CN105164533A - 具有内部校准的测定 - Google Patents
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Abstract
本文提供了用于具有内部校准的测定的试剂盒和方法。
Description
相关申请的交叉引用
本申请是2013年3月15日提交的美国申请号13/833,365的继续申请,该美国申请为了所有目的通过引用而全文并入本文。
技术领域
本文提供了用于具有内部校准的测定的试剂盒和方法。
背景技术
在过去几十年中,已经使用荧光、化学发光或响应于分析物产生信号的其他手段进行了测定。目前,许多测定通过测量在反应混合物的总体积中产生的光信号的强度来进行。产生的光信号可以通过光学手段来测量,其中产生的光信号由大量分子发出。在典型的实施方案中,这些测定可以如下进行:将怀疑含有抗原的样品与包含附接至固体支持物(例如,微粒)上的第一抗体的试剂组合,以形成反应混合物。该抗原如果存在于样品中,则与该第一抗体特异性结合。向反应混合物中引入包含其上附接有标记的第二抗体的偶联物,并与所述抗原特异性结合,该抗原与第一抗体特异性结合,该第一抗体如前所述附接至固体支持物上。这样的测定被称为夹心测定或免疫计量测定。这种类型的测定示意性地示于图1中。通常在通过进行洗涤步骤从反应混合物中除去未结合的偶联物之后,测量由标记物引起的信号。测量来源于反应混合物的总体积的信号,然后将其与校准曲线进行比较,以确定样品中存在的抗原的浓度。
当测定不包括从未结合的样品分析物中分离结合的样品分析物时,其被认为是‘一步’测定。当测定包括从未结合的样品分析物中分离结合的样品分析物时,其通常被认为是‘两步测定’(或延迟的一步测定,这取决于如何进行分离)。
在标准的夹心测定中,第一步是使用一组具有已知浓度的分析物校准物生成校准曲线。然后,使用该校准曲线确定未知样品的浓度。
发明内容
本发明提供了用于测定(如免疫测定)的内部校准的试剂盒和方法。本文所提供的内部校准方法和试剂盒无需制作校准曲线,并允许基于单一内部校准的参考点来确定大量测试样品中的分析物的存在和/或浓度。
因此,在一方面,本发明提供了试剂盒。在一些实施方案中,该试剂盒包含:包含第一标记物的示踪分析物、捕获分析物结合分子和包含第二标记物的检测分析物结合分子,其中该捕获分析物结合分子和该检测分析物结合分子能够同时与该示踪分析物结合。在不同的实施方案中,该捕获分析物结合分子附接至固体支持物上。在一些实施方案中,该固体支持物选自颗粒、微粒、珠子、电极和多孔板。在一些实施方案中,该捕获分析物结合分子和/或该检测分析物结合分子之一或两者是抗体或其片段。在一些实施方案中,第一标记物和第二标记物之一或两者是发色团。在一些实施方案中,第一标记物和第二标记物之一或两者是荧光团。
在另一方面,本发明提供了对测定进行内部校准的方法。在一些实施方案中,该测定包括:
a)使捕获分析物结合分子与预定浓度的用第一标记物标记的示踪分析物及预定浓度的用第二标记物标记的检测分析物结合分子接触,其中该捕获分析物结合分子和该检测分析物结合分子同时与该示踪分析物结合;
b)测量所获得的第一标记物的信号强度(I10)和第二标记物的信号强度(I20);
c)将校正因子(F)确定为第二标记物的强度(I20)与第一标记物的强度(I10)的比值;由此该校正因子的确定用于对所述测定的内部校准。通常,该方法在不存在测试样品的情况下进行。
在另一方面,本发明提供了确定一个或多个测试样品中的分析物浓度的方法。在一些实施方案中,该方法包括:
a)在不存在或存在可能包含测试分析物的一个或多个测试样品的情况下,使捕获分析物结合分子与预定浓度的用第一标记物标记的示踪分析物及预定浓度的用第二标记物标记的检测分析物结合分子接触,其中该捕获分析物结合分子和该检测分析物结合分子同时与该示踪分析物结合,并且如果存在的话,同时与所述一个或多个测试样品中的测试分析物结合;
b)测量在不存在所述一个或多个测试样品时获得的第一标记物的信号强度(I10)和第二标记物的信号强度(I20);
c)将校正因子(F)确定为第二标记物的强度(I20)与第一标记物的强度(I10)的比值;
d)测量在存在所述一个或多个测试样品时获得的第一标记物的信号强度(I1)和第二标记物的信号强度(I2);以及
e)通过将第二标记物的强度(I2)与第一标记物的强度(I1)的比值除以校正因子(F)并减去示踪分析物的预定浓度来确定在所述一个或多个测试样品中的测试分析物的浓度。在不同的实施方案中,步骤b)和d)可以同时或以任意顺序完成。在一些实施方案中,步骤d)和e)重复一次或多次。在一些实施方案中,步骤a)至c)只进行一次。在一些实施方案中,示踪分析物的预定浓度的范围为从低于预期的测试分析物浓度至高于预期的目标测试分析物浓度约5倍。
关于内部校准方法和测定分析物浓度的方法的另外的实施方案,在一些实施方案中,示踪分析物的预定浓度在捕获分析物结合分子的结合容量的饱和度以下。在一些实施方案中,使用两步测定形式。在一些实施方案中,使用一步测定形式。在不同的实施方案中,当使用两步测定形式时,检测分析物结合分子的预定浓度等于或超过在第一步中捕获的分析物和示踪分析物的浓度。在不同的实施方案中,当使用一步测定形式时,检测分析物结合分子的浓度超过分析物和示踪分析物的浓度。在一些实施方案中,所述方法使用自动化或半自动化系统来进行。在一些实施方案中,捕获分析物结合分子附接至固体支持物上。在一些实施方案中,该固体支持物选自颗粒、微粒、珠子、电极和多孔板。在一些实施方案中,捕获分析物结合分子和/或检测分析物结合分子之一或两者是抗体或其片段。在一些实施方案中,第一标记物是第一发色团且第二标记物是第二发色团。在一些实施方案中,第一标记物是第一荧光团且第二标记物是第二荧光团。
附图说明
图1提供了夹心测定的示意图。
图2提供了对使用单一示踪分析物内部校准的测定的实施方案进行说明的示意图。
图3示出了嗜中性粒细胞明胶酶相关脂质运载蛋白(NGAL)滴定的流程图。
图4示出了使用单一示踪分析物对测定条件变化的内部校正。
具体实施方式
本公开内容部分地基于使用内部校准物的测定和方法的发现和设计,该内部校准物可校正测定条件的变化并提高测定精度。此外,通过用单一校准物代替校准物组,可以减少校准运行的次数,例如,一个校准运行可以确定用于测量大量顺序运行的测试样品的分析物浓度的准确参数。
定义
以下术语与本公开内容有关:
“测定”是测量常常含有物质的复杂混合物的溶液中物质的存在或浓度的生化试验。在诸如血清或尿的生物液体中的分析物常常使用测定方法进行测定。此类测定是基于分析物结合分子(例如,抗体或其抗原反应性片段)以高特异性与一种或非常有限的一组分子结合的独特能力。与分析物结合分子(例如,抗体或其抗原反应性片段)结合的分子被称为分析物或抗原。需要分离步骤的测定,通常被称为分离测定或非均相测定,是普及的,因为它们容易设计,但它们经常需要多个步骤,包括对其上结合有标记的试剂的表面的仔细洗涤。一些测定可以在不进行分离步骤的情况下运行。此类测定常常可通过混合试剂和样品并进行物理测量来简单地进行。此类测定被称为均相测定,或者较不经常地,被称为非分离测定。
如本文所用的,表述“夹心测定”意指采用两种分析物结合分子同时(例如,在相同或单独的步骤中)与相同分析物结合的测定。所述分析物结合分子之一直接或间接地附接至固体支持物上,从而允许分析物直接或间接地附接至该固体支持物,例如,微粒或电极。其他分析物结合分子直接或间接地附接至标记物,从而允许分析物直接或间接地附接至该标记物以提供用于检测该分析物的信号。例如,分析物结合分子之一可以是用于与样品中的分析物(例如,抗原)特异性结合的捕获分析物结合分子(例如,抗体或其抗原反应性片段),由此该分析物(例如,抗原)直接或间接地附接至固体支持物,例如,电极或微粒,而其他的分析物结合分子可以是用于与样品中的分析物(例如,抗原)特异性结合的检测分析物结合分子(例如,抗体或其抗原反应性片段),由此该分析物(例如,抗原)直接或间接地附接至用于检测抗原的标记物。如果样品中存在相对较高的量的分析物,则将产生较高的信号。如果样品中存在相对较低的量的分析物,则将产生较低的信号。图1是说明夹心测定的代表性实例的示意图。
如本文所用的,术语“复合物”意指彼此特异性结合的至少两个分子。复合物的实例包括但不限于,与一个分析物结合分子结合的一个分析物,与多个分析物结合分子结合的一个分析物,例如,与两个分析物结合分子结合的一个分析物,与多个分析物结合的一个分析物结合分子,例如,与两个分析物结合的一个分析物结合分子。
如本文所用的,表述“固体支持物”意指分析物结合分子(例如,抗体或其抗原反应性片段)可附接至其上,从而使得该分析物结合分子在液体介质中不能从固体支持物上脱离的任何固体表面。固体支持物可以容易地与该固体支持物接触的液体分开。在不同的实施方案中,固体支持物可以是,例如,塑料、衍生塑料、磁性或非磁性金属、玻璃或硅。固体支持物的代表性实例包括但不限于电极、试管、珠子、微粒、纳米颗粒、微孔或多孔板的孔、凝胶、胶体、生物细胞、薄片、芯片和本领域普通技术人员所知的其他构造。分析物结合分子(例如,抗体或其抗原反应性片段)可以附接至其上的物体的一个实例是微粒,例如,磁性微粒。微粒一般具有小于1000微米的平均直径。微粒可以容易地从其分散于其中的液体中分离。微粒容易地分散在水性介质中。此外,固体支持物任选地提供回收分析物结合蛋白质的手段,即,在与进行测定的条件不同的受控条件下从表面上释放或脱离分析物结合分子的手段。例如,分析物结合分子可借助于可裂解的连接体附接至固体支持物上。
如本文所用的,表述“捕获分析物结合分子”意指一种分析物结合分子(例如,抗体或其抗原反应性片段):其将分析物,例如,抗原,结合至固体支持物上,其结果是抗体将该分析物附接至固体支持物上,由此该分析物直接地或通过居间的部分间接地附接至固体支持物上。
如本文所用的,表述“检测分析物结合分子”意指一种分析物结合分子(例如,抗体或其抗原反应性片段):其附接至在化学或生物反应中提供或可变成提供可检测的信号的部分。
术语“一步”测定是指不包括从未结合的样品分析物中分离结合的样品分析物的测定。
术语“两步”测定是指包括从未结合的样品分析物中分离结合的样品分析物的测定。
“约”是指从所述值大约+/-10%的变化。应当理解,这样的变化总是包含在本文所提供的任何给定值中,无论是否具体提及。
如本文进一步描述的,“分析物”是指待测的化合物或组合物,其可以是配体,其可以是单表位的或多表位的,抗原的或半抗原的,共享至少一个共同表位位点或受体的单个或多个化合物。说明性的感兴趣的分析物通常包括但不限于,例如,蛋白质、糖蛋白、肽、多肽、寡核苷酸或多核苷酸,以及更具体地,例如,抗体、抗原、半抗原、激素、药物、酶或受体。
“抗体”和“多个抗体”是指单克隆抗体、多特异性抗体、双功能抗体、人抗体、人源化抗体(完全或部分人源化的)、动物抗体(诸如但不限于鸟(例如鸭或鹅)、鲨鱼、鲸和哺乳动物,其包括非灵长类(例如,牛、猪、骆驼、美洲驼、马、山羊、兔、绵羊、仓鼠、豚鼠、猫、狗、大鼠、小鼠等)或非人灵长类(例如、猴、黑猩猩等)、重组抗体、嵌合抗体、单链Fv(“scFv”)、单链抗体、单域抗体、Fab片段、F(ab')片段、F(ab')2片段、二硫键连接的Fv("sdFv")以及抗独特型("anti-Id")抗体、双域抗体、双可变域(DVD)或三可变域(TVD)抗体(双可变域免疫球蛋白及其制备方法描述于Wu,C.等人,NatureBiotechnology,25(11):1290-1297(2007),以及公开号为WO2001/058956的国际专利申请,其中每一篇的内容均通过引用并入本文),以及上述任一种的功能活性表位结合片段。尤其是,抗体包括免疫球蛋白分子和免疫球蛋白分子的免疫反应性片段,即,含有分析物结合位点的分子。免疫球蛋白分子可以是任何类型(例如IgG、IgE、IgM、IgD、IgA和IgY)、类别(例如,IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1和IgA2)或亚类的。为了简单起见,针对分析物的抗体在本文中常被称为“抗分析物抗体”或仅称“分析物抗体”。如本文所用的术语“双功能抗体”是指包含对一个抗原位点具有特异性的第一臂和对一个不同的抗原位点具有特异性的第二臂的抗体,即,双功能抗体具有双重特异性。
“抗体片段”和“多个抗体片段”是指包含抗原结合位点或可变区的完整抗体的一部分。该部分不包括完整抗体的Fc区的恒定重链域(即,CH2、CH3或CH4,取决于抗体同种型)。抗体片段的实例包括但不限于Fab片段、Fab'片段、Fab'-SH片段、F(ab')2片段、Fd片段、Fv片段、双抗体、单链Fv(scFv)分子、只含有一个轻链可变域的单链多肽、含有轻链可变域的三个CDR的单链多肽、只含有一个重链可变区的重链可变区单链多肽和含有重链可变区的三个CDR的单链多肽。
“结合常数”如本文所述。在本文中可互换使用的术语“缔合速率常数”、“kon”或“ka”是指这样的值:其表示特异性结合对的第一成员(SBP1;例如,分析物结合分子,抗体(Ab)或其分析物反应性片段)和特异性结合对的第二成员(SBP2;例如,分析物(例如,抗原(Ag))的结合速率,或特异性结合对的第一成员与特异性结合对的第二成员之间的复合物形成的速率,如以下方程式所示:
SBP1+SBP2→SBP1-SBP2
Ab+Ag→Ab-Ag。
在本文中可互换使用的术语“解离速率常数”、“koff”或“kd”是指这样的值:其表示SBP1(例如,分析物结合分子,抗体或其分析物反应性片段)从SBP2(例如,抗原)上的解离速率,或SBP1-SBP2复合物(例如,抗体-抗原复合物)随时间分离成游离SBP1(例如,分析物结合分子、抗体或其分析物反应性片段)和SBP2(例如,抗原)的速率,如以下方程式所示:
SBP1+SBP2←SBP1-SBP2
Ab+Ag←Ab-Ag
用于确定缔合和解离速率常数的方法是本领域公知的。使用基于荧光的技术提供了高灵敏度和在平衡的生理缓冲液中检测样品的能力。可以使用其他实验方法和仪器如(生物分子相互作用分析)测定(例如,可从BIAcoreInternationalAB,GEHealthcare公司,Uppsala,Sweden获得的仪器)。此外,也可以使用可从SapidyneInstruments(Boise,Idaho)获得的(动力学排除测定)测定。
