BR112012032206A2 - comparações de amostras de proteínas - Google Patents

comparações de amostras de proteínas

Info

Publication number
BR112012032206A2
BR112012032206A2 BR112012032206A BR112012032206A BR112012032206A2 BR 112012032206 A2 BR112012032206 A2 BR 112012032206A2 BR 112012032206 A BR112012032206 A BR 112012032206A BR 112012032206 A BR112012032206 A BR 112012032206A BR 112012032206 A2 BR112012032206 A2 BR 112012032206A2
Authority
BR
Brazil
Prior art keywords
protein
sample
sitrs
digestion
comparisons
Prior art date
Application number
BR112012032206A
Other languages
English (en)
Inventor
Anton V Manuilov
David H Lee
Original Assignee
Abbvie Inc
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Abbvie Inc filed Critical Abbvie Inc
Publication of BR112012032206A2 publication Critical patent/BR112012032206A2/pt

Links

Classifications

    • GPHYSICS
    • G01MEASURING; TESTING
    • G01NINVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6803General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
    • G01N33/6848Methods of protein analysis involving mass spectrometry

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)

Abstract

comparações de amostras de proteínas. são fornecidos métodos para detectar quantitativa e/ou quantitativamente a presença de mutações, modificações ou impurezas em uma amostra de proteína. os métodos utilizam variantes de aminoácidos isotopicamente marcadas incorporadoas nas proteínas antes da digestão de proteínas, de forma a permitir comparações de duas amostras de proteína em cromatografia líquida bottom-up. as medições obtidas pela presenta invenção levam em consideração não apenas as massas dos peptídeos gerados durante a digestão proteolítica, mas também a abundância de cada peptídeo resultante. a medição da abundância de peptídeos pela ms é permitida através da utilização de uma amostra sitrs que é misturada com uma proteína não-marcada antes da digestão das proteínas. tal como aqui utilizado, o termo "amostra sitrs" ou "padrão sitrs" significa uma proteína (por exemplo, um anticorpo) de sequência conhecida, etiquetada com uma variante estável marcada isotopicamente em pelo menos um aminoácido presente na proteína.
BR112012032206A 2010-06-16 2011-06-16 comparações de amostras de proteínas BR112012032206A2 (pt)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US35526910P 2010-06-16 2010-06-16
PCT/US2011/040669 WO2011159878A1 (en) 2010-06-16 2011-06-16 Comparison of protein samples

Publications (1)

Publication Number Publication Date
BR112012032206A2 true BR112012032206A2 (pt) 2016-10-04

Family

ID=45329013

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
BR112012032206A BR112012032206A2 (pt) 2010-06-16 2011-06-16 comparações de amostras de proteínas

Country Status (15)

Country Link
US (1) US9170262B2 (pt)
EP (1) EP2582380A4 (pt)
JP (1) JP2013528818A (pt)
KR (1) KR20130088131A (pt)
CN (1) CN103025342A (pt)
AU (1) AU2011268310A1 (pt)
BR (1) BR112012032206A2 (pt)
CA (1) CA2802057A1 (pt)
MX (1) MX2012014838A (pt)
NZ (1) NZ604013A (pt)
RU (1) RU2013101779A (pt)
SG (1) SG186302A1 (pt)
TW (1) TW201207383A (pt)
WO (1) WO2011159878A1 (pt)
ZA (1) ZA201209390B (pt)

