CN113166735A - 使用非致病性细菌生产透明质酸的表达系统和使用该表达系统生产透明质酸的方法 - Google Patents
使用非致病性细菌生产透明质酸的表达系统和使用该表达系统生产透明质酸的方法 Download PDFInfo
- Publication number
- CN113166735A CN113166735A CN201980077146.7A CN201980077146A CN113166735A CN 113166735 A CN113166735 A CN 113166735A CN 201980077146 A CN201980077146 A CN 201980077146A CN 113166735 A CN113166735 A CN 113166735A
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- hyaluronic acid
- expression system
- promoter
- strain
- gene
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
- KIUKXJAPPMFGSW-DNGZLQJQSA-N (2S,3S,4S,5R,6R)-6-[(2S,3R,4R,5S,6R)-3-Acetamido-2-[(2S,3S,4R,5R,6R)-6-[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-acetamido-2,5-dihydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-2-carboxy-4,5-dihydroxyoxan-3-yl]oxy-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)oxan-4-yl]oxy-3,4,5-trihydroxyoxane-2-carboxylic acid Chemical compound CC(=O)N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O[C@H]2[C@@H]([C@@H](O[C@H]3[C@@H]([C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O3)C(O)=O)O)[C@H](O)[C@@H](CO)O2)NC(C)=O)[C@@H](C(O)=O)O1 KIUKXJAPPMFGSW-DNGZLQJQSA-N 0.000 title claims abstract description 138
- 229920002674 hyaluronan Polymers 0.000 title claims abstract description 138
- 229960003160 hyaluronic acid Drugs 0.000 title claims abstract description 138
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 title claims abstract description 80
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 title claims abstract description 35
- 244000052616 bacterial pathogen Species 0.000 title description 9
- 101710128038 Hyaluronan synthase Proteins 0.000 claims abstract description 13
- 101150057485 tuaD gene Proteins 0.000 claims description 32
- 108030001662 UDP-glucose 6-dehydrogenases Proteins 0.000 claims description 23
- 241000193830 Bacillus <bacterium> Species 0.000 claims description 19
- 244000063299 Bacillus subtilis Species 0.000 claims description 17
- 235000014469 Bacillus subtilis Nutrition 0.000 claims description 17
- 101100483116 Bacillus subtilis (strain 168) tuaD gene Proteins 0.000 claims description 16
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 15
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 12
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 12
- 108090000320 Hyaluronan Synthases Proteins 0.000 claims description 10
- 238000013518 transcription Methods 0.000 claims description 10
- 230000035897 transcription Effects 0.000 claims description 10
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 claims description 9
- 241000194017 Streptococcus Species 0.000 claims description 8
- 241000194108 Bacillus licheniformis Species 0.000 claims description 7
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 5
- 102000003918 Hyaluronan Synthases Human genes 0.000 claims description 3
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims description 2
- 108700026220 vif Genes Proteins 0.000 claims description 2
- 230000002103 transcriptional effect Effects 0.000 claims 2
- 239000000411 inducer Substances 0.000 abstract description 11
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 abstract description 3
- 230000002194 synthesizing effect Effects 0.000 abstract description 2
- 239000013612 plasmid Substances 0.000 description 28
- 101150097869 hasA gene Proteins 0.000 description 26
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 12
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 12
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 12
- 229960000723 ampicillin Drugs 0.000 description 11
- AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N ampicillin Chemical compound C1([C@@H](N)C(=O)N[C@H]2[C@H]3SC([C@@H](N3C2=O)C(O)=O)(C)C)=CC=CC=C1 AVKUERGKIZMTKX-NJBDSQKTSA-N 0.000 description 11
- BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N isopropyl beta-D-thiogalactopyranoside Chemical compound CC(C)S[C@@H]1O[C@H](CO)[C@H](O)[C@H](O)[C@H]1O BPHPUYQFMNQIOC-NXRLNHOXSA-N 0.000 description 11
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 8
- 108091008146 restriction endonucleases Proteins 0.000 description 8
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 7
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 7
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 7
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 7
- 229920001817 Agar Polymers 0.000 description 6
- 102000012410 DNA Ligases Human genes 0.000 description 6
- 108010061982 DNA Ligases Proteins 0.000 description 6
- 241000588724 Escherichia coli Species 0.000 description 6
- 239000008272 agar Substances 0.000 description 6
- 238000010367 cloning Methods 0.000 description 6
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 6
- FVAUCKIRQBBSSJ-UHFFFAOYSA-M sodium iodide Chemical compound [Na+].[I-] FVAUCKIRQBBSSJ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 6
- 241000120569 Streptococcus equi subsp. zooepidemicus Species 0.000 description 5
- 238000000569 multi-angle light scattering Methods 0.000 description 5
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 4
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 4
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 4
- 102100029640 UDP-glucose 6-dehydrogenase Human genes 0.000 description 4
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 4
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 4
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 4
- 241000276408 Bacillus subtilis subsp. subtilis str. 168 Species 0.000 description 3
- OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N Carbon Chemical compound [C] OKTJSMMVPCPJKN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- LZZYPRNAOMGNLH-UHFFFAOYSA-M Cetrimonium bromide Chemical compound [Br-].CCCCCCCCCCCCCCCC[N+](C)(C)C LZZYPRNAOMGNLH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 3
- 238000010521 absorption reaction Methods 0.000 description 3
- 238000004520 electroporation Methods 0.000 description 3
- 235000021472 generally recognized as safe Nutrition 0.000 description 3
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 3
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 3
- 238000005461 lubrication Methods 0.000 description 3
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 3
- 230000003020 moisturizing effect Effects 0.000 description 3
- 239000012521 purified sample Substances 0.000 description 3
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 3
- 241000894006 Bacteria Species 0.000 description 2
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 description 2
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L Magnesium sulfate Chemical compound [Mg+2].[O-][S+2]([O-])([O-])[O-] CSNNHWWHGAXBCP-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 2
- 241000264435 Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis Species 0.000 description 2
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 2
- 229960005091 chloramphenicol Drugs 0.000 description 2
- WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N chloramphenicol Chemical compound ClC(Cl)C(=O)N[C@H](CO)[C@H](O)C1=CC=C([N+]([O-])=O)C=C1 WIIZWVCIJKGZOK-RKDXNWHRSA-N 0.000 description 2
