WO2020153774A1 - 항체-페이로드 컨쥬게이트 제조용 화합물, 이의 용도 - Google Patents

항체-페이로드 컨쥬게이트 제조용 화합물, 이의 용도 Download PDF

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WO2020153774A1
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unsubstituted
substituted
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정상전
김주환
이영근
이태진
서진우
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Abtis Co Ltd
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Sungkyunkwan University
Abtis Co Ltd
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    • A61K47/6889—Conjugates wherein the antibody being the modifying agent and wherein the linker, binder or spacer confers particular properties to the conjugates, e.g. peptidic enzyme-labile linkers or acid-labile linkers, providing for an acid-labile immuno conjugate wherein the drug may be released from its antibody conjugated part in an acidic, e.g. tumoural or environment
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P29/00—Non-central analgesic, antipyretic or antiinflammatory agents, e.g. antirheumatic agents; Non-steroidal antiinflammatory drugs [NSAID]
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P31/00—Antiinfectives, i.e. antibiotics, antiseptics, chemotherapeutics
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
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    • C07D403/02—Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, not provided for by group C07D401/00 containing two hetero rings
    • C07D403/12—Heterocyclic compounds containing two or more hetero rings, having nitrogen atoms as the only ring hetero atoms, not provided for by group C07D401/00 containing two hetero rings linked by a chain containing hetero atoms as chain links
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    • C07K1/00—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length
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    • C07K1/1072—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length by chemical modification of precursor peptides by covalent attachment of residues or functional groups
    • C07K1/1077—General methods for the preparation of peptides, i.e. processes for the organic chemical preparation of peptides or proteins of any length by chemical modification of precursor peptides by covalent attachment of residues or functional groups by covalent attachment of residues other than amino acids or peptide residues, e.g. sugars, polyols, fatty acids
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    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IG], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies

Definitions

  • the present invention relates to the field of bioconjugation.
  • the present invention relates to a linker for preparing a site-specifically bound antibody-payload conjugate, an antibody-payload conjugate prepared using the same, and a method for preparing the same.
  • the linker includes a carbonyl group carbon having two or more different partial positive charges, and functional groups at both ends, and is capable of connecting compounds, peptides, and/or proteins to biological (target) molecules by substitution reaction, It relates to a linker.
  • Bioconjugation is a process of linking at least two molecules, wherein at least one molecule is a bioactive molecule.
  • Bioactive molecules can be referred to as “target molecules” or “interesting molecules”, for example, proteins (or peptides), glycans, nucleic acids (or oligonucleotides), lipids, hormones or natural drugs (or fragments thereof or these Combination of).
  • the linker connecting two or more molecules can be widely used in detection, diagnosis, and biomarker by combining a target specific protein such as an antibody with a fluorescent substance.
  • linkers such as PEG (polyethylene glycol), which are used for detection, diagnosis, and treatment as bioconjugation, are widely used commercially because they are highly water-soluble, non-toxic, non-antigenic and non-agglomerated.
  • linkers capable of binding cytotoxic drugs to target molecules such as antibodies has also been actively conducted.
  • Linkers capable of linking these two or more molecules are compatible with stability and stability in the blood in vivo. Both solubility and target specificity should be considered.
  • linkers currently being studied in the field of antibody-payload conjugates have problems such as a decrease in half-life by blocking the antibody's biological activity, for example, FcRn receptor binding, by length and size, and are site-specific. Difficulty in binding, it is difficult to produce a homogeneous antibody-drug conjugate. Therefore, in order to overcome these drawbacks, while maintaining the activity of the target molecule, in vivo blood stability, suitability. There is an urgent need for the development of linkers that are both excellent in solubility and site specificity.
  • the present invention includes a carbonyl group having two or more different partial positive charges ( ⁇ +), and includes a leaving group and/or a click compound at both ends, thereby affecting the biological activity of the target molecule.
  • a linker capable of linking a payload to a target molecule was invented.
  • the linker can increase reactivity by increasing the water solubility as well as the position-specificity of the target molecule through length adjustment.
  • This linker is intended to provide a more stable and economically efficient linker because the reaction conditions are not demanding and the conjugation yield to the molecule including the target molecule is high as bioconjugation.
  • This application intends to provide a linker having a novel trans structure comprising two or more carbonyl group electrophilic carbons and one or more click chemical moieties and a method for preparing the same.
  • This application intends to provide a linker having a novel cis structure comprising at least two click carbonyl residues and an electrophilic carbon of two or more carbonyl groups and a method for preparing the same.
  • this specification is intended to provide a linker that helps a transport and binding reaction to directly and/or indirectly link a payload to a target molecule.
  • the present application provides a compound represented by Formula 2:
  • R' is an ester group activating group
  • R'' is acetylene, transcyclooctene, cyclooctyne, diarylcyclooctyne, dyarylcyclooctyne, Methyl ester phosphine, norbornene, methylcyclopropene, azetine and cyanide
  • R''' is substituted or unsubstituted C 1-20 alkylene, substituted or unsubstituted C 2-20 alkenylene, substituted or unsubstituted C 1-10 alkynylene, substituted or unsubstituted C 1-10 polymethylene, substituted or unsubstituted C 5-12 aryl, substituted or unsubstituted C 5-14 aryl alkylene, substituted or unsubstituted C 8-16 aryl alkenylene, substituted or unsubstituted C 3-10 cycloalkylene, substituted or unsubsti
  • the present application provides a compound in which R'' is any of norbornene, transcyclooctene, cyclooctyne, and methylcyclopropene. Furthermore, the present application provides a compound wherein R'' is norbornene.
  • the present application provides a compound, characterized in that X is O.
  • the compound of Formula 2 provides a compound represented by the following Formula 2-1-2:
  • the present application prepares a linker-Fc binding peptide conjugate by reacting a linker having the structure of Formula 2 with an Fc binding peptide; Reacting the linker-Fc binding peptide conjugate with an antibody to include a first click chemical functional group in the antibody; And reacting a payload comprising a second click chemistry complementary to the first click chemistry to an antibody comprising the first click chemistry to prepare an antibody-payload conjugate having the structure of Formula 8:
  • a method for preparing an antibody-payload conjugate comprising:
  • Ab is an antibody
  • R''' is unsubstituted C 1-5 alkylene or unsubstituted C 1-5 polymethylene
  • Y 4 is N
  • Fp is an Fc-binding peptide
  • B is Any one of the structures formed by the click-chemistry of the first click chemical functional group and the second click chemical functional group
  • Am is an active moiety or a structure including the same, wherein the active moiety is a drug Any one selected from molecules, imaging moieties, optical agents, vitamins and toxins, n is an integer of 1 or more and 4 or less.
  • the Fc-binding peptide is any one peptide selected from Formula 13 or 14,
  • D is aspartic acid
  • C is cysteine
  • A is alanine
  • W is tryptophan
  • H is histidine
  • Xa X ,
  • G glycine
  • E is glutamic acid
  • L is leucine
  • V valine
  • T is threonine
  • K is lysine, where m is an integer of 1 or more and 4 or less
  • Ab is an antibody
  • R''' is unsubstituted C 1-5 alkylene or unsubstituted C 1-5 polymethylene
  • Y 4 is N
  • Fp is an Fc-binding peptide
  • B is One of the structures formed by click-chemistry of the first click chemical functional group and the second click chemical functional group
  • Am is an active moiety or a structure including the same, wherein the active moiety is a drug molecule , Imaging moieties, optical agents, vitamins and toxins, n is an integer of 1 or more and 4 or less.
  • this application is B or , Wherein A 1 is linked to the antibody and A 2 is linked to Am or A 1 is linked to Am and A 2 is linked to the antibody, thereby providing an antibody-payload conjugate. Furthermore, this application is B It provides an antibody-payload conjugate characterized in that.
  • the present application provides a pharmaceutical composition for treating cancer, comprising an antibody-payload conjugate comprising an anti-cancer agent.
  • Compound 1 disclosed herein provides a linker capable of linking a payload site-specifically to an antibody.
  • the linker has an effect that does not affect the biological activity such as half-life of the antibody, and can be usefully used as bioconjugation of detection, diagnosis, biomarkers, and anticancer drugs.
  • Compound 2 disclosed herein provides a linker capable of site-specifically linking a payload to an antibody.
  • the linker can affect the biological activity of the target molecule and has an effect of, for example, reducing the half-life of the target molecule and/or payload or promoting the release.
  • the linker may be useful as a bioconjugation utilized in detection, diagnosis, and biomarker.
  • Figure 2 shows the overall synthesis process of compound II (cis).
  • Figure 3 shows the results of the HPLC analysis spectrum analysis of the structure of the compound 6 isomer.
  • Figure 14 shows the reaction of compound I-FcBP(6Lys)-norbornene and antibody.
  • Figure 15 shows the structure of Ab (246/248 Lys)-Norbornene produced by the reaction of compound I-FcBP(6Lys)-norbornene with an antibody.
  • Figure 18 shows the structure of Ab (246/248 Lys)-Norbornene produced by the reaction of compound II-FcBP(6Lys)-norbornene with an antibody.
  • FIG. 21 shows the structure of the antibody-payload conjugate produced using the antibody comprising the first click chemical functional group of FIG. 18.
  • the enlarged structure is the structure of the payload, and the unexpanded part is the same as the structure of FIG. 18.
  • 35 is a mass spectrometer result of compound II-FcBP(L6Orn)-norbornene.
  • heteroalkyl refers to an alkyl group in which one or more carbon atoms are replaced with a hetero atom such as O, N or S.
  • a hetero atom eg, O, N or S
  • the resulting heteroalkyl group is an alkoxy group (eg, -OCH 3, etc.), respectively.
  • Amine for example, -NHCH 3 , -N(CH 3 ) 2, etc.
  • a thioalkyl group for example, -SCH 3
  • the resulting heteroalkyl group is each an alkyl ether (eg, -CH 2 CH 2 -O-CH 3 etc.), alkyl amines (eg -CH 2 NHCH 3 , -CH 2 N(CH 3 ) 2 etc.), or thioalkyl ethers (eg -CH 2 -S- CH 3 ).
  • alkyl ether eg, -CH 2 CH 2 -O-CH 3 etc.
  • alkyl amines eg -CH 2 NHCH 3 , -CH 2 N(CH 3 ) 2 etc.
  • thioalkyl ethers eg -CH 2 -S- CH 3
  • the resulting heteroalkyl group is a hydroxyalkyl group (for example, -CH 2 CH 2 -OH), an aminoalkyl group (for example, For example, -CH 2 NH 2 ), or an alkyl thiol group (for example, -CH2CH2-SH).
  • the heteroalkyl group may have, for example, 1 to 20 carbon atoms, 1 to 10 carbon atoms, or 1 to 6 carbon atoms.
  • C 1 -C 6 heteroalkyl group means a heteroalkyl group having 1 to 6 carbon atoms.
  • alkylene refers to a branched or straight chain or cyclic saturated hydrocarbon radical having two monovalent radical centers derived from the removal of two hydrogen atoms from two identical or different carbon atoms of the parent alkane. do.
  • the alkylene group can have 1 to 20 carbon atoms, 1 to 10 carbon atoms, or 1 to 6 carbon atoms.
  • Typical alkylene radicals are methylene (-CH 2 -), 1,1-ethyl (-CH(CH 3 )-), 1,2-ethyl (-CH 2 CH 2 -), 1,1-propyl (- CH(CH 2 CHV)-), 1,2-propyl(-CH 2 CH(CH 3 )-), 1,3-propyl(-CH 2 CH 2 CH 2 -), 1,4-butyl(-CH 2 CH 2 CH 2 CH 2 -) and the like.
  • alkenylene refers to a branched or straight chain or cyclic unsaturated hydrocarbon radical having two monovalent radical centers derived from the removal of two hydrogen atoms from two identical or different carbon atoms of the parent alkene.
  • an alkenylene group may have 1 to 20 carbon atoms, 1 to 10 carbon atoms, or 1 to 6 carbon atoms.
  • alkynylene refers to a branched or straight chain or cyclic unsaturated hydrocarbon radical having two monovalent radical centers derived from the removal of two hydrogen atoms from two identical or different carbon atoms of the parent alkyne.
  • an alkynylene group can have 1 to 20 carbon atoms, 1 to 10 carbon atoms, or 1 to 6 carbon atoms.
  • Typical alkynylene radicals include, but are not limited to, acetylene (-C ⁇ C-), propargyl (-CH 2 C ⁇ C-), and 4-pentynyl (-CH 2 CH 2 CH 2 C ⁇ C-). It does not work.
  • polymethylene means alkylene having one or more carbon atoms, and includes methylene, ethylene, trimethylene, tetramethylene, pentamethylene, hexamethylene and heptamethylene.
  • residues such as “alkyl”, “aryl”, “heterocyclyl” are substituted by one or more substituents, they are, optionally, “alkylene”, “arylene”, “heterocyclylene” It will be appreciated that it may be referred to as a residue, such as “that is, one or more hydrogen atoms of the parent “alkyl”, “aryl”, “heterocyclyl” residues are substituted with the substituents mentioned.
  • Residues such as “alkyl”, “aryl”, “heterocyclyl”, and the like are referred to herein as “substituted” or substituted in the figures (or optionally substituted, eg, the number of substituents is 0 to a positive number) ), terms such as “alkyl”, “aryl”, “heterocyclyl” and the like should be understood as interchangeable with “alkylene”, “arylene”, “heterocyclylene” and the like.
  • substituted such as “substituted alkyl”, “substituted alkylene”, “substituted aryl”, “substituted arylalkyl”, “substituted heterocyclyl” and “substituted carbocyclyl (Eg, substituted cycloalkyl)” is each alkyl, alkylene, aryl, arylalkyl, heterocyclyl, carbocyclyl, each of which one or more hydrogen atoms are each independently substituted with a non-hydrogen substituent (eg , Cycloalkyl).
  • a non-hydrogen substituent eg , Cycloalkyl
  • Optionally substituted refers to a specific portion of the compound of Formula 1 having one, two, or more substituents (eg, an optionally substituted aryl group).
  • leaving group refers to a chemical moiety that can be removed or replaced with another chemical functional group. Throughout the specification of the present invention, the term leaving group includes, but is not limited to, click chemistry functional group (NHS), NHS (N-Hydroxysuccinimide) or maleimide.
  • NHS click chemistry functional group
  • NHS N-Hydroxysuccinimide
  • maleimide N-Hydroxysuccinimide
  • target molecule refers to a molecule that wishes to link the payload to it.
  • the target molecule may be a bioactive molecule, and may be, for example, a protein (or peptide), glycan, nucleic acid (or oligonucleotide), lipid, hormone, or natural drug (or a fragment thereof or a combination thereof), and the like. It is not limited to this.
  • payload means a molecule that is intended to be linked to a target molecule.
  • the payload may be, but is not limited to, a compound, peptide, polypeptide, protein, and/or drug molecule.
  • click chemistry functional group refers to the functional groups involved in the click chemistry reaction.
  • the types of click chemistry and the functional groups involved are generally well known. For example, click chemical reactions are [3+2] cycloadditions, thiol-ene reactions, Diels-Alder reactions, inverse electron demand Diels-Alder reaction, [4+1] cycloadditions, and the like.
  • click chemical reactions include copper(I)-catalyzed cycloaddition reaction (Copper(I)-catalyzed azide-alkyne cycloaddition; CuAAC), Strain-promoted azide-alkyne cycloaddition (SPAAC), Strain-promoted alkyne-nitrone cycloaddition (SPANC), [3+2] cyclization addition of alkene and azide, inverse-demand Diels-Alder of alkene and tetrazine, photoclick reaction of alkene and tetrazole, and azide and alkyne Huisgen cycloaddition, but is not limited thereto.
  • CuAAC Copper(I)-catalyzed azide-alkyne cycloaddition
  • SPAAC Strain-promoted azide-alkyne cycloaddition
  • SPANC Strain-promoted alkyne-nitrone cycl
  • Click chemical functional groups are alkyne, cycloalkyne, cyclooctyne and cyclononyne (eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo[6.1.0) cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol), trans-cyclooctene, nitrone, nitrile oxide, azide, conjugate Conjugated Diene, dienophile, and cyclooctyne, cyclononyne, dibenzocyclooctyne (DIBO), biarylazacyclooctynone (BARAC), aryl (lesslless octyne), difluorinated (DIFO) cycloalkynes such as cyclooctyne), monofluorinated (MOFO), dibenzo-aza-cyclooctyne (DIBAC) and dimeth
  • ester group activating group refers to a moiety that is linked to the oxygen of the ester group to make the ester group an active ester.
  • Z is an ester group activation residue.
  • the ester group activating moiety includes an N-Hydroxysuccinimide group (NHS), a para-nitrophenyl group, and a pentafluorophenyl group.
  • NHS N-Hydroxysuccinimide group
  • para-nitrophenyl group a para-nitrophenyl group
  • pentafluorophenyl group pentafluorophenyl group.
  • the ester group activating residues of the present invention include, but are not limited to, those mentioned in wo/2015/122478.
  • active ester means an ester that is sensitive to nucleophilic substitution reactions.
  • the present application can provide a linker, which aids transport and binding reactions to link the payload to the desired target molecule.
  • the linker may include two or more functional groups capable of reacting with a payload and/or a target molecule.
  • the above reaction means that two or more of the same or different molecules or some functional groups of the molecules are connected to each other, or that an escape reaction, that is, E1, E2, SN1, SN2, and nucleophilic substitution reaction occurs.
  • the linkage can include both direct and indirect covalent and/or non-covalent bonds.
  • the first functional group among the two or more functional groups may be a leaving group.
  • the second functional group of the two or more functional groups may be a click chemistry functional group.
  • the linker may include an electrophilic carbon atom of two or more carbonyl groups.
  • the electrophilic carbon atom of the carbonyl group may be connected to a functional group.
  • the electrophilic carbon atom and functional group of the carbonyl group may be covalently bonded.
  • one or more atoms may be included between an electrophilic carbon atom of a carbonyl group and a functional group.
  • a nucleophilic atom may be included between a carbonyl electrophilic carbon atom and a functional group.
  • the nucleophile atom may be O (oxygen), N (nitrogen) or S (sulfur).
  • the linker may include electrophilic carbon atoms of a carbonyl group having two or more partial positive charges ( ⁇ +).
  • the carbonyl group having the largest partial positive charge ( ⁇ +) among the electrophilic carbon atoms of the two or more carbonyl groups may be a first carbonyl group carbon atom.
  • the carbonyl group having the second largest partial positive charge ( ⁇ +) among the electrophilic carbon atoms of the two or more carbonyl groups may be a second carbonyl group carbon atom.
  • the electrophilic carbon atom of the first carbonyl group may be connected to the first functional group.
  • a nucleophilic atom may be included between the electrophilic carbon atom of the first carbonyl group and the first functional group.
  • the electrophilic carbon atom of the second carbonyl group may be connected to the second functional group. At this time, the electrophilic carbon atom of the second carbonyl group may form a covalent bond with the first functional group.
  • the linker can control the position to which the payload to be covalently bound to the target molecule is bound.
  • the payload may be linked to the electrophilic carbon atom of the first carbonyl group.
  • the linker can control water solubility through length adjustment. For example, by increasing the number of alkyl groups including substituents capable of increasing water solubility, the water solubility of the linker can be increased.
  • a linker compound represented by the following Chemical Formula 1 and/or Chemical Formula 2 may be provided.
  • R' is an ester group activating group.
  • the ester group activating residues include, but are not limited to, N-Hydroxysuccinimide group (NHS), para-nitrophenyl group, and pentafluorophenyl group. Does not work. Furthermore, R'is or It can be either.
  • R'' is one of the click chemistry functional groups
  • the click chemistry functional group is alkyne, cyclooctyne and cyclononyne (eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo) [6.1.0] cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol, trans-cyclooctene, nitrone, nitrile oxide, azide ), Conjugated Diene (Conjugated Diene) and may be any one or more of a dienophile (dienophile), but is not limited thereto.
  • alkyne cyclooctyne and cyclononyne
  • cyclononyne eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo) [6.1.0] cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol, trans-cyclooctene, nitrone,
  • cycloalkyne is cyclooctyne, cyclononyne, dibenzocyclooctyne (DIBO), biarylazacyclooctynone (BARAC), oraryl-less octyne ALO ), difluorinated cyclooctyne (DIFO), monofluorinated (MOFO), dibenzo-aza-cyclooctyne (DIBAC) and dimethoxyazacylooctyne (DIMAC).
  • DIBO dibenzocyclooctyne
  • BARAC biarylazacyclooctynone
  • ALO oraryl-less octyne ALO
  • DIFO difluorinated cyclooctyne
  • MOFO monofluorinated
  • DIBAC dibenzo-aza-cyclooctyne
  • DIMAC dimethoxyazacylooctyn
  • the conjugated diene may be alkene and cycloalkane.
  • the conjugated diene may be tetrazine (eg, 1,2,3,4-tetrazine and/or 1,2,4,5-tetrazine).
  • the chineene may be alkene and cycloalkane, and the cycloalkene is bicyclic or fused. ) Includes cyclic structures.
  • the parent diene body may be norbornene.
  • R''' is substituted or unsubstituted C 1-20 alkylene, substituted or unsubstituted C 2-20 alkenylene, substituted or unsubstituted C 1-10 alkynylene, substituted or unsubstituted C 1-10 Polymethylene, substituted or unsubstituted C 5-12 aryl, substituted or unsubstituted C 5-14 aryl alkylene, substituted or unsubstituted C 8-16 aryl alkenylene, substituted or unsubstituted C 3-10 cyclo Alkylene, substituted or unsubstituted C 3-10 heterocycloalkylene, or substituted or unsubstituted C 5-12 heteroaryl, wherein the heteroalkylene, heterocycloalkylene or heteroaryl is N, O or S At least one,
  • Ra is H, C 1-6 alkyl, C 5-12 aryl, C 7-12 arylalkyl or heterocycle,
  • Rb is F, Cl, Br, or I
  • X may be any one of O, N and S.
  • R' is an ester group activating group.
  • the ester group activating residues include, but are not limited to, N-Hydroxysuccinimide group (NHS), para-nitrophenyl group, and pentafluorophenyl group. Does not work. Furthermore, R'is or It can be either.
  • the click chemistry functional group is alkyne, cyclooctyne and cyclononyne (eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo) [6.1.0] cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol), trans-cyclooctene, nitrone, nitrile oxide, azide ( azide), conjugated diene, and dienophile, but is not limited thereto.
  • alkyne cyclooctyne and cyclononyne
  • cyclononyne eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo) [6.1.0] cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol
  • trans-cyclooctene nitrone
  • nitrile oxide nitrile oxide
  • azide azide
  • cycloalkyne is cyclooctyne, cyclononyne, dibenzocyclooctyne (DIBO), biarylazacyclooctynone (BARAC), oraryl-less octyne ALO ), difluorinated cyclooctyne (DIFO), monofluorinated (MOFO), dibenzo-aza-cyclooctyne (DIBAC) and dimethoxyazacylooctyne (DIMAC).
  • DIBO dibenzocyclooctyne
  • BARAC biarylazacyclooctynone
  • ALO oraryl-less octyne ALO
  • DIFO difluorinated cyclooctyne
  • MOFO monofluorinated
  • DIBAC dibenzo-aza-cyclooctyne
  • DIMAC dimethoxyazacylooctyn
  • R''' is substituted or unsubstituted C 1-20 alkylene, substituted or unsubstituted C 2-20 alkenylene, substituted or unsubstituted C 1-10 alkynylene, substituted or unsubstituted C 1-10 Polymethylene, substituted or unsubstituted C 5-12 aryl, substituted or unsubstituted C 5-14 aryl alkylene, substituted or unsubstituted C 8-16 aryl alkenylene, substituted or unsubstituted C 3-10 cyclo Alkylene, substituted or unsubstituted C 3-10 heterocycloalkylene, or substituted or unsubstituted C 5-12 heteroaryl, wherein the heteroalkylene, heterocycloalkylene or heteroaryl is N, O or S At least one,
  • Ra is H, C 1-6 alkyl, C 5-12 aryl, C 7-12 arylalkyl or heterocycle,
  • X may be any one of O, N and S.
  • the compound represented by Chemical Formula 1 may be a trans-type compound.
  • R'' is one of the click chemistry functional groups
  • the click chemistry functional group is alkyne, cyclooctyne and cyclononyne (eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo) [6.1.0] cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol, trans-cyclooctene, nitrone, nitrile oxide, azide ), any one or more of dienophile such as conjugated diene and alkene, wherein the cycloalkyne, conjugated diene and diene are as described above.
  • cyclooctyne and cyclononyne eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo) [6.1.0] cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol, trans-cyclooctene, nitrone, nitrile oxide, azide
  • R''' is substituted or unsubstituted C 1-20 alkylene, substituted or unsubstituted C 1-20 heteroalkylene, substituted or unsubstituted C 1-20 haloalkyl, or C 1-10 polymethylene ,
  • the heteroalkylene includes at least one N, O or S,
  • Ra is H, C 1-6 alkyl, C 5-12 aryl, C 7-12 arylalkyl or heterocycle,
  • Rb is F, Cl, Br, or I
  • X is any one of O, N and S,
  • R''' is , And Is one of the
  • R 1 is H
  • the Y 1 may be any one of C, N, O and S,
  • the n may be any one of 1 to 20, but is not limited thereto.
  • R''' is And
  • the Y 1 may be any one of C, N, O and S,
  • the n may be any one of the integers from 1 to 10.
  • R'' is one of the click chemistry functional groups
  • R 4 is H
  • R 5 is H
  • R 6 is H
  • Y 1 is C
  • the compound represented by Formula 1 may be a compound described in Table 1 below.
  • Formula 1-1-13 Formula 1-1-12 Formula 1-1-13
  • R'' is one of the click chemistry functional groups
  • the click chemistry functional group is alkyne, cyclooctyne and cyclononyne (eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo) [6.1.0] cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol, trans-cyclooctene, nitrone, nitrile oxide, azide ), any one or more of dienophile such as conjugated diene and alkene, wherein the cycloalkyne, conjugated diene and diene are as described above.
  • cyclooctyne and cyclononyne eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo) [6.1.0] cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol, trans-cyclooctene, nitrone, nitrile oxide, azide
  • R''' is substituted or unsubstituted C 1-20 alkylene, substituted or unsubstituted C 1-20 heteroalkylene, substituted or unsubstituted C 1-20 haloalkyl, or C 1-10 polymethylene ,
  • the heteroalkylene includes at least one N, O or S,
  • Ra is H, C 1-6 alkyl, C 5-12 aryl, C 7-12 arylalkyl or heterocycle,
  • Rb is F, Cl, Br, or I
  • X is any one of O, N and S,
  • R''' is , And Is one of the
  • R 1 is H
  • the Y 1 may be any one of C, N, O and S,
  • the n may be any one of 1 to 20, but is not limited thereto.
  • R''' is And
  • the Y 1 may be any one of C, N, O and S,
  • the n may be any one of the integers from 1 to 10.
  • R'' is one of the click chemistry functional groups
  • N 1,
  • Y 1 is C
  • R'' is norbornene
  • R 4 is H
  • R 5 is H
  • R 6 is H
  • N 1,
  • Y 1 is C
  • the compound represented by Formula 1 may be a compound shown in Table 2 below.
  • Formula 1-2-3 Formula 1-2-4 Formula 1-2-5 Japanese Style 1-2-6 Formula 1-2-7 Formula 1-2-8 Formula 1-2-9 Formula 1-2-10 Formula 1-2-11 Formula 1-2-12 Formula 1-2-13
  • the compound represented by Chemical Formula 2 may be a cis-type compound.
  • R'' is one of the click chemistry functional groups
  • the click chemistry functional group is alkyne, cyclooctyne and cyclononyne (eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo) [6.1.0] cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol, trans-cyclooctene, nitrone, nitrile oxide, azide ), any one or more of dienophile such as conjugated diene and alkene, wherein the cycloalkyne, conjugated diene and diene are as described above.
