BR112012032206A2 - comparações de amostras de proteínas - Google Patents

comparações de amostras de proteínas

Info

Publication number
BR112012032206A2
BR112012032206A2 BR112012032206A BR112012032206A BR112012032206A2 BR 112012032206 A2 BR112012032206 A2 BR 112012032206A2 BR 112012032206 A BR112012032206 A BR 112012032206A BR 112012032206 A BR112012032206 A BR 112012032206A BR 112012032206 A2 BR112012032206 A2 BR 112012032206A2
Authority
BR
Brazil
Prior art keywords
protein
sample
sitrs
digestion
comparisons
Prior art date
Application number
BR112012032206A
Other languages
English (en)
Inventor
Anton V Manuilov
David H Lee
Original Assignee
Abbvie Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Abbvie Inc filed Critical Abbvie Inc
Publication of BR112012032206A2 publication Critical patent/BR112012032206A2/pt

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6803—General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
    • G01N33/6848—Methods of protein analysis involving mass spectrometry

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Abstract

comparações de amostras de proteínas. são fornecidos métodos para detectar quantitativa e/ou quantitativamente a presença de mutações, modificações ou impurezas em uma amostra de proteína. os métodos utilizam variantes de aminoácidos isotopicamente marcadas incorporadoas nas proteínas antes da digestão de proteínas, de forma a permitir comparações de duas amostras de proteína em cromatografia líquida bottom-up. as medições obtidas pela presenta invenção levam em consideração não apenas as massas dos peptídeos gerados durante a digestão proteolítica, mas também a abundância de cada peptídeo resultante. a medição da abundância de peptídeos pela ms é permitida através da utilização de uma amostra sitrs que é misturada com uma proteína não-marcada antes da digestão das proteínas. tal como aqui utilizado, o termo "amostra sitrs" ou "padrão sitrs" significa uma proteína (por exemplo, um anticorpo) de sequência conhecida, etiquetada com uma variante estável marcada isotopicamente em pelo menos um aminoácido presente na proteína.
BR112012032206A 2010-06-16 2011-06-16 comparações de amostras de proteínas BR112012032206A2 (pt)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US35526910P 2010-06-16 2010-06-16
PCT/US2011/040669 WO2011159878A1 (en) 2010-06-16 2011-06-16 Comparison of protein samples

Publications (1)

Publication Number Publication Date
BR112012032206A2 true BR112012032206A2 (pt) 2016-10-04

Family

ID=45329013

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
BR112012032206A BR112012032206A2 (pt) 2010-06-16 2011-06-16 comparações de amostras de proteínas

Country Status (15)

Country Link
US (1) US9170262B2 (pt)
EP (1) EP2582380A4 (pt)
JP (1) JP2013528818A (pt)
KR (1) KR20130088131A (pt)
CN (1) CN103025342A (pt)
AU (1) AU2011268310A1 (pt)
BR (1) BR112012032206A2 (pt)
CA (1) CA2802057A1 (pt)
MX (1) MX2012014838A (pt)
NZ (1) NZ604013A (pt)
RU (1) RU2013101779A (pt)
SG (1) SG186302A1 (pt)
TW (1) TW201207383A (pt)
WO (1) WO2011159878A1 (pt)
ZA (1) ZA201209390B (pt)

