DE1620645A1 - Verfahren zur in-vitro-Synthese biologisch aktiver intakter Nucleinsaeure und Herstellung von Replicasen,die hierfuer geeignet sind - Google Patents
Verfahren zur in-vitro-Synthese biologisch aktiver intakter Nucleinsaeure und Herstellung von Replicasen,die hierfuer geeignet sindInfo
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Description
Der- hier verwendete Ausdruck "biologisch aktiv" umfasst
die Grundlage für die unten beschriebene'Prüfmethode, die Herstellung von-infektiösen Virus-RNS und im allgemeinen
Stoffe, die genetisch ausreichende Merkmale oder Informationen besitzen, die wesentlich für orga-
nisches Leben oder Lebensprozess'e sind. Diese biologisch -aktiven Stoffe sind genetisch, -hinreichend geeignet und
können Informationen an ein System übermitteln, das ihren Instruktione-n folgt und "diese in biologischem
Sinne
Der%i;er vervitenöefee ;ftifsSt*Tie1c" ''i^ägen" bezieiit -sieh
-auf Bafctieiriopiiagen.
-•-Lebende,
BAD ORIGINAL
Lebende Organismen, einschliesslich Menschen, Tiere,
Pflanzen und Mikrο-Organismen, benutzen biologisch aktive
Nucleinsäuren bei den Prozessen der Speicherung und Übertragung übertragungsfähiger genetischer oder erblicher
Informationen oder Bötschäften und für die Synthese einer
grossen Anzahl von Gewebe- und Körperproteinen. Zwei Nucleinsäuren, die unter geeigneten Bedingungen als Überträger
des genetischen Codes dienen können, sind DNS (DesoxyribonucleiHsäure) und RNS (Ribonucleinsäure).
Im ^Mtoetfäeii^Organi?smus Isinä töieee Nucleinsäuren im a 11-.gemeinen
-unter ^Siidüng -v©n"Iferclieoproteinen mit Proteinen
lcombiniiert. '"" "
Dfe^se >!DilS^ün'd: WiS^MoSeMlIe >besteheii aus vergieieiisweise
•eiafäeh: ^zu^ammengesfetzten -NiiolieotiMen - (Stiekstoffbase,
-FeritOseieinheit und IPhjas^h^isgruppen),, welche zu Ketten:
^polymerisiert ^stod, ^Me ^liUfiderte bis tausende dieser
^Nuiσl·e·Q^tiMeiiÄ©ίten-eϊItlial#έ!n, '-lÄielehe -im el !gemeinen
;- idüt-eh -eitemisöHe SiÄungeai fiilifeeiöanldet· verbunden sind,, ■
Me *zwf sefeeii üeir ^AoispiSaife- !Äid ^äer 2u;elcergrup;pe bestehen.
als
öd;er ly^pitftiidine, 9&E e Weäüä&e if st -?e»twedier Ribbs;e
ril)-ds%.-Jfeös^pfeöi»
Se i 'VölliköinmeHer! liyapölyse 'fergeben idie ^ DNS und
9 0988771691 ' '
BAD ORIGINAL
Adenin (A) Adenin (A)
Cytosin CC) . Cytosin (C)
Guanin ;\*) ; : , Guanin. (G) - V .
Thjrniin 'T) : -;■ ■ . Uracil (U)
Methylc;ct,Gsin . . - : ; .
Hydroxy r;.e thylcytosln
DesoxyriGose Ribose
Phosphorsäure Phosphorsäure ·
Es ist zu beachten, dass die Basen-Adenin (A), Cytosin (C)
und uuanir« (G) sowohl den DNS als auch den RNS zukommen.
In den RKS ist die Base Thymin (T) der DfIS vollkommen
ersetzt durch die Base Uracil (U) * MethyIcytosin kommt
in kleinen Kengen in verschiedenen Desoxyribonucleinsäuren
tierischen Ursprungs vor sowie in Weizenkeimen., In den DNS verschiedener Bakteriophagen ist Cytosin vollständig
durch. Hydroniyethylcytosin ersetzt~.
Die Hydrolyse dieser Nucleinsäuren unter geeigneten Bedingungen setzt eine Gruppe von Verbindungen frei, die
als Nucleotide bekannt sind. Diese Nucleotide bestehen
aus einen; Purin oder Pyrimidinbasen, die an Pentoseeinheiten gebunden-sind, wobei die Zuckereinheit durch
Phosphorsäure verestert ist. Diese" Nucleotide, bilden
die Untereinheiten, aus denen sich die polymerenNuclein-
" "^ ■ - ""■■".-".■ '■■■■"
säuren zusanaaensetzen.
Die Ribonucleinsäure-Polynucleotidstruktur kann in Diagrammforin
beispielsweise wie folgt dargestellt werden:
909887/1£91
1820645
A | Pentose s ^ | Phosphat |
C | Pentose *> ~ ' " | Phosphat |
G | ^ <* + Pentose ^- < |
Phosphat |
T | Pentose ^. -· ~" | Phosphat |
Die obigen unterbrochenen Linien stellen Estergruppierungen zwischen einer der freien Hydroxylgruppen der
Pentose und deT Phosphatgruppen dar« Der Index η bedeutet die Anzahl der wiederkehrenden Einheiten, die
das spezielle Ribonucleinsäuremolekül bilden.
Neuere chemische Forschungen haben gezeigt, dass das
DNS-Molekül eine Doppelstrang-Kette aufweist, die, wenn
sie dreidimensional aufgezeichnet wird, zwei Ketten besitzt, die zu einer doppelten Helix gewunden sind. Jede
Kette besteht aus alternierenden Nucleotiden, wobei zehn Nucleotide in ^eder Kette pro Windung der Helix vorliegen
und wobei diese aus zehn Nucleotiden bestehende Kette eine Länge von etwa y\ 8 besitzt. Beide Ketten sind
rechtsläufige Helices; Diese Helices werden offensichtlich
zusammengehalten durch Wasserstoffbindungen, die
zwischen den Wasserstoff-, Stickstoff- und Sauerstoffatomen der betreffenden Ketten ausgebildet sind. Die
Struktur des DNS-Moleküls, wie sie sich ergibt auf Grund der Basensequenzen in dem Molekül, wird z.Z.aufgeklärt*
Diese Strukturuntersuchungen sind insofern wichtig, als im allgemeinen angenommen wird, dass die Basensequenz
909887/1691 . der
BAD ORIGINAL
Ööde ist,-, mit dessenJHiire das MS-MoIeMl s
1 infopffiafeion welieilölte-fe feziWi überträgt*
Öhemiker haben nunmehr aufgezeigt*, dass die HIiS im. .
allgemeine^ eine, Struktur mit -einem einzelnen Strang ist,
der in seiner Grundkefcte den aus 5 Kohlenstoffatomen '■,
übsteilenden; Zücker Rifeose anstelle deä Äudkers Desoxjr- .
i*ilsöse aufweist., der sidh-in dea* DNS finde^ Wie in den
BHS sind die v;ersahiedenen Üücleotide durch die Phosphat*
gruppea miteinander verbürideri unter Bildung einer langen
Kette und bilden so ein RES^Moiekül von hdhem Mölekülargewichfe*
Die RHS-Moleküle Scheinen nicht so hoch polymerisiert
zu sein wie die DNS^Mölekülei und ©bviohl An*
zeichen dafür existiereni dass Was.ser'stoffbindungeh-z
sche'n den RfiS-Basen in einigen Viren vorliögehi Mrd
angenommen^ dass hier keine Heiix-Strukfeür vorliegt*'
Bezüglic'h den DNS sind ^orschuhgen über die Säs'ehse^'
im Ganges \ ^ ' "* '"
in dgn.G&herLi den Speichernder irbfäktoreh lebender ,
2ellih und Vir^h^ besteheil=&1ά speziellen- getietisßhiii: „
informationen in den Nucle^tidsequgh^hi diä .i$ Mn DNif
und ,RiiS^Möiekülen erscheinehi Diese Sequen^eh; worden. .
überi^ägetti verschlüsselt' und ;in vivB durch Ifebendi ,":. ■ ·
Qj?gan,ismen reproduziert* Wenn ke^ihe Mpdifikatiöh der , , :
öder· RM; stattfindet>. wird ein gönaueijS, plipiikatj-..
eine genaue Wijedörgabe der·, S&qMöh^
iaht wi#d&r;Ufti ein· gentueS; ßupiikat öder ie
Wiedergabe eines speziellen Proteinmoleküls produziert*
Wenn jedoch in den DNS- oder RNS-Molekülen eine Veränderung
stattfindet> die durch bestimmte Einwirkungen.,, wie
z«B, Bestrahlung,- einen fremden chemischen Reaktions-*
teilnehmer usw.j hervorgerufen werden kann, findet eine
Mutation statt, wobei die veränderten. DNS- oder RNS-MölekÜie
die "neue" DNS- oder RNS verdoppeln oder vervielfältigen,
und diese wiederum produziert »cue oder
P veränderte Proteine, wie das von der veränderten Nucleotidstruktur
vorgeschrieben wird. .■■ ;
Gegenstand der Erfindung sind Verfahren und' Systeme, die
geeignet sind, für die in-vitro*Synthese von biologisch
aktiven Nucleinsäuren, die Herstellung einer gereinigten
Enzymkomponente dieser Systeme sowie der gebildeten gereinigten Enzymkomponenten, welche frei von nachweisbaren
Mengen abbauender Enzyme und Enzyminhibitoren öindjsowie die dadurch hergestellten biologisch aktiven
W Nucleinsäuren«
Die vorliegende Erfindung schlägt insbesondere ein Verfahren zur in-vitro^Synthese biologisch aktiver intakter
NüGleinsäure vor, das dadurch gekenrizelöhnet ist, dass
ein aktiviertes System gesehaffen wird, -welches imstande
ist, biologisch aktive Nucleinsäure für längere oder
ausgedehnte Zeiträume zu synthetisieren,- wobei dieses
System biologisch aktive Nucleinsäure, die spezifische Repliöäse für diese Nucleinsäure, '"welche frei: ist von
9Ö9887/1891
. ' nachweis-
nachweisbaren zersetzenden Verunreinigungen, undeine
NucleOtidbasen-Komponente oder -Komponenten umfasst,
und wobei die synthetisierte Nucleinsäure aus dem System
gewonnen wird., ' .. ;
Gemäss einer "'weiteren, Ausführungsform der Erfindung ist
das beim erfindungsgemässen Verfahren verv/endete aktivierte System im -wesentlichen' frei von nachweisbaren
Mengenanteilen ah Virus-Infektionsfähigkeit, um eine
erhöhte Vervielfältigungsaktivität sicherzustellen*
Durch das erfindungsgemässe Verfahren ist es möglich,
beispielsweise ein Ribonucleinsäuremo.lekül (BNS)kontinuierlich
über ausgedehnte Zeiträume, v^eiches identisch
ist mit der intakten "Schablone" (die Schablone ist
das Modell für die Vervie If alt igung)., zu synthetisieren,
bis oder vienn nicht eine willkürliche oder gezielte
Unterbrechung der Synthese stattfindet. Diese Selbstvervielfältigung
umfasst die tatsächliche und vollkommene
übertragung bzw. Übersetzung von der intakten ■
Schablone auf die liueleotide, wobei die-Nucleotide
strukturelii in der gleichen Sequenz'zusammengesetzt
sind, die die intakte: Schablone kennzeichnet. Das intakte synthetisierte Produkt kann entweder selektiv markiert
- ■ "'S ■■'.'■'. -..■■■-■"■ - - ■■'■'■'.■:"
(z.B. radioaktiv) oder nicht markiert werden und in
einer Form,-die frei von nachweisbaren Verunreinigungen
zusammen oder anderen Stoffen ist, mit denen/es sieh sonst In
der Natur f indet.
909887/1BBί
Insbe-
-■■' 'BAD ORIGINAL
Insbesondere liefert das kontrollierte System der Erfindung zur Synthese von intakter biologisch aktiver
Nucleinsäure in einem enzymatischen in-vitro-System aus Nucleotidbasen biologisch aktive Nucleinsäure, und
zwar unter Verwendung einer ausgewählten intakten 'biologisch,
aktiven Nucleinsäuren die frei von nachweisbaren Mengen von zerstörenden Stoffen ist, als Schablone
(z.B. als Zuführungsschabrone). Wenn das System biologisch
aktive Vervielfältigungen (identische Kopien des gleichen Molekulargewichts.) der Nuclelnsäureschablone produziert,
soll sich das Verfahren auf ein solches unter Einschluss dieser Vervielfältigung beziehen. Der Enzymkatalysator
soll eine Polymerase oder Repliease sein; wenn der Enzymkatalysator eine RIiS-abhängige RNS-PoIyraerase
ist, dann ist diese eine Replicase,
Das Verfahren be zw.- System der Erfindung ist insbesondere
gut geeignet zur in-vitro-Synthese biologisch aktiver Ribönucleinsäure (RNS) aus Ribonucleotidbasen- . ■
Komponenten (Substrate) mit hoher Bindungsenergie unter Verwendung, einer intakten homologen (enthaltend
die Information für ihre spezielle Replicase) biologisch
aktiven RKS-Schablone," einer homologen Replicase, welche
das Strukturprogramm oder die Botschaft der Schablone selektiv erkennt, xxZzxs. katalytische Wirksamkeit zur
Synthese biologisch aktiver RNS aus Ribonucleotiden besitzt
und vollständig frei ist von"nachweisbaren"Mengen
909887/16 91
an
BAD QRIG'NAI
an Ribonucleaseaktivitat .und nachweisbaren Mengen andere*1 aeräetzenöer enzyfflatischer Aktivitäten^ sowie; ;-unter·
Verwendung eines Cofaktors, der Zweiwertige
ionen liefert, die bei dem Vervielfaitigungss/stem ■
nicht verbraucht werden..
Die spezielle "Übersetzung" des Programmes der, Schabione .
durch die Eeplicase hängt von Faktöfsn ab, die naöft*
stehend erörtert werden«
Die Replicase für die' Vlrus-RMS wird erhalten-entweder"
durch Einführung einer ausgewählten Virus-Hueleinsäure
(ζ.B* Bakteriophagen)j die frei,ist von allen VGrIIe^
•genden proteinartigen Schutzüberzügenj in eine nicht *-
infizierte Gastbaktefienzelie>
um ein Enzym zu* synthe-'tisiereni
von dem angenommen wird> dass es;nicht vorher
in der Gastzelle vorhanden'war>
oder vorzugswet§e düröh
Einführung eines intakten Bakteriophagen (VirusSeilöhen)
in die.Bäkterienzelle, um dieses Enzym zu synthetisieren»
Die eingeführte oder eingedrungene RMS besitzfe ein ' "
Struktürprogrammi das eine Bo;tschaft definie^ti' Sie
in das Enzymprotein übersetzt und Während dieser Über1-*
setzung konserviert wird. Öieses Inzyräj eine
veränderten Zellen isoliert und" dann gereinigte
Entfernung naöhweisbärei* Mengen des g
1620845
tenden.Ribonucleaseaktivität und anderer zersetzenden
und störenden Enzymaktivitätenj die sich in der Bakterienzelle
finden« ■ ..
Das erhaltene teilweise gereinigte Enzym Replicase
erkennt scharf unterscheidend das intakte homologe RNS-Genorn
seines Ursprungs und benötigt dieses als Schablone für die normale synthetische Vervielfältigung* Die gereinigte
Replicase zeigt also eine einmalige und beson- ^ dere Abhängigkeit gegenüber und Bevorzugung tüte seiner
homologenViren-RNS., indem es eine polymerisierende Aktivität
(Synthese und/oder Vervielfältigung) für Viren-
RNS aufweist. Die. Repliease zeigt die einmalige und wertvolle
Fähigkeit zur Lieferung der Vervielfältigung von . nur intakten" Virus-RNS- und liefert- keine Vervielfältigung
von.Fragmenten oder fremden Sequenzen- oder unvollständigen
Kopien seines eigenen Genoms. Der Ausdruck "Genom" bezieht sich auf die gesamte Genausstattung in
einer Zelle. Die Gene bilden einen Speicher gene.tischer
™ ' Information für lebende Zellen und Viren»
Die Nucleotidbasen oder Substratkomponenten für die
en
Virus-RNS-Vervielfältigung soll/eine genügend hohe Bindungsenergie
für die Vervielfältigung aufweisen» Eine
befriedigende Vervielfältigung von Virus-RNS ist erzielt worden bei vier Ribösidtriphosphaten, nämlich Adenosinferiphpsphat
(Αϊ?)-, Guanosintriphosphat; (QT?) Cyti- -
und Uridiritriphosphat (ÜTP),
' -■ ' Bei SAD ORiGiNAL
Bei der Vervielfältigung, von,infekfeiöseri Virus-RNS in ·
vitro, vierden zwei verschiedene RKS-Replicasen in- einem
Stamm an- Eseherlchla coli induziert., und.zwar durch zwei
serologisch unterschiedliche RNS-Bakteriophagen"". (KS.-2.
■undQß), und gereinigt* Die Ensyß:proteinpräparate,. die
nachsteiiend im einzelnen, beschrieber, werden,.' waren frei
von nachweisbaren Mengen störender RKS-ase (Hibonuclease),
Fhqsphorylase und DNS-abhängiger.RMS-Polyperase (Trans-
<irl-ptase). Diese isolierten Enzyme (Replleasen) zeigten
sov/ohl ein obligatorisches Bedürfnis für die Schabionen-RNS
und die Fählgiceit^. eine lang anhaltende und ausgedehnte
.Gesamtsynthese von Polyribonucieotid (HiS)- zu
bewerkstelligen. Die beiden Repllessen zeigten eine
einmalige Suharf unterscheidende Äusviahlfähigkeit bezüglich
ihrem Ansprechen auf zugesetzte RNS,; TJhter'sonst
optimalen Bedingungen-waren beide Replicäsen tatsächlich
inaktiv bei heterologen RNS elnschliessllch Ribosorftennd
s-RNS des Gastes.-, Keine, der:beiden Eeplieaseri arbeitete,
wenn die RNS der anderen als Schablone verwendet ;. ™
vnirde. Jede Repllcase ericannfee nur das RKS-GenGir. seines
Ursprungs und benötigte es ausschllesslich als Schablone
für ihre synthetische Aktivität. '.. - --■;■'-,
Es liegen Hinweise^vor, dass die Repllcase die spezielle
-Sequenz von Nucleotiden zu Beginn und anrSnde der biologisch aktiven VIrus-RNS-Schablone iin Verlauf. der Yervielfältigung
erkennt/ Aus älesea Erkennungsmuster
903887/1Β9Ί ist
BAD ORIGINAL
ist abzuleiten, dass der -'dazwischenliegende Teil der/
RNS-Schablone nicht wesentlich ist für die Richtung oder
die Instruktion, die in dem vorliegend erörterten Mechanismus bei der Vervielfältigung gefunden wurde.
Diese Tatsache legt nahe, dass die yervielfäl.tigungssequenz von Nucleotiden, die zu Anfang und am Ende eines
biologisch aktiven RNS-Schablonen-Moleküls vorliegt,
selektiv an sonst nicht biologisch aktive oder nicht-Viren-RNS gebunden sein kann, um ein synthetisches biologisch
aktives RNS-Produkt herzustellen. Es 'wird.angenommen,
dass die RNS einen Kreisbildet und dass' diese
zwei Erkennungssequenzen des Moleküls-einander überlappen
unter Bildung von Dappelstrang-Bereichen;, derartige
überlappte Bereiche können daher eine. Identifizierung
des RNS-Moleküls in einem einzigen schnellen Abtastvorgang
liefern. ; .. .
Die RNS-Schablone eines in vitro-Vervierfältigungssystems
kann in" situ gebildet werden. Werin-man z.B. fremde Basen :
"oder Nucleotide (z.B. Analoge von'bekannten Basen oder
Nucleotiden) in "das· vorliegende Vervielfäitigungssystem
einführen würde,' körinte eine Mutänte gebildet werden,
die die biologisch gebildete Schablone für die Vervielfältigung
mit den "gleichen*"Basen" öder Nucieotiden'sein·
würde; in diesen' '"fällen'"'Würde man in vitro Mutanten
in bekannter :We£sei; synthetisieren. Demerits'prechend ist
darauf hinzuweisen, 'daä-s'die hier' beschriebene' In^vitro-
e9J : ; : Synthese
Synthese von biologisch aktiver intakter Nuoleinsäure
die Verwendung und/oder die Synthese einer mutanten
RNS einschliesst.
Vom praktischen Standpunkt aus gesehen erlaubt die Ver-.
fügbarkeit von relativ reiner Replicase gemäss der Erfindung
den Zugang zu Forschungsgebieten, die bisher noch nicht zugänglich waren. So kann man nunmehr die
Wirkung kleiner oder grosser Veränderungen in dem Repli- '
case-Molekül auf seine Fähigkeit zur Synthese von RNS*und
die Veränderung der biologischen Aktivität der so hergestellten JiNS durch die veränderte Heplicase bestimmen.
Da sie ein Protein ist und deshalb aus einer Reihe von '.. [ ■
Aminosäuren besteht, lässt sich nunmehr die Struktur
der Replicase untersuchen,und die Beziehung ihrer Struktur zur "Struktur der produzierten RNS kann wichtige
Informationen geben bezüglich einer vis-a-vis Struktur- ' aktivität-BeZiehung. Da die Replicase ein grosses Mole- ,·
kül ist undverschiedenen Graden der Hydrolyse durch - : ·
chemische oder enzymatisohe Massnahmen unterworfen ist, ™ wird es von Interesse sein, die Wirkung einer solchen
■Hydrolyse, oia sie nun verhältnismässig klein oder grosser
ist, auf die biologische Aktivität des zurückbleibenden
Moleküls zu bestimmen. Ausserdemkann das Proteinmolekül verschiedenen Graden: chemischer Veränderung unterworfen
werden, wie z.B. der Acetylierung seiner ümsetzungsfähigen
Amino* oder Hydroxylgruppen»der Halo-
909887/1691 . genierung
genierung,Nitrierung oder Sulfonierung; die Umsetzung
mit Salpetersäure wird die freien Aminogruppen des Proteins in Hydroxylgruppen umwandeln, wiederum unter
gewisser Veränderung hinsichtlich der Aktivität.
Die intakte Virus-RNS, die als Initiator-Schablone beim
Verfahren der Erfindung verwendet wird, wurde aus einem gereinigten Virus isoliert. Sie wurde erhalten durch
Enteiweissung der RNS mit Phenol und Reinigung der RNS mittels eines Sucrose-Gradienten. Sie wurde nicht
■ erhalten aus den virus-infizierten Bakterien, jedoch
aus den kompletten Virus-Teliehen (MS-2 und Qß).
