DE3523634C2 - - Google Patents
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Description
Gegenstand der Erfindung ist das in den Ansprüchen 1 bis 10 angegebene
β-Urogastron-Gen,
die entsprechenden Rekombinant-Plasmide nach den Ansprüchen 11 und 13 bis 17
sowie das Verfahren zu deren Herstellung und Anspruch 12, die entsprechenden Trans
formanten nach den Ansprüchen 18 bis 22, deren Herstellung nach Anspruch 23 und die Herstellung von
β-Urogastron nach Anspruch 24.
β-Urogastron ist ein Polypeptidhormon, das in den Speicheldrüsen,
z. B. des Menschen, synthetisiert wird (siehe
z. B. Heitz et al., Gut, 19, 408-413 (1978)). Seine Primär
struktur umfaßt 53 Aminosäuren mit der folgenden Sequenz
(siehe H. Gregory et al., Int. J. Peptide Protein Res., 9,
107-118 (1977)).
Für die Aminosäuren werden hier die folgenden Symbole ver
wendet:
β-Urogastron ist physiologisch wirksam, z. B. unterdrückt es
die Sekretion von Magensäure und es fördert Zellwachstum
(siehe Elder et al., Gut, 16, 887-893 (1975)). Es ist daher
bei der Behandlung von Ulcus und Wunden einsetzbar.
β-Urogastron wird in geringen Mengen im menschlichen Urin
ausgeschieden. Deshalb wird die Verbindung zur Zeit durch
Extraktion, Abtrennung und Reinigung aus Urin gewonnen.
Dieses Verfahren ist jedoch aufwendig, weil große Mengen der
Verbindung so nicht leicht gewonnen werden können, da die
Verbindung nur in geringen Mengen im menschlichen Urin vor
liegt.
Aus der Europäischen Offenlegungsschrift 00 46 039 ist es bekannt,
mit Hilfe eines β-Urogastron-Gens Urogastron durch
ein gentechnisches Verfahren herzustellen. Es ist zwar ein
Gen mit einer bestimmten Nucleotid-Sequenz beschrieben,
aber nicht offenbart, ob es andere Gene gibt, die nach einem
ähnlichen Verfahren β-Urogastron exprimieren können, und es
ist auch kein solches Gen mit einer bestimmten Nucleotid-
Sequenz beschrieben.
Theoretisch kann eine große Anzahl von Nucleotid-Sequenzen
für die Aminosäuresequenz von β-Urogastron codieren. Trotzdem
ist es nicht sicher, welches dieser Gene β-Urogastron
mit Hilfe eines gentechnischen Verfahrens exprimieren kann,
oder welches Gen besonders geeignet für die Anwendung der
gentechnischen Verfahren ist. Daher sind viele Versuche und
erfinderische Anstrengungen notwendig, um die günstigste
Nucleotid-Sequenz zu finden.
Der vorliegenden Erfindung liegt die Aufgabe zugrunde, ein
neues β-Urogastron-Gen zur Verfügung zu stellen, das in
seiner Nucleotid-Sequenz vollkommen verschieden von dem in
der Europäischen Offenlegungsschrift 00 46 039 beschriebenen
Gen ist, und das mit Hilfe von gentechnischen Verfahren
β-Urogastron exprimieren kann.
Eine andere Aufgabe der vorliegenden Erfindung ist es, ein
Gen zur Verfügung zu stellen, das für die Expression von
β-Urogastron durch gentechnische Verfahren besonders geeignet
ist.
Eine weitere Aufgabe der Erfindung ist es, neue
Rekombinant-Plasmide und Transformanten, entsprechend dem
neuen β-Urogastron-Gen zur Verfügung zu stellen.
Eine zusätzliche Aufgabe der vorliegenden Erfindung ist es,
ein Verfahren zur Verfügung zu stellen, das mit Hilfe des
neuen Gens unter Verwendung von gentechnischen Verfahren
die Herstellung größerer Mengen von β-Urogastron mit hoher
Reinheit ermöglicht.
Diese und andere Aufgaben der vorliegenden Erfindung werden
aus der folgenden Beschreibung deutlich.
Nach vielen Versuchen wurde das Gen I mit der folgenden
Nucleotid-Sequenz gefunden, das die Ziele der Erfindung
verwirklicht.
Die Buchstaben stehen für die Purin- oder Pyrimidinbasen,
die die Nucleotid-Sequenz ausmachen. Die hier verwendeten
Basensymbole sind die folgenden: A steht für Adenin,
G für Guanin, C für Cytosin und T für Thymin.
Gen I ist hinsichtlich seiner DNA-Sequenz neu und nicht nahe
liegend. Es wurde durch Bestimmung einzelner Nucleotid-Sequenzen
einer großen Anzahl von möglichen Nucleotid-Sequenzen
erhalten.
Gen I hat die folgenden Eigenschaften:
- (1) β-Urogastron kann unter Verwendung gentechnischer Verfahren sehr vorteilhaft exprimiert werden.
- (2) Die Codons des Gens I sind für die üblichen Wirtszellen verträglich, besonders für Escherichia coli (E. coli), so daß eine hohe Expressionsrate möglich ist.
- (3) Spezifische Restriktionsenzym-Erkennungsstellen können innerhalb des Gens und an beiden Enden zur Verfügung gestellt werden. Diese Stellen können nach Wunsch verändert werden, um die Verknüpfung mit anderen Genen und die Insertion in den Plasmidvektor zu erleichtern.
- (4) Zur Herstellung von Gen I können entsprechende Oligo nucleotid-Sequenzen zu Blöcken und die Blöcke leicht zu Untereinheiten verknüpft werden, die im wesentlichen frei von unerwünschten Verknüpfungen sind.
- (5) Nach Expression von β-Urogastron als Fusionprotein werden die nicht notwendigen Abschnitte entfernt, so daß man das gewünschte β-Urogastron erhält.
Wenn β-Urogastron unter Verwendung von Gen I exprimiert
werden soll, können Restriktionsenzym-Erkennungsstellen im
Hinblick auf die Verknüpfung mit dem Promotor, der Shine-
Dalgarno-Sequenz (nachstehend als "SD-Sequenz" bezeichnet),
dem Vektor und dergl., die für die Ex
pression gebraucht werden, am Anfang und/oder Ende des
Gens zur Verfügung gestellt werden. Darüber hinaus können,
falls erforderlich, ein Startcodon und/oder ein Stopcodon
stromaufwärts bzw. stromabwärts vom Gen
zur Verfügung gestellt werden. Die Erkennungsstellen, das
Startcodon und das Stopcodon sind nicht auf bestimmte Sequenzen
beschränkt, aber es können bestimmte Sequenzen ganz
gezielt eingesetzt werden.
Nachstehend ist ein Beispiel eines Gens mit einer verlängerten
Sequenz (nachstehend als "Gen II" bezeichnet) beschrieben,
das eine Restriktionsenzym-Erkennungsstelle und ein
Startcodon stromaufwärts von Gen I und ein Stopcodon und
eine Restriktions-Erkennungsstelle stromabwärts von
Gen I enthält. Die Erkennungsstellen und Codons sind in
der beschriebenen Reihenfolge angeordnet. Gen II schließt
noch weitere Restriktions-Erkennungsstellen ein.
Die Symbole für die Restriktionsenzyme in der vorstehenden
Sequenz haben die folgende Bedeutung:
E: | |
EcoRI, | |
Bg: | BglII, |
Mb: | MboII, |
Ba: | BamHI, |
Ml: | MluI, |
Ta: | TaqI, |
S: | Sau3AI, |
Hf: | HinfI, |
Hd: | HindIII, |
Th: | ThaI |
Die vorliegende Erfindung ist nicht auf den Gen I und Gen II be
schränkt, sondern schließt auch verwandte Gene ein, die in
der Nucleotid-Sequenz im wesentlichen mit diesen identisch
sind, und die für β-Urogastron codieren.
Bei der Synthese der Gene I oder II ist es zweckmäßig, die
Gene I oder II in zwei Abschnitten, der vorderen und der
hinteren Hälfte, zu kontruieren. Es ist z. B. möglich, eine
Untereinheit aus der vorderen Hälfte der Nucleotid-Sequenz
der Gene I oder II und eine andere Untereinheit aus der
hinteren Hälfte der Nucleotid-Sequenz, die dabei etwa in
der Mitte geschnitten wird, herzustellen, und diese zwei
Untereinheiten der Gene I oder II zu den Genen I oder II
zu verknüpfen. Die Untereinheit, die aus der vorderen Hälfte
der Nucleotid-Sequenz des Gens II besteht, kann eine
Restriktionsenzym-Erkennungsstelle am Ende besitzen, und
eine andere Untereinheit, die aus der hinteren Hälfte der
Nucleotid-Sequenz von Gen II besteht, kann eine Restriktionsenzym-
Erkennungsstelle am Anfang besitzen. Diese Untereinheiten
werden dann zum Gen II verknüpft.
Genauer ausgesrückt heißt das: die erste Untereinheit kann
eine Untereinheit A sein, die aus der vorderen Hälfte von
Gen II besteht und eine Restriktionsenzym (BamHI)-Erkennungs
stelle an ihrem Ende besitzt. Die zweite Untereinheit
kann eine Untereinheit B aus der hinteren Hälfte von Gen II
sein, die eine Restriktionsenzym (HindIII)-Erkennungsstelle
an ihrem Anfang besitzt. Diese Untereinheiten sind
nachstehend gezeigt.
Die Untereinheiten A und B werden beispielsweise in folgender
Weise synthetisiert. Zunächst werden Oligonucleotide
mit 11, 13 oder 15 Basen synthetisiert (A-1 bis A-16 und
B-1 bis B-16, d. h. 332 Oligonucleotide). Als nächstes werden
4 bis 6 dieser Oligonucleotide zusammengebracht und zu
Blöcken verknüpft (Block 1 bis Block 7, d. h. 7 Blöcke).
Diese Oligonucleotide und Blöcke sind nachstehend gezeigt.
Dann werden die Blöcke 1 bis 3 zur Untereinheit A verknüpft
und die Blöcke 4 bis 7 zur Untereinheit B.
Die vorliegende Erfindung wird nachstehend ausführlich unter
Bezug auf die Zeichnungen und Fotos be
schrieben.
Fig. 1 zeigt schematisch die Synthese eines Oligo
nucleotids durch das Festphasenverfahren.
Fig. 2 zeigt ein Verfahren zur Verknüpfung der Oligo
nucleotide A-1 bis A-16 zur Untereinheit A und
zur Einführung der Untereinheit in das Plasmid
pBR322 zur Gewinnung des Rekombinant-
Plasmids pUG1.
Fig. 3 zeigt ein ähnliches Verfahren zur Herstellung
des Rekombinant-Plasmids pUG2 durch Einführung
der Untereinheit B in das Plasmid pBR322.
Fig. 4 zeigt ein Verfahren zur Herstellung des Rekombinant-
Plasmids pUG3 aus pUG1 und pUG2.
Fig. 5 zeigt das Ergebnis der Nucleotidsequenzanalyse
von Oligonucleotid A-3 durch zweidimensionale
Fraktionierung, bestehend aus Elektrophorese
und Homochromatographie.
Fig. 6 zeigt ein Verfahren zur Herstellung des Rekombinant-
Plasmids pGH37.
Fig. 7 zeigt ein Verfahren zur Herstellung des Rekombinant-
Plasmids pGH35.
Fig. 8 zeigt ein Verfahren zur Herstellung des Rekombinant-
Plasmids pEK28.
Fig. 9 zeigt Verfahren zur Herstellung der Rekombinant-
Plasmide pUG102 bis pUG122 und der Rekombinant-Plasmide
pUG103-E und pUG117-E.
Fig. 10 zeigt Verfahren zur Herstellung der Rekombinant-Plasmide
pBRH02 und pBRH03.
Fig. 11 zeigt die MboII-Restriktionskarte von pUg3
einschließlich des H-Fragments (179 Bp), das
das β-Urogastron-Gen enthält.
Fig. 12 zeigt ein Verfahren zur Herstellung der Rekombinant-Plasmide
pUG2301 bis pUG2303.
Fig. 13 zeigt ein Verfahren zur Herstellung der Rekombinant-Plasmide
pUG2101 bis pUG2105.
Fig. 14 zeigt ein Verfahren zur Herstellung der Rekombinant-Plasmide
pUG2701 bis pUG2703.
Fig. 15 zeigt ein Verfahren zur Herstellung der Rekombinant-Plasmide
pUG1102 und pUG1105.
Fig. 16 zeigt ein Verfahren zur Herstellung des Rekombinant-Plasmids
pUG1004.
Fig. 17 zeigt ein Verfahren zur Herstellung des Rekombinant-Plasmids
pUG1201.
Fig. 18 zeigt ein Verfahren zur Herstellung des Rekombinant-Plasmids
pUG1301.
Die Fig. 19 bis 23 zeigen Analyseergebnisse der Nucleotidsequenzen
von Rekombinant-Plasmiden, die z. B. nach
Maxam und Gilbert erhalten wurden.
Die Verfahren zur Konstruktion des erfindungsgemäßen Gens II sind
bekannt. Die Oligonucleotide zur Herstellung von Gen II
können durch bekannte Verfahren hergestellt werden, z. B.
durch das nachstehend kurz beschriebene Festphasenverfahren
(siehe z. B. H. Ito et al., Nucleic Acids Research, 10,
1755-1769 (1982)).
