CN106404474A - 丝状真菌质谱鉴定蛋白提取技术 - Google Patents
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Abstract
本发明涉及一种丝状真菌质谱鉴定蛋白提取方法,包括用75%乙醇灭活洗脱丝状真菌的菌丝;再用磁珠加上合适比例的甲酸和乙腈结合旋涡震荡充分乳化和碾磨其细胞壁;最后用超声波超声破碎细胞,从而有利于真菌蛋白的完全析出,即可用于质谱的鉴定。通过这样富集提取的蛋白纯度和产量较高,可以使得大多数临床常见丝状真菌如曲霉菌属、暗色真菌、接合菌属、镰刀菌属、尖端赛多孢子菌、双相真菌的质谱鉴定到种的水平。
Description
技术领域
本发明涉及临床标本病原性真菌的蛋白检测,属于医学分子生物学领域。
背景技术
近几年来基质辅助激光解析飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)已越来越多的用于临床上病原微生物的鉴定。其在普通细菌的鉴定能力上已完全能够和传统的生化反应鉴定技术和金标准的序列测定技术相媲美。但在少见病原如分支杆菌、诺卡菌、真菌的鉴定方面由于这些病原菌自身的生长结构特点导致其蛋白提取效果不甚理想。因而不能达到满意的鉴定效果。
目前临床上常用的化学提取丝状真菌蛋白的方法只能提取临床上常见丝状真菌的少数菌属,对多数丝状真菌提取效果不甚理想,因此需要开发出一种新的提取方法解决存在的问题。本发明通过大量富集丝状真菌的菌丝,借助乙醇的洗脱沉淀纯化、磁珠的碾磨、超声波的破碎和甲酸乙腈的提取能够得到高纯度的丝状真菌蛋白,将能够使质谱鉴定丝状真菌的技术得到更好的应用。
发明内容
本发明的目的是提供一种临床标本丝状真菌质谱鉴定蛋白提取技术。所涉及的临床标本丝状真菌质谱鉴定蛋白提取技术采用7步法。是在临床常用的化学提取法基础上改进而来。在甲酸乙腈化学提取的基础上加入磁珠研磨和超声破碎步骤,通过反复提取,丝状真菌的蛋白能够充分释放出来,即可用于后续的高质量的质谱鉴定。具体作法为:
(1)液体沙保弱培养基垂直旋转培养临床丝状真菌,直至培养出足够多的丝状真菌,静止10分钟,待其沉淀;
(2)弃上清培养液,收集1.5ml的沉淀转移至eppendorf管中,13000rpm 离心2分钟,弃上清;再用75%的乙醇1ml 13000rpm 离心灭活洗脱3分钟。重复用75%的乙醇1ml洗脱沉淀2次,待沉淀充分干燥;
(3)沉淀中加入等量的0.1mm磁珠,视沉淀多少加入20~100µL的70%甲酸水溶液(要求加入的甲酸水溶液没过沉淀),充分研磨,漩涡震荡混匀作用5分钟;
(4)再加入等体积的乙腈溶液,充分研磨,漩涡震荡混匀作用5分钟;
(5)超声波超声破碎2分钟;
(6)13000rpm离心2分钟,吸取 1 µL 上清液添加到 MALDI靶板上,并在室温下自然晾干;
(7)在上述样品点上覆盖 1 µL HCCA 基质溶液并在室温下自然晾干。即可上机质谱鉴定。
本发明具有快速、灵敏度高、蛋白提取纯度高、产量高的特点,能够使质谱鉴定丝状真菌的能力从属的水平提高到种的水平。
Claims (1)
1.丝状真菌质谱鉴定蛋白提取技术,包括以下步骤:
(1)液体沙保弱培养基垂直旋转培养临床丝状真菌,直至培养出足够多的丝状真菌,静止10分钟,待其沉淀;
(2)弃上清培养液,收集1.5ml的沉淀转移至eppendorf管中,13000rpm 离心2分钟,弃上清;再用75%的乙醇1ml
13000rpm 离心灭活洗脱3分钟;重复用75%的乙醇1ml洗脱沉淀2次,待沉淀充分干燥;
(3)沉淀中加入等量的0.1mm磁珠,视沉淀多少加入20~100µL的70%甲酸水溶液(要求加入的甲酸水溶液没过沉淀),充分研磨,漩涡震荡混匀作用5分钟;
(4)再加入等体积的乙腈溶液,充分研磨,漩涡震荡混匀作用5分钟;
(5)超声波超声破碎2分钟;
(6)13000rpm离心2分钟,吸取 1 µL 上清液添加到 MALDI靶板上,并在室温下自然晾干;
(7)在上述样品点上覆盖 1 µL HCCA 基质溶液并在室温下自然晾干;即可上机质谱鉴定。
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Cited By (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN112430257A (zh) * | 2020-10-28 | 2021-03-02 | 融智生物科技(青岛)有限公司 | 用于产聚合物双歧杆菌蛋白提取的提取剂及提取方法与应用 |
CN112577795A (zh) * | 2019-09-27 | 2021-03-30 | 布鲁克道尔顿有限公司 | 用于基质辅助电离(例如maldi)的质谱样品制备 |
CN113219046A (zh) * | 2021-06-08 | 2021-08-06 | 郑州安图生物工程股份有限公司 | 基于基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱的丝状真菌多维蛋白指纹图谱数据库构建方法 |
Citations (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102253111A (zh) * | 2011-06-09 | 2011-11-23 | 曹际娟 | Maldi-tof ms辅助鉴定单增李斯特氏菌的方法 |
CN102653558A (zh) * | 2012-05-22 | 2012-09-05 | 中国农业大学 | 一种单链抗体及其在检测黄曲霉毒素中的应用 |
CN102766214A (zh) * | 2011-05-05 | 2012-11-07 | 中国科学院上海生命科学研究院 | 含蛋白标签的sumo融合蛋白及其应用 |
CN102808223A (zh) * | 2012-08-02 | 2012-12-05 | 向华 | 结核分枝杆菌的核酸指纹特征图谱库及其用途 |