Families Citing this family (27)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ES2367891T3 (es) 2000-09-29 2011-11-10 Schering Corporation Interleucina-10 pegilada.
CN101631560B (zh) 2006-09-28 2013-12-25 默沙东公司 聚乙二醇化的白细胞介素-10治疗癌的用途
WO2012128810A1 (en) 2011-03-23 2012-09-27 Abbott Laboratories Methods and systems for the analysis of protein samples
CN102959395B (zh) * 2011-06-01 2016-03-30 津村股份有限公司 Fp的特征值作成方法以及作成装置
MX2015014438A (es) 2013-04-18 2016-05-18 Armo Biosciences Inc Metodos de uso de interleucina-10 para tratar enfermedades y trastornos.
US9823255B2 (en) 2013-06-17 2017-11-21 Armo Biosciences, Inc. Method for assessing protein identity and stability
JP6509867B2 (ja) 2013-08-30 2019-05-08 アルモ・バイオサイエンシーズ・インコーポレイテッド 疾患及び障害を治療するためにインターロイキン−１０を使用する方法
EP3058362B1 (en) * 2013-10-18 2019-01-02 Dr. Reddy's Laboratories Limited In-vitro method for determining fate of polypeptide variant
EP3068425B1 (en) 2013-11-11 2021-01-27 Armo Biosciences, Inc. Methods of using interleukin-10 for treating diseases and disorders
WO2015187295A2 (en) 2014-06-02 2015-12-10 Armo Biosciences, Inc. Methods of lowering serum cholesterol
CN107001438A (zh) 2014-10-14 2017-08-01 阿尔莫生物科技股份有限公司 白细胞介素‑15组合物及其用途
CN107106655A (zh) 2014-10-22 2017-08-29 阿尔莫生物科技股份有限公司 使用白细胞介素‑10治疗疾病和病症的方法
US10618970B2 (en) 2015-02-03 2020-04-14 Armo Biosciences, Inc. Method of treating cancer with IL-10 and antibodies that induce ADCC
JP7121496B2 (ja) 2015-05-28 2022-08-18 アルモ・バイオサイエンシーズ・インコーポレイテッド 癌治療で使用するためのペグ化インターロイキン－１０
US10398761B2 (en) 2015-08-25 2019-09-03 Armo Biosciences, Inc. Methods of using combinations of PEG-IL-10 and IL-15 for treating cancers
US11698378B2 (en) * 2015-09-25 2023-07-11 Children's Medical Center Corporation Methods and compositions for tauopathy diagnosis and treatment
CN109477819A (zh) 2016-03-02 2019-03-15 沃特世科技公司 通过质谱法鉴定和定量抗体药物缀合物中的缀合肽
WO2017165734A1 (en) * 2016-03-25 2017-09-28 Genentech, Inc. Multiplexed total antibody and antibody-conjugated drug quantification assay
CN105785048B (zh) * 2016-04-15 2017-07-28 同济大学 基于轻同位素近同重标记的整体蛋白质定量分析方法
CN105866429B (zh) * 2016-05-06 2017-12-15 同济大学 基于自带电荷同位素试剂的生物分子标记和定量分析方法
US11385238B2 (en) * 2017-06-30 2022-07-12 Amgen Inc. Methods of protein clips recovery
WO2019094752A1 (en) * 2017-11-09 2019-05-16 University Of Washington A mistranslation method for assessing the effects of amino acid substitutions on protein stability and function
CN109856253A (zh) * 2017-11-30 2019-06-07 江苏众红生物工程创药研究院有限公司 一种peg修饰蛋白多关键参数同时检测方法
TWI786265B (zh) * 2018-02-02 2022-12-11 美商再生元醫藥公司 用於表徵蛋白質二聚合之系統及方法
JP7326324B2 (ja) * 2018-04-10 2023-08-15 ディーエイチ テクノロジーズ デベロップメント プライベート リミテッド 質量分析における抗体のトップダウン分析
EA202190355A1 (ru) * 2018-08-08 2021-05-25 Ридженерон Фармасьютикалз, Инк. Применение жх-мс/мс для количественного определения белковых биомаркеров
US20220244268A1 (en) * 2019-06-06 2022-08-04 Dr. Reddy's Laboratories Limited Method for identification and absolute quantification of product-related impurities in a protein using high-resolution mass spectrometry