Beim Festphasenverfahren werden die Oligonucleotide, wie
in Fig. 1 gezeigt, durch aufeinanderfolgende Kupplung
von Mononucleotiden oder Dinucleotiden an ein an Polystyrolharz
gebundenes Nucleosid synthetisiert, wobei eine
festgelegte Nucleotidsequenz entsteht.
Das Nucleosidträgerharz kann z. B. unter Verwendung eines
teilweise quervernetzten Polystyrolharzes durch Umsetzen
mit N-(Chlormethyl)-phthalimid hergestellt werden. Das
Produkt ergibt mit Hydrazin ein aminomethyliertes Poly
styrolharz, an dessen Aminogruppe ein Nucleosid mit einer
freien 5′-Hydroxylgruppe und einer geschützten Aminogruppe,
unter Verwendung von Bernsteinsäure als Arm, gebunden
wird.
Zur Herstellung von Mononucletiden oder Dinucleotiden
sind verschiedene Verfahren bekannt (siehe z. B. C. Broka
et al., Nucleic Acids Research, 8, 5461-5471 (1980)). Ein
Mononucleotid kann z. B. durch Umsetzen von o-chlorphenyl
phosphodichloridat, Triazol und einem Nucleosid mit
einer mit einer Dimethoxytritylgruppe (DMTr) geschützten
5′-Hydroxylgruppe in Gegenwart von Triäthylamin hergestellt
werden. Das Monotriazolid wird mit β-Cyanoäthanol in Gegenwart
von 1-Methylimidazol als Katalysator umgesetzt und das
Reaktionsprodukt an einer Kieselgelsäule, mit choroform-
Methanol als Elutionsmittel, gereinigt. Dieses Verfahren ergibt
ein vollständig geschütztes Mononucleotid.
Ein Dinucleotid kann durch Behandlung des vorstehend erhaltenen
vollständig geschützten Mononucleotids mit Benzol
sulfonsäure oder einer ähnlichen Säure hergestellt werden,
wobei zunächst das Mononucleotid mit der freien
5′-Hydroxylgruppe entsteht. Dieses wird mit dem vorstehend
erhaltenen Monotriazolid umgesetzt. Das Reaktionsprodukt
wird an einer Kieselgelsäule, mit Chloroform-Methanol als
Elutionsmittel, gereinigt. Dieses Verfahren ergibt ein vollständig
geschütztes Dinucleotid.
Die Festphasensynthese von Oligonucleotiden wird zweckmäßig
mit Hilfe eines DNA-Synthesizers durchgeführt.
Das vorstehend
erhaltene Nucleosidträgerharz wird in ein Reaktionsgefäß ge
geben und mit Dichlormethan-Isopropanol gewaschen. Dann
wird eine Lösung von Zinkbromid in Dichlormethan-Isopropanol
zum Harz zugegeben, um die Dimethoxytritylgruppe in
der 5′-Stellung zu entfernen. Dieses Verfahren wird mehrmals
wiederholt, bis die Lösung farblos ist. Das Harz wird
zunächst mit Dichlormethan-Isopropanol und dann mit einer
Lösung von Triäthylammoniumacetat in Dimethylformamid gewaschen,
um noch vorhandene Zinkionen zu entfernen. Danach
wird das Produkt mit Tetrahydrofuran gewaschen und einige
Minuten im Stickstoffstrom getrocknet.
Das vollständig geschützte Dinucleotid oder Mononucleotid
wird in Pyridin gelöst und mit Triäthylamin versetzt. Die
erhaltene Lösung wird geschüttelt, mehrere Stunden bei Raum
temperatur stehengelassen und dann unter vermindertem Druck
eingedampft. Das erhaltene Triäthylammoniumsalz wird in
Pyridin gelöst und zum Trocknen mehrmals mit Pyridin azeotrop
eingedampft. Das Nucleotidsalz wird in einer Lösung
von Mesitylensulfonyl-5-nitrotriazol (MSNT, Kondensations
reagens) in Pyridin gelöst. Die erhaltene Lösung wird zu
dem getrockneten Harz gegeben und bei Raumtemperatur stehengelassen.
Der Überstand des Reaktionsgemischs wird entfernt,
das Harz mit Pyridin gewaschen und dann in Tetrahydrofuran-
Pyridin mit Essigsäureanhydrid unter Verwendung von Dimethyl
aminopyridin als Katalysator umgesetzt, um die nicht
umgesetzte Hydroxylgruppe zu schützen. Schließlich wird das
Harz zur Vervollständigung eines Festphasensynthese-Zyklus
mit Pyridin gewaschen. Ein Zyklus verlängert die Nucleotid-
Sequenz um eine oder zwei Kettenlängen. Das vorstehend be
schriebene Verfahren wird wiederholt, um nach und nach bis
zur gewünschten Länge Mononucleotide oder Dinucleotide an
das Harz zu kuppeln. Auf diese Art und Weise wird ein vollständig
geschütztes Oligonucleotid, gebunden an das Harz,
erhalten.
Eine Lösung von Tetramethylguanidin-2-pyridinaldoximat in
Pyridin-Wasser wird zu dem Harz gegeben und das Gemisch
unter Erwärmen stehengelassen. Das Harz wird dann abfiltriert
und abwechselnd mit Pyridin und Äthanol gewaschen.
Die Waschlösung und die Filtrate werden vereinigt und
unter vermindertem Druck konzentriert. Das Konzentrat wird
in einer wäßrigen Lösung von Triäthylammoniumbicarbonat
(TEAB) gelöst und anschließend mit Äther gewaschen. Die
wäßrige Lösung wird an einer Sephadex G-50-Säule, mit einer
TEAB-Lösung als Elutionsmittel, chromatographiert. Die Fraktionen
werden gesammelt und die organische Dichte jeder Fraktion
bei 260 nm wird gemessen. Die Fraktion, die das erste Eluat
maximum enthält, wird konzentriert. Das Konzentrat wird
z. B. durch Hochgeschwindigkeits-Flüssigkeitschromatographie
gereinigt, bis man ein einziges Maximum erhält. Bei
dem so erhaltenen Oligonucleotid ist das 5′-Ende immer
noch durch eine Dimethoxytritylgruppe geschützt. Daher wird
das Produkt zur Entfernung der Schutzgruppe mit einer wäßrigen
Lösung von Essigsäure behandelt, wiederum gefolgt
von einer Hochgeschwindigkeits-Flüssigkeitschromatographie
oder ähnlichem, bis ein einziges Maximum erhalten wird.
Die gewünschten Oligonucleotide werden durch das vorstehend
beschriebene Verfahren hergestellt und dann einzeln
auf ihre Nucleotidsequenz durch zweidimensionale Fraktionierung,
nämlich Elektrophorese und Hochchromatographie,
und (oder) nach Maxam-Gilbert geprüft. Anschließend
werden sie zur Herstellung der Blöcke und Unterein
heiten eingesetzt.
Die zweidimensionale Fraktionierung zur Prüfung der Nucleotid
sequenz kann nach Verfahren von Wu et al., (E. Jay,
R. A. Bambara, R. Padmanabhan und R. Wu, Nucleic Acids Res.,
1, 331 (1974)) durchgeführt werden. Die lyophilisierten
Oligonucleotide werden in destilliertem Wasser in einer
Konzentration von etwa 0,1 µg/µl gelöst. Ein Teil dieser
Lösung wird zur Markierung des 5′-Endes mit ³²P mit
γ-³²P-ATP und T₄ Polynucleotidkinase behandelt und dann
mit Schlangengift-Phosphodiesterase partiell verdaut. Das
Produkt wird auf eine Celluloseacetatfolie aufgebracht
und in der ersten Dimension im elektrischen Feld getrennt,
wobei die Trennung nach dem Unterschied in den Basen erfolgt.
Nach der Elektrophorese werden deren Produkte auf
eine Diäthylaminoäthylcellulose (DEAE-Cellulose)-Platte gegeben
und in der zweiten Dimension unter Verwendung einer
Lösung von teilweise hydrolysierter RNA (Homogemisch) getrennt.
Dieses Verfahren wird Homochromatographie genannt.
Dabei werden die Oligonucleotide nach ihrer Kettenlänge getrennt.
Danach kann die Nucleotidsequenz des Oligonucleotids
mit Hilfe der Autoradiographie gelesen werden, wobei
am 5′-Ende begonnen wird.
Wenn die Prüfung der Sequenz mit diesem Verfahren schwierig
ist, kann auch das Maxam-Gilbert-Verfahren benutzt
werden (A. M. Maxam und W. Gilbert, Proc. Natl. Acad. Sci.,
USA, 74, 560 (1977); A. M. Maxam und W. Gilbert, Methods
in Enzymol., Bd. 65, S. 499, Academic Press 1980).
Das Verfahren, das auch als chemisches Abbauverfahren bezeichnet
wird, benutzt eine für eine bestimmte Base spezifische
Reaktion, um das Oligonucleotid an der Position der
Base zu spalten. Die Banden, die bei einer anschließenden
Elektrophorese erhalten werden, dienen zum Ablesen der Sequenz
vom 5′- oder vom 3′-Ende her. Die basenspezifischen
Reaktionen sind die folgenden. Guanin wird spezifisch durch
Dimethylsulfat methyliert. In Gegenwart einer Säure werden
Guanin und Adenin depuriniert. Thymin und Cytosin reagieren
beide mit Hydrazin bei einer niedrigen Salzkonzentration,
aber nur Cytosin reagiert auch bei einer hohen Salzkonzentration
mit Hydrazin. Nach der vollständigen Reaktion der
vier Basen, wird jedes Reaktionsgemisch mit Piperidin versetzt,
um ringgeöffnete Basen abzuspalten und um die
β-Eliminierung beider Phosphate von der Desoxyribose zu katalysieren.
Schließlich wird der DNA-Stang bei dieser Base gepalten.
Die erhaltenen Reaktionsmischungen werden elektrophoretisch auf einem
Polyacrylamid-Gel getrennt, um die Nucleotidsequenzen festzustellen,
die durch die einzelnen Reaktionen entstanden sind.
Als nächstes werden die Oligonucleotide unter Verwendung
einer T₄ DNA-Ligase, wie in Fig. 2 gezeigt, verknüpft.
Zur richtigen Verknüpfung werden die zur Untereinheit A
gehörenden 16 Oligonucleotide A-1 bis A-16 in drei Ab
schnitten verknüpft, d. h. Block 1 bestehend aus A-1, A-2,
A-3, A-14, A-15 und A-16, Block 2 bestehend aus A-4, A-5,
A-6, A-11, A-12 und A-13, und Block 3 bestehend aus A-7,
A-8, A-9 und A-10, wie in Fig. 2 gezeigt. Durch
Elektrophorese werden die Blöcke 1 bis 3 mit den richtigen
Sequenzen erhalten und weiter zur Untereinheit A verknüpft.
Im einzelnen werden einige der 5′-Enden der 16 Oligonucleotide
A-1 bis A-16 mit Hilfe von γ-³²P-ATP und T₄
Polynucleotidkinase mit ³²P markiert und und die Hydroxylgruppen
der verbleibenden 5′-Enden mit ATP phosphoryliert. Zur
Bildung der drei Blöcke werden die Oligonucleotide zusammen
gebracht und mit Hilfe der T4 DNA-Ligase verknüpft. Das
Produkt wird auf einem Polyacrylamidgel elektrophoretisch
aufgetrennt und der gewünschte Block isoliert. Die so erhaltenen
drei Blöcke werden mit Hilfe der T₄ DNA-Ligase zur
Untereinheit A verknüpft. Zwar kann in der Verknüpfungsreaktion
eine dimere Struktur entstehen, aber diese kann
leicht mit Hilfe der Restriktionsenzyme EcoRI und BamHI
zur Untereinheit A gespalten werden. Anschließend wird, wie
in Fig. 2 dargestellt, ein üblicher Plasmidvektor, pBR322,
mit EcoRI und BamHI gespalten und die Untereinheit A wird
in den Vektor eingeführt, wobei das Rekombinant-Plasmid
pUG 1 erhalten wird.
Nach dem gleichen Verfahren wird auch die Untereinheit B
hergestellt. Wie im Fall der Untereinheit A werden die
16 Oligonucleotide B-1 bis B-16 in vier Abschnitten, wie in
Fig. 3 gezeigt, verknüpft und die Blöcke werden zur
Untereinheit B verknüpft. Falls ein Dimer entsteht, wird
es durch die Restriktionsenzyme HindIII und BamHI zur
Untereinheit B gespalten. Ein Plasmidvektor, pBR322, wird
mit HindIII und BamHI gespalten und die Untereinheit B in
den Vektor eingeführt, wobei das Rekombinant-Plasmid pUG2,
wie in Fig. 3 dargestellt ist, erhalten wird.