CN103713065A (zh) * | 2014-01-06 | 2014-04-09 | 上海市农业科学院 | 一种同时检测多种真菌毒素的方法 |
CN103743808A (zh) * | 2014-01-17 | 2014-04-23 | 中国药科大学 | 人乳腺癌细胞乙酰化p53蛋白同位素标记定量方法 |
CN103823008A (zh) * | 2014-03-14 | 2014-05-28 | 北京市疾病预防控制中心 | 构建液相色谱-质谱数据库检测未知毒物的方法 |
CN104596816A (zh) * | 2015-01-09 | 2015-05-06 | 深圳出入境检验检疫局动植物检验检疫技术中心 | 一种用于maldi-tof ms检测的植物线虫前处理方法 |
CN104797939A (zh) * | 2012-05-01 | 2015-07-22 | 奥克索伊德有限公司 | 微生物分析的设备和方法 |
-
2015
- 2015-12-25 CN CN201510985224.7A patent/CN106404474B/zh active Active
Patent Citations (9)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN102766214A (zh) * | 2011-05-05 | 2012-11-07 | 中国科学院上海生命科学研究院 | 含蛋白标签的sumo融合蛋白及其应用 |
CN102253111A (zh) * | 2011-06-09 | 2011-11-23 | 曹际娟 | Maldi-tof ms辅助鉴定单增李斯特氏菌的方法 |
CN104797939A (zh) * | 2012-05-01 | 2015-07-22 | 奥克索伊德有限公司 | 微生物分析的设备和方法 |
CN102653558A (zh) * | 2012-05-22 | 2012-09-05 | 中国农业大学 | 一种单链抗体及其在检测黄曲霉毒素中的应用 |
CN102808223A (zh) * | 2012-08-02 | 2012-12-05 | 向华 | 结核分枝杆菌的核酸指纹特征图谱库及其用途 |
CN103713065A (zh) * | 2014-01-06 | 2014-04-09 | 上海市农业科学院 | 一种同时检测多种真菌毒素的方法 |
CN103743808A (zh) * | 2014-01-17 | 2014-04-23 | 中国药科大学 | 人乳腺癌细胞乙酰化p53蛋白同位素标记定量方法 |
CN103823008A (zh) * | 2014-03-14 | 2014-05-28 | 北京市疾病预防控制中心 | 构建液相色谱-质谱数据库检测未知毒物的方法 |
CN104596816A (zh) * | 2015-01-09 | 2015-05-06 | 深圳出入境检验检疫局动植物检验检疫技术中心 | 一种用于maldi-tof ms检测的植物线虫前处理方法 |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
李明春等: "一种快速、有效提取丝状真菌总RNA的方法", 《吉林农业大学学报》 * |
李锐等: "丝状真菌蛋白质组分析方法的建立", 《华北农学报》 * |
Cited By (7)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN112577795A (zh) * | 2019-09-27 | 2021-03-30 | 布鲁克道尔顿有限公司 | 用于基质辅助电离(例如maldi)的质谱样品制备 |
GB2589182A (en) * | 2019-09-27 | 2021-05-26 | Bruker Daltonik Gmbh | Mass spectrometric sample preparation for matrix-assisted Ionization (e.g. MALDI) |
US11145499B2 (en) | 2019-09-27 | 2021-10-12 | Bruker Daltonik Gmbh | Mass spectrometric sample preparation for matrix-assisted ionization |
GB2589182B (en) * | 2019-09-27 | 2022-04-06 | Bruker Daltonics Gmbh & Co Kg | Mass spectrometric sample preparation for matrix-assisted Ionization (e.g. MALDI) |
CN112577795B (zh) * | 2019-09-27 | 2024-02-20 | 布鲁克·道尔顿有限及两合公司 | 用于基质辅助电离的质谱样品制备 |
CN112430257A (zh) * | 2020-10-28 | 2021-03-02 | 融智生物科技(青岛)有限公司 | 用于产聚合物双歧杆菌蛋白提取的提取剂及提取方法与应用 |
CN113219046A (zh) * | 2021-06-08 | 2021-08-06 | 郑州安图生物工程股份有限公司 | 基于基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱的丝状真菌多维蛋白指纹图谱数据库构建方法 |
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Publication number | Publication date |
---|---|
CN106404474B (zh) | 2018-03-06 |
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