CN110551759A - 一种提高转基因细胞重组效率的组合物及方法 - Google Patents

一种提高转基因细胞重组效率的组合物及方法 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种提高转基因细胞重组效率的组合物及方法,通过使用含有SCR7、RS‑1或L755507的培养基处理转基因后的细胞,提高了转基因细胞的HDR效率。本发明的一些实例,通过使用特定的sgRNA组合,获得了更高的转基因效率,解决了二次注射会导致受精卵受损较为严重,出生率会下降比较严重而导致阳性繁殖数量不足的缺陷。

Description

一种提高转基因细胞重组效率的组合物及方法
技术领域
本发明涉及转基因领域,具体涉及一种提高转基因细胞重组效率的组合物及方法。
背景技术
动物模型,特别是转基因鼠模型,是进行各项生命科学研究的一个重要工具,应用范围 广泛。
在众多的转基因动物中,点突变鼠由于其易于培养,成本相对较低,是常见的转基因动 物模型。现有技术制备点突变鼠主要有3种方案:
一是传统ES打靶的方案,其缺点是:(1)需要复杂的打靶载体构建、ES细胞筛选、嵌合体小鼠选育等一系列步骤,不仅流程繁琐、对技术的要求很高,而且费用大、耗时较长,且效率低;(2)不同品系的鼠需要不同的ES细胞,目前ES打靶做得比较多的都是常见的C57BL/6品系,其他的品系没看到有相关的报道。例如,点突变模型主要用于研究人类疾病,其经常需要用到特殊的品系,由于没有相关的ES细胞,所以无法采用ES打靶这项技术进行制备。
二是TALEN方案:其缺点是:(1)设计识别20个碱基序列的TALEN蛋白含有一千多个氨基酸,因而可能会引起机体的免疫反应,这将降低TALEN在细胞中的作用;(2)TALEN也 存在脱靶的问题,这可能由于细胞中染色体的状态引起的,如TALEN技术对于处于异染色 体结构中的基因序列没有效果;(3)TALEN技术是否可以胜任掺入大的片段?目前TALEN技 术的应用主要集中在基因敲除方面,但是否适合大片段的基因插入还需进一步研究。最重要的是,目前较先进的ZFN/TALEN技术基于能特异性识别碱基核苷酸来构建基因打靶载体,但打靶载体的构建非常复杂,制备时间长,产生的细胞毒性大,且都不能真正做到同时完成基因组多位点的敲除。
三是CRISPR/Cas9方案。CRISPR/Cas9的方案包括两种,一种是野生型的hCas9,另一 种是突变型的Cas9_D10A。野生型的hCas9的缺点:(1)容易造成脱靶效应;(2)对于一些重要 基因的重要突变点容易造成致死。突变型的Cas9_D10A的缺点:两种不同的sgRNA对靶位 点两侧序列分别进行识别,然后结合单切口Cas9核酸酶,对两条链分别进行剪切,从而提高 了靶位点识别特异性,减少了脱靶效应,但由于单切口Cas9核酸酶效率比较低,导致Cas9_D10A方案的阳性率比较低。
CRISPR/Cas9技术的基因编辑机制:CRISPR/Cas9通过对预设的DNA位点进行切割,造 成DNA双链断裂(DSB,double strand break)。这种DNA的损伤可以启动细胞内的修复机制, 主要包括两种途径:一是低保真性的非同源末端连接途径(NHEJ,Non-homologous endjoining),此修复机制非常容易发生错误,导致修复后发生碱基的缺失或插入(Indel),从而 造成移码突变,最终达到基因敲除的目的。NHEJ是细胞内主要的DNA断裂损伤修复机制。利用靶向核酸酶可以在受精卵水平高效的实现移码突变,从而制备基因敲除模式动物。CRISPR/Cas9技术的出现,使得无需再使用相应物种的ES细胞系就可以制备基因敲除模式生 物,且已成功应用于小鼠、大鼠、猪、灵长类、果蝇等等。第二种DNA断裂修复途径为同 源介导的修复(HR,homology-directed repair),这种基于同源重组的修复机制保真性高,但是 发生概率低。在提供外源修复模板的情况下,靶向核酸酶对DNA的切割可以将同源重组发 生的概率提高约1000倍。利用这种机制可以实现基因组的精确编辑,如:条件性基因敲除、 基因敲进、基因替换、点突变等等。