Daraufhin wird, wie in Fig. 4 gezeigt, pUG1 mit den Restriktions
enzymen HindIII und SalI gespalten und ein aus
pUG2 mit Hilfe der gleichen Restriktionsenzyme herausge
schnittenes Fragment in pUG1 eingeführt, wobei das Rekombinant-
Plasmid pUG3 mit dem β-Urogastron-Strukturgen (Gen II)
entsteht.
pUg1, pUG2 und pUG3 sind Rekombinant-Plasmide, die jeweils
pBR322 und die Untereinheit A, nämlich die vordere Hälfte
des β-Urogastron-Strukturgens, die Untereinheit B, nämlich
die hintere Hälfte des Gens, oder das gesamte Strukturgen
enthalten. Diese Rekombinant-Plasmide können in großen
Mengen durch Einführung in einen üblichen Wirt, z. B. E. coli,
wie E.-coli-Stamm HB101, der bekannt und leicht zugänglich
ist, mit Hilfe der Calciummethode als Transformationsmethode,
hergestellt werden (E. Lederberg und S. Cohen, J.
Baceriol., 119, 1072 (1974)).
Ob pUG1, pUG2 und pUG3 im Wirt, wie dem E.-coli-Stamm
HB191 vorhanden sind, kann mit Hilfe der folgenden Verfahren
geprüft werden. Nach der Gewinnung der Plasmide
nach dem Alkaliextraktionsverfahren, werden pUG1 und pUG2
auf die Anwesenheit der BglII-Erkennungsstelle, die nicht
auf dem Vektor pBR322 vorhanden ist, geprüft. In ähnlicher
Weise wird geprüft, ob pUG2 und pUG3 durch MluI, dessen Er
kennungsstelle nicht auf pBR322 vorhanden ist, gespalten werden können.
Gemäß dem Alkaliextraktionsverfahren, wird E.-coli, das
das Plasmid enthält, inkubiert. Die Zellen werden geerntet
und mit Lysozym versetzt, um die Zellwand aufzulösen. Ein Gemisch
von Natronlauge und Natriumlaurylsulfat wird zur
Zerstörung der Zellen und zur Denaturierung der DNA einge
setzt, die dann wieder mit Natriumacetatpuffer neutralisiert
wird. Die chromosomale DNA bleibt dabei denaturiert,
während das Plasmid als extrachromosomale DNA seine anfängliche
Doppelstrangform behält. Die Plasmide werden aufgrund dieser
Eigenschaften gewonnen. Die Plasmide werden zur Reinigung
einer Dichtegradienten-Ultrazentrifugation mit Cäsium
chlorid und Ethidiumbromid unterworfen und dann zur Ent
fernung der RNA über eine Biogel A 50 m Säule gegeben. So
können Plasmide mit hoher Reinheit und in großen Mengen
erhalten werden. Auf diese Weise kann auch das erfindungs
gemäße β-Urogastron-Gen (Gen II) erhalten werden.
Als nächstes wird das Verfahren zur Einführung des β-Urogastron-
Gens in die Wirtszellen beschrieben.
Es gibt für die Erfindung keine Einschränkung hinsichtlich
der zu verwendenden Wirtszellen. Jede der bekannten Wirtszellen
kann benützt werden, z. B. E. coli, Bacillus, Pseudomonas
oder Hefen. Vorzugsweise wird E. coli eingesetzt.
Zu den Möglichkeiten der Expression des β-Urogastron-Gens
mit Hilfe von E. coli gehört einmal die direkte Expression
von β-Urogastron. Ein anderes Verfahren ist die Expression
als Fusionsprotein mit β-Lactamase ooder einem anderen
Protein.
Zur direkten Expression des β-Urogastron-Gens ist es notwendig,
stromaufwärts vom β-Urogastron-Gen eine Expressions
kontroll-Sequenz, d. h. einem Promotor und eine SD-Sequenz,
in das Rekombinant-Plasmid einzuführen.
Es gibt keine Einschränkung hinsichtlich des zu verwendenden
Promotors, aber wünschenswert sind Promotoren, die eine
hohe Expressionsrate ermöglichen, wie z. B. λPL, der links
seitige Promotor des λ-Phagen, lac UV5, der sich stromaufwärts
vom β-Galactosidase-Gen von E. coli befindet.
Wenn λPL als Promotor eingesetzt wird, gibt
es keine Einschränkung für die SD-Sequenz, aber vorzugsweise
wird die Vierbasensequenz AGGA verwendet.
Wenn lac UV5 als Promotor eingesetzt wird, wird vorzugsweise
die SD-Sequenz, die stromabwärts von lac UV-Promotor
liegt, oder die chemisch synthetisierte Sequenz verwendet.
Das Verfahren zur direkten Expression des β-Urogastron-Gens
ist am Beispiel λPL-SD-Sequenz-β-Urogastron-Gen be
schrieben.
Obwohl λPL ein starker Promotor ist (J. Hedgpeth et al.,
Molecular and General Genetics, 163, 197-203 (1978)), hat
der vollständig aktivierte λPL-Promotor eine letale Wirkung
auf die Wirtszellen E. coli. Es ist deshalb notwendig, die
Zellen zunächst unter für die Zelle nicht letalen Bedingungen
zu vermehren und erst danach den λPL-Promotor wirken
zu lassen. Andererseits ist CI857, ein Gen innerhalb
des λ-Phagen, eines der mutierten Gene des CI-Repressors,
das auf den Operator für λPL einwirkt. Bei niedrigen Temperaturen
(bis zu etwa 30°C) bindet der CI857 Repressor an
den Operator und hemmt vollständig die Aktivität von λPL
als Promotor, und erlaubt damit die Vermehrung von E. coli.
Die Wirtszellen können sich daher unter diesen Bedingungen
vermehren und werden dann auf eine Temperatur von mindestens
37°C gebracht, so daß der λPL-Promotor aktiv werden kann. Dar
überhinaus sind Plasmidvektoren, wie z. B. der bekannte und
leicht zugängliche Vektor PSC101, mit strikten Replikations
mechanismen und solche, wie z. B. pBR322, mit relaxierten
Replikationsmechanismen nicht unverträglich, sondern
können nebeneinander in derselben E.-coli-Zelle vorkommen.
Es ist daher günstig, ein Rekombinant-Plasmid pGH37 herzustellen,
in dem ein CI857-Gen in einen tetracyclin-resistenten
Plasmidvektor pSC101 (mit dem stromaufwärts gelegenen lac
UV5 Promotor zur wirksamen Expression von CI857), siehe
Fig. 6, eingeführt ist. Wenn dann das Rekombinant-Plasmid
in E. coli (z. B. Stamm HB101) eingeführt wird, erhält man eine
Transformante (Stamm-ECI-2), die als Wirt für den Vektor
zur Expression von β-Urogastron unter der Kontrolle des
λPL-Promotors eingesetzt werden kann.
Gemäß der vorliegenden Erfindung wird das λPL-SD-Sequenz-
β-Urogastron-Gen z. B. in pBR322 eingeführt, wobei ein β-Urogastron-
Expressionsvektor erhalten wird, der für die Transformation
des Stammes ECI-2 verwendet wird. Man erhält dabei
ein sogenanntes Zweiplasmid-System, in dem zwei nützliche
Plasmide nebeneinander in einer E.-coli-Zelle vorliegen.
In diesem System bindet der im pGH37-Plasmid codierte CI857-Repressor
an den Operator für den λPL-Promotor auf dem zweiten Plasmid,
wenn die Zellen z. B. bei 30°C kultiviert werden und erlaubt
so die Vermehrung der Zellen. Nachdem die Zellen sich
unter diesen Bedingungen vollständig vermehrt haben, wird
die Temperatur auf z. B. 40°C erhöht. Daraufhin löst sich
der CI857-Repressor vom Operator und der λPL-Promotor kann
damit die Expression von β-Urogastron bewirken.
Für die Expression von z. B. Fibroblasten-Interferon oder
SV-40 Small t-Antigen wurde ein ähnliches Konzept verwendet.
In diesen Fällen wird aber ein λ-Lysogen als Wirt verwendet,
in dem die ein CI857 Gen tragende DNA des λ-Phagen in
das Wirtschromosom eingeführt wurde (R. Derynck et al.,
Nature, 287, 193-197 (1980), C. Derom et al., Gene, 17,
45-54 (1982), K. Küpper et al., Nature, 289, 555-559 (1981)).
Mit dem System der vorliegenden Erfindung wird jedoch das
CI857-Gen in ein unterschiedliches tetracyclin-resistentes
Plasmid eingeführt. Daher hat das vorliegende System den
Vorteil, daß keine Möglichkeit besteht, daß der λ-Phage,
der in das Wirtschromosom eingeführt wurde, in die Vermehrung
eingreift. Damit kann der Stamm leicht kontrolliert werden.
Dieses Zweiplasmid-System wird zum ersten Mal zur Expression
von β-Urogastron verwendet.
Gemäß einem anderen System wird ein Abschnitt irgendeines
anderen Protein-Gens, wie z. b. des β-Lactamase-Gens, mit
dem β-Urogastron-Gen verknüpft, um das β-Urogastron-Gen als
ein Fusionsprotein zu exprimieren. Dieses Verfahren hat
den Vorteil, daß das Fusionsprotein weniger leicht durch
die Proteasen in E. coli angegriffen werden kann und so das
β-Urogastron schützt. Ein anderer Vorteil ist, daß das
Fusionsprotein in das Periplasma der E.-coli-Zelle wandert
und sich dort anreichert (S. J. Chan et al., Proc. Natl.
Acad. Sci., USA, 78, 5401-5405 (1981)). Es ist daher
leicht abzutrennen und zu reinigen.
Im einzelnen wird eine DNA-Sequenz in das β-Lactamase-Gen
an einer zweckmäßigen Restriktions-Erkennungsstelle eingeführt,
die für zwei basische Aminosäuren codiert. Diese
beiden Aminsäuren liefern eine Schnittstelle zur Abspaltung
von β-Urogastron aus dem Fusionsprotein. Das β-Urogastron-
Gen wird ann mit dem β-Lactamase-Gen verknüpft.
Die Sequenz der zwei basischen Aminosäuren ist vorzugsweise
-Lys-Arg- oder -Arg-Lys-. Beispiele für Enzyme, die diese
Aminosäuresequenz erkennen und β-Urogastron vom Fusionsprotein
abspalten können, sind Kallikrein und Trypsin.
Restriktionsenzyme, die das β-Lactamase-Gen spalten
können, sind z. B. XmnI, HincII, ScaI, PvuI, PstI, BglI
oder BanI.
Das so hergestellte β-Lactamase-β-Urogastron-rekombinant
plasmid kann in E. coli das Fusionsprotein in größeren Mengen
exprimieren. Das erhaltene Fusionsprotein wird z. B. mit
Kallikrein behandelt, wobei man β-Urogastron erhält.
Das Expressionssystem kann direkt durch Bestimmung der Nucleotid
sequenz des Gens nach der Methode von Maxam und Gilbert geprüft
werden. Dabei wird die Insertion des Gens und seine
Richtung durch die Minipräparation oder Mapping-Methode
bestätigt (H. C. Birnboim et al., Nucleic Acids Research, 7,
1513-1523 (1979)) oder durch ein Radioimmunoassay für
β-Urogastron.
Die so erhaltene Transformante der vorliegenden Erfindung
wird nach üblichen Verfahren vermehrt, wobei große Mengen
von Urogastron mit hoher Reinheit erhalten werden
können.
Die vorliegende Erfindung wird im nachfolgenden Beispiel
ausführlich beschrieben. Dieses beschränkt aber die Erfindung
in keiner Weise.
Verschiedene Nucleosid-Trägerharze werden nach dem folgenden
Verfahren hergestellt.
1 Gewichtsprozent quer-vernetztes Polystyrolharz "S-X1"
(hergestellt von BIO.RAD Laboratories, USA; Korngröße 200
bis 400 mesh; 35-75 µm) wird mit 2,41 g N-(chlormethyl)-phthalimid,
0,22 ml Trifluormethansulfonsäure und 50 ml Dichlormethan
gemischt und 2 Stunden bei Reaktionstemperatur gerührt. Nach
Beendigung der Reaktion wird das Harz abfiltriert, nacheinander
mit Dichlormethan, Äthanol und Methanol gewaschen,
unter vermindertem Druck getrocknet und dann unter Rückfluß
über Nacht mit 50 ml einer 5 Gew.-% Lösung von Hydrazin in
Äthanol erhitzt. Das Harz wird abfiltriert,
nacheinander mit Äthanol, Dichlormethan und Methanol gewaschen
und dann unter vermindertem Druck getrocknet. Ein
Gemisch des nach dem vorstehenden Verfahren erhaltenen
aminomethylierten Polystyrolharzes (2,5 g), 0,75 mM
Bernsteinsäureester des 5′-o-Dimethoxytritylnucleosids,
1,23 mM Dicyclohexylcarbodimid und 1 mM Dimethylaminopyridin
wird nach Zusatz von 30 ml Dichlormethan über Nacht
bei Raumtemperatur stehengelassen. Das Harz wird abfiltriert,
nacheinander mit Dichlormethan, Methanol und Pyridin gewaschen,
in Pyridin-Essigsäureanhydrid (Volumenverhältnis
90 : 10) eingegeben und bei Raumtemperatur 30 Minuten
stehengelassen. Das Nucleosidträgerharz wird abfiltriert,
mit Pyridin und Dichlormethan gewaschen, unter vermindertem
Druck getrocknet und so in die Festphasensynthesereaktion
eingesetzt.
