CN100378228C - 假互补肽核酸探针生物芯片及其基于spr原理的检测方法 - Google Patents
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Abstract
本发明公开了假互补肽核酸探针的生物芯片及其基于SPR原理的检测方法。本发明一种以假互补肽核酸为探针的检测生物芯片,它包括芯片固相载体和连接在其上的假互补肽核酸检测探针,其中,所述假互补肽核酸探针是通过附着在所述芯片固相载体上,具有表面等离子体共振响应特性的厚度为10nm~150nm的纳米金属膜与所述芯片固相载体连接的。本发明能够实现芯片技术的高通量、特异、敏感、快速的特点,将会产生较好的经济效益和社会效益。
Description
技术领域
本发明涉及生物芯片领域,特别是一种以假互补肽核酸为探针的生物芯片及其基于表面等离子体共振原理的检测方法。
技术背景
随着分子生物学在医学领域的广泛应用,芯片技术必将成为未来临床疾病诊断中不可缺少的一个新内容。芯片技术是伴随人类基因组计划而产生的,是近年来分子生物学及医学诊断技术的重要进展,其突出特点在于高速度、高通量、高并行性及多样化、微型化、自动化等,已经成为当今生物医学技术研究的热点,在基因诊断、药物开发和毒性分析、病原检测等多个领域显示出巨大的发展潜力和应用价值。
目前,尽管芯片技术已经取得了长足的发展,得到世人的瞩目,但是在样品的制备、探针合成与固定、分子的标记、数据的读取与分析等几个方面仍然存在着许多的问题,而且价格昂贵,从而严重地制约了芯片技术的广泛应用和进一步发展。尤其是在基因芯片的检测中,由于标记技术和杂交信号放大技术的限制,为提高检测灵敏度和特异性,通常的做法是在标记和分析前对样品进行适当程序的扩增,最常用的是PCR技术。而PCR扩增既需要设计引物,又要PCR仪,需要对各检测对象的靶序列建立不同的扩增体系、扩增方法和扩增条件,大大增加了工作量和工作难度。
肽核酸(Peptide Nucleic Acid,PNA)是借助计算机辅助设计的一种DNA模拟物,与DNA一样也是由ATCG四种碱基的单体聚合而成,只是两者的骨架结构不同:DNA是由磷酸二酯键连接而成的磷酸戊糖骨架;而PNA是由酰胺键连接的重复的N-2-氨乙基苷氨酸单位构成的。PNA不易被蛋白酶、核酸酶等降解,也不与血清中蛋白结合,但可以通过ATCG四种碱基的互补配对原则和DNA杂交结合。由于PNA的假肽骨架是电中性的,PNA与DNA或RNA间的杂交不存在静电斥力,因而具有更强的亲和性,其结合的稳定性和特异性都大大提高。将PNA引入检测芯片领域做为检测探针大大提高了生物芯片基因检测的灵敏度和特异性,成为当前检测芯片探针设计合成的热点。肽核酸(PNA)虽然对单链DNA、RNA表现了良好的杂交特性,但是与双链DNA杂交时只能是多聚嘌呤或者多聚嘧啶PNA,具有过于严格的序列限制性,大大限制了PNA探针对于双链DNA的检测能力,尤其对于完全基因组、粗制样本或未纯化样本的操作仍然不能满足分子生物学的需求。因此,对于PNA探针用于DNA检测,样本的处理必然包括了DNA的提取、纯化、变性等过程。
