 Lys Cys Lys Thr
Cys Lys Thr Lys Cys Lys Asp Glu Cys Glu Lys Tyr Lys Lys Phe
805 810 815
Glu Ala Cys Gly Thr Ala Gly Gly Gly Ile Gly Thr Ala Gly Ser
820 825 830
Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys His
835 840 845
Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly
850 855 860
Ser Ser Thr Thr Asn Ala Ala Ala Ser Thr Asp Glu Asn Lys Cys
865 870 875
Gln Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp Ile Gly
885 890 895
Thr
Thr
Pro
Ser
900
Ser
Tyr
Leu
Ser
Asn
905
Val
Leu
Asp
Asp
Asn
910
Ile
Thr
Gly
Ser
Tyr
720
Cys
Ile
Trp
Ile
Glu
800
Ile
Pro
Ile
Thr
Val
880
Leu
Cys
- 211 031876
Gly Ala Asp Lys Ala Pro Trp Thr
915 920
Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Thr 925
Glu Lys Cys Asn Lys Glu Arg Asp
930 935
Lys Ser Lys Ser Gln Ser Ser Asp
940
Thr Leu Val Val Val Asn Val Pro
945 950
Ser Pro Leu Gly Asn Thr Pro Tyr
955 960
Arg Tyr Lys Tyr Ala Cys Gln Cys 965
Lys Ile Pro Thr Asn Glu Glu Thr
970 975
Cys Asp Asp Arg Lys Glu Tyr Met
980
Asn Gln Trp Ser Cys Gly Ser Ala
985 990
Arg
Thr
Met
995
Lys
Arg
Gly
Tyr
Lys
1000
Asn Asp Asn Tyr Glu Leu Cys Lys 1005
Tyr Asn 1010 Gly Val Asp Val Lys 1015 Pro Thr Thr Val Arg 1020 Ser Asn Ser
Ser Lys Leu Asp Pro Glu Gly Gly Ser Leu Ala Ala Leu Thr Ala
1025 1030 1035
His Gln Ala Cys His Leu Pro Leu Glu Thr Phe Thr Arg His Arg
1040 1045 1050
Gln Pro Arg Gly Trp Glu Gln Leu Glu Gln Cys Gly Tyr Pro Val
1055 1060 1065
Gln Arg Leu Val Ala Leu Tyr Leu Ala Ala Arg Leu Ser Trp Asn
1070 1075 1080
Gln Val Asp Gln Val Ile Arg Asn Ala Leu Ala Ser Pro Gly Ser
1085 1090 1095
Gly Gly Asp Leu Gly Glu Ala Ile Arg Glu Gln Pro Glu Gln Ala
1100 1105 1110
Arg Leu Ala Leu Thr Leu Ala Ala Ala Glu Ser Glu Arg Phe Val
1115 1120 1125
Arg Gln Gly Thr Gly Asn Asp Glu Ala Gly Ala Ala Asn Gly Pro
1130 1135 1140
Ala Asp Ser Gly Asp Ala Leu Leu Glu Arg Asn Tyr Pro Thr Gly
- 212 031876
1145
1150
1155
Ala Glu 1160 Phe Leu Gly Asp Gly 1165 Gly Asp Ile Ser Phe 1170 Ser Thr Arg
Gly Thr Gln Asn Trp Thr Val Glu Arg Leu Leu Gln Ala His Arg
1175 1180 1185
Gln Leu Glu Glu Arg Gly Tyr Val Phe Val Gly Tyr His Gly Thr
1190 1195 1200
Phe Leu Glu Ala Ala Gln Ser Ile Val Phe Gly Gly Val Arg Ala
1205 1210 1215
Arg Ser Gln Asp Leu Asp Ala Ile Trp Arg Gly Phe Tyr Ile Ala
1220 1225 1230
Gly Asp Pro Ala Leu Ala Tyr Gly Tyr Ala Gln Asp Gln Glu Pro
1235 1240 1245
Asp Ala Arg Gly Arg Ile Arg Asn Gly Ala Leu Leu Arg Val Tyr
1250 1255 1260
Val Pro Arg Ser Ser Leu Pro Gly Phe Tyr Arg Thr Ser Leu Thr
1265 1270 1275
Leu Ala Ala Pro Glu Ala Ala Gly Glu Val Glu Arg Leu Ile Gly
1280 1285 1290
His Pro Leu Pro Leu Arg Leu Asp Ala Ile Thr Gly Pro Glu Glu
1295 1300 1305
Glu Gly Gly Arg Leu Glu Thr Ile Leu Gly Trp Pro Leu Ala Glu
1310 1315 1320
Arg Thr Val Val Ile Pro Ser Ala Ile Pro Thr Asp Pro Arg Asn
1325 1330 1335
Val Gly Gly Asp Leu Asp Pro Ser Ser Ile Pro Asp Lys Glu Gln
1340 1345 1350
Ala Ile Ser Ala Leu Pro Asp Tyr Ala Ser Gln Pro Gly Lys Pro
1355 1360 1365
Pro Arg
1370
Lys Asp Glu Leu
- 213 031876 <210> 66 <211> 1200 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 66
Asn His Ser Asp Ser Gly Lys Tyr Asp
5
Pro Cys Glu Lys Lys Leu Pro
15
Pro Tyr Asp Asp Asn Asp Gln Trp Lys
25
Cys Gln Gln Asn Ser Ser Asp 30
Gly Ser Gly Lys Pro Glu Asn Ile Cys
40
Val Pro Pro Arg Arg Glu Arg
Leu Cys Thr Tyr Asn Leu Glu Asn Leu
55
Lys Phe Asp Lys Ile Arg Asp
Asn Asn Ala Phe Leu Ala Asp Val Leu
70
Leu Thr Ala Arg Asn Glu Gly
80
Glu Lys Ile Val Gln Asn His Pro Asp 85
Thr Asn Ser Ser Asn Val Cys
95
Asn Ala Leu Glu Arg Ser Phe Ala Asp
100 105
Leu Ala Asp Ile Ile Arg Gly
110
Thr Asp Gln Trp Lys Gly Thr Asn Ser
115 120
Asn Leu Glu Lys Asn Leu Lys
125
Gln Met Phe Ala Lys
Ile Arg Glu Asn Asp Lys Val
Leu Gln Asp Lys
130
135
140
Tyr Pro Lys Asp Gln Lys Tyr Thr
145 150
Lys Leu Arg Glu Ala Trp Trp Asn
155 160
Ala Asn Arg Gln Lys Val Trp Glu 165
Val Ile Thr Cys Gly Ala Arg Ser
170 175
Asn Asp Leu Leu Ile Lys Arg Gly
180
Trp Arg Thr Ser Gly Lys Ser Asp
185 190
Arg Lys Lys Asn Phe Glu Leu Cys
195 200
Arg Lys Cys Gly His Tyr Glu Lys 205
Glu Val Pro Thr Lys Leu Asp Tyr
Val Pro Gln Phe Leu Arg Trp Leu
- 214 031876
210 215
Thr 225 Glu Trp Ile Glu Asp 230 Phe Tyr Arg
Asp Met Glu Arg His 245 Arg Glu Glu Cys
Lys Glu Gly Thr 260 Ser Tyr Cys Ser Thr 265
Tyr Cys Glu 275 Cys Val Lys Lys Trp 280 Lys
Asn Lys 290 Tyr Lys Asp Leu Tyr 295 Glu Gln
Lys 305 Asn Thr Ser Arg Tyr 310 Asp Asp Tyr
Leu Glu Ala Asn Tyr 325 Ser Ser Leu Glu
Tyr Phe Ala Glu 340 Tyr Ala Thr Lys Leu 345
Asp Ala Asn 355 Asn Pro Ser Gly Glu 360 Thr
Cys Asn 370 Cys Asn Glu Ser Gly 375 Ile Ser
Ser 385 Gly Pro Ser Ser Asn 390 Lys Thr Cys
Thr Asn Lys Lys Lys 405 Glu Cys Lys Asp
Asn Asp Lys Asp 420 Leu Lys Ile Cys Val 425
Gly Val Asp 435 Asn Cys Cys Cys Gln 440 Asp
Asn Cys 450 Ser Asp Asn Lys Arg 455 Gly Ser
220
Lys 235 Gln Asn Leu Ile Asp 240
Arg Glu Asp His Lys 255 Ser
Lys Asp Lys Cys 270 Lys Lys
Glu Trp Glu 285 Asn Gln Glu
Lys Asn 300 Lys Thr Ser Gln
Lys 315 Asp Phe Phe Glu Lys 320
Tyr Ile Lys Gly Asp 335 Pro
Phe Ile Leu Asn 350 Pro Ser
Asn His Asn 365 Asp Glu Ala
Val Gly 380 Gln Ala Gln Thr
Thr 395 His Ser Ser Ile Lys 400
Lys Leu Gly Val Arg 415 Glu
Glu Asp Thr Ser 430 Leu Ser
Leu Gly Ile 445 Leu Gln Glu
Ser Asn Asp Ser Cys Asp
460
- 215 031876
Asn
465
Ser
Arg
Gly
Gln
Asp
545
Cys
Pro
Glu
Trp
Phe
625
Gln
Asn
Met
Ser
Arg
705
Lys Asn Gln Asp Glu Cys 470 Gln Lys Lys Leu 475 Glu Lys Val Phe
Leu Thr Asn Gly Tyr Lys Cys Asp Lys Cys Lys Ser Gly Thr
485 490 495
Ser Lys Lys Lys Trp Ile Trp Lys Lys Ser Ser Gly Asn Glu
500 505 510
Leu Gln Glu Glu Tyr Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg
515 520 525
Ser Leu Tyr Leu Gly Asn Leu Pro Lys Leu Glu Asn Val Cys
530 535 540
Val Lys Asp Ile Asn Phe Asp Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ala
550 555
Leu Ile Val Ser Phe His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Lys Arg
565 570 575
Gln Asn Lys 580 Asn Ser Gly Asn Lys 585 Glu Asn Leu Cys Lys 590 Ala
Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser
595 600 605
Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Asn
610 615 620
Gly Lys Leu Phe Gly Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala
630 635
Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp
645 650 655
Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Thr Ala Met Lys His Gly Ala
660 665 670
Asn Ile Thr Thr Cys Asn Ala Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser
675 680 685
Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr
690 695 700
Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu Asn Phe Cys Glu Gln Arg Gln
710 715
Ala
480
Ser
Glu
Thr
Glu
Gly
560
Tyr
Leu
Ile
Asn
Glu
640
Trp
Glu
Gly
Leu
Ala
720
- 216 031876
Lys Val Lys Asp Val 725 Ile Thr Asn Cys Lys 730 Ser Cys Lys Glu Ser 735 Gly
Asn Lys Cys Lys Thr Glu Cys Lys Thr Lys Cys Lys Asp Glu Cys Glu
740 745 750
Lys Tyr Lys Lys Phe Ile Glu Ala Cys Gly Thr Ala Gly Gly Gly Ile
755 760 765
Gly Thr Ala Gly Ser Pro Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys
770 775 780
Arg Tyr Ser Lys His Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly
785 790 795 800
Thr Lys Asn Cys Gly Thr Ser Ser Thr Thr Asn Ala Ala Ala Ser Thr
805 810 815
Asp Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His
820 825 830
Leu Ile Asp 835 Ile Gly Leu Thr Thr 840 Pro Ser Ser Tyr Leu 845 Ser Asn Val
Leu Asp Asp Asn Ile Cys Gly Ala Asp Lys Ala Pro Trp Thr Thr Tyr
850 855 860
Thr Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys Cys Asn Lys Glu Arg Asp Lys Ser
865 870 875 880
Lys Ser Gln Ser Ser Asp Thr Leu Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro
885 890 895
Leu Gly Asn Thr Pro Tyr Arg Tyr Lys Tyr Ala Cys Gln Cys Lys Ile
900 905 910
Pro Thr Asn 915 Glu Glu Thr Cys Asp 920 Asp Arg Lys Glu Tyr 925 Met Asn Gln
Trp Ser Cys Gly Ser Ala Arg Thr Met Lys Arg Gly Tyr Lys Asn Asp
930 935 940
Asn Tyr Glu Leu Cys Lys Tyr Asn Gly Val Asp Val Lys Pro Thr Thr
945 950 955 960
Val Arg Ser Asn Ser Ser Lys Leu Asp Arg His Arg Gln Pro Arg Gly
965 970 975
- 217 031876
Trp Glu Gln Leu Tyr Pro Thr Gly Ala Glu Phe Leu Gly Asp Gly Gly
980 985 990
Asp Ile Ser Phe Ser Thr Arg Gly Thr Gln Asn Trp Thr Val Glu Arg
995 1000 1005
Leu Leu 1010 Gln Ala His Arg Gln 1015 Leu Glu Glu Arg Gly 1020 Tyr Val Phe
Val Gly Tyr His Gly Thr Phe Leu Glu Ala Ala Gln Ser Ile Val
1025 1030 1035
Phe Gly Gly Val Arg Ala Arg Ser Gln Asp Leu Asp Ala Ile Trp
1040 1045 1050
Arg Gly Phe Tyr Ile Ala Gly Asp Pro Ala Leu Ala Tyr Gly Tyr
1055 1060 1065
Ala Gln Asp Gln Glu Pro Asp Ala Arg Gly Arg Ile Arg Asn Gly
1070 1075 1080
Ala Leu Leu Arg Val Tyr Val Pro Arg Ser Ser Leu Pro Gly Phe
1085 1090 1095
Tyr Arg Thr Ser Leu Thr Leu Ala Ala Pro Glu Ala Ala Gly Glu
1100 1105 1110
Val Glu Arg Leu Ile Gly His Pro Leu Pro Leu Arg Leu Asp Ala
1115 1120 1125
Ile Thr Gly Pro Glu Glu Glu Gly Gly Arg Leu Glu Thr Ile Leu
1130 1135 1140
Gly Trp Pro Leu Ala Glu Arg Thr Val Val Ile Pro Ser Ala Ile
1145 1150 1155
Pro Thr Asp Pro Arg Asn Val Gly Gly Asp Leu Asp Pro Ser Ser
1160 1165 1170
Ile Pro Asp Lys Glu Gln Ala Ile Ser Ala Leu Pro Asp Tyr Ala
1175 1180 1185
Ser Gln Pro Gly Lys Pro Pro Arg Lys Asp Glu Leu
1190 1195 1200
<210> 67
- 218 031876 <211> 1316 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 67
Asn 1 His Ser Asp Ser 5 Gly Lys Tyr Asp Pro 10 Cys Glu Lys Lys Leu 15 Pro
Pro Tyr Asp Asp Asn Asp Gln Trp Lys Cys Gln Gln Asn Ser Ser Asp
20 25 30
Gly Ser Gly Lys Pro Glu Asn Ile Cys Val Pro Pro Arg Arg Glu Arg
35 40 45
Leu Cys Thr Tyr Asn Leu Glu Asn Leu Lys Phe Asp Lys Ile Arg Asp
50 55 60
Asn Asn Ala Phe Leu Ala Asp Val Leu Leu Thr Ala Arg Asn Glu Gly
65 70 75 80
Glu Lys Ile Val Gln Asn His Pro Asp Thr Asn Ser Ser Asn Val Cys
85 90 95
Asn Ala Leu Glu Arg Ser Phe Ala Asp Leu Ala Asp Ile Ile Arg Gly
100 105 110
Thr Asp Gln Trp Lys Gly Thr Asn Ser Asn Leu Glu Lys Asn Leu Lys
115 120 125
Gln Met Phe Ala Lys
Ile Arg Glu Asn Asp Lys Val
Leu Gln Asp Lys
130
135
140
Tyr 145 Pro Lys Asp Gln Lys 150 Tyr Thr Lys Leu Arg 155 Glu Ala Trp Trp Asn 160
Ala Asn Arg Gln Lys Val Trp Glu Val Ile Thr Cys Gly Ala Arg Ser
165 170 175
Asn Asp Leu Leu Ile Lys Arg Gly Trp Arg Thr Ser Gly Lys Ser Asp
180 185 190
Arg
Lys
Lys
195
Asn
Phe
Glu
Leu
Cys
200
Arg
Lys
Cys
Gly
His
205
Tyr
Glu
Lys
Glu
Val
210
Pro
Thr
Lys
Leu
Asp
215
Tyr
Val
Pro
Gln
Phe
220
Leu
Arg
Trp
Leu
- 219 031876
Thr Glu Trp 225 Ile Glu Asp 230 Phe Tyr Arg Glu Lys 235 Gln Asn Leu Ile Asp 240
Asp Met Glu Arg His Arg Glu Glu Cys Thr Arg Glu Asp His Lys Ser
245 250 255
Lys Glu Gly Thr Ser Tyr Cys Ser Thr Cys Lys Asp Lys Cys Lys Lys
260 265 270
Tyr Cys Glu Cys Val Lys Lys Trp Lys Thr Glu Trp Glu Asn Gln Glu
275 280 285
Asn Lys Tyr Lys Asp Leu Tyr Glu Gln Asn Lys Asn Lys Thr Ser Gln
290 295 300
Lys Asn Thr Ser Arg Tyr Asp Asp Tyr Val Lys Asp Phe Phe Glu Lys
305 310 315 320
Leu Glu Ala Asn Tyr Ser Ser Leu Glu Asn Tyr Ile Lys Gly Asp Pro
325 330 335
Tyr Phe Ala Glu Tyr Ala Thr Lys Leu Ser Phe Ile Leu Asn Pro Ser
340 345 350
Asp Ala Asn Asn Pro Ser Gly Glu Thr Ala Asn His Asn Asp Glu Ala
355 360 365
Cys Asn Cys Asn Glu Ser Gly Ile Ser Ser Val Gly Gln Ala Gln Thr
370 375 380
Ser Gly Pro Ser Ser Asn Lys Thr Cys Ile Thr His Ser Ser Ile Lys
385 390 395 400
Thr Asn Lys Lys Lys Glu Cys Lys Asp Val Lys Leu Gly Val Arg Glu
405 410 415
Asn Asp Lys Asp Leu Lys Ile Cys Val Ile Glu Asp Thr Ser Leu Ser
420 425 430
Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln Asp Leu Leu Gly Ile Leu Gln Glu
435 440 445
Asn Cys Ser Asp Asn Lys Arg Gly Ser Ser Ser Asn Asp Ser Cys Asp
450 455 460
Asn Lys Asn Gln Asp Glu Cys Gln Lys Lys Leu Glu Lys Val Phe Ala
- 220 031876
465
470
475
Ser Leu Thr Asn Gly 485 Tyr Lys Cys Asp Lys 490 Cys Lys Ser Gly Thr 495
Arg Ser Lys Lys Lys Trp Ile Trp Lys Lys Ser Ser Gly Asn Glu
500 505 510
Gly Leu Gln Glu Glu Tyr Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg
515 520 525
Gln Ser Leu Tyr Leu Gly Asn Leu Pro Lys Leu Glu Asn Val Cys
530 535 540
Asp Val Lys Asp Ile Asn Phe Asp Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ala
545 550 555
Cys Leu Ile Val Ser Phe His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Lys Arg
565 570 575
Pro Gln Asn Lys 580 Asn Ser Gly Asn Lys 585 Glu Asn Leu Cys Lys 590 Ala
Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser
595 600 605
Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Asn
610 615 620
Phe Gly Lys Leu Phe Gly Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala
625 630 635
Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp
645 650 655
Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Thr Ala Met Lys His Gly Ala
660 665 670
Met Asn Ile Thr Thr Cys Asn Ala Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser
675 680 685
Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr
690 695 700
Arg Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu Asn Phe Cys Glu Gln Arg Gln
705 710 715
480
Ser
Glu
Thr
Glu
Gly
560
Tyr
Leu
Ile
Asn
Glu
640
Trp
Glu
Gly
Leu
Ala
720
- 221 031876
Lys
Asn
Lys
Gly
Arg
785
Thr
Asp
Leu
Leu
Thr
865
Lys
Leu
Pro
Trp
Asn
945
Val
Val Lys Asp Val 725 Ile Thr Asn Cys Lys 730 Ser Cys Lys Glu Ser 735 Gly
Lys Cys Lys Thr Glu Cys Lys Thr Lys Cys Lys Asp Glu Cys Glu
740 745 750
Tyr Lys Lys Phe Ile Glu Ala Cys Gly Thr Ala Gly Gly Gly Ile
755 760 765
Thr Ala Gly Ser Pro Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys
770 775 780
Tyr Ser Lys His Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly
790 795 800
Lys Asn Cys Gly Thr Ser Ser Thr Thr Asn Ala Ala Ala Ser Thr
805 810 815
Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His
820 825 830
Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro Ser Ser Tyr Leu Ser Asn Val
835 840 845
Asp Asp Asn Ile Cys Gly Ala Asp Lys Ala Pro Trp Thr Thr Tyr
850 855 860
Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys Cys Asn Lys Glu Arg Asp Lys Ser
870 875 880
Ser Gln Ser Ser Asp Thr Leu Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro
885 890 895
Gly Asn Thr Pro Tyr Arg Tyr Lys Tyr Ala Cys Gln Cys Lys Ile
900 905 910
Thr Asn Glu Glu Thr Cys Asp Asp Arg Lys Glu Tyr Met Asn Gln
915 920 925
Ser Cys Gly Ser Ala Arg Thr Met Lys Arg Gly Tyr Lys Asn Asp
930 935 940
Tyr Glu Leu Cys Lys Tyr Asn Gly Val Asp Val Lys Pro Thr Thr
950 955 960
Arg Ser Asn Ser Ser Lys Leu Asp Pro Glu Gly Gly Ser Leu Ala
965 970 975
- 222 031876
Ala Leu Thr Ala His Gln Ala Cys His Leu Pro Leu Glu Thr Phe Thr
980 985 990
Arg His Arg Gln Pro Arg Gly Trp Glu Gln Leu Glu Gln Cys Gly Tyr
995 1000 1005
Pro Val Gln Arg Leu Val Ala 1015 Leu Tyr Leu Ala Ala 1020 Arg Leu Ser
1010
Trp Asn Gln Val Asp Gln Val Ile Arg Asn Ala Leu Ala Ser Pro
1025 1030 1035
Gly Ser Gly Gly Asp Leu Gly Glu Ala Ile Arg Glu Gln Pro Glu
1040 1045 1050
Gln Ala Arg Leu Ala Leu Thr Leu Ala Ala Ala Glu Ser Glu Arg
1055 1060 1065
Phe Val Arg Gln Gly Thr Gly Asn Asp Glu Ala Gly Ala Ala Asn
1070 1075 1080
Gly Pro Ala Asp Ser Gly Asp Ala Leu Leu Glu Arg Asn Tyr Pro
1085 1090 1095
Thr Gly Ala Glu Phe Leu Gly Asp Gly Gly Asp Ile Ser Phe Ser
1100 1105 1110
Thr Arg Gly Thr Gln Asn Trp Thr Val Glu Arg Leu Leu Gln Ala
1115 1120 1125
His Arg Gln Leu Glu Glu Arg Gly Tyr Val Phe Val Gly Tyr His
1130 1135 1140
Gly Thr Phe Leu Glu Ala Ala Gln Ser Ile Val Phe Gly Gly Val
1145 1150 1155
Arg Ala Arg Ser Gln Asp Leu Asp Ala Ile Trp Arg Gly Phe Tyr
1160 1165 1170
Ile Ala Gly Asp Pro Ala Leu Ala Tyr Gly Tyr Ala Gln Asp Gln
1175 1180 1185
Glu Pro Asp Ala Arg Gly Arg Ile Arg Asn Gly Ala Leu Leu Arg
1190 1195 1200
Val Tyr Val Pro Arg Ser Ser Leu Pro Gly Phe Tyr Arg Thr Ser
1205 1210 1215
- 223 031876
Leu
Thr
1220
Leu
Ala
Ala
Pro
Glu
1225
Ala
Ala
Gly
Glu
Val
1230
Glu
Arg
Leu
Ile
Gly
1235
His
Pro
Leu
Pro
Leu
1240
Arg
Leu
Asp
Ala
Ile
1245
Thr
Gly
Pro
Glu
Glu
1250
Glu
Gly
Gly
Arg
Leu
1255
Glu
Thr
Ile
Leu
Gly
1260
Trp
Pro
Leu
Ala
Glu
1265
Arg
Thr
Val
Val
Ile
1270
Pro
Ser
Ala
Ile
Pro
1275
Thr
Asp
Pro
Arg
Asn
1280
Val
Gly
Gly
Asp
Leu
1285
Asp
Pro
Ser
Ser
Ile
1290
Pro
Asp
Lys
Glu
Gln
1295
Ala
Ile
Ser
Ala
Leu
1300
Pro
Asp
Tyr
Ala
Ser
1305
Gln
Pro
Gly
Lys Pro Pro Arg Lys Asp Glu Leu
1310
1315 <210> 68 <211> 964 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400>68
Leu Ser Phe Ile Leu Asn Ser Ser
Asp Ala Asn Asn Pro Ser Glu Lys
1015
Ile Gln Lys Asn Asn Asp Glu Val
Cys Asn Cys Asn Glu Ser Gly Ile
30
Ala Ser Val Glu Gln Glu Gln Ile
40
Ser Asp Pro Ser Ser Asn Lys Thr 45
Cys Ile Thr His Ser Ser Ile Lys
55
Ala Asn Lys Lys Lys Val Cys Lys
His Val Lys Leu Gly Val Arg Glu
70
Asn Asp Lys Asp Leu Arg Val Cys
80
Val Ile Glu His Thr Ser Leu Ser 85
Gly Val Glu Asn Cys Cys Cys Gln
95
- 224 031876
Asp
Ser
Lys
Asp
145
Trp
Asn
Cys
Thr
Gly
225
Lys
Leu
Glu
Lys
Glu
305
Ala
Gly
Phe Leu Arg 100 Ile Leu Gln Glu Asn Cys 105 Ser Asp Asn Lys 110 Ser Gly
Ser Ser Asn Gly Ser Cys Asn Asn Lys Asn Gln Glu Ala Cys Glu
115 120 125
Asn Leu Glu Lys Val Leu Ala Ser Leu Thr Asn Cys Tyr Lys Cys
130 135 140
Lys Cys Lys Ser Glu Gln Ser Lys Lys Asn Asn Lys Asn Trp Ile
150 155 160
Lys Lys Ser Ser Gly Lys Glu Gly Gly Leu Gln Lys Glu Tyr Ala
165 170 175
Thr Ile Gly 180 Leu Pro Pro Arg Thr Gln 185 Ser Leu Cys Leu 190 Val Val
Leu Asp Glu Lys Gly Lys Lys Thr Gln Glu Leu Lys Asn Ile Arg
195 200 205
Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu
210 215 220
Lys Asn Leu Lys Pro Ser His Glu Lys Lys Asn Asp Asp Asn Gly
230 235 240
Lys Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp
245 250 255
Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu
260 265 270
Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe 280 Gly Lys Leu Phe Arg 285 Lys Tyr Ile
275
Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp
290 295 300
Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Leu
310 315 320
Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Ser Thr Thr Cys
325 330
Cys Gly Asp
335
Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile
340 345 350
- 225 031876
Asp Leu Ile 355 Pro Gln Tyr Leu Arg 360 Phe Leu Gln Glu Trp 365 Val Glu His
Phe Cys Lys Gln Arg Gln Glu Lys Val Lys Pro Val Ile Glu Asn Cys
370 375 380
Lys Ser Cys Lys Glu Ser Gly Gly Thr Cys Asn Gly Glu Cys Lys Thr
385 390 395 400
Glu Cys Lys Asn Lys Cys Glu Val Tyr Lys Lys Phe Ile Glu Asp Cys
405 410 415
Lys Gly Gly Asp Gly Thr Ala Gly Ser Ser Trp Val Lys Arg Trp Asp
420 425 430
Gln Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys Tyr Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn
435 440 445
Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Pro Ser Ser Thr Thr Asn Ala
450 455 460
Ala Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His
465 470 475 480
Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro Ser Ser Tyr Leu Ser Ile Val
485 490 495
Leu Asp Asp Asn Ile Cys Gly Ala Asp Lys Ala Pro Trp Thr Thr Tyr
500 505 510
Thr Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys Cys Asn Lys Glu Thr Asp Lys Ser
515 520 525
Lys Leu Gln Gln Cys Asn Thr Ala Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro
530 535 540
Leu Gly Asn Thr Pro His Gly Tyr Lys Tyr Ala Cys Gln Cys Lys Ile
545 550 555 560
Pro Thr Asn Glu Glu Thr Cys Asp Asp Arg Lys Glu Tyr Met Asn Gln
565 570 575
Trp Ser Cys Gly Ser Ala Arg Thr Met Lys Arg Gly Tyr Lys Asn Asp
580 585 590
Asn Tyr Glu Leu Cys Lys Tyr Asn Gly Val Asp Val Lys Pro Thr Thr
- 226 031876
595 600
Val Arg 610 Ser Asn Ser Ser Lys 615 Leu Asp
Ala 625 Leu Thr Ala His Gln 630 Ala Cys His
Arg His Arg Gln Pro 645 Arg Gly Trp Glu
Pro Val Gln Arg 660 Leu Val Ala Leu Tyr 665
Asn Gln Val 675 Asp Gln Val Ile Arg 680 Asn
Gly Gly 690 Asp Leu Gly Glu Ala 695 Ile Arg
Leu 705 Ala Leu Thr Leu Ala 710 Ala Ala Glu
Gly Thr Gly Asn Asp 725 Glu Ala Gly Ala
Gly Asp Ala Leu 740 Leu Glu Arg Asn Tyr 745
Gly Asp Gly 755 Gly Asp Ile Ser Phe 760 Ser
Thr Val 770 Glu Arg Leu Leu Gln 775 Ala His
Tyr 785 Val Phe Val Gly Tyr 790 His Gly Thr
Ile Val Phe Gly Gly 805 Val Arg Ala Arg
Trp Arg Gly Phe 820 Tyr Ile Ala Gly Asp 825
Ala Gln Asp 835 Gln Glu Pro Asp Ala 840 Arg
605
Glu Gly 620 Gly Ser Leu Ala
Pro 635 Leu Glu Thr Phe Thr 640
Leu Glu Gln Cys Gly 655 Tyr
Ala Ala Arg Leu 670 Ser Trp
Leu Ala Ser 685 Pro Gly Ser
Gln Pro 700 Glu Gln Ala Arg
Glu 715 Arg Phe Val Arg Gln 720
Asn Gly Pro Ala Asp 735 Ser
Thr Gly Ala Glu 750 Phe Leu
Arg Gly Thr 765 Gln Asn Trp
Gln Leu 780 Glu Glu Arg Gly
Leu 795 Glu Ala Ala Gln Ser 800
Gln Asp Leu Asp Ala 815 Ile
Ala Leu Ala Tyr 830 Gly Tyr
Arg Ile Arg Asn Gly Ala
845
- 227 031876
Leu Leu 850 Arg Val Tyr Val Pro 855 Arg Ser Ser Leu Pro 860 Gly Phe Tyr Arg
Thr Ser Leu Thr Leu Ala Ala Pro Glu Ala Ala Gly Glu Val Glu Arg
865 870 875 880
Leu Ile Gly His Pro Leu Pro Leu Arg Leu Asp Ala Ile Thr Gly Pro
885 890 895
Glu Glu Glu Gly Gly Arg Leu Glu Thr Ile Leu Gly Trp Pro Leu Ala
900 905 910
Glu Arg Thr Val Val Ile Pro Ser Ala Ile Pro Thr Asp Pro Arg Asn
915 920 925
Val Gly Gly Asp Leu Asp Pro Ser Ser Ile Pro Asp Lys Glu Gln Ala
930 935 940
Ile Ser Ala Leu Pro Asp Tyr Ala Ser Gln Pro Gly Lys Pro Pro Arg
945 950 955 960
Lys Asp Glu Leu <210> 69 <211> 848 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400>69
Leu Ser Phe Ile Leu Asn Ser Ser 15
Ile Gln Lys Asn Asn Asp Glu Val
Ala Ser Val Glu Gln Glu Gln Ile
3540
Cys Ile Thr His Ser Ser Ile Lys
5055
Asp Ala Asn Asn Pro Ser Glu Lys
15
Cys Asn Cys Asn Glu Ser Gly Ile
30
Ser Asp Pro Ser Ser Asn Lys Thr 45
Ala Asn Lys Lys Lys Val Cys Lys
His Val Lys Leu Gly Val Arg Glu Asn Asp Lys Asp Leu Arg Val
70 75
Cys
Val
Ile Glu His
Thr Ser Leu Ser Gly Val Glu Asn Cys
Cys
Cys Gln
- 228 031876
Asp
Ser
Lys
Asp
145
Trp
Asn
Cys
Thr
Gly
225
Lys
Leu
Glu
Lys
Glu
305
Ala
Phe Leu Arg 100 Ile Leu Gln Glu Asn 105 Cys Ser Asp Asn Lys 110 Ser Gly
Ser Ser Asn Gly Ser Cys Asn Asn Lys Asn Gln Glu Ala Cys Glu
115 120 125
Asn Leu Glu Lys Val Leu Ala Ser Leu Thr Asn Cys Tyr Lys Cys
130 135 140
Lys Cys Lys Ser Glu 150 Gln Ser Lys Lys Asn 155 Asn Lys Asn Trp Ile 160
Lys Lys Ser Ser Gly Lys Glu Gly Gly Leu Gln Lys Glu Tyr Ala
165 170 175
Thr Ile Gly 180 Leu Pro Pro Arg Thr Gln 185 Ser Leu Cys Leu 190 Val Val
Leu Asp Glu Lys Gly Lys Lys Thr Gln Glu Leu Lys Asn Ile Arg
195 200 205
Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu
210 215 220
Lys Asn Leu Lys Pro Ser His Glu Lys Lys Asn Asp Asp Asn Gly
230 235 240
Lys Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp
245 250 255
Ile Lys Gly Thr Ser Ile Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu
260 265 270
Leu Asn Leu Gln Lys Ile Phe 280 Gly Lys Leu Phe Arg 285 Lys Tyr Ile
275
Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp
290 295 300
Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Leu
310 315 320
Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Ser Thr Thr Cys
325 330
Cys Gly Asp
335
- 229 031876
Gly Ser Val Thr 340 Gly Ser Gly Ser Ser 345
Asp Leu Ile 355 Pro Gln Tyr Leu Arg 360 Phe
Phe Cys 370 Lys Gln Arg Gln Glu 375 Lys Val
Lys 385 Ser Cys Lys Glu Ser 390 Gly Gly Thr
Glu Cys Lys Asn Lys 405 Cys Glu Val Tyr
Lys Gly Gly Asp 420 Gly Thr Ala Gly Ser 425
Gln Ile Tyr 435 Lys Arg Tyr Ser Lys 440 Tyr
Arg Lys 450 Ala Gly Thr Lys Asn 455 Cys Gly
Ala 465 Glu Asn Lys Cys Val 470 Gln Ser Asp
Leu Ile Asp Ile Gly 485 Leu Thr Thr Pro
Leu Asp Asp Asn 500 Ile Cys Gly Ala Asp 505
Thr Thr Tyr 515 Thr Thr Thr Glu Lys 520 Cys
Lys Leu 530 Gln Gln Cys Asn Thr 535 Ala Val
Leu 545 Gly Asn Thr Pro His 550 Gly Tyr Lys
Pro Thr Asn Glu Glu 565 Thr Cys Asp Asp
Trp Ser Cys Gly 580 Ser Ala Arg Thr Met 585
Asp Asp Ile Pro 350 Thr Ile
Gln Glu Trp 365 Val Glu His
Pro Val 380 Ile Glu Asn Cys
Asn 395 Gly Glu Cys Lys Thr 400
Lys Phe Ile Glu Asp 415 Cys
Trp Val Lys Arg 430 Trp Asp
Glu Asp Ala 445 Lys Arg Asn
Ser Ser 460 Thr Thr Asn Ala
Asp 475 Ser Phe Phe Lys His 480
Ser Tyr Leu Ser Ile 495 Val
Ala Pro Trp Thr 510 Thr Tyr
Lys Glu Thr 525 Asp Lys Ser
Val Asn 540 Val Pro Ser Pro
Ala 555 Cys Gln Cys Lys Ile 560
Lys Glu Tyr Met Asn 575 Gln
Arg Gly Tyr Lys 590 Asn Asp
- 230 031876
Asn
Val
Trp
625
Asp
Leu
Gly
Gly
Tyr
705
Glu
Tyr
Leu
Pro
Gly
785
Val
Leu
Pro
Tyr Glu Leu Cys 595 Lys Tyr Asn Gly 600 Val Asp Val Lys 605 Pro Thr Thr
Arg Ser Asn Ser Ser Lys Leu Asp Arg His Arg Gln Pro Arg Gly
610 615 620
Glu Gln Leu Tyr Pro Thr Gly Ala Glu Phe Leu Gly Asp Gly Gly
630 635 640
Ile Ser Phe Ser Thr Arg Gly Thr Gln Asn Trp Thr Val Glu Arg
645 650 655
Leu Gln Ala His Arg Gln Leu Glu Glu Arg Gly Tyr Val Phe Val
660 665 670
Tyr His Gly Thr Phe Leu Glu Ala Ala Gln Ser Ile Val Phe Gly
675 680 685
Val Arg Ala Arg Ser Gln Asp Leu Asp Ala Ile Trp Arg Gly Phe
690 695 700
Ile Ala Gly Asp Pro Ala Leu Ala Tyr Gly Tyr Ala Gln Asp Gln
710 715 720
Pro Asp Ala Arg Gly Arg Ile Arg Asn Gly Ala Leu Leu Arg Val
725 730 735
