BR112013028383A2 - método para aumento do rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vitalidade, teor de óleo, rendimento da fibra, qualidade, resistência ao estresse abiótico, e/ou eficiência no uso do nitrogênio e/ou teor de óleo de uma planta, polinucleotídeo isolado, estrutura de ácido nucleico, polipeptídeo isolado, célula de planta, planta transgênica, e método de geração de uma planta transgênica - Google Patents

Abstract

MÉTODO PARA AUMENTO DO RENDIMENTO, BIOMASSA, TAXA DE CRESCIMENTO, VITALIDADE, TEOR DE ÓLEO, RENDIMENTO DA FIBRA, QUALIDADE DA FIBRA, RESISTÊNCIA AO ESTRESSE ABIÓTICO, E/OU EFICIÊNCIA NO USO DO NITROGÊNIO DE UMA PLANTA, POLINUCLEOTÍDEO ISOLADO, ESTRUTURA DE ÁCIDO NUCLEICO, POLIPEPTÍDEO ISOLADO, CÉLULA DE PLANTA, PLANTA TRANSGÊNICA, E MÉTODO DE GERAÇAO DE UMA PLANTA TRANSGÊNICA, fornece polinucleotídeos isolados que codificam um polipeptídeo, pelo menos, 80% homólogos à sequência de aminoácidos selecionada a partir do grupo que consiste dos Números de Identificação de Sequência [SEQ ID NO]: 757, 456-756, 758-774, 8385-10836 e 10838-14462; um polinucleotídeo isolado, compreendendo uma sequência de ácido nucleico, pelo menos, 80% idêntica aos Números e Identificação de Sequência: 377, 1-376, 378-455 e 775-8384; também são fornecidas estruturas de ácido nucleico, compreendendo os mesmos, polipeptídeos isolados codificados desse modo, células transgênicas e plantas transgênicas, compreendendo os mesmos e métodos de uso dos mesmos para aumentar o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vitalidade, teor de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio.

Description

1 / 378 MÉTODO PARA AUMENTO DO RENDIMENTO, BIOMASSA, TAXA DE CRESCIMENTO, VITALIDADE, TEOR DE ÓLEO, RENDIMENTO DA FIBRA, QUALIDADE DA FIBRA, RESISTÊNCIA AO ESTRESSE ABIÓTICO, E/OU EFICIÊNCIA NO USO DE NITROGÊNIO DE UMA PLANTA, PARA GERAÇÃO DE UMA PLANTA TRANSGÊNICA, CÉLULA VEGETAL, E, PLANTA TRANSGÊNICA

CAMPO E FUNDAMENTOS DA INVENÇÃO

[001] A presente invenção, em algumas modalidades da mesma, se refere a polipeptídeos e polinucleotídeos isolados, construtos de ácido nucléico compreendendo os mesmos, células transgênicas compreendendo os mesmos, plantas transgênicas exogenamente expressando os mesmos e mais particularmente, mas não exclusivamente, aos métodos para usar os mesmos para aumentar rendimento (por exemplo, rendimento de semente, rendimento de óleo), biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico, e/ou eficiência no uso de fertilizante (por exemplo, eficiência no uso de nitrogênio) de uma planta.

[002] Um método comum para promover crescimento da planta foi, e continua a ser, o uso de nutrientes naturais assim como sintéticos (fertilizantes). Assim, fertilizantes são o combustível por detrás da “revolução verde”, diretamente responsáveis pelo aumento excepcional nos rendimentos de safra durante os últimos 40 anos e são considerados a despesa geral número um na agricultura. Dos três macronutrientes providos como fertilizantes principais [Nitrogênio (N), Fosfato (P) e Potássio (K)], o nitrogênio é frequentemente o elemento limitante da taxa no crescimento da

2 / 378 planta e todas as safras de campo têm uma dependência fundamental no fertilizante nitrogenado inorgânico. O nitrogênio usualmente precisa ser reposto todos os anos, particularmente para cereais, que compreendem mais do que metade das áreas cultivadas no mundo inteiro. Por exemplo, os fertilizantes nitrogenados inorgânicos tais como nitrato de amônio, nitrato de potássio ou ureia, tipicamente representam 40% dos custos associados com safras tais como milho e trigo.

[003] O nitrogênio é um macronutriente essencial para a planta, responsável pela biossíntese de aminoácidos e ácidos nucléicos, grupos protéticos, hormônios vegetais, defesas químicas da planta, etc. Além disso, o nitrogênio é frequentemente o elemento limitante da taxa no crescimento da planta e todas as safras de campo têm uma dependência fundamental do nitrogênio inorgânico. Assim, o nitrogênio é transportado para a raiz, onde o mesmo é armazenado nas folhas e talo durante a etapa rápida de desenvolvimento da planta e até o florescimento. No milho por exemplo, as plantas acumulam a maior parte do seu nitrogênio orgânico durante o período de germinação de grão e até o florescimento. Uma vez que a fertilização da planta ocorreu, os grãos começam a se formar e tornam-se o coletor principal de nitrogênio da planta. O nitrogênio armazenado pode ser depois redistribuído a partir das folhas e talo que serviram como compartimentos de armazenagem até a formação de grão.

[004] Visto que o fertilizante é rapidamente esgotado a partir da maioria dos tipos de solo, o mesmo deve ser suprido para as safras em crescimento duas ou três vezes durante o período vegetativo. Além disso, a baixa eficiência no uso de nitrogênio (NUE) das safras principais (por exemplo, na faixa de apenas 30 a 70%) afeta negativamente as despesas com insumos para o agricultor, devido ao fertilizante em excesso aplicado. Além disso, o uso excessivo e ineficiente de fertilizantes são os fatores principais

3 / 378 responsáveis por problemas ambientais tais como eutrofização de lençóis freáticos, lagos, rios e mares, poluição de nitrato na água potável que pode causar metemoglobinemia, poluição de fosfato, poluição atmosférica e semelhantes. Entretanto, a despeito do impacto negativo dos fertilizantes sobre o ambiente e os limites sobre o uso de fertilizante, que foram regulamentados em diversos países, o uso de fertilizantes é esperado aumentar de modo a sustentar a produção de alimento e fibra para o crescimento populacional rápido sobre recursos de terra limitados.

[005] Por exemplo, foi estimado que em 2050, mais do que 150 milhões de toneladas de fertilizante nitrogenado serão usados anualmente no mundo todo.

[006] A eficiência de uso aumentada de nitrogênio pelas plantas deve permitir que safras sejam cultivadas com insumos fertilizantes mais baixos ou alternativamente sejam cultivadas em solos de qualidade inferior e, portanto, teria impacto econômico significante nos sistemas agrícolas tanto desenvolvidos quanto em desenvolvimento.

[007] O melhoramento genético da eficiência no uso de fertilizante (FUE) nas plantas pode ser gerado por intermédio de reprodução tradicional ou por intermédio de engenharia genética.

[008] Tentativas para gerar plantas com FUE aumentada foram descritas no Pedido de Patente dos EUA No. 20020046419 concedido a Choo et al.; Pedido de Patente dos EUA No. 20050108791 concedido a Edgerton et al.; Pedido de Patente dos EUA No. 20060179511 concedido a Chomet et al.; Good, A, et al. 2007 (Engineering nitrogen use efficiency with alanine aminotransferase. Canadian Journal of Botany 85: 252-262); e Good AG et al. 2004 (Trends Plant Sci. 9: 597-605).

[009] Yanagisawa et al. (Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004 101: 7833-8) descrevem plantas transgênicas em Dofl que exibem crescimento melhorado sob condições baixas de nitrogênio.

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[0010] A Patente dos EUA No. 6.084.153 concedida a Good et al. descreve o uso de um promotor responsivo ao estresse para controlar a expressão da Alanina Aminotransferase (AlaAT) e plantas transgênicas de canola com tolerância melhorada à seca e deficiência de nitrogênio quando comparadas com plantas de controle.

[0011] A população mundial cada vez maior e a disponibilidade cada vez menor em terras aráveis para agricultura afetam o rendimento das plantas e produtos relacionados com planta. A falta global de suprimento de água, desertificação, condições de estresse abiótico (ABS) (por exemplo, salinidade, seca, inundação, temperatura subóptima e poluição química tóxica) e/ou fontes limitadas de nitrogênio e fertilizante causam danos substancial às plantas agrícolas, tais como alterações maiores no metabolismo da planta, morte celular e diminuições no crescimento da planta e produtividade de safra.

[0012] A seca é um fenômeno gradual, que envolve períodos de tempo anormalmente secos que persistem por muito tempo para produzir sérios desequilíbrios hidrológicos tais como danos às safras, falta de suprimento de água e susceptibilidade aumentada para várias doenças.

[0013] A salinidade, altos níveis de sal, afeta um em cinco hectares de terra irrigada. Nenhuma das cinco safras alimentícias principais, isto é, trigo, milho, arroz, batatas e soja, podem tolerar sal excessivo. Efeitos nocivos do sal sobre as plantas resultam tanto do déficit de água, que leva ao estresse osmótico (similar ao estresse pela seca) e o efeito de íons sódio em excesso sobre os processos bioquímicos críticos. Como com congelamento e seca, o alto nível de sal causa déficit de água; e a alta presença de sal dificulta que as raízes da planta extraiam água do seu ambiente. Assim, a salinação de solos que são usados para a produção agrícola é um problema significante e crescente nas regiões que dependem fortemente da agricultura e é agravado pela utilização excessiva, fertilização excessiva e falta d’água, tipicamente

5 / 378 causada pela mudança climática e as demandas de crescimento populacional.

[0014] As temperaturas subótimas afetam o crescimento e desenvolvimento da planta através do ciclo de vida inteiro da planta. Assim, as temperaturas baixas reduzem a taxa de germinação e as temperaturas altas resultam em necrose de folha. Além disso, as plantas maduras que são expostas ao excesso de calor podem experienciar choque térmico, que pode surgir em diversos órgãos, incluindo folhas e particularmente frutos, quando a transpiração é insuficiente para superar o estresse térmico. O calor também danifica as estruturas celulares, incluindo organelas e citoesqueleto e prejudica a função de membrana. O choque térmico pode produzir uma diminuição na síntese global de proteínas, acompanhada pela expressão de proteínas de choque térmico, por exemplo, chaperonas, que estão envolvidas no redobramento de proteínas desnaturadas pelo calor. O dano pela alta temperatura ao pólen quase sempre ocorre em conjunção com o estresse pela seca e raramente ocorre sob condições bem irrigadas. O estresse combinado pode alterar o metabolismo da planta sob novas formas. Condições de frio excessivo, por exemplo, temperaturas baixas, porém acima do congelamento, afetam as safras de origens tropicais, tais como soja, arroz, milho e algodão. Os danos típicos do frio incluem murchamento, necrose, clorose ou vazamento de íons das membranas celulares. As condições de iluminação excessivas, que ocorrem sob condições atmosféricas claras subsequentes às noites frias do final do verão/outono, podem levar à fotoinibição da fotossíntese (interrupção da fotossíntese). Além disso, o frio pode levar a perdas de rendimento e qualidade de produto inferior através do amadurecimento atrasado do milho.

[0015] As deficiências de nutriente causam adaptações da arquitetura da raiz, particular e notavelmente por exemplo é a proliferação de raiz dentro das porções ricas em nutriente para aumentar a absorção de nutriente. As deficiências de nutriente causam também a ativação de caminhos metabólicos

6 / 378 da planta que maximizam os processos de absorção, assimilação e distribuição tais como pela ativação de mudanças arquiteturais. O engenheiramento da expressão dos genes deflagrados pode fazer com que a planta exiba as mudanças arquiteturais e metabolismo realçado também sob outras condições.

[0016] Além disso, é amplamente conhecido que as plantas usualmente respondem à deficiência de água pela criação de um sistema radicular mais profundo que permite acesso à umidade localizada em camadas de solo mais profundas. A deflagração deste efeito permitirá que as plantas acessem nutrientes e água localizados em horizontes de solo mais profundos particularmente aqueles prontamente dissolvidos em água como os nitratos.

[0017] O rendimento é afetado pelos diversos fatores, tais como o número e tamanho dos órgãos da planta, arquitetura da planta (por exemplo, o número de ramos), comprimento de conjunto de grãos, número de grãos cheios, vigor (por exemplo da muda), taxa de crescimento, desenvolvimento de raiz, utilização de água, nutrientes (por exemplo, nitrogênio) e fertilizantes e tolerância ao estresse.

[0018] As safras tais como, milho, arroz, trigo, canola e soja representam mais da metade da ingestão calórica humana total, seja através do consumo direto das próprias sementes ou através do consumo de produtos de carne criados a partir de sementes processadas ou forragem. As sementes também são uma fonte de açúcares, proteínas e óleos e metabólitos usados em processos industriais. A capacidade para aumentar o rendimento da planta, seja através do aumento da taxa de acúmulo de matéria seca, modificando a composição de celulose ou lignina, aumento da resistência do talo, ampliação do tamanho do meristema, mudança do padrão de ramificação da planta, firmeza das folhas, aumento na eficiência de fertilização, taxa de acúmulo de matéria seca na semente realçada, modificação do desenvolvimento de semente, enchimento de semente realçada ou aumentando-se o conteúdo de

7 / 378 óleo, amido ou proteína nas sementes teria muitas aplicações em usos agrícolas não agrícolas tais como na produção biotecnológica de produtos farmacêuticos, anticorpos ou vacinas.

[0019] Estudos têm mostrado que as adaptações da planta às condições ambientais adversas são traços genéticos complexos com natureza poligênica. Os meios convencionais para melhorias de safra e hortícolas utilizam técnicas de reprodução seletiva para identificar plantas tendo as características desejáveis. Entretanto, a reprodução seletiva é cansativa, consumidora de tempo e tem um resultado imprevisível. Além disso, recursos de germoplasma limitados para a melhora de rendimento e incompatibilidade nos cruzamentos entre espécies da planta distantemente relacionadas representam problemas significantes encontrados na reprodução convencional. Avanços na engenharia genética têm permitido que a humanidade modifique o germoplasma das plantas pela expressão de genes de interesse em plantas. Uma tal tecnologia tem a capacidade para gerar safras ou plantas com traços econômicos, agronômicos ou hortícolas.

[0020] A publicação WO No. 2009/013750 descreve genes, construtos e métodos de aumentar a tolerância ao estresse abiótico, biomassa e/ou rendimento em plantas deste modo geradas.

[0021] A publicação WO No. 2008/122980 descreve genes construtos e métodos para aumentar o conteúdo de óleo, a taxa de crescimento e a biomassa vegetal.

[0022] A publicação WO No. 2008/075364 descreve polinucleotídeos envolvidos no desenvolvimento de fibra vegetal e métodos para usar os mesmos.

[0023] A publicação WO No. 2007/049275 descreve polipeptídeos isolados, polinucleotídeos codificando os mesmos, plantas transgênicas expressando os mesmos e métodos para usar os mesmos para aumentar a eficiência no uso de fertilizante, tolerância ao estresse abiótico e biomassa

8 / 378 vegetal.

[0024] A publicação WO No. 2004/104162 descreve métodos de aumentar a tolerância ao estresse abiótico e/ou biomassa em plantas e plantas deste modo geradas.

[0025] A publicação WO No. 2005/121364 descreve polinucleotídeos e polipeptídeos envolvidos no desenvolvimento de fibra vegetal e métodos para usar os mesmos para melhorar a qualidade da fibra, rendimento e/ou biomassa de uma planta produtora de fibra.

[0026] A publicação WO No. 2007/020638 descreve métodos de aumentar a tolerância ao estresse abiótico e/ou biomassa em plantas e plantas deste modo geradas.

[0027] A publicação WO No. 2009/083958 descreve métodos de aumentar a eficiência no uso de água, eficiência no uso de fertilizante, tolerância ao estresse biótico/abiótico, rendimento e biomassa na planta e plantas deste modo geradas.

[0028] A publicação WO No. 2010/020941 descreve métodos de aumentar a eficiência no uso de nitrogênio, tolerância ao estresse abiótico, rendimento e biomassa em plantas e plantas deste modo geradas.

[0029] A publicação WO No. 2009/141824 descreve polinucleotídeos isolados e métodos usando os mesmos para aumentar a utilidade da planta.

[0030] A publicação WO No. 2010/076756 descreve polinucleotídeos isolados para aumentar a tolerância ao estresse abiótico, rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra e/ou eficiência no uso de nitrogênio de uma planta.

[0031] A publicação WO No. 2004/081173 descreve novas sequências reguladoras e construtos derivados da planta e métodos para usar tais sequências para direcionar a expressão de sequências de polinucleotídeo exógenas em plantas.

[0032] A publicação WO No. 2010/049897 descreve polinucleotídeos

9 / 378 e polipeptídeos isolados e métodos para usar os mesmos para aumentar o rendimento da planta, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, tolerância ao estresse abiótico das plantas e eficiência no uso de nitrogênio.

[0033] A publicação WO No. 2004/111183 descreve sequências de nucleotídeo para regular a expressão de gene em tricomas e construtos vegetais e métodos utilizando os mesmos.

[0034] A publicação WO No. 2011/080674 descreve polinucleotídeos e polipeptídeos isolados e métodos para usar os mesmos para aumentar o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo da planta, tolerância ao estresse abiótico e eficiência no uso de nitrogênio das plantas.

[0035] A publicação W02010/100595 descreve polinucleotídeos e polipeptídeos isolados e métodos para usar os mesmos para aumentar o rendimento e/ou características agrícolas da planta.

[0036] A publicação WO2011/015985 descreve polinucleotídeos e polipeptídeos para aumentar as qualidades desejáveis da planta.

[0037] A publicação WO2010/143138 descreve polinucleotídeos e polipeptídeos isolados e métodos para usar os mesmos para aumentar a eficiência no uso de nitrogênio, eficiência no uso de fertilizante, rendimento, taxa de crescimento, vigor, biomassa, conteúdo de óleo, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de água.

SUMÁRIO DA INVENÇÃO

[0038] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da presente invenção é provido um método para aumentar o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos codificando um polipeptídeo pelo menos 80% idêntico às SEQ ID NOs: 456- 774, 8385-8643, 8645-10650, 10652-10836, 10838-12575, 12577, 12579-

10 / 378 12583, 12585, 12586, 12590, 12591, 12593-12615, 12617-12624, 12628- 12637, 12639-12659, 12662-12666, 12668-12677, 12679-12681, 12683- 12695, 12697-12705, 12707-12709, 12711-12717, 12719-12727, 12729- 12755, 12757-12811, 12813, 12815-12817, 12819-12825, 12827-12840, 12847-12848, 12850, 12853, 12855-12859, 12861-12884, 12886, 12887, 12893, 12895, 12896, 12898-12902, 12904-12912, 12916-12926, 12930- 12937, 12940-12942, 12945-12954, 12956-12962, 12965-12967, 12969- 12977, 12979-12984, 12986-12992, 12994, 12999-13001, 13003, 13006- 13010, 13012-13016, 13018-13019, 13021-13029, 13031-13049, 13051- 13054, 13056-13063, 13065-13066, 13068-13070, 13073-13076, 13079- 13084, 13086-14461 ou 14462, aumentando deste modo o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio da planta.

[0039] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da presente invenção é provido um método para aumentar o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos codificando um polipeptídeo selecionado do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 456-774, 8385-10836, 10838-14461 e 14462, aumentando desse modo o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio da planta.

[0040] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da presente invenção é provido um método para aumentar o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de

11 / 378 nitrogênio de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos pelo menos 80% idêntica às SEQ ID NOs: 1-455, 775-6485, 64876657, 6660- 6664, 6666-6701, 6703-6745, 6748-6818, 6820-6821, 6824-6827, 68296881, 6883, 6885-8383 ou 8384, aumentando desse modo o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio da planta.

[0041] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da presente invenção é provido um método para aumentar o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo a sequência de ácidos nucléicos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 1-455, 7758383 e 8384, aumentando desse modo o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio da planta.

[0042] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da presente invenção é provido um método para aumentar a eficiência no uso de nitrogênio e/ou conteúdo de óleo de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos codificando um polipeptídeo pelo menos 80% idêntico à SEQ ID NO: 10837, aumentando desse modo a eficiência no uso de nitrogênio e/ou conteúdo de óleo da planta.

[0043] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da presente invenção é provido um método para aumentar a eficiência no uso de nitrogênio e/ou conteúdo de óleo de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência

12 / 378 de ácidos nucléicos codificando o polipeptídeo apresentado na SEQ ID NO: 10837, aumentando desse modo a eficiência no uso de nitrogênio e/ou conteúdo de óleo da planta.

[0044] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da presente invenção é provido um polinucleotídeo isolado compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos codificando um polipeptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos pelo menos 80% homóloga à sequência de aminoácidos apresentada nas SEQ ID NOs: 456-774, 8385-8643, 8645- 10650, 10652-10836, 10838-12575, 12577, 12579-12583, 12585, 12586, 12590, 12591, 12593-12615, 12617-12624, 12628-12637, 12639-12659, 12662-12666, 12668-12677, 12679-12681, 12683-12695, 12697-12705, 12707-12709, 12711-12717, 12719-12727, 12729-12755, 12757-12811, 12813, 12815-12817, 12819-12825, 12827-12840, 12847-12848, 12850, 12853, 12855-12859, 12861-12884, 12886, 12887, 12893, 12895, 12896, 12898-12902, 12904-12912, 12916-12926, 12930-12937, 12940-12942, 12945-12954, 12956-12962, 12965-12967, 12969-12977, 12979-12984, 12986-12992, 12994, 12999-13001, 13003, 13006-13010, 13012-13016, 13018-13019, 13021-13029, 13031-13049, 13051-13054, 13056-13063, 13065-13066, 13068-13070, 13073-13076, 13079-13084, 13086-14461 ou 14462, em que a sequência de aminoácidos é capaz de aumentar o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio de uma planta.

[0045] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da presente invenção é provido um polinucleotídeo isolado compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos codificando um polipeptídeo que compreende a sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 456-774, 8385-10836, 10838-14461 e 14462.

[0046] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da

13 / 378 presente invenção é provido um polinucleotídeo isolado compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos pelo menos 80% idêntica às SEQ ID NOs: 1- 455, 775-6485, 6487-6657, 6660-6664, 6666-6701, 67036745, 6748-6818, 6820-6821, 6824-6827, 6829-6881, 6883, 6885-8383 ou 8384, em que a sequência de ácidos nucléicos é capaz de aumentar o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio de uma planta.

[0047] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da presente invenção é provido um polinucleotídeo isolado compreendendo a sequência de ácidos nucléicos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 1-455, 775-8383 e 8384.

[0048] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da presente invenção é provido um construto de ácido nucléico compreendendo o polinucleotídeo isolado de algumas modalidades da invenção e um promotor para direcionar a transcrição da sequência de ácidos nucléicos em uma célula hospedeira.

[0049] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da presente invenção é provido um polipeptídeo isolado compreendendo uma sequência de aminoácidos pelo menos 80% homóloga às SEQ ID NOs: 456- 774, 8385-8643, 8645-10650, 10652-10836, 10838-12575, 12577, 12579- 12583, 12585, 12586, 12590, 12591, 12593-12615, 12617-12624, 12628- 12637, 12639-12659, 12662-12666, 12668-12677, 12679-12681, 12683- 12695, 12697-12705, 12707-12709, 12711-12717, 12719-12727, 12729- 12755, 12757-12811, 12813, 12815-12817, 12819-12825, 12827-12840, 12847-12848, 12850, 12853, 12855-12859, 12861-12884, 12886, 12887, 12893, 12895, 12896, 12898-12902, 12904-12912, 12916-12926, 12930- 12937, 12940-12942, 12945-12954, 12956-12962, 12965-12967, 12969- 12977, 12979-12984, 12986-12992, 12994, 12999-13001, 13003, 13006-

14 / 378 13010, 13012-13016, 13018-13019, 13021-13029, 13031-13049, 13051- 13054, 13056-13063, 13065-13066, 13068-13070, 13073-13076, 13079- 13084, 13086-14461 ou 14462, em que a sequência de aminoácidos é capaz de aumentar o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio de uma planta.

[0050] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da presente invenção é provido um polipeptídeo isolado compreendendo a sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 456-774, 8385-10836 e 10838-14462.

[0051] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da presente invenção é provida uma célula vegetal exogenamente expressando o polinucleotídeo de algumas modalidades da invenção ou o construto de ácido nucléico de algumas modalidades da invenção.

[0052] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da presente invenção é provida uma célula vegetal exogenamente expressando o polipeptídeo de algumas modalidades da invenção.

[0053] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da presente invenção é provida uma planta transgênica compreendendo o construto de ácido nucléico de algumas modalidades da invenção.

[0054] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da presente invenção é provido um método para gerar uma planta transgênica, compreendendo expressar o construto de ácido nucléico de algumas modalidades da invenção dentro da planta, gerando deste modo a planta transgênica.

[0055] De acordo com algumas modalidades da invenção, a sequência de ácidos nucléicos codifica uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 456-774, 8385-10836 e 10838-14462.

[0056] De acordo com algumas modalidades da invenção, a sequência

15 / 378 de ácidos nucléicos é selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 1- 455 e 775-8384.

[0057] De acordo com algumas modalidades da invenção, o polinucleotídeo consiste da sequência de ácidos nucléicos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 1-455 e 775-8384.

[0058] De acordo com algumas modalidades da invenção, a sequência de ácidos nucléicos codifica a sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 456-774, 8385-10836 e 10838-14462.

[0059] De acordo com algumas modalidades da invenção, a célula vegetal forma parte de uma planta.

[0060] De acordo com algumas modalidades da invenção, o método compreende adicionalmente cultivar a planta expressando o polinucleotídeo exógeno sob a(s) condição(ões) de estresse abiótico.

[0061] De acordo com algumas modalidades da invenção, o método compreende adicionalmente cultivar a planta expressando o polinucleotídeo exógeno sob a(s) condição(ões) limitante(s) de nitrogênio.

[0062] De acordo com algumas modalidades da invenção, o estresse abiótico é selecionado do grupo consistindo de salinidade, seca, privação de água, inundação, etiolação, temperatura baixa, temperatura alta, toxidez de metal pesado, anaerobiose, deficiência de nutriente, excesso de nutriente, poluição atmosférica e irradiação UV.

[0063] De acordo com algumas modalidades da invenção, o rendimento compreende rendimento de semente ou rendimento de óleo.

[0064] De acordo com algumas modalidades da invenção, o promotor é heterólogo para o polinucleotídeo isolado e/ou para a célula hospedeira.

[0065] De acordo com algumas modalidades da invenção, o método compreende adicionalmente cultivar a planta expressando o polinucleotídeo exógeno sob condições limitantes de nitrogênio.

[0066] A menos que de outro modo definido, todos os termos técnicos

16 / 378 e/ou científicos aqui usados têm os mesmos significados como habitualmente entendido por uma pessoa versada na técnica à qual a invenção pertence. Embora métodos e materiais similares ou equivalentes daqueles aqui descritos possam ser usados na prática ou teste de modalidades da invenção, métodos e/ou materiais exemplares são descritos abaixo. No caso de conflito, o relatório descritivo de patente, incluindo as definições, controlarão. Além disso, os materiais, métodos e exemplos são apenas ilustrativos e não são intencionados ser necessariamente limitantes.

BREVE DESCRIÇÃO DOS DESENHOS

[0067] Algumas modalidades da invenção são aqui descritas, apenas por via de exemplo, com referência aos desenhos anexos. Com referência específica agora aos desenhos em detalhes, é enfatizado que os particulares mostrados são por via de exemplo e para os propósitos de debate ilustrativo das modalidades da invenção. A este respeito, a descrição considerada com os desenhos torna evidente para aqueles versados na técnica como as modalidades da invenção podem ser praticadas.

[0068] Nos desenhos: a Figura 1 é uma ilustração esquemática do plasmídeo binário pGI modificado contendo o novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467) e o GUSintron (pQYN 6669) usado para expressar as sequências de polinucleotídeos isoladas da invenção. RB - T-DNA borda direita; LB - T- DNA borda esquerda; MCS — Sítio de clonagem múltipla; RE — qualquer enzima de restrição; NOS pro = promotor da nopalina sintase; NPT-II = gene da neomicina fosfotransferase; NOS ter = terminador da nopalina sintase; Sinal poli-A (sinal de poliadenilação); GUSintron — o gene repórter GUS (sequência codificadora e intron). As sequências de polinucleotídeos isoladas da invenção foram clonadas dentro do vetor ao substituir o gene repórter GUSintron.

[0069] A Figura 2 é uma ilustração esquemática do plasmídeo binário

17 / 378 pGI modificado contendo o novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467) (pQFN ou pQFNc) usado para expressar as sequências de polinucleotídeos isoladas da invenção. RB - T-DNA borda direita; LB T-DNA borda esquerda; MCS — Sítio de clonagem múltipla; RE — qualquer enzima de restrição; NOS pro = promotor da nopalina sintase; NPT-II = gene da neomicina fosfotransferase; NOS ter = terminador da nopalina sintase; Sinal poli-A (sinal de poliadenilação); As sequências de polinucleotídeos isoladas da invenção foram clonadas dentro do MCS do vetor.

[0070] As Figuras 3A-F são imagens representando a visualização do desenvolvimento de raiz de plantas transgênicas exogenamente expressando o polinucleotídeo de algumas modalidades da invenção quando cultivadas em placas de ágar transparentes sob condições normais (Figuras 3A-B), de estresse osmótico (15% de PEG; Figuras 3C-D) ou limitadas em nitrogênio (Figuras 3E-F). Os transgenes diferentes foram cultivados em placas de ágar transparentes durante 17 dias (7 dias na estufa e 10 dias depois do transplante). As placas foram fotografadas a cada 3 a 4 dias começando no dia 1 depois do transplante. Figura 3A — Uma imagem de uma fotografia das plantas tiradas a seguir de 10 dias depois do transplante nas placas de ágar quando cultivadas sob condições normais (padrão). Figura 3B — Uma imagem de análise de raiz das plantas mostradas na Figura 3A na qual os comprimentos das raízes medidas são representados pelas setas. Figura 3C — Uma imagem de uma fotografia das plantas tirada a seguir de 10 dias depois do transplante sobre placas de ágar, cultivadas sob altas condições osmóticas (PEG 15%). Figura 3D — Uma imagem da análise de raiz das plantas mostradas na Figura 3C na qual os comprimentos das raízes medidas são representados pelas setas. Figura 3E — Uma imagem de uma fotografia das plantas tiradas a seguir de 10 dias depois do transplante sobre placas de ágar, cultivadas sob condições de nitrogênio baixo. Figura 3F — Uma imagem da análise de raiz das plantas mostradas na Figura 3E na qual os comprimentos

18 / 378 das raízes medidas são representados pelas setas.

[0071] A Figura 4 é uma ilustração esquemática do plasmídeo binário pGI modificado contendo o Promotor de Raiz (pQNa RP) usado para expressar as sequências de polinucleotídeos isoladas da invenção. RB - T- DNA borda direita; LB - T-DNA borda esquerda; NOS pro = promotor da nopalina sintase; NPT-II = gene da neomicina fosfotransferase; NOS ter = terminador da nopalina sintase; Sinal poli-A (sinal de poliadenilação); As sequências de polinucleotídeos isoladas de acordo com algumas modalidades da invenção foram clonadas dentro do MCS (Sítio de clonagem múltipla) do vetor.

[0072] A Figura 5 é uma ilustração esquemática do plasmídeo pQYN.

[0073] A Figura 6 é uma ilustração esquemática do plasmídeo pQFN.

[0074] A Figura 7 é uma ilustração esquemática do plasmídeo pQFYN.

[0075] A Figura 8 é uma ilustração esquemática do plasmídeo binário pGI modificado (pQXNc) usado para expressar as sequências de polinucleotídeos isoladas de algumas modalidades da invenção. RB - T-DNA borda direita; LB - T-DNA borda esquerda; NOS pro = promotor da nopalina sintase; NPT-II = gene da neomicina fosfotransferase; NOS ter = terminador da nopalina sintase; RE = qualquer enzima de restrição; Sinal poli-A (sinal de poliadenilação); 35S — o promotor 35S (SEQ ID NO: 14463). As sequências de polinucleotídeos isoladas de algumas modalidades da invenção foram clonadas dentro do MCS (Sítio de clonagem múltipla) do vetor.

DESCRIÇÃO DE MODALIDADES ESPECÍFICAS DA INVENÇÃO

[0076] A presente invenção, em algumas modalidades da mesma, se refere a polinucleotídeos e polipeptídeos isolados, construtos de ácido nucléico codificando os mesmos, células expressando os mesmos, plantas transgênicas expressando os mesmos e métodos para usar os mesmos para aumentar rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo,

19 / 378 rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio de uma planta.

[0077] Antes de explicar pelo menos uma modalidade da invenção em detalhes, deve ser entendido que a invenção não é necessariamente limitada neste documento aos detalhes apresentados na seguinte descrição ou exemplificados pelos Exemplos. A invenção é capaz de outras modalidades ou de ser praticada ou realizada em diversos modos.

[0078] Os presentes inventores identificaram novos polipeptídeos e polinucleotídeos que podem ser usados para aumentar o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de fertilizante (por exemplo, eficiência no uso de nitrogênio) de uma planta.

[0079] Assim, como mostrado na seção de Exemplos que segue, os presentes inventores utilizaram ferramentas de bioinformática para identificar polinucleotídeos que realçassem o rendimento (por exemplo, rendimento de semente, rendimento de óleo, conteúdo de óleo), taxa de crescimento, biomassa, vigor, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio) de uma planta. Genes que afetam os traços de interesse foram identificados [Tabela 53, Exemplo 12, SEQ ID NOs: 1-455 (polinucleotídeos) e SEQ ID NOs: 456-774 (polipeptídeos)] com base na análise de correlação realizada usando ecotipos de Arabidopsis (Exemplos 2 e 3), variedades de tomate (Exemplo 4), ecotipos B. juncea (Exemplos 5 e 6), variedades de Sorgo (Exemplo 7), híbridos de Milho (Exemplo 8), variedades de Soja (Exemplo 9), acessos de Cevada (Exemplo 10) e espécies de Algodão (Exemplos 11) e os perfis de expressão dos genes de acordo com os conjuntos de expressão selecionados (por exemplo, tecidos, estágios desenvolvimentais e condições de estresse) (Tabelas 1-53, Exemplos 1-12). Os polipeptídeos e polinucleotídeos homólogos tendo a mesma função também foram identificados [Tabela 54,

20 / 378 Exemplo 13; SEQ ID NOs: 775-8384 (polinucleotídeos) e SEQ ID NOs: 8385-14462 (polipeptídeos)]. Os polinucleotídeos identificados foram clonados dentro de vetores binários (Exemplo 14) e plantas transgênicas superexpressando os polinucleotídeos e polipeptídeos identificados foram geradas (Exemplo 15) e adicionalmente avaliados quanto ao efeito do gene exógeno sobre o traço de interesse (por exemplo, peso fresco e seco aumentado, área da folha, cobertura e comprimento da raiz, taxa de crescimento relativa (RGR) da área de folha, RGR da cobertura da raiz, RGR do comprimento da raiz, rendimento de semente, rendimento de óleo, matéria seca, índice de colheita, taxa de crescimento, área da roseta, diâmetro da roseta, RGR do número de folha, RGR da cobertura do lote, RGR do diâmetro da roseta, área da lâmina da folha, porcentagem de óleo na semente e peso de 1000 sementes, cobertura do lote, tolerância às condições de estresse abiótico e às condições limitantes de fertilizante; Os exemplos 16- 18). Todos juntos, estes resultados sugerem o uso dos novos polinucleotídeos e polipeptídeos da invenção para aumentar o rendimento (incluindo rendimento de óleo, rendimento de semente e conteúdo de óleo), taxa de crescimento, biomassa, vigor, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio de uma planta.

[0080] Assim, de acordo com um aspecto de algumas modalidades da invenção, é provido método para aumentar o rendimento, taxa de crescimento, biomassa, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, eficiência no uso de fertilizante (por exemplo, eficiência no uso de nitrogênio) e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos codificando um polipeptídeo pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca

21 / 378 de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99% ou mais digamos 100% homóloga à sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 456-774, 8385-8643, 8645-10650, 10652- 10836, 10838-12575, 12577, 12579-12583, 12585, 12586, 12590, 12591, 12593-12615, 12617-12624, 12628-12637, 12639-12659, 12662-12666, 12668-12677, 12679-12681, 12683-12695, 12697-12705, 12707-12709, 12711-12717, 12719-12727, 12729-12755, 12757-12811, 12813, 12815- 12817, 1281912825, 12827-12840, 12847-12848, 12850, 12853, 12855- 12859, 12861-12884, 12886, 12887, 12893, 12895, 12896, 12898-12902, 12904-12912, 12916-12926, 12930-12937, 12940-12942, 12945-12954, 12956-12962, 12965-12967, 12969-12977, 12979-12984, 12986-12992, 12994, 12999-13001, 13003, 13006-13010, 13012-13016, 13018-13019, 13021-13029, 13031-13049, 13051-13054, 13056-13063, 13065-13066, 13068-13070, 13073-13076, 13079-13084, 13086-14461 e 14462, aumentando desse modo o rendimento, taxa de crescimento, biomassa, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, eficiência no uso de fertilizante (por exemplo, eficiência no uso de nitrogênio) e/ou tolerância ao estresse abiótico da planta.

[0081] Como aqui usada, a frase “rendimento da planta” se refere à quantidade (por exemplo, como determinada pelo peso ou tamanho) ou quantidade (números) de tecidos ou órgãos produzidos por planta ou por período vegetativo. Consequentemente, o rendimento aumentado afetaria o benefício econômico que se poderia obter da planta em uma certa área de cultivo e/ou tempo de cultivo.

[0082] Deve ser mencionado que um rendimento da planta pode ser

22 / 378 afetado por diversos parâmetros incluindo, mas não limitados à biomassa vegetal; vigor da planta; taxa de crescimento; rendimento de semente; quantidade de semente ou grão; qualidade de semente ou grão; rendimento de óleo; conteúdo de óleo, amido e/ou proteína nos órgãos colhidos (por exemplo, sementes ou partes vegetativas da planta); número de flores (flósculos) por panículo (expresso como uma razão de número de sementes cheias em relação ao número de panículos primários); índice de colheita; número de plantas cultivadas por área; número e tamanho de órgãos colhidos por planta e por área; número de plantas por área cultivada (densidade); número de órgãos colhidos no campo; área total da folha; assimilação de carbono e particionamento de carbono (a distribuição/localização de carbono dentro da planta); resistência ao sombreamento; número de órgãos colhíveis (por exemplo sementes), sementes por vagem, peso por semente; e arquitetura modificada [tal como diâmetro de talo aumentado, espessura ou melhora de propriedades físicas (por exemplo elasticidade)].

[0083] Como aqui usada, a frase “rendimento de semente” se refere ao número ou peso das sementes por planta, sementes por vagem ou por área cultivada ou ao peso de uma única semente ou ao óleo extraído por semente. Consequentemente, o rendimento de semente pode ser afetado pelas dimensões de semente (por exemplo, comprimento, largura, perímetro, área e/ou volume), número de sementes (cheias) e taxa de enchimento de semente e pelo conteúdo de óleo da semente. Consequentemente, aumentar o rendimento de semente por planta afetaria o benefício econômico que se pode obter a partir da planta em uma certa área de cultivo e/ou tempo de cultivo; e o aumento do rendimento de semente por área cultivada seria obtido aumentando-se o rendimento de semente por planta e/ou aumentando-se o número de plantas cultivadas na mesma área dada.

[0084] O termo “semente” (também aludido como “grão” ou “caroço”) como aqui usado se refere a uma planta embrionária pequena

23 / 378 incluída em uma cobertura chamada de revestimento de semente (usualmente com algum alimento armazenado), o produto do óvulo maduro das plantas gimnospérmicas e angiospérmicas que ocorre depois da fertilização e algum crescimento dentro da planta mãe.

[0085] A frase “conteúdo de óleo” como aqui usado se refere à quantidade de lipídeos em um dado órgão de planta, nas sementes (conteúdo de óleo da semente) ou na porção vegetativa da planta (conteúdo de óleo vegetativo) e é tipicamente expressa como porcentagem de peso seco (10% de umidade de sementes) ou peso úmido (para a porção vegetativa).

[0086] Deve ser mencionado que o conteúdo de óleo é afetado pela produção de óleo intrínseca de um tecido (por exemplo, semente, porção vegetativa), assim como a massa ou tamanho do tecido produtor de óleo por planta ou por período de crescimento.

[0087] Em uma modalidade, o aumento no conteúdo de óleo da planta pode ser obtido aumentando-se o tamanho/massa de um tecido(s) da planta que compreenda o óleo por período de crescimento.

[0088] Assim, o conteúdo de óleo aumentado de uma planta pode ser obtido aumentando-se o rendimento, taxa de crescimento, biomassa e vigor da planta.

[0089] Como aqui usada, a frase “biomassa vegetal” se refere à quantidade (por exemplo, medida em gramas de tecido seco ao ar) de um tecido produzido a partir da planta em um período vegetativo, que também determinaria ou afetaria o rendimento da planta ou o rendimento por área cultivada. Um aumento na biomassa vegetal pode ser na planta inteira ou em partes da mesma, tais como partes acima do solo (colhíveis), biomassa vegetativa, raízes e sementes.

[0090] Como aqui usada, a frase “taxa de crescimento” se refere no tamanho do órgão/tecido da planta por tempo (pode ser medido em cm2 por dia).

24 / 378

[0091] Como aqui usada, a frase “vigor da planta” se refere à quantidade (medida em peso) de tecido produzido pela planta em um dado tempo. Consequentemente, o vigor aumentado determinaria ou afetaria o rendimento da planta ou o rendimento por tempo de cultivo ou área de cultivo. Além disso, o vigor inicial (semente e/ou muda) resulta em posicionamento em campo melhorado.

[0092] Melhorar o vigor inicial é um objetivo importante dos programas modernos de reprodução de arroz tanto nos cultivares de arroz temperados quanto nos tropicais. As raízes longas são importantes para a ancoragem apropriada no solo em arroz semeado na água. Onde o arroz é semeado diretamente em campos inundados e onde as plantas devem emergir rapidamente através da água, brotos mais longos estão associados com vigor. Onde semeadura em fileira é praticada, mesocótilos e coleóptilos mais longos são importantes para boa emergência de muda. A capacidade para engenheirar vigor inicial nas plantas seria de enorme importância na agricultura. Por exemplo, vigor inicial insuficiente tem sido uma limitação para a introdução de híbridos de milho (Zea mays L.) à base de germoplasma do Cinturão do Milho no Atlântico Europeu.

[0093] Deve ser mencionado que um rendimento da planta pode ser determinado sob estresse (por exemplo, estresse abiótico, condições limitantes de nitrogênio) e/ou condições não estressantes (normais).

[0094] Como aqui usada, a frase “condições não estressantes” se refere às condições de cultivo (por exemplo, água, temperatura, ciclos de luz- escuro, umidade, concentração salina, concentração de fertilizante no solo, suprimento de nutrientes tais como nitrogênio, fósforo e/ou potássio), que significantemente não vai além das condições climáticas e outras abióticas cotidianas que as plantas podem encontrar e que permitem o crescimento, metabolismo, reprodução e/ou viabilidade ótimas de uma planta em qualquer estágio no seu ciclo de vida (por exemplo, em uma planta de safra a partir de

25 / 378 semente até uma planta madura e de volta para semente outra vez). As pessoas versadas na técnica estão cientes das condições normais de solo e condições climáticas para uma dada planta em uma dada localização geográfica. Deve ser mencionado que embora as condições não estressantes possam incluir algumas variações brandas das condições ótimas (que variam de um tipo/espécie de uma planta para outra), tais variações não fazem com que a planta pare de crescer sem a capacidade para retomar o crescimento.

[0095] A frase “estresse abiótico” como aqui usada se refere a qualquer efeito adverso sobre o metabolismo, crescimento, reprodução e/ou viabilidade de uma planta. Consequentemente, o estresse abiótico pode ser induzido pelas condições ambientais subótima de cultivo tal como, por exemplo, salinidade, privação de água, inundação, congelamento, temperaturas baixas ou altas, toxidez de metal pesado, anaerobiose, deficiência de nutriente, poluição atmosférica ou irradiação UV. As implicações de estresse abiótico são debatidas na seção Fundamentos.

[0096] A frase “tolerância ao estresse abiótico” como aqui usada se refere à capacidade de uma planta para suportar um estresse abiótico sem sofrer uma alteração substancial no metabolismo, crescimento, produtividade e/ou viabilidade.

[0097] As plantas são submetidas a uma faixa de desafios ambientais. Diversos destes, incluindo estresse salino, estresse osmótico geral, estresse pela seca e estresse no congelamento, têm a capacidade para impactar a planta inteira e a disponibilidade de água celular. Não surpreendentemente, depois, as respostas da planta a esta coleção de estresses são relacionadas. Zhu (2002) Ann. Rev. Plant Biol. 53: 247-273 et al. Observe que “a maioria dos estudos sobre a sinalização de estresse aquoso focalizou no estresse salino primariamente porque as respostas da planta ao sal e à seca são intimamente relacionadas e os mecanismos se sobrepõem”. Muitos exemplos de respostas e caminhos similares a este conjunto de estresses foram documentados. Por

26 / 378 exemplo, os fatores de transcrição CBF foram mostrados condicionar a resistência ao sal, congelamento e seca (Kasuga et al. (1999) Nature Biotech. 17: 287-291). O gene rd29B de Arabidopsis é induzido na resposta tanto ao estresse salino quanto ao de desidratação, um processo que é mediado amplamente através de um processo de transdução de sinal ABA (Uno et al. (2000) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 97: 11632-11637), resultando em atividade alterada de fatores de transcrição que se ligam a um elemento a montante dentro do promotor rd29B. Na Mesembryanthemum crystallinum (planta de gelo), Patharker e Cushman mostraram que uma cinase de proteína dependente de cálcio (McCDPK1) é induzida pela exposição aos estresses tanto de seca quanto sal (Patharker e Cushman (2000) Plant J. 24: 679-691). A cinase induzida por estresse também foi mostrada fosforilar um fator de transcrição, presumivelmente alterando a sua atividade, embora os níveis de transcrito do fator de transcrição alvo não sejam alterados em resposta ao estresse por sal ou pela seca. Similarmente, Saijo et al. demonstraram que uma cinase de proteína dependente de calmodulina induzida por sal/seca do arroz (OsCDPK7) conferiu tolerância aumentada a sal e seca para o arroz quando superexpressa (Saijo et al. (2000) Plant J. 23: 319-327).

[0098] A exposição à desidratação invoca estratégias de sobrevivência similares em plantas tal como o estresse por congelamento (ver, por exemplo, Yelenosky (1989) Plant Physiol 89: 444-451) e o estresse pela seca induz tolerância ao congelamento (ver, por exemplo, Siminovitch et al. (1982) Plant Physiol 69: 250-255; e Guy et al. (1992) Plant 188: 265-270). Além da indução de proteínas de aclimatização ao frio, estratégias que permitem que as plantas sobrevivam em baixas condições de água podem incluir, por exemplo, área de superfície reduzida ou produção superficial de óleo ou cera. Em um outro exemplo o conteúdo de soluto aumentado da planta impede a evaporação e a perda de água devido ao calor, seca, salinidade, osmótica e semelhantes provendo, portanto, uma melhor tolerância da planta aos

27 / 378 estresses acima.

[0099] Será avaliado que alguns caminhos envolvidos na resistência a um estresse (como descrito acima), também estarão envolvidos na resistência a outros estresses, regulados pelos mesmos genes ou homólogos. Naturalmente, os caminhos de resistência globais são relacionados, não idênticos e, portanto, nem todos os genes controlando a resistência para um estresse controlarão a resistência para os outros estresses. Não obstante, se um gene condiciona a resistência para um destes estresses, estaria evidente para uma pessoa versada na técnica testar quanto à resistência a estes estresses relacionados. Métodos de avaliar a resistência a estresse são adicionalmente providos na seção de Exemplos que segue.

[00100] Como aqui usada, a frase “a eficiência no uso de água (WUE)” se refere ao nível de matéria orgânica produzida por unidade de água consumida pela planta, isto é, o peso seco de uma planta em relação ao uso de água pela planta, por exemplo, a biomassa produzida por transpiração unitária.

[00101] Como aqui usada, a frase “eficiência no uso de fertilizante” se refere ao(s) processo(s) metabólico(s) que leva(m) a um aumento no rendimento, biomassa, vigor e taxa de crescimento da planta por unidade de fertilizante aplicada. O processo metabólico pode ser a captação, espalhamento, absorção, acúmulo, relocação (dentro da planta) e uso de um ou mais dos minerais e porções orgânicas absorvidas pela planta, tais como nitrogênio, fosfatos e/ou potássio.

[00102] Como aqui usada, a frase “condições limitantes de fertilizante” se refere às condições de cultivo que incluem um nível (por exemplo, concentração) de um fertilizante aplicado que esteja abaixo do nível necessário para o metabolismo, crescimento, reprodução e/ou viabilidade normais da planta.

[00103] Como aqui usada, a frase “eficiência no uso de nitrogênio

28 / 378 (NUE)” se refere ao(s) processo(s) metabólico(s) que leva(m) a um aumento no rendimento, biomassa, vigor e taxa de crescimento da planta por unidade de nitrogênio aplicada. O processo metabólico pode ser a captação, espalhamento, absorção, acúmulo, relocação (dentro da planta) e uso de nitrogênio absorvido pela planta.

[00104] Como aqui usada, a frase “condições limitantes de nitrogênio” se refere às condições de cultivo que incluem um nível (por exemplo, concentração) de nitrogênio (por exemplo, amônio ou nitrato) aplicado que esteja abaixo do nível necessário para o metabolismo, crescimento, reprodução e/ou viabilidade normais da planta.

[00105] A NUE e FUE melhoradas da planta são traduzidas no campo em quantidades similares colhidas de rendimento, enquanto implementa menos fertilizantes ou rendimentos aumentados ganhos pela implementação dos mesmos níveis de fertilizantes. Assim, NUE ou FUE melhoradas tem um efeito direto sobre o rendimento da planta no campo. Assim, os polinucleotídeos e polipeptídeos de algumas modalidades da invenção positivamente afetam o rendimento da planta, rendimento de semente e biomassa vegetal. Além disso, o benefício da NUE melhorada da planta certamente melhorará a qualidade da safra e constituintes bioquímicos da semente tais como rendimento de proteína e rendimento de óleo.

[00106] Deve ser mencionado que o ABST melhorado conferirá plantas com vigor melhorado também sob condições não estressantes, resultando em safras tendo biomassa e/ou rendimento melhorados por exemplo, fibras alongadas para a indústria do algodão, conteúdo de óleo mais alto.

[00107] O termo “fibra” é usualmente inclusivo de células condutoras de parede fina tais como vasos e traqueídeos e para agregados fibrilares de muitas células fibrosas individuais. Consequentemente, o termo “fibra” se refere a (a) células condutoras e não condutoras de parede fina do xilema; (b)

29 / 378 fibras de origem extraxilar, incluindo aquelas de floema, casca, tecido do solo e epiderme; e (c) fibras de talos, folhas, raízes, sementes e flores ou inflorescências (tais como aquelas de Sorghum vulgare usado na fabricação de escovas e vassouras).

[00108] O exemplo de plantas produtoras de fibra, incluem, mas não são limitadas às safras agrícolas tais como algodão, samaúma (Kapok, Ceiba pentandra), salgueiro do deserto, arbusto de creosota, winterfat, balsa, kenaf, roselle, juta, sisal, abacá, linho, milho, cana de açúcar, cânhamo, rami, paina, fibra de coco, bambu, musgo espanhol e Agave spp. (por exemplo, sisal).

[00109] Como aqui usada, a frase “qualidade da fibra” se refere a pelo menos um parâmetro da fibra que seja agricolamente desejado ou requerido na indústria de fibra (adicionalmente descrito abaixo). Os exemplos de tais parâmetros, incluem, mas não são limitados ao comprimento da fibra, resistência da fibra, bom estado da fibra, peso da fibra por comprimento unitário, razão de maturidade e uniformidade (adicionalmente descrito abaixo).

[00110] A qualidade da fibra de algodão (lint) é tipicamente medida de acordo com o comprimento, resistência e finura da fibra. Consequentemente, a qualidade do lint é considerada superior quando a fibra é mais longa, mais forte e mais fina.

[00111] Como aqui usada, a frase “rendimento de fibra” se refere ao total ou quantidade de fibras produzidas a partir da planta produtora de fibra.

[00112] Como aqui usado o termo “aumentar” se refere a pelo menos cerca de 2%, pelo menos cerca de 3%, pelo menos cerca de 4%, pelo menos cerca de 5%, pelo menos cerca de 10%, pelo menos cerca de 15%, pelo menos cerca de 20%, pelo menos cerca de 30%, pelo menos cerca de 40%, pelo menos cerca de 50%, pelo menos cerca de 60%, pelo menos cerca de 70%, pelo menos cerca de 80%, de aumento no rendimento, rendimento de semente, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento

30 / 378 de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio de uma planta quando comparada com uma planta nativa [isto é, uma planta não modificada com as biomoléculas (polinucleotídeos ou polipeptídeos) da invenção, por exemplo, uma planta não transformada da mesma espécie que é cultivada sob as mesmas (por exemplo, idênticas) condições de cultivo].

[00113] A frase “expressando dentro da planta um polinucleotídeo exógeno” como aqui usada se refere à suprarregulagem do nível de expressão de um polinucleotídeo exógeno dentro da planta pela introdução do polinucleotídeo exógeno dentro de uma célula vegetal ou planta e expressando pelos meios recombinantes, como adicionalmente aqui descrito abaixo.

[00114] Como aqui usado, “expressar” se refere à expressão ao nível do mRNA e opcionalmente ao do polipeptídeo.

[00115] Como aqui usada, a frase “polinucleotídeo exógeno” se refere a uma sequência heteróloga de ácidos nucléicos que podem não ser naturalmente expressos dentro da planta ou que a superexpressão na planta é desejada. O polinucleotídeo exógeno pode ser introduzido dentro da planta em uma maneira estável ou transitória, de modo a produzir uma molécula de ácido ribonucléico (RNA) e/ou uma molécula de polipeptídeo. Deve ser mencionado que o polinucleotídeo exógeno pode compreender uma sequência de ácidos nucléicos que é idêntica ou parcialmente homóloga a uma sequência endógena de ácidos nucléicos da planta.

[00116] O termo “endógeno” como aqui usado se refere a qualquer polinucleotídeo ou polipeptídeo que esteja presente e/ou naturalmente expresso dentro de uma planta ou uma célula da mesma.

[00117] De acordo com algumas modalidades da invenção, o polinucleotídeo exógeno da invenção compreende uma sequência de ácidos nucléicos codificando um polipeptídeo tendo uma sequência de aminoácidos

31 / 378 pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99% ou mais digamos 100% homóloga à sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 456-774, 8385-8643, 8645-10650, 10652-10836, 10838-12575, 12577, 12579-12583, 12585, 12586, 12590, 12591, 12593-12615, 12617-12624, 12628-12637, 12639- 12659, 12662-12666, 12668-12677, 12679-12681, 12683-12695, 12697- 12705, 12707-12709, 12711-12717, 12719-12727, 12729-12755, 12757-12811, 12813, 12815-12817, 12819-12825, 12827-12840, 12847- 12848, 12850, 12853, 12855-12859, 12861-12884, 12886, 12887, 12893, 12895, 12896, 12898-12902, 12904-12912, 12916-12926, 12930-12937, 12940-12942, 12945-12954, 12956-12962, 12965-12967, 12969-12977, 12979-12984, 12986-12992, 12994, 12999-13001, 13003, 13006-13010, 13012-13016, 13018-13019, 13021-13029, 13031-13049, 13051-13054, 13056-13063, 13065-13066, 13068-13070, 13073-13076, 13079-13084, 13086-14461 e 14462.

[00118] A homologia (por exemplo, homologia percentual, identidade + similaridade) pode ser determinada usando qualquer software de comparação de homologia, incluindo por exemplo, o software BlastP ou TBLASTN do National Center of Biotechnology Information (NCBI) tal como usando-se parâmetros de default, quando partindo de uma sequência de polipeptídeo; ou o algoritmo tBLASTX (disponível por intermédio da NCBI) tal como usando-se parâmetros de default, que comparam os produtos de tradução conceitual de seis matrizes de uma sequência consulta de

32 / 378 nucleotídeo (ambos os filamentos) contra uma base de dados de sequência de proteína.

[00119] De acordo com algumas modalidades da invenção, o termo “homology” ou “homóloga” se refere à identidade de duas ou mais sequências de ácidos nucléicos; ou identidade de duas ou mais sequências de aminoácidos.

[00120] As sequências homólogas incluem as sequências tanto ortólogas quanto parálogas. O termo “parálogo” se refere às duplicações de gene dentro do genoma de uma espécie levando a genes parálogos. O termo “ortólogo” se refere a genes homólogos em organismos diferentes devido às relações ancestrais.

[00121] Uma opção para identificar ortólogos em espécie de planta monocotiledônea é realizando-se uma pesquisa blast recíproca. Isto pode ser feito por um primeiro blast envolvendo submeter a blast a sequência de interesse contra qualquer base de dados de sequência, tal como a base de dados NCBI publicamente disponível que pode ser encontrada em: Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) ncbi (dot) nlm (dot) nih (dot) gov. Se ortólogos no arroz foram procurados, a sequência de interesse seria submetida a blast contra, por exemplo, os 28.469 clones de cDNA de comprimento completo de Oryza sativa Nipponbare disponíveis na NCBI. Os resultados de blast podem ser filtrados. As sequências de comprimento completo dos resultados filtrados ou dos resultados não filtrados são depois novamente submetidas a blast (segundo blast) contra as sequências do organismo a partir do qual a sequência de interesse é derivada. Os resultados do primeiro e segundo blasts são depois comparados. Um ortólogo é identificado quando a sequência resultante na contagem mais alta (melhor acerto) no primeiro blast identifica no segundo blast a sequência de consulta (a sequência de interesse original) como o melhor acerto. Usando o mesmo raciocínio um parálogo (homólogo para um gene no mesmo organismo) é

33 / 378 achado. No caso de famílias de sequência grandes, o programa ClustalW pode ser usado [Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) ebi (dot) ac (dot) uk/Tools/clustalw2/index (dot) html], seguido por uma árvore de união de vizinhos (Hypertext Transfer Protocol://en (dot) wikipedia (dot) org/wiki/Neighbor-joining) que ajuda a visualiza a clusterização.

[00122] De acordo com algumas modalidades da invenção, o polinucleotídeo exógeno da invenção codifica um polipeptídeo tendo uma sequência de aminoácidos pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99% ou mais digamos 100% idêntica à sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 456-774, 8385-8643, 8645-10650, 10652-10836, 10838-12575, 12577, 12579-12583, 12585, 12586, 12590, 12591, 12593-12615, 12617-12624, 12628-12637, 12639-12659, 12662-12666, 12668-12677, 12679-12681, 12727, 12729-12755, 12683-12695, 12757-12811, 12697-12705, 12707- 12709, 12711-12717, 12719-12813, 12815-12817, 12819-12825, 12827- 12840, 12847-12848, 12850, 12853, 12855-12859, 12861-12884, 12886, 12887, 12893, 12895, 12896, 12898-12902, 12904-12912, 12916-12926, 12930-12937, 12940-12942, 12945-12954, 12956-12962, 12965-12967, 12969-12977, 12979-12984, 12986-12992, 12994, 12999-13001, 13003, 13006-13010, 13012-13016, 13018-13019, 13021-13029, 13031-13049, 13051-13054, 13056-13063, 13065-13066, 13068-13070, 13073-13076, 13079-13084, 13086-14461 e 14462.

[00123] De acordo com algumas modalidades da invenção, o método

34 / 378 para aumentar o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio de uma planta é efetuado expressando-se dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos codificando um polipeptídeo pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99% ou mais digamos 100% idêntica à sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID Nos: 456-774, 8385-8643, 8645-10650, 10652-10836, 10838-12575, 12577, 12579-12583, 12585, 12586, 12590, 12591, 12593-12615, 12617-12624, 12628-12637, 12639-12659, 12662- 12666, 12668-12677, 12679-12681, 12683-12695, 12697-12705, 12707-12709, 12711-12717, 12719-12727, 12729-12755, 12757-12811, 12813, 12815-12817, 12819-12825, 12827-12840, 12847-12848, 12850, 12853, 12855-12859, 12861-12884, 12886, 12887, 12893, 12895, 12896, 12898-12902, 12904-12912, 12916-12926, 12930-12937, 12940-12942, 12945-12954, 12956-12962, 12965-12967, 12969-12977, 12979-12984, 12986-12992, 12994, 12999-13001, 13003, 13006-13010, 13012-13016, 13018-13019, 13021-13029, 13031-13049, 13051-13054, 13056-13063, 13065-13066, 13068-13070, 13073-13076, 13079-13084, 13086-14461 e 14462, aumentando desse modo o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio da planta.

[00124] De acordo com algumas modalidades da invenção, o

35 / 378 polinucleotídeo exógeno codifica um polipeptídeo consistindo da sequência de aminoácidos apresentada pelas SEQ ID NOs: 456-774, 8385-10836, 10838-14461 ou 14462.

[00125] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da invenção, o método para aumentar o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio de uma planta, é efetuado expressando-se dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos codificando um polipeptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 456-774, 8385-10836, 10838-14461 e 14462, aumentando desse modo o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio da planta.

[00126] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da invenção, é provido um método para aumentar o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos codificando um polipeptídeo selecionado do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 456-774, 8385-10836, 10838-14461 e 14462, aumentando desse modo o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio da planta.

[00127] De acordo com algumas modalidades da invenção, o polinucleotídeo exógeno codifica um polipeptídeo consistindo da sequência de aminoácidos apresentada pelas SEQ ID NOs: 456-774, 8385-10836, 10838-14461 ou 14462.

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[00128] De acordo com algumas modalidades da invenção o polinucleotídeo exógeno compreende uma sequência de ácidos nucléicos que sejam pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, por exemplo, 100% idêntica à sequência de ácidos nucléicos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 1-455, 775-6485, 6487-6657, 6660-6664, 6666-6701, 6703-6745, 6748- 6818, 6820-6821, 6824-6827, 6829-6881, 6883 e 6885-8384.

[00129] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da invenção, é provido um método para aumentar o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, por exemplo, 100% idêntica à sequência de ácidos nucléicos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 1-455, 775- 6485, 6487-6657, 6660-6664, 6666-6701, 6703-6745, 67486818, 6820-6821,

37 / 378 6824-6827, 6829-6881, 6883 e 6885-8384, aumentando desse modo o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio da planta.

[00130] De acordo com algumas modalidades da invenção, a homologia é uma homologia global, isto é, uma homologia em relação às sequências inteiras de aminoácidos ou ácidos nucléicos da invenção e não em relação às porções das mesmas.

[00131] De acordo com algumas modalidades da invenção, a identidade é uma identidade global, isto é, uma identidade em relação às sequências inteiras de aminoácido ou de ácidos nucléicos da invenção e não em relação às porções da mesma.

[00132] Identidade (por exemplo, homologia percentual) pode ser determinada usando qualquer software de comparação de homologia, incluindo por exemplo, o software BlastN do National Center of Biotechnology Information (NCBI) tal como usando-se parâmetros de default.

[00133] De acordo com algumas modalidades da invenção o polinucleotídeo exógeno é pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, por exemplo, 100% idêntico ao polinucleotídeo selecionado do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 1-455, 775-6485, 6487-6657, 6660-6664, 6666-6701, 6703-6745, 6748-6818, 6820-6821, 6824-6827, 6829-6881, 6883 e 6885-8384.

[00134] De acordo com algumas modalidades da invenção o

38 / 378 polinucleotídeo exógeno é apresentado pela SEQ ID NO: 1-455, 775-8383 ou

8384.

[00135] Como aqui usado o termo “polinucleotídeo” se refere a uma sequência de ácidos nucléicos de filamento único ou duplo que é isolada e provida na forma de uma sequência de RNA, uma sequência de polinucleotídeo complementar (cDNA), uma sequência de polinucleotídeo genômica e/ou uma das sequências de polinucleotídeos compósitas (por exemplo, uma combinação das acima).

[00136] O termo “isolado” se refere a pelo menos parcialmente separado do ambiente natural por exemplo, de uma célula vegetal.

[00137] Como aqui usada, a frase “sequência de polinucleotídeo complementar” se refere a uma sequência, que resulta da transcrição reversa de RNA mensageiro usando uma transcriptase reversa ou qualquer outra DNA polimerase dependente de RNA. Uma tal sequência pode ser subsequentemente amplificada em vivo ou em vitro usando uma DNA polimerase dependente de DNA.

[00138] Como aqui usada, a frase “sequência de polinucleotídeo genômica” se refere a uma sequência derivada (isolada) a partir de um cromossoma e assim a mesma representa uma porção contígua de um cromossoma.

[00139] Como aqui usada, a frase “sequência de polinucleotídeo compósita” se refere a uma sequência, que é pelo menos parcialmente complementar e pelo menos parcialmente genômica. Uma sequência compósita pode incluir algumas sequências exonais requeridas para codificar o polipeptídeo da presente invenção, assim como algumas sequências intrônicas interpostas entre elas. As sequências intrônicas podem ser de qualquer fonte, incluindo de outros genes e tipicamente incluirão sequências de sinal de junção conservada. Tais sequências intrônicas podem incluir ainda elementos reguladoras de expressão de ação cis.

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[00140] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da invenção, é provido um método para aumentar eficiência no uso de fertilizante (por exemplo, eficiência no uso de nitrogênio) e/ou conteúdo de óleo de uma planta, compreendendo expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos codificando um polipeptídeo pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99% ou mais digamos 100% homóloga à sequência de aminoácidos apresentada na SEQ ID NO: 10837, aumentando desse modo a eficiência no uso de fertilizante (por exemplo, eficiência no uso de nitrogênio) e/ou conteúdo de óleo da planta.

[00141] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da invenção, o método para aumentar a eficiência no uso de fertilizante (por exemplo, eficiência no uso de nitrogênio) e/ou conteúdo de óleo de uma planta é efetuado expressando-se dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos codificando o polipeptídeo apresentado na SEQ ID NO: 10837, aumentando desse modo a eficiência no uso de fertilizante (por exemplo, eficiência no uso de nitrogênio) e/ou conteúdo de óleo de uma planta.

[00142] De acordo com algumas modalidades da invenção, o polinucleotídeo exógeno codifica um polipeptídeo consistindo da sequência de aminoácidos apresentada pela SEQ ID NO: 10837.

[00143] As sequências de ácidos nucléicos codificando os polipeptídeos da presente invenção podem ser otimizadas quanto à expressão.

40 / 378 Os exemplos de tais modificações de sequência incluem, mas não são limitadas a um conteúdo de G/C alterado para se aproximar mais intimamente àquele tipicamente encontrado na espécie de planta de interesse e a remoção de códons atipicamente encontrados na espécie de planta habitualmente aludida como otimização de códon.

[00144] A frase “otimização de códon” se refere à seleção de nucleotídeos de DNA apropriados para o uso dentro de um gene estrutural ou fragmento do mesmo que se aproximem do uso de códon dentro da planta de interesse. Portanto, um gene ou sequência de ácidos nucléicos optimizados se refere a um gene no qual a sequência de nucleotídeo de um gene nativo ou de ocorrência natural foi modificado de modo a utilizar códons estatisticamente preferidos ou estatisticamente favorecidos dentro da planta. A sequência de nucleotídeo tipicamente é examinada ao nível de DNA e a região codificadora otimizada para expressão na espécie de planta determinada usando qualquer procedimento adequado, por exemplo como descrito em Sardana et al. (1996, Plant Cell Reports 15: 677-681). Neste método, o desvio padrão de uso de códon, uma medida de tendência do uso de códon, pode ser calculada achando-se primeiro o desvio proporcional elevado ao quadrado do uso de cada códon do gene nativo em relação àquele dos genes da planta altamente expressos, seguido por um cálculo do desvio médio elevado ao quadrado. A fórmula usada é: 1 SDCU = n = 1 N [ ( Xn - Yn ) / Yn ] 2 / N, onde Xn se refere à frequência de uso do códon n em genes de planta altamente expressos, onde Yn para a frequência de uso do códon n no gene de interesse e N se refere ao número total de códons no gene de interesse. Uma Tabela de uso de códon dos genes altamente expressos de plantas dicotiledôneas é compilada usando os dados de Murray et al. (1989, Nuc Acids Res. 17: 477- 498).

[00145] Um método de otimizar a sequência de ácidos nucléicos de acordo com o uso de códon preferido para um tipo particular de célula vegetal

41 / 378 está fundamentado no uso direto, sem realizar nenhum cálculo estatístico extra, de tabelas de otimização de códon tais como aquelas providas on line na Codon Usage Database através do banco de DNA do NIAS (National Institute of Agrobiological Sciences) no Japão (Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) kazusa (dot) ou (dot) jp/codon/). A Base de Dados do Uso de Códon contém tabelas do uso de códon para várias espécies diferentes, com cada tabela de uso de códon tendo sido estatisticamente determinada com base nos dados presentes no Genbank.

[00146] Usando as Tabelas acima para determinar os códons mais preferidos ou mais favorecidos para cada aminoácido em uma espécie particular (por exemplo, arroz), uma sequência de nucleotídeo de ocorrência natural codificando uma proteína de interesse pode ser otimizado no códon para esta espécie particular de planta. Isto é efetuado substituindo-se códons que possam ter uma incidência estatística baixa no genoma da espécie particular com códons correspondentes, com respeito a um aminoácido, que sejam estatisticamente mais favorecidos. Entretanto, um ou mais códons menos favorecidos podem ser selecionados para deletar sítios de restrição existentes, para criar novos nas junções potencialmente úteis (extremidades 5’ e 3’ para adicionar peptídeo de sinal ou cassetes de término, sítios internos que seriam usados para cortar e unir segmentos juntos para produzir uma sequência correta de comprimento completo) ou para eliminar sequências de nucleotídeo que possam negativamente afetar a estabilidade ou expressão do mRNA.

[00147] A sequência de nucleotídeo codificadora de ocorrência natural pode já, antes de qualquer modificação, contém diversos códons que correspondem a um códon estatisticamente favorecido em uma espécie particular de planta. Portanto, a otimização de códon da sequência de nucleotídeo nativa pode compreender determinar quais códons, dentro da sequência de nucleotídeo nativa, não são estatisticamente favorecidos com

42 / 378 respeito a uma planta particular e modificar estes códons de acordo com uma tabela de uso de códon da planta particular para produzir um derivado de códon otimizado. Uma sequência de nucleotídeo modificada pode ser total ou parcialmente otimizada para uso de códon de planta contanto que a proteína codificada pela sequência de nucleotídeo modificada seja produzida em um nível mais alto do que a proteína codificada pelo gene de ocorrência natural ou nativo correspondente. A construção de genes sintéticos pela alteração do uso de códon é descrita por exemplo no Pedido de Patente PCT 93/07278.

[00148] De acordo com algumas modalidades da invenção, o polinucleotídeo exógeno é um RNA não codificador.

[00149] Como aqui usada, a frase ‘RNA não codificador” se refere a uma molécula de RNA que não codifica uma sequência de aminoácidos (um polipeptídeo). Os exemplos de tais moléculas de RNA não codificadora incluem, mas não são limitadas a um RNA de antissentido, um pré-miRNA (precursor de um microRNA) ou um precursor de um RNA que interage com Piwi (piRNA).

[00150] Os exemplos não limitantes de polinucleotídeos de RNA não codificador são providos nas SEQ ID Nos: 201, 258, 455, 1269, 1312, 2017, 2174, 2278, 2289, 2564, 2565, 2641, 2642, 2643, 2799, 2827, 2828, 2829, 2830, 2835, 2836, 2837, 2852, 2853, 2873, 2877, 3026, 3181, 3250, 3311, 3466, 3480, 4017, 4243, 4339, 4346, 4347, 4508, 4509, 4540, 4541, 4546, 4547, 4548, 4563, 4564, 4565, 4569, 4570, 4581, 4906, 5530, 5955, 5979, 6033 e 6868.

[00151] Assim, a invenção abrange as sequências de ácidos nucléicos descritas acima; fragmentos das mesmas, sequências hibridizáveis com elas, sequências homóloga a elas, sequências codificando polipeptídeos similares com diferentes usos de códon, sequências alteradas distinguidas pelas mutações, tais como deleção, inserção ou substituição de um ou mais nucleotídeos, de ocorrência natural ou induzidas pelo ser humano,

43 / 378 aleatoriamente ou em uma maneira alvejada.

[00152] A invenção provê um polinucleotídeo isolado compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99%, por exemplo, 100% idêntica ao polinucleotídeo selecionado do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 1-455, 775-6485, 6487-6657, 6660-6664, 6666- 6701, 6703-6745, 6748-6818, 6820-6821, 6824-6827, 6829-6881, 6883 e 6885-8384.

[00153] De acordo com algumas modalidades da invenção a sequência de ácidos nucléicos é capaz de aumentar o rendimento, taxa de crescimento, vigor, biomassa, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, eficiência no uso de nitrogênio, eficiência no uso de fertilizante, tolerância ao estresse abiótico e/ou a eficiência no uso de água de uma planta.

[00154] De acordo com algumas modalidades da invenção o polinucleotídeo isolado compreendendo a sequência de ácidos nucléicos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 1-455, 775-8383 e 8384.

[00155] De acordo com algumas modalidades da invenção o polinucleotídeo isolado é apresentado pela SEQ ID NO: 1-455, 775-8383 ou

8384.

[00156] A invenção provê um polinucleotídeo isolado compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos codificando um polipeptídeo que compreende uma sequência de aminoácidos pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%,

44 / 378 pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99% ou mais digamos 100% homóloga à sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID Nos: 456-774, 8385-8643, 8645-10650, 10652-10836, 10838-12575, 12577, 12579-12583, 12585, 12586, 12590, 12591, 12593-12615, 12617-12624, 12628-12637, 12639- 12659, 12662-12666, 12668-12677, 12679-12681, 12683-12695, 12697- 12705, 12707-12709, 12711-12717, 12719-12727, 12729-12755, 12757- 12811, 12813, 12815-12817, 12819-12825, 12827-12840, 12847-12848, 12850, 12853, 12855-12859, 12861-12884, 12886, 12887, 12893, 12895, 12896, 12898-12902, 12904-12912, 12916-12926, 12930-12937, 12940- 12942, 12945-12954, 12956-12962, 12965-12967, 12969-12977, 12979- 12984, 12986-12992, 12994, 12999-13001, 13003, 13006-13010, 13012- 13016, 13018-13019, 13021-13029, 13031-13049, 13051-13054, 13056- 13063, 13065-13066, 13068-13070, 13073-13076, 13079-13084, 13086- 14461 e 14462.

[00157] De acordo com algumas modalidades da invenção a sequência de aminoácidos é capaz de aumentar o rendimento, taxa de crescimento, vigor, biomassa, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, eficiência no uso de nitrogênio, eficiência no uso de fertilizante, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de água de uma planta.

[00158] A invenção provê um polinucleotídeo isolado compreendendo uma sequência de ácidos nucléicos codificando um polipeptídeo que compreende a sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 456-774, 8385-10836, 10838-14461 e 14462.

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[00159] De acordo com um aspecto de algumas modalidades da invenção, é provido um construto de ácido nucléico compreendendo o polinucleotídeo isolado da invenção e um promotor para direcionar a transcrição da sequência de ácidos nucléicos em uma célula hospedeira.

[00160] A invenção provê um polipeptídeo isolado compreendendo uma sequência de aminoácidos pelo menos cerca de 80%, pelo menos cerca de 81%, pelo menos cerca de 82%, pelo menos cerca de 83%, pelo menos cerca de 84%, pelo menos cerca de 85%, pelo menos cerca de 86%, pelo menos cerca de 87%, pelo menos cerca de 88%, pelo menos cerca de 89%, pelo menos cerca de 90%, pelo menos cerca de 91%, pelo menos cerca de 92%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 93%, pelo menos cerca de 94%, pelo menos cerca de 95%, pelo menos cerca de 96%, pelo menos cerca de 97%, pelo menos cerca de 98%, pelo menos cerca de 99% ou mais digamos 100% homóloga a uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 456-774, 8385-8643, 8645-10650, 10652-10836, 10838-12575, 12577, 12579-12583, 12585, 12586, 12590, 12591, 12593-12615, 12617-12624, 12628-12637, 12639-12659, 12662- 12666, 12668-12677, 12679-12681, 12683-12695, 12697-12705, 12707- 12709, 12711-12717, 12719-12727, 12729-12755, 12757-12811, 12813, 12815-12817, 12819-12825, 12827-12840, 12847-12848, 12850, 12853, 12855-12859, 12861-12884, 12886, 12887, 12893, 12895, 12896, 12898- 12902, 12904-12912, 12916-12926, 12930-12937, 12940-12942, 12945- 12954, 12956-12962, 12965-12967, 12969-12977, 12979-12984, 12986- 12992, 12994, 12999-13001, 13003, 13006-13010, 13012-13016, 13018- 13019, 13021-13029, 13031-13049, 13051-13054, 13056-13063, 13065- 13066, 13068-13070, 13073-13076, 13079-13084, 13086-14461 e 14462.

[00161] De acordo com algumas modalidades da invenção, o polipeptídeo compreendendo uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo das SEQ ID NOs: 456-774, 8385-10836, 10838-14461 e

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14462.

[00162] De acordo com algumas modalidades da invenção, o polipeptídeo é apresentado pelas SEQ ID NOs: 456-774, 8385-10836, 10838- 14461 ou 14462.

[00163] A invenção também abrange fragmentos dos polipeptídeos descritos acima e polipeptídeos tendo mutações, tais como deleções, inserções ou substituições de um ou mais aminoácidos, de ocorrência natural ou induzida pelo ser humano, aleatoriamente ou em uma maneira alvejada.

[00164] O termo “planta” como aqui usado abrange plantas inteiras, ancestrais e a progênie das plantas e partes da planta, incluindo sementes, brotos, talos, raízes (incluindo tubérculos) e células, tecidos e órgãos de planta. A planta pode estar em qualquer forma incluindo culturas em suspensão, embriões, regiões meristemáticas, tecido de calo, folhas, gametófitos, esporófitos, pólen e micrósporos. As plantas que são particularmente úteis nos métodos da invenção incluem todas as plantas que pertencem à superfamília Viridiplantae, em particular plantas monocotiledôneas e dicotiledôneas incluindo um legume forrageiro ou de forragem, planta ornamental, safra alimentícia, árvore ou arbusto selecionados da lista compreendendo Acacia spp., Acer spp., Actinidia spp., Aesculus spp., Agathis australis, Albizia amara, Alsophila tricolor, Andropogon spp., Arachis spp, Areca catechu, Astelia fragrans, Astragalus cicer, Baikiaea plurijuga, Betula spp., Brassica spp., Bruguiera gymnorrhiza, Burkea africana, Butea frondosa, Cadaba farinosa, Calliandra spp, Camellia sinensis, Canna indica, Capsicum spp., Cassia spp., Centroema pubescens, Chacoomeles spp., Cinnamomum cassia, Coffea arabica, Colophospermum mopane, Coronillia varia, Cotoneaster serotina, Crataegus spp., Cucumis spp., Cupressus spp., Cyathea dealbata, Cydonia oblonga, Cryptomeria japonica, Cymbopogon spp., Cynthea dealbata, Cydonia oblonga, Dalbergia monetaria, Davallia divaricata, Desmodium spp., Dicksonia squarosa,

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Dibeteropogon amplectens, Dioclea spp, Dolichos spp., Dorycnium rectum, Echinochloa pyramidalis, Ehraffia spp., Eleusine coracana, Eragrestis spp., Erythrina spp., Eucalypfus spp., Euclea schimperi, Eulalia villosa, Pagopyrum spp., Feijoa sellowlana, Fragaria spp., Flemingia spp, Freycinetia banksli, Geranium thunbergii, GinAgo biloba, Glycine javanica, Gliricidia spp, Gossypium hirsutum, Grevillea spp., Guibourtia coleosperma, Hedysarum spp., Hemaffhia altissima, Heteropogon contoffus, Hordeum vulgare, Hyparrhenia rufa, Hypericum erectum, Hypeffhelia dissolute, Indigo incamata, Iris spp., Leptarrhena pyrolifolia, Lespediza spp., Lettuca spp., Leucaena leucocephala, Loudetia simplex, Lotonus bainesli, Lotus spp., Macrotiloma axillare, Malus spp., Manihot esculenta, Medicago saliva, Metasequoia glyptostroboides, Musa sapientum, Nicotianum spp., Onobrychis spp., Ornithopus spp., Oryza spp., Peltophorum africanum, Pennisetum spp., Persea gratissima, Petunia spp., Phaseolus spp., Phoenix canariensis, Phormium cookianum, Photinia spp., Picea glauca, Pinus spp., Pisum sativam, Podocarpus totara, Pogonarthria fleckii, Pogonaffhria squarrosa, Populus spp., Prosopis cineraria, Pseudotsuga menziesii, Pterolobium stellatum, Pyrus communis, Quercus spp., Rhaphiolepsis umbellata, Rhopalostilis sapida, Rhus natalensis, Ribes grossularia, Ribes spp., Robinia pseudoacacia, Rosa spp., Rubus spp., Salix spp., Schyzachyrium sanguineum, Sciadopitys vefficillata, Sequoia sempervirens, Sequoiadendron giganteum, Sorgo bicolor, Spinacia spp., Sporobolus fimbriatus, Stiburus alopecuroides, Stilosanthos humilis, Tadehagi spp, Taxodium distichum, Themeda triandra, Trifolium spp., Triticum spp., Tsuga heterophilla, Vaccinium spp., Vicia spp., Vitis vinifera, Watsonia pyramidata, Zantedeschia aethiopica, Zea mays, amaranto, alcachofra, aspargo, brócolis, couve de Bruxelas, repolho, canola, cenoura, couve flor, aipo, couve, linho, repolho crespo, lentilha, semente oleaginosa de colza, quiabo, cebola, batata, arroz, soja, palha, beterraba açucareira, cana de açúcar, girassol, tomate, chá de

48 / 378 abóbora, milho, trigo, cevada, centeio, aveia, amendoim, ervilha, lentilha e alfafa, algodão, colza, canola, pimenta, girassol, tabaco, beringela, eucalipto, uma árvore, uma planta ornamental, uma grama perene e uma safra forrageira. Alternativamente algas e outras não Viridiplantae podem ser usadas para os métodos da presente invenção.

[00165] De acordo com algumas modalidades da invenção, a planta usada pelo método da invenção é uma planta de safra tal como arroz, milho, trigo, cevada, amendoim, batata, gergelim, oliva, dendê, banana, soja, girassol, canola, cana de açúcar, alfafa, painço, leguminosas (feijão, ervilha), linho, tremoço, colza, tabaco, choupo e algodão.

[00166] De acordo com algumas modalidades da invenção a planta é uma planta dicotiledônea.

[00167] De acordo com algumas modalidades da invenção a planta é uma planta monocotiledônea.

[00168] De acordo com algumas modalidades da invenção, é provida uma célula vegetal exogenamente expressando o polinucleotídeo de algumas modalidades da invenção, o construto de ácido nucléico de algumas modalidades da invenção e/ou o polipeptídeo de algumas modalidades da invenção.

[00169] De acordo com algumas modalidades da invenção, a expressão do polinucleotídeo exógeno da invenção dentro da planta é efetuada transformando-se uma ou mais células da planta com o polinucleotídeo exógeno, seguido pela geração de uma planta madura a partir das células transformadas e cultivando a planta madura sob condições adequadas para expressar o polinucleotídeo exógeno dentro da planta madura.

[00170] De acordo com algumas modalidades da invenção, a transformação é efetuada introduzindo-se na célula vegetal um construto de ácido nucléico que inclui o polinucleotídeo exógeno de algumas modalidades da invenção e pelo menos um promotor para direcionar a transcrição do

49 / 378 polinucleotídeo exógeno em uma célula hospedeira (uma célula vegetal). Detalhes adicionais de métodos de transformação adequados são providos abaixo.

[00171] Como mencionado, o construto de ácido nucléico de acordo com algumas modalidades da invenção compreende uma sequência promotora e o polinucleotídeo isolado da invenção.

[00172] De acordo com algumas modalidades da invenção, o polinucleotídeo isolado é operavelmente ligado à sequência promotora.

[00173] Uma sequência codificadora de ácido nucléico é “operavelmente ligada” a uma sequência reguladora (por exemplo, promotora) se a sequência reguladora for capaz de exercer um efeito regulador sobre a sequência codificadora ligada a ela.

[00174] Como aqui usado, o termo “promotor” se refere a uma região de DNA que reside a montante do sítio de início transcricional de um gene ao qual a RNA polimerase se liga para iniciar a transcrição de RNA. O promotor controla onde (por exemplo, que porção de uma planta) e/ou quando (por exemplo, em qual estágio ou condição no tempo de vida de um organismo) o gene é expresso.

[00175] De acordo com algumas modalidades da invenção, o promotor é heterólogo para o polinucleotídeo isolado e/ou para a célula hospedeira.

[00176] Qualquer sequência promotora adequada pode ser usada pelo construto de ácido nucléico da presente invenção. Preferivelmente o promotor é um promotor constitutivo, um promotor específico de tecido ou um indutível pelo estresse abiótico.

[00177] De acordo com algumas modalidades da invenção, o promotor é um promotor de planta, que é adequado para a expressão do polinucleotídeo exógeno em uma célula vegetal.

[00178] Os promotores constitutivos adequados incluem, por exemplo, o promotor CaMV 35S [SEQ ID NO: 14463 (pQFNC); SEQ ID NO: 14464

50 / 378 (PH 35S de Brachypodium); SEQ ID NO: 14465 (Odell et al., Nature 313: 810-812, 1985)], promotor At6669 da Arabidopsis (SEQ ID NO: 14466; ver a Publicação PCT No. WO04081173A2 ou o novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467); Ubi 1 do milho (poliubiquitina-1 do milho, SEQ ID NO: 14468; Christensen et al., Plant Sol. Biol. 18: 675-689, 1992; Taylor et al., Plant Cell Rep 12:491-495, 1993); actina 1 do arroz (SEQ ID NO: 14469, McElroy et al., Plant Cell 2: 163-171, 1990); pEMU (Last et al., Theor. Appl. Genet. 81: 581-588, 1991); CaMV 19S (Nilsson et al., Physiol. Plant 100: 456-462, 1997); GOS2 (SEQ ID NO: 14470, de Pater et al, Plant J Nov;2(6): 837-44, 1992); promotor Ubi 1 (SEQ ID NO: 14471); promotor RBCS (SEQ ID NO: 14472); ciclofilina do arroz (Bucholz et al, Plant Mol Biol. 25(5): 837-43, 1994); H3 histona do milho (Lepetit et al, Mol. Gen. Genet. 231: 276-285, 1992); Actina 2 (An et al, Plant J. 10(1); 107-121, 1996) e Super MAS Sintético (Ni et al., The Plant Journal 7: 661-76, 1995). Outros promotores constitutivos incluem aqueles nas Patente dos EUA Nos. 5.659.026,

5.608.149, 5.608.144, 5.604.121, 5.569.597: 5.466.785, 5.399.680, 5.268.463, e 5.608.142.

[00179] Os promotores específicos de tecido adequados include, mas não limitado aos promotores específicos de flor [por exemplo, AT5G06690 (Tiorredoxina) (alta expressão, SEQ ID NO: 14473), AT5G61520 (AtSTP3) (baixa expressão, SEQ ID NO: 14474) descrito em Buttner et al 2000 Plant, Cell and Environment 23, 175-184 ou os promotores descritos em Yamamoto et al., Plant J. 12: 255-265, 1997; Kwon et al., Plant Physiol. 105: 357-67, 1994; Yamamoto et al., Plant Cell Physiol. 35: 773-778, 1994; Gotor et al., Plant J. 3: 509-18, 1993; Orozco et al., Plant Mol. Biol. 23: 1129-1138, 1993; e Matsuoka et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90: 9586-9590, 1993; assim como o promotor STP3 de Arabidopsis (AT5G61520) (Buttner et al., Plant, Cell and Environment 23: 175-184, 2000)], promotores [por exemplo, Napin (originado de Brassica napus que é distinguido por uma atividade promotora

51 / 378 específica de semente; Stuitje A.

R. et al.

Plant Biotechnology Journal 1 (4): 301-309; SEQ ID NO: 14475 a partir de genes específicos de semente (Simon, et al., Plant Mol.

Biol. 5. 191, 1985; Scofield, et al., J.

Biol.

Chem. 262: 12202, 1987; Baszczynski, et al., Plant Mol.

Biol. 14: 633, 1990), PG5a do arroz (US 7.700.835), desenvolvimento precoce de semente de Arabidopsis BAN (SEQ ID NO: 14476, US 2009/0031450 Al), desenvolvimento tardio de semente de Arabidopsis ABI3 (SEQ ID NO: 14477) (Ng et al., Plant Molecular Biology 54: 25-38, 2004), albumina de castanha do Pará (Pearson’ et al., Plant Mol.

Biol. 18: 235- 245, 1992), legumina (Ellis, et al.

Plant Mol.

Biol. 10: 203-214, 1988), Glutelina (arroz) (Takaiwa, et al., Mol.

Gen.

Genet. 208: 15-22, 1986; Takaiwa, et al., FEBS Letts. 221: 43-47, 1987), Zeína (Matzke et al Plant Mol Biol, 143), 323-32 1990), napA (Stalberg, et al, Plant 199: 515-519, 1996), SPA do Trigo (Albanietal, Plant Cell, 9: 171-184, 1997), oleosina do girassol (Cummins, et al., Plant Mol.

Biol. 19: 873- 876, 1992)], promotores específicos de endosperma [por exemplo, LMW e HMW do trigo, glutenina-1 (Thomas e Flavell, The Plant Cell 2: 1171-1180, 1990; Mol Gen Genet 216: 81-90, 1989; NAR 17: 461-2), gliadinas a, b e g do trigo (EMBO3: 1409-15, 1984), promotor ltrl da cevada, hordeína B1, C, D da cevada (Theor Appl Gen 98: 1253-62, 1999; Plant J 4: 34355, 1993; Mol Gen Genet 250: 750- 60, 1996), DOF da cevada (Mena et al, The Plant Journal, 116(1): 53- 62, 1998), Biz2 (EP99106056.7), SS2 da cevada (Guerin e Carbonero Plant Physiology 114: 1 55-62, 1997), Tarp60 do trigo (Kovalchuk et al., Plant Mol Biol 71: 81-98, 2009), hordeína D (D-Hor) e hordeína B (B-Hor) da cevada (Agnelo Furtado, Robert J.

Henry e Alessandro Pellegrineschi (2009)], Synthetic Promoter (Vicente-Carbajosa et al., Plant J. 13: 629-640, 1998), prolamina do arroz NRP33, globulina Glb-1 do arroz (Wu et al, Plant Cell Physiology 39(8) 885- 889, 1998), alfa-globulina REB/OHP-1 do arroz (Nakase et al.

Plant Mol.

Biol. 33: 513-S22, 1997), ADP-glicose PP do arroz (Trans Res 6: 157-68,

52 / 378 1997), família do gene ESR do milho (Plant J 12: 235-46, 1997), gama- Cafirina do sorgo (PMB 32: 1029-35, 1996)], promotores específicos de embrião [por exemplo, OSH1 do arroz (Sato et al, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 93: 8117-8122), KNOX (Postma-Haarsma et al, Plant Mol. Biol. 39: 257-71, 1999), oleosina do arroz (Wu et al, J. Biochem., 123: 386, 1998)] e promotores específicos de flor [por exemplo, AtPRP4, chalene sintase (chsA) (Van der Meer, et al., Plant Mol. Biol. 15, 95-109, 1990), LAT52 (Twell et al Mol. Gen Genet. 217: 240-245; 1989), Arabidopsis apetala-3 (Tilly et al., Development. 125: 1647-57, 1998), Arabidopsis APETALA 1 (AT1G69120, AP1) (SEQ ID NO: 14478) (Hempel et al., Development 124: 3845-3853, 1997)] e promotores de raiz [por exemplo, o promotor RAIZP [SEQ ID NO: 14479]; os promotores ExpB5 do arroz e ExpBl da cevada (Won et al. Mol. Cells 30: 369-376, 2010); promotor da monoterpeno sintase de Arabidopsis (AT3G25820) (Chen et al., Plant Phys 135: 1956-66, 2004); promotor Phol de Arabidopsis (SEQ ID NO: 14480, Hamburger et al., Plant Cell. 14: 889- 902, 2002), que também é levemente induzida pelo estresse Pi].

[00180] Os promotores indutíveis pelo estresse abiótico adequados incluem, mas não limitados aos promotores indutíveis por sal, tais como RD29A (Yamaguchi-Shinozalei et al., Mol. Gen. Genet. 236: 331-340, 1993); promotores indutíveis por seca, tais como promotor do gene rabl7 do milho (Pla et al., Plant Mol. Biol. 21: 259-266, 1993), promotor do gene rab28 do milho (Busk et al., Plant J. 11: 1285-1295, 1997) e promotor do gene Ivr2 do milho (Pelleschi et al., Plant Mol. Biol. 39: 373-380, 1999); promotores indutíveis por calor, tais como o promotor térmico hsp80 do tomate (Patente dos EUA No. 5.187.267).

[00181] O construto de ácido nucléico de algumas modalidades da invenção pode adicionalmente incluir um marcador selecionável apropriado e/ou uma origem de replicação. De acordo com algumas modalidades da invenção, o construto de ácido nucléico utilizado é um vetor transportador,

53 / 378 que pode propagar tanto na E. coli (em que o construto compreende um marcador selecionável apropriado e origem de replicação) quanto ser compatível com a propagação nas células. O construto de acordo com a presente invenção pode ser, por exemplo, um plasmídeo, um bacmídeo, um fagomídeo, um cosmídeo, um fago, um vírus ou um cromossoma artificial.

[00182] O construto de ácido nucléico de algumas modalidades da invenção pode ser utilizado para transformar estavelmente ou transitoriamente células vegetais. Na transformação estável, o polinucleotídeo exógeno é integrado dentro do genoma da planta e como tal o mesmo representa um traço estável e hereditário. Na transformação transitória, o polinucleotídeo exógeno é expresso pela célula transformada, mas não é integrado dentro do genoma e como tal o mesmo representa um traço transitório.

[00183] Existem diversos métodos de introduzir genes estranhos dentro das plantas tanto monocotiledôneas quanto dicotiledôneas (Potrykus, I., Annu. Rev. Plant. Physiol., Plant. Mol. Biol. (1991) 42: 205-225; Shimamoto et al., Nature (1989) 338: 274-276).

[00184] Os métodos fundamentais de causar integração estável de DNA exógeno dentro do DNA genômico da planta incluem duas abordagens principais: (i) Transferência de gene mediada por Agrobacterium: Klee et al. (1987) Annu. Rev. Plant Physiol. 38: 467-486; Klee e Rogers em Cell Culture and Somatic Cell Genetics of Plants, Vol. 6, Molecular Biology of Plant Nuclear Genes, eds. Schell, J. e Vasil, L. K., Academic Publishers, San Diego, Calif. (1989) p. 2-25; Gatenby, em Plant Biotechnology, eds. Kung, S. e Arntzen, C. J., Butterworth Publishers, Boston, Mass. (1989) p. 93-112; (ii) Captação de DNA Direta: Paszkowski et al., em Cell Culture and Somatic Cell Genetics of Plants, Vol. 6, Molecular Biology of Plant Nuclear Genes eds. Schell, J. e Vasil, L. K., Academic Publishers, San Diego, Calif. (1989) p. 52-68; incluindo métodos para a captação direta de

54 / 378 DNA dentro de protoplastos, Toriyama, K. et al. (1988) Bio/Technology 6: 1072-1074. Captação de DNA induzida por breves choques elétricos nas células vegetais: Zhang et al. Plant Cell Rep. (1988) 7:379-384. Fromm et al. Nature (1986) 319:791-793. Injeção de DNA dentro das células ou tecidos vegetais pelo bombardeamento de partícula, Klein et al. Bio/Technology (1988) 6: 559-563; McCabe et al. Bio/Technology (1988) 6: 923926; Sanford, Physiol. Plant. (1990) 79: 206-209; pelo uso de sistemas de micropipeta: Neuhaus et al., Theor. Appl. Genet. (1987) 75: 30-36; Neuhaus e Spangenberg, Physiol. Plant. (1990) 79: 213-217; transformação de pelos de fibras de vidro ou carbeto de silício de culturas celulares, tecido embrionário ou de calo, Patente dos EUA No. 5.464.765 ou pela incubação direta de DNA com pólen de germinação, DeWet et al. em Experimental Manipulation of Ovule Tissue, eds. Chapman, G. P. e Mantell, S. H. e Daniels, W. Longman, Londres, (1985) p. 197-209; e Ohta, Proc. Natl. Acad. Sci. USA (1986) 83: 715-719.

[00185] O sistema de Agrobacterium inclui o uso de vetores plasmídicos que contêm segmentos de DNA definidos que integram dentro do DNA genômico da planta. Os métodos de inoculação de tecido vegetal variam dependendo da espécie de planta e do sistema de liberação de Agrobacterium. Uma abordagem amplamente usada é o procedimento do disco de folha que pode ser realizado com qualquer explante tecidual que proveja uma boa fonte para a iniciação de diferenciação de planta inteira. Ver, por exemplo, Horsch et al. em Plant Molecular Biology Manual A5, Kluwer Academic Publishers, Dordrecht (1988) p. 1-9. Uma abordagem suplementar utiliza a combinação do sistema de entrega pela Agrobacterium com infiltração a vácuo. O sistema de Agrobacterium é especialmente viável na criação de plantas dicotiledôneas transgênicas.

[00186] Existem diversos métodos de transferência de DNA direta dentro da célula vegetal. Na eletroporação, os protoplastos são ligeiramente

55 / 378 expostos a um forte campo elétrico. Na microinjeção, o DNA é mecanicamente injetado diretamente dentro das células usando micropipetas muito pequenas. No bombardeamento de micropartícula, o DNA é adsorvido sobre microprojéteis tais como cristais de sulfato de magnésio ou partículas de tungstênio e os microprojéteis são fisicamente acelerados dentro das células ou tecidos vegetais.

[00187] A seguir da transformação estável a propagação da planta é praticada. O método mais comum de propagação de planta é pela semente. A regeneração pela propagação de semente, entretanto, tem a deficiência de que devido à heterozigosidade existe uma falta de uniformidade na safra, visto que as sementes são produzidas pelas plantas de acordo com as variações genéticas controladas pelas leis Mendelianas. Basicamente, cada semente é geneticamente diferente e cada uma crescerá com os seus próprios traços específicos. Portanto, é preferido que a planta transformada seja produzida tal que a planta regenerada tenha os traços e características idênticos da planta transgênica precursora. Portanto, é preferido que a planta transformada seja regenerada pela micropropagação que provê uma reprodução rápida, compatível com as plantas transformadas.

[00188] A micropropagação é um processo de cultivar nova geração de plantas a partir de um único pedaço de tecido que foi excisado a partir de uma planta ou cultivar precursores selecionados. Este processo permite a reprodução em massa das plantas tendo o tecido preferido expressando a proteína de fusion. A nova geração de plantas que é produzida é geneticamente idêntica a e tem todas as características da planta original. A micropropagação permite a produção em massa de material de planta de qualidade em um curto período de tempo e oferece uma multiplicação rápida de cultivares selecionados na preservação das características da planta original transgênica ou transformada. As vantagens de clonar plantas são a velocidade de multiplicação da planta e a qualidade e uniformidade das

56 / 378 plantas produzidas.

[00189] A micropropagação é um procedimento de estágio múltiplo que requer alteração de meio de cultura ou condições de cultivo entre estágios. Assim, o processo de micropropagação envolve quatro estágio básicos: Estágio um, cultivo do tecido inicial; estágio dois, multiplicação da cultura de tecido; estágio três, diferenciação e formação de planta; e estágio quatro, cultivo e fortalecimento em estufa. Durante o estágio um, a cultura de tecido inicial, a cultura de tecido é estabelecida e certificada livre de contaminantes. Durante o estágio dois, a cultura de tecido inicial é multiplicada até que um número suficiente de amostras de tecido seja produzido para atingir metas de produção. Durante o estágio três, as amostras de tecido cultivadas no estágio dois são divididas e cultivadas dentro de plântulas individuais. No estágio quatro, as plântulas transformadas são transferidas para uma estufa para fortalecimento onde a tolerância das plantas à luz é gradualmente aumentada de modo que a mesma possa ser cultivada no ambiente natural.

[00190] De acordo com algumas modalidades da invenção, as plantas transgênicas são geradas pela transformação transitória de células de folha, células meristemáticas ou da planta inteira.

[00191] A transformação transitória pode ser efetuada por qualquer um dos métodos de transferência de DNA direto descritos acima ou pela infecção viral usando vírus de planta modificados.

[00192] Os vírus que foram mostrados serem úteis para transformação de hospedeiros vegetais incluem CaMV, Vírus Mosaico do Tabaco (TMV), Vírus mosaico de bromo (BMV) e Vírus Mosaico do Feijão Comum (BV ou BCMV). A transformação das plantas usando vírus de planta está descrita na Patente dos EUA No. 4.855.237 (vírus mosaico do feijão dourado; BGV), EP- A 67.553 (TMV), Pedido Publicado Japonês No. 63-14693 (TMV), EPA

194.809 (BV), EPA 278.667 (BV); e Gluzman, Y. et al., Communications em

57 / 378 Molecular Biology: Viral Vectors, Cold Spring Harbor Laboratory, Nova Iorque, pp. 172-189 (1988). Partículas de pseudovírus para o uso na expressão de DNA estranho em muitos hospedeiros, incluindo plantas são descritas na WO 87/06261.

[00193] De acordo com algumas modalidades da invenção, o vírus usado para transformações transitórias é avirulento e assim é incapaz de causar sintomas severos tais como taxa de crescimento reduzida, mosaico, manchas de anel, enrolamento de folha, amarelamento, listras, formação de varíola, formação de tumor e corrosão. Um vírus avirulento adequado pode ser um vírus avirulento de ocorrência natural ou um vírus artificialmente atenuado. A atenuação viral pode ser efetuada usando-se métodos bem conhecidos na técnica incluindo, mas não limitado a, aquecimento subletal, tratamento químico ou pelas técnicas de mutagênese dirigidas tais como descritas, por exemplo, por Kurihara e Watanabe (Molecular Plant Pathology 4: 259-269, 2003), Gal-on et al. (1992), Atreya et al. (1992) e Huet et al. (1994).

[00194] As cepas virais adequadas podem ser obtidas a partir de fontes disponíveis tais como, por exemplo, da American Type Culture Collection (ATCC) ou pela isolação de plantas infectadas. A isolação de vírus a partir de tecidos vegetais infectados pode ser efetuada pelas técnicas bem conhecidas na técnica tais como descritas, por exemplo por Foster e Taylor, Eds. “Plant Virology Protocols: From Virus Isolation to Transgenic Resistence (Methods em Molecular Biology (Humana Pr), Vol 81)”, Humana Press, 1998. Em resumo, tecidos de uma planta infectada acreditada conter uma alta concentração de um vírus adequado, preferivelmente folhas jovens e pétalas de flor, são triturados em uma solução tampão (por exemplo, solução tampão de fosfato) para produzir uma seiva infectada com vírus que pode ser usada em inoculações subsequentes.

[00195] A construção dos vírus de RNA de planta para a introdução e

58 / 378 expressão de sequências de polinucleotídeo exógenas não virais em plantas é demonstrada pelas referências acima assim como em Dawson, W. O. et al., Virology (1989) 172: 285-292; Takamatsu et al. EMBO J. (1987) 6: 307-311; French et al. Science (1986) 231: 1294-1297; Takamatsu et al. FEBS Letters (1990) 269: 73-76; e Patente dos EUA No. 5.316.931.

[00196] Quando o vírus é um vírus de DNA, modificações adequadas podem ser feitas ao próprio vírus. Alternativamente, o vírus pode primeiro ser clonado dentro de um plasmídeo bacteriano para facilidade de construção do vetor viral desejado com o DNA estranho. O vírus pode depois ser excisado a partir do plasmídeo. Se o vírus for um vírus de DNA, uma origem bacteriana de replicação pode ser fixada ao DNA viral, que é depois replicado pelas bactérias. A transcrição e tradução deste DNA produzirá a proteína de revestimento que encapsidará o DNA viral. Se o vírus é um vírus de RNA, o vírus é geralmente clonado como um cDNA e inserido dentro de um plasmídeo. O plasmídeo é depois usado para fabricar todas as construções. O vírus de RNA é depois produzido transcrevendo-se a sequência viral do plasmídeo e a tradução dos genes virais para produzir a(s) proteína(s) de revestimento que encapsidam o RNA viral.

[00197] Em uma modalidade, um polinucleotídeo de vírus de planta é provido em que a sequência codificadora da proteína de revestimento nativa foi deletada a partir de um polinucleotídeo viral, uma sequência codificadora de proteína de revestimento viral de planta não nativo e um promotor não nativo, preferivelmente o promotor subgenômico da sequência codificadora de proteína de revestimento não nativa, capaz de expressão no hospedeiro vegetal, empacotamento do polinucleotídeo de vírus de planta recombinante e garantindo uma infecção sistêmica do hospedeiro pelo polinucleotídeo de vírus de planta recombinante foi inserido. Alternativamente, o gene da proteína de revestimento pode ser inativado pela inserção da sequência de polinucleotídeo não nativa dentro dele, tal que uma proteína seja produzida. O

59 / 378 polinucleotídeo de vírus de planta recombinante pode conter um ou mais promotores subgenômicos não nativos adicionais. Cada promotor subgenômico não nativo é capaz de transcrever ou expressar genes ou sequências de polinucleotídeos adjacentes no vegetal hospedeiro e incapazes de recombinação entre si e com promotores subgenômicos nativos. As sequências de polinucleotídeos não nativos (estranhos) podem ser inseridas adjacentes ao promotor subgenômico de vírus de planta nativo ou aos promotores subgenômicos de vírus de planta nativo e um não nativo se mais do que uma sequência de polinucleotídeo for incluída. As sequências de polinucleotídeos não nativas são transcritas ou expressas na planta hospedeira sob o controle do promotor subgenômico para produzir os produtos desejados.

[00198] Em uma segunda modalidade, um polinucleotídeo de vírus de planta recombinante é provido como na primeira modalidade exceto que a sequência codificadora da proteína de revestimento nativa é colocada adjacente àquela dos promotores subgenômicos de proteína de revestimento não nativa ao invés de uma sequência codificadora de proteína de revestimento não nativa.

[00199] Em uma terceira modalidade, um polinucleotídeo de vírus de planta recombinante é provido em que o gene da proteína de revestimento nativa é adjacente ao seu promotor subgenômico e um ou mais promotores subgenômicos não nativos foram inseridos dentro do polinucleotídeo viral. Os promotores subgenômicos não nativos inseridos são capazes de transcrever ou expressar genes adjacentes em um hospedeiro vegetal e são incapazes de recombinação entre si e com promotores subgenômicos nativos. As sequências de polinucleotídeos não nativas podem ser inseridas adjacentes aos promotores de vírus de planta subgenômicos não nativos tal que as sequências sejam transcritas ou expressas na planta hospedeira sob o controle dos promotores subgenômicos para produzir o produto desejado.

[00200] Em uma quarta modalidade, um polinucleotídeo de vírus de

60 / 378 planta recombinante é provido como na terceira modalidade exceto que a sequência codificadora da proteína de revestimento nativa é substituída por uma sequência codificadora de proteína de revestimento não nativa.

[00201] Os vetores virais são encapsidados pelas proteínas de revestimento codificadas pelo polinucleotídeo de vírus de planta recombinante para produzir um vírus de planta recombinante. O polinucleotídeo de vírus de planta recombinante ou vírus de planta recombinante são usados para infectar plantas hospedeiras apropriadas. Os polinucleotídeos de vírus de planta recombinantes são capazes de replicação no hospedeiro, espalhamento sistêmico no hospedeiro e transcrição ou expressão de gene(s) estranho(s) (polinucleotídeo exógeno) no hospedeiro para produzir a proteína desejada.

[00202] As técnicas para inoculação de vírus para plantas podem ser encontradas em Foster e Taylor, eds. “Plant Virology Protocols: From Vírus Isolation to Transgenic Resistence (Methods em Molecular Biology (Humana Pr), Vol 81)”, Humana Press, 1998; Maramorosh e Koprowski, eds. “Methods em Virology” 7 vols, Academic Press, Nova Iorque 1967-1984; Hill, S. A. “Methods em Plant Virology”, Blackwell, Oxford, 1984; Walkey, D.G.A. “Applied Plant Virology”, Wiley, Nova Iorque, 1985; e Kado e Agrawa, eds. “Principles and Techniques em Plant Virology”, Van Nostrand-Reinhold, Nova Iorque.

[00203] Além do acima, o polinucleotídeo da presente invenção pode também ser introduzido dentro de um genoma de cloroplasto permitindo deste modo a expressão de cloroplasto.

[00204] Uma técnica para introduzir sequências de polinucleotídeo exógenas ao genoma dos cloroplastos é conhecida. Esta técnica envolve os seguintes procedimentos. Primeiro, as células vegetais são quimicamente tratadas de modo a reduzir o número de cloroplastos por célula para cerca de um. Depois, o polinucleotídeo exógeno é introduzido por intermédio de

61 / 378 bombardeamento de partícula dentro das células com o objetivo de introduzir pelo menos uma molécula de polinucleotídeo exógeno dentro dos cloroplastos. Os polinucleotídeos exógenos selecionados tal que sejam integráveis dentro do genoma do cloroplasto por intermédio de recombinação homóloga que é facilmente efetuada pelas enzimas inerentes ao cloroplasto. Para esta finalidade, o polinucleotídeo exógeno inclui, além de um gene de interesse, pelo menos um trecho de polinucleotídeo que é derivado do genoma do cloroplasto. Além disso, o polinucleotídeo exógeno inclui um marcador selecionável, que serve pelos procedimentos de seleção sequencial para averiguar que todas ou substancialmente todas das cópias dos genomas de cloroplasto a seguir de tal seleção incluirá o polinucleotídeo exógeno. detalhes adicionais referentes a esta técnica são encontrados nas Pats. U.S. Nos. 4.945.050 e 5.693.507 que são aqui incorporadas por referência. Um polipeptídeo pode assim ser produzido pelo sistema de expressão de proteína do cloroplasto e tornar-se integrado dentro da membrana interna do cloroplasto.

[00205] Visto que os processos que aumentam o rendimento, rendimento de semente, rendimento de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, taxa de crescimento, biomassa, vigor, conteúdo de óleo, eficiência no uso de fertilizante, eficiência no uso de nitrogênio e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta pode envolver genes múltiplos atuando aditivamente ou em sinergia (ver, por exemplo, em Quesda et al., Plant Physiol. 130: 951- 063, 2002), a presente invenção também considera expressar uma pluralidade de polinucleotídeos exógenos em uma única planta hospedeira obter deste modo efeito superior sobre o rendimento, rendimento de semente, rendimento de fibra, qualidade da fibra, comprimento da fibra, taxa de crescimento, biomassa, vigor, conteúdo de óleo, eficiência no uso de fertilizante, eficiência no uso de nitrogênio e/ou tolerância ao estresse abiótico de uma planta.

[00206] A expressão de uma pluralidade de polinucleotídeos exógenos

62 / 378 em uma única planta hospedeira pode ser efetuada cointroduzindo-se construtos múltiplos de ácido nucléico, cada um incluindo um polinucleotídeo exógeno diferente, dentro de uma única célula vegetal. A célula transformada pode então ser regenerada em uma planta madura usando os métodos descritos acima.

[00207] Alternativamente, a expressão de uma pluralidade de polinucleotídeos exógenos em uma única planta hospedeira pode ser efetuada pela cointrodução dentro de uma única célula da planta de um único construto de ácido nucléico incluindo uma pluralidade de polinucleotídeos exógenos diferentes. Um tal construto pode ser planejado com uma única sequência promotora que pode transcrever um RNA mensageiro policistrônico incluindo todas as sequências de polinucleotídeo exógenas diferentes. Para permitir a cotradução dos polipeptídeos diferentes codificados pelo RNA mensageiro policistrônico, as sequências de polinucleotídeos podem ser interligadas por intermédio de uma sequência de sítio de entrada de ribossoma interno (IRES) que facilita a tradução de sequências de polinucleotídeos posicionadas a jusante da sequência IRES. Neste caso, uma molécula de RNA policistrônico transcrita codificando os diferentes polipeptídeos descritos acima será traduzida tanto a partir da extremidade 5’ encapuzada quanto das duas sequências de IRES internas da molécula de RNA policistrônico para deste modo produzir na célula todos os polipeptídeos diferentes. Alternativamente, o construto pode incluir diversas sequências promotoras cada uma ligada a uma sequência de polinucleotídeo exógeno diferente.

[00208] A célula vegetal transformada com o construto incluindo uma pluralidade de polinucleotídeos exógenos diferentes, pode ser regenerada dentro de uma planta madura, usando os métodos descritos acima.

[00209] Alternativamente, a expressão de uma pluralidade de polinucleotídeos exógenos em uma única planta hospedeira pode ser efetuada pela introdução de construtos de ácido nucléico diferentes, incluindo

63 / 378 polinucleotídeos exógenos diferentes, dentro de uma pluralidade das plantas. As plantas transformadas regeneradas podem ser depois cruzadas e a progênie resultante selecionada quanto aos traços superiores de tolerância ao estresse abiótico, a eficiência no uso de água, eficiência no uso de fertilizante, crescimento, biomassa, rendimento e/ou vigor, usando técnicas de reprodução de planta convencionais.

[00210] De acordo com algumas modalidades da invenção, o método compreende adicionalmente cultivar a planta expressando o polinucleotídeo exógeno sob o estresse abiótico.

[00211] Os exemplos não limitantes de condições de estresse abiótico incluem, salinidade, seca, privação de água, excesso de água (por exemplo, inundação, alagamento), etiolação, temperatura baixa, temperatura alta, toxidez de metal pesado, anaerobiose, deficiência de nutriente, excesso de nutriente, poluição atmosférica e irradiação UV.

[00212] De acordo com algumas modalidades da invenção, o método compreende adicionalmente cultivar a planta expressando o polinucleotídeo exógeno sob condições limitantes de fertilizante (por exemplo, condições limitantes de nitrogênio). Os exemplos não limitantes incluem cultivar a planta on solos com baixo conteúdo de nitrogênio (40 a 50% de Nitrogênio do conteúdo presente sob condições normais ou ótimas) ou ainda sob severa deficiência de nitrogênio (010% de Nitrogênio do conteúdo presente sob condições normais ou ótimas).

[00213] Assim, a invenção abrange plantas exogenamente expressando o(s) polinucleotídeo(s), os construtos de ácido nucléico e/ou polipeptídeo(s) da invenção.

[00214] Uma vez expressos dentro da célula vegetal ou da planta inteira, o nível do polipeptídeo codificado pelo polinucleotídeo exógeno pode ser determinado pelos métodos bem conhecidos na técnica tais como, ensaios de atividade, Western blots usando anticorpos capazes de especificamente

64 / 378 ligar o polipeptídeo, Ensaio Imunossorvente Ligado à Enzima (ELISA), radioimunoensaios (RIA), imuno-histoquímica, imunocitoquímica, imunofluorescência e os semelhantes.

[00215] Os métodos de determinar o nível na planta do RNA transcrito a partir do polinucleotídeo exógeno são bem conhecidos na técnica e incluem, por exemplo, a análise de Northern blot, análise da transcrição reversa seguida pela reação em cadeia da polimerase (RT-PCR) (incluindo a RT-PCR quantitativa, semiquantitativa ou em tempo real) e hibridização em situ de RNA.

[00216] A informação de sequência e anotações expostas pelas presentes descrições pode ser aproveitada em favor da reprodução clássica. Assim, os dados de subsequência destes polinucleotídeos descritos acima, podem ser usados como marcadores para a seleção assistida por marcador (MAS), na qual um marcador é usado para a seleção indireta de um determinante ou determinantes genéticos de um traço de interesse (por exemplo, biomassa, taxa de crescimento, conteúdo de óleo, rendimento, tolerância ao estresse abiótico, eficiência no uso de água, eficiência no uso de nitrogênio e/ou eficiência no uso de fertilizante). Os dados de ácido nucléico da presente descrição (sequência de DNA ou RNA) pode conter ou estar ligada aos sítios polimórficos ou marcadores genéticos no genoma tais como polimorfismo de comprimento de fragmento de restrição (RFLP), microssatélites e polimorfismo de nucleotídeo único (SNP), impressão digital de DNA (DFP), polimorfismo de comprimento de fragmento amplificado (AFLP), polimorfismo de nível de expressão, polimorfismo do polipeptídeo codificado e qualquer outro polimorfismo na sequência de DNA ou RNA.

[00217] Os exemplos de seleções assistidas por marcador incluem, mas não são limitadas à seleção quanto a um traço morfológico (por exemplo, um gene que afete a forma, coloração, esterilidade masculina ou resistência tal como a presença ou ausência de pragana, coloração da bainha da folha, altura,

65 / 378 cor do grão, aroma de arroz); seleção quanto a um traço bioquímico (por exemplo, um gene que codifique uma proteína que possa ser extraída e observada; por exemplo, isozimas e proteínas de armazenagem); seleção quanto a um traço biológico (por exemplo, raças de patógeno ou biotipos de inseto com base no patógeno hospedeiro ou interação com parasita hospedeiro podem ser usados como um marcador desde que a constituição genética de um organismo possa afetar a sua susceptibilidade aos patógenos ou parasitas).

[00218] Os polinucleotídeos e polipeptídeos descritos acima podem ser usados em uma ampla faixa de plantas econômicas, em uma maneira segura e constituição econômica.

[00219] As linhagens de planta exogenamente expressando o polinucleotídeo ou o polipeptídeo da invenção são triadas para identificar aquelas que mostram o maior aumento do traço de planta desejado.

[00220] O efeito do transgene (o polinucleotídeo exógeno codificando o polipeptídeo) sobre a tolerância ao estresse abiótico pode ser determinado usando métodos conhecidos tais como detalhados abaixo e na seção de Exemplos que segue.

[00221] Tolerância ao estresse abiótico – Plantas transformadas (isto é, expressando o transgene) e não transformadas (tipo selvagem) são expostas a uma condição de estresse abiótico, tal como privação de água, temperatura subótima (temperatura baixa, temperatura alta), deficiência de nutriente, excesso de nutriente, um condição de estresse salino, estresse osmótico, toxidez de metal pesado, anaerobiose, poluição atmosférica e irradiação UV.

[00222] Ensaio de tolerância à salinidade — Plantas transgênicas com tolerância às altas concentrações de sal são esperadas exibir melhor germinação, vigor ou crescimento de muda em sal alto. O estresse salino pode ser efetuado em muitos modos tais como, por exemplo, irrigando-se as plantas com uma solução hiperosmótica, cultivando-se as plantas hidroponicamente em uma solução de crescimento hiperosmótica (por exemplo, solução de

66 / 378 Hoagland) ou cultivando-se as plantas em um meio de crescimento hiperosmótico [por exemplo, meio de Murashige-Skoog a 50% (meio MS)]. Visto que plantas diferentes variam consideravelmente na sua tolerância à salinidade, a concentração de sal na água de irrigação, solução de crescimento ou meio de crescimento pode ser ajustada de acordo com aa características específicas do cultivar ou variedade específicos da planta, de modo a inflingir um efeito brando ou moderado sobre a fisiologia e/ou morfologia das plantas (para diretrizes como para concentração apropriada ver, Bernstein e Kafkafi, Root Growth Under Salinity Stress In: Plant Roots, The Hidden Half 3rd ed. Waisel Y, Eshel A e Kafkafi U. (editores) Marcel Dekker Inc., Nova Iorque, 2002 e referências nesta).

[00223] Por exemplo, um teste de tolerância à salinidade pode ser realizado irrigando-se as plantas em estágios desenvolvimentais diferentes com concentrações crescentes de cloreto de sódio (por exemplo 50 mM, 100 mM, 200 mM, 400 mM de NaCl) aplicados a partir do fundo e a partir do acima para garantir dispersão uniforme do sal. A seguir da exposição à condição de estresse as plantas são frequentemente monitoradas até que os efeitos fisiológicos e/ou morfológicos substanciais apareçam nas plantas do tipo selvagem. Assim, a aparência fenotípica externa, o grau de murchamento e sucesso global para atingir a maturidade e rendimento da progênie são comparados entre plantas de controle e transgênicas.

[00224] Os parâmetros quantitativos de tolerância medidos incluem, mas não são limitados aos pesos úmido e seco médios, taxa de crescimento, tamanho da folha, cobertura da folha (área de folha global), o peso das sementes produzidas, o tamanho de semente médio e o número de sementes produzidas por planta. As plantas transformadas não exibindo efeitos fisiológicos e/ou morfológicos substanciais ou exibindo biomassa mais alta do que as plantas do tipo selvagem, são identificadas como plantas tolerantes ao estresse abiótico.

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[00225] Teste de tolerância osmótica – Os ensaios de estresse osmótico (incluindo os ensaios com cloreto de sódio e manitol) são conduzidos para determinar se um fenótipo de estresse osmótico foi específico do cloreto de sódio ou se o mesmo foi um fenótipo relacionado com o estresse osmótico geral. As plantas que são tolerantes ao estresse osmótico podem ter mais tolerância à seca e/ou congelamento. Para os experimentos de germinação com sal e estresse osmótico, o meio é suplementado por exemplo com 50 mM, 100 mM, 200 mM de NaCl ou 100 mM, 200 mM de NaCl, 400 mM de manitol.

[00226] Ensaio de tolerância à seca/Ensaio Osmótico – A tolerância à seca é realizada para identificar os genes conferindo melhor sobrevivência de planta depois da privação aguda de água. Para analisar se as plantas transgênicas são mais tolerantes à seca, um estresse osmótico produzido pelo osmólito não iônico sorbitol no meio pode ser realizado. As plantas de controle e transgênicas são germinadas e cultivadas em placas de planta-ágar durante 4 dias, depois do que elas são transferidas para placas contendo 500 mM de sorbitol. O tratamento causa retardo no crescimento, depois tanto as plantas de controle quanto as plantas transgênicas são comparadas, medindo- se o peso da planta (úmida e seca), rendimento e pelas taxas de crescimento medidas como tempo para florescimento.

[00227] Ao contrário, triagens secas à base de solo são realizadas com plantas superexpressando os polinucleotídeos detalhados acima. As sementes de plantas Arabidopsis de controle ou outras plantas transgênicas superexpressando o polipeptídeo da invenção são germinadas e transferidas para vasos. O estresse pela seca é obtido depois que a irrigação é cessada acompanhada pela colocação dos vasos sobre papel de absorção para realçar a taxa de secagem do solo. As plantas transgênicas e de controle são comparadas entre si quando a maioria das plantas de controle desenvolvem murchamento severo. As plantas são novamente irrigadas depois de se obter

68 / 378 uma fração significante das plantas de controle demonstrando um murchamento severo. As plantas são classificadas comparando-se aos controles para cada um de dois critérios: tolerância às condições de seca e recuperação (sobrevivência) a seguir da retomada da irrigação.

[00228] Tolerância ao estresse pelo frio - Para analisar o estresse pelo frio, plantas maduras (25 dias de idade) são transferidas para câmaras a 4°C durante 1 ou 2 semanas, com luz constitutiva. Mais tarde as plantas são movidas de volta para a estufa. Duas semanas mais tarde os danos do período de congelamento, resultando no retardo de crescimento e outros fenótipos, são comparados tanto entre as plantas de controle quanto transgênicas, medindo- se o peso da planta (úmida e seca) e comparando-se as taxas de crescimento medidas como tempo para florescimento, tamanho de planta, rendimento e os semelhantes.

[00229] Tolerância ao estresse de calor – A tolerância ao estresse de calor é obtida pela exposição das plantas às temperaturas acima de 34°C durante um certo período. A tolerância de planta é examinada depois de transferir as plantas de volta para 22°C durante a recuperação e avaliação depois de 5 dias em relação aos controles internos (plantas não transgênicas) ou plantas não expostas nem aos estresses pelo frio ou calor.

[00230] A eficiência no uso de água — pode ser determinado como a biomassa produzida por transpiração unitária. Para analisar WUE, o conteúdo de água em relação à folha pode ser medido nas plantas de controle e transgênica. O peso fresco (FW) é imediatamente registrado; depois folhas são embebidas durante 8 horas em água destilada na temperatura ambiente no escuro e o peso túrgido (TW) é registrado. O peso seco total (DW) é registrado depois da secagem das folhas a 60°C a um peso constante. O conteúdo de água relativo (RWC) é calculado de acordo com a seguinte Fórmula I: Formula I

69 / 378 RWC = [(FW — DW) / (TW — DW)] x 100

[00231] Eficiência no uso de fertilizante - Para analisar se as plantas transgênicas são mais responsivas aos fertilizantes, as plantas são cultivadas em placas de ágar ou vasos com uma quantidade limitada de fertilizante, como descrito, por exemplo, Yanagisawa et al (Proc Natl Acad Sci U S A. 2004; 101: 7833-8). As plantas são analisadas quanto aos seu tamanho, tempo para florescimento, rendimento, conteúdo de proteína de broto e/ou grão global. Os parâmetros checados são o tamanho global da planta madura, o seu peso úmido e seco, o peso das sementes produzidas, o tamanho de semente médio e o número de sementes produzidas por planta. Outros parâmetros que podem ser testados são: o conteúdo de clorofila das folhas (como situação de nitrogênio da planta e o grau de verdura da folha é altamente correlacionado), aminoácido e o conteúdo de proteína total das sementes ou outras partes de planta tais como folhas ou brotos, conteúdo de óleo, etc. Similarmente, ao invés de prover nitrogênio em quantidades limitantes, fosfato ou potássio podem ser adicionando em concentrações crescentes. Mais uma vez, os mesmos parâmetros medidos são os mesmos como listados acima. Deste modo, a eficiência no uso de nitrogênio (NUE), eficiência no uso de fosfato (PUE) e eficiência no uso de potássio (KUE) são avaliados, checando a capacidade das plantas transgênicas para crescer sob condições restritiva de nutriente.

[00232] Eficiência no uso de nitrogênio — Para analisar se as plantas transgênicas (por exemplo, plantas Arabidopsis) são mais responsivas para nitrogênio, as plantas são cultivadas em 0,75 a 3 mM (condições deficientes nitrogênios) ou 6 a 10 mM (concentração de nitrogênio ótima). As plantas são deixadas crescer durante 25 dias adicionais ou até a produção de semente. As plantas são depois analisadas quanto ao seu tamanho global, tempo para florescimento, rendimento, conteúdo de proteína de broto e/ou produção de grão/semente. Os parâmetros checados podem ser o tamanho global da planta,

70 / 378 peso úmido e seco, o peso das sementes produzidas, o tamanho médio de semente e o número de sementes produzidas por planta. Outros parâmetros que podem ser testados são: o conteúdo de clorofila de folhas (visto que a situação de nitrogênio da planta e o grau de verdor da folha estão altamente correlacionados), aminoácido e o conteúdo de proteína total das sementes ou outras partes da planta tais como folhas ou brotos e conteúdo de óleo. As plantas transformadas não exibindo efeitos fisiológicos e/ou morfológicos ou exibindo níveis mais altos dos parâmetros medidos do que as plantas do tipo selvagem, são identificadas como plantas eficientes no uso de nitrogênio.

[00233] Ensaio de eficiência no uso de nitrogênio usando plântulas — O ensaio é feito de acordo com Yanagisawa-S. et al. com modificações menores (“Metabolic engineering with Dofl transciption factor em plants: Improved nitrogen assimilation and growth under low-nitrogen conditions” Proc. Natl. Acad. Sci. USA 101, 7833-7838). Em resumo, as plantas transgênicas que são cultivadas durante 7 a 10 dias em 0,5 x MS [Murashige- Skoog] suplementado com um agente de seleção são transferidos para duas condições limitantes de nitrogênio: meio MS no qual a concentração de nitrogênio combinada (NH4NO3 e KNO3) foi 0,75 mM (condições deficientes em nitrogênio) ou 6 a 15 mM (concentração de nitrogênio ótima). As plantas são deixadas crescer durante 30 a 40 dias adicionais e depois fotografadas, individualmente removidas do Ágar (o broto sem as raízes) e imediatamente pesadas (peso fresco) para a análise estatística mais tarde. Os construtos para os quais apenas sementes T1 são disponíveis são semeadas sobre meios seletivos e pelo menos 20 mudas (cada um representando um evento de transformação independente) são cuidadosamente transferidas para os meios limitados em nitrogênio. Para os construtos para os quais sementes T2 são disponíveis, eventos de transformação diferentes são analisados. Usualmente, 20 plantas aleatoriamente selecionado a partir de cada evento são transferidas para os meios limitados em nitrogênio deixadas crescer durante 3 a 4 semanas

71 / 378 adicionais e individualmente pesados no final deste período. Plantas transgênicas são comparadas para plantas de controle cultivadas em paralelo sob as mesmas condições. Plantas transgênicas simuladas expressando o gene repórter uidA (GUS) sob os mesmos promotores ou plantas transgênicas carregando o mesmo promotor, mas carecendo de um gene repórter são usadas como controle.

[00234] Determinação de nitrogênio — O procedimento para a determinação da concentração de N (nitrogênio) nas partes estruturais das plantas envolve o método de digestão de persulfato de potássio para converter N orgânico para NO3- (Purcell e King 1996 Argon. J. 88: 111-113, a redução mediada de Cd- modificada de NO3- para NO2- (Vodovotz 1996 Biotechniques 20: 390-394) e a medição de nitrito pelo ensaio de Griess (Vodovotz 1996, supra). Os valores de absorbância são medidos a 550 nm contra uma curva padrão de NaNO2. O procedimento é descrito em detalhes em Samonte et al. 2006 Agron. J. 98: 168-176.

[00235] Testes de germinação – Os testes de germinação comparam a porcentagem de sementes de plantas transgênicas que completaria o processo de germinação para a porcentagem de sementes de plantas de controle que são tratados da mesma maneira. As condições normais são consideradas por exemplo, incubações a 22°C sob ciclos diários de 22 horas de luz e 2 horas de escuro. A avaliação de germinação e vigor de muda é conduzida entre 4 e 14 dias depois do plantio. O meio basal é meio MS a 50% (Murashige e Skoog, 1962 Plant Physiology 15, 473-497).

[00236] A germinação é checada também em condições desfavoráveis tais como frio (incubando em temperaturas mais baixas do que 10°C ao invés de 22°C) ou usando soluções de inibição de semente que contém altas concentrações de um osmólito tal como sorbitol (nas concentrações de 50 mM, 100 mM, 200 mM, 300 mM, 500 mM e até 1000 mM) ou aplicando concentrações crescentes de sal (de 50 mM, 100 mM, 200 mM, 300 mM, 500

72 / 378 mM de NaCl).

[00237] O efeito do transgene sobre o vigor, taxa de crescimento, biomassa, rendimento e/ou conteúdo de óleo da planta pode ser determinado usando métodos conhecidos.

[00238] Vigor da planta - O vigor da planta pode ser calculado pelo aumento nos parâmetros de crescimento tais como área de folha, comprimento da fibra, diâmetro da roseta, peso fresco de planta e os semelhantes por tempo.

[00239] Taxa de crescimento - A taxa de crescimento pode ser medida usando análise de digital de plantas em crescimento. Por exemplo, imagens das plantas em crescimento na estufa com base no terreno podem ser capturadas a cada 3 dias e a área da roseta pode ser calculada pela análise digital. A área de crescimento da roseta é calculada usando a diferença da área da roseta entre dias de amostragem dividida pela diferença em dias entre as amostras.

[00240] A avaliação da taxa de crescimento pode ser feita medindo-se a biomassa vegetal produzida, área da roseta, tamanho da folha ou comprimento da raiz por tempo (podem ser medidas em cm2 por dia da área de folha).

[00241] A área de crescimento relativo pode ser calculada usando a Fórmula II. Formula II: Área de taxa de crescimento relativa = Coeficiente de regressão de área ao longo do curso de tempo.

[00242] Assim, a taxa de área de crescimento relativo está em unidades de 1/dia e a taxa de crescimento do comprimento está em unidades de 1/dia.

[00243] Rendimento de semente - Avaliação do rendimento de semente por planta pode ser feita medindo-se a quantidade (peso ou tamanho) ou quantidade (isto é, número) de sementes secas produzida e colhida de 8 a 16

73 / 378 plantas e dividida pelo número de plantas.

[00244] Por exemplo, as sementes totais de 8 a 16 plantas podem ser coletadas, pesadas usando por exemplo, uma balança analítica e o peso total pode ser dividido pelo número de plantas. O rendimento de semente por área cultivada pode ser calculado da mesma maneira embora levando em conta a área de cultivo dada para uma única planta. O rendimento de semente por área cultivada aumentado seria obtido aumentando-se o rendimento de semente por planta e/ou aumentando-se o número de plantas capazes de cultivar em uma dada área.

[00245] Além disso, o rendimento de semente pode ser determinado por intermédio do peso de 1000 sementes. O peso de 1000 sementes pode ser determinado como segue: as sementes são dispersas sobre uma bandeja de vidro e uma fotografia é tirada. Cada amostra é pesada e depois usando a análise digital, o número de sementes em cada amostra é calculada.

[00246] O peso de 1000 sementes pode ser calculado usando a fórmula III: Fórmula III: Peso de 1000 Sementes = número de sementes na amostra/ peso da amostra X 1000

[00247] O índice de colheita pode ser calculado usando Fórmula IV Fórmula IV: Índice de colheita = Rendimento médio de semente por planta/ Peso seco médio

[00248] Concentração de proteína de grão – O conteúdo de proteína de grão (g de proteína de grão m-2) é estimado como o produto da massa de grão N (g grão N m-2) multiplicado pelo N/razão de conversão de proteína de k-5,13 (Mosse 1990, supra). A concentração de proteína do grão é estimada como a razão do conteúdo de proteína de grão por massa unitária do grão (g de proteína do grão kg-1 de grão).

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[00249] Comprimento da fibra – O comprimento da fibra pode ser medido usando fibrograph. O sistema fibrograph foi usado para computar o comprimento em termos de comprimento “Médio da Metade Superior”. A média da metade superior (UHM) é o comprimento médio da metade mais longa da distribuição de fibra. O fibrograph mede o comprimento em comprimentos intervalos em um dado ponto de porcentagem (Hypertext Transfer Protocol:// World Wide Web (dot) cottoninc (dot)com/ClassificationofCotton/?Pg=4#Length).

[00250] De acordo com algumas modalidades da invenção, o rendimento aumentado do milho pode ser manifestado como um ou mais dos seguintes: aumento no número de plantas por área cultivada, aumento no número de espigas por planta, aumento no número de fileiras por espiga, número de grãos por fileira da espiga, peso do grão, peso de mil grãos (1000- peso), comprimento/diâmetro da espiga, conteúdo de óleo aumentado por grão e aumento do conteúdo de amido per grão.

[00251] Como mencionado, o aumento de rendimento da planta pode ser determinado pelos diversos parâmetros. Por exemplo, o rendimento aumentado de arroz pode ser manifestado por um aumento em um ou mais dos seguintes: número de plantas por área cultivada, número de panículas por planta, número de espiguetas por panículo, número de flores por panículo, aumento na taxa de enchimento de semente, aumento no peso de mil grãos (1000-peso), aumento no conteúdo de óleo por semente, aumento do conteúdo de amido por semente, entre outros. Um aumento no rendimento também pode resultar em arquitetura modificada ou pode ocorrer por causa da arquitetura modificada.

[00252] Similarmente, o rendimento aumentado de soja pode ser manifestado por um aumento em um ou mais dos seguintes: número de plantas por área cultivada, número de vagens por planta, número de sementes por vagem, aumento na taxa de enchimento de semente, aumento no peso de

75 / 378 mil sementes (1000-peso), redução no rompimento de vagem, aumento no conteúdo de óleo por semente, aumento no conteúdo de proteína por semente, entre outras. Um aumento no rendimento também pode resultar na arquitetura modificada ou pode ocorrer por causa da arquitetura modificada.

[00253] O rendimento aumentado de canola pode ser manifestado por um aumento em um ou mais dos seguintes: número de plantas por área cultivada, número de vagens por planta, número de sementes por vagem, aumento na taxa de enchimento de semente, aumento no peso de mil sementes (1000-peso), redução no rompimento de vagem, aumento do conteúdo de óleo por semente, entre outras. Um aumento no rendimento também pode resultar em arquitetura modificada ou pode ocorrer por causa da arquitetura modificada.

[00254] O rendimento aumentado do algodão pode ser manifestado por um aumento em um ou mais dos seguintes: número de plantas por área cultivada, número de cápsula por planta, número de sementes por cápsula, aumento na taxa de enchimento de semente, aumento no peso de mil sementes (1000-peso), aumento no conteúdo de óleo por semente, melhora no comprimento da fibra, resistência da fibra, entre outras. Um aumento no rendimento também pode resultar em arquitetura modificada ou pode ocorrer por causa da arquitetura modificada.

[00255] Conteúdo de óleo - O conteúdo de óleo de uma planta pode ser determinado pela extração do óleo da semente ou da porção vegetativa da planta. Em resumo, lipídeos (óleo) podem ser removidos da planta (por exemplo, semente) triturando-se o tecido da planta na presença de solventes específicos (por exemplo, hexano ou éter de petróleo) e extraindo o óleo em um extrator contínuo. A análise indireta do conteúdo de óleo pode ser realizada usando diversos métodos conhecidos tais como a Espectroscopia de Ressonância Magnética Nuclear (RMN), que mede a energia de ressonância absorvida pelos átomos de hidrogênio no estado líquido da amostra [ver, por

76 / 378 exemplo, Conway TF. e Earle FR., 1963, Journal of the American Oil Chemists’ Society; Springer Berlin / Heidelberg, ISSN: 0003-021X (Impresso) 1558-9331 (On line)]; a Espectroscopia Próxima ao Infravermelho (NI), que utiliza a absorção de energia próxima ao infravermelho (1100-2500 nm) pela amostra; e um método descrito na WO/2001/023884, que é fundamentado na extração do óleo com um solvente, evaporando o solvente em uma corrente gasosa que forma partículas de óleo e direcionando uma luz dentro da corrente gasosa e partículas de óleo que forma uma luz refletida detectável.

[00256] Assim, a presente invenção é de alto valor agrícola para promover o rendimento de safras comercialmente desejadas (por exemplo, biomassa de órgão vegetativo tal como madeira de choupo ou órgão reprodutivo tal como número de sementes ou biomassa de semente).

[00257] Qualquer uma das plantas transgênicas descritas acima ou partes das mesmas podem ser processadas para produzir uma preparação de ração, farinha, proteína ou óleo, tal como para animais ruminantes.

[00258] As plantas transgênicas descritas acima, que exibem um conteúdo de óleo aumentado podem ser usadas para produzir óleo vegetal (pela extração do óleo da planta).

[00259] O óleo vegetal (incluindo o óleo de semente e/ou o óleo da porção vegetativa) produzido de acordo com o método da invenção pode ser combinado com uma variedade de outros ingredientes. Os ingredientes específicos incluídos em um produto são determinados de acordo com o uso pretendido. Os produtos exemplares incluem ração animal, matéria prima para modificação química, plástico biodegradável, produto alimentício combinado, óleo comestível, biocombustível, óleo de cozer, lubrificante, biodiesel, salgadinhos, cosméticos e matéria-prima para processo de fermentação. Os produtos exemplares a serem incorporados ao óleo vegetal incluem rações para animais, produtos para alimentação humana tais como salgadinhos

77 / 378 extrusados, pães, como um agente aglutinante de alimento, rações de aquacultura, misturas fermentáveis, suplementos alimentícios, bebidas esportivas, barras de alimento nutricional, suplementos multivitamínicos, bebidas de dieta e alimentos de cereais.

[00260] De acordo com algumas modalidades da invenção, o óleo compreende um óleo de semente.

[00261] De acordo com algumas modalidades da invenção, o óleo compreende um óleo da porção vegetativa (óleo da porção vegetativa da planta).

[00262] De acordo com algumas modalidades da invenção, a célula vegetal forma uma parte de uma planta.

[00263] Como aqui usados o termo “cerca de” se refere a ± 10%.

[00264] Os termos “compreende”, “compreendendo”, “inclui”, “incluindo”, “tendo” e seus conjugados significa “incluindo, mas não limitado a”.

[00265] O termo “consistindo de” significa “incluindo e limitado a”.

[00266] O termo “consistindo essencialmente de” significa que a composição, método ou estrutura podem incluir ingredientes, etapas e/ou partes adicionais, mas apenas se os ingredientes, etapas e/ou partes adicionais não alterarem materialmente as características básicas e novas da composição, método ou estrutura reivindicados.

[00267] Como aqui usado, a forma singular “um”, “uma” e “o/a” incluem referências plurais a menos que o contexto claramente dite de outro modo. Por exemplo, o termo “um composto” ou “pelo menos um composto” pode incluir uma pluralidade de compostos, incluindo misturas dos mesmos.

[00268] Por todo este documento, várias modalidades desta invenção podem ser apresentadas em um formato de faixa. Deve ser entendido que a descrição no formato de faixa é meramente por conveniência e brevidade e não deve ser interpretado como uma limitação inflexível no escopo da

78 / 378 invenção. Consequentemente, a descrição de uma faixa deve ser especificamente considerada de forma a incluir todas as subfaixas possíveis descritas, assim como valores numéricos individuais dentro desta faixa. Por exemplo, a descrição de uma faixa tal como de 1 a 6 deve ser considerada ter subfaixas especificamente descritas tais como de 1 a 3, de 1 a 4, de 1 a 5, de 2 a 4, de 2 a 6, de 3 a 6 etc., assim como números individuais dentro desta faixa, por exemplo, 1, 2, 3, 4, 5 e 6. Isto se aplica independente da amplitude da faixa.

[00269] Sempre que uma faixa numérica é aqui indicada, é intencionado incluir qualquer numeral citado (fracionário ou integral) dentro da faixa indicada. As frases “variando/varia entre” um primeiro número indicado e um segundo número indicado e “variando/varia de” um primeiro número indicado “para” um segundo número indicado são aqui usadas intercambiavelmente e são intencionados a incluir o primeiro e segundo números indicados e todos os numerais fracionários e inteiros entre estes.

[00270] Como aqui usado o termo “método” se refere às maneiras, meios, técnicas e procedimentos para realizar uma dada tarefa incluindo, mas não limitados àquelas maneiras, meios, técnicas e procedimentos conhecidos ou facilmente desenvolvidos a partir de maneiras, meios, técnicas e procedimentos conhecidos pelos técnicos das técnicas química, farmacológica, biológica, bioquímica e médica.

[00271] É avaliado que certos traços da invenção, que são, para clareza, descritos no contexto de modalidades separadas, também podem ser providas em combinação em uma única modalidade. Ao contrário, diversos traços da invenção, que são, por brevidade, descritos no contexto de uma única modalidade, também podem ser providos separadamente ou em qualquer subcombinação adequada ou como adequado em qualquer outra modalidade descrita da invenção. Certos traços descritos no contexto de várias modalidades não devem ser considerados traços essenciais destas

79 / 378 modalidades, a menos que a modalidade seja inoperante sem estes elementos.

[00272] Várias modalidades e aspectos da presente invenção como delineados acima e como reivindicados na seção reivindicações abaixo encontram suporte experimental nos seguintes exemplos.

EXEMPLOS

[00273] Referência é agora feita aos seguintes exemplos, que juntos com as descrições acima ilustram algumas modalidades da invenção em uma maneira não limitante.

[00274] Geralmente, a nomenclatura aqui usada e os procedimentos de laboratório utilizados na presente invenção incluem técnicas moleculares, bioquímicas, microbiológicas e de DNA recombinante. Tais técnicas são completamente explicadas na literatura. Ver, por exemplo, “Molecular Cloning: A Laboratory Manual” Sambrook et al., (1989); “Current Protocols em Molecular Biology” Volumes I-III Ausubel, R. M., ed. (1994); Ausubel et al., “Current Protocols em Molecular Biology”, John Wiley and Sons, Baltimore, Mariland (1989); Perbal, “A Practical Guide to Molecular Cloning”, John Wiley & Sons, Nova Iorque (1988); Watson et al., “Recombinant DNA”, Scientific American Books, Nova Iorque; Birren et al. (eds) “Genome Analysis: A Laboratory Manual Series”, Vols. 1-4, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Nova Iorque (1998); metodologias como apresentadas nas Pats. U.S. Nos. 4.666.828, 4.683.202, 4.801.531, 5.192.659 e 5.272.057; “Cell Biology: A Laboratory Handbook”, Volumes I-III Cells, J. E., ed. (1994); “Current Protocols em Immunology” Volumes I-III Coligan J. E., ed. (1994); Stites et al. (eds), “Basic and Clinical Immunology” (8a Edição), Appleton & Lange, Norwalk, CT (1994); Mishell e Shiigi (eds), “Selected Methods em Cellular Immunology”, W. H. Freeman e Co., Nova Iorque (1980); os imunoensaios disponíveis são extensivamente descritos na literatura de patente e científica, ver, por exemplo, as Pats. U.S. Nos.

3.791.932, 3.839.153, 3.850.752, 3.850.578, 3.853.987, 3.867.517, 3.879.262,

80 / 378

3.901.654, 3.935.074, 3.984.533, 3.996.345, 4.034.074, 4.098.876, 4.879.219,

5.011.771 e 5.281.521; “Oligonucleotídeo Synthesis” Gait, M. J., ed. (1984); “Nucleic Acid Hybridization” Hames, B. D. e Higgins S. J., eds. (1985); “Transcription and Translation” Hames, B. D. e Higgins S. J., Eds. (1984); “Animal Cell Culture” Freshney, R. I., ed. (1986); “Immobilized Cells and Enzymes” IRL Press, (1986); “A Practical Guide to Molecular Cloning” Perbal, B., (1984) e “Methods em Enzymology” Vol. 1-317, Academic Press; “PCR Protocols: A Guide To Methods And Applications”, Academic Press, San Diego, CA (1990); Marshak et al., “Strategies for Protein Purification and Characterization - A Laboratory Course Manual” CSHL Press (1996); todas das quais são incorporadas por referência como se completamente aqui apresentada. Outras referências gerais são providas por todo este documento. Os procedimentos nessas são acreditados ser bem conhecidos na técnica e são providos para a conveniência do leitor. Toda a informação contida nessas é aqui incorporada por referência.

MÉTODOS GERAIS EXPERIMENTAIS E DE BIOINFORMÁTICA

[00275] Extração de RNA — Tecidos crescendo em várias condições de crescimento (como descritas abaixo) foram amostrados e o RNA foi extraído usando Reagente TRIzol da Invitrogen [Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) invitrogen (dot) com/content(dot)cfm?pageid=469]. Aproximadamente 30 a 50 mg de tecido foram recolhidos das amostras. Os tecidos pesados foram triturados usando pistilo e almofariz em nitrogênio líquido e recolocados em suspensão em 500 μl de Reagente TRIzol. Ao lisado homogeneizado, 100 μl de clorofórmio foram adicionados seguidos pela precipitação usando isopropanol e duas lavagens com 75% de etanol. O RNA foi eluído em 30 μl de água livre de RNase. As amostras de RNA foram limpas usando o protocolo de limpeza do mini conjunto RNeasy da Qiagen como pelo protocolo do fabricante (QIAGEN Inc, CA USA). Por conveniência, cada tipo de

81 / 378 tecido com informação de expressão de microarranjo recebeu uma expressão Set ID.

[00276] Análise de correlação — foi realizada para genes selecionados de acordo com algumas modalidades da invenção, em que os parâmetros distinguidos (parâmetros medidos de acordo com as Ids de correlação) foram usados como “eixo X” para a correlação com o transcriptoma tecidual que foi usado como o “eixo Y”. Para cada gene e parâmetro medido um coeficiente de correlação “R” foi calculado [usando o teste de correlação de Pearson Hypertext Transfer Protocol:// World Wide Web (dot) davidmlane (dot) com/hyperstat/A34739 (dot) html] junto com um valor p para a significância da correlação. Quando o coeficiente de correlação (R) entre os níveis de uma expressão de gene em um certo tecido e um desempenho fenotípico através de ecotipos/variedade/híbrido é alto em valor absoluto (entre 0,5 e 1), existe uma associação entre o gene (especificamente o nível de expressão deste gene) a característica fenotípica (por exemplo, eficiência melhorada no uso de nitrogênio, tolerância ao estresse abiótico, rendimento, taxa de crescimento e os semelhantes). Uma correlação positiva indica que a expressão do gene em um certo tecido ou estágio desenvolvimental e o vetor de correlação (desempenho fenotípico) são positivamente associados (ambos, a expressão e o desempenho fenotípico aumentam ou diminuem simultaneamente) enquanto uma correlação negativa indica uma associação negativa (enquanto uma está aumentando a outra está diminuindo e vice e versa). EXEMPLO 1

IDENTIFICAÇÃO DE GENES E PAPEL PREVISTO USANDO FERAMENTAS DE BIOINFORMÁTICA

[00277] Os presentes inventores identificaram polinucleotídeos que podem aumentar o rendimento da planta, rendimento de semente, rendimento de óleo, conteúdo de óleo, biomassa, taxa de crescimento, rendimento de fibra e/ou qualidade, tolerância ao estresse abiótico, eficiência no uso de nitrogênio

82 / 378 e/ou vigor de uma planta, como segue.

[00278] Os conjuntos de dados de sequência de nucleotídeo aqui usados foram de bases de dados publicamente disponíveis ou de sequências obtidas usando a tecnologia Solexa (por exemplo Cevada e Sorgo). Os dados de sequência de 100 espécies de planta diferentes foram introduzidos dentro de uma única base de dados, compreensiva. Outras informações sobre a expressão de gene, anotação de proteína, enzimas e caminhos também foram incorporadas. As bases de dados principais usadas incluem: Genomas

[00279] Genoma de Arabidopsis [genoma TAIR versão 8 (Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) arabidopsis (dot) org/)]; Genoma do Arroz [construção 6.0 (Hypertext Transfer Protocol://rice (dot) plantbiology(dot)msu(dot)edu/index. shtml]; Choupo [Populus trichocarpa cessão 1.1 da JGI (cessão de montagem v1.0) (Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) genoma (dot) jgi-psf (dot) org/)]; Brachypodium [montagem 4x da JGI, Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) brachpodium (dot) org)]; Soja [DOE-JGI SCP, versão Glyma 1 (Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) phytozome (dot) net/)]; Uva [French-Italian Public Consortium for Grapevine Genome Characterization genoma da videira (Hypertext Transfer Protocol:// World Wide Web (dot) genoscope (dot) cns (dot) fr /)]; Mamona [TIGR/J Craig Venter Institute montagem 4x [(Hypertext Transfer Protocol://msc (dot) jcvi (dot) org/r communis]; Sorgo [DOE-JGI SCP, versão Sbi1 [Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) phytozome (dot) net/)]; Genoma parcialmente montado do Milho [Hypertext Transfer Protocol://maizesequence (dot) org/];

83 / 378 As sequências de EST e mRNA expressas foram extraídos das seguintes bases de dados: Sequências de EST e RNA da NCBI (Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) ncbi (dot) nlm (dot) nih (dot) gov/dbEST/); RefSeq (Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) ncbi (dot) nlm (dot) nih (dot) gov/RefSeq/); TAIR (Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) arabidopsis (dot) org/); Bases de dados de proteína e caminho Uniprot [Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) uniprot (dot) org/]; AraCyc [Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) arabidopsis (dot) org/biocyc/index (dot) jsp]; ENZYME [Hypertext Transfer Protocol://expasy (dot) org/enzima/]. Os conjuntos de dados de microarranjo foram baixados da: GEO (Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web.ncbi.nlm.nih.gov/geo/) TAIR (Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web.arabidopsis.org/).

[00280] Dados de microarranjo patenteados (Ver a WO2008/122980) e Exemplos 2 a 9 abaixo. Informação de QTL e SNPs

[00281] Gramene [Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) gramene (dot) org/qtl/].

[00282] Panzea [Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) panzea (dot) org/index (dot) html].

[00283] Montagem de Base de Dados - foi realizada para construir uma base de dados ampla, rica, confiavelmente anotada e fácil de analisar compreendida de dados de sequências de mRNA genômico, ESTs DNA publicamente disponíveis, de várias safras assim como dados de expressão de

84 / 378 gene, anotação de proteína e caminho QTLs e outras informações relevantes.

[00284] A montagem de base de dados é compreendida de uma caixa de ferramentas com ferramentas refino, estruturação, anotação e análise de gene permitindo construir uma base de dados feita de encomenda para cada projeto de verificação de gene. As ferramentas de refino e estruturação de gene permitem detectar confiavelmente variantes de junção e transcritos antissentido, gerando entendimento de diversos resultados fenotípicos potenciais de um único gene. As capacidades da plataforma “LEADS” de Compugen LTD para analisar genoma humano foram confirmadas e aceitas pela comunidade científica [ver por exemplo, “Widespread Antisense Transcription”, Yelin, et al. (2003) Nature Biotechnology 21, 379-85; “Splicing of Alu Sequences”, Lev-Maor, et al. (2003) Science 300 (5623), 1288-91; “Computational analysis of alternative splicing usando EST tissue information”, Xie H et al. Genomics 2002] e foram comprovados ser mais eficientes também na genômica vegetal.

[00285] Clusterização ST e montagem de gene – Para a clusterização e montagem de gene de organismos com dados de sequência de genoma disponíveis (Arabidopsis, arroz, mamona, uva, brachypodium, choupo, soja, sorgo) a versão genômica de LEADS (GANG) foi utilizada. Esta ferramenta permite a clusterização mais precisa de ESTs e sequências de mRNA no genoma e prevê a estrutura do gene assim como eventos juncionais alternativos e transcrição antissentido.

[00286] Para os organismos sem nenhum dado de sequência de genoma completo disponível, o software de clusterização “LEADS expresso” foi aplicado. Anotação de gene – os genes e proteínas previstos foram anotados como segue: Pesquisa Blast [Hypertext Transfer Protocol://blast (dot) ncbi (dot) nlm (dot) nih (dot) gov /Blast (dot) cgi] contra todas as sequências de

85 / 378 plantas UniProt [Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) uniprot (dot) org/] foi realizada. Os quadros de leitura aberta de cada transcrito putativo foram analisados e a ORF mais longa com número mais alto de homólogos foi selecionado como proteína prevista do transcrito. As proteínas previstas foram analisadas pelo InterPro [Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) ebi (dot) ac (dot) uk/interpro/].

[00287] Blast contra as bases de dados de proteínas AraCyc e ENZYME foi usado para mapear os transcritos previstos para os caminhos AraCyc.

[00288] As proteínas previstas de espécies diferentes foram comparadas usando algoritmo blast [Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) ncbi (dot) nlm (dot) nih (dot) gov /Blast (dot) cgi] para validar a exatidão da sequência de proteína prevista e para a detecção eficiente de ortólogos.

[00289] Estabelecimento de perfil da expressão de gene - Diversas fontes de dados foram utilizadas para o estabelecimento do perfil de expressão de gene que combinou dados de microarranjo e perfil de expressão digital (ver abaixo). De acordo com o perfil de expressão de gene, uma análise de correlação foi realizada para identificar genes que são corregulados sob diferentes estágios de desenvolvimento e condições ambientais e que são associados com diferentes fenótipos.

[00290] Os conjuntos de dados de microarranjo publicamente disponíveis foram baixados dos websites TAIR e NCBI GEO, renormalizados e integrados dentro da base de dados. O estabelecimento do perfil de expressão é um dos dados de recurso mais importante para identificar genes importantes para o rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, tolerância ao estresse abiótico das plantas e eficiência no uso de nitrogênio.

[00291] Um resumo do perfil de expressão digital foi compilado para

86 / 378 cada cluster de acordo com todas as palavras-chaves incluídas nos registros de sequência compreendendo o cluster. A expressão digital, também conhecida como Northern Blot eletrônica, é uma ferramenta que exibe o perfil de expressão virtual com base nas sequências nas sequências EST formando o cluster de gene. A ferramenta provê o perfil de expressão de um cluster em termos da anatomia da planta (por exemplo, o tecido/órgão nos quais o gene é expresso), estágio desenvolvimental (por exemplo, os estágios desenvolvimentais nos quais um gene pode ser encontrado/expresso) e perfil de tratamento (provê as condições fisiológicas sob as quais um gene é expresso tais como seca, frio, infecção por patógeno, etc). Dada uma distribuição aleatória de ESTs nos clusters diferentes, a expressão digital provê um valor de probabilidade que descreve a probabilidade de um cluster tendo um total de N ESTs para conter X ESTs a partir de uma certa coleção de bibliotecas. Para os cálculos de probabilidade, o seguinte é levado em consideração: a) o número de ESTs no cluster, b) o número de ESTs das bibliotecas implicadas e relacionadas, c) o número global de ESTs disponível representando a espécie. Deste modo clusters com baixos valores de probabilidade são altamente enriquecidos com ESTs do grupo de bibliotecas de interesse indicando uma expressão especializada.

[00292] Recentemente, a exatidão deste sistema foi demonstrada por Portnoy et al., 2009 (Analysis Of The Melon Fruit Transcriptome Based On 454 Pyrosequencing) em: Plant & Animal Genomes XVII Conference, San Diego, CA. A análise transcriptômica, com base na abundância de EST relativa nos dados foi realizada pelos 454 pirossequenciamento de cDNA representando mRNA da fruta melão. Catorze amostras de cDNA de filamento duplo obtidas a partir de dois genótipos, dois tecidos de fruta (polpa e casca) e quatro estágios desenvolvimentais foram sequenciados. O pirossequenciamento de GS FLX (Roche/454 Life Sciences) de amostras de cDNA não normalizadas e purificadas produziram 1.150.657 etiquetas de

87 / 378 sequência expressas que montaram em 67.477 unigenes (32.357 singletons e

35.120 contigs). A análise dos dados obtidos contra a Base de Dados Cucurbit Genomics [Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) icugi (dot) org/] confirmou a exatidão do sequenciamento e montagem. Os padrões de expressão de genes selecionados se ajustaram bem aos seus dados de qRT- PCR. EXEMPLO 2

PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE ARABIDOPSIS E ANÁLISE DE CORRELAÇÃO DE ALTO RENDIMENTO DOS PARÂMETROS RENDIMENTO, BIOMASSA E/OU VIGOR RELACIONADOS USANDO

MICROARRANJO DE OLIGONUCLEOTÍDEO DO GENOMA COMPLETO DE ARABIDOPSIS DE 44K

[00293] Para produzir uma análise de correlação de alto rendimento, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo de Arabidopsis thaliana, produzido pela Agilent Technologies [Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) chem. (dot) agilent (dot) com/Scripts/PDS (dot) asp?1Page=50879]. O oligonucleotídeo do arranjo representa cerca de 40.000 genes de A. thaliana e transcritos designados com base nos dados da base de Dados TIGR ATH1 v.5 e base de dados de Arabidopsis MPSS (University of Delaware). Para definir as correlações entre os níveis de expressão de RNA e os parâmetros relacionados com rendimento, componentes de biomassa ou vigor, várias características de planta de 15 ecotipos de Arabidopsis diferentes foram analisadas. Entre eles, nove ecotipos abrangendo a variação observada foram selecionados para a análise de expressão de RNA. A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros distinguidos foi analisada usando o teste de correlação de Pearson [Hypertext Transfer Protocol:// World Wide Web (dot) davidmlane (dot) com/hyperstat/A34739 (dot) html]. Procedimentos Experimentais

88 / 378

[00294] Tecidos de Arabidopsis analisados — Cinco tecidos em estágios desenvolvimental diferentes incluindo raiz, folha, flor na antese, semente em 5 dias depois do florescimento (DAF) e semente em 12 DAF, representando características de planta diferentes, foram amostradas e o RNA foi extraído como descrito acima sob “GENERAL EXPERIMENTAL AND BIOINFORMATICS METHODS”. Para conveniência, cada tipo de tecido para informação de expressão de microarranjo recebeu um Set ID como resumido na Tabela 1 abaixo. Tabela 1 Tecidos usados para os conjuntos de expressão do transcriptoma de Arabidopsis Conjunto de Expressão ID do Conjunto Raiz no estágio reprodutivo 1 Semente 5 DAF no estágio reprodutivo 2 Semente 12 DAF no estágio reprodutivo 3 Flor no estágio reprodutivo 4 Folha no estágio reprodutivo 5 Tabela 1: São providos os dígitos de identificação (ID) de cada um dos conjuntos de expressão de Arabidopsis (1 a 5). DAF = Dias após o florescimento

[00295] Componentes de rendimento e avaliação de parâmetros relacionados com o vigor – Oito dos nove ecotipos de Arabidopsis foram usados em cada um dos 5 blocos repetitivos (denominados A, B, C, D e E), cada um contendo 20 plantas por canteiro. As plantas foram cultivadas em uma estufa em condições controladas a 22°C e o fertilizante N:P:K (20:20:20; razões em peso) [nitrogênio (N), fósforo (P) e potássio (K)] foi adicionado. Durante este tempo dados foram coletados, documentados e analisados. Dados adicionais foram coletados através do estágio de muda das plantas cultivadas em uma cultura de tecido em placas de cultura vertical em ágar transparentes. A maioria dos parâmetros escolhidos foi analisada pelo imageamento digital.

[00296] Imageamento Digital em Cultura de Tecido - Um sistema de aquisição de imagem de laboratório foi usado para capturar imagens das plântulas semeadas em placas quadradas em ágar. O sistema de aquisição de

89 / 378 imagem consiste de uma câmera digital de reflexo (Canon EOS 300D) acoplada a uma lente de comprimento focal de 55 mm (Canon série EF-S), montada sobre um dispositivo de reprodução (Kaiser RS), que incluiu 4 unidades de luz (4 bulbos de luz x 150 Watts) e localizado em uma sala escura.

[00297] Imageamento Digital em Estufa - O processo de captura de imagem foi repetido a cada 3 a 4 dias começando no dia 7 até dia 30. A mesma câmera acoplada a uma lente de comprimento focal de 24 mm (Canon série EF), colocada em uma montagem de ferro feita de encomenda, foi usada para capturar imagens de plantas maiores semeadas em baldes brancos em uma estufa com ambiente controlado. Os baldes brancos foram no formato quadrado com medições de 36 x 26,2 cm e 7,5 cm de profundidade. Durante o processo de captura, os baldes foram colocados atrás da montagem de ferro, evitando a luz solar direta e a projeção de sombras. Este processo foi repetido a cada 3 a 4 dias durante até 30 dias.

[00298] Um sistema de análise de imagem foi usado, que consiste de um computador pessoal de mesa (processor Intel P4 3,0 GHz) e um programa de domínio público – programa de processamento de imagem com base em Java, ImageJ 1.37, que foi desenvolvido no U.S National Institutes of Health e está gratuitamente disponível na internet no Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://rsbweb (dot) nih (dot) gov/. As imagens foram capturadas na resolução de 6 Mega Pixels (3072 x 2048 pixels) e armazenados em um formato JPEG (padrão Joint Photographic Experts Group) de baixa compressão. Em seguida, os dados analisados foram salvos em arquivos de texto e processados usando o software de análise estatística JMP (SAS institute).

[00299] Análise de folha - Usando a análise digital os dados de folhas foram calculados, incluindo número de folha, área, perímetro, comprimento e largura. No dia 30, 3 a 4 plantas representativas foram escolhidas a partir de cada canteiro dos blocos A, B e C. As plantas foram dissecadas, cada folha foi

90 / 378 separada e foi introduzida entre duas bandejas de vidro, uma foto de cada planta foi tirada e os diversos parâmetros (tais como área total de folha, comprimento laminar, etc.) foram calculados a partir das imagens. A circularidade da lâmina foi calculada como largura laminar dividida pelo comprimento laminar.

[00300] Análise de raiz - Durante 17 dias, os diferentes ecotipos foram cultivados em placas de ágar transparentes. As placas foram fotografadas a cada 3 dias começando no dia 7 na sala de fotografias e o desenvolvimento das raízes foi documentado (ver os exemplos nas Figuras 3A-F). A taxa de crescimento das raízes foi calculada de acordo com a Fórmula V. Fórmula V: Taxa de crescimento relativa de cobertura da raiz = Coeficiente de regressão da cobertura da raiz ao longo do curso de tempo.

[00301] Análise da taxa de crescimento vegetativo - foi calculada de acordo com Fórmula VI. A análise foi finalizada com o aparecimento de plantas sobrepostas. Fórmula VI Área relativa da taxa de crescimento vegetativo = Coeficiente de regressão de área vegetativa ao longo do curso de tempo.

[00302] Para comparação entre ecotipos a taxa calculada foi normalizada usando o estágio desenvolvimental de planta como representado pelo número de folhas verdadeiras. Nos casos onde as plantas com 8 folhas foram amostradas duas vezes (por exemplo no dia 10 e dia 13), apenas a amostra maior foi escolhida e adicionada à comparação Anova.

[00303] Sementes em análise de siliquas - No dia 70, 15 a 17 siliquas foram coletadas a partir de cada canteiro nos blocos D e E. As siliquas escolhidas foram de cor marrom claro, mas ainda intactas. As siliquas foram abertas na sala de fotografia e as sementes foram espalhadas sobre uma bandeja de vidro, um retrato digital de alta resolução foi tirada para cada canteiro. Usando as imagens o número de sementes por siliqua foi

91 / 378 determinado.

[00304] Peso médio das sementes - No final do experimento todas as sementes dos canteiros dos blocos A-C foram coletadas. Um peso médio de 0,02 gramas foi medido de cada amostra, as sementes foram espalhadas sobre uma bandeja de vidro e um retrato foi tirado. Usando a análise digital, o número de sementes em cada amostra foi calculado.

[00305] Porcentagem de óleo nas sementes - No final do experimento todas as sementes dos canteiros dos blocos A-C foram coletados. As sementes columbianas de 3 canteiros foram misturadas moídas e depois montadas na câmara de extração. 210 ml de n-Hexano (Cat No. 080951 Biolab Ltd.) foram usados como o solvente. A extração foi realizada durante 30 horas em aquecimento médio 50°C. Uma vez que a extração foi finalizada o n-Hexano foi evaporado usando o evaporador a 35°C e condições de vácuo. O processo foi repetido duas vezes. A informação obtida a partir do extrator Soxhlet (Soxhlet, F. Die gewichtsanalytische Bestimmung des Milchfettes, Politechnisches J. (Dingler’s) 1879, 232, 461) foi usada para criar uma curve de calibração para a RMN de Baixa Ressonância. O conteúdo de óleo de todas as amostras de semente foi determinado usando a RMN de Baixa Ressonância (MARAN Ultra — Oxford Instrument) e seu pacote de software MultiQuant.

[00306] Análise do comprimento da siliqua - No dia 50 da semeadura, 30 siliquas de plantas diferentes em cada canteiro foram amostras no bloco A. As siliquas escolhidas foram amarelo esverdeadas na cor e foram coletadas das partes do fundo de uma haste da planta cultivada. Uma fotografia digital foi tirada para determinar o comprimento da siliqua.

[00307] Peso seco e rendimento de semente – No dia 80 da semeadura, as plantas dos blocos A-C foram colhidas e deixadas secar a 30°C em uma câmara de secagem. Os pesos da biomassa e semente de cada canteiro foram separados, medidos e divididos pelo número de plantas. Peso seco = peso total da porção vegetativa acima do solo (excluindo as raízes) depois da secagem a 30°C em uma câmara de secagem; Rendimento de semente por

92 / 378 planta = peso total de semente por planta (g).

[00308] Rendimento de óleo - O rendimento de óleo foi calculado usando a Fórmula VII. Fórmula VII: Rendimento de óleo de semente = Rendimento de semente por planta (g) *% de óleo na semente.

[00309] Índice de colheita (semente) - O índice de colheita foi calculado usando a Fórmula IV (descrita acima): Índice de colheita = Rendimento médio de semente por planta/ Peso seco médio. Resultados Experimentais

[00310] Nove ecotipos de Arabidopsis diferentes foram cultivados e distinguidos por 18 parâmetros (chamados de vetores). Tabela 2 Parâmetros correlacionados com Arabidopsis (vetores) Parâmetro correlacionado com ID da Correlação Sementes por siliqua (número) 1 Índice de colheita (valor) 2 Rendimento de semente por planta (g) 3 Matéria seca por planta (g) 4 Área total da folha por planta (cm) 5 % de óleo por semente (porcentagem) 6 Rendimento de óleo por planta (mg) 7 Crescimento relativo de raiz (cm/dia) 8 Comprimento da raiz dia 7 (cm) 9 Comprimento da raiz dia 13 (cm) 10 Peso fresco (g) 11 Peso de semente (g) 12 Taxa de crescimento vegetativo (cm2/dia) 13 Comprimento da lâmina (cm) 14 Largura da lâmina (cm) 15 Largura/comprimento da folha (razão) 16 Circularidade da lâmina (cm) 17 Comprimento da siliqua (cm) 18 Tabela 2. São providos os parâmetros correlacionados com Arabidopsis (ID de correlação Nos. 1- 18). Abreviações: cm = centímetro(s); g = grama(s); mg = miligrama(s).

[00311] Os valores distinguidos estão resumidos nas Tabelas 3 e 4 abaixo e a análise de correlação é provida na Tabela 5 abaixo. Tabela 3 Parâmetros medidos em ecotipos Arabidopsis Ecotipo/ ID de Linha-1 Linha-2 Linha-3 Linha-4 Linha-5 Correlação No. 1 45,44 53,47 58,47 35,27 48,56

93 / 378 Ecotipo/ ID de Linha-1 Linha-2 Linha-3 Linha-4 Linha-5 Correlação No. 2 0,53 0,35 0,56 0,33 0,37 3 0,34 0,44 0,59 0,42 0,61 4 0,64 1,27 1,05 1,28 1,69 5 46,86 109,89 58,36 56,8 114,66 6 34,42 31,19 38,05 27,76 35,49 7 118,63 138,73 224,06 116,26 218,27 8 0,631 0,664 1,176 1,089 0,907 9 0,937 1,759 0,701 0,728 0,991 10 4,419 8,53 5,621 4,834 5,957 11 1,51 3,607 1,935 2,082 3,556 12 0,02031238 0,02302244 0,02522553 0,03444936 0,02021001 13 0,31258158 0,37755231 0,4841254 0,47415969 0,42508143 14 2,76683 3,54357 3,27353 3,78465 3,68982 15 1,38477 1,69708 1,45982 1,37418 1,82816 16 0,352785 0,287757 0,315993 0,258499 0,356279 17 0,508828 0,48083 0,45029 0,369857 0,500566 18 1,06 1,26 1,31 1,47 1,24 Tabela 3: São providos os valores de cada um dos parâmetros medidos em ecotipos Arabidopsis (linhas 1-5) usando os números ID de correlação descritos na Tabela 2 acima.