在本文中可互换使用的术语“平衡解离常数”或“KD”是指通过将解离速率(koff)除以缔合速率(kon)而得到的值。缔合速率、解离速率和平衡解离常数用来表示分析物结合分子(例如,抗体或其分析物反应性片段)对抗原的结合亲和力。这可由以下反应和方程式描述:
A+B→AB
这些结合常数中的任何一个,即,ka、kd或KD,可以想象可用来评估或比较“结合亲和力”,即,结合的倾向或强度。然而,通常如本文所述,结合亲和力是指KD。
“CDR”在本文中用来指分析物结合分子或抗体可变序列内的“互补性决定区”。在抗体中,在重链和轻链的每一个可变区中有三个CDR,对于每个可变区,它们被称为“CDR1”、“CDR2”和“CDR3”。如本文所用的术语“CDR组”是指在结合抗原的单个可变区中存在的一组三个CDR。这些CDR的确切边界根据不同的体系已有不同的定义。Kabat描述的体系(Kabat等人,SequencesofProteinsofImmunologicalInterest(NationalInstitutesofHealth,Bethesda,Md.(1987)和(1991))不仅提供了适用于抗体的任何可变区的明确的残基编号体系,而且还提供了限定三个CDR的精确的残基边界。这些CDR可被称为“KabatCDR”。Chothia和同事(Chothia和Lesk,J.Mol.Biol.,196:901-917(1987);和Chothia等人,Nature,342:877-883(1989))发现KabatCDR内的某些亚部分采用几乎相同的肽骨架构象,尽管在氨基酸序列水平上具有很大的多样性。这些亚部分被称为“L1”、“L2”和“L3”,或“H1”、“H2”和“H3”,其中“L”和“H”分别指代轻链和重链区。这些区域可以被称为“ChothiaCDR”,它们具有与KabatCDR重叠的边界。与KabatCDR重叠的限定CDR的其他边界已由Padlan,FASEBJ.,9:133-139(1995)和MacCallum,J.Mol.Biol.,262(5):732-745(1996)描述。另外其他的CDR边界限定可能不严格遵循此处的一种体系,但仍将与KabatCDR重叠,尽管根据特定残基或成组残基乃至整个CDR不显著影响分析物(例如,抗原)结合的预测或实验发现,它们得以缩短或加长。本文所使用的方法可以利用根据这些体系中的任意一个限定的CDR,尽管某些实施方案使用Kabat或Chothia限定的CDR。
“组分”、“多种组分”和“至少一种组分”通常是指捕获抗体、检测或偶联物抗体、校准物、对照、灵敏度组(panel)、容器、缓冲液、稀释剂、盐、酶、酶的辅助因子、检测试剂、预处理试剂/溶液、底物(例如,作为溶液)、终止溶液等,根据本文描述的方法和本领域所知的其他方法,其可包含在用于测定诸如患者血清样品的测试样品的试剂盒中。一些组分可以在溶液中或被冻干以便重建后在测定中使用。
如本文所用的,术语“偶联物”意指包含结合对成员和标记物的实体。
“对照”是指已知不含分析物(“阴性对照”)或含有分析物(“阳性对照”)的组合物。阳性对照可以包含已知浓度的分析物。“对照”、“阳性对照”和“校准物”在本文中可互换使用,其指包含已知浓度的分析物的组合物。“阳性对照”可用来确立测定性能特性,并且是试剂(例如,分析物)完整性的有用的指示物。
在本文中可互换使用的“校正因子”或“F”是指这样的数值,在算术运算中利用该数值来校正描述由来自检测抗原结合分子的标记物产生的信号的值。尤其是,测量在不存在测试样品时获得的第一标记物的信号强度(I10)和第二标记物的信号强度(I20),并且将校正因子(F)确定为第二标记物的强度(I20)与第一标记物的强度(I10)的比值。
“表位”、“多个表位”或“感兴趣的表位”是指被识别并且可以结合至其特异性结合配偶体(例如,分析物结合分子,例如,抗体或其片段)上的互补位点的任何分析物上的位点。分析物和抗原结合分子是特异性结合对的一部分。例如,表位可以在多肽、蛋白质、半抗原、碳水化合物抗原(例如但不限于糖脂、糖蛋白或脂多糖)或多糖上。其特异性结合配偶体可以是,但不限于,分析物结合分子(例如,抗体或其分析物反应性片段)。
如本文所使用的,术语“强度”意指每单位面积或体积上电、光、热或声的强度的量或程度。在不同的实施方案中,术语“强度”是指每单位时间每单位面积计数的光子的数目。例如,每单位面积1000个光子可以被记录为在单一像素中的500个计数,而每单位面积80个光子可以被记录为在单一像素中的40个计数。特定的转换取决于所使用的照相系统。强度与计数的光子数目成比例。
“标记物”和“可检测标记物”意指直接或间接地附接至分析物结合分子(例如,抗体或其分析物反应性片段)或分析物上以使分析物结合分子(例如,抗体或其分析物反应性片段)与分析物之间的反应变得可检测的部分,并且如此标记的分析物结合分子(例如,抗体或其分析物反应性片段)或分析物被称为“可检测地标记的”。标记物可以产生例如通过视觉或仪器手段可检测的信号。在此方面,标记物可以是任何信号生成部分。如本文所用的,标记物(或信号生成部分)产生可测量的信号,该信号通过外部手段是可检测的,例如,通过电磁辐射进行测量,并且根据所使用的系统,信号水平可以变化到该标记物是在诸如电极、微粒或珠子等固体支持物的环境中的程度。各种标记物包括信号产生物质,如酶(辣根过氧化物酶、碱性磷酸酶、碱性过氧化物酶、葡萄糖6-磷酸脱氢酶等),发色团或色原(例如,吸收在紫外或可见光区的光的染料、磷光体、荧光剂、荧光团(例如,荧光蛋白(绿色荧光蛋白、黄色荧光蛋白、红色荧光蛋白、青色荧光蛋白);藻胆素(藻红蛋白、R-藻红蛋白、B-藻红蛋白);呫吨衍生物(荧光素、罗丹明、俄勒冈绿(Oregongreen)、曙红、德克萨斯红(Texasred));花青衍生物(花青、Cy染料、吲哚羰花青、氧杂羰花青、硫杂羰花青、部花青);萘衍生物(丹酰和氟硅酸钠衍生物);香豆素衍生物;噁二唑衍生物(吡啶噁唑、硝基苯并噁二唑、苯并噁二唑);芘衍生物(级联蓝(cascadeblue));噁嗪衍生物(尼罗红(Nilered)、尼罗蓝(Nileblue)、甲酚紫、噁嗪170);吖啶衍生物(原黄素、吖啶橙、吖啶黄);芳基次甲基(arylmethine)衍生物(金胺、结晶紫、孔雀石绿);四吡咯衍生物(卟吩、酞菁、胆红素)),发光团,化学发光化合物,放射性化合物等)。标记物的代表性实例包括产生光的部分,例如,吖啶鎓化合物,以及产生荧光的部分,例如,荧光素。其他标记物在本文中描述。在此方面,所述部分本身可能不是可检测的,但当与另一部分反应时可能变为可检测的。例如,可以使用酶来产生信号或放大信号或前述两者兼具。作为另一实例,所述部分可以是所谓的猝灭剂或被猝灭剂作用的实体。术语“可检测标记物”的使用旨在包括这类标记的这些和其他手段。
“患者”和“受试者”可以互换使用,是指动物,如鸟(例如鸭或鹅)、鲨鱼、鲸和哺乳动物,包括非灵长类(例如,牛、猪、骆驼、美洲驼、马、山羊、兔、绵羊、仓鼠、豚鼠、猫、狗、大鼠和小鼠)和灵长类(例如,猴、黑猩猩和人)。优选地,患者或受试者是人,如怀疑具有、诊断为具有分析物缺乏或分析物的存在或过量或经历对此的预防性或治疗性处理的人。
“患者样品”、“测试样品”和“样品”在本文中可以互换使用。样品,如尿、血清、血浆、羊水、脑脊髓液、胎盘细胞或组织、内皮细胞、白细胞或单核细胞,可以按从患者处获得时那样直接使用,或者可进行预处理,例如,通过过滤、蒸馏、提取、浓缩、离心、灭活干扰组分、添加试剂等,从而以本文讨论的某种方式或以本领域已知的其他方式来改变样品的特性。在本公开内容的语境中,样品优选为血清或血浆,最优选为血清。
如在本文所述的诊断测定中所用的,“预处理试剂”,例如,裂解、沉淀和/或增溶试剂,是裂解存在于测试样品中的任何细胞和/或增溶存在于测试样品中的任何分析物的试剂。如本文进一步描述的,预处理对于所有样品不都是必需的。除其他方面外,增溶分析物需要从存在于样品中的任何内源结合蛋白质中释放分析物。预处理试剂可以是均相的(不需要分离步骤)或非均相的(需要分离步骤)。使用非均相预处理试剂时,在进行测定的下一个步骤之前要先从测试样品中移除任何沉淀的分析物结合蛋白质。预处理试剂任选地可以包含:(a)一种或多种溶剂和盐,(b)一种或多种溶剂、盐和去污剂,(c)去污剂,(d)去污剂和盐,或(e)适合于细胞裂解和/或分析物增溶的任何试剂或试剂组合。
在本文所述的测定和试剂盒的语境中,“质量控制试剂”包括但不限于校准物、对照和灵敏度组。一般使用“校准物”或“标准”(例如,一个或多个,如多个)以便建立校准(标准)曲线以用于分析物如抗体或分析物的浓度的内插。或者,可以使用接近预定的阳性/阴性截止值的单一校准物。可以结合使用多个校准物(即,多于一个校准物或变化量的校准物),以便包含“灵敏度组”。
“特异性结合配偶体”是特异性结合对的成员。特异性结合对包含两个不同的分子,它们通过化学或物理方式彼此特异性结合。因此,除了共同测定的分析物/分析物结合分子和抗原/抗体特异性结合对之外,其他的特异性结合对可以包括生物素和抗生物素蛋白(或链霉抗生物素蛋白)、碳水化合物和凝集素、互补核苷酸序列、效应物和受体分子、辅因子和酶、酶和酶抑制剂等。此外,特异性结合对可包括作为原始特异性结合成员的类似物的成员,例如,分析物-类似物。免疫反应性特异性结合成员包括抗原、抗原片段和抗体,包括单克隆和多克隆抗体以及复合物及其片段,无论是分离的还是重组产生的。
在特异性结合对的成员(例如,抗原(或其片段)和抗体(或其抗原反应性片段))之间的相互作用的语境中,“特异性的”和“特异性”是指该相互作用的选择反应性。词语“特异性结合”和类似词语是指特异性结合对的第一成员(例如,抗体或其抗原反应性片段)与特异性结合对的第二成员(例如,抗原)结合,而不与其他抗原(或其片段)特异性结合的能力。在本公开内容的语境中,与分析物特异性结合的抗体被认为对分析物是特异性的。
“示踪剂”是指附接至标记物的分析物或分析物片段,其中附接至标记物的分析物可以有效地与分析物竞争对分析物特异性的分析物结合分子上的位点。
提供上述术语是为了描述特定实施方案的目的。所述术语并非意在限制。
1.简介
本文提供的内部校准物试剂盒和测定方法尤其适用于夹心测定形式。用单一示踪剂(即,附接至标记物或报告分子的示踪分析物)代替校准物组。预定浓度的相同示踪剂也被添加进每个测试样品中作为内部校准物。采用示踪分析物允许仅使用单一内部校准物,该单一内部校准物可用于确定和分析一个或多个数据集。例如,内部校准物可以一天运行或测定一次并用于分析随后的读数,可以每周运行一次并用于分析随后的读数,或者可以每月运行一次并用于分析随后的读数。在设定的一段时间内是否需要再次运行或测定校准物取决于该测定的条件和情况,并且对于普通技术人员来说将是显而易见的。然而,本公开内容提供的是用单一内部校准物代替一组校准物,使得不需要运行校准曲线。因此,这种方法的好处至少有两方面:首先,产生经校准的测定所需的测定运行的次数减少;第二,内部校准物可以适应并校正测定条件的变化,这转而提高了测定精度。
用单一示踪分析物代替整组校准物简化了校准程序,并减少了试剂的使用和测定性能时间。单一示踪分析物还用作内部校准物。通常,单一示踪分析物与样品预混合,并形成三联体(tripartite)“夹心”复合物,该复合物同测试分析物竞争的同时与捕获和检测分析物分子结合。结合的示踪分析物的信号强度反映了测定条件(例如,基质、温度、反应时间、微粒损失、试剂稳定性等)的任何变化。结合的示踪分析物与结合的检测分析物结合分子的信号强度比自动校正反应条件的变化。
本文所描述的测定和方法无需使用多种外部校准物或无需制作校准曲线。内部校准物反映了测定条件的变化,因此降低了对仪器精度和试剂稳定性的要求。内部校准物的使用进一步减少或消除了对校准曲线稳定性的顾虑。
通常,对于使用标记的示踪分析物作为内部校准物,在饱和浓度的检测分析物结合分子的存在下测量预定浓度的示踪分析物的信号强度,然后针对在怀疑含有测试分析物的测试样品的存在下获得的强度值,估算标记的示踪分析物的信号强度的测量值。以这种方式,提供了单点校准值,其可用于确定大量顺序评估的测试样品的分析物浓度。
在用于生成单点校准值的特定实施方案中,所述方法包括:
a)使捕获分析物结合分子与预定浓度的用第一标记物标记的示踪分析物及预定浓度的用第二标记物标记的检测分析物结合分子接触,其中该捕获分析物结合分子和该检测分析物结合分子同时与该示踪分析物结合;
b)测量所获得的第一标记物的信号强度(I10)和第二标记物的信号强度(I20);
c)将校正因子(F)确定为第二标记物的强度(I20)与第一标记物的强度(I10)的比值;
本文还提供了确定一个或多个测试样品中的分析物的浓度的方法。在一个实施方案中,该方法包括:
a)在不存在或存在可能包含测试分析物的一个或多个测试样品的情况下,使捕获分析物结合分子与预定浓度的用第一标记物标记的示踪分析物及预定浓度的用第二标记物标记的检测分析物结合分子接触,其中该捕获分析物结合分子和该检测分析物结合分子同时与该示踪分析物结合,并且如果存在的话,同时与所述一个或多个测试样品中的测试分析物结合;
b)测量在不存在所述一个或多个测试样品时获得的第一标记物的信号强度(I10)和第二标记物的信号强度(I20);
c)将校正因子(F)确定为第二标记物的强度(I20)与第一标记物的强度(I10)的比值;
d)测量在存在所述一个或多个测试样品时获得的第一标记物的信号强度(I1)和第二标记物的信号强度(I2);以及
e)通过将第二标记物的强度(I2)与第一标记物的强度(I1)的比值除以校正因子(F)并减去示踪分析物的预定浓度来确定在所述一个或多个测试样品中的测试分析物的浓度。
采用上述方法,可以使用单一校准值评价大量测试样品(例如,约2至约200,000个、约2至约20,000个、约2至约2000个、约2至约200个或约2至约20个)而不需要生成校准曲线。
2.示踪分析物
