CN110713966A - 一种利用GlcN6P感应元器件促进N-乙酰氨基葡萄糖合成的方法 - Google Patents

一种利用GlcN6P感应元器件促进N-乙酰氨基葡萄糖合成的方法 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种利用GlcN6P感应元器件促进N‑乙酰氨基葡萄糖合成的方法,属于遗传工程技术领域。本发明以枯草芽孢杆菌BSGNY‑Pveg‑glmS‑P43‑GNA1为出发菌株,在基因组上整合了受GlcN6P响应元器件调控的CRISPRi系统动态弱化N‑乙酰氨基葡萄糖合成竞争途径;同时利用GlcN6P响应启动子在质粒上调控GNA1的表达动态调控N‑乙酰氨基葡萄糖合成途径;并对乙偶姻合成途径的关键基因alsSD进行了敲除。该菌株在15L发酵罐上进行补料分批发酵时N‑乙酰氨基葡萄糖产量达到131.6g/L,而且没有副产物乙偶姻的积累,这为工业化发酵法生产GlcNAc奠定了基础。

Description

一种利用GlcN6P感应元器件促进N-乙酰氨基葡萄糖合成的 方法
技术领域
本发明涉及一种利用GlcN6P感应元器件促进N-乙酰氨基葡萄糖合成的方法,属于遗传工程技术领域。
背景技术
乙酰氨基葡萄糖是生物体内的一种单糖,广泛存在于细菌、酵母、霉菌、植物以及动物体内。在人体中,乙酰氨基葡萄糖是糖胺聚糖二糖单元的合成前体,其对修复和维持软骨及关节组织功能具有重要作用。因此,乙酰氨基葡萄糖被广泛作为药物和营养膳食添加来治疗和修复关节损伤。此外,乙酰氨基葡萄糖在化妆品领域也具有诸多应用。目前,乙酰氨基葡萄糖主要采用酸解虾壳或蟹壳中甲壳素生产,此方法产生的废液对环境污染较为严重,而且得到的产品易引起过敏反应,不适宜海鲜过敏的人群服用。
枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)是一种被广泛用作食品酶制剂及重要营养化学品的生产宿主,其产品被FDA认证为“generally regarded as safe”(GRAS)安全级别。因此,运用代谢工程手段构建重组枯草芽孢杆菌是生产食品安全级乙酰氨基葡萄糖的有效途径。在以葡萄糖为底物合成N-乙酰氨基葡萄糖时,糖酵解途径、磷酸戊糖途径以及肽聚糖合成途径会竞争性地利用进入胞内的葡萄糖从而限制N-乙酰氨基葡萄糖的高效合成。公开号为CN108148797A的专利申请中提供了一种重组枯草芽孢杆菌(BSGNX-dCas9-zpg),利用木糖诱导的CRISPRi系统对这三条竞争途径进行了弱化,使得N-乙酰氨基葡萄糖的产量与产物转化率均达到较高水平,而且改造后解除了分解代谢物阻遏效应使其可以共利用葡萄糖和木糖。但是木糖的市场价格要比葡萄糖昂贵得多,在发酵生产中使用会造成生产成本的增加,而且诱导剂的添加也会增加发酵操作的复杂程度,因此还需进一步对重组枯草芽孢杆菌进行改造,使其在利用葡萄糖作为唯一碳源时可以自动对相关代谢网络进行调节,并高效地合成N-乙酰氨基葡萄糖。
因此,提供一种低成本、操作简单、无需添加诱导剂、高效的N-乙酰氨基葡萄糖合成方法,对于N-乙酰氨基葡萄糖的工业应用有重要价值。
发明内容
为了解决“发酵过程中加入诱导剂造成操作复杂,加入木糖引起生产成本增加”的问题,本发明只使用葡萄糖作为唯一碳源,利用重组枯草芽孢杆菌持续高效地合成N-乙酰氨基葡萄糖。
本发明的第一个目的是提供一种促进N-乙酰氨基葡萄糖合成的方法,是使用GlcN6P感应元器件控制N-乙酰氨基葡萄糖乙酰化酶GNA1的表达来动态调控N-乙酰氨基葡萄糖合成途径;同时利用GlcN6P感应元器件调控表达的dCas9蛋白和三个分别作用于zwf,pfkA与glmM基因的sgRNA表达片段结合后形成的复合体对糖酵解途径、磷酸戊糖途径和肽聚糖合成途径进行动态弱化;所述GlcN6P感应元器件包含有枯草芽孢杆菌的转录因子GamR以及含GamR结合位点的启动子,所述启动子是PgamA启动子或者将GamR结合位点添加到组成型启动子上构建的杂合启动子。
在本发明的一种实施方式中,所述转录因子GamR的氨基酸序列含NCBI编号为WP_015382651.1的氨基酸序列的第1-235位。
在本发明的一种实施方式中,所述启动子PgamA的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示,,所述构建的杂合启动子包括Pvg1、Pvg2、Pvg3、Pvg4、Pvg5、Pvg6、Pvg7、Prg、Plg、Pvg、Psg、Psg1、Psg2、Psg3,核苷酸序列分别如SEQ ID NO.6-SEQ ID NO.19所示。
在本发明的一种实施方式中,所述N-乙酰氨基葡萄糖乙酰化酶GNA1的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。
