CN112029859A - miR-142-5p在评估宫颈癌IDO活性中的应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了miR‑142‑5p在评估宫颈癌IDO活性中的应用,本发明首次发现了miR‑142‑5p的表达水平与IDO活性呈正相关,因此可以通过CCa患者miR‑142‑5p的表达水平对IDO活性进行评估;另外,由于血浆样本易获取,通过检测血浆外泌体中miR‑142‑5p的表达水平即可对IDO进行评估,具有实时性、灵敏性更强的优点,且更方便,避免了对患者由于活体取样带来的伤害;本发明还进一步提供了通过血浆外泌体中miR‑142‑5p的表达水平对吲哚胺‑2,3‑双加氧酶活性进行评估具体的方法,对吲哚胺‑2,3‑双加氧酶活性的评估具有重要意义。
Description
技术领域
本发明属于生物医药检测,涉及miR-142-5p在评估宫颈癌IDO活性中的应用。
背景技术
吲哚胺-2,3-双加氧酶(IDO)是催化色氨酸沿犬尿氨酸途径分解代谢第一步的限速酶,在肿瘤微环境中抑制T淋巴细胞免疫功能。因此可检测犬尿氨酸与色氨酸(K/T)的比例来评估IDO活性,进而判断肿瘤患者的免疫抑制状态。目前检测IDO的活性方式包括:1.检测IDO蛋白表达:采用“免疫组化法”直观检测肿瘤组织中IDO蛋白表达,但无法实时检测;2.测量IDO代谢产物:通过K/T比例反映IDO活性,但检测复杂,假阳性率高。因此,如何高效准确的检测IDO对评估肿瘤患者临床免疫抑制状态至关重要。
发明内容
针对上述问题,本发明的目的是提供一种可实现实时、灵敏、快速反映吲哚胺-2,3-双加氧酶活性的检测方法。
为实现上述目的,本发明采取的技术方案为:miR-142-5p在评估宫颈癌患者吲哚胺-2,3-双加氧酶活性中的应用。
本发明首次发现了miR-142-5p的表达量与宫颈癌患者吲哚胺-2,3-双加氧酶活性呈正相关,因此可根据miR-142-5p的表达量对患者吲哚胺-2,3-双加氧酶活性进行评估。
作为本发明的优选实施方式,所述应用为通过检测血浆外泌体中miR-142-5p的表达量,从而评估宫颈癌患者吲哚胺-2,3-双加氧酶活性。
优选通过检测血浆外泌体中miR-142-5p的表达量,具有实时性强、灵敏度高、快速且无创等优点。
作为本发明的优选实施方式,所述通过宫颈癌患者血浆评估宫颈癌患者吲哚胺-2,3-双加氧酶活性的方法:通过PCR对血浆外泌体中的miR-142-5p表达量进行检测,若血浆外泌体中miR-142-5p相对表达量≥0.823,则说明吲哚胺-2,3-双加氧酶活性高,否则说明吲哚胺-2,3-双加氧酶活性低。
作为本发明的优选实施方式,所述血浆外泌体的制备方法包括如下步骤:
(1)、收集宫颈癌患者血浆的全血样本,离心获取血浆;
(2)、离心所述血浆,去除残余血细胞;
(3)、离心步骤(2)去除残余血细胞后的血样,去除细胞碎片;
(4)、将步骤(3)获得的混合物与PBS等比例稀释,离心得到所述血浆外泌体。
更优选地,所述血浆外泌体的制备方法如下:
(1)、收集2mLCCa患者全血样本,4℃,3000g,离心30分钟,获取约1mL的血浆;
(2)、4℃,8000g,离心30分钟,去除残余血细胞;
(3)、4℃,12000g,离心30分钟,去除细胞碎片;
(4)、将离心去除血细胞和细胞碎片后的血浆用等体积的PBS稀释,4℃,160000g,离心16小时,富集得到所述血浆外泌体。
本发明还要求保护用于评估宫颈癌患者吲哚胺-2,3-双加氧酶活性的试剂盒,所述试剂盒包括检测miR-142-5p表达量的检测试剂。
作为本发明优选实施方式,所述检测miR-142-5p表达量的检测试剂包括miR-142-5p的PCR引物。
作为本发明的优选实施方式,所述miR-142-5p的PCR引物包括核苷酸序列如SEQID NO.1所示的引物。
更优选地,还包括引物mRQ 3’。
核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的引物为正向引物,引物mRQ 3’为反向引物,为TaKaRa公司的Mir-XTM miRNA First-Stand Synthesis and SYBRR qRT-PCR试剂盒中自带的引物。