Tabela 4 Parâmetros medidos em ecotipos Arabidopsis - continuação Ecotipo/ ID de Correlação No. Linha-6 Linha-7 Linha-8 Linha-9 1 37 39,38 40,53 25,53 2 0,32 0,45 0,51 0,41 3 0,43 0,36 0,62 0,55 4 1,34 0,81 1,21 1,35 5 110,82 88,49 121,79 93,04 6 32,91 31,56 30,79 34,02 7 142,11 114,15 190,06 187,62 8 0,774 0,606 0,701 0,782 9 1,163 1,284 1,414 1,251 10 6,372 5,649 7,06 7,041 11 4,338 3,467 3,479 3,71 12 0,02634353 0,02048623 0,02260485 0,02352516 13 0,64454891 0,42961167 0,38423782 0,47130278 14 4,59654 3,87735 3,71722 4,14899 15 1,64999 1,51005 1,81691 1,66772 16 0,272645 0,304707 0,335145 0,306598 17 0,375805 0,393745 0,491283 0,408787 18 1,09 1,18 1,18 1 Tabela 4: São providos os valores de cada um dos parâmetros medidos em ecotipos Arabidopsis (linhas 6-9) usando os números ID de correlação descritos na Tabela 2 acima.

Tabela 5 Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas modalidades da invenção em diversos tecidos e o desempenho fenotípico sob condições normais através de acessos de Arabidopsis Nome do Conj de ID de Nome do Conj de ID de R Valor p R Valor p Gene Exp. Corr. Gene Exp. Corr. LYD289 0,92 3,17E-03 2 18 LYD289 0,90 2,54E-03 4 18 LYD289 0,75 3,34E-02 5 3 LYD289 0,75 3,25E-02 5 7 LYD290 0,77 2,42E-02 1 18 LYD290 0,79 3,33E-02 2 9

94 / 378 Nome do Conj de ID de Nome do Conj de ID de R Valor p R Valor p Gene Exp.

Corr.

Gene Exp.

Corr.

LYD290 0,71 4,87E-02 3 2 LYD291 0,89 7,19E-03 2 2 LYD291 0,76 4,58E-02 2 6 LYD291 0,71 4,76E-02 3 18 LYD292 0,70 5,11E-02 1 1 LYD292 0,73 4,16E-02 4 8 LYD292 0,74 3,48E-02 5 12 LYD292 0,81 1,44E-02 5 18 LYD293 0,71 4,72E-02 3 18 LYD293 0,72 4,28E-02 5 3 LYD293 0,74 3,65E-02 5 7 LYD293 0,76 3,03E-02 5 8 LYD294 0,74 3,55E-02 1 18 LYD294 0,81 1,57E-02 5 12 LYD294 0,79 2,01E-02 5 18 LYD295 0,73 3,83E-02 1 18 LYD295 0,80 3,03E-02 2 2 LYD295 0,79 2,08E-02 3 3 LYD295 0,71 4,92E-02 3 7 LYD295 0,72 4,32E-02 5 1 LYD296 0,76 4,69E-02 2 18 LYD296 0,76 4,57E-02 2 3 LYD296 0,77 4,34E-02 2 7 LYD296 0,86 5,77E-03 3 18 LYD297 0,86 1,23E-02 2 1 LYD297 0,76 4,69E-02 2 18 LYD297 0,84 8,28E-03 3 4 LYD297 0,76 3,03E-02 5 12 LYD297 0,75 3,32E-02 5 18 LYD298 0,70 7,71E-02 2 1 LYD298 0,72 6,93E-02 2 18 LYD298 0,88 3,55E-03 3 12 LYD298 0,75 3,28E-02 3 18 LYD299 0,85 7,67E-03 1 12 LYD299 0,76 2,79E-02 1 18 LYD299 0,71 7,32E-02 2 14 LYD299 0,87 1,19E-02 2 13 LYD299 0,84 9,28E-03 3 12 LYD299 0,98 1,37E-05 4 12 LYD299 0,85 7,82E-03 5 12 LYD300 0,80 1,68E-02 1 12 LYD300 0,75 3,08E-02 1 18 LYD300 0,73 6,21E-02 2 9 LYD300 0,86 6,54E-03 3 12 LYD300 0,78 2,26E-02 3 18 LYD301 0,73 3,94E-02 1 3 LYD301 0,77 2,55E-02 1 7 LYD301 0,84 1,68E-02 2 4 LYD301 0,80 3,03E-02 2 3 LYD301 0,77 4,39E-02 2 7 LYD301 0,71 4,99E-02 3 15 LYD301 0,89 3,27E-03 3 10 LYD301 0,71 5,06E-02 4 4 LYD301 0,72 4,21E-02 4 15 LYD301 0,80 1,82E-02 4 3 LYD301 0,78 2,24E-02 4 7 LYD301 0,76 2,94E-02 4 13 LYD301 0,81 1,59E-02 5 4 LYD301 0,85 6,99E-03 5 15 LYD301 0,73 4,04E-02 5 5 LYD302 0,83 2,04E-02 2 16 LYD302 0,74 5,73E-02 2 17 LYD302 0,91 1,50E-03 3 18 LYD302 0,76 2,85E-02 4 18 LYD303 0,83 1,00E-02 1 15 LYD303 0,76 2,83E-02 1 5 LYD303 0,72 4,40E-02 3 15 LYD303 0,87 5,08E-03 3 10 LYD303 0,80 1,67E-02 4 18 LYD304 0,80 2,92E-02 2 2 LYD304 0,70 5,27E-02 3 3 LYD305 0,93 2,70E-03 2 4 LYD305 0,83 2,01E-02 2 15 LYD305 0,73 6,26E-02 2 3 LYD305 0,76 2,94E-02 3 18 LYD306 0,87 4,65E-03 1 1 LYD306 0,86 6,39E-03 1 18 LYD306 0,74 5,59E-02 2 9 LYD306 0,82 1,34E-02 3 9 LYD306 0,70 5,24E-02 3 10 LYD306 0,72 4,51E-02 4 1 LYD306 0,92 1,36E-03 5 18 LYD307 0,89 2,95E-03 3 3 LYD307 0,79 1,94E-02 3 7 LYD308 0,74 3,52E-02 1 9 LYD308 0,71 7,45E-02 2 2 LYD308 0,70 5,29E-02 5 12 LYD308 0,97 5,57E-05 5 14 LYD308 0,76 2,86E-02 5 11 LYD308 0,86 6,25E-03 5 13 LYD309 0,84 8,79E-03 3 16 LYD309 0,83 1,08E-02 4 1 LYD310 0,85 1,60E-02 2 12 LYD310 0,74 5,68E-02 2 13 LYD310 0,95 3,36E-04 3 16 LYD310 0,73 4,17E-02 3 17 LYD310 0,75 3,39E-02 5 3 LYD310 0,91 1,78E-03 5 6 LYD310 0,87 4,96E-03 5 7 LYD311 0,73 4,06E-02 3 12 LYD311 0,80 1,76E-02 3 18 LYD312 0,72 6,60E-02 2 18 LYD312 0,74 3,70E-02 3 12 LYD312 0,73 3,97E-02 5 18 LYD313 0,75 3,13E-02 4 1 LYD313 0,87 4,72E-03 5 12 LYD315 0,83 2,12E-02 2 2 LYD315 0,73 6,03E-02 2 6 LYD315 0,72 4,45E-02 3 3 LYD315 0,81 1,41E-02 4 18 LYD316 0,76 4,96E-02 2 1 LYD316 0,79 3,36E-02 2 18 LYD316 0,84 9,29E-03 3 3 LYD316 0,87 4,46E-03 3 7

95 / 378 Nome do Conj de ID de Nome do Conj de ID de R Valor p R Valor p Gene Exp. Corr. Gene Exp. Corr. LYD318 0,75 3,33E-02 5 2 LYD319 0,77 4,30E-02 2 4 LYD319 0,84 1,83E-02 2 15 LYD319 0,77 4,11E-02 2 5 LYD319 0,78 2,17E-02 3 1 LYD319 0,75 3,34E-02 3 17 LYD319 0,85 7,55E-03 4 6 LYD319 0,76 2,92E-02 4 7 LYD320 0,74 3,49E-02 3 14 LYD320 0,80 1,69E-02 3 13 LYD321 0,76 2,92E-02 4 1 LYD321 0,71 4,76E-02 5 17 LYD322 0,87 4,62E-03 5 4 LYD322 0,79 2,07E-02 5 15 LYD323 0,70 5,23E-02 1 16 LYD323 0,77 4,25E-02 2 2 LYD323 0,73 4,15E-02 4 1 LYD323 0,87 4,54E-03 4 17 LYD323 0,92 1,17E-03 5 1 LYD323 0,85 8,20E-03 5 17 LYD324 0,89 2,94E-03 3 12 LYD324 0,71 4,65E-02 3 18 LYD324 0,73 4,16E-02 5 4 LYD324 0,82 1,18E-02 5 3 LYD324 0,74 3,52E-02 5 7 LYD325 0,81 1,55E-02 1 12 LYD325 0,75 3,21E-02 3 12 LYD325 0,77 2,52E-02 3 18 LYD326 0,77 2,60E-02 4 9 LYD326 0,73 3,87E-02 4 10 LYD327 0,78 2,35E-02 3 16 LYD327 0,78 2,27E-02 5 18 LYD328 0,72 4,20E-02 3 3 LYD328 0,78 2,32E-02 5 12 LYD328 0,89 2,68E-03 5 8 LYD329 0,71 4,80E-02 1 8 LYD329 0,79 3,41E-02 2 1 LYD329 0,92 3,64E-03 2 17 LYD329 0,78 2,25E-02 3 3 LYD329 0,74 3,57E-02 3 13 LYD329 0,81 1,41E-02 3 8 LYD329 0,90 2,51E-03 5 8 LYD330 0,74 3,63E-02 3 2 LYD331 0,74 3,50E-02 1 6 LYD331 0,74 3,72E-02 1 7 LYD331 0,72 4,38E-02 3 3 LYD331 0,76 2,77E-02 3 7 LYD331 0,73 3,85E-02 3 17 LYD331 0,75 3,29E-02 4 3 LYD331 0,75 3,36E-02 4 6 LYD331 0,81 1,54E-02 4 7 LYD331 0,75 3,15E-02 5 3 LYD331 0,76 3,00E-02 5 6 LYD331 0,82 1,18E-02 5 7 LYD332 0,78 2,17E-02 1 6 LYD332 0,74 3,70E-02 3 16 LYD332 0,81 1,45E-02 3 17 LYD334 0,72 6,61E-02 2 3 LYD334 0,82 2,30E-02 2 6 LYD334 0,80 3,09E-02 2 7 LYD334 0,76 4,96E-02 2 8 LYD334 0,78 2,19E-02 3 12 LYD334 0,73 4,01E-02 4 3 LYD334 0,70 5,27E-02 4 7 LYD335 0,74 5,55E-02 2 2 LYD337 0,77 4,25E-02 2 10 LYD337 0,76 3,03E-02 3 3 LYD338 0,75 3,38E-02 3 2 LYD338 0,74 3,55E-02 4 13 LYD338 0,82 1,31E-02 5 6 LYD338 0,79 1,88E-02 5 7 LYD339 0,79 3,58E-02 2 2 LYD339 0,71 4,83E-02 4 3 LYD339 0,78 2,13E-02 4 6 LYD339 0,80 1,71E-02 4 7 LYD340 0,71 4,67E-02 1 8 LYD340 0,73 4,13E-02 4 3 LYD340 0,71 4,64E-02 4 7 LYD340 0,84 9,57E-03 5 3 LYD340 0,74 3,42E-02 5 6 LYD340 0,89 3,32E-03 5 7 LYD341 0,86 1,40E-02 2 2 LYD341 0,76 2,91E-02 5 16 LYD341 0,71 5,05E-02 5 17 LYD342 0,71 7,17E-02 2 18 LYD342 0,88 4,16E-03 3 12 LYD342 0,80 1,82E-02 4 13 LYD342 0,74 3,71E-02 5 4 LYD343 0,86 1,21E-02 2 2 LYD343 0,77 2,57E-02 3 4 LYD343 0,72 4,25E-02 3 3 LYD343 0,83 1,12E-02 5 14 LYD343 0,70 5,19E-02 5 13 LYD344 0,77 2,43E-02 1 13 LYD344 0,81 2,69E-02 2 2 LYD344 0,74 3,70E-02 3 3 LYD344 0,86 6,81E-03 5 2 Tabela 5. São providas as correlações (R) entre os níveis de expressão de genes melhoradores de rendimento e seus homólogos em tecidos [raízes, sementes, flor e folha; Conjuntos de expressão (Exp)] e o desempenho fenotípico em diversos componentes de rendimento, biomassa e rendimento direto [Vetor ID de correlação (corr.)] sob condição normal através de acessos de Arabidopsis. P = valor p.

EXEMPLO 3

96 / 378

PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE ARABIDOPSIS E ANÁLISE DE CORRELAÇÃO DE ALTO RENDIMENTO DE CONDIÇÕES NORMAIS E LIMITANTES DE NITROGÊNIO USANDO

MICROARRANJO DE OLIGONUCLEOTÍDEO DE ARABIDOPSIS DE 44K

[00312] De modo a produzir uma análise de correlação de alto rendimento, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo de Arabidopsis, produzido pela Agilent Technologies [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://World Wide Web (dot) Chem (dot) agilent (dot) com/Scripts/PDS (dot) asp?1Page=50879]. O oligonucleotídeo do arranjo representa cerca de 44.000 genes e transcritos de Arabidopsis. Para definir as correlações entre os níveis de expressão de RNA com NUE, componentes de rendimento ou parâmetros relacionados com vigor várias características de planta de 14 ecotipos de Arabidopsis diferentes foram analisadas. Entre eles, dez ecotipos abrangendo a variação observada foram selecionados para a análise de expressão de RNA. A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros distinguidos foi analisada usando o teste de correlação de Pearson [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://World Wide Web (dot) davidmlane (dot) com/hyperstat/A34739 (dot) html]. Procedimentos Experimentais

[00313] Dois tecidos das plantas [folhas e hastes] cultivados em dois níveis de fertilização com nitrogênio diferentes (1,5 mM de Nitrogênio ou 6 mM de Nitrogênio) foram amostrados e o RNA foi extraído como descrito acima sob “MÉTODOS GERAIS EXPERIMENTAIS E DE BIOINFORMÁTICA”. Por conveniência, cada tipo de tecido da informação de expressão de microarranjo recebeu uma ID do Conjunto como resumido na Tabela 6 abaixo.

97 / 378 Tabela 6 Tecidos usado para conjuntos de expressão de transcriptoma de Arabidopsis Conjunto de Expressão ID do Conjunto Folhas a 1,5 mM de fertilização de nitrogênio 1 Hastes a 6 mM de fertilização de nitrogênio 2 Folhas a 6 mM de fertilização de nitrogênio 3 Hastes a 1,5 mM de fertilização de nitrogênio 4 Tabela 6: São providos os dígitos de identificação (ID) de cada um dos conjuntos de expressão de Arabidopsis.

[00314] Avaliação de componentes de rendimento de Arabidopsis e parâmetros relacionados com vigor sob níveis de fertilização com nitrogênio diferentes — 10 acessos de Arabidopsis em 2 canteiros repetitivos cada um contendo 8 plantas por canteiro foram cultivados em estufa. O protocolo de cultivo usado foi como segue: as sementes esterilizadas na superfície foram semeadas em tubos Eppendorf contendo 0,5 x meio salino basal de Murashige-Skoog e cultivadas a 23°C sob ciclos diários de 12 horas de luz e 12 horas de escuro durante 10 dias. Depois, as mudas de tamanho similar foram cuidadosamente transferidas para vasos cheios com uma mistura de perlita e turfa em uma razão 1:1. As condições limitantes de nitrogênio constantes foram obtidas irrigando-se as plantas com uma solução contendo 1,5 mM de nitrogênio inorgânico na forma de KNO3, suplementado com 2 mM de CaCl2, 1,25 mM de KH2PO4, 1,50 mM de MgSO4, 5 mM de KCl, 0,01 mM de H3BO3 e microelementos, sob condições normais de irrigação (condições normais de Nitrogênio) foram obtidas aplicando-se uma solução de nitrogênio inorgânico a 6 mM também na forma de KNO3, suplementado com 2 mM de CaCl2, 1,25 mM de KH2PO4, 1,50 mM de MgSO4, 0,01 mM de H3BO3 e microelementos. Para seguir o crescimento da planta, as bandejas foram fotografadas no dia que as condições limitantes de nitrogênio foram iniciadas e subsequentemente a cada 3 dias durante cerca de 15 dias adicionais. A área vegetal da roseta foi depois determinada a partir dos retratos digitais. O software ImageJ foi usado for quantificar o tamanho da planta a partir dos retratos digitais [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://rsb (dot) info (dot) nih (dot) gm/AA utilizando

98 / 378 roteiros patenteados planejados para analisar o tamanho da área da roseta de plantas individuais como uma função do tempo. O sistema de análise de imagem incluiu um computador de mesa pessoal (processador Intel P4 3,0 GHz) e um programa de domínio público - ImageJ 1.37 (programa de processamento de imagem com base em Java, que foi desenvolvido no U.S. National Institutes of Health e gratuitamente disponível na internet [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://rsbweb (dot) nih (dot) gov/]. Em seguida, os dados analisados foram salvos em arquivos de texto e processados usando o software de análise estatística JMP (SAS institute).

[00315] Os parâmetros de dados coletados estão resumidos na Tabela 7, aqui abaixo. Tabela 7 Parâmetros correlacionados com Arabidopsis (vetores) Parâmetro correlacionado com ID de Correlação N 6 mM; Rendimento de semente [g/planta] 1 N 6 mM; Índice de colheita (razão) 2 N 6 mM; Peso de 1000 sementes [g] 3 N 6 mM; rendimento de semente/ área da roseta dia no dia 10 [g/cm2] 4 N 6 mM; rendimento de semente/lâmina de folha [g/cm2] 5 N 1,5 mM; Área da roseta no dia 8 [cm2] 6 N 1,5 mM; Área da roseta no dia 10 [cm2] 7 N 1,5 mM; Número de folha no dia 10 (número) 8 N 1,5 mM; Área da lâmina da folha no dia 10 [cm2] 9 N 1,5 mM; RGR da Área da roseta no dia 3 [cm2/dia] 10 N 1,5 mM; t50 de Florescimento [dia] 11 N 1,5 mM; Peso seco [g/planta] 12 N 1,5 mM; Rendimento de semente [g/planta] 13 N 1,5 mM; Índice de colheita (razão) 14 N 1,5 mM; Peso de 1000 sementes [g] 15 N 1,5 mM; rendimento de semente/ área da roseta no dia 10 [g/cm2] 16 N 1,5 mM; rendimento de semente/lâmina de folha [g/cm2] 17 N 1,5 mM; redução na% de rendimento de semente comparada com N 6 mM 18 (razão) N 1,5 mM;% De redução da biomassa comparada com N 6 mM (razão) 19 N 6 mM; Área da roseta no dia 8 [cm2] 20 N 6 mM; Área da roseta no dia 10 [cm2] 21 N 6 mM; Número de folha no dia 10 (número) 22 N 6 mM; Área da lâmina da folha no dia 10 (cm2) 23 N 6 mM; RGR da Área da roseta no dia 3 [cm2/g] 24 N 6 mM; t50 de Florescimento [dia] 25 N 6 mM; Peso seco [g/planta] 26 N 6 mM; Nível N /DW (unidade SPAD /g planta) 27 N 6 mM; DW/ Nível N [g/ Unidade SPAD] 28 N 6 mM; Nível N / FW (razão) 29

99 / 378 Parâmetro correlacionado com ID de Correlação N 6 mM; Rendimento de semente/Unidade N [g/ Unidade SPAD] 30 N 1,5 mM; Nível N /FW [Unidade SPAD/g] 31 N 1,5 mM; Nível N /DW [Unidade SPAD/g] 32 N 1,5 mM; DW/ Nível N [g/ Unidade SPAD] 33 N 1,5 mM; rendimento de semente/ Nível N [g/ Unidade SPAD] 34 Tabela 7. São providos os parâmetros correlacionados com Arabidopsis (vetores). “N” = Nitrogênio nas concentrações mencionadas; “g” = gramas; “SPAD” = níveis de clorofila; “t50” = tempo onde 50% das plantas floresceram; “g/ Unidade SPAD” = biomassa de planta expressa em gramas por unidade de nitrogênio na planta medida pelos SPAD. “DW” = Peso seco da planta; “FW” = Peso fresco da planta; “Nível N/DW” = nível de Nitrogênio da planta medido em Unidade SPAD por biomassa de planta [g]; “DW/ Nível N” = biomassa de planta por planta [g]/Unidade SPAD; Área da roseta (medida usando análise digital); Cobertura do lote no dia indicado [%](calculado pela divisão da área de planta total com a área de canteiro total); Área da lâmina da folha no dia indicado [cm2] (medida usando análise digital); RGR (taxa de crescimento relativa) da área da roseta no dia indicado [cm2/dia]; t50 de Florescimento [dia] (o dia no qual 50% da planta floresceram); rendimento de semente/ área da roseta no dia 10 [g/cm2] (calculada); rendimento de semente/lâmina de folha [g/cm2] (calculada); rendimento de semente/ Nível N [g/ Unidade SPAD] (calculada).

[00316] Avaliação de NUE, componentes de rendimento e parâmetros relacionados com vigor - Dez ecotipos de Arabidopsis foram cultivados em bandejas, cada um contendo 8 plantas por canteiro, em uma estufa com condições de temperatura controlada durante cerca de 12 semanas. As plantas foram irrigadas com diferentes concentrações de nitrogênio como descrito acima dependendo do tratamento aplicado. Durante este tempo, os dados foram coletados, documentados e analisados. A maioria dos parâmetros escolhidos foram analisados pelo imageamento digital. Imageamento digital — Ensaio em estufa

[00317] Um sistema de aquisição de imagem, que consiste de uma câmera digital de reflexo (Canon EOS 400D) acoplada com uma lente de comprimento confocal de 55 mm (Canon série EF-S) colocada em uma montagem de alumínio feita de encomenda, foi usado para capturar imagens das plantas plantadas em recipientes dentro de uma estufa com ambiente controlado. O processo de captura de imagem é repetido a cada 2 a 3 dias começando no dia 9-12 até dia 16-19 (respectivamente) a partir do transplante.

[00318] O sistema de processamento de imagem que foi usado está descrito no Exemplo 2 acima. As imagens foram capturadas na resolução de

100 / 378 10 Mega Pixels (3888 x 2592 pixels) e armazenadas em um formato JPEG (padrão Joint Photographic Experts Group) de baixa compressão. Em seguida, os dados de saída de processamento de imagem foram salvos em arquivos de texto e analisados usando o software de análise estatística JMP (SAS institute).

[00319] Análise de folha - Usando a análise digital os dados de folhas foram calculados, incluindo número de folha, área da lâmina da folha, cobertura do lote, Diâmetro da roseta e Área da roseta.

[00320] Área da taxa de crescimento relativa: A área da taxa de crescimento relativa da roseta e das folhas foi calculada de acordo com as Fórmulas VIII e IX, respectivamente. Fórmula VIII:

[00321] Taxa de crescimento relativa de área da roseta = Coeficiente de regressão of área da roseta ao longo do curso de tempo. Fórmula IX Taxa de crescimento relativa do número de folhas da planta = Coeficiente de regressão do número de folhas da planta ao longo do curso de tempo.

[00322] Rendimento de semente e Peso de 1000 sementes - No final do experimento todas as sementes de todos os canteiros foram coletadas e pesadas de modo a medir o rendimento de semente por planta em termos de peso total de semente por planta (g). Para o cálculo do peso de 1000 sementes, um peso médio de 0,02 gramas foi medido a partir de cada amostra, as sementes foram espalhadas sobre uma bandeja de vidro e um retrato foi tirado. Usando a análise digital, o número de sementes em cada amostra foi calculado.

[00323] Peso seco e rendimento de semente - No final do experimento, as plantas foram colhidas e deixadas secar a 30°C em uma câmara de secagem. A biomassa foi separada das sementes, pesada e dividida pelo número de plantas. Peso seco = peso total da porção vegetativa acima do solo

101 / 378 (excluindo as raízes) depois de secar a 30°C em uma câmara de secagem.

[00324] Índice de colheita (semente) - O índice de colheita foi calculado usando a Fórmula IV como descrita acima [Índice de colheita = Rendimento médio de semente por planta/ Peso seco médio].

[00325] T50 dias para o florescimento - Cada uma das repetições foi monitorada quanto à data do florescimento. Dias de florescimento foi calculado a partir da data de semeadura até que 50% dos canteiros florescessem.

[00326] Nível de Nitrogênio da planta - O conteúdo de clorofila das folhas é um bom indicador da situação do nitrogênio na planta visto que o grau de verdura da folha está altamente correlacionado com este parâmetro. O conteúdo de clorofila foi determinado usando um medidor de clorofila SPAD 502 da Minolta e a medição foi realizada no momento do florescimento. As leituras do medidor SPAD foram feitas sobre a folha jovem completamente desenvolvida. Três medições por folha foram determinadas por canteiro. Com base nesta medição, parâmetros tais como a razão entre rendimento de semente por unidade de nitrogênio [rendimento de semente/Nível N = rendimento de semente por planta [g]/Unidade SPAD], DW da planta por unidade de nitrogênio [DW/ Nível N = biomassa de planta por planta [g]/Unidade SPAD] e nível de nitrogênio por grama de biomassa [Nível N/DW= Unidade SPAD/ biomassa de planta por planta (g)] foram calculados.

[00327] Porcentagem de redução de rendimento de semente - mede a quantidade de sementes obtidas em plantas quando cultivadas sob condições limitantes de nitrogênio comparada com rendimento de semente produzido nos níveis normais de nitrogênio expressa em porcentagem (%). Resultados Experimentais

[00328] 10 acessos diferentes de Arabidopsis (ecotipos) foram cultivados e distinguidos para 37 parâmetros como descritos acima. A média para cada um dos parâmetros medidos foi calculada usando o software JMP

102 / 378 (Tabela 8 e 9 abaixo). A análise de correlação subsequente entre os diversos conjuntos de transcriptomas (Tabela 6) e os parâmetros médios foi conduzida (Tabela 10). Tabela 8 Parâmetros medidos em acessos de Arabidopsis Ecotipo/ Linha-1 Linha-2 Linha-3 Linha-4 Linha-5 ID de Corr. 1 0,11575 0,1651625 0,10846875 0,08195 0,11918125 2 0,27999946 0,30852795 0,28360337 0,15835749 0,2058752 3 0,01474256 0,01686869 0,01776982 0,01207785 0,01553451 4 0,08243942 0,10579199 0,04051086 0,03389743 0,05563382 5 0,33919761 0,52646 0,20718176 0,18267073 0,27723756 6 0,76004675 0,70878892 1,06135087 1,1569617 1,0001808 7 1,42963825 1,32500951 1,7662424 1,97095367 1,83234886 8 6,875 7,3125 7,3125 7,875 7,75 9 0,33486516 0,26631535 0,37431832 0,3868142 0,3699387 10 0,63055011 0,7927894 0,50199713 0,49086784 0,71950821 11 15,9674256 20,967741 14,8356433 24,7083342 23,6981965 12 0,164375 0,12375 0,081875 0,113125 0,12375 13 0,0317625 0,02526875 0,0230125 0,0098375 0,00879375 14 0,19221006 0,20271686 0,29498642 0,08498642 0,07117143 15 0,0164661 0,01575586 0,01752601 0,01428241 0,02237168 16 0,0221105 0,0190193 0,01356505 0,00522479 0,00495957 17 0,09480609 0,09462778 0,06338215 0,02639571 0,02415312 18 72,55939525 84,70067358 78,78421204 87,9957291 92,62153233 19 60,74626866 76,70588235 78,55973813 78,14009662 78,6407767 20 0,75895075 0,85681934 1,4770776 1,27750001 1,09516034 21 1,40594707 1,57034299 2,67253089 2,41758766 2,14203082 22 6,25 7,3125 8,0625 8,75 8,75 23 0,34248457 0,31479663 0,52295373 0,44862141 0,42970295 24 0,6891365 1,02385276 0,61434467 0,60098475 0,65076159 25 16,3714019 20,5000004 14,6346459 24 23,5950703 26 0,41875 0,53125 0,381875 0,5175 0,579375 27 22,49 28,27 28 0,018620067 0,018306704 29 53,70549848 54,62479871 30 0,004209091 0,002952562 31 45,59 42,11 32 167,3003802 241,0607735 33 0,005977273 0,004148331 34 0,001155 0,000360744 Tabela 8: São providos os valores de cada um dos parâmetros medidos em ecotipos Arabidopsis (linhas 1-5) usando os números ID de correlação descritos na Tabela 7 acima.

Tabela 9 Parâmetros medidos em acessos de Arabidopsis - continuação Ecotipo/ Linha-6 Linha-7 Linha-8 Linha-9 Linha-10 ID de Corr. 1 0,13876875 0,10695625 0,1380875 0,0948125 0,06754375 2 0,2762645 0,17062181 0,21248036 0,1655574 0,13618211 3 0,01543419 0,01403759 0,01660137 0,01608078 0,01601005 4 0,05702681 0,05537429 0,05071512 0,05818119 0,03071849 5 0,28118206 0,25233196 0,27125843 0,23547195 0,15792361

103 / 378 Ecotipo/ Linha-6 Linha-7 Linha-8 Linha-9 Linha-10 ID de Corr. 6 0,91049714 0,94164552 1,11820707 0,63830722 0,99598092 7 1,81767559 1,63622587 1,99606088 1,14962099 1,75392334 8 7,625 7,1875 8,625 5,92857143 7,9375 9 0,38633196 0,34966412 0,37896098 0,30665846 0,37272108 10 0,82522726 0,64561797 0,66798775 0,63647393 0,60534304 11 18,0593189 19,488184 23,5678247 21,8884261 23,5662586 12 0,134375 0,10625 0,148125 0,17125 0,18375 13 0,03231875 0,01931875 0,0120125 0,01350446 0,005525 14 0,24052391 0,1786763 0,08141143 0,07930284 0,03089076 15 0,0147897 0,01364492 0,0216896 0,01860767 0,01834821 16 0,01780867 0,01273805 0,00676616 0,01177002 0,00315298 17 0,08363306 0,05886 0,03430777 0,04403838 0,01485086 18 76,71035446 81,93770818 91,30080565 85,75666711 91,82011659 19 73,19201995 83,06772908 77,18960539 70,11995638 62,97229219 20 1,23563711 1,09369169 1,40984007 0,89057621 1,22408964 21 2,4744351 1,96527638 2,72071991 1,64211359 2,20715087 22 8,375 7,125 9,4375 6,3125 8,0625 23 0,49679143 0,42802388 0,50868963 0,40531471 0,43015889 24 0,67559702 0,58421861 0,61299718 0,51546854 0,47694692 25 15,032695 19,7496866 22,8871401 18,8041534 23,3779994 26 0,50125 0,6275 0,649375 0,573125 0,49625 27 33,32 39 17,64 28 0,015042326 0,014694282 0,028130951 29 66,4790786 68,05368458 35,54803406 30 0,005298764 0,003255054 0,00233267 31 53,11 67 28,15 32 194,9767442 169,3430657 157,8231293 33 0,005128817 0,005905172 0,006336207 34 0,00123354 0,000465671 0,000190517 Tabela 9: São providos os valores de cada um dos parâmetros medidos em ecotipos de Arabidopsi (linhas 6-10) usando os números ID de correlação descritos na Tabela 7 acima.

Tabela 10 Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas modalidades da invenção em diversos tecidos e o desempenho fenotípico sob condições normais ou de estresse abiótico através de acessos de Arabidopsis Nome do Conj de ID de Nome do Conj de ID de R Valor p R Valor p Gene Exp. Corr. Gene Exp. Corr. LYD289 0,74 1,36E-02 1 19 LYD289 0,72 2,76E-02 2 19 LYD289 0,76 1,02E-02 3 19 LYD289 0,71 2,17E-02 4 19 LYD290 0,78 8,04E-03 1 2 LYD290 0,70 2,34E-02 1 1 LYD290 0,74 1,53E-02 3 20 LYD290 0,81 4,63E-03 3 9 LYD290 0,77 9,60E-03 3 21 LYD290 0,86 1,41E-03 3 23 LYD291 0,74 2,25E-02 2 2 LYD291 0,79 1,13E-02 2 16 LYD291 0,73 2,44E-02 2 4 LYD291 0,81 8,40E-03 2 17 LYD291 0,71 3,28E-02 2 14 LYD291 0,76 1,10E-02 3 16 LYD291 0,76 1,08E-02 3 13 LYD292 0,74 1,38E-02 3 16 LYD292 0,73 1,65E-02 3 17 LYD292 0,75 1,17E-02 3 13 LYD292 0,92 2,05E-04 3 14 LYD293 0,82 3,60E-03 1 11 LYD293 0,77 8,67E-03 1 25 LYD293 0,81 4,43E-03 1 18 LYD293 0,86 2,95E-03 2 8 LYD294 0,71 2,05E-02 1 2 LYD294 0,84 2,53E-03 1 16 LYD294 0,85 1,76E-03 1 17 LYD294 0,84 2,49E-03 1 13 LYD294 0,75 1,18E-02 1 14 LYD294 0,70 2,41E-02 3 2 LYD294 0,72 1,94E-02 3 17

104 / 378 Nome do Conj de ID de Nome do Conj de ID de R Valor p R Valor p Gene Exp.

Corr.

Gene Exp.

Corr.

LYD294 0,81 4,93E-03 3 13 LYD295 0,93 8,65E-05 1 11 LYD295 0,89 5,39E-04 1 25 LYD295 0,87 1,15E-03 1 18 LYD295 0,73 1,76E-02 3 25 LYD296 0,71 2,28E-02 1 23 LYD297 0,73 1,58E-02 1 16 LYD297 0,78 7,28E-03 1 13 LYD300 0,73 2,51E-02 2 22 LYD303 0,70 2,39E-02 1 17 LYD303 0,72 1,91E-02 1 13 LYD303 0,77 9,48E-03 3 2 LYD303 0,76 1,11E-02 3 17 LYD303 0,83 2,91E-03 3 13 LYD303 0,73 1,73E-02 3 14 LYD304 0,70 2,34E-02 1 14 LYD304 0,72 1,84E-02 3 24 LYD308 0,78 8,33E-03 4 6 LYD309 0,72 1,82E-02 1 20 LYD310 0,76 1,10E-02 1 20 LYD310 0,73 1,65E-02 1 21 LYD310 0,72 1,82E-02 1 23 LYD315 0,88 8,81E-04 1 2 LYD315 0,82 3,42E-03 1 16 LYD315 0,84 2,10E-03 1 17 LYD315 0,84 2,42E-03 1 13 LYD315 0,79 6,32E-03 1 14 LYD315 0,70 3,57E-02 2 2 LYD315 0,70 3,52E-02 2 13 LYD315 0,79 1,05E-02 2 14 LYD315 0,78 7,74E-03 3 16 LYD315 0,86 1,43E-03 3 4 LYD315 0,75 1,22E-02 3 17 LYD315 0,75 1,33E-02 3 5 LYD315 0,91 2,42E-04 4 2 LYD315 0,75 1,27E-02 4 16 LYD315 0,78 7,43E-03 4 17 LYD315 0,77 9,03E-03 4 13 LYD315 0,81 4,26E-03 4 14 LYD318 0,78 7,45E-03 1 2 LYD318 0,86 1,26E-03 1 1 LYD318 0,75 1,22E-02 1 5 LYD318 0,86 1,36E-03 1 24 LYD318 0,71 2,14E-02 3 16 LYD318 0,74 1,35E-02 3 17 LYD318 0,77 9,45E-03 3 1 LYD318 0,76 1,01E-02 3 13 LYD318 0,72 1,95E-02 3 14 LYD319 0,74 1,41E-02 4 15 LYD320 0,81 4,38E-03 1 2 LYD320 0,76 1,10E-02 1 13 LYD320 0,79 6,15E-03 1 14 LYD320 0,72 2,73E-02 2 2 LYD320 0,81 8,30E-03 2 4 LYD320 0,79 1,20E-02 2 5 LYD320 0,78 1,33E-02 2 24 LYD320 0,78 8,46E-03 3 2 LYD320 0,78 8,03E-03 4 13 LYD320 0,90 3,95E-04 4 14 LYD322 0,72 1,91E-02 1 11 LYD322 0,74 1,43E-02 1 18 LYD323 0,72 1,95E-02 3 2 LYD325 0,86 1,24E-03 3 11 LYD325 0,87 1,22E-03 3 25 LYD325 0,94 6,39E-05 3 18 LYD327 0,79 6,01E-03 1 2 LYD327 0,83 2,81E-03 1 16 LYD327 0,81 4,37E-03 1 17 LYD327 0,92 1,95E-04 1 13 LYD327 0,81 4,43E-03 1 14 LYD327 0,83 5,30E-03 2 14 LYD327 0,80 5,34E-03 4 2 LYD327 0,84 2,31E-03 4 16 LYD327 0,84 2,56E-03 4 17 LYD327 0,92 1,27E-04 4 13 LYD327 0,90 3,59E-04 4 14 LYD330 0,75 2,05E-02 2 3 LYD331 0,74 1,36E-02 1 22 LYD331 0,81 4,46E-03 1 20 LYD331 0,70 2,28E-02 1 6 LYD331 0,81 4,34E-03 1 21 LYD331 0,70 2,39E-02 1 7 LYD331 0,77 9,77E-03 1 23 LYD331 0,75 1,92E-02 2 19 LYD331 0,78 1,34E-02 2 20 LYD331 0,76 1,78E-02 2 21 LYD331 0,71 3,20E-02 2 23 LYD331 0,74 1,36E-02 3 20 LYD331 0,74 1,35E-02 3 21 LYD331 0,87 1,02E-03 4 19 LYD332 0,86 1,42E-03 1 16 LYD332 0,82 3,66E-03 1 17 LYD332 0,90 3,17E-04 1 13 LYD332 0,79 6,66E-03 1 14 LYD332 0,81 4,49E-03 4 16 LYD332 0,80 4,97E-03 4 17 LYD332 0,79 6,44E-03 4 13 LYD334 0,73 2,65E-02 2 6 LYD335 0,71 2,19E-02 1 2 LYD335 0,79 6,85E-03 1 16 LYD335 0,78 8,37E-03 1 17 LYD335 0,73 1,70E-02 1 13 LYD335 0,72 1,85E-02 1 14 LYD335 0,72 1,97E-02 3 1 LYD337 0,76 1,07E-02 4 4 LYD337 0,77 9,01E-03 4 5 LYD339 0,71 2,23E-02 3 10 LYD339 0,78 8,08E-03 3 26 LYD340 0,77 9,66E-03 3 18 LYD340 0,85 1,69E-03 3 15 LYD341 0,76 1,10E-02 3 20 LYD341 0,78 7,19E-03 3 21 LYD341 0,85 1,62E-03 3 23 LYD344 0,80 5,20E-03 1 14

105 / 378 Nome do Conj de ID de Nome do Conj de ID de R Valor p R Valor p Gene Exp. Corr. Gene Exp. Corr. LYD344 0,74 1,49E-02 3 14 Tabela 10. São providas as correlações (R) entre os níveis de expressão de genes melhoradores de rendimento e seus homólogos em tecidos [Folhas ou hastes; Conjuntos de expressão (Exp)] e o desempenho fenotípico em diversos componentes de rendimento, biomassa, taxa de crescimento e/ou vigor [Vetor de correlação (corr.)] sob condições de estresse ou condições normais através de acessos de Arabidopsis. P = valor p.

EXEMPLO 4

PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE TOMATE E ANÁLISE DE

CORRELAÇÃO DE ALTO RENDIMENTO USANDO MICROARRANJO DE OLIGONUCLEOTÍDEO DO TOMATE DE 44K

[00329] De modo a produzir uma análise de correlação de alto rendimento entre fenótipos relacionados com NUE e expressão de gene, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo do Tomate, produzido pela Agilent Technologies [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://World Wide Web (dot) chem. (dot) agilent (dot) com/Scripts/PDS (dot) asp?1Page=50879]. O oligonucleotídeo do arranjo representa cerca de 44.000 genes e transcritos do Tomate. De modo a definir as correlações entre os níveis de expressão de RNA com NUE, ABST, componentes de rendimento ou parâmetros relacionados com vigor várias características de planta de 18 variedades diferentes de Tomate foram analisadas. Entre elas, 10 variedades abrangendo a variação observada foram selecionadas para a análise de expressão de RNA. A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros distinguidos foi analisada usando teste de correlação de Pearson [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://World Wide Web (dot) davidmlane (dot) com/hyperstat/A34739 (dot) html].

[00330] Correlação de variedades de Tomate através de ecotipos cultivados sob condições de cultivo de baixo Nitrogênio, secas e regulares Procedimentos Experimentais: 10 variedades de Tomate foram cultivadas em 3 blocos repetitivos, cada um contendo 6 plantas por canteiro foram cultivadas em

106 / 378 sombra de malha. Em resumo, o protocolo de cultivo foi como segue:

[00331] Condições regulares de cultivo: As variedades de Tomate foram cultivadas sob condições normais (4 a 6 Litros/m2 de água por dia e fertilizadas com NPK como recomendado nos protocolos para produção de tomate comercial).

[00332] Condições de fertilização com Nitrogênio baixo: As variedades de Tomate foram cultivadas sob condições normais (4 a 6 litros/m2 por dia e fertilizados com NPK como recomendado nos protocolos para a produção de tomate comercial) até o estágio de flor. Neste tempo, a fertilização com Nitrogênio foi interrompida.

[00333] Estresse pela seca: A variedade de tomate foi cultivada sob condições normais (4 a 6 Litros/m2 por dia) até o estágio de flor. Neste tempo, a irrigação foi reduzida para 50% comparada com as condições normais. As plantas foram fenotipadas em uma base diária a seguir do descritor padrão de tomate (Tabela 12). A colheita foi conduzida enquanto 50% das frutas estavam vermelhas (maduras). As plantas foram separadas da parte vegetativa e frutas, delas, 2 nós foram analisados quanto aos parâmetros de inflorescência adicionais tais como tamanho, número de flores e peso da inflorescência. O peso fresco de todo o material vegetativo foi medido. As frutas foram separadas por cor (vermelho vs. verde) e de acordo com o tamanho da fruta (pequena, média e grande). Em seguida, os dados analisados foram salvos em arquivos de texto e processados usando o software de análise estatística JMP (SAS institute). Os parâmetros de dados coletados estão resumidos nas Tabelas 13-15, aqui abaixo.

[00334] Tecidos de Tomate Analisados — Dois tecidos em estágios desenvolvimentais diferentes [flor e folha], representando características de planta diferentes, foram amostrados e o RNA foi extraído como descrito acima. Por conveniência, cada tipo de tecido de informação de expressão de microarranjo recebeu um ID do Conjunto como resumido na Tabela 11

107 / 378 abaixo. Tabela 11 Conjuntos de expressão de transcriptoma de tomate Conjunto de Expressão ID do Conjunto Folha no estágio reprodutivo sob condições de NUE 1+10 Flor sob condições normais 5+2 Folha no estágio reprodutivo sob condições normais 8+3 Flor sob condições de seca 9+7 Folha no estágio reprodutivo sob condições de seca 11+4 Flor sob condições de NUE 12+6

[00335] A Tabela 12 provê os parâmetros correlacionados com o tomate (Vetores). A média para cada um dos parâmetros medidos foi calculada usando o software JMP e os valores estão resumidos nas Tabelas 13-15 abaixo. A análise de correlação subsequente foi conduzida. Os resultados foram integrados com a base de dados (Tabela 16). Tabela 12 Parâmetros correlacionados com tomate (vetores) Parâmetro correlacionado com ID de Correlação NUE [rendimento/SPAD] (Normal) 1 NUpE [biomassa/SPAD] (Normal) 2 HI [rendimento/rendimento+biomassa] (Normal) 3 NUE2 [biomassa total/SPAD] (Normal) 4 Área total da folha [cm2] (Normal) 5 Comprimento do folíolo [cm] (Normal) 6 Largura do folíolo (Normal) 7 Peso de 100 frutas verdes (Normal) 8 Peso de 100 frutas vermelhas (Normal) 9 SLA [área de folha/biomassa de planta] (Normal) 10 Rendimento/área total da folha (Normal) 11 Rendimento/SLA (Normal) 12 Rendimento de Fruta/Planta (NUE) 13 FW/Planta (NUE) 14 peso médio da fruta vermelha (NUE) 15 NUE pela fruta/Normal 16 FW NUE/Normal 17 SPAD NUE 18 RWC NUE 19 SPAD 100% RWC (NUE) 20 SPAD NUE/Normal 21 SAPD 100% RWC NUE/Normal 22 RWC NUE/Normal 23 Nenhuma flor (NUE) 24 Peso de agrupamentos (flores) (NUE) 25 Num. Flores NUE/Normal 26 NUE por peso de agrupamento/Normal 27 RWC Seca 28 RWC Seca/Normal 29 Num de flores (Seca) 30 Peso de agrupamentos de flores (Seca) 31

108 / 378 Parâmetro correlacionado com ID de Correlação Num de Flor Seca/Normal 32 Num de Flor Seca/NUE 33 Peso de agrupamento de flores Seca/Normal 34 Peso de agrupamento de flores Seca/NUE 35 Rendimento de Fruta/Planta Seca 36 FW/Planta Seca 37 Peso médio da fruta vermelha seca 38 Rendimento de Fruta Seca/Normal 39 Fruta Seca/NUE 40 FW seca/Normal 41 peso de fruta vermelha Seca/Normal 42 Rendimento de Fruta /Planta (Normal) 43 FW/Planta (Normal) 44 Peso médio da fruta vermelha (Normal) 45 SPAD (Normal) 46 RWC (Normal) 47 SPAD 100% RWC (Normal) 48 Nenhuma flor (Normal) 49 Peso de agrupamentos de flor (Normal) 50 Área total da folha [cm2]) (Seca) 51 Comprimento do folíolo [cm]) (Seca) 52 Largura do folíolo [cm] (Seca) 53 Peso de 100 frutas verdes (Seca) 54 Peso de 100 frutas vermelhas (Seca) 55 NUE [rendimento/SPAD] (N baixo) 56 NUpE [biomassa/SPAD] (N baixo) 57 HI [rendimento/rendimento+biomassa] (N baixo) 58 NUE2 [biomassa total/SPAD] (N baixo) 59 Área total da folha [cm2] (N baixo) 60 Comprimento do folíolo [cm] (N baixo) 61 Largura do folíolo (N baixo) 62 Peso de 100 frutas verdes (N baixo) 63 SLA [área de folha/biomassa de planta] (N baixo) 64 Rendimento/área total da folha (N baixo) 65 Rendimento/SLA (N baixo) 66 Peso de 100 frutas vermelhas (N baixo) 67 Tabela 12. São providos os parâmetros correlacionados com tomate. “g” = gramas; “FW” = peso fresco; “NUE” = eficiência no uso de nitrogênio; “RWC” = conteúdo relativo de água; “NUpE” = eficiência na absorção de nitrogênio; “SPAD” = níveis de clorofila; “HI” = índice de colheita (peso vegetativo dividido pelo rendimento); “SLA” = área específica de folha (área de folha dividida pelo peso seco da folha), Tratamento entre parênteses.

[00336] Peso da Fruta (gramas) - No final do experimento [quando 50% das frutas foram maduros (vermelhos)] todas as frutas dos canteiros dentro dos blocos A-C foram coletadas. As frutas totais foram contadas e pesadas. O peso médio das frutas foi calculado dividindo-se o peso de fruta total pelo número de frutas.

[00337] Peso vegetativo da planta (gramas) - No final do experimento [quando 50% das frutas foram maduros (vermelhos)] todas as plantas dos canteiros dentro dos blocos A-C foram coletados. O peso fresco foi medido

109 / 378 (gramas).

[00338] Peso da Inflorescência (gramas) - No final do experimento [quando 50% das frutas foram maduros (vermelhos)] duas inflorescências dos canteiros dentro dos blocos A-C foram coletadas. O peso da inflorescência (g) e o número de flores por inflorescência foram contados.

[00339] SPAD – O conteúdo de clorofila foi determinado usando um medidor de clorofila SPAD 502 da Minolta e a medição foi realizada no tempo de florescimento. As leituras do medidor SPAD foram feitas sobre folhas jovens completamente desenvolvidas. Três medições por folha foram determinadas por canteiro.

[00340] A eficiência no uso de água (WUE) - pode ser determinada como a biomassa produzida por transpiração unitária. Para analisar a WUE, o conteúdo de água relativo da folha foi medido nas plantas de controle e transgênicas. O peso fresco (FW) foi imediatamente registrado; depois as folhas foram embebidas durante 8 horas em água destilada na temperatura ambiente no escuro e o peso túrgido (TW) foi registrado. O peso total seco (DW) foi registrado depois de secar 10 das folhas a 60°C até um peso constante. O conteúdo de água relativo (RWC) foi calculado de acordo com a seguinte Fórmula I [(FW - DW/TW - DW) x 100] como descrito acima. As plantas que mantiveram alto conteúdo de água relativo (RWC) comparado com as linhagens de controle foram consideradas mais tolerantes à seca do que aquelas exibindo conteúdo de água relativo reduzido Resultados Experimentais Tabela 13 Parâmetros medidos nos acessos de Tomate (linhas 1-6) Ecotipo/ID de Linha-1 Linha-2 Linha-3 Linha-4 Linha-5 Linha-6 Correlação No. 1 0,02 0,01 0,01 0,00 0,01 0,01 2 0,03 0,09 0,05 0,02 0,05 0,05 3 0,35 0,10 0,14 0,12 0,18 0,19 4 0,05 0,09 0,06 0,02 0,06 0,06 5 426,10 582,38 291,40 593,58 6 6,34 7,99 5,59 7,70 7 3,69 4,77 3,43 4,56 8 0,56 3,05 0,24 2,58

110 / 378 Ecotipo/ID de Linha-1 Linha-2 Linha-3 Linha-4 Linha-5 Linha-6 Correlação No. 9 0,82 2,46 0,50 2,76 10 140,99 689,67 130,22 299,12 11 0,00 0,00 0,00 0,00 12 0,00 0,00 0,00 0,00 13 0,41 0,66 0,48 0,46 1,35 0,35 14 4,04 1,21 2,25 2,54 1,85 3,06 15 0,02 0,19 0,01 0,01 0,10 0,00 16 0,49 1,93 0,97 3,80 2,78 0,78 17 2,65 0,38 0,74 3,01 0,83 1,54 18 38,40 39,40 47,50 37,00 44,60 41,70 19 74,07 99,08 69,49 63,24 77,36 77,91 20 28,47 39,04 33,01 23,42 34,53 32,51 21 0,77 1,06 0,85 0,80 0,93 0,96 22 0,79 1,37 0,92 0,75 1,31 0,97 23 1,02 1,30 1,08 0,94 1,41 1,00 24 19,00 5,33 9,00 13,00 10,67 16,67 25 0,53 0,37 0,31 0,35 0,47 0,25 26 3,35 0,28 1,42 1,70 1,10 2,00 27 0,46 1,07 0,44 0,01 1,08 0,02 28 72,12 74,51 65,33 72,22 66,13 68,33 29 0,99 0,97 1,02 1,08 1,21 0,88 30 16,67 6,50 15,67 20,33 11,67 25,33 31 0,37 0,41 0,33 0,29 0,55 0,31 32 2,94 0,34 2,47 2,65 1,21 3,04 33 0,88 1,22 1,74 1,56 1,09 1,52 34 0,32 1,19 0,47 0,01 1,25 0,03 35 0,69 1,11 1,06 0,82 1,16 1,25 36 0,47 0,48 0,63 0,35 2,04 0,25 37 2,62 1,09 1,85 2,22 2,63 2,71 38 0,01 0,19 0,21 0,00 0,10 0,00 39 0,57 1,41 1,27 2,88 4,20 0,55 40 1,15 0,73 1,32 0,76 1,51 0,71 41 1,72 0,34 0,61 2,63 1,18 1,36 42 0,19 24,37 25,38 0,02 20,26 0,04 43 0,83 0,34 0,49 0,12 0,49 0,45 44 1,53 3,17 3,02 0,84 2,24 1,98 45 0,05 0,01 0,01 0,29 0,01 0,05 46 49,70 37,20 55,80 46,40 48,20 43,40 47 72,83 76,47 64,29 67,07 54,79 77,61 48 36,17 28,45 35,89 31,09 26,38 33,68 49 5,67 19,33 6,33 7,67 9,67 8,33 50 1,17 0,34 0,69 56,35 0,44 11,31 56 0,01 0,02 0,01 0,02 0,04 0,01 57 0,14 0,03 0,07 0,11 0,05 0,09 58 0,09 0,35 0,18 0,15 0,42 0,10 59 0,16 0,05 0,08 0,13 0,09 0,11 60 565,93 384,77 294,83 378,00 476,39 197,08 61 6,40 5,92 3,69 5,43 6,95 3,73 62 3,47 1,97 1,79 2,55 3,52 1,73 63 0,87 3,66 0,57 0,37 3,40 0,68 64 140,04 317,12 131,29 148,82 257,51 64,34 65 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 66 0,00 0,00 0,00 0,00 0,01 0,01 67 1,06 6,87 0,65 0,53 7,17 0,44 Tabela 13. São providos os valores de cada um dos parâmetros (como descritos acima na Tabela 12) medidos em acessos de tomate (Número de linha) sob todas as condições de cultivo.

As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

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Tabela 14 Parâmetros medidos em acessos de Tomate (linhas 7-12) Ecotipo/ID de Linha-7 Linha-8 Linha-9 Linha-10 Linha-11 Linha-12 Correlação No. 1 0,01 0,01 0,00 0,01 0,02 0,00 2 0,02 0,04 0,05 0,05 0,05 0,08 3 0,38 0,17 0,06 0,10 0,27 0,05 4 0,03 0,05 0,06 0,06 0,06 0,08 5 947,59 233,35 340,73 339,11 190,14 421,79 6 7,85 6,22 6,16 5,65 4,39 4,44 7 4,44 3,15 3,37 3,13 2,40 2,02 8 6,32 5,75 0,38 0,30 1,95 2,53 9 5,32 5,24 0,61 0,66 2,70 0,70 10 1117,74 111,77 106,29 123,14 104,99 111,88 11 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 12 0,00 0,00 0,00 0,00 0,01 0,00 13 0,01 0,51 0,44 0,47 1,59 0,39 14 3,13 2,54 1,84 1,52 1,91 1,86 15 0,01 0,01 0,01 0,01 0,02 0,01 16 0,02 1,16 2,07 1,51 2,41 2,06 17 3,70 1,22 0,58 0,55 1,06 0,49 18 34,40 50,00 44,70 53,70 35,70 58,80 19 80,49 67,40 67,16 66,07 69,57 69,30 20 27,66 33,68 30,04 35,50 24,81 40,77 21 0,80 0,94 0,76 1,05 0,89 1,24 22 1,11 0,95 0,79 0,92 0,94 1,36 23 1,38 1,01 1,04 0,88 1,05 1,10 24 6,00 16,00 15,00 6,00 17,00 13,00 25 0,29 0,47 0,40 0,30 0,82 0,40 26 1,20 1,92 1,50 0,86 1,89 1,63 27 0,37 0,81 0,55 0,36 0,95 0,80 28 78,13 18,46 73,21 62,50 67,21 75,76 29 1,34 0,28 1,13 0,83 1,01 1,20 30 29,73 17,33 14,67 29,67 15,00 10,33 31 0,45 0,56 0,30 0,31 0,31 0,31 32 5,95 2,08 1,47 4,24 1,67 1,29 33 4,96 1,08 0,98 4,94 0,88 0,79 34 0,56 0,96 0,42 0,38 0,36 0,62 35 1,52 1,19 0,76 1,04 0,38 0,78 36 0,05 0,45 0,29 1,02 0,60 0,49 37 3,41 2,11 1,95 1,76 1,72 1,92 38 0,03 0,01 0,01 0,00 0,01 0,01 39 0,09 1,03 1,39 3,28 0,91 2,62 40 5,06 0,89 0,67 2,17 0,38 1,27 41 4,02 1,01 0,61 0,64 0,95 0,51 42 0,15 0,02 0,86 0,74 0,09 1,72 43 0,53 0,44 0,21 0,31 0,66 0,19 44 0,85 2,09 3,21 2,75 1,81 3,77 45 0,23 0,29 0,01 0,01 0,06 0,01 46 42,90 53,30 58,50 51,10 40,00 47,60 47 58,18 66,51 64,71 75,25 66,23 63,21 48 24,98 35,47 37,87 38,43 26,49 30,07 49 5,00 8,33 10,00 7,00 9,00 8,00 50 0,79 0,58 0,73 0,83 0,86 0,50 51 337,63 52 5,15 53 2,55

112 / 378 Ecotipo/ID de Linha-7 Linha-8 Linha-9 Linha-10 Linha-11 Linha-12 Correlação No. 54 0,80 55 0,89 56 0,00 0,02 0,01 0,01 0,06 0,01 57 0,11 0,08 0,06 0,04 0,08 0,05 58 0,00 0,17 0,19 0,24 0,45 0,17 59 0,11 0,09 0,08 0,06 0,14 0,06 60 453,24 625,51 748,01 453,96 164,85 338,30 61 4,39 6,72 6,66 4,39 3,90 5,29 62 1,87 3,54 3,28 2,52 2,61 2,61 63 0,45 0,47 0,54 0,39 0,97 0,91 64 144,60 246,05 405,55 299,32 86,19 182,32 65 0,00 0,00 0,00 0,00 0,01 0,00 66 0,00 0,00 0,00 0,00 0,02 0,00 67 0,55 0,75 0,58 1,27 1,34 Tabela 14. São providos os valores de cada um dos parâmetros (como descritos acima na Tabela 2) medidos em acessos de Tomate (Número de linha) sob todas as condições de cultivo. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 15 Parâmetros medidos em acessos de Tomate (linhas 13-18) Ecotipo/ID de Linha-13 Linha-14 Linha-15 Linha-16 Linha-17 Linha-18 Correlação No. 1 0,01 0,01 0,01 0,01 0,01 0,00 2 0,03 0,04 0,05 0,03 0,07 0,04 3 0,31 0,12 0,14 0,17 0,09 0,11 4 0,05 0,05 0,06 0,04 0,08 0,04 5 581,33 807,51 784,06 351,80 255,78 1078,10 6 6,77 7,42 6,71 5,87 4,16 10,29 7 3,80 3,74 2,98 3,22 2,09 5,91 8 1,42 2,03 1,39 2,27 0,45 0,42 9 2,64 4,67 2,17 0,49 0,34 0,75 10 307,95 419,37 365,81 212,93 84,94 469,87 11 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 12 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 13 0,32 0,45 0,14 0,40 1,44 0,50 14 2,47 2,62 1,08 1,17 0,92 1,09 15 0,01 0,05 0,36 0,04 0,63 16 0,38 1,64 0,41 1,21 4,59 1,70 17 1,31 1,36 0,51 0,71 0,31 0,47 18 47,50 45,20 39,00 45,00 65,30 51,90 19 100,00 57,66 90,79 68,00 59,65 72,17 20 47,47 26,06 35,38 30,60 38,97 37,46 21 0,82 0,94 0,89 0,83 1,57 0,88 22 1,44 1,50 1,05 0,56 1,48 0,84 23 1,76 1,60 1,17 0,68 0,94 0,96 24 8,67 9,33 12,67 6,67 9,33 8,00 25 0,35 0,43 0,35 0,45 0,28 0,47 26 1,63 1,17 1,65 0,74 0,88 0,89 27 0,34 0,61 0,94 0,68 0,40 1,44 28 62,82 70,69 55,75 75,22 63,68 62,31 29 1,11 1,97 0,72 0,75 1,01 0,83 30 18,33 12,00 20,33 12,67 12,67 11,33 31 8,36 0,29 0,34 0,44 0,27 0,43 32 3,44 1,50 2,65 1,41 1,19 1,26 33 2,12 1,29 1,61 1,90 1,36 1,42 34 8,20 0,41 0,91 0,67 0,38 1,31

113 / 378 Ecotipo/ID de Linha-13 Linha-14 Linha-15 Linha-16 Linha-17 Linha-18 Correlação No. 35 24,12 0,67 0,97 0,99 0,95 0,91 36 0,27 0,68 0,14 0,53 0,55 0,41 37 2,21 3,73 0,75 1,76 0,63 1,11 38 0,00 0,01 0,30 0,14 0,04 0,09 39 0,32 2,48 0,41 1,62 1,76 1,42 40 0,84 1,51 0,98 1,34 0,38 0,84 41 1,17 1,94 0,35 1,06 0,21 0,48 42 0,17 0,02 10,50 27,89 11,79 9,98 43 0,85 0,27 0,35 0,33 0,31 0,29 44 1,89 1,93 2,14 1,65 3,01 2,29 45 0,03 0,26 0,03 0,00 0,00 0,01 46 57,90 48,30 43,60 54,50 41,60 59,10 47 56,77 35,96 77,62 100,00 63,16 75,13 48 32,89 17,35 33,82 54,47 26,25 44,43 49 5,33 8,00 7,67 9,00 10,67 9,00 50 1,02 0,70 0,38 0,66 0,70 0,33 51 130,78 557,93 176,67 791,86 517,05 832,27 52 3,38 7,14 5,48 8,62 6,35 6,77 53 2,04 4,17 3,09 4,69 3,87 2,91 54 0,28 0,38 0,63 2,86 1,16 4,40 55 0,35 0,63 2,27 7,40 2,94 11,60 56 0,01 0,02 0,00 0,01 0,04 0,01 57 0,05 0,10 0,03 0,04 0,02 0,03 58 0,12 0,15 0,12 0,25 0,61 0,31 59 0,06 0,12 0,03 0,05 0,06 0,04 60 396,00 236,15 174,58 441,78 489,18 707,80 61 6,32 5,11 4,72 6,83 7,10 8,21 62 3,58 2,56 2,48 3,43 3,30 3,69 63 0,36 0,35 0,57 4,38 2,02 8,13 64 160,18 90,10 160,99 379,03 531,08 650,68 65 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 66 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 67 0,52 0,57 0,94 6,17 3,67 11,33 Tabela 15: São providos os valores de cada um dos parâmetros (como descritos acima na Tabela 12) medido em acessos de Tomate (Número de linha) sob todas as condições de cultivo. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento.

Tabela 16 Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas modalidades da invenção em diversos tecidos e o desempenho fenotípico sob condições normais e de estresse através de ecotipos de tomate Nome do Gene Conj. ID de Nome do Conj. ID de R Valor p R Valor p de Exp. Corr. Gene Exp. Corr. LYD475 0,71 2,04E-02 1 20 LYD475 0,79 6,15E-03 1 22 LYD475 0,77 2,51E-02 2 12 LYD475 0,75 3,15E-02 2 11 LYD475 0,73 1,61E-02 12 19 LYD477 0,87 9,33E-04 1 20 LYD477 0,88 3,84E-03 2 12 LYD477 0,84 9,63E-03 2 11 LYD477 0,81 4,38E-03 11 35 LYD477 0,80 5,67E-03 11 34 LYD477 0,81 4,78E-03 11 31 LYD478 0,73 1,69E-02 1 20 LYD478 0,83 5,37E-03 2 3 LYD478 0,85 4,01E-03 2 1 LYD478 0,76 2,79E-02 2 9 LYD478 0,88 1,78E-03 3 1 LYD478 0,86 1,59E-03 9 35 LYD478 0,83 2,72E-03 9 34 LYD478 0,85 1,69E-03 9 31 LYD478 0,88 8,98E-04 12 20 LYD478 0,73 1,76E-02 12 23 LYD478 0,82 3,55E-03 12 19

114 / 378 LYD479 0,80 1,76E-02 2 11 LYD479 0,73 1,63E-02 6 59 LYD479 0,75 1,17E-02 6 57 LYD479 0,77 9,70E-03 9 33 LYD479 0,75 1,24E-02 9 30 LYD479 0,74 1,37E-02 12 14 LYD479 0,83 3,23E-03 12 17 LYD479 0,77 8,56E-03 12 26 LYD479 0,71 2,25E-02 11 33 LYD479 0,76 1,10E-02 11 40 LYD480 0,92 4,80E-04 3 3 LYD480 0,81 8,33E-03 3 1 LYD480 0,74 1,36E-02 8 46 LYD481 0,89 1,16E-03 2 3 LYD481 0,94 1,51E-04 2 1 LYD481 0,82 1,18E-02 2 9 LYD481 0,78 1,41E-02 3 4 LYD482 0,73 4,01E-02 2 12 LYD482 0,81 1,41E-02 2 11 LYD482 0,76 1,13E-02 5 46 LYD482 0,72 1,87E-02 11 35 LYD482 0,82 3,41E-03 11 34 LYD482 0,74 1,47E-02 11 31 LYD483 0,77 2,42E-02 2 12 LYD483 0,74 3,73E-02 2 11 LYD483 0,75 1,95E-02 3 3 LYD483 0,83 2,98E-03 8 46 LYD484 0,73 1,63E-02 1 22 LYD484 0,75 1,95E-02 2 3 LYD484 0,81 8,10E-03 2 1 LYD487 0,78 2,17E-02 2 12 LYD487 0,74 2,39E-02 2 3 LYD487 0,75 1,99E-02 2 1 LYD487 0,84 9,32E-03 2 11 LYD489 0,72 2,72E-02 3 3 LYD489 0,90 2,63E-03 2 12 LYD489 0,81 1,44E-02 2 11 LYD489 0,81 4,72E-03 11 42 LYD489 0,83 3,14E-03 11 38 LYD491 0,70 5,16E-02 2 12 LYD491 0,74 3,46E-02 2 11 LYD491 0,74 2,24E-02 3 3 LYD491 0,77 1,55E-02 3 1 LYD491 0,75 1,26E-02 9 35 LYD491 0,78 7,60E-03 9 34 LYD491 0,75 1,31E-02 9 31 LYD491 0,72 1,85E-02 11 34 LYD491 0,71 2,25E-02 11 31 LYD492 0,83 3,20E-03 1 20 LYD492 0,73 1,67E-02 1 23 LYD492 0,71 2,06E-02 1 22 LYD492 0,76 1,07E-02 1 19 LYD492 0,83 5,13E-03 3 3 LYD492 0,80 1,04E-02 3 1 Tabela 16. São providas as correlações (R) entre os níveis de expressão de genes melhoradores de rendimento e seus homólogos em diversos tecidos [Conjuntos de Expressão (Exp)] e o desempenho fenotípico [componentes de rendimento, biomassa, taxa de crescimento e/ou vigor (ID do Vetor de Correlação (Corr.))] sob condições normais através de ecotipos de tomate. P = valor p.

EXEMPLO 5 PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE B. JUNCEA E ANÁLISE DE

CORRELAÇÃO DE ALTO RENDIMENTO COM PARÂMETROS DE

RENDIMENTO USANDO MICROARRANJOS DE OLIGONUCLEOTÍDEO DE B. JUNCEA DE 60K

[00341] De modo a produzir uma análise de correlação de alto rendimento, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo de B. juncea, produzido pela Agilent Technologies [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://World Wide Web (dot) chem. (dot) agilent (dot) com/Scripts/PDS (dot) asp?1Page=50879]. O oligonucleotídeo do arranjo representa cerca de 60.000 genes e transcritos de B. juncea. De modo a definir correlações entre os níveis de expressão de RNA com componentes de rendimento ou parâmetros relacionados com vigor, várias características de

115 / 378 planta de 11 variedades de B. juncea diferentes foram analisadas e usadas para a análise de expressão de RNA. A correlação entre os níveis de NA e os parâmetros distinguidos foi analisada usando o teste de correlação de Pearson.

[00342] Correlação dos níveis de expressão dos genes de B. juncea com características fenotípicas através do ecotipo Procedimentos Experimentais

[00343] 11 variedades de B. juncea foram cultivadas em três canteiros repetitivos, no campo. Em resumo, o protocolo de cultivo foi como segue: Sementes de B. juncea foram semeadas no solo e cultivadas sob condição normal até a colheita. De modo a definir correlações entre os níveis de expressão de RNA com componentes de rendimento ou parâmetros relacionados com vigor, as 11 variedades de B. juncea diferentes foram analisados e usados para a análise de expressão de gene. Tabela 17 Tecidos usados para conjuntos de expressão de transcriptoma de B. juncea Conjunto de Expressão ID do Conjunto Meristema no estágio vegetativo sob condições de cultivo normais 1 Flor no estágio de florescimento sob condições de cultivo normais 2 Folha no estágio vegetativo sob condições de cultivo normais 3 Vagem (R1-R3) sob condições de cultivo normais 4 Vagem (R4-R5) sob condições de cultivo normais 5

[00344] Extração de RNA — Todas as 11 variedades de B. juncea selecionadas foram amostradas para cada tratamento. Os tecidos vegetais [Folha, Vagem, Meristema Lateral e Flor] cultivados sob condições normais foram amostrados e o RNA foi extraído como descrito acima.

[00345] Os parâmetros de dados coletados foram como segue: Peso fresco (canteiro-colheita) [g/plantaJ — peso fresco total por canteiro no tempo da colheita normalizado para o número de plantas por canteiro.

[00346] Peso de Semente [miligramas /planta] — as sementes totais de cada canteiro foram extraídas, pesadas e normalizadas quanto aos números de plantas em cada canteiro.

116 / 378

[00347] Índice de colheita - O índice de colheita foi calculado: Peso de Semente / peso fresco

[00348] Dias até o pendoamento / florescimento — número de dias até 50% do pendoamento / florescimento para cada canteiro.

[00349] SPAD – O conteúdo de clorofila foi determinado usando um medidor de clorofila SPAD 502 da Minolta e a medição foi realizada no tempo de florescimento. As leituras do medidor de SPAD foram feitas sobre folha jovem completamente desenvolvida. Três medições por folha foram determinadas para cada canteiro.

[00350] Ramo principal - comprimento médio do nó — comprimento total / número total de nós no ramo principal.

[00351] Ramo lateral - comprimento médio do nó— comprimento total / número total de nós no ramo lateral.

[00352] Ramo principal – 20o comprimento — o comprimento da vagem no 20o nó a partir do ápice do ramo principal.

[00353] Ramo lateral - 20o comprimento — o comprimento da vagem no 20o nó a partir do ápice do ramo lateral.

[00354] Ramo principal - 20o No. de semente — número de sementes na vagem no 20o nó a partir do ápice do ramo principal.

[00355] Ramo lateral - 20o número de semente - número de sementes na vagem no 20o nó a partir do ápice do ramo lateral.

[00356] Número de ramos laterais — número total de ramos laterais, média de três plantas por canteiro.

[00357] Altura do ramo principal [cm] — comprimento total do ramo principal.

[00358] Posição min do ramo lateral — nó mais baixo no ramo principal que desenvolveu ramo lateral.

[00359] Posição máx do ramo lateral [#nó do ramo principal] — nó mais alto no ramo principal que desenvolveu ramo lateral.

117 / 378

[00360] Número máx de nós no ramo lateral — o número mais alto de nó que um ramo lateral teve por planta.

[00361] Comprimento máx do ramo lateral [cm] — o comprimento máx do ramo lateral por planta.

[00362] Diâmetro máx do ramo lateral [mm] — o diâmetro de base mais alto que um ramo lateral teve por planta.

[00363] Conteúdo de óleo – A análise indireta do conteúdo de óleo foi realizada usando a Espectroscopia de Ressonância Magnética Nuclear (RMN), que mede a energia de ressonância absorvida pelos átomos de hidrogênio no estado líquido da amostra [Ver, por exemplo, Conway TF. e Earle FR., 1963, Journal of the American Oil Chemists’ Society; Springer Berlin / Heidelberg, ISSN: 0003-021X (Print) 1558-9331 (On line)];

[00364] Peso fresco (planta única) (g/planta) — peso fresco médio de três plantas por canteiro determinadas no meio da estação.

[00365] Diâmetro da base do ramo principal [mm] — o diâmetro da base do ramo principal, média de três plantas por canteiro.

[00366] 1000 Sementes [g] — peso de 1000 sementes por canteiro. Resultados Experimentais

[00367] Onze variedades de B. juncea diferentes (isto é, Linhas 1-11) foram cultivadas e distinguidas para a 23 parâmetros como especificados na Tabela 18, abaixo. A média para cada um dos parâmetros medidos foi calculada usando o software JMP e os valores são resumidos nas Tabelas 19- 20 abaixo. A análise de correlação subsequente entre os diversos conjuntos de expressão de transcriptoma e os parâmetros médios foi conduzida (Tabela 21). Os resultados foram depois integrados à base de dados. Tabela 18 Parâmetros medidos em acessos de B. juncea Parâmetro correlacionado com ID de Correlação Dias até pendoamento (dias) 1 Peso fresco (colhido no canteiro) [g/planta] 2 Peso de semente por planta (g) 3 Índice de colheita (razão) 4

118 / 378 Parâmetro correlacionado com ID de Correlação Dias até florescimento (dias) 5 SPAD 6 Ramo principal - comprimento médio do nó (cm) 7 Ramo lateral - comprimento médio do nó (cm) 8 Ramo principal – 20o comprimento (cm) 9 Ramo lateral – 20o comprimento (cm) 10 Ramo principal - 20o número de semente (número) 11 Ramo lateral - 20o número de semente (número) 12 Número de ramos laterais (número) 13 Altura do ramo principal [cm] 14 Posição Min do Ramo Lateral 15 ([No. de nós do ramo principal) Posição máx do Ramo Lateral 16 [No. de nós do ramo principal] Número máx de nós no ramo lateral (número) 17 Comprimento máx do ramo lateral [cm] 18 Diâmetro máx do ramo lateral [mm] 19 Conteúdo de óleo (mg) 20 Peso fresco (planta única) [g/planta] 21 Diâmetro base do ramo principal [mm] 22 1000 Sementes [g] 23 Tabela 18. São providos os parâmetros correlacionados de B. juncea. “g” = gramas; mm = milímetros; “cm” = centímetros; “mg” = miligramas; “SPAD” = níveis de clorofila;

Tabela 19 Parâmetros medidos nos acessos de B. juncea (linhas 1-6) Ecotipo/ID de Correlação Linha-1 Linha-2 Linha-3 Linha-4 Linha-5 Linha-6 No. 1 57,33 60,33 59,67 56,33 55,00 46,67 2 69,24 45,22 39,27 49,11 43,95 46,42 3 0,00 0,01 0,01 0,01 0,01 0,01 4 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 5 66,00 69,67 69,33 66,00 61,33 53,00 6 33,02 30,01 32,83 37,53 41,44 35,41 7 0,48 0,41 0,63 0,43 0,38 0,68 8 0,65 0,43 0,74 0,57 0,56 0,79 9 4,28 3,72 3,62 3,50 2,74 5,20 10 4,32 3,69 4,14 3,37 3,06 3,96 11 13,22 13,67 10,44 14,11 9,78 15,22 12 13,00 14,00 13,22 13,44 11,00 13,11 13 15,22 14,89 13,56 14,89 14,00 9,78 14 140,72 125,22 112,44 133,39 142,00 101,50 15 6,78 6,33 5,56 3,67 3,00 3,11 16 15,22 14,89 13,56 14,89 14,00 10,89 17 5,22 7,00 5,22 7,00 6,56 9,44 18 40,44 47,22 41,61 60,50 59,78 59,44 19 4,20 4,85 4,34 5,74 5,87 5,68 20 40,19 40,71 40,91 38,57 40,14 42,63 21 197,78 142,22 147,22 243,33 192,33 163,78 22 14,53 11,99 19,91 14,32 12,59 12,30 23 3,76 2,21 3,26 2,36 2,00 3,12 Tabela 19: São providos os valores de cada um dos parâmetros (como descritos acima) medidos em acessos de B. juncea (número de linhas) sob condições normais.

119 / 378 Tabela 20 Parâmetros medidos nos acessos de B. juncea (linhas 7-11) Ecotipo/ID de Correlação Linha-7 Linha-8 Linha-9 Linha-10 Linha-11 No. 1 59,00 54,33 59,67 57,33 53,00 2 36,14 32,58 33,16 63,23 60,94 3 0,00 0,00 0,00 0,01 0,01 4 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 5 69,67 63,67 69,67 71,00 58,33 6 33,17 32,87 34,80 31,82 41,49 7 0,40 0,63 0,57 0,59 1,55 8 0,57 0,76 0,96 0,78 0,90 9 3,91 3,98 3,46 3,73 4,04 10 4,33 4,21 4,14 4,04 3,88 11 12,00 12,67 9,89 11,56 15,56 12 11,89 13,44 11,22 13,22 14,00 13 16,44 14,33 14,56 14,11 16,78 14 145,39 131,56 129,89 131,56 116,44 15 7,78 6,22 5,56 4,89 5,33 16 16,44 14,33 14,56 14,11 16,78 17 6,11 5,22 5,67 6,56 6,00 18 47,28 47,33 44,67 58,67 47,17 19 4,52 4,89 4,68 5,56 5,49 20 41,34 40,82 40,82 38,14 37,21 21 164,44 181,11 176,22 217,89 261,11 22 12,60 12,91 12,56 13,77 13,56 23 3,34 3,09 3,39 3,40 2,39 Tabela 20: São providos os valores de cada um dos parâmetros (como descritos acima) medidos nos acessos de B. juncea (número de linhas) sob condições normais.

Tabela 21 Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas modalidades da invenção em diversos tecidos e o desempenho fenotípico sob condições normais através de acessos de B. juncea Conj. ID do ID do Nome do Nome do Conj. de R Valor p de Conj. de R Valor p Conj. de Gene Gene Exp. Exp. Corr. Corr. LYD346 0,76 6,81E-03 5 20 LYD347 0,84 3,86E-02 2 3 LYD347 0,77 7,40E-02 2 2 LYD347 0,85 3,34E-02 2 12 LYD348 0,70 1,18E-01 2 19 LYD348 0,78 6,45E-02 2 11 LYD348 0,96 2,23E-03 2 21 LYD348 0,89 1,78E-02 2 3 LYD348 0,79 6,14E-02 2 7 LYD348 0,94 6,04E-03 2 2 LYD348 0,77 5,36E-03 5 17 LYD349 0,95 8,71E-05 1 21 LYD349 0,79 6,32E-02 2 21 LYD349 0,97 1,06E-03 2 3 LYD349 0,77 7,19E-02 2 7 LYD349 0,85 3,18E-02 2 2 LYD349 0,74 9,30E-02 2 12 LYD349 0,70 2,40E-02 3 22 LYD349 0,84 1,32E-03 5 8 LYD351 0,86 2,81E-03 1 2 LYD351 0,70 1,20E-01 2 21 LYD351 0,91 1,08E-02 2 3 LYD351 0,92 9,53E-03 2 2 LYD351 0,84 3,73E-02 2 12 LYD351 0,73 1,02E-02 5 7 LYD351 0,71 1,50E-02 5 8 LYD352 0,78 1,24E-02 1 6 LYD352 0,83 5,97E-03 1 21 LYD352 0,78 1,30E-02 1 4 LYD352 0,73 2,45E-02 1 3 LYD352 0,90 1,11E-03 1 7 LYD352 0,72 1,05E-01 2 20 LYD352 0,85 3,11E-02 2 4 LYD353 0,93 3,25E-04 1 11

120 / 378 Conj.

ID do ID do Nome do Nome do Conj. de R Valor p de Conj. de R Valor p Conj. de Gene Gene Exp.

Exp.

Corr.

Corr.

LYD353 0,71 3,22E-02 1 17 LYD353 0,88 2,07E-02 2 11 LYD353 0,80 5,37E-02 2 21 LYD353 0,84 3,75E-02 2 3 LYD353 0,97 1,03E-03 2 7 LYD354 0,94 4,59E-03 2 3 LYD354 0,72 1,05E-01 2 2 LYD354 0,77 7,17E-02 2 12 LYD354 0,77 1,59E-02 1 17 LYD354 0,74 2,15E-02 1 9 LYD354 0,71 1,39E-02 5 20 LYD354 0,72 1,20E-02 5 9 LYD355 0,85 3,49E-03 1 11 LYD355 0,90 8,14E-04 1 9 LYD355 0,87 2,61E-02 2 21 LYD355 0,95 3,74E-03 2 3 LYD355 0,72 1,07E-01 2 7 LYD355 0,94 5,40E-03 2 2 LYD355 0,79 4,05E-03 5 8 LYD356 0,73 1,68E-02 3 10 LYD356 0,79 7,12E-03 3 23 LYD357 0,92 8,69E-03 2 11 LYD357 0,87 2,54E-02 2 21 LYD357 0,88 2,07E-02 2 3 LYD357 0,98 5,08E-04 2 7 LYD357 0,73 1,02E-01 2 12 LYD357 0,82 3,51E-03 3 4 LYD358 0,86 2,81E-03 1 4 LYD358 0,78 6,49E-02 2 20 LYD358 0,86 2,77E-02 2 4 LYD358 0,88 7,61E-04 3 6 LYD358 0,72 1,29E-02 5 3 LYD359 0,80 5,55E-02 2 6 LYD359 0,78 6,68E-02 2 11 LYD359 0,85 3,12E-02 2 21 LYD359 0,94 5,89E-03 2 3 LYD359 0,90 1,34E-02 2 7 LYD359 0,79 6,11E-03 3 6 LYD360 0,76 1,86E-02 1 4 LYD360 0,70 1,21E-01 2 10 LYD360 0,77 7,03E-02 2 1 LYD360 0,89 1,89E-02 2 23 LYD360 0,82 4,39E-02 2 5 LYD360 0,91 1,14E-02 2 8 LYD360 0,70 1,62E-02 5 4 LYD361 0,91 1,23E-02 2 4 LYD361 0,82 3,94E-03 3 7 LYD361 0,85 1,84E-03 3 8 LYD361 0,76 6,39E-03 5 22 LYD362 0,82 7,41E-03 1 6 LYD362 0,82 6,74E-03 1 7 LYD362 0,78 6,84E-02 2 4 LYD362 0,72 2,00E-02 3 2 LYD364 0,75 1,97E-02 1 23 LYD364 0,77 7,31E-02 2 21 LYD364 0,92 9,20E-03 2 3 LYD364 0,89 1,74E-02 2 2 LYD364 0,72 1,05E-01 2 12 LYD365 0,86 2,66E-02 2 11 LYD365 0,83 3,98E-02 2 9 LYD365 0,84 3,55E-02 2 16 LYD365 0,84 3,55E-02 2 13 LYD366 0,89 1,67E-02 2 11 LYD366 0,90 1,55E-02 2 21 LYD366 0,85 3,10E-02 2 3 LYD366 0,82 4,41E-02 2 7 LYD366 0,91 1,24E-02 2 2 LYD366 0,80 5,80E-02 2 12 LYD367 0,79 1,06E-02 1 7 LYD367 0,74 2,23E-02 1 8 LYD367 0,88 1,92E-02 2 11 LYD367 0,71 1,10E-01 2 21 LYD367 0,80 5,61E-02 2 3 LYD367 0,94 4,77E-03 2 7 LYD367 0,71 2,02E-02 3 6 LYD368 0,78 1,35E-02 1 4 LYD368 0,81 4,99E-02 2 6 LYD368 0,78 6,86E-02 2 21 LYD368 0,73 1,02E-01 2 3 LYD368 0,87 2,58E-02 2 7 LYD368 0,83 1,54E-03 5 23 LYD497 0,81 7,77E-03 1 4 LYD497 0,89 1,60E-02 2 16 LYD497 0,89 1,60E-02 2 13 LYD497 0,71 1,42E-02 5 18 LYD497 0,72 1,21E-02 5 17 LYD498 0,72 2,85E-02 1 7 LYD498 0,94 6,09E-03 2 11 LYD498 0,86 2,92E-02 2 7 LYD498 0,87 2,44E-02 2 16 LYD498 0,87 2,44E-02 2 13 LYD498 0,74 1,54E-02 3 19 LYD498 0,78 7,69E-03 3 18 LYD499 0,71 1,12E-01 2 11 LYD499 0,94 4,67E-03 2 21 LYD499 0,84 3,73E-02 2 3 LYD499 0,80 5,81E-02 2 7 LYD499 0,93 7,27E-03 2 2 LYD500 0,73 1,01E-01 2 20 LYD500 0,78 6,91E-02 2 4 LYD500 0,82 1,96E-03 5 20 LYD501 0,91 6,50E-04 1 7 LYD501 0,95 4,38E-03 2 11 LYD501 0,84 3,49E-02 2 7 LYD501 0,84 3,77E-02 2 9 LYD501 0,91 1,21E-02 2 16 LYD501 0,91 1,21E-02 2 13 LYD501 0,72 1,99E-02 3 21 Tabela 21. São providas as correlações (R) entre os níveis de expressão de genes melhoradores de rendimento e seus homólogos em tecidos [Folhas, meristema, flor e vagens; Conjuntos de

121 / 378 expressão (Exp)] e o desempenho fenotípico em diversos componentes de rendimento, biomassa, taxa de crescimento e/ou vigor [ID de vetor de correlação (corr.)] sob condições normais através de acessos de B. juncea. P = valor p.

EXEMPLO 6 PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE B. JUNCEA E ANÁLISE DE

CORRELAÇÃO DE ALTO RENDIMENTO COM PARÂMETROS DE

RENDIMENTO DE JUNCEA CULTIVADA SOB VÁRIAS DENSIDADES POPULACIONAIS USANDO 60K MICROARRANJOS DE OLIGONUCLEOTÍDEO DE B. JUNCEA

[00368] De modo a produzir uma análise de correlação de alto rendimento, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo de B. juncea, produzido pela Agilent Technologies [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://World Wide Web (dot) chem. (dot) agilent (dot) com/Scripts/PDS (dot) asp?1Page=50879]. O oligonucleotídeo do arranjo representa cerca de 60.000 genes e transcritos de B. juncea. De modo a definir correlações entre os níveis de expressão de RNA com componentes de rendimento ou parâmetros relacionados com vigor, várias características de planta de duas variedades de B. juncea diferentes cultivadas sob sete densidades populacionais diferentes foram analisadas e usadas para a análise de expressão de RNA. A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros distinguidos foram analisados usando teste de correlação de Pearson.

[00369] Correlação dos níveis de expressão dos genes de B. juncea com características fenotípicas através de sete densidades populacionais para dois ecotipos Procedimentos Experimentais

[00370] Duas variedades de B. juncea foram cultivadas em um campo sob sete densidades populacionais (10, 60, 120, 160, 200, 250 e 300 plantas por m2) em dois canteiros repetitivos. Em resumo, o protocolo de cultivo foi como segue: sementes de B. juncea foram semeadas em solo e cultivadas sob condição normal até a colheita. De modo a definir correlações entre os níveis

122 / 378 de expressão de RNA com componentes de rendimento ou parâmetros relacionados com vigor, as duas variedades de B. juncea diferentes cultivadas sob várias densidades populacionais foram analisadas e usadas para a análise de expressão de gene. A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros distinguidos foram analisados usando o teste de correlação de Pearson para cada ecotipo independentemente. Tabela 22 Tecidos usados para conjuntos de expressão de transcriptoma de B. juncea Conjunto de Expressão ID do Conjunto Meristema sob condições de cultivo normais várias densidades populacionais 1+2 Flor sob condições de cultivo normais 3 várias densidades populacionais Tabela 22: São providos os dígitos de identificação (ID) de cada um dos conjuntos de expressão de B. juncea.

[00371] Extração de RNA — as duas variedades de B. juncea cultivadas sob sete densidades populacionais foram amostradas para cada tratamento. Tecidos vegetais [Flor e Meristema Lateral] cultivados sob condições normais foram amostrados e o RNA foi extraído como descrito acima. Por conveniência, cada tipo de tecido de informação de expressão em microarranjo recebeu um ID do Conjunto.

[00372] Os parâmetros de dados coletados foram como segue: Peso fresco (colhido no canteiro) [g/plantaJ — peso total fresco por canteiro no tempo da colheita normalizado para o número de plantas por canteiro.

[00373] Peso de semente [g/plantaJ — as sementes totais de cada canteiro foram extraídas, pesadas e normalizadas para o número de planta em cada canteiro.

[00374] Índice de colheita - O índice de colheita foi calculado: peso de semente / peso fresco

[00375] Dias até pendoamento / florescimento — número de dias até 50% de pendoamento / florescimento para cada canteiro.

[00376] SPAD – O conteúdo de clorofila foi determinado usando um

123 / 378 medidor de clorofila SPAD 502 da Minolta e a medição foi realizada no tempo de florescimento. As leituras do medidor SPAD foram feitas sobre folha jovem completamente desenvolvida. Três medições por folha foram determinadas para cada canteiro.

[00377] Ramo principal - comprimento médio do nó — comprimento total / número total de nós no ramo principal.

[00378] Ramo lateral - comprimento médio do nó— comprimento total / número total de nós no ramo lateral.

[00379] Ramo principal - 20o comprimento — o comprimento da vagem no 20o nó a partir do ápice do ramo principal.

[00380] Ramo lateral - 20o comprimento — o comprimento da vagem no 20o nó a partir do ápice do ramo lateral.

[00381] Ramo principal - 20o No. de semente — número de sementes na vagem no 20o nó a partir do ápice do ramo principal.

[00382] Ramo lateral - 20o número de semente - número de sementes na vagem no 20o nó a partir do ápice do ramo lateral.

[00383] Número de ramos laterais — número total de ramos laterais, média de três plantas por canteiro.

[00384] Altura do ramo principal [cm] — comprimento total do ramo principal.

[00385] Posição min do ramo lateral — nó mais baixo no ramo principal que desenvolveu ramo lateral.

[00386] Posição máx do ramo lateral [#nó do ramo principal] — nó mais alto no ramo principal que desenvolveu ramo lateral.

[00387] Número máx de nós no ramo lateral — o número mais alto de nó que um ramo lateral teve por planta.

[00388] Comprimento máx do ramo lateral [cm] — o comprimento mais alto do ramo lateral por planta.

[00389] Diâmetro máx do ramo lateral [mm] — o diâmetro de base

124 / 378 mais alto que um ramo lateral teve por planta.

[00390] Conteúdo de óleo - Análise Indireta do conteúdo de óleo foi realizada usando a Espectroscopia de Ressonância Magnética Nuclear (RMN), que mede a energia de ressonância absorvida pelos átomos de hidrogênio no estado líquido da amostra [Ver, por exemplo, Conway TF. e Earle FR., 1963, Journal of the American Oil Chemists’ Society; Springer Berlin / Heidelberg, ISSN: 0003-021X (Print) 1558-9331 (On line)];

[00391] Peso fresco (planta única) (g/planta) — peso médio fresco de três plantas por canteiro tomado no meio da estação.

[00392] Diâmetro base do ramo principal [mm] — o diâmetro da base do ramo principal, média de três plantas por canteiro.

[00393] 1000 Sementes [g] — peso de 1000 sementes por canteiro.

[00394] Ramo principal-número total de vagens — número total de vagens no ramo principal, média de três plantas por canteiro.

[00395] Ramo principal-dist 1-20 — o comprimento entre a vagem mais jovem e a vagem número 20 no ramo principal, média de três plantas por canteiro.

[00396] Ramo lateral-número total de vagens - número total de vagens no ramo lateral mais baixo, média de três plantas por canteiro.

[00397] Ramo lateral-dis. 1-20 — O comprimento entre a vagem mais jovem e a vagem número 20 no ramo lateral mais baixo, média de três plantas por canteiro.

[00398] Peso seco/planta — peso de plantas totais por canteiro na colheita depois de três dias em estufa a 60°C normalizada para o número de plantas por canteiro.

[00399] Área total da folha — A área total da folha por canteiro foi calculada com base em três plantas aleatórias e normalizada para o número de plantas por canteiro.

[00400] Perim. total — O perímetro total de folhas, foi calculado com

125 / 378 base em três plantas aleatórias e normalizado para o número de plantas por canteiro. Resultados Experimentais

[00401] Duas variedades de B. juncea foram cultivadas sob sete densidades populacionais diferentes e distinguidas para a 30 parâmetros como especificado na Tabela 23 abaixo. A média para cada um dos parâmetros medidos foi calculada usando o software JMP e os valores estão resumidos nas Tabelas 24-26 abaixo. A análise de correlação subsequente entre a expressão de genes selecionados em diversos conjuntos de expressão de transcriptoma e os parâmetros médios foi conduzida. Os resultados foram depois integrados para a base de dados (Tabela 27). Tabela 23 Parâmetros de correlação em acessos de B. juncea Parâmetro correlacionado com ID de Correlação Diâmetro base do ramo principal [mm] 1 Peso fresco (planta única) [g/planta] 2 Altura do ramo principal [cm] 3 Número de ramos laterais (número) 4 Posição Min de ramo lateral (número de nós na haste principal) 5 Posição máx no ramo lateral (número de nós na haste principal) 6 Número máx de nós no ramo lateral (número) 7 Comprimento máx do ramo lateral [cm] 8 Diâmetro máx do ramo lateral [mm] 9 Número total de vagens no ramo O principal (número) 10 Ramo principal-dist. 1-20 11 Ramo principal-20o comprimento (cm) 12 Ramo principal-20o número de semente (número) 13 Ramo lateral-número total de vagens (número) 14 Ramo lateral-dist. 1-20 15 Ramo lateral-20o comprimento (cm) 16 Ramo lateral-20o número de semente (número) 17 Conteúdo de óleo (mg) 18 SPAD 19 dias até pendoamento (dias) 20 dias até florescimento (dias) 21 Peso fresco (na colheita)/planta (g/planta) 22 Peso seco/planta (g/planta) 23 Peso de semente/planta (g/planta) 24 Peso fresco (colheita)/hectare (Kg/ hectare) 25 Peso seco/hectare (Kg./hectare) 26 Peso de semente/hectare 27 1000 Sementes [g] 28 Área total da folha (cm) 29 Perim Total (cm). 30 Tabela 23. São providos os parâmetros correlacionados de B. juncea. “g” = gramas; mm = milímetros; “cm” = centímetros; “mg” = miligramas; “SPAD” = níveis de clorofila; “Kg.” = quilogramas;

126 / 378 Tabela 24 Parâmetros medidos em variedades de B. juncea em várias densidades populacionais Variedade na linha 1- linha 1- linha 1- densidade linha 1- linha 1- densidade: densidade: densidade: populacional/ densidade: 160 densidade: 200 10 120 250 ID de Correlação No. 1 14,7666667 6,9 5,61666667 4,99166667 6,45 2 0,3675 0,03583333 0,03333333 0,02416667 0,0375 3 118,666667 115,5 111,333333 106 117,5 4 17,1666667 19,1666667 15,8333333 19,3333333 18,333333 5 1 11 7 11 9 6 20 23 19 24 22 7 10 4 4 4 6 8 122 41 43 36 40 9 7,7 2,9 2,5 2 3,4 10 20 15,33333333 17,6666667 16,5 23,166667 11 42,35 27,9 31,2166667 26,05 27,716667 12 5,11666667 4,633333333 4,6 4,66666667 4,7333333 13 20 17,66666667 18 18,5 17,666667 14 17,3333333 11,66666667 10,6666667 10,1666667 12,5 15 40,7333333 17,53333333 19,0833333 15,65 15,233333 16 5,11666667 4,483333333 4,36666667 4,33333333 4,35 17 21,6666667 19,33333333 17 18,8333333 15,666667 18 28,855 29,615 29,57 30,585 29,87 19 43,49 41,95 40,48 37,93 39,5 20 53 50,5 48 53 50 21 67 64 64 64 64 22 0,25972617 0,017544463 0,01160373 0,00941177 0,0086383 23 0,07146015 0,007860795 0,00318829 0,00218658 0,0027891 24 0,02093378 0,001837079 0.00088821 0.00073613 0.0008761 25 22434,188 22067,23763 32929,2929 18596,0411 20654,321 26 6109,01654 9857,366286 8940,69724 4363,21162 6702,2185 27 1797,45096 2307,336938 2552,83939 1466,27328 2100,3779 28 1,80123016 1,7524685 1,62082389 1,98973809 1,9222969 29 508,273183 37,4855833 24,9985 14,33268 50,78652 30 862,832233 100,498267 67,98265 37,90552 97,50658 Tabela 24: São providos os valores de cada um dos parâmetros (como descritos na Tabela 23 acima) medidos em 2 variedades de B. juncea nas densidades populacionais indicadas sob condições normais. Por exemplo, “linha 1 densidade: 10” se refere à variedade de Juncea 1 cultivada em uma densidade populacional de 10 plantas per m2.

Tabela 25 Parâmetros medidos nas variedades de B. juncea em várias densidades populacionais Variedade na linha 1- linha 2- densidade linha 1- linha 2- linha 2- densidade: densidade: populacional /ID densidade: 60 densidade: 10 densidade: 160 300 120 de Correlação No. 1 3,95 7,3666667 18,9 7,8083333 6,79166667 2 0,02166667 0,074 0,335 0,0433333 0,03166667 3 108 116 133,166667 144,58333 144,916667 4 17,8333333 16,166667 12,5 15,333333 16,8333333

127 / 378 5 9 5 1 8 9 6 20 20 14 17 21 7 4 6 11 6 5 8 42 78 127 42 34 9 2,5 4,4 8,4 3 2,6 10 16,83333333 15,166667 30,66666667 35,166667 29,83333333 11 31,85 37,583333 38,71666667 32,85 28,76666667 12 4,683333333 5,1 4,666666667 3,85 4,433333333 13 17,5 17,666667 14,33333333 10,333333 13,83333333 14 9,833333333 14 29,83333333 17,333333 12,83333333 15 17,73333333 28,25 33,41666667 14,266667 9,833333333 16 4,4 4,95 4,483333333 3,6666667 3,983333333 17 17,16666667 14,55 12,83333333 10,166667 12,33333333 18 25,215 26,775 34,39 38,65 39,66 19 45,57 40,89 43,83 41,31 40,86 20 51,5 53 55 50,5 47 21 62,5 62,5 64 61 61 22 0,009480434 0,0470682 0,186308744 0,015699 0,013530187 23 0,002374948 0,0111681 0,045443225 0,0045977 0,004239026 24 0.000755044 0,0031703 0,014292085 0,0015562 0,001265508 25 24019,71326 33376,441 16427,35043 15747,619 18531,76931 26 6009,085327 7906,6628 3979,782952 4609,2529 5801,024836 27 1901,668907 2247,0135 1270,039245 1560,5283 1732,849463 28 1,54010747 1,5648537 2,81538106 3,1954331 2,87691722 29 29,1283 76,394583 1338,57912 76,818567 34,4628 30 61,16926 219,13607 1518,31188 162,79095 82,7731667 Tabela 25: São providos os valores de cada um dos parâmetros (como descritos na Tabela 23 acima) medidos em 2 variedades de B. juncea nas densidades populacionais indicadas sob condições normais. Por exemplo, “linha 2-densidade: 300” se refere à variedade Juncea 2 cultivada em uma densidade populacional de 300 plantas por m2.

Tabela 26 Parâmetros medidos nas variedades de B. juncea em várias densidades populacionais Variedade na densidade linha 2- linha 2- linha 2- linha 2- populacional/ID de densidade: 200 densidade: 250 densidade: 300 densidade: 60 Correlação No. 1 6,95 7,533333 5,441667 8,766667 2 0,025 0,028333 0,024167 0,065833 3 138,5 144,1667 135,75 157,3333 4 16,66667 16,66667 15,5 12,83333 5 8 10 8 3 6 18 19 18 16 7 4 6 4 11 8 23 38 25 109 9 2,1 2,8 2,35 8 10 30,83333 29,33333 25,33333 33,83333 11 25,3 26,38333 25,06667 45,25 12 4,116667 4,116667 4,233333 4,433333 13 10,33333 11 10,66667 13,16667 14 11,16667 13 9 18,5 15 8,6 10,98333 6,35 21,58333 16 4,033333 3,966667 3,7 4,716667 17 10,66667 9,833333 9 11,16667 18 36,795 37,1 37,61 37,545 19 39,31 40,46 47,48 39,21 20 48 49 49 51,5

128 / 378 21 61 61 61 61 22 0,009797 0,008836 0,008388 0,039744 23 0,003773 0,002963 0,002531 0,011524 24 0.000842 0.000819 0.000729 0,0034 25 17182,54 16833,33 23055,66 20833,33 26 6581,384 5656,266 6882,516 6039,66 27 1472,184 1560,8 2005,713 1780,966 28 3,256972 3,276912 3,430244 2,773618 29 28,27737 41,3294 92,8963 218,1545 30 75,36597 83,49002 143,9019 328,9701 Tabela 26: São providos os valores de cada um dos parâmetros (como descritos na Tabela 23 acima) medidos em 2 variedades de B. juncea nas densidades populacionais indicadas sob condições normais. Por exemplo, “linha 2-densidade: 200” se refere à variedade Juncea 2 cultivada em uma densidade populacional de 200 plantas por m2.

Tabela 27 Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas modalidades da invenção em diversos tecidos e o desempenho fenotípico sob condições normais em densidades diferentes através de acessos de B. juncea ID do ID do Nome do Conj Nome do Conj. de R Valor p Conj. de R Valor p Conj. de Gene Exp. Gene Exp. Corr. Corr. LYD347 0,81 2,84E-02 2 13 LYD347 0,73 6,45E-02 2 21 LYD348 0,71 7,58E-02 2 26 LYD351 0,84 1,78E-02 2 6 LYD351 0,76 4,93E-02 2 5 LYD351 0,80 3,02E-02 2 4 LYD352 0,89 6,74E-03 2 9 LYD352 0,90 5,09E-03 2 8 LYD352 0,91 4,34E-03 2 1 LYD352 0,88 9,54E-03 2 7 LYD352 0,91 4,60E-03 2 15 LYD352 0,76 4,95E-02 2 16 LYD352 0,95 9,24E-04 2 24 LYD352 0,91 4,48E-03 2 13 LYD352 0,95 9,57E-04 2 29 LYD352 0,83 2,19E-02 2 11 LYD352 0,96 6,22E-04 2 2 LYD352 0,82 2,37E-02 2 14 LYD352 0,95 1,11E-03 2 23 LYD352 0,95 1,16E-03 2 30 LYD352 0,84 1,90E-02 2 21 LYD352 0,96 7,54E-04 2 22 LYD354 0,94 1,36E-03 2 9 LYD354 0,91 4,65E-03 2 8 LYD354 0,98 6,32E-05 2 1 LYD354 0,93 2,58E-03 2 7 LYD354 0,80 3,11E-02 2 3 LYD354 0,88 8,26E-03 2 15 LYD354 0,88 8,18E-03 2 16 LYD354 0,96 5,17E-04 2 24 LYD354 0,84 1,69E-02 2 12 LYD354 0,91 4,10E-03 2 13 LYD354 0,96 4,81E-04 2 29 LYD354 0,76 4,55E-02 2 11 LYD354 0,97 3,23E-04 2 2 LYD354 0,99 3,80E-05 2 14 LYD354 0,96 5,20E-04 2 23 LYD354 0,96 6,03E-04 2 30 LYD354 0,92 3,42E-03 2 21 LYD354 0,96 6,14E-04 2 22 LYD355 0,89 7,35E-03 2 5 LYD357 0,76 4,65E-02 2 9 LYD357 0,78 3,83E-02 2 8 LYD357 0,76 4,88E-02 2 7 LYD357 0,76 4,52E-02 2 15 LYD357 0,75 5,22E-02 2 24 LYD357 0,75 5,38E-02 2 12 LYD357 0,77 4,35E-02 2 29 LYD357 0,83 2,20E-02 2 11 LYD357 0,75 5,01E-02 2 2 LYD357 0,74 5,71E-02 2 23 LYD357 0,77 4,48E-02 2 30 LYD357 0,76 4,68E-02 2 22 LYD358 0,79 3,44E-02 2 9 LYD358 0,79 3,65E-02 2 8 LYD358 0,72 6,57E-02 2 1 LYD358 0,78 3,87E-02 2 7 LYD358 0,75 5,36E-02 2 3 LYD358 0,75 5,09E-02 2 15 LYD358 0,87 1,05E-02 2 16 LYD358 0,93 2,62E-03 2 12 LYD358 0,88 8,16E-03 2 14 LYD360 0,85 1,57E-02 2 9 LYD360 0,93 2,36E-03 2 8 LYD360 0,78 3,78E-02 2 1 LYD360 0,81 2,62E-02 2 7 LYD360 0,94 1,87E-03 2 15 LYD360 0,96 6,16E-04 2 16

129 / 378 LYD360 0,87 1,10E-02 2 24 LYD360 0,97 2,30E-04 2 12 LYD360 0,79 3,33E-02 2 13 LYD360 0,86 1,29E-02 2 29 LYD360 0,95 8,96E-04 2 11 LYD360 0,87 1,01E-02 2 2 LYD360 0,84 1,75E-02 2 14 LYD360 0,86 1,24E-02 2 23 LYD360 0,88 9,10E-03 2 30 LYD360 0,89 7,66E-03 2 22 LYD361 0,75 5,01E-02 2 13 LYD361 0,79 3,38E-02 2 21 LYD362 0,78 3,75E-02 2 9 LYD362 0,75 5,21E-02 2 8 LYD362 0,86 1,28E-02 2 19 LYD362 0,84 1,70E-02 2 27 LYD362 0,74 5,47E-02 2 1 LYD362 0,72 6,89E-02 2 7 LYD362 0,76 4,69E-02 2 15 LYD362 0,76 4,92E-02 2 24 LYD362 0,77 4,33E-02 2 29 LYD362 0,82 2,53E-02 2 11 LYD362 0,76 4,58E-02 2 2 LYD362 0,71 7,65E-02 2 14 LYD362 0,76 4,79E-02 2 23 LYD362 0,77 4,16E-02 2 30 LYD362 0,76 4,95E-02 2 22 LYD362 0,80 3,24E-02 2 26 LYD364 0,74 5,61E-02 2 6 LYD364 0,75 5,13E-02 2 28 LYD364 0,75 5,25E-02 2 4 LYD365 0,72 6,78E-02 2 18 LYD366 0,91 4,39E-03 2 5 LYD497 0,75 5,27E-02 2 5 LYD498 0,83 2,09E-02 2 5 LYD499 0,76 4,79E-02 2 1 LYD499 0,78 3,69E-02 2 24 LYD499 0,85 1,42E-02 2 13 LYD499 0,78 4,03E-02 2 29 LYD499 0,77 4,33E-02 2 2 LYD499 0,79 3,55E-02 2 23 LYD499 0,73 6,11E-02 2 30 LYD499 0,96 5,73E-04 2 21 LYD499 0,76 4,68E-02 2 22 LYD499 0,92 3,61E-03 2 17 LYD501 0,71 7,41E-02 2 15 LYD501 0,85 1,56E-02 2 16 LYD501 0,82 2,45E-02 2 12 LYD501 0,76 4,65E-02 2 11 LYD501 0,74 5,64E-02 2 5 Tabela 27. São providas as correlações (R) entre os níveis de expressão de genes melhoradores de rendimento e seus homólogos em tecidos [meristema e flor; Conjuntos de expressão (Exp)] e o desempenho fenotípico em diversos componentes de rendimento, biomassa, taxa de crescimento e/ou vigor [ID de Vetor de correlação (milho)] sob condições normais através de acessos de B. juncea. P = valor p.

EXEMPLO 7

PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE SORGO E ANÁLISE DE CORRELAÇÃO DE ALTO RENDIMENTO COM PARÂMETROS

RELACIONADOS COM ABST USANDO MICROARRANJOS DE OLIGONUCLEOTÍDEO DE SORGO DE 44K

[00402] De modo a produzir uma análise de correlação de alto rendimento entre fenótipo de planta e nível de expressão de gene, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo do sorgo, produzido pela Agilent Technologies [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://World Wide Web (dot) chem. (dot) agilent (dot) com/Scripts/PDS (dot) asp?1Page=50879]. O oligonucleotídeo do arranjo representa cerca de 44.000 genes e transcritos do sorgo. De modo a definir correlações entre os níveis de expressão de RNA com os componentes de ABST, rendimento e NUE ou parâmetros relacionados com vigor, várias

130 / 378 características de planta de 17 híbridos de sorgo diferentes foram analisadas. Entre eles, 10 híbridos abrangendo a variação observada foram selecionados para a análise de expressão de RNA. A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros distinguidos foi analisada usando o teste de correlação de Pearson [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://World Wide Web (dot) davidmlane (dot) com/hyperstat/A34739 (dot) html].

[00403] Correlação de variedades de Sorgo através de ecotipos cultivados sob condições de cultivo regular, condições de seca severa e condições de nitrogênio baixo Procedimentos Experimentais

[00404] 17 variedades de Sorgo foram cultivadas em 3 canteiros repetitivos, no campo. Em resumo, o protocolo de cultivo foi como segue:

[00405] Condições de cultivo regulares (normais): plantas de sorgo foram cultivadas no campo usando protocolos de fertilização e irrigação comerciais (370 litros por metro, fertilização de 14 unidades de ureia a 21% por período de crescimento inteiro).

[00406] Condições de seca: as sementes de sorgo foram semeadas em solo e cultivadas sob condição normal até em torno de 35 dias da semeadura, em torno do estágio V8 (oito folhas verdes são completamente expandidas, a inicialização ainda não começou). Neste ponto, a irrigação foi interrompida e estresse severo pela seca foi desenvolvido.

[00407] Condições de fertilização de baixo Nitrogênio: as plantas de sorgo foram fertilizadas com 50% menos quantidade de nitrogênio no campo do que a quantidade de nitrogênio aplicado no tratamento de crescimento regular. Todos os fertilizantes foram aplicados antes do florescimento.

[00408] Tecidos de Sorgo analisados — Todos os 10 híbridos de Sorgo selecionados foram amostrados para cada tratamento. Tecidos [Folha bandeira, Meristema floral e Flor] de plantas cultivadas sob condições

131 / 378 normais, estresse severo pela seca e condições de nitrogênio baixo foram amostradas e o RNA foi extraído como descrito acima. Cada tipo de tecido de informação de expressão de microarranjo recebeu um ID do Conjunto como resumido na Tabela 28 abaixo. Tabela 28 Conjuntos de expressão do transcriptoma do Sorgo Conjunto de Expressão ID do Conjunto Folha bandeira no estágio de florescimento sob condições de cultivo secas 1 Folha bandeira no estágio de florescimento sob condições de cultivo de nitrogênio baixo 2 Folha bandeira no estágio de florescimento sob condições de cultivo normais 3 Meristema floral no estágio de florescimento sob condições de cultivo secas 4 Meristema floral no estágio de florescimento sob condições de cultivo de nitrogênio baixo 5 Meristema floral no estágio de florescimento sob condições de cultivo normais 6 Flor no estágio de florescimento sob condições de cultivo secas 7 Flor no estágio de florescimento sob condições de cultivo de nitrogênio baixo 8 Flor no estágio de florescimento sob condições de cultivo normais 9 Tabela 28: São providos os conjuntos de expressão de transcriptoma do sorgo 1-9. Folha bandeira = a folha abaixo da flor; Meristema floral = Meristema apical seguindo a iniciação de panículo; Flor = a flor no dia da antese. Os conjuntos de expressão 1, 4 e 7 são de plantas cultivadas sob condições de seca; os conjuntos de expressão 2, 5 e 8 são de plantas cultivadas sob condições de nitrogênio baixo; Os conjuntos de expressão 3, 6 e 9 são de plantas cultivadas sob condições normais.

[00409] os seguintes parâmetros foram coletados usando sistema de imageamento digital:

[00410] No final do período de cultivo os grãos foram separados da ‘cabeça’ da planta e os seguintes parâmetros foram medidos e coletados:

[00411] Área de Grão Média (cm2) - Uma amostra de ~200 grãos foi pesada, fotografada e as imagens foram processadas usando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A área de grão foi medida a partir destas imagens e foi dividida pelo número de grãos.

[00412] (I) Razão Média Superior e Inferior da Área de Grão, Largura, Diâmetro e Perímetro – A projeção do grão de área, largura, diâmetro e perímetro foi extraída das imagens digitais usando o pacote de fonte aberta imagemJ (nih). Os dados de semente foram analisados em níveis médios de canteiro como segue:

[00413] Média de todas as sementes.

[00414] Média da fração de 20% superior - conteve a fração de 20%

132 / 378 superior de sementes.

[00415] Média da fração de 20% inferior - conteve a fração de 20% inferior de sementes.

[00416] Mais adiante, a razão entre cada fração e a média por canteiro foi calculada para cada um dos parâmetros de dados.

[00417] No final do período de cultivo 5 ‘Cabeças’ foram fotografadas e as imagens foram processadas usando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo.

[00418] Área Média da cabeça (cm2) - No final do período de cultivo 5 ‘Cabeças’ foram fotografadas e as imagens foram processadas usando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A área da ‘Cabeça’ foi medida a partir destas imagens e foi dividida pelo número de ‘Cabeças’.

[00419] Comprimento Médio da Cabeça (cm) - No final do período de cultivo 5 ‘Cabeças’ foram fotografadas e as imagens foram processadas usando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. O comprimento da ‘Cabeça’ (eixo mais longo) foi medido a partir destas imagens e foi dividido pelo número de ‘Cabeças’.

[00420] Largura média da Cabeça (cm) - No final do período de cultivo 5 ‘Cabeças’ foram fotografadas e as imagens foram processadas usando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A largura da ‘Cabeça’ foi medida a partir destas imagens e foi dividida pelo número de ‘Cabeças’.

[00421] Largura Média da Cabeça (cm) - No final do período de cultivo 5 ‘Cabeças’ foram fotografadas e as imagens foram processadas usando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. O perímetro da ‘Cabeça’ foi medido a partir destas imagens e foi dividido pelo número de ‘Cabeças’.

[00422] O sistema de processamento de imagem foi usado, que consiste de um computador de mesa pessoal (processador Intel P4 3,0 GHz) e

133 / 378 um programa de domínio público - ImageJ 1.37, o software de processamento de imagem com base no Java, que foi desenvolvido no U.S. National Institutes of Health e está gratuitamente disponível na internet no Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://rsbweb (dot) nih (dot) gov/. As imagens foram capturadas na resolução de 10 Mega Pixels (3888x2592 pixels) e armazenadas em um formato JPEG (padrão Joint Photographic Experts Group) de baixa compressão. Em seguida, os dados de saída de processamento de imagem para área de semente e comprimento de semente foram salvos em arquivos de texto e analisados usando o software de análise estatística JMP (SAS institute).

[00423] Os parâmetros adicionais foram coletados amostrando-se 5 plantas por canteiro ou medindo-se os parâmetros através de todas as plantas dentro do canteiro.

[00424] Peso de Grão Total/Cabeça (g) (rendimento de grão) - No final do experimento as cabeças (‘Cabeças’ de planta) dos canteiros dentro dos blocos A-C foram coletadas. 5 cabeças foram separadamente debulhadas e os grãos foram pesados, toda as cabeças adicionais foram debulhadas juntas e também pesadas. O peso de grão médio por cabeça foi calculado dividindo- se o peso de grão total pelo número total de cabeças por canteiro (com base no canteiro). No caso de 5 cabeças, o peso de grãos total de 5 cabeças foi dividido por 5.

[00425] FW de Cabeça/Grama de Planta - No final do experimento (quando as cabeças foram colhidas) as cabeças totais e 5 selecionadas por canteiros dentro dos blocos A-C foram coletadas separadamente. As cabeças (total e 5) foram pesadas (g) separadamente e o peso médio fresco por planta foi calculado para total (FW de Cabeça/ g de Planta com base no canteiro) e para 5 (FW de Cabeça/ g de Planta com base nas 5 plantas).

[00426] Altura da planta — as plantas foram distinguidas para à altura durante o período de cultivo em 5 pontos de tempo. Em cada medida, as

134 / 378 plantas foram medidas quanto à sua altura usando uma fita métrica. A altura foi medida a partir do nível do solo até o topo da folha mais longa.

[00427] SPAD - O conteúdo de clorofila foi determinado usando um medidor de clorofila SPAD 502 da Minolta e a medição foi realizada 64 dias após a semeadura. As leituras do medidor SPAD foram feitas sobre a folha jovem completamente desenvolvida. Três medições por folha foram determinadas por canteiro.

[00428] Peso fresco vegetativo e Cabeças - No final do experimento (quando a inflorescência foram seca) toda a inflorescência e material vegetativo dos canteiros dentro dos blocos A-C foram coletados. O peso da biomassa e Cabeças de cada canteiro foi separado, medido e dividido pelo número de Cabeças.

[00429] Biomassa de planta (Peso fresco) - No final do experimento (quando a Inflorescência foi seca) o material vegetativo dos canteiros dentro dos blocos A-C foram coletados. A biomassa das plantas sem a inflorescência foi medida e dividida pelo número de plantas.

[00430] FW de Cabeças/(FW de Cabeças + FW de Plantas) - O peso total fresco de cabeças e a sua respectiva biomassa de planta foi medido no dia da colheita. O peso das cabeças foi dividido pela soma de pesos de cabeças e plantas. Resultados Experimentais

[00431] 17 variedades de sorgo diferentes foram cultivadas e distinguidas quanto aos parâmetros diferentes (Tabela 29). A média para cada um dos parâmetros medidos foi calculada usando o software JMP (Tabelas 30-31) e uma análise de correlação subsequente entre os diversos conjuntos de transcriptoma (Tabela 28) e os parâmetros médios (Tabelas 30-31) foi conduzida. Os resultados foram depois integrados com a base de dados (Tabela 32).

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Tabela 29 Parâmetros correlacionados com o sorgo (vetores) Parâmetro correlacionado com ID de Correlação Peso de grão total /Cabeça g (com base no canteiro), Normal 1 Peso de grão total /Cabeça g (com base em 5 cabeças), Normal 2 Área Média da Cabeça (cm2), Normal 3 Perímetro Médio da Cabeça (cm), Normal 4 Comprimento Médio da Cabeça (cm), Normal 5 Largura Média da Cabeça (cm), Normal 6 Área de Grão Média (cm2), Normal 7 Área de Grão Média da Razão Superior, Normal 8 Área de Grão Média da Razão Inferior, Normal 9 Perímetro de Grão Médio da Razão Inferior, Normal 10 Comprimento de Grão Médio da Razão Inferior, Normal 11 Largura de Grão Média da Razão Inferior, Normal 12 Altura Final da Planta (cm), Normal 13 FW - Cabeça/Planta g (com base em 5 plantas), Normal 14 FW - Cabeça/Planta g (com base no canteiro), Normal 15 FW/Planta g (com base no canteiro), Normal 16 Folha SPAD 64 DPS (Dias Após a Semeadura), Normal 17 FW de Cabeças / (FW de Cabeças+ FW de Plantas)(todos os canteiros), Normal 18 [Biomassa de planta (FW)/SPAD 64 DPS], Normal 19 [Rendimento de Grão+Biomassa de Planta/SPAD 64 DPS], Normal 20 [Rendimento de Grão /SPAD 64 DPS], Normal 21 Peso de grão total /Cabeça (com base no canteiro) g, N baixo 22 Peso de grão total /Cabeça g (com base em 5 cabeças), N baixo 23 Área Média da Cabeça (cm2), N baixo 24 Perímetro Médio da Cabeça (cm), N baixo 25 Comprimento Médio da Cabeça (cm), N baixo 26 Largura Média da Cabeça (cm), N baixo 27 Área de Grão Média (cm2), N baixo 28 Área de Grão Média da Razão Superior, N baixo 29 Área de Grão Média da Razão Inferior, N baixo 30 Perímetro de Grão Médio da Razão Inferior, N baixo 31 Comprimento de Grão Médio da Razão Inferior, N baixo 32 Largura de Grão Média da Razão Inferior, N baixo 33 Altura Final da Planta (cm), N baixo 34 FW - Cabeça/Planta g (com base em 5 plantas), N baixo 35 FW - Cabeça/Planta g (com base no canteiro), N baixo 36 FW/Planta g (com base no canteiro), N baixo 37 Folha SPAD 64 DPS (Dias Após a Semeadura), N baixo 38 FW de Cabeças / (FW de Cabeças+ FW de Plantas)(todos os canteiros), N baixo 39 [Biomassa de planta (FW)/SPAD 64 DPS], N baixo 40 [Rendimento de Grão+biomassa de planta/SPAD 64 DPS], N baixo 41 [Rendimento de Grão /SPAD 64 DPS], N baixo 42 Peso de grão total /Cabeça g, (com base no canteiro) Seca 43 Área Média da Cabeça (cm2), Seca 44 Perímetro Médio da Cabeça (cm), Seca 45 Comprimento Médio da Cabeça (cm), Seca 46 Largura Média da Cabeça (cm), Seca 47 Área de Grão Média (cm2), Seca 48 Área de Grão Média da Razão Superior, Seca 49 Altura Final da Planta (cm), Seca 50 FW - Cabeça/Planta g (com base no canteiro), Seca 51 FW/Planta g (com base no canteiro), Seca 52 Folha SPAD 64 DPS (Dias Após a Semeadura), Seca 53 FW de Cabeças / (FW de Cabeças+ FW de Plantas) (todos os canteiros), Seca 54

136 / 378 Parâmetro correlacionado com ID de Correlação [Biomassa de planta (FW)/SPAD 64 DPS], Seca 55 Tabela 29. São providos os parâmetros correlacionados com o sorgo (vetores). “g” = gramas; `SPAD” = níveis de clorofila; “FW” = Peso fresco da planta; “normal” = condições de cultivo padrão.

Tabela 30 Parâmetros medidos em acessos de Sorgo (Linhas 1-9) Ecotipo/ID de Cor-relação Linha-1 Linha-2 Linha-3 Linha-4 Linha-5 Linha-6 Linha-7 Linha-8 Linha-9 No. 1 31,12 26,35 18,72 38,38 26,67 28,84 47,67 31,00 39,99 2 47,40 46,30 28,37 70,40 32,15 49,23 63,45 44,45 56,65 3 120,14 167,60 85,14 157,26 104,00 102,48 168,54 109,32 135,13 4 61,22 67,90 56,26 65,38 67,46 67,46 74,35 56,16 61,64 5 25,58 26,84 21,02 26,84 23,14 21,82 31,33 23,18 25,70 6 5,97 7,92 4,87 7,43 5,58 5,88 6,78 5,99 6,62 7 0,10 0,11 0,13 0,13 0,14 0,14 0,11 0,11 0,10 8 1,22 1,30 1,13 1,14 1,16 1,15 1,19 1,23 1,25 9 0,83 0,74 0,78 0,80 0,70 0,70 0,83 0,81 0,84 10 0,91 0,87 0,91 0,95 0,90 0,91 0,91 0,91 0,92 11 0,91 0,88 0,92 0,91 0,89 0,88 0,91 0,90 0,92 12 0,91 0,83 0,85 0,87 0,79 0,80 0,90 0,89 0,91 13 95,25 79,20 197,85 234,20 189,40 194,67 117,25 92,80 112,65 14 406,50 518,00 148,00 423,00 92,00 101,33 423,50 386,50 409,50 15 175,15 223,49 56,40 111,62 67,34 66,90 126,18 107,74 123,86 16 162,56 212,59 334,83 313,46 462,28 318,26 151,13 137,60 167,98 17 43,01 43,26 44,74 45,76 41,61 45,21 45,14 43,03 18 0,51 0,51 0,12 0,26 0,12 0,18 0,46 0,43 0,42 19 0,72 0,43 0,86 0,58 0,69 1,05 0,69 0,93 0,84 20 4,50 8,17 7,87 10,68 8,34 4,40 3,74 4,83 3,67 21 3,78 7,74 7,01 10,10 7,65 3,34 3,05 3,90 2,83 22 25,95 30,57 19,37 35,62 25,18 22,18 49,96 27,48 51,12 23 50,27 50,93 36,13 73,10 37,87 36,40 71,67 35,00 76,73 24 96,24 214,72 98,59 182,83 119,64 110,19 172,36 84,81 156,25 25 56,32 79,20 53,25 76,21 67,27 59,49 79,28 51,52 69,88 26 23,22 25,58 20,93 28,43 24,32 22,63 32,11 20,38 26,69 27 5,26 10,41 5,93 8,25 6,19 6,12 6,80 5,25 7,52 28 0,11 0,11 0,14 0,12 0,14 0,13 0,12 0,12 0,12 29 1,18 1,31 1,11 1,21 1,19 1,18 1,16 1,23 1,17 30 0,82 0,77 0,81 0,79 0,78 0,80 0,83 0,79 0,81 31 0,90 0,88 0,92 0,90 0,92 0,92 0,92 0,89 0,90 32 0,91 0,90 0,92 0,90 0,91 0,93 0,92 0,89 0,90 33 0,90 0,85 0,89 0,88 0,86 0,87 0,91 0,89 0,90 34 104,00 80,93 204,73 125,40 225,40 208,07 121,40 100,27 121,13 35 388,00 428,67 297,67 280,00 208,33 303,67 436,00 376,33 474,67 36 214,78 205,05 73,49 122,96 153,07 93,23 134,11 77,43 129,63 37 204,78 199,64 340,51 240,60 537,78 359,40 149,20 129,06 178,71 38 38,33 38,98 42,33 40,90 43,15 39,85 42,68 43,31 39,01 39 0,51 0,51 0,17 0,39 0,21 0,19 0,48 0,37 0,42 40 5,34 5,12 8,05 5,88 12,46 9,02 3,50 2,98 4,58 41 6,02 5,91 8,50 6,75 13,05 9,58 4,67 3,61 5,89 42 0,68 0,78 0,46 0,87 0,58 0,56 1,17 0,63 1,31 43 22,11 16,77 9,19 104,44 3,24 22,00 9,97 18,58 29,27 44 83,14 107,79 88,68 135,91 90,76 123,95 86,06 85,20 113,10 45 52,78 64,49 56,59 64,37 53,21 71,66 55,61 52,96 69,83 46 21,63 21,94 21,57 22,01 20,99 28,60 21,35 20,81 24,68 47 4,83 6,31 5,16 7,78 5,28 5,49 5,04 5,07 5,77

137 / 378 Ecotipo/ID de Cor-relação Linha-1 Linha-2 Linha-3 Linha-4 Linha-5 Linha-6 Linha-7 Linha-8 Linha-9 No. 48 0,10 0,11 0,11 0,09 0,09 0,11 49 1,31 1,19 1,29 1,46 1,21 1,21 50 89,40 75,73 92,10 94,30 150,80 110,73 99,20 84,00 99,00 51 154,90 122,02 130,51 241,11 69,03 186,41 62,11 39,02 58,94 52 207,99 138,02 255,41 402,22 233,55 391,75 89,31 50,61 87,02 53 40,58 40,88 45,01 42,30 45,24 40,56 44,80 45,07 40,65 54 0,42 0,47 0,42 0,37 0,23 0,31 0,41 0,44 0,40 55 5,13 3,38 5,67 9,51 5,16 9,66 1,99 1,12 2,14 Tabela 30: São providos os valores de cada um dos parâmetros (como descritos na Tabela 29 acima) medidos nos acessos (ecotipo) de Sorgo sob condições normais, de nitrogênio baixo e de seca. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 31 Parâmetros adicionais medidos em acessos de Sorgo (Linhas 10-17) Ecotipo/ ID de Linha- Linha- Linha- Linha- Linha- Correlação Linha-11 Linha-12 Linha-17 10 13 14 15 16 No. 1 38,36 32,10 32,69 32,79 51,53 35,71 38,31 42,44 2 60,00 45,45 58,19 70,60 70,10 53,95 59,87 52,65 3 169,03 156,10 112,14 154,74 171,70 168,51 162,51 170,46 4 71,40 68,56 56,44 67,79 71,54 78,94 67,03 74,11 5 28,82 28,13 22,97 28,09 30,00 30,54 27,17 29,26 6 7,42 6,98 6,19 7,02 7,18 7,00 7,39 7,35 7 0,12 0,12 0,11 0,12 0,11 0,10 0,11 0,11 8 1,24 1,32 1,22 1,18 1,18 1,22 1,25 1,22 9 0,79 0,77 0,80 0,81 0,82 0,81 0,82 0,82 10 0,93 0,91 0,92 0,90 0,91 0,90 0,91 0,91 11 0,92 0,89 0,91 0,91 0,91 0,90 0,90 0,91 12 0,85 0,86 0,88 0,90 0,90 0,91 0,90 0,90 13 97,50 98,00 100,00 105,60 151,15 117,10 124,45 126,50 14 328,95 391,00 435,75 429,50 441,00 415,75 429,50 428,50 15 102,75 82,33 77,59 91,17 150,44 109,10 107,58 130,88 16 128,97 97,62 99,32 112,24 157,42 130,55 135,66 209,21 17 45,59 44,83 45,33 46,54 43,99 45,09 45,14 43,13 18 0,44 0,46 0,45 0,45 0,51 0,46 0,44 0,39 19 0,72 0,72 0,70 1,17 0,79 0,85 0,98 20 2,89 2,91 3,12 4,75 3,69 3,85 5,84 21 2,18 2,19 2,41 3,58 2,90 3,01 4,85 22 36,84 29,45 26,70 29,42 51,12 37,04 39,85 41,78 23 57,58 42,93 36,47 68,60 71,80 49,27 43,87 52,07 24 136,71 137,70 96,54 158,19 163,95 138,39 135,46 165,64 25 66,17 67,37 57,90 70,61 73,76 66,87 65,40 75,97 26 26,31 25,43 23,11 27,87 28,88 27,64 25,52 30,33 27 6,59 6,85 5,32 7,25 7,19 6,27 6,57 6,82 28 0,13 0,13 0,12 0,12 0,11 0,11 0,12 0,11 29 1,22 1,24 1,19 1,23 1,16 1,34 1,21 1,21 30 0,77 0,74 0,80 0,79 0,82 0,80 0,81 0,81 31 0,91 0,89 0,90 0,90 0,91 0,89 0,90 0,90 32 0,91 0,89 0,90 0,89 0,91 0,89 0,89 0,90 33 0,86 0,84 0,90 0,89 0,91 0,90 0,90 0,90 34 94,53 110,00 115,07 104,73 173,67 115,60 138,80 144,40 35 437,67 383,00 375,00 425,00 434,00 408,67 378,50 432,00 36 99,83 76,95 84,25 92,24 138,83 113,32 95,50 129,49 37 124,27 101,33 132,12 117,90 176,99 143,67 126,98 180,45 38 42,71 40,08 43,98 45,44 44,75 42,58 43,81 46,73

138 / 378 Ecotipo/ ID de Linha- Linha- Linha- Linha- Linha- Correlação Linha-11 Linha-12 Linha-17 10 13 14 15 16 No. 39 0,44 0,43 0,39 0,44 0,44 0,44 0,43 0,42 40 2,91 2,53 3,00 2,60 3,96 3,38 2,90 3,86 41 3,77 3,26 3,61 3,24 5,10 4,25 3,81 4,76 42 0,86 0,73 0,61 0,65 1,14 0,87 0,91 0,89 43 10,45 14,77 12,86 18,24 11,60 18,65 16,36 44 100,79 80,41 126,89 86,41 92,29 77,89 76,93 45 65,14 55,27 69,06 53,32 56,29 49,12 51,88 46 24,28 21,95 24,98 19,49 20,42 16,81 18,88 47 5,37 4,66 6,35 5,58 5,76 5,86 5,10 50 92,20 81,93 98,80 86,47 99,60 83,00 83,53 92,30 51 76,37 33,47 42,20 41,53 131,67 60,84 44,33 185,44 52 120,43 37,21 48,18 44,20 231,60 116,01 123,08 342,50 53 45,43 42,58 44,18 44,60 42,41 43,25 40,30 40,75 54 0,44 0,47 0,47 0,48 0,35 0,35 0,23 0,33 55 2,65 0,87 1,09 0,99 5,46 2,68 3,05 8,40 Tabela 31: São providos os valores de cada um dos parâmetros (como descritos acima) medidos em acessos (ecotipo) de Sorgo sob condições normais, de nitrogênio baixo e de seca. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 32 Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas modalidades da invenção em diversos tecidos e o desempenho fenotípico sob condições normais ou de estresse abiótico através de acessos de Sorgo ID do ID do Conj. de Nome do Conj. de Nome do Gene R Valor p Conj. R Valor p Conj. Exp. Gene Exp. Corr. Corr. LYD423 0,77 8,63E-03 6 13 LYD423 0,72 1,85E-02 6 15 LYD423 0,80 5,31E-03 6 16 LYD423 0,81 4,12E-03 6 1 LYD423 0,94 6,58E-05 2 29 LYD423 0,84 2,13E-03 4 55 LYD423 0,70 2,37E-02 4 51 LYD423 0,84 2,18E-03 4 52 LYD423 0,91 2,94E-04 5 36 LYD423 0,73 1,72E-02 5 30 LYD423 0,86 1,23E-03 5 41 LYD423 0,91 2,82E-04 5 40 LYD423 0,71 2,20E-02 5 39 LYD423 0,85 2,08E-03 5 32 LYD423 0,89 5,04E-04 5 37 LYD423 0,76 1,15E-02 3 7 LYD423 0,72 2,95E-02 7 44 LYD423 0,76 1,81E-02 7 47 LYD424 0,86 1,41E-03 6 13 LYD424 0,72 1,87E-02 6 1 LYD424 0,83 2,76E-03 4 55 LYD424 0,80 5,92E-03 4 51 LYD424 0,84 2,20E-03 4 52 LYD425 0,82 3,55E-03 6 13 LYD425 0,84 2,37E-03 6 1 LYD425 0,73 1,58E-02 5 35 LYD425 0,71 2,25E-02 5 22 LYD425 0,85 1,74E-03 1 55 LYD425 0,72 1,95E-02 1 51 LYD425 0,86 1,32E-03 1 52 LYD427 0,77 9,39E-03 6 13 LYD427 0,87 1,03E-03 6 1 LYD427 0,73 1,75E-02 6 2 LYD427 0,71 2,11E-02 6 11 LYD427 0,89 4,79E-04 9 2 LYD427 0,82 4,05E-03 4 55 LYD427 0,72 1,87E-02 4 51 LYD427 0,82 3,41E-03 4 52 LYD427 0,71 2,16E-02 5 30 LYD427 0,73 1,58E-02 5 37 LYD427 0,81 4,42E-03 3 2 LYD427 0,71 2,05E-02 1 50 LYD428 0,73 1,59E-02 2 34 LYD431 0,74 1,42E-02 6 13 LYD431 0,87 9,18E-04 4 55 LYD431 0,72 1,85E-02 4 51 LYD431 0,86 1,24E-03 4 52 LYD432 0,71 2,07E-02 6 8 LYD432 0,70 2,31E-02 6 7 LYD432 0,79 6,56E-03 2 34 LYD432 0,83 3,06E-03 8 28 LYD432 0,72 1,85E-02 3 2 LYD432 0,73 1,69E-02 1 53 LYD433 0,73 1,60E-02 6 5

139 / 378 ID do ID do Conj. de Nome do Conj. de Nome do Gene R Valor p Conj. R Valor p Conj. Exp. Gene Exp. Corr. Corr. LYD433 0,81 4,12E-03 6 2 LYD433 0,70 3,45E-02 4 44 LYD433 0,70 2,39E-02 5 30 LYD434 0,73 1,56E-02 6 13 LYD434 0,74 1,35E-02 4 55 LYD434 0,79 6,92E-03 4 51 LYD434 0,75 1,29E-02 4 52 LYD434 0,91 7,59E-04 7 44 LYD434 0,81 7,61E-03 7 47 LYD434 0,91 6,53E-04 7 45 LYD434 0,72 2,77E-02 7 46 LYD435 0,76 9,94E-03 6 7 LYD435 0,72 1,97E-02 9 1 LYD436 0,85 1,95E-03 6 13 LYD436 0,77 9,58E-03 6 1 LYD436 0,92 1,39E-04 4 55 LYD436 0,84 2,39E-03 4 51 LYD436 0,93 1,13E-04 4 52 LYD436 0,77 9,25E-03 8 28 LYD436 0,75 1,17E-02 5 37 LYD507 0,71 2,17E-02 9 1 LYD507 0,77 8,97E-03 8 32 LYD507 0,74 1,54E-02 8 31 LYD508 0,76 1,03E-02 6 1 LYD508 0,75 1,16E-02 4 55 LYD508 0,77 9,61E-03 4 52 LYD508 0,77 8,64E-03 5 22 LYD508 0,71 2,11E-02 5 42 LYD508 0,73 1,72E-02 3 16 LYD509 0,81 4,73E-03 6 8 LYD509 0,71 2,16E-02 9 13 LYD509 0,80 4,97E-03 9 1 LYD509 0,74 2,22E-02 7 44 LYD509 0,78 1,38E-02 7 47 LYD509 0,71 3,30E-02 1 44 LYD509 0,70 3,41E-02 1 45 LYD509 0,81 7,56E-03 1 46 LYD510 0,79 6,74E-03 6 13 LYD510 0,73 1,76E-02 6 18 LYD510 0,71 2,21E-02 6 4 LYD510 0,73 1,68E-02 6 5 LYD510 0,75 1,17E-02 6 1 LYD510 0,87 1,03E-03 4 55 LYD510 0,75 1,33E-02 4 51 LYD510 0,87 9,50E-04 4 52 LYD510 0,75 1,32E-02 5 37 Tabela 32. São providas as correlações (R) entre os níveis de expressão de genes melhoradores de rendimento e seus homólogos em tecidos [Folha bandeira, Meristema Floral, Haste e Flor; Conjuntos de expressão (Exp)] e o desempenho fenotípico em diversos componentes de rendimento, biomassa, taxa de crescimento e/ou vigor [ID do Vetor de Correlação (con.)] sob condições de estresse ou condições normais através de acessos de Sorgo. P = valor p.

EXEMPLO 8

PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE MILHO E ANÁLISE DE CORRELAÇÃO DE ALTO DESEMPENHO COM RENDIMENTO E

PARÂMETROS RELACIONADOS COM NUE USANDO MICROARRANJOS DE OLIGONUCLEOTÍDEO DO MILHO DE 60K

[00432] De modo a produzir uma análise de correlação de alto rendimento entre fenótipo de planta e nível de expressão de gene, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo do milho, produzido pela Agilent Technologies [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://World Wide Web (dot) chem. (dot) agilent (dot) com/Scripts/PDS (dot) asp?1Page=50879]. O oligonucleotídeo do arranjo representa cerca de 60.000 genes e transcritos do milho. Correlação de híbridos do milho através de ecotipos cultivados sob condições de cultivo regulares

140 / 378 Procedimentos Experimentais

[00433] 12 híbridos de Milho foram cultivados no campo em 3 canteiros repetitivos. As sementes de milho foram plantadas e as plantas foram cultivadas no campo usando protocolos de fertilização e irrigação comerciais. De modo a definir correlações entre os níveis de expressão de RNA com estresse e componentes de rendimento ou parâmetros relacionados com vigor, os 12 híbridos de milho diferentes foram analisados. Entre eles, 10 híbridos abrangendo a variação observada foram selecionados para a análise de expressão de RNA. A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros distinguidos foi analisada usando o teste de correlação de Pearson [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://World Wide Web (dot) davidmlane (dot) com/hyperstat/A34739 (dot) html].

[00434] Tecidos de milho analisados — Todos os 10 híbridos de milho selecionados foram amostrados por 3 pontos de tempo (TP2 = V6-V8, TP5 = R1-R2, TP6 = R3-R4). Quatro tipos de tecidos vegetais [Espiga, folha bandeira indicada na Tabela 33 como “folha’, parte distal do grão e internós] cultivados sob condições normais foram amostrados e o RNA foi extraído como descrito acima. Cada tipo de tecido de informação de expressão de microarranjo recebeu uma ID do Conjunto como resumido na Tabela 33 abaixo. Tabela 33 Conjuntos de expressão de transcriptoma do Milho sob condições normais Conjunto de Expressão ID do conjunto Espiga no estágio reprodutivo (R1-R2) 1 Folha no estágio reprodutivo (R3-R4) 2 Folha no estágio vegetativo (V2-V3) 3 Internós no estágio vegetativo (V2-V3) 4 Internós no estágio reprodutivo (R3-R4) 5 Espiga no estágio reprodutivo (R3-R4) 6 Internós no estágio reprodutivo (R1-R2) 7 Folha no estágio reprodutivo (R1-R2) 8 Tabela 33: São providos o número de identificação (ID) de cada um dos conjuntos de expressão do Milho. Folha = a folha abaixo da espiga principal; Espiga = a flor fêmea no dia da antese; Internós = internós localizados acima e abaixo da espiga principal na planta.

[00435] Os seguintes parâmetros foram coletados usando sistema de

141 / 378 imageamento digital:

[00436] Área de grão (cm2) - No final do período de cultivo os grãos foram separados da espiga. Uma amostra de ~200 grãos foi pesada, fotografada e as imagens foram processadas usando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A área de grão foi medida a partir destas imagens e foi dividida pelo número (Num) de grãos.

[00437] Comprimento de grão e largura de grão (cm) - No final do período de cultivo os grãos foram separados da espiga. Uma amostra de ~200 grãos foi pesada, fotografada e as imagens foram processadas usando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A soma de comprimentos /ou larguras de grão (eixo mais longo) foi medida a partir destas imagens e foi dividida pelo número de grãos.

[00438] Área da Espiga (cm2) - No final do período de cultivo 5 espigas foram fotografadas e as imagens foram processadas usando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. A área de Espiga foi medida a partir destas imagens e foi dividida pelo número de Espigas.

[00439] Comprimento de Espiga e Largura de Espiga (cm) - No final do período de cultivo 5 espigas foram fotografadas e as imagens foram processadas usando o sistema de processamento de imagem descrito abaixo. O comprimento e largura da Espiga (eixo mais longo) foram medidos a partir destas imagens e foram divididos pelo número de espigas.

[00440] O sistema de processamento de imagem foi usado, que consiste de um computador de mesa pessoal (processor Intel P4 3,0 GHz) e um programa de domínio público - ImageJ 1.37, software de processamento de imagem com base no Java, que foi desenvolvido no U.S. National Institutes of Health e está gratuitamente disponível na internet no Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://rsbweb (dot) nih (dot) gov/. As imagens foram capturadas na resolução de 10 Mega Pixels (3888x2592 pixels) e armazenadas em um formato JPEG (Padrão Joint

142 / 378 Photographic Experts Group) de baixa compressão. Em seguida, os dados de saída de processamento de imagem para a área de semente e comprimento de semente foram salvos em arquivos de texto e analisados usando o software de análise estatística JMP (SAS institute).

[00441] Parâmetros adicionais foram coletados pela amostragem de 6 plantas por canteiro ou medindo-se o parâmetro através de todas as plantas dentro do canteiro.

[00442] Peso de Grão Normalizado por planta (g) - No final do experimento todas as espigas dos canteiros dentro dos blocos A-C foram coletadas. Seis espigas foram separadamente debulhadas e os grãos foram pesados, todas as espigas adicionais também foram debulhadas juntas e pesadas. O peso do grão médio por espiga foi calculado dividindo-se o peso de grão total pelo número total de espigas por canteiro (com base no canteiro). No caso de 6 espigas, o peso total de grãos de 6 espigas foi dividido por 6.

[00443] FW de Espiga (g) - No final do experimento (quando as espigas foram colhidas) totais e 6 espigas selecionadas por canteiro dentro dos blocos A-C foram coletadas separadamente. As plantas com (total e 6) foram pesadas (g) separadamente e a espiga média por planta foi calculada para o total (FW de Espiga por canteiro) e para 6 (FW de Espiga por planta).

[00444] Altura da planta e Altura da Espiga – As plantas foram distinguidas pela altura na colheita. Em cada medida, 6 plantas foram medidas quanto à sua altura usando uma fita métrica. A altura foi medida a partir do nível do solo até o topo da planta abaixo da borla. A altura da espiga foi medida a partir do nível do solo até o lugar onde a espiga principal está localizada.

[00445] Número de folha por planta – As plantas foram distinguidas para ao número de folha durante o período de cultivo em 5 pontos de tempo. Em cada medida, as plantas foram medidas quanto ao seu número de folha contando-se todas as de 3 plantas selecionadas por canteiro.

143 / 378

[00446] Taxa de crescimento relativa do número de folha - foi calculada usando a Fórmula IX (acima).

[00447] SPAD - O conteúdo de clorofila foi determinado usando um medidor de clorofila SPAD 502 da Minolta e a medição foi realizada 64 dias após a Semeadura. As leituras do medidor SPAD foram feitas sobre folha jovem completamente desenvolvida. Três medições por folha foram determinadas por canteiro. Os dados foram determinados depois de 46 e 54 dias depois da semeadura (DPS).

[00448] Peso seco por planta - No final do experimento (quando a Inflorescência foi seca) todo o material vegetativo dos canteiros dentro dos blocos A-C foram coletados.

[00449] Peso seco = peso total da porção vegetativa acima do solo (excluindo raízes) depois de secagem a 70°C em estufa durante 48 horas.

[00450] Índice de colheita (HI) (Milho)- O índice de colheita foi calculado usando a Fórmula X. Fórmula X Índice de colheita = Peso seco de grão médio por Espiga / (Peso seco vegetativo médio por Espiga + Peso seco médio da Espiga)

[00451] Porcentagem de Espiga Cheia [%] – a mesma foi calculada como a porcentagem da área de Espiga com grãos da espiga total.

[00452] Cheia por Toda a Espiga – a mesma foi calculada como o comprimento da espiga com grãos da espiga total.

[00453] Diâmetro do sabugo [cm] - O diâmetro do sabugo sem grãos foi medido usando uma régua.

[00454] Número de Fileiras de Grão por Espiga - O número de fileiras em cada espiga foi contado. Resultados Experimentais

[00455] 12 híbridos de milho diferentes foram cultivados e distinguidos quanto aos parâmetros diferentes. Os parâmetros correlacionados

144 / 378 são descritos na Tabela 34 abaixo. A média para cada um dos parâmetros medidos foi calculada usando o software JMP (Tabelas 35-36) e uma análise de correlação subsequente foi realizada (Tabela 37). Os resultados foram depois integrados com a base de dados. Tabela 34 Parâmetros correlacionados com o milho (vetores) Parâmetro correlacionado com ID de Correlação Taxa de crescimento Num de Folha (razão) 1 Altura de Planta por Canteiro (cm) 2 Altura da Espiga (cm) 3 Número de Folha por Planta (número) 4 Comprimento da Espiga (cm) 5 Porcentagem de Espiga Cheia (porcentagem) 6 Diâmetro do Sabugo (mm) 7 Número de Fileira de Grão por Espiga (número) 8 DW por planta com base em 6 (g). 9 FW de Espiga por planta com base em 6 (g). 10 Peso de Grão Normalizado por planta com base em 6 (g). 11 FW de Espigas por planta com base em todas (g). 12 Peso de Grão Normalizado por planta com base em todas (g). 13 Área da Espiga (cm2) 14 Largura da Espiga (cm) 15 Enchidos por Espiga Inteira (porcentagem) 16 Área do Grão (cm2) 17 Comprimento do Grão (cm) 18 Largura do Grão (cm) 19 SPAD 46DPS TP2 20 SPAD 54DPS TP5 21 Tabela 34. SPAD 46DPS e SPAD 54DPS: Nível de clorofila depois de 46 e 54 dias depois da semeadura (DPS). “FW” = peso fresco; “DW” = peso seco.

Tabela 35 Parâmetros medidos em acessos de Milho sob condições normais (linhas 1- 6) Ecotipo/ ID de Linha-1 Linha-2 Linha-3 Linha-4 Linha-5 Linha-6 Correlação No. 1 0,283 0,221 0,281 0,269 0,306 0,244 2 278,083 260,500 275,133 238,500 286,944 224,833 3 135,167 122,333 131,967 114.000 135,278 94,278 4 12.000 11,110 11,689 11,778 11,944 12,333 5 19,691 19,055 20,521 21,344 20,920 18,232 6 80,624 86,760 82,144 92,708 80,377 82,757 7 28,957 25,078 28,052 25,732 28,715 25,783 8 16,167 14,667 16,200 15,889 16,167 15,167 9 657,500 491,667 641,111 580,556 655,556 569,444 10 245,833 208,333 262,222 263,889 272,222 177,778 11 140,683 139,536 153,667 176,983 156,614 119,667 12 278,194 217,502 288,280 247,879 280,106 175,841 13 153,900 135,882 152,500 159,156 140,463 117,135 14 85,058 85,843 90,507 95,953 91,624 72,408 15 5,584 5,151 5,671 5,533 5,728 5,227

145 / 378 16 0,916 0,922 0,927 0,917 0,908 0,950 17 0,753 0,708 0,755 0,766 0,806 0,713 18 1,167 1,092 1,180 1,205 1,228 1,123 19 0,810 0,814 0,803 0,803 0,824 0,803 20 51,667 56,406 53,547 55,211 55,300 59,350 21 54,283 57,178 56,011 59,682 54,767 59,144 Tabela 35. São providos os valores de cada um dos parâmetros (como descritos acima) medidos em acessos de milho (ID de Semente) sob condições de cultivo regulares. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 36 Parâmetros adicionais medidos em acessos de Milho sob condições de cultivo regulares (linhas 7-12) Ecotipo/ID de Correlação Linha-7 Linha-8 Linha-9 Linha-10 Linha-11 Linha-12 No. 1 0,244 0,266 0,194 0,301 2 264,444 251,611 163,778 278,444 3 120,944 107,722 60,444 112,500 4 12,444 12,222 9,278 12,556 5 19,017 18,572 16,689 21,702 6 73,248 81,061 81,056 91,601 7 26,432 25,192 26,668 8 16.000 14,833 14,267 15,389 9 511,111 544,444 574,167 522,222 10 188,889 197,222 141,111 261,111 11 119,692 133,508 54,316 173,231 12 192,474 204,700 142,716 264,236 13 123,237 131,266 40,844 170,662 14 74,032 76,534 55,201 95,360 15 5,221 5,328 4,120 5,577 16 0,873 0,939 0,796 0,958 17 0,714 0,753 0,502 0,762 18 1,139 1,134 0,921 1,180 19 0,791 0,837 0,675 0,812 20 58,483 55,876 53,856 59,747 52,983 49,994 21 57,994 60,356 51,394 61,139 54,767 53,344 Tabela 36. São providos os valores de cada um dos parâmetros (como descritos acima) medidos em acessos de milho (ID de Semente) sob condições de cultivo regulares. As condições de cultivo são especificadas na seção de procedimento experimental.

Tabela 37 Correlação entre o nível de expressão de selecionados LYD genes de algumas modalidades da invenção em diversos tecidos e o desempenho fenotípico sob normal través de milho acessos Conj. ID do Nome do ID do Conj. de Nome do Gene R Valor p de Conj. Gene R Valor p Conj. de Exp. Exp. de Corr. Corr . LYD391 0,75 3,14E-02 5 19 LYD391 0,82 2,28E-02 7 14 LYD391 0,75 5,23E-02 7 13 LYD391 0,81 2,86E-02 7 2 LYD391 0,92 3,41E-03 7 3 LYD391 0,82 2,50E-02 7 12 LYD391 0,77 4,39E-02 7 10 LYD391 0,74 5,55E-02 7 11 LYD391 0,93 6,47E-03 1 7 LYD391 0,80 5,59E-02 6 19 LYD503 0,81 2,75E-02 7 4 LYD503 0,81 2,88E-02 7 16 LYD503 0,76 4,79E-02 7 2 LYD503 0,86 1,26E-02 7 19

146 / 378 LYD503 0,89 6,73E-03 8 4 LYD503 0,88 9,13E-03 8 21 LYD503 0,71 7,16E-02 8 18 LYD503 0,85 1,61E-02 8 16 LYD503 0,72 6,56E-02 8 17 LYD503 0,71 7,11E-02 8 19 LYD503 0,75 5,03E-02 1 14 LYD503 0,71 7,51E-02 1 13 LYD503 0,79 3,45E-02 1 2 LYD503 0,88 9,31E-03 1 3 LYD503 0,70 7,77E-02 1 15 LYD503 0,82 2,43E-02 1 12 LYD503 0,73 6,20E-02 1 10 LYD503 0,91 1,30E-02 6 4 Tabela 37. “ID Con.” - ID de Correlação do Conjunto de acordo com os parâmetros correlacionados da Tabela 34 acima. “Conjunto Exp.” - Conjunto de Expressão. “R” = Coeficiente de correlação de Pearson; “P” = valor p.

EXEMPLO 9 PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOM DA SOJA (GLYCINE MAX) E

ANÁLISE DE CORRELAÇÃO DE ALTO RENDIMENTO COM

PARÂMETROS DE RENDIMENTO USANDO MICROARRANJOS DE OLIGONUCLEOTÍDEO DA B. SOJA DE 44K

[00456] De modo a produzir uma análise de correlação de alto rendimento, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo da Soja, produzido pela Agilent Technologies [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://World Wide Web (dot) chem. (dot) agilent (dot) com/Scripts/PDS (dot) asp?1Page=50879]. O oligonucleotídeo do arranjo representa cerca de 42.000 genes e transcritos da Soja. De modo a definir as correlações entre os níveis de expressão de RNA com componentes de rendimento ou parâmetros relacionados com a arquitetura da planta ou parâmetros relacionados com o vigor da planta, várias características de planta de 29 variedades de Glycine max diferentes foram analisadas e 12 variedades foram adicionalmente usadas para a análise de expressão de RNA. A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros distinguidos foi analisada usando o teste de correlação de Pearson.

[00457] Correlação de níveis de expressão dos genes de Glycine max com características fenotípicas através do ecotipo Procedimentos Experimentais

[00458] 29 variedades de Soja foram cultivadas em três canteiros repetitivos, no campo. Em resumo, o protocolo de cultivo foi como segue:

147 / 378 sementes de Soja foram semeadas em solo e cultivadas sob condições normais até a colheita. De modo a definir as correlações entre os níveis de expressão de RNA com componentes de rendimento ou parâmetros relacionados com a arquitetura ou parâmetros relacionados com vigor, 12 variedades de Soja diferentes (das 29 variedades) foram analisadas e usadas para a análise de expressão de gene. A análise foi realizada em dois períodos de tempo predeterminados: na formação da vagem (quando as vagens de soja são formadas) e no tempo de colheita (quando as vagens de soja estiverem prontas para colheita, com sementes maduras). A Tabela 39 descreve os parâmetros de soja correlacionados. Os meios para cada um dos parâmetros medidos foram calculados usando o software JMP (Tabelas 40-41) e uma análise de correlação subsequente foi realizada (Tabela 42). Os resultados foram depois integrados com a base de dados. Tabela 38 Conjuntos de expressão de transcriptoma da Soja Conjunto de Expressão ID do Conjunto Meristema apical no estágio vegetativo sob condição de crescimento normal 1 Folha no estágio vegetativo sob condição de crescimento normal 2 Folha no estágio de florescimento sob condição de crescimento normal 3 Folha no estágio de formação de vagem sob condição de crescimento normal 4 Raiz no estágio vegetativo sob condição de crescimento normal 5 Raiz no estágio de florescimento sob condição de crescimento normal 6 Raiz no estágio de formação de vagem sob condição de crescimento normal 7 Haste no estágio vegetativo sob condição de crescimento normal 8 Haste no estágio de formação de vagem sob condição de crescimento normal 9 Botão de flor no estágio de florescimento sob condição de crescimento normal 10 Vagem no estágio de formação de vagem (R3-R4) sob condição de crescimento normal 11 Tabela 38: São providos os conjuntos de expressão de transcriptoma da soja.

[00459] Extração de RNA — Todas as 12 variedades de Soja selecionadas foram amostradas por tratamento. Os tecidos vegetais [folha, raiz, haste, vagem, meristema apical, botões de flor] cultivados sob condições normais foram amostrados e o RNA foi extraído como descrito acima.

[00460] Os parâmetros de dados coletados foram como segue:

[00461] Diâmetro da base do ramo principal [mm] na formação da vagem — o diâmetro médio da base do ramo principal (com base no diâmetro) de três plantas por canteiro.

148 / 378

[00462] Peso fresco [g/planta] na formação da vagem — peso total da porção vegetativa acima do solo (excluindo as raízes) antes da secagem na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00463] Peso seco [g/planta] na formação da vagem — peso total da porção vegetativa acima do solo (excluindo raízes) depois da secagem a 70°C em estufa durante 48 horas na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00464] Número total de nós com vagens nos ramos laterais [valor/planta]- a contagem de nós que contêm vagens nos ramos laterais na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00465] Número de ramos laterais na formação da vagem [valor/planta] – contagem do número de ramos laterais na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00466] Peso total de ramos laterais na formação da vagem [g/planta] - peso de todos os ramos laterais na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00467] Peso total de vagens na haste principal na formação da vagem [g/planta] - peso de todas as vagens na haste principal na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00468] Número total de nós na haste principal [valor/planta] - contagem de número de nós na haste principal começando dos primeiros nós acima do solo, média de três plantas por canteiro.

[00469] Número total de vagens com 1 semente nos ramos laterais na formação da vagem [valor/planta] - contagem do número de vagens contendo 1 semente em todos os ramos laterais na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00470] Número total de vagens com 2 sementes nos ramos laterais na formação da vagem [valor/planta] - contagem do número de vagens contendo 2 sementes em todos os ramos laterais na formação da vagem, média de três

149 / 378 plantas por canteiro.

[00471] Número total de vagens com 3 sementes nos ramos laterais na formação da vagem [valor/planta] - contagem do número de vagens contendo 3 sementes em todos os ramos laterais na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00472] Número total de vagens com 4 sementes nos ramos laterais na formação da vagem [valor/planta] - contagem do número de vagens contendo 4 sementes em todos os ramos laterais na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00473] Número total de vagens com 1 semente na haste principal na formação da vagem [valor/planta] - contagem do número de vagens contendo 1 semente na haste principal na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00474] Número total de vagens com 2 sementes na haste principal na formação da vagem [valor/planta] - contagem do número de vagens contendo 2 sementes na haste principal na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00475] Número total de vagens com 3 sementes na haste principal na formação da vagem [valor/planta] - contagem do número de vagens contendo 3 sementes na haste principal na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00476] Número total de vagens com 4 sementes na haste principal na formação da vagem [valor/planta] - contagem do número de vagens contendo 4 sementes na haste principal na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00477] Número total de sementes por planta na formação da vagem [valor/planta] – contagem do número de sementes nos ramos laterais e haste principal na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00478] Número total de sementes nos ramos laterais na formação da

150 / 378 vagem [valor/planta] – contagem do número total de sementes nos ramos laterais na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00479] Número total de sementes na haste principal na formação da vagem [valor/planta] - contagem do número total de sementes na haste principal na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00480] Altura da planta na formação da vagem [cm/planta] - comprimento total da parte de acima do solo até a ponta da haste principal na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00481] Altura da planta na colheita [cm/planta] - comprimento total da parte de acima do solo até a ponta da haste principal na colheita, média de três plantas por canteiro.

[00482] Peso total de vagens nos ramos laterais na formação da vagem [g/planta] - peso de todas as vagens nos ramos laterais na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

[00483] Razão do número de vagens por nós na haste principal na formação da vagem - calculada na fórmula XI, média de três plantas por canteiro. Fórmula XI: Número total de vagens na haste principal /Número total de nós na haste principal, média de três plantas por canteiro.

[00484] Razão do número total de sementes na haste principal para número de sementes nos ramos laterais - calculada na fórmula XII, média de três plantas por canteiro. Fórmula XII: Número total de sementes na haste principal na formação da vagem/ Número total de sementes nos ramos laterais na formação da vagem.

[00485] Peso total de vagens por planta na formação da vagem [g/planta] - peso de todas as vagens nos ramos laterais e haste principal na formação da vagem, média de três plantas por canteiro.

151 / 378

[00486] Dias até 50% de florescimento [dias] — número de dias até 50% de florescimento para cada canteiro.

[00487] Dias até 100% de florescimento [dias] — número de dias até 100% de florescimento para cada canteiro.

[00488] Maturidade [dias] - medida quando 95% das vagens em um canteiro amadureceram (se tornaram 100% marrons). Queda de folha retardada e hastes verdes não são consideradas na designação de maturidade. Os testes são observados 3 dias por semana, dia sim dia não, quanto à maturidade. A data de maturidade é a data que 95% das vagens atingiram a cor final. A maturidade é expressa em dias depois de 31 de agosto [de acordo com a definição aceita de maturidade no USA, Descriptor list for SOYBEAN, Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://World Wide Web (dot) ars-grin (dot) gov/cgi- bin/npgs/html/desclist (dot) pl?51].

[00489] Qualidade de semente [classificada de 1 a 5] – medição na colheita, uma estimativa visual com base em diversas centenas de sementes. O parâmetro é classificado de acordo com as seguintes contagens considerando a quantidade e grau de rugas, revestimento defeituoso (rachaduras), esverdeamento e mofado ou outro pigmento. A classificação é 1-muito boa, 2-boa, 3-regular, 4-insatisfatória, 5-muito insatisfatória.

[00490] Apresentação [classificada 1 a 5] - é classificada na maturidade por canteiro de acordo com as seguintes contagens: 1-a maioria das plantas em um canteiro estão eretas, 2-Todas as plantas levemente inclinadas ou umas poucas plantas no chão, 3-todas as plantas moderadamente inclinadas ou 25% a 50% no chão, 4-todas as plantas consideravelmente inclinadas ou 50% a 80% no chão, 5-a maioria das plantas no chão. Nota: contagens intermediárias tais como 1,5 são aceitáveis.

[00491] Tamanho da semente [g] - peso de 1000 sementes por canteiro normalizado para 13% de umidade, medida na colheita.

152 / 378

[00492] Peso total de sementes por planta [g/planta] - calculada na colheita (por 2 fileiras internas de um canteiro podado) como peso em gramas de sementes limpas ajustadas para 13% de umidade e divididas pelo número total de plantas em duas fileiras internas de um canteiro podado.

[00493] Rendimento na colheita [bushels/hectare] - calculado na colheita (por 2 fileiras internas de um canteiro podado) como peso em gramas de sementes limpas, ajustado para 13% de umidade e depois expresso como bushels por acre.

[00494] Sementes por vagem médias por ramo lateral [número] - Calcular Num de Sementes nos ramos laterais - na formação da vagem e dividir pelo número de Número total de vagens com sementes nos ramos laterais - na formação da vagem.

[00495] Sementes por vagem médias da haste principal [número] – Calcular o Número Total de Sementes na haste principal na formação da vagem e dividir pelo número de Número total de vagens com sementes na haste principal na formação da vagem.

[00496] Comprimento médio dos internós da haste principal [cm] – Calcular a Altura da planta na formação da vagem e dividir pelo número total de nós na haste principal na formação da vagem.

[00497] Número total de vagens com sementes na haste principal [número] — contagem de todas as vagens contendo sementes na haste principal na formação da vagem.

[00498] Número total de vagens com sementes nos ramos laterais [número]- contagem de todas as vagens contendo sementes nos ramos laterais na formação da vagem.

[00499] Número total de vagens por planta na formação da vagem [número]- contagem das vagens na haste principal e ramos laterais na formação da vagem. Resultados Experimentais

153 / 378

[00500] Doze variedades de Soja diferentes foram cultivadas e distinguidas para 40 parâmetros como especificado na Tabela 39 abaixo. Os meios para cada um dos parâmetros medidos foram calculados usando o software JMP e os valores são resumidos nas Tabelas 40-41 abaixo. A análise de correlação subsequente entre os diversos conjuntos de expressão de transcriptoma e os parâmetros médios foi conduzida (Tabela 42). Os resultados foram depois integrados com a base de dados. Tabela 39 Parâmetros correlacionados com a Soja (vetores) Parâmetro correlacionado com ID de Correlação Diâmetro da base na formação da vagem (mm) 1 DW na formação da vagem (g) 2 Peso fresco na formação da vagem (g) 3 Número total de nós com vagens nos ramos laterais (número) 4 Num dos ramos laterais (número) 5 Peso total de ramos laterais na formação da vagem (g) 6 Peso total de vagens na haste principal na formação da vagem (g) 7 Número total de nós na haste principal (número) 8 No total de vagens com 1 semente no ramo lateral (número) 9 Num de vagens com 1 semente na haste principal na formação da vagem 10 (número) No total de vagens com 2 semente no ramo lateral (número) 11 Num de vagens com 2 semente na haste principal (número) 12 No total de vagens com 3 semente no ramo lateral (número) 13 Num de vagens com 3 semente na haste principal (número) 14 No total de vagens com 4 semente no ramo lateral (número) 15 Num de vagens com 4 semente na haste principal (número) 16 Número total de sementes por planta 17 Número total de Sementes nos ramos laterais 18 Número total de Sementes na haste principal na formação da vagem 19 Altura da planta na formação da vagem (cm) 20 Peso total de vagens nos ramos laterais (g) 21 Razão número de vagens per nós na haste principal (razão) 22 Razão número de sementes por haste principal para sementes por ramo lateral 23 (razão) Peso total de vagens por planta (g) 24 50 por cento de florescimento (dias) 25 Maturidade (dias) 26 100 por cento de florescimento (dias) 27 Altura da planta na colheita (cm) 28 Qualidade da semente (score 1-5) 29 Peso total de sementes por planta (g/planta) 30 Tamanho da semente (g) 31 Apresentação (score 1-5) 32 Rendimento na colheita (bushel/hectare) 33 Sementes médias do ramo lateral por vagem (número) 34 sementes médias da haste principal por vagem (número) 35 Número total de vagens com sementes na haste principal na formação da vagem 36 (número)

154 / 378 Parâmetro correlacionado com ID de Correlação Num de vagens com sementes nos ramos laterais - na formação da vagem 37 (número) Número total de vagens por planta na formação da vagem (número) 38 Comprimento médio dos internós na haste principal (cm/número) 39 Tamanho da semente corrigido (g) 40 Tabela 39.

Tabela 40 Parâmetros medidos nas variedades de Soja (linhas 1-6) Ecotipo/ID de Correlação Linha 1 Linha 2 Linha 3 Linha 4 Linha 5 Linha 6 No. 1 8,33 9,54 9,68 8,11 8,82 10,12 2 53,67 50,33 38,00 46,17 60,83 55,67 3 170,89 198,22 152,56 163,89 224,67 265,00 4 23,00 16,00 23,11 33,00 15,22 45,25 5 9,00 8,67 9,11 9,89 7,67 17,56 6 67,78 63,78 64,89 74,89 54,00 167,22 7 22,11 14,33 16,00 15,00 33,78 9,00 8 16,56 16,78 16,11 18,11 16,78 17,11 9 1,56 3,00 1,78 1,78 5,67 5,63 10 1,11 4,38 1,44 1,44 4,56 1,67 11 17,00 18,75 26,44 32,33 21,56 33,50 12 16,89 16,25 13,22 16,89 27,00 8,11 13 38,44 2,00 26,44 31,33 8,89 82,00 14 29,56 1,75 19,78 22,33 11,67 22,78 15 0,00 0,00 0,00 0,00 0,00 1,50 16 0,00 0,00 0,11 0,11 0,00 0,44 17 274,44 99,78 221,67 263,11 169,00 412,50 18 150,89 55,89 134,00 160,44 75,44 324,63 19 123,56 43,89 87,67 102,67 93,56 88,00 20 86,78 69,56 62,44 70,89 69,44 63,89 21 26,00 14,89 20,11 20,11 21,11 30,25 22 2,87 1,38 2,13 2,26 2,60 1,87 23 0,89 0,90 0,87 0,89 2,32 0,37 24 48,11 29,22 36,11 35,11 54,89 38,88 25 61,00 65,33 60,67 61,00 54,67 68,33 26 24,00 43,67 30,33 30,33 38,33 40,00 27 67,33 71,67 67,67 67,33 60,00 74,00 28 96,67 76,67 67,50 75,83 74,17 76,67 29 2,33 3,50 3,00 2,17 2,83 2,00 30 15,09 10,50 17,23 16,51 12,06 10,25 31 89,00 219,33 93,00 86,00 191,33 71,33 32 1,67 1,83 1,17 1,67 2,67 2,83 33 47,57 43,77 50,37 56,30 44,00 40,33 34 2,67 1,95 2,43 2,53 2,13 2,68 35 2,60 1,89 2,52 2,53 2,17 2,59 36 47,56 23,11 34,56 40,78 43,22 33,00 37 57,00 28,56 54,67 65,44 36,11 122,63 38 104,56 51,67 89,22 106,22 79,33 155,63 39 5,24 4,15 3,91 3,92 4,15 3,74 40 89,00 * 93,00 86,00 * 71,33 Tabela 40.

Tabela 41 Parâmetros medidos nas variedades de Soja (linhas 7-12)

155 / 378 Ecotipo/ ID de Linha 7 Linha 8 Linha 9 Linha 10 Linha 11 Linha 12 Correlação No. 1 8,46 8,09 8,26 7,73 8,16 7,89 2 48,00 52,00 44,17 52,67 56,00 47,50 3 160,67 196,33 155,33 178,11 204,44 164,22 4 8,25 25,44 21,88 16,33 22,56 24,22 5 11,67 12,11 8,00 9,11 6,78 10,00 6 45,44 83,22 64,33 52,00 76,89 67,00 7 9,03 16,00 15,89 14,56 30,44 18,00 8 18,78 18,89 16,78 21,11 19,33 20,78 9 2,88 3,00 1,25 2,67 1,78 3,00 10 4,00 4,33 2,11 1,89 3,44 1,22 11 8,50 22,78 21,75 10,67 23,78 25,67 12 21,33 17,67 20,33 16,11 28,11 16,56 13 9,00 42,11 32,75 25,67 45,00 44,33 14 11,11 28,22 24,11 36,44 39,67 32,33 15 0,00 0,33 0,00 1,11 0,00 0,00 16 0,00 0,56 0,00 3,89 0,00 0,00 17 136,00 302,78 260,50 264,44 363,00 318,67 18 46,88 176,22 143,00 105,44 184,33 187,33 19 80,00 126,56 115,11 159,00 178,67 131,33 20 89,78 82,11 70,56 101,67 79,56 67,22 21 4,13 20,11 17,00 9,22 28,11 22,56 22 1,98 2,71 2,78 2,75 3,70 2,84 23 3,90 0,78 1,18 1,98 1,03 0,83 24 14,25 36,11 32,75 23,78 58,56 40,56 25 66,50 65,67 62,33 67,67 61,67 64,33 26 41,00 38,33 31,00 39,00 27,33 32,67 27 73,00 72,33 68,67 73,67 68,00 70,67 28 101,67 98,33 75,83 116,67 76,67 71,67 29 3,50 2,50 2,17 2,33 2,17 2,17 30 7,30 11,38 15,68 10,83 12,98 15,16 31 88,00 75,00 80,67 75,67 76,33 77,33 32 2,67 2,50 1,83 3,50 3,33 1,50 33 34,23 44,27 53,67 42,47 43,60 52,20 34 2,12 2,58 2,58 2,67 2,62 2,58 35 2,22 2,49 2,47 2,71 2,51 2,61 36 36,44 50,78 43,63 58,33 71,22 50,11 37 20,38 68,22 55,75 40,11 70,56 73,00 38 61,00 119,00 103,25 98,44 141,78 123,11 39 4,80 4,36 4,20 4,82 4,12 3,83 40 88,00 75,00 80,67 75,67 76,33 77,33 Tabela 41.

Tabela 42 Correlação entre o nível de expressão de genes selecionados de algumas modalidades da invenção em diversos tecidos e o desempenho fenotípico sob condições normais através de variedades de soja Nome do Conj. de ID de Nome do ID de Conj. Gene R Valor p Exp. Corr. do Gene R Valor p Corr. Exp. Conj. do Conj. LYD437 0,71 2,10E-02 5 23 LYD437 0,76 2,79E-02 9 14 LYD437 0,84 9,58E-03 9 19 LYD437 0,85 7,25E-03 9 22 LYD437 0,73 7,53E-03 4 30 LYD437 0,71 9,26E-03 4 33 LYD438 0,86 1,38E-03 8 30 LYD438 0,81 4,31E-03 8 33 LYD438 0,71 1,02E-02 10 4 LYD438 0,71 9,94E-03 10 17

156 / 378 Nome do Conj. de ID de Nome do ID de Conj.

Gene R Valor p Exp.

Corr. do Gene R Valor p Corr.

Exp.

Conj. do Conj.

