JP6339432B2 - 細胞観察情報処理システム、細胞観察情報処理方法、細胞観察情報処理プログラム - Google Patents
細胞観察情報処理システム、細胞観察情報処理方法、細胞観察情報処理プログラム Download PDFInfo
- Publication number
- JP6339432B2 JP6339432B2 JP2014145878A JP2014145878A JP6339432B2 JP 6339432 B2 JP6339432 B2 JP 6339432B2 JP 2014145878 A JP2014145878 A JP 2014145878A JP 2014145878 A JP2014145878 A JP 2014145878A JP 6339432 B2 JP6339432 B2 JP 6339432B2
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- tag
- information
- search
- culture equipment
- identification information
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Active
Links
- 230000010365 information processing Effects 0.000 title claims description 136
- 238000003672 processing method Methods 0.000 title claims description 7
- 238000000605 extraction Methods 0.000 claims description 188
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 117
- 230000008569 process Effects 0.000 claims description 68
- 230000000694 effects Effects 0.000 claims description 56
- 238000012258 culturing Methods 0.000 claims description 27
- 239000000284 extract Substances 0.000 claims description 18
- 230000004044 response Effects 0.000 claims description 18
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 description 590
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 64
- 238000012423 maintenance Methods 0.000 description 26
- 238000010586 diagram Methods 0.000 description 20
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 17
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 17
- 238000011160 research Methods 0.000 description 12
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 11
- 230000009471 action Effects 0.000 description 7
- 230000008859 change Effects 0.000 description 7
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 7
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 6
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 5
- 101150040681 cho1 gene Proteins 0.000 description 5
- 239000000470 constituent Substances 0.000 description 5
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 4
- 210000004748 cultured cell Anatomy 0.000 description 4
- 239000001963 growth medium Substances 0.000 description 4
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 4
- 238000010191 image analysis Methods 0.000 description 3
- 230000007774 longterm Effects 0.000 description 3
- 239000002609 medium Substances 0.000 description 3
- 125000002066 L-histidyl group Chemical group [H]N1C([H])=NC(C([H])([H])[C@](C(=O)[*])([H])N([H])[H])=C1[H] 0.000 description 2
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 2
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 2
- 238000004904 shortening Methods 0.000 description 2
- 230000009897 systematic effect Effects 0.000 description 2
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 1
- 230000010261 cell growth Effects 0.000 description 1
- 230000006727 cell loss Effects 0.000 description 1
- 238000011109 contamination Methods 0.000 description 1
- 230000007423 decrease Effects 0.000 description 1
- 230000003203 everyday effect Effects 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 1
- 238000004321 preservation Methods 0.000 description 1
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 description 1
- 230000035899 viability Effects 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B50/00—ICT programming tools or database systems specially adapted for bioinformatics
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
- C12M1/00—Apparatus for enzymology or microbiology
- C12M1/34—Measuring or testing with condition measuring or sensing means, e.g. colony counters
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12M—APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY; APPARATUS FOR CULTURING MICROORGANISMS FOR PRODUCING BIOMASS, FOR GROWING CELLS OR FOR OBTAINING FERMENTATION OR METABOLIC PRODUCTS, i.e. BIOREACTORS OR FERMENTERS
- C12M41/00—Means for regulation, monitoring, measurement or control, e.g. flow regulation
- C12M41/46—Means for regulation, monitoring, measurement or control, e.g. flow regulation of cellular or enzymatic activity or functionality, e.g. cell viability
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N21/00—Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using sub-millimetre waves, infrared, visible or ultraviolet light
- G01N21/17—Systems in which incident light is modified in accordance with the properties of the material investigated
- G01N21/25—Colour; Spectral properties, i.e. comparison of effect of material on the light at two or more different wavelengths or wavelength bands
- G01N21/27—Colour; Spectral properties, i.e. comparison of effect of material on the light at two or more different wavelengths or wavelength bands using photo-electric detection ; circuits for computing concentration
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06F—ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
- G06F16/00—Information retrieval; Database structures therefor; File system structures therefor
-
- G—PHYSICS
- G06—COMPUTING; CALCULATING OR COUNTING
- G06F—ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
- G06F16/00—Information retrieval; Database structures therefor; File system structures therefor
- G06F16/20—Information retrieval; Database structures therefor; File system structures therefor of structured data, e.g. relational data
- G06F16/24—Querying
- G06F16/245—Query processing
- G06F16/2455—Query execution
- G06F16/24564—Applying rules; Deductive queries
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16B—BIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
- G16B30/00—ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids
-
- G—PHYSICS
- G16—INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
- G16H—HEALTHCARE INFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR THE HANDLING OR PROCESSING OF MEDICAL OR HEALTHCARE DATA
- G16H10/00—ICT specially adapted for the handling or processing of patient-related medical or healthcare data
- G16H10/40—ICT specially adapted for the handling or processing of patient-related medical or healthcare data for data related to laboratory analysis, e.g. patient specimen analysis
-
