CN101659698A - 紫色杆菌素合成相关蛋白质系统及其编码基因簇与应用 - Google Patents

紫色杆菌素合成相关蛋白质系统及其编码基因簇与应用 Download PDF

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本发明公开了一种紫色杆菌素合成相关蛋白质系统及其编码基因簇与应用。紫色杆菌素合成相关蛋白质系统,是由如下1)至5)中五种蛋白质组成的:1)其氨基酸序列为序列表中的序列2;2)其氨基酸序列为序列表中的序列3;3)其氨基酸序列为序列表中的序列4;4)其氨基酸序列为序列表中的序列5;5)其氨基酸序列为序列表中的序列6。编码所述蛋白系统的基因簇的核苷酸序列是序列表中序列1。本发明的紫色杆菌素合成相关基因簇为构建高效基因工程菌生产紫色杆菌素奠定了基础。

Description

紫色杆菌素合成相关蛋白质系统及其编码基因簇与应用
技术领域
本发明涉及紫色杆菌素合成相关蛋白质系统及其编码基因簇与应用。
背景技术
Figure A20081011891400041
紫色杆菌素(violacein)、脱氧紫色杆菌素是微生物的代谢产物,它属于吲哚衍生物,由两个色氨酸分子氧化缩合而成。自从19世纪末紫色杆菌素被发现以来,人们对其生物功能进行了大量的探索,发现它具有很强生物功能,越来越受人们关注。
紫色杆菌素具有广谱抗菌性、抗原生动物活性、抗病毒性、抗肿瘤细胞及其它功能。紫色杆菌素对革兰氏阳性细菌如金黄色葡萄球菌(Staploylococcousaureus)、链球菌(Streptococcus sp)、芽孢杆菌(Bacillus sp)、分枝杆菌(Mycobacterium)、奈瑟球菌(Neisseria)及假单胞菌(Pseudomonas)有显著的抑制作用(de Souza,1999;Lichstein,1945;Nakamura et al.,2002;Nelsonet al.,2001;Yoshitoshi,2003),而对革兰氏阴性细菌如黄杆菌(F.balustinum)、黏质沙雷菌(S.marcescens)和大肠杆菌(E.coli)等(Nakamura et al.,2002)有较小的抑制性(DeMoss,1967;Lichstein,1945)。紫色杆菌素还具有杀锥虫活性(Caldas,1978;Durán et al.,1994;Haun et al.,1992)、抗利什曼原虫(Leishmania)的活性(Leon et al.,2001)。紫色杆菌素混合物(含有10%脱氧紫色杆菌素)对侵染Hela细胞的单纯性疱疹病毒(Herpes Simplex Virus,HSV)、脊髓灰质炎病毒(Polioviruses)有抵抗活性(Andrighetti-Frohner et al.,2003;Duran et al.,2001;May G.et al.,1991)。紫色杆菌素对白血病细胞(leukemiacells)、淋巴瘤(lymphoma)、肺、结肠(Durán,1997;Melo et al.,2000)以及由艾滋病毒(AIDS)引起的淋巴瘤(Durán,1996)都有很好的细胞毒性作用(Melo et al.,2000)。紫色杆菌素可以抵抗可见光辐射(Antonio et al.,2004)。此外,紫色杆菌素可代替人工色素作为染料,对天然原料(如丝绸、棉、毛)及合成原料(如尼龙)都有很好的着色效果(Shirata,2000)。
目前,已发现可以合成紫色杆菌素的微生物有Chromobacterium violaceum、C.fluviatile(Moss 1978)、Janthinobacterium lividum(Sneath 1956)、Alteromonasluteoviolacea(McCarthy SA 1985)、Pseudoalteromonas tunicata(Egan,James etal.2002)。在已发现的产紫色杆菌素的菌株中,对C.violaceum的研究最为广泛。
2003年,C.violaceum全基因组测序完成,为紫色杆菌素合成途径解析及应用提供了保证。目前,紫色杆菌素的生物合成途径基本清楚。紫色杆菌素的生物合成受一个基因簇的控制,长约7.3kb,包括5个基因如图1所示,分别是VioA、VioB、VioC、VioD和VioE。
目前Genebank已公布4个合成紫色杆菌素的基因序列,主要是来自C.violaceum和Janthinobacterium lividum菌株的。
发明内容
本发明的目的是提供一种紫色杆菌素合成相关蛋白质系统及其编码基因簇与应用。
本发明所提供的紫色杆菌素合成相关蛋白质系统,来源于杜擀氏菌属(Duganella sp.)B2CGMCC 2056,是由如下1)至5)中五种蛋白质组成的:
1)其氨基酸序列为序列表中的序列2或在序列表中序列2所示的氨基酸序列中经过取代和/或缺失和/或添加一个或几个氨基酸且与紫色杆菌素合成相关的由序列2限定的蛋白质衍生的蛋白质;
2)其氨基酸序列为序列表中的序列3或在序列表中序列3所示的氨基酸序列中经过取代和/或缺失和/或添加一个或几个氨基酸且与紫色杆菌素合成相关的由序列3限定的蛋白质衍生的蛋白质;
3)其氨基酸序列为序列表中的序列4或在序列表中序列4所示的氨基酸序列中经过取代和/或缺失和/或添加一个或几个氨基酸且与紫色杆菌素合成相关的由序列4限定的蛋白质衍生的蛋白质;
4)其氨基酸序列为序列表中的序列5或在序列表中序列5所示的氨基酸序列中经过取代和/或缺失和/或添加一个或几个氨基酸且与紫色杆菌素合成相关的由序列5限定的蛋白质衍生的蛋白质;
5)其氨基酸序列为序列表中的序列6或在序列表中序列6所示的氨基酸序列中经过取代和/或缺失和/或添加一个或几个氨基酸且与紫色杆菌素合成相关的由序列6限定的蛋白质衍生的蛋白质。
其中,序列表中序列2由435个氨基酸残基组成。序列表中序列3由1005个氨基酸残基组成。序列表中序列4由429个氨基酸残基组成。序列表中序列5由372个氨基酸残基组成。序列表中序列6由191个氨基酸残基组成。
为了便于所述五种蛋白的纯化,可在由序列表中序列2、3、4、5或6所示的氨基酸序列组成的蛋白质的氨基末端或羧基末端连接上如表1所示的标签。
表1.标签的序列
 标签  残基 序列
 Poly-Arg  5-6(通常为5个) RRRRR
 Poly-His  2-10(通常为6个) HHHHHH
 FLAG  8 DYKDDDDK
 Strep-tag II  8 WSHPQFEK
 c-myc  10 EQKLISEEDL
 MBP  367 序列表中序列7
带有表1所示的标签的蛋白可人工合成,也可先合成其编码基因,再进行生物表达得到。如带有表1所示的标签的序列2限定蛋白的编码基因可通过将序列表中序列1自5′末端第1-1308所示的DNA序列5′端和/或3′端连上表1所示的标签的编码序列得到。
编码所述蛋白系统的基因簇也属于本发明的保护范围。
所述基因簇具体可为如下的DNA分子:
1)其核苷酸序列是序列表中序列1;
2)在严格条件下可与序列表中序列1限定的DNA序列杂交且编码紫色杆菌素合成相关蛋白系统的DNA分子;
3)与1)的基因具有90%以上的同源性,且编码紫色杆菌素合成相关蛋白系统的DNA分子。
所述步骤3)中的基因簇,与1)的基因簇最好有95%以上的同源性。
上述严格条件可为在6×SSC,0.5%SDS的溶液中,在68℃下杂交,然后用2×SSC,0.1%SDS和1×SSC,0.1%SDS各洗膜一次。
序列表中的序列1由7315个核苷酸组成,序列表中的序列1自5′末端第1-1308位编码序列表中序列2所示的蛋白;序列1自5′末端第1305-4322位编码序列表中序列3所示的蛋白;序列1自5′末端第4323-5612位编码序列表中序列4所示的蛋白;序列1自5′末端第5612-6730位编码序列表中序列5所示的蛋白;序列1自5′末端第6740-7315位编码序列表中序列6所示的蛋白。
扩增上述基因簇全长或任一片段的引物对也属于本发明的保护范围。
含有上述基因簇的重组载体、转基因细胞系和重组菌也属于本发明的保护范围。
本发明的另一个目的是提供一种生产紫色杆菌素的方法。
本发明所提供的生产紫色杆菌素的方法,是将所述的基因簇转入大肠杆菌中获得重组大肠杆菌,培养所述重组大肠杆菌生产紫色杆菌素。
其中,所述大肠杆菌可为BL21-CodonPlus(DE3)-RIL。
杜擀氏菌属(Duganella sp.)B2CGMCC 2056采集于新疆天山冰川,其合成紫色杆菌素能力较强。本发明从产紫色杆菌素的杜擀氏菌属(Duganella sp.)B2CGMCC2056中分离了紫色杆菌素合成相关基因簇,该基因簇是一个新的基因资源,将其转入大肠杆菌中可以获得产紫色杆菌素的大肠杆菌。本发明的紫色杆菌素合成相关基因簇为构建高效基因工程菌生产紫色杆菌素奠定了基础。
附图说明
图1为紫色杆菌素基因簇结构示意图。
图2为紫色杆菌素基因簇的PCR克隆示意图及结果。
图3为两段式PCR扩增紫色杆菌素基因簇的结果。
图4为高效液相色谱结果图。
具体实施方式
实施例1、杜擀氏菌属(Duganella sp.)B2CGMCC 2056紫色杆菌素合成相关基因簇的制备
一、杜擀氏菌属(Duganella sp.)B2CGMCC 2056紫色杆菌素合成相关基因簇的克隆
将杜擀氏菌属(Duganella sp.)B2CGMCC 2056转接入液体培养基(淀粉15g/L、硫酸亚铁0.03g/L、硝酸钾1g/L、磷酸氢二钾0.7g/L、硫酸镁0.5g/L、色氨酸0.5g/L,调节pH为7.0),25℃,200rpm培养36小时,按上海生工基因组DNA提取试剂盒说明书提取杜擀氏菌B2CGMCC 2056基因组DNA。
根据紫色杆菌素合成相关基因簇序列(AF172851、AF367409),采用Oligo 7.10软件以vioB中较为保守的部分设计引物FB和RB,FB和RB序列见表1,以Duganellasp B2CGMCC 2056基因组DNA为模板,扩增得到长度为0.8kb的vioB基因内部片段,扩增产物的电泳结果如图2A所示,扩增产物测序后与已知vioB基因序列进行分析,然后再以测序结果作为设计引物的模板,根据保守的序列设计引物,引物序列如表1所示。
