CN112877228B - 一种高产红没药烯的酿酒酵母工程菌及应用 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种高产红没药烯的酿酒酵母工程菌及应用,所述酿酒酵母工程菌按如下方法构建:在增强甘油代谢途径的酿酒酵母菌中,转入红没药烯合成酶基因Agbis,同时敲除葡萄糖阻遏转录因子MIG1,构建得到高产红没药烯的酵母工程菌。本发明在酵母工程菌中采用增强甘油利用途径和敲除葡萄糖阻遏转录因子MIG1的组合策略,使得红没药烯摇瓶产量最终提高了91.1%,达到868.6mg/L,为目前报道的甘油蔗糖合成最小培养基摇瓶发酵最高产量。

Description

一种高产红没药烯的酿酒酵母工程菌及应用
(一)技术领域
本发明涉及一种采用增强甘油代谢和敲除葡萄糖阻遏转录因子MIG1的组合策略,提高酿酒酵母红没药烯产量的工程菌及方法。
(二)背景技术
酿酒酵母具有遗传操作简便、生物安全性高和发酵稳定等优点,是一种应用广泛的生物细胞工厂。萜类化合物的通用C5前体为异戊烯基焦磷酸(IPP)和二甲基烯丙基焦磷酸(DMAPP),它们在酵母中通过甲羟戊酸(MVA)途径合成。通过提高乙酰辅酶A和甲羟戊酸途径代谢水平,研究者已经成功地将酿酒酵母改造为异源生物合成萜类化合物的高产微生物。红没药烯是一种有类似果香和香脂气味的倍半萜精油成分,广泛应用于食用香精及日化香精,也是极具潜力的新型生物燃料;β-红没药烯和γ-红没药烯还具有抗痒、消炎的功能和抗癌活性。此外,红没药烯也是多种高附加值工业产品合成的前体物质,如生物燃料、生物塑料、化妆品、保健品及药品等。Jay D.Keasling等在酿酒酵母中合成红没药烯,摇瓶产量达到994mg/L(Identification and microbial production of a terpene-basedadvanced biofuel.Jay D.Keasling,et al.Nature Communications.)。但是该研究使用YPD作为发酵培养基,成本较昂贵。
2012年以来我国甘油产量总体呈现上升趋势。生物基甘油已成为一种廉价且丰富的资源。Lv等使用甘油替代培养基中的蔗糖,利用来源于BY4741的工程酵母菌发酵合成异戊二烯,1.4%甘油+0.6%蔗糖培养基中的产量比2%蔗糖培养基中的产量提高了超过200%(Enhanced isoprene biosynthesis in Saccharomyces cerevisiae byengineering of the native acetyl-CoA and mevalonic acid pathways with a push-pull-restrain strategy.Lv X,et al.Journal of Biotechnology,2014,186:128-136.)。文献报道,CEN.PK2相比BY4714(S288C)更适合作为萜类合成的宿主菌株(LinkingGenotype and Phenotype of Saccharomyces cerevisiae Strains Reveals MetabolicEngineering Targets and Leads to Triterpene Hyper-Producers.Madsen K M,etal.Plos One,2011,6(3):e14763.),然而CEN.PK2相比BY4714的甘油利用能力较差(本实验测得,见图1),本发明以来源于CEN.PK2-1D的YS036为出发菌株,增强其甘油代谢能力。
在代谢工程中,导入新代谢途径可能导致细胞产生代谢压力或对细胞有毒性的中间代谢物,导致细胞蛋白负荷增大,使得菌体的比生长速率下降,发酵启动延迟,发酵产量降低,或生物量降低。为了解决这个问题,研究者已设计了基于酵母GAL启动子的二次生长诱导系统,在该系统中,敲除GAL80基因的菌株,GAL启动子在培养基中糖耗尽后开始转录,无需半乳糖诱导。该系统成功地将细胞生长和产物积累阶段分离,减轻了产物对菌体的毒性,已在本发明酿酒酵母宿主菌YS036中实现。本发明中基于GAL启动子增强了菌株的甘油代谢能力。然而,该系统下,酿酒酵母工程菌倾向于先利用蔗糖碳源,甘油碳源得不到共同、充分利用,导致相比于蔗糖单一碳源,甘油蔗糖混合碳源培养基中的酿酒酵母工程菌比生长速率下降,生物量降低。
MIG1是酿酒酵母葡萄糖阻遏效应的关键调控因子之一。邹静等发现GAL80和MIG1双敲除菌株的半乳糖代谢流量同野生型相比增加15%,且半乳糖利用速率提高、半乳糖诱导所需时间减少、发酵周期缩短(Lac+酿酒酵母工程菌中GAL80基因敲除对乳糖利用的影响.邹静等.酿酒科技,2013,000(012):36-41.)。蔡艳青等发现MIG1和SNF1双敲除菌株利用葡萄糖加快,且葡萄糖和木糖可以被同时利用(敲除MIG1和SNF1基因对酿酒酵母共利用葡萄糖和木糖的影响.蔡艳青等.生物工程学报,2018(1):54-67.)。为了提高酿酒酵母工程菌同时利用蔗糖和甘油的能力,本发明通过敲除MIG1基因,部分解除葡萄糖阻遏效应。实验证明MIG1敲除有助于促进蔗糖和甘油的共利用,平衡细胞生长和目标倍半萜代谢产物产生,从而显著提高目标代谢产物的合成。
本发明以酵母工程菌中红没药烯的合成为例,采用增强甘油代谢和敲除葡萄糖阻遏转录因子MIG1的组合策略,提供了一种酿酒酵母工程菌中增加倍半萜产量的新方法。
(三)发明内容
本发明目的是提供一种高产红没药烯的酿酒酵母工程菌及提高红没药烯产量的方法,所述工程菌是增强转入红没药烯合成酶基因Agbis的酿酒酵母菌甘油利用途径,同时敲除葡萄糖阻遏转录因子MIG1,在已经构建好的高产倍半萜的酵母工程菌中,导入甘油代谢途径,构建蔗糖和甘油协同利用的菌株,同时通过敲除MIG1,部分解除葡萄糖阻遏,平衡细胞生长和目标倍半萜代谢产物产生,采用增强甘油代谢和敲除葡萄糖阻遏转录因子MIG1的组合策略,显著提高目标代谢产物的合成。
本发明采用的具体技术方案是:
本发明提供一种高产红没药烯的酿酒酵母工程菌,所述酿酒酵母工程菌按如下方法构建:在增强甘油代谢途径的酿酒酵母菌中,转入红没药烯合成酶基因Agbis,同时敲除葡萄糖阻遏转录因子MIG1,构建得到高产红没药烯的酿酒酵母工程菌;
所述增强酿酒酵母菌甘油代谢的酿酒酵母菌按如下步骤制备:第一步使用Gal10启动子高表达甘油转运通道基因PtFPS2;第二步用Gal1启动子高表达甘油脱氢酶基因Opgdh;第三步用Gal7启动子高表达二羟基丙酮激酶基因DAK1;第四步用Gal2启动子高表达NADH氧化酶基因NOXE。