LYD439 0,79 6,84E-03 7 11 LYD439 0,74 1,43E-02 8 3 LYD439 0,79 7,01E-03 8 15 LYD439 0,72 2,01E-02 8 9 LYD439 0,82 4,05E-03 8 31 LYD439 0,78 2,19E-02 9 30 LYD439 0,73 3,97E-02 9 33 LYD439 0,75 3,09E-02 9 19 LYD439 0,82 1,18E-02 9 22 LYD439 0,72 4,40E-02 9 7 LYD439 0,76 6,38E-03 2 31 LYD439 0,71 1,02E-02 10 3 LYD440 0,84 2,29E-03 7 23 LYD440 0,78 8,30E-03 7 30 LYD440 0,76 1,02E-02 7 33 LYD440 0,73 1,67E-02 7 31 LYD440 0,76 4,52E-03 11 30 LYD440 0,79 2,22E-03 11 33 LYD440 0,81 4,12E-03 5 7 LYD440 0,76 1,04E-02 8 15 LYD440 0,71 4,81E-02 9 23 LYD440 0,75 3,33E-02 9 33 LYD440 0,76 2,84E-02 9 7 LYD440 0,74 8,79E-03 2 31 LYD440 0,79 2,00E-03 4 7 LYD441 0,71 2,10E-02 7 18 LYD441 0,80 5,65E-03 7 3 LYD441 0,87 9,46E-04 7 6 LYD441 0,77 9,62E-03 7 4 LYD441 0,76 4,21E-03 11 30 LYD441 0,83 7,65E-04 11 33 LYD441 0,75 1,26E-02 5 3 LYD441 0,83 2,98E-03 5 6 LYD441 0,91 2,85E-04 5 1 LYD441 0,72 1,88E-02 8 23 LYD441 0,81 1,42E-02 9 25 LYD441 0,84 8,80E-03 9 15 LYD441 0,71 5,03E-02 9 6 LYD441 0,93 8,95E-04 9 5 LYD441 0,77 2,44E-02 9 27 LYD441 0,83 1,08E-02 9 9 LYD441 0,81 2,55E-03 2 31 LYD441 0,77 3,63E-03 10 15 LYD442 0,77 3,12E-03 11 30 LYD442 0,86 3,26E-04 11 33 LYD442 0,82 1,23E-02 9 5 LYD442 0,80 1,92E-03 4 25 LYD442 0,78 2,57E-03 4 27 LYD443 0,74 1,49E-02 7 26 LYD443 0,77 8,47E-03 7 3 LYD443 0,78 7,44E-03 7 1 LYD443 0,81 4,94E-03 7 9 LYD443 0,78 3,05E-03 11 30 LYD443 0,76 4,41E-03 11 33 LYD443 0,77 8,92E-03 8 15 LYD443 0,71 2,04E-02 8 28 LYD443 0,73 1,60E-02 8 6 LYD443 0,83 3,21E-03 8 5 LYD443 0,80 1,64E-02 9 12 LYD443 0,77 2,49E-02 9 31 LYD443 0,80 2,99E-03 2 31 LYD443 0,74 5,78E-03 10 32 LYD445 0,74 1,39E-02 5 14 LYD445 0,89 5,63E-04 5 13 LYD445 0,88 8,05E-04 5 18 LYD445 0,80 5,31E-03 5 11 LYD445 0,80 5,46E-03 5 4 LYD445 0,94 7,06E-05 5 17 LYD445 0,71 2,28E-02 5 9 LYD445 0,77 9,00E-03 8 13 LYD445 0,77 8,50E-03 8 18 LYD445 0,72 1,84E-02 8 4 LYD445 0,73 1,62E-02 8 17 LYD445 0,87 5,49E-03 9 30 LYD445 0,75 3,37E-02 9 33 LYD445 0,73 3,82E-02 9 12 LYD445 0,80 1,61E-02 9 22 LYD445 0,74 3,72E-02 9 7 LYD445 0,75 4,89E-03 4 9 LYD445 0,74 6,41E-03 1 3 LYD445 0,80 1,66E-03 1 15 LYD445 0,76 3,95E-03 1 6 LYD445 0,71 9,11E-03 1 4 LYD445 0,80 1,87E-03 10 13 LYD445 0,76 3,87E-03 10 18 LYD445 0,83 8,99E-04 10 17 LYD446 0,92 1,56E-04 5 14 LYD446 0,90 4,07E-04 5 19 LYD446 0,75 1,29E-02 5 22 LYD446 0,77 9,54E-03 5 17 LYD446 0,71 2,07E-02 8 14 LYD446 0,71 2,21E-02 8 30 LYD446 0,84 2,62E-03 8 13 LYD446 0,85 1,64E-03 8 18 LYD446 0,76 1,05E-02 8 3 LYD446 0,84 2,44E-03 8 15 LYD446 0,92 1,63E-04 8 6 LYD446 0,73 1,65E-02 8 5 LYD446 0,89 5,06E-04 8 4 LYD446 0,74 1,35E-02 8 17 LYD446 0,72 4,46E-02 9 30 LYD446 0,76 2,75E-02 9 33 LYD446 0,73 7,17E-03 10 13 LYD446 0,76 3,96E-03 10 18 LYD446 0,75 5,36E-03 10 6 LYD446 0,73 7,15E-03 10 5 LYD446 0,74 5,80E-03 10 4 LYD447 0,85 1,75E-03 7 9 LYD447 0,76 1,09E-02 5 30 LYD447 0,81 4,88E-03 5 33 LYD447 0,76 1,02E-02 5 13 LYD447 0,73 1,73E-02 5 18

157 / 378 Nome do Conj. de ID de Nome do ID de Conj.

Gene R Valor p Exp.

Corr. do Gene R Valor p Corr.

Exp.

Conj. do Conj.

LYD447 0,81 4,43E-03 5 17 LYD447 0,82 3,68E-03 8 13 LYD447 0,78 8,36E-03 8 18 LYD447 0,75 1,28E-02 8 5 LYD447 0,73 1,67E-02 8 4 LYD447 0,71 2,20E-02 8 17 LYD447 0,81 1,46E-02 9 1 LYD447 0,71 9,48E-03 10 14 LYD448 0,71 8,97E-03 10 18 LYD449 0,74 5,72E-03 11 1 LYD449 0,84 2,61E-03 5 13 LYD449 0,84 2,54E-03 5 18 LYD449 0,72 1,97E-02 5 11 LYD449 0,71 2,09E-02 5 3 LYD449 0,80 5,74E-03 5 15 LYD449 0,89 4,94E-04 5 6 LYD449 0,79 6,50E-03 5 5 LYD449 0,84 2,53E-03 5 4 LYD449 0,71 2,13E-02 5 1 LYD449 0,76 1,09E-02 5 17 LYD449 0,80 5,69E-03 8 13 LYD449 0,83 2,98E-03 8 18 LYD449 0,83 3,13E-03 8 11 LYD449 0,71 2,07E-02 8 3 LYD449 0,72 1,88E-02 8 15 LYD449 0,75 1,22E-02 8 6 LYD449 0,85 1,93E-03 8 4 LYD449 0,75 1,20E-02 8 21 LYD449 0,75 1,31E-02 8 17 LYD449 0,77 9,18E-03 8 9 LYD449 0,76 2,78E-02 9 30 LYD449 0,73 3,86E-02 9 33 LYD449 0,72 1,31E-02 2 1 LYD449 0,87 2,18E-04 1 1 LYD449 0,80 1,58E-03 10 13 LYD449 0,82 9,57E-04 10 18 LYD449 0,72 8,90E-03 10 11 LYD449 0,79 2,43E-03 10 4 LYD449 0,74 5,57E-03 10 17 LYD450 0,79 6,69E-03 7 29 LYD450 0,71 2,08E-02 7 10 LYD450 0,78 2,78E-03 11 30 LYD450 0,84 5,95E-04 11 33 LYD450 0,77 9,22E-03 5 29 LYD450 0,71 1,02E-02 10 17 LYD451 0,74 1,42E-02 7 3 LYD451 0,84 2,49E-03 7 9 LYD451 0,73 1,62E-02 5 22 LYD451 0,74 1,53E-02 8 16 LYD451 0,91 3,10E-04 8 15 LYD451 0,81 4,43E-03 8 31 LYD451 0,73 4,05E-02 9 3 LYD451 0,87 4,57E-03 9 15 LYD451 0,80 1,63E-02 9 6 LYD451 0,84 8,79E-03 9 5 LYD451 0,81 1,39E-02 9 1 LYD451 0,82 1,32E-02 9 9 LYD451 0,86 6,35E-03 9 31 LYD452 0,71 1,04E-02 11 12 LYD452 0,71 2,09E-02 5 13 LYD452 0,73 1,58E-02 5 18 LYD452 0,83 3,18E-03 5 15 LYD452 0,74 1,51E-02 5 6 LYD452 0,80 5,59E-03 5 4 LYD452 0,80 5,69E-03 8 13 LYD452 0,83 2,98E-03 8 18 LYD452 0,72 1,86E-02 8 11 LYD452 0,72 1,88E-02 8 15 LYD452 0,76 1,13E-02 8 6 LYD452 0,85 1,93E-03 8 4 LYD452 0,75 1,31E-02 8 17 LYD452 0,83 1,11E-02 9 30 LYD452 0,82 1,19E-02 9 33 LYD452 0,86 3,76E-04 1 3 LYD452 0,76 4,29E-03 1 6 LYD452 0,71 9,90E-03 10 14 LYD452 0,76 4,05E-03 10 13 LYD452 0,80 1,84E-03 10 18 LYD452 0,70 1,10E-02 10 11 LYD452 0,72 8,81E-03 10 19 LYD452 0,79 2,43E-03 10 4 LYD452 0,72 7,85E-03 10 17 LYD453 0,85 4,98E-04 11 30 LYD453 0,72 8,84E-03 11 33 LYD453 0,75 1,34E-02 5 1 LYD453 0,81 4,59E-03 8 31 LYD453 0,76 2,90E-02 9 30 LYD453 0,70 1,09E-02 1 12 LYD453 0,71 9,90E-03 1 7 LYD453 0,74 5,81E-03 10 11 LYD454 0,86 1,55E-03 7 30 LYD454 0,88 6,89E-04 7 33 LYD454 0,71 9,99E-03 11 30 LYD454 0,72 8,14E-03 11 33 LYD454 0,71 4,67E-02 9 14 LYD454 0,74 3,42E-02 9 30 LYD454 0,79 2,08E-02 9 24 LYD454 0,70 5,13E-02 9 19 LYD454 0,75 3,24E-02 9 22 LYD454 0,73 3,78E-02 9 7 LYD454 0,76 4,31E-03 1 9 LYD455 0,77 2,41E-02 9 14 LYD455 0,71 4,73E-02 9 30 LYD455 0,85 7,57E-03 9 19 LYD455 0,89 3,40E-03 9 22 LYD455 0,72 4,49E-02 9 7 LYD455 0,72 8,28E-03 10 14 LYD455 0,71 1,01E-02 10 19 LYD456 0,73 1,59E-02 7 33 LYD456 0,72 1,89E-02 8 30 LYD456 0,74 1,51E-02 8 33 LYD456 0,77 2,40E-02 9 33

158 / 378 Nome do Conj. de ID de Nome do ID de Conj.

Gene R Valor p Exp.

Corr. do Gene R Valor p Corr.

Exp.

Conj. do Conj.

LYD456 0,70 1,12E-02 10 33 LYD458 0,74 1,54E-02 7 15 LYD458 0,77 3,18E-03 11 30 LYD458 0,79 2,45E-03 11 33 LYD458 0,78 7,66E-03 8 14 LYD458 0,72 4,25E-02 9 21 LYD458 0,72 8,47E-03 4 30 LYD458 0,76 4,03E-03 10 30 LYD458 0,78 2,91E-03 10 33 LYD459 0,75 1,16E-02 7 13 LYD459 0,75 1,28E-02 7 18 LYD459 0,73 1,74E-02 7 3 LYD459 0,76 1,13E-02 7 15 LYD459 0,75 1,32E-02 7 4 LYD459 0,74 1,47E-02 7 17 LYD459 0,71 1,02E-02 11 30 LYD459 0,71 1,03E-02 11 33 LYD459 0,75 1,24E-02 5 13 LYD459 0,79 6,80E-03 5 18 LYD459 0,83 2,69E-03 5 6 LYD459 0,85 1,97E-03 5 4 LYD459 0,73 1,70E-02 5 21 LYD459 0,87 9,66E-04 8 23 LYD459 0,91 1,75E-03 9 16 LYD459 0,78 2,26E-02 9 13 LYD459 0,77 2,67E-02 9 18 LYD459 0,87 5,14E-03 9 15 LYD459 0,84 8,68E-03 9 6 LYD459 0,74 3,58E-02 9 5 LYD459 0,82 1,24E-02 9 4 LYD459 0,79 3,82E-03 2 14 LYD459 0,73 1,15E-02 2 13 LYD459 0,71 1,51E-02 2 17 LYD459 0,77 3,18E-03 10 13 LYD459 0,82 1,07E-03 10 18 LYD459 0,80 1,89E-03 10 11 LYD459 0,73 6,67E-03 10 6 LYD459 0,88 1,34E-04 10 4 LYD460 0,77 3,26E-03 11 33 LYD460 0,72 1,87E-02 5 18 LYD460 0,75 1,31E-02 5 11 LYD460 0,74 1,36E-02 5 6 LYD460 0,77 8,54E-03 5 4 LYD460 0,87 1,06E-03 8 1 LYD460 0,73 1,64E-02 8 31 LYD460 0,73 3,86E-02 9 25 LYD460 0,81 1,50E-02 9 15 LYD460 0,92 1,31E-03 9 5 LYD460 0,73 3,79E-02 9 27 LYD460 0,74 3,67E-02 9 9 LYD461 0,73 1,56E-02 5 14 LYD461 0,87 1,04E-03 5 16 LYD461 0,83 2,91E-03 5 19 LYD461 0,79 6,99E-03 5 20 LYD461 0,75 1,24E-02 8 16 LYD461 0,72 2,00E-02 8 28 LYD461 0,82 1,26E-02 9 30 LYD461 0,76 3,02E-02 9 33 LYD461 0,72 8,13E-03 10 1 LYD461 0,72 8,18E-03 10 9 LYD462 0,80 4,97E-03 7 1 LYD462 0,77 8,82E-03 5 31 LYD462 0,79 6,57E-03 8 13 LYD462 0,83 2,86E-03 8 18 LYD462 0,84 2,63E-03 8 11 LYD462 0,80 4,98E-03 8 6 LYD462 0,82 3,73E-03 8 4 LYD462 0,71 2,22E-02 8 21 LYD462 0,73 6,65E-03 10 3 LYD462 0,86 3,56E-04 10 6 LYD462 0,75 4,62E-03 10 5 LYD462 0,71 9,09E-03 10 4 LYD465 0,75 1,32E-02 8 14 LYD465 0,79 6,48E-03 8 8 LYD465 0,90 2,48E-03 9 23 LYD465 0,71 4,93E-02 9 29 LYD465 0,78 2,36E-02 9 20 LYD465 0,77 3,25E-03 10 14 LYD465 0,70 1,09E-02 10 13 LYD465 0,72 8,67E-03 10 18 LYD465 0,72 8,23E-03 10 17 LYD466 0,76 3,99E-03 11 30 LYD466 0,72 8,54E-03 11 33 LYD466 0,71 2,19E-02 8 22 LYD466 0,72 4,42E-02 9 30 LYD466 0,84 9,75E-03 9 13 LYD466 0,80 1,68E-02 9 18 LYD466 0,71 4,74E-02 9 4 LYD466 0,81 1,54E-02 9 17 LYD466 0,72 8,41E-03 10 30 LYD467 0,73 1,61E-02 7 15 LYD467 0,78 7,61E-03 7 5 LYD467 0,70 2,36E-02 7 9 LYD467 0,75 5,30E-03 11 30 LYD467 0,83 7,26E-04 11 33 LYD467 0,75 3,35E-02 9 3 LYD467 0,91 1,66E-03 9 32 LYD467 0,71 9,53E-03 10 33 LYD468 0,76 4,49E-03 11 2 LYD468 0,72 1,89E-02 5 3 LYD468 0,82 3,59E-03 8 3 LYD468 0,88 8,27E-04 8 15 LYD468 0,77 9,51E-03 8 1 LYD468 0,90 4,11E-04 8 9 LYD468 0,79 1,99E-02 9 16 LYD468 0,92 1,13E-03 9 3 LYD468 0,92 1,05E-03 9 15 LYD468 0,90 2,35E-03 9 6 LYD468 0,84 8,94E-03 9 5 LYD468 0,77 2,53E-02 9 4 LYD468 0,77 2,57E-02 9 1 LYD468 0,84 9,40E-03 9 9

159 / 378 Nome do Conj. de ID de Nome do ID de Conj.

Gene R Valor p Exp.

Corr. do Gene R Valor p Corr.

Exp.

Conj. do Conj.

LYD468 0,78 2,36E-02 9 31 LYD468 0,83 7,90E-04 4 3 LYD468 0,80 1,87E-03 4 9 LYD468 0,71 9,38E-03 1 1 LYD469 0,76 2,98E-02 9 33 LYD469 0,72 8,28E-03 4 31 LYD469 0,79 2,34E-03 1 14 LYD469 0,87 2,30E-04 1 19 LYD469 0,84 6,80E-04 1 22 LYD469 0,81 1,52E-03 1 20 LYD469 0,74 5,47E-03 1 28 LYD469 0,81 1,57E-03 10 13 LYD469 0,81 1,29E-03 10 18 LYD469 0,76 4,26E-03 10 15 LYD469 0,82 1,09E-03 10 6 LYD469 0,73 7,61E-03 10 4 LYD469 0,71 9,96E-03 10 17 LYD470 0,77 9,29E-03 7 30 LYD470 0,86 1,56E-03 7 33 LYD470 0,75 4,59E-03 11 30 LYD470 0,80 1,72E-03 11 33 LYD470 0,71 2,17E-02 8 14 LYD470 0,72 4,21E-02 9 12 LYD470 0,71 1,35E-02 2 13 LYD471 0,71 9,41E-03 11 8 LYD471 0,72 4,57E-02 9 30 LYD471 0,83 9,21E-04 10 14 LYD471 0,79 2,25E-03 10 13 LYD471 0,75 4,99E-03 10 18 LYD471 0,73 6,93E-03 10 19 LYD471 0,82 9,63E-04 10 17 LYD472 0,75 5,11E-03 11 30 LYD472 0,76 3,89E-03 11 33 LYD472 0,77 9,44E-03 5 1 LYD472 0,84 2,35E-03 8 3 LYD472 0,87 1,00E-03 8 9 LYD472 0,76 3,87E-03 4 23 LYD472 0,72 7,78E-03 10 33 LYD473 0,71 2,08E-02 7 33 LYD473 0,82 1,15E-03 11 30 LYD473 0,75 4,94E-03 11 33 LYD473 0,73 1,76E-02 8 14 LYD473 0,70 2,29E-02 8 17 LYD511 0,77 3,19E-03 11 30 LYD511 0,74 1,46E-02 8 33 LYD511 0,73 3,80E-02 9 11 LYD511 0,73 4,10E-02 9 3 LYD511 0,79 2,07E-02 9 15 LYD511 0,82 1,35E-02 9 6 LYD511 0,81 1,55E-02 9 4 LYD511 0,71 4,90E-02 9 1 LYD511 0,80 1,70E-02 9 9 LYD512 0,82 3,84E-03 7 1 LYD512 0,80 1,76E-02 9 30 LYD512 0,78 2,26E-02 9 1 LYD512 0,79 2,15E-03 1 9 LYD512 0,70 1,10E-02 10 7 LYD513 0,81 4,46E-03 7 14 LYD513 0,77 9,82E-03 7 17 LYD513 0,73 6,73E-03 11 30 LYD513 0,75 3,10E-02 9 14 LYD513 0,86 6,80E-03 9 30 LYD513 0,78 2,18E-02 9 33 LYD513 0,76 2,93E-02 9 24 LYD513 0,71 9,31E-03 10 30 LYD514 0,72 1,83E-02 7 33 LYD514 0,77 8,89E-03 8 33 LYD514 0,77 9,14E-03 8 16 LYD514 0,87 5,28E-03 9 30 LYD514 0,79 1,85E-02 9 33 LYD514 0,79 1,94E-02 9 22 LYD514 0,76 3,02E-02 9 7 LYD514 0,73 6,55E-03 4 22 LYD515 0,79 6,42E-03 7 31 LYD515 0,70 1,10E-02 10 19 LYD515 0,77 3,68E-03 10 22 LYD515 0,71 9,80E-03 10 7 LYD516 0,80 5,60E-03 5 11 LYD516 0,78 8,06E-03 5 24 LYD516 0,71 2,08E-02 5 1 LYD516 0,70 5,24E-02 9 18 LYD516 0,82 1,17E-02 9 11 LYD516 0,79 1,85E-02 9 4 LYD516 0,84 8,76E-03 9 21 LYD516 0,71 1,44E-02 2 22 LYD516 0,72 7,87E-03 10 18 LYD516 0,82 1,08E-03 10 11 LYD516 0,82 1,11E-03 10 4 LYD516 0,75 5,39E-03 10 21 LYD517 0,71 2,05E-02 7 19 LYD517 0,74 1,41E-02 7 22 LYD517 0,73 1,72E-02 7 6 LYD517 0,72 1,84E-02 5 28 LYD517 0,83 3,03E-03 8 13 LYD517 0,82 3,63E-03 8 18 LYD517 0,75 1,26E-02 8 6 LYD517 0,82 3,99E-03 8 4 LYD517 0,77 9,66E-03 8 17 LYD517 0,79 2,08E-02 9 13 LYD517 0,84 9,14E-03 9 18 LYD517 0,96 1,54E-04 9 11 LYD517 0,71 4,76E-02 9 6 LYD517 0,82 1,25E-02 9 4 LYD517 0,75 3,29E-02 9 21 LYD517 0,78 2,36E-02 9 17 LYD517 0,76 4,40E-03 1 23 LYD518 0,74 6,32E-03 11 19 LYD518 0,77 3,58E-03 11 22 LYD518 0,82 3,68E-03 5 13 LYD518 0,81 4,43E-03 5 18 LYD518 0,74 1,53E-02 5 15 LYD518 0,89 5,61E-04 5 6

160 / 378 Nome do Conj. de ID de Nome do ID de Conj.

Gene R Valor p Exp.

Corr. do Gene R Valor p Corr.

Exp.

Conj. do Conj.

LYD518 0,87 1,09E-03 5 5 LYD518 0,85 1,84E-03 5 4 LYD518 0,80 5,64E-03 8 3 LYD518 0,74 1,42E-02 8 15 LYD518 0,87 1,03E-03 8 9 LYD518 0,95 9,67E-06 2 16 LYD518 0,93 3,97E-05 2 15 LYD519 0,92 1,56E-04 5 14 LYD519 0,76 1,02E-02 5 13 LYD519 0,71 2,12E-02 5 18 LYD519 0,90 4,07E-04 5 19 LYD519 0,75 1,29E-02 5 22 LYD519 0,89 6,26E-04 5 17 LYD519 0,92 1,44E-04 8 13 LYD519 0,93 8,02E-05 8 18 LYD519 0,72 1,91E-02 8 11 LYD519 0,76 1,05E-02 8 3 LYD519 0,85 1,74E-03 8 15 LYD519 0,92 1,63E-04 8 6 LYD519 0,83 3,28E-03 8 5 LYD519 0,94 6,38E-05 8 4 LYD519 0,79 6,00E-03 8 17 LYD519 0,75 3,27E-02 9 30 LYD519 0,85 7,67E-03 9 33 LYD519 0,73 7,33E-03 10 13 LYD519 0,74 6,23E-03 10 18 LYD519 0,72 8,64E-03 10 6 LYD519 0,72 8,31E-03 10 5 LYD520 0,88 1,72E-04 11 30 LYD520 0,84 7,18E-04 11 33 LYD437 0,83 1,02E-02 9 36 LYD437 0,73 6,79E-03 10 36 LYD438 0,72 8,21E-03 10 34 LYD439 0,71 2,11E-02 7 37 LYD439 0,73 4,03E-02 9 36 LYD441 0,72 1,80E-02 7 37 LYD443 0,73 1,58E-02 8 39 LYD445 0,86 1,31E-03 5 37 LYD445 0,76 1,15E-02 5 35 LYD445 0,84 2,47E-03 5 34 LYD445 0,92 1,33E-04 5 38 LYD445 0,77 9,23E-03 8 37 LYD445 0,72 2,01E-02 8 35 LYD445 0,71 2,10E-02 8 38 LYD445 0,74 5,62E-03 10 37 LYD445 0,84 6,84E-04 10 38 LYD446 0,81 4,93E-03 5 35 LYD446 0,84 2,19E-03 5 36 LYD446 0,79 6,69E-03 5 34 LYD446 0,74 1,45E-02 5 38 LYD446 0,86 1,56E-03 8 37 LYD446 0,73 1,72E-02 8 35 LYD446 0,74 1,47E-02 8 34 LYD446 0,74 1,36E-02 8 38 LYD446 0,77 3,47E-03 10 37 LYD447 0,70 2,36E-02 5 37 LYD447 0,81 4,59E-03 5 38 LYD447 0,75 1,25E-02 8 37 LYD447 0,71 2,04E-02 8 35 LYD448 0,72 8,31E-03 10 37 LYD449 0,83 2,77E-03 5 37 LYD449 0,77 9,16E-03 5 38 LYD449 0,84 2,35E-03 8 37 LYD449 0,74 1,39E-02 8 38 LYD449 0,82 9,71E-04 10 37 LYD449 0,73 6,85E-03 10 38 LYD450 0,72 8,82E-03 10 38 LYD452 0,73 1,56E-02 5 37 LYD452 0,84 2,35E-03 8 37 LYD452 0,74 1,39E-02 8 38 LYD452 0,81 1,55E-03 10 37 LYD452 0,72 7,82E-03 10 38 LYD455 0,83 1,08E-02 9 36 LYD458 0,79 6,01E-03 8 35 LYD458 0,71 2,25E-02 8 34 LYD458 0,73 9,99E-03 2 35 LYD459 0,74 1,53E-02 7 37 LYD459 0,72 1,78E-02 7 35 LYD459 0,79 6,83E-03 7 34 LYD459 0,71 2,24E-02 7 38 LYD459 0,80 5,82E-03 5 37 LYD459 0,76 3,02E-02 9 37 LYD459 0,87 4,49E-04 2 35 LYD459 0,82 1,84E-03 2 34 LYD459 0,83 8,59E-04 10 37 LYD460 0,74 1,42E-02 5 37 LYD461 0,82 3,93E-03 5 36 LYD462 0,85 1,90E-03 8 37 LYD465 0,72 8,92E-03 10 37 LYD465 0,76 4,04E-03 10 34 LYD466 0,78 2,17E-02 9 37 LYD466 0,91 1,89E-03 9 35 LYD466 0,85 8,07E-03 9 34 LYD466 0,78 2,33E-02 9 38 LYD468 0,70 1,06E-02 1 34 LYD469 0,88 1,65E-04 1 36 LYD469 0,81 1,53E-03 10 37 LYD471 0,72 1,99E-02 8 35 LYD471 0,73 7,63E-03 10 37 LYD471 0,71 9,52E-03 10 35 LYD471 0,72 8,58E-03 10 34 LYD471 0,81 1,48E-03 10 38 LYD473 0,70 2,40E-02 8 35 LYD473 0,72 1,86E-02 8 34 LYD511 0,72 4,53E-02 9 37 LYD513 0,92 1,56E-04 7 35 LYD513 0,90 3,48E-04 7 34 LYD513 0,72 1,82E-02 7 38 LYD514 0,75 1,24E-02 8 35 LYD514 0,74 5,59E-03 4 36 LYD515 0,79 2,45E-03 10 36 LYD516 0,72 4,34E-02 9 37

161 / 378 Nome do Conj. de ID de Nome do ID de Conj. Gene R Valor p Exp. Corr. do Gene R Valor p Corr. Exp. Conj. do Conj. LYD516 0,75 4,91E-03 10 37 LYD516 0,71 9,74E-03 10 38 LYD517 0,72 1,83E-02 7 36 LYD517 0,81 4,61E-03 8 37 LYD517 0,78 7,26E-03 8 38 LYD517 0,86 6,47E-03 9 37 LYD517 0,79 1,93E-02 9 38 LYD518 0,81 1,40E-03 11 36 LYD518 0,80 5,27E-03 5 37 LYD519 0,81 4,93E-03 5 35 LYD519 0,84 2,19E-03 5 36 LYD519 0,80 5,26E-03 5 34 LYD519 0,87 9,29E-04 5 38 LYD519 0,93 8,53E-05 8 37 LYD519 0,79 6,99E-03 8 38 LYD519 0,74 6,38E-03 10 37 LYD437 0,74 3,55E-02 7 40 LYD438 0,74 3,46E-02 7 40 LYD438 0,79 6,15E-03 4 40 LYD438 0,71 2,21E-02 1 40 LYD440 0,74 5,82E-02 9 40 LYD440 0,72 1,90E-02 10 40 LYD447 0,71 2,25E-02 11 40 LYD447 0,72 1,97E-02 1 40 LYD448 0,78 2,31E-02 5 40 LYD449 0,83 1,02E-02 7 40 LYD449 0,76 1,77E-02 2 40 LYD449 0,77 9,76E-03 4 40 LYD455 0,73 1,62E-02 11 40 LYD465 0,73 6,40E-02 9 40 LYD514 0,73 1,71E-02 1 40 LYD517 0,74 1,47E-02 11 40 Tabela 42. São providas as correlações (R) entre os níveis de expressão de genes melhoradores de rendimento e seus homólogos em diversos tecidos [Conjuntos de Expressão (Exp)] e o desempenho fenotípico [rendimento, biomassa e arquitetura de planta (ID de Vetor de Correlação (Con.))] sob condições normais através de soja variedades. P = valor p.

EXEMPLO 10

PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE CEVADA E ANÁLISE DE

CORRELAÇÃO DE ALTO DESEMPENHO USANDO MICROARRANJO DE OLIGONUCLEOTÍDEO DE CEVADA DE 44K

[00501] De modo a produzir uma análise de correlação de alto rendimento, os presentes inventores utilizaram um microarranjo de oligonucleotídeo de Cevada, produzido pela Agilent Technologies [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://World Wide Web (dot) chem. (dot) agilent (dot) com/Scripts/PDS (dot) asp?1Page=50879]. O oligonucleotídeo do arranjo representa cerca de 47.500 genes e transcritos de cevada. De modo a definir correlações entre os níveis de expressão de RNA e rendimento ou parâmetros relacionados com vigor, várias características de planta de 25 acessos de foram analisados. Entre eles, 13 acessos abrangendo a variação observada foram selecionados para a análise de expressão de RNA. A correlação entre os níveis de RNA e os parâmetros distinguidos foi analisada usando o teste de correlação de Pearson [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://World Wide Web (dot) davidmlane (dot) com/hyperstat/A34739

162 / 378 (dot) html]. Procedimentos Experimentais

[00502] Cinco tecidos em estágios desenvolvimentais diferentes [meristema, flor, espiga de inicialização, haste, folha bandeira], representando características de planta diferentes, foram amostradas e o RNA foi extraído como descrito acima sob “MÉTODOS GERAIS EXPERIMENTAIS E DE BIOINFORMÁTICA”.

[00503] Por conveniência, cada tipo de tecido de informação de expressão de microarranjo recebeu um ID do Conjunto como resumido na Tabela 43 abaixo. Tabela 43 Conjuntos de expressão de transcriptoma de cevada Conjunto de Expressão ID do Conjunto Espiga de inicialização no estágio de florescimento 1 Haste no estágio de florescimento 2 Florescimento da espiga no estágio de florescimento 3 Meristema no estágio de florescimento 4 Tabela 43: São providos os dígitos de identificação (ID) de cada um dos conjuntos de expressão de Cevada.

[00504] Avaliação dos componentes de rendimento e parâmetros relacionados com vigor da Cevada — 13 acessos da cevada em 4 blocos repetitivos (chamados de A, B, C e D), cada um contendo 4 plantas por canteiro foram cultivadas em sombra de malha. As plantas foram fenotipadas em uma base diária seguindo o descritor padrão da cevada (Tabela 44, abaixo). A colheita foi conduzida quando 50% das espigas foram secas para evitar a liberação espontânea das sementes. As plantas foram separadas em parte vegetativa e espigas, delas, 5 espigas foram debulhadas (os grãos foram separados das glumas) para a análise de grão adicional tal como medição de tamanho, contagem de grão por espiga e Rendimento de Grão por espiga. Todo o material foi secado em estufa e as sementes foram debulhadas manualmente das espigas antes da medição das características da semente (peso e tamanho) usando varredura e análise de imagem. O sistema de análise de imagem incluiu um computador de mesa pessoal (processador Intel P4 3,0

163 / 378 GHz) e um programa de domínio público - ImageJ 1.37 (programa de processamento de imagem com base em Java, que foi desenvolvido no U.S. National Institutes of Health e gratuitamente disponível na internet [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://rsbweb (dot) nih (dot) gov/]. Em seguida, os dados analisados foram salvos em arquivos de texto e processados usando o software de análise estatística JMP (SAS institute). Tabela 44 Descritores padrão da cevada Traço Parâmetro Faixa Descrição Hábito de crescimento Contagem 1-9 Prostrado (1) ou Ereto (9) Pilosidade das P (Presença)/A Contagem Ausência (1) ou Presença (2) folhas basais (Ausência) Verde (1), apenas Basal ou Metade ou Pigmentação da haste Contagem 1-5 mais (5) Dias para o Dia Dias da semeadura para a emergência de Florescimento glumas Altura a partir do nível do solo até o topo Altura da planta Centímetros (cm) da espiga mais longa excluindo as glumas Espigas por planta Número Contagem terminal Comprimento da Centímetros (cm) Contagem terminal 5 espigas por planta Espiga Grãos por espiga Número Contagem terminal 5 espigas por planta Peso seco vegetativo Gramas Seco em estufa por 48 horas a 70°C Peso seco das espigas Gramas Seco em estufa por 48 horas a 30°C Tabela 44.

[00505] No final do experimento (50% das espigas foram secas) todas as espigas dos canteiros dentro dos blocos A-D foram coletadas e as seguintes medições foram realizadas: (i) Grãos por espiga - O número total de grãos de 5 espigas que foram manualmente debulhadas foi contado. Os grãos médios por espiga foram calculados dividindo-se o número total de grãos pelo número de espigas. (ii) Tamanho médio do grão (cm) – Os grãos totais de 5 espigas que foram manualmente debulhadas foram escaneados e as imagens foram analisadas usando o sistema de imageamento digital. A varredura de grão foi feita usando o escâner da Brother (modelo DCP-135), na resolução de 200 dpi e analisada com o software Image J. O tamanho de grão médio foi

164 / 378 calculado dividindo-se o tamanho de grão total pelo número de grão total. (iii) Peso de grão médio (mgr) - Os grãos totais de 5 espigas que foram manualmente debulhadas foram contadas e pesadas. O peso médio foi calculado dividindo-se o peso total pelo número total de grãos. (iv) Rendimento de Grão por espiga (g) - O total de grãos de 5 espigas que foram manualmente debulhadas foi pesado. O Rendimento de Grão foi calculado dividindo-se o peso total pelo número de espiga. (v) Análise do comprimento da espiga - As cinco espigas escolhidas por planta foram medidas usando fita métrica excluindo as barbas. (vi) Análise do número de espigas - As espigas por planta foram contadas.

[00506] Parâmetros adicionais foram medidos como segue:

[00507] Contagem do hábito de crescimento — No estágio de crescimento 10 (inicialização), cada uma das plantas foi classificada quanto Pa natureza do seu hábito de crescimento. A escala que foi usada foi 1 para natureza prostada até 9 para ereto.

[00508] Pilosidade das folhas basais - No estágio de crescimento 5 (bainhas de folha fortemente eretas; final do broto), de cada uma das plantas foi classificada quanto à sua natureza pilosa da folha antes da última. A escala que foi usada foi 1 para a natureza prostada até 9 para ereto.

[00509] Altura da planta — No estágio de colheita (50% das espigas foram secas), cada um das plantas foi medida quanto à sua altura usando fita métrica. A altura foi medida a partir do nível do solo até o topo da espiga mais longa excluindo as barbas.

[00510] Dias para florescimento — Cada uma das plantas foi monitorada quanto à data de florescimento. Os dias de florescimento foram calculados a partir da data de semeadura até a data de florescimento.

[00511] Pigmentação da haste - No estágio de crescimento 10 (inicialização), cada um das plantas foi classificada quanto à sua cor da haste.

165 / 378 A escala que foi usada foi 1 para verde até 5 para púrpura profunda.

[00512] Peso vegetativo seco e rendimento de espiga - No final do experimento (50% das espigas foram secas) todas as espigas e material vegetativo dos canteiros dentro dos blocos A-D são coletados. O peso da biomassa e espigas de cada canteiro foi separado, medido e dividido pelo número de plantas.

[00513] Peso seco = peso total da porção vegetativa acima do solo (excluindo as raízes) depois de secar a 70°C em estufa durante 48 horas;

[00514] Rendimento de espiga por planta = peso total da espiga por planta (g) depois de secar a 30°C em estufa durante 48 horas. Tabela 45 Parâmetros carrelacionados da cevada (vetores) Parâmetro correlacionado com ID de Correlação Espigas por planta (número) 1 dias para florescimento (dias) 2 Peso do grão (g) 3 Comprimento da espiga (cm) 4 Tamanho dos grãos (mm) 5 Grãos por espiga (número) 6 Hábito de crescimento (contagem 1-9) 7 Pilosidade de folhas basais (contagem 1-9) 8 Altura da planta (cm) 9 Rendimento de semente de 5 espigas (g) 10 Haste pigmentação (contagem 1-5) 11 Peso vegetativo seco (g) 12 Tabela 45. São providos os parâmetros correlacionados da cevada (vetores).

Resultados Experimentais

[00515] 13 acessos de cevada diferentes foram cultivados e distinguidos para 12 parâmetros como descritos acima. A média para cada um dos parâmetros medidos foi calculada usando o software JMP e os valores estão resumidos nas Tabelas 46 e 47 abaixo. A análise de correlação subsequente entre os diversos conjuntos de expressão de transcriptoma (Tabela 43) e os parâmetros médios (Tabelas 46-47) foi conduzida. A seguir, os resultados foram integrados com a base de dados (Tabela 48 abaixo). Tabela 46 Parâmetros medidos de IDs de Correlação em acessos de Cevada

166 / 378 (linhas 1-6) Ecotipo/ID de Correlação Linha-1 Linha-2 Linha-3 Linha-4 Linha-5 Linha-6 No. 1 48,846 48,273 37,417 61,917 33,273 41,692 2 62,400 64,083 65,154 58,917 63.000 70,538 3 35,046 28,065 28,761 17,869 41,216 29,734 4 12,036 10,932 11,825 9,900 11,682 11,532 5 0,265 0,229 0,244 0,166 0,295 0,275 6 20,229 17,983 17,267 17,733 14,467 16,783 7 2,600 2.000 1,923 3,167 4,333 2,692 8 1,533 1,333 1,692 1,083 1,417 1,692 9 134,267 130,500 138,769 114,583 127,750 129,385 10 3,559 2,538 2,583 1,574 3,030 2,517 11 1,133 2,500 1,692 1,750 2,333 2,308 12 78,871 66,141 68,491 53,389 68,300 74,173 Tabela 46. São providos os valores de cada um dos parâmetros medidos em acessos de cevada de acordo com as Identificações de Correlação (ver Tabela 45).

Tabela 47 Acessos da cevada, parâmetros adicionais medidos (linhas 7-13) Ecotipo/ ID de Correlação Linha-7 Linha-8 Linha-9 Linha-10 Linha-11 Linha-12 Linha-13 No. 1 40,000 40,625 62,000 49,333 50,600 43,091 51,400 2 52,800 60,875 58,100 53,000 60,400 64,583 56,000 3 25,224 34,994 20,580 27,501 37,126 29,564 19,583 4 8,863 11,216 11,108 8,583 10,179 10,505 9,803 5 0,220 0,278 0,187 0,224 0,273 0,271 0,179 6 12,120 14,067 21,540 12,100 13,400 15,283 17,067 7 3,600 3,500 3,000 3,667 2,467 3,500 3,000 8 1,300 1,188 1.000 1,167 1,600 1,083 1,167 9 103,889 121,625 126,800 99,833 121,400 118,417 117,167 10 1,549 2,624 2,300 1,678 2,677 2,353 1,673 11 1,700 2,188 2,300 1,833 3,067 1,583 2,167 12 35,354 58,334 62,230 38,322 68,306 56,148 42,682 Tabela 47. São providos os valores de cada um dos parâmetros medidos em acessos de cevada de acordo com as Identificações de Correlação (ver Tabela 45).

Tabela 48 Correlação entre o nível de expressão dos polinucleotídeos selecionados da invenção e seus homólogos em tecidos específicos ou estágios desenvolvimentais e o desempenho fenotípico através de acessos de cevada ID do Conj. de ID do Nome do Conj. de Nome do R Valor p Conj. de R Valor p Conj. Conj. de Gene Exp. Gene Exp. Exp. Corr. LYD370 0,71 4,80E-02 4 1 LYD371 0,78 2,21E-02 4 1 Tabela 48. São providas as correlações (R) entre os níveis de expressão de genes melhoradores de rendimento e seus homólogos em diversos tecidos [Conjuntos de Expressão (Exp)] e o desempenho fenotípico (ID do Vetor de correlação (Corr.))] sob condições normais através de variedades de cevada. P = valor p.

EXEMPLO 11

PRODUÇÃO DE TRANSCRIPTOMA DE COTTON E ANÁLISE DE

167 / 378

CORRELAÇÃO DE ALTO RENDIMENTO PARA DESENVOLVIMENTO DE FIBRA VEGETAL USANDO MICROARRANJO DE OLIGONUCLEOTÍDEO DO ALGODÃO

[00516] De modo a conduzir a análise de correlação da expressão de gene de alto rendimento, os presentes inventores usaram microarranjo de oligonucleotídeo do algodão, planejado e produzido pela “Comparative Evolutionary Genomics of Cotton” [Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto) www.cottonevolution (dot) info/). Este Microarranjo de Oligonucleotídeo de Algodão é composto de 12.006 oligonucleotídeos da Integrated DNA Technologies (IDT) derivados de uma montagem de mais do que 180.000 ESTs de Gossypium sequenciados a partir de 30 bibliotecas de cDNA. Para detalhes adicionais ver PCT/IL2005/000627 e PCT/IL2007/001590 que são aqui completamente incorporadas por referência. Tabela 49 Conjuntos experimentais de transcriptoma do algodão Conjunto de Expressão ID do Conjunto comprimento da fibra do algodão 15 dias após a antese 1 comprimento da fibra do algodão 5 dias após a antese 2 comprimento da fibra do algodão 10 dias após a antese 3 Tabela 49. São providos os conjuntos de expressão do transcriptoma do algodão.

[00517] De modo a definir correlações entre os níveis de expressão de RNA e comprimento de fibra, fibras de 8 linhagens de algodão diferentes foram analisadas. Estas fibras foram selecionadas apresentando qualidade muito boa da fibra e alto índice de índice de fiapos (tipos Pima, originando de outra espécie de algodão, a saber G. barbadense), níveis diferentes de qualidade e índices de fiapo de várias linhagens de G. hirsutum: qualidade boa e alto índice de fiapo (tipo Acala) e qualidade insatisfatória e índice de fiapo curto (tipo Tamcot e variedades velhas). Um resumo do comprimento de fibra das diferentes linhagens é provido na Tabela 51. Procedimentos Experimentais

[00518] Extração de RNA – Estágios de desenvolvimento de fibra,

168 / 378 representando características de fibra diferentes, em 5, 10 e 15 DPA (Dias Depois da Antese) foram amostrados e o RNA foi extraído como descrito acima.

[00519] Avaliação do comprimento da fibra – O comprimento da fibra das linhagens de algodão selecionadas foi medido usando fibrograph. O sistema fibrograph foi usado para computar o comprimento em termos de comprimento “Médio da Metade Superior”. A Média da Metade Superior (UHM) é o comprimento médio da metade mais longa da distribuição de fibra. O fibrograph mede o comprimento em comprimentos de intervalo em um dado ponto de porcentagem World Wide Web (dot) cottoninc (dot) com/ClassificationofCotton/?Pg=4#Length]. Resultados Experimentais

[00520] Oito linhagens de algodão diferentes foram cultivadas e seu comprimento de fibra foi medido. Os valores UHM das fibras estão resumidos na Tabela 51 aqui abaixo. A correlação entre o nível de expressão de genes de algumas modalidades da invenção e o comprimento da fibra do algodão sob condições de cultivo normais foi realizada (Tabela 52). Tabela 50 Parâmetro de correlação do algodão Parâmetro correlacionado com ID de Correlação Comprimento da Fibra 1 Tabela 50.

Tabela 51 Sumário do comprimento de fibra (UHM) das 8 linhagens de algodão diferentes ID de Correlação No./Ecotipo 1 Linha-1 1,21 Linha-2 1,1 Linha-3 1,36 Linha-4 1,26 Linha-5 0,89 Linha-6 1,01 Linha-7 1,06 Linha-8 1,15 Tabela 51: É apresentada a UHM de 8 linhagens de algodão diferentes.

Tabela 52

169 / 378 Correlação entre o nível de expressão de genes LYD selecionados de algumas modalidades da invenção em diversos tecidos e comprimentos da fibra do algodão sob normal condições de cultivo no algodão ID do ID do Nome do Conj. Nome do Conj. R Valor p Conj. de R Valor p Conj. de Gene Exp. Gene Exp. Corr. Corr. LYD380 0,84 1,92E-02 3 1 LYD382 0,79 1,92E-02 2 1 LYD382 0,87 1,08E-02 3 1 LYD383 0,72 4,20E-02 1 1 LYD385 0,77 2,52E-02 1 1 LYD386 0,76 2,70E-02 2 1 9,34 E-03 1 LYD386 0,77 4,35E-02 3 1 LYD387 0,84 1 1 LYD388 0,88 9,63E-03 3 1 LYD502 0,73 6,19E-02 3 1 Tabela 52. São providas as correlações entre o nível de expressão dos genes e o efeito sobre o comprimento da fibra. “Conj. Exp.” - Conjunto de Expressão. “R” = Coeficiente de correlação de Pearson; “P” = valor p.

EXEMPLO 12 IDENTIFICAÇÃO DE GENES QUE AUMENTAM O RENDIMENTO, BIOMASSA, TAXA DE CRESCIMENTO, VIGOR, CONTEÚDO DE ÓLEO, TOLERÂNCIA AO ESTRESSE ABIÓTICO DE PLANTAS E

EFICIÊNCIA NO USO DE NITROGÊNIO

[00521] Com base nas ferramentas de bioinformática e experimentais descritas acima, os presentes inventores identificaram 201 genes que têm um maior impacto sobre o rendimento, rendimento de semente, rendimento de óleo, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibra, qualidade da fibra, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência de uso de fertilizante (por exemplo, nitrogênio) quando a expressão dos mesmos é aumentada em plantas. Os genes identificados (incluindo genes, variantes, sequências selecionadas dos mesmos e sequências clonadas identificados pelas ferramentas de bioinformática) e sequências de polipeptídeo por meio destes codificadas estão resumidas na Tabela 53, abaixo. Tabela 53 Polinucleotídeos identificados que afetam o rendimento da planta, rendimento de semente, rendimento de óleo, conteúdo de óleo, biomassa, taxa de crescimento, vigor, rendimento de fibra, qualidade da fibra tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio

170 / 378 de uma planta

SEQ ID SEQ ID Nome do Nome do Agrupamento Organismo NO: do NO: do Gene Polin. Polip. LYD289 arabidopsis|10v1|AT1G02040 arabidopsis 1 456 LYD290 arabidopsis|10v1|AT1G09560 arabidopsis 2 457 LYD291 arabidopsis|10v1|AT1G10970 arabidopsis 3 458 LYD292 arabidopsis|10v1|AT1G13740 arabidopsis 4 459 LYD293 arabidopsis|10v1|AT1G14620 arabidopsis 5 460 LYD294 arabidopsis|10v1|AT1G27300 arabidopsis 6 461 LYD295 arabidopsis|10v1|AT1G27900 arabidopsis 7 462 LYD296 arabidopsis|10v1|AT1G30820 arabidopsis 8 463 LYD297 arabidopsis|10v1|AT1G51440 arabidopsis 9 464 LYD298 arabidopsis|10v1|AT1G55910 arabidopsis 10 465 LYD299 arabidopsis|10v1|AT1G61600 arabidopsis 11 466 LYD300 arabidopsis|10v1|AT1G61790 arabidopsis 12 467 LYD301 arabidopsis|10v1|AT1G74790 arabidopsis 13 468 LYD302 arabidopsis|10v1|AT1G77060 arabidopsis 14 469 LYD303 arabidopsis|10v1|AT2G01710 arabidopsis 15 470 LYD304 arabidopsis|10v1|AT2G03810 arabidopsis 16 471 LYD305 arabidopsis|10v1|AT2G05220 arabidopsis 17 472 LYD306 arabidopsis|10v1|AT2G07674 arabidopsis 18 473 LYD307 arabidopsis|10v1|AT2G17990 arabidopsis 19 474 LYD308 arabidopsis|10v1|AT2G37478 arabidopsis 20 475 LYD309 arabidopsis|10v1|AT2G40020 arabidopsis 21 476 LYD310 arabidopsis|10v1|AT2G40300 arabidopsis 22 477 LYD311 arabidopsis|10v1|AT2G40510 arabidopsis 23 478 LYD312 arabidopsis|10v1|AT2G42770 arabidopsis 24 479 LYD313 arabidopsis|10v1|AT3G04620 arabidopsis 25 480 LYD315 arabidopsis|10v1|AT3G05390 arabidopsis 26 481 LYD316 arabidopsis|10v1|AT3G09030 arabidopsis 27 482 LYD318 arabidopsis|10v1|AT3G11900 arabidopsis 28 483 LYD319 arabidopsis|10v1|AT3G14070 arabidopsis 29 484 LYD320 arabidopsis|10v1|AT3G15810 arabidopsis 30 485 LYD321 arabidopsis|10v1|AT3G18750 arabidopsis 31 486 LYD322 arabidopsis|10v1|AT3G21190 arabidopsis 32 487 LYD323 arabidopsis|10v1|AT3G44280 arabidopsis 33 488 LYD324 arabidopsis|10v1|AT3G47860 arabidopsis 34 489 LYD325 arabidopsis|10v1|AT3G49390 arabidopsis 35 490 LYD326 arabidopsis|10v1|AT3G49490 arabidopsis 36 491 LYD327 arabidopsis|10v1|AT3G51895 arabidopsis 37 492 LYD328 arabidopsis|10v1|AT3G59210 arabidopsis 38 493 LYD329 arabidopsis|10v1|AT3G62270 arabidopsis 39 494 LYD330 arabidopsis|10v1|AT4G13070 arabidopsis 40 495 LYD331 arabidopsis|10v1|AT4G17440 arabidopsis 41 496 LYD332 arabidopsis|10v1|AT4G35110 arabidopsis 42 497 LYD334 arabidopsis|10v1|AT5G03870 arabidopsis 43 498 LYD335 arabidopsis|10v1|AT5G04140 arabidopsis 44 499 LYD337 arabidopsis|10v1|AT5G11740 arabidopsis 45 500 LYD338 arabidopsis|10v1|AT5G12410 arabidopsis 46 501 LYD339 arabidopsis|10v1|AT5G13560 arabidopsis 47 502 LYD340 arabidopsis|10v1|AT5G16420 arabidopsis 48 503 LYD341 arabidopsis|10v1|AT5G36700 arabidopsis 49 504 LYD342 arabidopsis|10v1|AT5G44680 arabidopsis 50 505 LYD343 arabidopsis|10v1|AT5G46150 arabidopsis 51 506 LYD344 arabidopsis|10v1|AT5G64840 arabidopsis 52 507 LYD346 b_juncea|10v2|BJ1SLX00003156 b_juncea 53 508 LYD347 b_junceal|10v2|BJ1SLX00219277D1 b_juncea 54 509

171 / 378

SEQ ID SEQ ID Nome do Nome do Agrupamento Organismo NO: do NO: do Gene Polin. Polip. LYD348 b_juncea|10v2|BJ1SLX01241733D1 b_juncea 55 510 LYD349 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A0PVA b_juncea 56 511 LYD351 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01A2WXZ b_juncea 57 512 LYD352 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01A7124 b_juncea 58 513 LYD353 b_junceal|10v2|E6ANDIZOlAK44C b_juncea 59 514 LYD354 b_junceall0v2 E6ANDIZ01ALST2 b_juncea 60 515 LYD355 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AM1M7 b_juncea 61 516 LYD356 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AR3Y3 b_juncea 62 517 LYD357 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AUOCH b_juncea 63 518 LYD358 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AUG5K b_juncea 64 519 LYD359 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AVIGM b_juncea 65 520 LYD360 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BHOKJ b_juncea 66 521 LYD361 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BIDFA b_juncea 67 522 LYD362 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01C68KB b_juncea 68 523 LYD364 b_juncea|10v2|E6ANDIZOlET44E b_juncea 69 524 LYD365 b_junceal|10v2|E6ANDIZOlEWUI0 b_juncea 70 525 LYD366 b_juncea|10v2|E6ANDIZO2FS13L b_juncea 71 526 LYD367 b_junceal|10v2|E6ANDIZO2GKPXS b_juncea 72 527 LYD368 b_junceal|10v2|OXBJ1SLX00002741D1_T1 b_juncea 73 528 LYD370 barley|10v2|AV834829 cevada 74 529 LYD371 barley|10v2|BJ450532 cevada 75 530 LYD372 canola|10v1|CD828626 canola 76 531 LYD375 canola|10v1|DY011663 canola 77 532 LYD376 canola|10v1|ES964015 canola 78 533 LYD377 canola|10v1|EV098360 canola 79 534 LYD378 canola|10v1|EV114958 canola 80 535 LYD379 canola|10v1|EV129887 canola 81 536 LYD380 cotton|10v1|barbadense IBE054896 algodão 82 537 LYD381 cotton|10v1|AI727565 algodão 83 538 LYD382 cotton|10v2|AI726887 algodão 84 539 LYD383 cotton|10v2|BG447338 algodão 85 540 LYD385 cotton|10v2|DN799940 algodão 86 541 LYD386 cotton|10v2|DN804420 algodão 87 542 LYD387 cotton|10v2|DT466425 algodão 88 543 LYD388 cotton|10v2|EX167553 algodão 89 544 LYD390 cotton|gb164|AI055341 algodão 90 545 LYD391 maize|10v1|AA011869 milho 91 546 LYD392 maize|10v1|BE512624 milho 92 547 LYD393 medicago|09v1|AI974481 medicago 93 548 LYD395 medicago|09v1|AL379818 medicago 94 549 LYD396 medicago|09v1|AW256719 medicago 95 550 LYD397 medicago|09v1|AW257291 medicago 96 551 LYD398 medicago|09v1|AW329709 medicago 97 552 LYD399 medicago|09v1|AW688882 medicago 98 553 LYD401 medicago|09v1|AW690536 medicago 99 554 LYD402 medicago|09v1|AW694333 medicago 100 555 LYD403 medicago|09v1|AW698677 medicago 101 556 LYD404 medicago|09v1|AW736500 medicago 102 557 LYD405 medicago|09v1|AW775077 medicago 103 558 LYD407 medicago|09v1|BE322971 medicago 104 559 LYD408 medicago|09v1|BE324051 medicago 105 560 LYD409 medicago|09v1|BF521188 medicago 106 561 LYD410 medicago109v1K452469 medicago 107 562 LYD413 medicago|09v1|BQ124797 medicago 108 563 LYD414 medicago|09v1|BQ157221 medicago 109 564 LYD415 medicago|09v1|CX516971 medicago 110 565

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SEQ ID SEQ ID Nome do Nome do Agrupamento Organismo NO: do NO: do Gene Polin. Polip. LYD359 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01AVIGM b_juncea 217 668 LYD360 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01BHOKJ b_juncea 218 669 LYD361 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01BIDFA b_juncea 219 670 LYD364 b_junceal|10v2|E6ANDIZOlET44E b_juncea 220 671 LYD365 b_junceal|10v2|E6ANDIZOlEWUI0 b_juncea 221 672 LYD366 b_junceal|10v2|E6ANDIZO2FS13L b_juncea 222 673 LYD367 b_junceal|10v2|E6ANDIZO2GKPXS b_juncea 223 674 LYD371 barley|10v2|BJ450532 cevada 224 675 LYD376 canola|10v1|ES964015 canola 226 676 LYD377 canola|10v1|EV098360 canola 227 677 LYD378 canola|10v1|EV114958 canola 228 678 LYD380 cotton|10v1|barbadense IBE054896 algodão 230 679 LYD383 cotton|10v2|BG447338 algodão 231 680 LYD388 cotton|10v2|EX167553 algodão 232 681 LYD390 cotton|gb164|A1055341 algodão 233 682 LYD413 medicago|09v1|BQ124797 medicago 234 683 LYD417 medicago|09v1|LAL373168 medicago 235 684 LYD418 medicago|09v1|LAW688750 medicago 236 685 LYD421 medicago|09v1|LB1271813 medicago 238 686 LYD422 medicago|09v1|MT454X026824 medicago 239 687 LYD431 sorghum|09v1|SB05G020810 sorgo 240 688 LYD434 sorghum|09v1|SB07G019310 sorgo 241 689 LYD443 soybean|11v1|GLYMA04G41020 soja 242 690 LYD446 soybean|11v1|GLYMA06G17910 soja 243 691 LYD448 soybean|11v1|GLYMA07G08010 soja 244 692 LYD458 soybean|11v1|GLYMA13G22110 soja 245 693 LYD461 soybean|11v1|GLYMA15G37980 soja 246 694 LYD471 soybean|11v1|GLYMA20G38820 soja 247 695 LYD483 tomato|10v1|AW738746 tomate 250 696 LYD495 wheat|gb164|BG604441 trigo 252 697 LYD497 b_junceal|10v2|E6ANDIZOlAJCUK b_juncea 253 698 LYD499 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01B9PEA b_juncea 254 699 LYD500 b_junceal|10v2|E6ANDIZO2FZU2Y2 b_juncea 255 700 LYD501 b_junceal|10v2|E6ANDIZO2G7OKP b_juncea 256 701 LYD514 soybean|11v1|GLYMA05G04990 soja 257 702 LYD496 arabidopsis|10v1|AT1G58235 arabidopsis 258 LYD289 arabidopsis|10v1|AT1G02040 arabidopsis 259 456 LYD290 arabidopsis|10v1|AT1G09560 arabidopsis 260 457 LYD291 arabidopsis|10v1|AT1G10970 arabidopsis 261 458 LYD292 arabidopsis|10v1|AT1G13740 arabidopsis 262 459 LYD293 arabidopsis|10v1|AT1G14620 arabidopsis 263 460 LYD294 arabidopsis|10v1|AT1G27300 arabidopsis 264 461 LYD295 arabidopsis|10v1|AT1G27900 arabidopsis 265 462 LYD296 arabidopsis|10v1|AT1G30820 arabidopsis 266 463 LYD298 arabidopsis|10v1|AT1G55910 arabidopsis 268 465 LYD299 arabidopsis|10v1|AT1G61600 arabidopsis 269 466 LYD300 arabidopsis|10v1|AT1G61790 arabidopsis 270 467 LYD301 arabidopsis|10v1|AT1G74790 arabidopsis 271 468 LYD302 arabidopsis|10v1|AT1G77060 arabidopsis 272 469 LYD303 arabidopsis|10v1|AT2G01710 arabidopsis 273 470 LYD304 arabidopsis|10v1|AT2G03810 arabidopsis 274 471 LYD305 arabidopsis|10v1|AT2G05220 arabidopsis 275 472 LYD307 arabidopsis|10v1|AT2G17990 arabidopsis 277 474 LYD309 arabidopsis|10v1|AT2G40020 arabidopsis 279 476 LYD311 arabidopsis|10v1|AT2G40510 arabidopsis 281 478 LYD312 arabidopsis|10v1|AT2G42770 arabidopsis 282 479

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SEQ ID SEQ ID Nome do Nome do Agrupamento Organismo NO: do NO: do Gene Polin. Polip. LYD313 arabidopsis|10v1|AT3G04620 arabidopsis 283 480 LYD316 arabidopsis|10v1|AT3G09030 arabidopsis 285 482 LYD318 arabidopsis|10v1|AT3G11900 arabidopsis 286 483 LYD319 arabidopsis|10v1|AT3G14070 arabidopsis 287 484 LYD320 arabidopsis|10v1|AT3G15810 arabidopsis 288 485 LYD321 arabidopsis|10v1|AT3G18750 arabidopsis 289 486 LYD322 arabidopsis|10v1|AT3G21190 arabidopsis 290 487 LYD323 arabidopsis|10v1|AT3G44280 arabidopsis 291 488 LYD324 arabidopsis|10v1|AT3G47860 arabidopsis 292 489 LYD325 arabidopsis|10v1|AT3G49390 arabidopsis 293 490 LYD326 arabidopsis|10v1|AT3G49490 arabidopsis 294 491 LYD327 arabidopsis|10v1|AT3G51895 arabidopsis 295 492 LYD328 arabidopsis|10v1|AT3G59210 arabidopsis 296 493 LYD329 arabidopsis|10v1|AT3G62270 arabidopsis 297 494 LYD330 arabidopsis|10v1|AT4G13070 arabidopsis 298 495 LYD331 arabidopsis|10v1|AT4G17440 arabidopsis 299 496 LYD332 arabidopsis|10v1|AT4G35110 arabidopsis 300 497 LYD334 arabidopsis|10v1|AT5G03870 arabidopsis 301 498 LYD335 arabidopsis|10v1|AT5G04140 arabidopsis 302 499 LYD337 arabidopsis|10v1|AT5G11740 arabidopsis 303 500 LYD338 arabidopsis|10v1|AT5G12410 arabidopsis 304 501 LYD339 arabidopsis|10v1|AT5G13560 arabidopsis 305 502 LYD340 arabidopsis|10v1|AT5G16420 arabidopsis 306 503 LYD341 arabidopsis|10v1|AT5G36700 arabidopsis 307 504 LYD342 arabidopsis|10v1|AT5G44680 arabidopsis 308 505 LYD343 arabidopsis|10v1|AT5G46150 arabidopsis 309 506 LYD344 arabidopsis|10v1|AT5G64840 arabidopsis 310 507 LYD346 b_juncea|10v2|BJ1SLX00003156 b_juncea 311 508 LYD355 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AM1M7 b_juncea 319 516 LYD362 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01C68KB b_juncea 326 523 LYD368 b_junceal|10v2|OXBJ1SLX00002741D1T1 b_juncea 331 528 LYD372 canola|10v1|CD828626 canola 333 531 LYD376 canola|10v1|ES964015 canola 335 533 LYD380 cotton|10v1|barbadense IBE054896 algodão 339 537 LYD395 medicago|09v1|AL379818 medicago 350 549 LYD399 medicago|09v1|AW688882 medicago 354 553 LYD401 medicago|09v1|AW690536 medicago 355 554 LYD402 medicago|09v1|AW694333 medicago 356 555 LYD407 medicago|09v1|BE322971 medicago 360 559 LYD414 medicago|09v1|BQ157221 medicago 365 564 LYD423 sorghum|09v1|SB01G027910 sorgo 373 573 LYD424 sorghum|09v1|SB01G046300 sorgo 374 574 LYD425 sorghum|09v1|SB02G004290 sorgo 375 575 LYD427 sorghum|09v1|SB03G025240 sorgo 376 576 LYD431 sorghum|09v1|SB05G020810 sorgo 378 578 LYD432 sorghum|09v1|SB06G021780 sorgo 379 579 LYD433 sorghum|09v1|SB07G014630 sorgo 380 580 LYD434 sorghum|09v1|SB07G019310 sorgo 381 581 LYD435 sorghum|09v1|SB07G019840 sorgo 382 582 LYD437 soybean|11v1|GLYMA01G09460 soja 384 584 LYD438 soybean|11v1|GLYMA02G33320 soja 385 585 LYD439 soybean|11v1|GLYMA03G34340 soja 386 586 LYD440 soybean|11v1|GLYMA03G40870 soja 387 587 LYD441 soybean|11v1|GLYMA04G36500 soja 388 588 LYD442 soybean|11v1|GLYMA04G39480 soja 389 589 LYD443 soybean|11v1|GLYMA04G41020 soja 390 590

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SEQ ID SEQ ID Nome do Nome do Agrupamento Organismo NO: do NO: do Gene Polin. Polip. LYD445 soybean|11v1|GLYMA06G03510 soja 391 591 LYD448 soybean|11v1|GLYMA07G08010 soja 393 594 LYD450 soybean|11v1|GLYMA09G26770 soja 395 596 LYD451 soybean|11v1|GLYMA09G29610 soja 396 597 LYD453 soybean|11v1|GLYMA11G01120 soja 398 599 LYD454 soybean|11v1|GLYMA11G03570 soja 399 600 LYD458 soybean|11v1|GLYMA13G22110 soja 402 603 LYD459 soybean|11v1|GLYMA13G23920 soja 403 604 LYD460 soybean|11v1|GLYMA13G28620 soja 404 605 LYD461 soybean|11v1|GLYMA15G37980 soja 405 606 LYD465 soybean|11v1|GLYMA17G18250 soja 407 608 LYD466 soybean|11v1|GLYMA18G49340 soja 408 609 LYD467 soybean|11v1|GLYMA19G14700 soja 409 610 LYD468 soybean|11v1|GLYMA19G36240 soja 410 611 LYD469 soybean|11v1|GLYMA19G38830 soja 411 612 LYD471 soybean|11v1|GLYMA20G38820 soja 413 614 LYD472 soybean|gb168|AW348492 soja 414 615 LYD473 soybean|gb168|BE661322 soja 415 616 LYD474 sunflower|10v1|CD849185 girassol 416 617 LYD475 tomato|09v1|A1485596 tomate 417 618 LYD477 tomato|09v1|BP884530 tomate 418 619 LYD478 tomato|10v1|A1483112 tomate 419 620 LYD479 tomato|10v1|A1484249 tomate 420 621 LYD481 tomato|10v1|A1771986 tomate 422 623 LYD482 tomato|10v1|A1777950 tomate 423 624 LYD484 tomato|10v1|AW929870 tomate 425 626 LYD489 tomato|10v1|BG131472 tomate 427 628 LYD491 tomato|10v1|IBM061560 tomate 428 629 LYD492 tomato|10v1|DB714406 tomate 429 630 LYD495 wheat|gb164|BG604441 trigo 430 631 LYD498 b_junceal|10v2|E6ANDIZO lAJQJC b_juncea 432 633 LYD499 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01B9PEA b_juncea 433 634 LYD500 b_junceal|10v2|E6ANDIZO2FZU2Y2 b_juncea 434 635 LYD503 maize|10v1|A1637036 milho 437 638 LYD504 medicago|09v1|AA660909 medicago 438 639 LYD506 medicago|09v1|BE239698 medicago 440 641 LYD507 sorghum|09v1|SB01G017330 sorgo 441 642 LYD508 sorghum|09v1|SB02G014460 sorgo 442 643 LYD509 sorghum|09v1|SB02G028300 sorgo 443 644 LYD510 sorghum|09v1|SB09G025320 sorgo 444 645 LYD511 soybean|11v1|BE660230 soja 445 646 LYD512 soybean|11v1|GLYMA03G36420 soja 446 647 LYD513 soybean|11v1|GLYMA03G39480 soja 447 648 LYD514 soybean|11v1|GLYMA05G04990 soja 448 649 LYD515 soybean|11v1|GLYMA07G36970 soja 449 650 LYD516 soybean|11v1|GLYMA13G24040 soja 450 651 LYD517 soybean|11v1|GLYMA15G06930 soja 451 652 LYD519 soybean|gb168|AW686841 soja 453 654 LYD297 arabidopsis|10v1|AT1G51440 arabidopsis 267 703 LYD306 arabidopsis|10v1|AT2G07674 arabidopsis 276 704 LYD308 arabidopsis|10v1|AT2G37478 arabidopsis 278 705 LYD310 arabidopsis|10v1|1AT2G40300 arabidopsis 280 706 LYD315 arabidopsis|10v1|AT3G05390 arabidopsis 284 707 LYD347 b_juncea|10v2|BJ1SLX00219277D1 b_juncea 312 708 LYD348 b_junceal|10v2|BJ1SLX01241733D1 b_juncea 313 709 LYD349 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01A0PVA b_juncea 314 710

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SEQ ID SEQ ID Nome do Nome do Agrupamento Organismo NO: do NO: do Gene Polin. Polip. LYD351 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01A2WXZ b_juncea 315 711 LYD352 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A7124 b_juncea 316 712 LYD353 b_junceal|10v2|E6ANDIZOlAK44C b_juncea 317 713 LYD354 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01ALST2 b_juncea 318 714 LYD356 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01AR3Y3 b_juncea 320 715 LYD357 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01AUOCH b_juncea 321 716 LYD358 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01AUG5K b_juncea 322 717 LYD359 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01AVIGM b_juncea 323 718 LYD360 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01BHOKJ b_juncea 324 719 LYD361 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01BIDFA b_juncea 325 720 LYD364 b_junceal|10v2|E6ANDIZOlET44E b_juncea 327 721 LYD365 b_junceal|10v2|E6ANDIZOlEWUI0 b_juncea 328 722 LYD366 b_junceal|10v2|E6ANDIZO2FS13L b_juncea 329 723 LYD367 b_junceal|10v2|E6ANDIZO2GKPXS b_juncea 330 724 LYD370 barley|10v2|AV834829 cevada 332 725 LYD375 canola|10v1|DY011663 canola 334 726 LYD377 canola|10v1|EV098360 canola 336 727 LYD378 canola|10v1|EV114958 canola 337 728 LYD379 canola|10v1|EV129887 canola 338 729 LYD382 cotton|10v2|A1726887 algodão 340 730 LYD383 cotton|10v2|BG447338 algodão 341 731 LYD385 cotton|10v2|DN799940 algodão 342 732 LYD386 cotton|10v2|DN804420 algodão 343 733 LYD387 cotton|10v2|DT466425 algodão 344 734 LYD388 cotton|10v2|EX167553 algodão 345 735 LYD390 cotton|gb164|A1055341 algodão 346 736 LYD391 maize|10v1|AA011869 milho 347 737 LYD392 maize|10v1|BE512624 milho 348 738 LYD393 medicago|09v1|A1974481 medicago 349 739 LYD396 medicago|09v1|AW256719 medicago 351 740 LYD397 medicago|09v1|AW257291 medicago 352 741 LYD398 medicago|09v1|AW329709 medicago 353 742 LYD403 medicago|09v1|AW698677 medicago 357 743 LYD404 medicago|09v1|AW736500 medicago 358 744 LYD405 medicago|09v1|AW775077 medicago 359 745 LYD408 medicago|09v1|BE324051 medicago 361 746 LYD409 medicago|09v1|BF521188 medicago 362 747 LYD410 medicago|09v1|K452469 medicago 363 748 LYD413 medicago|09v1|BQ124797 medicago 364 749 LYD415 medicago|09v1|CX516971 medicago 366 750 LYD416 medicago|09v1|LAJ388869 medicago 367 751 LYD417 medicago|09v1|LAL373168 medicago 368 752 LYD418 medicago|09v1|LAW688750 medicago 369 753 LYD419 medicago|09v1|LAW698759 medicago 370 754 LYD420 medicago|09v1|LAW776476 medicago 371 755 LYD422 medicago|09v1|MT454X026824 medicago 372 756 LYD428 sorghum|09v1|SB04G002930 sorgo 377 757 LYD436 sorghum|09v1|SB09G003870 sorgo 383 758 LYD446 soybean|11v1|GLYMA06G17910 soja 392 759 LYD449 soybean|11v1|GLYMA07G10060 soja 394 760 LYD452 soybean|11v1|GLYMA09G31720 soja 397 761 LYD455 soybean|11v1|GLYMA11G11560 soja 400 762 LYD456 soybean|11v1|GLYMA12G01770 soja 401 763 LYD462 soybean|11v1|GLYMA16G04350 soja 406 764 LYD470 soybean|11v1|GLYMA19G43610 soja 412 765 LYD480 tomato|10v1|A1771275 tomate 421 766

178 / 378

SEQ ID SEQ ID Nome do Nome do Agrupamento Organismo NO: do NO: do Gene Polin. Polip. LYD483 tomato|10v1|AW738746 tomate 424 767 LYD487 tomato|10v1|BG127385 tomate 426 768 LYD497 b_junceal|10v2|E6ANDIZOlAJCUK b_juncea 431 769 LYD501 b_junceal|10v2|E6ANDIZO2G7OKP b_juncea 435 770 LYD502 cotton|10v2|DW503396 algodão 436 771 LYD505 medicago|09v1|AJ388789 medicago 439 772 LYD518 soybean|11v1|GLYMA18G48880 soja 452 773 LYD520 soybean|gb168|FG994976 soja 454 774 LYD496 arabidopsis|10v1|AT1G58235 arabidopsis 455 Tabela 53: São providos os genes identificados, sua anotação, organismo e identificadores de sequência de polinucleotídeo e polipeptídeo. “polinucl.” = polinucleotídeo; “polipep.” = polipeptídeo.

EXEMPLO 13

IDENTIFICAÇÃO DE SEQUÊNCIAS HOMÓLOGAS QUE AUMENTAM O RENDIMENTO DE SEMENTE, RENDIMENTO DE ÓLEO, TAXA DE CRESCIMENTO, CONTEÚDO DE ÓLEO, RENDIMENTO DE FIBRA, QUALIDADE DA FIBRA, BIOMASSA, VIGOR, ABST E/OU NUE DE UMA PLANTA

[00522] Os conceitos de ortologia e paralogia foram recentemente aplicados para definições e classificações funcionais na escala de comparações de genoma inteiro. Os ortólogos e parálogos constituem dois tipos principais de homólogos: Os primeiros evoluíram a partir de um ancestral comum pela especialização e os últimos estão relacionados pelos eventos de duplicação. É assumido que os parálogos que surgem a partir de eventos de duplicação antigos são prováveis de terem divergido na função enquanto que os ortólogos verdadeiros são mais prováveis de reterem função idêntica ao longo do tempo evolucionário.

[00523] Para identificar ortólogos putativos dos genes que afetam o rendimento da planta, rendimento de óleo, conteúdo de óleo, rendimento de semente, taxa de crescimento, vigor, biomassa, tolerância ao estresse abiótico e/ou eficiência no uso de nitrogênio, todas as sequências foram alinhadas usando o BLAST (Ferramenta Básica de Busca de Alinhamento Local (Basic Local Alignment Search Tool)). As sequências suficientemente similares foram tentativamente agrupadas. Estes ortólogos putativos foram

179 / 378 adicionalmente organizados sob um Filograma - um diagrama de ramificação (árvore) assumida ser uma representação das relações evolucionárias entre a taxa biológica. Os grupos ortólogos putativos foram analisados de acordo com a sua concordância com o filograma e nos casos de discordâncias estes grupos ortólogos foram decompostos consequentemente.

[00524] Os dados de expressão foram analisados e as bibliotecas de EST foram classificadas usando um vocabulário fixo de termos personalizados tais como estágios desenvolvimentais (por exemplo, genes mostrando perfil de expressão similar através do desenvolvimento com suprarregulagem em estágio específico, tal como no estágio de enchimento de semente) e/ou órgão de planta (por exemplo, genes mostrando perfil de expressão similar através de seus órgãos com suprarregulagem em órgãos específicos tais como semente). As anotações de todos os ESTs agrupados para um gene foram analisadas estatisticamente comparando-se a sua frequência no agrupamento versus a sua abundância na base de dados, permitindo a construção de um perfil de expressão numérico e gráfico deste gene, que é chamado de “expressão digital”. A justificativa de usar estes dois métodos complementares com métodos de estudo de associação fenotípica de QTLs, SNPs e correlação de expressão fenotípica está fundamentada na suposição de que ortólogos verdadeiros são prováveis de reter função idêntica ao longo do tempo evolucionário. Estes métodos proveem conjuntos diferentes de indicações nas similaridades de função entre dois genes homólogos, similaridades nos aminoácidos idênticos ao nível de sequência nos domínios de proteína e similaridade nos perfis de expressão.

[00525] A busca e identificação de genes homólogos envolve a triagem de informação de sequência disponível, por exemplo, nas bases de dados públicas tais como a Base de Dados de DNA do Japão (DDBJ), Genbank e a Base de Dados de Sequências de Ácidos Nucléicos de Laboratório de Biologia Molecular Européia (EMBL) ou versões das mesmas ou a base de

180 / 378 dados MIPS. Vários algoritmos de busca diferentes foram desenvolvidos, incluindo, mas não limitados ao conjunto de programas aludido como programas BLAST. Existem cinco implementações de BLAST, três planejadas para consultas de sequência de nucleotídeos (BLASTN, BLASTX e TBLASTX) e duas planejadas para consultas de sequência de proteína (BLASTP e TBLASTN) (Coulson, Trends em Biotechnology: 76-80, 1994; Birren et al., Genome Analysis, I: 543, 1997). Tais métodos envolvem alinhamento e comparação de sequências. O algoritmo BLAST calcula a identidade de sequência percentual e realiza uma análise estatística da similaridade entre as duas sequências. O software para realizar a análise BLAST está publicamente disponível através do National Center for Biotechnology Information. Outros de tais software ou algoritmos são GAP, BESTFIT, FASTA e TFASTA. GAP usa o algoritmo de Needleman e Wunsch (J. Mol. Biol. 48: 443-453, 1970) para achar o alinhamento de duas sequências completas que maximize o número de combinações e minimiza o número de lacunas.

[00526] Os genes homólogos podem pertencer à mesma família de gene. A análise de uma família de gene pode ser realizada usando análise de similaridade de sequência. Para realizar esta análise pode-se usar programas padrão para alinhamentos múltiplos por exemplo Clustal W. Uma árvore de junção de vizinhos das proteínas homólogas aos genes nesta invenção pode ser usada para prover uma visão geral de relações estruturais e ancestrais. A identidade de sequência pode ser calculada usando um programa de alinhamento como descrito acima. É esperado que outras plantas carregarão um gene funcional similar (ortólogo) ou uma família de genes similares e estes genes proverão o mesmo fenótipo preferido como os genes aqui apresentados. Vantajosamente, estes membros da família podem ser úteis nos métodos da invenção. Os exemplos de outras plantas são aqui incluídos mas não limitados a Cevada (Hordeum vulgare), Arabidopsis (Arabidopsis

181 / 378 thaliana), Milho (Zea mays), Algodão (Gossypium), Colza (Brassica napus), Arroz (Oryza sativa), Cana de Açúcar (Saccharum officinarum), Sorgo (Sorghum bicolor), Soja (Glycine max), Girassol (Helianthus annuus), Tomate (Lycopersicon esculentum), Trigo (Triticum aestivum).

[00527] As análises mencionadas acima para homologia de sequência podem ser realizadas em uma sequência de comprimento completo, mas também pode ser fundamentada em uma comparação de certas regiões tais como domínios conservados. A identificação de tais domínios, também estaria bem dentro da domínio da pessoa versada na técnica e envolveria, por exemplo, um formato legível por computador dos ácidos nucléicos da presente invenção, o uso de programas de software de alinhamento e o uso de informação publicamente disponível sobre domínios de proteína, motivos e caixas conservados. Esta informação está disponível nas bases de dados PRODOM (Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) biochem (dot) ucl (dot) ac (dot) uk/bsm/dbbrowser/protocol/prodomqry (dot) html), PIR (Hypertext Transfer Protocol://pir (dot) Georgetown (dot) edu/) ou Pfam (Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) Sanger (dot) ac (dot) uk/Software/Pfam/). Os programas de análise de sequência planejados para a busca de motivo podem ser usados para a identificação de fragmentos, regiões e domínios conservados como mencionados acima. Os programas de computador preferidos incluem, mas não são limitados ao MEME, SIGNALSCAN e GENESCAN.

[00528] Uma pessoa versada na técnica pode usar as sequências homólogas aqui providas para achar sequências similares em outras espécies e outros organismos. Os homólogos de uma proteína abrangem, peptídeos, oligopeptídeos, polipeptídeos, proteínas e enzimas tendo substituições, deleções e/ou inserções de aminoácido relativas à proteína não modificada em questão e tendo atividade biológica e funcional similares como a proteína não modificada a partir da qual eles são derivados. Para produzir tais homólogos,

182 / 378 aminoácidos da proteína podem ser substituídos por outros aminoácidos tendo propriedades similares (mudanças conservativas, tais como hidrofobicidade, hidrofilicidade, antigenicidade, propensão para formar ou decompor estruturas α-helicoidais ou estruturas de folha β similares). As tabelas de substituição conservativas são bem conhecidas na técnica (ver por exemplo Creighton (1984) Proteins. W.H. Freeman and Company). Os homólogos de um ácido nucléico abrangem ácidos nucléicos tendo substituições, deleções e/ou inserções de nucleotídeos relativas ao ácido nucléico não modificadas em questão e tendo atividade biológica e funcional similares como o ácido nucléico não modificado a partir do qual são derivados.

[00529] A Tabela 54, abaixo, lista um resumo de sequências ortólogas e homólogas das sequências de polinucleotídeos e sequências polipeptídeos apresentadas na Tabela 53 acima, que foram identificadas a partir das bases de dados usando o software BLAST da NCBI (por exemplo, usando os algoritmos Blastp e tBlastn) e needle (pacote EMBOSS) como sendo pelo menos 80% homólogas aos polinucleotídeos e polipeptídeos selecionados e que são esperadas aumentar o rendimento da planta, rendimento de semente, rendimento de óleo, conteúdo de óleo, taxa de crescimento, rendimento de fibra, qualidade da fibra, biomassa, vigor, ABST e/ou NUE de uma planta. Tabela 54 Polinucleotídeos e polipeptídeos homólogos que podem aumentar o rendimento da planta, rendimento de semente, rendimento de óleo, conteúdo de óleo, taxa de crescimento, rendimento de fibra, qualidade da fibra, biomassa, vigor, ABST e/ou NUE de uma planta Hom Polin. Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden. Algor. ID Nome do Gene NO: ID glob. NO: NO: 775 LYD289 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL000025_P1 8385 456 97,5 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJGI11009 776 LYD289 8386 456 94,7 globlastp 026_P1 thellungiella_parvulum|11v1|EPPRD006110 777 LYD289 8387 456 94,2 globlastp _P1 778 LYD289 b_rapa|gb162|EX015582_P1 8388 456 92,2 globlastp 779 LYD289 canola|10v1|CD838013 8389 456 92,2 globlastp

183 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 780 LYD289 canola|11v1|X70976_P1 8389 456 92,2 globlastp 781 LYD289 canola|10v1|CD838346 8390 456 91,9 globlastp 782 LYD289 canola|11v1|EE392267_P1 8391 456 87,3 globlastp 783 LYD289 radish|gb164|EV524997 8392 456 85,7 globlastp 784 LYD289 clementine|11v1|CV885474_P1 8393 456 80,4 globlastp 784 LYD289 orange|11v1|CV885474_P1 8393 456 80,4 globlastp 785 LYD289 citrus|gb166|CN181683_P1 8393 456 80,4 globlastp 786 LYD290 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL000925_P1 8394 457 96,8 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111006 787 LYD290 8395 457 91,0 globlastp 296_P1 788 LYD290 canola|11v1|EE463735_P1 8396 457 89,0 globlastp 789 LYD290 canola|10v1|CX281813 8397 457 88,6 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP000414 790 LYD290 8398 457 87,8 globlastp _P1 791 LYD290 radish|gb164|EW714848 8399 457 87,7 globlastp 792 LYD290 radish|gb164|EX764242 8400 457 87,7 globlastp 793 LYD290 radish|gb164|EV528912 8401 457 87,2 globlastp 794 LYD290 canola|10v1|CD812241 8402 457 86,5 globlastp 795 LYD290 canola|11v1|EE459182_P1 8402 457 86,5 globlastp 796 LYD290 radish|gb164|EV535180 8403 457 86,3 globlastp 797 LYD290 b_oleracea|gb161|AM385056_P1 8404 457 85,5 globlastp 798 LYD290 b_rapa|gb162|BQ790947_P1 8404 457 85,5 globlastp 799 LYD290 canola|11v1|EE423859_1)1 8405 457 85,0 globlastp 800 LYD290 canola|11v1|EV164120_P1 8405 457 85,0 globlastp 801 LYD290 canola|10v1|EE400596 8405 457 85,0 globlastp 802 LYD290 canola|11v1|EE400596_P1 8406 457 84,5 globlastp 803 LYD290 canola|11v1|SRR001111.29348_T1 8407 457 83,1 glotblastn 804 LYD291 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL001113_P1 8408 458 94,2 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP003305 805 LYD291 8409 458 89,9 globlastp _P1 806 LYD291 radish|gb164|EW714016 8410 458 86,1 globlastp 807 LYD291 canola|11v1|EE455360_P1 8411 458 85,3 globlastp 808 LYD291 canola|10v1|CD831215 8412 458 85,0 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111007 809 LYD291 8413 458 83,5 globlastp 638_P1 810 LYD291 canola|11v1|EE455394_T1 8414 458 83,4 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|BY809645_P 811 LYD291 8415 458 81,9 globlastp 1 812 LYD291 canola|11v1|AY570246_P1 8416 458 81,1 globlastp 813 LYD291 arabidopsis|10v1|AT1G60960_P1 8417 458 80,2 globlastp 814 LYD292 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL001445_T1 8418 459 96,6 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111008 815 LYD292 8419 459 86,0 globlastp 582_P1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP003439 816 LYD292 8420 459 84,3 globlastp _P1 817 LYD293 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL001542_P1 8421 460 97,9 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY811797_P 818 LYD293 8422 460 94,0 globlastp 1 819 LYD293 thellungiella_parvulum|11v1|BY811797_P1 8423 460 93,6 globlastp 820 LYD293 canola|10v1|CN828845 8424 460 92,9 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP016377 821 LYD293 8425 460 92,7 globlastp _P1 822 LYD293 canola|11v1|EE460144_P1 8426 460 92,5 globlastp 823 LYD293 canola|11v1|CN828844XX1_P1 8427 460 92,5 globlastp 824 LYD293 b_rapa|gb162|EE527596_P1 8427 460 92,5 globlastp 825 LYD293 canola|11v1|EE450219_P1 8428 460 92,4 globlastp 826 LYD293 canola|10v1|ES268763 8428 460 92,4 globlastp 827 LYD293 canola|11v1|DY002521_P1 8429 460 91,6 globlastp 828 LYD293 canola|10v1|DY002521 8430 460 91,2 globlastp 829 LYD293 b_rapa|gb162|EE519430_P1 8431 460 91,1 globlastp 830 LYD293 canola|10v1|EE423673 8432 460 90,7 globlastp

184 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 831 LYD293 canola|11v1|EE423673_P1 8432 460 90,7 globlastp 832 LYD293 radish|gb164|EV527277 8433 460 90,0 globlastp 833 LYD293 radish|gb164|EV544441 8434 460 84,0 globlastp 834 LYD294 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL002839_P1 8435 461 86,5 globlastp arabidopsis_lyrata|09v1|CRPALE007345_P 835 LYD295 8436 462 97,4 globlastp 1 thellungiella_halophilum|11v1|BY803200_P 836 LYD295 8437 462 92,9 globlastp 1 837 LYD295 canola|11v1|DY000828_P1 8438 462 91,8 globlastp 838 LYD295 thellungiella_parvulum|11v1|BY803 200_P1 8439 462 91,2 globlastp 839 LYD296 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL003210_P1 8440 463 96,8 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|B1698637_P 840 LYD296 8441 463 94,3 globlastp 1 841 LYD296 thellungiella_parvulum|11v1|B1698637_P1 8442 463 93,0 globlastp 842 LYD296 canola|11v1|ES904420_P1 8443 463 91,8 globlastp 843 LYD296 canola|11v1|EV195038_T1 8444 463 91,7 glotblastn 844 LYD296 canola|10v1|CX190497 8445 463 82,2 globlastp 845 LYD296 clementine|11v1|AU186361_P1 8446 463 80,2 globlastp 846 LYD297 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL004619_P1 8447 464 94,1 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHPRD1236 847 LYD297 8448 464 87,3 glotblastn 48_T1 thellungiella_halophilum|11v1|BY826241_P 848 LYD297 8449 464 85,4 globlastp 1 849 LYD297 thellungiella_parvulum|11v1|BY826 241_P1 8450 464 84,5 globlastp 850 LYD298 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL005061_P1 8451 465 96,6 globlastp 851 LYD298 thellungiella_parvulum|11v1|DN774820_P1 8452 465 89,7 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111005 852 LYD298 8453 465 88,5 globlastp 569_P1 853 LYD298 b_oleracea|gb161|DY018968_P1 8454 465 84,8 globlastp 854 LYD298 canolal|11v1|SRR019558,22273_P1 8455 465 83,8 globlastp 855 LYD298 radish|gb164|EV569831 8456 465 83,6 globlastp 856 LYD299 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL005797_P1 8457 466 92,5 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111022 857 LYD299 8458 466 89,7 globlastp 086_P1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP005928 858 LYD299 8459 466 87,8 globlastp _P1 859 LYD300 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL005765_P1 8460 467 98,0 globlastp 860 LYD300 thellungiella_parvulum|11v1|DN777634_P1 8461 467 89,9 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN777634_P 861 LYD300 8462 467 88,8 globlastp 1 862 LYD300 radish|gb164|EW724622 8463 467 86,4 globlastp 863 LYD300 canola|10v1|CD815396 8464 467 85,9 globlastp 864 LYD300 canola|11v1|EE420053_P1 8465 467 83,8 globlastp 865 LYD300 b_rapa|gb162|13Q791464_P1 8466 467 83,5 globlastp 866 LYD300 canola|10v1|CD813019 8467 467 83,2 globlastp 867 LYD300 canola|10v1|CD816911 8468 467 83,2 globlastp 868 LYD300 canola|11v1|CN825981_P1 8469 467 83,2 globlastp 869 LYD300 radish|gb164|EX747587 8470 467 82,2 globlastp 870 LYD301 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL007744_P1 8471 468 95,1 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY805365_P 871 LYD301 8472 468 92,0 globlastp 1 872 LYD301 thellungiella_parvulum|11v1|BY805365_P1 8473 468 90,1 globlastp 873 LYD301 canola|11v1|EE543579_P1 8474 468 87,2 globlastp 874 LYD302 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL007979_P1 8475 469 97,9 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY805311_P 875 LYD302 8476 469 95,0 globlastp 1 876 LYD302 thellungiella_parvulum|11v1|13Y805311_P1 8477 469 94,1 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111028 877 LYD302 8478 469 93,8 globlastp 715_P1 878 LYD302 canola|11v1|EE425272_P1 8479 469 93,3 globlastp 879 LYD302 b_rapa|gb162|BQ791216_P1 8480 469 93,0 globlastp

185 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 880 LYD302 canola|11v1|EE482659_P1 8481 469 93,0 globlastp 881 LYD302 radish|gb164|EW714306 8482 469 91,6 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY820865_P 882 LYD302 8483 469 84,4 globlastp 1 883 LYD302 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL002264_P1 8484 469 82,6 globlastp 884 LYD302 thellungiella_parvulum|11v1|BY820865_P1 8485 469 82,0 globlastp arabidopsis_lyrata|09v1|TMPLAT1G21440 885 LYD302 8486 469 82,0 globlastp T1_P1 885 LYD302 arabidopsis|10v1|AT1G21440_P1 8486 469 82,0 globlastp 886 LYD302 cacao|10v1|CU474081_T1 8487 469 81,5 glotblastn 887 LYD302 cotton|10v2|DT560838_T1 8488 469 81,1 glotblastn 888 LYD302 canola|11v1|EE556537XX1_P1 8489 469 81,1 globlastp 889 LYD302 canola|11v1|EE454393XX1_P1 8490 469 80,8 globlastp 890 LYD302 canola|10v1|PE554922 8491 469 80,6 globlastp 891 LYD302 b_rapa|gb162|EE523860_T1 8492 469 80,5 glotblastn 892 LYD302 radish|gb164|EW731644 8493 469 80,0 glotblastn 893 LYD303 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL016316_P1 8494 470 91,4 globlastp 894 LYD304 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL016586T1 8495 471 91,1 glotblastn 895 LYD305 arabidopsis|10v1|AT5G04800_P1 8496 472 98,6 globlastp 896 LYD305 arabidopsis|10v1|AT2G04390_P1 8497 472 97,2 globlastp 897 LYD305 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL020130_P1 8498 472 95,7 globlastp 898 LYD305 thellungiella_parvulum|11v1|BY818 903_P1 8499 472 93,6 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPPRD115633 899 LYD305 8499 472 93,6 globlastp _P1 900 LYD305 canola|11v1|EE542539_P1 8500 472 92,9 globlastp 901 LYD305 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL009483_P1 8501 472 92,9 globlastp 902 LYD305 b_rapa|gb162|BQ791494_P1 8500 472 92,9 globlastp 903 LYD305 canola|10v1|CD818148 8500 472 92,9 globlastp 904 LYD305 canola|10v1|DW997476 8500 472 92,9 globlastp 905 LYD305 canola|11v1|DW997476_P1 8500 472 92,9 globlastp 906 LYD305 canola|10v1|E174364 8500 472 92,9 globlastp 907 LYD305 canola|11v1|DY005944_P1 8500 472 92,9 globlastp 908 LYD305 b_juncea|10v2|E6ANDIZO lAKDJV_P1 8502 472 92,1 globlastp 909 LYD305 b_oleracea|gb161|AM395123_P1 8503 472 92,1 globlastp 910 LYD305 canola|10v1|CD829722 8504 472 92,1 globlastp 911 LYD305 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A3UPM_P1 8505 472 91,4 globlastp 912 LYD305 b_oleracea|gb161|DY025855_P1 8506 472 91,4 globlastp 913 LYD305 b_rapa|gb162|1-33499_P1 8507 472 91,4 globlastp 914 LYD305 canola|10v1|BQ704882 8507 472 91,4 globlastp 915 LYD305 canola|11v1|CN735924_P1 8507 472 91,4 globlastp 916 LYD305 canola|10v1|DY002163 8506 472 91,4 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000245 917 LYD305 8508 472 91,4 globlastp 2_P1 cleome_gynandra|10v1|SRR0155325000353 918 LYD305 8509 472 91,4 globlastp 4_P1 cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0000304 919 LYD305 8510 472 91,4 globlastp _P1 920 LYD305 radish|gb164|EV538469 8511 472 91,4 globlastp 921 LYD305 canola|11v1|CN730447_P1 8506 472 91,4 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY818903_P 922 LYD305 8512 472 90,7 globlastp 1 thellungiella_halophilum|11v1|DN773465_P 923 LYD305 8512 472 90,7 globlastp 1 924 LYD305 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BMO5C_P1 8513 472 90,7 globlastp 925 LYD305 cleome_spinosa|10v1|GR934344_P1 8514 472 90,7 globlastp cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0032977 926 LYD305 8515 472 90,7 globlastp _P1 927 LYD305 radish|gb164|EW723495 8516 472 90,7 globlastp 928 LYD305 thellungiella|gb167|DN773465 8512 472 90,7 globlastp 929 LYD305 thellungiella_parvulum|11v1|DN773465_P1 8517 472 90,0 globlastp 930 LYD305 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01B49UE_P1 8518 472 90,0 globlastp

186 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 931 LYD305 b_oleracea|gb161|DY026579_P1 8518 472 90,0 globlastp 932 LYD305 b_rapa|gb162|BQ790954_P1 8518 472 90,0 globlastp 933 LYD305 b_rapa|gb162|CX266502_P1 8518 472 90,0 globlastp 934 LYD305 canola|10v1|BQ704890 8518 472 90,0 globlastp 935 LYD305 canola|11v1|CN732900_P1 8518 472 90,0 globlastp 936 LYD305 canola|10v1|CD811690 8518 472 90,0 globlastp 937 LYD305 canola|10v1|CD833606 8518 472 90,0 globlastp 938 LYD305 canola|11v1|CN725771_P1 8518 472 90,0 globlastp 939 LYD305 canola|10v1|CD838146 8518 472 90,0 globlastp 940 LYD305 canola|11v1|EV013283_P1 8518 472 90,0 globlastp 941 LYD305 radish|gb164|EV547744 8519 472 90,0 globlastp 942 LYD305 radish|gb164|EX757400 8519 472 90,0 globlastp 943 LYD305 arabidopsis|10v1|AT3G10610_P1 8520 472 89,4 globlastp 944 LYD305 canolal 1 lvl 1CN731537_P1 8521 472 89,3 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP026669 945 LYD305 8522 472 88,7 globlastp _P1 946 LYD305 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL020299_P1 8523 472 88,7 globlastp 947 LYD305 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01A825A_P1 8524 472 88,6 globlastp 948 LYD305 b_junceal|10v2|E6ANDIZO lAWTB3_P1 8525 472 88,6 globlastp 949 LYD305 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01B1MYC_P1 8526 472 88,6 globlastp 950 LYD305 b_rapa|gb162|CV432393_P1 8527 472 88,6 globlastp 951 LYD305 canola|10v1|CN731537 8526 472 88,6 globlastp 952 LYD305 canola|10v1|CX195384 8528 472 88,6 globlastp 953 LYD305 radish|gb164|EW723870 8529 472 88,6 globlastp 954 LYD305 radish|gb164|1FD541521 8529 472 88,6 globlastp 955 LYD305 canola|11v1|H07655_P1 8530 472 87,9 globlastp 956 LYD305 clementine|11v1|BQ623498_P1 8531 472 87,9 globlastp 957 LYD305 b_rapa|gb162|CV544775_P1 8532 472 87,9 globlastp 958 LYD305 canola|10v1|-107655 8530 472 87,9 globlastp 959 LYD305 canola|11v1|CN830662_P1 8530 472 87,9 globlastp 960 LYD305 citrus|gb166|BQ623498_P1 8531 472 87,9 globlastp 961 LYD305 eucalyptus|11v2|CT980130_P1 8533 472 87,9 globlastp 962 LYD305 eucalyptus|gb166|CT980130 8533 472 87,9 globlastp 963 LYD305 radish|gb164|EV537169 8534 472 87,9 globlastp 964 LYD305 radish|gb164|EW725140 8535 472 87,9 globlastp 965 LYD305 radish|gb164|EX905460 8536 472 87,9 globlastp 966 LYD305 cucurbita|11v1|SRR091276X101995_P1 8537 472 87,3 globlastp 967 LYD305 cucumber|09v1|CF542153_P1 8538 472 87,3 globlastp 968 LYD305 momordica|10v1|SRR071315S0010678_P1 8539 472 87,3 globlastp 969 LYD305 canola|11v1|ES959302_P1 8540 472 87,1 globlastp 970 LYD305 orange|11v1|BQ623498_P1 8541 472 87,1 globlastp 971 LYD305 b_oleracea|gb161|DY028158_P1 8542 472 87,1 globlastp 972 LYD305 watermelon|11v1|CK758693_P1 8543 472 86,6 globlastp 973 LYD305 melon|10v1|DV634694_P1 8543 472 86,6 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111023 974 LYD305 8544 472 86,5 globlastp 897_P1 975 LYD305 radish|gb164|EV528035 8545 472 86,4 glotblastn 976 LYD305 radish|gb164|EX898193 8546 472 86,4 globlastp 977 LYD305 b_junceal|10v2|E6ANDIZO2FYL81_T1 8547 472 85,7 glotblastn 978 LYD305 nasturtiums|10v1|SRR032558S0001828 8548 472 85,2 globlastp 979 LYD305 nasturtium|10v1|SRR032558S0006197 8549 472 85,2 globlastp 980 LYD305 nasturtium|10v1|SRR032558S001988 8550 472 85,2 globlastp 981 LYD305 nasturtium|10v1|SRR032558S0037901 8548 472 85,2 globlastp 982 LYD305 eucalyptus|11v2|SRR001658X13518_P1 8551 472 85,1 globlastp 983 LYD305 b_juncea|10v2|E6ANDIZO2IJUBZ_P1 8552 472 85,0 globlastp 984 LYD305 cucurbita|11v1|SRR091276X106216_P1 8553 472 84,5 globlastp 985 LYD305 poplar|10v1|A1161459_P1 8554 472 84,4 globlastp 986 LYD305 flax|11v1|JG019933_P1 8555 472 83,7 globlastp 987 LYD305 flax|11v1|JG081511_P1 8555 472 83,7 globlastp 988 LYD305 canola|11v1|SRR019558,10631_P1 8556 472 83,6 globlastp 989 LYD305 tamarix|gb166|CN605585 8557 472 83,6 globlastp

187 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 990 LYD305 humulus|11v1|ES437765_P1 8558 472 83,3 globlastp 991 LYD305 humulus|11v1|ES654856_P1 8558 472 83,3 globlastp 992 LYD305 scabiosa|11v1|SRR063723X102091_P1 8559 472 83,3 globlastp 993 LYD305 apple|gb171|CN444753 8560 472 82,9 globlastp 994 LYD305 b_juncea|10v2|BJ1SLX00095161D1_P1 8561 472 82,9 globlastp 995 LYD305 chestnut|gb170|SRR006295S0017520_P1 8562 472 82,8 globlastp 996 LYD305 cannabis|12v1|JK496756_P1 8563 472 82,6 globlastp 997 LYD305 euphorbia|11v1|BP959159_P1 8564 472 82,6 globlastp 998 LYD305 scabiosa|11v1|SRR063723X109162_P1 8565 472 82,6 globlastp 999 LYD305 cirsium|11v1|SRR349641.107790_P1 8566 472 82,5 globlastp 1000 LYD305 iceplant|gb164|BE034284_P1 8567 472 82,4 globlastp 1001 LYD305 iceplant|gb164|BE037266_P1 8568 472 82,4 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111016 1002 LYD305 8569 472 82,3 globlastp 878_P1 1003 LYD305 aquilegia|10v2|JGIAC012114_P1 8570 472 82,3 globlastp 1004 LYD305 soybean|11v1|GLYMA02G36070 8571 472 82,3 globlastp 1005 LYD305 fagopyrum|11v1|SRR063689X110608_P1 8572 472 82,1 globlastp 1006 LYD305 fagopyrum|11v1|SRR063703X101913_P1 8572 472 82,1 globlastp 1007 LYD305 apple|11v1|CN443845_P1 8573 472 82,1 globlastp 1008 LYD305 apple|gb171|CN900285 8573 472 82,1 globlastp 1009 LYD305 beech|gb170|SRR006293 50024486_P1 8574 472 82,1 globlastp 1010 LYD305 potato|10v1|BF459686_P1 8575 472 82,1 globlastp 1011 LYD305 soybean|11v1|GLYMA10G08910 8576 472 82,1 globlastp 1012 LYD305 strawberry|11v1|CO380606 8577 472 82,1 globlastp 1013 LYD305 acacia|10v1|FS584770_P1 8578 472 81,8 globlastp 1014 LYD305 lotus|09v1|LA1967330_P1 8579 472 81,8 globlastp 1015 LYD305 papaya|gb165|AM903848_P1 8580 472 81,8 globlastp 1016 LYD305 poplar|10v1|A1162887_P1 8581 472 81,8 globlastp 1017 LYD305 primula|11v1|SRR098679X100982_P1 8582 472 81,7 globlastp 1018 LYD305 cacao|10v1|CU490530_P1 8583 472 81,7 globlastp 1019 LYD305 flax|11v1|JG021551_P1 8584 472 81,6 globlastp 1020 LYD305 cowpea|gb166|FC458752_P1 8585 472 81,6 globlastp 1021 LYD305 cowpea|gb166|FC461186_P1 8586 472 81,6 globlastp 1022 LYD305 cowpea|gb166|FG807845_P1 8585 472 81,6 globlastp 1023 LYD305 cyamopsis|10v1|IEG978086_P1 8587 472 81,6 globlastp 1024 LYD305 nuphar|gb166|CD474501_T1 8588 472 81,4 glotblastn 1025 LYD305 oil_palm|gb166|EL691751_T1 8589 472 81,4 glotblastn 1026 LYD305 flax|11v1|JG025425_P1 8590 472 81,4 globlastp 1027 LYD305 flax|11v1|JG103120_P1 8591 472 81,4 globlastp 1028 LYD305 tomato|11v1|P3G130634_P1 8592 472 81,4 globlastp 1029 LYD305 watermelon|11v1|AM718374_P1 8593 472 81,4 globlastp watermelon|11v1|VMEL078129019 1030 LYD305 8593 472 81,4 globlastp 01316_P1 1031 LYD305 cowpea|gb166|FC456716_P1 8594 472 81,4 globlastp 1032 LYD305 petunia|gb171|CV293320_P1 8592 472 81,4 globlastp 1033 LYD305 solanum_phureja|09v1|SPHBG13064 8595 472 81,4 globlastp 1034 LYD305 tomato|09v1|P3G130634 8592 472 81,4 globlastp 1035 LYD305 silene|11v1|GH293990_P1 8596 472 81,2 globlastp 1036 LYD305 heveal10v1PC601661_P1 8597 472 81,2 globlastp 1037 LYD305 lotus|09v1|LBG662465_P1 8598 472 81,2 globlastp 1038 LYD305 sunflower|10v1|CD852668 8599 472 81,2 globlastp 1039 LYD305 phyla|11v2|SRR099035X102085_P1 8600 472 81,1 globlastp 1040 LYD305 platanus|11v1|SRR096786X100931_P1 8601 472 81,1 globlastp 1041 LYD305 beet|gb162|BF011095_P1 8602 472 81,1 globlastp 1042 LYD305 cassava|09v1|DV452482_P1 8603 472 81,1 globlastp 1043 LYD305 safflower|gb162|EL407962 8604 472 81,1 globlastp 1044 LYD305 sunflower|10v1|CD850854 8605 472 81,1 globlastp 1045 LYD305 catharanthus|11v1|SRR098691X102 581_P1 8606 472 81,0 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X122851 1046 LYD305 8607 472 81,0 globlastp _P1 1047 LYD305 catharanthus|gb166|FD420801 8606 472 81,0 globlastp

188 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1048 LYD305 cotton|10v2|BF269908_P1 8608 472 81,0 globlastp 1049 LYD305 oak|10v1|PDB996387_P1 8609 472 81,0 globlastp 1050 LYD305 oak|10v1|DB997114_P1 8609 472 81,0 globlastp 1051 LYD305 oak|10v1|DN950767_P1 8610 472 81,0 globlastp 1052 LYD305 flax|11v1|JG082139_P1 8611 472 80,9 globlastp 1053 LYD305 flax|09v1|CV478169 8611 472 80,9 globlastp 1054 LYD305 flax|11v1|CV478169_P1 8611 472 80,9 globlastp 1055 LYD305 platanus|11v1|SRR096786X100640_P1 8612 472 80,8 globlastp nicotiana_benthamiana|gb162|CN74 1056 LYD305 8613 472 80,8 globlastp 1402_P1 1057 LYD305 senecio|gb170|DY658264 8614 472 80,8 globlastp 1058 LYD305 tobacco|gb162|CV016993 8613 472 80,8 globlastp 1059 LYD305 apple|11v1|CN900464_P1 8615 472 80,7 globlastp 1060 LYD305 cucurbita|11v1|SRR091276X121946_P1 8616 472 80,7 globlastp 1061 LYD305 tomato|11v1|X83421_P1 8617 472 80,7 globlastp 1062 LYD305 tripterygium|11v1|SRR098677X105 099_P1 8618 472 80,7 globlastp 1063 LYD305 apple|11v1|CN488998_P1 8615 472 80,7 globlastp 1064 LYD305 apple|gb171|CN490466 8615 472 80,7 globlastp 1065 LYD305 eggplant|10v1|FS003192_P1 8619 472 80,7 globlastp 1066 LYD305 eggplant|10v1|FS027213_P1 8620 472 80,7 globlastp 1067 LYD305 peanut|10v1|EE125258_P1 8621 472 80,7 globlastp 1068 LYD305 peanut|10v1|EE126185_P1 8621 472 80,7 globlastp 1069 LYD305 petunia|gb171|DW177127_P1 8622 472 80,7 globlastp 1070 LYD305 pigeonpea|10v1|GW352882_P1 8623 472 80,7 globlastp 1071 LYD305 potato|11v1|BG351052_P1 8620 472 80,7 globlastp 1072 LYD305 solanum_phureja|09v1|SPHX83421 8620 472 80,7 globlastp 1073 LYD305 strawberry|11v1|EX657748 8624 472 80,7 globlastp 1074 LYD305 tobacco|gb162|CV017499 8625 472 80,7 globlastp 1075 LYD305 tobacco|gb162|DV158979 8626 472 80,7 globlastp 1076 LYD305 tomato|09v1|X83421 8617 472 80,7 globlastp 1077 LYD305 zostera|10v1|SRR057351S0003834 8627 472 80,7 globlastp 1078 LYD305 euphorbia|11v1|DV131745_T1 8628 472 80,7 glotblastn 1079 LYD305 spurge|gb161|DV131745 8628 472 80,7 glotblastn 1080 LYD305 chelidonium|11v1|SRR084752X102 599_P1 8629 472 80,6 globlastp 1081 LYD305 silene|11v1|SRR096785X108850_P1 8630 472 80,6 globlastp 1082 LYD305 silene|11v1|SRR096785X111949 -P1 8631 472 80,6 globlastp 1083 LYD305 cassava|09v1|CK644179_P1 8632 472 80,6 globlastp 1084 LYD305 flaveria|11v1|SRR149244.160986_T1 8633 472 80,4 glotblastn 1085 LYD305 amsonia|11v1|SRR098688X100701_P1 8634 472 80,4 globlastp 1086 LYD305 primula|11v1|FS228389XX2_P1 8635 472 80,4 globlastp 1087 LYD305 acacia|10v1|FS588648_P1 8636 472 80,4 globlastp 1088 LYD305 lettuce|10v1|DWO80793_P1 8637 472 80,4 globlastp 1089 LYD305 prunus|10v1|CB819021 8638 472 80,4 globlastp 1090 LYD305 cacao|10v1|ICA796358_P1 8639 472 80,3 globlastp 1091 LYD305 cotton|10v2|AI728552_P1 8640 472 80,3 globlastp 1092 LYD305 cotton|10v2|E3F270777_P1 8641 472 80,3 globlastp 1093 LYD305 dandelion|10v1|DR399279 P1 8642 472 80,3 globlastp 1094 LYD305 heritiera|10v1|SRR005794S0004691_P1 8643 472 80,3 globlastp 1095 LYD305 jatropha|09v1|FM887263 T1 8644 472 80,3 glotblastn 1096 LYD305 oil_palm|gb166|EL687331 T1 8645 472 80,1 glotblastn 1097 LYD305 soybean|11v1|GLYMA20G02170 8646 472 80,1 globlastp 1098 LYD305 fagopyrum|11v1|GO496321 P1 8647 472 80,0 globlastp 1099 LYD305 fagopyrum|11v1|SRR063703X120141_P1 8648 472 80,0 globlastp 1100 LYD305 flaveria|11v1|SRR149232,355422_T1 8649 472 80,0 glotblastn 1101 LYD305 castorbean|09v1|T14820 8650 472 80,0 globlastp 1102 LYD305 castorbean|11v1|T14820_P1 8650 472 80,0 globlastp 1103 LYD305 cryptomeria|gb166|BP174480 T1 8651 472 80,0 glotblastn 1104 LYD305 cucumber|09v1|AM718374_P1 8652 472 80,0 globlastp 1105 LYD305 grape|11v1|GSVIVT01034653001_P1 8653 472 80,0 globlastp 1106 LYD305 grape|gb160|BQ796478 8653 472 80,0 globlastp 1107 LYD305 peanut|10v1|CX018157_P1 8654 472 80,0 globlastp

189 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1108 LYD306 Arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL011613_T1 8655 473 100,0 glotblastn 1109 LYD306 castorbean|11v1|RCCRP060025_P1 8656 473 91,6 globlastp 1110 LYD306 castorbean|11v1|SRR020785.392781 8656 473 91,6 globlastp 1111 LYD306 castorbean|09v1|SRR020785S0039278 8657 473 91,6 glotblastn 1112 LYD306 castorbean|11v1|EG656390_T1 8658 473 91,6 glotblastn 1113 LYD306 arroz|gb170|B1800272 8659 473 91,6 glotblastn 1114 LYD306 arroz|gb170|0S12G33922 8660 473 91,6 glotblastn 1115 LYD306 arroz gb170 0S12G33924 8659 473 91,6 glotblastn 1116 LYD306 watermelon|11v1|CLCRP052486_P1 8661 473 90,8 globlastp watermelon|11v1|VMEL10882125443088_P 1117 LYD306 8661 473 90,8 globlastp 1 1118 LYD306 cacao|10v1|CU479046 T1 8662 473 90,8 glotblastn 1119 LYD306 medicago|09v1|C0511977 T1 8663 473 90,8 glotblastn 1120 LYD306 sorghum|11v1|GFXZ85978Xl_T1 8664 473 89,9 glotblastn 1121 LYD306 grape|11v1|DV224008 T1 8665 473 89,9 glotblastn 1122 LYD306 grape|gb160|CB835105 8665 473 89,9 glotblastn 1123 LYD306 grape|11v1|CD013707_P1 8666 473 89,9 globlastp 1124 LYD306 grape|11v1|VVCRP224195_P1 8666 473 89,9 globlastp 1125 LYD306 sorghum|11v1|NC_008360_G5_CD_S_P1 8667 473 89,9 globlastp 1126 LYD306 cannabis|12v1|MDCRP002851_P1 8668 473 89,1 globlastp 1127 LYD306 lotus|09v1|CRPLJ038659_P1 8669 473 89,1 globlastp 1128 LYD306 cannabis|12v1|1SOLX00067463_T1 8670 473 89,1 glotblastn 1129 LYD306 foxtail_millet|11v3|PHY7SI020747M_T1 8664 473 89,1 glotblastn brachypodium|09v1|SRR031798S02 1130 LYD306 8664 473 89,1 glotblastn 15740_T1 1131 LYD306 cucumber|09v1|P3GI454G0029123_T1 8671 473 89,1 glotblastn 1132 LYD306 apple|11v1|CN860112_T1 8672 473 87,4 glotblastn 1133 LYD306 tomato|11v1|SRR015435S0107530_T1 8673 473 87,4 glotblastn 1134 LYD306 lotus|09v1|CRPLJ038587_P1 8674 473 82,8 globlastp 1135 LYD307 Arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL012270_P1 8675 474 95,3 globlastp 1136 LYD307 thellungiella_parvulum|11v1|DN776555_P1 8676 474 86,7 globlastp 1137 LYD307 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL022914_P1 8677 474 86,7 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN776555_P 1138 LYD307 8678 474 83,8 globlastp 1 1139 LYD307 canola|11v1|EE555154_P1 8679 474 81,1 globlastp 1140 LYD308 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL014924_P1 8680 475 92,8 globlastp 1141 LYD309 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL015272_P1 8681 476 87,8 globlastp 1142 LYD311 arabidopsis|10v1|AT2G40590_P1 8682 478 97,7 globlastp 1143 LYD311 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL015350_P1 8683 478 96,2 globlastp 1144 LYD311 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL015342_P1 8684 478 95,5 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY806508_P 1145 LYD311 8685 478 94,0 globlastp 1 1146 LYD311 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL018903_P1 8686 478 94,0 globlastp 1147 LYD311 arabidopsis|10v1|AT3G56340_P1 8687 478 94,0 globlastp 1148 LYD311 radish|gb164|EV536628 8688 478 94,0 globlastp 1149 LYD311 radish|gb164|EW716557 8689 478 94,0 globlastp 1150 LYD311 thellungiella|gb167|BY806508 8685 478 94,0 globlastp 1151 LYD311 canola|11v1|SRR341920.129494_P1 8690 478 93,2 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY802887_P 1152 LYD311 8691 478 93,2 globlastp 1 1153 LYD311 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A606W_P1 8692 478 93,2 globlastp 1154 LYD311 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01E3H5I_P1 8690 478 93,2 globlastp 1155 LYD311 b_oleracea|gb161|DY027147_P1 8690 478 93,2 globlastp 1156 LYD311 b_oleracea|gb161|DY029981_P1 8690 478 93,2 globlastp 1157 LYD311 b_rapa|gb162|CV433223_P1 8693 478 93,2 globlastp 1158 LYD311 b_rapa|gb162|CX270079_P1 8690 478 93,2 globlastp 1159 LYD311 canola|10v1|CN732251 8693 478 93,2 globlastp 1160 LYD311 canola|11v1|CN732251_P1 8693 478 93,2 globlastp 1161 LYD311 canola|10v1|CX188367 8690 478 93,2 globlastp 1162 LYD311 canola|11v1|CN731810_P1 8690 478 93,2 globlastp 1163 LYD311 radish|gb164|EV539488 8694 478 93,2 globlastp

190 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1164 LYD311 thellungiella|gb167|BY802887 8691 478 93,2 globlastp 1165 LYD311 canola|11v1|CN737290_P1 8690 478 93,2 globlastp 1166 LYD311 canola|11v1|SRR023612.8557_P1 8695 478 92,5 globlastp 1167 LYD311 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A5DG9_P1 8696 478 92,5 globlastp 1168 LYD311 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AUBWP_P1 8696 478 92,5 globlastp 1169 LYD311 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BIKHO_P1 8695 478 92,5 globlastp 1170 LYD311 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BRZS9_P1 8696 478 92,5 globlastp 1171 LYD311 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BX20L_P1 8697 478 92,5 globlastp 1172 LYD311 b_oleracea|gb161|AM061215_P1 8698 478 92,5 globlastp 1173 LYD311 b_rapa|gb162|CX271994_P1 8695 478 92,5 globlastp 1174 LYD311 brapa|gb162|1-33657_P1 8695 478 92,5 globlastp 1175 LYD311 canola|10v1|CD812488 8698 478 92,5 globlastp 1176 LYD311 canola|11v1|CN726208_P1 8698 478 92,5 globlastp 1177 LYD311 canola|11v1|CN731199_P1 8695 478 92,5 globlastp 1178 LYD311 canola|10v1|CD820909 8695 478 92,5 globlastp 1179 LYD311 canola|11v1|CN732218_P1 8695 478 92,5 globlastp 1180 LYD311 canola|10v1|CD830244 8699 478 92,5 globlastp 1181 LYD311 canola|11v1|CN726370_P1 8699 478 92,5 globlastp 1182 LYD311 radish|gb164|EV528350 8700 478 92,5 globlastp 1183 LYD311 radish|gb164|EW734878 8701 478 92,5 globlastp 1184 LYD311 radish|gb164|EX749032 8701 478 92,5 globlastp 1185 LYD311 radish|gb164|EX898202 8701 478 92,5 globlastp 1186 LYD311 canola|11v1|CN730564_P1 8702 478 91,7 globlastp 1187 LYD311 canola|11v1|SRR019556.44515_P1 8702 478 91,7 globlastp 1188 LYD311 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A3IFX_P1 8702 478 91,7 globlastp 1189 LYD311 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A6ZUM_P1 8703 478 91,7 globlastp 1190 LYD311 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AG1VJ_P1 8704 478 91,7 globlastp 1191 LYD311 b_juncea|10v2|E6ANDIZOlAIISG_P1 8705 478 91,7 globlastp 1192 LYD311 b_oleracea|gb161|DY025829_P1 8702 478 91,7 globlastp 1193 LYD311 b_rapa|gb162|CV433354_P1 8704 478 91,7 globlastp 1194 LYD311 brapa|gb162|CX265932_P1 8702 478 91,7 globlastp 1195 LYD311 canola|10v1|CD811936 8702 478 91,7 globlastp 1196 LYD311 canola|11v1|CN729043_P1 8702 478 91,7 globlastp 1197 LYD311 canola|10v1|CD811948 8702 478 91,7 globlastp 1198 LYD311 radish|gb164|EV525015 8706 478 91,7 globlastp 1199 LYD311 radish|gb164|EW714728 8706 478 91,7 globlastp 1200 LYD311 canola|11v1|EG019901_P1 8707 478 91,0 globlastp 1201 LYD311 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BH20A_P1 8708 478 91,0 globlastp 1202 LYD311 b_rapa|gb162|CA991848_P1 8709 478 91,0 globlastp 1203 LYD311 brapa|gb162|DY009030_P1 8709 478 91,0 globlastp 1204 LYD311 canola|10v1|CX195195 8710 478 91,0 globlastp 1205 LYD311 canola|11v1|EE425769_P1 8710 478 91,0 globlastp 1206 LYD311 canola|10v1|CD818937 8711 478 91,0 glotblastn 1207 LYD311 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A18QW_P1 8712 478 90,2 globlastp 1208 LYD311 thellungiella_parvulum|11v1|BY802 887_T1 8713 478 88,0 glotblastn 1209 LYD311 cleome_spinosa|10v1|GR932062_P1 8714 478 86,5 globlastp cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0248483 1210 LYD311 8715 478 86,5 globlastp _P1 1211 LYD311 canola|11v1|EV108619_T1 8716 478 85,0 glotblastn 1212 LYD311 peanut|10v1|CX018156_P1 8717 478 82,7 globlastp 1213 LYD311 zostera|10v1|AM767183 8718 478 82,7 globlastp 1214 LYD311 euonymus|11v1|SRR070038X107762_P1 8719 478 82,0 globlastp 1215 LYD311 beech|gb170|AM062777_P1 8720 478 82,0 globlastp 1216 LYD311 eschscholzia|10v1|CD480696 8721 478 82,0 globlastp 1217 LYD311 peanut|10v1|CX018188_P1 8722 478 82,0 globlastp 1218 LYD311 chelidonium|11v1|SRR084752X102478_P1 8723 478 81,6 globlastp 1219 LYD311 cannabis|12v1|1SOLX00031773_P1 8724 478 81,5 globlastp 1220 LYD311 humulus|11v1|PX519376_P1 8724 478 81,5 globlastp 1221 LYD311 eschscholzia|10v1|CD478920 8725 478 81,5 globlastp 1222 LYD311 cucurbita|11v1|SRR091276X104400_P1 8726 478 81,3 globlastp 1223 LYD311 peanut|10v1|EE126238_P1 8727 478 81,3 globlastp

191 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1224 LYD311 cucurbita|11v1|SRR091276X107646_P1 8728 478 81,2 globlastp 1225 LYD311 wheatnella|11v1|SRR066194X104836_P1 8729 478 81,2 globlastp 1226 LYD311 watermelon|11v1|AM742925_T1 8730 478 81,2 glotblastn 1227 LYD311 amborella|gb166|CK756581_P1 8731 478 81,2 globlastp 1228 LYD311 apple|11v1|CN491811_P1 8732 478 81,2 globlastp 1229 LYD311 apple|gb171|CN494732 8732 478 81,2 globlastp 1230 LYD311 beet|gb162|BE590289_P1 8733 478 81,2 globlastp 1231 LYD311 cucumber|09v1|DN910106_T1 8730 478 81,2 glotblastn 1232 LYD311 medicago|09v1|LAJ388694_P1 8729 478 81,2 globlastp 1233 LYD311 melon|10v1|AM742925_T1 8730 478 81,2 glotblastn 1234 LYD311 peanut|10v1|EE126532_P1 8734 478 81,2 globlastp 1235 LYD311 peanut|10v1|ES713518_P1 8735 478 81,2 globlastp 1236 LYD311 pigeonpea|10v1|SRR054580S0066602_T1 8736 478 81,2 glotblastn 1237 LYD311 soybean|11v1|GLYMA04G39940 8737 478 81,2 globlastp 1238 LYD311 silene|11v1|SRR096785X29266_P1 8738 478 81,0 globlastp 1239 LYD311 humulus|11v1|SRR098683X100497_P1 8739 478 80,7 globlastp 1240 LYD311 cacao|10v1|CU486111_T1 8740 478 80,6 glotblastn 1241 LYD311 cucurbita|11v1|SRR091276X129541_P1 8741 478 80,5 globlastp 1242 LYD311 apple|gb171|CN491811 8742 478 80,5 globlastp 1243 LYD311 bean|gb167|CA897290_P1 8743 478 80,5 globlastp 1244 LYD311 cyamopsis|10v1|EG981137_P1 8744 478 80,5 globlastp grape|11v1|GSVIVT01024576001_ 1245 LYD311 8745 478 80,5 globlastp P1 1246 LYD311 grape|gb160|BQ793461 8745 478 80,5 globlastp 1247 LYD311 liriodendron|gb166|CK765898_P1 8746 478 80,5 globlastp 1248 LYD311 momordica|10v1|SRR071315S0002878_P1 8747 478 80,5 globlastp 1249 LYD311 pea|09v1|FG528852 8748 478 80,5 globlastp 1250 LYD311 soybean|11v1|GLYMA06G14950 8749 478 80,5 globlastp 1251 LYD311 bean|gb167|CA897292_T1 8750 478 80,5 glotblastn 1252 LYD311 chickpea|09v2|DY475420_T1 8751 478 80,5 glotblastn 1253 LYD311 chickpea|09v2|GR392264_T1 8752 478 80,5 glotblastn 1254 LYD311 lotus|09v1|BU494262T1 8753 478 80,5 glotblastn 1255 LYD311 lotus|09v1|CN824997_T1 8753 478 80,5 glotblastn 1256 LYD311 pigeonpea|10v1|GW359736_T1 8736 478 80,5 glotblastn 1257 LYD311 prunus|10v1|PU044809 8754 478 80,5 glotblastn 1258 LYD311 soybean|11v1|GLYMA14G38950 8755 478 80,5 glotblastn 1259 LYD311 euonymus|11v1|SRR070038X101903_P1 8756 478 80,1 globlastp 1260 LYD311 apple|gb171|CN493089 8757 478 80,1 globlastp 1261 LYD311 prunus|10v1|CB819305 8758 478 80,1 globlastp 1262 LYD311 humulus|11v1|ES654982_P1 8759 478 80,0 globlastp 1263 LYD311 zostera|10v1|AM766161 8760 478 80,0 globlastp 1264 LYD312 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL015619_P1 8761 479 98,3 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|B1698673_P 1265 LYD312 8762 479 94,0 globlastp 1 1266 LYD312 thellungiella|gb167|B1698673 8762 479 94,0 globlastp 1267 LYD312 thellungiella_parvulum|11v1|B1698673_P1 8763 479 91,4 globlastp 1268 LYD312 radish|gb164|EV545662 8764 479 89,1 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHPRD1294 1269 LYD312 - 479 87,9 glotblastn 81_T1 1270 LYD312 canola|10v1|PE558412 8765 479 86,0 globlastp 1271 LYD312 canola|11v1|EE558412_P1 8766 479 85,6 globlastp 1272 LYD312 b_oleracea|gb161|EH417202_P1 8767 479 83,8 globlastp 1273 LYD312 b_rapa|gb162|DN192304_P1 8768 479 80,9 globlastp 1274 LYD313 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL008813_P1 8769 480 98,8 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPPRD042582 1275 LYD313 8770 480 92,7 globlastp _P1 thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111002 1276 LYD313 8771 480 92,1 globlastp 654_P1 1277 LYD313 canola|10v1|CX194066 8772 480 88,5 globlastp 1278 LYD313 canola|11v1|EV143607_P1 8772 480 88,5 globlastp 1279 LYD313 canola|11v1|GR450448_P1 8773 480 88,5 globlastp

192 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1280 LYD313 canola|10v1| 1CX191719 8774 480 87,9 globlastp 1281 LYD313 canola|11v1|GR450809XX1_P1 8774 480 87,9 globlastp 1282 LYD313 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A8H1F_P1 8775 480 86,7 globlastp 1283 LYD313 canola|10v1|EL588716 8776 480 86,7 globlastp 1284 LYD313 radish|gb164|EV526908 8777 480 86,7 globlastp 1285 LYD313 canola|10v1|CX188803 8778 480 86,1 globlastp 1286 LYD313 canola|11v1|GR452560_P1 8778 480 86,1 globlastp 1287 LYD313 canola|11v1|GR450902_P1 8779 480 85,5 globlastp 1288 LYD313 radish|gb164|EX895333 8780 480 84,2 glotblastn 1289 LYD315 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL008912_P1 8781 481 96,5 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJGI11004 1290 LYD315 8782 481 94,0 globlastp 453_P1 thellungiella_halophilum|11v1|EHPRD1215 1291 LYD315 8782 481 94,0 globlastp 42_P1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP011584 1292 LYD315 8783 481 92,9 globlastp _P1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP009311 1293 LYD315 8784 481 92,9 glotblastn _T1 1294 LYD316 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL009299_T1 8785 482 96,3 glotblastn thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP009492 1295 LYD316 8786 482 88,8 globlastp _P1 thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111003 1296 LYD316 8787 482 88,3 globlastp 515_P1 1297 LYD316 canola|11v1|CD818422_T1 8788 482 86,2 glotblastn 1298 LYD318 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL009619_P1 8789 483 97,0 globlastp 1299 LYD318 thellungiella_parvulum|11v1|DN776389_P1 8790 483 92,4 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN7 1300 LYD318 8791 483 92,0 globlastp 76389_P1 1301 LYD318 radish|gb164|EX754223 8792 483 92,0 globlastp 1302 LYD318 canolal|11v1|PE445253_P1 8793 483 90,5 globlastp 1303 LYD318 canola|10v1|CD836668 8794 483 90,3 globlastp 1304 LYD318 canolal|11v1|PE400369_P1 8795 483 89,8 globlastp 1305 LYD319 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL009870_P1 8796 484 93,6 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHCRP0261 1306 LYD319 8797 484 88,0 globlastp 23J1 thellungiella_parvulum|11v1|EPPRD057899 1307 LYD319 8798 484 86,5 glotblastn _T1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP012042 1308 LYD319 8799 484 85,8 globlastp _P1 1309 LYD319 canola|11v1|EV018380_T1 8800 484 85,6 glotblastn 1310 LYD319 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL004932_P1 8801 484 80,6 globlastp 1311 LYD319 arabidopsis|10v1|AT1G54115_P1 8802 484 80,0 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPPRD057993 1312 LYD320 - 485 92,8 glotblastn _T1 1313 LYD320 arabidopsis_lyrata|09v1|BQ834507_P1 8803 485 92,3 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHPRD1226 1314 LYD320 8804 485 91,0 glotblastn 21_T1 1315 LYD320 radish|gb164|EW722876 8805 485 88,7 globlastp 1316 LYD320 thellungiella_parvulum|11v1|DN775388P1 8806 485 88,6 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN775388_P 1317 LYD320 8807 485 88,2 globlastp 1 1318 LYD320 thellungiella|gb167|DN775388 8807 485 88,2 globlastp 1319 LYD320 b_rapa|gb162|DN962192_P1 8808 485 87,3 globlastp 1320 LYD320 canola|10v1|EG021058 8809 485 87,3 globlastp 1321 LYD320 canola|11v1|EG021058_P1 8809 485 87,3 globlastp 1322 LYD320 radish|gb164|EX756845 8810 485 86,0 globlastp 1323 LYD320 b_oleracea|gb161|EH414797_P1 8811 485 85,5 globlastp 1324 LYD320 canola|11v1|EG020125_P1 8812 485 85,1 globlastp 1325 LYD320 b_rapa|gb162|DN962315_P1 8813 485 84,2 globlastp 1326 LYD320 canola|10v1|CD818499 8813 485 84,2 globlastp 1327 LYD320 canola|11v1|SRR341920.175161_P1 8814 485 83,2 globlastp

193 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1328 LYD321 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL010419_P1 8815 486 97,9 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY810059_P 1329 LYD321 8816 486 92,1 globlastp 1 1330 LYD321 canola|11v1|EE471093_P1 8817 486 90,5 globlastp 1331 LYD321 canola|10v1|CD836798 8818 486 90,4 globlastp 1332 LYD321 canola|11v1|EV061853_P1 8819 486 90,2 globlastp 1333 LYD321 canola|11v1|GR458826_P1 8820 486 87,7 globlastp 1334 LYD321 thellungiella_parvulum|11v1|BY810059_P1 8821 486 85,7 globlastp 1335 LYD322 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL010711_P1 8822 487 98,6 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY805839_P 1336 LYD322 8823 487 93,6 globlastp 1 1337 LYD322 b_rapa|gb162|EX022374_P1 8824 487 93,1 globlastp 1338 LYD322 canola|10v1|CX192130 8825 487 93,1 globlastp 1339 LYD322 thellungiella_parvulum|11v1|BY805839_P1 8826 487 92,7 globlastp 1340 LYD322 canola|11v1|EV020616_P1 8827 487 92,2 globlastp 1341 LYD322 canola|11v1|EG020093_P1 8828 487 91,9 globlastp 1342 LYD322 b_rapa|gb162|EX026297_P1 8829 487 91,7 globlastp 1343 LYD322 radish|gb164|EW731194 8830 487 91,7 globlastp 1344 LYD322 radish|gb164|EV528233 8831 487 91,5 globlastp 1345 LYD322 thellungiella_parvulum|11v1|BY834583_P1 8832 487 84,8 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY834583_P 1346 LYD322 8833 487 84,4 globlastp 1 1347 LYD322 radish|gb164|EV537648 8834 487 84,1 globlastp 1348 LYD322 arabidopsis|10v1|AT1G51630_P1 8835 487 83,9 globlastp 1349 LYD322 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL004638_P1 8836 487 83,7 globlastp 1350 LYD322 canola|11v1|EE464409_P1 8837 487 82,7 globlastp 1351 LYD322 canola|11v1|EE483839_P1 8838 487 82,7 globlastp 1352 LYD322 b_rapa|gb162|EE518248_P1 8838 487 82,7 globlastp 1353 LYD322 canola|11v1|EE443966_P1 8839 487 81,6 globlastp 1354 LYD322 canola|11v1|EV047576_P1 8840 487 80,6 globlastp 1355 LYD323 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL017444_P1 8841 488 97,2 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111027 1356 LYD323 8842 488 89,9 globlastp 388_P1 thellungiella_halophilum|11v1|EHPRD1214 1357 LYD323 8843 488 87,4 glotblastn 74_T1 1358 LYD323 canola|10v1|EE456524 8844 488 84,3 globlastp 1359 LYD323 canola|11v1|EE456524_P1 8845 488 83,3 globlastp 1360 LYD323 radish|gb164|EV566583 8846 488 83,3 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP018363 1361 LYD323 8847 488 82,7 globlastp _P1 1362 LYD324 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL017910_P1 8848 489 88,3 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY823220_P 1363 LYD324 8849 489 82,3 globlastp 1 1364 LYD324 thellungiella_parvulum|11v1|BY823220_P1 8850 489 81,3 globlastp 1365 LYD324 canola|10v1|CB686132 8851 489 80,2 globlastp 1366 LYD324 radish|gb164|EV543990 8852 489 80,1 globlastp 1367 LYD325 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL018094P1 8853 490 94,2 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP019885 1368 LYD325 8854 490 85,1 globlastp _P1 thellungiella_halophilum|11v1|EHJGI11027 1369 LYD325 8855 490 84,4 globlastp 168_P1 1370 LYD325 canola|10v1|EG019603 8856 490 81,3 globlastp 1371 LYD325 canola|11v1|EG019603_P1 8856 490 81,3 globlastp 1372 LYD325 canola|11v1|EE471941_P1 8857 490 80,8 globlastp 1373 LYD326 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL018109_T1 8858 491 83,0 glotblastn 1374 LYD327 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL018400_P1 8859 492 97,3 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN773826_P 1375 LYD327 8860 492 92,2 globlastp 1 1376 LYD327 canola|11v1|AJ581745_P1 8861 492 91,9 globlastp 1377 LYD327 thellungiella_parvulum|11v1|DN773826_P1 8862 492 91,3 globlastp 1378 LYD327 canola|10v1|AJ581745 8863 492 90,9 globlastp

194 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1379 LYD327 canola|11v1|SRR019558.10076_P1 8864 492 82,8 globlastp 1380 LYD327 canola|11v1|DW998382_P1 8865 492 81,0 globlastp arabidopsis_lyrata|09v1|TMPLAT3G59210 1381 LYD328 8866 493 90,1 globlastp T1_P1 1382 LYD329 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL019576_P1 8867 494 98,4 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY818407_P 1383 LYD329 8868 494 95,6 globlastp 1 1384 LYD329 thellungiella_parvulum|11v1|BY818 407_P1 8869 494 93,8 globlastp 1385 LYD329 canola|11v1|ES904608_P1 8870 494 90,0 globlastp 1386 LYD329 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL016139_P1 8871 494 90,0 globlastp 1387 LYD329 arabidopsis|10v1|AT2G47160_P1 8872 494 90,0 globlastp 1388 LYD329 thellungiella_alophilum|11v1|BY801672_P1 8873 494 89,8 globlastp 1389 LYD329 canola|11v1|GFXGU827656X1_P1 8874 494 89,7 globlastp 1390 LYD329 thellungiella_parvulum|11v1|BY801672_P1 8875 494 89,6 globlastp 1391 LYD329 canola|11v1|ES902758_P1 8876 494 89,4 globlastp 1392 LYD329 canola|10v1|ES902758 8877 494 89,0 glotblastn 1393 LYD329 canola|11v1|EV072122_P1 8878 494 88,6 globlastp 1394 LYD329 canola|11v1|GFXGU827652X1_P1 8879 494 88,3 globlastp 1395 LYD329 clementine|11v1|DR911319_P1 8880 494 82,9 globlastp 1396 LYD329 orange|11v1|DR911319_P1 8880 494 82,9 globlastp 1397 LYD329 poplar|10v1|BU817339_P1 8881 494 82,9 globlastp 1398 LYD329 poplar|10v1|DB884373_P1 8882 494 82,9 globlastp 1399 LYD329 cacao|10v1|CU571714_P1 8883 494 82,8 globlastp cassava|09v1|JGICASSAVA36078VALID 1400 LYD329 8884 494 81,8 globlastp Ml_P1 1401 LYD329 euphorbia|11v1|DV137045_P1 8885 494 81,5 globlastp 1402 LYD329 canola|11v1|EV156689_P1 8886 494 81,0 globlastp 1403 LYD329 apple|11v1|CN860745_P1 8887 494 80,9 globlastp 1404 LYD329 castorbean|11v1|XM_002515178_P1 8888 494 80,8 globlastp 1405 LYD329 prunus|10v1|CN860745 8889 494 80,6 globlastp 1406 LYD329 watermelon|11v1|CK700793_P1 8890 494 80,5 globlastp 1407 LYD329 castorbean|09v1|XM002515178 8891 494 80,5 globlastp 1408 LYD329 monkeyflower|10v1|G0952257_T1 8892 494 80,5 glotblastn 1409 LYD329 strawberry|11v1|SRR034857S0001709 8893 494 80,4 glotblastn 1410 LYD329 cucumber|09v1|CK700793_P1 8894 494 80,4 globlastp 1411 LYD329 medicago|09v1|AW684781_P1 8895 494 80,3 globlastp 1412 LYD329 grape|11v1|GSVIVT01028186001_P1 8896 494 80,2 globlastp 1413 LYD329 eucalyptus|11v2|SRR001658X9834_T1 8897 494 80,1 glotblastn 1414 LYD329 1otus|09v1|A1967861_P1 8898 494 80,1 globlastp 1415 LYD329 soybean|11v1|GLYMA19G40720 8899 494 80,0 globlastp 1416 LYD330 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL032548_P1 8900 495 93,9 globlastp 1417 LYD330 thellungiella_parvulum|11v1|DN778413_P1 8901 495 83,4 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN778413_T 1418 LYD330 8902 495 82,8 glotblastn 1 1419 LYD331 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL026449_P1 8903 496 92,1 globlastp 1420 LYD332 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL024476_P1 8904 497 92,2 globlastp 1421 LYD332 thellungiella_parvulum|11v1|BY816573_P1 8905 497 83,7 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY816573_P 1422 LYD332 8906 497 82,7 globlastp 1 arabidopsis_lyrata|09v1|GFXEU352 1423 LYD334 8907 498 94,4 globlastp 111X1_P1 thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111023 1424 LYD334 8908 498 86,5 globlastp 772_P1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP024261 1425 LYD334 8909 498 81,5 globlastp _P1 thellungiella_parvulum|11v1|EPPRD116222 1426 LYD334 8910 498 80,4 glotblastn _T1 1427 LYD335 canola|11v1|EE503131_P1 8911 499 96,1 globlastp 1428 LYD335 thellungiella_parvulum|11v1|DN774603_P1 8912 499 95,9 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN774603_P 1429 LYD335 8913 499 95,4 globlastp 1

195 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1430 LYD335 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL020061_P1 8914 499 88,7 globlastp 1431 LYD335 orange|11v1|CF417945_T1 8915 499 83,8 glotblastn 1432 LYD335 oak|10v1|CU640782_P1 8916 499 83,8 globlastp 1433 LYD335 clementine|11v1|CF417945_P1 8917 499 83,7 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X100225 1434 LYD335 8918 499 83,4 globlastp _P1 1435 LYD335 poplar|10v1|P1070640_T1 8919 499 83,2 glotblastn 1436 LYD335 amsonia|11v1|SRR098688X102258_P1 8920 499 83,2 globlastp 1437 LYD335 poplar|10v1|PU820176_T1 8921 499 83,1 glotblastn 1438 LYD335 grape|11v1|GSVIVT01033621001_P1 8922 499 83,0 globlastp 1439 LYD335 prunus|10v1|PU040034 8923 499 83,0 globlastp 1440 LYD335 vinca|11v1|SRR098690X100714_P1 8924 499 82,5 globlastp 1441 LYD335 castorbean|09v1|EG658117 8925 499 82,5 glotblastn 1442 LYD335 castorbean|11v1|EG658117_T1 8925 499 82,5 glotblastn 1443 LYD335 strawberry|11v1|DY666929 8926 499 82,4 glotblastn 1444 LYD335 soybean|11v1|GLYMA03G28410 8927 499 82,3 globlastp 1445 LYD335 medicago|09v1|AW688937_T1 8928 499 82,3 glotblastn 1446 LYD335 watermelon|11v1|DQ641082_P1 8929 499 82,2 globlastp 1447 LYD335 silene|11v1|SRR096785X10217_T1 8930 499 82,1 glotblastn 1448 LYD335 soybean|11v1|GLYMA19G31120 8931 499 81,9 globlastp 1449 LYD335 pepper|gb171|CA517915_T1 8932 499 81,6 glotblastn 1450 LYD335 plantago|11v1|SRR066374X103519_T1 8933 499 81,5 glotblastn 1451 LYD335 tomato|11v1|AI484128_P1 8934 499 81,3 globlastp 1452 LYD335 tomato|09v1|AI484128 8934 499 81,3 globlastp 1453 LYD335 arnica|11v1|SRR099034X102086_T1 8935 499 81,2 glotblastn 1454 LYD335 monkeyflower|10v1|DV210601_T1 8936 499 80,5 glotblastn 1455 LYD335 triphysaria|10v1|EY005578 8937 499 80,5 glotblastn thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP016605 1456 LYD335 8938 499 80,4 globlastp _P1 1457 LYD335 eucalyptus|11v2|CD669629_T1 8939 499 80,4 glotblastn 1458 LYD335 cotton|10v2|C0080269_T1 8940 499 80,3 glotblastn 1459 LYD335 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL015419_P1 8941 499 80,1 globlastp 1460 LYD335 arabidopsis|10v1|AT2G41220_P1 8942 499 80,1 globlastp 1461 LYD337 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL020872_T1 8943 500 100,0 glotblastn 1462 LYD337 canola|10v1|CD812320 8944 500 81,3 glotblastn 1463 LYD337 canola|10v1|EE456730 8945 500 81,3 glotblastn 1464 LYD337 canola|11v1|GR444708_P1 8946 500 81,2 globlastp 1465 LYD337 canola|11v1|EE456730_P1 8947 500 81,2 globlastp 1466 LYD338 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL020944_P1 8948 501 92,8 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJGI11025 1467 LYD338 8949 501 83,1 glotblastn 024_T1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP023864 1468 LYD338 8950 501 81,6 glotblastn _T1 1469 LYD339 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL021040_P1 8951 502 96,3 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111024 1470 LYD339 8952 502 90,1 globlastp 390_P1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP023818 1471 LYD339 8953 502 88,8 globlastp _P1 1472 LYD339 canola|11v1|EG021151_P1 8954 502 86,8 globlastp 1473 LYD339 canola|11v1|ES955868_P1 8955 502 80,4 globlastp 1474 LYD340 thellungiella_parvulum|11v1|BY800922_T1 8956 503 91,6 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|BY800922_T 1475 LYD340 8957 503 90,7 glotblastn 1 1476 LYD341 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL027246_P1 8958 504 98,6 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BM9 1477 LYD341 8959 504 92,1 globlastp 86054_P1 1478 LYD341 thellungiella|gb167|B3M986054 8959 504 92,1 globlastp 1479 LYD341 thellungiella_parvulum|11v1|BM986054_P1 8960 504 91,2 globlastp 1480 LYD341 canola|10v1|CN827835 8961 504 90,6 globlastp 1481 LYD341 b_juncea|10v2|E6ANDIZOlAILV9_P1 8962 504 90,4 globlastp 1482 LYD341 canola|10v1|CN735913 8963 504 90,3 globlastp

196 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1483 LYD341 canola|11v1|CN735913_P1 8963 504 90,3 globlastp 1484 LYD341 canola|11v1|EE453491_P1 8964 504 90,1 globlastp 1485 LYD341 canola|11v1|CN827835_T1 8965 504 88,4 glotblastn 1486 LYD341 radish|gb164|EV525495 8966 504 86,9 globlastp 1487 LYD341 b_oleracea|gb161|DY014967_P1 8967 504 86,8 globlastp 1488 LYD341 b_rapa|gb162|DN960891_P1 8968 504 86,8 globlastp 1489 LYD341 canola|11v1|IGR441130_T1 8969 504 86,5 glotblastn 1490 LYD341 cleome_spinosa|10v1|GR934200_P1 8970 504 83,5 globlastp 1491 LYD341 aristolochia|10v1|SRR039082S0119986_P1 8971 504 80,9 globlastp Cleome_gynandra|10v1|SRR015532S00038 1492 LYD341 8972 504 80,7 globlastp 61_P1 1493 LYD342 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL028474_P1 8973 505 95,8 globlastp 1494 LYD342 thellungiella_parvulum|11v1|DN778963_P1 8974 505 87,9 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN778963_P 1495 LYD342 8975 505 86,8 globlastp 1 1496 LYD342 canola|11v1|CN734443_P1 8976 505 86,4 globlastp 1497 LYD342 radish|gb164|EV538664 8977 505 85,0 globlastp 1498 LYD342 canolal|11v1|PE557045_P1 8978 505 82,4 globlastp 1499 LYD343 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL028218_P1 8979 506 98,3 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP007025 1500 LYD343 8980 506 92,5 globlastp _P1 thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111022 1501 LYD343 8981 506 91,6 globlastp 965_P1 1502 LYD343 canola|11v1|CN736114_P1 8982 506 90,5 globlastp 1503 LYD343 b_rapa|gb162|EE520737_P1 8983 506 89,9 globlastp 1504 LYD343 radish|gb164|EV568634 8984 506 88,3 globlastp 1505 LYD344 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL031165_P1 8985 507 97,4 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN776083_P 1506 LYD344 8986 507 95,1 globlastp 1 1507 LYD344 thellungiella_parvulum|11v1|DN776083J1 8987 507 94,7 globlastp 1508 LYD344 canola|10v1|CD835164 8988 507 89,6 glotblastn 1509 LYD344 b_rapa|gb162|C0749294_P1 8989 507 89,6 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000125 1510 LYD344 8990 507 88,2 globlastp 6_P1 cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0002622 1511 LYD344 8991 507 88,0 globlastp _P1 1512 LYD344 radish|gb164|EV528944 8992 507 84,7 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP023987 1513 LYD344 8993 507 82,3 globlastp _P1 1514 LYD344 cacao|10v1|CF973757_P1 8994 507 82,1 globlastp 1515 LYD344 canola|11v1|EE558093_P1 8995 507 81,8 globlastp 1516 LYD344 cotton|10v2|ES821556J1 8996 507 81,7 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111024 1517 LYD344 8997 507 81,6 globlastp 175_P1 1518 LYD344 arabidopsis|10v1|AT5G09930J1 8998 507 81,5 globlastp 1519 LYD344 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL020673_P1 8999 507 81,4 globlastp 1520 LYD344 poplar|10v1|31072525_P1 9000 507 81,2 globlastp 1521 LYD344 cotton|10v2|A1731817_P1 9001 507 81,0 globlastp 1522 LYD344 cassava|09v1|CK647751_P1 9002 507 80,9 globlastp 1523 LYD344 euphorbia|11v1|DV151536_P1 9003 507 80,3 globlastp 1524 LYD346 b_rapa|gb162|CV545144_P1 508 508 100,0 globlastp 1525 LYD346 canola|11v1|A1352722J1 9004 508 82,7 globlastp 1526 LYD346 b_oleracea|gb161|EH416019_P1 9005 508 82,2 globlastp 1527 LYD347 b_oleracea|gb161|DY030010_P1 9006 509 96,9 globlastp 1527 LYD382 b_oleracea|gb161|DY030010_P1 9006 730 82,5 globlastp 1528 LYD347 arabidopsis|10v1|AT5G14780_P1 9007 509 91,7 globlastp 1528 LYD382 arabidopsis|10v1|AT5G14780_P1 9007 730 83,9 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000010 1529 LYD347 9008 509 87,6 globlastp 4_P1 cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000010 1529 LYD382 9008 730 80,2 globlastp 4_P1

197 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1530 LYD347 nasturtium|10v1|SRR032558S0026092 9009 509 86,2 globlastp 1530 LYD382 nasturtium|10v1|SRR032558S0026092 9009 730 84,8 globlastp 1531 LYD347 papaya|gb165|AM903607_P1 9010 509 84,0 globlastp 1531 LYD382 papaya|gb165|AM903607_P1 9010 730 85,3 globlastp 1532 LYD347 olea|11v1|SRR014463.14440_P1 9011 509 83,9 globlastp 1532 LYD382 olea|11v1|SRR014463.14440_P1 9011 730 88,8 globlastp 1533 LYD347 momordica|10v1|SRR071315S0001060_P1 9012 509 83,9 globlastp 1533 LYD382 momordica|10v1|SRR071315S0001060_P1 9012 730 87,5 globlastp 1534 LYD347 tobacco|gb162|EB426275 9013 509 83,9 globlastp 1534 LYD382 tobacco|gb162|EB426275 9013 730 86,8 globlastp 1535 LYD347 fraxinus|11v1|SRR058827.101326_T1 9014 509 83,4 glotblastn 1535 LYD382 fraxinus|11v1|SRR058827.101326_P1 9014 730 80,6 globlastp 1536 LYD347 platanus|11v1|SRR096786X11198_P1 9015 509 83,4 globlastp 1536 LYD382 platanus|11v1|SRR096786X11198_P1 9015 730 87,8 globlastp 1537 LYD347 vinca|11v1|SRR098690X108264_P1 9016 509 83,4 globlastp 1537 LYD382 vinca|11v1|SRR098690X108264_P1 9016 730 85,9 globlastp 1538 LYD347 watermelon|11v1|AA660126_P1 9017 509 83,4 globlastp 1538 LYD382 watermelon|11v1|AA660126_P1 9017 730 86,7 globlastp 1539 LYD347 melon|10v1|DV634169_P1 9018 509 83,4 globlastp 1539 LYD382 melon|10v1|DV634169_P1 9018 730 86,2 globlastp 1540 LYD347 eucalyptus|11v2|CD669597_P1 9019 509 83,3 globlastp 1540 LYD382 eucalyptus|11v2|CD669597_P1 9019 730 86,1 globlastp 1541 LYD347 tomato|11v1|BG129067_P1 9020 509 83,3 globlastp 1541 LYD382 tomato|11v1|BG129067_P1 9020 730 86,4 globlastp 1542 LYD347 vinca|11v1|SRR098690X100564_P1 9021 509 83,3 globlastp 1542 LYD382 vinca|11v1|SRR098690X100564_P1 9021 730 85,6 globlastp 1543 LYD347 citrus|gb166|BQ624436_P1 9022 509 83,2 globlastp 1543 LYD382 citrus|gb166|BQ624436_P1 9022 730 88,1 globlastp 1544 LYD347 orange|11v1|BQ624436_T1 9023 509 83,2 glotblastn 1544 LYD382 orange|11v1|BQ624436_T1 9023 730 87,8 glotblastn 1545 LYD347 pepper|gb171|BM062178_P1 9024 509 83,0 globlastp 1545 LYD382 pepper gb171 BM062178_P1 9024 730 86,1 globlastp 1546 LYD347 clementine|11v1|BQ624436_P1 9025 509 82,9 globlastp 1546 LYD382 clementine|11v1|BQ624436_P1 9025 730 87,5 globlastp 1547 LYD347 cucumber|09v1|AA660126_P1 9026 509 82,9 globlastp 1547 LYD382 cucumber|09v1|AA660126_P1 9026 730 85,9 globlastp 1548 LYD347 ipomoea_ni1|10v1|BJ553348_P1 9027 509 82,8 globlastp 1548 LYD382 ipomoea_ni|10v1|BJ553348_P1 9027 730 86,6 globlastp 1549 LYD347 potato|10v1|BF153260_P1 9028 509 82,8 globlastp 1549 LYD382 potato|10v1|BF153260_P1 9028 730 85,9 globlastp 1550 LYD347 tomato|09v1|K129067 9029 509 82,8 globlastp 1550 LYD382 tomato|09v1|BG129067 9029 730 85,9 globlastp 1551 LYD347 ambrosia|11v1|SRR346935.111324_T1 9030 509 82,8 glotblastn 1551 LYD382 ambrosia|11v1|SRR346935.111324_T1 9030 730 85,1 glotblastn 1552 LYD347 ambrosia|11v1|SRR346935.125745_T1 9031 509 82,8 glotblastn 1552 LYD382 ambrosia|11v1|SRR346935.125745_T1 9031 730 85,1 glotblastn 1553 LYD347 ambrosia|11v1|GW917809_P1 9032 509 82,6 globlastp 1553 LYD382 ambrosia|11v1|GW917809_P1 9032 730 85,6 globlastp 1554 LYD347 grape|11v1|GSVIVT01032479001_P1 9033 509 82,6 globlastp 1554 LYD382 grape|11v1|GSVIVT01032479001_P1 9033 730 88,5 globlastp 1555 LYD347 grape|gb160|BM438023 9033 509 82,6 globlastp 1555 LYD382 grape gb160 BM438023 9033 730 88,5 globlastp 1556 LYD347 ambrosia|11v1|SRR346943.106591_P1 9034 509 82,5 globlastp 1556 LYD382 ambrosia|11v1|SRR346943.106591_Pl 9034 730 85,6 globlastp 1557 LYD347 fagopyrum|11v1|SRR063689X10645_P1 9035 509 82,5 globlastp 1557 LYD382 fagopyrum|11v1|SRR063689X10645_P1 9035 730 85,3 globlastp 1558 LYD347 flax|11v1|EU828966_P1 9036 509 82,5 globlastp 1558 LYD382 flax|11v1|EU828966_P1 9036 730 83,8 globlastp 1559 LYD347 poplar|10v1|B1122017_P1 9037 509 82,5 globlastp 1559 LYD382 poplar|10v1|B1122017_P1 9037 730 84,8 globlastp

198 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1560 LYD347 sunflower|10v1|CX944970 9038 509 82,5 globlastp 1560 LYD382 sunflower|10v1|CX944970 9038 730 85,1 globlastp 1561 LYD347 tripterygium|11v1|SRR098677X105 560_P1 9039 509 82,4 globlastp 1561 LYD382 tripterygium|11v1|SRR098677X105560_P1 9039 730 86,0 globlastp 1562 LYD347 cassava|09v1|BM260108_P1 9040 509 82,4 globlastp 1562 LYD382 cassava|09v1|BM260108_P1 9040 730 86,2 globlastp 1563 LYD347 apple|gb171|CN491175 9041 509 82,4 globlastp 1563 LYD382 apple|gb171|CN491175 9041 730 85,5 globlastp 1564 LYD347 cirsium|11v1|SRR346952.1057863_P1 9042 509 82,3 globlastp 1564 LYD382 cirsium|11v1|SRR346952.1057863_P1 9042 730 85,6 globlastp 1565 LYD347 cucurbita|11v1|SRR091276X101026_P1 9043 509 82,3 globlastp 1565 LYD382 cucurbita|11v1|SRR091276X101026_P1 9043 730 85,9 globlastp 1566 LYD347 primula|11v1|ISRR098679X101712_P1 9044 509 82,3 globlastp 1566 LYD382 primula|11v1|ISRR098679X101712_P1 9044 730 87,2 globlastp 1567 LYD347 flaveria|11v1|SRR149232.127567_T1 9045 509 82,3 glotblastn 1567 LYD382 flaveria|11v1|SRR149232.127567_T1 9045 730 86,1 glotblastn 1568 LYD347 arnica|11v1|SRR099034X100307_P1 9046 509 82,2 globlastp 1568 LYD382 arnica|11v1|SRR099034X100307_P1 9046 730 86,4 globlastp 1569 LYD347 cacao|10v1|CA798573_P1 9047 509 82,2 globlastp 1569 LYD382 cacao|10v1|CA798573_P1 9047 730 96,1 globlastp 1570 LYD347 castorbean|09v1|EE260103 9048 509 82,2 globlastp 1570 LYD382 castorbean|09v1|EE260103 9048 730 88,2 globlastp 1571 LYD347 castorbean|11v1|GE632314_P1 9048 509 82,2 globlastp 1571 LYD382 castorbean|11v1|GE632314_P1 9048 730 88,2 globlastp 1572 LYD347 solanum_phureja|09v1|SPHBG129067 9049 509 82,2 globlastp 1572 LYD382 solanum_phureja|09v1|SPHBG129067 9049 730 85,3 globlastp 1573 LYD347 monkeyflower|10v1|DV209035_P1 9050 509 82,1 globlastp 1573 LYD382 monkeyflower|10v1|DV209035_P1 9050 730 85,2 globlastp 1574 LYD347 humulus|11v1|ES652349_T1 9051 509 82,0 glotblastn 1574 LYD382 humulus|11v1|ES652349_T1 9051 730 87,2 glotblastn 1575 LYD347 amsonia|11v1|SRR098688X105321_P1 9052 509 82,0 globlastp 1575 LYD382 amsonia|11v1|SRR098688X105321_P1 9052 730 86,6 globlastp 1576 LYD347 cirsium|11v1|SRR346952.100859XX2_P1 9053 509 82,0 globlastp 1576 LYD382 cirsium|11v1|SRR346952.100859XX2_P1 9053 730 85,1 globlastp 1577 LYD347 ginger|gb164|DY350675_P1 9054 509 82,0 globlastp 1577 LYD382 ginger|gb164|DY350675_P1 9054 730 83,6 globlastp 1578 LYD347 flax|11v1|CV478318_P1 9055 509 81,9 globlastp 1578 LYD382 flax|11v1| CV478318_P1 9055 730 83,2 globlastp 1579 LYD347 cassava|09v1|DB922389_P1 9056 509 81,9 globlastp 1579 LYD382 cassava|09v1|DB922389_P1 9056 730 83,6 globlastp 1580 LYD347 triphysaria|10v1|EY134477 9057 509 81,8 globlastp 1580 LYD382 triphysaria|10v1|EY134477 9057 730 86,7 globlastp 1581 LYD347 aquilegia|10v2|DR913682_P1 9058 509 81,8 globlastp 1581 LYD382 aquilegia|10v2|DR913682_P1 9058 730 86,2 globlastp 1582 LYD347 primula|11v1|SRR098679X125363_T1 9059 509 81,7 glotblastn 1582 LYD382 primula|11v1|SRR098679X125363_T1 9059 730 86,7 glotblastn 1583 LYD347 flaveria|11v1|SRR149229.106951_P1 9060 509 81,7 globlastp 1583 LYD382 flaveria|11v1|SRR149229.106951_P1 9060 730 85,1 globlastp 1584 LYD347 apple|11v1|CN496368_P1 9061 509 81,6 globlastp 1584 LYD382 apple|11v1| CN496368_P1 9061 730 85,2 globlastp 1585 LYD347 apple|gb171|CN496368 9061 509 81,6 globlastp 1585 LYD382 apple|gb171|CN496368 9061 730 85,2 globlastp 1586 LYD347 valeriana|11v1|SRR099039X105731_P1 9062 509 81,5 globlastp 1586 LYD382 valeriana|11v1|SRR099039X105731_P1 9062 730 84,6 globlastp 1587 LYD347 fagopyrum|11v1|SRR063689X181932_T1 9063 509 81,5 glotblastn 1587 LYD382 fagopyrum|11v1|SRR063689X181932_T1 9063 730 84,3 glotblastn 1588 LYD347 cirsium|11v1|SRR346952.654383_ T1 9064 509 81,5 glotblastn 1588 LYD382 cirsium|11v1|SRR346952.654383T1 9064 730 85,1 glotblastn 1589 LYD347 euonymus|11v1|SRR070038X106454_P1 9065 509 81,4 globlastp 1589 LYD382 euonymus|11v1|SRR070038X106454_P1 9065 730 84,7 globlastp

199 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1590 LYD347 coffea|10v1|DV685773_P1 9066 509 81,3 globlastp 1590 LYD382 coffea|10v1|DV685773_P1 9066 539 88,3 globlastp 1591 LYD347 cirsium|11v1|SRR346952.1001087_P1 9067 509 81,2 globlastp 1591 LYD382 cirsium|11v1|SRR346952.1001087_P1 9067 730 85,3 globlastp 1592 LYD347 euphorbia|11v1|SRR098678X111141_P1 9068 509 81,2 globlastp 1592 LYD382 euphorbia|11v1|SRR098678X11114l_P1 9068 730 84,5 globlastp 1593 LYD347 flaveria|11v1|SRR149229.119399_T1 9069 509 81,2 glotblastn 1593 LYD382 flaveria|11v1|SRR149229.119399_T1 9069 730 84,8 glotblastn 1594 LYD347 flaveria|11v1|SRR149232.147624_T1 9070 509 81,2 glotblastn 1594 LYD382 flaveria|11v1|SRR149232.147624_T1 9070 730 85,6 glotblastn 1595 LYD347 thalictrum|11v1|SRR096787X104425_P1 9071 509 81,2 globlastp 1595 LYD382 thalictrum|11v1|SRR096787X104425_P1 9071 730 86,4 globlastp 1596 LYD347 tragopogon|10v1|SRR020205S0001095 9072 509 81,2 globlastp 1596 LYD382 tragopogon|10v1|SRR020205S0001095 9072 730 83,9 globlastp 1597 LYD347 strawberry|11v1|CX309713 9073 509 81,2 globlastp 1597 LYD382 strawberry|11v1| CX309713 9073 730 82,2 globlastp 1598 LYD347 chelidonium|11v1|SRR084752X107866_P1 9074 509 81,0 globlastp 1598 LYD382 chelidonium|11v1|SRR084752X107866_P1 9074 730 83,6 globlastp 1599 LYD347 eucalyptus|11v2|CD669010_P1 9075 509 81,0 globlastp 1599 LYD382 eucalyptus|11v2|CD669010_P1 9075 730 86,1 globlastp 1600 LYD347 flaveria|11v1|SRR149229.204863_T1 9076 509 80,9 glotblastn 1600 LYD382 flaveria|11v1|SRR149229.204863_T1 9076 730 85,6 glotblastn amorphophallus|11v2|SRR089351X100835_ 1601 LYD347 9077 509 80,9 globlastp P1 amorphophallus|11v2|SRR089351X100835_ 1601 LYD382 9077 730 84,6 globlastp P1 amorphophallus|11v2|SRR089351X101509_ 1602 LYD347 9077 509 80,9 globlastp P1 amorphophallus|11v2|SRR089351X101509_ 1602 LYD382 9077 730 84,6 globlastp P1 1603 LYD347 artemisia|10v1|EY073413_P1 9078 509 80,9 globlastp 1603 LYD382 artemisia|10v1|EY073413_P1 9078 730 82,4 globlastp 1604 LYD347 prunus|10v1|BU040535 9079 509 80,8 globlastp 1604 LYD382 prunus|10v1|BU040535 9079 730 84,4 globlastp 1605 LYD347 maize|10v1|AI396543_P1 9080 509 80,7 globlastp 1605 LYD382 maize|10v1|AI396543_P1 9080 730 82,2 globlastp 1606 LYD347 brachypodium|09v1|DV469678_P1 9081 509 80,7 globlastp 1606 LYD382 brachypodium|09v1|DV469678_P1 9081 730 82,5 globlastp 1607 LYD347 dandelion|10v1|DR399741_P1 9082 509 80,7 globlastp 1607 LYD382 dandelion|10v1|DR399741_P1 9082 730 82,4 globlastp 1608 LYD347 cynara|gb167|GE583628_T1 9083 509 80,7 glotblastn 1608 LYD382 cynara|gb167|GE583628_P1 9083 730 81,5 globlastp 1609 LYD347 eucalyptus|11v2|ES591288_P1 9084 509 80,5 globlastp 1609 LYD382 eucalyptus|11v2|ES591288_P1 9084 730 85,1 globlastp 1610 LYD347 banana|10v1|ES432636_T1 9085 509 80,5 glotblastn 1610 LYD382 banana|10v1|ES432636_T1 9085 730 84,1 glotblastn 1611 LYD347 foxtail_millet|11v3|EC612516_P1 9086 509 80,4 globlastp 1611 LYD382 foxtail_millet|11v3|EC612516_P1 9086 730 82,5 globlastp 1612 LYD347 sorghum|09v1|SB10G016920 9087 509 80,4 globlastp 1612 LYD382 sorghum|09v1|SB10G016920 9087 730 82,5 globlastp 1613 LYD347 sugarcane|10v1|BQ532057 9088 509 80,4 globlastp 1613 LYD382 sugarcane|10v1|BQ532057 9088 730 82,2 globlastp 1614 LYD347 lettuce|10v1|DWO50040_P1 9089 509 80,4 globlastp 1614 LYD382 lettuce|10v1|DWO50040_P1 9089 730 83,7 globlastp 1615 LYD347 kiwi|gb166|FG403468_P1 9090 509 80,3 globlastp 1615 LYD382 kiwi|gb166|FG403468_P1 9090 730 86,5 globlastp 1616 LYD347 phalaenopsis|11v1|CB034755_T1 9091 509 80,3 glotblastn 1616 LYD382 phalaenopsis|11v1|CB034755_T1 9091 730 83,6 glotblastn 1617 LYD347 oat|11v1|G0589524_P1 9092 509 80,2 globlastp 1617 LYD382 oat|11v1|G0589524_P1 9092 730 80,9 globlastp 1618 LYD347 millet|10v1|EV0454PM004772_P1 9093 509 80,2 globlastp

200 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1618 LYD382 millet|10v1|EV0454PM004772_P1 9093 730 82,7 globlastp 1619 LYD347 orobanche|10v1|SRR023189S0016104_P1 9094 509 80,1 globlastp 1619 LYD382 orobanche|10v1|SRR023189S0016104_P1 9094 730 84,5 globlastp 1620 LYD351 arabidopsis|10v1|AT1G31800_P1 9095 512 93,5 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111024 1621 LYD353 9096 514 89,3 globlastp 072_P1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP023947 1622 LYD353 9097 514 88,9 globlastp _P1 1623 LYD353 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL020765_P1 9098 514 84,9 globlastp 1624 LYD353 arabidopsis|10v1|AT5G10770_P1 9099 514 84,7 globlastp 1625 LYD355 canola|11v1|CN736451_P1 9100 516 97,2 globlastp 1626 LYD355 b_oleracea|gb161|AM394007_P1 9101 516 96,6 globlastp 1627 LYD355 b_rapa|gb162|C0749256_P1 9102 516 96,3 globlastp 1628 LYD355 canola|11v1|EE476105_P1 9102 516 96,3 globlastp 1629 LYD355 radish|gb164|EV524473 9103 516 96,3 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY808349_P 1630 LYD355 9104 516 92,3 globlastp 1 1631 LYD355 thellungiella_parvulum|11v1|BY808349_P1 9105 516 92,0 globlastp 1632 LYD355 arabidopsis|10v1|AT4G11960_P1 9106 516 89,1 globlastp 1633 LYD355 canola|11v1|EV099323_P1 9107 516 88,5 globlastp 1634 LYD355 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL023225P1 9108 516 88,5 globlastp 1635 LYD355 cleome_spinosa|10v1|GR934825_P1 9109 516 86,7 globlastp 1636 LYD355 cleome_spinosa|10v1|GR934831_P1 9110 516 86,4 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000082 1637 LYD355 9111 516 85,5 globlastp 2_P1 cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000770 1638 LYD355 9112 516 85,5 globlastp 3_P1 1639 LYD355 thellungiella_parvulum|11v1|BQ060370_P1 9113 516 83,6 globlastp 1640 LYD355 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01B6EYB_P1 9114 516 82,7 globlastp 1641 LYD355 brapa|gb162|DN962684_P1 9115 516 82,0 globlastp 1642 LYD355 canola|11v1|DY023875_P1 9116 516 81,7 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BQ060370_P 1643 LYD355 9117 516 81,6 globlastp 1 1644 LYD355 canola|10v1|EV187672 9118 516 81,4 globlastp 1645 LYD355 canola|10v1|E107712 9119 516 81,4 globlastp 1646 LYD355 canola|11v1|EE536208_P1 9119 516 81,4 globlastp 1647 LYD355 b_rapa|gb162|BG543462_P1 9119 516 81,4 globlastp 1648 LYD355 radish|gb164|EV531280 9120 516 81,3 globlastp 1649 LYD355 canola|10v1|EG021185 9121 516 81,1 globlastp 1650 LYD355 b_oleracea|gb161|DY026614_P1 9122 516 81,1 globlastp 1651 LYD355 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BE1PA_P1 9123 516 81,1 globlastp 1652 LYD355 arabidopsis|10v1|AT4G22890J1 9124 516 80,9 globlastp 1653 LYD355 radish|gb164|EV525287 9125 516 80,9 globlastp 1654 LYD355 canola|11v1|EE445039_P1 9126 516 80,7 globlastp 1655 LYD355 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL025823_P1 9127 516 80,7 globlastp 1656 LYD357 canola|11v1|EV171423_P1 9128 518 87,0 globlastp 1657 LYD357 canola|11v1|SRR019559.7968_P1 9129 518 82,8 globlastp 1658 LYD357 canola|11v1|EV189571_T1 9130 518 82,5 glotblastn 1659 LYD358 canolal|11v1|PE421539_P1 9131 519 98,5 globlastp 1660 LYD358 canola|10v1|CD833137 9132 519 98,0 globlastp 1661 LYD358 cacao|10v1|CU497386_T1 9133 519 84,3 glotblastn 1662 LYD358 vinca|11v1|SRR098690X117469_T1 9134 519 83,4 glotblastn 1663 LYD358 euonymus|11v1|SRR070038X158390_P1 9135 519 82,8 globlastp 1664 LYD358 soybean|11v1|GLYMA02G37700_T1 9136 519 82,6 glotblastn 1665 LYD358 pigeonpea|10v1|GW348451_P1 9137 519 82,4 globlastp 1666 LYD358 tripterygium|11v1|SRR098677X128870_P1 9138 519 81,9 globlastp 1667 LYD358 soybean|11v1|GLYMA14G35990 9139 519 81,9 globlastp 1668 LYD358 switchgrass1gb1671FE615243_P1 9140 519 80,6 globlastp 1669 LYD358 foxtail_millet|11v3|PHY7SI029820M_P1 9141 519 80,5 globlastp 1670 LYD358 brachypodium|09v1|DV474127_P1 9142 519 80,1 globlastp 1671 LYD358 millet|10v1|EV0454PM001120_P1 9143 519 80,1 globlastp

