CN102584956B - 一种慢性乙型病毒性肝炎相关基因ifna2的新突变蛋白、编码基因及其应用 - Google Patents
一种慢性乙型病毒性肝炎相关基因ifna2的新突变蛋白、编码基因及其应用 Download PDFInfo
- Publication number
- CN102584956B CN102584956B CN201210031358.1A CN201210031358A CN102584956B CN 102584956 B CN102584956 B CN 102584956B CN 201210031358 A CN201210031358 A CN 201210031358A CN 102584956 B CN102584956 B CN 102584956B
- Authority
- CN
- China
- Prior art keywords
- gene
- viral hepatitis
- chronic viral
- ifna
- ifna2
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Expired - Fee Related
Links
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 title claims abstract description 56
- 230000001684 chronic effect Effects 0.000 title claims abstract description 30
- 101000959794 Homo sapiens Interferon alpha-2 Proteins 0.000 title claims abstract description 15
- 206010019799 Hepatitis viral Diseases 0.000 title abstract 5
- 201000001862 viral hepatitis Diseases 0.000 title abstract 5
- 102100040018 Interferon alpha-2 Human genes 0.000 claims abstract description 10
- 230000035772 mutation Effects 0.000 claims abstract description 9
- QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N L-alanine Chemical compound C[C@H](N)C(O)=O QNAYBMKLOCPYGJ-REOHCLBHSA-N 0.000 claims abstract description 7
- AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N Threonine Natural products CC(O)C(N)C(O)=O AYFVYJQAPQTCCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims abstract description 7
- 239000004473 Threonine Substances 0.000 claims abstract description 7
- 235000004279 alanine Nutrition 0.000 claims abstract description 4
- 208000002672 hepatitis B Diseases 0.000 claims description 36
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims description 8
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims description 8
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 abstract description 9
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 abstract description 9
- 238000001514 detection method Methods 0.000 abstract description 8
- 150000001413 amino acids Chemical group 0.000 abstract description 7
- 238000000034 method Methods 0.000 abstract description 7
- 238000011282 treatment Methods 0.000 abstract description 4
- 238000003745 diagnosis Methods 0.000 abstract description 3
- 206010008909 Chronic Hepatitis Diseases 0.000 abstract description 2
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 abstract description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract description 2
- 208000006454 hepatitis Diseases 0.000 abstract description 2
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 abstract description 2
- 101150028074 2 gene Proteins 0.000 abstract 2
- 238000009007 Diagnostic Kit Methods 0.000 abstract 2
- 229940079593 drug Drugs 0.000 abstract 1
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 abstract 1
- 230000008859 change Effects 0.000 description 19
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 16
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 15
- 238000012163 sequencing technique Methods 0.000 description 15
- 239000000047 product Substances 0.000 description 13
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 11
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 10
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 10
- 208000000419 Chronic Hepatitis B Diseases 0.000 description 9
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 9
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 8
- 102200093882 rs3810950 Human genes 0.000 description 7
- 239000000523 sample Substances 0.000 description 7
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 7
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 5
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 5
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 4
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 4
- 229940124872 Hepatitis B virus vaccine Drugs 0.000 description 4
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 4
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 4
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 4
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 4
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 4
- 230000004044 response Effects 0.000 description 4
- 108050009160 DNA polymerase 1 Proteins 0.000 description 3