本发明所述红没药烯合成酶基因Agbis来源于北美冷杉(Abiesgrandis),核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示,通过将基因Agbis(SEQ ID NO.1所示)克隆至pYES2载体Gal1启动子之后,乙酸锂化学转化法(Gietz,et al.Method.Enzymol.2002,350,87–96)导入酿酒酵母基因组YPRCtau3位点进行表达。
所述甘油转运通道蛋白基因PtFPS2来源于管囊酵母(Pachysolen tannophilus),核苷酸序列为SEQ ID NO.2所示,将基因PtFPS2连接Gal10启动子,构建基因PtFPS2表达盒;所述甘油脱氢酶基因Opgdh来源于Ogataea parapolymorpha,核苷酸序列为SEQ ID NO.3所示,将基因Opgdh连接Gal1启动子,构建基因Opgdh表达盒。
所述NADH氧化酶基因NOXE来源于乳酸乳球菌(Lactococcus lactis),核苷酸序列为SEQ ID NO.4所示,将基因NOXE连接Gal2启动子,构建基因NOXE表达盒;所述二羟基丙酮激酶基因DAK1核苷酸序列为SEQ ID NO.7所示,将基因DAK1连接Gal7启动子,构建因DAK1表达盒组。
将上述基因PtFPS2表达盒、基因Opgdh表达盒、基因NOXE表达盒和基因DAK1表达盒组装后,整合至酿酒酵母基因组(优选YPRCtau3位点)进行表达。
所述葡萄糖阻遏转录因子MIG1核苷酸序列为SEQ ID NO.15所示。本发明敲除葡萄糖阻遏转录因子MIG1的方法为使用CRISPR-Cas9技术,将开放阅读框中间有缺失的MIG1片段(SEQ ID NO.15)整合至基因组MIG1位点处。
进一步,所述酿酒酵母菌为酵母菌株YS036,已在专利申请CN110484572A中公开。
本发明增强酿酒酵母菌甘油代谢途径的方法为:以YS036基因组为模板,采用表4引物,在表1和表2条件下经PCR扩增得到整合位点上游同源臂(SEQ ID NO.5,记为片段1);以带有PtFPS2基因(SEQ ID NO.2)和带有Opgdh基因(SEQ ID NO.NO.3)的pESC载体为模板,在表1反应体系和表2PCR条件下经扩增得到PtFPS2-PGAL10/1-Opgdh(记为片段2);分别以酵母CEN.PK2-1D基因组为模板,在表1和表2条件下经PCR扩增,得到GAL7启动子(SEQ IDNO.6,记为片段3)、DAK1(SEQ ID NO.7,记为片段4)、His(SEQ ID NO.8,记为片段5)、GAL2启动子(SEQ ID NO.9,记为片段6)、NOXE(SEQ ID NO.4,记为片段7);以YS036基因组为模板,采用表4引物,在表1和表2条件下经PCR扩增得到整合位点下游同源臂(SEQ ID NO.10,记为片段8);使用重叠延伸PCR方法将片段1、片段2、片段3拼接成第一个大片段,将片段3、片段4、片段5拼接成第二个大片段,将片段5、片段6、片段7、片段8拼接成第三个大片段;将上述带有同源臂和重叠区的DNA长片段(第一个大片段、第二个大片段、第三个大片段),通过乙酸锂化学转化法,整合至YS036酵母基因组上,得到增强甘油代谢途径的酿酒酵母菌,记为菌株HJW04。
本发明还提供一种所述酿酒酵母工程菌高产红没药烯的方法,所述方法为:将所述酿酒酵母工程菌接种至甘油蔗糖合成最小培养基,加入体积终浓度5-15%(优选10%)的十二烷,培养温度28-32℃,转速180-220rpm,摇瓶发酵培养OD600达到8-10(优选培养温度30℃,转速200rpm,OD600达到9),培养物离心,取上清,分离提取,获得红没药烯;所述甘油蔗糖合成最小培养基质量终浓度组成:0.5-1.5%蔗糖,0.5-1.5%甘油,0.17%酵母氮源,0.5%硫酸铵和微量营养素,溶剂为蒸馏水,pH 5.0;其中微量营养素是指组氨酸、亮氨酸或尿嘧啶中的一种或多种,在培养基中的终浓度均为20mg/L,根据筛选不同选择标记的需要,在培养基中添加不同微量营养素。
进一步,所述蔗糖和甘油在培养基中的添加量均优选为1%。
进一步,所述酿酒酵母工程菌发酵前先在葡萄糖合成最小固体培养基上划线活化,温度30℃培养箱培养48h,单菌落接种至葡萄糖合成最小培养基,培养温度30℃,转速200rpm,摇瓶培养过夜,作为种子液;取种子液以体积浓度1-5%(优选2%)的接种量接种至甘油蔗糖合成最小培养基;所述葡萄糖合成最小培养基质量终浓度组成:2%葡萄糖,0.17%酵母氮源,0.5%硫酸铵和微量营养素,溶剂为蒸馏水,pH 5.0;其中微量营养素是指组氨酸、亮氨酸或尿嘧啶中的一种或多种,在培养基中的终浓度均为20mg/L。根据筛选不同选择标记的需要,在培养基中添加不同微量营养素。
所述蔗糖合成最小培养基为上述葡萄糖合成最小培养基中2%葡萄糖替换为2%蔗糖。
本发明以酵母菌株YS036为宿主菌,导入甘油代谢途径,构建蔗糖和甘油协同利用的菌株,平衡甘油代谢途径的影响,同时通过敲除MIG1,部分解除葡萄糖阻遏,平衡细胞生长和红没药烯产生,采用增强甘油代谢和敲除葡萄糖阻遏转录因子MIG1的组合策略,显著提高红没药烯的产量。
与现有技术相比,本发明有益效果主要体现在:本发明导入甘油代谢途径,构建蔗糖和甘油协同利用的菌株,混合碳源最佳比例(蔗糖和甘油的比例为1∶1时,即1%蔗糖和1%甘油培养基)下,可以降低约20%的碳源原料成本,红没药烯摇瓶产量提高了18.2%,达到537.1mg/L。采用增强甘油代谢和敲除葡萄糖阻遏转录因子MIG1的组合策略,显著提高红没药烯的合成,红没药烯摇瓶产量最终提高了91.1%,达到868.6mg/L,为目前报道的甘油蔗糖合成最小培养基摇瓶发酵最高产量。
(四)附图说明
图1为酵母菌株CEN.PK2-1D和BY4714分别在YPG培养基中发酵60h的生长曲线。
图2为酵母菌株HJW05在不同浓度梯度甘油蔗糖合成最小培养基中摇瓶培养96h后的红没药烯产量。
图3为出发菌株HJW03和代谢改造后的菌株HJW05和HJW11分别在蔗糖合成最小培养基和甘油蔗糖合成最小培养基中摇瓶培养96h后的红没药烯产量。
图4为酵母菌株HJW05和HJW11分别在甘油蔗糖合成最小培养基中发酵96h的生长曲线。