Die Replicasen wurden erhalten durch Einführung von
Virus-RNS in einen isolierten mutanten Hfr-Stamm von
E. coli (Q-I3). Das Molekulargewicht der Qß-Repliease.
betrug 1^0.000. ; .>,- i, ,.· =
Die Schablone wurde beispielsweise in vitro mit einem
14
Paktor von 10 reproduziert. Das bedeutet für jedes
Paktor von 10 reproduziert. Das bedeutet für jedes
^ Molekül der intakten Schablone, die erfindungsgemäss
synthetisiert wurde, 10 Vervielfältigungen. Weiterhin wurden 5 Mikrogramm (z.B. 3 x 10 Stränge) von synthetisierter
Viren-RNS in jeweils 20 Minuten pro 0,25 ml des Umsetzungsgemisches hergestellt.
Es wurden Prüfversuche mit den Replicasen durchgeführt,
die die folgenden Hauptmerkmale der Polymerase-Reaktion
ergaben: (1) Die Replioasen können nicht in geeigneter
909887/1691 Weise
BAD ORIGiNAt.
Weise ärbef ten mit '.'Fragmenten von homologen RNSj die Replicase
kann "daher weder'fremde"Sequenzen noch unvollständige Kopien ihres eigenen Genoms vervielfaltigen;
(2). die Replicaseenzyme erzeugen Polynucleotide von dem
gleichen Molekülargewicht wie die Schablonen-Virus-RNS;
- (>)■ Reaktionen, die mit der Schablone bei Konzentrationen
unterhalb der Sättigung der Replieaseenzyme eingeleitet
wurden^ zeigen eine autokatalytische Synthese von RfJSj
(4) das gereinigte Replicase-Enzymprodukt kann als Schablone
dienen mit der gleichen Wirksamkeit wie diejenige von Virus-RNSι (5) die durch das Enzym Replicase produzierteRNS-sind
biologisch aktiv, wie anhand von Infektibnsfähigkeitsprüfungen
gezeigt wurdej (6) die hergestellte RNS war genauso vollständig wirksam (wie sich
anhand der Ausbeute und des Grades der Infektionsfähigkeit ergab) wie die ursprüngliche RNS bei der Programmierung
der Synthese von vollständigen Virusteilchen.
Die erhaltenen Werte zeigten, dass die SelbstVermehrung :
vollständiger Virusgenome in einem wässrigen System eintrat, das sich >aus einem Puffer; gereinigter Replicase,
intakter RNS-Schablone, Nucleotiden und Magnesiumionen
zusammensetzte. Die im vorliegenden Falle zur Verfügung
stehenden Hinweise^eigen, dass jeder der verschiedenen
oben erwähnten Bestandteile in dem Reaktionsgemisch vorliegen muss, um den Vervielfältigungszyklus zu vervollständigen.
.~;7V;._ 909887/1891 Die
BAD
Die Isolierung und Reinigung einer RNS-abhängigen RNS-Polymerase (Replicase) aus E. coli, die mit dem
RNS-Bakteriophagen MS-2 infiziert worden waren, liefert
ein gereinigtes Enzym, das ein obligates Bedürfnis für zugesetzte RNS zeigt und weiterhin eine einmalige
Bevorzugung seiner homologen RNS erkennen lässt. Ribosome- und s-RNS des Gastes bilden keinen Ersatz
als Schablone, und keine dieser cellularen RNS-Typen ^ zeigt irgend eine Fähigkeit, die Schablonenfunktion
der Virus-RNS zu stören.
Die Fähigkeit der Replicase, scharf zu unterscheiden,
löst ein Hauptproblem für ein RNS-Virus, idas versucht, seine eigene Duplikation in einer Umgebung, die mit
anderen RNS-Molekülen überfüllt ist, auszurichten.
Durch Herstellung einer Polymerase, die die Masse der
vorher vorliegenden cellularen RNS ignoriert. Wird
eine Garantie dafür geschaffen, dass die Vervielfälti- W gung auf den einzelnen Strang der neu eintretenden !
Virus-RNS, dem letztlichen Fortpflanzungsursprung, brennpunktartig vereinigt wird.
Die Sequenzerkennung durch das Enzym kann nicht nur
für da.s Virus von Wert sein, sondern auch für die vorliegende Erfindung. Die Suche nach Virus-RNS-Replicasen
muss notwendigerweise aus einer Reihe von hochaktiven cellularen.Polymerasen erfolgen, die imstande sind,
Polyribonucleotide; zu synthetisieren. Wenn das sohliesslloh isolierte Enzym das geeignete Bedürfnis
90 9887/1691
= ■■"·■"■·>-'viAS BAD -original' hinsieht-
: ■·:■■ 1120641
hinsichtlich derSchablone besitzt, dann ist die ausreichende Sicherheit gegebenj, dass der erfolgte Aufwand
und die erhaltene Information tatsächlich anwendbar sind für ein Verständnis der Virus-Vervielfältigung.
Arbeitsmässig erfordert dieser Gesichtspunkt, dass bei ,der Nachprüfung hinsichtlich der Polymeraseaktlvität
Virus-RNS zu verwenden sind bei sämtlichen Fraktionierungs-Sohritten,
-
Diese Zusammenhänge lassen erwarten, dass RNS-Replieasen,
die durch andere RNS-Viren induziert worden sind, eine
ähnliche Bevorzugung für ihre homologen Schablonen zeigen.
Eine ,Möglichkeit, die Sicherheit dieser Vorhersage zu prüfen, ergab sich bei der Isolierung eines neuartigen
und nicht verwandten RNS-Bakteriophagen (Qß) im Laboratorium
von Professor X» Watanabe (Nihon Rinsho, 22f
24? (1964)). Eine Abandoning des Verfahrens, das zur
Isolierung der MS-2-Repliaase benutzt wurde, war aus*
reichend, um eine hQohvgereinigte und aktive §ß-R#pl3.ease
S5U gewinnen*
Die eindeutige Analya»
erfopöerfe den Beweis,, dasss die zu erforsehenäe
tafcsäohlieiv derar^ge VervielfIltigungeri erzeugt. Wenn
es sii?h im feesonderen yjn äi# Syntliese einer Virus^iiuoie
insäure handelt, sind Paten bezüglich der Basenzusammen
setzung und 4er ejsgsfcta JNs^
809887/16«
reichend» Es muss der letzte Beweis erbracht werden,
dass das PolynucleotidRrodukt die Information erhält,
die notwendig ist zur Produktion des entsprechenden VirusfceiiehenSin einem geeigneten Prüfverfahren-System.
Diese Bedingungen legen der Art der Versuchsdurchführung
schwere Beschränkungen auf, wenn diese annehmbar sein soll für die Lieferung eines Ergebnisses, das unwider-
ist
legbar zutreffend/bezüglich der Art und Weise des Ver-
legbar zutreffend/bezüglich der Art und Weise des Ver-
^ vielfältigungsmechanismus. Das verwendete Enzymsystem
muss frei sein von störenden und unerwünscht wirkenden Aktivitäten, so dass man die Reaktion in einem einfachen
Gemisch studieren kann, welches nur die benötigten Ionen, Substrate und Schablonen enthält. Pa die biologische
Aktivität des Produktes wahrscheinlich vollkommen zerstört wird selbst durch eine Bruchstelle (bread ?) im
Molekül, muss die Ausschaltung der Nucleaseaktivität " ganz aussergewöhnlich streng sein» Der erforderliche
Reinheitsgrad macht es notwendig, dass die enzyroolo^
gischen Gesichtspunkte der Erforschung absolut vollständig gegeben sein müssen, bevor eine sichere Prüfung
des Mtehantsmus erfolgen kann»
Insgesamt sseigen^ie gereinigten Replieasen folgende
Unterscheidungsmerkmale*; (a) Freiheit von nachweisbaren
Mengen.der DNS-abhängigen RNS-Polymerase, Ribonuclease I
(J,
BAD ORIGINAL
. ■ - 19 ■>■■"■■ ; : ■...■■'■
(J.Biöl. Chem., 259, 3716-3726 (1964)) undRNS-Phosphoryla'se;
(b) vollständige Abhängigkeit von zugesetzter RNS für die synthetische Aktivität; (c) Befähigung zur
längeren (mehr als 5 Stünden) Synthese von RNSj (d) die Fähigkeit zur vielmaligen Synthese der Einführungs-Schablonen;
(e) Sättigung bei einem niedrigen Niveau der RNS (l·/ RNS/40 η/ Protein); (f) tatsächliches
und ausschliessliches Bedürfnis für die intakte Homologe
Schablone unter optimalen Ionenbedingungen.
' 'VV--■'■ ■:■■ '- ' ■'"■ ■ :' / :
Die scharfe Unterscheidungsfähigkeit der Repllcase erlaubt eine einfache Prüfung in Bezug auf die Ähnlichkeit
zwischen Schablone und Produkt. Wenn man die Reaktionen
bei einer Schablonenkonzentration unterhalb derjenigen
beginnt, die zur Sättigung des Enzyms erforderlich ist,
folgt die RNS-Synthese einer autokatalytlsehen Kurve.
Wenn das Sättigungskonzentrations-Niveau erreicht ist, wird die Kinetik linear. Das autokatalytische Verhalten
unterhalb der Sättigung des Enzyms bewirkt, dass das
neu synthetisierte Produkt wiederum als Schablonen für die Reaktion dienen kann. Um diese Schlussfolgerung
direkt zu prüfen, wurde das Produkt -gereinigt aus einer
Reaktion, die man solange hat fortschreiten lassen,
bis sich ein 65-facher Zuwachs der Einführungs-RNS angereichert hätte-. Die Fähigkeit der neu synthetisierten
RNS, die Reaktion zu starten, wurde bei einem Sättigungsversuoh geprüft, und es würde gefunden, dass sie
Identisch ist mit der RNS, welche aus Virusteilchen
9098877T691 isoliert
isoliert wurde;. Es ist klar, dass die zur Erkennung
durch das Enzym verwendeten Sequenzen wahrheitsgetreu kopiert werden.müssen.
Besondere Aufmerksamkeit wurde der scharfen Unterscheidungsfähigkeit
geschenkt, die von den beiden Replicasen bezüglich ihres Ansprechens gegenüber hinzugefügter RNS
gezeigt wurde. Keine der Replicasen kann mit der RNS
der anderen arbeiten.· Jede erkennt das RNS-Genom ihres fe Ursprungs und benötigt dieses als eine Schablone für
ihre synthetische Aktivität. Die gezeigte Spezifität
der anderen arbeiten.· Jede erkennt das RNS-Genom ihres fe Ursprungs und benötigt dieses als eine Schablone für
ihre synthetische Aktivität. Die gezeigte Spezifität
wirft Fragen auf bezüglich des Mechanismus, der von der Replicase verwendet wird bei der Unterscheidung
ihrer Schablone von anderen RNS-Molekülen. Der augenscheinliche
Gedanke liegt nahe, dass eine beginnende Sequenz erkannt wird, eine Möglichkeit, die einer einfachen Prüfung zugänglich ist, wenn man die Wirkung der
Replicase auf Fragmentpräparate der homologen RNS herausfordert. Wenn die Anfangssequenz das einzige Bedürfnis
ist, dann sollten RNS, die zu halben und viertel Teilen zerbrochen sind, in angemessener Weise als
Schablonen dienen.
Versuche haben gezeigt, dass Virus-RNS-Fragmente völlig
unwirksam sind, um die Replicase zu synthetischer Aktivität anzuregen, wodurch aufgezeigt wird, dass der
Erkennungsmechanismus mehr als die Anfangssequenz umfasst.
Dieser ist offensichtlich so ausgerichtet, dass
die 909887/1691 ~
BAD ORIGINAL
die Vervielfältigung von Fragmenten ihres eigenen
Genoms vermieden wird* selbst wenn diese die Änfahgs-■
sequenz enthalten» ■ '
Die durch dieRepliease produzierte RNS ist vollständig
imstande, die Herstellung kompletter Virusteilchen zu
' programmieren. Die gereinigte; Repliease aus E, coil r
Bakterien, die mitfeinem RNS-Bakteriophagen-(Qß) infiziert waren, erzeugte ein Bolynuoleotid des gleichen
Molekulargewichtes wie die Virus-RNS, und die Repliease
kann nicht unterscheiden die Virus-RNS von seinem
eigenen RNS-Genom. Durch Startreaktionen mit Ei-nfÜhrungsverhältnlssen
unterhalb des Sättigungsniveaus der
Schablone zum Enzym wurde eine autokatalytische Kinetik
des RNS^-Zuwachses beobachtet. Es ist offensichtlich,
dass die Selbstvermehrung von vollständigen Virus-Genomen oder Vervielfältigungen der Einführungs-RNS in
diesem einfachen System vor sich ge.ht.
Die vorstehend genannten Eigenschaften lassen zwelfelsr
frei erkennen^ dass das erforschte Enzympräparat tatsächlich
identische Vervielfältigungen der Einführungsschablonen erzeugt.
Bei einer weiteren AusfÜhrungsfofm der Erfindung"sind
die: Replicasepräparate, welche verwendet werderij, im
wesentlichen frei von nachweisbaren Mengen an Virus-Infektionsfähigkeit^
um -eine erhöhte VervielfSifeigungs*
wirksamkeifc sicherzustellen.« , ^
; : -; '■■'■" '"'■''■ : :■ ■ .:■' Ζ" Die .-- ■"■
Die serienmässigen Übertragungsversuche in vitro, wie
sie.oben erwähnt wurden, benötigen Prüfverfahren für
die Infektionsfähigkeit der Umsetzungsgemische. Eine technische Schwierigkeit wird durch das Vorliegen von
lebensfähigen Virusteilchen in den Replicasepräparaten eingeführt. Ihr chemischer Beitrag zu dem RNS-Gehalt
ist nichtssagend verglichen mit den synthetisierten Mengen. Da sie jedoch eine weitaus grössere Infektionswirksamkeit haben als freie RNS, können selbst massige
* ' Verunreinigungen mit intakten Teilchen in dem Material nicht geduldet werden, das entweder bezüglich infektiöser
RNS geprüft werden soll oder das zur Einführung
in einen Gast benutzt wird. Um diesen Schwierigkeiten aus dem Wege zu gehen, werden sämtliche synthetisierten
Produkte mit Phenol gereinigt und auf vollständige Virusteilchen geprüft, ehe die Messung auf Infektionsfähigkeit vorgenommen wird. Dies jedoch macht das
Prüfverfahren sowohl aufwendig als mühsam und schliesst seine einfache Anwendung" in Laboratorienversuchen oder
als therapeutisches Mittel aus.
Die Abtrennung von Virusteilchen aus der Virus-Replicase
kann erreicht werden, indem man ihre Verschiedenheiten
hinsichtlich dervGrösse und Dichte vorteilhafterweise
heranzieht. Das Qß-Virus /"*J.Bacteriol., 91, 44-2
(1966)_7 «afc ein Molekulargewicht von 4,2 χ 10 und
eine Dichte von 1,43 gm/om , Es. war unwahrscheinlich,
dass
90 9 8 8 7/1601
, BADORlGiNAL
dass die Replicase eine solche Grosse oder Dichte aufweist.
Die erfolgreiche Reinigung der Replicase anhand der Grosse und Dichte erzeugte einen Effekt, der über
ein bequemes Ausschalten von Virüsteilchen hinausging.
Das gleiche Verfahren nämlich entfernte auch freie RNS und Replicase, die komplex gebunden ist an vorausgesetzte
"repllcative Formen" /fcf. Fed. Proceed., 23,
1285 (19)_7
Nachstehend wird die weitere Reinigung von Qß-Replicase
beschrieben durch Behandlung (banding) mit CsCl- A
Gradienten und nachfolgendem Zonen-Zentrifugieren in
linearen Sucrose-Gradienten. Das erhaltene Enzym ist im wesentlichen frei von Virus-Teilchen und verhält
sich bei den Fraktionierungen wie eine einzelne Komponente. Sein Molekulargewicht (110.000) und seine
Dichte (1,26) schliesssn eine Assoeiierung mit den sogenannten "replicativen Formen" oder "negativen" Strängen
aus.. Seine Fähigkeit, auf Qß-RNS durch synthetisierende
infektiöse Kopien anzusprechen, bleibt unverändert.
Die Daten weisen nicht auf eine verborgene -
Funktion von vorher vorliegenden RNS (doppelt- oder
einzelsträngig) bei der zu untersuchenden Reaktion hin.
An diesem Punkt des Reinigungsverfahrens liegen noch
.'■■""■ \ . ■ ■ ". .·■■■■."
Verunreinigungen durch andere biologisch inaktive Stoffe
vor, obwohl das Enzym (Replicase) im wesentlichen frei
von verunreinigenden Phagenteilehen und anderen Enzymen
909887/1691
ist. Der Prozentsatz an Enzym (bezogen auf Aktivitätsmessungen) liegt an diesem Punkt in dem Produkt im Bereich
von etwa 0,05 bis 0,5 Gew.-%. Weitere Reinigung
des Enzyms durch Entfernung von nicht-enzymatisch. biologisch inaktiven Stoffen wird erreicht durch Verwendung
einer oder mehrerer der folgenden Arbeitsweisen:
(1) Absorption an Cy-Aluminiumoxyd (Aluminiumhydroxydgel)
(2) isoelektrische Ausfällung ; (j5) Fraktionieren mit
Ammoniumsulfat und (2O Adsorption und Elution mit
fc DEAE-Cellulose. Derartige gereinigte Präparate behalten
in der Gesamtheit ihrer Eigenschaften diejenigen des oben efcwähnten vervielfältigenden Enzyms und besitzen
ausserdem folgende Merkmale:
(1) Das Replicase-Präparat ist frei von wesentlichen
Mengenanteilen an Virus-Tnfektionsfähigkeit;
es ist deshalb im wesentlichen nicht infektiös und nicht behaftet mit einer wesentlichen Konzentration
an verunreinigenden RNS-Molekülen.
(2) Wenn eine zufriedenstellende Reinigung durchge-™
führt worden ist unter Erzielung eines praktisch
gereinigten Replicase-Präparates, wie oben beschrieben,
dann sind aus der Replicase wesentliche Mengen an biologisch inaktiven Verunreinigungen
entfernt worden.
Die beiliegenden Zeichnungen seien wie folgt erläutert:
Pig. 1
909887/1691
BAD ORIGINAL
Fig. 1 zeigt einen V/ergieich der Diagramme des Proteins
und der Enzymaktivität der Präparate (vgl« Beispielί,
Teil 5), die von infizierten und nicht«infizierten Zellen
stammen (vgl* Beispiel I, Teil 7). Die Vollständige Abhängigkeit von Q,ß-RNS zeigt, dass das Enzym keine Nucleinsäure
enthält, welche innerhalb der Versuchszeit
zur Anregung der Enzymaktivität dienen kann. Eine entsprechende Fraktion von nicht-infizlerten Zellen ze.Jgt
ähnliche Elutionseigenschaften, besitzt Jedoch 'keine
nachweisbare RNS-Synthesefähigkeit. V
Fig.2 (vgl, Beispiel I, Teil 7) zeigt das kinetische
Verhalten der Replicaseaktivität in einem Reaktionsgemisch,
welches Sättigungsmengen der RNS-Sehablone
(Ιμβ- RNS pro 40 μg Protein) enthält. Durch Veränderung
der Menge an zugesetzter RNS sowie der Zeit, die
zur Synthese zügelassen wurde, ist tatsächlich Jeder
erwünschte. MehrfachzuwaehS des Äusgangsmaterials erzielt worden* -
(Beispiel Ί* Toil f) zeigt die Wirkung
gesetzter Pröteinmengen"bei einer festgesetzten Mengö
dei« RNS^Schablöfte ( 5 μ§ MS/p, 25 ffll.). Es ist ersiöht;
lichjVdass die Reaktion lineal? veilaiift^ wöduröh die
Abwesenheit von^störenden verunreinigungea int gerei»
Enzym aögez6igii,viird'* .
Fig* 4 zeigt das kinetische Verhalten &e? MS-Synthese
909887/1091
und vergleiöht das Auftreten sowohl der neuen RNS
und der infektiösen Einheiten bei verschiedenen Zeiträumen
(Beispiel III, Teil 1). Das Anwachsen der hergestellten RNS geht parallel mit einem Anstieg der
Anzahl der infektiösen Einheiten.
In Pig. 5 werden die neu synthetisierte HNS und die
infektiösen Einheiten bei den Schritten eines serlenmässigen
Übertragungsversuches verglichen (Beispiel III, Teil 2). Die neu synthetisierte RNS ist in derselben
Weise vollständig geeignet wie die ursprüngliche Virus-RNS zur Programmierung der Synthese von Virusteilchen
und um als Schablone für die Erzeugung weiterer Kopien zu dienen.
Fig. 6 zeigt das Ansprechen der Replicase auf intakte
und fragmentartige QB-RNS (Beispiel IV, Teil 2). Die
fragmentartige Qß-RNS ist nicht imstande, die Replicase
bis zu einem Grad anzuregen, der auch nur annähernd der vollen Aktivität entspricht.
Fig. 7 zeigt die Wirkungen der Grosse der RNS-Schablone
und des Mn+* auf die Kinetik der RNS-Synthese und die
anomalen Abweichungen, die bei der Reaktion entweder
durch brüehstüefcarfcige RNS oder das Vorliegen von
Mn+* hervorgerufen werden (Beispiel IV, iteil 2). ;
Die Synthese äer MS verlauffc während längerer Zeiträume
909887/1691
■ . -.'■ ■ - 27 - - .· ' ■■'■-■■
räume linear in Gegenwart von sättigenden Mengen der intakten Schablone und Mg++. Wenn Mn++ in das Reaktionsgemisch
eingeführt wird, hört die Umsetzung in etwa 60 Minuten auf, selbst wenn die 28S-RNS als
Schablone verwendet wird. Das Ansprechen des Enzyms auf eine fragmentartige Schablone verläuft derart,
dass die Anfangsreaktionsgeschwindigkeit geringer als
des Normalen ist und hört in JO Minuten vollständig
auf, ob Mn++ vorliegt oder nicht.
Fig. 8 bis 14 erläutern eine weitere Ausführungsform
der Erfindung, wobei die Replicasepräparate, die verwendet
werden, im wesentlichen frei von nachweisbarer Virus-Infektionsfähigkeit sind,und es werden Werte
für die Replicasepräparate aufgezeigt, die nur den Verfahrensschritten der CsCl-- und Sucrosezentrifugierung
unterworfen waren: Fig. B zeigt die Ergebnisse •der Bandenfraktionierung (banding) des Enzymproteins
in einem CsCl-Gradienten; Fig. 9 zeigt den Vergleich ·
des Substrat (primer)-Ansprechens durch die Replicase
vor und nach der CsCl-Reinigung; Fig. 10 zeigt einen
Vergleich der autokatalytischen Synthese durch die
Replicase vor und nach der CsCl-Reinigung; Fig. 11
zeigt.das,Verhalten der Replicase während der Sedimentation
im Sucrosegradientenj Fig. 12 zeigt die Wiederauflösung
der Replicase und Transcriptase in Sucrosegradienten;
Fig. 15 zeigtdie Sedimentationsanalyse
"■--■ -■"."-,' ,der ■ .