- 238000000354 decomposition reaction Methods 0.000 description 2
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 2
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 2
- 239000000945 filler Substances 0.000 description 2
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 2
- 238000000465 moulding Methods 0.000 description 2
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 2
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 2
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 2
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 2
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 2
- 239000002244 precipitate Substances 0.000 description 2
- 238000001556 precipitation Methods 0.000 description 2
- 239000000047 product Substances 0.000 description 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 2
- 238000011160 research Methods 0.000 description 2
- 235000009518 sodium iodide Nutrition 0.000 description 2
- 241000894007 species Species 0.000 description 2
- 238000001308 synthesis method Methods 0.000 description 2
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 2
- 230000001131 transforming effect Effects 0.000 description 2
- 238000013519 translation Methods 0.000 description 2
- LWIHDJKSTIGBAC-UHFFFAOYSA-K tripotassium phosphate Chemical compound [K+].[K+].[K+].[O-]P([O-])([O-])=O LWIHDJKSTIGBAC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 2
- 238000000108 ultra-filtration Methods 0.000 description 2
- VZSRBBMJRBPUNF-UHFFFAOYSA-N 2-(2,3-dihydro-1H-inden-2-ylamino)-N-[3-oxo-3-(2,4,6,7-tetrahydrotriazolo[4,5-c]pyridin-5-yl)propyl]pyrimidine-5-carboxamide Chemical compound C1C(CC2=CC=CC=C12)NC1=NC=C(C=N1)C(=O)NCCC(N1CC2=C(CC1)NN=N2)=O VZSRBBMJRBPUNF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 7553-56-2 Chemical compound [I] ZCYVEMRRCGMTRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 241000193744 Bacillus amyloliquefaciens Species 0.000 description 1
- RGHNJXZEOKUKBD-SQOUGZDYSA-N D-gluconic acid Chemical group OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)C(O)=O RGHNJXZEOKUKBD-SQOUGZDYSA-N 0.000 description 1
- RGHNJXZEOKUKBD-UHFFFAOYSA-N D-gluconic acid Natural products OCC(O)C(O)C(O)C(O)C(O)=O RGHNJXZEOKUKBD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 101100284008 Dictyostelium discoideum comH gene Proteins 0.000 description 1
- IAJILQKETJEXLJ-UHFFFAOYSA-N Galacturonsaeure Natural products O=CC(O)C(O)C(O)C(O)C(O)=O IAJILQKETJEXLJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000004566 IR spectroscopy Methods 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical compound C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- AFCARXCZXQIEQB-UHFFFAOYSA-N N-[3-oxo-3-(2,4,6,7-tetrahydrotriazolo[4,5-c]pyridin-5-yl)propyl]-2-[[3-(trifluoromethoxy)phenyl]methylamino]pyrimidine-5-carboxamide Chemical compound O=C(CCNC(=O)C=1C=NC(=NC=1)NCC1=CC(=CC=C1)OC(F)(F)F)N1CC2=C(CC1)NN=N2 AFCARXCZXQIEQB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N N-acelyl-D-glucosamine Chemical group CC(=O)NC1C(O)OC(CO)C(O)C1O OVRNDRQMDRJTHS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- OVRNDRQMDRJTHS-FMDGEEDCSA-N N-acetyl-beta-D-glucosamine Chemical group CC(=O)N[C@H]1[C@H](O)O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@@H]1O OVRNDRQMDRJTHS-FMDGEEDCSA-N 0.000 description 1
- 101710167959 Putative UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase Proteins 0.000 description 1
- 102000048175 UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferases Human genes 0.000 description 1
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 1
- 108090000637 alpha-Amylases Proteins 0.000 description 1
- AEMOLEFTQBMNLQ-WAXACMCWSA-N alpha-D-glucuronic acid Chemical compound O[C@H]1O[C@H](C(O)=O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H]1O AEMOLEFTQBMNLQ-WAXACMCWSA-N 0.000 description 1
- QSIYTPCKNAPAJY-UHFFFAOYSA-N aluminum;ethoxy-oxido-oxophosphanium;2-(trichloromethylsulfanyl)isoindole-1,3-dione Chemical compound [Al+3].CCO[P+]([O-])=O.CCO[P+]([O-])=O.CCO[P+]([O-])=O.C1=CC=C2C(=O)N(SC(Cl)(Cl)Cl)C(=O)C2=C1 QSIYTPCKNAPAJY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 206010003246 arthritis Diseases 0.000 description 1
- 229920001222 biopolymer Polymers 0.000 description 1
- 229940041514 candida albicans extract Drugs 0.000 description 1
- 229910052799 carbon Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 238000004891 communication Methods 0.000 description 1
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 1
- 239000003431 cross linking reagent Substances 0.000 description 1
- 238000005520 cutting process Methods 0.000 description 1
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 1
- 125000000600 disaccharide group Chemical group 0.000 description 1
- 239000003814 drug Substances 0.000 description 1
- 230000007613 environmental effect Effects 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- 239000003889 eye drop Substances 0.000 description 1
- 238000000855 fermentation Methods 0.000 description 1
- 230000004151 fermentation Effects 0.000 description 1
- 101150041954 galU gene Proteins 0.000 description 1
- 229950006191 gluconic acid Drugs 0.000 description 1
- 235000012208 gluconic acid Nutrition 0.000 description 1
- 101150096208 gtaB gene Proteins 0.000 description 1
- 239000012535 impurity Substances 0.000 description 1
- 230000006698 induction Effects 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 230000002458 infectious effect Effects 0.000 description 1
- 238000012844 infrared spectroscopy analysis Methods 0.000 description 1
- 239000007924 injection Substances 0.000 description 1
- 238000002347 injection Methods 0.000 description 1
- 229910052740 iodine Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011630 iodine Substances 0.000 description 1
- 210000003127 knee Anatomy 0.000 description 1
- 229910052943 magnesium sulfate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000019341 magnesium sulphate Nutrition 0.000 description 1
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 229950006780 n-acetylglucosamine Drugs 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 description 1
- 229940127557 pharmaceutical product Drugs 0.000 description 1
- 229910000160 potassium phosphate Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011009 potassium phosphates Nutrition 0.000 description 1
- 230000001376 precipitating effect Effects 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 239000002510 pyrogen Substances 0.000 description 1
- 238000010187 selection method Methods 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 238000004611 spectroscopical analysis Methods 0.000 description 1
- 238000003756 stirring Methods 0.000 description 1
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 1
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 1
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 1
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000012138 yeast extract Substances 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/10—Transferases (2.)
