CN104540827A - 吡咯并苯并二氮杂卓 - Google Patents

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CN104540827A CN201380035161.8A CN201380035161A CN104540827A CN 104540827 A CN104540827 A CN 104540827A CN 201380035161 A CN201380035161 A CN 201380035161A CN 104540827 A CN104540827 A CN 104540827A
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Abstract

式(I)的化合物或其盐或溶剂化物，其中，点线的双键表示在C2和C3之间存在单键或双键；R2选自-H、-OH、＝O、＝CH2、-CN、-R、OR、卤基、二卤基、＝CHR、＝CHRR’、-O-SO2-R、CO2R和COR；R7选自H、R、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR’、硝基、Me3Sn和卤基；其中R和R’独立地选自可选取代的C1-7烷基、C3-20杂环基和C5-20芳基；R10和R11一起形成双键，或分别选自H和QRQ，其中Q选自O、S和NH以及RQ是H或C1-7烷基或H和SOxM，其中x是2或3，并且M是单价药用阳离子；A选自(A1)、(A2)、(A3)、(A4)或(A5)，其中X1和Y1分别选自：CH和NH；CH和NMe；N和NMe；CH和S；N和S；N和O；以及CH和O；X2和Y2分别选自：CH和NH；CH和NMe；N和NMe；CH和S；N和S；N和O；以及CH和O；Z1选自O和S；Z2选自CH和N；F选自单键和–(E-F1)m-；每个E独立地选自单键和–C(＝O)-NH-；每个F1独立地是C3-20亚杂芳基；m是1、2或3；G选自氢、C1-4烷基、-C(＝O)-O-C1-4烷基、-(CH2)n-C3-20杂环烷基和–O-(CH2)n-C3-20杂环烷基；每个n是0-4；条件是A2不是A2’：其中A2’的X1和Y1分别选自：CH和NMe；COH和NMe；CH和S；N和NMe；N和S；以及条件是A3不是A3’：其中A3’的X2和Y2分别选自：CH和NMe；COH和NMe；CH和S；N和NMe；N和S；B是单键或(B1)，其中B1的X和Y分别选自：CH和NMe；COH和NMe；CH和S；N和NMe；N和S；以及R1是C1-4烷基。

Description

吡咯并苯并二氮杂卓
技术领域
本发明涉及吡咯并苯并二氮杂(吡咯并苯并二氮杂卓，PBD)并且尤其涉及PBD单体和合成PBD单体的方法。
背景技术
一些吡咯并苯并二氮杂(PBD)能够识别和结合于DNA的特定序列；优选的序列是PuGPu。1965年发现第一PBD抗肿瘤抗生素，安曲霉素(Leimgruber,et al.,J.Am.Chem.Soc.,87,5793-5795(1965)；Leimgruber,etal.,J.Am.Chem.Soc.,87,5791-5793(1965))。其后，已报道了若干天然存在的PBD，并且针对各种类似物已开发了10种以上的合成路线(Thurston,et al.,Chem.Rev.1994,433-465(1994))。家族成员包括abbeymycin(Hochlowski,et al.,J.Antibiotics,40,145-148(1987))、奇卡霉素(chicamycin)(Konishi,et al.,J.Antibiotics,37,200-206(1984))、DC-81(日本专利58-180487；Thurston,et al.,Chem.Brit.,26,767-772(1990)；Bose,et al.,Tetrahedron,48,751-758(1992))、甲基氨茴霉素(Kuminoto,et al.,J.Antibiotics,33,665-667(1980))、新丝拉霉素(neothramycin)A和B(Takeuchi,et al.,J.Antibiotics,29,93-96(1976))、porothramycin(Tsunakawa,et al.,J.Antibiotics,41,1366-1373(1988))、prothracarcin(Shimizu,et al,J.Antibiotics,35,972-978(1982)；Langley and Thurston,J.Org.Chem.,52,91-97(1987))、西班米星(sibanomicin)(DC-102)(Hara,et al.,J.Antibiotics,41,702-704(1988)；Itoh,et al.,J.Antibiotics,41,1281-1284(1988))、西伯里亚霉素(sibiromycin)(Leber,et al.,J.Am.Chem.Soc.,110,2992-2993(1988))和托马霉素(tomamycin)(Arima,et al.,J.Antibiotics,25,437-444(1972))。PBD具有以下一般结构：
它们的区别在于取代基的数量、类型和位置，在于它们的芳族A环和吡咯并C环两者，以及在于C环的饱和度。在B环中，在N10-C11位置(其是负责使DNA烷基化的亲电中心)处存在亚胺(N＝C)、甲醇胺(carbinolamine)(NH-CH(OH))或甲醇胺甲醚(NH-CH(OMe))。所有已知的天然产物在手性C11a位置处具有(S)-构型，当从C环到A环观察时，该构型向它们提供右手扭转(right-handed twist)。这给予它们用于与B型DNA的小沟的等螺旋性(isohelicity)的适当的三维形状，获得在结合位点处的滑动配合(Kohn,In Antibiotics III.Springer-Verlag,New York,pp.3-11(1975)；Hurley and Needham-VanDevanter,Acc.Chem.Res.,19,230-237(1986))。它们在小沟中形成加合物的能力使得它们可以干扰DNA加工，因此它们可用作抗肿瘤剂。化合物的合成已综述于Thurston,D.E.,et al.,Chem.Rev.,1994,94,433-465和Thurston,D.E.,et al.,Chem.Rev.,2011,111,2815-2864。
目前临床使用的大多数的抗生素源自杀菌或抑菌分子，其是由微生物(主要是属于霉菌和放线菌的那些微生物)作为次生代谢物所产生。筛选已识别了分子如吡咯并苯并二氮杂(PBD)托马霉素、安曲霉素和DC-81，通过结合于DNA的能力，其施加有效的相对于人类病原体的抗菌活性；这些化合物中的一些有可能作为癌症化疗剂，但相比于其他类化合物，高度的细胞毒性已使它们缺乏作为抗菌抗生素的吸引力。
然而，能够快速和有效水平传递编码抗生素抗性决定子的基因的多重耐药病原体的进化已在相对较短时间框架内促进一线抗菌化疗剂的许多治疗价值的侵蚀(erosion)。在革兰氏阴性病原体如铜绿假单胞菌和鲍氏不动杆菌中多药耐药性的增加已迫使重新评估黏菌素的全身应用；这种多粘菌素抗生素，发现于50多年前并直到最近都被认为对于非局部应用而言毒性太大，由于可用于这些感染的有限的治疗选择，现在被广泛全身使用。
已报道了PBD与吡咯和咪唑的一些结合物(conjugate)，如：
其中n＝1-3(Damayanthi,Y.,et al.,Journal of Organic Chemistry,64(1),290-292(1999))；
其中n＝1-3以及
其中n＝1-2(Kumar,R.and Lown,J.W.Oncology Research,13(4),221-233(2003))；Kumar,R.,et al.,Heterocyclic Communications,8(1),19-26(2002))；
其中n＝1-4(Baraldi,P.G.,et al.,Journal of Medicinal Chemistry,42(25),5131-5141(1999))；
其中n＝3(Wells,G.,et al.,Proc.Am.Assoc.Canc.Res.,2003,44,452)。
在WO 2005/085177中，本发明人中的一些公开了包含联芳基核心的氨基酸，其在DNA结合中可以具有有用的性能。
现在本发明人已经发现，可以修饰现有技术的PBD结合物以获得改善的性能，特别是抗菌性能。尤其是，本发明涉及在PBD结合物中并入包含5元杂环基团的氨基酸残基与基于亚芳基的氨基酸残基组合，产生高度有效的化合物。
发明内容
本发明的第一方面提供了式I的化合物：
或其盐或溶剂化物，其中：
点线的双键表示在C2和C3之间存在单键或双键；
R2选自-H、-OH、＝O、＝CH2、-CN、-R、OR、卤基、二卤基、＝CHR、＝CHRR’、-O-SO2-R、CO2R和COR；
R7选自H、R、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR’、硝基、Me3Sn和卤基；
其中R和R’独立地选自可选取代的C1-7烷基、C3-20杂环基和C5-20芳基；
R10和R11一起形式双键，或分别选自H和QRQ，其中Q选自O、S和NH并且RQ是H或C1-7烷基或H和SOxM，其中x是2或3，并且M是单价药用阳离子；
A选自A1、A2、A3、A4或A5：
其中
X1和Y1分别选自：CH和NH；CH和NMe；N和NMe；CH和S；N和S；N和O；以及CH和O；
X2和Y2分别选自：CH和NH；CH和NMe；N和NMe；CH和S；N和S；N和O；以及CH和O；
Z1选自O和S；
Z2选自CH和N；
F选自单键和–(E-F1)m-；
每个E独立地选自单键和–C(＝O)-NH-；
每个F1独立地是C3-20亚杂芳基；
m是1、2或3；
G选自氢、C1-4烷基、-C(＝O)-O-C1-4烷基、-(CH2)n-C3-20杂环烷基和–O-(CH2)n-C3-20杂环烷基，并且每个n是0-4；
条件是A2不是A2’：
其中A2’的X1和Y1分别选自：CH和NMe；COH和NMe；CH和S；N和NMe；N和S；并且
条件是A3不是A3’：
其中A3’的X2和Y2分别选自：CH和NMe；COH和NMe；CH和S；N和NMe；N和S；
在A2’和A3’中的B是单键或：
其中B1的X和Y分别选自：CH和NMe；COH和NMe；CH和S；N和NMe；N和S；并且
R1是C1-4烷基。
本发明的第二方面提供了合成式I的化合物的方法。
本发明的第三方面提供了包含本发明的第一方面的化合物和药用载体或稀释剂的药物组合物。
本发明的第四方面提供了本发明的第一方面的化合物用于在治疗方法中使用。
本发明的第五方面提供了本发明的第一方面的化合物在制造用于治疗细菌感染的药剂中的应用。此方面还提供了第一方面的化合物用于在治疗细菌感染的方法中使用。
本发明的第六方面提供了治疗遭受细菌感的患者的方法，包括给予所述患者治疗上可接受量的第一方面的化合物或第三方面的组合物。
在本发明的第四至第六方面中，可以单独或连同其他治疗一起(同时或顺序地，其取决于待治疗的病症)来给予本发明的化合物。在本发明的第三方面中，药物组合物可以包含一种或多种(例如，两种、三种或四种)另外的活性剂。
定义
取代基
如在本文中所使用的，短语“可选取代的”是指母体基团，其可以是未取代的或其可以是取代的。
如在本文中所使用的，除非另有说明，术语“取代的”是指母体基团，其具有一个或多个取代基。术语“取代基”在本文中是在常规意义上使用并且是指化学部分，其共价连接于，或者如果合适的话，稠合于母体基团。各种各样的取代基是众所周知的，以及用于它们的形成和引入各种母体基团的方法也是众所周知的。
下文详细描述取代基的实例。
C1-7烷基：如在本文中所使用的，术语“C1-7烷基”是指通过从具有1至7个碳原子的烃化合物的碳原子除去氢原子所获得的单价部分，其可以是脂族或脂环族的，并且其可以是饱和或不饱和的(例如，部分不饱和的、完全不饱和的)。因此，术语“烷基”包括下文讨论的亚类：烯基(链烯基，alkenyl)、炔基、环烷基等。
饱和烷基的实例包括但不限于甲基(C1)、乙基(C2)、丙基(C3)、丁基(C4)、戊基(C5)、己基(C6)和庚基(C7)。
饱和直链烷基的实例包括但不限于甲基(C1)、乙基(C2)、正丙基(C3)、正丁基(C4)、正戊基(戊基)(C5)、正己基(C6)和正庚基(C7)。
饱和支链烷基的实例包括异丙基(C3)、异丁基(C4)、仲丁基(C4)、叔丁基(C4)、异戊基(C5)和新戊基(C5)。
C2-7烯基：如在本文中所使用的，术语“C2-7烯基”是指具有一个或多个碳-碳双键的烷基。
不饱和烯基的实例包括但不限于乙烯基(ethenyl)(乙烯基(vinyl)，-CH＝CH2)、1-丙烯基(-CH＝CH-CH3)、2-丙烯基(烯丙基，-CH-CH＝CH2)、异丙烯基(1-甲基乙烯基，-C(CH3)＝CH2)、丁烯基(C4)、戊烯基(C5)和己烯基(C6)。
C2-7炔基：如在本文中所使用的，术语“C2-7炔基”是指具有一个或多个碳-碳三键的烷基。
不饱和炔基的实例包括但不限于乙炔基(ethynyl)(乙炔基(ethinyl)，-C≡CH)和2-丙炔基(炔丙基，-CH2-C≡CH)。
C3-7环烷基：如在本文中所使用的，术语“C3-7环烷基”是指其也是环基的烷基；即，通过从环烃(碳环)化合物的脂环原子除去氢原子所获得的单价部分，该部分具有3至7个碳原子，包括3至7个环原子。
环烷基的实例包括但不限于那些环烷基，其源自：
饱和单环烃化合物；
环丙烷(C3)、环丁烷(C4)、环戊烷(C5)、环己烷(C6)、环庚烷(C7)、甲基环丙烷(C4)、二甲基环丙烷(C5)、甲基环丁烷(C5)、二甲基环丁烷(C6)、甲基环戊烷(C6)、二甲基环戊烷(C7)和甲基环己烷(C7)；
不饱和单环烃化合物；
环丙烯(C3)、环丁烯(C4)、环戊烯(C5)、环己烯(C6)、甲基环丙烯(C4)、二甲基环丙烯(C5)、甲基环丁烯(C5)、二甲基环丁烯(C6)、甲基环戊烯(C6)、二甲基环戊烯(C7)和甲基环己烯(C7)；以及
饱和多环烃化合物；
降蒈烷(norcarane)(C7)、降蒎烷(norpinane)(C7)、降冰片烷(降莰烷，norbornane)(C7)。
C3-20杂环基：如在本文中所使用的，术语“C3-20杂环基”是指通过从杂环化合物的环原子除去氢原子所获得的单价部分，该部分具有3至20个环原子，其中1至10个是环杂原子。优选地，每个环具有3至7个环原子，其中1至4个是环杂原子。
在此上下文中，前缀(例如C3-20、C3-7、C5-6等)表示环原子的数目或环原子的数目范围，而不管是碳原子或杂原子。例如，如在本文中所使用的，术语“C5-6杂环基”是指具有5个或6个环原子的杂环基。
单环杂环基的实例包括但不限于源自以下的那些单环杂环基：
N1：氮杂环丙烷(C3)、氮杂环丁烷(C4)、吡咯烷(四氢吡咯)(C5)、吡咯啉(例如，3-吡咯啉、2,5-二氢吡咯)(C5)、2H-吡咯或3H-吡咯(异吡咯，异噁唑(isoazole))(C5)、哌啶(C6)、二氢吡啶(C6)、四氢吡啶(C6)、氮杂(azepine)(C7)；
O1：氧杂环丙烷(oxirane)(C3)、氧杂环丁烷(C4)、氧杂环戊烷(四氢呋喃)(C5)、氧杂茂(oxole)(二氢呋喃)(C5)、氧杂环己烷(oxane)(四氢吡喃)(C6)、二氢吡喃(C6)、吡喃(C6)、氧杂(oxepin)(C7)；
S1：硫杂环丙烷(C3)、硫杂环丁烷(C4)、硫杂环戊烷(四氢噻吩)(C5)、硫杂环己烷(thiane)(四氢噻喃)(C6)、硫杂环庚烷(thiepane)(C7)；
O2：二氧杂环戊烷(C5)、二氧杂环己烷(C6)和二氧杂环庚烷(dioxepane)(C7)；
O3：三氧杂环己烷(C6)；
N2：咪唑烷(C5)、吡唑烷(二偶氮烷(diazolidine))(C5)、咪唑啉(C5)、吡唑啉(二氢吡唑)(C5)、哌嗪(C6)；
N1O1：四氢噁唑(C5)、二氢噁唑(C5)、四氢异噁唑(C5)、二氢异噁唑(C5)、吗啉(C6)、四氢噁嗪(C6)、二氢噁嗪(C6)、噁嗪(C6)；
N1S1：噻唑啉(C5)、噻唑烷(C5)、硫代吗啉(C6)；
N2O1：噁二嗪(C6)；
O1S1：氧硫杂环戊二烯(噁噻吩，oxathiole)(C5)和氧硫杂环己烷(噻噁烷)(C6)；以及
N1O1S1：噁噻嗪(C6)。
取代的单环杂环基的实例包括那些取代的单环杂环基，其源自环形式的糖类，例如，呋喃糖(C5)，如阿拉伯呋喃糖、来苏呋喃糖(lyxofuranose)、呋喃核糖和呋喃木糖(xylofuranse)，以及吡喃糖(C6)，如别吡喃糖(allopyranose)、吡喃阿卓糖、吡喃葡萄糖、吡喃甘露糖、吡喃古洛糖(gulopyranose)、吡喃艾杜糖(idopyranose)、吡喃半乳糖和吡喃塔罗糖(talopyranose)。