909887/1891 -^-
der sehr erheblichen Synthese mittels der Replicase,
die durch CsCl und Sucrose gereinigt worden war; Fig. 14 zeigt die Synthese von RNS und infektiösen
Einheiten durch Enzyme, die durch CsCl- und Sucrosezentrifugieren gereinigt worden sind.
Bezüglich der folgenden Ausführüngsbeispiele umfasst
Beispiel I zwei RNS-Replicasen, welche in dem gleichen Gast durch nicht verwandte RNS-Bakteriophagen hervorgerufen
wurden. Beide Replicasen sind gereinigt worden, und ihr Ansprechen auf verschiedene RNS-Moleküle wurde
geprüft. Unter optimalen Ionenbedingungen sind beide völlig inaktiv gegenüber heterologen RNS, einschliesslieh
der Ribosomen- und s-RNS des Gastes. Keine der Replicasen kann mit der RNS der anderen arbeiten.
Jede erkennt das RNS-Genom ihres Ursprungs und benötigt dieses als eine Schablone für die synthetische
Aktivität. Diese scharf unterscheidende Auswahlfähigkeit seiner Replicase ist ein offensichtlicher Vorteil
eines Virus, das versucht, seine eigene Duplikation in einer cellülaren Umgebung, die mit anderen RNS-Molekülen
vollgefüllt ist, auszurichten.
In den nachfolgenden Beispielen II und III sind Versuche
mit einer gereinigten Replicase beschrieben, welche in E. coli durch den RNS-Bakteriophagen QS induziert
worden ist. Die Daten zeigen, dass das Enzym
- - identische
909887/1691
- identische Kopien der hinzugefügten, Virus-RNS erzeugen
kann. Ein serienmässiges Verdünnungsexperiment hat belegt,
dass die neu synthetisierte RNS genauso wie die ursprüngliche Virus-RNS geeignet ist, um die Synthese
von Virusteilchen zu programmieren und als Schablonen
für die Erzeugung weiterer Kopien zu dienen. Da die
Daten erkennen lassen, dass das Enzym tatsächlich •Vervielfältigungen erzeugt, ist nunmehr eine zweifeisfreie
Analyse des RNS-Veryielfältigurigsmechanismus
möglich, und zwar in einem einfachen System, welches
aus gereinigter Replicase der Schablone-RNS, Ribσsidtriphosphaten
und Mg besteht.
Gemäss dem nachfolgenden Beispiel IV wurde gefunden,
dass in Bruchstücke zerbrochene Virus-RNS aussergewöhnlich
unwirksam sind zur Anregung der Replicase bezüglich
synthetischer Aktivität,. Die Replicase ist offensichtlich befähigt, die Vervielfachung von Fragmenten
ihres eigenen Genoms zu vermelden. Obwohl die Synthese
von Virus-RNS während längerer Zeiträume in Gegenwart
..-■:. - f ■ : und Mg++
von Sättigungsmengen der intakten Schablone/linear Verläuft, hört die Reaktion nach einer verhältnisfflässig
kurzen Zeitspanne aUf# wenn dem Reaktionsgemisöh
Mn+"1* zugeführt
Das nachfolgende Beispiel V erläutert ein Verfahren zur Erzielung intakter Virus-RNS>■ wie z.B. 4ß-
■ ".-"".." '■■ zur
887/1691
zur Verwendung als Schablone. Das gleiche allgemeine
Verfahren kann verwendet werden sowohl zur Herstellung MS-2-Phagen als auch anderer Phagen.
Das nachfolgende Beispiel VI beschreibt im einzelnen
ein Verfahren zur Reinigung von RNS-abhängiger RNS-Polymerase
(Replicase), die gemäss einer weiteren Ausführungsform der Erfindung aus infizierten Bakteriophagenzellen
gewonnen wurde.
Beispiel I
1. Bakterien und Viren
1. Bakterien und Viren
Die verwendeten Bakterienviren sind MS-2 (ursprünglich
erhalten von Dr.A.J.Clark vom department of microbiology,
University of California, Berkeley, California) und Qß
(erhalten von Professor Watanabe). Wenn"man mit den beiden Viren MS-2 und Qß arbeitet, muss dauernd darauf
geachtet werden, dass keine Verunreinigung des einen mit dem anderen eintritt. Glücklicherweise liegt keine
serologische .Überkreuzungsreaktion zwischen den beiden ■■ .
. vor (Nihon Rinsho, 22, 243 (1964)), so dass die geeigneten
Antiseren zur Identifizierung und Reinheitsprüfung verwendet werden können.
Die beiden RNS-Goliphagen, MS,2 und Qß, wurden physikalisch
Und 'Serologisch charakterisiert: Ms-2 hat einen S2Q, -Wert von 79* ein Molekulargewicht von
3,6 X IG ,eine Dichte von 1,422 und einen pH-Wert
am isöelektrisehen Punkt von 3*9* Q.ß hat einen S„n .
, von 84# ein Molekulargewicht von 4,2 χ IQ , eine
'.-909887/1691
• Dichte
Dichte von 1,429>und einen -pH-Wert am isoelektrischen
Punkt von 5,j5. Ein Gastorganismus . (E. coil A-I9) erlaubt eine Unterscheidung zwischen den beiden auf Grund
eines ausgeprägten Unterschieds in der Grosse der
Plaque, Sie unterscheiden sich immunchemisch, da keine~ serologische Überkreuzungsreaktion entdeckt vrerden kann.
Der Gast- und Prüforganismus 1st ein mutanter Hfr-Stamm
von E. coil· (Q-l», der im Laboratorium von W. Gilbert
(department of biology, Harvard University,Cambridge,
Massachusetts) durch Diane Vargo, früher Assistent
bei Dr. Gilbert, nunmehr Mitarbeiter im department of
microbiology; Univerity of Illinois, Urbana, Illinois,
isoliert wurde. Der Stamm hat die günstige Eigenschaft,
dass ihm Ribonucleasen und RNS-Phsphorylase fehlt;
(Fed. Proc, 24, 295-(1-965) >.£-Q-l>
ist ein Abkömmling von A-19, einer RNS-ase negativen Mutanteri, die hier
erörtert wird. Die Herstellung der Virusausgangsmaterialien und der gereinigten RNS erfolgte gemäss
der Arbeitsweise von*Doi und Spiegelman (vgl. Proc.,
Nat 1I, Acad. Sei., U.S., 49, 355-360 (1963)).
2. Herstellung von infizierten Zellen
Das Grundmedium, das für das Wachstum der infizierten
\ ■ ■■-■■'
Zellen und zur Herstellung des Virus verwendet wurde,
enthielt die folgenden Bestandteile in g pro Liter:
NH^CIi Ij MgSO^.T H2Q, 0;06; Gelatine 1 x,10"5; ',
■-■■■-■■ -.' -Casamino-,
909^87/1691
Casaminosäuren (vatiminfrei), 15; Glycerin, JQ;
hierzu werden nach getrenntem Autoklavieren 7 ml 0,1 m CaCl2 und 10 ml, enthaltend 4 g Na2HPO2^ H2O
und 0,9 g KHpPOh, hinzugefügt. Zunächst werden Lysate
in Liter-Mengen hergestellt, die verwendet werden zur
Infektion grösserer Volumina von Zellsuspensionen. Diese werden erhalten durch Infizierung· von Kulturen
(QDßgQ von 0,25) in der log-Phase mit-einem gereinigten
Präparat von Phagen bei einer Multiplizität von etwa ™ -5« Diese werden unter Schütteln bei-370C inkubiert,
bis die Lysis vollständig ist, undftann wird hinsichtlich
des Gehalts und der Reinheit der Phagei geprüft. Derartige Lysate können bei -17°C in gefrorenem Zustand
unbegrenzt gelagert werden und lassen sich direkt vor der Verwendung auftauen. Im allgemeinen werden Mengen
von 35 Litern an Zellen in Glasballons bis zu einem 0D660 zwischen etwa 0,275 und 0,290 herangezüchtet.
Die Temperatur' in den Ballons beträgt 3^0C, während
Λ die Temperatur des Wasserbades, in das sie eintauchen,
bei 370C gehalten wird. Wenn die Zellen einen ODg^0
von 0,275 erreicht haben, werden sie mit dem Virus bei einer Multiplizität zwischen 10 und 50 infiziert
und 1 Minute lang zur Vermischung belüftet..Die Belüftung
wird 10 Minuten vor der Absorption unterbrochen,
wieder aufgenommen und die Inkubierung fortgesetzt. Nach 25 Minuten werden soviel Sucrose und Magnesium
hinzugefügt, 909887/1691
162Q64S
hinzugefügt, dass sich eine Endkonzentration von
1.8$ bzw. 0,01 m ergibt; Nach weiteren 5 Minuten wird
das Verfahren durch Zusatz von zersto'ssenem Eis beendet Die Zellen werden in.einer Sharples-Zentrifuge geerntet
und bei -l4°C gelagert, bei welcher Temperatur die
Enzymaktivität während einer Zeiti die 6 Monate überschreitet,
erhalten bleibt. Nicht-infizierte Zeilen,
werden in der gleichen V/eise hergestellt und gelagert.
Um einheitliche Präparate zur Enzymisolierung zu schaffen,
werden die Zellen irgendwann vor der Verwendung
aufgetaut und in einer Lösung wieder suspendiert .--... ■ "-
-fSö g gepackter Zellen in 100 ml), weiche 0,01 $l· frispuffer
pM-Wert 7,4, O,OQl m MgCl^ und 0,0005 "jn: -..-..
Mercaptöäthanöl sowie 5 IJ-g/ml DNS-ase (Ribonucleäse)
enthalt« Mäch .gründlicher Suspension mit einem Magnetrührej?
bei %°0 wird die Öüsperis i oh in ge eignet e" Anteile
in i»lästikrc5hren aufgeteilt, eingefroren und "bei -il^e
gelagert. -
3-
i
£■ -maskierte Ribonußlebisidffionbphosphate werden^ wie
in Sroc. Mät'i. Acad.^ Sci.^VIJ.S. t §0j -905-911; (19^3) be
schrieben^ hergesteiit. Die' iiiäi»kie*rten iiononucieotide
werden" enzymatis<;ft. in die ehfcs-pi^eGhehdeh Mbbriücleösidtriphosphate
uinge$mndeit iniit iiiifs^ eines Isolierten
KinasePräparates aus E. coil (Biööhiin. "Biophys;
61, 29-35 (1962)5. ':
9ö0ö8J/1Eft BA0
4. Chemische und biologische Reagenzien Die nicht markierten Ribasidtriph.ospha.te stammen von
P-L Biochemicals, Inc.^ Milwaukee, V/isconsin. DHS-ase
von V/orthington Biochemical Company, Freehold/ Hew
Jersey wurde zweimal urnkristallisiert, weiterhin an DEAE-Zellulosesäulen gereinigt, um verunreinigende
Ribonuclease zu entfernen, Phosphoir.ol^/ruvat (?3?)
und die entsprechende Kinase (PEP-Kinase) v/urde bezogen
von Calblochem, Inc., Los Angeles, California; Lysozym
von Armour and Company, Kankakee, Illinois und Protamlnsülfat
von SIi Lilly, Indianapolis, Indiana. Der gelbe Rübenmosaikvirus (TYIiV-RNS) und der "Satellitvirus"
des Tabaknekrosevirus (STtIV-RNS) wurden beide von
Dr.B..Reichmaftn (Botany Department, University of
Illinois) geliefert.
5. Snzyrnhersteilung
Die folgende, Arbeitsweise wird für 20 g gepackter Zellen
beschrieben. Die eingefrorene Zellsuspension (120 ml) wird aufgetaut, und zu derselben werden 0,5 mg/mi
Lysözym hinzugefügtj danach wird das Gemisch eingefroren
lind zweimal aufgetaut unter Vervendung von
Methanol und Trockeneis als Kältegemisch. Zu deni Lysat
werden 0,9 ml 1 m*MgCl2 und 2^5 μg/ml DMS-ase (Desoxyribonuclease)
hinzugefügt, und das erhaltene Gemisch wird 10 Minuten lang in einem Eisbad inkubiert. Der
Extrakt wird dann 20 Minuten lang bei 30.000 χ g
•zentrifugiert und der Überstand entfernt. Der plüttchenförmige
Zentrlfugierrückständ wird in einen vor- gAD ORIGINAL
8688HBSi
gekühlten
: T62064S
gekühlten Mörser gebracht, 5 Minuten vermählen;und.
dann in JO ml des gleichen Puffers suspendiert, der
auch für die "Zellsuspensiön verwendet wurde, mit der ,
Abwandlung., dass die Magnesiumkonzentration auf
0,01 m erhöht wurde, um die Wirksamkeit der DNS-ase-Wirkung
zu erhöhen. Der Extrakt wird dann bei '',_■/
30.000 χ g 20 Minuten lang zentrifugiert, und die beiden Überstände werden vereint auf eine Molaritat von
0,01 EKDA (Kthylehdiamintetraessigsäure, die vorher
auf einen pH-Wert von 7,^ gebracht worden.war) eingestellt
und bei Ö°C 5 Minuten lang inkubiert. Es traten
- - stoffe .■"-."■
unlösliche Eiv/eiss/ auf, die durch Zentrifugieren bei
3O.OOO x g während 20 Minuten entfernt vmrden. An diesef·
Stelle besass ein typischer aktiver infizierter Ex- ' trakt ein QD2^0 zwischen 150 und 180. Niedrigere Werte
zeigen im allgemeinen eine schlechte Infektion an, die eine geringe Ausbeute ah Enzym liefert. Zu der
geklärten Überstandflüssigkeit werden Q,01 rr.£ Protaminsulfat
für Jede ODpgQ-Einheit hinzugefügt. liach 10 Minuten
wird der gebildete Niederschlag, der praktisch die gesamte Enzymaktivität enthält, durch 10 minütiges
Zentrifugieren bei 12.000 χ g gesammelt. Er wird
in 12 ml eines Standardpuffers aufgelöst (0,01 m
Trispuffer, pH-Wert 7,^j 0,005 m MgCl2; 0,0005 m
MercaptOäthanol), auf eine ■(NHj.JgSQ^-Koiarität von
0,4 eingestellt und bei 0°C über Kacht stehen gelassen. >.
-■"·.-_"■ " : Diese : ;
SOa087/T69i —
Diese Wartezeit ist wichtig für die nachfolgende Fraktionierung,
da gefunden wurde, dass die vollständige Trennung, wesentlich ist für eine annehmbare Abtrennung
der Replicase von der Transcriptase (Transcriptase ist das Übermittl"ungsenzym, das DNS als Schablone benutzt
zur Synthese komplementärer RNS, und es ist weiterhin
bekannt.« als DNS-abhängige RNS-Polymerase). Der Extrakt wird verdünnt mit 24 ml eines Standardpuffers
und bei JO.000 χ g nach 20 Minuten 20 Minuten
lang zentrifugiert,, und zu jeweils 40 ml des Überstandes werden 12 ml einer 0,5$igen Lösung von Protaminsulfat
zugegeben. Der sich bildende Niederschlag enthält im wesentlichen die gesamte DNS-abhängige RNS-Polymerase
zusammen mit einer RNS-unabhängigen RNS-polymerisierenden
Aktivität*,, Die RNS-Replicase verbleibt im Überstand
und beginnt gute Abhängigkeit von hinzugefügter RNS zu zeigen. (Dies ist einer der kritischen Schritte
bei der Fraktionierung, und jede Veränderung bezüglich ^ des Gastorganismus, des Mediums, der Zeit oder Tempe- ' ·
ratur der Infektion verändert die Menge an Protamin,
die notwendig ist zur Erreichung der Trennung. Es ist
oftmals sicherer, geringe Anteile zu titrieren und die Menge an Protamin , welche benötigt wird, durch
geeignete Prüfmethoden zu bestimmen.)Nach IO Minuten
wird der Niederschlag durch 10 minütiges Zentrifugieren bei 12.000 χ g entfernt. Zu dem sich ergebenden Überstand
wird das gleiche Volumen an konzentrierter Ammo-
nium-909887/1691
BAD OHlGiNAL
162064S
niümsulfatlösung hinzugefügt (gesättigt bei ÖDG und
mit Ammoniumhydroxyd auf einen pH-Wert von 7.,O eingestellt)* Nach 10 Minuten bei O0S wird dear· Nieder-;
schlag durch Zentrifugieren bei 10'.-00O- -x g während _
10 Minuten gesammelt· und ;in 2J- ml eines Standard- -/
puffers aufgelöst, der 0,4 m Ämmöniumsüifat enthalt»
Die erhalten^; Lösung wird dann gsgen 1 'tdpm? einss :
Standärdpuffers während■" 1,§ Stunden dialysieft» Die
dialysisrte Fraktion wird mit dem Standardpüffer auf
tine AmffiöMuffiSülfateBolarifeäii von 0^05 eingegtsllt
Ufld äüröh eine ■ßlÄM-Oellultaseisä'üle (1,2·- 3c IO ö») ge^
kbi die direkt >or der Verwendurig mit 100 ml r
Stäftdärdpuffers ausgewaschen wurde»Nash Aufgabe
d#§ Fföteins .wird d-ife. Säule, mit 4© ml ©Anis Standard*
puffSi4S.: ausgewasöhen^ -'&&$>
Q3IM: m MaOl^ welshes das -
(J4 liol» Ühtfflv4 "
e entfernt,,: ©nthllfe* Sa-S Eagyffi wiru ■ daa-n
fflife 33 Ml dss Sfeandardpuff^PSr4J ü©r 0*SO ffi Mäöl
eiüitrt * !«. dia^ ft»akti€vneas uie
^ . wirä gesafetigte/ -Afflmenlufflsuif ätlösM&g- Ma
zugöf tigü, Uffi der, Endlösting öint lO^ige; gä
geben» Aß di&gejft JPunkfe :hk%; tlat lniyffipr"
■■Ößgjgö/pÖggO*^*1^!^^ Vöii-' Iv^.tiflä enthlit:
lieh M mg PröHfi-n pr©.-ffil.». Unter .ü§& änf tgtbi
lönenbedingüngen' isfe Mi -eiaef» tägtKliife ;¥-©|5. l-_-Möaa%"
Q0O kein' Aiifeiv-itltgrerlutt 2u fe;e#'Me&teft.*: -.■■■"'.
6 ♦ Stanclar-clunter suchun.nesy erfahr en -
untersuchung? der* Enzymaktivität durch Binver^-
lelbung -von radioaktiven nucleotiden
Das Stahdardurnsetzungsvolumen beträgt 0,25' ml,. und es
enthälts wenn nicht anders" angegeben, die folgenden
Bestandteile in μ-Molen: Tris-HCl pH-Wert 7,^, 21j
Magnesiumchlorid", 5*2 (Manganchlorid, wenn es verwendet
wird> 0,2); CT1B, ΑΪ?, U^P und GTP, o'ev/eils
0,2* Das Enzym wird gewöhnlich geprüft bei einer Menge
von 4O1Ug Protein in Gegenwart von 1 μ«; der RifS-Scha.-blone«.-Man
lässt die Reaktion 20 Minuten lang bei 35°C ablaufen_ und beendet sie in einem. Sisbad durch Zusats
von O* 15 Ml -neutralisisrteni gesättigtem Pyrophosphat,
0,15 ml neutralisiertem gesättigtem Orthophosphat
und.OjI ml SO^xger Trichloressigsäure. Der niederschlag
■wird auf ein Membranfilter überführt und siebenmal mit
5 ml kalter.lö^iger ^richloressigsäurs ausgewaschen.
Die Membran wird dann getrocknet und in einem Flüssigkeitsscintilationszahler
gezahlt, wie es in Pröc, -Nat 1I1, Acad* Sei*, U.S.,. 50,-905-9H-.(1963)
beschrieben Viird» Bisses . Auswaschv^rf ahren ergibt
Mulltei t"Zahlungen viehiger als öQ cprn mit Eingabe-Zählungen,
von 1 ic 10 cpsi4 Die spezifischen Aktivitäten
des hinzugefügten markiertan triphosphats wurden so
e Inges teilt >■ dass mit der angewenaeten '.'i-rksaakeit
1 & 10 ops 0^2 μΚοΙβή des entsprsGhenden ^riphosphats
Uli
BADORtGlNAL
7. Ergebnisse .
(A) EiRenscfag.ften der vereinigten Qß-Repliease
:
Pig. 1 betrifft; die Chromatographie des zweiten Protaminüberstandes
an PEAE-Gellulose und vergleicht die SIutionsdiägramme
von Protein und der Enzyrr.aktivita;t;von
Präparaten (vgl, nachfolgenden Teil 5), die äus.infizierten und nicht-infizierten Zellen
Für die Werte nach Fig. 1 .'wurde .die-folgende. Arbeitsweise
angewendet: 35 .sü·. von 0,2 in NaCl in dem Standardpuff
er v/urden auf die Säule gegeben, kurz bevor
Fraktion Nr. laufgefangen wurde. Vorher wurde die
Säule, wie in Teil 5 vorstehend beschrieben, mit 0^12 m HaCl ausgewaschen. Es ist zu beachten, dass
;der Peak der Snzymaktivität sich in-...der-.abfallenden
Schulter des 0. D.-Diagrarnmes findet, ilochmalige
'Chromatographie ergibt ein Zusammenfallen der beiden.
Infizierte Präparate zeigen, eine Pölyneraseakti'vität,"
die mit 0,2 m KaCl eluiert v/ird, ausgezeichnet auf
zugefügte Q3-HNS anspricht und frei ist von DHS-abhängiger
RNS-Polymerase. Die vollständige Abhängigkeit
von Qa-HWS lässt erkennen, dass das Enzym kerne
Nucleinsäure enthält, die zur Anregung des Srizyns
hinsichtlich seiner Aktivität innerhalb der "Versuchs -..
zeit dienen kann. Eine entsprechende Fraktion, von nicht-infizierteri Zellen zeigt ähnliche Elutionseigenschaften,
besitzt aber keine.nachweisbare
RriS-synthetisierende Fähigkeit. "
909887/16191 ^€
162064S
Die nachfolgende Tabelle 1 zeigt, dass nach der DEAE-Behandlung
das Enzym völlig frei ist von Ribonuclease I Phosphorylase und der durch K+ angeregten Ribonuclease.
- Die Gegenwart des Energie liefernden Systems (PEP +
ΡΞΡ-Kinase) hat nur geringe Wirkung" auf die Reaktion (vergl. Tabelle 2 unten) und zeigt, dass sie frei ist
von störenden Enzymen, die die Ribosidtriphosphate zerstören können. Schliesslich hat DNS-ase keinen Ein-
£ fluss auf die Reaktion, wohingegen, das Vorliegen selbst
geringer Mengen von Pancreas-Ribonuclease die gesamte
Synthese des.Polyribonucleotids völlig ausschaltet.
Das Enzymsystem benötigt nicht nur die Schablone, sondern ausserdem alle vier Ribosidtriphosphate (vergl.
Tabelle 3 unten). Die Replicase hat ein obligates Bedürfnis für zweiwertige Ionen',wobei Magnesium das bevorzugte
Ion bei homologer RHS ist.
