CN111719008B - 一种与小麦白粉病抗病基因Pm5e共分离的SNP及其应用 - Google Patents

一种与小麦白粉病抗病基因Pm5e共分离的SNP及其应用 Download PDF

Info

Publication number
CN111719008B
CN111719008B CN201910206693.2A CN201910206693A CN111719008B CN 111719008 B CN111719008 B CN 111719008B CN 201910206693 A CN201910206693 A CN 201910206693A CN 111719008 B CN111719008 B CN 111719008B
Authority
CN
China
Prior art keywords
wheat
sequence
powdery mildew
dna molecule
disease
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Active
Application number
CN201910206693.2A
Other languages
English (en)
Other versions
CN111719008A (zh
Inventor
刘志勇
郭广昊
谢菁忠
王勇
吴秋红
陆平
陈永兴
董玲丽
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Institute of Genetics and Developmental Biology of CAS
Original Assignee
Institute of Genetics and Developmental Biology of CAS
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Institute of Genetics and Developmental Biology of CAS filed Critical Institute of Genetics and Developmental Biology of CAS
Priority to CN201910206693.2A priority Critical patent/CN111719008B/zh
Publication of CN111719008A publication Critical patent/CN111719008A/zh
Application granted granted Critical
Publication of CN111719008B publication Critical patent/CN111719008B/zh
Active legal-status Critical Current
Anticipated expiration legal-status Critical

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6888Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms
    • C12Q1/6895Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for detection or identification of organisms for plants, fungi or algae
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/13Plant traits
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156Polymorphic or mutational markers

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Botany (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

本发明公开了一种与小麦白粉病抗性相关的SNP及其应用,具体涉及一种与小麦白粉病抗病基因Pm5e共分离的SNP及其应用,更具体涉及一种检测小麦抗白粉病基因的KASP标记及其应用。本发明提供的鉴定待测小麦白粉病抗病性的方法:检测待测小麦基于特异SNP的基因型;AA基因型小麦的白粉病抗病性高于GG基因型小麦。本发明提供的鉴定待测小麦是否携带Pm5e抗病基因的方法:检测待测小麦基于特异SNP的基因型;基因型为AA的小麦为携带Pm5e抗病基因的小麦,基因型为GG的小麦为不携带Pm5e抗病基因的小麦。本发明可以对白粉病抗病材料进行高通量精准的鉴定,操作简便,可在短时间内完成大规模材料的表型鉴定和筛选,提高分子辅助育种的效率。

