CN109468392B - 橘臀纹粉蚧的实时荧光pcr检测方法及检测用引物和探针 - Google Patents

橘臀纹粉蚧的实时荧光pcr检测方法及检测用引物和探针 Download PDF

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Abstract

本发明公开了一种橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法及检测用引物和探针,根据橘臀纹粉蚧的mtDNA中部分基因的序列设计特异性引物PCF3/PCR3和探针PC‑MGB,建立了橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法,以达到快速准确检测鉴定橘臀纹粉蚧,并用于准确区分橘臀纹粉蚧与大洋臀纹粉蚧的目的。

Description

橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法及检测用引物和探针
技术领域
本发明涉及农林业和植物检疫技术领域,具体涉及一种橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法;此外,本发明还涉及检测橘臀纹粉蚧的引物和探针。
背景技术
橘臀纹粉蚧Planococcus citris(Risso)又名橘粉蚧、柑橘臀纹粉蚧,隶属于同翅目(Homoptera)粉蚧科(Pseudococcidae)臀纹粉蚧属(Planococcus),是热带、亚热带观赏性植物、水果的主要害虫,其主要为害寄主植物的茎、叶片、花果等幼嫩部位,轻者叶片变黄,重者干枯脱落,使植株发育不良,严重影响水果的经济价值和观赏性植物的品相。同时,橘臀纹粉蚧与另一种重要的检疫性粉蚧大洋臀纹粉蚧P. minor (Maskell)形态相近,且常在一种寄主上混合发生,极易混淆,区分两者难度较大,因此建立快速准确鉴定橘臀纹粉蚧方法十分必要。
《GB/T 35340-2017 大洋臀纹粉蚧和柑橘臀纹粉蚧检疫鉴定方法》中列出了区分大洋臀纹粉蚧和橘臀纹粉蚧的传统形态学鉴定方法,传统形态学鉴定方法需2—3天,鉴定时间长;传统形态学检测方法需要先制作玻片,观察形态学特征才能鉴定,并且鉴定者需要一定鉴定经验,存在人工误差,影响鉴定准确率。
中国专利申请CN2011100500314公开了南洋臀纹粉蚧的实时荧光PCR引物、探针及检测方法,其检测目标是南洋臀纹粉蚧,与本发明的检测目标橘臀纹粉蚧种类不同,且设计的引物和探针、PCR反应体系和反应条件均不同。南洋臀纹粉蚧与橘臀纹粉蚧在外部形态上有区别,因此容易区分。
本发明橘臀纹粉蚧与大洋臀纹粉蚧不仅在外部形态上近似,两者在分子水平上的差异也较小,这对橘臀纹粉蚧实时荧光特异性Taqman探针的设计造成一定难度,是本领域的技术难题。因此,本领域亟需解决这一技术难题。
发明内容
本发明要解决的技术问题是提供一种橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法;为此,本发明还提供用于上述方法的检测引物和探针。利用橘臀纹粉蚧检测引物及探针可以快速、准确地对橘臀纹粉蚧进行检测鉴定。
本发明根据橘臀纹粉蚧的mtDNA中部分基因的序列设计特异性引物和探针,建立了橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR 检测方法,以达到快速准确检测鉴定橘臀纹粉蚧的目的。
在本发明的一方面,提供一种橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法,包括如下步骤:
(1) 设计引物和探针;
该引物的序列为:
上游引物PCF3:5’- GATTTTGATTATTAATTCCATCAC -3’ , 如SEQ ID NO:6所示序列或其互补链;
下游引物PCR3:5’- TTGGATTACCATTTCCTAATGG -3’ , 如SEQ ID NO:9所示序列或其互补链;
该探针的序列为:
橘臀纹粉蚧探针PC-MGB:5’- TTGAACACTTTACCCTCCTTTA-3’, 如SEQ ID NO:10所示序列或其互补链;荧光基团连接在探针的5’末端,淬灭基团连接在3’末端;
(2) 提取橘臀纹粉蚧DNA;
