CN104031961A - 生产成熟的人促红细胞生成素的方法以及包含获自该方法的人促红细胞生成素的组合物 - Google Patents

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S.戈马蒂纳亚加姆
S.哈密尔顿
H.李
N.塞图拉曼
T.A.斯塔黑姆
S.维尔德特
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Abstract

本发明涉及在巴斯德毕赤氏酵母中生产缺乏与针对宿主细胞抗原的抗体的可检测交叉结合活性的蛋白质的方法。描述了在巴斯德毕赤氏酵母中生产重组糖蛋白的方法，所述重组糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性，所述方法包括提供重组巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性，不展现对于N-聚糖或O-聚糖的选自β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性的至少一种活性，并且其包括编码所述重组糖蛋白的核酸分子；在培养基中生长所述宿主细胞；和从所述培养基中回收所述重组糖蛋白。

Description

生产成熟的人促红细胞生成素的方法以及包含获自该方法的人促红细胞生成素的组合物
本申请是申请日为2010年10月11日的中国专利申请201080057790.7“在巴斯德毕赤氏酵母中生产缺乏与针对宿主细胞抗原的抗体的可检测交叉结合活性的蛋白质的方法”的分案申请。
技术领域
本发明涉及在巴斯德毕赤氏酵母（Pichia pastoris）中生产蛋白质和糖蛋白的方法，所述蛋白质和糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。特别地，本发明涉及使用重组的巴斯德毕赤氏酵母菌株，其不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性，并且不展现选自由对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶1、3和4的活性构成的组的至少一种活性。这些重组巴斯德毕赤氏酵母菌株可以产生蛋白质和糖蛋白，在其上缺乏可检测的α-甘露糖苷酶抗性的β-甘露糖残基。本发明进一步涉及在巴斯德毕赤氏酵母（Pichia pastoris）中生产双唾液酸化的人促红细胞生成素的方法，所述双唾液酸化的人促红细胞生成素缺乏与针对宿主细胞抗原的抗体的可检测交叉结合活性。
背景技术
生产重组的人蛋白质的能力引起了人体健康护理领域的很大发展，仍然是药物开发的活跃领域。许多治疗蛋白质需要向蛋白质的特定天冬酰胺残基翻译后添加聚糖（N-糖基化）以确保适当的结构-功能活性和随后在人血清中的稳定性。对于在人类中的治疗用途，糖蛋白需要人类样的N-糖基化。可以模拟人类样糖蛋白加工的哺乳动物细胞系（例如，CHO细胞、人类视网膜细胞）具有几个缺点，包括低的蛋白质滴度、长发酵时间、异源产物、以及持续的病毒防范。因而希望的是使用不仅在短发酵时间中产生高的蛋白质滴度、而且还产生人类样糖蛋白的表达系统。真菌宿主例如甲基营养型酵母巴斯德毕赤氏酵母具有用于治疗蛋白质表达的独特优点，例如，它们不分泌高量的内源蛋白质，生产异源蛋白质的可诱导的强启动子是可用的，它们可以在化学成分已知的培养基中生长并且不使用动物血清，它们可以生产高滴度的重组蛋白质 （Cregg et al., FEMS Microbiol. Rev. 24: 45-66（2000））。然而，在巴斯德毕赤氏酵母中表达的糖基化蛋白质一般含有额外的甘露糖糖类，产生“高甘露糖”的聚糖，以及在糖蛋白上赋予负电荷的甘露糖基磷酸基团。具有高甘露糖聚糖或具有带电甘露聚糖的糖蛋白存在着在人类中引起不希望的免疫反应的风险（Takeuchi, Trends in Glycosci. Glycotechnol. 9:S29-S35（1997）；Rosenfeld and Ballou, J. Biol. Chem. 249: 2319-2321（1974））。因而，希望的是在真菌宿主细胞中生产治疗性糖蛋白，在所述宿主细胞中糖蛋白上的糖基化模式相同于、或类似于在人类中产生的糖蛋白上发生的模式，并且不具有可检测的β-甘露糖基化。
如在未感染的个体中保护性抗体的存在所证明的，β-连接的甘露聚糖可能是免疫原性的，或不利地影响施用包含β-连接的甘露聚糖的治疗蛋白质或糖蛋白的个体。另外，在治疗蛋白质上暴露的甘露糖基团被巨噬细胞上的甘露糖受体快速地清除，导致低药物效力。因而，在真菌宿主例如巴斯德毕赤氏酵母中表达的异源治疗蛋白质的N-或O-连接的聚糖上β-连接的甘露糖残基的存在不是期望的，考虑到它们的免疫原性可能性以及它们与清除因子结合的能力。
在巴斯德毕赤氏酵母中制造的糖蛋白已经被报道含有β-连接的甘露糖残基。在2003年，Trimble等（Glycobiol. 14: 265-274, Epub Dec 23）报道了在巴斯德毕赤氏酵母中表达的重组的人胆汁盐刺激脂肪酶（hBSSL）中β-1,2-连接的甘露糖残基的存在。已经在巴斯德毕赤氏酵母和白色念珠菌（Candida albicans）中鉴定了编码几种β-甘露糖基转移酶的基因（参见美国专利No. 7,465,577 和Mille et al., J. Biol. Chem. 283: 9724-9736（2008））。
根据上文，需要提供在甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母中制造重组治疗蛋白质或糖蛋白的方法，所述重组治疗蛋白质或糖蛋白缺乏在施用所述重组治疗蛋白质或糖蛋白的个体中可能引发不良反应的表位。确定重组治疗蛋白质或糖蛋白在施用给个体时是否提供了引发不良反应的风险的方法，是将重组治疗蛋白质或糖蛋白与针对总宿主细胞抗原制备的抗体接触。对于预期长期施用的蛋白质或糖蛋白这是特别关注的。缺乏与抗体的交叉结合表明所述重组治疗蛋白质或糖蛋白缺乏与所述抗体的可检测的交叉结合活性，并且当施用给个体时不太可能引发不良反应。因而，需要生产重组治疗蛋白质或糖蛋白的方法，所述重组治疗蛋白质或糖蛋白缺乏与所述抗体的可检测的交叉结合活性，并且当施用给个体时不太可能引发不良反应。
发明内容
本发明提供了在甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母中生产蛋白质和糖蛋白的方法，所述蛋白质和糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。特别地，本发明提供了利用重组的甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母菌株来生产重组蛋白质和糖蛋白的方法，所述酵母不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性，并且不展现选自β-甘露糖基转移酶1、β-甘露糖基转移酶3和β-甘露糖基转移酶4的对于N-聚糖或O-聚糖的至少一种活性。在一个方面，所述宿主细胞是巴斯德毕赤氏酵母菌株，其中编码β-甘露糖基转移酶2的BMT2基因，以及编码选自β-甘露糖基转移酶1、3和4的β-甘露糖基转移酶的至少一种基因（分别为基因BMT1、BMT3、BMT4）被删除或破坏或突变以产生无活性的β-甘露糖基转移酶，来生产重组蛋白质和糖蛋白。在其他方面β-甘露糖基转移酶1、β-甘露糖基转移酶3和β-甘露糖基转移酶4的一种或更多种的活性利用β-甘露糖基转移酶抑制物来取消，所述抑制物包括但不限于化合物、针对编码β-甘露糖基转移酶的一种或更多种mRNA的反义DNA，针对编码β-甘露糖基转移酶的一种或更多种mRNA的siRNA。
这些重组巴斯德毕赤氏酵母菌株可以生产蛋白质和糖蛋白，在其上缺乏可检测的α-甘露糖苷酶抗性的β-甘露糖残基。本发明进一步提供了在巴斯德毕赤氏酵母中生产双唾液酸化的人促红细胞生成素的方法，所述双唾液酸化的人促红细胞生成素缺乏与针对宿主细胞抗原的抗体的可检测的交叉结合活性。所述方法和宿主细胞允许产生重组治疗蛋白质和糖蛋白，与此处公开的未修饰的菌株中生产的相比，其在施用所述重组治疗蛋白质和糖蛋白的个体中具有引发不良反应的降低的风险。所述方法和宿主细胞对于生产具有结合清除因子的更低可能性的重组蛋白质或糖蛋白也是有用的。
在一个方面，本发明提供了重组甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性，并且不展现选自β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性的、对N-聚糖或O-聚糖的至少一种活性，并且其包括编码所述重组糖蛋白的核酸分子。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性、β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞进一步不展现对N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶4活性。在另一个方面，本发明提供了重组甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其具有编码β-甘露糖基转移酶2活性的基因的删除或破坏，以及选自编码β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性的基因的至少一种基因的删除或破坏，并且其包括编码所述重组糖蛋白的核酸分子。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞具有编码β-甘露糖基转移酶2活性、β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性的基因的删除或破坏。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞具有编码β-甘露糖基转移酶4活性的基因的删除或破坏。
在另一个方面，本发明提供了重组巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其中β-甘露糖基转移酶2（BMT2）基因和选自β-甘露糖基转移酶1（BMT1）和β-甘露糖基转移酶3（BMT3）的至少一种基因被删除或破坏，并且其包括编码所述重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子。在进一步的实施方式中，β-甘露糖基转移酶2（BMT2）、β-甘露糖基转移酶1（BMT1）和β-甘露糖基转移酶3（BMT3）基因被删除。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞进一步包括β-甘露糖基转移酶4（BMT4）基因的删除或破坏。
在另一个方面，本发明提供了在甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母中生产重组糖蛋白的方法，所述重组糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性，所述方法包括提供重组宿主细胞，所述重组宿主细胞不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性，不展现选自β-甘露糖基转移酶1和β-甘露糖基转移酶3的对于N-聚糖或O-聚糖的至少一种活性，以及其包括编码所述重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子；在对表达所述重组糖蛋白有效的条件下在培养基中生长所述宿主细胞；以及从所述培养基中回收所述重组糖蛋白，以产生缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性的重组糖蛋白。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性、β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞进一步不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶4活性。
在另一个方面，本发明提供了在甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母中生产重组糖蛋白的方法，所述重组糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性，所述方法包括提供重组宿主细胞，所述重组宿主细胞具有编码β-甘露糖基转移酶2活性的基因的删除或破坏，以及编码选自β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性的活性的至少一种基因的删除或破坏，以及其包括编码所述重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子；在对表达所述重组糖蛋白有效的条件下在培养基中生长所述宿主细胞；以及从所述培养基中回收所述重组糖蛋白，以产生缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性的重组糖蛋白。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞具有编码β-甘露糖基转移酶2活性、β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性的基因的删除或破坏。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞具有编码β-甘露糖基转移酶4活性的基因的删除或破坏。
在另一个方面，本发明提供了在巴斯德毕赤氏酵母中生产重组糖蛋白的方法，所述重组糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性，所述方法包括提供重组巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其中β-甘露糖基转移酶2（BMT2）基因和选自β-甘露糖基转移酶1（BMT1）和β-甘露糖基转移酶3（BMT3）的至少一种基因被删除或破坏，并且其包括编码所述重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子； 在对表达所述重组糖蛋白有效的条件下在培养基中生长所述宿主细胞；以及从所述培养基中回收所述重组糖蛋白，以产生缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性的重组糖蛋白。在进一步的实施方式中，所述β-甘露糖基转移酶2（BMT2）、β-甘露糖基转移酶1（BMT1）和β-甘露糖基转移酶3（BMT3）基因被删除或破坏。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞进一步包括β-甘露糖基转移酶（BMT4）基因的删除或破坏。一般地，与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性在例如夹心ELISA或Western印迹的分析中测定。所述方法对于生产治疗蛋白质或糖蛋白是特别有用的。治疗蛋白质或糖蛋白的实例包括但不限于促红细胞生成素（EPO）；细胞因子例如干扰素α、干扰素β、干扰素γ和干扰素ω；以及粒细胞-集落刺激因子（GCSF）；GM-CSF；凝血因子例如因子VIII、因子IX和人类蛋白质C；抗凝血酶III；凝血酶；可溶的IgE受体α链；免疫球蛋白例如IgG、IgG片段、IgG融合物和IgM；免疫粘附素和其他Fc融合蛋白，例如可溶的TNF受体-Fc融合蛋白；RAGE-Fc融合蛋白；白细胞介素；尿激酶；胃促胰酶；和脲胰蛋白酶抑制物；IGF-结合蛋白；表皮生长因子；生长激素释放因子；annexin V融合蛋白；血管抑素；血管内皮生长因子-2；骨髓祖代抑制因子-1；护骨素（osteoprotegerin）；α-1-抗胰蛋白酶；α-feto蛋白；DNase II；人类血纤蛋白溶解酶原的kringle 3；葡糖脑苷脂酶；TNF结合蛋白1；促滤泡激素；细胞毒T淋巴细胞相关抗原4– Ig；跨膜激活物和钙调节物和亲环蛋白（cyclophilin）配体；高血糖素样蛋白质1；和IL-2受体激动剂。
在宿主细胞或方法的特定实施方式中，编码所述重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子的核酸序列的密码子为了在巴斯德毕赤氏酵母表达而被优化。
在宿主细胞或方法的再进一步的实施方式中，所述宿主细胞被遗传工程化来产生具有人类样N-聚糖的糖蛋白。
在宿主细胞或方法的进一步的实施方式中，宿主细胞进一步不展现对于糖蛋白上的N-聚糖的α1,6-甘露糖基转移酶活性，并且包括与细胞靶向信号肽融合的α1,2-甘露糖苷酶催化结构域，所述细胞靶向信号肽通常不与所述催化结构域相连，并且被选择以将α1,2-甘露糖苷酶活性靶向宿主细胞的ER或高尔基体。
在宿主细胞或方法的再进一步的实施方式中，所述宿主细胞进一步包括与细胞靶向信号肽融合的GlcNAc转移酶I催化结构域，所述细胞靶向信号肽通常不与所述催化结构域相连，并且被选择以将GlcNAc转移酶I活性靶向宿主细胞的ER或高尔基体。
在宿主细胞或方法的再进一步的实施方式中，所述宿主细胞进一步包括与细胞靶向信号肽融合的甘露糖苷酶II催化结构域，所述细胞靶向信号肽通常不与所述催化结构域相连，并且被选择以将甘露糖苷酶II活性靶向宿主细胞的ER或高尔基体。
在宿主细胞或方法的再进一步的实施方式中，所述宿主细胞进一步包括与细胞靶向信号肽融合的GlcNAc转移酶II催化结构域，所述细胞靶向信号肽通常不与所述催化结构域相连，并且被选择以将GlcNAc转移酶II活性靶向宿主细胞的ER或高尔基体。
在宿主细胞或方法的再进一步的实施方式中，所述宿主细胞进一步包括与细胞靶向信号肽融合的半乳糖基转移酶催化结构域，所述细胞靶向信号肽通常不与所述催化结构域相连，并且被选择以将半乳糖基转移酶活性靶向宿主细胞的ER或高尔基体。
在宿主细胞或方法的再进一步的实施方式中，所述宿主细胞进一步包括与细胞靶向信号肽融合的唾液酸转移酶催化结构域，所述细胞靶向信号肽通常不与所述催化结构域相连，并且被选择以将唾液酸转移酶活性靶向宿主细胞的ER或高尔基体。
在宿主细胞或方法的再进一步的实施方式中，所述宿主细胞进一步包括与细胞靶向信号肽融合的岩藻糖基转移酶催化结构域，所述细胞靶向信号肽通常不与所述催化结构域相连，并且被选择以将岩藻糖基转移酶活性靶向宿主细胞的ER或高尔基体。
在宿主细胞或方法的再进一步的实施方式中，所述宿主细胞进一步包括选自由GnTIII、GnTIV、GnTV、GnTVI和GnTIX构成的组的一种或更多种GlcNAc转移酶。
在宿主细胞或方法的再进一步的实施方式中，所述宿主细胞被遗传工程化以产生糖蛋白，所述糖蛋白主要具有选自Man5GlcNAc2、GlcNAcMan5GlcNAc2、GalGlcNAcMan5GlcNAc2、NANAGalGlcNAcMan5GlcNAc2、GlcNAcMan3GlcNAc2、GlcNAc（ 1-4 ）Man3GlcNAc2、Gal（ 1-4 ）GlcNAc（ 1-4 ）Man3GlcNAc2、和NANA（ 1-4 ）Gal（ 1-4 ）GlcNAc（ 1-4 ）Man3GlcNAc2的N-聚糖，其中下标表示N-聚糖结构上特定糖残基的数目。N-聚糖结构的实例包括但不限于 Man5GlcNAc2、GlcNAcMan5GlcNAc2、GlcNAcMan3GlcNAc2、GlcNAc2Man3GlcNAc2、GlcNAc3Man3GlcNAc2、GlcNAc4Man3GlcNAc2、GalGlcNAc2Man3GlcNAc2、Gal2GlcNAc2Man3GlcNAc2、Gal2GlcNAc3Man3GlcNAc2、Gal2GlcNAc4Man3GlcNAc2、Gal3GlcNAc3Man3GlcNAc2、Gal3GlcNAc4Man3GlcNAc2、Gal4GlcNAc4Man3GlcNAc2、NANAGal2GlcNAc2Man3GlcNAc2、NANA2Gal2GlcNAc2Man3GlcNAc2、NANA3Gal3GlcNAc3Man3GlcNAc2和 NANA4Gal4GlcNAc4Man3GlcNAc2。
进一步的提供的是组合物，其包含使用上述宿主细胞的任一种通过上述方法获得的一种或更多种重组糖蛋白。
在进一步的方面中，本发明提供了重组甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其不展现β-甘露糖基转移酶2活性和选自β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性的至少一种活性，以及其包括两种或更多种核酸分子，各自编码融合蛋白，所述融合蛋白包含融合到信号肽的成熟的人促红细胞生成素，所述信号肽靶向ER，并且当所述融合蛋白处于ER中时被除去。在特定的实施方式中，所述宿主细胞进一步不展现β-甘露糖基转移酶4活性。
在进一步的方面中，本发明提供了重组甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其具有编码β-甘露糖基转移酶2活性、β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性的基因的删除或破坏，并且其包括两种或更多种核酸分子，各自编码融合蛋白，所述融合蛋白包含融合到信号肽的成熟的人促红细胞生成素，所述信号肽靶向ER，并且当所述融合蛋白处于ER中时被除去。在特定的实施方式中，所述宿主细胞进一步包括编码β-甘露糖基转移酶4活性的基因的删除或破坏。
在进一步的方面中，本发明提供了重组巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其具有β-甘露糖基转移酶2（BMT2）基因和选自β-甘露糖基转移酶1（BMT1）和β-甘露糖基转移酶3（BMT3）基因的至少一种基因的删除或破坏，并且其包括两种或更多种核酸分子，各自编码融合蛋白，所述融合蛋白包含融合到信号肽的成熟的人促红细胞生成素，所述信号肽靶向ER，并且当所述融合蛋白处于ER中时被除去。在特定的实施方式中，所述宿主细胞进一步包括编码β-甘露糖基转移酶4（BMT4）基因的基因的删除或破坏。
在再进一步的方面中，本发明提供了在甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母中生产成熟的人促红细胞生成素的方法，所述酵母主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖，并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性，所述方法包括： 提供重组宿主细胞，其不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性，不展现选自β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性的对于N-聚糖或O-聚糖的至少一种活性，被遗传工程化以产生唾液酸封端的双分枝N-聚糖，并且其包括两种或更多种核酸分子，各自编码融合蛋白，所述融合蛋白包含融合到信号肽的成熟的人促红细胞生成素，所述信号肽靶向ER，并且当所述融合蛋白处于ER中时被除去；在对表达和加工所述第一和第二融合蛋白有效的条件下在培养基中生长所述宿主细胞；以及从所述培养基回收所述成熟的人促红细胞生成素，来产生所述成熟的人促红细胞生成素，其主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性、β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞进一步不展现β-甘露糖基转移酶4活性。
在再进一步的方面中，本发明提供了在甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母中生产成熟的人促红细胞生成素的方法，所述酵母主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖，并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性，所述方法包括： 提供重组宿主细胞，其被遗传工程化以产生唾液酸封端的双分枝N-聚糖，其中编码β-甘露糖基转移酶2活性的基因以及编码选自β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性的活性的至少一种基因被删除或破坏，并且其包括两种或更多种核酸分子，各自编码融合蛋白，所述融合蛋白包含融合到信号肽的成熟的人促红细胞生成素，所述信号肽靶向ER，并且当所述融合蛋白处于ER中时被除去；在对表达和加工所述第一和第二融合蛋白有效的条件下在培养基中生长所述宿主细胞；以及从所述培养基回收所述成熟的人促红细胞生成素，来产生所述成熟的人促红细胞生成素，其主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。在进一步的实施方式中，所述宿主包含编码β-甘露糖基转移酶2活性、β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性的基因的删除或破坏。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞进一步包括编码β-甘露糖基转移酶3活性的基因的删除或破坏。
在再进一步的方面中，本发明提供了在巴斯德毕赤氏酵母中生产成熟的人促红细胞生成素的方法，所述巴斯德毕赤氏酵母主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖，并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性，包括： 提供重组巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其被遗传工程化以产生唾液酸封端的双分枝N-聚糖，其中β-甘露糖基转移酶2（BMT2）基因和选自β-甘露糖基转移酶1（BMT1）和β-甘露糖基转移酶3（BMT3）基因的至少一种基因被删除或破坏，并且其包括两种或更多种核酸分子，各自编码融合蛋白，所述融合蛋白包含融合到信号肽的成熟的人促红细胞生成素，所述信号肽靶向ER，并且当所述融合蛋白处于ER中时被除去；在对表达和加工所述第一和第二融合蛋白有效的条件下在培养基中生长所述宿主细胞；以及从所述培养基回收所述成熟的人促红细胞生成素，来产生所述成熟的人促红细胞生成素，其主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。在进一步的实施方式中，所述宿主包含β-甘露糖基转移酶2（BMT2）基因、β-甘露糖基转移酶1（BMT1）基因和β-甘露糖基转移酶3（BMT3）基因的删除或破坏。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞进一步包括β-甘露糖基转移酶3基因（BMT4）的删除或破坏。
在宿主细胞或方法的特定的实施方式中，融合到促红细胞生成素的N-末端的信号肽是酿酒酵母（S. cerevisiae）αMATpre信号肽或鸡溶菌酶信号肽。
在宿主细胞或方法的进一步的实施方式中，至少一种核酸分子编码融合蛋白，其中促红细胞生成素融合到酿酒酵母αMATpre信号肽，以及至少一种核酸分子编码融合蛋白，其中促红细胞生成素融合到酿酒酵母αMATpre信号肽、鸡溶菌酶信号肽。
在宿主细胞或方法的进一步的实施方式中，编码促红细胞生成素的核酸分子的核酸序列的密码子为了在巴斯德毕赤氏酵母中表达而被优化。
在方法的进一步的实施方式中，从所述培养基回收所述成熟的人促红细胞生成素包括阳离子交换层析步骤，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。
在方法的进一步的实施方式中，从所述培养基回收所述成熟的人促红细胞生成素包括羟磷灰石层析步骤，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。
在方法的进一步的实施方式中，从所述培养基回收所述成熟的人促红细胞生成素包括阴离子交换层析步骤，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。
在方法的进一步的实施方式中，从所述培养基回收所述成熟的人促红细胞生成素包括阳离子交换层析步骤，随后是羟磷灰石层析步骤，其任选地跟随着阴离子交换层析步骤，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。
本发明进一步提供了组合物，其包含利用上述宿主细胞从上述方法获得的成熟的人促红细胞生成素以及药学上可接受的盐，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。在特定的实施方式中，约50到60%的N-聚糖包含位于两个分枝上的唾液酸残基；在进一步的实施方式中，大于70%的N-聚糖包含位于两个分枝上的唾液酸残基；在进一步的实施方式中，大于80%的N-聚糖包含位于两个分枝上的唾液酸残基。在进一步的方面中，小于30%的N-聚糖是中性的N-聚糖（即，在N-聚糖的非还原末端处的至少一个末端上不是唾液酸化的）。在再进一步的方面中，小于20%的N-聚糖是中性的N-聚糖。在特定的方面中，约99%的N-聚糖含有一个或更多个唾液酸残基，以及小于1%的N-聚糖是中性的N-聚糖。在进一步的方面中，提供了组合物，其中存在每摩尔rhEPO 4.5摩尔或更多的唾液酸。在进一步的方面中，提供了组合物，其中存在每摩尔rhEPO 至少5.0摩尔的唾液酸。
在组合物的进一步的实施方式中，所述成熟的人促红细胞生成素共轭到亲水性聚合物，在特定的方面中所述亲水性聚合物是聚乙二醇聚合物，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。在特定的实施方式中，所述聚乙二醇聚合物共轭到所述成熟的人促红细胞生成素的N-末端，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。
定义
如在此使用的，术语“N-聚糖”和“糖形式”可互换地使用，是指N-连接的低聚糖，例如，通过天冬酰胺-N-乙酰葡萄糖胺连键与多肽的天冬酰胺残基连接的低聚糖。N-连接的糖蛋白含有与蛋白质中的天冬酰胺残基的酰胺氮连接的N-乙酰葡萄糖胺残基。糖蛋白中存在的主要糖类是葡萄糖、半乳糖、甘露糖、岩藻糖、N-乙酰半乳糖胺（GalNAc）、N-乙酰葡萄糖胺（GlcNAc）和唾液酸（例如，N-乙酰-神经氨酸（NANA））。对于N-连接的糖蛋白，糖基团的加工与翻译共同地发生于ER的腔中，并在翻译后在高尔基体中继续。
N-聚糖具有共同的Man3GlcNAc2 的五糖核心（“Man”是指甘露糖；“Glc”是指葡萄糖；“NAc”是指N-乙酰基；GlcNAc是指N-乙酰葡萄糖胺）。N-聚糖根据包含外周糖类（例如，GlcNAc、半乳糖、岩藻糖和唾液酸）的分枝（触角）的数目而不同，所述外周糖类被添加到Man3GlcNAc2（“Man3”）核心结构，所述核心结构也称作“三甘露糖核心”、“五糖核心”或“少甘露糖核心”。N-聚糖根据它们的分枝成分来分类（例如，高甘露糖、复合的或杂合的）。“高甘露糖”型N-聚糖具有五个或更多个甘露糖残基。“复合”型N-聚糖一般具有连接到1,3甘露糖臂的至少一个GlcNAc，和连接于“三甘露糖”核心的1,6甘露糖臂的至少一个GlcNAc。复合N-聚糖也可以具有半乳糖（“Gal”）或N-乙酰半乳糖胺（“GalNAc”）残基，其任选地用唾液酸或衍生物修饰（例如，“NANA”或“NeuAc”，其中“Neu”是指神经氨酸，“Ac”是指乙酰基）。复合N-聚糖还可以具有链内的取代，其包含“二分的（bisecting）”GlcNAc和核心岩藻糖（“Fuc”）。复合N-聚糖还可以具有“三甘露糖核心”上的多分枝，常称为“多分枝聚糖”。“杂合”N-聚糖具有在三甘露糖核心的1,3甘露糖臂的末端上的至少一个GlcNAc，以及三甘露糖核心的1,6甘露糖臂上的零个或更多个甘露糖。各种N-聚糖也被称为“糖形式”。
在此使用的缩写具有本领域通用的用途，参见，例如，上述的糖类缩写。其他常见的缩写包括“PNGase”或“聚糖酶”或“糖苷酶”，其都是指肽N-糖苷酶F（EC 3.2.2.18）。
如在此使用的，术语“重组宿主细胞（“表达宿主细胞”、“表达宿主系统”、“表达系统”或简称“宿主细胞”）意图指已经导入重组载体的细胞。要理解的是，这种术语不仅仅意图指特定的主题细胞，还指这种细胞的子代。由于突变或环境影响在继承的代中可能出现某些改变，实际上，这种子代可能不与母细胞相同，但仍然包括在此处使用的术语“宿主细胞”的范围内。重组宿主细胞可以是在培养物中生长的分离的细胞或细胞系，或可以是存在于活组织或生物体中的细胞。优选的宿主细胞是酵母和真菌。
“不展现”酶活性的宿主细胞是指一种宿主细胞，其中所述酶活性已经被取消或破坏。例如，通过删除或破坏编码酶活性的基因（包括删除或破坏控制基因表达的上游或下游调节序列）可以取消或破坏酶活性；通过突变编码酶活性的基因使得编码酶活性的基因无功能来取消或破坏酶活性；通过使用酶活性化学、肽或蛋白质抑制物来取消或破坏酶活性；通过使用基于核酸的表达抑制物，例如反义DNA和siRNA来取消或破坏酶活性；以及，通过使用转录抑制物或调节因子的表达或活性的抑制物来取消或破坏酶活性，所述调节因子控制或调节编码酶活性的基因的表达。
当涉及糖蛋白制品中存在的聚糖的“摩尔百分比”时，该术语是指当蛋白质制品用PNG'ase处理、然后通过不受糖形式组成影响的方法来定量时，所释放的N-连接的寡聚糖的库中存在的特定聚糖的摩尔百分比（例如，用荧光标签例如2- 氨基苯甲酰胺标记PNG'ase释放的聚糖库，然后通过高效液相层析法或毛细管电泳分离，然后通过荧光强度定量聚糖）。例如，50摩尔百分比的NANA2Gal2GlcNAc2Man3GlcNAc2是指，释放的聚糖的百分之50是NANA2Gal2GlcNAc2Man3GlcNAc2，其余百分之50包含其他N-连接的寡聚糖。在实施方式中，糖蛋白的制品中特定聚糖的摩尔百分比将在20%到100%之间，优选的高于25%、30%、35%、40%或45%，更优选的高于50%、55%、60%、65%或70%，以及最优选的高于75%、80%、85%、90%或95%。
如在此使用的，术语“主要地”或变体如“主要”或“主要的是”将被理解为意思是，在糖蛋白用PNGase处理、通过质谱法例如MALDI-TOF MS分析释放的聚糖之后，在总的N-聚糖中具有最高摩尔百分比（%）的聚糖种类。换句话说，用语“主要地”被定义为单个实体，例如特定的糖形式，其以比任何其他的单独实体更高的摩尔百分比存在。例如，如果组合物由40摩尔百分比的A种类、35摩尔百分比的B种类和25摩尔百分比的C种类组成，该组合物主要地包含A种类。
术语“治疗有效量”是指本发明的重组促红细胞生成素的量，其给予了为患者提供益处的血细胞比容的提高。所述量将在一个个体与另一个之间不同，将取决于许多因素，包括患者的总体身体状态以及贫血的基础病因。例如，对于患有慢性肾衰竭的患者，本发明的促红细胞生成素的治疗有效量可以基于治疗的适应症在20到300单位/kg或0.5μg/kg到500μg/kg的范围内。术语“单位”是指用于评估促红细胞生成素组合物的活性的领域公知的单位。一毫克纯的促红细胞生成素大约相当于150,000单位。给药日程表可以是每周约三次到每四周或六周约一次。实际的日程表将取决于许多因素，包括向患者施用的促红细胞生成素的类型（EPO或聚乙二醇化的-EPO）以及各个患者的响应。更高的剂量范围一般不在贫血应用中使用，但是对于其他治疗应用是有用的。对于患者实现和建立合适的促红细胞生成素剂量的手段是本领域公知的和常规实践的。
患者与患者之间给予的量和给药日程表的变化，通过与量或日程表一起地提及术语“约”来包括。用于治疗的促红细胞生成素的量给出了可接受的血细胞比容提高速率，并且将血细胞比容维持在有益的水平（例如，通常至少约30%，一般在30%到36%的范围内）。当前组合物的治疗有效量可以由本领域技术人员使用公众可获得的材料和操作来容易地确定。另外，在治疗期间可以给予患者铁来维持提高的红细胞生成。给予的量可以通过本领域技术人员通常使用的方法来容易地确定。
附图说明
附图1A-J显示了从野生型菌株NRRL-Y11430（附图1A）开始的、巴斯德毕赤氏酵母菌株YGLY3159（附图1E）和菌株YGLY7113到YGLY7122（附图1I）的家系。
附图2显示了质粒pGLY6的图谱。质粒pGLY6是靶向URA5座位的整合载体，含有包含酿酒酵母转化酶基因或转录单元（ScSUC2）的核酸分子，其一侧是包含来自巴斯德毕赤氏酵母URA5基因的5'区域（PpURA5-5'）的核苷酸序列的核酸分子，另一侧是包含来自巴斯德毕赤氏酵母URA5基因的3'区域（PpURA5-3'）的核苷酸序列的核酸分子。
附图3显示了质粒pGLY40的图谱。质粒pGLY40是靶向OCH1座位的整合载体，含有包含巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元（PpURA5）的核酸分子，其侧翼是包含lacZ重复的核酸分子（lacZ重复），随后在一侧是包含来自OCH1基因的5'区域（PpOCH1-5'）的核苷酸序列的核酸分子，在另一侧是来自OCH1基因的3'区域（PpOCH1-3'）的核苷酸序列的核酸分子。
附图4显示了质粒pGLY43a的图谱。质粒pGLY43a是靶向BMT2座位的整合载体，含有包含乳酸克鲁维酵母 UDP-N-乙酰葡萄糖胺（UDP-GlcNAc）转运蛋白基因或转录单元（KlGlcNAc Transp.）的核酸分子，其邻近于侧翼是包含lacZ重复的核酸分子（lacZ重复）的、包含巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元（PpURA5）的核酸分子，所述邻近的基因一侧是包含来自BMT2基因的5'区域（PpPBS2-5'）的核苷酸序列的核酸分子，另一侧是包含来自BMT2基因的3'区域（PpPBS2-3'）的核苷酸序列的核酸分子。
附图5显示了质粒pGLY48的图谱。质粒pGLY48是靶向MNN4L1座位的整合载体，含有表达盒，所述表达盒包含编码UDP-GlcNAc转运蛋白的小鼠同源物（MmGlcNAc Transp.）开放阅读框（ORF）的核酸分子，其在5'末端可操作地连接到包含酿酒酵母GAPDH启动子(PpGAPDH Prom)的核酸分子，和在3’末端可操作地连接到包含酿酒酵母CYC终止序列（ScCYC TT）的核酸分子，邻近于侧翼是lacZ重复（lacZ重复）的、包含巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元（PpURA5）的核酸分子，其中所述表达盒整体上在一侧是包含来自巴斯德毕赤氏酵母MNN4L1基因的5'区域（PpMNN4L1-5 '）的核苷酸序列的核酸分子，并且在另一侧包含来自MNN4L1基因的3’区域(PpMNN4L1-3’)的核苷酸序列的核酸分子。
附图6显示了质粒pGLY45的图谱。质粒pGLY45是靶向PNO1/MNN4座位的整合载体，含有包含巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元（PpURA5）的核酸分子，其侧翼是包含lacZ重复的核酸分子（lacZ重复），随后在一侧是包含来自PNO1基因的5'区域（PpPNO1-5'）的核苷酸序列的核酸分子，在另一侧是来自MNN4基因的3'区域（PpMNN4-3'）的核苷酸序列的核酸分子。
附图7显示了质粒pGLY247的图谱。质粒pGLY247是靶向MET16座位的整合载体，含有包含巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元（PpURA5）的核酸分子，其侧翼是包含lacZ重复的核酸分子（lacZ重复），随后在一侧是包含来自MET16基因的5'区域（PpMET16-5'）的核苷酸序列的核酸分子，在另一侧是来自MET16基因的3'区域（PpMET16-3'）的核苷酸序列的核酸分子。
附图8显示了质粒pGLY248的图谱。质粒pGLY248是靶向URA5座位的整合载体，含有包含巴斯德毕赤氏酵母MET16基因或转录单元（PpMET16）的核酸分子，其一侧是包含来自URA5基因的5'区域（PpURA5-5'）的核苷酸序列的核酸分子，另一侧是包含来自URA5基因的3'区域（PpURA5-3'）的核苷酸序列的核酸分子。
附图9显示了质粒pGLY582的图谱。质粒pGLY582是靶向HIS1座位的整合载体，含有串联的四个表达盒，它们编码（1）酿酒酵母UDP-葡萄糖差向异构酶（ScGAL10），（2）在N-末端与酿酒酵母KRE2-s前导区肽（33）融合的人半乳糖基转移酶I（hGalT）催化结构域，（3）侧翼是lacZ重复（lacZ重复）的巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元（PpURA5），和（4）黑腹果蝇（D. melanogaster）UDP-半乳糖转运蛋白（DmUGT）。所有的表达盒侧面都是HIS1基因的5'区域（PpHIS1-5'）和HIS1基因的3'区域（PpHIS1-3'）。PMA1是巴斯德毕赤氏酵母PMA1启动子；PpPMA1 TT是巴斯德毕赤氏酵母PMA1终止序列；GAPDH是巴斯德毕赤氏酵母GADPH启动子，ScCYC TT是酿酒酵母CYC终止序列；PpOCH1 Prom是巴斯德毕赤氏酵母OCH1启动子，PpALG12 TT是巴斯德毕赤氏酵母ALG12终止序列。
附图10显示了质粒pGLY167b的图谱。质粒pGLY167b是靶向ARG1座位的整合载体，含有串联的三个表达盒，它们编码（1）在N-末端与酿酒酵母MNN2前导区肽融合的黑腹果蝇甘露糖苷酶II催化结构域（密码子优化的）（CO-KD53），（2）巴斯德毕赤氏酵母HIS1基因或转录单元，以及（3）在N-末端与酿酒酵母MNN2前导区肽融合的大鼠N-乙酰葡萄糖胺（GlcNAc）转移酶II催化结构域（密码子优化的）(CO-TC54)。所有的表达盒侧面都是ARG1基因的5'区域（PpARG1-5'）和ARG1基因的3'区域（PpARG1-3'）。PpPMA1 Prom是巴斯德毕赤氏酵母PMA1启动子；PpPMA1 TT是巴斯德毕赤氏酵母PMA1终止序列；PpGAPDH是巴斯德毕赤氏酵母GADPH启动子，ScCYC TT是酿酒酵母CYC终止序列；PpOCH1 Prom是巴斯德毕赤氏酵母OCH1启动子；PpALG12 TT是巴斯德毕赤氏酵母ALG12终止序列。
附图11显示了质粒pGLY1430的图谱。质粒pGLY1430是靶向ADE1座位、不破坏该座位表达的KINKO整合载体，含有串联的四个表达盒，它们编码（1）在N-末端与巴斯德毕赤氏酵母SEC12前导区肽融合的人GlcNAc转移酶I催化结构域（密码子优化的）（CO-NA10），（2）UDP-GlcNAc转运蛋白的小鼠同源物（MmTr），（3）在N-末端与酿酒酵母SEC12前导区肽融合的小鼠甘露糖苷酶IA催化结构域（FB）（FB8），以及（4）侧翼是lacZ重复（lacZ）的巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元（PpURA5）。所有的表达盒侧面都是ADE1基因的5'区域和ORF（ADE1 5'和ORF）和ADE1基因的3'区域（PpADE1-3'）。PpPMA1 prom是巴斯德毕赤氏酵母PMA1启动子；PpPMA1 TT是巴斯德毕赤氏酵母PMA1终止序列；SEC4是巴斯德毕赤氏酵母SEC4启动子；OCH1 TT是巴斯德毕赤氏酵母OCH1终止序列；ScCYC TT是酿酒酵母CYC终止序列；PpOCH1 Prom是巴斯德毕赤氏酵母OCH1启动子；PpALG3 TT是巴斯德毕赤氏酵母ALG3终止序列；以及PpGAPDH是巴斯德毕赤氏酵母GADPH启动子。
附图12显示了质粒pGFI165的图谱。质粒pGFI165是靶向PRO1座位、不破坏该座位的表达的KINKO整合载体，含有表达盒，它们编码（1）在N-末端与酿酒酵母αMATpre信号肽融合的李氏木霉α-1,2-甘露糖苷酶催化结构域（aMATTrMan），以将嵌合蛋白靶向分泌途径并从细胞分泌；以及（2）侧翼是lacZ重复（lacZ重复）的巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元。所有的表达盒侧面都是PRO1基因的5'区域和ORF（5' PRO1orf）以及PRO1基因的3'区域（3' PRO）。ScCYC TT是酿酒酵母CYC终止序列；PpALG3 TT是巴斯德毕赤氏酵母ALG3终止序列；以及PpGAPDH是巴斯德毕赤氏酵母GADPH启动子。
附图13显示了质粒pGLY2088的图谱。质粒pGLY2088是靶向TRP2或AOX1座位的整合载体，含有编码以下的表达盒（1）在N-末端与酿酒酵母αMATpre信号肽（alpha MF-pre）融合以将嵌合蛋白靶向分泌途径并从细胞分泌的、密码子优化的成熟人促红细胞生成素（co-hEPO），和（2）zeocin抗性蛋白（ZeocinR）。表达盒在一端侧面是巴斯德毕赤氏酵母AOX1启动子（PpAOX1 Prom），在另一端是巴斯德毕赤氏酵母TRP2基因或转录单元（PpTRP2）。ScCYC TT是酿酒酵母CYC终止序列，ScTEF Prom是酿酒酵母TEF1启动子。
附图14显示了质粒pGLY2456的图谱。质粒pGLY2456是靶向TRP2座位而不破坏座位表达的KINKO整合载体，含有编码以下的六个表达盒（1）密码子优化的小鼠CMP唾液酸转运蛋白（CO mCMP-Sia Transp），（2）密码子优化的人UDP-GlcNAc 2-差向异构酶/N-乙酰甘露糖胺激酶（CO hGNE），（3）巴斯德毕赤氏酵母ARG1基因或转录单元,（4）密码子优化的人CMP-唾液酸合酶（CO hCMP-NANA S），（5）密码子优化的人N-乙酰神经氨酸-9-磷酸合酶（CO hSIAP S），和 （6）在N-末端与酿酒酵母KRE2前导肽融合的密码子优化的小鼠a-2,6-唾液酸转移酶催化结构域（comST6-33）。所有的表达盒侧面都是TRP2基因的5'区域和ORF（PpTRP2 5'）和TRP2基因的3'区域（PpTRP2-3'）。PpPMA1 prom是巴斯德毕赤氏酵母PMA1启动子；PpPMA1 TT是巴斯德毕赤氏酵母PMA1终止序列；CYC TT是酿酒酵母CYC终止序列；PpTEF Prom是巴斯德毕赤氏酵母TEF1启动子；PpTEF TT是巴斯德毕赤氏酵母TEF1终止序列；PpALG3 TT是巴斯德毕赤氏酵母ALG3终止序列；以及pGAP是巴斯德毕赤氏酵母GAPDH启动子。
附图15显示了质粒pGLY3411（pSH1092）的图谱。质粒pGLY3411（pSH1092）是含有表达盒的整合载体，所述表达盒包含侧翼是lacZ重复（lacZ重复）的巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元（PpURA5），其一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT4基因的5'核苷酸序列（PpPBS4 5'），另一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT4基因的3'核苷酸序列（PpPBS4 3'）。
附图16显示了质粒pGLY3430（pSH1115）的图谱。质粒pGLY3430（pSH1115）是包含表达盒的整合载体，所述表达盒包含核酸分子，其编码与棉阿舒囊霉（Ashbya gossypii ） TEF1启动子（PTEF）和棉阿舒囊霉TEF1终止序列（TTEF）可操作连接的诺尔丝菌素抗性ORF（NAT），在一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT1基因的5'核苷酸序列（PBS1 5'），在另一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT1基因的3'核苷酸序列（PBS1 3'）。
附图17显示了质粒pGLY4472（pSH1186）的图谱。质粒pGLY4472（pSH1186）含有表达盒，所述表达盒包含核酸分子，其编码与棉阿舒囊霉TEF1启动子（pTEF）和棉阿舒囊霉TEF1终止序列（TRFtt）可操作连接的E.coli潮霉素B磷酸转移酶基因ORF（Hyg），在一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT3基因的5'核苷酸序列（PpPBS3 5'），另一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT3基因的3'核苷酸序列（PpPBS3 3'）。
附图18显示了质粒pGLY2057的图谱。质粒pGLY2057是靶向ADE2座位的整合质粒，含有编码侧翼是lacZ重复（lacZ重复）的巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元（PpURA5）的表达盒。所述表达盒一侧是包含来自ADE2基因的5'区域的核苷酸序列的核酸分子（PpADE2-5'），另一侧是包含来自ADE2基因的3'区域的核苷酸序列的核酸分子（PpADE2-3'）。
附图19显示了质粒pGLY2680的图谱。质粒pGLY2680是可以靶向TRP2或AOX1座位的整合载体，含有编码以下的表达盒（1）在N-末端与鸡溶菌酶信号肽（鸡溶菌酶ss）融合的、密码子优化的人成熟促红细胞生成素（co-hEPO），和（2）没有启动子的巴斯德毕赤氏酵母ADE2基因（PpADE2）。表达盒在一端侧面是巴斯德毕赤氏酵母AOX1启动子（PpAOX1 Prom），在另一端是巴斯德毕赤氏酵母TRP2基因或转录单元（PpTRP2）。ScCYC TT是酿酒酵母CYC终止序列。
附图20显示了质粒pGLY2713的图谱。质粒pGLY2713是含有邻近于表达盒的巴斯德毕赤氏酵母PNO1 ORF（PpPNO1 ORF）的整合载体，所述表达盒包含侧翼是lacZ重复（lacZ重复）的巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元（PpURA5），其一侧是巴斯德毕赤氏酵母PEP4基因的5'核苷酸序列（PpPEP4 5'），另一侧是巴斯德毕赤氏酵母PEP4基因的3'核苷酸序列（PpPEP4 3'）。
附图21显示了说明发酵过程流程的示意图。
附图22是HCA抗体Western印迹，是大约在rhEPO的大小处的蛋白质的检测，显示了在菌株YGLY3159中产生的rhEPO具有与抗HCA抗体的交叉结合活性。左侧画面显示了Commassie Blue染色的4-20% SDS-PAGE凝胶，显示了rhEPO的位置，右侧画面显示了用1:3,000稀释度的兔抗-HCA抗体（SL rProA纯化的兔：9161）探测的类似凝胶的Western印迹。结合抗-HCA抗体使用PBS中1:5,000稀释度的、与辣根过氧化酶（HRP）缀合的山羊抗兔抗体来检测。结合的二级抗体的检测使用底物3'3二氨基联苯胺（DAB）。
附图23是抗-HCA抗体Western印迹，显示了当rhEPO使用PNAGase F脱糖基化时，在菌株YGLY3159中生产的rhEPO对抗-HCA抗体的交叉结合活性不被检测出。左侧画面显示了Commassie Blue染色的4-20% SDS-PAGE凝胶，显示了糖基化的和脱糖基化形式的rhEPO的位置，右侧画面显示了如附图22中用抗-HCA抗体探测的类似凝胶的Western印迹。
附图24显示了野生型巴斯德毕赤氏酵母中以及糖工程化的巴斯德毕赤氏酵母GS2.0菌株中生产的重组抗体（rhIgG）显示了与抗-HCA抗体的交叉结合活性，在所述巴斯德毕赤氏酵母GS2.0菌株中BMT2基因被破坏或删除。左侧画面显示了Commassie Blue染色的4-20% SDS-PAGE凝胶，右侧画面显示了如附图22中用抗-HCA抗体探测的类似凝胶的Western印迹。GS 2.0是产生主要具有Man5GlcNAc2N-聚糖的糖蛋白的巴斯德毕赤氏酵母菌株。显示的GS 2.0菌株产生具有约5% Man9GlcNAc2N-聚糖的rhIgG。WT是野生型巴斯德毕赤氏酵母。
附图25是在巴斯德毕赤氏酵母中产生的rhEPO和其他蛋白质制品中的HCA检测，比较了菌株YGLY3159中生产的rhEPO与其他含有复杂糖基化模式、但不是在巴斯德毕赤氏酵母中生产的糖基化蛋白质与抗-HCA抗体的交叉结合活性。上部画面显示了Commassie Blue染色的4-20% SDS-PAGE凝胶，显示了在巴斯德毕赤氏酵母中产生的糖基化以及脱糖基化形式的rhEPO的位置，以及在酿酒酵母中产生的重组人胎球蛋白、去唾液酸胎球蛋白（asialofetuin）（除去了末端唾液酸残基的人胎球蛋白）、人血清白蛋白（HSA）和重组LEUKINE的位置，下部画面显示了如附图22中用抗-HCA抗体探测的类似凝胶的Western印迹。S30S库是通过阳离子交换层析纯化的rhEPO。
附图26显示了在菌株YGLY3159中生产、以及通过羟磷灰石层析纯化（F071401-Mix-羟磷灰石I型 40μm纯化）的的rhEPO仍然具有与抗-HCA抗体的交叉结合活性。左侧画面显示了层析洗脱库1、2和3的Commassie Blue染色的4-20% SDS-PAGE凝胶，显示了rhEPO（还原的或非还原的，左边是还原的，右边是非还原的）的位置，右侧画面显示了如附图22中用抗-HCA抗体探测的类似凝胶的Western印迹（还原的或非还原的，左边是还原的，右边是非还原的）。在画面下方显示了库1、2和3中N-聚糖的HPLC分析的结果。
附图27A显示了来自羟磷灰石库1的在菌株YGLY3159中产生的rhEPO的Q SEPHAROSE FF阴离子层析纯化的层析谱。
