EA008607B1 - Полинуклеотид, кодирующий фосфолипазу aspergillus niger, фосфолипаза aspergillus niger и способы получения и применения полинуклеотида и фосфолипазы - Google Patents

Полинуклеотид, кодирующий фосфолипазу aspergillus niger, фосфолипаза aspergillus niger и способы получения и применения полинуклеотида и фосфолипазы Download PDF

Info

Publication number
EA008607B1
EA008607B1 EA200401531A EA200401531A EA008607B1 EA 008607 B1 EA008607 B1 EA 008607B1 EA 200401531 A EA200401531 A EA 200401531A EA 200401531 A EA200401531 A EA 200401531A EA 008607 B1 EA008607 B1 EA 008607B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
phospholipase
present
protein
polynucleotide
amino acid
Prior art date
Application number
EA200401531A
Other languages
English (en)
Other versions
EA200401531A1 (ru
Inventor
Кай Альберманн
Вольфрам Кеммнер
Эрик Кимпель
Дитер Майер
Фабио Спреафико
Александер Шток
Кристиан Вагнер
Де Лекс Бур
Рульф Бернхард Мейма
Original Assignee
ДСМ Ай Пи ЭССЕТС Б.В.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ДСМ Ай Пи ЭССЕТС Б.В. filed Critical ДСМ Ай Пи ЭССЕТС Б.В.
Publication of EA200401531A1 publication Critical patent/EA200401531A1/ru
Publication of EA008607B1 publication Critical patent/EA008607B1/ru

Links

Classifications

    • AHUMAN NECESSITIES
    • A21BAKING; EDIBLE DOUGHS
    • A21DTREATMENT, e.g. PRESERVATION, OF FLOUR OR DOUGH, e.g. BY ADDITION OF MATERIALS; BAKING; BAKERY PRODUCTS; PRESERVATION THEREOF
    • A21D8/00Methods for preparing or baking dough
    • A21D8/02Methods for preparing dough; Treating dough prior to baking
    • A21D8/04Methods for preparing dough; Treating dough prior to baking treating dough with microorganisms or enzymes
    • A21D8/042Methods for preparing dough; Treating dough prior to baking treating dough with microorganisms or enzymes with enzymes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/16Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
    • C12N9/18Carboxylic ester hydrolases (3.1.1)
    • C12N9/20Triglyceride splitting, e.g. by means of lipase
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide

Abstract

Настоящее изобретение относится к новой идентифицированной полинуклеотидной последовательности, включающей ген, который кодирует новую фосфолипазу, выделенную из Aspergillus niger. Настоящее изобретение относится к нуклеотидной последовательности нового гена полной длины, последовательности кДНК, включающей полную длину кодирующей последовательности для новой фосфолипазы, а также к аминокислотной последовательности функционального белка полной длины и ее функциональных эквивалентов. Изобретение также относится к способам применения ферментов в промышленных процессах и к способам диагностики грибных инфекций. В настоящее изобретение также включаются клетки, трансформированные полинуклеотидной последовательностью по настоящему изобретению, и клетки, в которых фосфолипаза по настоящему изобретению была генетически модифицирована с целью повышения или снижения ее активности и/или уровня экспрессии.