Description

一种与小麦白粉病抗病基因Pm5e共分离的SNP及其应用
技术领域
本发明属于生物技术领域,涉及一种与小麦白粉病抗性相关的SNP及其应用,具体涉及一种与小麦白粉病抗病基因Pm5e共分离的SNP及其应用,更具体涉及一种检测小麦抗白粉病基因的KASP标记及其应用。
背景技术
小麦是世界上种植面积最大、总产量最高的粮食作物,全世界约35%的人口以小麦为主要粮食。小麦白粉病是由专性寄生菌禾本科布氏白粉菌(Blumeria graminisf.sp.tritici,Bgt)引起的真菌性病害,严重影响小麦的产量和品质。小麦白粉病的发病面积广、范围大,曾先后于1981年和1990年在全国大部分地区流行,招致重大损失,成为影响小麦丰产的重要病害之一。虽然农药等化学手段可以起到一定的防治作用,但大面积的使用不但会增加人力、财力和物力,更重要的是会给环境造成破坏,所以推广抗性品种成为目前最为经济和有效的措施。
分子标记辅助育种是利用与目的基因紧密连锁的分子标记来检测目的基因的存在,已经成为小麦现代育种的一种重要辅助手段。功能分子标记是根据目的基因的多态性序列开发的分子标记,具有针对性强、鉴定准确的特点,功能分子标记的利用可以使基础研究的结果成功运用到育种实际,对小麦抗病育种工作具有重要意义。
发明内容
本发明的目的是提供一种与小麦白粉病抗性相关的SNP及其应用,具体涉及一种与小麦白粉病抗病基因Pm5e共分离的SNP及其应用,更具体涉及一种检测小麦抗白粉病基因的KASP标记及其应用。
本发明要求保护一种鉴定待测小麦白粉病抗病性的方法,包括如下步骤:检测待测小麦基于特异SNP的基因型;AA基因型小麦的白粉病抗病性高于GG基因型小麦。
本发明还保护一种鉴定待测小麦白粉病抗病性的方法,包括如下步骤:检测待测小麦基于特异SNP的基因型;AA基因型小麦为候选的白粉病抗病小麦。
本发明还保护一种鉴定待测小麦白粉病抗病性的方法,包括如下步骤:检测待测小麦基于特异SNP的基因型;GG基因型小麦为候选的白粉病感病小麦。
本发明还保护一种鉴定待测小麦是否携带Pm5e抗病基因的方法,包括如下步骤:检测待测小麦基于特异SNP的基因型;基因型为AA的小麦为携带Pm5e抗病基因的小麦,基因型为GG的小麦为不携带Pm5e抗病基因的小麦。
本发明还保护特异SNP作为检测靶标在鉴定待测小麦白粉病抗病性中的应用。
本发明还保护特异SNP作为检测靶标在鉴定待测小麦是否携带Pm5e抗病基因中的应用。
本发明还保护用于检测特异SNP的物质的应用,为如下(e1)或(e2)或(e3)或(e4)或(e5)或(e6)或(e7)或(e8):
(e1)鉴定或辅助鉴定小麦的白粉病抗病性;
(e2)筛选或辅助筛选白粉病抗病小麦;
(e3)筛选或辅助筛选白粉病感病小麦;
(e4)制备用于鉴定或辅助鉴定小麦的白粉病抗病性的试剂盒;
(e5)制备用于筛选或辅助筛选白粉病抗病小麦的试剂盒;
(e6)制备用于筛选或辅助筛选白粉病感病小麦的试剂盒;
(e7)鉴定或辅助鉴定待测小麦是否携带Pm5e抗病基因;
(e8)制备鉴定或辅助鉴定待测小麦是否携带Pm5e抗病基因的试剂盒。
本发明还保护一种特异引物组,由引物1、引物2和引物3组成;
引物1为如下(b1)或(b2):
(b1)序列表的序列5所示的单链DNA分子;
(b2)将序列5经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列5具有相同功能的DNA分子;
引物2为如下(c1)或(c2):
(c1)序列表的序列6所示的单链DNA分子;
(c2)将序列6经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列6具有相同功能的DNA分子;
引物3为如下(d1)或(d2):
(d1)序列表的序列7所示的单链DNA分子;
(d2)将序列7经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加且与序列7具有相同功能的DNA分子。
本发明还保护所述特异引物组的应用,为如下(e1)或(e2)或(e3)或(e4)或(e5)或(e6)或(e7)或(e8):
(e1)鉴定或辅助鉴定小麦的白粉病抗病性;
(e2)筛选或辅助筛选白粉病抗病小麦;
(e3)筛选或辅助筛选白粉病感病小麦;
(e4)制备用于鉴定或辅助鉴定小麦的白粉病抗病性的试剂盒;
(e5)制备用于筛选或辅助筛选白粉病抗病小麦的试剂盒;
(e6)制备用于筛选或辅助筛选白粉病感病小麦的试剂盒;
(e7)鉴定或辅助鉴定待测小麦是否携带Pm5e抗病基因;
(e8)制备鉴定或辅助鉴定待测小麦是否携带Pm5e抗病基因的试剂盒。
本发明还保护以上任一所述的方法或以上任一所述特异引物组在小麦育种中的应用;所述小麦育种为抗白粉病小麦育种。
以上任一所述特异SNP为如下(a1)或(a2):
(a1)位于小麦cDNA中的序列表的序列2所示DNA分子的第3033位核苷酸;
(a2)位于小麦基因组中的序列表的序列3所示DNA分子的第6235位核苷酸;
(a3)位于小麦基因组中的序列表的序列4所示DNA分子的第36位核苷酸。
以上任一所述Pm5e抗病基因为如下(f1)或(f2)或(f3):
(f1)小麦基因组中编码序列表的序列1所示的蛋白质的基因;
(f2)小麦基因组中表达特异RNA的基因;所述特异RNA为与序列表的序列2所示的DNA分子对应的RNA;
(f3)小麦基因组中序列表的序列3所示的DNA分子。
以上任一所述检测待测小麦基于特异SNP的基因型的方法具体可为:以待测小麦的基因组DNA为模板,采用所述特异引物对进行竞争性等位基因特异性PCR,然后输出基因型分型结果。
竞争性等位基因特异性PCR的反应体系中,引物1的浓度具体可为0.168μM,引物2的浓度具体可为0.168μM,引物3的浓度具体可为0.42μM。
竞争性等位基因特异性PCR的反应体系具体可为(10μL):1μL模板(DNA含量约100ng)、5μL KASP Master mix、1.4μL引物混合液、0.08μL 50mM氯化镁水溶液、2.52μL水。
竞争性等位基因特异性PCR采用的仪器具体可为Roche LightCycler480II(配套软件为LightCycler)。
竞争性等位基因特异性PCR的反应程序具体可为:95℃15分钟;95℃20秒、退火60秒(第一个循环的退火温度为65℃,每个循环比前一个循环降低1℃),10个循环;94℃20秒、57℃60秒,30个循环;37℃60秒。
以上任一所述用于检测特异SNP的物质具体可为所述特异引物组。
以上任一所述白粉病抗病小麦为免疫、近免疫、高度抗病或中度抗病的小麦。
以上任一所述白粉病抗病小麦为接种白粉病致病菌后表型为0-2的小麦。
以上任一所述白粉病感病小麦为中度感病或高度感病的小麦。
以上任一所述白粉病感病小麦为接种白粉病致病菌后表型为3-4的小麦。
本发明在对小麦抗白粉病基因Pm5e克隆的基础上,利用抗病基因Pm5e的基因序列关键SNP位点开发了功能标记,并利用现有多种小麦材料进行了验证。结果证明,本发明提供的功能分子标记可以对白粉病抗病材料进行高通量、精准的鉴定,操作简便,可在短时间内完成大规模材料的表型鉴定和筛选,提高分子辅助育种的效率,既可免除育种群体大量的田间接种鉴定工作,又可对育种材料进行早代选择并对目的基因进行精准的鉴定,从而有效服务于小麦抗白粉病育种工作。
附图说明
图1为实施例3的步骤一中部分样本的结果。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明,但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法,如无特殊说明,均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料,如无特殊说明,均为自常规生化试剂商店购买得到的。以下实施例中的定量试验,均设置三次重复实验,结果取平均值。
实施例1、SNP的发现
利用混池转录组测序(BSR-Seq)方法开发分子标记,以小麦复壮30和小麦农大015杂交后代的3705个F2:3家系为作图群体,进行精细定位,最终将Pm5e定位在染色体7BL分子标记WGGB2和WGGB3之间,标记之间的物理区间约为13.5kb。利用诺唯赞高保真DNA聚合酶,通过PCR扩增小麦复壮30及小麦农大015定位区间的物理序列。
最终从小麦复壮30中发现一个新蛋白,如序列表的序列1所示,将该蛋白命名为Pm5e蛋白。复壮30的cDNA中编码Pm5e蛋白的开放阅读框如序列表的序列2所示。复壮30的基因组DNA中,编码Pm5e蛋白的基因如序列表的序列3所示(具有4个外显子)。
将小麦复壮30基因组中编码Pm5e蛋白的基因与其它小麦品种中的同源基因进行比较,挖掘SNP,并验证各个SNP与小麦抗白粉病性状的相关性。发现一个SNP,该SNP与Pm5e抗病基因共分离,从而与小麦白粉病抗病性具有紧密相关性。该SNP即序列表的序列2的第3033位核苷酸(相应的,为序列表的序列3的第6235位核苷酸),多态形式为A/G多态,将该SNP又称为3033-SNP。经测序验证,小麦品种复壮30(简称小麦复壮30)基于3033-SNP的基因型为AA型,小麦品种农大015(简称小麦农大015)基于3033-SNP的基因型为GG型。基于3033-SNP,如果基因型为AA、小麦为携带Pm5e抗病基因的小麦,如果基因型为GG、小麦为不携带Pm5e抗病基因的小麦。基于3033-SNP,如果基因型为AA、小麦为白粉病抗病小麦,如果基因型为GG、小麦为白粉病感病小麦。
示例性的与小麦白粉病抗病性无显著相关性的4个SNP分别为:序列表的序列2的第246位核苷酸(相应的,为序列表的序列3的第2704位核苷酸),多态形式为T/C多态,将该SNP又称为246-SNP;序列表的序列2的第2071位核苷酸(相应的,为序列表的序列3的第4915位核苷酸),多态形式为G/A多态,将该SNP又称为2071-SNP;序列表的序列2的第2784位核苷酸(相应的,为序列表的序列3的第5628位核苷酸),多态形式为C/T多态,将该SNP又称为2784-SNP;序列表的序列2的第3022位核苷酸(相应的,为序列表的序列3的第6224位核苷酸),多态形式为G/C多态,将该SNP又称为3022-SNP。
实施例2、检测多个小麦品种基于SNP的基因型以及对白粉病的抗病性
供试小麦见表2。均为现有小麦品种。
一、检测多个小麦品种基于3033-SNP的基因型
提取供试小麦的基因组DNA。以基因组DNA为模板,采用引物1、引物2和引物3组成的引物组进行KASP(竞争性等位基因特异性PCR),然后输出基因型分型结果。如果分型结果与小麦复壮30一致,该小麦品种基于3033-SNP的基因型为AA型,如果分型结果与小麦农大015一致,该小麦品种基于3033-SNP的基因型为GG型。
引物1、引物2和引物3是基于KASP原理设计的。引物组的靶序列如序列表的序列4所示,其中SNP位点位于序列4的第36位。序列表的序列4中,R代表A或G。
引物1(序列5):5’-GAAGGTGACCAAGTTCATGCT GCTAGCATTTACAGCTTTGCTT-3’;
引物2(序列6):5’-GAAGGTCGGAGTCAACGGATT GCTAGCATTTACAGCTTTGCTC-3’;
引物3(序列7):5’-GCAGTGGGAGCGTCATCAAA-3’。
反应体系(10μL):1μL模板(DNA含量约100ng)、5μL KASP Master mix、1.4μL引物混合液、0.08μL 50mM氯化镁水溶液、2.52μL水。KASP Master mix:英国LGC公司,货号为KBS-1016-001。引物混合液提供的有效成分为引物1、引物2和引物3。反应体系中,引物1的浓度为0.168μM,引物2的浓度为0.168μM,引物3的浓度为0.42μM。