在不同的实施方案中,用作内部校准物的示踪分析物是感兴趣的分析物或其片段或模拟物,它可以在夹心测定中与捕获分析物结合分子和检测分析物结合分子形成复合物。在适当时,如本文所述及本领域中已知的,蛋白质分析物可以从天然来源中纯化或通过重组或合成手段产生。非蛋白质分析物可以通过本领域技术人员已知的化学和合成(包括生物合成)手段来产生。示踪分析物可以直接或间接地附接至标记物。
如本文所述,标记物可以是任何可检测的标记物。说明性的标记物包括,例如,荧光团、放射性部分、酶、生物素/抗生物素蛋白标记物、发色团、化学发光标记物等。可以使用如本领域已知的任何合适的可检测标记物。例如,可检测标记物可以是放射性标记物(如3H、125I、35S、14C、32P和33P),酶标记物(例如,辣根过氧化物酶、碱性磷酸酶、碱性过氧化物酶、葡萄糖6-磷酸脱氢酶等),化学发光标记物(例如吖啶酯、硫酯或磺酰胺;鲁米诺、异鲁米诺、菲啶鎓酯等),一种或多种发色团,例如,在紫外或可见光区发光的一种或多种染料,磷光体,荧光剂,荧光团(例如,荧光蛋白(绿色荧光蛋白、黄色荧光蛋白、红色荧光蛋白、青色荧光蛋白);藻胆素(藻红蛋白、R-藻红蛋白、B-藻红蛋白);呫吨衍生物(荧光素、罗丹明、俄勒冈绿、曙红、德克萨斯红);花青衍生物(花青、Cy染料、吲哚羰花青、氧杂羰花青、硫杂羰花青、部花青);萘衍生物(丹酰和氟硅酸钠衍生物);香豆素衍生物;噁二唑衍生物(吡啶噁唑、硝基苯并噁二唑、苯并噁二唑);芘衍生物(级联蓝);噁嗪衍生物(尼罗红、尼罗蓝、甲酚紫、噁嗪170);吖啶衍生物(原黄素、吖啶橙、吖啶黄);芳基次甲基衍生物(金胺、结晶紫、孔雀石绿);四吡咯衍生物(卟吩、酞菁、胆红素)),发光团,化学发光剂,荧光标记物(例如,荧光素(例如,5-荧光素、6-羧基荧光素、3’6-羧基荧光素、5(6)-羧基荧光素、6-六氯荧光素、6-四氯荧光素、异硫氰酸荧光素等)),罗丹明,量子点(例如,硫化锌加帽的硒化镉),温度测量标记物,或免疫-聚合酶链反应标记物。在不同的实施方案中,示踪分析物用藻胆素(例如,藻红蛋白、R-藻红蛋白、B-藻红蛋白)进行标记。在一些实施方案中,示踪分析物用吖啶鎓化合物,例如,吖啶-9-羧酰胺、至少一种吖啶-9-羧酸芳基酯或其任意组合进行标记。
3.分析物
本文所提供的试剂盒和方法对于检测任何感兴趣的分析物是有用的。说明性的感兴趣的分析物通常包括但不限于,例如,蛋白质、肽、多肽、寡核苷酸或多核苷酸,以及更具体地,例如,抗体、抗原、半抗原、激素、药物、酶或受体。在适当时,可商购的分析物结合分子(例如,抗体或其抗原反应性片段)可以在现在描述的试剂盒和测定中使用,或者分析物结合分子(例如,抗体或其抗原反应性片段)可以使用本领域中已知的方法来产生。通常,使用本文所述的试剂盒和方法检测的分析物可以通过夹心测定来检测。
使用本发明试剂盒和测定方法检测的说明性的感兴趣的分析物包括但不限于,例如,细胞因子、免疫抑制药物、心血管疾病抗原、癌抗原、传染病抗原、药物剂、激素、血浆、血清和/或血液抗原、生物标志物(例如,肾损伤的生物标志物)、维生素和自身免疫抗原。这样的分析物包括但不限于,例如:细胞因子、免疫抑制药物(例如,西罗莫司、他克莫司、依维莫司、坦罗莫司(temsorolimus)、唑罗莫司、环孢菌素或任何这些化合物的类似物);心血管疾病抗原(例如,肌钙蛋白I、心肌肌钙蛋白I(cTnI)、血清肌酸激酶MB同工酶(CKMB)、碱性或B型利尿钠肽(BNP)、半乳糖凝集素3、髓过氧化物酶(MPO)、肌红蛋白、D-二聚体纤维蛋白降解产物(或FDP)、高灵敏度C反应蛋白);癌抗原(例如,前列腺特异性抗原(PSA)、甲胎蛋白(AFP)、CA125、CA15-3、CA19-9、癌胚抗原(CEA)、细胞角蛋白19、细胞角蛋白片段21-1(CYFRA21-1)、人附睾蛋白4(HE4)、前胃泌素释放肽(ProGRP)、鳞状细胞癌抗原(SCC-Ag));传染病抗原(例如,巨细胞病毒(CMV)IgG、CMVIgM、风疹IgG抗体、风疹IgM、弓形虫IgG、弓形虫IgM、甲型肝炎病毒(HAV)IgG、HAVIgM、乙型肝炎病毒核心蛋白(HBc)、HBcIgM、乙型肝炎表面抗原(HBsAg)、乙型肝炎e抗原(HBeAg)、丙型肝炎病毒(HCV、人类免疫缺陷病毒(HIV))、美洲锥虫病(Chagas)、EB病毒(EBV)、梅毒、人嗜T淋巴细胞病毒(HTLV)、抗链球菌溶血素O(ASO));药物剂(例如,对乙酰氨基酚、苯丙胺/甲基苯丙胺、巴比妥酸盐、苯并二氮杂大麻酚、可卡因、迷幻药(Ecstasy)、乙醇、美沙酮、阿片剂、苯环利定(PCP)、丙氧芬、水杨酸盐、三环类抗抑郁药、阿米卡星、卡马西平、洋地黄毒苷、地高辛、庆大霉素、锂、苯巴比妥、苯妥英、奎尼丁、茶碱、妥布霉素、丙戊酸、万古霉素);激素(例如,硫酸脱氢表雄酮(DHEA-S)、雌二醇、卵泡刺激激素(FSH)、人绒毛膜促性腺素(hCG)、促黄体激素(LH)、孕酮、催乳素、性激素结合球蛋白(SHBG)、睾酮、皮质醇、胰岛素、胃蛋白酶原I、胃蛋白酶原II、C-肽、甲状旁腺激素(PTH)、甲状腺激素T3、甲状腺激素T4、促甲状腺激素)、酶(例如,酸性磷酸酶、丙氨酸氨基转移酶、碱性磷酸酶、淀粉酶、天冬氨酸氨基转移酶、肌酸激酶、γ-谷氨酰转移酶(GGT)、乳酸脱氢酶(LDH)、α羟丁酸脱氢酶(αHBDH)、脂肪酶、胆碱酯酶、血浆铜蓝蛋白);血浆、血清和/或血液抗原(例如,白蛋白、微量白蛋白、前白蛋白、肌酸酐、半胱氨酸蛋白酶抑制剂C、胆红素、脂蛋白(a)[Lp(a)]、低密度脂蛋白(LDL)、高密度脂蛋白(HDL)、载脂蛋白A1、载脂蛋白B、补体C3、补体C4、触珠蛋白、免疫球蛋白A(IgA)、免疫球蛋白E(IgE)、免疫球蛋白G(IgG)、免疫球蛋白M(IgM)、κ轻链、λ轻链、β2微球蛋白、血红蛋白、高半胱氨酸、C反应蛋白(CRP));生物标志物(例如,肾损伤的生物标志物,例如,嗜中性粒细胞明胶酶相关脂质运载蛋白(NGAL));维生素(例如,维生素B12、叶酸、维生素D);抗环瓜氨酸肽(抗CCP)抗体、α-1抗胰蛋白酶(AAT)、α-1糖蛋白、自身免疫抗原(例如,类风湿因子(RF)、抗甲状腺球蛋白(抗Tg)和抗甲状腺过氧化物酶抗体(抗TPO抗体))。
4.分析物结合分子
通常,本文所述的试剂盒和测定采用两种分析物结合分子,其中分析物结合分子与分析物和/或示踪分析物复合。与分析物和/或示踪分析物复合的两种分析物结合分子可以以相同或不同的亲和力结合分析物,例如,与分析物结合的亲和力有约3倍至约5倍、约5倍至约100倍、约5倍至约10倍、约10倍至约25倍、约25倍至约50倍、约50倍至约100倍、约3倍、约5倍、约10倍、约25倍、约50倍、约100倍或更多倍的差异。在不同的实施方案中,所述分析物结合分子之一或两者直接或间接地与标记物结合。在不同的实施方案中,所述分析物结合分子之一或两者是抗体或其抗原反应性片段(即,结合分析物)。
在一些实施方案中,捕获和检测分析物结合分子之一或两者是非抗体分析物结合分子。已开发了以类似于抗体的方式针对并结合靶标的其他化合物。这些“抗体模拟物”中的一些使用非免疫球蛋白骨架作为替代的蛋白质框架用于抗体的可变区。
例如,Ladner等人(美国专利号5,260,203)描述了单多肽链结合分子,其具有类似于聚集的、但在分子上分离的抗体轻链和重链可变区的结合特异性。该单链结合分子含有通过肽连接体连接的抗体重链和轻链可变区两者的抗原结合位点,并将折叠成类似于两肽抗体的结构。该单链结合分子相对于常规抗体显示出几个优点,包括更小的尺寸、更高的稳定性且更易于修饰。
Ku等人(Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.92(14):6552-6556(1995))公开了基于细胞色素b562的抗体替代物。Ku等人(1995)生成了一个文库,其中对细胞色素b562的两个环进行随机化并针对与牛血清白蛋白的结合进行选择。个别突变体被发现与抗BSA抗体类似地与BSA选择性结合。
Lipovsek等人(美国专利号6,818,418和7,115,396)公开了一种以纤连蛋白或纤连蛋白样蛋白质骨架和至少一个可变环为特征的抗体模拟物。这些基于纤连蛋白的抗体模拟物被称为Adnectins,表现出天然或工程化抗体的许多相同的特性,包括对于任何目标分析物的高亲和力和特异性。用于开发新的或改进的结合蛋白质的任何技术可与这些抗体模拟物一起使用。
这些基于纤连蛋白的抗体模拟物的结构类似于IgG重链的可变区的结构。因此,这些模拟物表现出与天然抗体在性质和亲和力方面相似的抗原结合性质。另外,这些基于纤连蛋白的抗体模拟物表现出超过抗体和抗体片段的某些好处。例如,这些抗体模拟物的天然折叠稳定性不依赖于二硫键,因此,在通常会分解抗体的条件下是稳定的。此外,由于这些基于纤连蛋白的抗体模拟物的结构类似于IgG重链,因此环随机化和改组过程可以在体外使用,该过程类似于抗体在体内的亲和力成熟的过程。
Beste等人(Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.96(5):1898-1903(1999))公开了一种基于脂质运载蛋白骨架的抗体模拟物脂质运载蛋白由在蛋白质的末端具有四个高变环的β桶状结构组成。Beste(1999)对环进行随机诱变并针对与例如荧光素的结合进行选择。三种变体表现出与荧光素特异性结合,其中一种变体显示出与抗荧光素抗体类似的结合。进一步的分析表明,所有随机化位置都是可变的,表明将适合用作抗体的替代物。是单链小肽,通常为160至180个残基,其提供了相对于抗体的若干优点,包括生产成本降低、储存稳定性增加和免疫反应降低。
Hamilton等人(美国专利号5,770,380)公开了一种合成抗体模拟物,其使用与用作结合位点的多个可变肽环连接的杯芳烃的刚性非肽有机骨架。肽环相对于彼此均从杯芳烃的几何学上的同一侧伸出。由于这种几何学确认,所有环均可用于结合,从而提高了与分析物的结合亲和力。然而,与其他抗体模拟物相比,基于杯芳烃的抗体模拟物并非完全由肽组成,因此,它较不易受蛋白酶的攻击。骨架也并不单纯由肽、DNA或RNA组成,这意味着该抗体模拟物在极端的环境条件下是相对稳定的并具有长寿命。另外,由于基于杯芳烃的抗体模拟物相对较小,因此不太可能产生免疫原性应答。
Murali等人(Cell.Mol.Biol.49(2):209-216(2003))讨论了一种将抗体缩小为较小的拟肽的方法,他们将其称作“抗体样结合拟肽”(ABiP),其也可以用作抗体的替代物。
Silverman等人(Nat.Biotechnol.,23:1556-1561(2005))公开了融合蛋白,它是包含多个结构域的单链多肽,被称为“avimer”。avimer通过体外外显子改组和噬菌体展示从人类细胞外受体结构域开发而来,是一类在其对于各种靶分子的亲和力和特异性方面略微类似于抗体的结合蛋白质。所产生的多域蛋白质可以包含多个独立的结合域,与单表位结合蛋白质相比,其可表现出提高的亲和力(在有些情况下是亚纳摩尔级的)和特异性。例如,在美国专利申请公开号2004-0175756、2005-0048512、2005-0053973、2005-0089932和2005-0221384中公开了关于avimer的构建和使用方法的其他细节。
通常情况下,可商购的抗体或分析物结合分子可以在本测定中使用。在不同的实施方案中,例如,使用已知的重组和/或单克隆抗体产生技术产生捕获和检测分析物结合分子之一或两者。
可以按照本领域已知的方法制备和修饰(例如,保守置换)单克隆抗体。修饰的抗体或其抗原反应性片段检测分析物的能力可使用本领域已知的用于评估抗原结合特异性的任何标准方法来测定,该方法包括,例如,本文描述和举例说明的方法。这样的方法包括但不限于酶联免疫吸附测定、Western印迹法、表面等离子体共振(例如,)、(动力学排除测定)测定和放射免疫测定。优选地,修饰的抗体或抗原反应性片段显示出至少与相应的未修饰抗体一样好,并且优选地(甚至期望地)好于相应的未修饰抗体的分析物结合特性。
a.合成产生
一旦经测序,就可以使用本领域已知的方法,例如,完全固相合成、部分固相合成、片段缩合和经典的溶液合成,来合成特异性地结合分析物的多肽如单克隆抗体(或其片段)。参见,例如,Merrifield,J.Am.Chem.Soc.85:2149(1963)。在固相上,合成一般使用α-氨基保护的树脂从肽的C-末端开始。例如,合适的起始原料可以通过将所需的α-氨基酸附接至氯甲基化树脂、羟甲基树脂或二苯甲基胺树脂来制备。一种这样的氯甲基化树脂由BioRadLaboratories(Richmond,CA)以商品名BIO-BEADSSX-1出售,并且Bodonszky等人,Chem.Ind.(London)38:1597(1966)描述了羟甲基树脂的制备。二苯甲基胺(BHA)树脂已由Pietta和Marshall,Chem.Comm.650(1970)描述,并且可作为盐酸盐的形式商购自BeckmanInstruments,Inc.(PaloAlto,CA)。如同订购肽一样,自动肽合成仪是可商购的。
因此,可以根据由Gisin,Helv.Chim.Acta.56:1467(1973)描述的方法,通过借助于例如碳酸氢铯催化剂将α-氨基保护的氨基酸偶联至氯甲基化树脂来制备多肽。初始偶联后,通过选择包括三氟乙酸(TFA)或盐酸(HCl)溶液的试剂在室温下在有机溶剂中除去α-氨基保护基团。
合适的α-氨基保护基团包括已知在肽的逐步合成技术中有用的那些基团。α-氨基保护基团的实例是:酰基型保护基团(例如,甲酰基、三氟乙酰基和乙酰基)、芳香族氨基甲酸酯型保护基团(例如,苄氧羰基(Cbz)和取代的Cbz)、脂肪族氨基甲酸酯保护基团(例如,叔丁氧羰基(Boc)、异丙氧羰基和环己氧羰基)和烷基型保护基团(例如,苄基和三苯基甲基)。Boc和Fmoc是有用的保护基团。侧链保护基团在偶联过程中保持完整并且在氨基末端保护基团的脱保护过程中或偶联过程中不会分裂开。侧链保护基团必须在完成最终肽的合成之后并且在不会改变目标肽的反应条件下是可移除的。
除去α-氨基保护基团后,剩余的被保护的氨基酸以所需顺序逐步偶联。过量的每种受保护的氨基酸通常与合适的羧基活化剂如二环己基碳二亚胺(DCC)在溶液中,例如,在二氯甲烷和二甲基甲酰胺(DMF)混合物中一起使用。