假互补肽核酸(Pseudocomplementary PNAs,即pcPNAs)是肽核酸的一种碱基修饰衍生物,是近年来在研究肽核酸的DNA双链侵袭杂交特性中发展而来的。即以双链DNA(dsDNA)两条链上的某段序列同时作为靶片段,分别设计针对该序列的两条PNA杂交片段。而PNA片段中的腺嘌呤(A)全部用二氨基嘌呤(D)取代,胸腺嘧啶(T)全部用巯基尿嘧啶(sU)取代。这样一来,当两条含有D、sU的pcPNAs与相应的dsDNA发生反应的时候,pcPNAs可同时与dsDNA两条链中相应的靶序列结合,形成稳定的PNA-dsDNA-PNA复合物。但pcPNAs本身两条链间由于D和sU立体结构的位阻作用却无法结合,这就保证了pcPNAs在识别靶序列的同时不会自己互补结合。pcPNAs-双链DNA的特殊识别方式显著的扩展了DNA的可能靶序列组成。实际上除了GC含量过高(A+T≤40%)的位点,dsDNA上任何混合碱基位点都可以做为pcPNA的靶序列。目前还未有以pcPNAs作为探针用于基因或蛋白检测方面的报道。
虽然目前还未有以pcPNAs作为探针用于基因或蛋白检测方面的报道,但我们分析后认为,与传统的PNA相比,pcPNAs做为核酸杂交探针在理论上可能更具有优势。因为传统PNA虽可以与单链或dsDNA杂交结合,但是当与dsDNA以链侵袭模式结合时由于PNA双链间的强结合力,只能是多聚同源嘧啶PNA(三链侵袭,Triplex invasion)或多聚同源嘌呤PNA(双链侵袭,Duplex Invasion),这显然降低了PNA作为探针的普遍性和选择性。而pcPNAs则可以设计成任何与靶序列互补的碱基序列,无需非得是多聚同源嘌呤或多聚同源嘧啶;且pcPNAs可同时与dsDNA两条链中相应的靶序列结合,形成稳定的PNA-dsDNA-PNA复合物。可以与pcPNAs杂交结合的dsDNA甚至可以是螺旋紧密的超螺旋质粒DNA,因此可以大大增加对DNA的检测能力,尤其适用于完全基因组、粗制样本或未纯化样本操作的应用研究,降低标本处理的复杂性,简化前期标本的准备时间和操作过程,从而为临床快速基因检测,特别是野战条件下的快速基因检测提供了可能。相比PNA探针,pcPNAs探针应用于基因检测减少了标本的纯化、变性过程,杂交中省略了变性处理时间,简化了杂交温度条件的控制。
基于上述理论,发明人开创性地以pcPNAs为探针,对pcPNAs与DNA、蛋白质的结合活性,及对其做为芯片检测的探针特性和杂交特性等系统地进行了研究,并与现行的芯片检测探针进行了比较。并在此基础上,首次将pcPNAs芯片引入表面等离子体共振传感器,对其做为检测探针的芯片的特异性、敏感性,及实际检测应用的方法和特性等进行了详细研究。
表面等离子体共振(Surface Plasmon Resonance,SPR)传感器是近年迅速发展起来的新型光学传感器装置,其突出特点是可以实时的(real time)、在线的(on line)检测生物分子之间的相互作用,而且不需要标记及纯化,是当前国际传感器领域的研究热点之一。其基本原理是当入射光以一定的角度经一组光学器件——通常为一高折射率的棱镜上顺序放置一层低折射率的耦合层(多为金属薄膜)耦合激发后,在金属膜界面上发生表面等离子体共振,即入射光与界表面的自由电子会发生相互作用,其中部分入射光波被电荷密度波吸收,则入射光线不能发生全反射,从而导致反射光的强度大大减弱,反射角也发生明显的偏差,而且这种反射光的强度和角度的变化与界面上吸附的生物物质分子的数量的多少成一定的比例关系。