采用的仪器为Roche LightCycler480II(配套软件为LightCycler)。
反应程序:95℃15分钟;95℃20秒、退火60秒(第一个循环的退火温度为65℃,每个循环比前一个循环降低1℃),10个循环;94℃20秒、57℃60秒,30个循环;37℃60秒。
结果见表2。
二、检测多个小麦品种基于各个其他SNP的基因型
通过测序检测供试小麦基于246-SNP的基因型。
通过测序检测供试小麦基于2071-SNP的基因型。
通过测序检测供试小麦基于2784-SNP的基因型。
通过测序检测供试小麦基于3022-SNP的基因型。
结果见表2。
三、检测多个小麦品种对白粉病的抗病性
供试小麦培养至一叶一心期,然后接种白粉病致病菌,接种10天后,观察植株的第一片叶片。接种方式:将感染白粉病致病菌并充分发病(充分发病的表型:菌丝层厚、菌丝致密且病斑多,产孢量大,菌丝连成片)的小麦薛早植株在供试植株上方进行人工拂掸。采用的白粉病致病菌为白粉病菌(Blumeriagraminis,sp.tritici,Bgt)E20生理小种。
根据表型,植株的白粉病抗病性采用0-4级的分级标准。0为免疫。0;为近免疫。1为高度抗病。2为中度抗病。3为中度感病。4为高度感病。按大分类来说,0-2为抗病表型,3-4为感病表型。各个分级标准相应的表型见表1。
表1
级别 表型
0 植株无白粉病相关症状
0; 出现过敏性坏死反应,失绿反应
1 菌丝层较稀薄且病斑少,可透绿
2 菌丝层较厚,不透绿,能产生一定量的孢子
3 菌丝层比较厚且病斑多,产孢量大,但菌丝不会连成片
4 菌丝层厚、菌丝致密且病斑多,产孢量大,菌丝连成片
结果见表2。表2中,R代表抗病表型,S代表感病表型。
表2
Figure BDA0001999204490000061
Figure BDA0001999204490000071
实施例3、检测多个小麦品种基于3033-SNP的基因型以及对白粉病的抗病性供试小麦见表3。均为现有小麦品种。
一、检测多个小麦品种基于3033-SNP的基因型
方法同实施例2的步骤一。
结果见图1和表3。
二、检测多个小麦品种对白粉病的抗病性
方法同实施例2的步骤三。
结果见表3。表3中,R代表抗病表型,S代表感病表型。
表3
Figure BDA0001999204490000072
Figure BDA0001999204490000081
SEQUENCE LISTING
<110> 中国科学院遗传与发育生物学研究所
<120> 一种与小麦白粉病抗病基因Pm5e共分离的SNP及其应用
<130> GNCYX190683
<160> 7
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 1067
<212> PRT
<213> Triticum aestivum L.
<400> 1
Met Ala Gln Met Glu Asp Val Asp Ala Ala Ser Pro Leu Pro Ala Met
1 5 10 15
Ala Leu Asp Pro Asp Leu His Ala Ala Ile Arg Ala Pro Val Thr Val
20 25 30
Met Leu Gly Pro Ser Ala Leu Leu Leu Arg Glu Leu Asp Ser Ser Gly
35 40 45
Gln Ser Leu Leu Gly Ala Glu Glu Leu Arg Leu Leu Arg Asp Ala Leu
50 55 60
Arg Glu Val Cys Ile Pro Leu Lys Ser Met Ser Glu Asp Asp Gly Ala
65 70 75 80
Ser Phe Met Ala Arg Trp Trp Met Lys Ile Val Arg Glu Leu Cys Tyr
85 90 95
Asp Thr Gln Asp Tyr Leu Asn Phe Val Gln Ser Ala Arg Asp Arg Pro
100 105 110
Glu Phe Ser Glu Leu Pro Asp Arg Ala Lys Ala Val Tyr Ser Gly Leu
115 120 125
Leu Ala Arg Ala Ile Asp Ala Arg Glu Arg Arg Arg Gly Phe Lys Trp
130 135 140
Ser Pro Lys Thr Thr Arg Ser Asp Thr Trp Glu Ala Phe Asn Arg Arg
145 150 155 160
Phe Ser Lys Lys Leu Val Gln Leu Leu Gly Ser Phe Gly Val His Thr
165 170 175
Thr Pro Gly Ala Val Val Val Glu Ala Pro Asn Lys Leu Val Gln Leu
180 185 190
Leu Ala Leu Asp Asp Asp Val Asn Asp Lys Thr Leu Lys Val Ile Pro
195 200 205
Ile Ile Gly Cys Ala Gly Val Gly Lys Thr Thr Ala Ala Arg Thr Leu
210 215 220
Tyr His Lys His Gly Gly Lys Phe Gln Cys Arg Ala Phe Val Ser Val
225 230 235 240
Ser Gln Asn Pro Asp Met Arg Gly Ile Leu Thr Ser Met Leu Ala Gln
245 250 255
Leu Lys Ala Pro Arg Pro Pro Gly Phe Pro Asp Val Leu Asp Leu Ile
260 265 270
Gly Ala Ile Ser Arg His Leu Gln Gly Lys Gly Tyr Leu Ile Val Leu
275 280 285
Asp Asp Leu Trp Thr Ala Ser Val Trp His Ile Val Ser Arg Ala Phe
290 295 300
Pro Arg Gly Asp His Arg Ser Arg Ile Ile Thr Thr Thr Gln Val His
305 310 315 320
Asp Val Ala Leu Ala Cys Ser Gly Tyr His Pro Val Arg Ile Tyr Lys
325 330 335
Met Glu Leu Leu Asp Glu Tyr Glu Ser Arg Lys Leu Phe Phe Arg Arg
340 345 350
Val Phe Ser Ser Ala Pro Gly Asp Gly Cys Ser Pro Ala Thr Lys Glu
355 360 365
Val Ser Tyr Glu Ile Ile Arg Lys Cys Glu Gly Leu Pro Leu Ala Ile
370 375 380
Val Ser Ile Ala Gly Leu Leu Ala Ser Glu Leu Ser Ile Val Met Glu
385 390 395 400
Asp Trp Arg His Ile Gln Asn Ser Phe Ser Ser Thr Ser Glu Gly Met
405 410 415
Lys Asp Ile Leu Asn Leu Ile Tyr Asn Ser Leu Pro Pro Gly Leu Arg
420 425 430
Thr Cys Leu Leu Tyr Leu Ser Met Tyr Pro Gln Gly Tyr Val Met Lys
435 440 445
Lys Ala Glu Leu Val Lys His Trp Val Ala Glu Gly Phe Ile Gly Val
450 455 460
Val Glu Gly Thr Val Ala Met Lys Ile Ala Glu Arg Tyr Phe Asp Glu
465 470 475 480
Leu Val Ser Arg Ala Met Val Gln Ala Val Asp Thr Asp Tyr Thr Gly
485 490 495
Lys Val Leu Ser Cys Thr Val His His Leu Val Leu Asp Phe Ile Arg
500 505 510
Ser Lys Ser Leu Asp Glu Asn Phe Val Thr Thr Val Asp Tyr Ser Glu
515 520 525
Ser Thr Leu Ala His Pro Asp Lys Val Arg Arg Leu Ser Ile Gln Phe
530 535 540
Gly Gly Val Lys Ser Ala Tyr Ile Pro Glu Thr Ile Val Thr Ser Lys
545 550 555 560
Val Arg Ser Leu Val Phe Trp Gly Phe Phe Lys Cys Ala Pro Pro Ser
565 570 575
Ile Met Asp Tyr Gly Phe Leu Arg Ile Leu Asn Leu His Ile Trp Ala
580 585 590
Asp Glu Asp Asn Glu Ile Phe Asp Leu Ile Gly Ile Gly Asn Leu Phe
595 600 605
Leu Leu Lys Tyr Leu Thr Val Glu Cys Asn Ile Thr Val Lys Leu Pro
610 615 620
Glu Lys Ile Gly Met Leu Arg Tyr Leu Glu Thr Leu Glu Val Asp Ala
625 630 635 640
Arg Leu Phe Ala Val Pro Ser Asp Met Asp Asn Leu Glu Arg Leu Leu
645 650 655
His Leu Arg Leu Pro Ser Glu Ser Ile Leu Pro Gln Gly Val Ala His
660 665 670
Met Thr Ser Leu Arg Thr Leu Gly Asn Phe Asp Leu Ser Arg Arg Tyr
675 680 685
Ser Ile Glu Asn Val Leu Gln Leu Gly Gly Leu Ser Asn Leu Gln Asp
690 695 700
Leu Gln Leu Thr Cys Ala Met Ala Gln Gln Ala Glu Asn Leu Glu Lys
705 710 715 720
Asn Val Leu Leu Leu Gly Trp Ile Val Glu Arg Leu Ser Phe Leu Gln
725 730 735
Thr Ile Thr Leu Val Pro Ala Ser Val Ser Ser His Gln Asp Asp Gly
740 745 750
Gln Ala Ala Ala Pro Thr Ser Ile Ile Ile Pro Pro Asp Gly Phe Asn
755 760 765