  • cyclooctyne and cyclononyne eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo) [6.1.0] cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol, trans-cyclooctene, nitrone, nitrile oxide, azide
  • R''' is substituted or unsubstituted C 1-20 alkylene, substituted or unsubstituted C 1-20 heteroalkylene, substituted or unsubstituted C 1-20 haloalkyl, or C 1-10 polymethylene ,
  • the heteroalkylene includes at least one N, O or S,
  • Ra is H, C 1-6 alkyl, C 5-12 aryl, C 7-12 arylalkyl or heterocycle,
  • Rb is F, Cl, Br, or I
  • X is any one of O, N and S,
  • R''' is , And Is one of the
  • R 7 is H
  • the Y 2 may be any one of C, N, O and S,
  • the n may be any one of 1 to 20, but is not limited thereto.
  • R''' is And
  • the Y 2 may be any one of C, N, O and S,
  • the n may be any one of the integers from 1 to 10.
  • R'' is one of the click chemistry functional groups
  • n 1,
  • R'' is norbornene
  • n 1,
  • R 10 is H
  • R 11 is H
  • R 12 is H
  • n 1,
  • the compound represented by Formula 2 may be a compound shown in Table 3 below.
  • Formula 2-1-3 Formula 2-1-4 Formula 2-1-5 Formula 2-1-6 Formula 2-1-7 Formula 2-1-8 Formula 2-1-9 Formula 2-1-10 Formula 2-1-11 Formula 2-1-12 Formula 2-1-13
  • R'' is one of the click chemistry functional groups
  • the click chemistry functional group is alkyne, cyclooctyne and cyclononyne (eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo) [6.1.0] cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol, trans-cyclooctene, nitrone, nitrile oxide, azide ), any one or more of dienophile such as conjugated diene and alkene, wherein the cycloalkyne, conjugated diene and diene are as described above.
  • cyclooctyne and cyclononyne eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo) [6.1.0] cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol, trans-cyclooctene, nitrone, nitrile oxide, azide
  • R''' is substituted or unsubstituted C 1-20 alkylene, substituted or unsubstituted C 1-20 heteroalkylene, substituted or unsubstituted C 1-20 haloalkyl or C 1-10 polymethylene,
  • the heteroalkylene includes at least one N, O or S,
  • Ra is H, C 1-6 alkyl, C 5-12 aryl, C 7-12 arylalkyl or heterocycle,
  • Rb is F, Cl, Br, or I
  • X is any one of O, N and S,
  • R''' is , And Is one of the
  • R 7 is H
  • the Y 2 may be any one of C, N, O and S,
  • the n may be any one of 1 to 20, but is not limited thereto.
  • R''' is And
  • the Y 2 may be any one of C, N, O and S,
  • the n may be any one of the integers from 1 to 10.
  • R'' is any of the click chemistry functional groups
  • R'' is norbornene
  • n 1,
  • R 10 is H
  • R 11 is H
  • R 12 is H
  • the compound represented by Formula 2 may be a compound described in Table 4 below.
  • the method of preparing the antibody-payload conjugate comprises: (1) preparing a linker-Fc binding peptide conjugate by reacting a linker with an Fc binding peptide; (2) reacting the linker-Fc binding peptide with the antibody to include a first click chemical functional group in the antibody; And (3) preparing an antibody-payload conjugate by reacting an antibody comprising a first click chemical functional group with a payload comprising a second click chemical functional group complementary to the first click chemical functional group.
  • each process is separated.
  • Fc binding peptide collectively refers to a peptide having the binding to the Fc domain of the antibody.
  • Fc-binding peptide a 13-mer peptide discovered by DeLano and the like, which is known to have binding to the FcRn domain, is well known.
  • the inventor of the present invention was able to react with a linker by inventing the Fc-binding peptides of SEQ ID NOs: 1 to 5, which substituted specific residues of the 13-mer peptide.
  • the Fc-binding peptides of SEQ ID NOs: 1 to 5 are residues containing a free amine group at residue 6, and can react with a linker through a free amine group.
  • the Fc-binding peptide according to SEQ ID NO: 1 is a peptide represented by Formula 13:
  • the Fc-binding peptide according to SEQ ID NO: 2 is a peptide represented by Formula 14:
  • D is aspartic acid
  • C is cysteine
  • A is alanine
  • W is tryptophan
  • H is histidine
  • K is lysine
  • G is glycine
  • E is glutamic acid
  • L is leucine
  • V is Valine
  • T is threonine
  • the N-terminal cysteine and the C-terminal cysteine may be selectively linked to each other.
  • the linker may be linked to an Fc-binding peptide by a nucleophilic substitution reaction.
  • the nucleophilic substitution reaction may be caused by a nucleophilic atom present in the Fc-binding peptide attacking a positively charged or partially positively charged atom of the linker.
  • the nucleophilic atom may be a nitrogen atom of lysine.
  • the positively charged or partially positively charged atom may be an electrophilic carbon of a carbonyl group.
  • linker-Fc binding peptide conjugate may have the structure of Formula 3.
  • R'' is one of the click chemistry functional groups
  • the click chemistry functional group is alkyne, cyclooctyne and cyclononyne (eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo) [6.1.0] cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol, trans-cyclooctene, nitrone, nitrile oxide, azide ), Conjugated Diene and any one or more of dienophile, wherein the cycloalkyne, conjugated diene and diene are as described above.
  • alkyne alkyne
  • cyclooctyne and cyclononyne eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo) [6.1.0] cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol, trans-cyclooctene, nitrone, nit
  • R''' is substituted or unsubstituted C 1-20 alkylene, substituted or unsubstituted C 2-20 alkenylene, substituted or unsubstituted C 1-10 alkynylene, substituted or unsubstituted C 1-10 Polymethylene, substituted or unsubstituted C 5-12 aryl, substituted or unsubstituted C 5-14 aryl alkylene, substituted or unsubstituted C 8-16 aryl alkenylene, substituted or unsubstituted C 3-10 cyclo Alkylene, substituted or unsubstituted C 3-10 heterocycloalkylene, or substituted or unsubstituted C 5-12 heteroaryl, wherein the heteroalkylene, heterocycloalkylene or heteroaryl is N, O or S At least one,
  • Ra is H, C 1-6 alkyl, C 5-12 aryl, C 7-12 arylalkyl or heterocycle,
  • Rb is F, Cl, Br, or I
  • X may be any one of O, N and S.
  • Y 3 may be any one of O, N and S.
  • Fp is an Fc binding peptide. Furthermore, Fp may be any one peptide selected from Formulas 13 or 14. Regarding the formulas 13 and 14 are as already described.
  • Fp can be linked via Y 3 at amino acid residue 6.
  • the amino acid residue 6 may be lysine, orthine, 2,3-diaminopropionic acid, or 2,4-diaminobutyric acid.
  • the compound represented by Chemical Formula 3 may be prepared by Scheme 1, for example.
  • Reaction Scheme 1 is a reaction for preparing a compound represented by Formula 3 by reacting the compound represented by Formula 1 with an Fc-binding peptide composed of 1 to 50 amino acids.
  • the substitution reaction may be a nucleophilic acyl substitution reaction.
  • the substitution reaction may be performed by any one of the amine group (-NH 2 ), thiol group (-SH) and hydroxy group (-OH) of the compound of Formula 1 and Fc-binding peptide.
  • Y 3 when reacting the compound of Formula 1 and the amine group (-NH 2 ) of the Fc-binding peptide, Y 3 may be N(H).
  • the peptides of SEQ ID NOs: 1 to 5 contain 2,3-diaminopropionic acid, 2,4-diaminobutyric acid, ortinine, or lysine at residue 6, and the residues are all substituted with free amine groups. The reaction can be carried out.
  • Y 3 when reacting the compound of Formula 1 and the thiol group (-SH) of the Fc-binding peptide, Y 3 may be S.
  • Y 3 when reacting with any one of the hydroxy group (-OH) of the compound of Formula 1 and the Fc-binding peptide, Y 3 may be O.
  • linker-Fc binding peptide conjugate may have the structure of Formula 4.
  • R'' is one of the click chemistry functional groups
  • the click chemistry functional group is alkyne, cyclooctyne and cyclononyne (eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo) [6.1.0] cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol, trans-cyclooctene, nitrone, nitrile oxide, azide ), Conjugated Diene and any one or more of dienophile, wherein the cycloalkyne, conjugated diene and diene are as described above.
  • alkyne alkyne
  • cyclooctyne and cyclononyne eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo) [6.1.0] cycloalkyne such as non-4-yn-9-ylmethanol, trans-cyclooctene, nitrone, nit
  • Rb is F, Cl, Br, or I
  • Y 4 may be any one of O, N and S.
  • Fp can be linked via Y 4 at amino acid residue 6.
  • the amino acid residue 6 may be lysine, orthine, 2,3-diaminopropionic acid, or 2,4-diaminobutyric acid.
  • the compound represented by Chemical Formula 4 may be prepared by Scheme 2, for example.
  • Reaction Scheme 2 is a reaction for preparing a compound represented by Formula 4 by reacting the compound represented by Formula 2 with an Fc-binding peptide composed of 1 to 50 amino acids.
  • the substitution reaction may be performed by any one of an amine group (-NH 2 ) thiol group (-SH) and a hydroxyl group (-OH) of the compound of Formula 2 and the Fc-binding peptide.
  • the carbon of the carbonyl group most closely connected to R' that is, the electrophilic carbon atom of the first carbonyl group may have the largest partial positive charge ( ⁇ +).
  • the linker-Fc-binding peptide conjugate can be induced to react to a specific position of the antibody.
  • the inventors of the present invention use the Fc-binding peptides of SEQ ID NOs: 1 to 5 that have affinity for the FcRn domain of the antibody, so that the specific position of the antibody, in particular lysine 246 (Fc-Lys246) or 248 lysine (Fc) -Lys248) has developed a technology capable of delivering a first click chemical functional group.
  • the reaction of the linker-Fc binding peptide conjugate with the antibody may be a nucleophilic substitution reaction.
  • the nucleophilic substitution reaction may occur by a nucleophilic atom present in the antibody attacking a positively charged or partially positively charged atom of the linker-Fc binding peptide conjugate.
  • the nucleophilic atom may be a nitrogen atom of lysine.
  • the positively charged or partially positively charged atom may be an electrophilic carbon of a carbonyl group included in the linker structure.
  • n 2
  • the nitrogen atom connected to Ab may be contained in lysine 246 of both Fc of the antibody.
  • n 2
  • the nitrogen atom linked to Ab may be contained in lysine 248 of both Fc of the antibody.
  • R''' is substituted or unsubstituted C 1-20 alkylene, substituted or unsubstituted C 2-20 alkenylene, substituted or unsubstituted C 1-10 alkynylene, substituted or unsubstituted C 1-10 Polymethylene, substituted or unsubstituted C 5-12 aryl, substituted or unsubstituted C 5-14 aryl alkylene, substituted or unsubstituted C 8-16 aryl alkenylene, substituted or unsubstituted C 3-10 cyclo Alkylene, substituted or unsubstituted C 3-10 heterocycloalkylene, or substituted or unsubstituted C 5-12 heteroaryl, wherein the heteroalkylene, heterocycloalkylene or heteroaryl is N, O or S At least one,
  • Fp is an Fc binding peptide. Furthermore, Fp may be any one peptide selected from Formulas 13 or 14. Regarding the formulas 13 and 14 are as already described.
  • Fp can be linked via Y 3 at amino acid residue 6.
  • the amino acid residue 6 may be lysine, orthine, 2,3-diaminopropionic acid, or 2,4-diaminobutyric acid.
  • the peptides of SEQ ID NOs: 1 to 5 include 2,3-diaminopropionic acid, 2,4-diaminobutyric acid lysine, orthine, or lysine, respectively, at residue 6, and all of the residues include free amine groups. It has a similar structure but only differs in the length of the carbon skeleton. Due to this, all of the peptides of SEQ ID NOs: 1 to 5 show binding to the Fc domain of the antibody.
  • the payload may include an active moiety.
  • the active moiety may be one or more selected from nucleic acids, peptides and compounds.
  • the active moiety can be any one selected from drug molecules, imaging moieties, optical agents, vitamins and toxins.
  • the active moiety can be a drug molecule.
  • the drug molecule may be a prodrug, a prousor drug, or a drug.
  • the drug molecule may be an anti-cancer agent, anti-inflammatory agent, other anti-disease agent, or antimicrobial agent (antibiotic, antifungal agent, antiviral agent).
  • the drug molecule may be mertansine (DM1).
  • the payload may include two or more drug molecules.
  • the active moiety may be an imaging moiety.
  • the imaging moiety may be a contrast agent, radioactive isotope, or fluorescent material.
  • the active moiety may be an optical agent, vitamin, toxin, etc., but is not limited thereto.
  • the antibody-payload conjugate may be represented by Formula 7.
  • the nitrogen atom linked to Ab may be contained in the 246 lysine or 248 lysine residue of the Fc of the antibody. Furthermore, the nitrogen atom linked to Ab may be contained in the lysine residue 246 of the Fc of the antibody. Alternatively, the nitrogen atom linked to Ab may be contained in the lysine residue 248 of the Fc of the antibody.
  • such a structure may be generated by connecting the payload to 246 lysine or 248 lysine, respectively, included in the two Fcs in one antibody.
  • n 4.
  • these structures may be generated by being connected to 246 lysine and 248 lysine, respectively, included in the two Fcs in one antibody.
  • the compound represented by Chemical Formula 7 may be prepared by Scheme 5 as an example.
  • R'''' is the second click chemistry and is as described when describing the payload.
  • the antibody-payload conjugate may be represented by Formula 8.
  • the nitrogen atom linked to Ab may be contained in the lysine 246 or 248 lysine residue of the antibody. Furthermore, the nitrogen atom linked to Ab may be contained in the lysine residue 246 of the antibody. Alternatively, the nitrogen atom linked to Ab may be contained in the lysine residue 248 of the antibody.
  • B may be any one of structures formed by click-chemistry of the first click chemistry group and the second click chemistry group.
  • B is alkyne, cyclooctyne and cyclononyne (eg, bicyclo[6.1.0]-non-4-in-9-yl methanol (bicyclo[6.1.0] cycloalkyne, such as non-4-yn-9-ylmethanol, trans-cyclooctene, nitrone, nitrile oxide, azide, conjugated
  • It may be one of structures that can be generated by two reactions selected from conjugated diene and dienophile. or Can be At this time, A 1 is connected to the antibody, A 2 may be connected to Am. Alternatively, A 1 may be linked to Am, and A 2 may be linked to an antibody.
  • Fp is an Fc binding peptide. Furthermore, Fp may be any one peptide selected from Formulas 13 or 14. Regarding the formulas 13 and 14 are as already described.
  • such a structure may be generated by connecting the payload to 246 lysine or 248 lysine, respectively, included in the two Fcs in one antibody.
  • n 4.
  • these structures may be generated by being connected to 246 lysine and 248 lysine, respectively, included in the two Fcs in one antibody.
  • the compound represented by Chemical Formula 8 may be prepared by Scheme 6 as an example.
  • R'''' is the second click chemistry and is as described when describing the payload above.
  • the Fc-binding peptide may have specificity for the heavy or light chain variable region of an IgG antibody.
  • the Fc-binding peptide may include a click chemical functional group.
  • N- methylhydroxyamine hydrochloride 0.1 g (0.88 mmol, 1.0 eq) of N- methylhydroxyamine hydrochloride is dissolved in 2 mL of -25 o C Tetrahydrofurane (THF) and stirred. Glutaric anhydride 0.07 g (0.88 mmol, 1.0 eq) was added and stirred for 10 minutes, then 0.25 mL (1.76 mmol, 2.0 eq) of Triethylamine was slowly added dropwise.
  • the reaction of attaching the activated residue to the clear amide resin by activating Fmoc-amino acid was sequentially performed from the C-terminal amino acid.
  • Elution solvent (A) 1.5 M Ammonium sulfate + 50 mM phosphate pH 7.0
  • Cell line '4. 3 Prepare according to the method described in (4) Preparation of cell lines.
  • the cell line is prepared, it is homogenized by resuspension, and the prepared cell line is immediately administered to animals.
  • transplanting a cell line sterilize the dorsal part of the animal with 70% alcohol, pull the skin of the dorsum with the thumb and index finger to make a space between the skin and muscle, and then 26 gauge needle in the subcutaneous space between the thumb and index finger from the front of the animal.
  • the attached needle is pierced and administered subcutaneously at a dose of 2.5 X 10 6 cells/0.2 mL/head.
  • the tumor size of each group is as uniform as possible according to the size of the ranked tumor when the tumor line size of the site where the cell line is transplanted reaches about 100-150 mm 3 Distribute so that it is distributed.
  • Example 9-1 Synthesis and structure confirmation of compound II-FcBP(L6Dap, L6Dab, L6Orn, L6Lys)-Norbornene
  • Example 9-1-1 Synthesis of FcBP (L6Dap, L6Dab, L6Orn, L6Lys)-Norbornene
  • the reaction of attaching the activated residue to the clear amide resin by activating Fmoc-amino acid was sequentially performed from the C-terminal amino acid.
  • the progress of the reaction was confirmed by the Kaiser test method, and when it is determined that unreacted amine remains, the reaction time is extended by 1 to 3 hours or the reaction solution is emptied and the above reaction process is repeated. Removal of the N-terminal Fmoc protecting group was performed using 20% piperidine-containing DMF, and then the peptide-attached resin was dried and weighed.
  • FcBP(L6Orn)-Norbornene Norbornene-PEG8-Asp-Cys*-Ala-Trp-His-Orn-Gly-Glu-Leu-Val-Trp-Cys*-Thr-NH 2 (Cys*: disulfide bond position)
  • Prep-LC purification conditions Equipment name Waters 2525 pump, Waters 2487 UV detector column Waters, XBridge Prep C18 5 ⁇ m OBD 19 x 250 mm Mobile phase A/B 0.1% TFA in H2O / 0.1% TFA in Acetonitrile gradient 0 min ⁇ 30 min: B 20% ⁇ B 100% Flow rate 10 mL/min Detection wavelength UV 280 nm
  • Example 10-1-1 Compound II-FcBP(L6Dap)-Norbornene based Trastuzumab-Norbornene synthesis
  • trastuzumab peaks on HIC-HPLC at 6.3 to 6.4 min, 8 min when only one of the two binding sites of trastuzumab is bound, and 9 min when both sites are bound by FcBP(L6Dap)-norbornene molecules.
  • Trastuzumab shows peaks on HIC-HPLC at 6.3 to 6.4 minutes, 8 minutes when only one of the two binding sites of trastuzumab is bound, and 9 minutes when both of the FcBP(L6Lys)-norbornene molecules are bound. HIC-HPLC chromatogram can be confirmed.

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Abstract

본 출원은 두 개 이상의 카보닐기의 친전자성 탄소 및 클릭 화학 작용기을 하나 이상 포함하는 바이오 컨쥬게이션에 이용되는 신규한 링커로, 보다 구체적으로, 치환반응에 의해 원하는 타겟분자, 즉 타겟분자에 화합물, 펩타이드 및/또는 단백질을 직접적 및/또는 간접적으로 연결시킬 수 있는 링커에 관한 것이다.

Description

항체-페이로드 컨쥬게이트 제조용 화합물, 이의 용도
본 발명은 바이오 컨쥬게이션(bioconjugation)분야에 관한 것이다. 본 발명은 위치특이적으로 결합된 항체-페이로드 컨쥬게이트를 제조하기 위한 링커, 이를 이용하여 제조된 항체-페이로드 컨쥬게이트 및 이를 제조하는 방법에 관한 것이다. 보다 구체적으로 상기 링커는 두 개 이상의 상이한 부분 양전하를 가진 카보닐기 탄소 및 양 말단에 작용기를 포함하고 있으며, 치환반응에 의해 생체(타겟) 분자에 화합물, 펩타이드 및/또는 단백질을 연결시킬 수 있는, 링커에 관한 것이다.
바이오 컨쥬게이션은 적어도 두 개 이상의 분자를 연결하는 과정으로서 이때 적어도 한 개 이상의 분자가 생체활성 분자 (bioactive molecule)인 것을 말한다. 생체활성 분자는 “타겟분자” 또는 “관심 분자”로 지칭될 수 있으며, 예를 들어 단백질(또는 펩타이드), 글리칸, 핵산(또는 올리고 뉴클레오티드), 지질, 호르몬 또는 천연 약물(또는 그의 단편 또는 이들의 조합) 등일 수 있다. 이러한 두 개 이상의 분자를 연결하는 링커는 항체와 같은 표적 특이적 단백질과 형광물질 등을 결합하여 검출, 진단 및 바이오마커 등에 광범위하게 사용될 수 있다.
현재, 바이오 컨쥬게이션으로서 검출, 진단 및 치료 등에 이용되는 링커, 예를 들어, PEG(폴리에틸렌글리콜)는 수용성이 높고, 비독성이고, 비항원성이며 응집되지 않아 상업적으로 널리 이용되고 있다. 최근에는 항체에 세포독성 약물(항암제)를 연결하여 특정 질환을 치료하는 치료제에 관한 관심이 증가하면서, 항체 등 타겟분자에 세포독성 약물을 결합시킬 수 있는 링커에 대한 연구도 활발해지고 있다. 이러한 두 개 이상의 분자를 연결시킬 수 있는 링커는 생체 내에서 혈중 안정성, 적합성. 용해도 및 타겟 특이성 등이 모두 고려되어야 한다.
한편, 현재 항체-페이로드 콘쥬게이트 분야에서 연구되고 있는 링커는 길이 및 크기에 의해 항체의 생물학적 활성, 예를 들어, FcRn 수용체 결합을 막음으로써 반감기가 감소하는 등의 문제점이 있고, 위치-특이적 결합하는데 어려움이 있어 균질한 항체-약물 결합체를 생산하는데 어려움이 있다. 따라서, 이러한 단점을 극복하기 위하여, 타겟분자의 활성을 유지하면서도 생체 내에서 혈중 안정성, 적합성. 용해도 및 위치 특이성이 모두 뛰어난 링커의 개발이 절실히 요구된다.
이러한 문제를 해결하기 위하여, 본 발명은 두 개 이상의 상이한 부분 양전하(δ+)를 가진 카보닐기를 포함하고, 양 말단에 이탈기 및/또는 클릭화합물을 포함하여, 타겟분자의 생물학적 활성에 영향을 미치지 않으면서, 타겟분자에 페이로드를 연결시킬 수 있는 링커를 발명하였다. 해당 링커는 길이 조절을 통해 타겟분자에 대한 위치-특이성 뿐만 아니라 수용성을 증가시킴으로써 반응성을 높일 수 있다. 이러한 링커는 반응 조건이 까다롭지 않고, 바이오 컨쥬게이션으로써 타겟분자를 포함한 분자에 대한 접합 수율이 높아, 보다 안정적이고 경제적으로 효용성이 높은 링커를 제공하고자 한다.
본 출원은 두 개 이상의 카보닐기의 친전자성 탄소 및 하나 이상의 클릭 화학 잔기를 포함하는 신규한 trans 구조를 가진 링커 및 이의 제조방법을 제공하고자 한다.
본 출원은 두 개 이상의 카보닐기의 친전자성 탄소 및 하나 이상의 클릭 화학 잔기를 포함하는 신규한 cis 구조를 가진 링커 및 이의 제조방법을 제공하고자 한다.
전술한 본 출원의 과제를 해결하고자, 본 명세서에서는 타겟분자에 페이로드를 직접적 및/또는 간접적으로 연결시키기 위해 운반 및 결합반응을 돕는 링커 (linker)를 제공하고자 한다.
일 양태에서, 본 출원은 하기 화학식 2로 표시되는 화합물을 제공한다:
[화학식 2]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000001
상기 식에서, R'은 에스터 그룹 활성화 잔기 (ester group activating group)이며, R''은 아세틸렌(Acetylene), 트랜스사이클로옥텐(transcyclooctene), 사이클로옥타인(cyclooctyne), 다이아릴사이클로옥타인(dyarylcyclooctyne), 메틸 에스터 포스핀(methyl ester phosphine), 노르보레인(norbornene), 메틸사이클로프로펜(methylcyclopropene), 아제틴(azetine) 및 사이아나이드(cyanide) 중 어느 하나이며, R'''은 치환 또는 비치환된 C1-20 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C2-20 알케닐렌, 치환 또는 비치환된 C1-10 알키닐렌, 치환 또는 비치환된 C1-10 폴리메틸렌, 치환 또는 비치환된 C5-12 아릴, 치환 또는 비치환된 C5-14 아릴 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C8-16 아릴 알케닐렌, 치환 또는 비치환된 C3-10 사이클로알킬렌, 치환 또는 비치환된 C3-10 헤테로사이클로알킬렌, 또는 치환 또는 비치환된 C5-12 헤테로아릴이며, 상기 헤테로알킬렌, 헤테로사이클로알킬렌 또는 헤테로아릴은 N, O 또는 S가 적어도 하나 이상 포함되고, 상기 치환은 비수소 치환기로 치환된 것으로, 상기 비수소 치환기는 -Ra, -O-, =O, -ORa, -SRa, -S-, -N(Ra)2, =NRa, -C(Rb)3, -N=C=O, -NCS, -NO, -NO2, =N-OH, =N2, -N3, -NHC(=O)Ra, -C(=O)Ra, -C(=O)NRaRa -S(=O)2O-, -S(=O)2OH, -S(=O)2Ra, -OS(=O)2ORa, -S(=O)2NRa, -S(=O)Ra, -C(=O)Ra, 알킬렌-C(=O)Ra, -C(=S)Ra, -C(=O)ORa, 알킬렌-C(=O)ORa, -C(=O)O-, 알킬렌-C(=O)O-, -C(=S)ORa, -C(=O)SRa, -C(=S)SRa, -C(=O)NRaRa, 알킬렌-C(=O)NRaRa, -C(=S)NRaRa, -C(-NRa)NRaRa 및 Rb로 이루어진 군으로부터 하나 이상 선택될 수 있고, 상기 Ra는 H, C1-6 알킬, C5-12 아릴, C7-12 아릴알킬 또는 헤테로사이클이고, 상기 Rb은 F, Cl, Br, 또는 I이고, X는 O, N 및 S 중 어느 하나이다. 나아가, 본 출원은 상기 R''은 노르보레인(norbornene), 트랜스사이클로옥텐(transcyclooctene), 사이클로옥타인(cyclooctyne) 및 메틸사이클로프로펜(methylcyclopropene) 중 어느 하나인 화합물을 제공한다. 더 나아가, 본 출원은 상기 R''은 노르보레인(norbornene)인 화합물을 제공한다.
또는 나아가, 본 출원은 R'''은 치환 또는 비치화된 C1-10알킬렌, 치환 또는 비치환된 C1-10 헤테로 알킬렌 및 C1-10폴리메틸렌 중 어느 하나이며, 상기 헤테로 알킬렌은 N, O 또는 S가 적어도 하나 이상 포함되고, 상기 치환은 비수소 치환기로 치환된 것으로, 비수소 치환기는 -O-, =O, -ORa, -SRa, -S-, -N(Ra)2, =NRa, -N=C=O, -NCS, -NO, -NO2, =N-OH, =N2, -N3, -NHC(=O)Ra, -C(=O)Ra, -C(=O)NRaRa -S(=O)2O-, -S(=O)2OH, -S(=O)2Ra, -OS(=O)2ORa, -S(=O)2NRa, -S(=O)Ra, -C(=O)Ra, 알킬렌-C(=O)Ra, -C(=S)Ra, -C(=O)ORa, 알킬렌-C(=O)ORa, -C(=O)O-, 알킬렌-C(=O)O-, -C(=S)ORa, -C(=O)SRa, -C(=S)SRa, -C(=O)NRaRa, 알킬렌-C(=O)NRaRa, -C(=S)NRaRa 및 -C(-NRa)NRaRa로 이루어진 군으로부터 하나 이상이며, 상기 Ra는 C1-6 알킬, C5-12 아릴, C7-12 아릴알킬 또는 헤테로사이클이고, 상기 Rb는 F, Cl, Br, 또는 I이고, X는 O, N 및 S 중 어느 하나인 것을 특징으로 하는 화합물을 제공한다. 더 나아가, 본 출원은 상기 R'''은 비치환된 C1-5 알킬렌 또는 비치환된 C1-5 폴리메틸렌인 것을 특징으로 하는, 화합물을 제공한다.
또는 나아가, 본 출원은 상기 X는 O인 것을 특징으로 하는, 화합물을 제공한다.
