WO2022070494A1 - データ処理システム、データ処理方法、及び情報処理装置を用いてデータ処理方法を実行するためのコンピュータプログラム - Google Patents

データ処理システム、データ処理方法、及び情報処理装置を用いてデータ処理方法を実行するためのコンピュータプログラム Download PDF

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隆二 澤田
周平 山本
剛士 大野
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株式会社島津製作所
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    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12MAPPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
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    • C12M41/30Means for regulation, monitoring, measurement or control, e.g. flow regulation of concentration
    • C12M41/36Means for regulation, monitoring, measurement or control, e.g. flow regulation of concentration of biomass, e.g. colony counters or by turbidity measurements

Definitions

  • the present invention relates to a computer program for executing a data processing method using a data processing system, a data processing method, and an information processing apparatus.
  • the folder structure has a hierarchical structure
  • the work of simultaneously checking and comparing multiple data stored in different folders becomes complicated, which may cause work mistakes.
  • child folders or data files are linked to the lower layer of the parent folder, so it is not easy to change the structure of the folder structure once built and rebuild another data structure. not.
  • the present invention has been made in view of the above problems, and an object of the present invention is to facilitate the management of a large number of data having different incidental information.
  • the data processing system is a data processing system having an information processing device and an information display device, and the information processing device uses a plurality of data acquired by a predetermined data acquisition device to obtain the data and the respective data.
  • a data registration unit configured to associate with at least one type of incidental information of the data and register it as data handled by the data processing system, and a registration data holding unit that holds the data registered by the data registration unit. Using the incidental information of an arbitrarily selected type, the plurality of data held in the registered data holding unit are grouped so that the data having the common incidental information belong to the same group, and the said. It is configured to display a data tree creation unit that creates a virtual data tree showing a state in which a plurality of data are divided into groups, and a data tree created by the data tree creation unit on the information display device. It is equipped with an information display unit.
  • the data processing method is optionally selected from a registration step of registering a plurality of data acquired by a predetermined data acquisition device while associating the data with at least one type of incidental information of each of the data.
  • the plurality of data registered in the registration step are grouped so that the data having the same incidental information belong to the same group, and the plurality of data are grouped. It includes a tree creation step for creating a virtual data tree indicating a state divided for each, and a display step for displaying the data tree created in the tree creation step on a predetermined information display device.
  • the "predetermined data acquisition device” includes a microscope for imaging the inside of the cell culture well, an analysis device for analyzing the image acquired by such a microscope, and the like.
  • the data acquisition device is a microscope that images the inside of the cell culture well
  • the acquired data is image data.
  • the data acquisition device is an analysis device that analyzes such an image
  • the acquired data is numerical data such as the number of cells (cells) in the image and the ratio of the area occupied by the cell region in the image.
  • the "accompanying information" of these data includes information about the imaged wells (well position on the culture plate, etc.), the type of microscope used for imaging, the number of days of cell culture, and the number of cell passages. Can include.
  • a plurality of data acquired by a predetermined data acquisition device are not distributed and managed in a plurality of folders forming a specific hierarchical structure, but are managed by associating the accompanying information with each of the plurality of data.
  • the accompanying information associated with each data acts as a label indicating the attributes of each data, and when the user selects the type of accompanying information that he / she wants to function effectively as a label, the selected type of accompanying information is common.
  • Each data is grouped so that the data to be processed (that is, the information such as the numerical value input as the incidental information of the type is the same) belongs to the same group, and a folder structure having a hierarchical structure is constructed. Create and display a virtual data tree like this.
  • each data so that the data having the selected type of incidental information in common belongs to the same group. Is divided into groups, and a virtual data tree is automatically created and displayed as if a folder structure with a hierarchical structure was built, so the user actually built a folder structure with a hierarchical structure. Even without it, a large number of data with different accompanying information can be easily managed.
  • FIG. 1 It is a block diagram which shows one Example of a data processing system. It is a flowchart which shows an example of a series of operations about data registration in the same Example. This is an example of the screen displayed when registering data. It is a conceptual diagram of the data structure after a plurality of data are registered. It is a flowchart which shows the operation for displaying a virtual data tree in the same embodiment.
  • This is an example of a data tree created when the priority of incidental information used for grouping is changed from the data tree of FIG.
  • This is an example of a data tree created when one of the accompanying information used for grouping is disabled.
  • This is an example of a data tree that is the basis for creating a graph. This is an example of a graph created based on the data tree of FIG.
  • FIG. 1 shows a schematic configuration of a data processing system.
  • the data processing system 1 includes an information processing device 2 and an information display device 4.
  • the information processing device 2 has a function of taking in a plurality of data acquired by the data acquisition device 6 and performing predetermined processing.
  • the information processing device 2 is a computer device (for example, a personal computer) provided with an information storage medium such as a hard disk drive and an electronic circuit provided with a CPU (central processing unit), and is a computer for realizing each function described later.