在本发明的一种实施方式中,所述N-乙酰氨基葡萄糖乙酰化酶GNA1以载体pSTg-GNA1为表达载体,所述载体pSTg-GNA1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,是将启动子PgamA与编码GNA1的基因连接到载体pSTOP1622上,替换了载体pSTOP1622上的阻遏蛋白xylR和启动子PxylA后得到的。载体pSTOP1622的构建方法见文献:Biedendieck,R.,Yang,Y.,Deckwer,W.D.,Malten,M.,Jahn,D.,2007.Plasmid system for the intracellularproduction and purification of affinity-tagged proteins in Bacillusmegaterium.Biotechnol.Bioeng.96,525–537.。
在本发明的一种实施方式中,GNA1的表达具体是将游离载体pSTg-GNA1转化到枯草芽孢杆菌中,并使用四环素筛选转化子。
在本发明的一种实施方式中,所述dCas9蛋白的氨基酸序列如专利CN108148797A中的SEQ ID NO.1所示。
在本发明的一种实施方式中,所述dCas9蛋白,所述载体pLCg-dCas9的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,是将载体pLCx-dCas9(构建方法记载于公开号为CN108148797A的专利申请中)中的阻遏蛋白XylR和木糖启动子替换为gamR和PgamA后得到的。所述载体pLCx-dCas9的PgamA上游含有氯霉素抗性基因,可用于抗性筛选;在氯霉素抗性基因-PgamA-dCas9两端为枯草芽孢杆菌lacA基因的上游和下游同源臂。
在本发明的一种实施方式中,dCas9蛋白的表达具体是通过转化使用内切酶Eco91I线性化后的pLCg-dCas9载体整合到枯草芽孢杆菌BSGNY-Pveg-glmS-P43-GNA1基因组上的lacA位点。
在本发明的一种实施方式中,所述作用于zwf的sgRNA表达片段的核苷酸序列如专利CN108148797A中的SEQ ID NO.2所示;所述作用于pfkA的sgRNA表达片段的核苷酸序列如专利CN108148797A中的SEQ ID NO.3所示;所述作用于glmM的sgRNA表达片段的核苷酸序列如专利CN108148797A中的SEQ ID NO.4所示。
在本发明的一种实施方式中,所述sgRNA的表达片段通过转化线性化后的整合载体psga-zpg(构建方法记载于公开号为CN108148797A的专利申请中)整合到重组枯草芽孢杆菌基因组上,所述载体psga-zpg的核苷酸序列如专利CN108148797A中的SEQ ID NO.7所示。
在本发明的一种实施方式中,所述三个分别作用于zwf,pfkA与glmM基因的sgRNA表达片段和dCas9结合后可通过CRISPRi机制对糖酵解途径、磷酸戊糖途径和肽聚糖合成途径进行动态弱化,具体是转录形成的sgRNA可以同dCas9蛋白形成复合体,然后引导其识别并结合到与该sgRNA特异性互补的基因组DNA上,从而阻止了RNA聚合酶通过该基因,抑制了基因的转录过程,实现了对特定基因的表达弱化。因为dCas9蛋白是使用GlcN6P感应元器件进行动态表达的,因此弱化的过程也是动态的。关于CRISPRi的具体原理可参见文献:Gilbert LA,Larson MH,Morsut L,Liu Z,Brar GA,Torres SE,Stern-Ginossar N,Brandman O,Whitehead EH,Doudna JA,Lim WA,Weissman JS,Qi LS.2013.CRISPR-mediated modular RNA-guided regulation of transcription in eukaryotes.Cell154:442.。
在本发明的一种实施方式中,所述sgRNA的表达片段通过转化内切酶Eco91I线性化后的psga-zpg载体整合到重组枯草芽孢杆菌BSGNY-Pveg-glmS-P43-GNA1基因组上amyE位点。
在本发明的一种实施方式中,所述方法还包括在枯草芽孢杆菌敲除了副产物乙偶姻合成关键基因alsSD。
在本发明的一种实施方式中,所述的乙偶姻合成途径关键基因alsSD的敲除是通过转化alsSD敲除框实现的,敲除框的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示,是通过融合PCR将alsSD基因的上下游同源臂与壮观霉素抗性基因融合之后得到的。
在本发明的一种实施方式中,所述副产物乙偶姻合成关键基因的敲除具体是:首先以枯草芽孢杆菌基因组为模板,扩增alsSD的上游和下游同源臂各1000bp;然后以p7S6质粒为模板,扩增壮观霉素抗性基因片段;之后通过融合PCR将alsSD上下游同源臂与壮观霉素抗性基因通过融合PCR进行融合,得到敲除框;直接将敲除框转化枯草芽孢杆菌后,使用壮观霉素抗性平板进行筛选。p7S6质粒以及详细基因敲除方法可参见文献:Yan X,Yu HJ,Hong Q,Li SP.2008.Cre/lox system and PCR-based genome engineering in Bacillussubtilis.Appl.Environ.Microbiol.74:5556–5562。