Family Cites Families (48)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
USRE30985E (en) 1978-01-01 1982-06-29 Serum-free cell culture media
US4634665A (en) 1980-02-25 1987-01-06 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Processes for inserting DNA into eucaryotic cells and for producing proteinaceous materials
US4399216A (en) 1980-02-25 1983-08-16 The Trustees Of Columbia University Processes for inserting DNA into eucaryotic cells and for producing proteinaceous materials
US5179017A (en) 1980-02-25 1993-01-12 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Processes for inserting DNA into eucaryotic cells and for producing proteinaceous materials
US4510245A (en) 1982-11-18 1985-04-09 Chiron Corporation Adenovirus promoter system
US4560655A (en) 1982-12-16 1985-12-24 Immunex Corporation Serum-free cell culture medium and process for making same
US4657866A (en) 1982-12-21 1987-04-14 Sudhir Kumar Serum-free, synthetic, completely chemically defined tissue culture media
GB8308235D0 (en) 1983-03-25 1983-05-05 Celltech Ltd Polypeptides
US4816567A (en) 1983-04-08 1989-03-28 Genentech, Inc. Recombinant immunoglobin preparations
US4767704A (en) 1983-10-07 1988-08-30 Columbia University In The City Of New York Protein-free culture medium
US5168062A (en) 1985-01-30 1992-12-01 University Of Iowa Research Foundation Transfer vectors and microorganisms containing human cytomegalovirus immediate-early promoter-regulatory DNA sequence
GB8516415D0 (en) 1985-06-28 1985-07-31 Celltech Ltd Culture of animal cells
US4968615A (en) 1985-12-18 1990-11-06 Ciba-Geigy Corporation Deoxyribonucleic acid segment from a virus
US5225539A (en) 1986-03-27 1993-07-06 Medical Research Council Recombinant altered antibodies and methods of making altered antibodies
US4927762A (en) 1986-04-01 1990-05-22 Cell Enterprises, Inc. Cell culture medium with antioxidant
US5476996A (en) 1988-06-14 1995-12-19 Lidak Pharmaceuticals Human immune system in non-human animal
US5223409A (en) 1988-09-02 1993-06-29 Protein Engineering Corp. Directed evolution of novel binding proteins
EP0435911B1 (en) 1988-09-23 1996-03-13 Cetus Oncology Corporation Cell culture medium for enhanced cell growth, culture longevity and product expression
US5750373A (en) 1990-12-03 1998-05-12 Genentech, Inc. Enrichment method for variant proteins having altered binding properties, M13 phagemids, and growth hormone variants
US5530101A (en) 1988-12-28 1996-06-25 Protein Design Labs, Inc. Humanized immunoglobulins
US5427908A (en) 1990-05-01 1995-06-27 Affymax Technologies N.V. Recombinant library screening methods
ES2139598T3 (es) 1990-07-10 2000-02-16 Medical Res Council Procedimientos para la produccion de miembros de parejas de union especifica.
GB9015198D0 (en) 1990-07-10 1990-08-29 Brien Caroline J O Binding substance
US5122469A (en) 1990-10-03 1992-06-16 Genentech, Inc. Method for culturing Chinese hamster ovary cells to improve production of recombinant proteins
JP4146512B2 (ja) 1991-03-01 2008-09-10 ダイアックス コープ． 小型タンパク質