Description

Область техники, к которой относится изобретение
Настоящее изобретение относится к новым идентифицированным полинуклеотидным последовательностям, включающим гены, которые кодируют новую фосфолипазу, выделенную из АзрегдШиз шдег. В изобретении описаны нуклеотидная последовательность новых генов полной длины, последовательность кДНК, включающая полную длину кодирующей последовательности для новой фосфолипазы, а также аминокислотная последовательность функционального белка полной длины и его функциональных эквивалентов. Изобретение также относится к способам применения указанных ферментов в промышленных процессах и к способам диагностики грибковых инфекций. В изобретение также включены клетки, трансформированные полинуклеотидом по настоящему изобретению, и клетки, в которых фосфолипаза по настоящему изобретению генетически модифицирована для усиления или снижения ее активности и/или уровня экспрессии.
Предпосылки создания изобретения
Фосфолипиды состоят из глицеринового скелета с двумя этерифицированными жирными кислотами во внешнем (зп-1) и внутреннем (зп-2) положениях, тогда как третья гидроксильная группа глицерина этерифицирована фосфорной кислотой. Фосфорная кислота может быть, в свою очередь, этерифицирована, например, аминоспиртом типа этаноламина (фосфатидилэтаноламина), холина (фосфатидилхолина). Третья гидроксильная группа может быть также, вместо этерификации фосфорной кислотой, связана с сахарными остатками, такими как галактоза или ее димер, такой как дигалактозилдиглицерид.
Фосфолипазы определяются в настоящем изобретении как ферменты, которые участвуют в гидролизе одной или более связей в фосфолипидах, включая указанный выше дигалактозилдиглицерид.
Может быть выделено несколько типов фосфолипазной активности, которые приводят к гидролизу эфирной(ых) связи(ей), которая(ые) соединяет(ют) фрагменты жирного ацила с глицероловым скелетом.
Фосфолипаза А1 (ЕС 3.1.1.32) и А2 (ЕС 3.1.1.4) катализируют деацилирование одной жирной ацильной группы в положениях зп-1 и 5п-2. соответственно, в диацилглицерофосфолипиде с образованием лизофосфолипида.
Лизофосфолипаза (ЕС 3.1.1.5, также называемая фосфолипазой В в соответствии с номенклатурой Комитета Международного Союза по биохимии и молекулярной биологии (Ишоп οί Вюсйет1зйу апб Мо1еси1аг Вю1о§у; Епхуте Мотепс1а1иге, Асабешю Ргезз, Ыете Уогк, 1992)) катализирует гидролиз оставшейся жирно-ацильной группы в лизофосфолипиде. Фосфолипаза В была открыта в РешсШшш по1а1пт (8айо е! а1., 1991, МеШобз ίη Епхуто1оду 197: 446-456), которая катализирует деацилирование обеих жирных кислот в диацилглицерофосфолипиде и по своей природе обладает лизофосфолипазной активностью.
Галактолипаза (ЕС 3.1.4.3) катализирует гидролиз одной или обеих жирно-ацильных групп в положениях зп-1 и зп-2, соответственно, в дигалактозилдиглицериде.
Фосфолипаза С (ЕС 3.1.4.3) гидролизует сложноэфирную фосфатную связь между глицериновым скелетом и фосфатной группой, например:
фосфатадилхолин + Н2О = 1,2-диацилглицерин + холинфосфат.
Фосфолипаза Ό (ЕС 3.1.4.4) гидролизует сложноэфирную фосфатную связь между фосфатной группой и аминоспиртом, например:
фосфатидилхолин + Н2О = холин + фосфатидная кислота.
Фосфолипазы могут быть получены с использованием микроорганизмов. Микробные фосфолипазы доступны из множества источников; виды ВасШпз представляют собой основной источник бактериальных ферментов, тогда как грибные ферменты обычно получают из клеток видов АзретдШиз.
Грибные ферменты с фосфолипазной активностью были описаны в различных источниках, включая Сгур1ососси5 пеоГогтапз (Сйеп е! а1., 1997, 1пГес!юп апб йппшпйу 6: 405-411); Еи8оЬас1егшт песгорйошт (ЕШз е! а1., 1996, УеЮгшагу МютоЬю1о§у 49: 219-233), РешсШшш по1аШт (также известный как РешсШшш сйтузодепит; Катазакц 1975, 1оитпа1 оГ Вюсйет1з!гу 77: 1233-1244; Мазиба е! а1., 1991, Еигореап 1оитпа1 оГ Вюсйепиз1гу 202: 783-787), РешаШит сус1оршт (Мпз1гап1а е! а1., 1995, Ргосезз Вюсйет1з!ту 30: 393401), 8ассйаготусез сетеу131ае (1сШтаза е! а1., 1985, Адпс. Вю1. Сйет. 49: 1083-1089; РаиЙаиГ е! а1., 1994, ί. Вю1. Сйет. 269: 19725-19730), То1игазрога бе1Ьтиески (старое название 8ассйаготусез гозе1, Ки^аЬага, 1988, Адпс. Вю1. СНет. 52: 2451-2458; \Уа1апаЬе е! а1., 1994, ЕЕМ8 М1сгоЫо1ощса1 Ье!!егз 124: 29-34), Иеигозрога сгазза (Сйактауатй е! а1., 1981, АтсШуез оГ Вюсйепиз1гу апб Вюрйузкз 206: 393-402), АзретдШиз шдет (Тесйшса1 Ви11е!ш, С-хуте'™ С6999, Епхуте Вю8уз1етз Ь!б.; Миз!тап!а е! а1., 1995, зирга), Согбсшт сеп1пГищ.пп (Иейата е! а1., 1979, Адпс. Вю1. СНет. 43: 517-525), Ризалит охузрогит (ГУО 98/26057) и Ризалит зо1аш (Тзипд-Сйе е! а1., 1968, Рйу!ораШо1о§1са1 Ио!ез 58: 1437-38).
Фосфолипазные гены грибов были клонированы из нескольких источников, включая РсшсШиш по1аШт (Мазиба е! а1., 1991, зирга), Тоги1азрога бе1Ьгиески (\Уа1апаЬе е! а1., 1994, ЕЕМ8 МютоЬю1о§у Ьейетз 124: 29-34), 8ассйаготусез сетеу1з1ае (Ьее е! а1., 1994, 1оитпа1 оГ Вю1одка1 Сйет1з!гу 269: 19725-19730), АзретдШиз (6Р 10155493), Ыеигозроза сгазза (ЕМВЬ 042791) и 8с1пхозассйаготусез ротЬе (ЕМВЬ 013857).
Фосфолипазы могут использоваться во множестве промышленных процессов, включая модификацию фосфолипидных эмульгаторов. Примером фосфолипидного эмульгатора является лецитин, который представляет смесь полярных и нейтральных липидов, где содержание полярных липидов составляет по
- 1 008607 меньшей мере 60%. Фосфолипидные эмульгаторы применяются во многих отраслях пищевой и непищевой промышленности, в частности яичный лецитин используется как эмульгатор, например, в молочных продуктах, в особенности в майонезе, заправках, мучных кондитерских изделиях и т.п., соевый лецитин используется, например, в качестве эмульгатора в (низкокалорийных) соусах, хлебе, маргарине, косметических продуктах и т.п., тогда как другие лецитины используются, например, в шоколаде, в корме для выпаивания телят. Модификация фосфолипидных эмульгаторов фосфолипазами может привести к повышению степени эмульгирования смеси масло/вода. Модификация фосфолипидных эмульгаторов фосфолипазами может повысить стабильность эмульсий, образуемых при добавлении модифицированных фосфолипидных эмульгаторов, включая стабильность в более широком диапазоне рН или при других значениях рН и/или в более широком диапазоне температур. Модификация фосфолипидных эмульгаторов фосфолипазами может повысить стабильность эмульсий, образуемых при добавлении модифицированных фосфолипидных эмульгаторов, в присутствии ионов Са2+ или Мд2'.
Другой пример промышленного применения фосфолипаз связан с тем, что они могут использоваться для дегумирования растительных масел при обработке таких масел. В типичном процессе дегумирования лецитины удаляют из растительных масел, например соевых масел, рапсовых масел (масла канолы), льняных масел, подсолнечных масел, с целью повышения, в числе других показателей, стабильности растительного масла, путем промывки масляной фазы водой, где смешивание воды и масла в условиях высокого сдвигающего усилия выталкивает лецитины в водную фазу, которую впоследствии удаляют с помощью сепаратора. В образованной так называемой фазе водного дегумирования удаляются только быстро гидратируемые фосфолипиды, например фосфатидилхолин, фосфатидилинозит и фосфатидилэтаноламин. Негидратируемые фосфолипиды/фосфатиды, прежде всего фосфолипиды, которые содержат до 50% магниевых и/или кальциевых солей, не поддаются легкому удалению на стадии водного дегумирования. Воздействие на негидратируемые фосфолипиды/фосфатиды фосфолипазой А2 делает указанные фосфолипиды более растворимыми в воде и, в этой связи, легче экстрагируемыми на стадии водного дегумирования. Другой пример промышленного применения фосфолипаз относится к тому, что их используют для удаления осадка, который образуется при осахаривании (с использованием α-амилазы и глюкоамилазы) пшеничной клейковины или пшеничного крахмала для получения глюкозных сиропов. Удаление осадка существенно ускоряет последующее фильтрование полученных глюкозных сиропов.
Указанные выше направления промышленного применения фермента фосфолипазы охватывают лишь несколько примеров, и указанный перечень не является ограничивающим.
Еще один пример промышленного применения фосфолипаз в производстве пищевых продуктов заключается в том, что фосфолипазы используют, в частности, в хлебопечении для повышения качества теста или хлебобулочных продуктов. Пшеничная мука содержит примерно 2,2-2,9% липидов. Липиды муки можно классифицировать на липиды крахмала (0,8-0,9%) и некрахмальные липиды (1,4-2,0%). В то время как крахмальные липиды состоят, в основном, из полярных лизофосфолипидов, некрахмальные липиды состоят примерно на 40% из нейтральных триглицеридов и на 40% из полярных фосфо- и гликолипидов. Для оптимизации состава липидной фракции муки возможно использовать гидролиз фосфолипидов в тесте ίη зйи путем добавления фосфолипазы А.
Например, в документах ЕР-А-109244 и \УО 98/26057 описывается использование фосфолипазы А в хлебопечении. В патенте Чехословакии АО 190264 используют фосфатидную кислоту (продукт гидролиза фосфолипазы Ό) в качестве средства, улучшающего тесто и качество хлеба. В соответствии с ЕР-А075463 вносят сочетание фосфолипазы А и фосфолипазы Ό с получением лизофосфатидной кислоты как средства для кондиционирования теста.
В XV О 00/32758 описывается получение вариантов липолитического фермента путем внесения изменений в аминокислотную последовательность липолитического фермента с целью повышения уровня желательной активности. Было показано, в контексте применения в хлебопечении, что особенно полезным является вариант липолитического фермента, выделенный из представителей семейства Нит1си1а или семейства 2удотусе1ез, поскольку он, по всей видимости, обладает фосфолипазной и/или дигалактозилдиглицеридной активностью. В ХУО 98/45453 описывается полипептид, обладающий липазной активностью, полученный из АзрегдШиз 1иЬ1депз1з, который также демонстрирует высокую гидролитическую активность в отношении дигалактозилдиглицерида. Однако указанные ферменты имеют недостаток, связанный с их относительно низкой удельной активностью.
В указанных выше процессах использование фосфолипаз имеет ряд преимуществ, которые связаны с тем, что они могут быть получены методами рекомбинантной ДНК. Такие полученные рекомбинантными методами ферменты обладают множеством преимуществ в сравнении с их традиционными очищенными вариантами. Рекомбинантные ферменты могут быть получены с низкой стоимостью, высоким выходом, без загрязняющих компонентов, таких как бактерии или вирусы, и, кроме того, они не содержат бактериальных токсинов или не проявляют активностей других загрязняющих ферментов.
Настоящее изобретение относится по меньшей мере к одной, если не ко всем указанным выше проблемам.
Объект настоящего изобретения
Объектом настоящего изобретения также является получение новых полинуклеотидов, кодирую
- 2 008607 щих новые фосфолипазы с улучшенными свойствами. Еще одним объектом является получение природных и рекомбинантных фосфолипаз, а также продуцирующих их рекомбинантных штаммов. Часть настоящего изобретения относится также к полипептидам слияния, а также к способам получения и использования полинуклеотидов и полипептидов по настоящему изобретению. Более конкретно, объектом настоящего изобретения является получение фосфолипаз, обладающих также галактолипазной активностью.
Объектом настоящего изобретения является получение новых фосфолипаз, которые позволяют решить по меньшей мере одну из указанных выше проблем, или получение новых фосфолипаз, которые обладают одним или более улучшенными свойствами в случае их использования при изготовлении теста и/или хлебобулочных изделий, выбранными из группы свойств, таких как повышенная всхожесть теста, повышенная эластичность теста, повышенная стабильность теста, сниженная липкость теста, повышенная растяжимость теста, усиление показателей теста, способствующих его машинной обработке, повышенный объем полученных хлебобулочных изделий, улучшенная консистенция хлебного мякиша, повышенная мягкость хлебобулочного изделия, улучшенный вкус хлебобулочного изделия, повышенная устойчивость против черствения, улучшенная корка хлебобулочного изделия, или фосфолипаз с более широкой субстратной специфичностью.
Краткое описание сущности изобретения
Настоящее изобретение относится к новым полинуклеотидам, кодирующим новые фосфолипазы. Более конкретно, изобретение относится к полинуклеотидам, имеющим нуклеотидную последовательность, которая гибридизуется предпочтительно в условиях высокой строгости с последовательностью, которую выбирают из группы, состоящей из 8ЕС ΙΌ N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14. Следовательно, настоящее изобретение относится к нуклеиновым кислотам, которые более чем на 40%, в частности примерно на 60%, предпочтительно на 65%, более предпочтительно на 70% и еще более предпочтительно на 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98 или 99%, гомологичны одной или более последовательностям, выбранным из группы, состоящей из 8ЕС ΙΌ N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14.
В более предпочтительном варианте настоящее изобретение относится к такому выделенному полинуклеотиду, получаемому из нитчатого гриба, в частности предпочтительно из АкрегдШик шдег.
В одном варианте настоящее изобретение относится к выделенному полинуклеотиду, включающему последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы, состоящей из 8ЕС ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15 или их функциональных эквивалентов.
В другом предпочтительном варианте настоящее изобретение относится к выделенному полинуклеотиду, кодирующему по меньшей мере один функциональный домен полипептида с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы, состоящей из 8ЕС ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15 или их функциональных эквивалентов.
В предпочтительном варианте настоящее изобретение относится к гену фосфолипазы с нуклеотидной последовательностью, выбранной из группы, состоящей из 8ЕС ΙΌ N0: 1, 4, 7, 10 и 13. В другом аспекте настоящее изобретение относится к выделенному полинуклеотиду, предпочтительно кДНК, кодирующему(ей) фосфолипазу из АкрегдШик шдег, которая имеет аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8ЕС ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15 или вариантов или фрагментов этого полипептида. В предпочтительном варианте кДНК имеет последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8ЕС ΙΌ N0: 2, 5, 8, 11 или 14 или их функциональных эквивалентов.
Еще в одном предпочтительном варианте настоящее изобретение относится к полинуклеотиду, включающему кодирующую последовательность для полипептидов по настоящему изобретению, которая предпочтительно относится к полинуклеотидным последовательностям, выбранным из группы, состоящей из 8ЕС ΙΌ N0: 2, 5, 8, 11 и 14.
Настоящее изобретение относится к векторам, включающим полинуклеотидную последовательность по настоящему изобретению, и к праймерам, зондам и фрагментам, которые могут использоваться для амплификации или обнаружения ДНК по настоящему изобретению.
Еще в одном предпочтительном варианте изобретения предлагается вектор, в котором полинуклеотидная последовательность по настоящему изобретению функционально связана с регуляторными последовательностями, подходящими для экспрессии кодируемой аминокислотной последовательности в соответствующей хозяйской клетке, такой как АкрегдШик шдег или А. огухеа. Настоящее изобретение также относится к способам получения полинуклеотидов и векторов по настоящему изобретению.
Настоящее изобретение также относится к полученным рекомбинантными методами хозяйским клеткам, которые содержат гетерологичные или гомологичные полинуклеотиды по настоящему изобретению.
В другом варианте настоящее изобретение относится к рекомбинантным хозяйским клеткам, в которых экспрессия фосфолипазы по настоящему изобретению существенно повышена или в которых повышена активность фосфолипазы.
В другом варианте настоящее изобретение относится к полученным рекомбинантными методами хозяйским клеткам, которые содержат гетерологичный или гомологичный полинуклеотид по настоящему изобретению, где указанная клетка способна продуцировать функциональную фосфолипазу по на
- 3 008607 стоящему изобретению, предпочтительно относится к клетке, способной к суперэкспрессии фосфолипазы по настоящему изобретению, например к штамму АкрегдШик, содержащему увеличенное количество копий гена или кДНК по настоящему изобретению.
Еще в одном аспекте настоящего изобретения предлагается очищенный полипептид. Полипептиды по настоящему изобретению включают полипептиды, кодируемые полинуклеотидами по настоящему изобретению. Особенно предпочтительным является полипептид, имеющий аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8ЕЦ ГО N0: 3, 6, 9, 12 и 15 или их функциональных эквивалентов.
Белки слияния, включающие полипептид по настоящему изобретению, также входят в область настоящего изобретения. Изобретение также относится к способам получения полипептидов по настоящему изобретению.
Настоящее изобретение также относится к использованию фосфолипазы по настоящему изобретению в любом промышленном процессе, описанном в настоящей заявке.
Подробное описание изобретения
Полинуклеотиды
Настоящее изобретение относится к полинуклеотидам, кодирующим фосфолипазы, имеющие аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8ЕЦ ГО N0: 3, 6, 9, 12 и 15 или их функционально эквивалентных последовательностей. Последовательности пяти генов, кодирующих фосфолипазы ФЛП03, ФЛП06, ФЛП15, ФЛП26 и ФЛП34, соответственно, были определены путем секвенирования соответствующих геномных клонов, полученных из АкрегдШик шдег. Изобретение относится к полинуклеотидным последовательностям, включающим гены, кодирующие фосфолипазы ФЛП03, ФЛП06, ФЛП15, ФЛП26 и ФЛП34, соответственно, а также к полной последовательности их кДНК и их кодирующей последовательности. Соответственно, настоящее изобретение относится к выделенному полинуклеотиду, включающему нуклеотидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14 или их функциональных эквивалентов.
Более конкретно, настоящее изобретение относится к выделенному полинуклеотиду, гибридизируемому в строгих условиях, предпочтительно в условиях высокой строгости, с полинуклеотидом, включающим нуклеотидную последовательность, выбранную их группы, состоящей из 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14 или их функциональных эквивалентов.
Преимущественно такие полинуклеотиды могут быть получены из нитчатых грибов, в частности из АкрегдШик шдег. Более конкретно, настоящее изобретение относится к выделенному полинуклеотиду, имеющему нуклеотидную последовательность, выбранную их группы, состоящей из 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14.
Настоящее изобретение также относится к выделенному полинуклеотиду, кодирующему по меньшей мере один функциональный домен полипептида с аминокислотной последовательностью, выбранной из группы, состоящей из 8ЕЦ ГО N0: 3, 6, 9, 12 и 15 или их функциональных эквивалентов.
В контексте настоящего описания термины ген и рекомбинантный ген относятся к молекулам нуклеиновой кислоты, которые могут быть выделены из хромосомной ДНК и которые включают открытую рамку считывания, кодирующую белок, например фосфолипазу из АкрегдШик шдег. Ген может включать кодирующие последовательности, некодирующие последовательности, интроны и регуляторные последовательности. Термин ген также относится к выделенной молекуле. Кроме того, термин ген относится к выделенной молекуле нуклеиновой кислоты, определенной в настоящем описании.
Молекула нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению, такая как молекула нуклеиновой кислоты с нуклеотидной последовательностью, выбранной из группы, состоящей из 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14 или ее функциональных эквивалентов, может быть выделена с использованием стандартных методик молекулярной биологии, и в настоящем описании приведена информация о полученных последовательностях. Например, с использованием части последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, состоящей из 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14, в качестве зонда для гибридизации, молекулы нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению могут быть выделены с использованием стандартных методик гибридизации и клонирования (см., например, в руководстве Самбрука (8атЬгоок, 1., Егбкк Е.Г., апб Машабк, Т. Мо1еси1аг С1ошпд: А ЬаЬогаЮгу Мапиа1, 2пб еб., Со1б 8рппд НагЬог ЬаЬогаЮгу, Со1б 8ргшд НагЬог ЬаЬогаФгу Ргекк, Со1б 8ргтд НагЬог ЬаЬогаЮгу, ИУ, 1989)).
Кроме того, молекула нуклеиновой кислоты, включающая всю или часть последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, состоящей из 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14, может быть выделена посредством полимеразной цепьевой реакции (ПЦР) с использованием синтетических олигонуклеотидных праймеров, разработанных на основе информации о последовательности молекул из группы, включающей 8ЕЦ ГО N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14.
Нуклеиновая кислота по настоящему изобретению может быть амплифицирована с использованием кДНК, мРНК или, альтернативно, геномной ДНК в качестве матрицы и соответствующих олигонуклеотидных праймеров по стандартным методикам проведения ПЦР-амплификации. Нуклеиновая кислота, амплифицированная таким образом, может быть далее клонирована в соответствующем векторе и охарактеризована путем анализа последовательности ДНК.
- 4 008607
Кроме того, олигонуклеотиды, соответствующие нуклеотидным последовательностям по настоящему изобретению или гибридизуемые с ними, могут быть получены по стандартным методикам синтеза, например с использованием автоматизированного синтезатора ДНК.
В одном предпочтительном варианте выделенная молекула нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению включает нуклеотидную последовательность, показанную в 8ЕЦ ΙΌ N0: 2. Последовательность 8ЕЦ ΙΌ N0: 2 соответствует кодирующей области гена фосфолипазы ФЛП03 из АкрегдШик шдег, показанной в 8ЕЦ ΙΌ N0: 1. Такая кДНК включает последовательность, кодирующую ФЛП03 полипептид из АкрегдШик шдег, показанную в 8ЕЦ ΙΌ N0: 3.
Во втором предпочтительном варианте выделенная молекула нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению включает нуклеотидную последовательность, показанную в 8ЕЦ ΙΌ N0: 5. Последовательность 8ЕЦ ΙΌ N0: 5 соответствует кодирующей области гена фосфолипазы ФЛП06 из АкрегдШик шдег, показанной в 8ЕЦ ΙΌ N0: 4. Такая кДНК включает последовательность, кодирующую полипептид ФЛП06 из АкрегдШик шдег, показанную в 8ЕЦ ΙΌ N0: 6.
В третьем предпочтительном варианте выделенная молекула нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению включает нуклеотидную последовательность, показанную в 8ЕЦ ΙΌ N0: 8. Последовательность 8ЕЦ ΙΌ N0: 8 соответствует кодирующей области гена фосфолипазы ФЛП15 из АкрегдШик шдег, показанной в 8ЕЦ ΙΌ N0: 7. Такая кДНК включает последовательность, кодирующую полипептид ФЛП15 из АкрегдШик шдег, показанную в 8ЕЦ ΙΌ N0: 9.
В четвертом предпочтительном варианте выделенная молекула нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению включает нуклеотидную последовательность, показанную в 8ЕЦ ΙΌ N0: 11. Последовательность 8ЕЦ ΙΌ N0: 11 соответствует кодирующей области гена фосфолипазы ФЛП26 из АкрегдШик шдег, показанной в 8ЕЦ ΙΌ N0: 10. Такая кДНК включает последовательность, кодирующую полипептид ФЛП26 из АкрегдШик шдег, показанную в 8ЕЦ ΙΌ N0: 12.
В пятом предпочтительном варианте выделенная молекула нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению включает нуклеотидную последовательность, показанную в 8ЕЦ ΙΌ N0: 14. Последовательность 8ЕЦ ΙΌ N0: 14 соответствует кодирующей области гена фосфолипазы ФЛП34 из АкрегдШик шдег, показанной в 8ЕЦ ΙΌ N0: 13. Такая кДНК включает последовательность, кодирующую полипептид ФЛП34 из АкрегдШик шдег, показанную в 8ЕЦ ΙΌ N0: 15.
В другом предпочтительном варианте выделенная молекула нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению включает молекулу нуклеиновой кислоты, которая является комплементарной к нуклеотидной последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14 или функционального эквивалента указанных нуклеотидных последовательностей.
Молекула нуклеиновой кислоты, которая комплементарна к другой нуклеотидной последовательности, представляет собой такую молекулу, которая обладает достаточной комплементарностью к другой нуклеотидной последовательности, так что может гибридизоваться с другой нуклеотидной последовательностью, образуя при этом стабильный дуплекс.
Один аспект настоящего изобретения относится к выделенным молекулам нуклеиновой кислоты, которые кодируют полипептид по настоящему изобретению или его функциональный эквивалент, такой как биологически активный фрагмент или домен, а также к молекулам нуклеиновой кислоты, подходящим для использования в качестве гибридизирующего зонда для идентификации молекул нуклеиновой кислоты, кодирующих полипептид по настоящему изобретению, и к фрагментам таких молекул нуклеиновой кислоты, которые пригодны для использования в качестве ПЦР-праймеров для амплификации или мутирования молекул нуклеиновой кислоты.
Термины выделенный полинуклеотид или выделенная нуклеиновая кислота обозначают ДНК или РНК, которые непосредственно не соприкасаются с обеими кодирующими последовательностями, с которыми в естественном геноме организма, из которого они были выделены, они непосредственно соприкасаются (одна на 5'-конце и одна на 3'-конце). Таким образом, в одном варианте выделенная нуклеиновая кислота включает несколько или все из 5'-некодирующих (например, промоторных) последовательностей, которые непосредственно примыкают к кодирующей последовательности. В этой связи, указанный термин включает, например, рекомбинантную ДНК, которая входит в состав вектора в автономно реплицирующихся плазмиде или вирусе или в состав геномной ДНК прокариота или эукариота или которая существует в виде отдельной молекулы (например, кДНК или фрагмента геномной ДНК, получаемой путем ПЦР или обработки рестрикционной эндонуклеазой), независимо от других последовательностей. Указанный термин также включает рекомбинантную ДНК, которая является частью гибридного гена, кодирующего дополнительный полипептид, который, по существу, не содержит клеточный материал, вирусный материал или культуральную среду (в случае получения по методикам рекомбинантной ДНК), или химические предшественники или другие химические вещества (в варианте химического синтеза). Кроме того, выделенный фрагмент нуклеиновой кислоты представляет собой фрагмент нуклеиновой кислоты, который в природе не встречается как фрагмент и не может быть обнаружен в естественном состоянии.
В контексте настоящего описания термины полинуклеотид или молекула нуклеиновой кислоты используются для обозначения молекул ДНК (например, кДНК или геномной ДНК) или молекул РНК
- 5 008607 (например, мРНК), а также аналогов ДНК и РНК, получаемых с использованием нуклеотидных аналогов. Молекула нуклеиновой кислоты может быть одноцепочечной или двуцепочечной, но предпочтительно является двуцепочечной. Нуклеиновая кислота может быть синтезирована с использованием аналогов или производных олигонуклеотидов (например, инозиновых или фосфотиатных нуклеотидов). Такие олигонуклеотиды могут использоваться, например, для получения нуклеиновых кислот, которые обладают измененными свойствами по спариванию оснований или повышенной устойчивостью к нуклеазам.
Другой вариант настоящего изобретения относится к выделенной молекуле нуклеиновой кислоты, которая является антисмысловой относительно молекулы нуклеиновой кислоты, полученной по настоящему изобретению. В область настоящего изобретения также включаются комплементарные цепи молекул нуклеиновой кислоты, приведенные в настоящем описании.
Ошибки последовательности
Информация о последовательностях, приведенная в настоящем описании, не должна восприниматься в узком контексте как о последовательностях, в которые включаются ошибочно идентифицированные основания. Конкретные последовательности, раскрытые в настоящем описании, могут без труда использоваться для выделения полного гена из нитчатых грибов, в частности АвретдШив пфсг. которые, в свою очередь, могут быть далее проанализированы с идентификацией имеющихся в последовательности ошибок.
Если особо не оговорено иное, все нуклеотидные последовательности, определенные при секвенировании описанных в настоящей заявке молекул ДНК, анализируют с использованием автоматизированного секвенатора ДНК и все аминокислотные последовательности полипептидов, кодируемые молекулами ДНК, определенными в настоящем изобретении, были прогнозированы как продукты трансляции последовательности ДНК, определенной выше. В этой связи, как известно в данной области, в любой последовательности ДНК, определенной с помощью такого автоматизированного подхода, могут содержаться некоторые ошибки нуклеотидной последовательности. Нуклеотидные последовательности, определенные путем автоматизированного секвенирования, в типичном случае по меньшей мере примерно на 90% идентичны, более типично от по меньшей мере примерно на 95% до по меньшей мере примерно на 99% идентичны фактической нуклеотидной последовательности секвенированной молекулы ДНК. Фактическая последовательность может быть более точно определена с помощью других подходов, включающих способ ручного секвенирования ДНК, также известный в данной области. Как известно в данной области техники, единственная вставка или делеция в определенной нуклеотидной последовательности в сравнении с фактической последовательностью может вызвать сдвиг рамки считывания при трансляции нуклеотидной последовательности, так что предсказанная аминокислотная последовательность, кодируемая определенной нуклеотидной последовательностью, будет совершенно иной относительно аминокислотной последовательности, фактически кодируемой секвенированной молекулой ДНК, начиная с точки такой вставки или делеции.
Каждый специалист со средним уровнем знаний в данной области способен определить такие ошибочно идентифицированные основания и знает, как корректировать такие ошибки.
Фрагменты нуклеиновой кислоты, зонды и праймеры
Молекула нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению может включать лишь часть или фрагмент последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, состоящей из ЗЕф ΙΌ N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14, например фрагмент, который может использоваться в качестве зонда, или праймера, или фрагмента, кодирующего часть белка по настоящему изобретению. Нуклеотидная последовательность, определенная при клонировании гена фосфолипазы и кДНК, позволяет получать зонды и праймеры, разработанные для целей использования при идентификации и/или клонировании других представителей семейства фосфолипаз, а также гомологов фосфолипазы из других видов. Зонд/праймер в типичном случае включает, по существу, очищенный олигонуклеотид, содержащий обычно область нуклеотидной последовательности, которая гибридизуется, предпочтительно в условиях высокой строгости, по меньшей мере, примерно на участке, включающем 12 или 15, предпочтительно примерно 18 или 20, предпочтительно примерно 22 или 25, более предпочтительно примерно 30, 35, 40, 45, 50, 55, 60, 65 или 75 или более идущих друг за другом нуклеотидов в нуклеотидной последовательности, выбранной из группы, состоящей из ЗЕф ΙΌ N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14 или их функционального эквивалента.
Зонды, основанные на нуклеотидной последовательности, приведенной в настоящем описании, могут быть использованы для выявления транскриптов (в основном, мРНК) или геномных последовательностей, кодирующих такие же или гомологичные белки, например, из других организмов. В предпочтительных вариантах зонд также включает метящую группу, присоединенную к нему, например метящую группу, которая может представлять собой радиоактивный изотоп, флуоресцентное соединение, фермент или кофактор фермента. Такие зонды также могут использоваться в качестве составного компонента в диагностических наборах для анализа клеток, которые экспрессируют фосфолипазу.
Идентичность и гомология
Термины гомология или процент идентичности используются в настоящем описании взаимозаменяемо. В контексте настоящего изобретения принимается, что для выявления процента идентичности двух аминокислотных последовательностей или двух последовательностей нуклеиновой кислоты проводят сопоставление указанных последовательностей с целью оптимального сравнения (например, могут
- 6 008607 быть введены гэпы в последовательность первой аминокислоты или в последовательность нуклеиновой кислоты для оптимального сопоставления со второй аминокислотной последовательностью или последовательностью нуклеиновой кислоты). Затем сравнивают аминокислотные остатки или нуклеотиды в соответствующих положениях аминокислоты или в соответствующих положениях нуклеотидов. В том случае, когда положение в первой последовательности занято тем же аминокислотным остатком или нуклеотидом, что и в соответствующем положении во второй последовательности, то молекулы определяются как идентичные в данном положении. Процент идентичности между двумя последовательностями является функцией числа идентичных положений в последовательностях (например, % идентичности = количество идентичных положений/общее количество положений (то есть перекрывающихся положений) х 100). Предпочтительно обе последовательности имеют одинаковую длину.
Специалист в данной области понимает, что имеется несколько разных компьютерных программ, доступных для определения гомологии между двумя последовательностями. Например, сравнение последовательностей и определение процента идентичности между двумя последовательностями может быть осуществлено с использованием математического алгоритма. В предпочтительном варианте процент идентичности между двумя аминокислотными последовательностями определяют по алгоритму Нидлмана и Вунша (№еб1етап апб ХУипксй; 1. Μοί. ΒίοΙ. (48): 444-453 (1970)), который включен в программу САР в составе пакета программного обеспечения ССС (доступен на веб-странице Ы1р://^тете.дсд.сот), с использованием матрицы В1оккот 62 или матрицы РАМ250, и гэпа с весовым значением 16, 14, 12, 10, 8, 6 или 4, и длины с весовым значением 1, 2, 3, 4, 5 или 6. Специалист в данной области понимает, что все указанные различные параметры приведут к несколько измененным результатам, но что общий процент идентичности двух последовательностей не будет существенно изменен при использовании такого алгоритма.
Еще в одном варианте процент идентичности между двумя нуклеотидными последовательностями определяют с использованием программы САР, входящей в состав пакета программного обеспечения ССС (доступен на веб-странице 1и1р://\\л\лу.дс8.со1п). с использованием матрицы Ы^Здарбпа.СМР, и гэпа с весовым значением 40, 50, 60, 70 или 80, и длины с весовым значением 1, 2, 3, 4, 5 или 6. В другом варианте процент идентичности между двумя аминокислотными или нуклеотидными последовательностями определяют по алгоритму Майерса и Миллера (Е. Меуегк апб V. МШет (САВЮ8, 4: 11-17, 1989)), который включен в программу АМСИ (версия 2.0) (доступен на веб-странице Ы1р://уеда.1дй.спгк.1г/Ьш/а11дп-диекк.сд1), с использованием таблицы весовых значений остатков в рамках РАМ120, при отклонении гэпа длиной 12 и гэпа с весовым значением 4.
Последовательности нуклеиновой кислоты и белковые последовательности по настоящему изобретению могут также использоваться в качестве запрашиваемой последовательности для проведения поиска в доступных базах данных для идентификации других представителей семейства или родственных последовательностей. Такие поиски могут проводиться с использованием программ ВЬАЗТЫ и ВЬА8ТХ (версия 2.0) (А11ксйи1, е! а1. (1990) 1. Мо1. Βίο1. 215:403-10). Поиски нуклеотидов в режиме ВЬА8Т могут проводиться с использованием программы ВЕА8ТЫ, где балльный показатель = 100, длина слова =12, с получением нуклеотидных последовательностей, гомологичных молекуле нуклеиновой кислоты для ФЛП03 по настоящему изобретению. Поиски белковых последовательностей в режиме ВЬА8Т могут проводиться с использованием программы ВЬА8ТХ, где балльный показатель = 50, длина слова = 3, с получением аминокислотных последовательностей, гомологичных белковым молекулам ФЛП03 по настоящему изобретению. В варианте сопоставления с включением гэпов для целей сравнения может использоваться гэпированная версия программы Сарреб ВЬА8Т, описанная Е. Альтшулем с соавт. (А11ксйи1, е! а1. (1997) ЫисЩс Ас1бк Век. 25(17): 3389-3402). В случае программ ВЬА8Т и Сарреб ВЬА8Т может использоваться введение по умолчанию параметров соответствующих программ (то есть ВЬА8ТХ и ВЬА8ТН). (См. веб-страницу 1Шр://\\л\лу.псЫ.шт.ш11.доЬ.)
Гибридизация
В контексте настоящего описания термин гибридизация применяется для описания условий гибридизации и промывки, при которых нуклеотидные последовательности по меньшей мере примерно на 50%, по меньшей мере примерно на 60%, по меньшей мере примерно на 70%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 80%, еще более предпочтительно по меньшей мере примерно на 85-90%, более предпочтительно по меньшей мере примерно на 95% гомологичны друг другу и в типичном случае остаются в гибридизованном состоянии друг с другом.
Предпочтительные неограничивающие примеры таких условий гибридизации включают гибридизацию в 6х хлориде натрия/цитрате натрия (88С) при температуре примерно 45°С с последующей одной или более промывками в 1х 88С, 0,1% ДСН при температуре 50°С, предпочтительно при температуре 55°С, предпочтительно при температуре 60°С, еще более предпочтительно при температуре 65°С.
Условия высокой строгости включают, например, гибридизацию при температуре 68°С в 5х 88С/5х растворе Денхардта/1,0% ДСН и промывку в 0,2х 88С/0,1% ДСН при комнатной температуре. Альтернативно, промывка может проводиться при 42°С.
Для специалиста в данной области известно, какие условия применяются для гибридизации в условиях высокой строгости и очень высокой строгости. В данной области имеется руководство, описываю
- 7 008607 щее такие условия, доступное, например, в работах Самбрука с соавт. и Аусубеля с соавт. (БатЬгоок е! а1., 1989, Мо1еси1аг С1ошпд, А ЬаЬота1оту Мапиа1, Со1б 8ρτίη§ НагЬог Ргекк, Ν.Υ., апб АикиЬе1 е! а1. (ебк.), 1995, Сштеп! Рго!осо1к ίη Мо1еси1аг Вю1оду, (1оЬп \УПеу & 8опк, Ν.Υ.)).
Разумеется, полинуклеотид, который гибридизуется только с поли-А последовательностью (такой как поли(А) тракт мРНК на З'-конце) или с комплементарной цепью из Т (или и) остатков, не включается в полинуклеотид по настоящему изобретению, предназначенный для специфической гибридизации с частью нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению, поскольку такой полинуклеотид будет гибридизоваться с любой молекулой нуклеиновой кислоты, содержащей цепь поли(А) или ее комплемент (например, практически с любым клоном двуцепочечной кДНК).
Получение ДНК полной длины из других организмов
В типичной процедуре описываемого подхода могут быть подвергнуты скринингу библиотеки кДНК, созданные на основе других организмов, например нитчатых грибов, в частности видов АкретдШик.
Например, штаммы АкретдШик могут быть подвергнуты скринингу для поиска гомологичных полинуклеотидов методом нозерн-блоттинга. При выявлении транскриптов, гомологичных к полинуклеотидам по настоящему изобретению, с использованием стандартных методик, известных специалистам в данной области, могут быть сконструированы библиотеки кДНК на основе РНК, выделенной из соответствующего штамма. Альтернативно, библиотека общей геномной ДНК может быть подвергнута скринингу с использованием зонда, гибридизуемого с полинуклеотидом по настоящему изобретению.
Гомологичные генные последовательности могут быть выделены при проведении ПЦР с использованием двух вырожденных олигонуклеотидных праймерных пулов, разработанных на основе нуклеотидных последовательностей по настоящему изобретению.
Матрица для реакции может представлять собой кДНК, полученную путем обратной транскрипции мРНК, полученных из штаммов, в отношении которых известно или предполагается, что они экспрессируют полинуклеотид по настоящему изобретению. Продукт ПЦР может быть подвергнут субклонированию и секвенированию для подтверждения того, что амплифицированные последовательности отражают последовательности новой последовательности нуклеиновой кислоты для ФЛП03 или ее функционального эквивалента.
ПЦР фрагмент может также использоваться для выделения клона кДНК полной длины с использованием множества известных способов. Так, например, амплифицированный фрагмент может быть помечен и использован для скрининга библиотеки кДНК бактериофагов или космид. Альтернативно, меченый фрагмент может использоваться для скрининга геномной библиотеки.
Методика ПЦР может также использоваться для выделения последовательности кДНК полной длины из других организмов. Например, РНК может быть выделена по стандартным процедурам из соответствующих клеточных или тканевых источников. Реакция обратной транскрипции может быть проведена на основе РНК с использованием олигонуклеотидного праймера, специфичного, прежде всего, к 5'-концу амплифицированного фрагмента, для осуществления функции затравки в синтезе первой цепи.
К полученному РНК/ДНК гидриду может быть далее привешен фрагмент хвоста (например, с помощью гуанинов) по стандартной методике концевой трансферазной реакции, после чего гибрид может быть расщеплен РНК-азой Н, с осуществлением далее затравочной функции для синтеза второй цепи (например, с помощью поли-С праймера). Таким образом, могут быть без труда выделены последовательности кДНК амплифицированного фрагмента в направлении против хода транскрипции. Обзор используемых методик клонирования приведен, например, в работах Самбрука с соавт. и Аусубеля с соавт. (БатЬгоок е! а1., кирга; и АикиЬе1 е! а1., кирга).
Векторы