Cas9蛋白含有HNH和RuvC两个带核酸酶活性的结构域,切割DNA时,HNH结构域 切割与crRNA向导序列互补的DNA单链,而RuvC结构域则剪切非互补DNA单链,从而形 成双链DNA断点。如果将RuvC结构域中一个天冬氨酸突变为丙氨酸(D10A),则可以使RuvC 结构域失去核酸酶活性,导致突变的Cas9蛋白(Cas9_D10A)只能在双链DNA上产生单链缺 口(nick)。这样,Cas9的内切酶活性就变为Cas9_D10A的切口酶活性(nickase)。为了在DNA 上切割产生双链DNA断点,就需要用Cas9_D10A和一对sgRNA分别在双链DNA的每条单 链上切出单链缺口。而只被一个Cas9_D10A切割产生的单链缺口会被高保真性的碱基切除修 复途径(base excision repair,BER)修复,不会在基因组DNA上造成突变。这时,双链DNA 断点的特异性就由两个sgRNA的识别位点共同决定,即在422×422(3.09×1026)个碱基长度的随机DNA序列中才会发现一个同时被两个Cas9_D10A切割的位点。因此,通过用两个 Cas9_D10A产生两个单链DNA缺口以造成双链DNA断点的策略,可有效地提高CRISPR/Cas 系统的特异性,而且此方法并不降低双链DNA断点产生的效率。
CRISPR/Cas系统操作使用更为方法,效率更高,越来越成为点突变动物的常用方法。
纯合致死的转基因动物,如转基因鼠的构建过程中,一般采用受精卵的条件性点突变的 方案构建的,构建的过程繁琐,构建难度也很高,阳性率很低,而且周期很长。具体的操作 参见Marin T M,Keith K,Davies B,et al.Rapamycin reverses hypertrophiccardiomyopathy in a mouse model of LEOPARD syndrome-associated PTPN11mutation[J].Journal of Clinical Investigation,2011.。
HSP于1876年由seeligmrller首先报道,是一组以双下肢进行性肌张力增高和无力、剪 刀步态为特征的具有明显遗传异质性的综合征。患病率为2/10万-10/10万。迄今,已有七十 多个基因簇和56个致病基因被报道,涉及不同的细胞通路。
为找到遗传性痉挛性截瘫家系的致病基因,第四军医大学博士后杨颖通过联合采用全外 显子组测序和基因芯片的homozygous mapping技术,将候选基因最终锁定到编码线粒体苯丙 氨酰-tRNA合成酶(mtPheRS)的FARS2基因上,且c.424G>T(p.D142Y)变异位点符合遗传共 分离规律。随后探讨了FARS2基因及其c.424G>T(p.D142Y)变异位点的致病性。体外构建了 野生型hmtPheRS和突变型hmtPheRS-D142Y的基因表达载体,纯化了相应的蛋白质,测定 了它们的氨基酸活化和氨基酰化活力。结果表明hmtPheRS-D142Y突变体的两种酶活力都远 低于野生型,故推测c.424G>T(p.D142Y)突变减少了hmtPheRS催化线粒体苯丙氨酰-tRNAPhe 的生成的速度。研究人员在大鼠中枢神经系统的组织上进行了免疫组化实验,结果显示FARS2 在大鼠小脑的Purkinje细胞中高表达。有研究报道Purkinje细胞在神经退行性疾病中起重要 作用,故mtPheRS有可能通过破坏Purkinje细胞的功能进而引起HSP的表型。
综上所述,研究人员推测编码mtPheRS的FARS2基因是HSP的一种新的致病基因,且c.424G>T(p.D142Y)变异位点是一可能的致病突变位点。此研究对于进一步揭示氨基酰-tRNA 合成酶调控神经退行性疾病的机制具有重要意义(参见Yang Y,Liu W,Fang Z,etal.A newly identified missense mutation in FARS2 causes autosomal-recessivespastic paraplegia[J].Human mutation,2016,37(2):165-169.)可见,获得健康的鼠Fars2基因c.424G>T(p.D142Y)鼠模型为 HSP疾病的研究提供一个很好的素材。
发明内容
本发明的目的在于克服现有技术的至少一种不足,提供一种提高转基因细胞重组效率的 组合物及方法。
本发明所采取的技术方案是:
本发明的第一个方面,提供:
一种提高转基因细胞重组效率的组合物,所述组合物为添加有SCR7、RS-1或L755507 的KSOM培养基,其中,SCR7在KSOM培养基中的终浓度为0.5~4.5μM,RS-1在KSOM培养基中的终浓度为3~9μM,L755507在KSOM培养基中的终浓度为2~7μM。
在一些组合物的实例中,SCR7在KSOM培养基中的终浓度为1.5~4.5μM。
本发明的第二个方面,提供:
一种利用CRISPR-Cas9系统制备点突变动物的方法,包括:
1)将Cas9-D10A mRNA和Donor oligo序列的混合物直接注入单细胞受精卵的一细胞的 胞浆内;
2)待受精卵发育成二细胞,把预混好的sgRNA混合物直接注入二细胞中;
3)注射后将二细胞期的受精卵放置在培养基内培养,其中,所述培养基为权利要求1或 2所述的组合物;
4)将培养后的细胞移植到雌体内,产仔后得到点突变动物。
在一些制备点突变动物的实例中,所述的点突变鼠为Fars2基因点突变鼠,突变点为 D142Y,优选为GAC>TAC的单核苷酸突变。
在一些Fars2基因制备点突变鼠的实例中,所述Donor oligo1的序列为 AGTGGTCACCACCTGGCAGAACTTCGATAGCCTGCTAATCCCAGCTGACCACCCCAGCA GGAAGAAGGGGTACAACTATTACTTGAATCGGGGACACATGCTGAGAGCACACACATC AGCACATCAGTGGGACTTGCTGCATG。
在一些制备Fars2基因点突变鼠的实例中,所述sgRNA对的序列为:
sgRNA对1:
Pair1-g1-F:caccgTTGTCCCCCTTCTTCCTGCT
Pair1-g1-R:aaacAGCAGGAAGAAGGGGGACAAc
或sgRNA对2:
Pair1-g2-F:caccgGGACAACTATTACTTGAATC
Pair1-g2-R:aaacGATTCAAGTAATAGTTGTCCc。
在一些制备点突变动物或Fars2基因点突变鼠的实例中,所述Cas9-D10A mRNA和Donor oligo序列的混合物中,Cas9-D10A mRNA和Donor oligo序列的终浓度分别为40ng/μL~120 ng/μL;优选的,Cas9-D10A mRNA和Donor oligo序列的质量比为1:1。
在一些制备点突变动物或Fars2基因点突变鼠的实例中,所述sgRNA混合物中,sgRNA1 和sgRNA2的终浓度分别为20ng/μL~60ng/μL;优选的,sgRNA1和sgRNA2的质量比为1: 1。
在一些制备点突变动物或Fars2基因点突变鼠的实例中,将二细胞期的受精卵放置在培 养基内培养的时间为12~48小时,优选为24小时。
在一些制备点突变动物或Fars2基因点突变鼠的实例中,所述鼠包括大鼠SD、LongEvans、 Wistar、F344;小鼠C57BL/6N、C57BL/6J、FVB。
在一些实例中,所述动物包括鼠、兔、犬、猴、猪。
本发明的有益效果是:
本发明的一些实例,可以有效提高细胞的重组效率。
本发明的一些实例,可以有效提高转基因动物的重组效率。
本发明的一些实例,可以有效构建得到FARS2模型。
本发明的一些实例,通过在受精卵的单细胞期和二细胞期分别进行显微注射,最终得到 的动物只有杂合子和野生型,不会有纯合子,解决了纯合致死的问题。
本发明的一些实例,通过使用特定的sgRNA组合,获得了更高的转基因效率,解决了二 次注射会导致受精卵受损较为严重,出生率会下降比较严重而导致阳性繁殖数量不足的缺陷。
附图说明
图1是Fars2基因打靶的策略图;
图2是含有目的条带的菌落PCR鉴定图,其中,其中,第一排从左至右依次为marker,1-1、 1-2、2-1、2-2、3-1、3-2、4-1、4-2、5-1、5-2、6-1、6-2、7-1、7-2、8-1、8-2;
图3是g1-g8的PCR回收后产物的电泳图,其中,从左至右依次为marker,g1,g2,g3,g4, g5,g6,g7,g8;
图4是g1-g8的转录产物的电泳图,其中,第一排从左至右依次为g1,g2,g3,g4,g5,g6,g7, g8,marker;
图5是g1-g8的回收后产物的电泳图,其中,第一排从左至右依次为g1,g2,g3,g4,g5,g6, g7,g8,marker;
图6是Cas9-D10A mRNA的回收后产物的电泳图,其中,从左至右依次为Cas9-D10AmRNA,marker。