Als Beispiel wird die Synthese des vollständig geschützten
Dinucleotids mit der Basensequenz TA beschrieben. 13,14 g
Adenosin, dessen 5′-Hydroxylgruppe mit einer Dimethoxy
tritylgruppe (DMTr) und dessen Aminogruppe mit einer Benzoylgruppe
geschützt sind, sowie 6,34 g Triazol werden in wasserfreiem
Dioxan gelöst. Unter Eiskühlung werden 8,35 ml Tri
äthylamin zugegeben und dann innerhalb von 10 Minuten
6,86 g o-Chlorphenylphosphodichloridat zu dem
Gemisch zugetropft. Das erhaltene Gemisch wird 21/2 Stunden
lang bei Raumtemperatur gerührt.
Das entstandene Triäthylamin-hydrochlorid wird abfiltriert
und das Filtrat auf etwa 2/3 seines Volumens konzentriert.
Das Konzentrat wird mit 3,6 g β-Cyanoäthanol und 4,8 g
1-Methylimidazol versetzt und 3 Stunden bei Raumtemperatur
gerührt. Das Reaktionsgemisch wird unter vermindertem
Druck konzentriert. Der Rückstand wird in Äthylacetat
gelöst, dreimal mit 0,1 M wäßriger Lösung von zweibasischem
Natriumphosphat und zweimal mit Wasser gewaschen und dann
unter vermindertem Druck konzentriert. Es werden 19,96 g
des Rohprodukts erhalten. Das Produkt wird durch Chromatographie
an einer Kieselgel-Säule unter Verwendung von Chloroform-
Methanol (Volumenverhältnis 98 : 2) als Elutionsmittel
gereinigt. Das Reinigungsverfahren wird wiederholt.
Es werden 15,12 g des vollständig geschützten Adenosin
mononucleotids erhalten.
7,81 g des erhaltenen Adenosinmononucleotids werden zu
einer Lösung (2 Gewichtsprozent) von Benzolsulfonsäure in
chloroform-Methanol (Volumenverhältnis 70 : 30) gegeben und
das Gemisch wird unter Eiskühlung 20 Minuten gerührt. Dann
wird mit einer wäßrigen Lösung von Natriumhydrogencarbonat
neutralisiert. Die abgetrennte Chloroformschicht wird mit
Wasser gewaschen und unter vermindertem Druck konzentriert.
Es werden 7,11 g des Rohprodukts erhalten. Das Produkt wird
auf eine Kieselgelsäule gegeben und mit Chloroform-Methanol
(Volumenverhältnis 97 : 3) eluiert. Es werden 4,3 g Adenosin
mononucleotid mit einer freien 5′-Hydroxylgruppe er
halten.
1,64 g Thymidin, dessen 5′-Hydroxylgruppe mit einer Dimeth
oxytritylgruppe geschützt ist, und 0,95 g Triazol werden in
21 ml wasserfreiem Dioxan gelöst und mit 1,25 ml Triäthylamin
versetzt. 0,69 ml o-Chlorphenylphosphodichloridat werden
innerhalb von 5 Minuten unter Rühren und Eiskühlung tropfenweise
dem Gemisch zugesetzt. Das Gemisch wird dann 1 Stunde
bei Raumtemperatur gerührt. Das entstandene Triäthylamin-
hydrochlorid wird abfiltriert und das Filtrat 10 Minuten
mit 1,1 ml einer 1 M wäßrigen Lösung von Pyridin
gerührt. 1,17 g Adenosinmononucleotid mit einer freien
5′-Hydroxylgruppe, das wie vorstehend beschrieben hergestellt
war, werden in 10 ml Dioxan gelöst und zur obigen
Lösung zugegeben. Danach werden 0,72 ml 1-Methylimidazol
zugesetzt und das Gemisch wird bei Raumtemperatur 3 Stunden gerührt.
Das erhaltene Reaktionsgemisch wird unter vermindertem
Druck konzentriert, der Rückstand in Äthylacetat gelöst
und die Lösung mit einer wäßrigen Lösung von 0,1 M
zweibasischem Natriumphosphat und dann mit Wasser gewaschen.
Nach dem Konzentrieren unter vermindertem Druck erhält
man 2,39 g des Rohprodukts. Das Produkt wird auf eine
Kieselgelsäule gegeben und mit Chloroform-Methanol (Volumen
verhältnis 98 : 2) eluiert. Es werden 2,39 g des vollständig
geschützten Dinucleotids TA erhalten.
Nach dem gleichen Verfahren werden verschiedene andere
Nucleotide hergestellt.
Es wird hier die Festphasensynthese des Oligonucleotids
A-1, d. h. des Undecanucleotids AATTCGAAGAT beschrieben.
40 mg Harz, an das das Nucleosid T angehängt ist, und das
nach dem vorstehend beschriebenen Verfahren 1 hergestellt
wurde, werden in ein Reaktionsgefäß gegeben, dreimal mit
Dichlormethan-Isopropanol (Volumenverhältnis 85 : 15) gewaschen
und dann mit einer Lösung von 1 M Zinkbromid in
Dichlormethan-Isopropanol zur Entfernung der Dimethoxy
tritylgruppe in der 5′-Stellung behandelt. Dieses Verfahren
wird mehrmals wiederholt, bis die Lösung farblos
ist. Das Harz wird mit Dichlormethan und dann zur Entfernung
der verbliebenen Zinkionen mit einer Lösung von 0,5 M Tri
äthylammoniumacetat in Dimethylformamid gewaschen. Nach
weiterem Waschen mit Tetrahydrofuran wird es getrocknet,
indem mehrere Minuten Stickstoff durch das Reaktionsgefäß
geleitet wird.
50 mg des vollständig geschützten Dinucleotids GA, das nach
dem vorstehend beschriebenen Verfahren 2 hergestellt wurde,
werden in 1 ml Pyridin gelöst, mit 1 ml Triäthylamin geschüttelt
und dann einige Stunden bei Raumtemperatur stehen
gelassen. Anschließend wird die Lösung unter vermindertem
Druck eingedampft. Der Rückstand wird mehrmals mit
Pyridin azeotrop eingedampft, um das Triäthylammoniumsalz
des Nucleotids zu erhalten. Das Salz wird in 0,3 ml einer
0,3 M Lösung von Mesitylen-sulfonyl-5-nitrotriazol in Pyridin
gelöst. In diese Lösung wird das getrocknete Harz
eingerührt und nach einer Umsetzungszeit von 60 Minuten
bei Raumtemperatur der Überstand vom Reaktionsgemisch
abfiltriert. Die feste Phase wird mit Pyridin gewaschen
und dann 5 Minuten in einem Gemisch von 0,2 ml Essigsäureanhydrid
und 0,8 ml einer 0,1 M Lösung von Dimethylaminopyridin in
Tetrahydrofuran-Pyridin zur Maskierung der nicht umgesetzten
Hydroxylgruppe stehengelassen. Schließlich wird das
Harz mit Pyridin gewaschen, womit ein Cyclus der Festphasen
synthese vollendet ist. Ein Cyclus verlängert die
Nucleotidkette um zwei Basenlängen. Das gleiche Verfahren,
wie es vorstehend beschrieben wurde, wird wiederholt, um nach
und nach die Dinucleotide AA, CG, TT und AA durch
Kondensation an das entstandene Nucleotid anzuknüpfen.
Man erhält schließlich, gebunden an das Harz, das vollständig
geschützte Undecanucleotid AATTCGAAGAT.
20 mg des erhaltenen Harzes werden 1 Stunde bei 40°C
mit 0,6 ml einer 0,5 M Lösung von Tetramethylguanidin-2-
pyridinaldoximat in Pyridin-Wasser (Volumenverhältnis 90 : 10)
stehengelassen. Das Harz wird dann mit Hilfe einer mit
Watte gestopften Pasteur-Pipette abfiltriert und ab
wechselnd mit Pyridin und Äthanol gewaschen. Die Waschlösung
und das Filtrat werden vereinigt und bei 40°C
unter vermindertem Druck konzentriert. Der Rückstand wird
in 2 ml einer wäßrigen Lösung von Triäthylammoniumbicarbonat
(TEAB, 10 mM) gelöst und dreimal mit Äther gewaschen.
Die wäßrige Phase wird auf eine Sephadex G50-Säule
2×100 cm) gegeben und mit 10 mM TEAB eluiert. Die Ab
sorption der Fraktionen bei 260 nm wird gemessen und die Fraktion,
die das erste Elutionsmaximum enthält, wird konzentriert.
Der Rückstand wird durch Hochgeschwindigkeits
flüssigkeitschromatographie (Pumpe: Modell 6000A,
Detektor: Modell 440, Hersteller: Waters Associates, USA)
gereinigt, bis eine Fraktion mit einem einzigen Maximum erhalten wird.
Als Säule für die Hochgeschwindigkeitsflüssigkeits
chromatographie wird eine µ-Bondapak-C₁₈-Säule (Hersteller:
Waters Associates, USA) und als Elutionsmittel für
die Gradientenelution (5→40 Volumenprozent) eine 0,1 M
wäßrige Lösung von Triäthylammoniumacetat in Acetonitril
verwendet. Das 5′-Ende des soweit gereinigten Undeca
nucleotids ist noch mit einer Dimethoxytritylgruppe ge
schützt. Zur Entfernung der Dimethoxytritylgruppe wird
die Verbindung 15 Minuten mit einer wäßrigen
Lösung von Essigsäure (80 Volumenprozent) behandelt und
dann wieder durch Hochgeschwindigkeitsflüssigkeitschromato
graphie gereinigt, bis ein einzelnes Maximum erhalten wird.
Es wird die gleiche Säule, wie sie vorstehend beschrieben
ist, benutzt und für die Gradientenelution (5→25 Volumen
prozent) wird eine 0,1 M wäßrige Lösung von Triäthyl
ammoniumacetat in Acetonitril eingesetzt.
In der gleichen, vorstehend beschriebenen, Weise werden
die Oligonucleotide A-2 bis A-16 und B-1 bis B-16 synthe
tisiert.
Tabelle I zeigt die Ausbeute der einzelnen Oligonucleotide.
Sie wird bestimmt, indem von 20 mg des nach der Fest
phasensynthese erhaltenen Harzes das Oligonucleotid ab
getrennt, die Schutzgruppe entfernt und das Oligonucleotid
gereinigt wird.
Die Ausbeute wird mit Hilfe der Absorptionsmessung des
Endproduktes bei 260 nm aus der Summe der Absorptionswerte
der Nucleotidbasen berechnet.
Die Sequenz wird gemäß der vorstehend beschriebenen zwei
dimensionalen Fraktionierung durch Elektrophorese und
Homochromatographie nach Wu et al. geprüft.
Die Oligonucleotide A-1 bis A-16 und B-1 bis B-16 haben
alle die erwartete Nucleotidsequenz. Fig. 5 zeigt das
Analysenergebnis von Oligonucleotid A-3. A-3 hat danach die
vom 5′-Ende her gelesene Sequenz GATTCTGAGTG.
Die Nucleotidsequenz aller Oligonucleotide wird auch nach
der Methode von Maxam und Gilbert geprüft. Auch damit
werden die erwarteten Nucleotidsequenzen von
A-1 bis A-16 und B-1 bis B-16 bestätigt.
Die Blöcke und Untereinheiten werden nach dem in Fig. 2
gezeigten, nachstehend genau beschriebenen, Verfahren
hergestellt.
Zunächst werden jeweils etwa 5 µg der Oligonucleotide A-1,
A-2, A-3, A-14, A-15 und A-16 in 50µl destilliertem Wasser
gelöst, so daß die Lösung eine Konzentration von
etwa 0,1 µg/µl hat. Jeweils 10 µl (1 µg, berechnet als DNA)
dieser sechs verschiedenen wäßrigen Lösungen werden einzeln
in sechs Eppendorf-Gefäße gegeben. 6 µl eines Gemischs aus
250 mM Tris-HCl (pH 7,6), 50 mM Magnesiumchlorid, 10 mM
Spermin und 50 mM DTT werden in jedes Gefäß gegeben, außerdem
noch 0,5 µl einer wäßrigen Lösung von γ-³²P-ATP,
0,5 µl T₄-Polynucleotidkinase
und 13 µl destilliertes Wasser. Das End
volumen beträgt damit 30 µl. Das Gemisch wird 30 Minuten
bei 37°C und nach Zugabe von 1 µl einer wäßrigen Lösung von
30 mM ATP weitere 30 Minuten umgesetzt. Die Reaktion wird
durch 2minütiges Kochen bei 100°C beendet und das Reaktionsgemisch
schnell mit Eis gekühlt. Jeweils 10 µl der Oligonucleotide
A-1, A-2, A-3, A-14, A-15 und A-16, deren 5′-
Ende nun phosphoryliert ist, werden in neue 1,5 ml
Eppendorf-Gefäße gegeben. Jedes Gefäß wird mit 40 µl einer
wäßrigen Lösung von 250 mM Tris-HCl (pH 7,6), 40 µl 50 mM Magnesium
chlorid und 35 µl destilliertem Wasser versetzt, so
daß das Gesamtvolumen 175 µl beträgt. Das Gemisch wird
2 Minuten auf 90°C erhitzt und dann langsam auf Raumtemperatur
abgekühlt. Nach Zugabe von 10 µl einer wäßrigen Lösung von 20 mM ATP
und 5 µl (100 Einheiten) T₄-DNA-Ligase,
wird das Gemisch über Nacht
bei 4°C umgesetzt. Dabei entsteht Block 1, verknüpft aus
den Oligonucleotiden A-1, A-2, A-3, A-15 und A-16.
