一种产1,3-丙二醇基因工程菌及其制备方法和应用
技术领域
本发明属于生物化工领域,涉及一种产1,3-丙二醇基因工程菌及其制备方法和应用。
背景技术
1,3-丙二醇(PDO)是一种重要的化工和医药中间体原料,是合成新型聚酯高分子材料聚对苯二甲酸丙二酯(PTT)的单体。与聚对苯二甲酸乙二酯(PET)、聚对苯二甲酸丁二酯(PBT)和尼龙等比较,PTT具有良好的印染特性、富有弹性、抗紫外线、静电性好、可生物降解并再生利用等多种优良特性,因此PTT在纺织服装业、地毯装饰业、工程塑料等众多领域有着十分广阔的应用前景。据估计,目前仅我国每年就需求PDO上百万吨,而且在未来十年我国对PDO的需求量还将继续增大。PTT是目前国际上公认的六大石化新产品之一。PTT生产的关键在于单体原料PDO的来源,其生产成本直接影响着PTT的工业化生产和应用规模。
1,3-丙二醇的生产方法主要有化学合成法和微生物发酵法。化学合成法目前仅有国外DuPont和Shell公司以及国内的少数几家单位在进行小规模工业化生产。技术路线分别是德国Degussa公司的丙烯醛合成法专利技术和Shell公司开发的环氧乙烷合成法,并用于聚合生产PTT。为了垄断市场,这两家跨国公司不对外销售用于PTT生产的PDO,而只向客户销售PTT切片及其下游产品。同时,化学合成法存在设备投资大、工艺要求严格、操作条件苛刻、有毒副产物多、产品提取难度大、三废处理成本高以及生产原料依赖于不可再生的石油资源等问题,导致PTT材料及其原料产品PDO的价格一直居高不下,制约其进一步的发展,因而我们采用微生物发酵法生产PDO,以可再生资源——碳水化合物为原料,具有操作简便、反应条件相对温和、副产物少、污染少且容易处理以及成本低廉等优点,引起了国内外相关企业和研究单位的高度重视,将具有广泛的应用情景和开发潜力。
微生物发酵法的生产方法包括:一是利用从自然界获得的菌株以甘油为底物直接发酵生产1,3-丙二醇;二是构建基因工程菌以葡萄糖或甘油为底物发酵生产1,3-丙二醇;基因工程菌构建策略主要有5种:
(1)强化原始菌株中还原途径限速酶的表达及阻止副产物的代谢途径;
(2)将1,3-丙二醇生产菌的关键酶基因dhaB、dhaT基因克隆到甘油生产菌中,以希望能获得将葡萄糖转化为1,3-丙二醇的基因工程菌;
(3)将甘油生产菌的DAR1、GPP2基因克隆到1,3-丙二醇生产菌中,以希望能获得将葡萄糖转化为1,3-丙二醇的基因工程菌;
(4)将产1,3-丙二醇的dha调控子基因克隆到大肠杆菌中,获得能转化甘油为1,3-丙二醇的基因工程菌;
(5)将1,3-丙二醇生产菌的关键酶基因dhaB、dhaT基因和甘油生产菌的DAR1、GPP2基因克隆到大肠杆菌中,从而获得能将葡萄糖转化为1,3-丙二醇的基因工程菌。
目前,国外DuPont公司已经在大肠杆菌中成功构建了以葡萄糖为底物发酵1.3-丙二醇的途径,产量高达135g/L。国内众多研究机构也纷纷针对产1,3-丙二醇途径中的关键酶进行了深入的研究,在模式大肠杆菌成功表达关键酶基因,但产量水平较低,而针对原始生产菌株肺炎克雷伯氏菌的基因工程手段改造鲜见报道,随着国际范围内生物柴油工业的广泛兴起,将产生大量的剩余副产品甘油,为利用发酵法制备1,3-丙二醇提供的一定了丰富的原料。
发明内容
本发明的目的是提供一种产1,3-丙二醇基因工程菌。
本发明另一个目的是提供上述产1,3-丙二醇基因工程菌的制备方法。
本发明还有一个目的是提供上述产1,3-丙二醇基因工程菌的应用。
本发明的目的是通过下列技术措施实现的:
一种产1,3-丙二醇基因工程菌,其分类命名为Klebsiella pneumoniae ATCC25955-pUC18-yqhD-TetR。
所述的产1,3-丙二醇基因工程菌,该工程菌是通过下列方法制备得到的:利用PCR技术从大肠杆菌中扩增出1,3-丙二醇氧化还原酶同功酶基因yqhD(SEQ ID No.5),从质粒载体pHY300PLK中扩增出四环素抗性基因TetR(SEQ ID No.6),通过多克隆位点将其串联到表达载体pUC18的合适位置,TetR基因置于yqhD的下游,得到重组质粒pUC18-yqhD-TetR,重组质粒转化肺炎克雷伯氏菌Klebsiella pneumoniae ATCC 25955,得到重组的肺炎克雷伯氏菌,即产1,3-丙二醇基因工程菌Klebsiella pneumoniae ATCC25955-pUC18-yqhD-TetR。
