CN103160547A - 一种醇脱氢酶在催化生成(r)-4-氯-3羟基丁酸乙酯中的应用 - Google Patents

一种醇脱氢酶在催化生成(r)-4-氯-3羟基丁酸乙酯中的应用 Download PDF

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chloro
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alcohol dehydrogenase
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严明
许琳
顾金海
郝宁
李艳
魏淼
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Abstract

本发明公开了一种氨基酸序列如SEQIDNO:2所示的醇脱氢酶在4-氯乙酰乙酸乙酯不对称还原制备(R)-4-氯-3羟基丁酸乙酯中的应用。即以氨基酸序列如SEQIDNO:2所示的醇脱氢酶为催化剂,以4-氯乙酰乙酸乙酯为底物,以NADH为辅因子,不对称还原制备(R)-4-氯-3羟基丁酸乙酯。本发明首次将氨基酸序列如SEQIDNO:2所示的醇脱氢酶应用于4-氯乙酰乙酸乙酯不对称还原制备(R)-4-氯-3羟基丁酸乙酯中,取得很好的效果,其酶活高达5.6U/mg,其对底物的得率高达94%、产物的对映体过量值为100%,且产量高,大大降低了生产成本。

Description

一种醇脱氢酶在催化生成(R)-4-氯-3羟基丁酸乙酯中的应用
技术领域
本发明属于生物技术领域,涉及一种醇脱氢酶的应用,尤其涉及一种醇脱氢酶(alcohol dehydrogenase)在以4-氯乙酰乙酸乙酯为底物不对称还原反应生产(R)-4-氯-3羟基丁酸乙酯中的应用。 
背景技术
(R)-4-氯-3羟基丁酸乙酯(Ethyl 4-chloro-3-hydroxybutanoate, (R)-CHBE)是一种重要的有机中间体,可用于很多活性药物的合成,如(-)-大内酰亚胺A((-)-macrolactin A)、L-肉碱(L-carnitine)和R-Y-氨基-β-羟基丁酸(GABOB)的关键手性中间体[1,2]。 
以4-氯乙酰乙酸乙酯(4-chloroacetoacetate Ethyl COBE)作为还原反应的潜手性底物,易于合成且价格低廉,以其为底物进行不对称还原反应获取(R)-CHBE是非常经济有效的制备途径。 
迄今为止关于COBE不对称还原制备手性CHBE已进行了很多的研究报道。概括起来主要有化学法和生物法。 
化学催化不对称还原法,所用催化剂包括价格昂贵的铑、釕等金属,采用化学法合成手性CHBE的缺点是产物的光学纯度不够高,且催化还原反应需要很高的氢气压,耗能高,污染大[3]。 
微生物法分为酶催化和全细胞催化法,全细胞法则分为采用野生酵母和基因工程菌催化COBE为(R)-CHBE两种。许多微生物都能还原COBE,但绝大多数微生物的还原产物是S构型的,只有少数微生物能获得R型还原产物,如赭色掷孢酵母(Sporobolomyces salmonicolor) 、麦芽糖假丝酵母(Candida maltosa) 、卡斯太拉德巴利酵母(Debaryomyces castellii)及掷孢圆酵母(Torulaspora nagoyaensis)等,但产物的手性选择性即对映体过量(ee) 值只有8%~63%[4,5]。采用野生酵母进行催化所获得的产物的光学活性往往很低,需要筛选到高立体选择性的优良微生物菌株非常困难,所以近来的研究着重集中于运用重组大肠杆菌不对称合成具有高立体选择性的(R)-CHBE。Hiroaki Yamamoto等[6]将来自于Candida parapsilosis醇脱氢酶基因在大肠杆菌E.coli W3110中表达,重组菌在水相体系中催化COBE不对称还原(辅底物为2-propanol),得到产物(R)-CHBE,光学纯度99% e.e。 Kataoka. M等[7]醛基还原酶基因 (来自Sporobolomyces salmonicolor) 和葡萄糖脱氢酶基因 (来自Bacillus megaterium) 在大肠杆菌中共表达将此转化菌株的细胞用于在水/乙酸正丁酯两相体系中催化COBE的不对称还原。在定期添加辅酶NADP、葡萄糖和底物以及控制 pH 值的条件下,得到在有机相中的产物(R)-CHBE 浓度为268 g/L,摩尔转化率和产物的光学纯度分别为94.1%和91.7% e.e. 。 
综上所述,现有催化COBE为(R)-CHBE的技术存在底物得率低、产物光学活性低、成本高等问题。 
本专利中涉及到的还原酶是醇脱氢酶,其包含336个氨基酸,其在Genbank中的收录号为EEQ43320.1 (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/EEQ43320.1 ),其氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示。编码该蛋白的基因含有1011 bp碱基 ,其在Genbank中的收录号为KC236900,(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/KC236900 )其基因序列如SEQ ID NO:1所示。至今未发现该醇脱氢酶用于COBE不对称还原制备(R)-CHBE的报道。 
  