- C12N9/1048—Glycosyltransferases (2.4)
- C12N9/1051—Hexosyltransferases (2.4.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C08—ORGANIC MACROMOLECULAR COMPOUNDS; THEIR PREPARATION OR CHEMICAL WORKING-UP; COMPOSITIONS BASED THEREON
- C08B—POLYSACCHARIDES; DERIVATIVES THEREOF
- C08B37/00—Preparation of polysaccharides not provided for in groups C08B1/00 - C08B35/00; Derivatives thereof
- C08B37/006—Heteroglycans, i.e. polysaccharides having more than one sugar residue in the main chain in either alternating or less regular sequence; Gellans; Succinoglycans; Arabinogalactans; Tragacanth or gum tragacanth or traganth from Astragalus; Gum Karaya from Sterculia urens; Gum Ghatti from Anogeissus latifolia; Derivatives thereof
- C08B37/0063—Glycosaminoglycans or mucopolysaccharides, e.g. keratan sulfate; Derivatives thereof, e.g. fucoidan
- C08B37/0072—Hyaluronic acid, i.e. HA or hyaluronan; Derivatives thereof, e.g. crosslinked hyaluronic acid (hylan) or hyaluronates
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/11—DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
- C12N15/52—Genes encoding for enzymes or proenzymes
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/74—Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora
- C12N15/75—Vectors or expression systems specially adapted for prokaryotic hosts other than E. coli, e.g. Lactobacillus, Micromonospora for Bacillus
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
- C12N9/0006—Oxidoreductases (1.) acting on CH-OH groups as donors (1.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
- C12P19/04—Polysaccharides, i.e. compounds containing more than five saccharide radicals attached to each other by glycosidic bonds
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
- C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
- C12P19/18—Preparation of compounds containing saccharide radicals produced by the action of a glycosyl transferase, e.g. alpha-, beta- or gamma-cyclodextrins
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y101/00—Oxidoreductases acting on the CH-OH group of donors (1.1)
- C12Y101/01—Oxidoreductases acting on the CH-OH group of donors (1.1) with NAD+ or NADP+ as acceptor (1.1.1)
- C12Y101/01022—UDP-glucose 6-dehydrogenase (1.1.1.22)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y204/00—Glycosyltransferases (2.4)
- C12Y204/01—Hexosyltransferases (2.4.1)
- C12Y204/01212—Hyaluronan synthase (2.4.1.212)
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Materials Engineering (AREA)
- Polymers & Plastics (AREA)
- Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明提供了透明质酸合酶表达系统、包含该表达系统的转化菌株以及使用该转化菌株生产透明质酸的方法,该表达系统即使在没有诱导剂的情况下也能够在非致病性菌株中合成透明质酸并进行组成型表达。
Description
技术领域
本发明涉及用于使用非致病性细菌生产透明质酸的利用组成型表达启动子的表达系统、包括该表达系统的非致病性细菌以及使用该非致病性细菌生产透明质酸的方法。
背景技术
透明质酸是由D-葡萄糖酸和N-乙酰基-D-葡萄糖胺的二糖单元组成的生物聚合物,并且取决于其分子量而用于各种用途,例如模制用填充剂、关节炎治疗剂和粘附抑制剂。
该透明质酸可通过链球菌属(Streptococcus spp.)菌株的发酵而产生,而链球菌属菌株是感染性微生物,并且在纯化过程中有可能被热原性物质等污染。为了改善这些问题,已经开发了通过用重组载体转化GRAS(Generally Recognized As Safe,通常被认为是安全的)菌株生产透明质酸的方法。
韩国专利注册号10-0879908和10-0885163(US 2003/175902)公开了将由组成型表达启动子(解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)α-淀粉酶基因(amyQ)启动子)调节的操纵子(由源自类马链球菌(Streptococcus equisimilis)的透明质酸合酶基因(hasA)、源自枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)的UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因(tuaD)和UDP-葡萄糖焦磷酸化酶(gtaB)组成)插入枯草芽孢杆菌基因组中,以能够产生透明质酸。
随后,US 2016/0237465公开了为了提高透明质酸的收率和透明质酸的分子量,使用含有由IPTG诱导型强启动子(Pgrac)调节的操纵子(由源自兽疫链球菌(Streptococcuszooepidemicus)的hasA基因和源自枯草芽孢杆菌的tuaD基因组成)的质粒转化枯草芽孢杆菌,从而显示出提高的收率和分子量。
然而,在IPTG诱导型的情况下,不仅必须使用昂贵的诱导剂IPTG,而且必须进一步进行诱导剂处理的生产过程。因此,如果透明质酸的收率不低,则更优选组成型表达类型。
发明内容
技术问题
本发明的目的是提供一种表达系统或重组载体,该表达系统或重组载体使得能够在不存在诱导剂的情况下在非致病性菌株中合成透明质酸。
本发明的另一个目的是提供导入了表达系统的菌株或通过重组载体转化的菌株以及使用该菌株生产透明质酸的方法。
技术方案
