BR112020020323A2

BR112020020323A2 - Combinação de vacina, e, método para induzir uma resposta imune.

Info

Publication number: BR112020020323A2
Application number: BR112020020323-8A
Authority: BR
Inventors: Bertrand Georges; Scot Roberts
Original assignee: Altimmune Inc
Priority date: 2018-04-04
Filing date: 2019-04-04
Publication date: 2021-01-05
Also published as: MX2020010421A; IL277719A; EP3773710A4; CA3096056A1; CN112638410A; JP2021520414A; AU2019249232A1; EP3773710A1; KR20210005046A; WO2019195626A1; US20210236623A1

Abstract

são providas aqui combinações de vacina e métodos para melhorar a resposta induzida a célula t específica a um antígeno em um indivíduo em necessidade do mesmo. os métodos combinam a vacinação sistêmica com uma primeira composição contendo um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou um imunogênio contendo um ou mais epítopos de célula t cd8+; e/ou uma segunda composição com micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado ao fluorocarboneto é: i) de 15 a 75 resíduos de aminoácido de comprimento; ii) a partir do antígeno ou imunogênio da primeira composição; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de célula t cd8+ da primeira composição do antígeno ou imunogênio para induzir células t cd8+ específicas a um antígeno; e opcionalmente uma terceira composição compreendendo uma composição de modulador imune.

Description

1 / 74 COMBINAÇÃO DE VACINA, E, MÉTODO PARA INDUZIR UMA

RESPOSTA IMUNE REFERÊNCIA CRUZADA A PEDIDOS RELACIONADOS

[001] Este pedido reivindica o benefício do Pedido de Patente Provisório dos EUA Nos 62/652.478, depositado em 4 de abril de 2018; e 62/652.484 depositado em 4 de abril de 2018, cujos conteúdos são aqui incorporados por referência na sua totalidade.

CAMPO DA INVENÇÃO

[002] Este pedido refere-se geralmente a uma combinação de vacina compreendendo uma dose iniciadora e/ou uma dose de reforço heteróloga e, opcionalmente, uma dose de inibidor imunológico e métodos para induzir uma resposta de célula T CD8+ específica a um antígeno.

FUNDAMENTOS DA INVENÇÃO

[003] As vacinas são limitadas em sua capacidade de promover respostas robustas de células T CD4+ e/ou CD8+ que são conhecidas por desempenhar um papel importante contra doenças induzidas por patógenos intracelulares e cânceres. A única exceção, a vacina BCG contra a tuberculose, parece proteger principalmente pela indução de células T.

[004] Esforços substanciais foram feitos para a geração de vacinas indutoras de células T destinadas a induzir células T CD4+ e/ou CD8+ de magnitude suficiente e função efetora que contribuem diretamente para a eliminação de células infectadas ou tumorais. As vacinas que usam peptídeos sintéticos ou DNA combinado com um sistema de entrega ou vetores virais recombinantes são de interesse particular para a indução de imunidade mediada por células, oferecendo a capacidade de entregar ou expressar um antígeno intracelularmente. No entanto, o regime de iniciadora-reforço homólogo, no qual uma dose iniciadora e dose de reforço de um antígeno/imunogênios/peptídeos são apresentados ao sistema imunológico através dos mesmos carreadores e/ou vetores de entrega, não foram capazes

2 / 74 de demonstrar eficácia clínica significativa devido à capacidade limitada na geração de imunidade de células T antivirais e antitumorais robusta e durável.

[005] A vacinação iniciadora-reforço heteróloga, usando diferentes carreadores e/ou vetores de entrega, representa uma estratégia promissora em comparação com a iniciadora-reforço homóloga para a indução de imunidade de células T devido a: i) respostas diminuídas de anticorpos do vetor antiviral que interferem na imunidade contra o antígeno alvo através da depuração da vacina por meio de imunocomplexos vacina-anticorpo; e ii) o potencial de diferentes tecnologias de vacinas para estimular a resposta imune de maneira diferente e trabalhar sinergicamente. Abordagens de iniciadora-reforço heterólogas examinaram as vacinas de várias composições, mas recentemente focaram principalmente em combinações de DNA/vetor viral ou vetor viral/vetor viral para desenvolvimento clínico. Com a perspectiva de estimular a imunidade de células T forte e durável, as estratégias de vacinas iniciadoras/reforço heterólogas são de particular interesse para infecção viral aguda e crônica, câncer, alergia e autoimunidade.

[006] As vacinas contra o câncer ou infecção viral crônica representam uma abordagem atraente para fornecer alta especificidade, um perfil de segurança favorável, aplicabilidade “off-the-shelf” e a promessa de imunidade antitumoral vitalícia em comparação com outras terapias. Mesmo que as vacinas de células T tenham sido grandemente melhoradas, em geral, elas ainda falham em fornecer qualquer benefício clínico como monoterapia em pacientes com câncer avançado ou infecções virais crônicas.

[007] No contexto do câncer e da infecção viral crônica, os mecanismos imunossupressores previnem ou reduzem a atividade efetora das células T específicas de um antígeno resultantes da imunoterapia com vacina. Esses mecanismos imunossupressores podem ser exercidos, direta ou indiretamente, por células mieloides supressoras, macrófagos associados a tumores, células T reguladoras e/ou receptores inibitórios expressos em

3 / 74 células T. Consequentemente, um anti-imunossupressor, tal como inibidores de bloqueio de checkpoint, inibidores de células mielpides supressoras ou compostos envolvidos na reprogramação ou repolarização de células mieloides supressivas representa uma classe de fármacos terapêuticos que têm o potencial de melhorar a indução e a função antiviral ou antitumoral de células T específicas de um antígeno resultantes da imunoterapia com vacina. Além disso, imunoativadores, tais como agentes direcionados a receptores coestimuladores expressos por células T, citocinas ou imunoestimulantes, também podem ser usados para melhorar na indução e na função antiviral ou antitumoral de células T específicas a um antígeno resultantes da imunoterapia com vacina.

[008] Assim, há uma necessidade de composições de vacina mais robustas que induzam respostas imunes mediadas por células, particularmente no contexto de câncer e infecções crônicas.

SUMÁRIO DA INVENÇÃO

[009] Aqui, algumas modalidades providas incluem combinações de vacinas e métodos para a administração de um regime de dosagem de iniciadora-reforço heterólogo, em que a composição da vacina da dose iniciadora é diferente da dose de reforço, desde que cada dose compreenda um ou mais epítopos de células T CD8+ que são iguais. Em outras palavras, as composições de vacina compreendem polipeptídeos com pelo menos um epítopo de célula T CD8+ em comum. As presentes composições de vacina são composições de vacina de indução de células T; vacinas projetadas para induzir células T CD4+ e/ou CD8+ de magnitude suficiente e fenótipo necessário ou função efetora que contribuem diretamente para depuração do patógeno ou do tumor por meio de mecanismos efetores mediados por células em comparação com apenas células T CD4+ ajudam para células B levando a respostas de anticorpos protetores.

[0010] Em certas modalidade é provida uma combinação de vacina

4 / 74 compreendendo a) uma primeira composição compreendendo um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou um imunogênio contendo um ou mais epítopos de célula T CD8+; e, b) uma segunda composição compreendendo micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado ao fluorocarboneto é: i) de 15 a 75 resíduos de aminoácido de comprimento; ii) a partir do antígeno ou imunogênio da primeira composição; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de célula T CD8+ da primeira composição do antígeno ou imunogênio. Ver Exemplo 1. Qualquer uma da primeira ou segunda composição pode ser a composição iniciadora ou a composição de reforço. Em certas modalidades, a combinação de vacina pode compreender adicionalmente um modulador imune que compreende um anti-imunossupressor ou um imunoativador.

[0011] Nas modalidades, o vetor viral não replicante é um vetor de adenovírus, um vetor de alphavirus, um vetor de vírus da herpes, um vetor de vírus do sarampo, um vetor de poxvirus ou um vetor de vírus da estomatite vesicular. Em certas modalidades, o vetor viral não replicante é um vetor de adenovírus deletado E1 e E3.

[0012] Em modalidades exemplificativas, a combinação de vacina é usada em métodos para induzir uma resposta imune como uma vacina contra o câncer ou vacina contra infecção crônica (profilaticamente ou terapeuticamente). Para vacinas contra o câncer, o desafio não é tanto encontrar antígenos específicos do paciente (embora isso ainda seja importante), mas desenvolver métodos mais imunogênicos de induzir a resposta imune necessária, o que requer quebrar a tolerância imunológica aos autoantígenos. Os requerentes aqui fornecem um regime de dosagem altamente imunogênico, em que o regime de dosagem heterólogo é sinérgico em comparação com a dosagem homóloga em um modelo de tumor murino testado aqui. Veja o Exemplo 3 e as Figuras 1 - 2.

[0013] Por conseguinte, são providos aqui métodos para induzir uma

5 / 74 resposta imune (por exemplo, uma resposta de célula T CD8+ de antígeno) em um indivíduo em necessidade, compreendendo a administração de uma primeira composição compreendendo um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou imunogênio contendo um ou mais epítopos de células T CD8+ ; e administrar uma segunda composição compreendendo micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado ao fluorocarboneto tem: i) 15 a 75 resíduos de aminoácidos de comprimento; ii) a partir do antígeno ou imunogênio da primeira composição; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de células T CD8+ da primeira composição do antígeno ou imunogênio.

Uma da primeira composição ou da segunda composição é administrada como uma dose iniciadora, e uma da primeira composição ou da segunda composição é administrada como uma dose de reforço, desde que ambas as primeira e segunda composições sejam administradas, Aqui, outras modalidades providas incluem combinações de vacinas e métodos para administrar essas composições da combinação de vacinas, em que a combinação compreende uma composição de vacina de indução de células T e uma composição que compreende um inibidor imune selecionado a partir de um inibidor de checkpoint imunológico ou um inibidor de células supressoras derivadas de mieloide (MDSC). As composições de vacina de indução de células T são vacinas projetadas para induzir células T CD4+ e/ou CD8+ de magnitude suficiente e fenótipo necessário ou função efetora que contribuem diretamente para depuração do patógeno ou do tumor por meio de mecanismos efetores mediados por células em comparação com apenas células T CD4+ ajudam para células B levando a respostas de anticorpos protetores.

Nas modalidades, a composição de vacina compreende um polipeptídeo com pelo menos um epítopo de célula T CD8+. Em certas modalidades, a presente composição de vacina de indução de células T compreende um vetor viral não replicante ou um(ns) peptídeo(s) ligado(s) a

6 / 74 fluorocarboneto.

[0014] Em certas modalidade é provida uma combinação de vacina compreendendo uma primeira composição compreendendo um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou um imunogênio contendo um ou mais epítopos de célula T CD8+; ou, b) uma segunda composição compreendendo micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado ao fluorocarboneto é: i) de 15 a 75 resíduos de aminoácido de comprimento; ii) a partir de um antígeno ou imunogênio; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de célula T CD8+ do antígeno ou imunogênio; e, c) uma terceira composição compreendendo um modulador imune selecionado a partir de um anti-imunossupressor ou um imunoativador.

[0015] Nas modalidades, o anti-imunossupressor alveja PD1, PDL1, PDL2, CD28, CD80, CD86, CTLA4, B7RP1, ICOS, B7RPI, B7-H3, B7-H4, BTLA, HVEM, KIR, TCR, LAG3, CD 137, CD137L, OX40, OX40L, CD27, CD70, CD40, CD40L, TIM3, GAL1, GAL3, GAL9, ADORA, CD276, VTCN1, IDO1, KIR3DL1, HAVCR2, VISTA, CD244, ADAM17, COX2, PGE-2, iNOS2, PDE5, c-kit, ARG1, PI3K, CSF-1R, Caspase-8, CCL2, RON, ROS, ou S100A8/A9. Em modalidades, o anti-imunossupressor é Pembrolizumabe (KEYTRUDA), Nivolumabe (OPDIVO), Cemiplimabe (LIBTAYO), Atezolizumabe (TECENTRIQ), Avelumabe (BAVENCIO), Durvalumabe (IMFINZI) Ipilimumabe (IMFINZI) REGN2810, BMS-936558, SHR1210, KN035, IBI308, PDR001, BGB-A317, BCD-100 ou JS001.

[0016] Em certas outras modalidades, o anti-imunossupressor é um inibidor de MDSC direcionado a PGE-2, COX2, NOS2, ARG1, PI3K, CSF- 1R, Caspase-8, CCL2, RON, ROSS100A8/A9 ou receptor X nuclear de fígado. Em modalidades, o inibidor de MDSC é PF-5480090, INCB7839, nitro-aspirina, SC58236, Celecoxib, IPI-549, PLX3397, BLZ945, GW2580, RG7155, IMC-CS4, AMG-820, ARRY-382, sildenafil, tadalafil, N-hidroxi- nor-L-Arg, imatinibe, z-IETD-FMK, trabectedina, Emricasan, anticorpo anti-

7 / 74 CCL2 (carlumabe ou ABN912), Tasquinimod, ASLAN002, IMC-RON8 ou GW3965.

[0017] Em certas modalidades, o imunoativador alveja o receptor tipo Toll (TLR) 3, TLR4, TLR5, TLR7, TLR8, TLR9, NOD1, NOD2, STING, cGAS, IFR3, receptor IL-2, receptor IL12 ou receptor IFN-alfa. Em certas modalidades, os imunoativadores são IMO-2125, SD-101, DV281, ADZ1419, PF-3512676 (AGATOLIMOD), CMP-001, Lefitolimod, IC31, MEDI9197 , RO6864018, RO7020531, GS-9620, AZD8848, LFX453, CV8102, Motolimod (VTX-2337), BDB001, HILTONOL, KIN131A, MK-4621 (RGT100), Inarigivir (SB9200), MIW815 (ADU-S100), MK-1454, BMS- 986301, SB 11285, IL-2, IL-12, ou IFN-α.

[0018] Nas modalidades, o vetor viral não replicante é um vetor de adenovírus, um vetor de alphavirus, um vetor de vírus da herpes, um vetor de vírus do sarampo, um vetor de poxvirus ou um vetor de vírus da estomatite vesicular. Em certas modalidades, o vetor viral não replicante é um vetor de adenovírus deletado E1 e E3.

[0019] Em certas modalidades, é aqui provida uma combinação de vacina que compreende uma primeira composição compreendendo um vetor viral não replicante que codifica um peptídeo de um antígeno ou imunogênio contendo um ou mais epítopos de células T CD8+; e, uma terceira composição compreendendo um modulador imune selecionado a partir de um anti-imunossupressor ou um imunoativador. Em certas outras modalidade é provida uma combinação de vacina compreendendo uma segunda composição compreendendo micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado ao fluorocarboneto é: i) de 15 a 75 resíduos de aminoácido de comprimento; ii) a partir de um antígeno ou imunogênio; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de célula T CD8+ de um antígeno ou imunogênio; e, uma terceira composição compreendendo um modulador imune selecionado a partir de um anti-imunossupressor ou um imunoativador.

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[0020] Em modalidades exemplificativas, a combinação de vacina é usada em métodos para induzir uma resposta imune como uma vacina contra o câncer ou vacina contra infecção crônica (profilaticamente ou terapeuticamente). Os requerentes aqui fornecem um regime de dosagem altamente imunogênico, em que a vacina indutora de células T é sinérgica com um modulador imune selecionado a partir de um inibidor de checkpoint imunológico ou um inibidor de células supressoras derivadas de mieloide (MDSC) em comparação com o modulador imune ou a composição de vacina de indução de células T sozinha em um modelo de tumor murino testado aqui. Ver exemplo 5 e 7.

[0021] Por conseguinte, são providos aqui métodos para induzir uma resposta imune (por exemplo, uma resposta de célula T CD8+ de antígeno) em um indivíduo em necessidade, compreendendo a administração de uma composição compreendendo um vetor viral não replicante que codifica um peptídeo de um antígeno ou imunogênio contendo um ou mais epítopos de células T CD8+ ou administrar uma composição compreendendo micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado ao fluorocarboneto tem: i) 15 a 75 resíduos de aminoácidos de comprimento; ii) a partir do antígeno ou imunogênio; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de células T CD8+ do antígeno ou imunogênio; e, administrar separadamente uma composição compreendendo um modulador imune selecionado a partir de um anti-imunossupressor ou um imunoativador.

BREVE DESCRIÇÃO DOS DESENHOS

[0022] Os desenhos anexos, que são incorporados e constituem uma parte deste relatório descritivo, ilustram uma ou mais modalidades da presente descrição e, juntamente com a descrição detalhada e seções de exemplos, servem para explicar os princípios e implementações da descrição.

[0023] A Figura 1 mostra as respostas ELISpot de IFN-γ cumulativas aos quatro peptídeos expressos como o número de células produtoras de IFN-

9 / 74 γ (células formadoras de spots, SFC) por milhão de células do baço calculadas para cada grupo no dia 24 após a administração da dose iniciadora. Grupos 5 (AdGP70 como a dose iniciadora e PepGP70 como a dose de reforço) e 6 (PepGP70 como a dose iniciadora e AdGP70 como a dose de reforço) são os grupos de regime de dosagem iniciadora-reforço heterólogo que mostram um efeito sinérgico em comparação com os grupos de iniciadora-reforço homólogos (Grupos 1 a 4). Ver exemplos 1 e 3.

[0024] A Figura 2 mostra a porcentagem de células T CD8+ positivas para coloração de dextrâmero no dia 24 após a administração da dose iniciadora. Os animais dos Grupos 1 a 4 foram submetidos a um regime de dosagem iniciadora-reforço homólogo (AdGP70 ou PepGP70) e os animais dos Grupos 4 e 5 foram submetidos a um regime de dosagem iniciadora- reforço heterólogo; AdGP70 como a dose iniciadora e PepGP70 como a dose de reforço (Grupo 5) ou PepGP70 como a dose iniciadora e AdGP70 como a dose de reforço (grupo 6). Ver Exemplo 3.

[0025] A Figura 3 mostra as composições de vacina PepGP70 e AdGP70, testadas individualmente ou como combinações de iniciadora- reforço, sinergia com um tratamento anti-PD1 em sua capacidade de promover uma resposta imune antitumoral, em que células T CD8+ específicas a um antígeno foram medidas no dia 6 (D6) e dia 20 (D20). Animais em: O Grupo 1 recebeu PepGP70 (como a dose iniciadora e de reforço) + anti-PD1; o Grupo 2 recebeu AdGP70 (como a dose iniciadora e de reforço) + anti-PD1; o Grupo 3 recebeu AdGP70 como dose iniciadora e PepGP70 como dose de reforço + anti-PD1; o Grupo 4 recebeu PepGP70 como a dose iniciadora e AdGP70 como a dose de reforço + anti-PD1; o Grupo 5 recebeu apenas anti-PD1 (controle); e Grupo 6 não recebeu tratamento (controle). O peptídeo AH1 é o epítopo de células T SPSYVYHQF (SEQ ID NO 72), que está presente em GP70-472 e GP70- CM.

10 / 74 Ver os Exemplos 1, 2 e 5.

[0026] As Figuras 4A e 4B mostram a resposta ELISpot de IFN-γ à vacina FP-OVA em comparação com o grupo de excipiente (Figura 4A) e a atividade antitumoral em termos de sobrevivência geral da vacina FP-OVA em comparação com o excipiente contra os modelos de tumor E.G7-OVA (Figura 4B). Os animais na Figura 4B foram induzidos com células E.G7- OVA no dia 24, em que a composição da vacina administrada anteriormente forneceu proteção contra a morte por crescimento do tumor. Ver Exemplo 6.

[0027] As Figuras 5A e 5B mostram a atividade antitumoral em termos de prevenção do crescimento tumoral da vacina FP-OVA (Figura 5B) em comparação com o excipiente (Figura 5A) contra os modelos de tumor E.G7-OVA. Os animais na Figura 5B foram induzidos com células E.G7- OVA no dia 24, em que a composição da vacina administrada anteriormente no dia 0 e no dia 14 forneceu proteção contra o crescimento do tumor. Ver Exemplo 6.

[0028] A Figura 6 mostra a atividade antitumoral em termos de sobrevivência geral da vacina FP-OVA (grupo 1 e 2) em comparação com o excipiente (grupo 3) contra os modelos de tumor E.G7-OVA, em que as composições de vacina foram administradas aos animais após os animais serem induzidos com células E.G7-OVA demonstrando o efeito terapêutico da composição da vacina.

[0029] A Figura 7 mostra as composições de vacina PepGP70 ou AdGP70, testadas individualmente ou em combinação com anti-PD1, sinergia com um tratamento anti-PD1 em sua capacidade de promover uma resposta imune antitumoral, em que o tamanho do tumor foi medido ao longo de um período de dias. Grupo 2 (AdGP70 + anti-PD1) forneceu 79% de animais livres de tumor em comparação com o Grupo 1 (AdGP70) com apenas 43% de animais livres de tumor; o Grupo 4 (PepGP70 + anti-PD1) forneceu 62% de animais livres de tumor em comparação com o Grupo 3 (PepGP70) com

11 / 74 apenas 15% de animais livres de tumor. O anti-PD1 sozinho forneceu apenas 29% de animais livres de tumor. Ver Exemplo 7.

[0030] As Figuras 8A e 8B mostram a sobrevivência geral para cada grupo; Vetor adenoviral GP70 (Fig. 8A) e peptídeos GP70 ligados a fluorocarboneto (Fig. 8B), com e sem o inibidor do checkpoint imunológico anti-PD1. Ver Exemplo 7.