- 241000238557 Decapoda Species 0.000 description 3
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 3
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 3
- 206010064571 Gene mutation Diseases 0.000 description 3
- 241000700721 Hepatitis B virus Species 0.000 description 3
- 101100333990 Xenopus laevis exo1 gene Proteins 0.000 description 3
- 239000012295 chemical reaction liquid Substances 0.000 description 3
- 229960000935 dehydrated alcohol Drugs 0.000 description 3
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 3
- 239000000284 extract Substances 0.000 description 3
- 239000011888 foil Substances 0.000 description 3
- 206010073071 hepatocellular carcinoma Diseases 0.000 description 3
- 231100000844 hepatocellular carcinoma Toxicity 0.000 description 3
- 238000011337 individualized treatment Methods 0.000 description 3
- 230000000873 masking effect Effects 0.000 description 3
- 230000000869 mutational effect Effects 0.000 description 3
- 238000011160 research Methods 0.000 description 3
- 238000007789 sealing Methods 0.000 description 3
- 238000011144 upstream manufacturing Methods 0.000 description 3
- BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N Dihydrogen disulfide Chemical compound SS BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 101100256910 Drosophila melanogaster sick gene Proteins 0.000 description 2
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- 238000012408 PCR amplification Methods 0.000 description 2
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 2
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 2
- 230000004087 circulation Effects 0.000 description 2
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 2
- 239000011259 mixed solution Substances 0.000 description 2
- 239000000843 powder Substances 0.000 description 2
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 2
- 239000011541 reaction mixture Substances 0.000 description 2
- 229960004249 sodium acetate Drugs 0.000 description 2
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 2
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 2
- 238000001179 sorption measurement Methods 0.000 description 2
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 2
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 2
- KQFRUSHJPKXBMB-BHDSKKPTSA-N Ala-Ala-Trp Chemical compound C1=CC=C2C(C[C@H](NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)C)C(O)=O)=CNC2=C1 KQFRUSHJPKXBMB-BHDSKKPTSA-N 0.000 description 1
- CRWFEKLFPVRPBV-CIUDSAMLSA-N Ala-Gln-Met Chemical compound [H]N[C@@H](C)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O CRWFEKLFPVRPBV-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- IYKVSFNGSWTTNZ-GUBZILKMSA-N Ala-Val-Arg Chemical compound C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N IYKVSFNGSWTTNZ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- VKKYFICVTYKFIO-CIUDSAMLSA-N Arg-Ala-Glu Chemical compound OC(=O)CC[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@@H](N)CCCN=C(N)N VKKYFICVTYKFIO-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- GXXWTNKNFFKTJB-NAKRPEOUSA-N Arg-Ile-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O GXXWTNKNFFKTJB-NAKRPEOUSA-N 0.000 description 1
- RYQSYXFGFOTJDJ-RHYQMDGZSA-N Arg-Thr-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O RYQSYXFGFOTJDJ-RHYQMDGZSA-N 0.000 description 1
- UGXVKHRDGLYFKR-CIUDSAMLSA-N Asn-Asp-Leu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](CC(O)=O)NC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O UGXVKHRDGLYFKR-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- QPTAGIPWARILES-AVGNSLFASA-N Asn-Gln-Phe Chemical compound [H]N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(O)=O QPTAGIPWARILES-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- MFMJRYHVLLEMQM-DCAQKATOSA-N Asp-Arg-His Chemical compound C1=C(NC=N1)C[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCCN=C(N)N)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N MFMJRYHVLLEMQM-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- XDGBFDYXZCMYEX-NUMRIWBASA-N Asp-Glu-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)NC(=O)[C@H](CC(=O)O)N)O XDGBFDYXZCMYEX-NUMRIWBASA-N 0.000 description 1
- QJHOOKBAHRJPPX-QWRGUYRKSA-N Asp-Phe-Gly Chemical compound OC(=O)C[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)NCC(O)=O)CC1=CC=CC=C1 QJHOOKBAHRJPPX-QWRGUYRKSA-N 0.000 description 1
