WO2023058271A1 - 細胞画像解析システム - Google Patents

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WO2023058271A1
WO2023058271A1 PCT/JP2022/024899 JP2022024899W WO2023058271A1 WO 2023058271 A1 WO2023058271 A1 WO 2023058271A1 JP 2022024899 W JP2022024899 W JP 2022024899W WO 2023058271 A1 WO2023058271 A1 WO 2023058271A1
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WO
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data tree
graph
cell image
data
user
Prior art date
Application number
PCT/JP2022/024899
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English (en)
French (fr)
Inventor
周平 山本
隆二 澤田
剛士 大野
啓晃 津島
Original Assignee
株式会社島津製作所
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 株式会社島津製作所 filed Critical 株式会社島津製作所
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Priority to JP2023552693A priority patent/JPWO2023058271A1/ja
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    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
    • C12M1/00—Apparatus for enzymology or microbiology
    • C12M1/34—Measuring or testing with condition measuring or sensing means, e.g. colony counters
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G—PHYSICS
    • G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
    • G06T—IMAGE DATA PROCESSING OR GENERATION, IN GENERAL
    • G06T7/00—Image analysis

Definitions

  • the present invention relates to a cell image analysis system.
  • JP 2021-64115 A discloses a technique for analyzing cell images obtained by photographing cells with a microscope. Specifically, Japanese Patent Application Laid-Open No. 2021-64115 discloses calculating the area of the entire cell and calculating the ratio of the cell area to the area of the entire imaging range from the cell image.
  • a data tree that classifies cell images according to a hierarchical structure may be created.
  • a graph representing the cell image analysis results may be created for each data tree.
  • the present invention has been made to solve the above problems, and one object of the present invention is to easily compare different data trees when managing cell images by data trees. is to provide a cell image analysis system capable of
  • a cell image analysis system in one aspect of the present invention creates a data tree related to cell images by grouping cell images having common classification information so that they belong to the same group.
  • a data tree creation unit a data tree storage unit for storing a plurality of data trees created by the data tree creation unit, and a graph related to the first data tree selected by the user at the lowest layer or lowest layer of the first data tree.
  • a graph creation unit that creates a graph with the classification information of the second layer from the bottom as a horizontal axis parameter and the analysis result of the cell image of the first data tree as a vertical axis parameter, and a display control that displays the graph created by the graph creation unit wherein the display control unit has the same horizontal axis parameter and vertical axis parameter as the first data tree among the plurality of data trees stored in the data tree storage unit, and is different from the first data tree Displaying the second data tree in a selectable manner by the user, and adding the cell image analysis results of the second data tree selected by the user to the graph when the second data tree is selected by the user , which is configured to update the graph.
  • the cell image analysis result of the second data tree different from the first data tree which has the same horizontal axis parameter and vertical axis parameter as the first data tree, is added to the graph.
  • Update the graph to
  • the analysis result of the cell image of the first data tree and the analysis result of the cell image of the second data tree different from the first data tree having the same horizontal axis parameter and vertical axis parameter as the first data tree. can be displayed side by side on the same graph.
  • the user creates a new data tree by adding the data of the second data tree to the first data tree in order to compare different data trees. It takes time to add the data of the second data tree to the data tree.
  • the cell image analysis result of the second data tree different from the first data tree which has the same horizontal axis parameter and vertical axis parameter as the first data tree, is added to the graph. so to update the graph.
  • the graph is automatically updated. Data trees can be easily compared.
  • the cell image analysis result of the second data tree different from the first data tree which has the same horizontal axis parameter and vertical axis parameter as the first data tree, is added to the graph. so to update the graph.
  • the graph is automatically updated, so that the user can easily align the vertical and horizontal axes of the graph appropriately. can be easily compared.
  • FIG. 1 is a block diagram showing a cell image analysis system according to one embodiment;
  • FIG. 1 is a functional block diagram of a cell image analysis device according to one embodiment;
  • FIG. It is a figure for demonstrating the data tree of the cell image analysis apparatus by one Embodiment.
  • FIG. 4 is a diagram for explaining a graph related to a data tree of the cell image analysis device according to one embodiment;
  • FIG. 4 is a diagram for explaining processing for searching a data tree of the cell image analysis device according to one embodiment; It is a figure for demonstrating the process which updates the graph of the cell image analysis apparatus by one Embodiment.
  • FIG. 4 is a diagram for explaining processing for outputting a CSV file of the cell image analysis device according to one embodiment;
  • FIG. 5 is a diagram for explaining a process of comparing data trees having different vertical axis parameters in the cell image analysis apparatus according to one embodiment
  • 4 is a flow chart for explaining control processing relating to comparison between data trees of the cell image analysis device according to one embodiment.
  • FIG. 11 is a block diagram showing a cell image analysis system according to a modification of one embodiment
  • FIG. 1 The configuration of a cell image analysis system 100 according to one embodiment will be described with reference to FIGS. 1 to 9.
  • FIG. 1 The configuration of a cell image analysis system 100 according to one embodiment will be described with reference to FIGS. 1 to 9.
  • FIG. 1 The configuration of a cell image analysis system 100 according to one embodiment will be described with reference to FIGS. 1 to 9.
  • FIG. 1 The configuration of a cell image analysis system 100 according to one embodiment will be described with reference to FIGS. 1 to 9.
  • the cell image analysis system 100 shown in FIG. 1 integrates imaging of the cell image 30, analysis processing on the cell image 30, and viewing of the analyzed image by a user who performs cell culture etc. in a single system. It is a cell image analysis system that can be implemented.
  • a cell image analysis system 100 includes a cell image analysis device 101 , a computer 110 and an imaging device 120 .
  • FIG. 1 shows an example of a cell image analysis system 100 constructed in a client-server model.
  • Computer 110 functions as a client terminal in cell image analysis system 100 .
  • the cell image analysis device 101 functions as a server in the cell image analysis system 100.
  • FIG. The cell image analysis device 101, the computer 110, and the imaging device 120 are connected via a network 130 so as to be able to communicate with each other.
  • the cell image analysis apparatus 101 performs various information processing in response to requests (processing requests) from the computer 110 operated by the user.
  • the cell image analysis apparatus 101 performs analysis processing on the cell image 30 in response to a request, and transmits the analysis result and the post-analysis image to the computer 110 .
  • Acceptance of operations on the cell image analysis device 101 and display of analysis results and post-analysis images analyzed by the cell image analysis device 101 are performed on a GUI (graphical user interface) displayed on the display unit 111 of the computer 110. done.
  • GUI graphical user interface
  • the network 130 connects the cell image analysis device 101, the computer 110, and the imaging device 120 so that they can communicate with each other.
  • the network 130 can be, for example, a LAN (Local Area Network) constructed within a facility.
  • Network 130 may be, for example, the Internet.
  • the cell image analysis system 100 can be a system constructed in the form of cloud computing.
  • the computer 110 is a so-called personal computer and includes a processor and a storage unit.
  • a display unit 111 and an input unit 112 are connected to the computer 110 .
  • Display unit 111 is, for example, a liquid crystal display device.
  • the display unit 111 may be an electroluminescence display, a projector, or a head-mounted display.
  • Input unit 112 is an input device including, for example, a mouse and a keyboard.
  • the input unit 112 may be a touch panel.
  • One or more computers 110 are provided in the cell image analysis system 100 .
  • the imaging device 120 includes a microscope and generates a cell image 30 by imaging cells. Imaging device 120 can transmit generated cell image 30 to computer 110 and/or cell image analysis device 101 via network 130 . The imaging device 120 captures microscopic images of cells. The imaging device 120 performs imaging by imaging methods such as a bright field observation method, a dark field observation method, a phase contrast observation method, and a differential interference observation method. One type or a plurality of types of imaging devices 120 are used depending on the imaging method. One or more imaging devices 120 may be provided in the cell image analysis system 100 .
  • the cell image analysis device 101 includes a processor 10 such as a CPU (Central Processing Unit), FPGA (Field-Programmable Gate Array), and ASIC (Application Specific Integrated Circuit). Arithmetic processing as the cell image analysis apparatus 101 is performed by the processor 10 executing a predetermined program 21 .
  • a processor 10 such as a CPU (Central Processing Unit), FPGA (Field-Programmable Gate Array), and ASIC (Application Specific Integrated Circuit).
  • Arithmetic processing as the cell image analysis apparatus 101 is performed by the processor 10 executing a predetermined program 21 .
  • the cell image analysis device 101 includes a storage unit 20.
  • Storage unit 20 includes a nonvolatile storage device. Non-volatile storage devices include, for example, hard disk drives and solid state drives.
  • Various programs 21 executed by the processor 10 are stored in the storage unit 20 .
  • Image data 22 is stored in the storage unit 20 .
  • the image data 22 includes cell images 30 captured by the imaging device 120 and various processed images generated by image processing on the cell images 30 .
  • the storage unit 20 also stores a learned model 23 that has learned to acquire a cell region from the cell image 30 .
  • the storage unit 20 also stores a data tree 24 in which the cell images 30 are classified according to a hierarchical structure. Details of the data tree 24 will be described later. Also, the storage unit 20 is an example of a "data tree storage unit" in the claims.
  • the cell image analysis device 101 performs analysis processing on the cell image 30 and display processing of the analysis results in response to requests from the computer 110 .
  • the cell image analysis device 101 acquires feature amounts based on the cell image 30 .
  • the cell image analysis apparatus 101 generates display information such as a graph 50 to be described later.
  • the cell image analysis device 101 transmits the acquired display information to the computer 110 .
  • Computer 110 that has received the display information causes display unit 111 to display a display based on the display information.
  • the processor 10 of the cell image analysis apparatus 101 includes a data tree creation unit 11, a graph creation unit 12, a display control unit 13, a data tree search unit 14, and a file output unit 15. Including as a function block.
  • the processor 10 executes the program 21 stored in the storage unit 20 to create the data tree creation unit 11, the graph creation unit 12, the display control unit 13, the data tree search unit 14, and the file output unit 15. function as
  • the data tree creating unit 11 creates a data tree 24 for the cell images 30 by grouping the cell images 30 having common classification information 40 into the same group. is configured as Multiple types of classification information 40 are associated with the cell image 30 .
  • the data tree creation unit 11 is configured to create a virtual data tree 24 having a hierarchical structure by grouping the cell images 30 according to multiple types of classification information 40 associated with the cell images 30. there is Further, the data tree creating unit 11 performs grouping step by step based on the arrangement order (priority order) set for each of the plurality of types of classification information 40, thereby creating a virtual data tree 24 having a hierarchical structure.
  • the display control unit 13 is configured to display the data tree 24 created by the data tree creating unit 11 on the display unit 111 by transmitting the data tree 24 to the computer 110 .
  • the data tree 24 is configured as a virtual data tree 24 having a hierarchical structure on the display screen of the display unit 111 .
  • the imaging device 120 (microscope identification number) that captured the cell image 30, the phase contrast observation method that is the imaging method that captured the cell image 30, the passage number of the cells, the number of culture days of the cells, and Wells (well numbers), which are depressions in which cells are cultured, are set as classification information 40 .
  • the order of arrangement is set in the order of the imaging device 120 (microscope identification number), phase contrast observation method, passage number, culture days, and well (well number).
  • the data tree creating unit 11 creates the data tree 24 of five layers, with the imaging device 120 as the top layer and the well as the bottom layer.
  • one or more cell images 30 are assigned to the bottom layer "Well_1", “Well_2", and "Well_3".
  • the data tree creation unit 11 is configured to be able to change the order of arrangement (priority) of the classification information 40 that constitutes the data tree 24 .
  • the data tree creation unit 11 changes the hierarchical structure of the data tree 24 by changing the arrangement order of the classification information 40 on the display screen of the display unit 111 based on the input operation of the input unit 112 by the user. is configured to change the order of Further, by deleting part of the classification information 40 on the display screen of the display unit 111 based on the input operation of the input unit 112 by the user, the data tree creation unit 11 changes the order of the hierarchical structure of the data tree 24.