(3) 采用步骤(1)设计的引物和探针进行实时荧光PCR检测,用以区分橘臀纹粉蚧与大洋臀纹粉蚧。
作为本发明优选的技术方案,步骤(2)具体为:取橘臀纹粉蚧单头虫样放入研钵,加液氮磨成粉末状,用试剂盒提取样品DNA。
作为本发明优选的技术方案,步骤(3)中,所述实时荧光PCR检测的反应体系为25μL,包括2×Premix Ex Taq12.5μL,50×ROX Reference Dye0.5μL,步骤(1)设计的上下游引物PCF3/ PCR3(5μmol/L)各1.0μL,PC-MGB探针1.0μL(5μmol/L),DNA模板2.0μL,超纯水补至25μL。
作为本发明优选的技术方案,步骤(3)中,所述实时荧光PCR检测的反应程序为:预变性95℃ 30sec;然后95℃ 5sec,60℃ 30sec 循环40 次。
在本发明的另一方面,提供一种用于检测橘臀纹粉蚧的引物,其序列为:
上游引物PCF3:5’- GATTTTGATTATTAATTCCATCAC -3’ , 如SEQ ID NO:6所示序列或其互补链;
下游引物PCR3:5’- TTGGATTACCATTTCCTAATGG -3’ , 如SEQ ID NO:6所示序列或其互补链。
在本发明的另一方面,提供一种用于检测橘臀纹粉蚧的探针,其序列为:PC-MGB:5’- TTGAACACTTTACCCTCCTTTA-3’, 如SEQ ID NO:10所示序列或其互补链;荧光基团连接在探针的5’末端,淬灭基团连接在3’末端。
上述实时荧光PCR检测方法采用TaqMan探针。TaqMan荧光探针是一种寡核苷酸探针,荧光基团连接在探针的5’末端,而淬灭剂则在3’末端。PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,Taq酶的5'-3'外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。常用的荧光基团是FAM,TET,VIC,HEX。
与现有技术相比,本发明的有益效果在于:
1、检测时间大大缩短,可以在6个小时内完成检测,传统的形态学鉴定方法需2—3天;《GB/T 35340-2017 大洋臀纹粉蚧和柑橘臀纹粉蚧检疫鉴定方法》中列出了区分大洋臀纹粉蚧和橘臀纹粉蚧的形态学鉴定方法,相较于GB/T 35340-2017,本发明检测方法检测时间大大缩短,可以在6个小时内完成检测。
2、对橘臀纹粉蚧的鉴定准确率增大,传统的形态学鉴定方法需要先制作玻片,观察形态学特征才能鉴定,并且鉴定者需要一定鉴定经验,存在人工误差,影响鉴定准确率。本发明检测方法则大大提高了对橘臀纹粉蚧的鉴定准确率。
3、橘臀纹粉蚧与大洋臀纹粉蚧不仅在外部形态上近似,两者在分子水平上的差异也较小,这对橘臀纹粉蚧实时荧光特异性Taqman探针的设计造成一定难度,部分探针会有假阳性扩增(见实施例1)。不同引物的选择对同一探针的扩增效率有所影响,部分引物的扩增效率较低,部分会有假阳性扩增,因此本实验在最终确定方法时,选择了其中扩增效率较高,同时重复性好的PCF3/ PCR3作为扩增引物。其特异性有引物和探针双重保证,为橘臀纹粉蚧的鉴定提供了一种新方法,检测准确度高,分析简单快捷,可用于基层实验室橘臀纹粉蚧快速鉴定(见实施例2)。经过实施例2的对比实验,筛选到PCF3/ PCR3及探针PC-MGB可以检测到橘臀纹粉蚧,可以作为橘臀纹粉蚧实时荧光检测用引物和探针。经实验验证,橘臀纹粉蚧特异性引物PCF3/ PCR3和探针PC-MGB具有特异性好、灵敏度高的特点,检测的最低DNA浓度可达pg级水平,和套式PCR的灵敏度相当,达到了预料不到的技术效果(见实施例3)。
附图说明
图1是本发明实施例1中引物citri -F / citri -R和探针citri -P在橘臀纹粉蚧的mtDNA上的位置示意图;
图2 是本发明实施例1中应用引物citri -F / citri -R和探针citri -P对不同来源的9个臀纹粉蚧属样品实时荧光PCR扩增的结果示意图;
图3 是本发明实施例2中引物PCF1、PCF2、PCF3、PCR1、PCR2、PCR3和探针PC-MGB在橘臀纹粉蚧的mtDNA上的位置示意图;
图4 是本发明实施例2中应用不同引物和探针PC-MGB对CS-1a样品实时荧光PCR扩增的结果示意图;
图5是本发明实施例2中应用引物PCF3/ PCR1和探针PC-MGB对3个臀纹粉蚧属样品实时荧光PCR扩增的结果示意图;