Другой аспект настоящего изобретения относится к векторам, предпочтительно векторам экспрессии, содержащим нуклеиновую кислоту, кодирующую белок по настоящему изобретению или его функциональный эквивалент. В контексте настоящего описания термин вектор относится к молекуле нуклеиновой кислоты, способной транспортировать другую нуклеиновую кислоту, к которой она присоединяется. Один тип векторов относится к плазмиде, которая представляет кольцевую двуцепочечную петлю ДНК, внутри которой могут быть лигированы дополнительные сегменты ДНК. Другой тип векторов представляет собой вирусный вектор, отличающийся тем, что в таком вирусном геноме могут быть лигированы дополнительные сегменты ДНК. Некоторые векторы способны к автономной репликации в хозяйской клетке, в которую они вводятся (например, бактериальные векторы, имеющие бактериальный ориджин репликации, и эписомальные векторы млекопитающих). Другие векторы (например, неэписомальные векторы млекопитающих) интегрируются в геном хозяйской клетки при их введении в хозяйскую клетку и таким образом реплицируются вместе с хозяйским геномом. Кроме того, некоторые векторы способны направлять экспрессию генов, с которыми они оперативно связаны. Такие векторы обозначаются в настоящем описании как векторы экспрессии. В целом, векторы экспрессии, используемые в методиках рекомбинантной ДНК, обычно имеют форму плазмид. Термины плазмида и вектор используются взаимозаменяемо в настоящем описании, поскольку плазмида чаще всего представлена в форме вектора. Однако настоящее изобретение включает и другие формы векторов экспрессии, такие как вирусные векторы (например, векторы ретровирусов с дефектами репликации, аденовирусов и аденоас
- 8 008607 социированных вирусов), которые выполняют эквивалентные функции.
Рекомбинантные векторы экспрессии по настоящему изобретению включают нуклеиновую кислоту по настоящему изобретению в форме, подходящей для экспрессии нуклеиновой кислоты в хозяйской клетке, что означает, что рекомбинантный вектор экспрессии включает одну или более регуляторных последовательностей, выбранных с учетом хозяйских клеток, которые будут использоваться для экспрессии, которые оперативно связаны с последовательностью нуклеиновой кислоты, подлежащей экспрессии. В контексте рекомбинантного вектора экспрессии термин оперативно связанный означает, что интересующая нуклеиновая последовательность соединена с регуляторной(ыми) последовательностью(ями) таким способом, который позволяет осуществлять экспрессию нуклеотидной последовательности (например, транскрипцию/трансляцию ίη νίίτο или в хозяйской клетке, когда вектор вводится в хозяйскую клетку). Термин регуляторная последовательность обозначает промоторы, энхансеры и другие контрольные элементы экспрессии (например, сигнал полиаденилирования). Такие регуляторные последовательности описаны в литературе (см., например, Соеббе1; Сепе Ехртеккюп Тес1по1оду: Ме1йобк ίη Еп/уто1оду 185, Асабетк Ргекк, 8ап О|едо. СА (1990)). Регуляторные последовательности включают такие последовательности, которые направляют конститутивную или индуцибельную экспрессию нуклеотидной последовательности в хозяйских клетках многих типов, а также последовательности, которые направляют экспрессию нуклеотидной последовательности только в определенных хозяйских клетках (например, тканеспецифичные регуляторные последовательности). Для специалистов в данной области очевидно, что разработка вектора экспрессии может зависеть от таких факторов, как выбор хозяйской клетки, подлежащей трансформации, желательный уровень экспрессии белка и т.п. Векторы экспрессии по настоящему изобретению могут встраиваться в хозяйские клетки, за счет чего достигается продукция белков или пептидов, кодируемых нуклеиновыми кислотами, раскрытыми в настоящем описании (например, фосфолипаз, мутантных фосфолипаз, их фрагментов, вариантов или функциональных эквивалентов, белков слияния и т.п.).
Рекомбинантные векторы экспрессии по настоящему изобретению могут быть созданы для экспрессии фосфолипаз в прокариотических или эукариотических клетках. Например, белок по настоящему изобретению может экспрессироваться в бактериальных клетках, таких как Е. сой и виды Васб1ик, в клетках насекомых (включая вектор экспрессии бакуловируса), в дрожжевых клетках и в клетках млекопитающих. Подходящие хозяйские клетки описаны также в указанной выше работе (см. Соеббе1, Сепе Ехртеккюп Тесйпо1о§у: МеИобк ίη Епхуто1оду 185, Асабетк Ргекк, 8ап П1едо, СА (1990)). Альтернативно, рекомбинантный вектор экспрессии может транскрибироваться и транслироваться ш νιΙΐΌ, например, с использованием промоторных регуляторных последовательностей Т7 и Т7-полимеразы.
Используемые в настоящем изобретении векторы экспрессии включают векторы хромосомного, эписомального и вирусного происхождения, например вирусы, полученные из бактериальных плазмид, бактериофагов, дрожжевых эписом, хромосомных элементов дрожжей, вирусов, таких как бакуловирусы, паповавирусы, вирусы осповакцины, аденовирусы, вирусы птичьей оспы, вирусы псевдобешенства и ретровирусы, а также векторы, полученные из их сочетаний, такие как векторы, полученные на основе плазмид и генетических элементов бактериофагов, такие как космиды и фагемиды.
Встраиваемая ДНК должна быть оперативно связана с соответствующим промотором, таким как РЬ промотор фага ламбда, 1ас, 1рт и 1ас промоторы Е. сой, ранний и поздний промоторы 8У40, а также промоторы длинных концевых повторов ретровирусов (ЬТК), если ограничиться указанием лишь нескольких наименований. Специалистам в данной области известны другие подходящие промоторы. В конкретном варианте предпочтительными являются промоторы, которые способны направлять высокий уровень экспрессии фосфолипаз в нитчатых грибах. Такие промоторы известны в данной области. Конструкции экспрессии могут содержать сайты инициации и терминации транскрипции, а в транскрибируемой области - сайт связывания рибосом для осуществления трансляции. Кодирующая часть зрелых транскриптов, экспрессируемых такими конструкциями, включает кодон инициации трансляции АИС и кодон терминации транскрипции, расположенные, соответственно, в начале и в конце полипептида, подлежащего трансляции.
Векторная ДНК может быть введена в прокариотические или эукариотические клетки по традиционным методикам трансформации или трансфекции. В контексте настоящего описания термины трансформация и трансфекция используются для обозначения множества известных в данной области методик введения чужеродной нуклеиновой кислоты (например, ДНК) в хозяйскую клетку, включая метод с использованием соосаждения фосфатом кальция или хлоридом кальция, метод трансфекции с использованием ДЭАЭ-декстрана, метод трансдукции, инфекции, липофекции, катионной трансфекции с использованием липидов или электропорации. Подходящие способы трансформации или трансфекции хозяйских клеток описаны, например, в руководстве Самбрука с соавт. и Дэвиса с соавт. (8атЬтоок е! а1. Мо1еси1аг С1ошпд: А ЬаЬога1оту Мапиа1, 2пб еб. Со1б 8рпп§ НагЬог ЬаЬога1огу, Со1б 8рпп§ НагЬог ЬаЬога1огу Ргекк, Со1б 8ртшд НагЬог, ΝΥ, 1989; Ωηνίκ е! а1., Вакк МеИобк ш Мо1еси1аг Вю1оду (1986)) и в других лабораторных руководствах.
В попытках достичь стабильной трансфекции клеток млекопитающих было показано, что лишь небольшая фракция клеток, зависимая от используемого вектора экспрессии и методики трансфекции, мо
- 9 008607 жет интегрировать чужеродную ДНК в свой геном. Для идентификации и отбора таких интегрантов обычно в хозяйские клетки вместе с интересующим геном встраивают ген, который кодирует селектируемый маркер (например, устойчивость к антибиотикам). Предпочтительные селектируемые маркеры включают такие маркеры, которые придают устойчивость к лекарственным средствам, таким как 0418, гигромицин и метотрексат. Нуклеиновую кислоту, кодирующую селектируемый маркер, предпочтительно вводят в хозяйскую клетку с тем же вектором, что и нуклеиновую кислоту, кодирующую белок по настоящему изобретению, или, альтернативно, она может вводиться на отдельном векторе. Клетки, стабильно трансфицированные введенной нуклеиновой кислотой, могут быть идентифицированы путем селекции с лекарственным средством (например, клетки, которые включают селектируемый маркерный ген, будут выживать, тогда как другие клетки погибают).
Экспрессию белков в прокариотах зачастую проводят в клетках Е. сой с использованием векторов, содержащих конститутивные или индуцибельные промоторы, направляющие экспрессию либо белков слияния, либо неслитых белков. Слитые векторы добавляют множество аминокислот к кодируемому белку, например к аминоконцу рекомбинантного белка. Такие слитые векторы в типичном случае служат для достижения трех целей: 1) для повышения экспрессии рекомбинантного белка; 2) для повышения растворимости рекомбинантного белка; и 3) для помощи в очистке рекомбинантного белка за счет функционирования в качестве лиганда при аффинной очистке. Часто, в случае экспрессии слитых векторов, в месте соединения слитого фрагмента и рекомбинантного белка вводят сайт расщепления протеолитическим ферментом для того, чтобы способствовать отделению рекомбинантного белка от слитого фрагмента после очистки белка слияния. Такие ферменты и распознаваемые ими последовательности включают фактор Ха, тромбин и энтерокиназу.
Как отмечалось, вектор экспрессии предпочтительно содержит селектируемые маркеры. Такие маркеры включают дигидрофолатредуктазу или устойчивость к неомицину, в случае культуры эукариотических клеток, и устойчивость к тетрациклину или ампициллину, в случае культивирования Е. сой и других бактерий. Репрезентативные примеры соответствующих хозяйских организмов включают бактериальные клетки, такие как Е. сой, 81тер!отусек и 8а1шоие11а !урЫтигшт; грибные клетки, такие как дрожжи; клетки насекомых, такие как Отокорййа 82 и 8робор!ета 8£9; клетки животных, такие как СНО, СО8 и меланома Вотек, а также растительные клетки. Соответствующие культуральные среды и условия выращивания указанных выше хозяйских клеток известны в данной области.
К числу векторов, предпочтительных для использования в бактериях, относятся рОЕ70. рЦЕ60 и РОЕ-9, доступные от 01адеп; рВ8 векторы, Рйадексйр! векторы, В1иекспр! векторы, рХН8Л, рХН16Л, рХН18Л, рХН46Л, доступные от 8!га!адепе; и р!гс99а, рКК223-3, рКК-233-3, рПК.540, рК1Т5, доступные от Рйаттааа. К числу векторов, предпочтительных для эукариотических клеток, относятся ΡΧΥΕΝΕΟ, р8У2САТ, рОО44, р2Т1 р80, доступные от 8!га!адепе; и р8УК3, рВРУ, рМ80 и р8УЪ, доступные от Рйаттааа. Специалистам в данной области известны также другие подходящие векторы.
Известные бактериальные промоторы, подходящие для использования в настоящем изобретении, включают 1ас1 и 1ас2 промоторы Е. сой, Т3 и Т7 промоторы, др! промотор, РК, РЬ промоторы ламбда фага и !гр промотор, промотор тимидинкиназы Н8У, ранний и поздний промоторы 8У40, промоторы ретровирусных длинных концевых повторов (ЬТК), такие как длинные концевые повторы вируса саркомы Рауса (К8У), и промоторы металлотионеина, такие как мышиный промотор металлотионеина-1.
Встраивание энхансерной последовательности в вектор может повышать уровень транскрипции ДНК, кодирующей полипептиды по настоящему изобретению, у высших эукариотов. Энхансеры представляют собой цис-активные элементы ДНК, обычно включающие от 10 до 300 п.н., которые действуют в плане повышения активности транскрипции промотора в хозяйской клетке данного типа. Примеры энхансеров включают энхансер 8У40, который расположен на поздней стороне ориджина репликации, на участке от 100 до 270 п.н., энхансер раннего промотора цитомегаловируса, энхансер полиомы на поздней стороне ориджина репликации и энхансеры аденовируса.
Для секреции транслированного белка в просвет эндоплазматического ретикулюма, в периплазматическое пространство или во внеклеточное окружение в экспрессированный полипептид может быть включен соответствующий сигнал секреции. Такие сигналы могут быть эндогенными для полипептида или могут представлять собой гетерологичные сигналы.
Полипептиды могут экспрессироваться в модифицированной форме, такой как белок слияния, и они могут включать не только сигналы секреции, но также дополнительные гетерологичные функциональные участки. Так, например, участок, включающий дополнительные аминокислоты, в особенности заряженные аминокислоты, может быть добавлен к Ν-концу полипептида для повышения стабильности и персистенции в хозяйской клетке, а также стабильности в процессе очистки или впоследствии при работе и хранении. К полипептиду для облегчения очистки могут быть также добавлены пептидные группы.
Полипептиды по настоящему изобретению
Настоящее изобретение относится к выделенному полипептиду, имеющему аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8ЕЦ ГО ΝΟ: 3, 6, 9, 12, и 15, или аминокислотную последовательность, получаемую при экспрессии полинуклеотидных последовательностей, выбранных из группы, состоящей из 8ЕЦ ГО ΝΟ: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14, в соответствующей хозяйской клетке.
- 10 008607
В настоящее изобретение входит также пептид или полипептид, включая функциональный эквивалент указанных полипептидов. Указанные выше полипептиды коллективно обозначаются термином полипептиды по настоящему изобретению.
Термины пептид и олигопептид рассматриваются как синонимы (как это обычно принято), и каждый термин может использоваться взаимозаменяемо, как того требует контекст, определяя цепь, состоящую по меньшей мере из двух аминокислот, соединенных пептидными связями. Слово полипептид используется в настоящем описании для обозначения цепей, содержащих более семи аминокислотных остатков. Все олигопептидные и полипептидные формулы или последовательности, приведенные в настоящем описании, написаны слева направо и в направлении от аминоконца к карбоксильному концу. Используемый в описании однобуквенный код аминокислот широко применяется в данной области, расшифровку его можно найти, например, в руководстве Самбрука с соавт. (8ашЬтоок с( а1., Мо1еси1аг С1ошпд: А ЬаЬотаГоту Мапиа1, 2пб еб., Со1б 8ртшд НагЬог ЬаЬотаГоту, Со1б 8ртшд НагЬог ЬаЬотаГоту Ргезз, Со1б 8ртшд НагЬог, ΝΥ, 1989)).
Термин выделенный в отношении полипептида или белка означает полипептид или белок, отобранный из своего нативного окружения. Например, полученные рекомбинантными методами полипептиды и белки, экспрессируемые в хозяйских клетках, рассматриваются в контексте настоящего изобретения как выделенные нативные или рекомбинантные полипептиды, которые были, по существу, очищены по соответствующей методике, такой как, например, одностадийный метод очистки, описанный Смитом и Джонсоном (8шИй аиб 1о1шзоп. Сепе 67:31-40 (1988)).
Фосфолипазы по настоящему изобретению могут быть восстановлены и очищены из культур рекомбинантных клеток известными способами, включающими осаждение сульфатом аммония или этанолом, экстракцию кислотой, анионо- или катионообменную хроматографию, хроматографию на фосфоцеллюлозе, хроматографию на основе гидрофобного взаимодействия, аффинную хроматографию, хроматографию на гидроксилапатите и хроматографию на лектине. Наиболее предпочтительно для очистки используют высокоэффективную жидкостную хроматографию (ВЭЖХ).
Полипептиды по настоящему изобретению включают природные очищенные продукты, продукты, полученные по процедурам химического синтеза, и продукты, получаемые рекомбинантными методиками, из клеток прокариотических или эукариотических хозяйских организмов, включая, например, клетки бактерий, дрожжей, грибов, высших растений, насекомых и млекопитающих. В зависимости от вида хозяйского организма, используемого в процедуре получения рекомбинантного продукта, полипептиды по настоящему изобретению могут быть гликозилированными или не гликозилированными. Кроме того, полипептиды по настоящему изобретению могут также включать исходный модифицированный остаток метионина, в некоторых случаях как результат процессов, определяемых хозяйским организмом.
Белковые фрагменты
Настоящее изобретение также относится к биологически активным фрагментам полипептидов по настоящему изобретению.
Биологически активные фрагменты полипептидов по настоящему изобретению включают полипептиды, содержащие аминокислотные последовательности, идентичные в достаточной мере аминокислотной последовательности фосфолипазы или полученные из нее (например, аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8ЕС ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15), которые включают меньшее число аминокислот, чем белок полной длины, и проявляют по меньшей мере одну биологическую активность соответствующего белка полной длины. В типичном случае биологически активные фрагменты включают домен или мотив по меньшей мере с одной активностью, свойственной соответствующему белку полной длины. Биологически активный фрагмент белка по настоящему изобретению может представлять собой полипептид, который включает, например, 10, 25, 50, 100 или более аминокислот в длину. Кроме того, рекомбинантными методиками могут быть получены другие биологически активные части, в которых делетированы другие области белка, и оценены на наличие одной или более биологических активностей, свойственных нативной форме полипептида по настоящему изобретению.
Настоящее изобретение также относится к фрагментам нуклеиновой кислоты, которые кодируют указанные выше биологически активные фрагменты фосфолипазы.
Белки слияния
Белки по настоящему изобретению или их функциональные эквиваленты, например их биологически активные части, могут быть оперативно связаны с нефосфолипазным полипептидом (например, с гетерологичными аминокислотными последовательностями) с образованием белков слияния. В контексте настоящего описания термины химерный белок или белок слияния относительно фосфолипазы включают фосфолипазный полипептид, оперативно связанный с нефосфолипазным полипептидом.
В предпочтительном варианте белок слияния включает по меньшей мере один биологически активный фрагмент фосфолипазы по настоящему изобретению. В другом предпочтительном варианте белок слияния включает по меньшей мере две биологически активных части фосфолипазы по настоящему изобретению. В контексте белка слияния термин оперативно связанный обозначает, что фосфолипазный и нефосфолипазный полипептиды слиты в открытой рамке считывания друг с другом на Ν-конце или Сконце фосфолипазы.
- 11 008607
Например, в одном варианте настоящего изобретения белок слияния представляет собой белок слияния С8Т-фосфолипазы. в котором фосфолипазные последовательности слиты с С-концом С8Т последовательностей. Такие белки слияния могут облегчать очистку рекомбинантной фосфолипазы. В другом варианте настоящего изобретения белок слияния представляет собой фосфолипазный белок, содержащий гетерологичную сигнальную последовательность на своем Ν-конце. В некоторых хозяйских клетках (например, в хозяйских клетках млекопитающих и дрожжей) экспрессия и/или секреция фосфолипазы может быть повышена путем использовании гетерологичной сигнальной последовательности.
В другом варианте может использоваться секреторная последовательность др67 белка оболочки бакуловируса в качестве гетерологичной сигнальной последовательности (Сиггеп! Рго!осок ίη Мо1еси1аг Βίοίοβν. Аи8иЬе1 е! а1.. ебк.. ίοΐιη \УПеу & 8опк. 1992). Другие примеры гетерологичных сигнальных последовательностей эукариотов включают секреторные последовательности мелитина и щелочной фосфатазы человеческой плаценты (81та!адепе; Ьа 1о11а. Калифорния). Еще в одном примере используемые гетерологичные сигнальные последовательности включают сигнал секреции р1юЛ (8ашЬгоок е! а1.. кирга) и сигнал секреции белка А (Рйатшаша Вю!есй; Р18ка1а^ау. Нью-Джерси).
Сигнальная последовательность может использоваться для облегчения секреции и выделения белка или полипептида по настоящему изобретению. В типичном случае сигнальные последовательности характеризуются наличием ядра из гидрофобных аминокислот, который, в основном, выщепляется из зрелого белка в ходе одного или двух явлений расщепления. Такие сигнальные полипептиды содержат сайты процессинга, которые позволяют расщеплять сигнальную последовательность зрелых белков, когда они вступают в секреторный механизм. Сигнальная последовательность направляет секрецию белка, такого как белок из эукариотического хозяйского организма, который был трансформирован вектором экспрессии, и сигнальная последовательность впоследствии или одновременно подвергается расщеплению. Белок может быть затем легко выделен из внеклеточной среды и очищен известными способами. Альтернативно, сигнальная последовательность может быть связана с интересующим белком с использованием последовательности. которая облегчает очистку. такой как домен С8Т. Таким образом. например. последовательность, кодирующая полипептид, может быть слита с маркерной последовательностью, такой как последовательность. кодирующая пептид. который облегчает очистку слитого полипептида. В некоторых предпочтительных вариантах данного аспекта изобретения маркерная последовательность представляет собой гексагистидиновый пептид. такой как метка. имеющаяся в векторе рОЕ (01адеп. 1пс.). в числе других. многие из которых коммерчески доступны. Как описано в литературе (Сеп1х е! а1.. Ргос. №!1. Асаб. 8сг И8А 86:821-824 (1989)). например. гексагистидин обеспечивает осуществление удобных методик очистки. НА метка представляет собой другой используемый для очистки пептид. который соответствует эпитопу белка гемагглютинина вируса гриппа. описанного. например. Вильсоном с соавт. даюп е! а1.. Се11 37:767 (1984)).
Предпочтительно химерный белок или белок слияния получают по стандартным процедурам на основе рекомбинатной ДНК. Например. фрагменты ДНК. кодирующие разные полипептидные последовательности. лигируют вместе в открытой рамке считывания по традиционным методикам. например путем использования липких концов или ступенчатых разрывов для лигирования. расщепления рестрикционным ферментом с обеспечением соответствующих концов. фланкирования липких концов. где это приемлемо. обработки щелочной фосфатазой для избежания нежелательного связывания и знзиматического лигирования. В другом варианте ген слияния может быть синтезирован традиционными методиками. включающими использование автоматизированного синтезатора ДНК.
Альтернативно. амплификация методом ПЦР фрагментов гена может быть проведена с использованием якорных праймеров. которые дают возможность комплементарно объединить выступающие участки между двумя последовательными генными фрагментами. которые впоследствии могут быть подвергнуты отжигу и повторной амплификации для создания химерной генной последовательности (см.. например. Сиггеп! Рго!осо1§ ίη Мо1еси1аг Вю1оду. ебк.. Лп5иЬе1 е! а1.. 1оНп \УПеу & 8опк: 1992). Кроме того. коммерчески доступно множество векторов экспрессии. которые кодируют слитый фрагмент (например. полипептид С8Т). Нуклеиновая кислота по настоящему изобретению может быть клонирована в таком векторе экспрессии. так что слитый фрагмент связывается в открытой рамке считывания со слитым фрагментом для экспрессии белка слияния. включающего белок по настоящему изобретению.
Функциональные эквиваленты
Термины функциональные эквиваленты и функциональные варианты используются в настоящем описании взаимозаменяемо. Функциональные эквиваленты ДНК. кодирующей фосфолипазу. представляют собой выделенные фрагменты ДНК. которые кодируют полипептид. демонстрирующий конкретную функцию фосфолипазы из ЛкрегдШпк шдег. определенной в настоящем описании. Функциональный эквивалент фосфолипазного полипептида по настоящему изобретению представляет собой полипептид. который демонстрирует по меньшей мере одну из функций фосфолипазы из ЛкрегдШпк шдег. определенной в настоящем описании. В этой связи. функциональные эквиваленты также охватывают биологически активные фрагменты.
Функциональные эквиваленты белка или полипептида могут содержать только консервативные замещения одной или более аминокислот в аминокислотных последовательностях. выбранных из группы.
- 12 008607 состоящей из 8ЕО ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15, или замещения, вставки или делеции аминокислот, не относящихся к незаменимым. Соответственно, аминокислота, не относящаяся к группе незаменимых, представляет собой остаток, который может быть изменен в аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8Е0 ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15, без существенного изменения биологической функции. Так, например, можно полагать, что аминокислотные остатки, которые являются консервативными для фосфолипазных белков по настоящему изобретению, в особенности не подлежат изменениям. Более того, аминокислоты, сохраняющиеся в фосфолипазных белках по настоящему изобретению и других фосфолипазах, также не подлежат изменениям.
Термин консервативное замещение указывает на замещение, при котором один аминокислотный остаток заменен другим аминокислотным остатком, имеющим похожую боковую цепь. Такие семейства известны в данной области и включают аминокислоты с боковой цепью основной природы (например, лизин, аргинин и гистидин), боковой цепью кислотной природы (например, аспарагиновую кислоту, глутаминовую кислоту), аминокислоты с незаряженной полярной боковой цепью (например, глицин, аспарагин, глютамин, серин, треонин, тирозин, цистеин), неполярной боковой цепью (например, аланин, валин, лейцин, изолейцин, пролин, фенилаланин, метионин, триптофан), бета-разветвленной боковой цепью (например, треонин, валин, изолейцин) и ароматической боковой цепью (например, тирозин, фенилаланин, триптофан, гистидин).
В типичном случае функциональные эквиваленты нуклеиновой кислоты могут содержать молчащие мутации, которые не изменяют биологической функции кодируемого полипептида. Соответственно, настоящее изобретение относится к молекулам нуклеиновой кислоты, кодирующим фосфолипазные белки, которые содержат изменения аминокислотных остатков, но которые не являются существенными для конкретной биологической активности. Такие белки отличаются по аминокислотной последовательности от последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8Е0 ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15, но при этом они сохраняют по меньшей мере одну биологическую активность. В одном варианте выделенная молекула нуклеиновой кислоты включает нуклеотидную последовательность, кодирующую белок, где указанный белок включает, по существу, гомологичную аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере на 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологична аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8Е0 ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15.
Рекомендации по получению фенотипически молчащих аминокислотных замен приведены, например, в работе Боуи (Во\\зс. 1.И. е! а1., 8с1еисе 247: 1306-1310 (1990)), где авторы показывают, что имеется два основных подхода для определения толерантности аминокислотной последовательности к изменениям в ее составе. Первый метод основан на эволюционном принципе, когда мутации либо воспринимаются, либо отвергаются естественным отбором. Во втором подходе используется генно-инженерный метод для введения аминокислотных изменений в конкретное положение клонированного гена с проведением впоследствии отбора или скрининга с целью идентификации последовательностей, которые способствуют сохранению функциональной активности. Исследования вышеуказанных авторов показали, что исследованные белки отличаются удивительной толерантностью к аминокислотным заменам. Далее авторы определили, какие изменения являются, скорее всего, допустимыми в конкретном положении белка. Так, например, большая часть заменяемых аминокислотных остатков требует наличия неполярных боковых цепей, тогда как некоторые особенности поверхности боковых цепей, в целом, сохраняются. Другие такие фенотипические молчащие замены описаны, например, в работе Боуи с соавт. (Во\\1е е! а1., кирга) и в приведенных в ней ссылках.
Выделенная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая белок, гомологичный белку, выбранному из группы, состоящей из 8Е0 ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15, может быть получена при введении одной или более нуклеотидных замен, вставок или делеций в кодирующие нуклеотидные последовательности, выбранные из группы, состоящей из 8Е0 ΙΌ N0: 1 и 2, 4 и 5, 7 и 8, 10 и 11, 13 и 14, соответственно, так что одна или более аминокислотных замен, делеций или вставок вводится в кодируемый белок. Эти мутации могут быть введены с помощью стандартных методик, таких как сайт-направленный мутагенез и мутаганез посредством ПЦР.
Термин функциональные эквиваленты также относится к ортологам фосфолипаз из АкрегдШик шдег, приведенных в настоящем описании. Ортологи фосфолипаз из АкрегдШик шдег представляют собой белки, которые могут быть выделены из других штаммов или видов и которые обладают близкой или идентичной биологической активностью. Такие ортологи могут быть без проблем идентифицированы как молекулы, включающие аминокислотную последовательность, которая, по существу, гомологична к аминокислотным последовательностям, выбранным из группы, состоящей из 8Е0 ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15.
В соответствии с определением по настоящему описанию термин по существу, гомологичные относится к первой аминокислотной или нуклеотидной последовательности, которая содержит достаточное или минимальное число аминокислот или нуклеотидов, идентичных или эквивалентных (например, имеющих похожую боковую цепь) второй аминокислотной или нуклеотидной последовательности, так что первая и вторая аминокислотная или нуклеотидная последовательности имеют общий домен. Например, аминокислотные или нуклеотидные последовательности, которые содержат общий домен, характеризуются примерно 60%, предпочтительно 65%, более предпочтительно 70%, еще более предпоч
- 13 008607 тительно 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98 или 99% или более идентичностью и определяются в рамках настоящего описания как достаточно идентичные.
Кроме того, нуклеиновые кислоты, кодирующие другие представители семейства фосфолипаз, которые имеют нуклеотидную последовательность, отличающуюся от нуклеотидной последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8ЕО ΙΌ N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14, также входят в область настоящего изобретения. Кроме того, нуклеиновые кислоты, кодирующие фосфолипазные белки из других видов, которые имеют нуклеотидную последовательность, отличающуюся от нуклеотидной последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8Е0 ΙΌ N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14, также входят в область настоящего изобретения. Молекулы нуклеиновой кислоты, соответствующие вариантам (например, природным аллельным вариантам) и гомологам ДНК по настоящему изобретению, могут быть выделены на основе их гомологии к нуклеиновым кислотам по настоящему изобретению с использованием раскрываемых в настоящем описании кДНК или их соответствующего фрагмента в качестве зонда для гибридизации по стандартным методикам гибридизации, предпочтительно в условиях высокой строгости гибридизации.
Специалисту в данной области понятно, что кроме природных аллельных вариантов последовательностей из АкрегдШик П1дсг. приведенных в настоящем описании, можно получить изменения за счет введения мутации в нуклеотидную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8Е0 ΙΌ N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14, с достижением изменений в аминокислотной последовательности фосфолипазного белка без существенного изменения функции белка.
В другом аспекте настоящего изобретения предлагаются улучшенные варианты фосфолипазы. Улучшенные фосфолипазы представляют собой белки, в которых достигнуто улучшение по меньшей мере одной биологической активности. Такие белки могут быть получены при введении случайных мутаций по всей кодирующей последовательности или по ее части, таких как мутации, вводимые путем мутагенеза по механизму насыщения, при этом получаемые мутанты могут быть экспрессированы рекомбинантно и подвергнуты скринингу на биологическую активность. Например, в настоящей области имеются стандартные тесты для определения ферментативной активности фосфолипаз и таким образом быть отобраны улучшенные белковые варианты.
В предпочтительном варианте фосфолипаза имеет аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15. В другом варианте фосфолипаза, по существу, гомологична аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15, и сохраняет по меньшей мере одну биологическую активность фосфолипазы, выбранной из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15, соответственно, но отличается по аминокислотной последовательности из-за наличия природных вариаций или за счет мутагенеза, описанного выше.
В другом предпочтительном варианте фосфолипаза имеет аминокислотную последовательность, кодируемую фрагментом выделенной нуклеиновой кислоты, способным гибридизоваться с нуклеиновой кислотой, выбранной из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14, предпочтительно в условиях высокой строгости гибридизации. Соответственно, фосфолипаза представляет собой белок, который включает аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере примерно на 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичностью к аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15.
В частности, фосфолипаза представляет собой белок, который включает аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере примерно на 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96,
97, 98, 99% или более гомологичностью к аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, или фосфолипаза представляет собой белок, который включает аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере примерно на 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологична аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕЦ ΙΌ N0: 6, или фосфолипаза представляет собой белок, который включает аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере примерно на 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологична аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕЦ ΙΌ N0: 9, или фосфолипаза представляет собой белок, который включает аминокислотную последовательность, характеризующуюся по меньшей мере примерно на 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичностью аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕЦ ΙΌ N0: 12, или фосфолипаза представляет собой белок, который включает аминокислотную последовательность, которая по меньшей мере примерно на 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 95, 96, 97,
98, 99% или более гомологична аминокислотной последовательности, показанной в 8ЕЦ ΙΌ N0: 15.
Функциональные эквиваленты белка по настоящему изобретению могут быть также идентифицированы, например, путем скрининга библиотек комбинаторных мутантов, например укороченных мутантов белка по настоящему изобретению на фосфолипазную активность. В одном варианте библиотеку мозаичных вариантов создают путем комбинаторного мутагенеза на уровне нуклеиновой кислоты. Библиотека мозаичных вариантов может быть получена, например, путем энзиматического лигирования смеси синтетических олигонуклеотидов в генных последовательностях, так что множество потенциальных белковых последовательностей, определяемое вырожденностью кода, экспрессируется в виде отдельных полипептидов или, альтернативно, в виде набора более крупных белков слияния (например, для
- 14 008607 индикации фага). Имеется множество разнообразных способов, которые могут использоваться для создания библиотек возможных вариантов полипептидов по настоящему изобретению на основе вырожденной олигонуклеотидной последовательности. Методы синтеза вырожденных олигонуклеотидов известны в данной области (см., например, №1гапд (1983) Те1гаИейгоп 39:3; Йакига е! а1. (1984) Аппи. Кеу. ВюсИет. 53: 323; Йакига е! а1. (1984) 8с1епсе 198: 1056; Ле е! а1. (1983) №.1с1е1с Ас1йк Век. 11:477).
Кроме того, библиотеки фрагментов кодирующей последовательности для полипептида по настоящему изобретению могут использоваться для создания мозаичной популяции полипептидов с целью скрининга путем отбора вариантов. Например, может быть создана библиотека фрагментов кодирующих последовательностей путем обработки нуклеазой двуцепочечного фрагмента интересующей кодирующей последовательности после ПЦР в условиях, когда одноцепочечные разрывы происходят только один раз на молекулу, с проведением впоследствии денатурации двуцепочечной ДНК, ренатурации ДНК с образованием двуцепочечной ДНК, которая может включать смысловые/антисмысловые пары из разных продуктов с ник-разрывами, удалением одноцепочечных частей из реформированных дуплексов путем обработки нуклеазой 81 и лигированием полученной библиотеки фрагментов в векторе экспрессии. С помощью этого способа может быть получена библиотека экспрессии, относящаяся к кодированию N концевых и внутренних фрагментов разного размера интересующего белка.
В данной области известно несколько методик скрининга генных продуктов в комбинаторных библиотеках, полученных путем точечных мутаций или процессирования, и скрининга библиотек кДНК для поиска генных продуктов, обладающих выбранным свойством. Наиболее часто используемые методики, которые позволяют осуществлять масштабный анализ при скрининге больших генных библиотек, включают в типичном случае клонирование генной библиотеки в реплицируемых векторах экспрессии, трансформацию подходящих клеток полученной библиотекой векторов и экспрессию комбинаторных генов в условиях, при которых обнаружение желаемой активности облегчает выделение вектора, кодирующего ген, продукт которого был выявлен. Рекурсивный согласованный мутагенез (РСМ (КЕМ)) представляет собой методику, которая повышает частоту образования функциональных мутантов в библиотеке и которая может использоваться в сочетании с методами скрининга для идентификации белка по настоящему изобретению (Агкш апй Уоигуап (1992) Ргос. №И. Асай. 8ск И8А 89: 7811-7815; Пе1дгауе е! а1. (1993) Рго!ет Епдшееппд 6(3): 327-331).
Для специалистов в данной области очевидно, что полиморфизм последовательности ДНК, ведущий к изменениям в аминокислотной последовательности фосфолипазы, может существовать только внутри данной конкретной популяции. Такой генетический полиморфизм может существовать в клетках из разных популяций или внутри отдельной популяции за счет наличия природных аллельных вариаций. Аллельные варианты могут также включать функциональные эквиваленты.
Фрагменты полинуклеотида по настоящему изобретению могут также включать полинуклеотиды, не кодирующие функциональные полипептиды. Такие полинуклеотиды могут функционировать в качестве зондов или праймеров для ПЦР.
Нуклеиновые кислоты по настоящему изобретению, независимо от того, кодируют они функциональные или нефункциональные полипептиды, могут использоваться в качестве зондов для гибридизации и в качестве праймеров для полимеразной цепьевой реакции (ПЦР). Использование молекул нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению, которые не кодируют полипептид с фосфолипазной активностью, включает, в том числе, (1) выделение гена, кодирующего фосфолипазу по настоящему изобретению, или его аллельных вариантов из библиотеки кДНК, например из организмов, отличных от АкрегдШик шдег, (2) гибридизацию ΐπ кйи (например, по методике ΡΙ8Η) с метафазными хромосомными пластинками для обеспечения точной хромосомной локализации ФЛП03 гена, как описано в работе Верма с соавт. (Уегта е! а1., Нитап СИготокотек: а Мапиа1 о£ Вакю Тесйтдиек, Регдатоп Ргекк, №\ν Уогк (1988); (3) нозерн-блоттинговый анализ для выявления экспрессии мРНК фосфолипазы в специфических тканях и/или клетках и (4) использование зондов и праймеров в качестве диагностического инструмента для анализа наличия нуклеиновой кислоты, гибридизуемой с фосфолипазным зондом в данном биологическом образце (например, в ткани).
Настоящее изобретение также относится к способу получения функционального эквивалента гена или кДНК, кодирующих фосфолипазу. Такой способ связан с получением меченого зонда, который включает выделенную нуклеиновую кислоту, кодирующую полную последовательность или часть последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15 или ее варианта; с последующим скринингом библиотеки фрагментов нуклеиновой кислоты с меченым зондом в условиях, которые позволяют осуществлять гибридизацию зонда с фрагментами нуклеиновой кислоты из библиотеки с образованием дуплекса нуклеиновой кислоты и с образованием генной последовательности полной длины на основе фрагментов нуклеиновой кислоты от любого меченого дуплекса, что позволяет получить ген, родственный гену фосфолипазы.
В одном варианте нуклеиновая кислота по настоящему изобретению по меньшей мере на 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологична последовательности нуклеиновой кислоты, выбранной из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14 или комплементарных последовательностей.
- 15 008607
В другом предпочтительном варианте полипептид по настоящему изобретению по меньшей мере на 40, 45, 50, 55, 60, 65, 70, 75, 80, 85, 90, 91, 92, 93, 94, 95, 96, 97, 98, 99% или более гомологичен аминокислотной последовательности, выбранной из группы, состоящей из 8ЕО ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15.
Хозяйские клетки
В другом варианте настоящее изобретение относится к клеткам, например трансформированным хозяйским клеткам или рекомбинантным хозяйским клеткам, которые содержат нуклеиновую кислоту по настоящему изобретению. Термины трансформированная клетка или рекомбинантная клетка относятся к клетке, в которую (или в ее предшественник) была введена нуклеиновая кислота по настоящему изобретению, например, по методике рекомбинантной ДНК. В область настоящего изобретения включаются и прокариотические, и эукариотические клетки, например бактерии, грибы, дрожжи и т.п., особенно предпочтительными клетками являются клетки нитчатых грибов, в частности АзрегдШиз шдег.
Может быть выбрана хозяйская клетка, которая модулирует экспрессию введенных последовательностей или модифицирует и процессирует генный продукт определенным, желательными образом. Такие модификации (например, гликозилирование) и процессирование (например, расщепление) белковых продуктов могут способствовать оптимальному функционированию белка.