Val Pro Arg 740 Ser Ser Leu Pro Gly 745 Phe Tyr Arg Thr Ser 750 Leu Thr
Ala Ala Pro Glu Ala Ala Gly Glu Val Glu Arg Leu Ile Gly His
755 760 765
Leu Pro Leu Arg Leu Asp Ala Ile Thr Gly Pro Glu Glu Glu Gly
770 775 780
Arg Leu Glu Thr Ile Leu Gly Trp Pro Leu Ala Glu Arg Thr Val
790 795 800
Ile Pro Ser Ala Ile Pro Thr Asp Pro Arg Asn Val Gly Gly Asp
805 810 815
Asp Pro Ser Ser Ile Pro Asp Lys Glu Gln Ala Ile Ser Ala Leu
820 825 830
Asp Tyr Ala Ser Gln Pro Gly Lys
835 840
Pro Pro Arg Lys Asp Glu Leu
845
- 231 031876 <210> 70 <211> 808 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 70
Asn 1 Tyr Ile Lys Gly 5 Asp Pro Tyr Phe Ala 10 Glu Tyr Ala Thr Lys 15 Leu
Ser Phe Ile Leu Asn Pro Ser Asp Ala Asn Asn Pro Ser Gly Glu Thr
20 25 30
Ala Asn His Asn Asp Glu Ala Cys Asn Cys Asn Glu Ser Gly Ile Ser
35 40 45
Ser Val Gly Gln Ala Gln Thr Ser Gly Pro Ser Ser Asn Lys Thr Cys
50 55 60
Ile Thr His Ser Ser Ile Lys Thr Asn Lys Lys Lys Glu Cys Lys Asp
65 70 75 80
Val Lys Leu Gly Val Arg Glu Asn Asp Lys Asp Leu Lys Ile Cys Val
85 90 95
Ile Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln Asp
100 105 110
Leu Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Arg Gly Ser
115 120 125
Ser Ser Asn Asp Ser Cys Asp Asn Lys Asn Gln Asp Glu Cys Gln Lys
130 135 140
Lys 145 Leu Glu Lys Val Phe Ala 150 Ser Leu Thr Asn Gly 155 Tyr Lys Cys Asp 160
Lys Cys Lys Ser Gly Thr Ser Arg Ser Lys Lys Lys Trp Ile Trp Lys
165 170 175
Lys Ser Ser Gly Asn Glu Glu Gly Leu Gln Glu Glu Tyr Ala Asn Thr
180 185 190
Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu Gly Asn Leu Pro
195 200 205
- 232 031876
Lys Leu 210 Glu Asn Val Cys Glu 215 Asp Val
Lys 225 Glu Lys Phe Leu Ala 230 Gly Cys Leu
Lys Asn Leu Lys Lys 245 Arg Tyr Pro Gln
Glu Asn Leu Cys 260 Lys Ala Leu Glu Tyr 265
Leu Ile Lys 275 Gly Thr Ser Ile Trp 280 Asp
Glu Leu 290 Asn Leu Gln Asn Asn 295 Phe Gly
Lys 305 Lys Asn Asn Thr Ala 310 Glu Gln Asp
Glu Leu Arg Glu Ser 325 Trp Trp Asn Thr
Ala Met Lys His 340 Gly Ala Glu Met Asn 345
Gly Ser Val 355 Thr Gly Ser Gly Ser 360 Ser
Asp Leu 370 Ile Pro Gln Tyr Leu 375 Arg Phe
Phe 385 Cys Glu Gln Arg Gln 390 Ala Lys Val
Lys Ser Cys Lys Glu 405 Ser Gly Asn Lys
Lys Cys Lys Asp 420 Glu Cys Glu Lys Tyr 425
Gly Thr Ala 435 Gly Gly Gly Ile Gly 440 Thr
Arg Trp 450 Asp Gln Ile Tyr Lys 455 Arg Tyr
Asp Ile 220 Asn Phe Asp Thr
Val 235 Ser Phe His Glu Gly 240
Lys Asn Ser Gly Asn 255 Lys
Phe Ala Asp Tyr 270 Gly Asp
Glu Tyr Thr 285 Lys Asp Leu
Leu Phe 300 Gly Lys Tyr Ile
Ser 315 Tyr Ser Ser Leu Asp 320
Lys Lys Tyr Ile Trp 335 Thr
Thr Thr Cys Asn 350 Ala Asp
Asp Asp Ile 365 Pro Thr Ile
Gln Glu 380 Trp Val Glu Asn
Asp 395 Val Ile Thr Asn Cys 400
Lys Thr Glu Cys Lys 415 Thr
Lys Phe Ile Glu 430 Ala Cys
Gly Ser Pro 445 Trp Ser Lys
Lys His 460 Ile Glu Asp Ala
- 233 031876
Lys
465
Thr
Ile
Ser
Lys
Asn
545
Val
Tyr
Ala
Thr
Glu
625
Ala
Leu
Ala
Arg
Gly
Arg Asn Arg Lys Ala 470 Gly Thr Lys Asn Cys 475 Gly Thr Ser Ser Thr 480
Asn Ala Ala Ala Ser Thr Asp Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser Asp
485 490 495
Asp Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro
500 505 510
Ser Tyr Leu Ser Asn Val Leu Asp Asp Asn Ile Cys Gly Ala Asp
515 520 525
Ala Pro Trp Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys Cys
530 535 540
Lys Glu Arg Asp Lys Ser Lys Ser Gln Ser Ser Asp Thr Leu Val
550 555 560
Val Asn Val Pro Ser Pro Leu Gly Asn Thr Pro Tyr Arg Tyr Lys
565 570 575
Arg His Arg Gln Pro Arg Gly Trp Glu Gln Leu Tyr Pro Thr Gly
580 585 590
Glu Phe Leu Gly Asp Gly Gly Asp Ile Ser Phe Ser Thr Arg Gly
595 600 605
Gln Asn Trp Thr Val Glu Arg Leu Leu Gln Ala His Arg Gln Leu
610 615 620
Glu Arg Gly Tyr Val Phe Val Gly Tyr His Gly Thr Phe Leu Glu
630 635 640
Ala Gln Ser Ile Val Phe Gly Gly Val Arg Ala Arg Ser Gln Asp
645 650 655
Asp Ala Ile Trp Arg Gly Phe Tyr Ile Ala Gly Asp Pro Ala Leu
660 665 670
Tyr Gly Tyr Ala Gln Asp Gln Glu Pro Asp Ala Arg Gly Arg Ile
675 680 685
Asn Gly Ala Leu Leu Arg Val Tyr Val Pro Arg Ser Ser Leu Pro
690 695 700
Phe Tyr Arg Thr Ser Leu Thr Leu Ala Ala Pro Glu Ala Ala Gly
- 234 031876
705
710
715
720
Glu Val Glu Arg Leu 725 Ile Gly His Pro Leu 730 Pro Leu Arg Leu Asp 735 Ala
Ile Thr Gly Pro Glu Glu Glu Gly Gly Arg Leu Glu Thr Ile Leu Gly
740 745 750
Trp Pro Leu Ala Glu Arg Thr Val Val Ile Pro Ser Ala Ile Pro Thr
755 760 765
Asp Pro Arg Asn Val Gly Gly Asp Leu Asp Pro Ser Ser Ile Pro Asp
770 775 780
Lys Glu Gln Ala Ile Ser Ala Leu Pro Asp Tyr Ala Ser Gln Pro Gly
785 790 795 800
Lys Pro Pro Arg Lys Asp Glu Leu
805
<210> 71
<211> 393
<212> Белок
<213> Искусственная
<220>
<223> Искусственная конструкция
<400> 71
Met Gly Ala Asp Asp Val Val Asp Ser Ser Lys Ser Phe Val Met Glu
1 5 10 15
Asn Phe Ser Ser Tyr His Gly Thr Lys Pro Gly Tyr Val Asp Ser Ile
20 25 30
Gln Lys Gly Ile Gln Lys Pro Lys Ser Gly Thr Gln Gly Asn Tyr Asp
35 40 45
Asp Asp Trp Lys Gly Phe Tyr Ser Thr Asp Asn Lys Tyr Asp Ala Ala
50 55 60
Gly Tyr Ser Val Asp Asn Glu Asn Pro Leu Ser Gly Lys Ala Gly Gly
65 70 75 80
Val Val Lys Val Thr Tyr Pro Gly Leu Thr Lys Val Leu Ala Leu Lys
85 90 95
Val Asp Asn Ala Glu Thr Ile Lys Lys Glu Leu Gly Leu Ser Leu Thr
100 105 110
- 235 031876
Glu
Gly
Ser
145
Ser
Asp
Arg
Val
Gly
225
Glu
Glu
Val
Val
Leu
305
Ala
Ser
Asp
Pro Leu Met 115 Glu Gln Val Gly 120 Thr Glu Glu Phe Ile 125 Lys Arg Phe
Asp Gly Ala Ser Arg Val Val Leu Ser Leu Pro Phe Ala Glu Gly
130 135 140
Ser Ser Val Glu Tyr Ile Asn Asn Trp Glu Gln Ala Lys Ala Leu
150 155 160
Val Glu Leu Glu Ile Asn Phe Glu Thr Arg Gly Lys Arg Gly Gln
165 170 175
Ala Met Tyr Glu Tyr Met Ala Gln Ala Cys Ala Gly Asn Arg Val
180 185 190
Arg Ser Val Gly Ser Ser Leu Ser Cys Ile Asn Leu Asp Trp Asp
195 200 205
Ile Arg Asp Lys Thr Lys Thr Lys Ile Glu Ser Leu Lys Glu His
210 215 220
Pro Ile Lys Asn Lys Met Ser Glu Ser Pro Asn Lys Thr Val Ser
230 235 240
Glu Lys Ala Lys Gln Tyr Leu Glu Glu Phe His Gln Thr Ala Leu
245 250 255
His Pro Glu Leu Ser Glu Leu Lys Thr Val Thr Gly Thr Asn Pro
260 265 270
Phe Ala Gly Ala Asn Tyr Ala Ala Trp Ala Val Asn Val Ala Gln
275 280 285
Ile Asp Ser Glu Thr Ala Asp Asn Leu Glu Lys Thr Thr Ala Ala
290 295 300
Ser Ile Leu Pro Gly Ile Gly Ser Val Met Gly Ile Ala Asp Gly
310 315 320
Val His His Asn Thr Glu Glu Ile Val Ala Gln Ser Ile Ala Leu
325 330 335
Ser Leu Met Val Ala Gln Ala Ile Pro Leu Val Gly Glu Leu Val
340 345 350
Ile Gly Phe Ala Ala Tyr Asn Phe Val Glu Ser Ile Ile Asn Leu
- 236 031876
355
360
365
Phe Gln Val Val
370
His Asn Ser Tyr Asn Arg Pro Ala Tyr Ser
375380
Pro Gly
His Lys Thr Gln Pro Met His Glu Phe
385390 <210>72 <211>1356 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400>72
Met Gly Ala Asp Asp Val Val Asp 15
Asn Phe Ser Ser Tyr His Gly Thr
Gln Lys Gly Ile Gln Lys Pro Lys
3540
Asp Asp Trp Lys Gly Phe Tyr Ser
5055
Ser Ser Lys Ser Phe Val Met Glu
15
Lys Pro Gly Tyr Val Asp Ser Ile
30
Ser Gly Thr Gln Gly Asn Tyr Asp 45
Thr Asp Asn Lys Tyr Asp Ala Ala
Gly Tyr 65 Ser Val Asp Asn 70 Glu Asn Pro Leu Ser 75 Gly Lys Ala Gly Gly 80
Val Val Lys Val Thr Tyr Pro Gly Leu Thr Lys Val Leu Ala Leu Lys
85 90 95
Val Asp Asn Ala Glu Thr Ile Lys Lys Glu Leu Gly Leu Ser Leu Thr
100 105 110
Glu Pro Leu Met Glu Gln Val Gly Thr Glu Glu Phe Ile Lys Arg Phe
115 120 125
Gly Asp Gly Ala Ser Arg Val Val Leu Ser Leu Pro Phe Ala Glu Gly
130 135 140
Ser Ser Ser Val Glu Tyr Ile Asn Asn Trp Glu Gln Ala Lys Ala Leu
145 150 155 160
Ser Val Glu Leu Glu Ile Asn Phe Glu Thr Arg Gly Lys Arg Gly Gln
165 170 175
- 237 031876
Asp
Arg
Val
Gly
225
Glu
Glu
Val
Val
Leu
305
Ala
Ser
Asp
Phe
His
385
Asp
Lys
Ala Met Tyr 180 Glu Tyr Met Ala Gln 185 Ala Cys Ala Gly Asn 190 Arg Val
Arg Ser Val Gly Ser Ser Leu Ser Cys Ile Asn Leu Asp Trp Asp
195 200 205
Ile Arg Asp Lys Thr Lys Thr Lys Ile Glu Ser Leu Lys Glu His
210 215 220
Pro Ile Lys Asn Lys Met Ser Glu Ser Pro Asn Lys Thr Val Ser
230 235 240
Glu Lys Ala Lys Gln Tyr Leu Glu Glu Phe His Gln Thr Ala Leu
245 250 255
His Pro Glu Leu Ser Glu Leu Lys Thr Val Thr Gly Thr Asn Pro
260 265 270
Phe Ala Gly Ala Asn Tyr Ala Ala Trp Ala Val Asn Val Ala Gln
275 280 285
Ile Asp Ser Glu Thr Ala Asp Asn Leu Glu Lys Thr Thr Ala Ala
290 295 300
Ser Ile Leu Pro Gly Ile Gly Ser Val Met Gly Ile Ala Asp Gly
310 315 320
Val His His Asn Thr Glu Glu Ile Val Ala Gln Ser Ile Ala Leu
325 330 335
Ser Leu Met Val Ala Gln Ala Ile Pro Leu Val Gly Glu Leu Val
340 345 350
Ile Gly Phe Ala Ala Tyr Asn Phe Val Glu Ser Ile Ile Asn Leu
355 360 365
Gln Val Val His Asn Ser Tyr Asn Arg Pro Ala Tyr Ser Pro Gly
370 375 380
Lys Thr Gln Pro Met His Glu Phe His Ser Asp Ser Gly Thr Asn
390 395 400
Pro Cys Asp Arg Ile Pro Pro Pro Tyr Gly Asp Asn Asp Gln Trp
405 410 415
Cys Ala Ile Ile Leu Ser Lys Val Ser Glu Lys Pro Glu Asn Val
- 238 031876
420
425
430
Phe Val Pro 435 Pro Arg Arg Gln Arg 440 Met Cys Ile Asn Asn 445 Leu Glu
Leu Asn Val Asp Lys Ile Arg Asp Lys His Ala Phe Leu Ala Asp
450 455 460
Leu Leu Thr Ala Arg Asn Glu Gly Glu Arg Ile Val Gln Asn His
465 470 475
Asp Thr Asn Ser Ser 485 Asn Val Cys Asn Ala 490 Leu Glu Arg Ser Phe 495
Asp Ile Ala Asp Ile Ile Arg Gly Thr Asp Leu Trp Lys Gly Thr
500 505 510
Ser Asn Leu Glu Gln Asn Leu Lys Gln Met Phe Ala Lys Ile Arg
515 520 525
Asn Asp Lys Val Leu Gln Asp Lys Tyr Pro Lys Asp Gln Asn Tyr
530 535 540
Lys Leu Arg Glu Asp Trp Trp Asn Ala Asn Arg Gln Lys Val Trp
545 550 555
Val Ile Thr Cys Gly 565 Ala Arg Ser Asn Asp 570 Leu Leu Ile Lys Arg 575
Trp Arg Thr Ser Gly Lys Ser Asn Gly Asp Asn Lys Leu Glu Leu
580 585 590
Arg Lys Cys Gly His Tyr Glu Glu Lys Val Pro Thr Lys Leu Asp
595 600 605
Val Pro Gln Phe Leu Arg Trp Leu Thr Glu Trp Ile Glu Asp Phe
610 615 620
Arg Glu Lys Gln Asn Leu Ile Asp Asp Met Glu Arg His Arg Glu
625 630 635
Cys Thr Ser Glu Asp His Lys Ser Lys Glu Gly Thr Ser Tyr Cys
645 650 655
Thr Cys Lys Asp Lys Cys Lys Lys Tyr Cys Glu Cys Val Lys Lys
660 665 670
Lys
Val
Pro
480
Ala
Asn
Glu
Arg
Glu
560
Gly
Cys
Tyr
Tyr
Glu
640
Ser
Trp
- 239 031876
Lys Ser Glu 675 Trp Glu Asn Gln Lys 680 Asn Lys Tyr Thr Glu 685 Leu Tyr
Gln Asn Lys Asn Glu Thr Ser Gln Lys Asn Thr Ser Arg Tyr Asp
690 695 700
Tyr Val Lys Asp Phe Phe Lys Lys Leu Glu Ala Asn Tyr Ser Ser
705 710 715
Glu Asn Tyr Ile Lys Gly Asp Pro Tyr Phe Ala Glu Tyr Ala Thr
725 730 735
Leu Ser Phe Ile Leu Asn Ser Ser Asp Ala Asn Asn Pro Ser Glu
740 745 750
Ile Gln Lys Asn Asn Asp Glu Val Cys Asn Cys Asn Glu Ser Gly
755 760 765
Ala Ser 770 Val Glu Gln Glu Gln 775 Ile Ser Asp Pro Ser 780 Ser Asn Lys
Cys Ile Thr His Ser Ser Ile Lys Ala Asn Lys Lys Lys Val Cys
785 790 795
His Val Lys Leu Gly 805 Val Arg Glu Asn Asp 810 Lys Asp Leu Arg Val 815
Val Ile Glu His Thr Ser Leu Ser Gly Val Glu Asn Cys Cys Cys
820 825 830
Asp Phe Leu Arg Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Ser
835 840 845
Ser Ser Ser Asn Gly Ser Cys Asn Asn Lys Asn Gln Glu Ala Cys
850 855 860
Lys Asn Leu Glu Lys Val Leu Ala Ser Leu Thr Asn Cys Tyr Lys
865 870 875
Asp Lys Cys Lys Ser Glu Gln Ser Lys Lys Asn Asn Lys Asn Trp
885 890 895
Trp Lys Lys Ser Ser Gly Lys Glu Gly Gly Leu Gln Lys Glu Tyr
900 905 910
Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Cys Leu Val
915 920 925
Gln
Asp
Leu
720
Lys
Lys
Ile
Thr
Lys
800
Cys
Gln
Gly
Glu
Cys
880
Ile
Ala
Val
- 240 031876
Cys Leu Asp Glu 930 Lys Gly Lys 935 Lys Thr Gln Glu Leu 940 Lys Asn Ile Arg
Thr Asn Ser Glu Leu Leu Lys Glu Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu
945 950 955 960
Gly Lys Asn Leu Lys Pro Ser His Glu Lys Lys Asn Asp Asp Asn Gly
965 970 975
Lys Lys Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp
980 985 990
Leu Ile Lys Gly Thr Ser Ile
995
Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu 1000 1005
Glu Leu 1010 Asn Leu Gln Lys Ile 1015 Phe Gly Lys Leu Phe 1020 Arg Lys Tyr
Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser Ser
1025 1030 1035
Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys Tyr
1040 1045 1050
Ile Trp Leu Ala Met Lys His Gly Ala Gly Met Asn Ser Thr Thr
1055 1060 1065
Cys Cys Gly Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys Asp
1070 1075 1080
Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe Leu
1085 1090 1095
Gln Glu Trp Val Glu His Phe Cys Lys Gln Arg Gln Glu Lys Val
1100 1105 1110
Lys Pro Val Ile Glu Asn Cys Lys Ser Cys Lys Glu Ser Gly Gly
1115 1120 1125
Thr Cys Asn Gly Glu Cys Lys Thr Glu Cys Lys Asn Lys Cys Glu