具体实施方式
本发明的第一个方面,提供:
一种提高转基因细胞重组效率的组合物,所述组合物为添加有SCR7、RS-1或L755507 的KSOM培养基,其中,SCR7在KSOM培养基中的终浓度为0.5~4.5μM,RS-1在KSOM培养基中的终浓度为3~9μM,L755507在KSOM培养基中的终浓度为2~7μM。
在一些组合物的实例中,SCR7在KSOM培养基中的终浓度为1.5~4.5μM。
本发明的第二个方面,提供:
一种利用CRISPR-Cas9系统制备点突变动物的方法,包括:
1)将Cas9-D10A mRNA和Donor oligo序列的混合物直接注入单细胞受精卵的一细胞的 胞浆内;
2)待受精卵发育成二细胞,把预混好的sgRNA混合物直接注入二细胞中;
3)注射后将二细胞期的受精卵放置在培养基内培养,其中,所述培养基为权利要求1或 2所述的组合物;
4)将培养后的细胞移植到雌体内,产仔后得到点突变动物。
在一些制备点突变鼠的实例中,所述的点突变鼠为Fars2基因点突变鼠,突变点为D142Y, 优选为GAC>TAC的单核苷酸突变。基因打靶的策略如图1所示。
在一些制备Fars2基因点突变鼠的实例中,所述Donor oligo的序列为 AGTGGTCACCACCTGGCAGAACTTCGATAGCCTGCTAATCCCAGCTGACCACCCCAGCA GGAAGAAGGGGTACAACTATTACTTGAATCGGGGACACATGCTGAGAGCACACACATC AGCACATCAGTGGGACTTGCTGCATG。
在一些制备Fars2基因点突变鼠的实例中,所述sgRNA对的序列为:
sgRNA对1:
Pair1-g1-F:caccgTTGTCCCCCTTCTTCCTGCT
Pair1-g1-R:aaacAGCAGGAAGAAGGGGGACAAc
或sgRNA对2:
Pair1-g2-F:caccgGGACAACTATTACTTGAATC
Pair1-g2-R:aaacGATTCAAGTAATAGTTGTCCc。
在一些制备点突变动物或Fars2基因点突变鼠的实例中,所述Cas9-D10A mRNA和Donor oligo序列的混合物中,Cas9-D10A mRNA和Donor oligo序列的终浓度分别为40ng/μL~120 ng/μL;优选的,Cas9-D10A mRNA和Donor oligo序列的质量比为1:1。
在一些制备点突变动物或Fars2基因点突变鼠的实例中,所述sgRNA混合物中,sgRNA1 和sgRNA2的终浓度分别为20ng/μL~60ng/μL;优选的,sgRNA1和sgRNA2的质量比为1: 1。
在一些制备点突变动物或Fars2基因点突变鼠的实例中,将二细胞期的受精卵放置在培 养基内培养的时间为12~48小时,优选为24小时。
在一些实例中,所述动物包括鼠、兔、犬、猴、猪。
本发明的一些实例,对鼠的品系没有特别的要求,现有的大鼠、小鼠均可以。在一些制 备点突变鼠的实例中,所述鼠包括但不限于大鼠SD、LongEvans、Wistar、F344等品系;小 鼠C57BL/6N、C57BL/6J、FVB等品系。
为了更好地说明本发明所解决的问题、所采用的技术方案和所达到的效果,现结合具体 实施例和相关资料进一步阐述。需要说明的是,本发明内容包含但不限于以下实施例及其组 合实施方式。
本发明实施例中未注明具体技术或条件的,按照本领域内的文献所描述的技术或条件或 者按照产品说明书进行。所用试剂或仪器未注明生产厂商者,均为可以通过市购等途径获得 的常规产品。
实施例1:利用CRISPR-Cas9系统制备Fars2基因点突变大鼠方法
具体操作包括:
1、sgRNA靶点设计
在NCBI的数据库中提取大鼠Fars2基因D142的上游和下游各50bp的序列,如下所示, 设计靶标位点:
ACTTCGATAGCCTGCTAATCCCAGCTGACCACCCCAGCAGGAAGAAGGGGGACAA CTATTACTTGAATCGGGGACACATGCTGAGAGCACACACATCAGCACA(SEQ ID NO.:1)。