  • the display control unit 13 is configured to display the changed data tree 24 on the display unit 111 .
  • the data tree 24 created by the data tree creation unit 11 is stored in the storage unit 20 in a state associated with the project and culture conditions related to cell culture.
  • the graph creating unit 12 creates a graph 50 related to the first data tree 24a selected by the user, based on the classification information 40 (here, "well") in the lowest layer of the first data tree 24a. ) as a horizontal axis parameter 51, and the analysis result of the cell image 30 included in the bottom layer of the first data tree 24a as a vertical axis parameter 52.
  • FIG. Specifically, the graph creation unit 12 creates the graph 50 when the user selects the display 61 "display graph" on the display screen of the display unit 111 based on the input operation of the input unit 112. is configured as Further, the display control unit 13 is configured to display the graph 50 created by the graph creation unit 12 on the display unit 111 by transmitting it to the computer 110 .
  • the horizontal axis parameter 51 is accompanying information regarding cell culture or imaging.
  • the horizontal axis parameter 51 is not particularly limited, but for example, culture days, wells, passage number, microscope, imaging method, microscope channel, cell type, medium, strain, substrate, inducer, oxygen concentration, carbon dioxide concentration, and temperature.
  • a vertical axis parameter 52 is a cell feature quantity obtained based on the cell image 30 .
  • the vertical axis parameter 52 is not particularly limited, but is the number of cells, morphological information of cells (length, roundness, radius, aspect ratio, etc.), differentiated/undifferentiated ratio of cells, similarity of cell texture. , and cell area information.
  • the display control unit 13 selects the same horizontal axis parameter as the first data tree 24a among the plurality of data trees 24 stored in the storage unit 20. 51 and a vertical axis parameter 52, which is different from the first data tree 24a, is displayed in a user-selectable manner, and when the user selects the second data tree 24b, the user-selected data tree 24b is displayed.
  • the graph 50 is updated so as to add the analysis result of the cell image 30 of the second data tree 24 b to the graph 50 .
  • the display control unit 13 displays the comparison target past case (the second data tree 24b) corresponding to the first data tree 24a in a user-selectable manner, and displays the comparison target past case selected by the user. It is configured to update the graph 50 so that the analysis result of the cell image 30 of (second data tree 24b) can be compared with the analysis result of the cell image 30 of the first data tree 24a that is the comparison source. . Based on the updated graph 50, the user can, for example, compare the validity of trends in the analysis results or find differences in the analysis results between the data trees 24 having the same horizontal axis parameter 51 and vertical axis parameter 52. It is possible to compare. Further, when the user selects a plurality of (two in FIG. 6) second data trees 24b, the display control unit 13 displays the analysis results of the cell images 30 of the plurality of second data trees 24b selected by the user. is configured to update the graph 50 to add to the graph 50 .
  • the display control unit 13 causes the display unit 111 to display the “compare” display 62 for the user to add the analysis result of the cell image 30 of the second data tree 24b to the graph 50.
  • the graph creation unit 12 generates the second data tree selected by the user. It is configured to recreate the graph 50 so as to add the analysis results of the cell image 30 of 24b to the graph 50 .
  • the display control unit 13 is configured to update the graph 50 displayed on the display unit 111 by transmitting the graph 50 recreated by the graph creation unit 12 to the computer 110 .
  • the graph creating unit 12 displays another second data tree 24b based on the input operation of the input unit 112 by the user.
  • the display 62 "compare" on the display screen of the unit 111 is selected, the analysis result of the cell image 30 of the second data tree 24b selected by the user is further added to the graph 50. is configured to recreate the Further, the display control unit 13 transmits to the computer 110 the graph 50 recreated by the graph creation unit 12 and to which the second data tree 24b is further added. is configured to update the The user can add to the graph 50 any number of analysis results of the cell images 30 of the second data tree 24b.
  • the data tree search unit 14 is configured to search for the second data tree 24b from among the plurality of data trees 24 stored in the storage unit 20.
  • the display control unit 13 is configured to display the second data tree 24b searched by the data tree search unit 14 in a user-selectable manner. At this time, the display control unit 13 is configured to list and display the second data tree 24b searched by the data tree search unit 14 .
  • the data tree search unit 14 selects a second data tree from among the plurality of data trees 24 stored in the storage unit 20 with a project and culture conditions related to cell culture specified as search conditions. 24b can be searched. Further, the display control unit 13 is configured to display the second data tree 24b searched by the data tree search unit 14 with the search condition specified so that the user can select the second data tree 24b.
  • the display control unit 13 displays on the display unit 111 a pull-down display 63 that allows selection of the project type (project name) and a pull-down display 64 that allows selection of the type of culture condition (culture condition name).
  • the data tree search unit 14 retrieves the selected project and culture conditions. It is configured to search the second data tree 24b corresponding to the condition. That is, the data tree search unit 14 is associated with the selected project, is associated with the selected culture condition, and has the same horizontal axis parameter 51 and vertical axis parameter 52 as the first data tree 24a. 2 data tree 24b. Note that the project name and culture condition name are set in advance by the user.
  • the data tree search unit 14 selects the second data tree from among the plurality of data trees 24 stored in the storage unit 20 with a different project and the same culture conditions as the first data tree 24a specified as search conditions. Search the data tree 24b.
  • the display control unit 13 selects a project different from the first data tree 24a and a culture condition identical to that of the first data tree 24a, which are searched by the data tree search unit 14 in a state in which a project different from that of the first data tree 24a and a culture condition identical to that of the first data tree 24a are designated as search conditions.
  • a second data tree 24b of culture conditions is displayed so as to be selectable by the user.
  • the data tree search unit 14 selects the second data tree from among the plurality of data trees 24 stored in the storage unit 20 with the same project and different incubation conditions as the first data tree 24a specified as search conditions. Search the data tree 24b.
  • the display control unit 13 controls the same project as the first data tree 24a and different culture conditions from the first data tree 24a, which are searched by the data tree search unit 14 with the same project and different incubation conditions as the search conditions.
  • a second data tree 24b of culture conditions is displayed so as to be selectable by the user. Note that the user can specify the same project and the same culture conditions as those of the first data tree 24a as search conditions, or can specify a different project and different culture conditions from those of the first data tree 24a as search conditions. can.
  • the display control unit 13 displays the analysis result of the cell image 30 of the second data tree 24b selected by the user in a color different from the analysis result of the cell image 30 of the first data tree 24a. It is configured to update graph 50 as it adds to graph 50 . For example, when the display control unit 13 displays the analysis results of the cell images 30 of the first data tree 24a in red in the graph 50, the display control unit 13 displays the analysis results of the cell images 30 of the second data tree 24b in red in the graph 50. are displayed in a different green color.
  • the display control unit 13 adds the analysis result of the cell image 30 of the second data tree 24b to the graph 50 in a state where the analysis result of the cell image 30 of the second data tree 24b is added to the graph 50
  • the analysis result of the cell image 30 of the second data tree 24b to be added is displayed in a color different from the analysis result of the cell image 30 of the first data tree 24a and the analysis result of the already added cell image 30 of the second data tree 24b.
  • the display control unit 13 displays the analysis results of the cell images 30 of the first data tree 24a in red, and displays the analysis results of the cell images 30 of the second data tree 24b that have already been added in green. If so, the analysis result of the cell image 30 of the second data tree 24b to be added is displayed in blue different from red and green.
  • the display control unit 13 when the user performs an operation to delete the analysis result of the second data tree 24b added to the graph 50, the display control unit 13 The graph 50 is updated such that the analysis results of the image 30 are deleted from the graph 50 .
  • the display control unit 13 is configured to display on the display unit 111 the display 65 of "reset” for the operation of deleting the analysis result of the second data tree 24b added to the graph 50.
  • the graph creation unit 12 adds the second data tree 24 b to the graph 50 .
  • the graph 50 is recreated so as to delete all the analysis results of the cell image 30 from the graph 50 . That is, the graph creation unit 12 deletes from the graph 50 all the analysis results of the cell images 30 of the second data tree 24b added to the graph 50, thereby restoring the initial state (the state of FIG. 5). It is configured to recreate graph 50 . Further, the display control unit 13 is configured to update the graph 50 displayed on the display unit 111 by transmitting the graph 50 recreated by the graph creation unit 12 to the computer 110 .
  • the file output unit 15 outputs the cell image 30 that is the basis of the graph 50 to which the analysis result of the cell image 30 of the second data tree 24b is added, and the second data tree 24b.
  • a graph 50 added with the analysis results of the cell image 30 of the data tree 24b is configured to be output as a CSV (Comma Separated Value) file 70 in which values are separated by commas. That is, the file output unit 15 converts the cell image 30 of the first data tree 24a and the cell image 30 of the second data tree 24b, which are the basis of the graph 50, and the graph 50 into numerical data in which the values are separated by commas.
  • CSV Common Separated Value
  • the file output unit 15 outputs the CSV file 70 to the computer 110 when the user selects the display 66 "file output" on the display screen of the display unit 111 based on the input operation of the input unit 112. is configured as
  • the file output unit 15 is configured to output the CSV file 70 with additional information including information on a project and culture conditions related to cell culture added.
  • the additional information is not particularly limited, but includes, for example, project name, culture condition name, classification information 40 (microscope, phase contrast observation method, passage number, culture days, well, etc.).
  • the display control unit 13 sets the same horizontal axis parameter 51 and different vertical axis parameter 51 as the first data tree 24a among the plurality of data trees 24 stored in the storage unit 20.
  • a third data tree 24c different from the first data tree 24a having an axis parameter 52 is displayed for selection by the user, and if the third data tree 24c is selected by the user, the third data tree 24c selected by the user is displayed.
  • It is configured to update the graph 50 by adding the analysis results of the cell image 30 in the data tree 24c to the graph 50 . Based on the updated graph 50, the user can examine, for example, the correlation of the analysis results between the data trees 24 having different vertical axis parameters 52 from each other.
  • the display control unit 13 is configured to display on the display unit 111 the display 68 "no restrictions" for selectively displaying the third data tree 24c. Further, when the user selects the display 67 of “no limit” on the display screen of the display unit 111 based on the input operation of the input unit 112 by the user, the display control unit 13 causes the same horizontal tree as the first data tree 24a to be displayed.
  • a display unit 111 that allows a user to select a plurality of data trees 24 stored in the storage unit 20 by removing the restriction for searching the second data tree 24b to have an axis parameter 51 and a vertical axis parameter 52. is configured to display on The user can select, from among the data trees 24 displayed on the display unit 111, the third data tree 24c having the same horizontal axis parameter 51 and different vertical axis parameter 52 as the first data tree 24a. .
  • the display control unit 13 is configured to display on the display unit 111 the display 68 of "compare” for the user to add the analysis result of the cell image 30 of the third data tree 24c to the graph 50. ing. Further, when the display 68 of "compare” on the display screen of the display unit 111 is selected based on the input operation of the input unit 112 by the user, the graph creation unit 12 generates the third data tree selected by the user. It is configured to recreate the graph 50 so as to add the analysis results of the cell image 30 of 24c to the graph 50 . Further, the display control unit 13 is configured to update the graph 50 displayed on the display unit 111 by transmitting the graph 50 recreated by the graph creation unit 12 to the computer 110 .
  • the updated graph 50 has, for example, the vertical axis parameter 52 of the first data tree 24a (aspect ratio in FIG. 8) on the left side of the graph, and the vertical axis parameter 52 of the third data tree 24c (in FIG. 8) on the right side of the graph. cell number).