作为探针固定的硫醇化合物表面单分子层自组装(Self-assembledMonolayer,SAM)技术自20世纪80年代初报道以来,由于其满足了作为模型界面的几个主要要求,包括和基底的牢固结合,可控制的分子取向有序排列,可控制的外表面性质及可控制的厚度等方面,因此很快地得到了各方的关注。总的来说,SAM是基于巯基化合物与基底材料(如金、银、铂等)的强烈化学结合而形成的。如在金膜表面,巯基被氧化而生成硫金化合键。其化学反应式如下:2Au+2RSH→2Au-SR+H2。Au-S之间的化学键合力很强,其键能高达184k J/mol,很少有其他基团可以与其竞争,这就保证了结合的选择性。同时,SAM的排列紧密有序,对酸、碱、离子渗透等有较强的抵抗力。应用此方法固定探针可以使探针结合牢固,且排列有序、分布均匀。我们基于巯基与金属表面的这种强烈化学结合的特性,在本发明中将巯基修饰的pcPNAs探针与表面等离子体共振设备的金属薄膜结合,制成pcPNAs探针阵列的芯片,完成对各种靶基因、蛋白的检测。
发明内容
本发明的目的之一是:提供一种以假互补肽核酸为探针的检测生物芯片;本发明的目的之二是提供一种基于表面等离子体共振原理所述以假互补肽核酸为探针的检测生物芯片进行检测的方法。通过本发明,可以绕过对样品进行扩增,简化样本处理步骤,提高检测的灵敏度和特异性;且以光学信号作为检测信号,即稳定,又易于检测,使结果检测、分析的设备和技术大为简化。从而可以利用生物芯片技术的高通量、高敏感、高特异的特性,克服目前检测芯片存在的主要缺点。
为实现本发明上述目的之一所采用的技术方案是这样的,即一种以假互补肽核酸为探针的检测生物芯片,其特征是:在所述芯片固相载体上连接假互补肽核酸检测探针。
上述假互补肽核酸探针与附着在芯片固相载体上具有表面等离子体共振响应特性的厚度为10nm~150nm的纳米金属膜连接。
本发明的目的之二所采用的技术方案是:一种基于表面等离子体共振原理所述以假互补肽核酸为探针的检测生物芯片进行检测的方法,其特征在于:方法包括以下步骤:
(一)、在芯片固相载体表面铺制具有表面等离子体共振感应性的纳米金属膜(厚度为10nm~150nm);在纳米金属膜表面连接pcPNAs探针制备芯片;
(二)、处理标本,并与生物芯片上的探针进行杂交反应;
(三)、利用表面等离子体共振设备对各探针杂交区进行偏振光检测,利用表面等离子体共振原理分析阵列探针杂交反应,获取结果。
上述步骤(一)中的在芯片固相载体表面铺制具有表面等离子体共振感应性的纳米金膜方法的步骤包括:
(1)、按柠檬酸三钠还原法(Frens法)制备纳米金溶液;
(2)、以N-β-(氨乙基)-γ氨丙基三价氧基硅烷(APTMS)为核心铺制性质均一的表面等离子体共振纳米金属膜;
(3)、所铺纳米金属膜氮气干燥后密封备用。
上述步骤(一)中在纳米金膜表面连接pcPNAs探针阵列方法的步骤包括:
(1)、清洁处理制备好的钠米金膜;
(2)、以表面自组装单分子层技术连接pcPNAs探针阵列,生成探针的自组装阵列;
(3)、清洗芯片,去除未组装的探针,干燥后封闭备用。
上述步骤(二)中标本的处理方法包括:
(1)、提取细菌、细胞及组织的DNA或RNA;由PCR或RT-PCR反应生成的核酸物质,如DNA、cDNA;
(2)、或提取细菌、细胞及组织的蛋白质,以及分泌液体中的蛋白质。
所述步骤(二)中标本与基因芯片上的探针进行杂交反应的步骤包括:
(1)、在所述的假互补肽核酸为探针的检测生物芯片上加样;
(2)、将处理好的标本注入微流动反应池中进行杂交反应;标本与检测探针杂交反应,条件为:
a)对于DNA芯片,缓冲液为20mM磷酸钠缓冲液(PH7.0),反应容积为10μl~50μl,循环反应的流速5~20μl/min,反应温度0~99℃,反应时间5分钟~50小时;