本文提供了用于生产透明质酸的表达系统,其包含UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因和透明质酸合酶基因;优选地,提供一种用于生产透明质酸的表达系统,其包含可操作地连接的转录启动子、透明质酸合酶基因、UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因的核糖体结合位点(RBS)和UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因。
本发明的发明人致力于创建具有高的透明质酸生产收率的组成型表达系统,如稍后将描述的,通过选择各种启动子选择了最佳启动子,比较了由hasA基因和tuaD基因组成的操纵子中tuaD基因表达所需的各种核糖体结合位点(RBS),结果证实了合适的位点。由此,本发明的发明人生产了用于生产透明质酸的表达系统以及含有该表达系统的非致病性菌株,该表达系统由比使用IPTG诱导型Pgrac启动子具有更高的透明质酸生产效率的启动子和RBS组成,并且开发了一种利用该表达系统生产透明质酸的方法,从而完成了本发明。
本发明的一种实施方式涉及一种用于生产透明质酸的表达系统,其包括可操作地连接的转录启动子、核糖体结合位点、UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因和透明质酸合酶基因。UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因和透明质酸合酶基因可以优选地配置一个操纵子,并且更优选地,其可以是其中透明质酸合酶基因、UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因的RBS和UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因按5'至3'方向顺序连接。
本发明的另一种实施方式涉及用于生产透明质酸的转化菌株,优选为非致病性细菌,该转化菌株包含用于生产透明质酸的表达系统。
本发明的另一种实施方式涉及用于生产透明质酸的转化菌株,该转化菌株包含用于生产透明质酸的表达系统,并且优选地涉及用于生产透明质酸的组合物,该组合物包含非致病性细菌。另外,本发明涉及用于生产透明质酸的转化菌株,该转化菌株包含用于生产透明质酸的表达系统,并且优选地涉及生产透明质酸的方法,该方法包括培养非致病性细菌的步骤。
根据本发明的用于生产透明质酸的表达系统改善了透明质酸的生产收率和透明质酸的分子量,增加了透明质酸合成过程中的安全性,不使用昂贵的IPTG诱导剂,因此具有降低生产成本的效果。根据本发明生产的透明质酸的分子量为500kDa至10000kDa,并且具有优异的优势,例如保湿效果、粘度增加、关节润滑作用、吸湿能力、弹性能力等。
在下文中,将更详细地描述本发明。
本发明的一种实施方式涉及用于生产透明质酸的表达系统,其包含UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因和透明质酸合酶基因,并且优选地涉及用于生产透明质酸的表达系统,其包括可操作地连接的转录启动子、核糖体结合位点(RBS)、UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因和透明质酸合酶基因。
本发明提供的用于生产透明质酸的表达系统包括合成透明质酸所需的UDP-葡萄糖6-脱氢酶和透明质酸合酶基因,并且可以提供基因表达所需的RBS和组成型表达启动子,从而即使在没有单独的诱导剂的情况下也产生透明质酸。
根据本发明的用于生产透明质酸的表达系统可以应用于芽孢杆菌属(Bacillusspp.)菌株,例如枯草芽孢杆菌或地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis),但不限于此。
适用于本发明的表达系统的转录启动子可以是芽孢杆菌属菌株中使用的组成型表达启动子,因此,该表达系统在没有表达诱导剂的情况下产生组成型表达的透明质酸合酶。另外,转录启动子可具有如下的转录水平,即透明质酸产量是具有包含P43启动子的表达系统的转化菌株的透明质酸产量的1.1至10倍。
组成型表达启动子可以是例如P43、Pmsm、Ppbp、Pylb、Pyob、Pyqe或Pyvl,优选地,它可以是Psigx、Pyob或Pyqe,但不限于此。可以选择并使用组成型表达启动子而没有限制,只要该组成型表达启动子可以获得与诱导型启动子相比相似或更高的透明质酸收率即可。Psigx启动子可以使用SEQ ID NO:53和54的引物通过PCR从枯草芽孢杆菌168菌株的基因组中获得(芽孢杆菌遗传储备中心(Bacillus Genetic Stock Center))。Psigx、Pyob或Pyqe启动子可分别包括SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63或SEQ ID NO:64的核苷酸序列。下表1中显示了可用于本发明的启动子的具体实例,下表2中显示了用于产生每种启动子的具体引物组。
[表1]
[表2]
在本发明的一种实施方式中,作为使用Psigx启动子将含有操纵子的载体转化到枯草芽孢杆菌中的结果,透明质酸的生产收率与使用需要IPTG诱导剂的诱导型启动子的情况几乎相同(图4)。因此,可以看出,Psigx启动子是适合于透明质酸生产的组成型表达启动子。
转录启动子可以是以下的启动子,该启动子的透明质酸生产能力是具有含P43启动子的表达系统的转化菌株的透明质酸生产能力的1.1至10倍、1.15至10倍、1.5至10倍、2至10倍、3至10倍、4至10倍、5至10倍、1.1至9倍、1.15至9倍、1.5至9倍、2至9倍、3至9倍、4至9倍、5至9倍、1.1至8倍、1.15至8倍、1.5至8倍、2至8倍、3至8倍、4至8倍、5至8倍、1.1至7倍、1.15至7倍、1.5至7倍、2至7倍、3至7倍、4至7倍、5至7倍、1.1至6.5倍、1.15至6.5倍、1.5至6.5倍、2至6.5倍、3至6.5倍、4至6.5倍、5至6.5倍、1.1至6倍、1.15至6倍、1.5至6倍、2至6倍、3至6倍、4至6倍、5至6倍、1.1至5.5倍、1.15至5.5倍、1.5至5.5倍、2至5.5倍、3至5.5倍、4至5.5倍、或5至5.5倍。
适用于本发明的表达系统的核糖体结合位点(RBS)可通过表达tuaD基因以及hasA基因而在芽孢杆菌属中产生透明质酸。RBS可以高水平翻译编码UDP-葡萄糖6-脱氢酶的基因,该核糖体结合位点可表现出透明质酸收率是使用tuaD RBS时的透明质酸收率的1.1到3倍、1.15到3倍、1.2到3倍、1.1到2.5倍、1.15到2.5倍、1.2到2.5倍、1.1到2倍、1.15到2倍、1.2到2倍、1.1到1.5倍、1.15至1.5倍、1.15至1.5倍、1.1至1.3倍、1.15至1.3倍、或1.2至1.3倍。
例如,RBS可以是BBa_B0030、BBa_B0031、BBa_B0032、BBa_B0033、BBa_B0034、BBa_B0035、tuaD基因的RBS(tuaD RBS)或pET质粒的RBS,其中的每个可包括SEQ ID NO:65至72的核苷酸序列,具体如下表3所示。
[表3]
名称 | SEQ ID NO | 核苷酸序列 |
BBa_B0030-RBS | 65 | attaaagaggagaaatactag |
BBa_B0031-RBS | 66 | tcacacaggaaacctactag |
BBa_B0032-RBS | 67 | tcacacaggaaagtactag |
BBa_B0033-RBS | 68 | tcacacaggactactag |
BBa_B0034-RBS | 69 | aaagaggagaaatactag |
BBa_B0035-RBS | 70 | attaaagaggagaatactag |
RBS_tuaD | 71 | gacactgcgaccattataaattggaagatcattttacaggagagggttgagcgct |
RBS_pET | 72 | aataattttgtttaactttaagaaggagatatacat |
在本发明的一种实施方式中,当使用BBa_B0034作为RBS时,它显示出比使用tuaDRBS时更优秀的收率,并且与先前已知,BBa_B0035相比于BBa_B0034表现出优异的表达效率的事实不同,当使用BBa_B0034 RBS序列时,透明质酸的生产收率最高(图5)。根据本发明的用于生产透明质酸的表达系统包含UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因和透明质酸合酶基因,其中该两个基因可以优选地配置一个操纵子,并且更优选地,其中透明质酸合酶基因、UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因的RBS和UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因按5'至3'方向顺序连接。