本发明的第二个目的是提供一种重组枯草芽孢杆菌,所述重组枯草芽孢杆菌使用GlcN6P感应元器件控制N-乙酰氨基葡萄糖乙酰化酶GNA1的表达来动态调控N-乙酰氨基葡萄糖合成途径;同时利用GlcN6P感应元器件调控表达的dCas9蛋白和三个分别作用于zwf,pfkA与glmM基因的sgRNA表达片段结合后形成的复合体对糖酵解途径、磷酸戊糖途径和肽聚糖合成途径进行动态弱化;所述GlcN6P感应元器件包含有枯草芽孢杆菌的转录因子GamR以及含GamR结合位点的启动子,所述转录因子GamR的氨基酸序列含NCBI编号为WP_015382651.1的氨基酸序列的第1-235位,所述启动子是PgamA启动子或者将GamR结合位点添加到组成型启动子上构建的杂合启动子。
本发明的第三个目的是提供所述基因工程菌的构建方法,所述方法是以枯草芽孢杆菌BSGNY-Pveg-glmS-P43-GNA1为出发菌株;所述出发菌株以枯草芽孢杆菌168(BS168)为基础,基因型作如下改造得到的:ΔnagPΔgamPΔgamAΔnagAΔnagBΔldhΔptaΔglcKΔpckAΔpyk::lox72,并以启动子Pveg调控表达来自大肠杆菌的磷酸酶yqaB与枯草芽孢杆菌168自身的glmS、在质粒上以启动子P43调控GNA1的重组表达。
在本发明的一种实施方式中,所述枯草芽孢杆菌BSGNY-Pveg-glmS-P43-GNA1,构建方法记载于公开号为CN107699533A的专利申请中。
本发明的第四个目的是提供一种生产乙酰氨基葡萄糖的方法,是将上述重组枯草芽孢杆菌进行种子培养,再转入发酵培养基中发酵培养。
在本发明的一种实施方式中,所述方法是将上述重组枯草芽孢杆菌置于35-39℃、200-220rpm下培养10-15h的种子以1-10%的接种量转入摇瓶发酵培养基,35-39℃、200-220pm条件下培养50-70h。
在本发明的一种实施方式中,所述方法是将35-39℃、200-220rpm下培养10-15h的种子以1-10%的接种量转入上罐发酵培养基,于装液量为30-50%的发酵罐中,35-39℃、pH6.5-7.5条件下培养,通气量为1-2vvm,转速控制在500-900rpm之间维持溶氧在30%以上,持续流加750g/L以控制葡萄糖浓度在1-30g/L之间。
本发明还提供上述重组枯草芽孢杆菌或上述促进N-乙酰氨基葡萄糖合成的方法在食品、制药、营养保健品或者化妆品领域中的应用。
本发明的有益效果:
(1)本发明提供了GlcN6P感应元器件的构建方法,得到了可以被胞内GlcN6P激活的一系列合成启动子。并利用该感应元器件实现了一种利用葡萄糖高效合成N-乙酰氨基葡萄糖的方法,即通过GlcN6P感应元器件调控N-乙酰氨基葡萄糖合成途径及其主要竞争途径(糖酵解途径、磷酸戊糖途径和肽聚糖合成途径),促进了N-乙酰氨基葡萄糖的持续高效合成;并进一步通过敲除副产物乙偶姻的合成途径,避免了副产物的积累,进一步提高了N-乙酰氨基葡萄糖的产量。
(2)本发明构建的重组枯草芽孢杆菌可持续高效地利用葡萄糖合成乙酰氨基葡萄糖,其在摇瓶上产量可达到28.0g/L,15L发酵罐上进行补料分批发酵时是产量可达到131.6g/L,是目前发酵生产的最高水平,为其工业化奠定了基础。
附图说明
图1为GlcN6P对相关基因调控的作用原理。1A为枯草芽孢杆菌中葡萄糖(Glc)、氨基葡萄糖(GlcN)和N-乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc)分解代谢相关基因,1B为GlcN6P对GlcN和GlcNAc分解相关基因的调控作用,1C为GlcN6P对启动子PgamA的调控机制。
图2为构建的GlcN6P响应元器件。2A为含有GamR结合位点的启动子的部分序列,2B为这些启动子在GamR结合前后的强度变化。
图3为GlcN6P响应元器件的调控作用验证。3A为激活作用验证,3B为抑制作用验证,3C为同时进行激活和抑制的作用验证。
图4为GlcN6P响应元器件的调控下的细胞生长与产物合成情况;4A是利用GlcN6P响应元器件进行调控的实现过程,4B为使用GlcN6P响应元器件调控后24h的细胞干重,4C为36h的细胞干重,4D为GlcNAc的合成情况,4E为副产物乙偶姻的合成情况。
图5为BNDR022的15L罐上的补料分批发酵结果。
图6为BNDR122的15L罐上的补料分批发酵结果。
具体实施方式
种子培养基(g/L):胰蛋白胨10,酵母粉5,NaCl 10。
摇瓶发酵培养基(g/L):胰蛋白胨6,酵母粉12,尿素6,K2HPO4·3H2O 12.5,KH2PO42.5,CaCO3 5,微量元素10ml/L;微量元素溶液按g/L计含有:MnSO4·5H2O 1.0,CoCl2·6H2O0.4,NaMoO4·2H2O 0.2,ZnSO4·7H2O 0.2,AlCl3·6H2O 0.1,CuCl2·H2O 0.1,H3BO4 0.05,含5M HCl。
发酵罐发酵培养基(g/L):胰蛋白胨20,酵母粉20,尿素10,K2HPO4·3H2O 12.5,KH2PO4 2.5,CaCO3 5,微量元素10ml/L;微量元素溶液按g/L计含有:MnSO4·5H2O 1.0,CoCl2·6H2O 0.4,NaMoO4·2H2O 0.2,ZnSO4·7H2O 0.2,AlCl3·6H2O 0.1,CuCl2·H2O 0.1,H3BO4 0.05,含5M HCl。