201 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1672 LYD359 flaveria|11v1|SRR149229.106616_P1 9144 520 81,1 globlastp flaveria|11v3|SRR149232,101689_ 1673 LYD359 9145 520 80,6 glotblastn T1 1674 LYD360 fraxinus|11v1|SRR058827.105177_T1 9146 521 84,2 glotblastn 1675 LYD361 B_rapa|gb162|CX265816_P1 9147 522 99,5 globlastp 1676 LYD361 radish|gb164|EV527913 9148 522 99,3 globlastp 1677 LYD361 canola|10v1|E174744 9149 522 99,3 globlastp 1678 LYD361 canola|11v1|CN736161_P1 9149 522 99,3 globlastp 1679 LYD361 thellungiella_parvulum|11v1|BY812098_P1 9150 522 97,0 globlastp Thellungiella_halophilum|11v1|BY812098_ 1680 LYD361 9151 522 94,9 globlastp P1 1681 LYD361 arabidopsis|10v1|AT1G43190_P1 9152 522 94,9 globlastp 1682 LYD361 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL003860_T1 9153 522 94,2 glotblastn 1683 LYD361 cotton|10v2|BM359742_P1 9154 522 87,2 globlastp 1684 LYD361 castorbean|11v1|EG661912_T1 9155 522 86,3 glotblastn 1685 LYD361 cacao|10v1|CU500347_P1 9156 522 86,3 globlastp 1686 LYD361 cassava|09v1|DV452263_P1 9157 522 85,6 globlastp 1687 LYD361 poplar|10v1|BI130401_P1 9158 522 85,6 globlastp 1688 LYD361 catharanthus|11v1|SRR098691X127119_T1 9159 522 85,4 glotblastn 1689 LYD361 eucalyptus|11v2|SRR001659X120392_P1 9160 522 84,0 globlastp 1690 LYD361 euphorbia|11v1|SRR098678X100013_P1 9161 522 84,0 globlastp 1691 LYD361 peanut|10v1|ES712655_P1 9162 522 84,0 globlastp 1692 LYD361 poplar|10v1|BI132286_P1 9163 522 83,8 globlastp 1693 LYD361 citrus|gb166|CF828428_P1 9164 522 83,6 globlastp 1694 LYD361 clementine|11v1|CF828428_P1 9165 522 83,6 globlastp 1695 LYD361 orange|11v1|CF828428_P1 9164 522 83,6 globlastp 1696 LYD361 peanut|10v1|ES703657_P1 9166 522 83,6 globlastp 1697 LYD361 pigeonpea|10v1|SRRO54580S0002896_P1 9167 522 83,2 globlastp 1698 LYD361 soybean|11v1|GLYMA16G27970_P1 9168 522 83,2 globlastp 1699 LYD361 euonymus|11v1|SRR070038X183598_P1 9169 522 83,0 globlastp 1700 LYD361 prunus|10v1|CN863451_P1 9170 522 82,9 globlastp 1701 LYD361 cassava|09v1|DB924424_P1 9171 522 82,8 globlastp 1702 LYD361 soybean|11v1|GLYMA02G08870_P1 9172 522 82,7 globlastp 1703 LYD361 euonymus|11v1|SRR070038X232447_P1 9173 522 82,6 globlastp 1704 LYD361 castorbean|09v1|EG661912 9174 522 82,6 globlastp 1705 LYD361 medicago|09v1|AW697167_T1 9175 522 82,5 glotblastn 1706 LYD361 soybean|11v1|GLYMA20G30820_P1 9176 522 82,4 globlastp 1707 LYD361 strawberry|11v1|C0380909_P1 9177 522 82,0 globlastp 1708 LYD361 oak|10v1|FP050105_P1 9178 522 81,9 globlastp 1709 LYD361 pigeonpea|10v1|SRR054580S0001419_P1 9179 522 81,8 globlastp 1710 LYD361 wheatnella|11v1|SRR066194X118927_P1 9180 522 81,8 globlastp 1711 LYD361 eucalyptus|11v2|CD668707_P1 9181 522 81,6 globlastp 1712 LYD361 soybean|11v1|GLYMA10G36770_P1 9182 522 81,3 globlastp 1713 LYD361 cannabis|12v1|JK494197_P1 9183 522 81,0 globlastp 1714 LYD361 lotus|09v1|BW597660_P1 9184 522 81,0 globlastp 1715 LYD361 tomato |11v1|AA840712_P1 9185 522 81,0 globlastp 1716 LYD361 solanum_phureja|09v1|SPHBG125314_P1 9186 522 80,7 globlastp 1717 LYD362 b_oleracea|gb161|AM058722_P1 523 523 100,0 globlastp 1718 LYD362 b_rapa|gb162|CX270841_P1 523 523 100,0 globlastp 1719 LYD362 canola|10v1| 1CD818750 523 523 100,0 globlastp 1720 LYD362 canola|11v1|CN735773_P1 523 523 100,0 globlastp 1721 LYD362 canola|10v1|CD818786 9187 523 99,1 globlastp 1722 LYD362 canola|11v1|DT469142XX1_P1 9188 523 99,1 globlastp 1723 LYD362 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01ARDSX_P1 9189 523 96,4 globlastp 1724 LYD362 radish|gb164|EV565231 9190 523 94,5 globlastp 1725 LYD362 radish|gb164|EW722889 9191 523 94,5 globlastp 1726 LYD362 radish|gb164|EY949609 9192 523 93,6 globlastp 1727 LYD362 arabidopsis|10v1|AT2G30410_P1 9193 523 92,9 globlastp 1728 LYD362 radish|gb164|EY909380 9194 523 92,7 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BM985651_ 1729 LYD362 9195 523 89,4 globlastp P1

202 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1730 LYD362 thellungiellatb167P3M985651 9196 523 89,4 globlastp 1731 LYD362 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL014106_P1 9197 523 86,7 globlastp 1732 LYD362 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL031573P1 9197 523 86,7 globlastp 1733 LYD362 cleome_spinosa|10v1|GR931717_P1 9198 523 84,1 globlastp 1734 LYD362 b_juncea|10v2|BJ1SLX00084544D1_P1 9199 523 82,7 globlastp 1735 LYD362 cleome_spinosa|10v1|GR933996_P1 9200 523 81,4 globlastp 1736 LYD364 canola|11v1|EE559498_P1 9201 524 97,2 globlastp 1737 LYD364 arabidopsis|10v1|AT2G39450_P1 9202 524 95,2 globlastp 1738 LYD364 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL032027_P1 9203 524 94,7 globlastp arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL0151 1739 LYD364 9204 524 93,9 globlastp 95_P1 1740 LYD364 castorbean|09v1|XM002533618 9205 524 84,3 globlastp 1741 LYD364 castorbean|11v1|XM002533618_P1 9205 524 84,3 globlastp 1742 LYD364 papaya|gb165|EX260866_P1 9206 524 84,0 globlastp 1743 LYD364 prunus|10v1|CN879479 9207 524 83,5 globlastp 1744 LYD364 nasturtium|10v1|ISRR032558S0022337 9208 524 83,1 globlastp 1745 LYD364 humulus|11v1|GD251458_P1 9209 524 83,0 globlastp 1746 LYD364 cassava|09v1|DB926040_P1 9210 524 82,7 globlastp 1747 LYD364 soybean|11v1|GLYMA02G10580 9211 524 81,8 globlastp 1748 LYD364 soybean|11v1|GLYMA18G52280 9212 524 81,8 globlastp 1749 LYD364 pigeonpea|10v1|SRR054580S0008451_P1 9213 524 81,6 globlastp 1750 LYD364 eucalyptus|11v2|CU397180_P1 9214 524 81,6 globlastp 1751 LYD364 poplar|10v1|BU817178_P1 9215 524 81,5 globlastp 1752 LYD364 cowpea|gb166|FF383719_P1 9216 524 81,3 globlastp 1753 LYD364 medicago|09v1|BG449878_P1 9217 524 81,3 globlastp 1754 LYD364 poplar|10v1|BI138818_P1 9218 524 81,0 globlastp 1755 LYD364 cannabis|12v1|SOLX00036108_P1 9219 524 80,9 globlastp 1756 LYD364 bean|gb167|CA899124_P1 9220 524 80,6 globlastp 1757 LYD364 spurge|gb161|DV146410 9221 524 80,3 globlastp 1758 LYD364 tomato|09v1|AWO31194 9222 524 80,1 globlastp 1759 LYD367 euphorbia|11v1|DV138613XX2_P1 9223 527 88,8 globlastp 1760 LYD367 castorbean|11v1|RCCRP026082_P1 9224 527 88,4 globlastp 1761 LYD367 castorbean|09v1|GE633160 9224 527 88,4 globlastp 1762 LYD367 prunus|10v1|BU574102 9225 527 87,3 globlastp 1763 LYD367 strawberry|11v1|DY666902 9226 527 87,3 globlastp 1764 LYD367 apple|11v1|CN491058_P1 9227 527 86,9 globlastp 1765 LYD367 apple|gb171|CN490020 9228 527 86,7 globlastp 1766 LYD367 apple|11v1|CN490020_P1 9229 527 85,4 globlastp 1767 LYD367 euonymus|11v1|SRR070038X1110_P1 9230 527 85,4 globlastp 1768 LYD367 grape|11v1|GSVIVT01032872001_P1 9231 527 85,3 globlastp 1769 LYD367 apple|11v1|CN544831_P1 9232 527 84,4 globlastp 1770 LYD367 strawberry|11v1|DV438123 9233 527 84,4 globlastp 1771 LYD367 soybean|11v1|GLYMA02G38500 9234 527 83,4 globlastp 1772 LYD367 cowpea|gb166|FC458770_P1 9235 527 83,4 globlastp 1773 LYD367 soybean|11v1|GLYMA14G36580 9236 527 83,4 globlastp 1774 LYD367 clementine|11v1|CB293725_P1 9237 527 82,5 globlastp 1775 LYD367 orange|11v1|CB293725_P1 9237 527 82,5 globlastp 1776 LYD367 soybean|11v1|GLYMA04G40290 9238 527 82,1 globlastp 1777 LYD367 castorbean|11v1|XM002520858_P1 9239 527 81,2 globlastp 1778 LYD367 artemisia|10v1|EY098387_P1 9240 527 80,5 globlastp 1779 LYD368 b_rapa|gb162|CV432839_P1 9241 528 97,9 globlastp 1780 LYD368 canola|10v1|EE412828 9242 528 97,9 globlastp 1781 LYD368 canola|11v1|DY024249_P1 9241 528 97,9 globlastp 1782 LYD368 b_oleracea|gb161|EH419690_P1 9243 528 96,9 globlastp 1783 LYD368 canola|10v1|DY024249 9243 528 96,9 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP012252 1784 LYD368 9244 528 87,5 glotblastn _P1 1785 LYD368 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AHGDF_P1 9245 528 84,4 globlastp 1786 LYD368 b_rapa|gb162|CV545051_P1 9246 528 84,4 globlastp 1787 LYD368 canola|10v1|H07527 9246 528 84,4 globlastp 1788 LYD368 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BH57J_P1 9247 528 83,3 globlastp

203 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1789 LYD368 radish|gb164|EV525681 9248 528 83,3 globlastp 1790 LYD368 radish|gb164|EV528102 9249 528 83,3 globlastp 1791 LYD368 canola|11v1|DW997927_P1 9250 528 82,3 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111002 1792 LYD368 9251 528 81,3 glotblastn 707_T1 arabidopsis_lyrata|09v1|CRPALE003204_P 1793 LYD368 9252 528 81,2 globlastp 1 1794 LYD368 canola|10v1|EV092534 9253 528 81,2 globlastp 1795 LYD368 canola|11v1|EV092534_P1 9253 528 81,2 globlastp 1796 LYD368 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01DLRGJ_P1 9254 528 80,2 globlastp 1797 LYD370 wheat|10v2|C0348607 9255 529 94,8 globlastp 1798 LYD370 wheat|10v2|CA621682 9256 529 94,0 globlastp 1799 LYD370 brachypodium|09v1|GT768373_P1 9257 529 86,0 globlastp 1800 LYD370 cenchrus|gb166|EB653682_P1 9258 529 82,3 globlastp 1801 LYD370 foxtail_millet|10v2|EC612415 9259 529 81,6 globlastp 1802 LYD370 foxtail_millet|11v3|EC612415_P1 9259 529 81,6 globlastp 1803 LYD370 arroz1gb17010S02G30210 9260 529 81,0 glotblastn 1804 LYD370 switchgrass1gb1671FE605702 9261 529 80,8 globlastp 1805 LYD370 millet|10v1|EV0454PM006085_P1 9262 529 80,5 globlastp 1806 LYD370 sorghum|11v1|SB04G020510_P1 9263 529 80,5 globlastp 1806 LYD370 sorghum|09v1|SB04G020510 9264 529 80,3 glotblastn 1807 LYD371 oat|11v1|G0587393_P1 9265 530 87,1 globlastp 1808 LYD371 oat|10v2|G0587393 9266 530 87,1 glotblastn 1809 LYD371 wheat|10v2|BE591640 9267 530 86,3 globlastp 1810 LYD371 brachypodium|09v1|GT785931_P1 9268 530 82,0 globlastp 1811 LYD372 canola|11v1|SRR329661.194576_ T1 9269 531 98,1 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|DN775351_P 1812 LYD372 9270 531 94,7 globlastp 1 1813 LYD372 thellungiella_parvulum|11v1|DN775351_P1 9271 531 93,8 globlastp 1814 LYD372 canola|11v1|EV191509_T1 9272 531 92,8 glotblastn 1815 LYD372 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL031176_P1 9273 531 91,7 globlastp 1816 LYD372 canola|11v1|ES975082_T1 9274 531 91,4 glotblastn 1817 LYD372 arabidopsis|10v1|AT5G64940_P1 9275 531 91,3 globlastp 1818 LYD372 canola|11v1|CN735553_T1 9276 531 88,6 glotblastn cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0000116 1819 LYD372 9277 531 84,2 globlastp _P1 1820 LYD375 b_rapa|gb162|EX135722_P1 9278 532 97,7 globlastp 1821 LYD375 canola|10v1|CN727702 9279 532 97,3 globlastp 1822 LYD375 thellungiella_parvulum|11v1|BY802168_P1 9280 532 93,7 globlastp 1823 LYD375 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AJVXG_P1 9281 532 93,7 globlastp 1824 LYD375 radish|gb164|EW714450 9282 532 93,7 globlastp 1825 LYD375 arabidopsis|10v1|AT5G26220_P1 9283 532 90,0 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY802168_P 1826 LYD375 9284 532 89,7 globlastp 1 1827 LYD375 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL022363_P1 9285 532 88,2 globlastp 1828 LYD375 radish|gb164|1FD960741 9286 532 85,0 glotblastn thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP014458 1829 LYD376 9287 533 83,2 globlastp _P1 thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111009 1830 LYD376 9288 533 82,6 globlastp 619_P1 1831 LYD376 arabidopsis|10v1|AT2G46340_P1 9289 533 82,6 globlastp 1832 LYD376 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL016038_P1 9290 533 81,6 globlastp 1833 LYD377 canola|11v1|EV098297_P1 9291 534 84,9 globlastp 1834 LYD379 b_rapa|gb162|CX271630_P1 9292 536 99,6 globlastp 1835 LYD379 radish|gb164|EV544172 9293 536 97,1 globlastp 1836 LYD379 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AMKB5_P1 9294 536 96,3 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111024 1837 LYD379 9295 536 94,7 globlastp 159_P1 thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111025 1838 LYD379 9296 536 94,7 glotblastn 592_T1 1839 LYD379 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01CHCMG_P1 9297 536 93,0 globlastp

204 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1840 LYD379 canola|10v1|CD822865 9298 536 92,2 globlastp 1841 LYD379 canola|11v1|EG020911_P1 9298 536 92,2 globlastp 1842 LYD379 radish|gb164|EV526885 9299 536 92,2 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP026832 1843 LYD379 9300 536 91,0 glotblastn _T1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP024302 1844 LYD379 9301 536 90,9 globlastp _P1 1845 LYD379 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL019940_P1 9302 536 88,7 globlastp 1846 LYD379 arabidopsis|10v1|AT5G03170_P1 9303 536 88,7 globlastp 1847 LYD379 brapa|gb162|EX016587_P1 9304 536 85,4 globlastp 1848 LYD379 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BL8GX_P1 9305 536 81,5 globlastp 1849 LYD380 cotton|10v2|SRR032367S0710599_T1 9306 537 92,7 glotblastn 1850 LYD386 cotton|10v2|BF278870_P1 9307 542 97,3 globlastp 1851 LYD387 cacao|10v1|CU513902_P1 9308 543 90,8 globlastp 1852 LYD387 clementine|11v1|DN799412_P1 9309 543 81,7 globlastp 1853 LYD387 orange|11v1|DN799412_P1 9310 543 80,3 globlastp 1854 LYD387 oak|10v1|FN698737 T1 9311 543 80,0 glotblastn 1855 LYD391 foxtail_millet|11v3|PHY7SI001924M_P1 9312 546 87,8 globlastp foxtail_millet|10v2|FXTRMSLX00201082D 1856 LYD391 9313 546 87,7 globlastp 1 1857 LYD391 arroz|gb170|OS01G51920 9314 546 84,1 globlastp 1858 LYD391 brachypodium|09v1|GT764491_P1 9315 546 82,9 globlastp 1859 LYD391 oat|10v2|GR325627 9316 546 82,7 glotblastn 1860 LYD391 oat|10v2|GR321475 9317 546 81,9 globlastp 1861 LYD391 wheat|10v2|BE498760 9318 546 81,6 globlastp 1862 LYD391 wheat|10v2|BE418714 9319 546 80,6 globlastp 1863 LYD392 sugarcane|10v1|BQ529848 9320 547 92,6 globlastp 1864 LYD392 sorghum|09v1|SB02G028940 9321 547 92,4 globlastp 1865 LYD392 sorghum|11v1|SB02G028940_P1 9321 547 92,4 globlastp 1866 LYD392 maize|10v1|AW215973_P1 9322 547 91,0 globlastp 1867 LYD393 wheatnella|11v1|SRR066194X125018_P1 9323 548 82,6 globlastp 1868 LYD393 wheatnella|11v1|SRR066194X111381_T1 9324 548 82,5 glotblastn 1869 LYD393 wheatnella|11v1|SRR066194X100657_P1 9325 548 82,2 globlastp 1870 LYD393 medicago|09v1|AW684192_P1 9326 548 82,2 globlastp 1871 LYD393 wheatnella|11v1|SRR066194X179446_P1 9327 548 82,1 globlastp 1872 LYD393 wheatnella|11v1|SRR066194X120068_P1 9328 548 81,7 globlastp 1873 LYD393 wheatnella|11v1|SRR066194X108217_T1 9329 548 81,3 glotblastn 1874 LYD395 cowpea|gb166|FF388146_T1 9330 549 87,4 glotblastn 1875 LYD395 soybean|11v1|GLYMA07G32980 9331 549 86,8 glotblastn 1876 LYD395 soybean|11v1|GLYMA02G15520 9332 549 86,1 glotblastn 1877 LYD395 pigeonpea|10v1|SRR054580S0035790_T1 9333 549 85,5 glotblastn 1878 LYD395 bean|gb167|CA910344_T1 9334 549 84,9 glotblastn 1879 LYD395 lotus|09v1|LBW596306_T1 9335 549 84,3 glotblastn 1880 LYD396 soybean|11v1|GLYMA15G06460 9336 550 84,6 globlastp 1881 LYD396 cowpea|gb166|FF386126_P1 9337 550 82,9 globlastp 1882 LYD396 peanut|10v1|ES717343J1 9338 550 81,7 globlastp 1883 LYD396 cassava|09v1|DV456223_P1 9339 550 80,0 globlastp 1884 LYD396 oak|10v1|SRR006307S0005274_P1 9340 550 80,0 globlastp 1885 LYD397 wheatnella|11v1|SRR066194X126544P1 9341 551 94,1 globlastp 1886 LYD397 peanut|10v1|ES718930_P1 9342 551 87,0 globlastp 1887 LYD397 bean|gb167|CB540509_P1 9343 551 85,5 globlastp 1888 LYD397 soybean|11v1|GLYMA09G30670 9344 551 85,0 globlastp 1889 LYD397 soybean|11v1|GLYMA07G11600 9345 551 84,4 globlastp 1890 LYD397 cowpea|gb166|FF539245_P1 9346 551 83,8 globlastp 1891 LYD399 cowpea|gb166|FF387908_P1 9347 553 90,0 globlastp 1892 LYD399 grape|gb160|CB914867 9348 553 88,8 globlastp 1893 LYD399 soybean|11v1|GLYMA15G07890 9349 553 87,6 globlastp 1894 LYD399 euphorbia|11v1|DV135472_P1 9350 553 87,3 globlastp 1895 LYD399 grape|11v1|GSVIVT01002021001_P1 9351 553 87,3 globlastp 1896 LYD399 bean|gb167|FE705939_T1 9352 553 87,3 glotblastn 1897 LYD399 lotus|09v1|P3P074755_P1 9353 553 86,9 globlastp

205 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1898 LYD399 soybean|11v1|GLYMA13G24930 9354 553 86,1 globlastp 1899 LYD399 wheatnella|11v1|SRR066194X332395_P1 9355 553 86,1 glotblastn 1900 LYD399 papaya|gb165|EX256723_P1 9356 553 85,7 globlastp 1901 LYD399 soybean|11v1|GLYMA07G31510 9357 553 85,7 globlastp 1902 LYD399 castorbean|11v1|EE255123T1 9358 553 85,7 glotblastn 1903 LYD399 cowpea|gb166|FF387808_P1 9359 553 85,3 globlastp 1904 LYD399 heritiera|10v1|SRR005795S0016182_T1 9360 553 85,3 glotblastn 1905 LYD399 cassava|09v1|CK642897_P1 9361 553 84,9 globlastp 1906 LYD399 castorbean|11v1|EE260645_P1 9362 553 84,5 globlastp 1907 LYD399 castorbean|09v1|PE260645 9362 553 84,5 globlastp 1908 LYD399 chestnut|gb170|SRR006297S0030011_P1 9363 553 84,5 globlastp 1909 LYD399 nasturtium|10v1|SRR032558S0141877 9364 553 84,5 globlastp 1910 LYD399 soybean|11v1|GLYMA13G31450 9365 553 84,5 globlastp 1911 LYD399 medicago|09v1|P3E240651_P1 9366 553 84,1 globlastp 1912 LYD399 peanut|10v1|IES719692_P1 9367 553 84,1 globlastp 1913 LYD399 poplar|10v1|P3U823784_P1 9368 553 84,1 globlastp 1914 LYD399 clementine|11v1|CK701105_P1 9369 553 83,7 globlastp 1915 LYD399 orange|11v1|CK701105_P1 9370 553 83,7 globlastp 1916 LYD399 citrus|gb166|CK701105_P1 9370 553 83,7 globlastp 1917 LYD399 valeriana|11v1|SRR099039X130276_ T1 9371 553 83,3 glotblastn 1918 LYD399 euonymus|11v1|SRR070038X178680_P1 9372 553 82,9 globlastp 1919 LYD399 silene|11v1|GH294151XX1_P1 9373 553 82,9 globlastp 1920 LYD399 cotton|10v2|C0495256_P1 9374 553 82,9 globlastp 1921 LYD399 strawberry|11v1|GW402854 9375 553 82,9 globlastp 1922 LYD399 euonymus|11v1|SRR070038X175660_P1 9376 553 82,5 globlastp 1923 LYD399 cotton|10v2|DT047262_P1 9377 553 82,5 globlastp 1924 LYD399 prunus|10v1|CN918732 9378 553 82,5 globlastp 1925 LYD399 pigeonpea|10v1|SRR054580S0032474_T1 9379 553 82,5 glotblastn 1926 LYD399 cucumber|09v1|AM718551_P1 9380 553 82,1 globlastp 1927 LYD399 watermelon|11v1|AM718551_P1 9381 553 81,7 globlastp 1928 LYD399 melon|10v1|AM718551_P1 9381 553 81,7 globlastp 1929 LYD399 poplar|10v1|BU877356_P1 9382 553 81,7 globlastp 1930 LYD399 apple|11v1|CN495494_P1 9383 553 81,3 globlastp 1931 LYD399 solanum_phureja|09v1|SPHA1777435 9384 553 80,9 globlastp 1932 LYD399 eucalyptus|11v2|SRR001659X187899_P1 9385 553 80,5 globlastp 1933 LYD399 monkeyflower|10v1|CV520980_P1 9386 553 80,5 globlastp 1934 LYD399 tomato|09v1|A1777435 9387 553 80,5 globlastp 1935 LYD399 silene|11v1|SRR096785X108973_T1 9388 553 80,5 glotblastn 1936 LYD399 cacao|10v1|CU469886 T1 9389 553 80,5 glotblastn 1937 LYD399 nasturtium|10v1|SRR032558S0071113 9390 553 80,5 glotblastn 1938 LYD399 orobanche|10v1|SRR02318950079506_T1 9391 553 80,2 glotblastn 1939 LYD399 coffea|10v1|DV675552_P1 9392 553 80,1 globlastp 1940 LYD399 triphysaria|10v1|PY184391 9393 553 80,1 globlastp 1941 LYD399 pineapple|10v1|CO731834_T1 9394 553 80,1 glotblastn 1942 LYD401 wheatnella|11v1|SRR066194X116571_P1 9395 554 93,7 globlastp 1943 LYD401 pigeonpea|10v1|SRR054580S0000550_T1 9396 554 88,3 glotblastn 1944 LYD401 soybean|11v1|GLYMA12G03620 9397 554 87,2 globlastp 1945 LYD401 soybean|11v1|GLYMA11G11470 9398 554 87,0 globlastp 1946 LYD401 bean|gb167|CA908778_P1 9399 554 86,8 globlastp 1947 LYD401 clementine|11v1|CB291203_P1 9400 554 81,8 globlastp 1948 LYD401 orange|11v1|CB291203_P1 9401 554 81,8 globlastp 1949 LYD401 citrus|gb166|CB291203_P1 9402 554 81,8 globlastp 1950 LYD401 cassava|09v1|JGICASSAVA3500M1_P1 9403 554 81,1 globlastp 1951 LYD401 cacao|10v1|CA795197_P1 9404 554 81,0 globlastp 1952 LYD401 soybean|11v1|GLYMA06G00610 9405 554 81,0 globlastp 1953 LYD401 poplar|10v1|CF236165_P1 9406 554 80,4 globlastp 1954 LYD401 grape|11v1|GSVIVT01009943001_P1 9407 554 80,0 globlastp 1955 LYD401 grape|gb160|CF373318 9408 554 80,0 globlastp 1956 LYD402 soybean|11v1|GLYMA16G03490 9409 555 91,7 globlastp 1957 LYD402 pigeonpea|10v1|SRR054580S0013470_P1 9410 555 90,8 globlastp

206 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 1958 LYD402 soybean|11v1|GLYMA09G00990 9411 555 90,8 globlastp 1959 LYD402 soybean|11v1|GLYMA15G11840 9412 555 90,5 globlastp 1960 LYD402 wheatnella|11v1|SRR066195X303860_T1 9413 555 89,5 glotblastn 1961 LYD402 cowpea|gb166|FF400752_P1 9414 555 88,2 globlastp 1962 LYD402 pigeonpea|10v1|SRR054580S0001612_P1 9415 555 88,2 globlastp 1963 LYD402 clover|gb162|13B906633_P1 9416 555 88,0 globlastp 1964 LYD402 peanut|10v1|CD037669_P1 9417 555 85,6 globlastp 1965 LYD402 bean|gb167|CA910295_P1 9418 555 83,8 globlastp 1966 LYD404 wheatnella|11v1|SRR066194X117614_P1 9419 557 93,9 globlastp 1967 LYD404 clover|gb162|13B903862_P1 9420 557 88,8 globlastp 1968 LYD404 pigeonpea|10v1|SRR054580S0004281_T1 9421 557 80,2 glotblastn 1969 LYD410 wheatnella|11v1|SRR066194X12105_P1 9422 562 90,0 globlastp 1970 LYD410 lotus|09v1|CRPLJ028057_P1 9423 562 81,4 globlastp 1971 LYD410 soybean|11v1|GLYMA17G03600 9424 562 80,5 globlastp 1972 LYD413 soybean|11v1|GLYMA11G19070 9425 563 86,0 globlastp 1973 LYD414 lotus|09v1|CRPLJ029488_P1 9426 564 94,2 globlastp 1974 LYD414 1otus|09v1|G0018872_P1 9427 564 94,2 globlastp 1975 LYD414 pigeonpea|10v1|GW359329_P1 9428 564 91,3 globlastp 1976 LYD414 soybean|11v1|GLYMA17G02670 9429 564 91,3 globlastp 1977 LYD414 soybean|11v1|GLYMA07G38030 9430 564 90,3 globlastp 1978 LYD414 cleome_spinosa|10v1|GR933852_P1 9431 564 89,3 globlastp 1979 LYD414 bean|gb167|FE680198_P1 9432 564 88,3 globlastp 1980 LYD414 lotus|09v1|CRPLJ020033_P1 9433 564 87,4 globlastp 1981 LYD414 peanut|10v1|G0265885_P1 9434 564 85,4 globlastp 1982 LYD414 apple|11v1|C0723505_P1 9435 564 84,5 globlastp 1983 LYD414 thellungiella_parvulum|11v1|BY806450_P1 9436 564 84,5 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPPRD115540 1984 LYD414 9436 564 84,5 globlastp _P1 1985 LYD414 peanut|10v1|SRR042421S0009019_P1 9437 564 84,5 globlastp 1986 LYD414 arabidopsis|10v1|AT5G18600_P1 9438 564 83,5 globlastp 1987 LYD414 cotton|10v2|DW495711_P1 9439 564 83,5 globlastp 1988 LYD414 nasturtium|10v1|SRR03256350302860 9440 564 83,5 glotblastn 1989 LYD414 strawberry|11v1|CRPFV006980 9441 564 83,5 globlastp 1990 LYD414 strawberry|11v1|DY667636 9442 564 83,5 globlastp 1991 LYD414 strawberry|11v1|EX659937 9443 564 83,5 globlastp 1992 LYD414 cotton|10v2|SRR032877S0785567_T1 9444 564 82,5 glotblastn 1993 LYD414 cannabis|12v1|SOLX00084372_P1 9445 564 82,5 globlastp 1994 LYD414 canola|11v1|SRR341921.89376_P1 9446 564 82,5 globlastp 1995 LYD414 clementine|11v1|CX299972_P1 9447 564 82,5 globlastp 1996 LYD414 orange|11v1|CX299972_P1 9447 564 82,5 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY806450_P 1997 LYD414 9448 564 82,5 globlastp 1 thellungiella_halophilum|11v1|EHPRD1235 1998 LYD414 9448 564 82,5 globlastp 85_P1 1999 LYD414 chestnut|gb170|SRR00629550025297_P1 9449 564 82,5 globlastp 2000 LYD414 oak|10v1|CU657214_P1 9449 564 82,5 globlastp 2001 LYD414 papaya|gb165|EX280370_P1 9450 564 82,5 globlastp 2002 LYD414 radish|gb164|EV527379 9451 564 82,5 globlastp 2003 LYD414 soybean|11v1|GLYMA13G28750 9452 564 82,5 globlastp 2004 LYD414 soybean|11v1|GLYMA15G10340 9453 564 82,5 globlastp 2005 LYD414 thellungiella|gb167|BY806450 9448 564 82,5 globlastp 2006 LYD414 canola|11v1|EE445453_P1 9454 564 82,5 globlastp 2007 LYD414 phyla|11v2|SRR099035X103366_P1 9455 564 81,6 globlastp 2008 LYD414 apple|gb171|CN912693 9456 564 81,6 globlastp 2009 LYD414 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL021580_P1 9457 564 81,6 globlastp 2010 LYD414 brapa|gb162|EX127132_P1 9458 564 81,6 globlastp 2011 LYD414 canola|10v1|T18374 9458 564 81,6 globlastp cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0016539 2012 LYD414 9459 564 81,6 globlastp _P1 2013 LYD414 poplar|10v1|CV130866_P1 9460 564 81,6 globlastp 2014 LYD414 prunus|10v1|CN912693 9461 564 81,6 globlastp

207 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 2015 LYD414 radish|gb164|EW716200 9462 564 81,6 globlastp 2016 LYD414 strawberry|11v1|SRR034859S0010037 9463 564 81,6 globlastp cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0048948 2017 LYD414 - 564 81,6 glotblastn _T1 2018 LYD414 thellungiella_parvulum|11v1|BY806 386_P1 9464 564 80,6 globlastp 2019 LYD414 b_junceal|10v2|GT068231_P1 9465 564 80,6 globlastp 2020 LYD414 canola|10v1|EV095853 9466 564 80,6 globlastp 2021 LYD414 canola|11v1|EV095853_P1 9466 564 80,6 globlastp 2022 LYD414 citrus|gb166|CX299972_P1 9467 564 80,6 globlastp 2023 LYD414 poplar|10v1|CV240662_P1 9468 564 80,6 globlastp 2024 LYD414 poplar|10v1|CV278171_P1 9469 564 80,6 globlastp 2025 LYD416 soybean|11v1|GLYMA06G46430 9470 566 87,0 globlastp 2026 LYD416 trigonella|11v1|SRR066194X101909_Pl 9471 566 85,9 globlastp 2027 LYD416 pigeonpea|10v1|SRR054580S0002803_P1 9472 566 85,1 globlastp 2028 LYD416 clover|gb162|BB914177_P1 9473 566 84,4 globlastp 2029 LYD416 peanut|10v1|ES713065_P1 9474 566 82,6 globlastp 2030 LYD416 cowpea|gb166|FF552168_P1 9475 566 82,2 globlastp 2031 LYD416 chestnut|gb170|SRR006295S0029361_P1 9476 566 80,9 globlastp 2032 LYD416 oak|10v1|CU657704_P1 9477 566 80,9 globlastp 2033 LYD416 cacao|10v1|ICU471550_T1 9478 566 80,3 glotblastn 2034 LYD419 cowpea|gb166|FF390537_P1 9479 569 80,7 globlastp 2035 LYD422 cowpea|gb166|AY193836_P1 9480 572 85,6 globlastp 2036 LYD422 soybean|11v1|GLYMA04G16670 9481 572 84,9 globlastp 2037 LYD422 peanut|10v1|G0257637_P1 9482 572 83,8 globlastp 2038 LYD422 cotton|10v2|C0070710_P1 9483 572 82,5 globlastp 2039 LYD422 grape|11v1|GSVIVT01012120001_P1 9484 572 80,7 globlastp 2040 LYD423 maize|10v1|AWO65872_P1 9485 573 94,9 globlastp 2041 LYD423 maize|10v1|BM078612_P1 9486 573 94,6 globlastp 2042 LYD423 foxtail_millet|10v2|SICRP033197 9487 573 91,1 globlastp 2043 LYD423 foxtail_millet|11v3|PHY7S1035674M_P1 9487 573 91,1 globlastp 2044 LYD423 switchgrass|gb167|FE647721 9488 573 87,9 glotblastn 2045 LYD424 maize|10v1|BM332887_P1 9489 574 91,7 globlastp 2046 LYD424 foxtail_millet|10v3|PHY7S1036740M_P1 9490 574 88,4 globlastp 2047 LYD424 rice|gb170|0S03G06680 9491 574 80,8 glotblastn 2048 LYD424 leymus|gb166|EG375050_P1 9492 574 80,0 globlastp 2049 LYD424 pseudoroegneria|gb167|FF340165 9493 574 80,0 glotblastn amorphophallus|11v2|SRR089351X105267_ 2050 LYD425 575 575 100,0 globlastp P1 amorphophallus|11v2|SRR089351X161133_ 2051 LYD425 575 575 100,0 globlastp P1 2052 LYD425 amsonia|11v1|SRR098688X115913_P1 575 575 100,0 globlastp 2053 LYD425 apple|11v1|CN489923_T1 9494 575 100,0 glotblastn 2054 LYD425 apple|11v1|G0552106_P1 575 575 100,0 globlastp 2055 LYD425 arnica|11v1|SRR099034X180374_P1 575 575 100,0 globlastp 2056 LYD425 catharanthus|11v1|EG557453XX1_P1 575 575 100,0 globlastp 2057 LYD425 chelidonium|11v1|SRR084752X213 032_P1 575 575 100,0 globlastp 2058 LYD425 cirsium|11v1|SRR346952.1007935_P1 575 575 100,0 globlastp 2059 LYD425 cirsium|11v1|SRR346952.1040707_P1 575 575 100,0 globlastp 2060 LYD425 cirsium|11v1|SRR346952.155897_P1 575 575 100,0 globlastp 2061 LYD425 cirsium|11v1|SRR346952.182812_P1 575 575 100,0 globlastp 2062 LYD425 cirsium|11v1|SRR346952.28824_P1 575 575 100,0 globlastp 2063 LYD425 cirsium|11v1|SRR349641.179804_P1 575 575 100,0 globlastp 2064 LYD425 clementine|11v1|BQ623073_P1 575 575 100,0 globlastp 2065 LYD425 cucurbita|11v1|SRR091276X104602_P1 575 575 100,0 globlastp 2066 LYD425 fagopyrum|11v1|SRR063689X107152_P1 575 575 100,0 globlastp 2067 LYD425 fagopyrum|11v1|ISRR063689X12648_P1 575 575 100,0 globlastp 2068 LYD425 flaveria|11v1|SRR149232.324408_P1 575 575 100,0 globlastp 2069 LYD425 humulus|11v1|GD244886_P1 575 575 100,0 globlastp 2070 LYD425 olea|11v1|SRR014463.33572_P1 575 575 100,0 globlastp 2071 LYD425 orange|11v1|BQ623073_P1 575 575 100,0 globlastp 2072 LYD425 plantago|11v1|SRR066373X248945_P1 575 575 100,0 globlastp

208 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 2073 LYD425 platanus|11v1|SRR096786X116167_P1 575 575 100,0 globlastp 2074 LYD425 primula|11v1|SRR098679X101493_P1 575 575 100,0 globlastp 2075 LYD425 primula|11v1|SRR098679X126892_P1 575 575 100,0 globlastp 2076 LYD425 sarracenia|11v1|SRR192669.105268_P1 575 575 100,0 globlastp 2077 LYD425 sarracenia|11v1|SRR192669.127382_P1 575 575 100,0 globlastp 2078 LYD425 sarracenia|11v1|SRR192669.154681_P1 575 575 100,0 globlastp 2079 LYD425 silene|11v1|DV768270_P1 575 575 100,0 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X17937_ 2080 LYD425 575 575 100,0 globlastp P1 2081 LYD425 thalictrum|11v1|SRR096787X11264l_P1 575 575 100,0 globlastp 2082 LYD425 tomato|11v1|BG130030_P1 575 575 100,0 globlastp 2083 LYD425 trigonella|11v1|SRR066194X117847_P1 575 575 100,0 globlastp 2084 LYD425 trigonella|11v1|SRR066194X334327_P1 575 575 100,0 globlastp 2085 LYD425 valeriana|11v1|SRR099039X101266_P1 575 575 100,0 globlastp 2086 LYD425 vinca|11v1|SRR098690X107973_P1 575 575 100,0 globlastp 2087 LYD425 vinca|11v1|SRR098690X155758_P1 575 575 100,0 globlastp 2088 LYD425 watermelon|11v1|AM735805_P1 575 575 100,0 globlastp 2089 LYD425 acacia|10v1|FS586303_P1 575 575 100,0 globlastp 2090 LYD425 antirrhinum|gb166|AJ559330_P1 575 575 100,0 globlastp 2091 LYD425 apple|gb171|CN489610 575 575 100,0 globlastp 2092 LYD425 aquilegia|10v2|JGIAC002861_P1 575 575 100,0 globlastp 2093 LYD425 aquilegia|10v2|JGIAC004817_P1 575 575 100,0 globlastp 2094 LYD425 aristolochia|10v1|FD748189_P1 575 575 100,0 globlastp 2095 LYD425 artemisia|10v1|SRR019254S0007321_P1 575 575 100,0 globlastp 2096 LYD425 artemisia|10v1|SRR019254S0067002_P1 575 575 100,0 globlastp 2097 LYD425 avocado|10v1|FD502501_P1 575 575 100,0 globlastp 2098 LYD425 banana|10v1|FF558222_P1 575 575 100,0 globlastp 2099 LYD425 banana|10v1|FF561412_P1 575 575 100,0 globlastp 2100 LYD425 barley|10v2|BI954362_P1 575 575 100,0 globlastp 2101 LYD425 barley|10v2|BQ470638_P1 575 575 100,0 globlastp 2102 LYD425 bean|gb167|CA912661_P1 575 575 100,0 globlastp 2103 LYD425 brachypodium|09v1|GT766635_P1 575 575 100,0 globlastp 2104 LYD425 brachypodium|09v1|GT789988_P1 575 575 100,0 globlastp 2105 LYD425 cacao|10v1|CA795914_P1 575 575 100,0 globlastp cassava|09v1|JGICASSAVA23391VALID 2106 LYD425 575 575 100,0 globlastp M1p1 cassava|09v1|JGICASSAVA37723VALID 2107 LYD425 575 575 100,0 globlastp M1p1 2108 LYD425 castorbean|09v1|NM002532065 575 575 100,0 globlastp 2109 LYD425 castorbean|11v1|NM002532065_P1 575 575 100,0 globlastp 2110 LYD425 catharanthus|gb166|EG557453 575 575 100,0 globlastp 2111 LYD425 centaureia|gb166|EH737074_P1 575 575 100,0 globlastp 2112 LYD425 centaureia|gb166|EH751161_P1 575 575 100,0 globlastp 2113 LYD425 chestnut|gb170|SRR006295S0080529p1 575 575 100,0 globlastp 2114 LYD425 cichorium|gb171|EH706683_P1 575 575 100,0 globlastp 2115 LYD425 citrus|gb166|BQ623073_P1 575 575 100,0 globlastp 2116 LYD425 cotton|10v2|BE053913_P1 575 575 100,0 globlastp 2117 LYD425 cotton|10v2|DT456177p1 575 575 100,0 globlastp 2118 LYD425 cowpea|gb166|FF393852_P1 575 575 100,0 globlastp 2119 LYD425 cucumber|09v1|AM735805_P1 575 575 100,0 globlastp 2120 LYD425 cynara|gb167|GE590957_P1 575 575 100,0 globlastp 2121 LYD425 cynodon|10v1|IES301115_P1 575 575 100,0 globlastp 2122 LYD425 dandelion|10v1|DY834532_P1 575 575 100,0 globlastp 2123 LYD425 dandelion|10v1|G0664890_P1 575 575 100,0 globlastp 2124 LYD425 eschscholzia|10v1|CK750386 575 575 100,0 globlastp 2125 LYD425 flax|09v1|EH791645 575 575 100,0 globlastp foxtail_millet|10v2|FXTRMSLX00757488D 2126 LYD425 575 575 100,0 globlastp 1 2127 LYD425 foxtail_millet|11v3|PHY7SI023709M_P1 575 575 100,0 globlastp 2128 LYD425 grape|gb160|CB919745 575 575 100,0 globlastp 2129 LYD425 ipomoea_ni1|10v1|BJ559825_P1 575 575 100,0 globlastp

209 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 2130 LYD425 lettuce|10v1|DWO72190_P1 575 575 100,0 globlastp 2131 LYD425 lettuce|10v1|DW105137_P1 575 575 100,0 globlastp 2132 LYD425 liquorice|gb171|FS241611_P1 575 575 100,0 globlastp 2133 LYD425 lotus|09v1|CRPLJ019393_P1 575 575 100,0 globlastp 2134 LYD425 lotus|09v1|LGO005169_P1 575 575 100,0 globlastp 2135 LYD425 medicago|09v1|LAW256385_P1 575 575 100,0 globlastp 2136 LYD425 melon|10v1|AM735805_P1 575 575 100,0 globlastp 2137 LYD425 nasturtium|10v1|GH171159 575 575 100,0 globlastp 2138 LYD425 nasturtium|10v1|SRR032558S0013949 575 575 100,0 globlastp 2139 LYD425 oak|10v1|CU656518_P1 575 575 100,0 globlastp 2140 LYD425 oak|10v1|FP030208_P1 575 575 100,0 globlastp 2141 LYD425 oak|10v1|FP047514_P1 575 575 100,0 globlastp 2142 LYD425 oat|11v1|GR357135_P1 575 575 100,0 globlastp 2143 LYD425 papaya|gb165|EX245233_P1 575 575 100,0 globlastp 2144 LYD425 peanut|10v1|IEG030174_P1 575 575 100,0 globlastp 2145 LYD425 peanut|10v1|ES718673_P1 575 575 100,0 globlastp 2146 LYD425 pepper|gb171|GD077972_P1 575 575 100,0 globlastp 2147 LYD425 pigeonpea|10v1|GW351313_P1 575 575 100,0 globlastp 2148 LYD425 poplar|10v1|IBU809810_P1 575 575 100,0 globlastp 2149 LYD425 poplar|10v1|BU825464_P1 575 575 100,0 globlastp 2150 LYD425 prunus|10v1|CN489610 575 575 100,0 globlastp 2151 LYD425 prunus|10v1|IPPA013662M 575 575 100,0 globlastp 2152 LYD425 rice|gb170|OS04G56760 575 575 100,0 globlastp 2153 LYD425 rice|gb170|OS05G30410 575 575 100,0 globlastp 2154 LYD425 safflower|gb162|EL407728 575 575 100,0 globlastp 2155 LYD425 Solanum_phureja|09v1|SPHBG130030 575 575 100,0 globlastp 2156 LYD425 soybean|11v1|CD406005 575 575 100,0 globlastp 2157 LYD425 soybean|11v1|GLYMA18G06890 575 575 100,0 globlastp 2158 LYD425 strawberry|11v1|DY675348 575 575 100,0 globlastp 2159 LYD425 strawberry|11v1|EX673811 575 575 100,0 globlastp 2160 LYD425 sugarcane|10v1|CA138731 575 575 100,0 globlastp 2161 LYD425 sunflower|10v1|DY928728 575 575 100,0 globlastp 2162 LYD425 switchgrass|gb167|FE614700 575 575 100,0 globlastp 2163 LYD425 switchgrass|gb167|FL832182 575 575 100,0 globlastp 2164 LYD425 switchgrass|gb167|FL898930 575 575 100,0 globlastp 2165 LYD425 switchgrass|gb167|FL960062 575 575 100,0 globlastp 2166 LYD425 tobacco|gb162|AM808031 575 575 100,0 globlastp 2167 LYD425 tomato|09v1|BG130030 575 575 100,0 globlastp 2168 LYD425 walnuts|gb166|EL901073 575 575 100,0 globlastp 2169 LYD425 wheat|10v2|BE399716 575 575 100,0 globlastp 2170 LYD425 wheat|10v2|BF475119 575 575 100,0 globlastp 2171 LYD425 zostera|10v1|SRR057351S0135099 575 575 100,0 globlastp 2172 LYD425 foxtail_millet|11v3|PHY7SI031575M_P1 575 575 100,0 globlastp 2173 LYD425 oat|11v1|CN815967_P1 575 575 100,0 globlastp 2174 LYD425 grape|11v1|GSVIVT01024719001_T1 - 575 100,0 glotblastn 2175 LYD425 apple|11v1|MDP0000131888_P1 9495 575 99,1 globlastp 2176 LYD425 eucalyptus|11v2|CB967527_P1 9496 575 99,1 globlastp 2177 LYD425 eucalyptus|11v2|CT980336_P1 9495 575 99,1 globlastp 2178 LYD425 euonymus|11v1|SRR070038X107757_P1 9497 575 99,1 globlastp 2179 LYD425 euonymus|11v1|SRR070038X161906_P1 9497 575 99,1 globlastp 2180 LYD425 euonymus|11v1|SRR070038X218339_P1 9497 575 99,1 globlastp 2181 LYD425 flaveria|11v1|SRR149232.110271_P1 9498 575 99,1 globlastp 2182 LYD425 flax|11v1|JG020066_P1 9499 575 99,1 globlastp 2183 LYD425 fraxinus|11v1|FR637641_P1 9500 575 99,1 globlastp 2184 LYD425 pteridium|11v1|SRR043594X132315_P1 9501 575 99,1 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111000 2185 LYD425 9497 575 99,1 globlastp 570_P1 thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111007 2186 LYD425 9497 575 99,1 globlastp 102_P1 thellungiella_halophilum|11v1|EHPRD1044 2187 LYD425 9497 575 99,1 globlastp 71_P1

210 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: thellungiella_halophilum|11v1|EHPRD1238 2188 LYD425 9497 575 99,1 globlastp 29_P1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP000296 2189 LYD425 9497 575 99,1 globlastp _P1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP015320 2190 LYD425 9497 575 99,1 globlastp _P1 thellungiella_parvulum|11v1|EPPRD022332 2191 LYD425 9497 575 99,1 globlastp _P1 2192 LYD425 tripterygium|11v1|SRR098677X132702_P1 9497 575 99,1 globlastp 2193 LYD425 flax111v1PH791645_P1 9499 575 99,1 globlastp 2194 LYD425 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL014057_P1 9497 575 99,1 globlastp 2195 LYD425 arabidopsis|10v1|AT1G07170_P1 9497 575 99,1 globlastp 2196 LYD425 arabidopsis|10v1|AT2G30000_P1 9497 575 99,1 globlastp 2197 LYD425 bruguiera|gb166|BP940013_P1 9502 575 99,1 globlastp 2198 LYD425 canola|11v1|CD812292_P1 9495 575 99,1 globlastp 2199 LYD425 castorbean|09v1|XM002525615 9503 575 99,1 globlastp 2200 LYD425 castorbean|11v1|XM002525615_P1 9503 575 99,1 globlastp 2201 LYD425 cichorium|gb171|EH710067_P1 9504 575 99,1 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S009816 2202 LYD425 9497 575 99,1 globlastp 5_P1 2203 LYD425 coffea|10v1|DV679024_P1 9495 575 99,1 globlastp 2204 LYD425 cynara|gb167|GE591125_P1 9505 575 99,1 globlastp 2205 LYD425 fern|gb171|DK956370_P1 9501 575 99,1 globlastp 2206 LYD425 fescue|gb161|DT687441_P1 9495 575 99,1 globlastp 2207 LYD425 foxtail_millet|10v2|FXTSLX00131413 9506 575 99,1 globlastp 2208 LYD425 lovegrass|gb167|EH194827_P1 9507 575 99,1 globlastp 2209 LYD425 maize|10v1|AW438239_P1 9495 575 99,1 globlastp 2210 LYD425 maize|10v1|1CD940362_P1 9495 575 99,1 globlastp 2211 LYD425 medicago|09v1|EV260408_P1 9508 575 99,1 globlastp 2212 LYD425 millet|10v1|EV0454PM824866_P1 9495 575 99,1 globlastp 2213 LYD425 monkeyflower|10v1|GR130117_P1 9509 575 99,1 globlastp 2214 LYD425 oat|10v2|CN815967 9495 575 99,1 globlastp 2215 LYD425 rhizophora|10v1|SRR005792S0006606 9502 575 99,1 globlastp 2216 LYD425 triphysaria|10v1|DR172195 9510 575 99,1 globlastp 2217 LYD425 triphysaria|10v1|EY131246 9511 575 99,1 globlastp 2218 LYD425 fraxinus|11v1|SRR058827.135537_T1 9512 575 99,1 glotblastn 2219 LYD425 canola|11v1|EE508869_P1 9513 575 98,2 globlastp 2220 LYD425 cephalotaxus|11v1|SRR064395X140383_P1 9514 575 98,2 globlastp 2221 LYD425 euphorbia|11v1|DV139505_P1 9515 575 98,2 globlastp 2221 LYD425 spurge|gb161|DV139505 9515 575 98,2 globlastp 2222 LYD425 euphorbia|11v1|SRR098678X354943_P1 9515 575 98,2 globlastp 2223 LYD425 utricularia|11v1|SRR094438.115684_P1 9516 575 98,2 globlastp 2224 LYD425 utricularia|11v1|SRR094438.159351_P1 9516 575 98,2 globlastp 2225 LYD425 b_oleracea|gb161|EH414456_P1 9513 575 98,2 globlastp 2226 LYD425 b_rapa|gb162|CX268032_P1 9513 575 98,2 globlastp 2227 LYD425 banana|10v1|DN238578_P1 9517 575 98,2 globlastp 2228 LYD425 banana|10v1|FF561782_P1 9518 575 98,2 globlastp 2229 LYD425 canola|10v1|CD822003 9513 575 98,2 globlastp 2230 LYD425 canola|11v1|EE465300_P1 9513 575 98,2 globlastp 2231 LYD425 canola|10v1|CD824002 9513 575 98,2 globlastp 2232 LYD425 canolal|11v1|IEV061028_P1 9513 575 98,2 globlastp 2233 LYD425 canola|10v1|DY006552 9513 575 98,2 globlastp 2234 LYD425 canola|11v1|DY006552_P1 9513 575 98,2 globlastp 2235 LYD425 cassava|09v1|CK644395_P1 9518 575 98,2 globlastp 2236 LYD425 castorbean|09v1|EV520777 9518 575 98,2 globlastp 2237 LYD425 castorbean|11v1|EV520777_P1 9518 575 98,2 globlastp 2238 LYD425 ceratodon|10v1|SRR07489050086532_P1 9514 575 98,2 globlastp 2239 LYD425 cryptomeria|gb166|BY882587_P1 9514 575 98,2 globlastp 2240 LYD425 gnetum|10v1|SRR064399S0369287_P1 9514 575 98,2 globlastp 2241 LYD425 guizotia|10v1|GE575364_P1 9519 575 98,2 globlastp 2242 LYD425 jatropha|09v1|GT229176_P1 9518 575 98,2 globlastp

211 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 2243 LYD425 marchantia|gb166|13J855887_P1 9514 575 98,2 globlastp 2244 LYD425 pine|10v2|BQ655295_P1 9514 575 98,2 globlastp 2245 LYD425 pine|10v2|CF392492_P1 9514 575 98,2 globlastp 2246 LYD425 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0137491 9514 575 98,2 globlastp 2247 LYD425 radish|gb164|EV545012 9513 575 98,2 globlastp 2248 LYD425 radish|gb164|EX754296 9513 575 98,2 globlastp 2249 LYD425 radish|gb164|EY896439 9513 575 98,2 globlastp 2250 LYD425 radish|gb164|EY919110 9513 575 98,2 globlastp 2251 LYD425 rhizophora|10v1|SRR005792S0003196 9520 575 98,2 globlastp 2252 LYD425 sciadopitys|10v1|SRR065035S0018437 9514 575 98,2 globlastp 2253 LYD425 sequoia|10v1|SRR065044S0084408 9514 575 98,2 globlastp 2254 LYD425 spikemoss|gb165|DN838775 9514 575 98,2 globlastp 2255 LYD425 spikemoss|gb165|FE428026 9514 575 98,2 globlastp 2256 LYD425 spruce|gb162|C0479995 9514 575 98,2 globlastp 2257 LYD425 pea|11v1|GH720785_P1 9521 575 98,2 globlastp 2258 LYD425 senecio|gb170|SRR00659250014193 9522 575 98,2 glotblastn 2259 LYD425 euphorbia|11v1|BP955584_P1 9523 575 97,3 globlastp 2260 LYD425 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1050171_P1 9524 575 97,3 globlastp 2261 LYD425 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1146944_P1 9524 575 97,3 globlastp 2262 LYD425 phyla|11v2|SRR099035X131927_P1 9525 575 97,3 globlastp 2263 LYD425 phyla|11v2|SRR099037X132761_P1 9525 575 97,3 globlastp 2264 LYD425 b_rapa|gb162|CX267600_P1 9526 575 97,3 globlastp 2265 LYD425 basilicum|10v1|DY322265_P1 9527 575 97,3 globlastp 2266 LYD425 canola|10v1|1CD817507 9526 575 97,3 globlastp 2267 LYD425 canola|10v1|CN727481 9526 575 97,3 globlastp 2268 LYD425 liriodendron|gb166|CK760175_P1 9528 575 97,3 globlastp 2269 LYD425 monkeyflower|10v1|G0959242_P1 9529 575 97,3 globlastp 2270 LYD425 physcomitrella|10v1|P3G409072_P1 9530 575 97,3 globlastp 2271 LYD425 poplar|10v1|P3U811180_P1 9525 575 97,3 globlastp 2272 LYD425 radish|gb164|EX754549 9526 575 97,3 globlastp 2273 LYD425 salvia|10v1|SRR014553S0001069 9525 575 97,3 globlastp 2274 LYD425 canola|11v1|CN732177_P1 9526 575 97,3 globlastp 2275 LYD425 cedrus|11v1|SRR065007X104880_T1 9531 575 97,3 glotblastn 2276 LYD425 cotton|10v2|SRR032367S0598584_T1 9532 575 97,3 glotblastn 2277 LYD425 cycas|gb166|DR063171_T1 9533 575 97,3 glotblastn 2278 LYD425 pea|09v1|GH720785 - 575 97,3 glotblastn maritime_pine|10v1|SRR073317S0023919_ 2279 LYD425 9534 575 96,4 globlastp P1 2280 LYD425 beet|gb162|BI643145_P1 9535 575 96,4 globlastp 2281 LYD425 cacao|10v1|CGD0028700_P1 9536 575 96,4 globlastp 2282 LYD425 radish|gb164|EW728224 9537 575 96,4 globlastp 2283 LYD425 apple|11v1|CN489610_T1 9538 575 96,4 glotblastn 2284 LYD425 ceratodon|10v1|SRR07489050013809_T1 9539 575 96,4 glotblastn 2285 LYD425 orobanche|10v1|SRR02318950003053_P1 9540 575 95,5 globlastp 2286 LYD425 poplar|10v1|P3U865642_P1 9541 575 95,5 globlastp 2287 LYD425 prunus|10v1|PPA020048M 9542 575 95,5 globlastp 2288 LYD425 zamia|gb166|FD766343 9543 575 95,5 globlastp 2289 LYD425 euphorbia|11v1|SRR098678X593150_T1 - 575 94,6 glotblastn 2290 LYD425 apple|11v1|MDP0000218860_P1 9544 575 94,5 globlastp 2291 LYD425 heritiera|10v1|SRRO05795S0000676_P1 9545 575 93,7 globlastp 2292 LYD425 platanus|11v1|SRR096786X154189_P1 9546 575 93,6 globlastp 2293 LYD425 volvox|gb162|CBH0620FWD 9547 575 92,7 globlastp 2294 LYD425 fagopyrum|11v1|SRR063703X101645_P1 9548 575 91,8 globlastp 2295 LYD425 chlamydomonas|gb162|BE227835_P1 9549 575 91,8 globlastp 2296 LYD425 potato|10v1|AM907607_P1 9550 575 91,8 globlastp 2297 LYD425 ambrosia|11v1|SRR346943.138808_P1 9551 575 90,0 globlastp 2298 LYD425 silene|11v1|SRR096785X251497_T1 9552 575 90,0 glotblastn 2299 LYD425 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01C8UZ4_P1 9553 575 90,0 globlastp 2300 LYD425 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01CGDU5_P1 9553 575 90,0 globlastp 2301 LYD425 ipomoea_batatas|10v1|DC882395_P1 9551 575 90,0 globlastp 2302 LYD425 distylium|11v1|SRR065077X341600_P1 9554 575 89,1 globlastp

212 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 2303 LYD425 b_juncea|10v2|E6ANDIZO2GDV1X_P1 9555 575 89,1 globlastp arabidopsis_lyrata|09v1|GFXEU379 2304 LYD425 9556 575 88,7 glotblastn 006Xl_T1 2305 LYD425 cirsium|11v1|SRR349641.408180_T1 9557 575 88,2 glotblastn 2306 LYD425 b_rapa|gb162|EE523503_P1 9558 575 87,3 globlastp 2307 LYD425 canola|11v1|EL629739_T1 9559 575 87,3 glotblastn 2308 LYD425 millet|10v1|EV0454PM088849_P1 9560 575 86,5 globlastp 2309 LYD425 strawberry|11v1|SRR034902S0020015 9561 575 86,1 globlastp 2310 LYD425 pteridium|11v1|SRR043594X168741_P1 9562 575 85,5 globlastp 2311 LYD425 plantago|11v1|SRR066373X28590_P1 9563 575 85,1 globlastp 2312 LYD425 podocarpus|10v1|SRR065014S0161209_P1 9564 575 84,5 globlastp 2313 LYD425 amborella|gb166|CK758391_T1 9565 575 83,8 glotblastn 2314 LYD425 ostreococcus|gb162|XM001415542_P1 9566 575 83,0 globlastp 2315 LYD425 tobacco|gb162|BP133671 9567 575 82,3 glotblastn 2316 LYD425 artemisia|10v1|SRR019254S0002036_P1 9568 575 81,8 globlastp 2317 LYD425 hevea|10v1|EC601944_P1 9569 575 80,9 globlastp 2318 LYD425 poplar|10v1|DB893816_P1 9570 575 80,9 globlastp 2319 LYD425 flaveria|11v1|SRR149238.345175_P1 9571 575 80,0 globlastp 2320 LYD425 kiwi|gb166|FG426337_T1 9572 575 80,0 glotblastn 2321 LYD427 maize|10v1|AA979755_P1 9573 576 92,1 globlastp 2322 LYD427 foxtail_millet|11v3|PHY7SI000345M_P1 9574 576 88,9 globlastp 2323 LYD427 maize|10v1|CD219227_P1 9575 576 87,6 globlastp 2324 LYD427 rice|gb170|OS01G36860 9576 576 80,9 glotblastn 2325 LYD428 switchgrass|gb167|DN141377 9577 577 85,7 globlastp foxtail_millet|10v2|FXTRMSLX00010744D 9578 577 84,1 2326 LYD428 globlastp 1 2327 LYD428 foxtail_millet|11v3|PHY7SI017948M_P1 9578 577 84,1 globlastp 2328 LYD428 sugarcane|10v1|CA082579 9579 577 83,8 globlastp 2329 LYD432 maize|10v1|AI622413_P1 9580 579 95,2 globlastp 2330 LYD432 switchgrass|gb167|FL706172 9581 579 92,1 globlastp 2331 LYD432 sugarcane|10v1|CA074303 9582 579 85,9 glotblastn 2332 LYD432 brachypodium|09v1|DV469137_P1 9583 579 85,5 globlastp 2333 LYD432 rice|gb170|OS04G42470 9584 579 85,2 globlastp 2334 LYD432 foxtail_millet|11v3|PHY7SI009830M_P1 9585 579 84,7 globlastp 2335 LYD432 wheat|10v2|BE401425 9586 579 83,3 globlastp 2336 LYD432 barley|10v2|BE413260_P1 9587 579 82,8 globlastp 2337 LYD433 sugarcane|10v1|BQ530273 9588 580 96,4 globlastp 2338 LYD433 maize|10v1|AWO61803_P1 9589 580 89,8 globlastp 2339 LYD433 switchgrass|gb167|FE646998 9590 580 89,8 globlastp 2340 LYD433 maize|10v1|IAI901310_P1 9591 580 89,3 globlastp 2341 LYD433 foxtail_millet|11v3|PHY7SI014487M_P1 9592 580 89,3 globlastp 2342 LYD433 switchgrass|gb167|DN145547 9593 580 88,0 globlastp 2343 LYD433 millet|10v1|EV0454PM010263_P1 9594 580 87,8 globlastp 2344 LYD433 foxtail_millet|10v2|SICRP025306 9595 580 87,3 globlastp 2345 LYD435 maize|10v1|DW832428_P1 9596 582 85,9 globlastp 2346 LYD435 foxtail_millet|11v3|PHY7SI014425M_P1 9597 582 80,8 globlastp 2347 LYD436 sugarcane|10v1|BQ530893 9598 583 91,2 globlastp 2348 LYD437 soybean|11v1|BE660894 9599 584 93,1 globlastp 2349 LYD437 pigeonpea|10v1|SRR054580S0019273 T1 9600 584 85,3 glotblastn 2350 LYD438 soybean|11v1|GLYMA13G41110 9601 585 90,2 globlastp 2351 LYD438 soybean|11v1|GLYMA15G04300 9602 585 88,1 globlastp 2352 LYD438 pigeonpea|10v1|GR471598_P1 9603 585 85,3 globlastp 2353 LYD438 pea|09v1|Z73553 9604 585 80,1 globlastp 2354 LYD438 pea|11v1|Z73553_P1 9604 585 80,1 globlastp 2355 LYD439 soybean|11v1|GLYMA10G06800 9605 586 81,6 globlastp 2356 LYD439 soybean|11v1|GLYMA13G20980 9606 586 81,4 globlastp 2357 LYD440 pigeonpea|10v1|SRR054580S0028717_P1 9607 587 85,8 globlastp 2357 LYD398 pigeonpea|10v1|SRR054580S0028717_T1 9607 742 80,6 glotblastn pigeonpea|10v1|SRR054580S0060137_P1 9608 587 8, 6 ., 2358 LYD440 globlastp 1 2358 LYD398 pigeonpea|10v1|SRR054580S0060137_T1 9608 742 81,4 glotblastn

213 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 2359 LYD440 bean|gb167|CA910622_P1 9609 587 81,3 globlastp 2359 LYD398 bean|gb167|CA910622_P1 9609 742 80,0 globlastp 2360 LYD442 soybean|11v1|GLYMA06G15380 9610 589 92,7 globlastp 2361 LYD442 bean|gb167|CV537092_P1 9611 589 91,4 globlastp 2362 LYD442 cowpea|gb166|FG808168_P1 9612 589 89,6 globlastp 2363 LYD442 medicago|09v1|AL370263_P1 9613 589 89,4 globlastp 2364 LYD442 peanut|10v1|ES719926_P1 9614 589 89,2 globlastp 2365 LYD442 trigonella|11v1|SRR066194X140506_P1 9615 589 88,4 globlastp 2366 LYD442 lotus|09v1|LBW618756_P1 9616 589 87,7 globlastp 2367 LYD442 trigonella|11v1|SRR066194X106162_P1 9617 589 86,6 globlastp 2368 LYD442 clover|gb162|AB236802_P1 9618 589 85,6 globlastp 2369 LYD442 cassava|09v1|DV441647_P1 9619 589 82,1 globlastp 2370 LYD442 clementine|11v1|C0913065_P1 9620 589 81,0 globlastp 2371 LYD442 orange|11v1|C0913065_P1 9620 589 81,0 globlastp 2372 LYD442 citrus|gb166|C0913065_P1 9620 589 81,0 globlastp 2373 LYD442 cucumber|09v1|DR974824_P1 9621 589 80,7 globlastp 2374 LYD442 melon|10v1|DR974824_T1 9622 589 80,3 glotblastn 2375 LYD442 watermelon|11v1|AM718097_P1 9623 589 80,1 globlastp 2376 LYD445 soybean|11v1|GLYMA04G03420 9624 591 91,7 globlastp 2377 LYD445 cowpea|gb166|FF543662_T1 9625 591 84,8 glotblastn 2378 LYD445 bean|gb167|CA899425_P1 9626 591 83,0 globlastp 2379 LYD445 pigeonpea|10v1|SRR054580S0144195_T1 9627 591 82,6 glotblastn 2380 LYD446 cowpea|gb166|FF383047_P1 9628 592 91,8 globlastp 2380 LYD519 cowpea|gb166|FF383047_P1 9628 654 80,2 globlastp 2381 LYD446 peanut|10v1|SRR042413S0021557__P1 9629 592 85,1 globlastp LYD519 peanut|10v1|SRR042413S0021557_P1 2381 9629 654 80,2 globlastp 2382 LYD447 soybean|11v1|GLYMA07G07100 9630 593 86,3 glotblastn 2383 LYD450 lotus|09v1|AW720055_T1 9631 596 80,6 glotblastn 2384 LYD451 soybean|11v1|GLYMA16G34190 9632 597 97,1 globlastp 2385 LYD451 cowpea|gb166|FC460201_T1 9633 597 95,8 glotblastn 2386 LYD451 medicago|09v1|ALF_P1 9634 597 83,8 globlastp 2387 LYD451 prunus|10v1|CB822934 9635 597 82,6 globlastp 2388 LYD451 apple|11v1|C0723687_P1 9636 597 81,5 globlastp 2389 LYD451 peanut|10v1|CD038199_P1 9637 597 81,5 globlastp 2390 LYD451 euonymus|11v1|SRR070038X249909_P1 9638 597 80,7 globlastp 2391 LYD451 strawberry|11v1|EX658118 9639 597 80,4 globlastp 2392 LYD454 amsonia|11v1|SRR098688X12244_P1 600 600 100,0 globlastp 2393 LYD454 amsonia|11v1|SRR098688X270988_P1 600 600 100,0 globlastp 2394 LYD454 cannabis|12v1|1GR220629_P1 600 600 100,0 globlastp 2395 LYD454 catharanthus|11v1|EG556445_P1 600 600 100,0 globlastp 2396 LYD454 catharanthus|11v1|EG559538_P1 600 600 100,0 globlastp 2397 LYD454 clementine|11v1|CF417630_P1 600 600 100,0 globlastp 2398 LYD454 cucurbita|11v1|SRR091276X101208_P1 600 600 100,0 globlastp 2399 LYD454 cucurbita|11v1|SRR091276X101980_P1 600 600 100,0 globlastp 2400 LYD454 cucurbita|11v1|SRR091276X112794_P1 600 600 100,0 globlastp 2401 LYD454 eucalyptus|11v2|CT981964_P1 600 600 100,0 globlastp 2402 LYD454 eucalyptus|11v2|CU404457_P1 600 600 100,0 globlastp 2403 LYD454 euonymus|11v1|SRR070038X100586_P1 600 600 100,0 globlastp 2404 LYD454 euonymus|11v1|SRR070038X101487_P1 600 600 100,0 globlastp 2405 LYD454 euonymus|11v1|SRR070038X107087_P1 600 600 100,0 globlastp 2406 LYD454 euonymus|11v1|SRR070038X115249_P1 600 600 100,0 globlastp 2407 LYD454 euonymus|11v1|SRR070038X120420_P1 600 600 100,0 globlastp 2408 LYD454 euphorbia|11v1|DV113425_P1 600 600 100,0 globlastp 2409 LYD454 euphorbia|11v1|SRR098678X184654_P1 600 600 100,0 globlastp 2410 LYD454 fagopyrum|11v1|SRR063689X101567_P1 600 600 100,0 globlastp 2411 LYD454 fagopyrum|11v1|SRR063689X107072_P1 600 600 100,0 globlastp 2412 LYD454 fagopyrum|11v1|SRR063689X108016_P1 600 600 100,0 globlastp 2413 LYD454 fagopyrum|11v1|SRR063689X108966_P1 600 600 100,0 globlastp 2414 LYD454 fagopyrum|11v1|SRR063703X101374_P1 600 600 100,0 globlastp 2415 LYD454 fagopyrum|11v1|SRR063703X104747_P1 600 600 100,0 globlastp

214 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 2416 LYD454 fagopyrum|11v1|SRR063703X118877_P1 600 600 100,0 globlastp 2417 LYD454 fagopyrum|11v1|SRR063703X118890P1 600 600 100,0 globlastp 2418 LYD454 fraxinus|11v1|SRR058827.106502_P1 600 600 100,0 globlastp 2419 LYD454 fraxinus|11v1|SRR058827.172228XXl_P1 600 600 100,0 globlastp 2420 LYD454 fraxinus|11v1|SRR058827.172228XX2_P1 600 600 100,0 globlastp 2421 LYD454 humulus|11v1|GD24623 l_P1 600 600 100,0 globlastp 2422 LYD454 humulus|11v1|GD249134_P1 600 600 100,0 globlastp 2423 LYD454 humulus|11v1|SRR098683X114579_P1 600 600 100,0 globlastp 2424 LYD454 humulus|11v1|SRR098683X129685_P1 600 600 100,0 globlastp 2425 LYD454 humulus|11v1|SRR098683X18710_P1 600 600 100,0 globlastp 2426 LYD454 humulus|11v1|SRR098683X44247_P1 600 600 100,0 globlastp 2427 LYD454 humulus|11v1|SRR098684X114260_P1 600 600 100,0 globlastp 2428 LYD454 humulus|11v1|SRR098687X104860_P1 600 600 100,0 globlastp 2429 LYD454 orange|11v1|CF417630_P1 600 600 100,0 globlastp 2430 LYD454 phyla|11v2|SRR099035X102134_P1 600 600 100,0 globlastp 2431 LYD454 plantago|11v1|SRR066373X102417_P1 600 600 100,0 globlastp 2432 LYD454 plantago|11v1|SRR066373X115592_P1 600 600 100,0 globlastp 2433 LYD454 platanus|11v1|SRR096786X114130_P1 600 600 100,0 globlastp 2434 LYD454 platanus|11v1|SRR096786X142170_P1 600 600 100,0 globlastp 2435 LYD454 platanus|11v1|SRR096786X36069_P1 600 600 100,0 globlastp 2436 LYD454 pteridium|11v1|SRR043594X61139_P1 600 600 100,0 globlastp 2437 LYD454 sarracenia|11v1|SRR192669.110655_P1 600 600 100,0 globlastp 2438 LYD454 sarracenia|11v1|SRR192669.112302_P1 600 600 100,0 globlastp 2439 LYD454 sarracenia|11v1|SRR192669.116502_P1 600 600 100,0 globlastp 2440 LYD454 scabiosa|11v1|SRR063723X100090_P1 600 600 100,0 globlastp 2441 LYD454 scabiosa|11v1|SRR063723X282056_P1 600 600 100,0 globlastp 2442 LYD454 sorghum|11v1|SBO4G036360_P1 600 600 100,0 globlastp 2443 LYD454 thalictrum|11v1|SRR096787X100485_P1 600 600 100,0 globlastp 2444 LYD454 thalictrum|11v1|SRR096787X102620_P1 600 600 100,0 globlastp 2445 LYD454 thalictrum|11v1|SRR096787X141553_P1 600 600 100,0 globlastp 2446 LYD454 tomato|11v1|BG125727_P1 600 600 100,0 globlastp 2447 LYD454 tomato|11v1|BG127553_P1 600 600 100,0 globlastp 2448 LYD454 tripterygium|11v1|SRR098677X111138_P1 600 600 100,0 globlastp 2449 LYD454 tripterygium|11v1|SRR098677X12834_P1 600 600 100,0 globlastp 2450 LYD454 tripterygium|11v1|SRR098677X139 077_P1 600 600 100,0 globlastp 2451 LYD454 utricularia|11v1|SRR094438,1034_P1 600 600 100,0 globlastp 2452 LYD454 valeriana|11v1|SRR099039X16229_P1 600 600 100,0 globlastp 2453 LYD454 valeriana|11v1|SRR099039X213611_P1 600 600 100,0 globlastp 2454 LYD454 valeriana|11v1|SRR099039X21641_P1 600 600 100,0 globlastp 2455 LYD454 vinca|11v1|SRR098690X116182_P1 600 600 100,0 globlastp 2456 LYD454 vinca|11v1|SRR098690X126932_P1 600 600 100,0 globlastp 2457 LYD454 vinca|11v1|SRR098690X17455_P1 600 600 100,0 globlastp 2458 LYD454 amaranthus|10v1|SRR039411S0005040_P1 600 600 100,0 globlastp 2459 LYD454 aristolochia|10v1|SRR039082S0002270_P1 600 600 100,0 globlastp 2460 LYD454 bean|gb167|CA897327_P1 600 600 100,0 globlastp 2461 LYD454 bean|gb167|CA897339_P1 600 600 100,0 globlastp 2462 LYD454 beech|gb170|SRR006294S0004097_P1 600 600 100,0 globlastp 2463 LYD454 cacao|10v1|CU482595_P1 600 600 100,0 globlastp 2464 LYD454 castorbean|09v1|NM002514131 600 600 100,0 globlastp 2465 LYD454 castorbeanl|11v1|XM002514131_P1 600 600 100,0 globlastp 2466 LYD454 castorbean|09v1|NM002515849 600 600 100,0 globlastp 2467 LYD454 castorbean|11v1|XM002515849_P1 600 600 100,0 globlastp 2468 LYD454 catharanthus|gb166|EG556445 600 600 100,0 globlastp 2469 LYD454 catharanthus|gb166|EG559538 600 600 100,0 globlastp 2470 LYD454 chestnut|gb170|SRR00629550000137_P1 600 600 100,0 globlastp 2471 LYD454 chestnut|gb170|SRR006295S0000483_P1 600 600 100,0 globlastp 2472 LYD454 chickpea|09v2|GR392983_P1 600 600 100,0 globlastp 2473 LYD454 chickpea|09v2|GR397603_P1 600 600 100,0 globlastp 2474 LYD454 citrus|gb166|CF417630_P1 600 600 100,0 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000542 2475 LYD454 600 600 100,0 globlastp 1_P1

215 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: cleome_gynandra|10v1|SRR015532S005884 2476 LYD454 600 600 100,0 globlastp 7_P1 cleome_gynandra|10v1|SRR015532S010896 2477 LYD454 600 600 100,0 globlastp 9_P1 2478 LYD454 cleome_spinosa|10v1|GR931858_P1 600 600 100,0 globlastp cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0018215 2479 LYD454 600 600 100,0 globlastp _P1 cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0018672 2480 LYD454 600 600 100,0 globlastp _P1 2481 LYD454 coffea|10v1|DV664965_P1 600 600 100,0 globlastp 2482 LYD454 cowpea|gb166|ES884175_P1 600 600 100,0 globlastp 2483 LYD454 cowpea|gb166|FC460241_P1 600 600 100,0 globlastp 2484 LYD454 cucumber|09v1|AM715327_P1 600 600 100,0 globlastp 2485 LYD454 cucumber|09v1|CK086097_P1 600 600 100,0 globlastp 2486 LYD454 cyamopsis|10v1|EG974840_P1 600 600 100,0 globlastp 2487 LYD454 cynodon|10v1|ES292646_T1 9640 600 100,0 glotblastn 2488 LYD454 eggplant|10v1|FS001318_P1 600 600 100,0 globlastp 2489 LYD454 eggplant|10v1|FS003293_P1 600 600 100,0 globlastp 2490 LYD454 eschscholzia|10v1|SRR014116S0004486 600 600 100,0 globlastp 2491 LYD454 eucalyptus|11v2|CT983213_P1 600 600 100,0 globlastp 2492 LYD454 eucalyptus|gb166|CT983213 600 600 100,0 globlastp foxtail_millet|10v2|OXFXTRMSLX001881 2493 LYD454 600 600 100,0 globlastp 38D1_T1 foxtail_millet|10v2|OXFXTRMSLX005419 2494 LYD454 600 600 100,0 globlastp 02D1_T1 2495 LYD454 foxtail_millet|11v3|PHY7SI019362M_P1 600 600 100,0 globlastp 2496 LYD454 ginger|gb164|DY361101_T1 9641 600 100,0 glotblastn 2497 LYD454 ginger|gb164|DY363934 T1 9642 600 100,0 glotblastn 2498 LYD454 ginseng|10v1|DV555276_P1 600 600 100,0 globlastp 2499 LYD454 ginseng|10v1|ES672876_P1 600 600 100,0 globlastp 2500 LYD454 grape|11v1|CB003420_P1 600 600 100,0 globlastp 2501 LYD454 grape|gb160|CB003420 600 600 100,0 globlastp 2502 LYD454 grape|11v1|GSVIVT01016902001_P1 600 600 100,0 globlastp 2503 LYD454 grape|gb160|CB006467 9643 600 100,0 glotblastn 2504 LYD454 ipomoea_batatas|10v1|CB330103_P1 600 600 100,0 globlastp 2505 LYD454 ipomoea_batatas|10v1|CB330148_P1 600 600 100,0 globlastp 2506 LYD454 Ipomoea_ni|10v1|CJ748162_P1 600 600 100,0 globlastp 2507 LYD454 jatropha|09v1|GT228650_P1 600 600 100,0 globlastp 2508 LYD454 liquorice|gb171|FS239086_P1 600 600 100,0 globlastp 2509 LYD454 liquorice|gb171|FS246568_P1 600 600 100,0 globlastp 2510 LYD454 liriodendron|gb166|CK764053_P1 600 600 100,0 globlastp 2511 LYD454 liriodendron|gb166|FD490791_P1 600 600 100,0 globlastp 2512 LYD454 lotus|09v1|P3G662483_P1 600 600 100,0 globlastp 2513 LYD454 lotus|09v1|LBW611845_P1 600 600 100,0 globlastp 2514 LYD454 maize|10v1|A1395997_P1 600 600 100,0 globlastp 2515 LYD454 maize|10v1|AW119946_P1 600 600 100,0 globlastp 2516 LYD454 melon|10v1|AM715327_P1 600 600 100,0 globlastp 2517 LYD454 melon|10v1|DV632974_P1 600 600 100,0 globlastp 2518 LYD454 millet|10v1|CD726330 T1 9644 600 100,0 glotblastn 2519 LYD454 momordica|10v1|SRR071315S0001369_P1 600 600 100,0 globlastp 2520 LYD454 monkeyflower|10v1|CV519494_P1 600 600 100,0 globlastp 2521 LYD454 monkeyflower|10v1|DV209402_P1 600 600 100,0 globlastp nicotiana_benthamiana|gb162|EH36 2522 LYD454 9645 600 100,0 glotblastn 5061_T1 2523 LYD454 oak|10v1|CU656826_P1 600 600 100,0 globlastp 2524 LYD454 oak|10v1|DN950635_P1 600 600 100,0 globlastp 2525 LYD454 orobanche|10v1|SRR023189S0043706_P1 600 600 100,0 globlastp 2526 LYD454 orobanche|10v1|SRR023495S0065779_P1 600 600 100,0 globlastp 2527 LYD454 papaya|gb165|EX265362_P1 600 600 100,0 globlastp 2528 LYD454 peanut|10v1|CD037648_P1 600 600 100,0 globlastp 2529 LYD454 peanut|10v1|CD038347_P1 600 600 100,0 globlastp

216 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 2530 LYD454 pepper|gb171|BM064227_P1 600 600 100,0 globlastp 2531 LYD454 pigeonpea|10v1|GR468726_P1 600 600 100,0 globlastp 2532 LYD454 pigeonpea|10v1|GW353331_P1 600 600 100,0 globlastp 2533 LYD454 poplar|10v1|BI128513_P1 600 600 100,0 globlastp 2534 LYD454 poplar|10v1|B1129531_P1 600 600 100,0 globlastp 2535 LYD454 poplar|10v1|BU815653_P1 600 600 100,0 globlastp 2536 LYD454 poppy|gb166|FE965539_P1 600 600 100,0 globlastp 2537 LYD454 potato|10v1|BG593145_T1 9646 600 100,0 glotblastn 2538 LYD454 potato|10v1|BQ515532_P1 600 600 100,0 globlastp 2539 LYD454 prunus|10v1|AJ533719 600 600 100,0 globlastp 2540 LYD454 prunus|10v1|CB821207 600 600 100,0 globlastp 2541 LYD454 rice|gb170|0S02G56014 600 600 100,0 globlastp 2542 LYD454 rice|gb170|OS06G07580 600 600 100,0 globlastp 2543 LYD454 rose|10v1|P31977665 600 600 100,0 globlastp 2544 LYD454 rose|10v1|EC588358 600 600 100,0 globlastp 2545 LYD454 salvia|10v1|CV168286 600 600 100,0 globlastp 2546 LYD454 sesame|10v1|BU670320 600 600 100,0 globlastp 2547 LYD454 Solanum_phureja|09v1|SPHBG125727 600 600 100,0 globlastp 2548 LYD454 solanum_phureja|09v1|SPHBG127553 600 600 100,0 globlastp 2549 LYD454 sorghum|09v1|SB04G036360 600 600 100,0 globlastp 2550 LYD454 sorghum|09v1|SB10G004940 600 600 100,0 globlastp 2551 LYD454 sorghum|11v1|SB10G004940_P1 600 600 100,0 globlastp 2552 LYD454 spurge|gb161|DV113425 600 600 100,0 globlastp 2553 LYD454 strawberry|11v1|C0381759 600 600 100,0 globlastp 2554 LYD454 strawberry|11v1| C0381795 600 600 100,0 globlastp 2555 LYD454 sugarcane|10v1|CA118705 600 600 100,0 globlastp 2556 LYD454 tea|10v1|CV014310 600 600 100,0 globlastp 2557 LYD454 tobacco|gb162|BP192531 9647 600 100,0 glotblastn 2558 LYD454 tobacco|gb162|CV017550 9648 600 100,0 glotblastn 2559 LYD454 tomato|09v1|K125727 600 600 100,0 globlastp 2560 LYD454 tomato|09v1|BG127553 600 600 100,0 globlastp 2561 LYD454 walnuts|gb166|EL901674 600 600 100,0 globlastp 2562 LYD454 wheat|10v2|BE401696 600 600 100,0 globlastp 2563 LYD454 wheat|10v2|CA626902 600 600 100,0 globlastp 2564 LYD454 humulus|11v1|SRR098683X22545_T1 - 600 100,0 glotblastn 2565 LYD454 petunia|gb171|DY395525_T1 - 600 100,0 glotblastn amorphophallus|11v2|SRR089351X100022_ 2566 LYD454 9649 600 98,4 globlastp P1 amorphophallus|11v2|SRR089351X100594_ 2567 LYD454 9649 600 98,4 globlastp P1 2568 LYD454 apple|11v1|CN882330_P1 9650 600 98,4 globlastp 2569 LYD454 cheliclonium|11v1|SRR084752X10217_P1 9651 600 98,4 globlastp 2570 LYD454 cheliclonium|11v1|SRR084752X155146_P1 9651 600 98,4 globlastp 2571 LYD454 euphorbia|11v1|DV132150_P1 9652 600 98,4 globlastp 2572 LYD454 foxtail_millet|11v3|PHY7SI007769M_P1 9649 600 98,4 globlastp 2573 LYD454 humulus|11v1|PX519236_P1 9653 600 98,4 globlastp 2574 LYD454 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1233743_P1 9649 600 98,4 globlastp 2575 LYD454 phalaenopsis|11v1|SRR138262.105880_P1 9649 600 98,4 globlastp 2576 LYD454 phalaenopsis|11v1|SRR138262.24922p1 9649 600 98,4 globlastp 2577 LYD454 pteridium|11v1|SRR043594X358491_P1 9649 600 98,4 globlastp 2578 LYD454 sarracenia|11v1|SRR192669.235484_P1 9654 600 98,4 globlastp 2579 LYD454 silene|11v1|SRR096785X107709_P1 9650 600 98,4 globlastp 2580 LYD454 silene|11v1|SRR096785X10884_P1 9650 600 98,4 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X185122 2581 LYD454 9651 600 98,4 globlastp _P1 thellungiella_halophilum|11v1|DN773562_P 2582 LYD454 9655 600 98,4 globlastp 1 2583 LYD454 trigonella|11v1|SRR066194X101436_P1 9651 600 98,4 globlastp 2584 LYD454 trigonella|11v1|SRR066194X107589_P1 9651 600 98,4 globlastp 2585 LYD454 antirrhinum|gb166|AJ787682_P1 9656 600 98,4 globlastp 2586 LYD454 antirrhinum|gb166|AJ789805_P1 9656 600 98,4 globlastp

217 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 2587 LYD454 apple|11v1|CN489296_P1 9650 600 98,4 globlastp 2588 LYD454 apple|gb171|CN489296 9650 600 98,4 globlastp 2589 LYD454 apple|11v1|CN490680_P1 9650 600 98,4 globlastp 2590 LYD454 apple|gb171|CN490680 9650 600 98,4 globlastp 2591 LYD454 apple|11v1|CN492591_P1 9650 600 98,4 globlastp 2592 LYD454 apple|gb171|CN492591 9650 600 98,4 globlastp 2593 LYD454 apple|gb171|CN865222 9650 600 98,4 globlastp 2594 LYD454 apple|11v1|CN897757_P1 9650 600 98,4 globlastp 2595 LYD454 apple|gb171|CN882330 9650 600 98,4 globlastp 2596 LYD454 apple|11v1|CN865222_P1 9650 600 98,4 globlastp 2597 LYD454 apple|gb171|CN893137 9650 600 98,4 globlastp 2598 LYD454 apple|gb171|CN941296 9650 600 98,4 globlastp 2599 LYD454 avocado|10v1|FD505930_P1 9657 600 98,4 globlastp 2600 LYD454 banana|10v1|DN238454_P1 9649 600 98,4 globlastp 2601 LYD454 basilicum|10v1|DY328963_P1 9651 600 98,4 globlastp 2602 LYD454 beet|gb162|B1096274_P1 9658 600 98,4 globlastp 2603 LYD454 beet|gb162|EG550268_P1 9658 600 98,4 globlastp 2604 LYD454 bruguiera|gb166|BP941089_P1 9649 600 98,4 globlastp 2605 LYD454 cacao|10v1|CA794757_P1 9649 600 98,4 globlastp 2606 LYD454 coffea|10v1|DV665767_P1 9649 600 98,4 globlastp 2607 LYD454 cotton|10v2|BE054657_P1 9649 600 98,4 globlastp 2608 LYD454 cotton|10v2|BE054863_P1 9649 600 98,4 globlastp 2609 LYD454 cotton|10v2|DT046683_P1 9649 600 98,4 globlastp 2610 LYD454 cotton|10v2|SRR032367S0039743_P1 9649 600 98,4 globlastp 2611 LYD454 ipomoea_batatas|10v1|EE878924_P1 9659 600 98,4 globlastp 2612 LYD454 ipomoea_ni|10v1|BJ565105_P1 9660 600 98,4 globlastp 2613 LYD454 kiwi|gb166|FG412755_P1 9655 600 98,4 globlastp 2614 LYD454 kiwi|gb166|FG416230_P1 9655 600 98,4 globlastp 2615 LYD454 kiwi|gb166|FG471624_P1 9655 600 98,4 globlastp 2616 LYD454 maize|10v1|AW171898_P1 9649 600 98,4 globlastp 2617 LYD454 maize|10v1|B1325283_P1 9649 600 98,4 globlastp 2618 LYD454 medicago|09v1|AJ388930_P1 9651 600 98,4 globlastp 2619 LYD454 medicago|09v1|AL380582_P1 9651 600 98,4 globlastp 2620 LYD454 medicago|09v1|LC0514023_P1 9651 600 98,4 globlastp 2621 LYD454 medicago|09v1|LEX525300_P1 9651 600 98,4 globlastp 2622 LYD454 millet|10v1|EV0454PM068270_P1 9650 600 98,4 globlastp 2623 LYD454 millet|10v1|EV0454PM354861_P1 9650 600 98,4 globlastp 2624 LYD454 nasturtium|10v1|GH162285 9661 600 98,4 globlastp 2625 LYD454 nasturtium|10v1|GH168259 9661 600 98,4 globlastp 2626 LYD454 nasturtium|10v1|ISRR032558S0008289 9661 600 98,4 globlastp 2627 LYD454 nasturtium|10v1|ISRR032558S0150221 9661 600 98,4 globlastp 2628 LYD454 orobanche|10v1|SRR023189S0002177_P1 9651 600 98,4 globlastp 2629 LYD454 orobanche|10v1|SRR023495S0047682_P1 9662 600 98,4 globlastp 2630 LYD454 papaya|gb165|EX283640_P1 9649 600 98,4 globlastp 2631 LYD454 pepper|gb171|BM063775_P1 9656 600 98,4 globlastp 2632 LYD454 sequoia|10v1|SRR065044S0018120 9663 600 98,4 globlastp 2633 LYD454 switchgrass|gb167|FL957137 9649 600 98,4 globlastp 2634 LYD454 tamarix|gb166|CF199241 9664 600 98,4 globlastp 2635 LYD454 thellungiella|gb167|EC599225 9655 600 98,4 globlastp 2636 LYD454 foxtail_millet|11v3|PHY7SI008503M_T1 9665 600 98,4 glotblastn tabernaemontana|11v1|SRR098689X173836 2637 LYD454 9666 600 98,4 glotblastn _T1 2638 LYD454 spurge|gb161|DV132150 9667 600 98,4 glotblastn 2639 LYD454 tobacco|gb162|CV016060 9668 600 98,4 glotblastn 2640 LYD454 walnuts|gb166|CV196094 9669 600 98,4 glotblastn 2641 LYD454 fraxinus|11v1|SRR058827.155403_T1 - 600 98,4 glotblastn 2642 LYD454 trigonella|11v1|SRR066198X205427_T1 - 600 98,4 glotblastn 2643 LYD454 cotton|10v2|SRR032367S0013477_T1 - 600 98,4 glotblastn 2644 LYD454 abies|11v2|SRR098676X122703_P1 9670 600 96,8 globlastp 2645 LYD454 ambrosia|11v1|SRR346943.110563XX1_P1 9671 600 96,8 globlastp 2646 LYD454 canola|11v1|DW997505_P1 9672 600 96,8 globlastp

218 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 2647 LYD454 canola|11v1|DY010683_P1 9672 600 96,8 globlastp 2648 LYD454 canola|11v1|EE452544_P1 9672 600 96,8 globlastp 2649 LYD454 canola|11v1|GR447572_P1 9672 600 96,8 globlastp cephalotaxus|11v1|ISRR064395X121034_P 2650 LYD454 9673 600 96,8 globlastp 1 2651 LYD454 cirsium|11v1|SRR346952.1065042_P1 9671 600 96,8 globlastp 2652 LYD454 cirsium|11v1|SRR346952.695965XX2_P1 9671 600 96,8 globlastp 2653 LYD454 distylium|11v1|SRR065077X104288_P1 9673 600 96,8 globlastp 2654 LYD454 flaveria|11v1|SRR149229.107796XX2_P1 9671 600 96,8 globlastp 2655 LYD454 flaveria|11v1|1SRR149229.115151_P1 9671 600 96,8 globlastp 2656 LYD454 flaveria|11v1|SRR149229.1175_P1 9671 600 96,8 globlastp 2657 LYD454 flaveria|11v1|SRR149229.141267_P1 9671 600 96,8 globlastp 2658 LYD454 flaveria|11v1|SRR149229.223529_P1 9671 600 96,8 globlastp 2659 LYD454 flaveria|11v1|SRR149232.15596_P1 9671 600 96,8 globlastp 2660 LYD454 flaveria|11v1|SRR149241.269089_P1 9671 600 96,8 globlastp 2661 LYD454 flaveria|11v1|SRR149244.126778_P1 9671 600 96,8 globlastp 2662 LYD454 maritime_pine|10v1|BX252798_P1 9670 600 96,8 globlastp 2663 LYD454 maritime_pine|10v1|BX254877_P1 9670 600 96,8 globlastp 2664 LYD454 maritime_pine|10v1|FN705856_P1 9670 600 96,8 globlastp maritime_pine|10v1|SRR073317S0015296_ 2665 LYD454 9670 600 96,8 globlastp P1 maritime_pine|10v1|SRR073317S0027363_ 2666 LYD454 9670 600 96,8 globlastp P1 2667 LYD454 oat|11v1|G0586308_P1 9671 600 96,8 globlastp 2668 LYD454 oat|11v1|G0586317_P1 9671 600 96,8 globlastp 2669 LYD454 oat|11v1|SRR020741.145798_P1 9671 600 96,8 globlastp 2670 LYD454 primula|11v1|ISRR098679X1160—P1 9674 600 96,8 globlastp 2671 LYD454 primula|11v1|ISRR098679X146021_P1 9674 600 96,8 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111013 2672 LYD454 9675 600 96,8 globlastp 517_P1 2673 LYD454 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL012029_P1 9672 600 96,8 globlastp 2674 LYD454 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL025122_P1 9672 600 96,8 globlastp 2675 LYD454 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL030232_P1 9672 600 96,8 globlastp 2676 LYD454 arabidopsis|10v1|AT2G19750_P1 9672 600 96,8 globlastp 2677 LYD454 arabidopsis|10v1|AT4G29390_P1 9672 600 96,8 globlastp 2678 LYD454 arabidopsis|10v1|AT5G56670_P1 9672 600 96,8 globlastp 2679 LYD454 artemisia|10v1|ES582153_P1 9671 600 96,8 globlastp 2680 LYD454 artemisia|10v1|EY038405_P1 9671 600 96,8 globlastp 2681 LYD454 artemisia|10v1|EY050476_P1 9671 600 96,8 globlastp 2682 LYD454 artemisia|10v1|EY057298_P1 9671 600 96,8 globlastp 2683 LYD454 artemisia|10v1|EY076672_P1 9671 600 96,8 globlastp 2684 LYD454 b_juncea|10v2|BJ1SLX00102850D1_P1 9672 600 96,8 globlastp 2685 LYD454 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A0LY1_P1 9672 600 96,8 globlastp 2686 LYD454 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A1XAZ_P1 9672 600 96,8 globlastp 2687 LYD454 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A7DRE_P1 9672 600 96,8 globlastp 2688 LYD454 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A8M5U_P1 9672 600 96,8 globlastp 2689 LYD454 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A919N_P1 9672 600 96,8 globlastp 2690 LYD454 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01ADZTM_P1 9672 600 96,8 globlastp 2691 LYD454 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AT472_P1 9672 600 96,8 globlastp 2692 LYD454 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BON7G_P1 9672 600 96,8 globlastp 2693 LYD454 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BSLTA_P1 9672 600 96,8 globlastp 2694 LYD454 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01CBBH_P1 9672 600 96,8 globlastp 2695 LYD454 b_oleracea|gb161|EE534617_P1 9672 600 96,8 globlastp 2696 LYD454 b_oleracea|gb161|EE535639_P1 9672 600 96,8 globlastp 2697 LYD454 b_oleracea|gb161|ES938999_P1 9672 600 96,8 globlastp 2698 LYD454 b_rapa|gb162|CA991993_P1 9672 600 96,8 globlastp 2699 LYD454 brapa|gb162|CV433918_P1 9672 600 96,8 globlastp 2700 LYD454 brapa|gb162|DY010043_P1 9672 600 96,8 globlastp 2701 LYD454 b_rapa|gb162|ES931561_P1 9672 600 96,8 globlastp 2702 LYD454 barley|10v2|BE454732_P1 9671 600 96,8 globlastp 2703 LYD454 barley|10v2|BE601876_P1 9671 600 96,8 globlastp

219 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 2704 LYD454 barley|10v2|BF621642_P1 9671 600 96,8 globlastp 2705 LYD454 brachypodium|09v1|GT765606_P1 9671 600 96,8 globlastp 2706 LYD454 brachypodium|09v1|GT769811_P1 9671 600 96,8 globlastp 2707 LYD454 canola|10v1|CD812564 9672 600 96,8 globlastp 2708 LYD454 canola|11v1|CN732375_P1 9672 600 96,8 globlastp 2709 LYD454 canola|10v1|CD813072 9672 600 96,8 globlastp 2710 LYD454 canola|10v1|CD814874 9672 600 96,8 globlastp 2711 LYD454 canola|10v1|CD818449 9672 600 96,8 globlastp 2712 LYD454 canola|11v1|EE415534_P1 9672 600 96,8 globlastp 2713 LYD454 canola|10v1|CD819525 9672 600 96,8 globlastp 2714 LYD454 canola|11v1|DW998052_P1 9672 600 96,8 globlastp 2715 LYD454 canola|10v1|CD839528 9672 600 96,8 globlastp 2716 LYD454 canola|11v1|CN731337_P1 9672 600 96,8 globlastp 2717 LYD454 canola|10v1|CN726009 9672 600 96,8 globlastp 2718 LYD454 canola|10v1|CX189267 9672 600 96,8 globlastp 2719 LYD454 canola|10v1|CX192558 9672 600 96,8 globlastp 2720 LYD454 canola|10v1|CX278325 9672 600 96,8 globlastp 2721 LYD454 canola|10v1|DW997505 9672 600 96,8 globlastp 2722 LYD454 canola|10v1|DY007588 9672 600 96,8 globlastp 2723 LYD454 canola|11v1|DY007588_P1 9672 600 96,8 globlastp 2724 LYD454 canola|10v1|EG019457 9672 600 96,8 globlastp 2725 LYD454 canola|10v1|H74605 9672 600 96,8 globlastp 2726 LYD454 cassava|09v1|CK641062_P1 9676 600 96,8 globlastp 2727 LYD454 ceratodon|10v1|AWO86856_P1 9677 600 96,8 globlastp 2728 LYD454 ceratodon|10v1|SRR074890S0000398_P1 9677 600 96,8 globlastp 2729 LYD454 cichorium|gb171|DT213339_P1 9671 600 96,8 globlastp 2730 LYD454 cichorium|gb171|EH697772_P1 9671 600 96,8 globlastp 2731 LYD454 cryptomeria|gb166|BP176298_P1 9678 600 96,8 globlastp 2732 LYD454 dandelion|10v1|DY814562_P1 9671 600 96,8 globlastp 2733 LYD454 dandelion|10v1|DY818579_P1 9671 600 96,8 globlastp 2734 LYD454 dandelion|10v1|DY820989_P1 9671 600 96,8 globlastp 2735 LYD454 eucalyptus|gb166|CT981964 9679 600 96,8 globlastp 2736 LYD454 gerbera|09v1|AJ751842_P1 9671 600 96,8 globlastp 2737 LYD454 iceplant|gb164|BE034600_P1 9671 600 96,8 globlastp 2738 LYD454 lettuce|10v1|DWO44488_P1 9671 600 96,8 globlastp 2739 LYD454 lettuce|10v1|DWO49058_P1 9671 600 96,8 globlastp 2740 LYD454 lettuce|10v1|DWO51320_P1 9671 600 96,8 globlastp 2741 LYD454 lettuce|10v1|DWO77155_P1 9671 600 96,8 globlastp 2742 LYD454 lettuce|10v1|DWO81576_P1 9671 600 96,8 globlastp 2743 LYD454 lolium|10v1|ES699043_P1 9671 600 96,8 globlastp 2744 LYD454 oat|10v2|G0586308 9671 600 96,8 globlastp 2745 LYD454 oat|10v2|G0597060 9671 600 96,8 globlastp 2746 LYD454 oat|11v1|G0597060_P1 9671 600 96,8 globlastp 2747 LYD454 oat|10v2|SRR020741S0014111 9671 600 96,8 globlastp 2748 LYD454 oat|11v1|SRR020741,14111_P1 9671 600 96,8 globlastp 2749 LYD454 oat|10v2|SRR020741S0017135 9671 600 96,8 globlastp orobanche|10v1|SRR023189S00008 2750 LYD454 9680 600 96,8 globlastp 68_P1 2751 LYD454 physcomitrella|10v1|AW145371_P1 9677 600 96,8 globlastp 2752 LYD454 physcomitrella|10v1|AW145482_P1 9677 600 96,8 globlastp 2753 LYD454 physcomitrella|10v1|AW145643_P1 9677 600 96,8 globlastp 2754 LYD454 physcomitrella|10v1|AW738898_P1 9677 600 96,8 globlastp 2755 LYD454 podocarpus|10v1|SRR065014S0028153_P1 9673 600 96,8 globlastp 2756 LYD454 radish|gb164|EV546138 9672 600 96,8 globlastp 2757 LYD454 radish|gb164|EW714205 9672 600 96,8 globlastp 2758 LYD454 radish|gb164|EW733313 9672 600 96,8 globlastp 2759 LYD454 radish|gb164|EX748549 9672 600 96,8 globlastp 2760 LYD454 radish|gb164|EX764385 9672 600 96,8 globlastp 2761 LYD454 radish|gb164|EX773248 9672 600 96,8 globlastp 2762 LYD454 radish|gb164|FD536591 9672 600 96,8 globlastp 2763 LYD454 salvia|10v1|CV170531 9671 600 96,8 globlastp

220 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 2764 LYD454 salvia|10v1|SRR014553S0003235 9671 600 96,8 globlastp 2765 LYD454 sciadopitys|10v1|SRR065035S0030903 9681 600 96,8 globlastp 2766 LYD454 senecio|gb170|DV038747 9671 600 96,8 globlastp 2767 LYD454 spruce|gb162|CO223398 9670 600 96,8 globlastp 2768 LYD454 spruce|gb162|DR508930 9670 600 96,8 globlastp 2769 LYD454 sugarcane|10v1|CN611654 9682 600 96,8 globlastp 2770 LYD454 sunflower|10v1|CD845768 9671 600 96,8 globlastp sunflower|10v1| 2771 LYD454 9671 600 96,8 globlastp CD846382 2772 LYD454 sunflower|10v1|CD849049 9671 600 96,8 globlastp 2773 LYD454 sunflower|10v1|DY910601 9671 600 96,8 globlastp 2774 LYD454 taxus|10v1|SRR032523S0012471 9673 600 96,8 globlastp 2775 LYD454 tragopogon|10v1|SRR020205S0009242 9671 600 96,8 globlastp 2776 LYD454 wheat|10v2|AL826328 9671 600 96,8 globlastp 2777 LYD454 wheat|10v2|BE399345 9671 600 96,8 globlastp 2778 LYD454 wheat|10v2|BE416316 9671 600 96,8 globlastp 2779 LYD454 wheat|10v2|BF473734 9671 600 96,8 globlastp 2780 LYD454 zamia|gb166|DY032275 9683 600 96,8 globlastp 2781 LYD454 zostera|10v1|SRR057351S0002653 9671 600 96,8 globlastp 2782 LYD454 canola|11v1|CN729033_P1 9672 600 96,8 globlastp 2783 LYD454 canola|11v1|CN726009_P1 9672 600 96,8 globlastp 2784 LYD454 canola|11v1|EG019457_P1 9672 600 96,8 globlastp 2785 LYD454 oat|11v1|SRR020741.119516_P1 9671 600 96,8 globlastp 2786 LYD454 cirsium|11v1|SRR346952.621859_T1 9684 600 96,8 glotblastn 2787 LYD454 utricularia|11v1|SRR094438.105225_T1 9685 600 96,8 glotblastn 2788 LYD454 amaranthus|10v1|SRR039411S0030601_T1 9686 600 96,8 glotblastn 2789 LYD454 b_oleracea|gb161|DY027988 T1 9687 600 96,8 glotblastn 2790 LYD454 brapa|gb162|CX265916_T1 9688 600 96,8 glotblastn 2791 LYD454 brapa|gb162|CX269689_T1 9689 600 96,8 glotblastn 2792 LYD454 b rapa|gb162|CX270469 T1 9690 600 96,8 glotblastn 2793 LYD454 oil_palm|gb166|EL690410 T1 9691 600 96,8 glotblastn 2794 LYD454 radish|gb164|EV536026 9692 600 96,8 glotblastn 2795 LYD454 radish|gb164|EW715786 9693 600 96,8 glotblastn 2796 LYD454 safflower|gb162|EL409667 9694 600 96,8 glotblastn 2797 LYD454 sequoia|10v1|SRR065044S0001520 9695 600 96,8 glotblastn 2798 LYD454 zostera|10v1|AM769623 9696 600 96,8 glotblastn 2799 LYD454 utricularia|11v1|SRR094438.106041_T1 - 600 96,8 glotblastn 2800 LYD454 cedrus|11v1|SRR065007X108153_P1 9697 600 95,2 globlastp 2801 LYD454 cedrus|11v1|SRR065007X133520_P1 9698 600 95,2 globlastp 2802 LYD454 clementine|11v1|DN797432_P1 9699 600 95,2 globlastp 2803 LYD454 flax|11v1|EU829296_P1 9700 600 95,2 globlastp 2804 LYD454 flax|11v1|JG082410_P1 9700 600 95,2 globlastp 2805 LYD454 fraxinus|11v1|SRR058827.122124_P1 9701 600 95,2 globlastp 2806 LYD454 orange|11v1|DN797432_P1 9699 600 95,2 globlastp 2807 LYD454 canola|10v1|ES994411 9702 600 95,2 globlastp 2808 LYD454 canola|11v1|EV138550_P1 9702 600 95,2 globlastp 2809 LYD454 cassava|09v1|CK641617_P1 9703 600 95,2 globlastp 2810 LYD454 citrus|gb166|DN797432_P1 9699 600 95,2 globlastp 2811 LYD454 flax|09v1|EU829296 9700 600 95,2 globlastp 2812 LYD454 flax|11v1|EU829395_P1 9700 600 95,2 globlastp 2813 LYD454 gerbera|09v1|AJ764262_P1 9704 600 95,2 globlastp 2814 LYD454 marchantia|gb166|C96083_P1 9705 600 95,2 globlastp 2815 LYD454 pinel|10v2|AA556923_P1 9706 600 95,2 globlastp 2816 LYD454 pseudotsugal|10v1|SRR065119S0016763 9697 600 95,2 globlastp 2817 LYD454 pseudotsugal|10v1|SRR065119S0069145 9697 600 95,2 globlastp 2818 LYD454 sciadopitys|10v1|SRR065035S0026248 9707 600 95,2 globlastp 2819 LYD454 thellungiella|gb167|BY827021 9708 600 95,2 globlastp 2820 LYD454 ambrosia|11v1|SRR346943,171352_T1 9709 600 95,2 glotblastn 2821 LYD454 cirsium|11v1|SRR346952.106937XX2 T1 9710 600 95,2 glotblastn 2822 LYD454 flaveria|11v1|SRR149229.47685_T1 9711 600 95,2 glotblastn 2823 LYD454 flaveria|11v1|SRR149244.156117_T1 9712 600 95,2 glotblastn

221 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: phalaenopsis|11v1|SRR125771.1386203XX 2824 LYD454 9713 600 95,2 glotblastn 1_T1 2825 LYD454 radish|gb164|EW714228 9714 600 95,2 glotblastn 2826 LYD454 safflower|gb162|EL510939 9715 600 95,2 glotblastn 2827 LYD454 humulus|11v1|SRR098683X12029_T1 - 600 95,2 glotblastn 2828 LYD454 scabiosa|11v1|SRR063723X110130_T1 - 600 95,2 glotblastn 2829 LYD454 barley|10v2|CA028561_T1 - 600 95,2 glotblastn 2830 LYD454 taxus|10v1|SRR032523S0049257 - 600 95,2 glotblastn 2831 LYD454 gnetum|10v1|SRR064399S0003290_P1 9716 600 93,7 globlastp 2832 LYD454 b_oleracea|gb161|EE534016_T1 9717 600 93,6 glotblastn 2833 LYD454 iceplant|gb164|BE033574_T1 9718 600 93,6 glotblastn 2834 LYD454 wheat|10v2|CA616714 9719 600 93,6 glotblastn 2835 LYD454 sarracenia|11v1|SRR192669.251034_T1 - 600 93,6 glotblastn thellungiella_parvulum|11v1|P3Y827021_T 2836 LYD454 - 600 93,6 glotblastn 1 2837 LYD454 cichorium|gb171|FL679669_T1 - 600 93,6 glotblastn 2838 LYD454 pine|10v2|AWO64649_P1 9720 600 93,5 globlastp 2839 LYD454 pine|10v2|BF221379_P1 9721 600 93,5 globlastp 2840 LYD454 tragopogon|10v1|SRR02020550114897 9722 600 93,5 globlastp 2841 LYD454 sarracenia|11v1|SRR192671.234142_T1 9723 600 91,9 glotblastn 2842 LYD454 rye|gb164|BE704867 9724 600 91,9 glotblastn 2843 LYD454 b_juncea|10v2|E6ANDIZ02JYZYI_P1 9725 600 91,9 globlastp 2844 LYD454 marchantia|gb166|C96371_P1 9726 600 91,9 globlastp 2845 LYD454 pine|10v2|AWO10141_P1 9727 600 91,9 globlastp 2846 LYD454 triphysaria|10v1|BM356870 9728 600 91,9 globlastp 2847 LYD454 triphysaria|10v1|EY008970 9728 600 91,9 globlastp 2848 LYD454 triphysaria|10v1|SRR023500S0063179 9728 600 91,9 globlastp 2849 LYD454 fagopyrum|11v1|SRR063703X169382_T1 9729 600 90,6 glotblastn 2850 LYD454 thalictrum|11v1|SRR096787X107927_T1 9730 600 90,3 glotblastn 2851 LYD454 pine|10v2|DN631114_T1 9731 600 90,3 glotblastn 2852 LYD454 euphorbia|11v1|P3P959302_T1 - 600 90,3 glotblastn 2853 LYD454 pteridium|11v1|SRR043594X10825XX l_T1 - 600 90,3 glotblastn 2854 LYD454 banana|10v1|FL658159_P1 9732 600 90,3 globlastp 2855 LYD454 fern|gb171|DK944768_P1 9733 600 90,3 globlastp 2856 LYD454 ginger|gb164|DY345606_P1 9734 600 89,9 globlastp 2857 LYD454 b_rapa|gb162|EX116720_T1 9735 600 88,7 glotblastn 2858 LYD454 beet|gb162|EG551257_T1 9736 600 88,7 glotblastn cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0050567 2859 LYD454 9737 600 87,3 globlastp _P1 thellungiella_halophilum|11v1|BY827021_P 2860 LYD454 9738 600 86,6 globlastp 1 2861 LYD454 thellungiella_parvulum|11v1|EC599225_P1 9739 600 86,6 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP031238 2862 LYD454 9740 600 86,6 globlastp _P1 2863 LYD454 canola|11v1|EE504791_P1 9741 600 85,5 globlastp 2864 LYD454 spikemoss|gb165|DN838769 9742 600 84,1 globlastp 2865 LYD454 triphysaria|10v1|CB815014 9743 600 84,1 globlastp 2866 LYD454 orobanche|10v1|SRR023189S0157062_P1 9744 600 83,9 globlastp 2867 LYD454 volvox|gb162|AW676277 9745 600 83,9 globlastp 2868 LYD454 chlamydomonas|gb162|AW676277_T1 9746 600 83,9 glotblastn 2869 LYD454 tobacco|gb162|CV015984 9747 600 82,7 globlastp 2870 LYD454 mesostigma|gb166|EC726985_P1 9748 600 82,3 globlastp 2871 LYD454 wheat 10v21CJ525342 9749 600 82,3 globlastp 2872 LYD454 apple|11v1|CV128717_T1 9750 600 82,3 glotblastn sarracenia|11v1|SRR192669.238960 2873 LYD454 - 600 82,3 glotblastn T1 nicotiana_benthamiana|gb162|CN742184_P 2874 LYD454 9751 600 81,3 globlastp 1 2875 LYD454 onion|gb162|CF436447_P1 9752 600 81,3 globlastp 2876 LYD454 aquilegia|10v2|DT735337_T1 9753 600 80,7 glotblastn 2877 LYD454 olead|11v1|SRR014464.70506_T1 - 600 80,7 glotblastn

222 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 2878 LYD454 mesostigma|gb166|DN255051_P1 9754 600 80,6 globlastp 2879 LYD454 spruce|gb162|ES660969 9755 600 80,6 globlastp 2880 LYD454 watermelon|11v1|AM715327_P1 9756 600 80,3 globlastp 2881 LYD454 watermelon|11v1|V634285_P1 9757 600 80,3 globlastp 2882 LYD458 soybean|11v1|GLYMA02G06120 9758 603 89,7 globlastp 2883 LYD458 pigeonpea|10v1|SRR054580S0707957_P1 9759 603 87,7 globlastp 2884 LYD458 cowpea|gb166|FC457470_P1 9760 603 87,4 globlastp 2885 LYD458 medicago|09v1|AL370573_P1 9761 603 83,7 globlastp 2886 LYD458 trigonella|11v1|SRR066194X87106_T1 9762 603 82,6 glotblastn 2887 LYD459 soybean|11v1|GLYMA19G01330 9763 604 88,5 globlastp 2888 LYD460 bean|gb167|CB542551_P1 9764 605 94,9 globlastp 2889 LYD460 cowpea|gb166|FC458286 T1 9765 605 94,6 glotblastn 2890 LYD460 soybean|11v1|GLYMA15G10490 9766 605 93,8 globlastp 2891 LYD460 medicago|09v1|AL376477_P1 9767 605 87,3 globlastp 2892 LYD460 1otus|09v1|AW720440_P1 9768 605 86,8 globlastp 2893 LYD460 cassava|09v1|DV443765_P1 9769 605 80,6 globlastp 2894 LYD461 soybean|11v1|GLYMA13G26930_P1 9770 606 90,4 globlastp 2895 LYD465 soybean|11v1|GLYMA05G21280 9771 608 92,7 globlastp 2896 LYD466 liquorice|gb171|FS244484_P1 609 609 100,0 globlastp 2897 LYD466 cyamopsis|10v1|EG981534_P1 9772 609 99,2 globlastp 2898 LYD466 liquorice|gb171|S238727_P1 9773 609 99,2 globlastp 2899 LYD466 oak|10v1|DN950897_P1 9774 609 99,2 globlastp 2900 LYD466 pigeonpea|10v1|GR466152_P1 9775 609 99,2 globlastp 2901 LYD466 cucurbita|11v1|SRR091276X101348_P1 9776 609 98,3 globlastp cucurbita|11v1|SRR091276X229924XX2_P 2902 LYD466 9776 609 98,3 globlastp 1 2903 LYD466 eucalyptus|11v2|CD668247_P1 9777 609 98,3 globlastp 2904 LYD466 cacao|10v1|1CU477307_P1 9778 609 98,3 globlastp 2905 LYD466 chestnut|gb170|SRR006295S0007913_P1 9779 609 98,3 globlastp 2906 LYD466 chestnut|gb170|SRR00629550008800_P1 9780 609 98,3 globlastp 2907 LYD466 cucumber|09v1|DV633091_P1 9776 609 98,3 globlastp 2908 LYD466 eucalyptus|gb166|CD668247 9777 609 98,3 globlastp 2909 LYD466 grape|11v1|GSVIVT01011419001_P1 9781 609 98,3 globlastp 2910 LYD466 grape|gb160|BQ799013 9781 609 98,3 globlastp 2911 LYD466 grape|11v1|GSVIVT01019985001_P1 9781 609 98,3 globlastp 2912 LYD466 grape|gb160|CB002131 9781 609 98,3 globlastp 2913 LYD466 hevea|10v1|IEC601405_P1 9782 609 98,3 globlastp 2914 LYD466 lotus|09v1|LBG662070_P1 9783 609 98,3 globlastp 2915 LYD466 momordica|10v1|SRR071315S0007426_P1 9776 609 98,3 globlastp 2916 LYD466 oak|10v1|FP041651_P1 9780 609 98,3 globlastp 2917 LYD466 peanut|10v1|ES717592_P1 9784 609 98,3 globlastp 2918 LYD466 poplar|10v1|P3U823770_P1 9785 609 98,3 globlastp 2919 LYD466 soybean|11v1|GLYMA01G05740 9786 609 98,3 globlastp 2920 LYD466 soybean|11v1|GLYMA02G11920 9786 609 98,3 globlastp 2921 LYD466 clementine|11v1|CF829369_P1 9787 609 97,5 globlastp 2922 LYD466 euphorbia|11v1|DV127901_P1 9788 609 97,5 globlastp 2923 LYD466 flaveria|11v1|SRR149229,123657_P1 9789 609 97,5 globlastp 2924 LYD466 flaveria|11v1|SRR149229,155515_P1 9790 609 97,5 globlastp 2925 LYD466 flaveria|11v1|SRR149229,356445XX2_P1 9789 609 97,5 globlastp 2926 LYD466 orange|11v1|CF829369_P1 9787 609 97,5 globlastp 2927 LYD466 phyla|11v2|SRR099035X100505_P1 9791 609 97,5 globlastp 2928 LYD466 phyla|11v2|SRR099037X112964_P1 9792 609 97,5 globlastp 2929 LYD466 watermelon|11v1|AA660127_P1 9788 609 97,5 globlastp 2930 LYD466 bruguiera|gb166|BP940899_P1 9793 609 97,5 globlastp 2931 LYD466 cacao|10v1|CA794726_P1 9794 609 97,5 globlastp 2932 LYD466 cacao|10v1|CU476824_P1 9795 609 97,5 globlastp 2933 LYD466 cassava|09v1|BM260178_P1 9796 609 97,5 globlastp 2934 LYD466 cassava|09v1|CK645001_P1 9797 609 97,5 globlastp 2935 LYD466 cassava|09v1|FF535419_P1 9797 609 97,5 globlastp 2936 LYD466 citrus|gb166|CF829369_P1 9787 609 97,5 globlastp 2937 LYD466 cowpea|gb166|FC457012_P1 9798 609 97,5 globlastp

223 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 2938 LYD466 cucumber|09v1|BG1454G0050262_P1 9799 609 97,5 globlastp 2939 LYD466 cucumber|09v1|CK085571_P1 9799 609 97,5 globlastp 2940 LYD466 cyamopsis|10v1|IEG977518_P1 9800 609 97,5 globlastp 2941 LYD466 ginseng|10v1|DV555890_P1 9801 609 97,5 globlastp 2942 LYD466 heritiera|10v1|SRR005795S0004876_P1 9802 609 97,5 globlastp 2943 LYD466 ipomoea_ni|10v1|BJ555580_P1 9803 609 97,5 globlastp 2944 LYD466 ipomoea_ni|10v1|BJ555811_P1 9804 609 97,5 globlastp 2945 LYD466 jatropha|09v1|FM887510_P1 9805 609 97,5 globlastp 2946 LYD466 melon|10v1|IDV632616_P1 9799 609 97,5 globlastp 2947 LYD466 melon|10v1|VMEL00700107581081_P1 9799 609 97,5 globlastp 2948 LYD466 poplar|10v1|A1163146_P1 9806 609 97,5 globlastp 2949 LYD466 prunus|10v1|CN488753 9807 609 97,5 globlastp 2950 LYD466 salvia|10v1|CV162376 9808 609 97,5 globlastp 2951 LYD466 eucalyptus|11v2|CD669633_P1 9809 609 97,5 globlastp 2952 LYD466 ambrosia|11v1|SRR346935,460478_P1 9810 609 96,7 globlastp 2953 LYD466 ambrosia|11v1|SRR346943,138303_P1 9811 609 96,7 globlastp 2954 LYD466 amsonia|11v1|SRR098688X10157_P1 9812 609 96,7 globlastp 2955 LYD466 cirsium|11v1|SRR346952.1001857_P1 9813 609 96,7 globlastp 2956 LYD466 cirsium|11v1|SRR346952.105500XXl_P1 9814 609 96,7 globlastp 2957 LYD466 clementine|11v1|CF834581_P1 9815 609 96,7 globlastp 2958 LYD466 cucurbita|11v1|SRR091276X111559_P1 9816 609 96,7 globlastp 2959 LYD466 flaveria|11v1|SRR149229.,157079XX1_P1 9810 609 96,7 globlastp 2960 LYD466 flaveria|11v1|SRR149229,223524_P1 9817 609 96,7 globlastp 2961 LYD466 flaveria|11v1|SRR149232.140872_P1 9810 609 96,7 globlastp 2962 LYD466 flaveria|11v1|1SRR149232.146129_P1 9817 609 96,7 globlastp 2963 LYD466 flaveria|11v1|SRR149232.200003_P1 9810 609 96,7 globlastp 2964 LYD466 flaveria|11v1|SRR149244.106209_P1 9817 609 96,7 globlastp 2965 LYD466 orange|11v1|CF834581_P1 9815 609 96,7 globlastp 2966 LYD466 phyla|11v2|SRR099035X113093_P1 9818 609 96,7 globlastp 2967 LYD466 platanus|11v1|SRR096786X104422_P1 9819 609 96,7 globlastp 2968 LYD466 platanus|11v1|SRR096786X108393_P1 9820 609 96,7 globlastp 2969 LYD466 sarracenia|11v1|SRR192669.103397_P1 9821 609 96,7 globlastp 2970 LYD466 sarracenia|11v1|SRR192669.124864_P1 9821 609 96,7 globlastp 2971 LYD466 sarracenia|11v1|SRR192669.160452P1 9821 609 96,7 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X108564 2972 LYD466 9822 609 96,7 globlastp _P1 2973 LYD466 thalictrum|11v1|SRR096787X101277_P1 9823 609 96,7 globlastp 2974 LYD466 thalictrum|11v1|SRR096787X103040_P1 9823 609 96,7 globlastp 2975 LYD466 tomato|11v1|P3G124377_P1 9824 609 96,7 globlastp 2976 LYD466 trigonella|11v1|SRR066194X184530_P1 9825 609 96,7 globlastp 2977 LYD466 tripterygium|11v1|SRR098677X111938_P1 9826 609 96,7 globlastp 2978 LYD466 watermelon|11v1|DV632616_P1 9827 609 96,7 globlastp 2979 LYD466 watermelon|11v1|SRR057379,197960_P1 9828 609 96,7 globlastp 2980 LYD466 bean|gb167|CA897859_P1 9829 609 96,7 globlastp 2981 LYD466 bean|gb167|CA897862_P1 9829 609 96,7 globlastp 2982 LYD466 cassava|09v1|CK642565_P1 9830 609 96,7 globlastp 2983 LYD466 castorbean|09v1|EV520590 9831 609 96,7 globlastp 2984 LYD466 castorbean|11v1|EV520590_P1 9831 609 96,7 globlastp 2985 LYD466 cichorium|gb171|EH684815_P1 9832 609 96,7 globlastp 2986 LYD466 citrus|gb166|CF834581_P1 9815 609 96,7 globlastp 2987 LYD466 coffea|10v1|GR995923_P1 9833 609 96,7 globlastp 2988 LYD466 cotton|10v2|SRR032367S0001161_P1 9834 609 96,7 globlastp 2989 LYD466 cotton|10v2|SRR03P12367S0164472_ 9835 609 96,7 globlastp 2990 LYD466 cowpea|gb166|FC459928_P1 9836 609 96,7 globlastp 2991 LYD466 cynara|gb167|GE585982_P1 9837 609 96,7 globlastp 2992 LYD466 eggplant|10v1|FS013353_P1 9824 609 96,7 globlastp 2993 LYD466 eucalyptus|gb166|CU398698 9838 609 96,7 globlastp 2994 LYD466 hevea|10v1|EC600287_P1 9839 609 96,7 globlastp 2995 LYD466 ipomoea_batatas|10v1|CB330053_ P1 9840 609 96,7 globlastp 2996 LYD466 ipomoea_ni|10v1|BJ555282_P1 9841 609 96,7 globlastp 2997 LYD466 kiwi|gb166|FG489709_P1 9842 609 96,7 globlastp

224 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 2998 LYD466 liriodendron|gb166|CK753799_P1 9843 609 96,7 globlastp 2999 LYD466 medicago|09v1|AW125981_P1 9844 609 96,7 globlastp 3000 LYD466 medicago|09v1|AW698456_P1 9845 609 96,7 globlastp 3001 LYD466 oi1_palm|gb166|CN599981_P1 9846 609 96,7 globlastp 3002 LYD466 peanut|10v1|CD038251_P1 9847 609 96,7 globlastp 3003 LYD466 peanut|10v1|ES718269_P1 9847 609 96,7 globlastp 3004 LYD466 pepper|gb171| BM062074_P1 9848 609 96,7 globlastp 3005 LYD466 pepper|gb171|BM065228_P1 9849 609 96,7 globlastp 3006 LYD466 pigeonpea|10v1|GR472227_P1 9850 609 96,7 globlastp 3007 LYD466 pigeonpea|10v1|SRR054580S0064353_P1 9851 609 96,7 globlastp 3008 LYD466 poplar|10v1|AI161812_P1 9852 609 96,7 globlastp 3009 LYD466 salvia|10v1|CV162276 9853 609 96,7 globlastp 3010 LYD466 salvia|10v1|ISRR014553S0001485 9854 609 96,7 globlastp 3011 LYD466 strawberry|11v1|DV438309 9855 609 96,7 globlastp 3012 LYD466 sunflower|10v1|CD849342 9810 609 96,7 globlastp 3013 LYD466 sunflower|10v1|CD852072 9817 609 96,7 globlastp 3014 LYD466 tomato|09v1|PG124377 9824 609 96,7 globlastp 3015 LYD466 tragopogon|10v1|ISRR020205S0010714 9817 609 96,7 globlastp 3016 LYD466 tragopogon|10v1|SRR020205 S0024028 9814 609 96,7 globlastp 3017 LYD466 eucalyptus|11v2|CD670009_P1 9856 609 96,7 globlastp 3018 LYD466 ambrosia|11v1|SRR346946.133561_T1 9857 609 96,7 glotblastn 3019 LYD466 flaveria|11v1|SRR149240.392156XX l_T1 9858 609 96,7 glotblastn 3020 LYD466 apple|11v1|CN488753_P1 9859 609 95,9 globlastp 3021 LYD466 apple|gb171|CN488753 9859 609 95,9 globlastp 3022 LYD466 flaverial|11v1|SRR149244.158738_T1 9860 609 95,8 glotblastn 3023 LYD466 fraxinus|11v1|SRR058827.125544_T1 9861 609 95,8 glotblastn 3024 LYD466 phyla|11v2|SRR099037X137502_T1 9862 609 95,8 glotblastn 3025 LYD466 lettuce|10v1|DWO82930_T1 9863 609 95,8 glotblastn 3026 LYD466 ambrosia|11v1|SRR346943.155207_T1 - 609 95,8 glotblastn 3027 LYD466 ambrosia|11v1|GW917906_P1 9864 609 95,8 globlastp 3028 LYD466 ambrosia|11v1|SRR346943.109747_P1 9865 609 95,8 globlastp 3029 LYD466 amsonia|11v1|SRR098688X106682_P1 9866 609 95,8 globlastp 3030 LYD466 amsonia|11v1|SRR098688X115447_P1 9867 609 95,8 globlastp 3031 LYD466 arnica|11v1|SRR099034X122814_P1 9864 609 95,8 globlastp 3032 LYD466 arnica|11v1|SRR099034X125577_P1 9864 609 95,8 globlastp 3033 LYD466 catharanthus|11v1|EG560575_P1 9868 609 95,8 globlastp 3034 LYD466 cirsium|11v1|SRR346952.1037114_P1 9869 609 95,8 globlastp 3035 LYD466 cirsium|11v1|SRR346952.107984_P1 9870 609 95,8 globlastp 3036 LYD466 clementine|11v1|CK665249_P1 9871 609 95,8 globlastp 3037 LYD466 euonymus|11v1|SRR070038X509880_P1 9872 609 95,8 globlastp 3038 LYD466 euphorbia|11v1|BP954359_P1 9873 609 95,8 globlastp 3039 LYD466 euphorbia|11v1|BP961561_P1 9873 609 95,8 globlastp 3040 LYD466 euphorbia|11v1|SRR098678X142028_P1 9873 609 95,8 globlastp 3041 LYD466 flaveria|11v1|SRR149232.123466_P1 9874 609 95,8 globlastp 3042 LYD466 flax|11v1|JG023418_P1 9875 609 95,8 globlastp 3043 LYD466 fraxinus|11v1|ISRR058827.112513_P1 9876 609 95,8 globlastp 3044 LYD466 fraxinus|11v1|ISRR058827.155166_P1 9876 609 95,8 globlastp 3045 LYD466 fraxinus|11v1|SRR058827.199934_P1 9877 609 95,8 globlastp 3046 LYD466 olea|11v1|SRR014464.48863_P1 9878 609 95,8 globlastp 3047 LYD466 platanus|11v1|SRR096786X101281_P1 9879 609 95,8 globlastp 3048 LYD466 scabiosa|11v1|SRR063723X112360_P1 9880 609 95,8 globlastp 3049 LYD466 scabiosa|11v1|SRR063723X131858_P1 9880 609 95,8 globlastp tabemaemontana|11v1|SRR098689X114081 3050 LYD466 9881 609 95,8 globlastp _P1 3051 LYD466 tomato|11v1|TOB6RPL_P1 9882 609 95,8 globlastp 3052 LYD466 trigonella|11v1|SRR066194X104803Pl 9883 609 95,8 globlastp 3053 LYD466 trigonella|11v1|SRR066194X108892_P1 9884 609 95,8 globlastp 3054 LYD466 tripterygium|11v1|SRR098677X102042_P1 9885 609 95,8 globlastp 3055 LYD466 acacia|10v1|GR480866_P1 9886 609 95,8 globlastp 3056 LYD466 aquilegia|10v2|JGIACO20198_P1 9887 609 95,8 globlastp 3057 LYD466 aristolochia|10v1|SRR039082S0084500_P1 9888 609 95,8 globlastp

225 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 3058 LYD466 bean|gb167|CA897867_P1 9889 609 95,8 globlastp 3059 LYD466 catharanthus|gb166|EG560575 9868 609 95,8 globlastp 3060 LYD466 centaureia|gb166|EH741299_P1 9890 609 95,8 globlastp 3061 LYD466 chickpea|09v2|GR391680_P1 9891 609 95,8 globlastp 3062 LYD466 chickpea|09v2|GR408111_P1 9892 609 95,8 globlastp 3063 LYD466 coffea|10v1|DV665302_P1 9893 609 95,8 globlastp 3064 LYD466 cotton|10v2|EF278805_P1 9894 609 95,8 globlastp 3065 LYD466 cynara|gb167|GE585895_P1 9895 609 95,8 globlastp 3066 LYD466 dandelion|10v1|DQ160155_P1 9865 609 95,8 globlastp 3067 LYD466 dandelion|10v1|DR399235_P1 9865 609 95,8 globlastp 3068 LYD466 dandelion|10v1|DR401148_P1 9896 609 95,8 globlastp 3069 LYD466 gerbera|09v1|AJ750117_P1 9897 609 95,8 globlastp 3070 LYD466 gerbera|09v1|AJ756963_P1 9898 609 95,8 globlastp 3071 LYD466 guizotia|10v1|GE557999_P1 9899 609 95,8 globlastp 3072 LYD466 kiwi|gb166|FG412429_P1 9900 609 95,8 globlastp 3073 LYD466 kiwi|gb166|FG422831_P1 9901 609 95,8 globlastp 3074 LYD466 lettuce|10v1|DWO45460_P1 9865 609 95,8 globlastp 3075 LYD466 lettuce|10v1|DWO50381_P1 9865 609 95,8 globlastp 3076 LYD466 lettuce|10v1|DWO56327_P1 9896 609 95,8 globlastp 3077 LYD466 lettuce|10v1|DWO78130_P1 9865 609 95,8 globlastp 3078 LYD466 lotus|09v1|A1967492_P1 9902 609 95,8 globlastp 3079 LYD466 medicago|09v1|LAW328958_P1 9903 609 95,8 globlastp 3080 LYD466 monkeyflower|10v1|DV206096_P1 9904 609 95,8 globlastp 3081 LYD466 orobanche|10v1|SRR023189S0018550_P1 9905 609 95,8 globlastp 3082 LYD466 papaya|gb165|EX283981_P1 9906 609 95,8 globlastp 3083 LYD466 pea|09v1|CD860560 9891 609 95,8 globlastp 3084 LYD466 pea|11v1|CD860560_P1 9891 609 95,8 globlastp 3085 LYD466 pepper|gb171|PM065210_P1 9907 609 95,8 globlastp 3086 LYD466 petunia|gb171|CV292770_P1 9908 609 95,8 globlastp 3087 LYD466 potato|10v1|PG590201_P1 9909 609 95,8 globlastp 3088 LYD466 potato|10v1|BG597356_P1 9910 609 95,8 globlastp 3089 LYD466 prunus|10v1|PU043944 9911 609 95,8 globlastp 3090 LYD466 rose|10v1|EC586485 9912 609 95,8 globlastp 3091 LYD466 solanum_phureja|09v1|SPHBG123236 9909 609 95,8 globlastp 3092 LYD466 solanum_phureja|09v1|SPHBG124377 9910 609 95,8 globlastp 3093 LYD466 solanum_phureja|09v1|SPHBG129941 9913 609 95,8 globlastp 3094 LYD466 strawberry|10v1|FX671725 9914 609 95,8 globlastp 3095 LYD466 sunflower|10v1|CD848121 9915 609 95,8 globlastp 3096 LYD466 sunflower|10v1|CD851684 9916 609 95,8 globlastp 3097 LYD466 tobacco|gb162|CV016534 9917 609 95,8 globlastp 3098 LYD466 tomato|09v1|P3G129941 9882 609 95,8 globlastp 3099 LYD466 triphysaria|10v1|DR173191 9918 609 95,8 globlastp 3100 LYD466 eggplant|10v1|FS011818_P1 9919 609 95,1 globlastp 3101 LYD466 ambrosia|11v1|SRR346935.32223_P1 9920 609 95,0 globlastp 3102 LYD466 ambrosia|11v1|SRR346946.152229_P1 9921 609 95,0 globlastp 3103 LYD466 arnica|11v1|SRR099034X110065_T1 9922 609 95,0 glotblastn 3104 LYD466 catharanthus|11v1|EG561156_P1 9923 609 95,0 globlastp 3105 LYD466 catharanthus|11v1|SRR098691X100213_P1 9924 609 95,0 globlastp 3106 LYD466 cirsium|11v1|SRR346952.1018707_P1 9925 609 95,0 globlastp 3107 LYD466 euonymus|11v1|SRR070038X10352_P1 9926 609 95,0 globlastp 3108 LYD466 euonymus|11v1|SRR070038X107613_P1 9926 609 95,0 globlastp 3109 LYD466 euonymus|11v1|SRR070038X115885_P1 9926 609 95,0 globlastp 3110 LYD466 euonymus|11v1|SRR070038X191281_P1 9927 609 95,0 globlastp 3111 LYD466 euphorbia|11v1|DV116308_P1 9928 609 95,0 globlastp 3112 LYD466 euphorbia|11v1|DV117602_P1 9928 609 95,0 globlastp 3113 LYD466 flaveria|11v1|SRR149229.154397_P1 9921 609 95,0 globlastp 3114 LYD466 flaveria|11v1|SRR149229.168348_P1 9929 609 95,0 globlastp 3115 LYD466 flaveria|11v1|SRR149244.128380_P1 9921 609 95,0 globlastp 3116 LYD466 flaveria|11v1|SRR149244.363711_T1 9930 609 95,0 glotblastn 3117 LYD466 flax|11v1|JG023203_P1 9931 609 95,0 globlastp

226 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 3118 LYD466 flax|11v1|JG031097_P1 9932 609 95,0 globlastp 3119 LYD466 flax|11v1|JG095374_P1 9931 609 95,0 globlastp 3120 LYD466 fraxinus|11v1|SRR058827.109128_P1 9933 609 95,0 globlastp 3121 LYD466 fraxinus|11v1|SRR058827.138818_P1 9934 609 95,0 globlastp 3122 LYD466 fraxinus|11v1|SRR058827.162993_P1 9935 609 95,0 globlastp 3123 LYD466 fraxinus|11v1|SRR058827.22962_P1 9936 609 95,0 globlastp 3124 LYD466 olea|11v1|SRR014463.59393_P1 9933 609 95,0 globlastp 3125 LYD466 pea|11v1|PSU10047_P1 9937 609 95,0 globlastp 3126 LYD466 phyla|11v2|SRR099035X109229_P1 9938 609 95,0 globlastp 3127 LYD466 phyla|11v2|SRR099037X132753XX 1_P1 9939 609 95,0 globlastp 3128 LYD466 plantago|11v1|SRR066373X1005_P1 9940 609 95,0 globlastp 3129 LYD466 plantago|11v1|SRR066373X105321_P1 9941 609 95,0 globlastp sarracenia|11v1|SRR192669.115424XX1_P 3130 LYD466 9942 609 95,0 globlastp 1 3131 LYD466 scabiosa|11v1|SRR063723X112852_P1 9943 609 95,0 globlastp 3132 LYD466 scabiosa|11v1|SRR063723X114440_P1 9943 609 95,0 globlastp 3133 LYD466 thalictrum|11v1|SRR096787X121276_P1 9944 609 95,0 globlastp 3134 LYD466 tomato|11v1|P3G123236_P1 9945 609 95,0 globlastp 3135 LYD466 tripterygium|11v1|SRR098677X101173_P1 9946 609 95,0 globlastp 3136 LYD466 vinca|11v1|SRR098690X106248_P1 9947 609 95,0 globlastp 3137 LYD466 vinca|11v1|SRR098690X112349_P1 9948 609 95,0 globlastp 3138 LYD466 vinca|11v1|SRR098690X114203_P1 9923 609 95,0 globlastp 3139 LYD466 antirrhinum|gb166|AJ558542_P1 9949 609 95,0 globlastp 3140 LYD466 antirrhinum|gb166|AJ559402_P1 9950 609 95,0 globlastp 3141 LYD466 aquilegia|10v2|JGIAC008518_P1 9951 609 95,0 globlastp 3142 LYD466 artemisia|10v1|EY033427_P1 9952 609 95,0 globlastp 3143 LYD466 artemisia|10v1|EY043212_P1 9953 609 95,0 globlastp 3144 LYD466 banana|10v1|FL649878_P1 9954 609 95,0 globlastp 3145 LYD466 castorbean|09v1|AM267451 9955 609 95,0 globlastp 3146 LYD466 castorbean|11v1|T14866_P1 9955 609 95,0 globlastp 3147 LYD466 catharanthus|gb166|CX119705 9923 609 95,0 globlastp 3148 LYD466 catharanthus|gb166|FD420757 9924 609 95,0 globlastp 3149 LYD466 citrus|gb166|CK665249_P1 9956 609 95,0 globlastp 3150 LYD466 coffea|10v1|IDV665604_P1 9957 609 95,0 globlastp 3151 LYD466 cotton|10v2|E3E054921_P1 9958 609 95,0 globlastp 3152 LYD466 cotton|10v2|E3F274382_P1 9959 609 95,0 globlastp 3153 LYD466 cotton|10v2|SRR03287850109146XX1_P1 9959 609 95,0 globlastp 3154 LYD466 cotton|10v2|SRR032880S0007101_P1 9960 609 95,0 globlastp 3155 LYD466 cowpea|gb166|FF546625_P1 9961 609 95,0 globlastp 3156 LYD466 dandelion|10v1|DR398599_P1 9962 609 95,0 globlastp 3157 LYD466 eggplant|10v1|FS007663_P1 9963 609 95,0 globlastp 3158 LYD466 eucalyptus|gb166|CD670009 9964 609 95,0 glotblastn 3159 LYD466 gerbera|09v1|AJ750464_P1 9965 609 95,0 globlastp 3160 LYD466 guizotia|10v1|GE565909_P1 9966 609 95,0 globlastp 3161 LYD466 iceplant|gb164|BE033619_P1 9967 609 95,0 globlastp 3162 LYD466 kiwi|gb166|FG414714_P1 9968 609 95,0 globlastp 3163 LYD466 lettuce|10v1|DWO44860_P1 9969 609 95,0 globlastp 3164 LYD466 lettuce|10v1|DWO76953_P1 9970 609 95,0 globlastp 3165 LYD466 monkeyflower|10v1|CV521479_P1 9971 609 95,0 globlastp 3166 LYD466 monkeyflower|10v1|DV210095_P1 9972 609 95,0 globlastp 3167 LYD466 nasturtium|10v1|GH166126 9973 609 95,0 globlastp 3168 LYD466 nicotiana_benthamiana|gb162|ES887594_P1 9974 609 95,0 globlastp 3169 LYD466 pea|09v1|PSU10047 9937 609 95,0 globlastp 3170 LYD466 petunia|gb171|CV294109_P1 9975 609 95,0 globlastp 3171 LYD466 petunia|gb171|DC240417_P1 9976 609 95,0 globlastp 3172 LYD466 prunus|10v1|BU042353 9977 609 95,0 globlastp 3173 LYD466 sesame|10v1|BU669488 9978 609 95,0 globlastp 3174 LYD466 soybean|11v1|GLYMA08G41280 9979 609 95,0 globlastp 3175 LYD466 soybean|11v1|GLYMA18G14980 9980 609 95,0 globlastp 3176 LYD466 spurge|gb161|DV116308 9928 609 95,0 globlastp 3177 LYD466 sunflower|10v1|CD850130 9921 609 95,0 globlastp

227 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 3178 LYD466 tomato|09v1|BG123236 9945 609 95,0 globlastp 3179 LYD466 triphysaria|10v1|BE574817 9981 609 95,0 globlastp 3180 LYD466 triphysaria|10v1|EX985120 9982 609 95,0 globlastp 3181 LYD466 fraxinus|11v1|SRR058827.128040_T1 - 609 95,0 glotblastn 3182 LYD466 ambrosia|11v1|SRR346943,181135XX1_P1 9983 609 94,2 globlastp amorphophallus|11v2|SRR089351X106208_ 3183 LYD466 9984 609 94,2 globlastp P1 amorphophallus|11v2|SRR089351X125311_ 3184 LYD466 9985 609 94,2 globlastp P1 3185 LYD466 euonymus|11v1|SRR070038X10972_P1 9986 609 94,2 globlastp 3186 LYD466 flaveria|11v1|SRR149229,144499_P1 9987 609 94,2 globlastp 3187 LYD466 flax|11v1|GW864813_P1 9988 609 94,2 globlastp 3188 LYD466 flax|11v1|JG032437_P1 9988 609 94,2 globlastp 3189 LYD466 flax|11v1|JG036980_P1 9988 609 94,2 globlastp 3190 LYD466 flax|11v1|JG106265_P1 9988 609 94,2 globlastp 3191 LYD466 humulus|11v1|ES654081_P1 9989 609 94,2 globlastp 3192 LYD466 humulus|11v1|EX515678_P1 9990 609 94,2 globlastp 3193 LYD466 plantago|11v1|SRR066373X112214_P1 9991 609 94,2 globlastp 3194 LYD466 silene|11v1|GH292442_P1 9992 609 94,2 globlastp 3195 LYD466 silene|11v1|SRR096785X10017_P1 9992 609 94,2 globlastp 3196 LYD466 silene|11v1|SRR096785X106520_P1 9992 609 94,2 globlastp 3197 LYD466 vinca|11v1|SRR098690X107741_P1 9993 609 94,2 globlastp 3198 LYD466 amborella|gb166|CK750154_P1 9994 609 94,2 globlastp 3199 LYD466 apple|11v1|CN443945_P1 9995 609 94,2 globlastp 3200 LYD466 apple|gb171|CN443945 9995 609 94,2 globlastp 3201 LYD466 avocado|10v1|CK767109_P1 9996 609 94,2 globlastp 3202 LYD466 avocado|10v1|DT592051_P1 9997 609 94,2 globlastp 3203 LYD466 banana|10v1|FF558891_P1 9998 609 94,2 globlastp 3204 LYD466 beet|gb162|BF011200_P1 9999 609 94,2 globlastp 3205 LYD466 beet|gb162|BQ592290_P1 10000 609 94,2 globlastp 3206 LYD466 centaureia|gb166|EH741072_P1 10001 609 94,2 globlastp 3207 LYD466 centaureia|gb166|EH788075_P1 10002 609 94,2 globlastp 3208 LYD466 cotton|10v2|DR456115_P1 10003 609 94,2 globlastp 3209 LYD466 curcuma|10v1|DY389480_P1 10004 609 94,2 globlastp 3210 LYD466 flax|09v1|EU830206 9988 609 94,2 globlastp 3211 LYD466 flax|11v1|EU830206_P1 9988 609 94,2 globlastp 3212 LYD466 iceplant|gb164|BM300151_P1 10005 609 94,2 globlastp 3213 LYD466 monkeyflower|10v1|DV207094_P1 10006 609 94,2 globlastp nicotiana_benthamiana|gb162|EH364881_P 3214 LYD466 10007 609 94,2 globlastp 1 3215 LYD466 tobacco|gb162|BQ842868 10008 609 94,2 globlastp 3216 LYD466 tobacco|gb162|TOB6RPL 10009 609 94,2 globlastp 3217 LYD466 triphysaria|10v1|BM357574 10010 609 94,2 globlastp 3218 LYD466 triphysaria|10v1|EX988172 10011 609 94,2 globlastp 3219 LYD466 triphysaria|10v1|EX993123 10012 609 94,2 globlastp 3220 LYD466 pteridiuml|11v1|SRR043594X101690 T1 10013 609 94,2 glotblastn 3221 LYD466 antirrhinum|gb166|AJ559698 T1 10014 609 94,2 glotblastn 3222 LYD466 ginger|gb164|DY345132 T1 10015 609 94,2 glotblastn 3223 LYD466 cucurbita|11v1|SRR091276X109737_P1 10016 609 93,4 globlastp 3224 LYD466 ginger|gb164|DY369183_P1 10017 609 93,4 globlastp 3225 LYD466 orobanche|10v1|SRR02318950023963_P1 10018 609 93,4 globlastp 3226 LYD466 flax|11v1|JG135899_T1 10019 609 93,3 glotblastn 3227 LYD466 heritiera|10v1|SRR005795S0064531 T1 10020 609 93,3 glotblastn 3228 LYD466 Ipomoea_ni|10v1|BJ555491_T1 10021 609 93,3 glotblastn 3229 LYD466 flax|11v1|JG029702_P1 10022 609 93,3 globlastp 3230 LYD466 fraxinus|11v1|SRR058827.130137_P1 10023 609 93,3 globlastp 3231 LYD466 silene|11v1|GH293781_P1 10024 609 93,3 globlastp 3232 LYD466 tripterygium|11v1|SRR098677X118 539_P1 10025 609 93,3 globlastp 3233 LYD466 valeriana|11v1|SRR099039X100858_P1 10026 609 93,3 globlastp 3234 LYD466 valeriana|11v1|SRR099039X105788_P1 10026 609 93,3 globlastp 3235 LYD466 vincai|11v1|SRR098690X187529_P1 10027 609 93,3 globlastp

228 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 3236 LYD466 banana|10v1|FL659202_P1 10028 609 93,3 globlastp 3237 LYD466 basilicum|10v1|DY342675_P1 10029 609 93,3 globlastp 3238 LYD466 beet|gb162|BQ587673_P1 10030 609 93,3 globlastp 3239 LYD466 millet|10v1|CD725510_P1 10031 609 93,3 globlastp 3240 LYD466 nasturtium|10v1|GH164367 10032 609 93,3 globlastp 3241 LYD466 nasturtium|10v1|SRR032558S0034221 10033 609 93,3 globlastp 3242 LYD466 pineapple|10v1|DT335779_P1 10034 609 93,3 globlastp 3243 LYD466 tamarix|gb166|EH050924 10035 609 93,3 globlastp 3244 LYD466 apple|11v1|CN879530_P1 10036 609 92,7 globlastp 3245 LYD466 apple|gb171|CN879530 10036 609 92,7 globlastp 3246 LYD466 chelidonium|11v1|SRR084752X102887_P1 10037 609 92,6 globlastp 3247 LYD466 apple|11v1|CN493979_P1 10038 609 92,6 globlastp 3248 LYD466 apple|gb171|CN493979 10038 609 92,6 globlastp 3249 LYD466 tea|10v1|CV013646 10039 609 92,6 globlastp 3250 LYD466 orobanche|10v1|SRR02318950005952_T1 - 609 92,6 glotblastn 3251 LYD466 cannabis|12v1|SOLX00031938_P1 10040 609 92,5 globlastp 3252 LYD466 cannabis|12v1|SOLX00060787_P1 10040 609 92,5 globlastp 3253 LYD466 chelidonium|11v1|SRR084752X10339_P1 10041 609 92,5 globlastp 3254 LYD466 fagopyrum|11v1|SRR063689X100103_P1 10042 609 92,5 globlastp 3255 LYD466 fagopyrum|11v1|SRR063689X14726_P1 10043 609 92,5 globlastp 3256 LYD466 fagopyrum|11v1|SRR063703X100631_P1 10043 609 92,5 globlastp 3257 LYD466 flax|11v1|JG037856_P1 10044 609 92,5 globlastp 3258 LYD466 fraxinus|11v1|SRR058827.130264_P1 10045 609 92,5 globlastp 3259 LYD466 phalaenopsis|11v1|1CK857186_P1 10046 609 92,5 globlastp 3260 LYD466 primula|11v1|SRR098679X103059_T1 10047 609 92,5 glotblastn sarracenia|11v1|SRR192669.108867 3261 LYD466 10048 609 92,5 globlastp P1 3262 LYD466 utricularia|11v1|SRR094438.108088_P1 10049 609 92,5 globlastp 3263 LYD466 valeriana|11v1|SRR099039X103096_P1 10050 609 92,5 globlastp 3264 LYD466 artemisia|10v1|EY048995_P1 10051 609 92,5 globlastp 3265 LYD466 banana|10v1|FL662344_P1 10052 609 92,5 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000255 3266 LYD466 10053 609 92,5 globlastp 6_P1 cleome_gynandra|10v1|SRR015532S001840 3267 LYD466 10054 609 92,5 globlastp 6_P1 cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0067386 3268 LYD466 10055 609 92,5 globlastp _P1 3269 LYD466 eschscholzia|10v1|CD480276 10056 609 92,5 globlastp 3270 LYD466 kiwi|gb166|FG419070_P1 10057 609 92,5 globlastp nicotiana_benthamiana|gb162|CN742494_P 3271 LYD466 10058 609 92,5 globlastp 1 3272 LYD466 strawberry|11v1|DV438433 10059 609 92,5 globlastp 3273 LYD466 zinnia|gb171|AU305312 10060 609 92,5 glotblastn 3274 LYD466 apple|11v1|CN579382_P1 10061 609 91,9 globlastp 3275 LYD466 apple|gb171|CN579382 10061 609 91,9 globlastp 3276 LYD466 fagopyrum|11v1|SRR063689X10183_P1 10062 609 91,7 globlastp 3277 LYD466 fagopyrum|11v1|SRR063703X102368_P1 10062 609 91,7 globlastp 3278 LYD466 fagopyrum|11v1|SRR063703X107830_P1 10062 609 91,7 globlastp 3279 LYD466 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1010654_P1 10063 609 91,7 globlastp 3280 LYD466 silene|11v1|SRR096785X104821_P1 10064 609 91,7 globlastp 3281 LYD466 thellungiella_parvulum|11v1|BM985665_P1 10065 609 91,7 globlastp 3282 LYD466 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL002665_P1 10066 609 91,7 globlastp 3283 LYD466 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL007167_P1 10067 609 91,7 globlastp 3284 LYD466 arabidopsis|10v1|AT1G26880_P1 10066 609 91,7 globlastp 3285 LYD466 banana|10v1|FL651470_P1 10068 609 91,7 globlastp 3286 LYD466 bruguiera|gb166|BP946784_P1 10069 609 91,7 globlastp 3287 LYD466 eschscholzia|10v1|SRR014116S0009486 10070 609 91,7 globlastp 3288 LYD466 foxtail_millet|10v2|SICRP010306 10071 609 91,7 globlastp 3289 LYD466 foxtail_millet|11v3|PHY7SI014672M_P1 10071 609 91,7 globlastp 3290 LYD466 lolium|10v1|ES699501_P1 10072 609 91,7 globlastp 3291 LYD466 maize|10v1|AI665168_P1 10073 609 91,7 globlastp

229 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 3292 LYD466 millet|10v1|EB410932_P1 10074 609 91,7 globlastp 3293 LYD466 nuphar|gb166|CK750236_P1 10075 609 91,7 globlastp 3294 LYD466 oil_palm|gb166|EL682504_P1 10076 609 91,7 globlastp 3295 LYD466 papaya|gb165|EX228263_P1 10077 609 91,7 globlastp 3296 LYD466 rice|gb170|0S09G24690 10078 609 91,7 globlastp 3297 LYD466 sorghum|09v1|SB07G003770 10071 609 91,7 globlastp 3298 LYD466 sorghum|11v1|SBO7G003770_P1 10071 609 91,7 globlastp 3299 LYD466 switchgrass|gb167|DN142201 10079 609 91,7 globlastp 3300 LYD466 switchgrass|gb167|FE606301 10079 609 91,7 globlastp 3301 LYD466 switchgrass|gb167|FE608833 10071 609 91,7 globlastp 3302 LYD466 switchgrass|gb167|FE641195 10071 609 91,7 globlastp 3303 LYD466 tamarix|gb166|CF198906 10080 609 91,7 globlastp 3304 LYD466 zamia|gb166|DY033077 10081 609 91,7 globlastp 3305 LYD466 humulus|11v1|SRR098683X131447_T1 10082 609 91,7 glotblastn 3306 LYD466 phyla|11v2|SRR099037X15202_T1 10083 609 91,7 glotblastn 3307 LYD466 curcuma|10v1|DY384916_T1 10084 609 91,7 glotblastn 3308 LYD466 iceplant|gb164|BE034528_T1 10085 609 90,8 glotblastn 3309 LYD466 kiwi|gb166|FG489451_T1 10086 609 90,8 glotblastn 3310 LYD466 canola|11v1|CN729041_T1 10087 609 90,8 glotblastn 3311 LYD466 b_oleracea|gb161|DY027255_T1 - 609 90,8 glotblastn 3312 LYD466 foxtail_millet|11v3|PHY7SI011205M_P1 10088 609 90,8 globlastp 3313 LYD466 oat|11v1|CN815407_P1 10089 609 90,8 globlastp 3314 LYD466 oat|11v1|G0587489_P1 10090 609 90,8 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BM985665_ 3315 LYD466 10091 609 90,8 globlastp P1 thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111006 3316 LYD466 10092 609 90,8 globlastp 410_P1 3317 LYD466 utricularial|11v1|SRR094438.10278_P1 10093 609 90,8 globlastp 3318 LYD466 arabidopsis|10v1|AT1G69620_P1 10094 609 90,8 globlastp 3319 LYD466 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A85WV_P1 10095 609 90,8 globlastp 3320 LYD466 b_rapa|gb162|CV432313_P1 10095 609 90,8 globlastp 3321 LYD466 brapa|gb162|EX015446_P1 10095 609 90,8 globlastp 3322 LYD466 barley|10v2|E3E213979_P1 10096 609 90,8 globlastp 3323 LYD466 canola|10v1|CD811629 10095 609 90,8 globlastp 3324 LYD466 canola|10v1|CD820310 10095 609 90,8 globlastp 3325 LYD466 canola|10v1|EE502392 10097 609 90,8 globlastp 3326 LYD466 canola|11v1|EE502392_P1 10097 609 90,8 globlastp 3327 LYD466 cenchrus|gb166|EB652499_P1 10098 609 90,8 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S001883 3328 LYD466 10099 609 90,8 globlastp 1_P1 3329 LYD466 cynodon|10v1|ES296047_P1 10100 609 90,8 globlastp 3330 LYD466 fescue|gb161|DT689471_P1 10090 609 90,8 globlastp 3331 LYD466 fescue|gb161|DT705028_P1 10101 609 90,8 globlastp foxtail_millet|10v2|OXFXTSLX00002448D 3332 LYD466 10098 609 90,8 globlastp 1T1 3333 LYD466 foxtail_millet|11v3|PHY7SI032704M_P1 10098 609 90,8 globlastp 3334 LYD466 lovegrass|gb167|DN481127_P1 10100 609 90,8 globlastp 3335 LYD466 maize|10v1|A1668539_P1 10102 609 90,8 globlastp 3336 LYD466 maize|10v1|AI901491_P1 10103 609 90,8 globlastp 3337 LYD466 millet|10v1|EV0454PM050725_P1 10104 609 90,8 globlastp 3338 LYD466 nuphar|gb166|CD475058_P1 10105 609 90,8 globlastp 3339 LYD466 oat|10v2|CN815407 10089 609 90,8 globlastp 3340 LYD466 oat|10v2|G0587489 10090 609 90,8 globlastp 3341 LYD466 oat|11v1|G0588768_P1 10090 609 90,8 globlastp 3342 LYD466 poppy|gb166|FE964496_P1 10106 609 90,8 globlastp 3343 LYD466 rose|10v1|EC586444 10107 609 90,8 globlastp 3344 LYD466 sorghum|09v1|SB07G021410 10108 609 90,8 globlastp 3345 LYD466 sorghum|11v1|SB07G021410_P1 10108 609 90,8 globlastp 3346 LYD466 sugarcane|10v1|BQ535353 10108 609 90,8 globlastp 3347 LYD466 switchgrass|gb167|FE626801 10088 609 90,8 globlastp 3348 LYD466 switchgrass|gb167|FL729319 10088 609 90,8 globlastp

230 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 3349 LYD466 thellungiella|gb167|BM985665 10091 609 90,8 globlastp 3350 LYD466 wheat|10v2|BE426547 10090 609 90,8 globlastp 3351 LYD466 wheat|10v2|BE427371 10096 609 90,8 globlastp 3352 LYD466 wheat|10v2|CA484908 10108 609 90,8 globlastp 3353 LYD466 zostera|10v1|AM766443 10109 609 90,8 globlastp 3354 LYD466 canola|11v1|CN737769XX1_P1 10110 609 90,0 globlastp 3355 LYD466 canola|11v1|EE451365_P1 10110 609 90,0 globlastp 3356 LYD466 canola|11v1|EG020375_P1 10111 609 90,0 globlastp 3357 LYD466 canola|11v1|SRR329661.101532_P1 10110 609 90,0 globlastp 3358 LYD466 oat|11v1|CN814739_P1 10112 609 90,0 globlastp 3359 LYD466 arabidopsis|10v1|AT3G28900_P1 10113 609 90,0 globlastp 3360 LYD466 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A4QS7_P1 10110 609 90,0 globlastp 3361 LYD466 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01ATRE_P1 10114 609 90,0 globlastp 3362 LYD466 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BJG10_P1 10115 609 90,0 globlastp 3363 LYD466 b_oleracea|gb161|DY029440_P1 10110 609 90,0 globlastp 3364 LYD466 b_oleracea|gb161|DY029567_P1 10110 609 90,0 globlastp 3365 LYD466 b rapa|gb162|AT002072_P1 10110 609 90,0 globlastp 3366 LYD466 b rapa|gb162|CA991923_P1 10110 609 90,0 globlastp 3367 LYD466 b rapa|gb162|CX268735_P1 10110 609 90,0 globlastp 3368 LYD466 b rapa|gb162|ES936659_P1 10115 609 90,0 globlastp 3369 LYD466 b rapa|gb162|47940_P1 10110 609 90,0 globlastp 3370 LYD466 barley|10v2|BE420950_P1 10116 609 90,0 globlastp 3371 LYD466 barley|10v2|BE421373_P1 10117 609 90,0 globlastp 3372 LYD466 canola|10v1|CD812261 10110 609 90,0 globlastp 3373 LYD466 canola|11v1|CN730536_P1 10110 609 90,0 globlastp 3374 LYD466 canola|10v1|CD812811 10110 609 90,0 globlastp 3375 LYD466 canola|11v1|CN732346_P1 10110 609 90,0 globlastp 3376 LYD466 canola|10v1|CD817148 10111 609 90,0 globlastp 3377 LYD466 canola|11v1|EE457869_P1 10111 609 90,0 globlastp 3378 LYD466 canola|10v1|CD822926 10110 609 90,0 globlastp 3379 LYD466 canola|11v1|CN732484_P1 10110 609 90,0 globlastp 3380 LYD466 canola|10v1|CN730618 10115 609 90,0 globlastp 3381 LYD466 canola|10v1|CN734486 10115 609 90,0 globlastp 3382 LYD466 canola|11v1|CN730618_P1 10115 609 90,0 globlastp cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0010384 3383 LYD466 10118 609 90,0 globlastp _P1 3384 LYD466 foxtail_millet|10v2|SICRP026937 10119 609 90,0 globlastp 3385 LYD466 foxtail_millet|11v3|EC613306_P1 10119 609 90,0 globlastp 3386 LYD466 lolium|10v1|AU250783_P1 10120 609 90,0 globlastp 3387 LYD466 lovegrass|gb167|EH188905_P1 10121 609 90,0 globlastp 3388 LYD466 maize|10v1|AI615141_P1 10122 609 90,0 globlastp 3389 LYD466 maize|10v1|AI901307_P1 10123 609 90,0 globlastp 3390 LYD466 oat|10v2|CN814739 10112 609 90,0 globlastp 3391 LYD466 oat|10v2|CN817735 10120 609 90,0 globlastp 3392 LYD466 oat|11v1|CN817735_P1 10120 609 90,0 globlastp 3393 LYD466 pseudoroegneria|gb167|FF340771 10117 609 90,0 globlastp 3394 LYD466 senecio|gb170|SRR00659250003334 10124 609 90,0 globlastp 3395 LYD466 sorghum|09v1|SB02G024610 10125 609 90,0 globlastp 3396 LYD466 sorghum|11v1|SBO2G024610_P1 10125 609 90,0 globlastp 3397 LYD466 sugarcane|10v1|BQ536361 10126 609 90,0 globlastp 3398 LYD466 switchgrass|gb167|FE629679 10127 609 90,0 globlastp 3399 LYD466 switchgrass|gb167|FE638524 10127 609 90,0 globlastp 3400 LYD466 tamarix|gb166|EG967245 10128 609 90,0 glotblastn 3401 LYD466 wheat|10v2|BE429097 10116 609 90,0 globlastp 3402 LYD466 zostera|10v1|SRR057351S0001505 10129 609 90,0 globlastp 3403 LYD466 abies|11v2|SRR098676X117135_P1 10130 609 89,2 globlastp 3404 LYD466 abies|11v2|SRR098676X140759XX2_P1_ 10131 609 89,2 globlastp 3405 LYD466 canola|11v1|ES976955_P1 10132 609 89,2 globlastp 3406 LYD466 canola|11v1|SRR341920.942381_ P1 10132 609 89,2 globlastp 3407 LYD466 flaveria|11v1|SRR149241.187612XX1_P1 10133 609 89,2 globlastp 3408 LYD466 maritime_pine|10v1|BX680042_P1 10134 609 89,2 globlastp

231 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 3409 LYD466 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AX4JX_P1 10135 609 89,2 globlastp 3410 LYD466 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BJV8P_P1 10136 609 89,2 globlastp 3411 LYD466 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BMIAL2_P1 10135 609 89,2 globlastp 3412 LYD466 b_juncea|10v2|E6ANDIZ02G104G_P1 10137 609 89,2 globlastp 3413 LYD466 brachypodium|09v1|DV477596_P1 10138 609 89,2 globlastp 3414 LYD466 canola|10v1|IDY006620 10139 609 89,2 globlastp 3415 LYD466 canola|11v1|DY006620_P1 10139 609 89,2 globlastp 3416 LYD466 canola|10v1|ES917673 10139 609 89,2 globlastp 3417 LYD466 canola|11v1|ES917673_P1 10139 609 89,2 globlastp 3418 LYD466 gnetum|10v1|SRR064399S0009119_P1 10140 609 89,2 globlastp 3419 LYD466 pine|10v2|AW289731_P1 10130 609 89,2 globlastp 3420 LYD466 poplar|10v1|XM002318742_P1 10141 609 89,2 globlastp 3421 LYD466 rice|gb170|0S08G06040 10142 609 89,2 globlastp 3422 LYD466 rice|gb170|OS08G33920 10143 609 89,2 globlastp 3423 LYD466 rye|gb164|BE587146 10144 609 89,2 globlastp 3424 LYD466 spruce|gb162|CO218416 10145 609 89,2 globlastp 3425 LYD466 b rapa|gb162|EX050031 T1 10146 609 89,2 glotblastn 3426 LYD466 zostera|10v1|AM770964 10147 609 89,2 glotblastn 3427 LYD466 poplar|10v1|IXM002305594_P1 10148 609 88,4 globlastp 3428 LYD466 flaveria|11v1|SRR149232.124853_T1 10149 609 88,3 glotblastn 3429 LYD466 flaveria|11v1|SRR149232.14349_P1 10150 609 88,3 globlastp 3430 LYD466 flaveria|11v1|SRR149240.379001XX1_P1 10150 609 88,3 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111019 3431 LYD466 10151 609 88,3 globlastp 261_P1 3432 LYD466 brachypodium|09v1|DV470647_P1 10152 609 88,3 globlastp 3433 LYD466 cycas|gb166|CB089723_P1 10153 609 88,3 globlastp 3434 LYD466 cynodon|10v1|ES293313_P1 10154 609 88,3 globlastp 3435 LYD466 kiwi|gb166|FG527795_P1 10155 609 88,3 globlastp 3436 LYD466 onion|gb162|BE205663_P1 10156 609 88,3 globlastp 3437 LYD466 peanut|10v1|SRR042413S0010874_P1 10157 609 88,3 globlastp 3438 LYD466 pine|10v2|AWO10336_P1 10158 609 88,3 globlastp 3439 LYD466 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0000181 10158 609 88,3 globlastp 3440 LYD466 radish|gb164|EV525005 10159 609 88,3 globlastp 3441 LYD466 radish|gb164|EV566975 10160 609 88,3 globlastp 3442 LYD466 radish|gb164|EX754106 10161 609 88,3 globlastp 3443 LYD466 radish|gb164|EY905161 10161 609 88,3 globlastp 3444 LYD466 radish|gb164|T25172 10161 609 88,3 globlastp 3445 LYD466 radish|gb164|T25177 10162 609 88,3 globlastp 3446 LYD466 spruce|gb162|CO215644 10163 609 88,3 globlastp 3447 LYD466 zostera|10v1|AM770097 10164 609 88,3 globlastp 3448 LYD466 cedrus|11v1|SRR065007X161440_P1 10165 609 87,5 globlastp 3449 LYD466 distylium|11v1|SRR065077X135159_P1 10166 609 87,5 globlastp 3450 LYD466 flaveria|11v1|SRR149232.108816_P1 10167 609 87,5 globlastp 3451 LYD466 maritime_pine|10v1|AL750317_T1 10168 609 87,5 glotblastn thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP006700 3452 LYD466 10169 609 87,5 globlastp _P1 3453 LYD466 antirrhinum|gb166|AJ560122_P1 10170 609 87,5 globlastp 3454 LYD466 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A6GJL1_P1 10171 609 87,5 globlastp 3455 LYD466 ginger|gb164|DY347970 T1 10172 609 87,5 glotblastn 3456 LYD466 onion|gb162|CF439762_T1 10173 609 87,5 glotblastn 3457 LYD466 pine|10v2|CD018384_P1 10174 609 87,5 globlastp 3458 LYD466 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0009795 10175 609 87,5 globlastp 3459 LYD466 sequoia|10v1|SRR065044S0012708 10176 609 87,5 globlastp 3460 LYD466 phyla|11v2|SRR099037X39930_P1 10177 609 87,3 globlastp 3461 LYD466 nasturtium|10v1|SRR032558S0005061 10178 609 87,1 globlastp 3462 LYD466 cedrus|11v1|SRR065007X10003_P1 10179 609 86,7 globlastp 3463 LYD466 sciadopitys|10v1|SRR065035S0015070 10180 609 86,7 globlastp 3464 LYD466 taxus|10v1|SRR032523S0068882 10181 609 86,7 globlastp 3465 LYD466 gnetuni|10v1|SRR064399S0011018T1 10182 609 86,7 glotblastn 3466 LYD466 thalictrum|11v1|SRR096787X108768_ T1 - 609 86,7 glotblastn 3467 LYD466 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL017076_P1 10183 609 86,1 globlastp

