CN104532359B - 玉米DNA指纹库构建及品种分子鉴定SNP核心位点组合-maizeSNP384 - Google Patents
玉米DNA指纹库构建及品种分子鉴定SNP核心位点组合-maizeSNP384 Download PDFInfo
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Abstract
本发明公开了一种用于玉米DNA指纹数据库构建和品种分析鉴定SNP核心位点组合maizeSNP384及其应用。本发明提供了384个SNP位点在如下任一中的应用：(1)构建玉米DNA指纹数据库；(2)检测玉米品种真实性；(3)玉米种质资源遗传分析；(4)玉米分子育种；所述384个SNP位点的物理位置是基于玉米品种B73的全基因组序列比对确定的，所述玉米品种B73全基因组序列的版本号为B73 RefGen V1；所述384个SNP位点是MG001‑MG384。实验证明，这384个SNP位点可应用于玉米品种DNA指纹数据库构建、品种真实性鉴定、种质资源类群划分，以及其它相关研究中。
Description
技术领域
本发明属于生物技术领域，涉及一种用于玉米DNA指纹数据库构建和品种分子鉴定的SNP核心位点组合maizeSNP384及其应用。
背景技术
玉米是重要的农作物，由于具有粮、经、果、饲、能多元用途而在全球广泛种植。2012年统计，玉米种植面积和总产量均居中国的第一位，在中国农业经济结构中具有关键作用。同时由于玉米为杂交作物、重组率高、遗传多样性丰富、以及较好的基因组学研究基础而成为遗传学研究的模式植物。自20世纪80年代以来，随着种业市场化的发展，我国玉米品种逐步增加，截止至2013年，已通过国家和省级审定的总品种数为6291个，其中国家审定503个，而且近几年每年参加国家、各省市的区域试验样品约2000个；申请品种权保护3585个，已授权1548个品种。庞大的玉米品种数量增加了品种管理的难度，同时，由于种质资源日趋狭窄，少数骨干亲本被集中应用，在原品种基础上仅改良少数甚至单个性状的依赖性派生品种增多，品种间的遗传差异越来越小，如何有效地管理和甄别数量庞大的玉米品种成为品种管理的难题。
传统田间种植鉴定、蛋白质电泳方法，由于区分能力有限，特别是随着育种技术的进步，品种间差异越来越小，这些方法已完全不能满足准确、快速鉴定的需要。DNA指纹鉴定技术具有不受环境影响、快速、准确的优点，成为目前玉米品种鉴定的重要手段。DNA指纹(DNA fingerprinting)指不同品种间遗传物质DNA的碱基组分、排列顺序及长度各不相同，分别呈现出各自特有的DNA序列，它们就像人类的指纹一样，具有专一性和特异性，因此被形象的称为DNA指纹；将能够检测区分上述DNA序列差异的技术称为DNA指纹鉴定技术(DNAfingerprinting technology)。各种DNA指纹鉴定标记，SSR和SNP由于均为共显性遗传、反映的是确定目的片段或序列信息的差异，染色体位置已知、具有高通量自动化的潜力而被UPOV(International Union for the Protection of New Varieties of Plants)的BMT分子测试指南推荐作为品种DNA指纹鉴定和数据库构建的优选标记。
SSR标记由于具有高区分能力、技术相对成熟简便，以及常规试验室即可开展的优势，在品种鉴定领域已应用十多年。但是随着技术的发展和鉴定需求的提高，SSR标记显示出了一些缺点：如位点通量难以提高，增加位点数目，工作量和成本都相应增加；不同电泳平台间数据共享困难等。SNP与SSR相比具有以下优势：一是在基因组中分布密度更高更均匀；二是SNP位点通常情况下为二等位基因，易实现平台间数据整合比较；三是更易实现位点高通量；四是SNP位点在基因内区域分布较多，可能与功能基因相关。近些年来，随着玉米全基因组序列信息的完善，大量SNP位点被开发，各种SNP基因分型平台的出现，SNP标记成为玉米品种DNA指纹鉴定和数据库构建最具发展潜力的标记系统。
SNP位点开发、筛选以及应用在玉米中具有较好的研究基础。基于Infinium或GoldenGate芯片技术平台各种SNP array被报道，如包含56110个位点高密度的SNP arraymaizeSNP50芯片，该芯片在全基因组关联分析、QTL定位中成功应用；包含768、1536个位点通量SNP芯片，该芯片在玉米种质资源遗传多样性评估、分子育种中成功应用；以及适于玉米品种DNA指纹分析和分子育种的通用型SNP芯片maizeSNP3072等。尽管有多种不同通量玉米SNP芯片可供使用，但是适于玉米真实性鉴定及指纹数据库构建的位点的选择标准与其它研究领域如遗传多样性、关联分析、分子育种等有很大差别，并不能直接将已报道的位点组合直接应用到玉米真实性鉴定和数据库构建中。
发明内容
本发明的目的是提供一种用于玉米指纹数据库构建和分子鉴定的核心SNP位点组合maizeSNP384及其应用。
本发明保护384个SNP位点在如下任一中的应用：
(1)构建玉米DNA指纹数据库；
(2)检测玉米品种真实性；
(3)玉米种质资源遗传分析(如类群划分、遗传结构分析或遗传多样性分析)；
(4)玉米分子育种；
所述384个SNP位点的物理位置是基于玉米品种B73的全基因组序列比对确定的，所述玉米品种B73全基因组序列的版本号为B73 RefGen V1；所述384个SNP位点是MG001-MG384(具体见实施例1)。
本发明所提供的位点组合可以形成用于检测所述384个SNP位点的基因芯片。
在本发明中，所述基因芯片具体是根据序列表中序列1-384所示序列按照Illumina公司的GoldenGate要求设计探针进而制作的芯片。
其中，根据序列表中序列1-384所示序列按照Illumina公司的GoldenGate要求设计探针具体是参照美国专利US 6355431和US 6429027进行的。
其中，序列表中序列1-384所示序列中n均表示a或t或c或g。
所述基因芯片在如下任一中的应用也属于本发明的保护范围：
(1)构建玉米DNA指纹数据库；
(2)检测玉米品种真实性；
(3)玉米种质资源遗传分析(如类群划分、遗传结构分析或遗传多样性分析)；
(4)玉米分子育种。
本发明还提供了一种构建玉米DNA指纹数据库的方法。
本发明所提供的构建玉米DNA指纹数据库的方法(记为方法A)，具体可包括如下步骤：
(a1)分别提取用于构建玉米DNA指纹数据库的所有玉米品种的基因组DNA；
(a2)利用所述基因芯片对每个所述玉米品种的基因组DNA进行所述384个SNP位点的检测，从而获得所有所述玉米品种在所述384个SNP位点上的基因型数据，即构成玉米DNA指纹数据库。
本发明还保护用于构建玉米DNA指纹数据库的试剂盒。
所述用于构建玉米DNA指纹数据库的试剂盒，含有所述基因芯片及记载有所述方法A的说明书。
本发明还提供了一种检测玉米品种真实性的方法。
本发明所提供的检测玉米品种真实性的方法(记为方法B)，具体可包括如下步骤：
(b1)分别提取待测玉米样品和对照玉米样品的基因组DNA；
(b2)利用所述基因芯片对所述待测玉米样品和所述对照玉米样品的基因组DNA分别进行所述384个SNP位点的检测，从而获得所述待测玉米样品和所述对照玉米样品各自在所述384个SNP位点上的基因型数据；
(b3)根据(b2)的结果，按照如下方法确定所述待测玉米样品的真实性与否：若所述待测玉米样品与所述对照玉米样品在所述384个SNP位点上的基因型数据中差异位点百分比小于5％，则所述待测玉米样品与所述对照玉米样品属于同一品种或候选属于同一品种；若所述待测玉米样品与所述对照玉米样品在所述384个SNP位点上的基因型数据中差异位点百分比大于等于5％，则所述待测玉米样品与所述对照玉米样品不属于同一品种。
本发明还保护用于检测玉米品种真实性的试剂盒。
所述用于检测玉米品种真实性的试剂盒，含有所述基因芯片及记载有所述方法B的说明书。
本发明还提供了一种对玉米种质资源进行类群划分的方法。
本发明所提供的对玉米种质资源进行类群划分的方法(记为方法C)，具体可包括如下步骤：
(c1)分别提取待进行类群划分的所有玉米品种的基因组DNA；
(c2)利用所述基因芯片对所有所述玉米品种的基因组DNA分别进行所述384个SNP位点的检测，从而获得所有所述玉米品种在所述384个SNP位点上的基因型数据；
(c3)根据步骤(c2)所得的基因型数据，建立聚类树状图(如NJ聚类树状图)，从而将所有所述玉米品种划分为不同类群。
在步骤(c3)中，所述“根据步骤(c2)所得的基因型数据，建立聚类树状图(如NJ聚类树状图)”具体为：根据步骤(c2)所得的基因型数据，利用Power-Marker ver.3.25软件，选用Rogers(1972)遗传距离计算法，分析建立NJ聚类树状图(neighbor-joining tree)。
本发明还保护用于对玉米种质资源进行类群划分的试剂盒。
所述用于对玉米种质资源进行类群划分的试剂盒，含有所述基因芯片及记载有所述方法C的说明书。
实验证明，这384个核心SNP位点具备兼容多平台、高稳定性、高重复性、高区分能力特点，满足标准指纹数据构建的要求；将待测玉米样品基因组DNA的这384个SNP位点基因型与对照玉米样品基因组DNA的所述384个SNP位点基因型进行比较，能够鉴别所述待测玉米品种的真实性；对骨干自交系分析显示，这384个SNP位点多态性较高而且无偏向性，能区分不同玉米类群。因此本发明提供的384个SNP位点可应用于玉米品种DNA指纹数据库构建、品种真实性鉴定、种质资源类群划分，以及其它相关研究中。这384个核心位点组合在玉米中的应用将加快我国玉米品种标准SNP指纹数据库构建的进程，推进SNP标记技术在真实性鉴定中的应用，为玉米品种管理、种子市场监测、企业维权等提供科技支撑，确保粮食生产安全；同时为玉米分子育种中种质资源分析奠定了技术基础，加快优良玉米新品种的选育进程。
附图说明
图1为基于300份玉米杂交种的384个SNP位点的基因型数据，品种间两两比较差异位点百分比分布图，横坐标为差异位点比值，纵坐标为两两比较的对数。
图2为基于300份玉米自交系的384个SNP位点的基因型数据，建立各类群的NJ聚类分析图。
具体实施方式
下述实施例中所使用的实验方法如无特殊说明，均为常规方法。
下述实施例中所用的材料、试剂等，如无特殊说明，均可从商业途径得到。
实施例1、用于玉米DNA指纹数据库构建和品种分子鉴定SNP核心位点组合maizeSNP384及其芯片的制备
基于300份玉米杂交种、300份国内外自交系以及240份DH系样品的3072个SNP位点数据(参见专利号为ZL 2012 8 0000286.2的中国发明专利)，从玉米通用型SNP芯片产品maizeSNP3072中，根据试验效果、区分效率、均匀分布原则筛选确定适于玉米真实性鉴定和指纹数据库构建的核心384个SNP位点。具体筛选过程分为三步：(1)根据以下指标“3072SNPs完全兼容GoldenGate和Infinium两种平台、高数据质量、MAF值≥0.2”获得1212个候选SNPs；(2)根据Illumina design rank score>＝0.7，AA、AB、BB三种基因型具备明显界限的原则获得800个候选SNPs；(3)包含96个区分杂种优势群的祖先信息位点；(4)基于在玉米自交系和杂交种具有高的区分能力，无紧密连锁，均匀分布的原则，确定了384个核心SNPs。
将384个SNP位点及其侧翼序列(具体参见序列表中序列1-384)提交Illumina公司(http://www.illumina.com)最终筛选评估获得的384个SNP位点，经芯片设计系统评估，384个SNP位点分值均在0.7以上，全部适合订制芯片。这384个SNP位点的物理位置及其侧翼序列是基于玉米品种B73的全基因组序列(版本号为B73 RefGen V1，网址：http://www.maizesequence.org/)比对确定的，所述384个SNP位点为MG001-MG384。
MG001位于1号染色体上第2291351位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG002位于1号染色体上第8950703位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG003位于1号染色体上第11450804位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG004位于1号染色体上第17673955位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG005位于1号染色体上第21456178位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG006位于1号染色体上第24680076位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG007位于1号染色体上第27908989位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG008位于1号染色体上第32276332位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG009位于1号染色体上第35094072位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG010位于1号染色体上第39182909位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG011位于1号染色体上第43113733位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG012位于1号染色体上第44702431位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG013位于1号染色体上第51119678位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG014位于1号染色体上第56663536位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG015位于1号染色体上第61693888位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG016位于1号染色体上第65906267位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG017位于1号染色体上第76603880位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG018位于1号染色体上第78211919位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG019位于1号染色体上第86755374位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG020位于1号染色体上第96547084位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG021位于1号染色体上第110113228位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG022位于1号染色体上第120826915位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG023位于1号染色体上第155470563位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG024位于1号染色体上第156581335位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG025位于1号染色体上第161564373位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG026位于1号染色体上第162595316位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG027位于1号染色体上第164414166位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG028位于1号染色体上第171401222位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG029位于1号染色体上第180787501位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG030位于1号染色体上第198107260位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG031位于1号染色体上第200694298位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG032位于1号染色体上第209039098位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG033位于1号染色体上第219701707位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG034位于1号染色体上第242421486位，其脱氧核苷酸为C或G；