图6 是本发明实施例2中应用引物PCF3/ PCR2和探针PC-MGB对3个臀纹粉蚧属样品实时荧光PCR扩增的结果示意图;
图7 是本发明实施例2中应用引物PCF3/ PCR3和探针PC-MGB对3个臀纹粉蚧属样品实时荧光PCR扩增的结果示意图;
图8是本发明实施例3中的引物PCF3/ PCR3和探针PC-MGB在橘臀纹粉蚧的mtDNA上的位置示意图;
图9 是本发明实施例3中应用本发明的引物PCF3/ PCR3和探针PC-MGB对不同来源的9个臀纹粉蚧属样品实时荧光PCR扩增的结果示意图;
图10 是本发明实施例3中不同稀释浓度的橘臀纹粉蚧样品实时荧光PCR扩增的结果示意图。
具体实施方式
下面结合附图和实施例对本发明作进一步详细的说明。应理解,这些实施例仅用于说明本发明而不用于限制本发明的范围。下列实施例中未注明具体条件的实验方法,通常按常规条件,例如Sambrook等人,分子克隆:实验室手册(New York: Cold SpringHarbor Laboratory Press, 1989)中所述条件,或按制造厂商所建议的条件。
实施例1
1.设计引物和探针
根据橘臀纹粉蚧的mtDNA(线粒体DNA)中部分基因的序列设计如下引物citri -F/ citri -R和探针citri -P(引物和探针由上海基康公司合成):
上游引物citri -F:5’- TCCCCGATTAAATAATTTTAGATTTTG -3’, 如SEQ ID NO:1所示;
下游引物citri -R:5’- GATCTAAAAATAGAAGAAATTCCATTTAAATG -3’,如SEQ IDNO:2所示序列;
探针citri -P:5’- TTGAACACTTTACCCTCCTTTA-3’, 如SEQ ID NO:3所示序列;
上述引物及探针的检测原理如图1所示。探针citri -P是一种寡核苷酸探针,荧光基团连接在探针的5’末端,而淬灭剂则在3’末端。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,引物citri -F / citri -R与橘臀纹粉蚧mtDNA完成高温变性、低温复性延伸的热循环,并遵守聚合酶链反应规律,同时加入的探针citri -P与橘臀纹粉蚧mtDNA互补,在低温复性延伸阶段,反应体系中的Taq酶的5'-3'外切酶活性将探针citri-P酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。
2、提取橘臀纹粉蚧DNA
取橘臀纹粉蚧单头虫样(样品来源见表1)放入研钵,加液氮磨成粉末状,用DNeasy®Blood&Tissue Kit(Qiagen公司)提取样品DNA。
供试样品材料包括上海辰山植物园(简称SCSBG)、云南西双版纳热带植物园(简称XTBG)兰花上采集的橘臀纹粉蚧,以及上海海关(简称SHCC)截获标本。外群应用大洋臀纹粉蚧(P. minor)、南洋臀纹粉蚧(P. lilacinus),为上海海关截获标本。
表1 样品具体信息
Figure DEST_PATH_IMAGE002
3、实时荧光PCR检测
实时荧光PCR 扩增体系25μL(大连宝生物公司TaKaRa Premix Ex TaqTM): 2×Premix Ex Taq12.5μL,50×ROX Reference Dye0.5μL,上下游引物citri -F / citri -R(5μmol/L)各1.0μL,citri -P探针(5μmol/L)1.0μL,DNA模板2.0μL,超纯水补至25μL。实时荧光PCR 扩增在7500 Real-Time PCR System 定量PCR 扩增仪上进行。打开“7500 FastSystem Software”,设置PCR反应条件,两步法扩增反应程序:预变性95℃ 30sec;然后95℃5sec,60℃ 30sec 循环40 次。点击运行,进行PCR反应,1h左右反应结束,保存文件,打开分析软件。
经PCR扩增,橘臀纹粉蚧特异性引物citri -F / citri -R和探针citri -P对供试的21个橘臀纹粉蚧样品(样品号见表1)均出现荧光增长曲线,有强的荧光信号增加,表现为阳性扩增,但供试的6个(样品号见表1)的大洋臀纹粉蚧、南洋臀纹粉蚧样品也有阳性扩增,且TH-1a及TH-3a呈强阳性扩增,空白对照则没有检测到荧光信号,表现为阴性,部分样品扩增曲线参照图2。由图2表明引物citri -F / citri -R和探针citri -P可以检测橘臀纹粉蚧,但对近似种检测会出现假阳性扩增,不能作为橘臀纹粉蚧实时荧光检测用引物和探针。