232 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 3468 LYD466 flaveria|11v1|SRR149232.193203_P1 10184 609 86,0 globlastp 3469 LYD466 wheat|10v2|CA622324 10185 609 85,8 glotblastn 3470 LYD466 cephalotaxus|11v1|SRR064395X129251_P1 10186 609 85,8 globlastp 3471 LYD466 cucurbita|11v1|SRR091276X100037_P1 10187 609 85,8 globlastp 3472 LYD466 cucurbita|11v1|SRR091276X120168_P1 10188 609 85,8 globlastp 3473 LYD466 distylium|11v1|SRR065077X104309_P1 10189 609 85,8 globlastp 3474 LYD466 humulus|11v1|SRR098683X100674_P1 10190 609 85,8 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP001172 3475 LYD466 10191 609 85,8 globlastp _P1 3476 LYD466 cryptomeria|gb166|AU299748_P1 10192 609 85,8 globlastp 3477 LYD466 podocarpus|10v1|SRR065014S0007932_P1 10193 609 85,8 globlastp 3478 LYD466 vinca|11v1|SRR098690X193654_P1 10194 609 85,0 globlastp 3479 LYD466 fescue|gb161|DT686314_P1 10195 609 85,0 globlastp 3480 LYD466 canola|11v1|EV180786_T1 - 609 85,0 glotblastn 3481 LYD466 valeriana|11v1|SRR099039X158152_T1 10196 609 84,4 glotblastn 3482 LYD466 canola|11v1|SRR341920.845570_P1 10197 609 84,2 globlastp 3483 LYD466 fern|gb171|DK944547_P1 10198 609 84,2 globlastp 3484 LYD466 radish|gb164|EW734752 10199 609 84,2 globlastp 3485 LYD466 sciadopitys|10v1|867SRR065035S0015 10200 609 84,2 globlastp 3486 LYD466 b oleracea|gb161|EE532161 T1 10201 609 84,2 glotblastn 3487 LYD466 lovegrass|gb167|EH186435 T1 10202 609 84,2 glotblastn 3488 LYD466 wheat|10v2|CA618490XX1 10203 609 84,2 glotblastn 3489 LYD466 ceratodon|10v1|AWO87022_P1 10204 609 83,6 globlastp 3490 LYD466 ceratodon|10v1|SRR07489050047922_P1 10205 609 83,5 globlastp 3491 LYD466 wheat|10v2|CA619143 10206 609 83,3 glotblastn 3492 LYD466 flaveria|11v1|SRR149240,369708_P1 10207 609 83,3 globlastp 3493 LYD466 flax|11v1|JG159162_P1 10208 609 83,3 globlastp 3494 LYD466 kiwi|gb166|FG403924_P1 10209 609 83,3 globlastp 3495 LYD466 ceratodon|10v1|SRR07489050021625_P1 10210 609 82,8 globlastp 3496 LYD466 cotton|10v2|BG447191 T1 10211 609 81,7 glotblastn 3497 LYD466 citrus|gb166|EY796850 T1 10212 609 80,8 glotblastn 3498 LYD466 physcomitrella|10v1|AW476934_T1 10213 609 80,8 glotblastn 3499 LYD466 physcomitrella|10v1|P3Q039887_T1 10214 609 80,8 glotblastn 3500 LYD466 rhizophora|10v1|ISRR005793S0033460 10215 609 80,8 glotblastn 3501 LYD466 orobanche|10v1|SRR023189S0012984_P1 10216 609 80,8 globlastp 3502 LYD466 pteridium|11v1|GW574873_P1 10217 609 80,3 globlastp 3503 LYD466 fern|gb171|DK944445_P1 10218 609 80,3 globlastp 3504 LYD466 physcomitrella|10v1|AW476753_P1 10219 609 80,3 globlastp 3505 LYD466 physcomitrella|10v1|P3G409369_P1 10220 609 80,3 globlastp 3506 LYD466 physcomitrella|10v1|FC401949_P1 10221 609 80,3 globlastp 3507 LYD466 flaveria|11v1|SRR149238.136603_T1 10222 609 80,0 glotblastn 3508 LYD466 cryptomeria|gb166|DC429756_T1 10223 609 80,0 glotblastn 3509 LYD466 physcomitrella|10v1|AW599486_T1 10224 609 80,0 glotblastn 3510 LYD469 soybeanl|11v1|GLYMA03G36190 10225 612 89,0 globlastp 3511 LYD470 soybean|11v1|GLYMA03G40960 10226 613 85,6 globlastp 3512 LYD470 pigeonpea|10v1|SRR054580S0017387_P1 10227 613 85,2 globlastp 3513 LYD472 soybean|11v1|GLYMA03G31970 10228 615 95,5 globlastp 3514 LYD472 lotus|09v1|LBP080700_P1 10229 615 85,4 globlastp 3515 LYD473 soybean|11v1|GLYMA09G31690 10230 616 82,2 globlastp 3516 LYD474 dandelion|10v1|DY809911_P1 10231 617 96,6 globlastp 3517 LYD474 ambrosia|11v1|SRR346943,226548XX1_T1 10232 617 91,9 glotblastn 3518 LYD474 parthenium|10v1|GW778335_P1 10233 617 91,1 globlastp 3519 LYD474 parthenium|10v1|GW775759_P1 10234 617 89,4 globlastp 3520 LYD474 ambrosia|11v1|SRR346943,107836_P1 10235 617 88,9 globlastp 3521 LYD474 ambrosia|11v1|SRR346947.102324_T1 10236 617 88,5 glotblastn 3522 LYD474 sunflower|10v1|CD846908 10237 617 88,5 globlastp 3523 LYD474 ambrosia|11v1|SRR346935.10269_P1 10238 617 87,7 globlastp 3524 LYD474 sunflower|10v1|PE654323 10239 617 85,5 globlastp 3525 LYD474 ambrosia|11v1|SRR346935.259596_P1 10240 617 85,1 globlastp 3526 LYD474 flaveria|11v1|SRR149229.140773_P1 10241 617 84,7 globlastp 3527 LYD474 arnica|11v1|SRR099034X10926_P1 10242 617 84,3 globlastp 3528 LYD474 flaveria|11v1|1SRR149232.113834_P1 10243 617 84,3 globlastp

233 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 3529 LYD474 flaveria|11v1|SRR149232.15805_P1 10244 617 83,8 globlastp 3530 LYD474 guizotia|10v1|GE551791_P1 10245 617 83,5 globlastp 3531 LYD474 ambrosia|11v1|SRR346935.116981P1 10246 617 82,3 globlastp 3532 LYD474 safflower|gb162|EL401339 10247 617 82,3 globlastp 3533 LYD474 ambrosia|11v1|SRR346935.171311_P1 10248 617 82,1 globlastp 3534 LYD474 centaureia|gb166|EH741181_P1 10249 617 81,4 globlastp 3535 LYD474 cirsium|11v1|SRR346952.1005770_P1 10250 617 81,0 globlastp 3536 LYD474 cirsium|11v1|SRR346952.103446_P1 10251 617 80,6 globlastp 3537 LYD474 cynara|gb167|GE605300_T1 10252 617 80,1 glotblastn 3538 LYD475 solanum_phureja|09v1|SPHA1485596 10253 618 84,1 globlastp 3539 LYD477 solanum_phureja|09v1|SPHBP884530 10254 619 95,2 globlastp 3540 LYD478 solanum_phureja|09v1|SPHAI483112 10255 620 95,2 globlastp 3541 LYD479 solanum_phureja|09v1|SPHCV506145 10256 621 94,2 globlastp 3542 LYD479 eggplant|10v1|IFS042319_P1 10257 621 82,2 globlastp 3543 LYD481 solanum_phureja|09v1|SPHAI771986 10258 623 97,5 globlastp 3544 LYD481 tobacco|gb162|EB425742 10259 623 91,7 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X102070 3545 LYD481 10260 623 82,8 globlastp _P1 3546 LYD481 Ipomoea_ni|10v1|CJ749177_T1 10261 623 82,8 glotblastn 3547 LYD481 amsonia|11v1|SRR098688X129208_P1 10262 623 81,9 globlastp 3548 LYD481 phyla|11v2|SRR099035X119207_P1 10263 623 81,9 globlastp 3549 LYD481 triphysaria|10v1|EX984006 10264 623 81,7 globlastp 3550 LYD481 antirrhinum|gb166|AJ790278_T1 10265 623 81,5 glotblastn 3551 LYD481 phyla|11v2|SRR099037X107300_P1 10266 623 81,1 globlastp 3552 LYD481 flax|11v1|EU830660_P1 10267 623 80,3 globlastp 3553 LYD481 monkeyflower|10v1|G0997296_P1 10268 623 80,3 globlastp 3554 LYD481 plantago|11v1|SRR066373X102791T1 10269 623 80,3 glotblastn 3555 LYD482 solanum_phureja|09v1|SPHAI77795 10270 624 97,1 globlastp 3556 LYD482 potato|10v1|BG593342_P1 10271 624 96,7 globlastp 3557 LYD482 pepper|gb171|BM061913_P1 10272 624 91,2 globlastp 3558 LYD482 olea|11v1|SRR014463.21854_P1 10273 624 83,4 globlastp 3559 LYD482 monkeyflower|10v1|DV213085_P1 10274 624 82,2 globlastp 3560 LYD482 fraxinus|11v1|SRR058827.10179_T1 10275 624 82,0 glotblastn 3561 LYD482 vinca|11v1|SRR098690X130952_P1 10276 624 81,9 globlastp 3562 LYD482 poplar|10v1|BU820838_P1 10277 624 81,8 globlastp 3563 LYD482 poplar|10v1|BU102278_P1 10278 624 81,6 globlastp 3564 LYD482 triphysaria|10v1|PY154119 10279 624 81,6 glotblastn 3565 LYD482 vinca|11v1|SRR098690X102232_T1 10280 624 81,6 glotblastn 3566 LYD482 euonymus|11v1|SRR070038X148338_P1 10281 624 81,4 globlastp 3567 LYD482 catharanthus|11v1|EG556968XX1 10282 624 81,2 globlastp 3568 LYD482 amsonia|11v1|SRR098688X104050_P1 10283 624 81,1 globlastp 3569 LYD482 fraxinus|11v1|SRR058827.100785_T1 10284 624 81,0 glotblastn 3570 LYD482 kiwi|gb166|FG405195_P1 10285 624 80,8 globlastp 3571 LYD482 orobanche|10v1|SRR023189S0025760_P1 10286 624 80,6 globlastp 3572 LYD482 citrus|gb166|CF417110_P1 10287 624 80,2 globlastp 3573 LYD482 clementine|11v1|CF417110_P1 10288 624 80,0 globlastp 3574 LYD482 cacao|10v1|CF973747_P1 10289 624 80,0 globlastp 3575 LYD484 solanum_phureja|09v1|SPHAW929870 10290 626 96,1 globlastp 3576 LYD489 solanum_phureja|09v1|SPHBG131472 10291 628 93,7 glotblastn 3577 LYD491 solanum_phureja|09v1|SPHCK273448 10292 629 98,8 globlastp 3578 LYD491 cucumber|09v1|GD176541_P1 10293 629 83,1 globlastp 3579 LYD491 grape|11v1|EC993942_P1 10294 629 83,0 globlastp 3580 LYD491 grape|11v1|GSVIVT01030385001_P1_ 10294 629 83,0 globlastp 3581 LYD491 watermelon|11v1|AM732921_P1 10295 629 82,8 globlastp 3582 LYD491 prunus|10v1|CN930801 10296 629 82,8 globlastp 3583 LYD491 apple|11v1|G0511707_P1 10297 629 82,7 globlastp 3584 LYD491 apple|11v1|CN930801_T1 10298 629 82,1 glotblastn 3585 LYD491 strawberry|11v1|SRR034884S0011354 10299 629 82,0 glotblastn 3586 LYD491 castorbean|11v1|RCPRD038366_P1 10300 629 81,9 globlastp 3587 LYD491 castorbean|09v1|NM002517901 10300 629 81,9 globlastp 3588 LYD491 castorbean|11v1|XM_002517901_P1 10300 629 81,9 globlastp 3589 LYD491 cassava|09v1|DV453570_P1 10301 629 81,6 globlastp

234 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 3590 LYD491 cacao|10v1|CU469588_P1 10302 629 81,0 globlastp 3591 LYD491 cotton|10v2|SRR032367S0422347_T1 10303 629 80,9 glotblastn 3592 LYD491 apple|11v1|MDPRD026100_T1 10304 629 80,7 glotblastn 3593 LYD491 monkeyflower|10v1|IDV209830_P1 10305 629 80,5 globlastp 3594 LYD491 soybean|11v1|GLYMA13G37420 10306 629 80,5 globlastp 3595 LYD491 cotton|10v2|DW235393_T1 10307 629 80,5 glotblastn 3596 LYD491 amsonia|11v1|SRR098688X117684_T1 10308 629 80,2 glotblastn 3597 LYD491 lotus|09v1|CRPLJ030399_P1 10309 629 80,1 globlastp 3598 LYD492 solanum_phureja|09v1|SPHDN587540 10310 630 96,7 globlastp 3599 LYD492 pepper|gb171|GD055412_T1 10311 630 85,0 glotblastn 3600 LYD492 tobacco|gb162|BP132794 10312 630 80,0 glotblastn 3601 LYD495 wheat|10v2|BF202465 10313 631 98,8 globlastp 3602 LYD495 wheat|10v2|SRR043335S0034386 10314 631 97,9 globlastp 3603 LYD495 leymus|gb166|CD809068_P1 10315 631 96,7 globlastp 3604 LYD495 barley|10v2|BE437359_P1 10316 631 96,4 globlastp 3605 LYD495 oat|10v2|G0591667 10317 631 93,4 globlastp 3606 LYD495 oat|11v1|G0591667_P1 10317 631 93,4 globlastp 3607 LYD495 pseudoroegneria|gb167|FF342268 10318 631 89,3 globlastp 3608 LYD495 foxtail_millet|11v3|PHY7SI036516M_P1 10319 631 88,1 globlastp 3609 LYD495 rice|gb170|0S10G06720 10320 631 87,8 globlastp 3610 LYD495 millet|10v1|EV0454PM003140_P1 10321 631 87,5 globlastp 3611 LYD495 switchgrass|gb167|DN150426 10322 631 86,9 globlastp 3612 LYD495 switchgrass|gb167|FL957320 10323 631 86,6 globlastp 3613 LYD495 brachypodium|09v1|DV468881_P1 10324 631 86,6 globlastp 3614 LYD495 sorghum|09v1|SB01G025920 10325 631 85,2 globlastp 3615 LYD495 sorghum|11v1|SBO1G025920_P1 10325 631 85,2 globlastp 3616 LYD495 maize|10v1|A1491469_P1 10326 631 83,9 globlastp 3617 LYD497 fescue|gb161|DT679813_P1 10327 632 83,1 globlastp 3618 LYD498 b rapa|gb162|DY010348_P1 10328 633 98,1 globlastp 3619 LYD498 canola|10v1|ES995187 10328 633 98,1 globlastp 3620 LYD498 canola|10v1|H07784 10328 633 98,1 globlastp 3621 LYD498 canola|11v1|EE452324_P1 10328 633 98,1 globlastp 3622 LYD498 canola|10v1|CX196221 10329 633 97,7 globlastp 3623 LYD498 canola|11v1|DW997891_P1 10329 633 97,7 globlastp 3624 LYD498 b_oleracea|gb161|AM387391_P1 10330 633 96,7 globlastp 3625 LYD498 radish|gb164|EV546792 10331 633 96,7 globlastp 3626 LYD498 radish|gb164|EY940573 10331 633 96,7 globlastp 3627 LYD498 thellungiella_parvulum|11v1|DN772758_P1 10332 633 96,3 globlastp 3628 LYD498 b_junceal|10v2|E6ANDIZ01CH10Y_P1 10333 633 95,8 globlastp 3629 LYD498 canola|10v1|CD834724 10333 633 95,8 globlastp 3630 LYD498 canola|11v1|EE432581_P1 10333 633 95,8 globlastp 3631 LYD498 b_oleracea|gb161|AM387038_P1 10334 633 95,3 globlastp 3632 LYD498 B_rapa|gb162|CV433055_P1 10335 633 95,3 globlastp 3633 LYD498 canola|10v1|H07800 10335 633 95,3 globlastp 3634 LYD498 canola|11v1|E107784_P1 10336 633 95,3 globlastp 3635 LYD498 radish|gb164|EX754447 10337 633 95,3 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN772758_P 3636 LYD498 10338 633 95,0 globlastp 1 3637 LYD498 thellungiella|gb167|DN772758 10339 633 93,6 glotblastn arabidopsis_lyrata|09v1|CRPALE013486_P 3638 LYD498 10340 633 91,3 globlastp 1 3639 LYD498 arabidopsis|10v1|AT4G29160_P1 10341 633 90,9 globlastp 3640 LYD498 nasturtium|10v1|SRR032558S0111259 10342 633 90,8 globlastp 3641 LYD498 euphorbia|11v1|P3P958070_P1 10343 633 90,4 globlastp 3642 LYD498 euphorbia|11v1|SRR098678X107861_P1 10344 633 89,4 globlastp 3643 LYD498 tripterygium|11v1|SRR098677X109821_P1 10345 633 89,4 globlastp 3644 LYD498 aristolochia|10v1|FD757653_P1 10346 633 89,4 globlastp 3645 LYD498 solanum_phureja|09v1|SPHBG630642 10347 633 89,4 globlastp 3646 LYD498 cannabis|12v1|X493272_P1 10348 633 89,0 globlastp 3647 LYD498 euphorbia|11v1|DV122707_P1 10349 633 89,0 globlastp 3648 LYD498 humulus|11v1|EX517613_P1 10348 633 89,0 globlastp

235 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000495 3649 LYD498 10350 633 89,0 globlastp 6_P1 3650 LYD498 peanut|10v1|G0267328_P1 10351 633 89,0 globlastp 3651 LYD498 clementine|11v1|13Q623156_P1 10352 633 88,6 globlastp 3652 LYD498 orange|11v1|BQ623156_P1 10352 633 88,6 globlastp 3653 LYD498 citrus|gb166|BQ623156_P1 10352 633 88,6 globlastp 3654 LYD498 watermelon|11v1|C0997378_P1 10353 633 88,5 globlastp 3655 LYD498 cassava|09v1|DV457532_P1 10354 633 88,5 globlastp 3656 LYD498 chestnut|gb170|SRR00629550008037_P1 10355 633 88,5 globlastp 3657 LYD498 melon|10v1|DV634841_P1 10356 633 88,5 globlastp 3658 LYD498 cirsium|11v1|SRR346952,101098_P1 10357 633 88,1 globlastp 3659 LYD498 cucurbita|11v1|SRR091276X133932_P1 10358 633 88,1 globlastp 3660 LYD498 cucurbita|11v1|SRR091276X152857_P1 10359 633 88,1 globlastp 3661 LYD498 tomato|11v1|BG630642_P1 10360 633 88,1 globlastp 3662 LYD498 aristolochia|10v1|SRR039082S0235625_P1 10361 633 88,1 globlastp 3663 LYD498 cacao|10v1|CF972750_P1 10362 633 88,1 globlastp 3664 LYD498 castorbean|09v1|EG659045 10363 633 88,1 globlastp 3665 LYD498 castorbean|11v1|EG659045_P1 10363 633 88,1 globlastp 3666 LYD498 cichorium|gb171|EL353927_P1 10364 633 88,1 globlastp 3667 LYD498 cucumber|09v1|C0997378_P1 10365 633 88,1 globlastp 3668 LYD498 oil_palm|gb166|EL684259_P1 10366 633 88,1 globlastp 3669 LYD498 papaya|gb165|EX267720_P1 10367 633 88,1 globlastp 3670 LYD498 potato|10v1|BQ515666_P1 10368 633 88,1 globlastp 3671 LYD498 spurge|gb161|DV122707 10369 633 88,1 globlastp 3672 LYD498 tomato|09v1|PG630642 10360 633 88,1 globlastp 3673 LYD498 eggplant|10v1|FS012070_P1 10370 633 88,0 globlastp 3674 LYD498 tobacco|gb162|EB425232 10371 633 88,0 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X100859 3675 LYD498 10372 633 87,7 globlastp _P1 3676 LYD498 eucalyptus|11v2|CD669263_P1 10373 633 87,7 globlastp 3677 LYD498 tragopogon|10v1|SRR020205S0020911 10374 633 87,6 glotblastn 3678 LYD498 tomato|11v1|BG131629_P1 10375 633 87,6 globlastp 3679 LYD498 cassava|09v1|CK652135_P1 10376 633 87,6 globlastp 3680 LYD498 cotton|10v2|SRR032367S0013850_P1 10377 633 87,6 globlastp 3681 LYD498 Ipomoea_ni|10v1|BJ559968_P1 10378 633 87,6 globlastp 3682 LYD498 lettuce|10v1|DWO50260_P1 10379 633 87,6 globlastp 3683 LYD498 lotus|09v1|AW720054_P1 10380 633 87,6 globlastp nicotiana_benthamiana|gb162|CK294844_P 3684 LYD498 10381 633 87,6 globlastp 1 3685 LYD498 potato|10v1|B1176571_P1 10382 633 87,6 globlastp 3686 LYD498 prunus|10v1|BU040884 10383 633 87,6 globlastp 3687 LYD498 tomato|09v1|BG131629 10375 633 87,6 globlastp 3688 LYD498 cucurbita|11v1|SRR091276X123682_T1 10384 633 87,6 glotblastn 3689 LYD498 grape|11v1|GSVIVT01035334001_P1 10385 633 87,5 globlastp 3690 LYD498 grape|gb160|BQ796340 10385 633 87,5 globlastp 3691 LYD498 chelidonium|11v1|SRR084752X102145_P1 10386 633 87,2 globlastp 3692 LYD498 cirsium|11v1|SRR346952.1001619XX1_P1 10387 633 87,2 globlastp 3693 LYD498 cirsium|11v1|SRR346952.104523_P1 10388 633 87,2 globlastp 3694 LYD498 euonymus|11v1|SRR070038X243241_P1 10389 633 87,2 globlastp 3695 LYD498 aquilegial|10v2|DR920918_P1 10390 633 87,2 globlastp 3696 LYD498 centaureia|gb166|EH724024_P1 10387 633 87,2 globlastp 3697 LYD498 cichorium|gb171|EH689078_P1 10391 633 87,2 globlastp 3698 LYD498 cowpea|gb166|FF543405_P1 10392 633 87,2 globlastp 3699 LYD498 cynara|gb167|GE586258_P1 10388 633 87,2 globlastp 3700 LYD498 grape|11v1|GSVIVT01015258001_P1 10393 633 87,2 globlastp 3701 LYD498 grape|gb160|BQ794273 10393 633 87,2 globlastp 3702 LYD498 hevea|10v1|EC601525_P1 10394 633 87,2 globlastp 3703 LYD498 ipomoea_batatas|10v1|BM878923_P1 10395 633 87,2 globlastp 3704 LYD498 momordica|10v1|SRR071315S0004512_P1 10396 633 87,2 globlastp 3705 LYD498 pigeonpea|10v1|SRR054580S0264395_P1 10397 633 87,2 globlastp 3706 LYD498 poplar|10v1|A1164344_P1 10398 633 87,2 globlastp 3707 LYD498 tobacco|gb162|EB428330 10399 633 87,2 globlastp

236 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 3708 LYD498 tomato|09v1|BG139259 10400 633 87,2 globlastp 3709 LYD498 dandelion|10v1|PDY816316_P1 10401 633 87,1 globlastp 3710 LYD498 kiwi|gb166|FG412421_P1 10402 633 87,1 globlastp 3711 LYD498 oak|10v1|PDB997543_P1 10403 633 87,1 globlastp 3712 LYD498 b_junceal|10v2|PDT317705_P1 10404 633 87,0 globlastp 3713 LYD498 zostera|10v1|AM766035 10405 633 86,9 globlastp 3714 LYD498 catharanthus|11v1|EG555002_P1 10406 633 86,8 globlastp 3715 LYD498 euonymus|11v1|SRR070038X174944_P1 10407 633 86,8 globlastp 3716 LYD498 cleome_spinosa|10v1|GR934055_P1 10408 633 86,8 globlastp 3717 LYD498 coffea|10v1|PDV673095_P1 10409 633 86,8 globlastp 3718 LYD498 cotton|10v2|SRRO32367S0536261_T1 10410 633 86,8 glotblastn 3719 LYD498 ambrosia|11v1|SRR346935.110494_T1 10411 633 86,7 glotblastn 3720 LYD498 ambrosia|11v1|SRR346935.174957_P1 10412 633 86,7 globlastp 3721 LYD498 chelidonium|11v1|SRR084752X106 647_P1 10413 633 86,7 globlastp 3722 LYD498 tripterygium|11v1|SRR098677X10550T1 10414 633 86,7 glotblastn 3723 LYD498 bean|gb167|CA899612_P1 10415 633 86,7 globlastp 3724 LYD498 cotton|10v2|EV486502_P1 10416 633 86,7 globlastp 3725 LYD498 cynara|gb167|GE593845_P1 10417 633 86,7 globlastp 3726 LYD498 ginger|gb164|DY359981_P1 10418 633 86,7 globlastp 3727 LYD498 lettuce|10v1|DWO66091_P1 10419 633 86,7 globlastp 3728 LYD498 solanum_phureja|09v1|SPHBG139259 10420 633 86,7 globlastp 3729 LYD498 tobacco|gb162|EB426267 10421 633 86,7 globlastp 3730 LYD498 ambrosia|11v1|SRR346943.107087_T1 10422 633 86,6 glotblastn amorphophallus|11v2|SRR089351X101001_ 3731 LYD498 10423 633 86,6 globlastp P1 3732 LYD498 aquilegia|10v2|DT729628_P1 10424 633 86,6 globlastp 3733 LYD498 amsonia|11v1|SRR098688X120656P1 10425 633 86,4 globlastp 3734 LYD498 vinca|11v1|SRR098690X119230_P1 10426 633 86,4 globlastp 3735 LYD498 vinca|11v1|SRR098690X140128_P1 10427 633 86,4 globlastp 3736 LYD498 medicago|09v1|LAW692733_P1 10428 633 86,4 globlastp 3737 LYD498 cotton|10v2|BQ408790_T1 10429 633 86,3 glotblastn 3738 LYD498 lotus|09v1|CN825333_T1 10430 633 86,2 glotblastn 3739 LYD498 arnica|11v1|SRR099034X108981_P1 10431 633 86,2 globlastp 3740 LYD498 cirsium|11v1|SRR346952.100641_P1 10432 633 86,2 globlastp 3741 LYD498 cirsium|11v1|SRR346952.1015762_P1 10433 633 86,2 globlastp 3742 LYD498 cirsium|11v1|SRR346952.1030690XX2_P1 10434 633 86,2 globlastp 3743 LYD498 phyla|11v2|SRR099035X13024_P1 10435 633 86,2 globlastp 3744 LYD498 centaureia|gb166|EH714360_P1 10433 633 86,2 globlastp 3745 LYD498 cowpea|gb166|FF385514_P1 10436 633 86,2 globlastp 3746 LYD498 cynara|gb167|GE594836_P1 10437 633 86,2 globlastp 3747 LYD498 pigeonpea|10v1|SRR054580S0019564_P1 10438 633 86,2 globlastp 3748 LYD498 poplar|10v1|AI165181_P1 10439 633 86,2 globlastp 3749 LYD498 safflower|gb162|EL390343 10440 633 86,2 globlastp 3750 LYD498 soybeanl|11v1|GLYMA01G00760 10441 633 86,2 globlastp 3751 LYD498 soybean|11v1|GLYMA08G03510 10442 633 86,2 globlastp 3752 LYD498 strawberry|11v1|C0381522 10443 633 86,2 globlastp 3753 LYD498 sunflower|10v1|CX947788 10444 633 86,2 globlastp 3754 LYD498 cirsium|11v1|SRR346952.1018140_P1 10445 633 85,8 globlastp 3755 LYD498 phalaenopsis|11v1|CB032055_P1 10446 633 85,8 globlastp 3756 LYD498 primula|11v1|SRR098679X138528_P1 10447 633 85,8 globlastp 3757 LYD498 sarracenia|11v1|SRR192669,113388_P1 10448 633 85,8 globlastp 3758 LYD498 valeriana|11v1|SRR099039X114490_P1 10449 633 85,8 globlastp 3759 LYD498 centaureia|gb166|EH716094_P1 10450 633 85,8 globlastp 3760 LYD498 melon|10v1|DV633130_P1 10451 633 85,8 globlastp 3761 LYD498 thalictrum|11v1|SRR096787X101792_T1 10452 633 85,8 glotblastn 3762 LYD498 antirrhinum|gb166|AJ568663_P1 10453 633 85,7 globlastp 3763 LYD498 dandelion|10v1|DY831128_P1 10454 633 85,7 globlastp 3764 LYD498 monkeyflower|10v1|G0961325_P1 10455 633 85,7 globlastp 3765 LYD498 vinca|11v1|SRR098690X108929_P1 10456 633 85,5 globlastp 3766 LYD498 vinca|11v1|SRR098690X120394_P1 10457 633 85,5 globlastp 3767 LYD498 flaveria|11v1|SRR149229.455470_T1 10458 633 85,3 glotblastn 3768 LYD498 sarracenia|11v1|SRR192669.107394_T1 10459 633 85,3 glotblastn

237 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 3769 LYD498 flaveria|11v1|SRR149229.104495_P1 10460 633 85,3 globlastp 3770 LYD498 flaveria|11v1|SRR149229.107943_P1 10461 633 85,3 globlastp 3771 LYD498 flaveria|11v1|SRR149229.299520_P1 10461 633 85,3 globlastp 3772 LYD498 flaveria|11v1|SRR149241.2984_P1 10462 633 85,3 globlastp 3773 LYD498 flaveria|11v1|SRR149244.135283_P1 10463 633 85,3 globlastp 3774 LYD498 watermelon|11v1|DV633130_P1 10464 633 85,3 globlastp 3775 LYD498 arabidopsis|10v1|AT2G19830_P1 10465 633 85,3 globlastp 3776 LYD498 cucumber|09v1|DV633130_P1 10466 633 85,3 globlastp 3777 LYD498 peanut|10v1|EG030489_P1 10467 633 85,3 globlastp 3778 LYD498 sunflower|10v1|DY915541 10468 633 85,3 globlastp 3779 LYD498 ambrosia|11v1|SRR346935.112852_P1 10469 633 84,9 globlastp 3780 LYD498 ambrosia|11v1|SRR346935.180633_P1 10470 633 84,9 globlastp 3781 LYD498 flaveria|11v1|SRR149229.102288_P1 10471 633 84,9 globlastp 3782 LYD498 flaveria|11v1|SRR149229.123427_P1 10472 633 84,9 globlastp 3783 LYD498 apple|11v1|CN492587_P1 10473 633 84,9 globlastp 3784 LYD498 apple|gb171|CN492587 10473 633 84,9 globlastp 3785 LYD498 apple|11v1|CN579625_P1 10474 633 84,9 globlastp 3786 LYD498 apple|gb171|CN579625 10474 633 84,9 globlastp 3787 LYD498 cotton|10v2|DW504788_P1 10475 633 84,9 globlastp 3788 LYD498 nuphar|gb166|C0997293_P1 10476 633 84,9 globlastp 3789 LYD498 sunflower|10v1|DY942504 10477 633 84,9 globlastp 3790 LYD498 flaveria|11v1|SRR149229.153687_T1 10478 633 84,9 glotblastn 3791 LYD498 flaveria|11v1|SRR149229.31446_T1 10479 633 84,9 glotblastn 3792 LYD498 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL012018_P1 10480 633 84,8 globlastp 3793 LYD498 orobanche|10v1|SRR023189S0010565_P1 10481 633 84,8 globlastp 3794 LYD498 salvia|10v1|CV166104 10482 633 84,8 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111021 3795 LYD498 10483 633 84,7 globlastp 098_P1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP011194 3796 LYD498 10484 633 84,5 globlastp _P1 3797 LYD498 catharanthus|gb166|EG555002 10485 633 84,5 globlastp 3798 LYD498 ambrosia|11v1|SRR346935.168773XX2_T1 10486 633 84,4 glotblastn 3799 LYD498 flaveria|11v1|SRR149229.100485_T1 10487 633 84,4 glotblastn 3800 LYD498 bean|gb167|CA899613_P1 10488 633 84,4 globlastp 3801 LYD498 chestnut|gb170|SRR00629550008625_P1 10489 633 84,4 globlastp 3802 LYD498 oak|10v1|FP030345XX2_P1 10489 633 84,4 globlastp 3803 LYD498 sunflower|10v1|DY952685 10490 633 84,4 globlastp 3804 LYD498 walnuts|gb166|CB304326 10491 633 84,4 globlastp 3805 LYD498 artemisia|10v1|PY045936_P1 10492 633 84,3 globlastp 3806 LYD498 utricularia|11v1|SRR094438.103286_P1 10493 633 84,1 globlastp 3807 LYD498 cichorium|gb171|EH686865_P1 10494 633 84,0 globlastp 3808 LYD498 lettuce|10v1|DWO54391_P1 10495 633 84,0 globlastp 3809 LYD498 fagopyrum|11v1|SRR063689X136257_P1 10496 633 83,9 globlastp 3810 LYD498 flaveria|11v1|SRR149229.119279_P1 10497 633 83,9 globlastp 3811 LYD498 flaveria|11v1|SRR149229.286945_P1 10498 633 83,9 globlastp 3812 LYD498 flaveria|11v1|SRR149241.105531_P1 10499 633 83,9 globlastp 3813 LYD498 centaureia|gb166|EL930685_P1 10500 633 83,9 globlastp 3814 LYD498 sequoia|10v1|SRR065044S0006484 10501 633 83,9 globlastp 3815 LYD498 soybean|11v1|GLYMA05G36130 10502 633 83,9 globlastp 3816 LYD498 triphysaria|10v1|PX982490 10503 633 83,9 globlastp 3817 LYD498 triphysaria|10v1|EY005747 10504 633 83,9 globlastp 3818 LYD498 phyla|11v2|SRR099037X105809_T1 10505 633 83,9 glotblastn 3819 LYD498 phyla|11v2|SRR099037X109786_T1 10506 633 83,9 glotblastn 3820 LYD498 arnica|11v1|SRR099034X119194_P1 10507 633 83,5 globlastp 3821 LYD498 guizotia|10v1|GE568246_T1 10508 633 83,5 glotblastn 3822 LYD498 cephalotaxus|11v1|SRR064395X114707_P1 10509 633 83,4 globlastp 3823 LYD498 distylium|11v1|SRR065077X103336_P1 10510 633 83,4 globlastp 3824 LYD498 sciadopitys|10v1|ISRR06503550004910 10511 633 83,4 globlastp 3825 LYD498 fagopyrum|11v1|SRR063703X108637_P1 10512 633 83,0 globlastp 3826 LYD498 podocarpus|10v1|SRR065014S0002203_P1 10513 633 83,0 globlastp 3827 LYD498 taxus|10v1|SRR032523S0022461 10514 633 83,0 glotblastn 3828 LYD498 fagopyrum|11v1|SRR063689X109855_P1 10515 633 82,9 globlastp

238 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 3829 LYD498 canola|11v1|EE470752_P1 10516 633 82,8 globlastp 3830 LYD498 canola|10v1|A1352864 10516 633 82,8 globlastp 3831 LYD498 canola|11v1|EV183065XX1_P1 10517 633 82,8 globlastp 3832 LYD498 phyla|11v2|SRR099035X117261_P1 10518 633 82,6 globlastp 3833 LYD498 cotton|10v2|C0108671_P1 10519 633 82,6 globlastp 3834 LYD498 triphysaria|10v1|P3M356736 10520 633 82,6 globlastp 3835 LYD498 cryptomeria|gb166|BW995862_P1 10521 633 82,5 globlastp 3836 LYD498 fagopyrum|11v1|SRR063689X113591_P1 10522 633 82,4 globlastp 3837 LYD498 fagopyrum|11v1|SRR063689X127703_P1 10523 633 82,4 globlastp 3838 LYD498 cycas|gb166|EX927010_P1 10524 633 82,4 globlastp 3839 LYD498 ipomoea_ni|10v1|CJ746512_P1 10525 633 82,1 globlastp 3840 LYD498 cucurbita|11v1|SRR091276X14686_T1 10526 633 81,9 glotblastn 3841 LYD498 pteridium|11v1|SRR043594X108982_P1 10527 633 81,7 globlastp 3842 LYD498 liquorice|gb171|FS240924_P1 10528 633 81,7 globlastp 3843 LYD498 eucalyptus|gb166|CD669263 10529 633 81,5 globlastp 3844 LYD498 radish|gb164|EV535191 10530 633 81,5 globlastp 3845 LYD498 spruce|gb162|CO216024 10531 633 81,5 globlastp 3846 LYD498 maritime_pine|10v1|P3X252210_P1 10532 633 81,4 globlastp 3847 LYD498 grape|11v1|GSVIVT01016913001_P1 10533 633 81,4 globlastp 3848 LYD498 grape|gb160|BM436937 10533 633 81,4 globlastp 3849 LYD498 cedrus|11v1|SRR065007X121874_P1 10534 633 81,3 globlastp 3850 LYD498 silene|11v1|SRR096785X101704_P1 10535 633 81,3 globlastp 3851 LYD498 cryptomeria|gb166|BP176690_P1 10536 633 81,1 globlastp 3852 LYD498 abies|11v2|SRR098676X102221_P1 10537 633 81,0 globlastp 3853 LYD498 pteridium|11v1|SRR043594X362552_T1 10538 633 81,0 glotblastn 3854 LYD498 pine|10v2|A1920159_P1 10539 633 81,0 globlastp 3855 LYD498 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0010806 10540 633 81,0 globlastp 3856 LYD498 banana|10v1|BBS657T3_T1 10541 633 80,9 glotblastn 3857 LYD498 potato|10v1|3G890632_T1 10542 633 80,7 glotblastn 3858 LYD498 cirsium|11v1|SRR346952.1021475_P1 10543 633 80,6 globlastp 3859 LYD498 onion|gb162|CF438534_P1 10544 633 80,6 globlastp 3860 LYD498 physcomitrella|10v1|3J157643_P1 10545 633 80,6 globlastp 3861 LYD498 acacia|10v1|FS590079_P1 10546 633 80,3 globlastp 3862 LYD498 petunia|gb171|FN002441_P1 10547 633 80,2 globlastp 3863 LYD498 marchantia|gb166|BJ840599_P1 10548 633 80,0 globlastp 3864 LYD499 b_rapa|gb162|EX030739_P1 634 634 100,0 globlastp 3865 LYD499 canola|10v1|CD828875 634 634 100,0 globlastp 3866 LYD499 b_oleracea|gb161|EE534268_P1 10549 634 97,1 globlastp 3867 LYD499 canola|10v1|EE430605 10550 634 97,1 globlastp 3868 LYD499 radish|gb164|EV528245 10551 634 94,8 globlastp 3869 LYD499 radish|gb164|EX887095 10552 634 92,1 globlastp 3870 LYD499 b_rapa|gb162|EX039532_P1 10553 634 89,1 globlastp 3871 LYD499 canola|10v1|EE430704 10553 634 89,1 globlastp 3872 LYD499 radish|gb164|EV546649 10554 634 89,1 glotblastn 3873 LYD499 thellungiella_parvulum|11v1|DN777906_P1 10555 634 88,8 globlastp 3874 LYD499 arabidopsis|10v1|AT1G34000_P1 10556 634 88,7 globlastp 3875 LYD499 canola|11v1|EE430704_T1 10557 634 88,0 glotblastn 3876 LYD499 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL003530_P1 10558 634 87,1 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN777906_P 3877 LYD499 10559 634 87,0 globlastp 1 3878 LYD499 thellungiella|gb167|DN777906_P1 10559 634 87,0 globlastp 3879 LYD500 canola|11v1|CD815130_P1 10560 635 98,2 globlastp 3880 LYD500 thellungiella_parvulum|11v1|BY829606_P1 10561 635 81,9 globlastp 3881 LYD500 b rapa|gb162|EX017798_P1 10562 635 80,1 globlastp 3882 LYD501 canola|11v1|SRR019556.25565_P1 10563 636 97,5 globlastp 3883 LYD501 canola|11v1|SRR019556.19225_P1 10564 636 95,6 globlastp 3884 LYD501 canola|11v1|EE434856_P1 10565 636 94,5 globlastp 3885 LYD501 thellungiella_parvulum|11v1|DN774406_P1 10566 636 93,4 globlastp 3886 LYD501 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL014140_P1 10567 636 93,2 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN774406_P 3887 LYD501 10568 636 92,9 globlastp 1 3888 LYD501 radish|gb164|EX772185 10569 636 92,9 globlastp

239 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 3889 LYD501 canola|11v1|EV126210XX1_P1 10570 636 92,1 globlastp 3890 LYD501 canola|10v1|EV042598 10571 636 91,9 globlastp 3891 LYD501 arabidopsis|10v1|AT2G30740J1 10572 636 91,6 globlastp 3892 LYD502 grape|11v1|GSVPIV1T01011412001_ 10573 637 88,7 globlastp 3893 LYD502 grape|gb160|CD012472 10573 637 88,7 globlastp 3894 LYD502 euphorbia|11v1|1AW862634_P1 10574 637 87,7 globlastp 3895 LYD502 medicago|09v1|CA990105_P1 10575 637 86,0 globlastp 3896 LYD502 peanut|10v1|DQ889532_P1 10576 637 86,0 globlastp 3897 LYD502 pea|11v1|FG536378_P1 10577 637 84,1 globlastp 3898 LYD502 primula|11v1|SRR098679X104124_P1 10578 637 83,0 globlastp 3899 LYD502 cyamopsis|10v1|EG987384_T1 10579 637 82,2 glotblastn 3900 LYD502 soybean|11v1|GLYMA19G02650 10580 637 81,8 globlastp 3901 LYD502 prunus|10v1|CN491201 10581 637 80,2 globlastp 3902 LYD503 sugarcane|10v1|P3Q534608 10582 638 91,6 glotblastn 3903 LYD503 maize|10v1|AA979951_P1 10583 638 91,4 globlastp 3904 LYD503 sorghum|09v1|SB02G010190 10584 638 87,6 globlastp 3905 LYD503 sorghum|11v1|SBO2G010190_P1 10584 638 87,6 globlastp 3906 LYD503 foxtail_millet|11v3|PHY7SI031265M_P1 10585 638 87,3 globlastp 3907 LYD503 foxtail_millet|10v2|SICRP010858 10585 638 87,3 globlastp 3908 LYD503 millet|10v1|EB411088_P1 10586 638 87,3 globlastp 3909 LYD503 cenchrus|gb166|BM084217_T1 10587 638 83,9 glotblastn 3910 LYD504 trigonella|11v1|SRR066194X10801_P1 10588 639 98,1 globlastp 3911 LYD504 chickpea|09v2|GR390741_P1 10589 639 91,7 globlastp 3912 LYD504 cyamopsis|10v1|EG975658_P1 10590 639 88,5 globlastp 3913 LYD504 soybean|11v1|GLYMA11G21480 10591 639 87,3 globlastp 3914 LYD504 pigeonpea|10v1|SRR054580S0009230_P1 10592 639 86,0 globlastp 3915 LYD504 peanut|10v1|CD038035_T1 10593 639 84,8 glotblastn 3916 LYD504 lotus|09v1|LBW629598_T1 10594 639 84,7 glotblastn 3917 LYD504 cowpea|gb166|FC462094_P1 10595 639 84,1 globlastp 3918 LYD504 bean|gb167|CA898550_P1 10596 639 83,4 globlastp 3919 LYD504 bean|gb167|CA907680_P1 10596 639 83,4 globlastp 3920 LYD505 trigonella|11v1|SRR066194X124780_P1 10597 640 93,9 globlastp 3921 LYD505 lotus|09v1|LAV774529_P1 10598 640 86,3 globlastp 3922 LYD505 soybean|11v1|GLYMA15G38010 10599 640 86,0 globlastp 3923 LYD505 cowpea|gb166|ES884208_P1 10600 640 85,1 globlastp 3924 LYD505 soybean|11v1|GLYMA13G26960 10601 640 85,0 globlastp 3925 LYD505 bean|gb167|CA907677_T1 10602 640 83,5 glotblastn 3926 LYD506 trigonella|11v1|SRR066194X174735_P1 10603 641 93,7 globlastp 3927 LYD506 soybean|11v1|GLYMA03G30030 10604 641 80,8 globlastp 3928 LYD506 soybean|11v1|GLYMA03G30020 10605 641 80,5 globlastp 3929 LYD506 soybean|11v1|GLYMA19G32910 10606 641 80,5 globlastp 3930 LYD507 maize|10v1|BM335422_P1 10607 642 80,9 globlastp 3931 LYD507 foxtail_millet|10v3|PHY7SI040097M_Ti 10608 642 80,0 glotblastn 3932 LYD508 sugarcane|10v1|CA071556 10609 643 98,5 globlastp 3933 LYD508 maize|10v1|AI691903_P1 10610 643 95,4 globlastp 3934 LYD508 rice|gb170|OS09G02284 10611 643 88,5 globlastp 3935 LYD508 switchgrass|gb167|FE614098 10612 643 88,5 globlastp 3936 LYD508 cenchrus|gb166|EB652688_P1 10613 643 88,1 globlastp 3937 LYD508 millet|10v1|EV0454PM010396_P1 10614 643 87,8 globlastp foxtail_millet|10v2|FXTRMSLX00382068D 3938 LYD508 10615 643 87,5 globlastp 1 3939 LYD508 foxtail_millet|11v3|PHY7SI033113M_P1 10615 643 87,5 globlastp 3940 LYD508 leymus|gb166|EG378054_P1 10616 643 85,2 globlastp 3941 LYD508 wheat|10v2|E3E443841 10617 643 84,3 globlastp 3942 LYD508 barley|10v2|AW982792_P1 10618 643 83,4 globlastp 3943 LYD508 brachypodium|09v1|DV473081_P1 10619 643 83,0 globlastp 3944 LYD509 maize|10v1|BM380291_P1 10620 644 84,6 globlastp 3945 LYD509 maize|10v1|ES701721_P1 10621 644 83,4 globlastp 3946 LYD509 foxtail_millet|11v3|PHY7SI029614M_P1 10622 644 80,5 globlastp 3947 LYD510 foxtail_millet|11v3|PHY7SI023676M_P1 10623 645 96,6 globlastp 3948 LYD510 foxtail_millet|10v2|FXTSLX00242000D1 10623 645 96,6 globlastp 3949 LYD510 maize|10v1|P3E511322_P1 10624 645 96,6 globlastp

240 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 3950 LYD510 sugarcane|10v1|CA134051 10625 645 96,6 globlastp 3951 LYD510 switchgrass|gb167|FL743200 10626 645 94,8 globlastp 3952 LYD510 millet|10v1|EV0454PM025791_T1 10627 645 92,2 glotblastn 3953 LYD510 rice|gb170|OS05G43680 10628 645 82,3 globlastp 3954 LYD510 brachypodium|09v1|DV472501_T1 10629 645 80,2 glotblastn 3955 LYD511 soybean|11v1|GLYMA08G02480 10630 646 91,5 globlastp 3956 LYD511 pigeonpea|10v1|SRR054580S0293514_T1 10631 646 81,9 glotblastn 3957 LYD512 cowpea|gb166|FC458039_P1 647 647 100,0 globlastp 3958 LYD512 cowpea|gb166|FC460613_P1 647 647 100,0 globlastp 3959 LYD512 cowpea|gb166|FF385728_P1 647 647 100,0 globlastp 3960 LYD512 bean|gb167|CA897309_P1 10632 647 98,5 globlastp 3961 LYD512 bean|gb167|CA897313_P1 10632 647 98,5 globlastp 3962 LYD512 cyamopsis|10v1|EG977272_P1 10633 647 98,5 globlastp 3963 LYD512 liquorice|gb171|FS238732_P1 10634 647 98,5 globlastp 3964 LYD512 liquorice|gb171|FS241431_P1 10634 647 98,5 globlastp 3965 LYD512 pigeonpea|10v1|GW352356_P1 10634 647 98,5 globlastp 3966 LYD512 pigeonpea|10v1|GW356722_P1 10634 647 98,5 globlastp 3967 LYD512 cowpea|gb166|FF389530_T1 10635 647 98,5 glotblastn 3968 LYD512 cucurbita|11v1|SRR091276X101745_P1 10636 647 96,9 globlastp 3969 LYD512 cucurbita|11v1|SRR091276X104194_P1 10636 647 96,9 globlastp 3970 LYD512 cucurbita|11v1|SRR091276X110453_P1 10636 647 96,9 globlastp 3971 LYD512 trigonella|11v1|SRR066194X10487_P1 10637 647 96,9 globlastp 3972 LYD512 bean|gb167|CA897315_P1 10638 647 96,9 globlastp 3973 LYD512 chestnut|gb170|SRR00629550001844_P1 10639 647 96,9 globlastp 3974 LYD512 chickpea|09v2|GE213103_P1 10637 647 96,9 globlastp 3975 LYD512 lotus|09v1|AW164064_P1 10640 647 96,9 globlastp 3976 LYD512 lotus|09v1|G0005048_P1 10640 647 96,9 globlastp 3977 LYD512 medicago|09v1|AW329043_P1 10637 647 96,9 globlastp 3978 LYD512 medicago|09v1|LC0512702_P1 10637 647 96,9 globlastp 3979 LYD512 oak|10v1|AJ277600_P1 10639 647 96,9 globlastp 3980 LYD512 oak|10v1|SRR006309S0008142_P1 10639 647 96,9 globlastp 3981 LYD512 rose|10v1|C586016 10641 647 96,9 globlastp 3982 LYD512 strawberry|11v1|CO379241 10641 647 96,9 globlastp 3983 LYD512 strawberry|11v1| CO381686 10641 647 96,9 globlastp 3984 LYD512 walnuts|gb166|EL898181 10639 647 96,9 globlastp 3985 LYD512 cucurbita|11v1|SRR091276X102492_P1 10642 647 95,4 globlastp 3986 LYD512 cucurbita|11v1|SRR091276X103773_P1 10642 647 95,4 globlastp 3987 LYD512 cucurbita|11v1|SRR091276X112166_P1 10642 647 95,4 globlastp 3988 LYD512 cucurbita|11v1|SRR091276X163510_P1 10642 647 95,4 globlastp 3989 LYD512 cucurbita|11v1|SRR091277X118300_P1 10642 647 95,4 globlastp 3990 LYD512 fagopyrum|11v1|SRR063689X100344_P1 10643 647 95,4 globlastp 3991 LYD512 fagopyrum|11v1|SRR063689X103955_P1 10643 647 95,4 globlastp 3992 LYD512 fagopyrum|11v1|SRR063703X101467_P1 10643 647 95,4 globlastp 3993 LYD512 fagopyrum|11v1|SRR063703X104553_P1 10643 647 95,4 globlastp 3994 LYD512 fagopyrum|11v1|SRR063703X107234_P1 10643 647 95,4 globlastp 3995 LYD512 flax|11v1|JG018952_P1 10644 647 95,4 globlastp 3996 LYD512 humulus|11v1|EX520567_P1 10645 647 95,4 globlastp 3997 LYD512 tripterygium|11v1|SRR098677X100 935_P1 10643 647 95,4 globlastp 3998 LYD512 watermelon|11v1|DV632274_P1 10642 647 95,4 globlastp 3999 LYD512 watermelon|11v1|DV632298_P1 10642 647 95,4 globlastp 4000 LYD512 watermelon|11v1|SRR091276.104194_P1 10642 647 95,4 globlastp watermelon|11v1|VMEL00286303570595_P 4001 LYD512 10642 647 95,4 globlastp 1 watermelon|11v1|VMEL02965027672733_P 4002 LYD512 10642 647 95,4 globlastp 1 4003 LYD512 acacia|10v1|FS589645_P1 10646 647 95,4 globlastp 4004 LYD512 cucumber|09v1|CK086170_P1 10642 647 95,4 globlastp 4005 LYD512 cucumber|09v1|DV632274_P1 10642 647 95,4 globlastp 4006 LYD512 cucumber|09v1|GD174009_P1 10642 647 95,4 globlastp 4007 LYD512 ginseng|10v1|DV553922_P1 10647 647 95,4 globlastp 4008 LYD512 lotus|09v1|CB828393_P1 10648 647 95,4 globlastp 4009 LYD512 lotus|09v1|LGO015051_P1 10649 647 95,4 globlastp

241 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 4010 LYD512 melon|10v1|AM722796_P1 10642 647 95,4 globlastp 4011 LYD512 melon|10v1|DV632274_P1 10642 647 95,4 globlastp 4012 LYD512 momordica|10v1|SRR071315S0006351_P1 10642 647 95,4 globlastp 4013 LYD512 momordica|10v1|SRR071315S0042009_P1 10642 647 95,4 globlastp 4014 LYD512 grape|11v1|GSVIVT01033420001_P1 10650 647 95,4 globlastp 4015 LYD512 cyamopsis|10v1|EG976339_T1 10651 647 95,4 glotblastn 4016 LYD512 grape|gb160|CB973093 10652 647 95,4 glotblastn 4017 LYD512 tripterygium|11v1|SRR098677X10933_T1 - 647 95,4 glotblastn 4018 LYD512 bean|gb167|FG233896_P1 10653 647 94,1 globlastp 4019 LYD512 ambrosia|11v1|GR935633_T1 10654 647 93,9 glotblastn 4020 LYD512 bean|gb167|FG234354_T1 10655 647 93,9 glotblastn 4021 LYD512 iceplant|gb164|MCU09194_T1 10656 647 93,9 glotblastn 4022 LYD512 pigeonpea|10v1|GW359801_T1 10657 647 93,9 glotblastn 4023 LYD512 ambrosia|11v1|SRR346943,10268_P1 10658 647 93,8 globlastp 4024 LYD512 ambrosia|11v1|SRR346943.11293_P1 10658 647 93,8 globlastp 4025 LYD512 ambrosia|11v1|SRR346943.186733_P1 10658 647 93,8 globlastp 4026 LYD512 ambrosia|11v1|SRR346943.86054_P1 10658 647 93,8 globlastp amorphophallus|11v2|SRR089351X104367_ 4027 LYD512 10659 647 93,8 globlastp P1 amorphophallus|11v2|SRR089351X252922_ 4028 LYD512 10659 647 93,8 globlastp P1 4029 LYD512 arnica|11v1|SRR099034X112842_P1 10658 647 93,8 globlastp 4030 LYD512 cannabis|12v1|1JK495592_P1 10660 647 93,8 globlastp 4031 LYD512 cannabis|12v1|1SOLX00008468_P1 10660 647 93,8 globlastp 4032 LYD512 cirsium|11v1|SRR346952.1001225_P1 10658 647 93,8 globlastp 4033 LYD512 cirsium|11v1|SRR346952.103566_P1 10658 647 93,8 globlastp 4034 LYD512 cirsium|11v1|SRR346952.1145627_P1 10658 647 93,8 globlastp 4035 LYD512 cirsium|11v1|SRR346952.385592_P1 10658 647 93,8 globlastp 4036 LYD512 cirsium|11v1|SRR349641.117218_P1 10658 647 93,8 globlastp 4037 LYD512 clementine|11v1|CB610765_P1 10661 647 93,8 globlastp 4038 LYD512 cucurbita|11v1|SRR091276X110768_P1 10662 647 93,8 globlastp 4039 LYD512 cucurbita|11v1|SRR091276X2700_P1 10662 647 93,8 globlastp 4040 LYD512 euonymus|11v1|SRR070038X103239_P1 10663 647 93,8 globlastp 4041 LYD512 humulus|11v1|EX515474_P1 10660 647 93,8 globlastp 4042 LYD512 humulus 11v1EX520211_P1 10660 647 93,8 globlastp 4043 LYD512 humulus|11v1|SRR098683X83555_P1 10660 647 93,8 globlastp 4044 LYD512 orange|11v1|CB610765_P1 10661 647 93,8 globlastp 4045 LYD512 sarracenia|11v1|SRR192669,106226_P1 10664 647 93,8 globlastp 4046 LYD512 sarracenia|11v1|SRR192669.10869_P1 10664 647 93,8 globlastp 4047 LYD512 sarracenia|11v1|SRR192669.124981_P1 10664 647 93,8 globlastp 4048 LYD512 sarracenia|11v1|SRR192669.126316_P1 10664 647 93,8 globlastp 4049 LYD512 scabiosa|11v1|SRR063723X10141_P1 10665 647 93,8 globlastp 4050 LYD512 scabiosa|11v1|SRR063723X101604_P1 10665 647 93,8 globlastp 4051 LYD512 scabiosa|11v1|SRR063723X115084_P1 10665 647 93,8 globlastp 4052 LYD512 valeriana|11v1|SRR099039X10965_P1 10665 647 93,8 globlastp 4053 LYD512 artemisia|10v1|EY060633_P1 10658 647 93,8 globlastp 4054 LYD512 b_juncea|10v2|E3J1SLX00504441_P1 10666 647 93,8 globlastp 4055 LYD512 bean|gb167|FG233905_P1 10667 647 93,8 globlastp 4056 LYD512 bean|gb167|FG233918_P1 10667 647 93,8 globlastp 4057 LYD512 bean|gb167|FG234031_P1 10667 647 93,8 globlastp 4058 LYD512 bean|gb167|FG234145_P1 10668 647 93,8 globlastp 4059 LYD512 bean|gb167|FG234215_P1 10667 647 93,8 globlastp 4060 LYD512 bean|gb167|FG234325_P1 10667 647 93,8 globlastp 4061 LYD512 cacao|10v1|CU471657_P1 10666 647 93,8 globlastp 4062 LYD512 centaureia|gb166|EH742423_P1 10658 647 93,8 globlastp 4063 LYD512 centaureia|gb166|EH746092_P1 10658 647 93,8 globlastp 4064 LYD512 cichorium|gb171|FL672664_P1 10658 647 93,8 globlastp 4065 LYD512 citrus|gb166|CB610765_P1 10661 647 93,8 globlastp 4066 LYD512 cynara|gb167|GE588251_P1 10658 647 93,8 globlastp 4067 LYD512 dandelion|10v1|DR401370_P1 10658 647 93,8 globlastp 4068 LYD512 dandelion|10v1|DY803766_P1 10658 647 93,8 globlastp 4069 LYD512 gerberai|09v1|AJ752989_P1 10658 647 93,8 globlastp

242 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 4070 LYD512 gerbera|09v1|AJ756810_P1 10658 647 93,8 globlastp 4071 LYD512 gerbera|09v1|AJ758255_P1 10658 647 93,8 globlastp 4072 LYD512 kiwi|gb166|FG501472_P1 10669 647 93,8 globlastp 4073 LYD512 lettuce|10v1|DWO48404_P1 10658 647 93,8 globlastp 4074 LYD512 lettuce|10v1|DWO53383_P1 10658 647 93,8 globlastp 4075 LYD512 lettuce|10v1|DWO57268_P1 10658 647 93,8 globlastp 4076 LYD512 lettuce|10v1|DWO77182_P1 10658 647 93,8 globlastp 4077 LYD512 lettuce 10v1 DWO80087_P1 10658 647 93,8 globlastp 4078 LYD512 lettuce 10v1 DWO85071_P1 10658 647 93,8 globlastp 4079 LYD512 lettuce|10v1|DW103212_P1 10658 647 93,8 globlastp 4080 LYD512 lettuce|10v1|DW105237_P1 10658 647 93,8 globlastp 4081 LYD512 liriodendron|gb166|CK766794_P1 10659 647 93,8 globlastp 4082 LYD512 liriodendron|gb166|FD495865_P1 10659 647 93,8 globlastp 4083 LYD512 nuphar|gb166|CK744704_P1 10659 647 93,8 globlastp 4084 LYD512 prunus|10v1|BU043749 10670 647 93,8 globlastp 4085 LYD512 prunus|10v1|CN493550 10671 647 93,8 globlastp 4086 LYD512 prunus|10v1|CV045040 10670 647 93,8 globlastp 4087 LYD512 sunflower|10v1|PG734530 10658 647 93,8 globlastp 4088 LYD512 sunflower|10v1|BU672107 10658 647 93,8 globlastp 4089 LYD512 sunflower|10v1|CD846378 10658 647 93,8 globlastp 4090 LYD512 sarracenia|11v1|SRR192669.129600_T1 10672 647 92,3 glotblastn 4091 LYD512 bean|gb167|FG233907_T1 10673 647 92,3 glotblastn 4092 LYD512 bean|gb167|FG234000_T1 10673 647 92,3 glotblastn 4093 LYD512 bean|gb167|FG234020_T1 10674 647 92,3 glotblastn 4094 LYD512 eschscholzia|10v1|CD477907 10675 647 92,3 glotblastn 4095 LYD512 ginger|gb164|DY357985_T1 10676 647 92,3 glotblastn nicotiana_benthamiana|gb162|CK99 4096 LYD512 10677 647 92,3 glotblastn 0201_T1 4097 LYD512 papaya|gb165|EX255081_T1 10678 647 92,3 glotblastn 4098 LYD512 rice|gb170|0S03G07110 10679 647 92,3 glotblastn 4099 LYD512 rye|gb164|BE494954 10680 647 92,3 glotblastn 4100 LYD512 spurge|gb161|DV113063 10681 647 92,3 glotblastn 4101 LYD512 wheat|10v2|CA598174 10682 647 92,3 glotblastn 4102 LYD512 apple|11v1|MDCRP032659_P1 10683 647 92,3 globlastp 4103 LYD512 arnica|11v1|SRR099034X13315_P1 10684 647 92,3 globlastp 4104 LYD512 cannabis|12v1|1EW701268_P1 10685 647 92,3 globlastp 4105 LYD512 cannabis|12v1|1SOLX00056818_P1 10685 647 92,3 globlastp 4106 LYD512 castorbean|11v1|EV520036_P1 10686 647 92,3 globlastp 4107 LYD512 euphorbia|11v1|BP954296_P1 10687 647 92,3 globlastp 4108 LYD512 euphorbia|11v1|DV112391_P1 10687 647 92,3 globlastp 4109 LYD512 euphorbia|11v1|DV113063_P1 10687 647 92,3 globlastp 4110 LYD512 euphorbia|11v1|DV147404_P1 10688 647 92,3 globlastp 4111 LYD512 euphorbia|11v1|SRR098678X1142_P1 10687 647 92,3 globlastp 4112 LYD512 flaveria|11v1|SRR149229.135267_P1 10689 647 92,3 globlastp 4113 LYD512 flaveria|11v1|SRR149229.366681XX1_P1 10689 647 92,3 globlastp 4114 LYD512 flaveria|11v1|SRR149232.109123_P1 10689 647 92,3 globlastp 4115 LYD512 flax|11v1|GW866471_P1 10690 647 92,3 globlastp 4116 LYD512 foxtail_millet|11v3|1EC613751_P1 10691 647 92,3 globlastp 4117 LYD512 foxtail_millet|11v3|PHY7SI039832M_P1 10691 647 92,3 globlastp 4118 LYD512 foxtail_millet|11v3|SICRP056006_P1 10691 647 92,3 globlastp 4119 LYD512 grape|11v1|SRR010820X107901_P1 10692 647 92,3 globlastp 4120 LYD512 oat|11v1|CN820781XX1_P1 10691 647 92,3 globlastp 4121 LYD512 platanus|11v1|SRR096786X100883_P1 10693 647 92,3 globlastp 4122 LYD512 platanus|11v1|SRR096786X102707_P1 10693 647 92,3 globlastp 4123 LYD512 pteridium|11v1|SRR043594X224099_P1 10694 647 92,3 globlastp 4124 LYD512 sorghum|11v1|BG411500_P1 10691 647 92,3 globlastp 4125 LYD512 sorghum|11v1|SBCRP012633_P1 10691 647 92,3 globlastp 4126 LYD512 vinca|11v1|SRR098690X133434_P1 10695 647 92,3 globlastp 4127 LYD512 amborella|gb166|CK757356_P1 10696 647 92,3 globlastp 4128 LYD512 antirrhinum|gb166|AJ788801_P1 10697 647 92,3 globlastp 4129 LYD512 apple|11v1|CN493550_P1 10683 647 92,3 globlastp 4130 LYD512 apple|gb171|CN493550 10683 647 92,3 globlastp

243 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 4131 LYD512 artemisia|10v1|EX980208_P1 10698 647 92,3 globlastp 4132 LYD512 avocado|10v1|FD502514_P1 10691 647 92,3 globlastp 4133 LYD512 barley|10v2|E3E411645_P1 10691 647 92,3 globlastp 4134 LYD512 bean|gb167|FG233928_P1 10699 647 92,3 globlastp 4135 LYD512 bean|gb167|FG233958_P1 10700 647 92,3 globlastp 4136 LYD512 bean|gb167|FG234344_P1 10701 647 92,3 globlastp 4137 LYD512 bean|gb167|FG234444_P1 10702 647 92,3 globlastp 4138 LYD512 bean|gb167|FG234466_P1 10703 647 92,3 globlastp 4139 LYD512 beet|gb162|BE590310_P1 10704 647 92,3 globlastp 4140 LYD512 beet|gb162|BI543735_P1 10704 647 92,3 globlastp 4141 LYD512 bruguiera|gb166|BP947364_P1 10705 647 92,3 globlastp 4142 LYD512 castorbean|09v1|CF981315 10686 647 92,3 globlastp 4143 LYD512 castorbean|11v1|CF981315_P1 10686 647 92,3 globlastp 4144 LYD512 castorbean|09v1|NM002520742 10686 647 92,3 globlastp 4145 LYD512 castorbean|11v1|NM_002520742_P 10686 647 92,3 globlastp 4146 LYD512 coffea|10v1|DV689839_P1 10686 647 92,3 globlastp 4147 LYD512 cyamopsis|10v1|EG976863_P1 10706 647 92,3 globlastp 4148 LYD512 cynodon|10v1|ES294749_P1 10691 647 92,3 globlastp 4149 LYD512 eggplant|10v1|FS001805_P1 10707 647 92,3 globlastp 4150 LYD512 flax|09v1|EU828803 10690 647 92,3 globlastp 4151 LYD512 flax|11v1|EU828803_P1 10690 647 92,3 globlastp 4152 LYD512 foxtail_millet|10v2|SICRP023444 10691 647 92,3 globlastp 4153 LYD512 ginger|gb164|DY352028_P1 10708 647 92,3 globlastp 4154 LYD512 grape|11v1|GSVIVT01033421001_P1 10709 647 92,3 globlastp 4155 LYD512 grape|gb160|BQ798496 10709 647 92,3 globlastp 4156 LYD512 heritiera|10v1|SRR005795S0046631_P1 10710 647 92,3 globlastp 4157 LYD512 hevea|10v1|EC600148_P1 10686 647 92,3 globlastp 4158 LYD512 hevea|10v1|EC604272_P1 10686 647 92,3 globlastp 4159 LYD512 iceplant|gb164|BE034112_P1 10704 647 92,3 globlastp 4160 LYD512 ipomoea_batatas|10v1|CB330617_P1 10711 647 92,3 globlastp 4161 LYD512 ipomoea_batatas|10v1|EE875241_P1 10711 647 92,3 globlastp 4162 LYD512 Ipomoea_ni|10v1|3J567448_P1 10711 647 92,3 globlastp 4163 LYD512 Ipomoea_ni|10v1|CJ741650_P1 10711 647 92,3 globlastp 4164 LYD512 jatropha|09v1|00246632_P1 10686 647 92,3 globlastp 4165 LYD512 kiwi|gb166|FG502716_P1 10712 647 92,3 globlastp 4166 LYD512 leymus|gb166|CN465789_P1 10691 647 92,3 globlastp 4167 LYD512 liriodendron|gb166|CK757694_P1 10691 647 92,3 globlastp 4168 LYD512 lolium|10v1|AU246272_P1 10691 647 92,3 globlastp 4169 LYD512 lolium|10v1|SRRP029314S0005569_P1 10691 647 92,3 globlastp 4170 LYD512 lovegrass|gb167|EH193296_P1 10713 647 92,3 globlastp 4171 LYD512 maize|10v1|A1396175_P1 10691 647 92,3 globlastp 4172 LYD512 maize|10v1|AW288648_P1 10691 647 92,3 globlastp 4173 LYD512 maize|10v1|F18654_P1 10691 647 92,3 globlastp 4174 LYD512 millet|10v1|CD726094_P1 10691 647 92,3 globlastp 4175 LYD512 millet|10v1|EV0454PM003734_P1 10691 647 92,3 globlastp 4176 LYD512 millet|10v1|EV0454PM063491_P1 10691 647 92,3 globlastp 4177 LYD512 monkeyflower|10v1|CV519455_P1 10697 647 92,3 globlastp 4178 LYD512 monkeyflower|10v1|DV206077_P1 10697 647 92,3 globlastp 4179 LYD512 monkeyflower|10v1|DV207931_P1 10697 647 92,3 globlastp 4180 LYD512 monkeyflower|10v1|DV209664_P1 10697 647 92,3 globlastp nicotiana_benthamiana|gb162|CN74 4181 LYD512 10714 647 92,3 globlastp 1435_P1 4182 LYD512 nicotiana_benthamiana|gb162|ES885119_P1 10714 647 92,3 globlastp 4183 LYD512 nuphar|gb166|FD383820_P1 10691 647 92,3 globlastp 4184 LYD512 oat|10v2|CN821628 10691 647 92,3 globlastp 4185 LYD512 oat|10v2|G0583896 10691 647 92,3 globlastp 4186 LYD512 oat|11v1|G0583896_P1 10691 647 92,3 globlastp 4187 LYD512 oat|10v2|G0585073 10691 647 92,3 globlastp 4188 LYD512 oat|11v1|G0585073_P1 10691 647 92,3 globlastp 4189 LYD512 oat|10v2|G0587378 10691 647 92,3 globlastp 4190 LYD512 oat|11v1|G0587378_P1 10691 647 92,3 globlastp 4191 LYD512 oat|10v2|SRR020741S0026729 10691 647 92,3 globlastp

244 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 4192 LYD512 oat|11v1|GR342871_P1 10691 647 92,3 globlastp 4193 LYD512 orobanche|10v1|SRR02349550039628_P1 10714 647 92,3 globlastp 4194 LYD512 orobanche|10v1|SRR02349550069297_P1 10714 647 92,3 globlastp 4195 LYD512 peanut|10v1|CD038141_P1 10715 647 92,3 globlastp 4196 LYD512 peanut|10v1|CD038379_P1 10715 647 92,3 globlastp 4197 LYD512 pepper|gb171|BM065338_P1 10716 647 92,3 globlastp 4198 LYD512 pineapple|10v1|DV190712_P1 10713 647 92,3 globlastp 4199 LYD512 podocarpus|10v1|SRR06501450024252_P1 10717 647 92,3 globlastp 4200 LYD512 podocarpus|10v1|SRR06501450038461_P1 10717 647 92,3 globlastp 4201 LYD512 podocarpus|10v1|SRR06501450059317_P1 10717 647 92,3 globlastp 4202 LYD512 prunus|10v1|CB818382 10718 647 92,3 globlastp 4203 LYD512 pseudoroegneria|gb167|FF340312 10691 647 92,3 globlastp 4204 LYD512 pseudoroegneria|gb167|FF352214 10691 647 92,3 globlastp 4205 LYD512 rhizophora|10v1|SRRO05793S0017882 10705 647 92,3 globlastp 4206 LYD512 rice|gb170|CF291634 10691 647 92,3 globlastp 4207 LYD512 rice|gb170|OS10G27174 10691 647 92,3 globlastp 4208 LYD512 safflower|gb162|EL410796 10719 647 92,3 globlastp 4209 LYD512 salvia|10v1|CV166059 10697 647 92,3 globlastp 4210 LYD512 salvia|10v1|CV169895 10720 647 92,3 globlastp 4211 LYD512 salvia|10v1|FE536283 10697 647 92,3 globlastp 4212 LYD512 senecio|gb170|SRR00659250002849 10721 647 92,3 globlastp 4213 LYD512 solanum_phureja|09v1|SPHBG123654 10722 647 92,3 globlastp 4214 LYD512 sorghum|09v1|SB01G038040 10691 647 92,3 globlastp 4215 LYD512 sorghum|11v1|SB01G038040_P1 10691 647 92,3 globlastp 4216 LYD512 sorghum|09v1|SB01G046070 10691 647 92,3 globlastp 4217 LYD512 sorghum|11v1|SB01G046070_P1 10691 647 92,3 globlastp 4218 LYD512 spurge|gb161|DV147404 10688 647 92,3 globlastp 4219 LYD512 sugarcane|10v1|BQ535635 10691 647 92,3 globlastp 4220 LYD512 sunflower|10v1|DY955911 10723 647 92,3 globlastp 4221 LYD512 switchgrass|gb167|DN142123 10691 647 92,3 globlastp 4222 LYD512 switchgrass|gb167|FE601372 10691 647 92,3 globlastp 4223 LYD512 switchgrass|gb167|FE604013 10691 647 92,3 globlastp 4224 LYD512 switchgrass|gb167|FE611374 10691 647 92,3 globlastp 4225 LYD512 switchgrass|gb167|FE615672 10691 647 92,3 globlastp 4226 LYD512 tea|10v1|CV014096 10711 647 92,3 globlastp 4227 LYD512 tea|10v1|FE861592 10711 647 92,3 globlastp 4228 LYD512 tobacco|gb162|BQ842950 10714 647 92,3 globlastp 4229 LYD512 tobacco|gb162|CV015915 10714 647 92,3 globlastp 4230 LYD512 tobacco|gb162|CV016915 10714 647 92,3 globlastp 4231 LYD512 tobacco|gb162|CV018015 10714 647 92,3 globlastp 4232 LYD512 tragopogon|10v1|SRR020205S0093299 10724 647 92,3 globlastp 4233 LYD512 tragopogon|10v1|SRR020205S0127296 10724 647 92,3 globlastp 4234 LYD512 wheat|10v2|AJ615357 10691 647 92,3 globlastp 4235 LYD512 wheat|10v2|BE423756 10691 647 92,3 globlastp 4236 LYD512 wheat|10v2|BE491999 10691 647 92,3 globlastp 4237 LYD512 wheat|10v2|BF291756 10691 647 92,3 globlastp 4238 LYD512 wheat|10v2|CA485457 10691 647 92,3 globlastp 4239 LYD512 wheat|10v2|CA635178 10691 647 92,3 globlastp 4240 LYD512 wheat|10v2|CD892035 10691 647 92,3 globlastp 4241 LYD512 flax|11v1|EH792097_P1 10690 647 92,3 globlastp 4242 LYD512 aquilegial|10v2|DT738899_P1 10725 647 92,3 globlastp 4243 LYD512 aquilegial|10v2|DT738899 - 647 92,3 globlastp 4244 LYD512 papaya|gb165|EX279085_P1 10726 647 90,9 globlastp 4245 LYD512 amsonia|11v1|SRR098688X123009_P1 10727 647 90,8 globlastp 4246 LYD512 amsonia|11v1|SRR098688X238562_P1 10727 647 90,8 globlastp 4247 LYD512 apple|11v1|MDCRP029240_P1 10728 647 90,8 globlastp 4248 LYD512 apple|11v1|MDCRP032863_P1 10728 647 90,8 globlastp 4249 LYD512 catharanthus|11v1|EG557054_P1 10727 647 90,8 globlastp 4250 LYD512 catharanthus|11v1|EG559238_P1 10727 647 90,8 globlastp 4251 LYD512 distylium|11v1|SRR065077X106870_P1 10729 647 90,8 globlastp 4252 LYD512 eucalyptus|11v2|CU394512_P1 10730 647 90,8 globlastp 4253 LYD512 flaveria|11v1|SRR149229.160224_P1 10731 647 90,8 globlastp

245 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 4254 LYD512 flaveria|11v1|SRR149232.317546_P1 10731 647 90,8 globlastp 4255 LYD512 flaveria|11v1|SRR149241,125082_P1 10731 647 90,8 globlastp 4256 LYD512 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1005582_P1 10732 647 90,8 globlastp 4257 LYD512 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1009932_P1 10732 647 90,8 globlastp 4258 LYD512 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1045870_P1 10732 647 90,8 globlastp 4259 LYD512 phyla|11v2|SRR099035X16238_P1 10727 647 90,8 globlastp 4260 LYD512 phyla|11v2|SRR099035X37513_P1 10733 647 90,8 globlastp 4261 LYD512 phyla|11v2|SRR099037X100392_P1 10734 647 90,8 globlastp 4262 LYD512 phyla|11v2|SRR099037X105459_P1 10734 647 90,8 globlastp 4263 LYD512 platanus|11v1|SRR096786X120365_P1 10735 647 90,8 globlastp 4264 LYD512 silene|11v1|SRR096785X118399_P1 10736 647 90,8 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X103459 4265 LYD512 10727 647 90,8 globlastp _P1 tabernaemontana|11v1|SRR098689X103799 4266 LYD512 10727 647 90,8 globlastp _P1 4267 LYD512 tomato|11v1|BG129356_P1 10737 647 90,8 globlastp 4268 LYD512 utricularia|11v1|SRR094438.10025_ P1 10738 647 90,8 globlastp 4269 LYD512 utricularia|11v1|SRR094438.19335_P1 10738 647 90,8 globlastp 4270 LYD512 antirrhinum|gb166|AJ558324_P1 10739 647 90,8 globlastp 4271 LYD512 antirrhinum|gb166|AJ788631_P1 10739 647 90,8 globlastp 4272 LYD512 apple|gb171|CN488836 10728 647 90,8 globlastp 4273 LYD512 apple|gb171|CN492778 10728 647 90,8 globlastp 4274 LYD512 apple|11v1|CN489200_P1 10728 647 90,8 globlastp 4275 LYD512 apple|gb171|CN903314 10728 647 90,8 globlastp 4276 LYD512 banana|10v1|DN239597_P1 10740 647 90,8 globlastp 4277 LYD512 banana|10v1|FF558846_P1 10741 647 90,8 globlastp 4278 LYD512 banana|10v1|FF561910_P1 10741 647 90,8 globlastp 4279 LYD512 banana|10v1|FL657436_P1 10741 647 90,8 globlastp 4280 LYD512 bean|gb167|FG233922_P1 10742 647 90,8 globlastp 4281 LYD512 bean|gb167|FG233944_P1 10743 647 90,8 globlastp 4282 LYD512 bean|gb167|FG233954_P1 10744 647 90,8 globlastp 4283 LYD512 bean|gb167|FG233980_P1 10745 647 90,8 globlastp 4284 LYD512 bean|gb167|FG233984_P1 10745 647 90,8 globlastp 4285 LYD512 bean|gb167|FG234048_P1 10746 647 90,8 globlastp 4286 LYD512 bean|gb167|FG234259_P1 10745 647 90,8 globlastp 4287 LYD512 bean|gb167|FG234334_P1 10747 647 90,8 globlastp 4288 LYD512 brachypodium|09v1|DV469351_P1 10748 647 90,8 globlastp 4289 LYD512 brachypodium|09v1|DV473284_P1 10748 647 90,8 globlastp 4290 LYD512 brachypodium|09v1|GT762582_P1 10748 647 90,8 globlastp 4291 LYD512 bruguiera|gb166|BP938755_P1 10749 647 90,8 globlastp 4292 LYD512 cassava|09v1|CK645311_P1 10750 647 90,8 globlastp 4293 LYD512 cassava|09v1|CK651521_P1 10750 647 90,8 globlastp 4294 LYD512 cassava|09v1|DV454666_P1 10751 647 90,8 globlastp 4295 LYD512 catharanthus|gb166|EG557054 10727 647 90,8 globlastp 4296 LYD512 catharanthus|gb166|EG559238 10727 647 90,8 globlastp 4297 LYD512 cotton|10v2|BG440579_P1 10752 647 90,8 globlastp 4298 LYD512 cotton|10v2|DT053340_P1 10752 647 90,8 globlastp 4299 LYD512 cotton|10v2|SRR032367S0060293_P1 10752 647 90,8 globlastp 4300 LYD512 cotton|10v2|SRR032878S0078188_P1 10752 647 90,8 globlastp 4301 LYD512 eucalyptus|11v2|CT981374_P1 10730 647 90,8 globlastp 4302 LYD512 eucalyptus|gb166|CT981374 10730 647 90,8 globlastp 4303 LYD512 eucalyptus|10v2|CU399026_P1 10753 647 90,8 globlastp 4304 LYD512 eucalyptus|gb166|CU399026 10754 647 90,8 globlastp 4305 LYD512 flax|09v1|EH792097 10755 647 90,8 globlastp 4306 LYD512 gnetum|10v1|SRR064399S0107325_P1 10756 647 90,8 globlastp 4307 LYD512 jatropha|09v1|GH295591_P1 10757 647 90,8 globlastp 4308 LYD512 marchantia|gb166|AU082043_P1 10758 647 90,8 globlastp 4309 LYD512 monkeyflower|10v1|DV208958_P1 10739 647 90,8 globlastp monkeyflower|10v1|SRR037228S0094987_ 4310 LYD512 10759 647 90,8 globlastp P1 4311 LYD512 nasturtium|10v1|GH171232 10760 647 90,8 globlastp 4312 LYD512 oilpalm|gb166|EL608946_P1 10761 647 90,8 globlastp

246 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 4313 LYD512 peanut|10v1|EE127578_P1 10762 647 90,8 globlastp 4314 LYD512 peanut|10v1|ES717260_P1 10762 647 90,8 globlastp 4315 LYD512 petunia|gb171|CV293879_P1 10763 647 90,8 globlastp 4316 LYD512 petunia|gb171|DY395623_P1 10763 647 90,8 globlastp 4317 LYD512 poplar|10v1|A1166801_P1 10764 647 90,8 globlastp 4318 LYD512 poplar|10v1|B1120216_P1 10764 647 90,8 globlastp 4319 LYD512 poppy|gb166|FE968115_P1 10765 647 90,8 globlastp 4320 LYD512 salvia|10v1|SRR014553S0000068 10739 647 90,8 globlastp 4321 LYD512 salvia|10v1|SRR014553S0001112 10734 647 90,8 globlastp 4322 LYD512 senecio|gb170|SRR00659250021285 10766 647 90,8 globlastp 4323 LYD512 solanum_phureja|09v1|SPHBG129356 10737 647 90,8 globlastp 4324 LYD512 sugarcane|10v1|BQ529658 10767 647 90,8 globlastp 4325 LYD512 tea|10v1|FE861346 10768 647 90,8 globlastp 4326 LYD512 tomato|09v1|K129356 10737 647 90,8 globlastp 4327 LYD512 zostera|10v1|AM772996 10769 647 90,8 globlastp 4328 LYD512 utricularia|11v1|SRR094438.104599_T1 10770 647 90,8 glotblastn 4329 LYD512 apple|11v1|CN488836_T1 10771 647 90,8 glotblastn 4330 LYD512 bean|gb167|FG233897_T1 10673 647 90,8 glotblastn 4331 LYD512 bean|gb167|FG233936_T1 10772 647 90,8 glotblastn 4332 LYD512 bean|gb167|FG234167_T1 10773 647 90,8 glotblastn 4333 LYD512 bean|gb167|FG234195_T1 10774 647 90,8 glotblastn 4334 LYD512 bean|gb167|FG234289_T1 10775 647 90,8 glotblastn 4335 LYD512 bean|gb167|FG234297_T1 10772 647 90,8 glotblastn 4336 LYD512 cichorium|gb171|EH702681_T1 10776 647 90,8 glotblastn 4337 LYD512 millet|10v1|EV0454PM036750_T1 10777 647 90,8 glotblastn 4338 LYD512 oil_palm|gb166|ES273939_T1 10778 647 90,8 glotblastn 4339 LYD512 cichorium|gb171|FL681407_T1 - 647 90,8 glotblastn 4340 LYD512 pteridium|11v1|SRR043594X104518_T1 10779 647 89,2 glotblastn 4341 LYD512 sarracenia|11v1|SRR192669.424846_T1 10780 647 89,2 glotblastn 4342 LYD512 bean|gb167|FG233854_T1 10781 647 89,2 glotblastn 4343 LYD512 bean|gb167|FG234018_T1 10782 647 89,2 glotblastn 4344 LYD512 bean|gb167|FG234474_T1 10783 647 89,2 glotblastn 4345 LYD512 papaya|gb165|EX288740_T1 10784 647 89,2 glotblastn 4346 LYD512 thalictrum|11v1|SRR096787X101011_T1 - 647 89,2 glotblastn 4347 LYD512 thalictrum|11v1|SRR096787X101305_T1 - 647 89,2 glotblastn 4348 LYD512 catharanthus|11v1|EG559177_P1 10785 647 89,2 globlastp 4349 LYD512 cephalotaxus|11v1|SRR064395X112971_P1 10786 647 89,2 globlastp 4350 LYD512 cephalotaxus|11v1|SRR064395X146406_P1 10786 647 89,2 globlastp 4351 LYD512 fraxinus|11v1|SRR058827.108765_P1 10787 647 89,2 globlastp 4352 LYD512 fraxinus|11v1|SRR058827.113258_P1 10787 647 89,2 globlastp 4353 LYD512 fraxinus|11v1|SRR058827.11700_P1 10787 647 89,2 globlastp 4354 LYD512 fraxinus|11v1|SRR058827.144119_P1 10787 647 89,2 globlastp 4355 LYD512 fraxinus|11v1|SRR058827.162531_P1 10787 647 89,2 globlastp 4356 LYD512 fraxinus|11v1|SRR058827.24084_P1 10787 647 89,2 globlastp 4357 LYD512 olea|11v1|ISRR014464.22806_P1 10787 647 89,2 globlastp 4358 LYD512 primula|11v1|ISRR098679X101655_P1 10788 647 89,2 globlastp 4359 LYD512 primula|11v1|SRR098679X125030_P1 10788 647 89,2 globlastp 4360 LYD512 primula|11v1|SRR098679X136794_P1 10788 647 89,2 globlastp 4361 LYD512 primula|11v1|SRR098679X187414_P1 10788 647 89,2 globlastp 4362 LYD512 silene|11v1|SRR096785X123206_P1 10789 647 89,2 globlastp 4363 LYD512 trigonella|11v1|SRR066194X111163_P1 10790 647 89,2 globlastp 4364 LYD512 vinca|11v1|SRR098690X12826_P1 10791 647 89,2 globlastp 4365 LYD512 vinca|11v1|SRR098690X131404_P 10792 647 89,2 globlastp 4366 LYD512 aristolochia|10v1|SRR039083S0089926_P1 10793 647 89,2 globlastp 4367 LYD512 banana|10v1|FF558706_P1 10794 647 89,2 globlastp 4368 LYD512 bean|gb167|FG233895_P1 10795 647 89,2 globlastp 4369 LYD512 bean|gb167|FG234253_P1 10796 647 89,2 globlastp 4370 LYD512 bean|gb167|FG234255_P1 10797 647 89,2 globlastp 4371 LYD512 bean|gb167|FG234309_P1 10798 647 89,2 globlastp 4372 LYD512 bean|gb167|FG234440_P1 10799 647 89,2 globlastp 4373 LYD512 ceratodon|10v1|SRR074890S0001398_P1 10800 647 89,2 globlastp 4374 LYD512 cryptomeria|gb166|BW992478_P1 10801 647 89,2 globlastp

247 / 378 Hom Polin. Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden. Algor. ID Nome do Gene NO: ID glob. NO: NO: 4375 LYD512 cycas|gb166|DR062568_P1 10802 647 89,2 globlastp 4376 LYD512 cycas|gb166|EX921162_P1 10802 647 89,2 globlastp 4377 LYD512 eggplant|10v1|FS000481_P1 10803 647 89,2 globlastp 4378 LYD512 eggplant|10v1|FS009241_P1 10804 647 89,2 globlastp 4379 LYD512 fern|gb171|DK943628_P1 10805 647 89,2 globlastp 4380 LYD512 monkeyflower|10v1|CRPMG02277_P1 10806 647 89,2 globlastp 4381 LYD512 nasturtium|10v1|GH171790 10807 647 89,2 globlastp 4382 LYD512 pepper|gb171|CA518060_P1 10808 647 89,2 globlastp 4383 LYD512 physcomitrella|10v1|AW145617_P1 10800 647 89,2 globlastp 4384 LYD512 physcomitrella|10v1|AW509882_P1 10800 647 89,2 globlastp 4385 LYD512 physcomitrella|10v1|BG362532_P1 10800 647 89,2 globlastp 4386 LYD512 sciadopitys|10v1|SRR065035S0001902 10809 647 89,2 globlastp 4387 LYD512 sciadopitys|10v1|SRR065035S0010668 10809 647 89,2 globlastp 4388 LYD512 senecio|gb170|SRR00659250003943 10810 647 89,2 globlastp 4389 LYD512 tamarix|gb166|CF199299 10811 647 89,2 globlastp 4390 LYD512 taxus|10v1|SRR032523S0023730 10812 647 89,2 globlastp 4391 LYD512 taxus|10v1|SRR065067S0012236 10786 647 89,2 globlastp 4392 LYD512 wheat|10v2|CA656149 10813 647 89,2 globlastp 4393 LYD512 zamia|gb166|DY033734 10814 647 89,2 globlastp 4394 LYD512 zostera|10v1|SRR057351S0008141 10815 647 89,2 globlastp 4395 LYD512 abies|11v2|SRR098676X15713_P1 10816 647 87,7 globlastp 4396 LYD512 canola|11v1|CN730151_P1 10817 647 87,7 globlastp 4397 LYD512 canola|11v1|EE451330_P1 10817 647 87,7 globlastp 4398 LYD512 canola|11v1|EE452234_P1 10817 647 87,7 globlastp 4399 LYD512 canola|11v1|SRR019556.29018_P1 10817 647 87,7 globlastp canola|11v1|SRR329674.394963_P1 10818 647 ,.., 4400 LYD512 globlastp

87. i 4401 LYD512 cedrus|11v1|SRR065007X10175_P1 10819 647 87,7 globlastp 4402 LYD512 cedrus|11v1|SRR065007X120542_P1 10819 647 87,7 globlastp 4403 LYD512 maritime_pine|10v1|AL749710_P1 10819 647 87,7 globlastp 4404 LYD512 maritime_pine|10v1|BX249765_P1 10819 647 87,7 globlastp 4405 LYD512 plantago|11v1|SRR066373X100013_P1 10820 647 87,7 globlastp 4406 LYD512 plantago|11v1|SRR066373X103996_P1 10820 647 87,7 globlastp 4407 LYD512 plantago|11v1|SRR066373X111155_P1 10820 647 87,7 globlastp 4408 LYD512 pteridium|11v1|SRR043594X103046_P1 10821 647 87,7 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EC599152_P 4409 LYD512 10817 647 87,7 globlastp 1 thellungiella_halophilum|11v1|EHCRP0078 4410 LYD512 10817 647 87,7 globlastp 76_P1 thellungiella_halophilum|11v1|EHCRP0429 4411 LYD512 10817 647 87,7 globlastp 37_P1 thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111017 4412 LYD512 10817 647 87,7 globlastp 827_P1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP006143 4413 LYD512 10817 647 87,7 globlastp _P1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP026792 4414 LYD512 10817 647 87,7 globlastp _P1 4415 LYD512 arabidopsis_lyrata|09v1|BQ834531_P1 10818 647 87,7 globlastp 4416 LYD512 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL006510_P1 10818 647 87,7 globlastp 4417 LYD512 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL009424_P1 10818 647 87,7 globlastp 4418 LYD512 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL020026_P1 10818 647 87,7 globlastp 4419 LYD512 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL031084_P1 10818 647 87,7 globlastp 4420 LYD512 arabidopsis|10v1|AT3G10090_P1 10818 647 87,7 globlastp 4421 LYD512 arabidopsis|10v1|AT5G03850_P1 10818 647 87,7 globlastp 4422 LYD512 b_juncea|10v2|BJ1SLX00016868D1_P1 10817 647 87,7 globlastp 4423 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A1L7C_P1 10817 647 87,7 globlastp 4424 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A3MZ4_P1 10818 647 87,7 globlastp 4425 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A5CNE_P1 10818 647 87,7 globlastp 4426 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AGZHD_P1 10818 647 87,7 globlastp 4427 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AP5N3_P1 10818 647 87,7 globlastp 4428 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZO lAXXOZ_P1 10817 647 87,7 globlastp 4429 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BDAJ2_P1 10818 647 87,7 globlastp

248 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 4430 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BYY46_P1 10818 647 87,7 globlastp 4431 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01CH5EY_P1 10817 647 87,7 globlastp 4432 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01CLNTO_P1 10818 647 87,7 globlastp 4433 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01D2EJZ_P1 10818 647 87,7 globlastp 4434 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01D5ENC_P1 10817 647 87,7 globlastp 4435 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZ02HHV0U_P1 10817 647 87,7 globlastp 4436 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZ02HMQ03_P1 10818 647 87,7 globlastp 4437 LYD512 b_juncea|10v2|E7FJ1I303C57S6_P1 10818 647 87,7 globlastp 4438 LYD512 b_oleracea|gb161|AM056573_P1 10817 647 87,7 globlastp 4439 LYD512 b_oleracea|gb161|DY027567_P1 10818 647 87,7 globlastp 4440 LYD512 b rapa|gb162|CV432660_P1 10817 647 87,7 globlastp 4441 LYD512 b rapa|gb162|CX266005_P1 10817 647 87,7 globlastp 4442 LYD512 b rapa|gb162|CX271643_P1 10818 647 87,7 globlastp 4443 LYD512 b rapalgb16433648_P1 10817 647 87,7 globlastp 4444 LYD512 bean|gb167|FG233952_P1 10822 647 87,7 globlastp 4445 LYD512 bean|gb167|FG234313_P1 10823 647 87,7 globlastp 4446 LYD512 canola|10v1|CD812262 10817 647 87,7 globlastp 4447 LYD512 canola|11v1|CN735683_P1 10817 647 87,7 globlastp 4448 LYD512 canola|10v1|CD812803 10818 647 87,7 globlastp 4449 LYD512 canola|11v1|EG019380_P1 10818 647 87,7 globlastp 4450 LYD512 canola|10v1|CD814488 10817 647 87,7 globlastp 4451 LYD512 canola|10v1|CD816398 10817 647 87,7 globlastp 4452 LYD512 canola|10v1|CN732039 10817 647 87,7 globlastp 4453 LYD512 canola|11v1|CN732039_P1 10817 647 87,7 globlastp 4454 LYD512 canola|10v1|CN732436 10818 647 87,7 globlastp 4455 LYD512 canola|11v1|CN732436_P1 10818 647 87,7 globlastp 4456 LYD512 canola|10v1|CX195298 10817 647 87,7 globlastp 4457 LYD512 canola|10v1|CX281671 10817 647 87,7 globlastp 4458 LYD512 canola|10v1|EE442320 10817 647 87,7 globlastp 4459 LYD512 canola|10v1|EE475415 10818 647 87,7 globlastp 4460 LYD512 canola|11v1|EE475415_P1 10818 647 87,7 globlastp 4461 LYD512 ceratodon|10v1|AWO86783_P1 10824 647 87,7 globlastp 4462 LYD512 ceratodon|10v1|SRR07489050014896_P1 10824 647 87,7 globlastp 4463 LYD512 ceratodon|10v1|SRR07489050032828_P1 10825 647 87,7 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000467 4464 LYD512 10818 647 87,7 globlastp 9_P1 cleome_gynandra|10v1|SRR015532S007064 4465 LYD512 10818 647 87,7 globlastp 0_P1 cleome_gynandra|10v1|SRR015532S010861 4466 LYD512 10818 647 87,7 globlastp 6_P1 4467 LYD512 medicago|09v1|BG453970_P1 10826 647 87,7 globlastp 4468 LYD512 mesostigma|gb166|DN254281_P1 10827 647 87,7 globlastp 4469 LYD512 mesostigma|gb166|EC726970_P1 10827 647 87,7 globlastp 4470 LYD512 orobanche|10v1|SRR02318950004283_P1 10828 647 87,7 globlastp 4471 LYD512 physcomitrellai|10v1|AW145131_P1 10824 647 87,7 globlastp 4472 LYD512 physcomitrella|10v1|AW497065_P1 10824 647 87,7 globlastp 4473 LYD512 pine|10v2|E3E662643_P1 10819 647 87,7 globlastp 4474 LYD512 poplar|10v1|P3I127311_P1 10829 647 87,7 globlastp 4475 LYD512 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0006202 10819 647 87,7 globlastp 4476 LYD512 radish|gb164|1EV528488 10817 647 87,7 globlastp 4477 LYD512 radish|gb164|EV535786 10818 647 87,7 globlastp 4478 LYD512 radish|gb164|1EW715704 10818 647 87,7 globlastp 4479 LYD512 radish|gb164|EW723424 10817 647 87,7 globlastp 4480 LYD512 radish|gb164|EX777355 10817 647 87,7 globlastp 4481 LYD512 spruce|gb162|CO215686 10819 647 87,7 globlastp 4482 LYD512 spruce|gb162|CO218766 10819 647 87,7 globlastp 4483 LYD512 spruce|gb162|CO244278 10819 647 87,7 globlastp 4484 LYD512 strawberry|11v1|CRPFV023807 10830 647 87,7 globlastp 4485 LYD512 thellungiella|gb167|EC599152 10817 647 87,7 globlastp 4486 LYD512 triphysaria|0v1|BM357464 10831 647 87,7 globlastp 4487 LYD512 triphysaria|10v1|DR175565 10831 647 87,7 globlastp 4488 LYD512 canola|11v1|DW998697_P1 10817 647 87,7 globlastp

249 / 378 Hom Polin. Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden. Algor. ID Nome do Gene NO: ID glob. NO: NO: 4489 LYD512 sarracenia|11v1|SRR192669.149258_T1 10832 647 87,7 glotblastn 4490 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AOUMW_T1 10833 647 87,7 glotblastn 4491 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01CSHE8_T1 10834 647 87,7 glotblastn 4492 LYD512 b_oleracea|gb161|AM056827_T1 10835 647 87,7 glotblastn 4493 LYD512 b rapa|gb162|CA992109_T1 10836 647 87,7 glotblastn 4494 LYD512 b rapa|gb162|CO749582_T1 10837 647 87,7 glotblastn 4495 LYD512 b rapa|gb164|L47858_T1 10838 647 87,7 glotblastn 4496 LYD512 bean|gb167|FG233996_T1 10839 647 87,7 glotblastn 4497 LYD512 bean|gb167|FG234221_T1 10840 647 87,7 glotblastn 4498 LYD512 bean|gb167|FG234271_T1 10841 647 87,7 glotblastn 4499 LYD512 bean|gb167|FG234438_T1 10842 647 87,7 glotblastn 4500 LYD512 potato|10v1|BG594649_T1 10843 647 87,7 glotblastn 4501 LYD512 radish|gb164|EV545800 10844 647 87,7 glotblastn 4502 LYD512 radish|gb164|EV552271 10845 647 87,7 glotblastn 4503 LYD512 radish|gb164|EY894218 10845 647 87,7 glotblastn 4504 LYD512 radish|gb164|EY903338 10846 647 87,7 glotblastn 4505 LYD512 radish|gb164|FD576341 10847 647 87,7 glotblastn 4506 LYD512 rye|gb164|BE704623 10848 647 87,7 glotblastn 4507 LYD512 spruce|gb162|CO232485 10849 647 87,7 glotblastn 4508 LYD512 bean|gb167|FG234012_T1 - 647 87,7 glotblastn 4509 LYD512 potato|10v1|BM111525_T1 - 647 87,7 glotblastn 4510 LYD512 bean|gb167|FG233943_P1 10850 647 86,8 globlastp 4511 LYD512 abies|11v2|SRR098676X123656_P1 10851 647 86,2 globlastp 4512 LYD512 apple|11v1|MDCRP053770_P1 10852 647 86,2 globlastp 4513 LYD512 apple|11v1|MDP0000803797_P1 10852 647 86,2 globlastp 4514 LYD512 chelidonium|11v1|SRR084752X126116_P1 10853 647 86,2 globlastp 4515 LYD512 primula|11v1|FS231641_P1 10854 647 86,2 globlastp 4516 LYD512 primula|11v1|ISRR098679X124782_P1 10855 647 86,2 globlastp 4517 LYD512 silene|11v1|GH293985_P1 10856 647 86,2 globlastp 4518 LYD512 silene|11v1|SRR096785X402407_P1 10857 647 86,2 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP024263 4519 LYD512 10858 647 86,2 globlastp _P1 4520 LYD512 arabidopsis|10v1|AT5G64140_P1 10859 647 86,2 globlastp 4521 LYD512 artemisia|10v1|EY041125_P1 10860 647 86,2 globlastp 4522 LYD512 b_juncea|10v2|E6ANDIZ02I04Q9_P1 10861 647 86,2 globlastp 4523 LYD512 chlamydomonas|gb162|AV640073_P1 10862 647 86,2 globlastp 4524 LYD512 cleome_spinosa|10v1|GR935009_P1 10863 647 86,2 globlastp cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0012112 4525 LYD512 10863 647 86,2 globlastp _P1 cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0013955 4526 LYD512 10863 647 86,2 globlastp _P1 cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0016798 4527 LYD512 10863 647 86,2 globlastp _P1 4528 LYD512 cryptomeria|gb166|AU299590_P1 10864 647 86,2 globlastp 4529 LYD512 orobanche|10v1|5RR02318950002252_P1 10865 647 86,2 globlastp Polin. nome do Agrupamento to Hom para Polip. % SEQ Horn SEQ Gene SEQ ID glob. Algor.

ID ID Nome NO: iden. NO: NO: 4530 LYD512 orobanche|10v1|SRR02318950002404_P1 10865 647 86,2 globlastp 4531 LYD512 orobanche|10v1|SRR02318950007404_P1 10865 647 86,2 globlastp 4532 LYD512 pine|10v2|H75162_P1 10866 647 86,2 globlastp 4533 LYD512 spikemoss|gb165|DN838953 10867 647 86,2 globlastp 4534 LYD512 spikemoss|gb165|DN839150 10867 647 86,2 globlastp 4535 LYD512 triphysaria|10v1|BM357152 10868 647 86,2 globlastp 4536 LYD512 triphysaria|10v1|EX988149 10868 647 86,2 globlastp 4537 LYD512 volvox|gb162|AW651985 10862 647 86,2 globlastp 4538 LYD512 bean|gb167|FG233926_T1 10869 647 86,2 glotblastn 4539 LYD512 bean|gb167|FG233946_T1 10870 647 86,2 glotblastn 4540 LYD512 bean|gb167|FG233986_T1 - 647 86,2 glotblastn 4541 LYD512 potato|10v1|BE920319_T1 - 647 86,2 glotblastn 4542 LYD512 bean|gb167|FG234342_T1 10871 647 84,6 glotblastn

250 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 4543 LYD512 onion|gb162|B1095549_T1 10872 647 84,6 glotblastn 4544 LYD512 radish|gb164|EX771975 10873 647 84,6 glotblastn 4545 LYD512 wheat|10v2|CA594088 10874 647 84,6 glotblastn 4546 LYD512 bean|gb167|FG233903_T1 - 647 84,6 glotblastn 4547 LYD512 bean|gb167|FG233911_T1 - 647 84,6 glotblastn 4548 LYD512 potato|10v1|BG889630_T1 - 647 84,6 glotblastn 4549 LYD512 aristolochia|10v1|SRR039082S0145919_P1 10875 647 84,6 globlastp 4550 LYD512 basilicum|10v1|DY336454_P1 10876 647 84,6 globlastp 4551 LYD512 nasturtium|10v1|SRR032558S0002107 10877 647 84,6 globlastp 4552 LYD512 oak|10v1|DN949801_P1 10878 647 84,6 globlastp 4553 LYD512 oak|10v1|DN950886_P1 10878 647 84,6 globlastp 4554 LYD512 sequoia|10v1|SRR065044S0012925 10879 647 84,6 globlastp 4555 LYD512 wheat|10v2|CJ507187 10880 647 84,6 globlastp 4556 LYD512 trigonella|11v1|SRR066194X110700_P1 10881 647 83,1 globlastp 4557 LYD512 chickpea|09v2|DY475499_P1 10882 647 83,1 globlastp 4558 LYD512 ipomoea_batatas|10v1|DV037504_P 10883 647 83,1 globlastp 4559 LYD512 rose|10v1|EC586279 10884 647 83,1 globlastp 4560 LYD512 sunflower|10v1|SFSLX01822194D1 10885 647 83,1 globlastp 4561 LYD512 sarracenia|11v1|SRR192671.251185_T1 10886 647 83,1 glotblastn 4562 LYD512 tea|10v1|FE861348 10887 647 83,1 glotblastn 4563 LYD512 flaveria|11v1|SRR149244.183097_T1 - 647 83,1 glotblastn 4564 LYD512 fraxinus|11v1|SRR058827.120236_T1 - 647 83,1 glotblastn 4565 LYD512 basilicum|10v1|DY337263_T1 - 647 83,1 glotblastn 4566 LYD512 fraxinus|11v1|SRR058827.13807_T1 10888 647 81,5 glotblastn 4567 LYD512 bean|gb167|FG230120_T1 10889 647 81,5 glotblastn 4568 LYD512 bean|gb167|FG233978_T1 10890 647 81,5 glotblastn 4569 LYD512 canola|11v1|ES268647_T1 - 647 81,5 glotblastn 4570 LYD512 pea|11v1|FG530409_T1 - 647 81,5 glotblastn 4571 LYD512 primula|11v1|FS228883_P1 10891 647 81,5 globlastp 4572 LYD512 aquilegia|10v2|CRPAC012415_P1 10892 647 81,5 globlastp 4573 LYD512 ostreococcus|gb162|XM001416346_P1 10893 647 81,5 globlastp 4574 LYD512 salvia|10v1|SRR014553S0007711 10894 647 81,5 globlastp 4575 LYD512 pine|10v2|SRR063941S0003740_P1 10895 647 80,3 globlastp arabidopsis_lyrata|09v1|TMPLEY903338T1 4576 LYD512 10896 647 80,0 globlastp _P1 4577 LYD512 cacao|10v1|ICGD0018598_P1 10897 647 80,0 globlastp 4578 LYD512 medicago|09v1|GFXAC147482X42_P1 10898 647 80,0 globlastp 4579 LYD512 spurge|gb161|DV112391 10899 647 80,0 globlastp 4580 LYD512 wheat|10v2|CA719059 10900 647 80,0 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S022161 4581 LYD512 - 647 80,0 glotblastn 8_T1 4582 LYD513 soybean|11v1|GLYMA19G42090 10901 648 96,8 globlastp 4583 LYD513 cowpea|gb166|FF383089_P1 10902 648 96,0 globlastp 4584 LYD513 pigeonpea|10v1|PE595417_P1 10903 648 96,0 globlastp 4585 LYD513 bean|gb167|CA904335_P1 10904 648 95,2 globlastp 4586 LYD513 liquorice|gb171|FS239664_P1 10905 648 95,2 globlastp 4587 LYD513 pigeonpea|10v1|SRR054580S0032264_P1 10906 648 94,4 globlastp 4588 LYD513 soybean|11v1|GLYMA10G29200 10907 648 94,4 globlastp 4589 LYD513 clementine|11v1|CB290340_P1 10908 648 93,6 globlastp 4590 LYD513 orange|11v1|CB290340_P1 10908 648 93,6 globlastp 4591 LYD513 citrus|gb166|CB290341_P1 10908 648 93,6 globlastp 4592 LYD513 cannabis|12v1|X499537_P1 10909 648 93,5 globlastp 4593 LYD513 cannabis|12v1|SOLX00014292_P1 10909 648 93,5 globlastp 4594 LYD513 cannabis|12v1|SOLX00031802_P1 10909 648 93,5 globlastp 4595 LYD513 cotton|10v2|BF269423_P1 10910 648 93,5 globlastp 4596 LYD513 medicago|09v1|AL365796_P1 10911 648 93,5 globlastp 4597 LYD513 soybean|11v1|GLYMA20G38080 10912 648 93,5 globlastp 4598 LYD513 cannabis|12v1|X495661_P1 10913 648 92,8 globlastp 4599 LYD513 cannabis|12v1|SOLX00040861_P1 10913 648 92,8 globlastp 4600 LYD513 humulus|11v1|SRR098684X105260_T1 10914 648 92,7 glotblastn 4601 LYD513 euphorbia|11v1|BP955767_P1 10915 648 92,7 globlastp 4602 LYD513 humulus|11v1|EX515441_P1 10916 648 92,7 globlastp

251 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 4603 LYD513 humulus|11v1|FG346186_P1 10916 648 92,7 globlastp 4604 LYD513 trigonella|11v1|SRR066194X107510_P1 10917 648 92,7 globlastp 4605 LYD513 cowpea|gb166|FF389703_P1 10918 648 92,7 globlastp 4606 LYD513 peanut|10v1|CD038704_P1 10919 648 92,7 globlastp 4607 LYD513 castorbean|09v1|EG658084 10920 648 92,0 globlastp 4608 LYD513 castorbean|11v1|PE255893_T1 10921 648 92,0 glotblastn 4609 LYD513 humulus|11v1|SRR098683X44395_P1 10922 648 91,9 globlastp 4610 LYD513 platanus|11v1|SRR096786X103370_P1 10923 648 91,9 globlastp 4611 LYD513 tripterygium|11v1|SRR098677X108844_P1 10924 648 91,9 globlastp 4612 LYD513 cassava|09v1|DV444762_P1 10925 648 91,9 globlastp 4613 LYD513 cotton|10v2|SRR032367S0174241_P1 10926 648 91,9 globlastp 4614 LYD513 grape|11v1|GSVIVT01031130001_P1 10927 648 91,9 globlastp 4615 LYD513 grape|gb160|CB009183 10927 648 91,9 globlastp 4616 LYD513 grape|11v1|GSVIVT01031158001_P1 10928 648 91,9 globlastp 4617 LYD513 grape|gb160|CF372581 10928 648 91,9 globlastp 4618 LYD513 poplar|10v1|A1162142_P1 10929 648 91,9 globlastp 4619 LYD513 spurge|gb161|DV116672 10930 648 91,9 globlastp 4620 LYD513 walnuts|gb166|EL895554 10931 648 91,9 globlastp 4621 LYD513 flax|11v1|EU830901_P1 10932 648 91,3 globlastp 4622 LYD513 apple|11v1|CN488470_P1 10933 648 91,2 globlastp 4623 LYD513 apple|gb171|CN489770 10933 648 91,2 globlastp 4624 LYD513 cassava|09v1|DV445154_P1 10934 648 91,1 globlastp 4625 LYD513 chestnut|gb170|SRR006295S0000545_P1 10935 648 91,1 globlastp 4626 LYD513 lotus|09v1|G0006827_P1 10936 648 91,1 globlastp 4627 LYD513 flax|11v1|JG018398_P1 10937 648 90,6 globlastp 4628 LYD513 citrus|gb166|DN795749_P1 10938 648 90,6 globlastp 4629 LYD513 scabiosa|11v1|SRR063723X13165_P1 10939 648 90,5 globlastp 4630 LYD513 castorbean|09v1|EG693531 10940 648 90,5 globlastp 4631 LYD513 castorbean|11v1|EG693531_P1 10940 648 90,5 globlastp 4632 LYD513 beet|gb162|BF011209_P1 10941 648 90,4 globlastp 4633 LYD513 bruguiera|gb166|BP944609_P1 10942 648 90,4 globlastp 4634 LYD513 euonymus|11v1|SRR070038X102758_P1 10943 648 90,3 globlastp 4635 LYD513 platanus|11v1|SRR096786X100019_P1 10944 648 90,3 globlastp 4636 LYD513 cucumber|09v1|CK085538_P1 10945 648 90,3 globlastp 4637 LYD513 cyamopsis|10v1|EG976392_P1 10946 648 90,3 globlastp 4638 LYD513 melon|10v1|AM714057_P1 10945 648 90,3 globlastp 4639 LYD513 poplar|10v1|P3U827971_P1 10947 648 90,3 globlastp 4640 LYD513 prunus|10v1|CB822690 10948 648 90,3 globlastp 4641 LYD513 prunus|10v1|CN444931 10949 648 90,3 globlastp 4642 LYD513 castorbean|09v1|EV520818 10950 648 89,8 globlastp 4643 LYD513 castorbean|11v1|PE255561_T1 10951 648 89,8 glotblastn 4644 LYD513 valeriana|11v1|SRR099039X111653_P1 10952 648 89,7 globlastp 4645 LYD513 vinca|11v1|SRR098690X106030_P1 10953 648 89,6 globlastp 4646 LYD513 apple|gb171|CN488470 10954 648 89,6 globlastp 4647 LYD513 apple|gb171|CN493487 10955 648 89,6 globlastp 4648 LYD513 cacao|10v1|CU571486_P1 10956 648 89,6 globlastp 4649 LYD513 walnuts|gb166|CB303799 10957 648 89,6 globlastp 4650 LYD513 chelidonium|11v1|SRR084752X106 078_P1 10958 648 89,5 globlastp 4651 LYD513 cucurbita|11v1|SRR091276X101050_P1 10959 648 89,5 globlastp 4652 LYD513 cucurbita|11v1|SRR091276X118267_P1 10960 648 89,5 globlastp 4653 LYD513 fagopyrum|11v1|SRR063689X100555_P1 10961 648 89,5 globlastp 4654 LYD513 watermelon|11v1|C0997628_P1 10960 648 89,5 globlastp 4655 LYD513 apple|11v1|CN444931_P1 10962 648 89,5 globlastp 4656 LYD513 apple|gb171|CN444931 10962 648 89,5 globlastp 4657 LYD513 cacao|10v1|1CU473875_P1 10963 648 89,5 globlastp 4658 LYD513 cotton|10v2|SRR032367S0128689_P1 10964 648 89,5 globlastp 4659 LYD513 iceplant|gb164|BE037240_P1 10965 648 89,5 globlastp 4660 LYD513 jatropha|09v1|FM896181_P1 10966 648 89,5 globlastp 4661 LYD513 lotus|09v1|LLBW594540_P1 10967 648 89,5 globlastp 4662 LYD513 momordica|10v1|SRR071315S0002588_P1 10960 648 89,5 globlastp 4663 LYD513 rose|10v1|B1978990 10968 648 89,5 globlastp 4664 LYD513 sarracenia|11v1|SRR192669.103226_P1 10969 648 89,0 globlastp

252 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 4665 LYD513 cassava|09v1|FF535437_P1 10970 648 89,0 globlastp 4666 LYD513 amsonia|11v1|SRR098688X110818_P1 10971 648 88,9 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X10926_ 4667 LYD513 10972 648 88,9 globlastp P1 4668 LYD513 fagopyrum|11v1|SRR063689X16772_P1 10973 648 88,8 globlastp 4669 LYD513 grape|11v1|GSVIVT01035141001_P1 10974 648 88,8 globlastp 4670 LYD513 grape|gb160|BQ796866 10974 648 88,8 globlastp 4671 LYD513 peanut|10v1|ES719337_P1 10975 648 88,8 globlastp 4672 LYD513 poplar|10v1|BU828110_P1 10976 648 88,8 globlastp 4673 LYD513 rhizophora|10v1|SRR005793S0012970 10977 648 88,8 globlastp 4674 LYD513 grape|11v1|PE071280_P1 10978 648 88,7 globlastp 4675 LYD513 tripterygium|11v1|SRR098677X116948_P1 10979 648 88,7 globlastp 4676 LYD513 acacia|10v1|1GR481725_P1 10980 648 88,7 globlastp 4677 LYD513 bean|gb167|CA897727_P1 10981 648 88,7 globlastp 4678 LYD513 grape|11v1|GSVIVT01028021001_P1 10978 648 88,7 globlastp 4679 LYD513 grape|gb160|BQ798950 10978 648 88,7 globlastp 4680 LYD513 hevea|10v1|EC600964_P1 10982 648 88,7 globlastp 4681 LYD513 pea|09v1|FG533744 10983 648 88,7 globlastp 4682 LYD513 pea|11v1|FG533744_P1 10983 648 88,7 globlastp 4683 LYD513 kiwi|gb166|FG402715_P1 10984 648 88,3 globlastp 4684 LYD513 sarracenia|11v1|SRR192669.10545XX1_P1 10985 648 88,2 globlastp 4685 LYD513 cucurbita|11v1|FG227191_P1 10986 648 88,1 globlastp 4686 LYD513 vinca|11v1|SRR098690X109230_P1 10987 648 88,1 globlastp 4687 LYD513 watermelon|11v1|AM713876_P1 10986 648 88,1 globlastp 4688 LYD513 cucumber|09v1|EB714648_P1 10986 648 88,1 globlastp 4689 LYD513 cynara|gb167|GE586491_P1 10988 648 88,1 globlastp 4690 LYD513 ginseng|10v1|CN846478_P1 10989 648 88,1 globlastp 4691 LYD513 kiwi|gb166|FG483390_P1 10990 648 88,1 globlastp 4692 LYD513 melon|10v1|IEB714648_P1 10986 648 88,1 globlastp 4693 LYD513 momordica|10v1|SRR071315S0000738_P1 10986 648 88,1 globlastp 4694 LYD513 safflower|gb162|EL372581 10988 648 88,1 globlastp 4695 LYD513 euphorbia|11v1|DV120709_P1 10991 648 88,0 globlastp 4696 LYD513 fagopyrum|11v1|SRR063689X101804_P1 10992 648 88,0 globlastp 4697 LYD513 fagopyrum|11v1|SRR063689X137119_P1 10993 648 88,0 globlastp 4698 LYD513 silene|11v1|GH291720_P1 10994 648 88,0 globlastp 4699 LYD513 tripterygium|11v1|SRR098677X207639_T1 10995 648 88,0 glotblastn 4700 LYD513 medicago|09v1|AW299173_P1 10996 648 88,0 globlastp 4701 LYD513 oat|11v1|GR356969_P1 10997 648 88,0 globlastp 4702 LYD513 spurge|gb161|DV112552 10991 648 88,0 globlastp 4703 LYD513 euonymus|11v1|SRR070038X102818_P1 10998 648 87,9 globlastp 4704 LYD513 sarracenia|11v1|SRR192669.115897_P1 10999 648 87,9 globlastp 4705 LYD513 sarracenia|11v1|SRR192669.117513_P1 11000 648 87,9 globlastp 4706 LYD513 tripterygium|11v1|SRR098677X117669_P1 11001 648 87,9 globlastp 4707 LYD513 avocado|10v1|CK754165_P1 11002 648 87,9 globlastp 4708 LYD513 chestnut|gb170|SRR006295S0002446_P1 11003 648 87,9 globlastp 4709 LYD513 gerbera|09v1|AJ750965_P1 11004 648 87,9 globlastp 4710 LYD513 jatropha|09v1|FM888130_T1 11005 648 87,9 glotblastn 4711 LYD513 nasturtium|10v1|GH163748 11006 648 87,9 globlastp 4712 LYD513 poplar|10v1|A1161664_P1 11007 648 87,9 globlastp 4713 LYD513 banana|10v1|ES433384_P1 11008 648 87,5 globlastp 4714 LYD513 oak|10v1|FP033752_P1 11009 648 87,5 globlastp 4715 LYD513 monkeyflower|10v1|DV209288_P1 11010 648 87,4 globlastp 4716 LYD513 catharanthus|11v1|EG561933_P1 11011 648 87,3 globlastp 4717 LYD513 cirsium|11v1|SRR346952.1011320_P1 11012 648 87,3 globlastp 4718 LYD513 cirsium|11v1|SRR346952.1308_P1 11013 648 87,3 globlastp 4719 LYD513 cucurbita|11v1|SRR091276X108522_P1 11014 648 87,3 globlastp 4720 LYD513 flaveria|11v1|SRR149229.116069_P1 11015 648 87,3 globlastp 4721 LYD513 flaveria|11v1|SRR149229.205952_P1 11015 648 87,3 globlastp 4722 LYD513 catharanthus|gb166|EG561933 11011 648 87,3 globlastp 4723 LYD513 centaureia|gb166|EH738083_P1 11012 648 87,3 globlastp 4724 LYD513 cichorium|gb171|DT211682_P1 11016 648 87,3 globlastp 4725 LYD513 cichorium|gb171|EH681294_P1 11017 648 87,3 globlastp

253 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 4726 LYD513 triphysaria|10v1|EY009373 11018 648 87,3 globlastp 4727 LYD513 euphorbia|11v1|SRR098678X101584_P1 11019 648 87,2 globlastp 4728 LYD513 phyla|11v2|SRR099035X139220_P1 11020 648 87,2 globlastp 4729 LYD513 trigonella|11v1|SRR066194X101552_P1 11021 648 87,2 globlastp 4730 LYD513 lettuce|10v1|DWO45182_P1 11022 648 87,2 globlastp 4731 LYD513 lettuce|10v1|DWO74978_P1 11022 648 87,2 globlastp 4732 LYD513 lettuce|10v1|DW104390_P1 11022 648 87,2 globlastp 4733 LYD513 lettuce|10v1|DW146249_P1 11022 648 87,2 globlastp 4734 LYD513 canola|11v1|CN726806_P1 11023 648 87,1 globlastp 4735 LYD513 canola|11v1|ES923924_P1 11023 648 87,1 globlastp 4736 LYD513 euphorbia|11v1|DV116672_P1 11024 648 87,1 globlastp 4737 LYD513 valeriana|11v1|SRR099039X13207_P1 11025 648 87,1 globlastp 4738 LYD513 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL008934_P1 11026 648 87,1 globlastp 4739 LYD513 arabidopsis|10v1|AT3G05560_P1 11027 648 87,1 globlastp 4740 LYD513 aristolochia|10v1|SRR039082S0099630_P1 11028 648 87,1 globlastp 4741 LYD513 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A2VUK_P1 11023 648 87,1 globlastp 4742 LYD513 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01B6F55_P1 11023 648 87,1 globlastp 4743 LYD513 b_rapa|gb162|BG544185_P1 11023 648 87,1 globlastp 4744 LYD513 b rapa|gb164|L33600_P1 11023 648 87,1 globlastp 4745 LYD513 canola|10v1|CD814674 11023 648 87,1 globlastp 4746 LYD513 chickpea|09v2|GR392656_P1 11029 648 87,1 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S001045 4747 LYD513 11030 648 87,1 globlastp 3_P1 4748 LYD513 cleome_spinosa|10v1|GR933127_P1 11031 648 87,1 globlastp 4749 LYD513 heritiera|10v1|SRR005795S0043155_P1 11032 648 87,1 globlastp 4750 LYD513 oak|10v1|FP042437_P1 11033 648 87,1 globlastp 4751 LYD513 oak|10v1|FP048829_P1 11033 648 87,1 globlastp 4752 LYD513 radish|gb164|EV539292 11023 648 87,1 globlastp 4753 LYD513 radish|gb164|EW715331 11023 648 87,1 globlastp 4754 LYD513 radish|gb164|EX749668 11023 648 87,1 globlastp 4755 LYD513 radish|gb164|EY896443 11023 648 87,1 globlastp 4756 LYD513 safflower|gb162|EL412119 11034 648 87,1 globlastp 4757 LYD513 strawberry|11v1|CO379765 11035 648 87,1 globlastp 4758 LYD513 grape|11v1|CB910723_T1 11036 648 86,7 glotblastn 4759 LYD513 Cirsium|11v1|SRR346952.1013899__P1 11037 648 86,6 globlastp 4760 LYD513 cleome_spinosa|10v1|GR931755_P1 11038 648 86,6 globlastp 4761 LYD513 eucalyptus|gb166|AJ627684 11039 648 86,6 globlastp 4762 LYD513 oil_palm|gb166|EL683006_P1 11040 648 86,6 globlastp 4763 LYD513 poplar|10v1|P3U884271_P1 11041 648 86,6 globlastp 4764 LYD513 vinca|11v1|SRR098690X101672_P1 11042 648 86,5 globlastp 4765 LYD513 cichorium|gb171|EH699592_P1 11043 648 86,5 globlastp 4766 LYD513 triphysaria|10v1|P3M357592 11044 648 86,5 globlastp 4767 LYD513 valeriana|11v1|SRR099039 X103182_P1 11045 648 86,4 globlastp 4768 LYD513 dandelion|10v1|DR401320_P1 11046 648 86,4 globlastp 4769 LYD513 tragopogon|10v1|SRR020205S0002082 11047 648 86,4 globlastp 4770 LYD513 triphysaria|10v1|P3M356849 11048 648 86,4 glotblastn 4771 LYD513 triphysaria|10v1|EY010714 11049 648 86,4 globlastp 4772 LYD513 cirsium|11v1|SRR346952.10 00538XX2Pl 11050 648 86,3 globlastp 4773 LYD513 euonymus|11v1|SRR0700 38X183713_P1 11051 648 86,3 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN775739_P 4774 LYD513 11052 648 86,3 globlastp 1 4775 LYD513 thellungiella_parvulum|11v1|EC598 950_P1 11053 648 86,3 globlastp 4776 LYD513 tripterygium|11v1|SRR0986 77X120515_P1 11054 648 86,3 globlastp 4777 LYD513 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A9KGR 2_P1 11055 648 86,3 globlastp 4778 LYD513 b_oleracea|gb161|DY025774_P1 11055 648 86,3 globlastp 4779 LYD513 b_oleracea|gb161|DY027332_P1 11056 648 86,3 globlastp 4780 LYD513 b rapa|gb162|BQ791532_P1 11055 648 86,3 globlastp 4781 LYD513 b rapa|gb162|CA991981_P1 11055 648 86,3 globlastp 4782 LYD513 b rapa|gb162|CX270100_P1 11055 648 86,3 globlastp 4783 LYD513 bean|gb167|CA897526_P1 11057 648 86,3 globlastp 4784 LYD513 canola|10v1|CD818310 11055 648 86,3 globlastp 4785 LYD513 canola|11v1|CN730374_P1 11055 648 86,3 globlastp

254 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 4786 LYD513 canola|10v1|CD819566 11055 648 86,3 globlastp 4787 LYD513 canola|10v1|CD820104 11055 648 86,3 globlastp 4788 LYD513 canola|10v1|CN733264 11055 648 86,3 globlastp 4789 LYD513 centaureia|gb166|EH733393_P1 11050 648 86,3 globlastp 4790 LYD513 cotton|10v2|DT456488_P1 11058 648 86,3 globlastp 4791 LYD513 eschscholzia|10v1|SRR014116S000884 11059 648 86,3 globlastp 4792 LYD513 kiwi|gb166|FG497891_P1 11060 648 86,3 globlastp 4793 LYD513 liquorice|gb171|FS242310_P1 11061 648 86,3 globlastp 4794 LYD513 petunia|gb171|CV299644_P1 11062 648 86,3 globlastp 4795 LYD513 radish|gb164|EV526770 11055 648 86,3 globlastp 4796 LYD513 radish|gb164|EV537012 11055 648 86,3 globlastp 4797 LYD513 radish|gb164|EV537498 11055 648 86,3 globlastp 4798 LYD513 radish|gb164|EV544085 11055 648 86,3 globlastp 4799 LYD513 radish|gb164|EV545505 11055 648 86,3 globlastp 4800 LYD513 radish|gb164|EV546676 11055 648 86,3 globlastp 4801 LYD513 radish|gb164|EW714839 11055 648 86,3 globlastp 4802 LYD513 radishgb164 EW715509 11055 648 86,3 globlastp 4803 LYD513 radishgb164 EW725328 11055 648 86,3 globlastp 4804 LYD513 rose|10v1|P31978841 11063 648 86,3 globlastp 4805 LYD513 soybean|11v1|GLYMA10G02270 11064 648 86,3 globlastp 4806 LYD513 thellungiella|gb167|DN775739 11052 648 86,3 globlastp 4807 LYD513 canola|11v1|CN733264_P1 11055 648 86,3 globlastp 4808 LYD513 oil_palm|gb166|CN600309_P1 11065 648 85,9 globlastp 4809 LYD513 cassava|09v1|DV453183_P1 11066 648 85,8 globlastp 4810 LYD513 ambrosia|11v1|SRR3469 35.123036_P1 11067 648 85,7 globlastp 4811 LYD513 cirsium|11v1|SRR346952.10 0262_P 1 11068 648 85,7 globlastp 4812 LYD513 cucurbita|11v1|SRR09127 6X100174_P1 11069 648 85,7 globlastp 4813 LYD513 flaveria|11v1|SRR149232.112266_P 1 11070 648 85,7 globlastp 4814 LYD513 silene|11v1|GH294013_P1 11071 648 85,7 globlastp 4815 LYD513 silene|11v1|SRR096785X10 7257_P1 11072 648 85,7 globlastp 4816 LYD513 dandelion|10v1|DR400419_P1 11073 648 85,7 globlastp 4817 LYD513 monkeyflower|10v1|DV210787_P1 11074 648 85,7 globlastp 4818 LYD513 ambrosia|11v1|SRR346943.107981_P1 11075 648 85,6 globlastp 4819 LYD513 euonymus|11v1|SRR070038X167266_P1 11076 648 85,6 globlastp 4820 LYD513 artemisia|10v1|EY034618_P1 11077 648 85,6 globlastp 4821 LYD513 ipomoea_batatas|10v1|BU690301_P1 11078 648 85,6 globlastp 4822 LYD513 ipomoea_ni|10v1|BJ553701_P1 11079 648 85,6 globlastp 4823 LYD513 poppy|gb166|FE964142_T1 11080 648 85,6 glotblastn 4824 LYD513 canola|11v1|CN731617_P1 11081 648 85,5 globlastp 4825 LYD513 euphorbia|11v1|SRR098678X108946_P1 11082 648 85,5 globlastp 4826 LYD513 primula|11v1|SRR098679X101049_P1 11083 648 85,5 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN773945_P 4827 LYD513 11084 648 85,5 globlastp 1 4828 LYD513 trigonella|11v1|SRR066194X107369_P1 11085 648 85,5 globlastp 4829 LYD513 acacia|10v1|FS589355_P1 11086 648 85,5 globlastp 4830 LYD513 arabidopsis_lyrata|09v1|JGI AL022456_P1 11087 648 85,5 globlastp 4831 LYD513 arabidopsis|10v1|AT5G27770_P1 11088 648 85,5 globlastp 4832 LYD513 artemisia|10v1|EY043319_P1 11089 648 85,5 globlastp 4833 LYD513 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01B7ZG3_P1 11090 648 85,5 globlastp 4834 LYD513 b_oleracea|gb161|AM057350_P1 11081 648 85,5 globlastp 4835 LYD513 canola|10v1|CD820346 11081 648 85,5 globlastp 4836 LYD513 canola|10v1|CD842102 11091 648 85,5 globlastp 4837 LYD513 liriodendron|gb166|FD500754_P1 11092 648 85,5 globlastp 4838 LYD513 lotus|09v1|CN825035_P1 11093 648 85,5 globlastp 4839 LYD513 medicago|09v1|AW686909_P1 11094 648 85,5 globlastp 4840 LYD513 nasturtium|10v1|GH163533 11095 648 85,5 globlastp 4841 LYD513 orobanche|10v1|SRR02318950004713_P1 11096 648 85,5 globlastp 4842 LYD513 petunia|gb171|DW177169_P1 11097 648 85,5 globlastp 4843 LYD513 radish|gb164|FD537267 11098 648 85,5 globlastp 4844 LYD513 soybean|11v1|GLYMA02G02140 11099 648 85,5 globlastp 4845 LYD513 strawberry|11v1|C0817747 11100 648 85,5 globlastp 4846 LYD513 sunflower|10v1|CX947850 11101 648 85,5 globlastp

255 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 4847 LYD513 thellungiella|gb167|DN773945 11084 648 85,5 globlastp 4848 LYD513 triphysaria|10v1|EX992272 11102 648 85,5 globlastp 4849 LYD513 canola|11v1|CN737195_P1 11091 648 85,5 globlastp 4850 LYD513 platanus|11v1|SRR096786X103173_T1 11103 648 85,5 glotblastn amorphophallus|11v2|SRR089351X105406_ 4851 LYD513 11104 648 85,3 globlastp P1 4852 LYD513 eucalyptus|11v2|AJ627684_P1 11105 648 85,2 globlastp 4853 LYD513 orobanche|10v1|SRR02318950046512_P1 11106 648 85,2 globlastp 4854 LYD513 ipomoeni|10v1|BJ558924_P1 11107 648 85,0 globlastp 4855 LYD513 tobacco |gb162|DWO04847 11108 648 85,0 globlastp 4856 LYD513 humulus|11v1|SRR098683X107472_T1 11109 648 84,9 glotblastn 4857 LYD513 flaveria|11v1|SRR149229.11 765_P1 11110 648 84,9 globlastp flaveria|11v1|SRR149229,381866_ 4858 LYD513 11110 648 84,9 globlastp 1 4859 LYD513 flaveria|11v1|SRR149232.123700_P1 11110 648 84,9 globlastp 4860 LYD513 flaveria|11v1|SRR149241.109921_P1 11110 648 84,9 globlastp 4861 LYD513 basilicum|10v1|DY340275_P1 11111 648 84,9 globlastp 4862 LYD513 dandelion|10v1|G0663210_P1 11112 648 84,9 globlastp 4863 LYD513 gerbera|09v1|AJ754474_P1 11113 648 84,9 globlastp 4864 LYD513 guizotia|10v1|GE554678_P1 11114 648 84,9 globlastp 4865 LYD513 lettuce|10v1|DWO78767_P1 11115 648 84,9 globlastp 4866 LYD513 salvia|10v1|CV163820 11116 648 84,9 globlastp 4867 LYD513 zinnia|gb171|AU285493 11117 648 84,9 globlastp 4868 LYD513 ginseng|10v1|GR873119_P1 11118 648 84,8 globlastp 4869 LYD513 tamarix|gb166|EB187196 11119 648 84,8 globlastp 4870 LYD513 arnica|11v1|SRR099034X186262_P 1 11120 648 84,7 globlastp 4871 LYD513 flaveria|11v1|SRR149244.12 975_P1 11121 648 84,7 globlastp 4872 LYD513 aristolochia|10v1|SRR039082S0078402_P1 11122 648 84,7 globlastp 4873 LYD513 nuphar|gb166|CD472395_P1 11123 648 84,7 globlastp 4874 LYD513 sunflower|10v1|CD853275 11124 648 84,7 globlastp 4875 LYD513 tobacco|gb162|B0842942 11125 648 84,7 globlastp 4876 LYD513 triphysaria|10v1|EY142731 11126 648 84,7 globlastp 4877 LYD513 lettuce|10v1|DW110372_T1 11127 648 84,7 glotblastn 4878 LYD513 flax|09v1|EH792319 11128 648 84,4 globlastp 4879 LYD513 flax|11v1|EH792319_P1 11128 648 84,4 globlastp 4880 LYD513 plantago|11v1|SRR066373X 104296_T1 11129 648 84,3 glotblastn 4881 LYD513 lettuce|10v1|DWO62884_T1 11130 648 84,1 glotblastn 4882 LYD513 flaveria|11v1|SRR149229.120812_P1 11131 648 84,1 globlastp 4883 LYD513 phyla|11v2|SRR099037X103352_P1 11132 648 84,1 globlastp 4884 LYD513 aquilegia|l0v2|DT734083_P1 11133 648 84,1 globlastp 4885 LYD513 euonymus|11v1|SRR070038 X106335_P1 11134 648 84,0 globlastp 4886 LYD513 tomato|11v1|BG123154_P1 11135 648 84,0 globlastp 4887 LYD513 basilicum|10v1|DY339120_P1 11135 648 84,0 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S001390 4888 LYD513 11136 648 84,0 globlastp 1_P1 4889 LYD513 cleome_spinosa|10v1|GR933436_P1 11137 648 84,0 globlastp nicotiana_benthamiana|gb162|CN746206_P 4890 LYD513 11138 648 84,0 globlastp 1 4891 LYD513 solanum_phureja|09v1|SPHBG123145 11135 648 84,0 globlastp 4892 LYD513 sunflower|10v1|CD851298 11139 648 84,0 globlastp 4893 LYD513 tobacco|gb162|BP192546 11138 648 84,0 globlastp 4894 LYD513 tomato|09v1|BG123154 11135 648 84,0 globlastp 4895 LYD513 euphorbia|11v1|BP957759_P1 11140 648 83,9 globlastp 4896 LYD513 platanus|11v1|SRR096786X116699_P1 11141 648 83,9 globlastp 4897 LYD513 thellungiella_parvulum|11v1|DN775739_P1 11142 648 83,9 globlastp 4898 LYD513 eucalyptus|11v2|ES591058_P1 11143 648 83,9 globlastp 4899 LYD513 eucalyptus|gb166|ES591058 11143 648 83,9 globlastp 4900 LYD513 sunflower|10v1|CD845654 11144 648 83,9 globlastp 4901 LYD513 sunflower|10v1|CD849620 11145 648 83,9 globlastp 4902 LYD513 triphysaria|10v1|BM356487 11146 648 83,9 globlastp 4903 LYD513 triphysaria|10v1|DR175698 11146 648 83,9 globlastp 4904 LYD513 euonymus|11v1|SRR070038X339241_T1 11147 648 83,9 glotblastn

256 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 4905 LYD513 sarracenia|11v1|SRR192669.318604_T1 11148 648 83,9 glotblastn 4906 LYD513 ambrosia|11v1|SRR346935.208559_T1 - 648 83,9 glotblastn 4907 LYD513 flax|11v1|JG030757_P1 11149 648 83,6 globlastp 4908 LYD513 oat|11v1|CN814675_P1 11150 648 83,6 globlastp 4909 LYD513 foxtail_millet|11v3|SIPRD089234_Ti 11151 648 83,6 glotblastn 4910 LYD513 plantago|11v1|SRR066373X 107650_P1 11152 648 83,5 globlastp 4911 LYD513 thalictrum|11v1|3SRR0967 87X14295_P1 11153 648 83,5 globlastp 4912 LYD513 nicotiana_benthamiana|gb162|ES884410_P1 11154 648 83,5 globlastp 4913 LYD513 phyla|11v2|SRR099037X164099_T1 11155 648 83,3 glotblastn foxtail_millet|10v2|OXFXTRMSLX 4914 LYD513 11156 648 83,3 glotblastn 01026417D1T1 4915 LYD513 sorghum|09v1|SB02G042710 11157 648 83,3 glotblastn 4916 LYD513 sorghum|11v1|SBO2G042710_T1 11157 648 83,3 glotblastn tabernaemontana|11v1|SR 4917 LYD513 11158 648 83,3 globlastp R098689X109700_P1 4918 LYD513 chickpea109v21EH058965_P1 11159 648 83,3 globlastp 4919 LYD513 utricularia|11v1|SRR094438.102262_P1 11160 648 83,2 globlastp 4920 LYD513 senecio|gb170|DY659748 11161 648 83,2 globlastp 4921 LYD513 ambrosia|11v1|SRR346943.136934_P1 11162 648 83,1 globlastp 4922 LYD513 canola|11v1|EG019879_P1 11163 648 83,1 globlastp 4923 LYD513 euphorbia|11v1|DV112552_P1 11164 648 83,1 globlastp 4924 LYD513 artemisia|10v1|SRR019254S0007751_P1 11165 648 83,1 globlastp 4925 LYD513 b_rapa|gb162|EX116552_P1 11166 648 83,1 globlastp 4926 LYD513 canola|10v1|EE472617 11166 648 83,1 globlastp 4927 LYD513 ginger|gb164|DY357661_P1 11167 648 83,1 globlastp 4928 LYD513 liriodendron|gb166|FD498270_P1 11168 648 83,1 globlastp 4929 LYD513 papaya|gb165|EX274892_P1 11169 648 83,1 globlastp 4930 LYD513 switchgrass|gb167|FE635043 11170 648 83,1 globlastp 4931 LYD513 castorbean|11v1|RCPRD041500_T1 11171 648 83,1 glotblastn 4932 LYD513 sarracenia|11v1|SRR192669.110146_T1 11172 648 83,1 glotblastn 4933 LYD513 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01DREF_T1 11173 648 83,1 glotblastn 4934 LYD513 cacao|10v1|CU492790_T1 11174 648 83,1 glotblastn 4935 LYD513 phalaenopsis|11v1|CB034569_P1 11175 648 82,9 globlastp 4936 LYD513 fescue|gb161|CK801857_P1 11176 648 82,9 globlastp 4937 LYD513 oat|10v2|CN814675 11177 648 82,9 globlastp 4938 LYD513 oat|11v1|CN814914_P1 11177 648 82,9 globlastp 4939 LYD513 flax|11v1|JG032172_P1 11178 648 82,8 globlastp 4940 LYD513 flax|11v1|JG036696_P1 11178 648 82,8 globlastp 4941 LYD513 tea|10v1|CV013672 11179 648 82,7 globlastp 4942 LYD513 phyla|11v2|SRR099037X100949_P1 11180 648 82,5 globlastp 4943 LYD513 silene|11v1|SRR096785X108457_P1 11181 648 82,5 globlastp 4944 LYD513 radish|gb164|EV565633 11182 648 82,5 globlastp 4945 LYD513 utricularia|11v1|SRR094438.104017_T1 11183 648 82,4 glotblastn 4946 LYD513 antirrhinum|gb166|AJ560256_P1 11184 648 82,4 globlastp 4947 LYD513 foxtail_millet|10v2|SICRP010615 11185 648 82,4 globlastp 4948 LYD513 foxtail_millet|11v3|EC612466_P1 11185 648 82,4 globlastp 4949 LYD513 pepper|gb171|BM062566_P1 11186 648 82,4 globlastp 4950 LYD513 salvia|10v1|SRR014553S0000183 11187 648 82,4 globlastp 4951 LYD513 nuphar|gb166|CK759983_P1 11188 648 82,3 globlastp 4952 LYD513 rice|gb170|0S07G47710 11189 648 82,3 globlastp 4953 LYD513 arnica|11v1|SRR099034X286991_T1 11190 648 82,3 glotblastn 4954 LYD513 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1017052_P1 11191 648 82,2 globlastp 4955 LYD513 barley|10v2|BE413243_P1 11192 648 82,2 globlastp 4956 LYD513 pseudoroegneria|gb167|FF361979 11193 648 82,2 globlastp 4957 LYD513 wheat|10v2|BE438494 11194 648 82,2 globlastp 4958 LYD513 pigeonpea|10v1|SRR054580S0109025_P1 11195 648 82,1 globlastp 4959 LYD513 sorghum|11v1|SBPRD033047_T1 11196 648 82,0 glotblastn 4960 LYD513 flax|11v1|JG020520_P1 11197 648 82,0 globlastp 4961 LYD513 fraxinus|11v1|FR640720_P1 11198 648 82,0 globlastp 4962 LYD513 fraxinus|11v1|SRR058827.104308_P1 11198 648 82,0 globlastp 4963 LYD513 primula|11v1|SRR098679X100264_P1 11199 648 81,9 globlastp 4964 LYD513 ipomoea_batatas|10v1|P3U692408_ P1 11200 648 81,9 globlastp

257 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 4965 LYD513 sorghum|09v1|SB01G035740 11201 648 81,8 globlastp 4966 LYD513 sorghum|11v1|SB01G035740_P1 11201 648 81,8 globlastp 4967 LYD513 oat|11v1|G0586090_T1 11202 648 81,8 glotblastn 4968 LYD513 amsonia|11v1|SRR098688X105388_P1 11203 648 81,7 globlastp 4969 LYD513 millet|10v1|CD725800_P1 11204 648 81,7 globlastp 4970 LYD513 rice|gb170|OS03G22340 11205 648 81,7 globlastp 4971 LYD513 tomato|11v1|BG127881_P1 11206 648 81,6 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000210 4972 LYD513 11207 648 81,6 globlastp 4_P1 4973 LYD513 potato|10v1|P31405294_P1 11208 648 81,6 globlastp 4974 LYD513 tobacco|gb162|DWO02267 11209 648 81,6 globlastp 4975 LYD513 tobacco|gb162|DWO04318 11210 648 81,6 globlastp 4976 LYD513 eggplant|10v1|FS005422_P1 11211 648 81,5 globlastp 4977 LYD513 gerbera|09v1|AJ758281_P1 11212 648 81,5 globlastp 4978 LYD513 fraxinus|11v1|SRR058827.109256_P1 11213 648 81,2 globlastp 4979 LYD513 fraxinus|11v1|SRR058827.130491_P1 11214 648 81,2 globlastp 4980 LYD513 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1852735_P1 11215 648 81,2 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S003535 4981 LYD513 11216 648 81,2 globlastp 3_P1 4982 LYD513 ipomoea_ni|10v1|3J554710_P1 11217 648 81,2 globlastp 4983 LYD513 fagopyrum|11v1|SRR063703X132889_P1 11218 648 81,1 globlastp 4984 LYD513 vinca|11v1|SRR098690X103207XX2_P1 11219 648 81,1 globlastp 4985 LYD513 foxtail_millet|11v3|PHY7SI031166M_P1 11220 648 81,1 globlastp 4986 LYD513 sugarcane|10v1|P3Q537517 11221 648 81,1 glotblastn 4987 LYD513 scabiosa|11v1|SRR063723X104698_P1 11222 648 81,0 globlastp 4988 LYD513 maize|10v1|A1586735_T1 11223 648 81,0 glotblastn 4989 LYD513 wheat|10v2|CA625957 11224 648 81,0 glotblastn 4990 LYD513 brachypodium|09v1|PDV479913_P1 11225 648 80,9 globlastp 4991 LYD513 cowpea|gb166|FC458088_P1 11226 648 80,9 globlastp 4992 LYD513 fescue|gb161|DT704464_P1 11227 648 80,9 globlastp 4993 LYD513 switchgrass|gb167|DN152088 11228 648 80,9 globlastp 4994 LYD513 switchgrass|gb167|FE607604 11228 648 80,9 globlastp 4995 LYD513 wheat|10v2|E3E419847 11227 648 80,9 globlastp 4996 LYD513 wheat|10v2|CA703682 11227 648 80,9 globlastp 4997 LYD513 utricularia|11v1|SRR094438.102360_P1 11229 648 80,8 globlastp 4998 LYD513 antirrhinum|gb166|AJ787272_P1 11230 648 80,8 globlastp 4999 LYD513 eggplant|10v1|FS001420_P1 11231 648 80,8 globlastp 5000 LYD513 eggplant|10v1|FS001889_P1 11232 648 80,8 globlastp 5001 LYD513 pepper|gb171|P3M062891_P1 11233 648 80,8 globlastp 5002 LYD513 podocarpus|10v1|SRR065014S0004051_T1 11234 648 80,8 glotblastn 5003 LYD513 potato|10v1|BG589386_P1 11235 648 80,8 globlastp 5004 LYD513 potato|10v1|CV473538_P1 11236 648 80,8 globlastp 5005 LYD513 solanum_phureja|09v1|SPHBG127881 11235 648 80,8 globlastp 5006 LYD513 sugarcane|10v1|CA076925 11237 648 80,8 glotblastn 5007 LYD513 maritime_pine|10v1|P3X251669_T1 11238 648 80,7 glotblastn 5008 LYD513 b_juncea|10v2|OXBJ1SLX00006068T1_T1 11239 648 80,7 glotblastn 5009 LYD513 pine|10v2|A1920012_T1 11240 648 80,7 glotblastn 5010 LYD513 pine|10v2|BG039375_T1 11240 648 80,7 glotblastn 5011 LYD513 ambrosia|11v1|SRR346949.173596_P1 11241 648 80,6 globlastp 5012 LYD513 amborella|gb166|CK764554_P1 11242 648 80,6 globlastp 5013 LYD513 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A6MR5_P1 11243 648 80,6 globlastp 5014 LYD513 curcuma|10v1|PDY395181_P1 11244 648 80,6 globlastp 5015 LYD513 tomato|09v1|BG127881 11245 648 80,6 globlastp 5016 LYD513 antirrhinum|gb166|AJ558298_P1 11246 648 80,5 globlastp 5017 LYD513 eucalyptus|11v2|SRR001659X114529_T1 11247 648 80,5 glotblastn 5018 LYD513 olea|11v1|SRR014463.29613_P1 11248 648 80,3 globlastp 5019 LYD513 cleome_spinosa|10v1|GR933371_P1 11249 648 80,3 globlastp 5020 LYD513 millet|10v1|CD726035_P1 11250 648 80,3 globlastp 5021 LYD513 onion|gb162|CF437957_T1 11251 648 80,2 glotblastn 5022 LYD513 barley|10v2|E3G300003XX1_T1 11252 648 80,2 glotblastn 5023 LYD513 wheat|10v2|E3E492748 11253 648 80,2 glotblastn 5024 LYD515 soybean|11v1|GLYMA17G03590 11254 650 88,5 globlastp

258 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 5025 LYD516 soybean|11v1|GLYMA07G32560 11255 651 99,2 globlastp 5026 LYD516 pigeonpea|10v1|SRR054580S0031019_P1 11256 651 98,4 globlastp 5027 LYD516 trigonella|11v1|SRR066194X204873_P1 11257 651 93,8 globlastp 5028 LYD516 peanut|10v1|SRR042413S0063230_P1 11258 651 92,2 globlastp 5029 LYD516 medicago|09v1|CX530843_P1 11259 651 90,9 globlastp 5030 LYD516 heritiera|10v1|SRR005795S0009199_T1 11260 651 90,5 glotblastn 5031 LYD516 oak|10v1|FP025273_P1 11261 651 90,5 globlastp 5032 LYD516 poplar|10v1|AI165993_P1 11262 651 90,1 globlastp 5033 LYD516 cacao|10v1|1CU508547_P1 11263 651 89,3 globlastp 5034 LYD516 cassava|09v1|DV446232_P1 11264 651 89,3 globlastp 5035 LYD516 grape|11v1|GSVIVT01008672001_P1 11265 651 89,3 globlastp 5036 LYD516 grape|gb160|CB970785 11265 651 89,3 globlastp 5037 LYD516 eucalyptus|11v2|SRR001658X12485_P1 11266 651 89,0 globlastp 5038 LYD516 sarracenia|11v1|SRR192669.104550_T1 11267 651 88,9 glotblastn 5039 LYD516 euonymus|11v1|SRR070038X536114_P1 11268 651 88,9 globlastp 5040 LYD516 aquilegia|10v2|JGIAC016826_P1 11269 651 88,9 globlastp 5041 LYD516 castorbean|09v1|PE260562 11270 651 88,9 globlastp 5042 LYD516 citrus|gb166|CF507311_P1 11271 651 88,9 globlastp 5043 LYD516 castorbean|11v1|PE260562_T1 11272 651 88,9 glotblastn 5044 LYD516 cirsium|11v1|SRR346952.1009815_P1 11273 651 88,5 globlastp 5045 LYD516 clementine|11v1|CF507311_P1 11274 651 88,5 globlastp 5046 LYD516 orange|11v1|CF507311_P1 11274 651 88,5 globlastp 5047 LYD516 cotton|10v2|DW518809_P1 11275 651 88,5 globlastp 5048 LYD516 poplar|10v1|CA823401_P1 11276 651 88,5 globlastp 5049 LYD516 strawberry|11v1|DV438628 11277 651 88,5 globlastp 5050 LYD516 sunflower|10v1|CD853568 11278 651 88,5 globlastp 5051 LYD516 cannabis|12v1|SOLX00016295_P1 11279 651 88,1 globlastp 5052 LYD516 cannabis|12v1|SOLX00022534_P1 11279 651 88,1 globlastp 5053 LYD516 cirsium|11v1|SRR346952.1053287_P1 11280 651 88,1 globlastp 5054 LYD516 tripterygium|11v1|SRR098677X167643_P1 11281 651 88,1 globlastp 5055 LYD516 watermelon|11v1|AM721327_P1 11282 651 88,1 globlastp 5056 LYD516 antirrhinum|gb166|AJ558491_P1 11283 651 88,1 globlastp 5057 LYD516 eggplant|10v1|IFS043100_P1 11284 651 88,1 globlastp 5058 LYD516 nasturtium|10v1|ISRR032558S0020529 11285 651 88,1 globlastp 5059 LYD516 triphysaria|10v1|PY135917 11286 651 88,1 globlastp 5060 LYD516 lotus|09v1|LLGO008293_T1 11287 651 88,1 glotblastn 5061 LYD516 flaveria|11v1|SRR149229.125238_P1 11288 651 87,7 globlastp 5062 LYD516 humulus|11v1|PX520638_P1 11289 651 87,7 globlastp 5063 LYD516 phyla|11v2|SRR0199035X138404_P 11290 651 87,7 globlastp 5064 LYD516 valeriana|11v1|SRR099039X126752_P1 11291 651 87,7 globlastp 5065 LYD516 monkeyflower|10v1|G0988970_P1 11292 651 87,7 globlastp 5066 LYD516 potato|10v1|P3Q518483_P1 11293 651 87,7 globlastp 5067 LYD516 solanum_phureja|09v1|SPHBG133348 11293 651 87,7 globlastp 5068 LYD516 amsonia|11v1|SRR098688X127436_T1 11294 651 87,5 glotblastn 5069 LYD516 euphorbia|11v1|DV132990_P1 11295 651 87,3 globlastp 5070 LYD516 tomato|11v1|BG133348_P1 11296 651 87,3 globlastp 5071 LYD516 flaveria|11v1|SRR149232.166080_P1 11297 651 87,2 globlastp 5072 LYD516 apple|11v1|1CN581445_P1 11298 651 87,2 globlastp 5073 LYD516 apple|gb171|CN581445 11298 651 87,2 globlastp 5074 LYD516 pepper|gb171|P3M064603_P1 11299 651 87,2 globlastp 5075 LYD516 tragopogon|10v1|SRR020205S0056237 11300 651 87,2 globlastp 5076 LYD516 ambrosia|11v1|SRR346935.211093_P1 11301 651 86,9 globlastp 5077 LYD516 ipomoea_ni|10v1|CJ750723_P1 11302 651 86,9 globlastp 5078 LYD516 ambrosia|11v1|SRR346935.107584_P1 11303 651 86,8 globlastp 5079 LYD516 annea|11v1|SRR099034X166025_P1 11304 651 86,8 globlastp 5080 LYD516 phyla|11v2|SRR099037X123707_P1 11305 651 86,8 globlastp 5081 LYD516 fagopyrum|11v1|SRR063689X100235_P1 11306 651 86,4 globlastp 5082 LYD516 cichorium|gb171|EH686475_P1 11307 651 86,4 globlastp 5083 LYD516 cucumber|09v1|AM721327_P1 11308 651 86,4 globlastp 5084 LYD516 dandelion|10v1|DY816266_P1 11309 651 86,4 globlastp 5085 LYD516 foxtail_millet|10v2|SICRP000764 11310 651 86,4 globlastp 5086 LYD516 foxtail_millet|11v3|PHY7SI037228M_P1 11310 651 86,4 globlastp

259 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 5087 LYD516 orobanche|10v1|SRR02318950025641_P1 11311 651 86,4 globlastp 5088 LYD516 tobacco|gb162|EB446786 11312 651 86,4 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111006 5089 LYD516 11313 651 86,2 globlastp 704_P1 5090 LYD516 artemisia|10v1|SRR019254S0000716_P1 11314 651 86,1 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP003771 5091 LYD516 11315 651 86,0 globlastp _P1 5092 LYD516 radish|gb164|EV526582 11316 651 86,0 globlastp 5093 LYD516 sorghum|09v1|SB01G002910 11317 651 86,0 globlastp 5094 LYD516 sorghum|11v1|SB01G002910_P1 11317 651 86,0 globlastp 5095 LYD516 sugarcane|10v1|CA080466 11318 651 86,0 globlastp 5096 LYD516 switchgrass|gb167|DN151337 11319 651 86,0 globlastp 5097 LYD516 switchgrass|gb167|FL906279 11320 651 86,0 globlastp 5098 LYD516 barley|10v2|E3G343745_P1 11321 651 85,7 globlastp 5099 LYD516 wheat|10v2|E3E490237 11322 651 85,7 globlastp 5100 LYD516 tomato|09v1|BG133348 11323 651 85,5 globlastp 5101 LYD516 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL002170_P1 11324 651 85,4 globlastp 5102 LYD516 centaureia|gb166|EH763345_P1 11325 651 85,2 globlastp 5103 LYD516 lettuce|10v1|DWO90930_P1 11326 651 85,2 globlastp 5104 LYD516 flaveria|11v1|SRR149232.112380_T1 11327 651 85,2 glotblastn amorphophallus|11v2|SRR089351X118179_ 5105 LYD516 11328 651 85,1 globlastp P1 5106 LYD516 canola|11v1|EE492115XX2_P1 11329 651 85,0 globlastp 5107 LYD516 arabidopsis|10v1|AT1G20575_P1 11330 651 85,0 globlastp 5108 LYD516 b rapa|gb162|DN192163_P1 11331 651 85,0 globlastp 5109 LYD516 canola|10v1|IEG020521 11331 651 85,0 globlastp 5110 LYD516 canola|11v1|EG020521_P1 11331 651 85,0 globlastp 5111 LYD516 millet|10v1|IEV0454PM004940_P1 11332 651 84,8 globlastp 5112 LYD516 rice|gb170|0S03G60939 11333 651 84,4 globlastp 5113 LYD516 guizotia|10v1|GE574338_T1 11334 651 84,4 glotblastn 5114 LYD516 barley|10v2|E31954789_P1 11335 651 84,1 globlastp 5115 LYD516 cucurbita|11v1|SRR091276X104098_P1 11336 651 83,7 globlastp 5116 LYD516 sunflower|10v1|DY912431 11337 651 83,7 globlastp 5117 LYD516 cotton|10v2|SRRO3P12367S0053467_P1 11338 651 83,2 globlastp 5118 LYD516 fraxinus|11v1|SRR058827.140800_P1 11339 651 82,4 globlastp 5119 LYD516 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1162821_P1 11340 651 82,3 globlastp 5120 LYD516 brachypodium|09v1|DV480052_P1 11341 651 82,0 globlastp 5121 LYD516 cynara|gb167|GE592012_P1 11342 651 81,5 globlastp 5122 LYD516 pea|11v1|FG535481_P1 11343 651 81,5 globlastp 5123 LYD516 sciadopitys|10v1|ISRR065035S0111756 11344 651 81,5 globlastp 5124 LYD516 sequoia|10v1|SRR065044S0071394 11345 651 81,5 glotblastn 5125 LYD516 prunus|10v1|CN581445 11346 651 81,3 globlastp 5126 LYD516 pine|10v2|C0161942_P1 11347 651 81,2 globlastp 5127 LYD516 spruce|gb162|DR480179 11348 651 81,2 globlastp 5128 LYD516 cirsium|11v1|SRR346952.104906_P1 11349 651 80,7 globlastp 5129 LYD516 rose|10v1|P3Q104509 11350 651 80,3 glotblastn 5130 LYD516 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0144926 11351 651 80,2 globlastp 5131 LYD517 soybean|11v1|GLYMA13G32400 11352 652 98,9 globlastp 5132 LYD517 cowpea|gb166|FF383594_P1 11353 652 97,9 globlastp 5133 LYD517 bean|gb167|CV543950_T1 11354 652 94,7 glotblastn 5134 LYD517 soybean|11v1|GLYMA01G35880 11355 652 92,6 globlastp 5135 LYD517 soybean|11v1|GLYMA15G19490 11356 652 92,6 globlastp 5136 LYD517 liquorice|gb171|FS243082_P1 11357 652 90,4 globlastp 5137 LYD517 pigeonpea|10v1|SRR054580S0027041_P1 11358 652 90,4 globlastp 5138 LYD517 trigonella|11v1|SRR066194X109349_P1 11359 652 83,3 globlastp 5139 LYD517 medicago|09v1|BE998971_P1 11360 652 81,1 globlastp 5140 LYD517 medicago|09v1|LEY475311_P1 11361 652 81,1 globlastp 5141 LYD517 lotus|09v1|LAW719440_P1 11362 652 80,9 globlastp 5142 LYD518 soybean|11v1|GLYMA09G37680 11363 653 90,8 globlastp 5143 LYD519 soybean|11v1|GLYMA17G13880 11364 654 97,1 globlastp 5143 LYD446 soybean|11v1|GLYMA17G13880 11364 759 80,7 globlastp 5144 LYD519 pigeonpea|10v1|SRR054580S0003918_P1 11365 654 90,0 globlastp

260 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 5144 LYD446 pigeonpea|10v1|SRR054580S0003918_T1 11365 759 80,1 glotblastn 5145 LYD519 medicago|09v1|AA660841_P1 11366 654 87,6 globlastp 5145 LYD446 medicago|09v1|AA660841_P1 11366 759 81,7 globlastp 5146 LYD519 trigonella|11v1|SRR066194X285692_P1 11367 654 86,9 globlastp 5146 LYD446 trigonella|11v1|SRR066194X285692_P1 11367 759 82,1 globlastp 5147 LYD519 bean|gb167|FE899248_P1 11368 654 81,7 globlastp 5147 LYD446 bean|gb167|FE899248_P1 11368 759 92,0 globlastp 5148 LYD519 pigeonpea|10v1|SRR054580S0003417_P1 11369 654 80,5 globlastp 5148 LYD446 pigeonpea|10v1|SRR054580S0003417_P1 11369 759 92,0 globlastp 5149 LYD519 soybean|11v1|GLYMA04G37140 11370 654 80,2 globlastp 5149 LYD446 soybean|11v1|GLYMA04G37140 11370 759 95,4 globlastp 5150 LYD520 soybean|11v1|GLYMA14G26410 11371 655 97,5 globlastp 5151 LYD520 wheat|10v2|CA713308 11372 655 97,5 glotblastn 5152 LYD346 canola|10v1|SRR019558S0000508 11373 656 90,6 globlastp 5153 LYD346 canola|10v1|SRR019558S0000166 11374 656 82,4 globlastp 5154 LYD346 radish|gb164|1EX756745 11375 656 82,0 glotblastn 5155 LYD346 radish|gb164|EW735537 11376 656 80,0 glotblastn 5156 LYD347 radish|gb164|EW723638 11377 657 87,5 glotblastn 5157 LYD347 rice|gb170|0S06G29180 11378 657 83,6 glotblastn 5157 LYD382 rice|gb170|OS06G29180 11378 730 81,9 globlastp 5158 LYD347 barley|10v2|D88272_T1 11379 657 83,6 glotblastn 5158 LYD382 barley|10v2|D88272_P1 11379 730 80,4 globlastp 5159 LYD347 oat|11v1|CN816354_T1 11380 657 82,8 glotblastn 5159 LYD382 oat|11v1|CN816354_T1 11380 730 80,1 glotblastn 5160 LYD347 sorghum|11v1|SB10G016920_T1 11381 657 82,8 glotblastn 5161 LYD347 switchgrass|gb167|DN152535 11382 657 82,8 glotblastn 5161 LYD382 switchgrass|gb167|DN152535 11382 730 80,4 globlastp 5162 LYD347 wheat|10v2|BE399573 11383 657 82,8 glotblastn 5162 LYD382 wheat|10v2|BE399573 11383 730 80,6 globlastp 5163 LYD347 wheat|10v2|BE402330 11383 657 82,8 glotblastn 5163 LYD382 wheat|10v2|BE402330 11383 730 80,6 globlastp 5164 LYD347 oat|10v2|CN816354 11384 657 82,8 glotblastn 5164 LYD382 oat|10v2|CN816354 11384 730 80,4 glotblastn 5165 LYD347 beet|gb162|BQ584012_T1 11385 657 82,0 glotblastn 5166 LYD347 pineapple|10v1|C0730916_T1 11386 657 82,0 glotblastn 5167 LYD347 cenchrus|gb166|EB656212_T1 11387 657 82,0 glotblastn 5167 LYD382 cenchrus|gb166|EB656212_T1 11387 730 81,9 glotblastn 5168 LYD347 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01B65C8_P1 11388 657 82,0 globlastp 5169 LYD347 momordica|10v1|EC612932_T1 11389 657 81,3 glotblastn 5170 LYD347 switchgrass|gb167|DN152447 11390 657 81,3 glotblastn 5170 LYD382 switchgrass|gb167|DN152447 11390 730 82,5 globlastp 5171 LYD347 cannabis|12v1|1EW701698_T1 11391 657 80,5 glotblastn 5171 LYD382 cannabis|12v1|EW701698_P1 11391 730 82,5 globlastp 5172 LYD347 phalaenopsis|11v1|H0059347_T1 11392 657 80,5 glotblastn 5173 LYD347 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1046126_T1 11393 657 80,5 glotblastn 5174 LYD347 ginger|gb164|DY368088_T1 11394 657 80,5 glotblastn 5175 LYD347 maize|10v1|CA829374_T1 11395 657 80,5 glotblastn 5176 LYD347 maize|10v1|GRMZM2G147714T01_T1 11396 657 80,5 glotblastn 5177 LYD347 petunia|gb171|CV296141_T1 11397 657 80,5 glotblastn 5178 LYD347 wheat|10v2|BE398406 11398 657 80,5 glotblastn 5179 LYD348 b_juncea|10v2|BJ1SLX00178941_T 11399 658 95,1 glotblastn 5180 LYD348 b rapa|gb162|EX025369_T1 11400 658 95,1 glotblastn 5181 LYD349 canola|11v1|ES900198_T1 11401 659 87,6 glotblastn 5182 LYD349 canola|10v1|CX193484 11402 659 84,3 glotblastn 5183 LYD349 thellungiellaparvulum|11v1|BY820471_T1 11403 659 81,6 glotblastn 5184 LYD351 b_oleracea|gb161|EH414500_T1 11404 660 98,4 glotblastn 5185 LYD351 radish|gb164|EV529730 11405 660 90,7 globlastp 5186 LYD351 canola|10v1|EV157501 11406 660 83,1 globlastp 5187 LYD351 cacao|10v1|CU509898_T1 11407 660 82,8 glotblastn 5188 LYD351 eucalyptus|11v2|CD668366_T1 11408 660 82,4 glotblastn 5189 LYD351 cannabis|12v1|SOLX00048062_T1 11409 660 81,8 glotblastn 5190 LYD351 apple|11v1|CN492458_T1 11410 660 81,5 glotblastn

261 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 5191 LYD351 castorbean|09v1|EG664260 11411 660 81,2 glotblastn 5192 LYD351 castorbean|11v1|EG664260_T1 11411 660 81,2 glotblastn 5193 LYD351 medicago|09v1|AW698369_T1 11412 660 81,2 glotblastn 5194 LYD351 peanut|10v1|G0257140_T1 11413 660 81,2 glotblastn 5195 LYD351 soybean|11v1|GLYMA09G38820 11414 660 81,2 glotblastn 5196 LYD351 apple|gb171|CN491801 11415 660 80,9 glotblastn 5197 LYD351 prunus|10v1|BU039990 11416 660 80,9 glotblastn 5198 LYD351 bean|gb167|CV531630_T1 11417 660 80,8 glotblastn 5199 LYD351 pigeonpea|10v1|SRR054580S0004621_T1 11418 660 80,8 glotblastn 5200 LYD351 strawberry|11v1|SRR034840S0001005 11419 660 80,8 glotblastn 5201 LYD351 watermelon|11v1|AM725308_T1 11420 660 80,6 glotblastn 5202 LYD351 melon|10v1|AM725308_T1 11421 660 80,6 glotblastn 5203 LYD351 monkeyflower|10v1|G0951608_T1 11422 660 80,6 glotblastn 5204 LYD351 solanum_phureja|09v1|SPHBG12392 11423 660 80,5 glotblastn 5205 LYD351 soybean|11v1|GLYMA18G47500 11424 660 80,5 glotblastn 5206 LYD351 valeriana|11v1|SRR099039X100750_T1 11425 660 80,5 glotblastn 5207 LYD351 cirsium|11v1|1SRR346952.123633_T1 11426 660 80,2 glotblastn 5208 LYD351 sorghum|09v1|SB04G037300 11427 660 80,2 glotblastn 5209 LYD351 sorghum|11v1|SBO4G037300_T1 11428 660 80,2 glotblastn 5210 LYD352 radish|gb164|EV545410 11429 661 98,1 glotblastn 5211 LYD352 b_oleracea|gb161|DY026468_T1 11430 661 97,0 glotblastn 5212 LYD352 b_rapa|gb162|DN961910_T1 11431 661 95,9 glotblastn cleome_gynandra|10v1|SRR015532S001130 5213 LYD352 11432 661 90,0 globlastp 6_P1 5214 LYD352 ambrosia|11v1|SRR346935.101212_T1 11433 661 89,5 glotblastn 5215 LYD352 ambrosia|11v1|SRR346935.103713_T1 11434 661 89,1 glotblastn 5216 LYD352 tragopogon|10v1|SRR020205S0026266 11435 661 89,1 glotblastn 5217 LYD352 spurge|gb161|DV127964 11436 661 88,8 glotblastn 5218 LYD352 arnica|11v1|SRR099034X104117_T1 11437 661 88,4 glotblastn 5219 LYD352 cirsium|11v1|SRR346952.1104703_T1 11438 661 88,4 glotblastn 5220 LYD352 flaveria|11v1|SRR149232.136427_T1 11439 661 88,4 glotblastn 5221 LYD352 tripterygium|11v1|SRR098677X108916_T1 11440 661 88,4 glotblastn 5222 LYD352 momordica|10v1|SRR071315S0009646_T1 11441 661 88,4 glotblastn 5223 LYD352 flaveria|11v1|SRR149229.409621_T1 11442 661 88,0 glotblastn 5224 LYD352 flaveria|11v1|SRR149232.121812_T1 11443 661 88,0 glotblastn 5225 LYD352 flaveria|11v1|SRR149232.201046_T1 11444 661 87,6 glotblastn 5226 LYD352 olea|11v1|SRR014463.16203_T1 11445 661 87,6 glotblastn 5227 LYD352 plantago|11v1|SRRT1066373X114220 11446 661 87,6 glotblastn 5228 LYD352 eschscholzia|10v1|SRR014116S0015867 11447 661 87,6 glotblastn 5229 LYD352 radish|gb164|EV539830 11448 661 87,4 globlastp 5230 LYD352 flaveria|11v1|SRR149229.35667_T1 11449 661 87,3 glotblastn 5231 LYD352 ipomoea_ni|10v1|P3J561491_T1 11450 661 87,3 glotblastn 5232 LYD352 ambrosia|11v1|SRR346935.116176_T1 11451 661 86,9 glotblastn 5233 LYD352 flaveria|11v1|SRR149238.21087_T1 11452 661 86,9 glotblastn 5234 LYD352 artemisia|10v1|EY042264_T1 11453 661 86,9 glotblastn 5235 LYD352 bean|gb167|CB556019_T1 11454 661 86,9 glotblastn 5236 LYD352 poplar|10v1|A1162727_T1 11455 661 86,9 glotblastn 5237 LYD352 triphysaria|10v1|PY159209 11456 661 86,9 glotblastn 5238 LYD352 thalictrum|11v1|SRR096787X11242_T1 11457 661 86,5 glotblastn 5239 LYD352 vinca|11v1|SRR0918690X123285_T 11458 661 86,5 glotblastn 5240 LYD352 papaya|gb165|EX245660_T1 11459 661 86,5 glotblastn 5241 LYD352 b_juncea|10v2|E6ANDIZ02HIGWB_P1 11460 661 86,5 globlastp 5242 LYD352 humulus|11v1|SRR098683X16251_T1 11461 661 86,1 glotblastn 5243 LYD352 phalaenopsis|11v1|CB032553XX1_T1 11462 661 86,1 glotblastn 5244 LYD352 clover|gb162|13B903320_T1 11463 661 86,1 glotblastn 5245 LYD352 kiwi|gb166|FG422711_T1 11464 661 86,1 glotblastn 5246 LYD352 oil_palm|gb166|EY399708_T1 11465 661 86,1 glotblastn 5247 LYD352 phyla|11v2|SRR099037X114925_T1 11466 661 85,8 glotblastn 5248 LYD352 sequoia|10v1|SRR065044S0008788 11467 661 85,8 glotblastn 5249 LYD352 taxus|10v1|ISRR032523 S0055454 11468 661 85,8 glotblastn 5250 LYD352 distylium|11v1|SRR065077X103079_T1 11469 661 85,4 glotblastn 5251 LYD352 fagopyrum|11v1|SRR063689X104399_T1 11470 661 85,4 glotblastn