根据本发明的UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因可以是例如tuaD基因或其变体。作为tuaD基因,可以不受限制地使用来源于已知具有tuaD基因的物种的tuaD基因。例如,它可以是来源于芽孢杆菌属菌株的tuaD基因,优选是来源于枯草芽孢杆菌菌株的tuaD基因。tuaD基因可以优选是枯草芽孢杆菌2217菌株的tuaD基因,但不限于此。tuaD基因可以是在必要时将适当的突变引入其中的tuaD基因。可以在不影响UDP-葡萄糖6-脱氢酶活性的范围内自由地修饰和使用tuaD基因。在本发明的一种实施方式中,tuaD基因可以包括SEQ ID NO:73的核苷酸序列。
在本发明的一种实施方式中,使用SEQ ID NO:37和38的引物对,通过聚合酶链式反应(PCR)从枯草芽孢杆菌2217菌株中获得核糖体结合位点和tuaD。
透明质酸合酶基因可以是例如hasA基因或其突变基因。作为hasA基因,可以不受限制地使用来源于已知具有hasA基因的物种的hasA基因,例如可以是链球菌属(Streptococcus spp.)菌株,优选是来源于兽疫链球菌(Streptococcus zooepidemicus)的菌株。hasA基因的突变基因可以包括在维持透明质酸活性合成的范围内的所有基因的突变。在本发明的一种实施方式中,hasA基因可以是编码由SEQ ID NO:74或76的氨基酸序列组成的蛋白质的基因,并且优选地可以包括SEQ ID NO:75或77的核苷酸序列。
在本发明的一种实施方式中,使用SEQ ID NO:1至36的引物(表4),通过基于PCR的两步DNA合成方法,从兽疫链球菌获得hasA基因作为透明质酸合酶基因。
具体地,使用SEQ ID NO:1至12的引物制备DNA片段1,并且分别使用SEQ ID NO:12至24和SEQ ID NO:25至36制备DNA片段2和3。为了获得全长的hasA基因,将所得的DNA片段1、片段2和片段3混合,并使用由SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:36组成的引物对进行PCR。
[表4]
本发明的一种实施方式可以是用于生产透明质酸的转化菌株或重组菌株,该转化菌株或重组菌株包含用于生产透明质酸的表达系统。该菌株可以是GRAS级菌株,并且可以是革兰氏阳性细菌,例如芽孢杆菌属(Bacillus spp.)菌株,优选枯草芽孢杆菌或地衣芽孢杆菌。透明质酸合成过程中的安全性可以通过使用GRAS级菌株来提高。在本发明的一种实施方式中,将用于生产透明质酸的表达系统引入枯草芽孢杆菌2217菌株中,以在即使没有诱导剂如IPTG的情况下获得产生透明质酸的菌株。
本发明涉及使用非致病性细菌生产透明质酸的方法,该方法包括培养含有透明质酸表达系统的用于生产透明质酸的转化菌株的步骤。更具体地,除了培养用于生产透明质酸的转化菌株的步骤之外,根据本发明的用于生产透明质酸的方法可以进一步包括分离和/或纯化透明质酸的步骤。例如,该方法可以包括从培养基中去除菌株的步骤,以及在已经去除了菌株的培养基中沉淀透明质酸的步骤。
在用于生产透明质酸的转化菌株和生产透明质酸的方法中,转录启动子、透明质酸合酶基因、UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因表达的核糖体结合位点、UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因等如上所述。
通过组成型表达启动子,即便在不存在诱导剂(例如IPTG)的情况下,使用根据本发明的重组菌株生产透明质酸的方法也可以表现出与使用诱导型启动子时相等或更高的透明质酸收率。
培养菌株的步骤可以使用蔗糖作为碳源,但不限于此。菌株的培养、菌株的去除和透明质酸的沉淀可以通过本领域已知的方法进行,并且可以根据需要由本领域技术人员适当地修改和使用。
生产透明质酸的方法可以进一步包括在透明质酸的沉淀步骤之后浓缩、纯化,或浓缩并纯化透明质酸的步骤。
使用上述生产方法获得的透明质酸的分子量可以为100至10,000kDa、500至10,000kDa、500至8,000kDa、3,000至8,000kDa或5,000至6,000kDa。
在本发明的一种实施方式中,可以从引入了透明质酸合成系统的芽孢杆菌属细菌中获得最大峰为5,455kDa的超高分子量透明质酸。与低分子量透明质酸相比,这种高分子量透明质酸具有优异的性质,例如保湿效果、粘度增加、关节润滑作用、吸湿能力、弹性能力等。因此,高分子量透明质酸作为诸如膝盖注射剂、滴眼剂和用于模制的填充剂的药物产品具有很高的实用价值。特别地,具有3000kDa或更高的超高分子量的透明质酸(例如通过使用本发明提供的表达系统生产的透明质酸)在体内的分解速率较慢,因此可以用作粘附抑制剂。
另外,为了将低分子量透明质酸转化为高分子量透明质酸,处理交联剂或化合物并经过复杂的过程是麻烦的,而将高分子量透明质酸转化为低分子量透明质酸的过程具有使用物理或化学方法相对容易的优点。
有益效果
本发明的用于合成透明质酸的菌株是非致病性菌株,该菌株增加了透明质酸合成期间的安全性,并且不使用昂贵的IPTG诱导剂作为表达诱导剂,从而降低了生产成本。
附图说明
图1显示了根据本发明的一种实施方式生产的pHCMC02-hasA-RBS34-tuaD质粒的载体图谱。
图2是根据本发明的一种实施方式生产的pHCMC02-hasA-RBS34-tuaD质粒的克隆过程的示意图。
图3图示了根据本发明的一种实施方式,在将包含各种启动子的表达系统引入芽孢杆菌属菌株后产生的透明质酸的相对浓度。
图4图示了根据本发明的一种实施方式,当使用组成型表达启动子Psigx和IPTC诱导型启动子Pgrac时产生的透明质酸的相对浓度。
图5图示了根据本发明的一种实施方式,当使用各种核糖体结合位点时产生的透明质酸的相对浓度。
图6是示出商购的透明质酸标准品和从根据本发明的一种实施方式的重组菌株的培养基中纯化的透明质酸的红外光谱分析的结果的图。
图7是使用多角度激光散射(MALLS)检测器测量从根据本发明的一种实施方式的重组菌株的培养基中纯化的透明质酸的分子量的结果。
具体实施方式
在下文中,将参考实施例更详细地描述本发明。然而,以下实施例用于解释本发明,并且本发明的范围不限于这些实施例的描述。
实施例1:hasA和tuaD操纵子的克隆
1-1:透明质酸合酶基因(hasA)的克隆
使用表4中所示的SEQ ID NO:1至36的引物,以下通过基于PCR的两步DNA合成方法(PTDS;Xiong,2004,核酸研究(Nucleic Acids Research)32:e98),合成了来源于兽疫链球菌的透明质酸合酶基因(hasA,Genbank编号AY173078核苷酸序列1至1254)(SEQ ID NO:75)。具体地,使用SEQ ID NO:1至12制备了DNA片段1,并且类似地,分别使用SEQ ID NO:13至24和25至36制备了DNA片段2和片段3。为了获得全长的hasA基因,将所得的DNA片段1、片段2和片段3混合,并使用由SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:36组成的引物对进行PCR,从而获得hasA基因。PCR条件是:使用热循环仪(applied biosystem),94℃变性15秒,55℃退火15秒,72℃延伸1分钟30秒,这些步骤总共进行25个循环。使用来源于兽疫链球菌的hasA基因作为透明质酸合酶基因,并通过上述方法使用SEQ ID NO:1至36的引物(表4)获得全长hasA基因。用限制酶BamHI和XbaI切割所获得的全长hasA基因,并用T4 DNA连接酶(NEB)来连接由BamHI和XbaI切割的pHCMC02(芽孢杆菌属遗传储备中心)质粒。将该载体导入大肠杆菌DH5α(Enzynomics)中,涂布在含有氨苄青霉素的琼脂平板培养基上,从所得到的耐氨苄青霉素转化体中分离出质粒pHCMC02-hasA。通过核苷酸序列分析证实了获得的质粒pHCMC02-hasA,该hasA基因被正常地克隆。
1-2:UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因(tuaD)的克隆
为了在芽孢杆菌属菌株中生产透明质酸,仅透明质酸合酶是不足的,并且必须共表达UDP-葡萄糖6-脱氢酶(Winder,2005,APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY,71:3747-3752)。为此,由hasA和tuaD组成的操纵子必须是完整的。