【参考文献】:
[1] Yan Q Ni, Jian-He Xu . Biocatalytic ketone reduction: A green and efficient access to enantiopure alcohols . Biotechnol Adv (2011)
[2] Ying Liu, Zhinan Xu . Asymmetric reduction of ethyl 4-chloro-3-oxobutanoate to ethyl (R)-4-chloro-3-hydroxybutanoate with two co-existing, recombinant Escherichia
coli strains . Biotechnology Letters (2005) 27: 119–125
[3] Zhou Y -G, Tang W, Wang W-B , Li W, Zhang X. J A m Chem Soc , 2002 , 124 (18) : 4952
[4] ShimizuS, Kataoka M, Kita K. J Mol Catal B, 1998, 5 (124) : 321
[5] Kita K, Kataoka M, ShimizuS. J Biosci Bioeng, 1999, 88(6) : 591
[6] Hiroaki Yamamoto , Akinobu Matsuyama , Yoshinori Kobayashi . Synthesis of ethyl (R)-4-chloro-3-hydroxybutanoate with Recombinant Escherichia coli Cell, 2002 ,66(2),481-483
发明内容
本发明所要解决的技术问题是提供一种醇脱氢酶在COBE不对称还原制备(R)-CHBE中的应用。 
为解决上述技术问题,本发明所采用的技术方案如下: 
一种氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示的醇脱氢酶在4-氯乙酰乙酸乙酯(COBE)不对称还原制备(R)-4-氯-3羟基丁酸乙酯((R)-CHBE)中的应用。
即以氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示的醇脱氢酶为催化剂,以4-氯乙酰乙酸乙酯为底物,不对称还原制备(R)-4-氯-3羟基丁酸乙酯。 
具体反应是将表达基因序列如SEQ ID NO:1所示的重组菌,25~50g/L的4-氯乙酰乙酸乙酯,在pH6.0~7.5、20~30℃、180~280rpm条件下,与200mmol/L~2mol/L异丙醇,反应16~20h,得到(R)-4-氯-3羟基丁酸乙酯。其中,加入异丙醇可生成NADH,且使反应循环进行,降低了加入量以减少了生产成本。 
发明人运用现代生物信息学工具,结合分子生物学技术,采用基因工程的手段从白色念珠菌 Candida albicans克隆醇脱氢酶的基因,在大肠杆菌中表达后发现其在水相中能够高效的催化COBE为(R)-CHBE,e.e值为100%。同时,通过在水相和水/有机相中反应、分批添加底物COBE等方式,解除了底物和产物对细胞和酶的抑制作用,显著的提高了转化效果。通过对醇脱氢酶的基因进行重组表达,获得了具有新型催化功能的酶蛋白,开发了该条基因的新功能——催化非天然底物COBE为高立体选择性的(R)-CHBE。 
有益效果:本发明首次将氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示的醇脱氢酶应用于COBE不对称还原制备(R)-CHBE中,取得很好的效果,其酶活高达5.6U/mg。氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示的醇脱氢酶对底物COBE的得率高(大于90%)、产物CHBE的光学活性高(e.e%为100%),且产量高,大大降低了生产成本。 
附图说明:
图1 为醇脱氢酶基因的构建图。
具体实施方式:
根据下述实施例,可以更好地理解本发明。然而,本领域的技术人员容易理解,实施例所描述的具体的物料配比、工艺条件及其结果仅用于说明本发明,而不应当也不会限制权利要求书中所详细描述的本发明。
  
