CN105713990B - 小麦分子标记及其在鉴定小麦产量相关性状中的应用 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了小麦分子标记及其在鉴定小麦产量相关性状中的应用。本发明公开的小麦分子标记，为以小麦的基因组DNA为模板、采用引物对P进行扩增得到的DNA分子；引物对P由名称为p1和p2的单链DNA组成，p1为与小麦基因组DNA中序列1的第70位上游特异结合的单链DNA，p2为与小麦基因组DNA中序列1的第241位下游特异结合的单链DNA；根据小麦分子标记对小麦进行基因型分型，共可以得到三种均为纯合型的基因型，即A1A1基因型、A2A2基因型和A3A3基因型。实验证明，小麦的A1A1、A2A2与A3A3基因型与小麦产量相关性状——每穗小穗数、单株穗数和千粒重相关，可以用于在培育高产量小麦品种。
Description
技术领域
本发明涉及生物技术领域中小麦分子标记及其在鉴定小麦产量相关性状中的应用。
背景技术
小麦(Triticum aestivum L.)作为世界上最主要粮食作物之一，其安全生产是人类粮食安全的重要保障。而选育高产小麦品种这一条经济有效的途径，对人类粮食生产安全具有极为重要的战略意义。常规育种通常进行表型选择，尽管也取得很大的进步，但是耗时费力；相比较而言，分子标记辅助育种策略较为简单易行且可以高效利用优异基因，从而显著加快育种进程。
发明内容
本发明所要解决的技术问题是如何鉴定小麦产量相关性状，如千粒重、每穗小穗数和/或单株穗数。
为解决上述技术问题，本发明首先提供了小麦分子标记在鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状中的应用；
所述小麦分子标记，其名称为CAPS-7A，为以小麦的基因组DNA为模板、采用引物对P进行扩增得到的DNA分子；所述引物对P由名称为p1和p2的单链DNA组成，所述p1为与小麦基因组DNA中序列1的第70位上游特异结合的单链DNA，所述p2为与小麦基因组DNA中序列1的第241位下游特异结合的单链DNA。
具体的，所述小麦分子标记，为小麦A基因组DNA中对应于序列1的第70位-第240位为下述1)、2)或3)：
1)序列1的第70位-第240位；
2)序列2的第70位-第240位；
3)序列3的第70位-第254位。
序列1由294个核苷酸组成，序列2由294个核苷酸组成，序列3由307个核苷酸组成。序列1与序列2的序列仅在第218位不同，序列1的第218位为T，序列2的第218位为G；序列3与序列1有三处不同，序列3为在序列1的第70位与第71位间插入TCTCTCTCTCTCTC、将序列1的第218位的T突变为G、并将序列1的第240位的C缺失得到的序列。
上述应用中，所述p1可为序列4所示的单链DNA，所述p2可为序列5所示的单链DNA。
为解决上述技术问题，本发明还提供了鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状的引物对，所述引物对为所述引物对P。
所述引物对P的两条单链DNA的摩尔比可为1:1。所述引物对P的两条单链DNA可独立包装。
为解决上述技术问题，本发明还提供了鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状的成套试剂，所述成套试剂由所述引物对P与限制性内切酶NcoⅠ组成。
其中，所述引物对P与限制性内切酶NcoⅠ可独立包装。
为解决上述技术问题，本发明还提供了鉴定或辅助鉴定小麦基因型的方法，所述基因型为A1A1基因型、A2A2基因型、A3A3基因型、A1A2基因型、A1A3基因型和A2A3基因型，所述方法为下述L、M、N或O：
L、包括如下L1)和L2)：
L1)以待测小麦基因组DNA为模板，利用所述引物对P进行PCR扩增得到PCR产物；
