DK2264051T3 - Nye genprodukter, der danner eller nedbryder polyaminosyrer, af Bacillus licheniformis og herpå byggende forbedrede bioteknologiske produktionsfremgangsmåder - Google Patents

Nye genprodukter, der danner eller nedbryder polyaminosyrer, af Bacillus licheniformis og herpå byggende forbedrede bioteknologiske produktionsfremgangsmåder Download PDF

Info

Publication number
DK2264051T3
DK2264051T3 DK10175016.4T DK10175016T DK2264051T3 DK 2264051 T3 DK2264051 T3 DK 2264051T3 DK 10175016 T DK10175016 T DK 10175016T DK 2264051 T3 DK2264051 T3 DK 2264051T3
Authority
DK
Denmark
Prior art keywords
val
gly
leu
lys
ala
Prior art date
Application number
DK10175016.4T
Other languages
English (en)
Inventor
Jörg Feesche
Stefan Evers
Armin Ehrenreich
Birgit Veith
Heiko Liesegang
Christina Herzberg
Gerhard Gottschalk
Anke Singer
Cornelius Bessler
Karl-Heinz Maurer
Original Assignee
Basf Se
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Family has litigation
First worldwide family litigation filed litigation Critical https://patents.darts-ip.com/?family=34969627&utm_source=google_patent&utm_medium=platform_link&utm_campaign=public_patent_search&patent=DK2264051(T3) "Global patent litigation dataset” by Darts-ip is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
Application filed by Basf Se filed Critical Basf Se
Application granted granted Critical
Publication of DK2264051T3 publication Critical patent/DK2264051T3/da

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/32Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Bacillus (G)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/52Genes encoding for enzymes or proenzymes
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12PFERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P13/00Preparation of nitrogen-containing organic compounds
    • C12P13/04Alpha- or beta- amino acids

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)

Claims (18)