b)对于蛋白质芯片,缓冲液为蛋白芯片杂交缓冲液,该缓冲液由20mMHEPES,1mM DTT,0.1mM EDTA,50mM KCl,5%甘油,200μg/ml牛血清白蛋白组成,反应容积为10μl~50μl,循环反应的流速5~20μl/min,反应温度0~99℃,反应时间5分钟~50小时;
(3)、清洗去除未杂交结合的标本。
所述步骤(三)中的表面等离子体共振检测包括:
(1)、对芯片杂交反应区进行表面等离子体共振扫描,即利用表面等离子体共振设备对所述检测生物芯片上各探针杂交区进行偏振光检测;
(2)、对扫描结果分析,获得芯片检测结果。
本技术发明的优点与效果如下:
(1)本发明采用pcPNAs做为杂交探针,较之普通DNA探针具有更高的灵敏度和特异性;
(2)本发明采用pcPNAs做为杂交探针,较之DNA探针或PNA探针,不但避免了PCR反应,而且降低了样品的处理要求,简化了操作步骤,缩短了检测时间;
(3)本发明采用pcPNAs做为杂交探针,并应用表面等离子体共振原理进行信号检测,不需要昂贵的检测仪器,降低了芯片的使用成本及实验条件。
本发明所使用的术语“生物芯片”是由生物大分子或组织附着于玻璃、陶瓷、金属片或尼龙膜、硝酸纤维素膜等芯片固相载体上构建而成的阵列。生物芯片的实例包括基因(核酸)芯片、细胞芯片、蛋白质芯片、抗体芯片或组织芯片等。
本发明所述的核酸包括DNA、RNA、cDNA或肽核酸、假互补肽核酸。
本发明所使用的术语“假互补肽核酸”是肽核酸的一种碱基修饰衍生物,即以dsDNA两条链上的某段序列同时作为靶片段,分别设计两条PNA探针。探针中的腺嘌呤(A)全部用二氨基嘌呤(D)取代,胸腺嘧啶(T)全部用巯基尿嘧啶(sU)取代。
本发明所述的蛋白包括各种抗体、抗原、核酸功能相关酶等。
本发明所使用的术语“纳米金属膜”是指由直径在10nm-150nm之间的纳米金属颗粒形成的厚度为10nm-150nm金属膜层,可以是金膜、银膜、铂膜等。本发明使用的优选的纳米金属膜层为厚度为50nm的纳米金膜。
总之,该技术的研制成功将真正实现芯片技术的高通量、特异、敏感、快速的特点。既可对病原微生物进行快速而准确的检测和鉴定,也可以进行某一或多个特定基因、或与其相关的表达产物的研究,还可以进行基因和蛋白质与疾病关系的研究、疾病相关基因的验证以及新药物的开发与筛选,疾病的分子诊断,治疗过程的追踪和预后等方面,为临床疾病的预防和治疗提供重要的指导作用;同时该技术也可以应用到在野战条件下由基层检验人员实施战场病原体分布的调查、战伤感染的早期诊断、生物战剂的早期发现等方面,将会产生较好的经济效益和社会效益。
附图说明
下面结合附图和实施例对本发明进行进一步说明。
图1.为本发明设计pcPNAs探针基本结构模式图;
图2.为本发明表面等离子体共振传感器基本结构模式图;
图3.为本发明表面等离子体共振芯片系统模式图。
参见图1,本发明设计的pcPNAs探针结构模式,其核心是假肽骨架,其碱基主要包括D、SU、G、C。图中a表示D与sU之间的空间位阻作用显著影响了PNA互补单体间的结合;但是可以和普通DNA副本结合形成稳定的配对;b表示DNA与PNA基本骨架的组成不同,DNA是核酸糖-磷酸主链,而PNA是假肽主链。
参见图2,本发明检测方法中采用的表面等离子体共振传感器装置的构成包括A:三棱镜;B:芯片;C:入射偏振光;D:反射光;E:光信号采集器;F:信号放大器;G:数字信号转换器;H:计算机。
参见图3,本发明表面等离子体共振芯片包括芯片固相载体4、纳米金属膜5、探针6;图中7为做杂交检测时的反应池,8为表面等离子体共振传感器装置的光信号采集器,1为激光束,2偏振片,3为棱镜。
具体实施方式