图5为酵母菌株HJW05和HJW11分别在甘油蔗糖合成最小培养基中发酵96h的红没药烯合成曲线。
(五)具体实施方式
为使本发明实施例的目的、技术方案和优点更加清楚,下面将对本发明实施例的技术方案进行清楚、完整的描述。显然,所描述的实施例是本发明的一部分实施例,而不是全部的实施例。基于所描述的本发明的实施例,本领域普通技术人员在无需创造性劳动的前提下所获得的所有其他实施例,都属于本发明的保护范围。除非另作定义,本专利公开所使用的技术术语或者科学术语应当为本发明所属领域内有一般技能的人士所理解的通常意义。
实施例1蔗糖和甘油协同利用菌株的构建
(1)基因和引物
将来源于北美冷杉(Abiesgrandis)的红没药烯合成酶基因Agbis(GenBank数据库登录号O81086.1),按酿酒酵母密码子偏好性,委托天霖生物科技有限公司合成核苷酸序列(SEQ ID NO.1所示),通过限制性内切酶BamHI/EcoRI克隆至pYES2载体(Invitrogen,美国)。
将来源于管囊酵母(Pachysolen tannophilus)的甘油转运通道基因PtFPS2(GenBank数据库登录号AFN43531.1),按酿酒酵母密码子偏好性,委托天霖生物科技有限公司合成核苷酸序列(SEQ ID NO.2所示),通过限制性内切酶NotI/SacI克隆至pESC载体(Invitrogen,美国)。将来源于Ogataea parapolymorpha的甘油脱氢酶基因Opgdh(GenBank数据库登录号XP_018210953.1),按酿酒酵母密码子偏好性,委托天霖生物科技有限公司合成核苷酸序列(SEQ ID NO.3所示),通过限制性内切酶BamHI-XhoI克隆至上述带有PtFPS2基因的pESC载体(Invitrogen,美国)上,获得Gal10/1双向启动子两侧带有PtFPS2基因(SEQID NO.2)和Opgdh基因(SEQ ID NO.NO.3)的pESC载体。
将来源于乳酸乳球菌(Lactococcus lactis)的NADH氧化酶NOXE(GenBank数据库登录号EQC87502.1),按酿酒酵母密码子偏好性,委托天霖生物科技有限公司合成核苷酸序列(SEQ ID NO.4所示),通过限制性内切酶NotI/SacI克隆至pESC载体(Invitrogen,美国)。
本实施例所用到的PCR引物序列和模板列于表4,菌株构建所用到的内源性启动子片段、内源酶编码基因及其终止子片段和同源臂片段,非特殊说明,均从酵母CEN.PK2-1D(EUROSCARF公司,德国)的基因组DNA中扩增,同时菌株构建过程中所有内源启动子和基因序列均可在酿酒酵母基因组数据库(www.yeastgenome.org)查询得到。
(2)菌株构建
菌株HJW04的构建:使用表4中所列引物和模板,以YS036基因组为模板,采用表4引物,在表1和表2条件下经PCR扩增得到整合位点上游同源臂(SEQ ID NO.5,记为片段1)。以Gal10/1双向启动子两侧带有PtFPS2基因(SEQ ID NO.2)和Opgdh基因(SEQ ID NO.NO.3)的pESC载体为模板,在表1和表2条件下经PCR扩增得到PtFPS2-PGAL10/1-Opgdh(记为片段2)。分别以酵母CEN.PK2-1D基因组为模板,在表1和表2条件下经PCR扩增,分别得到GAL7启动子(SEQ ID NO.6,记为片段3)、DAK1(SEQ ID NO.7,记为片段4)、His(SEQ ID NO.8,记为片段5)、GAL2启动子(SEQ ID NO.9,记为片段6)、NOXE(SEQ ID NO.4,记为片段7)。以YS036基因组为模板,采用表4引物,在表1和表2条件下经PCR扩增得到整合位点下游同源臂(SEQ IDNO.10,记为片段8)。
按照文献(Modular pathway engineering of diterpenoid synthases and themevalonic acid pathway for miltiradiene production,J.Am.Chem.Soc.(2012)134:3234-3241)的方法,使用重叠延伸PCR将这些DNA片段拼接为有重叠区的长片段。例如需要将上述8个片段整合到基因组上,可以使用重叠延伸PCR方法将片段1、片段2、片段3拼接成第一个大片段,将片段3、片段4、片段5拼接成第二个大片段,将片段5、片段6、片段7、片段8拼接成第三个大片段,其中片段1和8为基因组同源臂,片段3和片段5为重叠区。按照文献(DNA assembler,an in vivo genetic method for rapid construction ofbiochemical pathways,Nucleic.Acid.s Res.(2009)37:16)中的DNA装配方法,将上述带有同源臂和重叠区的DNA长片段(第一个大片段、第二个大片段、第三个大片段),通过乙酸锂化学转化法,整合至YS036酵母基因组上,通过His标记筛选阳性转化子,菌落PCR验证得到菌株HJW04。
表1、PCR扩增体系:
Figure BDA0002911693520000061
表2、PCR条件:
Figure BDA0002911693520000062
上述菌株YS036通过乙酸锂化学转化法转入带有红没药烯合成酶基因Agbis(SEQID NO.1)的pYES2质粒,通过ura3标记筛选阳性转化子,菌落PCR验证,构建含红没药烯合成酶基因Agbis的菌株HJW03。
同样条件下,将菌株YS036替换为HJW04,构建菌株HJW05。
(3)菌株培养
葡萄糖合成最小培养基质量终浓度组成:2%葡萄糖,0.17%酵母氮源,0.5%硫酸铵,微量营养素,溶剂为蒸馏水,pH 5.0;其中微量营养素是指组氨酸、亮氨酸和尿嘧啶中的一种或多种,在培养基中的终浓度均为20mg/L。根据筛选不同选择标记的需要,在培养基中添加不同微量营养素。
蔗糖合成最小培养基为上述葡萄糖合成最小培养基中2%葡萄糖替换为2%蔗糖。
甘油蔗糖合成最小培养基为上述葡萄糖合成最小培养基中2%葡萄糖替换为1%蔗糖和1%甘油。
YPD培养基质量终浓度组成:1%酵母粉,2%蛋白胨,2%葡萄糖,溶剂为蒸馏水,pH值自然。
YPG培养基为上述YPD培养基中2%葡萄糖替换为2%甘油。
固体平板在上述组分基础上再加入2%琼脂。