DESCRIÇÃO DETALHADA DA INVENÇÃO Introdução

[0031] A presente invenção provê composições e métodos para induzir uma resposta de células T aumentada. Em particular, a combinação de vacina instantânea induz imunidade mediada por células T, tanto profilaticamente quanto terapeuticamente, no controle de infecções virais persistentes e câncer. Os métodos e composições providos incluem a administração de uma dose iniciadora de vacina heteróloga e dose de reforço que leva a uma indução de uma resposta de células T, em que “heteróloga” significa uma dose iniciadora que é diferente de uma dose de reforço, desde que ambos compreendam pelo menos um, ou mais, dos mesmos epítopos de células T. Em certas modalidades, isso significa uma dose iniciadora e uma dose de reforço em que o antígeno/imunogênios/peptídeos são apresentados ao sistema imunológico por meio de diferentes carreadores e/ou vetores de entrega. Os requerentes verificaram que a administração de diferentes vacinas de indução de células T (por exemplo, vetor viral que codifica um antígeno e micelas contendo peptídeos que compreendem epítopos de células T compartilhados com o antígeno expresso de vetor viral) aumenta sinergicamente induzindo a resposta de células T específica a um antígeno. Ver Exemplo 3. Em modalidades, a dose iniciadora e a dose de reforço compreendem um ou mais dos mesmos epítopos de células T CD8+. Em certas modalidades, os polipeptídeos da dose iniciadora e/ou da dose de reforço também compreendem um ou mais epítopos de células T CD4+.

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[0032] A sequência do antígeno/imunogênios pode não ser a mesma, mas deve haver sobreposição em pelo menos um ou mais epítopos de células T (por exemplo, um pode ser de comprimento total e o outro um peptídeo curto derivado do antígeno de comprimento total, incluindo peptídeos quiméricos) na dose iniciadora e de reforço. Esses epítopos de células T podem ser identificados em antígenos ou imunogênios usando técnicas bem conhecidas na técnica, incluindo a partir de referências publicadas, incluindo bancos de dados ou sites que contêm sequências de peptídeos conhecidas por se ligarem a moléculas MHC de classe I e/ou classe II compiladas em relatórios publicados (por exemplo o site SYFPEITHI), ou algoritmos, como rede neural artificial (ANN) ou método de matriz estabilizada (SMM) (por exemplo, usando o site do Immune Epitope Database and Analysis Resource). Ver Exemplo 1. Em modalidades, a dose iniciadora e de reforço compreendem um ou mais epítopos de células T CD8+ compartilhados.

[0033] Em certas modalidade são providas aqui combinações de vacina que compreendem uma primeira composição compreendendo um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou um imunogênio contendo um ou mais epítopos de célula T CD8+; e uma segunda composição compreendendo micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado ao fluorocarboneto é: i) de 15 a 75 resíduos de aminoácido de comprimento; ii) a partir do antígeno ou imunogênio da primeira composição; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de célula T CD8+ da primeira composição do antígeno ou imunogênio. Em certas modalidades, a primeira composição é uma dose iniciadora e a segunda composição é a dose de reforço. Em certas outras modalidades, a primeira composição é a dose de reforço e a segunda composição é a dose iniciadora.

[0034] Como usado aqui, um “regime de dosagem heterólogo”, significa uma dose iniciadora e uma dose de reforço em que o antígeno/imunogênios/peptídeos são apresentados ao sistema imunológico por

13 / 74 meio de diferentes carreadores e/ou vetores de entrega. Por exemplo, na presente invenção, uma primeira composição (como uma dose iniciadora ou uma dose de reforço) compreende um antígeno ou imunogênio de vetor viral, e uma segunda composição (como uma dose iniciadora ou uma dose de reforço) compreende peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que o peptídeo compreende um ou mais epítopos de células T em comum com o antígeno ou imunogênio de vetor viral. Em outras palavras, em certas modalidades, a presente combinação de vacina é duas composições de vacina de indução de células T diferentes, em que cada composição induz células T CD8+ específicas a um antígeno contra o mesmo antígeno.

[0035] Os requerentes verificaram que um regime de dosagem heterólogo (em que pelo menos uma dose iniciadora e pelo menos uma dose de reforço são administradas) com um antígeno de vetor adenoviral e um peptídeo ligado a fluorocarboneto proveu um efeito sinérgico da resposta imune induzida em comparação com um regime de dosagem heterólogo com o antígeno de vetor adenoviral ou o peptídeo ligado a fluorocarboneto. Ver o Exemplo 3 e as Figuras 1 - 2. Os grupos 5 e 6 da Figura 1 e 2 representam os animais aos quais foi administrado um regime de dosagem heterólogo, em comparação com os grupos 1 a 4, que representam os animais aos quais foi administrado um regime de dosagem homólogo. A administração de uma dose iniciadora heteróloga e uma dose de reforço induzem uma resposta de células T CD8+ específicas a um antígeno, conforme demonstrado nas Figuras 1 e 2.

[0036] Em certas modalidades, a presente combinação de vacina é usada como um agente terapêutico para tratar tumores e/ou profilático contra o câncer. Os efeitos sinérgicos das combinações de vacinas presentes podem ser usados para tratar certos tumores. Ver Exemplo 4. Em certas outras modalidades, a presente combinação de vacina é usada como um agente terapêutico para tratar infecções crônicas.

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[0037] Em certas modalidades, a presente combinação de vacina compreende adicionalmente uma terceira composição compreendendo uma composição moduladora imune selecionada a partir de um anti- imunossupressor ou um imunoativador. Certas proteínas de checkpoint imunológico, como PD1 em células T e PD-L1 em células tumorais, ajudam a manter as respostas imunes silenciadas para esses tumores, em que quando PD1 é ligado por PD-L1 essa interação inibe as células T de matar essas células tumorais. Portanto, o bloqueio da interação de certas proteínas de checkpoint imunológico com um anti-imunossupressor permite que as células T matem as células tumorais. A presente invenção combina o efeito sinérgico do regime de dosagem heterólogo para induzir células T CD8+ específicas a um antígeno, como um câncer ou antígeno viral, específico para um tumor ou tipo de câncer (por exemplo, melanoma, linfoma, câncer de pulmão, etc.) com um anti-imunossupressor, como um inibidor de checkpoint imunológico que sinaliza de forma não específica as células T para matar as células cancerosas.

[0038] Em modalidades, o anti-imunossupressor é um inibidor de MDSC. As células supressoras derivadas de mieloides (MDSC) são um grupo heterogêneo de células imunes derivadas da linhagem mieloide e que se expandem em certas condições patológicas, como infecção crônica e câncer; eles também podem desempenhar um papel em certas doenças autoimunes. As MDSCs possuem fortes atividades imunossupressoras em vez de propriedades imunoestimulatórias, em que interagem com as células T e certas células apresentadoras de antígenos (APC) para regular sua função. As MDSCs são supressores conhecidos de células T (células T CD8+ e CD4+) e medeiam a indução de tolerância em doenças autoimunes e câncer. Portanto, os inibidores da atividade de MDSCs podem ajudar a quebrar a tolerância em certos estados patológicos. A presente invenção combina o efeito sinérgico do regime de dosagem heterólogo para induzir células T CD8+ específicas a um antígeno, como um câncer ou antígeno viral, específico para um tumor ou tipo

15 / 74 de câncer, com um inibidor de células supressoras derivadas de mieloide (MDSC) que ajuda a quebrar a tolerância pela inibição de MSDCs tolerogênicas e permitindo uma resposta imune mais robusta pelas células T CD8+ induzidas.

[0039] Os requerentes encontraram um efeito sinérgico do presente regime de dosagem heterólogo em combinação com o inibidor de checkpoint imunológico, anti-PD1, quando a segunda composição (peptídeo ligado a fluorocarboneto) é administrada como a dose iniciadora e a primeira composição (antígeno ou imunogênio de vetor viral não replicante) é administrada como a dose de reforço. Ver o Exemplo 5 e as Figura 3. Em certas modalidades, micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado a fluorocarboneto tem: i) 15 a 75 resíduos de aminoácidos de comprimento; ii) do antígeno ou imunogênio da dose de reforço; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de células T CD8+ da dose de reforço (por exemplo, PepGP70) são administradas como a dose iniciadora e um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou imunogênio contendo um ou mais epítopos de células T CD8+ ( por exemplo, AdGP70) é administrado como a dose de reforço, em combinação com a administração do inibidor de checkpoint imunológico anti-PD1. Os peptídeos ligados a fluorocarboneto são anfifílicos e espontaneamente formam micelas em certos solventes, em que essas micelas, quando administradas a um animal ou humano, são preferencialmente absorvidas por células apresentadoras de antígeno (APC) para processamento. Ver Patente dos EUA No 7.687.455 e

9.119.811; as descrições de cada um são aqui incorporadas por referência.

[0040] Os requerentes verificaram que a administração de uma primeira ou segunda composição de vacina em combinação com a terceira composição, um inibidor de checkpoint imunológico, proveu um efeito sinérgico da resposta imune induzida em comparação com a administração dessas composições sozinhas. Ver o Exemplo 7 e as Figuras 7, 8A e 8B. Os

16 / 74 grupos 2 e 4 da Figura 7 representam os animais aos quais foi administrada a combinação da vacina, em comparação com os grupos 1 e 3, que representam os animais aos quais foi administrada uma das duas composições de vacina indutoras de células T sozinha. A administração da combinação da vacina também aumentou a sobrevivência geral dos animais em comparação com os animais que recebem um único tratamento, conforme demonstrado nas Figuras 8A e 8B.

[0041] Em certas modalidades, são aqui providas combinações de vacina que compreendem uma primeira composição compreendendo um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou imunogênio contendo um ou mais epítopos de células T CD8+; e, uma terceira composição compreendendo um modulador imune selecionado a partir de um anti- imunossupressor ou um imunoativador. Em certas outras modalidade, são aqui providas combinações de vacina que compreendem uma segunda composição compreendendo micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado ao fluorocarboneto é: i) de 15 a 75 resíduos de aminoácido de comprimento; ii) a partir de um antígeno ou imunogênio; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de célula T CD8+ de um antígeno ou imunogênio; e, uma terceira composição compreendendo um modulador imune selecionado a partir de um anti-imunossupressor ou um imunoativador.

[0042] Em modalidades, a primeira composição compreende um vetor viral não replicante, como um vetor adenoviral. De todos os vetores virais deficientes para replicação disponíveis, o adenovírus é o mais potente no estímulo das respostas das células T ao antígeno recombinante. Em modalidades, a segunda composição compreende um peptídeo ligado a fluorocarboneto. Definições

[0043] Conforme usado aqui, os termos “um/uns” ou “uma/umas” são

17 / 74 usados, como é comum em documentos de patentes, para incluir um ou mais de um, independentemente de quaisquer outras instâncias ou usos de “pelo menos um” ou “um ou mais.”

[0044] Conforme usado aqui, o termo “ou” é usado para se referir a um não exclusivo ou, de modo que “A ou B” inclua “A mas não B”, “B mas não A” e “A e B”, a menos que indicado de outra forma.

[0045] Tal como aqui utilizado, o termo “cerca de” é usado para se referir a uma quantidade que é aproximadamente, proximamente, quase ou próxima de ser igual ou igual a uma quantidade declarada, por exemplo, a quantidade declarada mais/menos cerca de 5 %, cerca de 4%, cerca de 3%, cerca de 2% ou cerca de 1%.

[0046] Tal como aqui utilizado, um “adjuvante” refere-se a uma substância que aumenta a resposta imune do corpo a um antígeno, na presente descrição um adjuvante aumenta a resposta imune mediada por células induzida pela combinação da primeira composição, segunda composição e/ou terceira composição. Tal como aqui utilizado, um adjuvante é combinado em qualquer ou todas da primeira composição, segunda composição e/ou terceira composição. Um adjuvante é distinto da terceira composição da presente descrição. Exemplos de adjuvantes que podem ser usados para aumentar uma resposta imune mediada por células incluem, mas não estão limitados a um agonista de receptores tipo toll (TLR): por exemplo, de agonista de TLR2, TLR3, TLR7, TLR8, ou TLR9; ou um agonista de STING, cGAS, NOD1, NOD2 ou IRF3.

[0047] Por “administração” entende-se a introdução de uma composição de vacina ou combinação da presente descrição em um indivíduo; também pode se referir ao ato de prover uma composição da presente descrição a um indivíduo (por exemplo, por prescrição). O termo “quantidade terapeuticamente eficaz”, tal como aqui utilizado, refere-se à quantidade do composto a ser administrado que irá induzir uma resposta imune mediada por

18 / 74 células. O termo também se refere a uma quantidade das presentes composições ou combinações que irão aliviar ou prevenir até certo ponto um ou mais dos sintomas da condição a ser tratada. Em referência a condições/doenças que podem ser tratadas diretamente com uma composição da descrição, uma quantidade terapeuticamente eficaz se refere àquela quantidade que tem o efeito de prevenir a ocorrência da condição/doença em um animal que pode estar predisposto à doença, mas que ainda não experimentou ou exibiu sintomas da condição/doença (tratamento profilático), alívio dos sintomas da condição/doença, diminuição da extensão da condição/doença, estabilização (por exemplo, não agravamento) da condição/doença, prevenindo a propagação da condição/doença, retardamento ou desaceleração da progressão da condição/doença, melhoria ou paliação do estado da condição/doença e suas combinações. O termo “quantidade eficaz” refere-se à quantidade do composto a ser administrado que produzirá uma reação que é distinta de uma reação que ocorreria na ausência do composto. Em referência às modalidades da descrição, incluindo os compostos de imunoterapia da descrição, uma “quantidade eficaz” é aquela quantidade que aumenta a resposta imune no receptor em relação à resposta que seria esperada sem a administração do composto.

[0048] O termo “animal” refere-se a indivíduos mamíferos, incluindo humanos, cavalos, cães, gatos, porcos, gado e qualquer outro mamífero, juntamente com pássaros. Como aqui referido, o termo “animal” também inclui um animal individual em todas as fases de desenvolvimento, incluindo recém-nascido, embrionário e fetal.

[0049] O termo “hospedeiro” ou “organismo”, tal como aqui utilizado, inclui humanos, mamíferos (por exemplo, gatos, cães, cavalos, etc.), insetos, células vivas e outros organismos vivos. Um organismo vivo pode ser tão simples como, por exemplo, uma única célula eucariótica ou tão complexo como um mamífero. Hospedeiros típicos aos quais as modalidades da

19 / 74 presente descrição se referem serão mamíferos, particularmente primatas, especialmente humanos. Para aplicações veterinárias, uma grande variedade de indivíduos será adequada, por exemplo, gado, como bovinos, ovelhas, cabras, vacas, porcos e semelhantes; aves domésticas, como galinhas, patos, gansos, perus e semelhantes; e animais domesticados, particularmente animais de estimação, como cães e gatos. Para aplicações de pesquisa, uma grande variedade de mamíferos serão indivíduos adequados, incluindo roedores (por exemplo, camundongos, ratos, hamsters), coelhos, primatas e suínos, como porcos consanguíneos e semelhantes. Além disso, para aplicações in vitro, tais como aplicações de pesquisa in vitro, fluidos corporais e amostras de células dos indivíduos acima serão adequados para uso, tais como sangue de mamíferos (particularmente primatas, como humanos), urina ou amostras de tecido, ou sangue, urina ou amostras de tecido dos animais mencionados para aplicações veterinárias. Os hospedeiros que são “predispostos a” condição(ões) podem ser definidos como hospedeiros que não apresentam sintomas evidentes de uma ou mais dessas condições, mas que estão geneticamente, fisiologicamente ou de outra forma em risco de desenvolver uma ou mais dessas condições.

[0050] Os termos “proteína”, “polipeptídeo” e “peptídeo” podem ser aqui referidos indistintamente. No entanto, os termos podem ser distinguidos da seguinte forma. Uma “proteína” normalmente se refere ao produto final de modificações de transcrição, tradução e pós-tradução em uma célula. Tal como aqui utilizado, um “polipeptídeo” pode referir-se a uma “proteína” ou um “peptídeo”. Um “péptido”, em contraste com uma “proteína”, é tipicamente um polímero curto de aminoácidos, com um comprimento tipicamente de 100 ou menos aminoácidos.

[0051] As composições, formulações e métodos da presente invenção podem compreender, consistir essencialmente em, ou consistir nos componentes e ingredientes da presente invenção, bem como outros

20 / 74 ingredientes aqui descritos. Tal como aqui utilizado, “consistindo essencialmente em” significa que as composições, formulações e métodos podem incluir etapas, componentes ou ingredientes adicionais, mas apenas se as etapas, componentes ou ingredientes adicionais não alteram materialmente as características básicas e novas das composições, formulações e métodos reivindicadas.

[0052] Também deve ser notado que, conforme usado neste relatório descritivo e nas reivindicações anexas, o termo “configurado” descreve um sistema, aparelho ou outra estrutura que é construído ou configurado para executar uma tarefa específica ou adotar uma configuração específica. O termo “configurado” pode ser usado indistintamente com outras frases semelhantes, como arranjado e configurado, construído e arranjado, adaptado e configurado, adaptado, construído, fabricado e arranjado e semelhantes.

[0053] Tal como aqui utilizado, o termo “adenovírus humano” destina-se a abranger todos os adenovírus humanos da família Adenoviridae, que inclui membros do gênero Mastadenovírus. Até a data, foram identificados mais de cinquenta e um serótipos humanos de adenovírus (ver, por exemplo, Fields et al., Virology 2, Ch. 67 (3a ed., Lippincott-Raven Publishers)). O adenovírus pode ser de serogrupo A, B, C, D, E ou F. O adenovírus humano pode ser um serótipo 1 (Ad 1), serótipo 2 (Ad2), serótipo 3 (Ad3), serótipo 4 (Ad4), serótipo 5 (Ad5), serótipo 6 (Ad6), serótipo 7 (Ad7), serótipo 8 (Ad8), serótipo 9 (Ad9), serótipo 10 (Ad10), serótipo 11 (Ad11), serótipo 12 (Ad12), serótipo 13 (Ad13), serótipo 14 (Ad14), serótipo 15 (Ad15), serótipo 16 (Ad16), serótipo 17 (Ad17), serótipo 18 (Ad18), serótipo 19 (Ad19), serótipo 19a (Ad19a), serótipo 19p (Ad19p), serótipo 20 (Ad20), serótipo 21 (Ad21), serótipo 22 (Ad22), serótipo 23 (Ad23), serótipo 24 (Ad24), serótipo 25 (Ad25), serótipo 26 (Ad26), serótipo 27 (Ad27), serótipo 28 (Ad28), serótipo 29 (Ad29), serótipo 30 (Ad30), serótipo 31 (Ad31), serótipo 32 (Ad32), serótipo 33 (Ad33), serótipo 34 (Ad34), serótipo

21 / 74 35 (Ad35), serótipo 36 (Ad36), serótipo 37 (Ad37), serótipo 38 (Ad38), serótipo 39 (Ad39), serótipo 40 (Ad40), serótipo 41 (Ad41), serótipo 42 (Ad42), serótipo 43 (Ad43), serótipo 44 (Ad44 ), serótipo e 45 (Ad45), serótipo 46 (Ad46), serótipo 47 (Ad47), serótipo 48 (Ad48), serótipo 49 (Ad49), serótipo 50 (Ad50), serótipo 51 (Ad51) ou suas combinações, mas não estão limitadas a esses exemplos. Em certas modalidades, o adenovírus é serótipo 5(Ad5)

[0054] Tal como aqui utilizado, “modulador imune” refere-se a uma gama de tratamentos destinados a controlar o sistema imunológico de um paciente para atingir o controle imunológico, estabilização e erradicação potencial da doença. Por exemplo, um modulador imune pode ser uma substância usada para quebrar a tolerância (tal como pode estar presente em uma infecção crônica ou certas doenças autoimunes); ou uma substância usada para inativar células supressoras imunes para induzir ou aumentar uma resposta imune mediada por células hospedeiras contra um antígeno estranho ou autoantígeno (por exemplo, câncer); ou uma substância imunoestimuladora também usada para induzir ou aumentar uma resposta imune mediada por uma célula hospedeira contra um antígeno estranho ou autoantígeno (por exemplo, câncer). Em modalidades, os moduladores imune compreendem uma substância que modula as vias das células T e têm o potencial de revigorar uma resposta imune antitumoral ou antiviral.

[0055] Uma “composição farmacêutica” refere-se a uma mistura de um ou mais dos compostos de vacina aqui descritos, seus derivados ou seus sais farmaceuticamente aceitáveis, com outros componentes químicos, tais como carreadores e excipientes farmaceuticamente aceitáveis. Um dos objetivos de uma composição farmacêutica é facilitar a administração de um composto ao organismo.

[0056] Tal como aqui utilizado, um “carreador farmaceuticamente aceitável” refere-se a um carreador ou diluente que não causa irritação

22 / 74 significativa a um organismo e não anula a atividade biológica e as propriedades das composições de vacina administradas.