在所需氨基酸序列已经完成后,通过用诸如TFA或氟化氢(HF)的试剂处理,从树脂支持物上解偶所需的肽,该试剂不仅从树脂上切下肽,而且还切下所有剩余的侧链保护基团。当使用氯甲基化树脂时,氟化氢处理导致游离肽酸的形成。当使用二苯甲基胺树脂时,HF处理直接产生游离的肽酰胺。或者,当使用氯甲基化树脂时,可以通过用氨处理肽树脂来解偶侧链保护的肽,以得到所需的侧链保护的酰胺,或用烷基胺处理,以得到侧链保护的烷基酰胺或二烷基酰胺。然后以通常的方式通过用氟化氢处理除去侧链保护,以得到游离酰胺、烷基酰胺或二烷基酰胺。
这些和其他的固相肽合成程序是本领域中公知的。这样的程序也由Stewart和Young在SolidPhasePeptideSyntheses(第2版,PierceChemicalCompany,1984)中描述。
b.重组产生
特异性结合分析物(或其片段)的多肽如单克隆抗体(或其片段)可以使用本领域已知的方法重组产生。例如,包含编码抗体(或其片段)的核苷酸序列的分离的核酸可以在宿主细胞中表达,并且该抗体可以得到分离。分离的核酸包含编码针对分析物的抗体的氨基酸序列的核苷酸序列。例如,分离的核酸可以用寡核苷酸合成仪来合成。本领域普通技术人员将容易理解,由于遗传密码的简并性,一个以上的核苷酸序列可以编码给定的氨基酸序列。就此而言,可以使用编码与针对分析物的抗体的氨基酸序列基本相同的氨基酸序列的核苷酸序列,条件是所表达的变异抗体与针对分析物的抗体竞争。优选地选择给定宿主细胞偏好的密码子进行重组产生。可以使用聚合酶链反应(PCR)、连接或连接链反应(LCR)将编码针对分析物的抗体的氨基酸序列的核苷酸序列与其他核苷酸序列组合,以编码抗分析物抗体或其抗原反应性片段。单独的寡聚核苷酸通常含有互补组件的5'或3'突出端。一旦组装,即可将编码抗分析物抗体或其抗原反应性片段的核苷酸序列插入到载体中,可操作地连接至对于在给定宿主细胞中表达所必需的控制序列,并引入(如通过转化或转染)到宿主细胞中。核苷酸序列可以进一步操作(例如,连接至编码另外的免疫球蛋白域如另外的恒定区的一个或多个核苷酸序列)和/或在宿主细胞中表达。
虽然不是所有的载体和表达控制序列都可以起到同样好的表达感兴趣的多核苷酸序列的作用,并且不是所有的宿主都能用相同的表达系统起到同样好的作用,但认为本领域技术人员将能够在这些载体、表达控制序列、优化的密码子和宿主中作出选择以用于本公开内容中而无需任何过多的实验。例如,在选择载体方面,必须考虑宿主,因为载体必须能够在其中复制或能够整合到染色体中。还应考虑载体的拷贝数、控制拷贝数的能力和由该载体编码的任何其他蛋白质如抗生素标志物的表达。在选择表达控制序列方面,还可考虑多种因素。这些因素包括但不限于该序列的相对强度、其可控性以及其与编码抗分析物抗体的核苷酸序列的相容性,特别是在潜在的二级结构方面。应通过考虑以下因素来选择宿主:它们与所选载体的相容性、它们的密码子使用、其分泌特性、它们正确折叠多肽的能力、它们的发酵或培养要求、它们使蛋白质糖基化的能力(或其缺乏)以及由核苷酸序列编码的产物的易纯化性,等等。
重组载体可以是自主复制载体,即作为染色体外的实体存在的载体,其复制独立于染色体复制(如质粒)。或者,载体可以是当引入宿主细胞时被整合到宿主细胞基因组中并且与它被整合到的染色体一起复制的载体。
所述载体优选地是表达载体,其中编码抗分析物抗体的多核苷酸序列可操作地连接到该多核苷酸序列的转录所需的附加区段。载体通常来源于质粒或病毒DNA。许多用于在本文提及的宿主细胞中表达的合适的表达载体是可商购的或在文献中描述。对于真核宿主有用的表达载体包括但不限于包含来自SV40、牛乳头瘤病毒、腺病毒和巨细胞病毒的表达控制序列的载体。具体的载体包括pCDNA3.1(+)\Hyg(InvitrogenCorp.,Carlsbad,CA)和pCI-neo(Stratagene,LaJolla,CA)。在酵母细胞中使用的表达载体的实例包括但不限于2μ质粒及其衍生物、POT1载体(参见,例如,美国专利号4,931,373)、pJSO37载体(描述于Okkels,Ann.NewYorkAcad.Sci.782:202-207(1996))和pPICZA、B或C(Invitrogen)。在昆虫细胞中使用的表达载体的实例包括但不限于pVL941、pBG311(Cate等人,Cell45:685-698(1986))和pBluebac4.5以及pMelbac(这两者均可从Invitrogen获得)。
可以使用的其他载体允许编码抗分析物抗体的核苷酸序列发生拷贝数扩增。这类可扩增的载体是本领域中公知的。这些载体包括但不限于那些可以通过二氢叶酸还原酶(DHFR)扩增(参见,例如,Kaufinan,美国专利号4,470,461;和Kaufinan等人,Mol.Cell.Biol.2:1304-1319(1982))和谷氨酰胺合成酶(GS)扩增(参见,例如,美国专利号5,122,464和欧洲专利申请公开号0338841)而扩增的载体。
重组载体可以进一步包含使得该载体能够在所讨论的宿主细胞中复制的核苷酸序列。在哺乳动物宿主细胞中使用的这种序列的一个实例是SV40复制起点。使载体能够在酵母细胞中复制的合适的序列是酵母质粒2μ复制基因REP1-3和复制起点。
所述载体还可以包含选择性标记,即,其产物弥补了宿主细胞中的缺陷的基因或多核苷酸,如编码DHFR的基因或粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomycespombe)TPI基因(参见,例如,Russell,Gene40:125-130(1985)),或赋予对药物如氨苄青霉素、卡那霉素、四环素、氯霉素、新霉素、潮霉素或甲氨蝶呤的抗性的基因。对于丝状真菌,选择性标记包括但不限于amdS、pyrG、arcB、niaD和sC。
载体中还存在“控制序列”,其为对于抗分析物抗体的表达而言必需的或有利的任何组分。每种控制序列对编码抗分析物抗体的核苷酸序列而言可以是天然的或外来的。这类控制序列包括但不限于前导序列、聚腺苷酸化序列、前肽序列、启动子、增强子或上游激活序列、信号肽序列和转录终止子。至少,控制序列包括至少一个可操作地连接至编码抗分析物抗体的多核苷酸序列的启动子。
所谓“可操作地连接”是指借助于酶连接或以其他方式,相对于彼此以使得能够行使序列的正常功能的构型,两个或更多个核苷酸序列的共价连接。例如,编码前序列或分泌前导序列的核苷酸序列可操作地连接至多肽的核苷酸序列,如果其表达为参与该多肽的分泌的前蛋白质;启动子或增强子可操作地连接至编码序列,如果其影响该序列的转录;核糖体结合位点可操作地连接至编码序列,如果其定位成以便促进翻译。通常,“可操作地连接”意指所连接的核苷酸序列是连续的,并且在分泌性前导序列的情况下,是连续的且在同一阅读框中。连接通过在方便的限制性位点处连接来完成。如果不存在这样的位点,则可以同标准重组DNA方法一起使用合成的寡核苷酸衔接子或连接体。
在本公开内容的背景下可以使用众多的表达控制序列。这类有用的表达控制序列包括与上述表达载体的结构基因相关联的表达控制序列以及已知控制原核或真核细胞或其病毒的基因表达的任何序列及其各种组合。用于在哺乳动物细胞中引导转录的合适的控制序列的实例包括SV40和腺病毒的早期和晚期启动子,例如,腺病毒2主要晚期启动子、MT-1(金属硫蛋白基因)启动子、人巨细胞病毒立即早期基因启动子(CMV)、人延伸因子1α(EF-1α)启动子、果蝇最小热休克蛋白70启动子、劳斯肉瘤病毒(RSV)启动子、人遍在蛋白C(UbC)启动子、人生长激素终止子、SV40或腺病毒E1b区聚腺苷酸化信号以及Kozak共有序列(Kozak,J.Mol.Biol.196:947-50(1987))。
为了提高在哺乳动物细胞中的表达,可以在编码抗体或其片段的多核苷酸序列的5'非翻译区插入合成内含子。合成内含子的一个实例是来自质粒pCI-Neo(可从PromegaCorporation,Madison,WI获得)的合成内含子。
用于在昆虫细胞中引导转录的合适的控制序列的实例包括但不限于多角体蛋白启动子、P10启动子、杆状病毒立即早期基因1启动子、杆状病毒39K延迟早期基因启动子和SV40聚腺苷酸化序列。
用于在酵母宿主细胞中使用的合适的控制序列的实例包括酵母α-接合系统的启动子、酵母磷酸丙糖异构酶(TPI)启动子、来自酵母糖酵解基因或醇脱氢酶基因的启动子、ADH2-4c启动子和诱导型GAL启动子。
用于在丝状真菌宿主细胞中使用的合适的控制序列的实例包括ADH3启动子和终止子,源自编码米曲霉(Aspergillusoryzae)TAKA淀粉酶磷酸丙糖异构酶或碱性蛋白酶、黑曲霉(A.niger)α-淀粉酶、黑曲霉或构巢曲霉(A.nidulas)葡糖淀粉酶、构巢曲霉乙酰胺酶、米黑根毛霉(Rhizomucormiehei)天冬氨酸蛋白酶或脂肪酶的基因的启动子,TPI1终止子,以及ADH3终止子。
编码感兴趣的抗体的多核苷酸序列还可以包括或可以不包括编码信号肽的多核苷酸序列。当抗分析物抗体将从表达它的细胞中分泌时,存在信号肽。如果存在的话,这样的信号肽应该是被选择用于表达多肽的细胞所识别的信号肽。信号肽可以是与抗分析物单克隆抗体同源的或异源的,或者可以是与宿主细胞同源的或异源的,即,在正常情况下由该宿主细胞表达的信号肽或在正常情况下不由该宿主细胞表达的信号肽。因此,信号肽可以是原核的,例如,来源于细菌,或是真核的,例如,来源于哺乳动物、昆虫、丝状真菌或酵母细胞。
例如,信号肽的存在或不存在将取决于用于产生抗分析物抗体的表达宿主细胞。为了在丝状真菌中使用,信号肽可以方便地来源于编码曲霉(Aspergillussp.)淀粉酶或葡糖淀粉酶的基因、编码米黑根毛霉脂肪酶或蛋白酶或柔毛腐质霉(Humicolalanuginosa)脂肪酶的基因。为了在昆虫细胞中使用,信号肽可以来源于昆虫基因(参见,例如,国际专利申请公开号WO90/05783),如鳞翅目烟草天蛾(Manducasexta)脂动激素前体(参见,例如,美国专利号5,023,328)、蜜蜂蜂毒肽(Invitrogen)、蜕皮类固醇UDP葡糖基转移酶(egt)(Murphy等人,ProteinExpressionandPurification4:349-357(1993)或人胰脂肪酶(hpl)(MethodsinEnzymology284:262-272(1997))。
用于在哺乳动物细胞中使用的信号肽的具体实例包括鼠Igκ轻链信号肽(Coloma,J.Imm.Methods152:89-104(1992))。用于在酵母细胞中使用的合适的信号肽包括来自酿酒酵母的α-因子信号肽(参见,例如,美国专利号4,870,008)、小鼠唾液淀粉酶的信号肽(参见,例如,Hagenbuchle等人,Nature289:643-646(1981))、经修饰的羧肽酶信号肽(参见,例如,Valls等人,Cell48:887-897(1987))、酵母BAR1信号肽(参见,例如,国际专利申请公开号WO87/02670)和酵母天冬氨酸蛋白酶3(YAP3)信号肽(参见,例如,Egel-Mitani等人,Yeast6:127-137(1990))。
任何合适的宿主可以用于产生抗分析物抗体,包括细菌、真菌(包括酵母)、植物、昆虫、哺乳动物或其他合适的动物细胞或细胞系,以及转基因动物或植物。细菌宿主细胞的实例包括但不限于革兰氏阳性细菌,如芽孢杆菌属(Bacillus)的菌株,例如,短芽孢杆菌(B.brevis)或枯草芽孢杆菌(B.subtilis),假单胞菌属(Pseudomonas)或链霉菌属(Streptomyces)的菌株,或革兰氏阴性细菌,如大肠杆菌(E.coli)菌株。例如,通过原生质体转化(参见,例如,Chang等人,Molec.Gen.Genet.168:111-115(1979))、使用感受态细胞(参见,例如,Young等人,J.ofBacteriology81:823-829(1961),或Dubnau等人,J.ofMolec.Biol.56:209-221(1971))、电穿孔(参见,例如,Shigekawa等人,Biotechniques6:742-751(1988))或接合(参见,例如,Koehler等人,J.ofBacteriology169:5771-5278(1987)),能够实现载体向细菌宿主细胞内的引入。
合适的丝状真菌宿主细胞的实例包括但不限于曲霉属的菌株,例如,米曲霉、黑曲霉或构巢曲霉,镰孢属(Fusarium)或木霉属(Trichoderma)的菌株。可以使用本领域技术人员已知的技术,通过包括原生质体形成、原生质体转化以及细胞壁再生的方法转化真菌细胞。用于转化曲霉属宿主细胞的合适的程序在欧洲专利申请公开号238023和美国专利号5,679,543中描述。用于转化镰孢属的种的合适的方法由Malardier等人和国际专利申请公开号WO96/00787描述。可使用由Becker和Guarente,于Abelson,J.N.andSimon,M.I.,editors,GuidetoYeastGeneticsandMolecularBiology,MethodsinEnzymology194:182-187,AcademicPress,Inc.,NewYork;Ito等人,J.ofBacteriology153:163(1983);以及Hinnen等人,PNASUSA75:1920(1978)所述的程序转化酵母。
合适的酵母宿主细胞的实例包括酵母属的菌株,例如,酿酒酵母(S.cerevisiae),裂殖酵母属(Schizosaccharomyces),克鲁维酵母属(Klyveromyces),毕赤酵母属(Pichia)如巴斯德毕赤酵母(P.pastoris)或甲醇毕赤酵母(P.methanolica),汉逊酵母属(Hansenula)如多形汉逊酵母(H.polymorpha),或耶氏酵母属(yarrowia)的菌株。用异源多核苷酸转化酵母细胞以及从中产生异源多肽的方法由ClontechLaboratories,Inc,PaloAlto,CA,USA(在YeastmakerTM酵母转化系统试剂盒(YeastTranformationSystemKit)的产品方案中)和Reeves等人,FEMSMicrobiologyLetters99:193-198(1992),Manivasakam等人,NucleicAcidsResearch21:4414-4415(1993)以及Ganev等人,FEMSMicrobiologyLetters121:159-164(1994)披露。