为了配置操纵子,由于RBS(核糖体结合位点)必须存在于tuaD基因的前面,因此通过使用枯草芽孢杆菌2217菌株(韩国典型培养物保藏中心(KCTC))的DNA作为模板并使用SEQ ID NO:37的RBS tuaD_正向引物和SEQ ID NO:38的RBS_tuaD_反向引物扩增tuaD基因,使得RBS34(BioBrick BBa_B0034)被包含在tuaD基因的5'末端。进行PCR,其步骤为:使用热循环仪(applied biosystem),94℃变性15秒,55℃退火15秒,72℃延伸1分钟30秒,总共进行30个循环。
SEQ ID NO:37:5'-aatctagaaaagaggagaaatactagatgaaaaaaatagctgtcattgg-3'
SEQ ID NO:38:5'-gggttataaattgacgcttcccaagtctttagccaatt-3'
用限制酶XbaI切割扩增的RBS34-tuaD基因,并将用XbaI和SmaI切割的pBluescriptII SK+(Stratagene)质粒用T4 DNA连接酶(NEB)连接。将其导入大肠杆菌DH5α(Enzynomics)中,涂布在含有氨苄青霉素的琼脂平板培养基上,从得到的耐氨苄青霉素的转化体中分离出质粒pBSIISK-RBS34-tuaD。通过核苷酸序列分析证实了获得的质粒pBSIISK-RBS34-tuaD,Genbank编号AF015609的核苷酸序列bp(tuaD基因的蛋白编码位点,SEQ ID NO:73)被正常地克隆。
1-3:hasA和tuaD操纵子的克隆
为了完成由hasA和tuaD基因组成的操纵子,将实施例1-2中获得的pBSIISK-RBS34-tuaD用限制酶XbaI和SmaI切割,将切割后的RBS34-tuaD基因用相同的限制酶处理,并且将实施例1-1中获得的pHCMC02-hasA质粒用T4 DNA连接酶(NEB)连接。将其导入大肠杆菌DH5α(Enzynomics)中,涂布在含有氨苄青霉素的琼脂平板培养基上,从得到的耐氨苄青霉素的转化体中分离出质粒pHCMC02-hasA-RBS34-tuaD。图1和图2分别显示了pHCMC02-hasA-RBS34-tuaD的载体图谱和克隆过程示意图。
实施例2:选择用于hasA-tuaD操纵子表达的启动子
hasA-tuaD操纵子在实施例1中制备的质粒pHCMC02-hasA-RBS34-tuaD中的表达由PlepA启动子调节,并且已知PlepA启动子具有弱活性。因此,用各种启动子替换PlepA启动子,以选择具有高hasA-tuaD操纵子表达活性的启动子。选择候选启动子作为与芽孢杆菌属菌株中使用的组成型表达启动子P43相比表达活性更高的启动子(Yu,2015,ScientificReports,5:18405;Song,2016,PLoS One.11:e0158447)。
为了构建由每种测试的启动子调节的质粒,使用枯草芽孢杆菌168菌株DNA(芽孢杆菌遗传储备中心)作为模板并使用上表2中列出的引物通过PCR进行扩增。具体地,使用PP43启动子的正向和反向引物(SEQ ID NO:39和40)、Pmsm启动子的正向和反向引物(SEQID NO:41和42)、Ppbp启动子的正向和反向引物(SEQ ID NO:43和44)、Pylb启动子的正向和反向引物(SEQ ID NO:45和46)、pyob启动子的正向和反向引物(SEQ ID NO:47和48)、Pyqe启动子的正向和反向引物(SEQ ID NO:49和50)、Pyv1启动子的正向和反向引物(SEQ IDNO:51和52)和Psigx启动子的正向和反向引物(SEQ ID NO:53和54)。
将通过PCR扩增的每种启动子用限制酶NheI和BamHI切割,并且将用相同的限制酶切割的实施例1的pHCMC02-hasA-RBS34-tuaD用T4DNA连接酶(NEB)连接。将其导入大肠杆菌DH5α(Enzynomics)中,涂布在含有氨苄青霉素的琼脂平板培养基上,从得到的耐氨苄青霉素的转化体中分离出每种质粒。通过核苷酸序列分析证实,每种启动子被正常地克隆在每种分离的质粒中。
通过电穿孔疗法(Sun,2015,Applied Microbiology and Biotechnology,99:5151-5162)将具有互不相同的启动子的质粒导入芽孢杆菌2217菌株,以制备对氯霉素具有抗性的转化菌株。
接下来,将每种转化菌株接种到LB培养基中并培养过夜。将0.2mL培养过夜的菌株接种到包含在250mL锥形瓶中的20mL蔗糖培养基(每1L中具有含50g蔗糖、20g酵母提取物和1.5g硫酸镁(MgSO4)的50mM磷酸钾(pH7.0))中,然后在37℃下以180rpm振摇培养。在开始培养后65小时取出每种培养液,以10,000rpm离心1分钟,然后通过0.45μm的过滤器以去除菌株。
将3倍体积的乙醇添加至去除了菌株的培养基中,使其在4℃下静置2小时,并在4℃的温度下以15,000rpm离心10分钟以沉淀透明质酸。使沉淀的透明质酸干燥并溶解在水中,然后使用HA定量检测试剂盒(Corgenix,威斯敏斯特,CO,美国)测量透明质酸含量。将含有组成型表达启动子P43的转化菌株生产的透明质酸的含量(g/L)设定为100,指出含有测试启动子的转化菌株生产的透明质酸的相对含量,并在表5和图3中以%比例显示。
[表5]
启动子 | 透明质酸的相对生产能力(%) |
P43 | 100.0±4.2 |
Pmsm | 15.1±1.9 |
Ppbp | 3.9±0.8 |
Pylb | 38.1±2.3 |
pyob | 31.6±7.1 |
Pyqe | 134.3±6.7 |
Pyvl | 15.0±11.1 |
Psigx | 488.2±13.4 |
图3图示了由含有每种启动子的转化菌株产生的相对透明质酸含量。证实了Psigx启动子(SEQ ID NO:62)、Pyob启动子(SEQ ID NO:63)和pyqe启动子(SEQ ID NO:64)具有比P43启动子更高的表达水平,并且特别地,Psigx启动子比其他启动子更有效地生产透明质酸。随后,将克隆了Psigx启动子的质粒命名为pSigx-hasA-RBS34-tuaD。
实施例3:Psigx启动子的透明质酸收率
为了比较IPTG诱导型启动子Pgrac的表达效率与实施例2中被选为具有高表达效率的作为恒定表达启动子的Psigx启动子的表达效率,用IPTG诱导型Pgrac启动子替换pSigx-hasA-RBS34-tuaD质粒的Psigx启动子,以产生pgrac-hasA-RBS34-tuaD。
具体地,为了替换启动子,用限制酶NheI和BamHI切割pHT01质粒(Mobitec)以分离Laci和Pgrac启动子,将Laci和Pgrac启动子用相同的限制酶切割,将去除了Psigx启动子的pSigx-hasA-RBS34-tuaD用T4 DNA连接酶(NEB)连接。将其导入大肠杆菌DH5α(Enzynomics)中,涂布在含有氨苄青霉素的琼脂平板培养基上,从得到的耐氨苄青霉素的转化体中分离出质粒Pgrac-hasA-RBS34-tuaD。通过电穿孔将分离的质粒导入芽孢杆菌2217菌株中,以完成对氯霉素具有抗性的转化菌株。
比较了与透明质酸生产相关的合酶表达被完整PTG诱导型Pgrac启动子调节的转化菌株的透明质酸的生产收率与在根据实施例2的Psigx启动子中组成型表达与透明质酸生产相关的合酶的菌株的透明质酸的生产收率。以与实施例2基本相同的方式培养每种菌株,并在培养65小时后取培养液。但是,在IPTG诱导型的情况下,将培养过夜的菌株接种到蔗糖培养基中以诱导合酶的表达。2小时后,添加IPTG使得IPTG变为0.5mM。在诱导型的情况下,在72小时时取出培养液。以与实施例2基本相同的方式测量两种菌株的透明质酸生产能力,结果示于图4中。
如图4所示,证实了这两种菌株具有几乎相同的收率。由此,相比于使用昂贵的IPTG的诱导型,廉价且简单地创立了生产透明质酸的方法。
实施例4:用于过表达tuaD基因的RBS选择
D-葡萄糖醛酸是透明质酸的组分,它可由芽孢杆菌原本拥有的tuaD基因产生。然而,为了有效生产透明质酸,需要过表达tuaD基因。为此,如上所述,以操纵子的形式产生hasA基因和tuaD基因,以诱导tuaD基因与hasA基因一起过表达。为了配置操纵子,必须在tuaD基因的5'末端存在高活性RBS序列以调节tuaD基因的翻译。由于RBS的活性取决于序列的背景,因此它可以根据要调控的基因的序列而有所不同(Mutalik,2013,NatureMethods,10:347-353)。由于这些原因,进行了对tuaD的实际翻译有利并且因此适合于透明质酸生产的RBS选择过程。