进一步,所述的产1,3-丙二醇基因工程菌通过下列方法制备得到:
(1)基因yqhD的克隆:根据Genebank公布的大肠杆菌E.coli K12中yqhD基因的序列设计合成PCR所需的引物:
P1:5’-GAATTCATGAGCTATCGTATGTTTG-3’(SEQ ID No.1)
P2:5’-GGATCCCACTCAGAATGCCTGGCGG-3’(SEQ ID No.2)
引物两端分别引入EcoR I,BamHI,以大肠杆菌E.coli JM108或E.coli JM109基因组DNA为模板完成PCR反应;PCR反应条件:95℃变性5min,经94℃30sec,52℃30sec,72℃1min,30个循环,再经过72℃延伸3min,获得的PCR产物经电泳分析确认,经PCR产物纯化试剂盒纯化后,与pMD18-T载体连接,进行序列测定,EcoR I,BamHI酶切重组pMD18-T载体,回收其中1.16kb片段,根据所述酶切位点连接至pUC18载体的合适位置,获得重组质粒pUC18-yqhD;
(2)基因TetR的克隆:根据质粒载体pHY300PLK中四环素抗性基因序列设计合成PCR所需的引物:
P3:5’-GGATCCATGAAATACTGAATTTAAAA-3’(SEQ ID No.3)
P4:5’-AAGCTTCTTAACGATTTAGAAATCCC-3’(SEQ ID No.4)
引物两端分别引入BamHI,Hind III,以质粒pHY300PLK为模板完成PCR反应;PCR反应条件:95℃变性5min,经94℃30sec,52℃30sec,72℃1min,30个循环,再经过72℃延伸3min,获得的PCR产物经电泳分析确认,经PCR产物纯化试剂盒纯化后,与pMD18-T载体连接,经BamHI,Hind III酶切回收其中1.56kb片段,根据所述酶切位点连接至pUC18-yqhD载体的合适位置,TetR基因置于yqhD的下游,得到重组质粒pUC18-yqhD-TetR;
(3)重组基因工程菌的获得:将重组质粒pUC18-yqhD-TetR转化肺炎克雷伯氏菌Klebsiella pneumoniae ATCC 25955,涂布含40μg/mL的四环素平板,挑取阳性转化子,并进行菌落PCR鉴定,得到重组肺炎克雷伯氏菌,命名为Klebsiella pneumoniae ATCC25955-pUC18-yqhD-TetR。
所述的产1,3-丙二醇基因工程菌的制备方法,该方法包括下列步骤:利用PCR技术从大肠杆菌中扩增出1,3-丙二醇氧化还原酶同功酶基因yqhD,从质粒载体pHY300PLK中扩增出四环素抗性基因TetR,利用多克隆位点将其串联到表达载体pUC18的合适位置,TetR基因置于yqhD的下游,得到重组质粒pUC18-yqhD-TetR,重组质粒转化肺炎克雷伯氏菌Klebsiella pneumoniae ATCC25955,得到重组肺炎克雷伯氏菌,即产1,3-丙二醇基因工程菌Klebsiella pneumoniae ATCC25955-pUC18-yqhD-TetR。
进一步,所述的产1,3-丙二醇基因工程菌的制备方法包括下列步骤:
(1)基因yqhD的克隆:根据Genebank公布的大肠杆菌E.coli K12中yqhD基因的序列设计合成PCR所需的引物:
P1:5’-GAATTCATGAGCTATCGTATGTTTG-3’
P2:5’-GGATCCCACTCAGAATGCCTGGCGG-3’
引物两端分别引入EcoR I,BamHI,以大肠杆菌E.coli JM108或E.coli JM109基因组DNA为模板完成PCR反应;PCR反应条件:95℃变性5min,经94℃30sec,52℃30sec,72℃1min,30个循环,再经过72℃延伸3min,获得的PCR产物经电泳分析确认,经PCR产物纯化试剂盒纯化后,与pMD18-T载体连接,进行序列测定,EcoR I,BamHI酶切重组pMD18-T载体,回收其中1.16kb片段,根据所述酶切位点连连接至pUC18载体的合适位置,获得重组质粒pUC18-yqhD;