实施例1在玻璃载玻片上铺制50nm厚度的具有表面等离子体共振感应性的纳米金膜方法,步骤如下:
(1)、按柠檬酸三钠还原法(Frens法)制备金溶胶:取0.01%氯金酸水溶液100ml加热煮沸,搅动下准确加入1%柠檬酸三钠水溶液0.75ml,金黄色的氯金酸水溶液在2分钟内变为紫红色,继续煮沸15分钟,冷却后以蒸馏水恢复到原体积。
(2)、金膜铺制:
A、玻片酸洗清洁干净后,放入N-β-(氨乙基)-γ氨丙基三价氧基硅烷(APTMS)/甲苯溶液中回流12小时后洗净,取出,氮气吹干,置于清洁干燥处备用;
B、处理好的玻片置纳米金溶液中浸泡12小时后,浸入0.01mol/L,的PDDA水溶液中10-20min,取出用超纯水清洗。烘干后移入羟胺/氯金酸溶液中,浸泡0.5小时,玻片表面既形成光亮的金膜层。
实施例2应用表面自组装单分子层技术在金膜表面点制pcPNAs探针阵列方法,步骤如下:
(1)、制备好的钠米金金膜在piranha液(30%H2O2∶浓H2SO4=1∶3)中浸泡清洗,然后用双蒸水反复清洗,氮气吹干;
(2)、滴加500nM浓度的SH-pcPNAs/PBS缓冲液与纳米金膜上自组装反应,100%湿度反应24小时,生成探针的自组装阵列;
(3)、分别吸干缓冲液,6-巯基己醇封闭,双蒸水清洗,氮气吹干。
实施例3通过试剂Chelex-100一步法快速处理标本,提取细菌DNA,步骤如下:
(1)、用无菌接种环收集纯培养菌落一环,置于1.5ml灭菌Eppendorf管中;
(2)、加入5%Chelex悬浊液50μl,混匀,加入20mg/ml蛋白酶K,56℃水浴消化2h以上,再经沸水浴7.5min,随后立即置入冰浴3min,12000r/min离心5min,取上清液作DNA样本。
实施例4细胞裂解液裂解细胞,粗提细胞核蛋白质,步骤是:
(1)、将组织剪成小块,按每20mg组织加入200~300μl均浆液加入均浆液,4℃低温均浆;
(2)、静置10min后加入90μl10%NP-40,剧烈震荡30s,4℃800g离心15min,弃去上清;
(3)、沉淀再溶于裂解液5ml中,4℃震摇孵育30min,4℃13000g离心15min,取上清为胞核蛋白提取液;
实施例5DNA标本与基因芯片上的pcPNAs探针进行杂交反应,步骤是:
(1)、将制备好的芯片组装到所制作的表面等离子体共振传感器棱镜表面,流动反应池中注入20mM磷酸钠缓冲液(PH7.0)20μl,预热(45℃)30分钟,并读取此时反射光反射角度初始数值;
(2)、将处理好的标本上清液注入20μl流动反应池中,45℃循环流动杂交3小时,并读取各探针点样点反射光反射角度数值;
(3)、流动反应池中充入20μl 20mM磷酸钠缓冲液(PH7.0),37℃清洗芯片1小时,重复3次。
实施例6蛋白质标本与蛋白芯片上的pcPNAs探针进行杂交反应,步骤是:
(1)、将制备好的芯片组装到所制作的表面等离子体共振传感器棱镜表面,流动反应池中注入10mM TE缓冲液20μl,预热(37℃)30分钟,读取此时反射光反射角度初始数值;
(2)、将处理好的蛋白质标本上清液注入20μl流动反应池中,37℃杂交2小时,并读取各探针点样点反射光反射角度数值;
(3)、流动反应池中充入20μl 10mM TE缓冲液,37℃清洗芯片1小时,重复3次。
实施例7利用pcPNAs探针实施DNA芯片检测步骤为:
淋球菌由大坪医院检验科细菌室提供,鉴定标准按《全国临床检验操作规程》。
Chelex-100购自BioRad公司。制备5%Chelex缓冲液,含1%NP-40,1%Tween-20,0.03%SDS。