262 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 5252 LYD352 cynodon|10v1|ES296962_T1 11471 661 85,4 glotblastn 5253 LYD352 switchgrass|gb167|FE619761 11472 661 85,4 glotblastn 5254 LYD352 gnetum|10v1|CB081075_T1 11473 661 85,0 glotblastn 5255 LYD352 amaranthus|10v1|ISRR039411S0011775_T1 11474 661 84,6 glotblastn 5256 LYD352 leymus|gb166|CN466043_T1 11475 661 84,6 glotblastn 5257 LYD352 orobanche|10v1|SRR02318950030948_T1 11476 661 84,6 glotblastn 5258 LYD352 sciadopitys|10v1|SRR065035S0006970 11477 661 84,6 glotblastn 5259 LYD352 foxtail_millet|11v3|PHY7SI034613M_T1 11478 661 84,6 glotblastn 5260 LYD352 cedrus|11v1|SRR065007X106828_T1 11479 661 84,3 glotblastn 5261 LYD352 sarracenia|11v1|SRR192669.100984_T1 11480 661 84,3 glotblastn foxtail_millet|10v2|OXFXTRMSLX 5262 LYD352 11481 661 84,3 glotblastn 00010459D1T1 5263 LYD352 utricularia|11v1|SRR094438.104933_T1 11482 661 83,5 glotblastn 5264 LYD352 eggplant|10v1|IFS037002_P1 11483 661 83,5 globlastp 5265 LYD352 silene|11v1|SRR096785X102605_T1 11484 661 82,8 glotblastn 5266 LYD352 oilpalm|gb166|EL608857_T1 11485 661 82,4 glotblastn 5267 LYD352 pepper|gb171|CA523086_P1 11486 661 82,0 globlastp 5268 LYD352 physcomitrella|10v1|P3J171424_T1 11487 661 81,7 glotblastn 5269 LYD352 ceratodon|10v1|SRR07489050033327 Ti 11488 661 81,3 glotblastn 5270 LYD352 apple|11v1|CN496969_P1 11489 661 81,1 globlastp 5271 LYD352 petunia|gb171|FN004778_P1 11490 661 81,0 globlastp 5272 LYD352 physcomitrella|10v1|P3I741161_T1 11491 661 80,9 glotblastn 5273 LYD352 basilicum|10v1|PDY323163_P1 11492 661 80,4 globlastp 5274 LYD352 pigeonpea|10v1|SRR054580S0006246_P1 11493 661 80,3 globlastp 5275 LYD352 flaveria|11v1|SRR149229.143097_T1 11494 661 80,2 glotblastn 5276 LYD353 b_oleracea|gb161|AF518565_T1 11495 662 94,7 glotblastn 5277 LYD353 canola|10v1|PDY006446 11496 662 90,5 glotblastn 5278 LYD353 canola|10v1|EE392420 11497 662 84,3 globlastp 5279 LYD354 b_rapa|gb162|CA991777_T1 11498 663 97,3 glotblastn 5280 LYD354 canola|10v1|CD844283 11499 663 95,0 globlastp 5281 LYD354 radish|gb164|EV525615 11500 663 95,0 glotblastn 5282 LYD354 b_oleracea|gb161|EH425328_P1 11501 663 84,9 globlastp 5283 LYD354 canola|10v1|CD820441 11502 663 84,5 globlastp 5284 LYD354 cacao|10v1|CU472559_T1 11503 663 80,1 glotblastn 5285 LYD355 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A6OHG_T1 11504 664 99,4 glotblastn 5286 LYD355 canola|10v1|CX194122 11505 664 99,4 glotblastn 5287 LYD355 canola|11v1|SRR341921.283862_ T1 11506 664 97,4 glotblastn 5288 LYD355 nasturtium|10v1|SRR03255850033224 11507 664 86,9 glotblastn 5289 LYD355 papaya|gb165|EX246985_T1 11508 664 86,9 glotblastn 5290 LYD355 clover|gb162|13B903247_T1 11509 664 86,3 glotblastn 5291 LYD355 medicago|09v1|LLAW775404_T1 11510 664 86,3 glotblastn 5292 LYD355 tripterygium|11v1|SRR098677X106 287_T1 11511 664 85,6 glotblastn 5293 LYD355 peanut|10v1|CD037973_T1 11512 664 85,6 glotblastn 5294 LYD355 soybean|11v1|GLYMA17G14240 11513 664 85,6 glotblastn 5295 LYD355 canola|11v1|H07712_T1 11514 664 85,0 glotblastn 5296 LYD355 chestnut|gb170|SRR00629550032466_T1 11515 664 85,0 glotblastn 5297 LYD355 radish|gb164|EV526919 11516 664 85,0 glotblastn 5298 LYD355 soybean|11v1|GLYMA05G03730 11517 664 85,0 glotblastn 5299 LYD355 apple|11v1|CN493994_T1 11518 664 84,3 glotblastn 5300 LYD355 clementine|11v1|CD574793_T1 11519 664 84,3 glotblastn 5301 LYD355 euonymus|11v1|SRR070038X134724_T1 11520 664 84,3 glotblastn 5302 LYD355 tripterygium|11v1|SRR098677X110946_T1 11521 664 84,3 glotblastn 5303 LYD355 lotus|09v1|AV414211_T1 11522 664 84,3 glotblastn 5304 LYD355 pigeonpea|10v1|GW348054_T1 11523 664 84,3 glotblastn 5305 LYD355 orange|11v1|CD574793_T1 11524 664 83,7 glotblastn 5306 LYD355 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AEYJ6_T1 11525 664 83,7 glotblastn 5307 LYD355 bean|gb167|CB280490_T1 11526 664 83,7 glotblastn 5308 LYD355 castorbean|09v1|NM002509629 11527 664 83,7 glotblastn 5309 LYD355 castorbean|11v1|NM002509629_T1 11527 664 83,7 glotblastn 5310 LYD355 citrus|gb166|CD574793_T1 11528 664 83,7 glotblastn 5311 LYD355 oak|10v1|CR627875_T1 11529 664 83,7 glotblastn 5312 LYD355 strawberry|11v1|CX661491 11530 664 83,7 glotblastn

263 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 5313 LYD355 eucalyptus|11v2|ES590957_T1 11531 664 83,0 glotblastn 5314 LYD355 cowpea|gb166|FC460407_T1 11532 664 83,0 glotblastn 5315 LYD355 salvia|10v1|CV166630 11533 664 83,0 glotblastn 5316 LYD355 cucurbita|11v1|SRR091276X100581_T1 11534 664 82,4 glotblastn 5317 LYD355 scabiosa|11v1|SRR063723X103499_T1 11535 664 82,4 glotblastn 5318 LYD355 cassava|09v1|DV446891_T1 11536 664 82,4 glotblastn 5319 LYD355 rhizophora|10v1|4SRR005792S000393 11537 664 82,4 glotblastn 5320 LYD355 thellungiella|gb167|13Q060370 11538 664 82,4 glotblastn 5321 LYD355 walnuts|gb166|CV197891 11539 664 82,4 glotblastn 5322 LYD355 cannabis|12v1|1EW701812_T1 11540 664 81,7 glotblastn 5323 LYD355 watermelon|11v1|AM725626_T1 11541 664 81,7 glotblastn 5324 LYD355 cacao|10v1|CU497443_T1 11542 664 81,7 glotblastn 5325 LYD355 cotton|10v2|C0070876_T1 11543 664 81,7 glotblastn 5326 LYD355 ipomoea_ni|110v1|P3J560048_T1 11544 664 81,7 glotblastn 5327 LYD355 melon|10v1|AM719013_T1 11545 664 81,7 glotblastn 5328 LYD355 radish|gb164|EX894871 11546 664 81,7 globlastp 5329 LYD355 amsonia|11v1|SRR098688X107329_T1 11547 664 81,1 glotblastn 5330 LYD355 humulus|11v1|SRR098683X102237_T1 11548 664 81,1 glotblastn 5331 LYD355 humulus|11v1|SRR098683X122889_T1 11549 664 81,1 glotblastn 5332 LYD355 tomato|11v1|BG643189_T1 11550 664 81,1 glotblastn 5333 LYD355 eggplant|10v1|FS023952 T1 11551 664 81,1 glotblastn 5334 LYD355 lotus|09v1|AV408322_T1 11552 664 81,1 glotblastn 5335 LYD355 pepper|gb171|CA523690_T1 11553 664 81,1 glotblastn 5336 LYD355 poplar|10v1|AI164083_T1 11554 664 81,1 glotblastn 5337 LYD355 prunus|10v1|CN493994 11555 664 81,1 glotblastn 5338 LYD355 tobacco|gb162|EB425265 11556 664 81,1 glotblastn 5339 LYD355 tomato|09v|BG643189 11550 664 81,1 glotblastn 5340 LYD355 chelidonium|11v1|SRR084752X106940_T1 11557 664 80,4 glotblastn 5341 LYD355 phyla|11v2|SRR099035X106177_T1 11558 664 80,4 glotblastn 5342 LYD355 phyla|11v2|SRR099037X108839_T1 11559 664 80,4 glotblastn 5343 LYD355 cotton|10v2|SRR032367S0886821_T1 11560 664 80,4 glotblastn 5344 LYD355 heritiera|10v1|SRR005794S0008008_T1 11561 664 80,4 glotblastn nicotiana_benthamiana|gb162|CK283344_T 5345 LYD355 11562 664 80,4 glotblastn 1 5346 LYD355 poplar|10v1|PDT504899_T1 11563 664 80,4 glotblastn 5347 LYD355 solanum_phureja|09v1|SPHBG643189 11564 664 80,4 glotblastn 5348 LYD355 peanut|10v1|ES757895_P1 11565 664 80,3 globlastp 5349 LYD356 canola|11v1|SRR001111.1538_T1 11566 665 100,0 glotblastn 5350 LYD356 brapa|gb162|DN965431_T1 11567 665 100,0 glotblastn 5351 LYD356 canola|10v1|CD812013 11568 665 100,0 glotblastn 5352 LYD356 canola|11v1|PDW999400_T1 11569 665 99,2 glotblastn 5353 LYD356 canola|10v1|CD818021 11570 665 99,2 glotblastn 5354 LYD356 canola|11v1|EE456034_T1 11571 665 99,2 glotblastn 5355 LYD356 radish|gb164|EV535710 11572 665 99,2 glotblastn 5356 LYD356 canola|11v1|DY025387_T1 11573 665 98,3 glotblastn 5357 LYD356 canola|11v1|EV150587_T1 11574 665 98,3 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|EHJGI11017 5358 LYD356 11575 665 98,3 glotblastn 677_T1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP024594 5359 LYD356 11576 665 98,3 glotblastn _T1 thellungiella_parvulum|11v1|EPPRD115900 5360 LYD356 11577 665 98,3 glotblastn _T1 5361 LYD356 canola|11v1|SRR019556.38807_T1 11578 665 97,5 glotblastn 5362 LYD356 b_oleracea|gb161|EH424605_T1 11579 665 97,5 glotblastn 5363 LYD356 radish|gb164|EY903675 11580 665 97,5 glotblastn 5364 LYD356 canola|11v1|SRR019556.25802_T1 11581 665 96,6 glotblastn 5365 LYD356 b_juncea|10v2|BJ1SLX00097842_ P1 11582 665 95,8 globlastp 5366 LYD356 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BKCOG_P1 11583 665 95,8 globlastp 5367 LYD356 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL023575_T1 11584 665 94,9 glotblastn 5368 LYD356 canola|10v1|CD818409 11585 665 94,9 glotblastn 5369 LYD356 arabidopsis|10v1|AT4G02720_T1 11586 665 94,1 glotblastn 5370 LYD356 plantago|11v1|SRR066373X303297_T1 11587 665 87,4 glotblastn

264 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 5371 LYD356 oak|10v1|IFN699035_T1 11588 665 87,4 glotblastn 5372 LYD356 oak|10v1|ISRR006309S0035632_T1 11589 665 87,4 glotblastn 5373 LYD356 aquilegia|10v2|DR942514_T1 11590 665 87,3 glotblastn 5374 LYD356 ceratodon|10v1|SRR07489050163110_T1 11591 665 87,3 glotblastn 5375 LYD356 papaya|gb165|EX266455_T1 11592 665 87,3 glotblastn 5376 LYD356 oak|10v1|SRR006313S0030771_T1 11593 665 86,6 glotblastn 5377 LYD356 arnica|11v1|SRR099034X101611_T1 11594 665 86,4 glotblastn 5378 LYD356 euonymus|11v1|SRR070038X111481_T1 11595 665 86,4 glotblastn 5379 LYD356 flaveria|11v1|SRR149229.117955_T1 11596 665 86,4 glotblastn 5380 LYD356 flax|11v1|JG265449_T1 11597 665 86,4 glotblastn maritime_pine|10v1|SRR073317S0007921_ 5381 LYD356 11598 665 86,4 glotblastn T1 5382 LYD356 tripterygium|11v1|SRR098677X12073_T1 11599 665 86,4 glotblastn 5383 LYD356 artemisia|10v1|SRR019254S0004070_T1 11600 665 86,4 glotblastn 5384 LYD356 gnetum|10v1|SRR06439950013098_T1 11601 665 86,4 glotblastn 5385 LYD356 lettuce|10v1|BQ851656_T1 11602 665 86,4 glotblastn 5386 LYD356 physcomitrella|10v1|BQ826614_T1 11603 665 86,4 glotblastn 5387 LYD356 pine|10v2|BQ698784_T1 11604 665 86,4 glotblastn 5388 LYD356 poplar|10v1|BI138171_T1 11605 665 86,4 glotblastn 5389 LYD356 poplar|10v1|CV245819_T1 11606 665 86,4 glotblastn 5390 LYD356 spikemoss|gb165|FE429548 11607 665 86,4 glotblastn 5391 LYD356 sunflower|10v1|PE612000 11608 665 86,4 glotblastn 5392 LYD356 ambrosia|11v1|SRR346935.119259_T1 11609 665 85,6 glotblastn 5393 LYD356 cirsium|11v1|SRR346952.1012579_T1 11610 665 85,6 glotblastn 5394 LYD356 clementine|11v1|CK937619_T1 11611 665 85,6 glotblastn 5395 LYD356 euphorbia|11v1|DV124777_T1 11612 665 85,6 glotblastn 5396 LYD356 euphorbia|11v1|SRR098678X107912_T1 11613 665 85,6 glotblastn 5397 LYD356 fagopyrum|11v1|SRR063703X142561_T1 11614 665 85,6 glotblastn 5398 LYD356 orange|11v1|CK937619_T1 11615 665 85,6 glotblastn 5399 LYD356 primula|11v1|SRR098679X28143_T1 11616 665 85,6 glotblastn 5400 LYD356 trigonella|11v1|SRR066194X109214_T1 11617 665 85,6 glotblastn 5401 LYD356 cacao|10v1|CU482446_T1 11618 665 85,6 glotblastn 5402 LYD356 citrus|gb166|CX072860_T1 11619 665 85,6 glotblastn 5403 LYD356 cotton|10v2|ES840642_T1 11620 665 85,6 glotblastn 5404 LYD356 cotton|10v2|SRRO32367S0033019_T1 11621 665 85,6 glotblastn 5405 LYD356 kiwi|gb166|FG432036_T1 11622 665 85,6 glotblastn 5406 LYD356 nasturtium|10v1|SRR032561S0028000 11623 665 85,6 glotblastn 5407 LYD356 peanut|10v1|ES719543_T1 11624 665 85,6 glotblastn 5408 LYD356 pigeonpea|10v1|SRR054580S0028503_T1 11625 665 85,6 glotblastn 5409 LYD356 senecio|gb170|SRR00659250015752 11626 665 85,6 glotblastn 5410 LYD356 soybean|11v1|GLYMA02G16550 11627 665 85,6 glotblastn 5411 LYD356 soybean|11v1|GLYMA10G03290 11628 665 85,6 glotblastn 5412 LYD356 spruce|gb162|DV973304 11629 665 85,6 glotblastn 5413 LYD356 spurge|gb161|DV124777 11630 665 85,6 glotblastn 5414 LYD356 triphysaria|10v1|DR175417 11631 665 85,6 glotblastn 5415 LYD356 scabiosa|11v1|SRR063723X11768_P1 11632 665 85,0 globlastp 5416 LYD356 abies|11v2|SRR098676X135794XX1_T1 11633 665 84,8 glotblastn 5417 LYD356 amsonia|11v1|SRR098688X122456_T1 11634 665 84,8 glotblastn 5418 LYD356 chelidonium|11v1|SRR084752X104418_T1 11635 665 84,8 glotblastn 5419 LYD356 utricularia|11v1|SRR094438.105857_T1 11636 665 84,8 glotblastn 5420 LYD356 vinca|11v1|SRR098690X105973_T1 11637 665 84,8 glotblastn 5421 LYD356 cassava|09v1|FF379873_T1 11638 665 84,8 glotblastn 5422 LYD356 castorbean|09v1|EG677265 11639 665 84,8 glotblastn 5423 LYD356 castorbean|11v1|EG677265_T1 11639 665 84,8 glotblastn 5424 LYD356 coffea|10v1|DV681549_T1 11640 665 84,8 glotblastn 5425 LYD356 medicago|09v1|AW686788_T1 11641 665 84,8 glotblastn 5426 LYD356 monkeyflower|10v1|G0985950_T1 11642 665 84,8 glotblastn 5427 LYD356 orobanche|10v1|SRR02318950000451_T1 11643 665 84,8 glotblastn 5428 LYD356 sciadopitys|10v1|95SRR065035S00137 11644 665 84,8 glotblastn 5429 LYD356 spruce|gb162|CO237788 11645 665 84,8 glotblastn 5430 LYD356 taxus|10v1|SRR032523S0002704XX1 11646 665 84,8 glotblastn 5431 LYD356 tobacco|gb162|EB424813 11647 665 84,8 glotblastn

265 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 5432 LYD356 cedrus|11v1|SRR065007X136942_P1 11648 665 84,2 globlastp 5433 LYD356 apple|11v1|CN945493_T1 11649 665 83,9 glotblastn 5434 LYD356 cephalotaxus|11v1|SRR064395X163987_T1 11650 665 83,9 glotblastn 5435 LYD356 distylium|11v1|SRR065077X117387_T1 11651 665 83,9 glotblastn 5436 LYD356 phyla|11v2|SRR099035X124185_T1 11652 665 83,9 glotblastn 5437 LYD356 pteridium|11v1|SRR043594X101190_T1 11653 665 83,9 glotblastn 5438 LYD356 tomato|11v1|BG133792_T1 11654 665 83,9 glotblastn 5439 LYD356 aristolochia|10v1|FD757103_T1 11655 665 83,9 glotblastn 5440 LYD356 cichorium|gb171|EH703772_T1 11656 665 83,9 glotblastn 5441 LYD356 fescue|gb161|CK801362_P1 11657 665 83,9 globlastp nicotiana_benthamiana|gb162|CK28 5442 LYD356 11658 665 83,9 glotblastn 0501_T1 5443 LYD356 potato|10v1|BE923917_T1 11659 665 83,9 glotblastn 5444 LYD356 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0024802 11660 665 83,9 glotblastn 5445 LYD356 triphysaria|10v1|EY156207 11661 665 83,9 glotblastn 5446 LYD356 walnuts|gb166|EL891945 11662 665 83,9 glotblastn 5447 LYD356 wheat|10v2|AL818846 11663 665 83,9 glotblastn 5448 LYD356 apple|11v1|CN490746_T1 11664 665 83,5 glotblastn 5449 LYD356 b_juncea|10v2|BJ1SLX00231994D1_P1 11665 665 83,1 globlastp amorphophallus|11v2|SRR089351X228262_ 5450 LYD356 11666 665 83,1 glotblastn T1 5451 LYD356 eucalyptus|11v2|SRR001659X162636_T1 11667 665 83,1 glotblastn 5452 LYD356 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1032743_T1 11668 665 83,1 glotblastn 5453 LYD356 silene|11v1|SRR096785X148365_T1 11669 665 83,1 glotblastn 5454 LYD356 sorghum|11v1|SBPRD033244_T1 11670 665 83,1 glotblastn tabernaemontana|11v1|SRR098689X102369 5455 LYD356 11671 665 83,1 glotblastn _T1 5456 LYD356 valeriana|11v1|SRR099039X131482_T1 11672 665 83,1 glotblastn 5457 LYD356 barley|10v2|E3G343265_T1 11673 665 83,1 glotblastn 5458 LYD356 brachypodium|09v1|DV478575_T1 11674 665 83,1 glotblastn 5459 LYD356 cucumber|09v1|GD177374_T1 11675 665 83,1 glotblastn 5460 LYD356 eggplant|10v1|FS001151_T1 11676 665 83,1 glotblastn 5461 LYD356 grape|11v1|GSVIVT01001165001_T1 11677 665 83,1 glotblastn 5462 LYD356 grape|gb160|CB346996 11678 665 83,1 glotblastn 5463 LYD356 maize|10v1|A1861652_T1 11679 665 83,1 glotblastn 5464 LYD356 oat|11v1|GR337037_T1 11680 665 83,1 glotblastn 5465 LYD356 oil_palm|gb166|CN600839_T1 11681 665 83,1 glotblastn 5466 LYD356 podocarpus|10v1|SRR065014S0003833_T1 11682 665 83,1 glotblastn 5467 LYD356 prunus|10v1|AJ533094 11683 665 83,1 glotblastn 5468 LYD356 pseudoroegneria|gb167|FF364837 11684 665 83,1 glotblastn 5469 LYD356 sequoia|10v1|SRR065044S0066945XX2 11685 665 83,1 glotblastn 5470 LYD356 sorghum|09v1|SB02G026540 11686 665 83,1 glotblastn 5471 LYD356 sorghum|11v1|SB02G026540_T1 11687 665 83,1 glotblastn 5472 LYD356 strawberry|11v1|DY674471 11688 665 83,1 glotblastn 5473 LYD356 eucalyptus|11v2|ES595924_T1 11689 665 83,1 glotblastn 5474 LYD356 salvia|10v1|FE536257 11690 665 82,4 glotblastn 5475 LYD356 zostera|10v1|SRR057351S0011707 11691 665 82,4 glotblastn 5476 LYD356 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0186570 11692 665 82,2 glotblastn 5477 LYD356 rice|gb170|0S09G28220 11693 665 82,2 glotblastn 5478 LYD356 sugarcane|10v1|CA085363 11694 665 82,2 glotblastn 5479 LYD356 switchgrass|gb167|DN145224 11695 665 82,2 glotblastn 5480 LYD356 ipomoea_batatas|10v1|EE876122_ T1 11696 665 81,8 glotblastn 5481 LYD356 sarracenia|11v1|SRR192671,163689_T1 11697 665 81,4 glotblastn foxtail_millet|10v2|FXTRMSLX00755129D 5482 LYD356 11698 665 81,4 glotblastn 2 5483 LYD356 foxtail_millet|11v3|PHY7SI029571M_T1 11699 665 81,4 glotblastn 5484 LYD356 melon|10v1|VMEL00523006693402_T1 11700 665 81,4 glotblastn 5485 LYD356 millet|10v1|FV0454PM016880_T1 11701 665 81,4 glotblastn 5486 LYD356 catharanthus|11v1|SRR098691X116776_P1 11702 665 80,7 globlastp 5487 LYD356 eucalyptus|gb166|ES595924 11703 665 80,7 globlastp 5488 LYD356 marchantia|gb166|BJ864302_P1 11704 665 80,2 globlastp 5489 LYD357 b_rapa|gb162|EX023270_T1 11705 666 86,9 glotblastn

266 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 5490 LYD357 canola|11v1|SRR001112.17151_T1 11706 666 83,7 glotblastn 5491 LYD357 canola|10v1|PE462485 11707 666 80,2 glotblastn 5492 LYD358 b_rapa|gb162|CX270280_T1 11708 667 99,0 glotblastn 5493 LYD358 canola|11v1|PE400666_T1 11709 667 98,5 glotblastn 5494 LYD358 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A7E3I_P1 11710 667 89,9 globlastp 5495 LYD358 amsonia|11v1|SRR098688X143078_T1 11711 667 83,7 glotblastn 5496 LYD358 silene|11v1|SRR096785X126876_T1 11712 667 83,7 glotblastn 5497 LYD358 spurge|gb161|DV126456 11713 667 83,7 glotblastn 5498 LYD358 eggplant|10v1|FS004361_P1 11714 667 83,2 globlastp 5499 LYD358 radish|gb164|EX773740 11715 667 83,2 globlastp 5500 LYD358 catharanthus|11v1|SRR098691X103621_T1 11716 667 82,7 glotblastn cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0037218 5501 LYD358 11717 667 82,7 glotblastn _T1 5502 LYD358 petunia|gb171|FN003690_T1 11718 667 82,7 glotblastn 5503 LYD358 vinca|11v1|SRR098690X104484_T1 11719 667 82,1 glotblastn 5504 LYD358 valeriana|11v1|SRR099039X105133_T1 11720 667 81,6 glotblastn 5505 LYD358 cirsium|11v1|SRR346952.1031342_T1 11721 667 81,1 glotblastn 5506 LYD358 flax|11v1|EH792492_T1 11722 667 81,1 glotblastn 5507 LYD358 blueberry|10v1|CV091378_T1 11723 667 81,1 glotblastn 5508 LYD358 thalictrum|11v1|SRR096787X124040_T1 11724 667 80,6 glotblastn 5509 LYD358 bean|gb167|CA907763_T1 11725 667 80,6 glotblastn 5510 LYD358 cucurbita|11v1|SRR091276X217402_T1 11726 667 80,1 glotblastn 5511 LYD358 flaveria|11v1|SRR149229.165184_T1 11727 667 80,1 glotblastn 5512 LYD358 phyla|11v2|SRR099035X110496_T1 11728 667 80,1 glotblastn 5513 LYD358 phyla|11v2|SRR099037X306550_T1 11729 667 80,1 glotblastn 5514 LYD358 silene|11v1|SRR096785X372550_T1 11730 667 80,1 glotblastn cassava|09v1|JGICASSAVA1573VALIDM1 5515 LYD358 11731 667 80,1 glotblastn _T1 5516 LYD359 canola|11v1|EE490176_T1 11732 668 100,0 glotblastn 5517 LYD359 radish|gb164|EX899697 11733 668 98,5 glotblastn 5518 LYD359 canola|11v1|DY000280_T1 11734 668 97,7 glotblastn 5519 LYD359 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AG58J_T1 11735 668 97,7 glotblastn 5520 LYD359 b_juncea|10v2|E6ANDIZOlAKCG22_T1 11736 668 97,7 glotblastn 5521 LYD359 radish|gb164|EV566067 11737 668 97,7 glotblastn 5522 LYD359 canola|11v1|EE503198_T1 11738 668 97,0 glotblastn 5523 LYD359 thellungiella|gb167|DN776586 11739 668 94,7 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|DN776586_T 5524 LYD359 11740 668 91,9 glotblastn 1 5525 LYD359 b_juncea|10v2|E3J1SLX00658980Dl_T1 11741 668 84,9 glotblastn 5526 LYD359 canola|11v1|DY011839_T1 11742 668 84,1 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|EHJGI11003 5527 LYD359 11743 668 84,1 glotblastn 533_T1 nicotiana_benthamiana|gb162|CK28 5528 LYD359 11744 668 84,1 glotblastn 9869_T1 cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0018777 5529 LYD359 11745 668 83,6 globlastp _P1 5530 LYD359 canola|11v1|EV103857_T1 - 668 83,5 glotblastn 5531 LYD359 potato|10v1|P3Q112923_T1 11746 668 83,3 glotblastn 5532 LYD359 flaveria|11v1|SRR149244.142571_T1 11747 668 82,6 glotblastn 5533 LYD359 cucurbita|11v1|SRR091276X112867_T1 11748 668 81,8 glotblastn 5534 LYD359 flax|11v1|FJ667606_T1 11749 668 81,8 glotblastn 5535 LYD359 pteridium|11v1|SRR043594X114111_T1 11750 668 81,8 glotblastn 5536 LYD359 cucumber|09v1|DN909508_T1 11751 668 81,8 glotblastn 5537 LYD359 switchgrass|gb167|DN142539 11752 668 81,8 glotblastn 5538 LYD359 euonymus|11v1|3SRR070038X21335_T1 11753 668 81,1 glotblastn 5539 LYD359 flaveria|11v1|SRR149229.118245_T1 11754 668 81,1 glotblastn 5540 LYD359 olea|11v1|SRR014463.29907_T1 11755 668 81,1 glotblastn 5541 LYD359 tripterygium|11v1|SRR098677X104686_T1 11756 668 81,1 glotblastn 5542 LYD359 arabidopsis|10v1|AT3G21500_T1 11757 668 81,1 glotblastn 5543 LYD359 curcuma|10v1|DY392061_T1 11758 668 81,1 glotblastn 5544 LYD359 ipomoea_batatas|10v1|DC879850_T1 11759 668 81,1 glotblastn 5545 LYD359 millet|10v1|PMSLX0021194D1_T1 11760 668 81,1 glotblastn

267 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 5546 LYD359 peanut|10v1|G0334821_T1 11761 668 81,1 glotblastn 5547 LYD359 tragopogon|10v1|SRR020205S0037443 11762 668 81,1 glotblastn 5548 LYD359 ambrosia|11v1|SRR346935.191232T1 11763 668 80,3 glotblastn 5549 LYD359 cirsium|11v1|SRR349641.58535_T1 11764 668 80,3 glotblastn 5550 LYD359 fagopyrum|11v1|SRR063689X121326_T1 11765 668 80,3 glotblastn 5551 LYD359 fraxinus|11v1|SRR058827.101300_T1 11766 668 80,3 glotblastn 5552 LYD359 pea|11v1|AM161923_T1 11767 668 80,3 glotblastn 5553 LYD359 trigonella|11v1|SRR066194X133520_T1 11768 668 80,3 glotblastn watermelon|11v1|VMEL003317379 5554 LYD359 11769 668 80,3 glotblastn 93893_T1 5555 LYD359 artemisia|10v1|EY110588_T1 11770 668 80,3 glotblastn 5556 LYD359 chestnut|gb170|SRR00629650001908_T1 11771 668 80,3 glotblastn 5557 LYD359 cynodon|10v1|ES299726_T1 11772 668 80,3 glotblastn 5558 LYD359 iceplant|gb164|BE036942_T1 11773 668 80,3 glotblastn 5559 LYD359 lotus|09v1|AV779383_T1 11774 668 80,3 glotblastn 5560 LYD359 lotus|09v1|LAV779383_T1 11774 668 80,3 glotblastn 5561 LYD359 peanut|10v1|G0328545_T1 11775 668 80,3 glotblastn 5562 LYD359 pigeonpea|10v1|SRR054580S0195525_T1 11776 668 80,3 glotblastn 5563 LYD359 sugarcane|10v1|CA112682 11777 668 80,3 glotblastn 5564 LYD360 canola|11v1|SRR019556.17100_T1 11778 669 99,3 glotblastn 5565 LYD360 canola|10v1|DW998552 11779 669 99,3 glotblastn 5566 LYD360 canola|11v1|DW998552_T1 11780 669 99,3 glotblastn 5567 LYD360 canola|11v1|SRR019558.5477_T1 11781 669 98,5 glotblastn 5568 LYD360 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A00BR_T1 11782 669 98,5 glotblastn 5569 LYD360 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BQ44X_T1 11783 669 98,5 glotblastn 5570 LYD360 b rapa|gb162|AY460108_T1 11784 669 98,5 glotblastn 5571 LYD360 canola|10v1|CD832066 11785 669 98,5 glotblastn 5572 LYD360 canola|10v1|CD833090 11786 669 98,5 glotblastn 5573 LYD360 canola|10v1|EE457660 11787 669 98,5 glotblastn 5574 LYD360 radish|gb164|EV542093 11788 669 98,5 glotblastn 5575 LYD360 brapa|gb162|C0749825_T1 11789 669 97,8 glotblastn 5576 LYD360 b_oleracea|gb161|AM387742_T1 11790 669 97,8 glotblastn 5577 LYD360 canola|10v1|CN731858 11791 669 97,8 glotblastn 5578 LYD360 canola|11v1|CN731858_T1 11792 669 97,8 glotblastn 5579 LYD360 radish|gb164|EV565876 11793 669 97,8 glotblastn 5580 LYD360 thellungiella|gb167|DN773350 11794 669 97,8 glotblastn 5581 LYD360 canola|11v1|SRR023612.19864_T1 11795 669 97,0 glotblastn 5582 LYD360 canola|11v1|SRR329661.576405_T1 11796 669 95,6 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|EHPRD1229 5583 LYD360 11797 669 94,9 glotblastn 52_T1 5584 LYD360 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AY4OX_P1 11798 669 91,9 globlastp 5585 LYD360 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AXYLC_P1 11799 669 91,8 globlastp 5586 LYD360 primula|11v1|SRR098679X115772_T1 11800 669 88,1 glotblastn 5587 LYD360 thalictrum|11v1|SRR096787X11094_T1 11801 669 88,1 glotblastn cleome_gynandra|10v1|SRR015532S001150 5588 LYD360 11802 669 87,3 glotblastn 8_T1 5589 LYD360 scabiosa|11v1|SRR063723X105289_T1 11803 669 86,7 glotblastn 5590 LYD360 amaranthus|10v1|SRR039411S0001326_T1 11804 669 86,7 glotblastn 5591 LYD360 amaranthus|10v1|SRR039411S0006123_T1 11805 669 86,7 glotblastn cleome_gynandra|10v1|SRR015532S003050 5592 LYD360 11806 669 86,7 glotblastn 1_T1 5593 LYD360 euphorbia|11v1|DV115557_T1 11807 669 86,6 glotblastn 5594 LYD360 spurge|gb161|DV115557 11808 669 85,8 glotblastn 5595 LYD360 thellungiella|gb167|DN776690 11809 669 85,4 glotblastn 5596 LYD360 cleome_spinosa|10v1|GR934996_T1 11810 669 85,2 glotblastn 5597 LYD360 kiwi|gb166|FG397670_T1 11811 669 85,2 glotblastn 5598 LYD360 oak|10v1|FP032824_T1 11812 669 85,1 glotblastn 5599 LYD360 apple|11v1|CN444746_T1 11813 669 85,1 glotblastn 5600 LYD360 canola|10v1|CD812899 11814 669 84,7 glotblastn 5601 LYD360 canola|11v1|DY020776_T1 11815 669 84,7 glotblastn 5602 LYD360 fagopyrum|11v1|SRR063689X100984_T1 11816 669 84,4 glotblastn 5603 LYD360 primula|11v1|SRR098679X106813_T1 11817 669 84,4 glotblastn

268 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 5604 LYD360 sarracenia|11v1|SRR192669.115218_T1 11818 669 84,4 glotblastn 5605 LYD360 medicago|09v1|AW126260_T1 11819 669 84,4 glotblastn 5606 LYD360 momordica|10v1|SRR071315S0024912_T1 11820 669 84,4 glotblastn 5607 LYD360 oat|10v2|GR363558 11821 669 84,4 glotblastn 5608 LYD360 oat|11v1|GR363558_T1 11821 669 84,4 glotblastn 5609 LYD360 petunia|gb171|CV300069_T1 11822 669 84,4 glotblastn 5610 LYD360 ambrosia|11v1|SRR346935.410448_T1 11823 669 84,3 glotblastn 5611 LYD360 cucurbita|11v1|SRR091276X108228_T1 11824 669 84,3 glotblastn 5612 LYD360 apple|gb171|CN444746 11825 669 84,3 glotblastn 5613 LYD360 potato|10v1|BE921232_T1 11826 669 84,3 glotblastn 5614 LYD360 potato|10v1|BQ113327_T1 11827 669 84,3 glotblastn 5615 LYD360 sunflower|10v1|CX945348 11828 669 84,3 glotblastn 5616 LYD360 zinnia|gb171|AU301937 11829 669 84,3 glotblastn 5617 LYD360 b_rapa|gb162|EE516329_P1 11830 669 84,3 globlastp 5618 LYD360 B_oleracea|gb161|AM388348_T1 11831 669 83,9 glotblastn 5619 LYD360 canola|10v1|EE435089 11832 669 83,9 glotblastn 5620 LYD360 cichorium|gb171|FL672715_T1 11833 669 83,7 glotblastn 5621 LYD360 ipomoea_ni|10v1|CJ771651_T1 11834 669 83,7 glotblastn 5622 LYD360 leymus|gb166|EG397819_T1 11835 669 83,7 glotblastn 5623 LYD360 pseudoroegneria|gb167|FF350425 11836 669 83,7 glotblastn 5624 LYD360 wheat|10v2|BE492877 11837 669 83,7 glotblastn 5625 LYD360 cucurbita|11v1|SRR091276X118724_T1 11838 669 83,6 glotblastn 5626 LYD360 cucurbita|11v1|SRR091276X127327_T1 11839 669 83,6 glotblastn 5627 LYD360 cucurbita|11v1|SRR091276X176316_T1 11840 669 83,6 glotblastn 5628 LYD360 apple|gb171|CN495646 11841 669 83,6 glotblastn 5629 LYD360 oat|11v1|GR353893_T1 11842 669 83,6 glotblastn 5630 LYD360 walnuts|gb166|CV194988 11843 669 83,6 glotblastn 5631 LYD360 citrus|gb166|CV886939_T1 11844 669 83,0 glotblastn 5632 LYD360 eucalyptus|gb166|CT983802 11845 669 83,0 glotblastn 5633 LYD360 onion|gb162|CF437571_T1 11846 669 83,0 glotblastn 5634 LYD360 tragopogon|10v1|SRR020205S0094843 11847 669 83,0 glotblastn 5635 LYD360 wheat|10v2|BE428826 11848 669 83,0 glotblastn 5636 LYD360 wheat|10v2|BG262758 11849 669 83,0 glotblastn 5637 LYD360 fagopyrum|11v1|SRR063689X123297_Ti 11850 669 82,8 glotblastn 5638 LYD360 platanus|11v1|SRR096786X133734_T1 11851 669 82,8 glotblastn 5639 LYD360 banana|10v1|FF558854_T1 11852 669 82,8 glotblastn 5640 LYD360 iceplant|gb164|BE577569_T1 11853 669 82,8 glotblastn 5641 LYD360 melon|10v1|AM718298_T1 11854 669 82,8 glotblastn 5642 LYD360 potato|10v1|BG595277_T1 11855 669 82,8 glotblastn 5643 LYD360 salvia|10v1|FE537079 11856 669 82,8 glotblastn 5644 LYD360 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1130054_T1 11857 669 82,4 glotblastn 5645 LYD360 pteridium|11v1|GW574872_T1 11858 669 82,2 glotblastn 5646 LYD360 clover|gb162|BB903915_T1 11859 669 82,2 glotblastn 5647 LYD360 coffea|10v1|DV663605_T1 11860 669 82,2 glotblastn 5648 LYD360 papaya|gb165|EX288092_T1 11861 669 82,2 glotblastn 5649 LYD360 peanut|10v1|SRR042413 S0023193_T1 11862 669 82,2 glotblastn 5650 LYD360 flax|11v1|EB710725_T1 11863 669 82,1 glotblastn 5651 LYD360 phyla|11v2|SRR099035X111169_T1 11864 669 82,1 glotblastn 5652 LYD360 oil_palm|gb166|EL684407_T1 11865 669 82,1 glotblastn 5653 LYD360 pigeonpea|10v1|SRR054580S0020654_T1 11866 669 81,8 glotblastn 5654 LYD360 pepper|gb171|GD077370_P1 11867 669 81,5 globlastp 5655 LYD360 flax|11v1|JG123126_T1 11868 669 81,5 glotblastn 5656 LYD360 olea|11v1|SRR014463.11920_T1 11869 669 81,5 glotblastn 5657 LYD360 peanut|10v1|SRR042413 S0015373_T1 11870 669 81,5 glotblastn 5658 LYD360 cirsium|11v1|SRR346952.1001301_T1 11871 669 81,3 glotblastn 5659 LYD360 humulus|11v1|GD250731_T1 11872 669 81,3 glotblastn 5660 LYD360 platanus|11v1|SRR096786X10895_T1 11873 669 81,3 glotblastn 5661 LYD360 sarracenia|11v1|SRR192669.100315_T1 11874 669 81,3 glotblastn 5662 LYD360 centaureia|gb166|EL933654_T1 11875 669 81,3 glotblastn 5663 LYD360 cichorium|gb171|DT211242_T1 11876 669 81,3 glotblastn 5664 LYD360 cynara|gb167|GE591437_T1 11877 669 81,3 glotblastn 5665 LYD360 eggplant|10v1|FS033086_T1 11878 669 81,3 glotblastn

269 / 378 Hom Polin. Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden. Algor. ID Nome do Gene NO: ID glob. NO: NO: 5666 LYD360 ipomoea_ni|10v1|P3J568082_T1 11879 669 81,3 glotblastn 5667 LYD360 millet|10v1|EVO454PM046177_T1 11880 669 81,3 glotblastn 5668 LYD360 fagopyrum|11v1|SRR063703X117511_T1 11881 669 8u /,,._ glotblastn 5669 LYD360 olea|11v1|SRR014463.16600_T1 11882 669 80,7 glotblastn 5670 LYD360 pepper|gb171|GD055477_T1 11883 669 80,7 glotblastn 5671 LYD360 potato|10v1|AJ489100_T1 11884 669 80,7 glotblastn fagopyrum|11v1|SRR063689X131571_P1 11885 669 _ 5672 LYD360 globlastp

80. / 5673 LYD360 ambrosia|11v1|SRR346943.174803_T1 11886 669 80,6 glotblastn 5674 LYD360 cirsium|11v1|SRR346952.135278_T1 11887 669 80,6 glotblastn 5675 LYD360 euonymus|11v1|SRR070038X122146_T1 11888 669 80,6 glotblastn 5676 LYD360 flaveria|11v1|SRR149229.121676_T1 11889 669 80,6 glotblastn 5677 LYD360 flaveria|11v1|SRR149229.194597_T1 11890 669 80,6 glotblastn 5678 LYD360 flax|11v1|CA482731_T1 11891 669 80,6 glotblastn 5679 LYD360 chestnut|gb170|SRR00629550003307_Ti 11892 669 80,6 glotblastn 5680 LYD360 kiwi|gb166|FG411380_P1 11893 669 80,6 globlastp 5681 LYD360 lolium|10v1|DT669022_T1 11894 669 80,6 glotblastn 5682 LYD360 oak|10v1|FN708127_T1 11895 669 80,6 glotblastn 5683 LYD360 safflower|gb162|EL376935 11896 669 80,6 glotblastn 5684 LYD360 salvia|10v1|FE536026 11897 669 80,6 glotblastn 5685 LYD360 cynodon|10v1|ES298921_T1 11898 669 80,6 glotblastn 5686 LYD360 trigonella|11v1|SRR066194X154393_T1 11899 669 80,2 glotblastn 5687 LYD360 gerbera|09v1|AJ750312_T1 11900 669 80,2 glotblastn 5688 LYD360 lettuce|10v1|DW100136_T1 11901 669 80,2 glotblastn 5689 LYD360 chelidonium|11v1|SRR084752X101739_T1 11902 669 80,0 glotblastn 5690 LYD360 basilicum|10v1|DY329462_T1 11903 669 80,0 glotblastn 5691 LYD360 chickpea|09v2|GR403455_T1 11904 669 80,0 glotblastn 5692 LYD360 ginger|gb164|DY351005_T1 11905 669 80,0 glotblastn 5693 LYD360 nasturtium|10v1|SRR032558S0111187 11906 669 80,0 globlastp 5694 LYD360 pepper|gb171|P3M064746_T1 11907 669 80,0 glotblastn 5695 LYD361 b_oleracea|gb161|AM385405_T1 11908 670 99,2 glotblastn 5696 LYD361 tripterygium|11v1|SRR098677X138468_T1 11909 670 84,8 glotblastn 5697 LYD361 flaveria|11v1|SRR149229.122667_T1 11910 670 83,9 glotblastn tabernaemontana|11v1|SRR098689X125809 5698 LYD361 11911 670 83,9 glotblastn _T1 5699 LYD361 parthenium|10v1|GW786680_T1 11912 670 83,9 glotblastn 5700 LYD361 ambrosia|11v1|SRR346935.133224_T1 11913 670 83,1 glotblastn 5701 LYD361 cynara|gb167|GE577457_T1 11914 670 83,1 glotblastn 5702 LYD361 cichorium|gb171|EL347127_T1 11915 670 82,4 glotblastn 5703 LYD361 heritiera|10v1|SRR005794S0007778_T1 11916 670 82,4 glotblastn 5704 LYD361 amsonia|11v1|SRR098688X100426_T1 11917 670 82,2 glotblastn 5705 LYD361 senecio|gb170|DY658023 11918 670 81,7 glotblastn cleome_gynandra|10v1|SRR015532S001169 5706 LYD361 11919 670 80,7 glotblastn 5_T1 5707 LYD364 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AH21H_T1 11920 671 95,6 glotblastn 5708 LYD364 b_juncea|10v2|E6ANDIZ02F6CV4_T1 11921 671 94,7 glotblastn 5709 LYD364 ipomoea_ni1|10v1|3J561612_T1 11922 671 92,9 glotblastn nicotiana_benthamiana|gb162|CK281812_T 5710 LYD364 11923 671 92,0 glotblastn 1 5711 LYD364 tobacco|gb162|EB450183 11924 671 92,0 glotblastn 5712 LYD364 ambrosia|11v1|SRR346935.106828_T1 11925 671 91,2 glotblastn 5713 LYD364 ambrosia|11v1|SRR346935.112131_T1 11926 671 91,2 glotblastn 5714 LYD364 ambrosia|11v1|SRR346943.139013_T1 11927 671 91,2 glotblastn 5715 LYD364 flax|11v1|GW865802_T1 11928 671 91,2 glotblastn 5716 LYD364 flax|11v1|JG173317_T1 11929 671 91,2 glotblastn 5717 LYD364 sunflower|10v1|P3U023818 11930 671 91,2 glotblastn 5718 LYD364 tragopogon|10v1|SRR020205S0006230 11931 671 91,2 glotblastn 5719 LYD364 arnica|11v1|SRR099034X133755_T1 11932 671 90,3 glotblastn 5720 LYD364 flaveria|11v1|SRR149229.121780_T1 11933 671 90,3 glotblastn 5721 LYD364 trigonella|11v1|SRR066195X726617_T1 11934 671 90,3 glotblastn 5722 LYD364 apple|gb171|CN945125 11935 671 90,3 glotblastn 5723 LYD364 eucalyptus|gb166|CU397180 11936 671 90,3 glotblastn

270 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 5724 LYD364 peanut|10v1|EE125876_T1 11937 671 90,3 glotblastn 5725 LYD364 potato|10v1|CK253656_T1 11938 671 90,3 glotblastn 5726 LYD364 solanum_phureja|09v1|SPHAWO31194 11938 671 90,3 glotblastn 5727 LYD364 tragopogon|10v1|8SRR020205S003522 11939 671 90,3 glotblastn 5728 LYD364 cirsium|11v1|SRR346952.1004435_T1 11940 671 89,4 glotblastn 5729 LYD364 cirsium|11v1|SRR349641.175990_T1 11941 671 89,4 glotblastn 5730 LYD364 cucurbita|11v1|SRR091276X119946_T1 11942 671 89,4 glotblastn 5731 LYD364 flaveria|11v1|SRR149229.169963_T1 11943 671 89,4 glotblastn 5732 LYD364 fraxinus|11v1|SRR058827.102531_T1 11944 671 89,4 glotblastn 5733 LYD364 valeriana|11v1|SRR099039X42953_T1 11945 671 89,4 glotblastn 5734 LYD364 chestnut|gb170|SRR00629550053605_T1 11946 671 89,4 glotblastn 5735 LYD364 eggplant|10v1|FS047507_T1 11947 671 89,4 glotblastn amorphophallus|11v2|SRR089351X161177_ 11948 671 5736 LYD364 88,5 , glotblastn T1 5737 LYD364 cirsium|11v1|SRR346952.10377_T1 11949 671 88,5 glotblastn 5738 LYD364 silene|11v1|SRR096785X11002_T1 11950 671 88,5 glotblastn 5739 LYD364 aristolochia|10v1|FD751247_T1 11951 671 88,5 glotblastn 5740 LYD364 grape|11v1|GSVIVT01016640001_T1 11952 671 88,5 glotblastn 5741 LYD364 grape|gb160|CA816039 11953 671 88,5 glotblastn 5742 LYD364 cirsium|11v1|SRR346952.1066385_T1 11954 671 87,6 glotblastn 5743 LYD364 eucalyptus|11v2|SRR001659X139344_T1 11955 671 87,6 glotblastn sarracenia|11v1|SRR192669.109882XX2_T 5744 LYD364 11956 671 87,6 glotblastn 1 5745 LYD364 amaranthus|10v1|SRR039411S0006119_T1 11957 671 87,6 glotblastn 5746 LYD364 artemisia|10v1|EY083311_T1 11958 671 87,6 glotblastn 5747 LYD364 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0001409 11959 671 87,6 glotblastn 5748 LYD364 cedrus|11v1|SRR065007X122227_T1 11960 671 86,7 glotblastn 5749 LYD364 fagopyrum|11v1|SRR063689X127821_T1 11961 671 86,7 glotblastn 5750 LYD364 cotton|10v2|SRRO32877S0003205_T1 11962 671 86,7 glotblastn 751 LYD364 gnetum|10v1|SRR064399S0027176_T1 11963 671 86,7 glotblastn 5752 LYD364 rice|gb170|OS05G38670 11964 671 86,7 glotblastn 5753 LYD364 sequoia|10v1|SRR065044S0055390 11965 671 86,7 glotblastn 5754 LYD364 spruce|gb162|CO256190 11966 671 86,7 glotblastn 5755 LYD364 wheat|10v2|CA619872 11967 671 86,7 glotblastn amorphophallus|11v2|SRR089351X156007_ 11968 671 5756 LYD364 85,8 glotblastn T1 5757 LYD364 cephalotaxus|11v1|SRR064395X114663_T1 11969 671 85,8 glotblastn 5758 LYD364 chelidonium|11v1|SRR084752X140022_T1 11970 671 85,8 glotblastn 5759 LYD364 barley|10v2|AJ461622_T1 11971 671 85,8 glotblastn 5760 LYD364 brachypodium|09v1|GT791460_T1 11972 671 85,8 glotblastn foxtail_millet|10v2|FXTRMSLX01701757D 5761 LYD364 11973 671 85,8 glotblastn 2 5762 LYD364 foxtail_millet|11v3|PHY7S1001645M_T1 11974 671 85,8 glotblastn 5763 LYD364 leymus|gb166|EG375301_T1 11975 671 85,8 glotblastn 5764 LYD364 millet|10v1|EV0454PM014724_T1 11976 671 85,8 glotblastn 5765 LYD364 rice|gb170|OS01G62070 11977 671 85,8 glotblastn 5766 LYD364 sciadopitys|10v1|SRR065035S0042595 11978 671 85,8 glotblastn 5767 LYD364 switchgrass|gb167|FE636275 11979 671 85,8 glotblastn 5768 LYD364 switchgrass|gb167|FL689954 11980 671 85,8 glotblastn 5769 LYD364 wheat|10v2|CD910406 11981 671 85,8 glotblastn 5770 LYD364 euphorbia|11v1|3P956540_P1 11982 671 85,8 globlastp cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0227074 5771 LYD364 11983 671 85,7 globlastp _P1 5772 LYD364 thellungiella|gb167|BY801460 11984 671 85,4 globlastp maritime_pine|10v1|SRR073317S0041913_ 5773 LYD364 11985 671 85,0 glotblastn T1 5774 LYD364 platanus|11v1|SRR096786X142855_T1 11986 671 85,0 glotblastn 5775 LYD364 barley|10v2|AK250937_T1 11987 671 85,0 glotblastn 5776 LYD364 fescue|gb161|DT695847_T1 11988 671 85,0 glotblastn 5777 LYD364 maize|10v1|BE056147_T1 11989 671 85,0 glotblastn 5778 LYD364 oat|10v2|GR313367 11990 671 85,0 glotblastn 5779 LYD364 oat|11v1|1GR313367_T1 11991 671 85,0 glotblastn

271 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 5780 LYD364 pine|10v2|BQ696882_T1 11992 671 85,0 glotblastn 5781 LYD364 podocarpus|10v1|SRR065014S0014985_T1 11993 671 85,0 glotblastn 5782 LYD364 sorghum|09v1|SB03G039220 11994 671 85,0 glotblastn 5783 LYD364 sorghum|11v1|SB03G039220_T1 11994 671 85,0 glotblastn 5784 LYD364 sugarcane|10v1|CA102804 11995 671 85,0 glotblastn 5785 LYD364 b_rapa|gb162|DN191492_T1 11996 671 84,4 glotblastn 5786 LYD364 phalaenopsis|11v1|CK857898_T1 11997 671 84,1 glotblastn 5787 LYD364 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1001015_T1 11998 671 84,1 glotblastn 5788 LYD364 pteridium|11v1|SRR043594X100119_T1 11999 671 84,1 glotblastn 5789 LYD364 brachypodium|09v1|GT795519_T1 12000 671 84,1 glotblastn 5790 LYD364 cryptomeria|gb166|BY901929_T1 12001 671 84,1 glotblastn 5791 LYD364 cycas|gb166|EX925953_T1 12002 671 84,1 glotblastn 5792 LYD364 taxus|10v1|SRR032523S0006190 12003 671 84,1 glotblastn 5793 LYD364 zostera|10v1|SRR057351S0003681 12004 671 84,1 glotblastn 5794 LYD364 cucurbita|11v1|SRR091276X214940_P1 12005 671 84,0 globlastp 5795 LYD364 distylium|11v1|SRR065077X107821_T1 12006 671 83,2 glotblastn 5796 LYD364 momordica|10v1|SRR071315S0000271_T1 12007 671 83,2 glotblastn 5797 LYD364 oat|10v2|SRR020741S0038718 12008 671 82,8 glotblastn 5798 LYD364 oat|11v1|SRR020741.131397_T1 12009 671 82,8 glotblastn 5799 LYD364 olea|11v1|ISRR014463.56253_P1 12010 671 82,5 globlastp 5800 LYD364 cephalotaxus|11v1|SRR064395X137359_T1 12011 671 82,3 glotblastn 5801 LYD364 Foxtail_millet|10v2|SICRP002033 12012 671 81,4 glotblastn 5802 LYD364 foxtail_millet|11v3|PHY7SI022202M_T1 12013 671 81,4 glotblastn 5803 LYD364 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0016187 12014 671 81,4 glotblastn 5804 LYD364 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0106471 12015 671 81,4 glotblastn 5805 LYD364 abies|11v2|SRR098676X127699_T1 12016 671 80,5 glotblastn 5806 LYD364 sciadopitys|10v1|SRR065035S0157226 12017 671 80,5 glotblastn 5807 LYD365 canola|11v1|ES984275_T1 12018 672 91,2 glotblastn 5808 LYD365 radish|gb164|EX761695 12019 672 88,3 globlastp 5809 LYD365 radish|gb164|EX775330 12020 672 87,2 glotblastn 5810 LYD365 thellungiella|gb167|BY810879 12021 672 87,0 globlastp 5811 LYD365 canola|11v1|GT072857_P1 12022 672 86,2 globlastp 5812 LYD365 cotton|10v2|DW488586_T1 12023 672 80,4 glotblastn 5813 LYD366 radish|gb164|EV535443 12024 673 96,2 glotblastn 5814 LYD366 canola|11v1|CD813578_T1 12025 673 87,3 glotblastn 5815 LYD366 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01ES9WJ_T1 12026 673 87,3 glotblastn 5816 LYD366 radish|gb164|EX897742 12027 673 85,8 glotblastn 5817 LYD366 radish|gb164|FD560502 12028 673 85,3 glotblastn 5818 LYD366 canola|10v1|EV014524 12029 673 80,9 globlastp cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0007269 5819 LYD367 12030 674 98,2 glotblastn _T1 5820 LYD367 papaya|gb165|EX260912_T1 12031 674 95,5 glotblastn 5821 LYD367 cucurbita|11v1|SRR091276X204950_T1 12032 674 94,6 glotblastn 5822 LYD367 aquilegial|10v2|DR933416_T1 12033 674 94,6 glotblastn 5823 LYD367 castorbean|11v1|E0669531_T1 12034 674 94,6 glotblastn 5824 LYD367 melon|10v1|AM714178_T1 12035 674 93,6 glotblastn 5825 LYD367 cirsium|11v1|SRR346952,1000932_T1 12036 674 92,7 glotblastn 5826 LYD367 aristolochia|10v1|FD751804_T1 12037 674 92,7 glotblastn 5827 LYD367 avocado|10v1|CV004504_T1 12038 674 92,7 glotblastn 5828 LYD367 castorbean|09v1|NM002520858 12039 674 92,7 glotblastn 5829 LYD367 centaureia|gb166|EH729011_T1 12040 674 92,7 glotblastn 5830 LYD367 citrus|gb166|EY718574_T1 12041 674 92,7 glotblastn 5831 LYD367 grape|gb160|DT006013 12042 674 92,7 glotblastn 5832 LYD367 liriodendron|gb166|FD491724_T1 12043 674 92,7 glotblastn 5833 LYD367 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0001846 12044 674 92,7 glotblastn 5834 LYD367 abies|11v2|SRR098676X110149_T1 12045 674 91,8 glotblastn 5835 LYD367 chelidonium|11v1|SRR084752X111167_T1 12046 674 91,8 glotblastn 5836 LYD367 flax|11v1|GW864933_T1 12047 674 91,8 glotblastn 5837 LYD367 fraxinus|11v1|SRR058827.106277_T1 12048 674 91,8 glotblastn 5838 LYD367 chestnut|gb170|SRR00629750073285_T1 12049 674 91,8 glotblastn 5839 LYD367 citrus|gb166|CB293725_T1 12050 674 91,8 glotblastn 5840 LYD367 nasturtium|10v1|SRR032558S0003127 12051 674 91,8 glotblastn

272 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 5841 LYD367 nasturtium|10v1|SRR03255850011900 12052 674 91,8 glotblastn 5842 LYD367 nuphar|gb166|CK763308_T1 12053 674 91,8 glotblastn 5843 LYD367 oak|10v1|FP029855_T1 12054 674 91,8 glotblastn 5844 LYD367 sequoia|10v1|SRR065044S0012683 12055 674 91,8 glotblastn 5845 LYD367 solanum_phureja|09v1|SPHAW035221 12056 674 91,8 glotblastn 5846 LYD367 spruce|gb162|CO220971 12057 674 91,8 glotblastn 5847 LYD367 spruce|gb162|CO223147 12058 674 91,8 glotblastn 5848 LYD367 walnuts|gb166|CV196814 12059 674 91,8 glotblastn 5849 LYD367 zostera|10v1|SRR057351S0000726 12060 674 91,8 glotblastn 5850 LYD367 ambrosia|11v1|SRR346935,105602_T1 12061 674 90,9 glotblastn 5851 LYD367 cannabis|12v1|SOLX00007976_T1 12062 674 90,9 glotblastn 5852 LYD367 cirsium|11v1|SRR346952.1076540_T1 12063 674 90,9 glotblastn 5853 LYD367 cirsium|11v1|SRR346952.130641_ T1 12064 674 90,9 glotblastn 5854 LYD367 cirsium|11v1|SRR346952.283708XX2_T1 12065 674 90,9 glotblastn 5855 LYD367 flaveria|11v1|SRR149229.132370_T1 12066 674 90,9 glotblastn 5856 LYD367 flaveria|11v1|SRR149229.32333_T1 12067 674 90,9 glotblastn 5857 LYD367 flaveria|11v1|SRR149229.507541_T1 12068 674 90,9 glotblastn 5858 LYD367 flaveria|11v1|SRR149238.359193_T1 12069 674 90,9 glotblastn 5859 LYD367 maritime_pine|10v1|CT576292_T1 12070 674 90,9 glotblastn 5860 LYD367 olea|11v1|SRR014463.14519_T1 12071 674 90,9 glotblastn 5861 LYD367 trigonella|11v1|SRR066194X106720_T1 12072 674 90,9 glotblastn 5862 LYD367 trigonella|11v1|SRR066194X519652_T1 12073 674 90,9 glotblastn 5863 LYD367 tripterygium|11v1|SRR098677X106952_T1 12074 674 90,9 glotblastn 5864 LYD367 vinca|11v1|SRR098690X116305_T1 12075 674 90,9 glotblastn 5865 LYD367 apple|11v1|CN492832_T1 12076 674 90,9 glotblastn 5866 LYD367 apple|gb171|CN544831 12077 674 90,9 glotblastn 5867 LYD367 artemisia|10v1|EY079311_T1 12078 674 90,9 glotblastn 5868 LYD367 ceratodon|10v1|SRR07489050000494_T1 12079 674 90,9 glotblastn 5869 LYD367 cryptomeria|gb166|BW996943_T1 12080 674 90,9 glotblastn 5870 LYD367 cycas|gb166|CB092562_T1 12081 674 90,9 glotblastn 5871 LYD367 gnetum|10v1|CB082032_T1 12082 674 90,9 glotblastn 5872 LYD367 ipomoea_ni|10v1|P3J564547_T1 12083 674 90,9 glotblastn 5873 LYD367 kiwi|gb166|FG397176_T1 12084 674 90,9 glotblastn 5874 LYD367 medicago|09v1|AW256785_T1 12085 674 90,9 glotblastn 5875 LYD367 peanut|10v1|ES719984_T1 12086 674 90,9 glotblastn 5876 LYD367 pepper|gb171|CA522688_T1 12087 674 90,9 glotblastn 5877 LYD367 physcomitrella|10v1|P3J192437_T1 12088 674 90,9 glotblastn 5878 LYD367 pigeonpea|10v1|SRR054580S0000703_T1 12089 674 90,9 glotblastn 5879 LYD367 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0001434 12090 674 90,9 glotblastn 5880 LYD367 rhizophora|10v1|SRR005793S0002403 12091 674 90,9 glotblastn 5881 LYD367 spikemoss|gb165|DN839472 12092 674 90,9 glotblastn 5882 LYD367 spikemoss|gb165|FE452380 12092 674 90,9 glotblastn 5883 LYD367 sunflower|10v1|AJ828638 12093 674 90,9 glotblastn 5884 LYD367 ambrosia|11v1|SRR346935.147733_T1 12094 674 90,0 glotblastn 5885 LYD367 ambrosia|11v1|SRR346935.178069_T1 12095 674 90,0 glotblastn amorphophallus|11v2|SRR089351X112951_ 5886 LYD367 12096 674 90,0 glotblastn T1 5887 LYD367 arnica|11v1|SRR099034X159126_T1 12097 674 90,0 glotblastn 5888 LYD367 cirsium|11v1|SRR346952.1172107_T1 12098 674 90,0 glotblastn 5889 LYD367 cirsium|11v1|SRR346952.117874_T1 12099 674 90,0 glotblastn 5890 LYD367 fagopyrum|11v1|SRR063689X11984_T1 12100 674 90,0 glotblastn 5891 LYD367 flaveria|11v1|SRR149229.104797_T1 12101 674 90,0 glotblastn 5892 LYD367 flaveria|11v1|SRR149229.138180_T1 12102 674 90,0 glotblastn 5893 LYD367 flaveria|11v1|SRR149229.367117_T1 12103 674 90,0 glotblastn 5894 LYD367 vinca|11v1|SRR098690X104064_T1 12104 674 90,0 glotblastn 5895 LYD367 aquilegia|10v2|DR923174_T1 12105 674 90,0 glotblastn 5896 LYD367 centaureia|gb166|EH732999_T1 12106 674 90,0 glotblastn 5897 LYD367 lotus|09v1|AV771851_T1 12107 674 90,0 glotblastn 5898 LYD367 peanut|10v1|G0263445_T1 12108 674 90,0 glotblastn 5899 LYD367 pepper|gb171|GD087782_T1 12109 674 90,0 glotblastn 5900 LYD367 physcomitrella|10v1|AW699394_T1 12110 674 90,0 glotblastn 5901 LYD367 pigeonpea|10v1|SRR054580S0004838_T1 12111 674 90,0 glotblastn

273 / 378 Hom Polin. Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden. Algor. ID Nome do Gene NO: ID glob. NO: NO: 5902 LYD367 taxus|10v1|SRR032523S0006400XX1 12112 674 89,3 glotblastn 5903 LYD367 ambrosia|11v1|SRR346935.100427_T1 12113 674 89,1 glotblastn 5904 LYD367 ambrosia|11v1|SRR346935.2799_T1 12114 674 89,1 glotblastn 5905 LYD367 cirsium|11v1|SRR346952.1054548_T1 12115 674 89,1 glotblastn 5906 LYD367 pteridium|11v1|SRR043594X223763_T1 12116 674 89,1 glotblastn 5907 LYD367 scabiosa|11v1|SRR063723X1469_T1 12117 674 89,1 glotblastn valeriana|11v1|SRR099039X119875XX2_T 5908 LYD367 12118 674 89,1 glotblastn 1 5909 LYD367 amaranthus|10v1|SRR039411S0012428_T1 12119 674 89,1 glotblastn 5910 LYD367 banana|10v1|DN238108_T1 12120 674 89,1 glotblastn 5911 LYD367 bean|gb167|CA913133_T1 12121 674 89,1 glotblastn 5912 LYD367 cichorium[|gb171|EH691389_T1 12122 674 89,1 glotblastn 5913 LYD367 cichorium|gb171|EH700899_T1 12123 674 89,1 glotblastn 5914 LYD367 cynara|gb167|GE602515_T1 12124 674 89,1 glotblastn Polin. nome do Agrupamento to Hom para Polip. % SEQ Horn SEQ Gene SEQ ID glob. Algor.

ID ID Nome NO: iden. NO: NO: 5915 LYD367 oil_palm|gb166|EL688509_T1 12125 674 89,1 glotblastn 5916 LYD367 peanut|10v1|DT044311_T1 12126 674 89,1 glotblastn 5917 LYD367 pigeonpea|10v1|SRR054580S0002792_T1 12127 674 89,1 glotblastn 5918 LYD367 sunflower|10v1|CF078055 12128 674 89,1 glotblastn 5919 LYD367 sequoia|10v1|SRR065044S0105538 12129 674 88,4 glotblastn amorphophallus|11v2|SRR089351X261661_ 5920 LYD367 12130 674 88,2 glotblastn T1 5921 LYD367 arnica|11v1|SRR099034X134252_T1 12131 674 88,2 glotblastn 5922 LYD367 cirsium|11v1|SRR346952.468708_T1 12132 674 88,2 glotblastn 5923 LYD367 flaveria|11v1|SRR149229.101706_T1 12133 674 88,2 glotblastn 5924 LYD367 maritime_pine|10v1|CT581036_T1 12134 674 88,2 glotblastn 5925 LYD367 phyla|11v2|SRR099038X9150_T1 12135 674 88,2 glotblastn 5926 LYD367 plantago|11v1|SRR066373X130326_T1 12136 674 88,2 glotblastn 5927 LYD367 pteridiuml|11v1|SRR043594X111779_T1 12137 674 88,2 glotblastn 5928 LYD367 artemisia|10v1|EY085181_T1 12138 674 88,2 glotblastn 5929 LYD367 citrus|gb166|EY752937_T1 12139 674 88,2 glotblastn 5930 LYD367 lettuce|10v1|DWO74593_T1 12140 674 88,2 glotblastn 5931 LYD367 medicago|09v1|AW689662_T1 12141 674 88,2 glotblastn 5932 LYD367 pine|10v2|BE762098_T1 12142 674 88,2 glotblastn 5933 LYD367 rice|gb170|0S05G40410 12143 674 88,2 glotblastn 5934 LYD367 tragopogon|10v1|SRR020205S0002294 12144 674 88,2 glotblastn 5935 LYD367 triphysaria|10v1|EX983322 12145 674 88,2 glotblastn 5936 LYD367 distylium|11v1|SRR065077X115608_T1 12146 674 87,5 glotblastn 5937 LYD367 arnica|11v1|ISRR099034X144079_T1 12147 674 87,3 glotblastn 5938 LYD367 phyla|11v2|SRR099035X115629_T1 12148 674 87,3 glotblastn 5939 LYD367 trigonella|11v1|SRR066194X147598_T1 12149 674 87,3 glotblastn 5940 LYD367 aristolochia|10v1|SRR039082S0006000_T1 12150 674 87,3 glotblastn 5941 LYD367 brachypodium|09v1|DV472362_T1 12151 674 87,3 glotblastn 5942 LYD367 cenchrus|gb166|EB661926_T1 12152 674 87,3 glotblastn 5943 LYD367 dandelion|10v1|DR400957_T1 12153 674 87,3 glotblastn foxtail_millet|10v2|FXTRMSLX05049312D 5944 LYD367 12154 674 87,3 glotblastn 2 5945 LYD367 foxtail_millet|11v3|PHY7SI021998M_T1 12155 674 87,3 glotblastn 5946 LYD367 maize|10v1|AWO91026_T1 12156 674 87,3 glotblastn 5947 LYD367 mi11et|10v1|EV0454PM009739_T1 12157 674 87,3 glotblastn 5948 LYD367 nuphar|gb166|ES730419_T1 12158 674 87,3 glotblastn 5949 LYD367 sorghum|09v1| SB09G023710 12159 674 87,3 glotblastn 5950 LYD367 sorghum|11v1|SB09G023710_T1 12159 674 87,3 glotblastn 5951 LYD367 soybean|11v1|GLYMA09G40710 12160 674 87,3 glotblastn 5952 LYD367 soybean|11v1|GLYMA18G45110 12161 674 87,3 glotblastn 5953 LYD367 sugarcane|10v1|CA119210 12162 674 87,3 glotblastn 5954 LYD367 switchgrass|gb167|FE644637 12163 674 87,3 glotblastn 5955 LYD367 cephalotaxus|11v1|SRR064395X125946_T1 - 674 86,6 glotblastn 5956 LYD367 ambrosia|11v1|SRR346935.198800_T1 12164 674 86,4 glotblastn

274 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 5957 LYD367 scabiosa|11v1|SRR063723X127554_T1 12165 674 86,4 glotblastn 5958 LYD367 maize|10v1|AW067260_T1 12166 674 86,4 glotblastn 5959 LYD367 poplar|10v1|PT2CRP012145_T1 12167 674 86,4 glotblastn 5960 LYD367 switchgrass|gb167|FE602844 12168 674 86,4 glotblastn 5961 LYD367 cedrus|11v1|SRR065007X30235_T1 12169 674 85,5 glotblastn 5962 LYD367 olea|11v1|SRR014463.17446_T1 12170 674 85,5 glotblastn 5963 LYD367 phalaenopsis|11v1|SRR125771.100655_T1 12171 674 85,5 glotblastn 5964 LYD367 phyla|11v2|SRR099035X102998_T1 12172 674 85,5 glotblastn 5965 LYD367 safflower|gb162|EL386802 12173 674 85,5 glotblastn 5966 LYD367 triphysaria|10v1|EY140069 12174 674 85,5 glotblastn 5967 LYD367 utricularia|11v1|SRR094438.16248_T1 12175 674 84,6 glotblastn 5968 LYD367 barley|10v2|B1950418_T1 12176 674 84,6 glotblastn 5969 LYD367 ginger|gb164|DY357344_T1 12177 674 84,6 glotblastn 5970 LYD367 oat|10v2|G0590080 12178 674 84,6 glotblastn 5971 LYD367 oat|11v1|G0590080_T1 12178 674 84,6 glotblastn 5972 LYD367 sarracenia|11v1|SRR192671.80839_1 12179 674 83,8 globlastp 5973 LYD367 silene|11v1|SRR096785X27468_T1 12180 674 83,6 glotblastn 5974 LYD367 artemisia|10v1|EY043419_T1 12181 674 83,6 glotblastn 5975 LYD367 fescue|gb161|DT689636_T1 12182 674 83,6 glotblastn 5976 LYD367 oil_palm|gb166|EL689018_T1 12183 674 83,6 glotblastn 5977 LYD367 orobanche|10v1|SRR02318950021385_T1 12184 674 83,6 glotblastn 5978 LYD367 wheat|10v2|BE419765 12185 674 83,6 glotblastn 5979 LYD367 guizotia|10v1|GE569234_T1 - 674 83,6 glotblastn 5980 LYD367 pseudoroegneria|gb167|FF355597 12186 674 82,7 glotblastn 5981 LYD367 rice|gb170|0S12G31440 12187 674 82,7 glotblastn 5982 LYD367 centaureia|gb166|EH718339_T1 12188 674 82,3 glotblastn 5983 LYD367 platanus|11v1|SRR096786X204003_T1 12189 674 81,8 glotblastn 5984 LYD367 sorghum|09v1|SB08G015420 12190 674 81,8 glotblastn 5985 LYD367 sorghum|11v1|SBO8G015420_T1 12190 674 81,8 glotblastn 5986 LYD367 fagopyrum|11v1|SRR063689X103151_T1 12191 674 80,9 glotblastn 5987 LYD367 amborella|gb166|CD482229_T1 12192 674 80,9 glotblastn 5988 LYD367 brachypodium|09v1|GT813693_T1 12193 674 80,9 glotblastn 5989 LYD367 citrus|gb166|DN958969_T1 12194 674 80,9 glotblastn 5990 LYD367 maize|10v1|AI964659_T1 12195 674 80,9 glotblastn 5991 LYD367 sugarcane|10v1|CA087697 12196 674 80,9 glotblastn 5992 LYD367 clementine|11v1|CX295745_T1 12197 674 80,0 glotblastn 5993 LYD367 barley|10v2|BE437313_T1 12198 674 80,0 glotblastn 5994 LYD367 pseudoroegneria|gb167|FF365401 12199 674 80,0 glotblastn 5995 LYD367 rice|gb170|0S01G60200 12200 674 80,0 glotblastn 5996 LYD367 switchgrass|gb167|DN141731 12201 674 80,0 glotblastn 5997 LYD367 switchgrass|gb167|FE614785 12202 674 80,0 glotblastn 5998 LYD367 wheat|10v2|BQ743752 12203 674 80,0 glotblastn 5999 LYD371 fescue|gb161|DT681155_T1 12204 675 81,5 glotblastn 6000 LYD376 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01CYQ9J_P1 12205 676 97,3 globlastp 6001 LYD376 canola|11v1|EV095015_T1 12206 676 97,2 glotblastn 6002 LYD376 canola|11v1|EV099299_T1 12207 676 97,2 glotblastn 6003 LYD376 radish|gb164|FD543910 12208 676 96,1 glotblastn 6004 LYD376 b_rapa|gb162|DN964030_P1 12209 676 95,7 globlastp 6005 LYD376 canola|11v1|EE493324_T1 12210 676 91,7 glotblastn 6006 LYD376 canola|11v1|SRR023612.10965_T1 12211 676 89,5 glotblastn 6007 LYD376 b_oleracea|gb161|AM057497_P1 12212 676 89,5 globlastp cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0047913 6008 LYD376 12213 676 84,5 glotblastn _T1 6009 LYD377 b rapa|gb162|C0749638_T1 12214 677 96,2 glotblastn 6010 LYD378 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01B3NIF_T1 12215 678 100,0 glotblastn 6011 LYD378 canola|11v1|DR697840_T1 12216 678 98,3 glotblastn 6012 LYD378 canola|11v1|SRR329661.339530_T1 12217 678 98,3 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|EHPRD0423 6013 LYD378 12218 678 98,3 glotblastn 25_T1 6014 LYD378 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A5MR8_T1 12219 678 98,3 glotblastn 6015 LYD378 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AHDOV_T1 12220 678 98,3 glotblastn 6016 LYD378 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01APB48_T1 12221 678 98,3 glotblastn

275 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 6017 LYD378 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BLJ36_T1 12222 678 98,3 glotblastn b_juncea|10v2|OXBJ1SLX00000927D1T1_ 6018 LYD378 12223 678 98,3 glotblastn T1 6019 LYD378 b_juncea|10v2|OXBJ1SLX00001601T1_T1 12222 678 98,3 glotblastn b_juncea|10v2|OXBJ1SLX00006377D2Tl_ 6020 LYD378 12224 678 98,3 glotblastn T1 6021 LYD378 radish|gb164|EV546476 12225 678 98,3 glotblastn 6022 LYD378 radish|gb164|EV547145 12226 678 98,3 glotblastn 6023 LYD378 radish|gb164|EX901507 12227 678 98,3 glotblastn 6024 LYD378 radish|gb164|EY926429 12228 678 98,3 glotblastn 6025 LYD378 canola|11v1|CX192418 T1 12229 678 97,4 glotblastn 6026 LYD378 canola|11v1|EV017982 T1 12230 678 97,4 glotblastn 6027 LYD378 canola|11v1|SRR329670.138543_T1 12231 678 97,4 glotblastn thellungiella_parvulum|11v1|EPPRD046860 6028 LYD378 12232 678 97,4 glotblastn _T1 6029 LYD378 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A5TKV_T1 12233 678 97,4 glotblastn 6030 LYD378 b_juncea|10v2|OXBJ1SLX00002868T1_T1 12234 678 97,4 glotblastn 6031 LYD378 b_juncea|10v2|E6ANDIZOlAJ2J7_T1 12235 678 96,5 glotblastn 6032 LYD378 b_nigra|09v1|GT075327_T1 12236 678 96,5 glotblastn thellungiella_parvulum|11v1|EPPRD131368 6033 LYD378 - 678 96,5 glotblastn _T1 6034 LYD378 thellungiella|gb167|BM985729 12237 678 95,6 glotblastn 6035 LYD378 potato|10v1|B1405371_T1 12238 678 94,7 glotblastn 6036 LYD378 poppy|gb166|FE965193_T1 12239 678 93,9 glotblastn 6037 LYD378 tomato|11v1|AW441457_T1 12240 678 93,0 glotblastn 6038 LYD378 basilicum|10v1|DY321719_T1 12241 678 93,0 glotblastn 6039 LYD378 basilicum|10v1|DY322263_T1 12242 678 93,0 glotblastn 6040 LYD378 cleome_spinosa|10v1|GR934036_T1 12243 678 93,0 glotblastn nicotiana_benthamiana|gb162|CN744909_T 6041 LYD378 12244 678 93,0 glotblastn 1 6042 LYD378 petunia|gb171|CV294287_T1 12245 678 93,0 glotblastn 6043 LYD378 potato|10v1|CK862426_T1 12246 678 93,0 glotblastn 6044 LYD378 salvia|10v1|SRR014553S0000193 12247 678 93,0 glotblastn 6045 LYD378 tomato|09v1|AW441457 12248 678 93,0 glotblastn 6046 LYD378 canola|11v1|SRR329671.232832_T1 12249 678 92,1 glotblastn 6047 LYD378 grapel|11v1|NM002266166_T1 12250 678 92,1 glotblastn 6048 LYD378 cenchrus|gb166|EB653648_T1 12251 678 92,1 glotblastn foxtail_millet|10v2|FXTRMSLX00260397D 6049 LYD378 12252 678 92,1 glotblastn 1 6050 LYD378 pseudoroegneria|gb167|FF340573 12253 678 92,1 glotblastn 6051 LYD378 salvia|10v1|CV163274 12254 678 92,1 glotblastn 6052 LYD378 switchgrass|gb167|DN146005 12255 678 92,1 glotblastn 6053 LYD378 tea|10v1|GE650198 12256 678 92,1 glotblastn 6054 LYD378 tobacco|gb162|DWO03613 12257 678 92,1 glotblastn 6055 LYD378 wheat|10v2|E3G905439 12258 678 92,1 glotblastn 6056 LYD378 fagopyrum|11v1|SRR063689X119786_T1 12259 678 91,2 glotblastn 6057 LYD378 flax|11v1|CA482372_T1 12260 678 91,2 glotblastn 6058 LYD378 olea|11v1|SRR014463.18226_T1 12261 678 91,2 glotblastn 6059 LYD378 bean|gb167|CA900869_T1 12262 678 91,2 glotblastn 6060 LYD378 brachypodium|09v1|DV470217_T1 12263 678 91,2 glotblastn 6061 LYD378 cynodon|10v1|DN987401_T1 12264 678 91,2 glotblastn 6062 LYD378 eggplant|10v1|FS002314_T1 12265 678 91,2 glotblastn 6063 LYD378 eggplant|10v1|FS012540_T1 12266 678 91,2 glotblastn foxtail_millet|10v2|OXFXTRMSLX 6064 LYD378 12267 678 91,2 glotblastn 00036801D1T1 6065 LYD378 lolium|10v1|DT670856_T1 12268 678 91,2 glotblastn 6066 LYD378 lovegrass|gb167|EH185845_T1 12269 678 91,2 glotblastn 6067 LYD378 nasturtium|10v1|GH169874 12270 678 91,2 glotblastn 6068 LYD378 sugarcane|10v1|AA842797 12271 678 91,2 glotblastn 6069 LYD378 wheat|10v2|E31750578 12272 678 91,2 glotblastn 6070 LYD378 cirsium|11v1|SRR346952.58083_T1 12273 678 90,4 glotblastn

276 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: cucurbita|11v1|SRR091276X125827XX1_T 6071 LYD378 12274 678 90,4 glotblastn 1 6072 LYD378 euphorbia|11v1|3P961123_T1 12275 678 90,4 glotblastn 6073 LYD378 platanus|11v1|SRR096786X106256_T1 12276 678 90,4 glotblastn 6074 LYD378 scabiosa|11v1|SRR063723X103616_T1 12277 678 90,4 glotblastn 6075 LYD378 thalictrum|11v1|SRR096787X110894_ T1 12278 678 90,4 glotblastn 6076 LYD378 amaranthus|10v1|SRR039411S0016258_T1 12279 678 90,4 glotblastn 6077 LYD378 basilicum|10v1|DY323438_T1 12280 678 90,4 glotblastn 6078 LYD378 cotton|10v2|SRR032367S0014733_T1 12281 678 90,4 glotblastn 6079 LYD378 cotton|10v2|SRR032367S0054688_T1 12282 678 90,4 glotblastn 6080 LYD378 eggplant|10v1|IFS001214_T1 12283 678 90,4 glotblastn 6081 LYD378 eucalyptus|gb166|CB967558 12284 678 90,4 glotblastn 6082 LYD378 leymus|gb166|EG390551_T1 12285 678 90,4 glotblastn 6083 LYD378 millet|10v1|CD724455_T1 12286 678 90,4 glotblastn 6084 LYD378 millet|10v1|EV0454PM000567_T1 12287 678 90,4 glotblastn 6085 LYD378 millet|10v1|EV0454PM022284_T1 12288 678 90,4 glotblastn 6086 LYD378 oak|10v1|FP026027_T1 12289 678 90,4 glotblastn 6087 LYD378 oat|10v2|CN821646 12290 678 90,4 glotblastn 6088 LYD378 oilpalm|gb166|EL688766_T1 12291 678 90,4 glotblastn 6089 LYD378 rye|gb166|BE705372 12292 678 90,4 glotblastn 6090 LYD378 switchgrass|gb167|FE598877 12293 678 90,4 glotblastn 6091 LYD378 walnuts|gb166|EL897331 12294 678 90,4 glotblastn 6092 LYD378 thellungiella|gb167|BY803395 12295 678 89,6 globlastp nicotiana_benthamiana|gb162|CN743220_P 6093 LYD378 12296 678 89,5 globlastp 1 6094 LYD378 cirsium|11v1|SRR346952.102806_T1 12297 678 89,5 glotblastn 6095 LYD378 flax|11v1|JG152039_T1 12298 678 89,5 glotblastn 6096 LYD378 fraxinus|11v1|SRR058827.118157_T1 12299 678 89,5 glotblastn 6097 LYD378 olea|11v1|SRR014463.12858_T1 12300 678 89,5 glotblastn 6098 LYD378 thalictrum|11v1|SRR096787X110831_T1 12301 678 89,5 glotblastn 6099 LYD378 watermelon|11v1|DV632146_T1 12302 678 89,5 glotblastn 6100 LYD378 beech|gb170|SRR006293S0000235_T1 12303 678 89,5 glotblastn 6101 LYD378 centaureia|gb166|EL931201_T1 12304 678 89,5 glotblastn 6102 LYD378 cichorium|gb171|EH702760_T1 12305 678 89,5 glotblastn 6103 LYD378 cotton|10v2|DW225932_T1 12306 678 89,5 glotblastn 6104 LYD378 cyamopsis|10v1|EG976318_T1 12307 678 89,5 glotblastn 6105 LYD378 dandelion|10v1|DR399897_T1 12308 678 89,5 glotblastn 6106 LYD378 ipomoea_ni|10v1|CJ772812_T1 12309 678 89,5 glotblastn 6107 LYD378 parthenium|10v1|GW779007_T1 12310 678 89,5 glotblastn 6108 LYD378 ambrosia|11v1|SRR346935.11544_T1 12311 678 88,6 glotblastn 6109 LYD378 cirsium|11v1|SRR346952.850956_T1 12312 678 88,6 glotblastn 6110 LYD378 flaveria|11v1|SRR149229.100557_T1 12313 678 88,6 glotblastn 6111 LYD378 flaveria|11v1|SRR149229.176667_T1 12314 678 88,6 glotblastn 6112 LYD378 flaveria|11v1|SRR149232.107512_T1 12315 678 88,6 glotblastn 6113 LYD378 flaveria|11v1|SRR149241.182232_T1 12316 678 88,6 glotblastn 6114 LYD378 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1215264_T1 12317 678 88,6 glotblastn 6115 LYD378 sarracenia|11v1|SRR192669.100339_T1 12318 678 88,6 glotblastn 6116 LYD378 apple|gb171|CN492192 12319 678 88,6 glotblastn 6117 LYD378 basilicum|10v1|DY322324 _T1 12320 678 88,6 glotblastn 6118 LYD378 clover|gb162|13B904781_T1 12321 678 88,6 glotblastn 6119 LYD378 curcuma|10v1|DY386249_T1 12322 678 88,6 glotblastn 6120 LYD378 gerbera|09v1|AJ750690_T1 12323 678 88,6 glotblastn 6121 LYD378 ginger|gb164|DY350120_T1 12324 678 88,6 glotblastn 6122 LYD378 heritiera|10v1|SRR005795S0023609_T1 12325 678 88,6 glotblastn 6123 LYD378 liquorice|gb171|FS272394_T1 12326 678 88,6 glotblastn 6124 LYD378 papaya|gb165|EX243807_T1 12327 678 88,6 glotblastn 6125 LYD378 peanut|10v1|G0262437_T1 12328 678 88,6 glotblastn 6126 LYD378 pigeonpea|10v1|EE604807_T1 12329 678 88,6 glotblastn 6127 LYD378 podocarpus|10v1|SRR065014S0417362_T1 12330 678 88,6 glotblastn 6128 LYD378 senecio|gb170|DY663965 12331 678 88,6 glotblastn 6129 LYD378 tamarix|gb166|EG969299 12332 678 88,6 glotblastn 6130 LYD378 tragopogon|10v1|SRR020205S0007434 12333 678 88,6 glotblastn

277 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 6131 LYD378 wheat|10v2|CK160708 12334 678 88,6 glotblastn 6132 LYD378 flaveria|11v1|SRR149229.150147_T1 12335 678 87,7 glotblastn 6133 LYD378 flaveria|11v1|SRR149232.334067_T1 12336 678 87,7 glotblastn 6134 LYD378 flaveria|11v1|SRR149238.1735_T1 12337 678 87,7 glotblastn 6135 LYD378 flaveria|11v1|SRR149238.209221_T1 12338 678 87,7 glotblastn 6136 LYD378 fraxinus|11v1|SRR058827.140953_T1 12339 678 87,7 glotblastn 6137 LYD378 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1070254_T1 12340 678 87,7 glotblastn 6138 LYD378 scabiosa|11v1|SRR063723X120394_T1 12341 678 87,7 glotblastn 6139 LYD378 artemisia|10v1|SRR019254S0105821 _T1 12342 678 87,7 glotblastn 6140 LYD378 avocado|10v1|CK756491_T1 12343 678 87,7 glotblastn 6141 LYD378 guizotia|10v1|GE561707_T1 12344 678 87,7 glotblastn 6142 LYD378 liriodendron|gb166|CK747315_T1 12345 678 87,7 glotblastn 6143 LYD378 medicago|09v1|AW560377_T1 12346 678 87,7 glotblastn 6144 LYD378 nuphar|gb166|CD474545_T1 12347 678 87,7 glotblastn 6145 LYD378 pineapple|10v1|DT336930_T1 12348 678 87,7 glotblastn 6146 LYD378 salvia|10v1|CV162297 12349 678 87,7 glotblastn 6147 LYD378 sugarcane|10v1|BQ537086 12350 678 87,7 glotblastn 6148 LYD378 flaveria|11v1|SRR149241.387648XX1_P1 12351 678 87,7 globlastp 6149 LYD378 fagopyrum|11v1|SRR063689X145018 _T1 12352 678 86,8 glotblastn 6150 LYD378 fagopyrum|11v1|SRR063703X119654_T1 12353 678 80 6,., glotblastn 6151 LYD378 amaranthus|10v1|SRR039411S0004407_T1 12354 678 86,8 glotblastn 6152 LYD378 cryptomeria|gb166|BP176209_T1 12355 678 86,8 glotblastn 6153 LYD378 cynara|gb167|GE588994_T1 12356 678 86,8 glotblastn 6154 LYD378 pigeonpea|10v1|GW353751_T1 12357 678 86,8 glotblastn 6155 LYD378 pea|11v1|CD858828_T1 12358 678 86,8 glotblastn 6156 LYD378 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1019125_T1 12359 678 86,0 glotblastn 6157 LYD378 banana|10v1|FF558128_T1 12360 678 86,0 glotblastn 6158 LYD378 ipomoea_batatas|10v1|EE881828_T1 12361 678 86,0 glotblastn 6159 LYD378 peanut|10v1|SRR042413S0012947_T1 12362 678 86,0 glotblastn 6160 LYD378 canola|11v1|SRR341920.1055881_T1 12363 678 85,6 glotblastn 6161 LYD378 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1032981_T1 12364 678 85,1 glotblastn 6162 LYD378 primula|11v1|SRR098679X131473_T1 12365 678 85,1 glotblastn 6163 LYD378 pea|09v1|CD858828 12366 678 85,1 glotblastn 6164 LYD378 potato|10v1|EG012661_P1 12367 678 84,8 globlastp 6165 LYD378 flaveria|11v1|SRR149232.107286_T1 12368 678 84,2 glotblastn 6166 LYD378 ginger|gb164|DY357331_T1 12369 678 84,2 glotblastn 6167 LYD378 maize|10v1|A1714876_T1 12370 678 84,2 glotblastn 6168 LYD378 parthenium|10v1|GW778444 _T1 12371 678 84,2 glotblastn 6169 LYD378 melon|10v1|VMEL00687014123493_P1 12372 678 83,9 globlastp 6170 LYD378 ipomoea_ni1|10v1|P3J567405_T1 12373 678 83,5 glotblastn 6171 LYD378 primula|11v1|SRR098679X105050_T1 12374 678 83,3 glotblastn 6172 LYD378 ginger|gb164|DY362679_T1 12375 678 83,3 glotblastn 6173 LYD378 tobacco|gb162|AM794012 12376 678 83,3 globlastp 6174 LYD378 cryptomeria|gb162|BW994348_P1 12377 678 82,9 globlastp 6175 LYD378 zamia|gb166|FD766929 12378 678 82,5 glotblastn 6176 LYD378 flaveria|11v1|SRR149232.149174_P1 12379 678 82,1 globlastp 6177 LYD378 pine|10v2|SRR063935S0213665_T1 12380 678 82,1 glotblastn 6178 LYD378 utricularia|11v1|SRR094438.100048_T1 12381 678 81,9 glotblastn 6179 LYD378 potato|10v1|BG600955_P1 12382 678 81,6 globlastp 6180 LYD378 utricularia|11v1|SRR094438.111220_T1 12383 678 81,6 glotblastn 6181 LYD378 eitnis|gb166|CD573955_T1 12384 678 81,6 glotblastn 6182 LYD378 bean|gb167|CA900866_P1 12385 678 81,2 globlastp 6183 LYD378 fraxinus|11v1|SRR058827.11107_P1 12386 678 81,1 globlastp 6184 LYD378 petunia|gb171|FN020079_T1 12387 678 80,7 glotblastn 6185 LYD380 cotton|10v2|SRR032367S0002872_T1 12388 679 99,2 glotblastn 6186 LYD380 cacao|10v1|CU491446 _T1 12389 679 81,7 glotblastn 6187 LYD388 humulusl|11v1|PX517382_T1 12390 681 92,2 glotblastn 6188 LYD388 pigeonpea|10v1|GW358596_P1 12391 681 91,1 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000337 6189 LYD388 12392 681 90,7 glotblastn 5_T1 6190 LYD388 flaveria|11v1|SRR149229.128978_T1 12393 681 90,2 glotblastn 6191 LYD388 ambrosia|11v1|SRR346935.596524_T1 12394 681 89,8 glotblastn

278 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 6192 LYD388 vinca|11v1|SRR098690X10013_T1 12395 681 89,8 glotblastn amorphophallus|11v2|SRR089351X378857_ 6193 LYD388 12396 681 89,7 glotblastn T1 6194 LYD388 trigonella|11v1|SRR066198X1023993_T1 12397 681 89,7 glotblastn 6195 LYD388 artemisia|10v1|EX980101_T1 12398 681 89,1 glotblastn 6196 LYD388 guizotia|10v1|GE553532XX1_T1 12399 681 89,1 glotblastn 6197 LYD388 potato|10v1|BE920935_T1 12400 681 89,1 glotblastn 6198 LYD388 canola|11v1|CN827393_T1 12401 681 88,8 glotblastn 6199 LYD388 canola|10v1|CD834527 12402 681 88,8 glotblastn 6200 LYD388 solanum_phureja|09v1|SPHAA076677 12403 681 88,8 glotblastn 6201 LYD388 flaveria|11v1|SRR149238.109365_T1 12404 681 88,4 glotblastn 6202 LYD388 monkeyflower|10v1|CV520668_T1 12405 681 88,4 glotblastn 6203 LYD388 ambrosia|11v1|SRR346943.116737_T1 12406 681 88,3 glotblastn 6204 LYD388 plantago|11v1|SRR066373X107163_T1 12407 681 88,1 glotblastn 6205 LYD388 tragopogon|10v1|41SRR020205S00297 12408 681 87,9 glotblastn 6206 LYD388 sorghum|09v1|SB06G023840 12409 681 87,5 glotblastn 6207 LYD388 rice|gb170|OS04G45490 12410 681 86,8 glotblastn 6208 LYD388 ambrosia|11v1|SRR346935.149001_P1 12411 681 86,8 globlastp 6209 LYD388 apple|gb171|CN926018 12412 681 86,8 globlastp 6210 LYD388 coffea|10v1|DV665919_P1 12413 681 86,7 globlastp 6211 LYD388 maritime_pine|10v1|P3X252770_T1 12414 681 86,6 glotblastn 6212 LYD388 pine|10v2|131076874_T1 12415 681 86,6 glotblastn 6213 LYD388 podocarpus|10v1|SRR06501450001282_T1 12416 681 86,3 glotblastn 6214 LYD388 sequoia|10v1|SRR065044S0000715 12417 681 86,3 glotblastn 6215 LYD388 foxtail_millet|10v2|SICRP000634 12418 681 86,1 glotblastn 6216 LYD388 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0041143 12419 681 86,1 glotblastn 6217 LYD388 barley|10v2|AJ234426_T1 12420 681 85,9 glotblastn distylium|11v1|SRR065077X106569XX1_T 6218 LYD388 12421 681 85,7 glotblastn 1 6219 LYD388 flaveria|11v1|SRR149238.152316_P1 12422 681 85,6 globlastp 6220 LYD388 fescue|gb161|DT679668_T1 12423 681 85,2 glotblastn 6221 LYD388 flaveria|11v1|SRR149232.111649_P1 12424 681 85,2 globlastp 6222 LYD388 brachypodium|09v1|DV482284_T1 12425 681 85,2 glotblastn 6223 LYD388 oat|10v2|CN821648 12426 681 85,1 glotblastn 6224 LYD388 oat|11v1|CN821648_T1 12426 681 85,1 glotblastn 6225 LYD388 pteridium|11v1|SRR043594X102160_T1 12427 681 85,0 glotblastn 6226 LYD388 taxus|10v1|SRR032523S0000086 12428 681 85,0 glotblastn 6227 LYD388 millet|10v1|EV0454PM008349_P1 12429 681 84,5 globlastp 6228 LYD388 peanut|10v1|G0260070_T1 12430 681 84,5 glotblastn 6229 LYD388 euonymus|11v1|SRR070038X117654_P1 12431 681 84,1 globlastp 6230 LYD388 curcuma|10v1|DY385673_P1 12432 681 82,6 globlastp 6231 LYD388 flaveria|11v1|SRR149239.26158_P1 12433 681 81,6 globlastp 6232 LYD388 cynara|gb167|GE579498_T1 12434 681 80,9 glotblastn 6233 LYD388 physcomitrella|10v1|BJ158900_T1 12435 681 80,9 glotblastn 6234 LYD388 ceratodon|10v1|SRR07489050014010_T1 12436 681 80,8 glotblastn 6235 LYD388 grape|gb160|BM436915 12437 681 80,4 globlastp 6236 LYD388 spikemoss|gb165|DN837773 12438 681 80,2 glotblastn 6237 LYD388 flaveria|11v1|SRR149229.39858_T1 12439 681 80,0 glotblastn 6238 LYD388 spikemoss|gb165|FE429926 12440 681 80,0 glotblastn 6239 LYD388 citrus|gb166|CK701311_P1 12441 681 80,0 globlastp 6240 LYD390 cotton|10v2|ES812723_P1 12442 682 98,3 globlastp 6241 LYD390 cotton|10v2|DT564392_P1 12443 682 95,8 globlastp 6242 LYD390 cacao|10v1|CU487646_T1 12444 682 80,0 glotblastn 6243 LYD413 lotus|09v1|CRPLJ038657_P1 12445 683 87,7 globlastp 6244 LYD417 soybean|11v1|GLYMA05G27020 12446 684 83,2 glotblastn 6245 LYD421 medicago|09v1|CRPMT001820_T1 12447 686 83,7 glotblastn 6246 LYD421 medicago|09v1|CRPMT001893_T1 12448 686 83,3 glotblastn 6247 LYD422 medicago|09v1|B1272042J1 12449 687 94,9 globlastp 6248 LYD422 pigeonpea|10v1|SRR054580S0024854_P1 12450 687 88,4 globlastp 6249 LYD422 soybean|11v1|GLYMA11G25900 12451 687 88,1 globlastp 6250 LYD422 cacao|10v1|CU480709_P1 12452 687 87,0 globlastp 6251 LYD422 cotton|10v2|SRR032367S0551343_P1 12453 687 86,7 globlastp

279 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 6252 LYD422 castorbean|09v1|EG685203 12454 687 86,7 glotblastn 6253 LYD422 castorbean|11v1|EG685203_T1 12454 687 86,7 glotblastn 6254 LYD422 chelidonium|11v1|SRR084752X100 074_T1 12455 687 86,5 glotblastn 6255 LYD422 euphorbia|11v1|DV150044_T1 12456 687 86,1 glotblastn 6256 LYD422 strawberry|11v1|DY671101 12457 687 85,2 glotblastn 6257 LYD422 strawberry|11v1|EX683910 12458 687 85,2 glotblastn 6258 LYD422 catharanthus|11v1|SRR098691X106 789_T1 12459 687 85,0 glotblastn 6259 LYD422 oak|10v1|FN730816XX1_T1 12460 687 84,6 glotblastn 6260 LYD422 prunus|10v1|CN491996 12461 687 84,6 glotblastn cassava|09v1|JGICASSAVA36468VALIDM 6261 LYD422 12462 687 84,6 globlastp 1_P1 6262 LYD422 cucumber|09v1|G0897466_P1 12463 687 84,6 globlastp 6263 LYD422 vinca|11v1|SRR098690X102682_T1 12464 687 84,6 glotblastn 6264 LYD422 tobacco|gb162|AF321497 12465 687 84,2 glotblastn 6265 LYD422 clementine|11v1|CF828807_P1 12466 687 84,1 globlastp 6266 LYD422 cannabis|12v1|EW701745_P1 12467 687 83,9 globlastp 6267 LYD422 eucalyptus|11v2|SRR001659X101835_T1 12468 687 83,8 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|EHJGI11000 6268 LYD422 12469 687 83,7 globlastp 600_P1 6269 LYD422 cirsium|11v1|SRR346952.259146_T1 12470 687 83,7 glotblastn 6270 LYD422 orange|11v1|CF828807_P1 12471 687 83,6 globlastp 6271 LYD422 spurge|gb161|DV150044 12472 687 83,6 globlastp 6272 LYD422 ambrosia|11v1|SRR346935.142175_T1 12473 687 83,5 glotblastn 6273 LYD422 flaveria|11v1|SRR149229.127874_T1 12474 687 83,5 glotblastn 6274 LYD422 eucalyptus|11v2|CT988193_T1 12475 687 83,3 glotblastn 6275 LYD422 arabidopsis|10v1|AT2G35040_P1 12476 687 83,1 globlastp 6276 LYD422 canola|10v1|CD812941 12477 687 83,1 globlastp 6277 LYD422 poplar|10v1|BI069324_P1 12478 687 83,1 globlastp 6278 LYD422 ambrosia|11v1|SRR346935.103685_T1 12479 687 83,1 glotblastn 6279 LYD422 ambrosia|11v1|SRR346935.490751_T1 12480 687 83,1 glotblastn 6280 LYD422 citrus|gb166|CF828807_P1 12481 687 83,0 globlastp 6281 LYD422 canola|11v1|EE551702_P1 12482 687 82,9 globlastp 6282 LYD422 sunflower|10v1|CD853207 12483 687 82,7 glotblastn 6283 LYD422 monkeyflower|10v1|G0949859_T1 12484 687 82,5 glotblastn 6284 LYD422 tomato|11v1|AF321497_P1 12485 687 82,5 globlastp 6285 LYD422 tomato|09v1|BG643048 12486 687 82,5 globlastp 6286 LYD422 artemisia|10v1|EY033767_T1 12487 687 82,5 glotblastn 6287 LYD422 aristolochia|10v1|FD758333_P1 12488 687 82,3 globlastp 6288 LYD422 solanum_phureja|09v1|SPHBG643048 12489 687 82,3 globlastp 6289 LYD422 nasturtium|10v1|ISRR032558S0022711 12490 687 82,2 globlastp amorphophallus|11v2|SRR089351X225812_ 6290 LYD422 12491 687 82,0 glotblastn T1 6291 LYD422 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL014637_P1 12492 687 81,7 globlastp brachypodium|09v1|SRR031795S0012272_ 6292 LYD422 12493 687 81,2 glotblastn T1 6293 LYD422 flaveria|11v1|SRR149229.98719_T1 12494 687 81,1 glotblastn 6294 LYD422 canola|11v1|DY020098_T1 12495 687 81,1 glotblastn 6295 LYD422 foxtail_millet|11v3|PHY7SI013439M_T1 12496 687 81,1 glotblastn 6296 LYD422 rice|gb170|OS08G10570 12497 687 81,1 glotblastn 6297 LYD422 triphysaria|10v1|PY149036 12498 687 81,0 globlastp 6298 LYD422 flaveria|11v1|SRR149229.11675_T1 12499 687 80,9 glotblastn 6299 LYD422 flaveria|11v1|SRR149232.127123_T1 12500 687 80,9 glotblastn 6300 LYD422 wheat|10v2|E3M136889 12501 687 80,9 globlastp 6301 LYD422 silene|11v1|SRR096785X103903_T1 12502 687 80,8 glotblastn 6302 LYD422 valeriana|11v1|SRR099039X123791_P1 12503 687 80,0 globlastp 6303 LYD431 foxtail_millet|11v3|PHY7SI025920M_P1 12504 688 86,1 globlastp 6304 LYD434 maize|10v1|AI737158_P1 12505 689 89,8 globlastp 6305 LYD434 foxtail_millet|11v3|SOLX00024471_T1 12506 689 87,0 glotblastn 6306 LYD434 foxtail_millet|11v3|PHY7SI013394M_P1 12507 689 86,8 globlastp 6307 LYD443 soybean|11v1|GLYMA06G13820 12508 690 97,5 globlastp 6308 LYD443 pigeonpea|10v1|SRR054580S0026699_P1 12509 690 90,8 globlastp 6309 LYD443 medicago|09v1|P3E240322_P1 12510 690 85,7 globlastp

280 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 6310 LYD443 prunus|10v1|C0865636 12511 690 84,3 globlastp 6311 LYD443 cacao|10v1|CF974602_P1 12512 690 82,8 globlastp 6312 LYD443 cotton|10v2|SRR032367S0031308_P1 12513 690 82,0 globlastp 6313 LYD443 cassava|09v1|CK644353_P1 12514 690 81,8 globlastp 6314 LYD443 cotton|10v2|SRR032367S0198758_T1 12515 690 81,5 glotblastn 6315 LYD443 cassava|09v1|DV441944_P1 12516 690 81,5 globlastp 6316 LYD443 citnis|gb166|CK938806_T1 12517 690 81,1 glotblastn 6317 LYD443 apple|11v1|C0865636_P1 12518 690 80,9 globlastp 6318 LYD443 clementine|11v1|CK938806_P1 12519 690 80,9 globlastp 6319 LYD443 poplar|10v1|CK109402_P1 12520 690 80,9 globlastp 6320 LYD443 orange|11v1|CK938806_P1 12521 690 80,5 globlastp 6321 LYD443 castorbean|09v1|EG662900 12522 690 80,4 globlastp 6322 LYD443 castorbean|11v1|EG662900_P1 12522 690 80,4 globlastp 6323 LYD443 cannabis|12v1|1SOLX00049073_P1 12523 690 80,0 globlastp 6324 LYD471 lotus|09v1|LBP036021_P1 12524 695 82,9 globlastp 6325 LYD471 soybean|11v1|GLYMA10G44120 12525 695 80,9 glotblastn 6326 LYD483 solanum_phureja|09v1|SPHAW738746 12526 696 97,3 globlastp foxtail_millet|10v2|FXTRMSLX01800514D 6327 LYD495 12527 697 89,3 glotblastn 2 amorphophallus|11v2|SRR089351X278786_ 6328 LYD495 12528 697 81,5 glotblastn T1 6329 LYD495 phyla|11v2|SRR099035X167958_T1 12529 697 80,5 glotblastn 6330 LYD495 eucalyptus|11v2|CT980391_T1 12530 697 80,1 glotblastn 6331 LYD497 thellungiella_parvulum|11v1|DN775488_T1 12531 698 97,7 glotblastn cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0003837 6332 LYD497 12532 698 87,6 glotblastn _T1 6333 LYD497 canola|11v1|PE459144_T1 12533 698 87,4 glotblastn 6334 LYD497 b_juncea|10v2|OXBJ1SLX00004191T1_P1 12534 698 85,2 globlastp 6335 LYD497 b_rapa|gb162|CO749785_P1 12535 698 84,7 globlastp 6336 LYD497 radish|gb164|EW713571 12536 698 84,7 globlastp 6337 LYD497 amaranthus|10v1|SRR039411S0007706_T1 12537 698 84,0 glotblastn 6338 LYD497 plantago|11v1|SRR066373X103636_T1 12538 698 82,8 glotblastn 6339 LYD497 radish|gb164|EV535512 12539 698 82,8 globlastp 6340 LYD497 cotton|10v2|BG444106_T1 12540 698 82,4 glotblastn 6341 LYD497 pigeonpea|10v1|GW352224_T1 12541 698 82,4 glotblastn 6342 LYD497 vinca|11v1|SRR098690X102660_T1 12542 698 82,1 glotblastn 6343 LYD497 tragopogon|10v1|SRR020205S0003738 12543 698 82,1 glotblastn 6344 LYD497 eschscholzia|10v1|CD480606 12544 698 81,7 glotblastn 6345 LYD497 fagopyrum|11v1|SRR063689X100147_T1 12545 698 81,3 glotblastn 6346 LYD497 basilicum|10v1|DY323579_T1 12546 698 81,2 glotblastn 6347 LYD497 cucurbita|11v1|SRR091276X101255_T1 12547 698 80,9 glotblastn 6348 LYD497 fagopyrum|11v1|SRR063689X22962_T1 12548 698 80,9 glotblastn 6349 LYD497 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1096697_T1 12549 698 80,9 glotblastn 6350 LYD497 fraxinus|11v1|SRR058827.107168_T1 12550 698 80,8 glotblastn 6351 LYD497 cucumber|09v1|DN910339_T1 12551 698 80,8 glotblastn 6352 LYD497 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AHCYX_P1 12552 698 80,8 globlastp cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0006483 6353 LYD497 12553 698 80,5 glotblastn _T1 6354 LYD497 flaveria|11v1|SRR149232.8223_T1 12554 698 80,5 glotblastn 6355 LYD497 platanus|11v1|SRR096786X127261_T1 12555 698 80,5 glotblastn 6356 LYD497 basilicum|10v1|DY322340_P1 12556 698 80,2 globlastp 6357 LYD497 sunflower|10v1|PQ980037 12557 698 80,2 globlastp 6358 LYD497 ambrosia|11v1|SRR346935.124626_T1 12558 698 80,2 glotblastn 6359 LYD497 sunflower|10v1|PQ970741 12559 698 80,2 glotblastn 6360 LYD497 arnica|11v1|SRR099034X111067_T1 12560 698 80,1 glotblastn 6361 LYD497 cucurbita|11v1|SRR091276X109788_T1 12561 698 80,1 glotblastn 6362 LYD497 centaureia|gb166|EH764932_T1 12562 698 80,1 glotblastn 6363 LYD497 cichorium|gb171|EH692983_T1 12563 698 80,1 glotblastn 6364 LYD497 ginger|gb164|DY346584_T1 12564 698 80,1 glotblastn 6365 LYD499 canola|11v1|EE483676XX1_T1 12565 699 100,0 glotblastn 6366 LYD499 b_juncea|10v2|BJ1SLX01127239D1 12566 699 85,4 globlastp 6367 LYD499 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01BEK7Q_T1 12567 699 82,1 glotblastn

281 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 6368 LYD499 arabidopsis|10v1|CF773067_T1 12568 699 80,4 glotblastn 6369 LYD500 b_rapa|gb162|BG544497_T1 12569 700 98,3 glotblastn 6370 LYD500 canola|11v1|SRR341920.426223_ T1 12570 700 89,7 glotblastn 6371 LYD500 radish|gb164|EW714765 12571 700 89,7 glotblastn 6372 LYD500 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01CDXEZ 12572 700 81,4 glotblastn 6373 LYD500 b_nigra|09v1|GT069886 12573 700 81,4 glotblastn 6374 LYD501 canola|11v1|ISRR019556.29036_T1 12574 701 98,2 glotblastn 6375 LYD501 canola|11v1|EV042598_T1 12575 701 98,2 glotblastn 6376 LYD501 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01D8S9B_T1 12576 701 97,3 glotblastn 6377 LYD501 canola|11v1|GR440571XX1_T1 12577 701 96,4 glotblastn 6378 LYD501 b_rapa|gb162|C0750244_T1 12578 701 96,4 glotblastn 6379 LYD501 thellungiella|gb167|DN774406 12579 701 96,4 glotblastn 6380 LYD501 sarracenia|11v1|SRR192669.117763_P1 12580 701 96,4 globlastp 6381 LYD501 chelidonium|11v1|SRR084752X101765_T1 12581 701 95,6 glotblastn 6382 LYD501 euonymus|11v1|SRR070038X11091_T1 12582 701 95,5 glotblastn 6383 LYD501 tripterygium|11v1|SRR098677X110151_T1 12583 701 95,5 glotblastn cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0001215 6384 LYD501 12584 701 95,5 glotblastn _T1 6385 LYD501 melon|10v1|AM720686_T1 12585 701 95,5 glotblastn 6386 LYD501 nasturtium|10v1|SRR032558S0027189 12586 701 95,5 glotblastn 6387 LYD501 pigeonpea|10v1|GR464364_T1 12587 701 95,5 glotblastn 6388 LYD501 cucurbita|11v1|SRR091276X220982_T1 12588 701 94,7 glotblastn 6389 LYD501 cannabis|12v1|X500263_T1 12589 701 94,6 glotblastn 6390 LYD501 canola|11v1|SRR329674.174616_ T1 12590 701 94,6 glotblastn 6391 LYD501 euonymus|11v1|SRR070038X133733_T1 12591 701 94,6 glotblastn 6392 LYD501 euonymus|11v1|SRR070038X357738_T1 12592 701 94,6 glotblastn 6393 LYD501 flaveria|11v1|SRR149229.58197_T1 12593 701 94,6 glotblastn 6394 LYD501 sarracenia|11v1|SRR192669.313482_T1 12594 701 94,6 glotblastn 6395 LYD501 trigonella|11v1|SRR066194X123747_T1 12595 701 94,6 glotblastn 6396 LYD501 watermelon|11v1|AM720686_T1 12596 701 94,6 glotblastn 6397 LYD501 cacao|10v1|CU475870_T1 12597 701 94,6 glotblastn 6398 LYD501 cassava|09v1|DV444116_T1 12598 701 94,6 glotblastn 6399 LYD501 castorbean|09v1|PE256028 12599 701 94,6 glotblastn 6400 LYD501 castorbean|11v1|EE256028_T1 12599 701 94,6 glotblastn 6401 LYD501 chestnut|gb170|SRR00629550014001_T1 12600 701 94,6 glotblastn 6402 LYD501 cucumber|09v1|AM720686_T1 12601 701 94,6 glotblastn 6403 LYD501 kiwi|gb166|FG408237_T1 12602 701 94,6 glotblastn 6404 LYD501 oak|10v1|FP032780_T1 12603 701 94,6 glotblastn 6405 LYD501 peanut|10v1|CD037954_T1 12604 701 94,6 glotblastn 6406 LYD501 watermelon|11v1|AM718583_T1 12605 701 93,9 glotblastn 6407 LYD501 avocado|10v1|CK765173_T1 12606 701 93,9 glotblastn 6408 LYD501 melon|10v1|AM718583_T1 12607 701 93,9 glotblastn 6409 LYD501 clementine|11v1|CK739989_T1 12608 701 93,8 glotblastn 6410 LYD501 flax|11v1|JG020349_T1 12609 701 93,8 glotblastn 6411 LYD501 orange|11v1|CK739989_T1 12610 701 93,8 glotblastn 6412 LYD501 citrus|gb166|CK739989_T1 12608 701 93,8 glotblastn 6413 LYD501 ambrosia|11v1|SRR346935.113008_T1 12611 701 93,8 glotblastn 6414 LYD501 ambrosia|11v1|SRR346935.170141_T1 12612 701 93,8 glotblastn 6415 LYD501 ambrosia|11v1|SRR346935.290744_T1 12613 701 93,8 glotblastn 6416 LYD501 flaveria|11v1|SRR149229.122354_T1 12614 701 93,8 glotblastn 6417 LYD501 flaveria|11v1|SRR149229.189966_T1 12615 701 93,8 glotblastn 6418 LYD501 utricularia|11v1|SRR094438.103084_T1 12616 701 93,8 glotblastn cassava|09v1|JGICASSAVA29016VALIDM 6419 LYD501 12617 701 93,8 glotblastn 1_T1 6420 LYD501 cotton|10v2|BG444156_T1 12618 701 93,8 glotblastn 6421 LYD501 grape|11v1|GSVIVT01013564001_T1 12619 701 93,8 glotblastn 6422 LYD501 grape|gb160|CB912485 12619 701 93,8 glotblastn 6423 LYD501 ipomoea_ni|10v1|P3J567033_T1 12620 701 93,8 glotblastn 6424 LYD501 poplar|10v1|BU897763_T1 12621 701 93,8 glotblastn 6425 LYD501 senecio|gb170|DY661628 12622 701 93,8 glotblastn 6426 LYD501 sunflower|10v1|DY920668 12623 701 93,8 glotblastn 6427 LYD501 sunflower|10v1|DY950267 12624 701 93,8 glotblastn

282 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 6428 LYD501 ambrosia|11v1|SRR346935.166952_T1 12625 701 93,0 glotblastn 6429 LYD501 flax|11v1|JG018486_T1 12626 701 93,0 glotblastn 6430 LYD501 flax|11v1|JG083961_T1 12627 701 93,0 glotblastn 6431 LYD501 nasturtium|10v1|ISRR032558S0048292 12628 701 93,0 glotblastn 6432 LYD501 cucumber|09v1|AM718583_T1 12629 701 93,0 glotblastn 6433 LYD501 ambrosia|11v1|SRR346935.139527_T1 12630 701 92,9 glotblastn 6434 LYD501 ambrosia|11v1|SRR346935.186669_T1 12631 701 92,9 glotblastn 6435 LYD501 arnica|11v1|SRR099034X105547_T1 12632 701 92,9 glotblastn 6436 LYD501 arnica|11v1|SRR099034X111519_T1 12633 701 92,9 glotblastn 6437 LYD501 cirsium|11v1|SRR346952.118661_T1 12634 701 92,9 glotblastn 6438 LYD501 flaveria|11v1|SRR149229.108020_T1 12635 701 92,9 glotblastn 6439 LYD501 flaveria|11v1|SRR149232.120060_T1 12636 701 92,9 glotblastn 6440 LYD501 phyla|11v2|SRR099035X12762_T1 12637 701 92,9 glotblastn 6441 LYD501 scabiosa|11v1|SRR063723X229337_T1 12638 701 92,9 glotblastn 6442 LYD501 thalictrum|11v1|SRR096787X109593_T1 12639 701 92,9 glotblastn 6443 LYD501 aquilegia|10v2|DR913203_T1 12640 701 92,9 glotblastn 6444 LYD501 artemisia|10v1|EY079109_T1 12641 701 92,9 glotblastn 6445 LYD501 artemisia|10v1|EY100637_T1 12642 701 92,9 glotblastn 6446 LYD501 tragopogon|10v1|SRR020205S0031906 12643 701 92,9 glotblastn 6447 LYD501 poplar|10v1|BU889708_T1 12644 701 92,2 glotblastn 6448 LYD501 cucurbita|11v1|SRR091276X12184_T1 12645 701 92,1 glotblastn 6449 LYD501 cucurbita|11v1|SRR091276X18592_T1 12646 701 92,1 glotblastn 6450 LYD501 momordica|10v1|SRR071315S0000463_T1 12647 701 92,1 glotblastn 6451 LYD501 cotton|10v2|BQ411378_T1 12648 701 92,0 glotblastn 6452 LYD501 prunus|10v1|BU044562 12649 701 92,0 glotblastn 6453 LYD501 ambrosia|11v1|SRR346935.142048_T1 12650 701 92,0 glotblastn 6454 LYD501 canola|11v1|CN830272_T1 12651 701 92,0 glotblastn 6455 LYD501 distylium|11v1|SRR065077X105467_T1 12652 701 92,0 glotblastn 6456 LYD501 euphorbia|11v1|DV130999_T1 12653 701 92,0 glotblastn 6457 LYD501 silene|11v1|SRR096785X113387_T1 12654 701 92,0 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|DN778619_T 6458 LYD501 12655 701 92,0 glotblastn 1 6459 LYD501 thellungiella_parvulum|11v1|DN778619_T1 12656 701 92,0 glotblastn 6460 LYD501 valeriana|11v1|SRR099039X101707_T1 12657 701 92,0 glotblastn 6461 LYD501 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL019224_T1 12658 701 92,0 glotblastn 6462 LYD501 arabidopsis|10v1|AT3G59350_T1 12659 701 92,0 glotblastn 6463 LYD501 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01C52SG_T1 12660 701 92,0 glotblastn 6464 LYD501 b_juncea|10v2|E6ANDIZ02F8URY_T1 12661 701 92,0 glotblastn 6465 LYD501 canola|10v1|CN830272 12662 701 92,0 glotblastn 6466 LYD501 cichorium|gb171|EH678966_T1 12663 701 92,0 glotblastn 6467 LYD501 cycas|gb166|EX922507_T1 12664 701 92,0 glotblastn 6468 LYD501 lettuce|10v1|DWO55970_T1 12665 701 92,0 glotblastn 6469 LYD501 sciadopitys|10v1|SRR065035S0010378 12666 701 92,0 glotblastn 6470 LYD501 sequoia|10v1|SRR065044S0020248 12667 701 92,0 glotblastn 6471 LYD501 triphysaria|10v1|BM356608 12668 701 92,0 glotblastn 6472 LYD501 cirsium|11v1|SRR346952.1009668_T1 12669 701 91,4 glotblastn 6473 LYD501 cirsium|11v1|SRR346952.1035158_T1 12670 701 91,2 glotblastn 6474 LYD501 plantago|11v1|SRR066373X108282_T1 12671 701 91,2 glotblastn 6475 LYD501 cucurbita|11v1|SRR091276X219804_P1 12672 701 91,1 globlastp 6476 LYD501 flaveria|11v1|SRR149229.33632_T1 12673 701 91,1 glotblastn 6477 LYD501 flaveria|11v1|SRR149232.327394_T1 12674 701 91,1 glotblastn 6478 LYD501 phyla|11v2|SRR099037X107165_T1 12675 701 91,1 glotblastn 6479 LYD501 silene|11v1|SRR096785X226922_T1 12676 701 91,1 glotblastn 6480 LYD501 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL015668_T1 12677 701 91,1 glotblastn 6481 LYD501 basilicum|10v1|DY322775_T1 12678 701 91,1 glotblastn 6482 LYD501 centaureia|gb166|EL935310_T1 12679 701 91,1 glotblastn 6483 LYD501 eucalyptus|11v2|ES589063_T1 12680 701 91,1 glotblastn 6484 LYD501 eucalyptus|gb166|ES589063 12680 701 91,1 glotblastn 6485 LYD501 podocarpus|10v1|SRR065014S0006434_T1 12681 701 91,1 glotblastn 6486 LYD501 radish|gb164|EV532297 12682 701 91,1 glotblastn 6487 LYD501 sunflower|10v1|DY946959 12683 701 91,1 glotblastn 6488 LYD501 tobacco|gb162|DV161386 12684 701 91,1 glotblastn

283 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 6489 LYD501 tripterygium|11v1|SRR098677X10212_T1 12685 701 90,7 glotblastn 6490 LYD501 canola|10v1|EE505251 12686 701 90,4 glotblastn 6491 LYD501 canola|10v1|ES993173 12687 701 90,4 glotblastn 6492 LYD501 orobanche|10v1|SRR023189S0015650_T1 12688 701 90,4 glotblastn 6493 LYD501 safflower|gb162|EL374811 12689 701 90,4 glotblastn 6494 LYD501 canola|10v1|CN728487 12690 701 90,4 glotblastn 6495 LYD501 canola|11v1|EE505251_T1 12690 701 90,4 glotblastn 6496 LYD501 abies|11v2|SRR098676X108166_T1 12691 701 90,4 glotblastn 6497 LYD501 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0026297 12692 701 90,4 glotblastn 6498 LYD501 spruce|gb162|CO219510 12693 701 90,4 glotblastn 6499 LYD501 canola|11v1|SRR023612.19430_P1 12694 701 90,3 globlastp 6500 LYD501 switchgrass|gb167|DN141122 12695 701 90,3 glotblastn 6501 LYD501 canola|11v1|EE471702_T1 12696 701 90,2 glotblastn cephalotaxus|11v1|SRR064395X109433XX 6502 LYD501 12697 701 90,2 glotblastn 1_T1 6503 LYD501 fagopyrum|11v1|SRR063689X104361_T1 12698 701 90,2 glotblastn 6504 LYD501 fagopyrum|11v1|SRR063703X108027_T1 12699 701 90,2 glotblastn 6505 LYD501 flaveria|11v1|SRR149229.108872_T1 12700 701 90,2 glotblastn 6506 LYD501 flaveria|11v1|SRR149229.117136_T1 12701 701 90,2 glotblastn 6507 LYD501 flaveria|11v1|SRR149244.117797_T1 12702 701 90,2 glotblastn 6508 LYD501 plantago|11v1|SRR066373X115223_T1 12703 701 90,2 glotblastn 6509 LYD501 primula|11v1|SRR098679X108102_T1 12704 701 90,2 glotblastn 6510 LYD501 tomato|11v1|BG136954_T1 12705 701 90,2 glotblastn 6511 LYD501 b_juncea|10v2|BJ1SLX00304793D1_T1 12706 701 90,2 glotblastn 6512 LYD501 curcuma|10v1|PDY389264_T1 12707 701 90,2 glotblastn 6513 LYD501 marchantia|gb166|BJ846993_T1 12708 701 90,2 glotblastn 6514 LYD501 oat|10v2|G0592376 12709 701 90,2 glotblastn 6515 LYD501 oat|11v1|G0592376_T1 12709 701 90,2 glotblastn 6516 LYD501 pepper|gb171|GD131551_T1 12710 701 90,2 glotblastn 6517 LYD501 potato|10v1|BG598455_T1 12705 701 90,2 glotblastn 6518 LYD501 solanum_phureja|09v1|SPHBG136954 12711 701 90,2 glotblastn 6519 LYD501 taxus|10v1|SRR032523S0011074 12712 701 90,2 glotblastn 6520 LYD501 tomato|09v1|BG136954 12705 701 90,2 glotblastn 6521 LYD501 zostera|10v1|SRR057351S0040475 12713 701 90,2 glotblastn 6522 LYD501 jatropha|09v1|FM893117_P1 12714 701 89,8 globlastp 6523 LYD501 pteridium|11v1|SRR043594X104552_T1 12715 701 89,6 glotblastn 6524 LYD501 b_oleracea|gb161|EE530319_T1 12716 701 89,6 glotblastn 6525 LYD501 nuphar|gb166|CK765136_T1 12717 701 89,6 glotblastn 6526 LYD501 cedrus|11v1|SRR065007X122812XX2_T1 12718 701 89,5 glotblastn 6527 LYD501 chelidonium|11v1|SRR084752X103504_T1 12719 701 89,5 glotblastn 6528 LYD501 distylium|11v1|SRR065077X120250_T1 12720 701 89,5 glotblastn 6529 LYD501 maritime_pine|10v1|BX252090_T1 12721 701 89,5 glotblastn 6530 LYD501 arabidopsis|10v1|AT2G43230_T1 12722 701 89,5 glotblastn 6531 LYD501 pine|10v2|AWO10140_T1 12723 701 89,5 glotblastn 6532 LYD501 podocarpus|10v1|SRR06501450022714_T1 12724 701 89,5 glotblastn 6533 LYD501 taxus|10v1|SRR032523S0007007 12725 701 89,5 glotblastn 6534 LYD501 sciadopitys|10v1|SRR065035S0021406 12726 701 89,4 glotblastn 6535 LYD501 abies|11v2|SRR098676X102781_T1 12727 701 89,3 glotblastn 6536 LYD501 canola|11v1|SRR001111.50762_T1 12728 701 89,3 glotblastn 6537 LYD501 cephalotaxus|11v1|SRR064395X104877_T1 12729 701 89,3 glotblastn 6538 LYD501 flaveria|11v1|SRR149241.171581_T1 12730 701 89,3 glotblastn thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP016511 6539 LYD501 12731 701 89,3 glotblastn _11 6540 LYD501 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01A34CT_T1 12732 701 89,3 glotblastn 6541 LYD501 cotton|10v2|C0126006_T1 12733 701 89,3 glotblastn 6542 LYD501 eggplant|10v1|FS076981_T1 12734 701 89,3 glotblastn 6543 LYD501 gnetum|10v1|SRR06439950008537_T1 12735 701 89,3 glotblastn 6544 LYD501 lettuce|10v1|PDWO51632_T1 12736 701 89,3 glotblastn 6545 LYD501 sequoia|10v1|SRR065044S0002063 12737 701 89,3 glotblastn 6546 LYD501 zostera|10v1|SRR057351S0006961 12738 701 89,3 glotblastn 6547 LYD501 eucalyptus|1v2|CD668543_T1 12739 701 89,3 glotblastn 6548 LYD501 cannabis|12v1|SOLX00064565_T1 12740 701 89,3 glotblastn

284 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 6549 LYD501 sorghum|09v1|SB02G010180 12741 701 88,8 glotblastn 6550 LYD501 sorghum|11v1|SB02G010180_T1 12741 701 88,8 glotblastn 6551 LYD501 sugarcane|10v1|CA087300 12742 701 88,8 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|EHJGI11009 6552 LYD501 12743 701 88,7 glotblastn 353_T1 6553 LYD501 aristolochia|10v1|FD760646_T1 12744 701 88,7 glotblastn 6554 LYD501 cedrus|11v1|SRR065007X109178_T1 12745 701 88,5 glotblastn 6555 LYD501 pteridium|11v1|SRR043594X12287_T1 12746 701 88,5 glotblastn 6556 LYD501 canola|11v1|CN729845_T1 12747 701 88,4 glotblastn 6557 LYD501 canola|11v1|SRR341920.290244_T1 12748 701 88,4 glotblastn 6558 LYD501 catharanthus|11v1|EG556048_T1 12749 701 88,4 glotblastn 6559 LYD501 maritime_pine|10v1|BX250004_T1 12750 701 88,4 glotblastn tabemaemontana|11v1|SRR098689X120290 6560 LYD501 12751 701 88,4 glotblastn _T1 6561 LYD501 vinca|11v1|SRR098690X106945_T1 12752 701 88,4 glotblastn 6562 LYD501 vinca|11v1|SRR098690X15391_T1 12753 701 88,4 glotblastn 6563 LYD501 barley|10v2|AV833420_T1 12754 701 88,4 glotblastn 6564 LYD501 catharanthus|gb166|FD421865 12755 701 88,4 glotblastn 6565 LYD501 eucalyptus|gb166|CD668543 12756 701 88,4 glotblastn 6566 LYD501 pine|10v2|AW290119_T1 12757 701 88,4 glotblastn 6567 LYD501 pseudoroegneria|gb167|FF342576 12758 701 88,4 glotblastn 6568 LYD501 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0015451 12759 701 88,4 glotblastn 6569 LYD501 spruce|gb162|CO215839 12760 701 88,4 glotblastn 6570 LYD501 wheat|10v2|E3F485109XX1 12761 701 88,4 glotblastn 6571 LYD501 maize|10v1|AI712057_T1 12762 701 88,1 glotblastn 6572 LYD501 monkeyflower|10v1|G0944683_T1 12763 701 88,1 glotblastn 6573 LYD501 monkeyflower|10v1|G0952860_T1 12763 701 88,1 glotblastn 6574 LYD501 foxtail_millet|11v3|GT228214_T1 12764 701 87,9 glotblastn foxtail_millet|10v2|FXTRMSLX01082153D 6575 LYD501 12765 701 87,9 glotblastn 2 6576 LYD501 millet|10v1|EV0454PM005290_T1 12766 701 87,9 glotblastn 6577 LYD501 foxtail_millet|11v3|PHY7SI030254M_T1 12767 701 87,8 glotblastn 6578 LYD501 brachypodium|09v1|GT766165_T1 12768 701 87,8 glotblastn foxtail_millet|10v2|FXTRMSLX01324810D 6579 LYD501 12769 701 87,8 glotblastn 2 6580 LYD501 rice|gb170|OS09G33860 12770 701 87,8 glotblastn 6581 LYD501 sorghum|09v1|SB02G029730 12771 701 87,8 glotblastn 6582 LYD501 sorghum|11v1|SB02G029730_T1 12771 701 87,8 glotblastn 6583 LYD501 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1004990_T1 12772 701 87,7 glotblastn 6584 LYD501 platanus|11v1|SRR096786X100190_T1 12773 701 87,7 glotblastn 6585 LYD501 rice|gb170|OS01G67340 12774 701 87,7 glotblastn 6586 LYD501 amsonia|11v1|SRR098688X100581_T1 12775 701 87,5 glotblastn 6587 LYD501 distylium|11v1|SRR065077X115659_T1 12776 701 87,5 glotblastn 6588 LYD501 humulus|11v1|GD252681_T1 12777 701 87,5 glotblastn 6589 LYD501 vinca|11v1|SRR098690X100758_T1 12778 701 87,5 glotblastn 6590 LYD501 vinca|11v1|SRR098690X127724_T1 12779 701 87,5 glotblastn 6591 LYD501 gnetum|10v1|SRR064399S0074700_T1 12780 701 87,5 glotblastn 6592 LYD501 spikemoss|gb165|FE465784 12781 701 87,5 glotblastn 6593 LYD501 spikemoss|gb165|FE505299 12781 701 87,5 glotblastn 6594 LYD501 maize|10v1|AW076405_T1 12782 701 87,3 glotblastn 6595 LYD501 rice|gb170|OS03G62700 12783 701 87,2 glotblastn 6596 LYD501 momordica|10v1|GT228214_T1 12784 701 87,1 glotblastn 6597 LYD501 brachypodium|09v1|GT758946_T1 12785 701 87,0 glotblastn 6598 LYD501 nuphar|gb166|FD386628_T1 12786 701 87,0 glotblastn 6599 LYD501 switchgrass|gb167|FE601960 12787 701 87,0 glotblastn 6600 LYD501 maize|10v1|A1665162_T1 12788 701 86,8 glotblastn 6601 LYD501 maize|10v1|CF626481_T1 12789 701 86,8 glotblastn 6602 LYD501 sorghum|09v1|SB07G025590 12790 701 86,8 glotblastn 6603 LYD501 sorghum|11v1|SB07G025590_T1 12790 701 86,8 glotblastn 6604 LYD501 pineapple|10v1|DT338265_T1 12791 701 86,7 glotblastn 6605 LYD501 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1043390_T1 12792 701 86,6 glotblastn 6606 LYD501 valeriana|11v1|SRR099039X107868_T1 12793 701 86,6 glotblastn

285 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 6607 LYD501 b_rapa|gb162|EX038565_T1 12794 701 86,6 glotblastn 6608 LYD501 millet|10v1|EVO454PM018600_T1 12795 701 86,6 glotblastn 6609 LYD501 radish|gb164|EV550246 12796 701 86,6 glotblastn 6610 LYD501 foxtail_millet|11v3|PHY7SI001768M_T1 12797 701 86,6 glotblastn 6611 LYD501 amaranthus|10v1|SRR039411S0008288_P1 12798 701 86,6 globlastp 6612 LYD501 cynodon|10v1|ES296224_T1 12799 701 86,1 glotblastn 6613 LYD501 millet|10v1|EV0454PM007173_T1 12800 701 86,1 glotblastn 6614 LYD501 oat|10v2|CN814959 12801 701 86,1 glotblastn 6615 LYD501 oat|11v1|CN814959_T1 12801 701 86,1 glotblastn 6616 LYD501 sugarcane|10v1|BQ536827 12802 701 86,1 glotblastn 6617 LYD501 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01COV9W_P1 12803 701 86,0 globlastp 6618 LYD501 pteridium|11v1|SRR043594X105169_T1 12804 701 86,0 glotblastn 6619 LYD501 barley|10v2|AV923324_T1 12805 701 86,0 glotblastn 6620 LYD501 brachypodium|09v1|DV487120_T1 12806 701 86,0 glotblastn 6621 LYD501 leymus|gb166|EG376522_T1 12807 701 86,0 glotblastn 6622 LYD501 pseudoroegneria|gb167|FF366306 12808 701 86,0 glotblastn 6623 LYD501 sugarcane|10v1|CA276460 12809 701 86,0 glotblastn 6624 LYD501 switchgrass|gb167|FE619829 12810 701 86,0 glotblastn 6625 LYD501 flax|11v1|JG079201_T1 12811 701 85,8 glotblastn 6626 LYD501 humulus|11v1|SRR098683X116286_T1 12812 701 85,8 glotblastn 6627 LYD501 wheat|10v2|E3E427614 12813 701 85,8 glotblastn 6628 LYD501 scabiosa|11v1|SRR063723X219085_T1 12814 701 85,7 glotblastn 6629 LYD501 physcomitrella|10v1|AW156080_T1 12815 701 85,7 glotblastn 6630 LYD501 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0079234 12816 701 85,7 glotblastn 6631 LYD501 sequoia|10v1|SRR065044S0235159 12817 701 85,7 glotblastn 6632 LYD501 taxus|10v1|SRR032523S0034570 12818 701 85,7 glotblastn 6633 LYD501 onion|gb162|CF441584_P1 12819 701 85,7 globlastp 6634 LYD501 radish|gb164|EV567059 12820 701 85,5 glotblastn 6635 LYD501 millet|10v1|EV0454PM014854_T1 12821 701 85,2 glotblastn 6636 LYD501 cucurbita|11v1|SRR091276X122300_T1 12822 701 85,1 glotblastn 6637 LYD501 castorbean|09v1|NM002534328 12823 701 85,1 glotblastn 6638 LYD501 castorbean|11v1|XM002534328_T1 12823 701 85,1 glotblastn 6639 LYD501 poplar|10v1|XM002323294_T1 12824 701 85,1 glotblastn 6640 LYD501 cannabis|12v1|1SOLX00057941_P1 12825 701 85,0 globlastp 6641 LYD501 pteridium|11v1|SRR043594X118194_T1 12826 701 85,0 glotblastn 6642 LYD501 maize|10v1|AI901334_T1 12827 701 85,0 glotblastn 6643 LYD501 cedrus|11v1|SRR065007X103091_T1 12828 701 84,8 glotblastn 6644 LYD501 cephalotaxus|1v1|SRR064395X161006_T1 12829 701 84,8 glotblastn 6645 LYD501 canola|11v1|GR462897_T1 12830 701 84,8 glotblastn 6646 LYD501 ceratodon|10v1|SRR07489050002056_T1 12831 701 84,8 glotblastn 6647 LYD501 foxtail_millet|11v3|PHY7SI001812M_T1 12832 701 84,6 glotblastn 6648 LYD501 canola|10v1|EE420797 12833 701 84,6 glotblastn 6649 LYD501 foxtail_millet|11v3|PHY7SI036340M_T1 12834 701 84,2 glotblastn 6650 LYD501 sorghum|11v1|SB01G009910_T1 12835 701 84,2 glotblastn 6651 LYD501 tomato|11v1|BG136651_T1 12836 701 84,2 glotblastn 6652 LYD501 solanum_phureja|09v1|SPHBG136651 12837 701 84,2 glotblastn 6653 LYD501 sorghum|09v1|SB01G009910 12838 701 84,2 glotblastn 6654 LYD501 tobacco|gb162|AJ608157 12839 701 84,2 glotblastn 6655 LYD501 tomato|09v1|BG136651 12836 701 84,2 glotblastn 6656 LYD501 canola|11v1|SRR341920.180098_T1 12840 701 84,1 glotblastn 6657 LYD501 canola|11v1|SRR341920.339688_T1 12841 701 84,1 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|DN774052_T 6658 LYD501 12842 701 84,1 glotblastn 1 6659 LYD501 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL010263_T1 12843 701 84,1 glotblastn 6660 LYD501 b_juncea|10v2|E3J1SLX00027274D1_T1 12844 701 84,1 glotblastn 6661 LYD501 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01AFV8V_T1 12845 701 84,1 glotblastn 6662 LYD501 b_juncea|10v2|E6ANDIZO2H7YRF_T1 12846 701 84,1 glotblastn 6663 LYD501 cacao|10v1|CGD0023908_T1 12847 701 84,1 glotblastn cleome_gynandra|10v1|SRR015532S006104 6664 LYD501 12848 701 84,1 glotblastn 0_T1 6665 LYD501 canola|11v1|ES904690_T1 12849 701 84,1 glotblastn 6666 LYD501 canola|11v1|EV108950_T1 12850 701 84,1 glotblastn

286 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 6667 LYD501 fraxinus|11v1|SRR058827.109141_T1 12851 701 83,9 glotblastn maritime_pine|10v1|SRR073317S0029934_ 6668 LYD501 12852 701 83,9 glotblastn T1 6669 LYD501 bean|gb167|CB541648_T1 12853 701 83,9 glotblastn cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000368 6670 LYD501 12854 701 83,9 glotblastn 8_T1 6671 LYD501 cryptomeria|gb166|BY881522_T1 12855 701 83,9 glotblastn 6672 LYD501 foxtail_millet|10v2|SICRP030781 12856 701 83,9 glotblastn 6673 LYD501 millet|10v1|EV0454PM033789_T1 12857 701 83,9 glotblastn monkeyflower|10v1|SRR037227S0019168_ 6674 LYD501 12858 701 83,9 glotblastn T1 6675 LYD501 pine|10v2|DR047992_T1 12859 701 83,9 glotblastn 6676 LYD501 prunus|10v1|CO903806 12860 701 83,9 glotblastn 6677 LYD501 rice|gb170|OS03G51040 12861 701 83,9 glotblastn 6678 LYD501 sorghum|09v1|SB03G011910 12862 701 83,9 glotblastn 6679 LYD501 spruce|gb162|DR566499 12863 701 83,9 glotblastn 6680 LYD501 sugarcane|10v1|BQ804002 12864 701 83,9 glotblastn 6681 LYD501 switchgrass|gb167|FL754118 12865 701 83,9 glotblastn 6682 LYD501 barley|10v2|E3F623867_T1 12866 701 83,8 glotblastn 6683 LYD501 pseudoroegneria|gb167|FF343046 12867 701 83,8 glotblastn 6684 LYD501 radish|gb164|EW724766 12868 701 83,8 glotblastn 6685 LYD501 wheat|10v2|E3E443620 12869 701 83,8 glotblastn 6686 LYD501 watermelon|11v1|AM716819_T1 12870 701 83,5 glotblastn 6687 LYD501 cucumber|09v1|AM716819_T1 12871 701 83,5 glotblastn 6688 LYD501 sorghum|09v1|SB04G023390 12872 701 83,5 glotblastn 6689 LYD501 sorghum|11v1|SB04G023390_T1 12872 701 83,5 glotblastn amorphophallus|11v2|SRR089351X106030_ 6690 LYD501 12873 701 83,3 glotblastn T1 6691 LYD501 eucalyptus|11v2|JGIEG041800_T1 12874 701 83,3 glotblastn 6692 LYD501 foxtail_millet|11v3|PHY7SI018113M_T1 12875 701 83,3 glotblastn 6693 LYD501 foxtail_millet|11v3|PHY7SI040473M_T1 12876 701 83,3 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|EHJGI11001 6694 LYD501 12877 701 83,3 glotblastn 229_T1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP014654 6695 LYD501 12878 701 83,3 glotblastn _T1 6696 LYD501 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL015517_T1 12879 701 83,3 glotblastn 6697 LYD501 arabidopsis|10v1|AT2G41970_T1 12880 701 83,3 glotblastn 6698 LYD501 sciadopitys|10v1|SRR065035S0124453 12881 701 83,3 glotblastn 6699 LYD501 switchgrass|gb167|FL759588 12882 701 83,3 glotblastn 6700 LYD501 fagopyrum|11v1|SRR063689X101615_T1 12883 701 83,2 glotblastn 6701 LYD501 pteridium|11v1|SRR043594X61169_T1 12884 701 83,2 glotblastn 6702 LYD501 thellungiella_parvulum|11v1|DN774052_T1 12885 701 83,2 glotblastn 6703 LYD501 sorghum|09v1|SB01G041810 12886 701 83,2 glotblastn 6704 LYD501 sorghum|11v1|SB01G041810_T1 12886 701 83,2 glotblastn 6705 LYD501 switchgrass|gb167|FE634135 12887 701 83,2 glotblastn 6706 LYD501 ambrosia|11v1|SRR346935.120562_T1 12888 701 83,0 glotblastn 6707 LYD501 ambrosia|11v1|SRR346935.122457_T1 12889 701 83,0 glotblastn 6708 LYD501 arnica|11v1|SRR099034X10892_T1 12890 701 83,0 glotblastn 6709 LYD501 cirsium|11v1|SRR346952.105454_T1 12891 701 83,0 glotblastn 6710 LYD501 flaveria|11v1|SRR149229.115579_T1 12892 701 83,0 glotblastn 6711 LYD501 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1023922_T1 12893 701 83,0 glotblastn 6712 LYD501 plantago|11v1|SRR066373X136471_T1 12894 701 83,0 glotblastn 6713 LYD501 watermelon|11v1|AM719850_T1 12895 701 83,0 glotblastn 6714 LYD501 aquilegia|10v2|DR950025_T1 12896 701 83,0 glotblastn 6715 LYD501 artemisia|10v1|EY039568_T1 12897 701 83,0 glotblastn 6716 LYD501 cucumber|09v1|AM735968_T1 12898 701 83,0 glotblastn 6717 LYD501 cynara|gb167|GE605927_T1 12899 701 83,0 glotblastn 6718 LYD501 eggplant|10v1|FS076888_T1 12900 701 83,0 glotblastn 6719 LYD501 maize|10v1|ZMCRP2V120448_T1 12901 701 83,0 glotblastn 6720 LYD501 medicago|09v1|CRPMT033988_T1 12902 701 83,0 glotblastn 6721 LYD501 melon|10v1|AM719850_T1 12903 701 83,0 glotblastn 6722 LYD501 oat|10v2|CN814884 12904 701 83,0 glotblastn

287 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 6723 LYD501 oat|11v1|CN814884_T1 12904 701 83,0 glotblastn 6724 LYD501 peanut|10v1|ES721022_T1 12905 701 83,0 glotblastn 6725 LYD501 peanut|10v1|GO326528_T1 12906 701 83,0 glotblastn 6726 LYD501 poplar|10v1|CK108679_T1 12907 701 83,0 glotblastn 6727 LYD501 poplar|10v1|XM002308322_T1 12908 701 83,0 glotblastn 6728 LYD501 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0052282 12909 701 83,0 glotblastn 6729 LYD501 rice|gb170|OS03G12520 12910 701 83,0 glotblastn 6730 LYD501 soybean|11v1|GLYMA03G30260 12911 701 83,0 glotblastn 6731 LYD501 soybean|11v1|GLYMA09G16640 12912 701 83,0 glotblastn 6732 LYD501 sunflower|10v1|CD856673 12913 701 83,0 glotblastn 6733 LYD501 tobacco|gb162|EB427489 12914 701 83,0 glotblastn 6734 LYD501 tragopogon|10v1|SRR020205S0001042 12915 701 83,0 glotblastn 6735 LYD501 rice|gb170|OS01G21970 12916 701 82,9 glotblastn 6736 LYD501 leymus|gb166|EG390720_T1 12917 701 82,8 glotblastn 6737 LYD501 silene|11v1|SRR096785X105709_T1 12918 701 82,5 glotblastn 6738 LYD501 tomato|11v1|BG137599_T1 12919 701 82,5 glotblastn 6739 LYD501 foxtail_millet|10v2|SICRP028174 12920 701 82,5 glotblastn 6740 LYD501 foxtail_millet|11v3|PHY7SI036290M_T1 12921 701 82,5 glotblastn 6741 LYD501 maize|10v1|1AW562890_T1 12922 701 82,5 glotblastn 6742 LYD501 maize|10v1|BQ486315_T1 12923 701 82,5 glotblastn 6743 LYD501 rice|gb170|OS02G35760 12924 701 82,5 glotblastn 6744 LYD501 soybean|11v1|GLYMA19G33180 12925 701 82,5 glotblastn 6745 LYD501 tobacco|gb162|AJ608156 12926 701 82,5 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|EHJGI11005 6746 LYD501 12927 701 82,3 glotblastn 226_T1 thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP005167 6747 LYD501 12928 701 82,3 glotblastn _T1 6748 LYD501 cirsium|11v1|SRR346952.1011887_T1 12929 701 82,1 glotblastn 6749 LYD501 clementine|11v1|P3Q623394_T1 12930 701 82,1 glotblastn 6750 LYD501 clementine|11v1|JGICC016928_T1 12931 701 82,1 glotblastn 6751 LYD501 eucalyptus|11v2|CD668259_T1 12932 701 82,1 glotblastn 6752 LYD501 eucalyptus|11v2|PGIEG014547_T1 12933 701 82,1 glotblastn 6753 LYD501 euonymus|11v1|SRR070038X173263_T1 12934 701 82,1 glotblastn 6754 LYD501 orange|11v1|BQ623394_T1 12930 701 82,1 glotblastn 6755 LYD501 orange|11v1|JGICC016928_T1 12935 701 82,1 glotblastn 6756 LYD501 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1004831_T1 12936 701 82,1 glotblastn 6757 LYD501 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1006136_T1 12936 701 82,1 glotblastn 6758 LYD501 platanus|11v1|SRR096786X206803_T1 12937 701 82,1 glotblastn 6759 LYD501 scabiosa|11v1|SRR063723X148331_T1 12938 701 82,1 glotblastn 6760 LYD501 silene|11v1|SRR096785X107268_T1 12939 701 82,1 glotblastn 6761 LYD501 tomato|11v1|BQ518958_T1 12940 701 82,1 glotblastn 6762 LYD501 tomato|11v1|EU28007_T1 12941 701 82,1 glotblastn 6763 LYD501 trigonella|11v1|SRR066194X234165_T1 12942 701 82,1 glotblastn 6764 LYD501 tripterygium|11v1|SRR098677X109433_T1 12943 701 82,1 glotblastn 6765 LYD501 valeriana|11v1|SRR099039X119728_T1 12944 701 82,1 glotblastn 6766 LYD501 aquilegial|10v2|DR939004_T1 12945 701 82,1 glotblastn 6767 LYD501 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL019571_T1 12946 701 82,1 glotblastn 6768 LYD501 arabidopsis|10v1|AT3G62220_T1 12947 701 82,1 glotblastn 6769 LYD501 aristolochia|10v1|FD760252_T1 12948 701 82,1 glotblastn 6770 LYD501 barley|10v2|AV835239_T1 12949 701 82,1 glotblastn 6771 LYD501 bean|gb167|CV529402_T1 12950 701 82,1 glotblastn 6772 LYD501 beet|gb162|BI543314_T1 12951 701 82,1 glotblastn 6773 LYD501 brachypodium|09v1|BRADI1G10500_T1 12952 701 82,1 glotblastn 6774 LYD501 cacao|10v1|CU493885_T1 12953 701 82,1 glotblastn 6775 LYD501 citrus|gb166|BQ623394_T1 12930 701 82,1 glotblastn 6776 LYD501 cotton|10v2|DR458877_T1 12954 701 82,1 glotblastn 6777 LYD501 eggplant|10v1|FS027436_T1 12955 701 82,1 glotblastn 6778 LYD501 fescue|gb161|DT686745_T1 12956 701 82,1 glotblastn 6779 LYD501 foxtail_millet|10v2|FXTSLX00265159 12957 701 82,1 glotblastn 6780 LYD501 liquorice|gb171|FS268104_T1 12958 701 82,1 glotblastn 6781 LYD501 lotus|09v1|CB827659_T1 12959 701 82,1 glotblastn 6782 LYD501 maize|10v1|A1491549_T1 12960 701 82,1 glotblastn

288 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 6783 LYD501 maize|10v1|A1987228_T1 12961 701 82,1 glotblastn 6784 LYD501 millet|10v1|PMSLX0096074D1_T1 12962 701 82,1 glotblastn 6785 LYD501 monkeyflower|10v1|GR009251_T1 12963 701 82,1 glotblastn nicotiana_benthamiana|gb162|CK290452_T 6786 LYD501 12964 701 82,1 glotblastn 1 6787 LYD501 pigeonpea|10v1|SRR054580S0006991_T1 12965 701 82,1 glotblastn 6788 LYD501 pigeonpea|10v1|SRR054580S0007934_T1 12966 701 82,1 glotblastn 789 LYD501 poplar|10v1|B1129134_T1 12967 701 82,1 glotblastn 6790 LYD501 potato|10v1|B1405324_T1 12968 701 82,1 glotblastn 6791 LYD501 solanum_phureja|09v1|SPHBQ518958 12969 701 82,1 glotblastn 6792 LYD501 solanum_phureja|09v1|SPHLEU28007 12968 701 82,1 glotblastn 6793 LYD501 sorghum|09v1|SB03G042760 12970 701 82,1 glotblastn 6794 LYD501 sorghum|09v1|SB09G002850 12971 701 82,1 glotblastn 6795 LYD501 sorghum|11v1|SB09G002850_T1 12971 701 82,1 glotblastn 6796 LYD501 soybean|11v1|GLYMA02G01150 12972 701 82,1 glotblastn 6797 LYD501 soybean|11v1|GLYMA10G01200 12973 701 82,1 glotblastn 6798 LYD501 soybean|11v1|GLYMA19G40820 12974 701 82,1 glotblastn 6799 LYD501 strawberry|11v1|SRR034859S0004247 12975 701 82,1 glotblastn 6800 LYD501 sugarcane|10v1|AA577641 12976 701 82,1 glotblastn 6801 LYD501 tomato|09v1|BQ518958 12977 701 82,1 glotblastn 6802 LYD501 tomato|09v1|EU28007 12941 701 82,1 glotblastn 6803 LYD501 triphysaria|10v1|BM357128 12978 701 82,1 glotblastn 6804 LYD501 wheat|10v2|BE404390 12979 701 82,1 glotblastn 6805 LYD501 medicago|09v1|AW689792_T1 12980 701 82,1 glotblastn 6806 LYD501 petunia|gb171|FN011365_P1 12981 701 82,1 globlastp 6807 LYD501 barley|10v2|BM442672_T1 12982 701 82,1 glotblastn 6808 LYD501 brachypodium|09v1|BRAD13 G46280_T1 12983 701 82,1 glotblastn 6809 LYD501 fagopyrum|11v1|SRR063689X126034_T1 12984 701 81,9 glotblastn 6810 LYD501 fagopyrum|11v1|SRR063689X139486_T1 12985 701 81,9 glotblastn 6811 LYD501 oil_palm|gb166|EL682307_T1 12986 701 81,9 glotblastn 6812 LYD501 foxtail_millet|11v3|PHY7S1001961M_T1 12987 701 81,7 glotblastn 6813 LYD501 silene|11v1|GH295042_T1 12988 701 81,7 glotblastn foxtail_millet|10v2|FXTRMSLX00062108D 6814 LYD501 12987 701 81,7 glotblastn 1 6815 LYD501 onion|gb162|B1095633_T1 12989 701 81,7 glotblastn 6816 LYD501 cirsium|11v1|SRR346952.718843_T1 12990 701 81,6 glotblastn 6817 LYD501 monkeyflower|10v1|GR112379_T1 12991 701 81,6 glotblastn 6818 LYD501 triphysaria|10v1|SRR023501S0045209 12992 701 81,6 glotblastn 6819 LYD501 pineapple|10v1|DT338006_T1 12993 701 81,6 glotblastn 6820 LYD501 cheliclonium|11v1|SRR084752X101024_T1 12994 701 81,4 glotblastn 6821 LYD501 flaveria|11v1|SRR149244.109348_T1 12995 701 81,4 glotblastn 6822 LYD501 canola|10v1|CX278279 12996 701 81,4 glotblastn 6823 LYD501 ipomoea_batatas|10v1|EE875015_T1 12997 701 81,4 glotblastn 6824 LYD501 ipomoea_nil|10v1|CJ760692_T1 12998 701 81,4 glotblastn 6825 LYD501 amsonia|11v1|SRR098688X142027_T1 12999 701 81,3 glotblastn 6826 LYD501 apple|11v1|CO866258_T1 13000 701 81,3 glotblastn 6827 LYD501 apple|11v1|EB110697_T1 13001 701 81,3 glotblastn 6828 LYD501 canola|11v1|EG021170_T1 13002 701 81,3 glotblastn 6829 LYD501 castorbean|11v1|EG657546_T1 13003 701 81,3 glotblastn 6830 LYD501 cucurbita|11v1|SRR091276X100504_T1 13004 701 81,3 glotblastn 6831 LYD501 euphorbia|11v1|DV116440_T1 13005 701 81,3 glotblastn 6832 LYD501 flax|11v1|CA482925_T1 13006 701 81,3 glotblastn 6833 LYD501 fraxinus|11v1|SRR058827.100436_T1 13007 701 81,3 glotblastn 6834 LYD501 grape|11v1|GSVIVT01033472001_T1 13008 701 81,3 glotblastn maritime_pine|10v1|SRR073317S0028767_ 6835 LYD501 13009 701 81,3 glotblastn T1 6836 LYD501 sarracenia|11v1|SRR192669.144509_T1 13010 701 81,3 glotblastn 6837 LYD501 amaranthus|10v1|SRR03941150007133_T1 13011 701 81,3 glotblastn 6838 LYD501 apple|gb171|CN579477 13012 701 81,3 glotblastn 6839 LYD501 b_juncea|10v2|E6ANDIZ01ENCJB_T1 13013 701 81,3 glotblastn 6840 LYD501 bean|gb167|CA916087_T1 13014 701 81,3 glotblastn 6841 LYD501 brachypodium|09v1|DV475658_T1 13015 701 81,3 glotblastn

289 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 6842 LYD501 cacao|10v1|CU540382_T1 13016 701 81,3 glotblastn 6843 LYD501 cassava|09v1|CK642609_T1 13017 701 81,3 glotblastn 6844 LYD501 cassava|09v1|DR086867_T1 13018 701 81,3 glotblastn 6845 LYD501 castorbean|09v1|EG657546 13019 701 81,3 glotblastn 6846 LYD501 centaureia|gb166|EL931320_T1 13020 701 81,3 glotblastn 6847 LYD501 chestnut|gb170|SRR00629550006440_T1 13021 701 81,3 glotblastn 6848 LYD501 cichorium|gb171|EH682586_T1 13022 701 81,3 glotblastn 6849 LYD501 cotton|10v2|BF278036_T1 13023 701 81,3 glotblastn 6850 LYD501 cowpea|gb166|FF394649_T1 13024 701 81,3 glotblastn 6851 LYD501 cyamopsis|10v1|EG976753_T1 13025 701 81,3 glotblastn 6852 LYD501 foxtail_millet|10v2|FXTRMSLX00534304 13026 701 81,3 glotblastn 6853 LYD501 foxtail_millet|11v3|PHY7SI022446M_T1 13026 701 81,3 glotblastn 6854 LYD501 lettuce|10v1|DWO58707_T1 13027 701 81,3 glotblastn 6855 LYD501 millet|10v1|CD725591_T1 13028 701 81,3 glotblastn 6856 LYD501 momordica|10v1|SRR071315S0009178_T1 13029 701 81,3 glotblastn 6857 LYD501 nasturtium|10v1|SRR03255850007554 13030 701 81,3 glotblastn 6858 LYD501 nasturtium|10v1|SRR03255850091869 13031 701 81,3 glotblastn 6859 LYD501 oak|10v1|CU656232_T1 13032 701 81,3 glotblastn 6860 LYD501 orobanche|10v1|SRR02318950005258_T1 13033 701 81,3 glotblastn 6861 LYD501 pineapple|10v1|DV190737_T1 13034 701 81,3 glotblastn 6862 LYD501 rice|gb170|OS05G04520 13035 701 81,3 glotblastn 6863 LYD501 solanum_phureja|09v1|SPHBI435514 13036 701 81,3 glotblastn 6864 LYD501 soybean|11v1|GLYMA03G38200 13037 701 81,3 glotblastn 6865 LYD501 strawberry|11v1|DY675883 13038 701 81,3 glotblastn 6866 LYD501 switchgrass|gb167|DN151255 13039 701 81,3 glotblastn 6867 LYD501 switchgrass|gb167|FL786664 13040 701 81,3 glotblastn 6868 LYD501 petunia|gb171|DY396104_T1 - 701 81,3 glotblastn 6869 LYD501 sorghum|09v1|SB03G013140 13041 701 81,2 glotblastn 6870 LYD501 sorghum|11v1|SB03G013140_T1 13041 701 81,2 glotblastn 6871 LYD501 tobacco|gb162|BP530623 13042 701 81,2 globlastp 6872 LYD501 primula|11v1|SRR098679X106133_T1 13043 701 81,0 glotblastn 6873 LYD501 brachypodium|09v1|DV470851_T1 13044 701 81,0 glotblastn 6874 LYD501 grape|11v1|GSVIVT01017680001_T1 13045 701 81,0 glotblastn 6875 LYD501 grape|gb160|BQ795653 13046 701 81,0 glotblastn 6876 LYD501 wheat|10v2|E3E415417 13047 701 81,0 glotblastn 6877 LYD501 primula|11v1|SRR098679X105062_P1 13048 701 81,0 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJGI11010 6878 LYD501 13049 701 80,9 glotblastn 829_T1 6879 LYD501 chestnut|gb170|SRR00629650053275_T1 13050 701 80,7 glotblastn 6880 LYD501 kiwi|gb166|FG422741_T1 13051 701 80,7 glotblastn 6881 LYD501 soybean|11v1|GLYMA17G04410 13052 701 80,7 glotblastn 6882 LYD501 cichorium|gb171|DT211534_T1 13053 701 80,7 glotblastn 6883 LYD501 utricularia|11v1|SRR094438.112663_P1 13054 701 80,6 globlastp 6884 LYD501 canola|11v1|EV117604_T1 13055 701 80,5 glotblastn 6885 LYD501 thalictrum|11v1|SRR096787X113596_T1 13056 701 80,5 glotblastn 6886 LYD501 vinca|11v1|SRR098690X129395_T1 13057 701 80,5 glotblastn 6887 LYD501 cotton|10v2|BG442655_T1 13058 701 80,5 glotblastn 6888 LYD501 cotton|10v2|DR453534_T1 13059 701 80,5 glotblastn 6889 LYD501 switchgrass|gb167|DN142163 13060 701 80,5 glotblastn 6890 LYD501 switchgrass|gb167|FE626595 13061 701 80,5 glotblastn 6891 LYD501 olea|11v1|SRR014463.34522XX1_P1 13062 701 80,4 globlastp amorphophallus|11v2|SRR089351X10240X 6892 LYD501 13063 701 80,4 glotblastn X1_T1 6893 LYD501 arnica|11v1|ISRR099034X107501_T1 13064 701 80,4 glotblastn 6894 LYD501 catharanthus|11v1|SRR098691X101336_T1 13065 701 80,4 glotblastn 6895 LYD501 euonymus|11v1|SRR070038X634481_T1 13066 701 80,4 glotblastn 6896 LYD501 flaveria|11v1|SRR149229.262100XX2_T1 13067 701 80,4 glotblastn 6897 LYD501 oat|11v1|GR330195_T1 13068 701 80,4 glotblastn 6898 LYD501 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1002583_T1 13069 701 80,4 glotblastn 6899 LYD501 p1antago|11v1|SRR_T1066373X101008 13070 701 80,4 glotblastn 6900 LYD501 scabiosa|11v1|SRR063723X112974_T1 13071 701 80,4 glotblastn

290 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: tabernaemontana|11v1|SRR098689X103838 6901 LYD501 13072 701 80,4 glotblastn _T1 tabernaemontana|11v1|SRR098689X115418 6902 LYD501 13073 701 80,4 glotblastn _T1 6903 LYD501 trigonella|11v1|SRR066194X143892_T1 13074 701 80,4 glotblastn 6904 LYD501 arabidopsis|10v1|AT2G30730_T1 13075 701 80,4 glotblastn 6905 LYD501 brachypodium|09v1|GT762793_T1 13076 701 80,4 glotblastn 6906 LYD501 catharanthus|gb166|FD416078 13077 701 80,4 glotblastn 6907 LYD501 cenchrus|gb166|EB661212_T1 13078 701 80,4 glotblastn 6908 LYD501 kiwi|gb166|FG397290_T1 13079 701 80,4 glotblastn 6909 LYD501 liriodendron|gb166|FD495051_T1 13080 701 80,4 glotblastn 6910 LYD501 medicago|09v1|AW684813_T1 13081 701 80,4 glotblastn 6911 LYD501 oat|10v2|G0589888 13082 701 80,4 glotblastn 6912 LYD501 prunus|10v1|P3U042095 13083 701 80,4 glotblastn 6913 LYD501 senecio|gb170|DY665675 13084 701 80,2 globlastp 6914 LYD501 valeriana|11v1|SRR099039X104387XX1_Ti 13085 701 80,2 glotblastn 6915 LYD501 aquilegia|10v2|DR917214_T1 13086 701 80,2 glotblastn 6916 LYD501 barley|10v2|AV832515_T1 13087 701 80,2 glotblastn 6917 LYD501 oat|10v2|GR326255 13088 701 80,2 glotblastn 6918 LYD501 oat|11v1|GR326255_T1 13088 701 80,2 glotblastn 6919 LYD501 pine|10v2|BQ696329_T1 13089 701 80,2 glotblastn 6920 LYD501 switchgrass|gb167|FE615870 13090 701 80,0 glotblastn 6921 LYD514 soybean|11v1|GLYMA17G15380 13091 702 91,6 globlastp 6922 LYD514 cowpea|gb166|FG813581_P1 13092 702 87,9 globlastp 6923 LYD514 clover|gb162|BB913334_P1 13093 702 81,3 globlastp 6924 LYD514 medicago|09v1|AW257356_T1 13094 702 80,1 glotblastn 6925 LYD306 radish|gb164|EV544503 13095 704 93,3 globlastp 6926 LYD306 flaveria|11v1|SRR149229.509874_P1 13096 704 90,8 globlastp 6927 LYD306 safflower|gb162|DQ534204 13097 704 90,8 globlastp 6928 LYD306 ambrosia|11v1|SRR346935.260049_T1 13098 704 90,8 glotblastn 6929 LYD306 cirsium|11v1|SRR346952.100256_T1 13099 704 90,8 glotblastn 6930 LYD306 artemisia|10v1|SRR019254S0009872_T1 13100 704 90,8 glotblastn foxtail_millet|10v2|OXFXTRMSLX000010 6931 LYD306 13101 704 90,8 glotblastn 12D1_T1 6932 LYD306 guizotia|10v1|GE553022_T1 13102 704 90,8 glotblastn 6933 LYD306 millet|10v1|EV0454PM721643_T1 13101 704 90,8 glotblastn 6934 LYD306 tragopogon|10v1|SRR020205S0000151 13103 704 90,8 glotblastn 6935 LYD306 cotton|10v2|BF270030_T1 13104 704 89,9 glotblastn 6936 LYD306 sunflower|10v1|Z49775 13105 704 89,9 glotblastn 6937 LYD306 eucalyptus|gb166|CT988295 13106 704 89,9 globlastp 6938 LYD306 poppy|gb166|FE965747_P1 13107 704 89,9 globlastp 6939 LYD306 phyla|11v2|SRR099037X10112XX1_P1 13108 704 89,1 globlastp 6940 LYD306 silene|11v1|HM099805_P1 13109 704 89,1 globlastp 6941 LYD306 acacia|10v1|FS585063_P1 13110 704 89,1 globlastp amorphophallus|11v2|SRR089351X152955_ 6942 LYD306 13111 704 89,1 glotblastn T1 6943 LYD306 cirsium|11v1|SRR346952.1004757_T1 13112 704 89,1 glotblastn 6944 LYD306 beet|gb162|131543693_T1 13113 704 89,1 glotblastn 6945 LYD306 onion|gb162|Z49772_T1 13114 704 89,1 glotblastn 6946 LYD306 amsonia|11v1|SRR098688X113969_T1 13115 704 88,2 glotblastn maritime_pine|10v1|SRR073317S0084939_ 6947 LYD306 13116 704 88,2 globlastp P1 6948 LYD306 triphysaria|10v1|EY129772 13117 704 88,2 globlastp 6949 LYD306 flax|11v1|JG032950_P1 13118 704 87,4 globlastp 6950 LYD306 euonymus|11v1|SRR070038X114200_T1 13119 704 87,4 glotblastn 6951 LYD306 oak|10v1|SRR006309S0021947_T1 13120 704 87,4 glotblastn 6952 LYD306 citrus|gb166|CX046781_T1 13121 704 86,6 glotblastn 6953 LYD306 peanut|10v1|SRR042413S0027002_T1 13122 704 85,7 glotblastn 6954 LYD306 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1304731_P1 13123 704 85,7 globlastp 6955 LYD306 poplar|10v1|XM002338219_P1 13124 704 85,7 globlastp 6956 LYD306 fagopyrum|11v1|SRR063689X103218_T1 13125 704 84,9 glotblastn 6957 LYD306 distylium|11v1|SRR065077X213098_P1 13126 704 84,0 globlastp

291 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: thellungiella_halophilum|11v1|BY801512_P 6958 LYD308 13127 705 83,4 globlastp 1 6959 LYD310 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL015317_P1 13128 706 96,5 globlastp 6960 LYD310 radish|gb164|EV566941 13129 706 88,4 globlastp 6961 LYD310 radish|gb164|EV536862 13130 706 87,7 glotblastn 6962 LYD310 canola|10v1|CD818340 13131 706 87,3 globlastp 6963 LYD310 canola|11v1|DY020145_P1 13131 706 87,3 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN773273_P 6964 LYD310 13132 706 86,1 globlastp 1 6965 LYD310 thellungiella_parvulum|11v1|DN773273_P1 13133 706 85,3 globlastp 6966 LYD347 canola|11v1|CN827902_P1 13134 708 97,4 globlastp 6966 LYD382 canola|11v1|CN827902_P1 13134 730 82,8 globlastp 6967 LYD347 canola|10v1|CD817392 13134 708 97,4 globlastp 6967 LYD382 canola|10v1|CD817392 13134 730 82,8 globlastp 6968 LYD347 canola|11v1|CN729912_P1 13135 708 97,1 globlastp 6968 LYD382 canola|11v1|CN729912_P1 13135 730 82,6 globlastp 6969 LYD347 b_rapa|gb162|CA992216_P1 13135 708 97,1 globlastp 6969 LYD382 b_rapa|gb162|CA992216_P1 13135 730 82,6 globlastp 6970 LYD347 canola|10v1|CN729912 13135 708 97,1 globlastp 6970 LYD382 canola|10v1|CN729912 13135 730 82,6 globlastp 6971 LYD347 thellungiella_parvulum|11v1|DN772935_P1 13136 708 95,3 globlastp 6971 LYD382 thellungiella_parvulum|11v1|DN772935_P1 13136 730 83,0 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN772935_P 6972 LYD347 13137 708 95,0 globlastp 1 thellungiella_halophilum|11v1|DN772935_P 6972 LYD382 13137 730 82,8 globlastp 1 6973 LYD347 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL021172_P1 13138 708 93,2 globlastp 6973 LYD382 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL021172_P1 13138 730 83,6 globlastp 6974 LYD347 canola|11v1|EV078870_P1 13139 708 92,2 globlastp 6974 LYD382 canola|11v1|EV078870_P1 13139 730 80,4 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP013529 6975 LYD347 13140 708 87,5 globlastp _P1 thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111004 6976 LYD347 13141 708 86,9 globlastp 548_P1 6977 LYD347 iceplant|gb164|BE035085_P1 13142 708 84,7 globlastp 6977 LYD382 iceplant|gb164|BE035085_P1 13142 730 86,5 globlastp 6978 LYD347 fraxinus|11v1|SRR058827.105118_T1 13143 708 81,7 glotblastn 6978 LYD382 fraxinus|11v1|SRR058827.105118_T1 13143 730 87,4 glotblastn 6979 LYD347 phalaenopsis|11v1|SRR125771.100024_P1 13144 708 80,7 globlastp 6979 LYD382 phalaenopsis|11v1|SRR125771.100024_P1 13144 730 83,2 globlastp 6980 LYD347 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1001147_P1 13144 708 80,7 globlastp 6980 LYD382 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1001147_P1 13144 730 83,2 globlastp 6981 LYD347 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1040645_P1 13144 708 80,7 globlastp 6981 LYD382 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1040645_P1 13144 730 83,2 globlastp 6982 LYD348 canola|10v1|A1352748 13145 709 96,4 globlastp 6983 LYD348 canola|11v1|A1352748_P1 13146 709 95,5 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP018865 6984 LYD348 13147 709 90,3 globlastp _P1 thellungiella_halophilum|11v1|EHJGI11011 6985 LYD348 13148 709 89,2 globlastp 405_P1 arabidopsis_lyrata|09v1|GFXEU351066X1_ 6986 LYD348 13149 709 85,7 globlastp P1 6987 LYD348 arabidopsis|10v1|AT1G67070_P1 13150 709 84,7 globlastp 6988 LYD349 canola|11v1|EE472700_P1 13151 710 81,9 globlastp 6989 LYD349 canola|10v1|CD824560 13152 710 80,9 globlastp 6990 LYD351 b_rapa|gb162|DN960551_P1 13153 711 99,5 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY818615_P 6991 LYD351 13154 711 95,0 globlastp 1 6992 LYD351 thellungiella_parvulum|11v1|BY818 616_P1 13155 711 93,5 globlastp 6993 LYD351 canola|11v1|ES978033_P1 13156 711 89,2 globlastp 6994 LYD351 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL003298_P1 13157 711 80,9 globlastp 6995 LYD352 canola|11v1|EE425385_P1 13158 712 99,0 globlastp