C5-20芳基：如在本文中所使用的，术语“C5-20芳基”是指通过从芳族化合物的芳环原子除去氢原子所获得的单价部分，该部分具有3至20个环原子。优选地，每个环具有5至7个环原子。
在此上下文中,前缀(例如C3-20、C5-7、C5-6等)表示环原子的数目或环原子的数目范围，而不管是碳原子或杂原子。例如，如在本文中所使用的，术语“C5-6芳基”是指具有5或6个环原子的芳基。
环原子可以都是碳原子，如在“碳芳基”中。
碳芳基的实例包括但不限于源自以下的那些碳芳基：苯(即苯基)(C6)、萘(C10)、薁(甘菊环)(C10)、蒽(C14)、菲(C14)、萘并萘(C18)芘(C16)。
包含稠环(其至少之一是芳环)的芳基的实例包括但不限于源自以下的基团：茚满(例如2,3-二氢-1H-茚)(C9)、茚(C9)、异茚(C9)、四氢化萘(1,2,3,4四氢萘(C10)、苊(C12)、芴(C13)、非那烯(C13)、醋菲(C15)和醋蒽(C16)。
可替换地，环原子可以包括一个或多个杂原子，如在“杂芳基”中。单环杂芳基的实例包括但不限于源自以下的那些：
N1：吡咯(Pyrrole)(吡咯，azole)(C5)、吡啶(吖嗪)(C6)；
O1：呋喃(氧杂环戊二烯，oxole)(C5)；
S1：噻吩(thiophene)(噻吩，thiole)(C5)；
N1O1：噁唑(C5)、异噁唑(C5)、异噁嗪(C6)；
N2O1：噁二唑(呋咱)(C5)；
N3O1：噁三唑(C5)；
N1S1：噻唑(C5)、异噻唑(C5)；
N2：咪唑(1,3-二唑)(C5)、吡唑(1,2-二唑)(C5)、哒嗪(1,2-二嗪)(C6)、嘧啶(1,3-二嗪)(C6)(例如，胞嘧啶、胸腺嘧啶、尿嘧啶)、吡嗪(1,4-二嗪)(C6)；
N3：三唑(C5)、三嗪(C6)；以及，
N4：四唑(C5)。
包含稠环的杂芳基的实例包括但不限于：
衍生自以下的C9(具有2个稠环)：苯并呋喃(O1)、异苯并呋喃(O1)、吲哚(N1)、异吲哚(N1)、中氮茚(N1)、吲哚啉(N1)、异吲哚啉(N1)、嘌呤(N4)(例如，腺嘌呤、鸟嘌呤)、苯并咪唑(N2)、吲唑(N2)、苯并噁唑(N1O1)、苯并异噁唑(N1O1)、苯并二氧杂环戊二烯(苯并二噁茂)(O2)、苯并呋咱(N2O1)、苯并三唑(N3)、苯并噻吩(S1)、苯并噻唑(N1S1)、苯并噻二唑(N2S)；
衍生自以下的C10(具有2个稠环)：色烯(O1)、异色烯(O1)、色满(chroman)(O1)、异色满(O1)、苯并二氧杂环己烷(苯并二噁烷)(O2)、喹啉(N1)、异喹啉(N1)、喹嗪(N1)、苯并噁嗪(N1O1)、苯并二嗪(N2)、吡啶并吡啶(N2)、喹喔啉(N2)、喹唑啉(N2)、噌啉(N2)、酞嗪(phthalazine)(N2)、萘啶(二氮杂萘，naphthyridine)(N2)、蝶啶(N4)；
衍生自以下的C11(具有2个稠环)：苯并二氮杂(N2)；
衍生自以下的C13(具有3个稠环)：咔唑(N1)、二苯并呋喃(O1)、二苯并噻吩(S1)、咔啉(N2)、呸啶(萘嵌间二氮杂苯，perimidine)(N2)、吡啶并吲哚(N2)；以及，
衍生自以下的C14(具有3个稠环)：吖啶(N1)、呫吨(xanthene)(O1)、噻吨(S1)、噁蒽(oxanthrene)(O2)、吩噁噻(phenoxathiin)(O1S1)、吩嗪(N2)、吩噁嗪(N1O1)、吩噻嗪(N1S1)、噻蒽(S2)、菲啶(N1)、菲咯啉(N2)、吩嗪(N2)。
如在本文中所使用的，术语“亚芳基”、“亚碳芳基”、“亚杂芳基”是指通过从如上文针对芳基、碳芳基和杂芳基所描述的芳族化合物的两个环原子的每一个除去氢原子所获得的二价部分。
上述基团，无论单独地或是另一取代基的一部分，可以本身可选地被选自它们本身和以下列出的另外的取代基的一个或多个基团取代。
卤基：-F、-Cl、-Br和-I。
羟基：-OH。
醚：-OR，其中R是醚取代基，例如，C1-7烷基(还被称为C1-7烷氧基，下文讨论的)、C3-20杂环基(还被称为C3-20杂环氧基)或C5-20芳基(还被称为C5-20芳氧基)，优选C1-7烷基。
烷氧基：-OR，其中R是烷基，例如，C1-7烷基。C1-7烷氧基的实例包括但不限于-OMe(甲氧基)、-OEt(乙氧基)、-O(nPr)(正丙氧基)、-O(iPr)(异丙氧基)、-O(nBu)(正丁氧基)、-O(sBu)(仲丁氧基)、-O(iBu)(异丁氧基)和-O(tBu)(叔丁氧基)。
缩醛：-CH(OR1)(OR2)，其中R1和R2独立地是缩醛取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基，或在“环状”缩醛基团的情况下，R1和R2连同它们所连接的两个氧原子和它们所连接的碳原子一起形成具有4至8个环原子的杂环。缩醛基团的实例包括但不限于-CH(OMe)2、-CH(OEt)2和-CH(OMe)(OEt)。
半缩醛：-CH(OH)(OR1)，其中R1是半缩醛取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基。半缩醛基团的实例包括但不限于-CH(OH)(OMe)和-CH(OH)(OEt)。
缩酮：-CR(OR1)(OR2)，其中R1和R2是如针对缩醛所定义的，以及R是除氢以外的缩酮取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基。缩酮基团的实例包括但不限于-C(Me)(OMe)2、-C(Me)(OEt)2、-C(Me)(OMe)(OEt)、-C(Et)(OMe)2、-C(Et)(OEt)2和-C(Et)(OMe)(OEt)。
半缩酮：-CR(OH)(OR1)，其中R1是如针对半缩醛所定义，以及R是除氢以外的半缩酮取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基。半缩醛基团的实例包括但不限于-C(Me)(OH)(OMe)、-C(Et)(OH)(OMe)、-C(Me)(OH)(OEt)和-C(Et)(OH)(OEt)。
氧代(酮基，-酮)：＝O。
硫酮(Thione)(硫代酮，thioketone)：＝S。
亚氨基(亚胺)：＝NR，其中R是亚氨基取代基，例如，氢、C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选氢或C1-7烷基。酯基团的实例包括但不限于＝NH、＝NMe、＝Net和＝NPh。
甲酰基(羧甲醛(carbaldehyde)，羧基醛(carboxaldehyde))：-C(＝O)H。
酰基(酮基)：-C(＝O)R，其中R是酰基取代基，例如，C1-7烷基(还被称为C1-7烷基酰基或C1-7烷酰基)、C3-20杂环基(还被称为C3-20杂环基酰基)或C5-20芳基(还被称为C5-20芳酰基)，优选C1-7烷基。酰基的实例包括但不限于-C(＝O)CH3(乙酰基)、-C(＝O)CH2CH3(丙酰基)、-C(＝O)C(CH3)3(叔丁酰基)和-C(＝O)Ph(苯甲酰基，苯酮)。
羧基(羧酸)：-C(＝O)OH。
硫代羧基(硫代羧酸)：-C(＝S)SH。
巯基羧基(硫醇羧基，Thiolocarboxy)(巯基代羧酸(硫醇羧酸)，thiolocarboxylic acid)：-C(＝O)SH。
硫羰羧基(硫羰羧酸)：-C(＝S)OH。
亚氨酸(Imidic acid)：-C(＝NH)OH。
异羟肟酸：-C(＝NOH)OH。
酯(羧酸酯(carboxylate,carboxylic acid ester)，氧基羰基(oxycarbonyl))：-C(＝O)OR，其中R是酯取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基。酯基团的实例包括但不限于-C(＝O)OCH3、-C(＝O)OCH2CH3、-C(＝O)OC(CH3)3和-C(＝O)OPh。
酰氧基(反向酯，逆酯)：-OC(＝O)R，其中R是酰氧基取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基。酰氧基的实例包括但不限于-OC(＝O)CH3(乙酰氧基)、-OC(＝O)CH2CH3、-OC(＝O)C(CH3)3、-OC(＝O)Ph和-OC(＝O)CH2Ph。
氧基羰氧基(Oxycarboyloxy)：-OC(＝O)OR，其中R是酯取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基。酯基团的实例包括但不限于-OC(＝O)OCH3、-OC(＝O)OCH2CH3、-OC(＝O)OC(CH3)3和-OC(＝O)OPh。
氨基：-NR1R2，其中R1和R2独立地是氨基取代基，例如，氢、C1-7烷基(还被称为C1-7烷基氨基或二C1-7烷基氨基)、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选H或C1-7烷基，或在“环状”氨基的情况下，R1和R2连同它们所连接的氮原子一起形成具有4至8个环原子的杂环。氨基可以是伯氨基(-NH2)、仲氨基(-NHR1)或叔氨基(-NHR1R2)，以及在阳离子形式中，可以是季氨基(-+NR1R2R3)。氨基的实例包括但不限于-NH2、-NHCH3、-NHC(CH3)2、-N(CH3)2、-N(CH2CH3)2和-NHPh。环状氨基的实例包括但不限于氮丙啶基、氮杂环丁烷基、吡咯烷并、哌啶子基(piperidino)、哌嗪子基(piperazino)、吗啉代和硫代吗啉代。
酰氨基(氨基甲酰基，氨基甲酰，氨基羰基，氨甲酰)：-C(＝O)NR1R2，其中R1和R2独立地是氨基取代基，如针对氨基所定义的。酰氨基的实例包括但不限于-C(＝O)NH2、-C(＝O)NHCH3、-C(＝O)N(CH3)2、-C(＝O)NHCH2CH3和-C(＝O)N(CH2CH3)2，以及这样的酰氨基，其中R1和R2连同它们所连接的氮原子一起形成杂环结构，如在，例如，哌啶子基羰基、吗啉代羰基、硫代吗啉代羰基和哌嗪子基羰基中。
硫代酰氨基(硫代氨基甲酰)：-C(＝S)NR1R2，其中R1和R2独立地是氨基取代基，如针对氨基所定义的。酰氨基的实例包括但不限于-C(＝S)NH2、-C(＝S)NHCH3、-C(＝S)N(CH3)2和-C(＝S)NHCH2CH3。
酰基酰氨基(酰氨基)：-NR1C(＝O)R2，其中R1是酰胺取代基，例如，氢、C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选氢或C1-7烷基，以及R2是酰基取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选氢或C1-7烷基。酰胺基团的实例包括但不限于-NHC(＝O)CH3、-NHC(＝O)CH2CH3和-NHC(＝O)Ph。R1和R2可以一起形成环状结构，如在，例如，琥珀酰亚胺基、马来酰亚胺基和邻苯二甲酰亚胺基中：
氨基羰氧基：-OC(＝O)NR1R2，其中，R1和R2独立地是氨基取代基，如针对氨基所定义的。氨基羰氧基的实例包括但不限于-OC(＝O)NH2、-OC(＝O)NHMe、-OC(＝O)NMe2和-OC(＝O)NEt2。
脲基：-N(R1)CONR2R3，其中R2和R3独立地是氨基取代基，如针对氨基所定义的，以及R1是脲基取代基，例如，氢、C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选氢或C1-7烷基。脲基的实例包括但不限于-NHCONH2、-NHCONHMe、-NHCONHEt、-NHCONMe2、-NHCONEt2、-NMeCONH2、-NMeCONHMe、-NMeCONHEt、-NMeCONMe2和-NMeCONEt2。
胍基：-NH-C(＝NH)NH2。
四唑基：具有4个氮原子和1个碳原子的五元芳环，
亚氨基：＝NR，其中R是亚氨基取代基，例如，氢、C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选H或C1-7烷基。亚氨基的实例包括但不限于＝NH、＝NMe和＝Net。
脒(脒基)：-C(＝NR)NR2，其中每个R是脒取代基，例如，氢、C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选H或C1-7烷基。脒基团的实例包括但不限于-C(＝NH)NH2、-C(＝NH)NMe2和-C(＝NMe)NMe2。
硝基：-NO2。
亚硝基：-NO。
叠氮基：-N3。
氰基(腈，nitrile，carbonitrile)：-CN。
异氰基：-NC。
氰酰基(Cyanato)：-OCN。
异氰酰基：-NCO。
氰硫基(Thiocyano)(硫氰基)：-SCN。
异氰硫基(isothiocyano)(异硫氰基，isothiocyanato)：-NCS。
巯基(Sulfhydryl)(硫醇，thiol；巯基，mercapto)：-SH。
硫醚(硫化物)：-SR，其中R是硫醚取代基，例如，C1-7烷基(还被称为C1-7烷硫基)、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基。C1-7烷硫基的实例包括但不限于-SCH3和-SCH2CH3。
二硫化物：-SS-R，其中R是二硫化物取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基(在本文中还称为C1-7烷基二硫化物)。C1-7烷基二硫化物基团的实例包括但不限于-SSCH3和-SSCH2CH3。
硫肟基(锍化物，sulfine)(亚硫酰基，亚砜)：-S(＝O)R，其中R是硫肟基取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基、或C5-20芳基，优选C1-7烷基。硫肟基基团的实例包括但不限于-S(＝O)CH3和-S(＝O)CH2CH3。
砜(磺酰基)：-S(＝O)2R，其中R是砜取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基，包括，例如，氟化或全氟化C1-7烷基。砜基团的实例包括但不限于-S(＝O)2CH3(甲磺酰基)、-S(＝O)2CF3(三氟甲磺酰基，triflyl)、-S(＝O)2CH2CH3(乙磺酰基，esyl)、-S(＝O)2C4F9(九氟丁磺酰基，nonaflyl)、-S(＝O)2CH2CF3(三氟乙磺酰基，tresyl)、-S(＝O)2CH2CH2NH2(牛磺酰基，tauryl)、-S(＝O)2Ph(苯磺酰，苯磺酰基(besyl))、4-甲基苯磺酰基(甲苯磺酰基(tosyl))、4-氯苯磺酰基(氯苯磺酰基(closyl))、4-溴苯磺酰基(对溴苯磺酰基(brosyl))、4-硝基苯基(硝基苯磺酰基(nosyl))、2-萘磺酸酯(萘磺酰基，napsyl)和5-二甲基氨基萘-1-基磺酸酯(丹磺酰基(dansyl))。
亚磺酸(亚磺基)：-S(＝O)OH、-SO2H。
磺酸(磺基)：-S(＝O)2OH、-SO3H。
亚磺酸酯(sulfinate)(亚磺酸酯，sulfinic acid ester)：-S(＝O)OR，其中R是亚磺酸酯取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基。亚磺酸酯基团的实例包括但不限于-S(＝O)OCH3(甲氧基亚硫酰基；亚磺酸甲酯)和-S(＝O)OCH2CH3(乙氧基亚硫酰基；亚磺酸乙酯)。
磺酸酯(sulfonate)(磺酸酯，sulfonic acid ester)：-S(＝O)2OR，其中R是磺酸酯取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基。磺酸酯基团的实例包括但不限于-S(＝O)2OCH3(甲氧基磺酰基；磺酸甲酯)和-S(＝O)2OCH2CH3(乙氧基磺酰基；磺酸乙酯)。
亚硫酰氧基：-OS(＝O)R，其中R是亚硫酰氧基取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基。亚硫酰氧基的实例包括但不限于-OS(＝O)CH3和-OS(＝O)CH2CH3。
磺酰氧基：-OS(＝O)2R，其中R是磺酰氧基取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基。磺酰氧基的实例包括但不限于-OS(＝O)2CH3(甲磺酸酯)和-OS(＝O)2CH2CH3(乙磺酸酯)。
硫酸酯：-OS(＝O)2OR；其中R是硫酸酯取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基。硫酸酯基团的实例包括但不限于-OS(＝O)2OCH3和-SO(＝O)2OCH2CH3。