乙酰氨基葡萄糖的测定方法:高效液相色谱(HPLC)检测法:Agilent 1260,RID检测器,HPX-87H柱(Bio-Rad Hercules,CA),流动相:5mM H2SO4,流速0.6mL/min,柱温35℃,进样体积为10μL。
实施例1:GlcN6P感应元器件的构建
本发明的工作机制:在枯草芽孢杆菌中,6-磷酸氨基葡萄糖(GlcN6P)是重要的代谢调节物。在以葡萄糖为碳源时,其胞内浓度受到由glmS核糖开关介导的反馈调节。而在以氨基葡萄糖(GlcN)或N-乙酰氨基葡萄糖(GlcNAc)为碳源时,GlcN6P又会分别激活与这两种碳源分解代谢相关操纵子的表达,这一过程是通过转录因子GamR或NagR实现的(图1)。其中GamR的调控原理如图1C所示,GamR其可以识别和结合到启动子PgamA上的特异性位点(gamO)从而阻止RNA聚合酶的结合和转录的起始。当胞内的GlcN6P浓度高于其响应阈值时,gamO会与GamR结合并改变其结构从而使其丧失对启动子PgamA的结合能力,转录便可以正常进行(Gaugué,I.,Oberto,J.,Plumbridge,J.,2014.Regulation of amino sugar utilizationin Bacillus subtilis by the GntR family regulators,NagR andGamR.Mol.Microbiol.92,100–115.https://doi.org/10.1111/mmi.12544)。因此,可以用这一调控系统进行改造,并利用其实现对于N-乙酰氨基葡萄糖以及其主要竞争途径的自动调控,从而促进葡萄糖持续高效地流向N-乙酰氨基葡萄糖合成。
本发明构建的GlcN6P感应元器件由转录因子GamR和含有GamR结合位点的启动子组成,含有GamR结合位点的启动子的部分序列如图2A所示。感应元器件受胞内GlcN6P调控的作用机制如图1C所示,当GlcN6P浓度较低时,GamR与包含有其结合位点的启动子发生结合,限制了下游基因的转录;而随着GlcN6P浓度的升高,GamR与启动子的结合也越来越弱,因此下游基因的转录则逐渐增强。
为了构建得到不同强度的响应元件,设计了一系列包含有GamR结合位点的杂合启动子(核苷酸序列如SEQ ID NO.6-SEQ ID NO.19所示),合成后连接到了含有绿色荧光蛋白的载体上。同时将野生型的枯草芽孢杆菌168(BS168)中的gamR基因进行了敲除,得到重组菌株BS01(BS168△gamR),并将包含有上述杂合启动子的质粒分别转化到了BS168以及BS01中,验证GamR结合前后启动子的表达情况。
图2B为在GamR表达或者缺失时不同杂合启动子的强度变化情况,这些启动子中Pvg6、PgamA和Psg2在GamR结合前后表达强度分别有2.4、5.7和11.9倍的变化。为了进一步验证了这三个启动子对于GlcN6P的响应情况,在BS01中又敲除了GlcN6P流入糖酵解途径的相关基因nagB和gamA得到重组菌株BS03(BS168△gamR△nagB△gamA),这样可以通过添加不同浓度的GlcN来控制其胞内GlcN6P的浓度。利用图3A与3B所示的调控结构,分别验证了由GlcN6P响应元器件介导的基因的激活与抑制效应。验证激活作用时,将GamR与含有GamR结合位点的启动子都放置于同一载体上,并利用GFP验证了GlcN添加量对启动子强度的影响,Pvg6、PgamA和Psg2都是随着GlcN的添加量的增加而增强,且当添加量在1g/L时达到最大,超过此浓度时也不再增强,而且这三个启动子的强度大约为1:3:4;在验证抑制作用时,将pLCx-dCas9中阻遏蛋白XylR和木糖启动子分别替换成了gamR和Pvg6、gamR和PgamA、gamR和Psg2,得到载体pLCv-dCas9、pLCg-dCas9和pLCs-dCa9。将三个载体分别使用Eco91I进行线性化后转化BS03,再分别转化Eco31I线性化的GFP特异性sgRNA表达载体psga-GFP(核苷酸序列见SEQID NO.20)和组成型表达的GFP的质粒,得到菌株BS13,BS23和BS33。通过添加GlcN测定荧光蛋白的表达情况,抑制强度同样是随着GlcN添加量的增加而增强,而且三个启动子的弱化作用也是Pvg6<PgamA<Psg2。如图3C所示,最后使用绿色荧光蛋白(GFP)和红色荧光蛋白(mCherry)验证了利用GlcN6P响应元器件同时进行激活和抑制的效果。
实施例2:利用GlcN6P响应元器件调控GlcNAc合成
为了利用构建的GlcN6P响应元器件调控GlcNAc合成,将公开号为CN107699533A的专利申请中构建的重组枯草芽孢杆菌BSGNY-Pveg-glmS-P43-GNA1的gamR基因进行敲除,得到重组菌株BNDR000。将载体pLCg-dCas9(核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示)和paga-zpg(核苷酸序列如专利CN108148797A中的SEQ ID NO.7所示)使用内切酶Eco91I线性化后转化BNDR000得到BNDR020,再将受PgamA调控的GNA1表达载体pSTg-GNA1(核苷酸序列如SEQ IDNO.1所示)转化到BNDR020中后得到重组菌株BNDR022,最后敲除副产物乙偶姻合成的关键基因alsSD得到重组菌株BNDR122。