Die Blöcke 2 und 3 werden in ähnlicher Weise durch die Ver
knüpfung von A-4, A-5, A-6, A-11, A-12 und A-13 und durch
die Verknüpfung von A-7, A-8, A-9 und A-10 hergestellt.
Zu dem so hergestellten Reaktionsgemisch der Blöcke wird das zweifache
Volumen Äthanol zugesetzt und das Gemisch wird 30 Minuten
zur Ausfällung der DNA bei -80°C stehengelassen. Anschließend
werden eine Elektrophorese auf einem 12,5-gewichtsprozentigen
Polyacrylamidgel und eine Autoradiographie durchgeführt.
Es werden für den Block 1 Banden in den Positionen
72 Bp (Basenpaar) und 36 Bp, für den Block 2 eine Bande
in der Position 36 Bp und für den Block 3 Banden in
den Positionen 48 Bp und 24 Bp erhalten. Anschließend
wird jede Bande ausgeschnitten und in ein Gemisch aus 10 mM
Tris-HCl (pH 7,6) und eine wäßrige Lösung von 10 mM EDTA
(Tris-EDTA) gegeben. Das Gemisch wird zur Extraktion über
Nacht bei Raumtemperatur stehengelassen. Es wird sodann
zentrifugiert und der Überstand abgetrennt. Dieser wird
kräftig mit Phenol, gesättigt mit Tris-EDTA, geschüttelt
und dann zur Entfernung der unteren Schicht zentrifugiert.
Das gleiche Verfahren wird zweimal mit dem mit Tris-EDTA ge
sättigten Phenol wiederholt. Schließlich wird die obere
Schicht über eine Säule (1×20 cm) von Sephadex G-50 gegeben,
um das Phenol und Acrylamid zu entfernen. Das Eluat
wird dann auf 200 µl konzentriert und nach Zugabe des zweifachen
Volumens Äthanol zur Ausfällung der DNA 30 Minuten
bei -80°C stehengelassen.
Die drei Blöcke werden zusammengegeben und mit 50 mM Tris-HCl
(pH 7,6), 10 mM Magnesiumchlorid, 20 mM DTT, 1 mM ATP und
5 µl (100 Einheiten) T₄-DNA-Ligase versetzt. Das Gemisch
wird zur Verknüpfung über Nacht bei 4°C stehengelassen. An
schließend wird das 2fache Volumen Methanol zugesetzt und
das Gemisch zur Ausfällung der DNA 30 Minuten bei -80°C
stehengelassen. Es folgt eine Elektrophorese in einem
8gewichtsprozentigen Polyacrylamidgel und eine Autoradiographie,
wobei Banden bei 96 Bp und 192 Bp erhalten werden. Alle
Banden werden ausgeschnitten, in Tris-EDTA gegeben und
das Gemisch wird über Nacht bei Raumtemperatur zur Extraktion
stehengelassen. Das Gemisch wird dann zur Abtrennung des
Überstands zentrifugiert, und der Überstand kräftig mit
Tris-EDTA und gesättigtem Phenol geschüttelt. Die untere
Schicht wird verworfen. Das Ganze wird zweimal mit Tris-
EDTA gesättigtem Phenol wiederholt. Die obere Schicht wird
über eine Sephadex G-50-Säule gegeben. Das Eluat wird
konzentriert. Zum Konzentrat wird das zweifache Volumen
Äthanol gegeben und das Gemisch bei -80°C 30 Minuten zur
Ausfällung der DNA stehengelassen. Die Spaltung des Pro
dukts mit EcoRI und BamHI ergibt die Untereinheit A.
Wie in Fig. 3 gezeigt, wird das gleiche Verfahren zur
Verknüpfung der Oligonucleotide B-1, B-2, B-15 und B-16 zu
Block 4, von B-3, B-4, B-13 und B-14 zu Block 5, von B-5,
B-6, B-11 und B-12 zu Block 6 und von B-7, B-8, B-9 und
B-10 zu Block 7 wiederholt. Die erhaltenen Blöcke von
26 Bp und 52 Bp werden in ähnlicher Weise zu Blöcken
von 104 Bp und 208 Bp verknüpft. Durch Spaltung mit
HindIII und BamHI wird die Untereinheit B erhalten.
Wie in Fig. 2 gezeigt, wird das Plasmid pBR322 mit
EcoRI und BamHI gespalten und die Phosphatgruppen werden
mit alkalischer Phosphatase
von den 5′-Enden abgespalten, um den Aus
gangszustand nicht wieder herzustellen. Das gespaltene und
dephosphorylierte pBR322-Plasmid und die Untereinheit A
werden über Nacht bei 4°C in einem Gemisch von 50 mM Tris-HCl
(pH 7,6), 10 mM Magnesiumchlorid, 20 mM DTT und 1 mM ATP
unter Zusatz von 5 µl T₄-DNA-Ligase stehengelassen. Dabei
erfolgt die Verknüpfung. Das zweifache Volumen Äthanol wird
zu dem Gemisch zugesetzt und das Ganze 30 Minuten bei -80°C
zur Ausfällung der DNA stehengelassen. Das Gemisch wird
dann zentrifugiert, der Niederschlag getrocknet und in
100 µl destilliertem Wasser aufgenommen. Man erhält so das
Plasmid pUG1, in dem die Untereinheit A in pBR322 einge
führt ist.
Der E.-coli-Stamm HB101 wird mit Hilfe der Calciummethode
mit dem Plasmid pUG1 transformiert.
Der als Wirt dienende Stamm HB101 wird bei 37°C in 50 ml
LB-Kulturmedium (1 Gewichtsprozent Bactotrypton, 0,5 Ge
wichtsprozent Hefeextrakt und 0,5 Gewichtsprozent
Natriumchlorid) kultiviert. Wenn die Absorption bei 610 nm
den Wert 0,25 erreicht, werden 40 ml der Kulturflüssigkeit in einen
Zentrifugenbecher gegeben und bei 6000 UpM · 10 Minuten
bei 0°C zentrifugiert. Der Überstand wird verworfen, der
Niederschlag in 20 ml eiskalter 0,1 M Magnesiumchloridlösung
suspendiert und die Suspension unter den gleichen Bedingungen
noch einmal zentrifugiert. Der Überstand wird verworfen.
Der Niederschlag wird in 20 ml einer eiskalten
Lösung von 0,1 M Calciumchlorid und 0,05 M Magnesiumchlorid
suspendiert und 1 Stunde in Eis gekühlt. Die Suspension
wird zentrifugiert, der Überstand verworfen und der Niederschlag
in 2 ml einer eiskalten Lösung von 0,1 M Calciumchlorid
und 0,05 M Magnesiumchlorid suspendiert. Zu 200 µl
der Suspension werden 10 µl einer wäßrigen Lösung von
pUG1 zugegeben. Das Gemisch wird 1 Stunde in Eis gekühlt und
dann in einem Wasserbad 30 Sekunden auf 43,5°C erwärmt.
Dann werden 2,8 ml LB-Kulturmedium zum Gemisch zugegeben
und es wird 1 Stunde bei 37°C inkubiert. Die Kultur wird dann in
einer Menge von 200 µl pro Platte auf eine LB-Platte mit
50µg/ml Ampicillin ausgestrichen und über Nacht bei 37°C inkubiert.
Die wachsenden Kolonien werden geprüft, indem sie
auf eine LB-Platte mit 50 µl/ml Ampicillin und auf eine
LB-Platte mit 20 µl/ml Tetracyclin überimpft und über
Nacht bei 37°C inkubiert werden. Nur die gegen Ampicillin
resistenten Kolonien werden zur Gewinnung der transformierten
Zellen abgetrennt.
Plasmide werden in geringer Menge mit Hilfe der alkalischen
Extraktionsmethode aus den Zellen gewonnen und auf
die Anwesenheit einer BglII-Schnittstelle geprüft. Eine der
Zellen, die das Plasmid mit der BglII-Schnittstelle enthält,
wird in großem Maßstab kultiviert und das Plasmid
pUG1 in ähnlicher Weise mit Hilfe der alkalischen Extraktions
methode gewonnen.
Die Nucleotidsequenz der in das pUG1-Plasmid eingeführten
Untereinheit A wird in beiden Strängen nach der Methode von
Maxam und Gilbert bestimmt.
Fig. 19 und 20 zeigen die Analysenergebnisse. Die
Spalten 1 bis 4 sind das Ergebnis der Elektrophorese des
EcoRI-SalI-Fragments, die Spalten 5 bis 8 das des BamHI-
PstI-Fragments. Die Spalten 1 und 5 zeigen die Reaktions
produkte für Guanin, die Spalten 2 und 6 die Reaktionsprodukte
für Guanin und Adenin, die Spalten 3 und 7 zeigen
die Reaktionsprodukte für Thymin und Cytosin und die
Spalten 4 und 8 zeigen die Reaktionsprodukte für Cytosin.
Fig. 20 gibt die Ergebnisse wieder, die mit denselben Proben,
wie vorstehend erhalten werden, wobei ein Gebiet
höheren Molekulargewichts (entsprechend des oberen Teils
von Fig. 19) vergrößert ist. Damit ist die Nucleotid
sequenz der Untereinheit A bestätigt.
Wie in Fig. 3 gezeigt, wird das Plasmid pBR322 mit
HindIII und BamHI gespalten, das größere Fragment durch
Elektrophorese isoliert und mit der Untereinheit B verknüpft.
Damit wird das Plasmid pUG2, in dem die Unter
einheit B in pBR322 eingeführt ist, in ähnlicher Weise wie
pUG1 erhalten. Mit dem Plasmid pUG2 wird der Stamm HB101
transformiert und nur die gegen Ampicillin resistenten
Kolonien werden selektiert.
Plasmide werden von den Kolonien gewonnen und auf die An
wesenheit einer BglII-Schnittstelle und einer MluI-Schnittstelle
geprüft. Die Zellen, die das Plasmid mit beiden
Schnittstellen enthalten, werden selektiert. Eine der selektierten
Zellen wird in großem Maßstab kultiviert und so das gereinigte
Plasmid pUG2 erhalten. Die Nucleotidsequenz der in
pUG2 eingeführten Untereinheit B wird auf beiden Strängen
nach der Maxam-Gilbert-Methode geprüft.
Fig. 21 zeigt die Analysenergebnisse. Die Spalten 1 bis 4
zeigen das Ergebnis, das mit dem HindIII-SalI-Fragment erhalten
wird. Die Spalten 5 bis 8 zeigen das mit den gleichen
Proben erhaltene Ergebnis, wobei ein Gebiet höheren
Molekulargewichts (entsprechend des oberen Teils der
Spalten 1 bis 4) in einem vergrößerten Maßstab gezeigt
wird. Jede Spalte zeigt das in Fig. 19 entsprechende Reaktions
produkt. Damit wird die Nucleotidsequenz der Unterein
heit B bestätigt.
Wie in Fig. 4 gezeigt, wird pUG1 mit HindIII und SalI gespalten
und das größere Fragment über eine Biogel 1,5 m
Säule abgetrennt. pUG2 wird mit HindIII und SalI gespalten
und das kleinere Fragment durch Elektrophorese gewonnen.
Die zwei Fragmente werden zusammengegeben und zur Verknüpfung
mit T₄-DNA-Ligase behandelt. Dabei erhält man das
Plasmid pUG3, in das die Untereinheiten A und B, also das
β-Urogastron-Gen, in pBR322 eingeführt sind. Der E.-coli-Stamm
HB101 wird mit dem Plasmid pUG3 transformiert. Die Transformante
ist nach dem Budapester Vertrag über die internationale
Anerkennung der Hinterlegung im Fermentation Research
Institute, Agency of Industrial Science and Technology,
Ministry of International Trade and Industry, Japan, am
22. Juni 1984 mit der Hinterlegungs-Nr. FERM BP-543
hinterlegt worden.
Auch in diesem Fall werden die Zellen, die das nur gegen
Ampicillin resistente und eine MluI-Spaltstelle besitzende
Plasmid pUG3 enthalten, selektiert. Eine der selektierten
Zellen wird in großem Maßstab kultiviert und so das gereinigte
Plasmid pUG3 erhalten. Die Nucleotidsequenz des
β-Urogastron-Gens in pUG3 wird auf beiden Strängen nach der
Maxam-Gilbert-Methode bestimmt.
Fig. 22 zeigt die Analysenergebnisse. Die Spalten 1 bis 4
zeigen das Ergebnis, das mit dem BamHI-PstI-Fragment erhalten
wurde. Die Spalten 5 bis 8 zeigen das mit den gleichen
Proben erhaltene Ergebnis, wobei ein Gebiet
höheren Molekulargewichts (entsprechend des oberen Teils
der Spalten 1 bis 4) in einem vergrößerten Maßstab gezeigt
ist. Die Reaktionsprodukte der einzelnen Spalten entsprechen
den Reaktionsprodukten von Fig. 19. Die Analyse bestätigt
die Nucleotidsequenz des β-Urogastron-Gens.
Der λPL-Promotor, linksseitiger Promotor des λ-Phagens,
wird zur Expression von β-Urogastron verwendet, was nachstehend
ausführlich beschrieben ist.
Zunächst wird die Herstellung des Stammes ECI-2 aus dem
E.-coli-Stamm HB101 beschrieben. ECI-2 dient als Wirt für
λPL-Expressionsplasmide. Als nächstes wird die Clonierung
eines DNA-Fragments mit dem λPL-Promotor aus der DNA des
λCI857S₇, einer Mutante des λ-Phagens, und der Aufbau der
Expressionsplasmide aus der clonierten DNA gezeigt.