氨磺酰(sulfamyl)(氨磺酰(sulfamoyl)；亚磺酸酰胺；亚磺酰胺)：-S(＝O)NR1R2，其中R1和R2独立地是氨基取代基，如针对氨基所定义的。氨磺酰的实例包括但不限于-S(＝O)NH2、-S(＝O)NH(CH3)、-S(＝O)N(CH3)2、-S(＝O)NH(CH2CH3)、-S(＝O)N(CH2CH3)2和-S(＝O)NHPh。
亚磺酰氨基(亚氨磺酰基；磺酰胺；氨磺酰)：-S(＝O)2NR1R2，其中R1和R2独立地是氨基取代基，如针对氨基所定义的。亚磺酰氨基的实例包括但不限于-S(＝O)2NH2、-S(＝O)2NH(CH3)、-S(＝O)2N(CH3)2、-S(＝O)2NH(CH2CH3)、-S(＝O)2N(CH2CH3)2和-S(＝O)2NHPh。
磺氨基：-NR1S(＝O)2OH，其中R1是氨基取代基，如针对氨基所定义的。磺氨基的实例包括但不限于-NHS(＝O)2OH和-N(CH3)S(＝O)2OH。
磺酰氨基(Sulfonamino)：-NR1S(＝O)2R，其中R1是氨基取代基，如针对氨基所定义的，以及R是磺酰氨基取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优越C1-7烷基。磺酰氨基的实例包括但不限于-NHS(＝O)2CH3和-N(CH3)S(＝O)2C6H5。
亚磺酰氨基(Sulfinamino)：-NR1S(＝O)R，其中R1是氨基取代基，如针对氨基所定义的，以及R是亚磺酰氨基取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基。亚磺酰氨基的实例包括但不限于-NHS(＝O)CH3和-N(CH3)S(＝O)C6H5。
膦基(膦)：-PR2，其中R是膦基取代基，例如，-H、C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选-H、C1-7烷基或C5-20芳基。膦基的实例包括但不限于-PH2、-P(CH3)2、-P(CH2CH3)2、-P(t-Bu)2和-P(Ph)2。
二氧磷基：-P(＝O)2。
氧膦基(氧化膦)：-P(＝O)R2，其中R是氧膦基取代基，例如，C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选C1-7烷基或C5-20芳基。氧膦基的实例包括但不限于-P(＝O)(CH3)2、-P(＝O)(CH2CH3)2、-P(＝O)(t-Bu)2和-P(＝O)(Ph)2。
膦酸(膦酰基)：-P(＝O)(OH)2。
膦酸酯(膦酰基酯)：-P(＝O)(OR)2，其中R是膦酸酯取代基，例如，-H、C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选-H、C1-7烷基或C5-20芳基。膦酸酯基团的实例包括但不限于-P(＝O)(OCH3)2、-P(＝O)(OCH2CH3)2、-P(＝O)(O-t-Bu)2和-P(＝O)(OPh)2。
磷酸(膦酰氧基)：-OP(＝O)(OH)2。
磷酸酯(膦酰氧基酯)：-OP(＝O)(OR)2，其中R是磷酸酯取代基，例如，-H、C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选-H、C1-7烷基或C5-20芳基。磷酸酯基团的实例包括但不限于-OP(＝O)(OCH3)2、-OP(＝O)(OCH2CH3)2、-OP(＝O)(O-t-Bu)2和-OP(＝O)(OPh)2。
亚磷酸：-OP(OH)2。
亚磷酸酯：-OP(OR)2，其中R是亚磷酸酯取代基，例如，-H、C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选-H、C1-7烷基或C5-20芳基。亚磷酸酯基团的实例包括但不限于-OP(OCH3)2、-OP(OCH2CH3)2、-OP(O-t-Bu)2和-OP(OPh)2。
亚磷酰胺：-OP(OR1)-NR2 2，其中R1和R2是亚磷酰胺取代基，例如，-H、(可选取代的)C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选-H、C1-7烷基或C5-20芳基。亚磷酰胺基团的实例包括但不限于-OP(OCH2CH3)-N(CH3)2、-OP(OCH2CH3)-N(i-Pr)2和-OP(OCH2CH2CN)-N(i-Pr)2。
氨基磷酸酯：-OP(＝O)(OR1)-NR2 2，其中R1和R2是氨基磷酸酯取代基，例如，-H、(可选取代的)C1-7烷基、C3-20杂环基或C5-20芳基，优选-H、C1-7烷基或C5-20芳基。氨基磷酸酯基团的实例包括但不限于-OP(＝O)(OCH2CH3)-N(CH3)2、-OP(＝O)(OCH2CH3)-N(i-Pr)2和-OP(＝O)(OCH2CH2CN)-N(i-Pr)2。
氮保护基团
氮保护基是本领域中众所周知的。优选的氮保护基是氨基甲酸酯保护基，其具有以下通式：
大量的可能的氨基甲酸酯氮保护基列于Wuts,P.G.M.and Greene,T.W.,Protective Groups in Organic Synthesis,4th Edition,Wiley-Interscience,2007的第706至771页，其以引用方式结合于本文。
特别优选的保护基包括Alloc、Troc、Teoc、BOC、Doc、Hoc、TcBOC、Fmoc、1-Adoc和2-Adoc。
羟基保护基
羟基保护基是本领域中众所周知的。大量的适宜基团描述于Wuts,P.G.M.and Greene,T.W.,Protective Groups in Organic Synthesis,4th Edition,Wiley-Interscience,2007的第16至366页，其以引用方式结合于本文。
特别令人感兴趣的类别包括甲硅烷基醚(硅醚，silyl ethers)、甲基醚、烷基醚、苄基醚、酯、苯甲酸酯、碳酸酯和磺酸酯。
特别优选的保护基包括THP。
细菌感染和感染性疾病
本领域技术人员能够容易地确定候选化合物是否治疗细菌感染或细菌感染性疾病。例如，在以下实施例中描述了可方便地用来评估由特定化合物提供的活性的测定。
术语“细菌感染”是指细菌对身体组织的入侵，身体组织对它们产生的细菌和毒素的增殖和反应。术语“细菌感染性疾病”是指由细菌引起的疾病。
细菌感染和感染性细菌性疾病的实例包括但不限于医院和社区获得性感染，其起因于革兰氏阳性细菌如金黄色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)，包括多重耐药形式如耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)，以及起因于链球菌，包括耐药形式如耐万古霉素肠球菌(VRE)。可以治疗的其他感染包括起因于艰难梭菌、单核细胞增多性李斯特氏菌的那些感染，以及起因于革兰氏阳性细菌的皮肤感染。
优选地，本发明的化合物可用于治疗由涉及耐药性菌株的细菌感染引起的细菌感染感染性细菌性疾病。特别优选的菌株是金黄色葡萄球菌。
优选地，治疗是涉及MRSA、万古霉素-中间体金黄色葡萄球菌(VISA)、耐万古霉素金黄色葡萄球菌(VRSA)的细菌感染性疾病或细菌感染，以及起因于耐药性革兰氏阳性细菌的其他感染。
治疗方法
如上所述，本发明提供了本发明的第一方面的化合物在治疗方法中的应用。
术语“治疗有效量”是足以对患者显示益处的量。上述益处可以至少是至少一种症状的改善。给予的实际量、以及给予的速率和时间进程将取决于待治疗的病症的性质和严重程度。治疗处方，例如，对剂量的决定，是在全科医师和其他医生的责任范围内。
可以单独或连同其他治疗一起(同时或顺序地)来给予化合物，其取决于待治疗的病症。治疗和疗法的实例包括但不限于β-内酰胺药物如青霉素和头孢菌素、氨基糖苷类、氟喹诺酮类、噁唑烷酮类和链阳霉素类(streptogramins)。
按照本发明的药物组合物并且用于按照本发明的使用，除活性组分即式I的化合物之外，还可以包含药用赋形剂(excipient)、载体(carrier)、缓冲剂、稳定剂或本领域技术人员众所周知的其他材料。上述材料应该是无毒的并且不应干扰活性组分的功效。载体或其他材料的确切特性将取决于给予途径，其可以是口服或通过注射，例如皮肤、皮下或静脉内注射。
用于口服给予的药物组合物可以是在片剂、胶囊剂、散剂(粉末剂，powder)或液体形式中。片剂可以包含固体载体或佐剂。液体药物组合物通常包含液态载体如水、石油、动物或植物油、矿物油或合成油。可以包括生理盐水溶液、右旋糖或其他糖类溶液或二醇类如乙二醇、丙二醇或聚乙二醇。胶囊剂可以包含固体载体如明胶。
对于静脉内、皮肤或皮下注射，或在痛苦部位处的注射，活性组分将具有肠胃道外可接受的水溶液的形式，其是无热原的并具有适宜的pH、等渗性和稳定性。本领域的相关技术人员完全能够制备适宜的溶液，其中利用，例如，等渗媒介物(vehicle)如氯化钠注射液、林格氏注射液、乳酸林格氏注射液。根据要求，可以包括防腐剂、稳定剂、缓冲剂、抗氧化剂和/或其他添加剂。
剂量
本领域技术人员可以理解的是，化合物的适当剂量可以因患者而异。确定最佳剂量通常将涉及治疗益处的水平相对于任何危险或有害的副作用的平衡。选择的剂量水平将取决于各种因素，包括但不限于特定化合物的活性、给予途径、给予时间、化合物的排泄速率、治疗的持续时间、联合(组合，combination)使用的其他药物、化合物和/或材料、病症的严重程度、以及患者的物种、性别、年龄、体重、状况、一般健康状况和既往病史。化合物的量和给予途径最终将由医师、兽医或临床医师酌情决定，虽然通常将选择剂量以在作用部位达到局部浓度，其实现预期效果而不引起实质性的伤害或有害的副作用。
在整个治疗过程中，可以以一次剂量、连续地或间歇地(例如，以适当的间隔并以分开的剂量)来进行给予。确定给予的最有效的方法和剂量的方法是本领域技术人员众所周知的并且随用于治疗的制剂、治疗的目的、待治疗的一种或多种靶细胞和待治疗的受试者而变化。可以依据由治疗医师、兽医或临床医师选择的剂量水平和模式来进行单次或多次给予。
一般来说，活性化合物的适宜的剂量为约100ng至约25mg(更通常约1μg至约10mg)/受试者的千克体重/天。在活性化合物是盐、酯、酰胺、前药等的情况下，基于母体化合物来计算给予的量，所以按比例增加所使用的实际重量。
在一种实施方式中，按照以下剂量方案将活性化合物给予人患者：约100mg，每日3次。
在一种实施方式中，按照以下剂量方案将活性化合物给予人患者：约150mg，每日2次。
在一种实施方式中，按照以下剂量方案将活性化合物给予人患者：约200mg，每日2次。
对于疾病的预防或治疗，本发明的化合物的适当剂量将取决于待治疗疾病的类型(如上所定义的)、疾病的严重程度和病程，而不管给予分子是用于预防或治疗目的，先前的治疗、患者的临床史、对抗体的反应和主治医师的酌情决定。以一次或在一系列治疗中将分子适当地给予患者。取决于疾病的类型和严重程度，用于给予患者的初始候选剂量是约1μg/kg至15mg/kg(例如0.1-20mg/kg)分子，而不管，例如，通过一个或多个分开的给予或通过连续输注。典型的每日剂量可以为约1μg/kg至100mg/kg或更多，其取决于上文提到的因素。待给予患者的化合物的示例性剂量是在约0.1至约10mg/kg患者体重的范围内。对于经数天或更长时间的重复给予，取决于病症，持续治疗直到发生疾病症状的所期望的抑制。一种示例性剂量方案包括以下疗程：给予约4mg/kg的初始负荷剂量，接着每周、两周或三周给予化合物的另外的剂量。其他剂量方案可以是有用的。通过常规技术和测定法，容易监测这种疗法的进展。
包括其他形式
除非另有规定，在上文中包括的是这些取代基的众所周知的离子、盐、溶剂化物和保护形式。例如，提及羧酸(-COOH)还包括阴离子(羧酸根)形式(-COO-)、其盐或溶剂化物、以及常规保护形式。类似地，提及氨基包括质子化形式(-N+HR1R2)、氨基的盐或溶剂化物，例如，盐酸盐，以及氨基的常规保护形式。类似地，提及羟基还包括阴离子形式(-O-)、其盐或溶剂化物，以及常规保护形式。
异构体、盐和溶剂化物
某些化合物可以存在为一种或多种特定的几何形式、光学形式、对映体形式、非对映体形式、差向异构体形式、异位异构体形式、立体异构体形式、互变异构体形式、构象形式或异头异构体形式，包括但不限于顺式和反式；E型和Z型；c式、t式和r式；内形式和外形式；R型、S型和内消旋型；D型和L型；d型和l型；(+)和(-)形式；酮式、烯醇式和烯醇化物形式；顺式和反式；向斜形式和背斜形式；α形式和β形式；轴向形式和平伏形式；船式、椅式、扭式、信封式和半椅式；并且它们的组合，在下文中统称为“异构体”(或“异构体形式”)。
本发明的优选化合物具有在C11位置处的以下立体化学：
要注意的是，除非如下文针对互变异构体形式所讨论的，从术语“异构体”(如在本文中所使用的)明确排除结构(或构造)异构体(即，其差异在于在原子之间的连接而不仅在于原子在空间中的位置的异构体)。例如，提及甲氧基(OCH3)并不被解释为提及它的结构异构体(羟甲基，CH2OH)。类似地，提及邻氯苯基并不被解释为提及它的结构异构体(间氯苯基)。然而，提及一类结构可以包括落在上述类型的范围之内的结构异构体形式(例如C17烷基包括正丙基和异丙基；丁基包括正丁基、异丁基、仲丁基和叔丁基；甲氧基苯基包括邻甲氧基苯基、间甲氧基苯基和对甲氧基苯基)。
上述排除并不涉及互变异构体形式，如在，例如，以下互变异构体对中的例如，酮式、烯醇式和烯醇化物形式：酮/烯醇(如下图所示)、亚胺/烯胺、酰胺/亚氨基醇、脒/脒、亚硝基/肟、硫酮/烯硫醇、N-亚硝基/羟基偶氮和硝基/异硝基。
要注意的是，术语“异构体”特别包括具有一个或多个同位素取代的化合物。例如，H可以是任何同位素形式，包括1H、2H(D)和3H(T)；C可以是任何同位素形式，包括12C、13C和14C；O可以是任何同位素形式，包括16O和18O；等等。
除非另有规定，提及特定化合物包括所有上述异构体形式，包括(全部或部分地)它们的外消旋和其他混合物。用于制备(例如不对称合成)和分离(例如分级结晶和色谱方法)上述异构体形式的方法是本领域中已知的，或以已知方式容易获得的。其中通过适应本文教导的方法或已知方法。
除非另有规定，提及特定化合物还包括其离子、盐、溶剂化物和保护形式，例如，如下文讨论的。
可以方便的或所期望的是，制备、纯化和/或处理活性化合物的相应盐，例如，药用盐。在Berge,et al.,J.Pharm.Sci.,66,1-19(1977)中讨论了药用盐的实例。
例如，如果化合物是阴离子化合物，或具有可以是阴离子的官能团(例如-COOH可以是-COO-)，那么可以与适宜的阳离子来形成盐。适宜的无机阳离子的实例包括但不限于碱金属离子如Na+和K+，碱土阳离子如Ca2+和Mg2+，以及其他阳离子如Al3+。适宜的有机阳离子的实例包括但不限于铵离子(即NH4 +)和取代的铵离子(例如NH3R+、NH2R2 +、NHR3 +、NR4 +)。一些适宜的取代的铵离子的实例是衍生自以下的那些取代的铵离子：乙胺、二乙胺、二环己基胺、三乙胺、丁胺、乙二胺、乙醇胺、二乙醇胺、哌嗪、苄胺、苯基苄胺、胆碱、葡甲胺和氨丁三醇，以及氨基酸，如赖氨酸和精氨酸。常见的季铵离子的实例是N(CH3)4 +。
如果化合物是阳离子化合物，或具有可以是阳离子的官能团(例如-NH2可以是-NH3 +)，那么可以与适宜的阴离子来形成盐。适宜的无机阴离子的实例包括但不限于衍生自以下无机酸的那些：盐酸、氢溴酸、氢碘酸、硫酸、亚硫酸、硝酸、亚硝酸、磷酸和亚磷酸。
适宜的有机阴离子的实例包括但不限于衍生自以下有机酸的那些：2-乙酰氧基苯甲酸、乙酸、抗坏血酸、天冬氨酸、苯甲酸、樟脑磺酸、肉桂酸、柠檬酸、乙二胺四乙酸、乙烷二磺酸、乙磺酸、富马酸、葡庚糖酸、葡萄糖酸、谷氨酸、乙醇酸、羟基马来酸、羟基萘甲酸、羟乙磺酸、乳酸、乳糖酸、月桂酸、马来酸、苹果酸、甲磺酸、粘酸、油酸、草酸、棕榈酸、双羟萘酸(扑酸)、泛酸、苯乙酸、苯磺酸、丙酸、丙酮酸、水杨酸、硬脂酸、琥珀酸、磺胺酸(对氨基苯磺酸)、酒石酸、甲苯磺酸和戊酸。适宜的高分子有机阴离子的实例包括但不限于那些高分子有机阴离子，其衍生自以下聚合酸：丹宁酸、羧甲基纤维素。
可以方便的或所期望地制备、纯化和/或处理活性化合物的相应溶剂化物。术语“溶剂化物”在本文中在常规意义上用来指溶质(例如活性化合物、活性化合物的盐)和溶剂的复合物。如果溶剂是水，溶剂化物可以被方便地称为水合物，例如，一水合物、二水合物、三水合物等。
式I的化合物包括其中亲核溶剂(H2O、RAOH、RANH2、RASH)加入(加成，adds across)PBD部分的亚胺键，其是如下图所示，其中溶剂是水或醇(RAOH，其中RA是醚取代基，如上所述)：
这些形式可以被称为PBD的甲醇胺和甲醇胺醚形式。这些平衡(equilibria)的平衡(balance)取决于其中发现化合物的条件、以及上述部分本身的特性。
可以，例如，通过冷冻干燥，以固体形式来分离这些化合物。
一般合成路线