附图27B显示了夹心ELISA，显示了含有来自Q SEPHAROSE FF阴离子层析的rhEPO的Q SEPHAROSE FF库没有与抗-HCA抗体的可检测的交叉结合活性，而流通物含有与抗-HCA抗体的交叉结合活性。捕获抗体是抗-hEPO抗体，用在PBS中1:800起始稀释度下的兔抗-HCA抗体检测交叉结合活性，所述稀释物然后在PBS中1：1连续稀释一排结束于第11个反应孔1:819,200稀释度（反应孔12：阴性对照）。结合的抗-HCA抗体使用PBS中1:10,000稀释度的、与碱性磷酸酶（AP）缀合的山羊抗兔抗体来检测。结合的二级抗体的检测使用底物4-甲基伞形酮酰磷酸（4-MUPS）。下部的表格显示抗血清平板稀释度。
附图28显示了在菌株YGLY6661（Δ bmt2、Δ bmt4和Δ bmt1）和YGLY7013（Δ bmt2和Δ bmt4）中产生、通过BlueSEPHAROSE 6 FF层析（Blue库）捕获的的rhEPO仍然具有与抗-HCA抗体的交叉结合活性（第44周-rhEPO-Blue Sepharose 6 FF ,Blue Blue 库+/-PNGase F）。左侧画面显示了有（+）和没有（-）PNGase F处理的Blue库的Commassie蓝染色的4-20% SDS-PAGE凝胶。中央画面显示了用1:1,000稀释度与HRP缀合的抗-hEPO抗体探测的、DAB作为底物的相似凝胶的Western印迹。右侧画面显示了如附图22中用抗-HCA抗体探测的类似凝胶的Western印迹。
附图29在检测与抗-HCA抗体交叉结合活性的夹心ELISA中显示了在菌株YGLY6661（Δ bmt2、Δ bmt4和Δ bmt1）和YGLY7013（Δ bmt2和Δ bmt4）中产生、通过Blue SEPHAROSE 6 FF层析捕获的（Blue库）rhEPO仍然具有与抗-HCA抗体的交叉结合活性。ELISA如附图27B中的进行。右侧的表格显示抗血清平板稀释度。。
附图30显示了夹心ELISA，用于检测在菌株YGLY6661（Δ bmt2、Δ bmt4和Δ bmt1）以及YGLY7013（Δ bmt2和Δ bmt4）中产生的、通过Blue SEPHAROSE 6 FF层析捕获的、通过羟磷灰石层析纯化的（HA库1）的rhEPO与抗-HCA抗体的交叉结合活性。来自菌株YGLY6661的HA库1中的rhEPO没有与抗-HCA抗体的可检测的交叉结合活性。ELISA如附图27B中的进行。右侧的表格显示抗血清平板稀释度。。
附图31显示了在菌株YGLY6661（Δ bmt2、Δ bmt4和Δ bmt1）中产生的、通过Blue SEPHAROSE 6 FF层析捕获的（Blue库）rhEPO仍然具有与抗-HCA抗体的交叉结合活性（第45周-rhEPO-Blue Sepharose 6 FF ,Blue 库+/-PNGase F）。左侧画面显示了有（+）和没有（-）PNGase F处理的Blue库的Commassie Blue染色的4-20% SDS-PAGE凝胶。中间画面显示了用1:1,000稀释度下与HRP缀合的抗-hEPO抗体探测的、DAB作为底物的类似凝胶的Western印迹。右侧画面显示了如附图22中用抗-HCA抗体探测的类似凝胶的Western印迹。
附图32A显示了从菌株YGLY7361-7366（全为Δ bmt2、Δ bmt4、Δ bmt1和Δ bmt3）制备的、有（+）和没有（-）PNGase F处理的Blue Sepaharose 6 FF捕获库（Blue库）的Commassie Blue染色的4-20% SDS-PAGE凝胶（第46a周-SixFors-四重BMT敲除-Blue库+/-PNGase F处理）。菌株在500 mL SixFors发酵器中生长。
附图32B显示了从菌株YGLY7393-7398（全为Δ bmt2、Δ bmt4、Δ bmt1和Δ bmt3）制备的、有（+）和没有（-）PNGase F处理的Blue Sepaharose 6 FF捕获库（Blue库）的Commassie Blue染色的4-20% SDS-PAGE凝胶（第46b周-SixFors-四重BMT敲除-Blue库+/-PNGase F处理）。菌株在500 mL SixFors发酵器中生长。
附图33显示了夹心ELISA的结果，其用于检测在菌株YGLY7361-7366（全为Δ bmt2、Δ bmt4、Δ bmt1和Δ bmt3）以及YGLY7393-7398（全为Δ bmt2、Δ bmt4、Δ bmt1和Δ bmt3）中产生的、通过Blue SEPHAROSE 6 FF层析捕获的（Blue库）rhEPO与抗-HCA抗体的交叉结合活性（46周-SixFors-四重BMT敲除 -Blue库）。仅来自菌株YGLY7363和YGLY7365的 Blue库中的rhEPO具有与抗-HCA抗体的可检测的交叉结合活性。ELISA如附图27B中的进行。左侧画面是46a周，右侧画面是46b周。最下部的表格显示抗血清平板稀释度。
附图34以图表形式显示了在从菌株YGLY7361-7366和YGLY7393-7398（全为Δ bmt2、Δ bmt4、Δ bmt1和Δ bmt3）制备的Blue库中rhEPO上N-聚糖的HPLC分析的结果（第46a & b周-SixFors-四重BMT敲除 -Blue库）。“双”是指在双分枝N-聚糖的两个臂上都被唾液酸化的N-聚糖。“单”是指在双分枝N-聚糖的仅一条臂上被唾液酸化的N-聚糖。“中性的”是指不被唾液酸化的N-聚糖。
附图35A显示了从菌株YGLY7362、YGLY7366、YGLY7396和YGLY7398（全为Δ bmt2、Δ bmt4、Δ bmt1和Δ bmt3）以及YGLY3159（Δ bmt2）制备的Blue SEPHAROSE 6 FF层析（Blue库）和羟磷灰石纯化库（HA库1）的Commassie Blue染色的4-20% SDS-PAGE凝胶（第50周-四重BMT敲除菌株筛选rhEPO Blue库和HA库1s）。
附图35B显示了从菌株YGLY7362、YGLY7366、YGLY7396和YGLY7398（全为Δ bmt2、Δ bmt4、Δ bmt1和Δ bmt3）以及YGLY3159（Δ bmt2）制备的并如附图22中用抗-HCA抗体探测的、Blue SEPHAROSE 6 FF层析（Blue库）和羟磷灰石纯化库（HA库1）的4-20% SDS-PAGE凝胶的Western印迹（第50周-四重BMT敲除菌株筛选rhEPO Blue库和HA库1s）。与HCP的交叉反应仅在YGLY 3159中。
附图36是SDS-PAGE凝胶-Coomassie Blue染色的四重 BMT敲除菌株筛选（F080240-YGLY 7398-Blue库/HA库1），显示了在菌株YGLY7398（Δ bmt2、Δ bmt4、Δ bmt1和Δ bmt3）中生产的、用Blue SEPHAROSE 6 FF层析捕获的（Blue库）和通过羟磷灰石层析纯化的（HA库1）rhEPO没有与抗-HCA抗体的可检测的交叉结合活性。左侧画面显示了与从菌株YGLY3159制备的rhEPO相比，从菌株YGLY7398制备的Blue库和HA库1的Commassie Blue染色的4-20% SDS-PAGE凝胶。中间画面显示了如附图22中用抗-HCA抗体（1:3000）探测的类似凝胶的Western印迹。中间画面显示了如附图22中用抗-HCA抗体探测的类似凝胶的Western印迹，只是抗-HCA抗体来自另一种抗体制品（1:2,000的GiF多克隆兔::6316）。
附图37显示了夹心ELISA的结果，用于检测菌株YGLY7113-7122（Δ bmt2、Δ bmt4、Δ bmt1和Δ bmt3）中生产的以及通过Blue SEPHAROSE 6 FF层析捕获的（Blue库）rhEPO与抗-HCA抗体的交叉结合活性（SixFors-四重BMT敲除-Blue库）。菌株YGLY7118显示了与抗-HCA抗体的非常低的可检测的交叉结合活性。其他菌株都没有显示任何与抗-HCA抗体的可检测的交叉结合活性。ELISA如附图27B中的进行。最下部的表格显示抗血清平板稀释度。
附图38以图表形式显示了在从菌株YGLY7113-7122（全为Δ bmt2、Δ bmt4、Δ bmt1和Δ bmt3）制备的Blue库中的rhEPO上N-聚糖的HPLC分析结果（第48周-SixFors-四重 BMT敲除-Blue库）。“双”是指在双分枝N-聚糖的两个臂上都被唾液酸化的N-聚糖。“单”是指在双分枝N-聚糖的仅一条臂上被唾液酸化的N-聚糖。“中性的”是指不被唾液酸化的N-聚糖。
附图39A显示了从菌株YGLY7115、YGLY7117、YGLY7394、YGLY7395和YGLY7120（全为Δ bmt2、Δ bmt4、Δ bmt1和Δ bmt3）和 YGLY3159（Δ bmt2）制备的Blue SEPHAROSE 6 FF层析（Blue库）和羟磷灰石纯化库（HA库1）的Commassie Blue染色的4-20% SDS-PAGE凝胶（第51周-四重 BMT敲除菌株筛选rhEPO Blue库和HA库1s）。
附图39B显示了从菌株YGLY7115、YGLY7117、YGLY7394、YGLY7395和YGLY7120（全为Δ bmt2、Δ bmt4、Δ bmt1和Δ bmt3）以及YGLY3159（Δ bmt2）制备的并如附图22中用抗-HCA抗体探测的、Blue SEPHAROSE 6 FF层析（Blue库）和羟磷灰石纯化库（HA库1）的4-20% SDS-PAGE凝胶的Western印迹（第51周-四重 BMT敲除菌株筛选rhEPO Blue库和HA库1s）。
附图40A显示了YGLY3159（Δ bmt2）产生的以及通过羟磷灰石柱层析纯化的rhEPO的N-聚糖的HPLC痕迹（即，HA库1的分析）。
附图40B显示了YGLY7117（Δ bmt2、Δ bmt4、Δ bmt1和Δ bmt3）中产生的已经通过羟磷灰石柱层析纯化的rhEPO的N-聚糖的HPLC痕迹（即，HA库1的分析）。
具体实施方式
本发明提供了在甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母中生产蛋白质和糖蛋白的方法，所述蛋白质和糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。宿主细胞抗原还可以包括可能被重组蛋白质组合物带出的残余的宿主细胞蛋白质和细胞壁污染物，它们可能是免疫原性的，可以改变治疗蛋白质的治疗效力或安全性。与针对宿主细胞抗原制得的抗体具有交叉反应性的组合物是指该组合物含有某些污染的宿主细胞材料，通常是具有磷酸甘露糖残基或β-甘露糖残基等等的N-聚糖。巴斯德毕赤氏酵母的野生型菌株将产生具有这些N-聚糖结构的糖蛋白。针对总宿主细胞蛋白质制得的抗体制品预计将包括针对这些结构的抗体。然而，不含有N-聚糖的蛋白质可能同时包括与针对宿主细胞制得的抗体交叉反应的污染物质（蛋白质等）。
所述方法和宿主细胞允许产生重组治疗蛋白质和糖蛋白，与此处公开的未修饰的菌株中生产的相比，其在施用所述重组治疗蛋白质和糖蛋白的个体中具有引发不良反应的降低的风险。不良反应包括在个体中引发不希望的免疫反应，或与个体中的位点不希望的或不适当的结合、在其中聚集、或与之相互作用，其一般不利地影响个体的健康。在施用所述治疗蛋白质或糖蛋白的个体中引发不良反应的风险，对于要长期施用给个体的蛋白质或糖蛋白是特别关注的（例如，意图在延长的时间期上进行的治疗）。根据此处的方法生产的重组治疗蛋白质或糖蛋白没有与针对宿主细胞抗原的抗体的可检测的交叉结合活性，因而，具有在施用所述重组蛋白质或糖蛋白的个体中引发不良反应的降低的风险。所述方法和宿主细胞对于生产具有结合清除因子的更低可能性的重组蛋白质或糖蛋白也是有用的。
发明人发现，在巴斯德毕赤氏酵母的某些菌株中生产的特定糖蛋白可能具有在其上的N-或O-聚糖，其中上面的一个或更多个甘露糖残基是处于β1,2-连键中。用于治疗用途的并且上面具有一个或更多个β1,2-连接的甘露糖残基的糖蛋白提供了在施用该糖蛋白的个体中引发不希望的免疫反应的风险。这些β-连接的甘露糖残基可以使用针对总宿主细胞抗原制得的抗体来检测。由于不能预测哪些治疗糖蛋白将具有包含一个或更多个β1,2-连接的甘露糖残基的N-或O-聚糖，以及确实具有上面包含β1,2-连接的甘露糖残基的N-或O-聚糖的治疗糖蛋白是否将在接受该糖蛋白的个体中产生不希望的免疫原性反应，期望的是在巴斯德毕赤氏酵母菌株中产生治疗性糖蛋白，所述菌株已经被遗传工程化以缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合。这样的菌株可以通过删除或破坏巴斯德毕赤氏酵母β-甘露糖基转移酶（BMT）基因家族中的四种已知的β-甘露糖基转移酶（Bmtp）中的至少三种的活性来产生。如在此显示的，包括至少三种这些BMT基因的删除或破坏的巴斯德毕赤氏酵母菌株提供了可以产生蛋白质或糖蛋白的巴斯德毕赤氏酵母菌株，所述蛋白质或糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合。这些菌株在生产治疗蛋白质和糖蛋白中是有用的。已经展现了N-和/或O-聚糖上β-甘露糖结构的存在引发免疫反应。
巴斯德毕赤氏酵母和白色念珠菌中β-甘露糖基转移酶基因的鉴定已经在美国专利No. 7,465,577和Mille et al., J. Biol. Chem. 283 :9724-9736（2008）中报道了，其公开了β-甘露糖基化受到被称为AMR2或 BMT2的β-甘露糖基转移酶的影响，巴斯德毕赤氏酵母中该基因的破坏或删除产生了能够生产具有降低的β-甘露糖基化的糖蛋白的重组宿主。该专利还公开了基因的三种同源物，BMT1、BMT3和BMT4。然而，当研究某些糖蛋白制品与针对宿主细胞抗原制得的抗体的交叉结合活性的来源时，发明人发现，交叉结合活性是已经破坏或删除了BMT2基因的重组巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞的某些菌株中存留的残余β-甘露糖基化的结果。因而，这些重组宿主细胞中产生的异源糖蛋白具有仍然含β-甘露糖残基的N-聚糖。这些β-甘露糖残基在获自这些重组宿主细胞的培养物的异源糖蛋白的ELISA和Western印迹中用针对宿主细胞抗原（HCA）制得的抗体是可检测的。抗-HCA抗体是针对野生型巴斯德毕赤氏酵母菌株或NORF菌株产生的多克隆抗体，NORF菌株是以与生产异源糖蛋白的重组宿主细胞相同方式构建的重组宿主细胞，只是编码异源蛋白质的开放阅读框（ORF）被省略了。对于在巴斯德毕赤氏酵母中产生的治疗性糖蛋白，这些残余的β-甘露糖残基代表了在疾病或病症的治疗中接受该治疗蛋白质的某些个体中引发免疫反应的风险。本发明提供了在巴斯德毕赤氏酵母中生产糖蛋白的方法，所述糖蛋白不含有任何可检测的β-甘露糖基化并且因而不与针对宿主细胞抗原制得的抗体交叉结合。
BMT1 、 BMT2和BMT3展现了高度的序列同源性，而BMT4是较低程度上同源的，被认为是帽化α-甘露糖基转移酶。然而，BMT家族的所有四个成员看起来涉及具有β-连接的甘露糖结构的N-和/或O-聚糖的合成。虽然来自删除BMT2基因的巴斯德毕赤氏酵母菌株中产生的测试蛋白质的N-聚糖的MALDI-TOF可能未能检测出β-甘露糖基化，在此基于敏感抗体的分析能够检出Δ bmt2菌株中的β-甘露糖基化。因而，在此教导的基于抗-HCA抗体的检测方法显示了，BMT1和BMT3基因以及任选的BMT4基因的同时的删除或破坏是除去所有可检测的β-甘露糖结构所需的。编码三种β-甘露糖基转移酶的基因的删除或破坏可以通过以下实现（1）基因（包括启动子序列、开放阅读框（ORF）和/或转录终止序列）的完全或部分敲除；（2）ORF中阅读框移位的引入；（3）启动子的失活或调节；（4）通过siRNA或反义RNA的信息敲低；（5）或使用化学抑制物。结果是产生能够生产缺乏与抗-HCA抗体的可检测的交叉结合活性的糖蛋白的宿主细胞。
为了例示生产缺乏与抗-HCA抗体的可检测的交叉结合活性的糖蛋白的方法，已经被遗传地工程化以缺乏BMT2表达或活性、并能够产生具有唾液酸封端的双分枝N-聚糖的重组成熟的人促红细胞生成素（EPO）的巴斯德毕赤氏酵母的菌株，被进一步遗传工程化来缺乏BMT1和/或BMT3和/或BMT4基因的表达。其中仅BMT2基因的表达被破坏的菌株产生了具有与抗-HCA抗体的一定可检测的交叉结合活性的重组成熟人EPO。由于EPO分子上β-连接的甘露糖残基的存在发现了可检测的交叉结合活性（参见附图22-27B，实施例6）。当编码BMT1和BMT4的基因在菌株中被破坏或删除时，产生的EPO仍然具有与抗-HCA抗体的可检测的交叉结合活性（参见附图28-31）。然而，当BMT1、BMT2、BMT3和BMT4基因被破坏或删除时，大部分菌株产生了糖基化的重组人EPO，其缺乏与抗-HCA抗体的可检测的交叉结合活性，因而缺乏可检测的β-甘露糖残基（例如参见附图33和35B）。
因而，本发明进一步提供了生产重组蛋白质或糖蛋白的方法，所述重组蛋白质或糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性，所述方法涉及构建预期用于生产所述重组蛋白质的宿主细胞以进一步不与显示各种组合的β-甘露糖基转移酶活性。例如，宿主细胞被构建，其不显示对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性。缺乏显示β-甘露糖基转移酶2活性的宿主细胞用于生产所述重组蛋白质或糖蛋白，其然后利用针对菌株的NORF版本制备的抗体、通过Western印迹或ELISA来评估。NORF菌株是与宿主菌株相同的菌株，只是它缺乏编码重组糖蛋白的开放阅读框。如果通过所述宿主细胞产生的重组蛋白质或糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体可检测的结合，则宿主细胞对于生产缺乏与针对宿主细胞抗原的抗体的交叉结合活性的重组蛋白质或糖蛋白是有用的。然而，如果检测到可检测的交叉结合活性，则宿主细胞被进一步操纵以不显示对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶1、β-甘露糖基转移酶3或β-甘露糖基转移酶4活性。例如，缺乏β-甘露糖基转移酶2活性的宿主细胞被进一步操纵以缺乏β-甘露糖基转移酶1活性。所述宿主细胞被用于生产重组蛋白质或糖蛋白，其然后使用针对菌株的NORF版本制得的抗体通过Western印迹或ELISA来评估。如果通过所述宿主细胞产生的重组蛋白质或糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体可检测的结合，则宿主细胞对于生产缺乏与针对宿主细胞抗原的抗体的交叉结合活性的重组蛋白质或糖蛋白是有用的。
然而，如果检测到可检测的交叉结合活性，则宿主细胞被进一步操纵以不展示β-甘露糖基转移酶3活性或β-甘露糖基转移酶4活性。例如，缺乏β-甘露糖基转移酶2活性和β-甘露糖基转移酶1活性的宿主细胞被进一步操纵以缺乏对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶3活性。所述宿主细胞被用于生产蛋白质或重组糖蛋白，其然后使用针对菌株的NORF版本制得的抗体通过Western印迹或ELISA来评估。如果通过所述宿主细胞产生的重组蛋白质或糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体可检测的结合，则宿主细胞对于生产缺乏与针对宿主细胞抗原的抗体缺乏交叉结合活性的重组蛋白质或糖蛋白是有用的。
然而，如果检测到可检测的交叉结合活性，则菌株被进一步操纵以不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶4活性。宿主细胞被用于生产重组蛋白质或糖蛋白，其然后使用针对菌株的NORF版本制得的抗体通过Western印迹或ELISA来评估，以确认重组蛋白质或糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测结合。通过进一步的实例，构建了巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其中不同组合的BMT基因被删除或破坏。例如，构建巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其具有BMT2基因的破坏或删除。Δ bmt2宿主细胞被用于生产重组蛋白质或糖蛋白，其然后使用针对菌株的NORF版本制得的抗体通过Western印迹或ELISA来评估。NORF菌株是与宿主菌株相同的菌株，只是它缺乏编码重组糖蛋白的开放阅读框。如果通过所述Δ bmt2宿主细胞产生的重组蛋白质或糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体可检测的结合，则BMT2删除或破坏足以允许宿主细胞生产缺乏与针对宿主细胞抗原的抗体的交叉结合活性的重组蛋白质或糖蛋白。然而，如果检测到可检测的交叉结合活性，则宿主细胞被进一步操纵以具有BMT1、BMT3或BMT4基因的删除。例如，具有BMT2基因的破坏或删除的宿主细胞被进一步操纵以具有BMT1基因的删除或破坏。Δ bmt2 Δ bmt1宿主细胞被用于生产重组蛋白质或糖蛋白，其然后通过使用针对菌株的NORF版本制得的抗体通过Western印迹或ELISA来评估。如果Δ bmt2 Δ bmt1宿主细胞产生的重组蛋白质或糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的结合，则BMT1和 BMT2删除或破坏足以允许宿主细胞产生缺乏与针对宿主细胞抗原的抗体的交叉结合活性的重组蛋白质或糖蛋白。
然而，如果检测到可检测的交叉结合活性，则宿主细胞被进一步操纵以具有BMT3或BMT4基因的删除。例如，具有BMT1和BMT2基因的破坏或删除的宿主细胞被进一步操纵以具有BMT3基因的删除或破坏。Δ bmt2 Δ bmt1 Δ bmt3宿主细胞被用于生产蛋白质或重组糖蛋白，其然后通过使用针对菌株的NORF版本制得的抗体通过Western印迹或ELISA来评估。如果Δ bmt2 Δ bmt1 Δ bmt3宿主细胞产生的重组蛋白质或糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的结合，则BMT1、BMT2和BMT3删除或破坏足以允许宿主细胞产生缺乏与针对宿主细胞抗原的抗体的交叉结合活性的重组蛋白质或糖蛋白。
然而，如果检测到可检测的交叉结合活性，则宿主细胞被进一步操纵以具有BMT4基因的删除。Δ bmt2 Δ bmt1 Δ bmt3 Δ bmt4宿主细胞被用于生产重组蛋白质或糖蛋白，其然后使用针对菌株的NORF版本制得的抗体通过Western印迹或ELISA来评估，以确认重组蛋白质或糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测结合。本发明进一步提供了重组甲基营养型酵母宿主细胞例如巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其中所述宿主细胞不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性，不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶1活性或β-甘露糖基转移酶3活性的至少一种，并且其包括编码重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性、β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性。在进一步的方面中，本发明提供了重组宿主细胞，其不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性、β-甘露糖基转移酶1活性、β-甘露糖基转移酶3活性和β-甘露糖基转移酶4活性，并且其包括编码重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子。
本发明进一步提供了生产重组蛋白质或糖蛋白的一般方法，所述重组蛋白质或糖蛋白缺乏与抗宿主细胞抗原抗体的可检测的交叉结合活性，包括提供重组甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性，不展现对于N-聚糖或O-聚糖的选自β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性的至少一种活性，并且其包括编码重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子；在对表达所述重组蛋白质或糖蛋白有效的条件下在培养基中生长所述宿主细胞；以及从所述培养基中回收所述重组蛋白质或糖蛋白，以产生缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性的所述重组蛋白质或糖蛋白。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞缺乏对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性、β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性。
在进一步的方面中，本发明提供了生产重组蛋白质或糖蛋白的一般方法，所述重组蛋白质或糖蛋白缺乏与抗宿主细胞抗原抗体的可检测的交叉结合活性，所述方法包括提供重组甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性、β-甘露糖基转移酶1活性、β-甘露糖基转移酶3活性和β-甘露糖基转移酶4活性，并且其包括编码重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子；在对表达所述重组蛋白质或糖蛋白有效的条件下在培养基中生长所述宿主细胞； 以及从所述培养基中回收所述重组蛋白质或糖蛋白，以产生缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性的所述重组蛋白质或糖蛋白。
本发明进一步提供了重组甲基营养型酵母宿主细胞例如巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其中编码对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性的基因已经被删除或破坏，编码对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶1活性或β-甘露糖基转移酶3活性的至少一种基因已经被删除或破坏，以及其包括编码重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子。在进一步的实施方式中，编码对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性、β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性的基因已经被删除或破坏。在进一步的方面中，本发明提供了重组宿主细胞，编码对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性、β-甘露糖基转移酶1活性、β-甘露糖基转移酶3活性和β-甘露糖基转移酶4活性的基因被删除或破坏，并且其包括编码重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子。
本发明进一步提供了生产重组蛋白质或糖蛋白的一般方法，所述重组蛋白质或糖蛋白缺乏与抗宿主细胞抗原抗体的可检测的交叉结合活性，所述方法包括提供重组甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其中编码对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性的基因被删除或破坏，以及编码选自对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性的活性的至少一种基因被删除或破坏，以及其包括编码重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子；在对表达所述重组蛋白质或糖蛋白有效的条件下在培养基中生长所述宿主细胞；以及从所述培养基中回收所述重组蛋白质或糖蛋白，以产生缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性的所述重组蛋白质或糖蛋白。在进一步的实施方式中，编码对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性、β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性的基因被删除或破坏。
在进一步的方面中，本发明提供了生产重组蛋白质或糖蛋白的一般方法，所述重组蛋白质或糖蛋白缺乏与抗宿主细胞抗原抗体的可检测的交叉结合活性，所述方法包括提供重组甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其中编码对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性、β-甘露糖基转移酶1活性、β-甘露糖基转移酶3活性和β-甘露糖基转移酶4活性的基因被删除或破坏，以及其包括编码重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子；在对表达所述重组蛋白质或糖蛋白有效的条件下在培养基中生长所述宿主细胞；以及从所述培养基中回收所述重组蛋白质或糖蛋白，以产生缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性的所述重组蛋白质或糖蛋白。
本发明进一步提供了重组巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其中BMT2基因与BMT1基因和BMT3基因的至少一个被删除或破坏，并且其包括编码重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子。在进一步的实施方式中，BMT2基因、BMT1基因和BMT3基因被删除或破坏。在进一步的方面中，本发明提供了重组巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其中BMT1基因、BMT2基因、BMT3基因和BMT4基因被删除或破坏，以及其包括编码重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子。
本发明进一步提供了生产重组蛋白质或糖蛋白的一般方法，所述重组蛋白质或糖蛋白缺乏与抗宿主细胞抗原抗体的可检测的交叉结合活性，所述方法包括提供重组巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其中BMT2基因与BMT1基因和BMT3基因的至少一个被删除或破坏，并且其包括编码重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子；在对表达所述重组蛋白质或糖蛋白有效的条件下在培养基中生长所述宿主细胞； 以及从所述培养基中回收所述重组蛋白质或糖蛋白，以产生缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性的所述重组蛋白质或糖蛋白。在进一步的实施方式中，BMT2基因、BMT1基因和BMT3基因被删除或破坏。
在进一步的方面中，本发明提供了生产重组蛋白质或糖蛋白的一般方法，所述重组蛋白质或糖蛋白缺乏与抗宿主细胞抗原抗体的可检测的交叉结合活性，所述方法包括提供重组巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其中BMT1基因、BMT2基因、BMT3基因和BMT4基因被删除或破坏，以及其包括编码重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子；在对表达所述重组蛋白质或糖蛋白有效的条件下在培养基中生长所述宿主细胞；以及从所述培养基中回收所述重组蛋白质或糖蛋白，以产生缺乏与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性的所述重组蛋白质或糖蛋白。
本发明进一步提供了重组巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其中BMT2基因与BMT1基因和BMT3基因的至少一个被删除或破坏，并且其包括编码重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子。在进一步的实施方式中，BMT2基因、BMT1基因和BMT3基因被删除或破坏。在进一步的方面中，本发明提供了重组巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其中BMT1基因、BMT2基因、BMT3基因和BMT4基因被删除或破坏，以及其包括编码重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子。
一般地所述重组蛋白质或糖蛋白是治疗性糖蛋白。期待的治疗性糖蛋白的实例包括但不限于促红细胞生成素（EPO）；细胞因子，例如干扰素α、干扰素β、干扰素γ和干扰素ω；以及粒细胞-集落刺激因子（GCSF）；GM-CSF；凝血因子，例如因子VIII、因子IX和人蛋白质C；抗凝血酶III；凝血酶；可溶的IgE受体α-链；免疫球蛋白，例如IgG、IgG片段、IgG融合物和IgM；免疫粘附素和其他Fc融合蛋白，例如可溶的TNF受体-Fc融合蛋白；RAGE-Fc融合蛋白；白细胞介素；尿激酶；胃促胰酶；和脲胰蛋白酶抑制物；IGF-结合蛋白；表皮生长因子；生长激素释放因子；annexin V融合蛋白；血管抑素；血管内皮生长因子-2；骨髓祖代抑制因子-1；护骨素（osteoprotegerin）；α-1-抗胰蛋白酶；α-feto蛋白质；DNase II；人血纤蛋白溶解酶原的kringle 3；葡糖脑苷脂酶；TNF结合蛋白1；促滤泡激素；细胞毒T淋巴细胞相关抗原4–Ig；跨膜激活物和钙调节物和亲环蛋白（cyclophilin）配体；胰高血糖素样蛋白1；和IL-2受体激动剂。
在本发明的特定的方面中，编码重组蛋白质或糖蛋白的核酸分子是密码子优化的，以增强宿主细胞中所述重组蛋白质或糖蛋白的表达。例如，如实施例中所示，编码人促红细胞生成素的成熟形式的核酸分子被密码子优化，为了在甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母菌株中增强的表达，所述酵母已经被遗传工程化以产生包含双分枝N-聚糖的促红细胞生成素变体，其中主要的糖形式包含两个都被末端唾液酸化的分枝。
本发明进一步提供了包含一种或更多种蛋白质或糖蛋白的组合物，所述蛋白质或糖蛋白缺乏与针对宿主细胞抗原的抗体的可检测的交叉结合活性，所述宿主细胞抗原是使用此处的方法以及在此处描述的宿主细胞中产生的。所述组合物可以进一步包括药学上可接受的载体和盐。适合的宿主细胞包括任何下述宿主细胞，其包含巴斯德毕赤氏酵母BMT1、BMT2、BMT3和/或BMT4基因的同源物。当前，这样的宿主细胞的实例包括白色念珠菌和甲基营养型酵母巴斯德毕赤氏酵母。因而，在本发明的特别的方面中，宿主细胞是甲基营养型酵母，例如巴斯德毕赤氏酵母，以及其突变体和其遗传工程化的变体。期待用于本发明的甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母可以被遗传地修饰，从而它们表达糖蛋白，在所述糖蛋白中糖基化模式是人类样的或人源化的。照这样，可以生产糖蛋白组合物，其中特定的期望糖形式在组合物中是主要的。如US2004/0018590中描述的，这可以通过消除选定的内源糖基化酶、和/或遗传工程化宿主细胞、和/或提供外源的酶以模拟全部或部分哺乳动物糖基化途径来实现。如果希望，可以进行糖基化的其他遗传工程化，从而可以有或者没有核心岩藻糖基化地产生糖蛋白。低等真核宿主细胞的使用是进一步有益的，在于这些细胞能够产生高度同质的糖蛋白组合物，从而糖蛋白的主要糖形式可以在组合物的糖蛋白中以大于三十摩尔百分比存在。在特别的方面中，主要糖形式可以以组合物中存在的糖蛋白的大于四十摩尔百分比、五十摩尔百分比、六十摩尔百分比、七十摩尔百分比，以及最优选的大于八十摩尔百分比存在。这可以如Gerngross等，美国专利No. 7,029,872和美国专利No. 7,449,308所描述的通过消除选定的内源糖基化酶和/或提供外源的酶来实现。例如，可以选择或工程化宿主细胞来耗尽1,6-甘露糖基转移酶活性，不然其将在糖蛋白的N-聚糖上添加甘露糖残基。在一个实施方式中，宿主细胞进一步包括与细胞靶向信号肽融合的α1,2-甘露糖苷酶催化结构域，所述细胞靶向信号肽通常不与所述催化结构域相连，并且被选择以将α1,2-甘露糖苷酶活性靶向宿主细胞的ER或高尔基体。重组糖蛋白穿过宿主细胞的ER或高尔基体产生了包含Man5GlcNAc2糖形式的重组糖蛋白，例如，主要包含Man5GlcNAc2糖形式的重组糖蛋白组合物。例如，美国专利No. 7,029,872、美国专利No. 7,449,308和美国公开的专利申请No. 2005/0170452公开了能够生产包含Man5GlcNAc2糖形式的糖蛋白的低等真核生物宿主细胞。
在进一步的实施方式中，紧接地前述的宿主细胞进一步包括与细胞靶向信号肽融合的N-乙酰葡糖氨基转移酶I（GlcNAc转移酶I或GnT I）催化结构域，所述信号肽通常不与该催化结构域相连，并且被选择以将GlcNAc转移酶I活性靶向宿主细胞的ER或高尔基体。重组糖蛋白穿过宿主细胞的ER或高尔基体产生了包含GlcNAcMan5GlcNAc2糖形式的重组糖蛋白，例如，主要包含GlcNAcMan5GlcNAc2糖形式的重组糖蛋白组合物。例如，美国专利No. 7,029,872、美国专利No. 7,449,308和美国公开的专利申请No. 2005/0170452公开了能够生产包含GlcNAcMan5GlcNAc2糖形式的糖蛋白的低等真核生物宿主细胞。上述细胞中生产的糖蛋白可以用氨基己糖苷酶体外处理，来产生包含Man5GlcNAc2糖形式的重组糖蛋白。
在进一步的实施方式中，紧接地前述的宿主细胞进一步包括与细胞靶向信号肽融合的甘露糖苷酶II催化结构域，所述信号肽通常不与该催化结构域相连，并且被选择以将甘露糖苷酶II活性靶向宿主细胞的ER或高尔基体。重组糖蛋白穿过宿主细胞的ER或高尔基体产生了包含GlcNAcMan3GlcNAc2糖形式的重组糖蛋白，例如，主要包含GlcNAcMan3GlcNAc2糖形式的重组糖蛋白组合物。美国专利No. 7,029,872和美国公开的专利申请No. 2004/0230042公开了表达甘露糖苷酶II酶、并且能够生产主要具有GlcNAc2Man3GlcNAc2糖形式的糖蛋白的低等真核生物宿主细胞。上述细胞中生产的糖蛋白可以用氨基己糖苷酶体外处理，来产生包含Man3GlcNAc2糖形式的重组糖蛋白。
在进一步的实施方式中，紧接地前述的宿主细胞进一步包括与细胞靶向信号肽融合的N-乙酰葡糖氨基转移酶II（GlcNAc转移酶II或GnT II）催化结构域，所述信号肽通常不与该催化结构域相连，并且被选择以将GlcNAc转移酶II活性靶向宿主细胞的ER或高尔基体。重组糖蛋白穿过宿主细胞的ER或高尔基体产生了包含GlcNAc2Man3GlcNAc2糖形式的重组糖蛋白，例如，主要包含GlcNAc2Man3GlcNAc2糖形式的重组糖蛋白组合物。例如，美国专利No. 7,029,872和美国公开的专利申请No. 2004/0018590和2005/0170452公开了能够生产包含GlcNAc2Man3GlcNAc2糖形式的糖蛋白的低等真核生物宿主细胞。上述细胞中生产的糖蛋白可以用氨基己糖苷酶体外处理，来产生包含Man3GlcNAc2糖形式的重组糖蛋白。
在进一步的实施方式中，紧接地前述的宿主细胞进一步包括与细胞靶向信号肽融合的半乳糖基转移酶催化结构域，所述信号肽通常不与该催化结构域相连，并且被选择以将半乳糖基转移酶活性靶向宿主细胞的ER或高尔基体。重组糖蛋白穿过宿主细胞的ER或高尔基体产生了包含GalGlcNAc2Man3GlcNAc2 或Gal2GlcNAc2Man3GlcNAc2糖形式的重组糖蛋白，或其混合物，例如，主要包含GalGlcNAc2Man3GlcNAc2糖形式或Gal2GlcNAc2Man3GlcNAc2糖形式或其混合物的重组糖蛋白组合物。美国专利No. 7,029,872和美国公开的专利申请No. 2006/0040353公开了能够生产包含Gal2GlcNAc2Man3GlcNAc2糖形式的糖蛋白的低等真核生物宿主细胞。上述细胞中生产的糖蛋白可以用半乳糖苷酶体外处理，来产生包含GlcNAc2Man3GlcNAc2糖形式的重组糖蛋白,例如主要包含GlcNAc2Man3GlcNAc2糖形式的重组糖蛋白组合物。
在进一步的实施方式中，紧接地前述的宿主细胞进一步包括与细胞靶向信号肽融合的唾液酸转移酶催化结构域，所述信号肽通常不与该催化结构域相连，并且被选择以将唾液酸转移酶活性靶向宿主细胞的ER或高尔基体。重组糖蛋白穿过宿主细胞的ER或高尔基体产生了主要包含NANA2Gal2GlcNAc2Man3GlcNAc2糖形式或NANAGal2GlcNAc2Man3GlcNAc2糖形式或其混合物的重组糖蛋白。对于低等真核生物宿主细胞例如酵母和丝状真菌，有用的是所述宿主细胞进一步包括提供CMP-唾液酸用于向N-聚糖转移的手段。美国公开的专利申请No. 2005/0260729公开了遗传工程化低等真核生物以具有CMP-唾液酸合成途径的方法，美国公开的专利申请No.2006/0286637公开了遗传工程化低等真核生物来生产唾液酸化的糖蛋白的方法。上述细胞中生产的糖蛋白可以用神经氨酸酶体外处理，来产生主要包含Gal2GlcNAc2Man3GlcNAc2糖形式或GalGlcNAc2Man3GlcNAc2糖形式或其混合物的重组糖蛋白。
前述宿主细胞的任一种可以进一步包括选自由GnT III、GnT IV、GnT V、GnT VI和GnT IX构成的组的一种或更多种GlcNAc转移酶，以生产具有二分的（GnT III）和/或多触角的（GnT IV、V、VI和IX）的N-聚糖结构的糖蛋白，例如在美国公开的专利申请No. 2004/074458和2007/0037248中公开的。
在进一步的实施方式中，产生主要具有GlcNAcMan5GlcNAc2N-聚糖的糖蛋白的宿主细胞进一步包括与细胞靶向信号肽融合的半乳糖基转移酶催化结构域，所述信号肽通常不与该催化结构域相连，并且被选择以将半乳糖基转移酶活性靶向宿主细胞的ER或高尔基体。重组糖蛋白穿过宿主细胞的ER或高尔基体产生了主要包含GalGlcNAcMan5GlcNAc2糖形式的重组糖蛋白。
在进一步的实施方式中，产生主要具有GalGlcNAcMan5GlcNAc2N-聚糖的糖蛋白的直接地前述的宿主细胞进一步包括与细胞靶向信号肽融合的唾液酸转移酶催化结构域，所述信号肽通常不与该催化结构域相连，并且被选择以将唾液酸转移酶活性靶向宿主细胞的ER或高尔基体。重组糖蛋白穿过宿主细胞的ER或高尔基体产生了包含NANAGalGlcNAcMan5GlcNAc2糖形式的重组糖蛋白。
在进一步的方面中，前述宿主细胞的任一项，所述宿主细胞进一步被修饰以包括岩藻糖基转移酶，以及产生岩藻糖并转运岩藻糖进入ER或高尔基体的途径。修饰巴斯德毕赤氏酵母以使得它能够生产其中一个或更多个N-聚糖被岩藻糖基化的糖蛋白的方法的实例在PCT国际申请NO. PCT/US2008/002787中公开了。在本发明的特别的方面中，巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞被进一步修饰以包括岩藻糖基化途径，其包含GDP-甘露糖-4,6-脱水酶、GDP-酮基-脱氧-甘露糖-差向异构酶/GDP-酮基-脱氧-半乳糖-还原酶、GDP-岩藻糖转运蛋白和岩藻糖基转移酶。在特定的方面中，所述岩藻糖基转移酶选自由岩藻糖基转移酶构成的组，所述岩藻糖基转移酶选自由α1,2-岩藻糖基转移酶、α1,3-岩藻糖基转移酶、α1,4-岩藻糖基转移酶和α1,6-岩藻糖基转移酶构成的组。
各种前述宿主细胞进一步包括一种或更多种糖类转运蛋白，例如UDP-GlcNAc转运蛋白（例如,乳酸克鲁维酵母和小家鼠（Mus musculus）UDP-转运蛋白）、UDP-半乳糖转运蛋白（例如，果蝇（Drosophila melanogaster）UDP-半乳糖转运蛋白）和CPM-唾液酸转运蛋白（例如，人类唾液酸转运蛋白）。由于低等真核生物宿主细胞例如酵母和丝状真菌缺乏上述转运蛋白，优选的是低等真核生物宿主细胞例如酵母和丝状真菌被遗传工程化以包括上述转运蛋白。
宿主细胞进一步包括巴斯德毕赤氏酵母，其被遗传工程化以消除具有磷酸甘露糖残基的糖蛋白，通过删除或破坏磷酸甘露糖基转移酶基因PNO1和MNN4B（参见，例如，美国专利No. 7,198,921和7,259,007）之一或两者，其在进一步的方面中还可以包括删除或破坏MNN4A基因。破坏包括破坏编码特定酶的开放阅读框，或破坏开放阅读框的表达，或利用干扰RNA、反义RNA等取消编码一种或更多种β-甘露糖基转移酶和/或磷酸甘露糖基转移酶的RNA的翻译。宿主细胞可以进一步包括被修饰以产生特定N-聚糖结构的前述宿主细胞的任一种。
宿主细胞进一步包括低等真核生物细胞（例如，酵母，例如巴斯德毕赤氏酵母），其被遗传修饰以控制糖蛋白的O-糖基化，通过删除或破坏一种或更多种蛋白质O-甘露糖基转移酶（Dol-P-Man:Protein（Ser/Thr）甘露糖基转移酶基因）（PMTs）（参见美国专利No. 5,714,377），或在存在Pmtp抑制物和/或α-甘露糖苷酶的情况下生长，如在公开的国际申请No. WO 2007061631中公开的，或这两者。破坏包括破坏编码Pmtp的开放阅读框，或破坏开放阅读框的表达，或利用干扰RNA、反义RNA等取消编码一种或更多种Pmtps的RNA的翻译。宿主细胞可以进一步包括被修饰以产生特定N-聚糖结构的前述宿主细胞的任一种。Pmtp抑制物包括但不限于苯亚甲基噻唑烷二酮。可以使用的苯亚甲基噻唑烷二酮的实例有5-[ [ 3,4-二（苯基甲氧基）苯基]亚甲基]-4-氧代-2-硫代-3-噻唑烷乙酸；5-[ [ 3-（1-苯基乙氧基）-4-（2-苯基乙氧基）]苯基]亚甲基]-4-氧代-2-硫代-3-噻唑烷乙酸；和5-[ [ 3-（1-苯基-2-羟基）乙氧基）-4-（2-苯基乙氧基）]苯基]亚甲基]-4-氧代-2-硫代-3-噻唑烷乙酸。
在特定的实施方式中，至少一种内源的PMT基因的功能或表达被降低、破坏或删除。例如，在特定的实施方式中，选自由PMT1、PMT2、PMT3和PMT4基因构成的组的至少一种内源的PMT基因的功能或表达被降低、破坏或删除；或宿主细胞在存在一种或更多种PMT抑制物的情况下培养。在进一步的实施方式中，所述宿主细胞包括一种或更多种PMT基因删除或破坏，以及所述宿主细胞在存在一种或更多种Pmtp抑制物的情况下培养。在这些实施方式的特定方面中，所述宿主细胞还表达分泌的α-1,2-甘露糖苷酶。
PMT删除或破坏和/或Pmtp抑制物通过降低O-糖基化占用来控制O-糖基化；也就是通过降低被糖基化的糖蛋白上O-糖基化位点的总数量。细胞分泌的α-1,2-甘露糖酶的进一步添加通过降低糖蛋白上O-聚糖的甘露糖链长度来控制O-糖基化。因而，与分泌的α- 1,2-甘露糖苷酶的表达组合PMT删除或破坏和/或Pmtp抑制物通过降低占用和链长度控制O-糖基化。在特别的情况下，PMT删除或破坏、Pmtp抑制物以及α-1,2-甘露糖苷酶的特定组合经验性地确定，因为特定的异源糖蛋白（例如抗体）可能以不同的效率程度表达和通过高尔基体转运，因而可能需要PMT删除或破坏、Pmtp抑制物以及α-1,2-甘露糖苷酶的特定组合。在另一个方面，编码一种或更多种内源的甘露糖基转移酶的基因被删除。这种删除可以与提高分泌的α-1,2-甘露糖苷酶和/或PMT抑制物组合，或可以代替提供分泌的α-1,2-甘露糖苷酶和/或PMT抑制物。
因而，O-糖基化的控制对于在此处公开的宿主细胞中以更好的总产量生产特定糖蛋白，以及在正确组装的糖蛋白的产率方面是有用的。O-糖基化的降低或消除看起来对于糖蛋白例如完整抗体的组装和转运具有有益的效果，因为它们穿越分泌途径，并被转运到细胞表面。因而，在O-糖基化被控制的细胞中，相对于在O-糖基化不被控制的宿主细胞中获得的产量，正确组装的糖蛋白例如抗体片段的产量被提高了。糖蛋白的产量在某些情况下可以通过过量表达编码哺乳动物或人侣伴蛋白的核酸分子，或用编码一种或更多种哺乳动物或人侣伴蛋白的核酸分子替换编码一种或更多种内源侣伴蛋白的基因来改善。此外，哺乳动物或人侣伴蛋白在宿主细胞中的表达看起来也控制细胞中的O-糖基化。因而，进一步包括的是此处的宿主细胞，其中编码侣伴蛋白的至少一种内源基因的功能被降低或消除，编码至少一种侣伴蛋白的哺乳动物或人同源物的载体在所述宿主细胞中表达。还包括的是宿主细胞，其中表达内源的宿主细胞侣伴蛋白以及哺乳动物或人侣伴蛋白。在进一步的方面中，低等真核宿主细胞是酵母或丝状真菌宿主细胞。在PTC国际申请NO. PCT/US2009/033507中已经公开了宿主细胞的侣伴蛋白的运用的实例，其中人侣伴蛋白被导入以改善产量以及降低或控制重组蛋白质的O-糖基化。如同上述的，进一步包括的是低等真核宿主细胞，其中，除了如上所述用编码一种或更多种哺乳动物或人侣伴蛋白的核酸分子替换编码一种或更多种内源侣伴蛋白的基因、或过量表达一种或更多种哺乳动物或人侣伴蛋白之外，编码蛋白质O-甘露糖基转移酶（PMT）蛋白的至少一种内源基因的功能或表达被降低、破坏或删除。在特定的实施方式中，选自由PMT1、PMT2、PMT3和PMT4基因构成的组的至少一种内源PMT基因的功能被降低、破坏或删除。
因此，在此公开的方法可以使用被遗传修饰以产生糖蛋白的任何宿主细胞，在所述糖蛋白中主要N-聚糖选自由复合N-聚糖、杂合N-聚糖和高甘露糖N-聚糖构成的组，其中复合N-聚糖选自由Man3GlcNAc2, GlcNAC（1-4）Man3GlcNAc2, Gal（1-4）GlcNAc（1-4）Man3GlcNAc2和NANA（1-4）Gal（1-4）Man3GlcNAc2构成的组；杂合N-聚糖选自由Man5GlcNAc2, GlcNAcMan5GlcNAc2, GalGlcNAcMan5GlcNAc2和NANAGalGlcNAcMan5GlcNAc2构成的组； 以及高甘露糖N-聚糖选自由Man6GlcNAc2, Man7GlcNAc2, Man8GlcNAc2和Man9GlcNAc2构成的组。N-聚糖结构的实例包括但不限于 Man5GlcNAc2、GlcNAcMan5GlcNAc2、GlcNAcMan3GlcNAc2、GlcNAc2Man3GlcNAc2、GlcNAc3Man3GlcNAc2、GlcNAc4Man3GlcNAc2、GalGlcNAc2Man3GlcNAc2、Gal2GlcNAc2Man3GlcNAc2、Gal2GlcNAc3Man3GlcNAc2、Gal2GlcNAc4Man3GlcNAc2、Gal3GlcNAc3Man3GlcNAc2、Gal3GlcNAc4Man3GlcNAc2、Gal4GlcNAc4Man3GlcNAc2、NANAGal2GlcNAc2Man3GlcNAc2、NANA2Gal2GlcNAc2Man3GlcNAc2、NANA3Gal3GlcNAc3Man3GlcNAc2和NANA4Gal4GlcNAc4Man3GlcNAc2。
可以用于构建重组宿主细胞的酵母选择性标记包括药物抗性标志物和遗传学功能，其容许酵母宿主细胞合成关键的细胞营养物，例如，氨基酸。通常在酵母中使用的药物抗性标志物包括氯霉素、卡那霉素、甲氨蝶呤、G418（geneticin）、Zeocin，等等。容许酵母宿主细胞合成关键细胞营养物的遗传功能与在相应的基因组功能方面具有营养缺陷突变的可获得的酵母菌株一起使用。常见的酵母可选择标记物提供了合成亮氨酸（LEU2）、色氨酸（TRP1和TRP2）、脯氨酸（PRO1）、尿嘧啶（URA3、URA5、URA6）、组氨酸（HIS3）、赖氨酸（LYS2）、腺嘌呤（ADE1或ADE2）等的遗传功能。其他酵母选择性标记包括来自酿酒酵母的ARR3基因，其赋予了在存在亚砷酸盐的情况下生长的酵母细胞的亚砷酸盐抗性（Bobrowicz et al., Yeast, 13:819-828（1997）；Wysocki et al., J. Biol. Chem. 272:30061-30066（1997））。许多适合的整合位点包括在美国专利No. 7,479,389中例举的那些，包括酿酒酵母和其他酵母或真菌已知座位的同源物。将载体整合到酵母中的方法是公知的（参见，例如美国专利No. 7,479,389美国专利No. 7,514,253、美国公开的申请No. 2009012400和WO2009/085135）。插入位点的实例包括但不限于毕赤氏酵母ADE基因；毕赤氏酵母TRP（包括TRP1到TRP2）基因；毕赤氏酵母MCA基因；毕赤氏酵母CYM基因；毕赤氏酵母PEP基因；毕赤氏酵母PRB基因；和毕赤氏酵母LEU基因。毕赤氏酵母ADE1和ARG4基因已经在Lin Cereghino et al., Gene 263:159-169（2001）和美国专利No. 4,818,700中描述，HIS3和TRP1基因已经在Cosano et al., Yeast 14:861-867（1998）中描述，HIS4已经在GenBank Accession No. X56180中描述。
本发明进一步提供了在甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母中生产成熟的人促红细胞生成素的方法，所述酵母主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖，并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。所述方法包括提供重组巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其被遗传工程化以生产唾液酸封端的双分枝N-聚糖，其中至少BMT1、BMT2和BMT3基因被删除或破坏，并且其包括两种或更多种核酸分子，各自编码包含与信号肽融合的成熟的人促红细胞生成素EPO的融合蛋白，所述信号肽靶向ER或高尔基体，并且当所述融合蛋白处于ER或高尔基体中时被除去；在对表达和加工所述第一和第二融合蛋白有效的条件下在培养基中生长所述宿主细胞；以及从所述培养基回收所述成熟的人促红细胞生成素，来产生所述成熟的人促红细胞生成素，其主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。