[0057] Os termos “tratar”, “tratando” e “tratamento” são uma abordagem para obter resultados clínicos benéficos ou desejados. Especificamente, os resultados clínicos benéficos ou desejados incluem, mas não estão limitados a, alívio dos sintomas, diminuição da extensão da doença, estabilização (por exemplo, não agravamento) da doença, retardamento ou desaceleração da progressão da doença, prevenção substancial da disseminação da doença, melhoria ou paliação do estado patológico e remissão (parcial ou total), seja detectável ou indetectável. Além disso, “tratar”, “tratando” e “tratamento” também podem significar o prolongamento da sobrevivência em comparação com a sobrevivência esperada se não receber tratamento e/ou pode ser terapêutico em termos de cura parcial ou completa para uma doença e/ou efeito adverso atribuível à doença. Tal como aqui utilizado, os termos “tratar profilaticamente” ou “tratando profilaticamente” referem-se à prevenção completa, substancial ou parcial de uma doença/condição ou um ou mais dos seus sintomas em um hospedeiro. Da mesma forma, “retardar o início de uma condição” também pode ser incluído em “tratando profilaticamente” e se refere ao ato de aumentar o tempo antes do início real de uma condição em um paciente que está predisposto à condição.

[0058] Conforme referido aqui, uma “vacina” pode incluir um antígeno ou vetor, juntamente com outros componentes de uma formulação de vacina, incluindo, por exemplo, adjuvantes, compostos de liberação lenta, solventes, etc. Embora as vacinas sejam tradicionalmente usadas para prevenir ou tratar doenças infecciosas, as vacinas também são capazes de modificar a função dos metabólitos ligando-se a peptídeos ou proteínas de sinalização ou seus receptores e bloqueando antígenos únicos de certos tipos de células anormais, como, por exemplo, tumores. Por conseguinte, é uma

23 / 74 modalidade da invenção prover vacinas para melhorar a resposta imune a qualquer antígeno, independentemente da fonte de antígeno ou sua função, incluindo antígenos para alterar as funções fisiológicas que são desejáveis para melhorar a saúde, como a imunização contra o câncer.

[0059] Conforme referido aqui, um “vetor” carrega um código genético, ou uma porção dele, para um antígeno, no entanto, não é o próprio antígeno. Em um aspecto exemplificativo, um vetor pode incluir um vetor viral ou vetor bacteriano. Conforme referido aqui, um “antígeno” significa uma substância que induz uma resposta imune específica em um indivíduo, incluindo humanos e/ou animais. O antígeno pode compreender um organismo inteiro, morto, atenuado ou vivo; uma subunidade ou porção de um organismo; um vetor recombinante contendo um inserto com propriedades imunogênicas; um pedaço ou fragmento de DNA capaz de induzir uma resposta imune após a apresentação a um animal hospedeiro; um polipeptídeo, um epítopo, um hapteno ou qualquer combinação dos mesmos. Em vários aspectos, o antígeno é um vírus, bactéria, uma subunidade de um organismo, um autoantígeno ou um antígeno de câncer. Combinações de Vacinas

[0060] São providas aqui combinações de vacinas que compreendem uma primeira composição e uma segunda composição, em que essas composições servem como uma dose iniciadora heteróloga e uma dose de reforço para induzir imunidade mediada por células T. A primeira composição e a segunda composição compreendem um ou mais epítopos de células T CD8+ que são iguais. Em certas modalidades, a primeira ou segunda composição pode compreender um antígeno ou imunogênio de comprimento total, ou um fragmento do mesmo, cada um dos quais também é referido aqui como um “polipeptídeo”. Em certas modalidades, a dose iniciadora (como uma primeira ou segunda composição) compreende um antígeno ou imunogênio de comprimento total, e a dose de reforço (como uma

24 / 74 primeira ou segunda composição) compreende um fragmento deste, como um peptídeo, incluindo um peptídeo quimérico. Em certas outras modalidades, a dose iniciadora (como uma primeira ou segunda composição) compreende um fragmento de um antígeno ou imunogênio, como um peptídeo, incluindo peptídeos quiméricos, e a dose de reforço (como uma primeira ou segunda composição) compreende um antígeno ou imunogênio de comprimento total. Em certas outras modalidades, a dose iniciadora (como uma primeira ou segunda composição) compreende um fragmento de um antígeno ou imunogênio, como um peptídeo, incluindo peptídeos quiméricos, e a dose de reforço (como uma primeira ou segunda composição) compreende um fragmento de um antígeno ou imunogênio, tal como um peptídeo, incluindo peptídeos quiméricos. Heterólogo, como aqui utilizado, não se refere ao antígeno ou imunogênio, mas ao vetor ou carreador de entrega ligado ao antígeno ou imunogênio.

[0061] Nas modalidades, a primeira e a segunda composições compreendem um vetor ou carreador de entrega, que pode incluir peptídeos, cadeias lipofílicas ou vetores de expressão, incluindo vetores virais não replicantes. Em certas modalidades, o carreador pode ser uma cadeia de hidrocarboneto, opcionalmente substituída por um ou mais átomos de halogênio. Em certas modalidades, o carreador pode ser uma cadeia de fluorocarboneto. Em certas modalidades, o vetor de entrega pode ser um vetor viral não replicante, tais como aqueles selecionados a partir de um vetor de adenovírus, um vetor de alphavirus, um vetor de vírus da herpes, um vetor de vírus do sarampo, um vetor de poxvirus ou um vetor de vírus da estomatite vesicular. Em certas modalidades, o vetor viral não replicante é um vetor de adenovírus deletado E1 e/ou E3. Em certas modalidades, o vetor adenoviral não replicante é um vetor adenoviral humano.

[0062] São providas aqui combinações de vacinas que compreendem uma primeira composição e uma segunda composição, em que a primeira

25 / 74 composição compreende um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou imunogênio contendo um ou mais epítopos de células T CD8+ e a segunda composição compreende micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado a fluorocarboneto tem: i) 15 a 75 resíduos de aminoácidos de comprimento; ii) a partir do antígeno ou imunogênio da primeira composição; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de células T CD8+ da primeira composição do antígeno ou imunogênio. Qualquer uma das primeiras ou segundas composições pode ser a dose iniciadora ou de reforço. Para prover um regime de dosagem heterólogo, cada uma das primeira e segunda composições deve ser administrada a um animal em necessidade, uma como dose iniciadora e a outra como dose de reforço.

[0063] Outras modalidades providas aqui são combinações de vacinas que compreendem uma primeira composição ou uma segunda composição e uma terceira composição, em que a primeira ou a segunda composição induzem imunidade de células T e a terceira composição é um modulador imune selecionado a partir de um anti-imunossupressor ou um imunoativador, que em combinação, aumentam a resposta de células T específicas a um antígeno. A primeira composição e a segunda composição compreendem um ou mais epítopos de células T CD8+. Em certas modalidades, a primeira ou segunda composição pode compreender um antígeno ou imunogênio de comprimento total, ou um fragmento do mesmo, cada um dos quais também é referido aqui como um “polipeptídeo”. Em certas modalidades, a primeira composição compreende um antígeno ou imunogênio de comprimento total. Em certas outras modalidades, a primeira composição compreende um fragmento de um antígeno, como um peptídeo, incluindo um peptídeo quimérico. Em certas modalidades, a segunda composição compreende um antígeno ou imunogênio de comprimento total. Em certas outras modalidades, a segunda composição compreende um fragmento de um antígeno ou imunogênio, como um peptídeo, incluindo um peptídeo quimérico.

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[0064] São providas aqui combinações de vacinas que compreendem uma primeira composição ou uma segunda composição e uma terceira composição, em que a primeira composição compreende um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou imunogênio contendo um ou mais epítopos de células T CD8+; a segunda composição compreende micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado a fluorocarboneto tem: i) 15 a 75 resíduos de aminoácidos de comprimento; ii) a partir do antígeno ou imunogênio da primeira composição; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de células T CD8+ do antígeno ou imunogênio; e a terceira composição compreendendo um modulador imune selecionado a partir de um anti-imunossupressor ou um imunoativador. Antígeno e Imunogênios

[0065] A escolha de antígeno ou imunogênio (que pode ser usado aqui indistintamente) é determinada se as respostas das células T contra o antígeno foram consideradas protetoras e/terapêuticas ou se espera que sejam protetoras e/ou terapêuticas, tanto em humanos quanto em modelos de animais. O grau de polimorfismo encontrado entre diferentes isolados de antígenos, bem como antígenos altamente conservados, polimorfismos de moléculas HLA ou epítopos altamente conservados dentro de antígenos, também são fatores na seleção de antígenos. Ver Patente dos EUA No

8.642.531 e Public. de Patente dos EUA No 2016/0106830 para composições de vacina de células T à base de epítopos de células T de antígenos altamente conservados e polimorfismo de moléculas HLA em diferentes populações e/ou grupos étnicos de pessoas, cujo conteúdo é aqui incorporado por referência. Ver também, Publ. de Patente dos EUA No 2016/0199469 nos parágrafos [0121] a [0134], cujo conteúdo é aqui incorporado por referência. Em certas modalidades, os antígenos também podem ser selecionados que são uma combinação de regiões conservadas, ou epítopos conservados, de um ou mais antígenos para produzir um antígeno de vacina sintético [Goodman AL,

27 / 74 et al. New candidate vaccines against blood-stage Plasmodium falciparum malaria: prime-boost immunization regimens incorporating human and simian adenoviral vectors and poxviral vectors expressing an optimized antigen based on merozoite surface protein 1. Infection and Immunity 2010;78(11):4601-12; Letourneau S, et al. Design and pre-clinical evaluation of a universal HIV-1 vaccine. PLoS ONE 2007;2(10):e984]. Em certas modalidades, a combinação pode estar na forma de um pool de peptídeos ou polipeptídeos em uma primeira ou segunda composição de vacina, ou como um peptídeo ou polipeptídeo quimérico na primeira ou segunda composição de vacina. Em certas modalidades, a primeira e a segunda composições de vacina compreendem mais de um antígeno para reduzir a probabilidade de escape imunológico. Ver Pub. Pat. dos EUA No 2016/0199469 para uma vacina de oncologia de células T compreendendo dois ou mais antígenos, cujo conteúdo é aqui incorporado por referência.

[0066] Os epítopos de células T dentro dos antígenos podem ser identificados por previsão bioinformática e confirmação experimental, ou por meio de uma abordagem empírica usando uma biblioteca de peptídeos abrangendo a sequência completa do antígeno. Ver o Exemplo 1 para mais descrição sobre a identificação de epítopos de células T (tanto CD8+ quanto CD4+). No entanto, embora o conhecimento dos epítopos apresentados por tipos de HLA comuns possa ser útil na condução de estudos fenotípicos detalhados das respostas das células T na pesquisa clínica e no desenvolvimento de vacinas, não é necessário um conhecimento completo de todos os epítopos possíveis contidos no antígeno. As composições de vacinas instantâneas, primeira e/ou segunda composições, compreendem pelo menos um epítopo de célula T CD8+. Em certas modalidades, a primeira e a segunda composições compreendem pelo menos dois, três, quatro, cinco ou pelo menos seis epítopos de células T CD8+. Em certas outras modalidades, a primeira e/ou segunda composição de vacina compreende adicionalmente um

28 / 74 ou mais epítopos de células T CD4+. Entende-se que os antígenos na forma de polipeptídeos nas composições de vacina podem compreender um ou mais epítopos de células T que não são identificados usando as ferramentas disponíveis para identificação.

[0067] Em modalidades, o antígeno/imunogênio pode corresponder a uma porção menor ou polipeptídeo derivado de uma sequência de antígeno de comprimento total que pode ser selecionada com base na conservação de sequência e/ou na presença de epítopos de células T CD8+ e CD4+. Os epítopos de células T CD4+ e/ou CD8+ podem ser identificados usando ferramentas de bioinformática que identificam sequências de ligação de HLA classe I e/ou HLA classe II, ensaios in vitro usando amostras de PBMC humanas ou ensaios de ligação de HLA classe I e/ou HLA classe II in vitro. O imunogênio pode ser gerado por concatenação artificial de porções de sequência menores ou polipeptídeos derivados de uma única ou múltiplas sequências de antígeno do mesmo patógeno. As sequências concatenadas podem ser utilizadas para a geração de imunogênios peptídicos sintéticos ou a sequência de DNA correspondente pode ser incorporada em um vetor adenoviral.

[0068] Em certas modalidades, o antígeno ou imunogênio é de um patógeno, um antígeno de câncer ou um autoantígeno. Em certas modalidades, o antígeno ou imunogênio é um neoantígeno. Conforme usado aqui, “neoantígeno” se refere a uma proteína hospedeira conhecida com uma ou mais alterações de aminoácidos em comparação com o tipo selvagem que permite que o sistema imunológico do hospedeiro seja reconhecido como estranho. Os neoantígenos podem ser únicos para cada paciente e, portanto, como aqui utilizado, podem ser referidos como variantes de proteínas, incluindo variantes clínicas identificadas de pacientes individuais. Variantes clínicas humanas podem ser identificadas usando bancos de dados bem conhecidos que fornecem um arquivo público de relatórios das relações entre

29 / 74 variações e fenótipos humanos. Landrum MJ, et al. ClinVar: public archive of interpretations of clinically relevant variants. Nucleic Acids Res. 2016 Jan 4;44(D1):D862-8. Esses neoantígenos ou variantes clínicas são mapeados para epítopos de células T CD8+ que permitem o desenvolvimento das presentes combinações de vacinas. A descrição quanto ao uso de ferramentas bem conhecidas para mapear epítopos de células T de antígenos ou imunogênios é provida no Exemplo 1.

[0069] Em certas modalidades, o antígeno ou imunogênio é de um patógeno, incluindo aqueles conhecidos por levar ao desenvolvimento de câncer (e, portanto, podem ser expressos na superfície das células cancerosas). Nas modalidades, o patógeno é um vírus, fungo, parasita ou bactéria. Em certa modalidade, o antígeno ou imunogênio é do vírus selecionado a partir de EBV, HPV, HTLV-1, MCPvV, KSHV ou HERV. Cada um desses vírus é conhecido por induzir o crescimento de câncer ou tumor. Em certas modalidades, o antígeno ou imunogênio são provenientes do vírus do HCV (vírus da hepatite C) ou HBV (vírus da hepatite B).

[0070] Em certas modalidades, o antígeno ou imunogênios podem ser um ou mais dos seguintes: EBV (EBNA1, LMP1, LMP2 e BARF1), HPV (E1 a E7), HTLV-1 (tax), MCPyV (T grande, T pequeno), KSHV (Orf73, Orf57, K10.5 e K12), CMV (glicoproteína B e fosfoproteína 65), BKV ((T grande, T pequeno), JCV (T grande, T pequeno), SV40 (T grande, T pequeno), HERV (Env, Gag, Pol), HMTV (Env, Gag, Pol), HIV-1 (Env, Gag, Pol, Nef, Tat, Vif), HCV (Core, NS3, NS4, NS5), HBV (Core, Pol, Env e X), Influenza (HA, NP, NA, M1, PB1, PB2, PA), HRV (VP1-4, 2A-C, 3A-D), Mycobacterium tuberculosis (Ag85A, ASAT-6, RpfE, CFP-10) e Plasmodium falciparum (MSP-1. AMA-1, RTS,S, Pfs25).

[0071] Em modalidades, o antígeno induz uma resposta imune contra patógenos, incluindo, por exemplo, um vírus. Vírus exemplificativos incluem um ortomixovírus, um paramixovírus, um rinovírus, coronavírus, vírus

30 / 74 influenza, vírus sincicial respiratório (RSV), vírus do resfriado comum ou vírus do sarampo, vírus da herpes, vírus da raiva, varicela, vírus do papiloma humano (HPV), vírus da hepatite, ou outros patógenos virais conhecidos.

[0072] Em modalidades, o antígeno induz uma resposta imune contra patógenos bacterianos. Bactérias exemplificativas incluem Bacillus, Mycobacterium, Staphylococcus, Streptococcus, Pseudomonas, Klebsiella, Haemophilus, Mycoplasm e/ou Bacillus anthracis. Em certas modalidades, o antígeno induz uma resposta imune contra um patógeno fúngico. Nas modalidades, o fungo incluis Aspergillus, Candida, Cryptococcus, Histoplasma, Pneumocystis, e/ou Stachybotrys.

[0073] Em modalidades, o antígeno pode incluir um alérgeno ou um antígeno associado a tumor. Ainda em um aspecto adicional, o antígeno pode incluir polipeptídeos, peptídeos ou painéis dos mesmos que compreendem um ou mais epítopos de uma proteína associada a uma doença. Por exemplo, polipeptídeos, peptídeos ou painéis dos mesmos adequados podem compreender um ou mais epítopos de uma proteína associada a um patógeno. Os polipeptídeos adequados podem compreender a sequência de aminoácidos de comprimento total de uma proteína correspondente de um patógeno ou um fragmento deste. Primeira Composição da Combinação de Vacina

[0074] Nas modalidades, a primeira composição compreende um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou imunogênio contendo um ou mais epítopos de célula T CD8+. Em certas modalidades, o vetor viral não replicante é um vetor de adenovírus, um vetor de alphavirus, um vetor de vírus da herpes, um vetor de vírus do sarampo, um vetor de poxvirus ou um vetor de vírus da estomatite vesicular. Em modalidades exemplificativas, o vetor viral não replicante é um vetor adenoviral. A deleção ou disrupção da sequência E1 e/ou E3 resulta em um vetor adenoviral não replicante.

[0075] Nas modalidades, as composições e formulações incluem um

31 / 74 vetor, ou seja, um vetor viral. Conforme referido aqui, um “vetor viral” é um vírus projetado que incorporou genes para e expressou um antígeno. Os vetores virais podem ser não replicante e são seguros para o hospedeiro e o ambiente. Deve ser reconhecido que qualquer vetor viral pode ser incorporado nas composições, formulações e métodos da invenção para efetuar a entrega em uma célula.

[0076] Os vetores virais exemplificativos incluem adenovírus, retrovírus, lentivírus, vírus da herpes, vírus da varíola, vírus alfa, vírus adenoassociados, entre outros. Muitos desses vetores virais estão disponíveis na técnica. Os vectores aqui descritos podem ser construídos utilizando técnicas recombinantes convencionais amplamente disponíveis para um especialista na técnica. Essas técnicas podem ser encontradas em referências comuns de biologia molecular, como Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Sambrook, et al., 1989, Cold Spring Harbor Laboratory Press), Gene Expression Technology (Methods in Enzymology, Vol. 185, edited by D. Goeddel, 1991. Academic Press, San Diego, Calif.), e PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications (Innis, et al. 1990. Academic Press, San Diego, Calif.).

[0077] Em certas modalidades, o vetor viral não replicante é um adenovírus, incluindo, por exemplo, em que o adenovírus é um adenovírus bovino, um adenovírus canino, um adenovírus primata não humano, um adenovírus de galinha ou um adenovírus porcino ou suíno. Em certas modalidades, o vetor viral não replicante é um adenovírus humano.

[0078] Em modalidades, vetores adenovirais não replicantes são particularmente úteis para transferência de genes em células eucarióticas e desenvolvimento de vacinas, e em modelos animais.

[0079] Nas modalidades, qualquer vetor adenoviral (vetor Ad) conhecido por um versado na técnica e preparado para administração a um mamífero, que pode compreender e expressar um antígeno ou imunogênio

32 / 74 pode ser usado nas composições e com os métodos deste pedido. Esses vetores Ad incluem qualquer um daqueles nas Patentes dos EUA Nos

6.706.693; 6.716.823; 6.348.450; ou Publicação de Patente dos EUA. Nos 2003/0045492; 2004/0009936; 2005/0271689; 2007/0178115; 2012/0276138 (aqui incorporado por referência na totalidade).

[0080] Em certas modalidades, o vetor de adenovírus recombinante pode ser não replicante ou deficiente para replicação, requerendo atividade complementar de E1 para replicação. Em modalidades, o vetor de adenovírus recombinante pode incluir vetores de adenovírus defeituosos em E1, defeituosos em E3 e/ou defeituosos em E4, ou o vetor de adenovírus incompletos (“gutless”) no qual os genes virais são deletados. A mutação E1 aumenta a margem de segurança do vetor porque os mutantes de adenovírus defeituosos em E1 são incompetentes para replicação em células não permissivas. A mutação E3 aumenta a imunogenicidade do antígeno por disrupção do mecanismo pelo qual o adenovírus infrarregula as moléculas MHC de classe I. A mutação E4 reduz a imunogenicidade do vetor de adenovírus ao suprimir a expressão gênica tardia, podendo assim permitir a revacinação repetida utilizando o mesmo vetor. Nas modalidades, o vetor de adenovírus recombinante é um vetor defeituoso em E1 e/ou E3.

[0081] A replicação do vetor de adenovírus incompleto requer um vírus auxiliar e uma linhagem de células 293 humana especial expressando E1a e Cre, uma condição que não existe no ambiente natural; o vetor é privado de genes virais, portanto, o vetor como um carreador de vacina não é imunogênico e pode ser inoculado várias vezes para revacinação. O vetor de adenovírus incompleto também contém espaço de 36 kb para acomodar os transgenes, permitindo assim a coentrega de um grande número de genes de antígeno nas células. Motivos de sequência específica, como o motivo RGD, podem ser inseridos na alça H-I de um vetor de adenovírus para aumentar sua infecciosidade. Um adenovírus recombinante pode ser construído por

33 / 74 clonagem de transgenes específicos ou fragmentos de transgenes em qualquer um dos vetores de adenovírus, tais como aqueles descritos abaixo. O vetor recombinante de adenovírus é usado para transduzir células epidérmicas de um vertebrado em um modo não invasivo para uso como um agente imunizante. O vetor de adenovírus também pode ser usado para métodos de administração invasivos, como injeção intravenosa, intramuscular ou subcutânea.