可以由式2的化合物合成其中R10和R11一起形成双键的式I的化合物：
R’10是氮保护基以及R’11是O-R12，其中R12是H或羟基保护基。这样的技术是本领域中众所周知的，并且描述于，例如，Wuts,P.G.M.andGreene,T.W.,Protective Groups in Organic Synthesis,4th Edition,Wiley-Interscience,2007。如果氮和羟基保护基均是存在的，则优选加以选择以通过相同条件可以去除它们。
如果在式HQRQ的溶剂中进行这种脱保护，那么R10和R11将分别是H和QRQ。可替换地，通过将化合物加入与其中进行脱保护的不同的溶剂来引入这些基团。
通过添加适当的亚硫酸氢盐或亚磺酸盐，接着纯化步骤，可以实现如上所讨论的式I的化合物转化成具有R11作为SOxM的那些化合物。其他方法描述于GB 2 053 894，其以引用方式结合于本文。
可以在标准酰胺键形成条件下，例如在HOBt或DMAP和EDCl的存在下，由式3和式4的化合物的偶联(coupling)来制备式2的化合物：
可以由式5的化合物合成式3的化合物：
其中R’8是C1-4烷基，例如甲基。可以利用标准方式，例如用碱处理，来进行羧基的这种脱保护。
可以一般按照在WO 00/12506和WO 2007/039752(其以引用方式结合于本文)中描述的方法来合成式5的化合物。尤其是，通常借助于在适当位置的适当保护基，可以在合成的任何阶段引入丁酸侧链。例如，利用例如Mitsunobo偶联，通过将受保护的或前体形式偶联于在苯环上的羟基可以形成侧链。
可以利用在WO 2005/085177(其以引用方式结合于本文)中公开的方法来合成式4的化合物。还参考WO 2007/039752的公开内容。
DNA结合
可以利用如描述于Rahman,K.M.,et al.,Journal of the AmericanChemical Society 2009,131,13756和Narayanaswamy,M.,et al.,AnalyticalBiochemistry 2008,374,173中的离子对反相HPLC测定来测量化合物结合于DNA、以及尤其是寡核苷酸的能力。还可以通过利用如描述于Wells,G.,et al.,Journal of Medicinal Chemistry 2006,49,5442；Jenkins,T.C.,et al.,Journal of Medicinal Chemistry 1994,37,4529；以及Gregson,S.J.,et al.,Journal of Medicinal Chemistry 2001,44,737中的小牛胸腺DNA热变性测定来评估DNA结合亲和力。
进一步的参数选择(preferences)
C2
在任何实施方式中可以是优选的是，C2碳是sp2中心，使得当R2选自任何以下基团时：
-H、-OH、-CN、-R、-OR、卤基、-O-SO2-R、-CO2R和-COR
在C2和C3之间存在双键。
当R2选自任何以下基团时：
＝O、＝CH2、＝CHR、＝CHRR’
在C2和C3之间不可能存在双键。
R2
R2选自-H、-OH、＝O、＝CH2、-CN、-R、OR、卤基、二卤基、＝CHR、＝CHRR’、-O-SO2-R、CO2R和COR。
在一些实施方式中，R2可以选自-H、-OH、＝O、＝CH2、-CN、-R、-OR、＝CHR、＝CRR’、-O-SO2-R、-CO2R和-COR。
在一些实施方式中，R2可以选自-H、＝CH2、-R、＝CHR和＝CRR’。
在一种实施方式中，R2是H。
在一种实施方式中，R2是＝O。
在一种实施方式中，R2是＝CH2。
在一种实施方式中，R2是＝CHR。在PBD化合物内，基团＝CHR可以具有以下所示的任何一种构型：
在一种实施方式中，构型是构型(C1)。
在一种实施方式中，R2是＝CRR’。
在一种实施方式中，R2是＝CF2。
在一种实施方式中，R2是R。
在一种实施方式中，R2是可选取代的C5-20芳基。
当R2是可选取代的C5-20芳基时，它可以优选是可选取代的C5-7芳基或C8-10芳基。R2可以进一步优选是可选取代的苯基、可选取代的萘基、可选取代的吡啶基、可选取代的喹啉基或异喹啉基。在这些基团中，可选取代的苯基是最优选的。
当R2是可选取代的C5-20芳基时，它可以优选带有1至3个取代基，其中1和2个取代基是更加优选的，并且单取代的基团是最优选的。取代基可以在任何位置。
在R2是C5-7芳基的情况下，单取代基优选是在这样的环原子上，其并不邻近与化合物的剩余部分的键，即，它优选是在与化合物的剩余部分的键的β或γ位。因此，在C5-7芳基是苯基的情况下，取代基优选是在间位或对位，并且更优选是在对位。
在一种实施方式中，R2选自：
其中星号表示连接点。
在R2是C8-10芳基例如喹啉基或异喹啉基的情况下，它可以带有在喹啉或异喹啉环的任何位置处的任何数目的取代基。在一些实施方式中，它具有一个、两个或三个取代基，以及这些取代基可以是在近侧和远侧环或两者上(如果一个以上的取代基)。
当R2是可选取代的C5-20芳基时，取代基可以选自：卤基、羟基、醚、甲酰基、酰基、羧基、酯、酰氧基、氨基、酰氨基、酰基酰氨基、氨基羰氧基、脲基、硝基、氰基和硫醚。
当R2是可选取代的C5-20芳基时，取代基可以选自由以下组成的组：R、OR、SR、NRR’、NO2、卤基、CO2R、COR、CONH2、CONHR和CONRR’。
如果在R2上的取代基是卤基，则它优选是F或Cl，更优选Cl。
如果在R2上的取代基是醚，在一些实施方式中它可以是烷氧基，例如，C1-7烷氧基(例如甲氧基、乙氧基)或在一些实施方式中它可以是C5-7芳氧基(例如苯氧基、吡啶氧基、呋喃氧基)。
如果在R2上的取代基是C1-7烷基，它可以优选是C1-4烷基(例如甲基、乙基、丙基、丁基)。
如果在R2上的取代基是C3-7杂环基，则在一些实施方式中它可以是C6含氮杂环基，例如吗啉代、硫代吗啉代、哌啶基、哌嗪基。这些基团可以经由氮原子结合于PBD部分的其余部分。这些基团可被例如C1-4烷基进一步取代。
如果在R2上的取代基是双氧基-C1-3亚烷基，则它优选是双氧基亚甲基或双氧-亚乙基。
用于R2的特别优选的取代基包括甲氧基、乙氧基、氟基、氯基、氰基、双氧基亚甲基、甲基-哌嗪基、吗啉代和甲基-噻吩基。
特别优选的取代的R2基团包括但不限于4-甲氧基-苯基、3-甲氧基苯基、4-乙氧基-苯基、3-乙氧基-苯基、4-氟-苯基、4-氯-苯基、3,4-二氧基亚甲基-苯基、4-甲基噻吩基、4-氰基苯基、4-苯氧基苯基、喹啉-3-基和喹啉-6-基、异喹啉-3-基和异喹啉-6-基、2-噻吩基(2-thienyl)、2-呋喃基、甲氧基萘基以及萘基。
在一种实施方式中，R2是可选取代的C1-12烷基。
当R2是可选取代的C1-12烷基时，它可以选自：
(a)C1-5饱和的脂族烷基；
(b)C3-6饱和的环烷基；
(c)其中R21、R22和R23各自独立地选自H、C1-3饱和烷基、C2-3烯基、C2-3炔基和环丙基，其中在R12基团中碳原子的总数是不大于5；
(d)其中R25a和R25b中的一种是H和另一种选自：苯基，该苯基是由选自卤代甲基、甲氧基、吡啶基和苯硫基(thiophenyl)的基团可选取代的；以及
(e)其中R24选自：H；C1-3饱和烷基；C2-3烯基；C2-3炔基；环丙基；苯基，该苯基是由选自卤代甲基、甲氧基、吡啶基和苯硫基的基团可选取代的。
当R12是C1-5饱和脂族烷基时，它可以是甲基、乙基、丙基、丁基或戊基。在一些实施方式中，它可以是甲基、乙基或丙基(正戊基或异丙基)。在这些实施方式的一些中，它可以是甲基。在其他实施方式中，它可以是丁基或戊基，其可以是直链或支链的。
当R12是C3-6饱和的环烷基时，它可以是环丙基、环丁基、环戊基或环己基。在一些实施方式中，它可以是环丙基。
当R12是时，R21、R22和R23各自独立地选自H、C1-3饱和烷基、C2-3烯基、C2-3炔基和环丙基，其中在R12基团中碳原子的总数是不大于5。在一些实施方式中，在R12基团中碳原子的总数是不大于4或不大于3。
在一些实施方式中，R21、R22和R23中的一种是H，而另外两种基团则选自H、C1-3饱和烷基、C2-3烯基、C2-3炔基和环丙基。
在其他实施方式中，R21、R22和R23中的两种是H，而另一种基团则选自H、C1-3饱和烷基、C2-3烯基、C2-3炔基和环丙基。
在一些实施方式中，不是H的基团选自甲基和乙基。在一些这些实施方式中，不是H的基团是甲基。
在一些实施方式中，R21是H。
在一些实施方式中，R22是H。
在一些实施方式中，R23是H。
在一些实施方式中，R21和R22是H。
在一些实施方式中，R21和R23是H。
在一些实施方式中，R22和R23是H。
当R12是时，R25a和R25b中的一种是H而另一种选自：苯基，该苯基是由选自卤基、甲基、甲氧基、吡啶基和苯硫基的基团可选取代的。在一些实施方式中，不是H的基团是可选取代的苯基。如果苯基可选取代基是卤基，它优选是氟基。在一些实施方式中，苯基是未取代的。
当R12是时，R24选自：H；C1-3饱和烷基；C2-3烯基；C2-3炔基；环丙基；苯基，该苯基是由选自卤代甲基、甲氧基、吡啶基和苯硫基的基团的基团可选取代的。如果苯基可选取代基是卤基，它优选是氟基。在一些实施方式中，苯基是未取代的。在一些实施方式中，R24选自H、甲基、乙基、乙烯基和乙炔基。在这些实施方式的一些中，R24选自H和甲基。
在一种实施方式中，R2是卤基或二卤基。在一种实施方式中，R2是-F或-F2，上述取代基以下分别示为(C3)和(C4)：
R2可以优选选自＝CH2、＝CH-R，其中R更优选是可选取代的C1-4烷基，以及-R，其中R更优选是可选取代的C5-20芳基。用于R2的特别优选的基团包括＝CH2、＝CH-Me和可选取代的苯基。
R7
R7选自H、R、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR’、硝基、Me3Sn和卤基；
R7可以优选选自H、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR’和卤基。
R7可以更优选选自H和OR。
在一些实施方式中，R7是OR、以及更特别地OR7A，其中R7A独立地是可选取代的C1-7烷基。
R7A可以选自可选取代的饱和的C1-7烷基和可选取代的C2-4烯基。
R7A可以优选选自Me、CH2Ph和烯丙基。
R10/R11
R10和R11一起形成双键或分别选自H和QRQ，其中Q选自O、S和NH以及RQ是H或C1-7烷基，或H和SOxM，其中x是2或3，以及M是单价药用阳离子；
在一些实施方式中，R10和R11一起形成双键。
在一些实施方式中，R10是H以及R11是ORQ。在这些实施方式中，RQ可以优选选自H或Me。
在一些实施方式中，R10是H以及R11是SOxM。x可以优选是3，以及M可以优选是Na+。
R1
R1是C1-4烷基。
R1可以优选是C1-2烷基，以及更优选甲基。
A
A选自A1、A2、A3、A4或A5。
X1和Y1
对于A1、A2、A3、A4和A5中的每一种，X1和Y1分别选自：CH和NH；CH和NMe；N和NMe；CH和S；N和S；N和O；以及CH和O。
优选地，X1和Y1分别选自：CH和NMe；N和NMe；CH和S；以及CH和O。最优选地，X1和Y1分别选自N和NMe以及CH和NMe。
F
F选自单键和–(E-F1)m-。
当F是–(E-F1)m-时，每个E独立地选自单键和–C(＝O)-NH-；每个F1独立地是C3-20亚杂芳基；以及m是1、2或3。
优选地，F1是C5-6亚杂芳基，更优选C5亚杂芳基，更优选地，F1由结构F11表示：
其中X3和Y3分别选自：CH和NH；CH和NMe；N和NMe；CH和S；N和S；N和O；以及CH和O。优选地，X3和Y3分别选自：CH和O；以及CH和NMe。
因此，F11的优选结构是：
每个E独立地选自单键和–C(＝O)-NH-。在一些实施方式中，每个E是–C(＝O)-NH-。
m是1、2或3。优选地m是1。在其他实施方式中，m是3。
在一些实施方式中，F是单键。
G
G选自氢、C1-4烷基、-C(＝O)-O-C1-4烷基、-(CH2)n-C3-20杂环烷基和–O-(CH2)n-C3-20杂环烷基；以及每个n是0-4。
优选地，C3-20杂环烷基是吗啉基团。优选地，G选自由以下组成的组：–H、-Me、-C(＝O)-O-Me、-(CH2)n-N(CH2CH2OCH2CH2)和–O-(CH2)n-N(CH2CH2OCH2CH2)。
n是0-4。因此，n可以是0、1、2、3或4。
F和G的优选组合
在一些实施方式中，由结构FG1和FG2提供G和F的至少一个(-E-F1)-单元：
如果m是2或3，则FG1和FG2可以与F的其他–(E-F1)-单元合并。
A1
A1是由以下结构表示：
Z1是O或S。优选地，X1和Y1选自CH和NMe、以及N和NMe。
因此，A1的优选结构是A11、A12、A13和A14：
A2
A2是由以下结构表示：
优选地，X1和Y1选自CH和NMe、以及N和NMe。因此，A2的优选结构是A21、A22、A23和A24：
优选地，将–F-G安排在A2的亚苯基或吡啶基的对位。
当A2是由结构A21或A23表示时，A不能是A2’：
其中A2’的X1和Y1分别选自：CH和NMe以及N和NMe；
B是单键或：
其中(B1)的X和Y分别选自：CH和NMe；COH和NMe；CH和S；N和NMe；N和S；以及
R1是C1-4烷基。
A3
A3是由以下结构表示：
优选地，X1和Y1选自CH和NMe、N和NMe、以及CH和O。优选地，X2和Y2选自CH和NMe、以及N和NMe。
因此A3的优选结构是A31、A32、A33、A34、A35和A36：
优选地，将化合物的PBD部分安排在A3的亚苯基的对位。
当A3是由结构A31或A32表示时，A不能是A3’：
其中A3’的X2和Y2分别选自：CH和NMe；COH和NMe；CH和S；N和NMe；N和S；
B是单键或：
其中B1的X和Y分别选自：CH和NMe；COH和NMe；CH和S；N和NMe；N和S；以及
R1是C1-4烷基。
A4
A4是由以下结构表示：
优选地，X1和Y1是CH和O以及Z1是NMe。因此，A4的优选结构是A41：
A5
A5是由以下结构表示
优选地，X1和Y1选自CH和NMe、以及CH和O。所以A5的优选结构被表示为A51、A52、A53和A54：
当A5的Z2是CH时，F优选是单键。
本发明的优选化合物是如下化合物：
化合物26、27、28、35、54和56是优选的。化合物26、27和35是更优选的，以及化合物35是特别优选的。
实施例
一般方法
用ADP 220旋光仪(Bellingham Stanley Ltd)来测量旋光性并以g/100mL为单位来给出浓度(c)。利用数字熔点仪(Electrothermal)来测量熔点。用Perkin-Elmer Spectrum 1000FT IR分光计来记录IR谱。在300K处，利用分别在400和100MHz下的Bruker Advance NMR分光计来获得1H和13C NMR谱。相对于TMS(δ＝0.0ppm)来报告化学位移，并且信号被指定为s(单峰)、d(双峰)、t(三重峰)、dt(双三重峰)、dd(双峰的双峰)、ddd(双峰的双双峰)或m(多重峰)，其中以赫兹(Hz)为单位来给出偶合常数(coupling constant)。前PBD(pro-PBD)编号系统用于合成中间体的碳和质子指定(即，基于最终三环PBD环体系)。利用连接(couple)于具有Waters 2996PDA的Waters 2695 HPLC的Waters Micromass ZQ仪器来收集质谱数据。使用的Waters Micromass ZQ参数是：毛细管(kV)，3.38；锥体(V)，35；萃取器(V)，3.0；源温度(℃)，100；去溶剂化温度(℃)，200；锥形流动速率(L/h)，50；去溶剂化流动速率(L/h)，250。用Waters Micromass QTOFGlobal并以阳性W模式来记录高分辨率质谱数据，其中利用金属涂覆的硼硅酸盐玻璃尖端将样品引入仪器。在硅胶铝板(Merck 60，F254)上进行薄层色谱(TLC)，以及快速色谱利用硅胶(Merck 60，230-400目，ASTM)。利用RadleysTM Green House Synthesizer来进行平行反应并利用ISTVacmasterTM来进行平行纯化。对于平行进行的反应，利用Genevac VC2000D(Genevac Technologies,UK)来蒸发溶剂。利用Heto-Lyolab 3000冷冻干燥器来冷冻干燥纯化的化合物。利用连接于帕尔氢化装置的UHP-60H氢气发生器来进行加氢反应。合成结构单元(building block)购自MaybridgeChemicals(UK)、Bachem Chemicals(USA)和Sigma-Aldrich(UK)。试剂和溶剂购自Sigma-Aldrich(UK)。