_ Mangan' kann, dieses teilweise (10$) ersetzen und ruft
interessante Veränderungen in der Art der Reaktion hervor, deren Einzelheiten im nachfolgenden Beispiel
4 beschrieben werden.
90988 771691
BAD ORIGi[SJAL
'Tabelle 1
Untersuchungsverfahren für Ribonuclease;und
Phosphorylase +/ .--'-' /-'" - .·
14 ' ■ , 3
C-ADP. ; - : : ■:% H^-RNS, hydrolysiert
:".-.. '- ■; Incorporation (gO Min.) \ in 30 Min./
■-·■-"'-■-_ . ' cpm .-."■■■ 0,25 „0,25 keines von
;. ■■--■::-■ ·. '. V - -;. , -'-' M Κ-κ · . M NA+ ■ . beiden
Vor DEAE -v . .40 ++λ '
nach- DEAE 32 -^
"*".' Das Prüfverfahren für die -Phosphorylase vmrde ausgeführt
- ·. nach J,Mol.Biöl,, U,..257-271- (1965). -Jede Reaktion. tO,25 ml)
enthielt 40^g Protein und 1 μΜοΙ G -ADP bei 6 χ 10^ cpm,
■ ■■""-"■■""■ 4 ■■-
"*. Für: die Ribonuclease wurden-10 \xg bei 1 χ 10 /cpm . pro Reak'-
tionsgemisch hinzugefügt. -
Ähiiiiche Präparate vom "wilden Typ".".incorporieren.30«Ö'ÖÖ: öpm
(äquivalent'480 μΜοΙ) vor dem: DEAE Schritt, und .etwa .die Hälfte
davon nach der Elution aus'der Säule» . . - .-.. ..-..:
909887/1691
+) ■■-.■
Zusatz
Schablone
com ineorporiert
PEP (1,0 μίίοΐ)
+ PEP-Kinase (10μg)
4,803 9β
DNS-ase (5
RNS-ase (1 ug)
19 37
Keine
75
. Äusser den angegebenen Zusätzen wurden die Untersuchungen
ausgeführt,unter den im obigen Teil β beschriebenen Standardbedingungen,
Bedürfnisse der QjB-He pll case "** *- '
Untersuchungsgemisch UMP (oder AM?)-Incorporation
CD O (O
OO GO
-»J
Vollständig.
- Qß-RNS
- GTP
- Mg, - Mn
390
Die ÜntersuGhungsbedingungen entsprechen denen, die
vorstehend in Teil β beschrieben/wurden mit der Abv/andlung,
. dass Mn mit 0,2 μΜοΙεη pro 0,25 ml eingeführt
wurde»
BAD
■■-"■■■ - 43 -- ■·-,■-■■ "-... _ . -. ■
FiS. 2 betrifft das ;kinetiseheVerhalten derReolleäse-.aktivität
und zeigt die Kinetik, die in einem ileak-.
tionsgemisch beobachtet wird, das Sättigun-smengen der
Schablone (1 μ^ RNS pro 40 μβ"Protein}enthält. Für
die Werte von Fig. 2 gelten folgende Bedingungen: Jeweils
0,25 n*l enthielten 40 g.g Protein und 1 μ£
QiO-HKS'; alle anderen Bedingungen entsprächen den in
. Teil 6 angegebenen; die spezifische Aktivität des
"SO
■ UTP war derart, dass die Incorporation von H-.QQO μρτ.
der Synthese von 1 ^g ;RNS entsprach. Während eines Zeitraumes
über 5 Stunden wurde-eine kontinuierlicne Synthese
bei 35°C beobachtet* Ss ist festzustellen^ dass in
2 Stunden die Men^e der synthetisierten HNS dem
5-fachender Einführungsschablone entsprach. Durch
.Variierung der Kenge der zugesetzteri HNS und der Syn-■chesezeit
kann .tatsächlich jeder erwünschte !•Mehrfachsuviachs
des Ausgangsnraterials erzielt* i-.*erdsr,:. Die
Seendigung der Synthese innernaib von 5 bis IC Xir.uten,
vfie sie von anderen Verfassern für wahrscheinlich
ähnliche Präparate berichtet worden ist,, iss bei der
vorliegeriGen Erfindung nur in den. ersten Stufen der
Reinigung beobachtet worden«"Fig. 3 besieht sich auf
das Ansprechen gegenüber zugesetzter. Protein und
\ :." ■■'-.-.. .;.-.·"■- - .-_"■ .-;■-.■-.-■.
prüft die Wirkung von augesetzten Proteimr.engen bei
'», einer festgelegten Kehge der SchaOlone (5 ^g B213/öx25 "I).
■"" Für die:" in Fig. y aufgezeigter;. >.'erte"viurden/Versuchsansätze
durchgeführt, und zwar während 20 Minuten.tei
909887/1091 ^Q.
55°C unter den In Teil β angegebene-. 2~dir";"ungen, und.
wiederum entsprach die Ineorocraiiub v:n £.&0O;cpa-der.
Synthese von 1 ug.. ?~>73:.. Hc is:; c.;_"cr:c;.c.-.jli;l, cacs die
Reaktion linear verläuft, v.-oduro.;. cie /-...jweccnhiit von
störenden Verunreinigungen in άΰ::. görel-ilgv..:··" lin-zyr.'
angezeigt wird.
(B) Spezifische S-chabloneh"-Bedürfnisse ^tr r^olicase
Die nachfolgende Tabelle 4 zeigt die Fähigkeit verschiedener
RN-S-Kqleküle-, die QiI-Repli case zu synthetischer
Aktivität cei der Säüti^un^skonzentration (;1 ^i_\
der homolorer. R2^3 und dera Lz zollten dieser Menge anzuregen.
Das Ansprechen der Qii-P.eplicase ist für c.x&
MS-2-Rep.licase, v;ob&i die Bevorzugung klar auf ilt:·-·
eigene Schablone ausgerichtet 1st. -Die ein-zige heterloge
RNS, di«3 nachv.'eisbare Aktivität zeigt, ist TY.·.V, und
bei einer F.c-nge von 2 ,^.unterstützt sie eine 07η-thesre',
die 6y!> der^enige-n entspricht., T-;ie sie bei "dar
horüologen· Z.2,-Rl':3 c^obachtet x-rarde. Beide heterologsn
Virus-HK3, Mi~£ unc STHV sind völlig inaktiv und das
trifft Such für die rliboso^en- und Übertragungs"-Rl\3-Arten
der'Gastzelle (3V ebli £,-13) - zu. iüe zu erwarten,
zeig-t die RK3-Masse aus infizierten Zellen-eine gewisse'··
Sehablono-n^irksamkeit·^ z.L:~ i^it d$n: - Fortschreiten
der Infektion ansteigt. Es fi:.-et sich -<eine hachv/eis-
bare DNS-abhängige HNS-Poly^eraseaktlvität.
■'-■"' " ■""■ ' ' ' Tabelle K
•-,.-V./9 0 9 8 8 7/1691 Si '^ \>
X > ϊ ' "
1 ii. & | 4,9^5 |
.. --.Λ,929 | 312 |
146 - | :;.. -26^ |
35 - | ." . 9: |
.;_. . 45 _ . | .57 ,-. |
- . . 15 '·· | •263 |
- ' 146 ; | |
Sl ■■·■ | |
"..-- Ansprechen der Qß-Replicase auf verschiedene Schablonen ^'
" · . ■■ -.Elnführun,£!:smeng;en der "■■]
Schablone
TYMV
; MS-2 . - ■■'■■ '"'.'. ■-'. . ■".'-Ribosomen-RNS
.
S-RNS";' ":.';
S-RNS";' ":.';
RHS-Masse aus infizierten Zellen Satellit-Virus .
. DNS (10 μ-g) - ■■ ■ 36 ' -
-^' Die Untersuchungsbedingungen entsprechen denen,->v/ie sie im
-vorstehenden Teil 6 beschrieben sind. Via in allen Fällen
jedoch- wird die -Prüfung- für^ die. DNS-abhang!ge Aktivität .-mit
10\μ£ DNS pro .0,25 mi des .Reaktionsgemiscaes ausgeführt,
Keine Schablone enthaltende Kontrollreaktiönen ergaben einen .·
Durchschnittswert; von-JO eprs. - .
" " --- Um einen eindeutigen Vergleich der beiden Replicasen.
zu erhalten,- die von demselben Gastorganismus stammen,.
. wurde das MS-2-.Enzym aus'entsprechend infizierteKi Q-I3
: isolierjt. Die Reinigμng der MS-2-Replicase geschah ge-
.nau ;nach derselben Vorschrift wie für das. Q,B-Enzym
"...- (vergl. vorstehend Teil. 5)mit der Ausnahme, dass . .
--."■'. 0,22 m MaCl fun?; die Slution^gLUs der DEAE-Saule verwendet
worden ist, . j;l ..:.-.- ■■'.-- "' ■;.
Die.Ergebnisse des Vergleichs zwischen den beiden Re-""
plicasen gehen aus der nachfolgender. Tabelleb
909887/ tS91 :- und
BAD OR(GiNAL
und sie sind hinreichend eindeutig. Die. r-:3-2-Replica;
lässt keinen Ilinv-rsis'darauf erkennen, dass sie die
Qß-RNS als Schablone bei irgend einer Menge der 3273-Zuführung
annimmt, ϊη ähnlicher V.:eise ignoriert die
Qß-Repiieasa die IiS-2-RNS, während sie gut mit ihrer
eigenen Schablone arbeitet. Aus diesen VJerten dürfte sich ergeben, dass die Schablonenspezifitäu hinreichend gesichert ist.
i-.Vio v-■.
—pr-> i'"
■:>_o:_'QV--
Snzym · 1 ug 2 μg 1 ~g
τνϊ q ο L· -"7 - - ■ ~a £ £· C\
i. ill—' ™" £· ·" * *"i "V "T ». ^/ O V^ . T«>
Teil β genannten, wobei Kn'' in einer Ksngo von G,2 μΜ
pro 0,2p ml vorliegt.
s ^nzyiss und de-s riaini
gungsverfahrens ist as möglich, ν
Replicase aus geeignet infizierten vrildenHfr-i^^^^en
zu isolieren (Proc. Nat'1...Acad. Sei., U.S. ^G, 9C^-JIl
(1963)). Die Verwendung der Muuanten Z-Ip c_.v.:-.?.;iir-c-r.
offensichtlichen Vorteil für die Reinigung dar- Aeplicas;,
909887/Ί691
c.a
BAD
da. der Rohextrakt bereits frei von Ribonuclease-χ -und
Phosphorylase war. Die beiden zurüekbieibenden störende:
Aktivitäten waren auf die DNS-abhängise* RNS-PoiyrneraGe
(Transcriptase) und eine durch Kalium anregbare Ribonuclease
zurückzuführen. . ;;
Ss ist "-wichtig zu betonen, dass die vollständige-Entfernung'
der Transcriptase wesentlich ist, wenn Fragen
bezüglich des Mechanismus und der Replicasespezifität
zweifeisfrei beantwortet werden sollen. Die Sranscriptase
kann jede RMS als Schablone für die RXS-Synthese
verwenden und bildet bei "diesem Prozess eine r'ibonueleasebeständi^-e
Struktur. Dementsprechend schützt die Verwendung von DJüS-ase oder Actinoniycin-D nicht gegen
eine Vermischung mit Transcriptaseaktivitar. Eel dorr,
in Beispiel I, Teil 5, beschriebener. Arceitssan^ wird
der Hauptanteil der Transeriptase ir. aer i\Tiederschiagsfraktion
der zv;eiten Prctaminscufe. entfernt. - Dsr Rest
wird als spät auftretender Bestandteil.in dar ΒΞΛΞ-Säule
zurück-elassen; Die kaiiur^-abhäh^ige Ituclease
ist fest an Zellmescranfrainier.ten gebunden, die in der
mit niedriger Geschwindirkeit erhaltenem Praictichdurch
die vorliegende -varhältnisfciissir nriide'Sinfriar- '
•Die geringe .Miri5e ^an .RiscnucleS-ss, .die- den- 2;^trakt
mit C, 12-in ITaCl·entfernt, -welches-: gleichsreitif-' •^^^-=-- -
909887/1691 '^ ; :>
BAD
1620845
■ - 48 - . ■
und ein PoIy-A synthetisierendes Enzym (J. 3iol, Chen.,' '"
237, 3786-3793 (1962)) ausschaltet. Die Tatsache, dass<
die sich ergebende Replicase frei von störenden und unerwünscht
einwirkenden Aktivitäten ist., macht es möglich, diese in einem einfachen Gemisch zu untersucr.Gr;, v/el-.
ehes nur die erforderlichen Ionen·, Substrate und Schablone!
enthält. - .
Die Unterscheidungsmerkmale der gereinigten Replicasen,
die oben beschrieben wurden, können wie folgt zusammengefasst
werden: (a)'vollkommene Abhängigkeit von hinzugesetzter RNSi (b) Fähigkeit für längere Synthese -(mehr
als'5 Stunden) von BHS; (c) Fähigkeit zur vielmaligen
Synthese der Sinführungs-Schablone; (4) Satti--'
gung bei niedrigem Niveau von RNS (1 μg RNS pro 40 μg
Protein); (e) tatsächlich ausschliessliches Bedürfnis
für die homologe Schablone unter optimalen lonenbedingungen.
' Angesichts der .sehr unterschiedlichen Reinheitsgrade ' :
ist es schwierig, die Unterschiede bezüglich der Eigenschaf ten der erfindungsgernäss beobachteten Enzyme, -verglichen
mit denjenigen,· die von anderen Verfassern ent- -
deckt oder isoliert wurden* zu beschreiben. Die.von
...... ■',.". . . - ■■*-■-- '
' hinzugesetzter RNS- unabhängige Aktivität legt die Tatsache
nahe, dass die Reinigungen keine Entfernung.der
■--■■,-;-.-■ ι- -.-■ -, ■■ ..--.-, .-■■ '---:■ jedem
verunreinigenäen RlvTS bewirkt, haben, χιηά verhindert iny
90988 7/1691
BAD ORIGINAL
I- fall. die Prüfung der SchablonenspNezifitMt . -■;■;"
Der Vergleich der beiden berichteten Replicasen zeigt,
dass jede' ihre, homologe Schablone benötigt. Der Versuch■
'"■■; mit der Satellit-RNS (STNV) war einebesonders inter- ;
essante; Prüfung. Reichmann zeigte (Proe. Nat'l. Äcad. <
Sei., U.S. 52, 1009-lOlT (1964)), dass der Satellit ,
Virus nur soviel RNS enthält, um einen Gode·" für seihen \
eigenen Proteinüberzug zu liefern, was vermuten lasst, dass er.die Replicase seines Begleitvirus (TNV) für . seine
Vervielfältigung anwenden muss. Das bedeutet entweder, dass der Satellit bezüglich der Sequenz dem Λ
TNV-Virus verwandt ist, oder dass er eine- Eigensenafi; besitEt,
welche ihm erlaubt, jede beliebige yirus-RiTS- Replicase
zu verwenden^ Die Tatsache, dass STNV-RNS; .·'
für keine: der beiden gereinigteji Replicasen als -Scha- .
."■ blone dienen kann, lässt erkennen, dass die" Antwort =
in einer zumindest teilweisen Sequenz-Gleichartigkeit;
zwischen den STNV- und TNV-Genomen zu-finden "ist; dies Γ
ist noch durch das Experiment nachzuprüfen. - ·
Die gezeigten Spezifitätsbeziehungen führen zur Frage ι -:"'
des von der Replicase benutzten Mechanismus zur Untere [
scheidung ihrer Schablone von anderen RNS-Molekülen.
Die Einbeziehung einer beginnenden Sequenz ist'eine · .
offensichtliche Möglichkeit, Der Erkennungsmechanismus: j
jedoch ist wesentlich komplizierter/ da er sb; abgestellt j
- : - ;■■":.- - :-' -■ s:ein
909887/1601 : ^
BAD
sein muss, dass eine Vervielfältigung Von Fragmenten des eigenen Genoms vermieden wird, selbst wenn sie
die Anfangssequenz enthalten.
Es dürfte klar sein, dass die Replicasen auf einen Reinheitsgrad
gebracht worden sind, der die Durchführung zweifelsfreier Versuche erlaubt und zu der Hoffnung
Anlass gibt, den Mechanismus des RNS-Vervielfältigungsprozesses
aufzuklären.
■ Beispiel II
1. Biologisches System und Enzympräparat Der verwendete Bakterienvirus ist Qß und wurde von
Watanabe (Nihon Rinsho, 22, 24j (1964)) isoliert.
Der Gast- und Versuchsorga-nismus ist ein mutanter Hfr-Stamm von E. coil (Q13), der im Laboratorium von
W. Gilbert durch Diane Vargo isoliert worden ist. Dieser Bakterienstamm hat die günstige Eigenschaft (Fed. Proc.
24, 293 (1965)), dass ihm Ribonuclease-I und RNS- ·
Phosphorylase fehlt.. Die Herstellung von infizierten Zellen sowie die nachfolgende Isolierung und Reinigung
der Replicase entspricht in den Einzelheiten den Angaben des vorstehenden Beispiels I. Die Herstellung von
Virus-Ausgangsmaterial und die Reinigung von RNS aus
diesem erfolgte -gemäss dem Verfahren in Proc. Nat 1I.
Acad, Sei., U.S., 49, 353-360 (1963)).
909887/1691
BAD ORIGfNAl
2. Prüfung der Enzymaktivität durch Incorporierung
von radioaktiven Nucleotiden ·
Das Standardreaktionsgemisch von 0,25 ml enthielt ausser
40 γ des Enzyms die folgenden Bestandteile in μΜοΙ:
Tris-HCl, pH-Wert ?**#' 21; MgCl2, 5,2; CTP, ATP, UTP
und GTP jeweils 0,2. Die Umsetzung wird durch Zusatz
von 0,15 ml neutralisiertem geÄättigtemPyrophosphat,
0,1-5 ml neutralisiertem gesättigtem Orthophosphat und
0,1 ml 8Oj6lger Trichloressigsäure in einem Eisbad beendet.
Der Niederschlag wird auf ein Membranfilter übergeführt
und 7-mal mit'3 ml kalter 10#iger Trlchloressigsäure
ausgewaschen. Die Membran wird dann getrocknet
und in einem Flüssigkeitsscintillationszähler wie vorher
beschrieben gemessen. UTP^ wurde gemäss Proc. Nat
Acad. Sei», U.S., 50, 905-911 (1963) synthetisiert.
Es wurde bei einer solchen spezifischen Aktivität verwendet, dass die Incorporation ven 20.000 epm der Synthese
von 1γ RNS entsprach, was die Verwendung von 20 λ -Proben zur Verfolgung der Bildung" markierter
RNS erlaut»te> -
3. Isolierung des synthetisierten Produktes
Die von dem Reaktionsgemischλ abgenommenen Proben werden
sofort in eiri Eisbad gebracht, und es werden 20/\
entfernt zur sofortigen Untersuchung der radioaktiven RNS, wie in Teil 2 vorstehend, beschrieben· Das Volumen
wird dann mit TM-Puffer (IO"2 m Tris, 5 x 10"^ m MgCl0
pH-Wert 7*5) auf 1 ml eingestellt* Dann wird 1 ml,
909887Λ169Τ
: von
BADOBIQiNAU
von wassergesättigtem Phenol hinzugefügt und das Gemisch
bei 50C während 1 Stunde in starkwandigen Zentrifugenbechern
aus Glas (Sorvall, 18 χ 102 mm) geschüttelt. Nach Abtrennung der wässrigen Phase vom
Phenol durch Zentrifugieren bei 11,000 rpm während
10 Minuten wird nochmals 1· ml des TM-Puffers zu dem
Phenol hinzugefügt, der dann durch I5 minütiges Umschütteln
bei 5°C vermischt· wird. Dann werden wiederum die Phenol- und die wässrige Schicht voneinander getrennt
und die beiden wässrigen Schichten vereint. Das Phenol wird durch zweimalige Ätherextrakt'ion entfernt,
wobei dafür Sorge getragen wird, das Phenol von den Wänden der Zentrifugenröhren durch vollständige Füllung
derselben mit Äther nach jeder Extraktion zu entfernen. Der in der wässrigen Phase gelöste Äther wird
dann mittels eines StickstoffStroms enffernt. Die RNS wird ausgefällt durch Zusatz von 1/10 Volumen
Kaliumacetat (2m) und 2 Volumina von kaltem abs.
φ Äthanol. Die Proben werden 2 Stunden lang bei -200C
gehalten, bevor sie während 1 Stunde bei 14.000 rpm
in einem Sorvall SS J4-Rotor zentrifugiert werden.
Die Rückstandsplättehen werden abgetrocknet, und-der
restliche Alkohol wird durch Aufbewahrung in einem Vakuumexsikkator unter vermindertem Druck während
6 bis 8 Stunden bei 50C entfernt. Die RNS wird dann
in 1 ml Puffer (1O~2 m Tris, 10~2 m MgCl0, pH-Wert
7*5) aufgelöst^ und die Proben werden sofort für die
909887/169 1 Infektions-
BAD ORIGINAL
untersuchung
Infektionsfähigkeils entfernt. Die durch Trlchloressig- *säure ausfällbare Radioaktivität wird gemessen an 20y\ -Anteilen des Endproduktes, aus denf dieJirOzentuale Gewinnung* der synthetisierten. RNS bestimmt werden kann. Im Bereich von 1 bis 8 /γ wurde gefunden, dass im allgemeinen 65$ der synthetisierten RNS gewonnenwurden. Alle gereinigten Produkte wurden hinsichtlich deö Vorliegens intakter Virusteilchen durch Untersuchung- an ganzen Zellen geprüft; es wurden keine gefunden.
Infektionsfähigkeils entfernt. Die durch Trlchloressig- *säure ausfällbare Radioaktivität wird gemessen an 20y\ -Anteilen des Endproduktes, aus denf dieJirOzentuale Gewinnung* der synthetisierten. RNS bestimmt werden kann. Im Bereich von 1 bis 8 /γ wurde gefunden, dass im allgemeinen 65$ der synthetisierten RNS gewonnenwurden. Alle gereinigten Produkte wurden hinsichtlich deö Vorliegens intakter Virusteilchen durch Untersuchung- an ganzen Zellen geprüft; es wurden keine gefunden.