292 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 6996 LYD352 canola|11v1|CN827475_P1 13159 712 99,0 globlastp 6997 LYD352 canola|10v1|E174560 13160 712 98,6 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EC598964_P 6998 LYD352 13161 712 96,7 globlastp 1 6999 LYD352 thellungiella_parvulum|11v1|BY824 747_P1 13162 712 96,7 globlastp 7000 LYD352 arabidopsis|10v1|AT1G23190_P1 13163 712 96,6 globlastp 7001 LYD352 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL002495_P1 13164 712 96,2 globlastp 7002 LYD352 b_rapa|gb162|CV432482_P1 13165 712 96,1 globlastp 7003 LYD352 canola|10v1|CD814120 13165 712 96,1 globlastp 7004 LYD352 canola|11v1|DY000898_P1 13166 712 96,1 globlastp 7005 LYD352 canola|11v1|DY025603_P1 13167 712 95,4 globlastp 7006 LYD352 canola|10v1|CD816377 13168 712 94,9 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN775664- 7007 LYD352 13169 712 91,6 globlastp _P1 7008 LYD352 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL007312_P1 13170 712 91,6 globlastp 7009 LYD352 arabidopsis|10v1|AT1G70730_P1 13171 712 91,5 globlastp 7010 LYD352 thellungiella_parvulum|11v1|DN775664_P1 13172 712 89,6 globlastp 7011 LYD352 melon|10v1|ES597113_T1 13173 712 88,7 glotblastn 7012 LYD352 watermelon|11v1|ES597113_P1 13174 712 88,5 globlastp 7013 LYD352 cassava|09v1|CK645485_P1 13175 712 88,4 globlastp 7014 LYD352 chestnut|gb170|SRR00629550001891_P1 13176 712 88,3 globlastp 7015 LYD352 cassava|09v1|CK646348_P1 13177 712 88,2 globlastp 7016 LYD352 citrus|gb166|AY112996_P1 13178 712 88,2 globlastp 7017 LYD352 cotton|10v2|AI054958_P1 13179 712 88,2 globlastp 7018 LYD352 oak|10v1|FP028010_P1 13180 712 88,2 globlastp 7019 LYD352 nasturtium|10v1|SRR032558S0012721 13181 712 88,0 globlastp 7020 LYD352 cacao|10v1|CU491225_P1 13182 712 88,0 globlastp 7021 LYD352 castorbean|09v1|PE260732 13183 712 87,8 globlastp 7022 LYD352 castorbean|11v1|EE260732_P1 13183 712 87,8 globlastp 7023 LYD352 cucumber|09v1|DN909403_T1 13184 712 87,7 glotblastn 7024 LYD352 clementine|11v1|AY112996_P1 13185 712 87,7 globlastp 7025 LYD352 cotton|10v2|BQ402877_P1 13186 712 87,7 globlastp 7026 LYD352 peanut|10v1|PE125729_P1 13187 712 87,3 globlastp 7027 LYD352 euonymus|11v1|SRR070038X103220_P1 13188 712 87,2 globlastp 7028 LYD352 flaveria|11v1|SRR149229.101466_P1 13189 712 87,0 globlastp 7029 LYD352 eucalyptus|11v2|CB967512_P1 13190 712 86,8 globlastp 7030 LYD352 flaveria|11v1|SRR149229.401544_P1 13191 712 86,8 globlastp 7031 LYD352 flaveria|11v1|SRR149238.271423_P1 13192 712 86,8 globlastp 7032 LYD352 aquilegia|10v2|DR920183_P1 13193 712 86,6 globlastp 7033 LYD352 euonymus|11v1|SRR070038X156938_P1 13194 712 86,5 globlastp 7034 LYD352 chelidonium|11v1|SRR084752X110 277_P1 13195 712 86,3 globlastp 7035 LYD352 sunflower|10v1|DY940715 13196 712 86,3 globlastp 7036 LYD352 platanus|11v1|SRR096786X111135_P1 13197 712 86,1 globlastp 7037 LYD352 flaveria|11v1|SRR149229.11664_P1 13198 712 86,0 globlastp 7038 LYD352 phyla|11v2|SRR0199035X106669_P 13199 712 86,0 globlastp trigonella|11v1|SRR066194X11443 7039 LYD352 13200 712 86,0 globlastp 8_P1 grape|11v1|GSVIVT01011700001_ 7040 LYD352 13201 712 86,0 globlastp P1 7041 LYD352 grape|gb160|BQ793452 13201 712 86,0 globlastp 7042 LYD352 amsonia|11v1|SRR098688X113486_P1 13202 712 85,9 globlastp 7043 LYD352 cirsium|11v1|SRR346952.1000280_P1 13203 712 85,8 globlastp 7044 LYD352 valeriana|11v1|SRR099039X10581_P1 13204 712 85,8 globlastp 7045 LYD352 monkeyflower|10v1|DV206089_P1 13205 712 85,8 globlastp 7046 LYD352 triphysaria|10v1|EX984750 13206 712 85,6 globlastp 7047 LYD352 ambrosia|11v1|SRR346935.151767_P1 13207 712 85,4 globlastp 7048 LYD352 centaureia|gb166|EH711873_P1 13208 712 85,4 globlastp 7049 LYD352 poplar|10v1|P1122177_P1 13209 712 85,4 globlastp 7050 LYD352 arnica|11v1|SRR099034X102901_P1 13210 712 85,3 globlastp 7051 LYD352 cynara|gb167|GE579086_P1 13211 712 85,3 globlastp 7052 LYD352 soybean|11v1|GLYMA05G34790 13212 712 85,3 globlastp 7053 LYD352 ambrosia|11v1|SRR346943.100221_P1 13213 712 85,1 globlastp

293 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 7054 LYD352 vinca|11v1|SRR098690X109122_P1 13214 712 85,1 globlastp 7055 LYD352 vinca|11v1|SRR098690X134419_P1 13215 712 85,1 globlastp 7056 LYD352 lettuce|10v1|DW044063_P1 13216 712 85,1 globlastp 7057 LYD352 prunus|10v1|PU039293 13217 712 85,1 globlastp 7058 LYD352 soybean|11v1|GLYMA08G04890 13218 712 85,1 globlastp 7059 LYD352 cowpea|gb166|ES884082_P1 13219 712 85,1 globlastp 7060 LYD352 medicago|09v1|AW299179_P1 13220 712 85,1 globlastp 7061 LYD352 cirsium|11v1|SRR346952.101576_P1 13221 712 84,9 globlastp 7062 LYD352 eucalyptus|11v2|CD668683_P1 13222 712 84,9 globlastp 7063 LYD352 flaveria|11v1|SRR149229.226355_P1 13223 712 84,9 globlastp 7064 LYD352 cichorium|gb171|EH673920_P1 13224 712 84,8 globlastp 7065 LYD352 pea|09v1|AJ250769 13225 712 84,8 globlastp 7066 LYD352 pea|11v1|AJ250769_P1 13225 712 84,8 globlastp 7067 LYD352 strawberry|11v1|CO379511 13226 712 84,6 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X104686 7068 LYD352 13227 712 84,4 globlastp _P1 7069 LYD352 catharanthus|11v1|EG556386_P1 13228 712 84,2 globlastp 7070 LYD352 apple|gb171|CN887990 13229 712 84,2 globlastp 7071 LYD352 rice|gb170|OS03G50480 13230 712 84,2 globlastp 7072 LYD352 switchgrass|gb167|DN150596 13231 712 83,9 globlastp 7073 LYD352 switchgrass|gb167|FE598837 13232 712 83,9 globlastp 7074 LYD352 millet|10v1|EV0454PM004450_P1 13233 712 83,9 globlastp 7075 LYD352 sunflower|10v1|CD857473 13234 712 83,7 globlastp 7076 LYD352 potato|10v1|BF459951_P1 13235 712 83,7 globlastp 7077 LYD352 maize|10v1|ZMU89342_P1 13236 712 83,7 globlastp 7078 LYD352 tomato|11v1|BG132150_P1 13237 712 83,6 globlastp 7079 LYD352 maize|10v1|ZMU89341_P1 13238 712 83,6 globlastp 7080 LYD352 sorghum|09v1|SB01G010280 13239 712 83,6 globlastp 7081 LYD352 sorghum|11v1|SB01G010280_P1 13239 712 83,6 globlastp 7082 LYD352 cephalotaxus|11v1|SRR064395X100946_P1 13240 712 83,4 globlastp 7083 LYD352 tobacco|gb162|AB055503 13241 712 83,4 globlastp 7084 LYD352 tomato|09v1|PG132150 13242 712 83,4 globlastp 7085 LYD352 fescue|gb161|DT681692_P1 13243 712 83,4 globlastp 7086 LYD352 sugarcane|10v1|BU925781 13244 712 83,4 globlastp 7087 LYD352 barley|10v2|BE412460_P1 13245 712 83,0 globlastp 7088 LYD352 iceplant|gb164|MCU84888_P1 13246 712 82,9 globlastp 7089 LYD352 apple|gb171|CN496969 13247 712 82,9 globlastp 7090 LYD352 wheat|10v2|BF200900 13248 712 82,8 globlastp 7091 LYD352 wheat|10v2|BE406973 13249 712 82,7 globlastp 7092 LYD352 flaveria|11v1|SRR149232.100742_T1 13250 712 82,6 glotblastn 7093 LYD352 spruce|gb162|CO218052 13251 712 82,4 globlastp 7094 LYD352 podocarpus|10v1|SRR065014S0004087_P1 13252 712 82,4 globlastp 7095 LYD352 zostera|10v1|AM767609 13253 712 82,3 globlastp 7096 LYD352 brachypodium|09v1|DV471917_P1 13254 712 82,2 globlastp 7097 LYD352 flaveria|11v1|SRR149229.103711_P1 13255 712 82,0 globlastp 7098 LYD352 oat|11v1|CN821643_P1 13256 712 82,0 globlastp 7099 LYD352 oat|10v2|CN815680 13256 712 82,0 globlastp 7100 LYD352 oat|11v1|CN815680_P1 13257 712 82,0 globlastp 7101 LYD352 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0006408 13258 712 81,8 globlastp 7102 LYD352 maritime_pine|10v1|BX252576_P1 13259 712 81,7 globlastp 7103 LYD352 pine|10v2|AA739897_P1 13260 712 81,7 globlastp 7104 LYD352 coffea|10v1|DV664147_P1 13261 712 80,5 globlastp 7105 LYD352 euphorbia|11v1|DV127964_P1 13262 712 80,4 globlastp 7106 LYD352 abies|11v2|SRR098676X105259_P1 13263 712 80,3 globlastp 7107 LYD353 canola|11v1|EV044918_P1 13264 713 99,8 globlastp 7108 LYD353 canola|11v1|EE447036_P1 13265 713 97,9 globlastp 7109 LYD353 canola|10v1|CD827120 13266 713 91,6 globlastp 7110 LYD353 canola|11v1|DY005537_P1 13267 713 86,0 globlastp 7111 LYD353 canola|11v1|EE490789_P1 13268 713 86,0 globlastp 7112 LYD354 canola|11v1|DY010870_P1 13269 714 98,9 globlastp 7113 LYD354 canola|11v1|CN829982_P1 13270 714 98,6 globlastp 7114 LYD354 thellungiella_parvulum|11v1|DN776813_P1 13271 714 94,1 globlastp

294 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: thellungiella_halophilum|11v1|DN776813_P 7115 LYD354 13272 714 93,7 globlastp 1 7116 LYD354 arabidopsis|10v1|AT5G15410_P1 13273 714 93,0 globlastp 7117 LYD354 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL021237_P1 13274 714 92,3 globlastp 7118 LYD356 canola|11v1|EE455553_P1 13275 715 97,3 globlastp 7119 LYD356 canola|10v1|CD820930 13276 715 84,4 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN778236_P 7120 LYD358 13277 717 96,9 globlastp 1 7121 LYD358 thellungiella_parvulum|11v1|DN778236_P1 13278 717 96,9 globlastp 7122 LYD358 radish|gb164|EX777392 13279 717 96,7 globlastp 7123 LYD358 canola|11v1|ES912660_P1 13280 717 96,5 globlastp 7124 LYD358 canola|11v1|DY016227 Ti 13281 717 96,5 glotblastn 7125 LYD358 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL025650_P1 13282 717 96,0 globlastp 7126 LYD358 arabidopsis|10v1|AT4G24550_T1 13283 717 95,8 glotblastn 7127 LYD358 canola|11v1|EG020096_P1 13284 717 95,3 globlastp 7128 LYD358 canola|11v1|H07818_P1 13285 717 94,9 globlastp 7129 LYD358 cotton|10v2|DW239378_P1 13286 717 88,1 globlastp 7130 LYD358 castorbean|09v1|NM002513985 13287 717 87,0 globlastp 7131 LYD358 castorbean|11v1|XM002513985_P1 13287 717 87,0 globlastp 7132 LYD358 poplar|10v1|B1128436_P1 13288 717 85,8 globlastp 7133 LYD358 cassava|09v1|DB923069_P1 13289 717 85,7 globlastp 7134 LYD358 tragopogon|10v1|SRR020205S0003750 13290 717 85,4 globlastp 7135 LYD358 nasturtium|10v1|SRR032558S0018798 13291 717 85,1 globlastp 7136 LYD358 ambrosia|11v1|SRR346935.111555_P1 13292 717 85,0 globlastp 7137 LYD358 centaureia|gb166|EH745185_T1 13293 717 85,0 glotblastn 7138 LYD358 ambrosia|11v1|SRR346935.112597_T1 13294 717 84,7 glotblastn 7139 LYD358 cotton|10v2|DT462230_T1 13295 717 84,7 glotblastn 7140 LYD358 papaya|gb165|EX228531_P1 13296 717 84,7 globlastp 7141 LYD358 cichorium|gb171|EH674732_P1 13297 717 84,7 globlastp 7142 LYD358 kiwi|gb166|FG472017_P1 13298 717 84,7 globlastp 7143 LYD358 ambrosia|11v1|SRR346935.137750_T1 13299 717 84,5 glotblastn 7144 LYD358 flaveria|11v1|SRR149229.100882_P1 13300 717 84,5 globlastp 7145 LYD358 flaveria|11v1|SRR149229.439637_P1 13301 717 84,5 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X111546 7146 LYD358 13302 717 84,5 globlastp _P1 7147 LYD358 sunflower|10v1|PDY905409 13303 717 84,5 globlastp 7148 LYD358 artemisia|10v1|PY032569_P1 13304 717 84,3 globlastp 7149 LYD358 aquilegia|10v2|DR928698_P1 13305 717 84,3 globlastp 7150 LYD358 sarracenia|11v1|SRR192669.101663_T1 13306 717 84,3 glotblastn 7151 LYD358 melon|10v1|AM728198_P1 13307 717 84,1 globlastp watermelon|11v1|VMEL00186708740577_P 7152 LYD358 13308 717 84,1 globlastp 1 7153 LYD358 strawberry|11v1|PDY667286 13309 717 84,1 globlastp 7154 LYD358 grape|11v1|GSVIVT01009764001_P1 13310 717 84,1 globlastp 7155 LYD358 grape|gb160|BQ793335 13310 717 84,1 globlastp 7156 LYD358 ambrosia|11v1|SRR346935.124338_T1 13311 717 84,1 glotblastn 7157 LYD358 arnica|11v1|SRR099034X10855_T1 13312 717 84,1 glotblastn 7158 LYD358 euphorbia|11v1|PDV128097_P1 13313 717 83,9 globlastp 7159 LYD358 tomato|11v1|P3G126403_P1 13314 717 83,9 globlastp 7160 LYD358 tomato|09v1|P3G126403 13314 717 83,9 globlastp 7161 LYD358 oak|10v1|FP036824_P1 13315 717 83,8 globlastp 7162 LYD358 solanum_phureja|09v1|SPHBG126403 13316 717 83,7 globlastp 7163 LYD358 cannabis|12v1|X500389_P1 13317 717 83,4 globlastp 7164 LYD358 prunus|10v1|CN493589 13318 717 83,4 globlastp 7165 LYD358 clementine|11v1|CX074086_T1 13319 717 83,3 glotblastn 7166 LYD358 orange|11v1|CX074086_T1 13319 717 83,3 glotblastn 7167 LYD358 cirsium|11v1|SRR346952.101264_P1 13320 717 83,2 globlastp 7168 LYD358 oak|10v1|DN950828_P1 13321 717 82,8 globlastp 7169 LYD358 apple|11v1|CN493589_P1 13322 717 82,7 globlastp 7170 LYD358 fagopyrum|11v1|SRR063689X124568_Ti 13323 717 82,6 glotblastn 7171 LYD358 medicago|09v1|AL366036_P1 13324 717 81,7 globlastp 7172 LYD358 peanut|10v1|G0264557_P1 13325 717 81,6 globlastp

295 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 7173 LYD358 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1000629_P1 13326 717 81,5 globlastp amorphophallus|11v2|SRR089351X106804_ 7174 LYD358 13327 717 81,4 globlastp P1 7175 LYD358 cirsium|11v1|SRR346952.11143_P1 13328 717 81,3 globlastp 7176 LYD358 platanus|11v1|SRR096786X210793_T1 13329 717 81,2 glotblastn 7177 LYD358 trigonella|11v1|SRR066194X197002_T1 13330 717 81,2 glotblastn 7178 LYD358 lotus|09v1|LAW720494_P1 13331 717 80,8 globlastp 7179 LYD358 pine|10v2|BF010789_P1 13332 717 80,8 globlastp 7180 LYD358 soybean|11v1|GLYMA04G03220_P1 13333 717 80,8 globlastp 7181 LYD358 sorghum|11v1|SB02G039530_P1 13334 717 80,5 globlastp 7182 LYD358 monkeyflower|10v1|G0957776_P1 13335 717 80,4 globlastp 7183 LYD358 cephalotaxus|11v1|SRR064395X108425_P1 13336 717 80,3 globlastp 7184 LYD358 maize|10v1|AI861491_P1 13337 717 80,3 globlastp 7185 LYD358 maritime_pine|10v1|CT575375_P1 13338 717 80,3 globlastp 7186 LYD358 orobanche|10v1|SRR023189S0012328_P1 13339 717 80,3 globlastp 7187 LYD358 triphysaria|10v1|EY135060_P1 13340 717 80,3 globlastp 7188 LYD358 sugarcane|10v1|CA080454_P1 13341 717 80,1 globlastp 7189 LYD359 canola|10v1|CD837791 13342 718 99,3 globlastp 7190 LYD359 b_rapa|gb162|DQ452297_P1 13343 718 98,9 globlastp 7191 LYD359 canola|11v1|EE439147_P1 13344 718 98,5 globlastp 7192 LYD359 thellungiella_parvulum|11v1|DN776586_P1 13345 718 97,3 globlastp 7193 LYD359 canola|11v1|ES911658_P1 13346 718 96,5 globlastp 7194 LYD359 canola|11v1|ES976488_P1 13347 718 96,5 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN776731_P 7195 LYD359 13348 718 96,5 globlastp 1 7196 LYD359 arabidopsis|10v1|AT4G15560_P1 13349 718 96,0 globlastp 7197 LYD359 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL026709_T1 13350 718 95,4 glotblastn 7198 LYD359 cleome_spinosa|10v1|GR931196_P1 13351 718 88,7 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000208 7199 LYD359 13352 718 88,0 globlastp 4_P1 7200 LYD359 castorbean|09v1|T14878 13353 718 84,9 globlastp 7201 LYD359 castorbean|11v1|T14878_P1 13354 718 84,8 globlastp 7202 LYD359 pepper|gb171|Y15782_P1 13355 718 84,1 globlastp 7203 LYD359 oak|10v1|FP027361_P1 13356 718 84,0 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X102047 7204 LYD359 13357 718 84,0 globlastp _P1 7205 LYD359 tobacco|gb162|AJ291721 13358 718 83,9 globlastp 7206 LYD359 poplar|10v1|B1069093_P1 13359 718 83,9 globlastp 7207 LYD359 tomato|11v1|BG126679_P1 13360 718 83,8 globlastp 7208 LYD359 cotton|10v2|ES795906_P1 13361 718 83,5 globlastp 7209 LYD359 hevea|10v1|AY502939_P1 13362 718 83,3 globlastp 7210 LYD359 citrus|gb166|CF417125_P1 13363 718 83,3 globlastp 7211 LYD359 melon|10v1|VMEL00244637940219_P1 13364 718 83,3 globlastp 7212 LYD359 clementine|11v1|CF417125_P1 13365 718 83,2 globlastp 7213 LYD359 orange|11v1|CF417125_P1 13366 718 83,2 globlastp 7214 LYD359 vinca|11v1|SRR098690X102700_P1 13367 718 83,2 globlastp 7215 LYD359 arnica|11v1|SRR099034X102346_P1 13368 718 83,1 globlastp 7216 LYD359 humulus|11v1|ES652578_P1 13369 718 83,1 globlastp 7217 LYD359 phyla|11v2|SRR099035X104029_P1 13370 718 83,1 globlastp watermelon|11v1|VMEL00244637940219_P 7218 LYD359 13371 718 83,1 globlastp 1 7219 LYD359 catharanthus|11v1|SRR098691X106429_P1 13372 718 83,0 globlastp 7220 LYD359 eucalyptus|11v2|ES590054_P1 13373 718 82,9 globlastp 7221 LYD359 lotus|09v1|AV776968_P1 13374 718 82,9 globlastp 7222 LYD359 soybean|11v1|GLYMA17G02480_P1 13375 718 82,9 globlastp 7223 LYD359 triphysaria|10v1|PDR172879 13376 718 82,9 globlastp 7224 LYD359 cacao|10v1|CU477096_T1 13377 718 82,8 glotblastn 7225 LYD359 apple|gb171|CN444902 13378 718 82,8 globlastp 7226 LYD359 euphorbia |11v1|DV132442_P1 13379 718 82,7 globlastp 7227 LYD359 soybean|11v1|GLYMA13G28470 13380 718 82,7 globlastp 7228 LYD359 cassava|09v1|DV445486_P1 13381 718 82,7 globlastp 7229 LYD359 sunflower|10v1|CX943837 13382 718 82,6 globlastp

296 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 7230 LYD359 apple|11v1|CN443984_P1 13383 718 82,6 globlastp 7231 LYD359 strawberry|11v1|PDV440264 13384 718 82,6 globlastp 7232 LYD359 prunus|10v1|CB823779 13385 718 82,5 glotblastn 7233 LYD359 grape|11v1|GSVIVT01017832001_P1 13386 718 82,5 globlastp 7234 LYD359 tripterygium|11v1|SRR098677X133991_P1 13387 718 82,5 globlastp 7235 LYD359 ambrosia|11v1|SRR346935.112476_T1 13388 718 82,4 glotblastn 7236 LYD359 monkeyflower|10v1|DV209763_P1 13389 718 82,4 globlastp amorphophallus|11v2|SRR089351X1206_T 7237 LYD359 13390 718 82,4 glotblastn 1 7238 LYD359 vinca|11v1|SRR098690X112363_P1 13391 718 82,2 globlastp 7239 LYD359 aquilegia|10v2P|DR917919_T1 13392 718 82,2 glotblastn 7240 LYD359 apple|11v1|CN883362_P1 13393 718 82,1 globlastp 7241 LYD359 flaveria|11v1|SRR149229.154114_P1 13394 718 82,1 globlastp 7242 LYD359 plantago|11v1|SRR066374X117405_T1 13395 718 82,0 glotblastn 7243 LYD359 amsonia|11v1|SRR098688X106820_P1 13396 718 82,0 globlastp 7244 LYD359 medicago|09v1|AW689301_P1 13397 718 82,0 globlastp 7245 LYD359 tomato|09v1|P3G126679 13398 718 82,0 globlastp 7246 LYD359 oil_palm|gb166|AY583783_P1 13399 718 81,9 globlastp 7247 LYD359 flaveria|11v1|SRR149229.143002_T1 13400 718 81,8 glotblastn thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP012424 7248 LYD359 13401 718 81,7 globlastp _P1 7249 LYD359 ambrosia|11v1|SRR346935.612310_T1 13402 718 81,6 glotblastn 7250 LYD359 salvia|10v1|EU670744_P1 13403 718 81,5 globlastp 7251 LYD359 solanum_phureja|09v1|SPHBG126679 13404 718 81,5 globlastp 7252 LYD359 soybean|11v1|GLYMA07G38260 13405 718 81,4 globlastp 7253 LYD359 phalaenopsis|11v1|CK859150XX1_T1 13406 718 81,3 glotblastn 7254 LYD359 wheat|10v2|E3F292886_T1 13407 718 80,8 glotblastn 7255 LYD359 triphysaria|10v1|EX984112 13408 718 80,7 globlastp 7256 LYD359 foxtail_millet|11v3|PHY7SI021346M_P1 13409 718 80,6 globlastp 7257 LYD359 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL010748_P1 13410 718 80,5 globlastp 7258 LYD359 rice|gb170|OS05G33840_P1 13411 718 80,4 globlastp 7259 LYD359 sorghum|11v1|SB09G020140_P1 13412 718 80,4 globlastp 7260 LYD359 maize|10v1|AW267504_P1 13413 718 80,3 globlastp 7261 LYD359 bean|gb167|CA896562_P1 13414 718 80,1 globlastp 7262 LYD359 brachypodium|09v1|DV475713_T1 13415 718 80,1 glotblastn 7263 LYD359 flaveria|11v1|SRR149229.146166_P1 13416 718 80,0 globlastp 7264 LYD360 b_rapa|gb162|33530_P1 13417 719 99,6 globlastp 7265 LYD360 canola|10v1|CD825888 13418 719 99,6 globlastp 7266 LYD360 radish|gb164|EV536913 13419 719 99,6 globlastp 7267 LYD360 canola|11v1|EE428881_P1 13420 719 99,5 globlastp 7268 LYD360 thellungiella_parvulum|11v1|DN773350_P1 13421 719 99,1 globlastp 7269 LYD360 canola|11v1|DY003627_P1 13422 719 99,0 globlastp 7270 LYD360 canola|11v1|PE457660_P1 13423 719 99,0 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN773350_P 7271 LYD360 13424 719 98,9 globlastp 1 7272 LYD360 arabidopsis|10v1|AT3G09840_P1 13425 719 98,5 globlastp 7273 LYD360 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL009391_P1 13426 719 98,4 globlastp 7274 LYD360 arabidopsis|10v1|AT5G03340_P1 13427 719 96,4 globlastp 7275 LYD360 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL019961_P1 13428 719 96,1 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN776690_P 7276 LYD360 13429 719 95,7 globlastp 1 7277 LYD360 thellungiella_parvulum|11v1|DN776690_P1 13430 719 95,7 globlastp 7278 LYD360 canola|11v1|DY020898_T1 13431 719 94,6 glotblastn 7279 LYD360 vinca|11v1|SRR098690X113080_P1 13432 719 93,7 globlastp Polin. to Hom para Polip. % SEQ nome do Agrupamento SEQ Gene SEQ ID glob.

Algor.

ID Horn ID Nome NO: iden.

NO: NO: tabernaemontana|11v1|SRR098689X100752 7280 LYD360 13433 719 93,6 globlastp _P1 7281 LYD360 euphorbia|11v1|SRR098678X102577_P1 13434 719 93,5 globlastp 7282 LYD360 vinca|11v1|SRR098690X111803_P1 13435 719 93,5 globlastp

297 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 7283 LYD360 aquilegia|10v2|DR930212_P1 13436 719 93,3 globlastp 7284 LYD360 catharanthus|11v1|SRR098691X101984_P1 13437 719 93,2 globlastp 7285 LYD360 silene|11v1|SRR096785X101301_P1 13438 719 93,2 globlastp 7286 LYD360 vinca|11v1|SRR098690X105429_P1 13439 719 93,2 globlastp 7287 LYD360 chestnut|gb170|SRR006295S0000641_P1 13440 719 93,1 globlastp 7288 LYD360 castorbean|09v1|EE259385 13441 719 93,1 globlastp 7289 LYD360 castorbean|11v1|XM_002519454_P1 13441 719 93,1 globlastp 7290 LYD360 castorbean|11v1|EE259385_P1 13442 719 93,0 globlastp 7291 LYD360 tomato|11v1|BG131226_P1 13443 719 92,9 globlastp 7292 LYD360 solanum_phureja|09v1|SPHAA078722 13444 719 92,9 globlastp 7293 LYD360 tomato|09v1|AA078722 13443 719 92,9 globlastp cassava|09v1|JGICASSAVA23542VALIDM 7294 LYD360 13445 719 92,8 globlastp 1_P1 7295 LYD360 watermelon|11v1|AM718298_P1 13446 719 92,7 globlastp watermelon|11v1|VMEL00664135361361_P 7296 LYD360 13447 719 92,7 globlastp 1 7297 LYD360 tobacco|gb162|CN824904 13448 719 92,7 globlastp 7298 LYD360 oak|10v1|CU640839_P1 13449 719 92,7 globlastp 7299 LYD360 poplar|10v1|AI162980_P1 13450 719 92,7 globlastp 7300 LYD360 triphysaria|10v1|EX988582 13451 719 92,6 globlastp 7301 LYD360 melon|10v1|DV633427_P1 13452 719 92,6 globlastp 7302 LYD360 solanum_phureja|09v1|SPHBQ113326 13453 719 92,6 globlastp 7303 LYD360 euphorbia|11v1|SRR098678X117908_P1 13454 719 92,5 globlastp 7304 LYD360 cassava|09v1|DV450051_P1 13455 719 92,5 globlastp 7305 LYD360 amsonia|11v1|SRR098688X103469_P1 13456 719 92,4 globlastp 7306 LYD360 clementine|11v1|BE208902_P1 13457 719 92,4 globlastp 7307 LYD360 grape|11v1|GSVIVT01025723001_P1 13458 719 92,4 globlastp 7308 LYD360 orange|11v1|BE208902_P1 13457 719 92,4 globlastp 7309 LYD360 tomato|11v1|BG123641_P1 13459 719 92,4 globlastp 7310 LYD360 citrus|gb166|BE208902_P1 13457 719 92,4 globlastp 7311 LYD360 solanum_phureja|09v1|SPHBG123641 13460 719 92,4 globlastp 7312 LYD360 tomato|09v1|P3G123641 13459 719 92,4 globlastp 7313 LYD360 cotton|10v2|DW230981_P1 13461 719 92,4 globlastp 7314 LYD360 cotton|10v2|SRR032367S0023066_P1 13462 719 92,4 globlastp 7315 LYD360 cassava|09v1|FG805752_T1 13463 719 92,4 glotblastn 7316 LYD360 valeriana|11v1|SRR099039X104541_P1 13464 719 92,3 globlastp 7317 LYD360 poplar|10v1|AI162939_P1 13465 719 92,3 globlastp 7318 LYD360 flaveria|11v1|SRR149229.84510_T1 13466 719 92,2 glotblastn 7319 LYD360 ambrosia|11v1|SRR346935.108478_P1 13467 719 92,2 globlastp 7320 LYD360 ambrosia|11v1|SRR346935.11302_P1 13467 719 92,2 globlastp 7321 LYD360 cacao|10v1|CU470840_P1 13468 719 92,2 globlastp 7322 LYD360 chelidonium|11v1|SRR084752X100071_P1 13469 719 92,2 globlastp 7323 LYD360 trigonella|11v1|SRR066194X117413_P1 13470 719 92,2 globlastp 7324 LYD360 cotton|10v2|SRR032367S0080382_P1 13471 719 92,2 globlastp 7325 LYD360 cucumber|09v1|PDN910981_P1 13472 719 92,2 globlastp 7326 LYD360 pepper|gb171|BM064719_P1 13473 719 92,2 globlastp 7327 LYD360 peanut|10v1|ES712536_T1 13474 719 92,1 glotblastn 7328 LYD360 cotton|10v2|E3F271145_P1 13475 719 92,1 globlastp 7329 LYD360 plantago|11v1|SRR066373X103909_P1 13476 719 92,1 globlastp 7330 LYD360 silene|11v1|SRR096785X100313_P1 13477 719 92,1 globlastp 7331 LYD360 silene|11v1|SRR096785X101163_P1 13478 719 92,1 globlastp 7332 LYD360 chestnut|gb170|SRR00629550001538_P1 13479 719 92,1 globlastp 7333 LYD360 strawberry|11v1|CO378670 13480 719 92,1 globlastp 7334 LYD360 eucalyptus|11v2|CD669678_P1 13481 719 92,1 globlastp 7335 LYD360 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL018561_P1 13482 719 92,0 globlastp 7336 LYD360 arnica|11v1|SRR099034X101033_T1 13483 719 92,0 glotblastn 7337 LYD360 eucalyptus|11v2|CB967561_P1 13484 719 92,0 globlastp 7338 LYD360 plantago|11v1|SRR066373X104113_P1 13485 719 92,0 globlastp thellungiella_parvulum|11v1|EPCRP017828 7339 LYD360 13486 719 92,0 globlastp _P1 7340 LYD360 trigonella|11v1|SRR066194X103771_P1 13487 719 92,0 globlastp 7341 LYD360 tripterygium|11v1|SRR098677X11232_P1 13488 719 92,0 globlastp

298 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 7342 LYD360 vinca|11v1|SRR098690X105684_P1 13489 719 92,0 globlastp cassava|09v1|JGICASSAVA24998VALIDM 7343 LYD360 13490 719 92,0 glotblastn 1_T1 7344 LYD360 cannabis|12v1|SOLX00041614_P1 13491 719 91,9 globlastp 7345 LYD360 euonymus|11v1|SRR070038X11672_P1 13492 719 91,9 globlastp 7346 LYD360 orange|11v1|CV886939_P1 13493 719 91,9 globlastp 7347 LYD360 solanum_phureja|09v1|SPHBG129410 13494 719 91,9 globlastp 7348 LYD360 tomato|09v1|P3G129410 13495 719 91,9 globlastp 7349 LYD360 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1002738_P1 13496 719 91,8 globlastp 7350 LYD360 cotton|10v2|SRRO32367S0025804_T1 13497 719 91,7 glotblastn 7351 LYD360 arabidopsis|10v1|AT3G53230_P1 13498 719 91,7 globlastp 7352 LYD360 cacao|10v1|CU473703_P1 13499 719 91,7 globlastp soybean|11v1|GLYMA12G30060 7353 LYD360 13500 719 91,7 globlastp _P1 7354 LYD360 soybean|11v1|GLYMA19G36740_P1 13501 719 91,7 globlastp 7355 LYD360 apple|11v1|CN993046_P1 13502 719 91,6 globlastp 7356 LYD360 clementine|11v1|CV886939_P1 13503 719 91,6 globlastp 7357 LYD360 euonymus|11v1|SRR070038X129661_P1 13504 719 91,6 globlastp 7358 LYD360 soybean|11v1|GLYMA03G33990_P1 13505 719 91,6 globlastp 7359 LYD360 valeriana|11v1|SRR099039X101732_P1 13506 719 91,6 globlastp 7360 LYD360 monkeyflower|10v1|DV208629_P1 13507 719 91,5 globlastp 7361 LYD360 prunus|10v1|P3U042029_P1 13508 719 91,5 globlastp 7362 LYD360 kiwi|gb166|FG408431_P1 13509 719 91,5 globlastp 7363 LYD360 orobanche|10v1|SRR02318950000911_P1 13510 719 91,5 globlastp 7364 LYD360 soybean|11v1|GLYMA13G20680_P1 13511 719 91,4 globlastp 7365 LYD360 soybean|11v1|GLYMA13G39830_P1 13512 719 91,4 globlastp 7366 LYD360 tripterygium|11v1|SRR098677X108622_P1 13513 719 91,4 globlastp 7367 LYD360 sugarcane|10v1|P3Q537479 13514 719 91,4 globlastp 7368 LYD360 euonymus|11v1|SRR070038X108789_P1 13515 719 91,3 globlastp 7369 LYD360 tomato|11v1|1CA514631_P1 13516 719 91,3 globlastp 7370 LYD360 rice|gb170|OS10G30580 13517 719 91,3 globlastp 7371 LYD360 cucumber|09v1|DV633427_P1 13518 719 91,3 globlastp 7372 LYD360 tomato|09v1|BQ113326 13516 719 91,3 globlastp 7373 LYD360 ambrosia|11v1|SRR346935.122056_T1 13519 719 91,3 glotblastn 7374 LYD360 prunus|10v1|P3U039323 13520 719 91,3 glotblastn amorphophallus|11v2|SRR089351X10334_P 7375 LYD360 13521 719 91,2 globlastp 1 7376 LYD360 apple|11v1|CN490428_P1 13522 719 91,2 globlastp 7377 LYD360 cannabis|12v1|X497540_P1 13523 719 91,2 globlastp 7378 LYD360 flaveria|11v1|SRR149229.176527_P1 13524 719 91,2 globlastp 7379 LYD360 soybean|11v1|GLYMA10G06480_ P1 13525 719 91,2 globlastp 7380 LYD360 vinca|11v1|SRR098690X106865_P1 13526 719 91,2 globlastp 7381 LYD360 sorghum|09v1|SB01G020910 13527 719 91,2 globlastp 7382 LYD360 sorghum|11v1|SB01G020910_P1 13527 719 91,2 globlastp 7383 LYD360 maize|10v1|A1372195_P1 13528 719 91,2 globlastp 7384 LYD360 amsonia|11v1|SRR098688X103057_P1 13529 719 91,1 globlastp 7385 LYD360 arnica|11v1|SRR099034X100738_P1 13530 719 91,1 globlastp 7386 LYD360 distylium|11v1|SRR065077X1034_P1 13531 719 91,1 globlastp 7387 LYD360 euonymus|11v1|SRR070038X104405_P1 13532 719 91,1 globlastp 7388 LYD360 flaveria|11v1|SRR149229.101822_P1 13533 719 91,1 globlastp 7389 LYD360 aquilegia|10v2|DR921618_P1 13534 719 91,1 globlastp 7390 LYD360 lettuce|10v1|DWO47002_T1 13535 719 91,0 glotblastn 7391 LYD360 cephalotaxus|1v1|SRR064395X100320_P1 13536 719 91,0 globlastp 7392 LYD360 monkeyflower|10v1|DV206722_P1 13537 719 91,0 globlastp 7393 LYD360 sciadopitys|10v1|SRR065035S0005345_P1 13538 719 91,0 globlastp 7394 LYD360 soybean|11v1|GLYMA11G20060_P1 13539 719 91,0 globlastp 7395 LYD360 rice|gb170|OS03G05730 13540 719 91,0 globlastp 7396 LYD360 sorghum|09v1|SB01G046840 13541 719 91,0 globlastp 7397 LYD360 sorghum|11v1|SB01G046840_P1 13541 719 91,0 globlastp 7398 LYD360 artemisia|10v1|PY038805_P1 13542 719 91,0 globlastp 7399 LYD360 maize|10v1|AI901757_P1 13543 719 91,0 globlastp 7400 LYD360 maize|10v1|AW054146_P1 13544 719 91,0 globlastp

299 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 7401 LYD360 ambrosia|11v1|SRR346935.155102_T1 13545 719 90,9 glotblastn 7402 LYD360 annea|11v1|SRR099034X100029_P1 13546 719 90,9 globlastp 7403 LYD360 catharanthus|11v1|EG555134_P1 13547 719 90,9 globlastp 7404 LYD360 cephalotaxus|11v1|SRR064395X100924_P1 13548 719 90,9 globlastp amorphophallus|11v2|SRR089351X106403_ 7405 LYD360 13549 719 90,8 globlastp P1 amorphophallus|11v2|SRR089351X108348_ 7406 LYD360 13550 719 90,8 glotblastn T1 7407 LYD360 taxus|10v1|SRR06506750018624_P1 13551 719 90,8 globlastp 7408 LYD360 sunflower|10v1|AJ318233 13552 719 90,8 globlastp 7409 LYD360 flaveria|11v1|SRR149229.149173_P1 13553 719 90,6 globlastp 7410 LYD360 silene|11v1|SRR096785X106119_P1 13554 719 90,6 globlastp 7411 LYD360 poplar|10v1|CA925723_P1 13555 719 90,6 globlastp 7412 LYD360 maize|10v1|AWO76473_P1 13556 719 90,5 globlastp 7413 LYD360 phalaenopsis|11v1|CB032210_P1 13557 719 90,5 globlastp 7414 LYD360 sugarcane|10v1|BQ537481 13558 719 90,5 globlastp 7415 LYD360 artemisia|10v1|EY040075_P1 13559 719 90,5 globlastp 7416 LYD360 aristolochia|10v1|SRR039082S0002675_P1 13560 719 90,4 globlastp 7417 LYD360 annea|11v1|SRR099034X100340_P1 13561 719 90,4 globlastp 7418 LYD360 orobanche|10v1|SRR02318950005791_P1 13562 719 90,4 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJGI11028 7419 LYD360 13563 719 90,4 globlastp 772_P1 7420 LYD360 foxtail_millet|10v2|SICRP023839 13564 719 90,4 globlastp 7421 LYD360 foxtail_millet|11v3|PHY7SI034302M_P1 13564 719 90,4 globlastp 7422 LYD360 aristolochia|10v1|FD760594_P1 13565 719 90,3 globlastp 7423 LYD360 artemisia|10v1|PY034334_P1 13566 719 90,3 globlastp 7424 LYD360 cedrus|11v1|SRR065007X10249_T1 13567 719 90,3 glotblastn 7425 LYD360 switchgrass|gb167|FE605820 13568 719 90,2 globlastp 7426 LYD360 zostera|10v1|AM767583 13569 719 90,2 globlastp 7427 LYD360 flaveria|11v1|SRR149229.108715_P1 13570 719 90,1 globlastp 7428 LYD360 pine|10v2|AW056827_P1 13571 719 90,1 globlastp 7429 LYD360 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0031644_P1 13572 719 90,1 globlastp 7430 LYD360 barley|10v2|AF045927_P1 13573 719 90,1 globlastp 7431 LYD360 millet|10v1|CD726479_P1 13574 719 90,1 globlastp 7432 LYD360 ambrosia|11v1|SRR346935.103146_P1 13575 719 90,0 globlastp 7433 LYD360 abies|11v2|SRR098676X100740_P1 13576 719 89,9 globlastp 7434 LYD360 ambrosia|11v1|SRR346935.106549_P1 13577 719 89,9 globlastp 7435 LYD360 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0005050_P1 13578 719 89,9 globlastp 7436 LYD360 switchgrass|gb167|DN147365 13579 719 89,9 globlastp 7437 LYD360 oat|10v2|G0587736 13580 719 89,9 globlastp 7438 LYD360 oat|11v1|G0587736_P1 13580 719 89,9 globlastp 7439 LYD360 maritime_pine|10v1|AL751324_T1 13581 719 89,9 glotblastn 7440 LYD360 flaveria|11v1|SRR149232.324883_T1 13582 719 89,9 glotblastn 7441 LYD360 maritime_pine|10v1|BX251155_T1 13583 719 89,8 glotblastn 7442 LYD360 maritime_pine|10v1|FN692751_T1 13584 719 89,8 glotblastn 7443 LYD360 arnica|11v1|SRR099034X100884_P1 13585 719 89,8 globlastp 7444 LYD360 foxtail_millet|11v3|EC613957_P1 13586 719 89,8 globlastp 7445 LYD360 lettuce|10v1|DW059851_P1 13587 719 89,8 globlastp 7446 LYD360 spruce|gb162|CO216209_P1 13588 719 89,8 globlastp 7447 LYD360 taxus|10v1|SRR03252350007345_P1 13589 719 89,8 globlastp 7448 LYD360 poplar|10v1|AJ534500_P1 13590 719 89,7 globlastp 7449 LYD360 ambrosia|11v1|SRR346935.137736_T1 13591 719 89,6 glotblastn 7450 LYD360 distylium|11v1|SRR065077X102956_T1 13592 719 89,6 glotblastn 7451 LYD360 flaveria|11v1|SRR149229.152448_P1 13593 719 89,6 globlastp 7452 LYD360 arnica|11v1|SRR099034X100341_P1 13594 719 89,5 globlastp 7453 LYD360 podocarpus|10v1|SRR065014S0007339_P1 13595 719 89,5 globlastp 7454 LYD360 artemisia|10v1|EY045486_P1 13596 719 89,5 globlastp 7455 LYD360 strawberry|11v1|DY674092_P1 13597 719 89,4 globlastp 7456 LYD360 grape|11v1|GSVIVT01007689001_P1 13598 719 89,3 globlastp 7457 LYD360 fescue|gb161|DT675431_P1 13599 719 89,3 globlastp 7458 LYD360 sequoia|10v1|SRR065044S0004830_P1 13600 719 89,2 globlastp 7459 LYD360 cucumber|09v1|B1740224_P1 13601 719 89,1 globlastp

300 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 7460 LYD360 barley|10v2|E3F625506_P1 13602 719 89,1 globlastp 7461 LYD360 podocarpus|10v1|SRR06501450001924_T1 13603 719 89,1 glotblastn 7462 LYD360 pine|10v2|BX254966_T1 13604 719 89,1 glotblastn 7463 LYD360 clementine|11v1|CK665096_P1 13605 719 88,9 globlastp 7464 LYD360 ambrosia|11v1|SRR346935.136006_P1 13606 719 88,8 globlastp 7465 LYD360 orange|11v1|CK665096_P1 13607 719 88,8 globlastp 7466 LYD360 watermelon|11v1|P3I740224_P1 13608 719 88,8 globlastp 7467 LYD360 brachypodium|09v1|DV470229_T1 13609 719 88,7 glotblastn 7468 LYD360 spikemoss|gb165|DN838831_P1 13610 719 88,6 globlastp 7469 LYD360 physcomitrella|10v1|AW699229_P1 13611 719 88,5 globlastp 7470 LYD360 flaveria|11v1|SRR149232.282359_T1 13612 719 88,4 glotblastn 7471 LYD360 momordica|10v1|SRR071315S0000541_P1 13613 719 88,4 globlastp cassava|09v1|JGICASSAVA17649VALIDM 7472 LYD360 13614 719 88,2 globlastp 1_P1 7473 LYD360 eucalyptus|11v2|SRR001659X33273_P1 13615 719 88,2 globlastp 7474 LYD360 physcomitrella|10v1|P3J157374_P1 13616 719 88,2 globlastp 7475 LYD360 ambrosia|11v1|SRR346935.110808_P1 13617 719 88,1 globlastp 7476 LYD360 canola|11v1|CN828485_P1 13618 719 88,1 globlastp 7477 LYD360 flaveria|11v1|SRR149229.189174_T1 13619 719 88,0 glotblastn 7478 LYD360 nasturtium|10v1|SRR032558S0003567 13620 719 88,0 glotblastn 7479 LYD360 castorbean|11v1|EG663179_P1 13621 719 88,0 globlastp 7480 LYD360 ceratodon|10v1|SRR07489050010086_P1 13622 719 88,0 globlastp 7481 LYD360 tomato|11v1|CD002091_P1 13623 719 87,9 globlastp 7482 LYD360 physcomitrella|10v1|BQ827459_P1 13624 719 87,8 globlastp 7483 LYD360 lotus|09v1|BP063563_P1 13625 719 87,7 globlastp monkeyflower|10v1|SRR037227S0061683_ 7484 LYD360 13626 719 87,6 globlastp P1 7485 LYD360 physcomitrella|10v1|BQ826629_P1 13627 719 87,6 globlastp 7486 LYD360 ceratodon|10v1|SRR07489050009448_P1 13628 719 87,4 globlastp 7487 LYD360 cirsium|11v1|SRR346952.14656_P1 13629 719 87,2 globlastp 7488 LYD360 prunus|10v1|CN870307_P1 13630 719 87,2 globlastp 7489 LYD360 soybean|11v1|GLYMA06G19000_P1 13631 719 87,2 globlastp 7490 LYD360 triphysaria|10v1|DR175399_P1 13632 719 87,2 globlastp 7491 LYD360 soybean|11v1|GLYMA04G35950_P1 13633 719 87,1 globlastp 7492 LYD360 vinca|11v1|SRR098690X102460_T1 13634 719 87,0 glotblastn 7493 LYD360 physcomitrella|10v1|BQ826803_P1 13635 719 86,6 globlastp 7494 LYD360 ceratodon|10v1|SRR07489050026641_T1 13636 719 86,6 glotblastn 7495 LYD360 clementinel|11v1|JGICC007340_P1 13637 719 86,5 globlastp 7496 LYD360 physcomitrella|10v1|P3J964701_P1 13638 719 86,5 globlastp 7497 LYD360 canola|11v1|SRR019557.18816_P1 13639 719 86,4 globlastp 7498 LYD360 gnetum|10v1|SRR064399S0009592_P1 13640 719 86,4 globlastp 7499 LYD360 amsonia|11v1|SRR098688X104047_P1 13641 719 86,0 globlastp 7500 LYD360 orange|11v1|JGICC007340_P1 13642 719 86,0 globlastp 7501 LYD360 strawberry|11v1|SRR074309S0170443_T1 13643 719 86,0 glotblastn 7502 LYD360 spruce|gb162|CO221514_P1 13644 719 85,6 globlastp 7503 LYD360 apple|11v1|MDP0000143678_P1 13645 719 85,4 globlastp 7504 LYD360 sunflower|10v1|CD852052_P1 13646 719 85,3 globlastp 7505 LYD360 sunflower|10v1|DY904230 13647 719 85,1 glotblastn 7506 LYD360 tripterygium|11v1|SRR098677X111317_P1 13648 719 85,0 globlastp 7507 LYD360 medicago|09v1|CRPMT037348_P1 13649 719 84,8 globlastp 7508 LYD360 pteridium|11v1|SRR043594X103733_P1 13650 719 84,6 globlastp 7509 LYD360 nasturtium|10v1|SRR032558S0003251 13651 719 84,4 glotblastn 7510 LYD360 chlamydomonas|gb162|AI662862_P1 13652 719 84,1 globlastp 7511 LYD360 solanum_phureja|09v1|SPHCD002091_P1 13653 719 83,8 globlastp 7512 LYD360 aquilegia|10v2|JGIAC006528_P1 13654 719 83,7 globlastp 7513 LYD360 aquilegia|10v2|JGIAC006575_P1 13655 719 83,7 globlastp 7514 LYD360 ostreococcus|gb162|XM001415529_P1 13656 719 83,1 globlastp 7515 LYD360 chestnut|gb170|SRR00629550123561_T1 13657 719 82,8 glotblastn 7516 LYD360 zostera|10v1|SRR057351S0009061 13658 719 82,7 glotblastn 7517 LYD360 triphysaria|10v1|EY146602_T1 13659 719 82,2 glotblastn 7518 LYD360 cenchrus|gb166|EB652529_P1 13660 719 81,9 globlastp 7519 LYD360 switchgrass|gb167|FE628016_P1 13661 719 81,8 globlastp

301 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 7520 LYD360 volvox|gb162|AV629785_P1 13662 719 81,6 globlastp 7521 LYD360 brachypodium|09v1|BRADI1G75570_P1 13663 719 81,5 globlastp 7522 LYD360 medicago|09v1|CRPMT038389_T1 13664 719 81,4 glotblastn 7523 LYD360 soybean|11v1|GLYMA12G08410_T1 13665 719 81,0 glotblastn 7524 LYD360 canola|11v1|EE435089_P1 13666 719 80,7 globlastp 7525 LYD360 grape|11v1|GSVIVT01031517001_T1 13667 719 80,5 glotblastn 7526 LYD360 maritime_pine|10v1|BX254966XX1_P1 13668 719 80,4 globlastp 7527 LYD360 sorghum|11v1|CF482122_T1 13669 719 80,2 glotblastn 7528 LYD360 foxtail_millet|11v3|PHY7SI039056M_T1 13670 719 80,1 glotblastn 7529 LYD360 canola|11v1|SRR019559.31538_P1 13671 719 80,0 globlastp 7530 LYD361 vinca|11v1|SRR098690X12356_P1 13672 720 85,3 globlastp 7531 LYD361 sunflower|10v1|CD857682 13673 720 84,5 globlastp 7532 LYD361 flaveria|11v1|SRR149229.158084_P1 13674 720 84,3 globlastp 7533 LYD361 tragopogon|10v1|SRR020205S0037557 13675 720 84,3 globlastp 7534 LYD361 flaveria|11v1|SRR149229.14461_P1 13676 720 84,1 globlastp 7535 LYD361 flaveria|11v1|SRR149229.293038_P1 13677 720 84,0 globlastp 7536 LYD361 cirsium|11v1|SRR346952.100082_T1 13678 720 83,8 glotblastn 7537 LYD361 ambrosia|11v1|SRR346935.124045_P1 13679 720 83,6 globlastp 7538 LYD361 monkeyflower|10v1|G0950169_P1 13680 720 83,3 globlastp 7539 LYD361 lettuce|10v1|DWO55094_P1 13681 720 82,9 globlastp 7540 LYD361 momordica|10v1|SRR071315S0002004_T1 13682 720 82,7 glotblastn 7541 LYD361 arnica|11v1|SRR099034X141701_P1 13683 720 82,4 globlastp 7542 LYD361 grape|11v1|GSVPIV1T01034558001_P1 13684 720 82,4 globlastp 7543 LYD361 valeriana|11v1|SRR099039X104343_T1 13685 720 82,4 glotblastn 7544 LYD361 watermelon|11v1|A1563235_P1 13686 720 82,2 globlastp 7545 LYD361 cucurbita|11v1|EU793994_P1 13687 720 82,0 globlastp 7546 LYD361 artemisia|10v1|EY110625_T1 13688 720 81,8 glotblastn 7547 LYD361 orobanche|10v1|SRR02318950003707_T1 13689 720 81,5 glotblastn 7548 LYD361 kiwi|gb166|FG403353_P1 13690 720 81,3 globlastp 7549 LYD361 melon|10v1|VMEL01263807281546_P1 13691 720 81,1 globlastp 7550 LYD361 cucumber|09v1|A1563235_P1 13692 720 80,4 globlastp 7551 LYD364 canola|11v1|EE556689_P1 13693 721 98,2 globlastp 7552 LYD364 radish|gb164|EX763390 13694 721 97,2 globlastp 7553 LYD364 canola|10v1|IES269732 13695 721 97,0 globlastp 7554 LYD364 canola|11v1|PE414992_P1 13695 721 97,0 globlastp 7555 LYD364 radish|gb164|EX763193 13696 721 95,4 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY801459_P 7556 LYD364 13697 721 95,2 globlastp 1 cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000909 7557 LYD364 13698 721 85,8 globlastp 1_P1 7558 LYD364 clementine|11v1|BQ623000_P1 13699 721 85,0 globlastp 7559 LYD364 orange|11v1|BQ623000_P1 13699 721 85,0 globlastp 7560 LYD364 citrus|gb166|BQ623000_P1 13699 721 85,0 globlastp 7561 LYD364 tripterygium|11v1|SRR098677X163501_P1 13700 721 84,5 globlastp 7562 LYD364 apple|11v1|CN937262_P1 13701 721 84,0 globlastp 7563 LYD364 euonymus|11v1|SRR070038X111904_P1 13702 721 83,8 globlastp 7564 LYD364 cotton|10v2|DT466855_P1 13703 721 83,3 globlastp 7565 LYD364 apple|11v1|CN879479_P1 13704 721 83,2 globlastp 7566 LYD364 strawberry|11v1|DY670319 13705 721 83,2 globlastp 7567 LYD364 cacao|10v1|1CU496643_P1 13706 721 83,0 globlastp 7568 LYD364 amsonia|11v1|SRR098688X101177_P1 13707 721 82,7 globlastp 7569 LYD364 catharanthus|11v1|EG556426XX1_P1 13708 721 81,8 globlastp 7570 LYD364 oak|10v1|SRR006313S0059641_P1 13709 721 81,8 globlastp 7571 LYD364 cotton|10v2|SRR032367S0041565_P1 13710 721 81,8 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X104538 7572 LYD364 13711 721 81,4 globlastp _P1 7573 LYD364 aquilegia|10v2|DR925081_P1 13712 721 81,0 globlastp 7574 LYD364 melon|10v1|AM718233_P1 13713 721 80,3 globlastp 7575 LYD364 vinca|11v1|SRR098690X116717_P1 13714 721 80,2 globlastp 7576 LYD364 watermelon|11v1|AM718233_P1 13715 721 80,1 globlastp 7577 LYD364 cucumber|09v1|AM718233_P1 13716 721 80,1 globlastp 7578 LYD365 canola|10v1|ES984275 13717 722 97,1 globlastp

302 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 7579 LYD365 radish|gb164|EV569337 13718 722 95,1 globlastp 7580 LYD365 thellungiella_parvulum|11v1|DN776741_P1 13719 722 93,8 globlastp 7581 LYD365 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL024190_P1 13720 722 93,3 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN776741_P 7582 LYD365 13721 722 93,0 globlastp 1 7583 LYD365 arabidopsis|10v1|AT4G37680_P1 13722 722 92,5 globlastp 7584 LYD365 b_oleracea|gb161|AM386437_T1 13723 722 90,1 glotblastn 7585 LYD366 canola|11v1|PE392367_P1 13724 723 97,8 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN777760_P 7586 LYD366 13725 723 91,0 globlastp 1 7587 LYD366 thellungiella_parvulum|11v1|DN777760_P1 13726 723 90,1 globlastp 7588 LYD366 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL002262_P1 13727 723 90,1 globlastp 7589 LYD366 arabidopsis|10v1|A_T1G21410_P1 13728 723 89,3 globlastp 7590 LYD366 b_rapa|gb162|EX040164_P1 13729 723 89,2 globlastp 7591 LYD366 canola|11v1|EE460387_P1 13730 723 83,0 globlastp 7592 LYD366 thellungiella_parvulum|11v1|DN776452_P1 13731 723 82,3 globlastp 7593 LYD366 canola|10v1|EE463529 13732 723 81,9 globlastp 7594 LYD366 canola|11v1|CN726230_P1 13733 723 81,6 globlastp 7595 LYD366 arabidopsis|10v1|A_T1G77000_P1 13734 723 81,4 globlastp 7596 LYD366 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL007975_P1 13735 723 81,3 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN776452_P 7597 LYD366 13736 723 81,2 globlastp 1 7598 LYD367 b_rapa|gb162|AT000496_P1 13737 724 98,9 globlastp 7599 LYD367 canola|11v1|DY024476XX2_P1 13738 724 98,5 globlastp 7600 LYD367 canola|10v1|DY024476 13738 724 98,5 globlastp 7601 LYD367 canola|11v1|ES901940_P1 13739 724 97,7 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY814944_P 7602 LYD367 13740 724 97,5 globlastp 1 7603 LYD367 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL018667_P1 13741 724 97,2 globlastp 7604 LYD367 thellungiella_parvulum|11v1|BY814944_P1 13742 724 97,0 globlastp 7605 LYD367 canola|10v1|CX193818 13743 724 97,0 globlastp 7606 LYD367 canola|11v1|EV084177_P1 13744 724 96,8 globlastp 7607 LYD367 radish|gb164|EV545357 13745 724 96,8 globlastp 7608 LYD367 arabidopsis|10v1|AT3G54190_P1 13746 724 96,4 globlastp 7609 LYD367 radish|gb164|EV527102 13747 724 95,8 globlastp 7610 LYD367 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL015103_P1 13748 724 90,0 globlastp 7611 LYD367 arabidopsis|10v1|AT2G38630_P1 13749 724 90,0 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BY816181 7612 LYD367 13750 724 89,8 globlastp P1 7613 LYD367 watermelon|11v1|AM714178_P1 13751 724 88,7 globlastp 7614 LYD367 cassava|09v1|CK644908_P1 13752 724 88,7 globlastp 7615 LYD367 canola|11v1|ES978545_P1 13753 724 88,5 globlastp 7616 LYD367 cucumber|09v1|AM714178_P1 13754 724 88,4 globlastp 7617 LYD367 thellungiella_parvulum|11v1|BY816181_P1 13755 724 87,6 globlastp 7618 LYD367 orange|11v1|CF506466_P1 13756 724 86,8 globlastp 7619 LYD367 clementine|11v1|CF506466_P1 13757 724 86,6 globlastp 7620 LYD367 citrus|gb166|CF506466_P1 13757 724 86,6 globlastp 7621 LYD367 prunus|10v1|PU040716 13758 724 85,9 globlastp 7622 LYD367 oak|10v1|FP064948_P1 13759 724 85,7 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S002026 7623 LYD367 13760 724 85,4 globlastp 7_P1 7624 LYD367 grape|11v1|GSVIVT01029846001_P1 13761 724 85,4 globlastp 7625 LYD367 poplar|10v1|PI119637_P1 13762 724 85,3 globlastp 7626 LYD367 euonymus|11v1|SRR070038X213196_P1 13763 724 85,1 globlastp 7627 LYD367 eucalyptus|11v2|SRR001659X123173_P1 13764 724 84,9 globlastp 7628 LYD367 coffea|10v1|DV672335_P1 13765 724 84,7 globlastp 7629 LYD367 apple|gb171|CN492832 13766 724 84,4 globlastp 7630 LYD367 amsonia|11v1|SRR098688X101299P1 13767 724 84,0 globlastp 7631 LYD367 tripterygium|11v1|SRR098677X117322_P1 13768 724 84,0 globlastp cassava|09v1|JGICASSAVA25211VALIDM 7632 LYD367 13769 724 83,9 globlastp 1_P1 7633 LYD367 poplar|10v1|P3U811585_P1 13770 724 83,9 globlastp

303 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 7634 LYD367 cacao|10v1|CU522092_P1 13771 724 83,8 globlastp 7635 LYD367 tomato|09v1|AI482944 13772 724 83,5 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X102892 7636 LYD367 13773 724 83,4 globlastp _P1 7637 LYD367 cotton|10v2|DT572129_P1 13774 724 83,4 globlastp 7638 LYD367 eucalyptus|11v2|SRR001659X149861_P1 13775 724 83,2 globlastp 7639 LYD367 cannabis|12v1|SOLX00033218_P1 13776 724 82,8 globlastp 7640 LYD367 potato|10v1|BI406174_P1 13777 724 82,8 globlastp 7641 LYD367 cotton|10v2|CO132735_P1 13778 724 82,8 globlastp 7642 LYD367 medicago|09v1|AA660848_P1 13779 724 82,6 globlastp 7643 LYD367 cacao|10v1|CU482126_P1 13780 724 82,6 globlastp 7644 LYD367 solanum_phureja|09v1|SPHAI895877 13781 724 82,5 globlastp 7645 LYD367 catharanthus|11v1|EG560390XX1_P1 13782 724 82,4 globlastp 7646 LYD367 euonymus|11v1|SRR070038X241970_P1 13783 724 82,4 globlastp 7647 LYD367 poplar|10v1|P3I122314_P1 13784 724 82,4 globlastp 7648 LYD367 soybean|11v1|GLYMA06G14500 13785 724 82,4 globlastp 7649 LYD367 tomato|09v1|AI895877 13786 724 82,1 globlastp 7650 LYD367 lotus|09v1|LLAW720147_P1 13787 724 81,9 globlastp amorphophallus|11v2|SRR089351X596563_ 7651 LYD367 13788 724 81,7 globlastp P1 7652 LYD367 silene|11v1|DV768241_P1 13789 724 81,7 globlastp 7653 LYD367 monkeyflower|10v1|G0946808_P1 13790 724 81,6 globlastp 7654 LYD367 fagopyrum|11v1|SRR063703X101691_P1 13791 724 81,4 globlastp 7655 LYD367 poplar|10v1|DT479747_P1 13792 724 81,1 globlastp 7656 LYD367 cephalotaxus|11v1|SRR064395X13793_P1 13793 724 80,7 globlastp 7657 LYD367 sciadopitys|10v1|SRR065035S0002208 13794 724 80,5 globlastp 7658 LYD367 lettuce|10v1|DWO46871_P1 13795 724 80,1 globlastp 7659 LYD367 monkeyflower|10v1|DV206397_P1 13796 724 80,1 globlastp 7660 LYD367 pine|10v2|CD019457_P1 13797 724 80,0 globlastp 7661 LYD377 canola|11v1|CN826341_P1 13798 727 98,9 globlastp 7662 LYD378 canola|11v1|ES905670_P1 13799 728 99,0 globlastp 7663 LYD378 canola|10v1|CD839519 13800 728 99,0 globlastp 7664 LYD378 canola|11v1|PE437968XX2_P1 13801 728 98,8 globlastp 7665 LYD378 canola|10v1|CD836192 13802 728 98,8 globlastp 7666 LYD378 b_rapa|gb162|CV545263_P1 13803 728 98,8 globlastp 7667 LYD378 canola|11v1|DQ067236_P1 13804 728 98,4 globlastp 7668 LYD378 canola|11v1|EE503532_P1 13804 728 98,4 globlastp 7669 LYD378 canola|11v1|SRR019558.25865_P1 13805 728 98,4 globlastp 7670 LYD378 b_rapalgb16433540_P1 13804 728 98,4 globlastp 7671 LYD378 canola|11v1|EE437297_P1 13804 728 98,4 globlastp 7672 LYD378 b_rapa|gb162|DN965312_T1 13806 728 98,1 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|BY803395_P 7673 LYD378 13807 728 98,1 globlastp 1 7674 LYD378 radish|gb164|EV535158 13808 728 98,1 globlastp 7675 LYD378 arabidopsis|10v1|AT3G23810_P1 13809 728 97,7 globlastp 7676 LYD378 canola|11v1|DY030606_P1 13810 728 97,3 globlastp 7677 LYD378 b_rapa|gb162|BQ791463_P1 13810 728 97,3 globlastp 7678 LYD378 canola|10v1|P3Q704163 13810 728 97,3 globlastp 7679 LYD378 radish|gb164|EV552177 13811 728 97,3 globlastp 7680 LYD378 thellungiella_parvulum|11v1|BY810328_P1 13812 728 97,1 globlastp 7681 LYD378 canola|11v1|EE456663_P1 13813 728 97,1 globlastp 7682 LYD378 canola|10v1|CD825391 13813 728 97,1 globlastp 7683 LYD378 canola|11v1|ES903016_P1 13813 728 97,1 globlastp 7684 LYD378 b_oleracea|gb161|AM387065_P1 13814 728 97,1 globlastp 7685 LYD378 thellungiella_parvulum|11v1|BM985729_P1 13815 728 96,9 globlastp 7686 LYD378 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL011053_P1 13816 728 96,9 globlastp 7687 LYD378 b_oleracea|gb161|DY027191_P1 13817 728 96,9 globlastp 7688 LYD378 b_rapa|gb162|13Q791290_P1 13818 728 96,9 globlastp 7689 LYD378 canola|11v1|DW997127_P1 13819 728 96,7 globlastp 7690 LYD378 canola|10v1|CD814491 13819 728 96,7 globlastp 7691 LYD378 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL026959_P1 13820 728 96,7 globlastp

304 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: thellungiella_halophilum|11v1|BM985729_P 7692 LYD378 13821 728 96,5 globlastp 1 7693 LYD378 canola|11v1|ES951238_P1 13822 728 96,3 globlastp 7694 LYD378 arabidopsis|10v1|AT4G13940_P1 13823 728 96,3 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|BM986128_ 7695 LYD378 13824 728 95,7 glotblastn T1 cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000047 7696 LYD378 13825 728 93,8 globlastp 2_P1 7697 LYD378 cleome_spinosa|10v1|GR934744_P1 13826 728 93,6 globlastp 7698 LYD378 euonymus|11v1|SRR070038X102705_P1 13827 728 93,0 globlastp 7699 LYD378 poplar|10v1|A1162897_P1 13828 728 93,0 globlastp cleome_spinosa|10v1|SRR015531S0008307 7700 LYD378 13829 728 92,8 globlastp _P1 7701 LYD378 ambrosia|11v1|SRR346935.115152_P1 13830 728 92,6 globlastp 7702 LYD378 tripterygium|11v1|SRR098677X101295_P1 13831 728 92,6 globlastp 7703 LYD378 tripterygium|11v1|SRR098677X111590_P1 13832 728 92,6 globlastp 7704 LYD378 castorbean|09v1|CF981141 13833 728 92,6 globlastp 7705 LYD378 castorbean|11v1|CF981141_P1 13833 728 92,6 globlastp 7706 LYD378 oak|10v1|CU640715_P1 13834 728 92,6 globlastp 7707 LYD378 oak|10v1|DB998563_P1 13835 728 92,6 globlastp 7708 LYD378 oak|10v1|FP026841_P1 13835 728 92,6 globlastp 7709 LYD378 oak|10v1|FP061118_P1 13835 728 92,6 globlastp 7710 LYD378 poplar|10v1|A1161753_P1 13836 728 92,6 globlastp 7711 LYD378 cassava|09v1|CK641934_P1 13837 728 92,6 globlastp 7712 LYD378 ambrosia|11v1|SRR346935.137485_P1 13838 728 92,4 globlastp 7713 LYD378 amsonia|11v1|SRR098688X101618_P1 13839 728 92,4 globlastp 7714 LYD378 catharanthus|11v1|Z26881_P1 13840 728 92,4 globlastp 7715 LYD378 cirsium|11v1|SRR346952.116117_P1 13841 728 92,4 globlastp 7716 LYD378 platanus|11v1|SRR096786X100539_P1 13842 728 92,4 globlastp 7717 LYD378 monkeyflower|10v1|G0944626_P1 13843 728 92,4 globlastp 7718 LYD378 pepper|gb171|AF108882_P1 13844 728 92,4 globlastp 7719 LYD378 catharanthus|gb166|Z26881 13840 728 92,4 globlastp 7720 LYD378 chestnut|gb170|FK868468_P1 13845 728 92,4 globlastp 7721 LYD378 cannabis|12v1|1GR221625_P1 13846 728 92,2 globlastp 7722 LYD378 flaveria|11v1|SRR149239.26119_P1 13847 728 92,2 globlastp 7723 LYD378 tripterygium|11v1|SRR098677X102463_P1 13848 728 92,2 globlastp 7724 LYD378 watermelon|11v1|AF206620_P1 13849 728 92,2 globlastp 7725 LYD378 grape|11v1|GSVIVT01021041001_P1 13850 728 92,2 globlastp 7726 LYD378 grape|gb160|BQ797519 13850 728 92,2 globlastp 7727 LYD378 pepper|gb171|BM062377_P1 13851 728 92,2 globlastp 7728 LYD378 ginseng|10v1|CN845685_P1 13852 728 92,2 globlastp 7729 LYD378 oak|10v1|DB996218_P1 13853 728 92,2 globlastp 7730 LYD378 monkeyflower|10v1|DV208189_P1 13854 728 92,2 globlastp 7731 LYD378 castorbean|11v1|PE260052_T1 13855 728 92,2 glotblastn 7732 LYD378 ambrosia|11v1|SRR346935.101332_P1 13856 728 92,0 globlastp 7733 LYD378 ambrosia|11v1|SRR346935.111807_P1 13857 728 92,0 globlastp 7734 LYD378 arnica|11v1|SRR099034X100195_P1 13858 728 92,0 globlastp 7735 LYD378 platanus|11v1|SRR096786X10200_P1 13859 728 92,0 globlastp 7736 LYD378 barley|10v2|BE413441_P1 13860 728 92,0 globlastp 7737 LYD378 barley|10v2|BE438652_P1 13860 728 92,0 globlastp 7738 LYD378 basilicum|10v1|DY321720_P1 13861 728 92,0 globlastp 7739 LYD378 wheat|10v2|WHTSHH 13862 728 92,0 globlastp 7740 LYD378 flax|11v1|CA482818_P1 13863 728 92,0 globlastp 7741 LYD378 foxtail_millet|11v3|EC613141_P1 13864 728 92,0 globlastp 7742 LYD378 switchgrass|gb167|DN141744 13865 728 92,0 globlastp 7743 LYD378 apple|gb171|CN444564 13866 728 92,0 globlastp 7744 LYD378 cassava|09v1|CK641612_P1 13867 728 92,0 globlastp 7745 LYD378 kiwi|gb166|FG418602_P1 13868 728 92,0 globlastp 7746 LYD378 soybean|11v1|GLYMA11G36620 13869 728 92,0 globlastp 7747 LYD378 melon|10v1|AF206620_P1 13870 728 92,0 globlastp 7748 LYD378 sunflower|10v1|DY926132 13871 728 92,0 globlastp 7749 LYD378 apple|11v1|CN444564_P1 13866 728 92,0 globlastp

305 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 7750 LYD378 euonymus|11v1|SRR070038X101385_P1 13872 728 91,8 globlastp 7751 LYD378 euonymus|11v1|SRR070038X102446_P1 13873 728 91,8 globlastp 7752 LYD378 tomato|11v1|AF161705_P1 13874 728 91,8 globlastp 7753 LYD378 flax|09v1|CA483010 13875 728 91,8 globlastp 7754 LYD378 potato|10v1|BE919741_P1 13876 728 91,8 globlastp 7755 LYD378 solanum_phureja|09v1|SPHBG1306 13877 728 91,8 globlastp 7756 LYD378 tobacco|gb162|EB428053 13878 728 91,8 globlastp 7757 LYD378 tomato|09v1|AF161705 13874 728 91,8 globlastp 7758 LYD378 cenchrus|gb166|EB658452_P1 13879 728 91,8 globlastp 7759 LYD378 sorghum|09v1|SB05G014470 13880 728 91,8 globlastp 7760 LYD378 sorghum|11v1|SB05G014470_P1 13880 728 91,8 globlastp 7761 LYD378 wheat|10v2|CA618533 13881 728 91,8 globlastp 7762 LYD378 cotton|10v2|BF269328_P1 13882 728 91,8 globlastp 7763 LYD378 kiwilgb166FG396030_P1 13883 728 91,8 globlastp 7764 LYD378 oak|10v1|FN700901_P1 13884 728 91,8 globlastp 7765 LYD378 rice|gb170|OS11G26850T2 13885 728 91,8 globlastp 7766 LYD378 tobacco|gb162|CV019257 13886 728 91,8 glotblastn 7767 LYD378 cannabis|12v1|1EC855271_T1 13887 728 91,6 glotblastn 7768 LYD378 flaveria|11v1|SRR149244.163767_T1 13888 728 91,6 glotblastn 7769 LYD378 arnica|11v1|SRR099034X100153_P1 13889 728 91,5 globlastp 7770 LYD378 cucurbita|11v1|FG227000_P1 13890 728 91,5 globlastp 7771 LYD378 eucalyptus|11v2|CT982516_P1 13891 728 91,5 globlastp 7772 LYD378 olea|11v1|SRR014463.57499_P1 13892 728 91,5 globlastp 7773 LYD378 tomato|11v1|BG133606_P1 13893 728 91,5 globlastp 7774 LYD378 tripterygium|11v1|SRR098677X108849_P1 13894 728 91,5 globlastp 7775 LYD378 monkeyflower|10v1|DV208961_P1 13895 728 91,5 globlastp 7776 LYD378 potato|10v1|P3F459946_P1 13896 728 91,5 globlastp 7777 LYD378 coffea|10v1|PDV664635_P1 13897 728 91,5 globlastp 7778 LYD378 foxtai_millet|11v3|PHY7SI013650M_P1 13898 728 91,5 globlastp 7779 LYD378 solanum_phureja|09v1|SPHBG13360 13899 728 91,5 globlastp 7780 LYD378 tomato|09v1|P3G133606 13893 728 91,5 globlastp 7781 LYD378 artemisia|10v1|PY036475_P1 13900 728 91,5 globlastp 7782 LYD378 sunflower|10v1|CD851095 13901 728 91,5 globlastp 7783 LYD378 cucumber|09v1|AF206620_P1 13902 728 91,5 globlastp 7784 LYD378 flaveria|11v1|SRR149229.169205_P1 13903 728 91,3 globlastp 7785 LYD378 flaveria|11v1|SRR149229.89890_P1 13903 728 91,3 globlastp 7786 LYD378 flaveria|11v1|SRR149232.161521_P1 13904 728 91,3 globlastp 7787 LYD378 lotus|09v1|BP041862_P1 13905 728 91,3 globlastp 7788 LYD378 wheat|10v2|E3F293272 13906 728 91,3 globlastp 7789 LYD378 wheat|10v2|E3Q241367 13906 728 91,3 globlastp 7790 LYD378 maize|10v1|W21772_P1 13907 728 91,3 globlastp 7791 LYD378 solanum_phureja|09v1|SPHAF161705 13908 728 91,3 globlastp 7792 LYD378 basilicum|10v1|PDY325764_P1 13909 728 91,3 globlastp 7793 LYD378 cotton|10v2|AF129871_P1 13910 728 91,3 globlastp 7794 LYD378 eucalyptus|11v2|CB967558_P1 13911 728 91,3 globlastp 7795 LYD378 sunflower|10v1|PDY906149 13912 728 91,3 globlastp 7796 LYD378 prunus|10v1|P3F717170 13913 728 91,3 globlastp 7797 LYD378 soybean|11v1|GLYMA08G11480 13914 728 91,3 globlastp 7798 LYD378 ipomoea_ni|10v1|BJ553240_P1 13915 728 91,3 globlastp 7799 LYD378 sunflower|10v1|PDY937742 13916 728 91,3 globlastp 7800 LYD378 valeriana|11v1|SRR099039X105789_P1 13917 728 91,2 globlastp 7801 LYD378 apple|11v1|CN885050_T1 13918 728 91,2 glotblastn 7802 LYD378 dandelion|10v1|PDR400827_T1 13919 728 91,1 glotblastn 7803 LYD378 annea|11v1|SRR099034X101374_P1 13920 728 91,1 globlastp 7804 LYD378 chelidonium|11v1|SRR084752X101481_P1 13921 728 91,1 globlastp 7805 LYD378 flaveria|11v1|SRR149240.114769_P1 13922 728 91,1 globlastp 7806 LYD378 silene|11v1|SRR096785X100447_P1 13923 728 91,1 globlastp 7807 LYD378 vinca|11v1|SRR098690X100552_P1 13924 728 91,1 globlastp 7808 LYD378 vinca|11v1|SRR098690X101241_P1 13925 728 91,1 globlastp 7809 LYD378 leymus|gb166|EG385162_P1 13926 728 91,1 globlastp 7810 LYD378 medicago|09v1|ALFMSA2S_P1 13927 728 91,1 globlastp 7811 LYD378 switchgrass|gb167|DN142533 13928 728 91,1 globlastp

306 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 7812 LYD378 cacao|10v1|CU469921_P1 13929 728 91,1 globlastp 7813 LYD378 triphysaria|10v1|BM357049 13930 728 91,1 globlastp 7814 LYD378 lettuce|10v1|DWO85186_P1 13931 728 91,1 globlastp 7815 LYD378 euphorbia|11v1|DV114593_T1 13932 728 90,9 glotblastn 7816 LYD378 basilicum|10v1|DY321889_T1 13933 728 90,9 glotblastn 7817 LYD378 cichorium|gb171|DT213556_T1 13934 728 90,9 glotblastn 7818 LYD378 cichorium|gb171|EH673038_T1 13935 728 90,9 glotblastn 7819 LYD378 arnica|11v1|SRR099034X112089_P1 13936 728 90,9 globlastp 7820 LYD378 cedrus|11v1|SRR065007X100635_P1 13937 728 90,9 globlastp 7821 LYD378 plantago|11v1|SRR066373X100567_P1 13938 728 90,9 globlastp 7822 LYD378 silene|11v1|SRR096785X10053_P1 13939 728 90,9 globlastp tabemaemontana|11v1|SRR098689X100844 7823 LYD378 13940 728 90,9 globlastp _P1 7824 LYD378 strawberryl11v1|DV438640 13941 728 90,9 globlastp 7825 LYD378 potato|10v1|BG097905_P1 13942 728 90,9 globlastp 7826 LYD378 peanut|10v1|CD038771_P1 13943 728 90,9 globlastp 7827 LYD378 lettuce|10v1I|WO58898_P1 13944 728 90,9 globlastp 7828 LYD378 soybean|11v1|GLYMA05G28480 13945 728 90,9 globlastp 7829 LYD378 dandelion|10v1|DY802361_P1 13946 728 90,9 globlastp 7830 LYD378 flaveria|11v1|SRR149241.143610_T1 13947 728 90,7 glotblastn 7831 LYD378 basilicum|10v1|DY321957_T1 13948 728 90,7 glotblastn 7832 LYD378 amsonia|11v1|SRR098688X101360_P1 13949 728 90,7 globlastp 7833 LYD378 arnica|11v1|SRR099034X101065_P1 13950 728 90,7 globlastp 7834 LYD378 chelidonium|11v1|SRR084752X101659_P1 13951 728 90,7 globlastp 7835 LYD378 humulus|11v1|EX519040_P1 13952 728 90,7 globlastp 7836 LYD378 maritime_pine|10v1|AL750155_P1 13953 728 90,7 globlastp 7837 LYD378 phyla|11v2|SRR099035X116122_P1 13954 728 90,7 globlastp 7838 LYD378 valeriana|11v1|SRR099039X101920_P1 13955 728 90,7 globlastp 7839 LYD378 aquilegia|10v2|JGIAC022728_P1 13956 728 90,7 globlastp 7840 LYD378 triphysaria|10v1|DR172234 13957 728 90,7 globlastp 7841 LYD378 citrus|gb166|CB290974_P1 13958 728 90,7 globlastp 7842 LYD378 1otus|09v1|LA1967775_P1 13959 728 90,7 globlastp 7843 LYD378 triphysaria|10v1|3M357191 13960 728 90,7 globlastp 7844 LYD378 aquilegia|10v2|DR922048_P1 13961 728 90,6 globlastp 7845 LYD378 eucalyptus|11v2|SRR001658X13888_T1 13962 728 90,6 glotblastn 7846 LYD378 oat|10v2|G0586651 13963 728 90,5 glotblastn 7847 LYD378 oat|10v2|GR344174 13964 728 90,5 glotblastn 7848 LYD378 iceplant|gb164|MCU79766_T1 13965 728 90,5 glotblastn 7849 LYD378 oat|11v1|GR313462_P1 13966 728 90,5 globlastp 7850 LYD378 oat|11v1|GR325352_P1 13966 728 90,5 globlastp 7851 LYD378 phalaenopsis|11v1|SRR125771,1001108_P1 13967 728 90,5 globlastp 7852 LYD378 trigonella|11v1|SRR066194X130639_P1 13968 728 90,5 globlastp watermelon|11v1|VMEL03160725183103_P 7853 LYD378 13969 728 90,5 globlastp 1 7854 LYD378 fescue|gb161|DT689536_P1 13970 728 90,5 globlastp 7855 LYD378 oat|11v1|G0586651_P1 13966 728 90,5 globlastp 7856 LYD378 oat|10v2|G0582752 13966 728 90,5 globlastp 7857 LYD378 wheat|10v2|CA500890 13971 728 90,5 globlastp 7858 LYD378 barley|10v2|BF622755_P1 13972 728 90,5 globlastp 7859 LYD378 cowpea|gb166|FC457714_P1 13973 728 90,5 globlastp 7860 LYD378 spruce|gb162|CO215633 13974 728 90,5 globlastp 7861 LYD378 oat|11v1|GR344174_P1 13966 728 90,5 globlastp 7862 LYD378 oat|11v1|GR313665_P1 13966 728 90,5 globlastp 7863 LYD378 maritime_pine|10v1|AL750739_P1 13975 728 90,3 globlastp 7864 LYD378 oat|11v1|G0582752_P1 13976 728 90,3 globlastp 7865 LYD378 orange|11v1|CB290974_P1 13977 728 90,3 globlastp 7866 LYD378 phalaenopsis|11v1|X79905_P1 13978 728 90,3 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X100341 7867 LYD378 13979 728 90,3 globlastp _P1 7868 LYD378 vinca|11v1|SRR098690X101025_P1 13980 728 90,3 globlastp 7869 LYD378 oat|10v2|G0592301 13976 728 90,3 globlastp 7870 LYD378 oat|10v2|GR313665 13976 728 90,3 globlastp

307 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 7871 LYD378 antirrhinum|gb166|AJ558951_P1 13981 728 90,3 globlastp 7872 LYD378 amborella|gb166|CD482763_P1 13982 728 90,3 globlastp 7873 LYD378 clementine|11v1|CB290974_P1 13983 728 90,1 globlastp 7874 LYD378 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1000920_P1 13984 728 90,1 globlastp 7875 LYD378 plantago|11v1|SRR066373X100249_P1 13985 728 90,1 globlastp 7876 LYD378 banana|10v1|DV270762_P1 13986 728 90,1 globlastp 7877 LYD378 oilpalm|gb166|CN599616_P1 13987 728 90,1 globlastp 7878 LYD378 spruce|gb162|CO216143 13988 728 90,1 globlastp 7879 LYD378 eschscholzia|10v1|CD479487 13989 728 90,1 globlastp 7880 LYD378 lettuce|0v1|DWO79447_P1 13990 728 90,1 globlastp 7881 LYD378 cedrus|11v1|SRR065007X100240_P1 13991 728 89,9 globlastp 7882 LYD378 vinca|11v1|SRR098690X101569_P1 13992 728 89,9 globlastp 7883 LYD378 foxtail_millet|10v2|SICRP000601 13993 728 89,9 globlastp 7884 LYD378 poppy|gb166|EB740753_P1 13994 728 89,9 globlastp 7885 LYD378 wheat|10v2|E3F293436 13995 728 89,9 globlastp 7886 LYD378 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0000474 13996 728 89,9 globlastp 7887 LYD378 podocarpus|10v1|SRR06501450001919_P1 13997 728 89,9 globlastp 7888 LYD378 lettuce|10v1|DWO45122_P1 13998 728 89,9 globlastp 7889 LYD378 cotton|10v2|A1725445_P1 13999 728 89,7 globlastp 7890 LYD378 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0007645 14000 728 89,7 globlastp 7891 LYD378 orobanche|10v1|SRR02318950005157_P1 14001 728 89,7 globlastp 7892 LYD378 spikemoss|gb165|FE427744 14002 728 89,7 globlastp 7893 LYD378 spikemoss|gb165|FE428682 14002 728 89,7 globlastp 7894 LYD378 wheat|10v2|E3G274640 14003 728 89,7 glotblastn amorphophallus|11v2|SRR089351X145173_ 7895 LYD378 14004 728 89,5 globlastp P1 7896 LYD378 canola|11v1|ES264127_P1 14005 728 89,5 globlastp 7897 LYD378 pteridium|11v1|SRR043594X134214_P1 14006 728 89,5 globlastp 7898 LYD378 chickpea|09v2|AJ884609_P1 14007 728 89,5 globlastp 7899 LYD378 clover|gb162|AB236781_P1 14008 728 89,5 globlastp 7900 LYD378 sciadopitys|10v1|SRR065035S0002413 14009 728 89,5 globlastp 7901 LYD378 pine|10v2|AJ300723_T1 14010 728 89,5 glotblastn 7902 LYD378 sequoia|10v1|SRR065044S0008296 14011 728 89,3 globlastp 7903 LYD378 grape|11v1|GSVIVT01007578001_P1 14012 728 89,3 globlastp 7904 LYD378 grape|gb160|BG273708 14012 728 89,3 globlastp 7905 LYD378 sequoia|10v1|SRR065044S0001399 14013 728 89,3 globlastp 7906 LYD378 abies|11v2|SRR098676X100678_P1 14014 728 89,1 globlastp 7907 LYD378 abies|11v2|SRR098676X135135XX1_P1 14015 728 89,1 globlastp 7908 LYD378 cucumber|09v1|BG1454H0019958_P1 14016 728 89,1 globlastp 7909 LYD378 medicago|09v1|AW257137_P1 14017 728 89,1 globlastp 7910 LYD378 aristolochia|10v1|FD758204_P1 14018 728 89,1 globlastp 7911 LYD378 distylium|11v1|SRR065077X100334_P1 14019 728 88,9 globlastp 7912 LYD378 grape|11v1|EC973452_P1 14020 728 88,9 globlastp 7913 LYD378 platanus|11v1|SRR096786X112499_P1 14021 728 88,9 globlastp 7914 LYD378 trigonella|11v1|SRR066194X101523_P1 14022 728 88,9 globlastp 7915 LYD378 cephalotaxus|11v1|SRR064395X100750_P1 14023 728 88,7 globlastp 7916 LYD378 cotton|10v2|DN761470_P1 14024 728 88,7 globlastp 7917 LYD378 cycas|gb166|CB089508_P1 14025 728 88,7 globlastp amorphophallus|11v2|SRR089351X223228_ 7918 LYD378 14026 728 88,7 glotblastn T1 7919 LYD378 cephalotaxus|11v1|SRR064395X103851_P1 14027 728 88,5 globlastp 7920 LYD378 ginger|gb164|DY351813_P1 14028 728 88,5 globlastp 7921 LYD378 coffea|10v1|DV664613_P1 14029 728 88,5 globlastp 7922 LYD378 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1004214_T1 14030 728 88,5 glotblastn 7923 LYD378 flaveria|11v1|SRR149232.140380_P1 14031 728 88,0 globlastp 7924 LYD378 pine|10v2|AL751326_T1 14032 728 87,8 glotblastn 7925 LYD378 marchantia|gb166|13J841640_P1 14033 728 87,8 globlastp 7926 LYD378 phalaenopsis|11v1|CK857700_P1 14034 728 87,6 globlastp 7927 LYD378 taxus|10v1|SRR032523S0022935 14035 728 87,6 globlastp 7928 LYD378 podocarpus|10v1|SRR065014S0000841_P1 14036 728 87,4 globlastp 7929 LYD378 flaveria|11v1|SRR149232.114721_P1 14037 728 87,2 globlastp 7930 LYD378 gnetum|10v1|SRR06439950034636_P1 14038 728 87,2 globlastp

308 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 7931 LYD378 physcomitrella|10v1|AW599908_P1 14039 728 87,2 globlastp 7932 LYD378 physcomitrella|10v1|AW561393_P1 14040 728 87,2 globlastp 7933 LYD378 petunia|gb171|CV292638_P1 14041 728 87,0 globlastp 7934 LYD378 physcomitrella|10v1|AW739367_P1 14042 728 86,8 globlastp 7935 LYD378 ceratodon|10v1|SRR07489050069256_P1 14043 728 86,8 globlastp 7936 LYD378 scabiosa|11v1|SRR063723X100816_P1 14044 728 86,4 globlastp 7937 LYD378 zostera|10v1|SRR057351S0002262 14045 728 86,0 globlastp 7938 LYD378 tragopogon|10v1|3ISRR020205S001060 14046 728 85,6 globlastp 7939 LYD378 cacao|10v1|CU481992_P1 14047 728 85,6 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000718 7940 LYD378 14048 728 85,4 globlastp 7_P1 7941 LYD378 cotton|10v2|DT545969_P1 14049 728 84,9 globlastp 7942 LYD378 pteridium|11v1|GW574811_P1 14050 728 84,7 globlastp 7943 LYD378 b_rapa|gb162|13G544576_P1 14051 728 84,3 globlastp 7944 LYD378 primula|11v1|SRR098680X207816_P1 14052 728 84,1 globlastp 7945 LYD378 beet|gb162|BE590262_P1 14053 728 83,9 globlastp 7946 LYD378 pteridium|11v1|GW575179_P1 14054 728 82,3 globlastp 7947 LYD378 sequoia|10v1|SRR065044S0092560 14055 728 81,9 globlastp 7948 LYD378 canola|11v1|CD836192_P1 14056 728 81,3 globlastp 7949 LYD378 curcuma|10v1|DY388142_P1 14057 728 81,0 globlastp 7950 LYD378 artemisia|10v1|EY033112_P1 14058 728 80,2 globlastp 7951 LYD382 peanut|10v1|CX127907_P1 14059 730 85,9 globlastp 7952 LYD382 trigonella|11v1|SRR066194X105498_P1 14060 730 85,5 globlastp 7953 LYD382 aristolochia|10v1|FD754814_P1 14061 730 85,5 globlastp 7954 LYD382 eucalyptus|11v2|CU396775_P1 14062 730 85,1 globlastp 7955 LYD382 chestnut|gb170|SRR00629550000754_P1 14063 730 85,1 globlastp 7956 LYD382 oak|10v1|AJ873910_P1 14064 730 85,1 globlastp 7957 LYD382 lotus|09v1|LBI418341_P1 14065 730 85,0 globlastp 7958 LYD382 clover|gb162|13B903607_P1 14066 730 84,8 globlastp 7959 LYD382 soybean|11v1|GLYMA19G01200 14067 730 84,6 globlastp 7960 LYD382 aquilegia|10v2|DR944702_P1 14068 730 84,3 globlastp 7961 LYD382 medicago|09v1|LAW684105_P1 14069 730 84,2 globlastp 7962 LYD382 soybean|11v1|GLYMA13G23790 14070 730 84,1 globlastp 7963 LYD382 utricularia|11v1|SRR094438.102147_P1 14071 730 83,2 globlastp 7964 LYD382 safflower|gb162|EL374718 14072 730 83,0 globlastp 7965 LYD382 amborella|gb166|CD483403_P1 14073 730 82,5 globlastp 7966 LYD382 spurge|gb161|BG317312 14074 730 82,3 glotblastn 7967 LYD382 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1039093_T1 14075 730 82,0 glotblastn 7968 LYD382 antirrhinum|gb166|AJ568796_T1 14076 730 81,9 glotblastn 7969 LYD382 sarracenia|11v1|SRR192669.101165_T1 14077 730 81,8 glotblastn 7970 LYD382 cowpea|gb166|FF385586_P1 14078 730 80,4 globlastp 7971 LYD382 fescue|gb161|DT679486_P1 14079 730 80,4 globlastp 7972 LYD382 flaveria|11v1|SRR149229.113579_T1 14080 730 80,4 glotblastn 7973 LYD385 cotton|10v2|BQ403999_P1 14081 732 82,5 globlastp 7974 LYD387 cotton|10v2|DW506465_T1 14082 734 82,0 glotblastn 7975 LYD387 cassava|09v1|BM259711_P1 14083 734 81,3 globlastp 7976 LYD388 cacao|10v1|CF972938_P1 14084 735 94,9 globlastp 7977 LYD388 castorbean|09v1|NM002509535 14085 735 89,9 globlastp 7978 LYD388 castorbean|11v1|NM002509535_P1 14085 735 89,9 globlastp 7979 LYD388 tripterygium|11v1|SRR098677X10453_P1 14086 735 89,0 globlastp 7980 LYD388 cassava|09v1|DV443057_P1 14087 735 89,0 globlastp 7981 LYD388 soybean|11v1|GLYMA05G04210 14088 735 88,9 globlastp 7982 LYD388 cleome_spinosa|10v1|GR932635_P1 14089 735 88,3 globlastp 7983 LYD388 cassava|09v1|DV453987_P1 14090 735 88,3 globlastp 7984 LYD388 prunus|10v1|CN926018 14091 735 87,9 globlastp 7985 LYD388 poplar|10v1|P31071632_P1 14092 735 87,8 globlastp 7986 LYD388 watermelon|11v1|DV632848_P1 14093 735 87,7 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000332 7987 LYD388 14094 735 87,7 globlastp 0_P1 7988 LYD388 cannabis|12v1|EW701274_P1 14095 735 87,6 globlastp 7989 LYD388 oak|10v1|CU657806_P1 14096 735 87,6 globlastp 7990 LYD388 clementine|11v1|CK701311_P1 14097 735 87,4 globlastp

309 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 7991 LYD388 euphorbia|11v1|SRR098678X102845_P1 14098 735 87,4 globlastp 7992 LYD388 apple|11v1|CN926018_P1 14099 735 87,4 globlastp 7993 LYD388 orange|11v1|CK701311_P1 14100 735 87,3 globlastp 7994 LYD388 eucalyptus|11v2|ES590034_P1 14101 735 87,2 globlastp 7995 LYD388 cucumber|09v1|DV632848_P1 14102 735 87,0 globlastp 7996 LYD388 catharanthus|11v1|SRR098691X102854_P1 14103 735 86,6 globlastp 7997 LYD388 amsonia|11v1|SRR098688X100719_P1 14104 735 86,5 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN773721_P 7998 LYD388 14105 735 86,5 globlastp 1 7999 LYD388 canola|11v1|EE452078_P1 14106 735 86,3 globlastp 8000 LYD388 thellungiella_parvulum|11v1|DN773721_P1 14107 735 86,3 globlastp 8001 LYD388 medicago|09v1|AW127680_P1 14108 735 86,1 globlastp 8002 LYD388 strawberry|11v1|DY674203 14109 735 86,1 globlastp 8003 LYD388 arabidopsis|10v1|AT1G62750_P1 14110 735 86,0 globlastp 8004 LYD388 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL005652_P1 14111 735 85,6 globlastp 8005 LYD388 phyla|11v2|SRR099035X101386_P1 14112 735 85,5 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X112571 8006 LYD388 14113 735 85,5 globlastp _P1 8007 LYD388 aristolochia|10v1|FD761141_P1 14114 735 85,5 globlastp 8008 LYD388 flaveria|11v1|SRR149232.30580_P1 14115 735 85,3 globlastp 8009 LYD388 flaveria|11v1|SRR149229.117602_P1 14116 735 84,8 globlastp 8010 LYD388 ambrosia|11v1|SRR346935.209205_P1 14117 735 84,7 globlastp 8011 LYD388 tomato|11v1|P3G130489_P1 14118 735 84,7 globlastp 8012 LYD388 tomato|09v1|AA076677 14118 735 84,7 globlastp 8013 LYD388 ambrosia|11v1|SRR346935.394950_P1 14119 735 84,6 globlastp 8014 LYD388 ambrosia|11v1|SRR346935.128714_P1 14120 735 84,3 globlastp 8015 LYD388 arnica|11v1|SRR099034X104664_P1 14121 735 83,9 globlastp 8016 LYD388 sunflower|10v1|CX943962 14122 735 83,7 globlastp 8017 LYD388 triphysaria|10v1|PY148720 14123 735 83,4 globlastp 8018 LYD388 lettuce|10v1|DWO57556_P1 14124 735 83,3 globlastp 8019 LYD388 aquilegia|10v2|DT740030_P1 14125 735 83,0 globlastp 8020 LYD388 grape|11v1|GSVIVT01006035001_P1 14126 735 82,1 globlastp 8021 LYD388 sorghum|11v1|SB06G023840_P1 14127 735 81,9 globlastp 8022 LYD388 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1005741_P1 14128 735 81,6 globlastp 8023 LYD388 switchgrass|gb167|FE637605 14129 735 81,2 globlastp 8024 LYD388 zostera|10v1|SRR057351S0020994 14130 735 80,9 globlastp 8025 LYD388 maize|10v1|A1649702_P1 14131 735 80,8 globlastp 8026 LYD388 foxtail_millet|11v3|PHY7SI0094221M_P1 14132 735 80,8 globlastp 8027 LYD388 distylium|11v1|SRR065077X104454_P1 14133 735 80,6 globlastp 8028 LYD388 maize|10v1|CD969589_P1 14134 735 80,6 globlastp 8029 LYD388 cedrus|11v1|SRR065007X100464_P1 14135 735 80,3 globlastp 8030 LYD388 cephalotaxus|11v1|SRR064395X105408_P1 14136 735 80,2 globlastp 8031 LYD388 platanus|11v1|SRR096786X103276_P1 14137 735 80,2 globlastp 8032 LYD388 wheat|10v2|BE412213XX1 14138 735 80,2 globlastp 8033 LYD391 sorghum|09v1|SB03G032950 14139 737 93,0 globlastp 8034 LYD391 sorghum|11v1|SB03G032950_P1 14139 737 93,0 globlastp 8035 LYD391 switchgrass|gb167|DN141759 14140 737 88,1 globlastp 8036 LYD392 foxtail_millet|10v2|EC613417 14141 738 86,2 globlastp 8037 LYD392 foxtail_millet|11v3|EC613417_P1 14141 738 86,2 globlastp 8038 LYD392 switchgrass|gb167|FE646413 14142 738 85,3 glotblastn 8039 LYD392 millet|10v1|EV0454PM013913_P1 14143 738 84,3 globlastp 8040 LYD396 trigonella|11v1|SRR066194X231762_P1 14144 740 95,2 globlastp 8041 LYD396 soybean|11v1|GLYMA13G32830 14145 740 84,6 globlastp 8042 LYD396 pigeonpea|10v1|SRR054580S0009276_P1 14146 740 83,9 globlastp 8043 LYD396 pigeonpea|10v1|SRR054580S0023424_P1 14147 740 82,5 globlastp 8044 LYD397 chestnut|gb170|SRR00629550021804_P1 14148 741 80,8 globlastp 8045 LYD397 oak|10v1|FP036011_P1 14149 741 80,8 globlastp 8046 LYD398 trigonella|11v1|SRR066194X111474_P1 14150 742 88,7 globlastp 8047 LYD403 soybean|11v1|GLYMA09G07590 14151 743 84,4 globlastp 8048 LYD403 soybean|11v1|GLYMA15G18810 14152 743 84,4 globlastp 8049 LYD403 cowpea|gb166|FF546951_P1 14153 743 83,0 globlastp 8050 LYD403 pigeonpea|10v1|SRR054580S0008236_P1 14154 743 83,0 globlastp

310 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 8051 LYD408 trigonella|11v1|SRR066194X115949_P1 14155 746 81,5 globlastp 8052 LYD413 soybean|11v1|GLYMA12G09390 14156 749 87,5 globlastp 8053 LYD413 pigeonpea|10v1|SRR054580S0048726_T1 14157 749 83,2 glotblastn 8054 LYD415 soybean|11v1|GLYMA04G42010 14158 750 83,4 globlastp 8055 LYD415 pigeonpea|10v1|SRR054580S0082138_P1 14159 750 82,9 globlastp 8056 LYD415 soybean|11v1|GLYMA06G12760 14160 750 82,8 globlastp 8057 LYD415 bean|gb167|CB539322_P1 14161 750 80,4 globlastp 8058 LYD416 lotus|09v1|G0018503_T1 14162 751 86,6 glotblastn 8059 LYD416 poplar|10v1|A1167032_T1 14163 751 80,9 glotblastn 8060 LYD419 bean|gb167|CA906538_P1 14164 754 80,5 globlastp 8061 LYD422 tripterygium|11v1|SRR098677X105 702_P1 14165 756 81,1 globlastp 8062 LYD428 maize|10v1|AW231584_P1 14166 757 88,0 globlastp 8063 LYD436 maize|10v1|A1942031_P1 14167 758 96,1 globlastp 8064 LYD436 foxtail_millet|11v3|PHY7S I021562M_P1 14168 758 95,8 globlastp 8065 LYD436 foxtail_millet|10v2|SICRP027763 14169 758 94,8 glotblastn 8066 LYD436 brachypodium|09v1|DV470118_P1 14170 758 88,8 globlastp 8067 LYD436 rice|gb170|OS05G05800 14171 758 87,9 globlastp 8068 LYD446 soybean|11v1|GLYMA05G03300_P1 654 759 80,2 globlastp 8069 LYD456 soybean|11v1|GLYMA12G01800 14172 763 85,1 globlastp 8070 LYD456 soybean|11v1|GLYMA12G01780 14173 763 80,1 globlastp 8071 LYD480 solanum_phureja|09v1|SPHA1771275 14174 766 95,4 globlastp 8072 LYD487 potato|10v1|BE921852_P1 14175 768 95,9 globlastp 8073 LYD487 solanum_phureja|09v1|SPHBG127385 14176 768 95,7 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|DN775488_P 8074 LYD497 14177 769 97,6 globlastp 1 8075 LYD497 arabidopsis_lyrata|09v1|BQ834502_P 14178 769 96,4 globlastp 8076 LYD497 arabidopsis|10v1|AT3G44110_P1 14179 769 96,0 globlastp 8077 LYD497 radish|gb164|EW713755 14180 769 95,0 glotblastn thellungiella_halophilum|11v1|DN776143_P 8078 LYD497 14181 769 91,3 globlastp 1 8079 LYD497 thellungiella|gb167|DN775488 14181 769 91,3 globlastp 8080 LYD497 thellungiella_parvulum|11v1|DN776143_P1 14182 769 90,8 globlastp 8081 LYD497 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL021881_P1 14183 769 90,8 globlastp 8082 LYD497 b_rapa|gb162|BG543519_P1 14184 769 90,4 globlastp 8083 LYD497 b_rapa|gb162|BQ790681_P1 14185 769 90,1 globlastp 8084 LYD497 canola|10v1|DY020103 14186 769 90,1 globlastp 8085 LYD497 canola|11v1|DY020103_P1 14186 769 90,1 globlastp 8086 LYD497 canola|10v1|EE417645 14187 769 90,1 globlastp 8087 LYD497 canola|11v1|PE417645_P1 14187 769 90,1 globlastp 8088 LYD497 b_oleracea|gb161|DY029727_P1 14188 769 89,9 globlastp 8089 LYD497 b_rapa|gb162|L37658_P1 14189 769 89,9 globlastp 8090 LYD497 canola|10v1|DW997640 14190 769 89,9 globlastp 8091 LYD497 canola|11v1|DW997640XX1_P1 14190 769 89,9 globlastp 8092 LYD497 canola|10v1|H74465 14188 769 89,9 globlastp 8093 LYD497 canola|11v1|CN728966_P1 14188 769 89,9 globlastp 8094 LYD497 b_oleracea|gb161|DY027908_P1 14191 769 89,6 globlastp 8095 LYD497 canola|10v1|CX190136 14192 769 89,6 globlastp 8096 LYD497 canola|11v1|DY006307_P1 14192 769 89,6 globlastp 8097 LYD497 arabidopsis|10v1|AT5G22060_P1 14193 769 89,4 globlastp 8098 LYD497 radish|gb164|EV525842 14194 769 89,4 globlastp 8099 LYD497 radish|gb164|EW716467 14195 769 89,4 globlastp 8100 LYD497 apple|11v1|CN491118_P1 14196 769 88,0 globlastp 8101 LYD497 apple|gb171|CN491118 14196 769 88,0 globlastp 8102 LYD497 oak|10v1|DB997907_P1 14197 769 87,0 globlastp 8103 LYD497 apple|11v1|CN866270_P1 14198 769 87,0 globlastp 8104 LYD497 apple|gb171|CN866270 14198 769 87,0 globlastp 8105 LYD497 chestnut|gb170|SRR00629550002664_P1 14199 769 86,7 globlastp 8106 LYD497 trigonella|11v1|SRR066194X102083_P1 14200 769 86,6 globlastp 8107 LYD497 medicago|09v1|A1974233P1 14201 769 86,6 globlastp 8108 LYD497 soybean|11v1|GLYMA12G10150 14202 769 86,6 globlastp 8109 LYD497 catharanthus|11v1|EG556090_P1 14203 769 86,5 globlastp 8110 LYD497 peanut|10v1|ES721812_P1 14204 769 86,5 globlastp

311 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 8111 LYD497 ambrosia|11v1|SRR346935.160842P1 14205 769 86,3 globlastp 8112 LYD497 soybean|11v1|GLYMA11G17930 14206 769 86,3 globlastp 8113 LYD497 amsonia|11v1|SRR098688X107269_P1 14207 769 86,1 globlastp 8114 LYD497 pigeonpea|10v1|GW352659_P1 14208 769 85,9 globlastp 8115 LYD497 ambrosia|11v1|SRR346935.136048_P1 14209 769 85,8 globlastp 8116 LYD497 ambrosia|11v1|GR935619_P1 14210 769 85,6 globlastp 8117 LYD497 tripterygium|11v1|SRR098677X104761_P1 14211 769 85,6 globlastp 8118 LYD497 eucalyptus|11v2|CB967915_P1 14212 769 85,3 globlastp 8119 LYD497 euphorbia|11v1|BI975259_P1 14213 769 85,3 globlastp 8120 LYD497 orange|11v1|CF506830_P1 14214 769 85,3 globlastp 8121 LYD497 trigonella|11v1|SRR066194X100701_P1 14215 769 85,3 globlastp 8122 LYD497 iceplant|gb164|BE033497_P1 14216 769 85,3 globlastp 8123 LYD497 petunia|gb171|CV292987_P1 14217 769 85,3 globlastp 8124 LYD497 prunus|10v1|CN491118 14218 769 85,3 globlastp 8125 LYD497 melon|10v1|YMEL00562912803351_P1 14219 769 85,3 globlastp 8126 LYD497 peanut|10v1|EG029783_P1 14220 769 85,3 globlastp 8127 LYD497 sunflower|10v1|CD850942 14221 769 85,2 globlastp 8128 LYD497 fraxinus|11v1|SRR058827.104257_T1 14222 769 85,1 glotblastn 8129 LYD497 clementine|11v1|CF506830_P1 14223 769 85,1 globlastp tabernaemontana|11v1|SRR098689X104137 8130 LYD497 14224 769 85,1 globlastp _P1 8131 LYD497 vinca|11v1|SRR098690X102857_P1 14225 769 85,1 globlastp 8132 LYD497 citrus|gb166|CF506830_P1 14223 769 85,1 globlastp 8133 LYD497 cucumber|09v1|PDN910007_P1 14226 769 85,1 globlastp 8134 LYD497 pepper|gb171|BI480578_P1 14227 769 85,1 globlastp 8135 LYD497 solanum_phureja|09v1|SPHBG123223 14228 769 85,1 globlastp 8136 LYD497 soybean|11v1|GLYMA13G38790 14229 769 85,1 globlastp 8137 LYD497 lettuce|10v1|PDWO81072_P1 14230 769 85,0 globlastp 8138 LYD497 euonymus|11v1|SRR070038X100033_P1 14231 769 84,9 globlastp 8139 LYD497 flaveria|11v1|SRR149238.194383_P1 14232 769 84,9 globlastp 8140 LYD497 prunus|10v1|P31203058_P1 14233 769 84,9 globlastp 8141 LYD497 vinca|11v1|SRR098690X103365_P1 14234 769 84,9 globlastp 8142 LYD497 cotton|10v2|DT569498_P1 14235 769 84,9 globlastp 8143 LYD497 cowpea|gb166|FC457865_P1 14236 769 84,9 globlastp 8144 LYD497 grape|11v1|GSVIVT01036049001_P1 14237 769 84,9 globlastp 8145 LYD497 grape|gb160|CA815428 14237 769 84,9 globlastp 8146 LYD497 euonymus|11v1|SRR070038X113733_P1 14238 769 84,8 globlastp 8147 LYD497 phyla|11v2|SRR099035X104836_P1 14239 769 84,8 globlastp 8148 LYD497 soybean|11v1|GLYMA12G31620 14240 769 84,8 globlastp 8149 LYD497 flaveria|11v1|SRR149229.129866_P1 14241 769 84,7 globlastp 8150 LYD497 flaveria|11v1|SRR149229.171545_P1 14242 769 84,7 globlastp 8151 LYD497 flaveria|11v1|SRR149238.56747_P1 14243 769 84,7 globlastp 8152 LYD497 flax|11v1|CA482256_P1 14244 769 84,7 globlastp 8153 LYD497 ambrosia|11v1|SRR346935.161298_T1 14245 769 84,7 glotblastn 8154 LYD497 watermelon|11v1|PDQ641089_T1 14246 769 84,6 glotblastn 8155 LYD497 canola|11v1|PE415454_P1 14247 769 84,6 globlastp 8156 LYD497 tomato|11v1|NTU64914_P1 14248 769 84,6 globlastp 8157 LYD497 tripterygium|11v1|SRR098677X113291_T1 14249 769 84,6 glotblastn 8158 LYD497 papaya|gb165|AM903496_P1 14250 769 84,6 globlastp 8159 LYD497 tomato|09v1|P3G123223 14248 769 84,6 globlastp 8160 LYD497 medicago|09v1|A1974478_P1 14251 769 84,6 globlastp 8161 LYD497 lettuce|10v1|DWO71427_P1 14252 769 84,5 globlastp 8162 LYD497 aristolochia|10v1|FD760954_P1 14253 769 84,4 globlastp 8163 LYD497 grape|11v1|GSVIVT01034612001_P1 14254 769 84,4 globlastp 8164 LYD497 grape|gb160|BE846432 14254 769 84,4 globlastp 8165 LYD497 bean|gb167|BU791100_P1 14255 769 84,4 globlastp 8166 LYD497 antirrhinum|gb166|AJ790003_P1 14256 769 84,4 globlastp 8167 LYD497 oak|10v1|FP059464_P1 14257 769 84,4 globlastp 8168 LYD497 fagopyrum|11v1|SRR063689X103645_P1 14258 769 84,2 globlastp 8169 LYD497 flaveria|11v1|SRR149229.104349_P1 14259 769 84,2 globlastp 8170 LYD497 flaveria|11v1|SRR149229.253827_P1 14260 769 84,2 globlastp 8171 LYD497 flaveria|11v1|SRR149241.10961_P1 14261 769 84,2 globlastp

312 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 8172 LYD497 humulus|11v1|GD243562_P1 14262 769 84,2 globlastp 8173 LYD497 humulus|11v1|GD248904_P1 14262 769 84,2 globlastp 8174 LYD497 sunflower|10v1|CD850447 14263 769 84,2 globlastp 8175 LYD497 cowpea|gb166|FC457354_P1 14264 769 84,2 globlastp 8176 LYD497 cacao|10v1|CA794361_P1 14265 769 84,2 globlastp 8177 LYD497 ginger|gb164|DY344964_P1 14266 769 84,2 globlastp 8178 LYD497 euphorbia|11v1|BP961936_P1 14267 769 84,1 globlastp 8179 LYD497 orobanche|10v1|SRR023189S0000546_P1 14268 769 84,1 globlastp 8180 LYD497 lettuce|10v1|DWO46397_P1 14269 769 84,1 globlastp 8181 LYD497 ambrosia|11v1|SRR346935.120095P1 14270 769 84,0 globlastp 8182 LYD497 ambrosia|11v1|SRR346935.318001P1 14271 769 84,0 globlastp 8183 LYD497 chelidonium|11v1|SRR084752X100891_P1 14272 769 84,0 globlastp 8184 LYD497 flaveria|11v1|SRR149232.105608_P1 14273 769 84,0 globlastp 8185 LYD497 poppy|gb166|FE964493_P1 14274 769 84,0 globlastp 8186 LYD497 sunflower|10v1|DY915953_P1 14275 769 84,0 globlastp 8187 LYD497 dandelion|10v1|DQ160025_P1 14276 769 84,0 globlastp 8188 LYD497 triphysaria|10v1|DR171863_T1 14277 769 83,9 glotblastn 8189 LYD497 bean|gb167|CA906109_P1 14278 769 83,9 globlastp 8190 LYD497 castorbean|11v1|T15127_P1 14279 769 83,9 globlastp 8191 LYD497 chestnut|gb170|SRR00629650001007_P1 14280 769 83,9 globlastp 8192 LYD497 cirsium|11v1|SRR346952.1075053_P1 14281 769 83,9 globlastp 8193 LYD497 orange|11v1|BQ623197_P1 14282 769 83,9 globlastp 8194 LYD497 phalaenopsis|11v1|CB032807_P1 14283 769 83,9 globlastp 8195 LYD497 phalaenopsis|11v1|CB033750_P1 14283 769 83,9 globlastp 8196 LYD497 citrus|gb166|BQ623197_P1 14282 769 83,9 globlastp 8197 LYD497 sugarcane|10v1|BU102705 14284 769 83,8 globlastp 8198 LYD497 ambrosia|11v1|SRR346949.115705_T1 14285 769 83,7 glotblastn 8199 LYD497 arnica|11v1|SRR099034X100618_P1 14286 769 83,7 globlastp 8200 LYD497 cirsium|11v1|SRR346952.107147_P1 14287 769 83,7 globlastp 8201 LYD497 flax|11v1|CV478777_P1 14288 769 83,7 globlastp 8202 LYD497 monkeyflower|10v1|DV206666_P1 14289 769 83,7 globlastp 8203 LYD497 cotton|10v2|BG445245_P1 14290 769 83,7 globlastp 8204 LYD497 clementine|11v1|P3Q623197_P1 14291 769 83,6 globlastp tabemaemontana|11v1|SRR098689X101647 8205 LYD497 14292 769 83,6 globlastp _P1 8206 LYD497 watermelon|11v1|AA660002_P1 14293 769 83,6 globlastp 8207 LYD497 spurge|gb161|AF239932 14294 769 83,6 globlastp 8208 LYD497 melon|10v1|DV632533_P1 14295 769 83,6 globlastp 8209 LYD497 arnica|11v1|SRR099034X104887_P1 14296 769 83,5 globlastp 8210 LYD497 foxtail_millet|11v3|EC612074_P1 14297 769 83,5 globlastp 8211 LYD497 ginger|gb164|DY345527_P1 14298 769 83,5 globlastp 8212 LYD497 solanum_phureja|09v1|SPHAF124139_P1 14299 769 83,5 globlastp 8213 LYD497 artemisia|10v1|EY033510_P1 14300 769 83,5 globlastp 8214 LYD497 brachypodium|09v1|DV468896_P1 14301 769 83,5 globlastp 8215 LYD497 sorghum|09v1|SB01G013390 14302 769 83,5 globlastp 8216 LYD497 sorghum|11v1|SB01G013390_P1 14302 769 83,5 globlastp 8217 LYD497 banana|10v1|AY787796 14303 769 83,4 glotblastn 8218 LYD497 aquilegia|10v2|DR916833_P1 14304 769 83,4 globlastp 8219 LYD497 euphorbia|11v1|AF239932XX1_P1 14305 769 83,4 globlastp 8220 LYD497 canola|10v1|CX193725 14306 769 83,4 globlastp 8221 LYD497 canola|11v1|DV643263_P1 14307 769 83,4 globlastp 8222 LYD497 coffea|10v1|DQ124000_P1 14308 769 83,4 globlastp 8223 LYD497 coffea|10v1|DV663920_P1 14309 769 83,4 globlastp 8224 LYD497 cannabis|12v1|1GR221026_P1 14310 769 83,3 globlastp 8225 LYD497 chickpea|09v2|EH058882_P1 14311 769 83,3 globlastp 8226 LYD497 barley|10v2|E3E420930_P1 14312 769 83,3 globlastp 8227 LYD497 rice|gb170|OS03G44620T2 14313 769 83,3 globlastp 8228 LYD497 maize|10v1|A1396449_P1 14314 769 83,3 globlastp 8229 LYD497 ambrosia|11v1|SRR346943.197979_T1 14315 769 83,3 glotblastn 8230 LYD497 phalaenopsis|11v1|CB032781_T1 14316 769 83,2 glotblastn 8231 LYD497 triphysaria|10v1|DR172946_P1 14317 769 83,2 globlastp 8232 LYD497 cotton|10v2|DT544369_P1 14318 769 83,2 globlastp

313 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: 8233 LYD497 poplar|10v1|P31071897_P1 14319 769 83,2 globlastp 8234 LYD497 cotton|10v2|E3F268155_P1 14320 769 83,2 globlastp 8235 LYD497 cotton|10v2|SRR032368S0616524_P1 14321 769 83,2 globlastp 8236 LYD497 platanus|11v1|SRR096786X113897_T1 14322 769 83,2 glotblastn 8237 LYD497 walnuts|gb166|CB303856 14323 769 83,2 glotblastn 8238 LYD497 maize|10v1|W21742_P1 14324 769 83,1 globlastp 8239 LYD497 millet|10v1|CD724871_P1 14325 769 83,1 globlastp 8240 LYD497 apple|11v1|CN492813_P1 14326 769 83,0 globlastp 8241 LYD497 catharanthus|11v1|EG557170_P1 14327 769 83,0 globlastp 8242 LYD497 cirsium|11v1|SRR346952,1000189_P1 14328 769 83,0 globlastp 8243 LYD497 cirsium|11v1|SRR346952,108403_P1 14329 769 83,0 globlastp 8244 LYD497 curcuma|10v1|PDY385577_P1 14330 769 83,0 globlastp 8245 LYD497 eucalyptus|11v2|CB967867_P1 14331 769 83,0 globlastp 8246 LYD497 sugarcane|10v1|AA842770_P1 14332 769 83,0 globlastp 8247 LYD497 tomato|11v1|NTU64913_P1 14333 769 83,0 globlastp 8248 LYD497 poplar|10v1|AI166364_P1 14334 769 83,0 globlastp 8249 LYD497 pepper|gb171|AF109656_P1 14335 769 83,0 globlastp cucurbita|11v1|SRR091276X100595XX1_T 8250 LYD497 14336 769 82,9 glotblastn 1 8251 LYD497 apple|11v1|CN497067_P1 14337 769 82,9 globlastp 8252 LYD497 tobacco|gb162|AF154638_P1 14338 769 82,9 globlastp 8253 LYD497 wheat|10v2|E3F199715 14339 769 82,9 globlastp 8254 LYD497 wheat|10v2|CA649147 14340 769 82,8 glotblastn 8255 LYD497 kiwi|gb166|FG399461_P1 14341 769 82,8 globlastp 8256 LYD497 poplar|10v1|AI164534_P1 14342 769 82,8 globlastp 8257 LYD497 cynara|gb167|GE582183_T1 14343 769 82,7 glotblastn 8258 LYD497 sorghum|11v1|SB01G005860_P1 14344 769 82,7 globlastp 8259 LYD497 tobacco|gb162|NTU64913_P1 14345 769 82,7 globlastp 8260 LYD497 cacao|10v1|CU539774_P1 14346 769 82,7 globlastp 8261 LYD497 castorbean|09v1|XM002515819 14347 769 82,7 globlastp 8262 LYD497 castorbean|11v1|XM002515819_P1 14347 769 82,7 globlastp 8263 LYD497 switchgrass|gb167|DN143211_P1 14348 769 82,6 globlastp 8264 LYD497 valeriana|11v1|SRR099039X101240_P1 14349 769 82,6 globlastp 8265 LYD497 safflower|gb162|EL378154_T1 14350 769 82,5 glotblastn cassava|09v1|JGICASSAVA35716VALIDM 8266 LYD497 14351 769 82,5 globlastp 1_P1 8267 LYD497 curcuma|10v1|DY382981_P1 14352 769 82,5 globlastp 8268 LYD497 foxtail_millet|11v3|PHY7SI035864M_P1 14353 769 82,5 globlastp 8269 LYD497 maize|10v1|AW330975_P1 14354 769 82,5 globlastp 8270 LYD497 maize|10v1|T12693_P1 14355 769 82,5 globlastp 8271 LYD497 momordica|10v1|SRR071315S0005921_P1 14356 769 82,5 globlastp 8272 LYD497 tomato|11v1|P3G123571_P1 14357 769 82,5 globlastp 8273 LYD497 hevea|10v1|AF085275_T1 14358 769 82,5 glotblastn 8274 LYD497 oat|11v1|GO583965_P1 14359 769 82,4 globlastp 8275 LYD497 switchgrass|gb167|DN141212_P1 14360 769 82,4 globlastp 8276 LYD497 valeriana|11v1|SRR099039X10517 5_P1 14361 769 82,4 globlastp 8277 LYD497 cichorium|gb171|EH678387_P1 14362 769 82,4 globlastp 8278 LYD497 euonymus|11v1|3SRR070038X10082_P1 14363 769 82,3 globlastp 8279 LYD497 euonymus|11v1|SRR070038X101498_P1 14364 769 82,3 globlastp 8280 LYD497 euonymus|11v1|SRR070038X10587_P1 14365 769 82,3 globlastp 8281 LYD497 kiwi|gb166|FG397142_P1 14366 769 82,3 globlastp 8282 LYD497 switchgrass|gb167|DN140950_P1 14367 769 82,3 globlastp 8283 LYD497 switchgrass|gb167|DN144182_P1 14368 769 82,3 globlastp 8284 LYD497 vinca|11v1|SRR098690X100192_P1 14369 769 82,3 globlastp 8285 LYD497 vinca|11v1|SRR098690X101903_P1 14370 769 82,3 globlastp 8286 LYD497 strawberry|11v1|CX661998 14371 769 82,3 globlastp 8287 LYD497 amsonia|11v1|SRR098688X102635_P1 14372 769 82,2 globlastp 8288 LYD497 euphorbia|11v1|P3G317325_P1 14373 769 82,2 globlastp 8289 LYD497 tobacco|gb162|NTU64914_P1 14374 769 82,1 globlastp 8290 LYD497 ginger|gb164|DY346824_P1 14375 769 82,0 globlastp 8291 LYD497 rice|gb170|OS03G57340_P1 14376 769 82,0 globlastp 8292 LYD497 plantago|11v1|SRR066373X112159_P1 14377 769 81,9 globlastp

314 / 378 Hom Polin.

Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden.

Algor.

ID Nome do Gene NO: ID glob.

NO: NO: amorphophallus|11v2|SRR089351X120182_ 8293 LYD497 14378 769 81,8 globlastp P1 8294 LYD497 centaureia|gb166|EH729094_P1 14379 769 81,8 globlastp 8295 LYD497 ipomoea_batatas|10v1|BM878746_P1 14380 769 81,8 globlastp 8296 LYD497 kiwi|gb166|FG404353_P1 14381 769 81,8 globlastp 8297 LYD497 kiwi|gb166|FG405243_P1 14382 769 81,8 globlastp 8298 LYD497 kiwi|gb166|FG425469_P1 14383 769 81,8 globlastp 8299 LYD497 solanum_phureja|09v1|SPHBG123571_P1 14384 769 81,8 globlastp 8300 LYD497 oat|11v1|GR313436_P1 14385 769 81,7 globlastp 8301 LYD497 oat|11v1|GR319459_P1 14385 769 81,7 globlastp 8302 LYD497 cassava|09v1|DV443541_P1 14386 769 81,6 globlastp 8303 LYD497 phalaenopsis|11v1|CK857679XX1_P1 14387 769 81,6 globlastp 8304 LYD497 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1028274_P1 14387 769 81,6 globlastp 8305 LYD497 phyla|11v2|SRR099035X100969_P1 14388 769 81,6 globlastp 8306 LYD497 tripterygium|11v1|SRR098677X120361_P1 14389 769 81,6 globlastp 8307 LYD497 radish|gb164|EX766230 14390 769 81,6 globlastp 8308 LYD497 tripterygium|11v1|SRR098677X100943_T1 14391 769 81,6 glotblastn 8309 LYD497 oat|11v1|CN180781_P1 14392 769 81,5 globlastp 8310 LYD497 brachypodium|09v1|DV474532_P1 14393 769 81,4 globlastp 8311 LYD497 pepper|gb171|BM063592_P1 14394 769 81,3 globlastp 8312 LYD497 phalaenopsis|11v1|SRR125771.1004730_P1 14395 769 81,3 globlastp 8313 LYD497 oil_palm|gb166|CN600037_T1 14396 769 81,3 glotblastn 8314 LYD497 beet|gb162|131543703_T1 14397 769 81,1 glotblastn 8315 LYD497 platanus|11v1|SRR096786X117453_T1 14398 769 81,1 glotblastn 8316 LYD497 cenchrus|gb166|EB654693P1 14399 769 81,1 globlastp 8317 LYD497 silene|11v1|SRR096785X135277_P1 14400 769 81,1 globlastp 8318 LYD497 strawberry|11v1|SRR034859S0002902_P1 14401 769 81,1 globlastp 8319 LYD497 vinca|11v1|SRR098690X126485_P1 14402 769 81,1 globlastp 8320 LYD497 aquilegia|10v2|JGIAC004636_P1 14403 769 81,0 globlastp 8321 LYD497 flaveria|11v1|SRR149229.55441_T1 14404 769 81,0 glotblastn 8322 LYD497 flaveria|11v1|SRR149229.112420_P1 14405 769 80,9 globlastp amorphophallus|11v2|SRR089351X110673_ 8323 LYD497 14406 769 80,8 glotblastn T1 8324 LYD497 oil_palm|gb166|CN601428_T1 14407 769 80,8 glotblastn 8325 LYD497 pseudoroegneria|gb167|FF347829_1 14408 769 80,8 globlastp 8326 LYD497 leymus|gb166|EG374967_P1 14409 769 80,7 globlastp 8327 LYD497 strawberry|11v1|CO379354_P1 14410 769 80,7 globlastp 8328 LYD497 triphysaria|10v1|DR174399_P1 14411 769 80,7 globlastp 8329 LYD497 flaverial|11v1|SRR149239.91886_P1 14412 769 80,6 globlastp cleome_gynandra|10v1|SRR015532S000000 8330 LYD497 14413 769 80,6 globlastp 8_P1 8331 LYD497 plantago|11v1|SRR066373X105105P1 14414 769 80,5 globlastp 8332 LYD497 wheat|10v2|E3E412082XX1_P1 14415 769 80,5 globlastp 8333 LYD497 wheat|10v2|E3T008914_P1 14415 769 80,5 globlastp 8334 LYD497 pseudotsuga|10v1|SRR065119S0005084_P1 14416 769 80,4 globlastp 8335 LYD497 barley|10v2|E3E413088_P1 14417 769 80,3 globlastp 8336 LYD497 ambrosia|11v1|SRR346935.150833_T1 14418 769 80,2 glotblastn 8337 LYD497 cirsium|11v1|SRR346952,1046865_P1 14419 769 80,2 globlastp 8338 LYD497 onion|gb162|CF439090_T1 14420 769 80,1 glotblastn 8339 LYD497 triphysaria|10v1|P3M356522_P1 14421 769 80,1 globlastp 8340 LYD497 momordica|10v1|EC612074_P1 14422 769 80,0 globlastp 8341 LYD501 arabidopsis_lyrata|09v1|JGIAL000625_P1 14423 770 85,8 globlastp 8342 LYD501 arabidopsis|10v1|AT1G06700_P1 14424 770 85,8 globlastp thellungiella_halophilum|11v1|EHJG111008 8343 LYD501 14425 770 84,3 globlastp 939_P1 8344 LYD501 thellungiella_parvulum|11v1|DN774235_P1 14426 770 84,1 globlastp 8345 LYD501 canola|11v1|SRR019556,16525_P1 14427 770 83,2 globlastp 8346 LYD501 b_rapa|gb162|DQ006921_P1 14428 770 82,9 globlastp 8347 LYD501 canola|11v1|CN730195_P1 14429 770 82,4 globlastp 8348 LYD501 canola|11v1|PE434918_P1 14430 770 82,2 globlastp 8349 LYD501 apple|11v1|CN494165_P1 14431 770 81,9 globlastp 8350 LYD501 canola|11v1|ES963949_P1 14432 770 81,5 globlastp

315 / 378 Hom Polin. Polip. para % SEQ Hom para Nome do Agrupamento SEQ ID SEQ iden. Algor. ID Nome do Gene NO: ID glob. NO: NO: 8351 LYD501 canola|10v1|DY012432 14432 770 81,5 globlastp 8352 LYD501 apple|gb171|CO756295 14433 770 81,4 globlastp 8353 LYD501 medicago|09v1|AW698435_P1 14434 770 80,5 globlastp 8354 LYD501 soybean|11v1|GLYMA20038980 14435 770 80,4 globlastp 8355 LYD501 cowpea|gb166|FF394501_P1 14436 770 80,3 globlastp 8356 LYD501 soybean|11v1|GLYMA10044210 14437 770 80,3 globlastp 8357 LYD501 strawberry|11v1|C0817130 14438 770 80,3 globlastp 8358 LYD501 bean|gb167|CA898779_P1 14439 770 80,0 globlastp 8359 LYD501 lotus|09v1|LAW720407_P1 14440 770 80,0 globlastp 8360 LYD502 cacao|10v1|CU494553_P1 14441 771 93,4 globlastp 8361 LYD502 cassava|09v1|CK645954_P1 14442 771 89,7 globlastp 8362 LYD502 cassava|09v1|JGICASSAVA3004M1_P1 14443 771 89,7 globlastp 8363 LYD502 beech|gb170|AM231807_P1 14444 771 88,8 globlastp 8364 LYD502 cotton|10v2|DW227150_P1 14445 771 87,7 globlastp 8365 LYD502 cotton|10v2|SRRP032367S0000521_P1 14445 771 87,7 globlastp 8366 LYD502 nasturtium|10v1|SRR032558S0166768 14446 771 87,7 globlastp 8367 LYD502 sarracenia|11v1|SRR192669,107015_P1 14447 771 86,0 globlastp 8368 LYD502 poplar|10v1|A1163956_P1 14448 771 86,0 globlastp 8369 LYD502 chestnut|gb170|SRR006295S0000431_P1 14449 771 85,3 globlastp 8370 LYD502 oak|10v1|FP033074_P1 14449 771 85,3 globlastp 8371 LYD502 cowpea|gb166|FF387500_P1 14450 771 84,1 globlastp 8372 LYD502 lotus|09v1|G0031558_P1 14451 771 84,1 globlastp 8373 LYD502 nasturtium|10v1|SRR032558S0032412 14452 771 84,0 globlastp 8374 LYD502 strawberry|11v1|DV438041 14453 771 84,0 globlastp 8375 LYD502 grape|11v1|GSVIVT01020366001_T1 14454 771 83,0 glotblastn 8376 LYD502 peanut|10v1|ES720111_P1 14455 771 82,6 globlastp 8377 LYD502 bean|gb167|CA910369_P1 14456 771 82,2 globlastp 8378 LYD502 apple|11v1|CN494841_P1 14457 771 82,1 globlastp 8379 LYD502 apple|gb171|CN494841 14457 771 82,1 globlastp 8380 LYD502 rose|10v1|BQ104024 14458 771 81,5 globlastp 8381 LYD502 pigeonpea|10v1|SRR054580S0088396_T1 14459 771 81,3 glotblastn 8382 LYD502 soybean|11v1|GLYMA18G49400 14460 771 81,3 globlastp 8383 LYD502 kiwi|gb166|FG407436_T1 14461 771 81,1 glotblastn 8384 LYD502 cowpea|gb166|FF388339_P1 14462 771 81,1 globlastp Tabela 54: São providos polinucleotídeos (Polin.) e polipeptídeos (Polip.) que são homólogos aos polinucleotídeos ou polipeptídeos identificados da Tabela 53. Hom. = homólogo; “glob.” = global; “Iden.” = idêntico; Algor. = Algoritmo; EXEMPLO 14

CLONAGEM DE GENE E GERAÇÃO DE VETORES BINÁRIOS PARA EXPRESSÃO DE PLANTA

[00530] Para validar o seu papel na melhora do conteúdo de óleo, rendimento da planta, rendimento de semente, conteúdo de óleo, biomassa, taxa de crescimento, rendimento de fibra, qualidade da fibra, ABST, NUE e/ou vigor, os genes selecionados foram superexpressos em plantas, como segue. Estratégia de Clonagem

[00531] Os genes selecionados daqueles listados nos Exemplos 12 e 13

316 / 378 acima foram clonados em vetores binários para a geração de plantas transgênicas. Para a clonagem, o quadro de leitura aberta de comprimento completo (ORF) foi primeiro identificado. No caso de agrupamentos de ORF- EST e em alguns casos as sequências de mRNA já publicadas foram analisadas para identificar o quadro de leitura aberta inteiro comparando-se os resultados de diversos algoritmos de tradução para as proteínas conhecidas de outra espécie de planta. Para clonar os cDNAs de comprimento completo, a transcrição reversa (RT) seguida pela reação da cadeia da polimerase (PCR; RT-PCR) foi realizada no RNA total extraído de folhas, flores, siliquas ou outros tecidos vegetais, cultivados sob condições normais e diferentemente tratados. O RNA total foi extraído como descrito em “MÉTODOS GERAIS EXPERIMENTAIS E DE BIOINFORMÁTICA” acima. A produção de cDNA e a amplificação pela PCR foi realizada usando protocolos padrão descritos em outro lugar (Sambrook J., E.F. Fritsch e T. Maniatis. 1989. Molecular Cloning. A Laboratory Manual., 2a Ed. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Nova Iorque) que são bem conhecidos por aqueles versados na técnica. Os produtos de PCR são purificados usando o conjunto de purificação pela PCR (Qiagen). No caso onde a sequência codificadora inteira não foi encontrada, o conjunto RACE da Invitrogen (RACE = Amplificação Rápida de Extremidades de cDNA) foi usado para avaliar o transcrito de cDNA completo do gene a partir de amostras de RNA descritas acima. Os produtos RACE foram clonados dentro de vetor de cópia alta seguido pelo sequenciamento ou diretamente sequenciados.

[00532] A informação do procedimento RACE foi usado para a clonagem da ORF de comprimento completo dos genes correspondentes.

[00533] No caso do DNA genômico ser clonado, os genes foram amplificados pela PCR direta no DNA genômico extraído do tecido de folha usando o conjunto DNAeasy (Qiagen Cat. No. 69104).

[00534] Usualmente, 2 conjuntos de iniciadores foram sintetizados

317 / 378 para a amplificação de cada gene a partir de um cDNA ou uma sequência genômica; um conjunto externo de iniciadores e um conjunto interno (iniciadores de PCR abrigados). Quando necessário (por exemplo, quando a primeira reação de PCR não resultar em um produto satisfatório para sequenciamento), um iniciador adicional (ou dois) dos iniciadores de PCR abrigados foi usado.

[00535] Para facilitar a clonagem dos cDNAs/ sequências genômicas, um 8-12 por extensão foi adicionado à 5’ de cada iniciador. A extensão de iniciador inclui um sítio de restrição de endonuclease. Os sítios de restrição foram selecionados usando dois parâmetros: (a). O sítio não existe na sequência de cDNA; e (b). Os sítios de restrição nos iniciadores avançados e reversos são planejados tal que o cDNA digerido é inserido na formação de sentido dentro do vetor binário utilizado para a transformação.

[00536] Cada produto de PCR digerido foi inserido dentro de um vetor de cópia alto pUC19 [New England BioLabs Inc] ou dentro de plasmídeos que se originam deste vetor. Em alguns casos o produto de PCR não digerido foi inserido dentro de pCR-Blunt II-TOPO (Invitrogen).

[00537] O sequenciamento dos produtos de PCR amplificados foi realizado, usando o sequenciador ABI 377 (Amersham Biosciences Inc). Em alguns casos, depois de confirmar as sequências dos genes clonados, o cDNA clonado foi introduzido dentro de um vetor binário pGI modificado contendo o promotor At6669 por intermédio da digestão com endonucleases de restrição apropriadas. Em qualquer caso o inserto foi seguido pela cópia única do terminador NOS (SEQ ID NO: 14481). Os produtos digeridos e o vetor plasmídico linearizado foram ligados usando a enzima T4 DNA ligase (Roche, Suíça).

[00538] Plasmídeos de alta cópia contendo os genes clonados foram digeridos com as endonucleases de restrição (New England BioLabs Inc) de acordo com os sítios designados nos iniciadores e clonados dentro de vetores

318 / 378 binários.

[00539] Diversas sequências de DNA dos genes selecionados foram sintetizadas por um fornecedor comercial GeneArt [Hypertext Transfer Protocol://World Wide Web (dot) geneart (dot) com/]. O DNA sintético foi planejado em silico. Os sítios de enzimas de restrição adequados foram adicionados às sequências clonadas na extremidade 5’ e na extremidade 3’ para permitir a clonagem mais tarde no vetor binário pQFNc a jusante do promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467).

[00540] Vetores binários usados para clonagem: O plasmídeo pPI foi construído inserindo-se uma sequência de sinal poli-(A) sintética, originaria do vetor plasmídico básico pGL3 (Promega, Acc No U47295; em 4658-4811) dentro do sítio de restrição Hind-III do vetor binário pBI101,3 (Clontech, Acc. No. U12640). pGI (pBXYN) é similar ao pPI, mas o gene original na cadeia principal, o gene GUS, é substituído pelo gene GUS-Intron seguido pelo terminador NOS (SEQ ID NO: 14481) (Vancanneyt. G, et al MGG 220, 245- 50, 1990). pGI foi usado no passado para clonar as sequências de polinucleotídeo, inicialmente sob o Controle do promotor 35S [Odell, JT, et al. Nature 313, 810_ 812 (28 de fevereiro de 1985); SEQ ID NO: 14465].

[00541] Os vetores pGI modificados [pQXNc (Figura 8); ou pQFN (Figura 2), pQFNc (Figura 2) ou pQYN 6669 (Figura 1)] são versões modificadas do vetor pGI no qual o cassete é invertido entre as bordas esquerda e direita de modo que o gene e seu promotor correspondente estejam fechados para a borda direita e o gene NPTII esteja fechado para a borda esquerda.

[00542] At6669, a sequência promotora de Arabidopsis thaliana (SEQ ID NO: 14467) foi inserida no vetor binário pGI modificado, a montante para os genes clonados, seguido pela ligação de DNA e extração de plasmídeo binário a partir das colônias de E. coli positivas, como descrito acima.

[00543] As colônias foram analisadas pela PCR usando os iniciadores

319 / 378 abrangendo os insertos que são planejados para transpor o promotor e gene introduzidos. Os plasmídeos positivos foram identificados, isolados e sequenciados.

[00544] Os genes selecionados clonados pelos presentes inventores são providos na Tabela 55 abaixo.

320 / 378

Tabela 55 Genes clonados em plasmídeos de número de cópia alto Polin.

Polip.

Iniciadores usados Nome do Gene Plasmídeo de cópia alta Organismo SEQ ID SEQ ID SEQ ID NOs: NO: NO: LYD289 pUC19c_LYD289 Arabidopsis thalia 14482, 14670, 14482, 14670 259 456 LYD290 pUC19c_LYD290 Arabidopsis thalia 14483, 14671 260 457 LYD291 pUC19c_LYD291 Arabidopsis thalia 14484, 14672 261 458 LYD292 pUC19c_LYD292 Arabidopsis thalia 14485, 14673, 14858, 14955 262 459 LYD293 pUC19c_LYD293 Arabidopsis thalia 14486, 14674, 14859, 14956 263 460 LYD294 pUC19c_LYD294 Arabidopsis thalia 14487, 14675, 14860, 14957 264 461 LYD295 pUC19c_LYD295 Arabidopsis thalia 14488, 14676, 14488, 14676 265 462 LYD296 pUC19c_LYD296 Arabidopsis thalia 14489, 14677, 14861, 14958 266 463 LYD297 pUC19c_LYD297 Arabidopsis thalia 14490, 14678, 14862, 14678 267 703 LYD298 pUC19c_LYD298 Arabidopsis thalia 14491, 14679, 14863, 14959 268 465 LYD299 pMA_LYD299_GA GeneArt 269 466 LYD300 pOA_LYD300_GA GeneArt 270 467 LYD301 pUC19d_LYD301 Arabidopsis thalia 14492, 14680, 14864, 14960 271 468

320 / 378 LYD302 pUC19c_LYD302 Arabidopsis thalia 14493, 14681, 14493, 14961 272 469 LYD303 pUC19c_LYD303 Arabidopsis thalia 14494, 14682, 14865, 14962 273 470 LYD304 pUC19c_LYD304 Arabidopsis thalia 14495, 14683, 14495, 14683 274 471 LYD305 pUC19c_LYD305 Arabidopsis thalia 14496, 14684, 14866, 14963 275 472 LYD306 pUC19c_LYD306 Arabidopsis thalia 14497, 14685 276 704 LYD307 pUC19c_LYD307 Arabidopsis thalia 14498, 14686, 14867, 14964 277 474 LYD308 pUC19c_LYD308 Arabidopsis thalia 14499, 14687, 14868, 14965 278 705 LYD309 pUC19c_LYD309 Arabidopsis thalia 14500, 14688, 14500, 14966 279 476 LYD310 pUC19c_LYD310 Arabidopsis thalia 14501, 14689, 14501, 14689 280 706 LYD311 pUC19c_LYD311 Arabidopsis thalia 14502, 14690, 14502, 14690 281 478 LYD312 pUC19c_LYD312 Arabidopsis thalia 14503, 14691, 14503, 14691 282 479 LYD313 pUC19c_LYD313 Arabidopsis thalia 14504, 14692, 14504, 14692 283 480 LYD315 pUC19c_LYD315 Arabidopsis thalia 14505, 14693, 14869, 14967 284 707 LYD316 pUC19c_LYD316 Arabidopsis thalia 14506, 14694, 14506, 14694 285 482 LYD318 pUC19c_LYD318 Arabidopsis thalia 14507, 14695, 14870, 14968 286 483 LYD319 pUC19c_LYD319 Arabidopsis thalia 14508, 14696, 14871, 14696 287 484

321 / 378 Polin.

Polip.

Iniciadores usados Nome do Gene Plasmídeo de cópia alta Organismo SEQ ID SEQ ID SEQ ID NOs: NO: NO: LYD320 pUC19c_LYD320 Arabidopsis thalia 14509, 14697, 14872, 14969 288 485 LYD321 pUC19c_LYD321 Arabidopsis thalia 14510, 14698, 14873, 14970 289 486 LYD322 pUC19c_LYD322 Arabidopsis thalia 14511, 14699, 14874, 14971 290 487 LYD323 pUC19c_LYD323 Arabidopsis thalia 14512, 14700, 14875, 14972 291 488 LYD324 pUC19c_LYD324 Arabidopsis thalia 14513, 14701 292 489 LYD325 pUC19c_LYD325 Arabidopsis thalia 14514, 14702, 14514, 14702 293 490 LYD326 pUC19c_LYD326 Arabidopsis thalia 14515, 14703 294 491 LYD327 TopoB_LYD327 Arabidopsis thalia 14516, 14704, 14877, 14974 295 492 LYD328 pUC19c_LYD328 Arabidopsis thalia 14517, 14705, 14878, 14975 296 493 LYD329 pUC19c_LYD329 Arabidopsis thalia 14518, 14706, 14879, 14976 297 494 LYD330 pUC19c_LYD330 Arabidopsis thalia 14519, 14707, 14880, 14977 298 495 LYD331 pUC19c_LYD331 Arabidopsis thalia 14520, 14708, 14881, 14978 299 496 LYD332 pUC19c_LYD332 Arabidopsis thalia 14521, 14709, 14882, 14979 300 497 LYD334 pUC19c_LYD334 Arabidopsis thalia 14522, 14710, 14522, 14980 301 498 LYD335 pUC19c_LYD335 Arabidopsis thalia 14523, 14711, 14883, 14981 302 499 LYD337 pUC19c_LYD337 Arabidopsis thalia 14524, 14712 303 500 LYD338 pUC19c_LYD338 Arabidopsis thalia 14525, 14713, 14525, 14982 304 501

321 / 378 LYD339 pUC19c_LYD339 Arabidopsis thalia 14526, 14714, 14884, 14983 305 502 LYD340 pUC19c_LYD340 Arabidopsis thalia 14527, 14715, 14527, 14715 306 503 LYD341 pUC19c_LYD341 Arabidopsis thalia 14528, 14716, 14885, 14984 307 504 LYD342 pUC19c_LYD342 Arabidopsis thalia 14529, 14717, 14886, 14985 308 505 LYD343 pUC19c_LYD343 Arabidopsis thalia 14530, 14718, 14887, 14986 309 506 LYD344 pUC19c_LYD344 Arabidopsis thalia 14531, 14719, 14531, 14719 310 507 LYD346 pUC19c_LYD346 Brassica juncea 14532, 14720, 14532, 14720 311 508 LYD347 pUC19c_LYD347 Brassica juncea 14533, 14721, 14888, 14721 312 708 LYD348 pUC19c_LYD348 Brassica juncea 14534, 14722, 14889, 14987 313 709 LYD349 pUC19c_LYD349 Brassica juncea 14535, 14723, 14535, 14723 314 710 LYD351 pUC19c_LYD351 Brassica juncea 14536, 14724, 14890, 14988 315 711 LYD352 pUC19_LYD352 Brassica juncea 14537, 14725, 14537, 14725 316 712 LYD353 pUC19c_LYD353 Brassica juncea 14538, 14726, 14538, 14726 317 713 LYD354 pUC19_LYD354 Brassica juncea 14539, 14727, 14539, 14727 318 714 LYD355 pUC19c_LYD355 Brassica juncea 14540, 14728, 14540, 14728 319 516 LYD356 pUC19c_LYD356 Brassica juncea 14541, 14729, 14541, 14729 320 715

322 / 378 Polin.

Polip.

Iniciadores usados Nome do Gene Plasmídeo de cópia alta Organismo SEQ ID SEQ ID SEQ ID NOs: NO: NO: LYD357 pUC19c_LYD357 Brassica juncea 14542, 14730, 14891, 14989 321 716 LYD358 pUC19_LYD358 Brassica juncea 14543, 14731, 14892, 14990 322 717 LYD359 pUC19c_LYD359 Brassica juncea 14544, 14732, 14544, 14991 323 718 LYD360 pUC19c_LYD360 Brassica juncea 14545, 14733, 14545, 14733 324 719 LYD361 pUC19c_LYD361 Brassica juncea 14546, 14734, 14546, 14734 325 720 LYD362 pUC19c_LYD362 Brassica juncea 14547, 14735, 14893, 14992 326 523 LYD364 pUC19_LYD364 Brassica juncea 14548, 14736, 14894, 14736 327 721 LYD365 pUC19c_LYD365 Brassica juncea 14549, 14737 328 722 LYD366 pUC19c_LYD366 Brassica juncea 14550, 14738, 14895, 14993 329 723 LYD367 pUC19c_LYD367 Brassica juncea 14551, 14739, 14551, 14739 330 724 LYD368 pUC19c_LYD368 Brassica juncea 14552, 14740, 14552, 14994 331 528 LYD370 pUC19c_LYD370 CEVADA Hordeum vulgare L. 14553, 14741, 14553, 14741 332 725 LYD372 pUC19d_LYD372 CANOLA Brassica napus 14554, 14742, 14896, 14995 333 531 LYD375 pUC19c_LYD375 CANOLA Brassica napus 14555, 14743, 14555, 14996 334 726 LYD376 pUC19c_LYD376 CANOLA Brassica napus 14556, 14744, 14897, 14997 335 533 LYD377 TopoB_LYD377 CANOLA Brassica napus 14557, 14745, 14898, 14998 336 727 LYD378 pUC19c_LYD378 CANOLA Brassica napus 14558, 14746, 14558, 14746 337 728

322 / 378 LYD379 pUC19c_LYD379 CANOLA Brassica napus 14559, 14747 338 729 LYD380 pMK-RQ_LYD380_GA GeneArt 339 537 LYD382 pUC19c_LYD382 ALGODÃO Gossypium barbadense 14560, 14748, 14560, 14748 340 730 LYD383 pQFNc_LYD383 ALGODÃO Gossypium hirsutum 14561, 14749, 14899, 14999 341 731 LYD385 pUC19c_LYD385 ALGODÃO Gossypium barbadense 14562, 14750, 14900, 15000 342 732 LYD386 pUC19c_LYD386 ALGODÃO Gossypium barbadense 14563, 14751, 14901, 15001 343 733 LYD387 pUC19c_LYD387 ALGODÃO Gossypium barbadense 14564, 14752, 14902, 15002 344 734 LYD388 pUC19c_LYD388 ALGODÃO Gossypium barbadense 14565, 14753, 14565, 14753 345 735 LYD390 pUC19c_LYD390 ALGODÃO Gossypium barbadense 14566, 14754 346 736 LYD391 pUC19_LYD391 MILHO Zea mays L. 14567, 14755, 14567, 14755 347 737 LYD392 pUC19c_LYD392 MILHO Zea mays L. 14568, 14756, 14904, 15004 348 738 LYD393 pUC19c_LYD393 MEDICAGO Medicago trancatula 14569, 14757, 14569, 15005 349 739 LYD395 pUC19c_LYD395 MEDICAGO Medicago trancatula 14570, 14758, 14905, 15006 350 549 LYD396 pUC19c_LYD396 MEDICAGO Medicago trancatula 14571, 14759, 14906, 15007 351 740 LYD397 pUC19c_LYD397 MEDICAGO Medicago trancatula 14572, 14760, 14907, 15008 352 741 LYD398 pUC19c_LYD398 MEDICAGO Medicago trancatula 14573, 14761, 14573, 14761 353 742

323 / 378 Polin.

Polip.

Iniciadores usados Nome do Gene Plasmídeo de cópia alta Organismo SEQ ID SEQ ID SEQ ID NOs: NO: NO: LYD399 pUC19c_LYD399 MEDICAGO Medicago trancatula 14574, 14762, 14908, 15009 354 553 LYD401 pUC19c_LYD401 MEDICAGO Medicago trancatula 14575, 14763, 14909, 15010 355 554 LYD402 pUC19c_LYD402 MEDICAGO Medicago trancatula 14576, 14764, 14910, 15011 356 555 LYD403 pUC19c_LYD403 MEDICAGO Medicago trancatula 14577, 14765, 14911, 15012 357 743 LYD404 pUC19c_LYD404 MEDICAGO Medicago trancatula 14578, 14766, 14578, 15013 358 744 LYD405 pUC19c_LYD405 MEDICAGO Medicago trancatula 14579, 14767, 14579, 15014 359 745 LYD407 pMK-RQ_LYD407_GA GeneArt 360 559 LYD408 pUC19c_LYD408 MEDICAGO Medicago trancatula 14580, 14768, 14580, 15015 361 746 LYD409 pUC19c_LYD409 MEDICAGO Medicago trancatula 14581, 14769, 14912, 15016 362 747 LYD410 pUC19c_LYD410 MEDICAGO Medicago trancatula 14582, 14770, 14913, 15017 363 748 LYD413 pUC19d_LYD413 MEDICAGO Medicago trancatula 14583, 14771, 14914, 14771 364 749 LYD414 pUC19c_LYD414 MEDICAGO Medicago trancatula 14584, 14772, 14915, 15018 365 564 LYD415 pUC19c_LYD415 MEDICAGO Medicago trancatula 14585, 14773, 14916, 15019 366 750 LYD416 pUC19c_LYD416 MEDICAGO Medicago trancatula 14586, 14774, 14586, 14774 367 751 LYD417 pUC19c_LYD417 MEDICAGO Medicago trancatula 14587, 14775, 14587, 15020 368 752 LYD418 pUC19c_LYD418 MEDICAGO Medicago trancatula 14588, 14776, 14588, 14776 369 753 LYD419 pUC19c_LYD419 MEDICAGO Medicago trancatula 14589, 14777, 14917, 15021 370 754

323 / 378 LYD420 pUC19c_LYD420 MEDICAGO Medicago trancatula 14590, 14778, 14590, 14778 371 755 LYD422 pUC19c_LYD422 MEDICAGO Medicago trancatula 14591, 14779, 14918, 14779 372 756 LYD423 pUC19c_LYD423 Shorgum bicolor 14592, 14780, 14592, 15022 373 573 LYD424 pUC19c_LYD424 Shorgum bicolor 14593, 14781, 14593, 14781 374 574 LYD425 pUC19c_LYD425 Shorgum bicolor 14594, 14782, 14919, 15023 375 575 LYD427 pMA-RQ_LYD427_GA GeneArt 376 576 LYD428 pUC19c_LYD428 Shorgum bicolor 14595, 14783, 14595, 15024 377 757 LYD431 pMA_LYD431_GA GeneArt 378 578 LYD432 pUC19c_LYD432 Shorgum bicolor 14596, 14784, 14920, 15025 379 579 LYD433 TopoB_LYD433 Shorgum bicolor 14597, 14785, 14597, 14785 380 580 LYD434 pUC19c_LYD434 Shorgum bicolor 14598, 14786, 14598, 14786 381 581 LYD435 pUC19c_LYD435 Shorgum bicolor 14599, 14787 382 582 LYD436 pUC19c_LYD436 Shorgum bicolor 14600, 14788, 14600, 14788 383 758 LYD437 pUC19c_LYD437 SOJA Glycine max 14601, 14789, 14921, 15026 384 584 LYD438 pUC19c_LYD438 SOJA Glycine max 14602, 14790, 14922, 15027 385 585 LYD439 pUC19c_LYD439 SOJA Glycine max 14603, 14791, 14923, 15028 386 586

324 / 378 Polin.

Polip.

Iniciadores usados Nome do Gene Plasmídeo de cópia alta Organismo SEQ ID SEQ ID SEQ ID NOs: NO: NO: LYD440 pUC19c_LYD440 SOJA Glycine max 14604, 14792, 14604, 15029 387 587 LYD441 pUC19c_LYD441 SOJA Glycine max 14605, 14793, 14924, 15030 388 588 LYD442 pUC19c_LYD442 SOJA Glycine max 14606, 14794, 14606, 14794 389 589 LYD443 pMA-RQ_LYD443_GA GeneArt 390 590 LYD445 pUC19d_LYD445 SOJA Glycine max 14607, 14795, 14607, 14795 391 591 LYD446 pUC19c_LYD446p SOJA Glycine max 14608, 14796 392 759 LYD448 pUC19c_LYD448 SOJA Glycine max 14609, 14797, 14609, 15031 393 594 LYD449 pUC19c_LYD449 SOJA Glycine max 14610, 14798, 14610, 15032 394 760 LYD450 pUC19c_LYD450 SOJA Glycine max 14611, 14799, 14925, 15033 395 596 LYD451 pUC19c_LYD451 SOJA Glycine max 14612, 14800, 14612, 14800 396 597 LYD452 pUC19c_LYD452 SOJA Glycine max 14613, 14801, 14613, 14801 397 761 LYD453 pUC19c_LYD453 SOJA Glycine max 14614, 14802, 14926, 15034 398 599 LYD454 pUC19c_LYD454 SOJA Glycine max 14615, 14803, 14615, 14803 399 600 LYD455 pUC19c_LYD455 SOJA Glycine max 14616, 14804, 14616, 15035 400 762 LYD456 TopoB_LYD456 SOJA Glycine max 14617, 14805, 14927, 15036 401 763 LYD458 pUC19c_LYD458 SOJA Glycine max 14618, 14806, 14928, 14806 402 603 LYD459 pUC19c_LYD459 SOJA Glycine max 14619, 14807, 14619, 14807 403 604

324 / 378 LYD460 pUC19c_LYD460 SOJA Glycine max 14620, 14808, 14620, 14808 404 605 LYD461 pUC19c_LYD461 SOJA Glycine max 14621, 14809, 14929, 15037 405 606 LYD462 pUC19c_LYD462 SOJA Glycine max 14622, 14810, 14622, 15038 406 764 LYD465 pUC19c_LYD465 SOJA Glycine max 14623, 14811, 14623, 14811 407 608 LYD466 pUC19c_LYD466 SOJA Glycine max 14624, 14812, 14930, 15039 408 609 LYD467 pMA-RQ_LYD467_GA GeneArt 409 610 LYD468 pMA_LYD468_GA GeneArt 410 611 LYD469 pUC19c_LYD469 SOJA Glycine max 14625, 14813, 14625, 14813 411 612 LYD470 pUC19c_LYD470 SOJA Glycine max 14626, 14814, 14931, 15040 412 765 LYD471 pUC19c_LYD471 SOJA Glycine max 14627, 14815, 14627, 15041 413 614 LYD472 pUC19c_LYD472 SOJA Glycine max 14628, 14816 414 615 LYD473 pUC19c_LYD473 SOJA Glycine max 14629, 14817, 14629, 15043 415 616 LYD474 pUC19c_LYD474 GIRASSOL Helianthus annuus 14630, 14818, 14932, 15044 416 617 LYD475 pUC19c_LYD475 TOMATE Lycopersicum ND 14631, 14819, 14933, 15045 417 618 LYD477 pUC19_LYD477 TOMATE Lycopersicum ND 14632, 14820, 14934, 15046 418 619 LYD478 pUC19c_LYD478 TOMATE Lycopersicum ND 14633, 14821, 14935, 15047 419 620

325 / 378 Polin.

Polip.

Iniciadores usados Nome do Gene Plasmídeo de cópia alta Organismo SEQ ID SEQ ID SEQ ID NOs: NO: NO: LYD479 pUC19c_LYD479 TOMATE Lycopersicum ND 14634, 14822, 14936, 14822 420 621 LYD480 pUC19_LYD480 TOMATE Lycopersicum ND 14635, 14823, 14937, 15048 421 766 LYD481 pUC19c_LYD481 TOMATE Lycopersicum ND 14636, 14824 422 623 LYD482 pUC19c_LYD482 TOMATE Lycopersicum ND 14637, 14825, 14938, 15049 423 624 LYD483 pUC19c_LYD483 TOMATE Lycopersicum ND 14638, 14826, 14638, 14826 424 767 LYD484 pUC19c_LYD484 TOMATE Lycopersicum ND 14639, 14827, 14939, 15050 425 626 LYD487 pUC19c_LYD487 TOMATE Lycopersicum ND 14640, 14828, 14940, 15051 426 768 LYD489 pUC19c_LYD489 TOMATE Lycopersicum ND 14641, 14829, 14941, 15052 427 628 LYD491 pUC19c_LYD491 TOMATE Lycopersicum ND 14642, 14830, 14942, 14830 428 629 LYD492 pUC19c_LYD492 TOMATE Lycopersicum ND 14643, 14831, 14643, 15053 429 630 LYD495 pUC19c_LYD495 TRIGO Triticum aestivum L. 14644, 14832, 14943, 15054 430 631 LYD496 pUC19c_LYD496 Arabidopsis thalia 14669, 14857, 14669, 14857 455 LYD497 pUC19c_LYD497 Brassica juncea 14645, 14833, 14944, 15055 431 769 LYD498 pUC19c_LYD498 Brassica juncea 14646, 14834, 14646, 14834 432 633 LYD499 pUC19c_LYD499 Brassica juncea 14647, 14835, 14647, 14835 433 634 LYD500 pUC19_LYD500 Brassica juncea 14648, 14836, 14648, 14836 434 635 LYD501 pUC19c_LYD501 Brassica juncea 14649, 14837, 14945, 15056 435 770

325 / 378 LYD502 pUC19c_LYD502 ALGODÃO Gossypium barbadense 14650, 14838 436 771 LYD503 pUC19c_LYD503 MILHO Zea mays L. 14651, 14839, 14946, 15057 437 638 LYD504 pUC19c_LYD504 MEDICAGO Medicago trancatula 14652, 14840, 14652, 15058 438 639 LYD505 pUC19c_LYD505 MEDICAGO Medicago trancatula 14653, 14841, 14653, 15059 439 772 LYD506 pUC19c_LYD506 MEDICAGO Medicago trancatula 14654, 14842, 14947, 15060 440 641 LYD507 pUC19c_LYD507 Shorgum bicolor 14655, 14843, 14948, 15061 441 642 LYD508 pUC19d_LYD508 Shorgum bicolor 14656, 14844, 14949, 15062 442 643 LYD509 pUC19c_LYD509 Shorgum bicolor 14657, 14845, 14657, 14845 443 644 LYD510 pUC19c_LYD510 Shorgum bicolor 14658, 14846, 14658, 15063 444 645 LYD511 pUC19c_LYD511 SOJA Glycine max 14659, 14847, 14950, 15064 445 646 LYD512 pUC19c_LYD512 SOJA Glycine max 14660, 14848 446 647 LYD513 pUC19c_LYD513 SOJA Glycine max 14661, 14849 447 648 LYD514 TopoB_LYD514 SOJA Glycine max 14662, 14850, 14951, 15065 448 649 LYD515 pUC19c_LYD515 SOJA Glycine max 14663, 14851, 14952, 15066 449 650 LYD516 pUC19c_LYD516 SOJA Glycine max 14664, 14852, 14953, 15067 450 651 LYD517 pUC19c_LYD517 SOJA Glycine max 14665, 14853 451 652

326 / 378 Polin. Polip. Iniciadores usados Nome do Gene Plasmídeo de cópia alta Organismo SEQ ID SEQ ID SEQ ID NOs: NO: NO: LYD518 pUC19c_LYD518 SOJA Glycine max 14666, 14854, 14666, 14854 452 773 LYD519 pUC19c_LYD519 SOJA Glycine max 14667, 14855, 14954, 15068 453 654 LYD520 pUC19c_LYD520 SOJA Glycine max 14668, 14856 454 774 Tabela 55. “Polin.” — Polinucleotídeo; “Polip.” — polipeptídeo. Para a clonagem de cada gene pelo menos 2 iniciadores foram usados: Avançado (Fwd) ou Reverso (Rev). Em alguns casos, 4 iniciadores foram usados: avançado externo (EF), reverso externo (ER), avançado abrigado (NF) ou reverso abrigado (NR). As sequências dos iniciadores usados para a clonagem dos genes são providos na listagem de sequência.

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327 / 378 EXEMPLO 15

PRODUÇÃO DE PLANTAS ARABIDOPSIS TRANSGÊNICAS EXPRESSANDO OS POLINUCLEOTÍDEOS IDENTIFICADOS DE

ALGUMAS MODALIDADES DA INVENÇÃO Métodos Experimentais

[00545] Produção de células de Agrobacterium tumefaciens abrigando os vetores binários de acordo com algumas modalidades da invenção – Cada um dos vetores binários descritos no Exemplo 14 acima foram usados para transformar células de Agrobacterium. Dois construtos binários adicionais, tendo apenas o At6669 ou o promotor 35S ou nenhum promotor adicional foi usado como Controles negativos.

[00546] Os vetores binários foram introduzidos nas células competentes GV301 ou LB4404 de Agrobacterium tumefaciens (cerca de 109 células/mL) pela eletroporação. A eletroporação foi realizada usando um eletroporador MicroPulser (Biorad), cubetas de 0,2 cm (Biorad) e programa de electroporação EC-2 (Biorad). As células tratadas foram cultivadas em meio líquido LB a 28°C durante 3 horas, depois plaqueado em LB ágar suplementado com gentamicina (50 mg/L; para as cepas de Agrobacterium GV301) ou estreptomicina (300 mg/L; para a cepa de Agrobacterium LB4404) e canamicina (50 mg/L) a 28°C durante 48 horas. As colônias de Abrobacterium, que são desenvolvidas no meio seletivo, foram analisados ainda pela PCR usando os iniciadores planejados para transpor a sequência inserida no plasmídeo. Os produtos de PCR resultantes foram isolados e sequenciados para verificar que as sequências de polinucleotídeo corretas da invenção foram devidamente introduzidas nas células de Agrobacterium. Preparação de plantas arabidopsis para transformação - Arabidopsis thaliana var Columbia (plantas T0) foram transformadas de acordo com o procedimento Floral Dip [Clough SJ, Bent AF. (1998) Floral dip: a simplified method for Agrobacterium-mediated transformation of

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Arabidopsis thaliana.

Plant J. 16(6): 735-43; e Desfeux C, Clough SJ, Bent AF. (2000) Female reproductive tissues are the primary targets of agrobacterium-mediated transformation by the Arabidopsis floral-dip method.

Plant Physiol. 123(3): 895-904] com modificações menores.

Resumidamente, plantas T0 de Arabidopsis thaliana Columbia (Col0) foram semeadas em vasos de 250 ml enchido com mistura de crescimento à base de turva úmida.

Os vasos foram cobertos com folha de alumínio e uma cúpula de plástico, mantidos a 4°C durante 34 dias, depois descobertos e incubados em uma câmara de crescimento a 18-24°C sob ciclos de claro/escuro de 16/8 horas.

As plantas T0 foram prontas para transformação seis dias antes da antese.

Preparação da agrobacterium carreando os vetores binários para transformação em plantas Arabidopsis – Colônias únicas de agrobacterium carreando os vetores binários abrigando os genes de algumas modalidades da invenção foram cultivados em meio LB suplementado com canamicina (50 mg/L) e gentamicina (50 mg/L). As culturas foram incubadas a 28°C durante 48 horas sob agitação vigorosa e centrifugadas a 4000 rpm durante 5 minutos.

Os grânulos compreendendo células de Agrobacterium foram recolocadas em suspensão em um meio de transformação que contém meia concentração (2,15 g/L) de Murashige-Skoog (Duchefa); 0,044 μM de benzilamino purina (Sigma); 112 μg/L de vitaminas B5 Gambourg (Sigma); 5% de sacarose; e 0,2 ml/L de Silwet L-77 (OSI Specialists, CT) em água duplamente destilada, no pH de 5,7. Transformação de plantas arabidopsis com a agrobacterium - A transformação de plantas T0 foi realizada invertendo-se cada planta dentro de uma suspensão de Agrobacterium tal que o tecido de planta acima do solo fosse submergido durante 3 a 5 segundos.

Cada planta T0 inoculada foi imediatamente colocada em uma bandeja plástica, depois coberta com cúpula plástica clara para manter a umidade e foi mantida no escuro na temperatura ambiente durante 18 horas para facilitar a infecção e transformação.

As

329 / 378 plantas transformada (transgênica) foram depois descobertas e transferidas para uma estufa para recuperação e maturação. As plantas To transgênicas foram cultivadas na estufa durante 3 a 5 semanas até que as siliquas estivessem marrom e secas, depois as sementes foram colhidas das plantas e mantidas na temperatura ambiente até a semeadura. Geração de plantas transgênicas T1 e T2 - Para gerar plantas transgênicas T1 e T2 abrigando os genes, as sementes coletadas das plantas T0 transgênicas foram esterilizadas na superfície embebendo-as em etanol a 70% durante 1 minuto, seguido pelo embebimento em 5% de hipoclorito de sódio e 0,05% de triton durante 5 minutos. As sementes esterilizadas na superfície foram cuidadosamente lavadas em água destilada estéril depois colocadas nas placas de cultura contendo meia concentração de Murashig-Skoog (Duchefa); 2% de sacarose; 0,8% de ágar vegetal; 50 mM de canamicina; e 200 mM de carbenicilina (Duchefa). As placas de cultura foram incubadas a 4°C durante 48 horas depois transferidas para uma sala de crescimento a 25°C durante uma semana adicional de incubação. As plantas de Arabidopsis Vital T1 foram transferidas para uma das placas de cultura fresca para mais uma semana de incubação. A seguir da incubação as plantas T1 foram removidas das placas de cultura e plantadas em mistura de crescimento contida em vasos de 250 ml. As plantas transgênicas foram deixadas crescer em uma estufa até a maturidade. As sementes colhidas a partir das plantas T1 foram cultivadas e desenvolvidas até a maturidade como plantas T2 sob as mesmas condições como usadas para cultivar e desenvolver as plantas T1. EXEMPLO 16

AVALIAÇÃO DE ARABIDOPSIS TRANSGÊNICA QUANTO AO RENDIMENTO DE SEMENTE E TAXA DE CRESCIMENTO DE

PLANTA SOB CONDIÇÕES NORMAIS DE ENSAIOS EM ESTUFA (Ensaios GH —SM) Ensaio 1: Rendimento de semente, biomassa de planta e taxa

330 / 378 de crescimento de planta sob condições normais de estufa – Este ensaio segue a produção de rendimento de semente, a formação de biomassa e o crescimento da área da roseta das plantas cultivadas na estufa em condições de cultivo não limitantes de nitrogênio. As sementes de Arabidopsis transgênica foram semeadas em meio de ágar suplementado com ½ meio de MS e um agente de seleção (Canamicina). As mudas T2 transgênicas foram depois transplantadas para bandejas 1.7 cheias com turfa e perlita em uma razão 1:1. As bandejas foram irrigadas com uma solução contendo 6 mM de nitrogênio inorgânico na forma de KNO3 com 1 mM de KH2PO4, 1 mM de MgSO4, 2 mM de CaCl2 e microelementos. Todas as plantas foram cultivadas na estufa até sementes maduras. As sementes foram colhidas, extraídas e pesadas. A biomassa de planta remanescente (o tecido acima do solo) também foi colhido e pesado imediatamente ou a seguir da secagem em estufa a 50°C durante 24 horas. Cada construto foi validado na sua geração T2. As plantas transgênicas transformadas com um construto conformado por um vetor vazio carreando o promotor At6669 e o marcador selecionável foram usadas como Controle.

[00547] As plantas foram analisadas quanto ao seu tamanho global, taxa de crescimento, florescimento, rendimento de semente, peso de 1.000 sementes, matéria seca e índice de colheita (HI - rendimento de semente/matéria seca). O desempenho de plantas transgênicas foi comparado com o crescimento de plantas de Controle em paralelo sob as mesmas condições. As plantas transgênicas simuladas expressando o gene repórter uidA (GUSIntron) ou absolutamente sem nenhum gene, sob os mesmos promotores que foram usados como Controle.