中间体的合成
(a)4-(4-(叔丁氧基羰基氨基)苯基)-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酸甲酯(5)
(i)2-(三氯乙酰基)-1-甲基吡咯(2)
在2L的3颈烧瓶中，经1小时和10分钟的一段时间，将N-甲基吡咯(1)(113.06g,1.39mol,1.0当量)在无水乙醚(dry ether)(350mL)中的溶液逐滴加入三氯乙酰氯(254g,1.39mol,1.0当量)在无水乙醚(350mL)中的搅拌溶液。通过用氮气冲洗来除去在反应中产生的HCl气体。允许搅拌反应混合物1.5小时并通过TLC和LCMS来规律地监测反应的进展。在1.5小时以后，使用1M K2CO3溶液来淬灭(quench)反应。用乙酸乙酯来萃取(3x)反应混合物，然后合并有机层并真空浓缩。用正己烷来洗涤晶体残余物并最后在真空下干燥。产量–281.18g，79.5％，NMR与文献比较。
IR,(FTIR,v最大/cm-1)3299,3121,3008,2954,1789,1674,1521,1406,1206,1100,980,881,757；1H-NMR(CDCl3,400MHz)δ7.42(1H,dd,J＝4.4,1.6Hz),6.97(1H,t,J＝1.6Hz),6.22(1H,dd,J＝4.4,2.4Hz)3.97(3H,s)；13C NMR(CDCl3,400MHz):δ133.6,124.0,122.4,108.9,38.5。
(ii)1-(4-溴-1-甲基-1H-吡咯-2-基)-2,2,2-三氯乙酮(3)
在-10℃，将NBS(N-溴琥珀酰亚胺，2.36g，13.24mmol，1.0当量)加入2-(三氯乙酰基)-1-甲基吡咯(2)(3g，13.24mmol，1.0当量)在无水THF(35mL)中的搅拌溶液。将反应混合物保持在-10℃持续2小时，然后使其达到室温(约4小时)。真空蒸发过量的THF并将固体再溶解于EtOAc/正己烷(1:9)的混合物中。通过硅石塞来过滤产生的混合物，并真空蒸发滤液。产生的固体从正己烷再结晶以产生3(3.55g，88％)。IR(FTIR,v最大/cm-1):3148,2956,1669(C＝O),1458,1215,1189,1062,923,842,823,748,678；1H-NMR(CDCl3,400MHz)δ7.46(1H,d,J＝2.0Hz),6.95(1H,d,J＝1.6Hz)3.95(3H,s)；13C NMR(CDCl3,100MHz):δ172.4,132.8,124.6,132.2,96.1,38.7；EIMS m/z(+EI)(针对C7H5BrCl3NO计算的)(M)+305.38,LCMS(分析发现的)306.86(M+H)+
(iii)4-溴-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酸甲酯(4)
通过注射器向1-(4-溴-1-甲基-1H-吡咯-2-基)-2,2,2-三氯-乙酮(3)(3.28g，10.74mmol，1当量)在无水MeOH(30mL)中的搅拌溶液添加甲醇钠的溶液(0.5mL)。甲醇钠溶液制备自NaH(60％，在矿物油中)(43mg，1.07mmol，0.1当量)，其先前用正己烷加以洗涤。加热溶液以回流超过30分钟，其时TLC分析显示原始材料的完全消耗。将几滴浓H2SO4加入溶液以中和碱(pH 2)。真空蒸发过量MeOH并将得到的油再溶解于EtOAc(50mL)，然后用水(40mL)洗涤。用EtOAc萃取(3x40mL)水层、合并有机相、干燥(MgSO4)、过滤和真空浓缩以提供作为淡白色固体的产物(2.28g，97％)。IR(FTIR,ν最大/cm–1):3138,2948,1692,1472,1334,1245,1115,1082,921,823,753；1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ6.89(d,1H,J＝2.0Hz),6.76(d,1H,J＝2.0Hz),3.89(s,3H),3.81(s,3H)；13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ160.8,128.7,122.9,119.2,95.1,51.2,36.9；EIMS m/z(+EI)(针对C7H8BrNO2计算的)(M)+218.05，发现为219.26(M+H)+
(iv)4-(4-(叔丁氧基羰基氨基)苯基)-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酸甲酯(5)
在包括磁搅拌子的10-20mL微波小瓶中在K2CO3(2.856g，3当量)的存在下，将催化量的四(三苯膦)钯，Pd(PPh3)4(0.477g，0.413，0.06当量)加入4(1.5g，6.88mmol，1当量)和(4-((叔丁氧基羰基)氨基)苯基)硼酸(1.57g，6.88mmol，1.20当量)在EtOH、甲苯和水的9:3:1混合物(13.5ml)中的溶液中。在每次添加期间，用氮气冲洗反应容器。在惰性N2气氛中密封反应混合物并在100℃下在EMRYSTM Optimizer MicrowaveStation(Personal Chemistry)中借助于微波辐射来加热12分钟。在LCMS和TLC分析显示反应完成以后，用水(50mL)稀释冷却的反应混合物、用EtOAc(3x40mL)萃取、合并滤液、经MgSO4干燥并在真空下浓缩。使得到的油经受快速色谱(正己烷/EtOAc 9:1)以产生5(产量-2.2g，97％)。IR(FTIR,v最大/cm–1):3353,2975,1696,1521,1441,1366,1264,1235,1209,1058,822,799,657；1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ7.40(d,2H,J＝8.8Hz),7.33(d,2H,J＝8.8Hz),7.16(d,1H,J＝2.0Hz,),7.02(d,1H,J＝2.0),6.45(br s,1H),3.95(s,3H),3.83(s,3H),1.52(s,9H)；13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ161.7,152.8,136.5,129.5,125.9,125.6,123.7,123.0,119.0,114.6,80.5,51.1,36.9,28.4；EIMS m/z(+EI)(针对C18H22N2O4计算的)(M)+330.38，发现为330.46(M+H)+
(b)4-(4-(叔丁氧基羰基氨基)苯基)-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酸(6)
将NaOH(2.0当量)的0.5M溶液加入5(1.0g，3.027mmol)在二氧杂环己烷(40mL)中的溶液中。在室温下允许搅拌反应混合物6小时，此时TLC显示反应完成。在真空下蒸发过量1,4-二氧杂环己烷并用水稀释残余物。用0.5M HCl来酸化得到的溶液。用2x乙酸乙酯(100mL x 2)从水萃取产物并合并有机层、用盐水洗涤、经MgSO4干燥并真空浓缩。利用快速色谱(乙酸乙酯/正己烷2:8)来纯化产物。产量–0.92g，96.8％。IR(FTIR,v最大/cm-1):3371,2979,1698,1671,1522,1445,1367,1285,1161,1112,1047,823,803,762,714,631；1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ8.33(1H,s),7.55(d,2H,J＝8.8Hz),7.50(d,2H,J＝8.8Hz),7.36(d,1H,J＝2.0Hz,),7.22(d,1H,J＝2.0),3.97(s,3H),1.50(s,9H)；13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ162.3,153.7,138.6,123.0,127.1,126.0,124.4,124.0,119.5,115.1,79.9,36.9,28.6；EIMS m/z(+EI)(针对C17H20N2O4计算的)(M)+316.35，发现为315.16(M+H)+
(c)
(i)4-(4-氨基苯基)-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酸甲酯(7)
将5(1g，3.027mmol)溶解于小体积的MeOH并将在二氧杂环己烷(15mL)中的4M HCl缓慢加入搅拌溶液。搅拌反应混合物6小时，此时TLC显示反应完成。在真空下蒸发过量溶剂以获得棕色固体7。使固体产物经受快速色谱(正己烷/EtOAc 9:1)以产生纯7(065g，94.2％)。IR(FTIR,v最大/cm-1):3366,2987,1688,1629,1566,1422,1372,1262,1181,1103,1067,951,821,784,756；1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ7.28(2H,d,J＝8.4Hz),7.11(1H,d,J＝2.0Hz),6.96(1H,d,J＝2.0Hz),6.68(d,2H,J＝8.0Hz),3.94(s,3H),3.83(s,3H)；13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ161.7,144.7,126.2,125.4,125.2,115.5,114.4,51.0,36.8；EIMS m/z(+EI)(针对C13H14N2O2计算的)(M)+230.26，发现为231.1(M+H)+
(d)
(i)4-(4-(4-氨基苯基)-1-甲基-1H-吡咯-2-酰胺基)-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酸甲酯(9)
将两当量的EDCI和2.5当量的DMAP加入6(0.45gm，1.2当量)在DMF(8mL)中的搅拌溶液并允许搅拌混合物30分钟，其后，添加市售4-氨基-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酸甲酯(0.18g，1.18mmol，1.0当量)。允许搅拌反应混合物另外6小时，此时TLC显示反应完成。通过将它倒在冰/水混合物的混合物上来淬灭反应，并用乙酸乙酯(3x150mL)来萃取产生的混合物。用柠檬酸(100mL)、饱和含水NaHCO3(100mL)、水(100mL)、盐水(100mL)来顺序洗涤合并的萃取物并最后经MgSO4干燥。在减压下通过旋转蒸发器来蒸发过量乙酸乙酯并且粗产物9a(0.58gm，产量90.6％)用于boc脱保护步骤以提供9而不用进一步纯化。对于boc脱保护，将0.29gm的9a溶解于小体积的MeOH并将在二氧杂环己烷(15mL)中的4M HCl缓慢加入搅拌溶液。搅拌反应混合物6小时，此时TLC显示反应完成。在真空下蒸发过量溶剂以获得棕色固体(9)。使固体产物经受快速色谱(正己烷/EtOAc 9:1)以产生纯9。产量为0.21gm，95％。
(ii)4-(4-(4-(4-氨基苯基)-1-甲基-1H-吡咯-2-酰胺基)-1-甲基-1H-吡咯-2-酰胺基)-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酸甲酯(10)
在室温下，将氢氧化锂(68mg，1.65mmol，3当量)加入在含水二氧杂环己烷(8ml的二氧杂环己烷，4ml水)中的9a(0.25g，0.55mmol)。搅拌反应混合物3小时，此时TLC显示反应完成。在高真空下蒸发二氧杂环己烷并用水来稀释残余物。用1M柠檬酸来酸化得到的溶液，接着用乙酸乙酯(2x50mL)进行萃取。合并有机层并用盐水(50mL)洗涤，经MgSO4干燥并最后在减压下利用旋转蒸发器加以浓缩以获得9a的水解酸形式，作为白色固体(产量为0.23g，91.6％)。向白色固体(0.23gm，0.52nmol)在DMF中的搅拌溶液添加2.0当量的EDCI和2.5当量的DMAP。在搅拌混合物20分钟以后，添加市售4-氨基-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酸甲酯(80.1mg，0.52mmol，1.0当量)。允许搅拌反应混合物另外3小时，此时TLC显示反应完成。通过将它倒入冰/水混合物的混合物中来淬灭反应并用乙酸乙酯(3x50mL)来萃取产生的混合物。用饱和含水NaHCO3(50mL)和盐水(50mL)来顺序洗涤合并的萃取物并最后经MgSO4干燥。在减压下通过旋转蒸发器来蒸发过量乙酸乙酯并且粗产物用于boc脱保护步骤以提供10。对于boc脱保护，将粗中间体溶解于小体积的MeOH并将在二氧杂环己烷(5mL)中的4M HCl缓慢加入搅拌溶液。搅拌反应混合物3小时，此时TLC显示反应完成。在真空下蒸发过量溶剂以获得棕色固体(10)。使固体产物经受快速色谱(正己烷/EtOAc 8:2)以产生纯10。产量为0.20gm，83％，经2个步骤。1H-NMR(DMSO,400MHz):δ9.72(1H,s),8.09(1H,t,J＝5.6Hz),7.71(2H,d,J＝8.8Hz),7.49(2H,d,J＝8.8Hz),7.40(1H,d,J＝2.0Hz),7.27(1H,d,J＝2.0),7.19(1H,d,J＝2.0),7.03(1H,dd,J＝4.0,1.6Hz),7.00(1H,t,J＝2.0Hz),6.84(1H,d,J＝2.0Hz),6.10(1H,m),3.89(3H,s).m/z(+EI)(针对C25H26N6O4计算的)(M)+474.51，发现为475.35([M+H]+
(e)
4-(4-(4-氨基苯基)-1-甲基-1H-吡咯-2-酰胺基)-1-甲基-1H-咪唑-2-羧酸甲酯(11)
将0.3gm的boc保护的6(0.94mmol，1.2当量)溶解于DMF(5mL)中，向其添加2.0当量的EDCI和2.5当量的DMAP。允许搅拌混合物30分钟，其后添加市售4-氨基-1-甲基-1H-咪唑-2-羧酸甲酯(0.121g，0.79mmol，1.0当量)。允许搅拌反应混合物另外6小时，此时TLC显示反应完成。通过将它倒在冰/水混合物的混合物中来淬灭反应并用乙酸乙酯(3x150mL)来萃取产生的混合物。用饱和含水NaHCO3(50mL)、水(50mL)、盐水(50mL)来顺序洗涤合并的萃取物，并最后经MgSO4干燥。在减压下通过旋转蒸发器来蒸发过量乙酸乙酯并且粗产物(0.48gm)用于boc脱保护步骤以提供11。对于boc脱保护，将粗中间体溶解于小体积的MeOH并将在二氧杂环己烷(5mL)中的4M HCl缓慢加入搅拌溶液。搅拌反应混合物2小时，此时TLC显示反应完成。在真空下蒸发过量溶剂以获得棕色固体(11)。使固体产物经受快速色谱(正己烷/EtOAc 9:1)以产生纯11。产量为0.35gm，81％，经两个步骤。
1H-NMR(DMSO,400MHz):9.75(1H,s),8.03(1H,s),7.71(2H,d,J＝8.8Hz,7.53(1H,s),7.52(1H,s),7.48(2H,d,J＝8.8Hz),7.42(1H,s),7.19(1H,d,J＝2.0),3.94(3H,s),3.91(3H,s),3.89(3H,s).m/z(+EI)(针对C18H19N5O3计算的)(M)+353.38，发现为354.42([M+H]+
(f)4-(10-(烯丙氧基羰基)-7-甲氧基-5-氧代-11-(四氢-2H-吡喃-2-基氧基)-2,3,5,10,11,11a-六氢-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯并二氮杂8-基氧基)丁酸(13)
在室温下，将0.5M的NaOH溶液(制备自1.4135g的NaOH)加入12(化合物18，WO 2007/039752)在二氧杂环己烷中的溶液。允许搅拌反应混合物4小时，此时TLC显示反应完成。在高真空下蒸发二氧杂环己烷并用水稀释残余物。用1M柠檬酸来酸化得到的溶液，接着用乙酸乙酯(2x100mL)加以萃取。用盐水(100mL)来洗涤合并的有机层、经MgSO4干燥、并最后在减压下利用旋转蒸发器加以浓缩。产量–8.7g，(94％)，1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ7.2(2H,s),6.90(1H,s),6.58(1H,s),5.85(2H,d,J＝9.2Hz),5.73(2H,d,J＝9.2Hz),5.03-5.13(m,6H),4.68-4.35(m,4H),4.09-4.01(m,4H),3.91-3.82(m,8H),3.69-3.46(m,8H),2.60-2.55(m,4H),2.18-2.00(m,10H),1.76-1.55(m,4H),1.53-1.43(m,8H)；13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ177.6,167.6,149.8,132.1,131.9,126.7,117.3,114.9,110.8,100.7,96.0,91.7,88.5,67.9,66.6,63.6,60.1,56.1,46.5,31.1,30.3,28.8,25.2,24.1,23.2,20.0；EIMS m/z(+EI)(针对C26H34N2O9计算的)(M)+518.56，发现为519.26(M+H)+