满足5'-NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGG-3'共有10个,因为该基因具有纯合致死性,设计gRNA采用特异性更高的突变型Cas9(Cas9_D10A),减少脱靶导致的致死。Cas9_D10A 需要一对头对头的gRNAs才能识别和切割双链DNA,由于突变点为D142Y,如果设计的 gRNA对都不包含D142,重组之后,gRNA还会继续切割,将拿不到特定的阳性,考虑到这 个问题,只能要包含D142的gRNA对,一共有4对,具体序列如下:
pair2-g1:TTGTCCCCCTTCTTCCTGCTGGG(SEQ ID NO.:2)
pair2-g2:GGACAACTATTACTTGAATCGGG(SEQ ID NO.:3)
pair1-g3:GTTGTCCCCCTTCTTCCTGCTGG(SEQ ID NO.:4)
pair1-g4:GGGACAACTATTACTTGAATCGG(SEQ ID NO.:5)
pair3-g5:TGTCCCCCTTCTTCCTGCTGGGG(SEQ ID NO.:6)
pair3-g6:GACAACTATTACTTGAATCGGGG(SEQ ID NO.:7)
pair4-g7:CCCCCTTCTTCCTGCTGGGGTGG(SEQ ID NO.:8)
pair4-g8:GGGACAACTATTACTTGAATCGG(SEQ ID NO.:9)。
2、Donor oligo设计
以Fars2基因的D142为靶点,两端各70bp为同源臂,加粗标记的核苷酸为点突变位点, 设计Donor oligo序列并合成:
Donor oligo 1:
3.构建可表达sgRNA的Cas9-D10A质粒
(1)在金维智生物科技有限公司合成8对特异性的sgRNA靶序列引物。
(2)取g1-g8的上下游引物(100μM)各5μL,Annealing Buffer for DNA Oligos(5X)(碧 云天,货号:D0251)5μL,补水至255μL,混匀,PCR仪中37℃30min;95℃5min;0.1℃/s 降温至25℃退火成双链,分别插入经Bsal酶切好的PX335-Bsal载体中(来自addgene,Plasmid #42335,PX335对应的是突变型的CAS9蛋白Cas9_D10A,对比野生型的hCas9,突变型的 Cas9_D10A具有更高的特异性,减少脱靶的可能,减少脱靶到其他重要基因导致致死的可能, 提供存活率),转化,LB固体培养基涂板。37℃过夜培养,之后做菌落PCR鉴定(图2), 将验证正确的克隆菌液,放入LB液体培养基过夜扩大培养,提取过夜培养的菌液质粒,质 粒DNA测出浓度均大于为100ng/μL,经测序验证(金维智生物科技有限公司)插入片段大小正确,将正确的g1-g8质粒DNA用作扩增模板。
4.体外转录
(1)通过PCR扩增得到带有T7启动子序列的g1-g8,图3为g1-g8的PCR回收后产物的电泳图。用MEGAshortscriptTM Kit(Thermo,货号:AM1354)试剂盒体外转录g1-g19,图4为g1-g8的转录产物的电泳图。用MEGAclearTM Kit(Thermo,货号:AM1908)试剂盒回收g1-g19 的转录产物,图5为g1-g8的回收后产物的电泳图。
(2)转录Cas9-D10A载体。使用MEGAshortscriptTM Kit(Thermo,货号:AM1354)试剂盒,将PX335-T7载体经NotI线性化后,在体外转录成Cas9-D10A mRNA。用MEGAclearTM Kit(Thermo,货号:AM1908)试剂盒回收Cas9-D10A mRNA的转录产物,图6为Cas9-D10A mRNA的回收后产物的电泳图。
5.在斑马鱼体内验证以上4对gRNA的切割活性
(1)扩增包含gRNA的大鼠基因DNA片段1(DNA1)
Rat Fars2-DNA1-F:CTTGTGTGCTCTTTCCAGAGTTTGTG(SEQ ID NO.:11)
Rat Fars2-DNA1-R:CCATTTGCACAAATCCCTCACATAC(SEQ ID NO.:12)
产物长度:833bp
退火温度:60℃