- Y—GENERAL TAGGING OF NEW TECHNOLOGICAL DEVELOPMENTS; GENERAL TAGGING OF CROSS-SECTIONAL TECHNOLOGIES SPANNING OVER SEVERAL SECTIONS OF THE IPC; TECHNICAL SUBJECTS COVERED BY FORMER USPC CROSS-REFERENCE ART COLLECTIONS [XRACs] AND DIGESTS
- Y02—TECHNOLOGIES OR APPLICATIONS FOR MITIGATION OR ADAPTATION AGAINST CLIMATE CHANGE
- Y02A—TECHNOLOGIES FOR ADAPTATION TO CLIMATE CHANGE
- Y02A90/00—Technologies having an indirect contribution to adaptation to climate change
- Y02A90/10—Information and communication technologies [ICT] supporting adaptation to climate change, e.g. for weather forecasting or climate simulation
Landscapes
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Theoretical Computer Science (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Zoology (AREA)
- Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
- General Physics & Mathematics (AREA)
- Medical Informatics (AREA)
- Databases & Information Systems (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Data Mining & Analysis (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Evolutionary Biology (AREA)
- Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
- Sustainable Development (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Mathematical Physics (AREA)
- Immunology (AREA)
- Pathology (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Primary Health Care (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Computational Linguistics (AREA)
- Public Health (AREA)
- Bioethics (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By Optical Means (AREA)
Description
細胞を用いた実験・研究では、ユーザは、親株の培養容器内で細胞を増殖維持させながら、継代培養を繰り返し、継代培養された親株から分離して小分けした子株の細胞を実験・研究に用いる。
実験・研究の精度を高めるには、実験・研究毎に用いる夫々の細胞が良好な培養状態を保持していることが望まれる。
タイプ1の維持培養では、継代作業時に、継代元の培養容器内で培養されている一部の細胞を、一つの培養容器の培地に植え付ける。そして、この作業を継代の都度繰り返しながら細胞を培養していく。
このため、タイプ1の維持培養では、図31(a) に示すように、継代元の細胞と継代先の細胞とが一対一で繋がる。また、継代元の細胞と継代先の細胞とが複数代にわたって時系列で繋がる系統が一つ存在する。
このため、タイプ2の維持培養では、図31(b) に示すように、継代元の細胞と継代先の細胞とが一対多で繋がる。また、継代元の細胞と継代先の細胞とが複数代にわたって時系列で繋がる系統が存在するが、継代作業時に継代元の培養容器として選択されない培養容器内の細胞は、後の代の細胞とは時系列で繋がらない。
このため、拡大培養では、図31(c)に示すように、継代元の細胞と継代先の細胞とが、一対多で時系列的に繋がる。また、継代元の細胞と継代先の細胞とが複数代にわたって時系列で繋がる系統が複数存在する。
しかしながら、タイプ2の維持培養や拡大培養のような一対多の継代を行う継代培養の場合、特許文献1に記載のような一対一の情報の関連付けを適用しても、例えば、図32(b)、図32(c)に二点差線で示すような、複数代に跨る特定系統の細胞の観察情報を時系列で繋げることができず、ユーザは、複数代に跨る特定系統の細胞の観察情報を把握することができない。
図33は継代元と継代先とが一対多となっているタイプの継代培養の一例として図31(b)に示したタイプ2の維持培養における各継代数における継代元と継代先の培養容器、観察情報を時系列で模式的に示す説明図である。なお、ここでは、便宜上、継代元と継代先とが一対多となっているタイプの継代培養としてタイプ2の維持培養を用いて説明することとする。
図33の例では、継代数が“P0”の代においては、継代元の培養容器で培養されている一部の細胞を継代先の培養容器として2つの培養容器に分けて培養している。また、継代数が“P1”の代においては、2つの培養容器のうち上段に示す培養容器を継代元の培養容器として選択し、当該培養容器で培養されている一部の細胞を継代作業時に2つの培養容器に分けて培養しており、下段に示す培養容器は予備サンプル分の培養容器となっている。さらに、継代数が“P2”の代においては、2つの培養容器のうち下段に示す培養容器を継代元の培養容器として選択し、当該培養容器で培養されている一部の細胞を継代作業時に2つの培養容器に分けて培養しており、上段に示す培養容器は予備サンプル分の培養容器となっている。さらにまた、継代数が“P3”の代においては、2つの培養容器のうち上段に示す培養容器を継代元の培養容器として選択し、当該培養容器で培養されている一部の細胞を継代作業時に2つの培養容器に分けて培養し、下段に示す培養容器は予備サンプル分の培養容器となっている。なお、図33では、継代元に選択された時点を○、選択されなかった時点を×で示すとともに、継代数“P0”,“P1”,“P2”,“P3”,“P4”の夫々の代において夫々の培養容器で培養されている細胞について夫々の時点の観察情報をアルファベットで示してある。
そして、図33の例では、継代数“P0”〜 “P4”の代を通して、継代元の培養容器から継代されて培養されてきた細胞の観察情報は、観察情報A,C,F,H,I,K,M,Nとなっており、継代元の細胞と継代先の細胞とが複数代に跨って時系列で繋がる系統としては、観察情報A,C,F,H,I,K,Mが繋がった系統と、観察情報A,C,F,H,I,K,Nが繋がった系統の2つの系統が存在する。
例えば、図33の例において、継代数が“P0”の代の細胞から継代数が“P1”の代の細胞へと継代する際には、上述のように、継代数が“P0”の代の1つ培養容器で培養される細胞の一部を2つの培養容器に分けて培養するが、継代数が“P0”の代の細胞から継代数が“P1”の代の細胞へと継代した時点では、継代数が“P1”の代の2つの培養容器で培養されるいずれの細胞が次の継代元の細胞となるかは定まっていない。
このため、特許文献1に記載のような一対一の情報の関連付けでは、継代数が“P0”の代の細胞に対し、継代数が“P1”の代の2つの培養容器で培養される細胞のうちいずれの培養容器で培養される細胞が次の継代元の細胞となるか定まっていない時点で、いずれか一方の細胞のみと関連付けを行わざるを得ないため、次の継代元となる細胞と関連付けを行わずに次の継代元とならない細胞と関連付けをしてしまいやすい。
ここで、その後に観察情報B,Dが取得された次の継代元とならない細胞と関連付けを行った場合には、継代数がP2以降の代の細胞と時系列に繋がらない。このような問題は、各代における継代において起こりうる。
このように、特許文献1に記載のような一対一の情報の関連付けでは、継代元の細胞の情報と次の継代元となる培養容器で培養される細胞の情報を関連付けてデータベース化することが非常に困難であり、その結果、例えば、観察情報A,C,F,H,I,K,Mのみを繋げた特定系統の細胞の観察情報をデータベースファイルから抽出することはできない。
または、本発明の幾つかの態様によれば、1対多で継代を行うタイプの継代培養であっても、継代されて培養されてきた特定系統の細胞の観察情報を、代を跨いで把握することが可能な、細胞観察情報処理システム、細胞観察情報処理方法、細胞観察情報処理プログラムを提供することを目的としている。
本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムは、1時点での取得指示に対応して観察情報取得部を介して取得された、細胞画像及び細胞の活性度を示す活性度データを含む観察情報を検索するための検索用タグとして、細胞名、観察対象となっている細胞を培養する培養器材である第1の培養器材を継代数が同一の細胞を培養する他の培養器材と区別するための第1の培養器材識別情報及び前記第1の培養器材で培養される細胞に対する継代元の細胞を培養する培養器材である第2の培養器材を特定するための第2の培養器材識別情報を含む細胞識別情報を含むタグを取得するタグ取得部と、各時点での取得指示に対応して取得された夫々の前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された前記検索用タグを付与し、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を記録部に保存する保存部と、前記細胞名及び前記第1の培養器材識別情報を含むタグを検索条件として取得する検索条件取得部と、前記検索条件取得部により取得された前記検索条件を用いて前記記録部を検索し、同一の細胞株から培養され継代された、複数代に跨る細胞の検索用タグ付き観察情報を抽出する抽出部と、を備える。
細胞の活性度を示す活性度データとしては、細胞数・細胞密度・形状・生存率等が挙げられる。
観察情報は、細胞の観察結果を示す情報である。観察情報としては、細胞画像、活性度データの他に、例えば、観察名等が挙げられる。
細胞識別情報は、観察対象となっている細胞を識別するための識別情報である。より詳しくは、細胞名、第1の培養器材識別情報、第2の培養器材識別情報の他に、例えば、細胞の継代数、細胞種、培養を行う細胞であることを示す親株又はその親株から小分けした細胞であることを示す子株を識別するための細胞レベル情報等が挙げられる。
細胞名は、ユーザが実験・研究に用いる細胞に対して付ける任意の名称であり、細胞種は、分類される細胞固有の種類である。
本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、抽出部は、検索条件取得部により取得された検索条件を用いて記録部を検索し、該当する検索用タグ付き観察情報を抽出した後、さらに、抽出した検索用タグ付き観察情報に備わる第2の培養器材識別情報を検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を用いて記録部を再検索し、該当する検索用タグ付き観察情報を抽出する処理を、所定の観察情報の抽出範囲に基づき繰り返すように構成されている。
このようにすれば、抽出部による、同一の細胞株から培養され継代された、複数代に跨る細胞の検索用タグ付き観察情報の抽出が具現化できる。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、所定の観察情報の抽出範囲が、第2の培養器材識別情報が記録されていない検索用タグ付き観察情報を抽出するまでとなるように構成されている。
このようにすれば、データベース内で辿ることのできる最も古い継代元の代のデータまで、複数代に跨る細胞の検索用タグ付き観察情報の抽出が具現化できる。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、検索用タグは、さらに、観察情報取得時点の日時情報を含み、所定の観察情報の抽出範囲が、ユーザの操作により指定された観察情報取得時点の日時情報の範囲となるように構成されている。
または、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、検索用タグは、さらに、第1の培養器材で培養される細胞の継代数を含み、所定の観察情報の抽出範囲が、ユーザの操作により指定された継代数の範囲となるように構成されている。
これらのようにすれば、ユーザが必要とする範囲における、複数代に跨る細胞の検索用タグ付き観察情報の抽出が具現化できる。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、第1の培養器材識別情報は、第1の培養器材で培養される細胞の継代数と、第1の培養器材に固有の識別情報を有してなる。
このようにすれば、後述するような、第2の培養器材識別情報を第2の培養器材で培養される細胞の継代数と、第2の培養器材に固有の識別情報を有してなる構成とすることで、抽出部が一代前の検索用タグ付き観察情報を抽出するために、現在の継代数から1を減算した継代数を、抽出部が記録部を検索する際の検索条件の一部として別途設定することなく、抽出した当該データに備わる第2の培養器材識別情報の値を検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えるだけで、継代数が一代前の細胞の検索用タグ付き観察情報を抽出することができる。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、第2の培養器材識別情報は、第2の培養器材で培養される細胞の継代数と、第2の培養器材に固有の識別情報を有してなる。