Schließlich wird die Expression des β-Urogastron-Gens im
Wirtsstamm ECI-2 durch den λPL-Promotor beschrieben.
Der Stamm ECI-2 ist der E.-coli-HB101-Stamm mit dem Plasmid
pGH37 zur Expression des CI857-Gens.
pGH37 wird nach dem in Fig. 6 gezeigten Verfahren hergestellt.
Zunächst wird die DNA von λCI857S₇ mit BglII geschnitten,
und dann werden die überstehenden Enden der Spaltstelle mit
S1-Nuclease verdaut. 1 µg der mit BglII gespaltenen
DNA von λCI857S₇ wird mit 200 Einheiten SI-Nuclease 30 Minuten
bei 20°C in 100 µl einer wäßrigen Lösung (ph 4,5)
aus 200 mM Natriumchlorid, 30 mM Natriumacetat und 5 mM
Zinksulfat umgesetzt. Die so erhaltenen DNA-Fragmente haben
glatte Enden und werden auf einem 1gew.-%igen Agarosegel
elektrophoretisch aufgetrennt. Es wird ein Fragment aus
2385 Bp mit dem gesamten CI857-Strukturgen erhalten.
Das Fragment wird in die PvuII-Schnittstelle des Plasmids
pGL101 eingeführt, so daß das Plasmid pGH36 entsteht, das
das CI857-Gen unter der Kontrolle eines Promotors, lac UV5,
exprimiert. Anschließend wird pGH36 mit zwei Restriktionsenzymen,
EcoRI und PstI, geschnitten, so daß ein Fragment mit
1193 Bp erhalten wird, das in das Plasmid pSC101 zwischen
den EcoRI- und PstI-Schnittstellen eingeführt wird. Man erhält
so das Plasmid pGH37.
Anschließend wird der E.-coli-Stamm HB101 nach der vorstehend
beschriebenen Calciummethode mit pGH37 transformiert.
Einer der erhaltenen Stämme wird mit ECI-2 bezeichnet.
Der Stamm ECI-2 ist nach dem Budapester Vertrag über
die internationale Anerkennung der Hinterlegung im Fermentation
Research Institute, Agency of Industrial Science and Technology,
Ministry of International Trade and Industry, Japan, am 22. Juni 1984
mit der Hinterlegungs-Nummer FERM BP-542 hinterlegt worden. Dieser
Stamm ist tetracyclin-
resistent, exprimiert das CI857-Gen und erlaubt
durch Transformation das gleichzeitige Vorhandensein
anderer, z. B. von pBR322 abstammender, Plasmide. Demgemäß
wird der Stamm ECI-2 als Wirt für λPL-Expressionsplasmide
verwendet.
Wie in Fig. 7 gezeigt, wird als erstes pGH35 hergestellt.
Die DNA von λCI857S₇ wird mit EcoRI und SalI geschnitten,
wobei ein Fragment von 5925 Bp erhalten wird,
auf dem sich der λPL-Promotor und das CI857-Gen, wie auch
der λPR-Promotor, befinden. Das Fragment wird in das
Plasmid pBR322 zwischen den EcoRI- und SalI-Schnittstellen
eingeführt, wobei das Plasmid pGH25 entsteht.
Als nächstes wird pGH25 mit BamHI geschnitten und mit dem
ebenfalls mit BamHI geschnittenen pBR322-Plasmid verknüpft,
wobei das Plasmid pGH34 entsteht.
Anschließend wird pGH34 mit AvaI und BglII geschnitten und
dann mit S1-Nuclease behandelt, wobei ein Fragment mit
glatten Enden von etwa 4500 Bp entsteht. Das Fragment wird
mit T₄-DNA-Ligase zum Ring geschlosseen, so daß das Plasmid
pGH35 erhalten wird.
Als nächstes wird, wie in Fig. 8 gezeigt, das Plasmid
pEK28 konstruiert. Die synthetischen Oligonucleotide C-1-1
und C-1-2 dienen als Adapter, die eine SD-Sequenz besitzen
und die nachstehend gezeigte Nucleotid-Sequenz haben. Sie werden
mit dem Fragment, das durch Schneiden von pGH35 mit
HpaI erhalten wird, verknüpft. Dieser Bausatz wird weiter
mit dem mit BamHI geschnittenen Plasmid pMC1403 verknüpft,
wobei das Plasmid pEG2 erhalten wird. Das pEG2-Plasmid hat
zwei für Ampicillin-Resistenz codierende Gene und exprimiert das von
pMC1403 stammende β-Galactosidase-Gen unter der Kontrolle
des λPL-Promotors. Es benutzt sowohl das Startcoden als
auch die SD-Sequenz auf dem Adapter.
Die Frequenz C-1-1 und C-1-2 haben die folgende Nucleotid-
Sequenz:
Die Methode von Miller wird zur Feststellung der β-Galactosidase-
Expression in dem das Plasmid pEG2 enthaltenden Wert
ECI-2 eingesetzt (Miller, J. [1972], "Experiments in Molecular
Genetics", New York, Cold Spring Harbor Laboratory,
Seiten 352-355). Die Methode beruht auf der Umsetzung von
β-Galactosidase mit dem synthetischen Substrat ONPG
(o-Nitrophenylgalactosid), wobei die gelbe Verbindung
o-Nitrophenol freigesetzt wird. Die Methode von Miller
wird hier ausführlich beschrieben. 0,1 ml Kulturlösung
einer Bakterienprobe, deren Absorption bei 610 nm gemessen
wurde, wird mit 1,9 ml Testpuffer (0,1 M Natriumphosphat,
pH 7,0, 1 mM Magnesiumsulfat und 0,1 M β-Mercaptoäthanol
gemischt und 15 Sekunden kräftig mit 0,1 ml Toluol geschüttelt,
um die Permeabilität der Bakterienprobe zu erhöhen.
Das Toluol wird dann mit einer Saugvorrichtung abgezogen.
Nach Zugabe von 0,2 ml ONPG-Lösung (400 mg ONPG, gelöst
in 100 ml Testpuffer) wird das Gemisch bei 30°C inkubiert,
bis eine Gelbfärbung auftritt. Dann wird die Enzymreaktion
durch Zugabe von 0,5 ml 1-M-Natriumcarbonat gestoppt.
Die Absorption des Reaktionsgemisches wird bei 420
und 550 nm gemessen.
Die Aktivität der β-Galactosidase wird durch die Einheiten in
1 ml der Kulturflüssigkeit gemäß der folgenden Gleichung
definiert, in der die Absorption bei 610 nm als 1,0 gerechnet
wird.
t: Inkubationszeit (Minuten),
v: Menge der zum Reaktionssystem zugesetzten Bakterienprobe (0,1 ml),
OD₆₁₀: Absorption der Bakterienprobe bei 610 nm.
v: Menge der zum Reaktionssystem zugesetzten Bakterienprobe (0,1 ml),
OD₆₁₀: Absorption der Bakterienprobe bei 610 nm.
Bei Durchführung der vorstehend beschriebenen Methode erhält man die
folgenden Ergebnisse. Wenn der das Plasmid pEG2 enthaltende
ECI-2-Stamm bei 30°C inkubiert wird, erhält man
eine β-Galactosidaseaktivität von 98 Einheiten. Wenn jedoch
die Kultur noch eine weitere Stunde bei 42°C inkubiert
wird, wird der λPL-Promotor aktiviert, und man erhält eine
β-Galactosidaseaktivität von 9637 Einheiten. Dies bestätigt,
daß die Sequenz von λPL-Promotor zur β-Galactosidase
in der gewünschten Reihenfolge angeordnet ist.
Obwohl das Plasmid pEG2 zwei BglII-Schnittstellen hat,
ist nur die unmittelbar hinter der SD-Sequenz von β-Galactosidase
gelegene BglII-Schnittstelle notwendig, die andere
Stelle ist dagegen unerwünscht. Demgemäß wird das Plasmid
mit BamHI geschnitten und wieder verknüpft unter Entfernung
eines Fragments von etwa 770 Bp. Die Konstruktion
von pEK28, ein Expressionsplasmid mit dem
λPL-Promotor, ist damit vollständig.
Fig. 9 zeigt schematisch die Abfolge der Reaktion, die
nachstehend beschrieben wird.
Das Plasmid pUG101, das ein fusioniertes Gen aus der vorderen
Hälfte des β-Urogastron-Gens und des Gens der β-Galactosidase besitzt,
wird in folgender Weise konstruiert. Im einzelnen
werden pUG1, welches die vordere Hälfte des β-Urogastron-
Gens enthält, und pMC1403, das das β-Galactosidase-Gen enthält,
mit BamHI geschnitten und dann zum Plasmid pUG101 verknüpft.
In diesem Plasmid sind die vordere Hälfte des
β-Urogastron-Gens und das β-Galactosidase-Gen in gleichen Ableserahmen
verknüpft. Demgemäß exprimiert das Plasmid die
Aminosäuresequenz der zwei Gene als Fusionsprotein.
Zur Expression mit diesem Plasmid unter der Kontrolle des
λPL-Promotors werden die Plasmide pUG101 und pEK28 jeweils
mit BglII geschnitten.
Das Schneiden mit BglII ergibt ein DNA-Fragment mit überstehenden
5′-Enden in der Form von
Wenn
jedoch das DNA-Fragment mit einem großen Fragment der
E.-coli-DNA-Polymerase I (Klenow-Fragment), in Anwesenheit
der vier Desoxyribonucleotid-triphosphate dGTP, dATP,
dTTP und dCTP umgesetzt wird, erhält man ein glattes Ende,
in dem mit den entsprechenden Nucleotiden aufgefüllt wurde.
Die Enden lauten dann
Wenn nur dGTP als
Nucleotid zugesetzt wird, erhält man aufgrund der begrenzten
Reaktionsmöglichkeiten die Enden
Wenn S1-Nuclease zur Verdauung des verbleibenden Einzelstrangs
eingesetzt wird, erhält man ein glattes Ende in
der Form von
Ebenso erhält man, wenn dGTP und
dATP in der Klenow-Reaktion zugesetzt werden und anschließend
eine Verdauung mit S1-Nuclease durchgeführt wird,
die Enden
Wenn die Klenow-Reaktion durch Zufügung
von dGTP, dATP und dTTP, gefolgt von einer Verdauung
von S1-Nuclease, ausgeführt wird, erhält man
Wenn dagegen nur eine Verdauung mit S1-Nuclease
ohne Klenow-Reaktion erfolgt, erhält man
Wenn also ein DNA-Fragment mit den Enden
der Klenow-Reaktion unter Verwendung verschiedener
Nucleotide und/oder einer S1-Nuclease-Verdauung
unterworfen wird, so werden fünf verschiedene Arten von glatten
Enden erhalten, die sich um eine Basenpaarlänge unterscheiden.
Die Klenow-Reaktion und die S1-Nuclease-Reaktion werden
folgendermaßen durchgeführt.
1 µg Substrat-DNA wird mit jeweils 1 mM Desoxyribonucleotid-
triphosphat 30 Minuten bei 12°C in Gegenwart von
einer Enzymeinheit (Klenow-Fragment) und 1 mM ATP in 50 µl
Reaktionsmedium umgesetzt. Das Reaktionsmedium besteht aus
40 mM Natriumphosphatpuffer (pH 7,4), 1 mM β-Mercaptoäthanol
und 10 mM Magnesiumchlorid.
1 µg DNA-Substrat und 200 Enzymeinheiten werden 30 Minuten
bei 20°C in 100 µl Reaktionsmedium umgesetzt.
Das Reaktionsmedium besteht aus 200 mM Natriumchlorid,
30 mM Natriumacetat und 5 mM Zinksulfat (pH 4,5).
pEK28 und pUG101 werden jeweils mit BglII geschnitten
und dann verschiedenen Kombinationen der Klenow-Reaktion
und der S1-Nuclease-Reaktion unterworfen, so daß
Fragmente mit fünf verschiedenen Arten von glatten Enden
entstehen. Die zwei Fragmentarten ergeben, wenn man sie
kombiniert, 21 Kombinationen, die sich voneinander in der
Zahl und der Sequenz der Nucleotide zwischen der SD-Sequenz
und dem Startcodon des Fusionsproteins unterscheiden.
Sie sind in Tabelle II aufgelistet.
Die so erhaltenen DNA-Fragmente werden mit SalI geschnitten,
wobei aus pUG101 Fragmente entstehen, die das für das
Fusionsprotein aus der vorderen Hälfte des β-Urogastron-Gens
und das β-Galactosidase-Gen codierende Gen enthalten.
Aus pEK28 entstehen den λPL-Promotor enthaltende Fragmente.
Diese Fragmente werden durch T₄-DNA-Ligase zu Kombinationen
verknüpft, wie sie in Tabelle II gezeigt sind.
Dadurch erhält man Rekombinant-Plasmide, wie sie in Tabelle
III gezeigt sind. Die β-Galactosidaseaktivität der exprimierten
Fusionsproteine wird nach der Millerschen Methode
gemessen. Tabelle III zeigt, daß alle Plasmide einen
relativ hohen Stand an β-Galactosidaseaktivität haben.