또는 나아가, 상기 화학식 2의 화합물은 하기 화학식 2-1-2로 표시되는 것인 화합물을 제공한다:
[화학식 2-1-2]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000002
.
다른 양태에서, 본 출원은 화학식 2의 구조를 갖는 링커를 Fc 결합성 펩타이드와 반응시켜 링커-Fc 결합성 펩타이드 콘쥬게이트를 제조함; 상기 링커-Fc 결합성 펩타이드 콘쥬게이트와 항체를 반응시켜 상기 항체에 제1 클릭 화학 작용기를 포함시킴; 및 상기 제1 클릭 화학작용기를 포함하는 항체에 상기 제1 클릭 화학작용기와 상보적인 제2 클릭 화학작용기를 포함하는 페이로드를 반응시켜 하기 화학식 8의 구조를 갖는 항체-페이로드 콘쥬게이트를 제조함을 포함하는 항체-페이로드 콘쥬게이트를 제조하기 위한 방법을 제공한다:
[화학식 8]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000003
이때, Ab는 항체이고, R'''은 비치환된 C1-5 알킬렌 또는 비치환된 C1-5 폴리메틸렌이며, Y4는 N이고, Fp는 Fc 결합성 펩타이드이며, B는 상기 제1 클릭 화학작용기와 상기 제2 클릭 화학작용기의 클릭화학 반응 (click-chemistry)에 의하여 형성되는 구조들 중 어느 하나이며, Am은 활성 모이어티 또는 이를 포함하는 구조로서, 상기 활성 모이어티는 약물 분자, 이미징 모이어티, 광학 작용제, 비타민 및 독소로부터 선택된 어느 하나이고, n은 1 이상 4 이하의 정수이다.
나아가, 본 출원은 상기 Fc 결합성 펩타이드는 화학식 13 또는 14 중 선택된 어느 하나의 펩타이드이고,
이때
[화학식 13]
D-C-A-W-H-Xa-G-E-L-V-W-C-T
[화학식 14]
D-C-A-W-H-K-G-E-L-V-W-C-T
이때, D는 아스파르트산이고, C는 시스테인이며, A는 알라닌이고, W는 트립토판이며, H는 히스티딘이고, Xa는
Figure PCTKR2020001145-appb-I000004
이며, G는 글리신이고, E는 글루탐산이며, L은 류신이고, V는 발린이며, T는 트레오닌이고, K는 라이신이며, 이때, m은 1 이상 4 이하의 정수이고, N 말단의 시스테인과 C 말단의 시스테인은 선택적으로 서로 연결되어 있을 수 있으며, 이로써 n=2이고, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 양 Fc의 246번 라이신 또는 248번 라이신 잔기에 포함된 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트를 제조하기 위한 방법을 제공한다.
또 다른 양태에서, 본 출원은 화학식 8의 구조를 갖는 항체-페이로드 콘쥬게이트를 제공한다:
[화학식 8]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000005
이때, Ab는 항체이고, R'''은 비치환된 C1-5 알킬렌 또는 비치환된 C1-5 폴리메틸렌이며, Y4는 N이고, Fp는 Fc 결합성 펩타이드이며, B는 상기 제1 클릭 화학작용기와 상기 제2 클릭 화학작용기의 클릭화학 반응 (click-chemistry)에 의하여 형성되는 구조들 중 하나이며, Am은 활성 모이어티 또는 이를 포함하는 구조로서, 상기 활성 모이어티는 약물 분자, 이미징 모이어티, 광학 작용제, 비타민 및 독소로부터 선택된 어느 하나이고, n은 1 이상 4 이하의 정수이다.
나아가, 본 출원은 상기 Fp가 화학식 13 또는 14 중 선택된 어느 하나의 펩타이드이고,
이때
[화학식 13]
D-C-A-W-H-Xa-G-E-L-V-W-C-T
[화학식 14]
D-C-A-W-H-K-G-E-L-V-W-C-T
이때, D는 아스파르트산이고, C는 시스테인이며, A는 알라닌이고, W는 트립토판이며, H는 히스티딘이고, Xa는
Figure PCTKR2020001145-appb-I000006
이며, G는 글리신이고, E는 글루탐산이며, L은 류신이고, V는 발린이며, T는 트레오닌이고, K는 라이신이며, 이때, m은 1 이상 4 이하의 정수이고, N 말단의 시스테인과 C 말단의 시스테인은 선택적으로 서로 연결되어 있을 수 있으며, 상기 Fp는 6번 아미노산 잔기에서 Y4를 통해 연결되는 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트를 제공한다.
또는 나아가, 본 출원은 B는
Figure PCTKR2020001145-appb-I000007
또는
Figure PCTKR2020001145-appb-I000008
이고, 이때 A1은 항체와 연결되어있고 A2는 Am과 연결되어있거나 또는 A1은 Am과 연결되어있고 A2는 항체와 연결되어있는 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트를 제공한다. 더 나아가, 본 출원은 B는
Figure PCTKR2020001145-appb-I000009
인 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트를 제공한다.
또는, 본 출원은 상기 Am은 항암제를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트를 제공한다. 더 나아가, 본 출원은 상기 항암제는 메르탄신 (mertansine; DM1)인 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트를 제공한다. 또는 더 나아가, 본 출원은 상기 Am은 2개 이상의 항암제를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트를 제공한다.
또는, 본 출원은 Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 Fc의 246번 라이신 또는 248번 라이신 잔기에 포함된 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트를 제공한다.
또는, 본 출원은 n=2이고, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 양 Fc의 246번 라이신 또는 248번 라이신에 포함된 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트를 제공한다.
또 다른 양태에서, 본 출원은 항암제를 포함하는 항체-페이로드 콘쥬게이트를 포함하는, 암을 치료하기 위한 약학적 조성물을 제공한다.
나아가, 본 출원은 상기 암은 유방암인 것을 특징으로 하는 약학적 조성물을 제공한다.
본 명세서에 의해 개시되는 기술에 따르면, 다음과 같은 효과가 발생한다.
본 명세서에 개시된 화합물 1은 항체에 위치 특이적으로 페이로드(payload)를 연결시킬 수 있는 링커를 제공한다. 이러한 상기 링커는 항체의 반감기 등의 생물학적 활성에 영향을 주지 않는 효과를 가지며, 검출, 진단, 바이오마커 및 항암치료제의 바이오컨쥬게이션으로서 유용하게 사용될 수 있다.
또한, 본 명세서에 개시된 화합물 2는 항체에 위치 특이적으로 페이로드(payload)를 연결시킬 수 있는 링커를 제공한다. 상기 링커는 타겟분자의 생물학적 활성에 영향을 줄 수 있으며 예를 들어 타겟분자 및/또는 페이로드의 반감기를 감소시키거나 배출을 촉진시킬 수 있는 효과를 가진다. 이러한 상기 링커는 검출, 진단, 바이오마커에 활용되는 바이오컨쥬게이션으로서 유용하게 사용될 수 있다.
나아가, 화합물 1 및 화합물 2에 의하여 제공되는 항체-페이로드 콘쥬게이트는 그 결합 위치가 균일하여 높은 균일성 (uniformity)을 갖는 장점이 있다.
도 1은 화합물 I(trans)의 전체 합성 공정을 나타낸다.
도 2는 화합물 II(cis)의 전체 합성 공정을 나타낸다.
도 3은 화합물 6 이성질체 구조의 HPLC 분석 스펙트럼 분석 결과를 보여준다.
도 4는 화합물 6(cis)의 분자량 분석 결과를 나타낸다.
도 5는 화합물 6(trans)의 분자량 분석 결과를 나타낸다.
도 6은 화합물II의 이성질체 구조를 HPLC를 통해 확인한 결과를 나타낸다.
도 7은 HPLC 통해 화합물 II의 수득 결과를 보여준다.
도 8은 FcBP(6Lys)-Norbornene의 HPLC 결과이다.
도 9는 FcBP(6Lys)-Norbornene의 LC mass 결과이다.
도 10은 화합물Ⅰ-FcBP(6Lys)-norborene의 HPLC 결과이다.
도 11은 화합물Ⅰ-FcBP(6Lys)-norborene의 LC mass 결과이다.
도 12는 화합물Ⅱ-FcBP(6Lys)-norbornene의 HPLC 결과이다.
도 13은 화합물Ⅱ-FcBP(6Lys)-norbornene의 mass spectometer 결과이다.
도 14는 화합물Ⅰ-FcBP(6Lys)-norbornene과 항체의 반응을 도시한 것이다.
도 15는 화합물Ⅰ-FcBP(6Lys)-norbornene과 항체의 반응에 의해 생성된 Ab (246/248 Lys)-Norbornene의 구조를 나타낸 것이다.
도 16은 화합물Ⅰ-FcBP(6Lys)-norbornene과 항체의 반응을 HIC-HPLC를 통해 반응 모니터링한 결과이다.
도 17은 화합물Ⅱ-FcBP(6Lys)-norbornene과 항체의 반응을 도시한 것이다.
도 18은 화합물Ⅱ-FcBP(6Lys)-norbornene과 항체의 반응에 의해 생성된 Ab (246/248 Lys)-Norbornene의 구조를 나타낸 것이다.
도 19는 화합물Ⅱ-FcBP(6Lys)-norbornene과 항체의 반응을 HIC-HPLC를 통해 반응 모니터링한 결과이다.
도 20은 Herceptin-Norbornene의 질량 분석 결과이다.
도 21은 도 18의 제1 클릭화학 작용기를 포함하는 항체를 이용하여 생성된 항체-페이로드 콘쥬게이트의 구조를 나타낸 것이다. 확대된 구조는 페이로드의 구조이고, 확대되지 않은 부분은 도 18의 구조와 동일하다.
도 22는 도 18의 Ab (246/248 Lys)-Norbornene과 테트라진-PEG8-DM1 (Tetrazine-PEG8-DM1)의 반응을 HIC-HPLC를 통해 반응 모니터링한 결과이다.
도 23은 항체-페이로드 콘쥬게이트의 질량 분석 결과이다.
도 24 내지 도 27은 각각 NCI-N87, BT474, MDA-MB-468에 대한 세포 독성 실험 결과 및 이를 정리한 표이다.
도 28 및 도 29는 허셉틴과 본 출원에 의한 항체-페이로드 콘쥬게이트의 종양 성장 억제 실험 결과이다.
도 30은 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Dap)-norbornene의 HPLC 결과이다.
도 31은 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Dap)-norbornene의 mass spectrometer 결과이다.
도 32는 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Dab)-norbornene의 HPLC 결과이다.
도 33은 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Dab)-norbornene의 mass spectrometer 결과이다.
도 34는 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Orn)-norbornene의 HPLC 결과이다.
도 35는 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Orn)-norbornene의 mass spectrometer 결과이다.
도 36은 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Lys)-norbornene의 HPLC 결과이다.
도 37은 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Lys)-norbornene의 mass spectrometer 결과이다.
도 38은 화합물Ⅱ-FcBP(L6Dap)-norbornene 기반 항체와의 결합 반응 모니터링을 위한 HIC-HPLC 결과이다.
도 39는 화합물Ⅱ-FcBP(L6Dab)-norbornene 기반 항체와의 결합 반응 모니터링을 위한 HIC-HPLC 결과이다.
도 40은 화합물Ⅱ-FcBP(L6Orn)-norbornene 기반 항체와의 결합 반응 모니터링을 위한 HIC-HPLC 결과이다.
도 41은 화합물Ⅱ-FcBP(L6Lys)-norbornene 기반 항체와의 결합 반응 모니터링을 위한 HIC-HPLC 결과이다.
용어 "헤테로알킬"은 하나 이상의 탄소원자가 O, N 또는 S와 같은 헤테로 원자로 치환되어 있는 알킬기를 지칭한다. 예를 들면, 모 분자에 부착되어 있는 알킬기의 탄소원자가 헤테로 원자(예를 들면, O, N 또는 S)로 치환되는 경우, 결과물인 헤테로알킬기는 각각 알콕시 기(예를 들면, -OCH3 등), 아민(예를 들면, -NHCH3, -N(CH3)2 등), 또는 티오알킬기(예를 들면, -SCH3)이다. 모 분자에 부착되지 않은 알킬기의 비(非)-말단 탄소원자가 헤테로 원자(예를 들면, O, N 또는 S)로 치환되는 경우, 결과물인 헤테로알킬기는 각각 알킬 에터(예를 들면, -CH2CH2-O-CH3 등), 알킬 아민(예를 들면, -CH2NHCH3, -CH2N(CH3)2 등), 또는 티오알킬 에터(예를 들면, -CH2-S-CH3)이다. 알킬기의 말단 탄소원자가 헤테로 원자(예를 들면, O, N 또는 S)로 치환되는 경우, 결과물인 헤테로알킬기는 각각 하이드록시알킬기(예를 들면, -CH2CH2-OH), 아미노알킬기(예를 들면, -CH2NH2), 또는 알킬 티올 기(예를 들면, -CH2CH2-SH)이다. 헤테로알킬기는 예를 들면, 1 내지 20개의 탄소원자, 1 내지 10개의 탄소원자, 또는 1 내지 6개의 탄소원자를 가질 수 있다. C1-C6 헤테로알킬기는 1 내지 6개의 탄소원자를 갖는 헤테로알킬기를 의미한다.
용어 "알킬렌"은, 모(parent) 알칸의 동일하거나 상이한 2개의 탄소원자로부터 2개의 수소 원자가 제거되어 유도되는 2개의 1가 라디칼 중심을 갖는, 분지쇄 또는 직쇄 또는 고리형인 포화 탄화수소 라디칼을 지칭한다. 예를 들면, 알킬렌 기는 1 내지 20개의 탄소원자, 1 내지 10개의 탄소원자, 또는 1 내지 6개의 탄소원자를 가질 수 있다. 전형적인 알킬렌 라디칼은, 메틸렌(-CH2-), 1,1-에틸(-CH(CH3)-), 1,2-에틸(-CH2CH2-), 1,1-프로필(-CH(CH2CHV)-), 1,2-프로필(-CH2CH(CH3)-), 1,3-프로필(-CH2CH2CH2-), 1,4-부틸(-CH2CH2CH2CH2-) 등을 포함하지만, 이에 한정되지는 않는다.
용어 "알케닐렌"은 모 알켄의 동일하거나 상이한 2개의 탄소원자로부터 2개의 수소 원자가 제거되어 유도되는 2개의1가 라디칼 중심을 갖는, 분지쇄 또는 직쇄 또는 고리형인 불포화 탄화수소 라디칼을 지칭한다. 예를 들면, 알케닐렌 기는 1 내지 20개의 탄소원자, 1 내지 10개의 탄소원자, 또는 1 내지 6개의 탄소원자를 가질 수 있다. 전형적인 알케닐렌 기는 1,2-에틸렌(-CH=CH-)을 포함하지만, 이에 한정되지는 않는다.
용어 "알키닐렌"은 모 알킨의 동일하거나 상이한 2개의 탄소원자로부터 2개의 수소 원자가 제거되어 유도되는 2개의 1가 라디칼 중심을 갖는, 분지쇄 또는 직쇄 또는 고리형인 불포화 탄화수소 라디칼을 지칭한다. 예를 들면, 알키닐렌 기는 1 내지 20개의 탄소원자, 1 내지 10개의 탄소원자, 또는 1 내지 6개의 탄소원자를 가질 수 있다. 전형적인 알키닐렌 라디칼은 아세틸렌(-C≡C-), 프로파길(-CH2C≡C-), 및 4-펜티닐(-CH2CH2CH2C≡C-)을 포함하지만, 이에 한정되지는 않는다.
용어 “폴리메틸렌”은 하나 이상의 탄소원자를 갖는 알킬렌을 의미하고, 메틸렌, 에틸렌, 트리메틸렌, 테트라메틸렌, 펜타메틸렌, 헥사메틸렌 및 헵타메틸렌을 포함한다.
당업계의 숙련자라면, "알킬", "아릴", "헤테로사이클릴" 등의 잔기가 하나 이상의 치환기에 의해 치환되는 경우, 이들은 선택적으로, "알킬렌", "아릴렌", "헤테로사이클릴렌" 등의 잔기로서 지칭될 수 있음(즉, 모체인 "알킬", "아릴", "헤테로사이클릴" 잔기의 하나 이상의 수소 원자가 언급한 치환기로 치환됨을 의미한다)을 인식할 것이다. "알킬", "아릴", "헤테로사이클릴" 등와 같은 잔기가 본원에서 "치환된" 것으로 지칭되거나, 도면상 치환된 것(또는 임의로 치환된 것, 예를 들어 치환기의 개수가 0 내지 양수인 경우)으로 도시한 경우, "알킬", "아릴", "헤테로사이클릴" 등의 용어는 "알킬렌", "아릴렌", "헤테로사이클릴렌" 등과 상호교환적인 것으로 이해되어야만 한다.
용어 "아실"은 -C(=O)-알킬, -C(=O)-카보사이클(치환되거나 비치환됨), -C(=O)- 헤테로사이클(치환되거나 비치환됨)을 지칭하되, 여기서 그의 알킬, 카보사이클, 또는 헤테로사이클 부분은 본원에서 정의한 바와 같다. "아실"의 비-제한적인 예로는 -C(=O)CH3, -C(=O)CH2CH3, -C(=O)CH(CH3)2, -C(=O)C(CH3)3, -C(=O)-페닐(치환되거나 비치환됨), -C(=O)-사이클로프로필(치환되거나 비치환됨), -C(=O)-사이클로부틸(치환되거나 비치환됨), -C(=O)-사이클로펜틸(치환되거나 비치환됨), -C(=O)-사이클로헥실(치환되거나 비치환됨), -C(=O)-피리딜(치환되거나 비치환됨) 등을 포함한다.
용어 "치환된", 예를들면, "치환된 알킬", "치환된 알킬렌", "치환된 아릴", "치환된 아릴알킬", "치환된 헤테로사이클릴" 및 "치환된 카보사이클릴(예를 들어, 치환된 사이클로알킬)"은 각각 하나 이상의 수소 원자가 각각 독립적으로 비(非)수소 치환기로 치환된 알킬, 알킬렌, 아릴, 아릴알킬, 헤테로사이클릴, 카보사이클릴(예를 들어, 사이클로알킬)을 의미한다. 전형적인 치환기는 -X, -R, -O-, =O, -OR, -SR, -S-, -NR2, -N+R3, =NR, -C(X)3, -CN, -OCN, -SCN, -N=C=O, -NCS, -NO, -NO2, =N-OH, =N2, -N3, -NHC(=O)R, -C(=O)R, -C(=O)NRR -S(=O)2O-, -S(=O)2OH, -S(=O)2R, -OS(=O)2OR, -S(=O)2NR, -S(=O)R, -OP(=O)(OR)2, -C(=O)R, 알킬렌-C(=O)R, -C(S)R, -C(=O)OR, 알킬렌-C(=O)OR, -C(=O)O-, 알킬렌-C(=O)O-, -C(=S)OR, -C(=O)SR, -C(=S)SR, -C(=O)NRR, 알킬렌-C(=O)NRR, -C(=S)NRR, -C(-NR)NRR(여기서, 각 X는 독립적으로 할로겐: F, Cl, Br, 또는 I이고, R은 독립적으로 H, 알킬, 아릴, 아릴알킬 또는 헤테로사이클)을 포함하지만, 이에 한정되지는 않는다. 알킬렌, 알케닐렌, 및 알키닐렌 기는 또한 유사하게 치환될 수도 있다.
"임의로 치환된"은 1개, 2개, 또는 그 이상의 치환기를 갖는 화학식 1의 화합물의 특정 부분(예를 들면, 임의로치환된 아릴 기)을 지칭한다.
“이탈기(leaving group)”은 다른 화학적 작용기로 제거되거나 또는 대체될 수 있는 화학적 모이어티(moiety)를 나타낸다. 본 발명의 명세서 전반에서, 용어 이탈기는 클릭 화학 작용기 (click chemistry functional group), NHS(N-Hydroxysuccinimide) 또는 말레이미드(maleimide)를 포함하지만, 이에 한정되지는 않는다.
용어 "타겟분자 (target molecule)" 또는 "관심분자 (molecule of interest)"는 페이로드를 이에 연결시키고자 하는 분자를 의미한다. 예시적으로 타겟분자는 생체활성 분자일 수 있으며, 예를 들어 단백질(또는 펩타이드), 글리칸, 핵산(또는 올리고 뉴클레오티드), 지질, 호르몬 또는 천연 약물(또는 그의 단편 또는 이들의 조합) 등일 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.
용어 "페이로드 (payload)"는 타겟분자에 연결시키고자 하는 분자를 의미한다. 예시적으로 페이로드는 화합물, 펩타이드, 폴리펩타이드, 단백질, 및/또는 약물 분자일 수 있으나 이에 한정되는 것은 아니다.
용어 "클릭 화학 작용기 (click chemistry functional group)"는 클릭 화학 반응 (click chemistry reaction)에 관여하는 작용기를 통칭한다. 클릭 화학의 종류 및 이에 관여하는 작용기는 통상적으로 잘 알려져 있다. 예컨데, 클릭 화학 반응은 [3+2] 고리화 첨가 반응 ([3+2] cycloadditions), 티올-엔 반응 (thiol-ene reaction), 디엘스-알더 반응 (Diels-Alder reaction), inverse electron demand Diels-Alder reaction, [4+1] 고리화 첨가 반응 ([4+1] cycloadditions) 등을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 보다 구체적으로, 클릭 화학 반응은 구리(I)-촉매 고리화 첨가 반응 (Copper(I)-catalyzed azide-alkyne cycloaddition; CuAAC), Strain-promoted azide-alkyne cycloaddition (SPAAC), Strain-promoted alkyne-nitrone cycloaddition (SPANC), 알켄과 아자이드의 [3+2] 고리화 첨가반응, 알켄과 테트라진의 inverse-demand Diels-Alder, 알켄과 테트라졸의 포토클릭 반응 (photoclick reaction), 및 아지드와 알킨의 Huisgen cycloaddition을 포함하나 이에 한정되는 것은 아니다. 클릭 화학 작용기는 알킨, 시클로알킨(alkyne), 사이클로옥틴(cyclooctyne) 및 사이클로노닌(cyclononyne) (예로, 바이사이클로[6.1.0]-논-4-인-9-일 메탄올(bicyclo[6.1.0]non-4-yn-9-ylmethanol) 과 같은 사이클로알킨(cycloalkyne)), 트랜스-사이클로옥텐(trans-cyclooctene), 니트론(nitrone), 니트릴 옥사이드(nitrile oxide), 아자이드(azide), 컨쥬게이티드 다이엔(Conjugated Diene), 친다이엔체(dienophile), 및 사이클로옥틴(cyclooctyne), 사이클로노닌(cyclononyne), dibenzocyclooctyne(DIBO), BARAC(biarylazacyclooctynone), ALO(aryl-less octyne), DIFO(difluorinated cyclooctyne), MOFO(monofluorinated), DIBAC(dibenzo-aza-cyclooctyne) 및 DIMAC(dimethoxyazacylooctyne) 등의 시클로알킨을 포함하나, 이에 제한되는 것은 아니다.
용어 "에스터 그룹 활성화 잔기 (ester group activating group)"는 에스터 그룹의 산소에 연결되어 상기 에스터 그룹을 활성 에스터로 만들 수 있는 잔기를 통칭한다. 예컨데,
Figure PCTKR2020001145-appb-I000010
의 구조를 갖는 에스터 기가 활성 에스터라면 Z는 에스터 그룹 활성화 잔기이다. 예시적으로, 에스터 그룹 활성화 잔기는 N-히드록시석시니미드 기 (N-Hydroxysuccinimide group; NHS), 파라-니트로페닐 기 (p-nitrophenyl group), 및 펜타플루오로페닐 기 (pentafluorophenyl group)를 포함하나 이에 한정되지 않는다. 본 발명의 에스터 그룹 활성화 잔기는 wo/2015/122478에서 언급된 내용을 포함하나, 이에 한정되지 않는다. 용어 "활성화 에스터 (active ester)"는 친핵성 치환반응에 민감한 상태에 있는 에스터를 의미한다.
본 명세서에서, 제1, 제2 등의 용어는 다양한 구성요소들을 설명하는데 사용되며, 상기 용어들은 하나의 구성요소를 다른 구성 요소로부터 구별하는 목적으로만 사용된다.
또한, 본 명세서에서 사용되는 용어는 단지 예시적인 실시예들을 설명하기 위해 사용된 것으로, 본 발명을 한정하려는 의도는 아니다. 단수의 표현은 문맥상 명백하게 다르게 뜻하지 않는 한, 복수의 표현을 포함한다.
본 명세서에서 “포함한다”, “구비하다” 또는 “가지다” 등의 용어는 실시된 특징, 숫자, 단계, 구성 요소 또는 이들을 조합한 것이 존재함을 지정하려는 것이지, 하나 또는 그 이상의 다른 특징들이나 숫자, 단계, 구성 요소, 또는 이들을 조합한 것들의 존재 또는 부가 가능성을 미리 배제하지 않는 것으로 이해되어야 한다.
본 명세서에서는 다양한 변경을 가할 수 있고 여러 가지 형태를 가질 수 있는 바, 특정 실시예들을 예시하고 하기에서 상세하게 설명하고자 한다. 그러나, 이는 본 발명을 특정한 개시 형태에 대해 한정하려는 것이 아니며, 본 발명의 사상 및 기술 범위에 포함되는 모든 변경, 균등물 내지 대체물을 포함하는 것으로 이해되어야 한다.
이하에서, 상세하게 설명한다.
본 출원은 원하는 타겟분자에 페이로드를 연결시킬 수 있도록 운반 및 결합 반응을 돕는, 링커(linker)를 제공할 수 있다.
상기 링커는 페이로드 및/또는 타겟분자와 반응할 수 있는 2 이상의 작용기(functional group)를 포함할 수 있다.
상기 반응은 두 개 이상의 동일하거나 상이한 분자 또는 분자 중 일부 작용기가 서로 연결되거나, 이탈반응, 즉, E1, E2, SN1, SN2 및 친핵성 치환반응 등이 일어나는 것을 의미한다. 상기 연결은 직접적 또는 간접적 공유결합 및/또는 비공유 결합을 모두 포함할 수 있다.
일 예에서, 상기 2 이상의 작용기 중 제 1작용기는 이탈기일 수 있다.
일 예에서, 상기 2 이상의 작용기 중 제 2작용기는 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group)일 수 있다.
상기 링커는 두 개 이상의 카보닐기의 친전자성 탄소 원자를 포함할 수 있다.
상기 카보닐기의 친전자성 탄소원자는 작용기(functional group)와 연결될 수 있다.
일 예로, 카보닐기의 친전자성 탄소원자와 작용기는 공유결합을 할 수 있다.
다른 예로, 카보닐기의 친전자성 탄소원자와 작용기 사이에는 하나 이상의 원자를 포함할 수 있다. 예를 들어, 카보닐기 친전자성 탄소원자와 작용기 사이에는 친핵체 원자가 포함될 수 있다. 이때, 친핵체 원자는 O(산소), N(질소) 또는 S(황)일 수 있다.
상기 링커는 두 개 이상의 부분 양전하(δ+)가 상이한 카보닐기의 친전자성 탄소 원자를 포함할 수 있다.
상기 2개 이상의 카보닐기의 친전자성 탄소원자 중에서 가장 큰 부분 양전하(δ+)를 가진 카보닐기는 제 1카보닐기 탄소원자일 수 있다.
상기 2개 이상의 카보닐기의 친전자성 탄소원자 중에서 두번째로 큰 부분 양전하(δ+)를 가진 카보닐기는 제 2카보닐기 탄소원자일 수 있다.
일 예로, 상기 제 1카보닐기의 친전자성 탄소원자는 제 1작용기와 연결될 수 있다. 이때, 제 1카보닐기의 친전자성 탄소원자와 제 1작용기 사이에는 친핵체 원자가 포함될 수 있다.
다른 예로, 상기 제 2카보닐기의 친전자성 탄소원자는 제 2작용기와 연결될 수 있다. 이때, 제 2카보닐기의 친전자성 탄소원자는 제 1작용기와 공유결합을 형성할 수 있다.
상기 링커는 타겟분자에 공유 결합시키고자 하는 페이로드가 결합되는 위치를 조절할 수 있다.
