WO2009116566A1 - 工業的に有用な微生物 - Google Patents

工業的に有用な微生物 Download PDF

Info

Publication number
WO2009116566A1
WO2009116566A1 PCT/JP2009/055267 JP2009055267W WO2009116566A1 WO 2009116566 A1 WO2009116566 A1 WO 2009116566A1 JP 2009055267 W JP2009055267 W JP 2009055267W WO 2009116566 A1 WO2009116566 A1 WO 2009116566A1
Authority
WO
WIPO (PCT)
Prior art keywords
gene
sequence represented
dna
base sequence
coli
Prior art date
Application number
PCT/JP2009/055267
Other languages
English (en)
French (fr)
Inventor
貴美枝 桝田
典子 中村
溝口　寛
英郎 森
Original Assignee
協和発酵キリン株式会社
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by 協和発酵キリン株式会社 filed Critical 協和発酵キリン株式会社
Priority to EP09722714A priority Critical patent/EP2298880A4/en
Priority to US12/933,022 priority patent/US20110111458A1/en
Publication of WO2009116566A1 publication Critical patent/WO2009116566A1/ja

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/195—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria
    • C07K14/24—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from bacteria from Enterobacteriaceae (F), e.g. Citrobacter, Serratia, Proteus, Providencia, Morganella, Yersinia
    • C07K14/245—Escherichia (G)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/70—Vectors or expression systems specially adapted for E. coli
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/0004—Oxidoreductases (1.)
    • C12N9/0006—Oxidoreductases (1.) acting on CH-OH groups as donors (1.1)
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
    • C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P19/00—Preparation of compounds containing saccharide radicals
    • C12P19/26—Preparation of nitrogen-containing carbohydrates
    • C12P19/28—N-glycosides
    • C12P19/30—Nucleotides
    • C12P19/34—Polynucleotides, e.g. nucleic acids, oligoribonucleotides
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P21/00—Preparation of peptides or proteins
    • C12P21/02—Preparation of peptides or proteins having a known sequence of two or more amino acids, e.g. glutathione
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P7/00—Preparation of oxygen-containing organic compounds
    • C12P7/64—Fats; Fatty oils; Ester-type waxes; Higher fatty acids, i.e. having at least seven carbon atoms in an unbroken chain bound to a carboxyl group; Oxidised oils or fats
    • C12P7/6436—Fatty acid esters
    • C12P7/6445—Glycerides
    • C12P7/6463—Glycerides obtained from glyceride producing microorganisms, e.g. single cell oil

Definitions

  • the present invention relates to a mutant of Escherichia coli whose chromosomal DNA is shorter than that of wild-type E. coli, and a method for producing a useful substance using the mutant.
  • the base sequence displayed on the Internet site is a base sequence represented by Accession No. AC_000091 of NCBI (National Center for Biothechnology Information) GenBank.
  • a homologous gene refers to a gene in which the sequence homology is recognized in the base sequence of the gene in E. coli species, or a gene in which the sequence homology is recognized in the amino acid sequence of the protein encoded by the gene.
  • the sequence homology is recognized as 85% or more, preferably 90% or more, more preferably 95% or more, further preferably 98% or more, particularly preferably 99% or more of the sequence similarity or amino acid sequence in the base sequence.
  • the sequence similarity is 80% or more, preferably 90% or more, more preferably 95% or more, still more preferably 98% or more, and particularly preferably 99% or more.
  • E. coli mutant obtained by modification by a method selected from [1] Method for mitigating or canceling at least one mechanism for controlling biosynthesis of useful substances [2] Method for enhancing expression of at least one enzyme involved in biosynthesis of useful substances [3] Biosynthesis of useful substances Method of increasing at least one copy number of an enzyme gene involved in synthesis [4] Method of weakening or blocking at least one metabolic pathway branching from a biosynthetic pathway of a useful substance to a metabolite other than the useful substance [5] A method of selecting a cell line having a higher resistance to analogs of useful substances than wild-type E. coli can be mentioned.
  • the mutants of Escherichia coli of the above (1) to (23) have a part or all of a gene encoding a protein that is not directly involved in biosynthesis of a useful substance but indirectly suppresses the production of the useful substance. It is thought to be missing.
  • the mutant and the mutant of the above (24) are useful as mutants of E. coli that produce useful substances.
  • the Escherichia coli mutant of the present invention may be any Escherichia coli mutant as long as it belongs to Escherichia coli, preferably an Escherichia coli K-12 strain, an Escherichia coli B strain, and an Escherichia coli W strain, more preferably A mutant of E. coli K-12, more preferably a mutant of E.
  • Escherichia coli mutant of the present invention is not limited as long as the mutant can be obtained. It can be obtained by a method of deleting the gene or DNA.
  • a method using homologous recombination As a method for deleting a gene or DNA on the chromosomal DNA of Escherichia coli, a method using homologous recombination can be given.
  • a general method using homologous recombination a gene to be deleted on the chromosomal DNA of Escherichia coli or a DNA fragment existing on both outer sides of the DNA and a plasmid DNA having a drug resistance gene that cannot autonomously replicate in the Escherichia coli
  • a method using a plasmid for homologous recombination that can be produced by ligation can be mentioned.
  • a transformant in which the plasmid for homologous recombination is incorporated into the chromosomal DNA by homologous recombination is selected using drug resistance as an index.
  • the obtained transformant is cultured in a medium not containing the drug for several hours to 1 day, and then applied to the drug-containing agar medium and the drug-free agar medium.
  • a strain that can grow on the medium By selecting a strain that can grow on the medium, a strain in which the second homologous recombination has occurred on the chromosomal DNA can be obtained. It is possible to confirm that the target gene or DNA on the chromosomal DNA has been deleted by determining the base sequence of the region where the gene or DNA to be deleted on the chromosomal DNA was present.
  • a method using linear DNA can be mentioned. Specifically, a linear DNA containing a gene to be deleted on chromosomal DNA or a DNA fragment existing on both outer sides of the DNA is taken into the cell, and a homologous group between the chromosomal DNA and the introduced linear DNA. It is a method of causing a change.
  • This method can be applied to any microorganism as long as it efficiently incorporates linear DNA, and preferably includes E. coli expressing a recombinant protein group derived from ⁇ phage (Red recombination system). it can.
  • Escherichia coli expressing the ⁇ Red recombination system examples include Escherichia coli JM101 strain having pKD46 [available from Escherichia coli Genetic Stock Center (Yale University, USA)] which is a plasmid DNA having the ⁇ Red recombination system gene. be able to.
  • DNA used for homologous recombination As DNA used for homologous recombination, (A) a linear DNA having DNA existing on both sides of the region on the chromosomal DNA to be introduced with base deletion, substitution or addition, or DNA having homology with the DNA at both ends of the drug resistance gene; (B) DNA existing on both sides of the region on the chromosomal DNA to be introduced with base deletion, substitution or addition, or linear DNA directly ligated with DNA having homology with the DNA, (C) DNA existing on both sides of the region on the chromosomal DNA to be introduced with base deletion, substitution or addition, or DNA having homology with the DNA can be used for drug resistance gene and negative selection Linear DNA at both ends of the gene, (D) In the linear DNA of (a) above, a yeast-derived Flp recombinase [Proc Natl. Acad. Sci. USA., 82 , 5875 (1985)], a DNA having a base sequence recognized by Can give.
  • any drug resistance gene can be used as long as it is a drug resistance gene that imparts drug resistance to a drug to which Escherichia coli is sensitive.
  • the drug resistance gene include kanamycin resistance gene, chloramphenicol resistance gene, gentamicin resistance gene, spectinomycin resistance gene, tetracycline resistance gene, ampicillin resistance gene, and the like.
  • a gene that can be used for negative selection refers to a gene that is lethal to the E. coli under certain culture conditions when the gene is expressed in E. coli.
  • Examples of the gene include those belonging to the genus Bacillus. SacB gene [Appl. Environ. Microbiol., 59 , 1361-1366 (1993)] and rpsL gene [Genomics, 72 , 99-104 (2001)] derived from microorganisms belonging to the genus Escherichia Can do.
  • the length is preferably about 10 bp to 100 bp, more preferably about 20 bp to 50 bp, and further preferably about 30 to 40 bp.
  • the base sequence recognized by Flp recombinase derived from yeast is a base sequence recognized by the protein and catalyzing homologous recombination
  • the homologous DNA is a DNA having the same degree of identity that the homologous recombination occurs in the target region on the chromosomal DNA.
  • the specific homology is 80 % Or more, preferably 90% or more, more preferably 95% or more, and still more preferably 100% DNA having homology.
  • the homology of the base sequence can be determined using a program such as BLAST or FASTA described above.
  • the linear DNA fragment can be prepared by PCR.
  • the target linear DNA can be obtained by restriction enzyme treatment.
  • Method 1 A method of selecting the transformant in which the linear DNA of (a) or (d) is introduced into a host microorganism and the linear DNA is inserted into chromosomal DNA by homologous recombination using drug resistance as an index. .
  • Method 2 DNA existing on both outer sides of the region on the chromosomal DNA to be introduced with base deletion, substitution or addition, or DNA having homology with the transformant obtained by Method 1 above A method of replacing or deleting a region on the chromosomal DNA of a microorganism by introducing directly linked DNA and deleting the drug gene inserted on the chromosomal DNA by the method.
  • Method 3 [1] The linear DNA of the above (c) is introduced into a host microorganism, and a transformant in which the linear DNA is inserted into chromosomal DNA by homologous recombination is selected using drug resistance as an index.
  • [2] Synthesize DNA obtained by ligating DNA having homology with DNA located outside both ends of the target region of substitution or deletion on chromosomal DNA in the same direction as that on chromosomal DNA, and [1 To be introduced into the transformant obtained in [3] Under conditions where a gene that can be used for negative selection is expressed, the transformed strain subjected to the above operation [2] is cultured, and the strain that can grow in the culture is used as a drug resistance gene and negative selection. A method of selecting a strain in which a gene that can be used is deleted from chromosomal DNA.
  • Method 4 [1] The linear DNA of (d) above is introduced into a host microorganism, and a transformant in which the linear DNA is inserted into chromosomal DNA by homologous recombination is selected using drug resistance as an index. [2] A method for obtaining a strain sensitive to the drug used in the above [1] after introducing the Flp recombinase gene expression plasmid into the transformed strain obtained in the above [1] and expressing the gene.
  • any method can be used as long as it is a method for introducing DNA into the microorganism.
  • a method using calcium ion [Proc. Natl. Acad Sci., USA, 69 , 2110 (1972)], protoplast method (Japanese Patent Laid-Open No. 63-248394), electroporation method [Nucleic Acids Res., 16 , 6127 (1988)] and the like.
  • a drug resistance gene or the like is deleted by using a DNA in which an arbitrary gene to be inserted on the chromosomal DNA is inserted near the center of the DNA. At the same time, any gene can be inserted onto the chromosomal DNA. Since the above methods 2 to 4 are methods that do not leave a foreign gene such as a drug resistance gene and a gene that can be used for negative selection on the chromosomal DNA of the finally obtained transformant, use this method. By repeating the operations of Method 2, Method 3 [1] to [3], and Method 4 [1] [2] using the same drug resistance gene and a gene that can be used for negative selection, In addition, E. coli having a gene or DNA deficiency in two or more regions having different positions on the chromosomal DNA can be produced.
  • 1% ⁇ glucose, 0.6% disodium phosphate, 0.3% phosphate has a greater amount of E. coli mutants obtained by the above method than the wild-type E. coli after culturing for a certain period of time.
  • the parent strain was added to M9 minimal medium consisting of potassium dihydrogen, 0.05% sodium chloride, 0.1% ammonium chloride, 2 mmol / l magnesium sulfate heptahydrate, 10 mg / l iron sulfate, 100 ⁇ mol / l calcium chloride. Confirm the culture by culturing the wild-type Escherichia coli and the mutant, respectively, and measuring the 660 nm absorption of the culture at regular intervals or measuring the amount of ATP per medium according to a conventional method. Can do.
  • the Escherichia coli mutant of the present invention is a method for deleting a gene or DNA on chromosomal DNA of Escherichia coli having the ability to produce a useful substance, or a useful substance in Escherichia coli lacking a gene or DNA on chromosomal DNA. It can manufacture by the method of providing productivity.
  • the Escherichia coli having the ability to produce a useful substance may be any Escherichia coli as long as it has the ability to produce one or more useful substances, and the Escherichia coli itself is a strain isolated from nature. In the case of having E. coli, the strain itself can be exemplified by Escherichia coli and the like artificially imparted with the ability to produce a desired useful substance by a known method.
  • A a method for mitigating or releasing at least one of the mechanisms controlling biosynthesis of useful substances;
  • B a method for enhancing expression of at least one enzyme involved in biosynthesis of useful substances,
  • C a method of increasing at least one copy number of an enzyme gene involved in biosynthesis of a useful substance,
  • D a method of weakening or blocking at least one metabolic pathway that branches from a biosynthetic pathway of a useful substance to a metabolite other than the useful substance, and (e) a degree of resistance of the useful substance to an analog compared to a wild type strain
  • the above known methods can be used alone or in combination.