1130 1135 1140
Val Tyr Lys Lys Phe Ile Glu Asp Cys Lys Gly Gly Asp Gly Thr
1145 1150 1155
Ala Gly Ser Ser Trp Val Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys Arg
1160 1165 1170
- 241 031876
Tyr Ser 1175 Lys Tyr Ile Glu Asp 1180 Ala Lys Arg Asn Arg 1185 Lys Ala Gly
Thr Lys Asn Cys Gly Pro Ser Ser Thr Thr Asn Ala Ala Glu Asn
1190 1195 1200
Lys Cys Val Gln Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His Leu Ile
1205 1210 1215
Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro Ser Ser Tyr Leu Ser Ile Val Leu
1220 1225 1230
Asp Asp Asn Ile Cys Gly Ala Asp Lys Ala Pro Trp Thr Thr Tyr
1235 1240 1245
Thr Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys Cys Asn Lys Glu Thr Asp Lys
1250 1255 1260
Ser Lys Leu Gln Gln Cys Asn Thr Ala Val Val Val Asn Val Pro
1265 1270 1275
Ser Pro Leu Gly Asn Thr Pro His Gly Tyr Lys Tyr Ala Cys Gln
1280 1285 1290
Cys Lys Ile Pro Thr Asn Glu Glu Thr Cys Asp Asp Arg Lys Glu
1295 1300 1305
Tyr Met Asn Gln Trp Ser Cys Gly Ser Ala Arg Thr Met Lys Arg
1310 1315 1320
Gly Tyr Lys Asn Asp Asn Tyr Glu Leu Cys Lys Tyr Asn Gly Val
1325 1330 1335
Asp Val Lys Pro Thr Thr Val Arg Ser Asn Ser Ser Lys Leu Asp
1340 1345 1350
Ser Gly Arg
1355
<210> 73
<211> 1364
<212> Белок
<213> Искусственная
<220>
<223> Искусственная конструкция
<400> 73
- 242 031876
Met 1 Gly Ala Asp Asp 5 Val Val Asp Ser Ser 10 Lys Ser Phe Val Met 15 Glu
Asn Phe Ser Ser 20 Tyr His Gly Thr Lys 25 Pro Gly Tyr Val Asp 30 Ser Ile
Gln Lys Gly 35 Ile Gln Lys Pro Lys 40 Ser Gly Thr Gln Gly 45 Asn Tyr Asp
Asp Asp 50 Trp Lys Gly Phe Tyr 55 Ser Thr Asp Asn Lys 60 Tyr Asp Ala Ala
Gly 65 Tyr Ser Val Asp Asn 70 Glu Asn Pro Leu Ser 75 Gly Lys Ala Gly Gly 80
Val Val Lys Val Thr Tyr Pro Gly Leu Thr Lys Val Leu Ala Leu Lys
85 90 95
Val Asp Asn Ala Glu Thr Ile Lys Lys Glu Leu Gly Leu Ser Leu Thr
100 105 110
Glu Pro Leu Met Glu Gln Val Gly Thr Glu Glu Phe Ile Lys Arg Phe
115 120 125
Gly Asp Gly Ala Ser Arg Val Val Leu Ser Leu Pro Phe Ala Glu Gly
130 135 140
Ser Ser Ser Val Glu Tyr Ile Asn Asn Trp Glu Gln Ala Lys Ala Leu
145 150 155 160
Ser Val Glu Leu Glu Ile Asn Phe Glu Thr Arg Gly Lys Arg Gly Gln
165 170 175
Asp Ala Met Tyr 180 Glu Tyr Met Ala Gln 185 Ala Cys Ala Gly Asn 190 Arg Val
Arg Arg Ser Val Gly Ser Ser Leu Ser Cys Ile Asn Leu Asp Trp Asp
195 200 205
Val Ile Arg Asp Lys Thr Lys Thr Lys Ile Glu Ser Leu Lys Glu His
210 215 220
Gly Pro Ile Lys Asn Lys Met Ser Glu Ser Pro Asn Lys Thr Val Ser
225 230 235 240
Glu Glu Lys Ala Lys Gln Tyr Leu Glu Glu Phe His Gln Thr Ala Leu
245 250 255
- 243 031876
Glu
Val
Val
Leu
305
Ala
Ser
Asp
Phe
His
385
Asp
Lys
Cys
Leu
Leu
465
Asp
Asp
His Pro Glu 260 Leu Ser Glu Leu Lys 265 Thr Val Thr Gly Thr 270 Asn Pro
Phe Ala Gly Ala Asn Tyr Ala Ala Trp Ala Val Asn Val Ala Gln
275 280 285
Ile Asp Ser Glu Thr Ala Asp Asn Leu Glu Lys Thr Thr Ala Ala
290 295 300
Ser Ile Leu Pro Gly Ile Gly Ser Val Met Gly Ile Ala Asp Gly
310 315 320
Val His His Asn Thr Glu Glu Ile Val Ala Gln Ser Ile Ala Leu
325 330 335
Ser Leu Met Val Ala Gln Ala Ile Pro Leu Val Gly Glu Leu Val
340 345 350
Ile Gly Phe Ala Ala Tyr Asn Phe Val Glu Ser Ile Ile Asn Leu
355 360 365
Gln Val Val His Asn Ser Tyr Asn Arg Pro Ala Tyr Ser Pro Gly
370 375 380
Lys Thr Gln Pro Met His Glu Phe His Ser Asp Ser Gly Lys Tyr
390 395 400
Pro Cys Glu Lys Lys Leu Pro Pro Tyr Asp Asp Asn Asp Gln Trp
405 410 415
Cys Gln Gln Asn Ser Ser Asp Gly Ser Gly Lys Pro Glu Asn Ile
420 425 430
Val Pro Pro Arg Arg Glu Arg Leu Cys Thr Tyr Asn Leu Glu Asn
435 440 445
Lys Phe Asp Lys Ile Arg Asp Asn Asn Ala Phe Leu Ala Asp Val
450 455 460
Leu Thr Ala Arg Asn Glu Gly Glu Lys Ile Val Gln Asn His Pro
470 475 480
Thr Asn Ser Ser Asn Val Cys Asn Ala Leu Glu Arg Ser Phe Ala
485 490 495
Leu Ala Asp Ile Ile Arg Gly Thr Asp Gln Trp Lys Gly Thr Asn
- 244 031876
500
505
510
Ser
Asn
Lys
545
Val
Trp
Arg
Val
Arg
625
Cys
Thr
Lys
Gln
Tyr
705
Glu
Leu
Asn Leu Glu Lys Asn Leu Lys 520 Gln Met Phe Ala Lys 525 Ile Arg Glu
515
Asp Lys Val Leu Gln Asp Lys Tyr Pro Lys Asp Gln Lys Tyr Thr
530 535 540
Leu Arg Glu Ala Trp Trp Asn Ala Asn Arg Gln Lys Val Trp Glu
550 555 560
Ile Thr Cys Gly 565 Ala Arg Ser Asn Asp 570 Leu Leu Ile Lys Arg 575 Gly
Arg Thr Ser Gly Lys Ser Asp Arg Lys Lys Asn Phe Glu Leu Cys
580 585 590
Lys Cys Gly His Tyr Glu Lys Glu Val Pro Thr Lys Leu Asp Tyr
595 600 605
Pro Gln Phe Leu Arg Trp Leu Thr Glu Trp Ile Glu Asp Phe Tyr
610 615 620
Glu Lys Gln Asn Leu Ile Asp Asp Met Glu Arg His Arg Glu Glu
630 635 640
Thr Arg Glu Asp 645 His Lys Ser Lys Glu Gly Thr 650 Ser Tyr Cys 655 Ser
Cys Lys Asp Lys Cys Lys Lys Tyr Cys Glu Cys Val Lys Lys Trp
660 665 670
Thr Glu Trp Glu Asn Gln Glu Asn Lys Tyr Lys Asp Leu Tyr Glu
675 680 685
Asn Lys 690 Asn Lys Thr Ser 695 Gln Lys Asn Thr Ser 700 Arg Tyr Asp Asp
Val Lys Asp Phe Phe Glu Lys Leu Glu Ala Asn Tyr Ser Ser Leu
710 715 720
Asn Tyr Ile Lys Gly Asp Pro Tyr Phe Ala Glu Tyr Ala Thr Lys
725 730 735
Ser Phe Ile Leu Asn Pro Ser Asp Ala Asn Asn Pro Ser Gly Glu
740 745 750
- 245 031876
Thr
Ser
Cys
785
Asp
Val
Asp
Ser
Lys
865
Asp
Lys
Thr
Pro
Thr
945
Gly
Lys
Asp
Ala Asn His Asn Asp Glu Ala 760 Cys Asn Cys Asn Glu 765 Ser Gly Ile
755
Ser Val Gly Gln Ala Gln Thr Ser Gly Pro Ser Ser Asn Lys Thr
770 775 780
Ile Thr His Ser Ser Ile Lys Thr Asn Lys Lys Lys Glu Cys Lys
790 795 800
Val Lys Leu Gly Val Arg Glu Asn Asp Lys Asp Leu Lys Ile Cys
805 810 815
Ile Glu Asp Thr Ser Leu Ser Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln
820 825 830
Leu Leu Gly Ile Leu Gln Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Arg Gly
835 840 845
Ser Ser Asn Asp Ser Cys Asp Asn Lys Asn Gln Asp Glu Cys Gln
850 855 860
Lys Leu Glu Lys Val Phe Ala Ser Leu Thr Asn Gly Tyr Lys Cys
870 875 880
Lys Cys Lys Ser Gly Thr Ser Arg Ser Lys Lys Lys Trp Ile Trp
885 890 895
Lys Ser Ser Gly Asn Glu Glu Gly Leu Gln Glu Glu Tyr Ala Asn
900 905 910
Ile Gly Leu Pro Pro Arg Thr Gln Ser Leu Tyr Leu Gly Asn Leu
915 920 925
Lys Leu Glu Asn Val Cys Glu Asp Val Lys Asp Ile Asn Phe Asp
930 935 940
Lys Glu Lys Phe Leu Ala Gly Cys Leu Ile Val Ser Phe His Glu
950 955 960
Lys Asn Leu Lys Lys Arg Tyr Pro Gln Asn Lys Asn Ser Gly Asn
965 970 975
Glu Asn Leu Cys Lys Ala Leu Glu Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly
980 985 990
Leu
Ile
995
Lys
Gly
Thr
Ser
Ile
1000
Trp Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp 1005
- 246 031876
Leu Glu 1010 Leu Asn Leu Gln Asn 1015 Asn Phe Gly Lys Leu 1020 Phe Gly Lys
Tyr Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala Glu Gln Asp Thr Ser Tyr Ser
1025 1030 1035
Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp Trp Asn Thr Asn Lys Lys
1040 1045 1050
Tyr Ile Trp Thr Ala Met Lys His Gly Ala Glu Met Asn Ile Thr
1055 1060 1065
Thr Cys Asn Ala Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser Gly Ser Ser Cys
1070 1075 1080
Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr Leu Arg Phe
1085 1090 1095
Leu Gln Glu Trp Val Glu Asn Phe Cys Glu Gln Arg Gln Ala Lys
1100 1105 1110
Val Lys 1115 Asp Val Ile Thr Asn 1120 Cys Lys Ser Cys Lys 1125 Glu Ser Gly
Asn Lys Cys Lys Thr Glu Cys Lys Thr Lys Cys Lys Asp Glu Cys
1130 1135 1140
Glu Lys Tyr Lys Lys Phe Ile Glu Ala Cys Gly Thr Ala Gly Gly
1145 1150 1155
Gly Ile Gly Thr Ala Gly Ser Pro Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln
1160 1165 1170
Ile Tyr Lys Arg Tyr Ser Lys His Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn
1175 1180 1185
Arg Lys Ala Gly Thr Lys Asn Cys Gly Thr Ser Ser Thr Thr Asn
1190 1195 1200
Ala Ala Ala Ser Thr Asp Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser Asp Ile
1205 1210 1215
Asp Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro
1220 1225 1230
Ser Ser Tyr Leu Ser Asn Val Leu Asp Asp Asn Ile Cys Gly Ala
1235 1240 1245
- 247 031876
Asp Lys 1250 Ala Pro Trp Thr Thr 1255 Tyr Thr Thr Tyr Thr 1260 Thr Thr Glu
Lys Cys Asn Lys Glu Arg Asp Lys Ser Lys Ser Gln Ser Ser Asp
1265 1270 1275
Thr Leu Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro Leu Gly Asn Thr Pro
1280 1285 1290
Tyr Arg Tyr Lys Tyr Ala Cys 1300 Gln Cys Lys Ile Pro 1305 Thr Asn Glu
1295
Glu Thr Cys Asp Asp Arg Lys Glu Tyr Met Asn Gln Trp Ser Cys
1310 1315 1320
Gly Ser Ala Arg Thr Met Lys Arg Gly Tyr Lys Asn Asp Asn Tyr
1325 1330 1335
Glu Leu
1340
Cys Lys Tyr Asn Gly Val Asp Val Lys 1345
Pro
1350
Thr Thr Val
Arg Ser Asn Ser Ser Lys
Leu Asp Ser Gly Arg
1355
1360 <210> 74 <211> 1013 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400>74
Met Gly Ala Asp Asp Val Val Asp
Ser Ser Lys Ser Phe Val Met Glu
1015
Asn Phe Ser Ser Tyr His Gly Thr
Lys Pro Gly Tyr Val Asp Ser Ile
30
Gln Lys Gly Ile Gln Lys Pro Lys
40
Ser Gly Thr Gln Gly Asn Tyr Asp 45
Asp Asp Trp Lys Gly Phe Tyr Ser
55
Thr Asp Asn Lys Tyr Asp Ala Ala
Gly Tyr Ser Val Asp Asn Glu Asn
70
Pro Leu Ser Gly Lys Ala Gly Gly
80
- 248 031876
Val Val Lys Val Thr 85 Tyr Pro Gly Leu Thr 90 Lys Val Leu Ala Leu 95 Lys
Val Asp Asn Ala Glu Thr Ile Lys Lys Glu Leu Gly Leu Ser Leu Thr
100 105 110
Glu Pro Leu Met Glu Gln Val Gly Thr Glu Glu Phe Ile Lys Arg Phe
115 120 125
Gly Asp Gly Ala Ser Arg Val Val Leu Ser Leu Pro Phe Ala Glu Gly
130 135 140
Ser Ser Ser Val Glu Tyr Ile Asn Asn Trp Glu Gln Ala Lys Ala Leu
145 150 155 160
Ser Val Glu Leu Glu Ile Asn Phe Glu Thr Arg Gly Lys Arg Gly Gln
165 170 175
Asp Ala Met Tyr Glu 180 Tyr Met Ala Gln 185 Ala Cys Ala Gly Asn 190 Arg Val
Arg Arg Ser Val Gly Ser Ser Leu Ser Cys Ile Asn Leu Asp Trp Asp
195 200 205
Val Ile Arg Asp Lys Thr Lys Thr Lys Ile Glu Ser Leu Lys Glu His
210 215 220
Gly Pro Ile Lys Asn Lys Met Ser Glu Ser Pro Asn Lys Thr Val Ser
225 230 235 240
Glu Glu Lys Ala Lys Gln Tyr Leu Glu Glu Phe His Gln Thr Ala Leu
245 250 255
Glu His Pro Glu Leu Ser Glu Leu Lys Thr Val Thr Gly Thr Asn Pro
260 265 270
Val Phe Ala Gly Ala Asn Tyr Ala Ala Trp Ala Val Asn Val Ala Gln
275 280 285
Val Ile Asp Ser Glu Thr Ala Asp Asn Leu Glu Lys Thr Thr Ala Ala
290 295 300
Leu Ser Ile Leu Pro Gly Ile Gly Ser Val Met Gly Ile Ala Asp Gly
305 310 315 320
Ala Val His His Asn Thr Glu Glu Ile Val Ala Gln Ser Ile Ala Leu
325 330 335
- 249 031876
Ser Ser Leu Met 340 Val Ala Gln Ala Ile 345 Pro Leu Val Gly Glu 350 Leu
Asp Ile Gly Phe Ala Ala Tyr Asn Phe Val Glu Ser Ile Ile Asn
355 360 365
Phe Gln Val Val His Asn Ser Tyr Asn Arg Pro Ala Tyr Ser Pro
370 375 380
His Lys Thr Gln Pro Met His Glu Phe Leu Ser Phe Ile Leu Asn
385 390 395
Ser Asp Ala Asn Asn Pro Ser Glu Lys Ile Gln Lys Asn Asn Asp
405 410 415
Val Cys Asn Cys Asn Glu Ser Gly Ile Ala Ser Val Glu Gln Glu
420 425 430
Ile Ser Asp Pro Ser Ser Asn Lys Thr Cys Ile Thr His Ser Ser
435 440 445
Lys Ala Asn Lys Lys Lys Val Cys Lys His Val Lys Leu Gly Val
450 455 460
Glu Asn Asp Lys Asp Leu Arg Val Cys Val Ile Glu His Thr Ser
465 470 475
Ser Gly Val Glu Asn Cys Cys Cys Gln Asp Phe Leu Arg Ile Leu
485 490 495
Glu Asn Cys Ser Asp Asn Lys Ser Gly Ser Ser Ser Asn Gly Ser
500 505 510
Asn Asn Lys Asn Gln Glu Ala Cys Glu Lys Asn Leu Glu Lys Val
515 520 525
Ala Ser Leu Thr Asn Cys Tyr Lys Cys Asp Lys Cys Lys Ser Glu
530 535 540
Ser Lys Lys Asn Asn Lys Asn Trp Ile Trp Lys Lys Ser Ser Gly
545 550 555
Glu Gly Gly Leu Gln Lys Glu Tyr Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro
565 570 575
Arg Thr Gln Ser Leu Cys Leu Val Val Cys Leu Asp Glu Lys Gly
Val
Leu
Gly
Ser
400
Glu
Gln
Ile
Arg
Leu
480
Gln
Cys
Leu
Gln
Lys
560
Pro
Lys
- 250 031876
580
585
590
Lys
Glu
His
625
Glu
Trp
Phe
Gln
Asn
705
Met
Ser
Arg
Lys
Gly
785
Val
Gly
Thr Gln Glu 595 Leu Lys Asn Ile Arg 600 Thr Asn Ser Glu 605 Leu Leu
Trp Ile Ile Ala Ala Phe His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Pro
610 615 620
Glu Lys Lys Asn Asp Asp Asn Gly Lys Lys Leu Cys Lys Ala
630 635
Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser
645 650 655
Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Lys
660 665 670
Gly Lys Leu Phe Arg Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala
675 680 685
Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp
690 695 700
Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Leu Ala Met Lys His Gly Ala
710 715
Asn Ser Thr Thr Cys Cys Gly Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser
725 730 735
Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr
740 745 750
Phe Leu Gln 755 Glu Trp Val Glu His 760 Phe Cys Lys Gln 765 Arg Gln