L2)检测步骤L1)得到的PCR产物的序列，如果所述PCR产物含有X1所示的DNA片段但不含有X2或X3所示的DNA片段，所述待测小麦为A1A1基因型小麦；如果所述PCR产物含有所述X2所示的DNA片段且不含有所述X1或所述X3所示的DNA片段，所述待测小麦为A2A2基因型小麦；如果所述PCR产物含有所述X3所示的DNA片段且不含有所述X1或所述X2所示的DNA片段，所述待测小麦为A3A3基因型小麦；如果所述PCR产物含有所述X1和所述X2所示的DNA片段且不含有所述X3所示的DNA片段，所述待测小麦为A1A2基因型小麦；如果所述PCR产物含有所述X1和所述X3所示的DNA片段且不含有所述X2所示的DNA片段，所述待测小麦为A1A3基因型小麦；如果所述PCR产物含有所述X2和所述X3所示的DNA片段且不含有所述X1所示的DNA片段，所述待测小麦为A2A3基因型小麦；
所述X1为序列1的第70位-第240位；
所述X2为序列2的第70位-第240位；
所述X3为序列3的第70位-第254位；
M、包括如下M1)和M2)：
M1)以待测小麦基因组DNA为模板，利用所述引物对P进行PCR扩增得到PCR产物；
M2)检测步骤M1)得到的PCR产物的序列，如果所述PCR产物的序列为序列1，所述待测小麦为A1A1基因型小麦；如果所述PCR产物的序列为序列2，所述待测小麦为A2A2基因型小麦；如果所述PCR产物的序列为序列3，所述待测小麦为A3A3基因型小麦；如果所述PCR产物的序列为序列1和序列2，所述待测小麦为A1A2基因型小麦；如果所述PCR产物的序列为序列1和序列3，所述待测小麦为A1A3基因型小麦；如果所述PCR产物的序列为序列2和序列3，所述待测小麦为A2A3基因型小麦；
N、包括如下N1)和N2)：
N1)以待测小麦基因组DNA为模板，利用所述引物对P进行PCR扩增得到PCR产物，采用限制性内切酶NcoI处理所述PCR产物得到酶切产物；
N2)检测步骤N1)得到的酶切产物的大小，如果所述酶切产物为一条294bp的DNA片段，所述待测小麦为A1A1基因型小麦；如果所述酶切产物为两条大小分别为215bp和79bp的DNA片段，所述待测小麦为A2A2基因型小麦；如果所述酶切产物为两条大小分别为229bp和78bp的DNA片段，所述待测小麦为A3A3基因型小麦；如果所述酶切产物为三条大小分别为294bp、215bp和79bp的DNA片段，所述待测小麦为A1A2基因型小麦；如果所述酶切产物为三条大小分别为294bp、229bp和78bp的DNA片段，所述待测小麦为A1A3基因型小麦；如果所述酶切产物为四条大小分别为215bp、79bp、229bp和78bp的DNA片段，所述待测小麦为A2A3基因型小麦；
O、检测待测小麦基因组DNA中对应于序列1的第70位-第240位的DNA片段的序列，如果对应于序列1的第70位-第240位的DNA片段的序列为O1),所述待测小麦为A1A1基因型小麦；如果对应于序列1的第70位-第240位的DNA片段的序列为O2),所述待测小麦为A2A2基因型小麦；如果对应于序列1的第70位-第240位的DNA片段的序列为O3),所述待测小麦为A3A3基因型小麦；如果对应于序列1的第70位-第240位的DNA片段的序列为所述O1)和所述O2),所述待测小麦为A1A2基因型小麦；如果对应于序列1的第70位-第240位的DNA片段的序列为所述O1)和所述O3),所述待测小麦为A1A3基因型小麦；如果对应于序列1的第70位-第240位的DNA片段的序列为所述O2)和所述O3),所述待测小麦为A2A3基因型小麦；
所述O1)为序列1的第70位-第240位；
所述O2)为序列2的第70位-第240位；
所述O3)为序列3的第70位-第254位。
其中，A1A1基因型小麦的千粒重高于A3A3基因型小麦的千粒重，A2A2基因型小麦的千粒重高于A3A3基因型小麦的千粒重；A1A1基因型小麦的每穗小穗数小于A3A3基因型小麦的每穗小穗数，A2A2基因型小麦的每穗小穗数小于A3A3基因型小麦的每穗小穗数；A1A1基因型小麦的单株穗数小于A3A3基因型小麦的单株穗数。