在特定的方面中，编码成熟的人促红细胞生成素的核酸分子是密码子优化的，为了在甲基营养型酵母例如巴斯德毕赤氏酵母中最佳的表达。如在实施例中所示的，成熟的人促红细胞生成素作为融合蛋白被编码，其中EPO在促红细胞生成素的成熟形式的N-末端与信号肽的C-末端融合，所述信号肽将融合蛋白靶向分泌途径用于加工，包括糖基化。信号肽的实例包括但不限于酿酒酵母αMATpre信号肽或鸡溶菌酶信号肽。可以使用其他信号序列代替在此公开的那些，例如，黑曲霉α-淀粉酶信号肽以及人血清白蛋白（HSA）信号肽。在一个实施方式中，第一核酸分子编码下述融合蛋白，其中成熟的促红细胞生成素融合到酿酒酵母αMATpre 信号肽，第二核酸分子编码下述融合蛋白，其中成熟的促红细胞生成素融合到酿酒酵母αMATpre 信号肽鸡溶菌酶信号肽。所述信号肽可以通过接头肽融合到成熟的人促红细胞生成素，所述接头肽可以含有一个或更多个蛋白酶裂解位点。
在进一步的方面中，宿主细胞包括表达盒的二到十二个之间的拷贝，所述表达盒编码包含成熟的人促红细胞生成素的融合蛋白。在某些方面中，所述宿主细胞包括表达盒的约八个到十一个之间的拷贝，所述表达盒编码包含成熟的人促红细胞生成素的融合蛋白。在其他方面，所述宿主细胞包括约三到四个拷贝的第一核酸，以及五到七个拷贝的第二核酸。宿主细胞被遗传工程化以生产唾液酸封端的双分枝N-聚糖，其中至少BMT1、BMT2和BMT3基因被删除或破坏。这样的宿主细胞进一步包括至少OCH1、PNO1、MNN4和MNN4L1基因删除或破坏。宿主细胞进一步包括编码至少以下的嵌合的糖基化酶的一种或更多种核酸分子：与细胞靶向肽融合的α1,2-甘露糖苷酶催化结构域，所述细胞靶向肽将所述催化结构域靶向宿主细胞的ER或高尔基体；与细胞靶向肽融合的GlcNAc转移酶I催化结构域，所述细胞靶向肽将所述催化结构域靶向宿主细胞的ER或高尔基体；与细胞靶向肽融合的甘露糖苷酶II催化结构域，所述细胞靶向肽将所述催化结构域靶向宿主细胞的ER或高尔基体；与细胞靶向肽融合的GlcNAc转移酶II催化结构域，所述细胞靶向肽将所述催化结构域靶向宿主细胞的ER或高尔基体；与细胞靶向肽融合的β1,4-半乳糖基转移酶催化结构域，所述细胞靶向肽将所述催化结构域靶向宿主细胞的ER或高尔基体；以及与细胞靶向肽融合的α1,2-唾液酸转移酶催化结构域，所述细胞靶向肽将所述催化结构域靶向宿主细胞的ER或高尔基体。选择这些糖基化酶以在它们被靶向的ER或高尔基体中的位置处是有活性的。选择糖基化酶并为了最佳的活性将酶靶向ER或高尔基体的特定区域的方法已经在美国专利No. 7,029,872和7,449,308，和公开的美国申请Nos. 2006/0040353和2006/0286637中描述。宿主细胞被进一步修饰以包括如在公开的美国申请No.2006/0286637中公开的途径的酶，以生产CMP-唾液酸，并且以包括GlcNAc和半乳糖转运蛋白和UDP-半乳糖-4-差向异构酶。最后，宿主进一步包括核酸分子，其编码与细胞靶向肽融合的真菌α1,2-甘露糖苷酶催化结构域，所述细胞靶向肽将所述催化结构域靶向分泌途径用于分泌，并且其引起O-聚糖占用和链长度的降低。
与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性的检测可以在夹心ELISA中或在Western印迹中测定。
在进一步的方面中，回收成熟的人促红细胞生成素包括阳离子交换层析步骤和/或羟磷灰石层析步骤和/或阴离子交换层析步骤，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。在一个实施方式中，成熟的人促红细胞生成素的回收包括阳离子交换层析步骤和随后的羟磷灰石层析步骤，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。任选地，成熟的人促红细胞生成素的回收包括阴离子层析步骤，所述成熟的人促红细胞生成素主要地包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。
进一步提供的是包含成熟的人促红细胞生成素和药学上可接受的盐的组合物，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性，所述抗原是如在此公开的获得的。在特定的实施方式中，约50到60%的N-聚糖包含位于两个分枝上的唾液酸残基；在进一步的实施方式中，大于70%的N-聚糖包含位于两个分枝上的唾液酸残基。在进一步的方面中，小于30%的N-聚糖是中性的N-聚糖（即，在N-聚糖的非还原末端处的至少一个末端上不是唾液酸化的）。在再进一步的方面中，小于20%的N-聚糖是中性的N-聚糖。
在特定的方面中，成熟的人促红细胞生成素与亲水性聚合物共轭，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性，所述亲水性聚合物在特定的实施方式中是聚乙二醇聚合物。与聚乙二醇聚合物共轭的、主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖的成熟的人促红细胞生成素的实例已经在共同拥有的美国公开申请No. 2008/0139470中描述了。
聚乙二醇聚合物（PEG）基团可以是任何方便的分子量，可以是线性的或分枝的。PEG的平均分子量优选的从约2千道尔顿（“kD”）到约100 kDa；更优选的从约5 kDa到约60 kDa，更优选的从约20 kDa到约50 kDa；最优选的从约30 kDa到约40 kDa。这些PEG可以由任何商业上的供应商提供，包括NOF公司（Tokyo, Japan）、Dow Pharma（ChiroTech Technology, Cambridge,UK）、Nektar（San Carlos, CA）和SunBio（Anyang City, South Korea）。适合的PEG部分包括，例如，40 kDa的甲氧基聚（乙二醇）丙醛；60 kDa的甲氧基聚（乙二醇）丙醛；31 kDa的α-甲基-w-（3-氧基丙氧基），聚氧乙烯；30 kDa的PEG：30kDa的甲氧基聚（乙二醇）丙醛和45 kDa的2,3-二（甲基聚氧乙烯基-氧）-1-[（3-氧基丙基）聚氧乙烯-氧]-丙烷。PEG基团一般经由酰化或还原性氨基化作用通过PEG部分上的反应基团（例如，醛、氨基、硫醇或酯基）到蛋白质或目标多肽上的反应基团（例如，醛、氨基或酯基）连接于促红细胞生成素。例如，PEG部分可以直接地或通过接头连接到促红细胞生成素的N-末端氨基酸残基。
对于合成肽的PEG化的有用的策略包括通过在溶液中形成共轭键来组合合成肽和PEG部分，其各自带有针对对方相互反应性的特定官能团。肽可以用常规的固相合成（参见，例如，实施例4）来容易地制备。肽是在特定位点与合适的功能基团“预先活化的”。在与PEG部分反应之前，纯化前体并完全表征。肽与PEG的连接通常在水相中发生，可以通过反相分析HPLC容易地监视。PEG化的肽可以通过制备型HPLC容易地纯化，通过分析HPLC、氨基酸分析和激光脱附质谱法来表征。
以下实施例意图促进本发明的进一步理解。
实施例1
遗传工程化的巴斯德毕赤氏酵母菌株YGLY3159是产生带有唾液酸化的N-聚糖的重组人红细胞生成素（rhEPO）的菌株。菌株的构建已经在美国公开的申请No. 20080139470中描述，在附图1中示意地说明。简要地，菌株如下构建。
菌株YGLY3159是利用早先描述的方法从野生型巴斯德毕赤氏酵母菌株 NRRL-Y11430构建的 （参见，例如，美国专利No. 7,449,308；美国专利No. 7,479,389；美国公开的专利申请No. 20090124000；公开的PCT申请No. WO2009085135；Nett and Gerngross, Yeast 20:1279（2003）；Choi et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100:5022（2003）；Hamilton et al., Science 301:1244（2003））。所有质粒利用标准的分子生物学操作在pUC19质粒中制造。对于为在巴斯德毕赤氏酵母中表达而优化的核苷酸序列，天然的核苷酸序列通过GENEOPTIMIZER软件（GeneArt, Regensburg, Germany）分析，结果用于产生密码子为了巴斯德毕赤氏酵母表达而优化的核苷酸序列。通过电穿孔转化酵母菌株（使用电穿仪BioRad的厂家建议的标准技术）。
质粒pGLY6（附图2）是靶向URA5座位的整合载体，含有包含酿酒酵母转化酶基因或转录单元（ScSUC2；SEQ ID NO:1）的核酸分子，其一侧是包含来自巴斯德毕赤氏酵母URA5基因的5'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：59）的核酸分子，另一侧是包含来自巴斯德毕赤氏酵母URA5基因的3'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：60）的核酸分子。质粒pGLY6被线性化，线性化的质粒转化到野生型菌株 NRRL-Y11430中以产生多个菌株，在其中ScSUC2基因通过双交叉同源重组插入到URA5座位中。菌株YGLY1-3从所产生的菌株中选出，是对尿苷营养缺陷的。
质粒pGLY40（附图3）是靶向OCH1座位的整合载体，含有包含巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元（SEQ ID NO：61）的核酸分子，其侧翼是包含lacZ重复（SEQ ID NO：62）的核酸分子，随后在一侧是包含来自OCH1基因的5'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：64）的核酸分子，另一侧是包含来自OCH1基因的3'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：65）的核酸分子。质粒pGLY40用SfiI线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY1-3中以产生多个菌株，在其中侧翼是lacZ重复的URA5基因通过双交叉同源重组插入到OCH1座位中。菌株YGLY2-3从所产生的菌株中选出，是对URA5原养型的。菌株YGLY2-3在存在 5-氟乳清酸（5-FOA）的情况下反选择以产生多个菌株，在其中URA5基因已经丧失，在OCH1座位中仅留下lacZ重复。这使得菌株是对尿苷营养缺陷的。选出菌株YGLY4-3。
质粒pGLY43a（附图4）是靶向BMT2座位的整合载体，含有包含乳酸克鲁维酵母 UDP-N-乙酰葡萄糖胺（UDP-GlcNAc）转运蛋白基因或转录单元（KlMNN2-2, SEQ ID NO:3）的核酸分子，其邻近于侧翼是包含lacZ重复的核酸分子的、包含巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元的核酸分子。所述邻近的基因一侧是包含来自BMT2基因的5'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：66）的核酸分子，另一侧是包含来自BMT2基因的3'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：67）的核酸分子。质粒pGLY43a用SfiI线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY4-3中以产生多个菌株，在其中KlMNN2-2基因和侧翼是lacZ重复的URA5基因通过双交叉同源重组插入到BMT2座位中。BMT2基因已经在Mille et al., J. Biol. Chem. 283: 9724-9736（2008）和美国专利No.7,465,557中公开。菌株YGLY6-3从产生的菌株中选出，是对尿苷原养型的。菌株YGLY6-3在存在5-FOA的情况下反选择以产生多个菌株，在其中URA5基因已经丧失，仅留下lacZ重复。这使得菌株是对尿苷营养缺陷的。选出菌株YGLY8-3。
质粒pGLY48（附图5）是靶向MNN4L1座位的整合载体，含有表达盒，所述表达盒包含编码UDP-GlcNAc转运蛋白的小鼠同源物（SEQ ID NO：17）开放阅读框（ORF）的核酸分子，其在5'末端可操作连接到包含巴斯德毕赤氏酵母GAPDH启动子（SEQ ID NO：53）的核酸分子，在3'末端可操作连接到包含酿酒酵母CYC终止序列（SEQ ID NO：56）的核酸分子，邻近于侧翼是lacZ重复、包含巴斯德毕赤氏酵母URA5基因的核酸分子，其中表达盒在一起的一侧是包含来自巴斯德毕赤氏酵母MNN4L1基因的5'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：76）的核酸分子，另一侧是包含来自MNN4L1基因的3'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：77）的核酸分子。质粒pGLY48用SfiI线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY8-3中以产生多个菌株，在其中编码小鼠UDP-GlcNAc转运蛋白和URA5基因的表达盒通过双交叉同源重组插入到MNN4L1座位中。MNN4L1基因（也称为MNN4B）已经在美国专利No. 7,259,007中公开。菌株YGLY10-3从产生的菌株中选出，然后在存在5-FOA的情况下反选择以产生多个菌株，在其中URA5基因已经丧失，仅留下lacZ重复。选出菌株YGLY12-3。
质粒pGLY45（附图6）是靶向PNO1/MNN4座位的整合载体，含有包含巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元的核酸分子，其侧翼是包含lacZ重复的核酸分子，随后在一侧是包含来自PNO1基因的5'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：74）的核酸分子，另一侧是包含来自MNN4基因的3'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：75）的核酸分子。质粒pGLY45用SfiI线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY12-3中以产生多个菌株，在其中侧翼是lacZ重复的URA5基因通过双交叉同源重组插入到MNN4座位中。PNO1基因已经在美国专利No. 7,198,921中公开，MNN4基因（也称为MNN4B）已经在美国专利No. 7,259,007中公开。菌株YGLY14-3从产生的菌株中选出，然后在存在5-FOA的情况下反选择以产生多个菌株，在其中URA5基因已经丧失，仅留下lacZ重复。选出菌株YGLY16-3。
质粒pGLY247（附图7）是靶向MET16座位的整合载体，含有包含巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元的核酸分子，其侧翼是包含lacZ重复的核酸分子，随后在一侧是包含来自MET16基因的5'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：84）的核酸分子，另一侧是包含来自MET16基因的3'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：85）的核酸分子。质粒pGLY247用SfiI线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY16-3中以产生多个菌株，在其中侧翼是lacZ重复的URA5通过双交叉同源重组插入到MET16座位中。选出菌株YGLY20-3。
质粒pGLY248（附图8）是靶向URA5座位的整合载体，含有包含巴斯德毕赤氏酵母MET16基因（SEQ ID NO：86）的核酸分子，其一侧是包含来自URA5基因的5'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：59）的核酸分子，另一侧是包含来自URA5基因的3'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：60）的核酸分子。质粒pGLY248线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY20-3中以产生多个菌株，在其中被插入到URA5座位中的ScSUC2基因通过双交叉同源重组被MET16基因替换。菌株YGLY22-3被选出，然后在存在5-FOA的情况下反选择以产生多个菌株，在其中插入到MET16座位中的URA5基因已经丧失，仅留下lacZ重复。选出菌株YGLY24-3。
质粒pGLY582（附图9）为靶向HIS1座位的整合载体，含有串联的四个表达盒，其编码（1）酿酒酵母UDP-葡萄糖差向异构酶（ScGAL10），（2）在N-末端融合到酿酒酵母KRE2-s前导肽（33）将嵌合的酶靶向ER或高尔基体的人半乳糖基转移酶I（hGalT）催化结构域，（3）侧翼是lacZ重复的巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元，以及（4）黑腹果蝇UDP-半乳糖转运蛋白（DmUGT）。编码ScGAL10的表达盒包含编码ScGAL10 ORF（SEQ ID NO：21）的核酸分子，其在5'末端与包含巴斯德毕赤氏酵母PMA1启动子（SEQ ID NO：45）的核酸分子可操作连接，在3'末端与包含巴斯德毕赤氏酵母PMA1转录终止序列（SEQ ID NO：46）的核酸分子可操作连接。编码嵌合的半乳糖基转移酶I的表达盒包含为在巴斯德毕赤氏酵母中表达而密码子优化的、编码hGalT催化结构域的核酸分子（SEQ ID NO：23），其在5'末端融合到编码KRE2-s前导区33的核酸分子（SEQ ID NO：13），其在5'末端可操作连接到包含巴斯德毕赤氏酵母GAPDH启动子的核酸分子，在3'末端可操作连接到包含酿酒酵母CYC转录终止序列的核酸分子。URA5表达盒包含核酸分子，其包含侧翼是包含lacZ重复的核酸分子的巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元。编码DmUGT的表达盒包含编码DmUGTORF（SEQ ID NO：19）的核酸分子，其在5'末端与包含巴斯德毕赤氏酵母OCH1启动子（SEQ ID NO：47）的核酸分子可操作连接，在3'末端与包含巴斯德毕赤氏酵母ALG12转录终止序列（SEQ ID NO：48）的核酸分子可操作连接。所述四个串联的盒一侧是包含来自HIS1基因的5'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：87）的核酸分子，另一侧是包含来自HIS1基因的3'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：88）的核酸分子。质粒pGLY582线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY24-3中以产生多个菌株，在其中四个串联的表达盒通过同源重组插入到HIS1座位中。选出菌株YGLY58，是对组氨酸营养缺陷的，以及对尿苷原养型的。
质粒pGLY167b（附图10）靶向ARG1座位的整合载体，含有串联的三个表达盒，其编码（1）在N-末端融合到酿酒酵母MNN2前导肽（53）以将嵌合的酶靶向ER或高尔基体的黑腹果蝇甘露糖苷酶II催化结构域（KD），（2）巴斯德毕赤氏酵母HIS1基因或转录单元，和（3）在N-末端融合到酿酒酵母MNN2前导肽（54）以将嵌合的酶靶向ER或高尔基体的大鼠N-乙酰葡萄糖胺（GlcNAc）转移酶II催化结构域（TC）。编码KD53的表达盒包含为在巴斯德毕赤氏酵母中表达而密码子优化的、编码黑腹果蝇甘露糖苷酶II催化结构域的核酸分子（SEQ ID NO：33），其在5'末端融合到编码MNN2前导区53的核酸分子（SEQ ID NO：5），其在5'末端可操作连接到包含巴斯德毕赤氏酵母GAPDH启动子的核酸分子，在3'末端可操作连接到包含酿酒酵母CYC转录终止序列的核酸分子。HIS1表达盒包含核酸分子，其包含巴斯德毕赤氏酵母HIS1基因或转录单元（SEQ ID NO：89）。编码TC54的表达盒包含为在巴斯德毕赤氏酵母中表达而密码子优化的、编码大鼠GlcNAc转移酶II催化结构域的核酸分子（SEQ ID NO：31），其在5'末端融合到编码MNN2前导区54的核酸分子（SEQ ID NO：7），其在5'末端可操作连接到包含巴斯德毕赤氏酵母PMA1启动子的核酸分子，在3'末端可操作连接到包含巴斯德毕赤氏酵母PMA1转录终止序列的核酸分子。所述三个串联的盒一侧是包含来自ARG1基因的5'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：79）的核酸分子，另一侧是包含来自ARG1基因的3'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：80）的核酸分子。质粒pGLY167b用SfiI线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY58中以产生多个菌株（在其中三个串联的表达盒通过双交叉同源重组插入到ARG1座位中。菌株YGLY73从产生的菌株中选出，是对精氨酸营养缺陷的，并对尿苷和组氨酸原养型的。菌株然后在存在5-FOA的情况下反选择，以产生现在对尿苷营养缺陷的多个菌株。选出菌株YGLY1272。
质粒pGLY1430（附图11）是靶向ADE1座位而不破坏座位表达的KINKO整合载体，含有串联的四个表达盒，其编码（1）在N-末端融合到巴斯德毕赤氏酵母SEC12前导区肽（10）以将嵌合的酶靶向ER或高尔基体的人GlcNAc转移酶I催化结构域（NA），（2）UDP-GlcNAc转运蛋白的小鼠同源物（MmTr），（3）在N-末端融合到酿酒酵母SEC12前导肽（8）以将嵌合的酶靶向ER或高尔基体的小鼠甘露糖苷酶IA催化结构域（FB），和（4）巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元。KINKO（很少或没有敲除的敲入）整合载体允许将异源DNA插入到靶点座位而不破坏在靶点座位处基因的表达，已经在美国公开的申请No. 20090124000中描述了。编码NA10的表达盒包含为在巴斯德毕赤氏酵母中表达而密码子优化的、编码人GlcNAc转移酶I催化结构域的核酸分子（SEQ ID NO：25），其在5'末端融合到编码SEC12前导区10的核酸分子（SEQ ID NO：11），其在5'末端可操作连接到包含巴斯德毕赤氏酵母PMA1启动子的核酸分子，在3'末端可操作连接到包含巴斯德毕赤氏酵母PMA1转录终止序列的核酸分子。编码MmTr的表达盒包含编码UDP-GlcNAc转运蛋白的小鼠同源物ORF的核酸分子，其在5'末端与包含巴斯德毕赤氏酵母SEC4启动子（SEQ ID NO：49）的核酸分子可操作连接，在3'末端与包含巴斯德毕赤氏酵母OCH1终止序列（SEQ ID NO：50）的核酸分子可操作连接。编码FB8的表达盒包含编码小鼠甘露糖苷酶IA催化结构域的核酸分子（SEQ ID NO：27），其在5'末端融合到编码SEC12-m前导区8的核酸分子（SEQ ID NO：15），其在5'末端可操作连接到包含巴斯德毕赤氏酵母GADPH启动子的核酸分子，在3'末端可操作连接到包含酿酒酵母CYC转录终止序列的核酸分子。URA5表达盒包含核酸分子，其包含侧翼是包含lacZ重复的核酸分子的巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元。四个串联的盒在一侧是包含来自ADE1基因的5'区域和完整ORF的核苷酸序列（SEQ ID NO：82）的核酸分子，随后是巴斯德毕赤氏酵母ALG3终止序列（SEQ ID NO：54），在另一侧是包含来自ADE1基因的3'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：83）的核酸分子。质粒pGLY1430用SfiI线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY1272中以产生多个菌株，在其中四个串联的表达盒通过双交叉同源重组紧跟着ADE1 ORF插入到ADE1座位中。菌株YGLY1305从产生的菌株中选出，是对精氨酸营养缺陷的，并且现在对尿苷、组氨酸和腺嘌呤原养型的。菌株然后在存在5-FOA的情况下反选择，以产生现在对尿苷营养缺陷的多个菌株。菌株YGLY1461被选出，能够产生主要具有半乳糖终止的N-聚糖的糖蛋白。
质粒pGFI165（附图12）是靶向PRO1座位而不破坏座位表达的KINKO整合载体，含有表达盒，其编码（1）在N-末端融合到酿酒酵母αMATpre信号肽（aMATTrMan）以将嵌合的蛋白靶向分泌途径并从细胞分泌的李氏木霉α-1,2-甘露糖苷酶催化结构域，和（2）巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元。编码aMATTrMan的表达盒包含编码李氏木霉催化结构域的核酸分子（SEQ ID NO：29），其在5'末端融合到编码酿酒酵母αMATpre信号肽的核酸分子（SEQ ID NO：9），其在5'末端可操作连接到包含巴斯德毕赤氏酵母GADPH启动子的核酸分子，在3'末端可操作连接到包含酿酒酵母CYC转录终止序列的核酸分子。URA5表达盒包含核酸分子，其包含侧翼是包含lacZ重复的核酸分子的巴斯德毕赤氏酵母URA5基因或转录单元。两个串联的盒在一侧是包含来自PRO1基因的5'区域和完整ORF的核苷酸序列（SEQ ID NO：90）的核酸分子，随后是巴斯德毕赤氏酵母ALG3终止序列，在另一侧是包含来自PRO1基因的3'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：91）的核酸分子。质粒pGFI165用SfiI线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY1461中以产生多个菌株，在其中两个表达盒通过双交叉同源重组紧跟着PRO1 ORF插入到PRO1座位中。菌株YGLY1703从产生的菌株中选出，是对精氨酸营养缺陷的，并对尿苷、组氨酸、腺嘌呤和脯氨酸原养型的。这种菌株能够生产具有降低的O-糖基化的糖蛋白（参见公开的美国申请No.20090170159）。
质粒pGLY2088（附图13）是靶向TRP2或AOX1座位的整合载体，含有表达盒，其编码（1）在N-末端融合到酿酒酵母αMATpre信号肽（alpha MF-pre）以将嵌合的蛋白靶向分泌途径并从细胞分泌的成熟的人促红细胞生成素（EPO），以及（2）zeocin抗性蛋白（Sh ble或ZeocinR）。编码EPO的表达盒包含为在巴斯德毕赤氏酵母中表达而密码子优化的、编码成熟的人EPO的核酸分子（SEQ ID NO：92），其在5'末端融合到编码酿酒酵母αMATpre信号肽的核酸分子，其在5'末端可操作连接到包含巴斯德毕赤氏酵母AOX1启动子（SEQ ID NO：55）的核酸分子，在3'末端可操作连接到包含酿酒酵母CYC转录终止序列的核酸分子。ZeocinR表达盒包含编码Sh ble ORF（SEQ ID NO：58）的核酸分子，其在5'末端可操作连接到酿酒酵母TEF1启动子（SEQ ID NO：57），在3'末端可操作连接到酿酒酵母CYC终止序列。两个串联的盒在一侧是包含核苷酸序列的核酸分子，所述核苷酸序列包含TRP2基因（SEQ ID NO：78）。质粒pGLY2088在PmeI位点线性化，转化到菌株YGLY1703中来产生多个菌株，在其中两个表达盒通过单交叉同源重组中的滚动插入到AOX1座位中，其引起EPO表达盒的多个拷贝插入到AOX1座位中而不破坏AOX1座位。菌株YGLY2849从产生的菌株中选出，是对精氨酸营养缺陷的，并现在对尿苷、组氨酸、腺嘌呤和脯氨酸原养型的。通过测量分离自菌株的DNA的测序数据的强度来测出的，菌株含有约三个到四个拷贝的EPO表达盒。在ER和高尔基体中嵌合EPO的加工期间，前导肽被除去。因而，产生的rhEPO是EPO的成熟形式。
质粒pGLY2456（附图14）是靶向TRP2座位而不破坏座位表达的KINKO整合载体，含有六个表达盒，其编码（1）小鼠CMP-唾液酸转运蛋白（mCMP-Sia Transp），（2）人UDP-GlcNAc 2-差向异构酶/N-乙酰甘露糖胺激酶（hGNE），（3）巴斯德毕赤氏酵母ARG1基因或转录单元，（4）人CMP-唾液酸合酶（hCMP-NANA），（5）人N-乙酰基神经氨酸-9-磷酸合酶（hSIAP S），（6）在N-末端融合到酿酒酵母KRE2前导肽（33）以将嵌合的酶靶向ER或高尔基体的小鼠α-2，6-唾液酸转移酶催化结构域（mST6），以及巴斯德毕赤氏酵母ARG1基因或转录单元。编码小鼠CMP-唾液酸转运蛋白的表达盒包含为在巴斯德毕赤氏酵母中表达而密码子优化的、编码mCMP Sia Transp ORF的核酸分子（SEQ ID NO：35），其在5'末端与包含巴斯德毕赤氏酵母PMA1启动子的核酸分子可操作连接，在3'末端与包含巴斯德毕赤氏酵母PMA1转录终止序列的核酸分子可操作连接。编码人UDP-GlcNAc 2--差向异构酶/N-乙酰甘露糖胺激酶的表达盒包含为在巴斯德毕赤氏酵母中表达而密码子优化的、编码hGNE ORF的核酸分子（SEQ ID NO：37），其在5'末端与包含巴斯德毕赤氏酵母GAPDH启动子的核酸分子可操作连接，在3'末端与包含酿酒酵母CYC转录终止序列的核酸分子可操作连接。编码巴斯德毕赤氏酵母ARG1基因的表达盒包含（SEQ ID NO：81）。编码人CMP-唾液酸合酶的表达盒包含为在巴斯德毕赤氏酵母中表达而密码子优化的、编码hCMP-NANA S ORF的核酸分子（SEQ ID NO：39），其在5'末端与包含巴斯德毕赤氏酵母GPDAH启动子的核酸分子可操作连接，在3'末端与包含酿酒酵母CYC转录终止序列的核酸分子可操作连接。编码人N-乙酰基神经氨酸-9-磷酸合酶的表达盒包含为在巴斯德毕赤氏酵母中表达而密码子优化的、编码hSIAP S ORF的核酸分子（SEQ ID NO：41），其在5'末端与包含巴斯德毕赤氏酵母PMA1启动子的核酸分子可操作连接，在3'末端与包含巴斯德毕赤氏酵母PMA1转录终止序列的核酸分子可操作连接。编码嵌合小鼠α-2,6-唾液酸转移酶的表达盒包含为在巴斯德毕赤氏酵母中表达而密码子优化的、编码mST6催化结构域的核酸分子（SEQ ID NO：43），其在5'末端融合到编码酿酒酵母KRE2信号肽的核酸分子，其在5'末端可操作连接到包含巴斯德毕赤氏酵母TEF启动子（SEQ ID NO：51）的核酸分子，在3'末端可操作连接到包含巴斯德毕赤氏酵母TEF转录终止序列（SEQ ID NO：52）的核酸分子。六个串联的盒在一侧是包含来自编码Trp2p的ORF的5'区域、以终止密码子结束的核苷酸序列（SEQ ID NO：98）的核酸分子，随后是巴斯德毕赤氏酵母ALG3终止序列，在另一侧是包含来自TRP2基因的3'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：99）的核酸分子。质粒pGLY2456用SfiI线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY2849中以产生多个菌株，在其中六个表达盒通过双交叉同源重组紧跟着TRP2 ORF插入到TRP2座位中。菌株YGLY3159从产生的菌株中选出，现在对尿苷、组氨酸、腺嘌呤、脯氨酸、精氨酸和色氨酸是原养型的。菌株对Zeocin有抗性，并含有约三个到四个拷贝的EPO表达盒。菌株产生rhEPO；然而，使用实施例5中的方法，rhEPO具有与针对HCA制得的抗体的交叉反应性结合（参见实施例6）。
虽然在此处的实例中各种表达盒被整合到巴斯德毕赤氏酵母基因组的特定座位中，要理解的是，本发明的操作与用于整合的座位是无关的。与此处公开的座位不同的座位可以用于表达盒的整合。许多适合的整合位点包括在美国公开的申请No. 20070072262中例举的那些，包括酿酒酵母和其他酵母或真菌已知的座位的同源物。
实施例2
实施例1中的菌株YGLY3159进一步遗传工程化以破坏BMT1、BMT3和BMT4基因，如下。
菌株YGLY3159在存在5-FOA的情况下反选择来产生菌株YGLY3225，其现在是对尿苷营养缺陷的。
质粒pGLY3411（pSH1092）（附图15）是含有表达盒的整合载体，所述表达盒包含侧翼是lacZ重复的巴斯德毕赤氏酵母URA5基因，其一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT4基因的5'核苷酸序列（SEQ ID NO：72），另一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT4基因的3'核苷酸序列（SEQ ID NO：73）。质粒pGLY3411线性化，线性化的质粒转化到YGLY3159中以产生多个菌株，在其中URA5表达盒通过双交叉同源重组插入到BMT4座位中。菌株YGLY4439从产生的菌株中选出，是对尿嘧啶、腺嘌呤、组氨酸、脯氨酸、精氨酸和色氨酸原养型的。菌株对Zeocin有抗性，并含有约三个到四个拷贝的rhEPO表达盒。菌株具有BMT2和BMT4基因的破坏或删除。
质粒pGLY3430（pSH1115）（附图16）是含有表达盒的整合载体，所述表达盒包含编码诺尔丝菌素抗性（NATR）ORF的核酸分子（原本来自pAG25，其来自EROSCARF, Scientific Research and Development GmbH, Daimlerstrasse 13a, D-61352 Bad Homburg, Germany，参见Goldstein et al., Yeast 15 : 1541（1999））ORF（SEQ ID NO：102），与棉阿舒囊霉TEF1启动子（SEQ ID NO：105）和棉阿舒囊霉TEF1终止序列（SEQ ID NO：106）可操作地连接，在一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT1基因的5'核苷酸序列（SEQ ID NO：68），另一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT1基因的3'核苷酸序列（SEQ ID NO：69）。质粒pGLY3430线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY4439中以产生多个菌株，在其中NATR表达盒通过双交叉同源重组插入到BMT1座位中。菌株YGLY6661从产生的菌株中选出，对尿嘧啶、腺嘌呤、组氨酸、脯氨酸、精氨酸和色氨酸是原养型的。菌株对Zeocin和诺尔丝菌素有抗性，并含有约三个到四个拷贝的EPO表达盒。菌株具有BMT1、BMT2和BMT4基因的破坏或删除。也选出了菌株YGLY7013；然而，这个菌株仅有BMT1基因的部分破坏。这个菌株被指定为具有BMT1、BMT2和BMT4基因的破坏或删除。
质粒pGLY4472（pSH1186）（附图17）是含有表达盒的整合载体，所述表达盒包含编码大肠杆菌潮霉素B磷酸转移酶基因（HygR ）ORF（SEQ ID NO：103）的核酸分子，与棉阿舒囊霉TEF1启动子（SEQ ID NO：105）和棉阿舒囊霉TEF1终止序列（SEQ ID NO：106）可操作地连接，一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT3基因的5'核苷酸序列（SEQ ID NO：70），另一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT3基因的3'核苷酸序列（SEQ ID NO：71）。质粒pGLY3430线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY6661中以产生多个菌株，在其中HygR 表达盒通过双交叉同源重组插入到BMT3座位中。从产生的菌株中选出菌株YGLY7361到YGLY7366和菌株YGLY7393到YGLY7398，其是对尿嘧啶、腺嘌呤、组氨酸、脯氨酸、精氨酸和色氨酸原养型的。菌株对Zeocin、诺尔丝菌素和潮霉素有抗性，并含有约三个到四个拷贝的EPO表达盒。菌株具有BMT1、BMT2、BMT3和BMT4基因的破坏或删除，并产生缺乏与针对宿主细胞抗原（HCA）制得的抗体的交叉反应性结合的rhEPO。
实施例3
实施例1中的菌株YGLY3159进一步遗传工程化以产生其中BMT1、BMT3和BMT4基因被破坏或删除的菌株，以及包括几个拷贝的表达盒，所述表达盒编码与鸡溶菌酶前导肽融合的成熟的人EPO。简要地，自YGLY3159开始的这些菌株的构建在附图1中显示，下文中简要地描述。
菌株YGLY3159在存在5-FOA的情况下反选择来产生菌株YGLY3225，其现在是对尿苷营养缺陷的。
质粒pGLY2057（附图18）是靶向ADE2座位的整合载体，含有编码侧翼是lacZ重复的巴斯德毕赤氏酵母URA5基因的表达盒。所述表达盒一侧是包含来自ADE2基因的5'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：100）的核酸分子，另一侧是包含来自ADE2基因的3'区域的核苷酸序列（SEQ ID NO：101）的核酸分子。质粒pGLY2057用SfiI线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY3225中以产生多个菌株，在其中URA5盒通过双交叉同源重组插入到ADE2座位中。菌株YGLY3229从产生的菌株中选出，是对腺嘌呤营养缺陷的，并对尿苷、组氨酸、脯氨酸、精氨酸和色氨酸是原养型的。菌株对Zeocin有抗性，并含有约三个到四个拷贝的EPO表达盒。
质粒pGLY2680（附图19）是可以靶向TRP2或AOX1座位的整合载体，含有表达盒，其编码（1）包含人成熟促红细胞生成素(EPO)的嵌合EPO，其在N-末端与鸡溶菌酶信号肽融合以将嵌合蛋白质靶向分泌途径并从细胞分泌，和（2）没有启动子的巴斯德毕赤氏酵母ADE2基因。ADE2基因是从隐藏启动子不良地转录的。因而，在没有补充腺嘌呤的培养基中，用该载体转化的ade2Δ酵母菌株的选择需要多个拷贝载体整合到基因组中，以使得对于腺嘌呤是重组原养型的。由于载体进一步包括EPO表达盒，重组酵母也将包括整合到基因组中的多个拷贝的EPO盒。这种载体和方法已经在公开的PCT申请WO2009085135中描述。编码鸡溶菌酶信号肽的DNA序列在SEQ ID NO：94中示出，编码成熟的人EPO的密码子优化的ORF在SEQ ID NO：92中示出，没有其启动子、但是包括其终止序列的巴斯德毕赤氏酵母ADE2基因在SEQ ID NO：96中示出。嵌合EPO与AOX1启动子和酿酒酵母CYC终止序列可操作连接。两个串联的盒在一侧是包含核苷酸序列的核酸分子，所述核苷酸序列包含TRP2基因。质粒pGLY2680在PmeI位点线性化，转化到YGLY3229中来产生多个菌株，在其中两个表达盒通过单交叉同源重组中的滚动插入到AOX1座位中，其引起EPO表达盒的多个拷贝插入到AOX1座位中而不破坏AOX1座位。从产生的菌株中选出菌株YGLY4209。通过测量被插入到座位中、分离自菌株的DNA的测序数据的强度来测出的，这个菌株有约5-7个拷贝的EPO表达盒。该菌株对于腺嘌呤、尿苷、组氨酸、脯氨酸、精氨酸和色氨酸是原养型的。菌株含有总共约八到十一个拷贝的EPO表达盒。在ER和高尔基体中嵌合EPO的加工期间，前导肽被除去。因而，产生的rhEPO是EPO的成熟形式。
菌株YGLY4209在存在5’-FOA的情况下反选择，以产生对尿嘧啶为营养缺陷的多个菌株。从产生的转化体中选出菌株YGLY4244。
质粒pGLY2713（附图20），靶向巴斯德毕赤氏酵母PEP4基因（SEQ ID NO：104）的整合载体，含有巴斯德毕赤氏酵母PNO1 ORF，其邻近于表达盒，所述表达盒包含侧翼是lacZ重复的巴斯德毕赤氏酵母URA5基因，其一侧是巴斯德毕赤氏酵母PEP4基因的5'核苷酸序列，另一侧是巴斯德毕赤氏酵母PEP4基因的3'核苷酸序列。质粒pGLY2713用SfiI线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY4244中以产生多个菌株，在其中PNO1 ORF和URA5表达盒表达盒通过双交叉同源重组插入到PEP4座位中。菌株YGLY5053从产生的菌株中选出，然后在存在5-FOA的情况下反选择以产生多个菌株，在其中URA5基因已经从基因组中缺失。菌株YGLY5597从产生的菌株中选出，是对腺嘌呤、组氨酸、脯氨酸、精氨酸和色氨酸原养型的。菌株对Zeocin有抗性，并含有约八个到十一个拷贝的rhEPO表达盒。
质粒pGLY3411（pSH1092）（附图15）是含有表达盒的整合载体，所述表达盒包含侧翼是lacZ重复的巴斯德毕赤氏酵母URA5基因，其一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT4基因的5'核苷酸序列（SEQ ID NO：72），另一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT4基因的3'核苷酸序列（SEQ ID NO：73）。质粒pGLY3411线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY5597中以产生多个菌株，在其中URA5表达盒通过双交叉同源重组插入到BMT4座位中。菌株YGLY5618从产生的菌株中选出，对尿嘧啶、腺嘌呤、组氨酸、脯氨酸、精氨酸和色氨酸是原养型的。菌株对Zeocin和诺尔丝菌素有抗性，并含有约八个到十一个拷贝的rhEPO表达盒。菌株具有BMT2和BMT4基因的破坏。
质粒pGLY3430（pSH1115）（附图16）是含有表达盒的整合载体，所述表达盒包含编码诺尔丝菌素抗性（NATR）ORF的核酸分子（原本来自pAG25，其来自EROSCARF, Scientific Research and Development GmbH, Daimlerstrasse 13a, D-61352 Bad Homburg, Germany，参见Goldstein et al., Yeast 15 : 1541（1999））ORF（SEQ ID NO：102），与棉阿舒囊霉TEF1启动子和棉阿舒囊霉TEF1终止序列可操作地连接，在一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT1基因的5'核苷酸序列（SEQ ID NO：68），另一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT1基因的3'核苷酸序列（SEQ ID NO：69）。质粒pGLY3430线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY5618中以产生多个菌株，在其中NATR表达盒通过双交叉同源重组插入到BMT1座位中。菌株YGLY7110从产生的菌株中选出，对尿嘧啶、腺嘌呤、组氨酸、脯氨酸、精氨酸和色氨酸是原养型的。菌株对Zeocin和诺尔丝菌素有抗性，并含有约八个到十一个拷贝的rhEPO表达盒。菌株具有BMT1、BMT2和BMT4基因的破坏。
质粒pGLY4472（pSH1186）（附图17）是含有表达盒的整合载体，所述表达盒包含编码大肠杆菌潮霉素B磷酸转移酶基因（HygR ）ORF（SEQ ID NO：103）的核酸分子，与棉阿舒囊霉TEF1启动子和棉阿舒囊霉TEF1终止序列可操作地连接，一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT3基因的5'核苷酸序列（SEQ ID NO：70），另一侧是巴斯德毕赤氏酵母BMT3基因的3'核苷酸序列（SEQ ID NO：71）。质粒pGLY3430线性化，线性化的质粒转化到菌株YGLY7110中以产生多个菌株，在其中HygR 表达盒通过双交叉同源重组插入到BMT3座位中。菌株YGLY7113到YGLY7122从产生的菌株中选出，对尿嘧啶、腺嘌呤、组氨酸、脯氨酸、精氨酸和色氨酸是原养型的。菌株对Zeocin、诺尔丝菌素和潮霉素有抗性，并含有约八个到十一个拷贝的EPO表达盒。菌株具有BMT1、BMT2、BMT3和BMT4基因的破坏，并产生缺乏与针对HCA制得的抗体的可检测的交叉反应性结合的rhEPO。
实施例4
实施例1到3中的几种菌株被用于生产rhEPO，如下文所述，在附图21中示意地显示。简要地，通过用来自工作细胞库的细胞接种含有培养基的摇瓶开始生产，继续通过一系列接种、孵育，以及扩展的培养物转移到大小增加的容器中，直到足够的生物质可用来接种生产生物反应器。甘油是分批阶段中的主碳源，然后通过甘油和盐的饲喂维持培养物生长。当甘油被耗尽时，通过转变为甲醇饲喂，诱导细胞表达rhEPO蛋白质。在诱导时添加抑制物以最小化O-糖基化（例如，PMTi 3、5-[ [ 3-（1-苯基乙氧基）-4-（2-苯基乙氧基）]苯基]亚甲基]-4-氧代2-硫代-3-噻唑烷乙酸，（参见公开的PCT申请No.WO 2007061631））和最小化蛋白水解作用。在阶段的末期再次添加蛋白水解作用的抑制物以最小化蛋白水解作用。培养物冷却到约4℃并收获。
菌株的实验室规模培养一般使用以下操作在500 mL SixFors和3L发酵器中进行。生物反应器筛选（SIXFORS）在0.5L 容器（Sixfors多发酵系统，ATR Biotech, Laurel, MD）中使用以下条件进行：pH值6.5，24℃，0.3 SLPM和550 rpm的起始搅拌速度，350 mL起始工作体积（330 mL BMGY培养基和20mL接种物）。在接种一小时后，IRIS多发酵器软件（ART Biotech, Laurel, MD）用于在10小时内线性地将搅拌子速度从550 rpm提高到1200 rpm。种子培养物（在1L挡板烧瓶中200 mL的BMGY）直接从琼脂平板接种。种子烧瓶在24℃孵育72小时来达到95到100之间的光密度（OD600）。发酵器用200 mL稳定期烧瓶培养物接种，所述培养物是通过离心浓缩到20 mL的。分批期在初始进料甘油（18-24h）发酵完成时结束，继之以第二分批期，其通过添加17 mL的甘油给料溶液（50％[w/w]甘油，5mg/L生物素，12.5ml/L PMTi盐（65 g/L FeSO4.7H2O, 20 g/L ZnCl2, 9 g/L H2SO4, 6 g/L CuSO4.5H2O, 5 g/L H2SO4, 3 g/L MnSO4.7H2O, 500 mg/L CoCl2.6H2O, 200 mg/L NaMoO4.2H2O, 200 mg/L 生物素, 80 mg/L NaI, 20 mg/L H3BO4））来启动。在由溶解氧中的尖峰所指示的第二分批期完成时，通过以0.6 g/h饲喂甲醇给料溶液（100% MeOH 5 mg/L生物素，12.5 mL/L PMTi）32-40小时来启动诱导期。通过离心收获培养物。
生物反应器培养（3L）在3L（Applikon, Foster City , CA）和15L（Applikon, Foster City , CA）玻璃生物反应器以及40L（Applikon, Foster City , CA）不锈钢的、在适当位置有蒸汽的生物反应器中进行。种子培养物通过直接用冷冻的储备小瓶以1%体积比接种BMGY培养基来制备。种子烧瓶在24℃孵育48小时以获得20±5的光密度（OD600）以确保细胞在转移时指数地生长。培养基每升含有40 g甘油、18.2 g山梨醇、2.3 g K2HPO4、11.9 g KH2PO4、10 g酵母提取物（BD, Franklin Lakes, NJ）、20 g蛋白胨（BD, Franklin Lakes, NJ）、4×10-3 g生物素和13.4 g Yeast Nitrogen Base（BD, Franklin Lakes, NJ）。生物反应器用种子与初始培养基10%的体积比来接种。培养在以下条件下以进料-分批方式进行：温度设置在24±0.5℃，pH值用NH4OH控制到6.5±0.1，通过级联添加O2时的搅动率将溶解氧维持在1.7±0.1 mg/L。空气流速维持在0.7 vvm。在初始进料甘油（40 g/L）耗尽之后，含有12.5 mL/L PTM1盐的50%（w/w）甘油溶液在最大生长速度的50%时指数地饲喂八小时，直到达到250g/L的湿细胞重量。诱导在30分钟的饥饿期之后启动，此时指数地饲喂甲醇以维持0.01h-1的比生长速率。当达到150 mM/L/h的氧吸收率时，甲醇进料速度保持恒定以避免氧限制。通过离心收获培养物。
通过离心和微过滤来澄清之后，滤液通过超滤浓缩10×，通过使用蓝染料-亲和性和羟磷灰石的两个层析步骤的顺序来纯化rhEPO蛋白质。初次澄清通过离心进行。整个细胞发酵液转移到1000 mL离心瓶中，在4℃在13,000×g下离心15分钟。可以对更大的发酵器采用超滤步骤（10L到40L以及更大）。这个步骤可以使用孔径大小10K的Sartorious扁平片层进行到五倍浓度。
捕获步骤使用Blue SEPHAROSE 6 Fast Flow（Pseudo-Affinity）层析进行。Blue SEPHAROSE 6 fast Flow（FF）柱（GE Healthcare）用50 mM MOPS，pH 7.0平衡。培养物上清液调节到100 mM NaCl，在加载到柱上之前通过终端滤器（Whatman, Polycap TC）。在加载后用3倍柱体积（CV）洗涤，留存时间维持在约10分钟。洗脱是50 mM MOPS，pH 7.0中的1 M NaCl的4 CV的梯级洗脱。EPO在1 M NaCl下洗脱。
中间步骤使用羟磷灰石（HA）层析进行。MacrO-prep陶瓷羟磷灰石I型40μm（BiO-Rad）在捕获步骤之后使用。这个柱用平衡溶液来平衡：50 mM MOPS，pH 7.0，含有1 M NaCl和10 mM CaCl2。在加载之前，约10 mM的CaCl2添加到来自blue柱的集中的rhEPO中。柱洗涤用3 CV的平衡溶液进行，随后是MPOS，pH 7.0中12.5 mM磷酸钠下10 CV的梯级洗脱，以提供含有rhEPO的HA库1。
阳离子交换层析步骤可以用于进一步纯化rhEPO。在羟磷灰石层析步骤之后集中的样品（例如，HA库1）相对于50 mM乙酸钠，pH 5.0在4℃透析过夜，Source 30S柱或Poros阳离子交换柱（GE Healthcare）用相同的缓冲液平衡。透析的样品施加到柱上，施加0到750 mM NaCl的10 CV线性梯度，rhEPO在350到500 mM NaCl之间洗脱，提供rhEPO。纯化的rhEPO分子的N-末端可以通过还原的氨基化（PEG化）共轭到40-kDa线型聚乙二醇（PEG）。活化的PEG以1：10的蛋白质：PEG比例添加到pH 5.2的50 mM乙酸钠缓冲液中的rhEPO样品中（浓度约1 mg/mL）。通过向反应混合物添加10 mM氰基硼氢钠并搅动过夜，反应在还原条件下在室温下进行。通过添加10 mM Tris，pH 6.0来停止反应。
单聚乙二醇化的rhEPO产物使用阳离子交换层析步骤纯化，之后渗滤到最终的制剂缓冲液中（20 mM磷酸钠，120 mM氯化钠，0.005%聚山梨酯20（w/v），pH 7.0）。
最终产品稀释到适合于填充的浓度，无菌过滤到药物贮藏容器中。聚乙二醇化的rhEPO可以保存在2-8℃直到填充，此时它们被无菌地填充到玻璃小瓶中，然后用橡皮塞和铝盖密封。蛋白质的商业配方是已知的，并可以使用。实例包括但不限于ARANESP®：聚山梨酸酯溶液：每1mL含有0.05 mg聚山梨酯80，用2.12 mg磷酸二氢钠一水合物、0.66 mg无水磷酸氢二钠和8.18 mg氯化钠在注射用水中配置为pH 6.2±0.2，USP（到1 mL）。白蛋白溶液：每1 mL含有2.5 mg白蛋白（人），用2.23 mg磷酸二氢钠一水合物、0.53 mg无水磷酸氢二钠和8.18 mg氯化钠在注射用水中配置为pH 6.0±0.3，USP（到1 mL）。EPOGEN®在等渗的氯化钠/柠檬酸钠缓冲溶液或氯化钠/磷酸钠缓冲溶液中配制为无菌的、无色液体，用于静脉内的（IV）或皮下的（SC）施用。单剂量的、无防腐剂的小瓶：每1 ml的溶液含有处在注射用水的2000、3000、4000或10,000单位的阿法依伯汀（Epoetin alfa），2.5 mg白蛋白（人），5.8 mg柠檬酸钠，5.8 mg氯化钠和0.06 mg柠檬酸，USP（pH 6.9±0.3）。这种制剂不含有防腐剂。保存的小瓶含有1%苯甲醇。
实施例5
用于分析宿主细胞抗原（HCA）的存在或缺乏的方法包括Western印迹分析以及夹心酶联免疫吸附测定（ELISA）。宿主细胞抗原（HCA）抗体使用来自NORF菌株培养物的上清液在兔中制备。NORF菌株与YGLY3159是遗传上相同的，只是它缺乏编码人成熟EPO的ORF。在完全弗氏佐剂中制备的NORF菌株发酵上清液注射到兔中，其然后用弗氏不完全佐剂中制备的发酵上清液强化三次。在45天之后，兔子进行放血，使用标准方法制备针对HCA的多克隆抗体，例如，兔多克隆IgG 9161 F072208-S，其是SLr蛋白A纯化的，以及GiF2多克隆兔::6316完整兔血清。GIF2抗体不是蛋白A纯化的。
用于检测巴斯德毕赤氏酵母HCA的Western印迹如下进行。含有纯化的聚乙二醇化或非聚乙二醇化rhEPO的样品在样品加载缓冲液中还原，其中1 μL然后添加到4-20%聚丙烯酰胺SDS Tris-HCl（4-20% SDS-PAGE）凝胶（Bio RAD）的孔中，在150 V电泳约60分钟。在100V下，分辨的蛋白质电转移到硝化纤维素膜上持续约60分钟。在转移之后，用1%阻断溶液（Roche Diagnostics）阻断膜一小时。在阻断之后，膜用1:3000稀释的兔抗-HCA多克隆抗体（初级抗体）探测。以后，洗涤膜，兔抗-HCA抗体的检测用1:5000稀释度的、缀合到辣根过氧化酶（HRP）的山羊-抗-兔IgG（H+L）（Pierce #_31460, Lot # H51015156）二级抗体进行。在洗涤膜之后，结合的二级抗体的检测使用3,3'-二氨基联苯胺（DAB）。为了检测EPO蛋白质，初级抗体是在1:1000稀释度下使用的EPO（B-4）HRP-缀合的抗体（SC5290 Lot# A0507，Santa Cruz Biotechnology）。不使用二级抗体。常规地，EPO样品与已经用PNGaseF处理脱糖基化的rhEPO样品并行地电泳。脱糖基化使用50 μL样品进行，向其中添加500 单位/μL的1 μL的PNGaseF酶。在37℃下孵育2小时之后，样品在样品加载缓冲液中还原，除去1 μL等分量并施加到上述SDS凝胶上。