  • E. coli mutants capable of producing one or more amino acids can be prepared.
  • E. coli having the ability to produce other useful substances can also be used to enhance the biosynthetic enzymes of the useful substances, biosynthetic regulation mechanisms, excretion mechanisms, etc. It can be prepared by modification. 3.
  • the method for producing the useful substance of the present invention comprises culturing the Escherichia coli mutant of the present invention in a medium, generating and accumulating the useful substance in the culture, It is related with the manufacturing method of the useful substance characterized by extracting.
  • the useful substance is not particularly limited as long as it is a useful substance that can be produced using the Escherichia coli mutant of the present invention, and examples thereof include proteins, amino acids, nucleic acids, vitamins, sugars, organic acids, lipids, and the like.
  • inosine kinase Glutamate 5-kinase (EC 2.7.2.11), Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase (EC 1.2.1.41), Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2), human granulocyte colony stimulating factor, etc.
  • Glutathione as a peptide and amino acids such as L-alanine, glycine, L-glutamine, L-glutamic acid, L-asparagine, L-aspartic acid, L-lysine, L-methionine, L-threonine, L-leucine, L-valine, L-isoleucine, L-proline, L-histidine, L-arginine, L-tyrosine, L-tryptophan, L-pheny Lualanine, L-serine, L-cysteine, L-3-hydroxyproline, L-4-hydroxyproline, etc.
  • amino acids such as L-alanine, glycine, L-glutamine, L-glutamic acid, L-asparagine, L-aspartic acid, L-lysine, L-methionine, L-threonine, L-leucine, L-valine, L-isoleucine, L-proline, L-h
  • the method for producing a useful substance of the present invention is a method for producing a useful substance using an enzyme reaction that requires ATP, wherein an enzyme protein that catalyzes the enzyme reaction is produced in the E. coli mutant of the present invention, A production method is also included in which ATP for maintaining the progress of the reaction catalyzed by the enzyme protein is supplied from the E. coli mutant of the present invention.
  • the medium for culturing the Escherichia coli mutant used in the production method of the present invention contains a carbon source, a nitrogen source, inorganic salts, and the like that can be assimilated by the microorganism, as long as it can efficiently culture the microorganism. Either a natural medium or a synthetic medium may be used.
  • Any carbon source may be used as long as the microorganism can assimilate, glucose, fructose, sucrose, molasses containing them, carbohydrates such as starch or starch hydrolysate, organic acids such as acetic acid and propionic acid, ethanol, Alcohols such as propanol can be used.
  • Nitrogen sources include ammonia, ammonium salts of inorganic or organic acids such as ammonium chloride, ammonium sulfate, ammonium acetate, and ammonium phosphate, peptone, meat extract, yeast extract, corn steep liquor, casein hydrolyzate, soybean cake, large Soybean bean hydrolyzate, various fermented bacterial cells, digests thereof, and the like can be used.
  • the inorganic salt monopotassium phosphate, dipotassium phosphate, magnesium phosphate, magnesium sulfate, sodium chloride, ferrous sulfate, manganese sulfate, copper sulfate, calcium carbonate and the like can be used.
  • the culture is performed under aerobic conditions such as shaking culture or deep aeration stirring culture.
  • the culture temperature is preferably 15 to 40 ° C, and the culture time is usually 16 hours to 7 days.
  • the pH during the culture is preferably maintained at 3.0 to 9.0.
  • the pH is adjusted using an inorganic or organic acid, an alkaline solution, urea, calcium carbonate, ammonia or the like.
  • the target useful substance can be isolated and purified from the culture.
  • the useful substance is produced and accumulated in the microbial cells, after culturing, the microbial cells are recovered from the culture and then crushed by an appropriate method such as a mechanical or chemical method.
  • an ion exchange treatment method, a concentration method, a salting-out method, or the like in combination from the cell disruption solution a target useful substance can be isolated and purified from the cell disruption solution.
  • chromosome-reduced strains S1 to S10 lacking the region containing the gene shown in Table 2 below on the chromosome in Escherichia coli W3110 strain were prepared.
  • primer DNAs are designed based on the nucleotide sequences at both ends of the region on the chromosomal DNA to be deleted, and DNA fragments that are amplified using a PCR reaction using the chromosomal DNA as a template are used. Thus, any region on the chromosomal DNA can be deleted.
  • Growth Test Next, the growth of the W3110red strain, the chromosome-reduced strain S28 strain (WO2006 / 57341), and the S1 to S10 strains were compared. Table 2 shows the gene groups in which the Step28 strain is deleted on the chromosomal DNA.
  • the growth test was carried out using LB agar medium containing 30 mg / l kanamycin (LB medium [Bactotripton (Difco) 10 g / l, yeast extract (Difco) 10 g / l, sodium chloride 5 g / l)] Each strain was spread on a plate made by adding 15 g / l (Difco) and cultured at 37 ° C. overnight to obtain bacterial cells. The cells grown on the LB agar medium were inoculated into 5 ml of LB medium each containing a small amount of 30 mg / l kanamycin and cultured overnight at 37 ° C. to obtain a culture.
  • 300 ⁇ l of the culture was added to 30 ml of growth test medium (11.28 g / l 5 ⁇ M9 premixed salt, 100 mM MOPS buffer, 6% glucose, 1% yeast extract, 2 mM MgSO 4 , 0.1 mM CaCl 2 , 5 mg / l FeSO 4 , PH 6.8, 30 mg / l kanamycin) and cultured with shaking at 30 ° C. for 24 hours.
  • Turbidity of each chromosome-reduced strain after culture was measured by absorption at 660 nm. Table 3 shows the turbidity of each chromosome-reduced strain and the total deletion length of chromosomal DNA of each chromosome-reduced strain when the turbidity of the W3110red strain is 100.