  • the program was introduced.
  • the information display device 4 is a display (for example, a liquid crystal display) communicably connected to the information processing device 2.
  • Examples of the data acquisition device 6 include a microscope for imaging the inside of each well of the cell culture plate, an analysis device for analyzing an image acquired by such a microscope, and the like.
  • the information processing device 2 is a data acquisition device for acquiring analysis data. It also functions as 6.
  • the information processing apparatus 2 includes a data registration unit 8, a registration data holding unit 10, a data tree creation unit 12, an information display unit 14, and a graph creation unit 16.
  • the data registration unit 8, the data tree creation unit 12, the information display unit 14, and the graph creation unit 16 are functions realized by executing a predetermined computer program introduced in the information processing apparatus 2 by the CPU.
  • the registration data holding unit 10 is a function realized by a part of the storage area of the information storage medium in the information processing apparatus 2.
  • the data registration unit 8 is configured to associate the data acquired by the data acquisition device 6 with the accompanying information of the data and register it as the data handled by the data processing system 1.
  • the registration data holding unit 10 is configured to hold the data registered by the data registration unit 8.
  • the data registration unit 8 displays a data registration screen as shown in FIG. 3 on the information display device 4.
  • the user refers to the data captured or can be captured in the information processing apparatus 2, selects the data to be registered, and inputs the accompanying information of the data (step). 101).
  • FIG. 3 is an example of a screen for registering image data of a cell culture well imaged by a microscope, and the number of cell passages and the number of culture days are input as accompanying information of the data.
  • the data registration unit 8 inputs the selected data and the input accompanying information.
  • the information is associated with each other (step 102) and registered as data handled by the data processing system 1 (step 103).
  • the data registered by the data registration unit 8 is stored in the registration data holding unit 10 in a state associated with the accompanying information (step 104).
  • the data tree creating unit 12 of the information processing apparatus 2 groups a plurality of data held in the registered data holding unit 10 by the accompanying information associated with each data, and creates a virtual data tree having a hierarchical structure. It is configured to do.
  • the data tree is a format that shows a list of states in which each data is distributed to a plurality of folders with titles corresponding to the accompanying information of each data.
  • the creation of the data tree by the data tree creating unit 12 is executed, for example, when presenting a plurality of data held in the registered data holding unit 10 to the user.
  • the information display unit 14 is configured to display the virtual data tree created by the data tree creation unit 12 on the information display device 4.
  • the data tree creating unit 12 reads the target registered data from the registered data holding unit 10 (step 201), and uses the registered data as the registered data.
  • the registered data read out is grouped using the associated incidental information (step 202), and a hierarchical data tree based on the grouping is created (step 203).
  • the information display unit 14 displays the virtual data tree created by the data tree creation unit 12 on the information display device 4 (step 204).
  • the accompanying information associated with the registered data whether or not to use it for grouping and the priority used for grouping are set in advance.
  • These settings can be arbitrarily changed by the user.
  • all incidental information is used for grouping, and each incidental information has a default priority.
  • a data tree based on the default priority is created by the data tree creation unit 12, and the created data tree is used for grouping and incidental information thereof. It is displayed on the information display device 4 together with the grouping condition indicating the priority relationship of.
  • the user can switch whether each incidental information is used for grouping (valid) or not used for grouping (invalid), and can replace the priority relation of each incidental information, and can arbitrarily set the grouping conditions. Can be changed. Such an operation of changing the grouping condition can be performed by dragging with a mouse, key input, or the like.
  • the data tree creation unit 12 immediately creates a data tree based on the changed grouping condition and displays it on the information display device 4. As a result, the data tree based on the grouping conditions desired by the user is displayed in real time.
  • FIG. 6 is an example of a virtual data tree created by the data tree creation unit 12.
  • Each of the registered data A to H is associated with ancillary information of the type of "culture days” and "passage number", and any type of ancillary information is set to be used for grouping.
  • the types of incidental information used for grouping and the grouping conditions indicating their priority are displayed.
  • the priority of "culture days” is higher than the priority of "passage number”.
  • the group of "culture days: 1" data A to D
  • the group of "culture days: 2" data E to F
  • FIG. 7 is an example of a data tree created when the priority relationship of incidental information is changed from the data tree of FIG.
  • the group of "number of passages: 1" and the group of “number of passages: 2" are set so that the data having the same number of passages first belongs to the same group.
  • each group it is divided into a group of "culture days: 1" and a group of "culture days: 2".
  • a hierarchical data tree as shown in the figure is created.
  • FIG. 8 is an example of a data tree created when the accompanying information “culture days” used for grouping in the example of FIG. 7 is set to invalid (not used for grouping).
  • each data A to H was grouped only by the valid accompanying information "passage number", and the group was "passage number: 1".