表1.PCR引物表
  引物名称引物序列F-B             5’-CTGTTCAATATGTCGACGCCGC-3’R-B             5’-GATCGCACATCTGCCACATCAG-3’VioA 14-for     5’-GACATTTGCATCGTTGGCGC-3’vioB 780-rev    5’-GTGCTGGTAGAGAAAGGCGT-3’vio-22-for      5’-GTTAAAAAGGAATTTCGTATGA-3’vioA158-rev     5’-GTTGCTCGAAATGCGGATGGAGTTG-3’vioB 484-for    5’-CAGGACTTTCCGCAGACGAT-3’vioC953-rev     5’-GTCTTCCAGCGCCATGTTCAT-3’vioC163-for     5’-CTTCTTCCGCCACGGCTACAA-3’vioD-518-rev    5’-GCGGAACACCAGGTTCATCTG-3’vioD200-for     5’-GGTCGTATTCGGCTTCCAGT-3’Vio+1100-rev    5’-GCCGATGTTGATGACGGA-3’vioA-for        5’-GGATCATTAATGACAAATTATTCTGACATTTGCATAG-3’Vio3054-rev     5’-AAGAGTGGACTTGGCGGCCGCTTCGACCTG-3’Vio3046-for     5’-TACATGACTCAGGTCGAAGCGGCCGCCAAG-3’vioE-rev        5’-GGAATGTCCTCGAGTTCCGACACGAAAACGCTGGC-3’
分别以VioA 14-for和vioB 780-rev、vio-22-for和vioA158-rev、vioB484-for和vioC953-rev、vioC163-for和vioD-518-rev、vioD200-for和Vio+1100-rev为引物对,以Duganella sp B2CGMCC 2056基因组DNA为模板进行PCR扩增,对扩增产物进行测序,将序列拼接得到紫色杆菌素合成相关基因簇。
图2B为紫色杆菌素合成相关基因簇拼接示意图,其中A为引物vio-22-for和vioA158-rev的PCR产物,大小为0.5kb;B为引物VioA 14-for和vioB 780-rev的PCR产物,大小为2.8kb;C为引物vioB 484-for和vioC953-rev的PCR产物,大小为2.8kb;D为引物vioC163-for和vioD-518-rev的PCR产物,大小为1.6kb;E为引物vioD200-for和Vio+1100-rev的PCR产物,大小为2.6kb;F为引物F-B和R-B的PCR产物,大小为0.9kb。
拼接后的片段为8.7Kb,其部分序列为序列表中的序列1,序列表中的序列1为紫色杆菌素合成相关蛋白质系统的编码基因簇,包含5个ORF,整个片段的平均GC含量为62.7%(32.4%G+30.3%C),与Duganella sp B2CGMCC 2056基因组GC含量(63.6%)相近。序列表中的序列1自5′末端第1-1308位编码序列表中序列2所示的蛋白,命名为VioA;序列1自5′末端第1305-4322位编码序列表中序列3所示的蛋白,命名为VioB;序列1自5′末端第4323-5612位编码序列表中序列4所示的蛋白,命名为VioC;序列1自5′末端第5612-6730位编码序列表中序列5所示的蛋白,命名为VioD;序列1自5′末端第6740-7315位编码序列表中序列6所示的蛋白,命名为VioE。序列表中的序列1即为紫色杆菌素合成相关基因簇,由5个基因构成VioA、VioB、VioC、VioD和VioE,这5个基因编码的蛋白(VioA、VioB、VioC、VioD和VioE)组成了紫色杆菌素合成相关蛋白系统。
将VioA、VioB、VioC、VioD和VioE分别与Genebank数据库中序列比较,比较结果如表2所示。
表2.VioA、VioB、VioC、VioD和VioE与Genebank数据库中序列比较
Figure A20081011891400091
表2的分析结果表明,本发明的杜擀氏菌株B2CGMCC 2056的VioA、VioB、VioC、VioD和VioE基因和其他物种的同源基因具有一定的同源性,但氨基酸最高为相似性85.31%。
根据序列表中的序列1设计引物vioA-for和vio3054-rev、vio3046-for和vioE-rev,vioA-for和vio3054-rev、vio3046-for和vioE-rev的序列如表1所示。
以Duganella sp B2 CGMCC 2056基因组DNA为模板,利用高保真Pyrobest DNA聚合酶进行PCR扩增,扩增产物的电泳结果如图3。以vioA-for和vio3054-rev为引物PCR扩增片段A,对片段A进行测序,测序结果表明,片段A包括完整的vioA和部分vioB基因,以vio3046-for和vioE-rev为引物PCR扩增片段B,对片段B进行测序,测序结果表明,片段B包括完整的vioC、vioD、vioE和部分vioB基因,片段A和片段B经PCR纯化试剂盒回收,Ase I和NotI双酶切片段A、NotI和XhoI双酶切片段B,凝胶回收试剂盒回收酶切后的片段,与经过NdeI和XhoI双酶切后回收的载体pET30a在16℃过夜连接,得到重组载体pET30aVio,重组载体pET30aVio用热激法转化入E.coli DH5α中,转化产物涂于含卡那霉素(50mg/L)的LB平板上,挑取转化子培养后采用碱裂解法提取重组载体pET30aVio,pET30aVio插入的A和B两个片段分别编码VioA(氨基酸序列为序列表中的序列2)、VioB(氨基酸序列为序列表中的序列3)、VioC(氨基酸序列为序列表中的序列4)、VioD(氨基酸序列为序列表中的序列5)和VioE(氨基酸序列为序列表中的序列6)五个蛋白。
二、杜擀氏菌属(Duganella sp.)B2CGMCC №2056紫色杆菌素合成相关基因簇的功能
将重组载体pET30aVio转入E.coli BL21-CodonPlus(DE3)-RIL构建重组菌株E.coli BL21-CodonPlus(DE3)-RIL/pET30aVio。将pET30a载体转入E.coliBL21-CodonPlus(DE3)-RIL,获得的重组菌E.coliBL21-CodonPlus(DE3)-RIL-pET30a作为对照。
分别挑取E.coli BL21-CodonPlus(DE3)-RIL/pET30aVio和E.coliBL21-CodonPlus(DE3)-RIL-pET30a单菌落接种至3mL含有氯霉素30μg/mL、卡那霉素50μg/mL的LB液体培养基,37℃,200rpm振荡培养过夜。次日按1%的接种量,分别接种至新鲜的LB培养基(含有相应的抗生素)中37℃继续培养2-3h,OD600为0.5-0.6时加1mmol/L的IPTG进行诱导,20℃诱导培养20h。将50mL上述培养液在7000×g下离心10min,弃上清液,在沉淀物中加入无水乙醇5mL,用漩涡混合器将其混匀,然后在200W超声波清洗器中振荡0.5h,将振荡液9000×g离心5min,保留乙醇溶液。
由E.coli BL21-CodonPlus(DE3)-RIL/pET30aVio培养液制备的乙醇溶液中含有蓝紫色物质,而由对照菌培养液制备的乙醇溶液不含有蓝紫色物质。
将蓝紫色物质的甲醇溶液进行高效液相色谱分析,使用Agilent-1100高效液相色谱仪,色谱柱为Agilent Eclipse XDB-C18,150mm×4mm,5μm;柱温30℃;洗脱剂为体积比为70%的甲醇水溶液;流速1.0mL/min;检测波长:570nm。
高效液相色谱检测结果如图4所示,表明由重组菌E.coliBL21-CodonPlus(DE3)-RIL/pET30aVio合成的蓝紫色物质包含两种物质,分别与杜擀氏菌属Duganella B2CGMCC 2056合成的紫色杆菌素和脱氧紫色杆菌素洗脱时间时间一致(分别为3.0min和4.9min)。
上述实验结果表明,构建的载体pET30aVio在菌株E.coliBL21-CodonPlus(DE3)-RIL中成功表达紫色杆菌素和脱氧紫色杆菌素合成相关的酶,并在体内催化合成紫色杆菌素和脱氧紫色杆菌素。
图4中,I:杜擀氏菌属(Duganella sp.)B2 CGMCC 2056所产色素高效液相色谱图,第一峰为紫色杆菌素,第二峰为脱氧紫色杆菌素;
II:BL21-CodonPlus(DE3)-RIL/pET30aVio所产紫色物质的粗提物的高效液相谱图。
序列表
<110>清华大学
<120>紫色杆菌素合成相关蛋白质系统及其编码基因簇与应用
<130>CGGNARW81612
<160>1
<210>1
<211>7315
<212>DNA
<213>杜擀氏菌属(Duganella sp.)B2 CGMCC 2056
<400>1
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ccgaacaggt cgattacgcc tttctctacc agcacgtgat gagctactac gagctggtct    2880
atcccttcat gtcggacaag gtgttcagcc tggcggacca ctgcaagtgc gaaacctatt    2940
cgcgcctgat gtggcagatg tgcgatccgc agaaccggga caagagctat tacatgccga    3000
gcacgcgtga actgtcgctg ccgaaatcgc gcctgttcct gaaatacctg acccaggtcg    3060
aagcggccgc caagtccacg cttcctcaag cggtcgcacc gcatgtcatc ggctgcaagg    3120
ccgagtggat cgccgagctg aaaaaggcga tcgacctgga actgtcgctc atgctgcagt    3180