- 208000035473 Communicable disease Diseases 0.000 description 1
- OJQJUQUBJGTCRY-WFBYXXMGSA-N Cys-Ala-Trp Chemical compound C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CC1=CNC2=CC=CC=C21)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N OJQJUQUBJGTCRY-WFBYXXMGSA-N 0.000 description 1
- UCSXXFRXHGUXCQ-SRVKXCTJSA-N Cys-Leu-Lys Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)N UCSXXFRXHGUXCQ-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- NDNZRWUDUMTITL-FXQIFTODSA-N Cys-Ser-Val Chemical compound [H]N[C@@H](CS)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(O)=O NDNZRWUDUMTITL-FXQIFTODSA-N 0.000 description 1
- 108010090461 DFG peptide Proteins 0.000 description 1
- 238000007400 DNA extraction Methods 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- AJDMYLOISOCHHC-YVNDNENWSA-N Gln-Gln-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O AJDMYLOISOCHHC-YVNDNENWSA-N 0.000 description 1
- KVXVVDFOZNYYKZ-DCAQKATOSA-N Gln-Gln-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KVXVVDFOZNYYKZ-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- IHSGESFHTMFHRB-GUBZILKMSA-N Gln-Lys-Ala Chemical compound OC(=O)[C@H](C)NC(=O)[C@H](CCCCN)NC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O IHSGESFHTMFHRB-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- IOUQWHIEQYQVFD-JYJNAYRXSA-N Glu-Leu-Tyr Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=C(O)C=C1)C(O)=O IOUQWHIEQYQVFD-JYJNAYRXSA-N 0.000 description 1
- LKOAAMXDJGEYMS-ZPFDUUQYSA-N Glu-Met-Ile Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(O)=O LKOAAMXDJGEYMS-ZPFDUUQYSA-N 0.000 description 1
- YRMZCZIRHYCNHX-RYUDHWBXSA-N Glu-Phe-Gly Chemical compound [H]N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)NCC(O)=O YRMZCZIRHYCNHX-RYUDHWBXSA-N 0.000 description 1
- LWYUQLZOIORFFJ-XKBZYTNZSA-N Glu-Thr-Cys Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)N[C@@H](CS)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N)O LWYUQLZOIORFFJ-XKBZYTNZSA-N 0.000 description 1
- RGJKYNUINKGPJN-RWRJDSDZSA-N Glu-Thr-Ile Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H]([C@@H](C)O)NC(=O)[C@H](CCC(=O)O)N RGJKYNUINKGPJN-RWRJDSDZSA-N 0.000 description 1
- SOYWRINXUSUWEQ-DLOVCJGASA-N Glu-Val-Val Chemical compound CC(C)[C@@H](C(O)=O)NC(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)[C@@H](N)CCC(O)=O SOYWRINXUSUWEQ-DLOVCJGASA-N 0.000 description 1
- GZBZACMXFIPIDX-WHFBIAKZSA-N Gly-Cys-Asp Chemical compound C([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CS)NC(=O)CN)C(=O)O GZBZACMXFIPIDX-WHFBIAKZSA-N 0.000 description 1
- YOBGUCWZPXJHTN-BQBZGAKWSA-N Gly-Ser-Arg Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N YOBGUCWZPXJHTN-BQBZGAKWSA-N 0.000 description 1
- RYAOJUMWLWUGNW-QMMMGPOBSA-N Gly-Val-Gly Chemical compound NCC(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)NCC(O)=O RYAOJUMWLWUGNW-QMMMGPOBSA-N 0.000 description 1
- JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N H-Gly-Phe-OH Natural products NCC(=O)NC(C(O)=O)CC1=CC=CC=C1 JBCLFWXMTIKCCB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UFRXVQGGPNSJRY-CYDGBPFRSA-N Ile-Met-Arg Chemical compound CC[C@H](C)[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCN=C(N)N UFRXVQGGPNSJRY-CYDGBPFRSA-N 0.000 description 1
- MYGQXVYRZMKRDB-SRVKXCTJSA-N Leu-Asp-Lys Chemical compound CC(C)C[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN MYGQXVYRZMKRDB-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- ZTLGVASZOIKNIX-DCAQKATOSA-N Leu-Gln-Glu Chemical compound CC(C)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)N ZTLGVASZOIKNIX-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- PTRKPHUGYULXPU-KKUMJFAQSA-N Leu-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O PTRKPHUGYULXPU-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- XWEVVRRSIOBJOO-SRVKXCTJSA-N Leu-Pro-Gln Chemical compound [H]N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CCC(N)=O)C(O)=O XWEVVRRSIOBJOO-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- JGKHAFUAPZCCDU-BZSNNMDCSA-N Leu-Tyr-Leu Chemical compound CC(C)C[C@H]([NH3+])C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C([O-])=O)CC1=CC=C(O)C=C1 JGKHAFUAPZCCDU-BZSNNMDCSA-N 0.000 description 1
- 206010067125 Liver injury Diseases 0.000 description 1