本发明所述酿酒酵母工程菌培养方法为:将本发明构建的酿酒酵母工程菌HJW03和HJW05分别在葡萄糖合成最小固体培养基上划线活化,温度30℃培养箱培养48h,单菌落接种至葡萄糖合成最小培养基(HJW03培养基中加入组氨酸、亮氨酸,HJW05培养基中加入亮氨酸),培养温度30℃,转速200rpm,摇瓶培养过夜,作为种子液;取种子液以体积浓度2%的接种量接种至蔗糖合成最小培养基,加入体积终浓度10%的十二烷,用于红没药烯的边合成边萃取。培养温度30℃,转速200rpm,摇瓶培养96h后(OD600达到9),培养物离心,取上层十二烷,采用气相色谱测定待测红没药烯产量。红没药烯气相色谱测定条件:使用安捷伦7890A GC系统测定,进样口温度280℃,进样量1μl,分流比1:10,色谱柱:HP-5MS(30m×0.25μm×0.25μm);色谱条件:氦气流量1mL/min,100℃,5min,10℃/min升温到250℃。
表3本发明涉及到的菌株
Figure BDA0002911693520000071
表4本发明中所使用的引物列表
Figure BDA0002911693520000072
Figure BDA0002911693520000081
注:引物序列中的小写字母序列为与相邻片段的重叠序列,以便进行重叠延伸PCR。引物名称带有“up”为整合位点上游同源臂,“down”为下游同源臂。
实施例2不同梯度浓度的甘油蔗糖合成最小培养基中红没药烯产量测定
将实施例1构建的菌株HJW05作为导入甘油代谢途径的出发菌株,在葡萄糖合成最小固体培养基(培养基中加入亮氨酸)上划线活化,温度30℃培养箱培养48h,单菌落接种至葡萄糖合成最小培养基(培养基中加入亮氨酸),培养温度30℃,转速200rpm,培养过夜,作为种子液;取种子液以体积浓度2%的接种量接种至四个梯度浓度的甘油蔗糖合成最小培养基(2%蔗糖、1.5%蔗糖+0.5%甘油、1%蔗糖+1%甘油、0.5%蔗糖+1.5%甘油,加入亮氨酸,组成同实施例1)。加入体积终浓度10%的十二烷,用于红没药烯的边合成边萃取。培养温度30℃,转速200rpm,摇瓶培养96h后(OD600达到9),培养物离心,取上层十二烷,采用气相色谱测定待测红没药烯产量,结果见图2。
红没药烯气相色谱测定条件:使用安捷伦7890A GC系统测定,进样口温度280℃,进样量1μl,分流比1:10,色谱柱:HP-5MS(30m×0.25μm×0.25μm);色谱条件:氦气流量1mL/min,100℃,5min,10℃/min升温到250℃。
菌株HJW05在1%甘油+1%蔗糖的甘油蔗糖合成最小培养基中,红没药烯产量最高,达537.1mg/L,相比蔗糖合成最小培养基的产量提高了18.2%,且实验所实施的1%甘油+1%蔗糖、1.5%甘油+0.5%蔗糖的甘油蔗糖合成最小培养基中的产量均显著高于蔗糖合成最小培养基(p<0.05)。经计算,1%蔗糖+1%甘油组和蔗糖对照组t=4.295,P<0.005,差异显著;0.5%蔗糖+1.5%甘油组和蔗糖对照组t=3.11,P<0.025,差异显著。但是,1.5%蔗糖+0.5%甘油组和蔗糖对照组t=1.97,0.05<P<0.1,差异不显著。证明实施例1中菌株导入甘油代谢途径的构建与平衡能有效增加红没药烯产量,且可以降低发酵碳源成本。
实施例3敲除Mig1,部分解除葡萄糖阻遏对红没药烯合成的影响
本实施例所构建的菌株在表3列出,所用到的引物和模板在表4列出。
1、CAS9-gRNA载体的构建:以商业化质粒p414-TEF1p-Cas9-CYC1(Addgene公司)为模板,使用表4中所列引物,在表1和表2条件下PCR扩增得到CAS9片段(SEQ ID NO.11,记为片段12)。以商业化质粒p426-SNR52p-gRNA.CAN1.Y-SUP4t(Addgene公司)为模板,使用表4中所列引物,在表1和表2条件下扩增得到gRNA质粒骨架(SEQ ID NO.12,记为片段13),通过一步克隆试剂盒(诺唯赞,ClonExpress Ultra One Step Cloning Kit,C115)拼接成一个大片段,转化大肠DH5α菌株,通过氨苄青霉素抗性筛选阳性转化子,菌落PCR验证后,提质粒得到CAS9-gRNA表达盒。
2、靶位点为MIG1基因的CAS9-gRNA载体:利用chopchop网站,根据靶位点MIG1基因设计靶标序列(SEQ ID NO.15),以步骤1的CAS9-gRNA表达盒基因组为模板,使用表4中所列引物,在表1和表2条件下PCR扩增得到含SEQ ID NO.15所示靶标序列的CAS9-gRNA载体骨架(记为片段9),转化大肠DH5α菌株,菌落PCR验证后,提质粒得到靶位点为MIG1基因的CAS9-gRNA载体。
3、带有同源臂的DNA长片段:分别以菌株HJW05基因组为模板,使用表4中所列引物,在表1和表2条件下PCR扩增得到整合位点上游同源臂(SEQ ID NO.13,记为片段10)、整合位点下游同源臂(SEQ ID NO.14,记为片段11)。DNA拼接方法如前所述,将片段10、片段11拼接,获得带有同源臂的DNA长片段(不完整的MIG1编码区)。
4、菌株HJW10的构建:将步骤3带有同源臂的DNA长片段(不完整的MIG1编码区)和上述步骤2的CAS9-gRNA载体,通过乙酸锂化学转化法,整合至菌株HJW04基因组上,通过ura3标记筛选阳性转化子,菌落PCR验证。将上述步骤所得的阳性转化子在YPD培养基中30℃培养1-2天,吸取100μL培养物离心后用无菌水清洗,涂布在含有1mg/mL的5-氟乳清酸的葡萄糖合成最小培养基平板上,生长出的菌落即为去除筛选标记ura3(即成功丢失基因组编辑载体CAS9-gRNA)的菌株,得到菌株HJW10。
上述菌株HJW10,通过乙酸锂化学转化法转入带有红没药烯合成酶基因Agbis(SEQID NO.1)的pYES2质粒(含有ura3标记),通过ura3标记筛选阳性转化子,菌落PCR验证,构建红没药烯合成菌株HJW11。
实施例4不同菌株产红没药烯的影响
将实施例1和3构建的菌株HJW03、HJW05和HJW11,分别接种在蔗糖合成最小培养基(2%蔗糖)和甘油蔗糖合成最小培养基(1%蔗糖+1%甘油)中,其中HJW03的培养基中加入组氨酸、亮氨酸,HJW05的培养基中加入亮氨酸,HJW11的培养基中加入亮氨酸,30℃、200rpm摇瓶培养96h后,同实施例1方法测定红没药烯产量(图3)。