合适的昆虫宿主细胞的实例包括但不限于鳞翅目(Lepidoptora)细胞系,如草地贪夜蛾(Spodopterafrugiperda)(Sf9或Sf21)或粉纹夜蛾(Trichoplusiani)细胞(HighFive)(参见,例如,美国专利号5,077,214)。昆虫细胞的转化和异源多肽的产生是本领域技术人员公知的。
合适的哺乳动物宿主细胞的实例包括中国仓鼠卵巢(CHO)细胞系、猿(例如,绿猴)细胞系(COS)、小鼠细胞(例如,NS/O)、幼仓鼠肾(BHK)细胞系、人细胞(如人胚肾(HEK)细胞(例如,HEK293细胞(A.T.C.C.保藏号CRL-1573)))、不另外产生免疫球蛋白的骨髓瘤细胞和组织培养中的植物细胞。优选地,所述哺乳动物宿主细胞是CHO细胞系和HEK293细胞系。另一种宿主细胞是B3.2细胞系(例如,AbbottLaboratories,AbbottBioresearchCenter)或另一种二氢叶酸还原酶缺乏(DHFR-)CHO细胞系(例如,可从Invitrogen获得)。
用于将外源多核苷酸引入哺乳动物宿主细胞中的方法包括磷酸钙介导的转染、电穿孔、DEAE-葡聚糖介导的转染、脂质体介导的转染、病毒载体以及LifeTechnologiesLtd,Paisley,UK所述的使用LipofectamineTM2000的转染方法。这些方法是本领域中公知的,并且例如由Ausbel等人(编),CurrentProtocolsinMolecularBiology,JohnWiley&Sons,NewYork,USA(1996)所描述。哺乳动物细胞的培养根据已建立的方法来进行,例如,如Jenkins,Ed.,AnimalCellBiotechnology,MethodsandProtocols,HumanPressInc.Totowa,N.J.,USA(1999)以及Harrison和Rae,GeneralTechniquesofCellCulture,CambridgeUniversityPress(1997)中所披露的。
在生产方法中,使用本领域已知的方法在适于产生抗分析物抗体的营养培养基中培养细胞。例如,通过在合适的培养基中和在允许表达和/或分离抗人分析物单克隆抗体的条件下进行的摇瓶培养、在实验室或工业发酵罐中的小规模或大规模发酵(包括连续、分批、补料分批或固态发酵)来培养细胞。使用本领域已知的程序,在包含碳源和氮源以及无机盐的合适的营养培养基中进行培养。合适的培养基可从商业供应商获得或可以按照公开的组成(例如,在美国模式培养物保藏中心(AmericanTypeCultureCollection)的目录中)制备。如果抗分析物抗体被分泌到营养培养基中,则可以直接从培养基中回收。如果抗分析物抗体不分泌,则可以从细胞裂解物中回收。
所得到的抗分析物抗体可以通过本领域已知的方法来回收。例如,抗分析物抗体可以通过常规程序从营养培养基中回收,该程序包括但不限于离心、过滤、提取、喷雾干燥、蒸发或沉淀。
抗分析物抗体可以通过本领域已知的多种程序来纯化,该程序包括但不限于,色谱法(诸如但不限于离子交换、亲和力、疏水、色谱聚焦和大小排阻)、电泳程序(诸如但不限于制备型等电聚焦)、差示溶解度(诸如但不限于硫酸铵沉淀)、SDS-PAGE或提取(参见,例如,Janson和Ryden,editors,ProteinPurification,VCHPublishers,NewYork(1989))。
c.通过免疫、杂交瘤或其他手段的抗体产生
与分析物(或其片段)特异性结合的其他抗体(或其片段)可以使用本领域已知的多种不同技术来制备。例如,可以通过用含有合适的免疫原的免疫原制品对合适的受试者(诸如但不限于兔、山羊、小鼠或其他哺乳动物)进行免疫来产生多克隆和单克隆抗体。免疫原可以采用本领域公知的亲和色谱法、免疫沉淀或其他技术从其生产细胞中富集/纯化和分离。或者,免疫原可以利用本领域已知的常规技术使用化学合成来制备(诸如但不限于合成仪)。然后可以筛选在受试者中产生的抗体,以确定该抗体是否与免疫原(或其片段)结合。
免疫原(即,纯化的蛋白质、表达蛋白质的肿瘤细胞或重组表达的免疫原(或其片段或变体(或其片段))的单位剂量和免疫方案将取决于待免疫的受试者、其免疫状态和该受试者的体重。为了增强受试者中的免疫应答,免疫原可以与佐剂如弗氏完全或不完全佐剂一起施用。
如上所述用免疫原对受试者的免疫诱发多克隆抗体应答。在免疫的受试者中的抗体滴度可以使用固定化抗原通过诸如ELISA的标准技术随时间推移进行监测。
产生抗体的其他方法包括使用表达人免疫球蛋白基因的转基因小鼠(参见,例如,国际专利申请公开号WO91/00906、WO91/10741和WO92/03918)。或者,人单克隆抗体可以通过将抗原引入到已经移植了人类抗体产生细胞或组织(例如,人骨髓细胞、外周血淋巴细胞(PBL)、人胎儿淋巴结组织或造血干细胞)的免疫缺陷小鼠中来产生。这样的方法包括在SCID-hu小鼠(参见,例如,国际专利申请公开号WO93/05796;美国专利号5,411,749;或McCune等人,Science241:1632-1639(1988))或Rag-1/Rag-2缺陷小鼠中产生抗体。人抗体免疫缺陷小鼠也可商购获得。例如,Rag-2缺陷小鼠可从TaconicFarms(Germantown,NY)获得。
单克隆抗体可以通过用免疫原免疫受试者来产生。在免疫后适当的时间,例如,当抗体滴度处于足够高的水平时,可从免疫的动物收集抗体产生细胞并使用标准技术用其制备单克隆抗体。例如,可以通过标准体细胞融合程序将抗体产生细胞与无限增殖化细胞如骨髓瘤细胞融合,以产生杂交瘤细胞。这样的技术是本领域公知的,并且包括,例如,最初由Kohler和Milstein,Nature256:495-497(1975)开发的杂交瘤技术、人B细胞杂交瘤技术(Kozbar等人,ImmunologyToday4:72(1983))和产生人单克隆抗体的EB病毒(EBV)-杂交瘤技术(Cole等人,MonoclonalAntibodiesandCancerTherapy,AlanR.Liss,Inc.pp.77-96(1985))。用于产生单克隆抗体杂交瘤的技术是本领域技术人员公知的。
单克隆抗体也可以通过以下方式产生:从表达人免疫球蛋白基因并且已用免疫原免疫的转基因小鼠中收集抗体产生细胞,例如,脾细胞。脾细胞可通过与人骨髓瘤融合或通过用EBV转化而无限增殖化。这些杂交瘤可使用本领域中描述的人B细胞或EBV-杂交瘤技术来制备(参见,例如,Boyle等人,欧洲专利公开号0614984)。
通过筛选杂交瘤培养上清液,例如,通过筛选以选择与固定化免疫原(或其片段)特异性结合的抗体,或者通过如本文所述测试抗体以确定该抗体是否具有所需的特性,即,与免疫原(或其片段)结合的能力,来检测产生与免疫原特异性结合的单克隆抗体的杂交瘤细胞。鉴定出产生具有所需特异性的抗体的杂交瘤细胞之后,可以例如通过有限稀释程序,例如Wands等人(Gastroenterology80:225-232(1981))所述的程序,对克隆进行亚克隆,并通过标准方法进行培养。
产生在如本文所述的筛选测定中测试阳性的单克隆抗体的杂交瘤细胞可以在一定条件下在营养培养基中培养一定的时间,该条件和时间足以允许杂交瘤细胞分泌单克隆抗体到培养基中,从而产生完整抗体。适于杂交瘤细胞的组织培养技术和培养基在本领域中普遍描述(参见,例如,R.H.Kenneth,于MonoclonalAntibodies:ANewDimensionInBiologicalAnalyses,PlenumPublishingCorp.,NewYork,N.Y.(1980))。然后可收集含有所述抗体的条件化杂交瘤培养上清液。任选地,可以通过常规免疫球蛋白纯化程序,例如蛋白A色谱法、羟基磷灰石色谱法、凝胶电泳、透析或亲和色谱法,从培养基中分离由亚克隆分泌的单克隆抗体。
可以通过构建重组组合免疫球蛋白文库并用免疫原或其片段筛查该文库来工程构建单克隆抗体。用于产生和筛查噬菌体展示文库的试剂盒可商购获得(参见,例如,PharmaciaRecombinantPhageAntibodySystem,目录号27-9400-01;和StratageneSurfZAPPhageDisplayKit,目录号240612)。同样地,酵母展示载体是本领域已知的,并可商购获得(例如,可从Invitrogen获得的pYD1)。简言之,筛查抗体文库以鉴定并分离表达与免疫原或其片段特异性结合的抗体的噬菌体或酵母细胞。优选地,文库的初筛包括用固定化的免疫原或其片段筛查。
筛查后,分离出展示噬菌体或酵母,并且可以从展示噬菌体或酵母(例如,从噬菌体或酵母基因组)中回收编码所选抗体的多核苷酸,并通过众所周知的重组DNA技术将其亚克隆到其他表达载体(例如,酿酒酵母细胞,例如EBY100细胞(Invitrogen))中。该多核苷酸可以进一步操作(例如,连接至编码另外的免疫球蛋白域如另外的恒定区的核酸)和/或在宿主细胞中表达。
一旦按照上述方法获得了与分析物特异性结合的单克隆抗体,就可以根据本领域中已知的方法对其进行测序。然后可使用重组DNA技术、化学合成或化学合成与如上所述的重组DNA技术的组合来制备该抗体。
此外,在本公开内容的一些方面,也许有可能采用可商购的抗分析物抗体或如在文献中描述的用于产生抗分析物抗体的方法。或者,可以使用在文献中描述的方法来产生抗分析物抗体。
d.抗体片段
还可如本文所述使用与分析物结合的抗体的抗原反应性片段。抗体片段可以是Fab、Fab'、Fab'-SH片段、二硫键连接的Fv、单链Fv(scFv)、F(ab')2片段等。用于产生抗体片段的各种技术是本领域技术人员已知的。例如,这样的片段可以通过完整抗体的蛋白水解消化来衍生(参见,例如,Morimoto等人,J.Biochem.Biophys.Methods24:107-117(1992),和Brennan等人,Science229:81(1985)),或直接由重组宿主细胞产生。例如,Fab'-SH片段可以直接从大肠杆菌中回收并化学偶联以形成F(ab')2片段(参见,例如,Carter等人,Bio/Technology10:163-167(1992))。在另一个实施方案中,F(ab')2使用促进F(ab')2分子组装的亮氨酸拉链GCN4来形成。或者,Fv、Fab或F(ab')2片段可以直接从重组宿主细胞培养物中分离。单链可变区片段(scFv)通过使用短连接肽或序列连接轻链和/或重链可变区来制备(参见,例如,Bird等人,Science242:423-426(1998))。单链变体可以通过重组或合成方式产生。对于scFv的合成产生,可以使用自动化合成仪。对于scFv的重组产生,可以将含有编码scFv的多核苷酸的合适的质粒引入到合适的宿主细胞中,该宿主细胞或者是真核的,如酵母、植物、昆虫或哺乳动物细胞,或者是原核的,如大肠杆菌。编码感兴趣的scFv的多核苷酸可通过常规操作如多核苷酸的连接来制备。所得到的scFv可以使用本领域中已知的标准蛋白质纯化技术来分离。而且,其他形式的单链抗体如双抗体也涵盖在本公开内容中。双抗体是二价的双特异性抗体,其中VH和VL域在单条多肽链上表达,但使用的连接体过短以至于无法使同一条链上的两个域之间配对,从而迫使该域与另一条链的互补域配对并产生两个抗原结合位点(参见,例如,Holliger等人,PNASUSA90:6444-6448(1993);和Poljak等人,Structure2:1121-1123(1994))。
所述抗体及其抗原反应性片段具有多种用途。一方面,该抗体(或其片段)可用作一种或多种免疫诊断试剂。例如,该抗体可以在检测测试样品中分析物的存在的一种或多种方法中用作一种或多种免疫诊断试剂。更具体地,该抗体(或其抗原反应性片段)可在测定中用作捕获抗体或检测抗体,以检测测试样品中分析物的存在。
5.试剂盒
还提供了用于针对分析物(或其片段)测定测试样品的试剂盒。通常,试剂盒包含一起用于针对感兴趣的分析物测定测试样品的示踪分析物(即,用作如本文所述的内部校准物)、捕获分析物结合分子和检测分析物结合分子,以及针对分析物测定测试样品的说明书。在不同的实施方案中,试剂盒可包含含有第一标记物的示踪分析物、捕获分析物结合分子和含有第二标记物的检测分析物结合分子,其中该捕获分析物结合分子和该检测分析物结合分子可以同时与该示踪分析物和/或测试分析物结合。
如本领域技术人员所理解的,下面针对试剂盒所描述的组分在本文所描述的方法中也是有用的。因此,以下对固体支持物和标记物的描述同样适用于本文描述的试剂盒和方法。
在不同的实施方案中,该试剂盒可以包含通过本文所述的测定,例如微粒测定,来针对分析物(或其片段)测定测试样品的说明书。该说明书可以是纸质形式或计算机可读形式,如磁盘、CD、DVD等。可替代地或另外地,该试剂盒可包含校准物或对照,例如,纯化的和任选冻干的分析物(或其片段),和/或用于进行测定的至少一个容器(例如,管、微量滴定板或条,其可能已经用一种或多种分析物结合分子包被),和/或缓冲液,如测定缓冲液或洗涤缓冲液,其中任意一种可作为浓缩溶液、用于可检测标记物(例如,酶标记物)的底物溶液或终止溶液来提供。优选地,该试剂盒包含对于进行测定所必要的所有组分,即,试剂、标准、缓冲液、稀释剂等。该说明书还可以包括关于产生用于定量分析物目的的标准曲线或参考标准的说明书。
适当时或期望时,该试剂盒可以包含例如附接至捕获分析物结合分子的固体支持物。说明性的固体支持物包括,例如,电极、微粒、磁性颗粒、珠子、试管、微量滴定板、比色皿、膜、支架分子、薄膜、滤纸、盘或芯片。说明性的固体支持物包括但不限于,例如,电极、孔如微量滴定板的孔、试管、多孔凝胶(例如,硅胶、琼脂糖、葡聚糖或明胶)、聚合物膜(例如,聚丙烯酰胺)、珠子(例如,聚苯乙烯珠或磁珠)、过滤器/膜的条(例如,硝化纤维或尼龙)、微粒(例如,胶乳颗粒或可磁化微粒(例如,具有氧化铁或三氧化二铬核心以及均聚或杂聚涂层和大约1-10微米半径的微粒))。基底可以包含合适的多孔材料,该多孔材料具有合适的表面亲和力以结合捕获剂和足够的孔隙率以允许由检测剂进入。通常优选微孔材料,尽管可以使用水合状态的胶状材料。这样的多孔基底可以是片材的形式,其具有约0.01至约0.5mm的厚度,优选约0.1mm。孔径可以有很大不同,而优选孔径为约0.025至约15微米,更优选约0.15至约15微米。这样的基底的表面可以由导致分析物结合分子与基底的共价连接的化学过程来激活。捕获剂与基底的不可逆结合通常由通过疏水作用力的吸附来产生;或者,化学偶联剂或其他手段可以用来将捕获剂与基底共价结合,条件是这样的结合不干扰捕获剂结合分析物的能力。