acctgtacgc cgcgtatgcc attcccaact atgcgcaggg agtgaaactg gtcgaggccg    3240
gccgctggct gccggacgag ctggagctgg cctgcggcac cgaggaccgg cgccgcaaca    3300
gcggagcgcg tggcgccctg ctcgaaatcg cccatgaaga aatgattcac tacctgatgg    3360
tcaacaatgt gctgatggcg ctcggcgagc cgttctacgc cggcgccccg gcgctgggag    3420
aacaggcgcg ccagcgcttc ggcctggaca cggaatttgc cttcgaccct ttttccgagc    3480
atgtgctggc cagattcgtg cgtttcgagt ggcccgacta tcttcccacg cccggtaaat    3540
cgatcgccac cttctatgcg gcgatccgcc aggccgtggc cgatctgccc gatctgttcg    3600
acgccgacgg cggcaaacgc ggcggcgagc accacctgtt cctcaaagag ctcaccaacc    3660
gcgcctatcc cgcctatcag ctggaagtta gcgaccgcga cagcgcgctg ttcgcgctcg    3720
acttcgtcac cgaacagggc gaaggggtgg cggtggaatc gccccatttc gccgtgtcgc    3780
atttccagcg gctgcgcgcc ctggccggcc gcttttcggc acgcgaaaaa ccgttcgaac    3840
cggccgtgcc ggcgctgaaa aatccggtac tcgacccacg cgccgactgc accgtggtga    3900
ccgatcccaa ggcccgttcg ctgatgcagc tctaccaggg ctgctatgaa ctgaccttcg    3960
cgctgatggc gcaccacttc gcgcaaaagc cgctgggcag cctgcgccgc tcgcgcctga    4020
tgaatgcctc catcgacatc atgaccggtt tgctgcggcc cttgtcggcc gcgctgatga    4080
acatgccgtc cggcgtaccc gggcgcaacg ccggaccgcc cgtgcccggg ccggccgaca    4140
ccgccatcag cagtgactac agcctgggat gcgagctgct ggcgcagaaa tgcctggccc    4200
tggcgcagta cgcgcgcagc ctggaggccg aggtggccag cacggcgcag atcgacatgt    4260
tggagttctt taatcagcaa ctgaccgatt tatctcgggg aaagatgtca agagaggcct    4320
gaatgcacaa aatcatcatc gtgggcggcg gcctggcggg cagcctgacc gccacttatc    4380
tggcgcagcg cggacatgag gtccacgtta tcgaaaagcg cggcgatccg ctgcgggcgg    4440
agtcagccaa cgccgatccg gtcaactcgc gcgccattgg cgtgagcatg accgtgcgcg    4500
gcatcaaggc agtgctggcg gccggcatca gcaaggagga gctcgatcgg tgcggcgaac    4560
cggtcgtcgg catggcattt tcggtcggcg gcggccacaa ggtgcgcgaa ctgaccccgc    4620
tcgaaggctt gtttcccttg tcgctggacc gcaccgcgtt ccagcgcctg ctgaacaagt    4680
acgccgtcat gcacaaagtg aactattact tcgagcataa atgcctggac ctggacctgg    4740
acaagaaatc cgtgctgatc cagggcccgg acggcgcctt gcggcatctg caaggcgacc    4800
tgatcatcgg ggccgacggc gcccactccg ccgtgcggcg cgccatgcaa gccggcatgc    4860
ggcgcttcca gttcgaacaa tccttcttcc gccacggcta caagaccctg gtactgccga    4920
acgccgcggg actgggcttc cgcaaggatc tgctgtattt cttcggcatg gattccaagg    4980
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tcagccgcta cttcggcatc ctgccaccgg ccagccggga agagctggtg aatcagttca    5160
tcgcgctgcc tagcaacgac ctcatcaatg tccgctccag caccttccat tacaagagca    5220
atgtcctgct gatcggcgat gcggcgcatg cgaccgcccc cttcctcggt cagggcatga    5280
acatggcgct ggaagacgtc tacgtcttca tcaccttgct ggaaaagcat cgcgatgacc    5340
tgggcctggt cttgtcggag tttacggggc agcgcaaggt gcaggccgac gccatgcagg    5400
atatggcgat cgccaactac gaaatgctga gcaacccgaa ttttattttc ttcctgcaaa    5460
cccgctacac ccgctacatg cacaagaaat ttcccagtgt ttatccgccc gacatggcgg    5520
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acgtttggta caaacttgga agggtaaact aatgaaaatc ctcgtcatcg gcgccggacc    5640
agccggactg atctttgcaa gtcaaatgaa gcaagcccaa cccgcttggg atatcagcgt    5700
tgcggaaaaa aatacccagg aagaagtgct gggctggggc gtggtgctgc cgggacgccc  5760
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ggccggcatc acggtcagtt acgagacgcc gctggcgagc gtggcgcaac tggaagccga  6000
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cggccgctaa ggagacgcca tgccaccgca cgccaccccg ccgctgctgc cgatgcaatg  6780
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ctattgctgg ttcgactatg cccgcgacat ttgccgcatc gacggcctgt tcaatccctg  6900
gtcggaaaag gagacgggac accggctctg gatgtcggaa atcggcgacg ccaggcgcgg  6960
acaaagccgc aaacagaaag tcgcttatgc cagggaggcg gagccggccg gcgtgaagct  7020
gtacgagcgg gcgctggccg atgaggtcac gcccttccac gagctgttcc tgccgcaggc  7080
gatcctgatc gacggcgaag cgcgtcatga cggccgccac acggtgctgg gccaggcggc  7140
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ctttccgaac ttccttgccg gcgacatcgc ggccagcgtt ttcgtgtcgg aataa       7315
<210>2
<211>435
<212>PRT
<213>杜擀氏菌属(Duganella sp.)B2 CGMCC 2056
<400>2
Met Thr Asn Tyr Ser Asp Ile Cys Ile Val Gly Ala Gly Ile Gly Gly
1               5                   10                  15
Leu Ser Cys Ala Thr Gln Leu Ile Asn Ala Ala Ala Gly Lys Asn Leu
           20                  25                  30
Arg Ile Arg Val Phe Asp Met Asp Thr Thr Val Gly Gly Arg Ile Gln
        35                  40                  45
Ser His Lys Val Asp Glu Glu Glu Ile Ala Glu Leu Gly Ala Ala Arg