  • ATP production activity The ATP production activity of the W3110red strain, Step28 strain and S10 strain was measured by the following methods. Each strain was applied to an LB agar medium and cultured overnight at 30 ° C. A small amount of the cells grown on the LB agar medium was scraped, inoculated into a 96-well deep well plate containing 1 ml of LB medium containing 3% glucose, and cultured at 30 ° C. for 24 hours. Turbidity after culture was measured by absorption at 590 nm. In addition, ATP production activity per culture broth was measured by the method described in J. Biomol. Screen., 11 , 310 (2006). Table 4 shows the ATP production activity per culture solution of Step 28 strain and S10 strain when the ATP production activity per culture broth of W3110red strain was taken as 100. In S10 strain, ATP production activity per culture broth was remarkably improved.
  • the lacI gene of S28W strain and S10W strain was restored by the following method.
  • a DNA fragment containing a chloramphenicol resistance gene and a levansuclease gene is inserted into the W3110red strain chromosome, and at the same time, the region from the yafW gene to the yahM gene shown in Table 1 is inserted.
  • P1 phage was prepared from this strain, transduced into S28W strain and S10W strain, and a chloramphenicol resistant strain was obtained to obtain a lacI reverted strain in which the lacI gene in the vicinity of the marker gene was transduced. .
  • the marker part containing the chloramphenicol resistance gene and levanshuclease gene of the acquired lacI gene-reverted strain was removed using the method described in JP-A-2004-166576.
  • the lacI gene reversion strains derived from the S28W and S10W strains finally produced were named S28W_lacI strain and S10W_lacI strain.
  • a xylitol-producing gene group was introduced into each of the W3110 strain, S28W_lacI strain, and S10W_lacI strain to convert xylose into xylitol.
  • a strain to which ability was imparted was prepared. Each prepared strain was inoculated into 30 ml of medium containing 6% glucose, 8% xylose, 1% yeast extract, 0.1 mM IPTG, 100 mM MOPS buffer) in M9 minimal medium, and 30 ° C in a 300 ml baffled flask And cultured at 250 rpm with shaking.

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Virology (AREA)
  • Oil, Petroleum & Natural Gas (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Tropical Medicine & Parasitology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)

Abstract

　本発明の目的は、野生型の大腸菌の染色体ＤＮＡより１０４０kbp以上短い染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体、および該変異体を用いた有用物質の製造法を提供することができる。

Description

工業的に有用な微生物
　本発明は、野生型の大腸菌より染色体DNAが短い大腸菌の変異体、および該変異体を用いた有用物質の製造法に関する。
　大腸菌の染色体DNAの全塩基配列は明らかになっている（非特許文献１および２）。また、相同組換え手法を用いて、大腸菌の染色体DNA上に存在している任意の遺伝子または染色体上の任意の領域を欠損させる方法は知られている（非特許文献３）。
　染色体上の複数の領域が欠損している染色体縮小株としては、708kbpを欠損したMDS43株（非特許文献４）、1377kbpを欠損したΔ16株（非特許文献５）、1027kbpを欠損しているStep28株（特許文献１）が既に知られている。
　MDS43株は最少培地やLB培地において、親株である野生型大腸菌株MG1655と同等に生育することが知られている。また、Step28株は染色体上に欠損領域を持たない親株W3110red株に比べ、培養終了時の菌体量が増加しており、ATP再生活性が高いことが知られている。さらに、Step28株のスレオニン生合成系遺伝子を強化したStep28T株を用いたスレオニン生産においては、W3110red株を用いた場合に比べスレオニンの生産性が向上する。
　しかしながら、Δ16株については親株であるMG1655株と比べて生育速度が低下することがわかっている。このように、染色体縮小化株の示す表現型は菌株により異なっており、1000kbpを超える染色体領域の削除が大腸菌の性質をどのように変化させるのかを予測するのは困難であり、染色体DNAの1000kbp以上の領域を欠損した大腸菌が必ずしも有用な特性を示すとはいえない。
　また1040kbp以上の染色体DNA領域が欠損している大腸菌の変異体および該変異体を用いた有用物質の製造法については知られていない。
Science, 277, 1453 (1997) Nucleic Acids Research, 34, 1 (2006) J. Bacteriol., 180, 2063 (1998) Science, 312, 1044 (2006) Mol. Microbiol., 55, 137 (2005) WO2006/057341
　本発明の目的は、染色体ＤＮＡ上の１０４０ｋｂｐ以上の領域が欠損している産業上有用な大腸菌の変異体、および該変異体を用いた有用物質の製造法を提供することにある。
本発明は以下の（１）～（２８）に関する。
　（１）以下の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子を含み、かつ［２］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子を含まず、かつ野生型の大腸菌より１０４０kbp以上短い染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体。ただし、以下の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子中に、野生型の大腸菌が元来有していない遺伝子（以下、ＮＣ遺伝子という）がある場合には、該野生型の大腸菌に由来する上記大腸菌の変異体は、ＮＣ遺伝子を有していなくてもよい。
［１］thrL遺伝子、thrA遺伝子、thrB遺伝子、thrC遺伝子、talB遺伝子、mog遺伝子、htgA遺伝子、dnaK遺伝子、dnaJ遺伝子、mokC遺伝子、hokC遺伝子、sokC遺伝子、nhaA遺伝子、nhaR遺伝子、rpsT遺伝子、ribF遺伝子、ileS遺伝子、lspA遺伝子、fkpB遺伝子、ispH遺伝子、rihC遺伝子、dapB遺伝子、carA遺伝子、carB遺伝子、caiF遺伝子、caiE遺伝子、caiD遺伝子、caiC遺伝子、caiB遺伝子、caiA遺伝子、caiT遺伝子、fixA遺伝子、fixB遺伝子、fixC遺伝子、fixX遺伝子、kefF遺伝子、kefC遺伝子、folA遺伝子、apaH遺伝子、apaG遺伝子、ksgA遺伝子、pdxA遺伝子、surA遺伝子、imp遺伝子、djlA遺伝子、rluA遺伝子、hepA遺伝子、polB遺伝子、leuD遺伝子、leuC遺伝子、leuB遺伝子、leuA遺伝子、leuL遺伝子、leuO遺伝子、ilvI遺伝子、ilvH遺伝子、fruR遺伝子、mraZ遺伝子、mraW遺伝子、ftsL遺伝子、ftsI遺伝子、murE遺伝子、murF遺伝子、mraY遺伝子、murD遺伝子、ftsW遺伝子、murG遺伝子、murC遺伝子、ddlB遺伝子、ftsQ遺伝子、ftsA遺伝子、ftsZ遺伝子、lpxC遺伝子、secM遺伝子、secA遺伝子、mutT遺伝子、coaE遺伝子、guaC遺伝子、hofC遺伝子、hofB遺伝子、ppdD遺伝子、nadC遺伝子、ampD遺伝子、ampE遺伝子、aroP遺伝子、pdhR遺伝子、aceE遺伝子、aceF遺伝子、lpd遺伝子、acnB遺伝子、speD遺伝子、speE遺伝子、cueO遺伝子、gcd遺伝子、hpt遺伝子、can遺伝子、panD遺伝子、panC遺伝子、panB遺伝子、htrE遺伝子、ecpD遺伝子、folK遺伝子、pcnB遺伝子、dksA遺伝子、sfsA遺伝子、ligT遺伝子、hrpB遺伝子、mrcB遺伝子、hemL遺伝子、clcA遺伝子、btuF遺伝子、pfs遺伝子、dgt遺伝子、degP遺伝子、cdaR遺伝子、dapD遺伝子、glnD遺伝子、map遺伝子、tff遺伝子、rpsB遺伝子、tsf遺伝子、pyrH遺伝子、frr遺伝子、dxr遺伝子、ispU遺伝子、cdsA遺伝子、hlpA遺伝子、lpxD遺伝子、fabZ遺伝子、lpxA遺伝子、lpxB遺伝子、rnhB遺伝子、dnaE遺伝子、accA遺伝子、ldcC遺伝子、tilS遺伝子、rof遺伝子、nlpE遺伝子、proS遺伝子、rcsF遺伝子、metQ遺伝子、metI遺伝子、metN遺伝子、gmhB遺伝子、rrsH遺伝子、ileV遺伝子、alaV遺伝子、rrlH遺伝子、rrfH遺伝子、aspU遺伝子、dkgB遺伝子、mltD遺伝子、gloB遺伝子、rnhA遺伝子、dnaQ遺伝子、aspV遺伝子、ivy遺伝子、fadE遺伝子、lpcA遺伝子、pepD遺伝子、gpt遺伝子、frsA遺伝子、crl遺伝子、phoE遺伝子、proB遺伝子、proA遺伝子、thrW遺伝子、hemB遺伝子、proC遺伝子、aroL遺伝子、aroM遺伝子、rdgC遺伝子、mak遺伝子、araJ遺伝子、sbcC遺伝子、sbcD遺伝子、phoB遺伝子、phoR遺伝子、brnQ遺伝子、proY遺伝子、malZ遺伝子、queA遺伝子、tgt遺伝子、secD遺伝子、secF遺伝子、tsx遺伝子、ribD遺伝子、ribE遺伝子、nusB遺伝子、thiL遺伝子、pgpA遺伝子、dxs遺伝子、ispA遺伝子、xseB遺伝子、thiI遺伝子、panE遺伝子、cyoE遺伝子、cyoD遺伝子、cyoC遺伝子、cyoB遺伝子、cyoA遺伝子、ampG遺伝子、bolA遺伝子、tig遺伝子、clpP遺伝子、clpX遺伝子、lon遺伝子、hupB遺伝子、ppiD遺伝子、cof遺伝子、mdlA遺伝子、mdlB遺伝子、glnK遺伝子、amtB遺伝子、tesB遺伝子、ffs遺伝子、maa遺伝子、hha遺伝子、acrB遺伝子、acrA遺伝子、acrR遺伝子、kefA遺伝子、priC遺伝子、apt遺伝子、dnaX遺伝子、recR遺伝子、htpG遺伝子、adk遺伝子、hemH遺伝子、aes遺伝子、gsk遺伝子、fsr遺伝子、ushA遺伝子、copA遺伝子、cueR遺伝子、gcl遺伝子、hyi遺伝子、purK遺伝子、purE遺伝子、lpxH遺伝子、ppiB遺伝子、cysS遺伝子、folD遺伝子、sfmA遺伝子、sfmC遺伝子、sfmD遺伝子、sfmH遺伝子、sfmF遺伝子、fimZ遺伝子、argU遺伝子、entD遺伝子、fepA遺伝子、fes遺伝子、entF遺伝子、fepE遺伝子、fepC遺伝子