适用于本发明的一种支持物是微粒。适合与本文所述的方法一起使用的微粒包括但不限于磁性微粒。微粒的大小通常为约0.1至约100μm的范围。可商购的微粒能以各种各样的材料获得,包括由陶瓷、玻璃、聚合物和金属制成的材料。适合于在本文描述的方法中使用的磁性微粒是可商购获得的,例如,从AgilentTechnologies,SantaClara,CA获得。虽然普遍接受的0.1至100μm的定义补充了纳米颗粒的大小定义,还有其他的方式来定义大小。一般的共识是认为小于100nm的微粒是纳米颗粒。大于0.5μm的任何微粒和小于0.5mm的任何微粒被认为是微粒。一般而言,适合与本文所述的方法一起使用的微粒的大小必须足够大,以使得通过选择的图像系统能够辨析两个微粒。适合与本文所述的方法一起使用的微粒的特性,例如,颜色,是选择问题。本领域普通技术人员可以选择微粒的特性,以便满足由该方法的适当变化所造成的要求。
适合与本文所述的试剂盒和方法一起使用的反应容器包括微孔板。在不同的实施方案中,该反应容器可以具有可生成捕获分析物结合分子-分析物-检测分析物结合分子复合物的图像的特征。在一个实施方案中,反应容器对电磁辐射(通常在光谱的紫外线和可见光范围内)是可透的。适合于制造反应容器的材料包括玻璃和聚合物材料。在一个实施方案中,反应容器的材料不是自发荧光的。然而,通常,反应容器的具体形式或形状不是关键性的。
在一些实施方案中,捕获和/或检测分析物结合分子与微粒结合,该微粒先前已用链霉抗生物素蛋白或生物素(例如,使用Power-BindTM-SA-MP链霉抗生物素蛋白包被的微粒(Seradyn,Indianapolis,IN))或抗物种特异性单克隆抗体包被。如果有必要,基底可以衍生化为允许与捕获剂上的各种官能团的反应性。这样的衍生化需要使用某些偶联剂,其实例包括但不限于马来酸酐、N-羟基琥珀酰亚胺和1-乙基-3-(3-二甲基氨基丙基)碳二亚胺。如果需要,一种或多种捕获剂(例如,分析物结合分子(例如,抗体或其抗原活性片段)),其中每一种对分析物都是特异性的,可附接至固体支持物的不同的物理或可寻址的位置(例如,如以生物芯片配置(参见,例如,美国专利号6,225,047,国际专利申请公开号WO99/51773;美国专利号6,329,209;国际专利申请公开号WO00/56934,和美国专利号5,242,828)。
示踪分析物直接或间接地附接至第一标记物,并且检测分析物结合分子直接或间接地附接至第二标记物。说明性的标记物包括,例如,荧光团、放射性部分、酶、生物素/抗生物素蛋白标记物、发色团、化学发光标记物等。可以使用如本领域已知的任何合适的可检测标记物。例如,可检测标记物可以是放射性标记物(如3H、125I、35S、14C、32P和33P),酶标记物(例如,辣根过氧化物酶、碱性磷酸酶、碱性过氧化物酶、葡萄糖6-磷酸脱氢酶等),化学发光标记物(例如,吖啶酯、硫酯或磺酰胺;鲁米诺、异鲁米诺、菲啶鎓酯等),一种或多种发色团,例如,在紫外或可见光区发光的一种或多种染料,磷光体,荧光剂,荧光团(例如,荧光蛋白(绿色荧光蛋白、黄色荧光蛋白、红色荧光蛋白、青色荧光蛋白);藻胆素(藻红蛋白、R-藻红蛋白、B-藻红蛋白);呫吨衍生物(荧光素、罗丹明、俄勒冈绿、曙红、德克萨斯红);花青衍生物(花青、Cy染料、吲哚羰花青、氧杂羰花青、硫杂羰花青、部花青);萘衍生物(丹酰和氟硅酸钠衍生物);香豆素衍生物;噁二唑衍生物(吡啶噁唑、硝基苯噁二唑、苯基噁二唑);芘衍生物(级联蓝);噁嗪衍生物(尼罗红、尼罗蓝、甲酚紫、噁嗪170);吖啶衍生物(原黄素、吖啶橙、吖啶黄);芳基次甲基衍生物(金胺、结晶紫、孔雀石绿);四吡咯衍生物(卟吩、酞菁、胆红素)),发光团,化学发光剂,荧光标记(例如,荧光素(例如,5-荧光素、6-羧基荧光素、3’6-羧基荧光素、5(6)-羧基荧光素、6-六氯荧光素、6-四氯荧光素、异硫氰酸荧光素等)),罗丹明,量子点(例如,硫化锌加帽的硒化镉),温度测量标记物,或免疫-聚合酶链反应标记物。对标记物、标记程序和标记物检测的介绍可见于Polak和VanNoorden,IntroductiontoImmunocytochemistry,第2版,SpringerVerlag,N.Y.(1997)和Haugland,HandbookofFluorescentProbesandResearchChemicals,这是由MolecularProbes,Inc.,Eugene,Oregon出版的组合手册和目录。荧光标记物可以在FPIA中使用(参见,例如,美国专利号5,593,896、5,573,904、5,496,925、5,359,093和5,352,803,其通过引用而全文并入本文)。吖啶鎓化合物可以在均相化学发光测定中用作可检测标记物(参见,例如,Adamczyk等人,Bioorg.Med.Chem.Lett.16:1324-1328(2006);Adamczyk等人,Bioorg.Med.Chem.Lett.4:2313-2317(2004);Adamczyk等人,Biorg.Med.Chem.Lett.14:3917-3921(2004);和Adamczyk等人,Org.Lett.5:3779-3782(2003))。
在不同的实施方案中,第一标记物或第二标记物是藻胆素(例如,藻红蛋白、R-藻红蛋白、B-藻红蛋白)。R-藻红蛋白或PE可用作基于荧光的指示剂,用于在多种应用中标记分析物结合分子或其他分子。R-藻红蛋白在约566nm处强烈吸收并在496和545nm处有副峰,并在575nm处强烈发射。R-藻红蛋白是迄今为止鉴定的最亮的荧光染料之一。参见,例如,Phycoerythrin–Wikipedia,自由的百科全书,在因特网上的en.wikipedia.org/wiki/Phycoerythrin和R-PHYCOERYTHRIN(PB31),ProZymeInc.,Hayward,CA,这两者均通过引用并入本文。
在可检测标记物是至少一种吖啶鎓化合物的实施方案中,试剂盒可以包含至少一种吖啶-9-羧酰胺、至少一种吖啶-9-羧酸芳基酯或其任意组合。如果可检测标记物是至少一种吖啶鎓化合物,则试剂盒还可以包含过氧化氢的来源,如缓冲液、溶液和/或至少一种碱性溶液。
第一和第二标记物或报告分子可以是任何产生信号的分子(例如,如以上和此处所述),只要它们能彼此区别开来。在不同的实施方案中,它们可以独立地是荧光团或化学发光探针。在不同的实施方案中,它们可通过光谱差异、寿命差异、相继触发或其他区别特性来区分。
在一些实施方案中,试剂盒可以包含用于标记分析物结合分子的试剂或用于检测分析物结合分子(例如,检测分析物结合分子)和/或用于标记分析物的试剂或用于检测分析物的试剂。分析物结合分子、校准物和/或对照可以提供于分开的容器中或预先分配到合适的测定形式中,例如,微量滴定板中。
任选地,试剂盒包含质量控制组分(例如,灵敏度组、校准物和阳性对照)。质量控制试剂的制备是本领域公知的,并且在多种免疫诊断产品的插页上有描述。灵敏度组成员任选地用于确立测定性能特征,并进一步任选地是测定试剂盒试剂的完整性和测定的标准化的有用指示剂。
试剂盒还可以任选包含进行诊断测定或促进质量控制评价所需要的其他试剂,如缓冲液、盐、酶、酶辅因子、底物、检测试剂等。其他组分,如用于分离和/或处理测试样品的缓冲液和溶液(例如,预处理试剂),也可以包含在试剂盒中。试剂盒可以另外包含一个或多个其他对照。试剂盒的一个或多个组分可以被冻干,在此情况下,试剂盒可以进一步包含适合于冻干组分的重建的试剂。
试剂盒的各种组分任选地在必要时提供于适当的容器中,例如,微量滴定板中。试剂盒可以进一步包含用于保持或贮存样品的容器(例如,用于尿样的容器或筒匣)。在适当的情况下,试剂盒任选地还可以含有反应容器、混合容器和有利于试剂或测试样品的制备的其他组件。试剂盒还可以包含一个或多个协助获得测试样品的工具,诸如注射器、移液管、镊子、测量匙等。
在特定的实施方案中,试剂盒包含含有第一标记物的示踪分析物、捕获分析物结合分子和含有第二标记物的检测分析物结合分子,其中该捕获分析物结合分子和该检测分析物结合分子可以同时与该示踪分析物结合。
6.测定形式
本公开内容提供了确定测试样品中分析物(或其片段)的存在、量或浓度的方法。本领域已知的任何合适的测定均可在该方法中使用。实例包括但不限于,测定,如夹心测定(例如,包括放射性同位素检测(放射免疫测定(RIA))和酶检测(酶测定(EIA)或酶联免疫吸附测定(ELISA)(例如,QuantikineELISA测定,R&DSystems,Minneapolis,MN)),以及均相化学发光测定,等等。在基于SELDI的测定中,捕获试剂(例如,特异性结合分析物的一种或多种分析物结合分子)附接到质谱探针如预活化的蛋白质芯片阵列的表面上。化学发光微粒测定,尤其是采用自动化分析仪(AbbottLaboratories,AbbottPark,IL)的化学发光微粒测定,是有用的测定的一个实例。有用的测定的另一个实例是如在Abbott照护点(AbbottPointofCare)仪器(AbbottLaboratories)上进行的测定。有用的测定的又一个实例是使用例如荧光显微镜在合适的固体支持物(例如,微量滴定板)上进行的测定。
本领域公知的用于收集、处理和加工尿、血液、血清和血浆以及其他体液的方法在本发明的实践中使用,例如,当使用根据本公开内容的分析物结合分子作为免疫诊断试剂时,和/或在用于分析物的测定的试剂盒中使用时。除了分析物、感兴趣的其他分析物,例如,通常为蛋白质、肽、多肽、寡核苷酸或多核苷酸,以及更具体地,例如,抗体、抗原、半抗原、激素、药物、酶或受体,以及本文所述的说明性分析物和任何其他感兴趣的分析物之外,测试样品还可包含另外的部分。例如,样品可以是从受试者获得的全血样品。在如本文所述的测定之前(例如,用预处理试剂)处理测试样品,特别是全血,可能是有必要的或期望的。甚至在预处理不必要的情况下(例如,大多数尿样品),仅为了方便起见,可任选地进行预处理(例如,作为在商业平台上的方案的一部分)。优选地,测试样品是血清。
预处理试剂可以是适合与本文所述的测定和试剂盒一起使用的任何试剂。例如,Sackrison等人公开了将样品的pH值降低至5.5或更低以将分析物从分析物结合蛋白质上解离(参见,例如,美国专利申请公开号2004/0132104)。预处理任选地包括:(a)一种或多种溶剂(例如,甲醇和乙二醇)和盐,(b)一种或多种溶剂、盐和去污剂,(c)去污剂,或(d)去污剂和盐。预处理试剂是本领域已知的,并且可采用这样的预处理,例如,如用于在AbbottTDx、和分析仪(AbbottLaboratories,AbbottPark,IL)上的测定,如文献中所述的(参见,例如,Yatscoff等人,AbbottTDxMonoclonalAntibodyAssayEvaluatedforMeasuringCyclosporineinWholeBlood,Clin.Chem.36:1969-1973(1990),和Wallemacq等人,EvaluationoftheNewAxSYMCyclosporineAssay:ComparisonwithTDxMonoclonalWholeBloodandEMITCyclosporineAssays,Clin.Chem.45:432-435(1999)),和/或为可商购获得的。此外,可以如Abbott的美国专利号5,135,875、欧洲专利公开号0471293、2006年12月29日提交的美国临时专利申请60/878,017和美国专利申请公开号2008/0020401(由于其关于预处理的教导而通过引用全文并入本文)所述进行预处理。预处理试剂可以是非均相试剂或均相试剂。
对于非均相预处理试剂的使用,预处理试剂任选地使样品中存在的抗体沉淀。这样的预处理步骤包括经由将通过向样品中加入预处理剂而形成的混合物的上清液与沉淀的抗体分离来移除任何抗体。在这样的测定中,不存在任何结合蛋白质的混合物的上清液在该测定中使用,直接进行捕获步骤。
对于均相预处理试剂的使用,不存在这样的分离步骤。测试样品和预处理试剂的整个混合物与对分析物(或其片段)特异性的标记的分析物结合分子,如特异性结合分析物的标记的抗体或其抗原反应性片段相接触。在被第一分析物结合分子捕获之前或期间,此种测定使用的预处理试剂在预处理后的测试样品混合物中稀释。尽管进行了这样的稀释,但一定量的预处理试剂(例如,5M甲醇和/或0.6M乙二醇)在捕获期间仍存在(或余留)于测试样品混合物中。
在非均相形式中,在从受试者获得测试样品后,制备第一混合物。该混合物包含将要评估分析物(或其片段)的测试样品和第一或捕获分析物结合分子(例如,抗体或其抗原活性片段),其中该分析物结合分子和包含在测试样品中的任何分析物或示踪分析物形成分析物结合分子-分析物复合物或分析物结合分子-示踪分析物复合物。在不同的实施方案中,第一或捕获分析物结合分子可以是特异性结合分析物的抗体(或其片段),例如,本文所述的抗体,或其他可商购的抗体。测试样品和示踪分析物应该同时引入至其他分析物结合分子。在不同的实施方案中,第一或捕获分析物结合分子固定在固体支持物上。测定中使用的固体支持物(用于第一分析物结合分子)可以是本领域已知的任何固体支持物,诸如但不限于电极、磁性颗粒、微粒、珠子、试管、微量滴定板、比色皿、膜、支架分子、薄膜、滤纸、盘和芯片。
在含有第一或捕获分析物结合分子-分析物复合物的混合物形成后,使用本领域已知的任何技术将任何未结合的分析物从该复合物中去除。例如,未结合的分析物可以通过洗涤来去除。然而期望的是,分析物结合分子相对于测试样品中存在的任何分析物过量地存在,使得存在于测试样品中的所有分析物均被分析物结合分子结合。
