CN106460063A - 用于白菜种质资源多样性分析及分子育种的snp组合及其应用 - Google Patents

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Abstract

本发明公开了一种用于白菜遗传多样性分析及分子育种的SNP组合及其应用。本发明所提供的应用具体为571个SNP位点或用于检测所述571个SNP位点的物质在如下任一中的应用：(1)构建白菜DNA指纹数据库；(2)白菜种质资源遗传多样性分析和/或进化分析；(3)白菜分子育种；所述571个SNP位点的物理位置是基于白菜品种Chiifu‑402‑2的全基因组序列比对确定的，所述白菜品种Chiifu‑402‑2的全基因组序列的版本号为V1.5；所述571个SNP位点是BrSNPA01001‑BrSNPA10043。实验证明，这571个SNP位点能够应用于白菜遗传多样性分析、进化分析；同时这571个SNP位点还可用于白菜分子育种，为其提供重要的技术支撑。

Description

用于白菜种质资源多样性分析及分子育种的SNP组合及其 应用
技术领域
本发明属于分子生物学领域，涉及一种用于白菜种质资源多样性分析及分子育种的SNP组合及其应用。
背景技术
我国是世界蔬菜生产和消费第一大国，而白菜(Brassica rapaL.ssp.Pekinensis)是我国栽培面积最大的蔬菜作物，在菜篮子工程中的作用举足轻重。同时，由于白菜为杂交作物，其重组率高、遗传多样性丰富、以及较好的基因组学研究基础而成为遗传学研究的模式植物。我国是世界上白菜类作物种质资源最丰富的国家，除了常见的普通结球和不结球白菜外，还有京水菜、苔菜、菜薹、芜菁和油用白菜等多种类型，广泛分布于我国各个地区。这些类型与普通结球/不结球白菜相比，在形态上有明显的差异，但其食用和商品价值却非常高，是重要的育种材料。
实践表明，多种多样的种质资源是作物育种的物质基础。然而在现代白菜育种取得显著成就的同时，其种质资源有遗传基础日益贫乏的趋势，原因有：1.人们总是按照一定目标、沿着一定方向进行选择，选择时间越长、强度越大，品种的遗传基础就越窄。2.杂交育种中使用的亲本，越来越集中到综合性状最好、配合力最佳的少数几个材料上，这样就导致众多品种之间的亲缘相近。3.新品种的不断育成和推广，使原有老品种特别是地方品种逐渐被淘汰，但却未作为种质保存下来，致使许多有益的基因随之丢失。由于以上原因，使得对现有种质资源的保存、评价和分类的重要性愈益突出。预期在未来农业中，作物种质资源的丰富程度和有关研究工作的深入程度将决定作物育种的优势。
杂交种是目前白菜类作物的主导育种方式，正确选择亲本并予以合理组配是育种成败的关键。此外，通过杂交、回交导入外源遗传物质，是扩大遗传变异的重要途径。但上述过程都有一个共同问题亟待解决：无论是杂交还是回交，双亲或供体亲本中既有对作物改良有利的基因，也存在着大量的对作物改良不利的基因，这就需要一种准确有效的识别方法对获得的新种质进行背景选择，以确保尽可能地获取那些带有外源有益基因而整体背景又和目标亲本类似的新种质。
以前对白菜种质资源的评价和分类主要依赖于形态特征和RFLP、RAPD、AFLP和SSR等分子标记技术，这些技术的相互结合促进了我国对白菜类种质资源的评价与利用。但这些传统分子标记密度低，尤其不能实现对样品的高通量检测，大大限制了其在资源多样性分析方面的应用。实践证明SNP分子标记是检测种质资源遗传多样性和进行背景选择的有效工具，与其他类型分子标记相比，其具有数量多、全基因组覆盖、可实现高通量检测和操作周期短等显著优势。此外，其遗传稳定性要比SSR等遗传标记高得多，遗传分析或基因诊断时的重现性、准确性都优于其它标记。研究表明，SNP标记已经大规模应用于种质资源遗传多样性的评价及分类、种质筛选、品种认证和分子育种等多个领域。基于KASP(竞争性等位基因特异性PCR)的SNPline基因分型检测是英国LGC(Laboratory of the GovernmentChemist)有限公司开发的高通量SNP分型技术，其具有准确、灵活、低成本、高通量的特点，目前已经成为国际上SNP分析的主流方法之一。
发明内容
本发明的目的是提供一种用于白菜遗传多样性分析及分子育种的SNP组合、引物组合及其在育种中的应用。
本发明所提供的应用具体为571个SNP位点或用于检测所述571个SNP位点的物质在如下任一中的应用：
(1)白菜种质资源遗传多样性分析和/或进化分析；
(2)白菜分子育种；
(3)构建白菜DNA指纹数据库；
(4)对白菜进行基因分型；
(5)检测任两个白菜品种的相似性。
所述571个SNP位点的物理位置是基于白菜品种Chiifu-402-2的全基因组序列比对确定的，所述白菜品种Chiifu-402-2的全基因组序列的版本号为V1.5(下载地址http：//brassicadb.org/brad)；所述571个SNP位点是BrSNPA01001-BrSNPA10043(具体见实施例1)。
其中，所述“用于检测所述571个SNP位点的物质”可为任何能够检测所述571个SNP位点的基因型的试剂、仪器、设备等。在本发明中，所述“用于检测所述571个SNP位点的物质”具体为用于检测所述571个SNP位点的571组引物，每组引物用于检测所述571个SNP位点中的一种，所述571组引物中的每组引物由分别记为上游引物1和上游引物2的两条上游引物和一条下游引物组成；所述上游引物1的结构组成自5’端至3’端依次为：通用序列1、基因组特异序列、所述SNP位点处两种核苷酸中的一种；所述上游引物2的结构组成自5’端至3’端依次为：通用序列2、基因组特异序列、所述SNP位点处两种核苷酸中的另一种；所述下游引物仅由基因组特异序列组成。
进一步，在所述571组引物中，所有的所述上游引物中的基因组特异序列为将序列表中所有的序列X去除第1-21位后所得的1142个序列；所有的所述下游引物的核苷酸序列为序列表中所有的序列Y；其中，X为3N-2或3N-1，Y为3N，N为大于等于1且小于等于571的整数。即：序列表中共1142个序列n(n为1-1713中不是3的倍数的正整数，如1、2、4、5、7、8、......1711、1712)均去除第1-21位后所得的1142个序列为所有所述上游引物中的基因组特异序列；序列表中共571个序列m(m为1-1713中为3的倍数的正整数，如3、6、9、......、1713)为所有所述下游引物。
更进一步，所述通用序列1的核苷酸序列如序列表中序列1的第1-21所示；所述通用序列2的核苷酸序列如序列表中序列2的第1-22所示。
更加具体的，在本发明中，所述571组引物由序列表中序列1-序列1713所示的1713条单链DNA组成。
其中，序列1-3所示的3个引物用于检测SNP位点BrSNPA01001(实施例1中571个SNP位点中的第1个)；序列4-6所示的3个引物用于检测SNP位点BrSNPA01002(实施例1中571个SNP位点中的第2个)；序列7-9所示的3个引物用于检测SNP位点BrSNPA01003(实施例1中571个SNP位点中的第3个)；......，以此类推，......，序列1711-1713所示的3个引物用于检测SNP位点BrSNPA10043(实施例1中571个SNP位点中的第571个)。
对于如上所述(3)的应用而言，在白菜新品种选育过程中，通常将具有优良性状的自交系材料(供体)和综合性状较好的轮回亲本(受体)进行多代的回交，从而获得整体性状与轮回亲本相似，但增加了从供体转来的有利性状的后代。利用所述571个SNP位点可对回交育种过程中的中间材料进行背景选择，以达到快速获得整合了目标性状新品系的目的。
本发明还提供了一种构建白菜DNA指纹数据库的方法。
本发明所提供的构建白菜DNA指纹数据库的方法，具体可包括如下步骤：
(a1)分别提取用于构建白菜DNA指纹数据库的所有白菜品种的基因组DNA；
(a2)检测所述所有白菜品种的基因组DNA中所述571个SNP位点的基因型，所得基因型数据即构成白菜DNA指纹数据库。
在所述方法的步骤(a2)中，具体是采用如上所述的“用于检测所述571个SNP位点的物质”检测所述所有白菜品种的基因组DNA中所述571个SNP位点的基因型的。
本发明还提供了一种对白菜种质资源进行类群划分的方法。
本发明所提供的对白菜种质资源进行类群划分的方法，具体可包括如下步骤：
(b1)分别提取待进行类群划分的所有白菜品种的基因组DNA；
(b2)检测所有所述白菜品种的基因组DNA中所述571个SNP位点的基因型，根据所得基因型数据，建立聚类树状图，从而将所述所有白菜品种划分为不同类群。
在所述方法的步骤(b2)中，具体是采用如上所述的“用于检测所述571个SNP位点的物质”检测所述所有白菜品种的基因组DNA中所述571个SNP位点的基因型的。
在步骤(b2)中，所述“根据所得基因型数据，建立聚类树状图(如UPGMA法聚类树状图)”具体为：根据所得基因型数据，利用Power-Marker ver.3.25软件，选用Rogers 1972遗传距离计算法，分析建立UPGMA法聚类树状图。
在实际应用中，可以根据利用本发明所提供的方法构建的白菜DNA指纹数据库和/或建立的白菜种质资源的聚类树状图确定待测白菜品种是否是新的种质材料。
本发明还提供了一种白菜分子育种方法。
本发明所提供的白菜分子育种方法，具体可包括如下步骤：将携带有目标性状的白菜供体亲本与白菜受体亲本(具有较好的综合性状)杂交，再将所得杂交后代与所述白菜供体亲本进行若干次回交，分别检测所述白菜受体亲本以及所得的携带有所述目标性状的回交后代基因组DNA中所述571个SNP位点的基因型，根据检测结果从携带有所述目标性状的所述回交后代中选择所述571个SNP位点的基因型与所述白菜受体亲本一致性最高的个体。
本发明还提供了一种用于检测所述571个SNP位点的基因型的产品。
本发明所提供的用于检测所述571个SNP位点的基因型的产品，含有用于检测所述571个SNP位点的如上所述的571组引物。
所述产品在检测或辅助检测白菜基因组DNA中所述571个SNP位点的基因型中的应用也属于本发明的保护范围。
在本发明中，所述白菜可为结球白菜Brassica rapa ssp.Pekinensis、不结球白菜Brassica rapa ssp.Chinensis、油用白菜Brassica rapa ssp.oleifera(O)和芜菁Brassica rapa ssp.rapifera(R)；具体可选自如下表1所示品种中的全部或部分。
本研究利用白菜重测序数据挖掘的SNP位点，基于KASP技术，在国际上首次开发了全基因组覆盖、高密度、重复率高、扩增稳定的571对引物。利用该引物组合可快速实现对已有种质资源遗传多样性的鉴定及个体精确分类；同时，通过遗传分析和种群划分预测杂种优势，这使得我们在杂交育种亲本选配过程中，避开亲缘关系较近的亲本从而提高后代获得杂交优势的概率。此外，随着我国白菜育种工作的快速发展，每年新推出的品种数以百计，我们迫切需要开发新一代的SNP分子标记技术，制定相应的品种审定和资源评价标准来为知识产权的保护提供强大的技术支持。利用本研究开发的标记，可在分子水平上鉴定品种纯度和真伪，具有准确可靠、成本低、高通量等突出优点；同时，由于开发了全基因组覆盖的高密度SNP分子标记，与以往几个或几十个标记的鉴定结果相比，其鉴定准确度显著提高。
附图说明
图1为571个SNP位点在检测的255份白菜材料(表1)中有良好的多态性。其中，A为平均多态信息含量(PIC)；B为最小等位基因频率MAF；C为杂合度(Ho)；D为平均遗传多样性(GeneDiversity)。
图2为基于实施例3获得的255份白菜样品(表1)571个SNP位点的基因型数据对255份白菜样品进行类群划分。
图3为255份白菜材料(表1)的群体结构分析。其中，A为利用GGT2.0软件对测试样品进行基因分型；B为利用Power Marker和MEGA6.0对该测试样品进行聚类；C为相关测试样品照片。图中，303#表示“珍绿6号”；32#表示“胶二叶”。
具体实施方式
以下的实施例便于更好地理解本发明，但并不限定本发明。下述实施例中的实验方法，如无特殊说明，均为常规方法。下述实施例中所用的试验材料，如无特殊说明，均为自常规生化试剂商店购买得到的。
下述实施例中涉及的255份白菜种质样品如表1所示。
表1 255份白菜种质样品信息
注：表中绝大多数白菜为市面常售品种。
实施例1、用于白菜遗传多样性分析、进化分析及分子育种的571个SNP位点的获得
基于遗传背景具有广泛代表性的255份白菜种质样品(表1)重测序数据，对每个位点根据以下特征进行筛选评估：(a)，基因组均匀分布；(b)，SNP等位位点纯合程度＞95％；(c)，最小等位基因频率在0.1-0.5之间；(d)，重测序深度＞5×。最终得到用于白菜DNA指纹数据库构建、品种真实性检测、遗传资源分析及分子育种的571个SNP位点。
检测结果显示，选择的571个SNP位点在检测的255份白菜材料(表1)中有良好的多态性：(1)平均多态信息含量(PIC)为0.35；(2)MAF＞0.1的比例为99.1％；(3)杂合度＞0.1的比例为10％；(4)平均遗传多样性为0.35。详见图1。
这571个SNP位点的物理位置是基于白菜高代自交系Chiifu-401-42的全基因组序列比对确定的；
所述白菜品种Chiifu-401-42全基因组序列的版本号为V1.5；
所述571个SNP位点具体如下BrSNPA01001-BrSNPA10043：
BrSNPA01001位于A01号染色体上第612144位，其碱基为T或A；
BrSNPA01002位于A01号染色体上第1059908位，其碱基为T或C；
BrSNPA01004位于A01号染色体上第1385646位，其碱基为T或A；
BrSNPA01005位于A01号染色体上第1795429位，其碱基为T或C；
BrSNPA01006位于A01号染色体上第2112068位，其碱基为A或T；
BrSNPA01007位于A01号染色体上第2437505位，其碱基为G或A；
BrSNPA01008位于A01号染色体上第2830301位，其碱基为G或A；
BrSNPA01009位于A01号染色体上第2969334位，其碱基为G或A；
BrSNPA01010位于A01号染色体上第2970196位，其碱基为T或C；
BrSNPA01011位于A01号染色体上第3520140位，其碱基为T或C；
BrSNPA01012位于A01号染色体上第4182701位，其碱基为T或C；
BrSNPA01013位于A01号染色体上第4219165位，其碱基为C或A；
BrSNPA01014位于A01号染色体上第4225329位，其碱基为T或G；
BrSNPA01015位于A01号染色体上第4878177位，其碱基为T或C；
BrSNPA01016位于A01号染色体上第5849627位，其碱基为T或G；
BrSNPA01017位于A01号染色体上第6000315位，其碱基为C或G；
BrSNPA01018位于A01号染色体上第6385755位，其碱基为T或C；
BrSNPA01019位于A01号染色体上第7102966位，其碱基为T或A；
BrSNPA01020位于A01号染色体上第7105232位，其碱基为G或A；
BrSNPA01021位于A01号染色体上第7567812位，其碱基为T或C；
BrSNPA01022位于A01号染色体上第8475689位，其碱基为C或T；
BrSNPA01023位于A01号染色体上第9716212位，其碱基为G或C；
BrSNPA01024位于A01号染色体上第9865712位，其碱基为T或A；
BrSNPA01025位于A01号染色体上第10433882位，其碱基为A或G；
BrSNPA01026位于A01号染色体上第10454017位，其碱基为T或C；
BrSNPA01027位于A01号染色体上第11039761位，其碱基为T或C；
BrSNPA01028位于A01号染色体上第11576989位，其碱基为G或A；
BrSNPA01029位于A01号染色体上第12681321位，其碱基为T或G；
BrSNPA01030位于A01号染色体上第12708200位，其碱基为T或C；
BrSNPA01031位于A01号染色体上第12834470位，其碱基为G或C；
BrSNPA01032位于A01号染色体上第13128980位，其碱基为T或C；
BrSNPA01033位于A01号染色体上第14048162位，其碱基为T或C；
BrSNPA01034位于A01号染色体上第14897192位，其碱基为C或T；
BrSNPA01035位于A01号染色体上第15956879位，其碱基为T或C；
BrSNPA01036位于A01号染色体上第16592150位，其碱基为G或C；
BrSNPA01037位于A01号染色体上第17311260位，其碱基为T或C；
BrSNPA01038位于A01号染色体上第18199499位，其碱基为T或C；