用于检测巴斯德毕赤氏酵母HCA的夹心ELISA如下进行。96孔ELISA平板的反应孔用1 μg/孔的小鼠抗hEPO单克隆抗体包被。然后反应孔用磷酸盐缓冲盐水（PBS）阻断30分钟。浓缩到约200 ng/mL、约100 μL含有纯化的非聚乙二醇化rhEPO的样品添加到反应孔。初级检测使用PBS中1:800起始稀释度的兔抗-HCA多克隆抗体，其然后一排地连续1：1在PBS中稀释，到第11个反应孔以1:819,200稀释度结束。第12个反应孔充当阴性对照。ELISA的标准物是从YGLY3159纯化的rhEPO。在60分钟之后，反应孔用PBS洗涤三次。兔抗-HCA抗体的检测使用PBS中1:10,000稀释度的与碱性磷酸酶（AP）缀合的山羊抗兔抗体。60分钟之后，反应孔用PBS洗涤三次，结合的二级抗体的检测使用4-甲基伞形酮酰基磷酸（4-MUPS）。ELISA平板使用Tecan Genios Multidetection微量培养板读取器在340 nm激发波长和465 nm发射波长下读取。
实施例6
这个实施例显示了YGLY3159产生具有与抗-HCA抗体的交叉结合活性（CBA）的rhEPO，交叉结合活性是由于rhEPO上至少部分N-聚糖上β-1,2-甘露糖残基（α-1,2-甘露糖苷酶抗性）的存在，即使rhEPO是在β-1,2-甘露糖基转移酶基因BMT2被删除或破坏的菌株中产生的。rhEPO通过三步骤层析分离从糖工程化的巴斯德毕赤氏酵母生产菌株YGLY 3159的发酵上清液中回收，由SDS-PAGE、RP-HPLC和SEC-HPLC所测定的显示了约95%的蛋白质纯度。单聚乙二醇化的rhEPO通过阳离子交换层析步骤从它的超聚乙二醇化和未聚乙二醇化共轭物中分离，具有通过SDS-PAGE凝胶测定的约96%纯度。然而，针对YGLY3159菌株的HCA的抗体检测到从该菌株产生的rhEPO制品中的糖蛋白，其在Western印迹上与rhEPO共同迁移。附图22显示了抗-HCA抗体鉴定出在4-20% SDS-PAGE凝胶上与rhEPO共同迁移的蛋白质。从rhEPO上除去唾液酸不能消除交叉结合活性；然而，使用PNGase F从rhEPO上除去整个N-聚糖产生了rhEPO的脱糖基化的形式，其在使用抗-HCA抗体探测的Western印迹中是不可检出的。这在附图23中显示了，其显示了仅rhEPO的脱糖基化的形式缺乏与抗-HCA抗体的交叉结合活性。
为了确定该交叉结合活性是否是rhEPO特异性的，或是否可在来自其他重组巴斯德毕赤氏酵母菌株的纯化的糖蛋白制品中鉴定到，分离了其他菌株中产生的糖蛋白，通过4-20% SDS-PAGE凝胶分辨，凝胶转移到硝化纤维素膜。对于在重组巴斯德毕赤氏酵母中产生的重组人完整抗体（rhIgG）来说，在野生型巴斯德毕赤氏酵母（在N和O-糖基化区域中都是超甘露糖基化的）产生的、以及在重组GS2.0菌株中产生的蛋白质制品中检测到交叉结合活性，所述重组GS2.0菌株主要产生Man5GlcNAc2N-聚糖，并且也含有α-1,2-甘露糖苷酶抗性的可检测的Man9GlcNAc2N-聚糖（附图24，箭头）。然而，来自野生型巴斯德毕赤氏酵母的rhIgG制品含有大于rhIgG的表观分子量的交叉结合活性，表明制品含有污染的宿主细胞糖蛋白。交叉结合活性未能通过PNGase F消化除去（附图24中的圆圈）。附图25显示了在YGLY3159中产生的糖基化rhEPO具有与抗-HCA抗体的交叉结合活性，但是人胎球蛋白、人去唾液酸胎球蛋白、人血清白蛋白（HSA）和LEUKINE（在酿酒酵母中产生的重组人粒细胞巨噬细胞集落刺激因子（rhu GM-CSF）不具有与抗-HCA抗体的交叉结合活性。胎球蛋白是重度糖基化的血液糖蛋白，其在肝脏中产生，分泌到血流中。它们属于调节血流中各种货物物质的转运和可用性的结合蛋白质的大类。这些载体蛋白的公知的代表是血清白蛋白，是成年动物的血浆中最丰富的蛋白质。胎球蛋白在胎儿血液中是更为丰富的，由此得名“胎球蛋白（fetuin）”（来自拉丁语fetus）。胎牛血清含有比白蛋白更多的胎球蛋白，而成年血清含有的白蛋白比胎球蛋白更多。去唾液酸胎球蛋白是一类胎球蛋白，N-和O-聚糖上的末端唾液酸通过轻微的水解或神经氨酸酶处理被除去。当前，在酿酒酵母中没有β-连接的甘露糖的报道。HSA不是糖基化的蛋白质。
实验室规模的数据展现了，利用羟基磷灰石（HA）I型40μm树脂自Blue SEPHAROSE 6 FF捕获库中纯化rhEPO的中间层析步骤，可以从具有高甘露糖型N-聚糖的rhEPO（HA库2和3）中分离几乎不具有可检测的交叉结合活性的rhEPO（HA库1）。HA库1含有约90.40 %双唾液酸化的N-聚糖（期望的N-聚糖形式）和小于3.5%的中性的N-聚糖。相比之下，自0到100 mM磷酸钠的线性梯度洗脱显示了更晚的洗脱级分（HA库2和3）含有高甘露糖型N-聚糖，以及在Western印迹中提高的与抗-HCA抗体的交叉结合活性。这可以在附图26中显示的HPLC N-聚糖分析和4-20% SDS-PAGE凝胶的Western印迹中看出。
还测试了利用Q SEPHAROSE FF或Source 30Q阴离子树脂的阴离子柱层析。组合HA库1-3，并在4℃下相对于pH 5.0的50 mM乙酸钠透析过夜。透析的样品施加到柱上，施加0到750 mM NaCl的10 CV线性梯度，rhEPO在350到500 mM NaCl之间洗脱，提供rhEPO。附图27A显示了rhEPO的Q SEPHAROSE FF纯化的实例。数据显示了，当在夹心ELISA中分析结合和未结合的材料时，显示了更高交叉结合活性的高甘露糖型聚糖（Man6,7,8,9,>9，大部分是α1,2甘露糖苷酶抗性的）不结合阴离子交换树脂（附图27B）。表1显示了结合的级分（Q琼脂糖FF库1）和流通级分（Q SEPHAROSE FF流通物）中rhEPO的N-聚糖含量的HPLC分析结果。表2显示了表1中显示的中性的N-聚糖的N-聚糖含量。
附图和表格显示了，具有与抗-HCA抗体不可检测的交叉结合活性的rhEPO、以及好的蛋白质和聚糖质量因此可以结合/从阴离子交换树脂上洗脱。这些数据还表明，涉及β-1,2-连接的寡甘露糖生物合成的真菌基因的家族（BMT1、BMT2、BMT3、BMT4）对于rhEPO制品中低水平的交叉结合混杂物负责。
因而，当作为整体来看时，结果表明了，对抗-HCA抗体的交叉结合活性不是特异于rhEPO的，而是由于糖蛋白上的α-1,2-甘露糖苷酶抗性N-聚糖。通过敲除五种内源的糖基化基因并引入15种异源基因产生了YGLY 3159。YGLY3159是bmt2 Δ敲除的菌株。NMR光谱研究表明，bmt2 Δ敲除的菌株可以产生具有变化数量的残余β-1,2-甘露糖N-聚糖的糖蛋白。由于YGLY 3159是bmt2 Δ的，推测的是BMT1和BMT3对于核心N-聚糖上残余的低水平β-1,2-甘露糖转移负责。
虽然层析步骤的组合来纯化rhEPO可以产生没有与抗-HCA抗体的可检测交叉结合活性的rhEPO制品，特别希望的是遗传修饰巴斯德毕赤氏酵母宿主菌株来降低或消除菌株中与抗-HCA抗体的可检测交叉结合活性。这使得由于纯化中的变异性、带有交叉结合活性的rhEPO制品的可能的污染风险最小化了。此外，由于每个纯化步骤可能引起rhEPO的损失，遗传修饰的巴斯德毕赤氏酵母菌株可以降低纯化步骤的数量，因而减少了被省略的步骤期间损失的rhEPO数量。因而，四种BMT基因的表达被连续地删除或破坏，以鉴定不产生与抗-HCA抗体的可检测交叉结合活性的菌株。
实施例7
为了将β-连接的甘露糖型N-聚糖的存在降低到不可检测的水平，BMT1和BMT4基因被破坏，分析rhEPO中α-1,2-甘露糖苷酶抗性N-聚糖的存在。
菌株YGLY6661和YGLY7013如实施例2描述的构建，使用抗-HCA抗体分析α-1,2-甘露糖苷酶抗性N-聚糖的存在。菌株YGLY7013是bmt2 Δ和bmt4 Δ的，菌株YGLY6661是 bmt2 Δ、bmt4 Δ和 bmt1 Δ的。菌株产生的rhEPO经历Blue SEPHAROSE 6FF层析，Blue SEPHAROSE 6FF捕获库的等分量用PNGase F velnon处理。处理的和未处理的等分量在SDS-PAGE上电泳，凝胶转移到硝化纤维素膜，用抗EPO抗体或抗-HCA抗体探测膜。附图28显示了Blue SEPHAROSE 6 FF捕获库的等分量的4-20% SDS-PAGE凝胶的Western印迹中，每一个菌株产生的rhEPO仍然具有与抗-HCA抗体交叉反应的α-1,2-甘露糖苷酶抗性N-聚糖。表3和4显示了来自发酵和SixFors培养物的Blue Sepaharose 6 FF捕获库中rhEPO中N-聚糖种类的分布。如表格中所示的，两种菌株都产生了相当数量的中性的N-聚糖，其部分对体外α1,2-甘露糖苷酶消化有抗性。
与YGLY3159相比，从两种菌株中制得的Blue SEPHAROSE 6 FF捕获库中rhEPO的夹心ELISA显示了两种菌株都具有与抗-HCA抗体的交叉结合活性（附图29）。进一步通过羟磷灰石（HA）层析纯化rhEPO，通过夹心ELISA分析样品，显示了含有产自YGLY6661（bmt2 Δ、bmt4 Δ和bmt1 Δ）的rhEPO的HA库1看起来缺乏与抗-HCA抗体的可检测交叉结合活性，但是在YGLY7013（bmt2 Δ和 bmt4 Δ）中产生的rhEPO仍然具有与抗-HCA抗体的可检测交叉结合活性（附图30）。结果表明，删除BMT2和BMT1基因不足以除去所有可检测的交叉结合活性。结果还显示了羟磷灰石层析可以除去HA库1中可检测的交叉结合活性。附图31是4-20% SDS-PAGE凝胶的Western印迹，显示了在从菌株YGLY6661制备的其他Blue SEPHAROSE 6 FF捕获库中的rhEPO继续具有与抗-HCA抗体的交叉结合活性，并且交叉结合活性仍然可以通过rhEPO的脱糖基化变为不可检测。结果表明，为了产生没有与抗-HCA抗体的可检测交叉结合活性的rhEPO，需要通过破坏或删除来取消BMT3基因的表达。
实施例8
为了更有效地实现可检测的β-连接的甘露糖型聚糖的消除，涉及甘露糖基转移酶途径的所有四种BMT基因被破坏。评估菌株YGLY7361-7366和YGLY7393-7398（实施例2）产生缺乏与抗-HCA抗体的可检测交叉结合活性的rhEPO的能力。
其中涉及β-甘露糖基转移酶途径的所有四种BMT基因被破坏的各个YGLY7361-7366和YGLY7393-7398菌株在500 mL SixFors发酵器中生长，然后为rhEPO通过Blue SEPHAROSE 6 FF库（Blue库）加工。通过4-20% SDS-PAGE分析来自Blue库的等分量。附图32显示了有和没有PNGase F处理的、来自各个菌株的Blue库的Commassie Blue染色的4-20% SDS-PAGE凝胶。凝胶显示了，所有测试的菌株产生糖基化的rhEPO。通过夹心ELISA评估了一些菌株对抗-HCA抗体的交叉结合活性。附图33显示了大部分菌株缺乏与抗-HCA抗体的可检测交叉结合活性。然而，菌株YGLY7363和YGLY7365具有与抗-HCA抗体的可检测交叉结合活性。通过PCR对YGLY7365的重新确认表明了这个菌株不是完全敲除BMT3基因的，解释了在ELISA中出现的用抗-HCA抗体观察到的相对高的结合（附图33）。菌株YGLY7361-7366的HPLC N-聚糖分析在表5中显示，菌株YGLY7393-7398在表6中显示。表格中的数据在附图34中图形地呈现。
菌株YGLY7362、7366、7396和7398在3L发酵器中培养，通过Blue SEPHAROSE 6 FF层析、随后的羟磷灰石（HA）层析来加工。来自Blue库和HA库的等分量都被还原和通过4-20% SDS-PAGE分析。包括YGLY3159的相应的库作为阳性对照。附图35A显示了，Commassie Blue染色的4-20% SDS-PAGE显示了Blue库（凝胶的左半边）和HA库（凝胶的右半边）产生rhEPO。附图35B显示了抗-HCA抗体探测的相同样品的Western印迹。在Blue库或HA库1中，测试的菌株都没有与抗-HCA抗体的任何可检测的交叉结合活性。附图36分析了从YGLY7398的500mL SixFors培养物分离的rhEPO的Blue库和HA库1对抗-HCA抗体的交叉结合活性。最右侧画面显示了用另一种抗-HCA制品：GiF2多克隆兔：：6316探测的Western印迹。这种抗体产生了与使用F072208-S抗体产生的相同的结果，所述F072208-S抗体已经被用于产生此处显示的ELISAs和Western印迹。6316抗体显示了交叉结合活性不是抗体特异性的。这些结果显示了，所有四种BMT基因的删除或破坏可以产生这样的菌株，在初步的Blue SEPHAROSE 6 FF捕获步骤，或使用I型40μM羟磷灰石的中间羟磷灰石步骤之后，在两种rhEPO中，所述菌株不产生对抗-HCA抗体的可检测交叉结合活性。这些菌株最小化了rhEPO制品被制成含有与抗-HCA抗体的交叉结合活性的风险。这允许产生在接受rhEPO的个体中诱导有害免疫反应的更低风险的rhEPO。
实施例9
所有四种BMT基因被破坏或删除的、实施例2中产生的菌株中生产的并被聚乙二醇化的rhEPO的药物动力学比较，与产自菌株YGLY3159的聚乙二醇化的rhEPO相比。比较显示了聚乙二醇化的EPO具有降低的体内半衰期和更低的体内效力（参见表7和8）。在实施例2中产生的菌株中生产的rhEPO没有与抗-HCA抗体的可检测交叉结合活性，具有的药物动力学一般地类似于EPOGEN，没有ARANESP的更高药物动力学。发现了降低的药物动力学是双唾液酸化的双分枝N-聚糖数量的函数。rhEPO上更高水平的双唾液酸化的双分枝N-聚糖与更高的药物动力学相关。这些结果与公开的数据一致，显示了更长的半衰期与CHO细胞中产生的重组人红细胞生成素的更高唾液酸含量相关（Egrie et al, Exp. Hematol. 31: 290-299（2003））。
实施例10
为了有效地实现可检测的β-连接甘露糖型聚糖的消除，并产生生产更高药物动力学的rhEPO的菌株，制得实施例3中描述的菌株YGLY7113-7122，评估生产缺乏与抗-HCA抗体的可检测交叉结合活性的rhEPO的能力。这些菌株被修饰以也表达作为与鸡溶菌酶前导序列融合的融合蛋白的人成熟EPO。因而，这些菌株表达与酿酒酵母αMATpre信号肽融合的人成熟EPO，以及作为与鸡溶菌酶前导序列融合的融合蛋白的人成熟EPO。
其中涉及β-甘露糖基转移酶途径的所有四种BMT基因被破坏的各个YGLY7113-YGLY7122菌株在500 mL SixFors发酵器中生长，然后为了rhEPO通过Blue SEPHAROSE 6 FF库加工（Blue库）。使用抗-HCA抗体通过夹心ELISA分析了几种菌株的Blue库的等分量。附图37显示了YGLY7118具有与抗-HCA抗体的非常低的交叉结合活性，但是所有其他菌株没有显示与抗-HCA抗体的可检测的交叉结合活性。菌株YGLY7113-7117的HPLC N-聚糖分析在表9中示出，菌株YGLY7118-7122的在表10中示出。表格在附图38中图形地呈现。
菌株YGLY7115、7117和7120在3L发酵器中培养，通过Blue SEPHAROSE 6 FF层析、随后的羟磷灰石（HA）层析来加工。来自Blue库和HA库的等分量都被还原和通过4-20% SDS-PAGE分析。包括YGLY3159的相应的库作为阳性对照。包括YGLY7395的相应的库作为阴性对照。附图39A显示了，Commassie Blue染色的4-20% SDS-PAGE显示了Blue库（凝胶的左半边）和HA库（凝胶的右半边）产生rhEPO。附图35B显示了抗-HCA抗体探测的相同样品的Western印迹。在Blue库或HA库1中，测试的菌株都没有与抗-HCA抗体的任何可检测的交叉结合活性。这些结果也显示了，所有四种BMT基因的删除或破坏可以产生这样的菌株，在初步的Blue SEPHAROSE 6 FF捕获步骤，或使用I型40μM羟磷灰石的中间羟磷灰石步骤之后，在两种rhEPO中，所述菌株不产生对抗-HCA抗体的可检测交叉结合活性。这些菌株最小化了rhEPO制品被制成含有与抗-HCA抗体的交叉结合活性的风险。这允许产生在接受rhEPO的个体中诱导有害免疫反应的更低风险的rhEPO。
实施例11
含有YGLY7117产生的rhEPO的Blue库进一步进行羟磷灰石柱层析，分析HA库中的rhEPO的唾液酸化含量。附图40A和附图40B分别显示了，与来自YGLY7117中产生的rhEPO的N-聚糖相比，YGLY3159中产生的rhEPO的N-聚糖的HPLC痕迹。附图还显示了羟磷灰石柱除去了其他污染物；因而，在这个分析中，YGLY7117产生的rhEPO的唾液酸化含量是约99%（中性的N-聚糖是约1%），其中约89%是A2或双唾液酸化的，约10%是A1或单唾液酸化的。
在根据实施例3的过程PEG化之后，YGLY7117中产生的rhEPO的唾液酸化分析类似于PEG化之前唾液酸化的量；然而，唾液酸化的量可能取决于，例如，对生长条件进行什么样的修改，例如，培养基成分、饲喂速率等等而有限程度地改变（参见表11）。因而，此处的方法产生了rhEPO组合物，其具有至少约75%的A2唾液酸化，或约75%到89%之间的A2唾液酸化。因而，总唾液酸含量是至少4.5摩尔唾液酸每摩尔rhEPO，更具体地，约4.6到5.7摩尔唾液酸每摩尔rhEPO。
所有四种BMT基因被破坏或删除的、实施例3中产生的YGLY7117中生产的并被聚乙二醇化的rhEPO的药物动力学比较，与产自YGLY3159的聚乙二醇化的rhEPO相比。比较显示了菌株YGLY7117中产生的聚乙二醇化的rhEPO具有的体内半衰期和体内效力类似于YGLY3159和ARANESP的（参见表12和13）。
序列
用于生产实施例1-11中公开的某些菌株的序列在表14中提供。
虽然在此参考说明性实施方式描述了本发明，要理解的是本发明不限于此。具有本领域的普通技术并且接受此处的教导的人员将认识到其他修改和实施方式处于其范围内。因而，本发明仅由此处附随的权利要求限制。
序列表
<110> Bobrowicz, Piotr
Gomathinayagam, Sujatha
Hamilton, Stephen
Li, Huijuan
Setheraman, Natarajan
Stadheim, Terrance A.
Wildt, Stephan
<120> 在巴斯德毕赤氏酵母中生产缺乏与针对宿主细胞抗原的抗体的
可检测交叉结合活性的蛋白质的方法
<130> GFI-MIS-00002
<150> 61/252,312
<151> 2009-10-16
<160> 106
<170> FastSEQ for Windows Version 4.0
<210> 1
<211> 3029
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<221> CDS
<222> (909)...(2504)
<223> 编码转化酶
<400> 1
aggcctcgca acaacctata attgagttaa gtgcctttcc aagctaaaaa gtttgaggtt 60
ataggggctt agcatccaca cgtcacaatc tcgggtatcg agtatagtat gtagaattac 120
ggcaggaggt ttcccaatga acaaaggaca ggggcacggt gagctgtcga aggtatccat 180
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Met Leu Leu Gln Ala Phe Leu Phe Leu Leu Ala Gly Phe Ala
1 5 10
gcc aaa ata tct gca tca atg aca aac gaa act agc gat aga cct ttg 998
Ala Lys Ile Ser Ala Ser Met Thr Asn Glu Thr Ser Asp Arg Pro Leu
15 20 25 30
gtc cac ttc aca ccc aac aag ggc tgg atg aat gac cca aat ggg ttg 1046
Val His Phe Thr Pro Asn Lys Gly Trp Met Asn Asp Pro Asn Gly Leu
35 40 45
tgg tac gat gaa aaa gat gcc aaa tgg cat ctg tac ttt caa tac aac 1094
Trp Tyr Asp Glu Lys Asp Ala Lys Trp His Leu Tyr Phe Gln Tyr Asn
50 55 60
cca aat gac acc gta tgg ggt acg cca ttg ttt tgg ggc cat gct act 1142
Pro Asn Asp Thr Val Trp Gly Thr Pro Leu Phe Trp Gly His Ala Thr
65 70 75
tcc gat gat ttg act aat tgg gaa gat caa ccc att gct atc gct ccc 1190
Ser Asp Asp Leu Thr Asn Trp Glu Asp Gln Pro Ile Ala Ile Ala Pro
80 85 90
aag cgt aac gat tca ggt gct ttc tct ggc tcc atg gtg gtt gat tac 1238
Lys Arg Asn Asp Ser Gly Ala Phe Ser Gly Ser Met Val Val Asp Tyr
95 100 105 110
aac aac acg agt ggg ttt ttc aat gat act att gat cca aga caa aga 1286
Asn Asn Thr Ser Gly Phe Phe Asn Asp Thr Ile Asp Pro Arg Gln Arg
115 120 125
tgc gtt gcg att tgg act tat aac act cct gaa agt gaa gag caa tac 1334
Cys Val Ala Ile Trp Thr Tyr Asn Thr Pro Glu Ser Glu Glu Gln Tyr
130 135 140
att agc tat tct ctt gat ggt ggt tac act ttt act gaa tac caa aag 1382
Ile Ser Tyr Ser Leu Asp Gly Gly Tyr Thr Phe Thr Glu Tyr Gln Lys
145 150 155
aac cct gtt tta gct gcc aac tcc act caa ttc aga gat cca aag gtg 1430
Asn Pro Val Leu Ala Ala Asn Ser Thr Gln Phe Arg Asp Pro Lys Val
160 165 170
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Phe Trp Tyr Glu Pro Ser Gln Lys Trp Ile Met Thr Ala Ala Lys Ser
175 180 185 190
caa gac tac aaa att gaa att tac tcc tct gat gac ttg aag tcc tgg 1526
Gln Asp Tyr Lys Ile Glu Ile Tyr Ser Ser Asp Asp Leu Lys Ser Trp
195 200 205
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Lys Leu Glu Ser Ala Phe Ala Asn Glu Gly Phe Leu Gly Tyr Gln Tyr
210 215 220
gaa tgt cca ggt ttg att gaa gtc cca act gag caa gat cct tcc aaa 1622
Glu Cys Pro Gly Leu Ile Glu Val Pro Thr Glu Gln Asp Pro Ser Lys
225 230 235
tct tat tgg gtc atg ttt att tct atc aac cca ggt gca cct gct ggc 1670
Ser Tyr Trp Val Met Phe Ile Ser Ile Asn Pro Gly Ala Pro Ala Gly
240 245 250
ggt tcc ttc aac caa tat ttt gtt gga tcc ttc aat ggt act cat ttt 1718
Gly Ser Phe Asn Gln Tyr Phe Val Gly Ser Phe Asn Gly Thr His Phe
255 260 265 270
gaa gcg ttt gac aat caa tct aga gtg gta gat ttt ggt aag gac tac 1766
Glu Ala Phe Asp Asn Gln Ser Arg Val Val Asp Phe Gly Lys Asp Tyr
275 280 285
tat gcc ttg caa act ttc ttc aac act gac cca acc tac ggt tca gca 1814
Tyr Ala Leu Gln Thr Phe Phe Asn Thr Asp Pro Thr Tyr Gly Ser Ala
290 295 300
tta ggt att gcc tgg gct tca aac tgg gag tac agt gcc ttt gtc cca 1862
Leu Gly Ile Ala Trp Ala Ser Asn Trp Glu Tyr Ser Ala Phe Val Pro
305 310 315
act aac cca tgg aga tca tcc atg tct ttg gtc cgc aag ttt tct ttg 1910
Thr Asn Pro Trp Arg Ser Ser Met Ser Leu Val Arg Lys Phe Ser Leu
320 325 330
aac act gaa tat caa gct aat cca gag act gaa ttg atc aat ttg aaa 1958
Asn Thr Glu Tyr Gln Ala Asn Pro Glu Thr Glu Leu Ile Asn Leu Lys
335 340 345 350
gcc gaa cca ata ttg aac att agt aat gct ggt ccc tgg tct cgt ttt 2006
Ala Glu Pro Ile Leu Asn Ile Ser Asn Ala Gly Pro Trp Ser Arg Phe
355 360 365
gct act aac aca act cta act aag gcc aat tct tac aat gtc gat ttg 2054
Ala Thr Asn Thr Thr Leu Thr Lys Ala Asn Ser Tyr Asn Val Asp Leu
370 375 380
agc aac tcg act ggt acc cta gag ttt gag ttg gtt tac gct gtt aac 2102
Ser Asn Ser Thr Gly Thr Leu Glu Phe Glu Leu Val Tyr Ala Val Asn
385 390 395
acc aca caa acc ata tcc aaa tcc gtc ttt gcc gac tta tca ctt tgg 2150
Thr Thr Gln Thr Ile Ser Lys Ser Val Phe Ala Asp Leu Ser Leu Trp
400 405 410
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Phe Lys Gly Leu Glu Asp Pro Glu Glu Tyr Leu Arg Met Gly Phe Glu
415 420 425 430
gtc agt gct tct tcc ttc ttt ttg gac cgt ggt aac tct aag gtc aag 2246
Val Ser Ala Ser Ser Phe Phe Leu Asp Arg Gly Asn Ser Lys Val Lys
435 440 445
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Phe Val Lys Glu Asn Pro Tyr Phe Thr Asn Arg Met Ser Val Asn Asn
450 455 460
caa cca ttc aag tct gag aac gac cta agt tac tat aaa gtg tac ggc 2342
Gln Pro Phe Lys Ser Glu Asn Asp Leu Ser Tyr Tyr Lys Val Tyr Gly
465 470 475
cta ctg gat caa aac atc ttg gaa ttg tac ttc aac gat gga gat gtg 2390
Leu Leu Asp Gln Asn Ile Leu Glu Leu Tyr Phe Asn Asp Gly Asp Val
480 485 490
gtt tct aca aat acc tac ttc atg acc acc ggt aac gct cta gga tct 2438
Val Ser Thr Asn Thr Tyr Phe Met Thr Thr Gly Asn Ala Leu Gly Ser
495 500 505 510
gtg aac atg acc act ggt gtc gat aat ttg ttc tac att gac aag ttc 2486
Val Asn Met Thr Thr Gly Val Asp Asn Leu Phe Tyr Ile Asp Lys Phe
515 520 525
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Gln Val Arg Glu Val Lys
530
tttttttcaa aagccattct aaagggcttt agctaacgag tgacgaatgt aaaactttat 2594
gatttcaaag aatacctcca aaccattgaa aatgtatttt tatttttatt ttctcccgac 2654
cccagttacc tggaatttgt tctttatgta ctttatataa gtataattct cttaaaaatt 2714
tttactactt tgcaatagac atcatttttt cacgtaataa acccacaatc gtaatgtagt 2774
tgccttacac tactaggatg gacctttttg cctttatctg ttttgttact gacacaatga 2834
aaccgggtaa agtattagtt atgtgaaaat ttaaaagcat taagtagaag tataccatat 2894
tgtaaaaaaa aaaagcgttg tcttctacgt aaaagtgttc tcaaaaagaa gtagtgaggg 2954
aaatggatac caagctatct gtaacaggag ctaaaaaatc tcagggaaaa gcttctggtt 3014
tgggaaacgg tcgac 3029
<210> 2
<211> 532
<212> PRT
<213> 酿酒酵母
<400> 2
Met Leu Leu Gln Ala Phe Leu Phe Leu Leu Ala Gly Phe Ala Ala Lys
1 5 10 15
Ile Ser Ala Ser Met Thr Asn Glu Thr Ser Asp Arg Pro Leu Val His
20 25 30
Phe Thr Pro Asn Lys Gly Trp Met Asn Asp Pro Asn Gly Leu Trp Tyr
35 40 45
Asp Glu Lys Asp Ala Lys Trp His Leu Tyr Phe Gln Tyr Asn Pro Asn
50 55 60
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Asn Asp Ser Gly Ala Phe Ser Gly Ser Met Val Val Asp Tyr Asn Asn
100 105 110
Thr Ser Gly Phe Phe Asn Asp Thr Ile Asp Pro Arg Gln Arg Cys Val
115 120 125
Ala Ile Trp Thr Tyr Asn Thr Pro Glu Ser Glu Glu Gln Tyr Ile Ser
130 135 140
Tyr Ser Leu Asp Gly Gly Tyr Thr Phe Thr Glu Tyr Gln Lys Asn Pro
145 150 155 160
Val Leu Ala Ala Asn Ser Thr Gln Phe Arg Asp Pro Lys Val Phe Trp
165 170 175
Tyr Glu Pro Ser Gln Lys Trp Ile Met Thr Ala Ala Lys Ser Gln Asp
180 185 190
Tyr Lys Ile Glu Ile Tyr Ser Ser Asp Asp Leu Lys Ser Trp Lys Leu
195 200 205
Glu Ser Ala Phe Ala Asn Glu Gly Phe Leu Gly Tyr Gln Tyr Glu Cys
210 215 220
Pro Gly Leu Ile Glu Val Pro Thr Glu Gln Asp Pro Ser Lys Ser Tyr
225 230 235 240
Trp Val Met Phe Ile Ser Ile Asn Pro Gly Ala Pro Ala Gly Gly Ser
245 250 255
Phe Asn Gln Tyr Phe Val Gly Ser Phe Asn Gly Thr His Phe Glu Ala
260 265 270
Phe Asp Asn Gln Ser Arg Val Val Asp Phe Gly Lys Asp Tyr Tyr Ala
275 280 285
Leu Gln Thr Phe Phe Asn Thr Asp Pro Thr Tyr Gly Ser Ala Leu Gly
290 295 300
Ile Ala Trp Ala Ser Asn Trp Glu Tyr Ser Ala Phe Val Pro Thr Asn
305 310 315 320
Pro Trp Arg Ser Ser Met Ser Leu Val Arg Lys Phe Ser Leu Asn Thr
325 330 335
Glu Tyr Gln Ala Asn Pro Glu Thr Glu Leu Ile Asn Leu Lys Ala Glu
340 345 350
Pro Ile Leu Asn Ile Ser Asn Ala Gly Pro Trp Ser Arg Phe Ala Thr
355 360 365
Asn Thr Thr Leu Thr Lys Ala Asn Ser Tyr Asn Val Asp Leu Ser Asn
370 375 380
Ser Thr Gly Thr Leu Glu Phe Glu Leu Val Tyr Ala Val Asn Thr Thr
385 390 395 400
Gln Thr Ile Ser Lys Ser Val Phe Ala Asp Leu Ser Leu Trp Phe Lys
405 410 415
Gly Leu Glu Asp Pro Glu Glu Tyr Leu Arg Met Gly Phe Glu Val Ser
420 425 430
Ala Ser Ser Phe Phe Leu Asp Arg Gly Asn Ser Lys Val Lys Phe Val
435 440 445
Lys Glu Asn Pro Tyr Phe Thr Asn Arg Met Ser Val Asn Asn Gln Pro
450 455 460
Phe Lys Ser Glu Asn Asp Leu Ser Tyr Tyr Lys Val Tyr Gly Leu Leu
465 470 475 480
Asp Gln Asn Ile Leu Glu Leu Tyr Phe Asn Asp Gly Asp Val Val Ser
485 490 495
Thr Asn Thr Tyr Phe Met Thr Thr Gly Asn Ala Leu Gly Ser Val Asn
500 505 510
Met Thr Thr Gly Val Asp Asn Leu Phe Tyr Ile Asp Lys Phe Gln Val
515 520 525
Arg Glu Val Lys
530
<210> 3
<211> 2159
<212> DNA
<213> 乳酸克鲁维酵母
<220>
<221> CDS
<222> (1024)...(2007)
<223> 编码 UDP-GlcNAc 转运蛋白 (KIMNN2-2)
<400> 3
aaacgtaacg cctggcactc tattttctca aacttctggg acggaagagc taaatattgt 60
gttgcttgaa caaacccaaa aaaacaaaaa aatgaacaaa ctaaaactac acctaaataa 120
accgtgtgta aaacgtagta ccatattact agaaaagatc acaagtgtat cacacatgtg 180
catctcatat tacatctttt atccaatcca ttctctctat cccgtctgtt cctgtcagat 240
tctttttcca taaaaagaag aagaccccga atctcaccgg tacaatgcaa aactgctgaa 300
aaaaaaagaa agttcactgg atacgggaac agtgccagta ggcttcacca catggacaaa 360
acaattgacg ataaaataag caggtgagct tctttttcaa gtcacgatcc ctttatgtct 420
cagaaacaat atatacaagc taaacccttt tgaaccagtt ctctcttcat agttatgttc 480
acataaattg cgggaacaag actccgctgg ctgtcaggta cacgttgtaa cgttttcgtc 540
cgcccaatta ttagcacaac attggcaaaa agaaaaactg ctcgttttct ctacaggtaa 600
attacaattt ttttcagtaa ttttcgctga aaaatttaaa gggcaggaaa aaaagacgat 660
ctcgactttg catagatgca agaactgtgg tcaaaacttg aaatagtaat tttgctgtgc 720
gtgaactaat aaatatatat atatatatat atatatattt gtgtattttg tatatgtaat 780
tgtgcacgtc ttggctattg gatataagat tttcgcgggt tgatgacata gagcgtgtac 840
tactgtaata gttgtatatt caaaagctgc tgcgtggaga aagactaaaa tagataaaaa 900
gcacacattt tgacttcggt accgtcaact tagtgggaca gtcttttata tttggtgtaa 960
gctcatttct ggtactattc gaaacagaac agtgttttct gtattaccgt ccaatcgttt 1020
gtc atg agt ttt gta ttg att ttg tcg tta gtg ttc gga gga tgt tgt 1068
Met Ser Phe Val Leu Ile Leu Ser Leu Val Phe Gly Gly Cys Cys
1 5 10 15
tcc aat gtg att agt ttc gag cac atg gtg caa ggc agc aat ata aat 1116
Ser Asn Val Ile Ser Phe Glu His Met Val Gln Gly Ser Asn Ile Asn
20 25 30
ttg gga aat att gtt aca ttc act caa ttc gtg tct gtg acg cta att 1164
Leu Gly Asn Ile Val Thr Phe Thr Gln Phe Val Ser Val Thr Leu Ile
35 40 45
cag ttg ccc aat gct ttg gac ttc tct cac ttt ccg ttt agg ttg cga 1212
Gln Leu Pro Asn Ala Leu Asp Phe Ser His Phe Pro Phe Arg Leu Arg
50 55 60
cct aga cac att cct ctt aag atc cat atg tta gct gtg ttt ttg ttc 1260
Pro Arg His Ile Pro Leu Lys Ile His Met Leu Ala Val Phe Leu Phe
65 70 75
ttt acc agt tca gtc gcc aat aac agt gtg ttt aaa ttt gac att tcc 1308
Phe Thr Ser Ser Val Ala Asn Asn Ser Val Phe Lys Phe Asp Ile Ser
80 85 90 95
gtt ccg att cat att atc att aga ttt tca ggt acc act ttg acg atg 1356
Val Pro Ile His Ile Ile Ile Arg Phe Ser Gly Thr Thr Leu Thr Met
100 105 110
ata ata ggt tgg gct gtt tgt aat aag agg tac tcc aaa ctt cag gtg 1404
Ile Ile Gly Trp Ala Val Cys Asn Lys Arg Tyr Ser Lys Leu Gln Val
115 120 125
caa tct gcc atc att atg acg ctt ggt gcg att gtc gca tca tta tac 1452
Gln Ser Ala Ile Ile Met Thr Leu Gly Ala Ile Val Ala Ser Leu Tyr
130 135 140
cgt gac aaa gaa ttt tca atg gac agt tta aag ttg aat acg gat tca 1500
Arg Asp Lys Glu Phe Ser Met Asp Ser Leu Lys Leu Asn Thr Asp Ser
145 150 155
gtg ggt atg acc caa aaa tct atg ttt ggt atc ttt gtt gtg cta gtg 1548
Val Gly Met Thr Gln Lys Ser Met Phe Gly Ile Phe Val Val Leu Val
160 165 170 175
gcc act gcc ttg atg tca ttg ttg tcg ttg ctc aac gaa tgg acg tat 1596
Ala Thr Ala Leu Met Ser Leu Leu Ser Leu Leu Asn Glu Trp Thr Tyr
180 185 190
aac aag tac ggg aaa cat tgg aaa gaa act ttg ttc tat tcg cat ttc 1644
Asn Lys Tyr Gly Lys His Trp Lys Glu Thr Leu Phe Tyr Ser His Phe
195 200 205
ttg gct cta ccg ttg ttt atg ttg ggg tac aca agg ctc aga gac gaa 1692
Leu Ala Leu Pro Leu Phe Met Leu Gly Tyr Thr Arg Leu Arg Asp Glu
210 215 220
ttc aga gac ctc tta att tcc tca gac tca atg gat att cct att gtt 1740
Phe Arg Asp Leu Leu Ile Ser Ser Asp Ser Met Asp Ile Pro Ile Val
225 230 235
aaa tta cca att gct acg aaa ctt ttc atg cta ata gca aat aac gtg 1788
Lys Leu Pro Ile Ala Thr Lys Leu Phe Met Leu Ile Ala Asn Asn Val
240 245 250 255
acc cag ttc att tgt atc aaa ggt gtt aac atg cta gct agt aac acg 1836
Thr Gln Phe Ile Cys Ile Lys Gly Val Asn Met Leu Ala Ser Asn Thr
260 265 270
gat gct ttg aca ctt tct gtc gtg ctt cta gtg cgt aaa ttt gtt agt 1884
Asp Ala Leu Thr Leu Ser Val Val Leu Leu Val Arg Lys Phe Val Ser
275 280 285
ctt tta ctc agt gtc tac atc tac aag aac gtc cta tcc gtg act gca 1932
Leu Leu Leu Ser Val Tyr Ile Tyr Lys Asn Val Leu Ser Val Thr Ala
290 295 300
tac cta ggg acc atc acc gtg ttc ctg gga gct ggt ttg tat tca tat 1980
Tyr Leu Gly Thr Ile Thr Val Phe Leu Gly Ala Gly Leu Tyr Ser Tyr
305 310 315
ggt tcg gtc aaa act gca ctg cct cgc tgaaacaatc cacgtctgta 2027
Gly Ser Val Lys Thr Ala Leu Pro Arg
320 325
tgatactcgt ttcagaattt ttttgatttt ctgccggata tggtttctca tctttacaat 2087
cgcattctta attataccag aacgtaattc aatgatccca gtgactcgta actcttatat 2147
gtcaatttaa gc 2159
<210> 4
<211> 328
<212> PRT
<213> 乳酸克鲁维酵母
<400> 4
Met Ser Phe Val Leu Ile Leu Ser Leu Val Phe Gly Gly Cys Cys Ser
1 5 10 15
Asn Val Ile Ser Phe Glu His Met Val Gln Gly Ser Asn Ile Asn Leu
20 25 30
Gly Asn Ile Val Thr Phe Thr Gln Phe Val Ser Val Thr Leu Ile Gln
35 40 45
Leu Pro Asn Ala Leu Asp Phe Ser His Phe Pro Phe Arg Leu Arg Pro
50 55 60
Arg His Ile Pro Leu Lys Ile His Met Leu Ala Val Phe Leu Phe Phe
65 70 75 80
Thr Ser Ser Val Ala Asn Asn Ser Val Phe Lys Phe Asp Ile Ser Val
85 90 95
Pro Ile His Ile Ile Ile Arg Phe Ser Gly Thr Thr Leu Thr Met Ile
100 105 110
Ile Gly Trp Ala Val Cys Asn Lys Arg Tyr Ser Lys Leu Gln Val Gln
115 120 125
Ser Ala Ile Ile Met Thr Leu Gly Ala Ile Val Ala Ser Leu Tyr Arg
130 135 140
Asp Lys Glu Phe Ser Met Asp Ser Leu Lys Leu Asn Thr Asp Ser Val
145 150 155 160
Gly Met Thr Gln Lys Ser Met Phe Gly Ile Phe Val Val Leu Val Ala
165 170 175
Thr Ala Leu Met Ser Leu Leu Ser Leu Leu Asn Glu Trp Thr Tyr Asn
180 185 190
Lys Tyr Gly Lys His Trp Lys Glu Thr Leu Phe Tyr Ser His Phe Leu
195 200 205
Ala Leu Pro Leu Phe Met Leu Gly Tyr Thr Arg Leu Arg Asp Glu Phe
210 215 220
Arg Asp Leu Leu Ile Ser Ser Asp Ser Met Asp Ile Pro Ile Val Lys
225 230 235 240
Leu Pro Ile Ala Thr Lys Leu Phe Met Leu Ile Ala Asn Asn Val Thr
245 250 255
Gln Phe Ile Cys Ile Lys Gly Val Asn Met Leu Ala Ser Asn Thr Asp
260 265 270
Ala Leu Thr Leu Ser Val Val Leu Leu Val Arg Lys Phe Val Ser Leu
275 280 285
Leu Leu Ser Val Tyr Ile Tyr Lys Asn Val Leu Ser Val Thr Ala Tyr
290 295 300
Leu Gly Thr Ile Thr Val Phe Leu Gly Ala Gly Leu Tyr Ser Tyr Gly
305 310 315 320
Ser Val Lys Thr Ala Leu Pro Arg
325
<210> 5
<211> 108
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码 Mnn2 前导区 (53)
<400> 5
atgctgctta ccaaaaggtt ttcaaagctg ttcaagctga cgttcatagt tttgatattg 60
tgcgggctgt tcgtcattac aaacaaatac atggatgaga acacgtcg 108
<210> 6
<211> 36
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Mnn2 前导区 (53)
<400> 6
Met Leu Leu Thr Lys Arg Phe Ser Lys Leu Phe Lys Leu Thr Phe Ile
1 5 10 15
Val Leu Ile Leu Cys Gly Leu Phe Val Ile Thr Asn Lys Tyr Met Asp
20 25 30
Glu Asn Thr Ser
35
<210> 7
<211> 300
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码 Mnn2 前导区 (54). 最后9个核苷酸是包含AscI限制性位点的接头)
<400> 7
atgctgctta ccaaaaggtt ttcaaagctg ttcaagctga cgttcatagt tttgatattg 60
tgcgggctgt tcgtcattac aaacaaatac atggatgaga acacgtcggt caaggagtac 120
aaggagtact tagacagata tgtccagagt tactccaata agtattcatc ttcctcagac 180
gccgccagcg ctgacgattc aaccccattg agggacaatg atgaggcagg caatgaaaag 240
ttgaaaagct tctacaacaa cgttttcaac tttctaatgg ttgattcgcc cgggcgcgcc 300
<210> 8
<211> 100
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Mnn2 前导区 (54).