[0082] Nas modalidades, a primeira composição compreendendo o vetor viral não replicante que expressa o antígeno ou imunogênio da combinação de vacina de interesse pode ser formulada para administração a um mamífero. No que diz respeito às dosagens, vias de administração, formulações, adjuvantes e usos para vírus recombinantes e produtos de expressão dos mesmos, as composições da invenção podem ser usadas para administração parentérica ou mucosa, preferencialmente por vias intradérmica, subcutânea, intranasal ou intramuscular. Quando a administração mucosal é utilizada, é possível usar as vias oral, ocular ou nasal.

[0083] As formulações que podem compreender o vetor de adenovírus de interesse, podem ser preparadas de acordo com técnicas padrão bem conhecidas dos versados na técnica farmacêutica ou veterinária. Tais formulações podem ser administradas em dosagens e por técnicas bem conhecidas dos versados nas técnicas clínicas, levando em consideração fatores como idade, sexo, peso e a via de administração. As formulações podem ser administradas sozinhas ou podem ser coadministradas ou administradas sequencialmente com composições, por exemplo, com “outra” composição imunológica, ou vacina atenuada, inativada, recombinante ou composições terapêuticas, provendo assim composições multivalentes ou “cocktail” ou de combinação da invenção e métodos que as utilizam. Nas modalidades, as formulações podem compreender sacarose como um

34 / 74 crioprotetor e polissorbato-80 como um surfactante não iônico. Em certas modalidades, as formulações compreendem adicionalmente inibidores da oxidação de radical livre etanol e histidina, o quelante de íon metálico ácido etilenodiaminotetracético (EDTA) ou outros agentes com atividade comparável (por exemplo, bloquear ou prevenir a oxidação de radical livre catalisada por íon metálico).

[0084] As formulações podem estar presentes em uma preparação líquida para administração pela mucosa, por exemplo, oral, nasal, ocular, etc., formulações, tais como suspensões e, preparações para administração parentérica, subcutânea, intradérmica, intramuscular, intravenosa (por exemplo, administração injetável), tal como suspensões ou emulsões estéreis. Em tais formulações, o vetor adenoviral pode estar em mistura com um carreador, diluente ou excipiente adequado, como água estéril, soro fisiológico ou semelhantes. As formulações também podem ser liofilizadas ou congeladas. As formulações podem conter substâncias auxiliares, tais como agentes molhantes ou emulsionantes, agentes tamponantes de pH, adjuvantes, conservantes e semelhantes, dependendo da via de administração e da preparação desejada. As formulações podem conter pelo menos um composto adjuvante.

[0085] Textos padrão, tais como “REMINGTON’S PHARMACEUTICAL SCIENCE”, 17ª edição, 1985, aqui incorporados por referência, podem ser consultados para preparar preparações adequadas, sem experimentação indevida. Segunda Composição da Combinação de Vacina

[0086] Nas modalidades, a segunda composição compreende micelas que contêm peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado ao fluorocarboneto é: i) de 15 a 75 resíduos de aminoácido de comprimento; ii) a partir do antígeno ou imunogênio da primeira composição; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de célula T CD8+ do antígeno ou imunogênio,

35 / 74 Nas modalidades, o peptídeo tem um comprimento de 20 a 60 aminoácidos, como de 25 a 50 aminoácidos, de 30 a 40 aminoácidos, por exemplo, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44 ou 45 aminoácidos. Em certas modalidades, o peptídeo pode incluir sequências de aminoácidos curtas adicionais. As sequências adicionais podem facilitar a fabricação ou formulação do peptídeo ou aumentar a estabilidade do peptídeo. Por exemplo, o peptídeo pode compreender um ou mais aminoácidos adicionais, tipicamente no terminal N e/ou no terminal C para aumentar a carga positiva líquida do peptídeo e/ou para reduzir a hidrofobicidade do peptídeo. A carga positiva líquida pode ser aumentada de modo que o peptídeo tenha um ponto isoelétrico maior ou igual a 7.

[0087] Em certas modalidades, um ou mais, tais como dois ou três aminoácidos carregados positivamente (arginina e/ou lisina) são adicionados ao terminal N e/ou C de um ou mais dos peptídeos na composição. Por exemplo, três resíduos de lisina (KKK) podem ser adicionados ao terminal N e/ou C de um ou mais dos peptídeos. Ver Tabela 2. Os aminoácidos positivos são tipicamente adicionados no(s) final(is) dos peptídeos que têm uma hidrofobicidade geral de mais de 65%, uma carga líquida de menos de zero e/ou incluem agrupamento de aminoácidos hidrofóbicos.

[0088] Nas modalidades, onde o peptídeo está ligado a um fluorocarboneto, o terminal do peptídeo, tal como o terminal que não está conjugado ao fluorocarboneto, ou outra fixação, pode ser alterado, por exemplo, para promover a solubilidade do construto fluorocarboneto-peptídeo via a formação de micelas. Para facilitar a síntese em grande escala do construto, os resíduos de aminoácidos N- ou C-terminais do peptídeo podem ser modificados. Quando o peptídeo desejado é particularmente sensível à clivagem por peptidases, a ligação peptídica normal pode ser substituída por um mimético de peptídeo não clivável. Essas ligações e métodos de síntese são bem conhecidos na técnica.

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[0089] O peptídeo pode ser um peptídeo nativo. O peptídeo nativo pode ter extremidades livres ou modificadas. O peptídeo pode ser modificado para aumentar a longevidade, tal como meia-vida ou persistência no local de administração, do peptídeo in vivo ou para direcionar o peptídeo a células apresentadoras de antígeno. Por exemplo, o peptídeo imunogênico pode conter um ou mais aminoácidos de ocorrência não natural e/ou ligações covalentes de ocorrência não natural para conectar covalentemente aminoácidos adjacentes. Em certas modalidades, os aminoácidos não padronizados de ocorrência não natural também podem ser incorporados aos peptídeos imunogênicos, desde que não interfiram com a capacidade do peptídeo de interagir com as moléculas HLA e permanecer com reatividade cruzada com células T que reconhecem as sequências naturais. Os aminoácidos não naturais podem ser usados para melhorar a resistência do peptídeo à protease ou estabilidade química. Exemplos de aminoácidos não naturais incluem D-aminoácidos e modificações de cisteína.

[0090] Em modalidades, a segunda composição pode compreender vários peptídeos ligados a cadeias de fluorocarboneto. Por conseguinte, a composição pode compreender pelo menos dois, como pelo menos três, quatro, cinco, seis, sete, oito, nove, dez, onze, doze, treze, quatorze ou mais peptídeos. Em modalidades exemplificativas, a segunda composição compreende quatro peptídeos, cada um dos quais está ligado a uma cadeia de fluorocarboneto. Ver Exemplo 1.

[0091] Se um peptídeo é ou não capaz de induzir uma resposta específica de peptídeo em células T de um paciente com câncer, um paciente com uma infecção crônica ou um indivíduo saudável pode ser determinado por qualquer meio adequado, tipicamente testando uma amostra de células mononucleadas de sangue periférico (PBMCs) retirados do dito paciente ou indivíduo em um ensaio adequado. A resposta das células T é assim detectada in vitro na amostra. Os ensaios adequados podem medir ou detectar a ativação

37 / 74 de células T após incubação com um peptídeo de teste. A ativação de células T pode ser tipicamente indicada pela secreção de uma citocina, como IFN- gama, que pode ser detectada em qualquer ensaio adequado, tipicamente um imunoensaio como um ELISA ou ELISpot. A magnitude da resposta das células T de um paciente ou indivíduo pode ser determinada no mesmo ensaio, por exemplo, quantificando a quantidade de citocina liberada na amostra como um todo, ou por uma célula particular na amostra, após incubação com um peptídeo de teste. Os ensaios adequados são descritos mais abaixo e nos Exemplos.

[0092] Em certas modalidades, a segunda composição da invenção compreende um peptídeo ou peptídeos que induz uma resposta específica de células T CD8+ em pelo menos 20% de indivíduos saudáveis e/ou pacientes com câncer. Os ensaios imunológicos para medir as respostas de células T específicas de peptídeo em células mononucleares de sangue periférico humano (PBMCs) de indivíduos saudáveis ou pacientes com câncer podem ser realizados por meio de citocina ELISpot, tal como o ensaio IFN-γ ELISpot ou coloração de citocina intracelular usando citometria de fluxo. Os ensaios podem ser realizados a partir de PBMCs frescas ou congeladas. Os ensaios podem ser realizados ex vivo ou após culturas in vitro de curto prazo de PBMCs incubadas com um único peptídeo ou uma composição compreendendo vários peptídeos antigênicos. A quantidade do(s) peptídeo(s) na cultura in vitro de curto prazo pode variar de 0,001 μg por peptídeo a 100 μg/peptídeo. O tempo de incubação para culturas in vitro de curto prazo pode ser entre 5 a 15 dias, como 7 a 13 dias ou 9 a 11 dias. Culturas in vitro de curto prazo podem ser realizadas na presença de citocinas, tais como uma ou mais de IL-2, IL-15 e IL-7, preferencialmente IL-2 e IL-15. Culturas in vitro de curto prazo podem ser realizadas após a depleção das células T reguladoras e/ou células NK. A depleção de tais células pode ser particularmente desejável quando as PBMCs são de um paciente com câncer. A cultura in

38 / 74 vitro de curto prazo pode ser realizada na presença de anticorpos neutralizantes de IL-10, anticorpos anti-PD1, anticorpos anti-CTLA-4, anticorpos anti-OX-40, anticorpos anti-GITR, denileucina, diftitox, inibidores de quinase e / ou agonistas de receptores toll incluindo agonistas de TLR2, TLR3, TLR7, TLR8 e TLR9.

[0093] Em certas modalidades, o carreador é uma cadeia de hidrocarboneto substituída por um ou mais átomos de halogênio. Em modalidades, o carreador é uma cadeia de hidrocarboneto substituída por um ou mais átomos de flúor, aqui referida como uma “cadeia de fluorocarboneto”.

[0094] O fluorocarboneto pode compreender uma ou mais cadeias derivadas de perfluorocarboneto ou radicais mistos de fluorocarboneto/hidrocarboneto e pode ser saturado ou insaturado, cada cadeia tendo de 3 a 30 átomos de carbono. Assim, as cadeias na fixação de fluorocarboneto são tipicamente saturadas ou insaturadas, preferencialmente saturadas. As cadeias na fixação de fluorocarbono podem ser lineares ou ramificadas, mas preferencialmente são lineares. Cada cadeia tem tipicamente de 3 a 30 átomos de carbono, de 5 a 25 átomos de carbono ou de 8 a 20 átomos de carbono. A fim de ligar covalentemente o vetor de fluorocarboneto ao peptídeo, um grupo reativo, ou ligando, por exemplo —CO—, —NH—, S, O ou qualquer outro grupo adequado é incluído no vetor. O uso de tais ligandos para obter ligações covalentes é bem conhecida na técnica. O grupo reativo pode estar localizado em qualquer posição no vetor de fluorocarboneto.

[0095] O acoplamento do vetor de fluorocarboneto ao peptídeo pode ser alcançado por meio de grupos funcionais, tais como —OH, —SH, — COOH e —NH2, naturalmente presentes ou introduzidos em qualquer local do peptídeo. Exemplos de tais ligações incluem ligações de amida, hidrazona, dissulfeto, tioéter e oxima.

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[0096] Opcionalmente, um elemento espaçador (peptídico ou não peptídico) pode ser incorporado para permitir a clivagem do peptídeo do elemento de fluorocarboneto para processamento dentro de uma célula apresentadora de antígeno e para otimizar a apresentação estérica do peptídeo. O espaçador também pode ser incorporado para auxiliar na síntese da molécula e para melhorar sua estabilidade e/ou solubilidade. Exemplos de espaçadores incluem polietilenoglicol (PEG) ou aminoácidos, como lisina ou arginina, que podem ser clivados por enzimas proteolíticas.

[0097] Em certas modalidades, o peptídeo ligado a fluorocarboneto pode ter a estrutura química CmFn—CyHx-(Sp)-R ou derivados dos mesmos, em que m=3 a 30, n<=2m+1, y=0 a 15, x<=2y, (m+y)=3 a 30, Sp é um radical espaçador químico opcional e R é um peptídeo imunogênico. Normalmente m e n satisfazem a relação 2m − 1 ≦ n ≦ 2m + 1 e, preferencialmente, n = 2m +

1. Normalmente x e y satisfazem a relação 2y − 2 ≦ x ≦ 2y e, preferencialmente, x = 2y. Preferencialmente, o radical cmFn-cyHx é linear.

[0098] Nas modalidades, m é de 5 a 15, mais preferencialmente de 8 a

12. Em outras modalidades, y é de 0 a 8, mais preferencialmente de 0 a 6 ou 0 a 4. Em modalidades, o radical CmFn—CyHx é saturado (ou seja, n=2m+1 e x=2y) e linear, e que m=8 a 12 e y=0 a 6 ou 0 a 4.

[0099] Em certas modalidades, o vetor de fluorocarbono é derivado de ácido 2H, 2H, 3H, 3H-perfluoroundecanoico com a seguinte fórmula:

[00100] Nas modalidades, a fixação de fluorocarboneto é o radical saturado linear C8F17(CH2)2— que é derivado de C8F17(CH2)2COOH. Em certas modalidades, as fixações de fluorocarboneto têm as seguintes fórmulas: C6F13(CH2)2—, C7F15(CH2)2—, C9F19(CH2)2—, C10F21(CH2)2—, C5F11(CH2)3—, C6F13(CH2)3—, C7F15(CH2)3—, C8F17(CH2)3— e

40 / 74 C9F19(CH2)3— que são derivados de C6F13(CH2)2COOH, C7F15(CH2)2COOH, C9F19(CH2)2COOH, C10F21(CH2)2COOH, C5F11(CH2)3COOH, C6F13(CH2)3COOH, C7F15(CH2)3COOH, C8F17(CH2)3COOH e C9F19(CH2)3COOH respectivamente.

[00101] Nas modalidades, exemplos de estruturas adequadas para os construtos de vetor-antígeno de fluorocarboneto têm a fórmula: em que Sp e R são conforme definidos acima. Em certas modalidades, Sp é derivado de um resíduo de lisina e tem a fórmula — CONH—(CH2)4—CH(NH2)—CO—. Nas modalidades, R é um peptídeo com 15 a 75 resíduos de aminoácidos de comprimento; ii) a partir do antígeno ou imunogênio da primeira composição; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de célula T CD8+ da primeira composição do antígeno ou imunogênio.

[00102] Em certas modalidades, a fixação de fluorocarboneto pode ser modificado de modo que o composto resultante ainda seja capaz de entregar o peptídeo às células apresentadoras de antígeno. Assim, por exemplo, vários átomos de flúor podem ser substituídos por outros átomos de halogênio, como cloro, bromo ou iodo. Além disso, é possível substituir vários átomos de flúor por grupos metil ou hidrogênio e ainda reter as propriedades da molécula aqui descrita.

[00103] Nas modalidades, os peptídeos podem ser ligados ao vetor de fluorocarboneto por meio de um radical espaçador. Em uma modalidade, o

41 / 74 radical espaçador é um resíduo de lisina. Este resíduo espaçador pode estar presente além de quaisquer resíduos de lisina terminais como descrito acima, de modo que o peptídeo pode, por exemplo, ter um total de quatro resíduos de lisina N-terminais. Por conseguinte, em certas modalidades, a segunda composição da invenção pode compreender peptídeos ligados a fluorocarboneto em que os peptídeos têm um resíduo de lisina C-terminal ou N-terminal, preferencialmente um resíduo de lisina N-terminal. Nas modalidades, a lisina terminal nos peptídeos está ligada a um fluorocarboneto com a fórmula C8F17 (CH2)2COOH. Nas modalidades, o fluorocarboneto é acoplado à cadeia épsilon do resíduo de lisina N-terminal.

[00104] Nas modalidades, a segunda composição compreende pelo menos 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 ou 10 ou mais peptídeos imunogênicos ligados ao seu próprio vetor de fluorocarboneto. A Terceira Composição da Combinação de Vacina

[00105] Nas modalidades, a terceira composição compreende um modulador imune. Os moduladores imune compreendem uma variedade de tratamentos (por exemplo, substâncias ou compostos) destinados a controlar o sistema imunológico de um paciente para atingir o controle imunológico, estabilização e erradicação potencial da doença.

[00106] Em modalidades, os moduladores imune compreendem anticorpos de bloqueio de checkpoint imunológico que modulam as vias das células T e têm o potencial de revigorar uma resposta imune antitumoral ou antiviral. Em certas modalidades, os inibidores de checkpoint imunológico incluem, mas não estão limitados a, ipilimumabe, o primeiro anticorpo de checkpoint imunológico aprovado pela FDA licenciado para o tratamento de melanoma metastático que bloqueia uma molécula de checkpoint chamada antígeno de linfócito T citotóxico 4 (CTLA-4) e outros compostos (por exemplo, anticorpos) direcionados a receptores coinibidores, como CTLA-4, PD-1, Lag-3, Tim-3, TIGIT e/ou Vista.

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[00107] Nas modalidades, os moduladores imunes compreendem substâncias direcionadas a receptores coestimuladores expressos por células T, como aqueles selecionados a partir de receptores de fator de necrose tumoral (TNFRs), incluindo e não se limitando a TNFR induzido por glicocorticoides (GITR; CD357), CD27, OX40 (CD134), ICOS (CD278) ou 4-1BB (CD137) onde a ligação dessas glicoproteínas com anticorpos agonistas transfere ativamente sinais de ativação para o linfócito.

[00108] Em certas modalidades, os moduladores imunes compreendem inibidores de células mieloides supressoras, como, por exemplo, PDL1, PDL2, VISTA, B7-1, CD47, CD200, GLA1, GAL3, CLECG4 ou SIRPa. Nas modalidades, os moduladores imune compreendem compostos direcionados a uma gama de receptores tipo Toll (TLR) e receptores tipo NOD (NLR) que representam alvos para uma classe de agonistas, mas também moléculas antagonistas. Em modalidades adicionais, os moduladores imunes compreendem citocinas que são conhecidas por modular as respostas das células T, como fator estimulador de colônia de granulócitos (G-CSF), interferons, IL-2, IL-7 ou IL-12.

[00109] Em modalidades, a terceira composição compreende um inibidor de checkpoint imunológico que visa PD1, PDL1, PDL2, CD28, CD80, CD86, CTLA4, B7RP1, ICOS, B7RPI, B7-H3, B7-H4, BTLA, HVEM, KIR, TCR, LAG3, CD 137, CD137L, OX40, OX40L, CD27, CD70, CD40, CD40L, TIM3, GAL9, ADORA, CD276, VTCN1, IDO1, KIR3DL1, HAVCR2, VISTA ou CD244. Veja, por exemplo Exemplo 5, que provê um método para alvejar PD1.

[00110] Nas modalidades, a terceira composição compreende um inibidor de checkpoint imunológico selecionado a partir de Ipilimumabe, Nivolumabe, Pembrolizumabe, Atezolizumabe, Avelumabe, Durvalumabe, Cemiplimabe, REGN2810, BMS-936558, SHR1210, KN035, IBI308, PDR001, BCD-100, A317, JS001.

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[00111] Em outras modalidades, a terceira composição compreende um inibidor de MDSC que visa ADAM17, PEG-2, PDE5, COX2, iNOS2, PDE5, c-kit, ARG1, PI3K, CSF-1R, Caspase-8, CCL2, RON, ROS, S100A8/A9 ou receptor X nuclear de fígado.

[00112] Nas modalidades, o inibidor de MDSC é PF-5480090, INCB7839, nitro-aspirina, SC58236, Celecoxib, IPI-549, PLX3397, BLZ945, GW2580, RG7155, IMC-CS4, AMG-820, ARRY-382, sildenafil, tadalafil, N- hidroxi-nor-L-Arg, imatinibe, z-IETD-FMK, trabectedina, Emricasan, anticorpo anti-CCL2 (carlumabe ou ABN912), Tasquinimod, ASLAN002, IMC-RON8 ou GW3965. Ver, por exemplo, Fleming et al.” Targeting Myeloid-Derived Suppressor Cells to Bypass Tumor-Induced Immunosuppression” Front Immunol. 2018; 9: 398.

[00113] Nas modalidades, os inibidores imunológicos são formulados em uma solução aquosa apropriada para administração, em que a terceira composição é administrada como uma composição separada de qualquer uma das primeira ou segunda composições de vacina. Nas modalidades, a composição de inibidor imunológico é administrada em momentos e dias diferentes da primeira e/ou segunda composição de vacina. Métodos de Uso

[00114] Nas modalidades fornecidas aqui, estão métodos para induzir uma resposta de células T CD8+ de antígeno por meio da administração de uma dose iniciadora e de reforço heteróloga de uma composição de vacina. Em certas modalidade, aqueles métodos compreendem administrar uma combinação de vacina compreendendo a) uma primeira composição compreendendo um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou um imunogênio contendo um ou mais epítopos de célula T CD8+; e, administrar uma segunda composição compreendendo micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado ao fluorocarboneto é: i) de 15 a 75 resíduos de aminoácido de comprimento; ii) a partir do antígeno ou

44 / 74 imunogênio da primeira composição; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de célula T CD8+ da primeira composição do antígeno ou imunogênio, em que uma da primeira composição ou da segunda composição é administrada como uma dose iniciadora e a outra da primeira composição ou da segunda composição é administrada como uma dose de reforço, desde que a primeira e a segunda composições sejam administradas.