、fepG遺伝子、fepD遺伝子、fepB遺伝子、entC遺伝子、entE遺伝子、entB遺伝子、entA遺伝子、cstA遺伝子、dsbG遺伝子、ahpC遺伝子、ahpF遺伝子、tatE遺伝子、lipA遺伝子、lipB遺伝子、dacA遺伝子、rlpA遺伝子、mrdB遺伝子、mrdA遺伝子、cobC遺伝子、nadD遺伝子、holA遺伝子、rlpB遺伝子、leuS遺伝子、lnt遺伝子、miaB遺伝子、ubiF遺伝子、glnX遺伝子、glnV遺伝子、metU遺伝子、glnW遺伝子、glnU遺伝子、leuW遺伝子、metT遺伝子、asnB遺伝子、nagD遺伝子、nagC遺伝子、nagA遺伝子、nagB遺伝子、nagE遺伝子、glnS遺伝子、fur遺伝子、fldA遺伝子、seqA遺伝子、pgm遺伝子、potE遺伝子、speF遺伝子、kdpE遺伝子、kdpD遺伝子、kdpC遺伝子、kdpB遺伝子、kdpA遺伝子、nei遺伝子、abrB遺伝子、gltA遺伝子、sdhC遺伝子、sdhD遺伝子、sdhA遺伝子、sdhB遺伝子、sucA遺伝子、sucB遺伝子、sucC遺伝子、sucD遺伝子、mngR遺伝子、mngA遺伝子、mngB遺伝子、cydA遺伝子、cydB遺伝子、tolQ遺伝子、tolR遺伝子、tolA遺伝子、tolB遺伝子、pal遺伝子、lysT遺伝子、valT遺伝子、lysW遺伝子、valZ遺伝子、lysY遺伝子、lysZ遺伝子、lysQ遺伝子、nadA遺伝子、pnuC遺伝子、zitB遺伝子、aroG遺伝子、gpmA遺伝子、galM遺伝子、galK遺伝子、galT遺伝子、galE遺伝子、modF遺伝子、modE遺伝子、modA遺伝子、modB遺伝子、modC遺伝子、bioA遺伝子、bioB遺伝子、bioF遺伝子、bioC遺伝子、bioD遺伝子、uvrB遺伝子、moaA遺伝子、moaB遺伝子、moaC遺伝子、moaD遺伝子、moaE遺伝子、rhlE遺伝子、dps遺伝子、rhtA遺伝子、ompX遺伝子、rybA遺伝子、mntR遺伝子、fsaA遺伝子、moeB遺伝子、moeA遺伝子、iaaA遺伝子、cmr遺伝子、rybB遺伝子、grxA遺伝子、poxB遺伝子、hcr遺伝子、hcp遺伝子、aqpZ遺伝子、macA遺伝子、macB遺伝子、cspD遺伝子、clpS遺伝子、clpA遺伝子、serW遺伝子、infA遺伝子、aat遺伝子、cydC遺伝子、cydD遺伝子、trxB遺伝子、lrp遺伝子、ftsK遺伝子、lolA遺伝子、serS遺伝子、dmsA遺伝子、dmsB遺伝子、dmsC遺伝子、pflA遺伝子、pflB遺伝子、focA遺伝子、serC遺伝子、aroA遺伝子、cmk遺伝子、rpsA遺伝子、ihfB遺伝子、msbA遺伝子、lpxK遺伝子、kdsB遺伝子、smtA遺伝子、mukF遺伝子、mukE遺伝子、mukB遺伝子、aspC遺伝子、ompF遺伝子、asnS遺伝子、pncB遺伝子、pepN遺伝子、ssuB遺伝子、ssuC遺伝子、ssuD遺伝子、ssuA遺伝子、ssuE遺伝子、pyrD遺伝子、uup遺伝子、pqiA遺伝子、pqiB遺伝子、rmf遺伝子、fabA遺伝子、ompA遺伝子、sulA遺伝子、helD遺伝子、mgsA遺伝子、serT遺伝子、hyaA遺伝子、hyaB遺伝子、hyaC遺伝子、hyaD遺伝子、hyaE遺伝子、hyaF遺伝子、appC遺伝子、appB遺伝子、appA遺伝子、etp遺伝子、serX遺伝子、csgG遺伝子、csgF遺伝子、csgE遺伝子、csgD遺伝子、csgB遺伝子、csgA遺伝子、csgC遺伝子、mdoC遺伝子、mdoG遺伝子、mdoH遺伝子、msyB遺伝子、mdtG遺伝子、lpxL遺伝子、solA遺伝子、dinI遺伝子、pyrC遺伝子、grxB遺伝子、mdtH遺伝子、rimJ遺伝子、mviM遺伝子、mviN遺伝子、flgN遺伝子、flgM遺伝子、flgA遺伝子、flgB遺伝子、flgC遺伝子、flgD遺伝子、flgE遺伝子、flgF遺伝子、flgG遺伝子、flgH遺伝子、flgI遺伝子、flgJ遺伝子、flgK遺伝子、flgL遺伝子、rne遺伝子、rluC遺伝子、sraB遺伝子、rpmF遺伝子、plsX遺伝子、fabH遺伝子、fabD遺伝子、fabG遺伝子、acpP遺伝子、fabF遺伝子、pabC遺伝子、tmk遺伝子、holB遺伝子、ptsG遺伝子、fhuE遺伝子、hinT遺伝子、nagZ遺伝子、ndh遺伝子、mfd遺伝子、lolC遺伝子、lolD遺伝子、lolE遺伝子、cobB遺伝子、potD遺伝子、potC遺伝子、potB遺伝子、potA遺伝子、pepT遺伝子、phoQ遺伝子、phoP遺伝子、purB遺伝子、hflD遺伝子、trmU遺伝子、minE遺伝子、minD遺伝子、minC遺伝子、hlyE遺伝子、umuD遺伝子、umuC遺伝子、dsbB遺伝子、nhaB遺伝子、fadR遺伝子、dadA遺伝子、dadX遺伝子、cvrA遺伝子、ldcA遺伝子、emtA遺伝子、treA遺伝子、dhaH遺伝子、dhaL遺伝子、dhaK遺伝子、dhaR遺伝子、pth遺伝子、prsA遺伝子、ispE遺伝子、lolB遺伝子、hemA遺伝子、prfA遺伝子、prmC遺伝子、kdsA遺伝子、ldrA遺伝子、rdlA遺伝子、ldrB遺伝子、rdlB遺伝子、ldrC遺伝子、rdlC遺伝子、chaA遺伝子、chaB遺伝子、chaC遺伝子、narL遺伝子、narX遺伝子、narK遺伝子、narG遺伝子、narH遺伝子、narJ遺伝子、narI遺伝子、rttR遺伝子、tpr遺伝子、tyrV遺伝子、tyrT遺伝子、purU遺伝子、rssA遺伝子、rssB遺伝子、galU遺伝子、hns遺伝子、tdk遺伝子、adhE遺伝子、oppA遺伝子、oppB遺伝子、oppC遺伝子、oppD遺伝子、oppF遺伝子、cls遺伝子、kch遺伝子、tonB遺伝子、ompW遺伝子、trpA遺伝子、trpB遺伝子、trpC遺伝子、trpD遺伝子、trpE遺伝子、trpL遺伝子、rluB遺伝子、btuR遺伝子、sohB遺伝子、topA遺伝子、cysB遺伝子、acnA遺伝子、ribA遺伝子、pgpB遺伝子、pyrF遺伝子、osmB遺伝子、gmr遺伝子、rnb遺伝子、fabI遺伝子、sapF遺伝子、sapD遺伝子、sapC遺伝子、sapB遺伝子、sapA遺伝子、puuP遺伝子、puuA遺伝子、puuD遺伝子、puuR遺伝子、puuC遺伝子、puuB遺伝子、puuE遺伝子、pspF遺伝子、pspA遺伝子、pspB遺伝子、pspC遺伝子、pspD遺伝子、pspE遺伝子、ompG遺伝子、tyrR遺伝子、tpx遺伝子、mpaA遺伝子、mppA遺伝子、uspE遺伝子、fnr遺伝子、ogt遺伝子、abgT遺伝子、abgB遺伝子、abgA遺伝子、abgR遺伝子、isrA遺伝子、dbpA遺伝子、uspF遺伝子、ompN遺伝子、micC遺伝子、hslJ遺伝子、ldhA遺伝子、feaR遺伝子、feaB遺伝子、tynA遺伝子、maoC遺伝子、paaA遺伝子、paaB遺伝子、paaC遺伝子、paaD遺伝子、paaE遺伝子、paaF遺伝子、paaG遺伝子、paaH遺伝子、paaI遺伝子、paaJ遺伝子、paaK遺伝子、paaX遺伝子、paaY遺伝子、azoR遺伝子、hrpA遺伝子、aldA遺伝子、gapC_2遺伝子、gapC_1遺伝子、cybB遺伝子、hokB遺伝子、mokB遺伝子、sokB遺伝子、trg遺伝子、mdoD遺伝子、rimL遺伝子、tehA遺伝子、tehB遺伝子、ansP遺伝子、nhoA遺伝子、narV遺伝子、narW遺伝子、narY遺伝子、narZ遺伝子、narU遺伝子、fdnG遺伝子、fdnH遺伝子、fdnI遺伝子、adhP遺伝子、sfcA遺伝子、sra遺伝子、bdm遺伝子、osmC遺伝子、ddpF遺伝子、ddpD遺伝子、ddpC遺伝子、ddpB遺伝子、ddpA遺伝子、ddpX遺伝子、dos遺伝子、gadC遺伝子、gadB遺伝子、pqqL遺伝子、hipA遺伝子、hipB遺伝子、ego遺伝子、lsrC遺伝子、lsrD遺伝子、lsrB遺伝子、lsrF遺伝子、lsrG遺伝子、tam遺伝子、uxaB遺伝子、marC遺伝子、marR遺伝子、marA遺伝子、marB遺伝子、eamA遺伝子、dcp遺伝子、rspB遺伝子、rspA遺伝子、speG遺伝子、dmsD遺伝子、clcB遺伝子、dgsA遺伝子、asr遺伝子、mdtI遺伝子、mdtJ遺伝子、pntB遺伝子、pntA遺伝子、folM遺伝子、rstA遺伝子、rstB遺伝子、tus遺伝子、fumC遺伝子、fumA遺伝子、manA遺伝子、uidC遺伝子、uidB遺伝子、uidA遺伝子、uidR遺伝子、hdhA遺伝子、malI遺伝子、malX遺伝子、malY遺伝子、add遺伝子、blr遺伝子、rsxA遺伝子、rsxB遺伝子、rsxC遺伝子、rsxD遺伝子、rsxG遺伝子、rsxE遺伝子、nth遺伝子、gst遺伝子、pdxY遺伝子、tyrS遺伝子、pdxH遺伝子、slyB遺伝子、slyA遺伝子、sodC遺伝子、nemA遺伝子、gloA遺伝子、rnt遺伝子、lhr遺伝子、sodB遺伝子、purR遺伝子、cfa遺伝子、ribC遺伝子、mdtK遺伝子、valV遺伝子、valW遺伝子、pykF遺伝子、lpp遺伝子、sufE遺伝子、sufS遺伝子、sufD遺伝子、sufC遺伝子、sufB遺伝子、sufA遺伝子、rydB遺伝子、rprA遺伝子、aroD遺伝子、pps遺伝子、aroH遺伝子、nlpC遺伝子、btuD遺伝子、btuE遺伝子、btuC遺伝子、ihfA遺伝子、pheT遺伝子、pheS遺伝子、pheM遺伝子、rplT遺伝子、rpmI遺伝子、infC遺伝子、thrS遺伝子、arpB_1遺伝子、arpB_2遺伝子、pfkB遺伝子、cedA遺伝子、katE遺伝子、chbG遺伝子、chbF遺伝子、chbR遺伝子、chbA遺伝子、chbC遺伝子、chbB遺伝子、osmE遺伝子、nadE遺伝子、spy遺伝子、astE遺伝子、astB遺伝子、astD遺伝子、astA遺伝子、astC遺伝子、xthA遺伝子、nudG遺伝子、gdhA遺伝子、topB遺伝子、selD遺伝子、sppA遺伝子、ansA遺伝子、gapA遺伝子、mipA遺伝子、rnd遺伝子、fadD遺伝子、pabB遺伝子、sdaA遺伝子、manX遺伝子、manY遺伝子、manZ遺伝子、rrmA遺伝子、cspC遺伝子、kdgR遺伝子、htpX遺伝子、prc遺伝子、proQ遺伝子、pphA遺伝子、ryeA遺伝子、ryeB遺伝子、holE遺伝子、exoX遺伝子、ptrB遺伝子、purT遺伝子、eda遺伝子、edd遺伝子、zwf遺伝子、pykA遺伝子、lpxM遺伝子、znuA遺伝子、znuC遺伝子、znuB遺伝子、ruvB遺伝子、ruvA遺伝子、ruvC遺伝子、nudB遺伝子、aspS遺伝子、torZ遺伝子、torY遺伝子、cutC遺伝子、argS遺伝子、leuZ遺伝子、cysT遺伝子、glyW遺伝子、pgsA遺伝子、dsrA遺伝子、serU遺伝子、asnT遺伝子、shiA遺伝子、amn遺伝子、asnW遺伝子、asnU遺伝子、cbl遺伝子、nac遺伝子、asnV遺伝子、erfK遺伝子、cobT遺伝子、
cobS遺伝子、cobU遺伝子、sbmC遺伝子、dacD遺伝子、sbcB遺伝子、hisL遺伝子、hisG遺伝子、hisD遺伝子、hisC遺伝子、hisB遺伝子、hisH遺伝子、hisA遺伝子、hisF遺伝子、hisI遺伝子、cld遺伝子、ugd遺伝子、gnd遺伝子、galF遺伝子、wcaM遺伝子、wcaL遺伝子、wcaK遺伝子、wzxC遺伝子、wcaJ遺伝子、cpsG遺伝子、cpsB遺伝子、wcaI遺伝子、nudD遺伝子、fcl遺伝子、gmd遺伝子、wcaF遺伝子、wcaE遺伝子、wcaD遺伝子、wcaC遺伝子、wcaB遺伝子、wcaA遺伝子、wzc遺伝子、wzb遺伝子、wza遺伝子、asmA遺伝子、dcd遺伝子、udk遺伝子、thiD遺伝子、thiM遺伝子、mrp遺伝子、metG遺伝子、dusC遺伝子、cdd遺伝子、sanA遺伝子、mglC遺伝子、mglA遺伝子、mglB遺伝子、galS遺伝子、folE遺伝子、cirA遺伝子、lysP遺伝子、nfo遺伝子、fruA遺伝子、fruK遺伝子、fruB遺伝子、setB遺伝子、spr遺伝子、rtn遺伝子、bcr遺伝子、rsuA遺伝子、rplY遺伝子、proL遺伝子、narP遺伝子、ccmH遺伝子、ccmG遺伝子、ccmF遺伝子、ccmE遺伝子、ccmD遺伝子、ccmC遺伝子、ccmB遺伝子、ccmA遺伝子、napC遺伝子、napB遺伝子、napH遺伝子、napG遺伝子、napA遺伝子、napD遺伝子、napF遺伝子、eco遺伝子、mqo遺伝子、alkB遺伝子、ada遺伝子、ompC遺伝子、micF遺伝子、rcsD遺伝子、rcsB遺伝子、rcsC遺伝子、atoS遺伝子、atoC遺伝子、atoD遺伝子、atoA遺伝子、atoE遺伝子、atoB遺伝子、gyrA遺伝子、ubiG遺伝子、nrdA遺伝子、nrdB遺伝子、inaA遺伝子、glpQ遺伝子、glpT遺伝子、glpA遺伝子、glpB遺伝子、glpC遺伝子、ais遺伝子、arnT遺伝子、pmrD遺伝子、menE遺伝子、menC遺伝子、menB遺伝子、menD遺伝子、menF遺伝子、nuoN遺伝子、nuoM遺伝子、nuoL遺伝子、nuoK遺伝子、nuoJ遺伝子、nuoI遺伝子、nuoH遺伝子、nuoG遺伝子、nuoF遺伝子、nuoE遺伝子、nuoC遺伝子、nuoB遺伝子、nuoA遺伝子、lrhA遺伝子、ackA遺伝子、pta遺伝子、ubiX遺伝子、purF遺伝子、cvpA遺伝子、dedD遺伝子、folC遺伝子、accD遺伝子、dedA遺伝子、truA遺伝子、usg遺伝子、pdxB遺伝子、flk遺伝子、fabB遺伝子、trmC遺伝子、mepA遺伝子、aroC遺伝子、prmB遺伝子、sixA遺伝子、fadL遺伝子、vacJ遺伝子、argW遺伝子、dsdC遺伝子、dsdX遺伝子、dsdA遺伝子、emrY遺伝子、emrK遺伝子、evgA遺伝子、evgS遺伝子、oxc遺伝子、frc遺伝子、ddg遺伝子、glk遺伝子、mntH遺伝子、nupC遺伝子、alaX遺伝子、alaW遺伝子、gltX遺伝子、valU遺伝子、valX遺伝子、valY遺伝子、lysV遺伝子、xapR遺伝子、xapB遺伝子、xapA遺伝子、ligA遺伝子、zipA遺伝子、cysZ遺伝子、cysK遺伝子、ptsH遺伝子、ptsI遺伝子、crr遺伝子、pdxK遺伝子、cysM遺伝子、cysA遺伝子、cysW遺伝子、cysU遺伝子、cysP遺伝子、ucpA遺伝子、murP遺伝子、amiA遺伝子、hemF遺伝子、eutL遺伝子、eutC遺伝子、eutB遺伝子、eutA遺伝子、eutH遺伝子、eutG遺伝子、eutJ遺伝子、eutE遺伝子、cchB遺伝子、cchA遺伝子、eutI遺伝子、eutT遺伝子、eutQ遺伝子、eutP遺伝子、maeB遺伝子、talA遺伝子、tktB遺伝子、aegA遺伝子、narQ遺伝子、acrD遺伝子、dapE遺伝子、purC遺伝子、nlpB遺伝子、dapA遺伝子、gcvR遺伝子、bcp遺伝子、hda遺伝子、uraA遺伝子、upp遺伝子、purM遺伝子、purN遺伝子、ppk遺伝子、ppx遺伝子、guaA遺伝子、guaB遺伝子、xseA遺伝子、der遺伝子、hisS遺伝子、ispG遺伝子、ndk遺伝子、pbpC遺伝子、sseA遺伝子、ryfA遺伝子、sseB遺伝子、pepB遺伝子、fdx遺伝子、hscA遺伝子、hscB遺伝子、iscA遺伝子、iscU遺伝子、iscS遺伝子、iscR遺伝子、suhB遺伝子、csiE遺伝子、hcaT遺伝子、hcaR遺伝子、hcaE遺伝子、hcaF遺伝子、hcaC遺伝子、hcaB遺伝子、hcaD遺伝子、glyA遺伝子、hmp遺伝子、glnB遺伝子、sroF遺伝子、purL遺伝子、tadA遺伝子、acpS遺伝子、pdxJ遺伝子、recO遺伝子、era遺伝子、rnc遺伝子、lepB遺伝子、lepA遺伝子、rseC遺伝子、rseB遺伝子、rseA遺伝子、rpoE遺伝子、nadB遺伝子、srmB遺伝子、ung遺伝子、trxC遺伝子、pssA遺伝子、kgtP遺伝子、rrfG遺伝子、rrlG遺伝子、gltW遺伝子、rrsG遺伝子、clpB遺伝子、rluD遺伝子、pheL遺伝子、pheA遺伝子、tyrA遺伝子、aroF遺伝子、rplS遺伝子、trmD遺伝子、rimM遺伝子、rpsP遺伝子、ffh遺伝子、grpE遺伝子、recN遺伝子、smpA遺伝子、smpB遺伝子、ssrA遺伝子、gabD遺伝子、gabT遺伝子、gabP遺伝子、nrdF遺伝子、mprA遺伝子、emrA遺伝子、emrB遺伝子、luxS遺伝子、sraD遺伝子、gshA遺伝子、argQ遺伝子、argZ遺伝子、argY遺伝子、argV遺伝子、serV遺伝子、csrA遺伝子、alaS遺伝子、recX遺伝子、recA遺伝子、mltB遺伝子、norR遺伝子、norV遺伝子、norW遺伝子、hypF遺伝子、hydN遺伝子、ascG遺伝子、ascF遺伝子、ascB遺伝子、hycI遺伝子、hycH遺伝子、hycG遺伝子、hycF遺伝子、hycE遺伝子、hycD遺伝子、hycC遺伝子、hycB遺伝子、hycA遺伝子、hypA遺伝子、hypB遺伝子、hypC遺伝子、hypD遺伝子、hypE遺伝子、fhlA遺伝子、mutS遺伝子、pphB遺伝子、rpoS遺伝子、nlpD遺伝子、pcm遺伝子、surE遺伝子、truD遺伝子、ispF遺伝子、ispD遺伝子、ftsB遺伝子、cysC遺伝子、cysN遺伝子、cysD遺伝子、iap遺伝子、cysH遺伝子、cysI遺伝子、cysJ遺伝子、eno遺伝子、pyrG遺伝子、mazG遺伝子、chpR遺伝子、relA遺伝子、rumA遺伝子、barA遺伝子、gudD遺伝子、gudX遺伝子、gudP遺伝子、mltA遺伝子、metZ遺伝子、metW遺伝子、metV遺伝子、amiC遺伝子、argA遺伝子、recD遺伝子、recB遺伝子、ptr遺伝子、recC遺伝子、ppdC遺伝子、ppdB遺伝子、ppdA遺伝子、thyA遺伝子、lgt遺伝子、ptsP遺伝子、nudH遺伝子、mutH遺伝子、tas遺伝子、aas遺伝子、rygA遺伝子、rygB遺伝子、galR遺伝子、lysA遺伝子、lysR遺伝子、araE遺伝子、kduD遺伝子、kduI遺伝子、lysS遺伝子、prfB遺伝子、recJ遺伝子、dsbC遺伝子、xerD遺伝子、fldB遺伝子、bglA遺伝子、gcvP遺伝子、gcvH遺伝子、gcvT遺伝子、visC遺伝子、ubiH遺伝子、pepP遺伝子、zapA遺伝子、ssrS遺伝子、rygC遺伝子、serA遺伝子、rpiA遺伝子、argP遺伝子、argK遺伝子、argO遺伝子、mscS遺伝子、fbaA遺伝子、pgk遺伝子、epd遺伝子、tktA遺伝子、speB遺伝子、speA遺伝子、metK遺伝子、galP遺伝子、sprT遺伝子、endA遺伝子、gshB遺伝子、ansB遺伝子、mutY遺伝子、mltC遺伝子、nupG遺伝子、speC遺伝子、pheV遺伝子、pitB遺伝子、gss遺伝子、hybG遺伝子、hybF遺伝子、hybE遺伝子、hybD遺伝子、hybC遺伝子、hybB遺伝子、hybA遺伝子、hybO遺伝子、exbD遺伝子、exbB遺伝子、metC遺伝子、dkgA遺伝子、sufI遺伝子、plsC遺伝子、parC遺伝子、parE遺伝子、cpdA遺伝子、nudF遺伝子、tolC遺伝子、zupT遺伝子、ribB遺伝子、glgS遺伝子、rygD遺伝子、rfaE遺伝子、glnE遺伝子、htrG遺伝子、cca遺伝子、bacA遺伝子、folB遺伝子、ttdA遺伝子、ttdB遺伝子、rpsU遺伝子、dnaG遺伝子、rpoD遺伝子、ileX遺伝子、aer遺伝子、ebgR遺伝子、ebgA遺伝子、ebgC遺伝子、uxaA遺伝子、uxaC遺伝子、exuT遺伝子、exuR遺伝子、tdcG遺伝子、tdcF遺伝子、tdcE遺伝子、tdcD遺伝子、tdcC遺伝子、tdcB遺伝子、tdcA遺伝子、tdcR遺伝子、rnpB遺伝子、garK遺伝子、garR遺伝子、garL遺伝子、garP遺伝子、garD遺伝子、sohA遺伝子、agaR遺伝子、kbaZ遺伝子、agaV遺伝子、agaW遺伝子、agaA遺伝子、agaS遺伝子、kbaY遺伝子、agaB遺伝子、agaC遺伝子、agaD遺伝子、agaI遺伝子、mtr遺伝子、deaD遺伝子、nlpI遺伝子、pnp遺伝子、sraG遺伝子、rpsO遺伝子、truB遺伝子、rbfA遺伝子、infB遺伝子、nusA遺伝子、metY遺伝子、argG遺伝子、leuU遺伝子、secG遺伝子、glmM遺伝子、folP遺伝子、ftsH遺伝子、rrmJ遺伝子、greA遺伝子、dacB遺伝子、obgE遺伝子、rpmA遺伝子、rplU遺伝子、ispB遺伝子、sfsB遺伝子、murA遺伝子、kdsD遺伝子、kdsC遺伝子、rpoN遺伝子、ptsN遺伝子、npr遺伝子、mtgA遺伝子、elbB遺伝子、ryhA遺伝子、arcB遺伝子、gltB遺伝子、gltD遺伝子、nanT遺伝子、nanA遺伝子、nanR遺伝子、dcuD遺伝子、sspB遺伝子、sspA遺伝子、rpsI遺伝子、rplM遺伝子、degQ遺伝子、degS遺伝子、mdh遺伝子、argR遺伝子、aaeB遺伝子、aaeA遺伝子、aaeX遺伝子、aaeR遺伝子、tldD遺伝子、rng遺伝子、mreD遺伝子、mreC遺伝子、mreB遺伝子、accB遺伝子、accC遺伝子、panF遺伝子、prmA遺伝子、dusB遺伝子、fis遺伝子、rrfF遺伝子、thrV遺伝子、rrfD遺伝子、rrlD遺伝子、gltV遺伝子、rrsD遺伝子、purH遺伝子、purD遺伝子、zraR遺伝子、zraS遺伝子、zraP遺伝子、hupA遺伝子、nfi遺伝子、hemE遺伝子、nudC遺伝子、rsd遺伝子、thiC遺伝子、thiE遺伝子、thiF遺伝子、thiS遺伝子、thiG遺伝子、thiH遺伝子、htrC遺伝子、rpoC遺伝子、rpoB遺伝子、rplL遺伝子、rplJ遺伝子、rplA遺伝子、rplK遺伝子、nusG遺伝子、secE遺伝子、tufB遺伝子、thrT遺伝子、glyT遺伝子、tyrU遺伝子、thrU遺伝子、coaA遺伝子、birA遺伝子、murB遺伝子、rrfB遺伝子、rrlB遺伝子、gltT遺伝子、rrsB遺伝子、murI遺伝子、btuB遺伝子、trmA遺伝子、fabR遺伝子、sthA遺伝子、oxyR遺伝子、oxyS遺伝子、argH遺伝子、argB遺伝子、argC遺伝子、argE遺伝子、ppc遺伝子、fsaB遺伝子、gldA遺伝子、katG遺伝子、metF遺伝子、metL遺伝子、metB遺伝子、metJ遺伝子、rpmE遺伝子、priA遺伝子、cytR遺伝子、ftsN遺伝子、hslV遺伝子、hslU遺伝子、menA遺伝子、rraA遺伝子、glpF遺伝子、glpK遺伝子、glpX遺伝子、fpr遺伝子、tpiA遺伝子、cdh遺伝子、sbp遺伝子、pfkA遺伝子、fieF遺伝子、cpxP遺伝子、cpxR遺伝子、cpxA遺伝子、kdgT遺伝子、sodA遺伝子、fdhD遺伝子、fdoG遺伝子、fdoH遺伝子、fdoI遺伝子、fdhE遺伝子、bipA遺伝子、glnA遺伝子、glnL遺伝子、glnG遺伝子、hemN遺伝子、csrC遺伝子、spf遺伝子、polA遺伝子、dsbA遺伝子、mobA遺伝子、mobB遺伝子、rrfA遺伝子、rrlA遺伝子、alaT遺伝子、ileT遺伝子、rrsA遺伝子、hemG遺伝子、trkH遺伝子、pepQ遺伝子、fadB遺伝子、fadA遺伝子、fre遺伝子、ubiD遺伝子、rfaH遺伝子、tatD遺伝子、tatC遺伝子、tatB遺伝子、tatA遺伝子、ubiB遺伝子、ubiE遺伝子、rmuC遺伝子、udp遺伝子、metE遺伝子、metR遺伝子、pldB遺伝子、rhtB遺伝子、rhtC遺伝子、recQ遺伝子、pldA遺伝子、rarD遺伝子、corA遺伝子、uvrD遺伝子、xerC遺伝子、dapF遺伝子、cyaY遺伝子、cyaA遺伝子、hemC遺伝子、hemD遺伝子、hemX遺伝子、hemY遺伝子、ryiA遺伝子、aslA遺伝子、aslB遺伝子、proM遺伝子、leuT遺伝子、hisR遺伝子、argX遺伝子、rffM遺伝子、wzyE遺伝子、rffT遺伝子、wzxE遺伝子、rffA遺伝子、rffC遺伝子、rffH遺伝子、rffG遺伝子、rffD遺伝子、rffE遺伝子、wzzE遺伝子、rfe遺伝子、rho遺伝子、rhoL遺伝子、trxA遺伝子、rhlB遺伝子、gpp遺伝子、rep遺伝子、ppiC遺伝子、ilvC遺伝子、ilvY遺伝子、ilvA遺伝子、ilvD遺伝子、ilvE遺伝子、ilvM遺伝子、ilvG_2遺伝子、ilvG_1遺伝子、ilvL遺伝子、hdfR遺伝子、trpT遺伝子、aspT遺伝子、rrfC遺伝子、rrlC遺伝子、gltU遺伝子、rrsC遺伝子、asnC遺伝子、mioC遺伝子、oriC遺伝子、gidA遺伝子、gidB遺伝子、atpI遺伝子、atpB遺伝子、atpE遺伝子、atpF遺伝子、atpH遺伝子、atpA遺伝子、atpG遺伝子、atpD遺伝子、atpC遺伝子、glmU遺伝子、glmS遺伝子、pstS遺伝子、pstC遺伝子、pstA遺伝子、pstB遺伝子、phoU遺伝子、bglG遺伝子、bglF遺伝子、bglB遺伝子、bglH遺伝子、cbrC遺伝子、mdtL遺伝子、tnaB遺伝子、tnaA遺伝子、tnaC遺伝子、trmE遺伝子、rnpA遺伝子、rpmH遺伝子、dnaA遺伝子、dnaN遺伝子、recF遺伝子、gyrB遺伝子、ibpA遺伝子、ibpB遺伝子、emrD遺伝子、ivbL遺伝子、ilvB遺伝子、ilvN遺伝子、uhpA遺伝子、uhpB遺伝子、uhpC遺伝子、uhpT遺伝子、selC遺伝子、gltS遺伝子、recG遺伝子、trmH遺伝子、spoT遺伝子、rpoZ遺伝子、gmk遺伝子、ligB遺伝子、dinD遺伝子、rph遺伝子、pyrE遺伝子、ttk遺伝子、dut遺伝子、dfp遺伝子、rpmB遺伝子、rpmG遺伝子、mutM遺伝子、coaD遺伝子、kdtA遺伝子、rfaQ遺伝子、rfaG遺伝子、rfaP遺伝子、rfaS遺伝子、rfaB遺伝子、rfaI遺伝子、rfaJ遺伝子、rfaY遺伝子、rfaZ遺伝子、rfaK遺伝子、rfaL遺伝子、rfaC遺伝子、rfaF遺伝子、rfaD遺伝子、htrL遺伝子、kbl遺伝子、tdh遺伝子、envC遺伝子、gpmI遺伝子、grxC遺伝子、secB遺伝子、gpsA遺伝子、cysE遺伝子、lldD遺伝子、lldR遺伝子、lldP遺伝子、mtlR遺伝子、mtlD遺伝子、mtlA遺伝子、selA遺伝子、selB遺伝子、aldB遺伝子、sgbE遺伝子、sgbU遺伝子、sgbH遺伝子、lyxK遺伝子、avtA遺伝子、malS遺伝子、bax遺伝子、xylR遺伝子、xylH遺伝子、xylG遺伝子、xylF遺伝子、xylA遺伝子、xylB遺伝子、glyQ遺伝子