淋球菌pcPNAs探针:HS-(CH2)6-5’-sUCGCsUsUCsUCGGsUCGCsU-3’;5’-DGCGDCCGDGDDGCGD-(CH2)6-SH-3’,美国Applied Biosystems公司合成;
TCEP HCL:Tis(2-carboxyethyl)-Phosphine Hydrochloride,美国Pierce,0.287mg TCEP溶于1000ul水中制备1mmol/L TCEP;
(1)、用无菌接种环收集纯培养淋球菌菌落一环,置于1.5ml灭菌Eppendorf管中;
(2)、加入5%Chelex悬浊液50μl,混匀,加入蛋白酶K(20mg/ml)2μl,56℃水浴消化6h,再经沸水浴7.5min,随后立即置入冰浴3min,12000r/min离心5min,取上清液作DNA样本。
(3)、制备好的钠米金金膜在piranha(30%H2O2∶浓H2SO4=1∶3)液中浸泡清洗,然后用双蒸水反复清洗,氮气吹干。
(4)、25μM的SH-pcPNAs中加等体积1mmol/L TCEP,37℃还原30分钟,加入PBS缓冲液(1.44g NaH2PO4、8g NaCL、0.2g KCL、0.24g KH2PO4,加入800mL去离子水溶解后,用HCL调pH为6.5,定溶至1L,高压灭菌),SH-pcPNAs终浓度500nM;
(5)、滴加500nM浓度的SH-pcPNAs/PBS缓冲液与纳米金膜上自组装反应,100%湿度反应24小时,生成探针的自组装阵列。
(6)、将制备好的芯片组装到所制作的表面等离子体共振传感器棱镜表面,流动反应池中注入20mM磷酸钠缓冲液(PH7.0)20μl(10μl/min),预热(45℃)30分钟,并读取此时反射光反射角度初始数值;
(7)、将处理好的标本上清液注入20μl流动反应池中(5μl/min),45℃循环杂交3小时,并同时在表面等离子体共振传感器装置上读取各探针点样点反射光反射角度数值;
(8)、流动反应池中充入20μl 20mM磷酸钠缓冲液(PH7.0)(10μl/min),37℃清洗芯片1小时,重复3次。
实施例8利用pcPNAs探针实施蛋白芯片检测,步骤为:
根据NF-κB的核酸结合位点(GGGACTTTCC)设计pcPNAs探针,HS-(CH2)6-5’-AGT TGA GGG GAC TTT CCC AGG C-3’;
蛋白芯片杂交缓冲液:20mM HEPES,1mM DTT,0.1mM EDTA,50mM KCl,5%甘油,200μg/ml牛血清白蛋白;
(1)、将肝组织剪成小块,加入均浆液A(mmol/L:Hepes 10、Na3VO4 1、MgCl2 1.5、KCl 10、NaF 50、EDTA 0.1、EGTA 0.1、phenylmethylsulfonyl fluoride0.5、dithiothreitol 1和0.02%protease inhibitors cocktail,pH7.9)10ml,4℃低温均浆;
(2)、静置10min后加入90μ 100%NP-40,剧烈震荡30s,4℃800g离心15min,弃去上清;
(3)、沉淀再溶于裂解液B(mmol/L:Hepes 20、NaCl 420、MgCl2 1.5、EDTA 1、EGTA 1、dithiothreitol 1、phenylmethylsulfonyl fluoride 0.5、glycerol20%和0.02%protease inhibitors cocktail,pH 7.9)5ml中,4℃震摇孵育30min,4℃13000g离心15min,取上清为胞核蛋白提取液;