Met Glu Pro Pro Pro Asp Leu Leu Leu Gln Arg Ile Glu Met Ser Arg
770 775 780
His Cys Cys Ile Phe Phe Cys Ile Pro Lys Cys Phe Gly Glu Leu Arg
785 790 795 800
Lys Leu Cys Ile Leu Lys Ile Ala Ile Arg Ser Leu Ser Arg Ser Asp
805 810 815
Ile Glu Ile Leu Glu Arg Met Pro Ala Leu Ala Ala Leu Ala Leu Tyr
820 825 830
Asn Gln Thr Thr Pro Thr Glu Lys Met Ile Met Thr Asp Gly Gly Phe
835 840 845
Tyr Arg Leu Thr Tyr Phe Lys Phe Leu Cys Ala Ala Pro Cys Leu Ser
850 855 860
Phe Glu Gln Gly Ala Met Pro Lys Leu Gln Asn Leu Asn Leu Gly Phe
865 870 875 880
Asn Ser Asp Gln Trp Arg Ser Asp Thr Phe Glu Thr Leu Gly Leu Ser
885 890 895
His Leu Arg Gly Leu Thr Asp Val Cys Val Arg Leu Gly Thr Gly Ala
900 905 910
Ala Asp Asn Phe Asn Val Lys Val Ala Glu Ser Ala Leu Glu Ala Val
915 920 925
Val Arg Asn His Pro Asn Ser Pro Arg Ile Arg Ile Lys Phe Val Asp
930 935 940
Leu Ile Phe Asp Gly Lys Glu Asp Asp Ser Thr Ala Thr His Gln Tyr
945 950 955 960
Gln Glu Gly Lys Glu Ser Arg Ser Ala Arg Gly Gln Asp Gly Lys Gln
965 970 975
Asp Ala Thr Arg Gly Glu Arg Gln Gln Gln Gly Pro Pro Met Ser Lys
980 985 990
Gln Asp Ala Arg Arg Ser Lys Ala Val Gly Ala Ser Ser Lys Ala Val
995 1000 1005
Pro Pro Ile Ser Lys Ala Val Asn Ala Ser Lys Ser Arg Ala Ala
1010 1015 1020
Val Pro Pro Pro Thr Ser Ser Ser Pro Ser Lys Pro Met Pro Ser
1025 1030 1035
Ser Ser Leu Thr Ser Pro Pro Lys Pro Arg Arg Arg Gly Ser Arg
1040 1045 1050
Thr Ser Pro Pro Arg Pro Thr Ser Pro Pro Gln Pro Lys Arg
1055 1060 1065
<210> 2
<211> 3204
<212> DNA
<213> Triticum aestivum L.
<400> 2
atggcgcaga tggaggatgt agatgccgcg tcccctctgc cagcgatggc gttggaccct 60
gatctccacg cagcgattcg agctcctgtt actgttatgc tgggtccgtc ggccctcctc 120
ctccgggaac tcgattcttc cggacagagt cttctcggtg cggaggagct tcgtcttctt 180
agagatgctc tcagggaagt atgcatcccc ctgaagagta tgtccgaaga cgacggtgct 240
agctttatgg cccggtggtg gatgaagata gttcgggagc tttgttatga tacgcaggat 300
tacctcaact tcgtccaaag tgctcgagat cgtcctgaat tttcagagtt acctgatcgt 360
gccaaggctg tttattcagg cttacttgct cgcgccattg atgcgaggga aagacgcaga 420
ggtttcaagt ggtctcccaa gaccacccgg tctgacacgt gggaagcctt caaccgccgc 480
ttctccaaaa aacttgtcca gctgctgggt tccttcggtg tccataccac acccggtgcc 540
gtggtcgtgg aggccccaaa caagcttgtc cagctgctag ctttagatga tgatgtcaac 600
gacaagacac tcaaggtgat acctataatt ggatgtgcag gtgttggaaa gacaacagct 660
gccagaacct tgtatcacaa gcatggaggg aaatttcagt gccgggcttt tgtaagtgtg 720
tctcagaatc cagatatgag gggaatcctc accagcatgc tagcacaact taaggcacca 780
cggccccctg gctttcctga tgtgctggac cttattggcg ctatcagcag gcatctccaa 840
ggcaaagggt acttgatcgt acttgatgat ttatggactg catcggtatg gcatattgtt 900
agccgcgctt ttcctcgtgg tgatcaccgc agcagaataa taacaactac acaagtgcat 960
gacgtagcat tggcatgctc tggttatcac ccggtccgta tatataagat ggaacttctt 1020
gatgaatatg aatctcgaaa gttattcttc cgtagggtgt ttagctctgc ccctggagat 1080
ggttgttctc cagctaccaa agaagtctca tacgagatta tcagaaaatg tgaaggtttg 1140
ccgttagcaa ttgtaagtat agcaggtctg ttagcaagcg aattaagcat cgtcatggaa 1200
gattggaggc acatacaaaa ttctttttcc tccacttccg aagggatgaa agatatttta 1260
aaccttatct acaatagtct tccacctggt ttgaggacat gcttgctata tctgagtatg 1320
tatccacagg gctacgtgat gaagaaggct gagttggtga agcactgggt agccgaaggt 1380
tttatcggtg ttgtggaagg gacagtcgca atgaaaattg ctgagcgtta ttttgatgag 1440
cttgtcagca gagcaatggt ccaggccgtg gacaccgatt atactggcaa ggtgttgtca 1500
tgtacggttc accatttggt actggatttt attaggtcca aatctttgga tgagaatttt 1560
gtcaccactg tggactattc tgaatcaact ctagcacacc ctgacaaagt tcgtcggtta 1620
tccatccagt ttggaggggt aaaaagcgca tacattccag aaaccatcgt aacatcgaaa 1680
gttcggtcac ttgtattttg gggtttcttc aagtgtgcgc ctccttccat tatggattat 1740
ggatttcttc gtattctgaa tcttcatatt tgggctgatg aagacaatga gatttttgac 1800
ctcattggaa ttgggaactt atttcttctg aagtatctca cggttgaatg taatatcacc 1860
gtcaaacttc cagagaagat tggaatgctc cgatacttgg agacactgga agtagatgca 1920
agattgtttg ctgttccatc agatatggat aatctggaga ggttactgca cctccgtctt 1980
ccgagcgaat ctatcctgcc tcaaggagta gcccacatga catctcttcg cactttgggg 2040
aattttgatc tcagccgccg ttactcaata gagaatgtat tacaacttgg agggctgtct 2100
aatctccagg atctccagct cacctgtgct atggcacagc aagcagaaaa cctggaaaag 2160
aatgtgctac tccttggctg gattgttgag aggcttagtt tcttgcagac cataactttg 2220
gtacctgctt cagtgtcctc tcatcaggat gatggtcagg ctgcagcacc tacaagcata 2280
attattcccc ctgatggatt taacatggag cctcctccag acctgcttct acagaggatc 2340
gaaatgtcgc ggcactgctg catcttcttc tgcataccta agtgctttgg agagctaagg 2400
aaactctgca tcctaaagat tgcaattagg agtctgtcga ggagtgatat tgaaatcctg 2460
gaaagaatgc cggccctcgc tgctctcgcc ctgtataatc agacaactcc cacagaaaag 2520
atgatcatga ctgacggggg attctataga ctcacgtact tcaagttctt gtgtgctgca 2580
ccatgcctgt cctttgaaca aggagcgatg cccaaactcc aaaacctcaa cctaggattc 2640
aactcagacc aatggagatc ggataccttt gaaactcttg gcttgagtca cttgagaggc 2700
cttacggatg tatgtgtaag acttggtact ggggctgctg acaacttcaa cgtaaaagtt 2760
gccgagtcgg cattggaggc tgtcgtcagg aatcacccca actctcctag gatcagaata 2820
aaatttgtgg atctgatttt tgatggtaag gaggatgata gcaccgcaac tcaccagtat 2880
caagaaggca aggaaagcag gtctgccaga ggccaagatg gcaaacaaga tgcaacaagg 2940