- NRQRKMYZONPCTM-CIUDSAMLSA-N Lys-Asp-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O NRQRKMYZONPCTM-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- LLSUNJYOSCOOEB-GUBZILKMSA-N Lys-Glu-Asp Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H](CC(O)=O)C(O)=O LLSUNJYOSCOOEB-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- IMAKMJCBYCSMHM-AVGNSLFASA-N Lys-Glu-Lys Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@H](C(O)=O)CCCCN IMAKMJCBYCSMHM-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- DIBZLYZXTSVGLN-CIUDSAMLSA-N Lys-Ser-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O DIBZLYZXTSVGLN-CIUDSAMLSA-N 0.000 description 1
- SQRLLZAQNOQCEG-KKUMJFAQSA-N Lys-Tyr-Ser Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(=O)N[C@H](C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O)CC1=CC=C(O)C=C1 SQRLLZAQNOQCEG-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- JLVVSXFLKOJNIY-UHFFFAOYSA-N Magnesium ion Chemical compound [Mg+2] JLVVSXFLKOJNIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SODXFJOPSCXOHE-IHRRRGAJSA-N Met-Leu-Leu Chemical compound CSCC[C@H](N)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O SODXFJOPSCXOHE-IHRRRGAJSA-N 0.000 description 1
- 108091028043 Nucleic acid sequence Proteins 0.000 description 1
- MECSIDWUTYRHRJ-KKUMJFAQSA-N Phe-Asn-Leu Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O MECSIDWUTYRHRJ-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- CZQZSMJXFGGBHM-KKUMJFAQSA-N Phe-Pro-Gln Chemical compound C1C[C@H](N(C1)C(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O CZQZSMJXFGGBHM-KKUMJFAQSA-N 0.000 description 1
- IAOZOFPONWDXNT-IXOXFDKPSA-N Phe-Ser-Thr Chemical compound [H]N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O IAOZOFPONWDXNT-IXOXFDKPSA-N 0.000 description 1
- MHNBYYFXWDUGBW-RPTUDFQQSA-N Phe-Tyr-Thr Chemical compound C[C@H]([C@@H](C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC1=CC=C(C=C1)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=CC=C2)N)O MHNBYYFXWDUGBW-RPTUDFQQSA-N 0.000 description 1
- HATVCTYBNCNMAA-AVGNSLFASA-N Pro-Leu-Met Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCSC)C(O)=O HATVCTYBNCNMAA-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- KHRLUIPIMIQFGT-AVGNSLFASA-N Pro-Val-Leu Chemical compound [H]N1CCC[C@H]1C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O KHRLUIPIMIQFGT-AVGNSLFASA-N 0.000 description 1
- RIAKPZVSNBBNRE-BJDJZHNGSA-N Ser-Ile-Leu Chemical compound OC[C@H](N)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)CC)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(O)=O RIAKPZVSNBBNRE-BJDJZHNGSA-N 0.000 description 1
- QYSFWUIXDFJUDW-DCAQKATOSA-N Ser-Leu-Arg Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC(C)C)C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O QYSFWUIXDFJUDW-DCAQKATOSA-N 0.000 description 1
- GVMUJUPXFQFBBZ-GUBZILKMSA-N Ser-Lys-Glu Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CCCCN)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O GVMUJUPXFQFBBZ-GUBZILKMSA-N 0.000 description 1
- MQUZANJDFOQOBX-SRVKXCTJSA-N Ser-Phe-Ser Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H](CC1=CC=CC=C1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O MQUZANJDFOQOBX-SRVKXCTJSA-N 0.000 description 1
- SQHKXWODKJDZRC-LKXGYXEUSA-N Ser-Thr-Asn Chemical compound [H]N[C@@H](CO)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC(N)=O)C(O)=O SQHKXWODKJDZRC-LKXGYXEUSA-N 0.000 description 1
- XOTBWOCSLMBGMF-SUSMZKCASA-N Thr-Glu-Thr Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(=O)N[C@@H]([C@@H](C)O)C(O)=O XOTBWOCSLMBGMF-SUSMZKCASA-N 0.000 description 1
- KRGDDWVBBDLPSJ-CUJWVEQBSA-N Thr-His-Ser Chemical compound [H]N[C@@H]([C@@H](C)O)C(=O)N[C@@H](CC1=CNC=N1)C(=O)N[C@@H](CO)C(O)=O KRGDDWVBBDLPSJ-CUJWVEQBSA-N 0.000 description 1
- FDKDGFGTHGJKNV-FHWLQOOXSA-N Tyr-Phe-Gln Chemical compound C1=CC=C(C=C1)C[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](CC2=CC=C(C=C2)O)N FDKDGFGTHGJKNV-FHWLQOOXSA-N 0.000 description 1
- WNZSAUMKZQXHNC-UKJIMTQDSA-N Val-Ile-Gln Chemical compound CC[C@H](C)[C@@H](C(=O)N[C@@H](CCC(=O)N)C(=O)O)NC(=O)[C@H](C(C)C)N WNZSAUMKZQXHNC-UKJIMTQDSA-N 0.000 description 1
- MIQWEMDDUPSLRW-UHFFFAOYSA-N [O].O=C=O Chemical compound [O].O=C=O MIQWEMDDUPSLRW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010005233 alanylglutamic acid Proteins 0.000 description 1