このようにすれば、抽出部が一代前の検索用タグ付き観察情報を抽出するために、現在の継代数から1を減算した継代数を、記録部を検索する際の検索条件の一部として別途設定することなく、抽出した当該データに備わる第2の培養器材識別情報に含まれる継代数の値を、検索条件の一部として設定できる。そして、抽出した当該データに備わる第2の培養器材識別情報に含まれる第2の培養器材に固有の識別情報の値を検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を用いることにより、継代数が一代前の細胞の検索用タグ付き観察情報を抽出することができる。
さらに、上述のように、第1の培養器材識別情報を第1の培養器材で培養される細胞の継代数と、第1の培養器材に固有の識別情報を有してなる構成とすることで、抽出した当該データに備わる第2の培養器材識別情報の値を検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えるだけで、継代数が一代前の細胞の検索用タグ付き観察情報を抽出することができる。
(1−4−1)タグ取得部が、ユーザにより指定された細胞名を用いて記録部を検索し、該当する検索用タグ付き観察情報のうち、第1の培養器材で培養される細胞の継代数が最も大きい検索用タグ付き観察情報に備わる第1の培養器材識別情報を、第1の培養器材識別情報の候補として提示部に一覧出力し、ユーザにより選択された第1の培養器材識別情報を検索用タグの一部として取得するとともに、第1の培養器材識別情報を備えた検索用タグ付き観察情報に備わる第2の培養器材識別情報を検索用タグの一部として自動的に取得する構成による作用効果
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、検索用タグは、さらに、第1の培養器材で培養される細胞の継代数を含む。そして、タグ取得部は、ユーザの操作により指定された細胞名を用いて記録部を検索し、該当する検索用タグ付き観察情報から、第1の培養器材で培養される細胞の継代数が最も大きい検索用タグ付き観察情報を抽出し、抽出した検索用タグ付き観察情報に備わる第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得すべき第1の培養器材識別情報の候補として提示部に一覧出力する。そして、提示部に一覧出力した第1の培養器材識別情報の候補のうち、ユーザの操作により選択された第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得するとともに、当該ユーザの操作により選択された第1の培養器材識別情報を備えた検索用タグ付き観察情報に備わる第2の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として自動的に取得するように構成されている。
このようにすれば、ユーザが第1の培養器材識別情報、第2の培養器材識別情報をキー入力する手間が省けるとともに、キーの打ち間違いを無くすことができる。その結果、検索用タグ取得の効率が向上し、細胞の状態チェックの時間を短縮化できる。
特に、細胞をインキュベータの外部に持ち出した状態で細胞の状態変化をチェックする場合、細胞の状態チェックの時間が短縮されることによって、細胞に与えるダメージを低減できる。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、タグ取得部は、ユーザの操作により指定された第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得するとともに、ユーザの操作により指定された細胞名及び第1の培養器材識別情報を用いて記録部を検索し、該当する検索用タグ付き観察情報が存在するとき、当該検索用タグ付き観察情報に備わる第2の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として自動的に取得するように構成されている。
このようにすれば、ユーザが第2の培養器材識別情報をキー入力する手間が省けるとともに、キーの打ち間違いを無くすことができる。また、第2の培養器材識別情報をキー入力する手間が省ける分、検索用タグ取得の効率が向上し、細胞の状態チェックの時間を短縮化できる。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、検索用タグは、さらに、第1の細胞に対する作業が継代作業であるか否かを表す継代有無情報及び観察情報取得時点の日時情報を含む。そして、タグ取得部は、ユーザの操作により検索用タグの一部として取得すべき第1の培養器材識別情報として新規の培養器材識別情報が指定されたとき、ユーザの操作により指定された第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得するとともに、ユーザの操作により指定された細胞名を用いて記録部を検索し、該当する検索用タグ付き観察情報から、継代有無情報が継代作業であることを表す検索用タグ付き観察情報であり且つ当該検索用タグ付き観察情報のうちで日時情報における観察情報取得時点が直近の検索用タグ付き観察情報を抽出し、抽出した検索用タグ付き観察情報に備わる第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得すべき第2の培養器材識別情報の候補として提示部に一覧出力する。そして、提示部に一覧出力した第2の培養器材識別情報の候補のうち、ユーザの操作により選択された第2の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得するように構成されている。
このようにしても、ユーザが第2の培養器材識別情報をキー入力する手間が省けるとともに、キーの打ち間違いを無くすことができる。また、第2の培養器材識別情報をキー入力する手間が省ける分、検索用タグ取得の効率が向上し、細胞の状態チェックの時間を短縮化できる。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、検索用タグは、さらに、第1の培養器材で培養される細胞に対する作業が継代作業であるか否かを表す継代有無情報及び観察情報取得時点の日時情報を含む。そして、タグ取得部は、ユーザの操作により指定された第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得するとともに、ユーザの操作により指定された細胞名及び第1の培養器材識別情報を用いて記録部を検索し、該当する検索用タグ付き観察情報が存在しないとき、さらに、ユーザの操作により指定された細胞名を用いて記録部を検索し、該当する検索用タグ付き観察情報から、継代有無情報が継代作業であることを表す検索用タグ付き観察情報であり且つ当該検索用タグ付き観察情報のうちで日時情報における観察情報取得時点が直近の検索用タグ付き観察情報を抽出し、抽出した検索用タグ付き観察情報に備わる第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得すべき第2の培養器材識別情報の候補として提示部に一覧出力し、提示部に一覧出力した第2の培養器材識別情報の候補のうち、ユーザの操作により選択された第2の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得するように構成されている。
このようにしても、ユーザが第2の培養器材識別情報をキー入力する手間が省けるとともに、キーの打ち間違いを無くすことができる。また、第2の培養器材識別情報をキー入力する手間が省ける分、検索用タグ取得の効率が向上し、細胞の状態チェックの時間を短縮化できる。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、第1の培養器材識別情報は、第2の培養器材識別情報を含んでなり、抽出部は、検索条件取得部により取得された検索条件を用いて記録部を検索し、該当する検索用タグ付き観察情報を抽出した後、さらに、検索条件における第1の培養器材識別情報に含まれる夫々の代における第2の培養器材識別情報を夫々検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を用いて記録部を順次検索し、該当する検索用タグ付き観察情報を抽出するように構成されている。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、保存部は、タグ取得部により検索用タグとして取得された細胞名、第1の培養器材識別情報及び第2の培養器材識別情報を含む細胞識別情報を含むタグを、タグの取得履歴に関する情報として、さらに、記録部における検索用タグ付き観察情報を保存するためのファイルとは別のファイルに保存するように構成されている。
本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムのように、保存部がタグ取得部により検索用タグとして取得された細胞名、第1の培養器材識別情報及び第2の培養器材識別情報を含む細胞識別情報を含むタグを、タグの取得履歴に関する情報として、検索用タグ付き観察情報を保存するためのファイルとは別のファイルに保存するようにすれば、タグ取得部による検索用タグ取得処理や抽出部による検索用タグ付き観察情報抽出処理等の処理過程において、検索・抽出対象を、細胞画像といったバイト数の大きなデータを含まないタグの取得履歴に関する情報を保存したファイルとすることで、検索・抽出処理の効率を向上させることが可能となる。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、抽出部は、検索条件取得部により取得された検索条件を用いて記録部を検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報を抽出した後、さらに、抽出したタグの取得履歴に関する情報に備わる第2の培養器材識別情報を当該検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を新たに作成し、作成した検索条件を用いて記録部を再検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報を抽出する処理を、所定の取得履歴に関する情報の抽出範囲に基づき繰り返し、次いで、所定の取得履歴に関する情報の抽出範囲に基づくタグの取得履歴に関する情報の抽出に用いた全ての検索条件を用いて記録部を順次検索し、該当する検索用タグ付き観察情報を抽出するように構成されている。
このようにすれば、抽出部による、同一の細胞株から培養され継代された、複数代に跨る細胞の検索用タグ付き観察情報の抽出が具現化できることに加えて、抽出部による検索用タグ付き観察情報抽出処理の処理過程における検索・抽出処理の効率が向上する。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、所定の取得履歴に関する情報の抽出範囲が、第2の培養器材識別情報が記録されていないタグの取得履歴に関する情報を抽出するまでとなるように構成されている。
このようにすれば、データベース内で辿ることのできる最も古い継代元の代のデータまで、複数代に跨る細胞の検索用タグ付き観察情報の抽出が具現化できる。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、検索用タグは、さらに、観察情報取得時点の日時情報を含み、所定の取得履歴に関する情報の抽出範囲が、ユーザの操作により指定された観察情報取得時点の日時情報の範囲となるように構成されている。
または、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、検索用タグは、さらに、第1の培養器材で培養される細胞の継代数を含み、所定の取得履歴に関する情報の抽出範囲が、ユーザの操作により指定された継代数の範囲となるように構成されている。
これらのようにすれば、ユーザが必要とする範囲における、複数代に跨る細胞の検索用タグ付き観察情報の抽出が具現化できる。
(2−2−1)タグ取得部が、ユーザにより指定された細胞名を用いて記録部を検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報のうち、第1の培養器材で培養される細胞の継代数が最も大きいタグの取得履歴に関する情報に備わる第1の培養器材識別情報を、第1の培養器材識別情報の候補として提示部に一覧出力し、ユーザにより選択された第1の培養器材識別情報を検索用タグの一部として取得するとともに、第1の培養器材識別情報を備えたタグの取得履歴に関する情報に備わる第2の培養器材識別情報を検索用タグの一部として自動的に取得する構成による作用効果
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、検索用タグは、さらに、第1の培養器材で培養される細胞の継代数を含む。そして、タグ取得部は、ユーザの操作により指定された細胞名を用いて記録部を検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報から、第1の培養器材で培養される細胞の継代数が最も大きいタグの取得履歴に関する情報を抽出し、抽出した検索用タグ付き観察情報に備わる第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得すべき第1の培養器材識別情報の候補として提示部に一覧出力する。そして、提示部に一覧出力した第1の培養器材識別情報の候補のうち、ユーザの操作により選択された第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得するとともに、当該ユーザの操作により選択された第1の培養器材識別情報を備えたタグの取得履歴に関する情報に備わる第2の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として自動的に取得するように構成されている。