예를 들어, 상기 페이로드는 제 1카보닐기의 친전자성 탄소원자에 연결될 수 있다.
상기 링커는 길이 조절을 통해 수용성을 조절할 수 있다. 예를 들어, 수용성을 높일 수 있는 치환기를 포함한 알킬기의 수를 증가시킴으로써, 링커의 수용성을 증가시킬 수 있다.
이하 링커 구조에 대하여 상세하게 설명한다.
본 명세서에 개시된 일 양태에 의하면, 하기 화학식 1 및/또는 화학식 2로 표시되는 링커 화합물이 제공될 수 있다.
[화학식 1]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000011
[화학식 2]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000012
상기 화학식 1에서,
R'은 에스터 그룹 활성화 잔기 (ester group activating group)이다. 상기 에스터 그룹 활성화 잔기는 N-히드록시석시니미드 기 (N-Hydroxysuccinimide group; NHS), 파라-니트로페닐 기 (p-nitrophenyl group), 및 펜타플루오로페닐 기 (pentafluorophenyl group)를 포함하나 이에 한정되지 않는다. 나아가, R'은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000013
또는
Figure PCTKR2020001145-appb-I000014
중에 어느 하나일 수 있다.
R''은 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group) 중 어느 하나이며
상기 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group)은 알킨(alkyne), 사이클로옥틴(cyclooctyne) 및 사이클로노닌(cyclononyne) (예로, 바이사이클로[6.1.0]-논-4-인-9-일 메탄올(bicyclo[6.1.0]non-4-yn-9-ylmethanol) 과 같은 사이클로알킨(cycloalkyne), 트랜스-사이클로옥텐(trans-cyclooctene), 니트론(nitrone), 니트릴 옥사이드(nitrile oxide), 아자이드(azide), 컨쥬게이티드 다이엔(Conjugated Diene) 및 친다이엔체(dienophile) 중 어느 하나 이상일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group)이 사이클로알킨(cycloalkyne)인 경우, 사이클로알킨은 사이클로옥틴(cyclooctyne), 사이클로노닌(cyclononyne), dibenzocyclooctyne(DIBO), BARAC(biarylazacyclooctynone), ALO(aryl-less octyne), DIFO(difluorinated cyclooctyne), MOFO(monofluorinated), DIBAC(dibenzo-aza-cyclooctyne) 및 DIMAC(dimethoxyazacylooctyne) 중 어느 하나일 수 있다. 다만 이에 제한되지 않는다.
상기 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group)이 컨쥬게이티드 다이엔(Conjugated Diene)인 경우, 컨쥬게이티드 다이엔은 알켄(alkene) 및 사이클로 알켄(cycloalkane)일 수 있다. 일 예로, 컨쥬게이티드 다이엔은 테트라진(tetrazine)(예로, 1,2,3,4-tetrazine 및/또는 1,2,4,5-tetrazine)일 수 있다.
상기 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group)이 친다이엔체(dienophile)인 경우, 친다에엔체는 알켄(alkene) 및 사이클로 알켄(cycloalkane)일 수 있으며, 사이클로 알켄은 바이사이클릭 또는 접합된(fused) 사이클릭 구조를 포함한다. 일 예로, 상기 친다이엔체는 노르보레인(norbornene)일 수 있다.
R'''은 치환 또는 비치환된 C1-20 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C2-20 알케닐렌, 치환 또는 비치환된 C1-10 알키닐렌, 치환 또는 비치환된 C1-10 폴리메틸렌, 치환 또는 비치환된 C5-12 아릴, 치환 또는 비치환된 C5-14 아릴 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C8-16 아릴 알케닐렌, 치환 또는 비치환된 C3-10 사이클로알킬렌, 치환 또는 비치환된 C3-10 헤테로사이클로알킬렌, 또는 치환 또는 비치환된 C5-12 헤테로아릴이며, 상기 헤테로알킬렌, 헤테로사이클로알킬렌 또는 헤테로아릴은 N, O 또는 S가 적어도 하나 이상 포함되고,
상기 치환은 비수소 치환기로 치환된 것으로, 비수소 치환기는 -Ra, -O-, =O, -ORa, -SRa, -S-, -N(Ra)2, =NRa, -C(Rb)3, -N=C=O, -NCS, -NO, -NO2, =N-OH, =N2, -NV, -NHC(=O)Ra, -C(=O)Ra, -C(=O)NRaRa -S(=O)2O-, -S(=O)2OH, -S(=O)2Ra, -OS(=O)2ORa, -S(=O)2NRa, -S(=O)Ra, -C(=O)Ra, 알킬렌-C(=O)Ra, -C(=S)Ra, -C(=O)ORa, 알킬렌-C(=O)ORa, -C(=O)O-, 알킬렌-C(=O)O-, -C(=S)ORa, -C(=O)SRa, -C(=S)SRa, -C(=O)NRaRa, 알킬렌-C(=O)NRaRa, -C(=S)NRaRa, -C(-NRa)NRaRa 및 Rb로 이루어진 군으로부터 하나 이상 선택될 수 있고,
상기 Ra는 H, C1-6 알킬, C5-12 아릴, C7-12 아릴알킬 또는 헤테로사이클이고,
상기 Rb은 F, Cl, Br, 또는 I이고,
X는 O, N 및 S 중 어느 하나일 수 있다.
상기 화학식 2에서,
R'은 에스터 그룹 활성화 잔기 (ester group activating group)이다. 상기 에스터 그룹 활성화 잔기는 N-히드록시석시니미드 기 (N-Hydroxysuccinimide group; NHS), 파라-니트로페닐 기 (p-nitrophenyl group), 및 펜타플루오로페닐 기 (pentafluorophenyl group)를 포함하나 이에 한정되지 않는다. 나아가, R'은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000015
또는
Figure PCTKR2020001145-appb-I000016
중에 어느 하나일 수 있다.
R''은 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group) 중 어느 하나이며
상기 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group)은 알킨(alkyne), 사이클로옥틴(cyclooctyne) 및 사이클로노닌(cyclononyne) (예로, 바이사이클로[6.1.0]-논-4-인-9-일 메탄올(bicyclo[6.1.0]non-4-yn-9-ylmethanol)과 같은 사이클로알킨(cycloalkyne)), 트랜스-사이클로옥텐(trans-cyclooctene), 니트론(nitrone), 니트릴 옥사이드(nitrile oxide), 아자이드(azide), 컨쥬게이티드 다이엔(Conjugated Diene) 및 친다이엔체(dienophile) 중 어느 하나 이상일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
상기 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group)이 사이클로알킨(cycloalkyne)인 경우, 사이클로알킨은 사이클로옥틴(cyclooctyne), 사이클로노닌(cyclononyne), dibenzocyclooctyne(DIBO), BARAC(biarylazacyclooctynone), ALO(aryl-less octyne), DIFO(difluorinated cyclooctyne), MOFO(monofluorinated), DIBAC(dibenzo-aza-cyclooctyne) 및 DIMAC(dimethoxyazacylooctyne) 중 어느 하나일 수 있다. 다만 이에 제한되지 않는다.
상기 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group)이 컨쥬게이티드 다이엔(Conjugated Diene)인 경우, 컨쥬게이티드 다이엔은 알켄(alkene) 및 사이클로 알켄(cycloalkane)일 수 있다. 일 예로, 컨쥬게이티드 다이엔은 테트라진(tetrazine)(예로, 1,2,3,4-tetrazine 및/또는 1,2,4,5-tetrazine)일 수 있다.
상기 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group)이 친다이엔체(dienophile)인 경우, 친다에엔체는 알켄(alkene) 및 사이클로 알켄(cycloalkane)일 수 있으며, 사이클로 알켄은 바이사이클릭 또는 접합된(fused) 사이클릭 구조를 포함한다. 일 예로, 상기 친다이엔체는 TCO(Transcyclooctene), 노르보레인(norbornene)일 수 있다.
R'''은 치환 또는 비치환된 C1-20 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C2-20 알케닐렌, 치환 또는 비치환된 C1-10 알키닐렌, 치환 또는 비치환된 C1-10 폴리메틸렌, 치환 또는 비치환된 C5-12 아릴, 치환 또는 비치환된 C5-14 아릴 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C8-16 아릴 알케닐렌, 치환 또는 비치환된 C3-10 사이클로알킬렌, 치환 또는 비치환된 C3-10 헤테로사이클로알킬렌, 또는 치환 또는 비치환된 C5-12 헤테로아릴이며, 상기 헤테로알킬렌, 헤테로사이클로알킬렌 또는 헤테로아릴은 N, O 또는 S가 적어도 하나 이상 포함되고,
상기 치환은 비수소 치환기로 치환된 것으로, 비수소 치환기는 -Ra, -O-, =O, -ORa, -SRa, -S-, -N(Ra)2, =NRa, -C(Rb)3, -N=C=O, -NCS, -NO, -NO2, =N-OH, =N2, -N3, -NHC(=O)Ra, -C(=O)Ra, -C(=O)NRaRa -S(=O)2O-, -S(=O)2OH, -S(=O)2Ra, -OS(=O)2ORa, -S(=O)2NRa, -S(=O)Ra, -C(=O)Ra, 알킬렌-C(=O)Ra, -C(=S)Ra, -C(=O)ORa, 알킬렌-C(=O)ORa, -C(=O)O-, 알킬렌-C(=O)O-, -C(=S)ORa, -C(=O)SRa, -C(=S)SRa, -C(=O)NRaRa, 알킬렌-C(=O)NRaRa, -C(=S)NRaRa, -C(-NRa)NRaRa 및 Rb로 이루어진 군으로부터 하나 이상 선택될 수 있고,
상기 Ra는 H, C1-6 알킬, C5-12 아릴, C7-12 아릴알킬 또는 헤테로사이클이고,
상기 Rb은 F, Cl, Br, 또는 I이고,
X는 O, N 및 S 중 어느 하나일 수 있다.
본원의 화학식에서
Figure PCTKR2020001145-appb-I000017
은 핵 또는 골격 구조에 대한 잔기 또는 치환기의 부착 지점인 결합을 나타내기 위해 사용된다.
본 명세서에 개시된 일 실시예에 따르면, 상기 화학식1로 표시되는 화합물은 trans형 화합물일 수 있다.
상기 화학식 1로 표시되는 화합물에서,
R'은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000018
이며,
R''은 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group) 중 어느 하나이며
상기 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group)은 알킨(alkyne), 사이클로옥틴(cyclooctyne) 및 사이클로노닌(cyclononyne) (예로, 바이사이클로[6.1.0]-논-4-인-9-일 메탄올(bicyclo[6.1.0]non-4-yn-9-ylmethanol) 과 같은 사이클로알킨(cycloalkyne), 트랜스-사이클로옥텐(trans-cyclooctene), 니트론(nitrone), 니트릴 옥사이드(nitrile oxide), 아자이드(azide), 컨쥬게이티드 다이엔(Conjugated Diene) 및 알켄(alkene) 등의 친다이엔체(dienophile) 중 어느 하나 이상이며, 이때, 상기 사이클로 알킨, 컨쥬게이티드 다이엔 및 다이엔은 전술한 바와 같다.
R'''은 치환 또는 비치화된 C1-20알킬렌, 치환 또는 비치환된 C1-20 헤테로 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C1-20 할로알킬, 또는 C1-10폴리메틸렌이며, 상기 헤테로알킬렌은 N, O 또는 S가 적어도 하나 이상 포함되고,
상기 치환은 비수소 치환기로 치환된 것으로, 비수소 치환기는 -Ra, -O-, =O, -ORa, -SRa, -S-, -N(Ra)2, =NRa, -C(Rb)3, -N=C=O, -NCS, -NO, -NO2, =N-OH, =N2, -N3, -NHC(=O)Ra, -C(=O)Ra, -C(=O)NRaRa -S(=O)2O-, -S(=O)2OH, -S(=O)2Ra, -OS(=O)2ORa, -S(=O)2NRa, -S(=O)Ra, -C(=O)Ra, 알킬렌-C(=O)Ra, -C(=S)Ra, -C(=O)ORa, 알킬렌-C(=O)ORa, -C(=O)O-, 알킬렌-C(=O)O-, -C(=S)ORa, -C(=O)SRa, -C(=S)SRa, -C(=O)NRaRa, 알킬렌-C(=O)NRaRa, -C(=S)NRaRa, -C(-NRa)NRaRa 및 Rb로 이루어진 군으로부터 하나 이상 선택될 수 있고,
상기 Ra는 H, C1-6 알킬, C5-12 아릴, C7-12 아릴알킬 또는 헤테로사이클이고,
상기 Rb은 F, Cl, Br, 또는 I이고,
X는 O, N 및 S 중 어느 하나인 경우,
하기 화학식 1-1로 표시될 수 있다.
[화학식 1-1]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000019
구체적으로, 상기 R'''은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000020
,
Figure PCTKR2020001145-appb-I000021
및
Figure PCTKR2020001145-appb-I000022
중 하나이며,
상기 R1은 H 이고,
상기 R2는 H 또는 C(=O)이고,
상기 R3는 H 또는 C(=O)이며,
상기 R4는 H 또는 C(=O)이며,
상기 R5는 H 또는 C(=O)이며,
상기 R6은 H 또는 C(=O)이며,
상기 Y1은 C, N, O 및 S 중 어느 하나일 수 있고,
상기 n은 1 내지 20의 정수 중 어느 하나일 수 있지만, 이에 한정하는 것은 아니다.
이때, 상기 R5 및 R6은 동시에 C(=O)일 수 없으며,
상기 Y1이 N, O 및 S 중 어느 하나일 때는, R4, R5, R6은 C(=O)일 수 없다.
보다 구체적으로, 상기 R'''은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000023
이며,
상기 R4는 H 또는 C(=O)이며,
상기 R5는 H 또는 C(=O)이며,
상기 R6은 H 또는 C(=O)이며,
상기 Y1은 C, N, O 및 S 중 어느 하나일 수 있고,
상기 n은 1 내지 10의 정수 중 어느 하나일 수 있다.
일 실시 예에서, 상기 화학식 1-1로 표시되는 화합물에서,
R'은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000024
이며,
R''은 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group) 중 어느 하나이며
상기 R'''은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000025
이며,
n은 1이고,
상기 R4는 H 또는 C(=O)이며,
상기 R5는 H 또는 C(=O)이며,
상기 R6은 H 또는 C(=O)이며,
상기 Y1은 C이고,
상기 X는 N, O 및 S 중 어느 하나인 경우,
하기 화학식 1-1-1로 표시될 수 있다.
[화학식1-1-1]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000026
다른 실시예에서, 상기 화학식 1-1로 표시되는 화합물에서,
R'은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000027
이고,
R''은 노르보레인(norbornene)이며,
R'''은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000028
이고,
상기 R4는 H이며,
상기 R5는 H이며,
상기 R6은 H이며,
상기 n은 1이며,
상기 Y1은 C이고,
상기 X는 O인 경우,
하기 화학식 1-1-2로 표시될 수 있다.
[화학식 1-1-2]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000029
다른 실시예로, 상기 화학식 1에 의해 표시될 수 있는 화합물은 하기 표 1에 기재된 화합물일 수 있다.
화학식 1-1-3
Figure PCTKR2020001145-appb-I000030
화학식 1-1-4
Figure PCTKR2020001145-appb-I000031
화학식 1-1-5
Figure PCTKR2020001145-appb-I000032
화학식 1-1-6
Figure PCTKR2020001145-appb-I000033
화학식 1-1-7
Figure PCTKR2020001145-appb-I000034
화학식 1-1-8
Figure PCTKR2020001145-appb-I000035
화학식 1-1-9
Figure PCTKR2020001145-appb-I000036
화학식 1-1-10
Figure PCTKR2020001145-appb-I000037
화학식 1-1-11
Figure PCTKR2020001145-appb-I000038
화학식 1-1-12
Figure PCTKR2020001145-appb-I000039
화학식 1-1-13
Figure PCTKR2020001145-appb-I000040
상기 화학식1로 표시
되는 화합물에서,
R'은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000041
이며,
R''은 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group) 중 어느 하나이며
상기 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group)은 알킨(alkyne), 사이클로옥틴(cyclooctyne) 및 사이클로노닌(cyclononyne) (예로, 바이사이클로[6.1.0]-논-4-인-9-일 메탄올(bicyclo[6.1.0]non-4-yn-9-ylmethanol) 과 같은 사이클로알킨(cycloalkyne), 트랜스-사이클로옥텐(trans-cyclooctene), 니트론(nitrone), 니트릴 옥사이드(nitrile oxide), 아자이드(azide), 컨쥬게이티드 다이엔(Conjugated Diene) 및 알켄(alkene) 등의 친다이엔체(dienophile) 중 어느 하나 이상이며, 이때, 상기 사이클로 알킨, 컨쥬게이티드 다이엔 및 다이엔은 전술한 바와 같다.
R'''은 치환 또는 비치화된 C1-20알킬렌, 치환 또는 비치환된 C1-20 헤테로 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C1-20 할로알킬, 또는 C1-10폴리메틸렌이며, 상기 헤테로알킬렌은 N, O 또는 S가 적어도 하나 이상 포함되고,
상기 치환은 비수소 치환기로 치환된 것으로, 비수소 치환기는 -Ra, -O-, =O, -ORa, -SRa, -S-, -N(Ra)2, =NRa, -C(Rb)3, -N=C=O, -NCS, -NO, -NO2, =N-OH, =N2, -N3, -NHC(=O)Ra, -C(=O)Ra, -C(=O)NRaRa -S(=O)2O-, -S(=O)2OH, -S(=O)2Ra, -OS(=O)2ORa, -S(=O)2NRa, -S(=O)Ra, -C(=O)Ra, 알킬렌-C(=O)Ra, -C(=S)Ra, -C(=O)ORa, 알킬렌-C(=O)ORa, -C(=O)O-, 알킬렌-C(=O)O-, -C(=S)ORa, -C(=O)SRa, -C(=S)SRa, -C(=O)NRaRa, 알킬렌-C(=O)NRaRa, -C(=S)NRaRa, -C(-NRa)NRaRa 및 Rb로 이루어진 군으로부터 하나 이상 선택될 수 있고,
상기 Ra는 H, C1-6 알킬, C5-12 아릴, C7-12 아릴알킬 또는 헤테로사이클이고,
상기 Rb은 F, Cl, Br, 또는 I이고,
X는 O, N 및 S 중 어느 하나인 경우,
하기 화학식 1-2로 표시될 수 있다.
[화학식 1-2]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000042
구체적으로, 상기 R'''은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000043
,
Figure PCTKR2020001145-appb-I000044
및
Figure PCTKR2020001145-appb-I000045
중 하나이며,
상기 R1은 H 이고,
상기 R2는 H 또는 C(=O)이고,
상기 R3는 H 또는 C(=O)이며,
상기 R4는 H 또는 C(=O)이며,
상기 R5는 H 또는 C(=O)이며,
상기 R6은 H 또는 C(=O)이며,
상기 Y1은 C, N, O 및 S 중 어느 하나일 수 있고,
상기 n은 1 내지 20의 정수 중 어느 하나일 수 있지만, 이에 한정하는 것은 아니다.
이때, 상기 R5 및 R6은 동시에 C(=O)일 수 없으며,
상기 Y1이 N, O 및 S 중 어느 하나일 때는, R4, R5, R6은 C(=O)일 수 없다.
보다 구체적으로, 상기 R'''은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000046
이며,
상기 R4는 H 또는 C(=O)이며,
상기 R5는 H 또는 C(=O)이며,
상기 R6은 H 또는 C(=O)이며,
상기 Y1은 C, N, O 및 S 중 어느 하나일 수 있고,
상기 n은 1 내지 10의 정수 중 어느 하나일 수 있다.
일 실시예에서, 일 실시 예에서, 상기 화학식1-2로 표시되는 화합물에서,
상기 R'''은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000047
이며,
R''은 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group) 중 어느 하나이며
상기 n은 1이고,
상기 R4는 H 또는 C(=O)이며,
상기 R5는 H 또는 C(=O)이며,
상기 R6은 H 또는 C(=O)이며,
상기 Y1은 C이고,
상기 X는 N, O 및 S 중 어느 하나인 경우,
하기 화학식 1-2-1로 표시될 수 있다.
[화학식 1-2-1]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000048
다른 실시예에서, 상기 화학식1-2로 표시되는 화합물에서.
R'은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000049
이고,
R''은 노르보레인(norbornene)이며,
R'''은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000050
이고,
상기 R4는 H이며,
상기 R5는 H이며,
상기 R6은 H이며,
상기 n은 1이며,
상기 Y1은 C이고,
상기 X는 O인 경우,
하기 화학식 1-2-2로 표시될 수 있다.
[화학식 1-2-2]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000051
일 예로, 상기 화학식 1에 의해 표시될 수 있는 화합물은 하기 표2에 기재된 화합물일 수 있다.
화학식 1-2-3
Figure PCTKR2020001145-appb-I000052
화학식 1-2-4
Figure PCTKR2020001145-appb-I000053
화학식 1-2-5
Figure PCTKR2020001145-appb-I000054
화힉식 1-2-6
Figure PCTKR2020001145-appb-I000055
화학식 1-2-7
Figure PCTKR2020001145-appb-I000056
화학식 1-2-8
Figure PCTKR2020001145-appb-I000057
화학식 1-2-9
Figure PCTKR2020001145-appb-I000058
화학식 1-2-10
Figure PCTKR2020001145-appb-I000059
화학식 1-2-11
Figure PCTKR2020001145-appb-I000060
화학식 1-2-12
Figure PCTKR2020001145-appb-I000061
화학식 1-2-13
Figure PCTKR2020001145-appb-I000062
본 명세서에 개시된 일 실시예에 따르면, 상기 화학식2로 표시되는 화합물은 cis형 화합물일 수 있다.
상기 화학식 2로 표시되는 화합물에서,
R'은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000063
이며,
R''은 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group) 중 어느 하나이며
상기 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group)은 알킨(alkyne), 사이클로옥틴(cyclooctyne) 및 사이클로노닌(cyclononyne) (예로, 바이사이클로[6.1.0]-논-4-인-9-일 메탄올(bicyclo[6.1.0]non-4-yn-9-ylmethanol) 과 같은 사이클로알킨(cycloalkyne), 트랜스-사이클로옥텐(trans-cyclooctene), 니트론(nitrone), 니트릴 옥사이드(nitrile oxide), 아자이드(azide), 컨쥬게이티드 다이엔(Conjugated Diene) 및 알켄(alkene) 등의 친다이엔체(dienophile) 중 어느 하나 이상이며, 이때, 상기 사이클로 알킨, 컨쥬게이티드 다이엔 및 다이엔은 전술한 바와 같다.
R'''은 치환 또는 비치화된 C1-20알킬렌, 치환 또는 비치환된 C1-20 헤테로 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C1-20 할로알킬, 또는 C1-10폴리메틸렌이며, 상기 헤테로알킬렌은 N, O 또는 S가 적어도 하나 이상 포함되고,
상기 치환은 비수소 치환기로 치환된 것으로, 비수소 치환기는 -Ra, -O-, =O, -ORa, -SRa, -S-, -N(Ra)2, =NRa, -C(Rb)3, -N=C=O, -NCS, -NO, -NO2, =N-OH, =N2, -N3, -NHC(=O)Ra, -C(=O)Ra, -C(=O)NRaRa -S(=O)2O-, -S(=O)2OH, -S(=O)2Ra, -OS(=O)2ORa, -S(=O)2NRa, -S(=O)Ra, -C(=O)Ra, 알킬렌-C(=O)Ra, -C(=S)Ra, -C(=O)ORa, 알킬렌-C(=O)ORa, -C(=O)O-, 알킬렌-C(=O)O-, -C(=S)ORa, -C(=O)SRa, -C(=S)SRa, -C(=O)NRaRa, 알킬렌-C(=O)NRaRa, -C(=S)NRaRa, -C(-NRa)NRaRa 및 Rb로 이루어진 군으로부터 하나 이상 선택될 수 있고,
상기 Ra는 H, C1-6 알킬, C5-12 아릴, C7-12 아릴알킬 또는 헤테로사이클이고,
상기 Rb은 F, Cl, Br, 또는 I이고,
X는 O, N 및 S 중 어느 하나인 경우,
화학식 2-1로 표시될 수 있다.
[화학식 2-1]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000064
구체적으로, 상기 R'''은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000065
,
Figure PCTKR2020001145-appb-I000066
및
Figure PCTKR2020001145-appb-I000067
중 하나이며,
상기 R7은 H 이고,
상기 R8은 H 또는 C(=O)이고,
상기 R9는 H 또는 C(=O)이며,
상기 R10은 H 또는 C(=O)이며,
상기 R11은 H 또는 C(=O)이며,
상기 R12는 H 또는 C(=O)이며,
상기 Y2는 C, N, O 및 S 중 어느 하나일 수 있고,
상기 n은 1 내지 20의 정수 중 어느 하나일 수 있지만, 이에 한정하는 것은 아니다.
이때, 상기 R11 및 R12는 동시에 C(=O)일 수 없으며,
상기 Y2가 N, O 및 S 중 어느 하나일 때는, R10, R11, R12는 C(=O)일 수 없다.
보다 구체적으로, 상기 R'''은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000068
이며,
상기 R10은 H 또는 C(=O)이며,
상기 R11은 H 또는 C(=O)이며,
상기 R12는 H 또는 C(=O)이며,
상기 Y2는 C, N, O 및 S 중 어느 하나일 수 있고,
상기 n은 1 내지 10의 정수 중 어느 하나일 수 있다.
일 실시예에서, 상기 화학식 2-1로 표시되는 화합물에서,
R'은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000069
이며,
R''은 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group) 중 어느 하나이며
상기 R'''은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000070
이며,
n은 1이고,
상기 R10은 H 또는 C(=O)이며,
상기 R11은 H 또는 C(=O)이며,
상기 R12는 H 또는 C(=O)이며,
상기 Y2는 C이고,
상기 X는 N, O 및 S 중 어느 하나인 경우,
하기 화학식 2-1-1로 표시될 수 있다.
[화학식2-1-1]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000071
다른 실시예에서, 상기 화학식2-1로 표시되는 화합물에서,
상기 화합물은
R'은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000072
이고,
R''은 노르보레인(norbornene)이며,
R'''은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000073
이고,
n은 1이고,
상기 R10은 H이며,
상기 R11은 H이며,
상기 R12는 H이며,
상기 Y2는 C이고,
n은 1이며,
X는 O인 경우,
하기 화학식 2-1-2로 표시될 수 있다.
[화학식 2-1-2]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000074
일 예로, 상기 화학식 2에 의해 표시될 수 있는 화합물은 하기 표 3에 기재된 화합물일 수 있다.
화학식 2-1-3
Figure PCTKR2020001145-appb-I000075
화학식 2-1-4
Figure PCTKR2020001145-appb-I000076
화학식 2-1-5
Figure PCTKR2020001145-appb-I000077
화학식 2-1-6
Figure PCTKR2020001145-appb-I000078
화학식 2-1-7
Figure PCTKR2020001145-appb-I000079
화학식 2-1-8
Figure PCTKR2020001145-appb-I000080
화학식 2-1-9
Figure PCTKR2020001145-appb-I000081
화학식 2-1-10
Figure PCTKR2020001145-appb-I000082
화학식 2-1-11
Figure PCTKR2020001145-appb-I000083
화학식 2-1-12
Figure PCTKR2020001145-appb-I000084
화학식 2-1-13
Figure PCTKR2020001145-appb-I000085
상기 화학식2로 표시되는 화합물에서,
R'은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000086
이며,
R''은 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group) 중 어느 하나이며
상기 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group)은 알킨(alkyne), 사이클로옥틴(cyclooctyne) 및 사이클로노닌(cyclononyne) (예로, 바이사이클로[6.1.0]-논-4-인-9-일 메탄올(bicyclo[6.1.0]non-4-yn-9-ylmethanol) 과 같은 사이클로알킨(cycloalkyne), 트랜스-사이클로옥텐(trans-cyclooctene), 니트론(nitrone), 니트릴 옥사이드(nitrile oxide), 아자이드(azide), 컨쥬게이티드 다이엔(Conjugated Diene) 및 알켄(alkene) 등의 친다이엔체(dienophile) 중 어느 하나 이상이며, 이때, 상기 사이클로 알킨, 컨쥬게이티드 다이엔 및 다이엔은 전술한 바와 같다.
