CN102866038A - 血斑标本采集和处理方法及其采集卡干血斑dna提取方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了一种血斑标本采集和处理方法及其采集卡干血斑DNA提取方法。所述血斑标本采集和处理方法,包括以下步骤:(1)采血;(2)采集卡血斑处理;(3)采集卡干血斑的保存;(4)采集卡干血斑的递送。本发明的血斑标本可在常温保存,耐运输,方便送检,可代替抗凝全血作为基因诊断的DNA提取标本。
Description
技术领域
本发明涉及生物技术领域,具体是一种血斑标本采集和处理方法及其采集卡干血斑DNA提取方法。
背景技术
目前,用于地中海贫血基因诊断的DNA是从抗凝全血中提取的。该方法用柠檬酸钠或EDTA抗凝管保存静脉血,需在-20℃冰箱中低温保存,不耐运输,送检不方便。因些,急需一种方便运输的样本采集方法和高提取率的DNA提取方法。
发明内容
本发明的目的是为了解决上述问题,提供一种血斑标本采集和处理方法及其采集卡干血斑DNA提取方法。
本发明是通过以下技术方案实现的:
一种血斑标本采集和处理方法,包括以下步骤:
(1)采血
()用热毛巾温浴采血部位:不超过41℃,3~5分钟;
上述婴儿采血,6周~4月或小于5kg的婴儿采用脚后跟采血法; 4~10月或5~10kg的婴儿采用脚大拇指采血;大于10月或大于10kg的婴儿采用手指采血;
上述静脉采血用于婴儿之外的人群;
(2)采集卡血斑处理
血样采集完毕后,将制成的采集卡在干燥桌面放置3~4小时风干,形成干血斑,不要放在太阳下晾晒或用任何人工方法(如烘干机)加速干燥;
(3)采集卡干血斑的保存
采集卡风干后,将每张采集卡分装入封口袋中,并在封口袋中放入干燥剂,轻轻将封口袋的空气挤压出去在封口,遵循一袋一卡的原则,以避免交叉污染;
(4)采集卡干血斑的递送
准确填写样本信息卡后,将采集卡和信息卡一同放入大信封,采用常温运输。
上述采集卡干血斑DNA提取方法,包括以下步骤:
(1)将采集卡上的2个或以上血斑用打孔器打孔3*3mm(或将圆形的血斑剪下后,剪为约3*3mm的样品),置于1.5ml离心管中;
(2)加入300~400ul的Tissue Lysis Buffer,加入20ul蛋白酶K,震荡混匀;
(3)56℃温浴1h,期间颠倒混匀3~5次;
(4)取200ul上清液转入新的1.5ml离心管中,加入200ul的溶液L,70℃温浴10min,期间颠倒2~3次;
(5)加入200ul 4℃的无水乙醇,室温放置5min;
(6)将液体转入带硅胶柱的2ml离心管中,10000rpm离心1min,倒掉离心管的收集管中的废液,将硅胶柱放入收集管中;
(7)在硅胶柱中加入500ul溶液W1,10000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,将硅胶柱放入收集管中;
(8)在硅胶柱中加入500ul溶液W2,10000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液;
(9)重复步聚8;
(10)将硅胶柱放入收集管中,12000rpm空管离心3min,倒掉收集管中的废液;
(11)将硅胶柱放入新的1.5ml离心管中,开盖静置1~2min,往硅胶柱中心加入60ul的TE洗脱液,静置2~5min,12000rpm离心2min,弃柱得DNA;
所述溶液L为含有10% GuSCN、10% Tris的水溶液,溶液W1为含有10%GuSCN、1%EDTA、25%无水乙醇的水溶液,溶液W2为含有75%无水乙醇的水溶液,TE洗脱液为含有1%Tris、1%EDTA的水溶液,以上溶液除无水乙醇是体积浓度外,其他的皆为质量百分比浓度。
本发明采用过柱法的提取DNA,操作简单,快速省时,获得的DNA纯度高。血斑标本可在常温保存,耐运输,方便送检,可代替抗凝全血作为基因诊断的DNA提取标本。
附图说明
图1为本发明所采用的血样标本采集卡。
图2为采集卡干血斑。
具体实施方式