    50                  55                  60
Tyr Ser Pro Gln Leu His Pro His Phe Glu Gln Leu Met Gln Glu Cys
65                  70                  75                  80
Gly Leu Ala His Ala Thr Tyr Pro Phe Thr Gln Val Val Ser Leu Asp
                85                   90                 95
Gln Ala Gln Glu Lys Leu Lys Ala Thr Leu Leu Ser Leu Ser Ala Met
            100                 105                 110
Leu Lys Lys His Pro Asn Asp Ser Phe Leu Glu Phe Val Ser Gln Tyr
        115                 120                 125
Leu Gly Ala Ala Glu Ala Thr Arg Met Ile Lys Ala Thr Gly Tyr Asp
    130                 135                 140
Ala Leu Leu Leu Pro Val Val Ser Ala Ala Met Ala Tyr Asp Ile Ile
145                 150                 155                 160
Lys Lys His Pro Glu Thr Gln Ser Phe Thr Glu Asn Ala Ala Asn Glu
                165                 170                 175
Trp Arg Tyr Ala Thr Asp Gly Tyr Ser Glu Leu Leu Arg Gln Leu Gln
            180                 185                 190
Arg Gln Ala Gln Asp Ala Gly Val Glu Phe Arg Leu Gly His Arg Leu
        195                 200                 205
Leu Ser Val Glu Lys Ser Gly Thr Asp His Val Leu Ala Phe Arg His
    210                 215                 220
Met Gly Asp Thr Gln Met His Arg Ala Arg His Val Ile Thr Thr Leu
225                 230                 235                 240
Pro Pro Thr Ala Met Lys Arg Leu Asn Met Asp Phe Pro Ala Ala Phe
                245                 250                 255
Ser Pro Phe Gln Tyr Asp Ser Leu Pro Leu Phe Lys Gly Phe Leu Thr
            260                 265                 270
Phe Glu Thr Ala Trp Trp Asp Ala Leu Gly Leu Thr Asp Lys Val Leu
        275                 280                 285
Met Ala Asp Asn Pro Leu Arg Lys Ile Tyr Phe Lys Gly Asp Lys Tyr
    290                 295                 300
Leu Val Phe Tyr Thr Asp Ser Ala Ser Ala Thr Tyr Trp Arg Glu Tyr
305                 310                 315                 320
Leu Glu Gln Gly Glu Asp Val Tyr Leu Asp Arg Val Arg His His Leu
                325                 330                 335
Lys Glu Val Leu Pro Leu Asn Gly Gln Pro Leu Pro Gln Ile Lys Ala
            340                 345                 350
His Phe Tyr Lys His Trp Pro His Gly Val Glu Phe Ser Leu Glu Pro
        355                 360                 365
Glu Ala Glu His Pro Ala Thr Leu Leu His Arg Asp Gly Ile Ile Ser
    370                 375                 380
Cys Ser Asp Ala Tyr Thr Ser His Cys Gly Trp Met Glu Gly Ser Leu
385                 390                 395                 400
Ile Ser Ala Gly His Ala Thr Arg Leu Leu Leu Glu Arg Leu Ser His
                405                 410                 415
Pro Pro Ala Gln Ser Gly His Asp Phe Thr Leu Ala Thr Ser Leu Thr
            420                 425                 430
Glu Arg Ala
        435
<210>3
<211>1005
<212>PRT
<213>杜擀氏菌属(Duganella sp.)B2CGMCC 2056
<400>3
Met Ser Ile Leu Asp Phe Pro Arg Phe His Phe Arg Gly Phe Ala Arg
1               5                   10                  15
Ala Asn Val Pro Thr Ala Asn Arg Asn Thr His Gly His Ile Asp Ile
            20                  25                  30
Ala Thr Asn Ala Val Ser Ile Ala Gly Glu Pro Phe Asp Leu Ser Arg
        35                  40                  45
Pro Pro Ser Glu Phe His Glu His Met Lys Gln Leu Ala Pro Arg Phe
    50                  55                  60
Asp Ala Ala Gly Lys Pro Asp Pro Glu Gly Ile Phe Ser Glu Ala Ala
65                  70                  75                  80
Gly Tyr Asn Phe Cys Gly Asn Asn His Phe Ser Trp Glu Asn Ala Arg
                85                  90                  95
Ile Thr Gly Val Gln Leu Arg Asp Gly Glu Val Asp Thr Glu Asp Ala
            100                 105                 110
Leu Val Gly Ala Lys Leu Ala Leu Trp Gly His Tyr Asn Asp Tyr Leu
        115                 120                 125
Arg Thr Thr Val Asn Arg Ala Arg Trp Val Asp Asn Asn Pro Ala Glu
    130                 135                 140
Pro Asp Thr Thr Leu Ile Tyr Ala Gly Gln Phe Thr Leu Ser Gly Lys
145                  150                155                 160
Gln Ala Thr Pro Asn Thr Pro Ser Leu Phe Ser Ala Asp Ile Gly Gln
                165                 170                 175
Ala His Ser Val Arg Trp Val Gly Ser Gly His Ile Ser Glu Arg Ser
            180                 185                 190
Gly His Phe Leu Asp Asp Glu Phe Gly Arg Ser Arg Leu Phe Gln Phe
