CN105063017A - 一种质粒dna提取方法 - Google Patents
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Abstract
本发明提供一种质粒DNA提取方法,其包括以下步骤:挑选单一的菌落在含有抗生素的液体培养基中进行扩大培养;向离心管中加入溶液I,充分悬浮细菌沉淀,加入溶液II,缓慢翻转数次,充分裂解2-6min,之后加入溶液III,翻转数次至形成白色聚合物,室温放置2-4min,将得到的溶液离心后,取上清放置在收集管的离心柱上;离心后,弃掉收集管内的废液,继续装载离心柱,向离心柱内加入清洗液A,离心后弃滤液,之后向离心柱内加入清洗液B,离心后弃滤液并重复该步骤2-3次,将离心柱放入无菌工作台的无菌管内,加入预热后的TE缓冲液,静置1min,离心后去掉离心柱,无菌管内得到目的DNA。本发明价格低廉,可大规模的制备,用于科研和药物生产等领域都具有良好效果。
Description
技术领域
本发明涉及分子研究领域,具体的涉及一种质粒DNA提取方法。
背景技术
现有技术提取DNA采用碱裂解法,碱裂解法是一种应用最为广泛的制备质粒DNA的方法,其基本原理为:当菌体在NaOH和SDS溶液中裂解时,蛋白质与DNA发生变性,当加入中和液后,质粒DNA分子能够迅速复性,呈溶解状态,离心时留在上清中;蛋白质与染色体DNA不变性而呈絮状,离心时可沉淀下来。
碱裂解法的具体操作步骤为:取1.5ml培养物加入微量离心管中,室温离心12000g×1min,放弃上清,将离心管倒置,使液体尽可能流尽,残余液体可用移液枪吸净。
将细菌沉淀重悬于100μL预冷的溶液I(50mM葡萄糖,25mMTris-el,10mMEDTAPH:8.0)中,用振荡器剧烈振荡,使菌体分散混匀。
加200μL新鲜配制的溶液II(0.2MNaOH,1%SDS),颠倒数次混匀(不要剧烈振荡),并将离心管在室温下放置2min,使细胞膜裂解(溶液Ⅱ为裂解液,故离心管中菌液逐渐变清)。
加入150μL预冷的溶液III(乙酸钾,PH为4.8),将离心管温和颠倒数次混匀,见白色絮状沉淀,可在冰上放置5min。溶液III为中和溶液,此时质粒DNA复性,染色体和蛋白质不可逆变性,形成不可溶复合物,同时K+使SDS-蛋白复合物沉淀。
取上清至一新离心管中,加入400μL的溶液IV(苯酚/氯仿/异戊醇),振荡混匀,离心12000g×5min。
小心移出上清于一新微量离心管中,加入2.5倍体积预冷的无水乙醇,混匀,室温放置5min,离心12000g×15min。
在1ml预冷的70%乙醇中洗涤沉淀1-2次,离心8000g×7min,弃上清,将沉淀在室温下晾干。
沉淀溶于20μLTE(10mMTris-cl,1mMEDTA,含RNaseA20μg/ml),37℃水浴30min以降解RNA分子,-20℃保存备用。
该方法提取质粒DNA的过程中具有以下几个缺点:
1.提取出来的质粒DNA纯度不高。可能是实验过程中杂蛋白和RNA去除的不干净,影响产物纯度。
2.提取的量太少,可能是实验中反应不完全,损失较多导致的。
3.实验过程中用到苯酚/氯仿/异戊醇等有毒试剂,不利于人员健康。
发明内容
本发明为了解决上述提到的现有的质粒DNA提取过程存在的缺点,提供一种DNA纯度高的质粒DNA提取方法。
具体地,本发明提供一种质粒DNA提取方法,其包括以下步骤:
S1、细菌的培养:挑选单一的菌落在含有抗生素的液体培养基中进行扩大培养,在35℃-40℃下培养12-16小时,将培养后的菌液无菌封装在至少两个离心管中,离心后,放弃上清;
S2、细菌的裂解:向离心管中加入溶液I,充分悬浮细菌沉淀,加入溶液II,缓慢翻转数次,充分裂解2-6min,之后加入溶液III,翻转数次至形成白色聚合物,室温放置2-4min,溶液I、溶液II和溶液III的摩尔比为1∶1∶1.4;
S3、质粒DNA的分离:将S2得到的溶液离心后,取上清放置在收集管的离心柱上;
S4、质粒DNA的收集:离心后,弃掉收集管内的废液,继续装载离心柱,向离心柱内加入清洗液A,离心后后弃滤液,之后向离心柱内加入清洗液B,离心后弃滤液并重复该步骤2-3次,将离心柱放入无菌工作台的无菌管内,加入预热后的TE缓冲液,静置1min,离心后去掉离心柱,无菌管内得到目的DNA,放入-20℃保存或者常温干燥保存,其中清洗液A和清洗液B的摩尔比为5∶7。
优选地,溶液I为25mMTris-cl与10mMEDTA高压灭菌后加入RNaseA0.1067mg/ml得到,其PH为8.0。
优选地,溶液II为0.2MNaOH与1%SDS。
优选地,溶液III为4M盐酸胍与0.5M醋酸钾,其PH为4.2。
优选地,清洗液A为5M盐酸胍、20mMTris-cl与浓度为37.5%乙醇的混合液,其PH为6.0。
优选地,清洗液B为浓度为80%的乙醇。
优选地,TE缓冲液为10mMTris-cl与1mMEDTA,其PH为8.0。
优选地,收集管的离心柱装载有硅胶膜。
本发明的优点如下所述:
本发明针对质粒DNA纯度不高,在相应的试剂中添加盐酸胍来溶解去除多余的杂蛋白。