MG035位于1号染色体上第244833433位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG036位于1号染色体上第247822084位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG037位于1号染色体上第252588825位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG038位于1号染色体上第262292730位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG039位于1号染色体上第264555055位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG040位于1号染色体上第268351644位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG041位于1号染色体上第271899595位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG042位于1号染色体上第275823657位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG043位于1号染色体上第276645374位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG044位于1号染色体上第278278236位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG045位于1号染色体上第280217079位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG046位于1号染色体上第281703161位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG047位于1号染色体上第284690172位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG048位于1号染色体上第286632553位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG049位于1号染色体上第288230871位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG050位于1号染色体上第289251466位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG051位于1号染色体上第291348621位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG052位于1号染色体上第295655509位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG053位于1号染色体上第297663954位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG054位于2号染色体上第2483514位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG055位于2号染色体上第3726615位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG056位于2号染色体上第4679569位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG057位于2号染色体上第6871249位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG058位于2号染色体上第8865202位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG059位于2号染色体上第21509279位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG060位于2号染色体上第33999904位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG061位于2号染色体上第46941561位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG062位于2号染色体上第47576473位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG063位于2号染色体上第57039873位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG064位于2号染色体上第105286286位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG065位于2号染色体上第107475133位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG066位于2号染色体上第108929606位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG067位于2号染色体上第141861097位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG068位于2号染色体上第148803932位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG069位于2号染色体上第153094141位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG070位于2号染色体上第157152392位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG071位于2号染色体上第179023674位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG072位于2号染色体上第182739969位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG073位于2号染色体上第187496675位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG074位于2号染色体上第192365750位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG075位于2号染色体上第193006055位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG076位于2号染色体上第196281500位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG077位于2号染色体上第197555652位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG078位于2号染色体上第201045737位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG079位于2号染色体上第204223382位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG080位于2号染色体上第209334570位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG081位于2号染色体上第212505369位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG082位于2号染色体上第215440964位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG083位于2号染色体上第217577775位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG084位于2号染色体上第220261901位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG085位于2号染色体上第221570008位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG086位于2号染色体上第222474438位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG087位于2号染色体上第231394325位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG088位于3号染色体上第8770902位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG089位于3号染色体上第14970725位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG090位于3号染色体上第23869473位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG091位于3号染色体上第25511136位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG092位于3号染色体上第27454866位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG093位于3号染色体上第28849320位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG094位于3号染色体上第54625695位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG095位于3号染色体上第56747962位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG096位于3号染色体上第57710146位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG097位于3号染色体上第66926417位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG098位于3号染色体上第102622567位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG099位于3号染色体上第106771959位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG100位于3号染色体上第113329366位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG101位于3号染色体上第114260854位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG102位于3号染色体上第119099014位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG103位于3号染色体上第122279513位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG104位于3号染色体上第128759257位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG105位于3号染色体上第131053938位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG106位于3号染色体上第137850581位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG107位于3号染色体上第138928574位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG108位于3号染色体上第147226099位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG109位于3号染色体上第148672043位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG110位于3号染色体上第151396685位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG111位于3号染色体上第155059601位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG112位于3号染色体上第159996630位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG113位于3号染色体上第161035765位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG114位于3号染色体上第167578743位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG115位于3号染色体上第171335941位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG116位于3号染色体上第172886369位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG117位于3号染色体上第178024230位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG118位于3号染色体上第179218369位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG119位于3号染色体上第182373006位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG120位于3号染色体上第194157875位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG121位于3号染色体上第198368844位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG122位于3号染色体上第199886758位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG123位于3号染色体上第201963177位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG124位于3号染色体上第204804088位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG125位于3号染色体上第206480087位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG126位于3号染色体上第207472248位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG127位于3号染色体上第210409715位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG128位于3号染色体上第216464994位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG129位于3号染色体上第219993851位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG130位于3号染色体上第224676822位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG131位于3号染色体上第227739402位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG132位于4号染色体上第4110799位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG133位于4号染色体上第14102037位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG134位于4号染色体上第18669851位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG135位于4号染色体上第19918437位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG136位于4号染色体上第20603065位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG137位于4号染色体上第22417298位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG138位于4号染色体上第31603521位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG139位于4号染色体上第32969498位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG140位于4号染色体上第37185517位，其脱氧核苷酸为A或T；