        195                 200                 205
Ser Val Ala Lys Leu Asp Pro His Phe Leu Phe Asn Pro Asp Thr Pro
    210                 215                 220
Leu Pro Ala Ser Met Arg Ala Leu Gln Glu Ala Leu Ala Asp Glu Asp
225                 230                 235                 240
Val Leu Gly Leu Thr Val Gln Tyr Ala Leu Phe Asn Met Ser Thr Pro
                245                 250                 255
Gln Lys Pro Asp Ser Pro Val Phe Tyr Asp Leu Ala Gly Gly Ile Gly
            260                 265                 270
Leu Trp Arg Arg Asp Glu Leu Ala Thr Tyr Pro Ala Gly Arg Leu Leu
        275                 280                 285
Leu Pro Arg Gln Ser Ser Leu Gly Pro Val Leu Val Lys Val His Ala
    290                 295                 300
Asp Arg Val Ser Val Asn Met Pro Thr Ala Ile Pro Phe Thr Thr Arg
305                 310                 315                 320
Glu Ala Gly Ala Val Ser Glu Gln His Pro Thr His Ala Leu Gly Gly
                325                 330                 335
Lys Leu Ala Leu Gly Asp Leu Met Leu His Gly Ala Thr Gly Lys Leu
            340                 345                 350
Ile Ala Arg Ile Pro Gln Gln Leu Tyr Leu Asp Tyr Trp Arg His His
        355                 360                 365
Gly Val Phe Asp Val Pro Leu Leu His Pro Ala Thr Ala Ser Gly Ser
    370                 375                 380
Leu Ser Met Ser Ser Ala Gln Ala Gln Trp Asp Glu Ala Asp Trp Val
385                 390                 395                 400
Leu Gln Ser Asp Ser Asn His Leu Tyr Leu Glu Ala Pro Asn Arg Gln
                405                 410                 415
Arg Gln Gln Asp Phe Pro Gln Thr Ile Thr Val Gln Ser Arg Leu Arg
            420                 425                 430
Gly Glu Leu Ala Ala His Pro Ala Leu Thr Ala Gln Ala Gln Asp Gly
        435                 440                 445
Glu Ile Val Gly Val Arg Val Ala Pro Ser Ala Leu Gly Val Gly Tyr
    450                 455                 460
Ala Asp Leu Thr Leu Thr Gly Arg Arg Ser Gly Ala Thr Arg Ile Met
465                 470                 475                 480
Leu Gly Glu Ala Gln Gly Gln Gln Phe Ile Gly Ala Arg Val Leu Pro
                485                 490                 495
Asp Asp Trp His Leu Asp Asp Ile Pro Ala Glu Gln Val Asp Tyr Ala
            500                 505                 510
Phe Leu Tyr Gln His Val Met Ser Tyr Tyr Glu Leu Val Tyr Pro Phe
        515                 520                 525
Met Ser Asp Lys Val Phe Ser Leu Ala Asp His Cys Lys Cys Glu Thr
    530                 535                 540
Tyr Ser Arg Leu Met Trp Gln Met Cys Asp Pro Gln Asn Arg Asp Lys
545                 550                 555                 560
Ser Tyr Tyr Met Pro Ser Thr Arg Glu Leu Ser Leu Pro Lys Ser Arg
                565                 570                 575
Leu Phe Leu Lys Tyr Leu Thr Gln Val Glu Ala Ala Ala Lys Ser Thr
            580                 585                 590
Leu Pro Gln Ala Val Ala Pro His Val Ile Gly Cys Lys Ala Glu Trp
        595                 600                 605
Ile Ala Glu Leu Lys Lys Ala Ile Asp Leu Glu Leu Ser Leu Met Leu
    610                 615                 620
Gln Tyr Leu Tyr Ala Ala Tyr Ala Ile Pro Asn Tyr Ala Gln Gly Val
625                 630                 635                 640
Lys Leu Val Glu Ala Gly Arg Trp Leu Pro Asp Glu Leu Glu Leu Ala
                645                 650                 655
Cys Gly Thr Glu Asp Arg Arg Arg Asn Ser Gly Ala Arg Gly Ala Leu
            660                 665                 670
Leu Glu Ile Ala His Glu Glu Met Ile His Tyr Leu Met Val Asn Asn
        675                 680                 685
Val Leu Met Ala Leu Gly Glu Pro Phe Tyr Ala Gly Ala Pro Ala Leu
690                 695                 700
Gly Glu Gln Ala Arg Gln Arg Phe Gly Leu Asp Thr Glu Phe Ala Phe
705                 710                 715                 720
Asp Pro Phe Ser Glu His Val Leu Ala Arg Phe Val Arg Phe Glu Trp
                725                 730                 735
Pro Asp Tyr Leu Pro Thr Pro Gly Lys Ser Ile Ala Thr Phe Tyr Ala
            740                 745                 750
Ala Ile Arg Gln Ala Val Ala Asp Leu Pro Asp Leu Phe Asp Ala Asp
        755                 760                 765
Gly Gly Lys Arg Gly Gly Glu His His Leu Phe Leu Lys Glu Leu Thr
    770                 775                 780