R'''은 치환 또는 비치화된 C1-20알킬렌, 치환 또는 비치환된 C1-20 헤테로 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C1-20 할로알킬 또는 C1-10폴리메틸렌이며, 상기 헤테로알킬렌은 N, O 또는 S가 적어도 하나 이상 포함되고,
상기 치환은 비수소 치환기로 치환된 것으로, 비수소 치환기는 -Ra, -O-, =O, -ORa, -SRa, -S-, -N(Ra)2, =NRa, -C(Rb)3, -N=C=O, -NCS, -NO, -NO2, =N-OH, =N2, -N3, -NHC(=O)Ra, -C(=O)Ra, -C(=O)NRaRa -S(=O)2O-, -S(=O)2OH, -S(=O)2Ra, -OS(=O)2ORa, -S(=O)2NRa, -S(=O)Ra, -C(=O)Ra, 알킬렌-C(=O)Ra, -C(=S)Ra, -C(=O)ORa, 알킬렌-C(=O)ORa, -C(=O)O-, 알킬렌-C(=O)O-, -C(=S)ORa, -C(=O)SRa, -C(=S)SRa, -C(=O)NRaRa, 알킬렌-C(=O)NRaRa, -C(=S)NRaRa, -C(-NRa)NRaRa 및 Rb로 이루어진 군으로부터 하나 이상 선택될 수 있고,
상기 Ra는 H, C1-6 알킬, C5-12 아릴, C7-12 아릴알킬 또는 헤테로사이클이고,
상기 Rb은 F, Cl, Br, 또는 I이고,
X는 O, N 및 S 중 어느 하나인 경우,
하기 화학식 2-2로 표시될 수 있다.
[화학식 2-2]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000087
구체적으로, 상기 R''' 은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000088
,
Figure PCTKR2020001145-appb-I000089
및
Figure PCTKR2020001145-appb-I000090
중 하나이며,
상기 R7은 H 이고,
상기 R8은 H 또는 C(=O)이고,
상기 R9는 H 또는 C(=O)이며,
상기 R10은 H 또는 C(=O)이며,
상기 R11은 H 또는 C(=O)이며,
상기 R12는 H 또는 C(=O)이며,
상기 Y2는 C, N, O 및 S 중 어느 하나일 수 있고,
상기 n은 1 내지 20의 정수 중 어느 하나일 수 있지만, 이에 한정하는 것은 아니다.
이때, 상기 R11 및 R12는 동시에 C(=O)일 수 없으며,
상기 Y2가 N, O 및 S 중 어느 하나일 때는, R10, R11, R12는 C(=O)일 수 없다.
보다 구체적으로, 상기 R'''은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000091
이며,
상기 R10은 H 또는 C(=O)이며,
상기 R11은 H 또는 C(=O)이며,
상기 R12는 H 또는 C(=O)이며,
상기 Y2는 C, N, O 및 S 중 어느 하나일 수 있고,
상기 n은 1 내지 10의 정수 중 어느 하나일 수 있다.
일 실시예에서, 상기 화학식 2-2로 표시되는 화합물에서,
R'은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000092
이며,
R''은 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group) 중 어느 하나이며,
상기 R'''은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000093
이며,
n은 1이고,
상기 R10은 H 또는 C(=O)이며,
상기 R11은 H 또는 C(=O)이며,
상기 R12는 H 또는 C(=O)이며,
상기 Y2는 C이고,
상기 X는 N, O 및 S 중 어느 하나인 경우,
하기 화학식 2-2-1로 표시될 수 있다.
[화학식 2-2-1]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000094
다른 실시예에서, 상기 화학식2-1로 표시되는 화합물에서,
상기 화합물은
R'은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000095
이고,
R''은 노르보레인(norbornene)이며,
R'''은
Figure PCTKR2020001145-appb-I000096
이고,
n은 1이고,
상기 R10은 H이며,
상기 R11은 H이며,
상기 R12는 H이며,
상기 Y2는 C이고,
X는 O인 경우,
하기 화학식 2-2-2로 표시될 수 있다.
[화학식2-2-2]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000097
일 예로, 상기 화학식 2에 의해 표시될 수 있는 화합물은 하기 표 4에 기재된 화합물일 수 있다.
화학식 2-2-3
Figure PCTKR2020001145-appb-I000098
화학식 2-2-4
Figure PCTKR2020001145-appb-I000099
화학식 2-2-5
Figure PCTKR2020001145-appb-I000100
화학식 2-2-6
Figure PCTKR2020001145-appb-I000101
화학식 2-2-7
Figure PCTKR2020001145-appb-I000102
화학식 2-2-8
Figure PCTKR2020001145-appb-I000103
화학식 2-2-9
Figure PCTKR2020001145-appb-I000104
화학식 2-2-10
Figure PCTKR2020001145-appb-I000105
화학식 2-2-11
Figure PCTKR2020001145-appb-I000106
화학식 2-2-12
Figure PCTKR2020001145-appb-I000107
화학식 2-2-13
Figure PCTKR2020001145-appb-I000108
이하에서는 타겟 분자가 항체일 때 상기 설명된 링커를 이용하여 항체-페이로드 콘쥬게이트를 준비하는 방법을 설명한다. 항체-페이로드 콘쥬게이트를 준비하는 방법은 (1) 링커를 Fc 결합성 펩타이드와 반응시켜 링커-Fc 결합성 펩타이드 콘쥬게이트를 제조함; (2) 링커-Fc 결합성 펩타이드와 항체를 반응시켜 상기 항체에 제1 클릭 화학 작용기를 포함시킴; 및 (3) 제1 클릭 화학 작용기를 포함하는 항체에 제1 클릭 화학 작용기와 상보적인 제2 클릭 화학 작용기를 포함하는 페이로드를 반응시켜 항체-페이로드 콘쥬게이트를 제조함을 포함한다. 이하 각 과정을 분설한다.
항체-페이로드 콘쥬게이트를 준비하는 방법은 (1) 링커를 Fc 결합성 펩타이드와 반응시켜 링커-Fc 결합성 펩타이드 콘쥬게이트 (linker-Fc binding peptide conjugate)를 제조함을 포함할 수 있다.
Fc 결합성 펩타이드 (Fc binding peptide)는 항체의 Fc 도메인에 대한 결합성을 갖는 펩타이드를 통칭한다. Fc 결합성 펩타이드의 대표적인 예시로는 FcRn 도메인에 대한 결합성을 갖는 것으로 알려진 DeLano 등이 발견한 13-mer의 펩타이드가 잘 알려져 있다. 본 발명의 발명자는 상기 13-mer의 펩타이드의 특정 잔기를 치환한 서열번호 1 내지 5의 Fc 결합성 펩타이드를 발명함으로써 링커와 반응할 수 있도록 하였다. 이하 구조에서 보듯, 서열번호 1 내지 5의 Fc 결합성 펩타이드는 6번 잔기에서 자유 아민기를 포함하는 잔기로서, 자유 아민기를 통하여 링커와 반응할 수 있다.
서열번호 1에 의한 Fc 결합성 펩타이드는 화학식 13로 표시되는 펩타이드로서:
[화학식 13]
D-C-A-W-H-Xa-G-E-L-V-W-C-T (서열번호 1)
이때, D는 아스파르트산이고, C는 시스테인이며, A는 알라닌이고, W는 트립토판이며, H는 히스티딘이고, Xa는
Figure PCTKR2020001145-appb-I000109
이며, G는 글리신이고, E는 글루탐산이며, L은 류신이고, V는 발린이며, T는 트레오닌이다. 이때, m은 1 이상 4 이하의 정수이고, N 말단의 시스테인과 C 말단의 시스테인은 선택적으로 서로 연결되어 있을 수 있다. m=1인 경우 Xa는 2,3-디아미노프로피온산 (2,3-Diaminopropionic Acid; Dap)이고 (서열번호 3), m=2인 경우 Xa는 2,4-디아미노뷰티릭산 (2,4-diaminobutyric acid; Dab)이며 (서열번호 4), m=3인 경우 Xa는 오르티닌 (orthinie)이고 (서열번호 5), m=4인 경우 Xa는 라이신 (lysine)이다 (서열번호 2).
서열번호 2에 의한 Fc 결합성 펩타이드는 화학식 14로 표시되는 펩타이드로서:
[화학식 14]
D-C-A-W-H-K-G-E-L-V-W-C-T (서열번호 2)
이때, D는 아스파르트산이고, C는 시스테인이며, A는 알라닌이고, W는 트립토판이며, H는 히스티딘이고, K는 라이신이며, G는 글리신이고, E는 글루탐산이며, L은 류신이고, V는 발린이며, T는 트레오닌이고, N 말단의 시스테인과 C 말단의 시스테인은 선택적으로 서로 연결되어 있을 수 있다.
상기 링커는 이상의 화학식 1 또는 화학식 2에 의한 화합물 및 이의 구체예들을 포함한다.
링커와 Fc 결합성 펩타이드의 결합은 친핵성 치환 반응에 의한 것일 수 있다. 이때, 친핵성 치환 반응은 Fc 결합성 펩타이드에 존재하는 친핵성 원자 (nucleophilic atom)가 링커의 양전하를 띄거나 부분적으로 양전하를 띄는 원자를 공격함으로서 발생할 수 있다. 이때, 상기 친핵성 원자는 라이신의 질소 원자일 수 있다. 또한, 상기 양전하를 띄거나 부분적으로 양전하를 띄는 원자는 카르보닐기의 친전자성 탄소일 수 있다.
이하에서는 예시적으로 본 명세서에 의해 개시되는 화학식 1 및/또는 2로 표시되는 화합물, 즉 링커가 Fc 결합성 펩타이드와 결합하여 링커-Fc 결합성 펩타이드 콘쥬게이트를 형성하는 것을 보여준다.
예시적으로 상기 링커-Fc 결합성 펩타이드 콘쥬게이트는 화학식 3의 구조를 가질 수 있다.
[화학식 3]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000110
상기 화학식 3에서,
R''은 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group) 중 어느 하나이며
상기 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group)은 알킨(alkyne), 사이클로옥틴(cyclooctyne) 및 사이클로노닌(cyclononyne) (예로, 바이사이클로[6.1.0]-논-4-인-9-일 메탄올(bicyclo[6.1.0]non-4-yn-9-ylmethanol) 과 같은 사이클로알킨(cycloalkyne), 트랜스-사이클로옥텐(trans-cyclooctene), 니트론(nitrone), 니트릴 옥사이드(nitrile oxide), 아자이드(azide), 컨쥬게이티드 다이엔(Conjugated Diene) 및 친다이엔체(dienophile) 중 어느 하나 이상이며, 이때, 상기 사이클로 알킨, 컨쥬게이티드 다이엔 및 다이엔은 전술한 바와 같다.
R'''은 치환 또는 비치환된 C1-20 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C2-20 알케닐렌, 치환 또는 비치환된 C1-10 알키닐렌, 치환 또는 비치환된 C1-10 폴리메틸렌, 치환 또는 비치환된 C5-12 아릴, 치환 또는 비치환된 C5-14 아릴 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C8-16 아릴 알케닐렌, 치환 또는 비치환된 C3-10 사이클로알킬렌, 치환 또는 비치환된 C3-10 헤테로사이클로알킬렌, 또는 치환 또는 비치환된 C5-12 헤테로아릴이며, 상기 헤테로알킬렌, 헤테로사이클로알킬렌 또는 헤테로아릴은 N, O 또는 S가 적어도 하나 이상 포함되고,
상기 치환은 비수소 치환기로 치환된 것으로, 비수소 치환기는 -Ra, -O-, =O, -ORa, -SRa, -S-, -N(Ra)2, =NRa, -C(Rb)3, -N=C=O, -NCS, -NO, -NO2, =N-OH, =N2, -N3, -NHC(=O)Ra, -C(=O)Ra, -C(=O)NRaRa -S(=O)2O-, -S(=O)2OH, -S(=O)2Ra, -OS(=O)2ORa, -S(=O)2NRa, -S(=O)Ra, -C(=O)Ra, 알킬렌-C(=O)Ra, -C(=S)Ra, -C(=O)ORa, 알킬렌-C(=O)ORa, -C(=O)O-, 알킬렌-C(=O)O-, -C(=S)ORa, -C(=O)SRa, -C(=S)SRa, -C(=O)NRaRa, 알킬렌-C(=O)NRaRa, a-C(=S)NRaRa, -C(-NRa)NRaRa 및 Rb로 이루어진 군으로부터 하나 이상 선택될 수 있고,
상기 Ra는 H, C1-6 알킬, C5-12 아릴, C7-12 아릴알킬 또는 헤테로사이클이고,
상기 Rb은 F, Cl, Br, 또는 I이고,
X는 O, N 및 S 중 어느 하나일 수 있다.
Y3은 O, N 및 S 중 어느 하나일 수 있다.
Fp는 Fc 결합성 펩타이드이다. 나아가, Fp는 화학식 13 또는 14 중 선택된 어느 하나의 펩타이드일 수 있다. 화학식 13 및 14에 관한 것은 이미 설명된 바와 같다.
Fp는 6번 아미노산 잔기에서 Y3를 통해 연결될 수 있다. 이때, 상기 6번 아미노산 잔기는 라이신 (lysine), 오르티닌 (ornithine), 2,3-디아미노프로피온산, 또는 2,4-디아미노뷰티릭산 일 수 있다.
상기 화학식 3으로 표시되는 화합물은 일례로 반응식 1에 의해 제조될 수 있다.
[반응식 1]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000111
상기 반응식 1은, 상기 화학식 1로 표시되는 화합물을 1 내지 50개의 아미노산으로 이루어진 Fc 결합성 펩타이드와 반응시켜 화학식 3으로 표시되는 화합물을 제조하는 반응이다.
상기 Fc 결합성 펩타이드와 화학식1의 결합반응은 치환반응에 의해 수행될 수 있다.
상기 치환반응은 친핵성 아실 치환반응일 수 있다.
상기 치환반응은 화학식 1의 화합물과 Fc 결합성 펩타이드의 아민기(-NH2), 티올기(-SH) 및 하이드록시기(-OH)중 어느 하나의 반응에 의해 수행될 수 있다.
일 예로, 상기 화학식 1의 화합물과 Fc 결합성 펩타이드의 아민기(-NH2)와 반응할 경우, 상기 Y3는 N(H)일 수 있다. 서열번호 1 내지 5의 펩타이드는 6번 잔기에 2,3-디아미노프로피온산, 2,4-디아미노뷰리틱산, 오르티닌, 또는 라이신이 포함된 것으로서, 해당 잔기들은 모두 자유 아민기를 포함하고 있어 치환반응을 수행할 수 있다.
다른 예로, 상기 화학식 1의 화합물과 Fc 결합성 펩타이드의 티올기(-SH)와 반응할 경우, 상기 Y3는 S일 수 있다.
일 예로, 상기 화학식 1의 화합물과 Fc 결합성 펩타이드의 하이드록시기(-OH)중 어느 하나와 반응할 경우, 상기 Y3는 O일 수 있다.
예시적으로 상기 링커-Fc 결합성 펩타이드 콘쥬게이트는 화학식 4의 구조를 가질 수 있다.
[화학식 4]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000112
상기 화학식 4에서,
R''은 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group) 중 어느 하나이며
상기 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group)은 알킨(alkyne), 사이클로옥틴(cyclooctyne) 및 사이클로노닌(cyclononyne) (예로, 바이사이클로[6.1.0]-논-4-인-9-일 메탄올(bicyclo[6.1.0]non-4-yn-9-ylmethanol) 과 같은 사이클로알킨(cycloalkyne), 트랜스-사이클로옥텐(trans-cyclooctene), 니트론(nitrone), 니트릴 옥사이드(nitrile oxide), 아자이드(azide), 컨쥬게이티드 다이엔(Conjugated Diene) 및 친다이엔체(dienophile) 중 어느 하나 이상이며, 이때, 상기 사이클로 알킨, 컨쥬게이티드 다이엔 및 다이엔은 전술한 바와 같다.
R'''은 치환 또는 비치환된 C1-20 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C2-20 알케닐렌, 치환 또는 비치환된 C1-10 알키닐렌, 치환 또는 비치환된 C1-10 폴리메틸렌, 치환 또는 비치환된 C5-12 아릴, 치환 또는 비치환된 C5-14 아릴 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C8-16 아릴 알케닐렌, 치환 또는 비치환된 C3-10 사이클로알킬렌, 치환 또는 비치환된 C3-10 헤테로사이클로알킬렌, 또는 치환 또는 비치환된 C5-12 헤테로아릴이며, 상기 헤테로알킬렌, 헤테로사이클로알킬렌 또는 헤테로아릴은 N, O 또는 S가 적어도 하나 이상 포함되고,
상기 치환은 비수소 치환기로 치환된 것으로, 비수소 치환기는 -Ra, -O-, =O, -ORa, -SRa, -S-, -N(Ra)2, =NRa, -C(Rb)3, -N=C=O, -NCS, -NO, -NO2, =N-OH, =N2, -N3, -NHC(=O)Ra, -C(=O)Ra, -C(=O)NRaRa -S(=O)2O-, -S(=O)2OH, -S(=O)2Ra, -OS(=O)2ORa, -S(=O)2NRa, -S(=O)Ra, -C(=O)Ra, 알킬렌-C(=O)Ra, -C(=S)Ra, -C(=O)ORa, 알킬렌-C(=O)ORa, -C(=O)O-, 알킬렌-C(=O)O-, -C(=S)ORa, -C(=O)SRa, -C(=S)SRa, -C(=O)NRaRa, 알킬렌-C(=O)NRaRa, -C(=S)NRaRa, -C(-NRa)NRaRa 및 Rb로 이루어진 군으로부터 하나 이상 선택될 수 있고,
상기 Ra는 H, C1-6 알킬, C5-12 아릴, C7-12 아릴알킬 또는 헤테로사이클이고,
상기 Rb은 F, Cl, Br, 또는 I이고,
X는 O, N 및 S 중 어느 하나일 수 있다.
Y4는 O, N 및 S 중 어느 하나일 수 있다.
Fp는 Fc 결합성 펩타이드이다. 나아가, Fp는 화학식 13 또는 14 중 선택된 어느 하나의 펩타이드일 수 있다. 화학식 13 및 14에 관한 것은 이미 설명된 바와 같다.
Fp는 6번 아미노산 잔기에서 Y4를 통해 연결될 수 있다. 이때, 상기 6번 아미노산 잔기는 라이신 (lysine), 오르티닌 (ornithine), 2,3-디아미노프로피온산, 또는 2,4-디아미노뷰티릭산 일 수 있다.
상기 화학식 4로 표시되는 화합물은 일례로 반응식 2에 의해 제조될 수 있다.
[반응식 2]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000113
상기 반응식 2는, 상기 화학식 2로 표시되는 화합물을 1 내지 50개의 아미노산으로 이루어진 Fc 결합성 펩타이드와 반응시켜 화학식 4로 표시되는 화합물을 제조하는 반응이다.
상기 Fc 결합성 펩타이드는 화학식2와 치환반응에 의해 수행될 수 있다.
상기 치환반응은 친핵성 아실 치환반응일 수 있다.
상기 치환반응은 화학식 2의 화합물과 Fc 결합성 펩타이드의 아민기(-NH2) 티올기(-SH) 및 하이드록시기(-OH)중 어느 하나의 반응에 의해 수행될 수 있다.
일 예로, 상기 화학식 2의 화합물과 Fc 결합성 펩타이드의 아민기(-NH2)와 반응할 경우, 상기 Y4는 N일 수 있다. 서열번호 1 내지 5의 펩타이드는 6번 잔기에 2,3-디아미노프로피온산, 2,4-디아미노뷰리틱산, 오르티닌, 또는 라이신이 포함된 것으로서, 해당 잔기들은 모두 자유 아민기를 포함하고 있어 치환반응을 수행할 수 있다.
다른 예로, 상기 화학식 2의 화합물과 Fc 결합성 펩타이드의 티올기(-SH)와 반응할 경우, 상기 Y4는 S일 수 있다.
일 예로, 상기 화학식 2의 화합물과 Fc 결합성 펩타이드의 하이드록시기(-OH)중 어느 하나와 반응할 경우, 상기 Y4는 O일 수 있다.
상기 반응식 1 및 반응식 2에서, Fc 결합성 펩타이드의 아민기(-NH2) 티올기(-SH) 및 하이드록시기(-OH) 잔기는 제 1 카보닐기의 탄소원자와 반응하여, 화학식 3 및/또는 화학식 4로 표시되는 화합물이 제조될 수 있다.
이때, 상기 R'과 가장 근접하게 연결된 카보닐기의 탄소, 즉 제 1 카보닐기의 친전자성 탄소 원자는 가장 큰 부분 양전하(δ+)를 가지고 있을 수 있다.
항체-페이로드 콘쥬게이트를 준비하는 방법은 (2) 링커-Fc 결합성 펩타이드와 항체를 반응시켜 상기 항체에 제1 클릭 화학 작용기를 포함시킴을 포함할 수 있다.
또한 이때 Fc 결합성 펩타이드가 Fc 도메인의 특정 부위와 친화성을 갖는 경우 링커-Fc 결합성 펩타이드 콘쥬게이트가 항체의 특정 위치에 반응하도록 유도할 수 있다. 본 발명의 발명자는 항체의 FcRn 도메인에 대해 친화성을 갖는 서열번호 1 내지 5의 Fc 결합 펩타이드를 사용함으로써, 항체의 특정한 위치, 특히 Fc의 246번 라이신 (Fc-Lys246) 또는 248번 라이신 (Fc-Lys248) 위치에 제1 클릭 화학 작용기를 전달할 수 있는 기술을 개발하였다.
링커-Fc 결합성 펩타이드 콘쥬게이트와 항체의 반응은 친핵성 치환 반응일 수 있다. 이때, 친핵성 치환 반응은 항체에 존재하는 친핵성 원자 (nucleophilic atom)가 링커-Fc 결합성 펩타이드 콘쥬게이트의 양전하를 띄거나 부분적으로 양전하를 띄는 원자를 공격함으로서 발생할 수 있다. 이때, 상기 친핵성 원자는 라이신의 질소 원자일 수 있다. 또한, 상기 양전하를 띄거나 부분적으로 양전하를 띄는 원자는 링커 구조에 포함된 카르보닐기의 친전자성 탄소일 수 있다.
일 예시에서, 제1 클릭 화학작용기를 포함하는 항체는 화학식 5으로 표시될 수 있다.
[화학식 5]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000114
상기 화학식 5에서,
Ab는 항체이다. 나아가, Ab는 트라스투주맙 (Trastuzumab)일 수 있다.
R''은 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group) 중 어느 하나이며
상기 클릭 화학 작용기(click chemistry functional group)은 알킨(alkyne), 사이클로옥틴(cyclooctyne) 및 사이클로노닌(cyclononyne) (예로, 바이사이클로[6.1.0]-논-4-인-9-일 메탄올(bicyclo[6.1.0]non-4-yn-9-ylmethanol) 과 같은 사이클로알킨(cycloalkyne), 트랜스-사이클로옥텐(trans-cyclooctene), 니트론(nitrone), 니트릴 옥사이드(nitrile oxide), 아자이드(azide), 컨쥬게이티드 다이엔(Conjugated Diene) 및 친다이엔체(dienophile) 중 어느 하나 이상이며, 이때, 상기 사이클로 알킨, 컨쥬게이티드 다이엔 및 다이엔은 전술한 바와 같다.
또한, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 Fc의 246번 라이신 또는 248번 라이신 잔기에 포함된 것일 수 있다. 나아가, Ab와 연결된 질소 원자는 항체의 Fc의 246번 라이신 잔기에 포함된 것일 수 있다. 또는 나아가, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 Fc의 248번 라이신 잔기에 포함된 것일 수 있다.
n은 1 이상 4 이하의 정수이다. 예시적으로, n=2일 수 있다. 이 경우 R''이 1 개 항체 내의 2 개의 Fc에 각각 포함된 246번 라이신 또는 248번 라이신에 연결되어 이러한 구조가 생성될 수 있다. 다른 예시에서, n=4일 수 있다. 이 경우 1 개 항체 내의 2 개의 Fc에 각각 포함된 246번 라이신 및 248번 라이신에 연결되어 이러한 구조가 생성될 수 있다.
n=2이고, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 양 Fc의 246번 라이신에 포함된 것일 수 있다. 또는, n=2이고, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 양 Fc의 248번 라이신에 포함된 것일 수 있다.
화학식 5의 항체는 하기 반응식 3으로 표시되는 반응에 의하여 제조될 수 있다.
[반응식 3]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000115
이때, 화학식 3과 화학식 5에 대한 것은 이미 설명된 바와 같다.
이때 서열번호 1 내지 5의 펩타이드는 6번 잔기에 각각 2,3-디아미노프로피온산, 2,4-디아미노뷰티릭산라이신, 오르티닌, 또는 라이신이 포함된 것으로서, 해당 잔기들은 모두 자유 아민기를 포함하는 탄소 뼈대의 길이에 차이가 있을 뿐 유사한 구조를 가지고 있다. 이로 인해 서열번호 1 내지 5의 펩타이드는 모두 항체의 Fc 도메인에 대한 결합성을 보인다.
다른 예시에서, 제1 클릭 화학작용기를 포함하는 항체는 화학식 6으로 표시될 수 있다.
[화학식 6]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000116
상기 화학식 6에서,
Ab는 항체이다. 나아가, Ab는 트라스투주맙 (Trastuzumab)일 수 있다.
R'''은 치환 또는 비치환된 C1-20 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C2-20 알케닐렌, 치환 또는 비치환된 C1-10 알키닐렌, 치환 또는 비치환된 C1-10 폴리메틸렌, 치환 또는 비치환된 C5-12 아릴, 치환 또는 비치환된 C5-14 아릴 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C8-16 아릴 알케닐렌, 치환 또는 비치환된 C3-10 사이클로알킬렌, 치환 또는 비치환된 C3-10 헤테로사이클로알킬렌, 또는 치환 또는 비치환된 C5-12 헤테로아릴이며, 상기 헤테로알킬렌, 헤테로사이클로알킬렌 또는 헤테로아릴은 N, O 또는 S가 적어도 하나 이상 포함되고,
상기 치환은 비수소 치환기로 치환된 것으로, 비수소 치환기는 -Ra, -O-, =O, -ORa, -SRa, -S-, -N(Ra)2, =NRa, -C(Rb)3, -N=C=O, -NCS, -NO, -NO2, =N-OH, =N2, -N3, -NHC(=O)Ra, -C(=O)Ra, -C(=O)NRaRa -S(=O)2O-, -S(=O)2OH, -S(=O)2Ra, -OS(=O)2ORa, -S(=O)2NRa, -S(=O)Ra, -C(=O)Ra, 알킬렌-C(=O)Ra, -C(=S)Ra, -C(=O)ORa, 알킬렌-C(=O)ORa, -C(=O)O-, 알킬렌-C(=O)O-, -C(=S)ORa, -C(=O)SRa, -C(=S)SRa, -C(=O)NRaRa, 알킬렌-C(=O)NRaRa, -C(=S)NRaRa, -C(-NRa)NRaRa 및 Rb로 이루어진 군으로부터 하나 이상 선택될 수 있다.
또한, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 Fc의 246번 라이신 또는 248번 라이신 잔기에 포함된 것일 수 있다. 나아가, Ab와 연결된 질소 원자는 항체의 Fc의 246번 라이신 잔기에 포함된 것일 수 있다. 또는 나아가, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 Fc의 248번 라이신 잔기에 포함된 것일 수 있다.