MG141位于4号染色体上第39618112位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG142位于4号染色体上第44935572位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG143位于4号染色体上第49953068位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG144位于4号染色体上第60772052位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG145位于4号染色体上第63205453位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG146位于4号染色体上第74819867位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG147位于4号染色体上第84515480位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG148位于4号染色体上第127661947位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG149位于4号染色体上第144740041位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG150位于4号染色体上第148408171位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG151位于4号染色体上第150350375位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG152位于4号染色体上第152756426位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG153位于4号染色体上第153974554位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG154位于4号染色体上第163354678位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG155位于4号染色体上第169055342位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG156位于4号染色体上第172299781位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG157位于4号染色体上第176236874位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG158位于4号染色体上第178880463位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG159位于4号染色体上第183219284位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG160位于4号染色体上第199500796位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG161位于4号染色体上第207116896位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG162位于4号染色体上第214133419位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG163位于4号染色体上第220507264位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG164位于4号染色体上第226913660位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG165位于4号染色体上第228720778位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG166位于4号染色体上第236000480位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG167位于4号染色体上第237089995位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG168位于4号染色体上第239151613位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG169位于4号染色体上第241804341位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG170位于4号染色体上第243991142位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG171位于4号染色体上第245958679位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG172位于5号染色体上第6834311位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG173位于5号染色体上第8455336位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG174位于5号染色体上第11300586位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG175位于5号染色体上第13312227位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG176位于5号染色体上第15322608位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG177位于5号染色体上第17751972位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG178位于5号染色体上第20877786位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG179位于5号染色体上第29237661位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG180位于5号染色体上第30962174位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG181位于5号染色体上第32366357位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG182位于5号染色体上第34957687位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG183位于5号染色体上第38118282位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG184位于5号染色体上第47690446位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG185位于5号染色体上第58345404位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG186位于5号染色体上第60225222位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG187位于5号染色体上第61401491位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG188位于5号染色体上第63405163位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG189位于5号染色体上第71939496位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG190位于5号染色体上第74212685位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG191位于5号染色体上第80094131位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG192位于5号染色体上第85316061位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG193位于5号染色体上第87467942位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG194位于5号染色体上第92863878位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG195位于5号染色体上第130105526位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG196位于5号染色体上第140441745位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG197位于5号染色体上第160334643位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG198位于5号染色体上第162869078位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG199位于5号染色体上第165807754位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG200位于5号染色体上第172457687位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG201位于5号染色体上第173587411位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG202位于5号染色体上第175266499位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG203位于5号染色体上第178947337位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG204位于5号染色体上第180432899位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG205位于5号染色体上第189820502位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG206位于5号染色体上第198858603位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG207位于5号染色体上第207337892位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG208位于5号染色体上第214557504位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG209位于5号染色体上第216663900位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG210位于6号染色体上第3594640位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG211位于6号染色体上第4846063位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG212位于6号染色体上第6531788位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG213位于6号染色体上第8128695位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG214位于6号染色体上第22681927位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG215位于6号染色体上第32270905位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG216位于6号染色体上第35198309位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG217位于6号染色体上第38316309位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG218位于6号染色体上第53943758位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG219位于6号染色体上第56351681位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG220位于6号染色体上第57045256位，其脱氧核苷酸为C或G；
MG221位于6号染色体上第61188500位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG222位于6号染色体上第79482057位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG223位于6号染色体上第81808364位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG224位于6号染色体上第85125129位，其脱氧核苷酸为A或T；
MG225位于6号染色体上第91885599位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG226位于6号染色体上第107244784位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG227位于6号染色体上第108014976位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG228位于6号染色体上第109992539位，其脱氧核苷酸为A或T；
MG229位于6号染色体上第111815960位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG230位于6号染色体上第114331962位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG231位于6号染色体上第118295778位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG232位于6号染色体上第120679943位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG233位于6号染色体上第123864232位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG234位于6号染色体上第125454442位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG235位于6号染色体上第132291403位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG236位于6号染色体上第133554115位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG237位于6号染色体上第134283221位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG238位于6号染色体上第136542962位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG239位于6号染色体上第139044614位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG240位于6号染色体上第141474407位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG241位于6号染色体上第144135018位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG242位于6号染色体上第151652863位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG243位于6号染色体上第153124779位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG244位于6号染色体上第154315312位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG245位于6号染色体上第158782994位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG246位于6号染色体上第161570136位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG247位于6号染色体上第164775898位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG248位于7号染色体上第1196570位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG249位于7号染色体上第5404415位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG250位于7号染色体上第7951257位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG251位于7号染色体上第9217626位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG252位于7号染色体上第13091087位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG253位于7号染色体上第20954691位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG254位于7号染色体上第42784665位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG255位于7号染色体上第46346662位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG256位于7号染色体上第52223281位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG257位于7号染色体上第55099122位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG258位于7号染色体上第71391771位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG259位于7号染色体上第75112826位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG260位于7号染色体上第77173926位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG261位于7号染色体上第83086969位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG262位于7号染色体上第91734137位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG263位于7号染色体上第93110227位