BrSNPA01039位于A01号染色体上第18291203位，其碱基为T或C；
BrSNPA01040位于A01号染色体上第18635734位，其碱基为G或A；
BrSNPA01041位于A01号染色体上第18650317位，其碱基为G或A；
BrSNPA01042位于A01号染色体上第18657425位，其碱基为T或C；
BrSNPA01043位于A01号染色体上第18964955位，其碱基为G或C；
BrSNPA01044位于A01号染色体上第20057539位，其碱基为G或A；
BrSNPA01045位于A01号染色体上第21096109位，其碱基为C或A；
BrSNPA01046位于A01号染色体上第21986324位，其碱基为G或A；
BrSNPA01047位于A01号染色体上第22365926位，其碱基为G或C；
BrSNPA01048位于A01号染色体上第22417219位，其碱基为G或A；
BrSNPA01049位于A01号染色体上第22449302位，其碱基为G或A；
BrSNPA01050位于A01号染色体上第22523311位，其碱基为C或T；
BrSNPA01051位于A01号染色体上第22600539位，其碱基为T或C；
BrSNPA01052位于A01号染色体上第22695943位，其碱基为C或A；
BrSNPA01053位于A01号染色体上第24361302位，其碱基为T或C；
BrSNPA01054位于A01号染色体上第24456539位，其碱基为G或T；
BrSNPA01055位于A01号染色体上第24937773位，其碱基为G或A；
BrSNPA01056位于A01号染色体上第25108874位，其碱基为T或C；
BrSNPA01057位于A01号染色体上第26035077位，其碱基为T或A；
BrSNPA01058位于A01号染色体上第26549708位，其碱基为C或T；
BrSNPA01059位于A01号染色体上第26752589位，其碱基为G或A；
BrSNPA02001位于A02号染色体上第356794位，其碱基为C或T；
BrSNPA02002位于A02号染色体上第751652位，其碱基为G或A；
BrSNPA02003位于A02号染色体上第884677位，其碱基为T或A；
BrSNPA02004位于A02号染色体上第1026373位，其碱基为T或C；
BrSNPA02005位于A02号染色体上第1065889位，其碱基为T或A；
BrSNPA02006位于A02号染色体上第1142477位，其碱基为T或C；
BrSNPA02007位于A02号染色体上第2421548位，其碱基为A或C；
BrSNPA02008位于A02号染色体上第2663267位，其碱基为T或C；
BrSNPA02009位于A02号染色体上第2865799位，其碱基为T或C；
BrSNPA02010位于A02号染色体上第3245711位，其碱基为C或A；
BrSNPA02011位于A02号染色体上第3685320位，其碱基为G或A；
BrSNPA02012位于A02号染色体上第3812885位，其碱基为T或G；
BrSNPA02013位于A02号染色体上第4523362位，其碱基为T或A；
BrSNPA02014位于A02号染色体上第5184035位，其碱基为T或C；
BrSNPA02015位于A02号染色体上第6035955位，其碱基为T或G；
BrSNPA02016位于A02号染色体上第6431221位，其碱基为A或C；
BrSNPA02017位于A02号染色体上第6709555位，其碱基为C或A；
BrSNPA02018位于A02号染色体上第6957629位，其碱基为G或A；
BrSNPA02019位于A02号染色体上第8447338位，其碱基为T或C；
BrSNPA02020位于A02号染色体上第9141887位，其碱基为G或C；
BrSNPA02021位于A02号染色体上第9423555位，其碱基为T或C；
BrSNPA02022位于A02号染色体上第9490758位，其碱基为G或A；
BrSNPA02023位于A02号染色体上第11160802位，其碱基为C或A；
BrSNPA02024位于A02号染色体上第11181828位，其碱基为T或A；
BrSNPA02025位于A02号染色体上第11698932位，其碱基为T或A；
BrSNPA02026位于A02号染色体上第11780457位，其碱基为T或A；
BrSNPA02027位于A02号染色体上第13059562位，其碱基为G或A；
BrSNPA02028位于A02号染色体上第13619247位，其碱基为G或C；
BrSNPA02029位于A02号染色体上第14369430位，其碱基为T或A；
BrSNPA02030位于A02号染色体上第14606869位，其碱基为T或C；
BrSNPA02031位于A02号染色体上第14862673位，其碱基为T或C；
BrSNPA02032位于A02号染色体上第15736514位，其碱基为G或A；
BrSNPA02033位于A02号染色体上第16465013位，其碱基为G或C；
BrSNPA02034位于A02号染色体上第17440083位，其碱基为T或C；
BrSNPA02035位于A02号染色体上第17778839位，其碱基为G或A；
BrSNPA02036位于A02号染色体上第17828400位，其碱基为T或C；
BrSNPA02037位于A02号染色体上第17930830位，其碱基为T或C；
BrSNPA02038位于A02号染色体上第17961160位，其碱基为G或A；
BrSNPA02039位于A02号染色体上第18267114位，其碱基为T或C；
BrSNPA02040位于A02号染色体上第18364714位，其碱基为G或A；
BrSNPA02041位于A02号染色体上第18365894位，其碱基为T或G；
BrSNPA02042位于A02号染色体上第18425637位，其碱基为G或C；
BrSNPA02043位于A02号染色体上第19966721位，其碱基为T或A；
BrSNPA02044位于A02号染色体上第21426261位，其碱基为G或A；
BrSNPA02045位于A02号染色体上第21512340位，其碱基为G或A；
BrSNPA02046位于A02号染色体上第21970335位，其碱基为C或T；
BrSNPA02047位于A02号染色体上第22610904位，其碱基为T或C；
BrSNPA02048位于A02号染色体上第22844235位，其碱基为T或G；
BrSNPA02049位于A02号染色体上第22844925位，其碱基为G或A；
BrSNPA02050位于A02号染色体上第23028483位，其碱基为G或A；
BrSNPA02051位于A02号染色体上第23096858位，其碱基为T或C；
BrSNPA02052位于A02号染色体上第23174443位，其碱基为C或A；
BrSNPA02053位于A02号染色体上第23181920位，其碱基为G或C；
BrSNPA02054位于A02号染色体上第23632523位，其碱基为G或A；
BrSNPA02055位于A02号染色体上第24627499位，其碱基为A或G；
BrSNPA02056位于A02号染色体上第24987897位，其碱基为C或T；
BrSNPA02057位于A02号染色体上第25360564位，其碱基为C或A；
BrSNPA02058位于A02号染色体上第25748039位，其碱基为G或A；
BrSNPA02059位于A02号染色体上第26812976位，其碱基为G或C；
BrSNPA03001位于A03号染色体上第128271位，其碱基为C或A；
BrSNPA03002位于A03号染色体上第1038560位，其碱基为T或A；
BrSNPA03003位于A03号染色体上第1113130位，其碱基为T或C；
BrSNPA03004位于A03号染色体上第1964460位，其碱基为G或A；
BrSNPA03005位于A03号染色体上第2531794位，其碱基为T或C；
BrSNPA03006位于A03号染色体上第2904270位，其碱基为T或G；
BrSNPA03007位于A03号染色体上第3151130位，其碱基为G或A；
BrSNPA03008位于A03号染色体上第3151142位，其碱基为T或C；
BrSNPA03009位于A03号染色体上第3230367位，其碱基为T或C；
BrSNPA03010位于A03号染色体上第3596283位，其碱基为C或G；
BrSNPA03011位于A03号染色体上第3671765位，其碱基为T或C；
BrSNPA03012位于A03号染色体上第4366708位，其碱基为C或A；
BrSNPA03013位于A03号染色体上第4417310位，其碱基为T或G；
BrSNPA03014位于A03号染色体上第4471683位，其碱基为G或A；
BrSNPA03015位于A03号染色体上第5211812位，其碱基为A或T；
BrSNPA03016位于A03号染色体上第5450320位，其碱基为C或A；
BrSNPA03017位于A03号染色体上第6359471位，其碱基为G或A；
BrSNPA03018位于A03号染色体上第7120485位，其碱基为T或C；
BrSNPA03019位于A03号染色体上第7461075位，其碱基为G或C；
BrSNPA03020位于A03号染色体上第7482663位，其碱基为T或C；
BrSNPA03021位于A03号染色体上第7645227位，其碱基为T或C；
BrSNPA03022位于A03号染色体上第7828461位，其碱基为G或A；
BrSNPA03023位于A03号染色体上第7962179位，其碱基为G或A；
BrSNPA03024位于A03号染色体上第8473550位，其碱基为G或A；
BrSNPA03025位于A03号染色体上第8903849位，其碱基为T或A；
BrSNPA03026位于A03号染色体上第8939875位，其碱基为T或C；
BrSNPA03027位于A03号染色体上第9140011位，其碱基为G或A；
BrSNPA03028位于A03号染色体上第9143142位，其碱基为C或A；
BrSNPA03029位于A03号染色体上第10375219位，其碱基为T或G；
BrSNPA03030位于A03号染色体上第10697749位，其碱基为A或G；
BrSNPA03031位于A03号染色体上第10918916位，其碱基为T或G；
BrSNPA03032位于A03号染色体上第11197981位，其碱基为G或C；
BrSNPA03033位于A03号染色体上第11383704位，其碱基为T或C；
BrSNPA03034位于A03号染色体上第11557175位，其碱基为C或T；
BrSNPA03035位于A03号染色体上第11754718位，其碱基为G或A；
BrSNPA03036位于A03号染色体上第12070633位，其碱基为G或A；
BrSNPA03037位于A03号染色体上第12523505位，其碱基为G或C；
BrSNPA03038位于A03号染色体上第12806173位，其碱基为T或A；
BrSNPA03039位于A03号染色体上第13392725位，其碱基为G或A；
BrSNPA03040位于A03号染色体上第14206073位，其碱基为C或T；
BrSNPA03041位于A03号染色体上第14660690位，其碱基为G或A；
BrSNPA03042位于A03号染色体上第14844334位，其碱基为G或C；
BrSNPA03043位于A03号染色体上第15312198位，其碱基为T或G；
BrSNPA03044位于A03号染色体上第15431305位，其碱基为G或C；
BrSNPA03045位于A03号染色体上第16097389位，其碱基为G或A；
BrSNPA03046位于A03号染色体上第16144120位，其碱基为G或C；
BrSNPA03047位于A03号染色体上第17940082位，其碱基为T或G；
BrSNPA03048位于A03号染色体上第18277222位，其碱基为T或A；
BrSNPA03049位于A03号染色体上第19649018位，其碱基为A或G；
BrSNPA03050位于A03号染色体上第19734725位，其碱基为T或A；
BrSNPA03051位于A03号染色体上第19973528位，其碱基为T或C；
BrSNPA03052位于A03号染色体上第20233641位，其碱基为T或G；
BrSNPA03053位于A03号染色体上第20593495位，其碱基为A或T；
BrSNPA03054位于A03号染色体上第21003111位，其碱基为G或C；
BrSNPA03055位于A03号染色体上第21624403位，其碱基为T或G；
BrSNPA03056位于A03号染色体上第22632354位，其碱基为G或A；
BrSNPA03057位于A03号染色体上第23328550位，其碱基为C或A；
BrSNPA03058位于A03号染色体上第23335563位，其碱基为T或C；
BrSNPA03059位于A03号染色体上第23890389位，其碱基为A或G；
BrSNPA03060位于A03号染色体上第24086704位，其碱基为G或A；
BrSNPA03061位于A03号染色体上第24127049位，其碱基为T或A；
BrSNPA03062位于A03号染色体上第24352728位，其碱基为T或A；
BrSNPA03063位于A03号染色体上第25697075位，其碱基为T或A；
BrSNPA03064位于A03号染色体上第26316567位，其碱基为T或G；
BrSNPA03065位于A03号染色体上第26753682位，其碱基为G或A；
BrSNPA03066位于A03号染色体上第27196183位，其碱基为T或G；
BrSNPA03067位于A03号染色体上第27211545位，其碱基为C或A；
BrSNPA03068位于A03号染色体上第27471408位，其碱基为T或G；
BrSNPA03069位于A03号染色体上第28161015位，其碱基为G或C；
BrSNPA03070位于A03号染色体上第28193409位，其碱基为G或C；
BrSNPA03071位于A03号染色体上第28321741位，其碱基为G或A；
BrSNPA03072位于A03号染色体上第28629888位，其碱基为T或G；
BrSNPA03073位于A03号染色体上第28687095位，其碱基为G或A；
BrSNPA03074位于A03号染色体上第29060156位，其碱基为G或A；
BrSNPA03075位于A03号染色体上第29070757位，其碱基为C或A；
BrSNPA03076位于A03号染色体上第29086065位，其碱基为G或C；
BrSNPA03077位于A03号染色体上第30080620位，其碱基为T或C；
BrSNPA03078位于A03号染色体上第30648246位，其碱基为A或C；
BrSNPA04001位于A04号染色体上第556322位，其碱基为G或A；
BrSNPA04002位于A04号染色体上第898850位，其碱基为T或G；
BrSNPA04003位于A04号染色体上第1223515位，其碱基为G或A；
BrSNPA04004位于A04号染色体上第1378190位，其碱基为G或A；
BrSNPA04005位于A04号染色体上第1580901位，其碱基为T或C；
BrSNPA04006位于A04号染色体上第1661398位，其碱基为G或A；
BrSNPA04007位于A04号染色体上第1743434位，其碱基为G或A；
BrSNPA04008位于A04号染色体上第1833604位，其碱基为T或G；
BrSNPA04009位于A04号染色体上第2121284位，其碱基为G或A；
BrSNPA04010位于A04号染色体上第2232565位，其碱基为T或A；
BrSNPA04011位于A04号染色体上第2827196位，其碱基为G或A；
BrSNPA04012位于A04号染色体上第3162294位，其碱基为G或A；
BrSNPA04013位于A04号染色体上第3232728位，其碱基为G或C；
BrSNPA04014位于A04号染色体上第3760068位，其碱基为G或A；
BrSNPA04015位于A04号染色体上第3908277位，其碱基为G或A；
BrSNPA04016位于A04号染色体上第4437696位，其碱基为C或G；
BrSNPA04017位于A04号染色体上第4689758位，其碱基为T或C；
BrSNPA04018位于A04号染色体上第5060447位，其碱基为T或G；
BrSNPA04019位于A04号染色体上第6847805位，其碱基为G或C；
BrSNPA04020位于A04号染色体上第6933634位，其碱基为G或A；
BrSNPA04021位于A04号染色体上第8477239位，其碱基为A或C；
BrSNPA04022位于A04号染色体上第8662680位，其碱基为T或G；