Families Citing this family (27)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
EP1324779B1 (en) 2000-09-29 2011-07-20 Schering Corporation Pegylated interleukin-10
NZ597098A (en) 2006-09-28 2013-05-31 Merck Sharp & Dohme Use of pegylated il-10 to treat cancer
WO2012128810A1 (en) 2011-03-23 2012-09-27 Abbott Laboratories Methods and systems for the analysis of protein samples
EP2717045B1 (en) 2011-06-01 2021-08-11 Tsumura & Co. Creation method, creation program, and creation device for characteristic amount of pattern or fingerprint
JP2016519108A (ja) 2013-04-18 2016-06-30 アルモ・バイオサイエンシーズ・インコーポレイテッド インターロイキン−10を疾病及び疾患の治療に用いる方法
EP3010527B1 (en) 2013-06-17 2018-08-08 Armo Biosciences, Inc. Method for assessing protein identity and stability
AU2014311432A1 (en) 2013-08-30 2016-03-03 Armo Biosciences, Inc. Methods of using interleukin-10 for treating diseases and disorders
EP3058362B1 (en) * 2013-10-18 2019-01-02 Dr. Reddy's Laboratories Limited In-vitro method for determining fate of polypeptide variant
KR20160079114A (ko) 2013-11-11 2016-07-05 아르모 바이오사이언시스 인코포레이티드 질환 및 장애를 치료하기 위한 인터류킨-10을 사용하는 방법
WO2015187295A2 (en) 2014-06-02 2015-12-10 Armo Biosciences, Inc. Methods of lowering serum cholesterol
KR20170068553A (ko) 2014-10-14 2017-06-19 아르모 바이오사이언시스 인코포레이티드 인터류킨-15 조성물 및 이의 용도
ES2941234T3 (es) 2014-10-22 2023-05-19 Armo Biosciences Inc Métodos de uso de la interleucina-10 para el tratamiento de enfermedades y trastornos
WO2016126615A1 (en) 2015-02-03 2016-08-11 Armo Biosciences, Inc. Methods of using interleukin-10 for treating diseases and disorders
AU2016268403A1 (en) 2015-05-28 2017-12-07 Armo Biosciences, Inc. Pegylated interleukin-10 for use in treating cancer
AU2016312510A1 (en) 2015-08-25 2018-03-08 Armo Biosciences, Inc. Methods of using Interleukin-10 for treating diseases and disorders
WO2017053739A1 (en) * 2015-09-25 2017-03-30 Steen Judith Methods and compositions for tauopathy diagnosis and treatment
WO2017151892A2 (en) * 2016-03-02 2017-09-08 Waters Technologies Corporation Identification and quantification of conjugated peptides in antibody drug conjugates by mass spectrometry
WO2017165734A1 (en) * 2016-03-25 2017-09-28 Genentech, Inc. Multiplexed total antibody and antibody-conjugated drug quantification assay
CN105785048B (zh) * 2016-04-15 2017-07-28 同济大学 基于轻同位素近同重标记的整体蛋白质定量分析方法
CN105866429B (zh) * 2016-05-06 2017-12-15 同济大学 基于自带电荷同位素试剂的生物分子标记和定量分析方法
US11385238B2 (en) * 2017-06-30 2022-07-12 Amgen Inc. Methods of protein clips recovery
WO2019094752A1 (en) * 2017-11-09 2019-05-16 University Of Washington A mistranslation method for assessing the effects of amino acid substitutions on protein stability and function
CN109856253A (zh) * 2017-11-30 2019-06-07 江苏众红生物工程创药研究院有限公司 一种peg修饰蛋白多关键参数同时检测方法
TWI786265B (zh) * 2018-02-02 2022-12-11 美商再生元醫藥公司 用於表徵蛋白質二聚合之系統及方法
CN111936860A (zh) * 2018-04-10 2020-11-13 Dh科技发展私人贸易有限公司 质谱法中的抗体的自上而下分析
CN112888793A (zh) * 2018-08-08 2021-06-01 里珍纳龙药品有限公司 使用lc-ms/ms对蛋白质生物标志物进行定量
US20220244268A1 (en) * 2019-06-06 2022-08-04 Dr. Reddy's Laboratories Limited Method for identification and absolute quantification of product-related impurities in a protein using high-resolution mass spectrometry