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG264位于7号染色体上第96137669位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG265位于7号染色体上第101321793位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG266位于7号染色体上第103624919位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG267位于7号染色体上第111977099位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG268位于7号染色体上第114562381位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG269位于7号染色体上第118401811位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG270位于7号染色体上第120888593位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG271位于7号染色体上第126430375位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG272位于7号染色体上第127829509位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG273位于7号染色体上第130476806位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG274位于7号染色体上第131674513位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG275位于7号染色体上第137834968位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG276位于7号染色体上第138923162位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG277位于7号染色体上第142528488位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG278位于7号染色体上第147455775位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG279位于7号染色体上第150130995位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG280位于7号染色体上第151904405位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG281位于7号染色体上第153269358位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG282位于7号染色体上第156524408位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG283位于7号染色体上第157917621位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG284位于7号染色体上第163528332位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG285位于7号染色体上第166450957位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG286位于7号染色体上第169418608位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG287位于8号染色体上第2740538位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG288位于8号染色体上第4101256位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG289位于8号染色体上第7577347位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG290位于8号染色体上第10239988位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG291位于8号染色体上第14155221位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG292位于8号染色体上第16036321位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG293位于8号染色体上第21008409位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG294位于8号染色体上第31544514位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG295位于8号染色体上第40386926位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG296位于8号染色体上第56449824位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG297位于8号染色体上第64421998位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG298位于8号染色体上第66004593位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG299位于8号染色体上第69075165位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG300位于8号染色体上第72045416位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG301位于8号染色体上第76577600位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG302位于8号染色体上第77649015位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG303位于8号染色体上第83396810位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG304位于8号染色体上第84621877位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG305位于8号染色体上第97223736位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG306位于8号染色体上第99742088位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG307位于8号染色体上第109039339位，其脱氧核苷酸为C或G；
MG308位于8号染色体上第110391167位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG309位于8号染色体上第112317793位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG310位于8号染色体上第116211524位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG311位于8号染色体上第117366117位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG312位于8号染色体上第123929882位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG313位于8号染色体上第126026260位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG314位于8号染色体上第136908118位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG315位于8号染色体上第138282157位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG316位于8号染色体上第143828070位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG317位于8号染色体上第145235320位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG318位于8号染色体上第146874220位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG319位于8号染色体上第151781335位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG320位于8号染色体上第152551904位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG321位于8号染色体上第158103013位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG322位于8号染色体上第160463296位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG323位于8号染色体上第163639505位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG324位于8号染色体上第165094135位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG325位于8号染色体上第170127814位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG326位于8号染色体上第171785389位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG327位于8号染色体上第173505727位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG328位于9号染色体上第1038593位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG329位于9号染色体上第3777183位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG330位于9号染色体上第7122193位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG331位于9号染色体上第11340882位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG332位于9号染色体上第12461059位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG333位于9号染色体上第15894689位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG334位于9号染色体上第17342675位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG335位于9号染色体上第24087842位，其脱氧核苷酸为A或T；
MG336位于9号染色体上第27171025位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG337位于9号染色体上第32183124位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG338位于9号染色体上第47685154位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG339位于9号染色体上第53942150位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG340位于9号染色体上第59199744位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG341位于9号染色体上第61122296位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG342位于9号染色体上第64139007位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG343位于9号染色体上第86073765位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG344位于9号染色体上第92803136位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG345位于9号染色体上第94432509位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG346位于9号染色体上第98302469位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG347位于9号染色体上第100692646位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG348位于9号染色体上第119458911位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG349位于9号染色体上第122610816位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG350位于9号染色体上第138755619位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG351位于9号染色体上第143941650位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG352位于9号染色体上第144601527位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG353位于9号染色体上第146255553位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG354位于9号染色体上第146927858位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG355位于9号染色体上第150460618位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG356位于10号染色体上第2218807位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG357位于10号染色体上第10220689位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG358位于10号染色体上第22176194位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG359位于10号染色体上第32150546位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG360位于10号染色体上第42274147位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG361位于10号染色体上第49126182位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG362位于10号染色体上第60802340位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG363位于10号染色体上第76459965位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG364位于10号染色体上第81927296位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG365位于10号染色体上第84003048位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG366位于10号染色体上第89336128位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG367位于10号染色体上第95729487位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG368位于10号染色体上第103236809位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG369位于10号染色体上第109208850位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG370位于10号染色体上第113996493位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG371位于10号染色体上第117558317位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG372位于10号染色体上第121274991位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG373位于10号染色体上第129100890位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG374位于10号染色体上第130006259位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG375位于10号染色体上第130673535位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG376位于10号染色体上第131550491位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG377位于10号染色体上第132148750位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG378位于10号染色体上第133502119位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG379位于10号染色体上第134965045位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG380位于10号染色体上第135550678位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG381位于10号染色体上第136799253位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG382位于10号染色体上第139770786位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG383位于10号染色体上第144513547位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG384位于10号染色体上第147119052位，其脱氧核苷酸为A或G。