<400> 8
Met Leu Leu Thr Lys Arg Phe Ser Lys Leu Phe Lys Leu Thr Phe Ile
1 5 10 15
Val Leu Ile Leu Cys Gly Leu Phe Val Ile Thr Asn Lys Tyr Met Asp
20 25 30
Glu Asn Thr Ser Val Lys Glu Tyr Lys Glu Tyr Leu Asp Arg Tyr Val
35 40 45
Gln Ser Tyr Ser Asn Lys Tyr Ser Ser Ser Ser Asp Ala Ala Ser Ala
50 55 60
Asp Asp Ser Thr Pro Leu Arg Asp Asn Asp Glu Ala Gly Asn Glu Lys
65 70 75 80
Leu Lys Ser Phe Tyr Asn Asn Val Phe Asn Phe Leu Met Val Asp Ser
85 90 95
Pro Gly Arg Ala
100
<210> 9
<211> 57
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码酿酒酵母交配因子前信号序列
<400> 9
atgagattcc catccatctt cactgctgtt ttgttcgctg cttcttctgc tttggct 57
<210> 10
<211> 19
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 酿酒酵母交配因子前信号序列
<400> 10
Met Arg Phe Pro Ser Ile Phe Thr Ala Val Leu Phe Ala Ala Ser Ser
1 5 10 15
Ala Leu Ala
<210> 11
<211> 99
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码 Pp SEC12 (10)
<400> 11
atgcccagaa aaatatttaa ctacttcatt ttgactgtat tcatggcaat tcttgctatt 60
gttttacaat ggtctataga gaatggacat gggcgcgcc 99
<210> 12
<211> 33
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Pp SEC12 (10)
<400> 12
Met Pro Arg Lys Ile Phe Asn Tyr Phe Ile Leu Thr Val Phe Met Ala
1 5 10 15
Ile Leu Ala Ile Val Leu Gln Trp Ser Ile Glu Asn Gly His Gly Arg
20 25 30
Ala
<210> 13
<211> 183
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码 ScMnt1 (Kre2) (33)
<400> 13
atggccctct ttctcagtaa gagactgttg agatttaccg tcattgcagg tgcggttatt 60
gttctcctcc taacattgaa ttccaacagt agaactcagc aatatattcc gagttccatc 120
tccgctgcat ttgattttac ctcaggatct atatcccctg aacaacaagt catcgggcgc 180
gcc 183
<210> 14
<211> 61
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> ScMnt1 (Kre2) (33)
<400> 14
Met Ala Leu Phe Leu Ser Lys Arg Leu Leu Arg Phe Thr Val Ile Ala
1 5 10 15
Gly Ala Val Ile Val Leu Leu Leu Thr Leu Asn Ser Asn Ser Arg Thr
20 25 30
Gln Gln Tyr Ile Pro Ser Ser Ile Ser Ala Ala Phe Asp Phe Thr Ser
35 40 45
Gly Ser Ile Ser Pro Glu Gln Gln Val Ile Gly Arg Ala
50 55 60
<210> 15
<211> 318
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码 ScSEC12 (8)
<400> 15
atgaacacta tccacataat aaaattaccg cttaactacg ccaactacac ctcaatgaaa 60
caaaaaatct ctaaattttt caccaacttc atccttattg tgctgctttc ttacatttta 120
cagttctcct ataagcacaa tttgcattcc atgcttttca attacgcgaa ggacaatttt 180
ctaacgaaaa gagacaccat ctcttcgccc tacgtagttg atgaagactt acatcaaaca 240
actttgtttg gcaaccacgg tacaaaaaca tctgtaccta gcgtagattc cataaaagtg 300
catggcgtgg ggcgcgcc 318
<210> 16
<211> 106
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> ScSEC12 (8)
<400> 16
Met Asn Thr Ile His Ile Ile Lys Leu Pro Leu Asn Tyr Ala Asn Tyr
1 5 10 15
Thr Ser Met Lys Gln Lys Ile Ser Lys Phe Phe Thr Asn Phe Ile Leu
20 25 30
Ile Val Leu Leu Ser Tyr Ile Leu Gln Phe Ser Tyr Lys His Asn Leu
35 40 45
His Ser Met Leu Phe Asn Tyr Ala Lys Asp Asn Phe Leu Thr Lys Arg
50 55 60
Asp Thr Ile Ser Ser Pro Tyr Val Val Asp Glu Asp Leu His Gln Thr
65 70 75 80
Thr Leu Phe Gly Asn His Gly Thr Lys Thr Ser Val Pro Ser Val Asp
85 90 95
Ser Ile Lys Val His Gly Val Gly Arg Ala
100 105
<210> 17
<211> 981
<212> DNA
<213> 小家属
<220>
<221> CDS
<222> (1)...(978)
<223> 编码 MmSLC35A3 UDP-GlcNAc 转运蛋白
<400> 17
atg tct gcc aac cta aaa tat ctt tcc ttg gga att ttg gtg ttt cag 48
Met Ser Ala Asn Leu Lys Tyr Leu Ser Leu Gly Ile Leu Val Phe Gln
1 5 10 15
act acc agt ctg gtt cta acg atg cgg tat tct agg act tta aaa gag 96
Thr Thr Ser Leu Val Leu Thr Met Arg Tyr Ser Arg Thr Leu Lys Glu
20 25 30
gag ggg cct cgt tat ctg tct tct aca gca gtg gtt gtg gct gaa ttt 144
Glu Gly Pro Arg Tyr Leu Ser Ser Thr Ala Val Val Val Ala Glu Phe
35 40 45
ttg aag ata atg gcc tgc atc ttt tta gtc tac aaa gac agt aag tgt 192
Leu Lys Ile Met Ala Cys Ile Phe Leu Val Tyr Lys Asp Ser Lys Cys
50 55 60
agt gtg aga gca ctg aat aga gta ctg cat gat gaa att ctt aat aag 240
Ser Val Arg Ala Leu Asn Arg Val Leu His Asp Glu Ile Leu Asn Lys
65 70 75 80
ccc atg gaa acc ctg aag ctc gct atc ccg tca ggg ata tat act ctt 288
Pro Met Glu Thr Leu Lys Leu Ala Ile Pro Ser Gly Ile Tyr Thr Leu
85 90 95
cag aac aac tta ctc tat gtg gca ctg tca aac cta gat gca gcc act 336
Gln Asn Asn Leu Leu Tyr Val Ala Leu Ser Asn Leu Asp Ala Ala Thr
100 105 110
tac cag gtt aca tat cag ttg aaa ata ctt aca aca gca tta ttt tct 384
Tyr Gln Val Thr Tyr Gln Leu Lys Ile Leu Thr Thr Ala Leu Phe Ser
115 120 125
gtg tct atg ctt ggt aaa aaa tta ggt gtg tac cag tgg ctc tcc cta 432
Val Ser Met Leu Gly Lys Lys Leu Gly Val Tyr Gln Trp Leu Ser Leu
130 135 140
gta att ctg atg gca gga gtt gct ttt gta cag tgg cct tca gat tct 480
Val Ile Leu Met Ala Gly Val Ala Phe Val Gln Trp Pro Ser Asp Ser
145 150 155 160
caa gag ctg aac tct aag gac ctt tca aca ggc tca cag ttt gta ggc 528
Gln Glu Leu Asn Ser Lys Asp Leu Ser Thr Gly Ser Gln Phe Val Gly
165 170 175
ctc atg gca gtt ctc aca gcc tgt ttt tca agt ggc ttt gct gga gtt 576
Leu Met Ala Val Leu Thr Ala Cys Phe Ser Ser Gly Phe Ala Gly Val
180 185 190
tat ttt gag aaa atc tta aaa gaa aca aaa cag tca gta tgg ata agg 624
Tyr Phe Glu Lys Ile Leu Lys Glu Thr Lys Gln Ser Val Trp Ile Arg
195 200 205
aac att caa ctt ggt ttc ttt gga agt ata ttt gga tta atg ggt gta 672
Asn Ile Gln Leu Gly Phe Phe Gly Ser Ile Phe Gly Leu Met Gly Val
210 215 220
tac gtt tat gat gga gaa ttg gtc tca aag aat gga ttt ttt cag gga 720
Tyr Val Tyr Asp Gly Glu Leu Val Ser Lys Asn Gly Phe Phe Gln Gly
225 230 235 240
tat aat caa ctg acg tgg ata gtt gtt gct ctg cag gca ctt gga ggc 768
Tyr Asn Gln Leu Thr Trp Ile Val Val Ala Leu Gln Ala Leu Gly Gly
245 250 255
ctt gta ata gct gct gtc atc aaa tat gca gat aac att tta aaa gga 816
Leu Val Ile Ala Ala Val Ile Lys Tyr Ala Asp Asn Ile Leu Lys Gly
260 265 270
ttt gcg acc tcc tta tcc ata ata ttg tca aca ata ata tct tat ttt 864
Phe Ala Thr Ser Leu Ser Ile Ile Leu Ser Thr Ile Ile Ser Tyr Phe
275 280 285
tgg ttg caa gat ttt gtg cca acc agt gtc ttt ttc ctt gga gcc atc 912
Trp Leu Gln Asp Phe Val Pro Thr Ser Val Phe Phe Leu Gly Ala Ile
290 295 300
ctt gta ata gca gct act ttc ttg tat ggt tac gat ccc aaa cct gca 960
Leu Val Ile Ala Ala Thr Phe Leu Tyr Gly Tyr Asp Pro Lys Pro Ala
305 310 315 320
gga aat ccc act aaa gca tag 981
Gly Asn Pro Thr Lys Ala
325
<210> 18
<211> 326
<212> PRT
<213> 小家属
<400> 18
Met Ser Ala Asn Leu Lys Tyr Leu Ser Leu Gly Ile Leu Val Phe Gln
1 5 10 15
Thr Thr Ser Leu Val Leu Thr Met Arg Tyr Ser Arg Thr Leu Lys Glu
20 25 30
Glu Gly Pro Arg Tyr Leu Ser Ser Thr Ala Val Val Val Ala Glu Phe
35 40 45
Leu Lys Ile Met Ala Cys Ile Phe Leu Val Tyr Lys Asp Ser Lys Cys
50 55 60
Ser Val Arg Ala Leu Asn Arg Val Leu His Asp Glu Ile Leu Asn Lys
65 70 75 80
Pro Met Glu Thr Leu Lys Leu Ala Ile Pro Ser Gly Ile Tyr Thr Leu
85 90 95
Gln Asn Asn Leu Leu Tyr Val Ala Leu Ser Asn Leu Asp Ala Ala Thr
100 105 110
Tyr Gln Val Thr Tyr Gln Leu Lys Ile Leu Thr Thr Ala Leu Phe Ser
115 120 125
Val Ser Met Leu Gly Lys Lys Leu Gly Val Tyr Gln Trp Leu Ser Leu
130 135 140
Val Ile Leu Met Ala Gly Val Ala Phe Val Gln Trp Pro Ser Asp Ser
145 150 155 160
Gln Glu Leu Asn Ser Lys Asp Leu Ser Thr Gly Ser Gln Phe Val Gly
165 170 175
Leu Met Ala Val Leu Thr Ala Cys Phe Ser Ser Gly Phe Ala Gly Val
180 185 190
Tyr Phe Glu Lys Ile Leu Lys Glu Thr Lys Gln Ser Val Trp Ile Arg
195 200 205
Asn Ile Gln Leu Gly Phe Phe Gly Ser Ile Phe Gly Leu Met Gly Val
210 215 220
Tyr Val Tyr Asp Gly Glu Leu Val Ser Lys Asn Gly Phe Phe Gln Gly
225 230 235 240
Tyr Asn Gln Leu Thr Trp Ile Val Val Ala Leu Gln Ala Leu Gly Gly
245 250 255
Leu Val Ile Ala Ala Val Ile Lys Tyr Ala Asp Asn Ile Leu Lys Gly
260 265 270
Phe Ala Thr Ser Leu Ser Ile Ile Leu Ser Thr Ile Ile Ser Tyr Phe
275 280 285
Trp Leu Gln Asp Phe Val Pro Thr Ser Val Phe Phe Leu Gly Ala Ile
290 295 300
Leu Val Ile Ala Ala Thr Phe Leu Tyr Gly Tyr Asp Pro Lys Pro Ala
305 310 315 320
Gly Asn Pro Thr Lys Ala
325
<210> 19
<211> 1074
<212> DNA
<213> 黑腹果蝇
<220>
<221> CDS
<222> (1)...(1071)
<223> 编码 DmUGT
<400> 19
atg aat agc ata cac atg aac gcc aat acg ctg aag tac atc agc ctg 48
Met Asn Ser Ile His Met Asn Ala Asn Thr Leu Lys Tyr Ile Ser Leu
1 5 10 15
ctg acg ctg acc ctg cag aat gcc atc ctg ggc ctc agc atg cgc tac 96
Leu Thr Leu Thr Leu Gln Asn Ala Ile Leu Gly Leu Ser Met Arg Tyr
20 25 30
gcc cgc acc cgg cca ggc gac atc ttc ctc agc tcc acg gcc gta ctc 144
Ala Arg Thr Arg Pro Gly Asp Ile Phe Leu Ser Ser Thr Ala Val Leu
35 40 45
atg gca gag ttc gcc aaa ctg atc acg tgc ctg ttc ctg gtc ttc aac 192
Met Ala Glu Phe Ala Lys Leu Ile Thr Cys Leu Phe Leu Val Phe Asn
50 55 60
gag gag ggc aag gat gcc cag aag ttt gta cgc tcg ctg cac aag acc 240
Glu Glu Gly Lys Asp Ala Gln Lys Phe Val Arg Ser Leu His Lys Thr
65 70 75 80
atc att gcg aat ccc atg gac acg ctg aag gtg tgc gtc ccc tcg ctg 288
Ile Ile Ala Asn Pro Met Asp Thr Leu Lys Val Cys Val Pro Ser Leu
85 90 95
gtc tat atc gtt caa aac aat ctg ctg tac gtc tct gcc tcc cat ttg 336
Val Tyr Ile Val Gln Asn Asn Leu Leu Tyr Val Ser Ala Ser His Leu
100 105 110
gat gcg gcc acc tac cag gtg acg tac cag ctg aag att ctc acc acg 384
Asp Ala Ala Thr Tyr Gln Val Thr Tyr Gln Leu Lys Ile Leu Thr Thr
115 120 125
gcc atg ttc gcg gtt gtc att ctg cgc cgc aag ctg ctg aac acg cag 432
Ala Met Phe Ala Val Val Ile Leu Arg Arg Lys Leu Leu Asn Thr Gln
130 135 140
tgg ggt gcg ctg ctg ctc ctg gtg atg ggc atc gtc ctg gtg cag ttg 480
Trp Gly Ala Leu Leu Leu Leu Val Met Gly Ile Val Leu Val Gln Leu
145 150 155 160
gcc caa acg gag ggt ccg acg agt ggc tca gcc ggt ggt gcc gca gct 528
Ala Gln Thr Glu Gly Pro Thr Ser Gly Ser Ala Gly Gly Ala Ala Ala
165 170 175
gca gcc acg gcc gcc tcc tct ggc ggt gct ccc gag cag aac agg atg 576
Ala Ala Thr Ala Ala Ser Ser Gly Gly Ala Pro Glu Gln Asn Arg Met
180 185 190
ctc gga ctg tgg gcc gca ctg ggc gcc tgc ttc ctc tcc gga ttc gcg 624
Leu Gly Leu Trp Ala Ala Leu Gly Ala Cys Phe Leu Ser Gly Phe Ala
195 200 205
ggc atc tac ttt gag aag atc ctc aag ggt gcc gag atc tcc gtg tgg 672
Gly Ile Tyr Phe Glu Lys Ile Leu Lys Gly Ala Glu Ile Ser Val Trp
210 215 220
atg cgg aat gtg cag ttg agt ctg ctc agc att ccc ttc ggc ctg ctc 720
Met Arg Asn Val Gln Leu Ser Leu Leu Ser Ile Pro Phe Gly Leu Leu
225 230 235 240
acc tgt ttc gtt aac gac ggc agt agg atc ttc gac cag gga ttc ttc 768
Thr Cys Phe Val Asn Asp Gly Ser Arg Ile Phe Asp Gln Gly Phe Phe
245 250 255
aag ggc tac gat ctg ttt gtc tgg tac ctg gtc ctg ctg cag gcc ggc 816
Lys Gly Tyr Asp Leu Phe Val Trp Tyr Leu Val Leu Leu Gln Ala Gly
260 265 270
ggt gga ttg atc gtt gcc gtg gtg gtc aag tac gcg gat aac att ctc 864
Gly Gly Leu Ile Val Ala Val Val Val Lys Tyr Ala Asp Asn Ile Leu
275 280 285
aag ggc ttc gcc acc tcg ctg gcc atc atc atc tcg tgc gtg gcc tcc 912
Lys Gly Phe Ala Thr Ser Leu Ala Ile Ile Ile Ser Cys Val Ala Ser
290 295 300
ata tac atc ttc gac ttc aat ctc acg ctg cag ttc agc ttc gga gct 960
Ile Tyr Ile Phe Asp Phe Asn Leu Thr Leu Gln Phe Ser Phe Gly Ala
305 310 315 320
ggc ctg gtc atc gcc tcc ata ttt ctc tac ggc tac gat ccg gcc agg 1008
Gly Leu Val Ile Ala Ser Ile Phe Leu Tyr Gly Tyr Asp Pro Ala Arg
325 330 335
tcg gcg ccg aag cca act atg cat ggt cct ggc ggc gat gag gag aag 1056
Ser Ala Pro Lys Pro Thr Met His Gly Pro Gly Gly Asp Glu Glu Lys
340 345 350
ctg ctg ccg cgc gtc tag 1074
Leu Leu Pro Arg Val
355
<210> 20
<211> 357
<212> PRT
<213> 黑腹果蝇
<400> 20
Met Asn Ser Ile His Met Asn Ala Asn Thr Leu Lys Tyr Ile Ser Leu
1 5 10 15
Leu Thr Leu Thr Leu Gln Asn Ala Ile Leu Gly Leu Ser Met Arg Tyr
20 25 30
Ala Arg Thr Arg Pro Gly Asp Ile Phe Leu Ser Ser Thr Ala Val Leu
35 40 45
Met Ala Glu Phe Ala Lys Leu Ile Thr Cys Leu Phe Leu Val Phe Asn
50 55 60
Glu Glu Gly Lys Asp Ala Gln Lys Phe Val Arg Ser Leu His Lys Thr
65 70 75 80
Ile Ile Ala Asn Pro Met Asp Thr Leu Lys Val Cys Val Pro Ser Leu
85 90 95
Val Tyr Ile Val Gln Asn Asn Leu Leu Tyr Val Ser Ala Ser His Leu
100 105 110
Asp Ala Ala Thr Tyr Gln Val Thr Tyr Gln Leu Lys Ile Leu Thr Thr
115 120 125
Ala Met Phe Ala Val Val Ile Leu Arg Arg Lys Leu Leu Asn Thr Gln
130 135 140
Trp Gly Ala Leu Leu Leu Leu Val Met Gly Ile Val Leu Val Gln Leu
145 150 155 160
Ala Gln Thr Glu Gly Pro Thr Ser Gly Ser Ala Gly Gly Ala Ala Ala
165 170 175
Ala Ala Thr Ala Ala Ser Ser Gly Gly Ala Pro Glu Gln Asn Arg Met
180 185 190
Leu Gly Leu Trp Ala Ala Leu Gly Ala Cys Phe Leu Ser Gly Phe Ala
195 200 205
Gly Ile Tyr Phe Glu Lys Ile Leu Lys Gly Ala Glu Ile Ser Val Trp
210 215 220
Met Arg Asn Val Gln Leu Ser Leu Leu Ser Ile Pro Phe Gly Leu Leu
225 230 235 240
Thr Cys Phe Val Asn Asp Gly Ser Arg Ile Phe Asp Gln Gly Phe Phe
245 250 255
Lys Gly Tyr Asp Leu Phe Val Trp Tyr Leu Val Leu Leu Gln Ala Gly
260 265 270
Gly Gly Leu Ile Val Ala Val Val Val Lys Tyr Ala Asp Asn Ile Leu
275 280 285
Lys Gly Phe Ala Thr Ser Leu Ala Ile Ile Ile Ser Cys Val Ala Ser
290 295 300
Ile Tyr Ile Phe Asp Phe Asn Leu Thr Leu Gln Phe Ser Phe Gly Ala
305 310 315 320
Gly Leu Val Ile Ala Ser Ile Phe Leu Tyr Gly Tyr Asp Pro Ala Arg
325 330 335
Ser Ala Pro Lys Pro Thr Met His Gly Pro Gly Gly Asp Glu Glu Lys
340 345 350
Leu Leu Pro Arg Val
355
<210> 21
<211> 2100
<212> DNA
<213> 酿酒酵母
<220>
<221> CDS
<222> (1)...(2097)
<223> 编码 ScGAL10
<400> 21
atg aca gct cag tta caa agt gaa agt act tct aaa att gtt ttg gtt 48
Met Thr Ala Gln Leu Gln Ser Glu Ser Thr Ser Lys Ile Val Leu Val
1 5 10 15
aca ggt ggt gct gga tac att ggt tca cac act gtg gta gag cta att 96
Thr Gly Gly Ala Gly Tyr Ile Gly Ser His Thr Val Val Glu Leu Ile
20 25 30
gag aat gga tat gac tgt gtt gtt gct gat aac ctg tcg aat tca act 144
Glu Asn Gly Tyr Asp Cys Val Val Ala Asp Asn Leu Ser Asn Ser Thr
35 40 45
tat gat tct gta gcc agg tta gag gtc ttg acc aag cat cac att ccc 192
Tyr Asp Ser Val Ala Arg Leu Glu Val Leu Thr Lys His His Ile Pro
50 55 60
ttc tat gag gtt gat ttg tgt gac cga aaa ggt ctg gaa aag gtt ttc 240
Phe Tyr Glu Val Asp Leu Cys Asp Arg Lys Gly Leu Glu Lys Val Phe
65 70 75 80
aaa gaa tat aaa att gat tcg gta att cac ttt gct ggt tta aag gct 288
Lys Glu Tyr Lys Ile Asp Ser Val Ile His Phe Ala Gly Leu Lys Ala
85 90 95
gta ggt gaa tct aca caa atc ccg ctg aga tac tat cac aat aac att 336
Val Gly Glu Ser Thr Gln Ile Pro Leu Arg Tyr Tyr His Asn Asn Ile
100 105 110
ttg gga act gtc gtt tta tta gag tta atg caa caa tac aac gtt tcc 384
Leu Gly Thr Val Val Leu Leu Glu Leu Met Gln Gln Tyr Asn Val Ser
115 120 125
aaa ttt gtt ttt tca tct tct gct act gtc tat ggt gat gct acg aga 432
Lys Phe Val Phe Ser Ser Ser Ala Thr Val Tyr Gly Asp Ala Thr Arg
130 135 140
ttc cca aat atg att cct atc cca gaa gaa tgt ccc tta ggg cct act 480
Phe Pro Asn Met Ile Pro Ile Pro Glu Glu Cys Pro Leu Gly Pro Thr
145 150 155 160
aat ccg tat ggt cat acg aaa tac gcc att gag aat atc ttg aat gat 528
Asn Pro Tyr Gly His Thr Lys Tyr Ala Ile Glu Asn Ile Leu Asn Asp
165 170 175
ctt tac aat agc gac aaa aaa agt tgg aag ttt gct atc ttg cgt tat 576
Leu Tyr Asn Ser Asp Lys Lys Ser Trp Lys Phe Ala Ile Leu Arg Tyr
180 185 190
ttt aac cca att ggc gca cat ccc tct gga tta atc gga gaa gat ccg 624
Phe Asn Pro Ile Gly Ala His Pro Ser Gly Leu Ile Gly Glu Asp Pro
195 200 205
cta ggt ata cca aac aat ttg ttg cca tat atg gct caa gta gct gtt 672
Leu Gly Ile Pro Asn Asn Leu Leu Pro Tyr Met Ala Gln Val Ala Val
210 215 220
ggt agg cgc gag aag ctt tac atc ttc gga gac gat tat gat tcc aga 720
Gly Arg Arg Glu Lys Leu Tyr Ile Phe Gly Asp Asp Tyr Asp Ser Arg
225 230 235 240
gat ggt acc ccg atc agg gat tat atc cac gta gtt gat cta gca aaa 768
Asp Gly Thr Pro Ile Arg Asp Tyr Ile His Val Val Asp Leu Ala Lys
245 250 255
ggt cat att gca gcc ctg caa tac cta gag gcc tac aat gaa aat gaa 816
Gly His Ile Ala Ala Leu Gln Tyr Leu Glu Ala Tyr Asn Glu Asn Glu
260 265 270
ggt ttg tgt cgt gag tgg aac ttg ggt tcc ggt aaa ggt tct aca gtt 864
Gly Leu Cys Arg Glu Trp Asn Leu Gly Ser Gly Lys Gly Ser Thr Val
275 280 285
ttt gaa gtt tat cat gca ttc tgc aaa gct tct ggt att gat ctt cca 912
Phe Glu Val Tyr His Ala Phe Cys Lys Ala Ser Gly Ile Asp Leu Pro
290 295 300
tac aaa gtt acg ggc aga aga gca ggt gat gtt ttg aac ttg acg gct 960
Tyr Lys Val Thr Gly Arg Arg Ala Gly Asp Val Leu Asn Leu Thr Ala
305 310 315 320
aaa cca gat agg gcc aaa cgc gaa ctg aaa tgg cag acc gag ttg cag 1008
Lys Pro Asp Arg Ala Lys Arg Glu Leu Lys Trp Gln Thr Glu Leu Gln
325 330 335
gtt gaa gac tcc tgc aag gat tta tgg aaa tgg act act gag aat cct 1056
Val Glu Asp Ser Cys Lys Asp Leu Trp Lys Trp Thr Thr Glu Asn Pro
340 345 350
ttt ggt tac cag tta agg ggt gtc gag gcc aga ttt tcc gct gaa gat 1104
Phe Gly Tyr Gln Leu Arg Gly Val Glu Ala Arg Phe Ser Ala Glu Asp
355 360 365
atg cgt tat gac gca aga ttt gtg act att ggt gcc ggc acc aga ttt 1152
Met Arg Tyr Asp Ala Arg Phe Val Thr Ile Gly Ala Gly Thr Arg Phe
370 375 380
caa gcc acg ttt gcc aat ttg ggc gcc agc att gtt gac ctg aaa gtg 1200
Gln Ala Thr Phe Ala Asn Leu Gly Ala Ser Ile Val Asp Leu Lys Val
385 390 395 400
aac gga caa tca gtt gtt ctt ggc tat gaa aat gag gaa ggg tat ttg 1248
Asn Gly Gln Ser Val Val Leu Gly Tyr Glu Asn Glu Glu Gly Tyr Leu
405 410 415
aat cct gat agt gct tat ata ggc gcc acg atc ggc agg tat gct aat 1296
Asn Pro Asp Ser Ala Tyr Ile Gly Ala Thr Ile Gly Arg Tyr Ala Asn
420 425 430
cgt att tcg aag ggt aag ttt agt tta tgc aac aaa gac tat cag tta 1344
Arg Ile Ser Lys Gly Lys Phe Ser Leu Cys Asn Lys Asp Tyr Gln Leu
435 440 445
acc gtt aat aac ggc gtt aat gcg aat cat agt agt atc ggt tct ttc 1392
Thr Val Asn Asn Gly Val Asn Ala Asn His Ser Ser Ile Gly Ser Phe
450 455 460
cac aga aaa aga ttt ttg gga ccc atc att caa aat cct tca aag gat 1440
His Arg Lys Arg Phe Leu Gly Pro Ile Ile Gln Asn Pro Ser Lys Asp
465 470 475 480
gtt ttt acc gcc gag tac atg ctg ata gat aat gag aag gac acc gaa 1488
Val Phe Thr Ala Glu Tyr Met Leu Ile Asp Asn Glu Lys Asp Thr Glu
485 490 495
ttt cca ggt gat cta ttg gta acc ata cag tat act gtg aac gtt gcc 1536
Phe Pro Gly Asp Leu Leu Val Thr Ile Gln Tyr Thr Val Asn Val Ala
500 505 510
caa aaa agt ttg gaa atg gta tat aaa ggt aaa ttg act gct ggt gaa 1584
Gln Lys Ser Leu Glu Met Val Tyr Lys Gly Lys Leu Thr Ala Gly Glu
515 520 525
gcg acg cca ata aat tta aca aat cat agt tat ttc aat ctg aac aag 1632
Ala Thr Pro Ile Asn Leu Thr Asn His Ser Tyr Phe Asn Leu Asn Lys
530 535 540
cca tat gga gac act att gag ggt acg gag att atg gtg cgt tca aaa 1680
Pro Tyr Gly Asp Thr Ile Glu Gly Thr Glu Ile Met Val Arg Ser Lys
545 550 555 560
aaa tct gtt gat gtc gac aaa aac atg att cct acg ggt aat atc gtc 1728
Lys Ser Val Asp Val Asp Lys Asn Met Ile Pro Thr Gly Asn Ile Val
565 570 575
gat aga gaa att gct acc ttt aac tct aca aag cca acg gtc tta ggc 1776
Asp Arg Glu Ile Ala Thr Phe Asn Ser Thr Lys Pro Thr Val Leu Gly
580 585 590
ccc aaa aat ccc cag ttt gat tgt tgt ttt gtg gtg gat gaa aat gct 1824
Pro Lys Asn Pro Gln Phe Asp Cys Cys Phe Val Val Asp Glu Asn Ala
595 600 605
aag cca agt caa atc aat act cta aac aat gaa ttg acg ctt att gtc 1872
Lys Pro Ser Gln Ile Asn Thr Leu Asn Asn Glu Leu Thr Leu Ile Val
610 615 620
aag gct ttt cat ccc gat tcc aat att aca tta gaa gtt tta agt aca 1920
Lys Ala Phe His Pro Asp Ser Asn Ile Thr Leu Glu Val Leu Ser Thr
625 630 635 640
gag cca act tat caa ttt tat acc ggt gat ttc ttg tct gct ggt tac 1968
Glu Pro Thr Tyr Gln Phe Tyr Thr Gly Asp Phe Leu Ser Ala Gly Tyr
645 650 655
gaa gca aga caa ggt ttt gca att gag cct ggt aga tac att gat gct 2016
Glu Ala Arg Gln Gly Phe Ala Ile Glu Pro Gly Arg Tyr Ile Asp Ala
660 665 670
atc aat caa gag aac tgg aaa gat tgt gta acc ttg aaa aac ggt gaa 2064
Ile Asn Gln Glu Asn Trp Lys Asp Cys Val Thr Leu Lys Asn Gly Glu
675 680 685
act tac ggg tcc aag att gtc tac aga ttt tcc tga 2100
Thr Tyr Gly Ser Lys Ile Val Tyr Arg Phe Ser
690 695
<210> 22
<211> 699
<212> PRT
<213> 酿酒酵母
<400> 22
Met Thr Ala Gln Leu Gln Ser Glu Ser Thr Ser Lys Ile Val Leu Val
1 5 10 15
Thr Gly Gly Ala Gly Tyr Ile Gly Ser His Thr Val Val Glu Leu Ile
20 25 30
Glu Asn Gly Tyr Asp Cys Val Val Ala Asp Asn Leu Ser Asn Ser Thr
35 40 45
Tyr Asp Ser Val Ala Arg Leu Glu Val Leu Thr Lys His His Ile Pro
50 55 60
Phe Tyr Glu Val Asp Leu Cys Asp Arg Lys Gly Leu Glu Lys Val Phe
65 70 75 80
Lys Glu Tyr Lys Ile Asp Ser Val Ile His Phe Ala Gly Leu Lys Ala
85 90 95
Val Gly Glu Ser Thr Gln Ile Pro Leu Arg Tyr Tyr His Asn Asn Ile
100 105 110
Leu Gly Thr Val Val Leu Leu Glu Leu Met Gln Gln Tyr Asn Val Ser
115 120 125
Lys Phe Val Phe Ser Ser Ser Ala Thr Val Tyr Gly Asp Ala Thr Arg
130 135 140
Phe Pro Asn Met Ile Pro Ile Pro Glu Glu Cys Pro Leu Gly Pro Thr
145 150 155 160
Asn Pro Tyr Gly His Thr Lys Tyr Ala Ile Glu Asn Ile Leu Asn Asp
165 170 175
Leu Tyr Asn Ser Asp Lys Lys Ser Trp Lys Phe Ala Ile Leu Arg Tyr
180 185 190
Phe Asn Pro Ile Gly Ala His Pro Ser Gly Leu Ile Gly Glu Asp Pro
195 200 205
Leu Gly Ile Pro Asn Asn Leu Leu Pro Tyr Met Ala Gln Val Ala Val
210 215 220
Gly Arg Arg Glu Lys Leu Tyr Ile Phe Gly Asp Asp Tyr Asp Ser Arg
225 230 235 240
Asp Gly Thr Pro Ile Arg Asp Tyr Ile His Val Val Asp Leu Ala Lys
245 250 255
Gly His Ile Ala Ala Leu Gln Tyr Leu Glu Ala Tyr Asn Glu Asn Glu
260 265 270
Gly Leu Cys Arg Glu Trp Asn Leu Gly Ser Gly Lys Gly Ser Thr Val
275 280 285
Phe Glu Val Tyr His Ala Phe Cys Lys Ala Ser Gly Ile Asp Leu Pro
290 295 300
Tyr Lys Val Thr Gly Arg Arg Ala Gly Asp Val Leu Asn Leu Thr Ala
305 310 315 320
Lys Pro Asp Arg Ala Lys Arg Glu Leu Lys Trp Gln Thr Glu Leu Gln
325 330 335
Val Glu Asp Ser Cys Lys Asp Leu Trp Lys Trp Thr Thr Glu Asn Pro
340 345 350
Phe Gly Tyr Gln Leu Arg Gly Val Glu Ala Arg Phe Ser Ala Glu Asp
355 360 365
Met Arg Tyr Asp Ala Arg Phe Val Thr Ile Gly Ala Gly Thr Arg Phe
370 375 380
Gln Ala Thr Phe Ala Asn Leu Gly Ala Ser Ile Val Asp Leu Lys Val
385 390 395 400
Asn Gly Gln Ser Val Val Leu Gly Tyr Glu Asn Glu Glu Gly Tyr Leu
405 410 415
Asn Pro Asp Ser Ala Tyr Ile Gly Ala Thr Ile Gly Arg Tyr Ala Asn
420 425 430
Arg Ile Ser Lys Gly Lys Phe Ser Leu Cys Asn Lys Asp Tyr Gln Leu
435 440 445
Thr Val Asn Asn Gly Val Asn Ala Asn His Ser Ser Ile Gly Ser Phe
450 455 460
His Arg Lys Arg Phe Leu Gly Pro Ile Ile Gln Asn Pro Ser Lys Asp
465 470 475 480
Val Phe Thr Ala Glu Tyr Met Leu Ile Asp Asn Glu Lys Asp Thr Glu
485 490 495
Phe Pro Gly Asp Leu Leu Val Thr Ile Gln Tyr Thr Val Asn Val Ala
500 505 510
Gln Lys Ser Leu Glu Met Val Tyr Lys Gly Lys Leu Thr Ala Gly Glu
515 520 525
Ala Thr Pro Ile Asn Leu Thr Asn His Ser Tyr Phe Asn Leu Asn Lys
530 535 540
Pro Tyr Gly Asp Thr Ile Glu Gly Thr Glu Ile Met Val Arg Ser Lys
545 550 555 560
Lys Ser Val Asp Val Asp Lys Asn Met Ile Pro Thr Gly Asn Ile Val
565 570 575
Asp Arg Glu Ile Ala Thr Phe Asn Ser Thr Lys Pro Thr Val Leu Gly
580 585 590
Pro Lys Asn Pro Gln Phe Asp Cys Cys Phe Val Val Asp Glu Asn Ala
595 600 605
Lys Pro Ser Gln Ile Asn Thr Leu Asn Asn Glu Leu Thr Leu Ile Val
610 615 620
Lys Ala Phe His Pro Asp Ser Asn Ile Thr Leu Glu Val Leu Ser Thr
625 630 635 640
Glu Pro Thr Tyr Gln Phe Tyr Thr Gly Asp Phe Leu Ser Ala Gly Tyr
645 650 655
Glu Ala Arg Gln Gly Phe Ala Ile Glu Pro Gly Arg Tyr Ile Asp Ala
660 665 670
Ile Asn Gln Glu Asn Trp Lys Asp Cys Val Thr Leu Lys Asn Gly Glu
675 680 685
Thr Tyr Gly Ser Lys Ile Val Tyr Arg Phe Ser
690 695
<210> 23
<211> 1068
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码 hGalT 催化结构域 密码子优化的
(XB)
<400> 23
ggt aga gat ttg tct aga ttg cca cag ttg gtt ggt gtt tcc act cca 48
ttg caa gga ggt tct aac tct gct gct gct att ggt caa tct tcc ggt 96
gag ttg aga act ggt gga gct aga cca cct cca cca ttg gga gct tcc 144
tct caa cca aga cca ggt ggt gat tct tct cca gtt gtt gac tct ggt 192
cca ggt cca gct tct aac ttg act tcc gtt cca gtt cca cac act act 240
gct ttg tcc ttg cca gct tgt cca gaa gaa tcc cca ttg ttg gtt ggt 288
cca atg ttg atc gag ttc aac atg cca gtt gac ttg gag ttg gtt gct 336
aag cag aac cca aac gtt aag atg ggt ggt aga tac gct cca aga gac 384
tgt gtt tcc cca cac aaa gtt gct atc atc atc cca ttc aga aac aga 432
cag gag cac ttg aag tac tgg ttg tac tac ttg cac cca gtt ttg caa 480
aga cag cag ttg gac tac ggt atc tac gtt atc aac cag gct ggt gac 528
act att ttc aac aga gct aag ttg ttg aat gtt ggt ttc cag gag gct 576
ttg aag gat tac gac tac act tgt ttc gtt ttc tcc gac gtt gac ttg 624
att cca atg aac gac cac aac gct tac aga tgt ttc tcc cag cca aga 672
cac att tct gtt gct atg gac aag ttc ggt ttc tcc ttg cca tac gtt 720
caa tac ttc ggt ggt gtt tcc gct ttg tcc aag cag cag ttc ttg act 768
atc aac ggt ttc cca aac aat tac tgg gga tgg ggt ggt gaa gat gac 816
gac atc ttt aac aga ttg gtt ttc aga gga atg tcc atc tct aga cca 864
aac gct gtt gtt ggt aga tgt aga atg atc aga cac tcc aga gac aag 912
aag aac gag cca aac cca caa aga ttc gac aga atc gct cac act aag 960
gaa act atg ttg tcc gac gga ttg aac tcc ttg act tac cag gtt ttg 1008
gac gtt cag aga tac cca ttg tac act cag atc act gtt gac atc ggt 1056
act cca tcc tag 1068
<210> 24
<211> 355
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> hGalT 催化结构域 (XB)
<400> 24
Gly Arg Asp Leu Ser Arg Leu Pro Gln Leu Val Gly Val Ser Thr Pro
1 5 10 15
Leu Gln Gly Gly Ser Asn Ser Ala Ala Ala Ile Gly Gln Ser Ser Gly
20 25 30
Glu Leu Arg Thr Gly Gly Ala Arg Pro Pro Pro Pro Leu Gly Ala Ser
35 40 45
Ser Gln Pro Arg Pro Gly Gly Asp Ser Ser Pro Val Val Asp Ser Gly
50 55 60
Pro Gly Pro Ala Ser Asn Leu Thr Ser Val Pro Val Pro His Thr Thr
65 70 75 80
Ala Leu Ser Leu Pro Ala Cys Pro Glu Glu Ser Pro Leu Leu Val Gly
85 90 95
Pro Met Leu Ile Glu Phe Asn Met Pro Val Asp Leu Glu Leu Val Ala
100 105 110
Lys Gln Asn Pro Asn Val Lys Met Gly Gly Arg Tyr Ala Pro Arg Asp
115 120 125
Cys Val Ser Pro His Lys Val Ala Ile Ile Ile Pro Phe Arg Asn Arg
130 135 140
Gln Glu His Leu Lys Tyr Trp Leu Tyr Tyr Leu His Pro Val Leu Gln
145 150 155 160
Arg Gln Gln Leu Asp Tyr Gly Ile Tyr Val Ile Asn Gln Ala Gly Asp
165 170 175
Thr Ile Phe Asn Arg Ala Lys Leu Leu Asn Val Gly Phe Gln Glu Ala
180 185 190
Leu Lys Asp Tyr Asp Tyr Thr Cys Phe Val Phe Ser Asp Val Asp Leu
195 200 205
Ile Pro Met Asn Asp His Asn Ala Tyr Arg Cys Phe Ser Gln Pro Arg
210 215 220
His Ile Ser Val Ala Met Asp Lys Phe Gly Phe Ser Leu Pro Tyr Val
225 230 235 240
Gln Tyr Phe Gly Gly Val Ser Ala Leu Ser Lys Gln Gln Phe Leu Thr
245 250 255
Ile Asn Gly Phe Pro Asn Asn Tyr Trp Gly Trp Gly Gly Glu Asp Asp
260 265 270
Asp Ile Phe Asn Arg Leu Val Phe Arg Gly Met Ser Ile Ser Arg Pro
275 280 285
Asn Ala Val Val Gly Arg Cys Arg Met Ile Arg His Ser Arg Asp Lys
290 295 300
Lys Asn Glu Pro Asn Pro Gln Arg Phe Asp Arg Ile Ala His Thr Lys
305 310 315 320
Glu Thr Met Leu Ser Asp Gly Leu Asn Ser Leu Thr Tyr Gln Val Leu
325 330 335
Asp Val Gln Arg Tyr Pro Leu Tyr Thr Gln Ile Thr Val Asp Ile Gly
340 345 350
Thr Pro Ser
355
<210> 25
<211> 1224
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码人 GnTI 催化结构域 (NA)
密码子优化的
<400> 25
tcagtcagtg ctcttgatgg tgacccagca agtttgacca gagaagtgat tagattggcc 60
caagacgcag aggtggagtt ggagagacaa cgtggactgc tgcagcaaat cggagatgca 120
ttgtctagtc aaagaggtag ggtgcctacc gcagctcctc cagcacagcc tagagtgcat 180
gtgacccctg caccagctgt gattcctatc ttggtcatcg cctgtgacag atctactgtt 240
agaagatgtc tggacaagct gttgcattac agaccatctg ctgagttgtt ccctatcatc 300
gttagtcaag actgtggtca cgaggagact gcccaagcca tcgcctccta cggatctgct 360
gtcactcaca tcagacagcc tgacctgtca tctattgctg tgccaccaga ccacagaaag 420
ttccaaggtt actacaagat cgctagacac tacagatggg cattgggtca agtcttcaga 480
cagtttagat tccctgctgc tgtggtggtg gaggatgact tggaggtggc tcctgacttc 540
tttgagtact ttagagcaac ctatccattg ctgaaggcag acccatccct gtggtgtgtc 600
tctgcctgga atgacaacgg taaggagcaa atggtggacg cttctaggcc tgagctgttg 660
tacagaaccg acttctttcc tggtctggga tggttgctgt tggctgagtt gtgggctgag 720
ttggagccta agtggccaaa ggcattctgg gacgactgga tgagaagacc tgagcaaaga 780
cagggtagag cctgtatcag acctgagatc tcaagaacca tgacctttgg tagaaaggga 840
gtgtctcacg gtcaattctt tgaccaacac ttgaagttta tcaagctgaa ccagcaattt 900
gtgcacttca cccaactgga cctgtcttac ttgcagagag aggcctatga cagagatttc 960
ctagctagag tctacggagc tcctcaactg caagtggaga aagtgaggac caatgacaga 1020
aaggagttgg gagaggtgag agtgcagtac actggtaggg actcctttaa ggctttcgct 1080
aaggctctgg gtgtcatgga tgaccttaag tctggagttc ctagagctgg ttacagaggt 1140
attgtcacct ttcaattcag aggtagaaga gtccacttgg ctcctccacc tacttgggag 1200
ggttatgatc cttcttggaa ttag 1224
<210> 26
<211> 407
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人 GnTI 催化结构域 (NA)
<400> 26
Ser Val Ser Ala Leu Asp Gly Asp Pro Ala Ser Leu Thr Arg Glu Val
1 5 10 15
Ile Arg Leu Ala Gln Asp Ala Glu Val Glu Leu Glu Arg Gln Arg Gly
20 25 30
Leu Leu Gln Gln Ile Gly Asp Ala Leu Ser Ser Gln Arg Gly Arg Val
35 40 45
Pro Thr Ala Ala Pro Pro Ala Gln Pro Arg Val His Val Thr Pro Ala
50 55 60
Pro Ala Val Ile Pro Ile Leu Val Ile Ala Cys Asp Arg Ser Thr Val
65 70 75 80
Arg Arg Cys Leu Asp Lys Leu Leu His Tyr Arg Pro Ser Ala Glu Leu
85 90 95
Phe Pro Ile Ile Val Ser Gln Asp Cys Gly His Glu Glu Thr Ala Gln
100 105 110
Ala Ile Ala Ser Tyr Gly Ser Ala Val Thr His Ile Arg Gln Pro Asp
115 120 125
Leu Ser Ser Ile Ala Val Pro Pro Asp His Arg Lys Phe Gln Gly Tyr
130 135 140
Tyr Lys Ile Ala Arg His Tyr Arg Trp Ala Leu Gly Gln Val Phe Arg
145 150 155 160
Gln Phe Arg Phe Pro Ala Ala Val Val Val Glu Asp Asp Leu Glu Val
165 170 175
Ala Pro Asp Phe Phe Glu Tyr Phe Arg Ala Thr Tyr Pro Leu Leu Lys
180 185 190
Ala Asp Pro Ser Leu Trp Cys Val Ser Ala Trp Asn Asp Asn Gly Lys
195 200 205
Glu Gln Met Val Asp Ala Ser Arg Pro Glu Leu Leu Tyr Arg Thr Asp
210 215 220
Phe Phe Pro Gly Leu Gly Trp Leu Leu Leu Ala Glu Leu Trp Ala Glu
225 230 235 240
Leu Glu Pro Lys Trp Pro Lys Ala Phe Trp Asp Asp Trp Met Arg Arg
245 250 255
Pro Glu Gln Arg Gln Gly Arg Ala Cys Ile Arg Pro Glu Ile Ser Arg
260 265 270
Thr Met Thr Phe Gly Arg Lys Gly Val Ser His Gly Gln Phe Phe Asp
275 280 285
Gln His Leu Lys Phe Ile Lys Leu Asn Gln Gln Phe Val His Phe Thr
290 295 300
Gln Leu Asp Leu Ser Tyr Leu Gln Arg Glu Ala Tyr Asp Arg Asp Phe
305 310 315 320
Leu Ala Arg Val Tyr Gly Ala Pro Gln Leu Gln Val Glu Lys Val Arg
325 330 335
Thr Asn Asp Arg Lys Glu Leu Gly Glu Val Arg Val Gln Tyr Thr Gly
340 345 350
Arg Asp Ser Phe Lys Ala Phe Ala Lys Ala Leu Gly Val Met Asp Asp
355 360 365
Leu Lys Ser Gly Val Pro Arg Ala Gly Tyr Arg Gly Ile Val Thr Phe
370 375 380
Gln Phe Arg Gly Arg Arg Val His Leu Ala Pro Pro Pro Thr Trp Glu
385 390 395 400
Gly Tyr Asp Pro Ser Trp Asn
405
<210> 27
<211> 1407
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码 Mm ManI 催化结构域 (FB)
<400> 27
gagcccgctg acgccaccat ccgtgagaag agggcaaaga tcaaagagat gatgacccat 60
gcttggaata attataaacg ctatgcgtgg ggcttgaacg aactgaaacc tatatcaaaa 120
gaaggccatt caagcagttt gtttggcaac atcaaaggag ctacaatagt agatgccctg 180
gatacccttt tcattatggg catgaagact gaatttcaag aagctaaatc gtggattaaa 240
aaatatttag attttaatgt gaatgctgaa gtttctgttt ttgaagtcaa catacgcttc 300
gtcggtggac tgctgtcagc ctactatttg tccggagagg agatatttcg aaagaaagca 360
gtggaacttg gggtaaaatt gctacctgca tttcatactc cctctggaat accttgggca 420
ttgctgaata tgaaaagtgg gatcgggcgg aactggccct gggcctctgg aggcagcagt 480
atcctggccg aatttggaac tctgcattta gagtttatgc acttgtccca cttatcagga 540
gacccagtct ttgccgaaaa ggttatgaaa attcgaacag tgttgaacaa actggacaaa 600
ccagaaggcc tttatcctaa ctatctgaac cccagtagtg gacagtgggg tcaacatcat 660
gtgtcggttg gaggacttgg agacagcttt tatgaatatt tgcttaaggc gtggttaatg 720
tctgacaaga cagatctcga agccaagaag atgtattttg atgctgttca ggccatcgag 780
actcacttga tccgcaagtc aagtggggga ctaacgtaca tcgcagagtg gaaggggggc 840
ctcctggaac acaagatggg ccacctgacg tgctttgcag gaggcatgtt tgcacttggg 900
gcagatggag ctccggaagc ccgggcccaa cactaccttg aactcggagc tgaaattgcc 960
cgcacttgtc atgaatctta taatcgtaca tatgtgaagt tgggaccgga agcgtttcga 1020
tttgatggcg gtgtggaagc tattgccacg aggcaaaatg aaaagtatta catcttacgg 1080
cccgaggtca tcgagacata catgtacatg tggcgactga ctcacgaccc caagtacagg 1140
acctgggcct gggaagccgt ggaggctcta gaaagtcact gcagagtgaa cggaggctac 1200
tcaggcttac gggatgttta cattgcccgt gagagttatg acgatgtcca gcaaagtttc 1260
ttcctggcag agacactgaa gtatttgtac ttgatatttt ccgatgatga ccttcttcca 1320
ctagaacact ggatcttcaa caccgaggct catcctttcc ctatactccg tgaacagaag 1380
aaggaaattg atggcaaaga gaaatga 1407
<210> 28
<211> 468
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Mm ManI 催化结构域 (FB)
<400> 28
Glu Pro Ala Asp Ala Thr Ile Arg Glu Lys Arg Ala Lys Ile Lys Glu
1 5 10 15
Met Met Thr His Ala Trp Asn Asn Tyr Lys Arg Tyr Ala Trp Gly Leu
20 25 30
Asn Glu Leu Lys Pro Ile Ser Lys Glu Gly His Ser Ser Ser Leu Phe
35 40 45
Gly Asn Ile Lys Gly Ala Thr Ile Val Asp Ala Leu Asp Thr Leu Phe
50 55 60
Ile Met Gly Met Lys Thr Glu Phe Gln Glu Ala Lys Ser Trp Ile Lys
65 70 75 80
Lys Tyr Leu Asp Phe Asn Val Asn Ala Glu Val Ser Val Phe Glu Val
85 90 95
Asn Ile Arg Phe Val Gly Gly Leu Leu Ser Ala Tyr Tyr Leu Ser Gly
100 105 110
Glu Glu Ile Phe Arg Lys Lys Ala Val Glu Leu Gly Val Lys Leu Leu
115 120 125
Pro Ala Phe His Thr Pro Ser Gly Ile Pro Trp Ala Leu Leu Asn Met
130 135 140
Lys Ser Gly Ile Gly Arg Asn Trp Pro Trp Ala Ser Gly Gly Ser Ser
145 150 155 160
Ile Leu Ala Glu Phe Gly Thr Leu His Leu Glu Phe Met His Leu Ser
165 170 175
His Leu Ser Gly Asp Pro Val Phe Ala Glu Lys Val Met Lys Ile Arg
180 185 190
Thr Val Leu Asn Lys Leu Asp Lys Pro Glu Gly Leu Tyr Pro Asn Tyr
195 200 205
Leu Asn Pro Ser Ser Gly Gln Trp Gly Gln His His Val Ser Val Gly
210 215 220
Gly Leu Gly Asp Ser Phe Tyr Glu Tyr Leu Leu Lys Ala Trp Leu Met
225 230 235 240
Ser Asp Lys Thr Asp Leu Glu Ala Lys Lys Met Tyr Phe Asp Ala Val
245 250 255
Gln Ala Ile Glu Thr His Leu Ile Arg Lys Ser Ser Gly Gly Leu Thr
260 265 270
Tyr Ile Ala Glu Trp Lys Gly Gly Leu Leu Glu His Lys Met Gly His
275 280 285
Leu Thr Cys Phe Ala Gly Gly Met Phe Ala Leu Gly Ala Asp Gly Ala
290 295 300
Pro Glu Ala Arg Ala Gln His Tyr Leu Glu Leu Gly Ala Glu Ile Ala
305 310 315 320
Arg Thr Cys His Glu Ser Tyr Asn Arg Thr Tyr Val Lys Leu Gly Pro
325 330 335
Glu Ala Phe Arg Phe Asp Gly Gly Val Glu Ala Ile Ala Thr Arg Gln
340 345 350
Asn Glu Lys Tyr Tyr Ile Leu Arg Pro Glu Val Ile Glu Thr Tyr Met
355 360 365
Tyr Met Trp Arg Leu Thr His Asp Pro Lys Tyr Arg Thr Trp Ala Trp
370 375 380
Glu Ala Val Glu Ala Leu Glu Ser His Cys Arg Val Asn Gly Gly Tyr
385 390 395 400
Ser Gly Leu Arg Asp Val Tyr Ile Ala Arg Glu Ser Tyr Asp Asp Val
405 410 415
Gln Gln Ser Phe Phe Leu Ala Glu Thr Leu Lys Tyr Leu Tyr Leu Ile
420 425 430
Phe Ser Asp Asp Asp Leu Leu Pro Leu Glu His Trp Ile Phe Asn Thr
435 440 445
Glu Ala His Pro Phe Pro Ile Leu Arg Glu Gln Lys Lys Glu Ile Asp
450 455 460
Gly Lys Glu Lys
465
<210> 29
<211> 1494
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码 Tr ManI 催化结构域
<400> 29
cgcgccggat ctcccaaccc tacgagggcg gcagcagtca aggccgcatt ccagacgtcg 60
tggaacgctt accaccattt tgcctttccc catgacgacc tccacccggt cagcaacagc 120
tttgatgatg agagaaacgg ctggggctcg tcggcaatcg atggcttgga cacggctatc 180
ctcatggggg atgccgacat tgtgaacacg atccttcagt atgtaccgca gatcaacttc 240
accacgactg cggttgccaa ccaaggcatc tccgtgttcg agaccaacat tcggtacctc 300
ggtggcctgc tttctgccta tgacctgttg cgaggtcctt tcagctcctt ggcgacaaac 360
cagaccctgg taaacagcct tctgaggcag gctcaaacac tggccaacgg cctcaaggtt 420
gcgttcacca ctcccagcgg tgtcccggac cctaccgtct tcttcaaccc tactgtccgg 480
agaagtggtg catctagcaa caacgtcgct gaaattggaa gcctggtgct cgagtggaca 540
cggttgagcg acctgacggg aaacccgcag tatgcccagc ttgcgcagaa gggcgagtcg 600
tatctcctga atccaaaggg aagcccggag gcatggcctg gcctgattgg aacgtttgtc 660
agcacgagca acggtacctt tcaggatagc agcggcagct ggtccggcct catggacagc 720
ttctacgagt acctgatcaa gatgtacctg tacgacccgg ttgcgtttgc acactacaag 780
gatcgctggg tccttgctgc cgactcgacc attgcgcatc tcgcctctca cccgtcgacg 840
cgcaaggact tgaccttttt gtcttcgtac aacggacagt ctacgtcgcc aaactcagga 900
catttggcca gttttgccgg tggcaacttc atcttgggag gcattctcct gaacgagcaa 960
aagtacattg actttggaat caagcttgcc agctcgtact ttgccacgta caaccagacg 1020
gcttctggaa tcggccccga aggcttcgcg tgggtggaca gcgtgacggg cgccggcggc 1080
tcgccgccct cgtcccagtc cgggttctac tcgtcggcag gattctgggt gacggcaccg 1140
tattacatcc tgcggccgga gacgctggag agcttgtact acgcataccg cgtcacgggc 1200
gactccaagt ggcaggacct ggcgtgggaa gcgttcagtg ccattgagga cgcatgccgc 1260
gccggcagcg cgtactcgtc catcaacgac gtgacgcagg ccaacggcgg gggtgcctct 1320
gacgatatgg agagcttctg gtttgccgag gcgctcaagt atgcgtacct gatctttgcg 1380
gaggagtcgg atgtgcaggt gcaggccaac ggcgggaaca aatttgtctt taacacggag 1440
gcgcacccct ttagcatccg ttcatcatca cgacggggcg gccaccttgc ttaa 1494
<210> 30
<211> 497
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> Tr ManI 催化结构域
<400> 30
Arg Ala Gly Ser Pro Asn Pro Thr Arg Ala Ala Ala Val Lys Ala Ala
1 5 10 15
Phe Gln Thr Ser Trp Asn Ala Tyr His His Phe Ala Phe Pro His Asp
20 25 30
Asp Leu His Pro Val Ser Asn Ser Phe Asp Asp Glu Arg Asn Gly Trp
35 40 45
Gly Ser Ser Ala Ile Asp Gly Leu Asp Thr Ala Ile Leu Met Gly Asp
50 55 60
Ala Asp Ile Val Asn Thr Ile Leu Gln Tyr Val Pro Gln Ile Asn Phe
65 70 75 80
Thr Thr Thr Ala Val Ala Asn Gln Gly Ile Ser Val Phe Glu Thr Asn
85 90 95
Ile Arg Tyr Leu Gly Gly Leu Leu Ser Ala Tyr Asp Leu Leu Arg Gly
100 105 110
Pro Phe Ser Ser Leu Ala Thr Asn Gln Thr Leu Val Asn Ser Leu Leu
115 120 125
Arg Gln Ala Gln Thr Leu Ala Asn Gly Leu Lys Val Ala Phe Thr Thr
130 135 140
Pro Ser Gly Val Pro Asp Pro Thr Val Phe Phe Asn Pro Thr Val Arg
145 150 155 160
Arg Ser Gly Ala Ser Ser Asn Asn Val Ala Glu Ile Gly Ser Leu Val
165 170 175
Leu Glu Trp Thr Arg Leu Ser Asp Leu Thr Gly Asn Pro Gln Tyr Ala
180 185 190
Gln Leu Ala Gln Lys Gly Glu Ser Tyr Leu Leu Asn Pro Lys Gly Ser
195 200 205
Pro Glu Ala Trp Pro Gly Leu Ile Gly Thr Phe Val Ser Thr Ser Asn
210 215 220