BrSNPA04023位于A04号染色体上第9741929位，其碱基为G或T；
BrSNPA04024位于A04号染色体上第10563277位，其碱基为T或G；
BrSNPA04025位于A04号染色体上第11311194位，其碱基为G或C；
BrSNPA04026位于A04号染色体上第11642806位，其碱基为G或A；
BrSNPA04027位于A04号染色体上第11984195位，其碱基为T或G；
BrSNPA04028位于A04号染色体上第12352714位，其碱基为T或A；
BrSNPA04029位于A04号染色体上第12579896位，其碱基为G或A；
BrSNPA04030位于A04号染色体上第13764622位，其碱基为A或G；
BrSNPA04031位于A04号染色体上第14413900位，其碱基为G或A；
BrSNPA04032位于A04号染色体上第15528641位，其碱基为G或A；
BrSNPA04033位于A04号染色体上第15560443位，其碱基为T或C；
BrSNPA04034位于A04号染色体上第15732203位，其碱基为G或C；
BrSNPA04035位于A04号染色体上第16065091位，其碱基为T或A；
BrSNPA04036位于A04号染色体上第16331059位，其碱基为G或C；
BrSNPA04037位于A04号染色体上第16851784位，其碱基为T或C；
BrSNPA04038位于A04号染色体上第17018800位，其碱基为G或C；
BrSNPA04039位于A04号染色体上第18819192位，其碱基为T或C；
BrSNPA04040位于A04号染色体上第19072439位，其碱基为T或C；
BrSNPA04041位于A04号染色体上第19212412位，其碱基为G或A；
BrSNPA05001位于A05号染色体上第487586位，其碱基为A或T；
BrSNPA05002位于A05号染色体上第1283352位，其碱基为C或T；
BrSNPA05003位于A05号染色体上第2024918位，其碱基为G或A；
BrSNPA05004位于A05号染色体上第2253083位，其碱基为T或G；
BrSNPA05005位于A05号染色体上第2688397位，其碱基为G或C；
BrSNPA05006位于A05号染色体上第2809229位，其碱基为C或A；
BrSNPA05007位于A05号染色体上第2835432位，其碱基为G或A；
BrSNPA05008位于A05号染色体上第2945096位，其碱基为C或A；
BrSNPA05009位于A05号染色体上第3063334位，其碱基为G或T；
BrSNPA05010位于A05号染色体上第3608353位，其碱基为T或A；
BrSNPA05011位于A05号染色体上第3663635位，其碱基为T或C；
BrSNPA05012位于A05号染色体上第3669632位，其碱基为G或A；
BrSNPA05013位于A05号染色体上第3702768位，其碱基为T或A；
BrSNPA05014位于A05号染色体上第3711749位，其碱基为T或C；
BrSNPA05015位于A05号染色体上第4073949位，其碱基为G或A；
BrSNPA05016位于A05号染色体上第4227921位，其碱基为G或C；
BrSNPA05017位于A05号染色体上第4232210位，其碱基为G或A；
BrSNPA05018位于A05号染色体上第4379811位，其碱基为T或A；
BrSNPA05019位于A05号染色体上第5944167位，其碱基为T或A；
BrSNPA05020位于A05号染色体上第6796365位，其碱基为T或G；
BrSNPA05021位于A05号染色体上第7357437位，其碱基为C或A；
BrSNPA05022位于A05号染色体上第7531884位，其碱基为G或A；
BrSNPA05023位于A05号染色体上第7551654位，其碱基为G或A；
BrSNPA05024位于A05号染色体上第8088873位，其碱基为C或T；
BrSNPA05025位于A05号染色体上第8959623位，其碱基为G或A；
BrSNPA05026位于A05号染色体上第9401373位，其碱基为T或C；
BrSNPA05027位于A05号染色体上第9714592位，其碱基为G或C；
BrSNPA05028位于A05号染色体上第9832276位，其碱基为T或C；
BrSNPA05029位于A05号染色体上第9890212位，其碱基为T或A；
BrSNPA05030位于A05号染色体上第10343678位，其碱基为G或A；
BrSNPA05031位于A05号染色体上第10705210位，其碱基为C或A；
BrSNPA05032位于A05号染色体上第10722668位，其碱基为T或C；
BrSNPA05033位于A05号染色体上第10887243位，其碱基为T或C；
BrSNPA05034位于A05号染色体上第14441564位，其碱基为G或A；
BrSNPA05035位于A05号染色体上第14794179位，其碱基为T或C；
BrSNPA05036位于A05号染色体上第14801567位，其碱基为T或G；
BrSNPA05037位于A05号染色体上第14960042位，其碱基为G或C；
BrSNPA05038位于A05号染色体上第16182627位，其碱基为T或A；
BrSNPA05039位于A05号染色体上第16282153位，其碱基为T或C；
BrSNPA05040位于A05号染色体上第16543992位，其碱基为T或C；
BrSNPA05041位于A05号染色体上第16988803位，其碱基为T或A；
BrSNPA05042位于A05号染色体上第17247727位，其碱基为T或A；
BrSNPA05043位于A05号染色体上第17810370位，其碱基为G或A；
BrSNPA05044位于A05号染色体上第18626934位，其碱基为T或G；
BrSNPA05045位于A05号染色体上第19009544位，其碱基为G或C；
BrSNPA05046位于A05号染色体上第19022188位，其碱基为T或C；
BrSNPA05047位于A05号染色体上第20978461位，其碱基为C或A；
BrSNPA05048位于A05号染色体上第21254133位，其碱基为C或A；
BrSNPA05049位于A05号染色体上第21498528位，其碱基为G或A；
BrSNPA05050位于A05号染色体上第22030048位，其碱基为C或T；
BrSNPA05051位于A05号染色体上第22731111位，其碱基为G或C；
BrSNPA05052位于A05号染色体上第22895070位，其碱基为C或A；
BrSNPA05053位于A05号染色体上第22962829位，其碱基为T或C；
BrSNPA06001位于A06号染色体上第18887位，其碱基为C或G；
BrSNPA06002位于A06号染色体上第117846位，其碱基为A或G；
BrSNPA06003位于A06号染色体上第1296897位，其碱基为T或C；
BrSNPA06004位于A06号染色体上第1752922位，其碱基为G或A；
BrSNPA06005位于A06号染色体上第2426330位，其碱基为G或A；
BrSNPA06006位于A06号染色体上第2789766位，其碱基为T或G；
BrSNPA06007位于A06号染色体上第2931644位，其碱基为T或C；
BrSNPA06008位于A06号染色体上第6382083位，其碱基为C或A；
BrSNPA06009位于A06号染色体上第6403261位，其碱基为C或A；
BrSNPA06010位于A06号染色体上第8245454位，其碱基为G或A；
BrSNPA06011位于A06号染色体上第8618748位，其碱基为A或G；
BrSNPA06012位于A06号染色体上第10107459位，其碱基为G或A；
BrSNPA06013位于A06号染色体上第10568157位，其碱基为G或A；
BrSNPA06014位于A06号染色体上第10578879位，其碱基为T或C；
BrSNPA06015位于A06号染色体上第10874817位，其碱基为G或C；
BrSNPA06016位于A06号染色体上第11069822位，其碱基为T或G；
BrSNPA06017位于A06号染色体上第11344725位，其碱基为T或A；
BrSNPA06018位于A06号染色体上第12784985位，其碱基为T或C；
BrSNPA06019位于A06号染色体上第13424538位，其碱基为C或A；
BrSNPA06020位于A06号染色体上第13447511位，其碱基为G或A；
BrSNPA06021位于A06号染色体上第13534897位，其碱基为A或T；
BrSNPA06022位于A06号染色体上第13545093位，其碱基为T或C；
BrSNPA06023位于A06号染色体上第14701558位，其碱基为T或C；
BrSNPA06024位于A06号染色体上第14726472位，其碱基为C或A；
BrSNPA06025位于A06号染色体上第14730894位，其碱基为T或C；
BrSNPA06026位于A06号染色体上第14731133位，其碱基为T或A；
BrSNPA06027位于A06号染色体上第15606985位，其碱基为G或A；
BrSNPA06028位于A06号染色体上第15685596位，其碱基为G或A；
BrSNPA06029位于A06号染色体上第16018969位，其碱基为C或A；
BrSNPA06030位于A06号染色体上第16193195位，其碱基为G或C；
BrSNPA06031位于A06号染色体上第16201857位，其碱基为G或A；
BrSNPA06032位于A06号染色体上第16271874位，其碱基为T或A；
BrSNPA06033位于A06号染色体上第17483582位，其碱基为G或A；
BrSNPA06034位于A06号染色体上第17610866位，其碱基为A或G；
BrSNPA06035位于A06号染色体上第17773836位，其碱基为T或A；
BrSNPA06036位于A06号染色体上第18376779位，其碱基为G或A；
BrSNPA06037位于A06号染色体上第18546656位，其碱基为G或C；
BrSNPA06038位于A06号染色体上第18584746位，其碱基为G或A；
BrSNPA06039位于A06号染色体上第18685199位，其碱基为T或G；
BrSNPA06040位于A06号染色体上第19361503位，其碱基为G或C；
BrSNPA06041位于A06号染色体上第19387887位，其碱基为G或A；
BrSNPA06042位于A06号染色体上第20048140位，其碱基为G或A；
BrSNPA06043位于A06号染色体上第20833714位，其碱基为G或C；
BrSNPA06044位于A06号染色体上第20977558位，其碱基为T或C；
BrSNPA06045位于A06号染色体上第21415891位，其碱基为G或A；
BrSNPA06046位于A06号染色体上第21632076位，其碱基为G或A；
BrSNPA06047位于A06号染色体上第22374291位，其碱基为C或G；
BrSNPA06048位于A06号染色体上第23153503位，其碱基为C或A；
BrSNPA06049位于A06号染色体上第23563378位，其碱基为G或A；
BrSNPA06050位于A06号染色体上第23928146位，其碱基为G或A；
BrSNPA06051位于A06号染色体上第23955274位，其碱基为T或A；
BrSNPA06052位于A06号染色体上第24041088位，其碱基为C或T；
BrSNPA06053位于A06号染色体上第24284057位，其碱基为G或A；
BrSNPA06054位于A06号染色体上第24717886位，其碱基为C或A；
BrSNPA06055位于A06号染色体上第25147238位，其碱基为T或C；
BrSNPA07001位于A07号染色体上第246275位，其碱基为G或C；
BrSNPA07002位于A07号染色体上第641403位，其碱基为G或A；
BrSNPA07003位于A07号染色体上第1028346位，其碱基为T或A；
BrSNPA07004位于A07号染色体上第2560851位，其碱基为G或A；
BrSNPA07005位于A07号染色体上第2970833位，其碱基为A或G；
BrSNPA07006位于A07号染色体上第3216036位，其碱基为T或C；
BrSNPA07007位于A07号染色体上第3279889位，其碱基为T或G；
BrSNPA07008位于A07号染色体上第3358700位，其碱基为C或A；
BrSNPA07009位于A07号染色体上第3961792位，其碱基为T或A；
BrSNPA07010位于A07号染色体上第4234366位，其碱基为T或C；
BrSNPA07011位于A07号染色体上第5021185位，其碱基为T或G；
BrSNPA07012位于A07号染色体上第5153068位，其碱基为T或G；
BrSNPA07013位于A07号染色体上第6101124位，其碱基为T或A；
BrSNPA07014位于A07号染色体上第6254138位，其碱基为T或A；
BrSNPA07015位于A07号染色体上第6429733位，其碱基为T或C；
BrSNPA07016位于A07号染色体上第7129127位，其碱基为T或C；
BrSNPA07017位于A07号染色体上第7137784位，其碱基为G或A；
BrSNPA07018位于A07号染色体上第7249922位，其碱基为C或A；
BrSNPA07019位于A07号染色体上第8738315位，其碱基为T或G；
BrSNPA07020位于A07号染色体上第9057585位，其碱基为G或A；
BrSNPA07021位于A07号染色体上第9463049位，其碱基为T或C；
BrSNPA07022位于A07号染色体上第9678954位，其碱基为T或C；
BrSNPA07023位于A07号染色体上第11143455位，其碱基为T或C；
BrSNPA07024位于A07号染色体上第11295388位，其碱基为G或A；
BrSNPA07025位于A07号染色体上第11498098位，其碱基为T或G；
BrSNPA07026位于A07号染色体上第11520532位，其碱基为G或A；
BrSNPA07027位于A07号染色体上第11551826位，其碱基为T或C；
BrSNPA07028位于A07号染色体上第11750525位，其碱基为G或A；
BrSNPA07029位于A07号染色体上第12234015位，其碱基为C或T；
BrSNPA07030位于A07号染色体上第13554367位，其碱基为G或A；
BrSNPA07031位于A07号染色体上第14074310位，其碱基为T或C；
BrSNPA07032位于A07号染色体上第14523031位，其碱基为T或C；
BrSNPA07033位于A07号染色体上第14747998位，其碱基为T或A；
BrSNPA07034位于A07号染色体上第15655059位，其碱基为A或G；
BrSNPA07035位于A07号染色体上第15740558位，其碱基为C或A；
BrSNPA07036位于A07号染色体上第16130782位，其碱基为T或C；
BrSNPA07037位于A07号染色体上第16491110位，其碱基为T或G；
BrSNPA07038位于A07号染色体上第17285904位，其碱基为G或A；
BrSNPA07039位于A07号染色体上第18060124位，其碱基为T或G；
BrSNPA07040位于A07号染色体上第18453973位，其碱基为C或T；
BrSNPA07041位于A07号染色体上第19178191位，其碱基为T或C；
BrSNPA07042位于A07号染色体上第19761996位，其碱基为G或A；
BrSNPA07043位于A07号染色体上第19894600位，其碱基为T或C；
BrSNPA07044位于A07号染色体上第20112319位，其碱基为G或C；
BrSNPA07045位于A07号染色体上第21087891位，其碱基为A或G；
BrSNPA07046位于A07号染色体上第21941825位，其碱基为T或C；
BrSNPA07047位于A07号染色体上第22261109位，其碱基为T或G；
BrSNPA07048位于A07号染色体上第22291912位，其碱基为T或C；
BrSNPA07049位于A07号染色体上第22522822位，其碱基为C或T；
BrSNPA07050位于A07号染色体上第23348479位，其碱基为G或A；
BrSNPA07051位于A07号染色体上第24460147位，其碱基为G或C；
BrSNPA07052位于A07号染色体上第25407338位，其碱基为T或A；
