CN101054553A - 异戊酰螺旋霉素i基因工程菌株的构建 - Google Patents

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武临专
王以光
马春燕
赫卫清
周红霞
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Abstract

本发明涉及基因工程技术在改造抗生素组分中的应用,具体来讲,是对必特螺旋霉素产生菌中参与产生组分II和III相关的3-O-酰基转移酶基因实施阻断和破坏,通过同源基因双交换获得产生4″位异戊酰螺旋霉素I为主组份的基因工程菌,该菌株的获得十分有利于今后生产工艺的简化、生产成本的降低和质量标准的制定与控制。

Description

异戊酰螺旋霉素I基因工程菌株的构建
技术领域:
本发明涉及基因工程技术在改造抗生素组分中的应用。
背景技术:
异戊酰螺旋霉素I是本研究室利用基因工程技术构建的必特螺旋霉素(原名为生技霉素)产生菌所产生的一个组分[“生技霉素的制造方法”,专利号:ZL97104440.6]、[“必特螺旋霉素高产菌株的获得”,专利号:ZL 02148771.5]。必特螺旋霉素目前即将完成第III期临床实验。实验结果表明,在治疗呼吸道感染等疾病方面,显示了较好的临床疗效和安全性。
除异戊酰螺旋霉素I组分外,必特螺旋霉素成品中还包含异戊酰II和III组分,同时还含有少量4”丁酰基、丙酰基、乙酰基的衍生物及少量的螺旋霉素I、II、III(总含量应不超过5%)。目前现行的必特螺旋霉素成品质量标准中,规定其含有9个组分,4”酰化螺旋霉素总含量为80%,其中异戊酰螺旋霉素(I、II、III)3个组分的总含量为65%。而在必特螺旋霉素发酵液中还存在较大比例的螺旋霉素I、II、III,尤其II和III组分相对较多。必特螺旋霉素发酵液中的螺旋霉素主要依赖化学提取工艺将其清除。因此,抗生素发酵产品的多组分问题,给药品质量标准的制定以及发酵工艺和提取过程监控,经常带来很大的困难和挑战。所以,在不影响生物学活性的前提下,获得单一组分生产菌种,已成为抗生素研究和生产面临的重要课题。
必特螺旋霉素是以螺旋霉素为母核,利用基因工程技术在其4”位-羟基进行异戊酰基化所产生的。而螺旋霉素产生菌通常产生SPI、II、III三个组分,即内酯环3位分别为羟基(SP I)、乙酰基(SP II)和丙酰基(SP III),结构式如图A所示。SP I、SP II、SP III三个组分的生物学活性基本一致。螺旋霉素产生菌产生SPI、II、III三个组分的生化机理,是由3-O-酰基转移酶催化内酯环3-O-羟基所致。本研究室曾在获得螺旋霉素3-O-酰基转移酶基因序列(专利申请号200610087230.1,SEQ ID No.1)基础上,通过基因阻断技术,获得了主要产生螺旋霉素组分I的菌种。但是,仅仅产生异戊酰螺旋霉素I为主组分的菌种,迄今尚未见到相关报道。
Figure A20071009050700041
                          螺旋霉素结构
本发明的目的在于,借鉴上述成果,在必特螺旋霉素产生菌中通过破坏编码3-O-酰基转移酶基因,以获得产生异戊酰螺旋霉素I为主组分的基因工程菌。
发明内容:
根据已经获得的3-O-酰基转移酶基因及其两翼序列,在3-O-酰基转移酶基因序列中可以破坏该基因的任意区段设计1个引物,并插入4个任意设计的酶切位点,经PCR获得两个1.0kb左右的同源臂,酶切后将两个同源臂互连,另外两侧与能转入必特螺旋霉素产生菌的载体相连接,以必特螺旋霉素产生菌(ZL02148771.5,菌种保藏号:CGMCC No.0304)总DNA为模板,经PCR分别扩增两个与3-O-酰基转移酶基因同源片段,并以相应酶切位点插入具有选择性标记的链霉菌/大肠杆菌穿羧质粒载体,也可在两个同源基因中插入和使用质粒不同的选择性标记片段,构建重组质粒。将所构建的重组质粒转入必特螺旋霉素基因工程菌,以质粒上携带的选择性标记筛选转化子,根据转化子展现的选择性标记差异和PCR验证,获取因同源基因双交换而使3-O-酰基转移酶基因破坏的基因工程菌,称之为BT3-O-ATΔ变株。该基因工程菌在一定条件下,经发酵培养和产物的初步化学提取以及HPLC检测其发酵产物,证明本发明提供了产生异戊酰螺旋霉素I为主组分的基因工程菌。