Val Lys Pro Val Ile Glu Asn Cys Lys Ser Cys Lys Glu Ser
770 775 780
Thr Cys Asn Gly Glu Cys Lys Thr Glu Cys Lys Asn Lys Cys
790 795
Tyr Lys Lys Phe Ile Glu Asp Cys Lys Gly Gly Asp Gly Thr
805 810 815
Ser Ser Trp Val Lys Arg Trp Asp Gln Ile 820 825
Tyr Lys Arg Tyr
830
Lys
Ser
Leu
640
Ile
Ile
Glu
Trp
Gly
720
Gly
Leu
Glu
Gly
Glu
800
Ala
Ser
- 251 031876
Lys Tyr Ile 835 Glu Asp Ala Lys Arg 840 Asn Arg Lys Ala Gly 845 Thr Lys Asn
Cys Gly Pro Ser Ser Thr Thr Asn Ala Ala Glu Asn Lys Cys Val Gln
850 855 860
Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His Leu Ile Asp Ile Gly Leu Thr
865 870 875 880
Thr Pro Ser Ser Tyr Leu Ser Ile Val Leu Asp Asp Asn Ile Cys Gly
885 890 895
Ala Asp Lys Ala Pro Trp Thr Thr Tyr Thr Thr Tyr Thr Thr Thr Glu
900 905 910
Lys Cys Asn Lys 915 Glu Thr Asp Lys 920 Ser Lys Leu Gln Gln 925 Cys Asn Thr
Ala Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro Leu Gly Asn Thr Pro His Gly
930 935 940
Tyr Lys Tyr Ala Cys Gln Cys Lys Ile Pro Thr Asn Glu Glu Thr Cys
945 950 955 960
Asp Asp Arg Lys Glu Tyr Met Asn Gln Trp Ser Cys Gly Ser Ala Arg
965 970 975
Thr Met Lys Arg Gly Tyr Lys Asn Asp Asn Tyr Glu Leu Cys Lys Tyr
980 985 990
Asn Gly Val Asp Val Lys
995
Pro Thr Thr Val Arg Ser Asn Ser Ser Lys
10001005
Leu Asp Ser Gly Arg
1010 <210>75 <211>1036 <212> Белок <213> Искусственная <220>
<223> Искусственная конструкция <400> 75
Met Gly Ala Asp Asp Val Val Asp Ser Ser Lys Ser Phe Val Met Glu
5 10 15
Asn Phe Ser Ser Tyr His Gly Thr Lys Pro Gly Tyr Val Asp Ser Ile
- 252 031876
Gln Lys Gly Ile Gln Lys Pro Lys Ser Gly Thr Gln Gly Asn Tyr
35 40 45
Asp Asp Trp Lys Gly Phe Tyr Ser Thr Asp Asn Lys Tyr Asp Ala
50 55 60
Gly Tyr 65 Ser Val Asp Asn Glu Asn 70 Pro Leu Ser 75 Gly Lys Ala Gly
Val Val Lys Val Thr Tyr Pro Gly Leu Thr Lys Val Leu Ala Leu
85 90 95
Val Asp Asn Ala Glu Thr Ile Lys Lys Glu Leu Gly Leu Ser Leu
100 105 110
Glu Pro Leu Met Glu Gln Val Gly Thr Glu Glu Phe Ile Lys Arg
115 120 125
Gly Asp Gly Ala Ser Arg Val Val Leu Ser Leu Pro Phe Ala Glu
130 135 140
Ser Ser Ser Val Glu Tyr Ile Asn Asn Trp Glu Gln Ala Lys Ala
145 150 155
Ser Val Glu Leu Glu Ile Asn Phe Glu Thr Arg Gly Lys Arg Gly
165 170 175
Asp Ala Met Tyr 180 Glu Tyr Met Ala Gln Ala 185 Cys Ala Gly Asn 190 Arg
Arg Arg Ser Val Gly Ser Ser Leu Ser Cys Ile Asn Leu Asp Trp
195 200 205
Val Ile Arg Asp Lys Thr Lys Thr Lys Ile Glu Ser Leu Lys Glu
210 215 220
Gly Pro Ile Lys Asn Lys Met Ser Glu Ser Pro Asn Lys Thr Val
225 230 235
Glu Glu Lys Ala Lys Gln Tyr Leu Glu Glu Phe His Gln Thr Ala
245 250 255
Glu His Pro Glu Leu Ser Glu Leu
260
Lys
265
Thr Val
Thr Gly Thr Asn
270
Asp
Ala
Gly
Lys
Thr
Phe
Gly
Leu
160
Gln
Val
Asp
His
Ser
240
Leu
Pro
- 253 031876
Val
Phe
Ala
275
Gly
Ala
Asn
Tyr
Ala
280
Ala
Trp
Ala
Val
Asn
285
Val
Ala
Val
Ile
290
Asp
Ser
Glu
Thr
Ala
295
Asp
Asn
Leu
Glu
Lys
300
Thr
Thr
Ala
Leu 305 Ser Ile Leu Pro Gly 310 Ile Gly Ser Val Met 315 Gly Ile Ala Asp
Ala Val His His Asn Thr Glu Glu Ile Val Ala Gln Ser Ile Ala
325 330 335
Ser Ser Leu Met Val Ala Gln Ala Ile Pro Leu Val Gly Glu Leu
340 345 350
Asp Ile Gly Phe Ala Ala Tyr Asn Phe Val Glu Ser Ile Ile Asn
355 360 365
Phe Gln Val Val His Asn Ser Tyr Asn Arg Pro Ala Tyr Ser Pro
370 375 380
His Lys Thr Gln Pro Met His Glu Phe Asn Tyr Ile Lys Gly Asp
385 390 395
Tyr Phe Ala Glu Tyr Ala Thr Lys Leu Ser Phe Ile Leu Asn Pro
405 410 415
Asp Ala Asn Asn Pro Ser Gly Glu Thr Ala Asn His Asn Asp Glu
420 425 430
Cys Asn Cys 435 Asn Glu Ser Gly Ile 440 Ser Ser Val Gly Gln 445 Ala Gln
Ser Gly Pro Ser Ser Asn Lys Thr Cys Ile Thr His Ser Ser Ile
450 455 460
Thr Asn Lys Lys Lys Glu Cys Lys Asp Val Lys Leu Gly Val Arg
465 470 475
Asn Asp Lys Asp Leu 485 Lys Ile Cys Val Ile 490 Glu Asp Thr Ser Leu 495
Gly Val Asp Asn Cys Cys Cys Gln Asp Leu Leu Gly Ile Leu Gln
500 505 510
Asn Cys Ser Asp Asn Lys Arg Gly Ser Ser Ser Asn Asp Ser Cys
515 520 525
Gln
Ala
Gly
320
Leu
Val
Leu
Gly
Pro
400
Ser
Ala
Thr
Lys
Glu
480
Ser
Glu
Asp
- 254 031876
Asn
Ser
545
Arg
Gly
Gln
Asp
Cys
625
Pro
Glu
Trp
Phe
Gln
705
Asn
Met
Ser
Arg
Lys 530 Asn Gln Asp Glu Cys 535 Gln Lys Lys Leu Glu 540 Lys Val Phe
Leu Thr Asn Gly Tyr Lys Cys Asp Lys Cys Lys Ser Gly Thr
550 555
Ser Lys Lys Lys Trp Ile Trp Lys Lys Ser Ser Gly Asn Glu
565 570 575
Leu Gln Glu Glu Tyr Ala Asn Thr Ile Gly Leu Pro Pro Arg
580 585 590
Ser Leu Tyr Leu Gly Asn Leu Pro Lys Leu Glu Asn Val Cys
595 600 605
Val Lys Asp Ile Asn Phe Asp Thr Lys Glu Lys Phe Leu Ala
610 615 620
Leu Ile Val Ser Phe His Glu Gly Lys Asn Leu Lys Lys Arg
630 635
Gln Asn Lys Asn 645 Ser Gly Asn Lys Glu Asn 650 Leu Cys Lys Ala 655
Tyr Ser Phe Ala Asp Tyr Gly Asp Leu Ile Lys Gly Thr Ser
660 665 670
Asp Asn Glu Tyr Thr Lys Asp Leu Glu Leu Asn Leu Gln Asn
675 680 685
Gly Lys Leu Phe Gly Lys Tyr Ile Lys Lys Asn Asn Thr Ala
690 695 700
Asp Thr Ser Tyr Ser Ser Leu Asp Glu Leu Arg Glu Ser Trp
710 715
Thr Asn Lys Lys Tyr Ile Trp Thr Ala Met Lys His Gly Ala
725 730 735
Asn Ile Thr Thr Cys Asn Ala Asp Gly Ser Val Thr Gly Ser
740 745 750
Ser Cys Asp Asp Ile Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro Gln Tyr
755 760 765
Phe Leu Gln Glu Trp Val Glu Asn Phe Cys Glu Gln Arg Gln
770 775 780
Ala
Ser
560
Glu
Thr
Glu
Gly
Tyr
640
Leu
Ile
Asn
Glu
Trp
720
Glu
Gly
Leu
Ala
- 255 031876
Lys
785
Asn
Lys
Gly
Arg
Thr
865
Asp
Leu
Leu
Thr
Lys
945
Leu
Pro
Trp
Asn
Thr
Val Lys Asp Val Ile 790 Thr Asn Cys Lys Ser Cys 795 Lys Glu Ser Gly 800
Lys Cys Lys Thr Glu Cys Lys Thr Lys Cys Lys Asp Glu Cys Glu
805 810 815
Tyr Lys Lys Phe Ile Glu Ala Cys Gly Thr Ala Gly Gly Gly Ile
820 825 830
Thr Ala Gly Ser Pro Trp Ser Lys Arg Trp Asp Gln Ile Tyr Lys
835 840 845
Tyr Ser Lys His Ile Glu Asp Ala Lys Arg Asn Arg Lys Ala Gly
850 855 860
Lys Asn Cys Gly Thr Ser Ser Thr Thr Asn Ala Ala Ala Ser Thr
870 875 880
Glu Asn Lys Cys Val Gln Ser Asp Ile Asp Ser Phe Phe Lys His
885 890 895
Ile Asp Ile Gly Leu Thr Thr Pro Ser Ser Tyr Leu Ser Asn Val
900 905 910
Asp Asp Asn Ile Cys Gly Ala Asp Lys Ala Pro Trp Thr Thr Tyr
915 920 925
Thr Tyr Thr Thr Thr Glu Lys Cys Asn Lys Glu Arg Asp Lys Ser
930 935 940
Ser Gln Ser Ser Asp Thr Leu Val Val Val Asn Val Pro Ser Pro
950 955 960
Gly Asn Thr Pro Tyr Arg Tyr Lys Tyr Ala Cys Gln Cys Lys Ile
965 970 975
Thr Asn Glu Glu Thr Cys Asp Asp Arg Lys Glu Tyr Met Asn Gln
980 985 990
Ser Cys Gly Ser Ala Arg
995
Thr Met Lys Arg Gly Tyr
1000 1005
Tyr Glu Leu Cys Lys Tyr Asn Gly Val Asp Val
1010
1015
1020
Lys Asn Asp
Lys Pro Thr
Val Arg Ser Asn Ser Ser Lys Leu Asp Ser Gly Arg
- 256 031876
1025
1030
1035
<210> 76
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 76
aactacatca agggcgac 18
<210> 77
<211> 21
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 77
cttgttgata ttggtgtcgg t 21
<210> 78
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 78
cacagcgata gcggcaag 18
<210> 79
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 79
gtccagcttg ctggagtt 18
<210>
<211>
<212>
<213>
ДНК
Искусственная <220>
<223>
Последовательность праймера <400> 80 aactacatca agggcgac
- 257 031876 <210> 81 <211> 18 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Последовательность праймера <400>81 gtccagcttg ctggagtt18
<210> 82
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 82
aactacatca agggcgac 18
<210> 83
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 83
agcggcgttg gtggtgga 18
<210> 84
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 84
aactacatca agggcgac 18
<210>85 <211>
<212>
<213>
ДНК
Искусственная <220>
<223>
Последовательность праймера <400>85 gtacttgtac cggtaggg <210>86 <211>18 <212> ДНК
- 258 031876
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 86
cacagcgata gcggcaag 18
<210> 87
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 87
gtacttgtac cggtaggg 18
<210> 88
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 88
ctgaccaact gctacaag 18
<210> 89
<211> 19
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 89
ggtccagagg gtacagctt 19
<210> 90
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 90
ctgtccttca tcctgaac 18
<210> 91 <211> 21 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
- 259 031876 <223> Последовательность праймера <400>91 ttcagcgttg ttgtactcgt a
<210> 92
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 92
ctgtccttca tcctgaac 18
<210> 93
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 93
gtccagaggg tacagctt 18
<210> 94
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 94
cactctgact ctggcacc 18
<210> 95
<211> 24
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 95
agaggacttc atcttgttgt tggt 24
<210>96 <211>18 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Последовательность праймера <400> 96
- 260 031876 ctgtccttca tcctgaac
<210> 97
<211> 24
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 97
agaggacttc atcttgttgt tggt 24
<210> 98
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 98
cactctgact ctggcacc 18
<210> 99
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 99
gtccagctta gaggagtt 18
<210> 100
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 100
ctgtccttca tcctgaac 18
<210> 101
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 101
gtccagctta gaggagtt 18
- 261 031876 <210> 102 <211> 18 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Последовательность праймера <400>102 cactctgact ctggcacc18
<210> 103
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 103
ggcggcgttg gtggtaga 18
<210> 104
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 104
ctgtccttca tcctgaac 18
<210> 105
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 105
ggcggcgttg gtggtaga 18
<210>106 <211>
<212>
<213>
ДНК
Искусственная <220>
<223>
Последовательность праймера <400>106 cactctgact ctggcacc <210>107 <211>18 <212> ДНК
- 262 031876 <213>
Искусственная <220>
<223>
Последовательность праймера
107 <400>107 gtacttgtat ccgtgggg <210>108 <211>18 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Последовательность праймера <400>108 ctgtccttca tcctgaac18 <210>109 <211>18 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Последовательность праймера <400>109 gtacttgtat ccgtgggg18 <210>110 <211>18 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Последовательность праймера <400>110 cacagcgata gcggcaag18 <210>111 <211>36 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Последовательность праймера <400>111 ggtgtcgaag ttgatgtcgg gcagattgcc caggta36 <210>112 <211>18 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
- 263 031876 <223> Последовательность праймера <400>112 cacagcgata gcggcaag <210>113 <211>36 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Последовательность праймера <400>113 agctgcggcc agattagcgc cctcgtggaa ggacac36
<210> 114
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 114
cacagcgata gcggcaag 18
<210>115 <211>36 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Последовательность праймера <400>115 agcgcattca gctgcggcgt tggtcttgat ggagct36
<210> 116
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 116
cacagcgata gcggcaag 18
<210>117 <211>18 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Последовательность праймера <400> 117
- 264 031876 gtccagcttg ctggagtt
<210> 118
<211> 36
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 118
gctaatctgg ccgcagctta cccccagaat aagaac 36
<210> 119
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 119
gtccagcttg ctggagtt 18
<210> 120
<211> 36
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 120
gccgcagctg aatgcgctga cgtgaagctg ggcgtg 36
<210> 121
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 121
gtccagcttg ctggagtt 18
<210> 122 <211> 18 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Последовательность праймера <400> 122 cacagcgata gcggcaag 18
- 265 031876 <210> 123 <211> 18 <212> ДНК <213> Искусственная <220>
<223> Последовательность праймера <400>123 gtccagcttg ctggagtt18
<210> 124
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 124
cacagcgata gcggcaag 18
<210> 125
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 125
gtccagcttg ctggagtt 18
<210> 126
<211> 18
<212> ДНК
<213> Искусственная
<220>
<223> Последовательность праймера
<400> 126
cacagcgata gcggcaag 18
<210>127 <211>
<212>
<213>
ДНК
Искусственная <220>
<223>
Последовательность праймера <400> 127 gtccagcttg ctggagtt