其他Q1和Q2胺结构单元是市售的或类似合成的。
实施例1(比较化合物)
用于将不同的结构单元偶联于Alloc-THP保护的PBD酸至不同的结 构单元的一般实验步骤。这里给出的实施例是针对15a。采用类似的程序 以获得其他C8连接的Alloc-THP保护的PBD-杂化物(hybrid)。
(11aS)-7-甲氧基-8-(4-(4-(5-(甲氧基羰基)-1-甲基-1H-吡咯-3-基)苯基氨基)-4-氧代丁氧基)-5-氧代-11-(四氢-2H-吡喃-2-基氧基)-2,3,11,11a-六氢-1H-吡咯并[2,1-c][1,4]苯并二氮杂-10(5H)-羧酸烯丙基酯(15a)((11aS)-allyl7-methoxy-8-(4-(4-(5-(methoxycarbonyl)-1-methyl-1H-pyrrol-3-yl)phenylamino)-4-oxobutoxy)-5-oxo-11-(tetrahydro-2H-pyran-2-yloxy)-2,3,11,11a-hexahydro-1H-pyrrolo[2,1-c][1,4]benzodiazepine-10(5H)-carboxylate(15a))
将Alloc-THP保护的PBD酸13(3.72g，7.16mmol，1.2当量)的溶液溶解于DMF。在室温下，将EDCI(2.49g，13.02mmol，2.0当量)和DMAP(1.989g，16.28mmol，2.5当量)加入13的搅拌溶液并允许搅拌混合物30分钟，其后，添加MPB酯7(1.5g，6.514mmol，1.0当量)。允许搅拌反应混合物另外2小时，此时TLC显示反应完成。通过将它倒在冰/水混合物的混合物中来淬灭反应并用乙酸乙酯(3x150mL)来萃取产生的混合物。用柠檬酸(200mL)、饱和含水NaHCO3(250mL)、水(250mL)、盐水(250mL)来顺序洗涤合并的萃取物并最后经MgSO4干燥。在减压下通过旋转蒸发器来蒸发过量乙酸乙酯并通过硅胶快速色谱(MeOH:CHCl3,20:80)来纯化粗产物，以产生白色泡沫状固体，15a。产量–4.05g。85.5％。
(FTIR,v最大/cm–1):2949,2362,1704,1600,1514,1436,1372,1269,1203,1107,1021,964,765.(1H NMR,400MHz,CDCl3):δ7.82(1H,s),7.48(2H,m),7.41(1H,d,J＝2.0Hz),7.40(1H,d,J＝2.4Hz),7.23(2H,d,J＝8.4Hz),7.17(1H,d,J＝2.0Hz),7.04(1H,d,J＝2.0Hz),5.93-5.65(2H,m),5.09-5.4.97(m,4H),4.68-4.32(m,4H),4.15-4.10(m,4H),3.94-3.82(m,12H),3.68(m,2H),3.59-3.49(m,6H),2.60-2.57(m,3H),2.15-2.00(m,8H),1.88-1.80(m,2H),1.79-1.70(6H),1.60-1.44(m,12H)；(13C NMR,100MHz,CDCl3):δ177.1,170.5,167.3,161,6,149.1,136.3,132.1,131.9,130.4,128.9,127.1,125.9,125.4,123.5,123.1,120.3,117.3,114.6,110.8,91.5,88.6,68.2,66.5,64.3,63.6,60.3,56.0,51.1,46.4,36.8,31.1,30.9,29.1,25.1,24.6,23.2,21.0,20.1；m/z(+EI)(针对C39H46N4O10计算的)(M)+730.80，发现为731.67([M+H]+
通过使C8连接的Alloc-THP保护的PBD杂化物脱保护来获得最终 的PBD亚胺的一般实验步骤。这里给出的实施例是针对16。
将四[三苯膦]钯(5.60mg，4.8μM，0.05当量)加入Alloc-THP-PBD结合物15a(70mg，0.097mmol)、吡咯烷(8.36mg，0.117mmol，1.2当量)和三苯膦(8.62mg，0.25当量)在DCM(5mL)中的溶液。在室温下搅拌反应混合物2小时，此时TLC显示反应完成。在减压下通过旋转蒸发来除去过量DCM并在真空中干燥产生的残余物以除去吡咯烷酮。通过柱色谱(用正己烷65％％、EtOAc 35％洗脱)来纯化产物以产生产物，为淡黄色固体，3.37(40mg，77％)。[α]22.7 D+165°(c＝0.046,CHCl3)；IR(FTIR,ν最大/cm–1):3297,2944,2358,1701,1598,1567,1508,1442,1374,1264,1212,1181,1106,1072,824,730；1H-NMR(500MHz,CDCl3):δ7.68(1H,s),7.65(1H,d,J＝4.5Hz,H-11),7.52(1H,s,H-6),7.46(2H,dd,J＝8.4,2.0Hz,2Ar-H),7.40(2H,dd,J＝8.4,2.0Hz,2Ar-H),7.16(1H,d,J＝2.0Hz,Py-H),7.03(1H,d,J＝1.6Hz,Py-H),6.82(1H,s,H-9),4.12-4.20(2H,m,CH2侧链接头),3.94(3H,s,N-CH3),3.88(3H,s,O-CH3),3.68-3.71(1H,m,H-11a),3.50-3.60(2H,m,H2-3),2.58-2.62(2H,m,CH2),2.26-2.31(4H,m,CH2),1.50-1.54(2H,m,CH2)；13C-NMR(125MHz,CDCl3):δ164.5,162.4,161.6,150.5,147.8,140.7,125.9,125.5(2C),123.6,123.1,120.3,114.6,111.8,111.0,94.4(2C),68.0,63.7,56.1,53.7,51.0,46.6,36.8,31.9,29.6,25.2,24.8,24.1,20.2；HRMS m/z(+EI)(针对C30H32N4O6计算的)(M+H)+545.2400，发现为545.2422(M+H)+,δ4ppm
以类似的方式来制备化合物18
(S)-5-(4-(4-((7-甲氧基-5-氧代-2,3,5,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-8-基)氧基)丁酰氨基)苯基)噻吩-2-羧酸甲基酯(18)。
1H-NMR(500MHz,CDCl3):δ7.75(1H,s),7.69(2H,d,J＝8.4Hz),7.58(1H,s),7.49(2H,d,J＝8.4),7.23(1H,d,J＝4.0Hz),7.13(1H,d,J＝4.0Hz),4..24(2H,m,CH2侧链接头),3.90(3H,s,O-CH3),3.86(3H,s,O-CH3),3.71-3.73(1H,m,H-11a),3.50-3.60(2H,m,H2-3),2.55-2.67(2H,m,CH2),2.23-2.33(4H,m,CH2),1.56-1.74(2H,m,CH2)；13C-NMR(125MHz,CDCl3):δ164.5,162.5,161.4,150.6,147.7,140.6,134.5,132.9,132.1,131.9,128.6,126.8,120.3,114.6,111.8,111.0,94.4(2C),68.0,63.7,56.1,53.7,52.1,46.6,36.8,31.9,29.6,25.2,24.8,24.1,20.2；HRMS m/z(+EI)(针对C29H29N3O6S计算的)(M+H)+547.6200，发现为547.6422(M+H)+
实施例2(本发明的化合物)
用于将不同的(Q1)结构单元偶联于Alloc-THP保护的PBD酸13至不同的结构单元的一般实验步骤。这里给出的实施例是针对14a。采用类似的程序以获得其他C8连接的Alloc-THP保护的PBD杂化中间体。
(4-(((11S,11aS)-10-((烯丙氧基)羰基)-7-甲氧基-5-氧代-11-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)-2,3,5,10,11,11a-六氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-8-基)氧基)丁酰氨基)-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酸(14a)
将Alloc-THP保护的PBD酸13(1.85g，3.57mmol，1.2当量)的溶液溶解于DMF。在室温下将EDCI(1.24g，6.48mmol，2.0当量)和DMAP(0.99g，8.1mmol，2.5当量)加入13的搅拌溶液并允许搅拌混合物30分钟，其后添加市售4-氨基-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酸甲酯(0.5g，3.243mmol，1.0当量)。允许搅拌反应混合物另外6小时，此时TLC显示反应完成。通过将它倒在冰/水混合物的混合物中来淬灭反应并用乙酸乙酯(3x150mL)来萃取产生的混合物。用柠檬酸(200mL)、饱和含水NaHCO3(250mL)、水(250mL)、盐水(250mL)来顺序洗涤合并的萃取物并最后经MgSO4干燥。在减压下通过旋转蒸发器来蒸发过量乙酸乙酯并且粗产物(1.88gm)用于水解反应以提供14a。为了水解，在室温下，将氢氧化锂(0.24g，5.71mmol，3当量)加入在含水二氧杂环己烷(75ml的二氧杂环己烷，11.5ml水)中的粗产物(1.88g，2.87mmol)。搅拌反应混合物3小时，此时TLC显示反应完成。在高真空下蒸发二氧杂环己烷并用水来稀释残余物。用1M柠檬酸来酸化得到的溶液，接着用乙酸乙酯(2x100mL)加以萃取。合并有机层并用盐水(100mL)洗涤，经MgSO4干燥并最后在减压下利用旋转蒸发器加以浓缩，以获得14a，为白色固体(产量1.68gm，74.0％，经2个步骤)。
1H-NMR δ9.09(1H,s,NH),7.39(1H,d,J＝2.0Hz),7.14(1H,s,H-6),7.12(1H,s,H-6),6.96(1H,s,H-9),6.76(1H,d,J＝2.0Hz,Py-H),5.86-5.75(2H,m,H-11),5.13-4.84(3H,m),4.61-4.21(2H,m),4.06-3.88(3H,m,侧链H-1,吡喃H-6),3.87(3H,s,O/NCH3),3.87(3H,s,O/NCH3),3.86(3H,s),3.53-3.44(3H,m),2.55-2.45(2H,m),2.13-1.88(6H,m),1.70-1.39(6H).m/z(+EI)(针对C32H40N4O10计算的)(M)+640.68，发现为641.57([M+H]+
通过将Q2结构单元偶联于包含Q1结构单元的中间体(例如，14a)来 从14a获得26a的一般实验步骤。
7-甲氧基-8-(4-((5-((4-(5-(甲氧基羰基)-1-甲基-1H-吡咯-3-基)苯基)氨基甲酰基)-1-甲基-1H-吡咯-3-基)氨基)-4-氧代丁氧基)-5-氧代-11-((四氢-2H-吡喃-2-基)氧基)-2,3,11,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-10(5H)-羧酸(11S,11aS)-烯丙基酯(26a)。
将Alloc-THP保护的PBD-Py酸14a(150mg，0.23mmol，1.0当量)的溶液溶解于DMF。在室温下，将EDCI(0.46mmol，2.0当量)和DMAP(0.58mmol，2.5当量)加入14a的搅拌溶液并允许搅拌混合物30分钟，其后，添加苯并呋喃-5-胺(38.3mg，0.29mmol，1.25当量)。允许搅拌反应混合物另外3小时，此时TLC显示反应完成。通过将它倒在冰/水混合物的混合物中来淬灭反应并用乙酸乙酯(3x150mL)来萃取得到的混合物。用柠檬酸(50mL)、饱和含水NaHCO3(50mL)、水(50mL)、盐水(50mL)来顺序洗涤合并的萃取物并最后经MgSO4干燥。在减压下通过旋转蒸发器来蒸发过量乙酸乙酯并且粗产物直接用于下一步骤而不用进一步纯化。
m/z(+EI)(针对C40H45N5O10计算的)(M)+755.91，发现为756.76([M+H]+
以类似的方式，获得化合物26a、27a、28a、30a、31a、35a、37a、39a、40a、49a、51a、52a、53a、54a和56a。
通过同时Alloc-THP脱保护以自26a获得26的一般实验步骤。
(i)(S)-N-(苯并呋喃-5-基)-4-(4-((7-甲氧基-5-氧代-2,3,5,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂8-基)氧基)丁酰氨基)-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酰胺(26)
将四[三苯膦]钯(12.17mg，10.5μM，0.05当量)加入Alloc-THP-PBD结合物26a(154mg，0.21mmol)、吡咯烷(17.91mg，0.25mmol，1.2当量)和三苯膦(13.81mg，0.25当量)在DCM(5mL)中的溶液。在室温下搅拌反应混合物2小时，此时TLC显示反应完成。在减压下通过旋转蒸发来除去过量DCM并在真空中干燥产生的残余物以除去吡咯烷酮。通过高效液相色谱(用丙酮:水梯度洗脱，并具有1％TFA)来纯化产物以产生产物，为淡黄色固体，26(38mg，36％，在HPLC纯化以后)。
1H-NMR(500MHz,CDCl3):7.98(1H,s),7.94(1H,d,J＝2.0Hz),7.83(1H,s),7.65(1H,d,J＝4.4Hz),7.59(1H,d,J＝2.0Hz),7.52(1H,s),7.42(1H,d,J＝9.0Hz),7.33(1H,dd,J＝8.0Hz,2.0Hz),7.10(1H,s),6.82(1H,s,H-9),6.71(1H,s)4.06-4.14(2H,m,CH2),3.90(3H,s,N-CH3),3.88(3H,s,O-CH3),3.66-3.72(1H,m,H-11a),3.50-3.59(2H,m,H2-3),2.47-2.54(2H,m,CH2),2.18-2.31(4H,m,CH2),1.95-2.08(2H,m)；13C-NMR(125MHz,CDCl3):δ169.9,164.6,162.7,159.9,151.9,150.6,147.7,145.7,140.6,133.2,132.1,128.5,127.8,123.4(2C),121.5,120.5,119.6,118.0,113.2,111.8,111.3,111.0,106.8(2C),103.9,68.1,56.2(2C),53.7,46.7(2C),36.7(2C),33.1,29.8,24.5,24.1；HRMS m/z(+EI)(针对C31H31N5O6计算的)(M)+569.6900，发现为569.6981([M+H]+)
以类似的方式，获得化合物27、28、30、31、35、37、39、40、49、51、52、53、54和56。
ii)(S)-N-(苯并[b]苯硫-5-基)-4-(4-((7-甲氧基-5-氧代-2,3,5,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-8-基)氧基)丁酰氨基)-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酰胺(27)