本发明在收集DNA的过程中采用装有特定的硅胶膜装载在具有过滤垫片的空柱上,用来吸附裂解后的DNA,方便后期的杂蛋白和RNA去除,以及保证没有多余的DNA损失。
采用本发明提取的质粒DNA,在解决了传统方法所得产物纯度不高,有毒,量少等缺点的同时,与应用国外Qiagen柱式纯化试剂盒提取相同的质粒DNA比较,所得的DNA电泳条带同样清晰,无RNA混杂。本发明价格低廉,可扩大到较大规模的制备,用于科研和药物生产等领域都具有不错的效果。
具体实施方式
下面结合具体实施方式对本发明的结构及工作原理做进一步解释:
1.大肠杆菌的培养。挑选单一的菌落到3-4毫升的含有抗生素的液体培养基中进行扩大培养。培养温度一般为37°,180rpm(180转每分钟),时长为12-16小时。
2.将菌液无菌封装在2个2ml的离心管中,于12000rpm下离心2min,弃上清。
3.向离心管中加入250微升的溶液I充分悬浮细菌沉淀(移液器吹打)。
4.加入250微升溶液II,缓慢翻转数次,裂解充分4min左右。
5.加入350微升溶液III,翻转数次至形成白色聚合物,室温放置2min。
6.在12000rpm下离心10min,将上清加入安放在一个无盖的收集管上的装有硅胶膜的离心柱上,不能吸到沉淀,以免污染。
7.加热一定量的TE缓冲液,根据质粒种类决定数量,一般每管60-100微升。
8.在12000rpm下离心1min,弃掉收集管内的废液,继续装载离心柱。
9.向离心柱内加入500微升RinseA洗液,12000rpm,30s,然后弃滤液。
10.向离心柱内加入700微升RinseB洗液,12000rpm,30s,然后弃滤液。
11.重复10步骤。
12.12000rpm空离心,弃掉收集管。
13.将离心柱放入无菌工作台的无菌1.5mlEP管内,加入预热后的TE缓冲液60微升,静置1min。
14.12000rpm离心1min,去掉离心柱,EP管内就是目的DNA。放入-20保存或者常温干燥保存。
其中溶液I:25mMTris-cl,10mMEDTA,高压灭菌后加入RNaseA0.1067mg/ml,其PH为8.0;
溶液II:0.2MNaOH,1%SDS;
溶液III:4M盐酸胍,0.5M醋酸钾,其PH为4.2
RinseA:5M盐酸胍、20mMTris-cl以及浓度为37.5%乙醇,其PH为6.0。
RinseB:浓度为80%乙醇。
TE缓冲液:10mMTris-cl以及1mMEDTAPH8.0,并高压灭菌。
最后应说明的是:以上所述的各实施例仅用于说明本发明的技术方案,而非对其限制;尽管参照前述实施例对本发明进行了详细的说明,本领域的普通技术人员应当理解:其依然可以对前述实施例所记载的技术方案进行修改,或者对其中部分或全部技术特征进行等同替换;而这些修改或替换,并不使相应技术方案的本质脱离本发明各实施例技术方案的范围。
Claims (8)
1.一种质粒DNA提取方法,其特征在于:其包括以下步骤:
S1、细菌的培养:挑选单一的菌落在含有抗生素的液体培养基中进行扩大培养,在35℃-40℃下培养12-16小时,将培养后的菌液无菌封装在至少两个离心管中,离心后,放弃上清;
S2、细菌的裂解:向离心管中加入溶液I,充分悬浮细菌沉淀,加入溶液II,缓慢翻转数次,充分裂解2-6min,之后加入溶液III,翻转数次至形成白色聚合物,室温放置2-4min,溶液I、溶液II和溶液III的摩尔比为1∶1∶1.4;
S3、质粒DNA的分离:将S2得到的溶液离心后,取上清放置在收集管的离心柱上;
S4、质粒DNA的收集:离心后,弃掉收集管内的废液,继续装载离心柱,向离心柱内加入清洗液A,离心后后弃滤液,之后向离心柱内加入清洗液B,离心后弃滤液并重复该步骤2-3次,将离心柱放入无菌工作台的无菌管内,加入预热后的TE缓冲液,静置1min,离心后去掉离心柱,无菌管内得到目的DNA,放入-20℃保存或者常温干燥保存,其中清洗液A和清洗液B的摩尔比为5∶7。
2.根据权利要求1所述的质粒DNA提取方法,其特征在于:溶液I为25mMTris-cl与10mMEDTA高压灭菌后加入RNaseA0.1067mg/ml得到,其PH为8.0。
3.根据权利要求1所述的质粒DNA提取方法,其特征在于:溶液II为0.2MNaOH与1%SDS。
4.根据权利要求1所述的质粒DNA提取方法,其特征在于:溶液III为4M盐酸胍与0.5M醋酸钾,其PH为4.2。
5.根据权利要求1所述的质粒DNA提取方法,其特征在于:清洗液A为5M盐酸胍、20mMTris-cl与浓度为37.5%乙醇的混合液,其PH为6.0。
6.根据权利要求1所述的质粒DNA提取方法,其特征在于:清洗液B为浓度为80%的乙醇。
7.根据权利要求1所述的质粒DNA提取方法,其特征在于:TE缓冲液为10mMTris-cl与1mMEDTA,其PH为8.0。
8.根据权利要求1所述的质粒DNA提取方法,其特征在于:收集管的离心柱装载有硅胶膜。
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