Asn Arg Ala Tyr Pro Ala Tyr Gln Leu Glu Val Ser Asp Arg Asp Ser
785                 790                 795                 800
Ala Leu Phe Ala Leu Asp Phe Val Thr Glu Gln Gly Glu Gly Val Ala
                805                 810                 815
Val Glu Ser Pro His Phe Ala Val Ser His Phe Gln Arg Leu Arg Ala
            820                 825                 830
Leu Ala Gly Arg Phe Ser Ala Arg Glu Lys Pro Phe Glu Pro Ala Val
        835                 840                 845
Pro Ala Leu Lys Asn Pro Val Leu Asp Pro Arg Ala Asp Cys Thr Val
    850                 855                 860
Val Thr Asp Pro Lys Ala Arg Ser Leu Met Gln Leu Tyr Gln Gly Cys
865                 8708                 758                 80
Tyr Glu Leu Thr Phe Ala Leu Met Ala His His Phe Ala Gln Lys Pro
                885                 890                 895
Leu Gly Ser Leu Arg Arg Ser Arg Leu Met Asn Ala Ser Ile Asp Ile
            900                 905                 910
Met Thr Gly Leu Leu Arg Pro Leu Ser Ala Ala Leu Met Asn Met Pro
        915                 920                 925
Ser Gly Val Pro Gly Arg Asn Ala Gly Pro Pro Val Pro Gly Pro Ala
    930                 935                 940
Asp Thr Ala Ile Ser Ser Asp Tyr Ser Leu Gly Cys Glu Leu Leu Ala
945                 950                 955                 960
Gln Lys Cys Leu Ala Leu Ala Gln Tyr Ala Arg Ser Leu Glu Ala Glu
                965                 970                 975
Val Ala Ser Thr Ala Gln Ile Asp Met Leu Glu Phe Phe Asn Gln Gln
            980                 985                 990
Leu Thr Asp Leu Ser Arg Gly Lys Met Ser Arg Glu Ala
        995                 1000                 1005
<210>4
<211>429
<212>PRT
<213>杜擀氏菌属(Duganella sp.)B2 CGMCC 2056
<400>4
Met His Lys Ile Ile Ile Val Gly Gly Gly Leu Ala Gly Ser Leu Thr
1               5                   10                  15
Ala Thr Tyr Leu Ala Gln Arg Gly His Glu Val His Val Ile Glu Lys
            20                  25                  30
Arg Gly Asp Pro Leu Arg Ala Glu Ser Ala Asn Ala Asp Pro Val Asn
        35                  40                  45
Ser Arg Ala Ile Gly Val Ser Met Thr Val Arg Gly Ile Lys Ala Val
    50                  55                  60
Leu Ala Ala Gly Ile Ser Lys Glu Glu Leu Asp Arg Cys Gly Glu Pro
65                  70                  75                  80
Val Val Gly Met Ala Phe Ser Val Gly Gly Gly His Lys Val Arg Glu
                85                  90                  95
Leu Thr Pro Leu Glu Gly Leu Phe Pro Leu Ser Leu Asp Arg Thr Ala
            100                 105                 110
Phe Gln Arg Leu Leu Asn Lys Tyr Ala Val Met His Lys Val Asn Tyr
        115                 120                 125
Tyr Phe Glu His Lys Cys Leu Asp Leu Asp Leu Asp Lys Lys Ser Val
    130                 135                 140
Leu Ile Gln Gly Pro Asp Gly Ala Leu Arg His Leu Gln Gly Asp Leu
145                 150                 155                 160
Ile Ile Gly Ala Asp Gly Ala His Ser Ala Val Arg Arg Ala Met Gln
                165                 170                 175
Ala Gly Met Arg Arg Phe Gln Phe Glu Gln Ser Phe Phe Arg His Gly
            180                 185                 190
Tyr Lys Thr Leu Val Leu Pro Asn Ala Ala Gly Leu Gly Phe Arg Lys
        195                 200                 205
Asp Leu Leu Tyr Phe Phe Gly Met Asp Ser Lys Gly Gln Phe Ala Gly
    210                 215                 220
Arg Ala Ala Thr Ile Pro Asp Gly Ser Ile Ser Phe Ala Leu Cys Leu
225                 230                 235                 240
Pro Tyr Thr Gly Thr Pro Ser Leu Ala Thr Arg Asp Arg Ala Ala Met
                245                 250                 255
Gly Glu Phe Phe Ser Arg Tyr Phe Gly Ile Leu Pro Pro Ala Ser Arg
            260                 265                 270
Glu Glu Leu Val Asn Gln Phe Ile Ala Leu Pro Ser Asn Asp Leu Ile
        275                 280                 285
Asn Val Arg Ser Ser Thr Phe His Tyr Lys Ser Asn Val Leu Leu Ile
    290                 295                 300
Gly Asp Ala Ala His Ala Thr Ala Pro Phe Leu Gly Gln Gly Met Asn
305                 310                 315                 320
Met Ala Leu Glu Asp Val Tyr Val Phe Ile Thr Leu Leu Glu Lys His
                325                 330                 335
Arg Asp Asp Leu Gly Leu Val Leu Ser Glu Phe Thr Gly Gln Arg Lys
            340                 345                 350