  • step 201 the first data tree 24a on which the graph 50 is based is selected based on the input operation of the input unit 112 by the user. Then, in step 202, the hierarchical structure of the first data tree 24a is determined (changed) based on the input operation of the input unit 112 by the user. Then, in step 203, the graph creation unit 12 creates the graph 50 regarding the first data tree 24a, and the display control unit 13 displays the graph 50 created by the graph creation unit 12 on the display unit 111. .
  • step 204 the second data tree 24b is searched by the data tree search unit 14, and the second data tree 24b searched by the data tree search unit 14 is displayed on the display unit 111 by the display control unit 13. be done.
  • step 205 the second data tree 24 b to be added to the graph 50 is selected from among the second data trees 24 b displayed on the display unit 111 based on the input operation of the input unit 112 by the user.
  • step 206 the graph creation unit 12 recreates the graph 50 so as to add the analysis results of the cell image 30 of the second data tree 24b, and the display control unit 13 creates the graph 50 by the graph creation unit 12.
  • the corrected graph 50 is displayed on the display unit 111 (the graph 50 on the display unit 111 is updated).
  • step 207 the user determines whether or not to add the second data tree 24b. Then, in step 207, if the user determines to add the second data tree 24b, the process proceeds to step 205. FIG. Then, the processing of steps 205 and 206 is further performed. If the user determines in step 207 that the second data tree 24b is to be added, the process proceeds to step 208 .
  • step 208 the user determines whether to output the CSV file 70 or not. If the user determines in step 208 that the CSV file 70 is to be output, the process proceeds to step 209 . Then, in step 209 , the CSV file 70 including the cell image 30 on which the graph 50 is based and the numerical data of the graph 50 is output to the computer 110 by the file output unit 15 . Then go to step 210 . If the user determines in step 208 that the CSV file 70 is not to be output, the process proceeds to step 210 without performing step 209 .
  • step 210 the user determines whether or not to erase the second data tree 24b added to the graph 50 to restore the initial state. If the user determines in step 210 that the second data tree 24b added to the graph 50 should be deleted and returned to the initial state, the process proceeds to step 203 . Then, the processing of steps 203 to 209 is performed as appropriate. Further, when the user determines not to erase the second data tree 24b added to the graph 50 and restore the initial state, the user performs an operation to end the control process, and the control process ends. .
  • the cell image analysis system 100 creates the data tree 24 regarding the cell images 30 by grouping the cell images 30 having the common classification information 40 into the same group.
  • a data tree creation unit 11 a storage unit 20 for storing a plurality of data trees 24 created by the data tree creation unit 11;
  • the graph creation unit 12 creates a graph 50 created by the graph creation unit 12, with the classification information 40 of the lowest layer as a horizontal axis parameter 51 and the analysis result of the cell image 30 of the first data tree 24a as a vertical axis parameter 52.
  • the display control unit 13 displays the same horizontal axis parameter 51 and vertical axis parameter 52 as the first data tree 24a among the plurality of data trees 24 stored in the storage unit 20.
  • a second data tree 24b different from the first data tree 24a is selectably displayed by the user, and when the second data tree 24b is selected by the user, the second data tree 24b selected by the user is displayed. is configured to update the graph 50 so as to add the analysis results of the cell image 30 to the graph 50 .
  • the analysis result of the cell image 30 of the first data tree 24a and the second data tree 24b different from the first data tree 24a having the same horizontal axis parameter 51 and vertical axis parameter 52 as the first data tree 24a can be displayed in comparison on the same graph 50.
  • different data trees 24 can be easily compared.
  • the user may create a new data tree 24 by adding the data of the second data tree 24b to the first data tree 24a. This requires the user to add the data of the second data tree 24b to the first data tree 24a.
  • the analysis result of the cell image 30 of the second data tree 24b different from the first data tree 24a which has the same horizontal axis parameter 51 and vertical axis parameter 52 as the first data tree 24a. is added to the graph 50 to update the graph 50 .
  • the graph 50 is automatically updated. Therefore, data trees 24 that differ from each other can be easily compared.
  • the cell image analysis system 100 further includes the data tree search unit 14 that searches for the second data tree 24b from among the plurality of data trees 24 stored in the storage unit 20.
  • the display control unit 13 is configured to display the second data tree 24b searched by the data tree search unit 14 in a user-selectable manner. As a result, the second data tree 24b searched by the data tree search unit 14 is presented to the user, so that the user can easily select the desired second data tree 24b.
  • the data tree search unit 14 selects from among the plurality of data trees 24 stored in the storage unit 20 with the project and culture conditions related to cell culture specified as search conditions. , and the second data tree 24b can be searched, and the display control unit 13 displays the second data tree 24b searched by the data tree search unit 14 with the search condition specified so that the user can select it.
  • the user is presented with the second data tree 24b searched by the data tree search unit 14 with the project and culture conditions specified as search conditions, so that the user can more easily find the desired second data tree 24b. can be selected to
  • the data tree search unit 14 searches the plurality of data trees 24 stored in the storage unit 20 in a state in which the same culture conditions as those of the first data tree 24a are specified as search conditions.
  • the display control unit 13 is searched by the data tree search unit 14 with the same culture conditions as those of the first data tree 24a designated as search conditions.
  • the second data tree 24b having the same culture conditions as the first data tree 24a is displayed so that the user can select it.
  • the second data tree 24b having the same culture conditions as the first data tree 24a which is searched by the data tree search unit 14 while specifying the same culture conditions as the first data tree 24a as the search condition, is displayed. Therefore, the user can easily select the second data tree 24b having the same culture conditions as the first data tree 24a, which is often desired to be compared.
  • the display control unit 13 combines the analysis result of the cell image 30 of the second data tree 24b selected by the user with the analysis result of the cell image 30 of the first data tree 24a. are configured to update the graph 50 to add to the graph 50 with different colors. As a result, the user can easily visually distinguish between the analysis results of the cell images 30 in the second data tree 24b and the analysis results of the cell images 30 in the first data tree 24a. can be easily compared.
  • the display control unit 13 When the user performs an operation to delete the analysis result of the second data tree 24b added to the graph 50, the display control unit 13 The graph 50 is updated such that the analysis results of the cell images 30 in the data tree 24b are deleted from the graph 50.
  • FIG. As a result, when it is no longer necessary to compare the analysis results of the cell images 30 of the second data tree 24b added to the graph 50, the analysis results of the cell images 30 of the second data tree 24b that are no longer needed can be removed from the graph 50. can be deleted.
  • the horizontal axis parameter 51 is accompanying information regarding cell culture or imaging.
  • the horizontal axis parameter 51 can be appropriately set because the horizontal axis parameter 51 is associated information related to cell culture or imaging.
  • the vertical axis parameter 52 is a feature quantity based on the cell image 30 as described above. Accordingly, since the vertical axis parameter 52 is a feature amount based on the cell image 30, the vertical axis parameter 52 can be set appropriately.
  • the data tree 24 is configured as a virtual data tree 24 having a hierarchical structure on the display screen.
  • the data tree 24 is configured as a virtual data tree 24 having a hierarchical structure on the display screen.
  • troublesome work such as rebuilding folders is not required.
  • the cell images 30 can be managed by the data tree 24 without causing troublesome labor.
  • the cell image analysis system 100 includes the cell image 30 that is the basis of the graph 50 to which the analysis result of the cell image 30 in the second data tree 24b is added, and the second data It further includes a file output unit 15 for outputting, as a CSV file 70, a graph 50 to which the analysis result of the cell image 30 of the tree 24b is added.
  • the cell image 30 and the graph 50 which are the comparison results, can be output as a highly versatile CSV file 70, so that the comparison result data (CSV file 70) can be easily edited and compared. (CSV file 70) can be easily transferred between users.
  • the file output unit 15 is configured to output the CSV file 70 with additional information including at least one of project and culture condition information related to cell culture added. It is As a result, the user can check the project and culture conditions only with the CSV file 70 when performing work using the CSV file 70 . As a result, the user can save the trouble of checking the project or checking the culture conditions using files other than the CSV file 70 .
  • the display control unit 13 selects the horizontal axis parameter 51 that is the same as the first data tree 24a and the vertical axis parameter that is different from the first data tree 24a among the plurality of data trees 24 stored in the storage unit 20. 52, which is different from the first data tree 24a, is selectably displayed by the user, and when the third data tree 24c is selected by the user, the third data tree selected by the user is displayed. It is configured to update the graph 50 so as to add the analysis results of the cell image 30 of 24c to the graph 50 .
  • the cell image analysis device functions as a server for a cell image analysis system built on a client-server model, but the present invention is not limited to this.
  • the cell image analysis device may be composed of an independent computer, as shown in FIG. 10, for example.
  • the cell image analysis device 101 is configured by a computer 300 having a processor 310 and a storage section 320 .
  • a display unit 330 and an input unit 340 are connected to the computer 300 .
  • the computer 300 is communicably connected to the imaging device 120 .
  • the processor 310 of the computer 300 includes, as functional blocks, the data tree creation unit 11, the graph creation unit 12, the display control unit 13, the data tree search unit 14, and the file output unit 15 shown in the above embodiment.
  • the storage unit 320 is an example of a “data tree storage unit” in the claims.
  • a single processor performs all processes (data tree creation unit, graph creation unit, display control unit, data tree search unit, and file output unit). ) has been shown, but the present invention is not limited to this.
  • each of the above processes may be shared and executed by a plurality of processors. Each process may be performed by a separate processor. Multiple processors may be provided in separate computers.
  • the cell image analysis device may be composed of a plurality of computers that perform image processing.
  • the cell image analysis system has shown an example of a configuration including a display unit, but the present invention is not limited to this.
  • the cell image analysis system may not have a display. If the cell image analysis system does not have a display unit, the processor may be configured to output display information to an external display device.
  • the graph creation unit uses the classification information of the bottom layer of the first data tree as the horizontal axis parameter and the analysis result of the cell image of the first data tree as the vertical axis parameter, and creates a graph related to the first data tree.
  • the graph creation unit uses the classification information of the second layer from the bottom of the first data tree as the horizontal axis parameter and the analysis result of the cell image of the first data tree as the vertical axis parameter, and creates a graph related to the first data tree. may be configured to create a
  • the present invention is not limited to this.
  • the cell image analysis system does not have to include the data tree search section.
  • the display control unit displays the data tree stored in the storage unit without retrieving it, so that the user can select the second data tree from among the displayed data trees. good.
  • the cell image analysis system preferably has a data tree search unit.
  • the data tree search unit is configured to search the second data tree with the project and culture conditions specified as search conditions.
  • the present invention is limited to this. can't In the present invention, the data tree search unit may be configured to be able to search the second data tree with only one of the project and culture conditions designated as the search condition. Further, the data tree search unit may be configured to be able to search the second data tree with search conditions other than the project and culture conditions specified.
  • the display control unit when the user performs an operation to delete the analysis result of the second data tree added to the graph, deletes the analysis result of the cell image of the second data tree added to the graph.
  • the display control unit controls a part of the analysis results of the cell images of the second data tree added to the graph ( The one selected for deletion by the user and the one just added, etc.) may be configured to update the graph to remove from the graph.
  • the cell image analysis system includes a file output unit
  • the present invention is not limited to this.
  • the cell image analysis system may not have a file output unit.
  • the cell image analysis system preferably has a file output unit.
  • the display control unit displays the plurality of data trees stored in the storage unit, thereby displaying the third data tree in a user-selectable manner.
  • the data tree search unit may be configured to search for a third data tree having the same horizontal axis parameters and different vertical axis parameters as the first data tree.
  • the display control unit may be configured to display the third data tree retrieved by the data tree retrieval unit in a user-selectable manner.
  • the display control unit is configured to display the third data tree in a user-selectable manner, but the present invention is not limited to this. In the present invention, if the display control unit is configured to selectably display the first data tree by the user, it is not configured to selectably display the third data tree by the user. good too.