将实施例1和3构建的菌株HJW05和HJW11,分别接种在甘油蔗糖合成最小培养基(1%蔗糖+1%甘油),HJW05的培养基中加入亮氨酸,HJW11的培养基中加入亮氨酸,30℃、200rpm摇瓶培养,分别在12h、18h、24h、36h、48h、60h、72h、96h时取样,检测OD600,绘制生长曲线(图4);分别在36h、48h、72h、96h时,采用实施例1方法检测红没药烯产量,绘制红没药烯合成曲线(图5)。
如图3所示,PtFPS2、Opgdh、DAK1等甘油代谢基因过表达势必会加剧细胞体内氧化还原的不平衡,通过noxE基因可以氧化过剩的NADH以缓解这种不平衡。导入甘油代谢途径后,HJW05比HJW03在蔗糖合成最小培养基中,红没药烯产量有所下降,为454.5mg/L,下降4.6%;而HJW05在甘油蔗糖合成最小培养基中相比HJW03在蔗糖合成最小培养基中有所上升,为537.1mg/L,提高12.9%。
如图3所示,MIG1敲除后的HJW11相对于HJW05,在蔗糖合成最小培养基中摇瓶培养红没药烯产量降低,然而敲除后的菌株生物量均有增加,表现为OD600nm的增大。蔗糖单一碳源情况下,虽然部分被阻遏的基因的表达能够上调,但是MIG1的敲除破坏了细胞生长和产物积累两阶段的分离,使得该环境下菌体的碳源更多地倾向于细胞生长而非目标倍半萜代谢产物产生,一定程度上缓解了代谢压力。因此通过敲除MIG1,部分解除葡萄糖阻遏,具有在甘油蔗糖混合碳源中平衡细胞生长和目标红没药烯代谢产物产生的潜力(如图4和图5所示)。
图3明显观察到,相比于导入甘油代谢途径、优化混合碳源后的红没药烯产量小幅增加和敲除MIG1部分解除葡萄糖阻遏后的红没药烯产量同比下降,两者联用对红没药烯产量的增加有显著效果。HJW11在蔗糖合成最小培养基中摇瓶培养红没药烯产量为363.6mg/L,在甘油蔗糖合成最小培养基中红没药烯产量提高了138.8%,达到868.6mg/L;MIG1敲除有助于促进蔗糖和甘油的共利用,平衡细胞生长和红没药烯产生。最终,相比HJW05菌株在蔗糖合成最小培养基中红没药烯产量454.5mg/L,采用增强甘油代谢和敲除葡萄糖阻遏转录因子MIG1的组合策略的HJW11菌株在甘油蔗糖合成最小培养基中红没药烯产量达到868.6mg/L,产量提高了91.1%,为目前报道的甘油蔗糖合成最小培养基摇瓶发酵最高产量。
以上实施例的说明只是用于帮助理解本发明方法及其核心思想。应当指出,对于本技术领域的普通技术人员来说,在不脱离本发明原理的前提下,还可以对本发明进行若干改进和修饰,这些改进和修饰也落入本发明权利要求保护范围内。
序列表
<110> 浙江工业大学
<120> 一种高产红没药烯的酿酒酵母工程菌及应用
<160> 15
<170> SIPOSequenceListing 1.0
<210> 1
<211> 2454
<212> DNA
<213> 未知(Unknown)
<400> 1
atggcgggag ttagcgctgt ttctaaagtt agcagcctgg tatgcgatct ttcctcaact 60
tctggtttaa taagaaggac ggcgaaccct catcctaacg tttggggtta cgacttggta 120
cattctttga agagccctta cattgactca agctacagag agcgtgctga ggtgctggtc 180
tctgaaatta aagctatgct aaacccggcc atcactggcg acggcgaatc tatgataacg 240
cctagtgctt acgatacagc gtgggtcgca agggtgcccg ccatagatgg gagcgcaaga 300
ccgcaatttc ctcagaccgt cgactggatc ttgaagaatc aattgaaaga cggcagttgg 360
ggcatccaaa gtcacttcct actgtctgat agattattag caacgttgtc ctgcgttctt 420
gtgttactaa aatggaacgt cggagacttg caggtcgaac agggaattga gttcataaag 480
tctaatcttg aactagtgaa agatgaaacg gaccaagata gcctggtcac tgactttgag 540
ataatttttc caagtctgtt gcgtgaggcc caaagcctaa ggcttggcct tccttacgat 600
ctaccttata tacatctact gcaaacgaag agacaggaaa ggttggctaa gctatcacgt 660
gaggagattt acgccgttcc ctctccttta ctgtactctt tagaaggtat ccaggacatt 720
gttgaatggg agaggataat ggaggtccag agtcaagatg gttccttctt atcaagccca 780
gcgagcacgg cctgtgtttt catgcacacg ggtgatgcga aatgccttga gtttttaaat 840
tcagtaatga taaagttcgg caatttcgta ccgtgcctgt acccagttga tttacttgaa 900
aggctgttga tagtagacaa tatcgtccgt ttggggattt accgtcattt tgaaaaagaa 960
ataaaggagg ctctggatta tgtttatagg cattggaacg aacgtggaat aggttggggg 1020
aggctgaacc caatagcgga cttagagacc actgctttag gattccgtct gctgcgtttg 1080
cacagataca atgtcagtcc tgcgatcttt gacaatttta aagacgcaaa tgggaagttc 1140
atctgctcta caggacaatt taataaagac gtcgcctcaa tgttaaattt ataccgtgcg 1200
tcccagctag cattcccggg tgaaaatatt cttgatgaag cgaagagctt tgctaccaaa 1260
tacttacgtg aggcgttgga gaaaagcgag actagtagcg cctggaataa taagcagaac 1320