Claims (10)

  1. ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
    1. Применение конъюгата или слитого белка, содержащего полипептид VAR2CSA или его фрагмент и терапевтическую эффекторную молекулу, в качестве лекарственного средства для лечения злокачественного новообразования.
  2. 2. Применение по п.1, где терапевтическая эффекторная молекула выбрана из противоракового средства, радиоизотопа, токсина, цитостатического или цитолитического средства.
  3. 3. Применение по п.1 или 2, где терапевтическая эффекторная молекула выбрана из калихеамицина, ауристатина, доксорубицина, майтанзиноида, таксола, эктеинасцидина, гелданамицина, метотрексата и их производных, цитотоксических белков, таких как экзотоксин A Pseudomonas, дифтерийный токсин, токсин рицин, противовирусный белок фитолакки американской, сапорин, гелонин и их функциональные варианты, фрагменты и комбинации.
  4. 4. Применение по п.1 или 2, где фрагмент полипептида VAR2CSA образован доменом ID1 и доменом DBL2Xb.
  5. 5. Применение по п.4, где фрагмент полипептида VAR2CSA дополнительно содержит домен ID2a.
  6. 6. Применение по п.4, где фрагмент полипептида VAR2CSA содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 70% идентична любой аминокислотной последовательности 1577 SEQ ID NO:1, 1-592 SEQ ID NO:3, 1-579 SEQ ID NO:4, 1-576 SEQ ID NO:5, 1-586 SEQ ID NO:10, 1579 SEQ ID NO:11, 1-565 SEQ ID NO:29, 1-584 SEQ ID NO:34, 1-569 SEQ ID NO:36, 1-575 SEQ ID NO:37, 1-592 SEQ ID NO:38, 1-603 SEQ ID NO:41, 1-588 SEQ ID NO:43, 1-565 SEQ ID NO:44, 1-589 SEQ ID NO:45, 1-573 SEQ ID NO:48, 1-583 SEQ ID NO:53 или 1-569 SEQ ID NO:54.
  7. 7. Применение по любому из пп.4-6, где фрагмент полипептида VAR2CSA содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 70% идентична аминокислотной последовательности 578-640 SEQ ID NO:1, 593-656 SEQ ID NO:3, 580-643 SEQ ID NO:4, 577-640 SEQ ID NO:5, 587-650 SEQ ID NO:10, 580-643 SEQ ID NO:11, 566-628 SEQ ID NO:29, 585-647 SEQ ID NO:34, 570-632 SEQ ID NO:36, 576-639 SEQ ID NO:37, 593-655 SEQ ID NO:38, 604-667 SEQ ID NO:41, 589-652 SEQ ID NO:43, 566-628 SEQ ID NO:44, 590-653 SEQ ID NO:45, 574-637 SEQ ID NO:48, 584-646 SEQ ID NO:53 или 570632 SEQ ID NO:54.
  8. 8. Применение по любому из пп.4-7, где фрагмент полипептида VAR2CSA содержит аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 70% идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO:2, 6, 8, 9, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 30, 31, 32, 33, 35, 39, 40, 42, 46, 47, 49, 50, 51 или 52.
  9. 9. Применение фармацевтической композиции, включающей конъюгат или слитый белок, содержащий полипептид VAR2CSA и терапевтическую эффекторную молекулу, в качестве лекарственного средства для лечения злокачественного новообразования.
  10. 10. Применение конъюгата или слитого белка, содержащего полипептид VAR2CSA и диагностическую эффекторную молекулу, для диагностики злокачественного новообразования.
EA201491494A 2012-02-09 2013-02-08 Применения конъюгата, содержащего полипептид var2csa и эффекторную молекулу, для лечения и диагностики злокачественного новообразования EA031876B1 (ru)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201261596931P 2012-02-09 2012-02-09
PCT/EP2013/052557 WO2013117705A1 (en) 2012-02-09 2013-02-08 Targeting of chondroitin sulfate glycans