以下通过实施例对本发明进行详细的说明。
实施例:
一、对22个成年人进行本发明的血斑标本采集和处理
1. 静脉采血:用柠檬酸钠抗凝管静脉血,采集的抗凝全血用移液器移取80ul全血,对准如图1所示的血样标本采集卡采血圈中心缓慢将血液滴加在采集卡上,形成血斑,避免气泡产生;采集3个血圈;
2. 采集卡血斑处理
血样采集完毕后,将制成的采集卡在干燥桌面放置4小时风干,形成如图2所示的干血斑;
3. 采集卡干血斑的保存
采集卡风干后,将每张采集卡分装入封口袋中,并在封口袋中放入干燥剂,轻轻将封口袋的空气挤压出去在封口,遵循一袋一卡的原则,以避免交叉污染;
4. 采集卡干血斑的递送
准确填写样本信息卡后,将采集卡和信息卡一同放入大信封,采用常温运输。
上述采集卡干血斑DNA提取:
1. 将采集卡上的2个圆形的血斑剪下后,剪为3*3mm的样品,置于1.5ml离心管中(每处理完一个样本后,剪刀均需用75%乙醇擦拭,晾干后在酒精灯上烧热);
2. 加入300ul的Tissue Lysis Buffer,加入20ul蛋白酶K,震荡混匀;
3. 56℃温浴1h,期间颠倒混匀4次;
4. 取200ul上清液转入新的1.5ml离心管中,加入200ul的溶液L,70℃温浴10min,期间颠倒3次;
5. 加入200ul 4℃的无水乙醇,室温放置5min;
6. 将液体转入带硅胶柱的2ml离心管中,10000rpm离心1min,倒掉离心管的收集管中的废液,将硅胶柱放入收集管中;
7. 在硅胶柱中加入500ul溶液W1(使用前先检查是否加入无水乙醇),10000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,将硅胶柱放入收集管中;
8. 在硅胶柱中加入500ul溶液W2(使用前先检查是否加入无水乙醇),10000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液;
9. 重复步聚8;
10. 将硅胶柱放入收集管中,12000rpm空管离心3min,倒掉收集管中的废液;
11. 将硅胶柱放入新的1.5ml离心管中,开盖静置2min,往硅胶柱中心加入60ul的TE洗脱液(55℃预热),静置5min,12000rpm离心2min,弃柱得血斑DNA。
二、对上述22个成年人进行传统的抗凝全血DNA采集和处理
使用传统检测手段对同样的22个成年人进行抗凝全血DNA的采集和处理,得到抗凝全血DNA。
三、样品检测
将上述提取的血斑DNA和抗凝全血DNA采用潮州凯普生物化学有限公司生产的α-和β-地中海贫血基因检测试剂盒进行地贫基因检测。
22例抗凝全血DNA和血斑DNA的地贫基因检测结果如下:
序号 | 样本编号 | 抗凝全血DNA地贫基因检测结果 | 血斑DNA地贫基因检测结果 |
1 | A22 | αα/αα,β41-42/βA | αα/αα,β41-42/βA |
2 | A24 | αα/αα,βA/βA | αα/αα,βA/βA |
3 | A26 | -α3.7/-α3.7,βA/βA | -α3.7/-α3.7,βA/βA |
4 | A27 | αα/αα,β654/βA | αα/αα,β654/βA |
5 | A28 | -α3.7/ααQS,βA/βA | -α3.7/ααQS,βA/βA |
6 | A30 | --SEA/αα,βA/βA | --SEA/αα,βA/βA |
7 | A32 | -α4.2/αα,βA/βA | -α4.2/αα,βA/βA |
8 | A36 | αα/αα,β71-72/βA | αα/αα,β71-72/βA |
9 | A37 | αα/αα,β41-42/βA | αα/αα,β41-42/βA |
10 | A40 | -α3.7/αα,βA/βA | -α3.7/αα,βA/βA |
11 | A41 | αα/αα,β71-72/βA | αα/αα,β71-72/βA |
12 | A46 | --SEA/-α4.2,βA/βA | --SEA/-α4.2,βA/βA |