(2)将构建出的Cas9-D10A mRNA,大鼠基因DNA片段1,Pair1-g1和Pair1-g2为一组,Cas9-D10A mRNA,大鼠基因DNA片段1,Pair2-g3和Pair2-g4为一组,Cas9-D10A mRNA,大鼠基因DNA片段1,Pair3-g5和Pair3-g6为一组,Cas9-D10A mRNA,大鼠基因DNA片 段1,Pair4-g7和Pair4-g8为一组,共注射4组,分别显微注射到40枚斑马鱼受精卵中检测 g1-g8活性,(其中用量分别为cas9-D10A mRNA:100ng/μL,Pair1-g1:50ng/μL,Pair1-g2: 50ng/μL,包含所有gRNA的DNA片段1:100ng/μL)。
4组取分别取20个斑马鱼胚胎进行PCR鉴定,测序验证突变情况(金维智生物科技有限 公司),结果鱼卵中突变率如下表,结果显示Pair1(g1+g2)活性较高。
验证gRNA活性的PCR引物如下:
Rat Fars2-SPF1:GTTTGCTGTCCAAGGTGCTCCAG(SEQ ID NO.:13)
Rat Fars2-SPR1:AGTCTTATTACAGCAACACAAATGCCCTT(SEQ ID NO.:14)
产物长度:550bp
退火温度:60℃
表1、gRNA引物对1~4的活性比较
名称 注射组分 胚胎数量 突变数量 突变率
Pair1 g1+g2+DNA1+Cas9-D10A 20 7 35%
Pair2 g3+g4+DNA1+Cas9-D10A 20 4 20%
Pair3 g5+g6+DNA1+Cas9-D10A 20 3 15%
Pair4 g7+g8+DNA1+Cas9-D10A 20 3 15%
突变位点附近的序列如下:
g1(gRNA1,斜体标记部分)+g2(gRNA2,下划线标记部分)这两个gRNA的PAM序 列距离点突变的位置(斜体+下划线+加粗标记的序列)是比较近的,而且在体内验证切割效 率是最高的,gRNA的切割位点是在PAM(小写标记部分)的倒数第三或第四位,点突变距 离gRNA的切割位点越近,重组效果越好。
6、原核注射及胚胎移植
1)选3-4周龄发育良好的雌鼠(优选SD系大鼠),腹腔注射孕马血清促性腺激素(PMSG)20IU,48小时后注射人绒毛促性腺激素(hCG)30IU;一般会优选用3到4周,体重 约为80g的雌鼠作为超排鼠。
2)经过步骤1)的激素超排处理后的(优选SD系大鼠)雌鼠,与公鼠(优选SD系大鼠)按1:1合笼,次日清晨挑选检栓成功的雌鼠,从检栓成功的雌鼠得到单细胞受精卵;
3)选8周龄以上的正常SD雌鼠与输精管结扎过的SD公鼠按1:1合笼,次日选取检栓成功的雌鼠,即为假孕SD雌鼠;
4)将预混好的Cas9-D10A mRNA,Donor oligo 1的混合物利用显微注射方法直接注入单 细胞受精卵的一细胞的胞浆内,通过调节半定量仪的注射时间和注射压力来调整合适的注射 量,以溶液明显流入胞浆而不至于导致细胞死亡为止其中,Cas9-D10A mRNA,Donor oligo 1 的终浓度为50ng/μL,50ng/μL;等受精卵发育成二细胞,把经验证切割效率较高的sgRNA1 和sgRNA2的混合物利用显微注射方法直接注入二细胞中,其中,sgRNA1和sgRNA2的终 浓度均是25ng/μL;注射后将受精卵放置在添加有不同添加物的KSOM培养基内培养24h左 右,以提高Donor oligo同源重组的效率,同时设置一组将受精卵放置没有添加物的KSOM 培养基内培养24h左右作为对照组,移植到假孕SD雌鼠的输卵管内,待产仔后,用PCR方 法鉴定阳性大鼠。
7、基因打靶大鼠的鉴定
A:待仔鼠长至1周龄剪取2mm左右鼠尾,蛋白酶K,55℃消化后酚仿抽提提取鼠尾基因组。以鼠尾基因组为模板,分别设计针对Fars2点突变位置的引物,序列如下,进行PCR 扩增,对获得的PCR产物进行测序,如测序结果打靶位点附近出现双峰的情况,则可能为打 靶成功,则继续进一步鉴定。
针对Fars2点突变位置的引物:
Rat Fars2-SPF1:GTTTGCTGTCCAAGGTGCTCCAG
Rat Fars2-SPR1:AGTCTTATTACAGCAACACAAATGCCCTT
产物长度:550bp
退火温度:60℃
B:选择双峰的样品再次PCR,产物胶回收后TA克隆至T载体中,转化后挑取阳性克隆再次进行测序,如测序结果为D142Y(GAC>TAC),则代表Fars2点突变大鼠构建成功。
实验结果:
根据上述实验操作,分别计算不同添加物对HDR(同源定向修复)效率,结果如表2所 示:
表2、不同添加物对SD系大鼠HDR效率的影响
由上表可以看出,SCR7在KSOM培养基中的终浓度为1.5~4.5μM时同源重组效率最高,RS-1在KSOM培养基中的终浓度为3~9μM时同源重组效率最高,L755507在KSOM 培养基中的终浓度为2~7μM时同源重组效率最高。从添加物的提高同源重组的效率来看: Scr7>RS-1>L755507,其中Scr7的效果最优,最优的使用终浓度为1.5~4.5μM。
参照上述原核注射及胚胎移植的操作,分别使用不同品系的鼠受精卵进行转基因操作, 结果如下表所示:
表3、不同品系鼠对HDR效率的影响
从表3中的数据可以看出,本发明的方法对鼠的品系无要求,不同品系的鼠,其HDR效 率没有显著区别,说明其具有很好的通用性。
SEQUENCE LISTING
<110> 赛业(广州)生物科技有限公司
<120> 一种提高转基因细胞重组效率的组合物及方法
<130>
<160> 15
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 103
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 1
acttcgatag cctgctaatc ccagctgacc accccagcag gaagaagggg gacaactatt 60
acttgaatcg gggacacatg ctgagagcac acacatcagc aca 103
<210> 2
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 2
ttgtccccct tcttcctgct ggg 23
<210> 3
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
ggacaactat tacttgaatc ggg 23
<210> 4
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
gttgtccccc ttcttcctgc tgg 23
<210> 5
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 5
gggacaacta ttacttgaat cgg 23
<210> 6
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 6
tgtccccctt cttcctgctg ggg 23
<210> 7
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 7
gacaactatt acttgaatcg ggg 23
<210> 8
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 8
cccccttctt cctgctgggg tgg 23
<210> 9
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 9
gggacaacta ttacttgaat cgg 23
<210> 10
<211> 143
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 10
agtggtcacc acctggcaga acttcgatag cctgctaatc ccagctgacc accccagcag 60
gaagaagggg tacaactatt acttgaatcg gggacacatg ctgagagcac acacatcagc 120
acatcagtgg gacttgctgc atg 143
<210> 11
<211> 26
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 11
cttgtgtgct ctttccagag tttgtg 26
<210> 12
<211> 25
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 12
ccatttgcac aaatccctca catac 25