Publications (2)

Publication Number Publication Date
EA201491494A1 EA201491494A1 (ru) 2015-01-30
EA031876B1 true EA031876B1 (ru) 2019-03-29

Family

ID=47714079

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA201491494A EA031876B1 (ru) 2012-02-09 2013-02-08 Применения конъюгата, содержащего полипептид var2csa и эффекторную молекулу, для лечения и диагностики злокачественного новообразования

Country Status (15)

Country Link
US (3) US11787844B2 (ru)
EP (1) EP2812024B1 (ru)
JP (2) JP6517018B2 (ru)
CN (1) CN104136041B (ru)
AU (1) AU2013217986B2 (ru)
BR (1) BR112014018630A2 (ru)
CA (1) CA2861051C (ru)
DK (1) DK2812024T3 (ru)
EA (1) EA031876B1 (ru)
ES (1) ES2676029T3 (ru)
IL (1) IL233594B (ru)
PL (1) PL2812024T3 (ru)
SG (2) SG10201606195UA (ru)
WO (1) WO2013117705A1 (ru)
ZA (1) ZA201405187B (ru)

Families Citing this family (39)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
PL2968440T3 (pl) 2013-03-15 2019-12-31 Zymeworks Inc. Związki cytotoksyczne i antymitotyczne oraz sposoby ich stosowania
CN106456694B (zh) * 2013-12-20 2020-06-30 通用医疗公司 与循环肿瘤细胞相关的方法和测定法
SG11201605260VA (en) * 2013-12-27 2016-07-28 Zymeworks Inc Var2csa-drug conjugates
WO2015095953A1 (en) 2013-12-27 2015-07-02 The Centre For Drug Research And Development Sulfonamide-containing linkage systems for drug conjugates
JP6246030B2 (ja) * 2014-03-12 2017-12-13 東芝メディカルシステムズ株式会社 病理染色装置及び病理染色方法
SG11201702143PA (en) 2014-09-17 2017-04-27 Zymeworks Inc Cytotoxic and anti-mitotic compounds, and methods of using the same
US20180298098A1 (en) * 2015-02-26 2018-10-18 Var2 Pharmaceutical Aps Immunotherapeutic targeting of placental-like chondroitin sulfate using chimeric antigen receptors (cars) and immunotherapeutic targeting of cancer using cars with split-protein binding systems
CN106459224B (zh) * 2015-11-26 2019-12-27 广州中科蓝华生物科技有限公司 一种抗胎盘样硫酸软骨素的嵌合抗原受体及其应用
CN105753991B (zh) * 2015-11-26 2019-12-27 广州中科蓝华生物科技有限公司 一种抗胎盘样硫酸软骨素的嵌合抗原受体及其应用
WO2017088623A1 (zh) * 2015-11-26 2017-06-01 广州中科蓝华生物科技有限公司 一种抗胎盘样硫酸软骨素的嵌合抗原受体及其应用
WO2017179015A1 (en) * 2016-04-15 2017-10-19 Glaxosmithkline Intellectual Property Development Limited Compositions for the treatment of cancer
US10517958B2 (en) 2016-10-04 2019-12-31 Zymeworks Inc. Compositions and methods for the treatment of platinum-drug resistant cancer
CN106512022B (zh) * 2016-10-12 2019-09-27 广东艾时代生物科技有限责任公司 羟基红花黄色素a-红细胞黏附硫酸软骨素a受体蛋白多肽复合物在制备抗肿瘤药物的应用
WO2018107930A1 (zh) * 2016-12-14 2018-06-21 中国科学院上海巴斯德研究所 外周血循环肿瘤细胞检测体系及其应用
CN109589413B (zh) * 2017-09-28 2021-07-27 中国科学院深圳先进技术研究院 靶向胎盘样硫酸软骨素a的多肽、靶向纳米颗粒及其制备方法和应用
WO2019061648A1 (zh) * 2017-09-28 2019-04-04 中国科学院深圳先进技术研究院 靶向胎盘样硫酸软骨素a的多肽、靶向递送系统及其制备方法和应用
CN109568596B (zh) * 2017-09-28 2021-07-27 中国科学院深圳先进技术研究院 胎盘样硫酸软骨素a靶向运载体系及其制备方法和应用
CN109589416B (zh) * 2017-09-28 2021-07-27 中国科学院深圳先进技术研究院 胎盘样硫酸软骨素a靶向纳米投递系统及其制备方法和应用
CN109568598B (zh) * 2017-09-28 2021-07-27 中国科学院深圳先进技术研究院 用于药物流产的胎盘靶向纳米颗粒及其制备方法和应用
CN109568597B (zh) * 2017-09-28 2021-07-27 中国科学院深圳先进技术研究院 靶向胎盘样硫酸软骨素a的多肽药物偶联物及其制备方法和应用
CN108570118B (zh) * 2017-10-17 2020-07-03 中国科学院深圳先进技术研究院 一种胎盘样硫酸软骨素a或其衍生物的亲和层析纯化方法
US20210221880A1 (en) * 2017-11-29 2021-07-22 Guangzhou Cas Lamvac Biotech Co., Ltd Chimeric antigen receptor and application thereof
CN108828224A (zh) * 2018-04-24 2018-11-16 上海市第十人民医院 肝癌血清肿瘤标志物acan
EP3821244A1 (en) * 2018-07-13 2021-05-19 Varct Diagnostics ApS Isolation of circulating cells of fetal origin using recombinant malaria protein var2csa
WO2020033398A1 (en) * 2018-08-06 2020-02-13 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Compositions and methods for treating atii cell-dependent lung diseases
WO2020077532A1 (zh) * 2018-10-16 2020-04-23 中国科学院深圳先进技术研究院 一种基于胎盘样硫酸软骨素a的癌症筛查和早期诊断的试剂方法
CN109387627B (zh) * 2018-10-16 2021-09-24 中国科学院深圳先进技术研究院 一种基于胎盘样硫酸软骨素a的癌症筛查和早期诊断的试剂方法
KR102167443B1 (ko) * 2019-03-25 2020-10-19 주식회사 카티프라임 체외 골관절염 모델 및 이를 이용한 골관절염 치료제 스크리닝 방법
CN110124045A (zh) * 2019-04-30 2019-08-16 云南大学 疟原虫var2csa蛋白在抗肿瘤药物中的应用
CN114423777A (zh) * 2019-07-23 2022-04-29 希思特思医疗保健公司 血小板促进的治疗性化合物递送
CN113318225B (zh) * 2020-02-28 2024-01-19 无锡派列博生物医药科技有限公司 肿瘤免疫增强剂及其制法和应用
CN113956331A (zh) * 2020-07-21 2022-01-21 深圳先进技术研究院 异位子宫内膜识别多肽及其衍生物和应用
CN113967268A (zh) * 2020-07-21 2022-01-25 深圳先进技术研究院 一种子宫内膜异位症病灶靶向纳米投递系统及其制备方法和应用
US20240009290A1 (en) * 2020-11-19 2024-01-11 The United States Of America,As Represented By The Secretary,Department Of Health And Human Services Novel var2csa immunogens and methods of use thereof
CN113740521A (zh) * 2021-08-27 2021-12-03 安徽贝铭生物科技有限公司 检测尿液中癌胚硫酸软骨素的制剂在制备诊断泌尿系统恶性肿瘤的制剂、试剂盒中的应用
WO2023118150A1 (en) * 2021-12-22 2023-06-29 Royal College Of Surgeons In Ireland A conjugate for use in localising a molecule to the vascular endothelium.
CN114075298B (zh) * 2022-01-07 2022-04-29 广州中科蓝华生物科技有限公司 一种索烃化的var2csa重组蛋白及其制备方法和应用
WO2023148398A1 (en) * 2022-02-07 2023-08-10 Var2 Pharmaceuticals Aps Antibodies and antibody fragments and analogues specific for chondroitin sulfate
CN116874578B (zh) * 2022-12-09 2024-07-19 中山大学肿瘤防治中心(中山大学附属肿瘤医院中山大学肿瘤研究所) 一种var2csa重组蛋白及其制备方法和应用

Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2004067559A1 (en) * 2003-01-27 2004-08-12 Københavns Universitet Compounds useful in the diagnosis and treatment of pregnancy-associated malaria
WO2006039652A2 (en) * 2004-09-30 2006-04-13 The Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Chondroitin sulfate a binding domains
WO2012014073A2 (en) * 2010-07-30 2012-02-02 Institut De Recherche Pour Le Developpement (Ird) Vaccines against pregnancy-associated malaria