实施例3:重组枯草芽孢杆菌BNDR122发酵生产乙酰氨基葡萄糖
采用实施例2构建得到的重组芽孢杆菌BNDR022进行摇瓶发酵,以枯草芽孢杆菌BSGNY-Pveg-glmS-P43-GNA1作为对照,在相同条件下培养和发酵。将37℃、220rpm下培养12h的种子以5%的接种量转入发酵培养基,37℃、220rpm条件下培养60h。最终发酵上清液中的GlcNAc含量达到28.0g/L,较出发菌株(BSGNY-Pveg-glmS-P43-GNA1)提高了53.0%;同时本发明提供的重组枯草芽孢杆菌发酵N-乙酰氨基葡萄糖对葡萄糖的得率也由0.244g/g葡萄糖提高到了0.373g/g葡萄糖,但是菌株BNDR还是有10g/L的副产物乙偶姻生成。为了消除乙偶姻的生成,对乙偶姻合成关键基因alsSD进行了敲除,得到重组菌株BNDR122,对该菌株进行了15L发酵罐水平的验证。将37℃、220rpm下培养12h的种子以5%的接种量转入上罐发酵培养基,于15L发酵罐、37℃、pH 7.0条件下培养,通气量为1.5vvm,转速控制在500-900rpm之间维持溶氧在30%以上。初始装液量为7.5L,并持续流加750g/L以控制葡萄糖浓度在1-30g/L之间。最终发酵上清液中乙酰氨基葡萄糖含量达到131.6g/L,为目前发酵生产的最高水平,这为其工业化奠定了基础。
对照例1:使用不同的GlcN6P感应元器件调控GlcNAc合成
本发明的方法中,使用GlcN6P感应元器件对GlcNAc合成的关键基因GNA1进行了强化,并对其主要竞争途径的关键基因zwf、pfkA和glmM进行了弱化(图4A),从而促进了重组枯草芽孢杆菌利用葡萄糖持续高效合成GlcNAc。本发明共得到了三个强度不同的GlcN6P响应启动子Pvg6、PgamA和Psg2,在重组菌株BNDR122中强化与弱化都是使用的三个启动子中强度中等的启动子PgamA进行调控。为了比较不同强度启动子的影响,利用载体pLCs-dCas9(将载体pLCg-dCas9中的PgamA启动子替换为Psg2)和pLCv-dCas9(将载体pLCg-dCas9中的PgamA启动子替换为Pvg6)对Psg2和Pvg6表达的dCas9进行了整合;并转化了利用Psg2和Pvg6调控表达GNA1的载体pSTs-GNA1(将载体pSTg-GNA1中的PgamA启动子替换为Psg2)和pSTv-GNA1(将载体pSTg-GNA1中的PgamA启动子替换为Pvg6)。比较使用不同强度的启动子组合进行强化和弱化的结果如图4B-4E所示,只有强化与弱化都使用中等强度启动子PgamA时,GlcNAc的产量最高,为28.0g/L。
对照例2:乙偶姻合成途径敲除影响
BNDR122与BNDR022相比,没有副产物乙偶姻的积累。为了比较敲除乙偶姻合成关键基因alsSD的影响,对BNDR022和BNDR122在15L发酵罐上进行了补料分批发酵,发酵结果分被如图5和6所示。BNDR022生成的副产物乙偶姻最终可以达到22.9g/L,而GlcNAc产量可以达到96.3g/L;与之相比BNDR122的GlcNAc产量可以达到131.6g/L,而且没有副产物乙偶姻的生成,这不仅为其进一步的发酵生产奠定了基础,同时也更加有利于后续的分离与纯化过程。
虽然本发明已以较佳实施例公开如上,但其并非用以限定本发明,任何熟悉此技术的人,在不脱离本发明的精神和范围内,都可做各种的改动与修饰,因此本发明的保护范围应该以权利要求书所界定的为准。
SEQUENCE LISTING
<110> 江南大学
<120> 一种利用GlcN6P感应元器件促进N-乙酰氨基葡萄糖合成的方法
<160> 20
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 5755
<212> DNA
<213> 人工合成
<400> 1
ttcaccggtc caagaattgg agccaatcaa ttcttgcgga gaactgtgaa tgcgcaaacc 60
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tcgacgctca agtcagaggt ggcgaaaccc gacaggacta taaagatacc aggcgtttcc 240
ccctggaagc tccctcgtgc gctctcctgt tccgaccctg ccgcttaccg gatacctgtc 300
cgcctttctc ccttcgggaa gcgtggcgct ttctcatagc tcacgctgta ggtatctcag 360
ttcggtgtag gtcgttcgct ccaagctggg ctgtgtgcac gaaccccccg ttcagcccga 420
ccgctgcgcc ttatccggta actatcgtct tgagtccaac ccggtaagac acgacttatc 480
gccactggca gcagccactg gtaacaggat tagcagagcg aggtatgtag gcggtgctac 540