其检测的PCR扩增程序为:
(1)预变性:95℃30s;
(2)扩增:95℃5s,60℃34s,共40个循环。
作为本发明的优选实施方式,所述检测试剂盒还包括内参基因的引物。
更优选地,所述内参基因为U6。
本发明还要求保护miR-142-5p的PCR引物在制备评估宫颈癌患者吲哚胺-2,3-双加氧酶活性的诊断试剂或试剂盒中的应用。
本发明首次发现了miR-142-5p的表达水平与吲哚胺-2,3-双加氧酶活性呈正相关,因此可以通过CCa患者miR-142-5p的表达水平对吲哚胺-2,3-双加氧酶活性进行评估;由于miR-142-5p的表达水平可通过检测血浆外泌体进行检测,因此可以通过检测血浆外泌体中miR-142-5p的表达水平即可实现吲哚胺-2,3-双加氧酶活性的评估,实时性、灵敏性更强,且更方便;本发明还进一步提供了通过血浆外泌体中miR-142-5p的表达水平对吲哚胺-2,3-双加氧酶活性进行评估具体的方法,拓阔了吲哚胺-2,3-双加氧酶活性检测、评价渠道,且检测更准确。
附图说明
图1为肿瘤组织切片中miR-142-5p和IDO表达呈显著正相关;A为不同分期患者miR-142-5p和IDO的组织切片检测结果,比例尺:50μm,空心箭头指示淋巴管,实心箭头指示肿瘤细胞,B为对组织切片中miR-142-5p和IDO表达量的统计分析结果,***,P<0.001,C为通过spearman相关性分析对组织切片中miR-142-5p和IDO表达相关性的分析结果。
图2为血浆外泌体的提取流程图。
图3为血浆外泌体透射电镜鉴定结果;A为不同分期患者血浆外泌体的透射电镜拍照结果,B为不同分期患者血浆外泌体的粒径和浓度分析结果。
图4为通过WB对不同分期患者血浆外泌体表面特异性蛋白标志物的鉴定结果。
图5为对血浆外泌体中miR-142-5p和IDO表达呈显著正相关;A为不同分期患者血浆外泌体中miR-142-5p的相对表达情况检测结果,B为通过spearman相关性分析对血浆外泌体中miR-142-5p表达量和组织切片中IDO表达量相关性分析结果。
图6通过ROC曲线分析得到miR-142-5p表达的临界值。
具体实施方式
为更好的说明本发明的目的、技术方案和优点,下面将结合附图和具体实施例对本发明作进一步说明。
实施例1miR-142-5p表达与IDO活性相关
分别收集早期CCa组织(Figo 2018,I和II期)35例和晚期CCa组织(Figo2018,III和IV期)23例,制作石蜡连续切片。采用原位杂交法(Exiqon)和免疫组化法(CST,86630)分别检测miR-142-5p和IDO在CCa组织中的表达量,结果如图1。
由图1可得,相比于早期CCa组织,晚期CCa组织的癌巢中miR-142-5p和IDO表达更高;进一步通过spearman相关性分析对组织中的miR-142-5p和IDO表达进行分析发现,切片中的肿瘤miR-142-5p和IDO表达呈显著正相关(r=0.771,P<0.001),说明可通过检测切片中miR-142-5p的表达量,对IDO的活性进行评估。
通过根据上述临床标本中IDO免疫组化评分(H-score=Σpi(i+1),式中pi表示阳性细胞数量占切片中所有细胞数量的百分数;i代表染色强度)的中位值评估IDO活性,即H-score≥8即IDO活性高,H-score<8即IDO活性低。
实施例2通过血浆外泌体中的miR-142-5p判定IDO活性
收集实施例1所述患者的临床血样,提取血浆外泌体。
外泌体的提取方法如下(流程如图2):
(1)、收集2mLCCa患者全血样本,4℃,3000g,离心30分钟,获取约1mL的血浆;
(2)、4℃,8000g,离心30分钟,去除残余血细胞;
(3)、4℃,12000g,离心30分钟,去除细胞碎片;
(4)、将离心去除血细胞和细胞碎片后的血浆用等体积的PBS稀释,4℃,160000g,离心16小时,富集得到所述血浆外泌体。
对提取得到的外泌体通过透射电镜、WB鉴定,透射电镜的鉴定结果如图3,WB的鉴定结果如图4。
由图3电镜结果可见,肿瘤分期III+IV样本的外泌体粒径与肿瘤分期I+II样本基本一致,但血浆外泌体浓度略高于肿瘤分期I+II样本,说明晚期CCa组织中的外泌体的含量较早期更高。WB鉴定亦说明了成功提取CCa患者血浆外泌体。