このようにすれば、ユーザが第1の培養器材識別情報、第2の培養器材識別情報をキー入力する手間が省けるとともに、キーの打ち間違いを無くすことができる。その結果、検索用タグ取得の効率が向上し、細胞の状態チェックの時間を短縮化できる。加えて、タグ取得部による検索用タグ取得処理の処理過程における検索・抽出処理の効率が向上する。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、タグ取得部は、ユーザの操作により指定された第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得するとともに、ユーザの操作により指定された細胞名及び第1の培養器材識別情報を用いて記録部を検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報が存在するとき、当該タグの取得履歴に関する情報に備わる第2の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として自動的に取得するように構成されている。
このようにすれば、ユーザが第2の培養器材識別情報をキー入力する手間が省けるとともに、キーの打ち間違いを無くすことができる。また、第2の培養器材識別情報をキー入力する手間が省ける分、検索用タグ取得の効率が向上し、細胞の状態チェックの時間を短縮化できる。加えて、タグ取得部による検索用タグ取得処理の処理過程における検索・抽出処理の効率が向上する。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、検索用タグは、さらに、第1の細胞に対する作業が継代作業であるか否かを表す継代有無情報及び観察情報取得時点の日時情報を含む。そして、タグ取得部は、ユーザの操作により検索用タグの一部として取得すべき第1の培養器材識別情報として新規の培養器材識別情報が指定されたとき、ユーザの操作により指定された第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得するとともに、ユーザの操作により指定された細胞名を用いて記録部を検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報から、継代有無情報が継代作業であることを表すタグの取得履歴に関する情報であり且つ当該タグの取得履歴に関する情報のうちで日時情報における観察情報取得時点が直近のタグの取得履歴に関する情報を抽出し、抽出したタグの取得履歴に関する情報に備わる第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得すべき第2の培養器材識別情報の候補として提示部に一覧出力する。そして、提示部に一覧出力した第2の培養器材識別情報の候補のうち、ユーザの操作により選択された第2の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得するように構成されている。
このようにしても、ユーザが第2の培養器材識別情報をキー入力する手間が省けるとともに、キーの打ち間違いを無くすことができる。また、第2の培養器材識別情報をキー入力する手間が省ける分、検索用タグ取得の効率が向上し、細胞の状態チェックの時間を短縮化できる。加えて、タグ取得部による検索用タグ取得処理の処理過程における検索・抽出処理の効率が向上する。
また、本発明の実施形態の細胞観察情報処理システムにおいては、好ましくは、検索用タグは、さらに、第1の培養器材で培養される細胞に対する作業が継代作業であるか否かを表す継代有無情報及び観察情報取得時点の日時情報を含む。そして、タグ取得部は、ユーザの操作により指定された第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得するとともに、ユーザの操作により指定された細胞名及び第1の培養器材識別情報を用いて記録部を検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報が存在しないとき、さらに、ユーザの操作により指定された細胞名を用いて記録部を検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報から、継代有無情報が継代作業であることを表すタグの取得履歴に関する情報であり且つ当該タグの取得履歴に関する情報のうちで日時情報における観察情報取得時点が直近のタグの取得履歴に関する情報を抽出し、抽出したタグの取得履歴に関する情報に備わる第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得すべき第2の培養器材識別情報の候補として提示部に一覧出力し、提示部に一覧出力した第2の培養器材識別情報の候補のうち、ユーザの操作により選択された第2の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得するように構成されている。
このようにしても、ユーザが第2の培養器材識別情報をキー入力する手間が省けるとともに、キーの打ち間違いを無くすことができる。また、第2の培養器材識別情報をキー入力する手間が省ける分、検索用タグ取得の効率が向上し、細胞の状態チェックの時間を短縮化できる。加えて、タグ取得部による検索用タグ取得処理の処理過程における検索・抽出処理の効率が向上する。
なお、本発明の実施形態の細胞観察情報取得システムにおいては、好ましくは、ユーザ識別情報(本人や代表作業者)を検索用タグに備えて構成する。
ユーザ識別情報は、細胞観察を行うユーザを識別するための識別情報であって、より詳しくは、細胞の観察結果の入力を行う本人又は本人に代わり細胞観察や細胞の観察結果の入力を行なう代行者を識別するための識別情報である。
このようにすれば、複数のユーザ同士で同一の細胞名を付与した細胞の管理状況下にあっても、タグ取得部による検索用タグ取得処理の処理過程において提示部に表示された第1の培養器材識別情報を一覧から選択する際に、自己の管理下で観察情報への付与に使用した、第1の培養器材識別情報のみを提示部に一覧出力でき、他人の管理下で観察情報への付与に使用された参照不要な第1の培養器材識別情報を提示部への出力対象から除外できる。このため、ユーザによる観察情報に検索用タグの一部として付与すべき第1の培養器材識別情報の選択の誤りを防止できるとともに、選択の効率が向上する。その結果、検索用タグ取得の効率がより一層向上し、細胞の状態チェックの時間をより一層短縮化できる。
また、抽出部による検索用タグ付き観察情報抽出処理等の処理過程において、検索・抽出に不要な、他人の管理下による細胞の観察情報を除外できる。このため、ユーザは、複数のユーザ同士で同一の細胞名を付与した細胞の管理状況下にあっても、自己の管理下のみの、複数代に跨る特定系統の細胞の観察情報を正確に把握することができる。
図1は本発明の細胞観察情報処理システムの基本構成を概念的に示すブロック図である。図2は本発明の第1実施形態にかかる細胞観察情報処理システムの構成を示す説明図である。
第1実施形態の細胞観察情報処理システム10は、図1、図2に示すように、タグ取得部11と、保存部12と、検索条件取得部14と、抽出部15を備えている。なお、図1及び図2中、1は細胞観察情報処理装置本体、13は記録部、16はタグ選択部、18は提示部としてのモニタ、19は出力部、20は観察情報取得部、21はタグ入力部である。なお、図2では、細胞観察情報処理システム10は、タグ取得部11と、保存部12と、検索条件取得部14と、抽出部15とが、記録部13、タグ選択部16、タグ入力部21、提示部18、出力部19、観察情報取得部20とともに、一つの装置本体1に備えられたスタンドアロン型の構成となっている。細胞観察情報処理装置本体1は、例えば、撮像装置とデータベースを備えたコンピュータを備えた顕微鏡装置で構成されている。
なお、本実施形態では、便宜上、ユーザ識別情報としてユーザIDを用いることとするが、ユーザ識別情報は、ユーザIDに限定されるものではなく、例えば、ユーザの氏名やニックネーム等、ユーザを他のユーザと識別できる文字や記号等であればどのようなものでもよい。
ユーザID表示項目18aは、ユーザID入力画面において、ユーザが選択入力したユーザ識別情報を表示するように構成されている。日時情報表示項目18bは、観察情報取得部20を介して取得された当該観察情報における細胞画像にログとして記録されている撮像日時を表示するように構成されている。観察情報表示画面18cは、観察情報取得部20を介して取得された当該観察情報における細胞画像や、細胞画像に対し、例えば、図示しない画像処理部及び画像解析部を介した画像処理及び解析を施すことによって検出した細胞数・細胞密度・形状・生存率などの細胞の活性度を示す活性度データを表示するように構成されている。
提示部18は、さらに、継代作業有無選択ボタン18eを表示し、当該観察時点における細胞に対する作業が継代作業であるか否かの指示を選択可能に構成されている。選択された指示内容は検索用タグの一部として、タグ取得部11が取得する。
なお、本実施形態では、第1の培養器材識別情報は、第1の培養器材で培養される細胞の継代数と、第1の培養器材に固有の識別情報を有して構成されている。例えば、表示画面18d−31に第1の培養器材識別情報の候補を示すバーとして示されている“P1−1”のうちの、“P1”は継代数、“1”は第1の培養器材を識別するための識別番号である。また、本実施形態では、便宜上、継代数を“P”といった文字付きの数字で示すこととするが、継代数は数字のみで構成しても勿論よい。
そして、タグ取得部11は、ユーザによりタグ選択部16やタグ入力部21を介して指定・入力されたユーザID、細胞名を用いて記録部13を検索し、該当する検索用タグ付き観察情報から、継代有無情報が継代作業であることを表す検索用タグ付き観察情報であり且つ当該検索用タグ付き観察情報のうちで日時情報における観察情報取得時点が直近の検索用タグ付き観察情報を抽出する。次いで、タグ取得部11は、抽出した検索用タグ付き観察情報に備わる第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得すべき第2の培養器材識別情報の候補として、出力部19を介して提示部18に一覧出力させるように構成されている。なお、提示部18は、図4に示すように、出力部19を介して出力された第2の培養器材識別情報の候補の一覧を、その他の第2の培養器材識別情報を指定するためのバーとともにプルダウンメニュー形式で表示する表示画面18d−41を有している。図4の例では、第2の培養器材識別情報の候補を示すバーとして“P0−1”が示されている。
なお、本実施形態では、第2の培養器材識別情報は、第2の培養器材で培養される細胞の継代数と、第2の培養器材に固有の識別情報を有して構成されている。例えば、表示画面18d−41に第2の培養器材識別情報の候補を示すバーとして示されている“P0−1”のうちの、“P0”は継代数、“1”は第2の培養器材を識別するための識別番号である。
なお、その他の第2の培養器材を指定するためのバーが選択された場合、提示部18は、第2の培養器材識別情報指定・入力項目18d−4からのユーザによるタグ選択部16やタグ入力部21を介した第2の培養器材の指定・入力を受け付けるように構成されている。
そして、タグ取得部11は、ユーザによりタグ選択部16やタグ入力部21を介して指定・入力された第2の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得するように構成されている。
その場合、タグ取得部11は、ユーザにより指定・入力された第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得するとともに、ユーザにより指定・入力されたユーザID、細胞名、第1の培養器材識別情報を用いて記録部13を検索するように構成される。
そして、該当する検索用タグ付き観察情報が存在する場合、タグ取得部11は、当該検索用タグ付き観察情報に備わる第2の培養器材識別情報を、検索用タグにおける第2の培養器材識別情報として自動的に取得するように構成される。
ユーザによりタグ選択部16を介して表示画面18d−41からいずれかの第2の培養器材識別情報のバーが選択された場合、あるいは、その他の第2の培養器材を指定するためのバーが選択された場合におけるタグ取得部11、提示部18の構成は、上述したとおりである。
なお、画像タグとは、細胞画像を示すためのタグで、より詳しくは、例えば、提示部18に提示される図示しない画像選択入力画面において、小さなサイズで表示されうる画像や、画像と画像に対応した名称とが一体化した情報である。
図6中、18e−1はユーザID指定・入力項目、18e−2は細胞名指定・入力項目、18e−3は第1の培養器材指定・入力項目である。これらの項目は、ユーザにとって必須の指定・入力項目として構成されている。
なお、各指定・入力項目18e−1〜18e−3は、図示しないプルダウンメニュー形式の表示画面に表示される数件の候補情報からユーザが選択入力することができるように構成してもよい。
なお、日時情報の範囲指定・入力項目18e−4は、検索範囲の開始と終了の観察情報取得時点の日時情報を指定・入力するように構成される。あるいは、現在の観察情報取得時点から遡る期間を指定・入力するように構成されていてもよい。
また、継代数の範囲指定・入力項目18e−5は、検索範囲の開始と終了の継代数を指定・入力するように構成される。あるいは、現在の継代数から遡る代の数を指定・入力するように構成されていてもよい。
なお、ユーザによる細胞のメンテナンスのための作業に関する情報は、より詳しくは、作業の内容、希釈率、容器種類や容器サイズ等のうちの少なくとも一つ以上を含む識別情報である。
希釈率とは、培養容器内で培養されている細胞を、継代や実験のために間引くときの間引き量である。
また、活性度データの変化情報は、例えば、複数時点での活性度データ(例えば、細胞密度、細胞数、生存率)の変化量(即ち、変化率)であり、例えば、グラフの傾き等で示すことができる情報である。
また、図6の例の検索条件指定・入力画面18eにおけるユーザID指定・入力項目18e−1に、ユーザID入力画面においてユーザにより選択入力されたユーザIDを初期表示するように構成してもよい。その場合、さらには、ユーザID指定・入力項目18e−1の代わりに、ユーザID表示項目を設けて、ユーザID入力画面においてユーザにより選択入力されたユーザIDの表示のみを行い、ユーザによるユーザID入力を省くように構成してもよい。