- 108700007275 alfa 2(125-129) interferon Proteins 0.000 description 1
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 1
- 230000003321 amplification Effects 0.000 description 1
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 1
- 238000000137 annealing Methods 0.000 description 1
- 239000003146 anticoagulant agent Substances 0.000 description 1
- 229940127219 anticoagulant drug Drugs 0.000 description 1
- 230000010100 anticoagulation Effects 0.000 description 1
- 108010068380 arginylarginine Proteins 0.000 description 1
- 108010062796 arginyllysine Proteins 0.000 description 1
- 238000012098 association analyses Methods 0.000 description 1
- 230000009286 beneficial effect Effects 0.000 description 1
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 1
- 238000007622 bioinformatic analysis Methods 0.000 description 1
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 1
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 description 1
- 230000000052 comparative effect Effects 0.000 description 1
- 238000012937 correction Methods 0.000 description 1
- 238000004925 denaturation Methods 0.000 description 1
- 230000036425 denaturation Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 238000012631 diagnostic technique Methods 0.000 description 1
- 229960004756 ethanol Drugs 0.000 description 1
- 238000001415 gene therapy Methods 0.000 description 1
- 108010078144 glutaminyl-glycine Proteins 0.000 description 1
- 108010081985 glycyl-cystinyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010037850 glycylvaline Proteins 0.000 description 1
- 231100000234 hepatic damage Toxicity 0.000 description 1
- 238000009396 hybridization Methods 0.000 description 1
- 239000001257 hydrogen Substances 0.000 description 1
- 229910052739 hydrogen Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 1
- 230000037111 immune power Effects 0.000 description 1
- 230000000937 inactivator Effects 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 108010034529 leucyl-lysine Proteins 0.000 description 1
- 108010091871 leucylmethionine Proteins 0.000 description 1
- 230000008818 liver damage Effects 0.000 description 1
- 108010044348 lysyl-glutamyl-aspartic acid Proteins 0.000 description 1
- 108010054155 lysyllysine Proteins 0.000 description 1
- 229910001425 magnesium ion Inorganic materials 0.000 description 1
- 230000010534 mechanism of action Effects 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 208000028261 multifactorial inheritance Diseases 0.000 description 1
- 238000002887 multiple sequence alignment Methods 0.000 description 1
- 238000003199 nucleic acid amplification method Methods 0.000 description 1
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 1
- 210000005259 peripheral blood Anatomy 0.000 description 1
- 239000011886 peripheral blood Substances 0.000 description 1
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 1
- 108020001580 protein domains Proteins 0.000 description 1
- 238000000455 protein structure prediction Methods 0.000 description 1
- 239000011535 reaction buffer Substances 0.000 description 1
- 238000009877 rendering Methods 0.000 description 1
- 238000012216 screening Methods 0.000 description 1
- 108010026333 seryl-proline Proteins 0.000 description 1
- 101150041303 sick gene Proteins 0.000 description 1
- 238000004088 simulation Methods 0.000 description 1
- 238000007619 statistical method Methods 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 238000010998 test method Methods 0.000 description 1
- IBIDRSSEHFLGSD-UHFFFAOYSA-N valinyl-arginine Natural products CC(C)C(N)C(=O)NC(C(O)=O)CCCN=C(N)N IBIDRSSEHFLGSD-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000009423 ventilation Methods 0.000 description 1
Landscapes
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
Abstract
本发明公开了一种慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2的新突变蛋白、编码基因及其应用。本发明的慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2的新突变蛋白是在慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2蛋白的氨基酸序列第120位丙氨酸突变为苏氨酸，同时得到了该突变蛋白的编码基因，建立了基于IFNA2基因及其突变体的诊断试剂盒，该试剂盒可以对临床上慢性乙肝患者进行基因水平的诊断，还可以对其临床用药情况予以指导和个体化治疗。从长远看，对慢性乙型病毒性肝炎进行IFNA2基因的突变检测使我们有可能在今后通过纠正突变的基因疗法或其它针对这一突变的生物学效应的方法去治疗本病，在临床治疗方面有深远意义和应用前景。
Description
技术领域
本发明涉及生物工程及医学技术领域，具体涉及一种慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2的新突变蛋白、编码基因及其应用。
背景技术