  • a data tree consisting of a group of "passage number: 2" is created.
  • arbitrary incidental information is grouped by using an arbitrary priority relationship as a data tree. Can be displayed.
  • the "data" handled by the data processing system 1 is image data when the data acquisition device 6 is a microscope that captures an image of a cell culture well, but the information processing device 2 performs analysis processing of the image.
  • Numerical data such as "the number of cells” and “the ratio of the area occupied by the cell region” obtained by the information processing apparatus 2 itself analyzing the image data when the function is provided may be included in the "data".
  • the data registration unit 8 registers the numerical data obtained by analyzing the image data in association with the accompanying information such as "culture days” and "passage number” associated with the original image data. , Can be configured to be held by the registered data holding unit 10.
  • the graph creating unit 16 of the information processing apparatus 2 creates a data tree by using the numerical value of each registered data and the accompanying information associated with each registered data. It is configured to create a graph based on the data tree created by Part 12. An example of the relationship between the data tree created by the data tree creation unit 12 and the graph created by the graph creation unit 16 will be described below with reference to FIGS. 9 and 10.
  • FIG. 9 is a data tree showing a state in which the registered numerical data A to L are grouped according to the accompanying information “culture days” and “passage number”.
  • the graph creation unit 16 displays the lowermost layer (lowest priority) incidental information as shown in FIG.
  • the horizontal axis is the "passage number”
  • the vertical axis is the numerical value for expressing the numerical value of each data (here, the cell count number)
  • the "culture days" which is the second accompanying information from the bottom layer, is used as a legend.
  • Create a graph In this example, since there are two numerical data (for example, numerical data of 1 culture day and 1 passage number are data A and B) for each culture day, the average value thereof is displayed in a graph.
  • the graph created by the graph creating unit 16 is not limited to the bar graph as shown in FIG. 10, but may be various graphs such as a line graph and a pie chart.
  • An embodiment of the data processing system is a data processing system including an information processing device and an information display device, wherein the information processing device uses a plurality of data acquired by a predetermined data acquisition device to obtain the data.
  • a data registration unit configured to associate with at least one type of incidental information of each of the above data and register it as data handled by the data processing system, and registration data holding the data registered by the data registration unit.
  • the plurality of data held in the registered data holding unit are grouped so that the data having the common incidental information belongs to the same group.
  • the data tree creation unit that creates a virtual data tree showing the state in which the plurality of data are divided into groups and the data tree created by the data tree creation unit are displayed on the information display device. It is equipped with an information display unit configured in.
  • the data registration unit is configured to register a plurality of types of incidental information in association with each of the plurality of data
  • the data tree creation unit is configured.
  • the higher priority type of the incidental information preset for each type of the incidental information is located in the upper layer. It is configured to create the data tree of the structure.
  • the priority may be configured to be arbitrarily changeable. Then, the user can arbitrarily change the hierarchical structure of the data tree, and data management becomes easy.
  • the data is an image of cell culture or a numerical value obtained by analyzing the image.
  • the accompanying information may include at least one of the number of passages and the number of days of culture.
  • the data is a numerical value acquired by analysis or analysis.
  • the information processing apparatus is based on the structure of the data tree created by the data tree creation unit, and has a first axis showing each numerical value of the plurality of data and at least used for the grouping.
  • a graph creating unit may be provided for creating a graph having a second axis indicating one of the incidental information.
  • An embodiment of the data processing method includes a registration step of registering a plurality of data acquired by a predetermined data acquisition device in association with the data and at least one type of incidental information of the data. Using the incidental information of an arbitrarily selected type, the plurality of data registered in the registration step are grouped so that the data having the common incidental information belong to the same group, and the plurality of data are grouped. It includes a tree creation step that creates a virtual data tree that shows the state in which data is divided into groups, and a display step that displays the data tree created in the tree creation step on a predetermined information display device. There is.
  • a plurality of types of the incidental information are associated and registered with each of the plurality of data in the registration step, and preset for each type of the incidental information in the tree creation step.
  • the higher priority type of the incidental information is to create the data tree having a hierarchical structure located at the upper layer.
  • the order change step for changing the priority can be further provided. Then, the user can arbitrarily change the hierarchical structure of the data tree, and data management becomes easy.
  • each of the plurality of data is based on the structure of the data tree created in the tree creation step. It further comprises a graphing step of creating a graph having a first axis showing the numerical values and a second axis showing the at least one incidental information used for the grouping.
  • An embodiment of a computer program according to the present invention is configured to execute the above-mentioned data processing method by being applied to an information processing apparatus.