DK1471142T3 (da) 1991-04-10 2009-03-09 Scripps Research Inst Heterodimere receptor-biblioteker under anvendelse af fagemider
DE4122599C2 (de) 1991-07-08 1993-11-11 Deutsches Krebsforsch Phagemid zum Screenen von Antikörpern
US6914128B1 (en) 1999-03-25 2005-07-05 Abbott Gmbh & Co. Kg Human antibodies that bind human IL-12 and methods for producing
US20060141632A1 (en) * 2000-07-25 2006-06-29 The Procter & Gamble Co. New methods and kits for sequencing polypeptides
EP1358458B1 (en) * 2000-10-19 2012-04-04 Target Discovery, Inc. Mass defect labeling for the determination of oligomer sequences
EP1420254A3 (en) * 2002-11-06 2004-05-26 F. Hoffmann-La Roche Ag Amyloid quantification
TWI364295B (en) * 2002-12-26 2012-05-21 Mountain View Pharmaceuticals Polymer conjugates of cytokines, chemokines, growth factors, polypeptide hormones and antagonists thereof with preserved receptor-binding activity
US7422865B2 (en) * 2003-01-13 2008-09-09 Agilent Technologies, Inc. Method of identifying peptides in a proteomic sample
EP1686372A4 (en) 2003-11-21 2009-04-01 Eisai R&D Man Co Ltd QUANTIFICATION METHOD USING AN ISOTOPE-MARKED INTERNAL CALIBRATION, ANALYSIS SYSTEM FOR EXECUTING THE QUANTIFICATION METHOD AND ASSOCIATED SEPARATION PROGRAM
JP2007519910A (ja) * 2004-01-28 2007-07-19 イマティクス バイオテクノロジーズ ゲーエムベーハー 腫瘍関連ペプチドの同定および定量方法
JP2005300430A (ja) * 2004-04-14 2005-10-27 Shimadzu Corp ラベル化ペプチドの特異的検出法、および片在ピークの特異的検出法
EP2306198A1 (en) * 2004-07-02 2011-04-06 Eisai R&D Management Co., Ltd. Method of analyzing protein structural affinity relationship
US7939331B2 (en) 2005-03-07 2011-05-10 Life Technologies Corporation Isotopically-labeled proteome standards
JP2006300758A (ja) * 2005-04-21 2006-11-02 Apro Life Science Institute Inc 内部標準ペプチドを用いて生体由来試料に含まれる標的タンパク質を定量する方法
CA2575507A1 (en) * 2006-05-25 2007-11-25 Her Majesty The Queen In Right Of Canada As Represented By The Minister Of The Department Of Fisheries And Oceans Quantification of vitellogenin
FI119190B (fi) * 2006-06-21 2008-08-29 Ipsat Therapies Oy Modifioitu beta-laktamaasi ja menetelmä sen valmistamiseksi
US8679771B2 (en) * 2007-01-25 2014-03-25 The Regents Of The University Of California Specific N-terminal labeling of peptides and proteins in complex mixtures
US7943330B2 (en) 2007-03-23 2011-05-17 Academia Sinica Tailored glycoproteomic methods for the sequencing, mapping and identification of cellular glycoproteins
GB0815576D0 (en) * 2008-08-28 2008-10-01 Lucas & Co Analysis of glycated proteins
US20100286927A1 (en) * 2009-05-06 2010-11-11 Agilent Technologies, Inc. Data Dependent Acquisition System for Mass Spectrometry and Methods of Use
EP2309262A1 (en) * 2009-10-06 2011-04-13 Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. Method for quantifying biomolecules
WO2011064068A1 (en) * 2009-11-30 2011-06-03 Physikron Multiplexed tandem mass spectrometry method
WO2012128810A1 (en) 2011-03-23 2012-09-27 Abbott Laboratories Methods and systems for the analysis of protein samples