BrSNPA07053位于A07号染色体上第25633222位，其碱基为G或A；
BrSNPA07054位于A07号染色体上第25744414位，其碱基为A或C；
BrSNPA08001位于A08号染色体上第100717位，其碱基为C或G；
BrSNPA08002位于A08号染色体上第240722位，其碱基为G或A；
BrSNPA08003位于A08号染色体上第277090位，其碱基为T或C；
BrSNPA08004位于A08号染色体上第926709位，其碱基为G或A；
BrSNPA08005位于A08号染色体上第1715093位，其碱基为G或A；
BrSNPA08006位于A08号染色体上第2121093位，其碱基为G或A；
BrSNPA08007位于A08号染色体上第2374634位，其碱基为G或A；
BrSNPA08008位于A08号染色体上第3289888位，其碱基为T或G；
BrSNPA08009位于A08号染色体上第3422941位，其碱基为C或G；
BrSNPA08010位于A08号染色体上第3911814位，其碱基为T或G；
BrSNPA08011位于A08号染色体上第3915045位，其碱基为T或C；
BrSNPA08012位于A08号染色体上第4419556位，其碱基为C或T；
BrSNPA08013位于A08号染色体上第5430112位，其碱基为T或G；
BrSNPA08014位于A08号染色体上第6266345位，其碱基为C或A；
BrSNPA08015位于A08号染色体上第7150432位，其碱基为G或A；
BrSNPA08016位于A08号染色体上第7588851位，其碱基为T或C；
BrSNPA08017位于A08号染色体上第8135981位，其碱基为C或A；
BrSNPA08018位于A08号染色体上第8933259位，其碱基为G或A；
BrSNPA08019位于A08号染色体上第9415744位，其碱基为T或G；
BrSNPA08020位于A08号染色体上第10869244位，其碱基为C或T；
BrSNPA08021位于A08号染色体上第11195840位，其碱基为T或A；
BrSNPA08022位于A08号染色体上第12382048位，其碱基为T或A；
BrSNPA08023位于A08号染色体上第12394480位，其碱基为T或A；
BrSNPA08024位于A08号染色体上第12855208位，其碱基为C或A；
BrSNPA08025位于A08号染色体上第12939081位，其碱基为G或C；
BrSNPA08026位于A08号染色体上第13838879位，其碱基为T或A；
BrSNPA08027位于A08号染色体上第14102664位，其碱基为G或C；
BrSNPA08028位于A08号染色体上第14112886位，其碱基为T或C；
BrSNPA08029位于A08号染色体上第14137581位，其碱基为T或C；
BrSNPA08030位于A08号染色体上第14580308位，其碱基为T或C；
BrSNPA08031位于A08号染色体上第14960288位，其碱基为G或C；
BrSNPA08032位于A08号染色体上第15007562位，其碱基为T或G；
BrSNPA08033位于A08号染色体上第15287418位，其碱基为G或C；
BrSNPA08034位于A08号染色体上第15734124位，其碱基为G或A；
BrSNPA08035位于A08号染色体上第16162051位，其碱基为T或G；
BrSNPA08036位于A08号染色体上第16415364位，其碱基为T或A；
BrSNPA08037位于A08号染色体上第16583368位，其碱基为T或C；
BrSNPA08038位于A08号染色体上第17179902位，其碱基为T或G；
BrSNPA08039位于A08号染色体上第17537125位，其碱基为T或C；
BrSNPA08040位于A08号染色体上第17877117位，其碱基为T或C；
BrSNPA08041位于A08号染色体上第18085207位，其碱基为T或C；
BrSNPA08042位于A08号染色体上第18668405位，其碱基为T或C；
BrSNPA08043位于A08号染色体上第19658257位，其碱基为G或A；
BrSNPA08044位于A08号染色体上第19860954位，其碱基为C或T；
BrSNPA08045位于A08号染色体上第19861288位，其碱基为C或T；
BrSNPA08046位于A08号染色体上第20202413位，其碱基为G或C；
BrSNPA08047位于A08号染色体上第20416840位，其碱基为G或A；
BrSNPA08048位于A08号染色体上第20458612位，其碱基为T或C；
BrSNPA08049位于A08号染色体上第20716882位，其碱基为G或C；
BrSNPA09001位于A09号染色体上第165179位，其碱基为G或C；
BrSNPA09002位于A09号染色体上第211286位，其碱基为T或A；
BrSNPA09003位于A09号染色体上第443160位，其碱基为T或A；
BrSNPA09004位于A09号染色体上第583658位，其碱基为A或G；
BrSNPA09005位于A09号染色体上第898133位，其碱基为T或A；
BrSNPA09006位于A09号染色体上第1161182位，其碱基为T或C；
BrSNPA09007位于A09号染色体上第1379762位，其碱基为G或A；
BrSNPA09008位于A09号染色体上第1595348位，其碱基为T或G；
BrSNPA09009位于A09号染色体上第1627618位，其碱基为G或C；
BrSNPA09010位于A09号染色体上第1901646位，其碱基为T或A；
BrSNPA09011位于A09号染色体上第1930677位，其碱基为G或C；
BrSNPA09012位于A09号染色体上第3019969位，其碱基为G或T；
BrSNPA09013位于A09号染色体上第3817906位，其碱基为G或C；
BrSNPA09014位于A09号染色体上第3896403位，其碱基为G或A；
BrSNPA09015位于A09号染色体上第3903092位，其碱基为G或C；
BrSNPA09016位于A09号染色体上第4226515位，其碱基为G或A；
BrSNPA09017位于A09号染色体上第4354836位，其碱基为C或A；
BrSNPA09018位于A09号染色体上第4534869位，其碱基为C或A；
BrSNPA09019位于A09号染色体上第4566148位，其碱基为G或A；
BrSNPA09020位于A09号染色体上第4597771位，其碱基为G或C；
BrSNPA09021位于A09号染色体上第5122605位，其碱基为C或A；
BrSNPA09022位于A09号染色体上第5480210位，其碱基为T或C；
BrSNPA09023位于A09号染色体上第5575779位，其碱基为T或G；
BrSNPA09024位于A09号染色体上第6031641位，其碱基为T或C；
BrSNPA09025位于A09号染色体上第6984636位，其碱基为T或C；
BrSNPA09026位于A09号染色体上第7624272位，其碱基为C或T；
BrSNPA09027位于A09号染色体上第7624862位，其碱基为G或T；
BrSNPA09028位于A09号染色体上第7897532位，其碱基为T或C；
BrSNPA09029位于A09号染色体上第8589991位，其碱基为G或T；
BrSNPA09030位于A09号染色体上第8773906位，其碱基为G或T；
BrSNPA09031位于A09号染色体上第8876252位，其碱基为T或A；
BrSNPA09032位于A09号染色体上第8877380位，其碱基为C或G；
BrSNPA09033位于A09号染色体上第9006311位，其碱基为C或A；
BrSNPA09034位于A09号染色体上第9062940位，其碱基为T或C；
BrSNPA09035位于A09号染色体上第9303625位，其碱基为T或G；
BrSNPA09036位于A09号染色体上第9805886位，其碱基为C或T；
BrSNPA09037位于A09号染色体上第10247545位，其碱基为C或A；
BrSNPA09038位于A09号染色体上第11056315位，其碱基为T或A；
BrSNPA09039位于A09号染色体上第11230572位，其碱基为G或A；
BrSNPA09040位于A09号染色体上第12895394位，其碱基为G或A；
BrSNPA09041位于A09号染色体上第13470942位，其碱基为T或C；
BrSNPA09042位于A09号染色体上第16265081位，其碱基为A或C；
BrSNPA09043位于A09号染色体上第17752348位，其碱基为G或C；
BrSNPA09044位于A09号染色体上第18332606位，其碱基为T或C；
BrSNPA09045位于A09号染色体上第18356344位，其碱基为G或A；
BrSNPA09046位于A09号染色体上第18406676位，其碱基为T或C；
BrSNPA09047位于A09号染色体上第18417691位，其碱基为T或G；
BrSNPA09048位于A09号染色体上第20994890位，其碱基为T或C；
BrSNPA09049位于A09号染色体上第21636788位，其碱基为G或A；
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BrSNPA09051位于A09号染色体上第21654935位，其碱基为T或C；
BrSNPA09052位于A09号染色体上第21910417位，其碱基为T或C；
BrSNPA09053位于A09号染色体上第22627850位，其碱基为G或A；
BrSNPA09054位于A09号染色体上第23220955位，其碱基为G或A；
BrSNPA09055位于A09号染色体上第23322031位，其碱基为G或A；
BrSNPA09056位于A09号染色体上第25785187位，其碱基为G或A；
BrSNPA09057位于A09号染色体上第26222141位，其碱基为T或C；
BrSNPA09058位于A09号染色体上第26503872位，其碱基为T或A；
BrSNPA09059位于A09号染色体上第26520788位，其碱基为G或C；
BrSNPA09060位于A09号染色体上第26564841位，其碱基为G或A；
BrSNPA09061位于A09号染色体上第26594548位，其碱基为T或A；
BrSNPA09062位于A09号染色体上第26739505位，其碱基为T或A；
BrSNPA09063位于A09号染色体上第26924828位，其碱基为G或C；
BrSNPA09064位于A09号染色体上第27270361位，其碱基为T或C；
BrSNPA09065位于A09号染色体上第28770187位，其碱基为T或C；
BrSNPA09066位于A09号染色体上第29198476位，其碱基为T或C；
BrSNPA09067位于A09号染色体上第30179678位，其碱基为G或A；
BrSNPA09068位于A09号染色体上第30448774位，其碱基为T或A；
BrSNPA09069位于A09号染色体上第30507943位，其碱基为T或C；
BrSNPA09070位于A09号染色体上第31873135位，其碱基为T或C；
BrSNPA09071位于A09号染色体上第31875876位，其碱基为T或C；
BrSNPA09072位于A09号染色体上第32719234位，其碱基为C或T；
BrSNPA09073位于A09号染色体上第32983605位，其碱基为G或A；
BrSNPA09074位于A09号染色体上第33495110位，其碱基为A或C；
BrSNPA09075位于A09号染色体上第34559009位，其碱基为G或A；
BrSNPA09076位于A09号染色体上第37047265位，其碱基为T或G；
BrSNPA09077位于A09号染色体上第37238042位，其碱基为C或A；
BrSNPA09078位于A09号染色体上第37689520位，其碱基为T或A；
BrSNPA09079位于A09号染色体上第37741739位，其碱基为G或A；
BrSNPA09080位于A09号染色体上第37743859位，其碱基为G或A；
BrSNPA10001位于A10号染色体上第9384位，其碱基为T或G；
BrSNPA10002位于A10号染色体上第119709位，其碱基为T或A；
BrSNPA10003位于A10号染色体上第617354位，其碱基为T或A；
BrSNPA10004位于A10号染色体上第1861569位，其碱基为T或C；
BrSNPA10005位于A10号染色体上第3689550位，其碱基为T或C；
BrSNPA10006位于A10号染色体上第3708065位，其碱基为G或A；
BrSNPA10007位于A10号染色体上第3721991位，其碱基为T或C；
BrSNPA10008位于A10号染色体上第3800101位，其碱基为G或A；
BrSNPA10009位于A10号染色体上第3834274位，其碱基为C或A；
BrSNPA10010位于A10号染色体上第3849310位，其碱基为C或A；
BrSNPA10011位于A10号染色体上第3878034位，其碱基为T或A；
BrSNPA10012位于A10号染色体上第4497856位，其碱基为T或A；
BrSNPA10013位于A10号染色体上第4782602位，其碱基为T或C；
BrSNPA10014位于A10号染色体上第5601251位，其碱基为G或C；
BrSNPA10015位于A10号染色体上第5671082位，其碱基为G或A；
BrSNPA10016位于A10号染色体上第6046254位，其碱基为G或A；
BrSNPA10017位于A10号染色体上第6294669位，其碱基为T或G；
BrSNPA10018位于A10号染色体上第6364310位，其碱基为T或G；
BrSNPA10019位于A10号染色体上第6477381位，其碱基为C或A；
BrSNPA10020位于A10号染色体上第7174178位，其碱基为G或C；
BrSNPA10021位于A10号染色体上第7989917位，其碱基为G或C；
BrSNPA10022位于A10号染色体上第8425118位，其碱基为T或C；
BrSNPA10023位于A10号染色体上第8648405位，其碱基为T或A；
BrSNPA10024位于A10号染色体上第9700540位，其碱基为G或C；
BrSNPA10025位于A10号染色体上第10373824位，其碱基为G或A；
BrSNPA10026位于A10号染色体上第10740098位，其碱基为T或C；
BrSNPA10027位于A10号染色体上第12134922位，其碱基为A或G；
BrSNPA10028位于A10号染色体上第12492205位，其碱基为G或C；
BrSNPA10029位于A10号染色体上第12527035位，其碱基为G或C；
BrSNPA10030位于A10号染色体上第12619426位，其碱基为G或A；
BrSNPA10031位于A10号染色体上第13105346位，其碱基为C或A；
BrSNPA10032位于A10号染色体上第13127812位，其碱基为G或T；
BrSNPA10033位于A10号染色体上第13406296位，其碱基为T或G；
BrSNPA10034位于A10号染色体上第13716056位，其碱基为T或A；
BrSNPA10035位于A10号染色体上第13732849位，其碱基为T或C；
BrSNPA10036位于A10号染色体上第13859895位，其碱基为G或A；
BrSNPA10037位于A10号染色体上第14319070位，其碱基为T或A；
BrSNPA10038位于A10号染色体上第14443918位，其碱基为C或A；
BrSNPA10039位于A10号染色体上第14465630位，其碱基为G或C；
BrSNPA10040位于A10号染色体上第14638538位，其碱基为C或A；
BrSNPA10041位于A10号染色体上第15240989位，其碱基为G或C；
BrSNPA10042位于A10号染色体上第15835648位，其碱基为G或C；
BrSNPA10043位于A10号染色体上第16198723位，其碱基为G或A。
实施例2、利用实施例1筛选的571个SNP位点设计用于检测对应SNP位点基因型的KASP引物组合并建立基因型检测方法
一、利用实施例1筛选的571个SNP位点设计用于检测对应SNP位点基因型的KASP引物组合
根据实施例1筛选的571个SNP位点设计用于检测对应SNP位点基因型KASP引物组合。设计检测所述571个SNP位点的571组KASP引物，每组KASP引物用于检测所述571个SNP位点中的一种。每组KASP引物有2条上游引物(记为上游引物1和上游引物2)和1条下游引物。