Различные клетки обладают характерными и специфическими механизмами для осуществления посттрансляционного процессинга и модификации белков и генных продуктов. Могут быть выбраны соответствующие клеточные линии или системы хозяйских клеток, известные специалистам в области молекулярной биологии и/или микробиологии, которые обеспечивают желательную и корректную модификацию и процессинг экспрессированного чужеродного белка. Для указанных целей могут быть выбраны эукариотические хозяйские клетки, которые обладают клеточным механизмом для осуществления соответствующего процессинга первичного транскрипта, гликозилирования и фосфорилирования генного продукта. Такие хозяйские клетки известны в данной области.
Хозяйские клетки также включают, без ограничения, клеточные линии млекопитающих, такие как СНО, УЕКО, ВНК, НеЬа, СО8, МОСК, 293, 3Т3, ^138 и клеточные линии сосудистого сплетения (сйогсаб р1ехиз).
При необходимости, полипептиды по настоящему изобретению могут быть получены с помощью стабильно трансфицированной клеточной линии. Доступно множество векторов, пригодных для стабильной трансфекции клеток млекопитающих, и широко известны способы конструирования таких клеточных линий (см., например, АизиЬе1 е! а1., зирга).
Антитела
Настоящее изобретение также относится к антителам, таким как моноклональные или поликлональные антитела, которые специфически связаны с фосфолипазами по настоящему изобретению.
В контексте настоящего описания термины антитело (Ат) или моноклональное антитело (Мат) обозначают интактные молекулы, а также фрагменты антител (такие, как, например, ЕаЬ и Е(аЬ')2 фрагменты), которые способны к специфическому связыванию с белком ФЛП03. ЕаЬ и Е(аЬ')2 фрагменты утратили Ес-фрагмент интактного антитела, и, в этой связи, они быстрее удаляются из кровотока и характеризуются меньшей степенью неспецифического связывания с тканями, чем интактные антитела (\УаЫ е! а1., 1. №с1. Меб. 24: 316-325 (1983)). Таким образом, указанные фрагменты являются предпочтительными.
Антитела по настоящему изобретению могут быть получены с использованием множества способов. Например, клетки, экспрессирующие фосфолипазу и ее антигенный фрагмент, могут быть введены животному для индукции образования сыворотки, содержащей поликлональные антитела. В предпочтительном способе получают препарат фосфолипазы и очищают его с целью, по существу, полного освобождения от природных контаминантов. Такой препарат затем вводят в организм животного для образования поликлональной антисыворотки с большей удельной активностью.
В наиболее предпочтительном способе антитела по настоящему изобретению представляют собой моноклональные антитела (или их фрагменты, связывающиеся с фосфолипазой). Такие моноклональные антитела могут быть получены с использованием методики получения гибридом (КоШег е! а1., №-11иге 256:495 (1975); КоШег е! а1., Еиг. 1. 1ттипо1. 6:511 (1976); НаттеШпд е! а1., Ιη: Мопос1опа1 АпйЬоб1ез апб Т-Се11 НуЬпботаз, Е1зеу1ег, Ν.Υ., рр. 563-681 (1981)). В целом, такие процедуры включают иммунизацию животного (предпочтительно мыши) белком по настоящему изобретению или клеткой, экспрессирующей белок по настоящему изобретению. Экстрагируют спленоциты из таких мышей и сливают их с соответствующей миеломной клеточной линией. В целях настоящего изобретения может использоваться любая подходящая миеломная клеточная линия, однако, предпочтительно использовать родительскую миеломную клеточную линию (8Р2О), доступную из Американской Коллекции типовых культур (Атепсап Туре Си1Шге Со11есбоп, ВоскуШе, Магу1апб). После слияния полученные гибридомные клетки селективно поддерживают в среде НАТ и затем клонируют методом серийных разведений, как описано, например, в работе Вэндса с соавт. (ХУапбз е! а1. 6аз!го-еп!его1оду 80: 225-232 (1981)). Гибридомные клетки, полученные при таком отборе, затем анализируют для идентификации клонов, которые секретируют антитела, способные связывать белковый антиген ФЛП03. В основном, полипептиды могут быть связаны с белкомносителем, таким как КЕН, как описано в работе Аусубеля с соавт. (АизиЬе1 е! а1., зирга), в смеси с адъювантом и затем инъецированы в организм хозяина млекопитающего.
- 16 008607
В частности, различные животные-хозяева могут быть иммунизированы путем инъекции полипептида по настоящему изобретению. Примеры подходящих хозяйских организмов включают кроликов, мышей, морских свинок и крыс. Могут использоваться различные адъюванты для повышения иммунологического ответа, в зависимости от вида хозяйского организма, которые включают, без ограничения, адъювант Фрейнда (полный и неполный), адъюванты на основе минеральных гелей, такие как гидроксид алюминия, поверхностно-активные вещества, такие как лизолецитин, плуроновые полиоли, полианионы, пептиды, масляные эмульсии, гемоцианин лимфы улитки, динитрофенол, вакцина БЦЖ (бацилла Кальмете-Герена) и СогупеЬас1егшт рагуцт. Поликлональные антитела представляют собой гетерогенную популяцию антительных молекул, получаемых из сыворотки иммунизированных животных.
Такие антитела могут относиться к любому классу иммуноглобулинов, включая 1дС, 1дМ, 1дЕ, 1дА, Ι§Ό и любой их подкласс. Гибридомы, продуцирующие Мат по настоящему изобретению, могут культивироваться ίη νίΐτο или ίη νίνο.
Поликлональные или моноклональные антитела после их получения тестируют на способность к специфическому распознаванию белка по настоящему изобретению или его функционального эквивалента в иммунологическом тесте, таком как вестерн-блоттинг или анализ на основе иммунопреципитации с использованием стандартных методик, описанных, например, в работе Аусубеля с соавт. (АикиЬе1 е1 а1., кирга). В настоящем изобретении используют антитела, которые специфически связываются с белком по настоящему изобретению или его функциональными эквивалентами. Например, такие антитела могут использоваться в иммунологическом анализе для выявления белка по настоящему изобретению в патогенных или непатогенных штаммах АкрегдШик (например, в экстрактах АкрегдШик).
Предпочтительно антитела по настоящему изобретению получают с использованием фрагментов белка по настоящему изобретению, которые могут обладать антигенностью, по таким критериям, как высокая частота встречаемости заряженных остатков. Например, такие фрагменты могут быть получены по стандартным методикам осуществления ПЦР и затем клонированы в векторе экспрессии рСЕХ (АикиЬе1 е1 а1., кирга). Белки слияния могут быть затем экспрессированы в Е.соБ и очищены с помощью аффинной матрицы на основе глютатионагарозы, как описано в работе Аусубеля с соавт. (АикиЬе1 е1 а1., кирга). При необходимости, для каждого белка может быть получено несколько слияний (например, два или три), и каждый такой белок слияния может быть инъецирован по меньшей мере двум кроликам. Образование антисыворотки может быть индуцировано серией инъекций, включающих в типичном случае три бустер-инъекции. В типичном случае антисыворотки тестируют на их способность к иммунопреципитации рекомбинантного полипептида ФЛП03 или его функциональных эквивалентов, тогда как неродственные белки могут служить контролем для оценки специфичности иммунной реакции.
Альтернативно, методики, описанные для получения одноцепочечных антител (патенты США №№ 4946778 и 4704692), могут быть адаптированы для получения одноцепочечных антител к белку по настоящему изобретению или его функциональных вариантов. Наборы для создания и скрининга библиотек фаговой активности выпускаются, например, компанией Багтас1а.
Дополнительные примеры способов и реагентов, особенно пригодных для использования с целью создания и скрининга библиотеки антител, могут быть найдены в патентной литературе (патент США № 5223409; публикация РСТ Νο. νθ 92/18619; публикация РСТ Νο. νθ 91/17271; публикация РСТ Νο. \ν0 20791; публикация РСТ Νο. νθ 92/207 91; публикация РСТ Νο. νθ 92/15679; публикация РСТ Νο. νθ 93/01288; публикация РСТ Νο. νθ 92/01047; публикация РСТ Νο. νθ 92/09690; публикация РСТ Νο. νθ 90/02809; Бисйк е1 а1. (1991) Βΐο/ΤοΛηο^ 9: 1370-1372; Нау е1 а1. (1992) Нит. АпЙюб. ЩЬи^тав 3: 81-85; Нике е1 а1. (1989) Зс1епсе 246; 1275-1281; СгЖШк е1 а1. (1993) ЕМВ0 1. 12: 725-734).
Поликлональные и моноклональные антитела, которые специфически связываются с белком по настоящему изобретению или его функциональными эквивалентами, могут использоваться, например, для выявления экспрессии гена, кодирующего белок по настоящему изобретению или его функциональный эквивалент, например, в штамме, отличном от АкрегдШик. Например, белок по настоящему изобретению может быть без труда обнаружен методами традиционного иммунологического анализа клеток АкретдШик или их экстрактов. Примеры соответствующих методик включают, без ограничения, вестерн-блоттинг, ИФТФА, радиоиммуноанализ (РИА) и т.п.
Термин специфически связывается в контексте настоящего описания означает, что антитело распознает и связывается с конкретным антигеном, например белком по настоящему изобретению, но, по существу, не распознает и не связывается с другими неродственными молекулами в образце.
Антитела могут очищены, например, методами аффинной хроматографии, в которых полипептидный антиген иммобилизован на смоле.
Антитела (например, моноклональные антитела) к белку по настоящему изобретению могут использоваться для выделения белка стандартными методиками, такими как аффинная хроматография или иммунопреципитация. Кроме того, такие антитела могут использоваться для обнаружения белка (например, в клеточном лизате или супернатанте клеток) для оценки наличия и картины экспрессии белка. Антитела могут также использоваться в методах диагностики для оценки уровня белка в клетках или тканях как часть процедуры клинического тестирования, например для определения эффективности данного режима лечения или при диагностике аспергиллеза.
- 17 008607
Связывание антитела с выявляемым веществом может облегчать его обнаружение. Примеры выявляемых веществ включают различные ферменты, простетические группы, флуоресцентные материалы, люминесцентные материалы, биолюминесцентные материалы и радиоактивные материалы. Примеры подходящих ферментов включают пероксидазу хрена, щелочную фосфатазу, β-галактозидазу или ацетилхолинэстеразу; примеры подходящих флуоресцентных материалов включают умбеллиферон, флуоресцеин, изотиоцианат флуоресцеина, родамин, дихлортриазиниламинфлуоресцеин, дансилхлорид или фикоэритрин; примером люминесцентного материала является люминол; примеры биолюминесцентных материалов включают люциферазу, люциферин и акворин; примеры подходящих радиоактивных материалов включают 1251, 131Ι, 35§ или 3Н.
Предпочтительные эпитопы антигенного пептида представляют собой участки, которые расположены на поверхности белка, например гидрофильные участки. Для идентификации гидрофильных участков могут быть использованы карты гидрофобности белков.
Антигенный пептид или белок по настоящему изобретению включает по меньшей мере 7, предпочтительно 10, 15, 20 или 30 последовательных аминокислотных остатков в аминокислотной последовательности, выбранных из группы, состоящей из 8ЕО ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15, и охватывают эпитоп белка, так что индуцированное против пептида антитело образует специфический иммунный комплекс с данным белком. Предпочтительные эпитопы, имеющиеся на антигенном пептиде, представляют собой участки белка по настоящему изобретению, которые расположены на поверхности белка, например гидрофильные участки, гидрофобные участки, участки, содержащие альфа-спирали, участки, содержащие бета-цепи или бета-складчатую конформацию, спиральные участки, участки с завитой структурой и гибкие участки.
Иммунологические анализы
Качественное или количественное определение белка по настоящему изобретению в биологическом образце может быть осуществлено с использованием любого известного в данной области метода. Методики, основанные на действии антител, имеют определенное преимущество при анализе уровня конкретного полипептида в биологическом образце. В таких процедурах специфическое распознавание обеспечивается первичным антителом (поликлональным или моноклональным), тогда как вторичная система обнаружения может использовать флуоресцентное антитело, энзимсвязанное антитело или другие конъюгированные вторичные антитела. В результате образуется иммунный комплекс.
Соответственно, настоящее изобретение относится к способу диагностики инфекции определенного организма АкрегдШик, включающего стадии:
выделения биологического образца из указанного организма, в отношении которого имеется подозрение на инфицирование АкрегдШик, проведения реакции указанного образца с антителом по настоящему изобретению, выявления наличия образованных иммунных комплексов.
Ткани могут быть также экстрагированы, например, с использованием мочевины и нейтрального детергента для высвобождения белка с целью использования в вестерн-блоттинге или дот/слот-анализе. Такие методики могут также применяться для анализа жидкостей организма.
Другие способы, основанные на использовании антител для выявления белка по настоящему изобретению, включают методы иммуноанализа, такие как иммуноферментный твердофазный анализ (ИФТФА) и радиоиммуноанализ (РИА). Например, моноклональные антитела к белку по настоящему изобретению могут использоваться как в качестве иммуносорбента, так и в качестве меченного ферментом зонда для обнаружения и количественного определения белка по настоящему изобретению. Количество конкретного белка, присутствующего в образце, может быть вычислено относительно его количества, присутствующего в стандартном препарате, с использованием компьютерного алгоритма линейной регрессии. В другом методе ИФТФА могут использоваться два разных специфических моноклональных антитела для выявления белка по настоящему изобретению в биологической жидкости. В рамках такого анализа одно из антител используют в качестве иммуносорбента, а второе - в качестве меченного ферментом зонда.
Указанные выше методики могут осуществляться, по существу, в режиме одностадийного или двустадийного анализа. Одностадийный анализ включает приведение в контакт белка по настоящему изобретению с иммобилизованным антителом с последующим приведением смеси, без промывки, в контакт с меченым антителом. Двустадийный анализ включает промывку перед осуществлением контакта смеси с меченым антителом. Другие традиционные способы также могут использоваться согласно потребности. Обычно бывает желательно иммобилизовать один компонент анализируемой системы на подложке, что позволяет привести другие компоненты системы в контакт с данным компонентом и затем легко удалить из образца.
Подходящие для мечения ферменты включают, например, ферменты оксидазной группы, которые катализируют образование перекиси водорода при взаимодействии с субстратом. Активность оксидазной метки может быть проанализирована путем измерения концентрации перекиси водорода, образуемого в реакции меченного ферментом антитела/субстрата.
Другие приемлемые метки, кроме ферментов, включают радиоактивные изотопы, такие как йод (125Ι, 131Ι), углерод (14С), сера (358), тритий (3Н), индий (1121п) и технеций (99тТс), а также флуоресцентные
- 18 008607 метки, такие как флуоресцеин и родамин, а также биотин.
Специфическое связывание исследуемого соединения с белком по настоящему изобретению может быть выявлено, например, ш νίΙΐΌ путем обратимой или необратимой иммобилизации белка по настоящему изобретению на субстрате, например на поверхности ячейки в 96-ячеечном полистироловом микротитрационном планшете. Способы иммобилизации полипептидов и других малых молекул известны в данной области техники. Например, микротитрационные планшеты могут быть покрыты белком по настоящему изобретению путем добавления к каждой ячейке белка в растворе (в типичном случае в концентрации 0,05-1 мг/мл в объеме 1-100 мкл) с последующей инкубацией планшетов при температуре от комнатной до 37°С в течение периода времени от 0,1 до 36 ч. Белки, которые не связываются с планшетом, могут быть удалены с избытком раствора из планшета путем встряхивания с последующей промывкой планшета (однократной или повторной) водой или буфером. В типичном случае полипептид содержится в воде или буфере. Затем планшет промывают буфером, который удаляет связанный полипептид. Для блокирования свободных сайтов связывания белка на планшетах на указанные планшеты вносят для блокирования белок, не родственный связанному полипептиду. Например, можно использовать 300 мкл бычьего сывороточного альбумина (БСА) в концентрации 2 мг/мл в Трис-НС1. Приемлемые субстраты включают такие субстраты, которые обладают определенной сшитой структурой (например, пластиковые субстраты, такие как полистироловые, стироловые или полипропиленовые субстраты, например, от компании Корнинг Костар (Согшпд Сок!аг Согр. (СатЬпбде, МА)). При желании, в качестве субстрата могут использоваться гранулярные частицы, например гранулярная агароза или гранулярная сефароза.
Связывание исследуемого соединения с белками по настоящему изобретению может быть обнаружено с помощью множества известных в технике способов. Так, например, в иммуноанализе может использоваться специфическое антитело. При необходимости, антитело может быть помечено (например, флуоресцентной или радиоизотопной меткой) и выявлено непосредственно (см., например, \Уек1 апб МсМаРоп, 1. Се11. Вю1. 74:264, 1977). Альтернативно, для выявления может использоваться второе антитело (например, меченое антитело, которое связывает Рс-часть антитела к А№7). В альтернативном способе обнаружения белок по настоящему изобретению метят (например, путем мечения белка по настоящему изобретению радиоактивным изотопом, флуорофором, хромофором и т.п.) и затем выявляют введенную метку. Еще в одном способе белок по настоящему изобретению получают в виде белка слияния с белком, который может быть выявлен оптическим методом, например с зеленым флуоресцентным белком (который может быть обнаружен в УФ-свете). В альтернативном методе белок по настоящему изобретению может быть ковалентно присоединен или слит с ферментом, обладающим выявляемой ферментативной активностью, таким как пероксидаза хрена, щелочная фосфатаза, α-галактозидаза и глюкозооксидаза. Гены, кодирующие все такие ферменты, были клонированы и доступны специалистам в данной области для работы. При необходимости, белок слияния может включать антиген, и такой антиген может быть выявлен и количественно определен с помощью поликлонального или моноклонального антитела по традиционным методикам. Подходящие антигены включают ферменты (например, пероксидазу хрена, щелочную фосфатазу, α-галактозидазу) и неферментативные полипептиды (например, сывороточные белки, такие как БСА и глобулины, а также белки молока, такие как казеины).
Эпитопы, антигены и иммуногены
В другом аспекте настоящее изобретение относится к пептиду или полипептиду, включающему эпитопсодержащую часть полипептида по настоящему изобретению. Эпитоп указанной части полипептида представляет собой иммуногенный или антигенный эпитоп полипептида по настоящему изобретению. Термин иммуногенный эпитоп определяется как часть белка, которая проявляет антительную реакцию, когда целый белок является иммуногеном. Считается, что указанные иммуногенные эпитопы ограничены несколькими локусами молекулы. С другой стороны, участок белковой молекулы, к которому может присоединяться антитело, определяется как антигенный эпитоп. Количество иммуногенных эпитопов в белке, в основном, меньше, чем количество антигенных эпитопов (см., например, Сеукеп, Н.М. е! а1., Ргос. №б. Асаб. 8сР И8А 81: 3998-4002 (1984)).
Что касается выбора пептидов или полипептидов, несущих антигенный эпитоп (то есть участок белковой молекулы, с которым может связаться антитело), то в данной области хорошо известно, что относительно короткие синтетические пептиды, которые имитируют часть белковой последовательности, обычно способны проявлять свойства антисыворотки, которая реагирует с частично имитированным белком (см., например, 8и!с11йе, РС. е! а1., 8с1епсе 219:660-666 (1984)). Пептиды, способные проявлять свойства сывороток, реактивных в отношении белка, которые зачастую отражаются в первичной последовательности белка, могут быть охарактеризованы набором простых химических правил, которые не ограничиваются ни иммунодоминантными участками интактных белков (например, иммуногенными эпитопами), ни амино- или карбоксильными концами. Пептиды, которые характеризуются чрезвычайной гидрофобностью, и пептиды, содержащие шесть или менее остатков, в основном, не эффективны с точки зрения индукции антител, которые связываются с имитированными белками; тогда как более длинные растворимые пептиды, особенно пептиды, содержащие пролиновые остатки, обычно эффективны (8и!с11йе е! а1., кирга, а! 661). Например, 18 из 20 пептидов, полученных в соответствии с методиками указанных
- 19 008607 руководств, которые содержат 8-39 остатков, охватывающих 75% последовательности полипептидной цепи гемагглютинина вируса гриппа НА1, индуцируют антитела, которые взаимодействуют с НА1 белком или интактным вирусом, и 12/12 пептидов на основе полимеразы МиЬУ и 18/18 на основе гликопротеина вируса бешенства индуцируют антитела, которые осаждают соответствующие белки.
В этой связи пептиды и полипептиды по настоящему изобретению, несущие антигенные эпитопы, могут использоваться для индукции антител, включая моноклональные антитела, которые специфически связываются с полипептидом по настоящему изобретению. Таким образом, высокая доля гибридом, получаемых при слиянии селезеночных клеток от доноров, иммунизированных пептидом с антигенным эпитопом, в основном, секретирует антитело, реактивное с нативным белком (§и!с11ГГе, е! а1., зирга, а! 663). Антитела, индуцированные пептидами или полипептидами, несущими антигенные эпитопы, используются для обнаружения имитированного белка, а антитела к различным пептидам могут использоваться для отслеживания метаболизма различных участков белкового предшественника, который подвергается посттрансляционному процессингу. Пептиды и непептидные антитела могут использоваться в различных качественных и количественных методах анализа имитированного белка, например в конкурентном анализе, поскольку было показано, что даже короткие пептиды (например, включающие около 9 аминокислот) могут связываться и замещать более крупные пептиды в тестах с иммунопреципитацией (см., например, ХСИзот Ι.Α., е! а1., Се11 37:767-778 а! 777 (1984)). Антитела к пептидам по настоящему изобретению также используются для очистки имитированного белка, например, с помощью абсорбционной хроматографии с использованием известных в данной области методов.
Пептиды и полипептиды по настоящему изобретению, несущие антигенные эпитопы, разработанные в соответствии с указанными выше руководствами, предпочтительно содержат последовательность, включающую по меньшей мере 7, более предпочтительно по меньшей мере 9 и наиболее предпочтительно по меньшей мере от примерно 15 до примерно 30 аминокислот в составе аминокислотной последовательности полипептида по настоящему изобретению. Однако пептиды или полипептиды, включающие более крупный участок аминокислотной последовательности полипептида по настоящему изобретению, содержащие от примерно 30 до примерно 50 аминокислот, или участок любой другой длины, вплоть до полной аминокислотной последовательности полипептида по настоящему изобретению, также рассматриваются как пептиды или полипептиды по настоящему изобретению, несущие эпитопы, и также используются для индукции антител, которые взаимодействуют с имитированным белком. Предпочтительно аминокислотную последовательность пептида, несущего эпитопы, выбирают таким образом, чтобы обеспечить существенную растворимость в водных растворителях (например, последовательность включает относительно гидрофильные остатки, тогда как высоко гидрофобные последовательности предпочтительно не используются); и особенно предпочтительны последовательности, содержащие пролиновые остатки.
Пептиды и полипептиды по настоящему изобретению, несущие эпитопы, могут быть получены традиционными способами получения пептидов или полипептидов, включая рекомбинантные способы с использованием молекул нуклеиновой кислоты по настоящему изобретению. Например, короткая аминокислотная последовательность, несущая эпитоп, может быть слита с более крупным полипептидом, который действует как носитель в процессе рекомбинантного получения и очистки, а также в процессе иммунизации для индукции антител к пептиду.
Пептиды, несущие эпитоп, могут быть также синтезированы с использованием известных методов химического синтеза. Например, НоидЫеп описал простую методику синтеза большого числа пептидов, таких как по 10-20 мг 248 разных пептидов из 13 остатков, представляющих варианты сегмента НА1 полипептида по одной аминокислоте, который был получен и охарактеризован (в исследованиях по связыванию с использованием ИФТФА) менее чем за 4 недели (Ноидб!еп, К.А., Ргос. №И. Асаб. 8с1. И8А 82: 5131-5135 (1985)). Указанный процесс одновременного множественного пептидного синтеза (ОМПС) (81ти11апеоиз Ми1бр1е Рерббе 8уп!без1з (8МР8)) описан в патенте США № 4631211 (Ноидб!еп, е! а1. (1986)). В этой процедуре отдельные смолы для твердофазного синтеза различных пептидов содержатся в отдельных пакетах, проницаемых для растворителя, что позволяет оптимально использовать многие идентичные повторяющиеся стадии, входящие в методики твердофазного синтеза. Полностью ручная процедура позволяет осуществлять одновременно 500-1000 или более синтезов (Ноидб!еп, е! а1., зирга, а! 5134).
Пептиды и полипептиды по настоящему изобретению, несущие эпитоп, могут использоваться для индукции антител по настоящему изобретению в соответствии с методиками, известными в данной области (см., например, 8и!сбГГе е! а1., зирга; ХУПзоп е! а1., зирга; Сботе, М. е! а1., Ргос. Ν;·ι11. Асаб. δα. И8А 82: 910-914; апб Вббе, Р.1. е! а1., 1. Сеп. Убо1. 66: 2347-2354 (1985)). В целом, в соответствии с указанными методиками животные могут быть иммунизированы свободным пептидом; однако, титр антител к пептиду может быть получен бустинг-инъекцией при связывании пептида с макромолекулярным носителем, таким как гемоцианин лимфы улитки (ГЛУ) или столбнячный токсин. Например, пептиды, содержащие цистеин, могут быть связаны с носителем с использованием линкера, такого как малеимидобензоил-№гидроксисукцинимидный эфир (МБС), тогда как другие пептиды могут быть связаны с носителем с использованием более универсального связывающего средства, такого как глутаральдегид. Животных, таких как кролики, крысы и мыши, иммунизируют либо свободным пептидом, либо связанным с носителем, например, путем внутрибрюшинной и/или внутрикожной инъекции эмульсий, содержащих пример- 20 008607 но 100 мкг пептидного или белкового носителя и адъюванта Фрейнда. Может потребоваться несколько бустинг-инъекций, например, с интервалами примерно 2 недели для достижения полезного титра антител к белку, который может быть обнаружен, например, методом ИФТФА с использованием свободного пептида, сорбированного на твердой поверхности. Титр антител к пептиду в сыворотке иммунизированного животного может быть повышен при отборе противопептидных антител путем сорбции пептида на твердой подложке и элюции выбранных антител по известным в технике методикам.
Пептиды по настоящему изобретению, несущие иммуногенный эпитоп, то есть те части белка, которые проявляют антительную реакцию, когда целый белок является иммуногеном, идентифицируют по известным в технике методикам. Например, Гейсен с соавт. (Сеукеп е1 а1., кирга 1984) описывает процедуру быстрого одновременного синтеза на твердых подложках сотен пептидов с достаточной степенью чистоты, способных демонстрировать реакцию в иммуноферментном твердофазном анализе. При этом взаимодействие синтезированных пептидов с антителами легче выявляется без удаления их с подложки. В таком варианте пептид, несущий иммуногенный эпитоп желаемого белка, может быть идентифицирован обычными способами специалистом со средним уровнем знаний в данной области. Например, Гейсен с соавт. (Сеукеп е1 а1.) локализовал иммунологически важный эпитоп в белке оболочки вируса ящура с разрешением 7 аминокислот путем синтеза перекрывающегося набора из всех 208 возможных гексапептидов, охватывающих полностью последовательность белка из 213 аминокислот. Затем был синтезирован полный набор замещающих пептидов, в котором все 20 аминокислот были, в свою очередь, замещены по каждому положению внутри эпитопа, и были определены конкретные аминокислоты, придающие специфичность реакции с антителом. Таким образом, этим способом были получены пептидные аналоги пептидов по настоящему изобретению, несущих эпитоп. В патенте США № 4708781 (Сеукеп (1987)) описан также способ идентификации пептида, несущего иммуногенный эпитоп желаемого белка.
Кроме того, в патенте США № 5194392 (Сеукеп (1990)) описывается общий способ выявления или определения последовательности мономеров (аминокислот или других соединений), которые топологически эквивалентны эпитопу (например, мимотопу), который комплементарен конкретному паратопу (антигенсвязывающему сайту) целевого антитела. В более общей форме в патенте США № 4433092 (Сеукеп (1989)) описывается способ выявления или определения последовательности мономеров, которая является топографическим эквивалентом лиганда, комплементарного к сайту связывания лиганда конкретного целевого рецептора. Аналогично в патенте США № 5480971 (НоидЫеи, КА. е1 а1. (1996) 0п Рега1ку1а1еБ 01щорерНБе М1х1игек) раскрываются линейные С1-С7-алкильные пералкилированные олигопептиды, а также наборы и библиотеки таких пептидов и способы использования таких наборов и библиотек для определения последовательности пералкилированного пептида, который предпочтительно связывается с акцепторной целевой молекулой. Таким образом, с помощью указанных способов могут быть получены непептидные аналоги пептидов по настоящему изобретению, несущих эпитоп.
Применение фосфолипаз в промышленных процессах
Настоящее изобретение также относится к применению фосфолипазы по настоящему изобретению в ряде промышленных и фармацевтических способов. Хотя накоплен длительный опыт осуществления этих способов, фосфолипаза по настоящему изобретению, тем не менее, имеет множество существенных преимуществ в сравнении с ферментами, используемыми в настоящее время. В зависимости от конкретного варианта применения, такие преимущества могут включать аспекты, связанные с меньшими затратами на производство продукции, большей специфичностью к субстрату, меньшими антигенными свойствами, менее выраженными нежелательными явлениями, большим выходом при получении в соответствующем микроорганизме, более удобным диапазоном приемлемых рН и температуры, лучшим вкусом готового продукта, а также аспекты, связанные с качеством пищи и ее кошерными свойствами.
Важный аспект фосфолипаз по настоящему изобретению заключается в том, что они охватывают широкий диапазон оптимальных значений рН и температуры, которые идеально подходят для множества направлений их применения. Например, во многих крупномасштабных процессах выгодно использовать относительно высокие температуры: 50°С или выше, например, для снижения риска микробного заражения. Некоторые фосфолипазы по настоящему изобретению удовлетворяют такому требованию, но в то же время они не обладают достаточным уровнем термостабильности, чтобы противостоять последующей инактивации путем дополнительной тепловой обработки. Последняя особенность позволяет осуществлять режим производства, который приводит к получению готовых продуктов, таких как хлебобулочные изделия, не содержащих следов ферментативной активности. Кроме того, многие пищевые и кормовые продукты имеют слегка кислые значения рН, так что для их обработки предпочтительны фосфолипазы с кислым или почти нейтральным оптимумом рН. Фосфолипазы по настоящему изобретению соответствуют также и такой потребности.
Фосфолипазы по настоящему изобретению могут найти применение в любом практическом варианте, где желательно гидролизовать фосфолипид или получить специфические продукты его расщепления. Так, например, полипептиды по настоящему изобретению позволяют получать лизофосфолипиды, диацилглицерины, холин- или этаноламинфосфаты, лизофосфатидилхолин, лизофосфатидилэтаноламин и различные фосфатидаты. Фосфолипазы по настоящему изобретению предпочтительно используют при значении рН, оптимальном для их активности.
- 21 008607
Фосфолипазы по настоящему изобретению могут использоваться для дегумирования водного раствора или взвеси углеводов для улучшения свойств фильтруемости, в частности гидролизата крахмала и особенно гидролизата пшеничного крахмала, который трудно фильтруется и дает мутные фильтраты.
Обработка может проводиться с использованием известных в технике методов. См., например, ЕР-А219269 и ЕР-А-808903.
Фосфолипазы по настоящему изобретению могут использоваться в способе снижения содержания фосфолипидов в пищевом масле путем обработки масла полипептидом для гидролиза основной части фосфолипида и отделения водной фазы, содержащей гидролизованный фосфолипид, от масла. Такой способ применим для очистки любого пищевого масла, которое содержит фосфолипид, например растительного масла, такого как соевое масло, рапсовое масло и подсолнечное масло. Перед обработкой фосфолипазой масло предпочтительно подвергают предварительной обработке для удаления слизи (растительного клея), например, путем влажного рафинирования. В типичном случае масло содержит 50-250 м.д. фосфора в виде фосфолипида в начале обработки фосфолипазой, тогда как обработка может снизить уровень фосфора до значений менее 5-10 м.д.
Обработку фосфолипазой проводят при диспергировании водного раствора фосфолипазы, предпочтительно в виде капелек со средним диаметром менее 10 мкм. Количество воды составляет предпочтительно 0,5-5 мас.% относительно масла. Может быть необязательно добавлен эмульгатор. Может быть также применено механическое перемешивание для поддержания эмульсии.
Фосфолипазную обработку проводят в диапазоне рН от примерно 3,5 до примерно 5 с целью максимизации действия фермента, или может использоваться рН в диапазоне от примерно 1,5 до примерно 3 (например, 2-3) для подавления щелочного гидролиза триглицеридов (сапонификации). Соответствующее значение рН может быть доведено при добавлении лимонной кислоты, цитратного буфера или хлористо-водородной кислоты. Приемлемая температура составляет, в основном, 30-70°С (в частности, 3045°С, например 35-40°С). Время реакции составляет в типичном случае 1-12 ч (например, 2-6 ч). Подходящая дозировка фермента составляет 0,1-10 мг на литр (например, 0,5-5 мг на литр). Фосфолипазная обработка может проводиться периодически в партиях, например, в чане при перемешивании или может осуществляться в непрерывном режиме, например, в серии реакторов при перемешивании. После фосфолипазной обработки проводят разделение водной фазы и масляной фазы. Разделение может осуществляться традиционными способами, например путем центрифугирования. Водная фаза будет содержать фосфолипазу, при этом фермент может повторно использоваться для повышения экономичности процесса. Обработка может проводится с использованием любой известной в технике методики. См., например, патент США № 5264367, ЕР-А-654527, 1Р-А-153997.
Хлебобулочные изделия получают из теста, которое обычно делают из базовых ингредиентов, включающих муку, воду и необязательно соль. В зависимости от вида хлебобулочных изделий, другими необязательными ингредиентами могут быть сахара, вкусовые вещества и т.п. Для получения продуктов из разрыхленного теста используют преимущественно пекарские дрожжи, а также химические разрыхляющие системы, такие как сочетание кислоты (выделяющее ее соединение) и бикарбонат. Для улучшения свойств теста, способствующих обработке и/или улучшающих качество готовых хлебобулочных изделий, предпринимаются непрерывные попытки по разработке процессов, способствующих улучшению таких свойств. Свойства теста, подлежащие улучшению, включают его податливость к машинной обработке, способность удерживать газ и т. п. Свойства хлебобулочных изделий, которые могут быть улучшены, включают объем батона, хрустящие свойства корочки, крошливую структуру и мягкость, вкус, запах и срок годности. Существующие в настоящее время вспомогательные средства для обработки могут быть разделены на две группы: химические добавки и ферменты.
Химические добавки, направленные на улучшение таких свойств, включают окислители, такие как аскорбиновая кислота, бромат и азодикарбонат, восстановители, такие как Ь-цистеин и глютатион, эмульгаторы, действующие в качестве кондиционеров теста, такие как диацетилвинные эфиры моно/диглицеридов (ДАВЭМ), стеароиллактилат натрия (СЛН) или стеароиллактилат кальция (СЛК), или действующие в качестве смягчителей мякиша, такие как моностеарат глицерина (МСГ), жирные материалы, такие как триглицериды (жир) или лецитин, и другие.
В настоящее время наблюдается тенденция к замене химических добавок ферментами. Последние рассматриваются как более натуральные соединения и, в этой связи, более приемлемые для потребителей. Подходящие ферменты могут быть выбраны из группы, состоящей из ферментов, разлагающих крахмал, ферментов, разлагающих арабиноксилан- и другие гемицеллюлозы, ферментов, разлагающих целлюлозу, окислительных ферментов, ферментов, расщепляющих жирный материал, и ферментов деградации белка.
Настоящее изобретение также относится к способам приготовления теста или хлебобулочного изделия, включающим введение в тесто эффективного количества фосфолипазы по настоящему изобретению, которое улучшает одно или более свойств теста или хлебобулочного изделия, получаемого из этого теста, в сравнении с тестом или хлебобулочным изделием без включения указанного полипептида.
Фраза введение в тесто в контексте настоящего описания означает добавление фосфолипазы по настоящему изобретению к тесту, любому ингредиенту, из которого может быть получено тесто, и/или
- 22 008607 любой смеси ингредиентов, из которой изготавливается тесто. Иными словами, фосфолипаза по настоящему изобретению может быть добавлена на любой стадии приготовления теста, причем она может быть добавлена на одной, двух или более стадиях. Фосфолипазу по настоящему изобретению добавляют к ингредиентам теста, которые замешиваются и используются для выпечки хлебобулочных изделий по известным в технике способам. См., например, патент США № 4567046, ЕР-А-426211, ДР-А-60-78529, ДРА-62-111629 и ДР-А-63-258528.
Термин эффективное количество в контексте настоящего описания обозначает количество фосфолипазы по настоящему изобретению, которого достаточно для появления измеряемого эффекта по меньшей мере одного требуемого свойства теста или хлебобулочного изделия.
Термин улучшенное свойство в контексте настоящего описания обозначает любое свойство теста и/или продукта, получаемого из теста, в частности хлебобулочного изделия, которое улучшается под действием фосфолипазы по настоящему изобретению в сравнении с тестом или продуктом, не содержащим фосфолипазу по настоящему изобретению. Улучшенное свойство может включать, без ограничения, повышенную силу теста, повышенную эластичность теста, повышенную стабильность теста, сниженную липкость теста, улучшенную растяжимость теста, улучшенный запах хлебобулочного продукта, повышенную устойчивость хлебобулочного изделия против черствения.
Улучшенное свойство может быть выявлено при сравнении теста и/или хлебобулочного изделия, приготовленного при добавлении или без добавления полипептида по настоящему изобретению в соответствии со способами согласно изобретению, которые описаны ниже в примерах. Органолептические показатели могут быть оценены с использованием процедур, известных в хлебобулочной промышленности, и могут включать, например, использование набора тестеров вкуса.
Термин повышенная сила теста в контексте настоящего описания обозначает свойство теста, которое имеет отношение к большей эластичности и/или определяет потребность в более сильном воздействии для формования теста.
Термин повышенная эластичность теста в контексте настоящего описания обозначает свойство теста, которое определяет повышенную тенденцию теста восстанавливать исходную форму после действия на него некоторого физического усилия.
Термин повышенная стабильность теста в контексте настоящего описания обозначает свойство теста, которое определяет меньшую чувствительность к механической деформации, что позволяет лучше поддерживать его форму и объем.
Термин сниженная липкость теста в контексте настоящего описания означает свойство теста, которое определяет меньшую тенденцию прилипать к поверхностям, например, при машинном замешивании теста, и эту способность либо оценивается эмпирически опытным пекарем, либо ее измеряют с помощью анализатора консистенции (например, ТАХТ2), известного в данной области техники.
Термин улучшенная растяжимость теста в контексте настоящего описания обозначает свойство теста, которое определяет его способность поддаваться усилию или растяжению без разрыва.
Термин улучшенная машинабельность теста в контексте настоящего описания обозначает свойство теста, которое определяет его меньшую липкость, и/или большую плотность, и/или большую эластичность.
Термин повышенный объем хлебобулочного изделия измеряется как удельный объем данной буханки хлеба (объем/вес), определяемый в типичном случае по традиционному способу смещения с использованием рапса.
Термин улучшенная консистенция мякиша хлебобулочного изделия в контексте настоящего описания обозначает свойство хлебобулочного изделия, определяющее наличие мелких и/или тонких ячеек в мякише и/или более однородное/гомогенное распределение таких ячеек в мякише, и обычно оценивается эмпирически опытным пекарем.
Термин улучшенная мягкость хлебобулочного изделия означает свойство, противоположное твердости, и определяется в контексте настоящего описания как способность хлебобулочного изделия поддаваться более легкому прессованию, которая оценивается либо эмпирически опытным пекарем, либо определяется при использовании анализатора консистенции (например, ТАХТ2), известного в данной области техники.
Термин улучшенный вкус хлебобулочного изделия определяется дегустационной комиссией.
Термин повышенная устойчивость хлебобулочного изделия против черствения определяется в контексте настоящего описания как свойство хлебобулочного изделия, которое определяет сниженную скорость ухудшения параметров его качества, таких как мягкость и/или эластичность, при хранении.
Термин тесто в контексте настоящего описания определяется как смесь муки и других ингредиентов, достаточно твердая для замешивания и раскатывания. Тесто может быть свежим, замороженным, подвергнутым предварительному осаждению и предварительной выпечке. Получение замороженного теста описано Кульпом и Лоренцом (Ки1р апб Боген/ ш Его/еп апб ВеГпдеШеб Иоидйк апб ВаБегк).