ggcgaacgtc aacaacaggg gccaccaatg agcaaacaag atgcacggag gagcaaagca 3000
gtgggagcgt catcaaaggc agtaccaccg ataagcaaag ctgtaaatgc tagcaagtca 3060
agggcagcag tacctcctcc caccagctct agcccatcaa agccgatgcc atcttcctcc 3120
cttaccagtc caccaaaacc gaggcgacgt ggctcccgca ccagccctcc ccgacccacg 3180
agcccgcccc aacccaagcg ctaa 3204
<210> 3
<211> 7747
<212> DNA
<213> Triticum aestivum L.
<400> 3
acattctgag cttccacttc cactcaggtc gagtgtctct agctgattca gcttccagat 60
ttcccttgga agcctatcaa tgatgcccga tttgatgctc aggtatttca tcagcaccag 120
gctgtagata gcctgaatat ggcccgcact aaggtgagca cactctttca ggtccaacac 180
tcgcagcagt ttatacttgg taaaatctaa aacagcttca taactatcta gagttgccgc 240
cgcgccagtg gagaatactg ccagggtccg gagaagagat aaactctgag gcaaattcag 300
atgggcgttt gcacaagcat gcacagatag cctgcggagg tgttcgttct gcaattcggc 360
cacatcgtga gataaccata tgaaattctc cgacatggac cgttgggtga tgtactgccg 420
aatcgcatcg ccggtaggct ggcatctctt caccttccca ttgctgcttc tctgggtgga 480
cctgatgata ctggaaccaa caagcatgcc caaattgctg gctgcgcctt gttctcctgg 540
tacaagtcct tcagccgtcc atctcctttc taggggctta gtcctgacat gatgttcatg 600
agggaacaag cgcagatata gcaagcagtt gtggtaatca ccattaagat tacctcccct 660
catcaggaaa tgaaaattct gaatctccgc ggggacagca gcagccgccg cttgtgctgc 720
agccccttgt acaggaaagc caaacctctt tatccgttca gtcgttgcag ttgatctctc 780
cttgagttgg gcaattttgt cggcaaattc atcatcggtc gtcatcttgg cgttgaagct 840
gtctatacag tcttggatgt cataagccaa ggccctcagt tgtgcaaaat attctgcctg 900
caagaaactc atcggctcga cactggaagc atgatccttc atggcagctt cgatccactt 960
gagttcttca ctgatgatgg tagcatcagt atttagcttc cccttcacgc tgcagagctt 1020
cgacaaggcg acgccagcta ccgtgctaaa tgccgctaca gcaaactcca tcggtctctc 1080
tttccttgtc tccacagatc actcctcctc cctagatctg catgcacggc aaagagcggt 1140
tagtgttgct tcaaatggaa gagagaggga gagggaaggg gccgggagac agagcttctc 1200
tacctcggtg gagggagctt cagagttccc ctcctcggct gcagtgactt gatagagtca 1260
caagtcacaa gtcacaattc acaagtggca aggaggactg ggctaacata tactccctcc 1320
gttccaaaat agatgactca actttgtact aactttgtac taaagttagt acaaagttga 1380
gtcatctatt ttggaacgga gggagtactc tgctagtgtt tactatgaac ttgtttggga 1440
aactttttct ccagaacggt tttggatcta acgggactca gttttttttt catacatatc 1500
taattagagg tttgatttaa atttcagata attttgcaat agttggaatc atcttgtacg 1560
atcgatgatc agagaactaa ttaaatttgt atcatctcag acactcagag gtgctcgtag 1620
ctagtgataa gatatgtgtg cgtgtgttaa taggggtata tgtgatgatt gtcttcattt 1680
ataccgtgtt tacaaaaagg tctattctat atatattttt cattatttaa atgtgttaag 1740
atgcttcctc ttgctccctc tgtaaagaaa tataagagtg ttcaaatgct cttatagttt 1800
ttttacggag ggagcatctc ccaaggagta ttggacgtgt tatgtactta tattagcttc 1860
ctatataggt aagagtaatg gtagccgggt caatcaaagg ttcggcttgc ttctccccca 1920
tcctctctta tgaaatggat aacccaatgg atggttcacg ttacttttca cactgtctct 1980
ttttctaacc tgtaaccgtc actactataa aatcgttttc caagtaagaa aaatggacta 2040
agaggatcca tttgttttct atgttgatgt caattaatct aacccagatg gcagattcgt 2100
tccagatgtt aaccaccagt ggttgttgat agaataggca gcaatcacag tttttctttg 2160
gaggaggggc ggttccgtgg ggcggaggct tggccggttc ttccagtcac aggtcaggtc 2220
ttctaagcac cctccccttc cccatgttcc atgtacgtat agggggctgt tgagttgtgg 2280
tgttccactt tgtccacgca ctactttttc gcccatctga tagcttcgtc caaatcgaga 2340
tttccctggt agtgtctccc ctcccgagct ttctttgtcg ttcattcata caattacaaa 2400
tcatctggtt gtctatgagg gatcaatagt aatcatctgt ttcttgcttc aggtgaagat 2460
ggcgcagatg gaggatgtag atgccgcgtc ccctctgcca gcgatggcgt tggaccctga 2520
tctccacgca gcgattcgag ctcctgttac tgttatgctg ggtccgtcgg ccctcctcct 2580
ccgggaactc gattcttccg gacagagtct tctcggtgcg gaggagcttc gtcttcttag 2640
agatgctctc agggaagtat gcatccccct gaagagtatg tccgaagacg acggtgctag 2700
ctttatggcc cggtggtgga tgaagatagt tcgggagctt tgttatgata cgcaggatta 2760
cctcaacttc gtccaaagtg ctcgagatcg tcctgaattt tcagagttac ctgatcgtgc 2820
caaggctgtt tattcaggct tacttgctcg cgccattgat gcgagggaaa gacgcagagg 2880
tttcaagtgg tctcccaaga ccacccggtc tgacacgtgg gaagccttca accgccgctt 2940
ctccaaaaaa cttgtccagc tgctgggttc cttcggtgtc cataccacac ccggtgccgt 3000
ggtcgtggag gccccaaaca agcttgtcca gctgctagct ttagatgatg atgtcaacga 3060
caagacactc aaggtgatac ctataattgg atgtgcaggt acagtaataa tctatcctca 3120
acttgaatat ctctagtctt tttctgcccg gcccattaat gctagctgga acatatgcca 3180
agtttctttc atcttctttc aggtgttgga aagacaacag ctgccagaac cttgtatcac 3240
aagcatggag ggaaatttca gtgccgggct tttgtaagtg tgtctcagaa tccagatatg 3300
aggggaatcc tcaccagcat gctagcacaa cttaaggcac cacggccccc tggctttcct 3360
gatgtgctgg accttattgg cgctatcagc aggcatctcc aaggcaaagg gtgattgatc 3420
tcaactatac tgtctaaata agcaaattcc gtgttctctt ctcataaata aatcataggc 3480
ataattttat tttatgaggt tccagttatg gcgtgtcagg cattgccata gcattttgag 3540
aaattatgaa tattattaat gggtgttgac cctcaaaaaa aaattatagc acatgctcag 3600
gtgaacctag gcaaattaat atatatgctg ccgcttgagc aaggtatata ttaattttta 3660
ttttttctga cctaacatac aaaattatgc aggtacttga tcgtacttga tgatttatgg 3720
actgcatcgg tatggcatat tgttagccgc gcttttcctc gtggtgatca ccgcagcaga 3780
ataataacaa ctacacaagt gcatgacgta gcattggcat gctctggtta tcacccggtc 3840
cgtatatata agatggaact tcttgatgaa tatgaatctc gaaagttatt cttccgtagg 3900
gtgtttagct ctgcccctgg agatggttgt tctccagcta ccaaagaagt ctcatacgag 3960