또한, 이때 Fc 결합성 펩타이드는 제1 클릭 화학작용기를 포함할 수 있다. 상기 제1 클릭 화학 작용기는 알킨(alkyne), 사이클로옥틴(cyclooctyne) 및 사이클로노닌(cyclononyne) (예로, 바이사이클로[6.1.0]-논-4-인-9-일 메탄올(bicyclo[6.1.0]non-4-yn-9-ylmethanol) 과 같은 사이클로알킨(cycloalkyne), 트랜스-사이클로옥텐(trans-cyclooctene), 니트론(nitrone), 니트릴 옥사이드(nitrile oxide), 아자이드(azide), 컨쥬게이티드 다이엔(Conjugated Diene) 및 친다이엔체(dienophile) 중 어느 하나 이상이며, 이때, 상기 사이클로 알킨, 컨쥬게이티드 다이엔 및 다이엔은 전술한 바와 같다. 나아가, Fc 결합성 펩타이드는 그 서열의 N 말단에 인접한 아미노산 잔기에서 제1 클릭 화학작용기를 포함할 수 있다. 더 나아가, Fc 결합성 펩타이드는 그 서열의 N 말단에서 제1 클릭 화학작용기를 포함할 수 있다. 또는 나아가, Fc 결합성 펩타이드는 그 서열의 C 말단에 인접한 아미노산 잔기에서 제1 클릭 화학작용기를 포함할 수 있다. 더 나아가, Fc 결합성 펩타이드는 그 서열의 C 말단에서 제1 클릭 화학작용기를 포함할 수 있다.
Fp는 Fc 결합성 펩타이드이다. 나아가, Fp는 화학식 13 또는 14 중 선택된 어느 하나의 펩타이드일 수 있다. 화학식 13 및 14에 관한 것은 이미 설명된 바와 같다.
Fp는 6번 아미노산 잔기에서 Y3를 통해 연결될 수 있다. 이때, 상기 6번 아미노산 잔기는 라이신 (lysine), 오르티닌 (ornithine), 2,3-디아미노프로피온산, 또는 2,4-디아미노뷰티릭산 일 수 있다.
n은 1 이상 4 이하의 정수이다. 예시적으로, n=2일 수 있다. 이 경우 Fp가 1 개 항체 내의 2 개의 Fc에 각각 포함된 246번 라이신 또는 248번 라이신에 연결되어 이러한 구조가 생성될 수 있다. 다른 예시에서, n=4일 수 있다. 이 경우 1 개 항체 내의 2 개의 Fc에 각각 포함된 246번 라이신 및 248번 라이신에 연결되어 이러한 구조가 생성될 수 있다.
n=2이고, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 양 Fc의 246번 라이신에 포함된 것일 수 있다. 또는, n=2이고, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 양 Fc의 248번 라이신에 포함된 것일 수 있다.
화학식 6의 항체는 하기 반응식 4로 표시되는 반응에 의하여 제조될 수 있다.
[반응식 4]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000117
이때, 화학식 4과 화학식 6에 대한 것은 이미 설명된 바와 같다.
이때 서열번호 1 내지 5의 펩타이드는 6번 잔기에 각각 2,3-디아미노프로피온산, 2,4-디아미노뷰티릭산라이신, 오르티닌, 또는 라이신이 포함된 것으로서, 해당 잔기들은 모두 자유 아민기를 포함하는 탄소 뼈대의 길이에 차이가 있을 뿐 유사한 구조를 가지고 있다. 이로 인해 서열번호 1 내지 5의 펩타이드는 모두 항체의 Fc 도메인에 대한 결합성을 보인다.
항체-페이로드 콘쥬게이트를 준비하는 방법은 (3) 제1 클릭 화학 작용기를 포함하는 항체에 제1 클릭 화학 작용기와 상보적인 제2 클릭 화학 작용기를 포함하는 페이로드를 반응시켜 항체-페이로드 콘쥬게이트를 제조함을 포함할 수 있다.
상기 페이로드는 활성 모이어티 (active moiety)를 포함할 수 있다. 상기 활성 모이어티는 핵산, 펩타이드 및 화합물 중 선택된 하나 이상일 수 있다. 상기 활성 모이어티는 약물 분자, 이미징 모이어티, 광학 작용제, 비타민 및 독소로부터 선택된 어느 하나일 수 있다. 나아가, 상기 활성 모이어티는 약물 분자일 수 있다. 상기 약물 분자는 프로드러그(Prodrug), 약물전구체(prousor drug) 또는 약물(drug)일 수 있다. 상기 약물 분자는 항암제, 항염증제, 기타 항질환제, 항미생물제(항생제, 항진균제, 항바이러스제)일 수 있다. 더 나아가, 상기 약물 분자는 메르탄신 (mertansine; DM1)일 수 있다. 또는 나아가, 상기 페이로드는 2개 이상의 약물 분자를 포함할 수 있다. 또는, 상기 활성 모이어티는 이미징 모이어티(imaging moiety)일 수 있다. 상기 이미징 모이어티(imaging moiety)는 조영제, 방사성 동위원자, 형광물질일 수 있다. 또는 상기 활성 모이어티는 이외에도 광학 작용제, 비타민, 독소 등일 수 있으나 이에 제한되는 것은 아니다.
또한, 상기 페이로드는 제2 클릭 화학 작용기를 포함한다. 이때, 상기 제2 클릭 화학 작용기는 알킨(alkyne), 사이클로옥틴(cyclooctyne) 및 사이클로노닌(cyclononyne) (예로, 바이사이클로[6.1.0]-논-4-인-9-일 메탄올(bicyclo[6.1.0]non-4-yn-9-ylmethanol) 과 같은 사이클로알킨(cycloalkyne), 트랜스-사이클로옥텐(trans-cyclooctene), 니트론(nitrone), 니트릴 옥사이드(nitrile oxide), 아자이드(azide), 컨쥬게이티드 다이엔(Conjugated Diene) 및 친다이엔체(dienophile) 중 어느 하나 이상이며, 이때, 상기 사이클로 알킨, 컨쥬게이티드 다이엔 및 다이엔은 전술한 바와 같다.
일 예시에서, 항체-페이로드 콘쥬게이트는 화학식 7로 표시될 수 있다.
[화학식 7]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000118
상기 화학식 7에서,
Ab는 항체이다. 나아가, Ab는 트라스투주맙 (Trastuzumab)일 수 있다.
Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 Fc의 246번 라이신 또는 248번 라이신 잔기에 포함된 것일 수 있다. 나아가, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 Fc의 246번 라이신 잔기에 포함된 것일 수 있다. 또는 나아가, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 Fc의 248번 라이신 잔기에 포함된 것일 수 있다.
B는 제1 클릭 화학작용기와 제2 클릭 화학작용기의 클릭화학 반응 (click-chemistry)에 의하여 형성되는 구조들 중 어느 하나일 수 있다. 예를 들어, B는 알킨(alkyne), 사이클로옥틴(cyclooctyne) 및 사이클로노닌(cyclononyne) (예로, 바이사이클로[6.1.0]-논-4-인-9-일 메탄올(bicyclo[6.1.0]non-4-yn-9-ylmethanol) 과 같은 사이클로알킨(cycloalkyne), 트랜스-사이클로옥텐(trans-cyclooctene), 니트론(nitrone), 니트릴 옥사이드(nitrile oxide), 아자이드(azide), 컨쥬게이티드 다이엔(Conjugated Diene) 및 친다이엔체(dienophile) 중에서 선택된 2개의 반응에 의하여 생성될 수 있는 구조들 중 하나일 수 있다. 나아가, B는
Figure PCTKR2020001145-appb-I000119
또는
Figure PCTKR2020001145-appb-I000120
일 수 있다. 이때, A1은 항체와 연결되어있고, A2는 Am과 연결되어있을 수 있다. 또는, A1은 Am과 연결되어있고, A2는 항체와 연결되어있을 수 있다.
Am은 활성 모이어티 또는 이를 포함하는 구조이다. 이때, Am는 2개 이상의 활성 모이어티를 포함할 수 있다. 활성 모이어티에 관한 내용은 상기 페이로드의 설명에서 설명한 바와 같다.
n은 1 이상 4 이하의 정수이다. 예시적으로, n=2일 수 있다. 이 경우 페이로드가 1 개 항체 내의 2 개의 Fc에 각각 포함된 246번 라이신 또는 248번 라이신에 연결되어 이러한 구조가 생성될 수 있다. 다른 예시에서, n=4일 수 있다. 이 경우 1 개 항체 내의 2 개의 Fc에 각각 포함된 246번 라이신 및 248번 라이신에 연결되어 이러한 구조가 생성될 수 있다.
n=2이고, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 양 Fc의 246번 라이신에 포함된 것일 수 있다. 또는, n=2이고, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 양 Fc의 248번 라이신에 포함된 것일 수 있다.
상기 화학식 7로 표시되는 화합물은 일례로 반응식 5에 의해 제조될 수 있다.
[반응식 5]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000121
이때, R''은 제1 클릭 화학작용기이며 위에서 화학식 5를 설명할 때 설명한 바와 같다.
또한, R''''은 제2 클릭 화학작용기이며 상기 페이로드를 설명할 때 설명한 바와 같다.
일 예시에서, 항체-페이로드 콘쥬게이트는 화학식 8로 표시될 수 있다.
[화학식 8]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000122
상기 화학식 8에서,
Ab는 항체이다. 나아가, Ab는 트라스투주맙 (Trastuzumab)일 수 있다.
Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 246번 라이신 또는 248번 라이신 잔기에 포함된 것일 수 있다. 나아가, Ab와 연결된 질소 원자는 항체의 246번 라이신 잔기에 포함된 것일 수 있다. 또는 나아가, Ab와 연결된 질소 원자는 항체의 248번 라이신 잔기에 포함된 것일 수 있다.
B는 제1 클릭 화학작용기와 제2 클릭 화학작용기의 클릭화학 반응 (click-chemistry)에 의하여 형성되는 구조들 중 어느 하나일 수 있다. 예를 들어, B는 알킨(alkyne), 사이클로옥틴(cyclooctyne) 및 사이클로노닌(cyclononyne) (예로, 바이사이클로[6.1.0]-논-4-인-9-일 메탄올(bicyclo[6.1.0]non-4-yn-9-ylmethanol) 과 같은 사이클로알킨(cycloalkyne), 트랜스-사이클로옥텐(trans-cyclooctene), 니트론(nitrone), 니트릴 옥사이드(nitrile oxide), 아자이드(azide), 컨쥬게이티드 다이엔(Conjugated Diene) 및 친다이엔체(dienophile) 중에서 선택된 2개의 반응에 의하여 생성될 수 있는 구조들 중 하나일 수 있다. 나아가, B는
Figure PCTKR2020001145-appb-I000123
또는
Figure PCTKR2020001145-appb-I000124
일 수 있다. 이때, A1은 항체와 연결되어있고, A2는 Am과 연결되어있을 수 있다. 또는, A1은 Am과 연결되어있고, A2는 항체와 연결되어있을 수 있다.
Fp는 Fc 결합성 펩타이드이다. 나아가, Fp는 화학식 13 또는 14 중 선택된 어느 하나의 펩타이드일 수 있다. 화학식 13 및 14에 관한 것은 이미 설명된 바와 같다.
Fp는 6번 아미노산 잔기에서 Y4를 통해 연결될 수 있다. 이때, 상기 6번 아미노산 잔기는 라이신 (lysine), 오르티닌 (ornithine), 2,3-디아미노프로피온산, 또는 2,4-디아미노뷰티릭산 일 수 있다.
Am은 활성 모이어티 또는 이를 포함하는 구조이다. 이때, Am는 2개 이상의 활성 모이어티를 포함할 수 있다. 활성 모이어티에 관한 내용은 상기 페이로드의 설명에서 설명한 바와 같다.
B는 Fc 결합성 펩타이드 서열의 N 말단에 인접한 아미노산 잔기와 결합될 수 있다. 더 나아가, B는 Fc 결합성 펩타이드의 N 말단과 결합될 수 있다. 또는 나아가, B는 Fc 결합성 펩타이드 서열의 C 말단에 인접한 아미노산 잔기와 결합될 수 있다. 더 나아가, B는 Fc 결합성 펩타이드의 C 말단과 결합될 수 있다.
n은 1 이상 4 이하의 정수이다. 예시적으로, n=2일 수 있다. 이 경우 페이로드가 1 개 항체 내의 2 개의 Fc에 각각 포함된 246번 라이신 또는 248번 라이신에 연결되어 이러한 구조가 생성될 수 있다. 다른 예시에서, n=4일 수 있다. 이 경우 1 개 항체 내의 2 개의 Fc에 각각 포함된 246번 라이신 및 248번 라이신에 연결되어 이러한 구조가 생성될 수 있다.
n=2이고, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 양 Fc의 246번 라이신에 포함된 것일 수 있다. 또는, n=2이고, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 양 Fc의 248번 라이신에 포함된 것일 수 있다.
화학식 8로 표시되는 화합물은 일례로 반응식 6에 의해 제조될 수 있다.
[반응식 6]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000125
이때, R'''''은 제1 클릭 화학작용기이며 위에서 화학식 6을 설명할 때 설명한 바와 같다. Fc 결합성 펩타이드를 합성하는 과정에서 아미노산 잔기에 제1 클릭 화학작용기를 관여시킬 수 있다. 제1 클릭 화학작용기가 관여되는 아미노산 잔기는 어떠한 곳도 무방하나, 6번 잔기는 아닌 것이 바람직하다. 6번 잔기는 링커와의 치환 반응을 위하여 설계된 잔기이기 때문이다. 펩타이드의 인공 합성 과정에 따라, Fc 결합성 펩타이드는 그 서열의 N 말단에 인접한 아미노산 잔기에서 제1 클릭 화학작용기를 포함할 수 있다. 나아가, Fc 결합성 펩타이드는 그 서열의 N 말단에서 제1 클릭 화학작용기를 포함할 수 있다. 또는, Fc 결합성 펩타이드는 그 서열의 C 말단에 인접한 아미노산 잔기에서 제1 클릭 화학작용기를 포함할 수 있다. 나아가, Fc 결합성 펩타이드는 그 서열의 C 말단에서 제1 클릭 화학작용기를 포함할 수 있다.
또한, R''''은 제2 클릭 화학작용기이며 위에서 페이로드를 설명할 때 설명한 바와 같다.
본 출원은 원하는 타겟분자에 페이로드를 연결시킬 수 있도록 운반 및 결합 반응을 돕는 링커(linker)를 제공할 수 있다.
상기 링커 또는 링커의 모이어티(moiety)는 타겟분자에 직접적으로 연결될 수 있다. 상기 타겟분자에 직접적으로 연결된 링커 모이어티는 페이로드와 연결될 수 있다.
상기 링커 모이어티는 링커의 일부 잔기 또는 일부 작용기일 수 있다.
예를 들어, 상기 링커 모이어티는 R'' 또는 R''을 포함한 일부 잔기일 수 있다.
예를 들어, 상기 링커 모이어티는 R''을 제외한 링커의 일부 잔기일 수 있다.
상기 링커 모이어티가 연결된 타겟분자는 클릭 반응(click reaction) 즉, 클릭 화학 작용기간 반응에 의해 페이로드와 연결될 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
일 구현예에서, 상기 링커가 화학식1의 구조를 가지는 경우,
상기 타겟분자에 연결된 링커 모이어티는 클릭 화학 작용기을 포함할 수 있다.
이때, 상기 타겟분자에 연결된 링커 모이어티는 페이로드와 클릭반응에 참여할 수 있다.
이러한 링커는 타겟분자의 생물학적 활성에 영향을 주지 않을 수 있다. 즉, 타겟분자의 반감기, 배출 및 혈중 안정성 등에 영향을 거의 주지 않을 수 있다.
상기 타겟분자의 반감기는 상기 타겟분자의 FcRn 결합 친화성에 의해 결정될 수 있다. 예를 들어, 타겟분자는 FcRn과 결합함으로써 생체 내에서 recycling이 일어날 수 있고, 생체 내에서 반감기가 증가할 수 있다.
상기 타겟분자의 배출은 상기 단백질체의 응집(aggregation) 결과 신장에 의해 배출되는 정도에 의해 결정될 수 있다.
일 예로, 상기 링커는 세포 내 반감기가 짧은 단백질, 화합물 예를 들어 약물을 세포 내 반감기가 긴 타겟분자에 연결시킴으로써, 혈중에서 약물의 반감기를 증가시킬 수 있다.
다른 구현예에서, 상기 링커가 화학식2의 구조를 가지는 경우,
상기 타겟분자에 연결된 링커 모이어티는 클릭 화학 작용기을 포함하지 않을 수 있다.
상기 타겟분자에 연결된 링커 모이어티는 클릭 화학 작용기을 포함하고 있는 펩타이드, 폴리펩타이드, 단백질 및/또는 화합물과 연결될 수 있다.
상기 펩타이드, 폴리펩타이드, 단백질 및/또는 화합물은 페이로드와 클릭반응에 의해 연결될 수 있다.
이러한 링커는 타겟분자의 생물학적 활성에 영향을 줄 수 있다. 상기 타겟분자의 생물학적 활성에 영향을 주는 경우는 타겟분자의 반감기, 배출 또는 혈중 안정성에 영향을 미치는 경우이다. 예를 들어, 타겟분자에 간접적으로 링커를 연결시킬 경우, 상기 링커는 타겟분자의 반감기를 감소시킴으로써 페이로드를 생체 내에서 빠르게 배출시킬 수 있다.
상기 링커는 특정 타겟분자와 결합친화력(binding affinity)를 가지는 펩타이드 또는 폴리펩타이드와 연결될 수 있다. 이러한 링커는 타겟분자에 페이로드를 위치-특이적으로 연결시킬 수 있다.
일 예로, 상기 타겟분자는 항체일 수 있다.
예를 들어, 항체는 IgG 항체 또는 IgG항체의 일부 단편일 수 있다. 상기 IgG 항체는 인간 IgG (IgG1, IgG2, IgG3 또는 IgG4) 및/또는 토끼의 IgG일 수 있다. 상기 IgG 항체는 인간 유래 CH2-CH3 도메인 일 수 있다. 상기 타겟분자는 항체, 또는 항체 일부 단편일 수 있으나, 이에 제한되는 것은 아니다.
다른 예로, 상기 Fc 결합성 펩타이드는 항체와 결합친화력(binding affinity)을 가질 수 있다.
예를 들어, 상기 Fc 결합성 펩타이드는 IgG 항체와 결합친화력(binding affinity)을 가질 수 있다. 상기 Fc 결합성 펩타이드는 IgG 항체의 특정 도메인과 특이적으로 결합친화력을 가질 수 있다.
예를 들어, Fc 결합성 펩타이드는 IgG 항체의 중쇄 또는 경쇄 가변부에 대한 특이성을 가질 수 있다.
예를 들어, Fc 결합성 펩타이드는 IgG 항체의 중쇄의 불변 도메인과 특이성을 가질 수 있다. 이때 중쇄 불변 도메인은 CH2 도메인 및/또는 CH3도메인일 수 있다.
상기 Fc 결합성 펩타이드는 화합물이 연결된 펩타이드 또는 폴리펩타이드일 수 있다.
예를 들어, 상기 Fc 결합성 펩타이드는 클릭 화학 작용기을 포함할 수 있다.
본 발명은 항체-페이로드 콘쥬게이트를 투여함을 포함하는 암을 치료하기 위한 방법을 제공한다. 이때, 상기 암은 방광암, 골암, 뇌암, 유방암, 심장암, 자궁경부암, 대장암, 직장암, 식도암, 섬유육종, 위암, 위장암, 두경부암, 카포시 육종, 신장암, 백혈병, 간암, 폐암, 림프종, 흑색종, 골수종, 난소암, 췌장암, 음경암, 전립선암, 고환 생식세포 암, 흉선종 및 흉선암으로부터 선택될 수 있다. 나아가, 상기 암은 유방암일 수 있다.
본 발명은 항체-페이로드 콘쥬게이트를 포함하는, 암을 치료하기 위한 약학적 조성물을 제공한다. 이때, 상기 암은 방광암, 골암, 뇌암, 유방암, 심장암, 자궁경부암, 대장암, 직장암, 식도암, 섬유육종, 위암, 위장암, 두경부암, 카포시 육종, 신장암, 백혈병, 간암, 폐암, 림프종, 흑색종, 골수종, 난소암, 췌장암, 음경암, 전립선암, 고환 생식세포 암, 흉선종 및 흉선암으로부터 선택될 수 있다. 나아가, 상기 암은 유방암일 수 있다.
이하 실시예를 통하여 본 발명을 더욱 상세히 설명하고자 한다.
이들 실시예는 오로지 본 발명을 보다 구체적으로 설명하기 위한 것으로서, 본 발명의 범위가 이들 실시예에 의해 제한되지 않는다는 것은 본 발명이 속하는 기술분야에서 통상의 지식을 가진 자에 있어 자명할 것이다. 이하의 실시예에서 화합물들의 명칭에 붙여진 숫자들은 도면을 기준으로 작성된 것들이다.
[실시예 1] 화합물 I (Trans Linker: NHS & Norbornene, 화학식 1-1-2) 합성 방법 및 구조 확인
실시예 1-1. 화합물 1의 합성 및 구조확인
Monomethylglutarate 10 g (68.4 mmol, 1.0 eq)을 Dichloromethane (DCM) 250 mL에 녹여 교반시킨다. 1-Ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide (EDCi) 17.7 g (92.3 mmol, 1.34 eq)와 N,N-Diisopropylethylamine (DIPEA) 24 mL (138 mmol, 2.0 eq)를 천천히 적가하여 20 분 동안 교반시킨 후 O-benzylhydroxyamine 8 mL (68.7 mmol, 1.0 eq)를 천천히 적가하였다. 18 시간 뒤 반응 용액을 감압농축하여 제거하였고, Ethylacetate (EA)에 다시 녹여주었다. 유기 층을 10% 시트르산 용액을 사용하여 3번 씻어주었고, 포화소금용액과 황산 나트륨을 사용하여 건조하였다. 목적 화합물을 정제없이 다음 반응에 사용하였다 (crude yield : 12.9 g, 88%). TLC (EA:Hex = 2:1); Rf = 0.5
1H NMR (300 MHz, dmso) δ 7.35 (d, J = 3.5 Hz, 5H), 4.75 (d, J = 3.5 Hz, 2H), 3.56 (d, J = 4.0 Hz, 3H), 2.26 (td, J = 7.3, 3.8 Hz, 2H), 1.96 (t, J = 5.6 Hz, 2H), 1.78 - 1.61 (m, 2H).
실시예 1-2 화합물 2의 합성 및 구조확인
화합물 1 12.9 g을 N,N-Dimethylformamide (DMF) 200 mL에 녹인 후 0 ℃에서 교반시켰다. 1,8-Diazabicyclo(5.4.0)undec-7-ene (DBU) 24 mL (160 mmol, 3.08 eq)와 Methyliodide (MeI) 10 mL (160 mmol, 3.08 eq)를 천천히 적가하였다. Diethylamine 0.2 mL을 천천히 적가하였다. 20 시간 동안 교반시킨 후 반응 용매를 Celite와 섞어 감압농축하여 제거하였고, 컬럼크로마토그래피 (EA:Hex = 1:1)를 통하여 목적 화합물을 정제하였으며, 7.6 g을 획득하였다 (yield : 56%). TLC (EA:Hex = 1:1); Rf = 0.5
1H NMR (300 MHz, cdcl3) δ 7.44 - 7.33 (m, 5H), 4.82 (s, 2H), 3.65 (s, 3H), 3.20 (s, 3H), 2.43 (d, J = 7.2 Hz, 2H), 2.34 (t, J = 7.3 Hz, 2H), 1.98 - 1.85 (m, 2H).
실시예 1-3 화합물 3의 합성 및 구조확인
화합물 2 4.18 g (15.8 mmol, 1.0 eq)을 Tetrahydrofuran (THF) 100 mL에 녹인 후 교반시킨다. 2 N Lithium hydroxide (LiOH) 5 mL를 0 ℃에서 천천히 적가한 뒤 3 시간 동안 교반하였다. H2O 60 mL을 첨가하여 반응을 종결하였고, EA 150 mL을 사용하여 수층으로부터 2 회 씻어주었다. 이후 수 층에 2 N HCl 용액을 사용하여 pH 3.0까지 적정하였고, EA 50 mL을 이용하여 목적화합물을 3 회 추출하였다. 유기 층을 포화소금용액과 황산 나트륨을 사용하여 건조하였고, 2.46 g 획득하였다 (yield : 62%). TLC (EA:Hex = 1:1); Rf = 0.1
1H NMR (300 MHz, dmso) δ12.06 (s, 1H), 7.51 - 7.29 (m, 5H), 4.86 (s, 2H), 3.13 (s, 3H), 2.38 (t, J = 7.3 Hz, 2H), 2.22 (dt, J = 11.7, 7.4 Hz, 4H).
실시예 1-4 화합물 4의 합성 및 구조확인
화합물 3 2.46 g을 Methanol (MeOH) 40 mL에 녹인 후 Palladium on carbon (Pd/C) 존재 하에 수소화반응을 18 시간에 걸쳐 진행하였고, 반응 종결 후 short-path column을 통하여 Pd/C 제거 후 목적 화합물을 정제, 농축하여 1.2 g을 획득하였다 (yield : 76%).
1H NMR (300 MHz, dmso) δ 12.06 (s, 1H), 7.51 - 7.29 (m, 5H), 4.86 (s, 2H), 3.13 (s, 3H), 2.38 (t, J = 7.3 Hz, 2H), 2.22 (dt, J = 11.7, 7.4 Hz, 4H).
실시예 1-5 화합물 5의 합성 및 구조확인
화합물 4 0.17 g (1.06 mmol, 1.0 eq)를 DCM 10 mL에 녹여 교반시킨다. Exo-5-norbornene acid chloride 0.22 g (1.73 mmol, 1.63 eq)와 DIPEA 0.2 mL (1.1 mmol, 1.0 eq)를 0 ℃에서 천천히 적가하였다. 2 시간 동안 교반시킨 후 유기 층을 10% 시트르산 용액을 사용하여 3 번 씻어주었고, 포화소금용액과 황산 나트륨을 사용하여 건조하였다. 목적 화합물을 정제없이 다음 반응에 사용하였다 (crude yield : 0.24 g, 68%). TLC (DCM:MeOH = 10:1); Rf = 0.3
Expected M.W. (M+H)+: 282.13 g/mol
Measured M.W. (M+H)+: 282.1 g/mol
실시예 1-6 화합물 I의 합성 및 구조확인
화합물 5 0.24 g (0.72 mmol, 1.0 eq)을 DCM 3 mL에 녹여 교반시킨다. N,N,N',N'-Tetramethyl-O-(N-succinimidyl)uroniumtetrafluorborat (TSTU) 0.26 g (0.87 mmol, 1.2 eq)와 DIPEA 0.15 mL (0.87 mmol, 1.2 eq)를 천천히 적가하였다. 1 시간 동안 교반시킨 후 유기 층을 10% 시트르산 용액을 사용하여 3 번 씻어주었고, 포화소금용액과 황산 나트륨을 사용하여 건조하였다. 컬럼크로마토그래피 (EA:Hex = 1:1)를 통하여 목적 화합물을 정제하였으며, 0.04 g을 획득하였다 (yield : 15%). TLC (EA:Hex = 1:1); Rf = 0.3 (도 1 참고)
1H NMR (300 MHz, dmso) δ6.18 (ddd, J = 16.9, 5.5, 3.0 Hz, 2H), 2.94 (s, 1H), 2.80 (s, 4H), 2.71 (s, 1H), 2.67 (q, J = 1.0 Hz, 3H), 2.25 (dd, J = 25.9, 18.6 Hz, 4H), 1.86 (ddd, J = 18.9, 11.5, 5.8 Hz, 4H), 1.45 - 1.26 (m, 4H).