在去除任何未结合的分析物后,将第二或检测分析物结合分子加入到混合物中,以形成第一或捕获分析物结合分子-分析物-第二或检测分析物结合分子复合物。在不同的实施方案中,检测分析物结合分子是特异性结合分析物的抗体(或其片段)。通常,检测分析物结合分子用如本文所述的可检测标记物标记或含有该可检测标记物。
分析物测定通常可使用本领域已知的任何形式进行,诸如但不限于,如美国专利申请公开号US2009-0269777中进一步描述的夹心形式,该申请在2009年10月29日公开,并且通过引用并入本文。具体来说,在一种形式中,使用特异性结合分析物的分析物结合分子(例如,抗体或其抗原反应性片段)来确定样品中分析物(或其片段)的总量。更具体来说,分析物结合分子(例如,抗体或其抗原反应性片段)与分析物结合,形成免疫复合物,其被称为“夹心结构”。通常,用来捕获测试样品中的分析物(或其片段)的分析物结合分子(例如,抗体或其抗原反应性片段)被称为“捕获剂”,例如,在抗体的情况下为“捕获抗体”。用来结合可检测和可定量的标记物成为夹心结构的分析物结合分子(例如,抗体或其抗原反应性片段)被称为“检测剂”,例如,在抗体的情况下为“检测抗体”,或者为“偶联物”。
通常,正待检测(例如,怀疑含有)分析物(或其片段)的样品可与至少一种捕获剂(例如,分析物结合分子(例如,捕获抗体或其抗原反应性片段))和至少一种检测剂(例如,检测分析物结合分子(例如,抗体或其抗原反应性片段))同时或顺序地以及以任一顺序相接触。例如,测试样品可先与至少一种捕获剂接触,然后(顺序地)与至少一种检测剂接触。或者,测试样品可先与至少一种检测剂接触,然后(顺序地)与至少一种捕获剂接触。在另一个替代方案中,测试样品可同时与捕获剂和检测剂接触。
在夹心测定形式中,先使怀疑含有分析物(或其片段)的样品与至少一种捕获剂在允许形成捕获剂/分析物复合物的条件下进行接触。如果使用多于一种捕获剂,则形成多个捕获剂/分析物复合物。
任选地,在使测试样品与至少一种捕获剂接触之前,该至少一种捕获剂可结合至基底上以利于捕获剂/分析物复合物的分离。捕获剂所结合的基底可以是任何合适的固体支持物或如以上及此处所述有利于捕获剂/分析物复合物从样品中分离的固体支持物。
在正待测定分析物(或其片段)的测试样品与至少一种捕获剂接触后,温育该混合物以便允许捕获剂/分析物复合物的形成。如果测试样品与多于一种捕获剂相接触,则形成多个捕获剂/分析物复合物。温育可在约4.5到约10.0的pH、约2℃到约45℃的温度下进行至少约一(1)分钟到约十八(18)小时,优选约1到约24分钟,更优选约4到约18分钟的一段时间。本文所述的测定可以分一步(意味着测试样品、至少一种捕获剂和至少一种检测剂全部顺序地或同时地加入至反应容器中)或多于一步,如两步、三步等进行。
在捕获剂/分析物复合物形成后,使该复合物与至少一种检测剂接触(在允许捕获剂/分析物/检测剂复合物形成的条件下)。如果捕获剂/分析物复合物与多于一种检测剂接触,则形成多个捕获剂/分析物/检测剂复合物。就捕获剂来说,当至少一种检测剂与捕获剂/分析物复合物相接触时,捕获剂/分析物/检测剂复合物的形成需要在与上述条件类似的条件下温育一段时间。优选地,至少一种检测剂含有可检测标记物。可检测标记物可以在捕获剂/分析物/检测剂复合物形成之前、同时或之后与至少一种检测剂结合。可使用本领域已知的任何可检测标记物(参见上面的讨论,包括Polak和VanNoorden(1997)和Haugland(1996))。
可检测标记物可以直接地或通过偶联剂与检测剂结合。可以使用的偶联剂的一个实例是EDAC(1-乙基-3-(3-二甲氨基丙基)碳二亚胺盐酸盐),其可从Sigma-Aldrich,St.Louis,MO商购获得。可使用的其他偶联剂是本领域已知的。用于将可检测标记物与检测剂结合的方法是本领域已知的。此外,可以购买或合成已含有促进可检测标记物与分析物结合分子偶联的末端基团的许多可检测标记物,如CPSP-吖啶酯(即,9-[N-甲苯磺酰基-N-(3-羧丙基)]-10-(3-磺丙基)吖啶甲酰胺或SPSP-吖啶酯(即,N10-(3-磺丙基)-N-(3-磺丙基)-吖啶-9-甲酰胺)。
在标记物的定量前,捕获剂/分析物/检测剂复合物可以与,但不是必须与测试样品的其余部分分离。例如,如果至少一种捕获剂结合至固体支持物如孔或珠子,可通过从与固体支持物的接触中去除(测试样品的)流体来完成分离。或者,如果至少一种捕获剂结合至固体支持物,其可同时与测试样品和至少一种检测剂接触以形成捕获剂/分析物/检测剂复合物,随后从与固体支持物的接触中去除测试样品。如果至少一种捕获剂没有结合至固体支持物,则为了标记物的量的定量,捕获剂/分析物/检测剂复合物不需要从测试样品中去除。当测定不包括从未结合的样品分析物中分离结合的样品分析物时,其被认为是‘一步’测定。当测定包括从未结合的样品分析物中分离结合的样品分析物时,其通常被认为是‘两步测定’(或延迟的一步测定,这取决于如何进行分离)。
在标记的捕获剂/分析物/检测剂复合物形成后,使用本领域已知的技术定量复合物中标记物的量。产生的信号(例如,颜色、光、放射性、活性氧)可使用本领域技术人员所知的常规技术检测。基于产生的信号的强度,可以定量样品中分析物的量。具体来说,样品中分析物的量与产生的信号的强度成比例。存在的分析物的量可通过比较信号的量与参考标准来定量。
例如,如果使用酶标记物,则标记的复合物与产生可定量的反应如显色的该标记物的底物反应。如果标记物是放射性标记物,则使用闪烁计数器定量该标记物。如果标记物是荧光标记物,则通过用一种颜色(其被称为“激发波长”)的光刺激标记物并检测该标记物响应于该刺激而发射的另一种颜色(其被称为“发射波长”)来定量该标记物。如果标记物是化学发光标记物,则通过视觉地或使用光度计、X射线胶片、高速摄像胶片、CCD相机等检测发射的光来定量该标记物。
在不同的实施方案中,所述方法采用微粒固体支持物并使用自动化或半自动化系统来进行。适合在本文所述的方法中使用的成像系统可以是能够获得图像,以使得能解析单个微粒的任何系统。适合与本文所述的方法一起使用的成像系统包括但不限于光学显微镜、荧光成像扫描仪等。成像系统的此类使用例如在美国专利公开2012-0308997中描述,该申请由于其有关教导而通过引用并入本文。适合与本文所述的方法一起使用的图像文件类型包括但不限于JPEG/JFIF、GIF、BMP、TIFF和FITS。图像文件格式在“图像文件格式”—“维基百科,自由的百科全书”中描述,这可借助于超文本传输协议从网站en.wikipedia.org/wiki/image_file_formats获得,其通过引用并入本文,而FITS在“FITS”—“维基百科,自由的百科全书”中描述,这可借助于超文本传输协议从网站en.wikipedia.org/wiki/FITS获得,其通过引用并入本文。
图像获取过程中的曝光持续时间不是关键性的。适合与本文所述的方法一起使用的曝光时间可以是提供足以辨别图像的相关细节的分辨率的任何曝光时间。
感兴趣的区域的选择是重要的。通过使用合适的计算机程序,借助于对比或一些替代标准确定单个微粒的位置。与微粒或其他固体支持物相关联的像素可以被认为是感兴趣的区域。为获得样品中分析物浓度的有意义的值,通常至少约100个微粒,例如至少约200个微粒位于图像中。适合在本文所述的方法中使用的可商购的计算机程序包括但不限于,商标为“SLIDEBOOK”(IntelligentImagingInnovations,Inc.,Denver,CO;在因特网上的slidebook.com)和“METAMORPH”(MolecularDevices,LLC,Sunnyvale,CA)的那些程序,或在公开领域的软件,例如,ImageJ(在因特网上的rsbweb.nih.gov/ij/)。
在进行所述方法的一种形式时,可商购的荧光显微镜,例如落射荧光显微镜,可用于通过支撑它们的透明表面对复合物进行成像。可使用标准落射荧光显微镜、共焦或TIRF(全内反射荧光)显微镜。在不同的实施方案中,使用TIRF显微镜,因为这种类型的显微镜具有更好的z-平面分辨率,其可消除来自微粒所处的焦平面上方的信号,从而降低背景信号。这样的显微镜的代表性实例是与高分辨率CCD相机(例如,HamamatsuC4742-80-12AG型;在因特网上的learn.hamamatsu.com/products)耦接的机动化倒置荧光显微镜(例如,OLYMPUS“IX81”;在因特网上的olympusamerica.com/)。可以使用的其他类似的显微镜和相机是可商购获得的。
在所述方法的这种基本形式中,可使用单色方法来提供比采用来自反应混合物总体积的光信号的传统测定更高的灵敏度。这种更高的灵敏度可以通过相对于在传统测定中用作校准曲线的线性图的斜率,在较低浓度下具有更大斜率的线性函数图来证明。
承载捕获分析物结合分子的微粒、附接至荧光团的检测分析物结合分子和怀疑含有分析物的样品在合适的条件下组合以进行测定。在进行测试后,忽略不是从以下复合物发出的任何荧光信号:该复合物包含附接至捕获分析物结合分子的微粒、分析物和包含附接至荧光团的检测分析物结合分子的偶联物。然后,基于偶联物的荧光团发射的荧光进一步定量剩余的复合物。此后一步骤忽略微粒表面上没有达到选择标准的任何部分。基于统计参数,例如,标准偏差,选择标准的典型实例是,将被用于测量的微粒具有基本均匀的涂层,该涂层基本上消除可能由高度非特异性结合引起的偶联物的过度聚集。通常,选择标准根据特定的测定而变化。特定测定领域的普通技术人员应该能够为该特定测定制定有意义的选择标准。最后,测量合格颗粒的每个像素的强度平均值,以便将强度与作为强度的函数建立分析物浓度的校准曲线进行比较。合格颗粒的每个像素的强度平均值可借助于能够测量光强度的CCD相机来确定。将强度的测量值转化为以计数为单位表示的参数。每个像素具有对应于在该像素处测量的光强度的数字。
在另一个实施方案中,获得反应混合物的白光图像。采用该白光图像来定位每个固体支持物例如微粒的位置。白光图像通过使用完整的电磁谱进行照明和检测而形成。此步骤不是必需的,但是有用的,因为其消除了不是来源于微粒的信号。然后获得荧光图像以确定附接至微粒的检测分析物结合分子的位置和强度。荧光图像使用颜色,例如,红色、绿色。计算每个像素的计数,并且记录每个像素的计数的平均值和标准偏差。从分析中忽略计数大于或小于例如上述标准偏差的两倍的像素。计算剩余像素的每个像素的计数的平均数。从检测分析物结合分子的标记物测量的信号的量决定了分析物的浓度。
为了进行会提供更高灵敏度的测量,可使用可商购获得的落射荧光显微镜来通过支撑它们的透明表面对复合物进行成像。这样的显微镜的代表性实例是与高分辨率CCD相机(例如,HamamatsuC4742-80-12AG型)耦接的机动化倒置荧光显微镜(例如,OLYMPUS“IX81”),其可从许多来源商购获得。
在这种更高灵敏度的测量中,使用双色方法来提供比采用来自反应混合物总体积的光信号的传统测定和通过先前描述的单色方法进行的测量都更高的灵敏度。这种更高的灵敏度通过相对于在传统测定或使用单色方法的测定中用作校准曲线的线性图的斜率,在较低浓度下具有更大的斜率的线性函数图来证明。为实施本方法,改动可商购的仪器以增加用于检测用第一标记物标识的第一三联体复合物的第二检测通道,和用于检测用第二标记物标识的第二三联体复合物的第二通道。荧光通道用包含激发滤光器和发射滤光器的一组滤光器来限定,其允许具有特定波长的光到达样品并且具有特定波长的光到达CCD相机。例如,荧光团PE仅可在PE通道中检测到,而不能在任何其他荧光通道中检测到。类似地,荧光团Cy5仅可在Cy5通道中检测到,而不能在任何其他荧光通道中检测到。可以容易地改动从而包含第二检测通道的代表性自动化和半自动化系统包括,例如,EIA(珠子)、QuantumTMII和Abbott照护点(AbbottLaboratories)。
承载捕获分析物结合分子的微粒、附接到荧光团的检测分析物结合分子和怀疑含有分析物的样品在合适的条件下组合以进行测定。在进行测定后,忽略不是从以下复合物发出的任何荧光信号:该复合物包含附接至捕获分析物结合分子的微粒、分析物和包含附接至第一荧光团的检测分析物结合分子的偶联物。接下来,获得捕获分析物结合分子的图像(其特征在于与第一荧光团不同的第二荧光团)。该图像忽略与没有以均匀的方式用捕获分析物结合分子包被的任何微粒相对应的任何像素。如果微粒没有被均匀包被,则忽略来自该部分的像素。然后,基于偶联物发射的荧光进一步定量该复合物。此后一步骤忽略复合物上没有达到选择标准的任何部分。选择标准的典型实例是均匀的涂层,该涂层基本上消除可能由高度非特异性结合导致的偶联物的过度聚集。如前所述,选择标准根据特定的测定而变化。最后,测量合格颗粒的每个像素的强度平均值,以便将强度与建立分析物浓度的校准曲线进行比较。
在另一个实施方案中,获得样品的白光图像。采用该白光图像来确定微粒的位置。该步骤不是必需的,但是有用的,因为可能希望定位每个固体支持物例如微粒的位置。然后获得第一荧光图像以确定附接到微粒上的捕获分析物结合分子的位置。第一荧光图像使用颜色,例如,红色、绿色。获得第二荧光图像以确定作为偶联物的组分存在的分析物结合分子的位置。第二荧光图像使用颜色,例如,红色、绿色,但第二荧光图像的颜色与第一荧光图像的颜色不同。选择来源于微粒上的捕获分析物结合分子和偶联物上的分析物结合分子两者的像素用于进一步分析。计算每个像素的计数,并且记录每个像素的计数的平均值和标准偏差。从分析中忽略计数大于或小于例如计算的标准偏差的两倍的像素。计算剩余像素的每个像素的计数的平均数。从检测分析物结合分子的标记物测量的信号的量决定了分析物的浓度。
7.试剂盒和方法针对特定仪器的改动
可以改变试剂盒(或其组分),以及通过如本文所述的测定确定测试样品中分析物浓度的方法,以在多种自动化和半自动化系统(包括其中固体支持物包含电极或微粒的那些系统)中使用。仅作为示例包括以下的改动。说明性的自动化和半自动化系统例如在美国专利号5,089,424和5,006,309中描述,并且是商业销售的,例如,由AbbottLaboratories(AbbottPark,IL)作为销售。