ttaagccagg agattaaata tgcactaaaa acttcatggc acgcatcagt gcccagggta 1380
gaggccaaaa ggtattgcca agtatacaga cccgattacg ctcgtatcgc aaagtgcgta 1440
tacaagctgc cctacgtgaa caatgaaaaa tttcttgaac tgggcaagct ggatttcaat 1500
attatccagt caatacacca ggaggaaatg aaaaatgtga cgagctggtt cagggactca 1560
ggtttgcctc tattcacttt tgccagggaa cgtccgttgg agttttactt ccttgttgcg 1620
gctgggactt acgagccaca gtatgcgaaa tgcaggttcc tatttactaa ggtcgcatgt 1680
cttcagaccg tgcttgatga tatgtatgat acgtatggaa cgttggatga actaaaactt 1740
tttaccgagg ctgtaaggag atgggattta tcttttacag agaatttacc tgattatatg 1800
aaactttgct accaaatata ttacgatatc gttcatgagg tagcatggga agcagaaaaa 1860
gagcagggga gagaacttgt gagtttcttc cgtaagggct gggaagacta cttgcttggt 1920
tattacgaag aggcagaatg gcttgcagca gaatacgttc cgacgcttga cgagtacatc 1980
aagaatggta tcacgtcaat aggacaacgt attttacttt tgagcggagt cttgatcatg 2040
gatggacaat tgcttagcca ggaggcgctg gagaaggtcg actatccggg aaggcgtgtt 2100
ctaacggaac ttaatagctt aatcagcaga ttggccgatg acacaaaaac gtataaggcg 2160
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tgcacggagg aggaggctct ggaccacatt tactctatac tggagcccgc cgttaaggaa 2280
ctgaccagag aatttttgaa acctgatgac gtcccatttg cttgtaagaa aatgcttttc 2340
gaagaaacta gggtgactat ggtcattttc aaggacggtg acgggtttgg cgtgagtaag 2400
ctggaagtaa aggaccacat caaagagtgt ctaattgaac cgctgcccct ataa 2454
<210> 2
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<212> DNA
<213> 未知(Unknown)
<400> 2
atgcaaatag agaatgtgca gggatcaagc acgagttcaa atgagctatt ggccccagac 60
aagatcatta tcgaagaaga cgagatcatt gacgtccctc agtttaataa tgtttgggag 120
aggataaggc atgagtatag ggcctacttc gctgaatttt taggcactct gatcttagta 180
gcgtttggcg atggggtagt cgcccaaaaa aaactgagtg gcggggctgc aggttcttat 240
acgaatgtgt ctatgagttg gggttttgct gtaatgatgg gtttcctagt atctggtggg 300
atctctggcg gacatatgaa ccccgcagtc accctggtag cagcggcctt taggggtttt 360
tcctggagga aagtacctgg gtacatcttt tcccaacttt taggtgggct tataggcgcg 420
tatgtagtat acggaaccta ctaccaatct tttgatgatt acgaaggcgt aggcatcaga 480
acagttacgg gggacacagc tacagctggg atcttctgca cttttccggc cggggactac 540
ctaacaacta ggggacaagt tctgagcgaa tttgttagta gtgtattgct tgagataggg 600
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ttatttttcc ttatatacgg aattggcgct tgtttcggat accaaacggg gtacgcaatt 720
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tttaccgggg cgattatcta cgatttattc atctatcagg ggcaagactc tccgttaaat 900
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aatcagtact aa 972
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<212> DNA
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cctgaaataa aaaatccgaa tgacgtcaag ataaaagtga gctattgtgg gatttgcggt 120
acggatctaa aagagttcac ttattccgga gggcctgtat tctttccgaa gcagggtacc 180
aaagataaaa tctccggcta tgagttgcca ctgtgtcccg gtcacgaatt ctccgggacc 240