上述鉴定或辅助鉴定小麦基因型的方法中，利用所述引物对P进行PCR扩增的反应体系可含有：PCR buffer、所述p1和所述p2、dNTPs、DNA聚合酶、基因组DNA和水。所述反应体系具体可为：ddH2O 8.0μL、5×PCR buffer 3.0μL、引物p1(5μmol/L)和p2(5μmol/L)各0.6μL、dNTPs(2.5μmol/L)0.4μL、transfastpfu酶(5U)0.3μL、基因组DNA(20ng/μL)2.1μL。其中，5×PCR buffer和transfastpfu(5U)均可为北京全式金生物技术有限公司产品,dNTPs为Roche公司产品。
所述PCR扩增退火温度可为59℃。所述PCR扩增的条件具体可为:95℃5min,95℃30s,59℃30s,72℃30s,35次循环；72℃10min。
上述鉴定或辅助鉴定小麦基因型的方法中，检测待测小麦基因组DNA中对应于序列1的第70位-第240位的DNA片段的序列时，只要可以检测出该段DNA的序列即可，如通过DNA杂交的方法进行检测，具体可如Southern印记杂交。
为解决上述技术问题，本发明还提供了鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状的方法，所述方法为下述1)、2)或3)：
1)鉴定或辅助鉴定小麦千粒重性状的方法，包括按照所述鉴定或辅助鉴定小麦基因型的方法鉴定待测小麦的基因型，根据待测小麦的基因型确定所述待测小麦的千粒重性状：A1A1基因型待测小麦的千粒重高于或候选高于A3A3基因型待测小麦的千粒重，A2A2基因型待测小麦的千粒重高于或候选高于A3A3基因型待测小麦的千粒重；
2)鉴定或辅助鉴定小麦每穗小穗数性状的方法，包括按照所述鉴定或辅助鉴定小麦基因型的方法鉴定待测小麦的基因型，根据待测小麦的基因型确定所述待测小麦的每穗小穗数性状：A1A1基因型待测小麦的每穗小穗数小于或候选小于A3A3基因型待测小麦的每穗小穗数，A2A2基因型待测小麦的每穗小穗数小于或候选小于A3A3基因型待测小麦的每穗小穗数；
3)鉴定或辅助鉴定小麦单株穗数性状的方法，包括按照所述鉴定或辅助鉴定小麦基因型的方法鉴定待测小麦的基因型，根据待测小麦的基因型确定所述待测小麦的单株穗数性状：A1A1基因型待测小麦的单株穗数小于或候选小于A3A3基因型待测小麦的单株穗数。
上述鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状的方法中，所述待测小麦不为A1A3基因型小麦、A1A2基因型小麦和A2A3基因型小麦。
为解决上述技术问题，本发明还提供了CAPS-7A。
为解决上述技术问题，本发明还提供了下述Ⅰ-Ⅵ中的任一种：
Ⅰ、所述引物对P在下述Z1-Z5任一种中的应用；
Z1、鉴定或辅助鉴定小麦基因型；
Z2、制备鉴定或辅助鉴定小麦基因型产品；
Z3、鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状；所述小麦产量相关性状为小麦千粒重、每穗小穗数和/或单株穗数；
Z4、制备鉴定或辅助鉴定所述小麦产量相关性状产品；
Z5、小麦育种；
Ⅱ、所述成套试剂在上述Z1-Z5任一种中的应用；
Ⅲ、所述鉴定或辅助鉴定小麦基因型的方法在上述Z3或Z5中的应用；
Ⅳ、所述鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状的方法在上述Z5中的应用；
Ⅴ、CAPS-7A在上述Z5中的应用。
Ⅵ、检测CAPS-7A的物质在上述Z1-Z5任一种中的应用。
所述检测CAPS-7A的物质可为由所述成套试剂与进行PCR扩增所需的其他试剂和/或仪器。所述进行PCR扩增所需的其他试剂可为含有dATP、dTTP、dCTP和dGTP的dNTPs、DNA聚合酶和/或PCR反应缓冲液；所述进行PCR扩增所需的仪器可为PCR仪。
为解决上述技术问题，本发明还提供了小麦育种方法，所述方法包括按照所述鉴定或辅助鉴定小麦基因型的方法鉴定小麦的基因型，选择A1A1、A2A2或A3A3基因型的小麦作为亲本进行育种。
本发明中，所述小麦产量相关性状可为小麦千粒重、每穗小穗数和/或单株穗数。
本发明中，在检测PCR产物的大小时，可通过电泳检测，也可通过测序检测。