Besonders die Plasmide pUG103, pUG104 und pUG117
erreichen bemerkenswerte Ergebnisse.
Als nächstes wird ein Vektor zur Expression von β-Urogastron
aus pUG103 oder pUG117 hergestellt. Das Plasmid (pUG103
oder pUG117) wird mit HindIII und PvuII geschnitten, so daß
ein Fragment von 1,2 kBp erhalten wird, das den Bereich vom
λPL-Promotor bis zur vorderen Hälfte des β-Urogastron-Gens
enthält. Weiterhin wird pUG2 mit EcoRI geschnitten, die Schnittstellen werden mit dem
Klenow-Fragment ergänzt und mit HindIII geschnitten, wodurch
ein Fragment von 4,1 kBp erhalten wird. Die zwei
Fragmente werden mit T₄-DNA-Ligase verknüpft und der
E.-coli-Stamm ECI-2 damit nach der vorstehend beschriebenen
Calciummethode transformiert. Es wird eine Rekombinante
gewonnen, die das Plasmid pUG103-E oder pUG117-E zur Expression
der Kombination aus vorderer und hinterer Hälfte
des β-Urogastron-Gens, d. h. das gesamte β-Urogastron-Gen,
unter der Kontrolle des λPL-Promotors enthält.
Das β-Lactamase-Gen auf dem Plasmid pBR322 und das β-Urogastron-
Gen zur Expression von β-Urogastron als Fusionsprotein
werden miteinander verknüpft. Dieses Verfahren wird
nachstehend beschrieben.
pBRH02 wird durch Schneiden von pBR322 mit AvaI und PvuII,
gefolgt von der Klenow-Reaktion und Verknüpfung durch T₄-
DNA-Ligase erhalten. Dieses Plasmid besitzt Gene für
Ampicillinresistenz (ApR) und Tetracyclinresistenz (TcR)
als Marker. pBRH03 wird durch Schneiden von pBR325 mit
AvaI und HindIII, gefolgt von der Klenow-Reaktion, und Verknüpfung
erhalten, und besitzt Gene für ApR und Chloramphenicolresistenz
(CmR) als Marker. Fig. 10 zeigt diese Plasmide.
pUG3 wird, wie schon beschrieben, hergestellt und mit
MboII geschnitten. Es werden 13 verschiedene Arten von
DNA-Fragmenten erhalten, die mit A bis M in der Reihenfolge
ihrer Größe bezeichnet werden, wie das in Fig. 11
gezeigt ist. Unter diesen DNA-Fragmenten ist das H-Fragment,
das aus 179 Basenpaaren besteht. Es beginnt mit einem
Nucleotid, das für Asparagin am N-terminalen Ende von
β-Urogastron codiert, und endet mit 16 Basen stromabwärts
vom Stopcodon. Das Fragment umfaßt damit das gesamte Strukturgen
von β-Urogastron. Zur Isolierung des H-Fragments
werden die Fragmente auf einem 6gew.-%igen Polyacrylamidgel
elektrophoretisch getrennt, und das Fragment wird gereinigt.
Als Adapter werden die in Tabelle IV aufgeführten Oligonucleotide
nach dem vorher beschriebenen Verfahren hergestellt.
Die Sequenz der Adapter codiert für das basische
Aminosäurepaar Lys-Arg oder Arg-Lys, so daß β-Urogastron
enzymatisch aus dem exprimierten Fusionsprotein abgespalten
werden kann.
Tabelle IV | |||||||||||||||||||||||||||
D-1-3 | |||||||||||||||||||||||||||
CCGTAAG | |||||||||||||||||||||||||||
D-1-4 | |||||||||||||||||||||||||||
TTACGG | |||||||||||||||||||||||||||
D-2-1 | CGTAAG @ | D-2-2 | TTACG @ | D-3-2 | TTACGGAT @ | D-4-2 | TTACGTGCA @ | E-1 | CGCTAAACGG @ | E-2 | CGTTTAGCG @ | E-3 | GACAAACGG @ | E-4 | CGTTTGTC @ | E-5 | CGTTTAGCGAT @ | E-6 | CGTTTGTCTGCA @ | E-7 | CGGCTAAACGG @ | E-8 | CGTTTAGCCG @ | E-9 | CAAACGG @ | E-10 | CGTTTG |
Ein Vektor zur Expression des β-Lactamase-β-Urogastron-
Fusionsproteins wird in der Weise hergestellt, daß er in dem
Bereich, der den Adapter enthält, eine Restriktionsenzym-
Erkennungssequenz bekommt.
Das in Fig. 12 gezeigte Verfahren wird durchgeführt.
Das Plasmid pBRH02 wird innerhalb von 3 Stunden bei 37°C
vollständig mit XmnI geschnitten. Anschließend werden 3 µg
des Vektors, etwa 0,1 µg des β-Urogastronfragments aus
179 Basenpaaren und jeweils etwa 1 µg E-1 und E-2 (mit nicht-
phosphorylierten 5′-Enden) als Adapter in einem einzigen
Schritt bei 12°C innerhalb von 15 Stunden verknüpft, so daß
Plasmide als Expressionsvektoren erhalten werden. Der Stamm
HB101 wird mit den Plasmiden mit HIlfe der Calciummethode
transformiert.
Von den 499 erhaltenen TcR-Kolonien sind 168 (33,7%)
Kolonien ApS. Diese Kolonien werden durch Minipräparation
auf die Größe der Plasmid-DNA geprüft. 13 Plasmide
sind etwa 200 Basenpaaare größer als der Vektor, und es wird
angenommen, daß sie das β-Urogastron-Gen enthalten. Alle,
die eine MluI-Schnittstelle haben, werden mit HinfI geschnitten
und die Orientierung der Insertion des β-Urogastrongens
mit Hilfe einer Elektrophorese auf einen 1,5gew.-
%igen Agarosegel überprüft. Drei der geprüften Plasmide
ergeben Fragmente von etwa 1050 Basenpaaren und etwa 800 Basenpaaren.
Das zeigt, daß das β-Urogastron-Gen in
der gleichen Orientierung wie das β-Lactamase-Gen eingeführt ist.
Diese drei Plasmide werden mit pUG2301 bis pUG2303 bezeichnet.
Das in Fig. 13 gezeigte Verfahren wird durchgeführt.
Das Plasmid pBR322 wird als Vektor mit einer einzigen
PvuI-Schnittstelle im β-Lactamase-Gen verwendet. Gemäß
dem in 8-4-a beschriebenen Verfahren wird ein Expressionsvektor
unter Verwendung von E-1 und E-5 als Adapter
konstruiert.
Bei der Prüfung der 1626 erhaltenen TcR-Kolonien auf Ap-
Empfindlichkeit erweisen sich 31 Kolonien (1,9%) als ApS.
Mit 22 TcR- und ApS-Kolonien wird eine Minipräparation
durchgeführt, und die Plasmide werden durch Schneiden
mit MluI auf Insertion des β-Urogastron-Gens geprüft. 20 Plasmide
mit einer MluI-Schnittstelle werden gefunden. Die
Orientierung wird durch Schneiden mit HinfI oder BamHI geprüft.
Es wurde festgestellt, daß die Plasmide pUG2101
bis pUG2105 ein β-Urogastron-Gen in der gleichen Orientierung
wie das β-Lactamase-Gen enthalten.
Expressionsplasmide werden nach dem gleichen Verfahren wie
in 8-4-a) mit pBR322 als Vektor und E-7 und E-8 als
Adapter konstruiert. Der Verlauf ist in Fig. 14 gezeigt.
Von den 217 erhaltenen TcR-Kolonien sind 106 Kolonien (48,8%) ApS.
Mit 25 dieser Kolonien wird eine Minipräparation durchgeführt.
8 Plasmide enthalten etwa 200 Basenpaare mehr als
der Vektor und scheinen das β-Urogastrongen zu enthalten.
Diese 8 Plasmide werden daher mit BamHI geschnitten, und
die Orientierung des Gens wird geprüft. Dabei werden drei Plasmide
gefunden, die das β-Urogastron-Gen in der gleichen Orientierung
wie das β-Lactamase-Gen enthalten. Sie werden mit
pUG2701 bis 2703 bezeichnet.
Das nach dem Verfahren von 8-4-a) erhaltene Plasmid
pUG2301 produziert ein Fusionsprotein mit einem Anteil der
β-Lactamase und β-Urogastron. Die vorausgesagte Aminosäurefrequenz
und die entsrechende Nucleotidsequenz sind
nachstehend gezeigt.
In ähnlicher Weise produziert das nach dem Verfahren
8-4-b) erhaltene Plasmid pUG2101 ein Fusionsprotein mit
der folgenden Primärstruktur:
In ähnlicher Weise produziert das nach dem Verfahren
8-4-c) erhaltene Plasmid pUG2701 ein Fusionsprotein mit
folgender Primärstruktur.
Die Nucleotid-Sequenzen, die in den Plasmiden pUG2101,
pUG2301 und pUG2701 für die Fusionsproteine codieren, werden
nach der Maxam-Gilbert-Methode analysiert.
Fig. 23 zeigt die Analysenergebnisse. Dabei zeigen die Spalten
1 bis 4 das mit dem MluI-PstI-Fragment (224 Basenpaare)
von pUG2101 erhaltene Ergebnis. Die Spalten 5 bis
8 zeigen die mit dem MluI-EcoRI-Fragment (721 Basenpaare)
von pUG2101 erhaltenen Banden. Die Spalten 9 bis 12 ergeben
sich aus dem MluI-BamHI-Fragment (452 Basenpaare)
von pUG2301. Die Spalten 13 bis 16 zeigen das mit dem
MluI-PstI-Fragment (335 Basenpaare) von pUG2701 erhaltene
Ergebnis und die Spalten 17 bis 20 ergeben sich aus dem
MluI-EcoRI-Fragment (610 Basenpaare) von pUG2701. Die Spalten
1, 5, 9, 13 und 17 zeigen die Reaktionsprodukte für
Guanin, die Spalten 2, 6, 10, 14 und 18 die für Guanin
plus Adenin, die Spalten 3, 7, 11, 15 und 19 die Reaktionsprodukte
für Thymin und Cytosin, und die Spalten 4, 8,
12, 16 und 20 schließlich die Reaktionsprodukte für
Cytosin. Der mit "}" gekennzeichnete Abschnitt ist ein
Adapter.
Wie in Fig. 15 gezeigt, wird das β-Uroggastron-Gen in
das β-Lactamase-Gen von pBR322 an seiner einzigen PvuI-Restriktionsstelle
eingeführt, so daß Vektoren zur Expression
des Fusionsproteins aus β-Lactamase und β-Urogastron erhalten
werden.
Das Plasmid pBR322 wird innerhalb von 3 Stunden bei 37°C mit
PvuI geschnitten. Einige der Plasmide werden einer 1gew.-%igen
Agarosegelelektrophorese unterworfen, um festzustellen,
ob sie vollständig geschnitten sind. Die Adapter D-1-3
und D-3-2 werden innerhalb von 15 Stunden bei 12°C an das
Fragment geknüpft und das Verknüpfungsprodukt dann zur Isolierung
eines DNA-Fragmentes auf einem 1gew.-%igen Agarosegel
elektrophoretisch aufgetrennt. Anschließend werden das
β-Urogastronfragment und der Vektor in einem molaren Verhältnis
von etwa 5 : 1 zusammengegeben und innerhalb von 15 Stunden
bei 12°C verknüpft. Nach der Verknüpfung wird der Stamm
HB101 mit dem erhaltenen Plasmid transformiert, und die
Kolonien werden im Bezug auf TcR selektiert.
71 TcR-transformierte Kolonien werden erhalten und auf Ap-
Empfindlichkeit geprüft. Von 20 ApS-Kolonien (28,2%)
wird Plasmid-DNA hergestellt und dann auf die Anwesenheit
einer MluI-Restriktionsstelle geprüft, um die Insertion des
β-Urogastron-Gens zu bestätigen. Fünf dieser 20 Plasmide besitzen
die MluI-Schnittstelle des β-Urogastron-Gens. Die DNA
wird mit HinfI geschnitten, und die Fragmente werden durch eine
1,5gew.-%ige Agarosegel-Elektrophorese aufgetrennt, um die
Orientierung der Insertion zu prüfen. Zwei der Plasmide,
nämlich pUG1102 und pUG1105, enthalten das Gen in der richtigen
Orientierung.
Das in 8-5-a) beschriebene Verfahren wird mit PstI, HincII
und XmnI anstelle von PvuI wiederholt, wobei pUG1004,
pUG1201 und pUG1301, wie in den Fig. 16, 17 und 18
gezeigt, erhalten werden.
Die so konstruierten Expressionsplasmide werden zur Transformation
der E.-coli-Stämme HB101 oder ECI-2 verwendet.
Die Zellen werden nach dem nachstehend beschriebenen Verfahren
kultiviert und dann extrahiert. Zur Bestätigung
der Expression wird ein Radioimmunassay durchgeführt.