1. Fremgangsmåde til reduktion af slim, som skyldes poly-gamma-glutamat, kendetegnet ved undertrykkelse af funktionen i det af genet ywtB kodede protein YwtB (CapA, PgsA) med en aminosyresekvens, som er i det mindste 90% identisk med den i SEQ ID NO. 8 anførte aminosyresekvens, som et i dannelsen af polyaminosyrer impliceret enzym eller som underenhed af et sådant enzym.
2. Fremgangsmåde ifølge krav 1, kendetegnet ved, at funktionen af proteinet YwtB er undertrykt under fermenteringen af mikroorganismen.
3. Fremgangsmåde ifølge krav 1 eller 2, kendetegnet ved en reduktion af det slim, som skyldes polyaminosyrer, til 50%.
4. Fremgangsmåde ifølge et af kravene 1, 2 eller 3, kendetegnet ved, at mikroorganismen a) er en bakterie og/eller b) er en gram-negativ bakterie eller c) er en gram-positiv bakterie.
5. Fremgangsmåde ifølge krav 4, kendetegnet ved, at mikroorganismen er udvalgt blandt en af slægterne Escherichia, Klebsiella, Pseudomonas, Xanthomonas, Bacillus, Staphylococcus eller Corynebacterium.
6. Fremgangsmåde ifølge et af de foregående krav, kendetegnet ved følgende trin til undertrykkelse af funktionen af det af genet ywtB kodede protein YwtB: a) udvælgelse af to områder på sekvensen SEQ ID NO. 7, b) kloning af områderne i en vektor, således af de flankerer en del, som koder for et ikkeaktivt protein, eller således at de følger direkte efter hinanden, idet det derimellem liggende område udelades, c) deletering af genet ywtB med den i trin b) fremstillede vektor og d) påvisning af gen-deletionen.
7. Fremgangsmåde ifølge et af de foregående krav, kendetegnet ved, at funktionen af det af genet ywtB kodede protein YwtB (CapA, PsgA) er undertrykt ved hjælp af anvendelse af en nukleinsyre med en deletions- eller insertionsmutation, fortrinsvis omfattende de randsekvenser, som omfatter hver især i det mindste 70 til 150 nukleinsyrepositioner, af det for proteinet kodende område.
8. Fremgangsmåde til fremstilling af et genanvendeligt stof ved hjælp af fermentering af en mikroorganisme, kendetegnet ved, at dannelsen af poly-gamma-glutamat under fermenteringen er reduceret af mikroorganismen ved hjælp af undertrykkelse af funktionen af det af genet ywtB kodede protein YwtB (CapA, PgsA) med en aminosyresekvens, som er i det mindste 90% identisk med den i SEQ ID NO. 8 anførte aminosyresekvens, som et i dannelsen af polyaminosyrer impliceret enzym eller som underenhed af et sådant enzym.
9. Fremgangsmåde ifølge krav 8, kendetegnet ved, at funktionen af det af genet ywtB kodede protein YwtB (CapA, PgsA) er undertrykt ved hjælp af en fremgangsmåde med følgende trin: a) udvælgelse af to områder på sekvensen SEQ ID NO. 7, b) kloning af områderne i en vektor, således at de flankerer en del, som koder for et ikkeaktivt protein, eller således at de følger direkte efter hinanden, idet det derimellem liggende område udelades, c) deletering af genet ywtB med den i trin b) fremstillede vektor og d) påvisning af gen-deletionen.
10. Fremgangsmåde ifølge krav 8 eller 9, kendetegnet ved, at funktionen af det af genet ywtB kodede protein YwtB (CapA, PsgA) er undertrykt ved hjælp af anvendelse af en nukleinsyre med en deletions- eller insertionsmutation, fortrinsvis omfattende de randsekvenser, som omfatter hver især i det mindste 70 til 150 nukleinsyrepositioner, af det for proteinet kodende område.
11. Fremgangsmåde ifølge krav 8, 9 eller 10, kendetegnet ved, at det genanvendelige stof er et naturligt stof, et kosttilskudsmiddel eller en farmaceutisk relevant forbindelse eller et enzym.
12. Fremgangsmåde ifølge krav 11, kendetegnet ved, at enzymet er udvalgt af gruppen af a-amylaser, proteaser, cellulaser, lipaser, oxidoreduktaser, peroxidaser, laccaser, oxidaser og hemicellulaser.
13. Anvendelse af en nukleinsyre kodende for et i dannelsen af poly-gamma-glutamat impliceret protein YwtB (CapA, PgsA) med en aminosyresekvens, som er i det mindste 90% identisk med den i SEQ ID NO. 8 anførte aminosyresekvens, eller hver især dele heraf til undertrykkelse af funktionen af proteinet YwtB (CapA, PgsA) som et i dannelsen af polyaminosyrer impliceret enzym eller som underenhed af et sådant enzym.
14. Anvendelse af en nukleinsyre kodende for et i dannelsen af poly-gamma-glutamat impliceret protein YwtB (CapA, PgsA) med en aminosyresekvens, som er i det mindste 90% identisk med den i SEQ ID NO. 8 anførte aminosyresekvens, eller hver især dele heraf til reduktion af det slim, som skyldes poly-gamma-glutamat, til 50% under fermenteringen af en mikroorganisme.
15. Anvendelse ifølge krav 13 eller 14, kendetegnet ved, at nukleinsyren har sekvensen SEQ ID NO. 7.
16. Anvendelse af en nukleinsyre med en deletions- eller insertionsmutation omfattende de randsekvenser, som hver især omfatter i det mindste 70 til 150 nukleinsyrepositioner, af det for et protein YwtB (CapA, PsgA) med aminosyresekvensen, som er i det mindste 90% identisk med den i SEQ ID NO. 8 anførte aminosyresekvens, kodende område til reduktion af det slim, som skyldes poly-gamma-glutamat under fermenteringen af en mikroorganisme.
17. Mikroorganisme, hvor det for et i dannelsen af poly-gamma-glutamat impliceret genprodukt kodende gen ywtB funktionelt er inaktiveret, idet den kodende nukleotidsekvens ywtB har en nukleotidsekvens, som er i det mindste 94% identisk med den i SEQ ID NO. 7 anførte nukleotidsekvens.
18. Mikroorganisme ifølge krav 17, idet det drejer sig om Bacillus licheniformis.
DK10175016.4T 2004-06-26 2005-06-11 Nye genprodukter, der danner eller nedbryder polyaminosyrer, af Bacillus licheniformis og herpå byggende forbedrede bioteknologiske produktionsfremgangsmåder DK2264051T3 (da)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DE102004030938A DE102004030938A1 (de) 2004-06-26 2004-06-26 Neue, Polyaminosäuren bildende oder abbauende Genprodukte von Bacillus licheniformis und darauf aufbauende verbesserte biotechnologische Produktionsverfahren
EP05750181.9A EP1761557B2 (de) 2004-06-26 2005-06-11 Neue, polyaminosäuren bildende oder abbauende genprodukte von bacillus licheniformis und darauf aufbauende verbesserte biotechnologische produktionsverfahren