实验证明，本发明的发明人根据发现了一个与小麦产量相关的小麦分子标记CAPS-7A，根据CAPS-7A对小麦进行基因型分型，共可以得到三种均为纯合型的基因型，即A1A1基因型、A2A2基因型和A3A3基因型。A1A1与A2A2基因型小麦的每穗小穗数均极显著低于A3A3基因型小麦，A1A1与A2A2基因型小麦间的每穗小穗数无显著差异；A1A1基因型小麦的单株穗数极显著低于A3A3基因型小麦，A1A1与A2A2基因型小麦间的单株穗数无显著差异，A2A2与A3A3基因型小麦间的单株穗数无显著差异；A1A1与A2A2基因型小麦的千粒重均显著高于A3A3基因型小麦，A1A1与A2A2基因型小麦间的千粒重无显著差异。说明本发明中的CAPS-7A能够在选育小麦具有优异产量性状中起作用。本发明为小麦分子标记辅助选择育种提供了一个新的方法，在培养高产量小麦品种或研究中具有重要意义。
具体实施方式
下面结合具体实施方式对本发明进行进一步的详细描述，给出的实施例仅为了阐明本发明，而不是为了限制本发明的范围。
下述实施例中的实验方法，如无特殊说明，均为常规方法。
下述实施例中所用的材料、试剂等，如无特殊说明，均可从商业途径得到。
下述实施例中的5×PCR buffer和transfastpfu(5U)均为北京全式金生物技术有限公司产品,产品目录号为AP221-02；dNTPs为Roche公司产品，产品货号为#316K5S。
下述实施例中的NcoⅠ为Fermentas公司产品，产品目录号为ER0575。
实施例1、CAPS-7A与小麦产量相关性状相关
一、CAPS-7A的发现
本发明的发明人根据表1中32份普通六倍体小麦品种(来自于国家种质资源库，公众可从国家种质资源库获得)发现了一个与小麦产量相关的小麦分子标记，将其命名为CAPS-7A，该CAPS-7A为以小麦基因组DNA为模板、利用引物对P进行PCR扩增得到的PCR产物，在不同的小麦品种中共有三种序列，序列1、序列2和序列3。引物对P由名称为p1和p2的单链DNA组成，p1为序列4(5′-AGTCTATACCCCACACCCCATC-3′)所示的单链DNA，p2为序列5(5′-GCATTGAGTAGTGTTTTGTGCTGT-3′)所示的单链DNA。
将PCR产物序列为序列1的小麦命名为A1A1基因型小麦；将PCR产物序列为序列2的小麦命名为A2A2基因型小麦；将PCR产物序列为序列3的小麦命名为A3A3基因型小麦；将PCR产物序列为序列1和序列2的小麦命名为A1A2基因型小麦；将PCR产物序列为序列1和序列3的小麦命名为A1A3基因型小麦；将PCR产物序列为序列2和序列3的小麦命名为A2A3基因型小麦。
其中，序列2与序列3所示的DNA分子中均含有限制性内切酶NcoⅠ的识别序列，用NcoⅠ对序列2所示的DNA分子进行酶切，可以得到两条大小分别为215bp与79bp的DNA片段，用NcoⅠ对序列3所示的DNA分子进行酶切，可以得到两条大小分别为229bp与78bp的DNA片段。
表1、32份普通六倍体小麦品种
| 编号 | 名称 | 编号 | 名称 |
| 1 | PANDAS | 17 | 临抗5108 |
| 2 | 安85中124-1 | 18 | 白齐麦 |
| 3 | 偃展一号 | 19 | 昌乐5号 |
| 4 | 霸王鞭 | 20 | 红和尚 |
| 5 | 北京10号 | 21 | 北京8686 |
| 6 | 北京14号 | 22 | 04-044 |
| 7 | 沧州小麦 | 23 | 04-030 |
| 8 | 长武131 | 24 | 春22 9th-25 |
| 9 | 长6878 | 25 | 紫秆白芒先 |
| 10 | 大荔1号 | 26 | 京品10号 |
| 11 | 单R8093 | 27 | 春04 9th-5-1 |
| 12 | 丰抗13 | 28 | 春45 9th-50-1 |
| 13 | 冀麦41 | 29 | 内乡188 |
| 14 | 冀麦6号 | 30 | 京411 |
| 15 | 晋2148-7 | 31 | 中国春 |