  • Data processing system 2 Information processing device 4
  • Information display device 6 Data acquisition device 8
  • Data registration unit 10 Registered data retention unit 12
  • Data tree creation unit 14 Information display unit 16 Graph creation unit

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Abstract

情報処理装置(2)及び情報表示装置(4)を有するデータ処理システム(1)であって、前記情報処理装置(2)は、所定のデータ取得装置(6)により取得された複数のデータを、前記データとそれぞれの前記データの少なくとも1種類の付随情報とを関連付けて前記データ処理システム(1)で取り扱うデータとして登録するように構成されたデータ登録部(8)と、前記データ登録部(8)により登録されたデータを保持する登録データ保持部(10)と、任意に選択された種類の前記付随情報を用いて、前記登録データ保持部(10)に保持されている前記複数のデータを当該付随情報が共通する前記データが同じグループに属するようにグループ分けし、前記複数のデータがグループごとに分けられた状態を示す仮想的なデータツリーを作成するデータツリー作成部(12)と、前記データツリー作成部(12)により作成されたデータツリーを前記情報表示装置(4)に表示するように構成された情報表示部(14)と、を備えている。

Description

データ処理システム、データ処理方法、及び情報処理装置を用いてデータ処理方法を実行するためのコンピュータプログラム
 本発明は、データ処理システム、データ処理方法、及び情報処理装置を用いてデータ処理方法を実行するためのコンピュータプログラムに関するものである。
 細胞の培養では、培養プレートの各ウェル内の状態を観察するために、顕微鏡を用いて各ウェル内を撮像することが一般的である。各ウェル内の撮像画像は、細胞の継代数、培養日数、培養プレートにおける各ウェルの位置、撮像に用いた顕微鏡の種類といった付随情報と紐づけて管理される必要がある。そのため、PC(パーソナルコンピュータ)に各画像データを保存する際には、各画像データのファイル名にデータの付随情報を入れるとともに、画像の付随情報が付された複数のフォルダ群で形成される階層構造のフォルダ構成を作成し、付随情報の適合するフォルダ内に各画像データを振り分けて格納するといった手法が取られることが多い。
 上記のように階層構造のフォルダ構成によって多数の画像データを管理する手法では、フォルダ分け、ファイル名の命名等に関する規則は作業者によって異なり得るものである。そのため、最初にデータを整理した作業者以外の者はどのフォルダにどのようなデータが格納されているのかを把握することが難しいという問題があった。
 また、階層構造のフォルダ構成とすると、別のフォルダ内に格納されている複数のデータを同時に確認したり比較したりする作業が煩雑になり、作業ミスの原因になり得る。階層構造をもつフォルダ構成では、親フォルダの下層に子フォルダ又はデータファイルを紐づけることになるので、一度構築されたフォルダ構成の構造を変更して別のデータ構成を再構築することも容易ではない。
 本発明は上記問題に鑑みてなされたものであり、付随情報の異なる多数のデータの管理を容易にすることを目的とするものである。
 本発明に係るデータ処理システムは、情報処理装置及び情報表示装置を有するデータ処理システムであって、前記情報処理装置が、所定のデータ取得装置により取得された複数のデータを、前記データとそれぞれの前記データの少なくとも1種類の付随情報とを関連付けて前記データ処理システムで取り扱うデータとして登録するように構成されたデータ登録部と、前記データ登録部により登録されたデータを保持する登録データ保持部と、任意に選択された種類の前記付随情報を用いて、前記登録データ保持部に保持されている前記複数のデータを当該付随情報が共通する前記データが同じグループに属するようにグループ分けし、前記複数のデータがグループごとに分けられた状態を示す仮想的なデータツリーを作成するデータツリー作成部と、前記データツリー作成部により作成されたデータツリーを前記情報表示装置に表示するように構成された情報表示部と、を備えているものである。
 本発明に係るデータ処理方法は、所定のデータ取得装置により取得された複数のデータを、前記データとそれぞれの前記データの少なくとも1種類の付随情報とを関連付けながら登録する登録ステップと、任意に選択された種類の前記付随情報を用いて、当該付随情報が共通する前記データが同じグループに属するように、前記登録するステップにおいて登録された前記複数のデータをグループ分けし、前記複数のデータがグループごとに分けられた状態を示す仮想的なデータツリーを作成するツリー作成ステップと、前記ツリー作成ステップで作成されたデータツリーを所定の情報表示装置に表示する表示ステップと、を備えている。