将序列表中序列1-384提供给Illumina公司(http://www.illumina.com)，按照Illumina GoldenGate专利制造技术(美国专利，US 6355431和US 6429027)制作得到用于检测这384个SNP位点的芯片，将其命名为maizeSNP384。
实施例2、利用实施例1制备的SNP芯片构建玉米标准DNA指纹
1、DNA提取及质量鉴定
常规CTAB法分别提取用于构建玉米DNA指纹数据库的所有玉米品种的基因组DNA，并去除RNA。用琼脂糖电泳和紫外分光光度计分别检测所提取DNA的质量，发现提取的基因组DNA均达到了相关的质量要求，即琼脂糖电泳显示DNA条带单一，没有明显弥散；紫外分光光度计检测A260/280介于1.8-2.0之间(DNA样品没有蛋白污染)；A260/230介于1.8-2.0之间(DNA样品盐离子浓度低)；270nm没有明显的光吸收(DNA样品没有酚污染)；DNA浓度>50ng/μl；芯片检测DNA用量500ng/每样品。稀释DNA浓度成为50ng/μl左右。
2、SNP芯片检测
采用实施例1制备的maizeSNP384芯片对步骤1获得的各玉米品种的基因组DNA进行384个SNP位点的检测。具体按照Illumina GoldenGate芯片检测标准流程操作(GoldenGate Genotyping Assay,Manual,http://www.illumina.com)，使用IlluminaiScan芯片扫描仪(iScan，美国Illumina公司)扫描芯片，获得每个样本的原始数据。
3、基因型指纹数据
原始数据导入GenomeStudio software v2010软件，分析每个样品384个位点的基因型，最后导出获得SNP指纹数据。
实施例3、利用实施例1制备的SNP芯片鉴别玉米品种的真实性
一、利用实施例1制备的SNP芯片maizeSNP384鉴别玉米品种真实性检测结果判断标准的确定
与其它研究领域位点筛选原则不同，除了自交系样品之外，本发明还采用了大量杂交种作为评估材料，评估位点特异性、稳定性和品种区分能力，最终获得384个核心SNP位点(SNP位点筛选方法具体参见实施例1)。将300份玉米杂交种(1984-2011年国家审定推广品种)两两比较差异位点百分比分析，结果显示，几乎所有成对比较样品(98.91％)之间差异位点百分比介于40％-75％之间；其中差异位点百分比为60％左右的占据最多；差异位点百分比低于5％的成对比较样品数目极少，占据0.033％，因此384个位点完全可以应用到玉米品种真实性鉴定中，达到区分确认品种的鉴定目的(图1)。根据以上结果，将差异位点百分比5％作为玉米品种真实性鉴定的判断标准。
另外，农业行业标准(NY/T1432-2014)《玉米品种鉴定技术规程SSR标记法》，此标准为基于SSR标记的玉米品种DNA指纹鉴定方法，此标准将40个SSR位点中大于等于2个位点差异的品种认为是不同品种，按照位点比率计算同为5％差异。
所以，利用本发明进行玉米品种真实性检测具体判断标准如下：
获得待测样品和对照样品在384个SNP位点的基因型数据，并进行样品间数据比较，得到差异位点百分比。差异位点百分比的计算方法为D＝(差异位点数n/比较位点数N)×100％(比较位点数必须大≥365个，即数据缺失率＜5％，N最大值为384)。
(1)待测和对照品种间差异位点百分比≥5％，结论为检测到明显差异；
(2)待测和对照品种间差异位点百分比＜5％，结论为未检测到明显差异。
二、鉴定待测玉米样品是否为某已知对照玉米品种
以下将详述如何利用实施例1制备的SNP芯片maizeSNP384鉴别待测玉米样品(代号为A)是否为已知的对照玉米品种郑单958(代号为B)。
DNA提取及质量鉴定：提取待测玉米样品(代号为A)和对照玉米品种郑单958(代号为B)的基因组DNA，进行DNA质量鉴定、芯片检测和384个位点基因型指纹数据获得，具体方法同实施例2。
将样品A和样品B的384个SNP位点基因型指纹数据进行比对，结果为，A样品(待测玉米样品)和作为对照玉米样品的B样品(已知玉米品种郑单958)比较位点数为384个，差异位点数为243个，差异位点百分比为63％。根据5％的判断标准，鉴定待测玉米样品A不是郑单958。
另外，采用目前我国正在使用的40个SSR核心位点进行真实性鉴定的行业标准(NY/T1432-2014，玉米品种鉴定技术规程SSR标记法)进行检测，进一步证实玉米样品A不是郑单958。
实施例4、利用实施例1制备的SNP芯片对玉米种质资源进行类群划分。
本发明提供的384个SNP位点在筛选之初，由于考虑到区分玉米各杂种优势群的祖先信息型位点，因此可以用于玉米种质资源分析，如类群划分。以下将详述利用实施例1制备的SNP芯片maizeSNP384对300份不同杂种优势群代表自交系样品进行杂种优势群划分。
300份待分析样品DNA提取及质量鉴定、芯片检测和384个位点基因型指纹数据获得，具体方法同实施例2。基于获得的300份样品384个位点的基因型数据，利用Power-Marker ver.3.25软件，选用Rogers(1972)遗传距离计算法，分析建立NJ聚类树状图(neighbor-joining trree)，300份样品被划分为到不同的群内。
结果如图2所示，从图中可以看出，7个类群(唐四平头、P、改良瑞德、旅大红骨、兰卡斯特、甜糯、SSS)均能较好的区分开来。
Claims (9)
1.384个SNP位点在如下任一中的应用：
(1)构建玉米DNA指纹数据库；
(2)检测玉米品种真实性；
(3)玉米种质资源遗传分析；
(4)玉米分子育种；
所述384个SNP位点的物理位置是基于玉米品种B73的全基因组序列比对确定的，所述玉米品种B73全基因组序列的版本号为B73RefGen V1；所述384个SNP位点是MG001-MG384；
MG001位于1号染色体上第2291351位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG002位于1号染色体上第8950703位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG003位于1号染色体上第11450804位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG004位于1号染色体上第17673955位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG005位于1号染色体上第21456178位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG006位于1号染色体上第24680076位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG007位于1号染色体上第27908989位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG008位于1号染色体上第32276332位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG009位于1号染色体上第35094072位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG010位于1号染色体上第39182909位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG011位于1号染色体上第43113733位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG012位于1号染色体上第44702431位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG013位于1号染色体上第51119678位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG014位于1号染色体上第56663536位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG015位于1号染色体上第61693888位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG016位于1号染色体上第65906267位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG017位于1号染色体上第76603880位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG018位于1号染色体上第78211919位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG019位于1号染色体上第86755374位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG020位于1号染色体上第96547084位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG021位于1号染色体上第110113228位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG022位于1号染色体上第120826915位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG023位于1号染色体上第155470563位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG024位于1号染色体上第156581335位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG025位于1号染色体上第161564373位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG026位于1号染色体上第162595316位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG027位于1号染色体上第164414166位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG028位于1号染色体上第171401222位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG029位于1号染色体上第180787501位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG030位于1号染色体上第198107260位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG031位于1号染色体上第200694298位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG032位于1号染色体上第209039098位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG033位于1号染色体上第219701707位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG034位于1号染色体上第242421486位，其脱氧核苷酸为C或G；
MG035位于1号染色体上第244833433位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG036位于1号染色体上第247822084位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG037位于1号染色体上第252588825位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG038位于1号染色体上第262292730位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG039位于1号染色体上第264555055位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG040位于1号染色体上第268351644位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG041位于1号染色体上第271899595位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG042位于1号染色体上第275823657位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG043位于1号染色体上第276645374位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG044位于1号染色体上第278278236位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG045位于1号染色体上第280217079位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG046位于1号染色体上第281703161位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG047位于1号染色体上第284690172位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG048位于1号染色体上第286632553位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG049位于1号染色体上第288230871位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG050位于1号染色体上第289251466位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG051位于1号染色体上第291348621位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG052位于1号染色体上第295655509位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG053位于1号染色体上第297663954位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG054位于2号染色体上第2483514位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG055位于2号染色体上第3726615位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG056位于2号染色体上第4679569位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG057位于2号染色体上第6871249位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG058位于2号染色体上第8865202位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG059位于2号染色体上第21509279位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG060位于2号染色体上第33999904位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG061位于2号染色体上第46941561位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG062位于2号染色体上第47576473位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG063位于2号染色体上第57039873位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG064位于2号染色体上第105286286位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG065位于2号染色体上第107475133位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG066位于2号染色体上第108929606位