Der das Expressionsplasmid pUG103-E enthaltende Stamm ECI-2,
sowie der gleiche das Expressionsplasmid pUG117-E enthaltende
Stamm werden jeweils bei 25°C in zwei Flaschen, die je
einen Liter LB-Kulturmedium enthalten, kultiviert. Wenn
die Kultur in einer der Flaschen einen Absorptionswert von 0,3
bis 660 nm erreicht, wird die Kultur durch Erhöhen der Temperatur
auf 42°C für 1 Stunde induziert. Die Kultur in der anderen
Flasche wird weiter bei 25°C inkubiert, bis die Absorption
einen Wert von 0,4 erreicht. Die Zellen jeder Flasche werden
dann geerntet, mit PBS-Puffer (137 mM Natriumchlorid,
2,7 mM Kaliumchlorid, 8,1 mM zweibasisches Natriumphosphat
und 1,5 mM einbasisches Natriumphosphat (pH 7,0)) gewaschen
und in PBS-Puffer in 3 Volumenprozent des ursprünglichen
Kulturvolumens aufgenommen. Die Zellen werden dann
unter Eiskühlung durch Ultraschall
aufgeschlossen (100 Watt,
3·30 Sekunden). Der Überstand wird von den Zellresten
durch Ultrazentrifugation (40 000 g, 1 Stunde) abgetrennt
und gegen eine 0,01 n wäßrige Essigsäurelösung
dialysiert. Das Dialysat wird lyophilisiert und anschließend
in Radioimmunassay (nachstehend als "RIA" bezeichnet)
getestet.
Der E.-coli-Stamm HB101, der die Plasmide pUG1004, 1301,
2101, 2303 und 2703 enthält, wird bei 37°C in einem Kulturmedium
mit 50 µg/ml Tetracyclin vorinkubiert. Dann wird
mit dem gleichen Medium auf ein Volumenverhältnis von
1 : 100 verdünnt und kultiviert, bis die Absorption bei
660 nm den Wert von 0,4 erreicht. Die Zellen werden geerntet,
mit PBS-Puffer gewaschen, in PBS-Puffer in 3 Volumenprozent
des ursprünglichen Kulturvolumens aufgenommen und
unter Eiskühlung mit dem vorstehend erwähnten Gerät ultrabeschallt
(100 W, 3mal 30 Sekunden). Der Überstand wird von
den Zellresten durch Ultrazentrifugation (40 000 g, 1 Stunde)
abgetrennt, gegen eine 0,01 N wäßrige Essigsäurelösung dialysiert,
lyophilisiert und im RIA getestet.
Um die Anreicherung des Fusionsproteins in Periplasma festzustellen,
wird die periplasmatische Fraktion gemäß
S. J. Chan et al. (Chan, S. J., et al., Proc. Natl. Acad. Sci.,
USA, 78, 5401-5405 [1981]) hergestellt. Ein Teil der Kultur
wird mit frischem E-Kulturmedium (1 Liter einer wäßrigen
Lösung von 10 g zweibasischem Kaliumphosphat, 3,5 g Natriumammoniumhydrogenphosphat,
0,2 g Magnesiumsulfat-heptahydrat,
2 g Citronensäure, 2 g Glukose, 0,23 g L-Prolin, 39,5 mg
L-Leucin, 16,85 mg Thiamin und 20 mg Tetracyclin-hydrochlorid)
auf ein Volumenverhältnis von 1 : 100 verdünnt,
dann bei 37°C kultiviert, bis die Absorption bei 660 nm
einen Wert von 0,4 erreicht. Die Zellen werden geerntet
(6000 UpM, 10 Minuten) und zweimal mit einem Gemisch aus 10
mM Tris-HCl (pH 8,0) und 30 mM Natriumchlorid gewaschen.
1 g Zellen werden wieder in 80 ml 20% (w/v) Saccharose-,
30 mM Tris-HCl (pH 8,0) aufgenommen und EDTA bis zu einer
Konzentration von 1 mM zur Suspension zugegeben. Das Gemisch
wird 10 Minuten (24°C) auf einem Rundschüttler bei 180 U/min
geschüttelt und dann zentrifugiert (13 000 g, 10 Minuten).
Die so gewonnenen Zellen werden in 80 ml destilliertem
Wasser wieder aufgenommen. Die Suspension wird
10 Minuten in Eis unter gelegentlichem Rühren stehengelassen
und dann zentrifugiert (13 000 g, 10 Minuten). Der
Überstand wird als periplasmatische Fraktion (O-Sup) bezeichnet,
Das Pellet wird in einem Gemisch von 10 mM Tris-
HCl (pH 8,0) und 30 mM Natriumchlorid aufgenommen und mit
dem vorstehend erwähnten Gerät ultrabeschallt. Dabei wird
die cytoplasmatische Fraktion (O-Ppt) erhalten. Diese Proben
werden im RIA getestet.
Zur Gewinnung des Antiserums werden Kaninchen mit gereinigtem
menschlichem β-Urogastron als Antigen immunisiert. 300 µg
β-Urogastron werden in 0,2 ml destilliertem Wasser gelöst,
dann werden 1,5 ml einer 50prozentigen Polyvinylpyrrolidonlösung
zugegeben, und das Gemisch wird 2 Stunden bei Raumtemperatur
gerührt. Eine Emulsion aus dem Gemisch und aus 2,0 ml
komplettem Freundschen Adjuvans wird subkutan in den Brustbereich
von 3 Kaninchen gespritzt. Die Immunisierung wird
viermal alle 2 Wochen wiederholt, und dann werden noch einmal
50 µg Antigen intravenös verabreicht. 3 Tage danach
wird das Blut geammelt und das Serum abgetrennt.
Die Bedingungen für den RIA-Test werden dann bestimmt im
Hinblick auf die Titration zur Bestimmung der Antiserumverdünnung
im Test, die Inkubationszeit zur Optimierung der
Testbedingungen, das Verfahren zur Abtrennung des gebundenen
radioaktiv markierten Antigens (gebunden) vom freien
radioaktiv markierten Antigen (frei) und dergl.
Die eingesetzte Verdünnungslösung ist ein Phosphatpuffer
(10 mM, pH 7,4), der 0,5% (w/v) Rinderserumalbumin (BSA),
140 mM Natriumchlorid und 25 mM Dinatrium-EDTA enthält.
400 µl Verdünnungslösung, 100 µl Probe oder ein Standard von
menschlichem Urogastron und 100 µl Antiserum gegen das menschliche
β-Urogastron werden zusammengegeben. Nach 24stündiger
Inkubation des Gemischs bei 4°C werden 100 µl mit ¹²⁵J-
markiertem menschlichem β-Urogastron (etwa 5000 cpm) zugegeben.
Nach einer weiteren Inkubation von 48 Stunden bei
4°C werden 100 µl des zweiten Antikörpers (anti-Kaninchen-γ-
Globulin-Ziegenserum, 20fach mit PBS-Puffer verdünnt),
100 µl normales Kaninchenserum (200fach mit PBS-Puffer
verdünnt) und 900 µl 10 mM PBS-Puffer mit 5% (w/v) Polyäthylenglykol
zugesetzt und noch einmal 3 Stunden bei 4°C
inkubiert. Die Kultur wird 30 Minuten bei 3000 UpM
zentrifugiert, der Überstand wird abgetrennt und der Niederschlag
gezählt. Der Anteil des immunreaktiven menschlichen
β-Urogastrons in der Probe wird aus der Standardkurve, die
mit Hilfe des menschlichen β-Urogastronstandards aufgestellt
wurde, bestimmt.
Tabelle V zeigt die Ergebnisse des RIA-Testes, der mit dem
Expressionssystem unter Verwendung des λPL-Promotors
durchgeführt wurde.
Tabelle VI zeigt die Ergebnisse des RIA-Tests, der mit den
Systemen zur Expression des Fusionsproteins durchgeführt
wurde.
Tabelle VI | |
Expressionsplasmid | |
Produzierte Menge an β-Urogastron | |
(µg/l Kultur) | |
pUG1004 | |
729,6 | |
pUG1301 | 650,7 |
pUG2101 | 31,3 |
pUG2301 | 125,2 |
pUG2701 | 119,2 |
Tabelle VII zeigt die Lokalisierung des exprimierten
Fusionsproteins.
Die Tabellen V und VI machen deutlich, daß sowohl das
λPL-Promotor-System zur direkten Expression von
β-Urogastron als auch das System zur Expression der Verbindung
als Fusionsprotein immunreaktives β-Urogastron
in E. coli exprimieren. Tabelle VII zeigt, daß im Falle des
Fusionsproteins das exprimierte immunreaktive β-Urogastron
fast ausschließlich im Periplasma lokalisiert ist.
Claims (24)
1. β-Urogastron-Gen, gekennzeichnet
durch folgende Nucleotid-Sequenz:
2. Untereinheit des Gens nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet,
daß die Untereinheit aus der vorderen Hälfte
der Nucleotid-Sequenz nach Anspruch 1 besteht und daß
diese etwa in der Hälfte geschnitten ist.
3. Untereinheit des Gens nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet,
daß die Untereinheit aus der hinteren Hälfte
der Nucleotid-Sequenz nach Anspruch 1 besteht, und daß
diese etwa in der Hälfte geschnitten ist.
4. Gen nach Anspruch 1, dadurch gekennzeichnet, daß jeweils
eine Restriktionsenzym-Erkennungsstelle am Anfang
und/oder am Ende des Gens angefügt ist.
5. Gen nach Anspruch 4, dadurch gekennzeichnet, daß es
eine Restriktionsenzym-Erkennungsstelle und ein Startcodon
stromaufwärts vom Gen und/oder ein Stopcodon
und eine Restriktionsenzym-Erkennungsstelle stromabwärts
vom Gen besitzt.
6. Gen nach Anspruch 5, gekennzeichnet durch folgende
Nucleotid-Sequenz:
7. Untereinheit des Gens nach Anspruch 6, dadurch gekennzeichnet,
daß die Untereinheit aus der ersten Hälfte
der in Anspruch 6 beschriebenen Nucleotid-Sequenz, die
etwa in der Mitte geschnitten wurde, besteht, und daß
die Untereinheit eine Restriktionsenzym-Erkennungsstelle
am Ende ihrer Sequenz besitzt.
8. Untereinheit nach Anspruch 7, gekennzeichnet durch
folgende Nucleotid-Sequenz:
9. Untereinheit des Gens nach Anspruch 6, dadurch gekennzeichnet,
daß die Untereinheit aus der hinteren Hälfte
der in Anspruch 6 beschriebenen Nucleotid-Sequenz besteht,
die etwa in der Mitte geschnitten wurde, und daß die
Untereinheit eine Restriktionsenzym-Erkennungsstelle am
Anfang ihrer Sequenz besitzt.
10. Untereinheit nach Anspruch 9, gekennzeichnet durch die
folgende Nucleotid-Sequenz:
11. Rekombinant-Plasmid, dadurch gekennzeichnet, daß es das
Gen nach Anspruch 6 enthält.
12. Verfahren zur Herstellung des Rekombinant-Plasmids nach
Anspruch 11, dadurch gekennzeichnet, daß die Untereinheit
nach Anspruch 8 und die Untereinheit nach Anspruch
10 an einer geeigneten Insertionsstelle eines
geeigneten Plasmidvektors eingeführt werden.
13. Rekombinant-Plasmid, gekennzeichnet durch einen Plasmidvektor,
in den das β-Urogastron-Gen nach Anspruch 6 und
stromaufwärts vom β-Urogastron-Gen ein Promotor
zur Kontrolle der Genexpression und eine an den Promotor
gebundene SD-Sequenz eingeführt sind.
14. Rekombinant-Plasmid, gekennzeichnet durch einen Plasmidvektor,
der die Sequenz des vierten und der folgenden Basenpaare
des β-Urogastron-Gens nach Anspruch 6 und eine
Kombination eines Promotors, einer SD-Sequenz und
eines anderen darin stromaufwärts vom β-Urogastron-Gen
eingeführten Gens besitzt.
15. Rekombinant-Plasmid nach Anspruch 14, dadurch gekennzeichnet,
daß das andere Gen ein β-Lactamase-Gen ist.
16. Rekombinant-Plasmid nach Anspruch 13 oder 14, dadurch
gekennzeichnet, daß der Promotor der λPL- oder lac-
UV5-Promotor ist.
17. Rekombinant-Plasmid nach Anspruch 13 oder 14, dadurch
gekennzeichnet, daß der Plasmidvektor pBR322 ist.
18. Transformante, gekennzeichnet durch eine Wirtszelle,
die ein zur Expression des β-Urogastron-Gens nach Anspruch
1 fähiges Rekombinant-Plasmid enthält.
19. Transformante nach Anspruch 18, dadurch gekennzeichnet,
daß sie das Rekombinat-Plasmid nach Anspruch 13 enthält.
20. Transformante nach Anspruch 18, dadurch gekennzeichnet,
daß sie das Rekombinant-Plasmid nach Anspruch 14 enthält.
21. Transformante nach Anspruch 18, dadurch gekennzeichnet,
daß die Wirtszelle E. coli ist.
22. Transformante nach Anspruch 18, dadurch gekennzeichnet,
daß die Wirtszelle mit einem Rekombinant-Plasmid mit
einem TcR-Gen und einem CI857-Gen transformiert worden
ist.
23. Verfahren zur Herstellung einer Transformante, dadurch
gekennzeichnet, daß eine Wirtszelle mit einem zur Expression
des β-Urogastron-Gens nach Anspruch 1 fähigen
Rekombinant-Plasmid transformiert wird.
24. Verfahren zur Herstellung von β-Urogastron, dadurch gekennzeichnet,
daß man eine Transformante nach Anspruch 18
züchtet und das exprimierte β-Urogastron isoliert.
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