Gly Thr Phe Gln Asp Ser Ser Gly Ser Trp Ser Gly Leu Met Asp Ser
225 230 235 240
Phe Tyr Glu Tyr Leu Ile Lys Met Tyr Leu Tyr Asp Pro Val Ala Phe
245 250 255
Ala His Tyr Lys Asp Arg Trp Val Leu Ala Ala Asp Ser Thr Ile Ala
260 265 270
His Leu Ala Ser His Pro Ser Thr Arg Lys Asp Leu Thr Phe Leu Ser
275 280 285
Ser Tyr Asn Gly Gln Ser Thr Ser Pro Asn Ser Gly His Leu Ala Ser
290 295 300
Phe Ala Gly Gly Asn Phe Ile Leu Gly Gly Ile Leu Leu Asn Glu Gln
305 310 315 320
Lys Tyr Ile Asp Phe Gly Ile Lys Leu Ala Ser Ser Tyr Phe Ala Thr
325 330 335
Tyr Asn Gln Thr Ala Ser Gly Ile Gly Pro Glu Gly Phe Ala Trp Val
340 345 350
Asp Ser Val Thr Gly Ala Gly Gly Ser Pro Pro Ser Ser Gln Ser Gly
355 360 365
Phe Tyr Ser Ser Ala Gly Phe Trp Val Thr Ala Pro Tyr Tyr Ile Leu
370 375 380
Arg Pro Glu Thr Leu Glu Ser Leu Tyr Tyr Ala Tyr Arg Val Thr Gly
385 390 395 400
Asp Ser Lys Trp Gln Asp Leu Ala Trp Glu Ala Phe Ser Ala Ile Glu
405 410 415
Asp Ala Cys Arg Ala Gly Ser Ala Tyr Ser Ser Ile Asn Asp Val Thr
420 425 430
Gln Ala Asn Gly Gly Gly Ala Ser Asp Asp Met Glu Ser Phe Trp Phe
435 440 445
Ala Glu Ala Leu Lys Tyr Ala Tyr Leu Ile Phe Ala Glu Glu Ser Asp
450 455 460
Val Gln Val Gln Ala Asn Gly Gly Asn Lys Phe Val Phe Asn Thr Glu
465 470 475 480
Ala His Pro Phe Ser Ile Arg Ser Ser Ser Arg Arg Gly Gly His Leu
485 490 495
Ala
<210> 31
<211> 1068
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码大鼠 GnT II (TC) 密码子优化的
<400> 31
tccttggttt accaattgaa cttcgaccag atgttgagaa acgttgacaa ggacggtact 60
tggtctcctg gtgagttggt tttggttgtt caggttcaca acagaccaga gtacttgaga 120
ttgttgatcg actccttgag aaaggctcaa ggtatcagag aggttttggt tatcttctcc 180
cacgatttct ggtctgctga gatcaactcc ttgatctcct ccgttgactt ctgtccagtt 240
ttgcaggttt tcttcccatt ctccatccaa ttgtacccat ctgagttccc aggttctgat 300
ccaagagact gtccaagaga cttgaagaag aacgctgctt tgaagttggg ttgtatcaac 360
gctgaatacc cagattcttt cggtcactac agagaggcta agttctccca aactaagcat 420
cattggtggt ggaagttgca ctttgtttgg gagagagtta aggttttgca ggactacact 480
ggattgatct tgttcttgga ggaggatcat tacttggctc cagacttcta ccacgttttc 540
aagaagatgt ggaagttgaa gcaacaagag tgtccaggtt gtgacgtttt gtccttggga 600
acttacacta ctatcagatc cttctacggt atcgctgaca aggttgacgt taagacttgg 660
aagtccactg aacacaacat gggattggct ttgactagag atgcttacca gaagttgatc 720
gagtgtactg acactttctg tacttacgac gactacaact gggactggac tttgcagtac 780
ttgactttgg cttgtttgcc aaaagtttgg aaggttttgg ttccacaggc tccaagaatt 840
ttccacgctg gtgactgtgg aatgcaccac aagaaaactt gtagaccatc cactcagtcc 900
gctcaaattg agtccttgtt gaacaacaac aagcagtact tgttcccaga gactttggtt 960
atcggagaga agtttccaat ggctgctatt tccccaccaa gaaagaatgg tggatggggt 1020
gatattagag accacgagtt gtgtaaatcc tacagaagat tgcagtag 1068
<210> 32
<211> 355
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 大鼠 GnT II (TC) 密码子优化的
<400> 32
Ser Leu Val Tyr Gln Leu Asn Phe Asp Gln Met Leu Arg Asn Val Asp
1 5 10 15
Lys Asp Gly Thr Trp Ser Pro Gly Glu Leu Val Leu Val Val Gln Val
20 25 30
His Asn Arg Pro Glu Tyr Leu Arg Leu Leu Ile Asp Ser Leu Arg Lys
35 40 45
Ala Gln Gly Ile Arg Glu Val Leu Val Ile Phe Ser His Asp Phe Trp
50 55 60
Ser Ala Glu Ile Asn Ser Leu Ile Ser Ser Val Asp Phe Cys Pro Val
65 70 75 80
Leu Gln Val Phe Phe Pro Phe Ser Ile Gln Leu Tyr Pro Ser Glu Phe
85 90 95
Pro Gly Ser Asp Pro Arg Asp Cys Pro Arg Asp Leu Lys Lys Asn Ala
100 105 110
Ala Leu Lys Leu Gly Cys Ile Asn Ala Glu Tyr Pro Asp Ser Phe Gly
115 120 125
His Tyr Arg Glu Ala Lys Phe Ser Gln Thr Lys His His Trp Trp Trp
130 135 140
Lys Leu His Phe Val Trp Glu Arg Val Lys Val Leu Gln Asp Tyr Thr
145 150 155 160
Gly Leu Ile Leu Phe Leu Glu Glu Asp His Tyr Leu Ala Pro Asp Phe
165 170 175
Tyr His Val Phe Lys Lys Met Trp Lys Leu Lys Gln Gln Glu Cys Pro
180 185 190
Gly Cys Asp Val Leu Ser Leu Gly Thr Tyr Thr Thr Ile Arg Ser Phe
195 200 205
Tyr Gly Ile Ala Asp Lys Val Asp Val Lys Thr Trp Lys Ser Thr Glu
210 215 220
His Asn Met Gly Leu Ala Leu Thr Arg Asp Ala Tyr Gln Lys Leu Ile
225 230 235 240
Glu Cys Thr Asp Thr Phe Cys Thr Tyr Asp Asp Tyr Asn Trp Asp Trp
245 250 255
Thr Leu Gln Tyr Leu Thr Leu Ala Cys Leu Pro Lys Val Trp Lys Val
260 265 270
Leu Val Pro Gln Ala Pro Arg Ile Phe His Ala Gly Asp Cys Gly Met
275 280 285
His His Lys Lys Thr Cys Arg Pro Ser Thr Gln Ser Ala Gln Ile Glu
290 295 300
Ser Leu Leu Asn Asn Asn Lys Gln Tyr Leu Phe Pro Glu Thr Leu Val
305 310 315 320
Ile Gly Glu Lys Phe Pro Met Ala Ala Ile Ser Pro Pro Arg Lys Asn
325 330 335
Gly Gly Trp Gly Asp Ile Arg Asp His Glu Leu Cys Lys Ser Tyr Arg
340 345 350
Arg Leu Gln
355
<210> 33
<211> 3105
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码黑腹果蝇 ManII
密码子优化的 (KD)
<400> 33
agagacgatc caattagacc tccattgaag gttgctagat ccccaagacc aggtcaatgt 60
caagatgttg ttcaggacgt cccaaacgtt gatgtccaga tgttggagtt gtacgataga 120
atgtccttca aggacattga tggtggtgtt tggaagcagg gttggaacat taagtacgat 180
ccattgaagt acaacgctca tcacaagttg aaggtcttcg ttgtcccaca ctcccacaac 240
gatcctggtt ggattcagac cttcgaggaa tactaccagc acgacaccaa gcacatcttg 300
tccaacgctt tgagacattt gcacgacaac ccagagatga agttcatctg ggctgaaatc 360
tcctacttcg ctagattcta ccacgatttg ggtgagaaca agaagttgca gatgaagtcc 420
atcgtcaaga acggtcagtt ggaattcgtc actggtggat gggtcatgcc agacgaggct 480
aactcccact ggagaaacgt tttgttgcag ttgaccgaag gtcaaacttg gttgaagcaa 540
ttcatgaacg tcactccaac tgcttcctgg gctatcgatc cattcggaca ctctccaact 600
atgccataca ttttgcagaa gtctggtttc aagaatatgt tgatccagag aacccactac 660
tccgttaaga aggagttggc tcaacagaga cagttggagt tcttgtggag acagatctgg 720
gacaacaaag gtgacactgc tttgttcacc cacatgatgc cattctactc ttacgacatt 780
cctcatacct gtggtccaga tccaaaggtt tgttgtcagt tcgatttcaa aagaatgggt 840
tccttcggtt tgtcttgtcc atggaaggtt ccacctagaa ctatctctga tcaaaatgtt 900
gctgctagat ccgatttgtt ggttgatcag tggaagaaga aggctgagtt gtacagaacc 960
aacgtcttgt tgattccatt gggtgacgac ttcagattca agcagaacac cgagtgggat 1020
gttcagagag tcaactacga aagattgttc gaacacatca actctcaggc tcacttcaat 1080
gtccaggctc agttcggtac tttgcaggaa tacttcgatg ctgttcacca ggctgaaaga 1140
gctggacaag ctgagttccc aaccttgtct ggtgacttct tcacttacgc tgatagatct 1200
gataactact ggtctggtta ctacacttcc agaccatacc ataagagaat ggacagagtc 1260
ttgatgcact acgttagagc tgctgaaatg ttgtccgctt ggcactcctg ggacggtatg 1320
gctagaatcg aggaaagatt ggagcaggct agaagagagt tgtccttgtt ccagcaccac 1380
gacggtatta ctggtactgc taaaactcac gttgtcgtcg actacgagca aagaatgcag 1440
gaagctttga aagcttgtca aatggtcatg caacagtctg tctacagatt gttgactaag 1500
ccatccatct actctccaga cttctccttc tcctacttca ctttggacga ctccagatgg 1560
ccaggttctg gtgttgagga ctctagaact accatcatct tgggtgagga tatcttgcca 1620
tccaagcatg ttgtcatgca caacaccttg ccacactgga gagagcagtt ggttgacttc 1680
tacgtctcct ctccattcgt ttctgttacc gacttggcta acaatccagt tgaggctcag 1740
gtttctccag tttggtcttg gcaccacgac actttgacta agactatcca cccacaaggt 1800
tccaccacca agtacagaat catcttcaag gctagagttc caccaatggg tttggctacc 1860
tacgttttga ccatctccga ttccaagcca gagcacacct cctacgcttc caatttgttg 1920
cttagaaaga acccaacttc cttgccattg ggtcaatacc cagaggatgt caagttcggt 1980
gatccaagag agatctcctt gagagttggt aacggtccaa ccttggcttt ctctgagcag 2040
ggtttgttga agtccattca gttgactcag gattctccac atgttccagt tcacttcaag 2100
ttcttgaagt acggtgttag atctcatggt gatagatctg gtgcttactt gttcttgcca 2160
aatggtccag cttctccagt cgagttgggt cagccagttg tcttggtcac taagggtaaa 2220
ttggagtctt ccgtttctgt tggtttgcca tctgtcgttc accagaccat catgagaggt 2280
ggtgctccag agattagaaa tttggtcgat attggttctt tggacaacac tgagatcgtc 2340
atgagattgg agactcatat cgactctggt gatatcttct acactgattt gaatggattg 2400
caattcatca agaggagaag attggacaag ttgccattgc aggctaacta ctacccaatt 2460
ccatctggta tgttcattga ggatgctaat accagattga ctttgttgac cggtcaacca 2520
ttgggtggat cttctttggc ttctggtgag ttggagatta tgcaagatag aagattggct 2580
tctgatgatg aaagaggttt gggtcagggt gttttggaca acaagccagt tttgcatatt 2640
tacagattgg tcttggagaa ggttaacaac tgtgtcagac catctaagtt gcatccagct 2700
ggttacttga cttctgctgc tcacaaagct tctcagtctt tgttggatcc attggacaag 2760
ttcatcttcg ctgaaaatga gtggatcggt gctcagggtc aattcggtgg tgatcatcca 2820
tctgctagag aggatttgga tgtctctgtc atgagaagat tgaccaagtc ttctgctaaa 2880
acccagagag ttggttacgt tttgcacaga accaatttga tgcaatgtgg tactccagag 2940
gagcatactc agaagttgga tgtctgtcac ttgttgccaa atgttgctag atgtgagaga 3000
actaccttga ctttcttgca gaatttggag cacttggatg gtatggttgc tccagaagtt 3060
tgtccaatgg aaaccgctgc ttacgtctct tctcactctt cttga 3105
<210> 34
<211> 1034
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 黑腹果蝇 ManII 密码子优化的 (KD)
<400> 34
Arg Asp Asp Pro Ile Arg Pro Pro Leu Lys Val Ala Arg Ser Pro Arg
1 5 10 15
Pro Gly Gln Cys Gln Asp Val Val Gln Asp Val Pro Asn Val Asp Val
20 25 30
Gln Met Leu Glu Leu Tyr Asp Arg Met Ser Phe Lys Asp Ile Asp Gly
35 40 45
Gly Val Trp Lys Gln Gly Trp Asn Ile Lys Tyr Asp Pro Leu Lys Tyr
50 55 60
Asn Ala His His Lys Leu Lys Val Phe Val Val Pro His Ser His Asn
65 70 75 80
Asp Pro Gly Trp Ile Gln Thr Phe Glu Glu Tyr Tyr Gln His Asp Thr
85 90 95
Lys His Ile Leu Ser Asn Ala Leu Arg His Leu His Asp Asn Pro Glu
100 105 110
Met Lys Phe Ile Trp Ala Glu Ile Ser Tyr Phe Ala Arg Phe Tyr His
115 120 125
Asp Leu Gly Glu Asn Lys Lys Leu Gln Met Lys Ser Ile Val Lys Asn
130 135 140
Gly Gln Leu Glu Phe Val Thr Gly Gly Trp Val Met Pro Asp Glu Ala
145 150 155 160
Asn Ser His Trp Arg Asn Val Leu Leu Gln Leu Thr Glu Gly Gln Thr
165 170 175
Trp Leu Lys Gln Phe Met Asn Val Thr Pro Thr Ala Ser Trp Ala Ile
180 185 190
Asp Pro Phe Gly His Ser Pro Thr Met Pro Tyr Ile Leu Gln Lys Ser
195 200 205
Gly Phe Lys Asn Met Leu Ile Gln Arg Thr His Tyr Ser Val Lys Lys
210 215 220
Glu Leu Ala Gln Gln Arg Gln Leu Glu Phe Leu Trp Arg Gln Ile Trp
225 230 235 240
Asp Asn Lys Gly Asp Thr Ala Leu Phe Thr His Met Met Pro Phe Tyr
245 250 255
Ser Tyr Asp Ile Pro His Thr Cys Gly Pro Asp Pro Lys Val Cys Cys
260 265 270
Gln Phe Asp Phe Lys Arg Met Gly Ser Phe Gly Leu Ser Cys Pro Trp
275 280 285
Lys Val Pro Pro Arg Thr Ile Ser Asp Gln Asn Val Ala Ala Arg Ser
290 295 300
Asp Leu Leu Val Asp Gln Trp Lys Lys Lys Ala Glu Leu Tyr Arg Thr
305 310 315 320
Asn Val Leu Leu Ile Pro Leu Gly Asp Asp Phe Arg Phe Lys Gln Asn
325 330 335
Thr Glu Trp Asp Val Gln Arg Val Asn Tyr Glu Arg Leu Phe Glu His
340 345 350
Ile Asn Ser Gln Ala His Phe Asn Val Gln Ala Gln Phe Gly Thr Leu
355 360 365
Gln Glu Tyr Phe Asp Ala Val His Gln Ala Glu Arg Ala Gly Gln Ala
370 375 380
Glu Phe Pro Thr Leu Ser Gly Asp Phe Phe Thr Tyr Ala Asp Arg Ser
385 390 395 400
Asp Asn Tyr Trp Ser Gly Tyr Tyr Thr Ser Arg Pro Tyr His Lys Arg
405 410 415
Met Asp Arg Val Leu Met His Tyr Val Arg Ala Ala Glu Met Leu Ser
420 425 430
Ala Trp His Ser Trp Asp Gly Met Ala Arg Ile Glu Glu Arg Leu Glu
435 440 445
Gln Ala Arg Arg Glu Leu Ser Leu Phe Gln His His Asp Gly Ile Thr
450 455 460
Gly Thr Ala Lys Thr His Val Val Val Asp Tyr Glu Gln Arg Met Gln
465 470 475 480
Glu Ala Leu Lys Ala Cys Gln Met Val Met Gln Gln Ser Val Tyr Arg
485 490 495
Leu Leu Thr Lys Pro Ser Ile Tyr Ser Pro Asp Phe Ser Phe Ser Tyr
500 505 510
Phe Thr Leu Asp Asp Ser Arg Trp Pro Gly Ser Gly Val Glu Asp Ser
515 520 525
Arg Thr Thr Ile Ile Leu Gly Glu Asp Ile Leu Pro Ser Lys His Val
530 535 540
Val Met His Asn Thr Leu Pro His Trp Arg Glu Gln Leu Val Asp Phe
545 550 555 560
Tyr Val Ser Ser Pro Phe Val Ser Val Thr Asp Leu Ala Asn Asn Pro
565 570 575
Val Glu Ala Gln Val Ser Pro Val Trp Ser Trp His His Asp Thr Leu
580 585 590
Thr Lys Thr Ile His Pro Gln Gly Ser Thr Thr Lys Tyr Arg Ile Ile
595 600 605
Phe Lys Ala Arg Val Pro Pro Met Gly Leu Ala Thr Tyr Val Leu Thr
610 615 620
Ile Ser Asp Ser Lys Pro Glu His Thr Ser Tyr Ala Ser Asn Leu Leu
625 630 635 640
Leu Arg Lys Asn Pro Thr Ser Leu Pro Leu Gly Gln Tyr Pro Glu Asp
645 650 655
Val Lys Phe Gly Asp Pro Arg Glu Ile Ser Leu Arg Val Gly Asn Gly
660 665 670
Pro Thr Leu Ala Phe Ser Glu Gln Gly Leu Leu Lys Ser Ile Gln Leu
675 680 685
Thr Gln Asp Ser Pro His Val Pro Val His Phe Lys Phe Leu Lys Tyr
690 695 700
Gly Val Arg Ser His Gly Asp Arg Ser Gly Ala Tyr Leu Phe Leu Pro
705 710 715 720
Asn Gly Pro Ala Ser Pro Val Glu Leu Gly Gln Pro Val Val Leu Val
725 730 735
Thr Lys Gly Lys Leu Glu Ser Ser Val Ser Val Gly Leu Pro Ser Val
740 745 750
Val His Gln Thr Ile Met Arg Gly Gly Ala Pro Glu Ile Arg Asn Leu
755 760 765
Val Asp Ile Gly Ser Leu Asp Asn Thr Glu Ile Val Met Arg Leu Glu
770 775 780
Thr His Ile Asp Ser Gly Asp Ile Phe Tyr Thr Asp Leu Asn Gly Leu
785 790 795 800
Gln Phe Ile Lys Arg Arg Arg Leu Asp Lys Leu Pro Leu Gln Ala Asn
805 810 815
Tyr Tyr Pro Ile Pro Ser Gly Met Phe Ile Glu Asp Ala Asn Thr Arg
820 825 830
Leu Thr Leu Leu Thr Gly Gln Pro Leu Gly Gly Ser Ser Leu Ala Ser
835 840 845
Gly Glu Leu Glu Ile Met Gln Asp Arg Arg Leu Ala Ser Asp Asp Glu
850 855 860
Arg Gly Leu Gly Gln Gly Val Leu Asp Asn Lys Pro Val Leu His Ile
865 870 875 880
Tyr Arg Leu Val Leu Glu Lys Val Asn Asn Cys Val Arg Pro Ser Lys
885 890 895
Leu His Pro Ala Gly Tyr Leu Thr Ser Ala Ala His Lys Ala Ser Gln
900 905 910
Ser Leu Leu Asp Pro Leu Asp Lys Phe Ile Phe Ala Glu Asn Glu Trp
915 920 925
Ile Gly Ala Gln Gly Gln Phe Gly Gly Asp His Pro Ser Ala Arg Glu
930 935 940
Asp Leu Asp Val Ser Val Met Arg Arg Leu Thr Lys Ser Ser Ala Lys
945 950 955 960
Thr Gln Arg Val Gly Tyr Val Leu His Arg Thr Asn Leu Met Gln Cys
965 970 975
Gly Thr Pro Glu Glu His Thr Gln Lys Leu Asp Val Cys His Leu Leu
980 985 990
Pro Asn Val Ala Arg Cys Glu Arg Thr Thr Leu Thr Phe Leu Gln Asn
995 1000 1005
Leu Glu His Leu Asp Gly Met Val Ala Pro Glu Val Cys Pro Met Glu
1010 1015 1020
Thr Ala Ala Tyr Val Ser Ser His Ser Ser
1025 1030
<210> 35
<211> 1014
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码小鼠 CMP-唾液酸转运蛋白 (MmCST)
密码子优化的
<400> 35
atggctccag ctagagaaaa cgtttccttg ttcttcaagt tgtactgttt ggctgttatg 60
actttggttg ctgctgctta cactgttgct ttgagataca ctagaactac tgctgaggag 120
ttgtacttct ccactactgc tgtttgtatc actgaggtta tcaagttgtt gatctccgtt 180
ggtttgttgg ctaaggagac tggttctttg ggaagattca aggcttcctt gtccgaaaac 240
gttttgggtt ccccaaagga gttggctaag ttgtctgttc catccttggt ttacgctgtt 300
cagaacaaca tggctttctt ggctttgtct aacttggacg ctgctgttta ccaagttact 360
taccagttga agatcccatg tactgctttg tgtactgttt tgatgttgaa cagaacattg 420
tccaagttgc agtggatctc cgttttcatg ttgtgtggtg gtgttacttt ggttcagtgg 480
aagccagctc aagcttccaa agttgttgtt gctcagaacc cattgttggg tttcggtgct 540
attgctatcg ctgttttgtg ttccggtttc gctggtgttt acttcgagaa ggttttgaag 600
tcctccgaca cttctttgtg ggttagaaac atccagatgt acttgtccgg tatcgttgtt 660
actttggctg gtacttactt gtctgacggt gctgagattc aagagaaggg attcttctac 720
ggttacactt actatgtttg gttcgttatc ttcttggctt ccgttggtgg tttgtacact 780
tccgttgttg ttaagtacac tgacaacatc atgaagggat tctctgctgc tgctgctatt 840
gttttgtcca ctatcgcttc cgttttgttg ttcggattgc agatcacatt gtcctttgct 900
ttgggagctt tgttggtttg tgtttccatc tacttgtacg gattgccaag acaagacact 960
acttccattc agcaagaggc tacttccaag gagagaatca tcggtgttta gtag 1014
<210> 36
<211> 336
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 小鼠 CMP-唾液酸转运蛋白 (MmCST)
密码子优化的
<400> 36
Met Ala Pro Ala Arg Glu Asn Val Ser Leu Phe Phe Lys Leu Tyr Cys
1 5 10 15
Leu Ala Val Met Thr Leu Val Ala Ala Ala Tyr Thr Val Ala Leu Arg
20 25 30
Tyr Thr Arg Thr Thr Ala Glu Glu Leu Tyr Phe Ser Thr Thr Ala Val
35 40 45
Cys Ile Thr Glu Val Ile Lys Leu Leu Ile Ser Val Gly Leu Leu Ala
50 55 60
Lys Glu Thr Gly Ser Leu Gly Arg Phe Lys Ala Ser Leu Ser Glu Asn
65 70 75 80
Val Leu Gly Ser Pro Lys Glu Leu Ala Lys Leu Ser Val Pro Ser Leu
85 90 95
Val Tyr Ala Val Gln Asn Asn Met Ala Phe Leu Ala Leu Ser Asn Leu
100 105 110
Asp Ala Ala Val Tyr Gln Val Thr Tyr Gln Leu Lys Ile Pro Cys Thr
115 120 125
Ala Leu Cys Thr Val Leu Met Leu Asn Arg Thr Leu Ser Lys Leu Gln
130 135 140
Trp Ile Ser Val Phe Met Leu Cys Gly Gly Val Thr Leu Val Gln Trp
145 150 155 160
Lys Pro Ala Gln Ala Ser Lys Val Val Val Ala Gln Asn Pro Leu Leu
165 170 175
Gly Phe Gly Ala Ile Ala Ile Ala Val Leu Cys Ser Gly Phe Ala Gly
180 185 190
Val Tyr Phe Glu Lys Val Leu Lys Ser Ser Asp Thr Ser Leu Trp Val
195 200 205
Arg Asn Ile Gln Met Tyr Leu Ser Gly Ile Val Val Thr Leu Ala Gly
210 215 220
Thr Tyr Leu Ser Asp Gly Ala Glu Ile Gln Glu Lys Gly Phe Phe Tyr
225 230 235 240
Gly Tyr Thr Tyr Tyr Val Trp Phe Val Ile Phe Leu Ala Ser Val Gly
245 250 255
Gly Leu Tyr Thr Ser Val Val Val Lys Tyr Thr Asp Asn Ile Met Lys
260 265 270
Gly Phe Ser Ala Ala Ala Ala Ile Val Leu Ser Thr Ile Ala Ser Val
275 280 285
Leu Leu Phe Gly Leu Gln Ile Thr Leu Ser Phe Ala Leu Gly Ala Leu
290 295 300
Leu Val Cys Val Ser Ile Tyr Leu Tyr Gly Leu Pro Arg Gln Asp Thr
305 310 315 320
Thr Ser Ile Gln Gln Glu Ala Thr Ser Lys Glu Arg Ile Ile Gly Val
325 330 335
<210> 37
<211> 2172
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码人 UDP-GlcNAc
2-差向异构酶/N-乙酰甘露糖胺激酶 (HsGNE)
密码子优化的
<400> 37
atggaaaaga acggtaacaa cagaaagttg agagtttgtg ttgctacttg taacagagct 60
gactactcca agttggctcc aatcatgttc ggtatcaaga ctgagccaga gttcttcgag 120
ttggacgttg ttgttttggg ttcccacttg attgatgact acggtaacac ttacagaatg 180
atcgagcagg acgacttcga catcaacact agattgcaca ctattgttag aggagaggac 240
gaagctgcta tggttgaatc tgttggattg gctttggtta agttgccaga cgttttgaac 300
agattgaagc cagacatcat gattgttcac ggtgacagat tcgatgcttt ggctttggct 360
acttccgctg ctttgatgaa cattagaatc ttgcacatcg agggtggtga agtttctggt 420
actatcgacg actccatcag acacgctatc actaagttgg ctcactacca tgtttgttgt 480
actagatccg ctgagcaaca cttgatttcc atgtgtgagg accacgacag aattttgttg 540
gctggttgtc catcttacga caagttgttg tccgctaaga acaaggacta catgtccatc 600
atcagaatgt ggttgggtga cgacgttaag tctaaggact acatcgttgc tttgcagcac 660
ccagttacta ctgacatcaa gcactccatc aagatgttcg agttgacttt ggacgctttg 720
atctccttca acaagagaac tttggttttg ttcccaaaca ttgacgctgg ttccaaagag 780
atggttagag ttatgagaaa gaagggtatc gaacaccacc caaacttcag agctgttaag 840
cacgttccat tcgaccaatt catccagttg gttgctcatg ctggttgtat gatcggtaac 900
tcctcctgtg gtgttagaga agttggtgct ttcggtactc cagttatcaa cttgggtact 960
agacagatcg gtagagagac tggagaaaac gttttgcatg ttagagatgc tgacactcag 1020
gacaagattt tgcaggcttt gcacttgcaa ttcggaaagc agtacccatg ttccaaaatc 1080
tacggtgacg gtaacgctgt tccaagaatc ttgaagtttt tgaagtccat cgacttgcaa 1140
gagccattgc agaagaagtt ctgtttccca ccagttaagg agaacatctc ccaggacatt 1200
gaccacatct tggagacatt gtccgctttg gctgttgatt tgggtggaac taacttgaga 1260
gttgctatcg tttccatgaa gggagagatc gttaagaagt acactcagtt caacccaaag 1320
acttacgagg agagaatcaa cttgatcttg cagatgtgtg ttgaagctgc tgctgaggct 1380
gttaagttga actgtagaat cttgggtgtt ggtatctcta ctggtggtag agttaatcca 1440
agagagggta tcgttttgca ctccactaag ttgattcagg agtggaactc cgttgatttg 1500
agaactccat tgtccgacac attgcacttg ccagtttggg ttgacaacga cggtaattgt 1560
gctgctttgg ctgagagaaa gttcggtcaa ggaaagggat tggagaactt cgttactttg 1620
atcactggta ctggtattgg tggtggtatc attcaccagc acgagttgat tcacggttct 1680
tccttctgtg ctgctgaatt gggacacttg gttgtttctt tggacggtcc agactgttct 1740
tgtggttccc acggttgtat tgaagcttac gcatcaggaa tggcattgca gagagaggct 1800
aagaagttgc acgacgagga cttgttgttg gttgagggaa tgtctgttcc aaaggacgag 1860
gctgttggtg ctttgcattt gatccaggct gctaagttgg gtaatgctaa ggctcagtcc 1920
atcttgagaa ctgctggtac tgctttggga ttgggtgttg ttaatatctt gcacactatg 1980
aacccatcct tggttatctt gtccggtgtt ttggcttctc actacatcca catcgttaag 2040
gacgttatca gacagcaagc tttgtcctcc gttcaagacg ttgatgttgt tgtttccgac 2100
ttggttgacc cagctttgtt gggtgctgct tccatggttt tggactacac tactagaaga 2160
atctactaat ag 2172
<210> 38
<211> 722
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人 UDP-GlcNAc 2-差向异构酶/N-乙酰甘露糖胺
激酶 (HsGNE)
密码子优化的
<400> 38
Met Glu Lys Asn Gly Asn Asn Arg Lys Leu Arg Val Cys Val Ala Thr
1 5 10 15
Cys Asn Arg Ala Asp Tyr Ser Lys Leu Ala Pro Ile Met Phe Gly Ile
20 25 30
Lys Thr Glu Pro Glu Phe Phe Glu Leu Asp Val Val Val Leu Gly Ser
35 40 45
His Leu Ile Asp Asp Tyr Gly Asn Thr Tyr Arg Met Ile Glu Gln Asp
50 55 60
Asp Phe Asp Ile Asn Thr Arg Leu His Thr Ile Val Arg Gly Glu Asp
65 70 75 80
Glu Ala Ala Met Val Glu Ser Val Gly Leu Ala Leu Val Lys Leu Pro
85 90 95
Asp Val Leu Asn Arg Leu Lys Pro Asp Ile Met Ile Val His Gly Asp
100 105 110
Arg Phe Asp Ala Leu Ala Leu Ala Thr Ser Ala Ala Leu Met Asn Ile
115 120 125
Arg Ile Leu His Ile Glu Gly Gly Glu Val Ser Gly Thr Ile Asp Asp
130 135 140
Ser Ile Arg His Ala Ile Thr Lys Leu Ala His Tyr His Val Cys Cys
145 150 155 160
Thr Arg Ser Ala Glu Gln His Leu Ile Ser Met Cys Glu Asp His Asp
165 170 175
Arg Ile Leu Leu Ala Gly Cys Pro Ser Tyr Asp Lys Leu Leu Ser Ala
180 185 190
Lys Asn Lys Asp Tyr Met Ser Ile Ile Arg Met Trp Leu Gly Asp Asp
195 200 205
Val Lys Ser Lys Asp Tyr Ile Val Ala Leu Gln His Pro Val Thr Thr
210 215 220
Asp Ile Lys His Ser Ile Lys Met Phe Glu Leu Thr Leu Asp Ala Leu
225 230 235 240
Ile Ser Phe Asn Lys Arg Thr Leu Val Leu Phe Pro Asn Ile Asp Ala
245 250 255
Gly Ser Lys Glu Met Val Arg Val Met Arg Lys Lys Gly Ile Glu His
260 265 270
His Pro Asn Phe Arg Ala Val Lys His Val Pro Phe Asp Gln Phe Ile
275 280 285
Gln Leu Val Ala His Ala Gly Cys Met Ile Gly Asn Ser Ser Cys Gly
290 295 300
Val Arg Glu Val Gly Ala Phe Gly Thr Pro Val Ile Asn Leu Gly Thr
305 310 315 320
Arg Gln Ile Gly Arg Glu Thr Gly Glu Asn Val Leu His Val Arg Asp
325 330 335
Ala Asp Thr Gln Asp Lys Ile Leu Gln Ala Leu His Leu Gln Phe Gly
340 345 350
Lys Gln Tyr Pro Cys Ser Lys Ile Tyr Gly Asp Gly Asn Ala Val Pro
355 360 365
Arg Ile Leu Lys Phe Leu Lys Ser Ile Asp Leu Gln Glu Pro Leu Gln
370 375 380
Lys Lys Phe Cys Phe Pro Pro Val Lys Glu Asn Ile Ser Gln Asp Ile
385 390 395 400
Asp His Ile Leu Glu Thr Leu Ser Ala Leu Ala Val Asp Leu Gly Gly
405 410 415
Thr Asn Leu Arg Val Ala Ile Val Ser Met Lys Gly Glu Ile Val Lys
420 425 430
Lys Tyr Thr Gln Phe Asn Pro Lys Thr Tyr Glu Glu Arg Ile Asn Leu
435 440 445
Ile Leu Gln Met Cys Val Glu Ala Ala Ala Glu Ala Val Lys Leu Asn
450 455 460
Cys Arg Ile Leu Gly Val Gly Ile Ser Thr Gly Gly Arg Val Asn Pro
465 470 475 480
Arg Glu Gly Ile Val Leu His Ser Thr Lys Leu Ile Gln Glu Trp Asn
485 490 495
Ser Val Asp Leu Arg Thr Pro Leu Ser Asp Thr Leu His Leu Pro Val
500 505 510
Trp Val Asp Asn Asp Gly Asn Cys Ala Ala Leu Ala Glu Arg Lys Phe
515 520 525
Gly Gln Gly Lys Gly Leu Glu Asn Phe Val Thr Leu Ile Thr Gly Thr
530 535 540
Gly Ile Gly Gly Gly Ile Ile His Gln His Glu Leu Ile His Gly Ser
545 550 555 560
Ser Phe Cys Ala Ala Glu Leu Gly His Leu Val Val Ser Leu Asp Gly
565 570 575
Pro Asp Cys Ser Cys Gly Ser His Gly Cys Ile Glu Ala Tyr Ala Ser
580 585 590
Gly Met Ala Leu Gln Arg Glu Ala Lys Lys Leu His Asp Glu Asp Leu
595 600 605
Leu Leu Val Glu Gly Met Ser Val Pro Lys Asp Glu Ala Val Gly Ala
610 615 620
Leu His Leu Ile Gln Ala Ala Lys Leu Gly Asn Ala Lys Ala Gln Ser
625 630 635 640
Ile Leu Arg Thr Ala Gly Thr Ala Leu Gly Leu Gly Val Val Asn Ile
645 650 655
Leu His Thr Met Asn Pro Ser Leu Val Ile Leu Ser Gly Val Leu Ala
660 665 670
Ser His Tyr Ile His Ile Val Lys Asp Val Ile Arg Gln Gln Ala Leu
675 680 685
Ser Ser Val Gln Asp Val Asp Val Val Val Ser Asp Leu Val Asp Pro
690 695 700
Ala Leu Leu Gly Ala Ala Ser Met Val Leu Asp Tyr Thr Thr Arg Arg
705 710 715 720
Ile Tyr
<210> 39
<211> 1308
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码人 CMP-唾液酸合酶 (HsCSS)
密码子优化的
<400> 39
atggactctg ttgaaaaggg tgctgctact tctgtttcca acccaagagg tagaccatcc 60
agaggtagac ctcctaagtt gcagagaaac tccagaggtg gtcaaggtag aggtgttgaa 120
aagccaccac acttggctgc tttgatcttg gctagaggag gttctaaggg tatcccattg 180
aagaacatca agcacttggc tggtgttcca ttgattggat gggttttgag agctgctttg 240
gactctggtg ctttccaatc tgtttgggtt tccactgacc acgacgagat tgagaacgtt 300
gctaagcaat tcggtgctca ggttcacaga agatcctctg aggtttccaa ggactcttct 360
acttccttgg acgctatcat cgagttcttg aactaccaca acgaggttga catcgttggt 420
aacatccaag ctacttcccc atgtttgcac ccaactgact tgcaaaaagt tgctgagatg 480
atcagagaag agggttacga ctccgttttc tccgttgtta gaaggcacca gttcagatgg 540
tccgagattc agaagggtgt tagagaggtt acagagccat tgaacttgaa cccagctaaa 600
agaccaagaa ggcaggattg ggacggtgaa ttgtacgaaa acggttcctt ctacttcgct 660
aagagacact tgatcgagat gggatacttg caaggtggaa agatggctta ctacgagatg 720
agagctgaac actccgttga catcgacgtt gatatcgact ggccaattgc tgagcagaga 780
gttttgagat acggttactt cggaaaggag aagttgaagg agatcaagtt gttggtttgt 840
aacatcgacg gttgtttgac taacggtcac atctacgttt ctggtgacca gaaggagatt 900
atctcctacg acgttaagga cgctattggt atctccttgt tgaagaagtc cggtatcgaa 960
gttagattga tctccgagag agcttgttcc aagcaaacat tgtcctcttt gaagttggac 1020
tgtaagatgg aggtttccgt ttctgacaag ttggctgttg ttgacgaatg gagaaaggag 1080
atgggtttgt gttggaagga agttgcttac ttgggtaacg aagtttctga cgaggagtgt 1140
ttgaagagag ttggtttgtc tggtgctcca gctgatgctt gttccactgc tcaaaaggct 1200
gttggttaca tctgtaagtg taacggtggt agaggtgcta ttagagagtt cgctgagcac 1260
atctgtttgt tgatggagaa agttaataac tcctgtcaga agtagtag 1308
<210> 40
<211> 434
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人 CMP-唾液酸合酶 (HsCSS)
密码子优化的
<400> 40
Met Asp Ser Val Glu Lys Gly Ala Ala Thr Ser Val Ser Asn Pro Arg
1 5 10 15
Gly Arg Pro Ser Arg Gly Arg Pro Pro Lys Leu Gln Arg Asn Ser Arg
20 25 30
Gly Gly Gln Gly Arg Gly Val Glu Lys Pro Pro His Leu Ala Ala Leu
35 40 45
Ile Leu Ala Arg Gly Gly Ser Lys Gly Ile Pro Leu Lys Asn Ile Lys
50 55 60
His Leu Ala Gly Val Pro Leu Ile Gly Trp Val Leu Arg Ala Ala Leu
65 70 75 80
Asp Ser Gly Ala Phe Gln Ser Val Trp Val Ser Thr Asp His Asp Glu
85 90 95
Ile Glu Asn Val Ala Lys Gln Phe Gly Ala Gln Val His Arg Arg Ser
100 105 110
Ser Glu Val Ser Lys Asp Ser Ser Thr Ser Leu Asp Ala Ile Ile Glu
115 120 125
Phe Leu Asn Tyr His Asn Glu Val Asp Ile Val Gly Asn Ile Gln Ala
130 135 140
Thr Ser Pro Cys Leu His Pro Thr Asp Leu Gln Lys Val Ala Glu Met
145 150 155 160
Ile Arg Glu Glu Gly Tyr Asp Ser Val Phe Ser Val Val Arg Arg His
165 170 175
Gln Phe Arg Trp Ser Glu Ile Gln Lys Gly Val Arg Glu Val Thr Glu
180 185 190
Pro Leu Asn Leu Asn Pro Ala Lys Arg Pro Arg Arg Gln Asp Trp Asp
195 200 205
Gly Glu Leu Tyr Glu Asn Gly Ser Phe Tyr Phe Ala Lys Arg His Leu
210 215 220
Ile Glu Met Gly Tyr Leu Gln Gly Gly Lys Met Ala Tyr Tyr Glu Met
225 230 235 240
Arg Ala Glu His Ser Val Asp Ile Asp Val Asp Ile Asp Trp Pro Ile
245 250 255
Ala Glu Gln Arg Val Leu Arg Tyr Gly Tyr Phe Gly Lys Glu Lys Leu
260 265 270
Lys Glu Ile Lys Leu Leu Val Cys Asn Ile Asp Gly Cys Leu Thr Asn
275 280 285
Gly His Ile Tyr Val Ser Gly Asp Gln Lys Glu Ile Ile Ser Tyr Asp
290 295 300
Val Lys Asp Ala Ile Gly Ile Ser Leu Leu Lys Lys Ser Gly Ile Glu
305 310 315 320
Val Arg Leu Ile Ser Glu Arg Ala Cys Ser Lys Gln Thr Leu Ser Ser
325 330 335
Leu Lys Leu Asp Cys Lys Met Glu Val Ser Val Ser Asp Lys Leu Ala
340 345 350
Val Val Asp Glu Trp Arg Lys Glu Met Gly Leu Cys Trp Lys Glu Val
355 360 365
Ala Tyr Leu Gly Asn Glu Val Ser Asp Glu Glu Cys Leu Lys Arg Val
370 375 380
Gly Leu Ser Gly Ala Pro Ala Asp Ala Cys Ser Thr Ala Gln Lys Ala
385 390 395 400
Val Gly Tyr Ile Cys Lys Cys Asn Gly Gly Arg Gly Ala Ile Arg Glu
405 410 415
Phe Ala Glu His Ile Cys Leu Leu Met Glu Lys Val Asn Asn Ser Cys
420 425 430
Gln Lys
<210> 41
<211> 1080
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码人 N-乙酰神经氨酸-9-磷酸
合酶 (HsSPS) 密码子优化的
<400> 41
atgccattgg aattggagtt gtgtcctggt agatgggttg gtggtcaaca cccatgtttc 60
atcatcgctg agatcggtca aaaccaccaa ggagacttgg acgttgctaa gagaatgatc 120
agaatggcta aggaatgtgg tgctgactgt gctaagttcc agaagtccga gttggagttc 180
aagttcaaca gaaaggcttt ggaaagacca tacacttcca agcactcttg gggaaagact 240
tacggagaac acaagagaca cttggagttc tctcacgacc aatacagaga gttgcagaga 300
tacgctgagg aagttggtat cttcttcact gcttctggaa tggacgaaat ggctgttgag 360
ttcttgcacg agttgaacgt tccattcttc aaagttggtt ccggtgacac taacaacttc 420
ccatacttgg aaaagactgc taagaaaggt agaccaatgg ttatctcctc tggaatgcag 480
tctatggaca ctatgaagca ggtttaccag atcgttaagc cattgaaccc aaacttttgt 540
ttcttgcagt gtacttccgc ttacccattg caaccagagg acgttaattt gagagttatc 600
tccgagtacc agaagttgtt cccagacatc ccaattggtt actctggtca cgagactggt 660
attgctattt ccgttgctgc tgttgctttg ggtgctaagg ttttggagag acacatcact 720
ttggacaaga cttggaaggg ttctgatcac tctgcttctt tggaacctgg tgagttggct 780
gaacttgtta gatcagttag attggttgag agagctttgg gttccccaac taagcaattg 840
ttgccatgtg agatggcttg taacgagaag ttgggaaagt ccgttgttgc taaggttaag 900
atcccagagg gtactatctt gactatggac atgttgactg ttaaagttgg agagccaaag 960
ggttacccac cagaggacat ctttaacttg gttggtaaaa aggttttggt tactgttgag 1020
gaggacgaca ctattatgga ggagttggtt gacaaccacg gaaagaagat caagtcctag 1080
<210> 42
<211> 359
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 人 N-乙酰神经氨酸-9-磷酸合酶
(HsSPS) 密码子优化的
<400> 42
Met Pro Leu Glu Leu Glu Leu Cys Pro Gly Arg Trp Val Gly Gly Gln
1 5 10 15
His Pro Cys Phe Ile Ile Ala Glu Ile Gly Gln Asn His Gln Gly Asp
20 25 30
Leu Asp Val Ala Lys Arg Met Ile Arg Met Ala Lys Glu Cys Gly Ala
35 40 45
Asp Cys Ala Lys Phe Gln Lys Ser Glu Leu Glu Phe Lys Phe Asn Arg
50 55 60
Lys Ala Leu Glu Arg Pro Tyr Thr Ser Lys His Ser Trp Gly Lys Thr
65 70 75 80
Tyr Gly Glu His Lys Arg His Leu Glu Phe Ser His Asp Gln Tyr Arg
85 90 95
Glu Leu Gln Arg Tyr Ala Glu Glu Val Gly Ile Phe Phe Thr Ala Ser
100 105 110
Gly Met Asp Glu Met Ala Val Glu Phe Leu His Glu Leu Asn Val Pro
115 120 125
Phe Phe Lys Val Gly Ser Gly Asp Thr Asn Asn Phe Pro Tyr Leu Glu
130 135 140
Lys Thr Ala Lys Lys Gly Arg Pro Met Val Ile Ser Ser Gly Met Gln
145 150 155 160
Ser Met Asp Thr Met Lys Gln Val Tyr Gln Ile Val Lys Pro Leu Asn
165 170 175
Pro Asn Phe Cys Phe Leu Gln Cys Thr Ser Ala Tyr Pro Leu Gln Pro
180 185 190
Glu Asp Val Asn Leu Arg Val Ile Ser Glu Tyr Gln Lys Leu Phe Pro
195 200 205
Asp Ile Pro Ile Gly Tyr Ser Gly His Glu Thr Gly Ile Ala Ile Ser
210 215 220
Val Ala Ala Val Ala Leu Gly Ala Lys Val Leu Glu Arg His Ile Thr
225 230 235 240
Leu Asp Lys Thr Trp Lys Gly Ser Asp His Ser Ala Ser Leu Glu Pro
245 250 255
Gly Glu Leu Ala Glu Leu Val Arg Ser Val Arg Leu Val Glu Arg Ala
260 265 270
Leu Gly Ser Pro Thr Lys Gln Leu Leu Pro Cys Glu Met Ala Cys Asn
275 280 285
Glu Lys Leu Gly Lys Ser Val Val Ala Lys Val Lys Ile Pro Glu Gly
290 295 300
Thr Ile Leu Thr Met Asp Met Leu Thr Val Lys Val Gly Glu Pro Lys
305 310 315 320
Gly Tyr Pro Pro Glu Asp Ile Phe Asn Leu Val Gly Lys Lys Val Leu
325 330 335
Val Thr Val Glu Glu Asp Asp Thr Ile Met Glu Glu Leu Val Asp Asn
340 345 350
His Gly Lys Lys Ile Lys Ser
355
<210> 43
<211> 1092
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码小鼠 alpha-2,6-唾液酸转移酶
催化结构域 (MmmST6) 密码子优化的
<400> 43
gtttttcaaa tgccaaagtc ccaggagaaa gttgctgttg gtccagctcc acaagctgtt 60
ttctccaact ccaagcaaga tccaaaggag ggtgttcaaa tcttgtccta cccaagagtt 120
actgctaagg ttaagccaca accatccttg caagtttggg acaaggactc cacttactcc 180
aagttgaacc caagattgtt gaagatttgg agaaactact tgaacatgaa caagtacaag 240
gtttcctaca agggtccagg tccaggtgtt aagttctccg ttgaggcttt gagatgtcac 300
ttgagagacc acgttaacgt ttccatgatc gaggctactg acttcccatt caacactact 360
gaatgggagg gatacttgcc aaaggagaac ttcagaacta aggctggtcc atggcataag 420
tgtgctgttg tttcttctgc tggttccttg aagaactccc agttgggtag agaaattgac 480
aaccacgacg ctgttttgag attcaacggt gctccaactg acaacttcca gcaggatgtt 540
ggtactaaga ctactatcag attggttaac tcccaattgg ttactactga gaagagattc 600
ttgaaggact ccttgtacac tgagggaatc ttgattttgt gggacccatc tgtttaccac 660
gctgacattc cacaatggta tcagaagcca gactacaact tcttcgagac ttacaagtcc 720
tacagaagat tgcacccatc ccagccattc tacatcttga agccacaaat gccatgggaa 780
ttgtgggaca tcatccagga aatttcccca gacttgatcc aaccaaaccc accatcttct 840
ggaatgttgg gtatcatcat catgatgact ttgtgtgacc aggttgacat ctacgagttc 900
ttgccatcca agagaaagac tgatgtttgt tactaccacc agaagttctt cgactccgct 960
tgtactatgg gagcttacca cccattgttg ttcgagaaga acatggttaa gcacttgaac 1020
gaaggtactg acgaggacat ctacttgttc ggaaaggcta ctttgtccgg tttcagaaac 1080
aacagatgtt ag 1092
<210> 44
<211> 363
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 小鼠 alpha-2,6-唾液酸转移酶
催化结构域 (MmmST6) 密码子优化的
<400> 44
Val Phe Gln Met Pro Lys Ser Gln Glu Lys Val Ala Val Gly Pro Ala
1 5 10 15
Pro Gln Ala Val Phe Ser Asn Ser Lys Gln Asp Pro Lys Glu Gly Val
20 25 30
Gln Ile Leu Ser Tyr Pro Arg Val Thr Ala Lys Val Lys Pro Gln Pro
35 40 45
Ser Leu Gln Val Trp Asp Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Lys Leu Asn Pro
50 55 60
Arg Leu Leu Lys Ile Trp Arg Asn Tyr Leu Asn Met Asn Lys Tyr Lys
65 70 75 80
Val Ser Tyr Lys Gly Pro Gly Pro Gly Val Lys Phe Ser Val Glu Ala
85 90 95
Leu Arg Cys His Leu Arg Asp His Val Asn Val Ser Met Ile Glu Ala
100 105 110
Thr Asp Phe Pro Phe Asn Thr Thr Glu Trp Glu Gly Tyr Leu Pro Lys
115 120 125
Glu Asn Phe Arg Thr Lys Ala Gly Pro Trp His Lys Cys Ala Val Val
130 135 140
Ser Ser Ala Gly Ser Leu Lys Asn Ser Gln Leu Gly Arg Glu Ile Asp
145 150 155 160
Asn His Asp Ala Val Leu Arg Phe Asn Gly Ala Pro Thr Asp Asn Phe
165 170 175
Gln Gln Asp Val Gly Thr Lys Thr Thr Ile Arg Leu Val Asn Ser Gln
180 185 190
Leu Val Thr Thr Glu Lys Arg Phe Leu Lys Asp Ser Leu Tyr Thr Glu
195 200 205
Gly Ile Leu Ile Leu Trp Asp Pro Ser Val Tyr His Ala Asp Ile Pro
210 215 220
Gln Trp Tyr Gln Lys Pro Asp Tyr Asn Phe Phe Glu Thr Tyr Lys Ser
225 230 235 240
Tyr Arg Arg Leu His Pro Ser Gln Pro Phe Tyr Ile Leu Lys Pro Gln
245 250 255
Met Pro Trp Glu Leu Trp Asp Ile Ile Gln Glu Ile Ser Pro Asp Leu
260 265 270
Ile Gln Pro Asn Pro Pro Ser Ser Gly Met Leu Gly Ile Ile Ile Met
275 280 285
Met Thr Leu Cys Asp Gln Val Asp Ile Tyr Glu Phe Leu Pro Ser Lys
290 295 300
Arg Lys Thr Asp Val Cys Tyr Tyr His Gln Lys Phe Phe Asp Ser Ala
305 310 315 320
Cys Thr Met Gly Ala Tyr His Pro Leu Leu Phe Glu Lys Asn Met Val
325 330 335
Lys His Leu Asn Glu Gly Thr Asp Glu Asp Ile Tyr Leu Phe Gly Lys
340 345 350
Ala Thr Leu Ser Gly Phe Arg Asn Asn Arg Cys
355 360
<210> 45
<211> 1037
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpPMA1 启动子
<400> 45
aaatgcgtac ctcttctacg agattcaagc gaatgagaat aatgtaatat gcaagatcag 60
aaagaatgaa aggagttgaa aaaaaaaacc gttgcgtttt gaccttgaat ggggtggagg 120
tttccattca aagtaaagcc tgtgtcttgg tattttcggc ggcacaagaa atcgtaattt 180
tcatcttcta aacgatgaag atcgcagccc aacctgtatg tagttaaccg gtcggaatta 240
taagaaagat tttcgatcaa caaaccctag caaatagaaa gcagggttac aactttaaac 300
cgaagtcaca aacgataaac cactcagctc ccacccaaat tcattcccac tagcagaaag 360
gaattattta atccctcagg aaacctcgat gattctcccg ttcttccatg ggcgggtatc 420
gcaaaatgag gaatttttca aatttctcta ttgtcaagac tgtttattat ctaagaaata 480
gcccaatccg aagctcagtt ttgaaaaaat cacttccgcg tttctttttt acagcccgat 540
gaatatccaa atttggaata tggattactc tatcgggact gcagataata tgacaacaac 600
gcagattaca ttttaggtaa ggcataaaca ccagccagaa atgaaacgcc cactagccat 660
ggtcgaatag tccaatgaat tcagatagct atggtctaaa agctgatgtt ttttattggg 720
taatggcgaa gagtccagta cgacttccag cagagctgag atggccattt ttgggggtat 780
tagtaacttt ttgagctctt ttcacttcga tgaagtgtcc cattcgggat ataatcggat 840
cgcgtcgttt tctcgaaaat acagcttagc gtcgtccgct tgttgtaaaa gcagcaccac 900
attcctaatc tcttatataa acaaaacaac ccaaattatc agtgctgttt tcccaccaga 960
tataagtttc ttttctcttc cgctttttga ttttttatct ctttccttta aaaacttctt 1020
taccttaaag ggcggcc 1037
<210> 46
<211> 512
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpPMA1 终止子
<400> 46
taagcttcac gatttgtgtt ccagtttatc ccccctttat ataccgttaa ccctttccct 60
gttgagctga ctgttgttgt attaccgcaa tttttccaag tttgccatgc ttttcgtgtt 120
atttgaccga tgtctttttt cccaaatcaa actatatttg ttaccattta aaccaagtta 180
tcttttgtat taagagtcta agtttgttcc caggcttcat gtgagagtga taaccatcca 240
gactatgatt cttgtttttt attgggtttg tttgtgtgat acatctgagt tgtgattcgt 300
aaagtatgtc agtctatcta gatttttaat agttaattgg taatcaatga cttgtttgtt 360
ttaactttta aattgtgggt cgtatccacg cgtttagtat agctgttcat ggctgttaga 420
ggagggcgat gtttatatac agaggacaag aatgaggagg cggcgtgtat ttttaaaatg 480
gagacgcgac tcctgtacac cttatcggtt gg 512
<210> 47
<211> 798
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpOCH1 启动子
<400> 47
tggacacagg agactcagaa acagacacag agcgttctga gtcctggtgc tcctgacgta 60
ggcctagaac aggaattatt ggctttattt gtttgtccat ttcataggct tggggtaata 120
gatagatgac agagaaatag agaagaccta atattttttg ttcatggcaa atcgcgggtt 180
cgcggtcggg tcacacacgg agaagtaatg agaagagctg gtaatctggg gtaaaagggt 240
tcaaaagaag gtcgcctggt agggatgcaa tacaaggttg tcttggagtt tacattgacc 300
agatgatttg gctttttctc tgttcaattc acatttttca gcgagaatcg gattgacgga 360
gaaatggcgg ggtgtggggt ggatagatgg cagaaatgct cgcaatcacc gcgaaagaaa 420
gactttatgg aatagaacta ctgggtggtg taaggattac atagctagtc caatggagtc 480
cgttggaaag gtaagaagaa gctaaaaccg gctaagtaac tagggaagaa tgatcagact 540
ttgatttgat gaggtctgaa aatactctgc tgctttttca gttgcttttt ccctgcaacc 600
tatcattttc cttttcataa gcctgccttt tctgttttca cttatatgag ttccgccgag 660
acttccccaa attctctcct ggaacattct ctatcgctct ccttccaagt tgcgccccct 720
ggcactgcct agtaatatta ccacgcgact tatattcagt tccacaattt ccagtgttcg 780
tagcaaatat catcagcc 798
<210> 48
<211> 302
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpALG12 终止子
<400> 48
aatatatacc tcatttgttc aatttggtgt aaagagtgtg gcggatagac ttcttgtaaa 60
tcaggaaagc tacaattcca attgctgcaa aaaataccaa tgcccataaa ccagtatgag 120
cggtgccttc gacggattgc ttactttccg accctttgtc gtttgattct tctgcctttg 180
gtgagtcagt ttgtttcgac tttatatctg actcatcaac ttcctttacg gttgcgtttt 240
taatcataat tttagccgtt ggcttattat cccttgagtt ggtaggagtt ttgatgatgc 300
tg 302
<210> 49
<211> 435
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpSEC4 启动子
<400> 49
gaagtaaagt tggcgaaact ttgggaacct ttggttaaaa ctttgtaatt tttgtcgcta 60
cccattaggc agaatctgca tcttgggagg gggatgtggt ggcgttctga gatgtacgcg 120
aagaatgaag agccagtggt aacaacaggc ctagagagat acgggcataa tgggtataac 180
ctacaagtta agaatgtagc agccctggaa accagattga aacgaaaaac gaaatcattt 240