自动化或半自动化系统与非自动化系统(例如,ELISA)相比的一些区别包括捕获分析物结合分子(例如,捕获分析物结合分子,例如,抗体或其抗原反应性片段)所附接的基底(其可影响夹心结构形成和分析物反应性),以及捕获、检测和/或任何任选的洗涤步骤的长度和时机。非自动化形式如ELISA可能需要相对较长的与样品和捕获试剂的温育时间(例如,约2小时),而自动化或半自动化形式(例如,AbbottLaboratories)可能具有相对较短的温育时间(例如,对于约18分钟)。类似地,非自动化形式如ELISA可能温育检测分析物结合分子(例如,检测分析物结合分子,例如,抗体或其抗原反应性片段)如偶联物试剂相对较长的温育时间(例如,约2小时),而自动化或半自动化形式(例如,)可能具有相对较短的温育时间(例如,对于约4分钟)。
可从AbbottLaboratories获得的其他平台包括但不限于 (参见,例如,美国专利号5,294,404,其通过引用全文并入本文)、EIA(珠子)和QuantumTMII以及其他平台。此外,测定、试剂盒和试剂盒组分可以以其他形式使用,例如,在电化学或其他手持式或照护点测定系统上使用。例如,本公开内容适用于进行夹心测定的商业Abbott照护点(AbbottLaboratories)电化学测定系统。在单次使用测试装置中的免疫传感器及其制造和操作方法例如在美国专利号5,063,081、美国专利申请公开号2003/0170881、美国专利申请公开号2004/0018577、美国专利申请公开号2005/0054078和美国专利申请公开号2006/0160164中描述,这些文献由于其有关教导而通过引用全文并入本文。
特别地,对于测定针对系统的改动,下面的配置是有用的。制造了具有一对金电流测量工作电极和银-氯化银参比电极的微制造硅芯片。在一个工作电极上,具有固定的捕获分析物结合分子的聚苯乙烯珠子(0.2mm直径)附着到电极上的图案化聚乙烯醇的聚合物涂层上。在典型的测定中,其他电极用涂覆有抗人血清白蛋白或不与感兴趣的分析物结合的另一种蛋白质的参比珠子或微粒涂覆。将该芯片组装到具有适合测定的流体形式的筒匣中。在该筒匣的样品保持室的壁的一部分上,有包含用碱性磷酸酶(或其他标记物)标记的检测分析物结合分子的层。在该筒匣的流体袋内是包含对氨基苯酚磷酸的水性试剂。
在操作时,将含有分析物的样品加入到测试筒匣的保持室内,并且将筒匣插入到读取器中。在检测分析物结合分子(例如,检测分析物结合分子,例如,抗体或其抗原反应性片段)已经溶解到样品中后,筒匣内的泵组件迫使样品进入含有芯片的导管中。在其中对其进行振荡以促进在捕获分析物结合分子、分析物和标记的检测分析物结合分子之间形成夹心结构。在测定的倒数第二个步骤中,将流体从袋中压出并进入导管,以从芯片上洗下样品并进入废料室中。在测定的最后一个步骤中,碱性磷酸酶标记物与对氨基苯酚磷酸反应,以裂解磷酸基团并允许释放的对氨基苯酚在工作电极处被电化学氧化。基于测量的电流,读取器能够借助于内置的算法和出厂设定的校准曲线计算样品中的分析物的量。
进一步不言而喻,本文所述的方法和试剂盒必然包括用于进行测定的其他试剂和方法。例如,包括多种缓冲液,如本领域已知的和/或可容易制备的,或优化以用于例如洗涤的,作为偶联物稀释剂和/或作为校准稀释剂的缓冲液。示例性的偶联物稀释剂是在某些试剂盒(AbbottLaboratories,AbbottPark,IL)中使用的,并含有2-(N-吗啉代)乙磺酸(MES)、盐、蛋白质阻断剂、抗微生物剂和去污剂的偶联物稀释剂。示例性的校准物稀释剂是在某些试剂盒(AbbottLaboratories,AbbottPark,IL)中使用的,包含含有MES的缓冲液、其他盐、蛋白质阻断剂、抗微生物剂的人校准物稀释剂。此外,如2008年12月31日提交的美国专利申请号61/142,048中描述的,可以获得改善的信号生成,例如,以筒匣形式,使用连接到信号或检测分析物结合分子的核酸序列作为信号放大器。
通常,为了与本发明的试剂盒和方法一起使用,改动了自动化和半自动化系统以使用两个不同的通道分析样品,第一通道用于检测用第一标记物标识的第一三联体复合物,而第二通道用于检测用第二标记物标识的第二三联体复合物。
通常,本发明的试剂盒和方法可用于任何目的,例如,用于诊断、预测或评估患者的治疗性/预防性处理的功效,以及其他用途。
实施例
以下实施例用于说明本公开内容。这些实施例并非旨在以任何方式限定所请求保护的发明。
实施例1
嗜中性粒细胞明胶酶相关脂质运载蛋白(NGAL)的滴定
本实施例使用代表性分析物NGAL证明了采用单一示踪分析物作为内部校准物的功能性和有效性。
这些研究使用由ATCC登录号为PTA-8024的鼠杂交瘤细胞系1-2322-455产生的抗体(以下称为“mAb2322”)和由ATCC登录号为PTA-8026的鼠杂交瘤细胞系1-903-430产生的抗体(以下称为“mAb903”)来完成。鼠杂交瘤细胞系1-903-430和1-2322-455分别于2006年11月21日保藏在美国模式培养物保藏中心(AmericanTypeCultureCollection)(以下称为“ATCC”),10801UniversityBlvd.,Manassas,VA.20110-2209。细胞系1-903-430被分配了ATCC登录号PTA8026。细胞系1-2322-455被分配了ATCC登录号PTA-8024。微粒用抗NGAL抗体mAb2322包被。抗NGAL鼠单克隆抗体和重组人NGAL如以前发表的那样产生并纯化(Olejniczak,E.T.,Ruan,Q.,Ziemann,R.N.,Birkenmeyer,L.G.,Saldana,S.C.和Tetin,S.Y.Biopolymers(2010)93(7):657-67)。被抗人单克隆抗体包被的微粒能够直接与mAb2322连接。
抗NGAL抗体mAb903用Cy5标记(“Ab-Cy5”)。用Cy3标记的NGAL(NGAL-Cy3)作为分析物示踪剂/内部校准物。Cy3和Cy5是花青染料家族的反应性水溶性荧光染料。Cy3在电磁谱的黄色区域(约570nm)中发荧光,但在电磁谱的绿色区域(约550nm)中吸收。Cy5在电磁谱的红色区域(约650nm或670nm)中发荧光,但在电磁谱的橙色区域(约649nm)中吸收。参见,例如,"TechnicalInformationonProbesConjugatedtoAffinity-PurifiedAntibodiesandtoOtherProteins:CyanineDyes(Cy2,Cy3,andCy5)",这可借助于超文本传输协议从万维网上的网站jacsonimmuno.com/technical/f-cy3-5.asp获得,其通过引用并入本文。
一种校准物和7个样品按照表1制备,并如图3所示处理。通常,具有已知浓度的样品如同它们是测试样品一样进行处理。
表1
表2列出了每个样品的Cy5/Cy3强度比和用下式测量的NGAL的浓度(即,[分析物]):
其中示踪分析物浓度(即,[示踪剂])为40pM,校正因子F为2.0,Cy5/Cy3为表2的第二列中列出的强度比。
表2
从表2中可以看出,在已知的(制备的)样品浓度(第1列)与测得的分析物浓度(第3列)之间具有良好的一致性。
实施例2
NGAL测定
本实施例示范了使用测定和校准物试剂盒(AbbottLaboratories,AbbottPark,IL)进行的NGAL测定。分开制备NGAL示踪分析物(NGAL-Cy3)和抗体偶联物(mAb903-Cy5),并与试剂盒的组分(例如,NGAL微粒和NGAL校准物)一起使用。
试剂盒中六种NGAL校准物中的五种(即,10、100、500、1000和1500ng/mL的校准物)如同它们是测试样品一样进行加工和处理。使用0ng/mL的校准物作为制备内部校准物的稀释剂。对六种中的每一种进行以下步骤。
1.混合10μL的62.5ng/mlNGAL-Cy3+10μL的每个NGAL样品+2μL800nMAb偶联物。
2.温育5分钟。
3.添加2μL的NGAL0.1%微粒。
4.温育5分钟。
5.用HBS-EP缓冲液(GEHealthcare,Inc.,目录号BR-1001-88;10mMHEPES(4-(2-羟乙基)-1-哌嗪乙磺酸),150mMNaCl,3mMEDTA和0.005%Tween-20)洗涤两次。
在步骤1-5完成后,在显微镜上拍摄样品的荧光图像。
测量每个样品在Cy3和Cy5通道中的颗粒的荧光强度,并且将值列于以下表3中的第2和第3列。使用相同的公式,用Cy5/Cy3比(第4列)计算每个样品中的NGAL分析物浓度(第6列):
其中[示踪剂]为62.5ng/mL,F为0.57,Cy5/Cy3为列于表3第四列的强度比。
表3
测得的NGAL值与实际NGAL值之间的相关性为100%(通过对数据作图并拟合至一条线而获得的值;数据未示出)。这些结果证实,使用本文所述的方法进行测定仅需要一种校准物(内部校准物)。所有测得的NGAL值均相对于该校准物来确定。
例如,我们通过使用不同的微粒量和温育不同的时间段,进一步改变了NGAL测定条件,如图4所示。这些结果证实,对于给定的分析物浓度,偶联物或检测抗体(Cy5)与示踪剂(Cy3)的强度比保持恒定。这进一步证实了内部校准物可以自动校正实验变化。
应当理解,本文所述的实施例和实施方案仅用于说明性目的,并且基于此的各种修改或改变将会由本领域技术人员想到,并且将包含在本申请的精神和范围内以及所附权利要求书的范围内。
2013年3月15日提交的、名称为“ASSAYWITHINCREASEDDYNAMICRANGE”的共同拥有的、共同未决的申请——序列号为13/833,655的美国非临时申请,由于其中用于避免“钩效应”和增加测定动态范围的试剂盒和方法的教导而明确地通过引用全文并入。
本文引用的所有出版物、专利和专利申请均为了所有目的通过引用而全文并入本文。
Claims (23)
1.一种试剂盒,其包含:包含第一标记物的示踪分析物、捕获分析物结合分子和包含第二标记物的检测分析物结合分子,其中所述捕获分析物结合分子和所述检测分析物结合分子能够同时与所述示踪分析物结合。
2.根据权利要求1所述的试剂盒,其中所述捕获分析物结合分子附接至固体支持物上。
3.根据权利要求2所述的试剂盒,其中所述固体支持物选自颗粒、微粒、珠子、电极和多孔板。
4.根据权利要求1至3中任意一项所述的试剂盒,其中所述捕获分析物结合分子和/或所述检测分析物结合分子之一或两者是抗体或其片段。
5.根据权利要求1至4中任意一项所述的试剂盒,其中所述第一标记物和所述第二标记物之一或两者是发色团。
6.根据权利要求5所述的试剂盒,其中所述第一标记物和所述第二标记物之一或两者是荧光团。
7.一种对测定进行内部校准的方法,其包括:
a)使捕获分析物结合分子与预定浓度的用第一标记物标记的示踪分析物及预定浓度的用第二标记物标记的检测分析物结合分子接触,其中所述捕获分析物结合分子和所述检测分析物结合分子同时与所述示踪分析物结合;
b)测量所获得的第一标记物的信号强度(I10)和第二标记物的信号强度(I20);
c)将校正因子(F)确定为第二标记物的强度(I20)与第一标记物的强度(I10)的比值;由此该校正因子的确定用于对所述测定进行内部校准。
8.一种确定一个或多个测试样品中的分析物浓度的方法,其包括:
a)在不存在或存在可能包含测试分析物的一个或多个测试样品的情况下,使捕获分析物结合分子与预定浓度的用第一标记物标记的示踪分析物及预定浓度的用第二标记物标记的检测分析物结合分子接触,其中所述捕获分析物结合分子和所述检测分析物结合分子同时与所述示踪分析物结合,并且如果存在的话,同时与所述一个或多个测试样品中的测试分析物结合;
b)测量在不存在所述一个或多个测试样品时获得的第一标记物的信号强度(I10)和第二标记物的信号强度(I20);
c)将校正因子(F)确定为第二标记物的强度(I20)与第一标记物的强度(I10)的比值;
d)测量在存在所述一个或多个测试样品时获得的第一标记物的信号强度(I1)和第二标记物的信号强度(I2);以及
e)通过将第二标记物的强度(I2)与第一标记物的强度(I1)的比值除以校正因子(F)并减去示踪分析物的预定浓度来确定在所述一个或多个测试样品中的测试分析物的浓度。
9.根据权利要求7至8中任意一项所述的方法,其中示踪分析物的预定浓度在所述捕获分析物结合分子的结合容量的饱和度以下。
10.根据权利要求8至9中任意一项所述的方法,其中示踪分析物的预定浓度的范围为从低于预期的测试分析物浓度至高于预期的目标测试分析物浓度约5倍。
11.根据权利要求7至10中任意一项所述的方法,其中使用两步测定形式。
12.根据权利要求11所述的方法,其中当使用两步测定形式时,检测分析物结合分子的预定浓度等于或超过在第一步中捕获的分析物和示踪分析物的浓度。
13.根据权利要求7至10中任意一项所述的方法,其中使用一步测定形式。
14.根据权利要求13所述的方法,其中当使用一步测定形式时,检测分析物结合分子的预定浓度超过分析物和示踪分析物的浓度。
15.根据权利要求7至14中任意一项所述的方法,其中所述方法使用自动化或半自动化系统来进行。
16.根据权利要求7至15中任意一项所述的方法,其中所述捕获分析物结合分子附接至固体支持物上。
17.根据权利要求16所述的方法,其中所述固体支持物选自颗粒、微粒、珠子、电极和多孔板。
18.根据权利要求7至17中任意一项所述的方法,其中所述捕获分析物结合分子和/或检测分析物结合分子之一或两者是抗体或其片段。
19.根据权利要求7至18中任意一项所述的方法,其中所述第一标记物是第一发色团且所述第二标记物是第二发色团。
20.根据权利要求19所述的方法,其中所述第一标记物是第一荧光团且所述第二标记物是第二荧光团。
21.根据权利要求8至20中任意一项所述的方法,其中步骤b)和d)能够同时或以任意顺序完成。
22.根据权利要求8至21中任意一项所述的方法,其中步骤d)和e)重复一次或多次。
23.根据权利要求8至22中任意一项所述的方法,其中步骤a)至c)只进行一次。
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