| 16 | 京核8922 | 32 | 白糙麦 |
二、CAPS-7A与小麦产量相关性状相关
选取262份六倍体小麦组成自然群体1(表2)，采用步骤一中的CAPS-7A标记对自然群体1进行基因型分型，并对基因型与每穗小穗数、单株穗数和千粒重三个产量相关性状进行关联分析。
1、基因型的确定
1)提取待测小麦的基因组DNA，用基因组特异引物(F和R)进行PCR扩增，得到PCR扩增产物A；
F:5′-TCCAAAACAACCACGGCTAAC-3′；
R:5′-AGGACTCGGCCAAGAATACAAG-3′。
2)以稀释150倍的PCR扩增产物A为模板，采用步骤一中的引物对P进行PCR扩增，得到PCR扩增产物B；
PCR扩增的体系(15μL)为：ddH2O 8.0μL、5×PCR buffer 3.0μL、引物p1(5μmol/L)和p2(5μmol/L)各0.6μL、dNTPs(2.5μmol/L)0.4μL、transfastpfu酶(5U)0.3μL、基因组DNA(20ng/μL)2.1μL；
PCR扩增条件为:95℃5min,95℃30s,59℃30s,72℃30s,35次循环；72℃10min，4℃保存。
3)对PCR扩增产物B进行测序，根据步骤一中基因型分型的方法对自然群体1中的各植株进行基因型分型，结果如表2所示。
表2、自然群体1各个小麦单倍型统计结果
注：“-”表示无PCR产物。
4)用限制性内切酶NcoⅠ酶切PCR扩增产物B进行测序，根据酶切产物的大小按照步骤一中的方法对小麦进行基因型分型，结果与步骤3)中的基因型分型结果一致。
2、基因型与产量相关性状的关联分析
种植期间调查各个小麦品种的每穗小穗数、单株穗数与千粒重。用Tassel2.1软件利用GLM模型对三种单倍型和相关性状进行关联分析。
结果发现，A1A1与A2A2基因型小麦的每穗小穗数均极显著低于A3A3基因型小麦，A1A1与A2A2基因型小麦间的每穗小穗数无显著差异；A1A1基因型小麦的单株穗数极显著低于A3A3基因型小麦，A1A1和A3A3基因型分别与A2A2基因型小麦的单株穗数无显著差异；A1A1与A2A2基因型小麦的千粒重均显著高于A3A3基因型小麦，A1A1与A2A2基因型小麦间的千粒重无显著差异。说明本发明中的CAPS-7A能够在选育小麦具有优异产量性状中起作用。
表3、小麦自然群体1中三种基因型产量相关性状统计结果
| 性状 | A1A1 | A2A2 | A3A3 |
| 每穗小穗数(个) | 18.43±0.12B | 18.24±0.21B | 18.92±0.11A |
| 单株穗数(个) | 12.96±0.25B | 13.58±0.54AB | 14.03±0.32A |
| 千粒重(g) | 42.59±0.47a | 42.54±0.84a | 40.79±0.55b |
注：小写和大写字母分别代表不同基因型小麦之间性状差异显著(P<0.05)和极显著(P<0.01)。
Claims (19)
1.小麦分子标记在鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状中的应用；
所述小麦分子标记，为以小麦的基因组DNA为模板、采用引物对P进行扩增得到的DNA分子；所述引物对P由名称为p1和p2的单链DNA组成，所述p1为序列4所示的单链DNA，所述p2为序列5所示的单链DNA。
2.根据权利要求1所述的应用， 其特征在于：所述小麦产量相关性状为小麦千粒重、每穗小穗数和/或单株穗数。
3.鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状的引物对，为权利要求1或2中所述引物对P。
4.根据权利要求3所述的引物对，其特征在于：所述小麦产量相关性状为小麦千粒重、每穗小穗数和/或单株穗数。
5.鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状的成套试剂，由权利要求1或2中所述引物对P与限制性内切酶NcoⅠ组成。