(2)基因TetR的克隆:根据质粒载体中pHY300PLK四环素抗性基因序列设计合成PCR所需的引物:
P3:5’-GGATCCATGAAATACTGAATTTAAAA-3’
P4:5’-AAGCTTCTTAACGATTTAGAAATCCC-3’
引物两端分别引入BamHI,Hind III,以质粒pHY300PLK为模板完成PCR反应;PCR反应条件:95℃变性5min,经94℃30sec,52℃30sec,72℃1min 30个循环,再经过72℃延伸3min,获得的PCR产物经电泳分析确认,经PCR产物纯化试剂盒纯化后,与pMD18-T载体连接,经BamHI,HindIII酶切回收其中1.56kb片段,根据所述酶切位点连连接至pUC18-yqhD载体的合适位置,TetR基因置于yqhD的下游,得到重组质粒pUC18-yqhD-TetR;
(3)重组基因工程菌的获得:将重组质粒pUC18-yqhD-TetR转化肺炎克雷伯氏菌Klebsiella pneumoniae ATCC 25955,涂布含40μg/mL的四环素平板,挑取阳性转化子,并进行菌落PCR鉴定,得到重组肺炎克雷伯氏菌,命名为Klebsiella pneumoniae ATCC25955-pUC18-yqhD-TetR。
所述的产1,3-丙二醇基因工程菌Klebsiella pneumoniae ATCC25955-pUC18-yqhD-TetR在生产1,3-丙二醇中的应用。
所述的应用,该基因工程菌以甘油为底物发酵生产1,3-丙二醇,具体生产工艺为:
(1)出发菌株:Klebsiella pneumoniae ATCC 25955-pUC18-yqhD-TetR;
(2)种子培养基:酵母膏4-5g/l,麦芽3.0-4.0g/l,蛋白胨4-5g/l,NaCl 8-12g/l,四环素浓度20-40μg/l;
种子培养:250ml三角瓶,装液量35ml,培养温度31-37℃,摇床转速120-180r/min,培养12-24h;
(3)发酵培养:
培养基组成:酵母膏4-5g/l,K2HPO4·3H2O 8-12g/l,KH2PO4 1.5-2.5g/l,NH4Cl 0.8-1g/l,NaCl 0.3-0.6g/l,MgSO4·7H2O 0.08-0.12g/l,FeCl3·6H2O 25-35mg/l,CoCl2·6H2O 4-6mg/l,VitaminB12 4-6mg/l,glycerol 50-70g/l;
培养条件:接种量10v/v%,发酵温度31-37℃,接种6小时好氧发酵,加入IPTG诱导,IPTG的终浓度1.0mmol/L,此后,控制氧气的通入量(0.4-0.8L/min),维持微氧环境发酵即可。
分批补料流加甘油维持甘油浓度在20-30g/L。发酵时间30-60h。
本发明有益效果:
本发明在于提供一种新型基因工程菌,用于发酵产1,3-丙二醇,该菌在微氧条件下利用甘油高效发酵产1,3-丙二醇,突破了传统的厌氧发酵途径和微氧条件下低效率生产1,3-丙二醇的局限。分批补料发酵完毕:可利用130g/L的甘油,得到1,3-丙二醇73g/L,摩尔转化率近68%,接近理论最高水平(理论转化率72%);在相同条件下,原始菌株只能利用120g/L的甘油,得到53g/L的1,3-丙二醇,与原始克雷伯氏菌相比,重组菌株的生产1,3-丙二醇的能力得到显著提高,提高了对底物甘油的利用能力和转化率。与目前文献所报道利用基因手段构建重组微生物生产1,3-丙二醇方法相比,不仅质粒在宿主菌株中稳定性高,而且产物终浓度也较高(目前文献所报道的利用基因工程手段改造肺炎克雷伯氏菌生产1,3-丙二醇的产量在45g/L左右,质粒稳定性在40-50%左右,ZhengPing,Process Biochemistry 41(2006)2160-2169),另外还可在发酵过程中添加微量四环素,达到抑制部分杂细菌的目的,大大减少了在工业化过程中较易发生的染杂菌现象,提高产物质量,发酵时间也有所缩短,为微生物发酵法工业化生产1,3-丙二醇奠定了良好的基础。