Термин хлебобулочное изделие в контексте настоящего описания определяется как любой продукт, полученный из теста, либо мягкого, либо хрустящего характера. Примеры хлебобулочных изделий белого, светлого или темного типа, которые могут с успехом быть получены по настоящему изобретению, включают хлеб (в частности, белый, на основе муки из цельного зерна или рисовый хлеб), обычно в
- 23 008607 форме буханок или булочек, батонов типа французского багета, изделий из макаронного теста, лаваша, плоских маисовых лепешек, маисовых лепешек с начинкой, кексов, блинов, бисквитов, печенья, пирогов, заварного хлеба, хрустящих хлебцев и т.п.
Фосфолипазы по настоящему изобретению и/или дополнительный фермент, используемые в способах настоящего изобретения, могут иметь любую форму, пригодную для данного направления использования, например могут иметь вид сухого порошка, агломерированного порошка или гранулята, в частности обеспыленного гранулята, жидкости, в частности стабилизированной жидкости, или защищенного фермента, такого как описан в XV0 01/11974 и XV0 02/26044. Грануляты и агломерированные порошки могут быть получены традиционными способами, например путем разбрызгивания фосфолипазы по настоящему изобретению на носитель в грануляторе с псевдоожиженным слоем. Носитель может состоять из ядра, включающего частицы соответствующего размера. Указанный носитель может быть растворимым или нерастворимым, представляя собой, например, соль (такую, как №1С1 или сульфат натрия), сахар (такой, как сахароза или лактоза), сахарный спирт (такой, как сорбит), крахмал, рис, кукурузную крупу или сою. Фосфолипаза по настоящему изобретению и/или дополнительные ферменты могут входить в состав композиции с медленным высвобождением. Способы получения композиции с медленным высвобождением известны в данной области техники. Добавление приемлемых для пищевых продуктов стабилизаторов, таких как сахар, сахарный спирт или другой полиол и/или молочная кислота или другая органическая кислота, в соответствии с известными способами могут, в частности, способствовать стабилизации препаратов жидкого фермента.
Фосфолипазы по настоящему изобретению могут быть также включены в дрожжевые композиции, как описано, например, в ЕР-А 0619947, ЕР-А-0659344 и Χν0 02/49441.
Для введения муки в предварительно приготовленную смесь предпочтительно, чтобы полипептид по настоящему изобретению имел вид сухого продукта, например обеспыленного гранулята, тогда как для введения ее вместе с жидкостью предпочтительно, чтобы он был в жидкой форме.
В тесто могут быть включены один или более дополнительных ферментов. Дополнительные ферменты могут быть любой природы, включая в качестве источника организм млекопитающего и растения, и предпочтительно микробного происхождения (из бактерий, дрожжей или грибов), которые могут быть получены по известным в данной области методикам.
В предпочтительном варианте осуществления изобретения дополнительный фермент может представлять собой амилазу, такую как альфа-амилазу (используемую для получения сахаров, ферментируемых дрожжами, и замедления черствения) или бета-амилазу, циклодекстринглюканотрансферазу, пептидазу, в частности экзопептидазу (используемую для усиления вкуса), трансглутаминазу, липазу (используемую для модификации липидов, имеющихся в тесте или его компонентах, для смягчения теста), фосфолипазу, целлюлазу, гемицеллюлазу, в частности пентозаназу, такую как ксиланаза (используемую для частичного гидролиза пентозанов, что повышает растяжимость теста), протеазу (используемую для ослабления клейковины, в частности, в случае твердых сортов пшеницы), дисульфидизомеразу белка, например дисульфидизомеразу белка, описанную в XV0 95/00636, гликозилтрансферазу, пероксидазу (используемую для улучшения консистенции теста), лакказу или оксидазу, например глюкозооксидазу, гексозооксидазу, альдозооксидазу, пиранозооксидазу, липоксигеназу или оксидазу Ь-аминокислоты (используемую для улучшения консистенции теста).
В том случае, когда в соответствии со способами согласно изобретению добавляется одна или более дополнительных ферментативных активностей, указанные активности могут вводиться отдельно или вместе с полипептидом по настоящему изобретению, необязательно в качестве компонента(ов) композиции, улучшающего(их) качество хлебобулочных изделий и/или теста. Другие ферментативные активности могут представлять собой любую ферментативную активность из приведенного выше перечня и могут вводиться в дозе, установленной в хлебопекарной практике.
Настоящее изобретение также относится к способам получения хлебобулочного изделия, включающим выпечку теста, получаемого по способу согласно изобретению с получением хлебобулочного продукта. Выпечка теста с получением хлебобулочного изделия может проводиться с использованием известных в технике методов.
Настоящее изобретение также относится к тесту и хлебобулочным изделиям, соответственно, получаемым по способу согласно изобретению.
Настоящее изобретение также относится к предварительно приготовленной смеси, например к мучной смеси для приготовления теста и/или выпечки из теста хлебобулочных изделий, где указанная предварительно приготовленная смесь включает полипептид по настоящему изобретению. Термин предварительно приготовленная смесь в контексте настоящего описания понимается в традиционном значении, то есть как смесь хлебопекарных средств, включающих, в основном, муку, которая может использоваться не только на заводах/устройствах для крупномасштабной выпечки хлеба, но также в небольших пекарнях. Предварительно приготовленная смесь может быть получена при смешивании полипептида или композиции, улучшающей качество хлебобулочных изделий и/или теста по настоящему изобретению, которая включает полипептид в сочетании с соответствующим носителем, таким как мука, крахмал, сахар или соль. Предварительно приготовленная смесь может содержать другие добавки для улучшения
- 24 008607 качества теста и/или хлебобулочных изделий, например любые добавки из указанного выше перечня, включая ферменты.
Настоящее изобретение также относится к добавкам для выпечки хлебобулочных изделий в виде гранулята или агломерированного порошка, которые включают полипептид по настоящему изобретению. Добавки для выпечки хлебобулочных изделий предпочтительно характеризуются узким диапазоном распределения размера частиц, где более 95 мас.% частиц имеет размер в диапазоне от 25 до 500 мкм.
Способ согласно изобретению в аспекте изготовления теста и хлебобулочных изделий может использоваться в сочетании с указанными выше средствами, улучшающими обработку, такими как химические вспомогательные средства типа окислителей (например, аскорбиновая кислота), восстановители (например, Ь-цистеин), оксидоредуктазы (например, глюкозооксидаза) и/или другие ферменты, такие как ферменты модификации полисахаридов (например, α-амилаза, гемицеллюлаза, разветвляющие ферменты и т.п.) и/или ферменты модификации белка (эндопротеаза, экзопротеаза, разветвляющие ферменты и т.п.).
Пример 1. Ферментация АкретдШик пщег.
Фосфолипазы, кодируемые нуклеотидной последовательностью по настоящему изобретению, получают путем конструирования плазмид экспрессии, содержащих последовательности ДНК, трансформации штамма А. шдет указанной плазмидой и выращивания штаммов АкрещШик шдет указанным ниже способом.
Свежие споры (106-107) штаммов А. шдет инокулируют в 20 мл С8Ь-среды (колба на 100 мл с отражательной перегородкой), выращивают в течение 20-24 ч при 34°С и скорости качания 170 об./мин. После инокуляции 5-10 мл С8Ь предкультуры в 100 мл среды С8М (колба на 500 мл с отражательной перегородкой) штаммы ферментируют при 34°С и скорости качания 170 об./мин в течение 3-5 дней.
Бесклеточные супернатанты получают при центрифугировании в пробирках Грейнера на 50 мл (30 мин, 5000 об./мин). Супернатанты подвергают предварительному фильтрованию через стеклянный микроволоконный фильтр СГ/А \У11а1тап (150 мм для удаления крупных частиц, доводят (при необходимости) значение рН до 5 с помощью 4н. КОН и подвергают стерильному фильтрованию через фильтр с размером пор 0,2 мкм (насаженный на верх бутыли) с отсосом для удаления грибного материала. Супернатант хранят при 4°С (или при -20°С).
С8Ь среда состоит из (в количестве на литр): 100 г твердой кукурузной замочной жидкости (Кодиейе), 1 г №1Н2РО4 х Н2О, 0,5 г Мд8О4 х 7Н2О, 10 г глюкозы х Н2О и 0,25 г пеногасителя Базилдон (Вакйбоп). Ингредиенты растворяют в деминерализованной воде и доводят значение рН до 5,8 с использованием №1ОН или Н24; колбы на 100 мл с отражательной перегородкой и пенными шариками заполняют 20 мл ферментированного бульона и стерилизуют в течение 20 мин при 120°С, после чего к каждой колбе, охлажденной до комнатной температуры, добавляют 200 мкл раствора, содержащего 5000 МЕ/мл пенициллина и 5 мг/мл стрептомицина.
Среда С8М состоит из (в количестве на литр): 150 г мальтозы х Н2О, 60 г пептона Сойтон (8оу!опе), 1 г NаН2РО4 х Н2О, 15 г Мд8О4 х 7Н2О, 0,08 г Твина 80, 0,02 г пеногасителя Базилдон (Вакйбоп), 20 г МЕ8, 1 г Ь-аргинина. Ингредиенты растворят в деминерализованной воде и доводят значение рН до 6,2 с использованием №ЮН или Н24; колбы на 500 мл с отражательной перегородкой и пенными шариками заполняют 100 мл ферментированного бульона и стерилизуют в течение 20 мин при температуре 120°С, после чего к каждой колбе, охлажденной до комнатной температуры, добавляют 1 мл раствора, содержащего 5000 МЕ/мл пенициллина и 5 мг/мл стрептомицина.
Пример 2. Очистка фосфолипаз по настоящему изобретению.
Стадия 1. Получение ультрафильтратов.
Супернатанты культур, полученных в примере 1, подвергают ультрафильтрации для удаления низкомолекулярных загрязняющих примесей, которые могут мешать проведению тестов для определения ферментативной активности и качества выпечной продукции. Ультрафильтрацию 30 мл супернатанта проводят в системе М1Шроте ЬаЬкса1е ТРР, снабженной фильтром для отсечения молекулярной массы от 10 кДа.
Образцы, в зависимости от их цвета, промывают 3-5 раз с использованием 40 мл охлажденного 100 мМ фосфатного буфера при рН 6,0, включающего 0,5 мМ СаС12. Конечный объем ферментного раствора, который далее фигурирует в описании как ультрафильтрат, составляет 30 мл.
Стадия 2. Определение концентрации фосфолипазы с использованием системы ВЭГФ по поглощению при длине волны А280.
Концентрацию фосфолипазы в ультрафильтрате вычисляют на основе величины экстинкции при 280 нм (А280), определяемой поглощением фосфолипазы, и далее вычисляют коэффициент молекулярной экстинкции фосфолипазы. Вычисление А280 проводят на спектрофотометре Ш1коп ХЬ 8есотат (Веип бе Копбе, АЬсоибе, Нидерланды).
Коэффициент молекулярной экстинкции может быть вычислен, исходя из количества остатков тирозина, триптофана и цистеина на молекулу фермента (8.С. СШ апб Р.Н. νοη Н1рре1, Апа1. Вюсйет. 182, 319-326 (1989)). Коэффициент молекулярной экстинкции указанных аминокислот составляет 1280, 5690 и 120 1/М х см, соответственно. Данные о количестве остатков тирозина, триптофана и цистеина в фосфолипазе по настоящему изобретению могут быть получены на основании белковых последовательностей, выбранных из группы, состоящей из 8ЕО ΙΌ NО: 3, 6, 9, 12 и 15. Ниже в табл. 1 приведены вычисленные коэффициенты молекулярной экстинкции фосфолипаз по настоящему изобретению.
- 25 008607
Таблица 1
Фосфолипаза ЗЕО ΙΌ N0: Аминокислоты Вычисленный м. в. (Да) Вычисленный коэффициент экстинкции при 280 нм
Тгр Туг Суз М-1 х см-1 (1 мг/мл) -1х см’1
ФЛПОЗ 3 7 22 4 49683 165490 3,3
ФЛП06 6 6 10 7 31694 91880 2,9
ФЛП15 9 11 27 9 68440 217300 3,2
ФЛП26 12 16 23 8 68255 222870 3,3
ФЛП34 15 12 28 8 70320 228560 3,3
Экстинкция ультрафильтрата при длине волны 280 нм (А280), определяемая фосфолипазой, зависит от чистоты ферментного образца. Указанная чистота определяется с помощью ВЭГФ (НР8ЕС) (высокоэффективной гельпроникающей хроматографии) на колонке Т8К 8\\7-Х1. (300х7,8 мм; диапазон исключаемого размера 10-300 кДа). Элюирующий буфер состоит из 25 мМ натрийфосфатного буфера, рН 6,0, который пропускают через колонку со скоростью 1 мл/мин. Инъецируют образцы по 5-100 мкл. Далее измеряют поглощение при длине волны 280 нм.
Величину поглощения А280 в ультрафильтрате, определяемую фосфолипазой по настоящему изобретению, вычисляют на основе отношения площади пика, соответствующего пику фосфолипазы на хроматограмме, к общей площади пиков, поглощающих при 280 нм. Далее вычисляют концентрацию фосфолипазы, умножая величину А280 ультрафильтрата на коэффициент указанного выше отношения и деля на вычисленный коэффициент экстинции (1 мг/мл раствора значение в самой правой колонке табл. 1) для каждой фосфолипазы.
Пример 3. Измерение активности.
В ультрафильтратах, полученных по процедуре примера 2, измеряют активности следующих ферментов: фосфолипазы А1 или А2;
лизофосфолипазы;
фосфолипазы С; галактолипазы; грибной альфа-амилазы.
Активность фосфолипазы А определяют спектрофотометрически с использованием в качестве субстрата 1,2-дитиодиоктаноилфосфатидилхолина. Фосфолипаза А гидролизует сульфидную связь в положении 1 (ФЛА1) или в положении 2 (ФЛА2), высвобождая тем самым 4-тиооктановую кислоту, которая в следующей реакции вступает во взаимодействие с 4,4'-дитиопиридином с образованием 4-тиопиридона. Последнее соединение находится в таутомерном равновесии с 4-меркаптопиридином, который поглощает при длине волны 334 нм. Данную реакцию проводят в 0,1М ацетатном буфере при рН 4,0 с добавкой 0,2% Тритона-Х100 при температуре 37°С. 1 единицу активности фосфолипазы А (ФЛА) определяют как количество фермента, которое высвобождает 1 мкмоль 4-тиооктановой кислоты в минуту в указанных выше условиях реакции.
Активность лизофосфолипазы определяют методом 31Р-ЯМР спектроскопии с использованием в качестве субстрата лизофосфатидилхолина. Лизофосфолипаза гидролизует сложноэфирную связь, высвобождая тем самым жирную кислоту из глицеринового фрагмента. Полученный таким образом глицеринфосфохолин количественно определяют по методу ЯМР.
Реакцию проводят в 50 мМ ацетатном буфере при рН 4,5, который содержит также 1 мг/мл лизофосфатидилхолина и 5 мМ СаС12, в течение 30 мин при 55°С.
единицу активности лизофосфолипазы (РРС) определяют как количество фермента, которое в указанных условиях реакции образует 1 мкмоль 4-глицеролфосфохолина в минуту.
Активность фосфолипазы С определяют спектрофотометрически с использованием в качестве субстрата паранитрофенилфосфорилхолина. Фосфолипаза С гидролизует сложноэфирную связь, высвобождая паранитрофенол, который поглощает при длине волны 405 нм.
Указанную реакцию проводят в 100 мМ ацетатном буфере при рН 5,0, который содержит также 20 мМ СаС12, 0,25% Тритона-Х100 и 20 мМ паранитрофенилфосфорилхолина, при 37°С в течение 7 мин. Указанную реакцию останавливают и повышают рН добавлением к 1 объему реакционной смеси 0,75 объема 1М раствора Трис, после чего измеряют экстинкцию при длине волны 405 нм (ε405 нм=18500 М-1 х см-1).
единицу активности фосфолипазы С определяют как количество фермента, которое в указанных условиях реакции образует 1 мкмоль паранитрофенола в минуту.
Активность галактолипазы определяют методом Н-ЯМР спектроскопии с использованием в качестве субстрата дигалактозилдиглицерида по методу, описанному Хираяма и Мацуда (Нпауаша апй Ма1§ийа (1972) Адпс. Вю1. СЪет. 36, 1831). Галактолипаза гидролизует сложноэфирную связь между жирно-кислотными остатками и глицериновым скелетом, высвобождая одну или более жирных кислот.
Указанную реакцию проводят в 50 мМ ацетатном буфере при рН 4,5, который содержит также 4 мМ СаС12,
- 26 008607
0.2% Тритона Х-100 и 1 мг/мл дигалактозилдиглицерида (липидный продукт). при 37°С в течение 30 мин.
единицу активности галактолипазы определяют в указанных условиях реакции как количество фермента. который образует 1 мкмоль жирной кислоты в минуту.
Активность грибной альфа-амилазы определяют с использованием тест-таблеток Фадебас-амилазы (Р1абеЬа8-Лту1а8е) (Рйагтас1а). Таблетки Фадебас содержат водонерастворимый крахмальный субстрат и синий краситель. связанный с субстратом. Субстрат гидролизуется грибной амилазой. высвобождая при этом в раствор окрашенные растворимые мальтодекстрины. Строят калибровочную кривую на основе раствора. содержащего грибную альфа-амилазу с эталонной активностью.
Из стандарта и исследуемых образцов делают соответствующие разведения 50 мМ буфером с яблочной кислотой. рН 5.5. Образцы по 5 мл инкубируют при 30°С в течение 5 мин. добавляют таблетки Фадебас и через 15 мин останавливают реакцию добавлением 1.0 мл 0.5н. гидроксида натрия. Смеси оставляют на 5 мин для охлаждения до комнатной температуры. после чего добавляют 4.0 мл воды. встряхивают вручную и через 15 мин центрифугируют образцы при 4700 об./мин в течение 10 мин. Измеряют экстинкцию верхних слоев при длине волны 620 нм. Поглощение (ОП) при 620 нм используют как меру активности грибной альфа-амилазы.
единицу активности грибной амилазы (ΡΑϋ) в контексте настоящего описания определяют как количество фермента. которое превращает 1 г крахмала (100% по сухому остатку) в течение часа в указанных условиях реакции в продукт. характеризующийся прозрачностью при длине волны 620 нм после реакции с раствором йода известной активности.
Таблица 2а
Активность фосфолипазы в ультрафильтратах. полученных по процедуре примера 2
Фосфолипаза Белок (мг/мл) Грибная амилаза Фосфолипаза А Фосфолипаза С Лизофосфолипаза Галактолипаза
Способ БСА Анализ при 280 нм РАи/мл ФЛА/мл Ед/мл Ед/мл Ед/мл
ФЛПОЗ 4,04 3,3 1,07 0,23 5,5 7 0,55
ФЛП06 2,51 0,4 2,14 26,9 0,01 20 49,8
ФЛП15 4,37 1,7 1,14 206 0,01 >1300 0,19
ФЛП26 2,21 1,4 3,24 0,24 0,01 67 0,21
ФЛП34 3,87 0,07 7,97 2,29 Не опред. 200 0,31
Таблица 2Ь Активность фосфолипазы в единицах на мг белка. определяемая при измерении показателя поглощения А280 нм в ультрафильтратах. полученных по процедуре примера 2
Фосфолипаза Грибная амилаза Фосфолипаза А Фосфолипаза С Лизофосфолипаза Галактолипаза
РАЦ/мг ФЛА/мг Ед/мг Ед/мг Ед/мг
ФЛПОЗ 0,3 0,1 1,7 2,1 0,2
ФЛП06 5,4 67,3 0,0 50,0 124,5
ФЛП15 0,7 121,2 0,0 764,7 0,1
ФЛП26 2,3 0,2 0,0 47,9 0,2
ФЛП34 113,9 32,7 Не определяли 2857,1 4,4
В образцах. кроме указанной активности. присутствуют также минорные активности глюкоамилазы и ксиланазы. однако. в таких малых количествах. что указанные ферменты не влияют на эксперименты по выпечке. описанные в примере 4.
Пример 4. Эсперимент по выпечке 1 - булочки для хот-догов.
Булочки для хот-догов выпекают из кусочков теста по 150 г. получаемого при смешивании 200 г муки (Ко11Ьп™/1Ь18™. в соотношении 80/20). 1.4 г сухих пекарских дрожжей (Регт1рап®). 4 г соли. 3 г сахара. 10 мг аскорбиновой кислоты. 116 г воды и 3 г жира. После перемешивания в течение 6 мин и 15 с в тестомесильной машине шпилечного типа тесто разделяют на кусочки по 150 г и производят расстойку в течение 45 мин при 30°С. далее обминают. производят расстойку еще в течение 25 мин. формуют и кладут на противень. Расстойку производят при относительной влажности 90-100%. После завершения окончательной расстойки в течение 70 мин при температуре 30°С тесто выпекают в течение 20 мин при температуре 225°С.
Различные эффекты (табл. 3) разных фосфолипаз в экспериментах по выпечке сравнивают с контролем. содержащим такое же количество грибной амилазы. добавляемой в той же дозировке к ультрафильтрату (см. табл. 2 с данными по активности грибной амилазы в ультрафильтратах). Указанная обра
- 27 008607 ботка необходима, поскольку количества добавленной вместе с фосфолипазой грибной амилазы воздействуют преимущественно на объем булочек, а не на другие параметры. Объем изделий, получаемый с контрольным количеством грибной амилазы, берут за 100%.
Таблица 3
Эффект Баллы
1 2 3 4 5
Тесто Липкость теста Слишком липкое Липкое Контрольный хлеб Намного лучше Очень сухое
Растяжимость теста Слишком малая Меньше, чем в контроле Контрольный хлеб Хорошая Слишком большая
Хлеб после выпечки Структура мякиша Слабая Неоднородная Контрольный хлеб Хорошая Прекрасная
Цвет корки Почти белый Вполне светлый Контроль ный хлеб Прекрасный Слишком темный
Цвет мякиша Слишком желтый Вполне желтый Контрольный хлеб Прекрасный Абсолютно белый
Объем булочек определяют с помощью измерителя объема хлеба (Вгеай Уо1ите Меакигег ВУМ-3) (ΚΙ Сагйк ТпкйцтеПк АВ, У1кеп, Швеция). Принцип указанного метода основан на отражении ультразвука, который измеряется сенсором вокруг вращающегося хлеба. Время измерения составляет 45 с.
Липкость и растяжимость теста оцениваются квалифицированным пекарем с использованием шкалы, показанной в табл. 3. В среднем измеряют 2 булочки на каждый оцениваемый параметр.
После анализа указанные кусочки теста округляют и проводят первую расстойку в течение 45 мин при 30°С, после чего тесто обминают, формуют, кладут на противень и производят расстойку в течение 75 мин при 30°С. Относительную влажность в процессе расстойки поддерживают на уровне 85%.
Далее подтверждают стабильность теста после расстойки по наличию пузырей, разорванных участков на корке и неравномерно изогнутых поверхностей на корке. Сформованные кусочки теста выпекают в течение 25 мин при 225°С. Объем булочек определяют по методу ВУМ-3: в таблице представлено среднее значение показателя, измеряемого для двух хлебных изделий, которые выпекаются из одного и того же объекта.
Структуру мякиша оценивает квалифицированный пекарь с использованием шкалы, показанной в табл. 3. После хранения булочек в течение 3 дней в полиэтиленовых пакетах при комнатной температуре измеряют твердость корки с использованием анализатора структуры 81еуепк ТехШге Апа1укег. С помощью анализатора оценивают структуры двух срезов по 2 см толщиной, взятых из центра каждой булочки, с использованием пробоотборника с диаметром 1,5 дюйма, глубиной вдавливания 5 мм (25%) и скоростью прессования 0,5 мм/с. В таблице приведены средние значения показателей, полученные в двух измерениях.
Цвет корки оценивает квалифицированный пекарь по шкале, показанной в табл. 3. В качестве стандарта используют хлеб, выпеченный по стандартному рецепту голландского формового хлеба.
Цвет мякиша оценивает квалифицированный пекарь по шкале, показанной в табл. 3. Цвет мякиша контрольного хлеба оценивается как нормальный (3). В качестве позитивного контроля используют два объекта хлеба с тем же самым составом, что и контроль, плюс 0,5% соевой муки. Процедуру расстойки и выпечки производят, как и в контрольном варианте, без соевой муки. Последний показатель оценивают как превосходный.
Выступающую верхушку хлеба оценивают по уровню выступа верхней части в сравнении с формовым стандартом, чем ниже края верха, тем ниже балл при тестировании. Чем меньше выступ, тем лучший присваивается балл.
Таблица 4 Характеристика фосфолипаз по настоящему изобретению с точки зрения воздействия на качество выпечки
Параметр Фосфолипаза
ФЛПОЗ ФЛП06 ФЛП15 ФЛП26 ФЛП34
Объем (%) 100 108 112 110 107
Липкость теста 5 3 3 3 3
Растяжимость теста 2 3 3 2 3
Стабильность теста 4 5 4 4 4
л р. л л л
^хруштура хлеипиги мякиша
Цвет хлебной корки 4 4 4 4 4
Цвет хлебного мякиша 3 5 4 4 4
Выступающая верхушка хлеба 4 4 4 3 4
- 28 008607
Пример 5. Второй эксперимент по выпечке - батар.
Характеристики фосфолипаз по настоящему изобретению, определяемые их воздействием на вид выпечки, исследуют на примере хлеба типа французского батона, называемого батар. Батары изготавливают путем стандартного процесса выпечки при смешивании при температуре примерно 20°С 3000 г пшеничной муки, 70 г прессованных дрожжей, 60 г соли, 68 м.д. аскорбиновой кислоты, 17 м.д. препарата Фермизим® Р200 (Еегт1/уте® Ро) (грибная α-амилаза), 30 м.д. препарата Фермизим® Н82000 (Еегт1/уте® Н8оо) (грибная хемицеллюлаза), 7 м.д. препарата Бэйкзим® Р500 (Ваке/уте® Р500) и 1680 мл воды (810°С) в спиральном смесителе (Эюзпа: 2 мин со скоростью 1; 100 Вт/ч, ввод со скоростью 2). Температура теста составляет 27°С. Способность теста к машинной обработке анализирует вручную пекарь. Тесто отставляют для расстойки до нужного объема на 15 мин в расстойном шкафу при 32°С и 90% ОВ. Далее тесто разделяют на 6 кусочков по 350 г, округляют их и вновь производят расстойку в течение 15 мин при 32°С и 90% ОВ. В конце указанного периода времени формуют кусочки теста и производят окончательную расстойку в течение 90 мин при 32°С и 90% ОВ. Полностью расстойное тесто раскатывают в длину кусочка и выпекают в печи при 240°С в течение 30 мин при обработке вначале паром. После охлаждения до комнатной температуры определяют объем полученных булочек по методу с ипользованием анализатора ВУМ-3 (см. пример 4).
Полученный хлеб сразу после охлаждения до комнатной температуры анализирует пекарь на наличие трещин, разрывов корки и форму, ранжируя результаты по табл. 5. После выдерживания в течение 16 ч (в течение ночи) в закрытой коробке при комнатной температуре квалифицированный пекарь оценивает качество мякиша хлеба. Результат для каждого показателя получают из одного хлебного изделия в качестве объекта.
Таблица 5
Эффект Баллы
1 2 3 4 5
Разлом и разрыв корки хлеба Чересчур слабая и мягкая Слабая и мягкая Контрольный хлеб Тонкая и хрустящая, разрез прочный на разлом Слишком тонкая, слишком твердая
ххопк/ютспц/хл мякиша Г* -г» Л /-Т кЛОЮС1Л НсОДНОродная Контроль ный хлеб Хорошая Прокрас- ная
Форма Высота Плоская Средняя Контрольный хлеб Больше, чем (3) Гораздо больше, чем (3)
Разрез Закрытый разрез Закрытый разрез Контрольный хлеб Полностью открытый Полностью открытый
Таблица 6 Характеристики фосфолипаз по настоящему изобретению с точки зрения их эффекта на выпечку
Параметр Фосфолипаза
Не добавляют ФЛПОЗ ФЛП06 ФЛП26 ФЛП34
Дозировка* 0 Не исследуют 10 20 21
Объем хлеба (%) 100 Не исследуют 109 105 109
Разлом и разрыв корки хлеба 3 Не исследуют 4 4 4
Форма 3 Не исследуют 4 4 4
Консистенция мякиша 3 Не исследуют 4 4 4
*В м.д. на основании веса муки и веса фермента, определяемых по методу измерения А280.
- 29 008607
Список последовательностей <110> ϋ3Μ Ν.ν.
<120> Новые фосфолипазы и их применение <130> 20950ΗΌ <160> 15 <170> Патентин, версия 3.1 <210> 1 <211> 3763 <212> ДНК <213> АЗ^АГтПид ΠΪίΐ^Γ <400> 1
ддРддаЬдаЬ адсасасддд сдасдсаада РсдадаааЬа асЬЬддЬсаЬ саРЬаСЬЪсЬ 60
РдЬдддЬаад саададЬсЬЪ аСадддддСс сЬдсЬдЬддР сЬдсдасаЬс ЪддЬддаЬдЬ 120
ддаЬддасда ЬдаЬдаадаЬ дддддаасЬа ЬЬсссааЬдс ддрдсдсддд ЬдсдаЬддаа 180
Рддасаддаа дадааЬЬЬРЬ саЕсРсадда ЬРддддаааЬ ддРРдаасЬс дассддСдЬд 240
ЬдЬдидссдЬ идаадсадсь. ддадидЬиаи сЬдЬадиаис иасддисЬаи дсдсаЬсаис 300
РРсаасадаЬ ссдассадад ЬдЬдааадаР дссаЬсдаад ааадаааааЬ аасЬааассс 360
ддЬсдддасЬ дсЬаЬсдаса дссЬдаддса дЬааддсаде даддсадЬда ддсадЬдадд 420
садЬдаддса дЬсаддСдаР даЬсаддсаЬ ссааРсаЬсР сСдссЬсдсс дссЬЬдссдс 480
сЬддддЬдРс ааддсдаадд ассадсЬсдР саЬссдаРсд адаЬссаЬсс сдааЬааЬдЬ 540
ссаддсЪдЬЬ сдсадЬдссЬ ддЬдсЬадЬР дЬадаЬаЬае дддЬЬаЪдаЕ аЬсЬсасЬдЬ 600
РсСсЬассаЬ ссЬЬссЬдШ: ссЬддсЬсЬс РдсЬдРддЬд РдСаЬссдад сдддссддаа 660
дсЬассдаЬс дссддаЬЬде ЬссддсссЬЬ ЬЬсЪЬаЬЬсс аЬдддсЬдЬд сссЬЬасЬсС 720
дссРсЬсЬЫ: сЬаЬсЬЬЬсЬ сЬсЬсЬсесЬ сЬсЬсЬсЬда ЬЬсдЬЬссса аЬддадааЬЬ 780
саддЬасааа дЬааЬЬсссС сЬддсаЬдас РдсЬЬдасар дЬсдссаЪЬс аасаЬсаЬда 840
адЬасЬаадЬ адЬадЬадас саасЬасЪсЬ ддасддсЬда Ьадсадссаа Ьсасдддааа 900
дрддссасдс асдддддсрд ЬсдаСссссд аЬдаЬсдРдс аРЬддсадад ссаЬдаадаа 960
адасддЬадд асаадссЬсд ассадЬсЬсЬ дсЬасадЬдЬ аЬссссЬссс адаЬаСдддд 1020
ЬааасссЕса ааЬассдЬсс дасссддЬсс сЬсдЬдсссс РдсадаЬсда ЪдссаЬЬдда 1080
дЬЬдсаЬссд дссЪЬсдсдР сЬссассдаЬ ддадааддда дддСдааСаа ЬддсдЬссаЬ 1140
дсаааЬддсР сдсЬЬдасРс асаадаСдЬа дРасЬЬдЬЕЬ ааРдааааЬа даРддЬдЬсЬ 1200
сдассасЪРд асассассас дрдсадассс Ьдсаадддда дадаСдадда даааадсЬдЬ 1260
ссдадЬдаса дсЬссаасЬс сасссЬдасс аЬддЬаЬаад ааддсЬсссс сЬсдассаЬс 1320
ЬСдС-сааЕдд сЬаЬЬсЬсас садддЬаЬсд саЬЬсЬдссЬ ссЬссаЬсЬд ЬасЬасаааЬ 1380
Расаасадад сЬсассаЬдс аЬсссадРдс дсЬддЬсддр сЬдсЬддссЬ ЬЬдсЬдссдс 1440
рдссЬсддсс аЬссссдсса ассссадсса ЬааддсЬсас ЬссдасЬсдд ссдЬссадаа 1500
- 30 008607
БсБсаадБсд аадаСсаада аБдБсдЪсдЬ ссБддЕсакд дадааБсдЪБ ссдкддасаа 1560
ссСдСБддда ддЕсадасда ЕсаадддсБС ддадаасссс аРсаасаасд дссссБасБд 1620
саасссскас аасаБсассд ассБсБссса дддсассдБс ЕдсадЬдсдд ссададаска 1680
сдасЪсддкс ассдаЕдаЬс ссдаСсасдс сдксЕакддс ааБаасаксд адЕБсБасдд 1740
сассББсасс сссдасааЬд сддссаксдс ссадддсаад скдасссссБ сссадсаддд 1800
дБксдСсасд даасадсБдс дссБдБасад сдссдаЕдсс аассдсассд адсБдЕссдЕ 1860
дсаддЕсаГд аасИаБЕаса ссдадсадса ддЬдсссдЬд сксассЕсдс БсдЕссаааа 1920
сБаСдБсдБк кРсаассакк ддсасСсдда ЬдБдсскддк дкасдаассс сссссеесББ 1980
ссссББсссс ассЕБксадс ЕддсаасББд сБаасксада ЪЕсадсссас саассссаас 2040
сдддсБдссс БсассБсСдд сасСЕсдБаЪ ддБсасддаа ссаасдакда ддссБББдас 2100
аассасдссБ Ссссссадсд ЕБссаСсЕБс садсадсЬда ссдадассдд ссасЕссБдд 2160
аБсаасБаск дддасасддс ЕддСддсасЁ ддссссдакд ссдадкБсБа саасБддасБ 2220
ЬасассЬсса асаасассда сааддБсаад дссскддаас адЕБскасас ддаБдссдса 2280
дссддЕдссс ЬдссЪдааСР садсБасдкс аассссЕсдС дсБдсддСдк сддсассаас 2340
ЕсдаЬдсасс ссадиддЬси даисиссдас ддсдадаадс гдаисаадаа сдисиасдас 2400
дсБскдсдсд ссдддсссса дБддаасдад асссЕскЬса ЕсскдадсББ сдасдадасс 2460
ддкддсЬБсс асдассаБдС дсссссдссс сЕсдсЕсссс ддссддасаа ссБсасББас 2520
асддссасса ссссаадсдд сдаддаскас ассЪЕсаасЪ БЕаассдБсБ дддкддЬсде 2580
акссссасБс БдскдаБсЪс ссссЬдддСс ддсаадддаЬ аБдЪсдадса ааадддсасс 2640
адсдксассд дсдааассдЕ дБсББасЕсс дссЕссЕсда кссЕдсдсас сскдддсЪас 2700
сЬсЕдддасЕ БЕдасссЕБЕ сассссдсдд дБсдадкаБд сдссаЬссЪБ БдадсаБсБд 2760
дБдсадасдс дддсссдсда Еаасассссд асБдссЕЬдс сдадЕссддБ дсссРББсдд 2820
аадБаааСдд садаБаСБда аБдсддЬадЕ ддааасдЕск ааСдсаБааБ даасддаддд 2880
ааадЬадаЕс БдаааадсБд адссдсдЬсс дадаБасаса ЪдЩЩддЕса даБаЕББссБ 2940
дддсББадса сддЕасадад дакдаБадде сакдБакЕаБ БсаБдаБааа дссааааЕаа 3000
аЪадЕаБББд БааЕасакХд аЪддссаЪсд седдскдккд ккддасаЬБс сББаБдаЕсБ 3060
сБЕссасдас БаСЪасБдаЬ Ъддддсссаа БаасаадсБд сддаадааБа ББссааБсас 3120
ааБкдасакд БсЕЕдсддса дБЪЪаЕадаа аЕЕссдкада БЕБсаддсББ БдсасБссас 3180
сскдБаБаса сакдасББББ аЪаасдББсБ Бсасдсаакс БакаБасБдд БсБасаБсаа 3240
сссаБссБдд сБсксЪдааа саБддСБдад саддадсадс БЪдсасБсБд адГ-ссБасББ 3300
ЕаЪБББсааЕ ссаЕБссБаа аБассдЬдад аааддсаддд аасскассаС ЕддссББдсс 3360
сассассЪБд Ьсдаадаадд БсБддсБсдд ЕсдсЬБсскс аасссассда сдсскссЕсс 3420
сддЬассЪсс адддБсдасБ ддсссдассБ ЕсРдсасааБ адаЪЬдааСд сдБдЕсаада 3480
адсссЕссдБ сБсдадсЬдк БссддБддсд ЕаЕЕЕсдсад сассРдсада дБдассссад 3540
сдадсадсас ЕсссБсдсда сБссдРБсдБ ааРдБЕсаад сдасдсдадс дссаЕсссда 3600
саддЕсБаБа саБссаадсБ сЕдаадссдс ддаЬИасдад сЕЕЕсссдад аБдсЕЪаадд 3660
БдсЕасаада БдсаРадЕЕа сддБддаБаа ЕкаБаддддЕ ссЕадададс адсаСЬсдса 3720
даададсаас асРаЕадддс сссББдддсс аксЕББдада ска 3763
<210> 2 <211> 1365 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пддег
- 31 008607 <220>
<221> СЬЗ <222> (1)..(1365) <400> 2
аЕд саЕ ссс адЕ дед сЕд дЕс ддЕ сЕд сЕд дсс ЕЕЕ дсЕ дсс дсЕ дсс 48
МеЕ ΗΪ8 Рго Зег А1а Ьеи Уа1 С1у Ьеи Ьеи А1а РЬе А1а А1а А1а А1а
1 5 10 15
Есд дсс аЕс ссс дсс аас ссс аде саЕ аад дсЕ сас Есс дас Есд дсс 96
Зег А1а Не Рго А1а Азп Рго Зег Н13 Ьуз А1а Ηίβ Зег Азр Зег А1а
20 25 30
дЕс сад ааЕ сЕс аад Есд аад аЕс аад ааЕ дЕс дЕс дЕс сЕд дЕс аЕд 144
Уа1 Θΐη Азп Ьеи Ьуз Зег Ьуз Не Ьуз Азп Уа1 Уа1 Уа1 Ьеи Уа1 МеЕ
35 40 45
дад ааЕ сдЕ Есс дЕд дас аас сЕд ЕЕд дда ддЕ сад асд аЕс аад ддс 192
61и Азп Агд Зег Уа1 Азр Азп Ьеи Ьеи С1у 61у (31п ТЬг 11е Ьуз О1у
50 55 60
ЕЕд дад аас ссс аЕс аас аас ддс ссс Еас Еде аас ссс Еас аас аЕс 240
Ьеи С1и Азп Рго 11е Азп Азп С1у Рго Туг Суз Азп Рго Туг Азп 11е
65 70 75 80
асе дас сЕс Есс сад ддс асе дЕс Еде адЕ дед дсс ада дас Еас дас 288
ТЬг Азр Ьеи Зег <31п О1у ТЬг Уа1 Суз Зег А1а А1а Агд Азр Туг Азр
85 90 95
Есд дЕс асе даЕ даЕ ссс даЕ сас дсс дЕс ЕаЕ ддс ааЕ аас аЕс дад 336
Зег Уа1 ТЬг Азр Азр Рго Азр ΗΪ8 А1а Уа1 Туг О1у Азп Азп 11е О1и
100 105 110
ЕЕс Еас ддс асе ЕЕс асе ссс дас ааЕ дед дсс аЕс дсс сад ддс аад 384
РЬе Туг С1у ТЬг РЬе ТЬг Рго Азр Азп А1а А1а 11е А1а 61п О1у Ьуз
115 120 125
сЕд асе ссс Есс сад сад ддд ЕЕс дЕс асд даа сад сЕд сдс сЕд Еас 432
Ьеи ТЬг Рго Зег С31п Θΐη СЛу РЬе Уа1 ТЬг С1и <31п Ьеи Агд Ьеи Туг
130 135 140
аде дсс даЕ дсс аас сдс асе дад сЕд Есс дЕд сад дЕс аЕд аас ЕаЕ 480
Зег А1а Азр А1а Азп Агд ТЬг С1и Ьеи Зег Уа1 О1п Уа1 МеЕ Азп Туг
145 150 155 160
ЕЭС асе дад сад сад дЕд ССС дЕд сЕс асе Есд сЕс дЕс саа аас ЕаЕ 528
Туг ТЬг О1и С1п О1п Уа1 Рго Уа1 Ьеи ТЬг Зег Ьеи Уа1 О1п Азп Туг
165 170 175
дЕс дЕЕ ЕЕс аас саЕ Едд сас Есд даЕ дЕд ссЕ ддЕ ссс асе аас ссс 576
Уа1 Уа1 РЬе Азп ΗΪ8 Тгр Н18 Зег Азр Уа1 Рго С1у Рго ТЬг Азп Рго
180 185 190
- 32 008607
аас едд дсЕ дсс сЕс асе ЕсЕ дде асЕ Есд ЕаЕ ддЕ сас дда асе аас 624
Авп Агд А1а А1а Ьеи ТЬг Зег С1у ТЬг Зег Туг (31у Ηϊβ С1у ТЬг Авп
195 200 205
даЕ дад дсс ЕЕЕ дас аас сас дсс ЕЕС ссс сад сдЕ Есс аЕс ЕЕс сад 672
Авр С1и А1а РЬе Авр Авп ΗΪ8 А1а РЬе Рго О1п Агд Зег Не РЬе <31п
210 215 220
сад сЕд асе дад асе дде сас Есс ьдд аЕс аас Еас Едд дас асд дсЕ 720
С1п Ьеи ТЬг СЯи ТЬг (31у Ηϊβ Зег Тгр 11е Азп Туг Тгр Авр ТЬг А1а
225 230 235 240
ддЕ дде асЕ дде ссс даЕ дсс дад ЕЕс Еас аас Едд асЕ Еас асе Есс 768
С1у О1у ТЬг (31у Рго Авр А1а С1и РЬе Туг Азп Тгр ТЬг Туг ТЬг Зег
245 250 255
аас аас асе дас аад дЕс аад дсс сЕд даа сад ЕЕс Еас асд даЕ дсс 816
Азп Авп ТЬг Азр Ьуз Уа1 Ьув А1а Ьеи О1и С1п РЬе Туг ТЬг Азр А1а
260 265 270
дса дсс ддЕ дсс сЕд ссЕ даа ЕЕс аде Еас дЕс аас ссс Есд Еде Еде 864
А1а А1а С1у А1а Ьеи Рго С1и РЬе Зег Туг Уа1 Авп Рго Зег Сув Сув
275 280 285
ддЕ дЕс дде асе аас Есд аЕд сас ссс адЕ ддЕ сЕд аЕс Есс дас дде 912
(31у Уа1 С1у ТЬг Авп Зег МеЕ Ηϊβ Рго Зег С1у Ьеи 11е Зег Авр С1у
290 295 300
дад аад сЕд аЕс аад аас дЕс Еас дас дсЕ сЕд сдс дсс ддд ссс сад 960
О1и Ьув Ьеи Не Ьув Авп Уа1 Туг Азр А1а Ьеи Агд А1а С1у Рго С1п
305 310 315 320
Едд аас дад асе сЕс ЕЕс аЕс сЕд аде ЕЕс дас дад асе ддЕ дде ЕЕс 1008
Тгр Авп (31и ТЬг Ьеи РЬе Не Ьеи Зег РЬе Азр С1и ТЬг С1у С1у РЬе
325 330 335
сас дас саЕ дЕд ссс сед ссс сЕс дсЕ ссс едд сед дас аас сЕс асЕ 1056
ΗΪ8 Авр Ηϊβ Уа1 Рго Рго Рго Ьеи А1а Рго Агд Рго Азр Авп Ьеи ТЬг
340 345 350
Бас асд дсс асе асе сса аде дде дад дас Еас асе ЕЕс аас ЕЕЕ аас 1104
Туг ТЬг А1а ТЬг ТЬг Рго Зег С1у С1и Азр Туг ТЬг РЬе Азп РЬе Авп
355 360 365
сдЕ сЕд ддЕ ддЕ сдЕ аЕс ссс асЕ сЕд сЕд аЕс Есс ссс Едд дЕс дде 1152
Агд Ьеи О1у О1у Агд 11е Рго ТЬг Ьеи Ьеи 11е Зег Рго Тгр Уа1 С1у
370 375 380
аад дда ЕаЕ дЕс дад саа аад дде асе аде дЕс асе дде даа асе дкд 1200
Ьув С1у Туг Уа1 С1и С1п Ьув С1у ТЬг Зег Уа1 ТЬг С1у С1и ТЬг Уа1
385 390 395 400
ЕсЕ Бас ЕСС дсс Есс Есд аЕс сЕд сдс асе СЕд дде Еас сЕс ьдд дас 1248
5ег Туг 8ег А1а Зег Зег Не Ьеи Агд ТЬг Ьеи С1у Туг Ьеи Тгр Азр
405 410 415
- 33 008607
1296
еье дас ссЬ ЬЬс асе ссд едд дес дад еае дед сса есс еее дад сае
РЬе Аар Рго РЬе ТЬг Рго Агд Уа1 С1и Туг А1а Рго Зег РЬе СЛи НХЗ
420 425 430
сйд дкд сад асд едд дсс сдс дае аас асе ссд асе дсс еед ссд аде
Ьеи Уа1 С1п ТЬг Агд А1а Агд Азр Азп ТЬг Рго ТЬг А1а Ьеи Рго Зег
435 440 445
ссд дйд ссс ееъ едд аад еаа
Рго Уа1 Рго РЬе Агд Ьуз
450
1344
1365 <210> 3 <211> 454 <212> РКТ <213> АзрегдШиз пхдег <400> 3
Мее Нхз Рго Зег А1а Ьеи Уа1 СЛу Ьеи Ьеи А1а РЬе А1а А1а А1а А1а
1 5 10 15
Зег А1а Не Рго А1а Азп Рго Зег Нхз Ьуз А1а ΗΪ3 Зег Азр Зег А1а
20 25 30
Уа1 С1п Азп Ьеи Ьуз Зег Ьуз Не Ьуз Азп Уа1 Уа1 Уа1 Ьеи Уа1 МеЕ
35 40 45
О1и Азп Агд Зег Уа1 Азр Азп Ьеи Ьеи С1у СЛу С1п ТЬг Не Ьуз С1у
50 55 60
Ьеи С1и Азп Рго 11е Азп Азп СЛу Рго Туг Суз Азп Рго Туг Азп Не
65 70 75 80
ТЬг Азр Ьеи Зег Θΐη СЛу ТЬг Уа1 Суз Зег А1а А1а Агд Азр Туг Азр
85 90 95
Зег Уа1 ТЬг Азр Азр Рго Азр Нхз А1а Уа1 Туг О1у Азп Азп 11е О1и
100 105 110
РЬе Туг О1у ТЬг РЬе ТЬг Рго Азр Азп А1а А1а Не А1а (31П <31у Ьуз
115 120 125
Ьеи ТЬг Рго Зег С1п (31п О1у РЬе Уа1 ТЬг СЛи СЛп Ьеи Агд Ьеи Туг
130 135 14 0
Зег А1а Азр А1а Азп Агд ТЬг О1и Ьеи Зег Уа1 01п Уа1 МеЪ Азп Туг
145 150 155 160
Туг ТЬг (Э1и СЛп О1п Уа1 Рго Уа1 Ьеи ТЬг Зег Ьеи Уа1 С1п Азп Туг
165 170 175
Уа1 Уа1 РЬе Азп Нхз Тгр Нхз Зег Азр Уа1 Рго С1у Рго ТЬг Азп Рго
180 185 190
Азп Агд А1а А1а Ьеи ТЬг Зег СЛу ТЬг Зег Туг С1у Нхз СЛу ТЬг Азп
195 200 205
- 34 008607
Азр СЛи 210 А1а РЬе Азр Азп Ηϊβ 215 А1а РЬе Рго 01п Агд Зег 220 Не РЬе С1п
ϋΐη Ьеи ТЬг О1и ТЬг (31у Н1з Зег Тгр Не Азп Туг Тгр Азр ТЬг А1а
225 230 235 240
С1у С1у ТЬг С1у Рго Азр А1а О1и РЬе Туг Азп Тгр ТЬг Туг ТЬг Зег
245 250 255
Азп Азп ТЬг Азр Ьуз Уа1 Ьуз А1а Ьеи С1и О1п РЬе Туг ТЬг Азр А1а
260 265 270
А1а А1а С1у А1а Ьеи Рго С1и РЬе Зег Туг Уа1 Азп Рго Зег Суз Суз
275 280 285
(31у Уа1 С1у ТЬг Азп Зег МеЕ ΗΪ3 Рго Зег О1у Ьеи Не Зег Азр СЭ1у
290 295 300
<31и Ьуз Ьеи Не Ьуз Азп Уа1 Туг Азр А1а Ьеи Агд А1а С1у Рго С1п
305 310 315 320
Тгр Азп С1и Тпг Ьеи РЬе Не Ьеи Зег РЬе Азр С1и ТЬг С1у О1у Рпе
325 330 335
ΗΪ3 Азр ΗΪ8 Уа1 Рго Рго Рго Ьеи А1а Рго Агд Рго Азр Азп Ьеи ТЬг
340 345 350
Туг ТЬг А1а ТЬг ТЬг Рго Зег С1у С1и Азр Туг ТЬг РЬе Азп РЬе Азп
355 360 365
Агд Ьеи С1у С1у Агд Не Рго ТЬг Ьеи Ьеи Не Зег Рго Тгр Уа1 С1у
370 375 380
Ьуз С1у Туг Уа1 О1и О1п Ьуз С1у ТЬг Зег Уа1 ТЬг С1у С1и ТЬг Уа1
385 390 395 400
Зег Туг Зег А1а Зег Зег Не Ьеи Агд ТЬг Ьеи С1у Туг Ьеи Тгр Азр
405 410 415
РЬе Азр Рго РЬе ТЬг Рго Агд Уа1 О1и Туг А1а Рго Зег РЬе С1и Ηίβ
420 425 430
Ьеи Уа1 С1п ТЬг Агд А1а Агд Азр Азп ТЬг Рго ТЬг А1а Ьеи Рго Зег
435 440 445
Рго Уа1 Рго РЬе Агд Ьуз
450 <210> 4 <211> 3692 <212> ДНК <213 > АзрегдШиз пддег <400> 4
ЕЕЕддддЕЕд дЕсдЕдЕдсд ЕссЕдЕдсЕд ЕссЕдЕсЕЕд аассдаасса дасЕддсадд60 дасЕаЕЕаЕЕ ссдадЕаЕЕс сссддсдаад даЕддсадЕд аЕдадасаЕЕ сддсЕддаЕЕ120 ддаЕсддасс ссЕдсЕдаЕс адсЕсдддда аЕЕсЕссЕаЕ ЕссдЕдддаЕ ЕдаЕЕсЕЕЕЕ180
- 35 008607
СГГЬЬГсЪГГ ГсГаГГсГаГ дсГаГдсааа адасдЬдаСд ЬдЬдГсГддЬ ГддсдГСсса 240
ддадсдаада ГГдсГГГГсб ГасГабаЬГа ГкссГГсГГс ГабдГЬсГбд ааГГадсбаб 300
дсаддбадсд дГсааГабаЬ ссГГГаадса дабассЬГГа сГсГГдсбаГ ддабаГсаба 360
акссГадаад дГасабссас сабадасбас сГадбссссд дссасабсаГ дааабабсас 420
ЬддбасаГГа ГГсбссдада ассасадаас сасбссабад сасаддсаса ГааГддсасс 480
Гдсссасасс сасасбсасд дсГссбадба сСаассссбс дЬадбсссса дбасбссаса 540
ддбассГааб асасббдЬсс сасасссЬса ссаадассаа скаассасса аадсбасбсд 600
садаЬадсаа даГадГсасс Гдссасассд саасГсасГа асааасдсад аЬсасаадсс 660
ГааабаГГсд аассааассЬ даадааГссб ГГссаассаа сасасасасд дбаГдддГГд 720
дааддааддд ааадааадбд дддГЬаадса аасГаасбаа сааасЬсЬдс ааддбадсаа 780
асдсбасасб аассаассаа асЬадГГааа сГаабаГГаа ЬааГаабааГ аадаадаада 840
адабдаГдаб дааддадбса ГсдГГсГссс дбссссддсб ГабадГасдд даГдсГаадд 900
сГдсассссд садсасддда адсссддасд ГГддГддГСГ дсдддГдддГ дасбддаГГа 960
дасбадддда сбсдбааддс адсддасЬад ЬГаааГГааб ГдасЬадСад ЪсГдГдсбдд 1020
ус'ЬуууссЬа ЬсЬадЬасид ЬдаадЬдссд ддаидидссд ддЬдадидаа дадЬЬсаиЬа χϋόϋ
аГдааЬдабб даГГдаГГГд сдддддГддГ аддбдЬадсд ГГаддбааГд даассасббс 1140
ГЬабааГбдГ аГГасбсбас ГаасГдбааа ГдГдГдЬдГЪ Гбабддддас аддадаадбб 1200
ааддГадЬаб бдддддсддд ааааддддаГ ддГГдГсбаа ГГсадГГГдб ГбсааГадбб 1260
ЬдГГдаддба ГГГГсГбдГс ааадГГасбб дГГсадаГГа ЬдддсасдГд ГасдГдсбба 1320
дГГГСсабад аЪЪдбдГдба ГдГдГдбдбд Ьдсдсдбдсд ГдсЬдассса ГсГабадсаб 1380
дЬабсдсддГ сГдааГдбдГ аЬаадсдсбд саадбдабсд дсааадбдас аадаадбсГЪ 1440
Ьсбасдассс асГадГГаГЬ ЬдсаЬдесас даассасаас ассдссадГс асадсдасад 1500
сабдГдаада адГсбсадаб ГГсдГаасас ГсГсссдбсб асГдсГсбсс ГасГГдабад 1560
асбдасЬбас сбсддссЬдГ дсасабдсса ГдГсссбабс ссаабсбасб ддГссабдбд 1620
садассасдс сбссасдГГГ сГссдссадГ адабссЬГса асассдсГса ГссГсадаса 1680
асаГсбасбЬ ЪаГГбдасГГ ГГсддадаад ассабдсГГд Гсбасддсса дсЬабадсаЪ 1740
дсбаГадсад Гссдббаабс Гссассдддс Гсссдсбссд аасддадаГд дддссааасб 1800
дссасбссад ЪГдсдсаасд дасаддсасс даассддаас аааддабдсд даададдада 1860
сабддЬдссГ даГХдсаГдЬ дсГддсСГса ГсбдсЬаГсд ЬдадддЬдсЬ дбдсбддада 1920
ааГГГдГбдб сГдасббасс ссдсГГсГГд СГГЬГГ6Г.СС сссГдабдсс ссбдаГдддд 1980
ааббддддбд ддбаабабда ГасаддГаба ааадддддсб сддаддбдса дЪГддабада 2040
адсаЬГдбдЬ дГдсаббдса дсадГссдГГ ддГсбсасдб сГсЬддббдс сГсдаГГдба 2100
ЬаГабасбдс аддабдГГсГ сбддасддЬГ ЪддадГдсЬГ ГГдасддсдс Гсдсбдсдсб 2160
дадбдсГдсд дсассдасас сасГГдабдб дсддадбадд ГдГдссбдаб Гбдаадбддс 2220
Ьддабадсас бдабдааддб ГЬГдаабадд ГдГсбсдасб ГссасдГЬдд абдадсбдса 2280
аЬГдГГсбсд саабддГсбд ссдсадсГГа Гбдсбсдаас аабабсдасГ сддасдасбс 2340
Ьаасдбдаса Гдсасддссд асдссГдбсс абсадбсдад даддсдадса ссаадабдсб 2400
дсГддадббб дассГдГабд ГЬдсЬссадГ дааабддаба даасасадсЬ даГГдаабад 2460
дасаааГаас бббддаддса садссддГГГ ссбддссдсд дасаасасса асаадсддсб 2520
сдГддбсдсс ГХссдаддса дбадсассаЬ саадаасГдд аГ-бдсбдаГс ЬсдасГЪсаб 2580
ссбдсаадаб аасдабдасс ГсбдГасЬдд сбдсааддГЪ сасасбддаб Гсбддааддс 2640
аГдддаадсс дсбдсадаса абсГдасдад саадабсаад ГссдсдаГда дсасдбаббс 2700
дддсбаСасс сГсбасГГса ссдддсасад сббдддсддс дсаГСддсГа сасГдддадс 2760
- 36 008607
аасддбсббд сдааабдасд дббабадсдб бдаасбддбд адбдсббсад адддбдабса 2820
ббааасадсс ддббсбдаса дбсаабадба сассбабдда бдбссбсдад бсддааасба 2880
бдсдсбддсс дадсасабса ссадссаддд абсбддадсд аасббссдсд ббасасасбб 2940
даасдасабс дбсссссддб бдссасссаб ддасбббдда ббсадссадс саадбссада 3000
абасбддабс ассадбддса ссддадссад бдбсасддсд бсддабаббд аасбсабсда 3060
дддаабсааб бсдасддсдд ддаабдсадд сдаадсаасд дбддасдббб бддсбсасбб 3120
дбддбасббб ббсдсааббб сададбдбсб дсбабадсбд дасадбссда бдааабаадб 3180
дсддададаа адбдбаааба дбааббадба бабаабсадд сададаадса дбддбддбса 3240
дадаадааад адбдадабсс саббасдбад садабааасс асдбдбддад дсдсбдббсс 3300
бссасббдса дббдсддсса бсаабсабсб бсббсбссбб асбббсдбсс ассабаасбс 3360
бсабссбдсс адсбдбсдса бссссдддбб бсаасаасад бсдссбссдд дсссбссдбд 3420
дббсбссббб аббаббссаб ссдссддссд асдбббсасс сбсабссбдс дссдссдсаа 3480
ббсбсбссдд абсддбсаад бсасбсдаас сдссдсссдс абсдассбса ссдасссдас 3540
сдбсбдсдаб сдсссабссд бдсадссабд ббсссбдссс сдбсасбсбд абббдасдсб 3600
сааббдасбб ссдбддсаба сабасабсса дсадсабабд абсасадсбс ссссдссбсд 3660
бдссадбсбс дссдссдссд ссдббдссад сс 3692
<210>
<211>
894 <212>
ДНК
<220>
<221> СОЗ <222> (1)..(894) <400> 5
л кет Меб 1 ύϋο РЬе кеб Зег егета □ Д' О1у ГПП —ээ Агд 5 ббб РЬе пета О1у ст1-сг Уа1 ебб Ьеи М-сг — Ьеи 10 ага апа сбс Ьеи аг! ϋ-- А1а σπα А1а 15 сба --—* Ьеи 48
ТЬг А1а
адб дсб дед дса ссд аса сса ебб даб д+д едд адб дбе бед асб бсс 96
Зег А1а А1а А1а Рго ТЬг Рго Ьеи Азр Уа1 Агд Зег Уа1 Зег ТЬг Зег
20 25 30
асд ббд даб дад ебд саа ббд ббс бед саа ьдд бсб дсс дса дсб баб 144
ТЬг Ьеи Азр С1и Ьеи ΘΙη Ьеи РЬе Зег ΘΙη Тгр Зег А1а А1а А1а Туг
35 40 45
бдс бед аас ааб абс дас бед дас дас бсб аас дбд аса бде асд дсс 192
Суз Зег Азп Азп Не Азр Зег Азр Азр Зег Азп Уа1 ТЬг Суз ТЬг А1а
50 55 60
дас дсс бдб сса бса дьс дад дад дед аде асе аад абд ебд ебд дад 240