attatcagaa aatgtgaagg tttgccgtta gcaattgtaa gtatagcagg tctgttagca 4020
agcgaattaa gcatcgtcat ggaagattgg aggcacatac aaaattcttt ttcctccact 4080
tccgaaggga tgaaagatat tttaaacctt atctacaata gtcttccacc tggtttgagg 4140
acatgcttgc tatatctgag tatgtatcca cagggctacg tgatgaagaa ggctgagttg 4200
gtgaagcact gggtagccga aggttttatc ggtgttgtgg aagggacagt cgcaatgaaa 4260
attgctgagc gttattttga tgagcttgtc agcagagcaa tggtccaggc cgtggacacc 4320
gattatactg gcaaggtgtt gtcatgtacg gttcaccatt tggtactgga ttttattagg 4380
tccaaatctt tggatgagaa ttttgtcacc actgtggact attctgaatc aactctagca 4440
caccctgaca aagttcgtcg gttatccatc cagtttggag gggtaaaaag cgcatacatt 4500
ccagaaacca tcgtaacatc gaaagttcgg tcacttgtat tttggggttt cttcaagtgt 4560
gcgcctcctt ccattatgga ttatggattt cttcgtattc tgaatcttca tatttgggct 4620
gatgaagaca atgagatttt tgacctcatt ggaattggga acttatttct tctgaagtat 4680
ctcacggttg aatgtaatat caccgtcaaa cttccagaga agattggaat gctccgatac 4740
ttggagacac tggaagtaga tgcaagattg tttgctgttc catcagatat ggataatctg 4800
gagaggttac tgcacctccg tcttccgagc gaatctatcc tgcctcaagg agtagcccac 4860
atgacatctc ttcgcacttt ggggaatttt gatctcagcc gccgttactc aatagagaat 4920
gtattacaac ttggagggct gtctaatctc caggatctcc agctcacctg tgctatggca 4980
cagcaagcag aaaacctgga aaagaatgtg ctactccttg gctggattgt tgagaggctt 5040
agtttcttgc agaccataac tttggtacct gcttcagtgt cctctcatca ggatgatggt 5100
caggctgcag cacctacaag cataattatt ccccctgatg gatttaacat ggagcctcct 5160
ccagacctgc ttctacagag gatcgaaatg tcgcggcact gctgcatctt cttctgcata 5220
cctaagtgct ttggagagct aaggaaactc tgcatcctaa agattgcaat taggagtctg 5280
tcgaggagtg atattgaaat cctggaaaga atgccggccc tcgctgctct cgccctgtat 5340
aatcagacaa ctcccacaga aaagatgatc atgactgacg ggggattcta tagactcacg 5400
tacttcaagt tcttgtgtgc tgcaccatgc ctgtcctttg aacaaggagc gatgcccaaa 5460
ctccaaaacc tcaacctagg attcaactca gaccaatgga gatcggatac ctttgaaact 5520
cttggcttga gtcacttgag aggccttacg gatgtatgtg taagacttgg tactggggct 5580
gctgacaact tcaacgtaaa agttgccgag tcggcattgg aggctgtcgt caggaatcac 5640
cccaactctc ctaggatcag aataaaattt gtggatctga tttttgatgg taaggaggat 5700
gatagcaccg caactcacca gtatcaagaa ggcaaggaaa gcaggtacgg ctttttcttc 5760
cgtttacaag aattttgtag ggggtttaaa ggataggaat tttataaaag gatttctttg 5820
gaacccagtg atttgtagga atagaatctc attcctgtcc agcatagaaa ccaatccttt 5880
ctatttcaaa ggggggaaaa agcattagcc tagacccaaa cccaatgaaa aaaacaatca 5940
tatcctgtga atcagatgaa atgacatact tgtcacctca cttcatatga ttttccaatt 6000
ttgatgatat gcctattcaa tgaaccaaaa gagaccttaa cagggcattc gtccaatctt 6060
gcactgctaa tttgttcgtc atttttcctt caatcgcgac aggtctgcca gaggccaaga 6120
tggcaaacaa gatgcaacaa ggggcgaacg tcaacaacag gggccaccaa tgagcaaaca 6180
agatgcacgg aggagcaaag cagtgggagc gtcatcaaag gcagtaccac cgataagcaa 6240
agctgtaaat gctagcaagt caagggcagc agtacctcct cccaccagct ctagcccatc 6300
aaagccgatg ccatcttcct cccttaccag tccaccaaaa ccgaggcgac gtggctcccg 6360
caccagccct ccccgaccca cgagcccgcc ccaacccaag cgctaagctt ttggtacgat 6420
tatttcttct tcgtgcacca aaaatagaaa acgcttctaa tgtaccattt acagctttgc 6480
tcaagttttc caagctcttg gtatgatttt cccaaggaca taacagagtg tcgacctttt 6540
ctttcatgtc atgaagtcca tctgctacct actttcttcc ctctagaaac tctcttgtgc 6600
tggaaagtaa cttattcaaa gccagaactg ggctaggtgc ttattttcat tcatccctga 6660
cccaggccag gggttgagcg catcatcccg cttattagcg ccagggacat ccgacagaca 6720
gacggacgat gcaccaagcg gtgaaccatg cggcgggaag aacgagcatc cgaggagcag 6780
tccccaccct gatgccatcc aaactgatca gctctctaaa tattacagca tctattctac 6840
atccgtatgt acacatgtct gcttttcttg tgcactaagt tctgtactgt gttttcttat 6900
aggctggcac ttttcaaaaa aaattcaaaa tgaggatgta cccctcagcc tctgagtgat 6960
gcacacagcc ttataggctg gcattatacc atttgatact tctgtgacca tgccgtgagc 7020
tgcgggatcg acatgttctc gtttgaaatg gggaagacat aaacatatat gtcatacgaa 7080
gaaagcaaaa aaaatgtttc tgttgtaaat aatgagagaa ttcaagtgct atgagtgact 7140
tacttaggtt ttaaaacaaa acaaataggg cttgtgtagc ataggagtca tgagcacagc 7200
accagaacag cacccaagca cagcctccaa accccaaaac aatatcaacg aaaatttgaa 7260
attcaacacg tgaattctac caacatcacc agagcagaac tcaggaatca gtattaaaaa 7320
tctcgggatt gacaaatccc acaaacctaa atttaccact catcatgagt agtacatcaa 7380
acaatgcaaa tttattgaac actcacaaaa cactaccagg ttcaaacagg tgacactata 7440
attaggctta catctatgtc aataactatt tcgaaacaga aaaaaggagt ctcgccaaga 7500
gacatcaagg gtatatccaa acaaagagca tcacaaaaca cttccagctt attgaggcaa 7560
atttattgag ccacaaatct cattcgaaat cacattctac tcaccacaca ccaggcgtat 7620
atcaaacaag tcaaatttat tgggccacaa atctcattcg gaatcacata ctattcacca 7680
cataccatgg cgtatatcaa acaaggcaaa tttattgagc atcacaaaac acttcaggtt 7740
tcaggtc 7747
<210> 4
<211> 57
<212> DNA
<213> Triticum aestivum L.
<400> 4
gcagtgggag cgtcatcaaa ggcagtacca ccgatragca aagctgtaaa tgctagc 57
<210> 5
<211> 43
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<400> 5
gaaggtgacc aagttcatgc tgctagcatt tacagctttg ctt 43
<210> 6
<211> 43
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<400> 6
gaaggtcgga gtcaacggat tgctagcatt tacagctttg ctc 43
<210> 7
<211> 20
<212> DNA
<213> Artificial sequence
<400> 7
gcagtgggag cgtcatcaaa 20