实施例2 引物筛选
1. 设计引物和探针
根据橘臀纹粉蚧的mtDNA(线粒体DNA)中部分基因的序列设计如下特异性引物PCF1、PCF2、PCF3/PCR1、PCR2、PCR3和探针PC-MGB(本发明所公开的引物及探针,引物和探针由上海基康公司合成):
上游引物
PCF1:5’- CTATACCTATCATTATTGGAAG -3’,如SEQ ID NO:4所示序列;
PCF2:5’- CATCAGATTTAATTTTTCCCCG -3’ ,如SEQ ID NO:5所示序列;
PCF3:5’- GATTTTGATTATTAATTCCATCAC -3’ ,如SEQ ID NO:6所示序列;
下游引物
PCR1:5’- GCTCTTGATAAAATTGGAATAG -3’ ,如SEQ ID NO:7所示序列;
PCR2:5’- GTAATTGCTCTTGATAAAATTGG -3’ ,如SEQ ID NO:8所示序列;
PCR3:5’- TTGGATTACCATTTCCTAATGG -3’ ,如SEQ ID NO:9所示序列;
橘臀纹粉蚧探针PC-MGB:5’- TTGAACACTTTACCCTCCTTTA-3’,如SEQ ID NO:10所示序列;
上述引物及探针的检测原理如图3所示。探针PC-MGB是一种寡核苷酸探针,荧光基团连接在探针的5’末端,而淬灭剂则在3’末端。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,引物与橘臀纹粉蚧mtDNA完成高温变性、低温复性延伸的热循环,并遵守聚合酶链反应规律,同时加入的探针PC-MGB与橘臀纹粉蚧mtDNA互补,在低温复性延伸阶段,反应体系中的Taq酶的5'-3'外切酶活性将探针PC-MGB酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。
2、提取橘臀纹粉蚧DNA
同实施例1。
3、引物筛选
将上述6条引物依次进行组合,以CS-1a为DNA模板,应用探针PC-MGB进行实时荧光PCR检测,通过比较扩增效率筛选最优引物。实时荧光PCR 扩增体系及反应条件同实施例1。
经实时荧光PCR扩增,引物PCF3/PCR1、PCF3/PCR2、PCF3/ PCR3扩增效率较高(如图4所示)。
分别应用引物PCF3/PCR1、PCF3/PCR2、PCF3/ PCR3及探针PC-MGB,对CS-1a、VN-1a、TH-1a进行实时荧光PCR扩增,结果显示:
①应用引物PCF3/PCR1、PCF3/PCR2及探针PC-MGB对橘臀纹粉蚧CS-1a、VN-1a有阳性扩增,对近似种大洋臀纹粉蚧TH-1a也有阳性扩增,空白对照则没有检测到荧光信号,表现为阴性,扩增曲线参照图5、图6。由此表明引物PCF3/PCR1、PCF3/PCR2及探针PC-MGB可以检测到橘臀纹粉蚧,但对近似种检测会出现假阳性扩增,引物PCF3/PCR1、PCF3/PCR2不能作为橘臀纹粉蚧实时荧光检测用引物。
②应用引物PCF3/ PCR3及探针PC-MGB对CS-1a、VN-1a有阳性扩增,对近似种TH-1a、空白对照则没有检测到荧光信号,表现为阴性,扩增曲线参照图7。由此表明PCF3/ PCR3及探针PC-MGB可以检测到橘臀纹粉蚧,可以作为橘臀纹粉蚧实时荧光检测用引物和探针。
实施例3 橘臀纹粉蚧特异性引物PCF3/ PCR3和探针PC-MGB的验证与检测灵敏度测试
根据橘臀纹粉蚧的mtDNA(线粒体DNA)中部分基因的序列设计如下特异性引物PCF3/ PCR3和探针PC-MGB(本发明所公开的引物及探针,引物和探针由上海基康公司合成):
上游引物
PCF3:5’- GATTTTGATTATTAATTCCATCAC -3’ ,如SEQ ID NO:6所示序列;
下游引物
PCR3:5’- TTGGATTACCATTTCCTAATGG -3’,如SEQ ID NO:9所示序列;
橘臀纹粉蚧探针PC-MGB:5’- TTGAACACTTTACCCTCCTTTA-3’,如SEQ ID NO:10所示序列;