例えば、図6の検索条件指定・入力画面18eにおいて、日時情報の範囲指定・入力項目18e−4、継代数の範囲指定・入力項目18e−5のいずれにも指定・入力がない場合、所定の観察情報の抽出範囲は、“データベース内で辿れる最終データまで”、即ち、“第2の培養器材識別情報が記録されていない検索用タグ付き観察情報を抽出するまで”に定まる。
そして、抽出部15は、抽出した検索用タグ付き観察情報に備わる第2の培養器材識別情報を検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を用いて記録部13を再検索し、該当する検索用タグ付き観察情報を抽出する処理を、第2の培養器材識別情報を備えていない検索用タグ付き観察情報を抽出するまで繰り返す。
そして、抽出部15は、抽出した検索用タグ付き観察情報に備わる第2の培養器材識別情報を検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を用いて記録部13を再検索し、該当する検索用タグ付き観察情報を抽出する処理を、日時情報の範囲指定・入力項目18e−4に指定・入力された日時情報の範囲の日時情報を有する全ての検索用タグ付き観察情報を抽出し終えるまで繰り返す。
そして、抽出部15は、抽出した検索用タグ付き観察情報に備わる第2の培養器材識別情報を検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を用いて記録部13を再検索し、該当する検索用タグ付き観察情報を抽出する処理を、継代数の範囲指定・入力項目18e−5に指定・入力された継代数の範囲の継代数を有する全ての検索用タグ付き観察情報を抽出し終えるまで繰り返す。
ユーザが培養している細胞の状態を管理する段階には、培養している細胞の観察情報を記録部に保存する段階と、記録部から所望の細胞の観察情報を検索・抽出して細胞の状態をチェックする段階とがある。
ユーザは、図示しないシステムのログイン画面において、システムのログインIDやパスワードを入力する。すると、図示しないユーザID入力画面が表示される。次いで、ユーザは、自己のユーザID(図7の例では“ユーザ1”とする。)を選択入力する。すると、ユーザIDが装置本体1内の記憶領域に一時的に記憶されるとともに、図示しない画像撮像指示画面が表示され、ユーザが画像撮像指示操作を行うことができるようになる。
全ての時点の観察情報に対する検索用タグの付与及び検索用タグ付き観察情報の記録部13への保存が完了したとき、培養している細胞の観察情報を記録部に保存する段階での処理が終了する(ステップS6)。
図10は図9に示した要部のタグの取得手順を具体化した処理手順の一例を示すフローチャート、図11は図10の処理手順の変形例を示すフローチャートである。
まず、図10の例の処理手順を説明する。
図10の例の処理手順では、ユーザは、図4に示した検索用タグ指定・入力画面18dのユーザID指定・入力項目18d−1、又は図示しないユーザID指定画面から、ユーザIDを指定・入力するとともに、検索用タグ指定・入力画面18dの細胞名指定・入力項目18d−2から、細胞名を指定・入力する(ステップS31)。すると、タグ取得部11は、ユーザにより指定・入力されたユーザID、細胞名を検索用タグの一部として取得する(ステップS32)。次いで、タグ取得部11は、ユーザにより指定・入力されたユーザID、細胞名を用いて記録部13を検索し、該当する検索用タグ付き観察情報から、第1の培養器材で培養される細胞の継代数が最も大きい検索用タグ付き観察情報を抽出する(ステップS33)。次いで、タグ取得部11は、抽出した検索用タグ付き観察情報に備わる第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得すべき第1の培養器材識別情報の候補として、出力部19を介して提示部18に一覧出力させる。提示部18は、出力部19を介して出力された第1の培養器材識別情報の候補の一覧を、新規登録のバーとともにプルダウンメニュー形式の表示画面18d−31に表示する(ステップS34)。
次いで、ユーザは、表示画面18d−31に表示された第1の培養器材識別情報の候補の一覧、新規登録のバーのうちから所望のバーを選択する(ステップS35)。
次いで、タグ取得部11は、ユーザにより指定・入力されたユーザID、細胞名を用いて記録部13を検索し、該当する検索用タグ付き観察情報から、継代有無情報が継代作業であることを表す検索用タグ付き観察情報であり且つ当該検索用タグ付き観察情報のうちで日時情報における観察情報取得時点が直近の検索用タグ付き観察情報を抽出する(ステップS41)。次いで、タグ取得部11は、抽出した検索用タグ付き観察情報に備わる第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得すべき第2の培養器材識別情報の候補として、出力部19を介して提示部18に一覧出力させる。提示部18は、出力部19を介して出力された第2の培養器材識別情報の候補の一覧を、その他の第2の培養器材識別情報を指定するためのバーとともにプルダウンメニュー形式の表示画面18d−41に表示する(ステップS42)。
次いで、ユーザは、表示画面18d−41に表示された第2の培養器材識別情報の候補の一覧、その他の第2の培養器材識別情報を指定するためのバーのうちから所望のバーを選択する(ステップS43)。
ここで、ユーザによりいずれかの第2の培養器材識別情報のバーが選択された場合、タグ取得部11は、ユーザにより選択された第2の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得する(ステップS44、S45)。
一方、ユーザによりその他の第2の培養器材を指定するためのバーが選択された場合、提示部18は、第2の培養器材識別情報指定・入力項目18d−4からのユーザによる第2の培養器材の指定・入力を受け付ける。そして、ユーザは、検索用タグ指定・入力画面18dの第2の培養器材識別情報指定・入力項目18d−4から、第2の培養器材識別情報を指定・入力する(ステップS44、S46)。すると、タグ取得部11は、ユーザにより指定・入力された第2の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得する(ステップS47)。
ユーザによるユーザID、細胞名の指定・入力(ステップS31’)、タグ取得部11によるユーザID、細胞名の検索用タグの一部としての取得(ステップS32’)の処理手順は、図10の例における処理手順と略同じである。
次に、ユーザは、図4に示した検索用タグ指定・入力画面18dの第1の培養器材識別情報指定・入力項目18d−3から、第1の培養器材識別情報を指定・入力する(ステップS33’)。すると、タグ取得部11は、ユーザにより指定・入力された第1の培養器材識別情報を検索用タグの一部として取得する(ステップS34’)。次いで、タグ取得部11は、ユーザにより指定・入力されたユーザID、細胞名、第1の培養器材識別情報を用いて記録部13を検索する(ステップS35’)。
これに続く、ユーザによる所望のバーの選択(ステップS40’)以降の処理手順は、図10の例における処理手順と略同じである。
ユーザは、図6に示すような検索条件指定・入力画面18eにおいて、ユーザID、細胞名、第1の培養器材識別情報を含むタグを検索条件として指定する。入力が完了すると、検索条件取得部14は、検索条件指定画面においてユーザが入力した情報を検索条件として取得する(ステップS11)。なお、上述したように、図6の検索条件指定・入力画面18eにおけるユーザIDは、ユーザID入力画面においてユーザにより選択入力されたユーザIDを初期表示し、ユーザによる入力を省略するように構成されていてもよい。
検索用タグ付き観察情報の取得処理において、抽出部15は、検索条件取得部14により取得された検索条件(ユーザID、細胞名、第1の培養器材識別情報を含むタグ)を用いて、記録部13を検索し、該当する検索用タグ付き観察情報を抽出する(ステップS51)。さらに、抽出部15は、抽出した検索用タグ付き観察情報に備わる第2の培養器材識別情報を検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を用いて、記録部13を再検索し、該当する検索用タグ付き観察情報を抽出する処理を所定の観察情報の抽出範囲に基づいて繰り返す(ステップS52、S53)。
所定の観察情報の抽出範囲が“データベース内で辿れる最終データまで”に定まるのは、図6に示した検索条件指定・入力画面18eにおいて、日時情報の範囲指定・入力項目18e−4、継代数の範囲指定・入力項目18e−5のいずれにもユーザによる指定・入力がない場合である。この場合、抽出部15は、図16に示すように、抽出した検索用タグ付き観察情報に備わる第2の培養器材識別情報を検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を用いて、記録部13を再検索し、該当する検索用タグ付き観察情報を抽出する処理を、第2の培養器材識別情報が記録されていない検索用タグ付き観察情報を抽出するまで繰り返す(ステップS52’、S53)。
ユーザは、図6の検索条件指定・入力画面18eにおいて、ユーザID指定・入力項目18e−1に“ユーザ1”、 細胞名指定・入力項目18e−2に“CHO1”、 第1の培養器材識別情報指定・入力項目18e−3に“P2−2”を指定・入力する。なお、ここでは、説明の便宜上、日時情報の範囲指定・入力項目18e−4、継代数の範囲指定・入力項目18e−5のいずれにも指定・入力がない(即ち、上述した所定の観察情報の抽出範囲が“データベース内で辿れる最終データまで”に定まる場合である)ものとする。
抽出部15は、検索条件取得部14が取得した検索条件(ユーザID“ユーザ1”、 細胞名“CHO1”、 第1の培養器材識別情報“P2−2”を含むタグ)を用いて記録部13を検索し、該当する全ての検索用タグ付き観察情報(ここでは、図19(a)における符号R7で示す検索用タグ付き観察情報)を抽出する(ステップS51)。
そこで、抽出部15は、符号R7で示す検索用タグ付き観察情報に備わる第2の培養器材識別情報“P1−1”を検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を用いて記録部13を再検索し、該当する全ての検索用タグ付き観察情報(ここでは、図19(a)における符号R2、R4で示す夫々の検索用タグ付き観察情報)を抽出する(ステップS52、S53)。
そこで、抽出部15は、符号R2で示す検索用タグ付き観察情報に備わる第2の培養器材識別情報“P0−1”を検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を用いて記録部13を再検索し、該当する全ての検索用タグ付き観察情報(ここでは、図19(a)における符号R1で示す検索用タグ付き観察情報)を抽出する(ステップS52、S53)。
そこで、抽出部15は、検索用タグ付き観察情報の抽出処理を終了する(ステップS52、S53)。
(1)第1の培養器材識別情報“P2−2”が記録されている検索用タグ付き観察情報(R7)。
(2)検索用タグ付き観察情報(R7)に記録されている第2の培養器材識別情報“P1−1”が第1の培養器材識別情報として記録されている、検索用タグ付き観察情報(R7)の細胞に対する継代元の細胞の検索用タグ付き観察情報(R2、R4)。
(3)検索用タグ付き観察情報(R2、R4)に記録されている第2の培養器材識別情報“P0−1”が第1の培養器材識別情報として記録されている、検索用タグ付き観察情報(R2、R4)の細胞に対する継代元の細胞の検索用タグ付き観察情報(R1)。
なお、第1実施形態の細胞観察情報処理システム10において、第1の培養器材識別情報を、第1の培養器材で培養される細胞の継代数を含まない構成としても勿論よい。
なお、第1実施形態の細胞観察情報処理システム10において、第2の培養器材識別情報を、第2の培養器材で培養される細胞の継代数を含まない構成としても勿論よい。
図20は本発明の第2実施形態にかかる細胞観察情報処理システムの構成を示す説明図である。図21は細胞観察情報処理システムにおいて記録部に保存されるタグの取得履歴に関する情報のデータ構造の一例を示す説明図である。
第2実施形態の細胞観察情報処理システム10では、保存部12は、図5に示したような検索用タグ付き観察情報を第1の記録部13−1に保存するとともに、タグ取得部11により検索用タグとして取得されたタグの取得履歴に関する情報を、例えば、ユーザID等と関連付けて、第1の記録部13−1とは別のファイルである第2の記録部13−2に保存するように構成されている。記録部は、第1の記録部13−1と第2の記録部13−2を備えている。第1の記録部13−1は、データベースファイルで構成されている。第2の記録部13−2は、例えば、システムのログファイル等で構成されている。
そして、第2の記録部13−2には、同一のユーザID、細胞名、第1の培養器材識別情報、第2の培養器材識別情報に対応させた最新の観察情報取得日、継代数、継代有無情報が、検索用タグ付き観察情報を第1の記録部13−1に保存する時点で、随時更新された最新のタグの取得履歴に関する情報として保存されている。
そして、タグ取得部11は、ユーザによりタグ選択部16やタグ入力部21を介して指定・入力されたユーザID、細胞名を用いて第2の記録部13−2を検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報から、継代有無情報が継代作業であることを表すタグの取得履歴に関する情報であり且つ当該タグの取得履歴に関する情報のうちで日時情報における観察情報取得時点が直近のタグの取得履歴に関する情報を抽出する。次いで、タグ取得部11は、抽出したタグの取得履歴に関する情報に備わる第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得すべき第2の培養器材識別情報の候補として、出力部19を介して提示部18に一覧出力させるように構成されている。
この場合、タグ取得部11は、ユーザにより指定・入力された第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得するとともに、ユーザにより指定・入力されたユーザID、細胞名、第1の培養器材識別情報を用いて第2の記録部13−2を検索するように構成される。