Claims (10)

1.一种鉴定待测小麦白粉病抗病性的方法,包括如下步骤:检测待测小麦基于特异SNP的基因型;AA基因型小麦的白粉病抗病性高于GG基因型小麦;
所述特异SNP为如下(a1)或(a2):
(a1)位于小麦cDNA 中的序列表的序列2所示DNA分子的第3033位核苷酸;
(a2)位于小麦基因组中的序列表的序列3所示DNA分子的第6235位核苷酸。
2.一种鉴定待测小麦白粉病抗病性的方法,包括如下步骤:检测待测小麦基于特异SNP的基因型;AA基因型小麦为候选的白粉病抗病小麦;
所述特异SNP为如下(a1)或(a2):
(a1)位于小麦cDNA 中的序列表的序列2所示DNA分子的第3033位核苷酸;
(a2)位于小麦基因组中的序列表的序列3所示DNA分子的第6235位核苷酸。
3.一种鉴定待测小麦白粉病抗病性的方法,包括如下步骤:检测待测小麦基于特异SNP的基因型;GG基因型小麦为候选的白粉病感病小麦;
所述特异SNP为如下(a1)或(a2):
(a1)位于小麦cDNA 中的序列表的序列2所示DNA分子的第3033位核苷酸;
(a2)位于小麦基因组中的序列表的序列3所示DNA分子的第6235位核苷酸。
4.一种鉴定待测小麦是否携带Pm5e抗病基因的方法,包括如下步骤:检测待测小麦基于特异SNP的基因型;基因型为AA的小麦为携带Pm5e抗病基因的小麦,基因型为GG的小麦为不携带Pm5e抗病基因的小麦;
所述特异SNP为如下(a1)或(a2):
(a1)位于小麦cDNA 中的序列表的序列2所示DNA分子的第3033位核苷酸;
(a2)位于小麦基因组中的序列表的序列3所示DNA分子的第6235位核苷酸;
所述Pm5e抗病基因为如下(f1)或(f2)或(f3):
(f1)小麦基因组中编码序列表的序列1所示的蛋白质的基因;
(f2)小麦基因组中表达特异RNA的基因;所述特异RNA为与序列表的序列2所示的DNA分子对应的RNA;
(f3)小麦基因组中序列表的序列3所示的DNA分子。
5.特异SNP作为检测靶标在鉴定待测小麦白粉病抗病性中的应用;
所述特异SNP为如下(a1)或(a2):
(a1)位于小麦cDNA 中的序列表的序列2所示DNA分子的第3033位核苷酸;
(a2)位于小麦基因组中的序列表的序列3所示DNA分子的第6235位核苷酸。
6.特异SNP作为检测靶标在鉴定待测小麦是否携带Pm5e抗病基因中的应用;
所述特异SNP为如下(a1)或(a2):
(a1)位于小麦cDNA 中的序列表的序列2所示DNA分子的第3033位核苷酸;
(a2)位于小麦基因组中的序列表的序列3所示DNA分子的第6235位核苷酸;
所述Pm5e抗病基因为如下(f1)或(f2)或(f3):
(f1)小麦基因组中编码序列表的序列1所示的蛋白质的基因;
(f2)小麦基因组中表达特异RNA的基因;所述特异RNA为与序列表的序列2所示的DNA分子对应的RNA;
(f3)小麦基因组中序列表的序列3所示的DNA分子。
7.用于检测特异SNP的物质的应用,为如下(e1)或(e2)或(e3)或(e4)或(e5)或(e6)或(e7)或(e8):
(e1)鉴定或辅助鉴定小麦的白粉病抗病性;
(e2)筛选或辅助筛选白粉病抗病小麦;
(e3)筛选或辅助筛选白粉病感病小麦;
(e4)制备用于鉴定或辅助鉴定小麦的白粉病抗病性的试剂盒;
(e5)制备用于筛选或辅助筛选白粉病抗病小麦的试剂盒;
(e6)制备用于筛选或辅助筛选白粉病感病小麦的试剂盒;
(e7)鉴定或辅助鉴定待测小麦是否携带Pm5e抗病基因;
(e8)制备鉴定或辅助鉴定待测小麦是否携带Pm5e抗病基因的试剂盒;
所述特异SNP为如下(a1)或(a2):
(a1)位于小麦cDNA 中的序列表的序列2所示DNA分子的第3033位核苷酸;
(a2)位于小麦基因组中的序列表的序列3所示DNA分子的第6235位核苷酸;
所述Pm5e抗病基因为如下(f1)或(f2)或(f3):
(f1)小麦基因组中编码序列表的序列1所示的蛋白质的基因;
(f2)小麦基因组中表达特异RNA的基因;所述特异RNA为与序列表的序列2所示的DNA分子对应的RNA;
(f3)小麦基因组中序列表的序列3所示的DNA分子。
8.特异引物组,由引物1、引物2和引物3组成;
引物1为序列表的序列5所示的单链DNA分子;
引物2为序列表的序列6所示的单链DNA分子;
引物3为序列表的序列7所示的单链DNA分子。
9.权利要求8所述特异引物组的应用,为如下(e1)或(e2)或(e3)或(e4)或(e5)或(e6)或(e7)或(e8):
(e1)鉴定或辅助鉴定小麦的白粉病抗病性;
(e2)筛选或辅助筛选白粉病抗病小麦;
(e3)筛选或辅助筛选白粉病感病小麦;
(e4)制备用于鉴定或辅助鉴定小麦的白粉病抗病性的试剂盒;
(e5)制备用于筛选或辅助筛选白粉病抗病小麦的试剂盒;
(e6)制备用于筛选或辅助筛选白粉病感病小麦的试剂盒;
(e7)鉴定或辅助鉴定待测小麦是否携带Pm5e抗病基因;
(e8)制备鉴定或辅助鉴定待测小麦是否携带Pm5e抗病基因的试剂盒;
所述Pm5e抗病基因为如下(f1)或(f2)或(f3):
(f1)小麦基因组中编码序列表的序列1所示的蛋白质的基因;
(f2)小麦基因组中表达特异RNA的基因;所述特异RNA为与序列表的序列2所示的DNA分子对应的RNA;
(f3)小麦基因组中序列表的序列3所示的DNA分子。
10.权利要求1或2或3或4所述的方法或权利要求8所述特异引物组在小麦育种中的应用;所述小麦育种为抗白粉病小麦育种。
CN201910206693.2A 2019-03-19 2019-03-19 一种与小麦白粉病抗病基因Pm5e共分离的SNP及其应用 Active CN111719008B (zh)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910206693.2A CN111719008B (zh) 2019-03-19 2019-03-19 一种与小麦白粉病抗病基因Pm5e共分离的SNP及其应用