上游引物1的结构组成自5’端至3’端依次为：通用序列1+基因组特异序列+所述SNP位点处两种核苷酸中的一种；
上游引物2的结构组成自5’端至3’端依次为：通用序列2+基因组特异序列+所述SNP位点处两种核苷酸中的另一种；
下游引物仅由基因组特异序列组成。
即针对SNP位点，上游引物的3′端为等位变异碱基。
其中，本发明采用的通用序列1为FAM荧光标签序列5′-GAAGGTGACCAAGTTCATGCT-3′，通用序列2为HEX荧光标签序列5′-GAAGGTCGGAGTCAACGGATT-3′。
具体而言，本发明针对实施例1筛选的571个SNP位点设计的KASP引物组合由序列表中序列1-序列1713所示的1713条单链DNA组成。
其中，序列1、4、7、......、1171(即序列3N-2，其中N为大于等于1且小于等于571的整数)为针对所述571个SNP位点的上游引物1，自5’端起前21位核苷酸为通用序列1(FAM荧光标签序列)，其后的序列为基因组特异性序列，3’末端为对应SNP位点处两种核苷酸中的一种；序列2、5、8、......、1172(即序列3N-1，其中N为大于等于1且小于等于571的整数)为针对所述571个SNP位点的上游引物2，自5’端起前21位核苷酸为通用序列2(HEX荧光标签序列)，其后的序列为基因组特异性序列，3’末端为对应SNP位点处两种核苷酸中的另一种；序列3、6、9、......、1173(即序列3N，其中N为大于等于1且小于等于571的整数)为针对所述571个SNP位点的下游引物，为基因组特异性序列。序列1-3所示的3个引物用于检测SNP位点BrSNPA01001(实施例1中571个SNP位点中的第1个)；序列4-6所示的3个引物用于检测SNP位点BrSNPA01002(实施例1中571个SNP位点中的第2个)；序列7-9所示的3个引物用于检测SNP位点BrSNPA01003(实施例1中571个SNP位点中的第3个)；......，以此类推，......，序列1711-1713所示的3个引物用于检测SNP位点BrSNPA10043(实施例1中571个SNP位点中的第571个)。
二、利用KASP引物组合检测571个SNP位点基因型的方法的建立
1、基因组DNA的提取及质量鉴定
常规CTAB法分别提取供试白菜材料的基因组DNA。用琼脂糖电泳和Nanodrop2100分别检测所提取DNA的质量，发现提取的基因组DNA均达到了相关的质量要求，即琼脂糖电泳显示DNA条带单一，没有明显弥散；Nanodrop2100检测A260/280介于1.8-2.0之间(DNA样品没有蛋白污染)；A260/230介于1.8-2.0之间(DNA样品盐离子浓度低)；270nm没有明显的光吸收(DNA样品没有酚污染)；用于竞争性等位基因特异性PCR技术检测的DNA用量为4-10ng/每样品。稀释DNA浓度成为4-10ng/μl备用。
2、PCR扩增
以步骤一提取的基因组DNA为模板，用实施例1开发的KASP引物组合中的每种KASP引物分别进行PCR扩增，得到PCR扩增产物。
按照英国LGC(Laboratory of the Government Chemist政府化学家实验室)有限公司提供的标准实验流程，即基于竞争性等位基因特异性PCR技术的实验流程进行实验，以下试剂除特殊说明为均为LGC公司提供的配套试剂，试剂用量、用法、以及整个实验步骤按照LGC公司的操作指南KASP user guide and manual(www.lgcgenomics.com)进行：
KASPar反应在384微孔板(Part No.KBS-0750-001)或者1536微孔板(PartNo.KBS-0751-001)中进行，反应体系为3μl或1μl。
具体步骤为：首先利用K-pette分液工作站在微孔板中加入待测DNA模板(4～10ng/μl)1.5μl，60℃烘干。然后在Kraken操作系统下利用Meridian加样工作站向每个反应孔中加入终浓度为1×的Master mix(将Part No.KBS-1016-002或者Part No.KBS-1016-011稀释后所得)与引物预混液(两条上游引物和下游引物按照摩尔浓度比6∶6∶15混合，各引物终浓度为10μM)，Mix分装完毕立即将微孔板依次放在Kube热封仪和Fusion激光封膜仪上封膜。
PCR反应在高通量水浴系统Hydrocycler中进行，具体程序为：94℃预变性15分钟；94℃变性20秒，61℃-55℃复性&延伸1分钟，以touch down程序扩增10个循环，复性&延伸温度每循环降低0.6℃；94℃变性20秒，55℃60秒，26个循环。
实验同时设置反应体系中不添加模板DNA的空白对照。每个PCR扩增产物样本设置至少3个重复。
4、等位基因分型
扩增结束后，利用BMG PHERAstar仪器检测荧光信号并查看分型情况。若分型不充分，则继续扩增，每3个循环查看分型情况，直至分型完全。
利用KrakenTM软件将原始数据导出为microsoft office excel2010格式，分析待测样品在571个位点的基因分型情况。
实施例3、利用实施例2设计的KASP引物组合检测571个SNP位点基因型构建白菜DNA指纹数据库
一、DNA提取及质量鉴定
供试白菜品种：255份不同白菜亚种和变种的代表性自交系样品(表1)。
参见实施例2步骤二1提取各供试白菜品种的基因组DNA。
二、571个SNP位点基因型的检测
采用实施例2设计的KASP引物组合对步骤1获得的各供试白菜品种的基因组DNA分别进行实施例1中571个SNP位点基因型的检测。具体操作方法参见实施例2步骤二。最终所得各供试白菜品种的571个SNP位点的基因型数据即构成白菜DNA指纹数据库。
实施例4、利用实施例3获得的SNP白菜DNA指纹数据库对白菜遗传多样性分析和进化分析
本发明提供的571个SNP位点在筛选之初，由于已经考虑到区分白菜各亚种及变种，因此可以用于白菜遗传资源分析和类群划分。
以下将详述利用实施例1-3获得的571个SNP位点的基因型数据对255份不同白菜亚种和变种(同实施例3)的代表性自交系样品进行类群划分。
基于实施例3获得的255份白菜样品571个SNP位点的基因型数据，利用Power-Marker ver.3.25软件，选用Nei1972遗传距离计算法，分析建立UPGMA法聚类树状图，255份样品被划分为到不同的群内。
结果如图2所示，从图中可以看出，芸薹种作物的四个亚种及更为细分的变种，包括结球白菜Brassica rapa ssp.pekinensis(细分为秋播大白菜Aut(autumn-type)，夏播大白菜Sum(summer-type)，春播大白菜Spr(spring-type))，不结球白菜Brassica rapassp.chinensis(细分为青梗菜ssp.chinensis var.chinensis(C)，乌塌菜ssp.chinensisvar.Narinosa(Nar)，菜薹ssp.chinensis var.parachinensis(P)，苔菜ssp.chinensisvar.tsai-cai(T)，分蘖菜ssp.chinensis var.multiceps(J)，和奶白菜ssp.chinensisvar.nai-bai(N)，ssp.chinensis var.hei-ye(H)共计7个变种)，油用白菜Brassica rapassp.oleifera(O)和芜菁Brassica rapa ssp.rapifera(R)都能完整区分出来。
实施例5、利用SNP分子标记进行白菜分子育种的背景选择
在白菜新品种选育过程中，通常将具有优良性状的自交系材料(供体)和综合性状较好的轮回亲本(受体)进行多代的回交，从而获得整体性状与轮回亲本相似，但增加了从供体转来的有利性状的后代。利用所述571个SNP位点可对回交育种过程中的中间材料进行背景选择，以达到快速获得整合了目标性状新品系的目的。
例如，在本发明中，亲本材料胶二叶(品种“胶二叶”自交六代以后所获自交系，文献来源：TuMV株系分化的研究.齐秀菊，卢和英，王子欣-《华北农学报》-1989)具有较好的综合农艺性状，但不抗干烧心病；亲本材料珍绿6号(品种“珍绿6号”自交六代以后所获自交系，珍绿6号可从天津科润农业科技股份有限公司购得)综合农艺性状一般，但干烧心病抗性突出。为得到综合性状优异并且干烧心抗性良好的新育种材料，本发明的发明人以将胶二叶(受体)和珍绿6号(供体)首先进行杂交，然后以胶二叶为轮回亲本进行选育。在F1BC3干烧心抗性良好材料中，利用571个SNP位点进行筛选。结果显示F1BC3材料T224和T20与胶二叶最为类似，相似程度分别达到99％和97.6％(图3)，后期的农艺性状观察发现T224和T20确实具有如胶二叶一般较好的综合农艺性状。

Claims (15)

1.571个SNP位点或用于检测所述571个SNP位点的物质在如下任一中的应用：
(1)白菜种质资源遗传多样性分析和/或进化分析；
(2)白菜分子育种；
(3)构建白菜DNA指纹数据库；
(4)对白菜进行基因分型；
(5)检测任两个白菜品种的相似性；
所述571个SNP位点的物理位置是基于白菜品种Chiifu-402-2的全基因组序列比对确定的，所述白菜品种Chiifu-402-2的全基因组序列的版本号为V1.5；所述571个SNP位点如下：
BrSNPA01001位于A01号染色体上第612144位，其碱基为T或A；
BrSNPA01002位于A01号染色体上第1059908位，其碱基为T或C；
BrSNPA01003位于A01号染色体上第1248141位，其碱基为T或C；
BrSNPA01004位于A01号染色体上第1385646位，其碱基为T或A；
BrSNPA01005位于A01号染色体上第1795429位，其碱基为T或C；
BrSNPA01006位于A01号染色体上第2112068位，其碱基为A或T；
BrSNPA01007位于A01号染色体上第2437505位，其碱基为G或A；
BrSNPA01008位于A01号染色体上第2830301位，其碱基为G或A；
BrSNPA01009位于A01号染色体上第2969334位，其碱基为G或A；
BrSNPA01010位于A01号染色体上第2970196位，其碱基为T或C；
BrSNPA01011位于A01号染色体上第3520140位，其碱基为T或C；
BrSNPA01012位于A01号染色体上第4182701位，其碱基为T或C；
BrSNPA01013位于A01号染色体上第4219165位，其碱基为C或A；
BrSNPA01014位于A01号染色体上第4225329位，其碱基为T或G；
BrSNPA01015位于A01号染色体上第4878177位，其碱基为T或C；
BrSNPA01016位于A01号染色体上第5849627位，其碱基为T或G；
BrSNPA01017位于A01号染色体上第6000315位，其碱基为C或G；
BrSNPA01018位于A01号染色体上第6385755位，其碱基为T或C；
BrSNPA01019位于A01号染色体上第7102966位，其碱基为T或A；
BrSNPA01020位于A01号染色体上第7105232位，其碱基为G或A；
BrSNPA01021位于A01号染色体上第7567812位，其碱基为T或C；
BrSNPA01022位于A01号染色体上第8475689位，其碱基为C或T；
BrSNPA01023位于A01号染色体上第9716212位，其碱基为G或C；
BrSNPA01024位于A01号染色体上第9865712位，其碱基为T或A；
BrSNPA01025位于A01号染色体上第10433882位，其碱基为A或G；
BrSNPA01026位于A01号染色体上第10454017位，其碱基为T或C；
BrSNPA01027位于A01号染色体上第11039761位，其碱基为T或C；
BrSNPA01028位于A01号染色体上第11576989位，其碱基为G或A；
BrSNPA01029位于A01号染色体上第12681321位，其碱基为T或G；
BrSNPA01030位于A01号染色体上第12708200位，其碱基为T或C；
BrSNPA01031位于A01号染色体上第12834470位，其碱基为G或C；
BrSNPA01032位于A01号染色体上第13128980位，其碱基为T或C；
BrSNPA01033位于A01号染色体上第14048162位，其碱基为T或C；
BrSNPA01034位于A01号染色体上第14897192位，其碱基为C或T；
BrSNPA01035位于A01号染色体上第15956879位，其碱基为T或C；
BrSNPA01036位于A01号染色体上第16592150位，其碱基为G或C；
BrSNPA01037位于A01号染色体上第17311260位，其碱基为T或C；
BrSNPA01038位于A01号染色体上第18199499位，其碱基为T或C；
BrSNPA01039位于A01号染色体上第18291203位，其碱基为T或C；
BrSNPA01040位于A01号染色体上第18635734位，其碱基为G或A；
BrSNPA01041位于A01号染色体上第18650317位，其碱基为G或A；
BrSNPA01042位于A01号染色体上第18657425位，其碱基为T或C；
BrSNPA01043位于A01号染色体上第18964955位，其碱基为G或C；
BrSNPA01044位于A01号染色体上第20057539位，其碱基为G或A；
BrSNPA01045位于A01号染色体上第21096109位，其碱基为C或A；
BrSNPA01046位于A01号染色体上第21986324位，其碱基为G或A；
BrSNPA01047位于A01号染色体上第22365926位，其碱基为G或C；
BrSNPA01048位于A01号染色体上第22417219位，其碱基为G或A；
BrSNPA01049位于A01号染色体上第22449302位，其碱基为G或A；
BrSNPA01050位于A01号染色体上第22523311位，其碱基为C或T；
BrSNPA01051位于A01号染色体上第22600539位，其碱基为T或C；
BrSNPA01052位于A01号染色体上第22695943位，其碱基为C或A；
BrSNPA01053位于A01号染色体上第24361302位，其碱基为T或C；
BrSNPA01054位于A01号染色体上第24456539位，其碱基为G或T；
BrSNPA01055位于A01号染色体上第24937773位，其碱基为G或A；
BrSNPA01056位于A01号染色体上第25108874位，其碱基为T或C；
BrSNPA01057位于A01号染色体上第26035077位，其碱基为T或A；
BrSNPA01058位于A01号染色体上第26549708位，其碱基为C或T；
BrSNPA01059位于A01号染色体上第26752589位，其碱基为G或A；
BrSNPA02001位于A02号染色体上第356794位，其碱基为C或T；
BrSNPA02002位于A02号染色体上第751652位，其碱基为G或A；
BrSNPA02003位于A02号染色体上第884677位，其碱基为T或A；
BrSNPA02004位于A02号染色体上第1026373位，其碱基为T或C；
BrSNPA02005位于A02号染色体上第1065889位，其碱基为T或A；
BrSNPA02006位于A02号染色体上第1142477位，其碱基为T或C；
BrSNPA02007位于A02号染色体上第2421548位，其碱基为A或C；
BrSNPA02008位于A02号染色体上第2663267位，其碱基为T或C；
BrSNPA02009位于A02号染色体上第2865799位，其碱基为T或C；
BrSNPA02010位于A02号染色体上第3245711位，其碱基为C或A；
BrSNPA02011位于A02号染色体上第3685320位，其碱基为G或A；
BrSNPA02012位于A02号染色体上第3812885位，其碱基为T或G；
BrSNPA02013位于A02号染色体上第4523362位，其碱基为T或A；
BrSNPA02014位于A02号染色体上第5184035位，其碱基为T或C；
BrSNPA02015位于A02号染色体上第6035955位，其碱基为T或G；
BrSNPA02016位于A02号染色体上第6431221位，其碱基为A或C；
BrSNPA02017位于A02号染色体上第6709555位，其碱基为C或A；
BrSNPA02018位于A02号染色体上第6957629位，其碱基为G或A；
BrSNPA02019位于A02号染色体上第8447338位，其碱基为T或C；
BrSNPA02020位于A02号染色体上第9141887位，其碱基为G或C；
BrSNPA02021位于A02号染色体上第9423555位，其碱基为T或C；
BrSNPA02022位于A02号染色体上第9490758位，其碱基为G或A；