发明效果:
本发明利用基因工程技术将原必特螺旋霉素基因工程菌中的3-O酰基转移酶基因实施破坏,获得了只产生异戊酰螺旋霉素组分I的菌种。该菌种的获得,,使得必特螺旋霉素类抗生素发酵液中的多组分状况获得明显单一化,这将有助于简化生产过程发酵工艺的调控,实现提取过程的优化,提高收率,降低能耗和生产成本,为推进必特螺旋霉素类抗生素的产业化创造良好条件。
附图说明:
图1.用于3-O-酰基转移酶基因破坏的重组质粒pKCL1-4的构建及同源双交换
其中:Apramycin(阿普霉素抗性标记);
      GTG和TGA表示3-O-酰基转移酶基因阅读框的起始和终止密码子;
      a,b,c,d为PCR反应所设计的引物。
图2.染色体基因组PCR产物电泳(确证3-O-酰基转移酶基因的破坏)
其中:1.基因工程菌BT3-O-ATΔ变株;
      2.必特螺旋霉素产生菌原株;
      3.DNA分子量标记III。
图3.基因工程菌BT3-O-ATΔ变株发酵产物HPLC的检测
其中:A.必特螺旋霉素提取品(对照);
      B.必特螺旋霉素产生菌原株;
      C.基因工程菌BT3-O-ATΔ变株。
      I-异戊酰螺旋霉素I;
      II-异戊酰螺旋霉素II;
      III-异戊酰螺旋霉素III;
      SI-螺旋霉素I;
      SII-螺旋霉素II;
      SIII-螺旋霉素III;
      纵坐标-HPLC分析中紫外吸收百分比(abs);
      横坐标-分钟(min)。
实施方案:
以下实施例仅为帮助本领域技术人员进一步理解本发明,但不以任何方式限制本发明。
<实施例1>重组载体pKCL1-4的构建
根据本研究室已经获得的3-O-酰基转移酶基因及其两翼序列[NCBIDQ642742]设计两对引物,并插入相应的酶切位点(引物在染色体上的相对位置如图1所示):
L1上游引物(a)GCG AAGCTTTGCCCTGGCAATTGCAGTGTCAG    HindIII
  下游引物(b)GCG TCTAGAGCCGAACGTGACGATGTGCAGCG    XbaI
L2上游引物(c)GTC TCTAGACAGTGGTCCTTCGCCTTCTATCT    XbaI
  下游引物(d)GAC GGATCCTCGTCGCGCAGCAGGTCGTTGAG    BamHI
进行常规PCR扩增,获得与3-O-酰基转移酶基因两个部分同源的片段(左臂L1,1.0kb;右臂L2,1.0kb)。L1两端携带HindIII和XbaI酶切位点,L2两端携带XbaI和BamHI位点。将L1、L2片段和温敏型链霉菌/大肠杆菌穿梭质粒pKC1139(携带阿普霉素-Apramycin,Am抗性标记)以相应的酶切位点进行连接,获得重组载体pKCL1-4(构建过程见图1)。
<实施例2>必特螺旋霉素3-O-酰基转移酶基因破坏的基因工程菌株构建
必特螺旋霉素产生菌在斜面培养基[王以光等,生物工程学报,1992年8(1):1-14]上28℃培养7-10天,按照文献[D.A.Hopwood等Geneticmanipulation of Streptomyces,A Laboratory Manual,Norwich;JohnInnesFoundation UK,1985]描述的方法制备原生质体,将pKCL1-4通过原生质体转化方法,导入必特螺旋霉素产生菌中,以Am抗性作为选择性标记获得转化子;经无抗性平板在37℃条件下培养传代、单菌落分离,获得了Am敏感菌株(称为BT3-O-ATΔ变株)。