[00115] Nas modalidades, a dose iniciadora e de reforço são administradas com pelo menos 7 dias de intervalo, pelo menos 14 dias de intervalo ou mais. Nas modalidades, a dose iniciadora e a dose de reforço são administradas com cerca de 7 dias de intervalo, cerca de 14 dias de intervalo, cerca de 20 dias de intervalo, cerca de 25 dias de intervalo, cerca de 30 dias de intervalo, cerca de 35 dias de intervalo, cerca de 40 dias de intervalo, cerca de 45 dias de intervalo , com cerca de 50 dias de intervalo, cerca de 55 dias de intervalo, cerca de 60 dias de intervalo ou cerca de 65 dias de intervalo. Vantajosamente, as doses são administradas com cerca de 40 dias de intervalo, cerca de 41 dias de intervalo, cerca de 42 dias de intervalo, cerca de 43 dias de intervalo, cerca de 44 dias de intervalo, cerca de 45 dias de intervalo, cerca de 46 dias de intervalo , com cerca de 47 dias de intervalo, cerca de 48 dias de intervalo, cerca de 49 dias de intervalo ou cerca de 50 dias de intervalo. Nas modalidades, a dose iniciadora e a dose de reforço são administradas com cerca de 1 semana de intervalo, cerca de 2 semanas de intervalo, cerca de 3 semanas de intervalo, cerca de 4 semanas de intervalo, cerca de 5 semanas de intervalo, cerca de 6 semanas de intervalo, cerca de 7 semanas de intervalo, cerca de 8 semanas separados, cerca de 9 semanas de intervalo, cerca de 10 semanas de intervalo, cerca de 11 semanas de intervalo ou cerca de 12 semanas de intervalo. Em certas outras modalidades, a dose iniciadora e a dose de reforço são administradas com cerca de 1 mês de intervalo, cerca de 2 meses de intervalo, cerca de 3 meses de intervalo, cerca de 4 meses de intervalo, cerca de 5 meses de intervalo, cerca de 6 meses de

45 / 74 intervalo, cerca de 7 meses de intervalo, cerca de 8 meses de intervalo, cerca de 9 meses de intervalo, cerca de 10 meses de intervalo, cerca de 11 meses de intervalo ou cerca de 12 meses de intervalo.

[00116] Em certas modalidade, os métodos compreendem administrar uma primeira composição compreendendo um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou um imunogênio contendo um ou mais epítopos de célula T CD8+; ou, administrar uma segunda composição compreendendo micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado ao fluorocarboneto é: i) de 15 a 75 resíduos de aminoácido de comprimento; ii) a partir do antígeno ou imunogênio da primeira composição; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de célula T CD8+ do antígeno ou imunogênio, e administrar separadamente uma terceira composição compreendendo um modulador imune. Nas modalidades, o modulador imune é selecionado a partir de um anti-imunossupressor ou um imunoativador. O imunomodulador aumenta a resposta imune mediada por células induzida pela primeira e/ou segunda composição

[00117] Nas modalidades, a primeira ou a segunda composição de vacina é administrada como uma dose iniciadora e de reforço administradas com pelo menos 7 dias de intervalo, pelo menos 14 dias de intervalo ou mais. Nas modalidades, a dose iniciadora e a dose de reforço são administradas com cerca de 7 dias de intervalo, cerca de 14 dias de intervalo, cerca de 20 dias de intervalo, cerca de 25 dias de intervalo, cerca de 30 dias de intervalo, cerca de 35 dias de intervalo, cerca de 40 dias de intervalo, cerca de 45 dias de intervalo , com cerca de 50 dias de intervalo, cerca de 55 dias de intervalo, cerca de 60 dias de intervalo ou cerca de 65 dias de intervalo. Vantajosamente, as doses são administradas com cerca de 40 dias de intervalo, cerca de 41 dias de intervalo, cerca de 42 dias de intervalo, cerca de 43 dias de intervalo, cerca de 44 dias de intervalo, cerca de 45 dias de intervalo, cerca de 46 dias de intervalo , com cerca de 47 dias de intervalo,

46 / 74 cerca de 48 dias de intervalo, cerca de 49 dias de intervalo ou cerca de 50 dias de intervalo. Nas modalidades, a dose iniciadora e a dose de reforço são administradas com cerca de 1 semana de intervalo, cerca de 2 semanas de intervalo, cerca de 3 semanas de intervalo, cerca de 4 semanas de intervalo, cerca de 5 semanas de intervalo, cerca de 6 semanas de intervalo, cerca de 7 semanas de intervalo, cerca de 8 semanas separados, cerca de 9 semanas de intervalo, cerca de 10 semanas de intervalo, cerca de 11 semanas de intervalo ou cerca de 12 semanas de intervalo. Em certas outras modalidades, a dose iniciadora e a dose de reforço são administradas com cerca de 1 mês de intervalo, cerca de 2 meses de intervalo, cerca de 3 meses de intervalo, cerca de 4 meses de intervalo, cerca de 5 meses de intervalo, cerca de 6 meses de intervalo, cerca de 7 meses de intervalo, cerca de 8 meses de intervalo, cerca de 9 meses de intervalo, cerca de 10 meses de intervalo, cerca de 11 meses de intervalo ou cerca de 12 meses de intervalo.

[00118] Nas modalidades, a terceira composição, o modulador imune, é administrada nos mesmos dias que a primeira ou segunda composições de vacina. Nas modalidades, a terceira composição é administrada em vários dias, pelo menos dois dias, pelo menos três dias, pelo menos quatro dias, pelo menos cinco dias ou pelo menos seis dias. Nas modalidades, a terceira composição é administrada pelo menos uma vez entre uma dose iniciadora e de reforço da primeira ou segunda composição de vacina e pelo menos uma vez após a dose de reforço da primeira ou segunda combinação de vacina. Nas modalidades exemplificativas, a terceira composição é administrada no dia 4, 7, 11, 15, 18 e 22 após a administração da dose iniciadora da primeira ou segunda composição de vacina.

[00119] Nas modalidades, a combinação de vacina é administrada a um indivíduo que necessite da mesma. Nas modalidades, o indivíduo em necessidade é um vertebrado, como um mamífero, ave, réptil, anfíbio ou peixe. Em certas modalidades, o indivíduo é um ser humano, um animal de

47 / 74 companhia, domesticado ou produtor de alimentos ou produtor de rações ou gado ou animal de jogo ou corrida ou esporte, como uma vaca, um cão, um gato, uma cabra, uma ovelha ou um porco ou cavalo, ou mesmo aves como peru, patos ou galinha. Em certas modalidades, o vertebrado é um humano.

[00120] Tal como aqui utilizado, uma quantidade imunologicamente eficaz é uma quantidade ou concentração das composições da combinação de vacina que, quando administrada a um indivíduo em necessidade, produz uma resposta imunológica ao antígeno administrado. Em certas modalidades, a quantidade imunologicamente eficaz da combinação de vacina ou composições de vacina produz uma resposta de célula T CD8+ específica a um antígeno.

[00121] Os métodos da invenção podem ser apropriadamente aplicados para prevenir doenças como vacinação profilática ou tratar doenças como vacinação terapêutica. A combinação de vacina da presente invenção pode ser administrada a um indivíduo em necessidade tanto sozinha como uma dose iniciadora e dose de reforço ou em combinação com uma composição de inibidor imunológico. Além disso, a combinação de vacina da presente invenção pode ser administrada a um indivíduo em necessidade como uma dose iniciadora ou uma dose de reforço em combinação com uma composição de inibidor imunológico. A composição de modulador imunológico é uma terceira composição distinta da combinação de vacina e pode ser administrada no mesmo dia e hora da primeira composição da vacina e/ou da segunda composição da vacina, ou em um dia diferente. Nas modalidades exemplificativas, a composição do modulador imune é administrada após a primeira composição da vacina.

[00122] Em certas modalidades, a combinação de vacina é administrada a um indivíduo em necessidade para uso no tratamento ou prevenção do câncer. Nas modalidades, a combinação de vacina é usada como um terapêutico ou profilático para câncer de pulmão de células não pequenas,

48 / 74 câncer de mama, câncer hepático, câncer cerebral, câncer de estômago, câncer de pâncreas, câncer renal, câncer de ovário, câncer de mieloma, leucemia mielóide aguda, leucemia mielóide crônica, câncer de cabeça e pescoço, câncer colorretal, câncer renal , câncer de esôfago, câncer de pele com melanoma e/ou pacientes com câncer de próstata. Essas células cancerosas podem expressar neoantígenos ou antígenos virais, e as composições de vacina compreenderão polipeptídeos apropriados compreendendo um ou mais epítopos de células T CD+ 8, dependendo da biologia do câncer/tumor particular.

[00123] Em certas modalidades, a combinação de vacina é administrada a um indivíduo em necessidade para uso no tratamento ou prevenção de infecção crônica. Nas modalidades, a combinação de vacina é usada como um terapêutica ou profilática para indivíduos com infecção crônica ou para aqueles em risco de exposição a patógenos que causam infecções crônicas. Esses patógenos incluem, mas não estão limitados a, HIV, vírus da hepatite B e D, herpesvírus, vírus de Epstein-Barr, citomegalovírus e vírus linfotrópico T humano tipo III.

[00124] A combinação de vacina pode ser administrada a um indivíduo humano ou animal in vivo usando uma variedade de vias e técnicas conhecidas. Por exemplo, as composições da combinação de vacina podem ser providas como uma solução, suspensão ou emulsão injetável e administradas via parentérica, subcutânea, oral, epidérmica, intradérmica, intramuscular, intra-arterial, intraperitoneal, injeção intravenosa usando uma agulha e seringa convencionais, ou usando um sistema de injeção de jato de líquido. A composição da combinação de vacina pode ser administrada topicamente na pele ou tecido da mucosa, como nasal, intratraqueal, intestinal, sublingual, retal ou vaginal, ou provida como um spray finamente dividido, como uma névoa, adequado para administração respiratória ou pulmonar. Em certas modalidades, as composições de vacina são

49 / 74 administradas por via intramuscular.

[00125] As composições da combinação de vacina podem ser administradas a um indivíduo em uma quantidade que seja compatível com a composição de dosagem que será profilaticamente e/ou terapeuticamente eficaz. A administração da composição da invenção pode ser para fins “profiláticos” ou “terapêuticos”. Tal como aqui utilizado, o termo “terapêutico” ou “tratamento” inclui qualquer um ou mais dos seguintes: a prevenção de infecção; o tratamento da infecção crônica; a prevenção da tumorigênese/carcinogênese; a redução ou eliminação dos sintomas; e/ou a redução ou eliminação completa de um tumor ou câncer.

[00126] Nas modalidades, a combinação de vacina compreende antígenos de câncer ou antígenos virais associados ao câncer, em que o tratamento pode ser profilático (antes do diagnóstico confirmado do câncer) ou terapêutico (após o diagnóstico do câncer). O tratamento terapêutico pode ser dado aos cânceres nos estágios I, II, III ou IV, antes ou após a intervenção cirúrgica. O tratamento pode ser um tratamento de manutenção pós-cirurgia ou um tratamento de longo prazo para melhorar a sobrevivência livre de progressão ou a sobrevivência geral e/ou eliminação da doença.

[00127] A escolha do carreador, se necessário, é frequentemente uma função da via de entrega da composição. Dentro desta invenção, as composições podem ser formuladas para qualquer via adequada e meio de administração. Veículos ou diluentes farmaceuticamente aceitáveis incluem os utilizados nas composições adequadas para administração oral, ocular, rectal, nasal, tópica (incluindo bucal e sublingual), vaginal ou parentérica (incluindo subcutânea, intramuscular, intravenosa, intradérmica, transdérmica).

[00128] As composições podem ser administradas em qualquer forma adequada, por exemplo, como um líquido, sólido ou aerossol. Por exemplo, as formulações orais podem assumir a forma de emulsões, xaropes ou soluções

50 / 74 ou comprimidos ou cápsulas, que podem ser revestidos entericamente para proteger o componente ativo da degradação no estômago. As formulações nasais podem ser sprays, névoas ou soluções. As formulações transdérmicas podem ser adaptadas para seu sistema de entrega particular e podem compreender emplastros. As formulações para injeção podem ser soluções ou suspensões em água destilada ou outro solvente ou agente de suspensão farmaceuticamente aceitável.

[00129] A dosagem apropriada da vacina profilática ou terapêutica a ser administrada a um paciente será determinada na clínica. Doses múltiplas, além da dose iniciadora e de reforço original, podem ser necessárias para atingir um efeito imunológico ou clínico, que, se necessário, será administrado tipicamente entre 1 a 12 semanas de intervalo. Quando o reforço da resposta imune por períodos mais longos for necessário, doses repetidas de 1 mês a 5 anos podem ser aplicadas

EXEMPLOS

[00130] Os exemplos a seguir são apresentados de modo a fornecer àqueles versados na técnica uma divulgação e descrição completas de como usar as modalidades fornecidas aqui e não se destinam a limitar o escopo da descrição nem pretendem representar que os exemplos abaixo são todos os experimentos ou os únicos experimentos realizados. Esforços foram feitos para garantir a precisão com relação aos números usados (por exemplo, quantidades, temperatura, etc.), mas alguns erros experimentais e desvios devem ser levados em consideração. Salvo indicação em contrário, as partes são partes em volume e a temperatura está em graus centígrados. Deve ser entendido que variações nos métodos descritos podem ser feitas sem alterar os aspectos fundamentais que os Exemplos pretendem ilustrar. Exemplo 1: Preparação de uma combinação de vacina compreendendo uma combinação de dose iniciadora e de reforço heteróloga: Uma primeira composição (uma composição de vetor viral não replicante); e,

51 / 74 uma segunda composição (composição de peptídeo ligado a fluorocarboneto) Composição de vetor viral não replicante

[00131] O AdGP70 foi projetado como um vetor de serótipo de adenovírus recombinante 5 tornado a replicação defeituosa pela deleção de E1 e E3 (ΔE1E3) e permitindo a expressão da proteína GP70 (a proteína do envelope (Env) um vírus de leucemia murina - MuLV - número de acesso do GenBank ABC94931. 1) sob o promotor do citomegalovírus (CMV). Primeiro, um plasmídeo de transferência foi obtido após a clonagem de um gene GP70 otimizado por códons sintetizado quimicamente para expressão em células de mamíferos nos sítios de restrição HindIII/XbaI do vetor de transferência pAdHighγ (Altimmune Inc) em Genscript (Piscataway, NJ). A recombinação entre o vetor de transferência pAdHighγ contendo o transgene e o plasmídeo de esqueleto do adenovírus 5 pAdEasy-1 foi realizada na cepa de E. coli BJ5183 sob seleção de canamicina para geração de plasmídeo genômico pAdGP70. O plasmídeo pAdEasy-1 contém todas as sequências de Ad5, exceto os nucleotídeos 1-3.533 (abrangendo os genes E1) e os nucleotídeos 28.130-30.820 (abrangendo E3). Um plasmídeo genômico selecionado pAdGP70 foi transformado novamente em células DH10B da cepa de E. coli sob seleção de canamicina através de isolamento de colônia. Uma colônia pAdGP70 selecionada foi amplificada e purificada. A semente do vetor de adenovírus recombinante AdGP70 foi gerada por transfecção do plasmídeo genômico pAdGP70 purificado linearizado com PacI em linhas de células de empacotamento de adenovírus HEK293. O vetor AdGP70 foi propagado em células HEK293 e purificado por ultracentrifugação sobre um gradiente de cloreto de césio. Os vetores Ad5 purificados foram esterilizados por filtração com tamanho de poro de 0,22 μm e armazenados a −80°C em tampão de armazenamento adenoviral A195. O título de AdGP70 (4x1011 ifu/ml) foi determinado usando um kit de titulação rápida Adeno-X (Clontech,

52 / 74 Mountain View, CA) em células HEK293. Antes da administração in vivo, o AdGP70 foi posteriormente diluído em PBS até 4x1010 ifu/ml.

[00132] SEQ ID NO. 1: Sequência da proteína GP70 do vírus da leucemia murina - Número de acesso ABC94931.1

[00133] MDTRRPRQGSDHTPDKTIMESTTLSKPFKNQVNPWGPL

IVLLILGGVNPVALGNSPHQVFNLSWEVTNGDRETVWAITGNHPLWT WWPDLTPDLCMLALHGPFSPPPGPPCCSGSSDSTPGCSRDCEEPLTSY TPRCNTAWNRLKLSKVTHAHNEGFYVCPGPHRPRWARSCGGPESFY CASWGCETTGRASWKPSSSWDYITVSNNLTSDQATPVCKGNEWCNS LTIRFTSFGKQATSWVTGHWWGLRLYVSGHDPGLIFGIRLKITDSGPR VPIGPNPVLSDRRPPSRPRPTRSPPPSNSTPTETPLTLPEPPPAGVENRLL NLVKGAYQALNLTSPDKTQECWLCLVSGPPYYEGVAVLGTYSNHTS APANCSVASQHKLTLSEVTGQGLCIGAVPKTHQVLCNTTQKTSDGSY YLAAPTGTTWACSTGLTPCISTTILDLTTDYCVLVELWPRVTYHSPSY VYHQFERRAKYKREPVSLTLALLLGGLTMGGIAAGVGTGTTALVAT QQFQQLQAAMHDDLKEVEKSITNLEKSLTSLSEVVLQNRRGLDLLFL KEGGLCAALKEECCFYADHTGLVRDSMAKLRERLSQRQKLFESQQG WFEGLFNKSPWFTTLISTIMGPLIILLLILLFGPCILNRLVQFIKDRISVV QALVLTQQYHQLKTIGDCKSRE

[00134] Os epítopos de células T presentes no antígeno podem ser identificados usando vários métodos, incluindo epítopos publicados, rede neural artificial (ANN) ou método de matriz estabilizada (SMM) (usando o site Immune Epitope Database and Analysis Resource) ou o site SYFPEITHI que é um banco de dados compreendendo mais de 7000 sequências de peptídeos conhecidas por se ligarem a moléculas de MHC de classe I e classe II, conforme relatórios publicados. Os epítopos de células T de GP70 foram identificados pela previsão de peptídeos de ligação de alta afinidade para moléculas de MHC de classe I e II de murino (H-2Kd, H-2Dd, H-2Ld, IAd e IEd) usando a rede neural artificial (ANN) e matriz estabilizada método

53 / 74 (SMM) usando um corte IC50 previsto de <50nM e SYFPEITHI usando um limite de >20 (http://www.syfpeithi.de/). São providos na Tabela 1 os epítopos de células T da sequência da proteína GP70 identificados usando uma combinação desses métodos. Tabela 1: Epítopos de células T de GP70 SEQUÊNCIA POSI- POSI- MÉTODO ALE- AFINI-

ÇÃO ÇÃO LO DADE DE RESTRI- DO N- DO C- LI- ÇÃO DE TERM TERM GAÇÃO

MHC (nM) OU (CD4/CD8) PONTUA-

ÇÃO VNPWGPLIVLLILGG 32 46 SYFPEITHI CD4 IAd 23 SEQ ID NO: 2 NPWGPLIVL 33 41 SYFPEITHI CD8 Ld 22 SEQ ID NO: 3 PWGPLIVLLILGGVN 34 48 SYFPEITHI CD4 IAd 20 SEQ ID NO: 4 GPLIVLLIL 36 44 SYFPEITHI CD8 Ld 22 SEQ ID NO: 5 GPLIVLLILGGVNPV 36 50 SYFPEITHI CD4 IAd 21 SEQ ID NO: 6 LGGVNPVALGNSPHQ 44 58 SYFPEITHI CD4 IAd 27 SEQ ID NO: 7 NSPHQVFNL 54 62 SYFPEITHI CD8 Ld 22 SEQ ID NO: 8 NLSWEVTNGDRETVW 61 75 SYFPEITHI CD4 IEd 20 SEQ ID NO: 9 NGDRETVWAITGNHP 68 82 SYFPEITHI CD4 IAd 24 SEQ ID NO: 10 TPDLCMLAL 91 99 SYFPEITHI CD8 Ld 22 SEQ ID NO: 11 SYWGLEYRA 103 111 SYFPEITHI CD8 Kd 22 SEQ ID NO: 12 SYTPRCNTA 142 150 ANN CD8 Kd 25,22nM SEQ ID NO: 13 SYTPRCNTA 142 150 SYFPEITHI CD8 Kd 22 SEQ ID NO: 13 RCNTAWNRLKLSKVT 146 160 SYFPEITHI CD4 IAd 20 SEQ ID NO: 14 GP70- NTAWNRLKLSKVTHA 148 162 SYFPEITHI CD4 IAd 21 142 SEQ ID NO: 15 NTAWNRLKLSKVTHA 148 162 SYFPEITHI CD4 IEd 20 SEQ ID NO: 15 WNRLKLSKVTHAHNE 151 165 SYFPEITHI CD4 IAd 20 SEQ ID NO: 16 NEGFYVCPGPHRPRW 164 178 SYFPEITHI CD4 IEd 20 SEQ ID NO: 17 RSCGGPESF 180 188 SYFPEITHI CD8 Ld 21 SEQ ID NO: 18 CETTGRASWKPSSSW 196 210 SYFPEITHI CD4 IAd 22 SEQ ID NO: 19 GP70- KPSSSWDYI 204 212 SYFPEITHI CD8 Ld 20 196 SEQ ID NO: 20