  • (Item 1) a data tree creation unit that creates a data tree related to the cell images by grouping cell images having common classification information so that they belong to the same group; a data tree storage unit that stores the plurality of data trees created by the data tree creation unit; Analysis of the cell image of the first data tree with the classification information of the bottom layer or the second layer from the bottom of the first data tree as a horizontal axis parameter for a graph related to the first data tree selected by the user.
  • a graph creation unit that creates a result as a vertical axis parameter
  • a display control unit that displays the graph created by the graph creation unit;
  • the display control unit has the same horizontal axis parameter and vertical axis parameter as the first data tree among the plurality of data trees stored in the data tree storage unit.
  • a cellular image analysis system configured to update said graph to add to said graph.
  • (Item 2) further comprising a data tree search unit that searches for the second data tree from among the plurality of data trees stored in the data tree storage unit; 2.
  • the data tree search unit selects, from among the plurality of data trees stored in the data tree storage unit, the second The data tree is configured to be searchable, 3.
  • the display control unit is configured to selectably display the second data tree searched by the data tree search unit with the search condition specified.
  • the data tree search unit selects the second data tree from among the plurality of data trees stored in the data tree storage unit with the same culture condition as that of the first data tree specified as the search condition. is configured to be searchable,
  • the display control unit controls the second data of the same culture condition as the first data tree, which is searched by the data tree search unit while specifying the same culture condition as the first data tree as the search condition.
  • the cell image analysis system according to item 3, configured to display a tree selectable by the user.
  • the display control unit adds the analysis result of the cell image of the second data tree selected by the user to the graph in a color different from the analysis result of the cell image of the first data tree. 5.
  • the cell image analysis system according to any one of items 1 to 4, further configured to update the graph.
  • the display control unit deletes the analysis result of the cell image of the second data tree added to the graph. 6.
  • the cell image analysis system according to any one of items 1 to 5, configured to update the graph so as to delete from the graph.
  • (Item 7) The cell image analysis system according to any one of items 1 to 6, wherein the horizontal axis parameter is accompanying information regarding cell culture or imaging.
  • the display control unit among the plurality of data trees stored in the data tree storage unit, with the first data tree having the same horizontal axis parameter and different vertical axis parameter as the first data tree. displays a different third data tree in a selectable manner by the user, and when the user selects the third data tree, an analysis result of the cell image of the third data tree selected by the user 12.
  • the cell image analysis system according to any one of items 1 to 11, wherein the cell image analysis system is configured to update the graph so as to add to the graph.
  • data tree creation unit 12 graph creation unit 13 display control unit 14 data tree search unit 15 file output unit 20, 320 storage unit (data tree storage unit) 24 data tree 24a first data tree 24b second data tree 24c third data tree 30 cell image 40 classification information 50 graph 51 horizontal axis parameter 52 vertical axis parameter 70 CSV file 100 cell image analysis system

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Abstract

この細胞画像解析システム（１００）は、データツリー作成部（１１）と、グラフ作成部（１２）と、表示制御部（１３）と、を備える。表示制御部は、第１データツリー（２４ａ）と同一の横軸パラメータおよび縦軸パラメータを有する、第１データツリーとは異なる第２データツリー（２４ｂ）を、ユーザにより選択可能に表示するとともに、ユーザにより第２データツリーが選択された場合、ユーザにより選択された第２データツリーの細胞画像（３０）の解析結果を、グラフに追加するように、グラフを更新する。

Description

細胞画像解析システム
　本発明は、細胞画像解析システムに関する。
　従来、細胞画像を解析する技術が開示されている。このような技術は、たとえば、特開２０２１－６４１１５号公報に記載されている。
　上記特開２０２１－６４１１５号公報では、顕微鏡で細胞を撮影した細胞画像を解析する技術が開示されている。具体的には、上記特開２０２１－６４１１５号公報では、細胞画像から、細胞全体の面積を算出したり、撮影範囲全体の面積に対する細胞面積の割合を算出したりすることが開示されている。
特開２０２１－６４１１５号公報
　ここで、上記特開２０２１－６４１１５号公報には明記されていないが、細胞画像を管理するために、細胞画像を階層構造により分類したデータツリーが作成される場合がある。また、データツリーごとに細胞画像の解析結果を表示するために、データツリーごとに細胞画像の解析結果を表すグラフが作成される場合がある。この場合、細胞解析システムには複数のデータツリーが存在するが、データツリーごとにグラフを表示することができるだけで、互いに異なるデータツリー同士を容易に比較することができない。このため、データツリーにより細胞画像を管理する場合において、互いに異なるデータツリー同士を容易に比較することが望まれている。
　この発明は、上記のような課題を解決するためになされたものであり、この発明の１つの目的は、データツリーにより細胞画像を管理する場合において、互いに異なるデータツリー同士を容易に比較することが可能な細胞画像解析システムを提供することである。
　上記目的を達成するために、この発明の一の局面における細胞画像解析システムは、共通の分類情報を有する細胞画像同士が同じグループとなるようにグループ分けすることによって細胞画像に関するデータツリーを作成するデータツリー作成部と、データツリー作成部により作成された複数のデータツリーを記憶するデータツリー記憶部と、ユーザにより選択された第１データツリーに関するグラフを、第１データツリーの最下層または最下層から２番目の層の分類情報を横軸パラメータとし、第１データツリーの細胞画像の解析結果を縦軸パラメータとして、作成するグラフ作成部と、グラフ作成部により作成されたグラフを表示する表示制御部と、を備え、表示制御部は、データツリー記憶部に記憶された複数のデータツリーのうち、第１データツリーと同一の横軸パラメータおよび縦軸パラメータを有する、第１データツリーとは異なる第２データツリーを、ユーザにより選択可能に表示するとともに、ユーザにより第２データツリーが選択された場合、ユーザにより選択された第２データツリーの細胞画像の解析結果を、グラフに追加するように、グラフを更新するように構成されている。
　上記一の局面における細胞画像解析システムでは、第１データツリーと同一の横軸パラメータおよび縦軸パラメータを有する、第１データツリーとは異なる第２データツリーの細胞画像の解析結果を、グラフに追加するように、グラフを更新する。これにより、第１データツリーの細胞画像の解析結果と、第１データツリーと同一の横軸パラメータおよび縦軸パラメータを有する、第１データツリーとは異なる第２データツリーの細胞画像の解析結果とを、同一のグラフ上で対比して表示することができる。その結果、データツリーにより細胞画像を管理する場合において、互いに異なるデータツリー同士を容易に比較することができる。
　なお、互いに異なるデータツリー同士を比較するために、ユーザが第１データツリーに第２データツリーのデータを追加して新たなデータツリーを作成することも考えられるが、この場合、ユーザが第１データツリーに第２データツリーのデータを追加する手間が発生する。これに対して、上記のように、第１データツリーと同一の横軸パラメータおよび縦軸パラメータを有する、第１データツリーとは異なる第２データツリーの細胞画像の解析結果を、グラフに追加するように、グラフを更新する。これにより、ユーザにより第２データツリーが選択された場合、グラフが自動的に更新されるので、ユーザが第１データツリーに第２データツリーのデータを追加する手間を発生させることなく、互いに異なるデータツリー同士を容易に比較することができる。
　また、互いに異なるデータツリー同士を比較する場合、グラフの縦軸および横軸を適切に揃える必要があるが、この場合、ユーザがグラフの縦軸および横軸を適切に揃える手間が発生する。これに対して、上記のように、第１データツリーと同一の横軸パラメータおよび縦軸パラメータを有する、第１データツリーとは異なる第２データツリーの細胞画像の解析結果を、グラフに追加するように、グラフを更新する。これにより、ユーザにより第２データツリーが選択された場合、グラフが自動的に更新されるので、ユーザがグラフの縦軸および横軸を適切に揃える手間を発生させることなく、互いに異なるデータツリー同士を容易に比較することができる。