具体来说,对于RBS选择,比较了来自标准生物元件登记库(BioBrick Registryof standard biological parts)的6种合成RBS(BBa_B0030、BBa_B0031、BBa_B0032、BBa_B0033、BBa_B0034、BBa_B0035)、tuaD基因的天然RBS(tuaD RBS)和常用质粒(如pET)的RBS(RBS)。表3中显示了测试的8个RBS序列。为了确保包含在每个RBS序列的5'末端的tuaD基因,通过使用表4和SEQ ID NO:38所示的引物,并使用枯草芽孢杆菌168菌株(芽孢杆菌遗传储备中心)的DNA作为模板进行PCR。
用XbaI切割包括每个扩增RBS的tuaD基因,并将通过用XbaI和SmaI切割而缺失了RBS34-tuaD的pSigx-hasA-RBS34-tuaD质粒用T4 DNA连接酶(NEB)连接。将其导入大肠杆菌DH5α(Enzynomics)中,涂布在含有氨苄青霉素的琼脂平板培养基上,从得到的耐氨苄青霉素的转化体中分离出每种质粒。通过核苷酸序列分析证实,克隆了正常对应于每种分离的质粒的包括RBS的tuaD基因。
[表6]
通过电穿孔疗法将以上获得的具有互不相同的RBS的质粒导入枯草芽孢杆菌2217菌株,以生产对氯霉素具有抗性的转化菌株。接下来,以与实施例2基本相同的方式培养每种转化的菌株,取培养基,并测量透明质酸的含量。将使用pET质粒的RBS转化的菌株生产的透明质酸的含量(g/L)设定为100,指出由包含测试RBS序列的转化菌株产生的透明质酸的相对含量,结果在表7和图5中显示。
[表7]
RBS类型 | 透明质酸的相对生产能力(%) |
BBa_B0030-RBS | 83.6±8.9 |
BBa_B0031-RBS | 4.2±1.4 |
BBa_B0032-RBS | 4.7±0.5 |
BBa_B0033-RBS | 5.7±0.9 |
BBa_B0034-RBS | 123.3±1.8 |
BBa_B0035-RBS | 80.5±1.0 |
tuaD RBS | 75.7±9.5 |
pET RBS | 100.0±6.4 |
根据标准生物元件登记库(http://parts.igem.org/Ribosome_Binding_Sites/Prokaryotic/Constitutive/Community_Collection)的比较结果,已知BBa_B0035比BBa_B0034具有更优异的表达效率(对应于实施例1-2的RBS)。然而,根据本实施例的实验结果,不同于RBS本身的特性,在根据本发明的表达系统的情况下,当使用BBa_B0034 RBS序列时,证实了透明质酸的最高生产收率。
实施例5:测量生产的透明质酸的分子量
通过超滤纯化通过与实施例2中所描述的相同方法生产的透明质酸,然后测量分子量。首先,纯化生产的透明质酸的过程如下。将培养液以10,000rpm离心10分钟,然后通过0.45μm过滤器以去除菌株。将去除了菌株的培养液通过截止值为100kDa的超滤膜进行过滤以获得产物。在以上获得的整个产物中,添加十六烷基三甲溴化铵至浓度为1%(v/v),搅拌并离心1小时(7,000rpm,30分钟)以获得沉淀物。在搅拌下将沉淀物溶解于0.25M碘化钠溶液中10分钟,使得十六烷基三甲溴化铵与碘和钠反应。将反应溶液离心(7,000rpm,30分钟),取上清液以去除十六烷基三甲溴化铵和碘化钠的反应产物。将2%活性炭添加至上清液,搅拌1小时以吸附杂质,并使所述上清液通过0.22μm的过滤器以获得纯化样品。
通过红外光谱证实纯化样品与透明质酸标准品(sigma)一致,光谱分析的结果示于图6。
接下来,使用多角度激光散射(MALLS)测量纯化样品的分子量。测定条件示于下表8,分析结果示于图7。
作为图7显示的多角度激光散射测量的结果,纯化的透明质酸的分子量在属于超高分子量范围的1,000至7,000kDa的范围内显示峰值,特别地,主峰测量为5,455kDa。与低分子量透明质酸相比,这种高分子量透明质酸具有优异的性质,例如保湿效果、粘度增加、关节润滑作用、吸湿能力、弹性能力等。特别地,在3000kDa或更高的超高分子量透明质酸(例如使用本发明的表达系统生产的透明质酸)的情况下,其在体内的分解速率慢,因此可以用作粘附抑制剂。
[表8]
Claims (16)
1.一种用于在链球菌属(Streptococcus spp.)菌株中生产透明质酸的表达系统,其包含:可操作地连接的转录启动子、透明质酸合酶基因、UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因表达的核糖体结合位点和UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因。
2.根据权利要求1所述的表达系统,其中,所述表达系统在没有表达诱导剂的情况下产生组成型表达的透明质酸合酶。
3.根据权利要求1所述的表达系统,其中,所述表达系统在枯草芽孢杆菌(Bacillussubtilis)或地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)中生产透明质酸。
4.根据权利要求1所述的表达系统,其中,所述转录启动子是以下的启动子,其中透明质酸产量为具有包含P43启动子的表达系统的转化菌株的透明质酸产量的1.1至10倍。
5.根据权利要求1所述的表达系统,其中,所述转录启动子是在芽孢杆菌属(Bacillusspp.)菌株中的组成型表达启动子。
6.根据权利要求1所述的表达系统,其中,所述转录启动子是Psigx启动子、Pyob启动子或Pyqe启动子。
7.根据权利要求1所述的表达系统,其中,所述核糖体结合位点是BBa_B0030(SEQ IDNO:65)、BBa_B0031(SEQ ID NO:66)、BBa_B0032(SEQ ID NO:67)、BBa_B0033(SEQ ID NO:68)、BBa_B0034(SEQ ID NO:69)或BBa_B0035(SEQ ID NO:70)。
8.根据权利要求1所述的表达系统,其中,所述核糖体结合位点(RBS)显示透明质酸收率是tuaD自身的RBS的透明质酸收率的1.1至3倍。
9.根据权利要求8所述的表达系统,其中,所述核糖体结合位点是由SEQ ID NO:69的核苷酸序列组成的BBa_B0034。
10.根据权利要求1所述的表达系统,其中,所述UDP-葡萄糖6-脱氢酶基因是来源于枯草芽孢杆菌的tuaD基因。
11.根据权利要求1所述的表达系统,其中,所述透明质酸合酶基因是来源于链球菌属菌株的hasA。
12.一种用于生产透明质酸的重组菌株,其包含根据权利要求1至11中任一项中所述的用于生产透明质酸的表达系统。
13.根据权利要求11所述的用于生产透明质酸的重组菌株,其中,所述菌株为枯草芽孢杆菌或地衣芽孢杆菌。
14.一种使用重组菌株生产透明质酸的方法,所述方法包括以下步骤:培养用于生产透明质酸的重组菌株以获得培养物,以及从所述培养物中获得透明质酸,所述用于生产透明质酸的重组菌株包含根据权利要求1至11中任一项中所述的用于生产透明质酸的表达系统。
15.根据权利要求14所述的方法,其中,所述菌株是枯草芽孢杆菌或地衣芽孢杆菌。
16.根据权利要求14所述的方法,其中,所述透明质酸的分子量为100kDa至10,000kDa。
Applications Claiming Priority (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
KR20180158627 | 2018-12-10 | ||
KR10-2018-0158627 | 2018-12-10 | ||
KR1020190016267A KR102152625B1 (ko) | 2018-12-10 | 2019-02-12 | 비병원성 세균을 이용하여 히알루론산 생산을 위한 발현 시스템 및 상기 발현 시스템을 이용한 히알루론산 생산방법 |
KR10-2019-0016267 | 2019-02-12 | ||
PCT/KR2019/015082 WO2020122430A1 (ko) | 2018-12-10 | 2019-11-07 | 비병원성 세균을 이용하여 히알루론산 생산을 위한 발현 시스템 및 상기 발현 시스템을 이용한 히알루론산 생산방법 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
CN113166735A true CN113166735A (zh) | 2021-07-23 |
Family
ID=71143374
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
CN201980077146.7A Pending CN113166735A (zh) | 2018-12-10 | 2019-11-07 | 使用非致病性细菌生产透明质酸的表达系统和使用该表达系统生产透明质酸的方法 |