6.根据权利要求5所述的成套试剂，其特征在于：所述小麦产量相关性状为小麦千粒重、每穗小穗数和/或单株穗数。
7.鉴定或辅助鉴定小麦基因型的方法，所述基因型为A1A1基因型、A2A2基因型、A3A3基因型、A1A2基因型、A1A3基因型和A2A3基因型，所述方法为下述L：
L、包括如下L1)和L2)：
L1)以待测小麦基因组DNA为模板，利用权利要求1或2中所述引物对P进行PCR扩增得到PCR产物；
L2)检测步骤L1)得到的PCR产物的序列，如果所述PCR产物含有X1所示的DNA片段但不含有X2或X3所示的DNA片段，所述待测小麦为A1A1基因型小麦；如果所述PCR产物含有所述X2所示的DNA片段且不含有所述X1或所述X3所示的DNA片段，所述待测小麦为A2A2基因型小麦；如果所述PCR产物含有所述X3所示的DNA片段且不含有所述X1或所述X2所示的DNA片段，所述待测小麦为A3A3基因型小麦；如果所述PCR产物含有所述X1和所述X2所示的DNA片段且不含有所述X3所示的DNA片段，所述待测小麦为A1A2基因型小麦；如果所述PCR产物含有所述X1和所述X3所示的DNA片段且不含有所述X2所示的DNA片段，所述待测小麦为A1A3基因型小麦；如果所述PCR产物含有所述X2和所述X3所示的DNA片段且不含有所述X1所示的DNA片段，所述待测小麦为A2A3基因型小麦；
所述X1为序列1的第70位-第240位；
所述X2为序列2的第70位-第240位；
所述X3为序列3的第70位-第254位。
8.鉴定或辅助鉴定小麦基因型的方法，所述基因型为A1A1基因型、A2A2基因型、A3A3基因型、A1A2基因型、A1A3基因型和A2A3基因型，所述方法为下述M：
M、包括如下M1)和M2)：
M1)以待测小麦基因组DNA为模板，利用权利要求1或2中所述引物对P进行PCR扩增得到PCR产物；
M2)检测步骤M1)得到的PCR产物的序列，如果所述PCR产物的序列为序列1，所述待测小麦为A1A1基因型小麦；如果所述PCR产物的序列为序列2，所述待测小麦为A2A2基因型小麦；如果所述PCR产物的序列为序列3，所述待测小麦为A3A3基因型小麦；如果所述PCR产物的序列为序列1和序列2，所述待测小麦为A1A2基因型小麦；如果所述PCR产物的序列为序列1和序列3，所述待测小麦为A1A3基因型小麦；如果所述PCR产物的序列为序列2和序列3，所述待测小麦为A2A3基因型小麦。
9.鉴定或辅助鉴定小麦基因型的方法，所述基因型为A1A1基因型、A2A2基因型、A3A3基因型、A1A2基因型、A1A3基因型和A2A3基因型，所述方法为N：
N、包括如下N1)和N2)：
N1)以待测小麦基因组DNA为模板，利用权利要求1和2中所述引物对P进行PCR扩增得到PCR产物，采用限制性内切酶NcoI处理所述PCR产物得到酶切产物；
N2)检测步骤N1)得到的酶切产物的大小，如果所述酶切产物为一条294bp的DNA片段，所述待测小麦为A1A1基因型小麦；如果所述酶切产物为两条大小分别为215bp和79bp的DNA片段，所述待测小麦为A2A2基因型小麦；如果所述酶切产物为两条大小分别为229bp和78bp的DNA片段，所述待测小麦为A3A3基因型小麦；如果所述酶切产物为三条大小分别为294bp、215bp和79bp的DNA片段，所述待测小麦为A1A2基因型小麦；如果所述酶切产物为三条大小分别为294bp、229bp和78bp的DNA片段，所述待测小麦为A1A3基因型小麦；如果所述酶切产物为四条大小分别为215bp、79bp、229bp和78bp的DNA片段，所述待测小麦为A2A3基因型小麦。
10.鉴定或辅助鉴定小麦基因型的方法，所述基因型为A1A1基因型、A2A2基因型、A3A3基因型、A1A2基因型、A1A3基因型和A2A3基因型，所述方法为下述O：