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CN201910206693.2A CN111719008B (zh) 2019-03-19 2019-03-19 一种与小麦白粉病抗病基因Pm5e共分离的SNP及其应用

Publications (2)

Publication Number Publication Date
CN111719008A CN111719008A (zh) 2020-09-29
CN111719008B true CN111719008B (zh) 2021-11-09

Family

ID=72563027

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
CN201910206693.2A Active CN111719008B (zh) 2019-03-19 2019-03-19 一种与小麦白粉病抗病基因Pm5e共分离的SNP及其应用

Country Status (1)

Country Link
CN (1) CN111719008B (zh)

Families Citing this family (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN111763249B (zh) * 2019-03-08 2021-11-16 中国科学院遗传与发育生物学研究所 植物白粉病抗性相关蛋白Pm5e及其编码基因和应用
CN112359130B (zh) * 2020-11-30 2022-07-12 北京大学现代农业研究院 一种检测小麦秆锈病抗性基因SrTm5的诊断性分子标记及其育种应用
CN113025745B (zh) * 2021-04-25 2023-10-10 河南省作物分子育种研究院 一种用于检测小麦成株期抗白粉病基因PmBMYD的KASP引物及其应用
CN113234852B (zh) * 2021-06-30 2022-11-04 四川省农业科学院作物研究所 一种鉴定小麦白粉病抗性的分子标记、引物组及应用

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101659988A (zh) * 2008-08-29 2010-03-03 李祥 小麦抗白粉病基因复壮30的ssr标记及其获得方法
CN108300799B (zh) * 2018-04-19 2021-08-13 山东农业大学 小麦抗白粉病基因Pm5e的高通量检测标记及其在育种中的应用

Also Published As

Publication number Publication date
CN111719008A (zh) 2020-09-29

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN111719008B (zh) 一种与小麦白粉病抗病基因Pm5e共分离的SNP及其应用
CN109468315B (zh) 水稻耐淹基因Sub1共显性分子标记及应用
CN109112217B (zh) 一种与猪体长和乳头数显著关联的遗传标记及应用
KR101970264B1 (ko) 고추 풋마름병 저항성 품종 판별용 caps 마커 및 이의 용도
CN113061171B (zh) 抗稻瘟病蛋白和基因、分离的核酸及其应用
Oh et al. Fine mapping in tomato using microsynteny with the Arabidopsis genome: the Diageotropica (Dgt) locus
CN112176083B (zh) 小麦抗白粉病相关基因Pm41的功能型分子标记及其应用
CN109988771B (zh) 一个玉米抗盐qtl及其应用
CN107574171A (zh) 一种玉米抗盐主效qtl及其相关基因、分子标记和应用
CN115873867B (zh) 一种抗稻瘟病基因Pi69及其编码蛋白与应用
US20110083229A1 (en) EG1117 And EG307 Polynucleotides And Uses Thereof
KR102429219B1 (ko) 콩 역병균에 대한 저항성 또는 감수성을 가지는 콩 품종 판별용 마커 조성물 및 이의 용도
CN111763249B (zh) 植物白粉病抗性相关蛋白Pm5e及其编码基因和应用
KR101793042B1 (ko) 수박 흰가루병 저항성 유전자 선발용 분자마커
CN111334597B (zh) 用于检测西瓜白粉病抗性的snp位点、kasp标记及其应用
CN104109669A (zh) 猪ampd1基因启动子区域snp作为猪胴体性状的遗传标记及应用
CN106957907B (zh) 用于狗中的肝铜积累的遗传检测
CN111733278A (zh) 水稻钠钾离子吸收qtl连锁的snp分子标记及其应用
CN116640774B (zh) 水稻稻瘟病抗性基因Pik-W25及其应用
CN108315333B (zh) 水稻黑条矮缩病抗病基因RBSDV-6c及其编码蛋白
CN116970734B (zh) 一种棉花多心室控制基因GaMV连锁的SNP位点及其应用
KR102081964B1 (ko) 벼 키다리병 저항성 벼 판별용 snp 마커
KR100984169B1 (ko) Tmv 저항성 고추 품종을 선별하기 위한 프라이머 세트,방법 및 키트
CN106636386A (zh) 与玉米抗丝黑穗病次主效位点连锁的分子标记DNdCAPS8.03‑1及其应用
Sruoga et al. Evaluation of genetic diversity of perch (Perca fluviatilis) and pikeperch (Sander lucioperca) populations from Curonian lagoon and inshore waters of the Baltic Sea

Legal Events

Date Code Title Description
PB01 Publication
PB01 Publication
SE01 Entry into force of request for substantive examination
SE01 Entry into force of request for substantive examination
GR01 Patent grant
GR01 Patent grant