上述引物及探针的检测原理如图8所示。探针PC-MGB是一种寡核苷酸探针,荧光基团连接在探针的5’末端,而淬灭剂则在3’末端。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;PCR扩增时,引物PCF3/ PCR3与橘臀纹粉蚧mtDNA完成高温变性、低温复性延伸的热循环,并遵守聚合酶链反应规律,同时加入的探针PC-MGB与橘臀纹粉蚧mtDNA互补,在低温复性延伸阶段,反应体系中的Taq酶的5'-3'外切酶活性将探针PC-MGB酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,即每扩增一条DNA链,就有一个荧光分子形成,实现了荧光信号的累积与PCR产物形成完全同步。
2、提取橘臀纹粉蚧DNA
同实施例1。
3、橘臀纹粉蚧特异性引物PCF3/ PCR3和探针PC-MGB的验证与检测灵敏度测试
经PCR扩增,橘臀纹粉蚧特异性引物PCF3/ PCR3和探针PC-MGB对供试的21个橘臀纹粉蚧样品(样品号见表1)均出现荧光增长曲线,有强的荧光信号增加,表现为阳性扩增,而供试的6个(样品号见表1)大洋臀纹粉蚧、南洋臀纹粉蚧样品和空白对照则没有检测到荧光信号,表现为阴性,部分样品扩增曲线参照图9。由此表明此次实时荧光PCR检测到的是橘臀纹粉蚧,表明引物PCF3/ PCR3和探针PC-MGB可以特异性检测橘臀纹粉蚧。
将CS-1a样品DNA进行10倍梯度稀释,进行检测限位测试。经实时荧光PCR测定(反应体系和反应条件与试验样品相同),荧光信号曲线如图10所示,Ct值分别为1号17.68、2号19.95、3号23.90、4号26.92、5号30.62、6号34.53、7号39.48。由于7号的Ct值在>35,无法确定是否为阳性。所以,橘臀纹粉蚧特异性探针PC-MGB的检测限位CS-1aDNA浓度7.78mg/μL×10-5,即7.78×10-2ng/μL。
由上述3个实施例可以看出,橘臀纹粉蚧与大洋臀纹粉蚧不仅在外部形态上近似,两者在分子水平上的差异也较小,这对橘臀纹粉蚧实时荧光特异性Taqman探针的设计造成一定难度,部分探针会有假阳性扩增(见实施例1)。不同引物的选择对同一探针的扩增效率有所影响,部分引物的扩增效率较低,部分会有假阳性扩增,因此本实验在最终确定方法时,选择了其中扩增效率较高,同时重复性好的PCF3/ PCR3作为扩增引物。其特异性有引物和探针双重保证,为橘臀纹粉蚧的鉴定提供了一种新方法,检测准确度高,分析简单快捷,可用于基层实验室橘臀纹粉蚧快速鉴定(实施例2)。经过实施例2的对比实验,筛选到PCF3/PCR3及探针PC-MGB可以检测到橘臀纹粉蚧,可以作为橘臀纹粉蚧实时荧光检测用引物和探针。
橘臀纹粉蚧特异性引物PCF3/ PCR3和探针PC-MGB具有特异性好、灵敏度高的特点,检测的最低DNA浓度可达pg级水平,和套式PCR的灵敏度相当,达到了预料不到的技术效果(见实施例3)。
序列表
<110> 上海出入境检验检疫局动植物与食品检验检疫技术中心
<120> 橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法及检测用引物和探针
<130> WH-NP-18-100110
<160> 10
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 27
<212> DNA
<213> 人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223> 引物
<400> 1
tccccgatta aataatttta gattttg 27
<210> 2
<211> 32
<212> DNA
<213> 人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223> 引物
<400> 2
gatctaaaaa tagaagaaat tccatttaaa tg 32
<210> 3
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(未知)
<400> 3
ttgaacactt taccctcctt ta 22
<210> 4
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223> 引物
<400> 4