O、检测待测小麦基因组DNA中对应于序列1的第70位-第240位的DNA片段的序列，如果对应于序列1的第70位-第240位的DNA片段的序列为O1),所述待测小麦为A1A1基因型小麦；如果对应于序列1的第70位-第240位的DNA片段的序列为O2),所述待测小麦为A2A2基因型小麦；如果对应于序列1的第70位-第240位的DNA片段的序列为O3),所述待测小麦为A3A3基因型小麦；如果对应于序列1的第70位-第240位的DNA片段的序列为所述O1)和所述O2),所述待测小麦为A1A2基因型小麦；如果对应于序列1的第70位-第240位的DNA片段的序列为所述O1)和所述O3),所述待测小麦为A1A3基因型小麦；如果对应于序列1的第70位-第240位的DNA片段的序列为所述O2)和所述O3),所述待测小麦为A2A3基因型小麦；
所述O1)为序列1的第70位-第240位；
所述O2)为序列2的第70位-第240位；
所述O3)为序列3的第70位-第254位。
11.鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状的方法，为下述1)、2)或3)：
1)鉴定或辅助鉴定小麦千粒重性状的方法，包括按照权利要求7-10任一所述方法鉴定待测小麦的基因型，根据待测小麦的基因型确定所述待测小麦的千粒重性状：A1A1基因型待测小麦的千粒重高于或候选高于A3A3基因型待测小麦的千粒重，A2A2基因型待测小麦的千粒重高于或候选高于A3A3基因型待测小麦的千粒重；
2)鉴定或辅助鉴定小麦每穗小穗数性状的方法，包括按照权利要求7-10任一所述方法鉴定待测小麦的基因型，根据待测小麦的基因型确定所述待测小麦的每穗小穗数性状：A1A1基因型待测小麦的每穗小穗数小于或候选小于A3A3基因型待测小麦的每穗小穗数，A2A2基因型待测小麦的每穗小穗数小于或候选小于A3A3基因型待测小麦的每穗小穗数；
3)鉴定或辅助鉴定小麦单株穗数性状的方法，包括按照权利要求7-10任一所述方法鉴定待测小麦的基因型，根据待测小麦的基因型确定所述待测小麦的单株穗数性状：A1A1基因型待测小麦的单株穗数小于或候选小于A3A3基因型待测小麦的单株穗数。
12.权利要求1中所述小麦分子标记。
13.权利要求3或4所述引物对在下述Z1-Z5任一种中的应用；
Z1、鉴定或辅助鉴定小麦基因型；
Z2、制备鉴定或辅助鉴定小麦基因型产品；
Z3、鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状；所述小麦产量相关性状为小麦千粒重、每穗小穗数和/或单株穗数；
Z4、制备鉴定或辅助鉴定所述小麦产量相关性状产品；
Z5、小麦育种。
14.权利要求5或6所述成套试剂在下述Z1-Z5任一种中的应用；
Z1、鉴定或辅助鉴定小麦基因型；
Z2、制备鉴定或辅助鉴定小麦基因型产品；
Z3、鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状；所述小麦产量相关性状为小麦千粒重、每穗小穗数和/或单株穗数；
Z4、制备鉴定或辅助鉴定所述小麦产量相关性状产品；
Z5、小麦育种。
15.权利要求7-10任一所述鉴定或辅助鉴定小麦基因型的方法在下述Z3或Z5中的应用；
Z3、鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状；所述小麦产量相关性状为小麦千粒重、每穗小穗数和/或单株穗数；
Z5、小麦育种。
16.权利要求11所述鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状的方法在小麦育种中的应用。
17.权利要求1中所述小麦分子标记在小麦育种中的应用。
18.检测权利要求1中所述小麦分子标记的物质在下述Z1-Z5任一种中的应用：
Z1、鉴定或辅助鉴定小麦基因型；
Z2、制备鉴定或辅助鉴定小麦基因型产品；
Z3、鉴定或辅助鉴定小麦产量相关性状；所述小麦产量相关性状为小麦千粒重、每穗小穗数和/或单株穗数；
Z4、制备鉴定或辅助鉴定所述小麦产量相关性状产品；
Z5、小麦育种。
19.小麦育种方法，按照权利要求7-10任一所述的方法鉴定小麦的基因型，选择A1A1基因型、A2A2基因型或A3A3基因型的小麦作为亲本进行育种。
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