Val Gln Ala Asp Ala Met Gln Asp Met Ala Ile Ala Asn Tyr Glu Met
        355                 360                 365
Leu Ser Asn Pro Asn Phe Ile Phe Phe Leu Gln Thr Arg Tyr Thr Arg
    370                 375                 380
Tyr Met His Lys Lys Phe Pro Ser Val Tyr Pro Pro Asp Met Ala Glu
385                 390                 395                 400
Lys Leu Tyr Phe Thr Ser Val Pro Tyr Asp Val Leu Gln Gln Ile Gln
                405                 410                 415
Lys Lys Gln Asn Val Trp Tyr Lys Leu Gly Arg Val Asn
            420                 425
<210>5
<211>372
<212>PRT
<213>杜擀氏菌属(Duganella sp.)B2 CGMCC 2056
<400>5
Met Lys Ile Leu Val Ile Gly Ala Gly Pro Ala Gly Leu Ile Phe Ala
1               5                   10                  15
Ser Gln Met Lys Gln Ala Gln Pro Ala Trp Asp Ile Ser Val Ala Glu
            20                  25                  30
Lys Asn Thr Gln Glu Glu Val Leu Gly Trp Gly Val Val Leu Pro Gly
        35                  40                  45
Arg Pro Pro Arg His Pro Ala Asn Pro Leu Ser Tyr Leu Glu Gln Pro
    50                  55                  60
Glu Leu Leu Asn Pro Gln Phe Leu Glu Glu Phe Lys Leu Val His His
65                  70                   75                 80
Asp Gln Pro Asn Leu Met Ser Thr Gly Val Thr Leu Cys Gly Val Gly
                85                   90                 95
Arg Gln Val Leu Val Gln Ala Leu Arg Ala Lys Cys Val Ala Ala Gly
            100                 105                 110
Ile Thr Val Ser Tyr Glu Thr Pro Leu Ala Ser Val Ala Gln Leu Glu
        115                 120                 125
Ala Glu Tyr Asp Leu Val Val Val Ser Asn Gly Ile Asn His Lys Ser
    130                 135                 140
Leu Glu Leu Pro Pro Ala Leu Ala Ala Gln Val Glu Phe Gly Lys Asn
145                 150                 155                 160
Lys Tyr Ile Trp Tyr Gly Thr Thr Gln Leu Phe Asp Gln Met Asn Leu
                165                 170                 175
Val Phe Arg Glu Asn Ser Asn Gly Val Phe Ala Gly His Ala Tyr Lys
            180                 185                 190
Tyr Ser Asp Thr Met Ser Thr Phe Ile Val Glu Cys Ser Glu Glu Thr
        195                 200                 205
Tyr Ala Lys Ala Glu Leu Glu Phe Arg Ser Glu Arg Asp Ala Ala Ala
    210                 215                 220
Tyr Ile Ala Lys Thr Phe Ala Pro Glu Leu Gly Glu His Arg Leu Val
225                 230                 235                 240
Ser Gln Pro Gly Gln Gly Trp Arg Asn Phe Met Thr Leu Ser Arg Glu
                245                 250                 255
Val Ala Ser Asp Gly Lys Phe Val Leu Ile Gly Asp Ala Leu Gln Ser
            260                 265                 270
Gly His Phe Ser Ile Gly His Gly Thr Thr Met Ala Val Val Val Ala
        275                 280                 285
Gln Leu Leu Val Lys Thr Leu Ser Ala Glu Ala Gly Thr Ala Ala Ala
    290                 295                 300
Leu Ala Ser Phe Asn Ala Arg Ala Leu Pro Leu Val Gln Leu Phe Lys
305                 310                 315                 320
Glu His Ala Asp Ala Ser Arg Leu Trp Phe Glu Thr Val Ser Glu Arg
                325                 330                335
Val Gly Leu Gly Asn Ala Glu Leu Thr Ala Ser Phe Asp Ala Arg Arg
            340                 345                 350
Asn His Leu Pro Pro Leu Gln Asp Ala Leu Met Ala Ser Leu Gly Tyr
        355                 360                 365
Ala Leu Gly Arg
    370
<210>6
<211>191
<212>PRT
<213>杜擀氏菌属(Duganella sp.)B2 CGMCC 2056
<400>6
Met Pro Pro His Ala Thr Pro Pro Leu Leu Pro Met Gln Trp Ser Ser
1               5                   10                  15
Ala Tyr Ile Ser Tyr Trp Ser Pro Met Arg Glu Asp Asp Glu Val Thr
            20                  25                  30
Ser Gly Tyr Cys Trp Phe Asp Tyr Ala Arg Asp Ile Cys Arg Ile Asp
        35                  40                  45
Gly Leu Phe Asn Pro Trp Ser Glu Lys Glu Thr Gly His Arg Leu Trp
    50                  55                  60
Met Ser Glu Ile Gly Asp Ala Arg Arg Gly Gln Ser Arg Lys Gln Lys
65                  70                  75                  80
Val Ala Tyr Ala Arg Glu Ala Glu Pro Ala Gly Val Lys Leu Tyr Glu
                85                  90                  95
Arg Ala Leu Ala Asp Glu Val Thr Pro Phe His Glu Leu Phe Leu Pro
            100                 105                 110