Азр А1а Суз Рго Зег Уа1 С1и С1и А1а Зег ТЬг Ьуз Меб Ьеи Ьеи О1и
65 70 75 80
- 37 008607
ббб дас ебд аса ааб аас ббб дда ддс аса дсс ддб ббс ебд дсс дед 288
РЬе Азр Ьеи ТЬг Азп Азп РЬе С1у С1у ТЬг А1а С1у РЬе Ьеи А1а А1а
85 90 95
дас аас асе аас аад едд сбс дбд дбе дсс ббс еда ддс адб аде асе 336
Азр Азп ТЬг Азп Ьуз Агд Ьеи Уа1 Уа1 А1а РЬе Агд С1у Зег Зег ТЬг
100 105 110
абс аад аас бдд абб дсб даб сбс дас ббс абс ебд саа даб аас даб 384
Не Ьуз Азп Тгр 11е А1а Азр Ьеи Азр РЬе Не Ьеи ΘΙη Азр Азп Азр
115 120 125
дас сбс бдб асб ддс бде аад дбб сас аей дда ббс бдд аад дса бдд 432
Азр Ьеи Суз ТЬг С1у Суз Ьуз Уа1 Н13 ТЬг О1у РЬе Тгр Ьуз А1а Тгр
130 135 140
даа дсс дсб дса дас ааб ебд асд аде аад абс аад бсс дед абд аде 480
01и А1а А1а А1а Азр Азп Ьеи ТЬг Зег Ьуз Не Ьуз Зег А1а Меб Зег
145 150 155 160
асд баб бед ддс баб асе сбс бас ббс асе ддд сас аде ббд ддс ддс 528
ТЬг Туг Зег С1у Туг ТЬг Ьеи Туг РЬе ТЬг С1у ΗΪ3 Зег Ьеи С1у С1у
165 170 175
дса ббд дсб аса ебд дда дса асд дбе ббд еда ааб дас ддб баб аде 576
А1а Ьеи А1а ТЬг Ьеи С1у А1а ТЬг Уа1 Ьеи Агд Азп Азр О1у Туг Зег
180 185 190
дбб даа ебд бас асе баб дда бдб ссб еда дбе дда аас баб дед ебд 624
Уа1 О1и Ьеи Туг ТЬг Туг О1у Суз Рго Агд Уа1 О1у Азп Туг А1а Ьеи
195 200 205
дсс дад сас абс асе аде сад дда бсб дда дед аас ббс сдс дбб аса 672
А1а (31и ΗΪ3 11е ТЬг Зег ΘΙη С1у Зег О1у А1а Азп РЬе Агд Уа1 ТЬг
210 215 220
сас ббд аас дас абс дбе ссс едд ббд сса ссс абд дас ббб дда ббс 720
Нхз Ьеи Азп Азр 11е Уа1 Рго Агд Ьеи Рго Рго Меб Азр РЬе С1у РЬе
225 230 235 240
аде сад сса адб сса даа бас едд абс асе адб ддс асе дда дсс адб 768
Зег ΘΙη Рго Зег Рго О1и Туг Тгр 11е ТЬг Зег С1у ТЬг С1у А1а Зег
245 250 255
дбе асд дед бед даб абб даа сбс абс дад дда абс ааб бед асд дед 816
Уа1 ТЬг А1а Зег Азр 11е С1и Ьеи 11е О1и С1у Не Азп Зег ТЬг А1а
260 265 270
ддд ааб дса ддс даа дса асд д^д дас дбб ббд дсб сас ббд ьдд бас 864
С1у Азп А1а <31у <31и А1а ТЬг Уа1 Азр Уа1 Ьеи А1а Ηίβ Ьеи Тгр Туг
275 280 285
ббб ббс дса абб бса дад бдб ебд сба бад 894
РЬе РЬе А1а Пе Зег С1и Суз Ьеи Ьеи
290 295
<210> б <211> 297 <212> РКТ <213> АзрегдШиз пхдег <400> 6
Мей РЬе 5ег С1у Агд РЬе С1у Уа1 Ьеи Ьеи ТЬг А1а Ьеи А1а А1а Ьеи
1 5 10 15
Οβν Ά1 Ά Ί -> 7\ 1 ·= Π·» V» -V- Т.ап Л Г-.-Г-Ч и-з1 Τ7·= Ί Οβν гр 1-1 V.
ΧΆΑ. и гххи п± сд. С X Л ХД- ГХ V хдс и. гъо V СХХ ьд<с;х V О.Х исх X XXX
20 25 30
ТЬг Ьеи Азр С1и Ьеи (31п Ьеи РЬе Зег (31п Тгр Зег А1а А1а А1а Туг
35 40 45
Суз Зег Азп Азп 11е Азр Зег Азр Азр Зег Азп Уа1 ТЬг Суз ТЬг А1а
50 55 60
Авр А1а Суз Рго Зег Уа1 О1и С1и А1а Зег ТЬг Ьуз Мек Ьеи Ьеи С1и
65 70 75 80
РЬе Азр Ьеи ТЬг Азп Азп РЬе О1у О1у ТЬг А1а (Э1у РЬе Ьеи А1а А1а
85 90 95
Азр Азп ТЬг Азп Ьуз Агд Ьеи Уа1 Уа1 А1а РЬе Агд С1у Зег Зег ТЬг
100 105 110
Не Ьуз Азп Тгр 11е А1а Азр Ьеи Азр РЬе 11е Ьеи СЛп Азр Азп Азр
115 12 0 125
Азр Ьеи Суз ТЬг О1у Суз Ьуз Уа1 Н13 ТЬг С1у РЬе Тгр Ьуз А1а Тгр
130 135 140
С1и А1а А1а А1а Азр Азп Ьеи ТЬг Зег Ьуз 11е Ьуз Зег А1а Мей Зег
145 150 155 160
ТЬг Туг Зег С1у Туг ТЬг Ьеи Туг РЬе ТЬг С1у Ηίβ Зег Ьеи С1у <31у
165 170 175
А1а Ьеи А1а ТЬг Ьеи СЛу А1а ТЬг Уа1 Ьеи Агд Азп Азр (31у Туг Зег
180 185 190
Уа1 С1и Ьеи Туг ТЬг Туг О1у Суз РГО Агд Уа1 С1у Азп Туг А1а Ьеи
195 200 205
А1а О1и Н1з 11е ТЬг Зег О1п С1у Зег 01у А1а Азп РЬе Агд Уа1 ТЬг
210 215 220
ΗΪ3 Ьеи Азп Азр 11е Уа1 Рго Агд Ьеи Рго Рго Мек Азр РЬе (31у РЬе
225 230 235 240
8ег <31п Рго Зег Рго С1и Туг Тгр Не ТЬг Зег С1у ТЬг О1у А1а Зег
245 250 255
Уа1 ТЬг А1а Зег Азр 11е С1и Ьеи Не С1и С1у 11е Азп Зег ТЬг А1а
260 265 270
О1у Азп А1а С1у С1и А1а ТЬг Уа1 Азр Уа1 Ьеи А1а Ηίβ Ьеи Тгр Туг
275 280 285
- 39 008607
Рйе РЬе А1а Не Зег С1и Суз Ьеи Ьеи
290 295 <210> 7 <211> 3478 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пгдег <400> 7
ЬЬдскдЬаСа ЬЬЬддЪЕЬЪа скадаадааа дЕГЬааСйск дСЕадЪСддЕ дЪЪсЬЬдЬдЕ 60
дсЬсЬсаёдЬ ддсбдасСЬд адаадасЬса аакдЬЕддаЬ дЬсЬдЬсада дЬаадсЪдас 120
дЬЬдЬЬЬссд дсдаадкЬЬй ссЬсЬадЬЬд саСадСйасс сйдсйсассс даадЬЬааЬЬ 180
дсаЬЬадасс адаадЬЪдда сасдадсдаа ссасадсада дсЬдасЬдса дсаадссЬЬЬ 240
дсЪдсдсасс Ъсадссииси ддисссдидд асЕСсаиссд ЪсадсЬссдд асссасидаЁ 300
сдсЬдЬдаса ЬсадддЕссЬ ЬдЬдСдааСд БаЬассаддд сссЬЬдсддд ЬсЬсЬЬаЬсс 360
сЬдадЪадЬЬ дЬаасдЬааа ЬдссйЬааЬд сдЬЬсааадс аааЬдаЬкса сЬсасааЬЬд 420
дЬдадЬасса саёдддадъе ЪЬсадааЬсЬ адсааааадс скаасаадса дЬдЬдЬсдсс 480
саадаЪсдаЬ сссдкдбдаа ссайсаЬсса ЬдЬЬсддсйй ассаасЫХа аЪссЬсадсЬ 540
асЬасЬсЪсЬ дасйдссадС ЬсадсЬасдд ааЬЬдссддЬ ЬЬаааёсадс сЬссасаЬдЬ 600
адЬдЬсссда ассаЬддасЪ дсааЬЬсаай дссаЬсЬЬсд сЬЬсадассс ЬссааЬсакс 660
СаЬсааадаЬ ссаЬддССсй ссадассдса адсаасдадд СсасСаЬдаЪ сассассаад 720
асЬЬсддЬас сасесСбааС дсЬЬдасаад ЬааСддсаСа ЬсЬасЬассд аддсссЬсдд 780
седсдсадса ассЬСддЬсд ддЬЕддаааС ЬсдаадСддй сдсСсеСЕсЬ СдсЬдЕдаад 840
асдЬсдддда дадсбдкасе есассакссс аасссаССдд сСЬссесСад аааасадЬад 900
ссдбайаьеа сЬбдсбадса ЬдсадЬдсаС адсадсбкйа сЬЬдссЫЩд саадсабабЬ 960
дЬсаддЬЬЬд йсаййдРсаЬ йЬссадйййс ааЬЬСсасса ЬйдсасссЬЬ ссдсадсЬЬс 1020
сддадсйддЬ сйаассдсад адЫзссаЬад дсдкаадЬдс Ьадскксаас аакдадЪасд 1080
дсадасасЬЬ даЬдсадсад сдсдсдсЬас саааЕдсдсс ЬдаЬддайаЬ асассаасЬа 1140
сддЬсдддЬд сЬсЬдсдадк сдЬсссасЕд ЬдсдсадЪдс дасадсасЪс ЬсдЪсдаасд 1200
ааЬсдЪсаЬд дсЬааддасЬ сддаддааса айасасёдЬс ддссакдада дааЬЬсЬЬсд 1260
дЬсдсдЬсаа саЬЬасадас ЬЬЬдасдсЕд ЬддддЬаЪаЪ сааЬсдсаёс ЬсЬадсааса 1320
ссЬссдаЬИЬ дссдаакаЬЬ ддсаёЬдсйд ЬсЬсСддЬдд адддкассдд дсБсЬдакда 1380
асддбдсЬдд ддсааЬсаад дсЬСЬЬдаЬа аСсдЬасадй сааЬСсСаса адсааЪддЪс 1440
адсСдддЬдд асбдсЪдсаа ЬсадсаасаЬ айсЪддссдд ссЬсадЬддЬ ддддсаЬддй 1500
ЬддЪдддаСс ЬаЬсЪасЬЬд ааЪааЪЬЬсЬ ссассаЪсйс дбсдсЬЬсад ассЪасдаЬс 1560
сЬддЬдаЬдЪ сЬддсадЪЪс садаасЬсда ЪсСЬЬдаадд ссссдасддд даЬадЬаксс 1620
ааакСаЪада ЪЪсйдсаасс Ьасйасадад абаёйЪайда сдсадЬдксЬ ддаааддаЪд 1680
аЬдсаддЬЬд дсадасаЪсс аЪсасЬдаЕЕ асЬддЬаЕда дЬссЪадссс ааЬЬсЬсдсс 1740
садсадсдаЬ асйдаёдссс ассаддддсс дсдсдсЬсЬс аЪассадсЬс дЬсаасдсса 1800
ссдссддадд ааксаасйас ассЬддЬсаЪ ссайадсйсй дассдасЕсс ЬЬсаддаддд 1860
садаааЬдсс ааЬдсссдйд скадЪсдсад асддссдаСа сссадасдад сЬссЬадйса 1920
дсадсааёдс сасадЬскас дааЬЪсаасс ссйдддааЪЪ сддсассЬЬЬ дасссаасдд 1980
- 40 008607
ЕасасддсЕЕ сдЕдсссдЕЕ садЕаЕсЕдд дсЕсасдсЕЕ сдЕадссдда ЕсссЕЕссса 2040
дсаасдааад сЕдсдЕссдс дддЕЕЕдаса аЕддсддсЕЕ ЕаЕЕаЕддда ассЕсаЕсса 2100
ссЕЕаЕЕсаа ссааЕЕссЕЕ сЕЕсаааЕса асасаасЕад ссЕссссадс ЕЕссЕдааад 2160
асдсаЕЕЕас аадсаЕссЕа даадаЕсЕсд дсдаааасад ссаадасаЕа дсадЕЕЕаса 2220
сссссаассс дЕЕсЕаЕсЕс ЕдддссааЕЕ ссассЕсссс аЕссдсаадс сааасадЕсс 2280
ЕсдассЕсдЕ ддаЕддсддс даадассЕсс аааасаЕссс сЕЕасаЕсса сЕсаЕссадс 2340
сададсдсса ЕдЕддасдЕс аЕсЕЕЕдссд ЕддасЕссЕс сдсадасасд садЕаЕаасЕ 2400
ддсссаасдд сассдсаЕЕа дЕсдссассЕ асдадсдсад ссЕааасЕсЕ асдддсаЕсд 2460
дсааЕдддас адсЕЕЕсссЕ дсЕаЕссссд ассааааЕас ЕЕЕЕдЕсааЕ дадддЕсЕса 2520
аЕасдсдасс аасдЕЕсЕЕс дддЕдсаасЕ саЕсдааЕас сасЕдддсса дсассдЕЕад 2580
ЕЕдЕЕЕассЕ ЕссЕаасЕЕЕ ссдЕаЕдЕда сЕЕЕЕЕсдаа сдЕдЕсдасд ЕЕЕдаЕссда 2640
дЕЕасЕсдда дЕсдсададд даЕадЕаЕЕа ЕссЕЕааЕдд дЕаЕдаЕдЕд дссасдаЕдд 2700
ддааЕааЕад ЕсдсдаЕддд дааЕддЕсЕЕ сЕЕдЕдЕЕдс дЕдЕдсЕдЕЕ ЕЕдадЕсддЕ 2760
сЕЕЕЕдаасд дасЕаасасЕ асддЕдссдд аЕсадЕдЕад ссддЕдсЕЕЕ дададдЕасЕ 2820
дсЕддуаЕдд ЕасЕасдааЕ адЕЕсдасЕс СуууЕасЕЕа ЕдадсссадЕ асддЕаЕЕЕд 2880
аЕааЕдсЕдд дЕаЕдсЕдЕа аЕдссЕдсЕд ЕЕЕЕсдсдас ЕасдаЕддсЕ дсЕдсдасЕд 2940
ЕЕЕсддсдЕЕ ЕаЕдЕаддас аЕЕЕЕссдсЕ дЕЕсадддЕд ЕаЕдЕаЕадЕ дадаЕЕдаЕа 3000
ддаасадааа адЕсааЕдса ЕадЕаддЕЕЕ аЕаЕдаадаа адЕаЕаЕааЕ ЕдЕдсааЕЕс 3060
ааддсаЕЕсс аЕдаааЕдса ддадЕдаЕЕд асдЕдсЕсда сЕссддаЕда ддсадсссас 3120
ЕЕсссЕсасд ЕдЕсдсдЕЕа ссаддддаас сассдсссда Есдсссааас аадсаадсдд 3180
сасааасадд адсдЕссасЕ сдддсдасЕЕ сдаЕдаЕсдд ссЕссасЕдс ЕаасЕадЕса 3240
асаассасдс саасЕсдасс ассассаЕсс ссЕдсЕЕасЕ ЕЕаасссЕдс аЕасаадсЕЕ 3300
ссддддЕЕаа адсаадЕдаЕ ЕдЕЕсасЕЕа ЕсдссадЕдд асдсасааЕд адсасддсаа 3360
ЕЕсадЕасЕд адЕссссдсЕ дссассдаса сассасааса даадсдддас аЕсаасааса 3420
ссассЕссда ссЕсссдсдс ддЕадсаЕЕЕ ассдасЕссд ааЕаЕЕдаЕс адсасаса 3478
<210> 8 <211> 1902 <212> ДНК <213 > АзрегдШиз пддег <220>
<221> СОЗ <222> (1)..(1902) <400> 8
аЕд сад Еде аЕа дса дсЕ ЕЕа сЕЕ дсс ЕЕЕ дса аде аЕа ЕЕд Еса ддс 48
МеЕ (31п Суз Не А1а А1а Ьеи Ьеи А1а РЬе А1а Зег 11е Ьеи Зег (31у
1 5 10 15
дЕа адЕ дсЕ аде ЕЕс аас ааЕ дад Еас ддс ада сас ЕЕд аЕд сад сад 96
Уа1 Зег А1а Зег РЬе Азп Азп С1и Туг (31у Агд ΗΪ3 Ьеи МеЕ С1п О1п
25 30
- 41 008607
сдс дед сЕа сса ааЕ дед ССЕ даЕ дда ЕаЕ аса сса асЕ асд дЕс ддд 144
Агд А1а Ьеи Рго Азп А1а Рго Азр О1у Туг ТЬг Рго ТЬг ТЬг Уа1 О1у
35 40 45
Еде ЕсЕ дед адЕ сдЕ ссс асЕ дьд сдс адЕ дед аса дса сЕс Есд Есд 192
Суз Зег А1а Зег Агд Рго ТЬг Уа1 Агд Зег А1а ТЬг А1а Ьеи Зег Зег
50 55 60
аас даа Есд Еса Едд сЕа адд асЕ едд адд аас ааЕ аса сЕд Есд дсс 240
Азп (31и Зег Зег Тгр Ьеи Агд ТЬг Агд Агд Азп Азп ТЬг Ьеи Зег А1а
65 70 75 80
аЕд ада даа ЕЕС ЕЕс ддЕ сдс дЕс аас аЕЕ аса дас ЕЕЕ дас дсЕ дед 288
МеЕ Агд С1и РЬе РЬе (31у Агд Уа1 Азп 11е ТЬг Азр РЬе Азр А1а Уа1
85 90 95
ддд ЕаЕ аЕс ааЕ сдс аЕс ЕсЕ аде аас асе Есс даЕ ЕЕд сед ааЕ аЕЕ 336
С1у Туг Не Азп Агд 11е Зег Зег Азп ТЬг Зег Азр Ьеи Рго Азп 11е
100 105 110
ддс аЕЕ дсЕ дЕс ЕсЕ ддЕ дда ддд Еас едд дсЕ сЕд аЕд аас дде дсЕ 384
С1у Не А1а Уа1 Зег <Э1у О1у С1у Туг Агд А1а Ьеи МеЕ Азп С1у А1а
115 120 125
ддд дса аЕс аад дсЕ ЕЕЕ даЕ ааЕ сдЕ аса дЕс ааЕ ЕсЕ аса аде ааЕ 432
О1у А1а 11е Ьуз А1а РЬе Азр Азп Агд ТЬг Уа1 Азп Зег ТЬг Зег Азп
130 135 140
ддЕ сад сЕд ддЕ дда сЕд сЕд саа Еса дса аса ЕаЕ сЕд дсс ддс сЕс 480
С1у (31п Ьеи О1у О1у Ьеи Ьеи О1п Зег А1а ТЬг Туг Ьеи А1а (31у Ьеи
145 150 155 160
адЕ ддЕ ддд дса Едд ЕЕд дед дда ЕсЕ аЕс Еас ЬЕд ааЕ ааЕ ЕЕс Есс 528
Зег <31у О1у А1а Тгр Ьеи Уа1 О1у Зег 11е Туг Ьеи Азп Азп РЬе Зег
165 170 175
асе аЕс Есд Есд СЕЕ сад асе Еас даЕ ссЕ дде даЕ дЕс Едд сад ЕЕс 576
ТЬг 11е Зег Зег Ьеи С1п ТЬг Туг Азр Рго (Э1у Азр Уа1 Тгр С1п РЬе
180 185 190
сад аас Есд аЕс ЕЕЕ даа ддс ссс дас ддд даЕ адЕ аЕс саа аЕЕ аЕа 624
С1п Авп Зег 11е РЬе О1и О1у Рго Азр С1у Азр Зег Не (31п Не 11е
195 200 205
даЕ ЕсЕ дса асе Еас Еас ада даЕ аЕЕ ЕаЕ дас дса дЕд ЕсЕ дда аад 672
Азр Зег А1а ТЬг Туг Туг Агд Азр Не Туг Азр А1а Уа1 Зег <31у Ьуз
210 215 220
даЕ даЕ дса ддЕ Едд сад аса Есс аЕс асЕ даЕ Еас едд ддс сдс дед 720
Азр Азр А1а <31у Тгр <31п ТЬг Зег 11е ТЬг Азр Туг Тгр С1у Агд А1а
225 230 235 240
СЕС Еса Еас сад СЕС дЕс аас дсс асе дсс дда дда аЕс аас Еас асе 768
Ьеи Зег Туг (31η Ьеи Уа1 Азп А1а ТЬг А1а 61у С1у 11е Азп Туг ТЬг
245 250 255
- 42 008607
Едд еса есс аеа дсе сед асе дас есс еее адд адд дса даа аед сса 816
Тгр Зег Зег Не А1а Ьеи ТЬг Азр Зег РЬе Агд Агд А1а С1и Мее Рго
260 265 270
аед ссс дед сеа дес дса дас ддс еда еас сса дас дад сес сеа дес 864
Мее Рго Уа1 Ьеи Уа1 А1а Азр С1у Агд Туг Рго Азр О1и Ьеи Ьеи Уа1
275 280 285
аде аде аае дсс аса дес еас даа еее аас ссс едд даа еее ддс асе 912
Зег Зег Азп А1а ТЬг Уа1 Туг С!1и РЬе Азп Рго Тгр С1и РЬе О1у ТЬг
290 295 300
еее дас сса асд деа сас ддс еее дкд ссс дее сад еае сед ддс еса 960
РЬе Азр Рго ТЬг Уа1 ΗΪ5 О1у РЬе Уа1 Рго Уа1 С1п Туг Ьеи О1у Зег
305 310 315 320
сдс еее деа дсс дда есс сее ссс аде аас даа аде еде дес сдс ддд 1008
Агд РЬе Уа1 А1а О1у Зег Ьеи Рго Зег Азп О1и Зег Суз Уа1 Агд С1у
325 330 335
нее дас аае ддс ддс еее аее аед дда асе еса есс асе ееа еее аас 1056
РЬе Азр Азп (31у С1у РЬе Не Мее С1у ТЬг Зег Зег ТЬг Ьеи РЬе Азп
340 345 350
саа еее сее сее саа аес аас аса асе аде сес ссс аде еее сед ааа 1104
61п РЬе Ьеи Ьеи Θΐη Не Азп ТЬг ТЬг Зег Ьеи Рго Зег РЬе Ьеи Ьуз
355 360 365
дас дса еее аса аде аес сеа даа дае сес ддс даа аас аде саа дас 1152
Азр А1а РЬе ТЬг Зег Не Ьеи О1и Азр Ьеи (31у С1и Азп Зег (31п Азр
370 375 380
аеа дса дьь еас асе ссс аас ссд еее еае сес едд дсс аае есс асе 1200
Не А1а Уа1 Туг ТЬг Рго Азп Рго РЬе Туг Ьеи Тгр А1а Азп Зег ТЬг
385 390 395 400
есс сса есс дса аде саа аса дес сес дас сес дед дае ддс ддс даа 1248
Зег Рго Зег А1а Зег О1п ТЬг Уа1 Ьеи Азр Ьеи Уа1 Азр О1у С1у 61и
405 410 415
дас сес саа аас аес ссс ееа сае сса сес аес сад сса дад сдс сае 1296
Азр Ьеи Θΐη Азп Не Рго Ьеи ΗΪ8 Рго Ьеи Не С1п Рго (Э1и Агд ΗΪ8
420 425 430
дьд дас дес аес еее дсс дьд дас есс есс дса дас асд сад еае аас 1344
Уа1 Азр Уа1 Не РЬе А1а Уа1 Азр Зег Зег А1а Азр ТЬг С1п Туг Азп
435 440 445
Сдд ссс аас ддс асе дса ееа дес дсс асе еас дад сдс аде сеа аас 1392
Тгр Рго Азп (31у ТЬг А1а Ьеи Уа1 А1а ТЬг Туг С1и Агд Зег Ьеи Азп
450 455 460
ЬсЬ асд ддс аес ддс аае ддд аса дсе еее ссе дсе аес ссс дас саа 1440
Зег ТЬг С1у Не О1у Азп С1у ТЬг А1а РЬе Рго А1а Не Рго Азр (31п
465 470 475 480
- 43 008607
ааЕ асЕ ЕЕЕ дЕс ааЕ дад ддЕ сЕс ааЕ асд еда сса асд ЕЕс ЕЕс ддд 1488
Азп ТЬг РЬе Уа1 Азп С1и О1у Ьеи Азп ТЬг Агд Рго ТЬг РЬе РЬе О1у
485 490 495
Еде аас Еса Есд ааЕ асе асЕ ддд сса дса ссд ЕЕа дЕЕ дЕЕ Еас сЕЕ 1536
Суз Азп Зег Зег Азп ТЬг ТЬг С1у Рго А1а Рго Ьеи Уа1 Уа1 Туг Ьеи
500 505 510
ссЕ аас ЕЕЕ ссд ЕаЕ дЕд асЕ ЕЕЕ Есд аас дЕд Есд асд ЕЕЕ даЕ ссд 1584
Рго Азп РЬе Рго Туг Уа1 ТЬг РЬе Зег Азп Уа1 Зег ТЬг РЬе Азр Рго
515 520 525
адЕ Еас Есд дад Есд сад адд даЕ адЕ аЕЕ аЕс сЕЕ ааЕ ддд ЕаЕ даЕ 1632
8ег Туг Зег СЯи Зег С1п Агд Азр Зег 11е 11е Ьеи Азп С1у Туг Азр
530 535 540
дЕд дсс асд аЕд ддд ааЕ ааЕ адЕ сдс даЕ ддд даа Едд ЕсЕ ЕсЕ ЕдЕ 1680
Уа1 А1а ТЬг МеЕ С1у Азп Азп Зег Агд Азр С1у <31и Тгр Зег Зег Суз
545 550 555 560
дЕЕ дед ЕдЕ дсЕ дЕЕ ЕЕд адЕ сдд ЕсЕ ЕЕЕ даа сдд асЕ аас асЕ асд 1728
Уа1 А1а Суз А1а Уа1 Ьеи Зег Агд Зег РЬе С1и Агд ТЬг Азп ТЬг ТЬг
565 570 575
дЕд ссд даЕ сад ЕдЕ аде сдд Еде ЕЕЕ дад адд Еас Еде Едд даЕ ддЕ 1776
Уа1 Рго Азр С1п Суз Зег Агд Суз РЬе С1и Агд Туг Суз Тгр Азр О1у
580 585 590
асЕ асд ааЕ адЕ Есд асЕ ссд ддЕ асЕ ЕаЕ дад ссс адЕ асд дЕа ЕЕЕ 1824
ТЬг ТЬг Азп Зег Зег ТЬг Рго С1у ТЬг Туг С1и Рго Зег ТЬг Уа1 РЬе
595 600 605
даЕ ааЕ дсЕ ддд ЕаЕ дсЕ дЕа аЕд ссЕ дсЕ дЕЕ ЕЕс дед асЕ асд аЕд 1872
Азр Азп А1а О1у Туг А1а Уа1 МеЕ Рго А1а Уа1 РЬе А1а ТЬг ТЬг МеЕ
610 615 620
дсЕ дсЕ дед асЕ дЕЕ Есд дед ЕЕЕ аЕд Еад 1902
А1а А1а А1а ТЬг Уа1 Зег А1а РЬе МеЕ
625 630
<210> 9
<211> 633
<212> РКТ
<213> АзрегдШиз пхдег
<400> 9
МеЕ Θΐη Суз Не А1а А1а Ьеи Ьеи А1а РЬе А1а Зег 11е Ьеи Зег С1у
1 5 10 15
Уа1 Зег А1а Зег РЬе Азп Азп О1и Туг СНу Агд ΗΪ3 Ьеи МеЕ С1п С1п
20 25 30
- 44 008607
Агд А1а Ьеи Рго Азп А1а Рго Азр С1у Туг ТЬг 40 Рго ТЬг ТЬг 45 Уа1 СЛу
35
Суз Зег А1а Зег Агд Рго ТЬг Уа1 Агд Зег А1а ТЬг А1а Ьеи Зег Зег
50 55 60
Азп СЛи Зег Зег Тгр Ьеи Агд ТЬг Агд Агд Азп Азп ТЬг Ьеи Зег А1а
65 70 75 80
Мей Агд СЛи РЬе РЬе С1у Агд Уа1 Азп Не ТЬг Азр РЬе Азр А1а Уа1
85 90 95
СЛу Туг Не Азп Агд 11е Зег Зег Азп ТЬг Зег Азр Ьеи Рго Азп Не
100 105 110
СЛу Не А1а Уа1 Зег СЛу С1у СЛу Туг Агд А1а Ьеи МеС Азп <31у А1а
115 120 125
СЛу А1а 11е Ьуз А1а РЬе Азр Азп Агд ТЬг Уа1 Азп Зег ТЬг Зег Азп
130 135 140
С1у СЛп Ьеи О1у СЛу Ьеи Ьеи СЛп Зег А1а ТЬг Туг Ьеи А1а СЛу Ьеи
145 150 155 160
Зег СЛу С1у А1а Тгр Ьеи Уа1 СЛу Зег Не Туг Ьеи Азп Азп РЬе Зег
165 170 175
ТЬг 11е Зег Зег Ьеи СЛп ТЬг Туг Азр Рго С1у Азр Уа1 Тгр СЛп РЬе
180 185 190
(31п Азп Зег 11е РЬе СЛи СЛу Рго Азр СЛу Азр Зег Не СЛп 11е Не
195 200 205
Азр Зег А1а ТЬг Туг Туг Агд Азр 11е Туг Азр А1а Уа1 Зег (Лу Ьуз
210 215 220
Азр Азр А1а СЛу Тгр СЛп ТЬг Зег 11е ТЬг Азр Туг Тгр СЛу Агд А1а
225 230 235 240
Ьеи Зег Туг СЛп Ьеи Уа1 Азп А1а ТЬг А1а СЛу СЛу Не Азп Туг ТЬг
245 250 255
Тгр Зег Зег Пе А1а Ьеи ТЬг Азр Зег РЬе Агд Агд А1а СЛи Меп Рго
260 265 270
Мей Рго Уа1 Ьеи Уа1 А1а Азр СЛу Агд Туг Рго Азр С1и Ьеи Ьеи Уа1
275 280 285
Зег Зег Азп А1а ТЬг Уа1 Туг СЛи РЬе Азп Рго Тгр СЛи РЬе С1у ТЬг
290 295 300
РЬе Авр Рго ТЬг Уа1 Нхз СЛу РЬе Уа1 Рго Уа1 СЛп Туг Ьеи СЛу Зег
305 310 315 320
Агд РЬе Уа1 А1а СЛу Зег Ьеи Рго Зег Азп О1и Зег Суз Уа1 Агд СЛу
325 330 335
РЬе Азр Азп СЛу СЛу РЬе 11е МеЪ С1у ТЬг Зег Зег ТЬг Ьеи РЬе Азп
340 345 350
СЛп РЬе Ьеи Ьеи С31п 11е Азп ТЬг ТЬг Зег Ьеи Рго Зег РЬе Ьеи Ьуз
355 360 365
- 45 008607
Азр А1а 370 РЬе ТЬг Зег 11е Ьеи 375 <31и Азр Ьеи 61у <31и 380 Азп Зег СЛп Азр
11е А1а Уа1 Туг ТЬг Рго Азп Рго РЬе Туг Ьеи Тгр А1а Азп Зег ТЬг
385 390 395 400
Зег Рго Зег А1а Зег С1п ТЬг Уа1 Ьеи Азр Ьеи Уа1 Азр С1у СЛу СЛи
405 410 415
Азр Ьеи СЛп Азп 11е Рго Ьеи ΗΪ5 Рго Ьеи 11е СЛп Рго С1и Агд ΗΪ8
420 425 430
Уа1 Азр Уа1 11е РЬе А1а Уа1 Азр Зег Зег А1а Азр ТЬг СЛп Туг Азп
435 440 445
Тгр Рго Азп С1у ТЬг А1а Ьеи Уа1 А1а ТЬг Туг О1и Агд Зег Ьеи Азп
450 455 460
Зег ТЬг С1у 11е (31у Азп С1у ТЬг А1а РЬе Рго А1а 11е Рго Азр СЛп
465 470 475 480
Азп Т11Г РЬе Уа1 Азп С1и С1у Ьеи Азп ТЬг Агд Рго ТЬг РЬе РЬе СЛу
485 490 495
Суз Азп Зег Зег Азп ТЬг ТЬг С1у Рго А1а Рго Ьеи Х7а1 Уа1 Туг Ьеи
500 505 510
Рго Азп РЬе Рго Туг Уа1 ТЬг РЬе Зег Азп Уа1 Зег ТЬг РЬе Азр Рго
515 520 525
Зег Туг Зег О1и Зег 61п Агд Азр Зег Не Не Ьеи Азп С1у Туг Азр
530 535 540
Уа1 А1а ТЬг МеЕ 61у Азп Азп Зег Агд Азр СЛу С1и Тгр Зег Зег Суз
545 550 555 560
Уа1 А1а Суз А1а Уа1 Ьеи Зег Агд Зег РЬе С1и Агд ТЬг Азп ТЬг ТЬг
565 570 575
Уа1 Рго Азр С1п Суз Зег Агд Суз РЬе СЛи Агд Туг Суз Тгр Азр С1у
580 585 590
ТЬг ТЬг Азп Зег Зег ТЬг Рго С1у ТЬг Туг СЛи Рго Зег ТЬг Уа1 РЬе
595 600 605
Азр Азп А1а 01у Туг А1а Уа1 МеЕ Рго А1а Уа1 РЬе А1а ТЬг ТЬг МеЕ
610 615 620
А1а А1а А1а ТЬг Уа1 Зег А1а РЬе МеЕ
625 630 <210> 10 <211> 2292 <212> ДНК <213 > АзрегдШиз пддег <400> 10 сасадсЕдда садааЕддсЕ ддссЕЕдааЕ дсЕаЕаЕдса аЕасаддсаа саасассЕсд
- 46 008607
аЕсЕдааЕаЕ адЕаЕссада ддсЕЕдЕЕЕа асдсаЕдаЕд ЕсаЕаЕааЕЕ аааЕаЕаЕаЕ 120
аЕаЕааЕдаЕ сддЕассЕЕс садссаЕаас ассаасЕЕса дсадсаасаа ЕЕЕсааЕЕсЕ 180
сЕЕдсадЕсс саааадЕсЕс дЕЕдсааЕдс ЕдЕсдсЕЕЕЕ ааЕаЕсадса дсадсЕдсса 240
сЕсЕсдсаЕс ЕдсссЕддаа сЕЕссссадд дЕЕаЕЕсссс ддаЕссЕдЕс ЕсЕЕдсссаа 300
саааЕсЕЕЕс аЕддаЕссда ссддсадЕЕд дасЕсадсад адаЕдаадсд сааЕдддЕЕд 360
аадддсддаа дааЕдЕсаЕс сЕдддсЕсаЕ ЕадасдсаЕа ЕЕЕдааасда сЕсаассЕдд 420
асдасЕЕсда сасадасдаа ЕасаЕаЕсдс дЕсЕсаасаа сассадЕсад ассссааЕса 480
ЕдддааЕддс саЕсадЕдда ддаддЕЕЕсд даЕссдссЕа сассдддасЕ ддЕсЕааЕсс 540
дЕдсЕЕЕдда ЕдассдЕсЕЕ сссдсадсса асдадсаасд ЕассддЕдда сЕЕсЕасааа 600
дсаЕдассЕа ЕсЕдЕсЕддЕ ЕЕдЕсЕддад даЕссЕддсс сдсадЕдЕсс ЕЕсссаЕсаЕ 660
асаасЕЕЕсс сассдсадас дадаЕЕдЕсд аЕЕасЕддаа ассддадаЕЕ дассдаЕЕсЕ 720
ЕсасддЕсас даасассЕсЕ дсЕдаадсЕд сЕасЕддааа ддссаЕсЕЕЕ даасадаЕЕд 780
сЕасдаадЕа ссЕддсЕддс ЕЕсдаддЕад сдсЕаадЕда ЕЕаЕсЕадда сдаддаЕЕЕд 840
сдЕасдадЕЕ саЕЕсссдда сааЕссддсд дссЕааасас сасдЕЕЕЕсд дддаЕссдда 900
аЕсЕаадсаа ЕЕЕЕаЕсааЕ саЕсаааЕдс сдаЕдссЕаЕ саЕЕсаЕсЕд дсЕЕсадЕЕд 960
аассддаада ЕдсададЕас ЕасдассЕЕЕ ЕддЕдссдЕс аЕсЕааЕдда асдаЕЕдЕаа 1020
дЕадЕдсЕЕс ЕЕсЕсдаЕаа асЕассадсЕ ссадсЕаасд сддЕсЕадЕЕ ЕдаЕЕЕдасЕ 1080
сссЕЕсдааЕ ЕсддсдссЕд ддасддадас дЕдсаЕдсаЕ ЕЕасасссас ЕдадЕддсЕс 1140
ддааассаас ЕаЕссаасдд ЕаЕЕсссдЕа аассададса ааЕдсЕддаа аддаЕЕЕдаЕ 1200
сдаЕссЕсдЕ аадЕаасадЕ аЕддссссад ссЕсдсасдс ЕЕсЕаасЕЕс аЕсссадасЕ 1260
ЕдЕсаЕсддс ассЕссдссд асдссЕЕсаа сЕЕсЕддЕас сЕсдааадсд ЕсЕссаасдд 1320
аасссЕЕддс сааЕЕЕдсса аасдсЕссас сасЕсасдад ЕссЕсЕсЕса ссааасдаЕЕ 1380
дЕсссаассЕ дссаассЕда асдсасЕсдЕ ЕдасдссЕЕс саададассЕ ЕЕдаЕсЕааа 1440
ссЕаасссаа аЕсЕссЕасЕ сдаааЕЕссс саасссаЕЕс ассаассЕаЕ сссЕсЕсЕас 1500
сддЕааЕасс сасаааЕссЕ саасссЕааа ссЕсдЕсдас ддсадсдааа саддссааас 1560
ааЕсссссЕс Еддддссада Ессадсссдс дсдсаасдЕс дасЕЕсаЕса ЕадссЕддда 1620
сдасЕсссаа дасдсадасс ссЕасадсЕд даасаасддс асааассЕсЕ асаасасдЕа 1680
ссЕсдссдсс аасдсаасад ддсЕЕсссЕЕ ЕссдаЕааЕс ссасссЕсса даасааЕдаЕ 1740
даассЕдааЕ ЕасасЕсЕсс аЕссасааЕЕ сЕЕсддсЕдс дасдссаасс Есассассас 1800
аддсдасдас сдсдсассЕа ЕсдЕдсЕдЕа ЕаЕддсЕааЕ дсдссдЕаЕа дсдсаЕасас 1860
даасЕЕсЕсд ЕЕсЕддсада сддадасдад Есддсадсаа аЕдддддада ЕаЕЕсдЕдаа 1920
ЕадЕЕЕЕдаЕ аЕЕдЕЕасдс аадсдааЕдд дЕсдЕдддаЕ ддддадЕддд сддадЕдЕаЕ 1980
ддддЕдЕдсд дсЕдЕддааа даадЕЕЕддс дсдсдЕдддс аЕддададда сдаддсадЕд 2040
ЕсадсддЕдс ЕЕЕдададдЕ аЕЕдЕЕддда ЕдддасасЕЕ даЕдададдд аЕссЕддддЕ 2100
дЕЕддаЕссд асдЕЕадЕЕЕ ЕддаЕссддд ддЕдаадЕЕЕ дддЕЕдЕдда аЕдсЕасдаа 2160
ЕссЕЕаЕЕда ЕдсЕддЕЕЕЕ ддадЕЕасад ддддаддсЕд дЕсЕдддаад дЕаЕадЕасЕ 2220
ЕаддсЕЕЕдЕ ддаЕдааада ааЕаЕдЕдаЕ аЕЕЕддсаад ЕЕсасссЕаЕ адасссаЕсЕ 2280
даЕсЕЕЕЕЕЕ ьд 2292
<210> 11 <211> 1863 <212> ДНК
- 47 008607 <213 > АзрегдШиз пхдег <220>
<221> СЬЗ <222> (1).. (1863) <400> 11
абд ебд бед ебб бба аба бса дса дса дсб дсс асб сбс дса бсб дсс 48
Меб Ьеи Зег Ьеи Ьеи Не Зег А1а А1а А1а А1а ТЬг Ьеи А1а Зег А1а
1 5 10 15
ебд даа ебб ссс сад ддб баб бсс сед даб ссб дбе бсб бде сса аса 96
Ьеи С1и Ьеи Рго ΘΙη С1у Туг Зег Рго Азр Рго Уа1 Зег Суз Рго ТЬг
20 25 30
ааб ебб бса бдд абс еда сед дса дбб дда сбс аде ада даб даа дед 144
Азп Ьеи Зег Тгр Не Агд Рго А1а Уа1 С1у Ьеи Зег Агд Азр С1и А1а
35 40 45
саа ьдд дбб даа ддд едд аад ааб дбе абс ебд ддс бса бба дас дса 192
ΘΙη Тгр Уа1 О1и С1у Агд Ьуз Азп Уа1 11е Ьеи О1у Зег Ьеи Азр А1а
50 55 60
баб ббд ааа еда сбс аас ебд дас дас ббс дас аса дас даа бас аба 240
Туг Ьеи Ьуз Агд Ьеи Азп Ьеи Азр Азр РЬе Азр ТЬг Азр С1и Туг Не
ГЕ •7 Λ ТС оп
и 1 V / и ν
бед едб сбс аас аас асе адб сад асе сса абс абд дда абд дсс абс 288
Зег Агд Ьеи Азп Азп ТЬг Зег ΘΙη ТЬг Рго Не Меб О1у Меб А1а Не
85 90 95
адб дда дда ддь ббс дда бсс дсс бас асе ддд асб ддь сба абс едб 336
Зег (31у С1у О1у РЬе С1у Зег А1а Туг ТЬг С1у ТЬг О1у Ьеи 11е Агд
100 105 110
гггЧ· Ма аа1 ЛЯГ паЧ ебб ссс опа пгг аас пяа саа на!· асе ασί ааа 384
з-- — ”3 д’— — 3-- з — з 3-- з—з — 3 — 33 — 33 —
А1а Ьеи Азр Азр Агд Ьеи Рго А1а А1а Азп 61и ΘΙη Агд ТЬг С1у С1у
115 120 125
ебб сба саа аде абд асе баб ебд бсб ддь ббд бсб дда дда бсс бдд 432
Ьеи Ьеи ΘΙη Зег Меб ТЬг Туг Ьеи Зег О1у Ьеи Зег О1у О1у Зег Тгр
130 135 140
ссс дса дбд бсс ббс сса бса бас аас ббб ссс асе дса дас дад абб 480
Рго А1а Уа1 Зег РЬе Рго Зег Туг Азп РЬе Рго ТЬг А1а Азр С1и 11е
145 150 155 160
дбе даб бас бдд ааа сед дад абб дас еда ббс ббс асд дбе асд аас 528
Уа1 Азр Туг Тгр Ьуз Рго С1и Не Азр Агд РЬе РЬе ТЬг Уа1 ТЬг Азп
165 170 175
асе бсб дсб даа дсб дсб асб дда аад дсс абс ббб даа сад абб дсб 576
ТЬг Зег А1а (31и А1а А1а ТЬг С1у Ьуз А1а Не РЬе С1и ΘΙη 11е А1а
180 185 190
- 48 008607
асд аад Еас сЕд дсЕ ддс ЕЕс дад дЕа дед сЕа адЕ даЕ ЕаЕ сЕа дда 624
ТЬг Ьуз Туг Ьеи А1а С1у РЬе С1и Уа1 А1а Ьеи Зег Азр Туг Ьеи С1у
195 200 205
еда дда ЕЕЕ дед Еас дад ЕЕс аЕЕ ссс дда саа Есс ддс ддс сЕа аас 672
Агд С1у РЬе А1а Туг О1и РЬе Не Рго О1у ΘΙη Зег С1у С1у Ьеи Азп
210 215 220
асе асд ЕЕЕ Есд ддд аЕс едд ааЕ сЕа аде ааЕ ЕЕЕ аЕс ааЕ саЕ саа 720
ТЬг ТЬг РЬе Зег О1у 11е Агд Азп Ьеи Зег Азп РЬе Не Азп ΗΪ3 С1п
225 230 235 240
аЕд ссд аЕд ССЕ аЕс аЕЕ саЕ сЕд дсЕ Еса дЕЕ даа ссд даа даЕ дса 768
МеЕ Рго МеЕ Рго 11е 11е ΗΪ3 Ьеи А1а Зег Уа1 О1и Рго С1и Азр А1а
245 250 255
дад Еас Еас дас сЕЕ ЕЕд дьд ссд Еса ЕсЕ ааЕ дда асд аЕЕ ЕЕЕ даЕ 816
Й1и Туг Туг Азр Ьеи Ьеи Уа1 Рго Зег Зег Азп О1у ТЬг Не РЬе Азр
260 265 270
ЕЕд асЕ ссс ЕЕс даа ЕЕс ддс дсс Едд дас дда дас дЕд саЕ дса ЕЕЕ 864
Ьеи ТЬг Рго РЬе С1и РЬе С1у А1а Тгр Азр С1у Авр Уа1 ΗΪ8 А1а РЬе
275 280 285
аса ссс асЕ дад Едд сЕс дда аас саа сЕа Есс аас ддЕ аЕЕ ссс дЕа 912
ТЬг Рго ТЬг О1и Тгр Ьеи О1у Азп ΘΙη Ьеи Зег Азп С1у Не Рго Уа1
290 295 300
аас сад аде ааа Еде Едд ааа дда ЕЕЕ даЕ еда Есс Еса СЕЕ дЕс аЕс 960
Азп ΘΙη Зег Ьуз Суз Тгр Ьуз С1у РЬе Азр Агд Зег Зег Ьеи Уа1 Не
305 310 315 320
ддс асе Есс дсс дас дсс ЕЕс аас ЕЕс Едд Еас сЕс даа аде дЕс Есс 1008
<31у ТЬг Зег А1а Азр А1а РЬе Азп РЬе Тгр Туг Ьеи С1и Зег Уа1 Зег
325 330 335
аас дда асе СЕЕ ддс саа ЕЕЕ дсс ааа сдс Есс асе асЕ сас дад Есс 1056
Азп О1у ТЬг Ьеи О1у ΘΙη РЬе А1а Ьуз Агд Зег ТЬг ТЬг Ηίβ О1и Зег
340 345 350
ЕсЕ сЕс асе ааа еда ЕЕд Есс саа ссЕ дсс аас сЕд аас дса сЕс дЕЕ 1104
8ег Ьеи ТЬг Ьуз Агд Ьеи Зег ΘΙη Рго А1а Азп Ьеи Азп А1а Ьеи Уа1
355 360 365
дас дсс ЕЕС саа дад асе ЕЕЕ даЕ сЕа аас сЕа асе саа аЕс Есс Еас 1152
Азр А1а РЬе ΘΙη С1и ТЬг РЬе Азр Ьеи Азп Ьеи ТЬг ΘΙη Не Зег Туг
370 375 380
Есд ааа ЕЕс ссс аас сса ЕЕс асе аас сЕа Есс сЕс ЕсЕ асе ддЕ ааЕ 1200
Зег Ьуз РЬе Рго Азп Рго РЬе ТЬг Азп Ьеи Зег Ьеи Зег ТЬг О1у Азп
385 390 395 400
асе сас ааа Есс Еса асе сЕа аас сЕс дЕс дас ддс аде даа аса ддс 1248
ТЬг Ηίβ Ьуз Зег Зег ТЬг Ьеи Азп Ьеи Уа1 Азр С1у Зег С1и ТЬг О1у
405 410 415
- 49 008607
саа аса аРс ссс сРс Рдд ддс сад аРс сад ссс дед сдс аас др с дас 1296
Θΐη ТЬг Не Рго Ьеи Тгр С1у С1п Не С1п Рго А1а Агд Азп Уа1 Азр
420 425 430
РРс аРс аРа дес ьдд дас дас Рсс саа дас дса дас ссс Рас аде Рдд 1344
РЬе Не Не А1а Тгр Азр Азр Зег С1п Азр А1а Азр Рго Туг Зег Тгр
435 440 445
аас аас ддс аса аас сРс Рас аас асд Рас сРс дсс дсс аас дса аса 1392
Азп Азп СЛу ТЬг Азп Ьеи Туг Азп ТЬг Туг Ьеи А1а А1а Азп А1а ТЬг
450 455 460
ддд срр ссс ррр сед аРа аРс сса ссс Рсс ада аса аРд аРд аас сРд 1440
С1у Ьеи Рго РЬе Рго Не Не Рго Рго Зег Агд ТЬг Мер Мер Азп Ьеи
465 470 475 480
ааР Рас асР сРс саР сса саа РРс РРс ддс Рдс дас дсс аас сРс асе 1488
Азп Туг ТЬг Ьеи НХЗ Рго Θΐη РЬе РЬе С1у Суз Азр А1а Азп Ьеи ТЬг
485 490 495
асе аса ддс дас дас еде дса ССР аРс дрд сРд РаР аРд дсР ааР дед 1536
ТЬг ТЬг С1у Азр Азр Агд А1а Рго Не Уа1 Ьеи Туг Мер А1а Азп А1а
500 505 510
сед РаР аде дса Рас асд аас РРс Рсд РРс Рдд сад асд дад асд адР 1584
Рго Туг Зег А1а Туг ТЬг Азп РЬе Зег РЬе Тгр О1п ТЬг О1и ТЬг Зег
515 520 525
г«гтгт г»згг СЗ-м. βΊ-γύ гтгтгт гтагт а ύϋο гтЬгт за £ агтЬ РРР гт а Ъ πύϋ гт+“ к агп 1632
332 Э'-Э Э’-’- э *- ’-'-’Э
Агд (31п СПп Мер <31у <31и Не РЬе Уа1 Азп Зег РЬе Азр Не Уа1 ТЬг
530 535 540
саа дед ааР ддд Рсд ьдд даР ддд дад Рдд дед дад РдР аРд ддд РдР 1680
С1п А1а Азп С1у Зег Тгр Азр О1у О1и Тгр А1а С1и Суз Мер (31у Суз
545 550 555 560
дед дек дьд даа ада адр РРд дед сдс дрд ддс ард дад адд асд адд 1728
А1а А1а Уа1 С1и Ага ---—л Зег Ьеи А1а Агд Уа1 <31у Мер (31и Агд ТЬг Агд
565 570 575
сад ЬдЬ сад едд Рдс РРР дад адд РаР РдР Рдд даР ддд аса сРР даР 1776
О1п Суз С1п Агд Суз РЬе О1и Агд Туг Суз Тгр Азр С1у ТЬг Ьеи Азр
580 585 590
дад адд дар ссР ддд дьд РРд даР ссд асд РРа дрр РРд даР ссд ддд 1824
С1и Агд Азр Рго С1у Уа1 Ьеи Азр Рго ТЬг Ьеи Уа1 Ьеи Азр Рго С1у
595 600 605
дЬд аад РРР ддд РРд Рдд ааР дсР асд ааР ссР РаР Рда 1863
Уа1 Ьуз РЬе С1у Ьеи Тгр Азп А1а ТЬг Азп Рго Туг
610 615 620
<210> 12 <211> 620
- 50 008607 <212> ΡΗΤ <213> АзрегдШиз пгдег <400> 12
Меб Ьеи Зег Ьеи Ьеи 11е Зег А1а А1а А1а А1а ТЬг Ьеи А1а Зег А1а
1 5 10 15
Ьеи О1и Ьеи Рго О1п О1у Туг Зег Рго Азр Рго Уа1 Зег Суз Рго ТЬг
20 25 30
Азп Ьеи Зег Тгр 11е Агд Рго А1а Уа1 О1у Ьеи Зег Агд Азр О1и А1а
35 40 45
ΘΙη Тгр Уа1 О1и О1у Агд Ьуз Азп Уа1 Х1е Ьеи О1у Зег Ьеи Азр А1а
50 55 60
Туг Ьеи Ьуз Агд Ьеи Азп Ьеи Азр Азр РЬе Азр ТЬг Азр О1и Туг Х1е
65 70 75 80
Зег Агд Ьеи Азп Азп ТЬг Зег О1п ТЬг Рго Х1е Меб О1у Меб А1а 11е
85 90 95
Зег О1у О1у О1у РЬе О1у Зег А1а Туг ТЬг О1у ТЬг О1у Ьеи 11е Агд
100 105 110
А1а Ьеи Азр Азр Агд Ьеи Рго А1а А1а Азп 01и О1п Агд ТЬг О1у О1у
115 120 125
Ьеи Ьеи О1п Зег Меб ТЬг Туг Ьеи Зег О1у Ьеи Зег О1у О1у Зег Тгр
130 135 140
Рго А1а Уа1 Зег РЬе Рго Зег Туг Азп РЬе Рго ТЬг А1а Азр О1и 11е
145 150 155 160
Уа1 Азр Туг Тгр Ьуз Рго О1и 11е Азр Агд РЬе РЬе ТЬг Уа1 ТЬг Азп
165 170 175
ТЬг Зег А1а Θ1 и А1а А1а ТЬг О1у Ьуз А1а 11е РЬе О1и О1п 11е А1а
180 185 190
ТЬг Ьуз Туг Ьеи А1а О1у РЬе О1и Уа1 А1а Ьеи Зег Азр Туг Ьеи О1у
195 200 205
Агд 01у РЬе А1а Туг О1и РЬе 11е Рго О1у О1п Зег О1у О1у Ьеи Азп
210 215 220
ТЬг ТЬг РЬе Зег О1у Х1е Агд Азп Ьеи Зег Азп РЬе 11е Азп ΗΪ3 О1п
225 230 235 240
Меб Рго Меб Рго 11е 11е ΗΪ3 Ьеи А1а Зег Уа1 О1и Рго О1и Азр А1а
245 250 255
01и Туг Туг Азр Ьеи Ьеи Уа1 Рго Зег Зег Азп О1у ТЬг 11е РЬе Азр
260 265 270
Ьеи ТЬг Рго РЬе О1и РЬе О1у А1а Тгр Азр 01у Азр Уа1 ΗΪ8 А1а РЬе
275 280 285
ТЬг Рго ТЬг О1и Тгр Ьеи О1у Азп О1п Ьеи Зег Азп О1у 11е Рго Уа1
290 295 300
- 51 008607
Азп О1п Зег Ьуз Суз Тгр Ьуз С1у РЬе Азр Агд Зег Зег Ьеи Уа1 11е
305 310 315 320
СНу ТЬг Зег А1а Азр А1а РЬе Азп РЬе Тгр Туг Ьеи С1и Зег Уа1 Зег
325 330 335
Азп О1у ТЬг Ьеи О1у О1п РЬе А1а Ьуз Агд Зег ТЬг ТЬг ΗΪ3 С1и Зег
340 345 350
Зег Ьеи ТЬг Ьуз Агд Ьеи Зег О1п Рго А1а Азп Ьеи Азп А1а Ьеи Уа1
355 360 365
Азр А1а РЬе О1п О1и ТЬг РЬе Азр Ьеи Азп Ьеи ТЬг С1п Не Зег Туг
370 375 380
Зег Ьуз РЬе Рго Азп Рго РЬе ТЬг Азп Ьеи Зег Ьеи Зег ТЬг С1у Азп
385 390 395 400
ТЬг ΗΪ3 Ьуз Зег Зег ТЬг Ьеи Азп Ьеи Уа1 Азр С1у Зег С1и ТЬг С1у
405 410 415
01 п ТЬг Не Рго Ьеи Тгр О1у О1п 11е С1п Рго А1а Агд Азп Уа1 Азр
420 425 430
РЬе 11е Не А1а Тгр Азр Азр Зег С1п Азр А1а Азр Рго Туг Зег Тгр
435 440 445
Азп Азп О1у ТЬг Азп Ьеи Туг Азп ТЬг Туг Ьеи А1а А1а Азп А1а ТЬг
450 455 460
О1у Ьеи Рго РЬе Рго Не 11е Рго Рго Зег Агд ТЬг МеЪ МеС Азп Ьеи
465 470 475 480
Азп Туг ТЬг Ьеи ΉΪ3 Рго О1п РЬе РЬе С1у Суз Азр А1а Азп Ьеи ТЬг
485 490 495
ТЬг ТЬг О1у Азр Азр Агд А1а Рго Не Уа1 Ьеи Туг МеЬ А1а Азп А1а
500 505 510
Рго Туг Зег А1а Туг ТЬг Азп РЬе Зег РЬе Тгр (31п ТЬг С1и ТЬг Зег
515 520 525
Агд О1п О1п Мее О1у О1и 11е РЬе Уа1 Азп Зег РЬе Азр Не Уа1 ТЬг
530 535 540
<31п А1а Азп О1у Зег Тгр Азр С1у С1и Тгр А1а О1и Суз МеЁ С1у Суз
545 550 555 560
А1а А1а Уа1 О1и Агд Зег Ьеи А1а Агд Уа1 О1у МеС С1и Агд ТЬг Агд
565 570 575
С1п Суз О1п Агд Суз РЬе О1и Агд Туг Суз Тгр Азр С1у Тпг Ьеи Авр
580 585 590
О1и Агд Азр Рго О1у Уа1 Ьеи Азр РГО ТЬг Ьеи Уа1 Ьеи Азр Рго С1у
595 600 605
Уа1 Ьуз РЬе О1у Ьеи Тгр Азп А1а ТЬг Азп Рго Туг
610 615 620 <210> 13
- 52 008607 <211> 3637 <212> ДНК <213 > АзрегдШиз пхдег <400> 13
ссддаРдааа аРдадасаРд дсРааддРда РсддаРасаа РаадаРРдаР РдРддаддаа 60
адесдЬсдда Ьсаеедсеед аадссадааа дссссддасР сддсадааРс Рдассдсссд 120
сдсРдсадсе ссааРсдРад еееесесаае саРРдасадс ессаеесаее дсРРсРсРад 180
ссаРРасЬсс РдРсасеесс адаадРаРРс асРРедаСдс сСддРдРРса аедаееееес 240
сеаСЬаееда аЪсаааеаее РРдедсеаРа дсРаРаасаР сдсРсаРаРР РРсссддРад 300
даЪдееааРа сассасаРса дРссРсссаа дРсдсСРсРд сасааРРРса рддсРааРда 360
саРдадсРдР саРсРддасс аРаасаРдсР дсРРддсаас РдРадаааРа дсаРссаРсР 420
дасеесаСсе сдсеесадсд РдРадедаРР сРаасРдеес СсссддаРдс саадРСРсРд 480
аседЬсддРа дсдаассРаа РссддРадсР ееесссддсд РдаадРсРде едседъессе 540
асдссааСаа сддсРаадРс дсддссааРа асеесседсе адсддаРРРс аеесдеесае 600
аРсасдсссд асРаддддаа аРдаассаРа РРадаРааРР ддаасРддРд садРРдссРд 660
аЪедадддРс Рссасессдд ссРРдРРдае даРдсаддсР Сддсадссад сааРссддсс 720
есдеедсРсс дадаассссд рддрердсдс аддаРаРдсд ардддрдааа РаРРсадедд 780
сЪдРдсЪдда ссаССаасде сеедесаеае РРссасссдд ддссдРРдРа даддРРдадР 840
Ьссдааддее РассРаааса дедееееесд РРРдддаасд сддаадддРс РаадРРРсдд 900
дседссссае адддсрдадс сРаРдссаРР ссадРРддаа сссРдасСдс асаддаддаР 960
асеаеееедд аРсдссРсаа еаееагесед сРдссРддса ссассСРсса аРсдддРасс 1020
сссдееесае адасссЬдас кддддььесе дсасРадсРР адРРдаасда дасасааРдс 1080
ааСсасааРа дддЪссЬсаа РааРаРсРса ддсассасаа асРсадддсс даддаРдРсР 1140
асаЪдсЬдсд ссеедсседд сРРддсссРд ссассРсада еееедседед сРссаРРРаР 1200
дсаеесддад аееееддрас дсаддааРса дРаадсРсРа аеадРдРдде ссдсРсдРса 1260
аьеьсееаеа ааСсасссЬд дддсасссРс асСсссааРд сасСдадРсР дрдееардсе 1320
адасдРдРса сееддедсаа сссааадсад асаРдаадРР сааРдсасРс РРаасдассс 1380
Ъсдсддсдсе ддддРаеаЬс сааддРаРаР еессдаесее дааасРсаРс аРдсадсасР 1440
аасесаСдсе дасссдссса Раддаддсдс сдсддРРссР асаассдРсд ассРсасаРа 1500
СдсадасаРа РсассРсдсд сасРддаРаа РдссссРдаР ддРРаРассс сдадсааРдР 1560
аЬссЬдессе дсааасадас сдасдаРРсд садсдсдРса асссРдРсаР сдаасдадас 1620
ддсаедддед дасдРссддс драадсадас РдРсРсадсд аЪдааадасс РГРГсддсса 1680
ЬаесаасаРд адсСсаРСед асдсРареес дРасаРсаас адссаРРсаР саааРаРсас 1740
саасаЬассс аасаРсддРа РРдссдРдРс сддсддрддс Расададссс Рдассаасдд 1800
сдсдддадса сесааддсае РсдасадСсд аасддаааас РсаасссаРа аРддасадсР 1860
сддеддЬсРе сРдсадРсад ссасаРассе дРссддРсРс РссддаддРд дсРддсРссР 1920
дддсРсааЬс РасаРсааса асРРсассас сдРсРссааР срдсааасср асааададдд 1980
сдаадРсРдд садРРссада аресааРсас даааддссса аадассаасд дсРРдсаадс 2040
еедддаеаса дссаадРасР ассдсдаРсР ддссааддрд дРсдсРддса адааддасдс 2100
дддсЬРсаас асРРссРРса сддасРасРд дддРсдсдса сРсРссРасс адсРдаРРаа 2160
сдсдассдас ддаддсссад дсРасассРд дРсаРсдаРс дсРРРаассс аддасРРсаа 2220
даасддааас аРдсссаРдс сдсессееде сдссдасддс сдсаасссад дсдадасссР 2280
- 53 008607
ааЕсддсадс аасЕсдассд ЕдЕаЕдадЕЕ саассссЕдд дааЕЕсддса дЕЕЕЕдаЕсс 2340
дЕссаЕсЕЕс ддсЕЕсдсЕс сссЕсдааЕа ссЕсддаЕсс ЕасЕЕЕдада асддсдаадЕ 2400
сссаЕссадс сдаЕссЕдсд ЕссдсддсЕЕ сдаЕаасдса ддсЕЕсдЕса ЕдддаассЕс 2460
сЕссадЕсЕс ЕЕсаассааЕ ЕсаЕссЕдаа дсЕсаасасс ассдасаЕсс саЕсаасссЕ 2520
саааасддЕс аЕсдссадса ЕссЕадаада асЕаддсдас сдсаасдасд асаЕсдссаЕ 2580
сЕасЕсЕссс аассссЕЕсЕ асдддЕассд саасдсдаса дЕЕЕсаЕасд аааадасссс 2640
ддассЕдаас дЕсдЕсдасд дЕддсдаада сааасадаас сЕсссссЕсс аЕссЕсЕсаЕ 2700
ссаасссдсс сдсаасдЕдд асдЕсаЕсЕЕ сдссдЕсдас ЕссЕсадсса дЕассЕсдда 2760
саасЕддссс аасддаадЕс сЕсЕсдЕсдс дасЕЕасдаа сдЕадЕсЕса асЕсаассдд 2820
ЕаЕсддааас ддсассдсдЕ ЕсссЕадсаЕ сссддасаад адсассЕЕса ЕЕаассЕддд 2880
сЕЕдаасасс сдЕссдасЕЕ ЕсЕЕсддсЕд сааЕадЕЕсс ааЕаЕсасад дссаЕдсасс 2940
ссЕддЕЕдЕс ЕассЕсссса асЕассссЕа сасаасссЕс ЕссаасаадЕ сдассЕЕсса 3000
дсЕсаадЕас дадаЕсЕЕдд адсдЕдаЕда даЕдаЕсасс ааЕддсЕдда асдЕддЕЕас 3060
ЕаЕдддЕааЕ ддаЕсаадда адЕсЕЕасда ддаЕЕддссд асЕЕдЕдсдд дсЕдсдсСаЕ 3120
ЕсЕдадЕсдс ЕсдЕЕЕдаЕс ддасЕааЕас ссаддЕдссд даЕаЕдЕдсЕ сдсадЕдЕЕЕ 3180
ЕдасаадЕаЕ ЕдсЕдддаЕд даасдаддаа ЕадЕасдасд ссддсддсдЕ аЕдадссдаа 3240
ддЕаЕЕдаЕд дсЕадЕдсдд дЕдЕдадддд ЕаЕЕЕсдаЕд ЕсдаддЕЕдд ЕЕЕЕдддЕсЕ 3300
сЕЕЕссддЕд дЕддЕЕдддд ЕЕЕддаЕдаЕ дЕдадЕддад дЕЕдддаЕсЕ дааЕдЕЕддд 3360
аЕдЕдЕакдс ЕаддЕдаЕсЕ ЕаЕдадааЕд адЕЕЕасдас адЕссЕдаЕа ЕасЕЕсадаа 3420
дЕадаЕссад ЕааадаЕдЕд ЕЕасЕЕасаЕ адааадсадд ааЕддаЕЕдд аЕдЕааЕдсЕ 3480
ЕаЕЕсадЕЕа дасдЕаааад даасЕсаадЕ ссааЕасЕас ЕдсддЕасад саЕсассасс 3540
аааЕсссасЕ дасаЕссааЕ аааЕсаадЕд саааасЕссЕ ЕсЕЕЕсЕсаЕ сссЕсЕссад 3600
ЕЕдаЕсЕссс ЕддаадЕЕЕс сЕЕсаЕаада аасдсаЕ 3637
<210> 14 <211> 1923 <212> ДНК <213> АзрегдШиз пхдег <220>
<221> СЬЗ <222> (1) . . (1923) <400> 14
аЕд аад ЕЕс ааЕ дса сЕс ЕЕа асд асе сЕс дед дед сЕд ддд ЕаЕ аЕс 48
МеЕ Ьуз РЬе Азп А1а Ьеи Ьеи ТЬг ТЬг Ьеи А1а А1а Ьеи С1у Туг 11е
1 5 10 15
саа дда ддс дсс дед дЕЕ ссЕ аса асе дЕс дас сЕс аса ЕаЕ дса дас 96
С1п 51у С1у А1а А1а Уа1 Рго ТЬг ТЬг Уа1 Азр Ьеи ТЬг Туг А1а Азр
20 25 30
- 54 008607
аЕа Еса ССЕ сдс дса сЕд даЕ ааЕ дсс ссЕ даЕ ддЕ ЕаЕ асе ссд аде 144
11е Зег Рго Агд А1а Ьеи Азр Азп А1а Рго Азр С31у Туг ТЬг Рго Зег
35 40 45
ааЕ дЕа Есс ЕдЕ ссЕ дса аас ада ссд асд аЕЕ сдс аде дед Еса асе 192
Азп Уа1 Зег Суз Рго А1а Азп Агд Рго ТЬг Не Агд Зег А1а Зег ТЬг
50 55 60
сЕд Еса Есд аас дад асд дса Едд дЕд дас дЕс сдд сдЕ аад сад асЕ 240
Ьеи Зег Зег Азп С1и ТЬг А1а Тгр Уа1 Азр Уа1 Агд Агд Ьуз С1п ТЬг
65 70 75 80
дЕс Еса дед аЕд ааа дас сЕЕ ЕЕс ддс саЕ аЕс аас аЕд аде Еса ЕЕЕ 288
Уа1 Зег А1а МеЕ Ьуз Азр Ьеи РЬе С1у ΗΪ3 Не Азп МеЕ Зег Зег РЬе
85 90 95
дас дсЕ аЕЕ Есд Еас аЕс аас аде саЕ Еса Еса ааЕ аЕс асе аас аЕа 336
Азр А1а Не Зег Туг Не Азп Зег Н18 Зег Зег Азп Не ТЬг Азп Не
100 105 110
ссс аас аЕс ддЕ аЕЕ дсс дЕд Есс ддс ддЕ ддс Еас ада дсс сЕд асе 384
Рго Азп 11е О1у 11е А1а Уа1 Зег О1у О1у СЯу Туг Агд А1а Ьеи ТЬг
115 120 125
аас ддс дед дда дса сЕс аад дса ЕЕс дас адЕ еда асд даа аас Еса 432
Азп С1у А1а 61у А1а Ьеи Ьуз А1а РЬе Азр Зег Агд ТЬг О1и Азп Зег
130 135 140
асе саЕ ааЕ дда сад сЕс ддЕ ддЕ сЕЕ сЕд сад Еса дсс аса Еас сЕд 480
ТЬг ΗΪ8 Азп <31у СЛп Ьеи (31у С1у Ьеи Ьеи С1п Зег А1а ТЬг Туг Ьеи
145 150 155 160
Есс ддЕ сЕс Есс дда ддЕ ддс Едд сЕс сЕд ддс Еса аЕс Еас аЕс аас 528
Зег О1у Ьеи Зег С1у С1у О1у Тгр Ьеи Ьеи <31у Зег Не Туг Не Азп
165 170 175
аас ЕЕс асе асе дЕс Есс ааЕ сЕд саа асе Еас ааа дад ддс даа дЕс 576
Азп РЬе ТЬг ТЬг Уа1 Зег Азп Ьеи О1п ТЬг Туг Ьуз О1и О1у О1и Уа1
180 185 190
Едд сад ЕЕс сад ааЕ Еса аЕс асд ааа ддс сса аад асе аас ддс ЕЕд 624
Тгр 31п РЬе О1п Азп Зег Не ТЬг Ьуз <Э1у Рго Ьуз ТЬг Азп О1у Ьеи
195 200 205
саа дсЕ Едд даЕ аса дсс аад Еас Еас сдс даЕ сЕд дсс аад дЕд дЕс 672
С1п А1а Тгр Азр ТЬг А1а Ьуз Туг Туг Агд Азр Ьеи А1а Ьуз Уа1 Уа1
210 215 220
дсЕ ддс аад аад дас дед ддс ЕЕс аас асЕ Есс ЕЕс асд дас Еас Едд 720
А1а (31у Ьуз Ьуз Азр А1а О1у РЬе Азп ТЬг Зег РЬе ТЬг Азр Туг Тгр
225 230 235 240
ддЕ сдс дса сЕс ЕСС Еас сад сЕд аЕЕ аас дед асе дас дда ддс сса 768
О1у Агд А1а Ьеи Зег Туг О1п Ьеи Не Азп А1а ТЬг Азр СЯу О1у Рго
245 250 255
ддс еас асе Сдд еса есд аес дсе ееа асе сад дас еес аад аас дда 816
С1у Туг ТЬг Тгр Зег Зег Не А1а Ьеи ТЬг Θΐη Авр РЬе Ьув Авп С1у
260 265 270
аас аед ссс аед сед сес сее дес дсс дас ддс сдс аас сса ддс дад 864
Азп Мее Рго Мее Рго Ьеи Ьеи Уа1 А1а Азр О1у Агд Авп Рго С1у С1и
275 280 285
асе сеа акс ддс аде аас есд асе дед еае дад еес аас ссс ьдд даа 912
ТЬг Ьеи 11е С1у Зег Азп Зег ТЬг Уа1 Туг <31и РЬе Авп Рго Тгр О1и
290 295 300
еес ддс аде еее дае ссд есс аес еес ддс еес дсе ссс сес даа еас 960
РЬе О1у Зег РЬе Авр Рго Зег Не РЬе С1у РЬе А1а Рго Ьеи О1и Туг
305 310 315 320
сес дда есс еас еее дад аас ддс даа дес сса есс аде еда есс еде 1008
Ьеи С1у Зег Туг РЬе С1и Азп <31у С1и Уа1 Рго Зег Зег Агд Зег Сув
325 330 335
дес еде ддс еес дае аас дса ддс еес дес аед дда асе есс есс аде 1056
Уа1 Агд О1у РИе Авр Авп А1а О1у РЬе Уа1 Мее 01у ТЬг Зег Зег Зег
340 345 350
сес еес аас саа еес аес сед аад сес аас асе асе дас аес сса еса 1104
Ьеи РЬ.е Азп О1п РЬе 11е Ьеи Ьув Ьеи Авп ТЬг ТЬг Авр 11е Рго Зег
355 360 365
асе сес ааа асд де с аес дсс аде аес сеа даа даа сеа ддс дас сдс 1152
ТЬг Ьеи Ьуз ТЬг Уа1 11е А1а Зег 11е Ьеи С1и О1и Ьеи <31у Азр Агд
370 375 380
аас дас дас аес дсс аес еас есе ссс аас ссс еес еас ддд еас сдс 1200
Азп Азр Азр 11е А1а 11е Туг Зег Рго Авп Рго РЬе Туг С1у Туг Агд
385 390 395 400
аас дед аса дее еса еас даа аад асе ссд дас сед аас дес дес дас 1248
Азп А1а ТЬг Уа1 Зег Туг С1и Ьув ТЬг Рго Авр Ьеи Авп Уа1 Уа1 Авр
405 410 415
ддк ддс даа дас ааа сад аас сес ссс сес сае ссе сес аес саа ссс 1296
С1у С1у СПи Авр Ьув О1п Авп Ьеи Рго Ьеи Ηίβ Рго Ьеи 11е СЯп Рго
420 425 430
дес еде аас дед дас дес аес еес дсс дес дас есс еса дсс аде асе 1344
А1а Агд Авп Уа1 Авр Уа1 11е РЬе А1а Уа1 Азр Зег Зег А1а Зег ТЬг
435 440 445
кед дас аас Ъдд ссс аас дда аде ссе сес дес дед асе еас даа еде 1392
Зег Авр Авп Тгр Рго Авп С1у Зег Рго Ьеи Уа1 А1а ТЬг Туг С1и Агд
450 455 460
аде СЁ.С аас еса асе дде аес дда аас ддс асе дед еес ссе аде аес 1440
Зег Ьеи Авп Зег ТЬг С1у 11е СЛу Авп <31у ТЬг А1а РЬе Рго Зег 11е
465 470 475 480
- 56 008607
ссд дас аад аде асе ййс айй аас ейд ддс ййд аас асе сдй ссд аей 1488
Рго Аар Ьуа Зег ТЬг РЬе 11е Азп Ьеи О1у Ьеи Азп ТЬг Агд Рго ТЬг
485 490 495
ййс ййс ддс йдс аай адй йсс аай айс аса ддс сай дса ссс ейд дйй 1536
РЬе РЬе (31у Суз Азп Зег Зег Азп Х1е ТЬг (31у Ηίβ А1а Рго Ьеи Уа1
500 505 510
Эйс йас сйс ссс аас йас ссс йас аса асе сйс йсс аас аад йсд асе 1584
Уа1 Туг Ьеи Рго Азп Туг Рго Туг ТЬг ТЬг Ьеи Зег Азп Ьуз Зег ТЬг
515 520 525
ййс сад сйс аад йас дад айс ййд дад сдй дай дад айд айс асе аай 1632
РЬе С1п Ьеи Ьуз Туг <31и 11е Ьеи С1и Агд Азр С1и Мей 11е ТЬг Азп
530 535 540
ддс йдд аас дед дйй аей айд ддй аай дда йса адд аад йей йас дад 1680
С1у Тгр Азп Уа1 Уа1 ТЬг Мей С1у Азп О1у Зег Агд Ьуз Зег Туг С1и
545 550 555 560
дай йдд ссд аей йдй дед ддс йдс дей айй ейд адй сдс йсд ййй дай 1728
Аар Тгр Рго ТЬг Суз А1а С1у Суз А1а 11е Ьеи Зег Агд Зег РЬе Азр
565 570 575
едд аей аай асе сад дйд ссд дай айд йдс йсд сад йдй ййй дас аад 1776
Агд ТЬг Азп ТЬг С1п Уа1 Рго Азр Мей Суз Зег О1п Суз РЬе Азр Ьуз
580 585 590
+- в 4- +· /»/4 4— —1 -л 4- ·—» 1 X “» ♦· *1 опл
исг и. 1—V» ‘-дд дда ехСу адд αα и. сху и аСу с1СС| ССу дед дед ио и дад х. и *х
Туг Суэ Тгр Азр С1у ТЬг Агд Азп Зег ТЬг ТЬг Рго А1а А1а Туг (31и
595 600 605
ссд аад дйа ййд айд дей адй дед ддй дйд адд ддй айй йсд айд йсд 1872
Рго Ьуз Уа1 Ьеи Мей А1а Зег А1а С1у Уа1 Агд С1у 11е Зег Мей Зег
610 615 620
адд ййд дйй ййд ддй сйс ййй ссд дед дйд дйй ддд дйй едд айд айд 1920
Агд Ьеи Уа1 Ьеи О1у Ьеи РЬе Рго Уа1 Уа1 Уа1 С1у νβΐ Тгр Мей Мей
625 630 635 640
йда 1923
<210> 15
<211> 640
<212> РКТ
<213> АзрегдШиз пгдег
<400> 15
Мей Ьуз РЬе Азп А1а Ьеи Ьеи ТЬг ТЬг Ьеи А1а А1а Ьеи (31у Туг 11е
1 5 10 15
С1п 61у О1у А1а А1а А7а1 Рго ТЬг ТЬг Уа1 Азр Ьеи ТЬг Туг А1а Азр
20 25 30
- 57 008607
11е Зег Рго Агд А1а Ьеи Азр Азп А1а Рго Азр С1у Туг ТЬг Рго Зег
35 40 45
Азп Уа1 Зег Суз Рго А1а Азп Агд Рго ТЬг Не Агд Зег А1а Зег ТЬг
50 55 60
Ьеи Зег Зег Азп 01и ТЬг А1а Тгр Уа1 Азр Уа1 Агд Агд Ьуз С1п ТЬг
65 70 75 80
Уа1 Зег А1а Мер Ьуз Азр Ьеи РЬе <31у Нхз Не Азп МеЕ Зег Зег РЬе
85 90 95
Азр и Ί « τΉ Зег τΊ _ Зех тт- ~ О 09 — ГУ - — •л т Ί — тХ Т Ί 09
Λία не 1ух не лап П1Ь ОС1 ОС! лап не XXIX лап НС
100 105 но
Рго Азп Не С1у Не А1а Уа1 Зег С1у 01у <31у Туг Агд А1а Ьеи ТЬг
115 120 125
Азп С1у А1а С1у А1а Ьеи Ьуз А1а РЬе Азр Зег Агд ТЬг С1и Азп Зег
130 135 140
ТЬг Нхз Азп С1у 01п Ьеи (31у С1у Ьеи Ьеи С1п Зег А1а ТЬг Туг Ьеи
145 150 155 160
Зег 61у Ьеи Зег 61у О1у 61у Тгр Ьеи Ьеи <31у Зег Не Туг Не Азп
165 170 175
Азп РЬе ТЬг ТЬг Уа1 Зег Азп Ьеи (31п ТЬг Туг Ьуз С1и О1у (31и Уа1
180 185 190
Тгр О1п РЬе С31п Азп Зег Не ТЬг Ьуз 01у Рго Ьуз ТЬг Азп (31у Ьеи
195 200 205
С1п А1а Тгр Азр ТЬг А1а Ьуз Туг Туг Агд Азр Ьеи А1а Ьуз Уа1 Уа1
210 215 220
А1а О1у Ьуз Ьуз Азр А1а (31у РЬе Азп ТЬг Зег РЬе ТЬг Азр Туг Тгр
225 230 235 240
(31у Агд А1а Ьеи Зег Туг (31п Ьеи Не Азп А1а ТЬг Азр О1у О1у Рго
245 250 255
О1у Туг ТЬг Тгр Зег Зег Не А1а Ьеи ТЬг С1п Азр РЬе Ьуз Азп С1у
260 265 270
Азп МеЬ Рго МеЪ Рго Ьеи Ьеи Уа1 А1а Азр <31у Агд Азп РГО О1у (31и
275 280 285
ТЬг Ьеи Не С1у Зег Азп Зег ТЬг Уа1 Туг С1и РЬе Азп Рго Тгр (31и
290 295 300
РЬе О1у Зег РЬе Азр Рго Зег Не РЬе С1у РЬе А1а Рго Ьеи С1и Туг
305 310 315 320
Ьеи (31у Зег Туг РЬе О1и Азп (31у С1и Уа1 Рго Зег Зег Агд Зег Суз
325 330 335
Уа1 Агд С1у РЬе Азр Азп А1а О1у РЬе Уа1 МеЕ 01у ТЬг Зег Зег Зег
340 345 350
Ьеи РЬе Азп О1п РЬе Не Ьеи Ьуз Ьеи Азп ТЬг ТЬг Азр Не Рго Зег
355 360 365
- 58 008607
ТЬг Ьеи Ьуз ТЬг Уа1 11е А1а Зег 11е Ьеи СЛи (Ли Ьеи 61у Азр Агд
370 375 380
Азп Азр Азр 11е А1а 11е Туг Зег Рго Азп Рго РЬе Туг С1у Туг Агд
385 390 395 400
Азп А1а ТЬг Уа1 Зег Туг СЛи Ьуз ТЬг Рго Азр Ьеи Азп Уа1 Уа1 Азр
405 410 415
СЛу (Лу СЛи Азр Ьуз Θΐη Азп Ьеи Рго Ьеи Н18 Рго Ьеи Не (Лп Рго
420 425 430
А1а Агд Азп Уа1 Азр Уа1 11е РЬе А1а Уа1 Азр Зег Зег А1а Зег ТЬг
435 440 445
Зег Азр Азп Тгр Рго Азп СЛу Зег Рго Ьеи Уа1 А1а ТЬг Туг (Ли Агд
450 455 460
Зег Ьеи Азп Зег ТЬг СЛу 11е СЛу Азп СЛу ТЬг А1а РЬе Рго Зег Пе
465 470 475 480
Рго Азр Ьуз Зег ТЬг РЬе Не Азп Ьеи СЛу Ьеи Авп ТЬг Агд Рго ТЬг
485 490 495
РЬе РЬе СЛу Суз Азп Зег Зег Азп 11е ТЬг СЛу ΗΪ8 А1а Рго Ьеи Уа1
500 505 510
Уа1 Туг Ьеи Рго Азп Туг Рго Туг ТЬг ТЬг Ьеи Зег Азп Ьуз Зег ТЬг
515 520 525
РЬе СЛп Ьеи Ьуз Туг СЛи 11е Ьеи О1и Агд Азр О1и МеЕ Не ТЬг Азп
530 535 540
СЛу Тгр Азп Уа1 Уа1 ТЬг МеС СЛу Азп СЛу Зег Агд Ьуз Зег Туг (Ли
545 550 555 560
Азр Тгр Рго ТЬг Суз А1а СЛу Суз А1а Пе Ьеи Зег Агд Зег РЬе Азр
565 570 575
Агд ТЬг Азп ТЬг СЛп Уа1 Рго Азр МеС Суз Зег СЛп Суз РЬе Азр Ьуз
580 585 590
Туг Суз Тгр Азр СЛу ТЬг Агд Азп Зег ТЬг ТЬг Рго А1а А1а Туг О1и
595 600 605
Рго Ьуз Уа1 Ьеи МеЕ А1а Зег А1а (Лу Уа1 Агд СЛу Не Зег МеС Зег
610 615 620
Агд Ьеи Уа1 Ьеи СЛу Ьеи РЬе Рго Уа1 Уа1 Уа1 61у Уа1 Тгр МеС МеС
625 630 635 640
ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ

Claims (20)

1. Выделенный полинуклеотид, кодирующий фосфолипазу АкрегдШик шдег, имеющий нуклеотидные последовательности 8ЕЦ ΙΌ N0: 1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11, 13 и 14, а также полинуклеотид, гибридизуемый с указанным в условиях высокой жесткости, раскрытых в описании.
2. Выделенный полинуклеотид, кодирующий фосфолипазу АкрегдШик шдег, имеющую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15 или их функциональных эквивалентов.
3. Выделенный полинуклеотид, кодирующий по меньшей мере один функциональный домен фосфолипазы АкрегдШик шдег, имеющей аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8ЕЦ ΙΌ N0: 3, 6, 9, 12 и 15 или их функциональных эквивалентов.
- 59 008607
4. Вектор, включающий выделенный полинуклеотид по любому из пп.1-3.
5. Вектор по п.4, отличающийся тем, что указанный полинуклеотид функционально связан с регуляторными последовательностями, обеспечивающими его экспрессию в подходящей клетке-хозяине.
6. Вектор по п.5, отличающийся тем, что указанная подходящая клетка-хозяин представляет собой клетку нитевидного гриба.
7. Способ получения полинуклеотида по любому из пп.1-3, включающий культивирование клеткихозяина, трансформированной указанным полинуклеотидом, и выделение указанного полинуклеотида из указанной клетки-хозяина.
8. Способ размножения вектора по любому из пп.4-6, включающий культивирование клеткихозяина, трансформированной указанным вектором, и выделение указанного вектора из указанной клетки-хозяина.
9. Выделенная фосфолипаза АкрегдШик шдет, имеющая аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из 8Еф ΙΌ Ν0: 3, 6, 9, 12 и 15 или их функциональных эквивалентов.
10. Выделенная фосфолипаза, полученная путем экспрессии полинуклеотида по любому из пп.1-3 или вектора по любому из пп.4-6 в соответствующей клетке-хозяине, например клетке АкрегдШик шдег.
11. Рекомбинантная фосфолипаза, включающая функциональный домен фосфолипазы по любому из пп.9-10.
12. Способ получения фосфолипазы по любому из пп.9-11, включающий трансформацию подходящей клетки-хозяина выделенным полинуклеотидом по любому из пп.1-3 или вектором по любому из пп.4-6, культивирование указанной клетки в условиях, обеспечивающих экспрессию указанного полинуклеотида, и, при необходимости, очистку фосфолипазы из указанной клетки или культуральной среды.
13. Рекомбинантная клетка-хозяин, содержащая полинуклеотид по любому из пп.1-3 или вектор по любому из пп.4-6.
14. Рекомбинантная клетка-хозяин, экспрессирующая фосфолипазу по любому из пп.9-11.
15. Очищенное антитело, взаимодействующее с фосфолипазой по любому из пп.9-11.
16. Белок слияния, включающий фосфолипазу по любому из пп.9-11.
17. Способ получения теста, включающий добавление к муке фосфолипазы по любому из пп.9-11 и других агентов для улучшения свойств хлебобулочного изделия или теста и формирование теста.
18. Способ получения хлебобулочного изделия, отличающийся тем, что используют тесто, полученное согласно способу по п.17.
19. Применение фосфолипазы по любому из пп.9-11 для получения теста.
20. Применение фосфолипазы по любому из пп.9-11 для получения хлебобулочных продуктов из теста, полученного по п.17.
EA200401531A 2002-05-21 2003-05-21 Полинуклеотид, кодирующий фосфолипазу aspergillus niger, фосфолипаза aspergillus niger и способы получения и применения полинуклеотида и фосфолипазы EA008607B1 (ru)