、glyS遺伝子、hokA遺伝子、cspA遺伝子、tiaE遺伝子、bisC遺伝子、tag遺伝子、eptB遺伝子、proK遺伝子、dppA遺伝子、dppB遺伝子、dppC遺伝子、dppD遺伝子、dppF遺伝子、rdlD遺伝子、ldrD遺伝子、bcsG遺伝子、bcsF遺伝子、bcsE遺伝子、bcsA遺伝子、bcsB遺伝子、bcsZ遺伝子、bcsC遺伝子、dctA遺伝子、kdgK遺伝子、treF遺伝子、gadA遺伝子、gadX遺伝子、gadY遺伝子、gadW遺伝子、mdtF遺伝子、mdtE遺伝子、gadE遺伝子、hdeD遺伝子、hdeA遺伝子、hdeB遺伝子、slp遺伝子、arsC遺伝子、arsB遺伝子、arsR遺伝子、gor遺伝子、prlC遺伝子、uspA遺伝子、pitA遺伝子、nikR遺伝子、nikE遺伝子、nikD遺伝子、nikC遺伝子、nikB遺伝子、nikA遺伝子、acpT遺伝子、dcrB遺伝子、zntA遺伝子、ftsY遺伝子、ftsE遺伝子、ftsX遺伝子、rpoH遺伝子、livJ遺伝子、livK遺伝子、livH遺伝子、livM遺伝子、livG遺伝子、livF遺伝子、ugpB遺伝子、ugpA遺伝子、ugpE遺伝子、ugpC遺伝子、ugpQ遺伝子、ggt遺伝子、gntR遺伝子、gntK遺伝子、gntU遺伝子、asd遺伝子、glgB遺伝子、glgX遺伝子、glgC遺伝子、glgA遺伝子、glgP遺伝子、glpD遺伝子、glpE遺伝子、glpG遺伝子、glpR遺伝子、rtcR遺伝子、rtcB遺伝子、rtcA遺伝子、malT遺伝子、malP遺伝子、malQ遺伝子、gntT遺伝子、gntY遺伝子、gntX遺伝子、bioH遺伝子、feoB遺伝子、feoA遺伝子、greB遺伝子、ompR遺伝子、envZ遺伝子、pck遺伝子、hslO遺伝子、hslR遺伝子、nudE遺伝子、mrcA遺伝子、hofQ遺伝子、aroK遺伝子、aroB遺伝子、damX遺伝子、dam遺伝子、rpe遺伝子、gph遺伝子、trpS遺伝子、cysG遺伝子、nirC遺伝子、nirD遺伝子、nirB遺伝子、tsgA遺伝子、ppiA遺伝子、fic遺伝子、pabA遺伝子、argD遺伝子、crp遺伝子、prkB遺伝子、kefG遺伝子、kefB遺伝子、slyD遺伝子、slyX遺伝子、fkpA遺伝子、rpsL遺伝子、rpsG遺伝子、fusA遺伝子、tufA遺伝子、rpsJ遺伝子、rplC遺伝子、rplD遺伝子、rplW遺伝子、rplB遺伝子、rpsS遺伝子、rplV遺伝子、rpsC遺伝子、rplP遺伝子、rpmC遺伝子、rpsQ遺伝子、rplN遺伝子、rplX遺伝子、rplE遺伝子、rpsN遺伝子、rpsH遺伝子、rplF遺伝子、rplR遺伝子、rpsE遺伝子、rpmD遺伝子、rplO遺伝子、secY遺伝子、rpmJ遺伝子、rpsM遺伝子、rpsK遺伝子、rpsD遺伝子、rpoA遺伝子、rplQ遺伝子、zntR遺伝子、mscL遺伝子、trkA遺伝子、rsmB遺伝子、fmt遺伝子、def遺伝子、smf遺伝子、smg遺伝子、aroE遺伝子、rrsE遺伝子、ileU遺伝子、alaU遺伝子、rrlE遺伝子、rrfE遺伝子、metA遺伝子、aceB遺伝子、aceA遺伝子、aceK遺伝子、arpA遺伝子、iclR遺伝子、metH遺伝子、pepE遺伝子、lysC遺伝子、pgi遺伝子、ubiC遺伝子、ubiA遺伝子、plsB遺伝子、dgkA遺伝子、lexA遺伝子、dinF遺伝子、zur遺伝子、qor遺伝子、dnaB遺伝子、alr遺伝子、tyrB遺伝子、aphA遺伝子、uvrA遺伝子、ssb遺伝子、soxS遺伝子、soxR遺伝子、ryjA遺伝子、actP遺伝子、acs遺伝子、nrfA遺伝子、nrfB遺伝子、nrfC遺伝子、nrfD遺伝子、nrfE遺伝子、nrfF遺伝子、nrfG遺伝子、gltP遺伝子、fdhF遺伝子、rpiR遺伝子、rpiB遺伝子、proP遺伝子、basS遺伝子、basR遺伝子、eptA遺伝子、adiC遺伝子、adiY遺伝子、adiA遺伝子、melR遺伝子、melA遺伝子、melB遺伝子、fumB遺伝子、dcuB遺伝子、dcuR遺伝子、dcuS遺伝子、lysU遺伝子、cadA遺伝子、cadB遺伝子、cadC遺伝子、pheU遺伝子、dipZ遺伝子、cutA遺伝子、dcuA遺伝子、aspA遺伝子、fxsA遺伝子、groS遺伝子、groL遺伝子、efp遺伝子、ecnA遺伝子、ecnB遺伝子、sugE遺伝子、blc遺伝子、ampC遺伝子、frdD遺伝子、frdC遺伝子、frdB遺伝子、frdA遺伝子、poxA遺伝子、psd遺伝子、rsgA遺伝子、orn遺伝子、glyV遺伝子、glyX遺伝子、glyY遺伝子、amiB遺伝子、mutL遺伝子、miaA遺伝子、hfq遺伝子、hflX遺伝子、hflK遺伝子、hflC遺伝子、purA遺伝子、rnr遺伝子、rlmB遺伝子、ulaF遺伝子、rpsF遺伝子、priB遺伝子、rpsR遺伝子、rplI遺伝子、fklB遺伝子、cycA遺伝子、cpdB遺伝子、cysQ遺伝子、msrA遺伝子、chpS遺伝子、chpB遺伝子、ppa遺伝子、fbp遺伝子、mpl遺伝子、pmbA遺伝子、cybC遺伝子、nrdG遺伝子、nrdD遺伝子、treC遺伝子、treB遺伝子、treR遺伝子、mgtA遺伝子、pyrI遺伝子、pyrB遺伝子、pyrL遺伝子、argI遺伝子、valS遺伝子、holC遺伝子、pepA遺伝子、idnR遺伝子、idnT遺伝子、idnO遺伝子、idnD遺伝子、idnK遺伝子、leuX遺伝子、dnaC遺伝子、dnaT遺伝子、bglJ遺伝子、fhuF遺伝子、leuV遺伝子、leuP遺伝子、leuQ遺伝子、rsmC遺伝子、holD遺伝子、rimI遺伝子、prfC遺伝子、osmY遺伝子、deoC遺伝子、deoA遺伝子、deoB遺伝子、deoD遺伝子、lplA遺伝子、serB遺伝子、radA遺伝子、nadR遺伝子、slt遺伝子、trpR遺伝子、rob遺伝子、creA遺伝子、creB遺伝子、creC遺伝子、creD遺伝子、arcA遺伝子
［２］fhuA遺伝子、fhuC遺伝子、fhuD遺伝子、fhuB遺伝子、yafJ遺伝子、yafK遺伝子、yafQ遺伝子、dinJ遺伝子、yafL遺伝子、yafM遺伝子、fhiA遺伝子、mbhA遺伝子、dinB遺伝子、yafN遺伝子、yafO遺伝子、yafP遺伝子、ykfJ遺伝子、prfH遺伝子、yagP遺伝子、yagQ遺伝子、yagR遺伝子、yagS遺伝子、yagT遺伝子、yagU遺伝子、ykgJ遺伝子、yagV遺伝子、yagW遺伝子、yagX遺伝子、yagY遺伝子、yagZ遺伝子、ykgK遺伝子、ykgL遺伝子、ykgM(JW5034)遺伝子、ykgM(JW5035)遺伝子、eaeH遺伝子、ykgA遺伝子、ykgB遺伝子、ykgI遺伝子、ykgC遺伝子、ykgD遺伝子、ykgE遺伝子、ykgF遺伝子、ykgG遺伝子、ykgH遺伝子、betA遺伝子、betB遺伝子、betI遺伝子、betT遺伝子、yahA遺伝子、yahB遺伝子、yahC遺伝子、yahD遺伝子、yahE遺伝子、yahF遺伝子、yahG遺伝子、yahH遺伝子、yahI遺伝子、yahJ遺伝子、yahK遺伝子、yahL遺伝子、yahM遺伝子、yahN遺伝子、yahO遺伝子、prpR遺伝子、prpB遺伝子、prpC遺伝子、prpD遺伝子、prpE遺伝子、codB遺伝子、codA遺伝子、cynR遺伝子、cynT遺伝子、cynS遺伝子、cynX遺伝子、lacA遺伝子、lacY遺伝子、lacZ遺伝子、lacI遺伝子、mhpR遺伝子、mhpA遺伝子、mhpB遺伝子、mhpC遺伝子、mhpD遺伝子、mhpF遺伝子、mhpE遺伝子、mhpT遺伝子、yaiL遺伝子、frmB遺伝子、frmA遺伝子、frmR遺伝子、yaiO遺伝子、yaiX遺伝子、yaiF遺伝子、yaiP遺伝子、yaiS遺伝子、tauA遺伝子、tauB遺伝子、tauC遺伝子、tauD遺伝子、yaiT遺伝子、yaiU遺伝子、yaiV遺伝子、ampH遺伝子、sbmA遺伝子、yaiW遺伝子、yaiY遺伝子、yaiZ遺伝子、ddlA遺伝子、yaiB遺伝子、phoA遺伝子、psiF遺伝子、yaiC遺伝子、ybbO遺伝子、tesA遺伝子、ybbA遺伝子、ybbP遺伝子、ylbG遺伝子、ybbB遺伝子、ybbS遺伝子、allA遺伝子、allR遺伝子、glxR遺伝子、ybbV遺伝子、ybbW遺伝子、allB遺伝子、ybbY遺伝子、glxK遺伝子、ylbA遺伝子、allC遺伝子、allD遺伝子、fdrA遺伝子、ylbE_1遺伝子、ylbE_2遺伝子、ylbF遺伝子、ybcF遺伝子、envY遺伝子、ybcH遺伝子、nfrA遺伝子、nfrB遺伝子、cusS遺伝子、cusR遺伝子、cusC遺伝子、cusF遺伝子、cusB遺伝子、cusA遺伝子、pheP遺伝子、ybdG遺伝子、nfnB遺伝子、ybdF遺伝子、ybdJ遺伝子、ybdK遺伝子、hokE遺伝子、ybeL遺伝子、ybeQ遺伝子、ybeR遺伝子、djlB遺伝子、ybeT遺伝子、ybeU遺伝子、djlC遺伝子、hscC遺伝子、rihA遺伝子、gltL遺伝子、gltK遺伝子、gltJ遺伝子、gltI遺伝子、kdpF遺伝子、ybfA遺伝子、ybgA遺伝子、phr遺伝子、ybiA遺伝子、dinG遺伝子、ybiB遺伝子、ybiC遺伝子、ybiJ遺伝子、ybiI遺伝子、ybiX遺伝子、fiu遺伝子、ybiM遺伝子、ybiN遺伝子、ybiO遺伝子、glnQ遺伝子、glnP遺伝子、glnH遺伝子、yliA遺伝子、yliB遺伝子、yliC遺伝子、yliD遺伝子、yliE遺伝子、yliF遺伝子、yliG遺伝子、yliH遺伝子、yliI遺伝子、yliJ遺伝子、dacC遺伝子、deoR遺伝子、ybjG遺伝子、ybjC遺伝子、nfsA遺伝子、rimK遺伝子、ybjN遺伝子、potF遺伝子、potG遺伝子、potH遺伝子、potI遺伝子、ybjO遺伝子、rumB遺伝子、artJ遺伝子、artM遺伝子、artQ遺伝子、artI遺伝子、artP遺伝子、ybjP遺伝子、ybjQ遺伝子、ybjR遺伝子、ybjS遺伝子、ybjT遺伝子、ltaE遺伝子、ymcC遺伝子、ymcD遺伝子、cspH遺伝子、cspG遺伝子、ymcE遺伝子、gnsA遺伝子、yccM遺伝子、torS遺伝子、torT遺伝子、torR遺伝子、torC遺伝子、torA遺伝子、torD遺伝子、cbpM遺伝子、cbpA遺伝子、yccE遺伝子、agp遺伝子、yccJ遺伝子、wrbA遺伝子、ymdF遺伝子、ycdG遺伝子、ycdH遺伝子、ycdI遺伝子、rarA遺伝子、ycdK遺伝子、ycdL遺伝子、ycdM遺伝子、ycdC遺伝子、putA遺伝子、putP遺伝子、ycdN_1遺伝子、ycdN_2遺伝子、ycdO遺伝子、ycdB遺伝子、phoH遺伝子、ycdP遺伝子、ycdQ遺伝子、ycdR遺伝子、ycdS遺伝子、ycdT遺伝子、ymdE遺伝子、ycdU遺伝子、elbA遺伝子、ycgX遺伝子、ycgE遺伝子、ycgF遺伝子、ycgZ遺伝子、ymgA遺伝子、ymgB遺伝子、ymgC遺伝子、ycgG遺伝子、ymgF遺伝子、ycgH_1遺伝子、ycgH_2遺伝子、ymgD遺伝子、ymgG遺伝子、ymgH遺伝子、ycgI遺伝子、ydfH遺伝子、ydfZ遺伝子、ydfI遺伝子、ydfJ遺伝子、yecT遺伝子、flhE遺伝子、flhA遺伝子、flhB遺伝子、cheZ遺伝子、cheY遺伝子、cheB遺伝子、cheR遺伝子、tap遺伝子、tar遺伝子、cheW遺伝子、cheA遺伝子、motB遺伝子、motA遺伝子、flhC遺伝子、flhD遺伝子、yecG遺伝子、otsA遺伝子、otsB遺伝子、araH遺伝子、araG遺伝子、araF遺伝子、yecI遺伝子、yecJ遺伝子、isrB遺伝子、yecR遺伝子、ftn遺伝子、yecH遺伝子、tyrP遺伝子、uvrC遺伝子、uvrY遺伝子、yecF遺伝子、sdiA遺伝子、yecC遺伝子、yecS遺伝子、yedO遺伝子、fliY遺伝子、fliZ遺伝子、fliA遺伝子、fliC遺伝子、fliD遺伝子、fliS遺伝子、fliT遺伝子、amyA遺伝子、yedD遺伝子、yedE遺伝子、yedF遺伝子、yedK遺伝子、yedL遺伝子、yedN_2遺伝子、yedN_1遺伝子、yedM遺伝子、intG遺伝子、fliE遺伝子、fliF遺伝子、fliG遺伝子、fliH遺伝子、fliI遺伝子、fliJ遺伝子、fliK遺伝子、fliL遺伝子、fliM遺伝子、fliN遺伝子、fliO遺伝子、fliP遺伝子、fliQ遺伝子、fliR遺伝子、rcsA遺伝子、dsrB遺伝子、yodD遺伝子、yedA遺伝子、vsr遺伝子、dcm遺伝子、yedJ遺伝子、yedR遺伝子、yedS_1遺伝子、yedS_2遺伝子、yedS_3遺伝子、hchA遺伝子、yedV遺伝子、yedW遺伝子、yedX遺伝子、yedY遺伝子、yedZ遺伝子、yodA遺伝子、wbbL_2遺伝子、wbbL_1遺伝子、wbbK遺伝子、wbbJ遺伝子、wbbI遺伝子、wbbH遺伝子、glf遺伝子、rfbX遺伝子、rfbC遺伝子、rfbA遺伝子、rfbD遺伝子、rfbB遺伝子、yegE遺伝子、alkA遺伝子、yegD遺伝子、yegI遺伝子、yegJ遺伝子、yegK遺伝子、yegL遺伝子、ryeC遺伝子、ryeD遺伝子、mdtA遺伝子、mdtB遺伝子、mdtC遺伝子、mdtD遺伝子、baeS遺伝子、baeR遺伝子、yegP遺伝子、yegQ遺伝子、ryeE遺伝子、ogrK遺伝子、yegZ遺伝子、yegR遺伝子、yegS遺伝子、gatR_1遺伝子、gatR_2遺伝子、gatD遺伝子、gatC遺伝子、gatB遺伝子、gatA遺伝子、gatZ遺伝子、gatY遺伝子、fbaB遺伝子、yegT遺伝子、yegU遺伝子、yegV遺伝子、yegW遺伝子、yegX遺伝子、molR_1遺伝子、molR_2遺伝子、molR_3遺伝子、yehI遺伝子、yehK遺伝子、yehL遺伝子、yehM遺伝子、yehP遺伝子、yehQ遺伝子、yehR遺伝子、yehS遺伝子、yehT遺伝子、yehU遺伝子、mlrA遺伝子、yohO遺伝子、yehW遺伝子、yehX遺伝子、yehY遺伝子、yehZ遺伝子、bglX遺伝子、dld遺伝子、pbpG遺伝子、yohC遺伝子、yeiI遺伝子、yeiJ遺伝子、rihB遺伝子、yeiL遺伝子、yeiM遺伝子、yeiN遺伝子、yeiC遺伝子、elaB遺伝子、elaA遺伝子、elaC遺伝子、elaD遺伝子、yfbK遺伝子、yfbL遺伝子、yfbM遺伝子、yfbN遺伝子、yfbO遺伝子、yfbP遺伝子、yfcC遺伝子、yfcD遺伝子、yfcE遺伝子、yfcF遺伝子、yfcG遺伝子、folX遺伝子、yfcH遺伝子、yfcI遺伝子、hisP遺伝子、hisM遺伝子、hisQ遺伝子、hisJ遺伝子、argT遺伝子、ypdA遺伝子、ypdB遺伝子、ypdC遺伝子、ypdD遺伝子、ypdE遺伝子、ypdF遺伝子、ypdG遺伝子、ypdH遺伝子、pinH遺伝子、ypjB遺伝子、ypjC遺伝子、ileY遺伝子、ygaQ遺伝子、ygaR遺伝子、yqaC遺伝子、yqaD遺伝子、ygaT遺伝子、csiR遺伝子、ygaU遺伝子、yqaE遺伝子、ygaV遺伝子、ygaP遺伝子、stpA遺伝子、ygaW遺伝子、ygaC遺伝子、ygaM遺伝子、nrdH遺伝子、nrdI遺伝子、nrdE遺伝子、proV遺伝子、proW遺伝子、proX遺伝子、ygaX遺伝子、ygaY遺伝子、ygaZ遺伝子、ygaH遺伝子、srlA遺伝子、srlE遺伝子、srlB遺伝子、srlD遺伝子、gutM遺伝子、srlR遺伝子、gutQ遺伝子、yqeG遺伝子、yqeH遺伝子、yqeI遺伝子、yqeJ遺伝子、yqeK遺伝子、ygeF遺伝