 ここで、「所定のデータ取得装置」には、細胞培養ウェル内を撮像するための顕微鏡、そのような顕微鏡によって取得された画像を解析する解析装置などが含まれる。データ取得装置が細胞培養ウェル内を撮像する顕微鏡である場合には、取得されるデータは画像のデータである。また、データ取得装置がそのような画像を解析する解析装置である場合には、取得されるデータは画像中の細胞(セル)の数、画像中で細胞領域が占める面積の割合といった数値のデータである。これらのデータの「付随情報」には、撮像されたウェルに関する情報(培養プレートにおけるウェルの位置等)、撮像に用いられた顕微鏡の種類、細胞の培養日数、細胞の継代数といった種類の情報を含むことができる。
 本発明では、所定のデータ取得装置で取得された複数のデータを特定の階層構造を形成する複数のフォルダに振り分けて管理するのではなく、複数のデータのそれぞれに付随情報を関連付けて管理する。各データに関連付けられた付随情報は各データの属性を示すラベルの役割を果たすものであり、ユーザがラベルとして有効に機能させたい付随情報の種類を選択すると、選択された種類の付随情報が共通する(すなわち、その種類の付随情報として入力されている数値等の情報が同一である)データが同じグループに属するように各データをグループ分けし、あたかも階層構造をもつフォルダ構成が構築されているように、仮想的なデータツリーを作成して表示する。
 本発明に係るデータ処理システム及びデータ処理方法では、ユーザがラベルとして有効に機能させたい付随情報の種類を選択すると、選択された種類の付随情報が共通するデータが同じグループに属するように各データがグループ分けされ、あたかも階層構造をもつフォルダ構成が構築されているように、仮想的なデータツリーが自動的に作成されて表示されるので、実際に階層構造をもつフォルダ構成をユーザが構築しなくても、異なる付随情報をもつ多数のデータを容易に管理することができる。
データ処理システムの一実施例を示すブロック図である。 同実施例におけるデータ登録に関する一連の動作の一例を示すフローチャートである。 データ登録の際に表示される画面の一例である。 複数のデータが登録された後のデータ構成の概念図である。 同実施例において仮想的なデータツリーを表示するための動作を示すフローチャートである。 仮想的なデータツリーの一例である。 グループ分けに使用する付随情報の優先順位を図6のデータツリーから変更したときに作成されるデータツリーの一例である。 グループ分けに使用する付随情報の1つを無効にしたときに作成されるデータツリーの一例である。 グラフの作成の基となるデータツリーの一例である。 図9のデータツリーに基づいて作成されたグラフの一例である。
 以下、本発明に係るデータ処理システム、データ処理方法及びコンピュータプログラムの一実施形態について図面を参照しながら説明する。
 図1に、データ処理システムの概略的構成を示す。
 データ処理システム1は情報処理装置2及び情報表示装置4を備えている。情報処理装置2は、データ取得装置6で取得された複数のデータを取り込んで所定の処理を行なう機能を有するものである。情報処理装置2は、ハードディスクドライブなどの情報記憶媒体及びCPU(中央演算装置)を備えた電子回路を備えたコンピュータ装置(例えば、パーソナルコンピュータ)であって、後述する各機能を実現するためのコンピュータプログラムが導入されたものである。情報表示装置4は情報処理装置2と通信可能に接続されたディスプレイ(例えば、液晶ディスプレイ)である。データ取得装置6としては、細胞培養プレートの各ウェル内を撮像するための顕微鏡、そのような顕微鏡により取得された画像を解析する解析装置などが挙げられる。なお、この実施例では示されていないが、情報処理装置2が顕微鏡から取り込まれた画像データの解析を行なう機能を備えている場合、情報処理装置2が解析データを取得するためのデータ取得装置6としても機能する。
 情報処理装置2は、データ登録部8、登録データ保持部10、データツリー作成部12、情報表示部14及びグラフ作成部16を備えている。データ登録部8、データツリー作成部12、情報表示部14及びグラフ作成部16は、情報処理装置2に導入されている所定のコンピュータプログラムがCPUによって実行されることで実現される機能である。登録データ保持部10は、情報処理装置2内の情報記憶媒体の一部の記憶領域によって実現される機能である。
 データ登録部8は、データ取得装置6によって取得されたデータを、そのデータの付随情報と関連付けてこのデータ処理システム1で取り扱うデータとして登録するように構成されている。登録データ保持部10は、データ登録部8により登録されたデータを保持するように構成されている。
 図2及び図3を用いて、データ登録に関する一連の動作について説明する。
 ユーザがデータの登録の指示を情報処理装置2に入力すると、データ登録部8は、図3に示されるようなデータ登録画面を情報表示装置4に表示する。ユーザは、表示されたデータ登録画面上で、情報処理装置2に取り込まれている又は取り込むことが可能なデータを参照して、登録したいデータを選択し、そのデータの付随情報を入力する(ステップ101)。
 図3は、顕微鏡によって撮像された細胞培養ウェルの画像データの登録画面の例であり、データの付随情報として細胞の継代数、培養日数を入力するようになっている。ユーザが登録すべきデータを選択してそのデータの付随情報を入力し、その内容を決定する(図3では登録ボタンを押す)と、データ登録部8は選択されているデータと入力された付随情報とを互いに関連付け(ステップ102)、このデータ処理システム1で取り扱うデータとして登録する(ステップ103)。データ登録部8によって登録されたデータは、付随情報と関連付けられた状態で登録データ保持部10に保存される(ステップ104)。