Family Cites Families (48)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
USRE30985E (en) 1978-01-01 1982-06-29 Serum-free cell culture media
US4399216A (en) 1980-02-25 1983-08-16 The Trustees Of Columbia University Processes for inserting DNA into eucaryotic cells and for producing proteinaceous materials
US4634665A (en) 1980-02-25 1987-01-06 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Processes for inserting DNA into eucaryotic cells and for producing proteinaceous materials
US5179017A (en) 1980-02-25 1993-01-12 The Trustees Of Columbia University In The City Of New York Processes for inserting DNA into eucaryotic cells and for producing proteinaceous materials
US4510245A (en) 1982-11-18 1985-04-09 Chiron Corporation Adenovirus promoter system
US4560655A (en) 1982-12-16 1985-12-24 Immunex Corporation Serum-free cell culture medium and process for making same
US4657866A (en) 1982-12-21 1987-04-14 Sudhir Kumar Serum-free, synthetic, completely chemically defined tissue culture media
GB8308235D0 (en) 1983-03-25 1983-05-05 Celltech Ltd Polypeptides
US4816567A (en) 1983-04-08 1989-03-28 Genentech, Inc. Recombinant immunoglobin preparations
US4767704A (en) 1983-10-07 1988-08-30 Columbia University In The City Of New York Protein-free culture medium
US5168062A (en) 1985-01-30 1992-12-01 University Of Iowa Research Foundation Transfer vectors and microorganisms containing human cytomegalovirus immediate-early promoter-regulatory DNA sequence
GB8516415D0 (en) 1985-06-28 1985-07-31 Celltech Ltd Culture of animal cells
US4968615A (en) 1985-12-18 1990-11-06 Ciba-Geigy Corporation Deoxyribonucleic acid segment from a virus
US5225539A (en) 1986-03-27 1993-07-06 Medical Research Council Recombinant altered antibodies and methods of making altered antibodies
US4927762A (en) 1986-04-01 1990-05-22 Cell Enterprises, Inc. Cell culture medium with antioxidant
US5476996A (en) 1988-06-14 1995-12-19 Lidak Pharmaceuticals Human immune system in non-human animal
US5223409A (en) 1988-09-02 1993-06-29 Protein Engineering Corp. Directed evolution of novel binding proteins
DE68925971T2 (de) 1988-09-23 1996-09-05 Cetus Oncology Corp Zellenzuchtmedium für erhöhtes zellenwachstum, zur erhöhung der langlebigkeit und expression der produkte
US5530101A (en) 1988-12-28 1996-06-25 Protein Design Labs, Inc. Humanized immunoglobulins
US5427908A (en) 1990-05-01 1995-06-27 Affymax Technologies N.V. Recombinant library screening methods
AU665190B2 (en) 1990-07-10 1995-12-21 Cambridge Antibody Technology Limited Methods for producing members of specific binding pairs
GB9015198D0 (en) 1990-07-10 1990-08-29 Brien Caroline J O Binding substance
US5122469A (en) 1990-10-03 1992-06-16 Genentech, Inc. Method for culturing Chinese hamster ovary cells to improve production of recombinant proteins
DE69129154T2 (de) 1990-12-03 1998-08-20 Genentech, Inc., South San Francisco, Calif. Verfahren zur anreicherung von proteinvarianten mit geänderten bindungseigenschaften