具体实施方式
以下通过实施例对本发明作进一步的阐述。
实施例1:Klebsiella pneumoniae ATCC 25955-pUC18-yqhD-TetR的构建
(1)基因yqhD的克隆:根据Genebank公布的大肠杆菌E.coli K12中yqhD基因的序列设计合成PCR所需的引物:
P1:5’-GAATTCATGAGCTATCGTATGTTTG-3’(SEQ ID No.1)
P2:5’-GGATCCCACTCAGAATGCCTGGCGG-3’(SEQ ID No.2)
引物两端分别引入EcoR I,BamHI,以大肠杆菌E.coli JM 108或E.coli JM 109基因组DNA为模板完成PCR反应:PCR反应条件:95℃变性5min,经94℃30sec,52℃30sec,72℃1min,30个循环,再经过72℃延伸3min,获得的PCR产物经电泳分析确认,经PCR产物纯化试剂盒纯化后,与pMD18-T载体连接,进行序列测定,EcoR I,BamHI酶切重组pMD18-T载体,回收其中1.16kb片段,连接至pUC18载体,获得重组质粒pUC18-yqhD
(2)基因TetR的克隆:根据质粒载体中pHY300PLK四环素抗性基因序列设计合成PCR所需的引物:
P3:5’-GGATCCATGAAATACTGAATTTAAAA-3’(SEQ ID No.3)
P4:5’-AAGCTTCTTAACGATTTAGAAATCCC-3’(SEQ ID No.4)
引物两端分别引入BamHI,Hind III,以质粒pHY300PLK为模板完成PCR反应:PCR反应条件:95℃变性5min,经94℃30sec,52℃30sec,72℃1min,30个循环,再经过72℃延伸3min,获得的PCR产物经电泳分析确认,经PCR产物纯化试剂盒纯化后,与pMD18-T载体连接,经BamHI,Hind III酶切回收其中1.56kb片段,连接至pUC18-yqhD载体的合适位置,TetR基因置于yqhD的下游,得到重组质粒pUC18-yqhD-TetR。
实施例2:重组质粒pUC18-yqhD-TetR转化肺炎克雷伯氏菌Klebsiella pneumoniaeATCC25955
利用电穿孔仪将重组质粒pUC18-yqhD-TetR转化肺炎克雷伯氏菌Klebsiellapneumoniae ATCC 25955,电转化条件参数为:电压2.5kv,阻值200Ω,脉冲时间4.5msec。电击转化完毕,将经过电击处理过的Klebsiella pneumoniae ATCC25955涂布于含有40μg/m L四环素的LB培养基上,得到阳性克隆Klebsiella pneumoniaeATCC25955-pUC18-yqhD-TetR。
实施例3:工程菌Klebsiella pneumoniae ATCC25955-pUC18-yqhD-TetR的质粒稳定性考察
考察方法:从新鲜转化平板上挑取单菌落接种至3mL不含四环素的LB培养基中,37℃下培养12h作种子,转种培养24h,即为传种20代,转种培养5次,即为100代,将上述菌液涂布于不含抗生素的LB板上,从中挑选100个单菌落分别点在添加和不添加四环素的平板上,37℃下培养12~16h,比较在添加和不添加四环素的平板上的菌落数即得其稳定性。
考察结果:传种100代之后其质粒稳定性为100%。
实施例4:工程菌Klebsiella pneumoniae ATCC 25955-pUC18-yqhD-TetR利用甘油在摇瓶中发酵产1,3-丙二醇
(1)出发菌株:Klebsiella pneumoniae ATCC 25955-pUC18-yqhD-TetR;
(2)种子培养基:酵母膏5g/l,麦芽3.0g/l,蛋白胨5g/l,NaCl.0g/l;
种子培养:250ml三角瓶,装液量35ml,培养温度31℃,摇床转速180r/min,培养12h;
(3)发酵培养:
培养基组成:酵母膏5g/l,K2HPO4·3H2O 10g/l,KH2PO4 2g/l,NH4Cl 1g/l,NaCl0.5g/l,MgSO4·7H2O 0.1g/l,FeCl3·6H2O 30mg/l,CoCl2·6H2O 5mg/l,VitaminB12 5mg/l,glycerol 60g/l;