1H-NMR(500MHz,CDCl3):δ8.23(1H,d,J＝4.5Hz),8.21(1H,d,J＝2.0Hz),7.74(1H,d,J＝8.4Hz),7.66(1H,d,J＝4.0Hz),7.61(1H,d,J＝1.6Hz),7.53(1H,d,J＝3.6Hz),7.48(1H,s),7.45(2H,dd,J＝8.0Hz,2.0Hz),7.39(1H,s),7.09(1H,d,J＝1.6Hz),6.80(1H,s,H-9),4.03-4.08(2H,m,CH2),3.85(3H,s,N-CH3),3.82(3H,s,O-CH3),3.63-3.69(1H,m,H-11a),3.49-3.57(2H,m,H2-3),2.44-2.49(2H,m,CH2),2.15-2.29(4H,m,CH2),1.95-2.04(2H,m)；13C-NMR(125MHz,CDCl3):δ169.9,164.6,162.7,160.0,150.7,147.7,140.7,140.1,135.1,132.8,131.9,128.6,127.3,123.9,123.2,122.5,121.6,120.4,119.8,118.1,114.8,111.8,110.9,104.2,68.1,56.1(2C),53.7,46.7(2C),36.7(2C),32.9,29.5,24.9,24.2；
iii)(S)-5-(4-(4-((7-甲氧基-5-氧代-2,3,5,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-8-基)氧基)丁酰氨基)-1-甲基-1H-吡咯-2-酰胺基)苯并[b]噻吩-2-羧酸甲基酯(28)
1H-NMR(500MHz,CDCl3):δ8.29(1H,d,J＝2.0Hz),8.10(1H,s),7.97(1H,s),7.76(1H,d,J＝8.0Hz),7.73(1H,s),7.66(1H,dd,J＝8.0Hz,2.0Hz),7.64(1H,d,J＝1.6Hz),7.55(2H,dd,J＝8.0Hz,2.0Hz),7.47(2H,d,J＝3.0Hz),7.11(1H,s),6.83(1H,s,H-9),4.09-4.15(2H,m,CH2),3.93(3H,s,N-CH3),3.90(3H,s,O-CH3),3.87(3H,s,O-CH3),3.68-3.73(1H,m,H-11a),3.51-3.60(2H,m,H2-3),2.49-2.57(2H,m,CH2),2.19-2.34(4H,m,CH2),1.94-2.09(2H,m)；13C-NMR(125MHz,CDCl3):δ169.9,164.6,163.2,150.6,147.7,139.3,137.66,135.7,134.3,132.8,132.1,132.0,131.9,130.5,128.6,123.1,122.5,121.5,120.9,120.0,116.1,111.8,104.2,101.1,68.1,56.2(2C),53.7,52.5,46.7(2C),36.7(2C),33.1,29.6,25.0,24.2；
iv)(S)-4-(4-((7-甲氧基-5-氧代-2,3,5,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-8-基)氧基)丁酰氨基)-1-甲基-N-(4-吗啉代苯基)-1H-吡咯-2-羧酰胺(30)
1H-NMR(500MHz,CDCl3):δ7.71(1H,s),7.65(1H,d,J＝4.6Hz),7.52(1H,s),7.46(2H,d,J＝8.4Hz),7.06(1H,d,J＝2.0Hz),6.87(2H,d,J＝8.4Hz),6.82(1H,s),6.55(1H,d,J＝1.6Hz),4.05-4.19(2H,m,CH2),3.88(3H,s,N-CH3),3.85(3H,s,O-CH3),3.73-3.82(4H,m),3.66-3.72(1H,m,H-11a),3.52-3.60(2H,m,H2-3),3.03-3.13(4H,m),2.50-2.56(2H,m,CH2),2.19-2.33(4H,m,CH2),1.97-2.07(2H,m)；13C-NMR(125MHz,CDCl3):δ169.9,164.6,162.7,159.6,150.6,148.1,147.7,130.8,123.5,121.5,120.6,119.5,116.4,111.8,111.1,103.8,68.1,66.9(2C),56.2(2C),53.7,49.8,46.7(2C),36.7(2C),33.1,29.6,25.0,24.2；
v)(S)-4-(4-((7-甲氧基-5-氧代-2,3,5,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-8-基)氧基)丁酰氨基)-1-甲基-N-(6-吗啉代吡啶-3-基)-1H-吡咯-2-羧酰胺(31)
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ8.23(1H,s),7.92(1H,s),7.89(1H,d,J＝8.4Hz),7.83(1H,s),7.65(1H,d,J＝3.6Hz),7.51(1H,s),7.08(1H,s),6.82(1H,s),6.63(1H,d,J＝8.4Hz),6.56(1H,s),4.05-4.16(2H,m,CH2),3.91(3H,s,N-CH3),3.85(3H,s,O-CH3),3.74-3.82(4H,m),3.67-3.71(1H,m,H-11a),3.51-3.61(2H,m,H2-3),3.41-3.48(4H,m),2.49-2.57(2H,m,CH2),2.17-2.26(2H,m,CH2),1.99-2.09(2H,m)；13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ169.9,164.5,162.7,159.9,156.8,150.6,147.7,140.6,131.5,126.3,123.0,121.5,120.6,119.7,111.9,111.1,106.8,104.2,68.1,66.7(2C),56.2(2C),53.7,46.7,46.1(2C),41.0,36.7(2C),33.1,29.6,25.0,24.2；
vi)(S)-5-(4-(4-((7-甲氧基-5-氧代-2,3,5,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-8-基)氧基)丁酰氨基)-1-甲基-1H-咪唑-2-酰胺基)苯并[b]噻吩-2-羧酸甲基酯(35)
1H-NMR(500MHz,CDCl3):δ9.04(1H,s),8.35(1H,s),8.04(1H,s),7.74(1H,d,J＝8.4Hz),7.66(1H,d,J＝4.0Hz),7.61(1H,d,J＝1.6Hz),7.53(1H,d,J＝3.6Hz),7.48(1H,s),7.45(2H,dd,J＝8.0Hz,2.0Hz),7.39(1H,s),7.09(1H,d,J＝1.6Hz),4.10-4.22(2H,m,CH2),3.96(3H,s,N-CH3),3.94(3H,s,O-CH3),3.80(3H,s,O-CH3),3.66-3.71(1H,m,H-11a),3.50-3.57(2H,m,H2-3),2.49-2.57(2H,m,CH2),2.21-2.34(4H,m,CH2),1.95-2.08(2H,m)；13C-NMR(125MHz,CDCl3):δ169.9,164.6,163.2,150.6,147.7,139.3,137.66,135.7,134.3,132.9,132.1,132.0,131.9,130.5,128.5,123.2,122.5,121.5,120.1,120.0,115.4,114.8,11.6,111.0,100.0,67.7,56.1(2C),53.7,52.5,46.7(2C),35.8(2C),33.0,29.6,24.7,24.1；
vii)(S)-4-(4-((7-甲氧基-5-氧代-2,3,5,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-8-基)氧基)丁酰氨基)-1-甲基-N-(4-吗啉代苯基)-1H-咪唑-2-羧酰胺(37)
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ8.80(1H,s),7.98(1H,s),7.83(1H,s),7.64(1H,d,J＝4.0Hz),7.54(1H,s),7.51(2H,d,J＝8.4Hz),7.40(1H,s),6.90(2H,d,J＝8.4Hz),6.82(1H,s),4.05-4.18(2H,m,CH2),4.01(3H,s,N-CH3),3.95(3H,s,O-CH3),3.74-3.82(4H,m),3.67-3.71(1H,m,H-11a),3.52-3.57(2H,m,H2-3),3.11-3.14(4H,m),2.61-2.63(2H,m,CH2),2.17-2.23(2H,m,CH2),2.02-2.09(2H,m)；13C-NMR(125MHz,CDCl3):δ169.9,164.5,162.5,156.4,150.5,148.3,147.8,140.7,135.7,133.9,130.2,120.9,120.6,116.3,114.5(2C),111.6,110.9,67.8,66.9(2C),56.1(2C),53.7,49.7(2C),46.7,35.8(2C),29.6,24.8,24.1；
viii)(S)-4-(4-((7-甲氧基-5-氧-2,3,5,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-8-基)氧基)丁酰氨基)-1-甲基-N-(4-(2-吗啉代乙氧基)苯基)-1H-咪唑-2-羧酰胺(39)
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ8.80(1H,s),7.96(1H,s),7.83(1H,s),7.65(1H,d,J＝4.0Hz),7.54(1H,s),7.51(2H,d,J＝8.8Hz),7.41(1H,s),6.90(2H,d,J＝8.8Hz),6.83(1H,s),4.17-4.22(2H,m,CH2),4.06-4.12(4H,m),4.06(3H,s,N-CH3),3.95(3H,s,O-CH3),3.72-3.79(4H,m),3.67-3.71(1H,m,H-11a),3.52-3.57(2H,m,H2-3),2.79-2.81(4H,m),2.53-2.66(6H,m,CH2),2.31-2.29(2H,m,CH2),2.01-2.07(2H,m)；13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ174.7,169.5,167.0,162.5,155.6,149.4,147.8,147.8,140.7,135.7,131.8,130.9,121.3,120.6,115.1,111.6,110.9,67.8,66.9(2C),66.0,57.6,56.1(2C),54.0,53.7,48.2(2C),46.7,35.8(2C),33.0,29.6,24.8,24.2,24.1；
ix)(S)-4-(4-((7-甲氧基-5-氧代-2,3,5,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-8-基)氧基)丁酰氨基)-1-甲基-N-(6-吗啉代吡啶-3-基)-1H-咪唑-2-羧酰胺(40)
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ8.73(1H,s),8.27(1H,s),7.98(2H,m),7.64(1H,d,J＝3.6Hz),7.53(1H,s),7.42(1H,s),6.82(1H,s),6.64(1H,d,J＝7.2Hz),4.07-4.22(2H,m,CH2),4.04(3H,s,N-CH3),3.93(3H,s,O-CH3),3.78-3.85(4H,m),3.67-3.72(1H,m,H-11a),3.52-3.59(2H,m,H2-3),3.44-3.5(4H,m),2.58-2.65(2H,m,CH2),2.23-2.34(2H,m,CH2),2.00-2.08(2H,m)；13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ169.6,164.5,162.7,159.9,150.4,147.8,140.6,139.9,135.8,133.6,130.4,125.7,120.7,114.6,111.7,110.9,106.8,67.8,66.7(3C),56.1(2C),53.7,46.7,46.1(2C),35.7(2C),32.9,29.6,24.7,24.2；
x)(S)-4-(4-(4-((7-甲氧基-5-氧代-2,3,5,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-8-基)氧基)丁酰氨基)苯基)-1-甲基-N-(4-吗啉代苯基)-1H-吡咯-2-羧酰胺(49)
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ7.75(1H,s),7.9(1H,s),7.64(1H,d,J＝4.0Hz),7.52(1H,s),7.46(2H,d,J＝8.0Hz),7.39(2H,d,J＝8.0Hz),7.00(1H,s),6.91(1H,s),6.90(2H,d,J＝8.0Hz),6.82(1H,s),4.08-4.14(2H,m,CH2),3.98(3H,s,N-CH3),3.87(3H,s,O-CH3),3.74-3.82(4H,m),3.69-3.74(1H,m,H-11a),3.55-3.4(2H,m,H2-3),3.11-3.13(4H,m),2.58-2.60(2H,m,CH2),2.25-2.31(4H,m,CH2),2.03-2.06(2H,m)；13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ175.4,169.9,162.5,162.7,150.4,148.1,147.7,140.7,130.8,125.4,124.9,123.2,121.6,120.4,116.4,111.7,110.9,109.3,67.9,66.9(2C),56.1(2C),53.7,49.8,46.7(2C),36.9(2C),34.1,29.6,24.8,24.2；
xi)(S)-4-(4-(4-((7-甲氧基-5-氧代-2,3,5,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-8-基)氧基)丁酰氨基)苯基)-1-甲基-N-(4-(2-吗啉代乙氧基)苯基)-1H-吡咯-2-羧酰胺(51)
1H-NMR(400MHz,CDCl3):δ7.77(1H,s),7.73(1H,s),7.65(1H,d,J＝4.4Hz),7.52(1H,s),7.8(2H,d,J＝8.0Hz),7.45(1H,s),7.38(2H,d,J＝8.0Hz),7.00(1H,s),6.91(2H,d,J＝8.8Hz),6.83(1H,s),4.14-4.18(2H,m,CH2),4.09-4.14(4H,m),3.98(3H,s,N-CH3),3.87(3H,s,O-CH3),3.77-3.83(1H,m,H-11a),3.71-3.75(4H,m),3.52-3.57(2H,m,H2-3),2.79-2.82(2H,m),2.53-2.64(6H,m,CH2),2.25-2.31(4H,m,CH2),2.01-2.07(2H,m)；13C-NMR(100MHz,CDCl3):δ174.7,164.6,162.2,159.8,155.4,150.5,147.7,140.7,135.7,131.8,126.6,125.4,125.0,122.0,120.4,115.0,111.7,110.9,67.9,66.8(2C),66.0,57.6,56.1(2C),54.1(2C),53.7,46.7,35.9,33.0,29.6,24.8,24.2；
xii)(S)-4-(4-(4-((7-甲氧基-5-氧代-2,3,5,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-8-基)氧基)丁酰氨基)苯基)-1-甲基-N-(4-(2-吗啉代乙氧基)苄基)-1H-吡咯-2-羧酰胺(52)