4. Prüfung hinsichtlich Infektionsfähigkeit der
synthetisierten RNS · v-
Das verwendete Verfahren ist eine Modifikation der
Sphäroplastenarbeitsweise -von Guthrie und Sinshelmer
gemäss J. Mol. Bio!,,. 2, 297 (196Q), Die notwendigen
Bestandteile waren folgende:
; (A) Medium l· ' :__:'-~:~ : /
Das verwendete Medium ist eine Modifikation des 3XD*-Mediums von Fräser and Jerrel (J.-Biol, Chem., 205,
291-295 (1953)) und enthält in g/l die folgenden Bestandteile: Na2HPO4, 2 g; KH2PO4, 0,9 g; NH4Cl, 1 g; -Glycerin
(Pisher-Reagenz), JO gji Difco-Hefeextrakt, "
5Q mg; Qasaminosäureh (Difco, vitamihfi*e£), 15 g;
L-Methionin," ICL^mg; D, L-Leucin, IO wg; MgSO4^TH2O,
0,5 g. Diese Bestandteiie werden vermischt in der angegebenen Reihenfolge in 5OO ml glasdestilliertem
Wasser. Hierzu werden schliessiich weitere 500 ml,
die 0,3 ml m GaOl2 enthalten, hinzugefügt. ^^
(B) Sucrose-Nährlösung (SNB) '
Die SNB enthält in g/l folgende Bestandteile: Casaminosäuren
(Difco), 10 g; Nährlösung (Difco), 10 g;
Glucose, 1 g; Sucrose, 100 g., Nach Autoklavieren wer-.derr folgende Stoffe unter aseptischen Bedingungen
hinzugefügt: 10 ml 10# MgSO2^ und 3,3 ml 30#iges
Rinderserumalbumin (BSA) von Armour Laboratories.
(C) Für die Herstellung der Sphäroplasten erforder-
liehe Reagenzien
Die folgenden Lösungen sind notwendig zur Herstellung von Sphäroplasten: Lysozym ,(Sigma) 2 mg/ml in 0,25 m
Tris-Puffer, pH-Wert 8,0; Protamlnsulfat von Eli Lilly
and Co., 0,1$; und sterile Lösungen von JO^igem
BSA; 0,25 m Tris (Trizma), pH-Wert 8,0; 0,01 m TriSr
Puffer, pH-Wert 7,5 und 8,0; 0,5 m Sucrose; EDTA in 0,01 m Trispuffer, pH-Wert 7,5.
Zur Herstellung der Sphäroplasten wurde eine über Nacht gewachsene Kultur von Q13 in dem JXD-Medium
zuerst mit einem frischen Medium bis zu einem 0D660 von °'°6 verdünnt. Die Kultur wird bei 30°C
bis zu einem OD^g0 zwischen 0,2 und 0,22 weiter gezüchtet und die^-ZeIlen bei Raumtemperatur abzentri-•fugiert,(spun
down). Das Rückstandsplättehen von 25 ml der Zellen wird zuerst in 35 ml 0,5 m" Sucrose"
plus 0,1 ml 0,25 m Tris-Puffer, pH-Wert 8,0>
sus^
pendiert. 90988 7/1691 :
BAD ORSGÜSäAL
pendiert. Dann werden 0/01 ml Lysozym hinzugefügt und danach
0.,OjJ ml EDTA. Nach 10 Minuten bei Raumtemperatur,
wenn die Umwandlung zu Sphäroplasten 99,9% beträgt,
werden 0,2 ml dieses Ansatzes mit >,8 ml SNB verdünnt,
und es werden 0,025 ml Protaminsulfat zugefügt. Die
Sphäroplastenmasse wird mikroskopisch vor der Weiterverarbeitung
geprüft. Das Vorliegen von nur 5$ Bruchstückender
Sphäroplasten zeigt ein Präparat an, das beim Agarplattenversuch nur eine geringe Wirksamkeit
ergibt. In Übereinstimmung mit Paränchych (Biochem.
Biophys.. Res. Commun.,* 11, 28 (1963)) wurde erfindungsgemäss
festgestellt, dass Protamin die Wirksamkeit der
Entdeckung infektiöser RNS erhöht. Die optimale Protaminkonzentration
im vorliegenden System ist jedoch
bedeutend niedriger als die von Paränchych verwendete.
Die RNS-Infektion wird üblicher Welse ausgeführt bei
Raumtemperatur mit Lösungen, die 0,5 Y von RNS/ml enthalten,
eine Konzentration, bei der das Untersuchungs-·
verfahren nicht durch die Anzahl des Sphäroplasten pro infektiöser Einheit beschränkt ist.'Es werden zu
0,2 ral/ RNS 0,2·ml des Sphäroplastenmaterials hinzuge-
fügt,, das etwa 3 x. 10 Sphäroplasten enthält. Die Proben
werden vermischt, und es wird sofort eine anteilmassige
Menge entfernt und in geeigneter Weise mit;
SNB verdünnt, ehe der Plattenversuch mit L-Agar unter
Verwendung von QlJ als Indikator vorgenommen wird.
, 90 9887/169 1 Die
Die verwendete weiche Agar-Schicht (0,7$), die 2,5 ml
ausmacht, enthält 10$ Sucrose, 0,1$ MgSO^ und 0,01 ml
30$ige BSA pro Glas" plus 0,2 ml einer über Nacht gewachsenen
Kultur von QlJ. Um Reproduzierbarkeit zu
erhalten, wird die Späroplastenmasse 15 bis 45 Minuten
nach der Verdünnung mit SNB verwendet. Die Wirksamkeit des Plattenversuches (e.o.p.) liegt gewöhnlich zwischen
2 - 8 χ ΙΟ"7. Höhere Wirksamkeiten ( > 1 χ 10"6)
können eher erzielt werden, wenn die Sphäroplastenmässe
sofort nach der Verdünnung verwendet und eine Stabi-
■ .Chen
lisierungszeit bei den SNB-Verdünnungsröhr/ . einbezogen
wird, als durch eine sofortige Agar-Plattenuntersuchung.
Diese höhere Agar-Plattenwirksamkeit fällt jedoch schnell ab und macht es schwierig, reproduzierbare
Duplikate bei wiederholten Ansätzen zu erhalten. Da die Reproduzierbarkeit wichtiger war als
die Wirksamkeit, wurde das oben im einzelnen aufgeführte Prüfverfahren verwendet.
5. Ergebnisse
Bei "Muster"versuchen., die Infektionsfahigkeitsuntersuchungen
von enzymatisch synthetisierter RNS ein-, schliessen, ist es wichtig zu erfahren, dass selbst
hochgereinigte Enzyme aus infizierten Zellen, obwohl
sie nachweisbar keine intakten Zellen enthalten, wahrscheinlich
einige Virusteilchen enthalten. Vom chemischen
909887/1691
. 162QS4S
■- - - 57 ,.- ■ . ■ .. . ■/-■■■-..■ "■■" ;;"■
sehen Standpunkt aus ist die Verunreinigung belanglös,
da sie sich auf 0,l6 γ Nucleinsäure und 0,8 γ Protein
für jeweils 1*000 γ Enzymprotein, das bei den vorliegendenVersuchen
verwendet wurde, beläuft. Da 40 y an Protein für jeweils 0,25 ml der Reaktion verwendet
Werden, ist der Beitrag der Teilchen zu den gesamten ;
RNS nur 0,006 γ, was in Vergleich zu setzen ist mit den
0,2 γ der Einführun&s-iiiiSunä den·5-20 γ; die bei der
üblichen Arbeitsweise ■- synthetisiert werden. Es konnte
in Kontroll versuchen gezeigt werden, dass RTTS, die
aus Teilchen in dem Heaktionsgemisch frisch extrahiert
nicht ■■'-, , "'- in
wurden/infektiöser sind als diejenigen, welche aus dem /
üblicher Weise gereinigten Viruspräparat gewonnen wurden*,
Weiterhin beweist das obligate Bedürfnis für zugesetzte ·
RNS, dass innerhalb der verwendeten Inkubationszeiten
diese kleine Menge an RNS entweder zur Einleitung der
Reaktion nicht angemessen ist oder nicht zur Verfügung
steht. Diese Teilchen beeinflussen also !unwesentlichen
,weder die chemischen noch die enzymatischen Gesichts- "
punkte des Versuches. Wegen Ihrer höheren infektiösen
Wirksamkeit Jedoch können selbst massige Mengen ah
intaktem Virus bei den Prüfungen hinsichtlich der synthetisierten RNS auf Infektionsfähigkeit. nicht* geduldef
werden» Demzufolge wurdai sämtliche RNS-Präparate
vor dem Versuch mit Phenol behandelt (vergl, die Arbeitsweise in Beispiel TI, Teil >)*,, Weiterhin wurden -
.... ; : ' . ; /"■ ' die '■■■■.
90988 7/1691
die phenolgerelnigten RNS routinemässlg auf vollständige
,Virusteilchen geprüft, und bei den hier erörterten
Versuchen wurden keine gefunden,
Es wurden Experimente durchgeführt, bei denen das* kine-■ tische Verhalten beim Auftreten von neuer RNS und infektiösen
Einheiten auf zwei unterschiedliche Arten
geprüft wurde. Die erste zeigte, dass die Anreicherung
an radioaktiver RNS begleitet wird von einem propor-. tionalen Anstieg der infektiösen Einheiten. Die zweite
bewies anhand eines serienmässigen Verdünnungsversuches, dass die neu synthetisierte RNS infektiös ist.
1. Prüfung der Infektionsfähigkeit des gereinigten
Produktes
Um das.Auftreten der neuen RNS und infektiösen Einheiten
bei einer ausgedehnten Synthese zu vergleichen, wurden
8 ml eines Reaktionsgemisches angesetzt, das die notwendigen Komponenten in den in Beispiel II, Teil 2,
angegebenen Konzentrationen enthielt. Es wurden nach
den'für die Bestimmung von radioaktiver RNS angegebenen
Zeiten und Reinigung des Produktes für die Infektlonsfähigkeitprüfung
Anteile abgenommen. Die Er-
co ^
o gebnisse, die die Kinetik der RNS-Synthese und die
cx> Bildung von infektiösen Einheiten betreffen, werden
oo -° in FIg. 4 zusammengefasst, und zwar in Form einer
ο, halblogarlthmischen Aufzeichnung gegen die Zeit des
co .
-». beobachteten Anstiegs sowohl bei den RNS als auch
den Infektlösen Einheiten.
BAD ORIGINAL
Für die Werte gemäss Fig. 4 wurde ein 8 ml-Reäktionsgemisch
angesetzt, das die Bestandteile in den in
Beispiel II, Teil 2, angegebenen Konzentrationen enthielt.
Proben wurden wie/folgt abgenommen: 1 ml zur
Zeit O und nach 30 Minuten, 0,5 ml nach 60 Minuten,
0,3 ml nach 90 Minuten und 0,2 ml nachfolgend in entsprechenden
Zeitabständen. Es wurden 2Q")\ zur Untersuchung auf incorporierte Radioaktivität, wie in Beispiel
II, Teil 2, beschrieben, entfernt,Die RNS aus dem Rest wurdegereinigt (Beispiel II, Teil 3), wobei
die Radioaktivität in dem Endprodukt zur Prüfung der
erhaltenen Ausbeute bestimmt wurde. Infektionsfähig- .
keitsprüfungen wurden gemäss Beispiel II, Teil 4,
durchgeführt. . .
Die Menge an RNS (0,8 γ/ml), die zur Zeit 0 eingegeben
wurde, liegt wesentlich unter dem Sattigungsniveau
des vorliegenden Enzyms.. Dementsprechend nimmt die RIiS autokatalytisch während etwa der ersten 90 Minuten
zu, und zwar mit nachfolgender Synthese, die linear mit der Zeit verläuft, ein Merkmal-, das schon vorher
beobachtet worden war. Es ist festzustellen, dass
der Anstieg der RNS-Menge parallel läuft mit einer Zunahme der Zah>
der infektiösen Einheiten. Während der 240 minütigen inkubation fand eine 75-fache Vermehrung
der RNS und eine 35-i"ache ^Termehrung der
■..■■"'" . .infektiösen
909887/169 1
BAD
infektiösen Einheiten über diejenige Menge hinaus
statt, die zur Zeit O vorlag. Diese Zahlen stimmen überein mit den Genauigkeitsgrenzen des InfektlonsfähigkeitsprüfVerfahrens.
Mit einem anderen Enzympräparat durchgeführte Experimente brachten Ergebnisse, die mit den oben beschriebenen völlig übereinstimmen.
Es ist offensichtlich, dass man den Nachweis für eine
Zunahme der Zahl der infektiösen Einheiten erbringen kann, die parallel läuft mit dem Auftreten neu synthetisierter
RNS. -."■■.;. .
2. Beweis, dass die neu synthetisierten RNS-Moleküle infektionsfähig sind
Die Art der oben beschriebenen Versuche zeigt deutlichdie
Infektionsfähigkeit der radioaktiven RNS auf.
Sie sind jedoch nicht beweiskräftig, weil sie nicht
die Möglichkeit ausschliessen , dass die beobachtete Übereinstimmung zufällig ist. Man könnte argumentieren,
dass das Enzym die Infektionsfähigkeit der Ein-:
führungs-RNS "aktiviert", während es neue nicht-infektiöse
RNS. synthetisiert,und dass das ziemlich komplizierte, Gemisch der exponentieIlen und linearen'Kinetik
der beiden Prozesse zufälligerxweise übereinstimmt.
Ein direkter Beweis, dass die neu synthetisierte RNS infektiös ist, kann prinzipiell erbracht werden durch
Versuche," die N * -. $ - markierte Anfangsschablonen
unter Erzeugung eines N - P^ - markierten Produktes
9 0 9 8 8 7/1691
verwenden.
BAD ORIGINAL
verwenden. Die beiden lassen sich dann trennen (Proc.
Nat.1I* Acad. Sei,/· U-.S., 49, 355-360 (1963)) in Gleichgewichts
-Dichtegradienten -von Cs2SO1,. Derartige Versuche
sind für andere Zwecke bereits durchgeführt worden.
Die Steilheit der Cs2SO^ Dichtegradienten macht
es jedoch schwierig, eine Trennung herbeizuführen, die eine genügende Reinheit bietet, um vollständig
zufriedenstellend zu sein.
Es besteht jedoch noch eine weitere ÄnnäherungsmÖglichkeit,
die diese technischen Schwierigkelten umgeht und aus der Tatsache Vorteil zieht, dass es sich
im vorliegenden Falle um eine sich selbst vermehrende
Einhext handelt. Es möge eine Reihe von Reagenzglas "
sern vorliegen, von denen jedes 0,25 ml des Standardumsetzungsgemisches, aber keine hinzugefügte Schablone
enthält. Das erste Glas wird mit 0,2 γ Qß-RNS beimpft und solange irikubiert, bis eine Synthese verschiedener
γ radioaktiver RNS eingetreten ist'. Eine anteilige Menge (50 X) wird dann "auf das zweite Glas
übertragen, worin man die Synthese etwa der gleichen
Menge ah RNS ablaufen lasst, davon wird wiederum -ein
Anteil' auf ein drittes Glas übertragen usw. Wenn
jede aufeinanderfolgende Synthese RNS produziert, die
dazu dienen kann, die nächste einzuleiten, kann der Versuch solange fortgesetzt werden, bis ein Punkt
erreicht ist, an dem die anfängliche RNS des Glases 1
909087/1691 " bis-
bis zu einer unbedeutenden Menge verdünnt ist. Tat~ sächlich können genügend Übertragungen durchgeführt·
werden um sicherzustellen, dass das letzte Glas weniger als einen Strang des Einführungssubstrates (primer)
enthält. Wenn in allen Gläsern einsehliesslich des letzten die Zahl der infektiösen Einheiten der Menge
der radioaktiven RNS,die gefunden wurde, entspricht, dann ist der überzeugende Nachweis erbracht, dass die
neu synthetisierte FINS infektiös ist.
Tabelle 6 zeigt nachfolgend einen vollständigen Ablauf eines derartigen serienmässigen Übertragungsversuches,
und die entsprechende Legende liefert die notwendigen Einzelheiten der Versuche und Berechnungen. Es wurden
16 Gläser benutzt. Das erste (Glas 0) stellt eine nicht-inkub'ierte Kontrolle beim Zeitpunkt 0 dar. Es
ist darauf hinzuweisen, dass die aufeinanderfolgende Verdünnung derart war (1 zu 6), dass bis zum B.Glas
weniger als eineinfektiöse Einheit den einleitenden 0,2 y der RNS zuzuschreiben war. Nichtsdestoweniger
zeigte das gleiche Glas 8,8 χ 10-3 neu synthetisierte
infektiöse Einheiten während der 30 Minuten seiner
Inkubation. Schliesslich produzierte das Glas 15, welches weniger^ als einen Strang der ursprünglichen
12
Einführungsmenge enthielt, 1,4 χ 10 neue Stränge
und 5,2 χ 105 infektiöse Einheiten in 20 Minuten.
Es
909 88 7/169 1
'■■■■■.-. BAD ORIGIfSJAL
Es ist zu beachten., dass das Kontrollglas, dem keine
RNS, hinzugefügt worden war, 60 Minuten lang inkubiert
worden ist. Verglichen mit Glas 1, in dem 4.800 cpm
für jeweils 20 in 40 Minuten ineorporiert wurden,,
zeigte die Kontrolle keinen Anstieg über das Niveau von 80 cpm bei der Zeit 0. Weiterhin konnte' kein Anstieg
bezüglich der infektiösen Einheiten in diesen Kontrollen beobachtet werden.
. Tabelle 6
909887/169 1
BAD ORIGINAL
ο: | O U5 | —^ | O | O | O | KN | CJ | LP1ONlTiH | HHHHHHH |
6 ί | H M | H | .Ή | H | O | LfN ·. | |||
r—t ' | H | H | H | ||||||
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CJ CJ JS-. O VO HCO OO·?^ KNCO ·.
H H CJ Ji- VO H H KN LpicO H OJ KN
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r-i ·->, <Χ ίΛ ΚΛ·=Γ LPvVO ;>-C-CO a\r-i H HH
I I I 1 I I I t I I I I I 1 1 I
oooooooooooooooo
HHHHHHHHHHHHHHHH
xxxxxxxxxxxxxx χ χ
O O O ί—Η ΟΛΗ HVO^r-^rOVC HCOH
(X c^i-=t-1^p r~i r-i k\ inco η cj -=r vo η η κλ
OVOlTlH L1NVO C- ΚΛ CN H CJ GNCO UN ON
O KVO* H E^- H ^ ΚΛ O vO KNCO <M C- oT^t
η Heu cj KV3- -=t in LPivo vo r-c—
ο ο CNVO^ η η vo vo cj η ^- on :--^t·
O KN KN-^r UN^- VO VO vO O VO lTv-=t -3- -=t OJ
Oc CJ C^ f- >- C— CJ
<S\ H. CJ CO £— O H ON VO
o" KN^P in vo" LfN C^ c^raco"' t^vo vo" vo" in KY
O ^r JS- 'OJ -^- KN-=r O CJ ^=T vo -=r H KNCO LTN
VOCO H KNH^r LfYOVO LPk KNO. OJ H L—
r-i r-i r-i r-i r-i r-i r-i r-t i-i i-i r-i rH
Γ·Λ O ί OOOOOOOOOOOOOOOO
Cs! j ■■ --JS- CO-"CU VO ONOJ LiNCO. H JS" VOCO O OJ-=1"
η η η Cv oj α· knknkaknjt j=}-js-
OOOOOOOOOOOOOOOO
-=r JS- -=3- J?" KN KN \t\ KN K\KN CU CV OJ CJ Co
KNJ5- LP.VO >~-CO CN O H CJ- «ΛjS- Lf\
r-i r-1. r-t r-'. r-i i->.
909887/1691
BAD ORiGiNAt
Bildung | Il Serien^tJbertragungs-Versuch |
13 | 14 | |
11 | von IU | Beobachtete | ·%■ | |
' ι. ' ■■''■ | χ 10-5 | 12 | e.o.p X 10^7 |
Ausbeute an p32-RNS |
Übertragung Nr. |
1,0 - | χ 10~5 | •5,5 | « · O |
O | 5,2 | 1,0 | 3,2 | 54,2 |
1 | 2,2 | 5,2 | 2,0 | 88,3 . |
2 | 11,3 | 6,5 - | 5,3' | 59,9 |
3 | 5,7 | 17,4 | 3,0 ; | 42,5 |
4 | ; 7,4 | 21,2 | . · 3,0 | 65,4 |
■ ■ 5 ■ ' · ■ ' | 15,0 | 27,6 :· . | 3,7 | 82>4 |
>: ■ β ■ , : ■·■■ | 13,4 | '56,4 ■■·■·: | 5,0 | 52,9 |
■■■■■■■ ■ ι .■·.,.' | 8,8 | 48,1 ; | 5,2 | . :..■ -51,4 |
. . 8 / | : 5,6' | 54,7 | ■2,0 | 92,6 - |
■.■;.-· · 9 | 9,3 | 58,4 ■·. | 4,0 | 54,2 . . |
■ 10 | 6,5 ί | 66,8 | 3;7 | •74,3 |
11 " | ' 6,9 | 73,7 | 7>0 , | 46,8 |
12 | 3,6 | 84,3 . | 4,0 | 49,2 |
13 | 10,8· | 89,4- | 5,7 | . 79,7 |
14 .■ · | 3,2 | 102,0 | 5,5 | 65 4 |
;, ' 15' ' Λ | 105,0 | |||
m > α
30
fs)
Serienübertragungsversuch (zu Tabelle 6 gehörig)
Es wurden ΐβ Umsetzungsgemische.von 0,25 ^l angesetzt, ■ ■
von denen jedes 40 γ Protein und die anderen Komponenten,
die für den Standardversuch gemäss obigem Beispiel II aufgeführt
wurden, enthielt, 0,2 γ der Schablone RNS wurden zu den Gläsern Ound 1 hinzugefügt; RNS wurde aus ersterem
sofort extrahiert, und das letztere wurde 40 Minuten lang inkubiert. Dann wurden 50 λ von Glas 1 in das Glas 2 übertragen,
das 40 Minuten lang inkubiert wurde, und 50 Λ
von Glas 2 wurden dann in Glas 3 übertragen usw., wobei jeder Schritt nach dem ersten eine 1-6-Verdünnung des
Einführungsmaterials umschloss. Jedes Glas wurde aus einem Eisbad lh ein Wasserbad von 35°C wenige Minuten vor der
Verwendung übertragen, um einen Temperaturausgleich herbeizuführen. Nach der Übertragung aus einem gegebenen Glas
wurden 20 Λ entfernt, um die Menge an synthetisierter
P^-RNS zu bestimmen, und das Produkt wurde von dem' Rest,
wie im obigen Beispiel II besehrieben, gereinigt. Kontrollgläser, die 60 Minuten lang ohne Zusatz der 0,2 γ RNS
inkubiert worden waren, zeigten weder eine nachweisbare
RNS-Synthese noch irgend eine Bildung infektiöser Einheiten.
Alle numerierten Ansätze wurden auf ein Normalvolumen von 0,25 flil gebracht. Die Spalten.1, 2 und 3 beziehen sich auf
die Übertragungsnummer, das für die Synthese gegebenen Zeit-' interval! bzw. die verflossene Zeit vom Zeitpunkt. 0 aus.