[실시예 2] 화합물 II(Cis Linker: NHS & Norbornene, 화학식 2-1-2) 합성 방법 및 구조 확인
실시예 2-1 화합물 6의 합성 및 구조확인
N-methylhydroxyamine hydrochloride 0.1 g (0.88 mmol, 1.0 eq)를 -25 oC의 Tetrahydrofurane (THF) 2 mL에 녹여 교반시킨다. Glutaric anhydride 0.07 g (0.88 mmol, 1.0 eq)를 첨가하고 10 분간 교반시킨 후 Triethylamine 0.25 mL (1.76 mmol, 2.0 eq)를 천천히 적가하였다. 1 시간 후 (1S,2R,4S)-bicyclo[2.2.1]hept-5-ene-2-carbonyl chloride 0.14 g (0.88 mmol, 1.0 eq)와 Triethylamine 0.12 mL (0.88 mmol, 1.0 eq)를 천천히 적가한 후 상온에서 1 시간 동안 반응을 진행하였다. 반응 용액을 감압 농축을 통하여 제거한 후, Ethyl acetate (EA)에 다시 녹이고 10% 시트르산 용액을 사용하여 3번 씻어주었고, 포화소금용액과 황산 나트륨을 사용하여 건조하였다. 목적 화합물을 정제없이 다음 반응에 사용하였다. TLC (DCM:MeOH = 3:1, acetic acid 1 drop); Rf = 0.4
계산된 질량 (M+H)+: 282.13 g/mol
측정된 질량 (M+H)+: 282.1 g/mol
실시예 2-2 화합물 II의 합성
화합물 6을 Dichloromethane (DCM) 2 mL에 녹이고 TSTU 0.22 g (0.73 mmol, 0.8 eq)와 N,N-Diisopropylethylamine (DIPEA) 0.15 mL (0.88 mmol, 1.0 eq)를 천천히 적가하였다. 1 시간동안 반응 후, 반응 용액을 10% 시트르산 용액을 사용하여 3번 씻어주었고, 포화 탄산수소나트륨 용액, 포화소금용액과 황산 나트륨을 사용하여 건조하였다. 컬럼크로마토그래피 (EA:Hex = 1:1)를 통하여 목적 화합물을 정제하였다 TLC (EA:Hex = 2:1); Rf = 0.4 (도 3참고)
실시예 2-3 화합물 Ⅱ 의 구조 확인
최종 화합물 II의 합성은 실시예 2-1 내지 2-2에서 명시한 방법으로 진행하였으며, 도 6에 나타난 바와 같이 HPLC 분석을 통해 이성질체의 존재를 확인하였다. 도 6의 분석 조건을 토대로 HPLC 정제를 수행하였으며, HPLC 분석을 통해 도 7과 같은 순도의 화합물 II(cis)를 수득하였다. 정제된 화합물II의 구조 분석은 질량 분석법을 통해 확인함으로써 최종 화합물II의 분석을 완료하였다.
계산된 질량 (M+H)+: 379.14 g/mol
측정된 질량 (M+H)+: 379.0 g/mol
[실시예 3] 이성질체 화합물 6(Cis Linker or Trans Linker: NHS & Norbornene) 구조 확인
이성질체인 화합물 6을 고속액체크로마토그래피(HPLC, High speed liquid chromatograph) 장비를 이용하여 화합물 6의 Cis와 trans 구조를 확인하였다. HPLC 분석은 Waters사의 Waters 2695 HPLC 모델을 사용하였으며, 분석 칼럼은 Xbridge C18 (4.6 x 250 mm, 5 μm ; Waters), 이동상 용매의 경우 A 용매는 0.1%의 삼불화아세트산이 포함된 물과 B 용매는 0.075% 삼불화아세트산이 포함된 아세토니트릴을 사용하였다. 상기에 따라, 220 nm 파장의 흡광도를 통해 각 구조체의 특성을 분석하였다.
도 3에 나타난 바와 같이, 화합물 6의 Cis 형태의 구조는 14.89 분, Trans 형태의 구조는 15.32 분에 피크가 관찰됨을 확인하였다. 각 구조에 대한 분석은 질량분석기법(Shimadzu, LCMS-8050)을 통해 확인하였으며, 도 4및 도 5는 화합물 6의 Cis 및 Trans 구조에 대한 질량 분석 결과를 나타낸 것이다. 분자량을 확인한 결과, 각 피크에 해당하는 물질은 수소 한 분자가 결합된 282의 분자량이 관찰됨을 확인하였다.
계산된 질량 (M+H)+: 282.13 g/mol
측정된 질량 (M+H)+: 282.1 g/mol
[실시예 4] Fc 결합성 펩타이드 합성 및 구조 확인
실시예 4-1. FcBP(6Lys)-Norbornene 합성 및 구조 확인
[화학식 10]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000126
실시예 4-1-1: FcBP(6Lys)-Norbornene의 합성
사용된 Fmoc 아미노산 목록 및 도입순서
Fmoc-L-Thr(tBu)-OH, Fmoc-Cys(Trt)-OH, Fmoc-L-Trp(Boc)-OH, Fmoc-L-Val-OH, Fmoc-L-Leu-OH, Fmoc-L-Glu(OtBu)-OH, Fmoc-Gly-OH, Fmoc-Lys(Boc)-OH, Fmoc-L-His(Trt)-OH, Fmoc-L-Trp(Boc)-OH, Fmoc-Ala-OH, Fmoc-Cys(Trt)-OH, Fmoc-Asp(tBu)-OH.
제조 방법
(a) 아미노산 도입
하기 과정에서 사용된 시약의 양은 0.25 mmole에 기초하였다. 0.5 g의 Clear amide resin (0.48 mmole/g, PeptideInternational, 미국)를 합성 반응기에 넣고, 각각의 Fmoc-아미노산 블록 1 mmole의 무게를 달아 펩타이드 아미노산 서열 순서대로 C-말단에서부터 N-말단까지 준비하였다.
Fmoc-아미노산을 활성화하여 Clear amide resin에 활성화된 잔기를 부착하는 반응을 C-말단 아미노산부터 순차적으로 진행하였다.
Fmoc의 제거는 20% 피페리딘 함유 DMF에서 수행하였고 잔기의 활성화 및 도입은 서열에 맞추어 준비한 아미노산을 2 mL 0.5 M HOBt 함유 DMF 용액, 2 mL 0.5 M HBTU 함유 DMF 용액, 그리고 174 μL DIPEA와 5 분간 혼합한 다음 레진이 담긴 반응기에 부어 2 시간 동안 혼합하였다.
도입 반응의 확인은 카이저 시험법으로 수행하였으며 미반응으로 확인되면 도입 반응을 1회 더 반복하거나 20% Ac2O함유 DMF용액으로 캡핑을 실시하였다. 각 도입 반응과 Fmoc 제거 과정에서 다음 단계로 넘어가기 전에 DMF와 DCM으로 수지를 충분히 세척하였다. 이러한 과정은 목표한 펩타이드 서열이 완성될 때까지 반복하여 진행하였다.
(b) H-PEG8-OH의 도입
아미노산 도입이 모두 끝난 다음에 N-말단에 H-PEG8-OH를 도입하기 위하여 1 mL 0.5 M Fmoc-N-amido-dPEG8-acid in DMF 용액, 1 mL 0.5 M HBTU 함유 DMF 용액, 1 mL 0.5 M HOBt 함유 DMF 용액, 그리고 87 μL DIPEA와 5 분간 혼합한 다음 반응 레진이 담긴 반응기에 부어 2 시간 동안 혼합하였다.
반응의 진행은 카이저 시험법으로 확인하였으며, 미반응 아민이 남아있는 것으로 판단되면 반응 시간을 1 ~ 3시간 더 연장하거나 반응액을 비우고 상기의 반응 과정을 다시 반복하였다. N-말단의 Fmoc 보호기의 제거는 20% 피페리딘 함유 DMF를 사용하여 수행한 다음, 펩타이드가 부착된 레진을 건조하고 중량을 측정하였다.
(c) 노르보레인(norbornene)의 도입
N-말단의 Fmoc 보호기의 제거는 레진에 노르보레인 카르복실산 4당량, 2 mL 0.5 M HOBt 함유 DMF 용액, 2 mL 0.5 M HBTU 함유 DMF 용액, 그리고 174 μL DIPEA와 5 분간 혼합한 다음 레진이 담긴 반응기에 부어 2 시간 동안 혼합하였다. 도입 반응의 확인은 카이저 시험법으로 수행하였으며 미반응으로 확인되면 도입 반응을 1회 더 반복하였다.
(d) 상기 (c) 과정에서 준비한 펩타이드가 부착된 수지 250 mg을 TFA, TIS, 물 그리고 EDT (94:1.0:2.5:2.5)의 혼합액 2 mL과 함께 실온에서 120 분간 교반하여 레진에서 펩타이드를 절단하였다. 절단 혼합물을 여과하고 여과액을 질소 가스로 절반 가량 농축한 다음 에테르를 부어 펩타이드를 침전시켰다. 침전된 펩타이드를 에테르로 3 회 더 세척하고 질소 가스로 건조시켰다. 건조된 침전을 0.1% TFA-30% ACN 함유 물에 녹인 다음 6 시간 동안 교반한 다음 농축하였다.
농축액을 5%-DMSO-20%-ACN 함유 0.01 M ammonium acetate buffer (pH 6.5) 용액에 0.1 mg/mL 농도로 녹인 다음 공기 노출된 상태로 3 일 동안 교반하였다. 이황화 결합 형성 반응의 진행은 HPLC로 관측하였으며, 더 이상 진행하지 않는 것으로 판단되면 반응액을 동결건조하여 펩타이드 침전물을 얻었다.
(e) 정제
상기 (d) 과정에서 동결건조하여 얻은 펩타이드 침전물을 하기 표 5에 기재된 prep-LC 조건에서 정제하고 동결 건조하였다. 얻어진 펩타이드는 각각 90% 이상의 순도임을 분석용 HPLC로 확인하였으며, 도 8에 나타내었다.
norbornene-PEG8-Asp-Cys*-Ala-Trp-His-Lys-Gly-Glu-Leu-Val-Trp-Cys*-Thr-NH2 (Cys*: 이황화 결합 위치)
Prep-LC 정제조건
장비명 Waters 2525 pump, Waters 2487 UV detector
컬럼 Waters, XBridge Prep C18 5 μm OBD 19 x 250 mm
이동상 A/B 0.1% TFA in H2O / 0.1% TFA in Acetonitrile
구배 0 min → 30 min : B 20% → B 100%
유속 10 mL/min 검출파장 UV 280 nm
실시예 4-1-2: : FcBP(6Lys)-norbornene (oxidized form)의 구조 확인LC mass 기반 분자량 측정을 통해 FcBP(6Lys)의 합성을 확인하였다.
측정 장비 : Waters quattro premier xe
Calculated molecular weight : 2088.40 g/mol
Measured molecular weight (M/2+H)2+ : 1044.84 g/mol
그 결과를 도 9에 도시하였다.
실시예 4-2. 화합물 Ⅰ-FcBP(6Lys)-Norbornene 합성 및 구조 확인
[화학식 11]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000127
실시예 4-2-1: 화합물 Ⅰ-FcBP(6Lys)-Norbornene의 합성
화합물 Ⅰ (trans-norbornene weinreb amide)-FcBP의 합성은 DMF에서 수행하였고 FcBP(6Lys)-norbornene에 화합물 Ⅰ를 도입하기 위해 DMF에 녹인 2.5 μmol의 FcBP(6Lys)-norbornene에 3 당량의 DIPEA와 3 μmol의 화합물 Ⅰ을 녹여 교반하였다.
도입 반응의 확인은 HPLC를 통한 분석을 시행하였으며 반응이 종결되지 않았으면 DIPEA를 1 eq씩 추가하여 반응의 종결을 관찰하였다
반응의 종결을 확인한 후 반응 용액을 농축하였으며, Preparative-HPLC를 통하여 Ⅰ-FcBP(6Lys)-norbornene의 정제를 시도하였다. 정제 후 동결 건조를 통하여 2.07 μmol을 확보하였으며, 순도 또한 HPLC를 이용하여 확인하였다 (Purity; >95% (HPLC), yield: 83%).
상기 결과를 도 10에 도시하였다.
실시예 4-2-2: 화합물 Ⅰ-FcBP(6Lys)-norbornene 의 구조 확인
LC mass 기반 분자량 측정을 통해 화합물 Ⅰ-FcBP(6Lys)-norbornene의 합성을 확인하였다.
측정 장비 : Waters quattro premier xe
Calculated molecular weight : 2351.69 g/mol
Measured molecular weight (M/2+H)2+ : 1176.42 g/mol
상기 결과를 도 11에 도시하였다.
실시예 4-3. 화합물 Ⅱ-FcBP(6Lys)-Norbornene 합성 및 구조 확인
[화학식 12]
Figure PCTKR2020001145-appb-I000128
실시예 4-3-1: 화합물 Ⅱ-FcBP(6Lys)-Norbornene의 합성
화합물 Ⅱ(Cis-norbornene weinreb amide)-FcBP의 합성은 DMF에서 수행하였고 FcBP(6Lys)-norbornene에 화합물 Ⅱ를 도입하기 위해 위해 DMF에 녹인 2.5 μmol의 FcBP(6Lys)-norbornene에 3 당량의 DIPEA와 3 μmol의 화합물 Ⅱ를 녹여 교반하였다.
도입 반응의 확인은 HPLC를 통한 분석을 시행하였으며 반응이 종결되지 않았으면 DIPEA를 1 eq씩 추가하여 반응의 종결을 관찰하였다
반응의 종결을 확인한 후 반응 용액을 농축하였으며, Preparative-HPLC를 통하여 Ⅱ-FcBP(6Lys)-norbornene의 정제를 시도하였다. 정제 후 동결 건조를 통하여 2.02 μmol을 확보하였으며, 순도 또한 HPLC를 이용하여 확인하였다 (Purity; >95% (HPLC), yield: 81%).
상기 결과를 도 12에 도시하였다.
실시예 4-3-2: 화합물 Ⅱ-FcBP(6Lys)-norbornene 의 구조 확인
측정 장비 : Waters quattro premier xe
Calculated molecular weight : 2351.69 g/mol
Measured molecular weight (M/2+H)2+ : 1176.42 g/mol
상기 결과를 도 13에 도시하였다.
[실시예 5] Antibody-Click Chemistry Chemical 합성 방법 및 구조 확인
실시예 5-1: Antibody-Norbornene
실시예 5-1-1: 트라스투주맙(trastuzumab)-Norbornene 합성 방법 (1)
화합물 Ⅰ-FcBP(6Lys)-norbornene를 이용한 도입 반응
Ab (246/248 Lys)-Norbornene의 합성은 pH 7.4 PBS(phosphate buffered saline) buffer 상에서 화합물 Ⅰ-FcBP(6Lys)-norbornene을 이용하여 진행하였다. 항체의 특정 2 곳의 위치에 norbornene 도입을 위해 항체 당 6 당량의 화합물Ⅰ-FcBP(6Lys)-norbornene을 반응액에 넣은 후 반응을 진행하였다. 반응 상온에서 1 주일 이상 소요되었으며, 반응 모니터링 및 종결은 HIC-HPLC를 통해 확인하였다. 정제는 투석(Dialysis, pH 5.5 20 mM Histidine acetate buffer) 3회 및 크기배제크로마토그래피 기법(분자량 Cut-off 40 kDa)을 이용하여 정제를 진행하였다.
화합물 Ⅰ-FcBP(6Lys)-norbornene과 항체의 반응을 도 14에 도시하고 최종 결과물인 Ab (246/248 Lys)-Norbornene의 구조를 도 15에 도시하였으며, HIC-HPLC를 통한 반응 모니터링은 도 16에 도시하였다.
실시예 5-1-2: 트라스투주맙(Trastuzumab)-Norbornene 합성 방법 (2)
화합물 Ⅱ-FcBP(6Lys)-norbornene를 이용한 도입 반응
Ab (246/248 Lys)-Norbornene의 합성은 pH 7.4 PBS(phosphate buffered saline) buffer 상에서 화합물 Ⅱ-FcBP(6Lys)-norbornene을 이용하여 진행하였다. 항체의 특정 2 곳의 위치에 norbornene 도입을 위해 항체 당 6 당량의 화합물Ⅱ-FcBP(6Lys)-norbornene을 반응액에 넣은 후 반응을 진행하였다. 반응 온도 및 시간은 상온에서 12 시간 소요되었으며, 반응 모니터링 및 종결은 HIC-HPLC를 통해 확인하였다. 정제는 투석(Dialysis, pH 5.5 20 mM Histidine acetate buffer) 3회 및 크기배제크로마토그래피 기법(분자량 Cut-off 40 kDa)을 이용하여 정제를 진행하여 150 mg의 트라스투주맙(trastuzumab) 중 135 mg을 확보하였다. (yield = 90%)
화합물Ⅱ-FcBP(6Lys)-norbornene과 항체의 반응을 도 17에 도시하였으며, 생성물인 Ab (246/248 Lys)-Norbornene의 구조를 도 18에 도시하였다. HIC-HPLC를 통한 반응 모니터링은 도 19에 도시하였다.
실시예 5-2-1: Herceptin-Norbornene 결합 확인
항체에 FcBP 노보넨 링커가 포함된 항체 중간체 (도 18)의 확인은 질량 분석법을 기반으로 검증되었다.
측정 장비: Ultraflex III (TOF/TOF)
Analysis mode: Linear mode
Polarity: Positive
Detection: m/z 2,000~300,000
Laser repetition rate: 100 Hz
Number of shot: 1,000 shot
Deflection: On, 5,000 Da
Voltage: Ion Source Ⅰ25.00 kV, Ion Source Ⅱ 23.00 kV, Lens 9.00 kV
Calculated molecular weight : 152,385 g/mol
Measured molecular weight : 152,407 g/mol (M+Na)
상기 분석결과를 도 20에 도시하였다.
[실시예 6] Antibody Drug Conjugate 합성 및 확인
실시예 6-1: Antibody-Drug Conjugation
실시예 6-1-1: 트라스투주맙(Trastuzumab)-DM1 합성 방법
화합물Ⅱ-FcBP(6Lys)-norbornene에 의해 Norbornene 두 분자가 도입된 트라스투주맙(trastuzumab) (도 18)을 이용하여 항체-페이로드 콘쥬게이트 제작을 수행하였다. 4.5 mg/mL 농도로 25 mL의 양을 이용하여 반응을 수행하였으며, 항체에 접합되어 있는 norbornene과의 생물직교반응(biorthogonal chemistry)을 위해 테트라진-PEG8-DM1 (Tetrazine-PEG8-DM1) 약물의 접합을 시도하였다. 항체 대비 4 당량의 약물을 사용하였으며, 접합 반응은 상온에서 24 시간 동안 pH 5.5 20 mM Histidine aceatate 용액하에서 진행하였다. 접합 반응의 관찰은 HIC-HPLC를 통해 확인하였으며, 트라스투주맙에 FcBP 링커만 결합되어 나타나는 9.4분 대의 피크가 항체-FcBP 링커와 약물이 반응함에 따라 11.2분 대로 변화하는 것을 관찰함으로써 항체-페이로드 콘쥬게이트 생성을 관찰하였다.
생성물인 항체-페이로드 콘쥬게이트의 구조를 도 21에 도시하였으며, HIC-HPLC를 통한 반응 모니터링은 도 22에 도시하였다. 도 21에서, 확대된 구조는 페이로드의 구조이고, 확대되지 않은 부분은 도 18의 구조와 동일하다.
실시예 6-1-2: 트라스투주맙(Trastuzumab)-DM1 정제 방법
고순도의 항체-페이로드 콘쥬게이트를 수득하기 위해 pH 5.5 20 mM histidine acetate 용액을 이용한 투석 및 FPLC(Fast Protein Liquid Chromatography)를 이용한 HIC 정제를 수행하였다.
HIC 정제 조건은 다음과 같다.
FPLC Model : AKTA pure
Flow rate : 1 mL/min
Column : HiPrep butyl FF16/10 칼럼
Elution solvent : (A) 1.5 M Ammonium sulfate + 50 mM phosphate pH 7.0
(B) 50 mM Phosphate pH 7.0
Elution condition
0:00-10:00 A:40%, B:60%
10:00-20:00 A:65%, B:35%
20:00-102.5:00 A:75%, B:25%
102:5-115:00 A:100%, B:0%
115:00-135:00 A:100%, B:0%
정제된 항체-페이로드 콘쥬게이트의 HIC 크로마토그램은 도 19에 도시하였다.
상기 방법을 통해, 2 곳에 약물이 접합된 (Drug Antibody Ratio = 2) 트라스투주맙(trastuzumab)-DM1을 67 mg 수득하였다. (yield = 60%)
실시예 6-1-3: 트라스투주맙(Trastuzumab)-DM1 결합 확인
FcBP 링커와 약물이 포함된 항체-페이로드 콘쥬게이트의 확인은 질량 분석법을 기반으로 검증되었다.
측정 장비 : Ultraflex III (TOF/TOF)
Analysis mode: Linear mode
Polarity: Positive
Detection: m/z 2,000~300,000
Laser repetition rate: 100 Hz
Number of shot: 1,000 shot
Deflection: On, 5,000 Da
Voltage: Ion Source Ⅰ25.00 kV, Ion Source Ⅱ 23.00 kV, Lens 9.00 kV
Calculated molecular weight : 155,493 g/mol
Measured molecular weight : 155,523 g/mol (approx. M+Na)
상기 분석결과를 도 23에 도시하였다.
[실시예 7] 신규 항체 약물 복합체 (ADC, trastzumab-DM1 conjugate)에 의한 세포수준에서의 약효평가 (In vitro cytotoxicity test)
암세포의 마커 표적마커 수준에 따라서 항체-페이로드 콘쥬게이트 (ADC, Trastuzumab-DM1 conjugate)의 효력 평가를 수행하였으며, 표적 항원인 Her2의 양성 발현 세포주는 NCI-N87, BT474를 음성세포주는 MDA-MB-468를 이용하여 세포 독성 실험을 진행하였다. Her2 과발현세포인 NCI-N87과 BT474에서는 제작된 항체 약물 복합체를 농도별로 처리하여 관찰한 결과, IC50 값이 82.1 ng/mL과 29.6 ng/mL을 나타내는 우수한 항암 효과를 확인하였다. 상용화된 허셉틴 ADC인 캐싸일라 (Kadcyla)와 비교할 때 효과가 동등한 수준으로 확인되어 신규한 ADC로서의 효용을 확인할 수 있었다.
상기 실험에 대한 결과는 도 24 내지 27에 도시하였다.
[실시예 8] 신규 항체-페이로드 콘쥬게이트 (ADC, trastzumab-DM1 conjugate)에 의한 동물 수준에서의 약효평가 (In vivo cytotoxicity test)
표적 항원이 과발현 되어있는 NCI-N87 위암 세포주를 피하 이식하여 xenograft 모델을 제작하였으며, 4개의 그룹으로 분류하여 투여 물질에 대한 항암 효력 시험을 수행하였다. 본 실험에서 사용되는 BALB/c nude 마우스는 T 세포가 결핍되어 있어 암세포 이식이 용이하여 설치류를 이용한 항암 효력시험에 적절한 모델로 사용하였다.
(a) 세포주의 준비
인체종양 세포주 (NCI-N87 cell line) 1 vial을 heat inactivation 된 10 % FBS (fetal bovine serum, Gibco, 10082-742)가 들어있는 RPMI1640 medium (Gibco, 22400-089)을 세포배양용 플라스크에 넣고 37 ℃, 5 % CO2 incubator에서 배양한다. PBS를 이용하여 washing하고, 2.5 % Trypsin-EDTA (Gibco, 15090)를 10 배 희석한 다음, 이를 첨가하여 세포를 분리한 후, 원심분리 (1,000 rpm, 5 분)하여 상층액을 버린 뒤, 새로운 배지로 세포 부유액을 얻는다. 현미경을 이용하여 viability를 확인한 다음, 1.25 x 107 cells/mL의 농도로 배지와 matrigel을 1:1로 섞은 용액에 희석하여 세포주를 준비한다.
(b) 세포주의 이식
세포주는 '4. 3) (4) 세포주의 준비'에 기술된 방법에 따라 준비한다. 세포주 준비 시 재현탁 (resuspension)시켜 균질화하며, 준비된 세포주는 즉시 동물에 투여하도록 한다. 세포주 이식 시, 동물의 등쪽 부위를 70 % 알코올로 소독하고, 엄지와 검지로 경배부의 피부를 잡아당겨 피부와 근육 사이에 공간을 만든 후 동물의 전방으로부터 엄지와 검지사이의 피하공간에 26 gauge needle이 장착된 주사침을 찔러 넣고 2.5 X 106 cells/0.2 mL/head의 투여액량으로 피하 투여한다. 순화기간 중 건강한 동물을 선발하여 세포주 접종을 실시한 뒤, 세포주를 이식한 부위의 종양 크기가 약 100-150 mm3에 도달하였을 때, 순위화한 종양의 크기에 따라 각 군의 종양 크기가 최대한 균일하게 분포하도록 분배한다.
(c) 시험군 구성, 투여량 및 투여방법 결정
Cell line = NCI-N87
Mouse type = BALB/c nude (CAnN.Cg-Foxn1nu/CrljOri)
Number of group = 5
투여 방법 = 정맥주사 (Intravenous injection, 26gauge needle syringe) 이용
투여량 = 5 mg/kg
투여 횟수 = 1 회/ 2 일, 3회 투여
관찰 기간 = 5주
그룹 1: PBS, 그룹 2: 허셉틴 (Herceptin, Trastuzumab), 그룹 3: 신규 제작 ADC (허셉틴-DM1 Conjugate, 1.5st ADC)
(d) 관찰 및 검사 항목
일반증상
투여 및 관찰기간 동안 사망을 포함한 일반증상의 종류, 발현일 및 증상의 정도를 1 일 1 회 관찰하고, 개체별로 기록한다. 일반증상이 악화된 개체는 격리한다.
체중
군분리일 또는 시험물질 투여개시일, 그 이후에는 2 회/주 측정한다.
종양 크기 측정
시험물질 투여개시일부터 2 회/주, 5 주간 측정한다. 캘리퍼스 (calipers)를 이용하여 종양의 장축 및 단축을 측정하고 다음의 계산식을 이용하여 종양 크기를 산출한다.
종양 크기 = ab2/2 (a: 장축 길이, b: 단축 길이)
(e) 결과
인산완충용액 (PBS)와 허셉틴 (Herceptin, trastuzumab)를 주사한 그룹은 5 주간의 관찰 기간동안 종양의 성장을 억제하는 경향을 나타내지 않았다. 본 출원에 의하여 제작한 항체-페이로드 콘쥬게이트 (Herceptin-DM1)는 허셉틴에 비하여 종양 성장 억제 능력이 뛰어난 것으로 확인되어 ADC로서 성공적으로 기능하는 것을 확인하였다.
상기 관련 결과는 도 28 및 29에 도시하였다.
[실시예 9] 탄소 길이에 따른 위치 특이적 인터랙톰 합성 및 구조 확인
실시예 9-1. 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Dap, L6Dab, L6Orn, L6Lys)-Norbornene 합성 및 구조 확인
Figure PCTKR2020001145-appb-I000129
실시예 9-1-1: FcBP(L6Dap, L6Dab, L6Orn, L6Lys)-Norbornene의 합성
FcBP(L6Dap) : 사용된 Fmoc 아미노산 목록 및 도입순서 (n =1)
Fmoc-L-Thr(tBu)-OH, Fmoc-Cys(Trt)-OH, Fmoc-L-Trp(Boc)-OH, Fmoc-L-Val-OH, Fmoc-L-Leu-OH, Fmoc-L-Glu(OtBu)-OH, Fmoc-Gly-OH, Fmoc-Dap(Boc)-OH, Fmoc-L-His(Trt)-OH, Fmoc-L-Trp(Boc)-OH, Fmoc-Ala-OH, Fmoc-Cys(Trt)-OH, Fmoc-Asp(tBu)-OH.
FcBP(L6Dab) : 사용된 Fmoc 아미노산 목록 및 도입순서 (n =2)
Fmoc-L-Thr(tBu)-OH, Fmoc-Cys(Trt)-OH, Fmoc-L-Trp(Boc)-OH, Fmoc-L-Val-OH, Fmoc-L-Leu-OH, Fmoc-L-Glu(OtBu)-OH, Fmoc-Gly-OH, Fmoc-Dab(Boc)-OH, Fmoc-L-His(Trt)-OH, Fmoc-L-Trp(Boc)-OH, Fmoc-Ala-OH, Fmoc-Cys(Trt)-OH, Fmoc-Asp(tBu)-OH.
FcBP(L6Orn) : 사용된 Fmoc 아미노산 목록 및 도입순서 (n =3)
Fmoc-L-Thr(tBu)-OH, Fmoc-Cys(Trt)-OH, Fmoc-L-Trp(Boc)-OH, Fmoc-L-Val-OH, Fmoc-L-Leu-OH, Fmoc-L-Glu(OtBu)-OH, Fmoc-Gly-OH, Fmoc-Orn(Boc)-OH, Fmoc-L-His(Trt)-OH, Fmoc-L-Trp(Boc)-OH, Fmoc-Ala-OH, Fmoc-Cys(Trt)-OH, Fmoc-Asp(tBu)-OH.