54 / 74 DYITVSNNL 210 218 ANN CD8 Kd 33,91mM SEQ ID NO: 21 DYITVSNNL 210 218 SMM CD8 Kd 46,55nM SEQ ID NO: 21 DYITVSNNL 210 218 SYFPEITHI CD8 Kd 24 SEQ ID NO: 21 ITVSNNLTSDQATPV 212 226 SYFPEITHI CD4 IAd 22 SEQ ID NO: 22 TGHWWGLRLYVSGHD 252 266 SYFPEITHI CD4 IAd 25 SEQ ID NO: 23 LYVSGHDPG 260 268 SYFPEITHI CD8 Kd 22 SEQ ID NO: 24 VPIGPNPVL 284 292 ANN CD8 Ld 38,04nM SEQ ID NO: 25 VPIGPNPVL 284 292 SYFPEITHI CD8 Ld 21 SEQ ID NO: 25 NPVLSDRRPPSRPRP 289 303 SYFPEITHI CD4 IEd 20 SEQ ID NO: 26 NSTPTETPL 311 319 SYFPEITHI CD8 Ld 21 SEQ ID NO: 27 TPTETPLTL 313 321 SYFPEITHI CD8 Ld 21 SEQ ID NO: 28 PPAGVENRL 325 333 SYFPEITHI CD8 Ld 21 SEQ ID NO: 29 KTQECWLCLVSGPPY 351 366 SYFPEITHI CD4 IAd 23 SEQ ID NO: 30 PPYYEGVAVLGTYSN 363 377 SYFPEITHI CD4 IAd 22 SEQ ID NO: 31 PYYEGVAVL 364 372 SYFPEITHI CD8 Kd 21 SEQ ID NO: 32 YSNHTSAPANCSVAS 375 389 SYFPEITHI CD4 IAd 29 SEQ ID NO: 33 NHTSAPANCSVASQH 377 391 SYFPEITHI CD4 IAd 22 SEQ ID NO: 34 CSVASQHKL 385 393 SYFPEITHI CD8 Ld 21 SEQ ID NO: 35 VASQHKLTLSEVTGQ 387 401 SYFPEITHI CD4 IAd 20 SEQ ID NO: 36 SDGSYYLAAPTGTTW 422 436 SYFPEITHI CD4 IAd 28 SEQ ID NO: 37 WACSTGLTPCISTTI 437 451 SYFPEITHI CD4 IAd 22 SEQ ID NO: 38 TPCISTTIL 444 452 SYFPEITHI CD8 Ld 22 SEQ ID NO: 39 SPSYVYHQF 472 480 ANN CD8 Ld 30,26nM SEQ ID NO: 40 SPSYVYHQF 472 480 SYFPEITHI CD8 Ld 22 SEQ ID NO: 40 SPSYVYHQFERRAKY 472 486 SYFPEITHI CD4 IEd 26 SEQ ID NO: 41 YHQFERRAKYKREPV 477 491 SYFPEITHI CD4 IEd 32 SEQ ID NO: 42 GP70- KYKREPVSL 485 493 SYFPEITHI CD8 Kd 25 472 SEQ ID NO: 43 KYKREPVSLTLALLL 485 499 SYFPEITHI CD4 IAd 24 SEQ ID NO: 44 EPVSLTLAL 489 497 SYFPEITHI CD8 Ld 21 SEQ ID NO: 45 EPVSLTLALLLGGLT 489 503 SYFPEITHI CD4 IAd 24 SEQ ID NO: 46

55 / 74 PVSLTLALLLGGLTM 490 504 SYFPEITHI CD4 IAd 22 SEQ ID NO: 47 VSLTLALLLGGLTMG 491 505 SYFPEITHI CD4 IAd 24 SEQ ID NO: 48 GLTMGGIAAGVGTGT 501 515 SYFPEITHI CD4 IAd 26 SEQ ID NO: 49 GTGTTALVATQQFQQ 512 526 SYFPEITHI CD4 IAd 22 SEQ ID NO: 50 TNLEKSLTS 543 551 SYFPEITHI CD8 Kd 21 SEQ ID NO: 51 RRGLDLLFLKEGGLC 560 574 SYFPEITHI CD4 IAd 22 SEQ ID NO: 52 LKEECCLYADHTGLV 577 591 SYFPEITHI CD4 IAd 21 SEQ ID NO: 53 CCLYADHTGLVRDSM 581 595 SYFPEITHI CD4 IEd 20 SEQ ID NO: 54 LYADHTGLV 583 591 SYFPEITHI CD8 Kd 21 SEQ ID NO: 55 ADHTGLVRDSMAKLR 585 599 SYFPEITHI CD4 IAd 24 SEQ ID NO: 56 RDSMAKLRERLSQRQ 592 606 SYFPEITHI CD4 IAd 20 SEQ ID NO: 57 MAKLRERLSQRQKLF 595 609 SYFPEITHI CD4 IEd 20 SEQ ID NO: 58 ERLSQRQKLFESQQG 600 614 SYFPEITHI CD4 IAd 20 SEQ ID NO: 59 WFTTLISTI 625 633 ANN CD8 Kd 6,17nM SEQ ID NO: 60 WFTTLISTI 625 633 SMM CD8 Kd 44,68nM SEQ ID NO: 60 WFTTLISTI 625 633 SYFPEITHI CD8 Kd 21 SEQ ID NO: 60 MGPLIILLLILLFGP 634 648 SYFPEITHI CD4 IAd 22 SEQ ID NO: 61 PLIILLLILLFGPCI 636 650 SYFPEITHI CD4 IAd 21 SEQ ID NO: 62 ILLFGPCILNRLVQF 643 657 SYFPEITHI CD4 IEd 20 SEQ ID NO: 63 LVQFIKDRISVVQA 654 667 Casares N. et CD4 H2d N.A. SEQ ID NO: 64 al * classe

II QFIKDRISVVQALVL 656 670 SYFPEITHI CD4 IAd 24 SEQ ID NO: 65 KDRISVVQALVLTQQ 659 673 SYFPEITHI CD4 IAd 27 SEQ ID NO: 66 ISVVQALVL 662 670 SYFPEITHI CD8 Ld 20 SEQ ID NO: 67

[00111] N Casares; J J Lasarte; A L de Cerio; P Sarobe; M Ruiz; I Melero; J Prieto; F Borrás-Cuesta. Immunization with a tumor-associated CTL epitope plus a tumor-related or unrelated Th1 helper peptide elicits protective CTL immunity. 2001. Eur J Immunol. 31: 1780-9. Composição de peptídeo ligado a fluorocarboneto

[00112] A composição de peptídeo ligado a fluorocarboneto

56 / 74

(PepGP70) contém quatro peptídeos modificados por fluorocarboneto (GP70- 142, GP70-196, GP70-472, GP70-CM) derivados do GP70, a proteína do envelope (Env) e o vírus da leucemia murina (MuLV) . As sequências de GP- 70-142, GP70-196, GP70-472, GP70-CM são apresentadas na Tabela 1 e na Tabela 2. Os quatro peptídeos foram selecionados com base na previsão de peptídeos de ligação de alta afinidade para moléculas de MHC de classe I e II de murino (H-2Kd, H-2Dd, H-2Ld, IAd e IEd) usando a rede neural artificial (ANN) e matriz estabilizada método (SMM) usando um corte IC50 previsto de <50nM (www.iedb.org/) e SYFPEITHI usando um limite de >20 (www.syfpeithi.de/) e informações publicadas.

GP70-142, GP70-196, GP70- 472, GP70-CM foram obtidos por síntese de peptídeos em fase sólida (SPPS). Todos os peptídeos foram sintetizados pela American Peptide Company (Sunnyvale, CA) construindo o peptídeo em resina usando a química de 9- fluoreninetoxicarbonil (Fmoc) padrão.

A incorporação da cadeia de fluorocarbono do ácido 2H, 2H, 3H, 3H-perfluoroundecanoico (C8F17(CH2)2COOH) na cadeia épsilon de uma lisina adicional seletivamente desprotegida do terminal C ou N para derivar os peptídeos modificados por fluorocarboneto.

Após clivagem e remoção dos grupos de proteção da cadeia lateral, os peptídeos brutos foram precipitados a partir de éter frio e coletados por filtração.

A pureza foi avaliada por RP-HPLC e foi superior a 90% para todos os peptídeos.

Peptídeos liofilizados ligados a fluorocarboneto foram armazenados a -20°C.

PepGP70 foi obtido após solubilização dos peptídeos GP-70-142, GP70-196, GP70-472, GP70-CM, mistura, adição de solução de manitol/água, filtração usando um filtro de 0,22 µm e liofilização para gerar frascos individuais contendo 1400 µg por peptídeo.

PepGP70 liofilizada foi armazenada a -20°C.

Antes da administração in vivo, frascos de PepGP70 liofilizados foram reconstituídos com 1,4 ml de L-Histidina 28 mM contendo ODN1585 (agonista de TLR 9; Invivogen, Toulouse, França) levando a uma dosagem de 100 µg/ODN1585/ml e 1000 µg/peptídeo/ml.

57 / 74 Tabela 2: Quatro peptídeos da composição de PepGP70 Nome Sequência GP70-142 SYTPRCNTAWNRLKLSKVTHAHNE(K)FA1 (SEQ ID NO: 68) GP70-196 FA1(K)ETTGRASWKPSSSWDYITVSNNLTSDQATPVKKK (SEQ ID NO: 69) GP70-472 SPSYVYHQFERRAKYKREPVSLTLALLLGGLTMGKKK(K)FA1 (SEQ ID NO: 70) GP70-CM SPSYVYHQFKKKLVQFIKDRISVVQA(K)FA1 (SEQ ID NO: 71) FA1=C8F17(CH2)2-CO-

[00113] Os peptídeos acima derivados da sequência da proteína GP70 estão sublinhados na sequência de comprimento total da proteína acima (SEQ ID NO: 1) e epítopos de células T identificados na Tabela 1. GP70-472 e GP70-CM contêm o epítopo de linfócito T citotóxico (CTL) SPSYVYHQF (SEQ ID NO: 72) (também referido como AH1 no dextrâmero). KKK é um ligante e não está presente na sequência da proteína GP70 de comprimento total. GP70-CM é um peptídeo quimérico contendo um epítopo CTL (epítopo CD8+), um ligante KKK e um epítopo de linfócito T auxiliar (HTL).

[00114] Por conseguinte, é provida aqui uma combinação de vacina para um regime de dosagem iniciadora-reforço heterólogo em que a combinação compreende uma primeira composição compreendendo um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou imunogênio contendo um ou mais epítopos de células T CD8+; e, uma segunda composição compreendendo micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado ao fluorocarboneto tem: i) 15 a 75 resíduos de aminoácidos de comprimento; ii) a partir do antígeno ou imunogênio da primeira composição; e, iii) contém um ou mais epítopos de células T CD8+ do antígeno ou imunogênio na primeira composição; em que qualquer uma da primeira ou segunda composição é uma composição iniciadora ou uma composição de reforço. Exemplo 2: Preparação de uma combinação de vacina compreendendo uma composição de vacina de células T e uma combinação de composição de modulador imune: Uma primeira composição (uma composição de vetor viral não replicante); e, uma segunda composição (composição de peptídeo ligado a fluorocarboneto); e, uma terceira composição (uma

58 / 74 composição de modulador imune)

[00115] A composição de vetor viral não replicante (a primeira composição) e a composição de peptídeo ligado a fluorocarboneto (a segunda composição) foram preparadas conforme descrito no Exemplo 1. Composição do modulador imune

[00116] As composições de moduladores imune podem ser qualquer uma das aqui descritas e providas em solução aquosa apropriada. No presente exemplo, o anti-PD-1 foi fornecido em PBS e, conforme descrito abaixo, administrado separadamente, e em um ponto de tempo diferente, de qualquer uma das primeira ou segunda composições de vacina descritas acima.

[00117] Por conseguinte, é provida aqui uma combinação de vacina para uso na indução da resposta de células T CD8+ e redução do tamanho do tumor, em que a combinação compreende uma primeira composição compreendendo um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou imunogênio contendo um ou mais epítopos de células T CD8+; ou, uma segunda composição compreendendo micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado a fluorocarboneto tem: i) 15 a 75 resíduos de aminoácidos de comprimento; ii) a partir do antígeno ou imunógeno da primeira composição; e, iii) contém um ou mais epítopos de células T CD8+ do antígeno ou imunogênio; e, uma terceira composição compreendendo um modulador imune selecionado a partir de um anti- imunossupressor ou um imunoativador. A primeira ou segunda composição é administrada separadamente da terceira composição.

[00118] Em certas modalidades, são providas aqui combinações de vacinas compreendendo duas a três composições selecionadas de: a) uma primeira composição compreendendo um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou imunogênio contendo um ou mais epítopos de células T CD8+; b) uma segunda composição compreendendo micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado a

59 / 74 fluorocarboneto tem: i) 15 a 75 resíduos de aminoácidos de comprimento; ii) a partir do antígeno ou imunogênio da primeira composição; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de células T CD8 + da primeira composição do antígeno ou imunogênio; e c) uma terceira composição compreendendo um modulador imune selecionado a partir de um anti-imunossupressor ou um imunoativador, em que quando a primeira composição e a segunda composição são selecionadas, qualquer uma da primeira ou segunda composição é uma composição iniciadora ou uma composição de reforço. Exemplo 3: Indução de uma resposta de células T CD8+ específica a um antígeno usando a composição de vetor viral não replicante e a composição de peptídeo ligado a fluorocarboneto; Uma combinação de vacina heteróloga

[00119] A preparação de AdGP70 (composição de vetor não viral) e PepGP70 (composição de peptídeo ligado a fluorocarboneto) são descritos no Exemplo 1, em que AdGP70 é um vetor adenoviral deficiente de replicação que expressa GP70 (SEQ ID NO: 1) e PepGP70 é uma combinação de quatro peptídeos (SEQ ID NOs: 68 a 71) individualmente ligados a uma cadeia de fluorocarboneto e presente em micelas.

[00120] A comparação de uma dosagem iniciadora/reforço homóloga e dosagem iniciadora/reforço heteróloga das composições de AdGP70 e PepGP70 foi realizada, em que a imunogenicidade das composições de AdGP70 e PepGP70 após uma ou duas administrações em camundongos BALB/c foi comparada com as combinações iniciadora/de reforço heterólogas de AdGP70 e PepGP70. Os camundongos foram imunizados pela via subcutânea com 14 dias de intervalo entre a administração de uma dose iniciadora e a administração de uma dose de reforço. O Grupo 1 (n = 8) recebeu 50 µl de PepGP70 (50ug/peptídeo) por via subcutânea no dia 0. O Grupo 2 (n = 8) recebeu 50 µl de AdGP70 (2x109 ifu) por via subcutânea no dia 0. O Grupo 3 (n = 8) recebeu 50 µl de PepGP70 (50ug/peptídeo) por via

60 / 74 subcutânea no dia 0 e dia 14. O Grupo 4 (n = 8) recebeu 50 µl de PepGP70 (50ug/peptídeo) por via subcutânea no dia 0 e dia 14. O Grupo 5 (n = 8) recebeu 50 µl de AdGP70 (2x109 ifu) e PepGP70 (50ug/peptídeo) por via subcutânea no dia 0 e dia 14 respectivamente. O Grupo 6 (n = 8) recebeu 50 µl de PepGP70 (50ug/peptídeo) e AdGP70 (2x109 ifu) por via subcutânea no dia 1 e dia 14 respectivamente. 10 dias após a administração final (medição no dia 24), as células do baço de cada animal foram isoladas e processadas por meio de dois tipos de imunoensaios: (1) um ensaio ELISpot IFN-γ in vitro para avaliar a frequência de células T específicas de GP70 em animais individuais (Figura 1) e (2) um ensaio de coloração de dextrâmero por citometria de fluxo para medir a frequência de células T CD8+ específicas para Epítopo restrito em H-2Ld derivado de gp70 (peptídeo AH1, sequência SPSYVYHQF (SEQ ID NO: 72)). Veja as Figuras 1 e 2.

[00121] Os ensaios clínicos demonstraram a eficácia das vacinas indutoras de células T contra uma série de doenças e, embora muitas abordagens para avaliar as respostas de células T protetoras possam ser tomadas, o ensaio ELISpot tornou-se o meio mais adequado para determinar a imunogenicidade da vacina. Slota M. et al., ELISpot for measuring human immune responses to vaccines. Expert Rev Vaccines 2011;10(3):299-306. Para o ensaio ELISpot IFN-γ, placas de ELISpot (MSIPS4510 Merck Millipore) foram pré-revestidas com 100 µl/poço de anticorpo IFN-γ de captura diluído em PBS a 5 µg/ml (par de ELISPOT de IFNg de camundongo, BD, ref 551881) sob condições assépticas e incubadas durante a noite a 4°C. O anticorpo de revestimento foi removido e as placas lavadas e, em seguida, incubadas 2 horas à temperatura ambiente com 200 µL/poço de meio de cultura completo composto por RPMI Glutamax 1640 (GIBCO, ref 11548876) suplementado com 10% de soro fetal bovino, (GIBCO, ref 10270- 098), e solução de penicilina-estreptomicina a 1% (GIBCO, ref. 11548876). Após a remoção do meio, suspensões de células de baço em meio de cultura

61 / 74 completo foram adicionadas a uma concentração de 5x105 células por poço às placas de ELISpot pré-revestidas na presença de 10ug/ml de cada peptídeo individual (GP-70-142, GP70- 196, GP70-472, GP70-CM) ou uma mistura de quatro peptídeos, concanavalina A como controle positivo (eBiosciences, ref 00-4978-03) em um volume de 200 µl por poço. O meio isolado foi usado como controle negativo. Cada condição de teste foi alcançada em duplicata. As placas foram incubadas por 18 horas a 37°C, 5% de CO2 em um ambiente umidificado. Após duas etapas de lavagem com água deionizada (DI) para remover completamente as células, as placas foram extensivamente lavadas com tampão de lavagem ELISpot (1X Dulbecco’s PBS, Gibco, Fisher cat no 11540486), 0,05% Tween®20 Fisher no 10113103). Em seguida, as placas de ELISpot foram incubadas 2 horas à temperatura ambiente com 100 µl/poço de anticorpo de detecção anti-IFN-g (par de ELISPOT de IFNg de camundongo, BD, ref 551881) diluído em PBS suplementado com 10% de soro fetal bovino a 2ug/ml. A solução de detecção de anticorpos foi descartada e as placas lavadas com tampão de lavagem de ELISpot antes de serem incubadas por 1 hora à temperatura ambiente com 100 µL/poço de estreptavidina-HRP diluída (B ™ ELISPOT Streptavidin-HRP, cat. No 557630). A solução de estreptavidina-HRP foi removida e as placas lavadas com tampão de lavagem de ELISpot. 100 µL de solução de substrato final (AEC) foram adicionados a cada poço. O desenvolvimento de spots foi monitorado por 15-20 min e a reação do substrato interrompida por lavagem dos poços com água DI. As placas foram então secas ao ar durante a noite à temperatura ambiente no escuro. A enumeração de spots foi realizada usando um analisador ELISPOT: Leitor de placas ImmunoSpot® ELISpot (CTL - Europe GmbH, Alemanha). As células formadoras de manchas, SFC/poço, foram enumeradas para quantificar o número de células que produzem IFN-γ em resposta a estímulos específicos.

[00122] Ver Figura 1 que mostra as respostas ELISpot de IFN-γ

62 / 74 cumulativas aos quatro peptídeos expressos como o número de células produtoras de IFN-γ (células formadoras de spots, SFC) por milhão de células do baço calculadas para cada grupo no dia 24 após a administração da dose iniciadora. Os grupos 5 e 6 são os grupos de iniciadora-reforço heterólogos que mostram um efeito sinérgico em comparação com os grupos de iniciadora-reforço homólogos.

[00123] Para o ensaio de dextrâmero, células de baço murino foram coradas com dextrâmero H-2 Ld preparado com o peptídeo AH1 (epítopo de célula T CD8+ derivado de GP70, sequência: SPSYVYHQF (SEQ ID NO: 73)) ou um dextrâmero H-2 Ld de controle irrelevante preparado com o peptídeo NP118-126 (epítopo de célula T CD8+ derivado da nucleoproteína de LCMV, sequência: RPQASGVYM (SEQ ID NO: 74)), ambos marcados com Ficoeritrina (PE). Os reagentes de dextrâmero consistem em um esqueleto de polímero de dextrano transporando um número otimizado de complexos MHC-peptídeo e fluorocromos, oferecendo a capacidade de detectar células T específicas a um antígeno com o receptor de células T reconhecendo especificamente o complexo MHC/peptídeo transportado pelo polímero de dextrana. O processo de coloração de células para análise de citometria de fluxo é descrito a seguir. Células de baço individuais do grupo 1 a 6 animais (1x106 células) foram cultivadas em 200 µl de meio de cultura completo composto de RPMI Glutamax 1640 (GIBCO, ref 11548876) suplementado com 10% de soro fetal bovino, (GIBCO, ref 10270-098), e solução de estreptomicina-penicilina a 1% (GIBCO, ref 11548876) em placas de 96 poços. As placas foram incubadas durante a noite a 37°C, 5% de CO2 em um ambiente umidificado. Após a incubação, as células do baço de camundongos individuais foram agrupadas por grupo e lavadas com tampão de coloração (DPBS1X suplementado com 5% de soro fetal bovino, EDTA 2 mM e solução de penicilina-estreptomicina a 1%) por centrifugação por 6 min a 1300 rpm 4°C. Os receptores Fc foram bloqueados incubando as células do

63 / 74 baço por 10 minutos a 4°C com 25 µL de tampão de coloração a frio contendo um anticorpo CD16/32 anti-camundongo diluído a 1:200. Em seguida, as células foram coradas com o dextrâmero AH-1/H-2 Ld relevante (Immudex, ref JG3294-OPT) ou NP118-126/H-2 Ld dextrâmero irrelevante (Immudex, ref JG2750-OPT). 25ul de dextrâmero pré-diluído apropriado 1:2,5 em tampão de coloração foram adicionados às células bloqueadas do receptor Fc seguindo por incubação por 30 minutos a 4°C. Após a incubação, um coquetel de anticorpos 2X contendo CD4 Pe-Cy7 anticamundongo (Ozyme, ref BLE100422), CD8a BV510 anticamundongo (Ozyme, ref BLE100752), CD44 BV650 anticamundongo (Ozyme, ref BLE103049), CD62L anticamundongo BV711 (Ozyme, ref BLE104445), CD45 APC anticamundongo (Ozyme, ref BLE103112), PD1 PERCP-Cy5.5 anticamundongo (Ozyme, ref BLE109119), CD69 APC-eFluor780 anticamundongo (eBioscience, ref 47-0691 -80) e Viability Dye eFluor™ 520 (eBioscience, ref 65-0867-14) foi preparado em tampão de coloração. 50 µL de coquetel de anticorpos foram adicionados às células coradas com dextrâmero seguindo por incubação de 20 minutos a 4°C. Após as etapas de coloração, as células foram lavadas duas vezes com tampão de coloração por centrifugação por 6 min a 1300 rpm 4˚C e ressuspensas em 200ul de tampão de coloração antes da aquisição e análise por citometria de fluxo. Os eventos foram bloqueados em células CD45+CD8 vivas. A Figura 2 mostra a porcentagem de células T CD8+ positivas para coloração de dextrâmero.