一実施形態による細胞画像解析システムを示したブロック図である。 一実施形態による細胞画像解析装置の機能ブロック図である。 一実施形態による細胞画像解析装置のデータツリーを説明するための図である。 一実施形態による細胞画像解析装置のデータツリーに関するグラフを説明するための図である。 一実施形態による細胞画像解析装置のデータツリーを検索する処理を説明するための図である。 一実施形態による細胞画像解析装置のグラフを更新する処理を説明するための図である。 一実施形態による細胞画像解析装置のＣＳＶファイルを出力する処理を説明するための図である。 一実施形態による細胞画像解析装置の縦軸パラメータが互いに異なるデータツリー同士を比較する処理を説明するための図である。 一実施形態による細胞画像解析装置のデータツリー同士の比較に関する制御処理を説明するためのフローチャートである。 一実施形態の変形例による細胞画像解析システムを示したブロック図である。
　以下、本発明を具体化した実施形態を図面に基づいて説明する。
　図１～図９を参照して、一実施形態による細胞画像解析システム１００の構成について説明する。
（細胞画像解析システム）
　図１に示す細胞画像解析システム１００は、細胞培養などを行うユーザが、細胞画像３０の撮像、細胞画像３０に対する解析処理、および解析処理を行った画像の閲覧を単一のシステムで統合して実施することが可能な細胞画像解析システムである。
（細胞画像解析システムの概要）
　細胞画像解析システム１００は、細胞画像解析装置１０１と、コンピュータ１１０と、撮像装置１２０と、を備える。
　図１では、クライアントサーバモデルで構築された細胞画像解析システム１００の例を示している。コンピュータ１１０は、細胞画像解析システム１００におけるクライアント端末として機能する。細胞画像解析装置１０１は、細胞画像解析システム１００においてサーバとして機能する。細胞画像解析装置１０１と、コンピュータ１１０と、撮像装置１２０とは、ネットワーク１３０を介して相互に通信可能に接続されている。細胞画像解析装置１０１は、ユーザが操作するコンピュータ１１０からのリクエスト（処理要求）に応じて、各種の情報処理を行う。細胞画像解析装置１０１は、リクエストに応じて細胞画像３０に対する解析処理を行い、解析結果および解析後の画像をコンピュータ１１０に送信する。細胞画像解析装置１０１に対する操作の受け付け、および、細胞画像解析装置１０１で解析された解析結果および解析後の画像の表示は、コンピュータ１１０の表示部１１１に表示されるＧＵＩ（グラフィカルユーザーインターフェース）上で行われる。
　ネットワーク１３０は、細胞画像解析装置１０１と、コンピュータ１１０と、撮像装置１２０とを相互に通信可能に接続する。ネットワーク１３０は、たとえば施設内に構築されたＬＡＮ（Ｌｏｃａｌ　Ａｒｅａ　Ｎｅｔｗｏｒｋ）でありうる。ネットワーク１３０は、たとえばインターネットでありうる。ネットワーク１３０がインターネットである場合、細胞画像解析システム１００は、クラウドコンピューティングの形態で構築されるシステムでありうる。
　コンピュータ１１０は、いわゆるパーソナルコンピュータであり、プロセッサおよび記憶部を備える。コンピュータ１１０には、表示部１１１および入力部１１２が接続されている。表示部１１１は、たとえば液晶表示装置である。表示部１１１は、エレクトロルミネッセンス表示装置、プロジェクタ、または、ヘッドマウントディスプレイであってもよい。入力部１１２は、たとえばマウスおよびキーボードを含む入力装置である。入力部１１２は、タッチパネルであってもよい。コンピュータ１１０は、細胞画像解析システム１００において１つまたは複数設けられる。
　撮像装置１２０は、顕微鏡を含み、細胞を撮像した細胞画像３０を生成する。撮像装置１２０は、ネットワーク１３０を介して、コンピュータ１１０および／または細胞画像解析装置１０１に、生成した細胞画像３０を送信できる。撮像装置１２０は、細胞の顕微鏡画像を撮影する。撮像装置１２０は、明視野観察法、暗視野観察法、位相差観察法、および、微分干渉観察法などの撮影方法による画像化を行う。撮影方法に応じて、１種または複数種の撮像装置１２０が用いられる。細胞画像解析システム１００には、１つまたは複数の撮像装置１２０が設けられ得る。
　細胞画像解析装置１０１は、ＣＰＵ（Ｃｅｎｔｒａｌ　Ｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ　Ｕｎｉｔ）、ＦＰＧＡ（Ｆｉｅｌｄ－Ｐｒｏｇｒａｍｍａｂｌｅ　Ｇａｔｅ　Ａｒｒａｙ）、および、ＡＳＩＣ（Ａｐｌｉｃａｔｉｏｎ　Ｓｐｅｃｉｆｉｃ　Ｉｎｔｅｇｒａｔｅｄ　Ｃｉｒｃｕｉｔ）などのプロセッサ１０を備える。プロセッサ１０が、所定のプログラム２１を実行することにより、細胞画像解析装置１０１としての演算処理が行われる。
　細胞画像解析装置１０１は、記憶部２０を備える。記憶部２０は、不揮発性記憶装置を含む。不揮発性記憶装置は、たとえば、ハードディスクドライブ、および、ソリッドステートドライブなどである。記憶部２０には、プロセッサ１０が実行する各種のプログラム２１が記憶されている。また、記憶部２０には、画像データ２２が記憶される。画像データ２２は、撮像装置１２０で撮像された細胞画像３０、および、細胞画像３０に対する画像処理により生成される各種の処理画像を含む。また、記憶部２０には、細胞画像３０から細胞領域を取得することを学習させた学習済みモデル２３が記憶されている。また、記憶部２０には、細胞画像３０を階層構造により分類したデータツリー２４が記憶されている。なお、データツリー２４の詳細については、後述する。また、記憶部２０は、請求の範囲の「データツリー記憶部」の一例である。
　細胞画像解析装置１０１は、コンピュータ１１０からのリクエストに応じて、細胞画像３０に対する解析処理、および、解析結果の表示処理を行う。解析処理では、細胞画像解析装置１０１は、細胞画像３０に基づく特徴量を取得する。また、解析結果の表示処理では、細胞画像解析装置１０１は、後述するグラフ５０などの表示情報を生成する。細胞画像解析装置１０１は、取得した表示情報をコンピュータ１１０へ送信する。表示情報を受信したコンピュータ１１０は、表示部１１１において、表示情報に基づく表示を表示させる。
（細胞画像解析装置の構成）
　図２に示すように、細胞画像解析装置１０１のプロセッサ１０は、データツリー作成部１１と、グラフ作成部１２と、表示制御部１３と、データツリー検索部１４と、ファイル出力部１５と、を機能ブロックとして含む。言い換えると、プロセッサ１０は、記憶部２０に記憶されたプログラム２１を実行することによって、データツリー作成部１１、グラフ作成部１２、表示制御部１３、データツリー検索部１４、および、ファイル出力部１５として機能する。
　図２および図３に示すように、データツリー作成部１１は、共通の分類情報４０を有する細胞画像３０同士が同じグループとなるようにグループ分けすることによって細胞画像３０に関するデータツリー２４を作成するように構成されている。細胞画像３０には、複数種類の分類情報４０が関連付けられている。データツリー作成部１１は、細胞画像３０に関連付けられた複数種類の分類情報４０によって、細胞画像３０をグループ分けすることによって、階層構造を有する仮想的なデータツリー２４を作成するように構成されている。また、データツリー作成部１１は、複数種類の分類情報４０の各々について設定された並び順（優先順位）に基づいて、段階的にグループ分けすることによって、階層構造を有する仮想的なデータツリー２４を作成するように構成されている。また、表示制御部１３は、データツリー作成部１１により作成されたデータツリー２４を、コンピュータ１１０に送信することによって、表示部１１１に表示するように構成されている。本実施形態では、データツリー２４は、表示部１１１の表示画面上で階層構造を有する仮想的なデータツリー２４として構成されている。
　図３に示す例では、細胞画像３０を撮像した撮像装置１２０（顕微鏡の識別番号）、細胞画像３０を撮像した撮像方法である位相差観察方法、細胞の継代数、細胞の培養日数、および、細胞が培養される窪みであるウェル（ウェル番号）が、分類情報４０として設定されている。また、撮像装置１２０（顕微鏡の識別番号）、位相差観察方法、継代数、培養日数、および、ウェル（ウェル番号）の順番で、並び順が設定されている。この場合、データツリー作成部１１により、撮像装置１２０を最上層とし、ウェルを最下層とする５階層のデータツリー２４が作成されることになる。また、最下層の「ウェル＿１」、「ウェル＿２」、および、「ウェル＿３」には、１以上の細胞画像３０が振り分けられることになる。
　また、データツリー作成部１１は、データツリー２４を構成する分類情報４０の並び順（優先順位）を変更可能に構成されている。具体的には、ユーザによる入力部１１２の入力操作に基づいて、表示部１１１の表示画面上の分類情報４０の並び順を変更させることによって、データツリー作成部１１は、データツリー２４の階層構造の並び順を変更させるように構成されている。また、ユーザによる入力部１１２の入力操作に基づいて、表示部１１１の表示画面上の分類情報４０の一部を削除させることによって、データツリー作成部１１は、データツリー２４の階層構造の並び順の一部を削除するように変更させるように構成されている。また、表示制御部１３は、変更後のデータツリー２４を、表示部１１１に表示するように構成されている。また、データツリー作成部１１により作成されたデータツリー２４は、細胞培養に関するプロジェクトおよび培養条件に関連付けられた状態で記憶部２０に記憶される。
　図２～図４に示すように、グラフ作成部１２は、ユーザにより選択された第１データツリー２４ａに関するグラフ５０を、第１データツリー２４ａの最下層の分類情報４０（ここでは、「ウェル」）を横軸パラメータ５１とし、第１データツリー２４ａの最下層に含まれる細胞画像３０の解析結果を縦軸パラメータ５２として、作成するように構成されている。具体的には、グラフ作成部１２は、ユーザによる入力部１１２の入力操作に基づいて、表示部１１１の表示画面上の「グラフを表示」という表示６１が選択された場合、グラフ５０を作成するように構成されている。また、表示制御部１３は、グラフ作成部１２により作成されたグラフ５０を、コンピュータ１１０に送信することによって、表示部１１１に表示するように構成されている。
　また、本実施形態では、横軸パラメータ５１は、細胞の培養または撮像に関する付随情報である。横軸パラメータ５１は、特に限られないが、たとえば、培養日数、ウェル、継代数、顕微鏡、撮像方法、顕微鏡のチャンネル、細胞種、培地、株、基質、誘導剤、酸素濃度、二酸化炭素濃度、および、温度などである。また、縦軸パラメータ５２は、細胞画像３０に基づいて得られる細胞の特徴量である。縦軸パラメータ５２は、特に限られないが、細胞数、細胞の形態的情報（長さ、真円度、半径およびアスペクト比など）、細胞の分化・未分化の割合、細胞のテクスチャの類似度、および、細胞の面積的情報などである。
　ここで、本実施形態では、図５および図６に示すように、表示制御部１３は、記憶部２０に記憶された複数のデータツリー２４のうち、第１データツリー２４ａと同一の横軸パラメータ５１および縦軸パラメータ５２を有する、第１データツリー２４ａとは異なる第２データツリー２４ｂを、ユーザにより選択可能に表示するとともに、ユーザにより第２データツリー２４ｂが選択された場合、ユーザにより選択された第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を、グラフ５０に追加するように、グラフ５０を更新するように構成されている。
　言い換えると、表示制御部１３は、第１データツリー２４ａに対応する比較対象の過去事例（第２データツリー２４ｂ）を、ユーザにより選択可能に表示するとともに、ユーザにより選択された比較対象の過去事例（第２データツリー２４ｂ）の細胞画像３０の解析結果を、比較元となる第１データツリー２４ａの細胞画像３０の解析結果と比較可能なように、グラフ５０を更新するように構成されている。ユーザは、更新されたグラフ５０に基づいて、同一の横軸パラメータ５１および縦軸パラメータ５２を有するデータツリー２４同士において、たとえば、解析結果の傾向の妥当性を比較したり、解析結果の相違を比較したりすることが可能である。また、表示制御部１３は、ユーザにより複数（図６では、２つ）の第２データツリー２４ｂが選択された場合、ユーザにより選択された複数の第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を、グラフ５０に追加するように、グラフ５０を更新するように構成されている。
　具体的には、表示制御部１３は、ユーザが第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果をグラフ５０に追加する操作のための「比較する」という表示６２を表示部１１１に表示するように構成されている。また、グラフ作成部１２は、ユーザによる入力部１１２の入力操作に基づいて、表示部１１１の表示画面上の「比較する」という表示６２が選択された場合、ユーザにより選択された第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を、グラフ５０に追加するように、グラフ５０を作成し直すように構成されている。また、表示制御部１３は、グラフ作成部１２により作成し直されたグラフ５０を、コンピュータ１１０に送信することによって、表示部１１１に表示されたグラフ５０を更新するように構成されている。