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG067位于2号染色体上第141861097位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG068位于2号染色体上第148803932位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG069位于2号染色体上第153094141位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG070位于2号染色体上第157152392位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG071位于2号染色体上第179023674位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG072位于2号染色体上第182739969位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG073位于2号染色体上第187496675位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG074位于2号染色体上第192365750位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG075位于2号染色体上第193006055位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG076位于2号染色体上第196281500位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG077位于2号染色体上第197555652位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG078位于2号染色体上第201045737位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG079位于2号染色体上第204223382位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG080位于2号染色体上第209334570位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG081位于2号染色体上第212505369位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG082位于2号染色体上第215440964位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG083位于2号染色体上第217577775位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG084位于2号染色体上第220261901位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG085位于2号染色体上第221570008位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG086位于2号染色体上第222474438位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG087位于2号染色体上第231394325位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG088位于3号染色体上第8770902位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG089位于3号染色体上第14970725位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG090位于3号染色体上第23869473位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG091位于3号染色体上第25511136位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG092位于3号染色体上第27454866位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG093位于3号染色体上第28849320位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG094位于3号染色体上第54625695位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG095位于3号染色体上第56747962位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG096位于3号染色体上第57710146位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG097位于3号染色体上第66926417位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG098位于3号染色体上第102622567位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG099位于3号染色体上第106771959位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG100位于3号染色体上第113329366位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG101位于3号染色体上第114260854位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG102位于3号染色体上第119099014位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG103位于3号染色体上第122279513位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG104位于3号染色体上第128759257位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG105位于3号染色体上第131053938位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG106位于3号染色体上第137850581位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG107位于3号染色体上第138928574位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG108位于3号染色体上第147226099位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG109位于3号染色体上第148672043位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG110位于3号染色体上第151396685位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG111位于3号染色体上第155059601位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG112位于3号染色体上第159996630位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG113位于3号染色体上第161035765位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG114位于3号染色体上第167578743位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG115位于3号染色体上第171335941位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG116位于3号染色体上第172886369位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG117位于3号染色体上第178024230位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG118位于3号染色体上第179218369位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG119位于3号染色体上第182373006位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG120位于3号染色体上第194157875位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG121位于3号染色体上第198368844位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG122位于3号染色体上第199886758位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG123位于3号染色体上第201963177位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG124位于3号染色体上第204804088位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG125位于3号染色体上第206480087位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG126位于3号染色体上第207472248位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG127位于3号染色体上第210409715位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG128位于3号染色体上第216464994位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG129位于3号染色体上第219993851位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG130位于3号染色体上第224676822位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG131位于3号染色体上第227739402位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG132位于4号染色体上第4110799位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG133位于4号染色体上第14102037位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG134位于4号染色体上第18669851位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG135位于4号染色体上第19918437位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG136位于4号染色体上第20603065位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG137位于4号染色体上第22417298位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG138位于4号染色体上第31603521位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG139位于4号染色体上第32969498位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG140位于4号染色体上第37185517位，其脱氧核苷酸为A或T；
MG141位于4号染色体上第39618112位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG142位于4号染色体上第44935572位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG143位于4号染色体上第49953068位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG144位于4号染色体上第60772052位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG145位于4号染色体上第63205453位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG146位于4号染色体上第74819867位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG147位于4号染色体上第84515480位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG148位于4号染色体上第127661947位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG149位于4号染色体上第144740041位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG150位于4号染色体上第148408171位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG151位于4号染色体上第150350375位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG152位于4号染色体上第152756426位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG153位于4号染色体上第153974554位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG154位于4号染色体上第163354678位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG155位于4号染色体上第169055342位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG156位于4号染色体上第172299781位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG157位于4号染色体上第176236874位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG158位于4号染色体上第178880463位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG159位于4号染色体上第183219284位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG160位于4号染色体上第199500796位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG161位于4号染色体上第207116896位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG162位于4号染色体上第214133419位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG163位于4号染色体上第220507264位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG164位于4号染色体上第226913660位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG165位于4号染色体上第228720778位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG166位于4号染色体上第236000480位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG167位于4号染色体上第237089995位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG168位于4号染色体上第239151613位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG169位于4号染色体上第241804341位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG170位于4号染色体上第243991142位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG171位于4号染色体上第245958679位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG172位于5号染色体上第6834311位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG173位于5号染色体上第8455336位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG174位于5号染色体上第11300586位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG175位于5号染色体上第13312227位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG176位于5号染色体上第15322608位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG177位于5号染色体上第17751972位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG178位于5号染色体上第20877786位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG179位于5号染色体上第29237661位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG180位于5号染色体上第30962174位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG181位于5号染色体上第32366357位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG182位于5号染色体上第34957687位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG183位于5号染色体上第38118282位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG184位于5号染色体上第47690446位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG185位于5号染色体上第58345404位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG186位于5号染色体上第60225222位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG187位于5号染色体上第61401491位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG188位于5号染色体上第63405163位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG189位于5号染色体上第71939496位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG190位于5号染色体上第74212685位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG191位于5号染色体上第80094131位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG192位于5号染色体上第85316061位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG193位于5号染色体上第87467942位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG194位于5号染色体上第92863878位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG195位于5号染色体上第130105526位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG196位于5号染色体上第140441745位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG197位于5号染色体上第160334643位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG198位于5号染色体上第162869078位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG199位于5号染色体上第165807754位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG200位于5号染色体上第172457687位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG201位于5号染色体上第173587411位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG202位于5号染色体上第175266499位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG203位于5号染色体上第178947337位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG204位于5号染色体上第180432899位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG205位于5号染色体上第189820502位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG206位于5号染色体上第198858603位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG207位于5号染色体上第207337892位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG208位于5号染色体上第214557504位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG209位于5号染色体上第216663900位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG210位于6号染色体上第3594640位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG211位于6号染色体上第4846063位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG212位于6号染色体上第6531788位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG213位于6号染色体上第8128695位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG214位于6号染色体上第22681927位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG215位于6号染色体上第32270905位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG216位于6号染色体上第35198309位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG217位于6号染色体上第38316309位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG218位于6号染色体上第53943758位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG219位于6号染色体上第56351681位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG220位于6号染色体上第57045256位，其脱氧核苷酸为C或G；
MG221位于6号染色体上第61188500位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG222位于6号染色体上第79482057位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG223位于6号染色体上第81808364位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG224位于6号染色体上第85125129位，其脱氧核苷酸为A或T；
MG225位于6号染色体上第91885599位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG226位于6号染色体上第107244784位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG227位于6号染色体上第108014976位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG228位于6号染色体上第109992539位，其脱氧核苷酸为A或T；
MG229位于6号染色体上第111815960位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG230位于6号染色体上第114331962位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG231位于6号染色体上第118295778位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG232位于6号染色体上第120679943位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG233位于6号染色体上第123864232位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG234位于6号染色体上第125454442位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG235位于6号染色体上第132291403位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG236位于6号染色体上第133554115位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG237位于6号染色体上第134283221位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG238位于6号染色体上第136542962位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG239位于6号染色体上第139044614位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG240位于6号染色体上第141474407位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG241位于6号染色体上第144135018位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG242位于6号染色体上第151652863位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG243位于6号染色体上第153124779位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG244位于6号染色体上第154315312位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG245位于6号染色体上第158782994位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG246位于6号染色体上第161570136位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG247位于6号染色体上第164775898位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG248位于7号染色体上第1196570位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG249位于7号染色体上第5404415位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG250位于7号染色体上第7951257位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG251位于7号染色体上第9217626位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG252位于7号染色体上第13091087位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG253位于7号染色体上第20954691位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG254位于7号染色体上第42784665位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG255位于7号染色体上第46346662位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG256位于7号染色体上第52223281位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG257位于7号染色体上第55099122位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG258位于7号染色体上第71391771位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG259位于7号染色体上第75112826位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG260位于7号染色体上第77173926位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG261位于7号染色体上第83086969位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG262位于7号染色体上第91734137位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG263位于7号染色体上第93110227位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG264位于7号染色体上第96137669位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG265位于7号染色体上第101321793位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG266位于7号染色体上第103624919位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG267位于7号染色体上第111977099位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG268位于7号染色体上第114562381位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG269位于7号染色体上第118401811位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG270位于7号染色体上第120888593位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG271位于7号染色体上第126430375位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG272位于7号染色体上第127829509位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG273位于7号染色体上第130476806位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG274位于7号染色体上第131674513位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG275位于7号染色体上第137834968位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG276位于7号染色体上第138923162位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG277位于7号染色体上第142528488位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG278位于7号染色体上第147455775位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG279位于7号染色体上第150130995位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG280位于7号染色体上第151904405位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG281位于7号染色体上第153269358位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG282位于7号染色体上第156524408位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG283位于7号染色体上第157917621位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG284位于7号染色体上第163528332位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG285位于7号染色体上第166450957位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG286位于7号染色体上第169418608位