Publications (1)

Publication Number Publication Date
DK2264051T3 true DK2264051T3 (da) 2016-12-19

Family

ID=34969627

Family Applications (3)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DK10175015.6T DK2267007T3 (da) 2004-06-26 2005-06-11 Nye genprodukter, der danner eller nedbryder polyaminosyrer, af Bacillus licheniformis og herpå byggende forbedrede bioteknologiske produktionsfremgangsmåder
DK10175016.4T DK2264051T3 (da) 2004-06-26 2005-06-11 Nye genprodukter, der danner eller nedbryder polyaminosyrer, af Bacillus licheniformis og herpå byggende forbedrede bioteknologiske produktionsfremgangsmåder
DK05750181.9T DK1761557T4 (da) 2004-06-26 2005-06-11 Nye genprodukter af bacillus licheniformis, som danner eller nedbryder polyaminosyrer, og herpå baserende forbedrede bioteknologikse produktionsfremgangsmåder

Family Applications Before (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DK10175015.6T DK2267007T3 (da) 2004-06-26 2005-06-11 Nye genprodukter, der danner eller nedbryder polyaminosyrer, af Bacillus licheniformis og herpå byggende forbedrede bioteknologiske produktionsfremgangsmåder

Family Applications After (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DK05750181.9T DK1761557T4 (da) 2004-06-26 2005-06-11 Nye genprodukter af bacillus licheniformis, som danner eller nedbryder polyaminosyrer, og herpå baserende forbedrede bioteknologikse produktionsfremgangsmåder

Country Status (10)

Country Link
US (1) US7807443B2 (da)
EP (4) EP2264051B1 (da)
JP (1) JP4926049B2 (da)
CN (1) CN101384615A (da)
AT (1) ATE517911T1 (da)
DE (1) DE102004030938A1 (da)
DK (3) DK2267007T3 (da)
ES (2) ES2606536T3 (da)
PL (3) PL1761557T5 (da)
WO (1) WO2006000308A1 (da)

Families Citing this family (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP2072526B1 (en) * 2000-10-06 2012-05-30 Novozymes, Inc. Methods for disrupting a gene involved in PGA synthesis in Bacillus licheniformis
US8168773B2 (en) * 2000-10-06 2012-05-01 Novozymes, Inc. Methods for monitoring multiple gene expression
US20100064393A1 (en) * 2006-11-29 2010-03-11 Novozymes, Inc. Bacillus liceniformis chromosome
JP6437737B2 (ja) * 2014-05-09 2018-12-12 花王株式会社 枯草菌変異株及びそれを用いたポリ−γ−グルタミン酸の製造方法
US11224647B2 (en) 2016-08-01 2022-01-18 The Regents Of The University Of California Safe potent single platform vaccine against Tier 1 select agents and other pathogens
FI3585910T3 (fi) * 2017-02-24 2024-06-19 Danisco Us Inc Koostumukset ja menetelmät proteiinin tuotannon lisäämiseksi bacillus licheniformiksessa
CN112534050A (zh) * 2018-05-18 2021-03-19 帝斯曼知识产权资产管理有限公司 突变体脂肪酶及其用途
CN114369561B (zh) * 2022-01-11 2024-07-02 江南大学 调控CapBCA单体表达水平的菌株及在聚谷氨酸生产的应用
CN115820470B (zh) * 2022-09-28 2023-08-08 天曲生物科技有限公司 一株解淀粉芽孢杆菌zh804及其应用

Family Cites Families (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP0410638A3 (en) * 1989-07-26 1991-06-05 Takeda Chemical Industries, Ltd. Method for producing polyglutamic acid or a salt thereof
JPH08308590A (ja) 1995-05-18 1996-11-26 Fukuoka Pref Gov ポリ−γ−グルタミン酸の製造方法
CA2310631A1 (en) * 1997-11-18 1999-05-27 Worcester Polytechnic Institute High molecular weight .gamma.-poly(glutamic acid)
JP2001017182A (ja) 1999-07-09 2001-01-23 Nagase & Co Ltd ポリ−γ−グルタミン酸の製造方法
DE10019881A1 (de) 2000-04-20 2001-11-15 Gerhard Miksch Verfahren zur Überexpression und extrazellulären Produktion bakterieller Phytasen in Escherichia coli
EP2072526B1 (en) 2000-10-06 2012-05-30 Novozymes, Inc. Methods for disrupting a gene involved in PGA synthesis in Bacillus licheniformis
KR20010078440A (ko) 2001-01-11 2001-08-21 김형순,성문희 고분자량의 폴리-감마-글루탐산을 생산하는 내염성 균주바실러스 서브틸리스 청국장
EP2298797A3 (en) * 2004-01-09 2011-05-18 Novozymes Inc. Increased bacillus YweA expression