子、ygeG遺伝子、ygeH遺伝子、ygeI遺伝子、pbl遺伝子、ygeK遺伝子、ygeL遺伝子、ygeM遺伝子、ygeN遺伝子、ygeO遺伝子、ygeP遺伝子、ygeQ遺伝子、glyU遺伝子、ygeR遺伝子、xdhA遺伝子、xdhB遺伝子、xdhC遺伝子、ygeV遺伝子、ygeW遺伝子、ygeX遺伝子、ygeY遺伝子、hyuA遺伝子、yqeA遺伝子、yqeB遺伝子、yqeC遺伝子、ygfJ遺伝子、ygfK遺伝子、ssnA遺伝子、ygfM遺伝子、xdhD遺伝子、ygfO遺伝子、guaD遺伝子、ygfQ遺伝子、ygfS遺伝子、ygfT遺伝子、ygfU遺伝子、idi遺伝子、cmtA遺伝子、cmtB遺伝子、yghD遺伝子、yghE遺伝子、yghF遺伝子、yghG遺伝子、pppA遺伝子、yghJ遺伝子、yghK遺伝子、glcB遺伝子、glcG遺伝子、glcF遺伝子、glcE遺伝子、glcD遺伝子、glcC遺伝子、yghO遺伝子、yghQ遺伝子、yghR遺伝子、yghS遺伝子、yghT遺伝子、ygiS遺伝子、ygiT遺伝子、ygiU遺伝子、ygiV遺伝子、ygiW遺伝子、qseB遺伝子、qseC遺伝子、ygiZ遺伝子、mdaB遺伝子、ygiN遺伝子、gltF遺伝子、yhcA遺伝子、yhcD遺伝子、yhcE遺伝子、yhcF遺伝子、yhcG遺伝子、yhcH遺伝子、nanK遺伝子、nanE遺伝子、yhdJ遺伝子、yhdU遺伝子、envR遺伝子、acrE遺伝子、acrF遺伝子、yhdV遺伝子、yhdW遺伝子、yhdX遺伝子、yhdY遺伝子、yijP遺伝子、yijO遺伝子、frwD遺伝子、pflC遺伝子、pflD遺伝子、frwB遺伝子、frwC遺伝子、ptsA遺伝子、rhaT遺伝子、rhaR遺伝子、rhaS遺伝子、rhaB遺伝子、rhaA遺伝子、rhaD遺伝子、yiiL遺伝子、frvA遺伝子、frvB遺伝子、frvX遺伝子、frvR遺伝子、yiiG遺伝子、yiiF遺伝子、yiiE遺伝子、yiiD遺伝子、dtd遺伝子、rbn遺伝子、yihX遺伝子、yihW遺伝子、yihV遺伝子、yihU遺伝子、yihT遺伝子、yihS遺伝子、yihR遺伝子、yihQ遺伝子、yihP遺伝子、yihO遺伝子、ompL遺伝子、yihN遺伝子、yihM遺伝子、yihL遺伝子、hsrA遺伝子、rbsR遺伝子、rbsK遺伝子、rbsB遺伝子、rbsC遺伝子、rbsA遺伝子、rbsD遺伝子、trkD遺伝子、yieN遺伝子、yieM遺伝子、asnA遺伝子、yidB遺伝子、yidA遺伝子、yidX遺伝子、dgoR遺伝子、dgoK遺伝子、dgoA遺伝子、dgoD遺伝子、dgoT遺伝子、cbrA遺伝子、yidR遺伝子、yidQ遺伝子、yidE遺伝子、yidP遺伝子、glvC遺伝子、glvB遺伝子、glvG遺伝子、ysdC遺伝子、yidL遺伝子、yidK遺伝子、yidJ遺伝子、yidI遺伝子、yidH遺伝子、yidG遺伝子、yidF遺伝子、yhiN遺伝子、yhiM遺伝子、yhiL遺伝子、yhiK遺伝子、yhiJ遺伝子、yhiI遺伝子、rbbA遺伝子、yhhJ遺伝子、chiA遺伝子、bfd遺伝子、bfr遺伝子、gspO遺伝子、gspM遺伝子、gspL遺伝子、gspK遺伝子、gspJ遺伝子、gspI遺伝子、gspH遺伝子、gspG遺伝子、gspF遺伝子、gspE遺伝子、gspD遺伝子、gspC遺伝子、gspA遺伝子、pioO遺伝子、yjbE遺伝子、yjbF遺伝子、yjbG遺伝子、yjbH遺伝子、yjbA遺伝子、xylE遺伝子、malG遺伝子、malF遺伝子、malE遺伝子、malK遺伝子、lamB遺伝子、malM遺伝子、yjbI遺伝子、yjcP遺伝子、yjcQ遺伝子、yjcR遺伝子、yjcS遺伝子、alsK遺伝子、alsE遺伝子、alsC遺伝子、alsA遺伝子、alsB遺伝子、yjdP遺伝子、phnP遺伝子、phnO遺伝子、phnN遺伝子、phnM遺伝子、phnL遺伝子、phnK遺伝子、phnJ遺伝子、phnI遺伝子、phnH遺伝子、phnG遺伝子、phnF遺伝子、phnE(JW4064)遺伝子、phnE(JW4065)遺伝子、phnD遺伝子、phnC遺伝子、phnB遺伝子、phnA遺伝子、yjdA遺伝子、yjcZ遺伝子、yjfI遺伝子、yjfJ遺伝子、yjfK遺伝子、yjfL遺伝子、yjfM遺伝子、yjfC遺伝子、aidB遺伝子、yjfN遺伝子、yjfO遺伝子、yjfP遺伝子、ulaR遺伝子、ulaG遺伝子、ulaA遺伝子、ulaB遺伝子、ulaC遺伝子、ulaD遺伝子、ulaE遺伝子、yjhS遺伝子、yjhT遺伝子、yjhA遺伝子、fimB遺伝子、fimE遺伝子、fimA遺伝子、fimI遺伝子、fimC遺伝子、fimD遺伝子、fimF遺伝子、fimG遺伝子、fimH遺伝子、gntP遺伝子、uxuA遺伝子、uxuB遺伝子、uxuR遺伝子、yjiC遺伝子、yjiD遺伝子、yjiE遺伝子、iadA遺伝子、yjiG遺伝子、yjiH遺伝子、kptA遺伝子、yjiJ遺伝子、yjiK遺伝子、yjiL遺伝子、yjiM遺伝子、yjiN遺伝子、yjiO遺伝子、yjiP遺伝子、yjiQ遺伝子、yjiR遺伝子、yjiS遺伝子、yjiT遺伝子、yjiV遺伝子、mcrC遺伝子、mcrB遺伝子、yjiW遺伝子、hsdS遺伝子、hsdM遺伝子、hsdR遺伝子、mrr遺伝子、yjiA遺伝子、yjiX遺伝子、yjiY遺伝子、tsr遺伝子、yjiZ遺伝子、yjjM遺伝子、yjjN遺伝子、mdoB遺伝子、yjjA遺伝子
　（２）配列番号１で表される塩基配列中の以下の［１］～［８３］記載の塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含む染色体ＤＮＡを有する(１)記載の大腸菌の変異体。
［１］1番～15298番目で表される塩基配列
［２］16751番～19620番目で表される塩基配列
［３］20815番～65857番目で表される塩基配列
［４］78797番～167400番目で表される塩基配列
［５］173316番～244300番目で表される塩基配列
［６］253747番～262299番目で表される塩基配列
［７］387868番～389474番目で表される塩基配列
［８］404040番～518365番目で表される塩基配列
［９］533048番～535840番目で表される塩基配列
［１０］550552番～564276番目で表される塩基配列
［１１］608455番～640668番目で表される塩基配列
［１２］659193番～675439番目で表される塩基配列
［１３］689711番～729156番目で表される塩基配列
［１４］739930番～832888番目で表される塩基配列
［１５］848427番～867974番目で表される塩基配列
［１６］883811番～891334番目で表される塩基配列
［１７］909717番～1049224番目で表される塩基配列
［１８］1097358番～1105534番目で表される塩基配列
［１９］1106991番～1196528番目で表される塩基配列
［２０］1225485番～1295721番目で表される塩基配列
［２１］1297023番～1300822番目で表される塩基配列
［２２］1302896番～1397636番目で表される塩基配列
［２３］1399079番～1413662番目で表される塩基配列
［２４］1436899番～1469664番目で表される塩基配列
［２５］1472404番～1504839番目で表される塩基配列
［２６］1506619番～1528866番目で表される塩基配列
［２７］1534766番～1630050番目で表される塩基配列
［２８］1654610番～1853604番目で表される塩基配列
［２９］1864144番～1875287番目で表される塩基配列
［３０］1888500番～1963662番目で表される塩基配列
［３１］1992215番～1995800番目で表される塩基配列
［３２］2027349番～2032587番目で表される塩基配列
［３３］2043516番～2068287番目で表される塩基配列
［３４］2081066番～2103531番目で表される塩基配列
［３５］2115204番～2145402番目で表される塩基配列
［３６］2186995番～2199807番目で表される塩基配列
［３７］2228990番～2255033番目で表される塩基配列
［３８］2262631番～2292234番目で表される塩基配列
［３９］2293834番～2324498番目で表される塩基配列
［４０］2322075番～2411311番目で表される塩基配列
［４１］2413007番～2422503番目で表される塩基配列
［４２］2433238番～2471990番目で表される塩基配列
［４３］2482140番～2504213番目で表される塩基配列
［４４］2513697番～2519690番目で表される塩基配列
［４５］2521089番～2599856番目で表される塩基配列
［４６］2613439番～2754814番目で表される塩基配列
［４７］2788619番～2794311番目で表される塩基配列
［４８］2800029番～2803445番目で表される塩基配列
［４９］2809286番～2824451番目で表される塩基配列
［５０］2829399番～2909409番目で表される塩基配列
［５１］2909710番～2921193番目で表される塩基配列
［５２］2943639番～2984497番目で表される塩基配列
［５３］3032267番～3076223番目で表される塩基配列
［５４］3078056番～3109245番目で表される塩基配列
［５５］3133480番～3164769番目で表される塩基配列
［５６］3172082番～3184621番目で表される塩基配列
［５７］3186056番～3224889番目で表される塩基配列
［５８］3240401番～3261074番目で表される塩基配列
［５９］3262220番～3361080番目で表される塩基配列
［６０］3370892番～3411501番目で表される塩基配列
［６１］3421222番～3486426番目で表される塩基配列
［６２］3496906番～3536155番目で表される塩基配列
［６３］3549687番～3556477番目で表される塩基配列
［６４］3576239番～3697304番目で表される塩基配列
［６５］3709527番～3742812番目で表される塩基配列
［６６］3744293番～3748980番目で表される塩基配列
［６７］3747997番～3750486番目で表される塩基配列
［６８］3751906番～3762908番目で表される塩基配列
［６９］3772817番～3774086番目で表される塩基配列
［７０］3785257番～3794687番目で表される塩基配列
［７１］3803459番～3868134番目で表される塩基配列
［７２］3878460番～3918087番目で表される塩基配列
［７３］3919815番～3986454番目で表される塩基配列
［７４］3988342番～4003004番目で表される塩基配列
［７５］4021347番～4055371番目で表される塩基配列
［７６］4061466番～4128290番目で表される塩基配列
［７７］4141016番～4170562番目で表される塩基配列
［７８］4186909番～4239493番目で表される塩基配列
［７９］4255871番～4303000番目で表される塩基配列
［８０］4316735番～4318540番目で表される塩基配列
［８１］4334946番～4414758番目で表される塩基配列
［８２］4428378番～4501437番目で表される塩基配列
［８３］4604873番～4646332番目で表される塩基配列
　（３）uspG遺伝子、ybdR遺伝子、rnk遺伝子、rna遺伝子、citT遺伝子、citG遺伝子、citX遺伝子、citF遺伝子、citE遺伝子、citD遺伝子、citC遺伝子、citA遺伝子、citB遺伝子、dcuC遺伝子、crcA遺伝子、cspE遺伝子、crcB遺伝子、ybeH遺伝子、およびybeM遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）または（２）記載の大腸菌の変異体。