ctatacctat cattattgga ag 22
<210> 5
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223> 引物
<400> 5
catcagattt aatttttccc cg 22
<210> 6
<211> 24
<212> DNA
<213> 人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223> 引物
<400> 6
gattttgatt attaattcca tcac 24
<210> 7
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223> 引物
<400> 7
gctcttgata aaattggaat ag 22
<210> 8
<211> 23
<212> DNA
<213> 人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223> 引物
<400> 8
gtaattgctc ttgataaaat tgg 23
<210> 9
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(未知)
<220>
<221> misc_feature
<223> 引物
<400> 9
ttggattacc atttcctaat gg 22
<210> 10
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列(未知)
<400> 10
ttgaacactt taccctcctt ta 22

Claims (5)

1.一种橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1) 设计引物和探针;
该引物的序列为:
上游引物PCF3为如SEQ ID NO:6所示序列:
5’- GATTTTGATTATTAATTCCATCAC -3’;
下游引物PCR3为如SEQ ID NO:9所示序列:
5’- TTGGATTACCATTTCCTAATGG -3’;
该探针的序列为:
橘臀纹粉蚧探针PC-MGB为如SEQ ID NO:10所示序列:
5’- TTGAACACTTTACCCTCCTTTA-3’;荧光基团连接在探针的5’末端,淬灭基团连接在3’末端;
(2) 提取橘臀纹粉蚧DNA;
(3) 采用步骤(1)设计的引物和探针进行实时荧光PCR检测,用以区分橘臀纹粉蚧与大洋臀纹粉蚧。
2.如权利要求1所述的橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法,其特征在于,步骤(2)具体为:取橘臀纹粉蚧单头虫样放入研钵,加液氮磨成粉末状,用试剂盒提取样品DNA。
3.如权利要求1所述的橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法,其特征在于,步骤(3)中,所述实时荧光PCR检测的反应体系为25μL,包括2×Premix Ex Taq12.5μL,50×ROXReference Dye0.5μL,步骤(1)设计的上下游引物PCF3和PCR3各1.0μL,浓度为5μmol/L,PC-MGB探针1.0μL,浓度为5μmol/L,DNA模板2.0μL,超纯水补至25μL。
4.如权利要求1或3所述的橘臀纹粉蚧的实时荧光PCR检测方法,其特征在于,步骤(3)中,所述实时荧光PCR检测的反应程序为:预变性95℃ 30sec;然后95℃ 5sec,60℃ 30sec循环40 次。
5.一种用于实时荧光PCR检测橘臀纹粉蚧的引物和探针组,其特征在于,所述引物序列为:
上游引物PCF3为如SEQ ID NO:6所示序列:
5’- GATTTTGATTATTAATTCCATCAC -3’;
下游引物PCR3为如SEQ ID NO:9所示序列:
5’- TTGGATTACCATTTCCTAATGG -3’;
所述探针序列为:
PC-MGB为如SEQ ID NO:10所示序列:
5’- TTGAACACTTTACCCTCCTTTA-3’;荧光基团连接在探针的5’末端,淬灭基团连接在3’末端。
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