[00124] A Figura 2 que mostra a porcentagem de células T CD8+ positivas para coloração de dextrâmero no dia 24 após a administração da dose iniciadora. Os grupos 5 e 6 são os grupos de iniciadora-reforço heterólogos que mostram um efeito sinérgico em comparação com os grupos de iniciadora-reforço homólogos.

[00125] Os resultados do ensaio ELISpot demonstram um aumento no número de células do baço produtoras de IFN-gama em comparação com uma

64 / 74 única administração versus duas administrações de PepGP70 ou AdGP70. Surpreendentemente, uma administração de dose iniciadora-reforço heteróloga (AdGP70 seguido por PepGP70 ou o oposto) induziu uma resposta imune periférica mais forte em comparação com uma administração de dose iniciadora-reforço homóloga com AgGP70 ou PepGP70. Veja as Figuras 1 e

2. Os dados revelam uma sinergia inesperada entre os dois tipos diferentes de imunogênios em sua capacidade de promover respostas de células T mais robustas, incluindo respostas de células T CD8+ quando combinadas em uma administração de dose heteróloga iniciadora-reforço. Os resultados também indicam que um regime de iniciadora-reforço heterólogo usando o PepGP70 primeiro e seguido pela administração de AdGP70 representa uma condição mais favorável para a indução de células T CD8+ de antígeno conforme revelado pelo imunoensaio de dextrâmero. Ver figura 2.

[00126] Por conseguinte, é provido aqui um método de induzir uma resposta imune em um indivíduo em necessidade usando um regime de dose heterólogo, em que o método compreende a administração de uma primeira composição compreendendo um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou imunogênio compreendendo um ou mais epítopos de células T CD8+ ; e administração de uma segunda composição compreendendo micelas contendo peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado a fluorocarboneto tem: i) 15 a 75 resíduos de aminoácidos de comprimento; ii) a partir do antígeno ou imunogênio da primeira composição; e, iii) compreende um ou mais epítopos de células T CD8+ dentro do antígeno ou imunogênio do vetor viral, em que uma resposta de células T CD8+ específicas a um antígeno é induzida. A primeira composição ou da segunda composição é administrada como uma dose iniciadora, e uma da primeira composição ou da segunda composição é administrada como uma dose de reforço, desde que ambas as primeira e segunda composições sejam administradas,

65 / 74 Exemplo 4: Uso da composição de vetor viral não replicante e composição de peptídeo ligado a fluorocarboneto em um regime de dosagem heterólogo

[00127] A sinergia entre AdGP70 e PepGP70 é examinada avaliando a atividade antitumoral em camundongos BALB/c desafiados com células tumorais CT26. Camundongos BALB/c fêmeas com 6-8 semanas de idade são usados para o experimento. No dia 0, 2x104 de células CT26 em 100 µL de PBS são injetadas por via subcutânea no flanco de camundongos. A composição da vacina de AdGP70 e PepGP70 é preparada de acordo com o Exemplo 1, em que as vacinas formuladas são preparadas como 50 µL de soluções injetáveis. As composições são administradas por via subcutânea de acordo com um cronograma de iniciadora/ eforço com 14 dias entre a administração da dose iniciadora e a dose de reforço.

[00128] O Grupo 1 recebeu 50 µl de PepGP70 (50µg/peptídeo) por via subcutânea no dia 1 e dia 14 respectivamente. O Grupo 2 recebeu 50 µl de AdGP70 (2x109 ifu) por via subcutânea no dia 7 e dia 14 respectivamente. O Grupo 3 recebeu apenas vacina 50 µl de AdGP70 (2x109 ifu) e PepGP70 (50µg/peptídeo) por via subcutânea no dia 7 e dia 14 respectivamente. O Grupo 4 recebeu 50 µl de PepGP70 (50ug/peptídeo) e 50µl de AdGP70 (2x109 ifu) por via subcutânea no dia 1 e dia 14 respectivamente. O Grupo 5 não recebeu tratamento.

[00129] Ambas as vacinas PepGP70 e AdGP70 testadas individualmente ou como combinações de iniciadora-reforço para promover uma resposta antitumoral. O regime de vacinas que consiste em uma combinação iniciadora/de reforço promove melhores respostas antitumorais em comparação com PepGP70 e AdGP70 testados individualmente. Exemplo 5: Uso da composição de vetor viral não replicante e composição de peptídeo ligado a fluorocarboneto em um regime de dosagem heterólogo em combinação com um inibidor de checkpoint

66 / 74 imunológico (anti-PD1)

[00130] A preparação de AdGP70 (composição de vetor não viral) e PepGP70 (composição de peptídeo ligado a fluorocarboneto) são descritos no Exemplo 1, em que AdGP70 é um vetor adenoviral deficiente de replicação que expressa GP70 (SEQ ID NO: 1) e PepGP70 é uma combinação de quatro peptídeos (SEQ ID NOs: 68 a 71) individualmente ligados a uma cadeia de fluorocarboneto e presente em micelas; e, a preparação da composição do inibidor de checkpoint imunológico é descrita no Exemplo 2.

[00131] A sinergia entre AdGP70 e PepGP70 em combinação com tratamento anti-PD1 foi examinada avaliando a resposta imune induzida por vacina em camundongos BALB/c desafiados com células tumorais CT26. Camundongos BALB/c fêmeas com 6-8 semanas de idade (n=12 por grupo) foram usados para o experimento. Os animais foram anestesiados com uma mistura de cetamina-domitor (0,7/80mg/kg) para permitir que os animais fossem rapados no local da inoculação das células tumorais e despertar induzidos por uma injeção de antisedan (2mg/kg). No dia 0, 2x104 de células CT26 em 100 µL de PBS foram injetadas por via subcutânea no flanco de camundongos.

[00132] A composição da vacina de AdGP70 e PepGP70 foi preparada de acordo com o Exemplo 1, em que as vacinas formuladas foram preparadas como 50 µL de soluções injetáveis. As composições foram administradas por via subcutânea de acordo com um cronograma de iniciadora/ eforço com 7 dias entre a administração da dose iniciadora e a dose de reforço. Neste modelo experimental de tumor, uma dose de reforço é administrada após 7 dias, em vez dos 14 dias típicos, para garantir que uma resposta imune robusta seja montada para detectar o efeito da resposta imune contra o tumor. Seis injeções da composição do inibidor de imuno-checkpoint, anti-PD1 (anti- CD279 - clone RMP1-14, InVivoPlus, Euromedex, ref BP0146-100mg; GoInVivo, Ozyme, ref BLE114115) foram administradas por via intra-

67 / 74 peritoneal.

[00133] O grupo 1 (n=12) recebeu 50 µl de PepGP70 (50 µg/peptídeo) por via subcutânea no dia 7 e dia 14, respectivamente, e 200 µg de PD1 anticamundongo em 100 µl intraperitonealmente nos dias 7, 11, 14, 18, 22 e

25. O grupo 2 (n=12) recebeu 50 µl de AdGP70 (2x109 ifu) por via subcutânea no dia 7 e dia 14, respectivamente, e 200 µg de PD1 anticamundongo em 100 µl intraperitonealmente nos dias 7, 11, 14, 18, 22 e

25. O grupo 3 (n=12) recebeu apenas vacina de 50 µl de AdGP70 (2x109 ifu) e PepGP70 (50 µg/peptídeo) por via subcutânea no dia 7 e dia 14, respectivamente, e 200 µg de PD1 anticamundongo em 100 µl intraperitonealmente nos dias 7, 11, 14, 18, 22 e 25. O grupo 4 (n=12) recebeu 50 µl de PepGP70 (50ug/peptídeo) e 50 µl de AdGP70 (2x109 ifu) por via subcutânea no dia 7 e dia 14, respectivamente, e 200 µg de PD1 anticamundongo em 100 µl intraperitonealmente nos dias 7, 11, 14, 18, 22 e

25. O Grupo 5 recebeu 200 µg de PD1 anticamundongo em 100 µL intraperitonealmente nos dias 7, 11, 14, 18, 22 e 25. O Grupo 6 (n= 12) não recebeu tratamento.

[00134] Para o ensaio de dextrâmero, PBMCs coletadas no dia 6 (D6) ou dia 20 (D20) foram coradas com dextrâmero H-2 Ld preparado com o peptídeo AH1 (epítopo de célula T CD8+ derivado de GP70, sequência: SPSYVYHQF (SEQ ID NO: 73) marcado com Ficoeritrina (PE). O processo de coloração de células para análise de citometria de fluxo é descrito a seguir. 200 µl de amostras de sangue total do grupo 1 a 6 animais foram coletados por meio da técnica de sangramento retro-orbital em um tubo revestido com EDTA e invertido várias vezes para evitar a coagulação. Os glóbulos vermelhos foram lisados usando tampão de lise de RBC multi-espécies de acordo com as recomendações do fabricante (eBiosciences, ref 00-4300-54). Amostras de PBMCs individuais do grupo 1 a 6 animais foram cultivadas em 200 µl de meio de cultura completo composto de RPMI Glutamax 1640

68 / 74

(GIBCO, ref 11548876) suplementado com 10% de soro fetal bovino, (GIBCO, ref 10270-098), e solução de estreptomicina-penicilina a 1% (GIBCO, ref 11548876) em placas de 96 poços.

As placas foram incubadas durante a noite a 37°C, 5% de CO2 em um ambiente umidificado.

Após a conclusão da lise de glóbulos vermelhos, incubação, PBMCs de camundongos individuais foram lavados com tampão de coloração (DPBS1X suplementado com 5% de soro fetal bovino, EDTA 2 mM e solução de penicilina- estreptomicina 1%) por centrifugação por 6 min a 1300 rpm à temperatura ambiente.

Os receptores de Fc foram bloqueados incubando as células do baço por 10 minutos a 4°C com 25 µL de tampão de coloração a frio contendo um anticorpo CD16/32 anticamundongo diluído a 1: 200. As células foram então coradas com o dextrâmero AH-1/H-2 Ld relevante (Immudex, ref JG3294-OPT) ou NP118-126/H-2 Ld dextrâmero irrelevante (Immudex, ref JG2750-OPT). 25µl de dextrâmero pré-diluído apropriado 1:2,5 em tampão de coloração foram adicionados às células bloqueadas do receptor Fc seguindo por incubação por 30 minutos a 4°C.

Após a incubação, um coquetel de anticorpos 2X contendo CD4 Pe-Cy7 anticamundongo (Ozyme, ref BLE100422), CD8a BV510 anticamundongo (Ozyme, ref BLE100752), CD44 (Miltenyi, ref 130-102-443), PD1 PERCP-Cy5.5 anticamundongo (Ozyme, ref BLE109119), CD25 PEeFluor 610 (eBioscience, ref 61-0251- 82), CD11b Alexa 700 (eBioscience, ref 56-0112-82) e Viability Dye eFluor™ 520 (eBioscience, ref 65-0867-14) foi preparado em tampão de coloração. 50 µL de coquetel de anticorpos foram adicionados em células coradas com dextrâmero seguindo por incubação por 20 minutos a 4°C.

Após as etapas de coloração, as células foram lavadas duas vezes com tampão de coloração por centrifugação por 6 min a 1300 rpm 4˚C.

As células coradas superficiais foram ressuspensas em 200 µl de solução de trabalho de fixação/permeabilização preparada de acordo com as recomendações do fabricante (kit de conjunto de tampões de fixação/permeabilização e

69 / 74 permeabilização, eBioscience, ref 00-5523-00) e incubadas por 25 minutos a 4°C. As células foram então lavadas com tampão de permeabilização 1X por centrifugação por 6 min a 1300 rpm 4°C antes de serem coradas com um Perforin APC anticamundongo (eBioscience, ref 17-9392-80). 50 µL de Perforin APC pré-diluído foram adicionados às células coradas com dextrâmero seguindo por incubação de 20 minutos a 4°C. As células foram lavadas duas vezes com tampão de permeabilização 1X por centrifugação por 6 min a 1300 rpm 4˚C e depois ressuspensas em tampão de coloração antes da aquisição e análise por citometria de fluxo. Os eventos foram bloqueados em Dextrâmero + CD8 + vivas. A Figura 3 mostra a porcentagem de células T CD8+ positivas para coloração de dextrâmero expressa como valor médio para cada grupo no dia 6 (D6) e no dia 20 (D20).

[00135] Ambas as composições de vacina PepGP70 e AdGP70, testadas individualmente ou como combinações de iniciadora-reforço, sinergia com um tratamento anti-PD1 em sua capacidade de promover uma resposta imune antitumoral como apresentada na Figura 3, em que células T CD8+ específicas a um antígeno foram medidas no dia 6 (D6) e dia 20 (D20). A combinação da vacina que consiste em um iniciadora com PepGP70 e um reforço com AdGP70 com o tratamento anti-PD1 promove uma resposta muito maior em comparação com outros regimes de vacina. Todo o regime de dosagem da vacina (Grupos 1 a 4) sinergia com anti-PD1, mas o regime de dosagem com PepGP70 como a dose iniciadora e AdGP70 como a dose de reforço (Grupo 4) demonstrou sinergia em comparação com vacinas de regime de dosagem homóloga (Grupos 1 e 2) . Exemplo 6: Uso da composição de peptídeo ligado a fluorocarboneto em regime de dosagem homóloga para induzir uma resposta de célula T CD4+ e CD8+ específica ao antígeno e atividade antitumoral

[00136] A composição do peptídeo ligado a fluorocarboneto (FP-OVA) foi preparada de acordo com a descrição no Exemplo 1, exceto que um

70 / 74 peptídeo OVA foi usado no lugar dos peptídeos GP70. FP-OVA é composto por um peptídeo derivado de ovalbumina (sequência ISQAVHAAHAEINEAGRESIINFEKLTEWT (SEQ ID NO: 75)) contendo o epítopo de células T CD4+ (Ova 323-339, sequência ISQAVHAAHAEINEAGR (SEQ ID NO:76)) e o epítopo de células T CD8+ (posição de aminoácido 257-264, sequência SIINFEKL (SEQ ID NO: 77)).

[00137] Neste experimento, camundongos C57BL/6 fêmeas (n = 15/grupo) foram vacinados por via subcutânea no dia 0 e no dia 14 com 200 µg de vacina FP-OVA em 100 µl (grupo 1) ou 100 µl de solução de excipiente (grupo 2). No dia 24, 5 camundongos foram sacrificados em cada grupo para medir a resposta imune por meio de um ensaio ELISpot. A resposta imune à composição da vacina foi medida da seguinte forma: os baços foram coletados e as células foram estimuladas com 1ng/ml de epítopo OVA-CTL (Ova 257-264, sequência SIINFEKL (SEQ ID NO: 77) (epítopo de célula T CD8+)) ou 10 µg/mL OVA-HTL (Ova 323-339, sequência ISQAVHAAHAEINEAGR (SEQ ID NO: 76) (epítopos de células T CD4+)) em um ensaio ELISpot de IFNγ. O número de células formadoras de spots de IFNγ (SFC) foi contado. A Figura 4A mostra o número de células formadoras de spots de IFNγ (SFC)/106 esplenócitos produzidos em resposta ao OVA- CTL ou OVA-HTL, para camundongos individuais, após subtração dos valores de poço de controle (a linha representa o valor de resposta médio). Os dados foram definidos como paramétricos por meio do teste de normalidade de Kolmogorov-Smirnov e as análises estatísticas foram realizadas por meio do teste t de Student, onde P<0,001 = ***.

[00138] No dia 24, os 10 camundongos restantes em cada grupo receberam uma injeção subcutânea de 2x106 células E.G7-OVA; células EL4 de timoma de camundongo estavelmente transfectadas com o DNA complementar de ovalbumina de galinha (OVA) e, assim, expressam epítopos de OVA como um antígeno único. Os camundongos desafiados foram

71 / 74 eliminados quando os tamanhos do tumor atingiram 150 mm2. A Figura 4B mostra a sobrevivência global medida ao longo do tempo nos dois grupos diferentes. A Figura 5 mostra o crescimento do tumor medido ao longo do tempo no grupo do excipiente (Fig. 5A) e no grupo da vacina (Fig. 5B). As Figuras 4 e 5 demonstram a eficácia dos peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que os peptídeos são antígenos de câncer únicos, como profilático contra o câncer.

[00139] Em um segundo experimento, camundongos fêmeas C57BL/6 (n = 10/grupo) receberam injeção subcutânea de uma injeção subcutânea de 2x106 células E.G7-OVA em um flanco no dia 0 e uma segunda administração de 2x106 células E.G7-OVA no animal sobrevivente no flanco oposto no dia 50. O Grupo 1 então recebeu 200ug de vacina FP-OVA em 100 ul por via subcutânea no dia 1 e no dia 8. O Grupo 2 recebeu 200ug de vacina FP-OVA em 100ul por via subcutânea no dia 3 (correspondendo ao dia de detecção de um tumor palpável em pelo menos um animal) e no dia 10. O Grupo 3 recebeu 100ul de excipiente por via subcutânea no dia 1 e no dia 8. Os camundongos desafiados foram eliminados quando os tamanhos do tumor atingiram 150 mm2. A Figura 6 mostra a sobrevivência global medida ao longo do tempo nos diferentes grupos, em que cada um dos grupos 1 e 2 tinha uma taxa de sobrevivência de pelo menos 60%, demonstrando a eficácia dos peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que os peptídeos são antígenos de câncer únicos, como um agente terapêutico para câncer. Exemplo 7: Uso da composição de vetor viral não replicante ou composição de peptídeo ligado a fluorocarboneto em combinação com um inibidor de checkpoint imunológico (anti-PD1)

[00140] A preparação de AdGP70 (composição de vetor não viral) e PepGP70 (composição de peptídeo ligado a fluorocarboneto) são descritos no Exemplo 1, em que AdGP70 é um vetor adenoviral deficiente de replicação que expressa GP70 (SEQ ID NO: 1) e PepGP70 é uma combinação de quatro

72 / 74 peptídeos (SEQ ID NOs: 68 a 71) individualmente ligados a uma cadeia de fluorocarboneto e presente em micelas; e, a preparação da composição do inibidor de checkpoint imunológico é descrita no Exemplo 2.

[00141] A sinergia entre AdGP70 ou PepGP70 com tratamento anti- PD1 foi examinada avaliando suas respectivas atividades antitumorais contra o tumor de carcinoma do cólon CT26 em camundongos BALB/c. Camundongos BALB/c fêmeas com 6-8 semanas de idade (n=12 por grupo) foram usados para o experimento. Os animais foram anestesiados com uma mistura de cetamina-domitor (0,7/80mg/kg) para permitir que os animais fossem rapados no local da inoculação das células tumorais e despertar induzidos por uma injeção de antisedan (2mg/kg). No dia 0, 2x10^4 de células CT26 em 100 µL de PBS foram injetadas no flanco de camundongos. A palpação do tumor foi realizada cinco vezes por semana para determinar a data da primeira detecção positiva do tumor. Uma vez detectado um tumor sólido, seu tamanho era medido aproximadamente três vezes por semana. As medições do tamanho do tumor foram realizadas com um calibrador em duas dimensões e volume determinado de acordo com a fórmula: L*l^2/2; (L = eixo mais longo e l = eixo mais curto). Os animais foram sacrificados de acordo com os seguintes endpoints humanos: volume do tumor ≥2000 mm3, presença de tumor necrótico ou ulcerado, mobilidade prejudicada incluindo prostração transitória ou postura curvada, interferência com uma função fisiológica vital incluindo respiração, distensão abdominal significativa ou > 20% perda de peso em uma semana.

[00142] As composições de vacina formuladas foram preparadas de acordo com os Exemplos 1 e 2 como 50 µL de soluções injetáveis e foram administradas por via subcutânea de acordo com um cronograma de iniciadora/reforço com 14 dias entre uma dose iniciadora e a administração da dose de reforço. Seis injeções do imuno-checkpoint, anti-PD1 (anti-CD279 - clone RMP1-14, InVivoPlus, Euromedex, ref BP0146-100mg; GoInVivo,

73 / 74 Ozyme, ref BLE114115) foram administradas por via intra-peritoneal, a cada 3 ou4 dias após iniciação do tumor.