gtagttgaag ttgggagcgg cgttacaagt gtaaaaccag gggacagggt tgccgtagaa 300
gcgacctctc actgcagtga caggagcagg tataaagaca ccgtggcaca agatttgggc 360
ctgtgcatgg catgtcagtc aggctcacct aactgctgcg ccagtttgag cttctgtggt 420
ttgggtggag cttccggcgg ttttgcggaa tatgtagtat acggagagga tcacatggtg 480
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cttcaagaac tctgtagcac cgcctacata cctcgctctg ctaatcctgt taccagtggc 5760
tgctgccagt ggcgataagt cgtgtcttac cgggttggac tcaagacgat agttaccgga 5820
taaggcgcag cggtcgggct gaacgggggg ttcgtgcaca cagcccagct tggagcgaac 5880
gacctacacc gaactgagat acctacagcg tgagctatga gaaagcgcca cgcttcccga 5940
agggagaaag gcggacaggt atccggtaag cggcagggtc ggaacaggag agcgcacgag 6000
ggagcttcca gggggaaacg cctggtatct ttatagtcct gtcgggtttc gccacctctg 6060
acttgagcgt cgatttttgt gatgctcgtc aggggggcgg agcctatgga aaaacgccag 6120
caacgcggcc tttttacggt tcctggcctt ttgctggcct tttgctcaca tgttctttcc 6180
tgcgttatcc cctgattctg tggataaccg tattaccgcc tttg 6224
<210> 13
<211> 909
<212> DNA
<213> 未知(Unknown)
<400> 13
agaagttagc gagccagcac gtttccttcg cgccggtttt tttttttatt ttttatttaa 60
tttttttcaa aacttgacgt gtagaagatt gacgtctggg gttggcccca tgaatttttt 120
atctatttct tccctgtgcc taattcgtaa tatctccact gatagcgtaa aaaagcgctt 180
tatttttccg aaagttgtga tggcattcca tacagtttat aggatggtag caagtgataa 240
gagcttgggg cccacaatta agcagcagaa aagcgcaatt gcgacactag cagtgtaact 300
cgataggatt ttatggagtg ttgatgaatg tagttgccat tataatggct tctcaggaaa 360
cctgtagcgg ccgggccccg cgagaaactc cagagtggcg taggccggct tgtttagttg 420
ctagcatact tgttcgagct cttgagttct cctggctttt ctccacgtgt ctgcttgttg 480
cctttgattt cgcgagagac tgcggactgc caccccactc cgggaaaacc tggagtgatg 540
gtaaaggccc tgcggcgctt tctttcggaa aaactaatac gaaagaagca acaacaaatt 600
tttacaacag gctggacgag aaaagtgggg aagagcaagc agaaaaaaga aaagagaata 660
gtcgttcttg gataatttat ttattataac cctttttttt caccccagta ctcattaacg 720
aagacaaagg agagtaagaa agcccggtaa agcatttcga agataagaga gccatttatt 780
ctagctcgct tgtaactaca cgagagttga gtatagtgga gacgacatac taccatagcc 840
atgcaaagcc catatccaat gacacaagtg tctaacgttg atgatgggtc actattgaag 900
gagagtaaa 909
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<211> 717
<212> DNA
<213> 未知(Unknown)
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caacagcagc aagagcaaca taccctactg caatcacaaa atacgtcaaa ccaaagtcaa 60
aatcaaaatc aaaatcaaat gatggcttcc agtagttcgt taagtacaac cccgttatta 120
ttgtcaccaa gggtgaatat gattaatact gctatatcca cccaacaaac ccccatttct 180
cagtcggatt cacaagttca agaactggaa acattaccac ccataagaag tttaccgttg 240
cccttcccac acatggactg atacgctgac aagtttttgg cggtgcagat aaatcaaaag 300
acaatagaca agaattaata atattaacaa ttaataatta ataaataata aataataata 360
ataataataa taataataat aataatagta ataataataa taattaataa cgataaaaat 420
atttaattat gatagtaaga atacatattt tgattgtctt agtcttccgc agagataatt 480