aaactgtagg atgttttggc tcattgtctg gaaggctggc tgtttattgc cctgttcttt 300
gcatgggaat aagctattat atccctcaca taatcccaga aaatagattg aagcaacgcg 360
aaatccttac gtatcgaagt agccttctta cacattcacg ttgtacggat aagaaaacta 420
ctcaaacgaa caatc 435
<210> 50
<211> 404
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpOCH1 终止子
<400> 50
aatagatata gcgagattag agaatgaata ccttcttcta agcgatcgtc cgtcatcata 60
gaatatcatg gactgtatag tttttttttt gtacatataa tgattaaacg gtcatccaac 120
atctcgttga cagatctctc agtacgcgaa atccctgact atcaaagcaa gaaccgatga 180
agaaaaaaac aacagtaacc caaacaccac aacaaacact ttatcttctc ccccccaaca 240
ccaatcatca aagagatgtc ggaacacaaa caccaagaag caaaaactaa ccccatataa 300
aaacatcctg gtagataatg ctggtaaccc gctctccttc catattctgg gctacttcac 360
gaagtctgac cggtctcagt tgatcaacat gatcctcgaa atgg 404
<210> 51
<211> 600
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpTEF1 启动子
<400> 51
ttaaggtttg gaacaacact aaactacctt gcggtactac cattgacact acacatcctt 60
aattccaatc ctgtctggcc tccttcacct tttaaccatc ttgcccattc caactcgtgt 120
cagattgcgt atcaagtgaa aaaaaaaaaa ttttaaatct ttaacccaat caggtaataa 180
ctgtcgcctc ttttatctgc cgcactgcat gaggtgtccc cttagtggga aagagtactg 240
agccaaccct ggaggacagc aagggaaaaa tacctacaac ttgcttcata atggtcgtaa 300
aaacaatcct tgtcggatat aagtgttgta gactgtccct tatcctctgc gatgttcttc 360
ctctcaaagt ttgcgatttc tctctatcag aattgccatc aagagactca ggactaattt 420
cgcagtccca cacgcactcg tacatgattg gctgaaattt ccctaaagaa tttctttttc 480
acgaaaattt tttttttaca caagattttc agcagatata aaatggagag caggacctcc 540
gctgtgactc ttcttttttt tcttttattc tcactacata cattttagtt attcgccaac 600
<210> 52
<211> 301
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpTEF1 终止子
<400> 52
attgcttgaa gctttaattt attttattaa cataataata atacaagcat gatatatttg 60
tattttgttc gttaacattg atgttttctt catttactgt tattgtttgt aactttgatc 120
gatttatctt ttctacttta ctgtaatatg gctggcgggt gagccttgaa ctccctgtat 180
tactttacct tgctattact taatctattg actagcagcg acctcttcaa ccgaagggca 240
agtacacagc aagttcatgt ctccgtaagt gtcatcaacc ctggaaacag tgggccatgt 300
c 301
<210> 53
<211> 486
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpGAPDH 启动子
<400> 53
tttttgtaga aatgtcttgg tgtcctcgtc caatcaggta gccatctctg aaatatctgg 60
ctccgttgca actccgaacg acctgctggc aacgtaaaat tctccggggt aaaacttaaa 120
tgtggagtaa tggaaccaga aacgtctctt cccttctctc tccttccacc gcccgttacc 180
gtccctagga aattttactc tgctggagag cttcttctac ggcccccttg cagcaatgct 240
cttcccagca ttacgttgcg ggtaaaacgg aggtcgtgta cccgacctag cagcccaggg 300
atggaaaagt cccggccgtc gctggcaata atagcgggcg gacgcatgtc atgagattat 360
tggaaaccac cagaatcgaa tataaaaggc gaacaccttt cccaattttg gtttctcctg 420
acccaaagac tttaaattta atttatttgt ccctatttca atcaattgaa caactatcaa 480
aacaca 486
<210> 54
<211> 376
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpALG3 终止子
<400> 54
atttacaatt agtaatatta aggtggtaaa aacattcgta gaattgaaat gaattaatat 60
agtatgacaa tggttcatgt ctataaatct ccggcttcgg taccttctcc ccaattgaat 120
acattgtcaa aatgaatggt tgaactatta ggttcgccag tttcgttatt aagaaaactg 180
ttaaaatcaa attccatatc atcggttcca gtgggaggac cagttccatc gccaaaatcc 240
tgtaagaatc cattgtcaga acctgtaaag tcagtttgag atgaaatttt tccggtcttt 300
gttgacttgg aagcttcgtt aaggttaggt gaaacagttt gatcaaccag cggctcccgt 360
tttcgtcgct tagtag 376
<210> 55
<211> 934
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpAOX1 启动子和整合座位
<400> 55
aacatccaaa gacgaaaggt tgaatgaaac ctttttgcca tccgacatcc acaggtccat 60
tctcacacat aagtgccaaa cgcaacagga ggggatacac tagcagcaga ccgttgcaaa 120
cgcaggacct ccactcctct tctcctcaac acccactttt gccatcgaaa aaccagccca 180
gttattgggc ttgattggag ctcgctcatt ccaattcctt ctattaggct actaacacca 240
tgactttatt agcctgtcta tcctggcccc cctggcgagg ttcatgtttg tttatttccg 300
aatgcaacaa gctccgcatt acacccgaac atcactccag atgagggctt tctgagtgtg 360
gggtcaaata gtttcatgtt ccccaaatgg cccaaaactg acagtttaaa cgctgtcttg 420
gaacctaata tgacaaaagc gtgatctcat ccaagatgaa ctaagtttgg ttcgttgaaa 480
tgctaacggc cagttggtca aaaagaaact tccaaaagtc ggcataccgt ttgtcttgtt 540
tggtattgat tgacgaatgc tcaaaaataa tctcattaat gcttagcgca gtctctctat 600
cgcttctgaa ccccggtgca cctgtgccga aacgcaaatg gggaaacacc cgctttttgg 660
atgattatgc attgtctcca cattgtatgc ttccaagatt ctggtgggaa tactgctgat 720
agcctaacgt tcatgatcaa aatttaactg ttctaacccc tacttgacag caatatataa 780
acagaaggaa gctgccctgt cttaaacctt tttttttatc atcattatta gcttactttc 840
ataattgcga ctggttccaa ttgacaagct tttgatttta acgactttta acgacaactt 900
gagaagatca aaaaacaact aattattcga aacg 934
<210> 56
<211> 293
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> ScCYC1 终止子
<400> 56
acaggcccct tttcctttgt cgatatcatg taattagtta tgtcacgctt acattcacgc 60
cctcctccca catccgctct aaccgaaaag gaaggagtta gacaacctga agtctaggtc 120
cctatttatt ttttttaata gttatgttag tattaagaac gttatttata tttcaaattt 180
ttcttttttt tctgtacaaa cgcgtgtacg catgtaacat tatactgaaa accttgcttg 240
agaaggtttt gggacgctcg aaggctttaa tttgcaagct gccggctctt aag 293
<210> 57
<211> 427
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> ScTEF1 启动子
<400> 57
gatcccccac acaccatagc ttcaaaatgt ttctactcct tttttactct tccagatttt 60
ctcggactcc gcgcatcgcc gtaccacttc aaaacaccca agcacagcat actaaatttc 120
ccctctttct tcctctaggg tgtcgttaat tacccgtact aaaggtttgg aaaagaaaaa 180
agagaccgcc tcgtttcttt ttcttcgtcg aaaaaggcaa taaaaatttt tatcacgttt 240
ctttttcttg aaaatttttt tttttgattt ttttctcttt cgatgacctc ccattgatat 300
ttaagttaat aaacggtctt caatttctca agtttcagtt tcatttttct tgttctatta 360
caactttttt tacttcttgc tcattagaaa gaaagcatag caatctaatc taagttttaa 420
ttacaaa 427
<210> 58
<211> 375
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码 Sh ble ORF (Zeocin 抗性标记物):
<400> 58
atggccaagt tgaccagtgc cgttccggtg ctcaccgcgc gcgacgtcgc cggagcggtc 60
gagttctgga ccgaccggct cgggttctcc cgggacttcg tggaggacga cttcgccggt 120
gtggtccggg acgacgtgac cctgttcatc agcgcggtcc aggaccaggt ggtgccggac 180
aacaccctgg cctgggtgtg ggtgcgcggc ctggacgagc tgtacgccga gtggtcggag 240
gtcgtgtcca cgaacttccg ggacgcctcc gggccggcca tgaccgagat cggcgagcag 300
ccgtgggggc gggagttcgc cctgcgcgac ccggccggca actgcgtgca cttcgtggcc 360
gaggagcagg actga 375
<210> 59
<211> 898
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpURA5的5'-区
<400> 59
atcggccttt gttgatgcaa gttttacgtg gatcatggac taaggagttt tatttggacc 60
aagttcatcg tcctagacat tacggaaagg gttctgctcc tctttttgga aactttttgg 120
aacctctgag tatgacagct tggtggattg tacccatggt atggcttcct gtgaatttct 180
attttttcta cattggattc accaatcaaa acaaattagt cgccatggct ttttggcttt 240
tgggtctatt tgtttggacc ttcttggaat atgctttgca tagatttttg ttccacttgg 300
actactatct tccagagaat caaattgcat ttaccattca tttcttattg catgggatac 360
accactattt accaatggat aaatacagat tggtgatgcc acctacactt ttcattgtac 420
tttgctaccc aatcaagacg ctcgtctttt ctgttctacc atattacatg gcttgttctg 480
gatttgcagg tggattcctg ggctatatca tgtatgatgt cactcattac gttctgcatc 540
actccaagct gcctcgttat ttccaagagt tgaagaaata tcatttggaa catcactaca 600
agaattacga gttaggcttt ggtgtcactt ccaaattctg ggacaaagtc tttgggactt 660
atctgggtcc agacgatgtg tatcaaaaga caaattagag tatttataaa gttatgtaag 720
caaatagggg ctaataggga aagaaaaatt ttggttcttt atcagagctg gctcgcgcgc 780
agtgtttttc gtgctccttt gtaatagtca tttttgacta ctgttcagat tgaaatcaca 840
ttgaagatgt cactcgaggg gtaccaaaaa aggtttttgg atgctgcagt ggcttcgc 898
<210> 60
<211> 1060
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpURA5的3'-区
<400> 60
ggtcttttca acaaagctcc attagtgagt cagctggctg aatcttatgc acaggccatc 60
attaacagca acctggagat agacgttgta tttggaccag cttataaagg tattcctttg 120
gctgctatta ccgtgttgaa gttgtacgag ctcggcggca aaaaatacga aaatgtcgga 180
tatgcgttca atagaaaaga aaagaaagac cacggagaag gtggaagcat cgttggagaa 240
agtctaaaga ataaaagagt actgattatc gatgatgtga tgactgcagg tactgctatc 300
aacgaagcat ttgctataat tggagctgaa ggtgggagag ttgaaggtag tattattgcc 360
ctagatagaa tggagactac aggagatgac tcaaatacca gtgctaccca ggctgttagt 420
cagagatatg gtacccctgt cttgagtata gtgacattgg accatattgt ggcccatttg 480
ggcgaaactt tcacagcaga cgagaaatct caaatggaaa cgtatagaaa aaagtatttg 540
cccaaataag tatgaatctg cttcgaatga atgaattaat ccaattatct tctcaccatt 600
attttcttct gtttcggagc tttgggcacg gcggcgggtg gtgcgggctc aggttccctt 660
tcataaacag atttagtact tggatgctta atagtgaatg gcgaatgcaa aggaacaatt 720
tcgttcatct ttaacccttt cactcggggt acacgttctg gaatgtaccc gccctgttgc 780
aactcaggtg gaccgggcaa ttcttgaact ttctgtaacg ttgttggatg ttcaaccaga 840
aattgtccta ccaactgtat tagtttcctt ttggtcttat attgttcatc gagatacttc 900
ccactctcct tgatagccac tctcactctt cctggattac caaaatcttg aggatgagtc 960
ttttcaggct ccaggatgca aggtatatcc aagtacctgc aagcatctaa tattgtcttt 1020
gccagggggt tctccacacc atactccttt tggcgcatgc 1060
<210> 61
<211> 957
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码 PpURA5 营养缺陷标记物
<400> 61
tctagaggga cttatctggg tccagacgat gtgtatcaaa agacaaatta gagtatttat 60
aaagttatgt aagcaaatag gggctaatag ggaaagaaaa attttggttc tttatcagag 120
ctggctcgcg cgcagtgttt ttcgtgctcc tttgtaatag tcatttttga ctactgttca 180
gattgaaatc acattgaaga tgtcactgga ggggtaccaa aaaaggtttt tggatgctgc 240
agtggcttcg caggccttga agtttggaac tttcaccttg aaaagtggaa gacagtctcc 300
atacttcttt aacatgggtc ttttcaacaa agctccatta gtgagtcagc tggctgaatc 360
ttatgctcag gccatcatta acagcaacct ggagatagac gttgtatttg gaccagctta 420
taaaggtatt cctttggctg ctattaccgt gttgaagttg tacgagctgg gcggcaaaaa 480
atacgaaaat gtcggatatg cgttcaatag aaaagaaaag aaagaccacg gagaaggtgg 540
aagcatcgtt ggagaaagtc taaagaataa aagagtactg attatcgatg atgtgatgac 600
tgcaggtact gctatcaacg aagcatttgc tataattgga gctgaaggtg ggagagttga 660
aggttgtatt attgccctag atagaatgga gactacagga gatgactcaa ataccagtgc 720
tacccaggct gttagtcaga gatatggtac ccctgtcttg agtatagtga cattggacca 780
tattgtggcc catttgggcg aaactttcac agcagacgag aaatctcaaa tggaaacgta 840
tagaaaaaag tatttgccca aataagtatg aatctgcttc gaatgaatga attaatccaa 900
ttatcttctc accattattt tcttctgttt cggagctttg ggcacggcgg cggatcc 957
<210> 62
<211> 709
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Ec lacZ 基因的部分
<400> 62
cctgcactgg atggtggcgc tggatggtaa gccgctggca agcggtgaag tgcctctgga 60
tgtcgctcca caaggtaaac agttgattga actgcctgaa ctaccgcagc cggagagcgc 120
cgggcaactc tggctcacag tacgcgtagt gcaaccgaac gcgaccgcat ggtcagaagc 180
cgggcacatc agcgcctggc agcagtggcg tctggcggaa aacctcagtg tgacgctccc 240
cgccgcgtcc cacgccatcc cgcatctgac caccagcgaa atggattttt gcatcgagct 300
gggtaataag cgttggcaat ttaaccgcca gtcaggcttt ctttcacaga tgtggattgg 360
cgataaaaaa caactgctga cgccgctgcg cgatcagttc acccgtgcac cgctggataa 420
cgacattggc gtaagtgaag cgacccgcat tgaccctaac gcctgggtcg aacgctggaa 480
ggcggcgggc cattaccagg ccgaagcagc gttgttgcag tgcacggcag atacacttgc 540
tgatgcggtg ctgattacga ccgctcacgc gtggcagcat caggggaaaa ccttatttat 600
cagccggaaa acctaccgga ttgatggtag tggtcaaatg gcgattaccg ttgatgttga 660
agtggcgagc gatacaccgc atccggcgcg gattggcctg aactgccag 709
<210> 63
<211> 222
<212> PRT
<213> 巴斯德毕赤氏酵母
<400> 63
Met Ser Leu Glu Gly Tyr Gln Lys Arg Phe Leu Asp Ala Ala Val Ala
1 5 10 15
Ser Gln Ala Leu Lys Phe Gly Thr Phe Thr Leu Lys Ser Gly Arg Gln
20 25 30
Ser Pro Tyr Phe Phe Asn Met Gly Leu Phe Asn Lys Ala Pro Leu Val
35 40 45
Ser Gln Leu Ala Glu Ser Tyr Ala Gln Ala Ile Ile Asn Ser Asn Leu
50 55 60
Glu Ile Asp Val Val Phe Gly Pro Ala Tyr Lys Gly Ile Pro Leu Ala
65 70 75 80
Ala Ile Thr Val Leu Lys Leu Tyr Glu Leu Gly Gly Lys Lys Tyr Glu
85 90 95
Asn Val Gly Tyr Ala Phe Asn Arg Lys Glu Lys Lys Asp His Gly Glu
100 105 110
Gly Gly Ser Ile Val Gly Glu Ser Leu Lys Asn Lys Arg Val Leu Ile
115 120 125
Ile Asp Asp Val Met Thr Ala Gly Thr Ala Ile Asn Glu Ala Phe Ala
130 135 140
Ile Ile Gly Ala Glu Gly Gly Arg Val Glu Gly Cys Ile Ile Ala Leu
145 150 155 160
Asp Arg Met Glu Thr Thr Gly Asp Asp Ser Asn Thr Ser Ala Thr Gln
165 170 175
Ala Val Ser Gln Arg Tyr Gly Thr Pro Val Leu Ser Ile Val Thr Leu
180 185 190
Asp His Ile Val Ala His Leu Gly Glu Thr Phe Thr Ala Asp Glu Lys
195 200 205
Ser Gln Met Glu Thr Tyr Arg Lys Lys Tyr Leu Pro Lys Glx
210 215 220
<210> 64
<211> 2875
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpOCH1的5'-区
<400> 64
aaaacctttt ttcctattca aacacaaggc attgcttcaa cacgtgtgcg tatccttaac 60
acagatactc catacttcta ataatgtgat agacgaatac aaagatgttc actctgtgtt 120
gtgtctacaa gcatttctta ttctgattgg ggatattcta gttacagcac taaacaactg 180
gcgatacaaa cttaaattaa ataatccgaa tctagaaaat gaacttttgg atggtccgcc 240
tgttggttgg ataaatcaat accgattaaa tggattctat tccaatgaga gagtaatcca 300
agacactctg atgtcaataa tcatttgctt gcaacaacaa acccgtcatc taatcaaagg 360
gtttgatgag gcttaccttc aattgcagat aaactcattg ctgtccactg ctgtattatg 420
tgagaatatg ggtgatgaat ctggtcttct ccactcagct aacatggctg tttgggcaaa 480
ggtggtacaa ttatacggag atcaggcaat agtgaaattg ttgaatatgg ctactggacg 540
atgcttcaag gatgtacgtc tagtaggagc cgtgggaaga ttgctggcag aaccagttgg 600
cacgtcgcaa caatccccaa gaaatgaaat aagtgaaaac gtaacgtcaa agacagcaat 660
ggagtcaata ttgataacac cactggcaga gcggttcgta cgtcgttttg gagccgatat 720
gaggctcagc gtgctaacag cacgattgac aagaagactc tcgagtgaca gtaggttgag 780
taaagtattc gcttagattc ccaaccttcg ttttattctt tcgtagacaa agaagctgca 840
tgcgaacata gggacaactt ttataaatcc aattgtcaaa ccaacgtaaa accctctggc 900
accattttca acatatattt gtgaagcagt acgcaatatc gataaatact caccgttgtt 960
tgtaacagcc ccaacttgca tacgccttct aatgacctca aatggataag ccgcagcttg 1020
tgctaacata ccagcagcac cgcccgcggt cagctgcgcc cacacatata aaggcaatct 1080
acgatcatgg gaggaattag ttttgaccgt caggtcttca agagttttga actcttcttc 1140
ttgaactgtg taacctttta aatgacggga tctaaatacg tcatggatga gatcatgtgt 1200
gtaaaaactg actccagcat atggaatcat tccaaagatt gtaggagcga acccacgata 1260
aaagtttccc aaccttgcca aagtgtctaa tgctgtgact tgaaatctgg gttcctcgtt 1320
gaagaccctg cgtactatgc ccaaaaactt tcctccacga gccctattaa cttctctatg 1380
agtttcaaat gccaaacgga cacggattag gtccaatggg taagtgaaaa acacagagca 1440
aaccccagct aatgagccgg ccagtaaccg tcttggagct gtttcataag agtcattagg 1500
gatcaataac gttctaatct gttcataaca tacaaatttt atggctgcat agggaaaaat 1560
tctcaacagg gtagccgaat gaccctgata tagacctgcg acaccatcat acccatagat 1620
ctgcctgaca gccttaaaga gcccgctaaa agacccggaa aaccgagaga actctggatt 1680
agcagtctga aaaagaatct tcactctgtc tagtggagca attaatgtct tagcggcact 1740
tcctgctact ccgccagcta ctcctgaata gatcacatac tgcaaagact gcttgtcgat 1800
gaccttgggg ttatttagct tcaagggcaa tttttgggac attttggaca caggagactc 1860
agaaacagac acagagcgtt ctgagtcctg gtgctcctga cgtaggccta gaacaggaat 1920
tattggcttt atttgtttgt ccatttcata ggcttggggt aatagataga tgacagagaa 1980
atagagaaga cctaatattt tttgttcatg gcaaatcgcg ggttcgcggt cgggtcacac 2040
acggagaagt aatgagaaga gctggtaatc tggggtaaaa gggttcaaaa gaaggtcgcc 2100
tggtagggat gcaatacaag gttgtcttgg agtttacatt gaccagatga tttggctttt 2160
tctctgttca attcacattt ttcagcgaga atcggattga cggagaaatg gcggggtgtg 2220
gggtggatag atggcagaaa tgctcgcaat caccgcgaaa gaaagacttt atggaataga 2280
actactgggt ggtgtaagga ttacatagct agtccaatgg agtccgttgg aaaggtaaga 2340
agaagctaaa accggctaag taactaggga agaatgatca gactttgatt tgatgaggtc 2400
tgaaaatact ctgctgcttt ttcagttgct ttttccctgc aacctatcat tttccttttc 2460
ataagcctgc cttttctgtt ttcacttata tgagttccgc cgagacttcc ccaaattctc 2520
tcctggaaca ttctctatcg ctctccttcc aagttgcgcc ccctggcact gcctagtaat 2580
attaccacgc gacttatatt cagttccaca atttccagtg ttcgtagcaa atatcatcag 2640
ccatggcgaa ggcagatggc agtttgctct actataatcc tcacaatcca cccagaaggt 2700
attacttcta catggctata ttcgccgttt ctgtcatttg cgttttgtac ggaccctcac 2760
aacaattatc atctccaaaa atagactatg atccattgac gctccgatca cttgatttga 2820
agactttgga agctccttca cagttgagtc caggcaccgt agaagataat cttcg 2875
<210> 65
<211> 997
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpOCH1的3'-区
<400> 65
aaagctagag taaaatagat atagcgagat tagagaatga ataccttctt ctaagcgatc 60
gtccgtcatc atagaatatc atggactgta tagttttttt tttgtacata taatgattaa 120
acggtcatcc aacatctcgt tgacagatct ctcagtacgc gaaatccctg actatcaaag 180
caagaaccga tgaagaaaaa aacaacagta acccaaacac cacaacaaac actttatctt 240
ctccccccca acaccaatca tcaaagagat gtcggaacca aacaccaaga agcaaaaact 300
aaccccatat aaaaacatcc tggtagataa tgctggtaac ccgctctcct tccatattct 360
gggctacttc acgaagtctg accggtctca gttgatcaac atgatcctcg aaatgggtgg 420
caagatcgtt ccagacctgc ctcctctggt agatggagtg ttgtttttga caggggatta 480
caagtctatt gatgaagata ccctaaagca actgggggac gttccaatat acagagactc 540
cttcatctac cagtgttttg tgcacaagac atctcttccc attgacactt tccgaattga 600
caagaacgtc gacttggctc aagatttgat caatagggcc cttcaagagt ctgtggatca 660
tgtcacttct gccagcacag ctgcagctgc tgctgttgtt gtcgctacca acggcctgtc 720
ttctaaacca gacgctcgta ctagcaaaat acagttcact cccgaagaag atcgttttat 780
tcttgacttt gttaggagaa atcctaaacg aagaaacaca catcaactgt acactgagct 840
cgctcagcac atgaaaaacc atacgaatca ttctatccgc cacagatttc gtcgtaatct 900
ttccgctcaa cttgattggg tttatgatat cgatccattg accaaccaac ctcgaaaaga 960
tgaaaacggg aactacatca aggtacaagg ccttcca 997
<210> 66
<211> 870
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpBMT2的5'-区
<400> 66
ggccgagcgg gcctagattt tcactacaaa tttcaaaact acgcggattt attgtctcag 60
agagcaattt ggcatttctg agcgtagcag gaggcttcat aagattgtat aggaccgtac 120
caacaaattg ccgaggcaca acacggtatg ctgtgcactt atgtggctac ttccctacaa 180
cggaatgaaa ccttcctctt tccgcttaaa cgagaaagtg tgtcgcaatt gaatgcaggt 240
gcctgtgcgc cttggtgtat tgtttttgag ggcccaattt atcaggcgcc ttttttcttg 300
gttgttttcc cttagcctca agcaaggttg gtctatttca tctccgcttc tataccgtgc 360
ctgatactgt tggatgagaa cacgactcaa cttcctgctg ctctgtattg ccagtgtttt 420
gtctgtgatt tggatcggag tcctccttac ttggaatgat aataatcttg gcggaatctc 480
cctaaacgga ggcaaggatt ctgcctatga tgatctgcta tcattgggaa gcttcaacga 540
catggaggtc gactcctatg tcaccaacat ctacgacaat gctccagtgc taggatgtac 600
ggatttgtct tatcatggat tgttgaaagt caccccaaag catgacttag cttgcgattt 660
ggagttcata agagctcaga ttttggacat tgacgtttac tccgccataa aagacttaga 720
agataaagcc ttgactgtaa aacaaaaggt tgaaaaacac tggtttacgt tttatggtag 780
ttcagtcttt ctgcccgaac acgatgtgca ttacctggtt agacgagtca tcttttcggc 840
tgaaggaaag gcgaactctc cagtaacatc 870
<210> 67
<211> 1733
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpBMT2的3'-区
<400> 67
ccatatgatg ggtgtttgct cactcgtatg gatcaaaatt ccatggtttc ttctgtacaa 60
cttgtacact tatttggact tttctaacgg tttttctggt gatttgagaa gtccttattt 120
tggtgttcgc agcttatccg tgattgaacc atcagaaata ctgcagctcg ttatctagtt 180
tcagaatgtg ttgtagaata caatcaattc tgagtctagt ttgggtgggt cttggcgacg 240
ggaccgttat atgcatctat gcagtgttaa ggtacataga atgaaaatgt aggggttaat 300
cgaaagcatc gttaatttca gtagaacgta gttctattcc ctacccaaat aatttgccaa 360
gaatgcttcg tatccacata cgcagtggac gtagcaaatt tcactttgga ctgtgacctc 420
aagtcgttat cttctacttg gacattgatg gtcattacgt aatccacaaa gaattggata 480
gcctctcgtt ttatctagtg cacagcctaa tagcacttaa gtaagagcaa tggacaaatt 540
tgcatagaca ttgagctaga tacgtaactc agatcttgtt cactcatggt gtactcgaag 600
tactgctgga accgttacct cttatcattt cgctactggc tcgtgaaact actggatgaa 660
aaaaaaaaaa gagctgaaag cgagatcatc ccattttgtc atcatacaaa ttcacgcttg 720
cagttttgct tcgttaacaa gacaagatgt ctttatcaaa gacccgtttt ttcttcttga 780
agaatacttc cctgttgagc acatgcaaac catatttatc tcagatttca ctcaacttgg 840
gtgcttccaa gagaagtaaa attcttccca ctgcatcaac ttccaagaaa cccgtagacc 900
agtttctctt cagccaaaag aagttgctcg ccgatcaccg cggtaacaga ggagtcagaa 960
ggtttcacac ccttccatcc cgatttcaaa gtcaaagtgc tgcgttgaac caaggttttc 1020
aggttgccaa agcccagtct gcaaaaacta gttccaaatg gcctattaat tcccataaaa 1080
gtgttggcta cgtatgtatc ggtacctcca ttctggtatt tgctattgtt gtcgttggtg 1140
ggttgactag actgaccgaa tccggtcttt ccataacgga gtggaaacct atcactggtt 1200
cggttccccc actgactgag gaagactgga agttggaatt tgaaaaatac aaacaaagcc 1260
ctgagtttca ggaactaaat tctcacataa cattggaaga gttcaagttt atattttcca 1320
tggaatgggg acatagattg ttgggaaggg tcatcggcct gtcgtttgtt cttcccacgt 1380
tttacttcat tgcccgtcga aagtgttcca aagatgttgc attgaaactg cttgcaatat 1440
gctctatgat aggattccaa ggtttcatcg gctggtggat ggtgtattcc ggattggaca 1500
aacagcaatt ggctgaacgt aactccaaac caactgtgtc tccatatcgc ttaactaccc 1560
atcttggaac tgcatttgtt atttactgtt acatgattta cacagggctt caagttttga 1620
agaactataa gatcatgaaa cagcctgaag cgtatgttca aattttcaag caaattgcgt 1680
ctccaaaatt gaaaactttc aagagactct cttcagttct attaggcctg gtg 1733
<210> 68
<211> 411
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpBMT1的5'-区
<400> 68
catatggtga gagccgttct gcacaactag atgttttcga gcttcgcatt gtttcctgca 60
gctcgactat tgaattaaga tttccggata tctccaatct cacaaaaact tatgttgacc 120
acgtgctttc ctgaggcgag gtgttttata tgcaagctgc caaaaatgga aaacgaatgg 180
ccatttttcg cccaggcaaa ttattcgatt actgctgtca taaagacagt gttgcaaggc 240
tcacattttt ttttaggatc cgagataaag tgaatacagg acagcttatc tctatatctt 300
gtaccattcg tgaatcttaa gagttcggtt agggggactc tagttgaggg ttggcactca 360
cgtatggctg ggcgcagaaa taaaattcag gcgcagcagc acttatcgat g 411
<210> 69
<211> 692
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpBMT1的3'-区
<400> 69
gaattcacag ttataaataa aaacaaaaac tcaaaaagtt tgggctccac aaaataactt 60
aatttaaatt tttgtctaat aaatgaatgt aattccaaga ttatgtgatg caagcacagt 120
atgcttcagc cctatgcagc tactaatgtc aatctcgcct gcgagcgggc ctagattttc 180
actacaaatt tcaaaactac gcggatttat tgtctcagag agcaatttgg catttctgag 240
cgtagcagga ggcttcataa gattgtatag gaccgtacca acaaattgcc gaggcacaac 300
acggtatgct gtgcacttat gtggctactt ccctacaacg gaatgaaacc ttcctctttc 360
cgcttaaacg agaaagtgtg tcgcaattga atgcaggtgc ctgtgcgcct tggtgtattg 420
tttttgaggg cccaatttat caggcgcctt ttttcttggt tgttttccct tagcctcaag 480
caaggttggt ctatttcatc tccgcttcta taccgtgcct gatactgttg gatgagaaca 540
cgactcaact tcctgctgct ctgtattgcc agtgttttgt ctgtgatttg gatcggagtc 600
ctccttactt ggaatgataa taatcttggc ggaatctccc taaacggagg caaggattct 660
gcctatgatg atctgctatc attgggaagc tt 692
<210> 70
<211> 546
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpBMT3的5'-区
<400> 70
gatatctccc tggggacaat atgtgttgca actgttcgtt gttggtgccc cagtccccca 60
accggtacta atcggtctat gttcccgtaa ctcatattcg gttagaacta gaacaataag 120
tgcatcattg ttcaacattg tggttcaatt gtcgaacatt gctggtgctt atatctacag 180
ggaagacgat aagcctttgt acaagagagg taacagacag ttaattggta tttctttggg 240
agtcgttgcc ctctacgttg tctccaagac atactacatt ctgagaaaca gatggaagac 300
tcaaaaatgg gagaagctta gtgaagaaga gaaagttgcc tacttggaca gagctgagaa 360
ggagaacctg ggttctaaga ggctggactt tttgttcgag agttaaactg cataattttt 420
tctaagtaaa tttcatagtt atgaaatttc tgcagcttag tgtttactgc atcgtttact 480
gcatcaccct gtaaataatg tgagcttttt tccttccatt gcttggtatc ttccttgctg 540
ctgttt 546
<210> 71
<211> 378
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpBMT3的3'-区
<400> 71
acaaaacagt catgtacaga actaacgcct ttaagatgca gaccactgaa aagaattggg 60
tcccattttt cttgaaagac gaccaggaat ctgtccattt tgtttactcg ttcaatcctc 120
tgagagtact caactgcagt cttgataacg gtgcatgtga tgttctattt gagttaccac 180
atgattttgg catgtcttcc gagctacgtg gtgccactcc tatgctcaat cttcctcagg 240
caatcccgat ggcagacgac aaagaaattt gggtttcatt cccaagaacg agaatatcag 300
attgcgggtg ttctgaaaca atgtacaggc caatgttaat gctttttgtt agagaaggaa 360
caaacttttt tgctgagc 378
<210> 72
<211> 1043
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpBMT4的5'-区
<400> 72
aagcttgttc accgttggga cttttccgtg gacaatgttg actactccag gagggattcc 60
agctttctct actagctcag caataatcaa tgcagcccca ggcgcccgtt ctgatggctt 120
gatgaccgtt gtattgcctg tcactatagc caggggtagg gtccataaag gaatcatagc 180
agggaaatta aaagggcata ttgatgcaat cactcccaat ggctctcttg ccattgaagt 240
ctccatatca gcactaactt ccaagaagga ccccttcaag tctgacgtga tagagcacgc 300
ttgctctgcc acctgtagtc ctctcaaaac gtcaccttgt gcatcagcaa agactttacc 360
ttgctccaat actatgacgg aggcaattct gtcaaaattc tctctcagca attcaaccaa 420
cttgaaagca aattgctgtc tcttgatgat ggagactttt ttccaagatt gaaatgcaat 480
gtgggacgac tcaattgctt cttccagctc ctcttcggtt gattgaggaa cttttgaaac 540
cacaaaattg gtcgttgggt catgtacatc aaaccattct gtagatttag attcgacgaa 600
agcgttgttg atgaaggaaa aggttggata cggtttgtcg gtctctttgg tatggccggt 660
ggggtatgca attgcagtag aagataattg gacagccatt gttgaaggta gagaaaaggt 720
cagggaactt gggggttatt tataccattt taccccacaa ataacaactg aaaagtaccc 780
attccatagt gagaggtaac cgacggaaaa agacgggccc atgttctggg accaatagaa 840
ctgtgtaatc cattgggact aatcaacaga cgattggcaa tataatgaaa tagttcgttg 900
aaaagccacg tcagctgtct tttcattaac tttggtcgga cacaacattt tctactgttg 960
tatctgtcct actttgctta tcatctgcca cagggcaagt ggatttcctt ctcgcgcggc 1020
tgggtgaaaa cggttaacgt gaa 1043
<210> 73
<211> 695
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpBMT4的3'-区
<400> 73
gccttggggg acttcaagtc tttgctagaa actagatgag gtcaggccct cttatggttg 60
tgtcccaatt gggcaatttc actcacctaa aaagcatgac aattatttag cgaaataggt 120
agtatatttt ccctcatctc ccaagcagtt tcgtttttgc atccatatct ctcaaatgag 180
cagctacgac tcattagaac cagagtcaag taggggtgag ctcagtcatc agccttcgtt 240
tctaaaacga ttgagttctt ttgttgctac aggaagcgcc ctagggaact ttcgcacttt 300
ggaaatagat tttgatgacc aagagcggga gttgatatta gagaggctgt ccaaagtaca 360
tgggatcagg ccggccaaat tgattggtgt gactaaacca ttgtgtactt ggacactcta 420
ttacaaaagc gaagatgatt tgaagtatta caagtcccga agtgttagag gattctatcg 480
agcccagaat gaaatcatca accgttatca gcagattgat aaactcttgg aaagcggtat 540
cccattttca ttattgaaga actacgataa tgaagatgtg agagacggcg accctctgaa 600
cgtagacgaa gaaacaaatc tacttttggg gtacaataga gaaagtgaat caagggaggt 660
atttgtggcc ataatactca actctatcat taatg 695
<210> 74
<211> 937
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpPNO1 和 PpMNN4的5'-区
<400> 74
tcattctata tgttcaagaa aagggtagtg aaaggaaaga aaaggcatat aggcgaggga 60
gagttagcta gcatacaaga taatgaagga tcaatagcgg tagttaaagt gcacaagaaa 120
agagcacctg ttgaggctga tgataaagct ccaattacat tgccacagag aaacacagta 180
acagaaatag gaggggatgc accacgagaa gagcattcag tgaacaactt tgccaaattc 240
ataaccccaa gcgctaataa gccaatgtca aagtcggcta ctaacattaa tagtacaaca 300
actatcgatt ttcaaccaga tgtttgcaag gactacaaac agacaggtta ctgcggatat 360
ggtgacactt gtaagttttt gcacctgagg gatgatttca aacagggatg gaaattagat 420
agggagtggg aaaatgtcca aaagaagaag cataatactc tcaaaggggt taaggagatc 480
caaatgttta atgaagatga gctcaaagat atcccgttta aatgcattat atgcaaagga 540
gattacaaat cacccgtgaa aacttcttgc aatcattatt tttgcgaaca atgtttcctg 600
caacggtcaa gaagaaaacc aaattgtatt atatgtggca gagacacttt aggagttgct 660
ttaccagcaa agaagttgtc ccaatttctg gctaagatac ataataatga aagtaataaa 720
gtttagtaat tgcattgcgt tgactattga ttgcattgat gtcgtgtgat actttcaccg 780
aaaaaaaaca cgaagcgcaa taggagcggt tgcatattag tccccaaagc tatttaattg 840
tgcctgaaac tgttttttaa gctcatcaag cataattgta tgcattgcga cgtaaccaac 900
gtttaggcgc agtttaatca tagcccactg ctaagcc 937
<210> 75
<211> 1906
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpPNO1 和 PpMNN4的3'-区
<400> 75
cggaggaatg caaataataa tctccttaat tacccactga taagctcaag agacgcggtt 60
tgaaaacgat ataatgaatc atttggattt tataataaac cctgacagtt tttccactgt 120
attgttttaa cactcattgg aagctgtatt gattctaaga agctagaaat caatacggcc 180
atacaaaaga tgacattgaa taagcaccgg cttttttgat tagcatatac cttaaagcat 240
gcattcatgg ctacatagtt gttaaagggc ttcttccatt atcagtataa tgaattacat 300
aatcatgcac ttatatttgc ccatctctgt tctctcactc ttgcctgggt atattctatg 360
aaattgcgta tagcgtgtct ccagttgaac cccaagcttg gcgagtttga agagaatgct 420
aaccttgcgt attccttgct tcaggaaaca ttcaaggaga aacaggtcaa gaagccaaac 480
attttgatcc ttcccgagtt agcattgact ggctacaatt ttcaaagcca gcagcggata 540
gagccttttt tggaggaaac aaccaaggga gctagtaccc aatgggctca aaaagtatcc 600
aagacgtggg attgctttac tttaatagga tacccagaaa aaagtttaga gagccctccc 660
cgtatttaca acagtgcggt acttgtatcg cctcagggaa aagtaatgaa caactacaga 720
aagtccttct tgtatgaagc tgatgaacat tggggatgtt cggaatcttc tgatgggttt 780
caaacagtag atttattaat tgaaggaaag actgtaaaga catcatttgg aatttgcatg 840
gatttgaatc cttataaatt tgaagctcca ttcacagact tcgagttcag tggccattgc 900
ttgaaaaccg gtacaagact cattttgtgc ccaatggcct ggttgtcccc tctatcgcct 960
tccattaaaa aggatcttag tgatatagag aaaagcagac ttcaaaagtt ctaccttgaa 1020
aaaatagata ccccggaatt tgacgttaat tacgaattga aaaaagatga agtattgccc 1080
acccgtatga atgaaacgtt ggaaacaatt gactttgagc cttcaaaacc ggactactct 1140
aatataaatt attggatact aaggtttttt ccctttctga ctcatgtcta taaacgagat 1200
gtgctcaaag agaatgcagt tgcagtctta tgcaaccgag ttggcattga gagtgatgtc 1260
ttgtacggag gatcaaccac gattctaaac ttcaatggta agttagcatc gacacaagag 1320
gagctggagt tgtacgggca gactaatagt ctcaacccca gtgtggaagt attgggggcc 1380
cttggcatgg gtcaacaggg aattctagta cgagacattg aattaacata atatacaata 1440
tacaataaac acaaataaag aatacaagcc tgacaaaaat tcacaaatta ttgcctagac 1500
ttgtcgttat cagcagcgac ctttttccaa tgctcaattt cacgatatgc cttttctagc 1560
tctgctttaa gcttctcatt ggaattggct aactcgttga ctgcttggtc agtgatgagt 1620
ttctccaagg tccatttctc gatgttgttg ttttcgtttt cctttaatct cttgatataa 1680
tcaacagcct tctttaatat ctgagccttg ttcgagtccc ctgttggcaa cagagcggcc 1740
agttccttta ttccgtggtt tatattttct cttctacgcc tttctacttc tttgtgattc 1800
tctttacgca tcttatgcca ttcttcagaa ccagtggctg gcttaaccga atagccagag 1860
cctgaagaag ccgcactaga agaagcagtg gcattgttga ctatgg 1906
<210> 76
<211> 1128
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpMNN4L1的5'-区
<400> 76
gatctggcca ttgtgaaact tgacactaaa gacaaaactc ttagagtttc caatcactta 60
ggagacgatg tttcctacaa cgagtacgat ccctcattga tcatgagcaa tttgtatgtg 120
aaaaaagtca tcgaccttga caccttggat aaaagggctg gaggaggtgg aaccacctgt 180
gcaggcggtc tgaaagtgtt caagtacgga tctactacca aatatacatc tggtaacctg 240
aacggcgtca ggttagtata ctggaacgaa ggaaagttgc aaagctccaa atttgtggtt 300
cgatcctcta attactctca aaagcttgga ggaaacagca acgccgaatc aattgacaac 360
aatggtgtgg gttttgcctc agctggagac tcaggcgcat ggattctttc caagctacaa 420
gatgttaggg agtaccagtc attcactgaa aagctaggtg aagctacgat gagcattttc 480
gatttccacg gtcttaaaca ggagacttct actacagggc ttggggtagt tggtatgatt 540
cattcttacg acggtgagtt caaacagttt ggtttgttca ctccaatgac atctattcta 600
caaagacttc aacgagtgac caatgtagaa tggtgtgtag cgggttgcga agatggggat 660
gtggacactg aaggagaaca cgaattgagt gatttggaac aactgcatat gcatagtgat 720
tccgactagt caggcaagag agagccctca aatttacctc tctgcccctc ctcactcctt 780
ttggtacgca taattgcagt ataaagaact tgctgccagc cagtaatctt atttcatacg 840
cagttctata tagcacataa tcttgcttgt atgtatgaaa tttaccgcgt tttagttgaa 900
attgtttatg ttgtgtgcct tgcatgaaat ctctcgttag ccctatcctt acatttaact 960
ggtctcaaaa cctctaccaa ttccattgct gtacaacaat atgaggcggc attactgtag 1020
ggttggaaaa aaattgtcat tccagctaga gatcacacga cttcatcacg cttattgctc 1080
ctcattgcta aatcatttac tcttgacttc gacccagaaa agttcgcc 1128
<210> 77
<211> 1231
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpMNN4L1的3'-区
<400> 77
gcatgtcaaa cttgaacaca acgactagat agttgttttt tctatataaa acgaaacgtt 60
atcatcttta ataatcattg aggtttaccc ttatagttcc gtattttcgt ttccaaactt 120
agtaatcttt tggaaatatc atcaaagctg gtgccaatct tcttgtttga agtttcaaac 180
tgctccacca agctacttag agactgttct aggtctgaag caacttcgaa cacagagaca 240
gctgccgccg attgttcttt tttgtgtttt tcttctggaa gaggggcatc atcttgtatg 300
tccaatgccc gtatcctttc tgagttgtcc gacacattgt ccttcgaaga gtttcctgac 360
attgggcttc ttctatccgt gtattaattt tgggttaagt tcctcgtttg catagcagtg 420
gatacctcga tttttttggc tcctatttac ctgacataat attctactat aatccaactt 480
ggacgcgtca tctatgataa ctaggctctc ctttgttcaa aggggacgtc ttcataatcc 540
actggcacga agtaagtctg caacgaggcg gcttttgcaa cagaacgata gtgtcgtttc 600
gtacttggac tatgctaaac aaaaggatct gtcaaacatt tcaaccgtgt ttcaaggcac 660
tctttacgaa ttatcgacca agaccttcct agacgaacat ttcaacatat ccaggctact 720
gcttcaaggt ggtgcaaatg ataaaggtat agatattaga tgtgtttggg acctaaaaca 780
gttcttgcct gaagattccc ttgagcaaca ggcttcaata gccaagttag agaagcagta 840
ccaaatcggt aacaaaaggg ggaagcatat aaaaccttta ctattgcgac aaaatccatc 900
cttgaaagta aagctgtttg ttcaatgtaa agcatacgaa acgaaggagg tagatcctaa 960
gatggttaga gaacttaacg ggacatactc cagctgcatc ccatattacg atcgctggaa 1020
gacttttttc atgtacgtat cgcccaccaa cctttcaaag caagctaggt atgattttga 1080
cagttctcac aatccattgg ttttcatgca acttgaaaaa acccaactca aacttcatgg 1140
ggatccatac aatgtaaatc attacgagag ggcgaggttg aaaagtttcc attgcaatca 1200
cgtcgcatca tggctactga aaggccttaa c 1231
<210> 78
<211> 1815
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpTRP2 基因整合座位
<400> 78
taatggccaa acggtttctc aattactata tactactaac catttacctg tagcgtattt 60
cttttccctc ttcgcgaaag ctcaagggca tcttcttgac tcatgaaaaa tatctggatt 120
tcttctgaca gatcatcacc cttgagccca actctctagc ctatgagtgt aagtgatagt 180
catcttgcaa cagattattt tggaacgcaa ctaacaaagc agatacaccc ttcagcagaa 240
tcctttctgg atattgtgaa gaatgatcgc caaagtcaca gtcctgagac agttcctaat 300
ctttacccca tttacaagtt catccaatca gacttcttaa cgcctcatct ggcttatatc 360
aagcttacca acagttcaga aactcccagt ccaagtttct tgcttgaaag tgcgaagaat 420
ggtgacaccg ttgacaggta cacctttatg ggacattccc ccagaaaaat aatcaagact 480
gggcctttag agggtgctga agttgacccc ttggtgcttc tggaaaaaga actgaagggc 540
accagacaag cgcaacttcc tggtattcct cgtctaagtg gtggtgccat aggatacatc 600
tcgtacgatt gtattaagta ctttgaacca aaaactgaaa gaaaactgaa agatgttttg 660
caacttccgg aagcagcttt gatgttgttc gacacgatcg tggcttttga caatgtttat 720
caaagattcc aggtaattgg aaacgtttct ctatccgttg atgactcgga cgaagctatt 780
cttgagaaat attataagac aagagaagaa gtggaaaaga tcagtaaagt ggtatttgac 840
aataaaactg ttccctacta tgaacagaaa gatattattc aaggccaaac gttcacctct 900
aatattggtc aggaagggta tgaaaaccat gttcgcaagc tgaaagaaca tattctgaaa 960
ggagacatct tccaagctgt tccctctcaa agggtagcca ggccgacctc attgcaccct 1020
ttcaacatct atcgtcattt gagaactgtc aatccttctc catacatgtt ctatattgac 1080
tatctagact tccaagttgt tggtgcttca cctgaattac tagttaaatc cgacaacaac 1140
aacaaaatca tcacacatcc tattgctgga actcttccca gaggtaaaac tatcgaagag 1200
gacgacaatt atgctaagca attgaagtcg tctttgaaag acagggccga gcacgtcatg 1260
ctggtagatt tggccagaaa tgatattaac cgtgtgtgtg agcccaccag taccacggtt 1320
gatcgtttat tgactgtgga gagattttct catgtgatgc atcttgtgtc agaagtcagt 1380
ggaacattga gaccaaacaa gactcgcttc gatgctttca gatccatttt cccagcagga 1440
accgtctccg gtgctccgaa ggtaagagca atgcaactca taggagaatt ggaaggagaa 1500
aagagaggtg tttatgcggg ggccgtagga cactggtcgt acgatggaaa atcgatggac 1560
acatgtattg ccttaagaac aatggtcgtc aaggacggtg tcgcttacct tcaagccgga 1620
ggtggaattg tctacgattc tgacccctat gacgagtaca tcgaaaccat gaacaaaatg 1680
agatccaaca ataacaccat cttggaggct gagaaaatct ggaccgatag gttggccaga 1740
gacgagaatc aaagtgaatc cgaagaaaac gatcaatgaa cggaggacgt aagtaggaat 1800
ttatggtttg gccat 1815
<210> 79
<211> 1373
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpARG1的5'-区
<400> 79
gatctggcct tccctgaatt tttacgtcca gctatacgat ccgttgtgac tgtatttcct 60
gaaatgaagt ttcaacctaa agttttggtt gtacttgctc cacctaccac ggaaactaat 120
atcgaaacca atgaaaaagt agaactggaa tcgtcaatcg aaattcgcaa ccaagtggaa 180
cccaaagact tgaatctttc taaagtctat tctagtgaca ctaatggcaa cagaagattt 240
gagctgactt ttcaaatgaa tctcaataat gcaatatcaa catcagacaa tcaatgggct 300
ttgtctagtg acacaggatc aattatagta gtgtcttctg caggaagaat aacttccccg 360
atcctagaag tcggggcatc cgtctgtgtc ttaagatcgt acaacgaaca ccttttggca 420
ataacttgtg aaggaacatg cttttcatgg aatttaaaga agcaagaatg tgttctaaac 480
agcatttcat tagcacctat agtcaattca cacatgctag ttaagaaagt tggagatgca 540
aggaactatt ctattgtatc tgccgaagga gacaacaatc cgttacccca gattctagac 600
tgcgaacttt ccaaaaatgg cgctccaatt gtggctctta gcacgaaaga catctactct 660
tattcaaaga aaatgaaatg ctggatccat ttgattgatt cgaaatactt tgaattgttg 720
ggtgctgaca atgcactgtt tgagtgtgtg gaagcgctag aaggtccaat tggaatgcta 780
attcatagat tggtagatga gttcttccat gaaaacactg ccggtaaaaa actcaaactt 840
tacaacaagc gagtactgga ggacctttca aattcacttg aagaactagg tgaaaatgcg 900
tctcaattaa gagagaaact tgacaaactc tatggtgatg aggttgaggc ttcttgacct 960
cttctctcta tctgcgtttc tttttttttt tttttttttt tttttttcag ttgagccaga 1020
ccgcgctaaa cgcataccaa ttgccaaatc aggcaattgt gagacagtgg taaaaaagat 1080
gcctgcaaag ttagattcac acagtaagag agatcctact cataaatgag gcgcttattt 1140
agtagctagt gatagccact gcggttctgc tttatgctat ttgttgtatg ccttactatc 1200
tttgtttggc tcctttttct tgacgttttc cgttggaggg actccctatt ctgagtcatg 1260
agccgcacag attatcgccc aaaattgaca aaatcttctg gcgaaaaaag tataaaagga 1320
gaaaaaagct cacccttttc cagcgtagaa agtatatatc agtcattgaa gac 1373
<210> 80
<211> 1470
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpARG1的3'-区
<400> 80
gggactttaa ctcaagtaaa aggatagttg tacaattata tatacgaaga ataaatcatt 60
acaaaaagta ttcgtttctt tgattcttaa caggattcat tttctgggtg tcatcaggta 120
cagcgctgaa tatcttgaag ttaacatcga gctcatcatc gacgttcatc acactagcca 180
cgtttccgca acggtagcaa taattaggag cggaccacac agtgacgaca tctttctctt 240
tgaaatggta tctgaagcct tccatgacca attgatgggc tctagcgatg agttgcaagt 300
tattaatgtg gttgaactca cgtgctactc gagcaccgaa taaccagcca gctccacgag 360
gagaaacagc ccaactgtcg acttcatctg ggtcagacca aaccaagtca caaaatcctc 420
cttcatgagg gacctcttgc gctcggctga gaactctgat ttgatctaac atgcgaatat 480
cgggagagag accaccatgg atacataata ttttaccatc aatgatggca ctaagggtta 540
aaaagtcgaa cacctggcaa cagtacttcc agacagtggt ggaaccatat ttattgagac 600
attcctcata aaatccataa acctgagtga tctgtctgga ttcatgattt ccccttacca 660
atgtgatatg ttgaggaaac ttaattttta aaatcatgag taacgtgaac gtctccaacg 720
agaaatagcc tctatccaca tagtctccta ggaagatata gttctgtttt attccattag 780
aggaggatcc gggaaaccca ccactaatct tgaaaagttc cagtagatcg tgaaattggc 840
cgtgaatatc tccgcatact gtcactggac tctgcactgg ctgtatattg gattcctcca 900
tcagcaaatc cttcacccgt tcgcaaagat gcttcatatc attttcactt aaagccttgc 960
agcttttgac ttcttcaaac cactgatctg gtcctctttc tggcatgatt aaggtctata 1020
atatttctga gctgagatgt aaaaaaaaat aataaaaatg gggagtgaaa aagtgtgtag 1080
cttttaggag tttgggattg ataccccaaa atgatcttta tgagaattaa aaggtagata 1140
cgcttttaat aagaacacct atctatagta ctttgtggtc ttgagtaatt gagatgttca 1200
gcttctgagg tttgccgtta ttctgggata gtagtgcgcg accaaacaac ccgccaggca 1260