Spalte 4 zeigt die Menge an radioaktiver RNS, die in jedem Glas nach Beendigung der Inkubation gefunden wurde,und
Spalte 5 die Gesamtmenge an RNS in jedem Glas; Spalte 6
gibt die Gesamtsynthese während des Zeitintervalls an.
die
Spalte 7 führt/gesteigerte Synthese der RNS auf. Die abfallenden
Konzentrationen der Einführungs-RNS, die sich aus den serienmässigen Verdünnungen ergeben-, werden in y in
Spalte 8, die Zahl der Stränge in Spalte 9 und die infektiösen Einheiten :(IU). pro-Glas in Spalte 10 wiedergegeben.
Die letztere; ist aus Spalte 9 und aus der
909887/1691 ... - Wirksamkeit
BAD ORIGINAL
Wirksamkeit der Agar-Platten-Ergebnisse (e.o.p.) von
5 χ IO - berechnet worden. Spalte 11 zeigt die Zunahme
an infektiösen Einheiten, die während jeder Syntheseperiode
beobachtet worden ist und die hinsichtlich der Wirksamkeit der Ausbeute (Spalte 14) korrigiert wurde.
Spalte 12 gibt, die entsprechende Summe wieder. Spalte 1J>
zeigt die Agar-Platten-Wirksamkeit (e.o.p. )* die aus der
beobachteten Anzahl von Plaquen (Spalte 11) bestimmt wurde, sowie die tatsächliche Menge an RNS, die untersucht und
aus den Spalten 6 und 14 bestimmt wurde. Spalte 14 beruht
auf Untersuchungsergebnissen von säuregefällter Radioaktivität an 20 Λ -Anteilen des Endproduktes im'Vergleich
zu Spalte 5· . ■ -
9098877169Ί
■■'■-. BAD ORIGINAL
-DO-
Pig. 5 betrifft die RNS-Synthese- und die Bildung von
infektiösen Einheiten bei einem serienmässigen Übertragungsversuch
und vergleicht die mit der Zeit angehäuften Zunahmen der neu synthetisierten RNS (Spalte 7>
Tabelle 6) und infektiösen Einheiten (Spalte 12, Tabelle 6). Alle Einzelheiten
von Fig. 5 sind in der obigen Tabelle 6 beschrieben,
und die Daten aus Spalten 7 und 11 der Tabelle 6 entnommen
und gegen die verflossene Zeit (Spalte 3) und die entsprechende
Übertragungsnummer (Spalte 1) aufgetragen. Beide Ordinaten von Fig. 5 beziehen sich auf die Mengen, die
in den 0,25 ml-Anteilen gefunden wurden.
Die Übereinstimmung zwischen dem Zuwachs der synthetisierten
RNS und(der neu auftretenden infektiösen Einheiten ist in
jeder'Stufe der Serienübertragung ausgezeichnet - undgeht
kontinuierlich bis zum letzten Glas. Lange nach Verdünnung der Einleitungs-RNS auf unbedeutende Mengen dient die RNS,
von einem Glas zur Initiierung der Synthese in dem nächsten. Weiterhin, wie sich ergibt aus der verhältnismässigen Konstanz
der Infektionswirksamkeit (Fig. 5 und Spalte IJ von
Tabelle 6), ist die neue RNS genau so wie die ursprüngliche
Virus-RNS geeignet, die Synthese von Virusteilchen in Sphäroplastenzu synthetisieren.
Um den Beweis zu vervollständigen war es notwendig zu
zeigen, dass die durch die synthetisierte RNS produzierten
Viren tatsächlich Qß waren, d.h. die ursprüngliche Quelle
der
909887/1691 - :
BAD ORiGiNAL
_.:69 ■;. . ; 162084S
der RNS,. die zur Einleitung des ÜbertragungsVersuchs
als Einsaat in Glas 1 verwendet wurde.. Da Qß ein ein-,
maliger serologischer Typ ist (Nihon Rihsho, 22, 24>y
(1964)), wurde diese's Merkmal als bequemer diagnostischer
Test Verwendet, Pläquen, die durch die in Glas 15 synthetisierte RNS induziert wurden, wurden zur Herstellung
der Lysate verwendet, und die sich ergebenden Teilchen AntiserexL gegen MS-2 und Qß ausgesetzt. Die in Tabelle
kurz zusammengefassten Ergebnisse zeigen deutlich, dass'
die synthetische RNS Virusteilchen des·gleichen serologischen'Typs
wie die authentische Qß'hervorruft, :
. : ," ; ; -,.."= Tabelle 7
909887/1691 ;>
\ '^ ; " ;
■■■■■-■■- BAU
"synthetische" RNS+' gebildet worden sind.
O CO CD OO
1, | Zeit | O ■ | 1, | Anti-Q,ß | überlebende | Zeit | Anti | O | -MS-2 | io8 | überlebende | |
Viren ■ ^^\^ | 1, | 9 x | 108^ | 8, | 10 Min. | 0,052 | 1,1 | χ ΙΟ8 | 10 Min. | 108 | ■ 96 | |
Authentische Qß | 5 x | ίο?;. | Ox 10-3 | 0,053 | 1,5 | χ ΙΟ8 | 1,06 χ | 93 | ||||
Virus aussynthe-' tischer RNS |
8 χ 104 | 1,40 x | ||||||||||
In allen Fällen wurden Lysate aus E. coli Q13 hergestellt, das auch als .Untersuchungsorganismus
verwendet wurde. Die Antiseren wurden mit l/lüO Verdünnung
verwendet., und die Inkubationstemperatur betruß 35 C. Die Nummern geben die
Plaqueh-Bildner pro ml wieder.
TO CD cn
cn
Es ist vielleicht verstellbar, dass ein einen komplexen
Kopierprozess ausführendes Enzym eine hohe Fehlerfrequenz
zeigt, wenn es in einer unnatürlichen Umgebung
arbeitet, wie sie bei enzymologischen Versuchen vorliegt.
Wenn dieses eine quantitative und ins Gewicht fallende Komplizierung \väre, müssten'sich biologisch inaktive _-
Stränge entsprechend dem Portschreiten der Synthese,
angereichert haben. Dass dieses nicht der Fall ist,
wird eindeutig erläutert durch den Serienubertragungsversuch
(Tabelle 6, Fig. 5). Die nach der 15. Übertragung synthetisierte RNS ist biologisch in-gleicher
Weise geeignet wie initiierendes "Natur"material, das .
von Virusteilchen stammt.
Die erfolgreiche Synthese einer biologisch aktiven
Nucleinsäure mit einem gereinigten Enzym"ist selbst
von offensichtlichem Interesse. Ein fruchtbarer Aspekt hinsichtlich einer möglichen Anwendbarkeit beruht jedoch
auf dem Nachweis, dass die Replicase tatsächlich identische Kopien der Virus--RNS' erzeugt. Es ist zum ersten
Kai ein System verfügbar gemacht Korden, das es er- laubt,
die molekulare Grundlage, die der Vervielfäl-..:
tigung einer sich selbst vermehrender, ^cleinsäure/
zu Grunde liegt ^analytisch zu erfassen; Jeder notwendige
Schritt und Bestandteil für die vollständige Vervielfachung muss bei.dem beschriebenen Reaktionsgenisch
gegeben sein. Wenn zwei Enzyme benötigt werden
. ■ ' ■ - " ■ - ■ (Fed.
909887/1691 —
(Fed. Proc., 23, I285-I296 (1964)), müssen beide vor-
c te
liegerij und es soll/ möglich sein, ■'entweder ihr Vorliegen festzustellen oder zu beweisen, dass nur eins erforderlich ist. Wenn ein dazwischenliegender "vervielfältigender" Schritt zwischen der Schablone und der endgültigen identischen Kopie liegt (Fed. Proc, 2j5j 1285-1296 (1964)), dann müsste eine "replikative Form" in dem Umsetzungsgemisch nachweisbar sein. Falls der Kopievorgang direkt verläuft, dürfte kein derartiges Zwischenprodukt gefunden werden.
liegerij und es soll/ möglich sein, ■'entweder ihr Vorliegen festzustellen oder zu beweisen, dass nur eins erforderlich ist. Wenn ein dazwischenliegender "vervielfältigender" Schritt zwischen der Schablone und der endgültigen identischen Kopie liegt (Fed. Proc, 2j5j 1285-1296 (1964)), dann müsste eine "replikative Form" in dem Umsetzungsgemisch nachweisbar sein. Falls der Kopievorgang direkt verläuft, dürfte kein derartiges Zwischenprodukt gefunden werden.
Beispiel IV 1. Verfahren
Der Gast- und Untersuchungsorganismüs ist E. coli QlJ*
eine Hfr-Mutante, der Ribonuclease-I und Phosphorylase
(Fed. Proc, 24, 293 (1965)) fehlt. Das Virus ist Qß und wurde von Watanabe (Nition Rinsho, 22, 24^ (1964))
isoliert. Alle Verfahren zur Herstellung infektiöser Zellen, zur Reinigung der Replicase, zur Synthese
radioaktiver Substrate und zur Prüfung und Bestimmung der Enzymaktivität sind oben im einzelnen beschrieben
worden.
. " *■■'■'
Zerlegung
Die RNS des QS-Virus ist einer enzymatischen/offensichtlich
mehr zugänglich als die von MS-2, und daher muss
bei der Herstellung der RNS aus diesem Virus Sorgfalt und Schnelligkeit angewendet werden.
Die Verfahren waren wie folgt: E. coli (Ql>)-Kulturen
909887/1691 mraea '
• BAD ORIGINAL
wurden, bis zu einejix QBgg0 zwischen 0,2 und .Q, j in . . ■-■ '-.
Gegenwart von MS-2-Antise:p,uni bei' eine-r Verdünnung. V-QR
1 :;: 10,000 ■gezüchtet« Die gf^Phägen werden^hinzugesetzt-.b@i
einer jCnfektionspiulfeiplizifeät von 10>
und die Kultur
wird 50 Minuten lang bei -379S ohne SQntlttsln"inkU:öie.rt,
Die· Kulturen werden dann duröh Scnütteln-Idielüftitj.
naoli etwa:2 itundgri Lysis auftritt. Das SeMtteln
weitere 4 Stunden fortgesetzt, und clann werden; äie
türen abgekühlt. Das. Lysat wird 10 ;Minuten l4ng -bei
3,OQO % g gentrifugiert:, und e:§. werden 311 g.
gulfat tß- tite^ des abgekühltin^-über§tand.§§ ^in
gefügt» Niaoh 3 bis 4 atunägn bei 5öö weräen di© fe
tit durah fgntrifugiQrifi bei 15,000.3ξ g
, Si© w^rd.en godanji in §inga 3?M*Pufftp - · ■
g se iqä^-m Mgeig>
pH-Wept TiS^witäiP
und zweimalVwßhrend. .g itund.§Pi gaitn . - . ■ '
fM:-Pufi?ra äial^Bier^/.;.. Sie ihagefe-Süspsäwird
dann _iq Minuten lang'bei- lO.ÖOO χ g
fugierfe und öle. üb§rst§h&nö@
ι Stund© bei 3Q°a mit ppena&e (1 mg/ml)
ybig um
und" die- MS- (
2· Ergebnisse
(A) Absprechen auf bruchstückarti^e 0,9,-RMS
Zn Bruchstücke zerlegte RNS-Moleküle v/erden leicht erhalten au§ Qß,. indem man die 4 Stunden dauernde/ Perioce
der AmmoniumguifafcausfaHung auf 10 Stunden^ und aar-üoerhinaus
verlängert, pig erhaltene HKS zsi^t rait-DeutXichlceit
tine geordnete Zerlegung in BruchstÜQke, die durch
'das Auftreten von reprodugiertiaren Peaks" be st St igt v;ird,
welehe niedrigers SedimentatiQnswerte aui'v/eiserj als die
a8s dir intakten Vi^ug-RNS. Diese werden hinsiohtlich
mit e4nsm SuQrdsegr&d.ienter, frsktiöraert,
gg und dureh Alkoholausfällung konzentriert,
I1Ig, β geigt das Ansprechen der Repl'ioase auf intakte
und bruQhgtÜOkartige 0,B-RIvS/ Die Sedinien
gramrot ä@p drei Präparate werden in der
Zeichnung von Fig.. β gezeigt. Dag erste' entspricht
d@r intakten. Virus-RNS ,(SSS), di§, v/ie in Teil 1 besahriebiri,
hergisttllt wurde. Dag zweite entspricht einem
·....■■■-■ ha.lbiertss i©il rait einem Mittelwert von etwa. 17S und
das dritte beiitgt eine Seäirnentations-KQeffizienteh
von 78, Das Ansp.r-esheii; der Repliaase auf. die drei HN3«
e "wii'd in FIg, 6 gegeigt, S-s ist ergiohtlich,
§ äa§ bruchstUakartig© Material nicht irnstande ist/ ,
die Rgplicasi auf einen Wert, d©r auch nur annähernd
ihrer völlitindigen Aktivität entspricht;, anzu.regan»
.. Insbesondere ,
.'- 9-09-887/1681
BAD GRIGiNAL
Insbesondere stellt die eingefügte Zeichnung in Fig. 6 '
die Verteilung eines linearen Sucrosegradienten (2,5 ~-,
Vj%) von RIiS dar, die, wie in Teil 1 oben beschrieben,
hergestellt und fraktioniert wurde. ■ Jedes Präparat lief
in einem getrennten Behälter 12 Stunden lang bei
25.000 rpm und 40C in einem SW-^S-Spinco-Rotqr mit Markierüngssubstanzen
(Mb ο some-RNS),, um die Bestimmung der
S-Werte durchzuführen. Die Sehablonenfunktion jeder
Grö'ssenklasse der RNS wurde bestimmt gemäss dem im
obigen Beispiel I beschriebenen Versuch. Ausser 40 {ig
Protein enthielt jedes Standard-Reaktionsvolumen von
0,25 ml die folgenden Bestandteile in μ Mol; Tris-HCl,
pH-Wert T,^, 21; MgCl^y 3,2; MnClg, 0,2) CTP, ATP,
UTP und GTP, jedes G,2. Die Reaktion wird bei 35°C
20 Minuten lang ablaufen gelassen und in einem Eisbad
beendet, wonach Ausfällung mit Trichloressigsäure und
Auswaschen auf einer Membran erfolgty^Weeks FlüssigkeitsscintillationsZahlurigi
-wie in Beispiel I oben beschrieben. "UTP- , das nach Haruna et äl (Proc. Mat-'l^ Acad. Sei.,
U.S. 50, 905 (1963)) -synthetisiert ivorden war, wurde
in einer Menge von 1 χ IG cpm/0,2 μ KoI. verwendet, "
.'-.. (B) Die Hirkun?~ von Kangan auf .die Grosse
■ und das Sequenzbedürfnis der Repileäse
■ und das Sequenzbedürfnis der Repileäse
Im Verlauf der Prüfung der Schablonenspezifität und
<ies GrÖssenbedürfnisses der Qß-Replicase vmrde ein
eindeutiger Effekt von Mangan aufgedeckt..Eine typische
■■■;.■■■. - . '■ . ;: Reihe -.'.
909β87/1691 "" ™-'
-, 76 -
1620845
ist die Pähig-
i :
Reihe von Ergebnissen ist in der nachfolgenden Tabelle 8
zusammengestellt. In Gegenwart von Mg
keit.sowohl des 17S*-Pragments als auch der
das Enzym anzuregen, fast zu vernachlässigen entspre*- ;
chend den 2 bzw. 4$ von derjenigen;, die bei intakten ■ , '
RNS beobachtet wurde. Falls andererseits Mg+* durch Mn+4"
ersetzt wird, ist eine wesentliche Änderung zu beobachten.
Die normale Synthese mit 28S-RNS"wird, stark gehemmt, -. ;
wohingegen: die anomalen Aktivitäten 'angeregt werden** (lie
bei 17S- und RYMV-RNS beobachtet werden. Wenn man tat- ' >
sächlich die optimalen Bedingungen für die Funktion dieses Enzyms nicht keimen würde, könnte man versucht?
sein, aus den mit Mn erhaltenen Ergebnissen zu folgern; -.
dass.die Q;ß-Replicase TYMV-RNS als Schablone bevorzugt /
und dass sie verhältnismässig indifferent ist gegenübei? · *
der Grosse der RNSj mit der zusammen sie arbeitet-*
909887/1601
BAD ORIGINAL
• '/'■ .-'
Wirkungen' von Mg und Mn auf die Schablonenspezrfität der Replicase
Wirkungen' von Mg und Mn auf die Schablonenspezrfität der Replicase
,, ·..·. Incorp.
. Schablone Mg (μΜοί) Mn (μΜοί) · cpm
146 63
TYMV - - 0
Qß-28S ' 4 - '·' 4655
Qß-17S -4 - ' 109
TYM 4 . - 218
t — -
■ 4 ' - ' 1
Qß-28S ' - . 0,12 · 474
Qß-I7S - 0^12 222
TYMV , - 0,12 766
103
12 | |
O^ | 12 |
o, | 12 |
0, | 12 |
o, | 2 |
°* | 2 |
o, | 2. |
o, | 2 |
Qß-28S 3 0,2 2804
Qß-17S 3 . '0,2 240
TYMV - 3 0,2. 1037
—τ 3 . . 0,2 103
■ +^Die Reaktionen (0,25 ml), enthielten 1 μ£ der angegebenen RNS
und 40 μ£ Protein ausser dort anderen Bestandteilen, die im
co einzelnen in der Beschreibung von Pig. 6 vorstehend angegeben ■
^ .werden, und zwar mit den am Ende der Tabelle aufgezeigten Abwand- s
o° lüngen. Die Inkubationen wurden durchgeführt bei 35°C währendop
" ' »
■<i 20 Minuten; das Auswaschen und Zählen geschah, in der gleichen Weise
Ij ' wie in Fig. 6 beschrieben..TYMV bezieht sich auf intakte RNS/. die ;
^ aus dem gelben Rubenmosaikvirus isoliert wurde. Qß-28S ist die
—» intakte RNS des Qß-Bakteriophagen und 17S ist das Fragment von
der halben Grosse. - _. ßAD OR1G«NAL Γ
Die anomalenAbweichungen,, die in der Reaktion entweder,
durch, bruchstückartige RMS oder das Vorliegen von Mangan
hervorgerufen- werden, gehen noch besser aus dem kinetischen Verhalten der Reaktion (vergl. Pig. T) hervor.
Die Reaktionen wurden gemäss den in Fig. 6/aufgezeigten.
Einzelheiten "angesetzt mit der -Abwandlung/ dass Mn**.,
wie angegeben, ausgelassen oder hinzugefügt wurde .--Es
wurden Proben von 0,25 nil abgenommen und zur Zahlung
entsprechend Fig. β behandelt. Die Schablonenkonzentrationen waren in allen Fällen 1 μ§-RNS. auf jeweils
40 μζ Enzym in 0,25 ml* Es ist zu beachten, dass die
Ordinate der rechten Hälfte von Fig. 7 nur 1/iO derjenigen
der linken Hälfte der FIg, 7 ausmacht.
Wie bereits beobachtet worden ist, verläuft die Synthese während ausgedehnter Zeiträume in Gegenwart von Sättigungsmengen" der intakten Schablone und von Mg linear.
Wenn man jedoch Mn dem Reaktionsgemisch zufügt, bricht
die Reaktion in etwa. .60· Minuten ab, selbst wenn die
28s-RNS als Schablone verwendet wird. Wenn nunmehr- das
Ansprechen des Enzyms auf die bruchstückartig zerlegte
Schablone (Fig. 7) geprüft wird>
wird ersichtlich, dass die Anfangsreaktionsgeschwindigkeit geringer 1st als
10$ der normalen und dass sie in JO Minuten völlig ; }
aufhört, ob Mn+* zugegen ist oder nicht.
..Beispiel·
f 9 09887/1 691 \;
. : BAD
: ' - Beispiel V
Intakte Vifus -ItNS zur Verwendung als Schablone können . .·
■'. · getnäßs dem nachstehend beschriebenen Verf-ahrenherge-.
stellt werdenί
Der GastOrganismus ist ein Hfr-Stamm von E. coli (Q-I^).
• Er würde gezüchtet bei 370C unter kräftiger Belüftung
in einem JXD-Medium (j; Biol. Chem., 205, 291 (1953))
bis zu einer optischen Dichte bei 66Ο πιμ von 0,15 ent-
sprechend 5 χ 10 Zellen pro ml. Um jede Möglichkeit
von Überkreuzüngs-Verunreinigungen auszuschliessen, z.B. "j
mit 8!S~2, wurde eine. 10 -Verdünnung .von MS-2-Antiserum
der Kultur zugesetzt. Wenn MS-2 herangezüchtet wird, dann wird das Atttiserum gegen Qß in die Kultur einbe- !-
zogen. Die Kultur wird dann infiziert bei einer Infektions-MultipUzität
von 5 oder darüber von Virusteilclien zu Zellen, ßs wird eine Ruhezeit von 5 Minuten zur
^Absorption ,erlaubt und dann wird belüftet', bis in etwa
: 2 bis 3 Stunden Lysis auftritt.
„Bas Iflrsat wird dann untersucht« um die Anzahl von Virus-
* . · ■ ■ i
,. teilchen pro ml zu bestimmen, die sich gewöhnlich auf !
■ einen t/ert zwischen 3 und 8x10 Plaquen-bildenden
-.""' Einheiten pro ml belauft. An dieser Stelle-wird das
%, Vorliegen anderefNnöglichen verunreinigenden Teilchen
' ■ weiterhin geprüft unter Verwendung anderer Gastorganis-
. ■ . men, z.B. E. coli B. Ausserdem werden die Phagenteil-
' ' chen gegenüber dß-Antiserum geprüft, um sicherzugehen,
V 909887/1691
- 8ο -
1820645
dass es sich auch tatsächlich um Qß-Phagenteilchen handelt,
■ ■ .",·»■
Das Lysat wird dann bei 9.000 rpm. 45 bis 60 Minuten .
lang zentrifugiert. Der tiberstand wird in 3 bis 4 Liter-Bechergläser
gegossen, und 311 g Amrnoniumsulfat pro
Liter des Überstandes werden sodann hinzugefügt. Diese Mischung wird-dann 2 1/2 bis 3 1/2 Stunden bei 40C.
stehengelassen und wiederum 45 bis 6o Minuten lang
bei 9.000 rpm zentrifugiert. Der Überstand wird verworfen. Die abzentrifugierten zurückbleibenden Plättchen
werden in 20 bis 30 ml 0,01 m Trispuffer mit einem
pH-V/ert von 1,3 und einer Magnesiurnkonzentration von
'10"^ m wiedersuspendiert. Dann wird gegen 200 ml des
gleichen Puffers bei 40C mindestens 4 Stunden lang dialysiert.
Nach der Dialyse wird die Phagensuspension 20 bis 30 Minuten lang bei 15.ΟΟΟ rpm zentrifugiert und die
abzentrifugierten Plättchen verworfen. Der so erhaltene Überstand wird in Gegenwart von 1 mg pro ml Pronase
60 Minuten lang bei 35°C inkubiert ; und dann auf 0,2^
in Bezug auf IJätriumdodecylsulfat gebracht. Die erhaltene
Suspension v/ird mit wass.ergesättigtem Phenol geschüttelt*
Das Protein wird in der Zvrischenschicht zwischen Phenol.
und Wasser gehalten, und die proteinfreie- RInTS verbleibt
in der wässrigen- Phase. Die RIJS kann sodann mit zwei Volumina
in der Kälte ausgefällt v/erden, und die intakte
Virus RNS wird durch Zentrifugieren gewonnen und in
einem
909887/1691
BAD
einem geeigneten Puffer zur Weiterverwendung wiedersuspendiert.