EP0575485A1 (en) 1991-03-01 1993-12-29 Dyax Corp. Process for the development of binding mini-proteins
ATE269401T1 (de) 1991-04-10 2004-07-15 Scripps Research Inst Bibliotheken heterodimerer rezeptoren mittels phagemiden
DE4122599C2 (de) 1991-07-08 1993-11-11 Deutsches Krebsforsch Phagemid zum Screenen von Antikörpern
US6914128B1 (en) 1999-03-25 2005-07-05 Abbott Gmbh & Co. Kg Human antibodies that bind human IL-12 and methods for producing
US20060141632A1 (en) * 2000-07-25 2006-06-29 The Procter & Gamble Co. New methods and kits for sequencing polypeptides
AU2002253825B8 (en) * 2000-10-19 2007-03-22 Target Discovery, Inc. Mass defect labeling for the determination of oligomer sequences
EP1420254A3 (en) 2002-11-06 2004-05-26 F. Hoffmann-La Roche Ag Amyloid quantification
BR0317752A (pt) * 2002-12-26 2005-11-22 Mountain View Pharmaceuticals Conjugados poliméricos de citocinas, quimiocinas, fatores do crescimento, hormÈnios polipeptìdicos e seus antagonistas com atividade de ligação a receptores conservada
US7422865B2 (en) * 2003-01-13 2008-09-09 Agilent Technologies, Inc. Method of identifying peptides in a proteomic sample
EP1686372A4 (en) 2003-11-21 2009-04-01 Eisai R&D Man Co Ltd QUANTIFICATION METHOD USING AN ISOTOPE-MARKED INTERNAL CALIBRATION, ANALYSIS SYSTEM FOR EXECUTING THE QUANTIFICATION METHOD AND ASSOCIATED SEPARATION PROGRAM
EP1714157A2 (en) * 2004-01-28 2006-10-25 Immatics Biotechnologies GmbH Method for identifying and quantifying of tumour-associated peptides
JP2005300430A (ja) * 2004-04-14 2005-10-27 Shimadzu Corp ラベル化ペプチドの特異的検出法、および片在ピークの特異的検出法
JP4469853B2 (ja) * 2004-07-02 2010-06-02 エーザイ・アール・アンド・ディー・マネジメント株式会社 タンパク質構造親和性相関の解析方法
US7939331B2 (en) 2005-03-07 2011-05-10 Life Technologies Corporation Isotopically-labeled proteome standards
JP2006300758A (ja) * 2005-04-21 2006-11-02 Apro Life Science Institute Inc 内部標準ペプチドを用いて生体由来試料に含まれる標的タンパク質を定量する方法
CA2575507A1 (en) * 2006-05-25 2007-11-25 Her Majesty The Queen In Right Of Canada As Represented By The Minister Of The Department Of Fisheries And Oceans Quantification of vitellogenin
FI119190B (fi) * 2006-06-21 2008-08-29 Ipsat Therapies Oy Modifioitu beta-laktamaasi ja menetelmä sen valmistamiseksi
CA2675776A1 (en) * 2007-01-25 2008-07-31 The Regents Of The University Of California Specific n-terminal labeling of peptides and proteins in complex mixtures
US7943330B2 (en) * 2007-03-23 2011-05-17 Academia Sinica Tailored glycoproteomic methods for the sequencing, mapping and identification of cellular glycoproteins
GB0815576D0 (en) * 2008-08-28 2008-10-01 Lucas & Co Analysis of glycated proteins
US20100286927A1 (en) * 2009-05-06 2010-11-11 Agilent Technologies, Inc. Data Dependent Acquisition System for Mass Spectrometry and Methods of Use
EP2309262A1 (en) 2009-10-06 2011-04-13 Max-Planck-Gesellschaft zur Förderung der Wissenschaften e.V. Method for quantifying biomolecules
JP5727503B2 (ja) * 2009-11-30 2015-06-03 フィジクロン ソシエテアノニム 多重タンデム質量分析法
WO2012128810A1 (en) 2011-03-23 2012-09-27 Abbott Laboratories Methods and systems for the analysis of protein samples