そして、該当するタグの取得履歴に関する情報が存在する場合、タグ取得部11は、当該タグの取得履歴に関する情報に備わる第2の培養器材識別情報を、検索用タグにおける第2の培養器材識別情報として自動的に取得するように構成される。
ユーザによりタグ選択部16を介して表示画面18d−41からいずれかの第2の培養器材識別情報のバーが選択された場合、あるいは、その他の第2の培養器材を指定するためのバーが選択された場合におけるタグ取得部11、提示部18の構成は、上述したとおりである。
例えば、図6の検索条件指定・入力画面18eにおいて、日時情報の範囲指定・入力項目18e−4、継代数の範囲指定・入力項目18e−5のいずれにも指定・入力がない場合、所定の取得履歴に関する情報の抽出範囲は、“タグの取得履歴に関する情報ファイルのデータベース内で辿れる最終データまで”、即ち、“第2の培養器材識別情報が記録されていないタグの取得履歴に関する情報を抽出するまで”に定まる。
そして、抽出部15は、抽出したタグの取得履歴に関する情報に備わる第2の培養器材識別情報を当該検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を新たに作成し、作成した検索条件を用いて第2の記録部13−2を再検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報を抽出する処理を、第2の培養器材識別情報を備えていないタグの取得履歴に関する情報を抽出するまで繰り返す。
そして、抽出部15は、抽出した取得履歴に関する情報に備わる第2の培養器材識別情報を当該検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を新たに作成し、作成した検索条件を用いて第2の記録部13−2を再検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報を抽出する処理を、日時情報の範囲指定・入力項目18e−4に指定・入力された日時情報の範囲の日時情報を有する全てのタグの取得履歴に関する情報を抽出し終えるまで繰り返す。
そして、抽出部15は、抽出した取得履歴に関する情報に備わる第2の培養器材識別情報を当該検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を新たに作成し、作成した検索条件を用いて第2の記録部13−2を再検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報を抽出する処理を、継代数の範囲指定・入力項目18e−5に指定・入力された継代数の範囲の継代数を有する全てのタグの取得履歴に関する情報を抽出し終えるまで繰り返す。
まず、図22の例の処理手順を説明する。
ユーザID、細胞名の指定・入力(ステップS61)、タグ取得部11によるユーザID、細胞名の検索用タグの一部としての取得(ステップS62)の処理手順は、第1実施形態の図10の例における処理手順と略同じである。
次いで、タグ取得部11は、ユーザによりタグ指定・入力されたユーザID、細胞名を用いて第2の記録部13−2を検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報から、継代有無情報が継代作業であることを表すタグの取得履歴に関する情報であり且つ当該タグの取得履歴に関する情報のうちで日時情報における観察情報取得時点が直近のタグの取得履歴に関する情報を抽出する(ステップS63)。次いで、タグ取得部11は、抽出したタグの取得履歴に関する情報に備わる第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得すべき第2の培養器材識別情報の候補として、出力部19を介して提示部18に一覧出力させる。提示部18は、出力部19を介して出力された第1の培養器材識別情報の候補の一覧を、新規登録のバーとともにプルダウンメニュー形式の表示画面18d−31に表示する。(ステップS64)。
次いで、ユーザは、表示画面18d−31に表示された第1の培養器材識別情報の候補の一覧、新規登録のバーのうちから所望のバーを選択する(ステップS65)。
次いで、タグ取得部11は、ユーザにより指定・入力されたユーザID、細胞名を用いて第2の記録部13−2を検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報から、継代有無情報が継代作業であることを表すタグの取得履歴に関する情報であり且つ当該タグの取得履歴に関する情報のうちで日時情報における観察情報取得時点が直近のタグの取得履歴に関する情報を抽出する(ステップS71)。次いで、タグ取得部11は、抽出したタグの取得履歴に関する情報に備わる第1の培養器材識別情報を、検索用タグの一部として取得すべき第2の培養器材識別情報の候補として、出力部19を介して提示部18に一覧出力させる。提示部18は、出力部19を介して出力された第2の培養器材識別情報の候補の一覧を、その他の第2の培養器材識別情報を指定するためのバーとともにプルダウンメニュー形式の表示画面18d−41に表示する(ステップS72)。
それに続く、ユーザによる所望のバーの選択(ステップS73)以降の処理手順は、第1実施形態における図10の例における処理手順と略同じである。
ユーザによるユーザID、細胞名の指定・入力(ステップS61’)〜タグ取得部11による第1の培養器材識別情報の検索用タグの一部としての取得(ステップS64’)の処理手順は、第1実施形態の図11の例における処理手順と略同じである。
次いで、タグ取得部11は、ユーザにより指定・入力されたユーザID、細胞名、第1の培養器材識別情報を用いて第2の記録部13−2を検索する(ステップS65’)。
これに続く、ユーザによる所望のバーの選択(ステップS70’)以降の処理手順は、第1実施形態の図11の例における処理手順と略同じである。
図24は図20の細胞観察情報処理システムを用いた、記録部から所望の細胞の観察情報を検索・抽出する段階での、抽出部による同一の細胞株から培養され継代された、複数代に跨る細胞の検索用タグ付き観察情報の抽出処理の処理手順の一例を示すフローチャートである。
検索用タグ付き観察情報の取得処理において、抽出部15は、検索条件取得部14により取得された検索条件(ユーザID、細胞名、第1の培養器材識別情報を含むタグ)を用いて、第2の記録部13−2を検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報を抽出する(ステップS81、S82)。さらに、抽出部15は、抽出したタグの取得履歴に関する情報に備わる第2の培養器材識別情報を当該検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を新たに作成し、作成した検索条件を用いて、第2の記録部13−2を検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報を抽出する処理を所定の取得履歴に関する情報の抽出範囲に基づいて繰り返す(ステップS83〜S86)。
所定の取得履歴に関する情報の抽出範囲が“タグの取得履歴に関する情報ファイルのデータベース内で辿れる最終データまで”に定まるのは、図6に示した検索条件指定・入力画面18eにおいて、日時情報の範囲指定・入力項目18e−4、継代数の範囲指定・入力項目18e−5のいずれにもユーザによる指定・入力がない場合である。この場合、抽出部15は、図25に示すように、抽出したタグの取得履歴に関する情報に備わる第2の培養器材識別情報を当該検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を新たに作成し、作成した検索条件を用いて、第2の記録部13−2を検索し、該当するタグの取得履歴に関する情報を抽出する処理を、第2の培養器材識別情報が記録されていないタグの取得履歴に関する情報を抽出するまで繰り返す(ステップS83’〜S86)。
図28は本発明の第3実施形態にかかる細胞観察情報処理システムにおいて記録部に保存される第1の培養器材識別情報、第2の培養器材識別情報のデータ構造の一例を示す説明図で、(a)は検索用タグ付き観察情報における第1の培養器材識別情報、第2の培養器材識別情報のデータ構造の一例を示す図、(b)はタグの取得履歴に関する情報における第1の培養器材識別情報、第2の培養器材識別情報のデータ構造の一例を示す図である。
第3実施形態の細胞観察情報処理システム10では、第1の培養器材識別情報は、例えば、図28(a)に示すように、第2の培養器材識別情報を含んで構成されている。
図28(a)に示す検索用タグ付き観察情報ファイルに保存されている各データにおける第1の培養器材識別情報は、右一桁の数値が、第1の培養器材に固有の識別情報(例えば、培養容器に固有の番号等)、残りの桁の数値が第2の培養器材識別情報となっている。
より詳しくは、例えば、図28(a)に示す検索用タグ付き観察情報ファイルに保存されている符号R7で示すデータ中の第1の培養器材識別情報“1−1−2”のうち、符号α1で示す右一桁の数値“2”が第1の培養器材に固有の識別情報、符号α2で示す二桁の数値“11”が第2の培養器材識別情報となっている。
そして、符号α2で示す二桁の数値“11”は、符号R4,R2で示す継代数が一代前のデータにおける第1の培養器材識別情報を示す値と一致している。また、符号α2で示す二桁の数値“11”のうち、右一桁の数値“1”が符号R4,R2で示す継代数が一代前のデータにおける第1の培養器材に固有の識別情報、左一桁の数値“1”が符号R1で示す継代数が二代前のデータにおける第1の培養器材識別情報を示す値と夫々一致している。
また、第3実施形態の細胞観察情報処理システム10では、第1の培養器材識別情報は、第1実施形態や第2実施形態の細胞観察情報処理システム10における第1の培養器材識別情報や第2の培養器材識別情報とは異なり、データ中に継代数の情報を含まない構成となっている。
図29は図28の細胞観察情報処理システムを用いた、記録部から所望の細胞の観察情報を検索・抽出する段階での、抽出部による同一の細胞株から培養され継代された、複数代に跨る細胞の検索用タグ付き観察情報の抽出処理の処理手順の一例を示すフローチャートである。
検索用タグ付き観察情報の取得処理において、抽出部15は、検索条件取得部14により取得された検索条件(ユーザID、細胞名、第1の培養器材識別情報を含むタグ)を用いて、記録部13を検索し、該当する検索用タグ付き観察情報を抽出する(ステップS91)。さらに、抽出部15は、検索条件における第1の培養器材識別情報に含まれる夫々の代における第2の培養器材識別情報を夫々検索条件における第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を用いて記録部13を順次検索し、該当する検索用タグ付き観察情報を抽出する(ステップS92)。
また、明示的に容器に関連付けたタグを一括して付与することができるため、観察情報に付与すべき検索用タグを個々に設定する構成に比べて、ユーザによるタグ設定のミスを減らすことができる。
変形例1:装置が自動的にタグの取得及び付与を行う構成
タグ取得部は、装置内に予め内容が指定されたタグを保存しておき、タグの付与時に、装置内に保存されたタグを取得し付与するように構成してもよい。例えば、装置に対してユーザが固定されている場合、そのユーザのユーザIDを予め装置内に保存する。
変形例1によれば、装置が自動的にタグを取得し付与するため、ユーザによるタグの入力負担が減る。
変形例2:ユーザのその他の入力態様によりタグの取得及び付与を行う構成
タグ取得部は、ユーザによる音声入力、視線入力やジェスチャー入力などによってタグを取得し付与するように構成してもよい。
例えば、音声入力の場合、タグ取得部は、特開2012−252181号公報に開示されているような音声解析技術を用いて、ユーザにより音声入力されたタグの音声情報をタグの文字列情報に変換し、そのタグの文字列情報を画像等の観察情報に付与するように構成してもよい。
また、例えば、視線入力の場合、ユーザの視線が動く方向とその方向に対する文字とを対応付けた対応付け情報を装置内に記憶しておき、タグ取得部は、ユーザの視線の方向を視線検出センサなどの視線検出部で検出し、その検出したユーザの視線の方向と対応付け情報とをもとに、その方向に対応付けられた文字をタグとして取得するように構成してもよい。
さらに、例えば、ジェスチャー入力の場合、ユーザの手、足や体幹等の体の部位が動く方向とその方向に対する文字とを対応付けた対応付け情報を装置内に記憶しておき、タグ取得部は、ユーザの体の部位の動作方向をジェスチャー検出センサなどのジェスチャー検出部で検出し、その検出したユーザの体の部位の動作方向と対応付け情報とをもとに、その方向に対応付けられた文字をタグとして取得するように構成してもよい。
なお、本変形例では、ユーザのその他の入力態様として、音声入力や視線入力等のユーザ入力態様を挙げたが、ユーザの入力態様は、これらに限られるものではなく、例えば、脳波による入力等によってタグの取得及び付与を行うように構成することも可能である。
10 細胞観察情報処理システム
11 タグ取得部
12 保存部
13 記録部
13−1 第1の記録部
13−2 第2の記録部
14 検索条件取得部
15 抽出部
16 タグ選択部
18 提示部
19 出力部
20 観察情報取得部
21 タグ入力部
Claims (19)
- 1時点での取得指示に対応して観察情報取得部を介して取得された、細胞画像及び細胞の活性度を示す活性度データを含む観察情報を検索するための検索用タグとして、細胞名、観察対象となっている細胞を培養する培養器材である第1の培養器材を継代数が同一の細胞を培養する他の培養器材と区別するための第1の培養器材識別情報及び前記第1の培養器材で培養される細胞に対する継代元の細胞を培養する培養器材である第2の培養器材を特定するための第2の培養器材識別情報を含む細胞識別情報を含むタグを取得するタグ取得部と、
各時点での取得指示に対応して取得された夫々の前記観察情報に対して、前記タグ取得部により取得された前記検索用タグを付与し、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を記録部に保存する保存部と、