1H-NMR(500MHz,CDCl3):δ7.77(1H,s),7.68(1H,s),7.65(1H,d,J＝4.0Hz),7.51(1H,s),7.44(2H,d,J＝8.0Hz),7.35(2H,d,J＝8.0Hz),7.27(1H,s),6.96(1H,d,J＝2.0Hz),6.88(2H,dd,J＝7.0,2.0Hz),6.82(1H,s),6.73(1H,s),4.50(2H,d,J＝5.5Hz),4.10-4.20(4H,m,CH2),3.98(3H,s,N-CH3),3.87(3H,s,O-CH3),3.78-3.83(1H,m,H-11a),3.68-3.71(4H,m),3.52-3.59(2H,m,H2-3),2.80-2.82(2H,m),2.53-2.64(6H,m,CH2),2.24-2.33(4H,m,CH2),2.01-2.07(2H,m)；13C-NMR(125MHz,CDCl3):δ174.7,164.6,161.6,158.1,150.4,147.7,140.7,137.5,135.7,131.8,129.2,126.6,125.4,124.5,120.4,114.9(2C),111.7,110.9,108.7,67.9,66.8(2C),66.0,57.6,56.1(2C),54.1(2C),53.7,46.7,35.9,33.0,29.6,24.8,24.2；
xiii)(S)-4-(4-(4-((7-甲氧基-5-氧代-2,3,5,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-8-基)氧基)丁酰氨基)苯基)-1-甲基-N-(6-吗啉代吡啶-3-基)-1H-吡咯-2-羧酰胺(53)
1H-NMR(500MHz,CDCl3):δ8.25(1H,s),7.96(1H,d,J＝6.5Hz),7.90(1H,s),7.85(1H,s),7.65(1H,d,J＝4.0Hz),7.51(1H,s),7.44(2H,d,J＝8.0Hz),7.35(2H,d,J＝8.0Hz),7.00(1H,s),6.95(1H,s),6.82(1H,s),6.65(1H,d,J＝9.0Hz),4.08-4.15(2H,m,CH2),3.97(3H,s,N-CH3),3.84(3H,s,O-CH3),3.78-3.82(4H,m),3.67-3.70(2H,m,H2-3),3.53-3.59(1H,m,H-11a),3.42-3.46(4H,m),2.55-2.58(2H,m,CH2),2.23-2.30(4H,m,CH2),1.99-2.05(2H,m)；13C-NMR(125MHz,CDCl3):δ174.7,164.6,162.7,159.9,156.8,150.4,147.7,140.7,131.6,126.2,125.4,125.1,120.4,111.7,110.8,109.6,106.9,67.9,66.7(3C),56.1,53.7,46.7,46.1(2C),41.0,36.9(2C),34.0,29.6,24.8,24.2；
xiv)(S)-4-(4-(4-(4-((7-甲氧基-5-氧代-2,3,5,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-8-基)氧基)丁酰氨基)苯基)呋喃-2-酰胺基)-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酸甲基酯(54)
1H-NMR(500MHz,CDCl3):δ7.98(1H,s,NH),7.88(1H,s,NH),7.68(1H,s,H-6),7.65(1H,d,J＝4.0Hz,H-11),7.64(2H,d,J＝8.0Hz,2Ar-H),7.54(1H,d,J＝1.6Hz,Py-H),7.52(1H,d,J＝1.6Hz,Py-H),7.45(1H,d,J＝2.0Hz,Py-H),7.33(2H,d,J＝8.0Hz,2Ar-H),6.97(1H,s,Py-H),6.89(1H,s,H-9),4.08-4.18(2H,m,CH2),3.97(3H,s,N-CH3),3.89(3H,s,N-CH3),3.84(3H,s,O-CH3),3.79(3H,s,O-CH3),3.66-3.70(1H,m,H-11a),3.55-3.60(2H,m,H2-3),2.56-2.61(2H,m,CH2),2.23-2.32(4H,m,CH2),2.00-2.05(2H,m)；13C-NMR(125MHz,CDCl3):δ162.5,161.6,159.1,150.4,147.7,138.4,132.8,132.1131.9(2C),128.6,128.4(2C),125.4(2C),124.8,123.0,121.0,120.4(2C),116.2,114.6(2C),109.9,94.2,67.4,63.6,57.1,53.7,51.1,46.7,36.9,36.7,34.0,29.6,24.2；
xv)(S)-4-(4-(4-(4-(4-((7-甲氧基-5-氧代-2,3,5,11a-四氢-1H-苯并[e]吡咯并[1,2-a][1,4]二氮杂-8-基)氧基)丁酰氨基)苯基)呋喃-2-酰胺基)苯基)-1-甲基-1H-吡咯-2-羧酸甲基酯(56)。
1H-NMR(500MHz,CDCl3):δ7.72(1H,s,NH),7.69(1H,s,NH),7.66(1H,d,J＝4.0Hz,H-11),7.57(2H,d,J＝8.0Hz,2Ar-H),7.53(1H,s,H-6),7.46(4H,d,J＝8.0Hz,4Ar-H),7.41(2H,d,J＝8.0Hz,2Ar-H),7.20(1H,d,J＝2.0Hz,Py-H),7.06(1H,d,J＝2.0Hz,Py-H),7.02(1H,d,J＝1.6Hz,Py-H),6.92(1H,s,Py-H),6.84(1H,s,H-9),4.12-4.20(2H,m,CH2侧链接头),4.00(3H,s,N-CH3),3.96(3H,s,N-CH3),3.88(3H,s,O-CH3),3.84(3H,s,O-CH3),3.70-3.73(1H,m,H-11a),3.55-3.61(2H,m,H2-3),2.58-2.62(2H,m,CH2),2.29-2.31(2H,m,CH2),1.93-2.06(4H,m,CH2)；13C-NMR(125MHz,CDCl3):δ164.5,162.4,161.7,150.7,147.3,139.2,126.0,125.6,125.4(2C),125.2(2C),123.0,120.4(2C),114.6(2C),111.4,94.6(2C),68.3,63.7,56.1,51.6(2C),41.0,36.9,31.9,29.6,25.2,24.2,24.1,20.2。
实施例3-抗菌评价
如下所述，利用CLSI肉汤微板测定，相对于若干菌株比较了本发明的化合物26、27、28、30、31、33、35、37、39、40、49、51、52、53、54、56和59与比较化合物16和18的抗菌性能。
耐甲氧西林金黄色葡萄球菌(MRSA)株EMRSA-15和EMRSA-16分离自临床材料(在Royal Free Hospital,London)；MRSA菌株BB568是BrigitteInstitute of Medical Microbiology,University of Zürich,瑞士的赠送。社区相关的MRSA分离物USA300购买自American TypeCulture Collection，为BAA-1556。金黄色葡萄球菌VISA菌株Mu50是MRSA临床分离物(具有万古霉素中间体抗性)并且由Keiichi Hiramatsu,Juntendo University,Tokyo所分离和提供。ATCC 29213是抗生素敏感的金黄色葡萄球菌参比菌株。在Royal Free Hospital分离耐万古霉素肠球菌分离株粪肠球菌(E.faecalis)VRE1和屎肠球菌(E.faecium)VRE10。在37℃在米-欣(Mueller-Hinton，MH)肉汤(Oxoid)中或在MH琼指平板上生长细菌。
如先前所描述的(Hadjivassileva T,Stapleton PD,Thurston DE et al.Interactions of pyrrolobenzodiazepine dimers and duplex DNA frommethicillin-resistant Staphylococcus aureus.Int J Antimicrob Agents 2007；290:672-678)，通过CLSI肉汤微板测定来确定抗菌剂的MIC；在肉汤中稀释以前，将抗菌剂溶解于DMSO。在所使用的浓度下，溶剂对细菌生长没有影响。对于每种测试的化合物，重复进行三次MIC确定/菌株。
*比较实施例。

Claims (47)

1.一种式I的化合物：
或其盐或溶剂化物，其中：
点线的双键表示在C2和C3之间存在单键或双键；
R2选自-H、-OH、＝O、＝CH2、-CN、-R、OR、卤基、二卤基、＝CHR、＝CHRR’、-O-SO2-R、CO2R和COR；
R7选自H、R、OH、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR’、硝基、Me3Sn和卤基；
其中R和R’独立地选自可选取代的C1-7烷基、C3-20杂环基和C5-20芳基；
R10和R11一起形成双键，或分别选自H和QRQ，其中Q选自O、S和NH以及RQ是H或C1-7烷基或H和SOxM，其中x是2或3，并且M是单价药用阳离子；
A选自A1、A2、A3、A4或A5：
其中
X1和Y1分别选自：CH和NH；CH和NMe；N和NMe；CH和S；N和S；N和O；以及CH和O；
X2和Y2分别选自：CH和NH；CH和NMe；N和NMe；CH和S；N和S；N和O；以及CH和O；
Z1选自O和S；
Z2选自CH和N；
F选自单键和–(E-F1)m-；
每个E独立地选自单键和–C(＝O)-NH-；
每个F1独立地是C3-20亚杂芳基；
m是1、2或3；
G选自氢、C1-4烷基、-C(＝O)-O-C1-4烷基、-(CH2)n-C3-20杂环烷基和–O-(CH2)n-C3-20杂环烷基；
每个n是0-4；
条件是A2不是A2’：
其中A2’的X1和Y1分别选自：CH和NMe；COH和NMe；CH和S；N和NMe；N和S；以及
条件是A3不是A3’：
其中A3’的X2和Y2分别选自：CH和NMe；COH和NMe；CH和S；N和NMe；N和S；
B是单键或：
其中B1的X和Y分别选自：CH和NMe；COH和NMe；CH和S；N和NMe；N和S；以及
R1是C1-4烷基。
2.根据权利要求1所述的化合物，其中，R7选自H、OR、SH、SR、NH2、NHR、NRR’和卤基。
3.根据权利要求2所述的化合物，其中，R7选自H和OR。
4.根据权利要求3所述的化合物，其中，R7是OR7A，其中R7A是可选取代的C1-7烷基。
5.根据权利要求4所述的化合物，其中，R7A选自Me、CH2Ph和烯丙基。
6.根据权利要求1至5中任一项所述的化合物，其中，R10和R11一起形成双键。
7.根据权利要求1至5中任一项所述的化合物，其中，R10是H并且R11是ORQ。
8.根据权利要求7所述的化合物，其中，RQ选自H或Me。
9.根据权利要求1至5中任一项所述的化合物，其中，R10是H并且R11是SO3M。
10.根据权利要求9所述的化合物，其中，M是Na+。
11.根据权利要求1至10中任一项所述的化合物，其中，R1是C1-2烷基。
12.根据权利要求11所述的化合物，其中，R1是甲基。
13.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物，其中，R2选自-H、-OH、＝O、＝CH2、-CN、-R、-OR、＝CHR、＝CRR’、-O-SO2-R、-CO2R和-COR。
14.根据权利要求13所述的化合物，其中，R2选自-H、＝CH2、-R、＝CHR和＝CRR’。
15.根据权利要求13所述的化合物，其中，R2具有构型C1：
16.根据权利要求1至14中任一项所述的化合物，其中，R2是可选取代的C5-20芳基。
17.根据权利要求16所述的化合物，其中，R2选自可选取代的苯基、可选取代的萘基、可选取代的吡啶基、可选取代的喹啉基或异喹啉基。
18.根据权利要求16或权利要求17所述的化合物，其中，R2基团具有1至3个取代基。
19.根据权利要求16至18中任一项所述的化合物，其中，所述可选的取代基选自甲氧基、乙氧基、氟基、氯基、氰基、双氧基-亚甲基、甲基-哌嗪基、吗啉代和甲基-噻吩基。
20.根据权利要求16或权利要求17所述的化合物，其中，R2选自4-甲氧基-苯基、3-甲氧基苯基、4-乙氧基-苯基、3-乙氧基-苯基、4-氟-苯基、4-氯-苯基、3,4-双氧基亚甲基-苯基、4-甲基噻吩基、4-氰基苯基、4-苯氧基苯基、喹啉-3-基和喹啉-6-基、异喹啉-3-基和异喹啉-6-基、2-噻吩基、2-呋喃基、甲氧基萘基和萘基。
21.根据权利要求1至14中任一项所述的化合物，其中，R2选自：
(a)C1-5饱和的脂族烷基；
(b)C3-6饱和的环烷基；
(c)其中R21、R22和R23各自独立地选自H、C1-3饱和烷基、C2-3烯基、C2-3炔基和环丙基，其中在R12基团中的碳原子的总数不大于5；
(d)其中R25a和R25b中的一种是H而另一种选自：苯基，该苯基是由选自卤代甲基、甲氧基的基团可选取代的；吡啶基；和苯硫基；以及
(e)其中R24选自：H；C1-3饱和烷基；C2-3烯基；C2-3炔基；环丙基；苯基，该苯基是由选自卤代甲基、甲氧基的基团可选取代的；吡啶基；以及苯硫基。
22.根据权利要求21所述的化合物，其中，R2选自甲基、乙基、丙基、丁基或戊基。
23.根据权利要求21所述的化合物，其中，R2选自环丙基、环丁基、环戊基和环己基。
24.根据权利要求21所述的化合物，其中，R2是以及在R2基团中碳原子的总数不大于4。
25.根据权利要求21或权利要求24所述的化合物，其中，R21、R22和R23中的一种是H，而另外两种基团选自H、C1-3饱和烷基、C2-3烯基、C2-3炔基和环丙基。
26.根据权利要求21或权利要求24所述的化合物，其中，R21、R22和R23中的两种是H，而另外一种基团选自H、C1-3饱和烷基、C2-3烯基、C2-3炔基和环丙基。
27.根据权利要求25或权利要求26所述的化合物，其中，不是H的所述基团选自甲基和乙基。
28.根据权利要求21所述的化合物，其中，R2是并且不是H的基团是可选取代的苯基。
29.根据权利要求21所述的化合物，其中，R2是并且R24选自H和甲基。
30.根据权利要求1至29中任一项所述的化合物，其中，如果R2选自以下基团中的任一种：-H、-OH、-CN、-R、-OR、卤基、-O-SO2-R、-CO2R和–COR，则在C2和C3之间存在双键。
31.根据权利要求1至29中任一项所述的化合物，其中，如果R2选自＝O、＝CH2、＝CHR、＝CHRR’，则在C2和C3之间存在单键。
32.根据权利要求1至12中任一项所述的化合物，其中，在C2和C3之间不存在双键并且R2是H。
33.根据权利要求1至32中任一项所述的化合物，其中，R1是甲基。
34.根据权利要求1至33中任一项所述的化合物，其中，X1和Y1分别选自：CH和NMe；N和NMe；CH和S；以及CH和O。
35.根据权利要求34所述的化合物，其中，X1和Y1分别选自N和NMe以及CH和NMe。
36.根据权利要求1至35中任一项所述的化合物，其中，F是–(E-F1)m-，并且F1是C5亚杂芳基。
37.根据权利要求36所述的化合物，其中，F1由结构F11表示：
其中X3和Y3分别选自：CH和O；以及CH和NMe。
38.根据权利要求36或权利要求37所述的化合物，其中，E是单键。
39.根据权利要求36或权利要求37所述的化合物，其中，E是–C(＝O)-NH-。
40.根据权利要求1至39中任一项所述的化合物，其中，G选自由以下组成的组：–H、-Me、-C(＝O)-O-Me、-(CH2)n-N(CH2CH2OCH2CH2)和–O-(CH2)n-N(CH2CH2OCH2CH2)。
41.根据权利要求1至33中任一项所述的化合物，其中，A选自由以下组成的组：A11、A12、A13、A14、A21、A22、A23、A24、A31、A32、A33、A34、A35、A36、A41、A51、A52、A53和A54。
42.一种药物组合物，包含根据权利要求1至41中任一项所述的化合物，以及药用载体或稀释剂。
43.根据权利要求1至41中任一项所述的化合物，用于在治疗方法中使用。
44.根据权利要求1至41中任一项所述的化合物在制造用于治疗细菌感染的药剂中的应用。
45.根据权利要求1至41中任一项所述的化合物，用于在治疗细菌感染的方法中使用。
46.一种用于治疗细菌感染患者的方法，包括给予所述患者治疗上可接受量的根据权利要求1至41中任一项所述的化合物或根据权利要求42所述的组合物。
47.根据权利要求1至41中任一项所述的化合物的合成方法。
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