实施例1:重组大肠杆菌E.coli Rosetta(pET-22b-CA)
1、醇脱氢酶基因的获取
白色念珠菌 Candida albicans(购于 Centraalbureauvoor Schimmelcultures (CBS) Fungal Biodiversiry Centre),培养基YPD(g·L-1):酵母提取物10g,蛋白胨20g,葡萄糖20g,补蒸馏水至1L。
将白色念珠菌 Candida albicans接种于5mL YPD液体培养基中30℃培养至对数生长期,使用基因组DNA提取试剂盒(北京天为生物工程有限公司酵母基因组提取试剂盒,GD2415 Yeast gDNA Kit)提取基因组。 
构建表达载体所用的引物加设酶切位点,引物序列如下: 
上游引物(CA-sense含NdeI)为:5'- GGAATTC CATATGTCAATTCCATCTACTCAGTACG -3'
下游引物(CA-anti含BamHI)为:5'- CGC GGATCCTTATGGATTAAACACGACTCTTCCT -3'
所有引物均由美吉生物公司合成。
基因的PCR条件: 
94 ℃变性7 min,按如下参数循环30次:94 ℃变性1 min,60 ℃退火50 s,72 ℃延伸1.5 min。最后72 ℃延伸10 min。
  
2、表达载体的构建
用Nde I 及BamH I分别酶切pET-22b (pET-22b购于Novagen(默克中国))及所扩增含有两个酶切位点的目的基因,分别胶回收已双酶切的目的片段和表达载体,将已双酶切的表达载体pET-22b与目的基因用T4连接酶进行连接过夜, 将10 uL的连接产物pET-22b-CA加入100uL的Rosetta(DE3)感受态细胞中,冰上放置30 min,42 ℃热激90 sec。冰上放置2min。加入预热的0.45mL LB。220 rpm 37℃ 1h。将200 uL菌液加入分别含有100 μg/mL的氨苄青霉素和34μg/mL氯霉素的LB平板上,37℃过夜培养12-16,得到重组菌E.coli Rosseta(含pET-22b-CADH)。构建图谱见图1。
  
3、酶活的测定
挑取重组菌E.coli Rosseta(pET-22b-CA)及出发大肠杆菌Rosseta(DE3)至含100μg/mL氨苄青霉素和34μg/mL氯霉素的LB液体培养基中,37℃振荡培养过夜。然后按2 %接种量分别接种到含100μg/mL氨苄青霉素和34μg/mL氯霉素的LB新鲜培养基中,37 ℃培养至OD600约为0.6时,加入IPTG至终浓度0.8 mmol·L-1,25℃,220rpm,诱导表达10 h后,离心(4℃,5000rpm,15min),菌泥用100mM磷酸纳缓冲(pH7.0)重悬,超声破碎细胞(功率300W,超声5s,间歇5s,共5min),离心(4℃,12000rpm,15min),测定上清中的酶活。
酶反应体系包括100mM 磷酸钠缓冲液(pH7.0),5mM NADH,20mM COBE,30℃,340nm处测定吸光值的下降。酶活定义为每分钟内氧化1μmol NADH所需要的酶量为一个酶活单位U。蛋白采用Brandford法进行测定。 
结果显示,出发大肠杆菌Rosseta(DE3)的比酶活为0.12U/mg protein,而重组菌E.coli Rosseta(pET22b-CA)的比酶活为5.6U/mg protein。 
  