Also Published As

Publication number Publication date
PL2267007T3 (pl) 2017-02-28
DE102004030938A1 (de) 2006-01-12
DK1761557T3 (da) 2011-10-31
EP2267007A1 (de) 2010-12-29
PL2264051T3 (pl) 2017-02-28
EP2264051B1 (de) 2016-08-24
PL1761557T5 (pl) 2016-09-30
ES2606536T3 (es) 2017-03-24
EP2267007B1 (de) 2016-09-14
ATE517911T1 (de) 2011-08-15
CN101384615A (zh) 2009-03-11
US7807443B2 (en) 2010-10-05
ES2603984T3 (es) 2017-03-02
JP4926049B2 (ja) 2012-05-09
WO2006000308A1 (de) 2006-01-05
EP3121192A1 (de) 2017-01-25
EP1761557B2 (de) 2015-09-02
JP2008504021A (ja) 2008-02-14
EP2264051A1 (de) 2010-12-22
US20070190604A1 (en) 2007-08-16
DK2267007T3 (da) 2017-01-09
EP1761557B1 (de) 2011-07-27
DK1761557T4 (da) 2015-12-14
EP1761557A1 (de) 2007-03-14
PL1761557T3 (pl) 2011-12-30

Similar Documents

Publication Publication Date Title
DK2264051T3 (da) Nye genprodukter, der danner eller nedbryder polyaminosyrer, af Bacillus licheniformis og herpå byggende forbedrede bioteknologiske produktionsfremgangsmåder
US20170067064A1 (en) Gene Products of Bacillus Licheniformis Which Form Odorous Substances and Improved Biotechnological Production Methods Based Thereon
Peters-Wendisch et al. Pyruvate carboxylase from Corynebacterium glutamicum: characterization, expression and inactivation of the pyc gene
CN101883853B (zh) 具有生产1,4-丁二醇能力的突变体和使用该突变体制备1,4-丁二醇的方法
Gerth et al. Stress induction of the Bacillus subtilis clpP gene encoding a homologue of the proteolytic component of the Clp protease and the involvement of ClpP and ClpX in stress tolerance
EP2900689B1 (en) Bacterial mutants with improved transformation efficiency
CN101528918A (zh) 生产3-羟基丙酸的β-丙氨酸/α-酮戊二酸氨基转移酶
Kobayashi et al. Molecular cloning of the transglutaminase gene from Bacillus subtilis and its expression in Escherichia coli
JP2001046067A (ja) 好熱性バチルス属細菌由来のl−リジン生合成系遺伝子
CN101495625A (zh) 地衣芽孢杆菌中的氯霉素抗性选择
CN101918551B (zh) 草酸脱羧酶的生产中利用的重组表达质粒载体及重组菌、以及重组草酸脱羧酶的生产方法
CN101010424A (zh) 生产异源蛋白酶的改进方法
EP2157174A1 (en) Increased production of pantothenate (vitamin B5)
CN113015811A (zh) 改善的核黄素生产
EP1523679A2 (en) Methods for producing secreted polypeptides having l-asparaginase activity
US20060057674A1 (en) Translocating enzyme as a selection marker
CN108368477A (zh) 修饰的膜渗透性
CN110997899B (zh) 嗜热赖氨酸脱羧酶的异源表达及其用途
US7807808B2 (en) Bacteria with increased levels of protein secretion, nucleotide sequences coding for a SecA protein with increased levels of protein secretion, and method for producing proteins
CN109790557B (zh) 控制生物膜分散以产生氨基酸或氨基酸衍生产物
DK2340306T3 (da) Ekspressionsforstærkede nukleinsyrer
US20230332116A1 (en) Polypeptide with aspartate kinase activity and use thereof in production of amino acid
JP2000166560A (ja) 新規挿入配列
CN111032874B (zh) 表达活性d-脯氨酸还原酶的微生物以及生产活性d-脯氨酸还原酶的方法
WO1999035274A2 (en) Nucleic acids encoding thermostable pullulanases