 上記の一連の動作を、データ処理システム1で取り扱うべきデータのすべてについて実行する。その結果、登録データ保持部10には、図4に示されているように、複数のデータが共通の種類の付随情報と関連付けられた状態で存在することになる。
 図1に戻って説明を続ける。情報処理装置2のデータツリー作成部12は、登録データ保持部10に保持されている複数のデータを各データに関連付けられた付随情報によってグループ分けし、階層構造を有する仮想的なデータツリーを作成するように構成されている。データツリーとは、各データの付随情報に対応するタイトルの複数のフォルダに各データが振り分けられた状態を一覧で示す形式である。データツリー作成部12によるデータツリーの作成は、例えば、ユーザに対して登録データ保持部10に保持されている複数のデータを提示する際に実行される。情報表示部14は、データツリー作成部12により作成された仮想的なデータツリーを情報表示装置4に表示するように構成されている。
 図5を用いて、データツリーの作成に関する一連の動作について説明する。
 データツリー作成部12は、例えばユーザがこのデータ処理システム1に登録されたデータを参照しようとしたときに、対象の登録データを登録データ保持部10から読み出し(ステップ201)、それらの登録データに関連付けられている付随情報を用いて読み出した登録データのグループ分けを行ない(ステップ202)、そのグループ分けに基づいた階層構造のデータツリーを作成する(ステップ203)。情報表示部14は、データツリー作成部12により作成された仮想的なデータツリーを情報表示装置4に表示する(ステップ204)。
 ここで、登録データに関連付けられる付随情報には、グループ分けに使用するか否か、グループ分けに使用される優先順位がそれぞれ予め設定されている。これらの設定は、ユーザが任意に変更することができる。例えば、デフォルトの設定ではすべの付随情報がグループ分けに使用されるようになっており、各付随情報にデフォルトの優先順位が設定されている。ユーザがデータを参照しようとした際には、デフォルトの優先順位に基づいたデータツリーがデータツリー作成部12によって作成され、作成されたデータツリーが、グループ分けに使用する付随情報及びそれらの付随情報の優先関係を示すグループ分け条件とともに情報表示装置4に表示される。ユーザは、各付随情報についてグループ分けに使用する(有効)かグループ分けに使用しない(無効)かの切替え、及び、各付随情報の優先関係の入替えを行なうことができ、任意にグループ分け条件を変更することができる。このようなグループ分け条件の変更操作は、マウスによるドラッグ、キー入力などによって行なうことができる。ユーザによってグループ分け条件が変更されると、データツリー作成部12によって変更後のグループ分け条件に基づくデータツリーが即時に作成され、情報表示装置4に表示される。これにより、ユーザの所望するグループ分け条件に基づくデータツリーがリアルタイムで表示される。
 図6は、データツリー作成部12により作成された仮想的なデータツリーの一例である。登録されたデータA~Hのそれぞれに、「培養日数」、「継代数」という種類の付随情報が関連付けられており、いずれの種類の付随情報もグループ分けに使用するように設定されている。最上部には、グループ分けに使用する付随情報の種類とそれらの優先関係を示すグループ分け条件が表示されており、この例では、「培養日数」の優先順位が「継代数」の優先順位よりも高く設定されている。この設定では、最初に、培養日数が共通するデータが同じグループに属するように「培養日数:1」のグループ(データA~D)と「培養日数:2」のグループ(データE~F)に分けられ、各グループ内で「継代数:1」のグループと「継代数:2」のグループに分けられる。その結果、図のような階層構造のデータツリーが作成される。
 図7は、図6のデータツリーから付随情報の優先関係を変更したときに作成されるデータツリーの一例である。ユーザが継代数の優先順位を培養日数の優先順位よりも高く設定すると、最初に継代数が同じデータが同じグループに属するように「継代数:1」のグループと「継代数:2」のグループに分けられ、各グループ内で「培養日数:1」のグループと「培養日数:2」のグループに分けられる。その結果、図のような階層構造のデータツリーが作成される。
 図8は、図7の例においてグループ分けに使用されていた付随情報「培養日数」を無効(グループ分けに使用しない)に設定したときに作成されるデータツリーの一例である。この例では、付随情報「培養日数」が無効にされたため、有効になっている付随情報「継代数」のみで各データA~Hのグループ分けが行われ、「継代数:1」のグループと「継代数:2」のグループからなるデータツリーが作成されている。
 以上のように、この実施例のデータ処理システム1では、ユーザが登録済みの複数のデータを参照しようとしたときに、任意の付随情報を任意の優先関係で用いてグループ分けし、データツリーとして表示することができる。