　また、グラフ作成部１２は、第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果をグラフ５０に追加した状態で、ユーザによる入力部１１２の入力操作に基づいて、別の第２データツリー２４ｂの表示部１１１の表示画面上の「比較する」という表示６２が選択された場合、ユーザにより選択された第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を、グラフ５０にさらに追加するように、グラフ５０を作成し直すように構成されている。また、表示制御部１３は、グラフ作成部１２により作成し直された、第２データツリー２４ｂがさらに追加されたグラフ５０を、コンピュータ１１０に送信することによって、表示部１１１に表示されたグラフ５０を更新するように構成されている。ユーザは、任意の数の第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を、グラフ５０に追加可能である。
　また、本実施形態では、データツリー検索部１４は、記憶部２０に記憶された複数のデータツリー２４のうちから、第２データツリー２４ｂを検索するように構成されている。また、表示制御部１３は、データツリー検索部１４により検索された第２データツリー２４ｂを、ユーザにより選択可能に表示するように構成されている。この際、表示制御部１３は、データツリー検索部１４により検索された第２データツリー２４ｂを、リスト化して表示するように構成されている。
　また、本実施形態では、データツリー検索部１４は、細胞培養に関するプロジェクトおよび培養条件を検索条件として指定した状態で、記憶部２０に記憶された複数のデータツリー２４のうちから、第２データツリー２４ｂを検索可能に構成されている。また、表示制御部１３は、検索条件を指定した状態でデータツリー検索部１４により検索された第２データツリー２４ｂを、ユーザにより選択可能に表示するように構成されている。
　表示制御部１３は、プロジェクトの種類（プロジェクト名）を選択可能なプルダウン形式の表示６３、および、培養条件の種類（培養条件名）を選択可能なプルダウン形式の表示６４を表示部１１１に表示するように構成されている。また、データツリー検索部１４は、ユーザによる入力部１１２の入力操作に基づいて、表示部１１１の表示画面上の表示６３および６４においてプロジェクトおよび培養条件が選択された場合、選択されたプロジェクトおよび培養条件に対応する第２データツリー２４ｂを検索するように構成されている。すなわち、データツリー検索部１４は、選択されたプロジェクトに関連付けられ、かつ、選択された培養条件に関連付けられ、かつ、第１データツリー２４ａと同一の横軸パラメータ５１および縦軸パラメータ５２を有する第２データツリー２４ｂを検索するように構成されている。なお、プロジェクト名および培養条件名は、ユーザにより予め設定されている。
　たとえば、ユーザにより、第１データツリー２４ａと異なるプロジェクトおよび同一の培養条件が検索条件として指定（選択）されたとする。この場合、データツリー検索部１４は、第１データツリー２４ａと異なるプロジェクトおよび同一の培養条件を検索条件として指定した状態で、記憶部２０に記憶された複数のデータツリー２４のうちから、第２データツリー２４ｂを検索する。また、表示制御部１３は、第１データツリー２４ａと異なるプロジェクトおよび同一の培養条件を検索条件として指定した状態でデータツリー検索部１４により検索された、第１データツリー２４ａと異なるプロジェクトおよび同一の培養条件の第２データツリー２４ｂを、ユーザにより選択可能に表示する。
　また、たとえば、ユーザにより、第１データツリー２４ａと同一のプロジェクトおよび異なる培養条件が検索条件として指定（選択）されたとする。この場合、データツリー検索部１４は、第１データツリー２４ａと同一のプロジェクトおよび異なる培養条件を検索条件として指定した状態で、記憶部２０に記憶された複数のデータツリー２４のうちから、第２データツリー２４ｂを検索する。また、表示制御部１３は、第１データツリー２４ａと同一のプロジェクトおよび異なる培養条件を検索条件として指定した状態でデータツリー検索部１４により検索された、第１データツリー２４ａと同一のプロジェクトおよび異なる培養条件の第２データツリー２４ｂを、ユーザにより選択可能に表示する。なお、ユーザは、第１データツリー２４ａと同一のプロジェクトおよび同一の培養条件を検索条件として指定することもできるし、第１データツリー２４ａと異なるプロジェクトおよび異なる培養条件を検索条件として指定することもできる。
　また、本実施形態では、表示制御部１３は、ユーザにより選択された第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を、第１データツリー２４ａの細胞画像３０の解析結果とは異なる色で、グラフ５０に追加するように、グラフ５０を更新するように構成されている。たとえば、表示制御部１３は、グラフ５０において第１データツリー２４ａの細胞画像３０の解析結果を赤色で表示している場合、グラフ５０において第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を赤色とは異なる緑色で表示する。
　また、表示制御部１３は、グラフ５０に第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を追加した状態で、グラフ５０に第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果をさらに追加する場合、さらに追加する第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を、第１データツリー２４ａの細胞画像３０の解析結果および追加済みの第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果とは異なる色で、グラフ５０に追加するように、グラフ５０を更新するように構成されている。たとえば、表示制御部１３は、グラフ５０において、第１データツリー２４ａの細胞画像３０の解析結果を赤色で表示し、追加済みの第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を緑色で表示している場合、さらに追加する第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を赤色および緑色とは異なる青色で表示する。
　また、本実施形態では、表示制御部１３は、グラフ５０に追加した第２データツリー２４ｂの解析結果を削除する操作がユーザにより行われた場合、グラフ５０に追加した第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を、グラフ５０から削除するように、グラフ５０を更新するように構成されている。具体的には、表示制御部１３は、グラフ５０に追加した第２データツリー２４ｂの解析結果を削除する操作のための「リセット」という表示６５を表示部１１１に表示するように構成されている。また、グラフ作成部１２は、ユーザによる入力部１１２の入力操作に基づいて、表示部１１１の表示画面上の「リセット」という表示６５が選択された場合、グラフ５０に追加した第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果の全てを、グラフ５０から削除するように、グラフ５０を作成し直すように構成されている。すなわち、グラフ作成部１２は、グラフ５０に追加した第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果の全てを、グラフ５０から削除することによって、初期状態（図５の状態）に戻すように、グラフ５０を作成し直すように構成されている。また、表示制御部１３は、グラフ作成部１２により作成し直されたグラフ５０を、コンピュータ１１０に送信することによって、表示部１１１に表示されたグラフ５０を更新するように構成されている。
　また、本実施形態では、図７に示すように、ファイル出力部１５は、第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を追加したグラフ５０の基となった細胞画像３０、および、第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を追加したグラフ５０を、値をカンマで区切ったＣＳＶ（Ｃｏｍｍａ　Ｓｅｐａｒａｔｅｄ　Ｖａｌｕｅ）ファイル７０として出力するように構成されている。すなわち、ファイル出力部１５は、グラフ５０の基となった第１データツリー２４ａの細胞画像３０および第２データツリー２４ｂの細胞画像３０と、グラフ５０とを、値をカンマで区切った数値データとして取得するとともに、数値データとして取得された細胞画像３０およびグラフ５０を含むＣＳＶファイル７０として、コンピュータ１１０に出力するように構成されている。また、ファイル出力部１５は、ユーザによる入力部１１２の入力操作に基づいて、表示部１１１の表示画面上の「ファイル出力」という表示６６が選択された場合、ＣＳＶファイル７０をコンピュータ１１０に出力するように構成されている。
　また、本実施形態では、ファイル出力部１５は、細胞培養に関するプロジェクトおよび培養条件の情報を含む付加情報を付加した状態で、ＣＳＶファイル７０を出力するように構成されている。付加情報としては、特に限られないが、たとえば、プロジェクト名、培養条件名、分類情報４０（顕微鏡、位相差観察方法、継代数、培養日数およびウェルなど）などである。
　また、本実施形態では、図８に示すように、表示制御部１３は、記憶部２０に記憶された複数のデータツリー２４のうち、第１データツリー２４ａと同一の横軸パラメータ５１および異なる縦軸パラメータ５２を有する、第１データツリー２４ａとは異なる第３データツリー２４ｃを、ユーザにより選択可能に表示するとともに、ユーザにより第３データツリー２４ｃが選択された場合、ユーザにより選択された第３データツリー２４ｃの細胞画像３０の解析結果を、グラフ５０に追加するように、グラフ５０を更新するように構成されている。ユーザは、更新されたグラフ５０に基づいて、互いに異なる縦軸パラメータ５２を有するデータツリー２４同士において、たとえば、解析結果の相関性を調べることが可能である。
　具体的には、表示制御部１３は、第３データツリー２４ｃを選択可能に表示するための「制限無」という表示６８を表示部１１１に表示するように構成されている。また、表示制御部１３は、ユーザによる入力部１１２の入力操作に基づいて、表示部１１１の表示画面上の「制限無」という表示６７が選択された場合、第１データツリー２４ａと同一の横軸パラメータ５１および縦軸パラメータ５２を有するという、第２データツリー２４ｂを検索するための制限を解除することによって、記憶部２０に記憶された複数のデータツリー２４をユーザにより選択可能に表示部１１１に表示するように構成されている。ユーザは、表示部１１１に表示されたデータツリー２４のうちから、第１データツリー２４ａと同一の横軸パラメータ５１および異なる縦軸パラメータ５２を有する第３データツリー２４ｃを選択することが可能である。
　また、表示制御部１３は、ユーザが第３データツリー２４ｃの細胞画像３０の解析結果をグラフ５０に追加する操作のための「比較する」という表示６８を表示部１１１に表示するように構成されている。また、グラフ作成部１２は、ユーザによる入力部１１２の入力操作に基づいて、表示部１１１の表示画面上の「比較する」という表示６８が選択された場合、ユーザにより選択された第３データツリー２４ｃの細胞画像３０の解析結果を、グラフ５０に追加するように、グラフ５０を作成し直すように構成されている。また、表示制御部１３は、グラフ作成部１２により作成し直されたグラフ５０を、コンピュータ１１０に送信することによって、表示部１１１に表示されたグラフ５０を更新するように構成されている。更新されたグラフ５０は、たとえば、グラフ左側に第１データツリー２４ａの縦軸パラメータ５２（図８では、アスペクト比）を有し、グラフ右側に第３データツリー２４ｃの縦軸パラメータ５２（図８では、細胞数）を有している。
　次に、図９を参照して、本実施形態の細胞画像解析システム１００によるデータツリー２４同士の比較に関する制御処理を説明する。
　図９に示すように、まず、ステップ２０１において、ユーザによる入力部１１２の入力操作に基づいて、グラフ５０の基となる第１データツリー２４ａが選択される。そして、ステップ２０２において、ユーザによる入力部１１２の入力操作に基づいて、第１データツリー２４ａの階層構造が決定（変更）される。そして、ステップ２０３において、グラフ作成部１２により、第１データツリー２４ａに関するグラフ５０が作成されるとともに、表示制御部１３により、グラフ作成部１２により作成されたグラフ５０が表示部１１１に表示される。
　そして、ステップ２０４において、データツリー検索部１４により、第２データツリー２４ｂが検索されるとともに、表示制御部１３により、データツリー検索部１４により検索された第２データツリー２４ｂが表示部１１１に表示される。そして、ステップ２０５において、ユーザによる入力部１１２の入力操作に基づいて、表示部１１１に表示された第２データツリー２４ｂのうちから、グラフ５０に追加する第２データツリー２４ｂが選択される。そして、ステップ２０６において、グラフ作成部１２により、第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を追加するようにグラフ５０が作成し直されるとともに、表示制御部１３により、グラフ作成部１２により作成し直されたグラフ５０が表示部１１１に表示される（表示部１１１上のグラフ５０が更新される）。
　そして、ステップ２０７において、ユーザにより、第２データツリー２４ｂをさらに追加するか否かの判断が行われる。そして、ステップ２０７において、ユーザにより、第２データツリー２４ｂをさらに追加すると判断された場合、ステップ２０５に進む。そして、ステップ２０５および２０６の処理がさらに行われる。また、ステップ２０７において、ユーザにより、第２データツリー２４ｂをさらに追加すると判断された場合、ステップ２０８に進む。
　そして、ステップ２０８において、ユーザにより、ＣＳＶファイル７０を出力するか否かの判断が行われる。そして、ステップ２０８において、ユーザにより、ＣＳＶファイル７０を出力すると判断された場合、ステップ２０９に進む。そして、ステップ２０９において、ファイル出力部１５により、グラフ５０の基となった細胞画像３０およびグラフ５０の数値データを含むＣＳＶファイル７０がコンピュータ１１０に出力される。そして、ステップ２１０に進む。また、ステップ２０８において、ユーザにより、ＣＳＶファイル７０を出力しないと判断された場合、ステップ２０９の処理を行うことなく、ステップ２１０に進む。