Applications Claiming Priority (5)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP02100521 2002-05-21
EP02100538 2002-05-21
EP02100524 2002-05-21
EP02100528 2002-05-21
PCT/EP2003/005450 WO2003097825A2 (en) 2002-05-21 2003-05-21 Novel phospholipases and uses thereof

Publications (2)

Publication Number Publication Date
EA200401531A1 EA200401531A1 (ru) 2005-06-30
EA008607B1 true EA008607B1 (ru) 2007-06-29

Family

ID=29554302

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
EA200401531A EA008607B1 (ru) 2002-05-21 2003-05-21 Полинуклеотид, кодирующий фосфолипазу aspergillus niger, фосфолипаза aspergillus niger и способы получения и применения полинуклеотида и фосфолипазы

Country Status (17)

Country Link
US (2) US7588925B2 (ru)
EP (1) EP1506291B1 (ru)
JP (2) JP4511342B2 (ru)
CN (2) CN100545261C (ru)
AR (1) AR039839A1 (ru)
AT (1) ATE476500T1 (ru)
AU (1) AU2003232821A1 (ru)
BR (1) BR0311205A (ru)
CA (1) CA2486529A1 (ru)
DE (1) DE60333629D1 (ru)
DK (1) DK1506291T3 (ru)
EA (1) EA008607B1 (ru)
ES (1) ES2347550T3 (ru)
PL (1) PL373887A1 (ru)
PT (1) PT1506291E (ru)
SI (1) SI1506291T1 (ru)
WO (1) WO2003097825A2 (ru)

Families Citing this family (18)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6936289B2 (en) 1995-06-07 2005-08-30 Danisco A/S Method of improving the properties of a flour dough, a flour dough improving composition and improved food products
ATE362315T1 (de) 2001-05-18 2007-06-15 Danisco Verfahren zur herstellung von teig mit einem enzym
WO2003097825A2 (en) 2002-05-21 2003-11-27 Dsm Ip Assets B.V. Novel phospholipases and uses thereof
US7588928B2 (en) * 2003-08-11 2009-09-15 Codexis, Inc. Halohydrin dehalogenases and related polynucleotides
BRPI0513438A2 (pt) 2004-07-16 2011-01-04 Danisco método enzimático para degomagem de óleo
DE102006046857A1 (de) 2006-10-02 2008-04-03 Ab Enzymes Gmbh Klonierung, Expression und Verwendung saurer Lysophospholipasen
DE102006046719A1 (de) * 2006-10-02 2008-04-03 Ab Enzymes Gmbh Klonierung, Expression und Verwendung saurer Phospholipasen
US8338133B2 (en) 2007-01-30 2012-12-25 Mitsubishi-Kagaku Foods Corporation DNA encoding glyceroglycolipid lipase
WO2010124975A1 (en) * 2009-04-28 2010-11-04 Dsm Ip Assets B.V. Method of preparing an egg composition
DE102009051013A1 (de) 2009-10-28 2011-06-09 Ab Enzymes Gmbh Klonierung, Expression und Verwendung saurer Phospholipasen
JP2012152128A (ja) * 2011-01-25 2012-08-16 Mitsubishi-Kagaku Foods Corp 小麦粉製品の製造方法
AU2015286897B2 (en) * 2014-07-07 2019-01-17 Novozymes A/S Dough with a lipolytic enzyme and/or xylanase and a monooygenase
CN105695430B (zh) * 2014-11-26 2020-07-10 丰益(上海)生物技术研发中心有限公司 改进的磷脂酶及其制备方法和用途
CN108220267B (zh) * 2016-12-22 2022-10-04 丰益(上海)生物技术研发中心有限公司 磷脂酶及其应用
AU2019360247A1 (en) * 2018-10-17 2021-06-03 Perfect Day, Inc. Recombinant components and compositions for use in food products
JP2021023178A (ja) * 2019-08-02 2021-02-22 日本製粉株式会社 冷凍粥の製造方法
CN111057688B (zh) * 2019-12-11 2022-09-23 上海交通大学 一种制备n-乙酰氨基半乳糖转移酶的方法
CN113848720B (zh) * 2021-10-09 2023-11-03 国核电力规划设计研究院有限公司 基于全功率直驱风机控制惯性的系统稳定性分析方法

Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6146869A (en) * 1999-10-21 2000-11-14 Novo Nordisk Biotech, Inc. Polypeptides having phospholipase B activity and nucleic acids encoding same

Family Cites Families (42)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CS190264B1 (en) 1977-10-18 1979-05-31 Otakar Novotny Method of production of the bread and pastry with the use of the fosphatide acids salts
US4433092A (en) 1981-03-09 1984-02-21 Champion Spark Plug Company Green ceramic of lead-free glass, conductive carbon, silicone resin and AlPO4, useful, after firing, as an electrical resistor
JPS5851853A (ja) 1981-09-18 1983-03-26 Kyowa Hakko Kogyo Co Ltd リン脂質混合物の処理法
JPS6030488B2 (ja) 1982-11-10 1985-07-17 協和醗酵工業株式会社 生地の改良剤およびそれを含有してなる生地
JPS6078529A (ja) 1983-10-07 1985-05-04 協和醗酵工業株式会社 生地
WO1986000991A1 (en) 1984-07-24 1986-02-13 Commonwealth Serum Laboratories Commission Method for determining mimotopes
US4631211A (en) 1985-03-25 1986-12-23 Scripps Clinic & Research Foundation Means for sequential solid phase organic synthesis and methods using the same
GB8525012D0 (en) 1985-10-10 1985-11-13 Cpc International Inc Carbohydrate refining process
LU86128A1 (fr) 1985-10-18 1987-06-02 Vander Poorten Henri Procede permettant l'impression ou le revetement de ceramique simultanement a son electroformage et conduisant en monocuisson a des produits decoratifs ou techniques
JPS62111629A (ja) 1985-11-09 1987-05-22 キユーピー株式会社 ケ−キの製造方法
US4704692A (en) 1986-09-02 1987-11-03 Ladner Robert C Computer based system and method for determining and displaying possible chemical structures for converting double- or multiple-chain polypeptides to single-chain polypeptides
US4946778A (en) 1987-09-21 1990-08-07 Genex Corporation Single polypeptide chain binding molecules
JPS63258528A (ja) 1987-04-15 1988-10-26 キユーピー株式会社 スポンジケ−キの製造方法
JP2709736B2 (ja) 1988-08-11 1998-02-04 昭和産業株式会社 油脂の精製方法
AU4308689A (en) 1988-09-02 1990-04-02 Protein Engineering Corporation Generation and selection of recombinant varied binding proteins
US5223409A (en) 1988-09-02 1993-06-29 Protein Engineering Corp. Directed evolution of novel binding proteins
ES2047827T3 (es) 1989-09-29 1994-03-01 Unilever Nv Productos alimenticios que contienen lisofosfolipoproteina deshidratada.
US5427908A (en) 1990-05-01 1995-06-27 Affymax Technologies N.V. Recombinant library screening methods
GB9015198D0 (en) 1990-07-10 1990-08-29 Brien Caroline J O Binding substance
DK0585287T3 (da) 1990-07-10 2000-04-17 Cambridge Antibody Tech Fremgangsmåde til fremstilling af specifikke bindingsparelementer
DK0564531T3 (da) 1990-12-03 1998-09-28 Genentech Inc Berigelsesfremgangsmåde for variantproteiner med ændrede bindingsegenskaber
ES2287206T3 (es) 1991-03-01 2007-12-16 Dyax Corporation Proceso para el desarrollo de mini-proteinas de union.
IE921169A1 (en) 1991-04-10 1992-10-21 Scripps Research Inst Heterodimeric receptor libraries using phagemids
DE4115938A1 (de) 1991-05-16 1992-11-19 Metallgesellschaft Ag Enzymatisches verfahren zur verminderung des gehaltes an phosphorhaltigen bestandteilen in pflanzlichen und tierischen oelen
DE4122599C2 (de) 1991-07-08 1993-11-11 Deutsches Krebsforsch Phagemid zum Screenen von Antikörpern
CZ264U1 (cs) 1992-01-20 1993-04-28 Oto Doc. Ing. Csc. Vrana Štiepkocementové došky vytvrdené za tlaku
DE69402752T2 (de) 1993-03-31 1997-07-31 Gist Brocades Nv Hefeformulierung zur Herstellung von Backwaren
US5480971A (en) 1993-06-17 1996-01-02 Houghten Pharmaceuticals, Inc. Peralkylated oligopeptide mixtures
DK76893D0 (ru) 1993-06-28 1993-06-28 Novo Nordisk As
DE4339556C1 (de) 1993-11-19 1995-02-02 Metallgesellschaft Ag Verfahren zum Entschleimen von Pflanzenöl mittels Enzymen
EP0659344B1 (en) 1993-12-24 2001-07-04 Dsm N.V. Dry yeast compositions
DE19620649A1 (de) * 1996-05-22 1997-11-27 Roehm Gmbh Rekombinant hergestellte Lysophospholipase aus Aspergillus
JPH10155493A (ja) 1996-10-04 1998-06-16 Sankyo Co Ltd アスペルギルス属由来のホスホリパーゼa1をコードする遺伝子
AR010340A1 (es) 1996-12-09 2000-06-07 Novozymes As COMPOSICIoN PARA HORNEADO, USO DE DICHA COMPOSICIoN Y USO DEL POLIPÉPTIDO DE DICHA COMPOSICIoN.
DE19701348A1 (de) * 1997-01-16 1998-07-23 Roehm Gmbh Protein mit Phospholipaseaktivität
EP1193314B1 (en) * 1997-04-09 2004-10-20 Danisco A/S Use of lipase for improving doughs and baked products
DK1131416T3 (da) 1998-11-27 2009-10-26 Novozymes As Lipolytiske enzymvarianter
AU7411100A (en) 1999-08-17 2001-03-13 Dsm N.V. Liquid bread improving composition
ATE494366T1 (de) * 1999-10-14 2011-01-15 Novozymes As Lysophospholipase aus aspergillus
CA2421833A1 (en) 2000-09-28 2002-04-04 Dsm N.V. Liquid bread improving compositions
CN1481217A (zh) 2000-12-20 2004-03-10 DSMIP�ʲ����޹�˾ 液体酵母组合物
WO2003097825A2 (en) 2002-05-21 2003-11-27 Dsm Ip Assets B.V. Novel phospholipases and uses thereof

Patent Citations (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6146869A (en) * 1999-10-21 2000-11-14 Novo Nordisk Biotech, Inc. Polypeptides having phospholipase B activity and nucleic acids encoding same

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
DATABASE EMBL 'Online! 10 October 2002 (2002-10-10), MACHIDA M. ET AL.: "Aspergillus oryzae polynucleotide SEQ ID NO: 5401", retrieved from EBI, Database accession no. ABZ56288, XP002250492, abstract *
DATABASE EMBL 'Online! 28 September 2000 (2000-09-28), BERKA R.M. ET AL.: "Aspergillus orizae EST SEQ ID NO: 4754", retrieved from EBI, Database accession no. AAF12231, XP002250493, abstract *

Also Published As

Publication number Publication date
JP2005525818A (ja) 2005-09-02
JP2009183302A (ja) 2009-08-20
US7588925B2 (en) 2009-09-15
US7838274B2 (en) 2010-11-23
PL373887A1 (en) 2005-09-19
AR039839A1 (es) 2005-03-02
CN101684470A (zh) 2010-03-31
EA200401531A1 (ru) 2005-06-30
BR0311205A (pt) 2005-03-15
PT1506291E (pt) 2010-09-21
EP1506291B1 (en) 2010-08-04
US20070207521A1 (en) 2007-09-06
ATE476500T1 (de) 2010-08-15
CN1659277A (zh) 2005-08-24
CN100545261C (zh) 2009-09-30
US20100047877A1 (en) 2010-02-25
WO2003097825A3 (en) 2004-04-01
WO2003097825A2 (en) 2003-11-27
DE60333629D1 (de) 2010-09-16
EP1506291A2 (en) 2005-02-16
SI1506291T1 (sl) 2010-10-29
JP4511342B2 (ja) 2010-07-28
ES2347550T3 (es) 2010-11-02
CA2486529A1 (en) 2003-11-27
DK1506291T3 (da) 2010-10-18
AU2003232821A1 (en) 2003-12-02

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US7838274B2 (en) Phospholipases and uses thereof
US8216586B2 (en) Lipases and uses thereof
KR101268315B1 (ko) 단백질
JP5118651B2 (ja) 新規のリパーゼおよびその使用
JP2013503612A (ja) Ssl代替物としてのベーキング酵素組成物
WO2004018662A2 (en) Cellulases and hemicellulases and uses thereof
JP2015133976A (ja) タンパク質
RU2380414C2 (ru) Белок
ZA200500794B (en) Novel lipases and uses thereof
CN101389644A (zh) 新颖的脂肪酶及其用途

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s)

Designated state(s): AM AZ BY KZ KG MD TJ TM

MM4A Lapse of a eurasian patent due to non-payment of renewal fees within the time limit in the following designated state(s)

Designated state(s): RU