进一步通过miRNeasy Mini试剂盒提取血浆外泌体miRNAs,并通过qRT-PCR检测血浆外泌体中miR-142-5p表达情况,检测使用TaKaRa公司的Mir-XTM miRNA First-StandSynthesis andqRT-PCR试剂盒,配制PCR体系(cDNA根据试剂盒体系反转录得到)如下:
表1 PCR反应体系
其中,正向引物由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,核苷酸序列为:GCGCGCATAAAGTAGAAAGCACTACT(SEQ ID NO.1),反向引物为试剂盒中的mRQ 3’引物。内参使用U6,正向引物为ATTGGAACGATACAGAGAAGAT,反向引物为GGAACGCTTCACGAATTT。
扩增程序为:
PCR检测结果如图5。由图5可得,相比于早期CCa患者,晚期CCa患者血浆外泌体中miR-142-5p的表达明显增高。通过spearman相关性分析发现,血浆外泌体中miR-142-5p和IDO表达呈显著正相关(r=0.702,P<0.001),说明可通过血浆外泌体中miR-142-5p的含量对IDO的活性进行评估。
结合ROC曲线(如图6)进一步发现,血浆外泌体中miR-142-5p水平能够有效评估IDO活性(ROC曲线下面积:0.911,P<0.001),Youden’s指标表明血浆外泌体中miR-142-5p评估IDO活性的最优界值为0.823,即血浆外泌体中miR-142-5p相对表达量≥0.823,IDO活性高;血浆外泌体中miR-142-5p相对表达量<0.823,IDO活性低。
最后应当说明的是,以上实施例仅用以说明本发明的技术方案,而非对本发明保护范围的限制,尽管参照较佳实施例对本发明作了详细地说明,本领域的普通技术人员应当理解,可以对本发明的技术方案进行修改或者等同替换,而不脱离本发明技术方案的实质和范围。
SEQUENCE LISTING
<110> 广州医科大学附属第一医院(广州呼吸中心)
<120> miR-142-5p在评估宫颈癌IDO活性中的应用
<160> 1
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
gcgcgcataa agtagaaagc actact 26
Claims (8)
1.miR-142-5p在评估宫颈癌患者吲哚胺-2,3-双加氧酶活性中的应用。
2.如权利要求1所述的应用,其特征在于,通过检测宫颈癌患者血浆外泌体中miR-142-5p的表达量,从而评估宫颈癌患者吲哚胺-2,3-双加氧酶活性。
3.一种通过宫颈癌患者血浆评估宫颈癌患者吲哚胺-2,3-双加氧酶活性的方法,其特征在于,所述方法为:通过PCR对血浆外泌体中的miR-142-5p表达量进行检测,若血浆外泌体中miR-142-5p相对表达量≥0.823,则说明吲哚胺-2,3-双加氧酶活性高,否则说明吲哚胺-2,3-双加氧酶活性低。
4.如权利要求3所述的方法,其特征在于,所述血浆外泌体的制备方法包括如下步骤:
(1)、收集宫颈癌患者血浆的全血样本,离心获取血浆;
(2)、离心步骤(1)所述血浆,去除残余血细胞;
(3)、离心步骤(2)去除残余血细胞后的血样,去除细胞碎片;
(4)、将步骤(3)获得的混合物与PBS等比例稀释,离心得到所述血浆外泌体。
5.用于评估宫颈癌患者吲哚胺-2,3-双加氧酶活性的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括检测miR-142-5p表达量的检测试剂。
6.如权利要求5所述的试剂盒,其特征在于,所述检测miR-142-5p表达量的检测试剂包括miR-142-5p的PCR引物。
7.如权利要求6所述试剂盒,其特征在于,所述miR-142-5p PCR引物包括核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示的引物。
8.miR-142-5p的PCR引物在制备评估宫颈癌患者吲哚胺-2,3-双加氧酶活性的诊断试剂或试剂盒中的应用。
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