　そして、ステップ２１０において、ユーザにより、グラフ５０に追加した第２データツリー２４ｂを消去して初期状態に戻すか否かの判断が行われる。そして、ステップ２１０において、ユーザにより、グラフ５０に追加した第２データツリー２４ｂを消去して初期状態に戻すと判断された場合、ステップ２０３に進む。そして、ステップ２０３～２０９の処理が適宜行われる。また、ユーザにより、グラフ５０に追加した第２データツリー２４ｂを消去して初期状態に戻さないと判断された場合、ユーザにより制御処理を終了させるための操作が行われて制御処理が終了される。
　（本実施形態の効果）
　本実施形態では、以下のような効果を得ることができる。
　本実施形態では、上記のように、細胞画像解析システム１００は、共通の分類情報４０を有する細胞画像３０同士が同じグループとなるようにグループ分けすることによって細胞画像３０に関するデータツリー２４を作成するデータツリー作成部１１と、データツリー作成部１１により作成された複数のデータツリー２４を記憶する記憶部２０と、ユーザにより選択された第１データツリー２４ａに関するグラフ５０を、第１データツリー２４ａの最下層の分類情報４０を横軸パラメータ５１とし、第１データツリー２４ａの細胞画像３０の解析結果を縦軸パラメータ５２として、作成するグラフ作成部１２と、グラフ作成部１２により作成されたグラフ５０を表示する表示制御部１３と、を備え、表示制御部１３は、記憶部２０に記憶された複数のデータツリー２４のうち、第１データツリー２４ａと同一の横軸パラメータ５１および縦軸パラメータ５２を有する、第１データツリー２４ａとは異なる第２データツリー２４ｂを、ユーザにより選択可能に表示するとともに、ユーザにより第２データツリー２４ｂが選択された場合、ユーザにより選択された第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を、グラフ５０に追加するように、グラフ５０を更新するように構成されている。
　これにより、第１データツリー２４ａの細胞画像３０の解析結果と、第１データツリー２４ａと同一の横軸パラメータ５１および縦軸パラメータ５２を有する、第１データツリー２４ａとは異なる第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果とを、同一のグラフ５０上で対比して表示することができる。その結果、データツリー２４により細胞画像３０を管理する場合において、互いに異なるデータツリー２４同士を容易に比較することができる。
　なお、互いに異なるデータツリー２４同士を比較するために、ユーザが第１データツリー２４ａに第２データツリー２４ｂのデータを追加して新たなデータツリー２４を作成することも考えられるが、この場合、ユーザが第１データツリー２４ａに第２データツリー２４ｂのデータを追加する手間が発生する。これに対して、上記のように、第１データツリー２４ａと同一の横軸パラメータ５１および縦軸パラメータ５２を有する、第１データツリー２４ａとは異なる第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を、グラフ５０に追加するように、グラフ５０を更新する。これにより、ユーザにより第２データツリー２４ｂが選択された場合、グラフ５０が自動的に更新されるので、ユーザが第１データツリー２４ａに第２データツリー２４ｂのデータを追加する手間を発生させることなく、互いに異なるデータツリー２４同士を容易に比較することができる。
　また、互いに異なるデータツリー２４同士を比較する場合、グラフ５０の縦軸および横軸を適切に揃える必要があるが、この場合、ユーザがグラフ５０の縦軸および横軸を適切に揃える手間が発生する。これに対して、上記のように、第１データツリー２４ａと同一の横軸パラメータ５１および縦軸パラメータ５２を有する、第１データツリー２４ａとは異なる第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を、グラフ５０に追加するように、グラフ５０を更新する。これにより、ユーザにより第２データツリー２４ｂが選択された場合、グラフ５０が自動的に更新されるので、ユーザがグラフ５０の縦軸および横軸を適切に揃える手間を発生させることなく、互いに異なるデータツリー２４同士を容易に比較することができる。
　また、上記実施形態では、以下のように構成したことによって、下記のような更なる効果が得られる。
　すなわち、本実施形態では、上記のように、細胞画像解析システム１００は、記憶部２０に記憶された複数のデータツリー２４のうちから、第２データツリー２４ｂを検索するデータツリー検索部１４をさらに備え、表示制御部１３は、データツリー検索部１４により検索された第２データツリー２４ｂを、ユーザにより選択可能に表示するように構成されている。これにより、データツリー検索部１４により検索された第２データツリー２４ｂがユーザに提示されるので、ユーザは、所望の第２データツリー２４ｂを容易に選択することができる。
　また、本実施形態では、上記のように、データツリー検索部１４は、細胞培養に関するプロジェクトおよび培養条件を検索条件として指定した状態で、記憶部２０に記憶された複数のデータツリー２４のうちから、第２データツリー２４ｂを検索可能に構成されており、表示制御部１３は、検索条件を指定した状態でデータツリー検索部１４により検索された第２データツリー２４ｂを、ユーザにより選択可能に表示するように構成されている。これにより、プロジェクトおよび培養条件を検索条件として指定した状態でデータツリー検索部１４により検索された第２データツリー２４ｂがユーザに提示されるので、ユーザは、所望の第２データツリー２４ｂをより容易に選択することができる。
　また、本実施形態では、上記のように、データツリー検索部１４は、第１データツリー２４ａと同一の培養条件を検索条件として指定した状態で、記憶部２０に記憶された複数のデータツリー２４のうちから、第２データツリー２４ｂを検索可能に構成されており、表示制御部１３は、第１データツリー２４ａと同一の培養条件を検索条件として指定した状態でデータツリー検索部１４により検索された、第１データツリー２４ａと同一の培養条件の第２データツリー２４ｂを、ユーザにより選択可能に表示するように構成されている。これにより、第１データツリー２４ａと同一の培養条件を検索条件として指定した状態でデータツリー検索部１４により検索された、第１データツリー２４ａと同一の培養条件の第２データツリー２４ｂが表示されるので、ユーザは、比較したい場合が多い第１データツリー２４ａと同一の培養条件の第２データツリー２４ｂを容易に選択することができる。
　また、本実施形態では、上記のように、表示制御部１３は、ユーザにより選択された第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を、第１データツリー２４ａの細胞画像３０の解析結果とは異なる色で、グラフ５０に追加するように、グラフ５０を更新するように構成されている。これにより、ユーザは、第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果と、第１データツリー２４ａの細胞画像３０の解析結果とを容易に視覚的に識別することができるので、データツリー２４同士の比較を容易に行うことができる。
　また、本実施形態では、上記のように、表示制御部１３は、グラフ５０に追加した第２データツリー２４ｂの解析結果を削除する操作がユーザにより行われた場合、グラフ５０に追加した第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を、グラフ５０から削除するように、グラフ５０を更新するように構成されている。これにより、グラフ５０に追加した第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果の比較の必要がなくなった場合、不要になった第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を、グラフ５０から削除することができる。
　また、本実施形態では、上記のように、横軸パラメータ５１は、細胞の培養または撮像に関する付随情報である。これにより、横軸パラメータ５１が細胞の培養または撮像に関する付随情報であるので、横軸パラメータ５１を適切に設定することができる。
　また、本実施形態では、上記のように、縦軸パラメータ５２は、細胞画像３０に基づく特徴量である。これにより、縦軸パラメータ５２が細胞画像３０に基づく特徴量であるので、縦軸パラメータ５２を適切に設定することができる。
　また、本実施形態では、上記のように、データツリー２４は、表示画面上で階層構造を有する仮想的なデータツリー２４として構成されている。これにより、階層構造を有するフォルダを構築することによりデータツリー２４を構成する場合と異なり、階層構造を変更したい場合に、フォルダを再構築するなどの煩雑な手間を発生させることがない。その結果、煩雑な手間を発生させることなく、データツリー２４により細胞画像３０を管理することができる。
　また、本実施形態では、上記のように、細胞画像解析システム１００は、第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を追加したグラフ５０の基となった細胞画像３０、および、第２データツリー２４ｂの細胞画像３０の解析結果を追加したグラフ５０を、ＣＳＶファイル７０として出力するファイル出力部１５をさらに備える。これにより、比較結果である細胞画像３０およびグラフ５０を、汎用性の高いＣＳＶファイル７０として出力することができるので、比較結果のデータ（ＣＳＶファイル７０）を容易に編集したり、比較結果のデータ（ＣＳＶファイル７０）をユーザ間で容易に受け渡したりすることができる。
　また、本実施形態では、上記のように、ファイル出力部１５は、細胞培養に関するプロジェクトおよび培養条件の情報の少なくとも１つを含む付加情報を付加した状態で、ＣＳＶファイル７０を出力するように構成されている。これにより、ユーザは、ＣＳＶファイル７０を用いた作業を行う際に、ＣＳＶファイル７０だけで、プロジェクトを確認したり、培養条件を確認したりすることができる。その結果、ユーザがＣＳＶファイル７０以外を用いて、プロジェクトを確認したり、培養条件を確認したりする手間を省くことができる。
　また、本実施形態では、上記のように、表示制御部１３は、記憶部２０に記憶された複数のデータツリー２４のうち、第１データツリー２４ａと同一の横軸パラメータ５１および異なる縦軸パラメータ５２を有する、第１データツリー２４ａとは異なる第３データツリー２４ｃを、ユーザにより選択可能に表示するとともに、ユーザにより第３データツリー２４ｃが選択された場合、ユーザにより選択された第３データツリー２４ｃの細胞画像３０の解析結果を、グラフ５０に追加するように、グラフ５０を更新するように構成されている。これにより、縦軸パラメータ５２が同一のデータツリー２４（第１データツリー２４ａおよび第２データツリー２４ｂ）同士だけでなく、縦軸パラメータ５２が互いに異なるデータツリー２４（第１データツリー２４ａおよび第３データツリー２４ｃ）同士も、同一のグラフ５０上で対比して表示することができる。その結果、ユーザによる細胞画像３０の解析結果の比較作業の自由度を向上させることができる。
　［変形例］
　なお、今回開示された実施形態は、すべての点で例示であって制限的なものではないと考えられるべきである。本発明の範囲は、上記した実施形態の説明ではなく請求の範囲によって示され、さらに請求の範囲と均等の意味および範囲内でのすべての変更（変形例）が含まれる。
　たとえば、上記実施形態では、細胞画像解析装置が、クライアントサーバモデルで構築された細胞画像解析システムのサーバとして機能する例を示したが、本発明はこれに限られない。本発明では、細胞画像解析装置は、たとえば図１０に示すように、独立したコンピュータにより構成されていてもよい。図１０の変形例では、細胞画像解析装置１０１は、プロセッサ３１０および記憶部３２０を備えたコンピュータ３００により構成されている。コンピュータ３００には、表示部３３０および入力部３４０が接続されている。コンピュータ３００は、撮像装置１２０と通信可能に接続されている。コンピュータ３００のプロセッサ３１０が、上記実施形態で示したデータツリー作成部１１と、グラフ作成部１２と、表示制御部１３と、データツリー検索部１４と、ファイル出力部１５と、を機能ブロックとして含む。なお、記憶部３２０は、請求の範囲の「データツリー記憶部」の一例である。
　また、上記実施形態および図１０の変形例では、単一のプロセッサにより、全ての処理（データツリー作成部、グラフ作成部、表示制御部、データツリー検索部、および、ファイル出力部としての各処理）を実行する例を示したが、本発明はこれに限られない。本発明では、上記各処理は、複数のプロセッサによって分担して実行されてもよい。１つ１つの処理が別々のプロセッサによって実行されてもよい。複数のプロセッサは、別々のコンピュータに設けられていてもよい。つまり、細胞画像解析装置が、画像処理を行う複数台のコンピュータによって構成されていてもよい。
　また、上記実施形態では、細胞画像解析システムが、表示部を備える構成の例を示したが、本発明はこれに限られない。たとえば、細胞画像解析システムは、表示部を備えていなくてもよい。細胞画像解析システムが表示部を備えていない場合、プロセッサは、外部の表示装置に対して、表示情報を出力するように構成すればよい。
　また、上記実施形態では、グラフ作成部は、第１データツリーの最下層の分類情報を横軸パラメータとし、第１データツリーの細胞画像の解析結果を縦軸パラメータとして、第１データツリーに関するグラフを作成するように構成されている例を示したが、本発明はこれに限られない。たとえば、グラフ作成部は、第１データツリーの最下層から２番目の層の分類情報を横軸パラメータとし、第１データツリーの細胞画像の解析結果を縦軸パラメータとして、第１データツリーに関するグラフを作成するように構成されていてもよい。