Gln Ala Ile Leu Ile Asp Gly Glu Ala Arg His Asp Gly Arg His Thr
        115                 120                 125
Val Leu Gly Gln Ala Ala Asp Ala Trp Val Val Glu Arg Pro Gly Lys
    130                 135                 140
Ala Ala Ser Val Phe Tyr Leu Gln Ala Gly Gly Asn His Leu Leu Arg
145                 150                 155                 160
Met Val Thr Gly Asn Asp Ala Gln His Gln Ser Val Arg Asp Phe Pro
                165                 170                 175
Asn Phe Leu Ala Gly Asp Ile Ala Ala Ser Val Phe Val Ser Glu
            180                 185                 190
<210>7
<211>367
<212>PRT
<213>大肠杆菌属大肠杆菌(Escherichia coli)
<400>7
Met Lys Ile Glu Glu Gly Lys Leu Val Ile Trp Ile Asn Gly Asp Lys
1               5                   10                  15
Gly Tyr Asn Gly Leu Ala Glu Val Gly Lys Lys Phe Glu Lys Asp Thr
            20                  25                  30
Gly Ile Lys Val Thr Val Glu His Pro Asp Lys Leu Glu Glu Lys Phe
        35                  40                  45
Pro Gln Val Ala Ala Thr Gly Asp Gly Pro Asp Ile Ile Phe Trp Ala
    50                  55                  60
His Asp Arg Phe Gly Gly Tyr Ala Gln Ser Gly Leu Leu Ala Glu Ile
65                  70                  75                  80
Thr Pro Asp Lys Ala Phe Gln Asp Lys Leu Tyr Pro Phe Thr Trp Asp
                85                  90                  95
Ala Val Arg Tyr Asn Gly Lys Leu Ile Ala Tyr Pro Ile Ala Val Glu
            100                 105                 110
Ala Leu Ser Leu Ile Tyr Asn Lys Asp Leu Leu Pro Asn Pro Pro Lys
        115                 120                 125
Thr Trp Glu Glu Ile Pro Ala Leu Asp Lys Glu Leu Lys Ala Lys Gly
    130                 135                 140
Lys Ser Ala Leu Met Phe Asn Leu Gln Glu Pro Tyr Phe Thr Trp Pro
145                 150                 155                 160
Leu Ile Ala Ala Asp Gly Gly Tyr Ala Phe Lys Tyr Glu Asn Gly Lys
                165                 170                 175
Tyr Asp Ile Lys Asp Val Gly Val Asp Asn Ala Gly Ala Lys Ala Gly
            180                 185                 190
Leu Thr Phe Leu Val Asp Leu Ile Lys Asn Lys His Met Asn Ala Asp
        195                 200                 205
Thr Asp Tyr Ser Ile Ala Glu Ala Ala Phe Asn Lys Gly Glu Thr Ala
    210                 215                 220
Met Thr Ile Asn Gly Pro Trp Ala Trp Ser Asn Ile Asp Thr Ser Lys
225                 230                 235                 240
Val Asn Tyr Gly Val Thr Val Leu Pro Thr Phe Lys Gly Gln Pro Ser
                245                 250                 255
Lys Pro Phe Val Gly Val Leu Ser Ala Gly Ile Asn Ala Ala Ser Pro
            260                 265                 270
Asn Lys Glu Leu Ala Lys Glu Phe Leu Glu Asn Tyr Leu Leu Thr Asp
        275                 280                 285
Glu Gly Leu Glu Ala Val Asn Lys Asp Lys Pro Leu Gly Ala Val Ala
    290                 295                 300
Leu Lys Ser Tyr Glu Glu Glu Leu Ala Lys Asp Pro Arg Ile Ala Ala
305                 310                 315                 320
Thr Met Glu Asn Ala Gln Lys Gly Glu Ile Met Pro Asn Ile Pro Gln
                325                 330                 335
Met Ser Ala Phe Trp Tyr Ala Val Arg Thr Ala Val Ile Asn Ala Ala
            340                 345                 350
Ser Gly Arg Gln Thr Val Asp Glu Ala Leu Lys Asp Ala Gln Thr
        355                 360                 365

Claims (9)

1、一种紫色杆菌素合成相关蛋白质系统,是由如下1)至5)中五种蛋白质组成的:
1)其氨基酸序列为序列表中的序列2或在序列表中序列2所示的氨基酸序列中经过取代和/或缺失和/或添加一个或几个氨基酸且与紫色杆菌素合成相关的由序列2限定的蛋白质衍生的蛋白质;
2)其氨基酸序列为序列表中的序列3或在序列表中序列3所示的氨基酸序列中经过取代和/或缺失和/或添加一个或几个氨基酸且与紫色杆菌素合成相关的由序列3限定的蛋白质衍生的蛋白质;
3)其氨基酸序列为序列表中的序列4或在序列表中序列4所示的氨基酸序列中经过取代和/或缺失和/或添加一个或几个氨基酸且与紫色杆菌素合成相关的由序列4限定的蛋白质衍生的蛋白质;
4)其氨基酸序列为序列表中的序列5或在序列表中序列5所示的氨基酸序列中经过取代和/或缺失和/或添加一个或几个氨基酸且与紫色杆菌素合成相关的由序列5限定的蛋白质衍生的蛋白质;
5)其氨基酸序列为序列表中的序列6或在序列表中序列6所示的氨基酸序列中经过取代和/或缺失和/或添加一个或几个氨基酸且与紫色杆菌素合成相关的由序列6限定的蛋白质衍生的蛋白质。
2、编码权利要求1所述蛋白系统的基因簇。
3、根据权利要求2所述的基因簇,其特征在于:所述基因簇为如下1)或2)或3)的DNA分子:
1)其核苷酸序列是序列表中序列1;
2)在严格条件下可与序列表中序列1限定的DNA序列杂交且编码紫色杆菌素合成相关蛋白系统的DNA分子;
3)与1)的基因具有90%以上的同源性,且编码紫色杆菌素合成相关蛋白系统的DNA分子。
4、含有权利要求2或3所述基因簇的重组表达载体。
5、根据权利要求4所述的重组表达载体,其特征在于:所述重组表达载体为在表达载体pET30a的多克隆位点插入权利要求2或3所述基因簇得到的重组载体。
6、扩增权利要求2或3所述基因簇全长或任一片段的引物对。
7、含有权利要求2或3所述基因簇的转基因细胞系或重组菌。
8、一种生产紫色杆菌素的方法,是将权利要求2或3所述的基因簇转入大肠杆菌中获得重组大肠杆菌,培养所述重组大肠杆菌生产紫色杆菌素。
9、根据权利要求9所述的方法,其特征在于:所述大肠杆菌为BL21-CodonPlus(DE3)-RIL。
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