Family Cites Families (49)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4203570A (en) 1978-08-23 1980-05-20 The Western States Machine Company Power-operated loading gate for centrifugal machines incorporating an auxiliary drive device
US4873191A (en) 1981-06-12 1989-10-10 Ohio University Genetic transformation of zygotes
US4546082A (en) 1982-06-17 1985-10-08 Regents Of The Univ. Of California E. coli/Saccharomyces cerevisiae plasmid cloning vector containing the alpha-factor gene for secretion and processing of hybrid proteins
US4599311A (en) 1982-08-13 1986-07-08 Kawasaki Glenn H Glycolytic promotersfor regulated protein expression: protease inhibitor
US4713339A (en) 1983-01-19 1987-12-15 Genentech, Inc. Polycistronic expression vector construction
JPS60501140A (ja) 1983-04-22 1985-07-25 アムジエン 酵母による外因性ポリペプチドの分泌
NZ207926A (en) 1983-04-25 1988-04-29 Genentech Inc Use of yeast #a#-factor to assist in expression of proteins heterologus to yeast
US4745051A (en) 1983-05-27 1988-05-17 The Texas A&M University System Method for producing a recombinant baculovirus expression vector
US4870008A (en) 1983-08-12 1989-09-26 Chiron Corporation Secretory expression in eukaryotes
US4879236A (en) 1984-05-16 1989-11-07 The Texas A&M University System Method for producing a recombinant baculovirus expression vector
US4931373A (en) 1984-05-25 1990-06-05 Zymogenetics, Inc. Stable DNA constructs for expression of α-1 antitrypsin
DK58285D0 (da) 1984-05-30 1985-02-08 Novo Industri As Peptider samt fremstilling og anvendelse deraf
US4766073A (en) 1985-02-25 1988-08-23 Zymogenetics Inc. Expression of biologically active PDGF analogs in eucaryotic cells
US4885249A (en) 1984-12-05 1989-12-05 Allelix, Inc. Aspergillus niger transformation system
US4683202A (en) 1985-03-28 1987-07-28 Cetus Corporation Process for amplifying nucleic acid sequences
DE3650202T3 (de) 1985-08-29 2004-06-03 Genencor International, Inc., South San Francisco Expression von heterologen Polypeptiden in filamentösen Pilzen, Verfahren zu deren Herstellung und Vektoren zu deren Herstellung.
US4882279A (en) 1985-10-25 1989-11-21 Phillips Petroleum Company Site selective genomic modification of yeast of the genus pichia
HU206897B (en) 1985-10-25 1993-01-28 Zymogenetics Inc Process for utilizing bar-1 gen for selecting strange proteins
US4935349A (en) 1986-01-17 1990-06-19 Zymogenetics, Inc. Expression of higher eucaryotic genes in aspergillus
DK122686D0 (da) 1986-03-17 1986-03-17 Novo Industri As Fremstilling af proteiner
GB8610600D0 (en) 1986-04-30 1986-06-04 Novo Industri As Transformation of trichoderma
GB8615942D0 (en) 1986-06-30 1986-08-06 Animal & Food Research Council Peptide production
NZ221259A (en) 1986-07-31 1990-05-28 Calgene Inc Seed specific transcriptional regulation
EP0832981A1 (en) 1987-02-17 1998-04-01 Pharming B.V. DNA sequences to target proteins to the mammary gland for efficient secretion
US4873316A (en) 1987-06-23 1989-10-10 Biogen, Inc. Isolation of exogenous recombinant proteins from the milk of transgenic mammals
US5024947A (en) 1987-07-24 1991-06-18 Cetus Corporation Serum free media for the growth on insect cells and expression of products thereby
ATE170557T1 (de) 1987-07-24 1998-09-15 Chiron Corp Züchtung von insektenzellen mit airlift-reaktoren
US5004697A (en) 1987-08-17 1991-04-02 Univ. Of Ca Cationized antibodies for delivery through the blood-brain barrier
EP0383779B2 (en) 1987-09-04 2000-05-31 Novo Nordisk A/S PROCESS FOR THE PRODUCTION OF PROTEIN PRODUCTS IN $i(ASPERGILLUS) AND PROMOTERS FOR USE IN $i(ASPERGILLUS)
DK463887D0 (da) 1987-09-07 1987-09-07 Novo Industri As Gaerleader
US5037743A (en) 1988-08-05 1991-08-06 Zymogenetics, Inc. BAR1 secretion signal
GB8826446D0 (en) 1988-11-11 1988-12-14 Agricultural & Food Res Peptide production
AU4647889A (en) 1988-11-18 1990-06-12 Cetus Corporation Insect signal peptide mediated secretion of recombinant proteins
GB8910962D0 (en) 1989-05-12 1989-06-28 Natural Environment Res Novel baculovirus expression vectors and use thereof in the expression of foreign proteins in insects or insect cells
US5077214A (en) 1989-07-07 1991-12-31 The Texas A&M University System Use of baculovirus early promoters for expression of foreign genes in stably transformed insect cells
US5162222A (en) 1989-07-07 1992-11-10 Guarino Linda A Use of baculovirus early promoters for expression of foreign genes in stably transformed insect cells or recombinant baculoviruses
US5155037A (en) 1989-08-04 1992-10-13 The Texas A&M University System Insect signal sequences useful to improve the efficiency of processing and secretion of foreign genes in insect systems
US5023328A (en) 1989-08-04 1991-06-11 The Texas A&M University System Lepidopteran AKH signal sequence
US5073964A (en) 1989-08-04 1991-12-17 Aware, Inc. Signal processing device and method
US5225584A (en) * 1989-09-06 1993-07-06 Tropix, Inc. Synthesis of stable water-soluble chemiluminescent 1,2-dioxetanes and intermediates therefor
DK300090D0 (da) 1990-12-19 1990-12-19 Novo Nordisk As Fremgangsmaade til fremstilling af leadersekvenser
AU1228592A (en) 1991-01-11 1992-08-17 American Red Cross Expression of active human protein c in mammary tissue of transgenic animals
WO2001016326A2 (en) * 1999-09-01 2001-03-08 The Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Identification of the domain of plasmodium falciparum erythrocyte membrane protein 1 (pfemp1) that mediates adhesion to chondroitin sulfate a
FR2805821B1 (fr) * 2000-03-01 2004-01-16 Diatos Sequences d'acides amines facilitant la penetration d'une substance d'interet a l'interieur des cellules et/ou des noyaux cellulaires
DE60229508D1 (de) 2001-02-28 2008-12-04 Nat Inst Of Advanced Ind Scien Drosophila-stamm, der in diesen übertragene(s) bradeion-gen(e) enthält
CA2511775A1 (en) 2002-12-10 2004-06-24 Epimmune Inc. Hla-a1,-a2 -a3,-a24,-b7,and -b44 tumor associated antigen peptides and compositions
BR112012009296A2 (pt) * 2009-10-20 2021-02-02 Prometheus Laboratories Inc. métodos para determinar o nível ou estado de ativação de uma proteína de fusão oncogênica, para otimizar terapia e/ou reduzir a toxicidade em um sujeito tendo câncer, para selecionar um medicamento anti-câncer adequado para o tratamento de um câncer, para identificar a resposta de um câncer ao tratamento com um medicamento câncer, pra identificar a resposta de um câncer ao tratamento com um medicamento anti-câncer, para predizer a resposta de um sujeito tendo câncer ao tratamento com um medicamento anti-câncer, e, para determinar se um sujeito tendo câncer é resistente ao tratamento com um medicamento anti-câncer.
WO2012002069A1 (ja) * 2010-06-29 2012-01-05 富士フイルム株式会社 形状抽出方法及び装置、並びに寸法測定装置及び距離測定装置
US20140294930A1 (en) * 2011-08-04 2014-10-02 The Regents Of The University Of California STREPTOCOCCAL GlcNAc-LACKING GLYCOPOLYPEPTIDES, CELL WALL CARBOHYDRATES, STREPTOCOCCUS VACCINES, AND METHODS FOR MAKING AND USING THEM

Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
WO2004067559A1 (en) * 2003-01-27 2004-08-12 Københavns Universitet Compounds useful in the diagnosis and treatment of pregnancy-associated malaria
WO2006039652A2 (en) * 2004-09-30 2006-04-13 The Government Of The United States Of America, As Represented By The Secretary, Department Of Health And Human Services Chondroitin sulfate a binding domains
WO2012014073A2 (en) * 2010-07-30 2012-02-02 Institut De Recherche Pour Le Developpement (Ird) Vaccines against pregnancy-associated malaria

Non-Patent Citations (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ADAM F. SANDER, ALI SALANTI, THOMAS LAVSTSEN, MORTEN A. NIELSEN, PAMELA MAGISTRADO, JOHN LUSINGU, NICAISE TUIKUE NDAM, DAVID E. AR: "Multiple var2csa-Type PfEMP1 Genes Located at Different Chromosomal Loci Occur in Many Plasmodium falciparum Isolates", PLOS ONE, PUBLIC LIBRARY OF SCIENCE, vol. 4, no. 8, 1 January 2009 (2009-01-01), pages e6667, XP055057871, ISSN: 19326203, DOI: 10.1371/journal.pone.0006667 *
BIGEY PASCAL; GNIDEHOU S�DAMI; DORITCHAMOU JUSTIN; QUIVIGER MICKAEL; VIWAMI FIRMINE; COUTURIER AUDE; SALANTI ALI; NIELSEN MORTEN A: "The NTS-DBL2X region of VAR2CSA induces cross-reactive antibodies that inhibit adhesion of several Plasmodium falciparum isolates to chondroitin sulfate A", THE JOURNAL OF INFECTIOUS DISEASES, INFECTIOUS DISEASES SOCIETY OF AMERICA, US, vol. 204, no. 7, 1 October 2011 (2011-10-01), US, pages 1125 - 1133, XP009156487, ISSN: 1537-6613, DOI: 10.1093/infdis/jir499 *
BITA BORDBAR, NICAISE TUIKUE-NDAM, PASCAL BIGEY, JUSTIN DORITCHAMOU, DANIEL SCHERMAN, PHILIPPE DELORON: "Identification of Id1-DBL2X of VAR2CSA as a key domain inducing highly inhibitory and cross-reactive antibodies", VACCINE, ELSEVIER, vol. 30, no. 7, 1 February 2012 (2012-02-01), pages 1343 - 1348, XP055019210, ISSN: 0264410X, DOI: 10.1016/j.vaccine.2011.12.065 *
MADELEINE DAHLB�CK, LARS M. J�RGENSEN, MORTEN A. NIELSEN, THOMAS M. CLAUSEN, SISSE B. DITLEV, MAFALDA RESENDE, VERA V. PINTO, DAVI: "The chondroitin sulfate A-binding site of the VAR2CSA protein involves multiple N-terminal domains.", J. BIOL. CHEM., vol. 286, no. 18, 6 May 2011 (2011-05-06), pages 15908 - 15917, XP002669767, ISSN: 1083-351X, DOI: 10.1074/JBC.M110.191510 *
RESENDE, M. ; DITLEV, S.B. ; NIELSEN, M.A. ; BODEVIN, S. ; BRUUN, S. ; PINTO, V.V. ; CLAUSEN, H. ; TURNER, L. ; THEANDER, T.G. ; S: "Chondroitin sulphate A (CSA)-binding of single recombinant Duffy-binding-like domains is not restricted to Plasmodium falciparum Erythrocyte Membrane Protein 1 expressed by CSA-binding parasites", INTERNATIONAL JOURNAL OF PARASITOLOGY, PERGAMON PRESS, GB, vol. 39, no. 11, 1 September 2009 (2009-09-01), GB, pages 1195 - 1204, XP026322957, ISSN: 0020-7519, DOI: 10.1016/j.ijpara.2009.02.022 *
SRIVASTAVA A, GANGNARD S, DECHAVANNE S, AMIRAT F, LEWIT BENTLEY A, ET AL: "Var2CSA Minimal CSA Binding Region Is Located within the N-Terminal Region", PLOS ONE, PUBLIC LIBRARY OF SCIENCE, US, vol. 6, no. 5, 19 May 2011 (2011-05-19), US, pages E20270 - E20270-10, XP002669766, ISSN: 1932-6203, DOI: 10.1371/JOURNAL.PONE.0020270 *
T. M. CLAUSEN, S. CHRISTOFFERSEN, M. DAHLBACK, A. E. LANGKILDE, K. E. JENSEN, M. RESENDE, M. O. AGERBAEK, D. ANDERSEN, B. BERISHA,: "Structural and Functional Insight into How the Plasmodium falciparum VAR2CSA Protein Mediates Binding to Chondroitin Sulfate A in Placental Malaria", JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY, AMERICAN SOCIETY FOR BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, vol. 287, no. 28, 6 July 2012 (2012-07-06), pages 23332 - 23345, XP055058098, ISSN: 00219258, DOI: 10.1074/jbc.M112.348839 *

Also Published As

Publication number Publication date
JP2018076333A (ja) 2018-05-17
EP2812024A1 (en) 2014-12-17
SG11201403988WA (en) 2014-10-30
JP2015513524A (ja) 2015-05-14
AU2013217986B2 (en) 2017-04-27
US20170081373A1 (en) 2017-03-23
IL233594B (en) 2021-07-29
US11787844B2 (en) 2023-10-17
US9932375B2 (en) 2018-04-03
ZA201405187B (en) 2022-05-25
SG10201606195UA (en) 2016-09-29
IL233594A0 (en) 2014-08-31
ES2676029T3 (es) 2018-07-16
AU2013217986A1 (en) 2014-07-24
US20170016905A1 (en) 2017-01-19
US9926350B2 (en) 2018-03-27
CN104136041B (zh) 2021-06-29
BR112014018630A2 (pt) 2017-07-04
CN104136041A (zh) 2014-11-05
US20150004099A1 (en) 2015-01-01
CA2861051A1 (en) 2013-08-15
WO2013117705A1 (en) 2013-08-15
CA2861051C (en) 2021-06-22
EP2812024B1 (en) 2018-04-11
EA201491494A1 (ru) 2015-01-30
DK2812024T3 (en) 2018-07-23
PL2812024T3 (pl) 2018-09-28
JP6517018B2 (ja) 2019-05-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US9926350B2 (en) Targeting of chondroitin sulfate glycans
AU2016223379B2 (en) Immunotherapeutic targeting of placental-like chondroitin sulfate using chimeric antigen receptors (CARs) and immunotherapeutic targeting of cancer using CARs with split-protein binding systems
JP6820286B2 (ja) 補体活性化の阻害剤
JP6471385B2 (ja) 標的化剤としてのGlaドメイン
JP2021506849A (ja) 腫瘍ホーミング及び細胞透過性ペプチド免疫抗がん剤複合体、ならびにそれらの使用方法
JP2002518521A (ja) 医用画像解析、診断および治療のための膜透過性ペプチド錯体
US20060018831A1 (en) TF binding agent and use thereof
EP3024844B1 (en) Short peptides derived from vdac1, compositions and methods of use thereof
US20040072755A1 (en) TF antagonist
WO2004007557A2 (en) Tf antagonist

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s)

Designated state(s): AM KZ KG TJ TM