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG287位于8号染色体上第2740538位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG288位于8号染色体上第4101256位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG289位于8号染色体上第7577347位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG290位于8号染色体上第10239988位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG291位于8号染色体上第14155221位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG292位于8号染色体上第16036321位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG293位于8号染色体上第21008409位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG294位于8号染色体上第31544514位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG295位于8号染色体上第40386926位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG296位于8号染色体上第56449824位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG297位于8号染色体上第64421998位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG298位于8号染色体上第66004593位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG299位于8号染色体上第69075165位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG300位于8号染色体上第72045416位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG301位于8号染色体上第76577600位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG302位于8号染色体上第77649015位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG303位于8号染色体上第83396810位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG304位于8号染色体上第84621877位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG305位于8号染色体上第97223736位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG306位于8号染色体上第99742088位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG307位于8号染色体上第109039339位，其脱氧核苷酸为C或G；
MG308位于8号染色体上第110391167位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG309位于8号染色体上第112317793位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG310位于8号染色体上第116211524位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG311位于8号染色体上第117366117位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG312位于8号染色体上第123929882位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG313位于8号染色体上第126026260位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG314位于8号染色体上第136908118位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG315位于8号染色体上第138282157位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG316位于8号染色体上第143828070位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG317位于8号染色体上第145235320位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG318位于8号染色体上第146874220位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG319位于8号染色体上第151781335位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG320位于8号染色体上第152551904位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG321位于8号染色体上第158103013位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG322位于8号染色体上第160463296位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG323位于8号染色体上第163639505位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG324位于8号染色体上第165094135位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG325位于8号染色体上第170127814位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG326位于8号染色体上第171785389位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG327位于8号染色体上第173505727位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG328位于9号染色体上第1038593位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG329位于9号染色体上第3777183位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG330位于9号染色体上第7122193位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG331位于9号染色体上第11340882位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG332位于9号染色体上第12461059位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG333位于9号染色体上第15894689位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG334位于9号染色体上第17342675位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG335位于9号染色体上第24087842位，其脱氧核苷酸为A或T；
MG336位于9号染色体上第27171025位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG337位于9号染色体上第32183124位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG338位于9号染色体上第47685154位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG339位于9号染色体上第53942150位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG340位于9号染色体上第59199744位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG341位于9号染色体上第61122296位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG342位于9号染色体上第64139007位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG343位于9号染色体上第86073765位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG344位于9号染色体上第92803136位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG345位于9号染色体上第94432509位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG346位于9号染色体上第98302469位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG347位于9号染色体上第100692646位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG348位于9号染色体上第119458911位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG349位于9号染色体上第122610816位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG350位于9号染色体上第138755619位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG351位于9号染色体上第143941650位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG352位于9号染色体上第144601527位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG353位于9号染色体上第146255553位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG354位于9号染色体上第146927858位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG355位于9号染色体上第150460618位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG356位于10号染色体上第2218807位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG357位于10号染色体上第10220689位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG358位于10号染色体上第22176194位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG359位于10号染色体上第32150546位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG360位于10号染色体上第42274147位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG361位于10号染色体上第49126182位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG362位于10号染色体上第60802340位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG363位于10号染色体上第76459965位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG364位于10号染色体上第81927296位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG365位于10号染色体上第84003048位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG366位于10号染色体上第89336128位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG367位于10号染色体上第95729487位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG368位于10号染色体上第103236809位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG369位于10号染色体上第109208850位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG370位于10号染色体上第113996493位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG371位于10号染色体上第117558317位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG372位于10号染色体上第121274991位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG373位于10号染色体上第129100890位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG374位于10号染色体上第130006259位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG375位于10号染色体上第130673535位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG376位于10号染色体上第131550491位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG377位于10号染色体上第132148750位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG378位于10号染色体上第133502119位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG379位于10号染色体上第134965045位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG380位于10号染色体上第135550678位，其脱氧核苷酸为A或G；
MG381位于10号染色体上第136799253位，其脱氧核苷酸为T或G；
MG382位于10号染色体上第139770786位，其脱氧核苷酸为T或C；
MG383位于10号染色体上第144513547位，其脱氧核苷酸为A或C；
MG384位于10号染色体上第147119052位，其脱氧核苷酸为A或G。
2.用于检测权利要求1中所述384个SNP位点的基因芯片。
3.权利要求2所述的基因芯片在如下任一中的应用：
(1)构建玉米DNA指纹数据库；
(2)检测玉米品种真实性；
(3)玉米种质资源遗传分析；
(4)玉米分子育种。
4.一种构建玉米DNA指纹数据库的方法，包括如下步骤：
(a1)分别提取用于构建玉米DNA指纹数据库的所有玉米品种的基因组DNA；
(a2)利用权利要求2所述的基因芯片对每个所述玉米品种的基因组DNA进行所述384个SNP位点的检测，从而获得所有所述玉米品种在所述384个SNP位点上的基因型数据，即构成玉米DNA指纹数据库。
5.一种用于构建玉米DNA指纹数据库的试剂盒，含有权利要求2所述的基因芯片及记载有权利要求4所述方法的说明书。
6.一种检测玉米品种真实性的方法，包括如下步骤：
(b1)分别提取待测玉米样品和对照玉米样品的基因组DNA；
(b2)利用权利要求2所述的基因芯片对所述待测玉米样品和所述对照玉米样品的基因组DNA分别进行所述384个SNP位点的检测，从而获得所述待测玉米样品和所述对照玉米样品各自在所述384个SNP位点上的基因型数据；
(b3)根据(b2)的结果，按照如下方法确定所述待测玉米样品的真实性与否：若所述待测玉米样品与所述对照玉米样品在所述384个SNP位点上的基因型数据中差异位点百分比小于5％，则所述待测玉米样品与所述对照玉米样品属于同一品种或候选属于同一品种；若所述待测玉米样品与所述对照玉米样品在所述384个SNP位点上的基因型数据中差异位点百分比大于等于5％，则所述待测玉米样品与所述对照玉米样品不属于同一品种或候选不属于同一品种。
7.一种用于检测玉米品种真实性的试剂盒，含有权利要求2所述的基因芯片及记载有权利要求6所述方法的说明书。
8.一种对玉米种质资源进行类群划分的方法，包括如下步骤：
(c1)分别提取待进行类群划分的所有玉米品种的基因组DNA；
(c2)利用权利要求2所述的基因芯片对所有所述玉米品种的基因组DNA分别进行所述384个SNP位点的检测，从而获得所有所述玉米品种在所述384个SNP位点上的基因型数据；
(c3)根据步骤(c2)所得的基因型数据，建立聚类树状图，从而将所有所述玉米品种划分为不同类群。
9.一种用于对玉米种质资源进行类群划分的试剂盒，含有权利要求2所述的基因芯片及记载有权利要求8所述方法的说明书。
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