Also Published As

Publication number Publication date
TW201207383A (en) 2012-02-16
CA2802057A1 (en) 2011-12-22
JP2013528818A (ja) 2013-07-11
NZ604013A (en) 2014-10-31
MX2012014838A (es) 2013-02-07
EP2582380A4 (en) 2014-03-05
CN103025342A (zh) 2013-04-03
EP2582380A1 (en) 2013-04-24
AU2011268310A1 (en) 2013-01-10
ZA201209390B (en) 2014-02-26
RU2013101779A (ru) 2014-07-27
KR20130088131A (ko) 2013-08-07
US20110312010A1 (en) 2011-12-22
WO2011159878A1 (en) 2011-12-22
US9170262B2 (en) 2015-10-27
SG186302A1 (en) 2013-02-28

Similar Documents

Publication Publication Date Title
BR112012032206A2 (pt) comparações de amostras de proteínas
BR112017018821A2 (pt) métodos para quantificação de níveis de insulina através de espectrometria de massa
BR112014026613A2 (pt) método para determinação quantitativa de impureza presente em composição de produto de peptídeo, kit de reagentes para determinação da quantidade de impurezas em composição de produto lixisenatide e método para controle de qualidade de composição compreendendo um produto de peptídeo de exendina
BR112013023540A2 (pt) anticorpo, kit e método para a determinação de peptídeos amilóides
BR112015011317A2 (pt) métodos para preparar conjugados de proteínas contendo dissulfeto
BR112016013138A2 (pt) mistura de peptídeos
EA201792045A1 (ru) Новый комплекс, содержащий проникающий в клетку пептид, карго-молекулу и пептидный агонист tlr
BR112014017645A2 (pt) molécula imunológica; polinucleotídeo; vetor; célula recombinante que compreende o vetor; método para produzir molécula imunológica; anticorpo ou fragmento de ligação de antígeno do mesmo; composição farmacêutica; uso da molécula imunológica, do anticorpo, do fragmento de ligação de anticorpo ou da composição farmacêutica; método diagnóstico para diagnosticar uma doença em um indivíduo, em que a doença é selecionada do grupo que consiste em câncer, uma doença autoimune ou uma doença infecciosa; ensaio para diagnosticar uma doença em uma amostra de tecido tomada de um indivíduo; uso de um anticorpo ou um fragmento que se liga especificamente à seq id no: 10; e método diagnóstico para determinar se realiza o uso ou administra a composição
BR112015019969A2 (pt) sistemas de célula de fluxo e métodos para análise de partículas em amostras de sangue
BRPI0816117B8 (pt) anticorpo monoclonal isolado ou fragmento do mesmo, composiçãofarmacêutica, kit para tratamento de desordens relacionadas com colesterol, e, uso de uma proteína de ligação de antígeno ou de um anticorpo monoclonal ou fragmento do mesmo
BR112015008036A2 (pt) população de peptídeos isolados, método para detectar em uma amostra um anticorpo, método para diagnosticar erliquiose monocítica e/ou granulocítica e kit
BR112018071686A2 (pt) exibição de proteínas integrais de membrana em vírions extracelulares envelopados de poxvírus
BR112017006598A2 (pt) anticorpo de repetições antidipeptídeo derivado de ser humano (dprs)
BR112015026246A2 (pt) dispositivo de transferência de coleta de sangue e separação de sangue e sistema de teste
Lewis et al. Mass spectrometric identification of dystrophin isoform Dp427 by on-membrane digestion of sarcolemma from skeletal muscle
MX2018009339A (es) Métodos para la identificación y análisis de secuencias de aminoácidos de las proteínas.
BR112019000098A2 (pt) proteína de fornecimento ao cérebro, método de tratamento e/ou profilaxia de distúrbios cerebrais em mamíferos que possuem ou encontram-se em risco de desenvolver o mencionado distúrbio e método de diagnóstico e/ou detecção de distúrbios cerebrais em mamíferos suspeitos de possuir ou que se encontram em risco de desenvolver o mencionado distúrbio
BR112016000585A2 (pt) modificações quimioenzimáticas sítio-específicas de proteína
BR112018013801A2 (pt) ?anticorpo, peptídeo, molécula de ácido nucleico, vetor, célula ou animal não humano, composição, kit, usos de um anticorpo, de um peptídeo, de uma molécula, ou de um vetor, métodos para determinar se células que expressam cd9 estão presentes em uma amostra, para produzir um anticorpo ou parte funcional ou equivalente funcional, para tratar e/ou evitar um distúrbio associado às células que expressam cd9 e para produzir uma célula imune específica para cd9 ou um anticorpo específico para cd9, método ex vivo para determinar se um indivíduo está sofrendo de um câncer positivo para cd9, composição imunogênica, e, kit de diagnóstico?
AR105379A1 (es) Dispositivo para detectar proteínas mal plegadas y sus métodos de uso
BR112013032088A2 (pt) "polipeptídeo, composição farmacêutica e seu uso"
BR112013023978A2 (pt) "polipeptídeo com afinidade por proteínas de choque térmico e seu uso em diagnóstico de doença infecciosa, produção de resposta imune e tratamento 5 de câncer, bem como ácido nucleico, composição e método de fracionamento de substância para pesquisa ou análise clínica de amostra biológica".
BR112019009565A2 (pt) método de avaliação da cinética molecular e método de rastreamento
BR112016002150A2 (pt) proteínas de ligação de fator h de ocorrência natural (fhbp) e métodos de uso das mesmas
WO2011109112A3 (en) Method of detecting tau protein and tau fragments in serum

Legal Events

Date Code Title Description
B08F Application fees: application dismissed [chapter 8.6 patent gazette]
B08K Patent lapsed as no evidence of payment of the annual fee has been furnished to inpi [chapter 8.11 patent gazette]
B350 Update of information on the portal [chapter 15.35 patent gazette]