13 | A47 | -α3.7/αα,βA/βA | -α3.7/αα,βA/βA |
14 | A51 | -α4.2/αα,βA/βA | -α4.2/αα,βA/βA |
15 | A52 | --SEA/αα,βA/βA | --SEA/αα,βA/βA |
16 | A54 | -α4.2/-α4.2,βA/βA | -α4.2/-α4.2,βA/βA |
17 | A60 | -α4.2/αα,βA/βA | -α4.2/αα,βA/βA |
18 | A63 | --SEA/αα,βA/βA | --SEA/αα,βA/βA |
19 | A64 | αα/αα,βA/βA | αα/αα,βA/βA |
20 | A66 | αα/αα,β41-42/βA | αα/αα,β41-42/βA |
21 | A67 | -α4.2/αα,βA/βA | -α4.2/αα,βA/βA |
22 | A74 | -α4.2/αα,βA/βA | -α4.2/αα,βA/βA |
22例血样的地贫基因检测结果:14例为α-地中海贫血,6例为β-地中海贫血,2例为正常。血斑DNA的检测结果与抗凝全血DNA的检测结果完全一致。
上述实验结果说明,血斑DNA与抗凝全血DNA的基因检测结果在灵敏度和特异度方面具有很高的一致性,同时血斑标本具有易保存、易运输的优点,更适合于样本送检和基因谱查。
Claims (2)
1.一种血斑标本采集和处理方法,包括以下步骤:
(1)采血
上述婴儿采血,6周~4月或小于5kg的婴儿采用脚后跟采血法; 4~10月或5~10kg的婴儿采用脚大拇指采血;大于10月或大于10kg的婴儿采用手指采血;
上述静脉采血用于婴儿之外的人群;
(2)采集卡血斑处理
血样采集完毕后,将制成的采集卡在干燥桌面放置3~4小时风干,形成干血斑;
(3)采集卡干血斑的保存
采集卡风干后,将每张采集卡分装入封口袋中,并在封口袋中放入干燥剂,轻轻将封口袋的空气挤压出去在封口,遵循一袋一卡的原则,以避免交叉污染;
(4)采集卡干血斑的递送
准确填写样本信息卡后,将采集卡和信息卡一同放入大信封,采用常温运输。
2.权利要求1所述采集卡干血斑DNA提取方法,包括以下步骤:
(1)将采集卡上的2个或以上血斑用打孔器打孔3*3mm,或将圆形的血斑剪下后,剪为3*3mm的样品,置于1.5ml离心管中;
(2)加入300~400ul的Tissue Lysis Buffer,加入20ul蛋白酶K,震荡混匀;
(3)56℃温浴1h,期间颠倒混匀3~5次;
(4)取200ul上清液转入新的1.5ml离心管中,加入200ul的溶液L,70℃温浴10min,期间颠倒2~3次;
(5)加入200ul 4℃的无水乙醇,室温放置5min;
(6)将液体转入带硅胶柱的2ml离心管中,10000rpm离心1min,倒掉离心管的收集管中的废液,将硅胶柱放入收集管中;
(7)在硅胶柱中加入500ul溶液W1,10000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液,将硅胶柱放入收集管中;
(8)在硅胶柱中加入500ul溶液W2,10000rpm离心1min,倒掉收集管中的废液;
(9)重复步聚8;
(10)将硅胶柱放入收集管中,12000rpm空管离心3min,倒掉收集管中的废液;
(11)将硅胶柱放入新的1.5ml离心管中,开盖静置1~2min,往硅胶柱中心加入60ul的TE洗脱液,静置2~5min,12000rpm离心2min,弃柱得DNA;
所述溶液L为含有10% GuSCN、10% Tris的水溶液,溶液W1为含有10%GuSCN、1%EDTA、25%无水乙醇的水溶液,溶液W2为含有75%无水乙醇的水溶液,TE洗脱液为含有1%Tris、1%EDTA的水溶液,以上溶液除无水乙醇是体积浓度外,其他的皆为质量百分比浓度。
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