实施例2:重组大肠杆菌E.coli Rosseta(pET22b-CA)的发酵
挑取重组菌E.coli Rosseta(pET-22b-CA)至含抗生素的LB培养液,37℃振荡培养过夜。然后按2 %接种量分别接种到新鲜培养液中,37 ℃培养至OD600约为0.6时,加入IPTG至终浓度0.8 mmol·L-1,25℃,220rpm,诱导表达10 h后,8000 rpm,4 ℃离心10 min,弃上清,沉淀备用。
  
实施例3:
取实施例2的沉淀用磷酸钠缓冲(100 mmol·L-1, pH 6.5)洗涤两次,称取2g(湿重)的大肠杆菌菌泥,悬浮于总体系25 mL的反应液中(pH 6.5磷酸钾缓冲与醋酸丁酯体积比为1:1)。加入异丙醇150mmol/L,COBE 25g/L,30℃,180rpm,12h。产物(R)-CHBE的产量为20.5 g/L,产物的得率为:82%,光学纯度e.e%为100%。
产物的检测方法如下(以下实施例中产物的检测方法和实施例3相同): 
对于水相反应:反应结束后, 8000 rpm离心10 min分离有机层和水层。小心吸取上层乙酸乙酯过有机膜,加入内标,保存测样。
对于水/有机两相反应:反应结束后8000 rpm离心10 min分离有机层和水层。小心吸取上层乙酸乙酯过有机膜,保存测样。 
检测产物旋光性的样品处理(乙酰化):取5-10 ul 样品,加入乙酸酐0.2 mL,无水吡啶0.1mL,密闭条件下沸水浴中保持l h,冷却至室温,加入l mL乙酸乙酯,用水洗涤两次(每次l mL),然后用同样体积的饱和食盐水洗涤两次,分出有机层用无水硫酸钠干燥过夜。 
测定COBE和CHB浓度以及产物的旋光性都使用气相7820A(Agilent)进行检测。测定COBE和CHB浓度,色谱柱为PEG-20M 毛细管柱(HP-FFAP;30m×0.32mm×0.25mm;Agilent),检测器FID温度220℃,汽化室温度220℃,柱温130℃。对产物的旋光性进行分析,色谱柱CP-Chirasil-Dex CB (25m*25mm*25um;Aglilent),检测器FID温度250℃,汽化室温度250℃,柱温120℃,R型和S型CHBE的出峰时间分别为:16.813min和17.413min。 
  
实施例4:
取实施例2的沉淀用磷酸钠缓冲(100 mmol·L-1, pH 6.5)洗涤两次,称取5g(湿重)的大肠杆菌菌泥,悬浮于总体系25 mL的反应液中(pH 6.5磷酸钾缓冲)。加入异丙醇150mmol/L,COBE 25g/L,30℃,180rpm,12h。产物(R)-CHBE的产量为23.5 g/L,产物的得率为:94%,光学纯度e.e%为100%。
  
实施例5:
取实施例2的沉淀用磷酸钠缓冲(100 mmol·L-1, pH 6.5)洗涤两次,称取5g(湿重)的大肠杆菌菌泥,悬浮于总体系25 mL的反应液中(pH 6.5磷酸钾缓冲与醋酸丁酯体积比为1:1)。加入异丙醇300mmol/L,COBE 50g/L,30℃,180rpm,12h。产物(R)-CHBE的产量为37.2g/L,产物的得率为:74.3%,光学纯度e.e%为100%。
  