前記細胞名及び前記第1の培養器材識別情報を含むタグを検索条件として取得する検索条件取得部と、
前記検索条件取得部により取得された前記検索条件を用いて前記記録部を検索し、同一の細胞株から培養され継代された、複数代に跨る細胞の検索用タグ付き観察情報を抽出する抽出部と、
を備えることを特徴とする細胞観察情報処理システム。 - 前記抽出部は、
前記検索条件取得部により取得された前記検索条件を用いて前記記録部を検索し、該当する前記検索用タグ付き観察情報を抽出した後、さらに、
抽出した前記検索用タグ付き観察情報に備わる前記第2の培養器材識別情報を前記検索条件における前記第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を用いて前記記録部を再検索し、該当する前記検索用タグ付き観察情報を抽出する処理を、所定の観察情報の抽出範囲に基づき繰り返す
ことを特徴とする請求項1に記載の細胞観察情報処理システム。 - 前記所定の観察情報の抽出範囲が、前記第2の培養器材識別情報が記録されていない前記検索用タグ付き観察情報を抽出するまでとなるように構成されていることを特徴とする請求項2に記載の細胞観察情報処理システム。
- 前記検索用タグは、さらに、観察情報取得時点の日時情報を含み、
前記所定の観察情報の抽出範囲が、ユーザの操作により指定された前記観察情報取得時点の日時情報の範囲となるように構成されていることを特徴とする請求項2に記載の細胞観察情報処理システム。 - 前記検索用タグは、さらに、前記第1の培養器材で培養される細胞の継代数を含み、
前記所定の観察情報の抽出範囲が、ユーザの操作により指定された前記継代数の範囲となるように構成されていることを特徴とする請求項2に記載の細胞観察情報処理システム。 - 前記第1の培養器材識別情報は、前記第1の培養器材で培養される細胞の継代数と、前記第1の培養器材に固有の識別情報を有してなることを特徴とする請求項1に記載の細胞観察情報処理システム。
- 前記第2の培養器材識別情報は、前記第2の培養器材で培養される細胞の継代数と、前記第2の培養器材に固有の識別情報を有してなることを特徴とする請求項1に記載の細胞観察情報処理システム。
- 前記検索用タグは、さらに、前記第1の培養器材で培養される細胞の継代数を含み、
前記タグ取得部は、
ユーザの操作により指定された前記細胞名を用いて前記記録部を検索し、該当する前記検索用タグ付き観察情報から、前記第1の培養器材で培養される細胞の継代数が最も大きい前記検索用タグ付き観察情報を抽出し、抽出した前記検索用タグ付き観察情報に備わる前記第1の培養器材識別情報を、前記検索用タグの一部として取得すべき前記第1の培養器材識別情報の候補として提示部に一覧出力し、
前記提示部に一覧出力した前記第1の培養器材識別情報の候補のうち、ユーザの操作により選択された前記第1の培養器材識別情報を、前記検索用タグの一部として取得するとともに、
当該ユーザの操作により選択された前記第1の培養器材識別情報を備えた前記検索用タグ付き観察情報に備わる前記第2の培養器材識別情報を、前記検索用タグの一部として自動的に取得することを特徴とする請求項1に記載の細胞観察情報処理システム。 - 前記タグ取得部は、
ユーザの操作により指定された前記第1の培養器材識別情報を、前記検索用タグの一部として取得するとともに、
ユーザの操作により指定された前記細胞名及び前記第1の培養器材識別情報を用いて前記記録部を検索し、該当する前記検索用タグ付き観察情報が存在するとき、当該検索用タグ付き観察情報に備わる前記第2の培養器材識別情報を、前記検索用タグの一部として自動的に取得することを特徴とする請求項1に記載の細胞観察情報処理システム。 - 前記第1の培養器材識別情報は、前記第2の培養器材識別情報を含んでなり、
前記抽出部は、前記検索条件取得部により取得された前記検索条件を用いて前記記録部を検索し、該当する前記検索用タグ付き観察情報を抽出した後、さらに、前記検索条件における前記第1の培養器材識別情報に含まれる夫々の代における前記第2の培養器材識別情報を夫々前記検索条件における前記第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を用いて前記記録部を順次検索し、該当する前記検索用タグ付き観察情報を抽出することを特徴とする請求項1に記載の細胞観察情報処理システム。 - 前記保存部は、前記タグ取得部により前記検索用タグとして取得された前記細胞名、前記第1の培養器材識別情報及び前記第2の培養器材識別情報を含む細胞識別情報を含むタグを、タグの取得履歴に関する情報として、さらに、前記記録部における前記検索用タグ付き観察情報を保存するためのファイルとは別のファイルに保存することを特徴とする請求項1に記載の細胞観察情報処理システム。
- 前記抽出部は、
前記検索条件取得部により取得された前記検索条件を用いて前記記録部を検索し、該当する前記タグの取得履歴に関する情報を抽出した後、さらに、
抽出した前記タグの取得履歴に関する情報に備わる前記第2の培養器材識別情報を当該検索条件における前記第1の培養器材識別情報として置き換えた検索条件を新たに作成し、作成した検索条件を用いて前記記録部を再検索し、該当する前記タグの取得履歴に関する情報を抽出する処理を、所定の取得履歴に関する情報の抽出範囲に基づき繰り返し、
次いで、前記所定の取得履歴に関する情報の抽出範囲に基づく前記タグの取得履歴に関する情報の抽出に用いた全ての検索条件を用いて前記記録部を順次検索し、該当する前記検索用タグ付き観察情報を抽出することを特徴とする請求項11に記載の細胞観察情報処理システム。 - 前記所定の取得履歴に関する情報の抽出範囲が、前記第2の培養器材識別情報が記録されていない前記タグの取得履歴に関する情報を抽出するまでとなるように構成されていることを特徴とする請求項12に記載の細胞観察情報処理システム。
- 前記検索用タグ及び前記タグの取得履歴に関する情報は、夫々、さらに、観察情報取得時点の日時情報を含み、
前記所定の取得履歴に関する情報の抽出範囲が、ユーザの操作により指定された前記観察情報取得時点の日時情報の範囲となるように構成されていることを特徴とする請求項12に記載の細胞観察情報処理システム。 - 前記検索用タグ及び前記タグの取得履歴に関する情報は、夫々、さらに、前記第1の培養器材で培養される細胞の継代数を含み、
前記所定の取得履歴に関する情報の抽出範囲が、ユーザの操作により指定された前記継代数の範囲となるように構成されていることを特徴とする請求項12に記載の細胞観察情報処理システム。 - 前記検索用タグは、さらに、前記第1の培養器材で培養される細胞の継代数を含み、
前記タグ取得部は、
ユーザの操作により指定された前記細胞名を用いて前記記録部を検索し、該当する前記タグの取得履歴に関する情報から、前記第1の培養器材で培養される細胞の継代数が最も大きい前記タグの取得履歴に関する情報を抽出し、抽出した前記タグの取得履歴に関する情報に備わる前記第1の培養器材識別情報を、前記検索用タグの一部として取得すべき前記第1の培養器材識別情報の候補として提示部に一覧出力し、
前記提示部に一覧出力した前記第1の培養器材識別情報の候補のうち、ユーザの操作により選択された前記第1の培養器材識別情報を、前記検索用タグの一部として取得するとともに、
当該ユーザの操作により選択された前記第1の培養器材識別情報を備えた前記タグの取得履歴に関する情報に備わる前記第2の培養器材識別情報を、前記検索用タグの一部として自動的に取得することを特徴とする請求項11に記載の細胞観察情報処理システム。 - 前記タグ取得部は、
ユーザの操作により指定された前記第1の培養器材識別情報を、前記検索用タグの一部として取得するとともに、
ユーザの操作により指定された前記細胞名及び前記第1の培養器材識別情報を用いて前記記録部を検索し、該当する前記タグの取得履歴に関する情報が存在するとき、当該タグの取得履歴に関する情報に備わる前記第2の培養器材識別情報を、前記検索用タグの一部として自動的に取得することを特徴とする請求項11に記載の細胞観察情報処理システム。 - 1時点での取得指示に対応して取得された、細胞画像及び細胞の活性度を示す活性度データを含む観察情報を検索するための検索用タグとして、細胞名、観察対象となっている細胞を培養する培養器材である第1の培養器材を継代数が同一の細胞を培養する他の培養器材と区別するための第1の培養器材識別情報及び前記第1の培養器材で培養される細胞に対する継代元の細胞を培養する培養器材である第2の培養器材を特定するための第2の培養器材識別情報を含む細胞識別情報を含むタグを取得するタグ取得段階と、
各時点での取得指示に対応して取得された夫々の前記観察情報に対して、前記タグ取得段階において取得された前記検索用タグを付与し、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を記録部に保存する保存段階と、
前記細胞名及び前記第1の培養器材識別情報を含むタグを検索条件として取得する検索条件取得段階と、
前記検索条件取得段階において取得した前記検索条件を用いて前記記録部を検索し、同一の細胞株から培養され継代された、複数代に跨る細胞の検索用タグ付き観察情報を抽出する抽出段階と、
を備えることを特徴とする細胞観察情報処理方法。 - コンピュータを、
1時点での取得指示に対応して取得された、細胞画像及び細胞の活性度を示す活性度データを含む観察情報を検索するための検索用タグとして、細胞名、観察対象となっている細胞を培養する培養器材である第1の培養器材を継代数が同一の細胞を培養する他の培養器材と区別するための第1の培養器材識別情報及び前記第1の培養器材で培養される細胞に対する継代元の細胞を培養する培養器材である第2の培養器材を特定するための第2の培養器材識別情報を含む細胞識別情報を含むタグを取得するタグ取得手段、
各時点での取得指示に対応して取得された夫々の前記観察情報に対して、前記タグ取得手段が取得した前記検索用タグを付与し、該検索用タグを付与した検索用タグ付き観察情報を記録部に保存する保存手段、
前記第1の細胞の細胞名及び前記第1の培養器材識別情報を含むタグを検索条件として取得する検索条件取得手段、
前記検索条件取得手段が取得した前記検索条件を用いて前記記録部を検索し、同一の細胞株から培養され継代された、複数代に跨る細胞の検索用タグ付き観察情報を抽出する抽出手段、
として機能させるための細胞観察情報処理プログラム。
Priority Applications (5)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2014145878A JP6339432B2 (ja) | 2014-07-16 | 2014-07-16 | 細胞観察情報処理システム、細胞観察情報処理方法、細胞観察情報処理プログラム |
EP15822539.1A EP3171158A4 (en) | 2014-07-16 | 2015-05-08 | Cell observation data processing system, cell observation data processing method, and cell observation data processing program |
PCT/JP2015/063325 WO2016009708A1 (ja) | 2014-07-16 | 2015-05-08 | 細胞観察情報処理システム、細胞観察情報処理方法、細胞観察情報処理プログラム |
CN201580038276.1A CN106537118B (zh) | 2014-07-16 | 2015-05-08 | 细胞观察信息处理系统、细胞观察信息处理方法和细胞观察信息处理程序 |
US15/405,545 US20170177789A1 (en) | 2014-07-16 | 2017-01-13 | Cell observation information processing system, cell observation information processing method, and cell observation information processing program |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2014145878A JP6339432B2 (ja) | 2014-07-16 | 2014-07-16 | 細胞観察情報処理システム、細胞観察情報処理方法、細胞観察情報処理プログラム |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2016023942A JP2016023942A (ja) | 2016-02-08 |
JP6339432B2 true JP6339432B2 (ja) | 2018-06-06 |
Family
ID=55078212
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2014145878A Active JP6339432B2 (ja) | 2014-07-16 | 2014-07-16 | 細胞観察情報処理システム、細胞観察情報処理方法、細胞観察情報処理プログラム |
Country Status (5)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20170177789A1 (ja) |
EP (1) | EP3171158A4 (ja) |
JP (1) | JP6339432B2 (ja) |
CN (1) | CN106537118B (ja) |
WO (1) | WO2016009708A1 (ja) |
Families Citing this family (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CN110612345B (zh) * | 2017-05-09 | 2023-04-28 | 仪景通株式会社 | 图像再现装置和观察系统 |
JP7018955B2 (ja) | 2017-10-03 | 2022-02-14 | オリンパス株式会社 | 培養情報処理装置 |