慢性乙型病毒性肝炎（慢性乙肝）是由乙型肝炎病毒（HBV）感染而引起的以肝脏损害为主要表现的传染性疾病，是关系到我国乃至全球公共卫生的重大疾病。宿主的遗传背景在其易感性及免疫应答中起重要作用。而人群对乙肝免疫力的高低存在明显的个体差异。
中国专利200810004159.5公开了一种与肝细胞癌相关的乙型肝炎病毒基因组标志物以及预测HBV感染个体发展成肝细胞癌(HCC)的遗传素因的试剂盒。该试剂盒包括一种或更多种探针，当其与HBV基因组接触时，如果所述基因组为IFNA2基因型、且包括至少一种对应于某段核苷酸序列上的核苷酸（170C;和/或2170G2;和/或2441C;和/或799G）时会选择性地与所述基因组杂交。
发明内容
本发明的目的在于提供一种慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2的新突变蛋白。
本发明的另一目的是提供上述慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2的新突变蛋白的编码基因。
本发明的又一目的是提供上述慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2的新突变蛋白、该突变蛋白的编码基因的应用。
本发明通过以下技术方案实现上述目的：
一种慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2的新突变蛋白，是在慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2蛋白的氨基酸序列第120位丙氨酸Ala突变为苏氨酸Thr，本发明中用p.Ala120Thr表示。
上述慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2的新突变蛋白，氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。
上述慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2的新突变蛋白的编码基因。该编码基因的核苷酸序列优选如SEQ ID NO:2所示。
慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2的新突变蛋白在制备慢性乙型病毒性肝炎的检测试剂中的应用。
慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2的新突变蛋白的编码基因在制备慢性乙型病毒性肝炎的检测试剂中的应用。
一种慢性乙型病毒性肝炎检测试剂盒，由以下成分组成：核苷酸序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的引物，PCR反应液，PCR产物纯化盒和测序反应液；
所述PCR反应液为溶解了Tag DNA聚合酶、dNTPs、镁离子（如MgCl2）、PCR反应缓冲液（如10×Taq Buffer），以上试剂均可直接购买相应商品，如（10mM）dNTPs购自上海生工生物工程技术服务有限公司；Tag DNA聚合酶及其配套的10×Taq Buffer、MgCl2购自Fermentas公司。各试剂的用量及浓度均为本领域常规值，如1u/μL Tag DNA聚合酶1μL、2mmol/L 的dNTP（即浓度均为2mmol/L 的4种dNTP的混合物）3μL、25mmol/L MgCl2 3μL、10×Taq Buffer（内含(NH4)2SO4）3μL、灭菌ddH2O 17μL。
所述PCR产物纯化盒为纯化PCR产物的溶液和DNA吸附柱Labell；所述纯化PCR产物的溶液为：1u/μL虾碱性磷酸酶（SAP，可购于Fermentas公司）0.6μL、20u/μL外切酶（Exo I，可购于Fermentas公司）0.15μL和灭菌ddH2O 1.25-1.75μL，或按上述比例配制的其他体积的混合液。纯化PCR产物的溶液优选2-2.5μL。
所述测序反应液为BigDye（购自ABI公司）和5×Sequence buffer（购自ABI公司）的混合液，BigDye和5×Sequence buffer的体积比优选为1:2，如1μLBigDye与2μL5×Sequence buffer混合。
上述慢性乙型病毒性肝炎检测试剂盒，优选核苷酸序列如SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的引物浓度分别为3.2μmol/L。
本发明的慢性乙型病毒性肝炎的相关基因IFNA2及其新突变p.Ala120Thr，是通过对“相对极端性状的”50例慢性乙肝患者及40例未注射过乙肝疫苗正常对照进行全基因组外显子测序，通过生物信息学分析及进一步的数据筛选找到最有可能的候选基因；然后再对所找到的候选基因进行大样本量的病例-对照（其中慢性乙肝患者1728例，未注射乙肝疫苗正常对照1636例）相关关系研究；最后通过相关基因的作用机理及统计学分析结果（IFNA2基因新突变与慢性乙肝相关的统计学P 值为2.76×10-5，优势比（OR）为4.08，说明两者有显著相关性）最终确定了IFNA2基因新突变与慢性乙型肝炎相关。
本发明的人IFNA2基因核苷酸全长序列（包含突变位点）通常是用聚合酶链式反应（PCR）进行。对于PCR扩增法，可根据IFNA2基因的核苷酸序列，进行引物设计，并以所检测的患慢性乙型肝炎患者抽提的DNA作为模板，扩增目的序列。最后通过测序反应检测及确定相关基因的突变。
由于前期的研究已经证明了慢性乙型肝炎与IFNA2基因新突变的高度相关性，因此检测这个基因的突变可用于鉴定慢性乙型肝炎患者的宿主遗传背景的易感性及对免疫应答的反应能力，进一步地用于之后靶向个体化治疗，如在患有慢性乙型肝炎患者中检测到了IFNA2基因的突变，我们可以进一步采取用干扰素来治疗本病。
与现有技术相比，本发明具有以下有益效果：
我们通过全基因组外显子测序及大样本量的相关研究，发现了与慢性乙型病毒性肝炎的相关基因——IFNA2及其新突变。因此，找寻及检测慢性乙肝相关基因及其突变，不仅是了解及阐明本病的发病机理的必要途径，同时也为建立鉴定本病的基因诊断和个体化治疗提供了新的契机。在已了解与本病相关的IFNA2基因及其突变之后，我们可以建立起基于IFNA2基因及其变异的诊断技术，以期对临床上慢性乙肝患者进行基因水平的诊断，还可以对其临床用药情况予以指导和个体化治疗。由于基因的突变是导致本病遗传背景发生改变从而致使其易感性及免疫应答发生改变的重要因素，从长远看，对本病进行IFNA2基因的突变检测使我们有可能在今后通过纠正突变的基因疗法或其它针对这一突变的生物学效应的方法去治疗本病。因此，从长远看，与本病相关的IFNA2基因突变的发现在临床治疗方面有深远的意义和前景。
附图说明
图1：IFNA2基因的部分测序结果，其中上面部分为IFNA2野生型的测序结果，下面部分为IFNA2 p.Ala120Thr杂合性突变的测序结果（箭头所示为突变位点）。
图2：IFNA2 p.Ala120Thr突变型蛋白整体的结构模拟图，第120位苏氨酸和第116位天冬酰胺处用虚线圆圈框起。
具体实施方式
以下实施例中如无特殊说明均为本领域常规试剂和试验方法。
实施例1 病例收集
来自中山大学附属第三医院传染科的1728例慢性乙型肝炎患者和来自同一地区的1636例未注射乙肝疫苗或自报疫苗注射史不明的健康自愿者，在取得上述患者、自愿者及家属知情同意后，取外周血于EDTA抗凝管中备用。用Qiagen公司生产的QIAamp DNA Blood Mini Kits（试剂盒）从抗凝外周血中提取DNA，TE溶解，-80℃保存，备用。
实施例2 IFNA2基因的突变检测
IFNA2基因的mRNA序列来自Genbank（NM_000605）。Genomic DNA序列来自UCSC数据库（http://genome.ucsc.edu/）和Ensembl数据库（http://asia.ensembl.org/index.html）。
主要步骤：
1. PCR扩增：PCR反应体积为30μL：10×Taq Buffer（内含(NH4)2SO4）3μL，25mmol/L MgCl2 3μL，2mmol/L dNTP混合物3μL，3.2μmol/L上、下游引物各1μL，1u/μL Taq DNA聚合酶1μL，实施例1提取的DNA模板1μL，灭菌ddH2O补足体积至30μL。PCR反应条件：95℃预变性3min；95℃ 30s，引物特异性退火温度1min，72℃ 45s，36个循环；最后72℃ 延伸10min。
检测IFNA2基因突变位点的上游引物P1（SEQ ID NO：3）的序列为：5’- CTTTGAAATGGCAGATCATAA -3’，下游引物P2（SEQ ID NO：4）的序列为：5’- AAATGTAAACGAGTATGTTCCC -3’。
2. 测序反应方案
（1）预反应：反应体积共3μL：1u/μL虾碱性磷酸酶（SAP）0.6μL、20u/μL外切酶（Exo I）0.15μL （Fermentas公司）、PCR产物0.5-1.0μL、灭菌ddH2O补足体积至3μL。反应混合物在PCR仪上反应，37℃温浴15min，85℃ 15min灭活酶。反应完毕后反应混合物直接作为测序反应的模板用。
（2）测序反应：用ABI公司的96孔板，在GeneAmp 9700 PCR仪上进行。反应体积共10μL：3μL的预反应产物、2μL的5×Sequence buffer（ABI公司）、1μL的BigDye（ABI公司）、1μL的引物（3.2μmol/L），3μL的灭菌ddH2O。反应条件：98℃ 2min；96℃ 10s，50℃ 5s，60℃ 4min，30个循环；最后4℃保存。
（3）测序纯化：直接在96孔板上进行。
a) 测序反应完毕后，配无水乙醇6mL+3mol/L醋酸钠（pH5.2）240μL混合溶液（即无水乙醇：醋酸钠体积比=25:1），每个样品中加入50μL混合溶液。用锡箔纸封闭，并振荡混匀。
b) 将测序产物放于-20℃避光静置20min以上。
c) 20℃，3700 rpm离心30min。
d) 倒去上清液，倒扣在四层吸水纸上，360rpm离心10s。