FcBP(L6Lys) : 사용된 Fmoc 아미노산 목록 및 도입순서 (n =4)
Fmoc-L-Thr(tBu)-OH, Fmoc-Cys(Trt)-OH, Fmoc-L-Trp(Boc)-OH, Fmoc-L-Val-OH, Fmoc-L-Leu-OH, Fmoc-L-Glu(OtBu)-OH, Fmoc-Gly-OH, Fmoc-Lys(Boc)-OH, Fmoc-L-His(Trt)-OH, Fmoc-L-Trp(Boc)-OH, Fmoc-Ala-OH, Fmoc-Cys(Trt)-OH, Fmoc-Asp(tBu)-OH.
제조 방법
(a) 아미노산 도입
하기 과정에서 사용된 시약의 양은 0.25 mmole에 기초하였다. 0.5 g의 Clear amide resin (0.48 mmole/g, PeptideInternational, 미국)를 합성 반응기에 넣고, 각각의 Fmoc-아미노산 블록 1 mmole의 무게를 달아 펩타이드 아미노산 서열 순서대로 C-말단에서부터 N-말단까지 준비하였다.
Fmoc-아미노산을 활성화하여 Clear amide resin에 활성화된 잔기를 부착하는 반응을 C-말단 아미노산부터 순차적으로 진행하였다.
Fmoc의 제거는 20% 피페리딘 함유 DMF에서 수행하였고 잔기의 활성화 및 도입은 서열에 맞추어 준비한 아미노산을 2 mL 0.5 M HOBt 함유 DMF 용액, 2 mL 0.5 M HBTU 함유 DMF 용액, 그리고 174 μL DIPEA와 5 분간 혼합한 다음 레진이 담긴 반응기에 부어 2 시간 동안 혼합하였다.
도입 반응의 확인은 카이저 시험법으로 수행하였으며 미반응으로 확인되면 도입 반응을 1회 더 반복하거나 20% Ac2O함유 DMF용액으로 캡핑을 실시하였다. 각 도입 반응과 Fmoc 제거 과정에서 다음 단계로 넘어가기 전에 DMF와 DCM으로 수지를 충분히 세척하였다. 이러한 과정은 목표한 펩타이드 서열이 완성될 때까지 반복하여 진행하였다.
(b) H-PEG8-OH의 도입
아미노산 도입이 모두 끝난 다음에 N-말단에 H-PEG8-OH를 도입하기 위하여 1 mL 0.5 M Fmoc-N-amido-dPEG8-acid in DMF 용액, 1 mL 0.5 M HBTU 함유 DMF 용액, 1 mL 0.5 M HOBt 함유 DMF 용액, 그리고 87 μL DIPEA와 5 분간 혼합한 다음 반응 레진이 담긴 반응기에 부어 2 시간 동안 혼합하였다.
반응의 진행은 카이저 시험법으로 확인하였으며, 미반응 아민이 남아있는 것으로 판단되면 반응 시간을 1 ~ 3시간 더 연장하거나 반응액을 비우고 상기의 반응 과정을 다시 반복하였다. N-말단의 Fmoc 보호기의 제거는 20% 피페리딘 함유 DMF를 사용하여 수행한 다음, 펩타이드가 부착된 레진을 건조하고 중량을 측정하였다.
(c) 노르보레인(Norbornene)의 도입
N-말단의 Fmoc 보호기의 제거는 레진에 노르보레인 카르복실산 4당량, 2 mL 0.5 M HOBt 함유 DMF 용액, 2 mL 0.5 M HBTU 함유 DMF 용액, 그리고 174 μL DIPEA와 5 분간 혼합한 다음 레진이 담긴 반응기에 부어 2 시간 동안 혼합하였다. 도입 반응의 확인은 카이저 시험법으로 수행하였으며 미반응으로 확인되면 도입 반응을 1회 더 반복하였다.
(d) 상기 (c) 과정에서 준비한 펩타이드가 부착된 수지 250 mg을 TFA, TIS, 물 그리고 EDT (94:1.0:2.5:2.5)의 혼합액 2 mL과 함께 실온에서 120 분간 교반하여 레진에서 펩타이드를 절단하였다. 절단 혼합물을 여과하고 여과액을 질소 가스로 절반 가량 농축한 다음 에테르를 부어 펩타이드를 침전시켰다. 침전된 펩타이드를 에테르로 3 회 더 세척하고 질소 가스로 건조시켰다. 건조된 침전을 0.1% TFA-30% ACN 함유 물에 녹인 다음 6 시간 동안 교반한 다음 농축하였다.
농축액을 5%-DMSO-20%-ACN 함유 0.01 M ammonium acetate buffer (pH 6.5) 용액에 0.1 mg/mL 농도로 녹인 다음 공기 노출된 상태로 3 일 동안 교반하였다. 이황화 결합 형성 반응의 진행은 HPLC로 관측하였으며, 더 이상 진행하지 않는 것으로 판단되면 반응액을 동결건조하여 펩타이드 침전물을 얻었다.
(e) 정제
상기 (d) 과정에서 동결건조하여 얻은 펩타이드 침전물을 하기 표 6에 기재된 prep-LC 조건에서 정제하고 동결 건조하였다. 얻어진 펩타이드는 각각 90% 이상의 순도임을 확인하였다.
(f) 서열
FcBP(L6Dap)-Norbornene : Norbornene-PEG8-Asp-Cys*-Ala-Trp-His-Dap-Gly-Glu-Leu-Val-Trp-Cys*-Thr-NH2 (Cys*: 이황화 결합 위치)
FcBP(L6Dab)-Norbornene : Norbornene-PEG8-Asp-Cys*-Ala-Trp-His-Dab-Gly-Glu-Leu-Val-Trp-Cys*-Thr-NH2 (Cys*: 이황화 결합 위치)
FcBP(L6Orn)-Norbornene : Norbornene-PEG8-Asp-Cys*-Ala-Trp-His-Orn-Gly-Glu-Leu-Val-Trp-Cys*-Thr-NH2 (Cys*: 이황화 결합 위치)
FcBP(L6Lys)-Norbornene : Norbornene-PEG8-Asp-Cys*-Ala-Trp-His-Lys-Gly-Glu-Leu-Val-Trp-Cys*-Thr-NH2 (Cys*: 이황화 결합 위치)
Prep-LC 정제조건
장비명 Waters 2525 pump, Waters 2487 UV detector
컬럼 Waters, XBridge Prep C18 5 μm OBD 19 x 250 mm
이동상 A/B 0.1% TFA in H2O / 0.1% TFA in Acetonitrile
구배 0 min → 30 min : B 20% → B 100%
유속 10 mL/min 검출파장 UV 280 nm
실시예 9-1-2: 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Dap)-Norbornene의 합성화합물 Ⅱ(Cis-norbornene weinreb amide)-FcBP의 합성은 DMF에서 수행하였고 FcBP(L6Dap)-norbornene에 화합물 Ⅱ를 도입하기 위해 위해 DMF에 녹인 7.3 μmol의 FcBP(6Dap)-norbornene에 3 당량의 DIPEA와 8.4 μmol의 화합물 Ⅱ를 녹여 교반하였다.
반응의 종결을 확인한 후 반응 용액을 농축하였으며, Preparative-HPLC를 통하여 화합물 Ⅱ-FcBP(6Dap)-norbornene의 정제를 시도하였다. 정제 후 동결 건조를 통하여 14.1 mg을 확보하였으며, 순도 또한 HPLC를 이용하여 확인하였다 (Purity; >99% (HPLC), yield: 83%).
상기 결과를 도 30에 도시하였다.
실시예 9-1-3: 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Dap)-Norbornene의 구조 확인
측정 장비 : Waters quattro premier xe
Calculated molecular weight : 2309.61 g/mol
Measured molecular weight (M/2+H)2+ : 1155.08 g/mol
상기 결과를 도 31에 도시하였다.
실시예 9-1-4: 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Dab)-Norbornene의 합성
화합물 Ⅱ(Cis-norbornene weinreb amide)-FcBP의 합성은 DMF에서 수행하였고 FcBP(L6Dab)-norbornene에 화합물 Ⅱ를 도입하기 위해 위해 DMF에 녹인 7.3 μmol의 FcBP(6Dab)-norbornene에 3 당량의 DIPEA와 8.4 μmol의 화합물 Ⅱ를 녹여 교반하였다.
반응의 종결을 확인한 후 반응 용액을 농축하였으며, Preparative-HPLC를 통하여 화합물 Ⅱ-FcBP(6Dab)-norbornene의 정제를 시도하였다. 정제 후 동결 건조를 통하여 13.8 mg을 확보하였으며, 순도 또한 HPLC를 이용하여 확인하였다 (Purity; >99% (HPLC), yield: 82%).
상기 결과를 도 32에 도시하였다.
실시예 9-1-5: 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Dab)-Norbornene의 구조 확인
측정 장비 : Waters quattro premier xe
Calculated molecular weight : 2323.64 g/mol
Measured molecular weight (M/2+H)2+ : 1162.02 g/mol
상기 결과를 도 33에 도시하였다.
실시예 9-1-6: 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Orn)-Norbornene의 합성
화합물 Ⅱ(Cis-norbornene weinreb amide)-FcBP의 합성은 DMF에서 수행하였고 FcBP(L6Orn)-norbornene에 화합물 Ⅱ를 도입하기 위해 위해 DMF에 녹인 7.2 μmol의 FcBP(L6Orn)-norbornene에 3 당량의 DIPEA와 8.3 μmol의 화합물 Ⅱ를 녹여 교반하였다.
반응의 종결을 확인한 후 반응 용액을 농축하였으며, Preparative-HPLC를 통하여 화합물 Ⅱ-FcBP(L 6Orn)-norbornene의 정제를 시도하였다. 정제 후 동결 건조를 통하여 14.8 mg을 확보하였으며, 순도 또한 HPLC를 이용하여 확인하였다 (Purity; >99% (HPLC), yield: 88%).
상기 결과를 도 34에 도시하였다.
실시예 9-1-7: 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Orn)-Norbornene의 구조 확인
측정 장비 : Waters quattro premier xe
Calculated molecular weight : 2337.66 g/mol
Measured molecular weight (M/2+H)2+ : 1169.03 g/mol
상기 결과를 도 35에 도시하였다.
실시예 9-1-8: 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Lys)-Norbornene의 합성
화합물 Ⅱ(Cis-norbornene weinreb amide)-FcBP의 합성은 DMF에서 수행하였고 FcBP(L6Lys)-norbornene에 화합물 Ⅱ를 도입하기 위해 위해 DMF에 녹인 7.2 μmol의 FcBP(L6Lys)-norbornene에 3 당량의 DIPEA와 8.3 μmol의 화합물 Ⅱ를 녹여 교반하였다.
반응의 종결을 확인한 후 반응 용액을 농축하였으며, Preparative-HPLC를 통하여 화합물 Ⅱ-FcBP(6Lys)-norbornene의 정제를 시도하였다. 정제 후 동결 건조를 통하여 15.4 mg을 확보하였으며, 순도 또한 HPLC를 이용하여 확인하였다 (Purity; >99% (HPLC), yield: 91%).
상기 결과를 도 36에 도시하였다.
실시예 9-1-9: 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Lys)-Norbornene의 구조 확인
측정 장비 : Waters quattro premier xe
Calculated molecular weight : 2351.69 g/mol
Measured molecular weight (M/2+H)2+ : 1176.04 g/mol
상기 결과를 도 37에 도시하였다.
[실시예 10] 탄소 길이에 따른 위치 특이적 인터랙톰의 항체 결합 효율 검증
실시예 10-1. 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Dap, L6Dab, L6Orn, L6Lys)-Norbornene에 의한 Site-specific Antibody-Norbornene conjugate 제작
실시예 10-1-1: 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Dap)-Norbornene 기반 트라스투주맙(Trastuzumab)-Norbornene 합성
Ab (246/248 Lys)-Norbornene의 합성은 pH 7.4 PBS (phosphate buffered saline) buffer 상에서 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Dap)-norbornene을 이용하여 진행하였다. 항체(Trastuzumab 4mg/mL, 1mL)의 특정 2 곳의 위치에 norbornene 도입을 위해 항체 당 6 당량의 화합물Ⅱ-FcBP(L6Dap)-norbornene을 반응액에 넣은 후 반응을 진행하였다. 반응 온도 및 시간은 상온에서 12 시간 소요되었으며, 반응 모니터링 및 종결은 HIC-HPLC를 통해 확인하였다. 트라스투주맙은 HIC-HPLC 상에서 6.3 ~ 6.4 분에 피크를 나타내며, 트라스투주맙의 두 결합 위치 중 한 부분만 결합 했을 때는 8 분, 두 위치 모두 FcBP(L6Dap)-norbornene 분자가 결합했을 때는 9 분의 HIC-HPLC 크로마토그램을 확인할 수 있다. 화합물Ⅱ-FcBP(L6Dap)-norbornene 기반 항체와의 결합 반응 모니터링은 도 38에 도시하였다. 9.074분에서 피크가 관측되는 것을 통해 DAR=2인 항체-페이로드 콘쥬게이트가 합성되는 것을 확인하였다.
실시예 10-1-2: 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Dab)-Norbornene 기반 트라스투주맙(Trastuzumab)-Norbornene 합성
Ab (246/248 Lys)-Norbornene의 합성은 pH 7.4 PBS (phosphate buffered saline) buffer 상에서 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Dab)-norbornene을 이용하여 진행하였다. 항체(Trastuzumab 4mg/mL, 1mL)의 특정 2 곳의 위치에 norbornene 도입을 위해 항체 당 6 당량의 화합물Ⅱ-FcBP(L6Dab)-norbornene을 반응액에 넣은 후 반응을 진행하였다. 반응 온도 및 시간은 상온에서 12 시간 소요되었으며, 반응 모니터링 및 종결은 HIC-HPLC를 통해 확인하였다. 트라스투주맙은 HIC-HPLC 상에서 6.3 ~ 6.4 분에 피크를 나타내며, 트라스투주맙의 두 결합 위치 중 한 부분만 결합 했을 때는 8 분, 두 위치 모두 FcBP(L6Dab)-norbornene 분자가 결합했을 때는 9 분의 HIC-HPLC 크로마토그램을 확인 할 수 있다. 화합물Ⅱ-FcBP(L6Dab)-norbornene 기반 항체와의 결합 반응 모니터링은 도 39에 도시하였다. 9.231분에서 피크가 관측되는 것을 통해 DAR=2인 항체-페이로드 콘쥬게이트가 합성되는 것을 확인하였다.
실시예 10-1-3: 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Orn)-Norbornene 기반 트라스투주맙(Trastuzumab)-Norbornene 합성
Ab (246/248 Lys)-Norbornene의 합성은 pH 7.4 PBS (phosphate buffered saline) buffer 상에서 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Orn)-norbornene을 이용하여 진행하였다. 항체(Trastuzumab 4mg/mL, 1mL)의 특정 2 곳의 위치에 norbornene 도입을 위해 항체 당 6 당량의 화합물Ⅱ-FcBP(L6Orn)-norbornene을 반응액에 넣은 후 반응을 진행하였다. 반응 온도 및 시간은 상온에서 12 시간 소요되었으며, 반응 모니터링 및 종결은 HIC-HPLC를 통해 확인하였다. 트라스투주맙은 HIC-HPLC 상에서 6.3 ~ 6.4 분에 피크를 나타내며, 트라스투주맙의 두 결합 위치 중 한 부분만 결합 했을 때는 8 분, 두 위치 모두 FcBP(L6Orn)-norbornene 분자가 결합했을 때는 9 분의 HIC-HPLC 크로마토그램을 확인 할 수 있다. 화합물Ⅱ-FcBP(L6Orn)-norbornene 기반 항체와의 결합 반응 모니터링은 도 40에 도시하였다. 8.975분에서 피크가 관측되는 것을 통해 DAR=2인 항체-페이로드 콘쥬게이트가 합성되는 것을 확인하였다.
실시예 10-1-4: 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Lys)-Norbornene 기반 트라스투주맙(Trastuzumab)-Norbornene 합성
Ab (246/248 Lys)-Norbornene의 합성은 pH 7.4 PBS (phosphate buffered saline) buffer 상에서 화합물 Ⅱ-FcBP(L6Lys)-norbornene을 이용하여 진행하였다. 항체(Trastuzumab 4mg/mL, 1mL)의 특정 2 곳의 위치에 norbornene 도입을 위해 항체 당 6 당량의 화합물Ⅱ-FcBP(L6Lys)-norbornene을 반응액에 넣은 후 반응을 진행하였다. 반응 온도 및 시간은 상온에서 12 시간 소요되었으며, 반응 모니터링 및 종결은 HIC-HPLC를 통해 확인하였다. 트라스투주맙은 HIC-HPLC 상에서 6.3 ~ 6.4 분에 피크를 나타내며, 트라스투주맙의 두 결합 위치 중 한 부분만 결합 했을 때는 8 분, 두 위치 모두 FcBP(L6Lys)-norbornene 분자가 결합했을 때는 9 분의 HIC-HPLC 크로마토그램을 확인 할 수 있다. 화합물Ⅱ-FcBP(L6Lys)-norbornene 기반 항체와의 결합 반응 모니터링은 도 41에 도시하였다. 9.120분에서 피크가 관측되는 것을 통해 DAR=2인 항체-페이로드 콘쥬게이트가 합성되는 것을 확인하였다.

Claims (20)

  1. 하기 화학식 2로 표시되는 화합물:
    [화학식 2]
    Figure PCTKR2020001145-appb-I000130
    상기 식에서,
    R'은 에스터 그룹 활성화 잔기이며,
    R''은 아세틸렌(Acetylene), 트랜스사이클로옥텐(transcyclooctene), 사이클로옥타인(cyclooctyne), 다이아릴사이클로옥타인(dyarylcyclooctyne), 메틸 에스터 포스핀(methyl ester phosphine), 노르보레인(norbornene), 메틸사이클로프로펜(methylcyclopropene), 아제틴(azetine) 및 사이아나이드(cyanide) 중 어느 하나이며,
    R'''은 치환 또는 비치환된 C1-20 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C2-20 알케닐렌, 치환 또는 비치환된 C1-10 알키닐렌, 치환 또는 비치환된 C1-10 폴리메틸렌, 치환 또는 비치환된 C5-12 아릴, 치환 또는 비치환된 C5-14 아릴 알킬렌, 치환 또는 비치환된 C8-16 아릴 알케닐렌, 치환 또는 비치환된 C3-10 사이클로알킬렌, 치환 또는 비치환된 C3-10 헤테로사이클로알킬렌, 또는 치환 또는 비치환된 C5-12 헤테로아릴이며, 상기 헤테로알킬렌, 헤테로사이클로알킬렌 또는 헤테로아릴은 N, O 또는 S가 적어도 하나 이상 포함되고,
    상기 치환은 비수소 치환기로 치환된 것으로, 상기 비수소 치환기는 -Ra, -O-, =O, -ORa, -SRa, -S-, -N(Ra)2, =NRa, -C(Rb)3, -N=C=O, -NCS, -NO, -NO2, =N-OH, =N2, -N3, -NHC(=O)Ra, -C(=O)Ra, -C(=O)NRaRa -S(=O)2O-, -S(=O)2OH, -S(=O)2Ra, -OS(=O)2ORa, -S(=O)2NRa, -S(=O)Ra, -C(=O)Ra, 알킬렌-C(=O)Ra, -C(=S)Ra, -C(=O)ORa, 알킬렌-C(=O)ORa, -C(=O)O-, 알킬렌-C(=O)O-, -C(=S)ORa, -C(=O)SRa, -C(=S)SRa, -C(=O)NRaRa, 알킬렌-C(=O)NRaRa, -C(=S)NRaRa, -C(-NRa)NRaRa 및 Rb로 이루어진 군으로부터 하나 이상 선택될 수 있고,
    상기 Ra는 H, C1-6 알킬, C5-12 아릴, C7-12 아릴알킬 또는 헤테로사이클이고,
    상기 Rb은 F, Cl, Br, 또는 I이고,
    X는 O, N 및 S 중 어느 하나임.
  2. 제 1항에 있어서,
    상기 R''은 노르보레인(norbornene), 트랜스사이클로옥텐(transcyclooctene), 사이클로옥타인(cyclooctyne) 및 메틸사이클로프로펜(methylcyclopropene) 중 어느 하나인 화합물.
  3. 제 2항에 있어서,
    상기 R''은 노르보레인(norbornene)인 화합물.
  4. 제 1항에 있어서,
    R'''은 치환 또는 비치화된 C1-10알킬렌, 치환 또는 비치환된 C1-10 헤테로 알킬렌 및 C1-10폴리메틸렌 중 어느 하나이며,
    상기 헤테로 알킬렌은 N, O 또는 S가 적어도 하나 이상 포함되고,
    상기 치환은 비수소 치환기로 치환된 것으로, 비수소 치환기는 -O-, =O, -ORa, -SRa, -S-, -N(Ra)2, =NRa, -N=C=O, -NCS, -NO, -NO2, =N-OH, =N2, -N3, -NHC(=O)Ra, -C(=O)Ra, -C(=O)NRaRa -S(=O)2O-, -S(=O)2OH, -S(=O)2Ra, -OS(=O)2ORa, -S(=O)2NRa, -S(=O)Ra, -C(=O)Ra, 알킬렌-C(=O)Ra, -C(=S)Ra, -C(=O)ORa, 알킬렌-C(=O)ORa, -C(=O)O-, 알킬렌-C(=O)O-, -C(=S)ORa, -C(=O)SRa, -C(=S)SRa, -C(=O)NRaRa, 알킬렌-C(=O)NRaRa, -C(=S)NRaRa 및 -C(-NRa)NRaRa로 이루어진 군으로부터 하나 이상이며,
    상기 Ra는 C1-6 알킬, C5-12 아릴, C7-12 아릴알킬 또는 헤테로사이클이고,
    상기 Rb는 F, Cl, Br, 또는 I이고,
    X는 O, N 및 S 중 어느 하나인 것을 특징으로 하는 화합물.
  5. 제 4항에 있어서,
    상기 R'''은 비치환된 C1-5 알킬렌 또는 비치환된 C1-5 폴리메틸렌인 것을 특징으로 하는, 화합물.
  6. 제 1항에 있어서,
    상기 X는 O인 것을 특징으로 하는, 화합물.
  7. 제 1항에 있어서, 상기 화학식 2의 화합물은 하기 화학식 2-1-2로 표시되는 것인 화합물
    [화학식 2-1-2]
    Figure PCTKR2020001145-appb-I000131
    .
  8. 제1항에 의한 링커를 Fc 결합성 펩타이드와 반응시켜 링커-Fc 결합성 펩타이드 콘쥬게이트를 제조함;
    상기 링커-Fc 결합성 펩타이드 콘쥬게이트와 항체를 반응시켜 상기 항체에 제1 클릭 화학 작용기를 포함시킴; 및
    상기 제1 클릭 화학작용기를 포함하는 항체에 상기 제1 클릭 화학작용기와 상보적인 제2 클릭 화학작용기를 포함하는 페이로드를 반응시켜 하기 화학식 8의 구조를 갖는 항체-페이로드 콘쥬게이트를 제조함을 포함하는
    항체-페이로드 콘쥬게이트를 제조하기 위한 방법:
    [화학식 8]
    Figure PCTKR2020001145-appb-I000132
    이때, Ab는 항체이고,
    R'''은 비치환된 C1-5 알킬렌 또는 비치환된 C1-5 폴리메틸렌이며,
    Y4는 N이고,
    Fp는 Fc 결합성 펩타이드이며,
    B는 상기 제1 클릭 화학작용기와 상기 제2 클릭 화학작용기의 클릭화학 반응 (click-chemistry)에 의하여 형성되는 구조들 중 어느 하나이며,
    Am은 활성 모이어티 또는 이를 포함하는 구조로서, 상기 활성 모이어티는 약물 분자, 이미징 모이어티, 광학 작용제, 비타민 및 독소로부터 선택된 어느 하나이고,
    n은 1 이상 4 이하의 정수임.
  9. 제8항에 있어서,
    상기 Fc 결합성 펩타이드는 화학식 13 또는 14 중 선택된 어느 하나의 펩타이드이고,
    이때
    [화학식 13]
    D-C-A-W-H-Xa-G-E-L-V-W-C-T
    [화학식 14]
    D-C-A-W-H-K-G-E-L-V-W-C-T
    이때, D는 아스파르트산이고, C는 시스테인이며, A는 알라닌이고, W는 트립토판이며, H는 히스티딘이고, Xa는
    Figure PCTKR2020001145-appb-I000133
    이며, G는 글리신이고, E는 글루탐산이며, L은 류신이고, V는 발린이며, T는 트레오닌이고, K는 라이신이며,
    이때, m은 1 이상 4 이하의 정수이고, N 말단의 시스테인과 C 말단의 시스테인은 선택적으로 서로 연결되어 있을 수 있으며,
    이로써 n=2이고, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 양 Fc의 246번 라이신 또는 248번 라이신 잔기에 포함된 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트를 제조하기 위한 방법.
  10. 화학식 8의 구조를 갖는 항체-페이로드 콘쥬게이트:
    [화학식 8]
    Figure PCTKR2020001145-appb-I000134
    이때, Ab는 항체이고,
    R'''은 비치환된 C1-5 알킬렌 또는 비치환된 C1-5 폴리메틸렌이며,
    Y4는 N이고,
    Fp는 Fc 결합성 펩타이드이며,
    B는 상기 제1 클릭 화학작용기와 상기 제2 클릭 화학작용기의 클릭화학 반응 (click-chemistry)에 의하여 형성되는 구조들 중 하나이며,
    Am은 활성 모이어티 또는 이를 포함하는 구조로서, 상기 활성 모이어티는 약물 분자, 이미징 모이어티, 광학 작용제, 비타민 및 독소로부터 선택된 어느 하나이고,
    n은 1 이상 4 이하의 정수임.
  11. 제10항에 있어서,
    상기 Fp는 화학식 13 또는 14 중 선택된 어느 하나의 펩타이드이고,
    이때
    [화학식 13]
    D-C-A-W-H-Xa-G-E-L-V-W-C-T
    [화학식 14]
    D-C-A-W-H-K-G-E-L-V-W-C-T
    이때, D는 아스파르트산이고, C는 시스테인이며, A는 알라닌이고, W는 트립토판이며, H는 히스티딘이고, Xa는
    Figure PCTKR2020001145-appb-I000135
    이며, G는 글리신이고, E는 글루탐산이며, L은 류신이고, V는 발린이며, T는 트레오닌이고, K는 라이신이며,
    이때, m은 1 이상 4 이하의 정수이고, N 말단의 시스테인과 C 말단의 시스테인은 선택적으로 서로 연결되어 있을 수 있으며,
    상기 Fp는 6번 아미노산 잔기에서 Y4를 통해 연결되는 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트.
  12. 제10항에 있어서,
    B는
    Figure PCTKR2020001145-appb-I000136
    또는
    Figure PCTKR2020001145-appb-I000137
    이고,
    이때 A1은 항체와 연결되어있고 A2는 Am과 연결되어있거나 또는 A1은 Am과 연결되어있고 A2는 항체와 연결되어있는 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트.
  13. 제12항에 있어서,
    B는
    Figure PCTKR2020001145-appb-I000138
    인 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트.
  14. 제10항에 있어서,
    상기 Am은 항암제를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트.
  15. 제14항에 있어서,
    상기 항암제는 메르탄신 (mertansine; DM1)인 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트.
  16. 제14항에 있어서,
    상기 Am은 2개 이상의 항암제를 포함하는 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트.
  17. 제10항에 있어서,
    Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 Fc의 246번 라이신 또는 248번 라이신 잔기에 포함된 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트.
  18. 제10항에 있어서,
    n=2이고, Ab와 연결된 질소 원자는 상기 항체의 양 Fc의 246번 라이신 또는 248번 라이신에 포함된 것을 특징으로 하는 항체-페이로드 콘쥬게이트.
  19. 제14항에 의한 항체-페이로드 콘쥬게이트를 포함하는, 암을 치료하기 위한 약학적 조성물.
  20. 제19항에 있어서,
    상기 암은 유방암인 것을 특징으로 하는 약학적 조성물.
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