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tcttcgccat cataaacatt tttaactgtt aatgtgagaa acaaccaacg aactgttggc 4260
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<213> 人工合成
<400> 2
Met His His His His His His Ser His Ile Phe Asp Ala Ser Val Leu
1 5 10 15
Ala Pro His Ile Pro Ser Asn Leu Pro Asp Asn Phe Lys Val Arg Pro
20 25 30
Leu Ala Lys Asp Asp Phe Ser Lys Gly Tyr Val Asp Leu Leu Ser Gln
35 40 45
Leu Thr Ser Val Gly Asn Leu Asp Gln Glu Ala Phe Glu Lys Arg Phe
50 55 60
Glu Ala Met Arg Thr Ser Val Pro Asn Tyr His Ile Val Val Ile Glu
65 70 75 80
Asp Ser Asn Ser Gln Lys Val Val Ala Ser Ala Ser Leu Val Val Glu
85 90 95
Met Lys Phe Ile His Gly Ala Gly Ser Arg Gly Arg Val Glu Asp Val
100 105 110
Val Val Asp Thr Glu Met Arg Arg Gln Lys Leu Gly Ala Val Leu Leu
115 120 125
Lys Thr Leu Val Ser Leu Gly Lys Ser Leu Gly Val Tyr Lys Ile Ser
130 135 140
Leu Glu Cys Val Pro Glu Leu Leu Pro Phe Tyr Ser Gln Phe Gly Phe
145 150 155 160
Gln Asp Asp Cys Asn Phe Met Thr Gln Arg Phe
165 170
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<212> DNA
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taaatgtaca agtgttggcc aaggaacgtt ttagagctag aaatagcaag ttaaaataag 3120
gctagtccgt tatcaacttg aaaaagtggc accgagtcgg tgcttttttt gaattccgtc 3180
gacatggatg agcgatgatg atatccgttt aggctgggcg gtgatagctt ctcgttcagg 3240
cagtacgcct cttttctttt ccagacctga gggaggcgga aatggtgtga ggttcccggg 3300
gaaaagccaa ataggcgatc gcgggagtgc tttatttgaa gatcaggcta tcactgcggt 3360
caatagattt cacaatgtga tggctggaca gcctgaggaa ctctcgaacc cgaatggaaa 3420
caaccagata tttatgaatc agcgcggctc acatggcgtt gtgctggcaa atgcaggttc 3480
atcctctgtc tctatcaata cggcaacaaa attgcctgat ggcaggtatg acaataaagc 3540
tggagcgggt tcatttcaag tgaacgatgg taaactgaca ggcacgatca atgccaggtc 3600
tgtagctgtg ctttatcctg atgatattgc aaaagcgcct catgttttcc ttgagaatta 3660
caaaacaggt gtaacacatt ctttcaatga tcaactgacg attaccttgc gtgcagatgc 3720
gaatacaaca aaagccgttt atcaaatcaa taatggacca gagacggcgt ttaaggatgg 3780
agatcaattc acaatcggaa aaggagatcc atttggcaaa acatacacca tcatgttaaa 3840
aggaacgaac agtgatggtg taacgaggac cgagaaatac agttttgtta aaagagatcc 3900
agcgtcggcc aaaaccatcg gctatcaaaa tccgaatcat tggagccagg taaatgctta 3960
tatctataaa catgatggga gccgagtaat tgaattgacc ggatcttggc ctggaaaacc 4020
aatgactaaa aatgcagacg gaatttacac gctgacgctg cctgcggaca cggatacaac 4080