e) 配75%乙醇（无水乙醇7.5mL+ddH2O 2.5mL混合溶液的比例），每个样品中加入90μL混合溶液。用锡箔纸封闭，并振荡混匀。
f) 将测序产物放于-20℃避光静置20min以上。
g) 20℃，3700 rpm离心30min。
h) 倒去上清液，倒扣在四层吸水纸上，360rpm离心10s。
i) 室温通风处，避光晾干，30min以上。
j) 每个样品中加ddH2O 10μL，用锡箔纸封闭，振荡后离心。
k) 待测样品放于4℃避光静置1.5h以上，以充分溶解，上ABI3730测序仪进行测序。
3. 测序结果分析：用ABI序列分析软件进行分析
发明人对来自中山大学附属第三医院传染科的1728例慢性乙型肝炎患者和来自同一地区的1636例未注射乙肝疫苗或自报疫苗注射史不明的健康自愿者进行IFNA2基因的突变检测。结果如下：
突变位点为：发生在IFNA2基因的氨基酸序列中第120位丙氨酸突变为苏氨酸（p.Ala120Thr），突变后的氨基酸序列如SEQ ID NO：1所示。其中有36例患者和9例正常对照存在杂合性突变。在1728例病例和1636例对照研究中，其风险等位基因的个数分别是36个和9个，优势比值（OR值）为4.08，P值为2.76×10-5。多基因遗传病的研究中，通常是通过关联分析来确定其风险基因的，本实验结果中，P值有显著差异，且OR值为4.08，说明该基因的突变是导致该病的危险因素。测序结果见图1。
实施例3 IFNA2 p.Ala120Thr突变型蛋白结构预测
方法：用the program PyMol (http://pymol.org)、Discovery Studio 3.0 (Accelrys Inc.)、the programs MultAlin (Corpet F. Multiple sequence alignment with hierarchical clustering. Nucleic. Acids. Res. 1988; 16, 10881-10890) 及 ESPript软件 (Gouet P, Robert X, Courcelle E. ESPript/ENDscript: Extracting and rendering sequence and 3D information from atomic structures of proteins. Nucleic. Acids. Res. 2003; 31, 3320-3323) 预测IFNA2 p.Ala120Thr突变型蛋白的结构及功能域。
蛋白质结构预测结果见图2。对IFNA2基因编码的蛋白质结构域的预测，发现第120位亲水性的丙氨酸突变为了疏水性的苏氨酸后，新生成的第120位苏氨酸的OG与其主链上与之毗邻的第116位天冬酰胺的羰基氧（carbonyl oxygen）之间形成了一氢键。且由于第120位的氨基酸残基正好位于C螺旋结构域的C末端，此位置的氨基酸替换可能会影响到C螺旋结构域的构造，最终可触发与之相连的整个Loop结构域的改变。此外，由于在野生型的IFNA2蛋白中螺旋结构A和C上的相互毗邻的氨基酸残基Cys24和Cys121之间会形成二硫键，因此倘若第120位的丙氨酸发生突变可能也会破坏其附近形成的二硫键，最终使得A螺旋结构发生改变。
实施例4IFNA2基因突变检测试剂盒的制备
制备—试剂盒，具体成分见表1
表1
| 试剂名称 | 具体成分 |
| 上游引物P1 | （SEQ ID NO：3），干粉 2 OD，溶解后浓度：3.2μmol/L，体积：1μL |
| 下游引物P2 | （SEQ ID NO：4），干粉 2 OD，溶解后浓度：3.2μmol/L，体积：1μL |
| PCR反应液 | 1u/μL Taq DNA聚合酶1μL（购自Fermentas公司）、2mmol/L dNTP 3μL、25mmol/LMgCl2 3μL（Taq DNA聚合酶配套试剂）、10×Taq Buffer（内含(NH4)2SO4，Taq DNA聚合酶配套试剂）3μL 、灭菌ddH2O 17μL。 |
| PCR产物纯化盒 | 2-2.5μL 纯化PCR产物的溶液（内含1u/μL虾碱性磷酸酶（SAP，购自Fermentas公司）0.6μL、20u/μL外切酶（Exo I，购自Fermentas公司）0.15μL和灭菌ddH2O 1.25-1.75μL），DNA吸附柱Labell |
| 测序反应液 | 含1μL BigDye和2μL 的5×Sequence buffer（均购自ABI公司） |
上述试剂盒的使用方法：抽取待检测患者的血液2mL，使用常规方法（或特定的DNA提取试剂盒）从血液中提取DNA。将IFNA2基因突变检测试剂盒中的PCR引物稀释至3.2μmol/L，以所提取的DNA为模板与所提供的引物进行PCR反应。使用检测试剂和所提供的PCR产物纯化盒对PCR产物进行纯化。将纯化的产物进行测序反应后直接测序。观察测序所得到的序列是否存在错义突变，即SEQ ID NO：1所示氨基酸序列第120位丙氨酸（Ala）是否发生突变。
SEQUENCE LISTING
<110> 中山大学
<120> 一种慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2的新突变蛋白、编码基因及其应用
<130>
<160> 4
<170> PatentIn version 3.3
<210> 1
<211> 188
<212> PRT
<213> 人工序列
<400> 1
Met Ala Leu Thr Phe Ala Leu Leu Val Ala Leu Leu Val Leu Ser Cys
1 5 10 15
Lys Ser Ser Cys Ser Val Gly Cys Asp Leu Pro Gln Thr His Ser Leu
20 25 30
Gly Ser Arg Arg Thr Leu Met Leu Leu Ala Gln Met Arg Arg Ile Ser
35 40 45
Leu Phe Ser Cys Leu Lys Asp Arg His Asp Phe Gly Phe Pro Gln Glu
50 55 60
Glu Phe Gly Asn Gln Phe Gln Lys Ala Glu Thr Ile Pro Val Leu His
65 70 75 80
Glu Met Ile Gln Gln Ile Phe Asn Leu Phe Ser Thr Lys Asp Ser Ser
85 90 95
Ala Ala Trp Asp Glu Thr Leu Leu Asp Lys Phe Tyr Thr Glu Leu Tyr
100 105 110
Gln Gln Leu Asn Asp Leu Glu Thr Cys Val Ile Gln Gly Val Gly Val
115 120 125
Thr Glu Thr Pro Leu Met Lys Glu Asp Ser Ile Leu Ala Val Arg Lys
130 135 140
Tyr Phe Gln Arg Ile Thr Leu Tyr Leu Lys Glu Lys Lys Tyr Ser Pro
145 150 155 160
Cys Ala Trp Glu Val Val Arg Ala Glu Ile Met Arg Ser Phe Ser Leu
165 170 175
Ser Thr Asn Leu Gln Glu Ser Leu Arg Ser Lys Glu
180 185
<210> 2
<211> 567
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 2
atggccttga cctttgcttt actggtggcc ctcctggtgc tcagctgcaa gtcaagctgc 60
tctgtgggct gtgatctgcc tcaaacccac agcctgggta gcaggaggac cttgatgctc 120
ctggcacaga tgaggagaat ctctcttttc tcctgcttga aggacagaca tgactttgga 180
tttccccagg aggagtttgg caaccagttc caaaaggctg aaaccatccc tgtcctccat 240
gagatgatcc agcagatctt caatctcttc agcacaaagg actcatctgc tgcttgggat 300
gagaccctcc tagacaaatt ctacactgaa ctctaccagc agctgaatga cctggaaacc 360
tgtgtgatac agggggtggg ggtgacagag actcccctga tgaaggagga ctccattctg 420
gctgtgagga aatacttcca aagaatcact ctctatctga aagagaagaa atacagccct 480
tgtgcctggg aggttgtcag agcagaaatc atgagatctt tttctttgtc aacaaacttg 540
caagaaagtt taagaagtaa ggaatga 567
<210> 3
<211> 21
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 3
ctttgaaatg gcagatcata a 21
<210> 4
<211> 22
<212> DNA
<213> 人工序列
<400> 4
aaatgtaaac gagtatgttc cc 22
Claims (2)
1.一种慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2的新突变蛋白，其特征在于在慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2蛋白的氨基酸序列第120位丙氨酸突变为苏氨酸，所述IFNA2的新突变蛋白的氨基酸序列如SEQ ID NO:1所示。