[00548] O experimento foi planejado na distribuição de canteiro randomizado abrigado. Para cada gene da invenção três a cinco eventos de transformação independentes foram analisados a partir de cada construto. Imageamento digital – Um sistema de aquisição de imagem

331 / 378 de laboratório, que consiste de uma câmera reflexiva digital (Canon EOS 300D) acoplada com uma lente de comprimento focal de (Série Canon EF-S), montada em um dispositivo de reprodução (Kaiser RS), que inclui 4 unidades de luz (4 lâmpadas claras x 150 Watts) foi usado para capturar imagens das amostras de planta.

[00549] O processo de captura de imagem foi repetido a cada 2 dias começando no dia 1 depois do transplante até o dia 15. A mesma câmera, colocada em um suporte de ferro personalizado, foi usada para capturar imagens de plantas maiores semeadas em baldes brancos em uma estufa ambientalmente controlada. Os baldes que são quadrados no formato incluem bandejas de 1,7 litros. Durante o processo de captura, os baldes foram colocados em baixo da montagem de ferro, evitando a luz solar direta e a projeção de sombras.

[00550] Um sistema de análise de imagem foi usado, que consiste de um computador de mesa pessoal (processador Intel P4 3,0 GHz) e um programa de domínio público - Imagem J 1.39 [programa de processamento de imagem com base em Java que foi desenvolvido no U.S. National Institutes of Health e gratuitamente disponível na internet no Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://rsbweb (dot) nih (dot) gov/]. As imagens foram capturadas na resolução de 10 Mega Pixels (3888 x 2592 pixels) e armazenadas em um formato JPEG de baixa compressão (padrão Joint Photographic Experts Group). Em seguida, os dados analisados foram salvos em arquivos de texto e processados usando o software de análise estatística (SAS institute).

[00551] Análise de folha - Usando a análise digital os dados de folhas foram calculados, incluindo número de folha, área da roseta, diâmetro da roseta e área da lâmina da folha.

[00552] Taxa de crescimento vegetativo: a taxa de crescimento relativa (RGR) do número de folha [fórmula IX (descrita acima)], área da

332 / 378 roseta [fórmula VIII (descrita acima)], cobertura do canteiro (fórmula XIII, abaixo) e índice de colheita [fórmula IV (descrita acima)] foi calculada com as fórmulas indicadas. Fórmula XIII Taxa de crescimento relativa da cobertura do canteiro = Coeficiente de regressão de cobertura do canteiro ao longo do curso de tempo.

[00553] Peso médio de sementes – No final do experimento todas as sementes foram coletadas. As sementes foram espalhadas sobre uma bandeja de vidro e uma foto foi tirada. Usando a análise digital, o número de sementes em cada amostra foi calculado.

[00554] Peso seco e rendimento de semente - Em cerca de 80 dias da semeadura, as plantas foram colhidas e deixadas secar a 30°C em uma câmara de secagem. A biomassa e o peso de semente de cada canteiro foram medidos e divididos pelo número de plantas em cada canteiro. Peso seco = peso total da porção vegetativa acima do solo (excluindo as raízes) depois de secar a 30°C em uma câmara de secagem; Rendimento de semente por planta = peso total de semente por planta (g). Peso de 1000 sementes (o peso de 1000 sementes) (g).

[00555] O índice de colheita (HI) foi calculado usando a Fórmula IV como descrita acima.

[00556] Porcentagem de óleo nas sementes – No final do experimento todas as sementes de cada canteiro foram coletadas. As sementes de 3 canteiros foram misturadas moídas e depois montadas na câmara de extração. 210 ml de n-Hexano (Cat No. 080951 Biolab Ltd.) foram usados como o solvente. A extração foi realizada durante 30 horas em aquecimento médio de 50°C. Uma vez que a extração terminou o n-Hexano foi evaporado usando o evaporador a 35°C e condições de vácuo. O processo foi repetido duas vezes. A informação obtida a partir do extrator Soxhlet (Soxhlet, F. Die gewichtsanalytische Bestimmung des Milchfettes, Politechnisches J.

333 / 378 (Dingler’s) 1879, 232, 461) foi usado para criar uma curva de calibração para a RMN de Baixa Ressonância. O conteúdo de óleo de todas as amostras de semente foi determinada usando a RMN de Baixa Ressonância (MARAN Ultra - Oxford Instrument) e seu pacote de software MultiQuant.

[00557] Análise do comprimento da siliqua - No dia 50 a partir da semeadura, 30 siliquas de plantas diferentes em cada canteiro foram amostradas no bloco A. As siliquas escolhidas foram amarelo-esverdeadas na cor e foram coletadas das partes mais baixas de uma haste da planta em desenvolvimento. Uma fotografia digital foi tirada para determinar o comprimento da siliqua.

[00558] Análises estatísticas - Para identificar genes e construtos com desempenho superior, os resultados dos eventos de transformação independentes testados foram analisados separadamente. Os dados foram analisados usando o teste t de Student e os resultados são considerados significantes se o valor p foi menor do que 0,1. O pacote de software JMP statistics foi usado (Versão 5.2.1, SAS Institute Inc., Cary, NC, USA).

[00559] As Tabelas 56 a 60 resumem os fenótipos observados de plantas transgênicas exogenamente expressando os construtos de gene usando os ensaios de maturação de semente (GH-SM) sob condições normais. A avaliação de cada gene foi realizada testando-se o desempenho de números de evento diferentes. Evento com valor p <0,1 foi considerado estatisticamente significante. Tabela 56 Genes mostrando desempenho de planta melhorado nas condições normais de cultivo sob regulagem do promotor At6669 Emergência de Peso Seco [mg] Florescimento Nome do Inflorescência Evento # Gene P- % P- % P- % Ave. Ave. Ave. Val. Incr. Val. Incr. Val Incr. LYD513 67217.3 - - - 38,5 0,02 -3 32,1 0,28 -1 LYD512 67209.1 - - - 38,6 0,13 -2 32,0 0,15 -1 LYD512 67209.4 - - - - - - 32,1 0,28 -1 LYD512 67211.1 - - - - - - 32,1 0,28 -1 LYD512 67212.2 - - - - - - 32,1 0,28 -1

334 / 378 Emergência de Peso Seco [mg] Florescimento Nome do Inflorescência Evento # Gene P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val.

Incr.

Val Incr.

LYD482 67334.1 - - - - - - 32,1 0,28 -1 LYD482 67334.3 - - - - - - 32,0 0,15 -1 LYD475 67202.3 - - - 38,8 0,07 -2 - - - LYD475 67204.4 - - - 38,0 0,02 -4 32,0 0,15 -1 LYD472 67332.1 - - - 37,6 L -5 32,0 0,15 -1 LYD472 67332.3 - - - 38,7 0,04 -2 32,0 0,15 -1 LYD472 67332.4 - - - 38,0 0,02 -4 32,0 0,15 -1 LYD466 67119.4 - - - - - - 32,1 0,28 -1 LYD466 67121.1 - - - 37,5 L -5 32,0 0,15 -1 LYD466 67121.3 - - - - - - 32,1 0,28 -1 LYD452 67106.2 - - - - - - 32,0 0,15 -1 LYD451 67187.7 - - - - - - 32,1 0,28 -1 LYD451 67188.1 - - - 38,9 0,11 -1 32,1 0,28 -1 LYD451 67188.4 - - - 38,3 0,26 -3 - - - LYD445 67353.1 - - - - - - 32,0 0,15 -1 LYD445 67353.2 - - - 38,5 0,02 -3 32,0 0,15 -1 LYD439 67095.6 - - - 39,0 0,20 -1 32,1 0,28 -1 LYD415 67264.5 - - - 38,8 0,07 -2 - - - LYD415 67266.1 - - - 39,0 0,20 -1 32,1 0,28 -1 LYD382 67175.2 - - - - - - 32,1 0,28 -1 LYD382 67176.3 - - - - - - 32,0 0,15 -1 LYD339 67246.3 - - - - - - 32,0 0,15 -1 LYD339 67247.6 - - - - - - 32,0 0,15 -1 LYD324 67167.1 - - - 38,7 0,08 -2 32,0 0,15 -1 LYD321 67280.1 - - - - - - 32,1 0,28 -1 LYD321 67283.1 - - - - - - 32,1 0,28 -1 LYD321 67283.4 - - - 38,0 0,02 -4 32,0 0,15 -1 LYD302 67413.1 - - - - - - 32,1 0,28 -1 LYD302 67414.2 - - - - - - 32,1 0,28 -1 LYD302 67416.3 - - - 38,7 0,04 -2 32,0 0,15 -1 LYD296 67358.6 - - - 38,8 0,08 -2 32,1 0,28 -1 LYD296 67360.1 - - - 38,7 0,09 -2 - - - LYD290 67233.1 - - - 39,0 0,20 -1 32,1 0,28 -1 LYD290 67233.5 - - - 38,6 0,03 -2 - - - CONT. - - - - 39,5 - - 32,3 - - LYD517 67222.1 - - - 37,5 0,05 -3 32,0 0,23 -1 LYD515 67151.1 - - - 37,1 0,18 -4 32,0 0,23 -1 LYD50 67341.5 - - - 37,5 0,05 -3 32,0 0,23 -1 YD502 67342.2 - - - - - - 32,0 0,23 -1 LYD498 67252.3 - - - - - - 32,0 0,23 -1 LYD492 67364.1 - - - - - - 32,0 0,23 -1 LYD492 67366.3 - - - 37,1 0,06 -4 LYD474 67199.1 - - - 37,7 0,10 -2 32,0 0,23 -1 LYD454 67192.5 - - - 37,6 0,07 -3 - - - LYD450 67178.4 - - - 37,6 0,07 -3 - - - LYD450 67182.2 - - - 37,6 0,07 -3 32,0 0,23 -1 LYD397 67322.1 - - - 37,6 0,07 -3 32,0 0,23 -1 LYD397 67324.2 - - - 37,1 0,06 -4 32,0 0,23 -1 LYD328 67238.2 - - - 37,1 0,06 -4 32,0 0,23 -1 LYD323 67286.4 - - - - - - 32,0 0,23 -1 LYD323 67287.1 - - - 37,0 0,12 -4 32,0 0,23 -1 LYD323 67287.3 - - - 36,8 0,01 -5 32,0 0,23 -1 LYD312 67256.4 - - - 37,5 0,05 -3 32,0 0,23 -1 LYD312 67256.5 - - - 37,6 0,07 -3 32,0 0,23 -1 LYD312 67257.1 - - - 37,9 0,29 -2 32,0 0,23 -1

335 / 378 Emergência de Peso Seco [mg] Florescimento Nome do Inflorescência Evento # Gene P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val.

Incr.

Val Incr.

LYD312 67257.3 - - - 37,5 0,05 -3 32,0 0,23 -1 LYD310 67160.2 - - - 38,0 0,29 -1 32,0 0,23 -1 LYD301 67347.1 - - - 37,9 0,29 -2 32,0 0,23 -1 LYD301 67347.2 - - - 37,1 0,06 -4 32,0 0,23 -1 LYD298 66962.3 - - - 37,9 0,29 -2 32,0 0,23 -1 LYD298 66964.4 - - - 37,5 0,05 -3 32,0 0,23 -1 LYD298 66966.1 - - - 37,6 0,07 -3 - - - LYD291 67402.2 - - - - - - 32,0 0,23 -1 CONT. - - - - 38,6 - - 32,4 - - LYD508 67823.2 1170,6 0,04 9 - - - - - - LYD508 67824.3 1310,0 0,22 22 37,9 0,08 -4 31,8 0,13 -2 LYD495 67731.2 1120,0 0,26 5 - - - - - - LYD495 67732.5 1178,1 0,23 10 - - - - - - LYD491 67874.3 1120,0 0,26 5 - - - - - - LYD491 67874.6 1187,5 0,03 11 - - - - - - LYD489 67784.4 1118,8 0,29 4 - - - - - - LYD479 67727.4 1198,8 0,02 12 - - - - - - LYD433 67702.4 1228,8 L 15 - - - - - - LYD428 67472.2 - - - 38,5 0,22 -3 32,0 0,20 -1 LYD428 67473.3 1204,4 0,17 12 37,6 0,14 -5 31,6 0,22 -3 LYD305 67533.1 1353,1 L 26 - - - - - - CONT. - 1071,0 - - 39,6 - - 32,5 - - LYD484 67133.3 - - - - - - 27,8 0,03 -4 LYD484 67135.3 - - - 34,8 0,08 -2 27,8 0,02 -4 LYD470 67125.4 - - - 34,5 0,02 -3 27,9 0,02 -4 LYD470 67126.7 - - - 33,8 0,28 -5 27,0 0,27 -7 LYD459 67112.1 - - - - - - 27,4 0,24 -6 LYD414 67091.1 - - - 33,8 0,28 -5 LYD414 67091.2 - - - 33,7 0,16 -5 28,3 0,19 -2 LYD387 67316.1 - - - 34,7 0,17 -2 LYD387 67317.1 - - - - - - 28,0 0,03 -3 LYD387 67317.4 - - - - - - 27,9 0,03 -4 LYD386 67860.3 - - - - - - 28,1 0,04 -3 LYD347 67848.2 - - - 34,5 0,02 -3 27,2 0,13 -6 LYD341 67055.2 - - - 34,8 0,08 -2 27,3 0,20 -6 LYD338 67442.3 - - - 33,9 0,26 -4 28,0 0,03 -3 LYD338 67443.1 - - - 34,7 0,17 -2 - - - LYD337 66994.3 - - - 34,3 L -3 - - - LYD337 66995.4 - - - 33,8 0,28 -5 27,3 0,20 -6 LYD322 66884.2 - - - 33,8 0,28 -5 27,5 0,13 -5 LYD322 66886.6 - - - 34,5 0,02 -3 - - - LYD322 66887.1 - - - 33,1 L -7 - - - LYD307 66977.3 - - - - - - 27,4 0,24 -6 CONT. - - - - 35,5 - - 29,0 - - LYD496 67737.2 - - - 31,5 0,18 -2 LYD496 67739.1 - - - 37,1 0,11 -3 LYD496 67741.6 - - - - - - 31,2 0,06 -2 LYD410 67546.3 1274,9 0,18 12 - - - 31,1 0,04 -3 LYD409 67468.2 1203,1 0,05 6 - - - - - - LYD405 67696.2 - - - - - - 31,6 0,28 -1 137 LYD403 67769.4 L 21 - - - - - - 5,0 LYD403 67771.1 - - - - - - 31,4 0,18 -2 LYD402 67760.2 1203,1 0,14 6 37,1 0,29 -3 - - - LYD379 67677.1 1 181,9 0,14 4 - - - - - -

336 / 378 Emergência de Peso Seco [mg] Florescimento Nome do Inflorescência Evento # Gene P- % P- % P- % Ave. Ave. Ave. Val. Incr. Val. Incr. Val Incr. LYD379 67678.1 - - - - - - 31,5 0,18 -2 LYD372 67673.4 1281,2 0,23 13 37,1 0,11 -3 31,2 0,06 -2 LYD366 67812.5 1192,5 0,08 5 - - - - - - 117 LYD362 67538.2 0,20 3 5,0 LYD362 67543.5 - - - 36,7 0,02 -4 31,3 0,21 -2 1180, LYD355 67641.2 0,15 4 - - - - - - 0 LYD347 67844.2 1213,8 0,03 7 - - - 31,3 0,21 -2 LYD335 67557.5 - - - 31,5 0,18 -2 CONT. 1135,6 - - 38,1 - - 32,0 - - LYD504 67136.3 - - - 33,0 L -8 26,8 L -8 LYD504 67138.1 - - - 34,7 0,04 -3 27,9 0,02 -5 LYD504 67139.1 - - - - - - 27,6 0,16 -6 LYD504 67140.1 - - - 34,6 0,08 -3 - - - LYD466 67119.4 - - - 34,0 L -5 28,1 L -4 LYD442 67103.1 - - - - - - 28,0 L -4 LYD442 67104.3 - - - 34,7 0,06 -3 28,1 0,01 -4 LYD440 66902.1 - - - - - - 28,4 0,28 -3 LYD440 66903.1 - - - 34,7 0,06 -3 27,8 L -5 LYD425 67454.5 - - - 35,1 0,17 -2 28,1 L -4 LYD408 67304.1 - - - 34,4 0,02 -4 LYD408 67305.6 - - - 34,7 0,11 -3 27,9 L -5 LYD408 67306.2 - - - 34,1 0,01 -5 28,0 L -4 LYD401 67086.3 - - - 34,9 0,09 -2 - - - LYD375 67071.4 - - - 34,9 0,18 -2 - - - LYD375 67073.2 - - - 34,4 0,02 -4 28,0 L -4 LYD342 67062.1 - - - 34,9 0,09 -2 28,4 0,28 -3 LYD329 67277.4 - - - 34,4 0,16 -4 28,0 L -4 LYD320 67040.3 - - - 34,8 0,09 -3 28,4 0,28 -3 LYD318 66980.5 - - - 35,0 0,16 -2 - - - LYD318 66982.1 - - - 34,9 0,19 -2 - - - LYD318 66983.4 - - - 33,4 0,03 -6 27,3 0,18 -7 LYD316 67436.1 - - - 34,7 0,06 -3 - - - LYD316 67439.1 - - - 34,7 0,06 -3 - - - LYD298 66962.3 - - - 35,1 0,17 -2 - - - LYD292 66998.3 - - - 34,5 0,03 -3 27,5 L -6 LYD292 66999.4 - - - 34,4 0,16 -4 28,4 0,25 -3 LYD292 67000.1 - - - 34,4 0,02 -4 28,9 0,28 -1 CONT. - - - - 35,8 - - 29,2 - - Tabela 56. “CONT.”- Controle; “Ave.”- Média; “% Incr.” =% de incremento; “p-val.”- valor p, L- p<0,01. Os transgenes foram sob a regulagem transcricional do novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467). “-” = os resultados ainda estão indisponíveis.

Tabela 57 Genes mostrando desempenho de planta melhorado nas condições normais de cultivo sob a regulagem do promotor At6669 Área da lâmina da folha Número de folha Cobertura do canteiro [cm2] Nome do Evento # P- % P- % P- Gene Ave. Ave. Ave. % Incr. Val. Incr. Val. Incr. Val. LYD499 68152.2 1,1 0,22 7 - - - - - - LYD446 68110.1 1,1 0,14 15 - - - 63,1 0,03 18 LYD443 68163.1 1,1 0,05 15 - - - 62,3 0,14 17

337 / 378 Área da lâmina da folha Número de folha Cobertura do canteiro [cm2] Nome do Evento # P- % P- % P- Gene Ave.

Ave.

Ave. % Incr.

Val.

Incr.

Val.

Incr.

Val.

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Ave.

Ave. % Incr.

Val.

Incr.

Val.

Incr.

Val.

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339 / 378 Área da lâmina da folha Número de folha Cobertura do canteiro [cm2] Nome do Evento # P- % P- % P- Gene Ave.

Ave.

Ave. % Incr.

Val.

Incr.

Val.

Incr.

Val.

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340 / 378 Área da lâmina da folha Número de folha Cobertura do canteiro [cm2] Nome do Evento # P- % P- % P- Gene Ave.

Ave.

Ave. % Incr.

Val.

Incr.

Val.

Incr.

Val.

LYD365 68093.2 1,0 0,07 15 9,2 0,06 3 53,3 0,17 8 LYD359 67946.3 1,0 0,01 10 9,2 0,19 3 51,7 0,29 5 LYD359 67947.2 1,0 0,19 8 - - - - - - LYD359 67949.4 - - - 9,7 0,22 8 - - - LYD351 68126.2 1,0 L 14 - - - 55,8 L 13 LYD351 68129.3 1,0 0,04 7 - - - - - - LYD351 68129.5 1,0 0,26 10 - - - 52,4 0,14 6 LYD306 66971.1 1,0 L 13 - - - 56,4 L 14 LYD299 68115.4 - - - 9,4 0,09 5 - - - LYD299 68115.7 1,1 L 21 - - - 57,4 L 17 CONT. - 0,9 - - 9,0 - - 49,2 - - LYD506 67144.2 1,0 0,02 16 11,4 0,26 6 67,1 0,01 19 LYD506 67146.2 1,1 0,19 18 11,8 0,30 8 70,2 0,10 24 LYD504 67136.2 1,0 0,23 7 11,5 0,30 6 63,0 0,04 12 LYD504 67136.3 1,0 0,04 15 12,2 0,02 12 69,6 L 23 LYD504 67138.1 - - - - - - 62,5 0,16 11 LYD504 67139.1 1,0 0,02 17 11,6 L 7 69,0 0,02 22 LYD504 67140.1 - - - 11,4 0,05 5 61,8 0,13 9 LYD466 67119.4 1,0 0,13 8 - - - 61,0 0,24 8 LYD442 67104.3 1,0 0,14 15 11,4 0,22 5 69,3 0,20 23 LYD440 66902.1 1,0 0,12 12 - - - 66,3 0,08 17 LYD440 66902.2 1,0 0,06 12 11,1 0,20 2 65,6 0,08 16 LYD440 66905.1 - - - 11,1 0,20 2 - - - LYD440 66906.1 1,0 0,06 12 11,3 0,02 4 67,4 L 19 LYD432 67959.2 1,0 0,14 15 11,4 0,26 6 69,2 0,22 22 LYD432 67961.2 1,0 0,07 11 - - - 67,5 L 19 LYD425 67454.3 - - - 11,6 L 7 62,8 0,05 11 LYD425 67454.5 1,0 0,24 11 - - - 64,7 0,15 15 LYD408 67304.1 1,1 0,01 19 11,8 L 8 74,3 L 32 LYD408 67305.6 1,1 L 23 - - - 74,5 0,07 32 LYD408 67306.2 1,0 0,13 9 11,4 0,10 6 63,4 0,09 12 LYD401 67084.2 1,0 0,11 9 - - - 60,9 0,17 8 LYD375 67070.2 1,0 0,26 9 - - - 64,0 0,05 13 LYD375 67073.2 1,1 0,02 19 - - - 65,9 0,03 17 LYD342 67059.4 1,0 0,07 11 - - - 64,0 0,03 13 LYD342 67062.1 1,0 0,01 18 12,0 0,16 11 72,6 L 28 LYD329 67275.1 - - - - - - 59,6 0,26 6 LYD329 67277.4 - - - - - - 65,4 0,04 16 LYD320 67040.2 - - 11,6 L 7 59,7 0,24 6 LYD320 67043.1 1,0 0,20 7 - - - 60,1 0,20 6 LYD318 66980.3 - - - - - - 60,8 0,14 8 LYD318 66980.5 - - - - - - 62,6 0,08 11 LYD318 66982.1 - - - 11,6 L 7 63,8 0,03 13 LYD318 66983.4 1,0 0,03 15 12,3 0,08 14 70,6 L 25 LYD316 67436.1 1,0 0,24 11 11,7 0,05 8 64,7 0,02 14 LYD316 67437.2 1,0 0,05 12 - - - 65,1 0,02 15 LYD316 67439.1 1,0 0,01 17 11,8 0,10 8 69,6 L 23 LYD298 66963.4 - - - 11,8 0,21 8 - - - LYD292 66998.3 1,0 0,01 17 11,6 0,01 7 68,3 L 21 LYD292 66999.2 1,1 0,04 24 11,6 0,13 7 74,8 0,05 32 LYD292 66999.4 1,0 0,16 12 - - - 64,7 0,14 15 LYD292 67000.1 1,1 0,02 21 - - - 75,6 0,01 34 CONT. - 0,9 - - 10,8 - - 56,5 - - LYD362 67543.5 0,75 0,12 10,2 - - - - - - LYD362 67541.3 0,75 0,13 10 - - - - - - LYD362 67538.2 0,74 0,15 9,3 - - - - - -

341 / 378 Área da lâmina da folha Número de folha Cobertura do canteiro [cm2] Nome do Evento # P- % P- % P- Gene Ave. Ave. Ave. % Incr. Val. Incr. Val. Incr. Val. LYD362 67543.3 0,72 0,32 6,3 - - - - - - LYD362 67543.6 0,72 0,34 6,1 - - - - - - LYD366 67810.1 0,74 0,18 8,5 - - - - - - LYD366 67812.5 0,73 0,29 6,8 - - - - - - LYD386 67860.3 0,71 0,47 4,5 - - - - - - LYD386 67856.1 0,71 0,50 4,2 - - - - - - CONT. - 0,68 - - - - - - - - LYD362 67543.5 0,74 0,06 12,3 - - - - - - LYD362 67541.3 0,74 0,06 12,2 - - - - - - LYD362 67538.2 0,74 0,07 12,0 - - - - - - LYD362 67543.3 0,73 0,11 10,6 - - - - - - LYD362 67543.6 0,73 0,11 10,5 - - - - - - LYD366 67810.1 0,72 0,16 9,2 - - - - - - LYD366 67812.5 0,72 0,19 8,4 - - - - - - LYD366 67808.2 0,71 0,27 7,0 - - - - - - LYD366 67812.1 0,70 0,33 6,1 - - - - - - LYD366 67810.4 0,70 0,38 5,6 - - - - - - LYD386 67860.3 0,70 0,39 5,3 - - - - - - LYD386 67856.1 0,69 0,41 5,2 - - - - - - CONT. - 0,66 - - - - - - - - LYD434 67978.2 - - - 9,7 0,22 3,1 - - - LYD434 67977.3 - - - 9,6 0,32 2,1 - - - CONT. - - - - 9,4 - - - - - Tabela 57. “CONT.”_ Controle; “Ave.”_ Média; “% Incr.” =% de incremento; “p-val.”_ valor p, L- p<0,01. Os transgenes foram sob a regulagem transcricional do novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467). “-” = os resultados ainda estão indisponíveis.

Tabela 58 Genes mostrando desempenho de planta melhorado nas condições de normais de cultivo sob a regulagem do promotor At6669 RGR do Número de RGR Da Cobertura do RGR do Diâmetro da Nome do Evento Folha canteiro Roseta Gene # P- % P- % Ave. Ave. Ave. P- Val. % Incr. Val. Incr. Val. Incr. LYD446 68109,4 - - - 8,2 0,23 15 0,5 0,16 9 LYD446 68110,1 - - - 8,4 0,13 18 LYD443 68163,1 - - - 8,3 0,15 16 0,5 0,14 8 LYD443 68164,2 - - - 8,7 0,07 21 0,5 0,13 8 LYD443 68165,3 - - - 8,4 0,11 18 0,5 0,05 11 LYD436 68073,1 - - - - - - 0,5 0,26 7 LYD436 68073,3 - - - 8,7 0,07 22 0,5 0,20 7 LYD436 68075,3 - - - 8,9 0,07 24 0,5 0,09 12 LYD416 67904,3 0,7 0,29 16 - - - - - - LYD416 67907,6 - - - - - - 0,5 0,22 7 LYD391 68160,4 - - - 9,2 0,02 29 0,5 0,01 15 LYD388 68096. 2 - - - 8,5 0,09 19 0,5 0,09 9 LYD388 68098,2 - - - 9,3 0,01 30 0,5 0,02 12 LYD388 68098,3 - - - 0,5 0,18 7 LYD388 68098,4 - - - 8,7 0,08 22 0,5 0,14 9 LYD367 68066,1 - - - 8,1 0,28 14 0,5 0,19 9 LYD367 68066,5 - - - 9,2 0,02 29 0,5 0,02 13 LYD367 68066,6 - - - 8,5 0,15 19 0,5 0,20 8 LYD367 68068,5 - - - 8,4 0,16 17 0,5 0,15 8 LYD364 68018,3 - - - 8,2 0,23 15 0,5 0,10 10

342 / 378 RGR do Número de RGR Da Cobertura do RGR do Diâmetro da Nome do Evento Folha canteiro Roseta Gene # P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

P- Val. % Incr.

Val.

Incr.

Val.

Incr.

LYD364 68018,4 - - - 8,1 0,22 14 0,5 0,12 9 LYD364 68020,5 - - - 9,8 L 37 0,5 0,03 12 LYD364 68022,1 - - - 8,3 0,15 16 - - - LYD360 68061,1 - - - 8,7 0,06 22 0,5 0,02 12 LYD360 68061,2 - - - - - - 0,5 0,26 6 LYD360 68063,2 - - - - - - 0,5 0,24 6 LYD357 68228,1 - - - - - - 0,5 0,13 8 LYD354 68133,4 - - - 8,2 0,22 14 - - - LYD354 68133,6 - - - 8,0 0,29 12 - - - LYD354 68134. 8 - - - 8,2 0,21 15 - - - LYD349 68085,5 - - - 10,3 L 45 0,5 0,02 12 LYD308 66881,2 - - - 8,4 0,12 18 - - - LYD295 67972,2 - - - 8,5 0,11 19 0,5 0,03 12 LYD295 67972,4 - - - 8,2 0,18 15 - - - CONT. - 0,6 - - 7,1 - - 0,5 - - LYD513 67217,3 - - - 6,0 0,05 22 0,4 0,06 10 LYD512 67209,1 - - - 5,6 0,26 13 0,3 0,28 7 LYD512 67209,4 - - - - - - 0,3 0,27 6 LYD482 67334,1 - - - - - - 0,3 0,28 6 LYD475 67204,4 - - - 5,9 0,08 19 0,4 0,04 11 LYD472 67332,1 - - - 6,1 0,04 23 0,4 0,05 11 LYD472 67332,3 - - - - - - 0,3 0,26 7 LYD472 67332,4 - - - 6,1 0,04 23 0,3 0,14 8 LYD466 67121,1 - - - 5,9 0,07 20 0,4 0,06 10 LYD451 67187,7 - - - - - - 0,3 0,19 7 LYD451 67188,1 - - - 5,8 0,13 18 0,4 0,02 14 LYD451 67188,4 - - - 5,8 0,12 17 0,3 0,26 6 LYD445 67353,2 - - - 5,6 0,19 14 0,3 0,26 6 LYD439 67094,1 - - - 5,5 0,26 12 0,3 0,23 8 LYD439 67094,3 - - - 5,8 0,12 18 0,3 0,13 8 LYD439 67095,6 - - - 5,6 0,22 13 - - - LYD415 67266,6 - - - - - - 0,3 0,27 7 LYD382 67174,1 - - - 5,6 0,20 14 - - - LYD382 67175,2 - - - 5,7 0,15 16 - - - LYD382 67176,3 - - - - - - 0,3 0,14 9 LYD324 67167,1 - - - - - - 0,3 0,23 7 LYD321 67280,1 - - - - - - 0,3 0,24 7 LYD321 67283,1 - - - 5,8 0,10 18 0,4 0,09 9 LYD321 67283,3 - - - - - - 0,4 0,08 10 LYD321 67283,4 - - - 6,8 L 37 0,4 L 16 LYD302 67414, 3 - - - 5,6 0,22 13 0,3 0,17 7 LYD302 67416, 3 - - - 5,6 0,20 14 0,4 0,09 9 LYD296 67358,6 - - - 6,1 0,05 23 0,4 0,07 12 LYD296 67359,3 - - - 0,3 0,25 6 LYD296 67360,1 - - - 0,3 0,27 6 CONT. - - - - 4,9 - - 0,3 - - LYD517 67222,1 - - - 4,1 0,30 15 0,3 0,19 11 LYD515 67151,1 - - - 4,2 0,20 18 0,4 0,11 12 LYD515 67151,4 - - - 0,3 0,30 8 LYD515 67152,4 - - - 4,7 0,04 31 0,4 0,05 15 LYD502 67341,5 - - - 4,1 0,30 15 0,3 0,21 9 LYD498 67252,3 - - - 4,2 0,20 18 0,3 0,20 9 LYD498 67254,3 - - - 4,2 0,20 18 0,4 0,07 14 LYD492 67364,5 - - - - - - 0,3 0,28 8 LYD454 67192,5 - - - 4,2 0,19 19 - - -

343 / 378 RGR do Número de RGR Da Cobertura do RGR do Diâmetro da Nome do Evento Folha canteiro Roseta Gene # P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

P- Val. % Incr.

Val.

Incr.

Val.

Incr.

LYD450 67178,3 - - - 4,1 0,29 15 - - - LYD450 67182,2 - - - 4,2 0,18 19 0,3 0,25 9 LYD397 67324,2 - - - 4,6 0,05 29 0,4 0,08 14 LYD323 67286,1 - - - 4,2 0,23 17 0,3 0,20 9 LYD323 67287,3 - - - 4,2 0,22 18 0,3 0,24 9 - - - 4,2 0,28 18 - - - LYD323 67288,2 - - - - - - - - - LYD312 67256,4 - - - 4,6 0,05 30 0,3 0,21 9 LYD312 67256,5 - - - 4,2 0,24 17 - - - LYD301 67347,2 - - - 4,5 0,06 28 0,4 0,01 20 LYD298 66964,4 - - - 4,4 0,08 25 0,4 0,07 13 LYD298 66966,2 - - - 4,1 0,29 15 - - - CONT. - - - - 3,6 - - 0,3 - - LYD508 67824,3 - - - 5,8 0,11 19 - - - LYD479 67727,4 - - - 6,3 0,03 28 0,3 0,10 16 LYD428 67473,3 0,8 0,20 17 6,4 0,02 31 0,3 0,07 17 LYD346 67606,2 - - - 5,6 0,29 14 - - - CONT. - 0,6 - - 4,9 - - 0,3 - - LYD470 67126,7 - - - 8,7 0,15 19 0,4 0,02 12 LYD459 67116,4 - - - - - - 0,4 0,24 6 LYD387 67316,1 - - - - - - 0,4 0,12 9 LYD387 67317,4 0,8 0,25 12 9,3 0,04 26 0,4 L 15 LYD347 67848,2 - - - - - - 0,4 0,15 7 LYD338 67442,3 - - - 9,0 0,09 22 0,4 0,02 12 LYD337 66995,4 - - - - - - 0,4 0,07 10 LYD337 66995,5 - - - - - - 0,4 0,10 8 LYD322 66884,1 - - - - - - 0,4 0,24 6 LYD322 66884,2 - - - 8,4 0,26 14 0,4 0,17 7 LYD322 66886,6 - - - - - - 0,4 0,12 8 LYD322 66887,1 - - - - - - 0,4 0,12 8 LYD307 66975,3 - - - - - - 0,4 0,11 8 LYD307 66975,4 - - - - - - 0,4 0,25 6 LYD307 66976,3 - - - - - - 0,4 0,12 8 LYD307 66977,3 - - - 8,6 0,17 17 0,4 0,06 10 LYD303 67298,1 - - - - - - 0,4 0,20 7 LYD303 67300,6 - - - - - - 0,4 0,19 7 CONT. - 0,7 - - 7,4 - - 0,4 - - LYD410 67546,3 0,8 0,22 14 - - - - - - LYD379 67678,1 - - - 6,1 0,29 12 0,3 0,25 9 CONT. - 0,7 - - 5,5 - - 0,3 - - LYD489 67787,3 0,7 0,14 24 - - - - - - LYD483 68054,4 0,6 0,29 16 - - - - - - LYD471 68050, 2 0,7 0,20 22 - - - - - - LYD456 67964,1 0,7 0,22 21 - - - - - - LYD456 67967,4 0,6 0,24 19 - - - 0,5 0,17 11 LYD423 68218,3 0,7 0,09 26 - - - - - - LYD422 68103,4 - - - 7,3 0,28 13 - - - LYD392 68033,3 - - - 7,7 0,13 19 - - - LYD365 68092,5 0,6 0,24 19 7,7 0,13 19 0,5 0,14 12 LYD359 67949,4 0,7 0,19 22 - - - - - - LYD351 68126,2 - - - 7,4 0,24 14 - - - LYD306 66971,1 - - - 7,4 0,21 15 - - - LYD299 68115,7 - - - 7,6 0,15 18 0,5 0,28 8 CONT. - 0,5 - - 6,5 - - 0,4 - - LYD506 67144,2 0,8 0,25 10 8,3 0,10 22 0,4 0,25 9

344 / 378 RGR do Número de RGR Da Cobertura do RGR do Diâmetro da Nome do Evento Folha canteiro Roseta Gene # P- % P- % Ave. Ave. Ave. P- Val. % Incr. Val. Incr. Val. Incr. LYD506 67146,2 - - - 8,5 0,07 24 - - - LYD504 67136,2 - - - 7,8 0,26 14 - - - LYD504 67136,3 0,8 0,09 16 8,6 0,06 25 0,4 0,17 11 LYD504 67139,1 - - - 8,4 0,08 23 0,4 0,18 11 LYD442 67104, 3 - - - 8,6 0,06 26 - - - LYD440 66902,1 - - - 8,1 0,16 19 LYD440 66902,2 - - - 8,0 0,23 16 0,4 0,26 9 LYD440 66906,1 - - - 8,2 0,15 20 LYD432 67959,2 - - - 8,5 0,08 24 0,4 0,27 9 LYD432 67961,2 - - - 8,3 0,12 21 - - - LYD425 67454,3 0,8 0,22 11 7,8 0,25 14 - - - LYD425 67454,5 - - - 8,0 0,21 16 - - - LYD408 67304,1 0,8 0,21 12 9,1 0,02 33 0,4 0,21 10 LYD408 67305,6 - - - 9,0 0,02 32 - - - LYD401 67086,2 - - - 7,8 0,27 14 - - - LYD375 67070,2 - - - 8,0 0,19 17 - - - LYD375 67073,2 - - - 8,1 0,16 19 - - - LYD342 67059,4 - - - 7,9 0,22 16 - - - LYD342 67062,1 - - - 8,9 0,03 30 - - - LYD329 67277,4 - - - 8,0 0,18 17 - - - LYD320 67040, 2 0,8 0,28 11 - - - - - - LYD318 66980,7 - - - 7,8 0,29 14 - - - LYD318 66982,1 - - - 7,9 0,25 15 - - - LYD318 66983,4 - - - 8,6 0,06 25 - - - LYD316 67436,1 0,8 0,11 15 8,1 0,17 18 - - - LYD316 67437,2 - - - 8,1 0,18 18 0,4 0,29 8 LYD316 67439,1 0,8 0,15 14 8,5 0,07 24 - - - LYD298 66963,4 0,9 0,07 18 7,9 0,28 15 - - - LYD292 66998. 3 - - - 8,4 0,09 22 - - - LYD292 66999,2 - - - 9,2 0,01 34 0,4 0,26 9 LYD292 66999,4 - - - 8,0 0,21 17 - - - LYD292 67000,1 - - - 9,3 0,01 36 0,4 0,27 9 CONT. - 0,7 - - 6,9 - - 0,4 - - Tabela 58. “CONT.”_ Controle; “Ave.”_ Média; “% Incr.” =% de incremento; “p-val.”_ valor p, L- p<0,01. RGR = taxa de crescimento relativa. Os transgenes foram sob a regulagem transcricional do novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467). “-” = os resultados ainda estão indisponíveis.

Tabela 59 Genes mostrando o desempenho de planta melhorado nas condições normais de cultivo sob a regulagem do promotor At6669 Diâmetro da roseta Índice de colheita Área da roseta [cm21 cm] Nome do Gene Evento # P- % P- % P- % Ave. Ave. Ave. Val. Incr. Val Incr. Val Incr. LYD446 68109,4 - - - - - - 5,0 0,26 8 LYD446 68110,1 - - - 7,9 0,03 18 4,9 0,03 6 LYD443 68163,1 - - - 7,8 0,14 17 5,0 0,13 8 LYD443 68164,2 - - - 8,0 0,12 20 5,0 L 7 LYD443 68165,3 - - - 7,9 L 18 5,1 L 9 LYD436 68073,3 - - - 8,0 0,02 21 5,0 L 6 LYD416 67904,3 - - - 7,1 0,03 6 4,7 0,29 1 LYD416 67907,6 - - - - - - 4,7 0,24 1 LYD391 68156,4 - - - 7,2 L 9 4,8 0,12 3

345 / 378 Diâmetro da roseta Índice de colheita Área da roseta [cm21 cm] Nome do Gene Evento # P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val Incr.

Val Incr.

LYD391 68160,4 - - - 8,6 0,09 28 5,3 0,14 13 LYD388 68096,2 - - - 7,9 L 19 5,0 L 8 LYD388 68098,2 - - - 8,6 L 29 5,2 L 12 LYD388 68098,3 - - - 7,2 0,14 9 4,9 0,22 5 LYD388 68098,4 - - - - - - 5,1 0,17 9 LYD367 68066,5 - - - 8,6 0,14 29 5,2 0,07 11 LYD364 68018,4 - - - 7,5 0,03 13 4,9 0,06 5 LYD364 68020,1 - - - 6,9 0,29 3 - - - LYD364 68020,5 - - - 9,1 L 36 5,2 L 12 LYD364 68022,1 - - - 7,8 0,15 17 4,9 0,16 6 LYD361 68147,1 - - - 7,0 0,25 5 - - - LYD360 68061,1 - - - 8,1 0,02 22 5,2 0,03 11 LYD360 68063,2 - - - 7,3 0,26 9 4,8 0,12 3 LYD357 68228,1 - - - 7,2 0,20 8 4,8 L 4 LYD354 68133,4 - - - 7,7 0,11 16 4,9 0,29 5 LYD349 68085,3 - - - - - - 4,7 0,14 2 LYD349 68085,5 - - - 9,6 0,08 44 5,3 0,04 14 LYD308 66881,2 - - - 7,9 0,02 18 4,9 0,02 5 LYD295 67972,2 - - - 7,9 0,17 18 5,0 0,02 8 LYD295 67972,4 - - - 7,7 0,20 16 4,9 0,22 6 CONT. - - - - 6,7 - - 4,7 - - LYD513 67217,3 - - - 6,2 L 22 4,3 0,04 10 LYD512 67209,1 - - - - - - 4,2 0,24 8 LYD482 67334,1 - - - - - - 4,2 0,24 7 LYD482 67335,3 - - - - - - 4,0 0,24 3 LYD482 67336,1 - - - - - - 4,1 0,23 4 LYD475 67202,3 - - - - - - 4,1 0,21 6 LYD475 67204,4 - - - 6,0 L 18 4,2 0,03 9 LYD472 67332,1 - - - 6,2 0,06 23 4,3 0,03 10 LYD472 67332,3 - - - - - - 4,2 0,21 7 LYD472 67332,4 - - - 6,2 L 23 4,4 L 11 LYD466 67121,1 - - - 6,1 L 21 4,3 L 11 LYD452 67106,2 - - - 5,4 0,20 7 - - - LYD451 67187,9 - - - 5,5 0,09 8 - - - LYD451 67188,1 - - - - - - 4,3 0,20 9 LYD451 67188,4 - - - 5,9 0,07 17 4,1 0,12 6 LYD445 67353,1 - - - 5,4 0,27 7 - - - LYD445 67353,2 - - - 5,9 L 16 4,2 0,01 8 LYD445 67354,5 - - - 5,3 0,29 6 - - - LYD439 67094,1 - - - - - - 4,2 0,22 7 LYD439 67094,3 - - - 5,9 0,06 17 4,2 0,03 8 LYD439 67095,2 - - - - - - 4,1 0,16 6 LYD439 67095,6 - - - 5,7 0,02 13 4,2 0,02 6 LYD415 67262,1 - - - 5,6 0,21 11 4,2 L 8 LYD415 67264,5 - - - 5,4 0,13 7 4,0 0,21 3 LYD382 67174,1 - - - 5,7 0,19 13 - - - LYD382 67175,2 - - - 5,9 0,16 17 4,2 0,05 7 LYD382 67176,3 - - - - - - 4,2 0,06 7 LYD339 67247,3 - - - - - - 4,0 0,25 2 LYD324 67167,1 - - - - - - 4,1 0,30 4 LYD321 67283,1 - - - 6,0 0,01 18 4,2 0,07 8 LYD321 67283,3 - - - - - - 4,2 0,13 6 LYD321 67283,4 - - - 6,9 0,04 36 4,6 0,03 19 LYD302 67414,3 - - - 5,8 0,03 14 4,2 L 8 LYD302 67416,3 - - - 5,7 0,02 12 4,2 0,02 7

346 / 378 Diâmetro da roseta Índice de colheita Área da roseta [cm21 cm] Nome do Gene Evento # P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val Incr.

Val Incr.

LYD296 67358,6 - - - 6,3 0,14 24 4,4 0,24 12 LYD296 67359,3 - - - - - - 4,2 0,01 7 LYD296 67360,1 - - - - - - 4,1 0,08 5 CONT. - - - - 5,1 - - 3,9 - - LYD517 67221,3 - - - 3,8 0,14 6 3,6 0,03 7 LYD517 67221,5 - - - - - - 3,4 0,29 3 LYD515 67151,1 - - - 4,2 0,08 17 3,8 0,02 12 LYD515 67151,4 - - - - - - 3,7 0,28 9 LYD515 67151,6 - - - - - - 3,6 0,05 7 LYD515 67152,4 - - - 4,6 L 29 3,8 0,03 14 LYD502 67340,4 - - - 4,0 0,09 13 3,6 0,12 6 LYD502 67341,5 - - - 4,1 0,04 15 3,7 0,02 10 LYD502 67342,6 - - - 3,9 0,02 11 3,5 0,09 5 LYD498 67252,3 - - - 4,2 L 17 3,7 0,01 9 LYD498 67254,1 - - - 3,9 0,06 10 3,5 0,06 6 LYD498 67254,3 - - - 4,1 0,01 16 3,7 L 10 LYD492 67364,5 - - - 3,9 0,20 11 3,6 0,20 7 LYD474 67199,1 - - - 3,9 0,05 9 - - - LYD454 67192,5 - - - 4,2 0,02 18 3,6 0,02 9 LYD450 67178,3 - - - 4,1 0,02 14 3,6 0,07 7 LYD450 67180,2 - - - 4,0 0,27 11 3,6 0,18 7 LYD450 67182,2 - - - 4,2 0,01 18 3,7 0,06 10 LYD428 67472,2 - - - - - - 3,5 0,11 5 LYD397 67322,1 - - - 3,8 0,28 6 - - - LYD397 67324,2 - - - 4,5 0,04 28 3,8 L 14 LYD323 67286,1 - - - 4,1 0,29 16 3,7 0,08 9 LYD323 67287,3 - - - 4,1 L 16 3,6 0,02 7 LYD312 67256,4 - - - 4,6 0,08 30 3,8 0,09 13 LYD312 67256,5 - - - 4,1 L 16 3,6 0,02 7 LYD310 67161,1 - - - 4,0 0,04 12 3,5 0,29 3 LYD310 67164,1 - - - 3,8 0,08 7 3,5 0,22 3 LYD301 67347,2 - - - 4,4 0,01 25 3,8 0,05 14 LYD301 67347,4 - - - 4,0 0,13 12 3,6 0,08 6 LYD298 66964,4 - - - 4,4 0,15 24 3,8 0,01 14 LYD298 66966,2 - - - 4,1 L 15 3,6 0,02 7 CONT. - - - - 3,5 - - 3,4 - - LYD508 67823,1 0,4 0,23 14 - - - - - - LYD508 67823,2 0,4 0,29 7 5,6 0,13 7 4,0 0,23 2 LYD508 67823,4 0,4 0,14 11 - - - - - - LYD508 67824,3 - - - 6,2 0,08 18 4,2 0,11 6 LYD503 67526,2 0,4 0,08 17 - - - - - - LYD503 67529,1 0,4 0,24 7 - - - - - - LYD503 67529,3 0,4 0,27 8 - - - - - - LYD497 67880,3 0,4 0,30 8 - - - - - - LYD497 67883,4 - - - 5,8 0,03 10 4,1 0,08 5 LYD491 67876,2 0,4 0,29 20 - - - - - - LYD489 67787,4 0,4 0,16 9 - - - - - - LYD479 67727,4 - - - 6,7 0,21 28 4,4 L 12 LYD458 67922,2 0,4 0,29 11 - - - - - - LYD435 67707,3 0,4 0,14 9 - - - - - - LYD435 67708,2 0,4 0,03 15 - - - - - - LYD433 67700,1 0,4 0,04 21 - - - - - - LYD433 67704,4 0,4 0,19 9 - - - - - - LYD428 67473,3 0,4 0,07 12 6,8 L 29 4,4 L 12 LYD428 67474,3 0,4 0,08 14 - - - - - -

347 / 378 Diâmetro da roseta Índice de colheita Área da roseta [cm21 cm] Nome do Gene Evento # P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val Incr.

Val Incr.

LYD305 67535,5 0,4 0,29 7 - - - - - - CONT. - 0,4 - - 5,2 - - 3,9 - - LYD484 67135,3 - - - 8,1 0,05 6 4,9 0,20 3 LYD470 67126,7 - - - 9,1 L 20 5,2 0,04 9 LYD470 67127,3 - - - 7,7 0,25 2 4,8 0,20 2 LYD459 67116,4 - - - - - - 4,9 0,02 3 LYD387 67317,4 - - - 9,4 0,06 24 5,4 L 14 LYD338 67442,3 - - - 9,2 0,12 21 5,3 L 11 LYD337 66994,3 - - - 7,8 0,12 4 - - - LYD337 66995,4 - - - - - - 5,0 0,27 5 LYD337 66995,5 - - - 8,2 0,23 8 - - - LYD322 66884,1 - - - - - - 4,9 0,03 3 LYD322 66884,2 - - - 8,6 L 13 5,0 L 5 LYD322 66886,6 - - - - - - 4,9 0,04 4 LYD322 66887,1 - - - 8,3 0,02 9 5,0 0,13 5 LYD307 66975,3 - - - 8,1 0,05 7 4,9 0,02 4 LYD307 66975,4 - - - - - - 4,9 0,11 2 LYD307 66977,3 - - - 8,7 0,13 15 5,1 0,21 8 CONT. - - - - 7,6 - - 4,7 - - LYD453 67484,1 0,4 0,07 12 - - - - - - LYD453 67485,2 0,4 0,07 11 - - - - - - LYD453 67485,5 0,4 0,10 15 - - - - - - LYD410 67546,1 0,4 0,25 6 - - - - - - LYD410 67548,3 0,4 0,08 11 - - - - - - LYD409 67468,2 0,4 0,29 8 - - - - - - LYD409 67469,1 0,4 0,29 5 - - - - - - LYD405 67694,4 0,4 0,12 9 - - - - - - LYD405 67695,2 0,5 L 22 - - - - - - LYD405 67696,2 0,4 0,02 16 - - - - - - LYD405 67697,2 0,4 0,16 7 - - - - - - LYD404 67690,2 0,4 0,18 8 - - - - - - LYD404 67690,4 0,4 0,24 16 - - - - - - LYD403 67770,3 0,4 0,20 7 - - - - - - LYD402 67762,1 0,4 0,19 8 - - - - - - LYD402 67765,3 0,4 0,21 7 - - - - - - LYD396 67754,1 0,4 0,11 17 - - - - - - LYD396 67759,3 0,4 0,04 17 - - - - - - LYD379 67678,1 - - - 6,4 0,13 11 4,2 0,02 5 LYD372 67673,4 - - - - - - 4,1 0,12 3 LYD366 67810,4 0,4 0,19 16 - - - - - - LYD366 67812,1 0,4 0,12 8 - - - - - - LYD362 67538,2 0,4 0,03 13 - - - - - - LYD362 67543,5 0,4 0,29 6 - - - - - - LYD362 67543,6 0,4 0,01 19 - - - - - - LYD355 67641,3 0,4 0,02 15 - - - - - - LYD355 67641,4 0,4 0,11 9 - - - - - - LYD355 67643,3 0,4 0,05 12 - - - - - - LYD348 67851,6 0,4 0,25 6 - - - - - - LYD348 67851,7 0,4 L 18 - - - - - - LYD348 67853,1 0,5 0,08 24 - - - - - - LYD348 67854,3 0,4 0,02 16 - - - - - - LYD347 67844,2 0,4 0,10 9 - - - - - - LYD347 67848,2 0,4 0,10 9 - - - - - - CONT. - 0,4 - - 5,7 - - 4,0 - - LYD489 67785,4 - - - 6,5 0,18 6 - - -

348 / 378 Diâmetro da roseta Índice de colheita Área da roseta [cm21 cm] Nome do Gene Evento # P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val Incr.

Val Incr.

LYD472 67332,4 - - - 6,7 0,18 10 - - - LYD458 67922,1 - - - - - - 4,6 0,27 3 LYD456 67966,3 - - - 6,7 0,06 8 4,7 0,14 4 LYD456 67967,4 - - - 6,4 0,14 5 4,7 0,18 4 LYD422 68103,3 - - - - - - 4,7 0,15 4 LYD417 68045,3 - - - - - - 4,6 0,28 3 LYD392 68032,2 - - - 6,7 0,21 8 4,7 0,09 6 LYD392 68033,3 - - - 7,3 L 18 4,8 0,14 6 LYD365 68092,4 - - - 6,6 0,13 7 4,6 0,26 3 LYD365 68092,5 - - - 7,2 0,22 18 4,9 0,01 9 LYD365 68093,2 - - - 6,7 0,17 8 4,7 0,27 4 LYD359 67946,3 - - - 6,5 0,29 5 - - - LYD351 68126,2 - - - 7,0 L 13 4,7 0,09 5 LYD351 68129,5 - - - 6,5 0,14 6 - - - LYD306 66971,1 - - - 7,0 L 14 4,8 0,06 6 LYD299 68115,7 - - - 7,2 L 17 4,8 0,04 7 CONT. - - - - 6,2 - - 4,5 - - LYD506 67144,2 - - - 8,4 0,01 19 5,1 L 9 LYD506 67146,2 - - - 8,8 0,10 24 5,1 0,28 9 LYD504 67136,2 - - - 7,9 0,04 12 4,9 0,06 5 LYD504 67136,3 - - - 8,7 L 23 5,1 L 10 LYD504 67138,1 - - - 7,8 0,16 11 - - - LYD504 67139,1 - - - 8,6 0,02 22 5,1 0,02 10 LYD504 67140,1 - - - 7,7 0,13 9 4,8 0,27 3 LYD466 67119,4 - - - 7,6 0,24 8 - - - LYD442 67104,3 - - - 8,7 0,20 23 5,1 0,17 9 LYD440 66902,1 - - - 8,3 0,08 17 5,0 0,03 6 LYD440 66902,2 - - - 8,2 0,08 16 5,0 0,04 6 LYD440 66906,1 - - - 8,4 L 19 5,0 0,03 7 LYD432 67959,2 - - - 8,6 0,22 22 5,1 0,22 9 LYD432 67961,2 - - - 8,4 L 19 5,1 0,10 9 LYD425 67454,3 - - - 7,9 0,05 11 4,9 0,07 5 LYD425 67454,5 - - - 8,1 0,15 15 4,9 0,22 5 LYD408 67304,1 - - - 9,3 L 32 5,2 0,01 12 LYD408 67305,6 - - - 9,3 0,07 32 5,3 L 14 LYD408 67306,2 - - - 7,9 0,09 12 - - - LYD401 67084,2 - - - 7,6 0,17 8 4,8 0,27 3 LYD401 67086,2 - - - - - - 4,9 0,19 6 LYD375 67070,2 - - - 8,0 0,05 13 4,9 0,05 5 LYD375 67073,2 - - - 8,2 0,03 17 5,0 0,03 7 LYD342 67059,4 - - - 8,0 0,03 13 4,9 0,05 5 LYD342 67062,1 - - - 9,1 L 28 5,1 L 9 LYD329 67275,1 - - - 7,5 0,26 6 - - - LYD329 67277,4 - - - 8,2 0,04 16 5,0 0,25 7 LYD320 67040,2 - - - 7,5 0,24 6 - - - LYD320 67043,1 - - - 7,5 0,20 6 4,8 0,14 4 LYD318 66980,3 - - - 7,6 0,14 8 4,9 0,12 5 LYD318 66980,5 - - - 7,8 0,08 11 4,8 0,17 4 LYD318 66982,1 - - - 8,0 0,03 13 4,9 0,17 4 LYD318 66983,4 - - - 8,8 L 25 5,1 L 10 LYD316 67436,1 - - - 8,1 0,02 14 4,9 0,19 5 LYD316 67437,2 - - - 8,1 0,02 15 5,0 0,10 8 LYD316 67439,1 - - - 8,7 L 23 5,1 0,02 10 LYD311 67425,1 - - - - - - 4,8 0,27 4 LYD292 66998,3 - - - 8,5 L 21 5,0 0,02 7

349 / 378 Diâmetro da roseta Índice de colheita Área da roseta [cm21 cm] Nome do Gene Evento # P- % P- % P- % Ave. Ave. Ave. Val. Incr. Val Incr. Val Incr. LYD292 66999,2 - - - 9,3 0,05 32 5,3 L 13 LYD292 66999,4 - - - 8,1 0,14 15 - - - LYD292 67000,1 - - - 9,5 0,01 34 5,2 0,04 11 CONT. - - - - 7,1 - - 4,7 - - Tabela 59. “CONT.”_ Controle; “Ave.”_ Média; “% Incr.” =% de incremento; “p-val.” valor p, L- p<0,01. Os transgenes foram sob a regulagem transcricional do novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467). “-” = os resultados ainda estão indisponíveis.

Tabela 60 Genes mostrando o desempenho de planta melhorado nas condições normais de cultivo sob a regulagem do promotor At6669 Peso de 1000 Sementes Nome do Rendimento de semente [mg] Evento # [mg] Gene Ave. P-Val. % Incr. Ave. P-Val % Incr. LYD508 67823,2 459,9 0,08 18 - - - LYD508 67823,4 432,1 0,24 11 - - - LYD508 67824,3 455,4 0,08 17 - - - LYD503 67529,1 430,3 0,25 10 - - - LYD503 67529,3 417,3 0,13 7 - - - LYD497 67883,1 427,1 0,08 9 - - - LYD489 67784,4 413,4 0,18 6 - - - LYD435 67706,1 426,1 0,11 9 - - - LYD435 67708,1 417,9 0,24 7 - - - LYD433 67700,1 487,3 0,01 25 - - - LYD433 67704,4 435,2 0,11 11 - - - LYD428 67473,3 494,4 0,06 27 - - - LYD428 67474,3 444,4 0,20 14 - - - LYD346 67605,4 444,8 0,06 14 - - - CONT. - 390,4 - - - - - LYD453 67485,2 454,1 0,13 7 - - - LYD410 67546,3 454,3 0,06 7 - - - LYD409 67468,2 490,5 0,18 15 - - - LYD405 67695,2 511,4 0,02 20 - - - LYD405 67696,2 534,5 0,28 26 - - - LYD396 67759,5 483,5 L 14 - - - LYD379 67677,1 476,9 0,19 12 - - - LYD366 67812,5 478,3 0,14 12 - - - LYD362 67538,2 499,0 L 17 - - - LYD355 67641,3 470,8 0,08 11 - - - LYD348 67851,7 476,1 0,01 12 - - - LYD348 67853,1 519,8 0,18 22 - - - LYD348 67854,3 472,8 0,29 11 - - - LYD347 67844,2 497,9 L 17 - - - CONT. - 425,5 - - - - - Tabela 60. “CONT.”_ Controle; “Ave.”_Média; “% Incr.” =% incremento; “p-val.” valor p, L- p<0,01. Os transgenes foram sob a regulagem transcricional do novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467). “-” = os resultados ainda estão indisponíveis.

EXEMPLO 17

AVALIAÇÃO DE ARABIDOPSIS TRANSGÊNICA QUANTO AO RENDIMENTO DE SEMENTE E TAXA DE CRESCIMENTO DE

350 / 378

PLANTA SOB CONDIÇÕES NORMAIS EM ENSAIOS DE ESTUFA ATÉ O PENDOAMENTO (ENSAIOS GH-SB) Ensaio 2: Melhora do desempenho de planta medido até o estágio de pendoamento: biomassa de planta e taxa de crescimento de planta sob condições normais de estufa (ensaios GH-SB). Este ensaio segue a formação de biomassa de planta e o desenvolvimento da área da roseta das plantas cultivadas na estufa sob condições normais de cultivo. Sementes de Arabidopsis transgênicas foram semeadas em meio de ágar suplementado com ½ meio MS e um agente de seleção (Canamicina). As mudas transgênicas T2 foram depois transplantadas para 1,7 bandejas cheias com turfa e perlita em uma razão 1:1. As bandejas foram irrigadas com uma solução contendo 6 mM de nitrogênio inorgânico na forma de KNO3 com 1 mM de KH2PO4, 1 mM de MgSO4, 2 mM de CaCl2 e microelementos. Todas as plantas foram cultivadas na estufa até o estágio de pendoamento. A biomassa de planta (o tecido acima do solo) foi pesado diretamente depois da colheita da roseta (peso fresco da planta [FW]). A seguir as plantas foram secadas em uma estufa a 50°C durante 48 horas e pesadas (Peso seco da planta [DW]).

[00560] Cada construto foi validado na sua geração T2. As plantas transgênicas transformadas com um construto conformado por um vetor vazio carreando o promotor 35S e o marcador selecionável foi usado como controle.

[00561] As plantas foram analisadas quanto ao seu tamanho global, taxa de crescimento, peso fresco e matéria seca. O desempenho das plantas transgênicas foi comparado com o das plantas de controle cultivadas em paralelo sob as mesmas condições. As plantas transgênicas simuladas expressando o gene repórter uidA (GUS-Intron) ou absolutamente sem nenhum gene, sob o mesmo promotor foram usadas como controle.

[00562] O experimento foi planejado na distribuição de canteiro aleatória abrigada. Para cada gene da invenção três a cinco eventos de

351 / 378 transformação independentes foram analisados a partir de cada construto.

[00563] Imageamento digital – Um sistema de aquisição de imagem de laboratório, que consiste de uma câmera reflexiva digital (Canon EOS 300D) acoplada com uma lente de comprimento focal de 55 mm (Canon série EF-S), montada sobre um dispositivo de reprodução (Kaiser RS), que inclui 4 unidades de luz (4 lâmpadas claras x 150 Watts) foi usado para capturar imagens das amostras de planta. O processo de captura de imagem foi repetido a cada 2 dias começando a partir do dia 1 depois do transplante até o dia 15. A mesma câmera, colocada em um suporte de ferro personalizado, foi usado para capturar imagens de plantas maiores semeadas em baldes brancos em uma estufa ambientalmente controlada. Os baldes foram quadrados no formato e incluem bandejas de 1,7 litro. Durante o processo de captura, os baldes foram colocados em baixo da montagem de ferro, evitando-se luz solar direta e a projeção de sombras.

[00564] Um sistema de análise de imagem foi usado, que consiste de um computador de mesa pessoal (processador Intel P4 3,0 GHz) e um programa de domínio público - Image J 1.39 [programa de processamento de imagem com base em Java que foi desenvolvido no U.S. National Institutes of Health e gratuitamente disponível na internet no Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://rsbweb (dot) nih (dot) gov/]. As imagens foram capturadas em resolução de 10 Mega Pixels (3888 x 2592 pixels) e armazenadas em um formato JPEG de baixa compressão (padrão Joint Photographic Experts Group). Em seguida, os dados analisados foram salvos em arquivos de texto e processados usando o software de análise estatística JMP (SAS institute).

[00565] Análise de Folha - Usando a análise digital os dados de folhas foram calculados, incluindo número de folha, área da roseta, diâmetro da roseta e área da lâmina da folha.

[00566] Taxa de crescimento vegetativo: a taxa de crescimento relativa

352 / 378 (RGR) do número de folha (Fórmula IX, descrita acima), área da roseta (Fórmula VIII descrita acima) e cobertura do canteiro (Fórmula XIII, descrita acima) foram calculadas usando as fórmulas indicadas.

[00567] Peso Fresco e Seco de Planta - Em torno do dia 80 da semeadura, as plantas foram colhidas e diretamente pesadas para a determinação do peso fresco da planta (FW) e deixadas secar a 50°C em uma câmara de secagem durante cerca de 48 horas antes da pesagem para determinar o peso seco da planta (DW).

[00568] Análise estatística - Para identificar genes e construtos com desempenho superior, os resultados dos eventos de transformação independentes testados foram analisados separadamente. Os dados foram analisados usando o teste t de Student e os resultados são considerados significantes se o valor p foi menor do que 0,1. O pacote de software estatístico JMP foi usado (Versão 5.2.1, SAS Institute Inc., Cary, NC, USA). Resultados Experimentais:

[00569] As Tabelas 61 a 64 resumem os fenótipos observados de plantas transgênicas expressando os construtos de genes usando os Ensaios GH-SB.

[00570] Os genes listados nas Tabelas 61 a 64 melhoraram o desempenho de planta quando cultivados em condições normais. Estes genes produziram plantas maiores com uma área fotossintética maior, biomassa (peso fresco, peso seco, diâmetro da roseta, área da roseta e cobertura do canteiro), taxa de crescimento relativa, área relativa da lâmina e área relativa do pecíolo. Os genes foram clonados sob a regulagem de um promotor constitutivo At6669 (SEQ ID NO: 14467). A avaliação de cada gene foi realizada testando-se o desempenho de números de eventos diferentes. Evento com valor p <0,1 foi considerado estatisticamente significante. Tabela 61 Genes mostrando desempenho de planta melhorado nas condições normais

353 / 378 de cultivo sob a regulagem do promotor At6669 Peso seco [mg] Peso Fresco [mg] Número de folha Nome do Gene Evento # P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val Incr.

Val.

Incr.

LYD511 67774,3 426,2 0,21 7 - - - - - - LYD441 67714,3 - - - - - - 10,2 0,11 3 LYD410 67546,2 431,2 0,23 8 5181,2 0,14 7 - - - LYD410 67546,3 - - - - - - 10,6 0,13 7 LYD396 67754,1 426,2 0,22 7 5081,2 0,25 5 10,6 0,14 7 LYD396 67759,3 453,8 0,26 14 - - - - - - CONT. - 398,3 - - 4845,8 - - 9,9 - - LYD504 67136,2 - - - 5918,8 0,02 8 10,8 0,03 3 LYD504 67140,1 383,1 0,15 6 - - - - - - LYD484 67133,3 - - - 5720,5 0,19 4 - - - LYD478 67272,3 389,4 0,20 8 - - - 10,7 0,13 2 LYD470 67125,4 391,4 0,17 9 - - - - - - LYD470 67126,7 - - - 5968,8 0,25 9 - - - LYD466 67118,1 - - - 5606,2 0,19 2 - - - LYD466 67120,2 377,5 0,17 5 - - - - - - LYD442 67103,1 380,6 0,09 6 - - - - - - LYD440 66903,1 383,1 0,15 6 6168,8 L 13 11,2 0,14 8 LYD438 66899,2 - - - 6087,5 0,23 11 11,1 0,27 6 LYD438 66900,3 379,4 0,28 5 - - - - - - LYD408 67305,6 373,8 0,24 4 - - - - - - LYD395 67080,6 - - - 5843,8 0,01 7 - - - LYD387 67317,1 389,4 0,03 8 - - - - - - LYD387 67317,4 - - - - - - 10,9 0,08 4 LYD385 66891,2 - - - 5762,5 0,04 5 - - - LYD385 66893,1 - - - 5850,0 L 7 - - - LYD375 67070,2 - - - 5818,8 0,10 6 - - - LYD375 67070,3 383,8 0,19 6 5756,2 0,18 5 - - - LYD375 67071,4 - - - 6281,2 0,18 15 - - - LYD342 67063,2 - - - 5937,5 0,11 8 - - - LYD330 67046,2 417,5 L 16 5912,5 0,17 8 11,1 0,27 6 LYD330 67050,2 - - - - - - 11,1 L 6 LYD330 67050,5 - - - - - - 10,7 0,13 2 LYD329 67277,4 373,1 0,29 3 5700,0 0,04 4 - - - LYD325 67015,4 373,1 0,29 3 - - - - - - LYD322 66884,2 - - - 5700,0 0,19 4 - - - LYD320 67043,1 - - - 5706,2 0,28 4 - - - LYD320 67044,2 - - - 5748,8 0,02 5 - - - LYD318 66983,4 409,4 0,04 14 6275,0 0,15 15 - - - LYD315 67004,4 - - - - - - 11,3 0,06 8 LYD315 67005,2 - - - 5656,2 0,25 3 - - - LYD315 67007,4 413,8 0,04 15 5875,0 0,26 7 11,3 0,06 8 LYD298 66962,3 382,0 0,20 6 - - - - - - LYD293 66957,2 - - - 5793,8 L 6 - - - LYD292 66998,3 413,1 0,11 15 6712,5 L 23 - - - LYD292 67000,1 380,6 0,09 6 6362,5 0,10 16 - - - CONT. - 360,6 - - 5474,6 - - 10,5 - - LYD471 68050,2 353,8 0,05 26 4675,0 0,10 25 - - - LYD471 68050,4 - - - 4656,2 0,15 25 9,8 0,10 4 LYD446 68109,4 - - - 4143,8 0,17 11 - - - LYD446 68110,1 - - - 3943,8 0,28 6 9,7 0,30 4 LYD446 68110,3 302,5 0,24 8 4593,8 0,10 23 - - - LYD446 68111,4 - - - - - - 9,8 0,15 4 LYD432 67959,2 - - - 3937,5 0,30 6 - - - LYD432 67960,6 - - - - - - 9,8 0,18 5

354 / 378 Peso seco [mg] Peso Fresco [mg] Número de folha Nome do Gene Evento # P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val Incr.

Val.

Incr.

LYD422 68102,3 - - - 4537,5 0,23 22 9,7 0,16 4 LYD422 68103,3 366,9 0,29 31 4587,5 0,01 23 - - - LYD417 68043,1 315,0 0,09 12 4487,5 0,27 20 - - - LYD417 68043,3 - - - 4065,2 0,17 9 - - - LYD417 68043,5 302,5 0,28 8 - - - - - - LYD385 66891,2 305,0 0,21 9 4306,2 0,04 15 - - - LYD385 66891,3 - - - - - - 9,9 0,07 6 LYD368 67661,1 324,4 0,23 16 4050,0 0,21 9 - - - LYD364 68018,3 - - - 4137,5 0,07 11 - - - LYD364 68020,1 306,9 0,17 9 - - - - - - LYD364 68020,2 - - - - - - 9,8 0,18 5 LYD351 68129,3 - - - 4131,2 0,09 11 - - - LYD344 68123,2 - - - 4400,0 0,08 18 - - - LYD335 67557,5 - - - - - - 9,7 0,16 4 LYD330 67047,8 - - - 4156,2 0,09 11 9,7 0,16 4 LYD315 67004,4 - - - - - - 9,7 0,16 4 LYD315 67007,4 362,5 0,29 29 4312,5 0,24 16 - - - LYD309 67421,4 - - - - - - 9,8 0,18 5 LYD308 66880,2 331,2 0,03 18 4075,0 0,11 9 - - - LYD299 68114,6 - - - - - - 9,6 0,29 3 LYD299 68115,4 - - - 4331,2 0,02 16 - - - LYD299 68115,6 339,4 0,01 21 4056,3 0,28 9 - - - LYD299 68115,7 - - - 4006,2 0,17 7 - - - LYD299 68118,5 347,5 0,24 24 4537,5 L 22 - - - CONT. - 280,6 - - 3731,2 - - 9,4 - - LYD517 67221,3 508,8 0,20 10 7375,0 0,03 8 - - - LYD517 67221,5 493,8 0,09 7 7412,5 0,03 9 - - - LYD517 67222,1 503,1 0,08 9 7550,0 L 11 - - - LYD515 67151,1 517,5 0,05 12 8000,0 0,08 18 - - - LYD515 67151,4 512,5 0,12 11 7343,8 0,12 8 - - - LYD515 67151,6 - - - 7612,5 L 12 - - - LYD512 67209,1 485,0 0,16 5 7556,2 0,24 11 - - - LYD512 67211,4 509,4 0,02 11 7362,5 0,03 8 - - - LYD512 67212,2 501,2 0,04 9 7331,2 0,04 8 - - - LYD502 67342,6 490,0 0,18 6 7381,2 0,03 8 - - - LYD498 67254,3 488,8 0,11 6 7081,2 0,25 4 - - - LYD492 67364,5 512,5 0,15 11 7468,8 0,14 10 - - - LYD482 67334,1 506,9 0,03 10 7637,5 L 12 - - - LYD475 67204,2 - - - 7437,5 0,23 9 - - - LYD475 67204,4 - - - 7681,2 0,26 13 - - - LYD454 67192,5 523,8 0,01 14 7275,0 0,25 7 - - - LYD454 67193,4 - - - 7387,5 0,12 9 - - - LYD452 67106,2 545,0 0,09 18 7637,5 0,11 12 - - - LYD451 67187,7 483,1 0,24 5 7112,5 0,19 5 - - - LYD451 67188,4 534,4 0,04 16 7893,8 0,08 16 10,2 0,07 5 LYD450 67182,2 - - - 7425,0 0,25 9 - - - LYD445 67353,1 - - - 7325,0 0,08 8 - - - LYD439 67094,1 - - - - - - 10,1 0,17 4 LYD439 67096,1 - - - - - - 10,4 0,03 7 LYD415 67262,1 - - - 7781,2 L 14 - - - LYD415 67266,1 - - - 7612,5 0,27 12 - - - LYD415 67266,3 - - - 7681,2 L 13 - - - LYD415 67266,6 500,0 0,04 9 7393,8 0,22 9 - - - LYD399 67448,3 556,2 0,20 21 8118,8 L 19 10,7 0,02 10 LYD397 67322,2 482,5 0,23 5 - - - - - - LYD397 67323,2 - - - 7225,0 0,13 6 - - -

355 / 378 Peso seco [mg] Peso Fresco [mg] Número de folha Nome do Gene Evento # P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val Incr.

Val.

Incr.

LYD339 67247,3 - - - - - - 10,0 0,23 3 LYD328 67238,2 491,9 0,10 7 - - - - - - LYD328 67242,1 512,5 0,30 11 7468,8 0,02 10 - - - LYD324 67168,4 492,5 0,09 7 7143,8 0,15 5 - - - LYD323 67287,3 - - - 7087,5 0,23 4 - - - LYD323 67288,2 - - - 7662,5 0,29 13 - - - LYD321 67280,1 519,4 L 13 7356,2 0,07 8 - - - LYD321 67281,6 498,8 0,05 8 7331,2 0,29 8 - - - LYD321 67283,1 484,4 0,17 5 - - - - - - LYD321 67283,3 508,8 0,10 10 7300,0 0,25 7 - - - LYD316 67437,2 512,5 0,01 11 7412,5 0,07 9 - - - LYD316 67439,1 - - - 7356,2 0,11 8 - - - LYD312 67256,4 518,8 L 13 7868,8 L 16 - - - LYD312 67257,3 511,9 0,01 11 7293,8 0,05 7 - - - LYD310 67163,1 486,9 0,26 6 7343,8 0,04 8 - - - LYD310 67164,1 494,4 0,24 7 - - - 10,1 0,15 4 LYD309 67418,3 518,1 L 12 7737,5 0,02 14 - - - LYD296 67359,1 515,0 0,01 12 7718,8 L 13 10,1 0,17 4 LYD291 67400,2 529,1 0,17 15 7560,7 0,07 11 - - - LYD291 67400,5 - - - 7806,2 0,11 15 - - - LYD290 67233,3 - - - 7187,5 0,21 6 - - - LYD290 67233,5 - - - 7331,2 0,12 8 - - - LYD290 67236,4 - - - 7368,8 0,18 8 - - - CONT. - 460,8 - - 6804,7 - - 9,7 - - LYD489 67785,4 - - - 5331,2 L 10 - - - LYD489 67787,4 - - - 5093,8 0,22 5 - - - LYD458 67922,2 434,4 0,24 6 - - - - - - LYD453 67484,1 436,9 0,07 6 - - - - - - LYD453 67485,1 - - - - - - 10,6 0,20 4 LYD453 67487,2 - - - - - - 11,8 L 15 LYD448 67918,2 - - - 5168,8 0,16 7 10,6 0,15 4 LYD433 67700,1 - - - 5162,5 0,26 7 - - - LYD433 67704,4 - - - - - - 10,9 0,21 7 LYD409 67467,4 - - - 5193,8 0,05 7 - - - LYD409 67468,1 - - - 5300,0 0,30 10 11,4 0,08 12 LYD404 67690,2 - - - 5464,6 0,13 13 - - - LYD403 67768,3 - - - 5087,5 0,16 5 - - - LYD403 67771,1 - - - 5375,0 0,16 11 - - - LYD402 67760,2 451,5 0,02 10 5151,8 0,05 6 - - - LYD402 67762,3 - - - - - - 11,1 0,02 9 LYD402 67765,3 - - - 5168,8 0,06 7 - - - LYD368 67659,1 - - - 5520,5 0,24 14 11,1 0,27 8 LYD368 67659,5 460,6 0,23 12 - - - - - - LYD368 67661,1 - - - 5325,0 0,30 10 - - - LYD355 67640,1 - - - 5106,2 0,20 6 - - - LYD347 67844,2 - - - 5450,0 0,13 13 - - - LYD346 67605,4 - - - 5231,2 0,19 8 - - - CONT. - 411,0 - - 4839,6 - - 10,2 - - LYD483 68054,3 264,4 0,16 13 3631,2 0,12 12 - - - LYD483 68054,4 256,2 0,14 9 3487,5 0,27 8 - - - LYD483 68056,4 265,0 0,06 13 - - - - - - LYD478 67268,1 - - - - - - 9,8 0,02 5 LYD478 67269,2 265,6 0,05 13 3956,2 L 22 - - - LYD478 67270,1 - - - 3637,5 0,16 12 - - - LYD460 67930,1 286,2 L 22 - - - - - - LYD460 67930,3 - - - - - - 10,3 0,04 11

356 / 378 Peso seco [mg] Peso Fresco [mg] Número de folha Nome do Gene Evento # P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val Incr.

Val.

Incr.

LYD423 68216,2 - - - 3600,0 0,23 11 - - - LYD423 68216,3 262,5 0,06 12 3600,0 0,10 11 - - - LYD423 68218,7 - - - 3768,8 0,03 16 - - - LYD395 67077,1 - - - 3806,2 0,14 18 - - - LYD395 67078,1 - - - - - - 9,8 0,14 6 LYD395 67080,6 - - - 3600,0 0,21 11 - - - LYD392 68032,2 257,5 0,11 10 - - - 9,6 0,13 3 LYD392 68033,3 - - - 3525,0 0,28 9 - - - LYD388 68098,3 - - - - - - 9,6 0,13 3 LYD376 68024,2 - - - 3963,4 L 22 - LYD376 68025,1 - - - - - - 9,6 0,06 4 LYD376 68026,2 - - - 3637,5 0,08 12 - - - LYD367 68066,5 270,0 0,18 15 3731,2 0,11 15 - - - LYD367 68066,6 - - - 3550,0 0,18 10 - - - LYD367 68068,5 257,5 0,11 10 - - - - - - LYD365 68092,3 - - - 3556,2 0,23 10 - - - LYD365 68092,4 - - - 3518,8 0,19 9 - - - LYD365 68092,5 - - - 3525,0 0,20 9 - - - LYD361 68145,9 - - - - - - 9,6 0,13 3 LYD361 68146,7 255,0 0,14 9 3668,8 0,07 13 - - - LYD361 68147,1 - - - - - - 9,9 0,20 6 LYD360 68061,2 - - - - - - 9,8 0,14 6 LYD360 68064,1 - - - - - - 9,6 0,13 3 LYD356 68139,2 - - - 3737,5 0,04 15 9,6 0,13 3 LYD356 68140,3 - - - - - - 9,9 0,04 6 LYD354 68133,6 - - - 3712,5 0,09 15 - - - LYD349 68084,1 - - - 3562,5 0,14 10 - - - LYD349 68085,5 - - - - - - 9,5 0,20 2 LYD349 68085,6 - - - - - - 9,6 0,15 4 LYD332 66988,1 321,2 L 37 3981,2 L 23 - - - LYD332 66989,2 286,2 L 22 3700,0 0,05 14 - - - LYD325 67015,4 - - - 3506,2 0,20 8 LYD297 67227,5 - - - - - - 9,8 0,14 6 CONT. - 234,6 - - 3237,5 - - 9,3 - LYD434 67978,2 - - - - - - 9,7 0,22 3,1 LYD434 67977,3 - - - - - - 9,6 0,32 2,1 CONT. - - - - - - - 9,4 - - LYD305 67535,2 440,3 0,19 10 4865,8 0,84 1,2 - - - CONT. - 400,4 - - 4808,2 - - - - - LYD481 67778,1 471,2 0,07 18,3 - - - - - - LYD491 67874,3 428,1 0,45 7,5 - - - - - - LYD435 67709,2 420,0 0,58 5,4 - - - - - - LYD481 67779,4 420,0 0,58 5,4 - - - - - - CONT. - 398,3 - - - - - - - - Tabela 61. “CONT.” - Controle; “Ave.” - Média; “% Incr.” =% de incremento; “p-val.” - valor p, L- p<0,01. Os transgenes foram sob a regulagem transcricional do novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467). “-” = os resultados ainda estão indisponíveis.

357 / 378

Tabela 62 Genes mostrando desempenho de planta melhorado nas condições normais de cultivo sob a regulagem do promotor At6669 Cobertura do canteiro Área da roseta [cm2] Diâmetro da roseta [cm] [cm2] Nome do Evento P_ Gene # P- % P- % Ave.

Val. % Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val.

Incr.

Incr.

LYD479 67728,5 - - - - - - 4,5 0,07 8 LYD396 67754,1 - - - - - - 4,5 0,27 6 CONT. - - - - - - - 4,2 - - LYD504 67136,2 79,9 0,03 16 10,0 0,03 16 5,5 L 10 LYD484 67135,3 - - - - - - 5,2 0,15 4 LYD478 67269,2 79,6 L 15 10,0 L 15 5,5 L 11 LYD478 67272,3 74,9 0,16 8 9,4 0,16 8 - - - LYD470 67126,7 - - - - - - 5,1 0,24 3 LYD470 67127,3 - - - - - - 5,1 0,19 3 LYD440 66903,1 75,7 0,06 9 9,5 0,06 9 5,3 L 7 LYD438 66898,3 - - - - - - 5,2 0,16 4 LYD438 66899,2 82,4 0,21 19 10,3 0,21 19 5,6 0,05 12 LYD438 66900,3 74,5 0,15 8 9,3 0,15 8 5,2 0,18 5 LYD414 67091,1 - - - - - - 5,1 0,25 2 LYD408 67305,6 74,4 0,26 8 9,3 0,26 8 - - - LYD387 67317,4 74,5 0,07 8 9,3 0,07 8 5,3 0,09 7 LYD385 66893,1 - - - - - - 5,2 0,08 4 LYD385 66893,2 - - - - - - 5,2 0,09 5 LYD342 67063,2 - - - - - - 5,2 0,05 4 LYD337 66995,4 - - - - - - 5,1 0,19 3 LYD332 66988,2 74,4 0,20 7 9,3 0,20 7 5,4 0,06 7 LYD330 67046,2 83,5 L 21 10,4 L 21 5,5 0,01 11 LYD330 67050,2 - - - - - - 5,5 0,02 10 LYD329 67277,4 74,2 0,07 7 9,3 0,07 7 5,1 0,19 3 LYD320 67040,2 - - - - - - 5,4 0,26 7 LYD318 66983,4 76,1 0,08 10 9,5 0,08 10 5,3 0,03 7 LYD315 67005,2 - - - - - - 5,2 0,25 3 LYD315 67007,1 75,7 0,09 9 9,5 0,09 9 5,3 L 7 LYD307 66975,3 - - - - - - 5,1 0,20 3 LYD307 66976,3 - - - - - - 5,2 0,09 4 CONT. - 69,2 - 8,6 5,0 LYD471 68050,2 48,2 0,06 21 6,0 0,06 21 4,3 0,09 6 LYD471 68050,4 47,6 0,02 19 6,0 0,02 19 4,5 0,07 10 LYD446 68109,4 45,8 0,06 15 5,7 0,06 15 4,4 L 9 LYD446 68110,3 48,1 L 20 6,0 L 20 4,3 0,10 5 LYD438 66899,2 42,4 0,20 6 5,3 0,20 6 - - - LYD432 67961,5 - - - - - - 4,2 0,22 2 LYD422 68103,3 46,3 0,18 16 5,8 0,18 16 4,2 0,25 4 LYD417 68043,3 44,3 0,04 11 5,5 0,04 11 - - - LYD385 66891,2 47,1 L 18 5,9 L 18 4,3 0,02 7 LYD385 66891,3 51,9 0,04 30 6,5 0,04 30 4,5 0,04 10 LYD368 67660,4 45,4 0,07 14 5,7 0,07 14 4,2 0,11 5 LYD364 68018,3 42,2 0,21 6 5,3 0,21 6 - - - LYD364 68020,5 49,9 0,05 25 6,2 0,05 25 4,4 0,10 9 LYD351 68126,2 48,4 0,12 21 6,1 0,12 21 4,3 0,07 6 LYD351 68129,3 45,3 0,24 13 5,7 0,24 13 4,2 0,23 3 LYD330 67047,8 43,2 0,13 8 5,4 0,13 8 4,2 0,10 4 LYD315 67004,4 43,3 0,10 8 5,4 0,10 8 - - -

358 / 378 LYD315 67006,2 42,2 0,24 6 5,3 0,24 6 - - - LYD315 67007,4 43,6 0,09 9 5,4 0,09 9 - - - LYD299 68115,4 46,1 0,07 16 5,8 0,07 16 4,3 0,16 6 LYD299 68118,5 45,0 0,02 13 5,6 0,02 13 4,2 0,08 4 CONT. - 39,9 - - 5,0 - - 4,1 - - LYD517 67221,3 51,3 0,17 16 6,4 0,17 16 4,5 0,23 8 LYD517 67221,5 54,1 0,02 22 6,8 0,02 22 4,8 L 15 LYD517 67222,1 53,1 0,21 20 6,6 0,21 20 4,6 0,11 10 LYD515 67151,1 61,3 L 39 7,7 L 39 5,0 L 21 LYD515 67151,6 - - - - - - 4,4 0,19 6 LYD515 67152,4 - - - - - - 4,5 0,17 8 LYD512 67209,1 49,2 0,14 11 6,2 0,14 11 4,5 0,10 8 LYD512 67212,2 56,4 0,05 27 7,0 0,05 27 4,8 0,15 15 LYD502 67342,6 53,2 0,05 20 6,7 0,05 20 4,6 0,04 11 LYD498 67254,3 49,2 0,19 11 6,2 0,19 11 - - - LYD482 67334,1 55,2 0,15 25 6,9 0,15 25 4,7 0,16 14 LYD475 67204,2 48,0 0,28 8 6,0 0,28 8 4,5 0,14 9 LYD454 67193,4 54,9 0,13 24 6,9 0,13 24 4,6 0,05 11 LYD452 67106,1 47,7 0,29 8 6,0 0,29 8 4,4 0,14 7 LYD452 67106,2 52,5 0,05 19 6,6 0,05 19 4,6 0,03 11 LYD452 67106,4 - - - - - - 4,4 0,15 7 LYD452 67108,1 48,2 0,30 9 6,0 0,30 9 4,3 0,28 5 LYD451 67187,7 51,3 0,20 16 6,4 0,20 16 4,7 0,22 12 LYD451 67188,4 52,6 0,02 19 6,6 0,02 19 4,6 0,04 11 LYD450 67182,2 51,4 0,11 16 6,4 0,11 16 4,5 0,11 9 LYD445 67352,3 - - - - - - 4,5 0,23 8 LYD439 67094,1 50,3 0,19 14 6,3 0,19 14 4,5 0,08 10 LYD439 67096,1 61,0 0,16 38 7,6 0,16 38 4,9 0,11 19 LYD415 67262,1 58,2 L 31 7,3 L 31 4,9 L 18 LYD415 67264,5 49,1 0,22 11 6,1 0,22 11 4,4 0,20 6 LYD415 67266,3 55,6 L 26 7,0 L 26 4,8 0,01 15 LYD415 67266,6 51,7 0,04 17 6,5 0,04 17 4,6 0,07 10 LYD399 67448,3 63,9 L 44 8,0 L 44 5,1 L 23 LYD339 67247,3 54,4 0,01 23 6,8 0,01 23 4,8 L 16 LYD328 67242,1 53,5 0,03 21 6,7 0,03 21 4,7 0,05 12 LYD324 67168,4 49,9 0,15 13 6,2 0,15 13 4,4 0,11 7 LYD323 67287,1 - - - - - - 4,7 0,26 14 LYD323 67288,2 57,9 0,04 31 7,2 0,04 31 4,7 0,05 14 LYD321 67280,1 58,2 0,09 31 7,3 0,09 31 4,8 0,17 15 LYD321 67281,6 52,6 0,27 19 6,6 0,27 19 LYD321 67283,1 54,3 0,11 23 6,8 0,11 23 4,7 0,10 13 LYD316 67439,1 49,5 0,12 12 6,2 0,12 12 4,4 0,21 5 LYD312 67256,3 49,3 0,14 11 6,2 0,14 11 4,3 0,25 5 LYD312 67256,4 57,2 0,09 29 7,2 0,09 29 4,7 0,18 14 LYD312 67257,3 52,2 0,05 18 6,5 0,05 18 4,6 0,02 12 LYD310 67163,1 53,5 0,06 21 6,7 0,06 21 4,7 0,01 14 LYD309 67418,1 - - - - - - 4,4 0,22 6 LYD309 67418,3 52,8 0,04 19 6,6 0,04 19 4,5 0,06 9 LYD309 67420,1 47,7 0,29 8 6,0 0,29 8 4,3 0,25 5 LYD296 67359,1 61,2 L 38 7,7 L 38 5,0 L 21 LYD296 67359,3 63,9 0,13 44 8,0 0,13 44 5,2 0,02 26 LYD291 67400,2 47,9 0,25 8 6,0 0,25 8 4,4 0,12 7 LYD291 67400,5 55,9 L 26 7,0 L 26 4,7 L 13 LYD291 67401,4 53,5 0,02 21 6,7 0,02 21 4,7 L 13 LYD290 67233,3 - - - - - - 4,4 0,17 7 LYD290 67236,4 - - - - - - 4,4 0,29 6 CONT. - 44,3 - - 5,5 - - 4,1 - - LYD501 67889,1 - - - - - - 4,9 0,07 8

359 / 378 LYD489 67787,3 - - - - - - 4,9 0,22 7 LYD453 67487,2 70,8 0,08 18 8,8 0,08 18 5,0 0,25 10 LYD448 67918,2 70,5 0,02 18 8,8 0,02 18 5,0 0,02 10 LYD409 67468,1 73,2 L 22 9,2 L 22 4,9 0,05 9 LYD403 67770,3 67,0 0,22 12 8,4 0,22 12 - - - LYD402 67762,3 78,1 L 30 9,8 L 30 5,3 L 16 LYD368 67659,1 74,3 0,27 24 9,3 0,27 24 5,0 0,19 11 LYD347 67844,2 71,5 0,23 19 8,9 0,23 19 5,0 0,19 9 LYD347 67845,1 - - - - - - 4,9 0,23 7 LYD347 67847,3 - - - - - - 4,9 0,27 7 LYD346 67605,4 74,1 L 24 9,3 L 24 5,1 L 13 LYD346 67606,2 - - - - - - 5,0 0,02 10 CONT. - 59,9 - - 7,5 - - 4,6 - - LYD483 68054,1 - - - - - - 3,8 0,25 4 LYD483 68054,4 - - - - - - 3,8 0,21 4 LYD483 68056,4 36,5 0,22 9 4,6 0,22 9 3,9 0,25 6 LYD483 68056,5 36,2 L 8 4,5 L 8 3,9 0,01 8 LYD478 67269,2 37,7 0,08 12 4,7 0,08 12 4,0 L 9 LYD478 67270,1 39,6 0,10 18 4,9 0,10 18 4,0 0,03 9 LYD423 68216,2 41,1 0,17 22 5,1 0,17 22 4,1 0,21 13 LYD423 68218,7 38,9 L 16 4,9 L 16 4,0 0,16 10 LYD395 67077,1 39,0 L 16 4,9 L 16 4,0 L 10 LYD395 67080,6 38,9 L 16 4,9 L 16 3,9 0,22 7 LYD392 68030,1 38,4 L 14 4,8 L 14 4,0 L 9 LYD392 68032,2 - - - - - - 4,1 0,16 13 LYD392 68033,3 44,4 0,13 32 5,6 0,13 32 4,2 0,14 16 LYD392 68035,1 - - - - - - 3,9 0,18 8 LYD388 68096,5 - - - - - - 3,8 0,03 3 LYD388 68098,4 - - - - - - 3,9 0,20 7 LYD376 68024,2 41,1 0,23 22 5,1 0,23 22 4,1 0,23 12 LYD376 68026,2 36,7 0,08 9 4,6 0,08 9 4,0 L 8 LYD367 68066,1 - - - - - - 3,9 0,08 7 LYD367 68066,5 36,8 0,01 10 4,6 0,01 10 4,0 L 9 LYD367 68068,5 36,3 0,07 8 4,5 0,07 8 - - - LYD365 68092,3 35,3 0,24 5 4,4 0,24 5 3,8 0,10 4 LYD365 68092,4 40,4 L 20 5,1 L 20 4,0 0,01 10 LYD365 68092,5 - - - - - - 3,9 0,03 6 LYD361 68146,7 40,3 0,10 20 5,0 0,10 20 4,1 0,08 11 LYD360 68061,2 42,2 0,06 26 5,3 0,06 26 4,1 0,12 11 LYD360 68064,1 - - - - - - 3,7 0,11 3 LYD356 68139,2 39,9 0,11 19 5,0 0,11 19 4,0 0,16 9 LYD356 68142,2 - - - - - - 3,8 0,07 4 LYD354 68133,6 40,8 0,01 21 5,1 0,01 21 4,1 L 12 LYD354 68133,9 - - - - - - 3,8 0,05 3 LYD354 68134,1 - - - - - - 3,7 0,13 2 LYD349 68084,1 36,3 0,26 8 4,5 0,26 8 3,9 0,26 5 LYD349 68085,3 40,7 0,03 21 5,1 0,03 21 4,0 L 9 LYD332 66988,1 41,2 L 22 5,1 L 22 4,2 L 14 LYD332 66988,2 - - - - - - 3,9 0,16 7 LYD332 66989,2 - - - - - - 3,9 0,24 8 LYD325 67013,2 - - - - - - 3,8 0,09 5 CONT. - 33,6 - - 4,2 - - 3,7 - - Tabela 62. “CONT.” - Controle; “Ave.” - Média; “% Incr.” =% de incremento; “p-val.” - valor p, L- p<0,01. Os transgenes foram sob a regulagem transcricional do novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467). “-” = os resultados ainda estão indisponíveis.

360 / 378

Tabela 63 Genes mostrando o desempenho de planta melhorado nas condições normais de cultivo sob a regulagem do promotor At6669 RGR da Cobertura do RGR do Diâmetro da RGR do Número de folha Nome do Evento canteiro Roseta Gene # P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val.

Incr.

Val.

Incr.

LYD496 67741,5 0,8 0,25 14 - - - - - - LYD479 67728,5 - - - - - - 0,4 0,27 10 LYD396 67754,1 - - - 7,2 0,25 16 - - - CONT. - 0,7 - - 6,2 - - 0,4 - - LYD504 67136,2 - - - 10,1 0,15 16 0,5 0,15 9 LYD484 67133,3 0,8 0,10 12 - - - - - - LYD484 67135,3 - - - - - - 0,5 0,29 7 LYD478 67269,2 - - - 10,2 0,11 17 0,5 0,02 15 LYD466 67118,1 0,9 0,01 23 - - - 0,5 0,30 7 LYD440 66903,1 0,8 0,03 16 9,7 0,29 11 0,5 0,20 8 LYD438 66899,2 - - - 10,5 0,07 20 0,5 0,04 14 LYD387 67317,4 0,8 0,13 11 - - - 0,5 0,11 11 LYD385 66893,1 - - - - - - 0,5 0,28 7 LYD375 67071,4 - - - - - - 0,5 0,21 9 LYD342 67063,2 - - - - - - 0,5 0,24 7 LYD334 67294,3 0,8 0,03 17 - - - - - - LYD332 66988,2 - - - - - - 0,5 0,22 8 LYD330 67046,2 - - - 10,5 0,06 20 0,5 0,07 12 LYD330 67050,2 0,8 0,25 9 10,1 0,16 16 0,5 0,06 12 LYD330 67050,5 0,8 0,20 9 - - - - - - LYD318 66983,4 - - - - - - 0,5 0,07 12 LYD315 67004,4 0,8 0,04 15 - - - - - - LYD315 67007,1 0,8 0,07 15 - - - - - - LYD315 67007,4 0,8 0,12 13 - - - 0,5 0,24 8 LYD307 66976,3 0,8 0,12 11 - - - 0,5 0,20 8 LYD292 66998,3 - - - 10,0 0,18 15 - - - CONT. - 0,7 - - 8,7 - - 0,4 - - LYD471 68050,2 - - - 6,2 0,14 22 - - - LYD471 68050,4 - - - 6,0 0,19 19 - - - LYD446 68110,3 - - - 6,2 0,15 22 - - - LYD422 68102,3 - - - 6,1 0,17 22 - - - LYD422 68103,3 - - - 5,9 0,26 17 - - - LYD417 68043,1 - - - 5,9 0,28 17 - - - LYD385 66891,3 - - - 6,6 0,04 32 - - - LYD364 68020,5 - - - 6,4 0,09 26 - - - LYD351 68126,2 - - - 6,1 0,19 20 - - - LYD330 67046,2 - - - 6,0 0,22 19 - - - LYD309 67421,4 0,7 0,16 21 - - - - - - CONT. - 0,6 - - 5,0 - - - - - LYD517 67221,5 - - - 6,9 0,16 22 0,4 0,15 19 LYD517 67222,1 - - - 6,8 0,20 21 - - - LYD515 67151,1 - - - 7,9 0,02 39 0,4 0,07 24 LYD512 67212,2 - - - 7,2 0,10 27 0,4 0,21 16 LYD502 67342,6 - - - 6,8 0,20 20 - - - LYD482 67334,1 - - - 7,1 0,13 25 0,4 0,14 19 LYD475 67204,2 - - - - - - 0,4 0,20 16 LYD475 67204,4 - - - 7,1 0,14 25 0,4 0,30 15 LYD454 67193,4 - - - 7,1 0,13 25 0,4 0,30 13 LYD452 67106,2 - - - 6,7 0,25 18 - - -

361 / 378 RGR da Cobertura do RGR do Diâmetro da RGR do Número de folha Nome do Evento canteiro Roseta Gene # P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val.

Incr.

Val.

Incr.

LYD451 67188,4 - - - 6,7 0,26 18 - - - LYD439 67096,1 - - - 7,8 0,03 38 0,4 0,15 19 LYD415 67262,1 - - - 7,5 0,06 31 0,4 0,11 20 LYD415 67266,3 - - - 7,1 0,11 26 0,4 0,19 17 LYD399 67448,3 - - - 8,3 L 46 0,5 0,04 28 LYD339 67247,3 - - - 7,0 0,14 24 0,4 0,10 21 LYD328 67242,1 - - - 6,9 0,17 22 0,4 0,15 18 LYD323 67287,1 - - - 7,1 0,15 24 0,4 0,26 15 LYD323 67288,2 - - - 7,4 0,06 31 0,4 0,25 15 LYD321 67280,1 - - - 7,5 0,05 33 0,4 0,16 18 LYD321 67281,6 - - - 6,7 0,25 19 - - - LYD321 67283,1 - - - 6,9 0,17 22 - - - LYD316 67437,2 - - - 6,8 0,25 20 - - - LYD312 67256,4 - - - 7,3 0,07 29 0,4 0,26 15 LYD312 67257,3 - - - 6,6 0,29 17 - - - LYD310 67163,1 - - - 6,8 0,21 20 0,4 0,26 15 LYD309 67418,3 - - - 6,7 0,24 19 - - - LYD296 67359,1 - - - 7,9 0,02 39 0,5 0,05 25 LYD296 67359,3 - - - 8,1 0,01 44 0,5 0,03 29 LYD291 67400,5 - - - 7,1 0,11 26 0,4 0,23 15 LYD291 67401,4 - - - 6,9 0,19 21 0,4 0,22 16 CONT. - - - - 5,7 - - 0,4 - - LYD453 67487,2 0,8 0,18 17 8,8 0,14 17 - - - LYD448 67918,2 - - - 8,9 0,12 17 - - - LYD409 67468,1 - - - 9,0 0,09 19 - - - LYD403 67770,3 - - - 8,5 0,28 13 - - - LYD402 67762,1 - - - 8,8 0,27 17 - - - LYD402 67762,3 - - - 9,6 0,03 27 - - - LYD368 67659,1 - - - 9,3 0,06 23 - - - LYD347 67844,2 - - - 8,9 0,13 18 - - - LYD346 67605,4 - - - 9,2 0,06 22 0,5 0,18 12 CONT. - 0,7 - - 7,5 - - 0,4 - - LYD478 67270,1 - - - 4,9 0,24 17 - - - LYD460 67930,3 0,8 0,03 36 - - - - - - LYD460 67931,2 0,6 0,28 16 - - - - - - LYD423 68216,2 - - - 5,2 0,11 24 0,4 0,18 14 LYD423 68218,3 0,7 0,21 20 - - - - - - LYD423 68218,7 - - - 4,9 0,24 17 0,3 0,23 12 LYD395 67077,1 - - - 4,9 0,23 17 0,3 0,26 11 LYD395 67080,6 - - - 4,9 0,25 16 - - - LYD392 68032,2 - - - 4,9 0,25 17 0,4 0,17 14 LYD392 68033,3 - - - 5,5 0,05 31 0,4 0,17 15 LYD392 68035,1 - - - - - - 0,3 0,27 11 LYD376 68024,2 - - - 5,2 0,14 22 0,4 0,19 14 LYD376 68025,3 0,6 0,25 17 - - - - - - LYD376 68026,2 - - - - - - 0,3 0,26 11 LYD367 68066,5 - - - - - - 0,3 0,24 13 LYD365 68092,4 - - - 5,1 0,14 21 0,3 0,24 11 LYD361 68146,5 - - - 4,9 0,28 16 - - - LYD361 68146,7 - - - 5,1 0,14 21 0,3 0,22 12 LYD360 68061,2 - - - 5,3 0,10 25 - - - LYD360 68063,2 0,7 0,28 18 - - - - - - LYD356 68139,2 - - - 5,0 0,21 18 - - - LYD356 68142,2 0,7 0,20 20 - - - - - - LYD354 68133,6 - - - 5,2 0,13 22 0,3 0,23 12

362 / 378 RGR da Cobertura do RGR do Diâmetro da RGR do Número de folha Nome do Evento canteiro Roseta Gene # P- % P- % P- % Ave. Ave. Ave. Val. Incr. Val. Incr. Val. Incr. LYD349 68085,3 - - - 5,1 0,15 21 - - - LYD332 66988,1 - - - 5,2 0,12 23 0,4 0,10 17 LYD332 66989,2 - - - 4,9 0,27 16 - - - CONT. - 0,6 - - 4,2 - - 0,3 - - Tabela 63. “CONT.” - Controle; “Ave.” - Média; “% Incr.” =% de incremento; “p-val.” - valor p, L- p<0,01. Os transgenes foram sob a regulagem transcricional do novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467). “-” = os resultados ainda estão indisponíveis.

Tabela 64 Genes mostrando desempenho de planta melhorado nas condições normais de cultivo sob a regulagem do promotor At6669 Área Relativa do Pecíolo Área Relativa do Pecíolo Área relativa do Pecíolo TP2 TP3 TP4 Nome do Gene Evento # P- P- % P- % Ave. % Incr. Ave. Ave. Val. Val. Incr. Val. Incr. LYD520 67310,2 11,6 0,068 14,9 14,2 0,53 2,9 - - - LYD520 67310,1 11,6 0,074 14,3 - - - - - - LYD520 67310,3 11,5 0,076 14,0 - - - - - - LYD520 67313,3 11,5 0,078 13,9 - - - - - - LYD520 67312,1 11,5 0,085 13,2 - - - - - - LYD519 67156,2 10,8 0,42 6,9 - - - - - - LYD519 67157,2 10,7 0,43 6,5 - - - - - - LYD519 67154,3 10,7 0,44 6,3 - - - - - - Tabela 64. “CONT.” - Controle; “Ave.” - Média; “% Incr.” =% de incremento; “p-val.” - valor p, L- p<0,01. Os transgenes foram sob a regulagem transcricional do novo promotor (SEQ ID NO: 14467). “TP” = um ponto de tempo relativo entre as medições. “-” = os resultados ainda estão indisponíveis.

EXEMPLO 18

AVALIAÇÃO DE ARABIDOPSIS TRANSGÊNICA SOB CONDIÇÕES NORMAIS USANDO ENSAIOS IN VITRO [CULTURA DE TECIDO DE PLANTAS T2 E T1, ENSAIOS TC -T2 E TC-T1]

[00571] Sementes esterilizadas na superfície foram semeadas em meio basal [50% de meio de Murashige-Skoog (MS) suplementado com 0,8% de ágar vegetal como agente de solidificação] na presença de Canamicina (usada como um agente de seleção). Depois da semeadura, as placas foram transferidas por 2 a 3 dias para estratificação a 4°C e depois cultivadas a 25°C sob ciclos diários de 12 horas de luz 12 horas escuro por 7 a 10 dias. Neste ponto de tempo, as mudas aleatoriamente escolhidas foram cuidadosamente transferidas para placas contendo ½ meio MS (15 mM de N). Para os experimentos realizados nas linhagens T2, cada placa conteve 5 mudas do

363 / 378 mesmo evento transgênico e 3 a 4 placas diferentes (réplicas) para cada evento. Para cada polinucleotídeo da invenção pelo menos quatro a cinco eventos de transformação independentes foram analisados a partir de cada construto. Para os experimentos realizados nas linhagens T1, cada placa conteve 5 mudas de eventos transgênicos independentes e 3 a 4 placas diferentes (réplicas) foram plantadas. No total, para as linhagens T1, 20 eventos independentes foram avaliados. As plantas expressando os polinucleotídeos da invenção foram comparados com a medição média das plantas de controle (vetor vazio ou gene repórter GUS sob o mesmo promotor) usado no mesmo experimento.

[00572] Imageamento digital – Um sistema de aquisição de imagem de laboratório, que consiste de uma câmara reflexiva digital (Canon EOS 300D) acoplada com uma lente de comprimento focal de 55 mm (Canon série EF-S), montada sobre um dispositivo de reprodução (Kaiser RS), que inclui 4 unidades de luz (4 lâmpadas claras x 150 Watts) e localizado em um quarto escuro, foi usado para capturar imagens da plântulas semeadas em placas de ágar.

[00573] O processo de captura de imagem foi repetido a cada 3 a 4 dias começando no dia 1 até o dia 10 (ver por exemplo as imagens nas Figuras 3A- F). Um sistema de análise de imagem foi usado, que consiste de um computador de mesa pessoal (processor Intel P4 3,0 GHz) e um programa de domínio público - Image J 1.39 [programa de processamento de imagem com base em Java que foi desenvolvido no U.S. National Institutes of Health e gratuitamente disponível na internet no Hypertext Transfer Protocol (Protocolo de Transferência de Hipertexto)://rsbweb (dot) nih (dot) gov/]. As imagens foram capturadas na resolução de 10 Mega Pixels (3888 x 2592 pixels) e armazenadas em um formato JPEG de baixa compressão (padrão Joint Photographic Experts Group). Em seguida, os dados analisados foram salvos em arquivos de texto e processados usando o software de análise

364 / 378 estatística JMP (SAS institute).

[00574] Análise de Muda - Usando a análise digital os dados de muda foram calculados, incluindo área de folha, cobertura da raiz e comprimento de raiz.

[00575] A taxa de crescimento relativa para os diversos parâmetros de muda foi calculada de acordo com as seguintes fórmulas XIV (RGR da área de folha) e XV (RGR do comprimento de raiz). Fórmula XIV: Taxa de crescimento relativa da área de folha = Coeficiente de regressão da área de folha ao longo do curso de tempo. Fórmula XV: Taxa de crescimento relativa do comprimento de raiz = Coeficiente de regressão do comprimento de raiz ao longo do curso de tempo.

[00576] No final do experimento, as plântulas foram removidas do meio e pesadas para a determinação do peso fresco da planta. As plântulas foram depois secadas durante 24 horas a 60°C e mais uma vez pesadas para a medição do peso seco da planta para análise estatística posterior. Os pesos fresco e seco são providos para cada planta Arabidopsis. A taxa de crescimento foi determinada comparando-se a cobertura da área de folha, cobertura da raiz e comprimento da raiz, entre cada par de fotografias sequenciais e os resultados foram usados para resolver o efeito do gene introduzido sobre o vigor da planta sob condições ideais. Similarmente, o efeito do gene introduzido sobre o acúmulo de biomassa, sob condições ideais, foi determinado comparando-se os pesos fresco e seco das plantas com aqueles das plantas de controle (contendo um vetor vazio ou o gene repórter GUS sob o mesmo promotor). A partir de cada construto criado, 3 a 5 eventos de transformação independentes foram examinados em réplicas.

[00577] Análise estatística - Para identificar genes conferindo vigor da planta significantemente melhorado ou arquitetura de raiz ampliada, os

365 / 378 resultados obtidos a partir das plantas transgênicas foram comparadas com aqueles obtidos a partir das plantas de controle. Para identificar genes e construtos com desempenho superior, os resultados dos eventos de transformação independentes testados foram analisados separadamente. Para avaliar o efeito de um evento de gene em relação a um controle os dados foram analisados pelo teste t de Student e o valor p foi calculado. Os resultados foram considerados significantes se p < 0,1. O pacote de software de estatística JMP foi usado (Versão 5.2.1, SAS Institute Inc., Cary, NC, USA). Resultados Experimentais:

[00578] As Tabelas 65 a 67 resumem os fenótipos observados de plantas transgênicas expressando os construtos de gene usando os Ensaios TC-T2.

[00579] Os genes apresentados na Tabela 65 mostraram uma melhora significante visto que eles produziram biomassa de planta maior (peso fresco e seco de planta) na geração T2 quando cultivados sob condições normais de cultivo, comparados com as plantas de controle. Os genes foram clonados sob a regulagem de um promotor constitutivo (At6669, SEQ ID NO: 14467). A avaliação de cada gene foi realizada testando-se o desempenho de números diferentes de eventos. Alguns dos genes foram avaliados em mais do que um ensaio de cultura de tecido. Os resultados obtidos neste segundo dos experimentos também foram significantemente positivos. Tabela 65 Genes mostrando desempenho de planta melhorado em condições normais de cultivo sob a regulagem do promotor At6669 Peso Seco [mg] Peso Fresco [mg] Nome do Gene Evento # Ave. P-Val. % Incr. Ave. P-Val. % Incr. LYD480 68333,4 11,6 0,02 88 223,1 0,03 95 LYD477 68234,4 10,0 0,16 62 194,1 0,12 70 LYD477 68237,2 8,6 0,14 39 170,6 0,06 49 LYD470 67126,7 10,0 0,06 62 181,5 0,04 59 LYD420 68342,1 14,1 0,02 128 242,3 0,02 112 LYD419 67911,3 11,7 0,11 90 216,0 0,11 89 LYD418 68336,1 8,1 0,25 32 - - -

366 / 378 Peso Seco [mg] Peso Fresco [mg] Nome do Gene Evento # Ave.

P-Val. % Incr.

Ave.

P-Val. % Incr.

LYD398 68038,2 8,0 0,29 29 152,2 0,21 33 LYD377 67952,3 8,1 0,29 31 - - - LYD358 68274,1 - - - 158,3 0,22 39 LYD352 68328,3 8,8 0,25 43 160,3 0,18 40 CONT. - 6,2 - - 114,3 - - LYD507 67552,3 14,5 L 133 276,8 L 125 LYD507 67552,5 9,8 0,10 57 180,2 0,16 47 LYD507 67553,4 10,3 0,28 65 209,9 0,24 71 LYD487 67498,1 - - - 156,7 0,24 27 LYD487 67498,3 9,8 0,02 58 212,8 0,02 73 LYD487 67500,1 9,4 0,26 51 186,9 0,20 52 LYD473 67493,1 8,9 0,24 43 175,0 0,29 42 LYD473 67494,1 8,6 0,18 38 169,2 0,26 38 LYD465 67569,2 9,6 0,03 55 189,4 0,01 54 LYD461 67522,6 9,3 0,23 49 196,8 0,21 60 LYD449 67479,1 8,9 0,06 44 181,7 0,10 48 LYD449 67482,2 8,1 0,30 30 - - - LYD393 67563,1 11,4 0,09 82 214,9 0,09 75 LYD331 67592,1 11,7 0,10 88 221,7 0,08 80 LYD331 67593,1 10,5 0,01 69 197,5 0,03 61 LYD327 67589,5 11,6 0,09 86 204,0 0,06 66 LYD313 67430,1 8,6 0,29 37 - - - LYD313 67432,1 11,9 0,09 91 223,8 0,10 82 LYD294 67406,1 13,1 0,03 110 274,1 0,04 123 LYD294 67407,4 8,8 0,14 41 167,2 0,21 36 LYD289 67461,4 9,2 0,23 48 206,1 0,13 68 CONT. - 6,2 - - 122,9 - - LYD477 68234,1 14,1 0,12 55 270,7 0,07 77 LYD377 67952,4 12,3 0,05 35 201,3 0,08 32 LYD359 67947,2 14,9 0,02 63 257,8 L 69 LYD343 67067,3 14,8 L 62 269,9 L 77 LYD343 67068,6 - - - 210,3 0,26 38 LYD319 67833,3 10,5 0,24 15 - - - LYD295 67971,5 15,4 0,03 69 253,8 0,03 66 CONT. - 9,1 - - 152,8 - - LYD507 67552,2 14,1 L 140 268,5 L 144 LYD507 67552,3 11,8 0,02 101 204,2 0,06 85 LYD507 67553,5 10,3 L 76 188,6 L 71 LYD487 67496,1 7,3 0,26 25 - - - LYD473 67493,1 11,2 0,03 91 195,3 0,02 77 LYD393 67562,3 7,6 0,28 29 - - - LYD393 67563,5 10,0 0,17 71 183,9 0,22 67 LYD390 67684,3 7,9 0,19 35 142,8 0,18 30 LYD390 67686,2 9,7 0,11 64 176,7 0,05 60 LYD370 67665,2 8,0 0,25 36 - - - LYD370 67666,2 13,1 0,06 122 244,0 0,05 121 LYD340 67600,3 8,3 0,20 41 141,1 0,24 28 LYD340 67600,5 10,2 0,05 74 169,2 0,11 54 LYD340 67601,3 13,4 L 128 255,6 L 132 LYD331 67593,5 8,3 0,16 42 158,7 0,09 44 LYD331 67594,1 9,4 0,26 60 - - - LYD331 67594,3 7,5 0,24 28 142,8 0,16 30 LYD327 67588,1 - - - 167,5 0,24 52 LYD327 67589,5 10,3 0,11 75 189,2 0,07 72 LYD327 67589,6 10,3 0,03 75 204,8 0,08 86 LYD313 67432,1 9,2 0,08 56 161,1 0,15 46 LYD294 67407,6 8,2 0,17 40 144,1 0,29 31

367 / 378 Peso Seco [mg] Peso Fresco [mg] Nome do Gene Evento # Ave.

P-Val. % Incr.

Ave.

P-Val. % Incr.

CONT. - 5,9 - - 110,2 - - LYD518 67750,1 15,4 0,05 57 241,9 0,22 27 LYD516 67743,4 16,0 0,19 63 277,8 0,24 45 LYD516 67744,2 12,8 0,12 30 250,6 0,10 31 LYD516 67745,4 11,7 0,24 19 - - - LYD514 67511,4 15,9 0,02 61 278,0 0,03 46 LYD510 67828,2 19,2 L 95 341,3 L 79 LYD510 67829,1 18,4 L 87 304,9 0,04 60 LYD505 67502,1 15,2 L 54 268,8 0,04 41 LYD505 67505,2 14,6 0,17 48 262,1 0,22 37 LYD505 67507,2 14,1 0,05 43 245,7 0,26 29 LYD469 67937,2 12,1 0,19 23 - - - LYD462 67868,3 19,1 L 93 337,3 L 77 LYD462 67870,1 17,3 L 76 298,7 0,01 56 LYD462 67871,3 16,1 0,14 64 276,5 0,17 45 LYD462 67872,2 16,5 L 68 307,1 0,02 61 LYD455 67816,3 13,1 0,12 33 - - - LYD455 67817,1 12,4 0,29 26 - - - LYD424 67797,2 15,6 0,12 58 270,6 0,18 42 LYD424 67798,5 13,1 0,24 33 - - - LYD419 67913,2 12,6 0,08 28 231,2 0,25 21 LYD326 67842,3 14,5 0,15 47 289,7 0,25 52 LYD304 67806,2 15,5 0,06 57 274,3 0,13 44 CONT. - 9,8 - - 191,1 - - LYD518 67750,1 7,6 0,03 45 149,3 0,06 35 LYD516 67743,4 10,6 L 101 224,0 L 103 LYD514 67508,2 8,1 0,09 54 162,0 0,06 47 LYD514 67511,2 10,2 0,03 95 208,6 L 89 LYD514 67511,4 7,8 0,20 48 163,8 0,10 49 LYD510 67829,5 9,0 0,02 71 181,5 L 65 LYD505 67505,3 11,2 L 112 204,8 0,02 86 LYD505 67507,1 8,7 0,11 66 186,7 0,07 69 LYD469 67934,3 8,9 0,03 70 172,6 0,07 57 LYD469 67935,3 9,0 0,10 71 182,8 0,08 66 LYD469 67936,3 6,3 0,20 21 133,8 0,08 21 LYD469 67937,2 6,6 0,28 27 - - - LYD462 67868,3 6,7 0,11 27 143,0 0,06 30 LYD462 67872,2 14,1 L 169 285,9 L 159 LYD455 67818,5 8,6 0,08 63 172,6 0,13 57 LYD437 67899,1 7,2 0,17 38 156,8 0,04 42 LYD437 67899,4 10,0 0,07 90 205,9 0,08 87 LYD437 67900,1 11,5 0,01 120 214,7 0,04 95 LYD437 67900,2 8,4 0,21 60 181,7 0,15 65 LYD437 67902,5 9,8 0,02 88 224,6 0,03 104 LYD424 67798,5 7,7 0,11 47 145,4 0,15 32 LYD424 67798,6 8,0 0,10 52 160,6 0,04 46 LYD424 67799,5 10,6 L 101 218,0 L 98 LYD326 67838,1 - - - 127,4 0,18 16 LYD326 67839,4 10,4 L 98 202,5 L 84 LYD326 67840,1 6,6 0,15 25 - - - LYD304 67805,1 6,5 0,22 23 - - - LYD304 67806,1 11,2 0,03 112 234,1 0,01 112 LYD304 67806,2 13,1 0,01 150 256,8 L 133 CONT. - 5,2 - - 110,2 - - Tabela 65. “CONT.” - Controle; “Ave.” - Média; “% Incr.” =% de incremento; “p-val.” - valor p, L- p<0,01. Os transgenes foram sob a regulagem transcricional do novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467). “-” = os resultados ainda estão indisponíveis.

368 / 378

[00580] Os genes apresentados nas Tabelas 66 e 67 mostram uma melhora significante no desempenho da planta visto que eles produziram uma biomassa de folha (área de folha) e biomassa de raiz (comprimento de raiz e cobertura de raiz) maiores (Tabela 66) e uma taxa de crescimento relativa mais alta da área de folha, cobertura da raiz e comprimento da raiz (Tabela 67) quando cultivados sob condições normais de cultivo, comparados com as plantas de controle. As plantas produzindo biomassa de raiz maior tiveram melhores possibilidades para absorver quantidades maiores de nitrogênio do solo. As plantas produzindo biomassa de folha maior tiveram melhor capacidade para produzir assimilados. Os genes foram clonados sob a regulagem de um promotor constitutivo (At6669). A avaliação de cada gene foi realizada testando-se o desempenho de diferentes números de eventos. Alguns dos genes foram avaliados em mais do que um ensaio de cultura de tecido. Este segundo experimento confirmou o incremento significante no desempenho de folha e raiz. O evento com valor p < 0,1 foi considerado estatisticamente significante. Tabela 66 Genes mostrando desempenho de planta melhorado nas condições normais de cultivo sob a regulagem do promotor At6669 Área de folha Cobertura das Raízes Comprimento das Raízes [cm 2] [cm2] [cm] Nome do Gene Evento # P- % P- % P- % Ave. Ave. Ave. Val. Incr. Val Incr. Val. Incr. LYD480 68331,4 - - - - - - 6,6 0,18 9 LYD480 68331,6 - - - - - - 6,7 0,11 11 LYD480 68333,4 0,8 L 58 11,3 0,08 67 6,8 0,23 12 LYD480 68335,1 - - - - - - 6,7 0,21 10 LYD477 68234,1 - - - - - - 6,9 0,06 13 LYD477 68234,4 0,8 0,07 56 9,8 0,20 45 6,8 0,23 12 LYD477 68237,1 0,7 0,05 31 9,3 0,11 39 7,1 0,02 17 LYD477 68237,2 0,7 0,02 37 - - - - - - LYD470 67126,7 0,7 0,01 46 - - - - - - LYD420 68342,1 0,9 0,01 72 13,3 0,02 98 6,8 0,20 13 LYD420 68343,2 0,6 0,10 26 - - - - - - LYD420 68344,2 - - - - - - 6,6 0,24 9 LYD419 67911,3 0,7 0,13 45 11,2 0,20 66 - - - LYD418 68336,1 0,6 0,10 25 9,5 0,09 41 7,1 0,05 17 LYD398 68037,1 - - - - - - 6,7 0,10 11 LYD398 68038,2 0,6 0,11 24 9,5 0,10 40 6,8 0,14 11 LYD398 68038,6 - - - - - - 6,7 0,15 10 LYD377 67952,3 0,7 0,06 35 9,0 0,17 34 - - -

369 / 378 Área de folha Cobertura das Raízes Comprimento das Raízes [cm 2] [cm2] [cm] Nome do Gene Evento # P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val Incr.

Val.

Incr.

LYD377 67952,4 0,7 0,09 30 - - 7,0 0,02 16 LYD377 67953,3 - - - - - - 6,9 0,10 13 LYD358 68274,1 0,6 0,30 21 9,0 0,24 33 6,6 0,27 9 LYD352 68327,3 - - - - - - 6,8 0,08 12 LYD352 68328,3 0,7 0,08 29 - - - - - - LYD319 67833,3 0,6 0,16 21 - - - - - - LYD509 - - - - - - - 6,1 0,89 2 CONT. - 0,5 - - 6,7 - - 6,1 - - LYD507 67552,3 1,1 L 85 13,3 L 44 7,9 0,16 5 LYD507 67552,5 0,8 0,09 33 - - - - - - LYD507 67553,4 0,8 0,15 37 - - - 7,9 0,26 5 LYD487 67498,3 0,8 0,02 34 11,1 0,14 20 - - - LYD487 67500,1 0,8 0,13 31 11,4 0,13 24 8,0 0,06 6 LYD473 67494,1 0,8 0,07 27 - - - - - - LYD465 67569,2 0,8 0,04 27 - - - - - - LYD461 67522,6 0,8 0,18 27 - - - - - - LYD449 67479,1 0,8 0,14 24 - - - - - - LYD393 67563,1 0,8 0,07 37 12,7 0,10 38 8,1 0,19 8 LYD370 67666,2 0,7 0,28 20 - - - - - - LYD331 67592,1 0,8 0,10 34 - - - - - - LYD331 67593,1 0,8 0,10 27 - - - - - - LYD327 67589,5 0,8 0,07 36 11,3 0,29 22 - - - LYD313 67430,1 0,8 0,20 22 - - - - - - LYD313 67432,1 0,9 0,10 47 14,3 0,12 55 8,4 0,09 12 LYD294 67406,1 0,9 0,03 48 11,9 0,18 29 - - - LYD294 67407,4 0,8 0,05 28 - - - - - - LYD289 67461,4 0,9 0,06 38 12,0 0,09 31 7,9 0,21 4 CONT. - 0,6 - - 9,2 - - 7,5 - - LYD477 68234,1 1,0 0,07 34 15,3 0,08 37 8,1 0,06 6 LYD456 67966,3 - - - 13,3 0,20 20 - - - LYD436 68073,1 - - - - - - 8,0 0,19 5 LYD377 67952,4 1,0 0,01 31 - - - - - - LYD359 67947,2 1,0 L 39 13,9 0,06 25 - - - LYD359 67947,4 0,9 0,18 23 - - - - - - LYD343 67064,3 0,8 0,19 14 - - - - - - LYD343 67066,2 - - - 15,4 0,08 38 8,6 L 13 LYD343 67067,3 1,1 L 44 17,4 L 57 8,2 0,09 8 LYD319 67833,3 0,9 L 29 - - - - - - LYD295 67971,5 1,1 L 52 15,6 0,06 40 8,2 0,03 8 CONT. - 0,7 - - 11,1 - - 7,6 - - LYD507 67552,2 1,1 L 95 14,4 0,02 67 7,8 0,09 10 LYD507 67552,3 0,9 0,01 55 13,0 L 50 7,9 0,03 11 LYD507 67553,5 0,8 0,01 45 11,6 0,02 35 - - - LYD473 67493,1 0,8 0,02 42 12,6 0,06 46 7,7 0,12 8 LYD473 67494,1 - - - 10,5 0,15 21 - - - LYD465 67569,2 - - - 10,7 0,18 24 7,9 0,11 10 LYD461 67520,5 - - - - - - 7,5 0,24 5 LYD461 67522,1 - - - - - - 7,8 0,05 10 LYD461 67522,2 0,7 0,22 19 10,6 0,20 23 7,6 0,23 7 LYD393 67563,5 0,8 0,20 33 - - - - - - LYD390 67683,5 - - - 10,5 0,17 22 7,6 0,27 7 LYD390 67684,3 0,7 0,19 26 10,8 0,23 26 - - - LYD390 67686,2 0,8 0,03 44 12,7 0,03 47 7,6 0,17 7 LYD370 67665,2 - - - 10,2 0,20 19 7,6 0,28 6 LYD370 67666,2 1,0 0,03 78 11,8 0,06 36 - - - LYD370 67667,1 - - - - - - 7,5 0,24 5 LYD370 67667,4 - - - - - - 7,6 0,19 7 LYD340 67600,3 0,7 0,24 21 - - - - - -

370 / 378 Área de folha Cobertura das Raízes Comprimento das Raízes [cm 2] [cm2] [cm] Nome do Gene Evento # P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val Incr.

Val.

Incr.

LYD340 67600,5 0,7 0,16 29 - - - - - - LYD340 67601,3 1,0 L 66 13,3 L 55 7,8 0,12 10 LYD331 67593,5 0,7 0,20 19 11,4 0,03 32 7,8 0,11 9 LYD331 67594,3 - - - 10,2 0,18 19 7,6 0,17 6 LYD327 67587,4 0,7 0,08 25 - - - - - - LYD327 67588,1 0,8 0,17 44 13,6 0,12 57 8,1 0,11 13 LYD327 67588,2 0,7 0,27 16 10,0 0,26 16 - - - LYD327 67589,5 0,8 0,02 47 10,7 0,17 25 - - - LYD327 67589,6 0,8 0,02 40 11,1 0,12 28 - - - LYD313 67432,1 0,7 0,18 28 11,6 0,13 35 - - - LYD294 67407,6 - - - 12,5 0,04 45 7,7 0,10 8 LYD289 67461,1 - - - 10,0 0,28 16 - - - LYD289 67461,4 - - - - - - 7,8 0,08 9 CONT. - 0,6 - - 8,6 - - 7,1 - - LYD518 67748,2 - - - 15,1 0,02 27 8,4 0,01 16 LYD518 67748,4 - - - 13,9 0,21 16 8,4 L 17 LYD518 67750,1 0,9 0,28 17 19,1 0,02 60 8,7 L 21 LYD518 67750,6 0,9 0,25 15 13,8 0,23 15 7,8 0,14 8 LYD516 67743,4 1,0 0,15 34 17,1 0,03 44 8,4 L 17 LYD516 67744,2 0,9 0,06 19 14,8 0,06 24 8,6 L 19 LYD516 67745,4 0,9 0,17 14 15,1 0,06 27 8,3 L 15 LYD514 67508,1 0,9 0,15 15 16,5 0,09 39 8,1 0,08 12 LYD514 67508,2 - - - - - - 7,8 0,10 8 LYD514 67511,4 1,0 L 30 15,3 0,09 28 8,0 0,02 11 LYD510 67828,2 1,2 L 52 17,7 L 49 8,2 0,06 13 LYD510 67829,1 1,1 L 47 16,2 0,02 36 7,9 0,07 10 LYD510 67830,6 - - - 13,8 0,11 15 8,0 0,01 10 LYD505 67502,1 1,0 L 34 14,2 0,06 19 7,8 0,15 8 LYD505 67505,2 1,0 0,14 27 15,3 L 28 8,4 L 17 LYD505 67505,3 - - - - - - 7,8 0,19 8 LYD505 67507,1 1,0 0,08 24 13,5 0,27 13 - - - LYD505 67507,2 1,0 0,05 26 14,3 0,11 20 8,0 0,12 11 LYD469 67934,3 - - - - - - 7,9 0,03 9 LYD469 67935,1 - - - 15,2 0,27 28 8,3 0,06 15 LYD469 67937,1 - - - - - - 7,6 0,22 5 LYD462 67868,3 1,2 L 58 19,7 L 65 8,6 L 19 LYD462 67870,1 1,1 L 45 16,0 0,01 34 8,3 L 15 LYD462 67871,3 1,1 0,08 38 16,0 0,05 34 8,0 0,05 10 LYD462 67872,2 1,0 L 35 17,2 L 44 8,3 L 15 LYD455 67815,1 - - - - - - 7,7 0,19 6 LYD455 67816,3 0,9 0,03 21 15,5 0,02 30 8,5 L 18 LYD455 67817,1 0,9 0,29 13 - - - - - - LYD455 67818,4 0,9 0,18 11 - - - - - - LYD455 67818,5 - - - 14,4 0,05 21 7,8 0,19 8 LYD437 67899,4 - - - - - - 7,8 0,06 9 LYD437 67900,1 - - - - - - 7,8 0,08 8 LYD437 67900,2 0,9 0,22 22 14,1 0,18 19 7,8 0,10 8 LYD437 67902,5 - - - - - - 7,8 0,22 8 LYD424 67797,2 1,1 0,02 43 15,0 0,17 26 7,8 0,13 8 LYD424 67798,5 0,9 0,13 21 - - - - - - LYD424 67799,5 0,9 0,17 12 - - - - - - LYD419 67912,4 - - - - - - 8,5 L 17 LYD419 67913,2 0,9 0,21 15 - - - - - - LYD326 67838,1 - - - - - - 8,4 L 17 LYD326 67840,1 - - - 14,0 0,08 18 8,3 L 15 LYD326 67842,3 1,0 0,08 25 - - - - - - LYD304 67803,3 0,9 0,29 13 15,3 L 28 8,3 L 15 LYD304 67806,2 1,0 L 34 14,9 0,08 25 8,0 0,07 10

371 / 378 Área de folha Cobertura das Raízes Comprimento das Raízes [cm 2] [cm2] [cm] Nome do Gene Evento # P- % P- % P- % Ave. Ave. Ave. Val. Incr. Val Incr. Val. Incr. CONT. - 0,8 - - 11,9 - - 7,2 - - LYD518 67748,4 - - - 9,4 0,21 34 7,5 0,11 9 LYD518 67750,1 0,6 0,19 13 11,2 0,02 60 7,9 0,01 16 LYD516 67743,4 0,9 L 60 13,3 L 89 8,1 0,02 18 LYD516 67744,1 0,7 0,29 21 9,1 0,20 29 7,7 0,07 13 LYD514 67508,1 - - - 8,8 0,06 25 7,3 0,14 7 LYD514 67508,2 0,8 0,02 37 11,6 L 64 7,6 0,02 11 LYD514 67511,2 0,8 L 46 10,9 0,02 55 - - - LYD514 67511,3 - - - 9,3 0,06 31 7,7 L 13 LYD514 67511,4 0,7 0,02 27 10,6 L 50 7,7 0,02 13 LYD510 67828,2 - - - 10,5 0,09 50 7,8 L 14 LYD510 67829,5 0,8 L 46 9,9 0,01 40 - - - LYD505 67505,3 0,9 L 58 12,0 L 70 8,0 L 17 LYD505 67507,1 0,8 0,07 41 9,9 0,07 40 - - - LYD469 67934,3 0,8 0,06 35 10,2 0,04 45 7,5 0,13 9 LYD469 67935,3 0,7 0,05 27 - - - - - - LYD469 67936,3 0,6 0,17 15 - - - - - - LYD469 67937,1 - - - 8,9 0,27 26 - - - LYD469 67937,2 0,7 0,23 18 8,7 0,22 23 - - - LYD462 67868,3 0,7 0,09 20 9,9 0,04 40 7,7 0,01 13 LYD462 67871,3 0,7 0,19 18 9,4 0,11 33 7,4 0,12 8 LYD462 67872,2 1,0 L 76 14,5 L 106 8,2 L 20 LYD455 67816,3 - - - 9,3 0,06 32 7,8 0,18 14 LYD455 67818,4 - - - 8,0 0,21 14 - - - LYD455 67818,5 0,8 0,06 44 10,9 0,09 54 - - - LYD437 67899,1 0,7 L 32 - - - - - - LYD437 67899,4 0,9 0,04 61 11,0 0,09 56 8,2 L 20 LYD437 67900,1 0,9 L 56 11,7 0,02 66 8,0 0,06 17 LYD437 67900,2 0,7 0,09 33 10,9 0,01 54 7,5 0,17 9 LYD437 67902,5 0,8 L 45 11,7 0,03 66 7,3 0,24 6 LYD424 67798,5 0,8 0,03 36 8,9 0,21 26 - - - LYD424 67798,6 0,7 0,04 34 - - - - - - LYD424 67799,5 0,9 L 56 10,8 0,06 53 - - - LYD326 67838,1 0,6 0,15 15 - - - - - - LYD326 67839,4 0,8 L 47 12,0 L 70 7,4 0,22 8 LYD326 67840,1 0,6 0,19 10 8,3 0,11 18 - - - LYD326 67842,2 0,6 0,14 13 - - - - - - LYD304 67803,1 0,6 0,27 14 9,7 0,09 38 - - - LYD304 67805,1 0,7 0,11 22 - - - - - - LYD304 67806,1 0,9 L 55 12,6 0,01 79 8,0 L 17 LYD304 67806,2 0,9 L 65 14,3 L 103 8,0 L 17 LYD304 67807,2 0,6 0,29 17 9,2 0,23 30 7,5 0,03 10 CONT. - 0,6 - - 7,0 - - 6,8 - - Tabela 66. “CONT.” - Controle; “Ave.” - Média “% Incr.” =% de incremento; “p-val.” - valor p, L- p<0,01. Os transgenes foram sob a regulagem transcricional do novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467). “-” = os resultados ainda estão indisponíveis.

Tabela 67 Genes mostrando desempenho de planta melhorado nas condições normais de cultivo sob a regulagem do promotor At6669 RGR da Cobertura de RGR do RGR da Área de folha Nome do raízes Comprimento de Raiz Evento # Gene P- % P- % P- % Ave. Ave. Ave. Val. Incr. Val Incr. Val. Incr LYD480 68333.4 0,1 L 60 1,4 0,04 71 - - -

372 / 378 RGR da Cobertura de RGR do RGR da Área de folha Nome do raízes Comprimento de Raiz Evento # Gene P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val Incr.

Val.

Incr LYD477 68234.1 - - - - - - 0,7 0,15 17 LYD477 68234.4 0,1 0,05 56 1,2 0,18 46 - - - LYD477 68237.1 0,1 0,24 26 1,1 0,20 38 0,8 0,08 24 LYD477 68237.2 0,1 0,21 27 - - - - - - LYD470 67126.7 0,1 0,04 48 - - - - - - LYD420 68342.1 0,1 L 82 1,6 L 102 0,7 0,24 16 LYD419 67911.3 0,1 0,06 51 1,4 0,08 72 - - - LYD418 68336.1 - - - 1,2 0,16 42 0,7 0,23 15 LYD398 68037.1 - - - - - - 0,7 0,16 17 LYD398 68038.2 0,1 0,28 24 1,2 0,15 42 - - - LYD398 68038.6 - - - - - - 0,7 0,25 14 LYD377 67952.3 0,1 0,15 33 1,1 0,23 36 - - - LYD377 67952.4 0,1 0,25 26 - - - 0,7 0,22 14 LYD377 67953.3 - - - - - - 0,7 0,12 19 LYD358 68274.1 0,1 0,24 28 1,1 0,24 36 - - - LYD352 68327.3 - - - - - - 0,7 0,19 15 LYD352 68328.3 0,1 0,25 26 - - - - - - CONT. - 0,1 - - 0,8 - - 0,6 - - LYD507 67552.3 0,1 L 92 1,6 0,02 44 0,8 0,03 17 LYD507 67552.5 0,1 0,03 43 - - - - - - LYD507 67553.4 0,1 0,05 44 - - - - - - LYD487 67498.3 0,1 0,02 43 1,4 0,24 22 0,8 0,10 12 LYD487 67500.1 0,1 0,06 37 1,4 0,18 25 0,8 0,08 12 LYD473 67494.1 0,1 0,08 31 - - - - - - LYD465 67569.2 0,1 0,08 30 - - - - - - LYD461 67522.6 0,1 0,16 28 - - - - - - LYD449 67479.1 0,1 0,11 28 - - - - - - LYD449 67482.1 - - - - - - 0,8 0,11 13 LYD393 67563.1 0,1 0,03 42 1,6 0,07 39 0,8 0,11 14 LYD390 67684.2 0,1 0,30 21 - - - - - - LYD370 67666.2 0,1 0,28 20 - - - - - - LYD370 67667.1 - - - - - - 0,8 0,28 8 LYD331 67592.1 0,1 0,04 41 - - - - - - LYD331 67593.1 0,1 0,06 35 - - - - - - LYD327 67589.5 0,1 0,05 39 1,4 0,24 24 0,8 0,13 14 LYD313 67430.1 0,1 0,20 23 - - - - - - LYD313 67432.1 0,1 0,04 48 1,8 0,02 56 0,9 0,03 18 LYD294 67406.1 0,1 L 52 1,5 0,13 31 - - - LYD294 67407.4 0,1 0,06 32 - - - - - - LYD289 67461.4 0,1 0,03 43 1,5 0,09 31 0,8 0,08 12 CONT. - 0,1 - - 1,1 - - 0,7 - - LYD477 68234.1 0,1 0,03 35 1,9 0,03 39 0,8 0,13 13 LYD456 67966.3 - - - 1,6 0,20 21 - - - LYD436 68073.1 - - - - - - 0,8 0,15 12 LYD436 68075.1 - - - - - - 0,8 0,19 11 LYD377 67952.4 0,1 0,11 21 - - - - - - LYD359 67947.2 0,1 L 41 1,7 0,08 27 - - - LYD359 67947.4 0,1 0,21 19 1,6 0,27 21 - - - LYD343 67064.3 0,1 0,22 16 - - - - - - LYD343 67066.2 - - - 1,9 0,03 39 0,8 0,07 15 LYD343 67067.3 0,1 L 44 2,1 L 59 0,8 0,15 14 LYD319 67833.3 0,1 0,07 22 - - - - - - LYD295 67971.5 0,1 L 52 1,9 0,02 42 0,8 0,06 17 CONT. - 0,1 - - 1,3 - - 0,7 - - LYD507 67552.2 0,1 L 103 1,7 L 70 0,7 0,22 13

373 / 378 RGR da Cobertura de RGR do RGR da Área de folha Nome do raízes Comprimento de Raiz Evento # Gene P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val Incr.

Val.

Incr LYD507 67552.3 0,1 0,01 55 1,6 L 53 0,8 0,05 20 LYD507 67553.5 0,1 0,02 51 1,4 0,03 39 0,7 0,20 14 LYD473 67493.1 0,1 0,02 48 1,5 0,02 48 - - - LYD473 67494.1 - - - 1,3 0,19 23 - - - LYD465 67569.2 - - - 1,3 0,17 26 0,7 0,17 15 LYD461 67522.1 - - - - - - 0,7 0,25 12 LYD461 67522.2 0,1 0,28 21 1,2 0,21 23 - - - LYD393 67563.5 0,1 0,15 34 - - - - - - LYD390 67683.5 - - - 1,3 0,18 25 0,7 0,28 12 LYD390 67684.3 0,1 0,18 29 1,3 0,17 26 - - - LYD390 67686.2 0,1 0,02 48 1,5 0,01 49 - - - LYD370 67665.2 - - - 1,2 0,24 20 - - - LYD370 67666.2 0,1 L 81 1,4 0,04 39 0,7 0,28 11 LYD370 67667.1 - - - - - - 0,7 0,29 11 LYD340 67600.5 0,1 0,16 30 - - - - - - LYD340 67601.3 0,1 L 73 1,6 L 59 0,8 0,08 19 LYD331 67593.5 0,1 0,29 21 1,4 0,06 34 - - - LYD331 67594.1 - - - 1,4 0,15 36 0,7 0,22 15 LYD331 67594.3 - - - 1,2 0,26 20 - - - LYD327 67587.4 0,1 0,17 26 1,2 0,26 22 - - - LYD327 67588.1 0,1 0,08 42 1,6 0,01 59 0,8 0,08 22 LYD327 67589.5 0,1 0,02 50 1,3 0,15 27 0,7 0,26 12 LYD327 67589.6 0,1 0,04 42 1,3 0,11 30 - - - LYD313 67432.1 0,1 0,25 25 1,4 0,07 36 - - - LYD294 67407.6 - - - 1,5 0,02 49 0,7 0,28 11 CONT. - 0,1 - - 1,0 - - 0,6 - - LYD518 67748.2 - - - 1,8 0,02 27 0,8 0,01 23 LYD518 67748.4 - - - 1,6 0,20 15 0,8 0,05 18 LYD518 67750.1 0,1 0,23 18 2,3 L 60 0,8 0,01 25 LYD518 67750.6 0,1 0,25 16 1,7 0,18 17 0,8 0,04 17 LYD516 67743.4 0,1 0,05 37 2,0 L 44 0,8 0,06 18 LYD516 67744.2 0,1 0,09 22 1,8 0,05 24 0,8 0,01 24 LYD516 67745.4 0,1 0,22 17 1,8 0,03 28 0,8 0,01 22 LYD514 67508.1 0,1 0,13 21 2,0 L 41 0,8 0,21 13 LYD514 67511.4 0,1 0,02 32 1,8 0,04 26 - - - LYD510 67828.2 0,1 L 59 2,1 L 50 0,8 0,03 23 LYD510 67829.1 0,1 L 52 1,9 L 36 0,8 0,12 14 LYD510 67830.6 - - - 1,7 0,12 18 0,8 0,02 18 LYD505 67502.1 0,1 L 37 1,7 0,09 19 0,7 0,17 12 LYD505 67505.2 0,1 0,08 28 1,8 0,01 29 0,9 L 27 LYD505 67507.1 0,1 0,08 26 - - - - - - LYD505 67507.2 0,1 0,06 27 1,7 0,11 20 0,8 0,19 13 LYD469 67934.3 - - - 1,6 0,27 14 - - - LYD469 67935.1 0,1 0,26 23 1,8 0,10 28 0,8 0,04 20 LYD469 67937.1 - - - - - - 0,7 0,26 9 LYD462 67868.3 0,1 L 64 2,3 L 63 0,8 0,12 16 LYD462 67870.1 0,1 L 50 1,9 L 34 0,8 L 25 LYD462 67871.3 0,1 0,02 40 1,9 0,01 33 0,7 0,25 11 LYD462 67872.2 0,1 L 40 2,0 L 43 0,8 0,12 15 LYD455 67815.1 - - - - - - 0,7 0,17 11 LYD455 67816.3 0,1 0,06 25 1,9 0,01 31 0,9 L 27 LYD455 67817.1 0,1 0,29 14 - - - - - - LYD455 67818.4 0,1 0,27 14 - - - - - - LYD455 67818.5 - - - 1,7 0,07 21 - - - LYD437 67899.4 - - - - - - 0,7 0,23 10

374 / 378 RGR da Cobertura de RGR do RGR da Área de folha Nome do raízes Comprimento de Raiz Evento # Gene P- % P- % P- % Ave.

Ave.

Ave.

Val.

Incr.

Val Incr.

Val.

Incr LYD437 67900.1 - - - - - - 0,7 0,20 11 LYD437 67900.2 0,1 0,15 23 1,7 0,17 18 - - - LYD424 67797.2 0,1 L 51 1,8 0,06 28 0,8 0,02 22 LYD424 67798.5 0,1 0,08 25 - - - - - - LYD424 67799.5 0,1 0,25 14 - - - 0,8 0,12 15 LYD419 67912.4 - - - - - - 0,8 L 23 LYD419 67913.2 0,1 0,19 18 - - - - - - LYD326 67838.1 0,1 0,19 25 - - - 0,8 0,02 20 LYD326 67840.1 - - - 1,7 0,13 18 0,8 0,03 19 LYD326 67842.3 0,1 0,04 30 - - - - - - LYD304 67803.3 0,1 0,28 15 1,8 0,02 28 0,8 0,04 19 LYD304 67806.2 0,1 L 38 1,7 0,07 23 - - - CONT. - 0,1 - - 1,4 - - 0,7 - - LYD518 67748.4 - - - 1,1 0,07 34 - - - LYD518 67750.1 0,1 0,30 14 1,4 L 61 0,8 0,07 14 LYD516 67743.4 0,1 L 65 1,6 L 87 0,8 0,08 15 LYD516 67744.1 0,1 0,10 30 1,1 0,12 30 0,8 0,02 20 LYD516 67745.4 - - - 1,0 0,26 20 - - - LYD514 67508.1 - - - 1,1 0,13 25 - - - LYD514 67508.2 0,1 0,01 39 1,4 L 62 - - - LYD514 67511.2 0,1 L 52 1,3 L 52 - - - LYD514 67511.3 - - - 1,1 0,06 31 0,8 0,16 10 LYD514 67511.4 0,1 0,03 30 1,3 L 47 - - - LYD510 67828.2 0,1 0,22 19 1,3 0,02 46 0,8 0,14 11 LYD510 67829.5 0,1 L 54 1,2 0,02 38 - - - LYD510 67830.2 0,1 0,24 21 1,1 0,20 28 - - - LYD505 67505.3 0,1 L 70 1,5 L 70 0,8 L 21 LYD505 67507.1 0,1 L 47 1,2 0,04 37 - - - LYD469 67934.3 0,1 0,01 41 1,2 0,02 43 - - - LYD469 67935.3 0,1 0,04 32 - - - - - - LYD469 67936.3 0,1 0,13 21 - - - - - - LYD469 67937.1 - - - 1,1 0,18 25 - - - LYD469 67937.2 0,1 0,23 18 1,1 0,19 23 - - - LYD462 67868.3 0,1 0,10 23 1,2 0,03 38 0,7 0,21 9 LYD462 67871.3 0,1 0,18 21 1,1 0,06 33 - - - LYD462 67872.2 0,1 L 91 1,7 L 104 0,8 0,01 20 LYD455 67816.3 - - - 1,1 0,06 32 0,8 0,28 10 LYD455 67818.5 0,1 L 53 1,3 0,01 55 0,8 0,13 13 LYD437 67899.1 0,1 L 38 - - - - - - LYD437 67899.4 0,1 L 72 1,3 0,02 52 0,8 0,04 16 LYD437 67900.1 0,1 L 66 1,4 L 67 0,8 0,03 19 LYD437 67900.2 0,1 0,01 43 1,3 L 54 - - - LYD437 67902.5 0,1 L 55 1,4 L 66 - - - LYD424 67798.5 0,1 L 47 1,1 0,13 27 - - - LYD424 67798.6 0,1 0,01 41 - - - - - - LYD424 67799.5 0,1 L 69 1,3 L 54 - - - LYD326 67838.1 0,1 0,20 18 - - - - - - LYD326 67839.4 0,1 L 58 1,4 L 66 - - - LYD326 67840.1 0,1 0,30 13 1,0 0,21 19 0,8 0,18 10 LYD326 67842.2 0,1 0,18 18 - - - - - - LYD304 67803.1 0,1 0,13 22 1,2 0,03 39 - - - LYD304 67805.1 0,1 0,06 28 - - - - - - LYD304 67806.1 0,1 L 61 1,5 L 77 - - - LYD304 67806.2 0,1 L 75 1,7 L 101 0,8 0,10 13 LYD304 67807.2 0,1 0,14 24 1,1 0,10 31 - - -

375 / 378 RGR da Cobertura de RGR do RGR da Área de folha Nome do raízes Comprimento de Raiz Evento # Gene P- % P- % P- % Ave. Ave. Ave. Val. Incr. Val Incr. Val. Incr CONT. - 0,1 - - 0,9 - - 0,7 - - Tabela 67. “CONT.” - Controle; “Ave.” - Média; “% Incr.” =% de incremento; “p-val.” - valor p, L- p<0,01. Os transgenes foram sob a regulagem transcricional do novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467). “-” = os resultados ainda estão indisponíveis.

Resultados de plantas T1

[00581] Os genes apresentados nas Tabelas 68 a 70 mostraram uma melhora significante na biomassa de planta e desenvolvimento de raiz visto que eles produziram uma biomassa mais alta (peso seco e fresco, Tabela 68), uma folha mais larga e biomassa de raiz (área de folha, comprimento de raiz e cobertura de raiz) (Tabela 69) e uma taxa de crescimento relativa mais alta da área de folha, cobertura da raiz e comprimento de raiz (Tabela 70) quando cultivados sob condições normais de cultivo, comparados com as plantas de controle. As plantas produzindo biomassa de raiz maior têm melhores possibilidades para absorver maiores quantidades de nitrogênio do solo. As plantas produzindo maior folha biomassa tem melhor capacidade para produzir assimilados). Os genes foram clonados sob a regulagem de um promotor constitutivo (At6669; SEQ ID NO: 14467). A avaliação de cada gene foi realizada testando-se o desempenho de números de eventos diferentes. Alguns dos genes foram avaliados em mais do que um ensaio de cultura de tecido. Este segundo experimento confirmou o incremento significante no desempenho de folha e raiz. O evento com valor p < 0,1 foi considerado estatisticamente significante. As Tabelas 68 a 70 resumem os fenótipos observados de plantas transgênicas expressando os construtos de gene usando os ensaios TC-T1. Tabela 68 Genes mostrando desempenho de planta melhorado nas condições normais de cultivo sob regulagem do promotor A6669 Peso Seco [mg] Peso Fresco [mg] Nome do Gene Ave. P-Val. % Incr. Ave. P-Val. % Incr. LYD467 11,2 0,15 20 - - - LYD427 11,0 0,17 18 176,4 0,12 24 LYD407 11,2 0,23 20 192,3 0,15 36 LYD300 10,35 0,37 11 163,7 0,27 15,5 LYD353 10,1 0,53 8,6 163,2 0,33 15,1

376 / 378 Peso Seco [mg] Peso Fresco [mg] Nome do Gene Ave. P-Val. % Incr. Ave. P-Val. % Incr. LYD378 9,95 0,57 6,9 179,4 0,69 5,3 LYD380 - - - 147,6 0,76 4,1 CONT. 9,3 - - 141,8 - - LYD383 11,9 0,02 35 200,5 0,06 29 CONT. 8,8 - - 156,0 - - Tabela 68. “CONT.” - Controle; “Ave.” - Média; “% Incr.” =% de incremento; “p-val.” - valor p, L- p<0,01. Os transgenes foram sob a regulagem transcricional do novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467). “-” = os resultados ainda estão indisponíveis.

Tabela 69 Genes mostrando desempenho de planta melhorado nas condições normais de cultivo sob regulagem do promotor At6669 Área de folha [cm21 Cobertura de Raízes [cm21 Comprimento das Raízes [cm] P_ Nome do Gene P- % P- % Ave. Val. % Ave. Ave. Val. Incr. Val Incr. Incr. LYD467 0,8 L 17 - - - 6,7 0,09 14 LYD407 0,8 0,16 11 8,9 0,29 26 7,0 0,22 19 LYD380 - - - - - - 6,4 0,45 8,9 CONT. 0,7 - - 7,1 - - 5,9 - - LYD413 - - - 8,0 0,28 21 6,6 0,14 16 LYD383 0,9 0,04 35 - - - - - - LYD500 0,7 0,93 8 6,7 0,9 1,8 6,1 0,55 6 CONT. 0,7 - - 6,6 - - 5,7 - - Tabela 69. “CONT.” - Controle; “Ave.” - Média; “% Incr.” =% de incremento; “p-val.” - valor p, L- p<0,01. Os transgenes foram sob a regulagem transcricional do novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467). “-” = os resultados ainda estão indisponíveis.

Tabela 70 Genes mostrando desempenho de planta melhorado nas condições normais de cultivo sob a regulagem do promotor At6669 RGR da Área de Folha RGR da Cobertura de Raízes RGR do Comprimento de Raiz Nome do P- % P- % P- % Gene Ave. Ave. Ave. Val. Incr. Val. Incr. Val Incr. LYD467 0,1 0,03 20 - - - 0,7 0,10 18 LYD407 0,1 0,29 10 1,1 0,10 26 0,8 0,03 26 CONT. 0,1 - - 0,9 - - 0,6 - - LYD413 - - - 1,0 0,22 22 0,8 0,05 18 LYD383 0,1 L 45 - - - - - - CONT. 0,1 - - 0,8 - - 0,7 - - Tabela 70. “CONT.” - Controle; “Ave.” - Média; “% Incr.” =% de incremento; “p-val.” - valor p, L- p<0,01. Os transgenes foram sob a regulagem transcricional do novo promotor At6669 (SEQ ID NO: 14467). “-” = os resultados ainda estão indisponíveis.

[00582] Estes resultados demonstram que os polinucleotídeos da invenção são capazes de melhorar o rendimento e traços agrícolas importantes valiosos adicionais tais como aumento de biomassa, tolerância ao estresse abiótico, eficiência no uso de nitrogênio, rendimento, vigor, rendimento de fibra e/ou qualidade. Assim, as plantas transformadas mostrando peso fresco e

377 / 378 seco melhorados demonstram a capacidade do gene para melhorar a biomassa um traço chave de safras para forragem e produtividade da planta; as plantas transformadas mostrando melhora de rendimento de semente demonstram a capacidade dos genes para melhorar a produtividade de planta; as plantas transformadas mostrando melhora de cobertura do lote e diâmetro da roseta demonstram a capacidade dos genes para melhorar a resistência de planta seca visto que os mesmos reduzem a perda de água do solo pela evaporação simples e reduzem a competição com ervas daninhas; consequentemente, reduzem a necessidade para usar herbicidas para controlar as ervas daninhas. As plantas transformadas mostrando melhora de taxa de crescimento relativa de diversos órgãos (folha e raiz) demonstram a capacidade do gene para promover o crescimento da planta e consequentemente, reduzirão a necessidade de período de crescimento e/ou alternativamente melhorarão a utilização de nutrientes e água disponíveis levando ao aumento de produtividade da terra; as plantas transformadas mostrando melhora de número de órgão como demonstrado pelo parâmetro do número de folha exibindo um potencial para melhorar o rendimento da biomassa importante para safras forrageiras e melhorar a produtividade da planta; plantas transformadas mostrando comprimento de raiz e cobertura aumentadas demonstram a capacidade do gene para melhorar a resistência à seca e melhor utilização de fertilizantes visto que as raízes podem atingir volume de solo maior; as plantas transformadas mostrando melhora da área relativa ao pecíolo da folha e área da lâmina da folha demonstram a capacidade dos genes para enfrentar resultados em intensidades de luz limitadas de aumentar as densidades populacionais da planta e consequentemente, melhorar a produtividade da terra.

[00583] Embora a invenção tenha sido descrita em conjunção com as modalidades específicas da mesma, fica evidente que muitas alternativas, modificações e variações estarão evidentes para aqueles versados na técnica.

378 / 378 Consequentemente, é pretendido abranger todas de tais alternativas, modificações e variações que caiam dentro do espírito e escopo amplo das reivindicações anexas.

[00584] Todas as publicações, patentes e pedidos de patente mencionados neste relatório descritivo são neste incorporados em sua totalidade por referência dentro do relatório descritivo, no mesmo grau como se cada publicação, patente ou pedido de patente individuais fossem específica e individualmente indicados ser aqui incorporados por referência. Além disso, a citação ou identificação de qualquer referência neste documento não devem ser interpretadas como uma admissão que tal referência esteja disponível como técnica anterior à presente invenção. Até o grau que os cabeçalhos de seção são usados, eles não devem ser interpretados como necessariamente limitantes.

Claims (1)

1. REIVINDICAÇÕES

   1. “MÉTODO DE AUMENTO DE PRODUÇÃO, BIOMASSA, TAXA DE CRESCIMENTO, VIGOR, CONTEÚDO DE ÓLEO, PRODUÇÃO DA FIBRA, QUALIDADE DA FIBRA, TOLERÂNCIA AO 5 ESTRESSE ABIÓTICO, E/OU EFICIÊNCIA NO USO DE NITROGÊNIO DE UMA PLANTA”, caracterizado por compreender expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo a sequência de ácido nucléico codificando um polipeptídio pelo menos 80% idêntico ao ID das SEQ N.ºs: 760, 474-759, 761- 10 770, 772-835 e 4178-4195, 4197-4213, 4215-4216, 4218-5334, 5336-5522, 5524-5754, 5756-6215, 6217, 6220-6223, 6230, 6232, 6235-6607, 6609-6614, 6620-7129 ou 7130, dessa forma aumentando a tolerância ao estresse abiótico, rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, 15 rendimento de fibras, qualidade de fibras, e/ou eficiência de utilização de nitrogênio da planta.

   2. “MÉTODO DE AUMENTO DE PRODUÇÃO, BIOMASSA, TAXA DE CRESCIMENTO, VIGOR, CONTEÚDO DE ÓLEO, PRODUÇÃO DA FIBRA, QUALIDADE DA FIBRA, TOLERÂNCIA AO 20 ESTRESSE ABIÓTICO, E/OU EFICIÊNCIA NO USO DE NITROGÊNIO DE UMA PLANTA”, caracterizado por compreender expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácido nucléico codificando um polipeptídio selecionado de um grupo consistindo do ID das SEQ N.ºs: 760, 25 474-759, 761-835, 4178-6223, 6226-7129 e 7130, dessa forma aumentando a tolerância ao estresse abiótico, rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibras, qualidade de fibra, e/ou eficiência de utilização de nitrogênio da planta.

   3. “MÉTODO DE AUMENTO DE PRODUÇÃO, BIOMASSA, TAXA DE CRESCIMENTO, VIGOR, CONTEÚDO DE ÓLEO, PRODUÇÃO DA FIBRA, QUALIDADE DA FIBRA, TOLERÂNCIA AO 5 ESTRESSE ABIÓTICO, E/OU EFICIÊNCIA NO USO DE NITROGÊNIO DE UMA PLANTA”, caracterizado por compreender expressar dentro da planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo a sequência de ácido nucléico pelo menos 80% idêntico ao ID das SEQ N.ºs: 320, 1-319, 321-473, 836-1652, 1654-3221, 10 3225-3241, 3243-3630, 3632-4176 ou 4177, dessa forma aumentando a tolerância ao estresse abiótico, rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibras, qualidade de fibra, e/ou eficiência de utilização de nitrogênio da planta.

   15 4. “MÉTODO DE AUMENTO DE PRODUÇÃO, BIOMASSA, TAXA DE CRESCIMENTO, VIGOR, CONTEÚDO DE ÓLEO, PRODUÇÃO DA FIBRA, QUALIDADE DA FIBRA, TOLERÂNCIA AO ESTRESSE ABIÓTICO, E/OU EFICIÊNCIA NO USO DE NITROGÊNIO DE UMA PLANTA”, caracterizado por compreender expressar da 20 planta um polinucleotídeo exógeno compreendendo uma sequência de ácido nucléico selecionado de um grupo consistindo do ID das SEQ N.ºs: 320, 1-319, 321-473, 836- 4176 e 4177, dessa forma aumentando a tolerância ao estresse abiótico, rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, 25 conteúdo de óleo, rendimento de fibras, qualidade de fibra, e/ou eficiência de utilização de nitrogênio da planta.

   5. “POLINUCLEOTÍDEO ISOLADO”, compreendendo uma sequência de ácido nucléico codificando um polipeptídio que compreende uma sequência de aminoácido pelo menos 80% homóloga a sequência de aminoácidos descrita na ID das SEQ N.ºs: 760, 474-759, 761-770, 772-835 e 4178-4195, 4197-4213, 4215-4216, 4218-5334, 5336-5522, 5524-5754, 5756- 5 6215, 6217, 6220-6223, 6230, 6232, 6235-6607, 6609-6614, 6620-7129 ou 7130, caracterizado por a mencionada sequência de aminoácidos ser capaz de aumentar a tolerância ao estresse abiótico, rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibras, 10 qualidade de fibras, e/ou eficiência de utilização de nitrogênio de uma planta.

   6. “POLINUCLEOTÍDEO ISOLADO”, caracterizado por compreender uma sequência de ácido nucléico codificando um polipeptídio que compreende a 15 sequência de aminoácido selecionado do grupo consistindo do ID das SEQ N.ºs: 760, 474-759, 761-835, 4178-6223, 6226-7129 e 7130.

   7. “POLINUCLEOTÍDEO ISOLADO”, compreendendo uma sequência de ácido nucléico pelo menos 80% 20 idêntica ao ID das SEQ N.ºs: 320, 1-319, 321-473, 836-1652, 1654-3221, 3225-3241, 3243-3630, 3632-4176 ou 4177, caracterizado por a mencionada sequência de ácidos nucleicos ser capaz de aumentar a tolerância ao estresse abiótico, rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo 25 de óleo, rendimento de fibras, qualidade de fibras, e/ou eficiência de utilização de nitrogênio de uma planta.

   8. “POLINUCLEOTÍDEO ISOLADO”, caracterizado por compreender uma sequência de ácido nucléico selecionada do grupo consistindo do ID das SEQ N.ºs: 320, 1-319, 321-473, 836-4176 e 4177.

   9. “CONSTRUÇÃO DE ÁCIDO NUCLEICO”, caracterizado por compreender o polinucleotídeo 5 isolado, de acordo com as reivindicações 5, 6, 7 ou 8 e um promotor da transcrição direta da referida sequência de ácido nucleico em uma célula hospedeira.

   10. “POLIPEPTÍDIO ISOLADO”, compreendendo uma sequência de aminoácido pelo menos 80% 10 homóloga ao ID das SEQ N.ºs: 760, 474-759, 761-770, 772-835 e 4178-4195, 4197-4213, 4215-4216, 4218-5334, 5336-5522, 5524-5754, 5756-6215, 6217, 6220-6223, 6230, 6232, 6235- 6607, 6609-6614, 6620-7129 ou 7130, caracterizado por mencionada sequência de aminoácidos ser capaz de aumentar a 15 tolerância ao estresse abiótico, rendimento, biomassa, taxa de crescimento, vigor, conteúdo de óleo, rendimento de fibras, qualidade de fibras, e/ou eficiência de utilização de nitrogênio de uma planta.

   11. “POLIPEPTÍDIO ISOLADO”, 20 caracterizado por compreender a sequência de aminoácido selecionada do grupo consistindo do ID das SEQ N.ºs: 760, 474-759, 761-835, 4178-6223, 6226-7129 e 7130.

   12. “CÉLULA VEGETAL”, caracterizado por expressar de forma exógena o polipeptídeo, 25 de acordo com as reivindicações 5, 6, 7 ou 8 ou a construção de ácidos nucléicos, de acordo com a reivindicação 9.

   13. “CÉLULA DE PLANTA EXÓGENA”, caracterizada por expressar o polipeptídio, de acordo com as reivindicações 10 ou 11.

   14. “MÉTODO DE AUMENTO DE PRODUÇÃO, BIOMASSA, TAXA DE CRESCIMENTO, VIGOR, CONTEÚDO DE ÓLEO, PRODUÇÃO DA FIBRA, QUALIDADE DA FIBRA, TOLERÂNCIA AO 5 ESTRESSE ABIÓTICO, E/OU EFICIÊNCIA NO USO DE NITROGÊNIO DE UMA PLANTA”, de acordo com as reivindicações 1 ou 3, polinucleotídeo isolado, de acordo com a reivindicação 5, construção de ácidos nucléicos, de acordo com a reivindicação 9, ou célula vegetal, de acordo com a 10 reivindicação 12, caracterizado por tal sequência de ácidos nucléicos codificar uma sequência de aminoácidos selecionada do grupo consistindo do ID das SEQ N.ºs: 760, 474-759, 761- 835, 4178-6223, 6226-7129 e 7130.

   15. “MÉTODO DE AUMENTO DE 15 PRODUÇÃO, BIOMASSA, TAXA DE CRESCIMENTO, VIGOR, CONTEÚDO DE ÓLEO, PRODUÇÃO DA FIBRA, QUALIDADE DA FIBRA, TOLERÂNCIA AO ESTRESSE ABIÓTICO, E/OU EFICIÊNCIA NO USO DE NITROGÊNIO DE UMA PLANTA”, de acordo com as reivindicações 1, ou 2, ou 3, ou 4, polinucleotídeo isolado, de acordo com as 20 reivindicações 5, ou 6, ou 7, ou 8, construção de ácidos nucléicos, de acordo com a reivindicação 9, ou célula vegetal, de acordo com a reivindicação 12, caracterizado por tal sequência de ácidos nucléicos ser selecionada do grupo consistindo do ID das SEQ N.ºs: 320, 1-319, 321-473, 836- 25 4176 e 4177.

   16. “MÉTODO DE AUMENTO DE PRODUÇÃO, BIOMASSA, TAXA DE CRESCIMENTO, VIGOR, CONTEÚDO DE ÓLEO, PRODUÇÃO DA FIBRA, QUALIDADE DA FIBRA, TOLERÂNCIA AO

   ESTRESSE ABIÓTICO, E/OU EFICIÊNCIA NO USO DE NITROGÊNIO DE UMA PLANTA”, de acordo com as reivindicações 1, ou 2, ou 3, ou 4, polinucleotídeo isolado, de acordo com as reivindicações 5, ou 6, ou 7, ou 8, construção de ácidos 5 nucléicos, de acordo com a reivindicação 9, ou célula vegetal, de acordo com a reivindicação 12, caracterizado por tal polinucleotídeo consistir da sequência de ácidos nucléicos selecionada do grupo consistindo do ID das SEQ N.ºs: 320, 1-319, 321-473, 836-4176 e 4177.

   10 17. “MÉTODO DE AUMENTO DE PRODUÇÃO, BIOMASSA, TAXA DE CRESCIMENTO, VIGOR, CONTEÚDO DE ÓLEO, PRODUÇÃO DA FIBRA, QUALIDADE DA FIBRA, TOLERÂNCIA AO ESTRESSE ABIÓTICO, E/OU EFICIÊNCIA NO USO DE NITROGÊNIO DE UMA PLANTA”, de acordo com a reivindicação 1, 15 polinucleotídeo isolado, de acordo com a reivindicação 5, construção do ácidos nucléicos, de acordo com a reivindicação 9, ou célula vegetal, de acordo com a reivindicação 12, caracterizado por tal sequência de ácidos nucléicos codificar a sequência de aminoácidos selecionada 20 do grupo consistindo das SEQ ID Nºs: 760, 474-759, 761-835, 4178-6223, 6226-7129 e 7130.

   18. “CÉLULA VEGETAL”, de acordo com as reivindicações 12 ou 13, caracterizada por tal célula vegetal fazer parte de uma planta.

   25 19. “MÉTODO DE AUMENTO DE PRODUÇÃO, BIOMASSA, TAXA DE CRESCIMENTO, VIGOR, CONTEÚDO DE ÓLEO, PRODUÇÃO DA FIBRA, QUALIDADE DA FIBRA, TOLERÂNCIA AO ESTRESSE ABIÓTICO, E/OU EFICIÊNCIA NO USO DE NITROGÊNIO DE

   UMA PLANTA”, de acordo com as reivindicações 1, ou 2, ou 3, ou 4, ou 14, ou 15, ou 16, ou 17, caracterizado por compreender ainda o cultivo da planta que expressa o referido polinucleotídeo exógeno sob o estresse abiótico.

   5 20. “MÉTODO DE AUMENTO DE PRODUÇÃO, BIOMASSA, TAXA DE CRESCIMENTO, VIGOR, CONTEÚDO DE ÓLEO, PRODUÇÃO DA FIBRA, QUALIDADE DA FIBRA, TOLERÂNCIA AO ESTRESSE ABIÓTICO, E/OU EFICIÊNCIA NO USO DE NITROGÊNIO DE UMA PLANTA”, de acordo com as reivindicações 1, ou 2, ou 3, 10 ou 4, ou 14, ou 15, ou 16, ou 17, e ou 19, polinucleotídeo isolado de acordo com as reivindicações 5 ou 7, ou construção de ácidos nucléicos da reivindicação 9, polipeptídeo isolado de acordo com a reivindicação 10, célula vegetal das reivindicações 12 ou 13, caracterizado 15 por o referido estresse abiótico ser selecionado a partir de um grupo consistindo de salinidade, estiagem, privação de água, inundação, estiolamento, baixas temperaturas, altas temperaturas, toxicidade de metais pesados, anaerobiose, deficiência de nutrientes, excesso de nutrientes, poluição 20 atmosférica e irradiação UV.

   21. “MÉTODO DE AUMENTO DE PRODUÇÃO, BIOMASSA, TAXA DE CRESCIMENTO, VIGOR, CONTEÚDO DE ÓLEO, PRODUÇÃO DA FIBRA, QUALIDADE DA FIBRA, TOLERÂNCIA AO ESTRESSE ABIÓTICO, E/OU EFICIÊNCIA NO USO DE NITROGÊNIO DE 25 UMA PLANTA”, de acordo com as reivindicações 1, ou 2, ou 3, ou 4, ou 14, ou 15, ou 16, ou 17, e ou 19, polinucleotídeo isolado, de acordo com as reivindicações 5 ou 7, ou construção de ácidos nucléicos, de acordo com a reivindicação 9, polipeptídeo isolado, de acordo com a reivindicação 10, célula vegetal, de acordo com a reivindicação 12 ou 13, caracterizado por o rendimento compreender rendimento da semente ou rendimento de óleo.

   5 22. “PLANTA TRANSGÊNICA”, caracterizada por compreender a construção de ácidos nucléicos da reivindicação 9.

   23. “MÉTODO DE AUMENTO DE PRODUÇÃO, BIOMASSA, TAXA DE CRESCIMENTO, VIGOR, CONTEÚDO DE 10 ÓLEO, PRODUÇÃO DA FIBRA, QUALIDADE DA FIBRA, TOLERÂNCIA AO ESTRESSE ABIÓTICO, E/OU EFICIÊNCIA NO USO DE NITROGÊNIO DE UMA PLANTA”, de acordo com as reivindicações 1, ou 2, ou 3, ou 4, ou 14, ou 15, ou 16, ou 17, caracterizado por compreender ainda o cultivo da planta expressando o referido 15 polinucleotídeo exógeno sob condições de nitrogênio limitantes.

   24. “CONSTRUÇÃO DE ÁCIDO NUCLEICO”, de acordo com a reivindicação 9, caracterizada por o referido promotor ser heterólogo com relação ao 20 referido polinucleotídeo isolado e/ou à referida célula hospedeira.