实施例6:
取实施例4的沉淀用磷酸钠缓冲(100 mmol·L-1, pH 7.0)洗涤两次,称取2g(湿重)的大肠杆菌菌泥,悬浮于15 mL的pH 7.0磷酸钠缓冲中。超声处理细胞(功率300W,超声5s,间歇5s,共5min),加入葡萄糖500mmol/L,COBE 50g/L(0h、2h、4h、6h、10h各10g/L ),GDH 200U,NAD 0.1mmol/L,25℃,220rpm,16h。产物(R)-CHBE的产量为46.5g/L,产物的得率为:93%,光学纯度e.e%为100%。
  
实施例7:
取实施例4的沉淀用磷酸钠缓冲(100 mmol·L-1, pH 7.0)洗涤两次,称取2g(湿重)的大肠杆菌菌泥,悬浮于15 mL的pH 7.0磷酸钠缓冲中。超声处理细胞(功率300W,超声5s,间歇5s,共5min),加入甲酸钠 500mmol/L,COBE 50g/L(0、2、4、6、10h各10g/L ),FDH 200U,NAD 0.1mmol/L,25℃,220rpm,16h。产物(R)-CHBE的产量为43.8g/L,产物的得率为:87.6%,光学纯度e.e%为100%。
  
<110>  南京工业大学
 
<120>  一种醇脱氢酶在催化生成(R)-4-氯-3-羟基丁酸乙酯中的应用
 
<130>  njut080822
 
<140>  2012-10-29
<141>  2012-10-29
 
<160>  2    
 
<170>  PatentIn version 3.5
 
<210>  1
<211>  1011
<212>  DNA
<213>  Candida albicans
 
<313>  (1)..(3)
 
<400>  1
atgtcaattc catctactca gtacggattt ttttataata aagctagtgg tcttaacttg       60
 
aaaaaagact tgccggttaa caagccaggt gctggtcaat tgcttttaaa ggttgatgca      120
 
gttggccttt gtcattcaga tttacatgtt ctctatgaag gtttggattg tggtgataat      180
 
tatgtgatgg gccacgaaat tgctgggact gttgctgaac taggtgaaga ggtgagtgag      240
 
tttgcagttg gagatcgtgt cgcttgtgtc ggccccaatg gatgtggtct ttgtaaacac      300
 
tgtcttactg gtaacgataa tgtttgtacc aagtcgtttt tggattggtt tggattgggt      360
 
tacaatggag gttacgagca attcttgtta gtcaagagac caagaaactt ggtcaagatc      420
 
cctgacaatg ttacttccga ggaagctgca gctattacgg atgccgtatt gactccttac      480
 
catgctatca agtctgcagg tgttggtcca gcaagtaata tattaattat cggagctggt      540
 
ggattaggag gtaacgctat tcaagttgca aaagcatttg gtgcgaaggt tactgttttg      600
 
gataaaaagg ataaggcaag agaccaagct aaggcctttg gagctgacca ggtttacagt      660
 
gaattaccag acagcgtttt acctgggtca ttcagtgctt gttttgattt tgtttcggtt      720
 
caggcaacat acgatttgtg tcaaaagtat tgtgagccaa agggtactat tgttcccgta      780
 
ggtctaggtg caacttcgct taacataaat cttgctgatt tagatcttcg tgaaattacc      840
 
gtcaagggct cattctgggg taccctgatg gacttaagag aagcatttga attggctgca      900
 
cagggaaagg tcaaaccaaa tgttgctcat gctccattgt cagaattgcc taagtatatg      960
 
gagaagttga gagccggtgg ttatgaagga agagtcgtgt ttaatccata a              1011
 
 
<210>  2
<211>  336
<212>  PRT
<213>  Candida albicans
 
<400>  2
 
Met Ser Ile Pro Ser Thr Gln Tyr Gly Phe Phe Tyr Asn Lys Ala Ser
1               5                   10                  15     
 
 
Gly Leu Asn Leu Lys Lys Asp Leu Pro Val Asn Lys Pro Gly Ala Gly
            20                  25                  30         
 