aattgttctc attttcaaag tcatctatat gtattgattg agctctactg ttgtttttaa 540
ctttattgtg gccccctaaa atataatttt taccagtatt aaccattttg ctcttattag 600
tacttttact gatggtggaa cccttgaaat ttgtcatggg cgattcaatc catagattgt 660
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<212> DNA
<213> 未知(Unknown)
<400> 15
catacaaact cccaccctcg 20

Claims (4)

1.一种高产红没药烯的酿酒酵母工程菌,其特征在于所述酿酒酵母工程菌按如下方法构建:在增强甘油代谢途径的酿酒酵母菌中,转入红没药烯合成酶基因Agbis,同时敲除葡萄糖阻遏转录因子MIG1,构建得到高产红没药烯的酿酒酵母工程菌;
所述增强甘油代谢途径的酿酒酵母菌按如下步骤制备:第一步使用Gal10启动子高表达甘油转运通道基因PtFPS2;第二步用Gal1启动子高表达甘油脱氢酶基因Opgdh;第三步用Gal7启动子高表达二羟基丙酮激酶基因DAK1;第四步用Gal2启动子高表达NADH氧化酶基因NOXE;
所述红没药烯合成酶基因Agbis核苷酸序列为SEQ ID NO.1所示;所述葡萄糖阻遏转录因子MIG1核苷酸序列为SEQ ID NO.15所示;
所述甘油转运通道基因PtFPS2核苷酸序列为SEQ ID NO.2所示;所述甘油脱氢酶基因Opgdh核苷酸序列为SEQ ID NO.3所示;
所述NADH氧化酶基因NOXE核苷酸序列为SEQ ID NO.4所示;所述二羟基丙酮激酶基因DAK1核苷酸序列为SEQ ID NO.7所示;
所述酿酒酵母菌为酿酒酵母菌株YS036。
2.一种权利要求1所述酿酒酵母工程菌产红没药烯的方法,其特征在于所述方法为:将权利要求1所述的酿酒酵母工程菌接种至甘油蔗糖合成最小培养基中,加入体积终浓度5-15%的十二烷,培养温度 28-32 ℃ ,转速180-220 rpm,摇瓶发酵培养OD600达到8-10,培养物离心,取上清,分离提取,获得红没药烯;所述甘油蔗糖合成最小培养基质量终浓度组成:0.5-1.5%蔗糖,0.5-1.5%甘油,0.17%酵母氮源,0.5%硫酸铵,微量营养素,溶剂为蒸馏水,pH5.0;其中微量营养素是指组氨酸、亮氨酸或尿嘧啶中的一种或多种,在培养基中的终浓度均为20 mg/L。
3.如权利要求2所述的方法,其特征在于所述蔗糖和甘油在培养基中的质量添加量均为1%。
4.如权利要求2所述的方法,其特征在于所述酿酒酵母工程菌发酵前先在葡萄糖合成最小固体培养基上划线活化, 30 ℃ 培养48h,取单菌落接种至葡萄糖合成最小培养基,培养温度 30 ℃ ,转速200 rpm,摇瓶培养过夜,作为种子液;取种子液以体积浓度1-5%的接种量接种至甘油蔗糖合成最小培养基;
所述葡萄糖合成最小培养基质量终浓度组成:2%葡萄糖,0.17%酵母氮源,0.5%硫酸铵,微量营养素,溶剂为蒸馏水,pH 5.0;其中微量营养素是指组氨酸、亮氨酸或尿嘧啶中的一种或多种,在培养基中的终浓度均为20 mg/L。
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Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20150132809A1 (en) * 2012-07-27 2015-05-14 The Regents Of The University Of California Systems and Methods for Enhancing Gene Expression
CN110484572A (zh) * 2019-08-30 2019-11-22 浙江工业大学 一种提高酿酒酵母橙花叔醇产量的方法
CN110982723A (zh) * 2019-12-30 2020-04-10 江苏瑞霆生物科技有限公司 一种重组酿酒酵母及其在生产α-红没药醇中的应用
CN111088175A (zh) * 2019-11-26 2020-05-01 天津科技大学 一种产红没药烯的解脂耶氏酵母及其构建方法与用途

Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20150132809A1 (en) * 2012-07-27 2015-05-14 The Regents Of The University Of California Systems and Methods for Enhancing Gene Expression
CN110484572A (zh) * 2019-08-30 2019-11-22 浙江工业大学 一种提高酿酒酵母橙花叔醇产量的方法
CN111088175A (zh) * 2019-11-26 2020-05-01 天津科技大学 一种产红没药烯的解脂耶氏酵母及其构建方法与用途
CN110982723A (zh) * 2019-12-30 2020-04-10 江苏瑞霆生物科技有限公司 一种重组酿酒酵母及其在生产α-红没药醇中的应用

Non-Patent Citations (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
Synthetic Derivatives of (+)-epi-α-Bisabolol Are Formed by Mammalian Cytochromes P450 Expressed in a Yeast Reconstituted Pathway;Arthur Sarrade-Loucheur等;《ACS Synth. Biol.》;20200124;第9卷;第368-380页 *
柠檬烯和红没药烯的微生物代谢工程;庞亚如等;《生物工程学报》;20180125;第34卷(第1期);第24-33页 *
酿酒酵母以甘油为碳源发酵生产乙醇的研究;潘晓睿;《万方数据》;20110803;第1-64页 *

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