 なお、このデータ処理システム1で取り扱う「データ」は、データ取得装置6が細胞培養ウェルの画像を撮像する顕微鏡である場合には画像データであるが、情報処理装置2がその画像の解析処理を行なう機能を備えている場合に、情報処理装置2自身が画像データを解析処理して得られた「細胞数」、「細胞領域の占める面積割合」といった数値データも「データ」に含まれ得る。その場合、データ登録部8は、画像データを解析処理して得られた数値データを、元の画像データに関連付けられていた「培養日数」、「継代数」等の付随情報と関連付けて登録し、登録データ保持部10に保持させるように構成することができる。
 図1に戻って、情報処理装置2のグラフ作成部16は、登録データが数値データである場合に、各登録データの数値と各登録データに関連付けられている付随情報を用いて、データツリー作成部12により作成されたデータツリーに基づくグラフを作成するように構成されている。データツリー作成部12によって作成されるデータツリーとグラフ作成部16によって作成されるグラフとの関係の一例を、図9及び図10を用いて以下に説明する。
 図9は、登録された数値データA~Lが付随情報「培養日数」、「継代数」によってグループ分けされた状態を示すデータツリーである。このようなデータツリーが作成されたときに、例えばユーザがデータの解析を指示すると、グラフ作成部16は、図10に示されているように、最下層の(最も優先順位が低い)付随情報である「継代数」を横軸にとり、各データの数値を表すための数値(ここではセルカウント数)を縦軸にとり、最下層から2番目の付随情報である「培養日数」を凡例とするグラフを作成する。この例では、各培養日数に2つの数値データ(例えば、培養日数:1かつ継代数:1の数値データはデータA、B)が存在するため、それらの平均値がグラフ表示されている。
 グラフ作成部16が作成するグラフは、図10のような棒グラフに限定されるものではなく、折れ線グラフ、円グラフ等、種々のグラフであってよい。
 以上において説明した実施例は、本発明の実施形態の例示に過ぎない。本発明の実施形態は以下に示す通りである。
 本発明に係るデータ処理システムの実施形態は、情報処理装置及び情報表示装置を有するデータ処理システムであって、前記情報処理装置は、所定のデータ取得装置により取得された複数のデータを、前記データとそれぞれの前記データの少なくとも1種類の付随情報とを関連付けて前記データ処理システムで取り扱うデータとして登録するように構成されたデータ登録部と、前記データ登録部により登録されたデータを保持する登録データ保持部と、任意に選択された種類の前記付随情報を用いて、前記登録データ保持部に保持されている前記複数のデータを当該付随情報が共通する前記データが同じグループに属するようにグループ分けし、前記複数のデータがグループごとに分けられた状態を示す仮想的なデータツリーを作成するデータツリー作成部と、前記データツリー作成部により作成されたデータツリーを前記情報表示装置に表示するように構成された情報表示部と、を備えている。
 データ処理システムの前記実施形態の第1態様では、前記データ登録部は、前記複数のデータのそれぞれに複数種類の前記付随情報を関連付けて登録するように構成されており、前記データツリー作成部は、前記グループ分けに複数種類の前記付随情報を使用するように設定されている場合に、前記付随情報の種類ごとに予め設定されている優先順位が高い種類の前記付随情報ほど上層に位置する階層構造の前記データツリーを作成するように構成されている。
 上記第1態様において、前記優先順位は、任意に変更可能であるように構成されていてもよい。そうすれば、ユーザは任意にデータツリーの階層構造を変更することができ、データ管理が容易になる。
 データ処理システムの前記実施形態の第2態様では、前記データは細胞培養の画像、又は、前記画像を解析して取得された数値である。その場合、前記付随情報として、継代数及び培養日数の少なくともいずれか一方を含むことができる。この第2態様は上記第1態様と組み合わせることができる。
 データ処理システムの前記実施形態の第3態様では、前記データは分析又は解析により取得された数値である。その場合、前記情報処理装置は、前記データツリー作成部により作成された前記データツリーの構造に基づき、前記複数のデータの各数値を示す第1の軸、及び、前記グループ分けに使用された少なくとも1つの前記付随情報を示す第2の軸を有するグラフを作成するグラフ作成部をさらに備えていてもよい。この第3態様は、上記第1態様及び/又は第2態様と組み合わせることができる。
 本発明に係るデータ処理方法の実施形態は、所定のデータ取得装置により取得された複数のデータを、前記データとそれぞれの前記データの少なくとも1種類の付随情報とを関連付けて登録する登録ステップと、任意に選択された種類の前記付随情報を用いて、当該付随情報が共通する前記データが同じグループに属するように、前記登録するステップにおいて登録された前記複数のデータをグループ分けし、前記複数のデータがグループごとに分けられた状態を示す仮想的なデータツリーを作成するツリー作成ステップと、前記ツリー作成ステップで作成されたデータツリーを所定の情報表示装置に表示する表示ステップと、を備えている。
 データ処理方法の実施形態の第1態様では、前記登録ステップにおいて前記複数のデータのそれぞれに複数種類の前記付随情報を関連付けて登録し、前記ツリー作成ステップにおいて、前記付随情報の種類ごとに予め設定されている優先順位が高い種類の前記付随情報ほど上層に位置する階層構造の前記データツリーを作成する。