[00143] O Grupo 1 (n = 15) recebeu apenas preparações de composição de vacina, 50 µL de PepGP70 (50ug/peptídeo) no dia 1 e no dia 15, respectivamente. Grupo 2 (n = 14) recebeu 50 µl de PepGP70 (50ug/peptídeo) no dia 1 e dia 15, respectivamente e 200 µg de PD1 anticamundongo em dose de entrega de 100ul (anti-CD279 - clone RMP1-14) nos dias 4, 7, 11, 15, 18 e 22. Grupo 3 (n = 14) recebeu apenas preparações de vacina, 50 µl de AdGP70 (2x109 ifu) no dia 0 e no dia 14, respectivamente. Grupo 4 (n = 15) recebeu 50 µl de AdGP70 (2x109 ifu) no dia 0 e dia 14, respectivamente e 200 µg de PD1 anticamundongo em dose de entrega de 100ul (anti-CD279 - clone RMP1-14) nos dias 4, 7, 11 , 15, 18 e 22. Grupo 5 (n = 15) recebeu 50ul de preparação de vacina contendo apenas agonista de TLR9 no dia 1 e dia 15, respectivamente, e 200 µg de PD1 anticamundongo em dose de entrega de 100ul (anti-CD279 - clone RMP1-14) nos dias 4, 7, 11, 15, 18 e 22. O Grupo 6 (n= 12) não recebeu tratamento. Os resultados são apresentados na Figura 7 (volume do tumor em cada animal) e nas Figuras 8A e 8B (sobrevivência global para cada grupo).

[00144] Ambas as composições PepGP70 e AgGP70 promovem uma atividade antitumoral com o crescimento retardado do tumor e a sobrevivência global melhorada, conforme apresentado na Figura 7 e Figuras 8A e 8B, respectivamente. Além disso, ambas as composições de vacinas se beneficiam do tratamento de combinação com anti-PD1 mostrando uma sobrevivência global superior e perfil de crescimento tumoral retardado em comparação com o animal que recebeu apenas as composições de vacina ou o tratamento anti-PD1. Exemplo 8: Uso da composição de vetor viral não replicante ou composição de peptídeo ligado a fluorocarboneto em combinação com composição de inibidor de células supressoras derivadas de mieloide

74 / 74 (MDSC)

[00145] AdGP70 ou PepGP70 em combinação com um inibidor de MDSC são examinados avaliando a atividade antitumoral em camundongos BALB/c desafiados com células tumorais CT26. Camundongos BALB/c fêmeas com 6-8 semanas de idade são usados para o experimento. No dia 0, 2x104 de células CT26 em 100 µL de PBS são injetadas por via subcutânea no flanco de camundongos. A composição da vacina de AdGP70 e PepGP70 é preparada de acordo com o Exemplo 1, em que as vacinas formuladas são preparadas como 50 µL de soluções injetáveis. As composições são administradas por via subcutânea de acordo com um cronograma de iniciadora/reforço com 14 dias entre a administração da dose iniciadora e a dose de reforço com animais individuais recebendo uma dose de AdGP70 ou uma dose de PepGP70.

[00146] O Grupo 1 recebe 50 µl de PepGP70 (50 µg/peptídeo) por via subcutânea no dia 1 e no dia 14 e o inibidor de MDSC é administrado diariamente por via intraperitoneal. Grupo 2 recebe 50 µl de AdGP70 (2x109 ifu) por via subcutânea no dia 1 e no dia 14. Grupo 3 recebe o inibidor de MDSC diariamente por via intraperitoneal. Grupo 4 não recebe tratamento.

Claims

1 / 11 REIVINDICAÇÕES

1. Combinação de vacina, caracterizada pelo fato de que compreende de duas a três composições selecionadas a partir de: a) uma primeira composição compreendendo um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou imunogênio contendo um ou mais epítopos de célula T CD8+; b) uma segunda composição compreendendo micelas que contêm peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado ao fluorocarboneto é: i) de 15 a 75 resíduos de aminoácido de comprimento; ii) a partir do antígeno ou imunogênio da primeira composição; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de célula T CD8+ da primeira composição do antígeno ou imunogênio; e c) uma terceira composição compreendendo um modulador imune selecionado a partir de um anti-imunossupressor ou um imunoativador, em que quando a primeira composição e a segunda composição são selecionadas, a primeira ou a segunda composição é uma composição iniciadora ou uma composição de reforço.

2. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que o anti-imunossupressor alveja PD1, PDL1, PDL2, CD28, CD80, CD86, CTLA4, B7RP1, ICOS, B7RPI, B7-H3, B7-H4, BTLA, HVEM, KIR, TCR, LAG3, CD 137, CD137L, OX40, OX40L, CD27, CD70, CD40, CD40L, TIM3, GAL1, GAL3, GAL9, ADORA, CD276, VTCN1, IDO1, KIR3DL1, HAVCR2, VISTA, CD244, ADAM17, COX2, PGE-2, iNOS2, PDE5, c-kit, ARG1, PI3K, CSF-1R, Caspase-8, CCL2, RON, ROS, ou S100A8/A9.

3. Combinação, de vacina de acordo com a reivindicação 2, caracterizada pelo fato de que o anti-imunossupressor alveja PD1 ou PDL1.

4. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 2, caracterizada pelo fato de que o anti-imunossupressor é um anticorpo anti-

2 / 11 PD1 ou anti-PDL1.

5. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que o imunoativador alveja o receptor tipo Toll (TLR) 3, TLR4, TLR5, TLR7, TLR8, TLR9, NOD1, NOD2, STING, cGAS, IFR3, receptor IL-2, receptor IL12 ou receptor IFN-alfa.

6. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que o vetor viral não replicante é um vetor de adenovírus, um vetor de alphavirus, um vetor de vírus da herpes, um vetor de vírus do sarampo, um vetor de poxvirus ou um vetor de vírus da estomatite vesicular.

7. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 6, caracterizada pelo fato de que o vetor viral não replicante é um vetor de adenovírus deletado E1 e E3.

8. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que a primeira, segunda ou terceira composição é formulada para administração parenteral, oral, ocular, retal, nasal, transdérmica, tópica ou vaginal.

9. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que o antígeno ou imunogênio é de um patógeno.

10. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 9, caracterizada pelo fato de que o patógeno é um vírus, fungo, parasita ou bactéria.

11. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 10, caracterizada pelo fato de que o vírus é EBV, HPV, HTLV-1, MCPvV, KSHV, HERV, HCV ou HBV.

12. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que o antígeno ou imunogênio é um antígeno cancerígeno.

13. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 1,

3 / 11 caracterizada pelo fato de que a primeira composição é uma composição iniciadora e a segunda composição é uma composição de reforço.

14. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que a segunda composição é uma composição iniciadora e a primeira composição é uma composição de reforço.

15. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que a porção de fluorocarboneto do peptídeo ligado a fluorocarboneto é uma cadeia de fluorocarboneto de 3 a 30 átomos de carbono.

16. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 15, caracterizada pelo fato de que uma ou mais o radical de flúor da cadeia de fluorocarboneto é substituída com cloro, bromo, iodo, hidrogênio ou um grupo metila.

17. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que o peptídeo ligado a fluorocarboneto é de estrutura CmFn—CyHx-(Sp)-R, em que m=3 a 30, n<=2m+1, y=0 a 15, x<=2y, (m+y)=3-30, Sp é um radical espaçador químico opcional e R é o peptídeo.

18. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que o peptídeo ligado a fluorocarboneto é de acordo com a estrutura F2 F2 F2 F 3C C C C Sp R

C C C C F2 F2 F2 F2 onde Sp é um radical espaçador químico opcional e R é o peptídeo.

19. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que o peptídeo ligado a fluorocarboneto da segunda composição compreende pelo menos um epítopo de ligação de MHC classe II e pelo menos um epítopo de ligação de MHC classe I.

20. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que a primeira, segunda ou terceira composição

4 / 11 compreende adicionalmente e independentemente um ou mais carreadores, excipientes, diluentes ou adjuvantes farmaceuticamente aceitáveis.

21. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 20, caracterizada pelo fato de que o adjuvante é um agonista de TLR2, TLR3, TLR7, TLR8 ou TLR9, STING, cGAS, IFR3, NOD1 ou NOD2.

22. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que a primeira, segunda ou terceira composição está na forma de um líquido, emulsão, sólido, aerossol, névoa ou gás.

23. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que a primeira composição e a segunda composição são selecionadas.

24. Combinação de vacina de acordo com a reivindicação 1, caracterizada pelo fato de que uma da primeira composição ou da segunda composição é selecionada, e a terceira composição é selecionada.

25. Método para induzir uma resposta imune em um indivíduo em necessidade da mesma, caracterizado pelo fato de que compreende: a) administrar uma primeira composição compreendendo um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou imunogênio contendo um ou mais epítopos de célula T CD8+; e b) administrar uma segunda composição compreendendo micelas que contêm peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado ao fluorocarboneto é: i) de 15 a 75 resíduos de aminoácido de comprimento; ii) a partir do antígeno ou imunogênio da primeira composição; e, iii) contém um ou mais dos epítopos de célula T CD8+ da primeira composição do antígeno ou imunogênio, em que uma da primeira composição ou da segunda composição é administrada como uma dose iniciadora, e uma da primeira composição ou da segunda composição é administrada como uma dose de reforço, desde que ambas as primeira e segunda composições sejam

5 / 11 administradas, por meio do que uma resposta a células T CD8+ específica a um antígeno é induzida.

26. Método de acordo com a reivindicação 25, caracterizado pelo fato de que a dose iniciadora e a dose de reforço são administradas pelo menos com 14 dias de diferença.

27. Método de acordo com a reivindicação 25, caracterizada pelo fato de que a segunda composição é a dose iniciadora e a primeira composição é a dose de reforço.

28. Método de acordo com a reivindicação 25, caracterizada pelo fato de que a primeira composição é a dose iniciadora e a segunda composição é a dose de reforço

29. Método de acordo com a reivindicação 25, caracterizado pelo fato de que o indivíduo é um mamífero, uma ave, um réptil, um anfíbio ou um peixe.

30. Método de acordo com a reivindicação 2, caracterizado pelo fato de que o indivíduo é um humano, uma vaca, um cachorro, um gato, uma cabra, uma ovelha, um porco, um peru, um pato ou uma galinha.

31. Método de acordo com a reivindicação 25, caracterizado pelo fato de que compreende administrar a terceira composição compreendendo um modulador imune selecionado a partir de um anti- imunossupressor ou um imunoativador,

32. Método de acordo com a reivindicação 31, caracterizada pelo fato de que o anti-imunossupressor alveja PD1, PDL1, PDL2, CD28, CD80, CD86, CTLA4, B7RP1, ICOS, B7RPI, B7-H3, B7-H4, BTLA, HVEM, KIR, TCR, LAG3, CD 137, CD137L, OX40, OX40L, CD27, CD70, CD40, CD40L, TIM3, GAL1, GAL3, GAL9, ADORA, CD276, VTCN1, IDO1, KIR3DL1, HAVCR2, VISTA, CD244, ADAM17, COX2, PGE-2, iNOS2, PDE5, c-kit, ARG1, PI3K, CSF-1R, Caspase-8, CCL2, RON, ROS,

6 / 11 ou S100A8/A9.

33. Método de acordo com a reivindicação 31, caracterizada pelo fato de que o anti-imunossupressor alveja PD1 ou PDL1.

34. Método de acordo com a reivindicação 31, caracterizada pelo fato de que o anti-imunossupressor é um anticorpo anti-PD1 ou anti- PDL1.

35. Método de acordo com a reivindicação 31, caracterizada pelo fato de que o imunoativador alveja o receptor tipo Toll (TLR) 3, TLR4, TLR5, TLR7, TLR8, TLR9, NOD1, NOD2, STING, cGAS, IFR3, receptor IL-2, receptor IL12 ou receptor IFN-alfa.

36. Método de acordo com a reivindicação 31, caracterizada pelo fato de que a etapa de administração da terceira composição é realizada após a administração da primeira composição.

37. Método de acordo com a reivindicação 25, caracterizada pelo fato de que o antígeno ou imunogênio é de um patógeno.

38. Método de acordo com a reivindicação 37, caracterizada pelo fato de que o patógeno é um vírus, fungo, parasita ou bactéria.

39. Método de acordo com a reivindicação 38, caracterizada pelo fato de que o vírus é EBV, HPV, HTLV-1, MCPvV, KSHV, HERV, HCV ou HBV.

40. Método de acordo com a reivindicação 25, caracterizada pelo fato de que o antígeno ou imunogênio é um antígeno cancerígeno.

41. Método de acordo com a reivindicação 25, caracterizado pelo fato de que a resposta imune induzida é um tratamento terapêutico ou profilático para câncer de pulmão de células não pequenas, câncer de mama, câncer hepático, câncer cerebral, câncer de estômago, câncer de pâncreas, câncer renal, câncer de ovário, câncer de mieloma, leucemia mielóide aguda, leucemia mielóide crônica, câncer de cabeça e pescoço, câncer colorretal, câncer renal , câncer de esôfago, câncer de pele com melanoma e/ou pacientes

7 / 11 com câncer de próstata.

42. Método de acordo com a reivindicação 25, caracterizado pelo fato de que a resposta imune induzida é um tratamento terapêutico ou profilático para indivíduos com infecção crônica ou risco de exposição a patógenos que causam infecções crônicas, em que os patógenos são selecionados a partir de vírus da imunodeficiência humana (HIV), vírus da hepatite B, vírus da hepatite D, vírus da herpes, vírus Epstein-Barr, citomegalovírus, vírus do papiloma humano, ou vírus linfotrópico T humano tipo III.

43. Método de acordo com a reivindicação 26, caracterizado pelo fato de que a rota de administração da primeira e/ou da segunda composição é selecionada a partir de parenteral, subcutânea, oral, epidérmica, intradérmica, intramuscular, intra-arterial, intraperitoneal, intravenosa, nasal, intratraqueal, intestinal, sublingual, retal ou vaginal.

44. Método de acordo com a reivindicação 25, caracterizada pelo fato de que o vetor viral não replicante é um vetor de adenovírus, um vetor de alphavirus, um vetor de vírus da herpes, um vetor de vírus do sarampo, um vetor de poxvirus ou um vetor de vírus da estomatite vesicular.

45. Método de acordo com a reivindicação 44, caracterizada pelo fato de que o vetor viral não replicante é um vetor de adenovírus deletado E1 e / E3.

46. Método de acordo com a reivindicação 25, caracterizada pelo fato de que a porção de fluorocarboneto do peptídeo ligado a fluorocarboneto é uma cadeia de fluorocarboneto de 3 a 30 átomos de carbono.

47. Método de acordo com a reivindicação 46, caracterizada pelo fato de que uma ou mais o radical de flúor da cadeia de fluorocarboneto é substituída com cloro, bromo, iodo, hidrogênio ou um grupo metila.

48. Método de acordo com a reivindicação 25, caracterizada

8 / 11 pelo fato de que o peptídeo ligado a fluorocarboneto é de estrutura CmFn— CyHx-(Sp)-R, em que m=3 a 30, n<=2m+1, y=0 a 15, x<=2y, (m+y)=3-30, Sp é um radical espaçador químico opcional e R é o peptídeo.

49. Método de acordo com a reivindicação 25, caracterizada pelo fato de que o peptídeo ligado a fluorocarboneto é de acordo com a estrutura F2 F2 F2 F 3C C C C Sp R

50. Método de acordo com a reivindicação 25, caracterizada pelo fato de que o peptídeo ligado a fluorocarboneto da segunda composição compreende pelo menos um epítopo de ligação de MHC classe II e pelo menos um epítopo de ligação de MHC classe I.

51. Método para induzir uma resposta imune em um indivíduo em necessidade da mesma, caracterizado pelo fato de que compreende: a) administrar uma primeira composição compreendendo um vetor viral não replicante que codifica um antígeno ou imunogênio ou um fragmento do mesmo contendo um ou mais epítopos de célula T CD8+; ou, b) administrar uma segunda composição compreendendo micelas que contêm peptídeos ligados a fluorocarboneto, em que cada peptídeo ligado ao fluorocarboneto é: i) 15 a 75 resíduos de aminoácido de comprimento; ii) a partir de um antígeno ou imunogênio; e, iii) contém um ou mais epítopos de célula T CD8+; e, c) administrar separadamente uma terceira composição compreendendo um modulador imune selecionado a partir de um anti- imunossupressor ou um imunoativador, por meio do que uma resposta a células T CD8+ específica a um antígeno é induzida.

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52. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizado pelo fato de que o indivíduo é um mamífero, uma ave, um réptil, um anfíbio ou um peixe.

53. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizado pelo fato de que o indivíduo é um humano, uma vaca, um cachorro, um gato, uma cabra, uma ovelha, um porco, um peru, um pato ou uma galinha.

54. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizada pelo fato de que o anti-imunossupressor alveja PD1, PDL1, PDL2, CD28, CD80, CD86, CTLA4, B7RP1, ICOS, B7RPI, B7-H3, B7-H4, BTLA, HVEM, KIR, TCR, LAG3, CD 137, CD137L, OX40, OX40L, CD27, CD70, CD40, CD40L, TIM3, GAL1, GAL3, GAL9, ADORA, CD276, VTCN1, IDO1, KIR3DL1, HAVCR2, VISTA, CD244, ADAM17, COX2, PGE-2, iNOS2, PDE5, c-kit, ARG1, PI3K, CSF-1R, Caspase-8, CCL2, RON, ROS, ou S100A8/A9.

55. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizada pelo fato de que o anti-imunossupressor alveja PD1 ou PDL1.

56. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizada pelo fato de que o anti-imunossupressor é um anticorpo anti-PD1 ou anti- PDL1.

57. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizada pelo fato de que o imunoativador alveja o receptor tipo Toll (TLR) 3, TLR4, TLR5, TLR7, TLR8, TLR9, NOD1, NOD2, STING, cGAS, IFR3, receptor IL-2, receptor IL12 ou receptor IFN-alfa.

58. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizada pelo fato de que a etapa de administração da terceira composição é realizada após a administração da primeira ou segunda composição.

59. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizada pelo fato de que o antígeno ou imunogênio é de um patógeno.

60. Método de acordo com a reivindicação 59, caracterizada

10 / 11 pelo fato de que o patógeno é um vírus, fungo, parasita ou bactéria.

61. Método de acordo com a reivindicação 60, caracterizada pelo fato de que o vírus é EBV, HPV, HTLV-1, MCPvV, KSHV, HERV, HCV ou HBV.

62. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizada pelo fato de que o antígeno ou imunogênio é um antígeno cancerígeno.

63. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizado pelo fato de que a resposta imune induzida é um tratamento terapêutico ou profilático para câncer de pulmão de células não pequenas, câncer de mama, câncer hepático, câncer cerebral, câncer de estômago, câncer de pâncreas, câncer renal, câncer de ovário, câncer de mieloma, leucemia mielóide aguda, leucemia mielóide crônica, câncer de cabeça e pescoço, câncer colorretal, câncer renal , câncer de esôfago, câncer de pele com melanoma e/ou pacientes com câncer de próstata.

64. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizado pelo fato de que a resposta imune induzida é um tratamento terapêutico ou profilático para indivíduos com infecção crônica ou risco de exposição a patógenos que causam infecções crônicas, em que os patógenos são selecionados a partir de vírus da imunodeficiência humana (HIV), vírus da hepatite B, vírus da hepatite D, vírus da herpes, vírus Epstein-Barr, citomegalovírus, vírus do papiloma humano, ou vírus linfotrópico T humano tipo III.

65. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizado pelo fato de que a rota de administração da primeira ou da segunda composição e da terceira composição é selecionada a partir de parenteral, subcutânea, oral, epidérmica, intradérmica, intramuscular, intra-arterial, intraperitoneal, intravenosa, nasal, intratraqueal, intestinal, sublingual, retal ou vaginal.

66. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizada

11 / 11 pelo fato de que o vetor viral não replicante é um vetor de adenovírus, um vetor de alphavirus, um vetor de vírus da herpes, um vetor de vírus do sarampo, um vetor de poxvirus ou um vetor de vírus da estomatite vesicular.

67. Método de acordo com a reivindicação 66, caracterizada pelo fato de que o vetor viral não replicante é um vetor de adenovírus deletado E1 e / E3.

68. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizada pelo fato de que a porção de fluorocarboneto do peptídeo ligado a fluorocarboneto é uma cadeia de fluorocarboneto de 3 a 30 átomos de carbono.

69. Método de acordo com a reivindicação 68, caracterizada pelo fato de que uma ou mais o radical de flúor da cadeia de fluorocarboneto é substituída com cloro, bromo, iodo, hidrogênio ou um grupo metila.

70. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizada pelo fato de que o peptídeo ligado a fluorocarboneto é de estrutura CmFn— CyHx-(Sp)-R, em que m=3 a 30, n<=2m+1, y=0 a 15, x<=2y, (m+y)=3-30, Sp é um radical espaçador químico opcional e R é o peptídeo.

71. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizada pelo fato de que o peptídeo ligado a fluorocarboneto é de acordo com a estrutura F2 F2 F2 F 3C C C C Sp R

72. Método de acordo com a reivindicação 51, caracterizada pelo fato de que o peptídeo ligado a fluorocarboneto da segunda composição compreende pelo menos um epítopo de ligação de MHC classe II e pelo menos um epítopo de ligação de MHC classe I.