caacgcaaaa gtgattttta ataatggcag cgcccaagtg cccggtcaga atcagcctgg 4140
ctttgattac gtgctaaatg gtttatataa tgactcgggc ttaagcggtt ctcttcccca 4200
ttgacccaag cttagatcta ttaccctgtt atccctac 4238

Claims (10)

1.一种促进N-乙酰氨基葡萄糖合成的方法,其特征在于,使用GlcN6P感应元器件控制N-乙酰氨基葡萄糖乙酰化酶GNA1的表达来动态调控N-乙酰氨基葡萄糖合成途径;同时利用GlcN6P感应元器件调控表达的dCas9蛋白和三个分别作用于zwf,pfkA与glmM基因的sgRNA表达片段结合后形成的复合体对糖酵解途径、磷酸戊糖途径和肽聚糖合成途径进行动态弱化;所述GlcN6P感应元器件包含有转录因子GamR以及含GamR结合位点的启动子,所述转录因子GamR含NCBI编号为WP_015382651.1的氨基酸序列的第1-235位,所述启动子是PgamA启动子或者将GamR结合位点添加到组成型启动子上构建的杂合启动子。
2.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述启动子PgamA的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示。
3.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述N-乙酰氨基葡萄糖乙酰化酶GNA1的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示;所述N-乙酰氨基葡萄糖乙酰化酶GNA1以载体pSTg-GNA1为表达载体,所述载体pSTg-GNA1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。
4.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述dCas9蛋白的氨基酸序列如专利CN108148797A中的SEQ ID NO.1所示;所述dCas9蛋白以载体pLCg-dCas9为表达载体进行整合表达,所述载体pLCg-dCas9的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示。
5.如权利要求1所述的方法,其特征在于,所述作用于zwf的sgRNA表达片段的核苷酸序列如专利CN108148797A中的SEQ ID NO.2所示;所述作用于pfkA的sgRNA表达片段的核苷酸序列如专利CN108148797A中的SEQ ID NO.3所示;所述作用于glmM的sgRNA表达片段的核苷酸序列如专利CN108148797A中的SEQ ID NO.4所示;所述sgRNA的表达片段通过转化载体psga-zpg整合到重组枯草芽孢杆菌基因组上,所述载体psga-zpg的核苷酸序列如专利CN108148797A中的SEQ ID NO.7所示。
6.如权利要求1-5任一所述的方法,其特征在于,所述方法还包括同时敲除了副产物乙偶姻合成关键基因alsSD。
7.一种重组枯草芽孢杆菌,其特征在于,所述重组枯草芽孢杆菌使用GlcN6P感应元器件控制N-乙酰氨基葡萄糖乙酰化酶GNA1的表达来动态调控N-乙酰氨基葡萄糖合成途径;同时利用GlcN6P感应元器件调控表达的dCas9蛋白和三个分别作用于zwf,pfkA与glmM基因的sgRNA表达片段结合后形成的复合体对糖酵解途径、磷酸戊糖途径和肽聚糖合成途径进行动态弱化;所述GlcN6P感应元器件包含有转录因子GamR以及含GamR结合位点的启动子,所述转录因子GamR含NCBI编号为WP_015382651.1的氨基酸序列的第1-235位,所述启动子是PgamA启动子或者将GamR结合位点添加到组成型启动子上构建的杂合启动子。
8.如权利要求7所述的重组枯草芽孢杆菌,其特征在于,是以枯草芽孢杆菌BSGNY-Pveg-glmS-P43-GNA1为出发菌株;所述出发菌株以枯草芽孢杆菌168为基础,基因型作如下改造得到的:ΔnagPΔgamPΔgamAΔnagAΔnagBΔldhΔptaΔglcKΔpckAΔpyk::lox72,并以启动子Pveg调控表达来自大肠杆菌的磷酸酶yqaB与枯草芽孢杆菌168自身的glmS、在质粒上以启动子P43调控GNA1的重组表达。
9.一种生产乙酰氨基葡萄糖的方法,其特征在于,所述方法是将权利要求7或8所述的重组枯草芽孢杆菌置于35-39℃、200-220rpm下培养10-15h的种子以1-10%的接种量转入摇瓶发酵培养基,35-39℃、200-220pm条件下培养50-70h;或,所述方法是将权利要求7或8所述的重组枯草芽孢杆菌置于35-39℃、200-220rpm下培养10-15h的种子以1-10%的接种量转入上罐发酵培养基,于装液量为30-50%的发酵罐中,35-39℃、pH 6.5-7.5条件下培养,通气量为1-2vvm,转速控制在500-900rpm之间维持溶氧在30%以上,持续流加750g/L以控制葡萄糖浓度在1-30g/L之间。