Also Published As

Publication number Publication date
RU2013101779A (ru) 2014-07-27
AU2011268310A1 (en) 2013-01-10
US9170262B2 (en) 2015-10-27
MX2012014838A (es) 2013-02-07
EP2582380A4 (en) 2014-03-05
ZA201209390B (en) 2014-02-26
SG186302A1 (en) 2013-02-28
US20110312010A1 (en) 2011-12-22
JP2013528818A (ja) 2013-07-11
KR20130088131A (ko) 2013-08-07
NZ604013A (en) 2014-10-31
CN103025342A (zh) 2013-04-03
CA2802057A1 (en) 2011-12-22
EP2582380A1 (en) 2013-04-24
TW201207383A (en) 2012-02-16
WO2011159878A1 (en) 2011-12-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
BR112012032206A2 (pt) comparações de amostras de proteínas
BR112017018821A2 (pt) métodos para quantificação de níveis de insulina através de espectrometria de massa
BR112014026613A2 (pt) método para determinação quantitativa de impureza presente em composição de produto de peptídeo, kit de reagentes para determinação da quantidade de impurezas em composição de produto lixisenatide e método para controle de qualidade de composição compreendendo um produto de peptídeo de exendina
BR112017004899A2 (pt) detecção de proteínas mal dobradas
BR112013023540A2 (pt) anticorpo, kit e método para a determinação de peptídeos amilóides
BR112015011317A2 (pt) métodos para preparar conjugados de proteínas contendo dissulfeto
EA201792045A1 (ru) Новый комплекс, содержащий проникающий в клетку пептид, карго-молекулу и пептидный агонист tlr
BR112016013138A2 (pt) mistura de peptídeos
BR112014017645A2 (pt) molécula imunológica; polinucleotídeo; vetor; célula recombinante que compreende o vetor; método para produzir molécula imunológica; anticorpo ou fragmento de ligação de antígeno do mesmo; composição farmacêutica; uso da molécula imunológica, do anticorpo, do fragmento de ligação de anticorpo ou da composição farmacêutica; método diagnóstico para diagnosticar uma doença em um indivíduo, em que a doença é selecionada do grupo que consiste em câncer, uma doença autoimune ou uma doença infecciosa; ensaio para diagnosticar uma doença em uma amostra de tecido tomada de um indivíduo; uso de um anticorpo ou um fragmento que se liga especificamente à seq id no: 10; e método diagnóstico para determinar se realiza o uso ou administra a composição
BR112015008036A2 (pt) população de peptídeos isolados, método para detectar em uma amostra um anticorpo, método para diagnosticar erliquiose monocítica e/ou granulocítica e kit
BR112018071686A2 (pt) exibição de proteínas integrais de membrana em vírions extracelulares envelopados de poxvírus
BR112017006598A2 (pt) anticorpo de repetições antidipeptídeo derivado de ser humano (dprs)
BR112015005887A2 (pt) quantificação de tiroglobulina por espectroscopia de massa
BR112015026246A2 (pt) dispositivo de transferência de coleta de sangue e separação de sangue e sistema de teste
MX2018009339A (es) Métodos para la identificación y análisis de secuencias de aminoácidos de las proteínas.
BR112018013801A2 (pt) ?anticorpo, peptídeo, molécula de ácido nucleico, vetor, célula ou animal não humano, composição, kit, usos de um anticorpo, de um peptídeo, de uma molécula, ou de um vetor, métodos para determinar se células que expressam cd9 estão presentes em uma amostra, para produzir um anticorpo ou parte funcional ou equivalente funcional, para tratar e/ou evitar um distúrbio associado às células que expressam cd9 e para produzir uma célula imune específica para cd9 ou um anticorpo específico para cd9, método ex vivo para determinar se um indivíduo está sofrendo de um câncer positivo para cd9, composição imunogênica, e, kit de diagnóstico?
BR112016000585A2 (pt) modificações quimioenzimáticas sítio-específicas de proteína
AR105379A1 (es) Dispositivo para detectar proteínas mal plegadas y sus métodos de uso
BR112013032088A2 (pt) "polipeptídeo, composição farmacêutica e seu uso"
BR112013023978A2 (pt) "polipeptídeo com afinidade por proteínas de choque térmico e seu uso em diagnóstico de doença infecciosa, produção de resposta imune e tratamento 5 de câncer, bem como ácido nucleico, composição e método de fracionamento de substância para pesquisa ou análise clínica de amostra biológica".
BR112019009565A2 (pt) método de avaliação da cinética molecular e método de rastreamento
WO2011109112A3 (en) Method of detecting tau protein and tau fragments in serum
BR112017020606A2 (pt) ?composições e métodos de uso de peptídeos de interleucina-10 e anticorpos anti-interleucina?
GB2522131A (en) Isotopic labelling of proteins
MX2015015023A (es) Metodo para la determinacion de cobre libre.

Legal Events

Date Code Title Description
B08F Application fees: application dismissed [chapter 8.6 patent gazette]
B08K Patent lapsed as no evidence of payment of the annual fee has been furnished to inpi [chapter 8.11 patent gazette]
B350 Update of information on the portal [chapter 15.35 patent gazette]