BrSNPA02023位于A02号染色体上第11160802位，其碱基为C或A；
BrSNPA02024位于A02号染色体上第11181828位，其碱基为T或A；
BrSNPA02025位于A02号染色体上第11698932位，其碱基为T或A；
BrSNPA02026位于A02号染色体上第11780457位，其碱基为T或A；
BrSNPA02027位于A02号染色体上第13059562位，其碱基为G或A；
BrSNPA02028位于A02号染色体上第13619247位，其碱基为G或C；
BrSNPA02029位于A02号染色体上第14369430位，其碱基为T或A；
BrSNPA02030位于A02号染色体上第14606869位，其碱基为T或C；
BrSNPA02031位于A02号染色体上第14862673位，其碱基为T或C；
BrSNPA02032位于A02号染色体上第15736514位，其碱基为G或A；
BrSNPA02033位于A02号染色体上第16465013位，其碱基为G或C；
BrSNPA02034位于A02号染色体上第17440083位，其碱基为T或C；
BrSNPA02035位于A02号染色体上第17778839位，其碱基为G或A；
BrSNPA02036位于A02号染色体上第17828400位，其碱基为T或C；
BrSNPA02037位于A02号染色体上第17930830位，其碱基为T或C；
BrSNPA02038位于A02号染色体上第17961160位，其碱基为G或A；
BrSNPA02039位于A02号染色体上第18267114位，其碱基为T或C；
BrSNPA02040位于A02号染色体上第18364714位，其碱基为G或A；
BrSNPA02041位于A02号染色体上第18365894位，其碱基为T或G；
BrSNPA02042位于A02号染色体上第18425637位，其碱基为G或C；
BrSNPA02043位于A02号染色体上第19966721位，其碱基为T或A；
BrSNPA02044位于A02号染色体上第21426261位，其碱基为G或A；
BrSNPA02045位于A02号染色体上第21512340位，其碱基为G或A；
BrSNPA02046位于A02号染色体上第21970335位，其碱基为C或T；
BrSNPA02047位于A02号染色体上第22610904位，其碱基为T或C；
BrSNPA02048位于A02号染色体上第22844235位，其碱基为T或G；
BrSNPA02049位于A02号染色体上第22844925位，其碱基为G或A；
BrSNPA02050位于A02号染色体上第23028483位，其碱基为G或A；
BrSNPA02051位于A02号染色体上第23096858位，其碱基为T或C；
BrSNPA02052位于A02号染色体上第23174443位，其碱基为C或A；
BrSNPA02053位于A02号染色体上第23181920位，其碱基为G或C；
BrSNPA02054位于A02号染色体上第23632523位，其碱基为G或A；
BrSNPA02055位于A02号染色体上第24627499位，其碱基为A或G；
BrSNPA02056位于A02号染色体上第24987897位，其碱基为C或T；
BrSNPA02057位于A02号染色体上第25360564位，其碱基为C或A；
BrSNPA02058位于A02号染色体上第25748039位，其碱基为G或A；
BrSNPA02059位于A02号染色体上第26812976位，其碱基为G或C；
BrSNPA03001位于A03号染色体上第128271位，其碱基为C或A；
BrSNPA03002位于A03号染色体上第1038560位，其碱基为T或A；
BrSNPA03003位于A03号染色体上第1113130位，其碱基为T或C；
BrSNPA03004位于A03号染色体上第1964460位，其碱基为G或A；
BrSNPA03005位于A03号染色体上第2531794位，其碱基为T或C；
BrSNPA03006位于A03号染色体上第2904270位，其碱基为T或G；
BrSNPA03007位于A03号染色体上第3151130位，其碱基为G或A；
BrSNPA03008位于A03号染色体上第3151142位，其碱基为T或C；
BrSNPA03009位于A03号染色体上第3230367位，其碱基为T或C；
BrSNPA03010位于A03号染色体上第3596283位，其碱基为C或G；
BrSNPA03011位于A03号染色体上第3671765位，其碱基为T或C；
BrSNPA03012位于A03号染色体上第4366708位，其碱基为C或A；
BrSNPA03013位于A03号染色体上第4417310位，其碱基为T或G；
BrSNPA03014位于A03号染色体上第4471683位，其碱基为G或A；
BrSNPA03015位于A03号染色体上第5211812位，其碱基为A或T；
BrSNPA03016位于A03号染色体上第5450320位，其碱基为C或A；
BrSNPA03017位于A03号染色体上第6359471位，其碱基为G或A；
BrSNPA03018位于A03号染色体上第7120485位，其碱基为T或C；
BrSNPA03019位于A03号染色体上第7461075位，其碱基为G或C；
BrSNPA03020位于A03号染色体上第7482663位，其碱基为T或C；
BrSNPA03021位于A03号染色体上第7645227位，其碱基为T或C；
BrSNPA03022位于A03号染色体上第7828461位，其碱基为G或A；
BrSNPA03023位于A03号染色体上第7962179位，其碱基为G或A；
BrSNPA03024位于A03号染色体上第8473550位，其碱基为G或A；
BrSNPA03025位于A03号染色体上第8903849位，其碱基为T或A；
BrSNPA03026位于A03号染色体上第8939875位，其碱基为T或C；
BrSNPA03027位于A03号染色体上第9140011位，其碱基为G或A；
BrSNPA03028位于A03号染色体上第9143142位，其碱基为C或A；
BrSNPA03029位于A03号染色体上第10375219位，其碱基为T或G；
BrSNPA03030位于A03号染色体上第10697749位，其碱基为A或G；
BrSNPA03031位于A03号染色体上第10918916位，其碱基为T或G；
BrSNPA03032位于A03号染色体上第11197981位，其碱基为G或C；
BrSNPA03033位于A03号染色体上第11383704位，其碱基为T或C；
BrSNPA03034位于A03号染色体上第11557175位，其碱基为C或T；
BrSNPA03035位于A03号染色体上第11754718位，其碱基为G或A；
BrSNPA03036位于A03号染色体上第12070633位，其碱基为G或A；
BrSNPA03037位于A03号染色体上第12523505位，其碱基为G或C；
BrSNPA03038位于A03号染色体上第12806173位，其碱基为T或A；
BrSNPA03039位于A03号染色体上第13392725位，其碱基为G或A；
BrSNPA03040位于A03号染色体上第14206073位，其碱基为C或T；
BrSNPA03041位于A03号染色体上第14660690位，其碱基为G或A；
BrSNPA03042位于A03号染色体上第14844334位，其碱基为G或C；
BrSNPA03043位于A03号染色体上第15312198位，其碱基为T或G；
BrSNPA03044位于A03号染色体上第15431305位，其碱基为G或C；
BrSNPA03045位于A03号染色体上第16097389位，其碱基为G或A；
BrSNPA03046位于A03号染色体上第16144120位，其碱基为G或C；
BrSNPA03047位于A03号染色体上第17940082位，其碱基为T或G；
BrSNPA03048位于A03号染色体上第18277222位，其碱基为T或A；
BrSNPA03049位于A03号染色体上第19649018位，其碱基为A或G；
BrSNPA03050位于A03号染色体上第19734725位，其碱基为T或A；
BrSNPA03051位于A03号染色体上第19973528位，其碱基为T或C；
BrSNPA03052位于A03号染色体上第20233641位，其碱基为T或G；
BrSNPA03053位于A03号染色体上第20593495位，其碱基为A或T；
BrSNPA03054位于A03号染色体上第21003111位，其碱基为G或C；
BrSNPA03055位于A03号染色体上第21624403位，其碱基为T或G；
BrSNPA03056位于A03号染色体上第22632354位，其碱基为G或A；
BrSNPA03057位于A03号染色体上第23328550位，其碱基为C或A；
BrSNPA03058位于A03号染色体上第23335563位，其碱基为T或C；
BrSNPA03059位于A03号染色体上第23890389位，其碱基为A或G；
BrSNPA03060位于A03号染色体上第24086704位，其碱基为G或A；
BrSNPA03061位于A03号染色体上第24127049位，其碱基为T或A；
BrSNPA03062位于A03号染色体上第24352728位，其碱基为T或A；
BrSNPA03063位于A03号染色体上第25697075位，其碱基为T或A；
BrSNPA03064位于A03号染色体上第26316567位，其碱基为T或G；
BrSNPA03065位于A03号染色体上第26753682位，其碱基为G或A；
BrSNPA03066位于A03号染色体上第27196183位，其碱基为T或G；
BrSNPA03067位于A03号染色体上第27211545位，其碱基为C或A；
BrSNPA03068位于A03号染色体上第27471408位，其碱基为T或G；
BrSNPA03069位于A03号染色体上第28161015位，其碱基为G或C；
BrSNPA03070位于A03号染色体上第28193409位，其碱基为G或C；
BrSNPA03071位于A03号染色体上第28321741位，其碱基为G或A；
BrSNPA03072位于A03号染色体上第28629888位，其碱基为T或G；
BrSNPA03073位于A03号染色体上第28687095位，其碱基为G或A；
BrSNPA03074位于A03号染色体上第29060156位，其碱基为G或A；
BrSNPA03075位于A03号染色体上第29070757位，其碱基为C或A；
BrSNPA03076位于A03号染色体上第29086065位，其碱基为G或C；
BrSNPA03077位于A03号染色体上第30080620位，其碱基为T或C；
BrSNPA03078位于A03号染色体上第30648246位，其碱基为A或C；
BrSNPA04001位于A04号染色体上第556322位，其碱基为G或A；
BrSNPA04002位于A04号染色体上第898850位，其碱基为T或G；
BrSNPA04003位于A04号染色体上第1223515位，其碱基为G或A；
BrSNPA04004位于A04号染色体上第1378190位，其碱基为G或A；
BrSNPA04005位于A04号染色体上第1580901位，其碱基为T或C；
BrSNPA04006位于A04号染色体上第1661398位，其碱基为G或A；
BrSNPA04007位于A04号染色体上第1743434位，其碱基为G或A；
BrSNPA04008位于A04号染色体上第1833604位，其碱基为T或G；
BrSNPA04009位于A04号染色体上第2121284位，其碱基为G或A；
BrSNPA04010位于A04号染色体上第2232565位，其碱基为T或A；
BrSNPA04011位于A04号染色体上第2827196位，其碱基为G或A；
BrSNPA04012位于A04号染色体上第3162294位，其碱基为G或A；
BrSNPA04013位于A04号染色体上第3232728位，其碱基为G或C；
BrSNPA04014位于A04号染色体上第3760068位，其碱基为G或A；
BrSNPA04015位于A04号染色体上第3908277位，其碱基为G或A；
BrSNPA04016位于A04号染色体上第4437696位，其碱基为C或G；
BrSNPA04017位于A04号染色体上第4689758位，其碱基为T或C；
BrSNPA04018位于A04号染色体上第5060447位，其碱基为T或G；
BrSNPA04019位于A04号染色体上第6847805位，其碱基为G或C；
BrSNPA04020位于A04号染色体上第6933634位，其碱基为G或A；
BrSNPA04021位于A04号染色体上第8477239位，其碱基为A或C；
BrSNPA04022位于A04号染色体上第8662680位，其碱基为T或G；
BrSNPA04023位于A04号染色体上第9741929位，其碱基为G或T；
BrSNPA04024位于A04号染色体上第10563277位，其碱基为T或G；
BrSNPA04025位于A04号染色体上第11311194位，其碱基为G或C；
BrSNPA04026位于A04号染色体上第11642806位，其碱基为G或A；
BrSNPA04027位于A04号染色体上第11984195位，其碱基为T或G；
BrSNPA04028位于A04号染色体上第12352714位，其碱基为T或A；
BrSNPA04029位于A04号染色体上第12579896位，其碱基为G或A；
BrSNPA04030位于A04号染色体上第13764622位，其碱基为A或G；
BrSNPA04031位于A04号染色体上第14413900位，其碱基为G或A；
BrSNPA04032位于A04号染色体上第15528641位，其碱基为G或A；
BrSNPA04033位于A04号染色体上第15560443位，其碱基为T或C；
BrSNPA04034位于A04号染色体上第15732203位，其碱基为G或C；
BrSNPA04035位于A04号染色体上第16065091位，其碱基为T或A；
BrSNPA04036位于A04号染色体上第16331059位，其碱基为G或C；
BrSNPA04037位于A04号染色体上第16851784位，其碱基为T或C；
BrSNPA04038位于A04号染色体上第17018800位，其碱基为G或C；
BrSNPA04039位于A04号染色体上第18819192位，其碱基为T或C；
BrSNPA04040位于A04号染色体上第19072439位，其碱基为T或C；
BrSNPA04041位于A04号染色体上第19212412位，其碱基为G或A；
BrSNPA05001位于A05号染色体上第487586位，其碱基为A或T；
BrSNPA05002位于A05号染色体上第1283352位，其碱基为C或T；
BrSNPA05003位于A05号染色体上第2024918位，其碱基为G或A；
BrSNPA05004位于A05号染色体上第2253083位，其碱基为T或G；
BrSNPA05005位于A05号染色体上第2688397位，其碱基为G或C；
BrSNPA05006位于A05号染色体上第2809229位，其碱基为C或A；
BrSNPA05007位于A05号染色体上第2835432位，其碱基为G或A；
BrSNPA05008位于A05号染色体上第2945096位，其碱基为C或A；
BrSNPA05009位于A05号染色体上第3063334位，其碱基为G或T；
BrSNPA05010位于A05号染色体上第3608353位，其碱基为T或A；
BrSNPA05011位于A05号染色体上第3663635位，其碱基为T或C；
BrSNPA05012位于A05号染色体上第3669632位，其碱基为G或A；
BrSNPA05013位于A05号染色体上第3702768位，其碱基为T或A；
BrSNPA05014位于A05号染色体上第3711749位，其碱基为T或C；
BrSNPA05015位于A05号染色体上第4073949位，其碱基为G或A；
BrSNPA05016位于A05号染色体上第4227921位，其碱基为G或C；
BrSNPA05017位于A05号染色体上第4232210位，其碱基为G或A；
BrSNPA05018位于A05号染色体上第4379811位，其碱基为T或A；
BrSNPA05019位于A05号染色体上第5944167位，其碱基为T或A；
BrSNPA05020位于A05号染色体上第6796365位，其碱基为T或G；
BrSNPA05021位于A05号染色体上第7357437位，其碱基为C或A；
BrSNPA05022位于A05号染色体上第7531884位，其碱基为G或A；
BrSNPA05023位于A05号染色体上第7551654位，其碱基为G或A；