. .-- ; > '
Versuche zur Analyse des Vervielfältigungsmechanismus
müssen der Tatsache Rechnung tragen, dass die hier einbezogenen Enzyme wahrscheinlich sehr kompliziert zusammengesetzte Moleküle sind. Ein hoher Grad komplexer1
Zusammensetzung ergibt eine Flexibilität,· die das Auftreten
anomaler Aktivitäten erlaubt, einer Möglichkeit, die hervorgehoben werden kann durch entweder fremde Umgebung oder durch ungewöhnliche Bestandteile. In Ab-Wesenheit
des Substrats (primer) leitet die DNS-abhängige DNS-Poiymerase eventuell die Synthese eines A-T-Mischpolymerisates
(J. Bio!» Chem. '■ 235, 2242 (I96Ö)) ein. ; ·
In Gegenwart von Mn+* führt das gleiche Enzym Ribosidtriphösphate
in ein gemischtes Polymerisat ein (Berg,
P., H, Pancher, und M. Chamberlin, in Informational
Macromoleculesj herausgegeben v. H.J.Vogel, V.Brysoii
und J.0.Lampen (New York· Äöademic Press, (1963))♦
In analoger Weise synthetisiert die DNS-abhängige
RNS-Polymerase (Transcriptase) Poly-Ä, wenn ihr nur
ATP zugeführt wird, eine Reaktion, die gehemmt wird,
wenn die anderen Ribosidtriphosphate zugefügt .werden
(Symposia, gehalten auf dem VII.,Internationalen Kongress
für Mikrobiologie, S0 Sl-iOJ (1958);. Proc, Nat'l, Acad."
Sol., U.S. 48, 81 (1962)>v Wenn ihr eine einzelsträngige
DNS zugegeben wird> synthetisiert die Transoriptase
ein DNS-RNS-Hybrid (J. Mol. Biol,, 8, 29T (1964ΪΧ ·
9Ö9887/1&91
,■ ■■;.".. / - ■■"■■- .-." ;J,MoX, ·
' BAD
J..MoX. Biol.; 8, 289 (1964); Proc.Natrl. Aead. Sei.,
U.S. 52, 796 (1964); Biophys. J., 5, 231 (19β5)), und
falls die Schablone RNS ist, ergibt sich eine doppelte
RNS (,duplex) (Proc, Nat 1I. Acad. Sei., U.S., 49, 88
(1965); Proc. Nat 1X.' Acad* Sei., 48, 88O (1962);
J.Mol. Biol., 9, 193 (I964)). Die Tatsache, dass derartige Kunstprodukte auftreten können, macht es schwierig,
unwiderlegbare Schlussfolgerungen aus dem Auftreten eines
* ■■ " Produktes bei einer Umsetzung-zu ziehen. Ein Nachweis,
A ■■·.■■ ■·■■-..■■■..
w der nicht nur einfach auf seinem blossen Vorliegen beruht,
muss geschaffen werden, ehe der Bestandteil als
obligatorisches normales Zwischenprodukt bei dem Polymerisationsprozess angenommen werden kann.
obligatorisches normales Zwischenprodukt bei dem Polymerisationsprozess angenommen werden kann.
Die aufgeführten Versuche zeigen, dass das Ansprechen
der Replicase auf fragmentartige Qß und heterologe
RNS sehr verschieden in Bezug darauf ist, was zusammen
mit der intakten Qß-RNS beobachtet wird. Im vorliegenden
Falle muss betont werden, dass die Untersuchung der
normalen Funktionen der Replicase intakte homologe
" RNS und die Vermeidung des Vorliegens von Mn++ erfordert.
Das frühzeitige Aufhören der Reaktion mit Fragmenten
(vergl. Fig. 7) kann die beschränkte Synthese erklären,
die von anderen Verfassern mit teilweise gereinigten
Enzympräparaten festgestellt wurde, aus denen Nucleasen nicht vollständig ausgeschaltet worden sind. .^
Die Unfähigkeit der Replicase, Bruchstücke ihres
9 0*98 8-7/16 9.1 . , eigenen
BAD ORIG1NAC
eigenen Genoms als Schablonen in geeigneter Weise zu
verwenden, stellt ein Argument gegen einenErkennungsmechanismus
dar, in welchen nur eine beginnende Sequenz
einbezogen sein soll. Offensichtlich "merkt" es das Enzym, wenn es einem intakten RNS-Molekül gegenübersteht,
ein Hinweis, dass gewisse Elemente der Sekundär-Struktur hier eine Rolle spielen. Man kann eine plausible
formelle Erklärung vorschlagen im Sinne einer "funktionellen
Kreisanordnung11 * Man kann auf diese Weise hinsichtlich
der Unversehrtheit eines linearen Heteropolymerisates leicht entscheiden durch Prüfung beider
Enden in Bezug auf die geeigneten Sequenzen. Eine derartige Prüfung kann physikalisch unterstützt werden
durch Bildung feiner Kreisstruktur unter Verwendung der Endsequenzen von sich überlappenden Ergänzungseigenschaften. Das Enzym kann dann den entstandenen Bereich
der Doppel-Stranganordnungen erkennen. Dieser spezielle
Mechanismus wird nur als theoretisches Beispiel (nicht
- - ■"'■." .■■'■■ ■■■ ■ ■- . : - - - ■■.-■■::■■-■
zur Beschränkung der vorliegenden Erfindung) dafür
vorgebracht, wie ein Enzym gleichzeitig sowohl die Sequenz als auch die Unversehrtheit unterscheiden
könnte* Welche Einzelheiten hier auch vorliegen mögen, so hat es den Anschein, dass die HMS-Replicasen imstande
sind, die Zwecklosigkeit zu vermeiden, entweder fremde
Sequenzen oder unvollständige Kopien ihres eigenen Genoms zu,vervielfältigen.-
909887/1691 '
Beispiel VI
(A-) Verfahren und Materialien
Katalase (2 χ umkristallisiert) wurde von der Firma Sigma Chemical Co..bezogen und wie in J. Biol. Chem.,
236, 1372 (1964) beschrieben geprüft..Als CsCl wurde
das 99i7# reine Material von Penn Rare Metals, Inc.,
Reverse, Pennsylvania, verwendet. Ein nicht zufriedenstellender hoher- 0.D. -Wert konnte leicht korrigiert
werden durch Filtration durch ein Cellulosenitratmembranfilter (Schleicher und Sohttll, B-6, 27 mm).
Als Gast- .und Untersuohungsorganismus wurde wie in Beispiel I ein mutanter Hfr-Stamm von E. CoIi (Q-I]J)
verwendet.
(B) Prüfung der Enzymaktivität durch Incorporation
radioaktiver Nucleotide
Es wurde die gleiche Arbeitsweise wie in Beispiel I
verwendet.
(C) Herstellung infizierter Zellen
Es wurde die gleiche Arbeitsweise wie in Beispiel I
verwendet.
(D) Enzymherstellung
Es wurde die gleiche Arbeitsweise wie in Beispiel I
verwendet.
(E) Zentrifugieren in CsCl
Ein ml von 10#igerä Ammohiumsulfat im Standardpuffer
(0,01 m Tris, pH-Wert .7,4j 0,005 m MgCl2; 0,0005 m
2-Mercaptoäthanoi) enthaltend 10 bis 15 mg eines Enzymproteins,
das nach der DEAE-Behandlung erhalten wurde,
90 98 8 7/16 91
wird
wird über 4 ml einer CsOl-Lösung geschichtet, die
auf eine Dichte von 1^40 gm/cm<
eingestellt war» Das Röhrchen wird bei Ö°C 24 Stunden läng in einem
Spincö-SW-39-Rotor bei 39.000 rpm zentrifugiert. "
Nach dem Zentrifuglei'en wird das ZentrifugenrÖhrchen ' .·.".-an
der Seite unmittelbar unterhalb des sichtbaren Proteinbandes
durchbohrt und die Fraktionen durch eine
Nadel von 0,5 mm einer Injektionsspritze aufgefangeri.
Die Nadel wird im rechten Winkel gebogen, um eine Ein-
;führung mit dem langen Ende der Nadel nach oben zu ge- £
statten, danach wird..4as lange Ende um 180° gedreht,
damit der Inhalt des Röhrchens auslaufen kann. -Der untere Teil im Röhrchen wird dann entfernt,- indem man .
den Boden durchbohrt und Fraktionen auffängt. Auf dieseWeise ist die Verunreinigung des Proteinbarides
durch das "Virusband minimal auf Grund der wesentlichen .
Unterschiede der Dichten der.beiden Stoffe. Die Frak-
-V" 10j6igem; ■""■■': - : '-■.""■_
tiönen werden dann auf 1 ml mit/Ammoniumsulfat im
Standardpuffer verdünnt, um optische Dichtenmessungen ■ .j
■-■ ; ■ ; *■'■ - ; ' €5
und EngymprÜfungen durchzuführen. . . .:- !
(F) Sedimentation mittels Suorosegradienten. ■ '--".
Die Peaks enthaltenden Röhrchen aus den Enzymbereicheri
der CsCl-Grädien^en werden gesammelt und mit SO^igem ;
gesättigtem Ammonsulfat ausgefällt. Der Niederschlag :
wird im Standardpuffer bis zu einer Proteinkonzdntra- ' e-■
tion von 25 bis ?O mg/ml dispergiert und die Suspension
9 Q 988 7/1 69 1 2 Stunden
2 Stunden lang bei O0C gegen 250 ml Stanäardpuffer
dialysiert. Zwischen 0*2 und 0,3 ml der dialysierten
Proteinlösung werden auf 5,4 ml eines 5 bis 20Jiigen
linearen "Gradienten von Sucrose aufgeschichtet, die
im Standardpuffer gelöst ist. Wenn ein Bezugsprotein
erwünscht ist, werden ΧΟΟγ Katalase zu Jeweils 0,2 ml
. der Proteinlösung hinzugesetzt. Die Gradienten werden
bei Q0C 12 bis 15 Stunden lang in einem SpinGo-SW-39-Rotor
bei 39.000 rpm zentrifugiert. Wiederum wird,
um eine Verunreinigung mit abgeschiedenen Virusteilchen und anderen Materialien zu vermeiden* der Enzymbereich
seitlich abgenommen, wie das bei dem CsCl-Zentrifugieren
beschrieben worden ist. Aliquote Anteile werden von jeder Probe für die 0»D.-Messungen und Enzymbestimmungen
abgenommen. Um eine Verdünnungsinaktivierung zu vermeiden, werden diejenigen Röhrchen, die
Replicaseaktivität enthalten, nicht verdünnt,; aliquote
Anteile werden entfernt zur Verdünnung und 0.D.-Bestimmung. Röhrchen mit Aktivitäts-Peaks werden vereinigt
und ohne weitere Behandlung verwendet. Um einen hohen Aktivitätsverlust zu vermeiden, ist darauf zu
achten, dass die Reinigung mittels Suerosegradienten
durchgeführt werden' muss bei angemessenen Proteinmengen, nicht weniger als 4 mg pro Röhrehen.
Es wurden vor der Zentrifugierreinigung andere Rei- ' ·
nigungsarbeitsweisen benutzt. Zu diesen Arbeitsweisen
&09887/Ί691 gehören
BAD
gehören folgende Methodenϊ Ammoniumsulfatfraktionierung,
Adsorption und Elution an Ογ-Aluminiumoxyd und an
DEAE-Cellulose, Chromatographie mit Hydroxylapatit-GeI,
isoelektrische Ausfällung und Elektrophorese.
(G) Prüfung.auf infektiöse RNS
Es wurden Protoplasten hergestellt durch eine Modifi-
- " ■ ■-' - "■ "-■'.: ■ weise ■' -. - ""--,. .[■'.-■'. _' "_.
zierung der Arbeits vonGuthrie und Sinsheimer
(Bioahem. Blophys. Aota,, 72» 290 (1963)) und Strauss
(J* Med. Bio!,, lQt 442 (1965)). E*·ooli K12-W6-Kulturen,
die Von Dr. R.L.Sinsheimer (Galifornia Institute of
Technology) zur Verfügung gestellt worden waren/ wurden
in 50 ml -5XD-Medium (J. Biol, Cheou, 205, 291 (1955))
bis zu einer 2Selldichte von 5 χ 10 /ml gezüchtet und
durch Zentrifugieren bei >. 000 rpro und Raumtemperatur
während'.'-10 Minuten,geerntet. Der Zellrückstand wird
gründliche getrocknet und dann in 0>35 ml 1,5m Sucrose,
0,17 ml Rinderserumalbumin (Armour, 3Oj6).und 0^04 ml
2 mg/ml Lysozym (Armour), gelöst in 0,25 m Tris, pH-Weife
8,1, dispergiert. Die erhaltene Suspension wird 2 Minuten bei Raumtemperatur stehengelassen, währenddessen
der gesamte zurückgebliebene Rückstand völlig
wiedersuspendiert wurde, dann werden ,0,05 ml von.
4$6igera EDTAOnit^aOH bis zu einem pH-Wert von 7*\ neutralisiert)
hinzugefügt. Nach..30 weiteren Sekunden . werden 10 ml PAM {1% Casaminosäure, Difco; I^ Nährlösung,
Difco; Iji Glucose; 10^ Sucrose; 0,2J
009887/1891 wobei
INSPECTED
wobei das letztere nach dem Autoklavieren zugefügt
wurde).hinzugesetzt. f
Die Protoplastenpraparate werden bei 20C gelagert
und innerhalb von 5 Tagen nach der Herstellung aufgebraucht.
Die Wirksamkeit der Infektion durch Virus-RNS erreicht ein Maximum in 2 oder 3 Tagen nach Herstellung
der Protoplasten und bleibt mindestens -5 Tage lang
stabil. Die erhaltenen routinemässigen Agarplatten-Wirksamkeiten liegen im Bereidi von 1O~' bis 10"
infektiösen Einheiten pro Strang der Einführungs-Virus-RNS.
Bei der Untersuchung vervielfältigter Produkte hinsichtlich der Infektionsfähigkeit wurden aliquote
Mengen aus Reaktionsgemischen mit 0,01 m Tris, pH-Wert
7,4; 0,005 m MgCIp bis zu einer RNS-Konzentration von
0,2 bis 0,8 γ/ml verdünnt (wie durch Zählungen incorporierter
Radioaktivität während der Synthese festgestellt wurde). 0,2 ml des verdünnten Reaktionsgemisches
werden auf 35°C gebracht, und 0,2 ml der Protoplastensuspension
werden bei Raumtemperatur hinzugefügt. Nach 30 Sekunden bei 350C wird das Gemisch um
das 5-fache mit PAM-Nährlösung verdünnt, weitere 10 Mi-
nuten lang bei 35°c Inkubiert und dann die Agarplatten-Untersuchüng
durchgeführt. Als Indikatororganismus
dient E. coli K 38, erhalten von Dr. N. Zinder
(Rockerfeiler University). Die Plattenpräparate wurden bei 340C inkubiert.
Nach
909887/1691
Nach der zunächst durchgeführten Fraktionierung an DEAE-Oellulose (S. 58I von Proc. Nat'l. Acad, Sei,,
U.S., 54 579 (1965)) enthalten. Replicasepräparate
IQ? bis IQ12 Plaquen-bildende Teilchen pro mg Protein.
Zur direkten Prüfung der Umsetzungsgemische auf infektiöse: RNSist die Herabsetzung des Gehalts an
Virusteilchen um einen Faktor von 10 erforderlich.
Die anfängliche Abtrennung voncPratein und'Virus auf
Grund der Dichte: wird erreicht durch Gleichgewichfcs-Zentrifugieren
ijä CsCl-Dichte-Gradienten» Die restlichen Virusteilchen werden durch Sedimentation in
Sucroge^Gradienten entfernt»
Pycnographisehe Heiniffun^ ι Die Ergebnisse der^ bandenmJEssigen
Trennung (banding) des En^mprotein-fraparafce
das nach dem ersten DEÄB^hj?ömatographie§ehritt in .
,einem ösßl-Srädientep erhalfee|i wurde* sind in Big* 8
wisäe^gegthen.. Um diese Ergebnis se, zu: erhal^eiijt wurden
die Brec.hungsindiaes gemes^en^und d^nn wurd.e?i die Pro^
ben auf 1 ml verdünnt:i von denen jeweils eine 20 % <■-■
Iraktion zur Prüfung der En^piaktivität im Standard-- ·
Reaktiqnsgemls,eh. benutzt wurde \ die Inkubationsbedingungen
Tiaren 3QQQ während |Q Jfinuten.
fanden sip.J% bel^e.iner pishte enfcsprgahend 4
Die Beplipase zeigte Sänger^ (bands) bei 1^b
dis,
und kann daher leieht wn iem
Etwa IQ der m
909887/1891
909887/1891
werden* Etwa IQ der ugsprünglichen
gung
BAD
gung wird im·Peak der Proteinmasse zurückgehalten,
und wiederholte. Band-Trennungsversuche des Proteins in CsCl konnten die Verunreinigung nicht wesentlich
herabsetzen. Wahrscheinlich wirkt der in den hohen
Konzentrationen von CsCl gebildete Proteinniederschiag
als Ionenaustauscher-Oberfläche, wobei die restliche Virus-Verunreinigung die Adsorptionskapazität des
Niederschlages darstellt. '
Nach der Reinigung in CsGl bleibt das Bedürfnis und da,s
Ansprechen hinsichtlieh hinzugefügter Qß-rRNS erhalten.
Wie jedoch in den Sättigungskurven von Fig. 9 gezeigt
wird, tritt eine wesentliche.Zunahme in der beobachteten
Aktivät des Enzyms nach der Pycnographie auf.
Um dies,e. Kurven zu erhalten, wurden Standard-Reaktionsgernische verwendet, die 50 μg Enzymprotein enthielten*
Und zwar mit einer spezifischen Aktivität von *Priphosphat
von 2 χ 1CP cpm/0,2 μ Mol/ wobei die Inkubationfesbedingungen
30^C während 30 Minuten waren. Da
äquivalente Konzentrationen von RNS zur Sättigung
des Enzyms benötigt' werden^ scheint die nach der
psGl^Behandlung beobaeht^te Anregung zu einer sehnelleren "Afelesun^' (read-pqut) der Schablone zu fiihren. Bies
ergibt iicl| duj^feh Prüfuiig der Synthese im Exponential-^
be.reien während einer Besehrankung in Bezug auf die
Schablone..
: - . : Fig. ίο
9Di8 8 7/1601 ■ - ■ ■':. "~ ■ -
ψ -
SADORfGiNAL
Pig, 10 ist ein Vergleich der autokatalytischen Synthese
der Repliease vor und nach der CsCl-Reinigung; die
Verdopplungszelt der RNS beträgt das 3-fache desjenigen,
was durch ein Enzym katalysiert wird, welches nicht weiterhin gereinigt worden war. Um diesen Vergleich
zu erhalten, wurden Reaktionen, die 50 ^g
Protein und 0,15 gg Q-RNS in jedem Standard-Reäktionsgemisch
erhielten, bei 30GC durchgeführt, und es
wurden aliquote Anteilenach den angegebenen Zeitintervallen abgenommeni die spezifische Aktivität
des iriphosphats war derart, dass jS.3°° cPm
des RNS-Prodüktes "ixi; jeweils 0,25 ml entsprachen.»
Sedimentationsreinigung: Proteinpräparate, die nach der
Bandauf-trennung (banding) in CsCl erhalten wurden,." erhalten noch zuviel Virusteilchen, um direkte Prüfungen des Reaktionsproduktes hinsichtlich Infektionsfähigkeit zu erlauben. Die restliche Verunreinigung
wird auf eine annehmbare Höhe herabgesetzt durch Sedimentierung des mit CsCl gereinigten Enzymproteins
mittels linearer Gradienten von Sucrose. Fig. 11
zeigt die Sedimentatiönsdiägramme der Replicaseaktiyitat,
wobei Katalase als Bezugssubstanz einbezogen
worden war. Nach 12-stündigemZentrifugierenwurden
die infektiösen Virusteilchen als Rückstand im Zentrifugenröhrchen gefunden. Es ist zu beachten,
009887/1691
dass die Replicaseaktivitat eine Sedimentieruiig entsprechend
einem einzelnen Peak zeigt. Unter Anwendung von Katalase (Molekulargewicht 2,5 x 1O-3) als Standardsubstanz
lässt sich das Molekulargewicht der Replicase zu 1,1 χ 1O^ festsetzen).
Tabelle 9 fasst die wichtigen Eigenschaften des Replicasepräparates
bei jeder Reinigungsstufe zusammen. Im einzelnen zeigt Tabelle 9 die Ausbeute an Replicase
aktivität, Virusverunreinigung und relativen optischen
Dichtemessungen während einer Reinigung. Sehr oft sind die 0.D.260/0*D. -Verhältnisse der Enzympräparate
nach der DEAE-Behandlung von einer Höhe entsprechend
einem Wert von 1,0. Nach der CsCl- und Sucrose-Behandlung
jedoch wird dieser unveränderlich auf 0,60 herabgesetzt, was die Wirksamkeit der Arbeitsweise anzeigt.
Auch übersteigen die Aktivitätsausbeuten aus der CsCl-Behandlung
oftmals 100$.
Tabelle 9 ■
Eigenschaften gungsstufen |
der Repliease bei verschiedenen Reini- | 0'.D. | 260ZO-D.280 | |
Stufe | Ausbeute an Replicase aktivitat |
Plaquen-bildende Einheiten pro mg Protein |
o, | 660 |
Nach DEAE-Bhdlg, | . (100$) | 6,5 x J-O11 | 0, | 602 |
Nach DEAE- und CsCl-Bhdlg. |
' 82<£ ^ | 4,6 xlO5 | 0, | 604 |
Nach DSAE-, CsCl- und Sucrose- Bhdlg. . 69% |
/^50 |
90 9887/1691 Der
BAD ORfGiNAL
. 95 . 1620545
Der endgültige 'Rest der Phagen-Veruhreiniguhg: .Ist derart,,
dass nur I bis 10 Piaquenrhildende Einheiten in ein
Standard-Reaktionsgemlseh eingeführt werden, eine Menge,
die durch die vorliegende übliche Proben-Arbeltsweise
nicht entdeckt werdeit würde. "'] '"■ - V ·;
Die Synthese ergibt gewöhnlich' das Auftreten von. 0,2 bis
20 γ neuer RNS entsprechehd 10 bis 10 infektiösen Einheiten pro ReaktionsgefflischvUnter den angegebenen Versuchsbedingungen, Die Mengen reifer Phagenverunreinigungen
liegen eindeutig unterhalb der Naehwelsbarkeits-' grenze. --".."" . ' _ \ ~ ■-_■ ; ' ._-. ■ -.; ;
Gelegentlich verunreinigt etwas iranscriptase (DNS-abhängige
RNS-Polymerase) den Repl i case-Pe afc, der aus ■·
der DEAE-Säule eluiert worden ist.Nochmalige Chromatographie ist zu empfehlen, wenn das eintritt.-. Wie
jedoch In FIg. 12 gezeigt wird, kann Sedimentation-mittels
Sucrose-Grädiehten verwendet werden zur Trennung
der Replicase von Transeriptase. Diese Arbeitawelse ist;',
auch äusserst wirksam zum Ausschalten irgendwelcher zurückgebliebenen Spuren an RNS-ase, die zu Anfang, des
Gradienten zurückbleibt. Für die Werte gemäss FIg,· 12
wurden Zentrifugieren, Auffangen und Untersuchung·auf
Re pll case, wie ob"en beschrieben, durchgeführt; bei der
Prüfung auf DNS-abhängige-Aktivität^wurde Qß-RNS in :
dem Standard-Reaktionsgemisch durch 10 pg Kalbsthymus«
: .■:■ : : -■-" V : Λ-"-' DNS
909887/1691
DNS ersetzt, und aus den .relativen Sedimentationsgeschwindigkeiten
der beiden Aktivitäten wurde das Molekulargewicht der Transcriptase berechnet zu 3 x 10^.