(4)、制备好的钠米金金膜在piranha(30%H2O2∶浓H2SO4=1∶3)液中浸泡清洗,然后用双蒸水反复清洗,氮气吹干。
(5)、25μM的SH-pcPNAs中加等体积1mmol/L TCEP,37℃还原30分钟,加入PBS缓冲液(1.44g NaH2PO4、8g NaCL、0.2g KCL、0.24g KH2PO4,加入800mL去离子水溶解后,用HCL调pH为6.5,定溶至1L,高压灭菌),SH-pcPNAs终浓度500nM;
(6)、滴加500nM浓度的SH-pcPNAs/PBS缓冲液与纳米金膜上自组装反应,100%湿度反应24小时,生成探针的自组装阵列。
(7)、将制备好的芯片组装到所制作的表面等离子体共振传感器棱镜表面,流动反应池中注入蛋白芯片杂交缓冲液20μl(10μl/min),0℃静置30分钟,并读取此时反射光反射角度初始数值;
(8)、将处理好的标本上清液2μl注入20μl流动反应池中(5μl/min),25℃循环杂交3小时,并读取各探针点样点反射光反射角度数值;
(9)、流动反应池中充入20μl蛋白芯片杂交缓冲液(10μl/min),0℃清洗芯片1小时,重复3次。
实施例9杂交检测和结果分析
实验检测采用折射光角度调制方式,角度调制范围从40度到70度角;角分辨率精度高于0.001度;检测最小浓度小于1×10-11M。根据设计芯片探针的检测靶DNA/蛋白质,利用标准品浓度梯度分别测量相应角度响应改变值绘制靶DNA/蛋白质浓度/角度反应曲线。实验结束后根据实验结果角度变化值与曲线相应位置对比检测靶DNA/蛋白质的存在与否以及浓度。
Claims (4)
1.一种以假互补肽核酸为探针的检测生物芯片,它包括芯片固相载体和连接在其上的假互补肽核酸检测探针,其中,所述假互补肽核酸探针是通过附着在所述芯片固相载体上,具有表面等离子体共振响应特性的厚度为10nm~150nm的纳米金属膜与所述芯片固相载体连接的。
2.根据权利要求1所述的检测生物芯片,其特征是:所述附着在芯片固相载体上具有表面等离子体共振响应特性的纳米金属膜是金膜、银膜或铂膜。
3.根据权利要求1或2所述的检测生物芯片,其特征是:所述假互补肽核酸检测探针通过探针的固化-自组装单分子层技术连接在所述纳米金属膜上。
4.一种基于表面等离子体共振原理使用权利要求1所述检测生物芯片对样本进行检测的方法,包括以下步骤:
(1)在如权利要求1所述的假互补肽核酸为探针的检测生物芯片上加样;
(2)样本与检测探针杂交反应,条件为:
a)对于DNA样本,缓冲液为pH7.020mM磷酸钠缓冲液,反应容积为10μl-50μl,循环反应的流速5-20μl/min,反应温度0-99℃,反应时间5分钟-50小时;
b)对于蛋白质样本,缓冲液为蛋白质芯片杂交缓冲液,该缓冲液由20mMHEPES,1mM DTT,0.1mM EDTA,50mM KCl,5%甘油,200μg/ml牛血清白蛋白组成,反应容积为10μl-50μl,循环反应的流速5-20μl/min,反应温度0-99℃,反应时间5分钟-50小时;
(3)清洗去除未杂交结合的标本;
(4)利用表面等离子体共振设备对所述检测生物芯片上各探针杂交区进行偏振光检测,利用表面等离子体共振原理分析假互补肽核酸探针杂交反应,获取结果。
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