BrSNPA05024位于A05号染色体上第8088873位，其碱基为C或T；
BrSNPA05025位于A05号染色体上第8959623位，其碱基为G或A；
BrSNPA05026位于A05号染色体上第9401373位，其碱基为T或C；
BrSNPA05027位于A05号染色体上第9714592位，其碱基为G或C；
BrSNPA05028位于A05号染色体上第9832276位，其碱基为T或C；
BrSNPA05029位于A05号染色体上第9890212位，其碱基为T或A；
BrSNPA05030位于A05号染色体上第10343678位，其碱基为G或A；
BrSNPA05031位于A05号染色体上第10705210位，其碱基为C或A；
BrSNPA05032位于A05号染色体上第10722668位，其碱基为T或C；
BrSNPA05033位于A05号染色体上第10887243位，其碱基为T或C；
BrSNPA05034位于A05号染色体上第14441564位，其碱基为G或A；
BrSNPA05035位于A05号染色体上第14794179位，其碱基为T或C；
BrSNPA05036位于A05号染色体上第14801567位，其碱基为T或G；
BrSNPA05037位于A05号染色体上第14960042位，其碱基为G或C；
BrSNPA05038位于A05号染色体上第16182627位，其碱基为T或A；
BrSNPA05039位于A05号染色体上第16282153位，其碱基为T或C；
BrSNPA05040位于A05号染色体上第16543992位，其碱基为T或C；
BrSNPA05041位于A05号染色体上第16988803位，其碱基为T或A；
BrSNPA05042位于A05号染色体上第17247727位，其碱基为T或A；
BrSNPA05043位于A05号染色体上第17810370位，其碱基为G或A；
BrSNPA05044位于A05号染色体上第18626934位，其碱基为T或G；
BrSNPA05045位于A05号染色体上第19009544位，其碱基为G或C；
BrSNPA05046位于A05号染色体上第19022188位，其碱基为T或C；
BrSNPA05047位于A05号染色体上第20978461位，其碱基为C或A；
BrSNPA05048位于A05号染色体上第21254133位，其碱基为C或A；
BrSNPA05049位于A05号染色体上第21498528位，其碱基为G或A；
BrSNPA05050位于A05号染色体上第22030048位，其碱基为C或T；
BrSNPA05051位于A05号染色体上第22731111位，其碱基为G或C；
BrSNPA05052位于A05号染色体上第22895070位，其碱基为C或A；
BrSNPA05053位于A05号染色体上第22962829位，其碱基为T或C；
BrSNPA06001位于A06号染色体上第18887位，其碱基为C或G；
BrSNPA06002位于A06号染色体上第117846位，其碱基为A或G；
BrSNPA06003位于A06号染色体上第1296897位，其碱基为T或C；
BrSNPA06004位于A06号染色体上第1752922位，其碱基为G或A；
BrSNPA06005位于A06号染色体上第2426330位，其碱基为G或A；
BrSNPA06006位于A06号染色体上第2789766位，其碱基为T或G；
BrSNPA06007位于A06号染色体上第2931644位，其碱基为T或C；
BrSNPA06008位于A06号染色体上第6382083位，其碱基为C或A；
BrSNPA06009位于A06号染色体上第6403261位，其碱基为C或A；
BrSNPA06010位于A06号染色体上第8245454位，其碱基为G或A；
BrSNPA06011位于A06号染色体上第8618748位，其碱基为A或G；
BrSNPA06012位于A06号染色体上第10107459位，其碱基为G或A；
BrSNPA06013位于A06号染色体上第10568157位，其碱基为G或A；
BrSNPA06014位于A06号染色体上第10578879位，其碱基为T或C；
BrSNPA06015位于A06号染色体上第10874817位，其碱基为G或C；
BrSNPA06016位于A06号染色体上第11069822位，其碱基为T或G；
BrSNPA06017位于A06号染色体上第11344725位，其碱基为T或A；
BrSNPA06018位于A06号染色体上第12784985位，其碱基为T或C；
BrSNPA06019位于A06号染色体上第13424538位，其碱基为C或A；
BrSNPA06020位于A06号染色体上第13447511位，其碱基为G或A；
BrSNPA06021位于A06号染色体上第13534897位，其碱基为A或T；
BrSNPA06022位于A06号染色体上第13545093位，其碱基为T或C；
BrSNPA06023位于A06号染色体上第14701558位，其碱基为T或C；
BrSNPA06024位于A06号染色体上第14726472位，其碱基为C或A；
BrSNPA06025位于A06号染色体上第14730894位，其碱基为T或C；
BrSNPA06026位于A06号染色体上第14731133位，其碱基为T或A；
BrSNPA06027位于A06号染色体上第15606985位，其碱基为G或A；
BrSNPA06028位于A06号染色体上第15685596位，其碱基为G或A；
BrSNPA06029位于A06号染色体上第16018969位，其碱基为C或A；
BrSNPA06030位于A06号染色体上第16193195位，其碱基为G或C；
BrSNPA06031位于A06号染色体上第16201857位，其碱基为G或A；
BrSNPA06032位于A06号染色体上第16271874位，其碱基为T或A；
BrSNPA06033位于A06号染色体上第17483582位，其碱基为G或A；
BrSNPA06034位于A06号染色体上第17610866位，其碱基为A或G；
BrSNPA06035位于A06号染色体上第17773836位，其碱基为T或A；
BrSNPA06036位于A06号染色体上第18376779位，其碱基为G或A；
BrSNPA06037位于A06号染色体上第18546656位，其碱基为G或C；
BrSNPA06038位于A06号染色体上第18584746位，其碱基为G或A；
BrSNPA06039位于A06号染色体上第18685199位，其碱基为T或G；
BrSNPA06040位于A06号染色体上第19361503位，其碱基为G或C；
BrSNPA06041位于A06号染色体上第19387887位，其碱基为G或A；
BrSNPA06042位于A06号染色体上第20048140位，其碱基为G或A；
BrSNPA06043位于A06号染色体上第20833714位，其碱基为G或C；
BrSNPA06044位于A06号染色体上第20977558位，其碱基为T或C；
BrSNPA06045位于A06号染色体上第21415891位，其碱基为G或A；
BrSNPA06046位于A06号染色体上第21632076位，其碱基为G或A；
BrSNPA06047位于A06号染色体上第22374291位，其碱基为C或G；
BrSNPA06048位于A06号染色体上第23153503位，其碱基为C或A；
BrSNPA06049位于A06号染色体上第23563378位，其碱基为G或A；
BrSNPA06050位于A06号染色体上第23928146位，其碱基为G或A；
BrSNPA06051位于A06号染色体上第23955274位，其碱基为T或A；
BrSNPA06052位于A06号染色体上第24041088位，其碱基为C或T；
BrSNPA06053位于A06号染色体上第24284057位，其碱基为G或A；
BrSNPA06054位于A06号染色体上第24717886位，其碱基为C或A；
BrSNPA06055位于A06号染色体上第25147238位，其碱基为T或C；
BrSNPA07001位于A07号染色体上第246275位，其碱基为G或C；
BrSNPA07002位于A07号染色体上第641403位，其碱基为G或A；
BrSNPA07003位于A07号染色体上第1028346位，其碱基为T或A；
BrSNPA07004位于A07号染色体上第2560851位，其碱基为G或A；
BrSNPA07005位于A07号染色体上第2970833位，其碱基为A或G；
BrSNPA07006位于A07号染色体上第3216036位，其碱基为T或C；
BrSNPA07007位于A07号染色体上第3279889位，其碱基为T或G；
BrSNPA07008位于A07号染色体上第3358700位，其碱基为C或A；
BrSNPA07009位于A07号染色体上第3961792位，其碱基为T或A；
BrSNPA07010位于A07号染色体上第4234366位，其碱基为T或C；
BrSNPA07011位于A07号染色体上第5021185位，其碱基为T或G；
BrSNPA07012位于A07号染色体上第5153068位，其碱基为T或G；
BrSNPA07013位于A07号染色体上第6101124位，其碱基为T或A；
BrSNPA07014位于A07号染色体上第6254138位，其碱基为T或A；
BrSNPA07015位于A07号染色体上第6429733位，其碱基为T或C；
BrSNPA07016位于A07号染色体上第7129127位，其碱基为T或C；
BrSNPA07017位于A07号染色体上第7137784位，其碱基为G或A；
BrSNPA07018位于A07号染色体上第7249922位，其碱基为C或A；
BrSNPA07019位于A07号染色体上第8738315位，其碱基为T或G；
BrSNPA07020位于A07号染色体上第9057585位，其碱基为G或A；
BrSNPA07021位于A07号染色体上第9463049位，其碱基为T或C；
BrSNPA07022位于A07号染色体上第9678954位，其碱基为T或C；
BrSNPA07023位于A07号染色体上第11143455位，其碱基为T或C；
BrSNPA07024位于A07号染色体上第11295388位，其碱基为G或A；
BrSNPA07025位于A07号染色体上第11498098位，其碱基为T或G；
BrSNPA07026位于A07号染色体上第11520532位，其碱基为G或A；
BrSNPA07027位于A07号染色体上第11551826位，其碱基为T或C；
BrSNPA07028位于A07号染色体上第11750525位，其碱基为G或A；
BrSNPA07029位于A07号染色体上第12234015位，其碱基为C或T；
BrSNPA07030位于A07号染色体上第13554367位，其碱基为G或A；
BrSNPA07031位于A07号染色体上第14074310位，其碱基为T或C；
BrSNPA07032位于A07号染色体上第14523031位，其碱基为T或C；
BrSNPA07033位于A07号染色体上第14747998位，其碱基为T或A；
BrSNPA07034位于A07号染色体上第15655059位，其碱基为A或G；
BrSNPA07035位于A07号染色体上第15740558位，其碱基为C或A；
BrSNPA07036位于A07号染色体上第16130782位，其碱基为T或C；
BrSNPA07037位于A07号染色体上第16491110位，其碱基为T或G；
BrSNPA07038位于A07号染色体上第17285904位，其碱基为G或A；
BrSNPA07039位于A07号染色体上第18060124位，其碱基为T或G；
BrSNPA07040位于A07号染色体上第18453973位，其碱基为C或T；
BrSNPA07041位于A07号染色体上第19178191位，其碱基为T或C；
BrSNPA07042位于A07号染色体上第19761996位，其碱基为G或A；
BrSNPA07043位于A07号染色体上第19894600位，其碱基为T或C；
BrSNPA07044位于A07号染色体上第20112319位，其碱基为G或C；
BrSNPA07045位于A07号染色体上第21087891位，其碱基为A或G；
BrSNPA07046位于A07号染色体上第21941825位，其碱基为T或C；
BrSNPA07047位于A07号染色体上第22261109位，其碱基为T或G；
BrSNPA07048位于A07号染色体上第22291912位，其碱基为T或C；
BrSNPA07049位于A07号染色体上第22522822位，其碱基为C或T；
BrSNPA07050位于A07号染色体上第23348479位，其碱基为G或A；
BrSNPA07051位于A07号染色体上第24460147位，其碱基为G或C；
BrSNPA07052位于A07号染色体上第25407338位，其碱基为T或A；
BrSNPA07053位于A07号染色体上第25633222位，其碱基为G或A；
BrSNPA07054位于A07号染色体上第25744414位，其碱基为A或C；
BrSNPA08001位于A08号染色体上第100717位，其碱基为C或G；
BrSNPA08002位于A08号染色体上第240722位，其碱基为G或A；
BrSNPA08003位于A08号染色体上第277090位，其碱基为T或C；
BrSNPA08004位于A08号染色体上第926709位，其碱基为G或A；
BrSNPA08005位于A08号染色体上第1715093位，其碱基为G或A；
BrSNPA08006位于A08号染色体上第2121093位，其碱基为G或A；
BrSNPA08007位于A08号染色体上第2374634位，其碱基为G或A；
BrSNPA08008位于A08号染色体上第3289888位，其碱基为T或G；
BrSNPA08009位于A08号染色体上第3422941位，其碱基为C或G；
BrSNPA08010位于A08号染色体上第3911814位，其碱基为T或G；
BrSNPA08011位于A08号染色体上第3915045位，其碱基为T或C；
BrSNPA08012位于A08号染色体上第4419556位，其碱基为C或T；
BrSNPA08013位于A08号染色体上第5430112位，其碱基为T或G；
BrSNPA08014位于A08号染色体上第6266345位，其碱基为C或A；
BrSNPA08015位于A08号染色体上第7150432位，其碱基为G或A；
BrSNPA08016位于A08号染色体上第7588851位，其碱基为T或C；
BrSNPA08017位于A08号染色体上第8135981位，其碱基为C或A；
BrSNPA08018位于A08号染色体上第8933259位，其碱基为G或A；
BrSNPA08019位于A08号染色体上第9415744位，其碱基为T或G；
BrSNPA08020位于A08号染色体上第10869244位，其碱基为C或T；
BrSNPA08021位于A08号染色体上第11195840位，其碱基为T或A；
BrSNPA08022位于A08号染色体上第12382048位，其碱基为T或A；
BrSNPA08023位于A08号染色体上第12394480位，其碱基为T或A；
BrSNPA08024位于A08号染色体上第12855208位，其碱基为C或A；
BrSNPA08025位于A08号染色体上第12939081位，其碱基为G或C；
BrSNPA08026位于A08号染色体上第13838879位，其碱基为T或A；
BrSNPA08027位于A08号染色体上第14102664位，其碱基为G或C；
BrSNPA08028位于A08号染色体上第14112886位，其碱基为T或C；
BrSNPA08029位于A08号染色体上第14137581位，其碱基为T或C；
BrSNPA08030位于A08号染色体上第14580308位，其碱基为T或C；
BrSNPA08031位于A08号染色体上第14960288位，其碱基为G或C；
BrSNPA08032位于A08号染色体上第15007562位，其碱基为T或G；
BrSNPA08033位于A08号染色体上第15287418位，其碱基为G或C；
BrSNPA08034位于A08号染色体上第15734124位，其碱基为G或A；
BrSNPA08035位于A08号染色体上第16162051位，其碱基为T或G；
BrSNPA08036位于A08号染色体上第16415364位，其碱基为T或A；
BrSNPA08037位于A08号染色体上第16583368位，其碱基为T或C；
BrSNPA08038位于A08号染色体上第17179902位，其碱基为T或G；
BrSNPA08039位于A08号染色体上第17537125位，其碱基为T或C；
BrSNPA08040位于A08号染色体上第17877117位，其碱基为T或C；