 
Gln Leu Leu Leu Lys Val Asp Ala Val Gly Leu Cys His Ser Asp Leu
        35                  40                  45             
 
 
His Val Leu Tyr Glu Gly Leu Asp Cys Gly Asp Asn Tyr Val Met Gly
    50                  55                  60                 
 
 
His Glu Ile Ala Gly Thr Val Ala Glu Leu Gly Glu Glu Val Ser Glu
65                  70                  75                  80 
 
 
Phe Ala Val Gly Asp Arg Val Ala Cys Val Gly Pro Asn Gly Cys Gly
                85                  90                  95     
 
 
Leu Cys Lys His Cys Leu Thr Gly Asn Asp Asn Val Cys Thr Lys Ser
            100                 105                 110        
 
 
Phe Leu Asp Trp Phe Gly Leu Gly Tyr Asn Gly Gly Tyr Glu Gln Phe
        115                 120                 125            
 
 
Leu Leu Val Lys Arg Pro Arg Asn Leu Val Lys Ile Pro Asp Asn Val
    130                 135                 140                
 
 
Thr Ser Glu Glu Ala Ala Ala Ile Thr Asp Ala Val Leu Thr Pro Tyr
145                 150                 155                 160
 
 
His Ala Ile Lys Ser Ala Gly Val Gly Pro Ala Ser Asn Ile Leu Ile
                165                 170                 175    
 
 
Ile Gly Ala Gly Gly Leu Gly Gly Asn Ala Ile Gln Val Ala Lys Ala
            180                 185                 190        
 
 
Phe Gly Ala Lys Val Thr Val Leu Asp Lys Lys Asp Lys Ala Arg Asp
        195                 200                 205            
 
 
Gln Ala Lys Ala Phe Gly Ala Asp Gln Val Tyr Ser Glu Leu Pro Asp
    210                 215                 220                
 
 
Ser Val Leu Pro Gly Ser Phe Ser Ala Cys Phe Asp Phe Val Ser Val
225                 230                 235                 240
 
 
Gln Ala Thr Tyr Asp Leu Cys Gln Lys Tyr Cys Glu Pro Lys Gly Thr
                245                 250                 255    
 
 
Ile Val Pro Val Gly Leu Gly Ala Thr Ser Leu Asn Ile Asn Leu Ala
            260                 265                 270        
 
 
Asp Leu Asp Leu Arg Glu Ile Thr Val Lys Gly Ser Phe Trp Gly Thr
        275                 280                 285            
 
 
Ser Met Asp Leu Arg Glu Ala Phe Glu Leu Ala Ala Gln Gly Lys Val
    290                 295                 300                 
 
 
Lys Pro Asn Val Ala His Ala Pro Leu Ser Glu Leu Pro Lys Tyr Met
305                 310                 315                 320
 
 
Glu Lys Leu Arg Ala Gly Gly Tyr Glu Gly Arg Val Val Phe Asn Pro
                325                 330                 335    
 
 
 

Claims (3)

1.一种醇脱氢酶在4-氯乙酰乙酸乙酯不对称还原制备(R)-4-氯-3羟基丁酸乙酯中的应用,其特征在于以氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示的醇脱氢酶为催化剂,以4-氯乙酰乙酸乙酯为底物,以NADH为辅因子,不对称还原制备(R)-4-氯-3羟基丁酸乙酯。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于以氨基酸序列如SEQ ID NO:2所示的醇脱氢酶为催化剂,以4-氯乙酰乙酸乙酯为底物,以NADH为辅因子,醇脱氢酶的酶活为5.6U/mg protein。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于表达基因序列如SEQ ID NO:1所示的重组菌,与200mmol/L~300mmol/L 异丙醇、1.5~50g/L的4-氯乙酰乙酸乙酯,在pH6.0~7.5、20~30℃、180~280rpm条件下反应16~20h,得到(R)-4-氯-3羟基丁酸乙酯。
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