发酵培养条件:250ml摇瓶,装液量100ml,接种量5~10%(v/v),发酵温度37℃,摇床转速110rpm,发酵时间20h左右。
发酵结果:60g/l的底物甘油经转化得到33.8g/l的1,3-丙二醇。
对比例1:原始菌Klebsiella pneumoniae ATCC25955利用甘油在摇瓶中发酵产1,3-丙二醇
(1)出发菌株:Klebsiella pneumoniae ATCC25955
(2)种子培养基:酵母膏5g/l,麦芽3.0g/l,蛋白胨5g/l,NaCl 10g/l,
种子培养:250ml三角瓶,装液量35ml,培养温度31℃,摇床转速180r/min,培养12h。
(3)发酵培养:
培养基组成:酵母膏5g/l,K2HPO4·3H2O 10g/l,KH2PO4 2g/l,NH4Cl 1g/l,NaCl 0.5g/l,MgSO4·7H2O 0.1g/l,FeCl3·6H2O 30mg/l,CoCl2·6H2O 5mg/l,VitaminB12 5mg/l,glycerol 60g/l
发酵培养条件:250ml摇瓶,装液量100ml,接种量5~10%(v/v),发酵温度37℃,摇床转速110rpm,发酵时间20h左右。
发酵结果:60g/l的底物甘油经转化得到29.8g/l的1,3-丙二醇。
实施例5:工程菌Klebsiella pneumoniae ATCC 25955-pUC18-yqhD-TetR利用甘油在3L发酵罐中分批补料发酵生产产1,3-丙二醇
(1)出发菌株:Klebsiella pneumoniae ATCC 25955-pUC18-yqhD-TetR;
(2)种子培养基:酵母膏5g/l,麦芽3.0g/l,蛋白胨5g/l,NaCl 10g/l;
种子培养:250ml三角瓶,装液量35ml,培养温度31℃,摇床转速180r/min,培养12h。
(3)发酵培养:
培养基组成:酵母膏5g/l,K2HPO4·3H2O 10g/l,KH2PO4 2g/l,NH4Cl 1g/l,NaCl0.5g/l,MgSO4·7H2O 0.1g/l,FeCl3·6H2O 30mg/l,CoCl2·6H2O 5mg/l,VitaminB12 5mg/l,glycerol 30g/l;
培养条件:3L发酵罐(New Brunswick Scientific,NJ),接种量10%(v/v),发酵温度37℃,接种6小时好氧发酵,6小时之后控制通气量(0.4-0.8L/min)维持微氧环境发酵。发酵时间45±1h,分批补料流加甘油维持甘油浓度在25±1g/L。
发酵结果:底物甘油消耗130g/L,产物1,3-丙二醇浓度73g/L。
对比例2:原始菌Klebsiella pneumoniae ATCC25955利用甘油在3L发酵罐中添加分批补料发酵生产产1,3-丙二醇
(1)出发菌株:Klebsiella pneumoniae ATCC25955
(2)种子培养基:酵母膏5g/l,麦芽3.0g/l,蛋白胨5g/l,NaCl 10g/l;
种子培养:250ml三角瓶,装液量35ml,培养温度31℃,摇床转速180r/min,培养12h。
(3)发酵培养:
培养基组成:酵母膏5g/l,K2HPO4·3H2O 10g/l,KH2PO4 2g/l,NH4Cl 1g/l,NaCl0.5g/l,MgSO4·7H2O 0.1g/l,FeCl3·6H2O 30mg/l,CoCl2·6H2O 5mg/l,VitaminB12 5mg/l,glycerol 30g/l;
培养条件:3L发酵罐(New Brunswick Scientific,NJ),接种量10%(v/v),发酵温度37℃,接种6小时好氧发酵,6小时之后维持微氧环境(0.4-0.8L/min)发酵。发酵时间50±1h,分批补料流加甘油维持甘油浓度在25±1g/L。
发酵结果:底物甘油消耗120g/L,产物1,3-丙二醇浓度53g/L。
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