BrSNPA08041位于A08号染色体上第18085207位，其碱基为T或C；
BrSNPA08042位于A08号染色体上第18668405位，其碱基为T或C；
BrSNPA08043位于A08号染色体上第19658257位，其碱基为G或A；
BrSNPA08044位于A08号染色体上第19860954位，其碱基为C或T；
BrSNPA08045位于A08号染色体上第19861288位，其碱基为C或T；
BrSNPA08046位于A08号染色体上第20202413位，其碱基为G或C；
BrSNPA08047位于A08号染色体上第20416840位，其碱基为G或A；
BrSNPA08048位于A08号染色体上第20458612位，其碱基为T或C；
BrSNPA08049位于A08号染色体上第20716882位，其碱基为G或C；
BrSNPA09001位于A09号染色体上第165179位，其碱基为G或C；
BrSNPA09002位于A09号染色体上第211286位，其碱基为T或A；
BrSNPA09003位于A09号染色体上第443160位，其碱基为T或A；
BrSNPA09004位于A09号染色体上第583658位，其碱基为A或G；
BrSNPA09005位于A09号染色体上第898133位，其碱基为T或A；
BrSNPA09006位于A09号染色体上第1161182位，其碱基为T或C；
BrSNPA09007位于A09号染色体上第1379762位，其碱基为G或A；
BrSNPA09008位于A09号染色体上第1595348位，其碱基为T或G；
BrSNPA09009位于A09号染色体上第1627618位，其碱基为G或C；
BrSNPA09010位于A09号染色体上第1901646位，其碱基为T或A；
BrSNPA09011位于A09号染色体上第1930677位，其碱基为G或C；
BrSNPA09012位于A09号染色体上第3019969位，其碱基为G或T；
BrSNPA09013位于A09号染色体上第3817906位，其碱基为G或C；
BrSNPA09014位于A09号染色体上第3896403位，其碱基为G或A；
BrSNPA09015位于A09号染色体上第3903092位，其碱基为G或C；
BrSNPA09016位于A09号染色体上第4226515位，其碱基为G或A；
BrSNPA09017位于A09号染色体上第4354836位，其碱基为C或A；
BrSNPA09018位于A09号染色体上第4534869位，其碱基为C或A；
BrSNPA09019位于A09号染色体上第4566148位，其碱基为G或A；
BrSNPA09020位于A09号染色体上第4597771位，其碱基为G或C；
BrSNPA09021位于A09号染色体上第5122605位，其碱基为C或A；
BrSNPA09022位于A09号染色体上第5480210位，其碱基为T或C；
BrSNPA09023位于A09号染色体上第5575779位，其碱基为T或G；
BrSNPA09024位于A09号染色体上第6031641位，其碱基为T或C；
BrSNPA09025位于A09号染色体上第6984636位，其碱基为T或C；
BrSNPA09026位于A09号染色体上第7624272位，其碱基为C或T；
BrSNPA09027位于A09号染色体上第7624862位，其碱基为G或T；
BrSNPA09028位于A09号染色体上第7897532位，其碱基为T或C；
BrSNPA09029位于A09号染色体上第8589991位，其碱基为G或T；
BrSNPA09030位于A09号染色体上第8773906位，其碱基为G或T；
BrSNPA09031位于A09号染色体上第8876252位，其碱基为T或A；
BrSNPA09032位于A09号染色体上第8877380位，其碱基为C或G；
BrSNPA09033位于A09号染色体上第9006311位，其碱基为C或A；
BrSNPA09034位于A09号染色体上第9062940位，其碱基为T或C；
BrSNPA09035位于A09号染色体上第9303625位，其碱基为T或G；
BrSNPA09036位于A09号染色体上第9805886位，其碱基为C或T；
BrSNPA09037位于A09号染色体上第10247545位，其碱基为C或A：
BrSNPA09038位于A09号染色体上第11056315位，其碱基为T或A；
BrSNPA09039位于A09号染色体上第11230572位，其碱基为G或A；
BrSNPA09040位于A09号染色体上第12895394位，其碱基为G或A；
BrSNPA09041位于A09号染色体上第13470942位，其碱基为T或C；
BrSNPA09042位于A09号染色体上第16265081位，其碱基为A或C；
BrSNPA09043位于A09号染色体上第17752348位，其碱基为G或C；
BrSNPA09044位于A09号染色体上第18332606位，其碱基为T或C；
BrSNPA09045位于A09号染色体上第18356344位，其碱基为G或A；
BrSNPA09046位于A09号染色体上第18406676位，其碱基为T或C；
BrSNPA09047位于A09号染色体上第18417691位，其碱基为T或G；
BrSNPA09048位于A09号染色体上第20994890位，其碱基为T或C；
BrSNPA09049位于A09号染色体上第21636788位，其碱基为G或A；
BrSNPA09050位于A09号染色体上第21654909位，其碱基为T或C；
BrSNPA09051位于A09号染色体上第21654935位，其碱基为T或C；
BrSNPA09052位于A09号染色体上第21910417位，其碱基为T或C；
BrSNPA09053位于A09号染色体上第22627850位，其碱基为G或A；
BrSNPA09054位于A09号染色体上第23220955位，其碱基为G或A；
BrSNPA09055位于A09号染色体上第23322031位，其碱基为G或A；
BrSNPA09056位于A09号染色体上第25785187位，其碱基为G或A；
BrSNPA09057位于A09号染色体上第26222141位，其碱基为T或C；
BrSNPA09058位于A09号染色体上第26503872位，其碱基为T或A；
BrSNPA09059位于A09号染色体上第26520788位，其碱基为G或C；
BrSNPA09060位于A09号染色体上第26564841位，其碱基为G或A；
BrSNPA09061位于A09号染色体上第26594548位，其碱基为T或A；
BrSNPA09062位于A09号染色体上第26739505位，其碱基为T或A；
BrSNPA09063位于A09号染色体上第26924828位，其碱基为G或C；
BrSNPA09064位于A09号染色体上第27270361位，其碱基为T或C；
BrSNPA09065位于A09号染色体上第28770187位，其碱基为T或C；
BrSNPA09066位于A09号染色体上第29198476位，其碱基为T或C；
BrSNPA09067位于A09号染色体上第30179678位，其碱基为G或A；
BrSNPA09068位于A09号染色体上第30448774位，其碱基为T或A；
BrSNPA09069位于A09号染色体上第30507943位，其碱基为T或C；
BrSNPA09070位于A09号染色体上第31873135位，其碱基为T或C；
BrSNPA09071位于A09号染色体上第31875876位，其碱基为T或C；
BrSNPA09072位于A09号染色体上第32719234位，其碱基为C或T；
BrSNPA09073位于A09号染色体上第32983605位，其碱基为G或A；
BrSNPA09074位于A09号染色体上第33495110位，其碱基为A或C；
BrSNPA09075位于A09号染色体上第34559009位，其碱基为G或A；
BrSNPA09076位于A09号染色体上第37047265位，其碱基为T或G；
BrSNPA09077位于A09号染色体上第37238042位，其碱基为C或A；
BrSNPA09078位于A09号染色体上第37689520位，其碱基为T或A；
BrSNPA09079位于A09号染色体上第37741739位，其碱基为G或A；
BrSNPA09080位于A09号染色体上第37743859位，其碱基为G或A；
BrSNPA10001位于A10号染色体上第9384位，其碱基为T或G；
BrSNPA10002位于A10号染色体上第119709位，其碱基为T或A；
BrSNPA10003位于A10号染色体上第617354位，其碱基为T或A；
BrSNPA10004位于A10号染色体上第1861569位，其碱基为T或C；
BrSNPA10005位于A10号染色体上第3689550位，其碱基为T或C；
BrSNPA10006位于A10号染色体上第3708065位，其碱基为G或A；
BrSNPA10007位于A10号染色体上第3721991位，其碱基为T或C；
BrSNPA10008位于A10号染色体上第3800101位，其碱基为G或A；
BrSNPA10009位于A10号染色体上第3834274位，其碱基为C或A；
BrSNPA10010位于A10号染色体上第3849310位，其碱基为C或A；
BrSNPA10011位于A10号染色体上第3878034位，其碱基为T或A；
BrSNPA10012位于A10号染色体上第4497856位，其碱基为T或A；
BrSNPA10013位于A10号染色体上第4782602位，其碱基为T或C；
BrSNPA10014位于A10号染色体上第5601251位，其碱基为G或C；
BrSNPA10015位于A10号染色体上第5671082位，其碱基为G或A；
BrSNPA10016位于A10号染色体上第6046254位，其碱基为G或A；
BrSNPA10017位于A10号染色体上第6294669位，其碱基为T或G；
BrSNPA10018位于A10号染色体上第6364310位，其碱基为T或G；
BrSNPA10019位于A10号染色体上第6477381位，其碱基为C或A；
BrSNPA10020位于A10号染色体上第7174178位，其碱基为G或C；
BrSNPA10021位于A10号染色体上第7989917位，其碱基为G或C；
BrSNPA10022位于A10号染色体上第8425118位，其碱基为T或C；
BrSNPA10023位于A10号染色体上第8648405位，其碱基为T或A；
BrSNPA10024位于A10号染色体上第9700540位，其碱基为G或C；
BrSNPA10025位于A10号染色体上第10373824位，其碱基为G或A；
BrSNPA10026位于A10号染色体上第10740098位，其碱基为T或C；
BrSNPA10027位于A10号染色体上第12134922位，其碱基为A或G；
BrSNPA10028位于A10号染色体上第12492205位，其碱基为G或C；
BrSNPA10029位于A10号染色体上第12527035位，其碱基为G或C；
BrSNPA10030位于A10号染色体上第12619426位，其碱基为G或A；
BrSNPA10031位于A10号染色体上第13105346位，其碱基为C或A；
BrSNPA10032位于A10号染色体上第13127812位，其碱基为G或T；
BrSNPA10033位于A10号染色体上第13406296位，其碱基为T或G；
BrSNPA10034位于A10号染色体上第13716056位，其碱基为T或A；
BrSNPA10035位于A10号染色体上第13732849位，其碱基为T或C；
BrSNPA10036位于A10号染色体上第13859895位，其碱基为G或A；
BrSNPA10037位于A10号染色体上第14319070位，其碱基为T或A；
BrSNPA10038位于A10号染色体上第14443918位，其碱基为C或A；
BrSNPA10039位于A10号染色体上第14465630位，其碱基为G或C；
BrSNPA10040位于A10号染色体上第14638538位，其碱基为C或A；
BrSNPA10041位于A10号染色体上第15240989位，其碱基为G或C；
BrSNPA10042位于A10号染色体上第15835648位，其碱基为G或C；
BrSNPA10043位于A10号染色体上第16198723位，其碱基为G或A。
2.根据权利要求1所述的应用，其特征在于：所述“用于检测所述571个SNP位点的物质”为用于检测所述571个SNP位点的571组引物，所述571组引物中的每组引物由分别记为上游引物1和上游引物2的两条上游引物和一条下游引物组成；所述上游引物1的结构组成自5’端至3’端依次为：通用序列1、基因组特异序列、所述SNP位点的两种核苷酸中的一种；所述上游引物2的结构组成自5’端至3’端依次为：通用序列2、基因组特异序列、所述SNP位点的两种核苷酸中的另一种；所述下游引物仅由基因组特异序列组成。
3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于：在所述571组引物中，所有的所述上游引物中的基因组特异序列为将序列表中所有的序列X去除第1-21位后所得的1142个序列；所有的所述下游引物的核苷酸序列为序列表中所有的序列Y；其中，X为3N-2或3N-1，Y为3N，N为大于等于1且小于等于571的整数。
4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于：所述通用序列1的核苷酸序列如序列表中序列1的第1-21所示；所述通用序列2的核苷酸序列如序列表中序列2的第1-22所示。
5.根据权利要求4所述的应用，其特征在于：所述571组引物由序列表中序列1-序列1713所示的1713条单链DNA组成。
6.一种构建白菜DNA指纹数据库的方法，包括如下步骤：
(a1)分别提取用于构建白菜DNA指纹数据库的所有白菜品种的基因组DNA；
(a2)检测所述所有白菜品种的基因组DNA中权利要求1中所述的571个SNP位点的基因型，所得基因型数据即构成白菜DNA指纹数据库。
7.根据权利要求6所述的方法，其特征在于：所述方法的步骤(a2)中，是采用权利要求2-5任一中所述的“用于检测所述571个SNP位点的物质”检测所述所有白菜品种的基因组DNA中所述571个SNP位点的基因型的。
8.一种对白菜种质资源进行类群划分的方法，包括如下步骤：
(b1)分别提取待进行类群划分的所有白菜品种的基因组DNA；
(b2)检测所有所述白菜品种的基因组DNA中权利要求1中所述的571个SNP位点的基因型，根据所得基因型数据，建立聚类树状图，从而将所述所有白菜品种划分为不同类群。
9.根据权利要求8所述的方法，其特征在于：所述方法的步骤(b2)中，是采用权利要求2-5任一中所述的“用于检测所述571个SNP位点的物质”检测所述所有白菜品种的基因组DNA中所述571个SNP位点的基因型的。
10.一种白菜分子育种方法，包括如下步骤：将携带有目标性状的白菜供体亲本与白菜受体亲本杂交，再将所得杂交后代与所述白菜供体亲本进行若干次回交，分别检测所述白菜受体亲本以及所得的携带有所述目标性状的回交后代基因组DNA中权利要求1中所述的571个SNP位点的基因型，根据检测结果从携带有所述目标性状的所述回交后代中选择所述571个SNP位点的基因型与所述白菜受体亲本一致性最高的个体。
11.用于检测权利要求1中所述的571个SNP位点的基因型的产品，含有用于检测所述571个SNP位点的571组引物，所述571组引物中的每组引物由分别记为上游引物1和上游引物2的两条上游引物和一条下游引物组成；所述上游引物1的结构组成自5’端至3’端依次为：通用序列1、基因组特异序列、所述SNP位点的两种核苷酸中的一种；所述上游引物2的结构组成自5’端至3’端依次为：通用序列2、基因组特异序列、所述SNP位点的两种核苷酸中的另一种；所述下游引物仅由基因组特异序列组成。
12.根据权利要求11所述的产品，其特征在于：在所述571组引物中，所有的所述上游引物中的基因组特异序列为将序列表中所有的序列X去除第1-21位后所得的1142个序列；所有的所述下游引物的核苷酸序列为序列表中所有的序列Y；其中，X为3N-2或3N-1，Y为3N，N为大于等于1且小于等于571的整数。
13.根据权利要求12所述的产品，其特征在于：所述通用序列1的核苷酸序列如序列表中序列1的第1-21所示；所述通用序列2的核苷酸序列如序列表中序列2的第1-22所示。
14.根据权利要求13所述的产品，其特征在于：所述571组引物由序列表中序列1-序列1713所示的1713条单链DNA组成。
15.权利要求11-14中任一所述的产品在检测或辅助检测白菜基因组DNA中权利要求1中所述571个SNP位点的基因型中的应用。
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