提取变株和原株基因组DNA为模板,以引物a和d配对,进行PCR扩增和产物的电泳鉴定。由于必特螺旋霉素原株中的3-O-酰基转移酶基因组与载体携带的L1和L2片段发生了同源双交换,使BT3-O-ATΔ变株中3-O-酰基转移酶基因在阅读框架内删除了612bp的序列,因此,BT3-O-ATΔ变株PCR产物约为2.0kb,比原株(约2.6kb)小0.6kb(结果见图2),表明必特螺旋霉素原株中3-O-酰基转移酶基因的部分序列已被删除和破坏。所获得的变株即为必特螺旋霉素3-O-酰基转移酶基因破坏的基因工程菌株。
<实施例3>必特螺旋霉素3-O-酰基转移酶基因破坏的基因工程菌株发酵产物的HPLC检测
BT3-O-ATΔ变株的发酵培养及产物初步提取按照文献[王以光等,生物工程学报,1992年8(1):1-14]进行。发酵液初步提取液挥发干后,以少量甲醇溶解,采用岛津LC-10ATvp液相色谱议,二级管阵列检测器,色谱柱为KromasilC184.5*150mm,流动相为甲醇/1%磷酸二氢钠溶液(53/47),流速为1mL/min。以必特螺旋霉素纯品为对照,以必特螺旋霉素主要组分的保留时间为标准[姜威等中国抗生素杂志.2002,27(7):387-391],取5ul发酵液,经初步提取的样品进行HPLC检测。发酵主要产物所占比例的HPLC定量分析结果见图4和表1。
表1  BT3-O-ATΔ变株发酵主要产物的HPLC检测
 组分   保留时间(min)   峰面积比%
  原株   BT3-O-ATΔ变株
 螺旋霉素I   7.389   测不出   32.39
 螺旋霉素II   8.563~8.77   21.36   测不出
 螺旋霉素III   13.865~14.059   18.79   测不出
 异戊酰螺旋霉素I   41.022~42.259   3.29   23.47
 异戊酰螺旋霉素II   47.019~47.911   15.07   测不出
 异戊酰螺旋霉素III   78.9~82.464   5.41   测不出
HPLC分析结果表明,原株发酵产生异戊酰螺旋霉素I为3.29%,螺旋霉素II和III所占总组分比例约为40.15%;本发明获得的BT3-O-ATΔ变株不产生螺旋霉素II、III和异戊酰螺旋霉素II、III。BT3-O-ATΔ变株所产生的异戊酰螺旋霉素I占总组分的比例约为23.47%;螺旋霉素I占总组分的比例为32.39%。这一结果充分证明,必特螺旋霉素原株中3-O-酰基转移酶基因已经完全破坏。本发明获得了4”位酰化螺旋霉素中以产生异戊酰螺旋霉素I为主组份的基因工程菌。

Claims (2)

1、异戊酰螺旋霉素I基因工程菌株的构建,其特征是在必特螺旋霉素产生菌中通过破坏编码3-O-酰基转移酶基因,以获得产生异戊酰螺旋霉素I为主组分的基因工程菌。
2、如权利要求1所述的构建方法,其特征是以3-O-酰基转移酶基因序列为模板,在3-O-酰基转移酶基因序列中可以破坏该基因的任意区段设计4个引物,并插入4个任意设计的酶切位点,经PCR获得两个1.0kb左右的同源臂,酶切后将两个同源臂互连,另外两侧与能转入必特螺旋霉素产生菌的载体相连接,获得重组载体,并转入必特螺旋霉素产生菌,以载体上的选择性标记挑取转化子,通过筛选抗性标记和PCR验证,获得3-O-酰基转移酶基因被破坏的变株,经发酵及对产物提取后HPLC分析,证明所获变株为主要产生异戊酰螺旋霉素组分I的菌种。
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