Synthese infektiöser Nucleinsäure. Es ist bereits
gezeigt worden, dass das Ansprechen der Repliease auf
die Schablone während der Reinigung erhalten bleibt.
Weiterhin zeigt Fig. 15, dass das gereinigte Enzyrnprodukt
ein Sedimentationsrnuster ähnlich Q,ß-RNS besitzt. Zur Durchführung der Sedimentationsanalyse gemäss
Pig. β enthält das Standard-Reaktionsgemisch 5Ομ£ äes
"gereinigten" Enzymproteins und 0,2 μg Qß-RNS; die
Reaktion wird weitere 4-0 Minuten bei 35°C durchgeführt,
währenddessen eine 30-fache Synthese eintritt. Zu 0,1 mldes
Reaktionsgemisches wurden hinzugefügt: 0,01 ml 20$iges Natriumdodecylsulfat, 0,005 ml Y? GJ3-RNS,
0,20 ml 0,01 m Tris, pH-Wert 7,Λ. und 0,00.5 m MgCl2;
dieses wurde dann auf einen linearen Gradienten von 2,5 bis 15% Sucrose in 0,01 rn Tris, pH-Wert 7,4;
0,005. in MgCl2 und 0,1 m NaCl gebracht und bei 25.000 rpra
und 10°C 12 Stunden lang zentrifugiert, und zwar in einem Spinco-SW-25-Rotor.
VJie in Proc. Nat 1I, Acad. Sei., U.S., 54, 919 (I965)
gezeigt wird, liefert ein mittels der ersten DSAE-Stufe
gereinigtes Enzym einen ausreichenden Beweis, dass die durch Replicase synthetisierte RNS die biologische
Informa-909 887/169 1 ~
SAD ORlGJNAL
Informationschar»akteristikvon Qß besitzt. Bei diesen
Versuchen wird das Produkt einer Reaktion, die mittels Qß~RNS eingeleitet worden-ist; in aufeinanderfolgenden
Reaktionen serienmässig verdünnt^ bis die ursprüngliche
Qß-RNS zu einer nur noch -unbedeutenden Menge herabgesetzt
wurde,, Das letzte Glas enthält neue radioaktive
RNS, die im biologischen Sinne genauso voll wirksam ist. wie die Virus-RMS, welche verwendet wurde zum Start
der Reaktion in dem ersten Glas»
Ein ähnlicher Nachweis zeigte dass weiter mittels
CsCl und Sucrose-Gradiehten gereinigte Replicase unbeeinflusst die Fähigkeit beibehältj» biologisch aktive
Kopien zu erzeugen. · ·
Die Reaktion wird eingeleitet bei einem Wert geringer
als die Substratsattigung,und die Synthese wird dann
ablaufen gelassen. Nach einem geeigneten Zeitintervall wird i/läjStel dieser Reaktion verwendete um eine..zweite
einzuleiten, Nachdem die Synthese in angemessener Weise
abgelaufen ist* wird üer gleiche aliquote Anteil aus
dem zweiten Glas als die Schablone für eine dritte Reaktion verwendet^und dies wird für 10 Überträgungen
durchgeführt» Fig. 1# zeigt die Synthese von RNS und
infektiöse Einheiten durch gereinigte Enzyme. Da die Reaktion im ersten Glas mit 6 χ ΙΟ10 Strängen (O51γ)
von Q3-RHS eingeleitet wird und jede Übertragung eine
lil255raVerdünnung einschliesst^ ist der Beitrag der
009887/1691 . einleitenden
BAD ORJGiWAL
einleitenden RNS zu den infektiösen Zentren, die im vierten Glas gemessen werden, unterhalt) der Nachweisgrenze,
und dieses Glas enthält 2,4 χ ICK infektiöse Einheiten. Schliesslich enthält die elfte Reaktion
weniger als einen Strang des einleitenden Substrats (primer) und zeigt gleichzeitig 2,5 x ΙΟ-3 infektiöse
Einheiten, wie durch die Plaquen bei dem Protoplasten-Untersuchungsverfahren
bestimmt wurde. Die .durch Pycnographie und Sedimentation gereinigte Replicase
offensichtlich . .
hat/ihre Fähigkeit zur Produktion biologisch wirksamer Vervielfältigungen beibehalten.
Pur die Daten gemäss Fig. 14 wurden elf Reaktionsgemische
von 0,125 ml hergestellt, von denen jedes 22 μg durch CsCl- und Sucrose-Zentrifugieren gereinigtes "
Enzym -sowie die anderen Bestandteile des Standard-Reaktionsgemisches
enthielten. Die spezifische Aktivität von P^2~UTP war derart, dass 8.000 cpm 1 μg des RNS-Produktes
anzeigten. Zu dem ersten Glas wurden 0,1 μg :
Qß-RNS hinzugefügt, und die Reaktion wurde bei 350C
25 Minuten lang durchgeführt, worauf 0,02 ml für die Zählung und O5Ol ml als Schablone für die zweite Reaktion
abgenommen wurden. Das erste Glas wurde dann eingefroren und bei"--700C gelagert. Das zweite Reaktionsprodukt wurde verwendet, um das dritte einzuleiten usw.
Eine zweite Rlhe von Übertragungen wurde in derselben
Weise durchgeführt wie beschrieben., wobei darauf geachtet'
§09887/16-91 - —— · '
BAD ORIGINAL
■■"■ - 97 -'-■"■';-:- ·■-■■.-■-
tet wurde,-dass keine einleitende RNS-Schablone zu
dem ersten Umsetzungsgemisch hinzugesetzt wurde. Aliquote
Anteile von allen diesen Reaktionsgemisctien' wurden direkt
wie oben beschrieben auf'ihre infektionsfähigen Einhei- '-.
. ten untersucht. Im Falle der Kontrollübertragungsreihe. -;.-.
wurden die Proben 1,:10 inTMverdünnt und. dajih init" .
Protoplasten vermischt. Alle anderen Proben-wurden auf
0,2 bis 0,8 ^g RMS-Produkt/ml vor dem Vermischenmit r
den Protoplasten eingestellt. ; :' ; : ^- .
Diese oben im einzelnen auf:geführten Arbeitsweisen
zur Reinigung von Q,ß«Replicase ergaben Präparate, die
zufriedenstellend frei von Virusteilchen■warenund ;
eine direkte Prüfung des RHS-Produktes -hinsiehtlich
seiner biologischen Aktivität erlaubten. :; v
Die vorliegende Erfindung ist geeignet für Untersuohungen
und/oyder Präparate von Produkten mit Antivirus- _.-..,
Wirksamkeit, Antikrebswirksamkeit und-Hormpn-r und/öder ;
Enzymaktivität. Eine derartigeForschung könnte zu - '
wichtigen therapeutischen Fortschritten führen» ..
Es ist vorstellbar, dass eine veränderte Replicase unter
gewissen Bedingungen eine .-veränderte RNS herstellen - ;
könnte, die im vorliegenden System möglicherweise ITipus-Eigenschaften
verändert -haben könnte oder unter iäealen
Bedingungen vielleicht Anti-^Virus-Eigenschaften :aufweisen
90988771091 ; 7
^ OBiGiHAL
würde. Es kann möglich sein, dieses System eventuell
zu benutzen* indem man einen neuen Bestandteil zu dem. bakterienreinen (bacteria-pure) .RNS-Virus-System
hinzufügt, das eine neue Replicase ergeben- " könnte, wobei das Rep^icase-Sys-tem auf die Herstellung
von Anti-Virus-Molekülen gerichtet sein könnte."-"
Bei der Herstellung eines Impfstoffes gegen eine Virus-Krankheit mit Hilfe der vorliegenden iViassnahmen wird
das.Virus in einem komplex zusammengesetzten Medium '
α herangezüchtet. Dann wird es durch chemische oder physikalische
Mittel so verändert, dass seine kranheitserregenden Eigenschaften beschränkt vier den; das abgeschwächte
Virus wird dann einem Tier injiziert, um Antikörper zu produzieren. Diese Antikörper sind wirksam
zur Neutralisierung der Aktivität des abgeschwächten Virus und des ursprünglichen Virus selbst. Wenn
man grosse und fast unbeschränkte Mengen an Replicase
für .einen bestimmten Virus zur Verfügung hat, kann das die Herstellung von Impfstoffen gegen das Virus,
™ wie ζ.Β. im folgenden Absatz beschrieben wird, unterstützen.
; Es ist zu erwarten, dass die Replicase per se bei'In-
: Rektion in einen^tierischen Organismus ein Virusteil-'■
chen vervielfältigt ,und den Krankheitszustand herbeiführt.
Eine Replicase kann jedoch bei Injektion in
■ ■ *
einen
909887/1691
BAD ORIGINAL
■>9 - ■
einen"-tierischen" Organismus Teilchen hervorrufen, die
direkt eine Form einer Viruserkrankung prqäusiererkönnen
und auf die der tierische Körper· niit der Herst
ellung von Antikörpern reagieren kann. liY einem solchen System könnte das aus veränderter Hepiicase .αηά
dem Tierkörper bestehende System Antikörper herstellen
leny und zwar auf direktem Wege,unter Vermeidung des
unviirtsehaftlichen und mühsamen Systems der-bisherigen
Impfstoffherstellungο '.
Bei dem vorstehend erörterten Reaktionssystem wurde
eine Replicase isoliert. Es ist bekannt, dass andere
krankheitsverursaehende Viren ebenfalls BiJS-rioIeküle
sind, z.B. sind die Viren, Vielehe die Tabak- und fforaateniftos
aikkr ankhe it; Poliomyelitis, 'Influenza, liex\rcastle-Krankheit
bei Geflügel sowie Mumps verursachen, Mbonucleinsäure
enthaltende Proteine. Die vorliegende Erfindung weist auf die Möglichkeit hin, dass Beplicasen
für ^edes dieser RNS-Viren offensichtlich aus einem
geeigneten System gevionnen viei*den können. Die in vitro-Synthese
derartiger Eeplicasen in reiner Form stellt
einen wesentlichen SOrtschritt bei der Untersuchung der Biochemie der Krankheiten und der Herstellung von
Impfstoffen daro
\ "' - ' ¥enrx man eine reine Replicase in der Hand hat^1 ist
es möglich^ ihre spezielle Aminosäurestruktur zu
Ιΐβιΐη aüss^rdem die reine BHS verfügbar
diir-fte es laögüöii sein, sowohl die Hucleotidrin der RMS als attefo ihre Meiterert :.'"-"■-.-:
diir-fte es laögüöii sein, sowohl die Hucleotidrin der RMS als attefo ihre Meiterert :.'"-"■-.-:
BAD OBiGiMAL
162Q64S
strukturellen Merkmale zu bestimmen. Die Bestimmung
von AminosäureStrukturen und Codes, die die spezielle,
RNS-Nucleotidsequenz ergeben, sind wichtig bei der Aufklärung der Beziehung zwischen Aminosäure- und
Nucleotidsequenz. .
Die biologisch aktive RNS-Polymerase (Replicase) und
die infektiöse RNS, die mit Hilfe des Systems und des
Verfahrens der Erfindung hergestellt werden, sind intakt und frei von denjenigen Verunreinigungen oder
Begleitstoffen, mit denen zusammen sie sonst in der Natur vorkommen. Beispielsweise ist die synthetisierte
Virus-RNS frei von ihrem normalerweise auftretenden
Proteinüberzug. Das in geregelter V/eise hergestellte RNS-Produkt, wie es mit Hilfe des Systems und des
Verfahrens der «Erfindung erzielt werden kann, bietet den Vorteil, dass es für experimentelle, läbormässige
und kommerzielle Arbeitsweisen geeignet ist, wo es erwünscht is-t, eine biologisch aktive RNS zu verwenden,
die frei ist von nachweisbaren störenden oder fremden Materialien. Das.geregelte System der Srfindung
ist ebenfalls frei von nachweisbaren störenden oder fremden Stoffen und bietet so ein wichtiges
Mittel zur Erforschung des Mechanismus-, durch den genetische Veränderungen und Reduplikationen bei
Lebensprozessen hervorgerufen werden, sowie eine Möglichkeit,
derartige Prozesse oder Mechanismen zu ver- ■■
stehen^ su modifizieren o.dsr su verändern.
f ^m- - - Patentansprüche Γ""'
BAD
Claims (1)
- - .101 i-1.) Verfahren, zur In vitro-Synthese blQioglseii; aktiver^ :intakter Nucleinsäure, dadurch gekennzelchnetj, dass man ein aktiviertes System: erzeugt, das imstande-Ist,:, wäh--' rend längerer oder ausgedehnter Zeiträume ; biologisch aktive Hucleinsaure zu synthetislereiij, und äas-biologischaktive^ intakte Kucleinsäurei die spezifische Se^lipase für die Hucleinsaure," die von nachweisbaren1^chiädlichen Verunreinigungen frei Ist j und einen Nucleotidbasen- ' - ': *" bestandteil oder -Bestandteile^ enthält, und da$s: man die synthetisierte Nuclelnsäure aus dem System gewlrmt«2.) Verfahren nachdass man als Nucleinsäure;eine Bibonuclelnsäüre· YpV-: : wendet» "/".:" ■ . ; \ ■'■''. '" : '-.- ■■■■■ ■""■" -- ■" ^ ;: '■': '" ."-■"■'.-■j5.') Verfahren nach Anspruehi/i zur in vitro-Synthese; ; biologisch aktiver^ ansprechbarer> übersetzbarer>; In- takter Ribonucleinsäure durch.Kopie ihrer Basengeqüenz, dadurch gekennzeichnet,- dass man ein aktiviertes System verwendet, das biologisch aktive, homologe, intakte Ribonucleinsäure* eine spezifische Replicase für die ' Ribonucleinsäuren die frei vcjn nachweisbaren: ^bbaüe:näen-Enzymen sowie Hemmstoffen isti und; einen ^iucleo/tid». ; ' basenbestandteil oder -befstandteile enthält« \ ' ; _' ;:■-:-.-■4.) Verfaliren nach Anspruch;! zur VeryieIfaltlgung blo-""'■ . ·* ,: . ; '■-" logisch;BAD- -102 -logisch aktiver, intakter Ribonucleinsäure in vitro, dadurch gekennzeichnet, dass man ein enzymatiseiles, sich selbstverdoppelndes in vitro-System anwendet, aas (a) eine biologisch aktive, homologe intakte, sich selbstvermehrende Ribonucleinsäureschablone; (b·) die' spezifische, selektive, aktive, homologe Replicase ; für die Ribonucleinsäure, die eine selektive Bevorzugung für die homologe Schablone"zeigt und frei von * nachweisbarer Nucleaseaktivität und zerstörender Enzym-™ ' aktivität Ist; (c) den spezifischen Nucleotidbasenbestandteil oder -bestandteile für die Ribonucleinsäure und (d) aktivierende, zweiwertige Metall-Cofakfcoren aufweist; und dass man die hergestellte biologisch aktive Ribonucleinsäure aus dem System gewinnt.ί 5O Verfahren nach Anspruch 1 bis 4, dadurch gekennzeichnet, dass man als Nucleinsäure eine Virus-Ribonu- ! ■ Oleinsäure verwendet.6ο) Verfahren nach Anspruch 1 bis 5*'dadurch gekennzeichnet, dass man als Nucleinsäure Ribonucleinsäure des Bakteriophagen . Qß verwendet..70 Verfahren nach Anspruch 1 bis 6, dadurch gekennzeichnet!, dass man als Nucleinsäure Ribonucleinsäure ^ des Bakteriophagen MS-2 verwendet.8.) Verfahren nach Anspruch 1 bis 7, dadurch gekenn-' '--"—._' zeichnet, dass man' ein System verwendet, das praktisch.-■■"-.■■■" ' ' frei909687/rial ——■ ■. BAD■" .· 1B2084S.*■' - 103* '-■'■■ ■ » -■ . --■-.-■ frei.von,Transcriptase.und pesoxyribonußlelnsäure .ist.$'.) .Verfahren nach, Anspruch 1 bis,77 dadurch gekennzeichnet, dass man ein System verwendet, In dem Transeriptase nicht zusammen mit DesoxyribOnuolein- ; säure vorliegt. 'lÜ.) Verfahren nach Anspruch 1 bis 7,. dadurch gekenn- ίzeichnet,, dass man ein System '.verwendet, das Desoxy- i ribonucleinsätire enthält und wobei die ReplicaseTranscriptase enthält. · ■ t ■ \11.) Verfahren nach Anspruch 1 bis 10, dadurch gekennzeichnet*' dass· man den Nucleotidbasenbestandteil oder . -bestandteile im System in "der Triphosphätform verwen- ■"! det. ; "-.,ν;"" .--.■"".'. . "■_■ ■-"■■■12») Verfahren nach Anspruch U4 dadurch gekennzeich- * ; net, dass man als, iJucleotiäbasenbestandteil oder -bestandteile Adenosintriphosphat, Guanosintriphosphat^ Qyfeiäintripßospiiat und/oder Uridintriphosphat; verwendet. *13») Verfahren nach Anspruch 1 bis 12 s dadurch ,gekennzeichnetj, dass man einen isotopenmarkierten Hucleotld- ; basenbestandteü oder »isestandteile verwendet«I%o) Verfahren nach Anspruch 1 bis 1% dadurch gekenn= dass aan eine jrucleinsäure-Sinführungs«- ■■ .-"-.-" -"-.',- .■'■.-- schabloneBAD ORIGINAL1820645schablone bei dem System verwendet, ätt von einem Froteinüberzug frei ist, wobei ein Nualeinsäureprodukt erhalten wird., das von einem proteinartigen Überzug frei ist. \ '" ." * :'u '■■ .. " *:15.) Verfäliren nach "Anspruch 1 bis" 14, dadurch gekennzeichnet, dass-man in dem System eine für die angewandte Nucleinsäu-re "spezifische Replica.se verwendet, die praktisch frei von Virus-Xnfektionsfähigkeit ist.16,)" Verfahren zur Herstellung einer "Replicase fürVirus-RNSj, - öaclureli gekenn^siaSmisti dass man eine Replicase in. der· !©ist g-swiimt^ dass sie von nachweis-baren Mengen--abbauendes? Enzyme sowie Hemmstoffen frei". und .befähigt" ist^ sine" laagaadauernds oder ausgedehnte . ■ Yervielfältiguag.- feoisologer^ lasalcter 7irus-RMS zu17c) ferfahren aach/ünspr-uch. "iÖ;, ä&mzpoh,' gek:ennzeic£i-" tm%a össs_ man -siae EepAiuass ^si-weiiäetj; ils ini-we- -' : seatlieäsa - fr®i ^on "/i^us-^ifokt-ioasfahisicsit;-." ge- /Q.'3t5 class άΐ&ιι clie Η^ϋΐ: : .ι is, der 'Äise-· "x". . - " .. - - ■
dass "sie:ästiges© Eigsja.^-cjäftsa "aufweist. V Badorig,Nal19.) Verfahren nach Anspruch 17 oder 13 zur Herstellung von Replloasen für Virus-RHS aus Mikroorganismen, .'da- j durch gekennzeichnet* dass man folgende Reinigungs- I schritte anwendet: Lysis, Abbau durch DNS-ase, Protamin-j fraktionierung,, Ammoniumsulfatfraktionierung, Adsorp- I tion und Elution mit einer Diäthylaminoäthylcellulose-Säule, Bandenbildung in Cäsiumchloridlösung und Zoneiizentrifugieren in linearen Gradienten wässriger Sucroselösung. ' . · *'".·■'20.]) Verfahren nach Anspruch 19j dadurch gekennzeichnet, dass man als Mikroorganismus ein Virus, z.B. einen Bakteriophagen, verwendet-.909887/1691
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Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US3907778A (en) * | 1969-05-26 | 1975-09-23 | Nakao Ishida | Double stranded RNA from basidiomycetes |
BE754934A (fr) * | 1969-08-16 | 1971-02-17 | Jachertz Diether | Procede de production enzymatique d'arn-messager |
US4786600A (en) * | 1984-05-25 | 1988-11-22 | The Trustees Of Columbia University In The City Of New York | Autocatalytic replication of recombinant RNA |
US4957858A (en) * | 1986-04-16 | 1990-09-18 | The Salk Instute For Biological Studies | Replicative RNA reporter systems |
US4795699A (en) * | 1987-01-14 | 1989-01-03 | President And Fellows Of Harvard College | T7 DNA polymerase |
US4994372A (en) * | 1987-01-14 | 1991-02-19 | President And Fellows Of Harvard College | DNA sequencing |
US5145776A (en) * | 1987-01-14 | 1992-09-08 | President & Fellows Of Harvard College | Method of using T7 DNA polymerase to mutagenize and fill-in DNA |
US5266466A (en) * | 1987-01-14 | 1993-11-30 | President And Fellows Of Harvard College | Method of using T7 DNA polymerase to label the 3' end of a DNA molecule |
US4946786A (en) * | 1987-01-14 | 1990-08-07 | President And Fellows Of Harvard College | T7 DNA polymerase |
US4942130A (en) * | 1987-01-14 | 1990-07-17 | President & Fellows Of Harvard College | T7 DNA polymerase |
WO2003024980A1 (fr) * | 2001-09-14 | 2003-03-27 | Universite De Liege | Preparation de composes organiques triphosphoryles eventuellement marques au phosphore 32 ou au phosphore 33 |
-
1966
- 1966-03-18 US US535596A patent/US3444041A/en not_active Expired - Lifetime
- 1966-06-23 US US559933A patent/US3444042A/en not_active Expired - Lifetime
- 1966-09-06 GB GB39867/66A patent/GB1137170A/en not_active Expired
- 1966-09-27 DE DE19661717206 patent/DE1717206A1/de active Pending
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