 上記第1態様において、前記優先順位を変更する順位変更ステップをさらに備えることができる。そうすれば、ユーザは任意にデータツリーの階層構造を変更することができ、データ管理が容易になる。
 データ処理方法の実施形態の第2態様では、前記データが分析又は解析により取得された数値である場合に、前記ツリー作成ステップで作成された前記データツリーの構造に基づき、前記複数のデータの各数値を示す第1の軸、及び、前記グループ分けに使用された少なくとも1つの前記付随情報を示す第2の軸を有するグラフを作成するグラフ作成ステップをさらに備えている。
 本発明に係るコンピュータプログラムの実施形態は、情報処理装置に適用されることにより上述のデータ処理方法を実行するように構成されたものである。
   1   データ処理システム
   2   情報処理装置
   4   情報表示装置
   6   データ取得装置
   8   データ登録部
   10   登録データ保持部
   12   データツリー作成部
   14   情報表示部
   16   グラフ作成部

Claims (10)

  1.  情報処理装置及び情報表示装置を有するデータ処理システムであって、
     前記情報処理装置は、
     所定のデータ取得装置により取得された複数のデータを、前記データとそれぞれの前記データの少なくとも1種類の付随情報とを関連付けて前記データ処理システムで取り扱うデータとして登録するように構成されたデータ登録部と、
     前記データ登録部により登録されたデータを保持する登録データ保持部と、
     任意に選択された種類の前記付随情報を用いて、前記登録データ保持部に保持されている前記複数のデータを当該付随情報が共通する前記データが同じグループに属するようにグループ分けし、前記複数のデータがグループごとに分けられた状態を示す仮想的なデータツリーを作成するデータツリー作成部と、
     前記データツリー作成部により作成されたデータツリーを前記情報表示装置に表示するように構成された情報表示部と、を備えている、データ処理システム。
  2.  前記データ登録部は、前記複数のデータのそれぞれに複数種類の前記付随情報を関連付けて登録するように構成されており、
     前記データツリー作成部は、前記グループ分けに複数種類の前記付随情報を使用するように設定されている場合に、前記付随情報の種類ごとに予め設定されている優先順位が高い種類の前記付随情報ほど上層に位置する階層構造の前記データツリーを作成するように構成されている、請求項1に記載のデータ処理システム。
  3.  前記優先順位は、任意に変更可能であるように構成されている、請求項2に記載のデータ処理システム。
  4.  前記データは細胞培養の画像、又は、前記画像を解析して取得された数値であり、
     前記付随情報は、継代数及び培養日数の少なくともいずれか一方を含む、請求項1に記載のデータ処理システム。
  5.  前記データは分析又は解析により取得された数値であり、
     前記情報処理装置は、前記データツリー作成部により作成された前記データツリーの構造に基づき、前記複数のデータの各数値を示す第1の軸、及び、前記グループ分けに使用された少なくとも1つの前記付随情報を示す第2の軸を有するグラフを作成するグラフ作成部をさらに備えている、請求項1に記載のデータ処理システム。
  6.  所定のデータ取得装置により取得された複数のデータを、前記データとそれぞれの前記データの少なくとも1種類の付随情報とを関連付けて登録する登録ステップと、
     任意に選択された種類の前記付随情報を用いて、当該付随情報が共通する前記データが同じグループに属するように、前記登録するステップにおいて登録された前記複数のデータをグループ分けし、前記複数のデータがグループごとに分けられた状態を示す仮想的なデータツリーを作成するツリー作成ステップと、
     前記ツリー作成ステップで作成されたデータツリーを所定の情報表示装置に表示する表示ステップと、を備えているデータ処理方法。
  7.  前記登録ステップにおいて前記複数のデータのそれぞれに複数種類の前記付随情報を関連付けて登録し、
     前記ツリー作成ステップにおいて、前記付随情報の種類ごとに予め設定されている優先順位が高い種類の前記付随情報ほど上層に位置する階層構造の前記データツリーを作成する、請求項6に記載のデータ処理方法。
  8.  前記優先順位を変更する順位変更ステップをさらに備えている、請求項7に記載のデータ処理方法。
  9.  前記データが分析又は解析により取得された数値である場合に、前記ツリー作成ステップで作成された前記データツリーの構造に基づき、前記複数のデータの各数値を示す第1の軸、及び、前記グループ分けに使用された少なくとも1つの前記付随情報を示す第2の軸を有するグラフを作成するグラフ作成ステップをさらに備えている、請求項6に記載のデータ処理方法。
  10.  情報処理装置に適用されることにより請求項6に記載されたデータ処理方法を実行するように構成されたコンピュータプログラム。
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