aagtgtgttg tgctcgaaga cgattgccag aagagtaagt ccgtcctgcc tcagatgtta 1320
cacactttct tccctagaca gtcgatgcat catcggattt aaacctgaaa ctttgatgcc 1380
atgatacgcc tagtcacgtc gactgagatt ttagataagc cccgatccct ttagtacatt 1440
cctgttatcc atggatggaa tggcctgata 1470
<210> 81
<211> 1854
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpARG1 营养缺陷标记物
<400> 81
cagttgagcc agaccgcgct aaacgcatac caattgccaa atcaggcaat tgtgagacag 60
tggtaaaaaa gatgcctgca aagttagatt cacacagtaa gagagatcct actcataaat 120
gaggcgctta tttagtagct agtgatagcc actgcggttc tgctttatgc tatttgttgt 180
atgccttact atctttgttt ggctcctttt tcttgacgtt ttccgttgga gggactccct 240
attctgagtc atgagccgca cagattatcg cccaaaattg acaaaatctt ctggcgaaaa 300
aagtataaaa ggagaaaaaa gctcaccctt ttccagcgta gaaagtatat atcagtcatt 360
gaagactatt atttaaataa cacaatgtct aaaggaaaag tttgtttggc ctactccggt 420
ggtttggata cctccatcat cctagcttgg ttgttggagc agggatacga agtcgttgcc 480
tttttagcca acattggtca agaggaagac tttgaggctg ctagagagaa agctctgaag 540
atcggtgcta ccaagtttat cgtcagtgac gttaggaagg aatttgttga ggaagttttg 600
ttcccagcag tccaagttaa cgctatctac gagaacgtct acttactggg tacctctttg 660
gccagaccag tcattgccaa ggcccaaata gaggttgctg aacaagaagg ttgttttgct 720
gttgcccacg gttgtaccgg aaagggtaac gatcaggtta gatttgagct ttccttttat 780
gctctgaagc ctgacgttgt ctgtatcgcc ccatggagag acccagaatt cttcgaaaga 840
ttcgctggta gaaatgactt gctgaattac gctgctgaga aggatattcc agttgctcag 900
actaaagcca agccatggtc tactgatgag aacatggctc acatctcctt cgaggctggt 960
attctagaag atccaaacac tactcctcca aaggacatgt ggaagctcac tgttgaccca 1020
gaagatgcac cagacaagcc agagttcttt gacgtccact ttgagaaggg taagccagtt 1080
aaattagttc tcgagaacaa aactgaggtc accgatccgg ttgagatctt tttgactgct 1140
aacgccattg ctagaagaaa cggtgttggt agaattgaca ttgtcgagaa cagattcatc 1200
ggaatcaagt ccagaggttg ttatgaaact ccaggtttga ctctactgag aaccactcac 1260
atcgacttgg aaggtcttac cgttgaccgt gaagttagat cgatcagaga cacttttgtt 1320
accccaacct actctaagtt gttatacaac gggttgtact ttaccccaga aggtgagtac 1380
gtcagaacta tgattcagcc ttctcaaaac accgtcaacg gtgttgttag agccaaggcc 1440
tacaaaggta atgtgtataa cctaggaaga tactctgaaa ccgagaaatt gtacgatgct 1500
accgaatctt ccatggatga gttgaccgga ttccaccctc aagaagctgg aggatttatc 1560
acaacacaag ccatcagaat caagaagtac ggagaaagtg tcagagagaa gggaaagttt 1620
ttgggacttt aactcaagta aaaggatagt tgtacaatta tatatacgaa gaataaatca 1680
ttacaaaaag tattcgtttc tttgattctt aacaggattc attttctggg tgtcatcagg 1740
tacagcgctg aatatcttga agttaacatc gagctcatca tcgacgttca tcacactagc 1800
cacgtttccg caacggtagc aataattagg agcggaccac acagtgacga catc 1854
<210> 82
<211> 1250
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpADE1的5'-区
<400> 82
gagtcggcca agagatgata actgttacta agcttctccg taattagtgg tattttgtaa 60
cttttaccaa taatcgttta tgaatacgga tatttttcga ccttatccag tgccaaatca 120
cgtaacttaa tcatggttta aatactccac ttgaacgatt cattattcag aaaaaagtca 180
ggttggcaga aacacttggg cgctttgaag agtataagag tattaagcat taaacatctg 240
aactttcacc gccccaatat actactctag gaaactcgaa aaattccttt ccatgtgtca 300
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acaacttgct gttcgtcgca actgaccgta tctccgctta cgatgtgatt atgacaaacg 480
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catcaaaact gtctgaagaa aaatacaaat ctcaattaga gggacgatcc ttgatagtaa 660
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ggaaagagta caagaactca aaaactgtcc atggagtcaa ggttgaaaac gagaaccttc 780
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aacacgatga aaacatctct attgaacaag ctgctgagat tgtaggtaaa gacatttgtg 900
agaaggtcgc tgtcaaggcg gtcgagttgt attctgctgc aaaaaacctc gcccttttga 960
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aaaagtatat tgaagcttat gaagcaatta ctggcaagaa atgggcttga 1250
<210> 83
<211> 882
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpADE1的3'-区
<400> 83
atgattagta ccctcctcgc ctttttcaga catctgaaat ttcccttatt cttccaattc 60
catataaaat cctatttagg taattagtaa acaatgatca taaagtgaaa tcattcaagt 120
aaccattccg tttatcgttg atttaaaatc aataacgaat gaatgtcggt ctgagtagtc 180
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tagcaaaaat tctggaccaa gaaaacgatt ttgccaaaac atacgtcggt acgccgtatt 780
acatgtctcc tgaagtgctg ttggaccaac cctactcacc attatgtgat atatggtctc 840
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<210> 84
<211> 909
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> MET16的5'-区
<400> 84
gggtgggcct ggtaatgttc actcctagga actactagaa aaactgtgct aaacggatta 60
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ccacctgctc tttgagttcc ggaaattcgt tgacaatctt ttgtcccaat gtcgattggg 240
cgtatttaaa gcccagctgt tttcctctga gaaattgatt caacttcctc accacctcca 300
caaactcacg cgtgtatata tcagggtttc taccgtcttc gatataattg actacgtcca 360
cggggatggg aatgttcaaa tctgtgttgt ggagcttttg caagtgctct acaaccttgt 420
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cattcaaatg cctttaccct tcatctgtgg tacctcaggc taagaacggg tcacgtgata 840
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cgaaacggg 909
<210> 85
<211> 825
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> MET16的3'-区
<400> 85
ctagatttgc acaatatttg aaagctcagc aaaacatatg aatataattt tttttttctc 60
tacactattt atcctgtaag tttctgtttc cccatgtagg atctttttct ccttctctgt 120
ctcccatttt ttttgttccc tgtagtcttg ccttgcctga gatgcgagct cgtccgccca 180
tccagtcgtg tgaagggcct agcttttcaa aaagaaaata cctcccgcta aaggaggcgt 240
tgccccttct atcagtagtg tcgtaaccaa ttttcacaaa caataaaaaa aggacaccaa 300
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tggtgcttgc ggtaaaactt gtctattgat ggtgtttgcc gagggcgagt tccctccatc 480
ttatgttcca actgtttttg agaactatgc caccccagta gaggttgaca acagaatagt 540
acaactcact ctatgggata ctgccggaca ggaagattat gatagactga gacctctttc 600
ctatcccgat gccaatgtgg tcttgatttg ttttgctatt gacattcctg acaccttaga 660
taacgttcaa gagaagtgga ttagtgaggt gttgcatttc tgtcctggag tccctatcat 720
tttagttggt tgtaaacttg acttgagaaa cgatccagag gttatccgtg aattacaagc 780
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<210> 86
<211> 1796
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpMET16 营养缺陷标记物
<400> 86
caacttcctc accacctcca caaactcacg cgtgtatata tcagggtttc taccgtcttc 60
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taagaacggg tcacgtgata tttcgacact catcgccaca atatgtacta gcaagaactt 600
ttcagattta gtaatccgtt cgaaacggga aaaaatgttt ttacccttct atcaactgct 660
aatctttcta ggtttatact gccagcagcc cgttccagat accaacatgc cattcactat 720
aggccagtca aaaaccagtt tgaacctctc caaggtccaa gtggaccacc ttaacctttc 780
tcttcagaat ctcagtccag aagaaatcat acaatggtct atcattacct tcccacacct 840
gtatcaaact acggcattcg gattgactgg gttgtgtata actgacatgg ttcacaaaat 900
aacagccaaa agaggcaaaa agcatgctat tgacttgatt ttcatagaca ccttacatca 960
ttttccacag actttagatc tcgttgaacg agtcaaagat aaataccact gcaatgttca 1020
tgtcttcaaa ccacagaatg ccactactga gctcgagttt ggggcgcaat atggcgaaaa 1080
cttatgggaa acagatgata acaagtatga ctacctcgta aaagttgaac cctcacaacg 1140
tgcctaccat gcattagacg tctgcgccgt cttcacagga agaagacggt ctcaaggtgg 1200
taaaagggga gaattgcccg tgattgaaat tgatgaaatt tctcaggtgg tcaagattaa 1260
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cactaaaaat ggtgaagatg aaagagcagg caggtggaga ggtaaacaaa agagtgagtg 1440
tggtatccac gaagcttcta gatttgcaca atatttgaaa gctcagcaaa acatatgaat 1500
ataatttttt ttttctctac actatttatc ctgtaagttt ctgtttcccc atgtaggatc 1560
tttttctcct tctctgtctc ccattttttt tgttccctgt agtcttgcct tgcctgagat 1620
gcgagctcgt ccgcccatcc agtcgtgtga agggcctagc ttttcaaaaa gaaaatacct 1680
cccgctaaag gaggcgttgc cccttctatc agtagtgtcg taaccaattt tcacaaacaa 1740
taaaaaaagg acaccaacaa cgaaatcaac tatttacaca catccagatc cgtccc 1796
<210> 87
<211> 461
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpHIS1的5'-区
<400> 87
taactggccc tttgacgttt ctgacaatag ttctagagga gtcgtccaaa aactcaactc 60
tgacttgggt gacaccacca cgggatccgg ttcttccgag gaccttgatg accttggcta 120
atgtaactgg agttttagta tccattttaa gatgtgtgtt tctgtaggtt ctgggttgga 180
aaaaaatttt agacaccaga agagaggagt gaactggttt gcgtgggttt agactgtgta 240
aggcactact ctgtcgaagt tttagatagg ggttacccgc tccgatgcat gggaagcgat 300
tagcccggct gttgcccgtt tggtttttga agggtaattt tcaatatctc tgtttgagtc 360
atcaatttca tattcaaaga ttcaaaaaca aaatctggtc caaggagcgc atttaggatt 420
atggagttgg cgaatcactt gaacgataga ctattatttg c 461
<210> 88
<211> 1841
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpHIS1的3'-区
<400> 88
gtgacattct tgtctttgag atcagtaatt gtagagcata gatagaataa tattcaagac 60
caacggcttc tcttcggaag ctccaagtag cttatagtga tgagtaccgg catatattta 120
taggcttaaa atttcgaggg ttcactatat tcgtttagtg ggaagagttc ctttcactct 180
tgttatctat attgtcagcg tggactgttt ataactgtac caacttagtt tctttcaact 240
ccaggttaag agacataaat gtcctttgat gctgacaata atcagtggaa ttcaaggaag 300
gacaatcccg acctcaatct gttcattaat gaagagttcg aatcgtcctt aaatcaagcg 360
ctagactcaa ttgtcaatga gaaccctttc tttgaccaag aaactataaa tagatcgaat 420
gacaaagttg gaaatgagtc cattagctta catgatattg agcaggcaga ccaaaataaa 480
ccgtcctttg agagcgatat tgatggttcg gcgccgttga taagagacga caaattgcca 540
aagaaacaaa gctgggggct gagcaatttt ttttcaagaa gaaatagcat atgtttacca 600
ctacatgaaa atgattcaag tgttgttaag accgaaagat ctattgcagt gggaacaccc 660
catcttcaat actgcttcaa tggaatctcc aatgccaagt acaatgcatt tacctttttc 720
ccagtcatcc tatacgagca attcaaattt tttttcaatt tatactttac tttagtggct 780
ctctctcaag cgataccgca acttcgcatt ggatatcttt cttcgtatgt cgtcccactt 840
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agggatagag aacagaacaa tgaaccatat gaggttctgt ccagcccatc accagttttg 960
tccaaaaact taaaatgtgg tcacttggtt cgattgcata agggaatgag agtgcccgca 1020
gatatggttc ttgtccagtc aagcgaatcc accggagagt catttatcaa gacagatcag 1080
ctggatggtg agactgattg gaagcttcgg attgtttctc cagttacaca atcgttacca 1140
atgactgaac ttcaaaatgt cgccatcact gcaagcgcac cctcaaaatc aattcactcc 1200
tttcttggaa gattgaccta caatgggcaa tcatatggtc ttacgataga caacacaatg 1260
tggtgtaata ctgtattagc ttctggttca gcaattggtt gtataattta cacaggtaaa 1320
gatactcgac aatcgatgaa cacaactcag cccaaactga aaacgggctt gttagaactg 1380
gaaatcaata gtttgtccaa gatcttatgt gtttgtgtgt ttgcattatc tgtcatctta 1440
gtgctattcc aaggaatagc tgatgattgg tacgtcgata tcatgcggtt tctcattcta 1500
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ccggaagacc tgggaagaat tgaataccta ttaagtgaca aaactggaac tcttactcaa 1680
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gatattattt ctgatcatgt taaaggtctt aataacgcta aaacatcgag gaaagatctt 1800
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<210> 89
<211> 1729
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpHIS1 营养缺陷标记物
<400> 89
caagttgcgt ccggtatacg taacgtctca cgatgatcaa agataatact taatcttcat 60
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gctaatgtaa ctggagtttt agtatccatt ttaagatgtg tgtttctgta ggttctgggt 360
tggaaaaaaa ttttagacac cagaagagag gagtgaactg gtttgcgtgg gtttagactg 420
tgtaaggcac tactctgtcg aagttttaga taggggttac ccgctccgat gcatgggaag 480
cgattagccc ggctgttgcc cgtttggttt ttgaagggta attttcaata tctctgtttg 540
agtcatcaat ttcatattca aagattcaaa aacaaaatct ggtccaagga gcgcatttag 600
gattatggag ttggcgaatc acttgaacga tagactatta tttgctgttc ctaaagaggg 660
cagattgtat gagaaatgcg ttgaattact taggggatca gatattcagt ttcgaagatc 720
cagtagattg gatatagctt tgtgcactaa cctgcccctg gcattggttt tccttccagc 780
tgctgacatt cccacgtttg taggagaggg taaatgtgat ttgggtataa ctggtattga 840
ccaggttcag gaaagtgacg tagatgtcat acctttatta gacttgaatt tcggtaagtg 900
caagttgcag attcaagttc ccgagaatgg tgacttgaaa gaacctaaac agctaattgg 960
taaagaaatt gtttcctcct ttactagctt aaccaccagg tactttgaac aactggaagg 1020
agttaagcct ggtgagccac taaagacaaa aatcaaatat gttggagggt ctgttgaggc 1080
ctcttgtgcc ctaggagttg ccgatgctat tgtggatctt gttgagagtg gagaaaccat 1140
gaaagcggca gggctgatcg atattgaaac tgttctttct acttccgctt acctgatctc 1200
ttcgaagcat cctcaacacc cagaactgat ggatactatc aaggagagaa ttgaaggtgt 1260
actgactgct cagaagtatg tcttgtgtaa ttacaacgca cctagaggta accttcctca 1320
gctgctaaaa ctgactccag gcaagagagc tgctaccgtt tctccattag atgaagaaga 1380
ttgggtggga gtgtcctcga tggtagagaa gaaagatgtt ggaagaatca tggacgaatt 1440
aaagaaacaa ggtgccagtg acattcttgt ctttgagatc agtaattgta gagcatagat 1500
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gtaccggcat atatttatag gcttaaaatt tcgagggttc actatattcg tttagtggga 1620
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<210> 90
<211> 1231
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpPRO1的5'-区
<400> 90
gaagggccat cgaattgtca tcgtctcctc aggtgccatc gctgtgggca tgaagagagt 60
caacatgaag cggaaaccaa aaaagttaca gcaagtgcag gcattggctg ctataggaca 120
aggccgtttg ataggacttt gggacgacct tttccgtcag ttgaatcagc ctattgcgca 180
gattttactg actagaacgg atttggtcga ttacacccag tttaagaacg ctgaaaatac 240
attggaacag cttattaaaa tgggtattat tcctattgtc aatgagaatg acaccctatc 300
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tcatgcagac tacctgtttt tggtgactga tgtggactgt ctttacacgg ataaccctcg 420
tacgaatccg gacgctgagc caatcgtgtt agttagaaat atgaggaatc taaacgtcaa 480
taccgaaagt ggaggttccg ccgtaggaac aggaggaatg acaactaaat tgatcgcagc 540
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gagggagttg aacaagctgg acattccttt gcatacacgt ttcgttggcc acagttttaa 780
tgctgttaat aacaaagagt tttggttact ccatggacta aaggccaacg gagccattat 840
cattgatcca ggttgttata aggctatcac tagaaaaaac aaagctggta ttcttccagc 900
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ccgtgcccgt tgtaattacc ccagcaatca aatcaacaaa attaagggtc tacaaagctc 1080
gcagatcgag caggttctag gttacgctga cggtgagtat gttgttcaca gggacaactt 1140
ggctttccca gtatttgccg atccagaact gttggatgtt gttgagagta ccctgtctga 1200
acaggagaga gaatccaaac caaataaata g 1231
<210> 91
<211> 1425
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpPRO1的3'-区
<400> 91
aatttcacat atgctgcttg attatgtaat tataccttgc gttcgatggc atcgatttcc 60
tcttctgtca atcgcgcatc gcattaaaag tatacttttt tttttttcct atagtactat 120
tcgccttatt ataaactttg ctagtatgag ttctaccccc aagaaagagc ctgatttgac 180
tcctaagaag agtcagcctc caaagaatag tctcggtggg ggtaaaggct ttagtgagga 240
gggtttctcc caaggggact tcagcgctaa gcatatacta aatcgtcgcc ctaacaccga 300
aggctcttct gtggcttcga acgtcatcag ttcgtcatca ttgcaaaggt taccatcctc 360
tggatctgga agcgttgctg tgggaagtgt gttgggatct tcgccattaa ctctttctgg 420
agggttccac gggcttgatc caaccaagaa taaaatagac gttccaaagt cgaaacagtc 480
aaggagacaa agtgttcttt ctgacatgat ttccacttct catgcagcta gaaatgatca 540
ctcagagcag cagttacaaa ctggacaaca atcagaacaa aaagaagaag atggtagtcg 600
atcttctttt tctgtttctt cccccgcaag agatatccgg cacccagatg tactgaaaac 660
tgtcgagaaa catcttgcca atgacagcga gatcgactca tctttacaac ttcaaggtgg 720
agatgtcact agaggcattt atcaatgggt aactggagaa agtagtcaaa aagataaccc 780
gcctttgaaa cgagcaaata gttttaatga tttttcttct gtgcatggtg acgaggtagg 840
caaggcagat gctgaccacg atcgtgaaag cgtattcgac gaggatgata tctccattga 900
tgatatcaaa gttccgggag ggatgcgtcg aagtttttta ttacaaaagc atagagacca 960
acaactttct ggactgaata aaacggctca ccaaccaaaa caacttacta aacctaattt 1020
cttcacgaac aactttatag agtttttggc attgtatggg cattttgcag gtgaagattt 1080
ggaggaagac gaagatgaag atttagacag tggttccgaa tcagtcgcag tcagtgatag 1140
tgagggagaa ttcagtgagg ctgacaacaa tttgttgtat gatgaagagt ctctcctatt 1200
agcacctagt acctccaact atgcgagatc aagaatagga agtattcgta ctcctactta 1260
tggatctttc agttcaaatg ttggttcttc gtctattcat cagcagttaa tgaaaagtca 1320
aatcccgaag ctgaagaaac gtggacagca caagcataaa acacaatcaa aaatacgctc 1380
gaagaagcaa actaccaccg taaaagcagt gttgctgcta ttaaa 1425
<210> 92
<211> 501
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码截短的 hEPO DNA (密码子优化的)
<400> 92
gctccaccaa gattgatttg tgactccaga gttttggaga gatacttgtt ggaggctaaa 60
gaggctgaga acatcactac tggttgtgct gaacactgtt ccttgaacga gaacatcaca 120
gttccagaca ctaaggttaa cttctacgct tggaagagaa tggaagttgg acaacaggct 180
gttgaagttt ggcaaggatt ggctttgttg tccgaggctg ttttgagagg tcaagctttg 240
ttggttaact cctcccaacc atgggaacca ttgcaattgc acgttgacaa ggctgtttct 300
ggattgagat ccttgactac tttgttgaga gctttgggtg ctcagaaaga ggctatttct 360
ccaccagatg ctgcttcagc tgctccattg agaactatca ctgctgacac tttcagaaag 420
ttgttcagag tttactccaa cttcttgaga ggaaagttga agttgtacac tggtgaagct 480
tgtagaactg gtgactagta a 501
<210> 93
<211> 165
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 截短的 hEPO
<400> 93
Ala Pro Pro Arg Leu Ile Cys Asp Ser Arg Val Leu Glu Arg Tyr Leu
1 5 10 15
Leu Glu Ala Lys Glu Ala Glu Asn Ile Thr Thr Gly Cys Ala Glu His
20 25 30
Cys Ser Leu Asn Glu Asn Ile Thr Val Pro Asp Thr Lys Val Asn Phe
35 40 45
Tyr Ala Trp Lys Arg Met Glu Val Gly Gln Gln Ala Val Glu Val Trp
50 55 60
Gln Gly Leu Ala Leu Leu Ser Glu Ala Val Leu Arg Gly Gln Ala Leu
65 70 75 80
Leu Val Asn Ser Ser Gln Pro Trp Glu Pro Leu Gln Leu His Val Asp
85 90 95
Lys Ala Val Ser Gly Leu Arg Ser Leu Thr Thr Leu Leu Arg Ala Leu
100 105 110
Gly Ala Gln Lys Glu Ala Ile Ser Pro Pro Asp Ala Ala Ser Ala Ala
115 120 125
Pro Leu Arg Thr Ile Thr Ala Asp Thr Phe Arg Lys Leu Phe Arg Val
130 135 140
Tyr Ser Asn Phe Leu Arg Gly Lys Leu Lys Leu Tyr Thr Gly Glu Ala
145 150 155 160
Cys Arg Thr Gly Asp
165
<210> 94
<211> 78
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码鸡溶菌酶信号肽 (CLSP)
<400> 94
atgctgggta agaacgaccc aatgtgtctt gttttggtct tgttgggatt gactgctttg 60
ttgggtatct gtcaaggt 78
<210> 95
<211> 26
<212> PRT
<213> 人工序列
<220>
<223> 鸡溶菌酶信号肽 (CLSP)
<400> 95
Met Leu Gly Lys Asn Asp Pro Met Cys Leu Val Leu Val Leu Leu Gly
1 5 10 15
Leu Thr Ala Leu Leu Gly Ile Cys Gln Gly
20 25
<210> 96
<211> 1892
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 编码 PpAde2
<400> 96
atggattctc aggtaatagg tattctagga ggaggccagc taggccgaat gattgttgag 60
gccgctagca ggctcaatat caagaccgtg attcttgatg atggtttttc acctgctaag 120
cacattaatg ctgcgcaaga ccacatcgac ggatcattca aagatgagga ggctatcgcc 180
aagttagctg ccaaatgtga tgttctcact gtagagattg agcatgtcaa cacagatgct 240
ctaaagagag ttcaagacag aactggaatc aagatatatc ctttaccaga gacaatcgaa 300
ctaatcaagg ataagtactt gcaaaaggaa catttgatca agcacaacat ttcggtgaca 360
aagtctcagg gtatagaatc taatgaaaag gcgctgcttt tgtttggaga agagaatgga 420
tttccatatc tgttgaagtc ccggactatg gcttatgatg gaagaggcaa ttttgtagtg 480
gagtctaaag aggacatcag taaggcatta gaattcttga aagatcgtcc attgtatgcc 540
gagaagtttg ctccttttgt taaagaatta gcggtaatgg ttgtgagatc actggaaggc 600
gaagtattct cctacccaac cgtagaaact gtgcacaagg acaatatctg tcatattgtg 660
tatgctccgg ccagagttaa tgacaccatc caaaagaaag ctcaaatatt agctgaaaac 720
actgtgaaga ctttcccagg cgctggaatc ttcggagttg agatgttcct attgtctgat 780
ggagaacttc ttgtaaatga gattgctcca aggccccaca attctggtca ctatacaatc 840
gatgcatgtg taacatctca gttcgaagca catgtaagag ccataactgg tctgccaatg 900
ccactagatt tcaccaaact atctacttcc aacaccaacg ctattatgct caatgttttg 960
ggtgctgaaa aatctcacgg ggaattagag ttttgtagaa gagccttaga aacacccggt 1020
gcttctgtat atctgtacgg aaagaccacc cgattggctc gtaagatggg tcatatcaac 1080
ataataggat cttccatgtt ggaagcagaa caaaagttag agtacattct agaagaatca 1140
acccacttac catccagtac tgtatcagct gacactaaac cgttggttgg agttatcatg 1200
ggttcagact ctgatctacc tgtgatttcg aaaggttgcg atattttaaa acagtttggt 1260
gttccattcg aagttactat tgtctctgct catagaacac cacagagaat gaccagatat 1320
gcctttgaag ccgctagtag aggtatcaag gctatcattg caggtgctgg tggtgctgct 1380
catcttccag gaatggttgc tgccatgact ccgttgccag tcattggtgt tcctgtcaag 1440
ggctctacgt tggatggtgt agactcgcta cactcgattg tccaaatgcc tagaggtgtt 1500
cctgtggcta cggttgctat caacaacgcc accaatgccg ctctgttggc catcaggatt 1560
ttaggtacaa ttgaccacaa atggcaaaag gaaatgtcca agtatatgaa tgcaatggag 1620
accgaagtgt tggggaaggc atccaacttg gaatctgaag ggtatgaatc ctatttgaag 1680
aatcgtcttt gaatttagta ttgtttttta atagatgtat atataatagt acacgtaact 1740
tatctattcc attcataatt ttattttaaa ggttcggtag aaatttgtcc tccaaaaagt 1800
tggttagagc ctggcagttt tgataggcat tattatagat tgggtaatat ttaccctgca 1860
cctggaggaa ctttgcaaag agcctcatgt gc 1892
<210> 97
<211> 563
<212> PRT
<213> 巴斯德毕赤氏酵母
<400> 97
Met Asp Ser Gln Val Ile Gly Ile Leu Gly Gly Gly Gln Leu Gly Arg
1 5 10 15
Met Ile Val Glu Ala Ala Ser Arg Leu Asn Ile Lys Thr Val Ile Leu
20 25 30
Asp Asp Gly Phe Ser Pro Ala Lys His Ile Asn Ala Ala Gln Asp His
35 40 45
Ile Asp Gly Ser Phe Lys Asp Glu Glu Ala Ile Ala Lys Leu Ala Ala
50 55 60
Lys Cys Asp Val Leu Thr Val Glu Ile Glu His Val Asn Thr Asp Ala
65 70 75 80
Leu Lys Arg Val Gln Asp Arg Thr Gly Ile Lys Ile Tyr Pro Leu Pro
85 90 95
Glu Thr Ile Glu Leu Ile Lys Asp Lys Tyr Leu Gln Lys Glu His Leu
100 105 110
Ile Lys His Asn Ile Ser Val Thr Lys Ser Gln Gly Ile Glu Ser Asn
115 120 125
Glu Lys Ala Leu Leu Leu Phe Gly Glu Glu Asn Gly Phe Pro Tyr Leu
130 135 140
Leu Lys Ser Arg Thr Met Ala Tyr Asp Gly Arg Gly Asn Phe Val Val
145 150 155 160
Glu Ser Lys Glu Asp Ile Ser Lys Ala Leu Glu Phe Leu Lys Asp Arg
165 170 175
Pro Leu Tyr Ala Glu Lys Phe Ala Pro Phe Val Lys Glu Leu Ala Val
180 185 190
Met Val Val Arg Ser Leu Glu Gly Glu Val Phe Ser Tyr Pro Thr Val
195 200 205
Glu Thr Val His Lys Asp Asn Ile Cys His Ile Val Tyr Ala Pro Ala
210 215 220
Arg Val Asn Asp Thr Ile Gln Lys Lys Ala Gln Ile Leu Ala Glu Asn
225 230 235 240
Thr Val Lys Thr Phe Pro Gly Ala Gly Ile Phe Gly Val Glu Met Phe
245 250 255
Leu Leu Ser Asp Gly Glu Leu Leu Val Asn Glu Ile Ala Pro Arg Pro
260 265 270
His Asn Ser Gly His Tyr Thr Ile Asp Ala Cys Val Thr Ser Gln Phe
275 280 285
Glu Ala His Val Arg Ala Ile Thr Gly Leu Pro Met Pro Leu Asp Phe
290 295 300
Thr Lys Leu Ser Thr Ser Asn Thr Asn Ala Ile Met Leu Asn Val Leu
305 310 315 320
Gly Ala Glu Lys Ser His Gly Glu Leu Glu Phe Cys Arg Arg Ala Leu
325 330 335
Glu Thr Pro Gly Ala Ser Val Tyr Leu Tyr Gly Lys Thr Thr Arg Leu
340 345 350
Ala Arg Lys Met Gly His Ile Asn Ile Ile Gly Ser Ser Met Leu Glu
355 360 365
Ala Glu Gln Lys Leu Glu Tyr Ile Leu Glu Glu Ser Thr His Leu Pro
370 375 380
Ser Ser Thr Val Ser Ala Asp Thr Lys Pro Leu Val Gly Val Ile Met
385 390 395 400
Gly Ser Asp Ser Asp Leu Pro Val Ile Ser Lys Gly Cys Asp Ile Leu
405 410 415
Lys Gln Phe Gly Val Pro Phe Glu Val Thr Ile Val Ser Ala His Arg
420 425 430
Thr Pro Gln Arg Met Thr Arg Tyr Ala Phe Glu Ala Ala Ser Arg Gly
435 440 445
Ile Lys Ala Ile Ile Ala Gly Ala Gly Gly Ala Ala His Leu Pro Gly
450 455 460
Met Val Ala Ala Met Thr Pro Leu Pro Val Ile Gly Val Pro Val Lys
465 470 475 480
Gly Ser Thr Leu Asp Gly Val Asp Ser Leu His Ser Ile Val Gln Met
485 490 495
Pro Arg Gly Val Pro Val Ala Thr Val Ala Ile Asn Asn Ala Thr Asn
500 505 510
Ala Ala Leu Leu Ala Ile Arg Ile Leu Gly Thr Ile Asp His Lys Trp
515 520 525
Gln Lys Glu Met Ser Lys Tyr Met Asn Ala Met Glu Thr Glu Val Leu
530 535 540
Gly Lys Ala Ser Asn Leu Glu Ser Glu Gly Tyr Glu Ser Tyr Leu Lys
545 550 555 560
Asn Arg Leu
<210> 98
<211> 1302
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Pp TRP2: 5' 和 ORF
<400> 98
actgggcctt tagagggtgc tgaagttgac cccttggtgc ttctggaaaa agaactgaag 60
ggcaccagac aagcgcaact tcctggtatt cctcgtctaa gtggtggtgc cataggatac 120
atctcgtacg attgtattaa gtactttgaa ccaaaaactg aaagaaaact gaaagatgtt 180
ttgcaacttc cggaagcagc tttgatgttg ttcgacacga tcgtggcttt tgacaatgtt 240
tatcaaagat tccaggtaat tggaaacgtt tctctatccg ttgatgactc ggacgaagct 300
attcttgaga aatattataa gacaagagaa gaagtggaaa agatcagtaa agtggtattt 360
gacaataaaa ctgttcccta ctatgaacag aaagatatta ttcaaggcca aacgttcacc 420
tctaatattg gtcaggaagg gtatgaaaac catgttcgca agctgaaaga acatattctg 480
aaaggagaca tcttccaagc tgttccctct caaagggtag ccaggccgac ctcattgcac 540
cctttcaaca tctatcgtca tttgagaact gtcaatcctt ctccatacat gttctatatt 600
gactatctag acttccaagt tgttggtgct tcacctgaat tactagttaa atccgacaac 660
aacaacaaaa tcatcacaca tcctattgct ggaactcttc ccagaggtaa aactatcgaa 720
gaggacgaca attatgctaa gcaattgaag tcgtctttga aagacagggc cgagcacgtc 780
atgctggtag atttggccag aaatgatatt aaccgtgtgt gtgagcccac cagtaccacg 840
gttgatcgtt tattgactgt ggagagattt tctcatgtga tgcatcttgt gtcagaagtc 900
agtggaacat tgagaccaaa caagactcgc ttcgatgctt tcagatccat tttcccagca 960
ggtaccgtct ccggtgctcc gaaggtaaga gcaatgcaac tcataggaga attggaagga 1020
gaaaagagag gtgtttatgc gggggccgta ggacactggt cgtacgatgg aaaatcgatg 1080
gacacatgta ttgccttaag aacaatggtc gtcaaggacg gtgtcgctta ccttcaagcc 1140
ggaggtggaa ttgtctacga ttctgacccc tatgacgagt acatcgaaac catgaacaaa 1200
atgagatcca acaataacac catcttggag gctgagaaaa tctggaccga taggttggcc 1260
agagacgaga atcaaagtga atccgaagaa aacgatcaat ga 1302
<210> 99
<211> 1085
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Pp TRP2: 3'
<400> 99
acggaggacg taagtaggaa tttatgtaat catgccaata catctttaga tttcttcctc 60
ttctttttaa cgaaagacct ccagttttgc actctcgact ctctagtatc ttcccatttc 120
tgttgctgca acctcttgcc ttctgtttcc ttcaattgtt cttctttctt ctgttgcact 180
tggccttctt cctccatctt tcgttttttt tcaagccttt tcagcagttc ttcttccaag 240
agcagttctt tgattttctc tctccaatcc accaaaaaac tggatgaatt caaccgggca 300
tcatcaatgt tccactttct ttctcttatc aataatctac gtgcttcggc atacgaggaa 360
tccagttgct ccctaatcga gtcatccaca aggttagcat gggccttttt cagggtgtca 420
aaagcatctg gagctcgttt attcggagtc ttgtctggat ggatcagcaa agactttttg 480
cggaaagtct ttcttatatc ttccggagaa caacctggtt tcaaatccaa gatggcatag 540
ctgtccaatt tgaaagtgga aagaatcctg ccaatttcct tctctcgtgt cagctcgttc 600
tcctcctttt gcaacaggtc cacttcatct ggcatttttc tttatgttaa ctttaattat 660
tattaattat aaagttgatt atcgttatca aaataatcat attcgagaaa taatccgtcc 720
atgcaatata taaataagaa ttcataataa tgtaatgata acagtacctc tgatgacctt 780
tgatgaaccg caattttctt tccaatgaca agacatccct ataatacaat tatacagttt 840
atatatcaca aataatcacc tttttataag aaaaccgtcc tctccgtaac agaacttatt 900
atccgcacgt tatggttaac acactactaa taccgatata gtgtatgaag tcgctacgag 960
atagccatcc aggaaactta ccaattcatc agcactttca tgatccgatt gttggcttta 1020
ttctttgcga gacagatact tgccaatgaa ataactgatc ccacagatga gaatccggtg 1080
ctcgt 1085
<210> 100
<211> 1007
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Pp ADE2 5' 区
<400> 100
cttaaaatca tctgcctcac cccaccgacc aatgggaatt ctagaaacaa tttcattgct 60
cttcttctcg ttaccataag aatcggctgt catgtttgac ttaacgaacc ctggaacaag 120
ggaattcacg gtaatacctt ttggagcaag ttcaaccgat agagccttca ttaatgagtt 180
gattgcacct ttggtggtcg catataccga ttgattcggg taggtcactt cgaaactgta 240
cagggaggca gtaaagatga tcctaccctt aatctggttc ttaataaagt gtttagtgac 300
tagctgtgtc aatctaaatg gaaaatcgac atttaccttt tggatagccg cgtaatcttt 360
ctccgtaaaa cttgtaaact cagatttaat ggcaatggca gcgttgttga ttaaaatgtc 420
aatctttcca gtggaactct tctccaccgc aggactcgtt acggtctctt ccagctttgc 480
aagatcggca tccactagat ccaactcaat tgtatgtatg gaggcaccat cggcatttga 540
cattctcacc tcttcaatga aagccgttgg gtctgtagaa ggtctatgga taagaataag 600
ttctgcacct gcttcataaa gtcctcgaac tattccttgg cctaatccgc tggtaccacc 660
ggtgatcaag gcgaccttac cattcaaaga aaacaaatca gcggacatta gcgacttgaa 720
tagggaatgg gttagacaaa tgaaagccga cgagccagca ctttatagta agtgcaggtg 780
agtcaataag aataaatgta tggcttgctg tccctatcgc gtaagaagct tactaagatc 840
gcctaaattg aaaagttgaa caaatcagtt ctagctggcc tccatcagca tttcgttctc 900
ctctgatcat ctttgccaat cgctagcatg ccctcagcgt gcaaggaaaa gcacgcttct 960
ttcttatcga cgtattttca actatggcag agccaggtta gcaagtc 1007
<210> 101
<211> 1676
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> Pp ADE2 3' 区
<400> 101
atttagtatt gttttttaat agatgtatat ataatagtac acgtaactta tctattccat 60
tcataatttt attttaaagg ttcggtagaa atttgtcctc caaaaagttg gttagagcct 120
ggcagttttg ataggcatta ttatagattg ggtaatattt accctgcacc tggaggaact 180
ttgcaaagag cctcatgtgc tctaaaagga tgtcagaatt ccaacatttc aaaattatat 240
ctgcatgcgt ctgtaatact ggaactgtta tttttctggt caggatttca ccgctcttgt 300
cgtcatgttt ctcgtcgtct gaaagtaaac tgactttcct ctttccataa acacaaaaat 360
cgattgcaac ttggttattc ttgagattga aatttgctgt gtcttcagtg cttagctgaa 420
tatcaacaaa cttacttagt actaataacg aagcactatg gtaagtggca taacatagtg 480
gtattgaagc gaacagtgga tattgaaccc aagcattggc aacatctggc tctgttgata 540
ctgatccgga tcgtttggca ccaattcctg aaacggcgta gtgccaccaa ggtttcgatt 600
tgagaacagg ttcatcatca gagtcaacca ccccaatgtc aatggcaggc tccaacgaag 660
taggtccaac aacaacagga agtatttgac cttgaagatc tgttccttta tgatccacca 720
caccttgccc caattccaat aactttacca gtcccgatgc agacatgata actggtacta 780
atgatctcca ttgattttcg tcggcactac gtaaagcctc caaaaatgaa ttcagaatat 840
cttctgaaac tagattctgc ttctgtgatt caagcattgc tttatgtaga catctcttga 900
ataaaagcaa ttctccacat attggtgtgt gtaagataga tctggaaaga tgtatctgga 960
atagtccagt caacgttgtg caattgatta gcattacctt actgtgaaca tctctatcta 1020
caacaacaga ctcaattcga tagacgttcc gggaaagttt ttcaagcgca ttcagtttgc 1080
tgttgaacaa agtgactttg ctttccaatg tgcaaatacc cctgtatatc aagtccatca 1140
catcactcaa gaccttggtg gaaaagaatg aaacagctgg agcataattt tcgaatgaat 1200
taggtaaggt cacttcatcc ttatctgttg taatgctata atcaatagcg gaactaacat 1260
cttcccatgt aacaggtttc ttgatctctg aatctgaatc tttatttgaa aaagaattga 1320
aaaaagactc atcactcatt gggaattcaa ggtcattagg gtattccatt gttagttctg 1380
gtctaggttt aaagggatca ccttcgttaa gacgatggaa aatagctaat ctgtacaata 1440
accagatact tctaacgaag ctctctctat ccatcagttg acgtgttgag gatatctgaa 1500
ctagctcttt ccactgcgaa tcaggcatgc tcgtatagct ggcaagcatg ttattcagct 1560
ttaccaagtt agaagccctt tggaaaccat ctatagattc ccgaaaaaac ttatacccac 1620
tgagggtttc actgagcata gtcagtgaca tcaaagagca tttcaaatcc atctca 1676
<210> 102
<211> 582
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> NATR ORF
<400> 102
atgggtacca ctcttgacga cacggcttac cggtaccgca ccagtgtccc gggggacgcc 60
gaggccatcg aggcactgga tgggtccttc accaccgaca ccgtcttccg cgtcaccgcc 120
accggggacg gcttcaccct gcgggaggtg ccggtggacc cgcccctgac caaggtgttc 180
cccgacgacg aatcggacga cgaatcggac gacggggagg acggcgaccc ggactcccgg 240
acgttcgtcg cgtacgggga cgacggcgac ctggcgggct tcgtggtcgt ctcgtactcc 300
ggctggaacc gccggctgac cgtcgaggac atcgaggtcg ccccggagca ccgggggcac 360
ggggtcgggc gcgcgttgat ggggctcgcg acggagttcg cccgcgagcg gggcgccggg 420
cacctctggc tggaggtcac caacgtcaac gcaccggcga tccacgcgta ccggcggatg 480
gggttcaccc tctgcggcct ggacaccgcc ctgtacgacg gcaccgcctc ggacggcgag 540
caggcgctct acatgagcat gccctgcccc taatcagtac tg 582
<210> 103
<211> 1029
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> HygR ORF
<400> 103
atgggtaaaa agcctgaact caccgcgacg tctgtcgaga agtttctgat cgaaaagttc 60
gacagcgtct ccgacctgat gcagctctcg gagggcgaag aatctcgtgc tttcagcttc 120
gatgtaggag ggcgtggata tgtcctgcgg gtaaatagct gcgccgatgg tttctacaaa 180
gatcgttatg tttatcggca ctttgcatcg gccgcgctcc cgattccgga agtgcttgac 240
attggggaat tcagcgagag cctgacctat tgcatctccc gccgtgcaca gggtgtcacg 300
ttgcaagacc tgcctgaaac cgaactgccc gctgttctgc agccggtcgc ggaggccatg 360
gatgcgatcg ctgcggccga tcttagccag acgagcgggt tcggcccatt cggaccgcaa 420
ggaatcggtc aatacactac atggcgtgat ttcatatgcg cgattgctga tccccatgtg 480
tatcactggc aaactgtgat ggacgacacc gtcagtgcgt ccgtcgcgca ggctctcgat 540
gagctgatgc tttgggccga ggactgcccc gaagtccggc acctcgtgca cgcggatttc 600
ggctccaaca atgtcctgac ggacaatggc cgcataacag cggtcattga ctggagcgag 660
gcgatgttcg gggattccca atacgaggtc gccaacatct tcttctggag gccgtggttg 720
gcttgtatgg agcagcagac gcgctacttc gagcggaggc atccggagct tgcaggatcg 780
ccgcggctcc gggcgtatat gctccgcatt ggtcttgacc aactctatca gagcttggtt 840
gacggcaatt tcgatgatgc agcttgggcg cagggtcgat gcgacgcaat cgtccgatcc 900
ggagccggga ctgtcgggcg tacacaaatc gcccgcagaa gcgcggccgt ctggaccgat 960
ggctgtgtag aagtactcgc cgatagtgga aaccgacgcc ccagcactcg tccgagggca 1020
aaggaatag 1029
<210> 104
<211> 2957
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> PpPEP4 区
<400> 104
atttgagtca cctgctttag ggctggaaga tatttggtta ctagatttta gtacaaactc 60
ttgctttgtc aatgacatta aaataggcaa gaatcgcaaa actcaaatat ttcatggaga 120
tgagatatgc ttgttcaaag atgcccagaa aaaagagcaa ctcgtttata gggttcatat 180
tgatgatgga acaggccttt tccagggagg tgaaagaacc caagccaatt ctgatgacat 240
tctggatatt gatgaggttg atgaaaagtt aagagaacta ttgacaagag cctcaaggaa 300
acggcatatc acccctgcat tggaaactcc tgataaacgt gtaaaaagag cttatttgaa 360
cagtattact gataactctt gatggacctt aaagatgtat aatagtagac agaattcata 420
atggtgagat taggtaatcg tccggaatag gaatagtggt ttggggcgat taatcgcacc 480
tgccttatat ggtaagtacc ttgaccgata aggtggcaac tatttagaac aaagcaagcc 540
acctttcttt atctgtaact ctgtcgaagc aagcatcttt actagagaac atctaaacca 600
ttttacattc tagagttcca tttctcaatt actgataatc aatttaaaga tgatatttga 660
cggtactacg atgtcaattg ccattggttt gctctctact ctaggtattg gtgctgaagc 720
caaagttcat tctgctaaga tacacaagca tccagtctca gaaactttaa aagaggccaa 780
ttttgggcag tatgtctctg ctctggaaca taaatatgtt tctctgttca acgaacaaaa 840
tgctttgtcc aagtcgaatt ttatgtctca gcaagatggt tttgccgttg aagcttcgca 900
tgatgctcca cttacaaact atcttaacgc tcagtatttt actgaggtat cattaggtac 960
ccctccacaa tcgttcaagg tgattcttga cacaggatcc tccaatttat gggttcctag 1020
caaagattgt ggatcattag cttgcttctt gcatgctaag tatgaccatg atgagtcttc 1080
tacttataag aagaatggta gtagctttga aattaggtat ggatccggtt ccatggaagg 1140
gtatgtttct caggatgtgt tgcaaattgg ggatttgacc attcccaaag ttgattttgc 1200
tgaggccaca tcggagccgg ggttggcctt cgcttttggc aaatttgacg gaattttggg 1260
gcttgcttat gattcaatat cagtaaataa gattgttcct ccaatttaca aggctttgga 1320
attagatctc cttgacgaac caaaatttgc cttctacttg ggggatacgg acaaagatga 1380
atccgatggc ggtttggcca catttggtgg tgtggacaaa tctaagtatg aaggaaagat 1440
cacctggttg cctgtcagaa gaaaggctta ctgggaggtc tcttttgatg gtgtaggttt 1500
gggatccgaa tatgctgaat tgcaaaaaac tggtgcagcc atcgacactg gaacctcatt 1560
gattgctttg cccagtggcc tagctgaaat tctcaatgca gaaattggtg ctaccaaggg 1620
ttggtctggt caatacgctg tggactgtga cactagagac tctttgccag acttaacttt 1680
aaccttcgcc ggttacaact ttaccattac tccatatgac tatactttgg aggtttctgg 1740
gtcatgtatt agtgctttca cccccatgga ctttcctgaa ccaataggtc ctttggcaat 1800
cattggtgac tcgttcttga gaaaatatta ctcagtttat gacctaggca aagatgcagt 1860
aggtttagcc aagtctattt aggcaagaat aaaagttgct cagctgaact tatttggtta 1920
cttatcaggt agtgaagatg tagagaatat atgtttaggt attttttttt agtttttctc 1980
ctataactca tcttcagtac gtgattgctt gtcagctacc ttgacagggg cgcataagtg 2040
atatcgtgta ctgctcaatc aagatttgcc tgctccattg ataagggtat aagagaccca 2100
cctgctcctc tttaaaattc tctcttaact gttgtgaaaa tcatcttcga agcaaattcg 2160
agtttaaatc tatgcggttg gtaactaaag gtatgtcatg gtggtatata gtttttcatt 2220
ttacctttta ctaatcagtt ttacagaaga ggaacgtctt tctcaagatc gaaataggac 2280
taaatactgg agacgatggg gtccttattt gggtgaaagg cagtgggcta cagtaaggga 2340
agactattcc gatgatggag atgcttggtc tgcttttcct tttgagcaat ctcatttgag 2400
aacttatcgc tggggagagg atggactagc tggagtctca gacaatcatc aactaatttg 2460
tttctcaatg gcactgtgga atgagaatga tgatattttg aaggagcgat tatttggggt 2520
cactggagag gctgcaaatc atggagagga tgttaaggag ctttattatt atcttgataa 2580
tacaccttct cactcttata tgaaatacct ttacaaatat ccacaatcga aatttcctta 2640
cgaagaattg atttcagaga accgtaaacg ttccagatta gaaagagagt acgagattac 2700
tgactctgaa gtactgaagg ataacagata ttttgatgtg atctttgaaa tggcaaagga 2760
cgatgaagat gagaatgaac tttactttag aattaccgct tacaaccgag gtcccacccc 2820
tgccccttta catgtcgctc cacaggtaac ctttagaaat acctggtcct ggggtataga 2880
tgaggaaaag gatcacgaca aacctatagc ttgcaaggaa taccaagaca acaactattc 2940
tattcggtta gatagtt 2957
<210> 105
<211> 388
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 棉阿舒囊霉 TEF1 启动子
<400> 105
gatctgttta gcttgcctcg tccccgccgg gtcacccggc cagcgacatg gaggcccaga 60
ataccctcct tgacagtctt gacgtgcgca gctcaggggc atgatgtgac tgtcgcccgt 120
acatttagcc catacatccc catgtataat catttgcatc catacatttt gatggccgca 180
cggcgcgaag caaaaattac ggctcctcgc tgcagacctg cgagcaggga aacgctcccc 240
tcacagacgc gttgaattgt ccccacgccg cgcccctgta gagaaatata aaaggttagg 300
atttgccact gaggttcttc tttcatatac ttccttttaa aatcttgcta ggatacagtt 360
ctcacatcac atccgaacat aaacaacc 388
<210> 106
<211> 247
<212> DNA
<213> 人工序列
<220>
<223> 棉阿舒囊霉 TEF1 终止序列
<400> 106
taatcagtac tgacaataaa aagattcttg ttttcaagaa cttgtcattt gtatagtttt 60
tttatattgt agttgttcta ttttaatcaa atgttagcgt gatttatatt ttttttcgcc 120
tcgacatcat ctgcccagat gcgaagttaa gtgcgcagaa agtaatatca tgcgtcaatc 180
gtatgtgaat gctggtcgct atactgctgt cgattcgata ctaacgccgc catccagtgt 240
cgaaaac 247

Claims (14)

1.一种在巴斯德毕赤氏酵母中生产成熟的人促红细胞生成素的方法，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖，并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性，所述方法包括：
（a） 提供重组巴斯德毕赤氏酵母宿主细胞，其被遗传工程化以生产唾液酸封端的双分枝N-聚糖，并且不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性，并且不展现选自对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性的至少一种活性，并且其包括两种或更多种核酸分子，各自编码包含融合到信号肽的成熟的人促红细胞生成素的融合蛋白，所述信号肽靶向ER并且当所述融合蛋白处于ER中时被除去；
（b） 在对表达和加工所述第一和第二融合蛋白有效的条件下在培养基中生长所述宿主细胞；以及
（c） 从所述培养基回收所述成熟的人促红细胞生成素，来产生所述成熟的人促红细胞生成素，其主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。
2.权利要求1的方法，其中所述宿主细胞不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶2活性、β-甘露糖基转移酶1活性和β-甘露糖基转移酶3活性。
3.权利要求2的方法，其中所述宿主细胞进一步不展现对于N-聚糖或O-聚糖的β-甘露糖基转移酶4活性。
4.权利要求1的方法，其中所述信号肽是酿酒酵母αMATpre信号肽或鸡溶菌酶信号肽。
5.权利要求1的方法，其中至少一种核酸分子编码下述融合蛋白，其中促红细胞生成素融合到酿酒酵母αMATpre信号肽，并且至少一种核酸分子编码下述融合蛋白，其中促红细胞生成素融合到酿酒酵母αMATpre信号肽鸡溶菌酶信号肽。
6.权利要求1的方法，其中编码促红细胞生成素的核酸分子的核酸序列的密码子为了在巴斯德毕赤氏酵母中表达而被优化。
7.权利要求1的方法，其中与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性在夹心ELISA中测定。
8.权利要求1的方法，其中与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性在Western印迹中测定。
9.权利要求1的方法，其中从所述培养基回收所述成熟的人促红细胞生成素包括阳离子交换层析步骤，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。
10.权利要求1的方法，其中从所述培养基回收所述成熟的人促红细胞生成素包括羟磷灰石层析步骤，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。
11.权利要求1的方法，其中从所述培养基回收所述成熟的人促红细胞生成素包括阴离子交换层析步骤，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。
12.一种包含获自权利要求8的方法的成熟的人促红细胞生成素和药学上可接受的盐的组合物，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。
13.权利要求12的组合物，其中所述成熟的人促红细胞生成素共轭到亲水性聚合物，所述成熟的人促红细胞生成素主要包含唾液酸封端的双分枝N-聚糖并且没有与针对宿主细胞抗原制得的抗体的可检测的交叉结合活性。
14.权利要求13的组合物，其中所述亲水性聚合物是聚乙二醇聚合物。
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