Country Status (2)
Country | Link |
---|---|
KR (1) | KR102152625B1 (zh) |
CN (1) | CN113166735A (zh) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN114214352A (zh) * | 2021-12-27 | 2022-03-22 | 黄山同兮生物科技有限公司 | 一种发酵乳糖的大肠杆菌基因组优化方法 |
Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN104212732A (zh) * | 2014-09-12 | 2014-12-17 | 江南大学 | 一种产透明质酸的重组毕赤酵母及其构建方法 |
CN104263666A (zh) * | 2014-09-12 | 2015-01-07 | 江南大学 | 一种产小分子透明质酸的重组毕赤酵母及其构建方法 |
CN104293726A (zh) * | 2014-10-17 | 2015-01-21 | 江南大学 | 一种产小分子透明质酸的重组枯草芽孢杆菌 |
CN105087456A (zh) * | 2015-09-10 | 2015-11-25 | 江南大学 | 一种产特定分子量透明质酸的重组枯草芽孢杆菌构建的方法 |
-
2019
- 2019-02-12 KR KR1020190016267A patent/KR102152625B1/ko active IP Right Grant
- 2019-11-07 CN CN201980077146.7A patent/CN113166735A/zh active Pending
Patent Citations (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN104212732A (zh) * | 2014-09-12 | 2014-12-17 | 江南大学 | 一种产透明质酸的重组毕赤酵母及其构建方法 |
CN104263666A (zh) * | 2014-09-12 | 2015-01-07 | 江南大学 | 一种产小分子透明质酸的重组毕赤酵母及其构建方法 |
CN104293726A (zh) * | 2014-10-17 | 2015-01-21 | 江南大学 | 一种产小分子透明质酸的重组枯草芽孢杆菌 |
CN105087456A (zh) * | 2015-09-10 | 2015-11-25 | 江南大学 | 一种产特定分子量透明质酸的重组枯草芽孢杆菌构建的方法 |
Non-Patent Citations (1)
Title |
---|
YU XIAOXIA ET AL: "Identification of a highly efficient stationary phase promoter in Bacillus subtilis", SCIENTIFIC REPORTS, vol. 05, no. 18405, pages 1 - 9 * |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN114214352A (zh) * | 2021-12-27 | 2022-03-22 | 黄山同兮生物科技有限公司 | 一种发酵乳糖的大肠杆菌基因组优化方法 |
CN114214352B (zh) * | 2021-12-27 | 2024-04-16 | 黄山同兮生物科技有限公司 | 一种发酵乳糖的大肠杆菌基因组优化方法 |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
KR20200070968A (ko) | 2020-06-18 |
KR102152625B1 (ko) | 2020-09-07 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US10017802B2 (en) | Process for the production of hyaluronic acid in Escherichia coli or Bacillus subtilis | |
KR101632642B1 (ko) | 신규한 프로모터 및 그의 용도 | |
JP6320621B2 (ja) | プシコースエピマー化酵素及びこれを利用したプシコースの製造方法 | |
JP5393481B2 (ja) | コンドロイチン生産細菌及びコンドロイチンの製造法 | |
US20080038780A1 (en) | Production of low molecular weight hyaluronic acid | |
JP2007535917A (ja) | 細菌細胞中でのヒアルロン酸の生産方法 | |
JP2012531198A (ja) | Crm197及びその誘導体の産生のための人工遺伝子の細菌発現 | |
EP2614087A1 (en) | Process for the production of hyaluronic acid in escherichia coli or bacillus megaterium | |
CN108018269B (zh) | 一种热稳定性提高的果聚糖蔗糖酶突变体 | |
Rieder et al. | Experimental tools to identify RNA-protein interactions in Helicobacter pylori | |
Lin et al. | Cloning and expression of the γ-polyglutamic acid synthetase gene pgsBCA in Bacillus subtilis WB600 | |
CN113166735A (zh) | 使用非致病性细菌生产透明质酸的表达系统和使用该表达系统生产透明质酸的方法 | |
TWI707952B (zh) | 新穎d-阿洛酮糖3-表異構酶及使用該d-阿洛酮糖3-表異構酶製造d-阿洛酮糖之方法 | |
JP5945168B2 (ja) | 組換え微生物及びそれを用いたポリ−γ−グルタミン酸の製造方法 | |
JP2017195861A (ja) | 枯草菌変異株及びその利用 | |
KR100914525B1 (ko) | 신규 n―아세틸글루코사민―2―에피머라아제 및 이를 이용한 cmp―n―아세틸뉴라민산의 제조방법 | |
Firsova et al. | Functionality of the xoxF gene in Methylobacterium dichloromethanicum DM4 | |
JP2007068424A (ja) | 二機能性ホルムアルデヒド固定酵素遺伝子 | |
RU2650667C1 (ru) | Мутантная рекомбинантная гепариназа I с повышенной удельной активностью из Pedobacter heparinus, фрагмент ДНК, кодирующий указанную гепариназу | |
WO2020122430A1 (ko) | 비병원성 세균을 이용하여 히알루론산 생산을 위한 발현 시스템 및 상기 발현 시스템을 이용한 히알루론산 생산방법 | |
KR102135044B1 (ko) | 히알루론산 합성효소 변이 단백질 및 이를 이용한 히알루론산 생산 방법 | |
Babich et al. | Expression of recombinant L-phenylalanine ammonia-lyase in Escherichia coli | |
CN107163110B (zh) | 基因hah_1662在制备多糖中的应用 | |
JP2018102282A (ja) | トリプトファンシンターゼβサブユニット遺伝子が導入された形質転換体及びその処理物、形質転換体の処理物の製造方法、並びに形質転換体の処理物を用いたL−カルボシステインの製造方法 | |
Sabiqoh et al. | HAY AT I |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
PB01 | Publication | ||
PB01 | Publication | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
SE01 | Entry into force of request for substantive examination |