<210> 13
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 13
gtttgctgtc caaggtgctc cag 23
<210> 14
<211> 29
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 14
agtcttatta cagcaacaca aatgccctt 29
<210> 15
<211> 103
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 15
acttcgatag cctgctaatc ccagctgacc accccagcag gaagaagggg gacaactatt 60
acttgaatcg gggacacatg ctgagagcac acacatcagc aca 103

Claims (10)

1.一种提高转基因细胞重组效率的组合物,其特征在于:所述组合物为添加有SCR7、RS-1或L755507的KSOM培养基,其中,SCR7在KSOM培养基中的终浓度为0.5~4.5μM,RS-1在KSOM培养基中的终浓度为3~9μM,L755507在KSOM培养基中的终浓度为2~7μM。
2.根据权利要求1所述的组合物,其特征在于:SCR7在KSOM培养基中的终浓度为1.5~4.5μM。
3.一种利用CRISPR-Cas9系统制备点突变动物的方法,包括:
1)将Cas9-D10A mRNA和Donor oligo序列的混合物直接注入单细胞受精卵的一细胞的胞浆内;
2)待受精卵发育成二细胞,把预混好的sgRNA混合物直接注入二细胞中;
3)注射后将二细胞期的受精卵放置在培养基内培养,其中,所述培养基为权利要求1或2所述的组合物;
4)将培养后的细胞移植到雌体内,产仔后得到点突变动物。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:所述的点突变动物为Fars2基因点突变鼠,突变点为D142Y,优选为GAC>TAC的单核苷酸突变;优选的,所述Donor oligo的序列为AGTGGTCACCACCTGGCAGAACTTCGATAGCCTGCTAATCCCAGCTGACCACCCCAGCAGGAAGAAGGGGTACAACTATTACTTGAATCGGGGACACATGCTGAGAGCACACACATCAGCACATCAGTGGGACTTGCTGCATG。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于:所述sgRNA对的序列为:
sgRNA对1:
Pair1-g1-F:caccgTTGTCCCCCTTCTTCCTGCT
Pair1-g1-R:aaacAGCAGGAAGAAGGGGGACAAc
或sgRNA对2:
Pair1-g2-F:caccgGGACAACTATTACTTGAATC
Pair1-g2-R:aaacGATTCAAGTAATAGTTGTCCc。
6.根据权利要求4或5所述的方法,其特征在于:所述Cas9-D10A mRNA和Donor oligo序列的混合物中,Cas9-D10A mRNA和Donor oligo序列的终浓度分别为40ng/μL~120ng/μL;优选的,Cas9-D10A mRNA和Donor oligo序列的质量比为1:1。
7.根据权利要求3~5任一项所述的方法,其特征在于:所述sgRNA混合物中,sgRNA1和sgRNA2的终浓度分别为20ng/μL~60ng/μL;优选的,sgRNA1和sgRNA2的质量比为1:1。
8.根据权利要求3~5任一项所述的方法,其特征在于:将二细胞期的受精卵放置在培养基内培养的时间为12~48小时,优选为24小时。
9.根据权利要求3~5任一项所述的方法,其特征在于:所述动物包括大鼠SD、LongEvans、Wistar、F344;小鼠C57BL/6N、C57BL/6J、FVB。
10.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:所述动物包括鼠、兔、犬、猴、猪。
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