　また、上記実施形態では、細胞画像解析システム（細胞画像解析装置）が、データツリー検索部を備える構成の例を示したが、本発明はこれに限られない。たとえば、細胞画像解析システム（細胞画像解析装置）は、データツリー検索部を備えていなくてもよい。この場合、表示制御部は、記憶部に記憶されたデータツリーを検索せずに表示することにより、表示されたデータツリーのうちから、第２データツリーを、ユーザにより選択可能に表示してもよい。なお、ユーザの利便性の観点から、細胞画像解析システム（細胞画像解析装置）は、データツリー検索部を備えている方が好ましい。
　また、上記実施形態では、データツリー検索部は、プロジェクトおよび培養条件を検索条件として指定した状態で、第２データツリーを検索可能に構成されている例を示したが、本発明はこれに限られない。本発明では、データツリー検索部は、プロジェクトおよび培養条件のうちの一方のみを検索条件として指定した状態で、第２データツリーを検索可能に構成されていてもよい。また、データツリー検索部は、プロジェクトおよび培養条件以外を検索条件として指定した状態で、第２データツリーを検索可能に構成されていてもよい。
　また、上記実施形態では、表示制御部は、グラフに追加した第２データツリーの解析結果を削除する操作がユーザにより行われた場合、グラフに追加した第２データツリーの細胞画像の解析結果の全てを、グラフから削除するように、グラフを更新するように構成されている例を示したが、本発明はこれに限られない。本発明では、表示制御部は、グラフに追加した第２データツリーの解析結果を削除する操作がユーザにより行われた場合、グラフに追加した第２データツリーの細胞画像の解析結果の一部（ユーザにより削除選択された１つ、および、直前に追加した１つなど）を、グラフから削除するように、グラフを更新するように構成されていてもよい。
　また、上記実施形態では、細胞画像解析システム（細胞画像解析装置）が、ファイル出力部を備える構成の例を示したが、本発明はこれに限られない。たとえば、細胞画像解析システム（細胞画像解析装置）は、ファイル出力部を備えていなくてもよい。なお、ユーザの利便性の観点から、細胞画像解析システム（細胞画像解析装置）は、ファイル出力部を備えている方が好ましい。
　また、上記実施形態では、表示制御部は、記憶部に記憶された複数のデータツリーを表示することにより、第３データツリーを、ユーザにより選択可能に表示するように構成されている例を示したが、本発明はこれに限られない。たとえば、データツリー検索部が、第１データツリーと同一の横軸パラメータおよび異なる縦軸パラメータを有する第３データツリーを検索可能に構成されていてもよい。この場合、表示制御部は、データツリー検索部により検索された第３データツリーを、ユーザにより選択可能に表示するように構成されていてもよい。
　また、上記実施形態では、表示制御部は、第３データツリーを、ユーザにより選択可能に表示するように構成されている例を示したが、本発明はこれに限られない。本発明では、表示制御部は、第１データツリーを、ユーザにより選択可能に表示するように構成されていれば、第３データツリーを、ユーザにより選択可能に表示するように構成されていなくてもよい。
　［態様］
　上記した例示的な実施形態は、以下の態様の具体例であることが当業者により理解される。
（項目１）
　共通の分類情報を有する細胞画像同士が同じグループとなるようにグループ分けすることによって前記細胞画像に関するデータツリーを作成するデータツリー作成部と、
　前記データツリー作成部により作成された複数の前記データツリーを記憶するデータツリー記憶部と、
　ユーザにより選択された第１データツリーに関するグラフを、前記第１データツリーの最下層または最下層から２番目の層の前記分類情報を横軸パラメータとし、前記第１データツリーの前記細胞画像の解析結果を縦軸パラメータとして、作成するグラフ作成部と、
　前記グラフ作成部により作成された前記グラフを表示する表示制御部と、を備え、
　前記表示制御部は、前記データツリー記憶部に記憶された前記複数のデータツリーのうち、前記第１データツリーと同一の前記横軸パラメータおよび前記縦軸パラメータを有する、前記第１データツリーとは異なる第２データツリーを、前記ユーザにより選択可能に表示するとともに、前記ユーザにより前記第２データツリーが選択された場合、前記ユーザにより選択された前記第２データツリーの前記細胞画像の解析結果を、前記グラフに追加するように、前記グラフを更新するように構成されている、細胞画像解析システム。
（項目２）
　前記データツリー記憶部に記憶された前記複数のデータツリーのうちから、前記第２データツリーを検索するデータツリー検索部をさらに備え、
　前記表示制御部は、前記データツリー検索部により検索された前記第２データツリーを、前記ユーザにより選択可能に表示するように構成されている、項目１に記載の細胞画像解析システム。
（項目３）
　前記データツリー検索部は、細胞培養に関するプロジェクトおよび培養条件のうちの少なくとも１つを検索条件として指定した状態で、前記データツリー記憶部に記憶された前記複数のデータツリーのうちから、前記第２データツリーを検索可能に構成されており、
　前記表示制御部は、前記検索条件を指定した状態で前記データツリー検索部により検索された前記第２データツリーを、前記ユーザにより選択可能に表示するように構成されている、項目２に記載の細胞画像解析システム。
（項目４）
　前記データツリー検索部は、前記第１データツリーと同一の培養条件を前記検索条件として指定した状態で、前記データツリー記憶部に記憶された前記複数のデータツリーのうちから、前記第２データツリーを検索可能に構成されており、
　前記表示制御部は、前記第１データツリーと同一の培養条件を前記検索条件として指定した状態で前記データツリー検索部により検索された、前記第１データツリーと同一の培養条件の前記第２データツリーを、前記ユーザにより選択可能に表示するように構成されている、項目３に記載の細胞画像解析システム。
（項目５）
　前記表示制御部は、前記ユーザにより選択された前記第２データツリーの前記細胞画像の解析結果を、前記第１データツリーの前記細胞画像の解析結果とは異なる色で、前記グラフに追加するように、前記グラフを更新するように構成されている、項目１～４のいずれか１項に記載の細胞画像解析システム。
（項目６）
　前記表示制御部は、前記グラフに追加した前記第２データツリーの解析結果を削除する操作が前記ユーザにより行われた場合、前記グラフに追加した前記第２データツリーの前記細胞画像の解析結果を、前記グラフから削除するように、前記グラフを更新するように構成されている、項目１～５のいずれか１項に記載の細胞画像解析システム。
（項目７）
　前記横軸パラメータは、細胞の培養または撮像に関する付随情報である、項目１～６のいずれか１項に記載の細胞画像解析システム。
（項目８）
　前記縦軸パラメータは、前記細胞画像に基づく特徴量である、項目１～７のいずれか１項に記載の細胞画像解析システム。
（項目９）
　前記データツリーは、表示画面上で階層構造を有する仮想的なデータツリーとして構成されている、項目１～８のいずれか１項に記載の細胞画像解析システム。
（項目１０）
　前記第２データツリーの前記細胞画像の解析結果を追加した前記グラフの基となった前記細胞画像、および、前記第２データツリーの前記細胞画像の解析結果を追加した前記グラフを、ＣＳＶファイルとして出力するファイル出力部をさらに備える、項目１～９のいずれか１項に記載の細胞画像解析システム。
（項目１１）
　前記ファイル出力部は、細胞培養に関するプロジェクトおよび培養条件の情報の少なくとも１つを含む付加情報を付加した状態で、前記ＣＳＶファイルを出力するように構成されている、項目１０に記載の細胞画像解析システム。
（項目１２）
　前記表示制御部は、前記データツリー記憶部に記憶された前記複数のデータツリーのうち、前記第１データツリーと同一の前記横軸パラメータおよび異なる前記縦軸パラメータを有する、前記第１データツリーとは異なる第３データツリーを、前記ユーザにより選択可能に表示するとともに、前記ユーザにより前記第３データツリーが選択された場合、前記ユーザにより選択された前記第３データツリーの前記細胞画像の解析結果を、前記グラフに追加するように、前記グラフを更新するように構成されている、項目１～１１のいずれか１項に記載の細胞画像解析システム。
　１１　データツリー作成部
　１２　グラフ作成部
　１３　表示制御部
　１４　データツリー検索部
　１５　ファイル出力部
　２０、３２０　記憶部（データツリー記憶部）
　２４　データツリー
　２４ａ　第１データツリー
　２４ｂ　第２データツリー
　２４ｃ　第３データツリー
　３０　細胞画像
　４０　分類情報
　５０　グラフ
　５１　横軸パラメータ
　５２　縦軸パラメータ
　７０　ＣＳＶファイル
　１００　細胞画像解析システム

Claims (12)

  1. 　共通の分類情報を有する細胞画像同士が同じグループとなるようにグループ分けすることによって前記細胞画像に関するデータツリーを作成するデータツリー作成部と、
    　前記データツリー作成部により作成された複数の前記データツリーを記憶するデータツリー記憶部と、
    　ユーザにより選択された第１データツリーに関するグラフを、前記第１データツリーの最下層または最下層から２番目の層の前記分類情報を横軸パラメータとし、前記第１データツリーの前記細胞画像の解析結果を縦軸パラメータとして、作成するグラフ作成部と、
    　前記グラフ作成部により作成された前記グラフを表示する表示制御部と、を備え、
    　前記表示制御部は、前記データツリー記憶部に記憶された前記複数のデータツリーのうち、前記第１データツリーと同一の前記横軸パラメータおよび前記縦軸パラメータを有する、前記第１データツリーとは異なる第２データツリーを、前記ユーザにより選択可能に表示するとともに、前記ユーザにより前記第２データツリーが選択された場合、前記ユーザにより選択された前記第２データツリーの前記細胞画像の解析結果を、前記グラフに追加するように、前記グラフを更新するように構成されている、細胞画像解析システム。
  2. 　前記データツリー記憶部に記憶された前記複数のデータツリーのうちから、前記第２データツリーを検索するデータツリー検索部をさらに備え、
    　前記表示制御部は、前記データツリー検索部により検索された前記第２データツリーを、前記ユーザにより選択可能に表示するように構成されている、請求項１に記載の細胞画像解析システム。
  3. 　前記データツリー検索部は、細胞培養に関するプロジェクトおよび培養条件のうちの少なくとも１つを検索条件として指定した状態で、前記データツリー記憶部に記憶された前記複数のデータツリーのうちから、前記第２データツリーを検索可能に構成されており、
    　前記表示制御部は、前記検索条件を指定した状態で前記データツリー検索部により検索された前記第２データツリーを、前記ユーザにより選択可能に表示するように構成されている、請求項２に記載の細胞画像解析システム。
  4. 　前記データツリー検索部は、前記第１データツリーと同一の培養条件を前記検索条件として指定した状態で、前記データツリー記憶部に記憶された前記複数のデータツリーのうちから、前記第２データツリーを検索可能に構成されており、
    　前記表示制御部は、前記第１データツリーと同一の培養条件を前記検索条件として指定した状態で前記データツリー検索部により検索された、前記第１データツリーと同一の培養条件の前記第２データツリーを、前記ユーザにより選択可能に表示するように構成されている、請求項３に記載の細胞画像解析システム。
  5. 　前記表示制御部は、前記ユーザにより選択された前記第２データツリーの前記細胞画像の解析結果を、前記第１データツリーの前記細胞画像の解析結果とは異なる色で、前記グラフに追加するように、前記グラフを更新するように構成されている、請求項１に記載の細胞画像解析システム。
  6. 　前記表示制御部は、前記グラフに追加した前記第２データツリーの解析結果を削除する操作が前記ユーザにより行われた場合、前記グラフに追加した前記第２データツリーの前記細胞画像の解析結果を、前記グラフから削除するように、前記グラフを更新するように構成されている、請求項１に記載の細胞画像解析システム。
  7. 　前記横軸パラメータは、細胞の培養または撮像に関する付随情報である、請求項１に記載の細胞画像解析システム。
  8. 　前記縦軸パラメータは、前記細胞画像に基づく特徴量である、請求項１に記載の細胞画像解析システム。
  9. 　前記データツリーは、表示画面上で階層構造を有する仮想的なデータツリーとして構成されている、請求項１に記載の細胞画像解析システム。
  10. 　前記第２データツリーの前記細胞画像の解析結果を追加した前記グラフの基となった前記細胞画像、および、前記第２データツリーの前記細胞画像の解析結果を追加した前記グラフを、ＣＳＶファイルとして出力するファイル出力部をさらに備える、請求項１に記載の細胞画像解析システム。
  11. 　前記ファイル出力部は、細胞培養に関するプロジェクトおよび培養条件の情報の少なくとも１つを含む付加情報を付加した状態で、前記ＣＳＶファイルを出力するように構成されている、請求項１０に記載の細胞画像解析システム。
  12. 　前記表示制御部は、前記データツリー記憶部に記憶された前記複数のデータツリーのうち、前記第１データツリーと同一の前記横軸パラメータおよび異なる前記縦軸パラメータを有する、前記第１データツリーとは異なる第３データツリーを、前記ユーザにより選択可能に表示するとともに、前記ユーザにより前記第３データツリーが選択された場合、前記ユーザにより選択された前記第３データツリーの前記細胞画像の解析結果を、前記グラフに追加するように、前記グラフを更新するように構成されている、請求項１に記載の細胞画像解析システム。
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