10.权利要求7-8任一所述的重组枯草芽孢杆菌或权利要求1-6任一所述的促进N-乙酰氨基葡萄糖合成的方法在食品、制药、营养保健品或者化妆品领域中的应用。
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Cited By (3)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112779278A (zh) * 2021-01-14 2021-05-11 江南大学 6-磷酸氨基葡萄糖生物传感器及其在菌株筛选中的应用
CN114250188A (zh) * 2021-10-29 2022-03-29 北京化工大学 合成n-乙酰氨基葡萄糖的基因工程菌及其应用
CN114540395A (zh) * 2022-01-10 2022-05-27 天津大学(青岛)海洋工程研究院有限公司 希瓦氏菌中木糖利用代谢的构建方法

Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101365785A (zh) * 2002-07-01 2009-02-11 阿基昂生命科学公司,以生物技术资源部的名义经营 用于生产葡糖胺和n-乙酰氨基葡糖的方法和物质
CN104498394A (zh) * 2014-11-27 2015-04-08 江南大学 一种乙酰氨基葡萄糖产量提高的重组枯草芽孢杆菌
CN106479945A (zh) * 2015-12-29 2017-03-08 山东润德生物科技有限公司 一种高效合成乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌
KR20170130293A (ko) * 2016-05-18 2017-11-28 고려대학교 산학협력단 해당과정 플럭스 조절에 의해 n-아세틸글루코사민 생성능이 향상된 변이 미생물
CN107604025A (zh) * 2017-10-12 2018-01-19 江南大学 一种提高重组枯草芽孢杆菌乙酰氨基葡萄糖产量的方法
CN108148797A (zh) * 2018-01-15 2018-06-12 江南大学 一种基于CRISPRi的共利用葡萄糖和木糖生产N-乙酰氨糖的方法

Patent Citations (6)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101365785A (zh) * 2002-07-01 2009-02-11 阿基昂生命科学公司,以生物技术资源部的名义经营 用于生产葡糖胺和n-乙酰氨基葡糖的方法和物质
CN104498394A (zh) * 2014-11-27 2015-04-08 江南大学 一种乙酰氨基葡萄糖产量提高的重组枯草芽孢杆菌
CN106479945A (zh) * 2015-12-29 2017-03-08 山东润德生物科技有限公司 一种高效合成乙酰氨基葡萄糖的重组枯草芽孢杆菌
KR20170130293A (ko) * 2016-05-18 2017-11-28 고려대학교 산학협력단 해당과정 플럭스 조절에 의해 n-아세틸글루코사민 생성능이 향상된 변이 미생물
CN107604025A (zh) * 2017-10-12 2018-01-19 江南大学 一种提高重组枯草芽孢杆菌乙酰氨基葡萄糖产量的方法
CN108148797A (zh) * 2018-01-15 2018-06-12 江南大学 一种基于CRISPRi的共利用葡萄糖和木糖生产N-乙酰氨糖的方法

Non-Patent Citations (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
ISABELLE GAUGUE等: "Regulation of amino sugar utilization in Bacillus subtilis by the GntR family regulators, NagR and GamR", 《MOLECULAR MICROBIOLOGY》 *
马文龙: "中心代谢优化促进枯草芽孢杆菌积累 N-乙酰氨基葡萄糖", 《中国博士学位论文全文数据库 工程科技I辑》 *

Cited By (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN112779278A (zh) * 2021-01-14 2021-05-11 江南大学 6-磷酸氨基葡萄糖生物传感器及其在菌株筛选中的应用
CN114250188A (zh) * 2021-10-29 2022-03-29 北京化工大学 合成n-乙酰氨基葡萄糖的基因工程菌及其应用
CN114250188B (zh) * 2021-10-29 2023-12-15 北京化工大学 合成n-乙酰氨基葡萄糖的基因工程菌及其应用
CN114540395A (zh) * 2022-01-10 2022-05-27 天津大学(青岛)海洋工程研究院有限公司 希瓦氏菌中木糖利用代谢的构建方法

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