JPWO2022070494A1 (ja) * | 2020-09-30 | 2022-04-07 |
Family Cites Families (26)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
CA2223525C (en) * | 1995-06-07 | 2008-12-23 | Aastrom Biosciences, Inc. | Apparatus and method for maintaining and treating biological cells |
TW201022287A (en) * | 2001-01-03 | 2010-06-16 | Senomyx Inc | T1R taste receptors and genes encoding same |
JP4751566B2 (ja) * | 2002-04-09 | 2011-08-17 | オリンパス株式会社 | 細胞培養システム、培養細胞照合装置および細胞培養装置 |
US20060127365A1 (en) * | 2002-05-31 | 2006-06-15 | Victor Nurcombe | Method of cell therapy using fused cell hybrids |
JP2004016194A (ja) * | 2002-06-20 | 2004-01-22 | Hitachi Medical Corp | 細胞培養装置 |
JPWO2005073890A1 (ja) * | 2004-01-30 | 2007-11-15 | 独立行政法人産業技術総合研究所 | イベントシークエンサー |
JP4448388B2 (ja) * | 2004-06-18 | 2010-04-07 | 株式会社カネカ | 細胞試料管理システム |
JP4504748B2 (ja) * | 2004-06-25 | 2010-07-14 | 株式会社日立製作所 | 細胞組織培養管理方法及びシステム |
JP4528584B2 (ja) * | 2004-09-06 | 2010-08-18 | 国立大学法人名古屋大学 | 保存細胞管理システム |
JP2006271210A (ja) * | 2005-03-28 | 2006-10-12 | Olympus Corp | 自動細胞培養装置 |
EP2594631A1 (en) * | 2005-04-05 | 2013-05-22 | Cellpoint Diagnostics | Devices and method for detecting circulating tumor cells and other particles |
JP2007330145A (ja) * | 2006-06-14 | 2007-12-27 | Nikon Corp | 細胞培養装置 |
US8541228B2 (en) * | 2007-06-22 | 2013-09-24 | Nikon Corporation | Cell observation apparatus, cell observation method, and program |
WO2009031283A1 (ja) * | 2007-09-03 | 2009-03-12 | Nikon Corporation | 培養装置、培養情報管理方法およびプログラム |
WO2009050886A1 (ja) * | 2007-10-19 | 2009-04-23 | Nikon Corporation | プログラム、コンピュータおよび培養状態解析方法 |
JP5186924B2 (ja) * | 2008-01-08 | 2013-04-24 | 大日本印刷株式会社 | 顕微鏡観察システム |
JP2009211358A (ja) * | 2008-03-04 | 2009-09-17 | Nikon Corp | 顕微鏡用画像の情報処理装置 |
JP2010152829A (ja) * | 2008-12-26 | 2010-07-08 | Nikon Corp | 細胞培養管理システム |
WO2011021391A1 (ja) * | 2009-08-19 | 2011-02-24 | 国立大学法人名古屋大学 | 培養細胞評価装置、インキュベータおよびプログラム |
WO2012099005A1 (ja) * | 2011-01-19 | 2012-07-26 | 株式会社ニコン | 細胞情報データの作成方法 |
US9404864B2 (en) * | 2013-03-13 | 2016-08-02 | Denovo Sciences, Inc. | System for imaging captured cells |
JP5274731B1 (ja) * | 2011-12-22 | 2013-08-28 | 三洋電機株式会社 | 観察システム、プログラム及び観察システムの制御方法 |
US10467594B2 (en) * | 2012-08-03 | 2019-11-05 | Label Independent, Inc. | Systems and methods for designing, developing, and sharing assays |
JP6303347B2 (ja) * | 2013-09-11 | 2018-04-04 | 大日本印刷株式会社 | 検体画像管理システム及び検体画像管理プログラム |
JP6153434B2 (ja) * | 2013-09-26 | 2017-06-28 | オリンパス株式会社 | 細胞観察情報処理システム、細胞観察情報処理方法、細胞観察情報処理プログラム、細胞観察情報処理システムに備わる記録部、細胞観察情報処理システムに備わる装置 |
JP6234138B2 (ja) * | 2013-09-26 | 2017-11-22 | オリンパス株式会社 | 細胞観察情報処理システム、細胞観察情報処理方法、細胞観察情報処理プログラム、細胞観察情報処理システムに備わる記録部、細胞観察情報処理システムに備わる装置 |
-
2014
- 2014-07-16 JP JP2014145878A patent/JP6339432B2/ja active Active
-
2015
- 2015-05-08 CN CN201580038276.1A patent/CN106537118B/zh active Active
- 2015-05-08 EP EP15822539.1A patent/EP3171158A4/en not_active Withdrawn
- 2015-05-08 WO PCT/JP2015/063325 patent/WO2016009708A1/ja active Application Filing
-
2017
- 2017-01-13 US US15/405,545 patent/US20170177789A1/en not_active Abandoned
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
CN106537118B (zh) | 2019-09-24 |
CN106537118A (zh) | 2017-03-22 |
WO2016009708A1 (ja) | 2016-01-21 |
JP2016023942A (ja) | 2016-02-08 |
EP3171158A4 (en) | 2018-03-21 |
EP3171158A1 (en) | 2017-05-24 |
US20170177789A1 (en) | 2017-06-22 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
JP4287234B2 (ja) | 業務プロセストラッキング装置,業務プロセストラッキング方法,業務プロセストラッキングプログラム,業務プロセストラッキングプログラムを記録した記録媒体 | |
JP5498579B2 (ja) | 診療支援システム及び診療支援方法 | |
WO2015046053A1 (ja) | 細胞観察情報処理システム、細胞観察情報処理方法、細胞観察情報処理プログラム、細胞観察情報処理システムに備わる記録部、細胞観察情報処理システムに備わる装置 | |
Schuh | Integrating specimen databases and revisionary systematics | |
CN103080971B (zh) | 医疗信息系统及医疗信息显示装置 | |
JP6339432B2 (ja) | 細胞観察情報処理システム、細胞観察情報処理方法、細胞観察情報処理プログラム | |
JP6234138B2 (ja) | 細胞観察情報処理システム、細胞観察情報処理方法、細胞観察情報処理プログラム、細胞観察情報処理システムに備わる記録部、細胞観察情報処理システムに備わる装置 | |
JP6396032B2 (ja) | 細胞観察情報処理システム、細胞観察情報処理方法、細胞観察情報処理プログラム、細胞観察情報処理システムに備わる記録部、細胞観察情報処理システムに備わる装置 | |
KR101458555B1 (ko) | 전자의무기록 시스템 기반 이미지 데이터 표시 방법 및 시스템 | |
WO2015159753A1 (ja) | 細胞観察情報処理システム、細胞観察情報処理方法、細胞観察情報処理プログラム、細胞観察情報処理システムに備わる記録部、細胞観察情報処理システムに備わる装置 | |
Davidova et al. | Paradigms, approaches and principals of knowledge management | |
JP5649027B2 (ja) | 医用診断レポートシステム、当該システムとして機能させるためのプログラム、および医用診断レポート作成支援方法 | |
Wachter et al. | A Smartphone App for Simple Soil Structure Analysis | |
JP5897446B2 (ja) | 電子日誌システム | |
CN106459861B (zh) | 细胞观察信息处理系统、细胞观察信息处理方法 | |
JP2020042704A (ja) | 材料開発支援システム、材料開発支援方法 | |
US20230063161A1 (en) | Data management system, data management method, and computer-readable medium | |
Odumuyiwa et al. | Collaborative information retrieval among Economic Intelligence actors | |
US11669603B2 (en) | Clothing pattern making management system | |
US11348350B2 (en) | Observation system and information management method | |
Plitzner et al. | Bottom-up taxon characterisations with shared knowledge: describing specimens in a semantic context. | |
Khoo et al. | Historical Considerations in Biodiversity Informatics | |
Cantwell | Planning for the archives of the future | |
Farkas | Dynamic capabilities developed by the interaction of individuals | |
Dellinger et al. | Makelabels: a Bash script for generating data matrix codes for collection management |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20170623 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20180501 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20180510 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Ref document number: 6339432 Country of ref document: JP Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
S111 | Request for change of ownership or part of ownership |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313111 |
|
R371 | Transfer withdrawn |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R371 |
|
S111 | Request for change of ownership or part of ownership |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R313111 |
|
R350 | Written notification of registration of transfer |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R350 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |
|
R250 | Receipt of annual fees |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R250 |