2.权利要求1所述慢性乙型病毒性肝炎相关基因IFNA2的新突变蛋白的编码基因，所述IFNA2的新突变蛋白的编码基因的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示。
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN201210031358.1A CN102584956B (zh) | 2012-02-13 | 2012-02-13 | 一种慢性乙型病毒性肝炎相关基因ifna2的新突变蛋白、编码基因及其应用 |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| CN201210031358.1A CN102584956B (zh) | 2012-02-13 | 2012-02-13 | 一种慢性乙型病毒性肝炎相关基因ifna2的新突变蛋白、编码基因及其应用 |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| CN102584956A CN102584956A (zh) | 2012-07-18 |
| CN102584956B true CN102584956B (zh) | 2014-09-17 |
Family
ID=46474268
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| CN201210031358.1A Expired - Fee Related CN102584956B (zh) | 2012-02-13 | 2012-02-13 | 一种慢性乙型病毒性肝炎相关基因ifna2的新突变蛋白、编码基因及其应用 |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| CN (1) | CN102584956B (zh) |
Families Citing this family (1)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN104387457B (zh) * | 2014-10-28 | 2017-05-24 | 中山大学 | 慢性乙型和丁型肝炎病毒肝细胞受体编码基因slc10a1的新突变蛋白、编码基因及其应用 |
Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN1970789A (zh) * | 2005-11-21 | 2007-05-30 | 林远 | 流式细胞仪－微载体基因芯片 |
| CN101255474A (zh) * | 2004-09-10 | 2008-09-03 | 香港中文大学 | 与肝细胞癌相关的乙型肝炎病毒基因组标志物 |
| CN101304758A (zh) * | 2005-06-29 | 2008-11-12 | 维兹曼科学研究所耶达研究与发展有限公司 | 重组干扰素α2（IFNα2）突变体 |
-
2012
- 2012-02-13 CN CN201210031358.1A patent/CN102584956B/zh not_active Expired - Fee Related
Patent Citations (3)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| CN101255474A (zh) * | 2004-09-10 | 2008-09-03 | 香港中文大学 | 与肝细胞癌相关的乙型肝炎病毒基因组标志物 |
| CN101304758A (zh) * | 2005-06-29 | 2008-11-12 | 维兹曼科学研究所耶达研究与发展有限公司 | 重组干扰素α2（IFNα2）突变体 |
| CN1970789A (zh) * | 2005-11-21 | 2007-05-30 | 林远 | 流式细胞仪－微载体基因芯片 |
Non-Patent Citations (4)
| Title |
|---|
| "GenBank Accession No:JN848522.1";Hanif,K.等;《GenBank》;20111126;第1页 * |
| Ghasriani,H.等."GenBank Accession No：NP_000596".《GenBank》.2000,第1-4页. |
| Ghasriani,H.等."GenBank Accession No:NP_000596".《GenBank》.2000,第1-4页. * |
| Hanif,K.等."GenBank Accession No:JN848522.1".《GenBank》.2011,第1页. |
Also Published As
| Publication number | Publication date |
|---|---|
| CN102584956A (zh) | 2012-07-18 |
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| WO2008024114A1 (en) | Genemap of the human genes associated with schizophrenia | |
| CN103834639B (zh) | 一种与肝癌易感性相关的单核苷酸多态性位点rs9275319及其应用 | |
| JP5727694B2 (ja) | Ｃ型肝炎の治療効果を予測するためのマーカー及びｃ型肝炎の治療効果の予測を行う方法並びにｃ型肝炎の予防又は治療剤 | |
| CN110699446B (zh) | 一种与非综合征型唇腭裂诊断相关的SNP标志物rs3174298及其应用 | |
| CN109913482B (zh) | Pik3ca-i874r突变基因及其在乳腺癌辅助诊断中的应用 | |
| CN104745592B (zh) | Cyp4v2基因突变体及其应用 | |
| CN102584956B (zh) | 一种慢性乙型病毒性肝炎相关基因ifna2的新突变蛋白、编码基因及其应用 | |
| Li et al. | Comprehensive analysis of circRNAs expression profiles in different periods of MDBK cells infected with bovine viral diarrhea virus | |
| CN102558312B (zh) | 一种慢性乙型病毒性肝炎相关基因nlrx1的新突变蛋白、编码基因及其应用 | |
| CN116004642A (zh) | 长qt综合征变异基因kcnh2及其应用 | |
| CN104387457B (zh) | 慢性乙型和丁型肝炎病毒肝细胞受体编码基因slc10a1的新突变蛋白、编码基因及其应用 | |
| CN115679003A (zh) | 用于预测药物疗效的组合物、系统及用途 | |
| CN109457031A (zh) | BRCA2基因g.32338309A>G突变体及其在乳腺癌辅助诊断中的应用 | |
| CN115478111A (zh) | 一种与绵羊免疫性状相关的分子标记、其检测方法和应用 | |
| CN109504763B (zh) | 用于预测α干扰素治疗乙肝患者疗效的分子标记 | |
| CN102558311B (zh) | 一种慢性乙型病毒性肝炎相关基因tmem2的突变蛋白、编码基因及其应用 | |
| CN111139295B (zh) | 一种与非综合征型多生牙诊断相关的snp标志物及其应用 | |
| KR20060096437A (ko) | 비만증에 대한 유전적 표식형질 | |
| CN102532279A (zh) | 一种慢性乙型病毒性肝炎相关基因c2的突变蛋白、编码基因及其应用 | |
| CN113444791B (zh) | 一种辅助筛查家族性甲状腺乳头状癌的arms-pcr试剂盒 | |
| CN110819713B (zh) | Snp标志物在胰腺癌预后中的应用 | |
| KR20130113208A (ko) | 만성 ｂ형 간염 치료제의 약제내성 예측용 조성물 및 그 예측 방법 | |
| CN107354223B (zh) | 与hcv感染肝硬化相关的单核苷酸多态性位点及其应用 | |
| Vij et al. | Autophagy Related Gene ATG5 Genetic Variants and Hepatitis B Virus Infection Susceptibility | |
| CN112143802A (zh) | 一种基于sirt3基因与结核病易感性相关的SNP标志物、检测试剂、试剂盒及应用 |
Legal Events
| Date | Code | Title | Description |
|---|---|---|---|
| C06 | Publication | ||
| PB01 | Publication | ||
| C10 | Entry into substantive examination | ||
| SE01 | Entry into force of request for substantive examination | ||
| C14 | Grant of patent or utility model | ||
| GR01 | Patent grant | ||
| CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee | ||
| CF01 | Termination of patent right due to non-payment of annual fee |
Granted publication date: 20140917 Termination date: 20170213 |