　（４）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号塩基番号640669番～659192番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（３）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（５）yqcA遺伝子、yqcB遺伝子、yqcC遺伝子、syd遺伝子、yqcD遺伝子、ygdH遺伝子、sdaC遺伝子、sdaB遺伝子、exo遺伝子、fucO遺伝子、fucA遺伝子、fucP遺伝子、fucI遺伝子、fucK遺伝子、fucU遺伝子、fucR遺伝子、ygdE遺伝子、ygdD遺伝子、gcvA遺伝子、ygdI遺伝子、csdA遺伝子、およびygdK遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まず、かつchpA遺伝子またはその相同遺伝子を含む染色体ＤＮＡを有する（１）～（４）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（６）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号2921194番～2943638番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（５）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（７）araD遺伝子、araA遺伝子、araB遺伝子、araC遺伝子、yabI遺伝子、thiQ遺伝子、thiP遺伝子、tbpA遺伝子、sgrR遺伝子、およびsetA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（６）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（８）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号65858番～78796番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（７）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（９）yhfZ遺伝子、yhfY遺伝子、yhfX遺伝子、yhfW遺伝子、php遺伝子、yhfU遺伝子、yhfT遺伝子、yhfS遺伝子、frlR遺伝子、frlD遺伝子、frlC遺伝子、frlB遺伝子、frlA遺伝子、およびyhfL遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（８）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（１０）　配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号4128291番～4141015番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（９）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（１１）pncA遺伝子、ydjE遺伝子、ydjF遺伝子、ydjG遺伝子、ydjH遺伝子、ydjI遺伝子、ydjJ遺伝子、ydjK遺伝子、ydjL遺伝子、yeaC遺伝子、およびyeaA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（１０）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（１２）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号1853605番～1864143番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（１１）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（１３）ade遺伝子、yicO遺伝子、yicN遺伝子、yicM遺伝子、yicS遺伝子、nlpA遺伝子、yicL遺伝子、およびsetC遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（１２）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（１４）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号3794688番～3803458番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（１３）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（１５）ygjI遺伝子、ygjJ遺伝子、ygjK遺伝子、fadH遺伝子、ygjM遺伝子、ygjN遺伝子、ygjO遺伝子、ygjP遺伝子、ygjQ遺伝子、ygjR遺伝子、alx遺伝子、sstT遺伝子、およびygjV遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（１４）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（１６）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号3224890番～3240400番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（１５）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（１７）yrhB遺伝子、yrhA遺伝子、yhhZ遺伝子、yhhY遺伝子、yhhX遺伝子、およびyhhW遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（１６）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（１８）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号4055372番～4061465番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（１７）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（１９）yeaK遺伝子、yoaI遺伝子、yeaL遺伝子、yeaM遺伝子、yeaN遺伝子、yeaO遺伝子、yoaF遺伝子、yeaP遺伝子、yeaQ遺伝子、yoaG遺伝子、yeaR遺伝子、yeaS遺伝子、yeaT遺伝子、yeaU遺伝子、yeaV遺伝子、yeaW遺伝子、およびyeaX遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（１８）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（２０）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号1875288番～1888499番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（１９）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（２１）hyfA遺伝子、hyfB遺伝子、hyfC遺伝子、hyfD遺伝子、hyfE遺伝子、hyfF遺伝子、hyfG遺伝子、hyfH遺伝子、hyfI遺伝子、hyfJ遺伝子、hyfR遺伝子、およびfocB遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（２０）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（２２）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号2599857番～2613438番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する（１）～（２１）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
　（２３）以下の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子を含み、かつ［２］および［３］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子の１０％以下を含み、かつ野生型の大腸菌より１０４０kbp以上短い染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体。ただし、以下の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子中に、ＮＣ遺伝子がある場合には、該野生型の大腸菌に由来する上記大腸菌の変異体は、ＮＣ遺伝子を有していなくてもよい。
［１］thrL遺伝子、thrA遺伝子、thrB遺伝子、thrC遺伝子、talB遺伝子、mog遺伝子、htgA遺伝子、dnaK遺伝子、dnaJ遺伝子、mokC遺伝子、hokC遺伝子、sokC遺伝子、nhaA遺伝子、nhaR遺伝子、rpsT遺伝子、ribF遺伝子、ileS遺伝子、lspA遺伝子、fkpB遺伝子、ispH遺伝子、rihC遺伝子、dapB遺伝子、carA遺伝子、carB遺伝子、caiF遺伝子、caiE遺伝子、caiD遺伝子、caiC遺伝子、caiB遺伝子、caiA遺伝子、caiT遺伝子、fixA遺伝子、fixB遺伝子、fixC遺伝子、fixX遺伝子、kefF遺伝子、kefC遺伝子、folA遺伝子、apaH遺伝子、apaG遺伝子、ksgA遺伝子、pdxA遺伝子、surA遺伝子、imp遺伝子、djlA遺伝子、rluA遺伝子、hepA遺伝子、polB遺伝子、leuD遺伝子、leuC遺伝子、leuB遺伝子、leuA遺伝子、leuL遺伝子、leuO遺伝子、ilvI遺伝子、ilvH遺伝子、fruR遺伝子、mraZ遺伝子、mraW遺伝子、ftsL遺伝子、ftsI遺伝子、murE遺伝子、murF遺伝子、mraY遺伝子、murD遺伝子、ftsW遺伝子、murG遺伝子、murC遺伝子、ddlB遺伝子、ftsQ遺伝子、ftsA遺伝子、ftsZ遺伝子、lpxC遺伝子、secM遺伝子、secA遺伝子、mutT遺伝子、coaE遺伝子、guaC遺伝子、hofC遺伝子、hofB遺伝子、ppdD遺伝子、nadC遺伝子、ampD遺伝子、ampE遺伝子、aroP遺伝子、pdhR遺伝子、aceE遺伝子、aceF遺伝子、lpd遺伝子、acnB遺伝子、speD遺伝子、speE遺伝子、cueO遺伝子、gcd遺伝子、hpt遺伝子、can遺伝子、panD遺伝子、panC遺伝子、panB遺伝子、htrE遺伝子、ecpD遺伝子、folK遺伝子、pcnB遺伝子、dksA遺伝子、sfsA遺伝子、ligT遺伝子、hrpB遺伝子、mrcB遺伝子、hemL遺伝子、clcA遺伝子、btuF遺伝子、pfs遺伝子、dgt遺伝子、degP遺伝子、cdaR遺伝子、dapD遺伝子、glnD遺伝子、map遺伝子、tff遺伝子、rpsB遺伝子、tsf遺伝子、pyrH遺伝子、frr遺伝子、dxr遺伝子、ispU遺伝子、cdsA遺伝子、hlpA遺伝子、lpxD遺伝子、fabZ遺伝子、lpxA遺伝子、lpxB遺伝子、rnhB遺伝子、dnaE遺伝子、accA遺伝子、ldcC遺伝子、tilS遺伝子、rof遺伝子、nlpE遺伝子、proS遺伝子、rcsF遺伝子、metQ遺伝子、metI遺伝子、metN遺伝子、gmhB遺伝子、rrsH遺伝子、ileV遺伝子、alaV遺伝子、rrlH遺伝子、rrfH遺伝子、aspU遺伝子、dkgB遺伝子、mltD遺伝子、gloB遺伝子、rnhA遺伝子、dnaQ遺伝子、aspV遺伝子、ivy遺伝子、fadE遺伝子、lpcA遺伝子、pepD遺伝子、gpt遺伝子、frsA遺伝子、crl遺伝子、phoE遺伝子、proB遺伝子、proA遺伝子、thrW遺伝子、hemB遺伝子、proC遺伝子、aroL遺伝子、aroM遺伝子、rdgC遺伝子、mak遺伝子、araJ遺伝子、sbcC遺伝子、sbcD遺伝子、phoB遺伝子、phoR遺伝子、brnQ遺伝子、proY遺伝子、malZ遺伝子、queA遺伝子、tgt遺伝子、secD遺伝子、secF遺伝子、tsx遺伝子、ribD遺伝子、ribE遺伝子、nusB遺伝子、thiL遺伝子、pgpA遺伝子、dxs遺伝子、ispA遺伝子、xseB遺伝子、thiI遺伝子、panE遺伝子、cyoE遺伝子、cyoD遺伝子、cyoC遺伝子、cyoB遺伝子、cyoA遺伝子、ampG遺伝子、bolA遺伝子、tig遺伝子、clpP遺伝子、clpX遺伝子、lon遺伝子、hupB遺伝子、ppiD遺伝子、cof遺伝子、mdlA遺伝子、mdlB遺伝子、glnK遺伝子、amtB遺伝子、tesB遺伝子、ffs遺伝子、maa遺伝子、hha遺伝子、acrB遺伝子、acrA遺伝子、acrR遺伝子、kefA遺伝子、priC遺伝子、apt遺伝子、dnaX遺伝子、recR遺伝子、htpG遺伝子、adk遺伝子、hemH遺伝子、aes遺伝子、gsk遺伝子、fsr遺伝子、ushA遺伝子、copA遺伝子、cueR遺伝子、gcl遺伝子、hyi遺伝子、purK遺伝子、purE遺伝子、lpxH遺伝子、ppiB遺伝子、cysS遺伝子、folD遺伝子、sfmA遺伝子、sfmC遺伝子、sfmD遺伝子、sfmH遺伝子、sfmF遺伝子、fimZ遺伝子、argU遺伝子、entD遺伝子、fepA遺伝子、fes遺伝子、entF遺伝子、fepE遺伝子、fepC遺伝子、fepG遺伝子、fepD遺伝子、fepB遺伝子、entC遺伝子、entE遺伝子、entB遺伝子、entA遺伝子、cstA遺伝子、dsbG遺伝子、ahpC遺伝子、ahpF遺伝子、tatE遺伝子、lipA遺伝子、lipB遺伝子、dacA遺伝子、rlpA遺伝子、mrdB遺伝子、mrdA遺伝子、cobC遺伝子、nadD遺伝子、holA遺伝子、rlpB遺伝子、leuS遺伝子、lnt遺伝子、miaB遺伝子、ubiF遺伝子、glnX遺伝子、glnV遺伝子、metU遺伝子、glnW遺伝子、glnU遺伝子、leuW遺伝子、metT遺伝子、asnB遺伝子、nagD遺伝子、nagC遺伝子、nagA遺伝子、nagB遺伝子、nagE遺伝子、glnS遺伝子、fur遺伝子、fldA遺伝子、seqA遺伝子、pgm遺伝子、potE遺伝子、speF遺伝子、kdpE遺伝子、kdpD遺伝子、kdpC遺伝子、kdpB遺伝子、kdpA遺伝子、nei遺伝子、abrB遺伝子、gltA遺伝子、sdhC遺伝子、sdhD遺伝子、sdhA遺伝子、sdhB遺伝子、sucA遺伝子、sucB遺伝子、sucC遺伝子、sucD遺伝子、mngR遺伝子、mngA遺伝子、mngB遺伝子、cydA遺伝子、cydB遺伝子、tolQ遺伝子、tolR遺伝子、tolA遺伝子、tolB遺伝子、pal遺伝子、lysT遺伝子、valT遺伝子、lysW遺伝子、valZ遺伝子、lysY遺伝子、lysZ遺伝子、lysQ遺伝子、nadA遺伝子、pnuC遺伝子、zitB遺伝子、aroG遺伝子、gpmA遺伝子、galM遺伝子、galK遺伝子、galT遺伝子、galE遺伝子、modF遺伝子、modE遺伝子、modA遺伝子、modB遺伝子、modC遺伝子、bioA遺伝子、bioB遺伝子、bioF遺伝子、bioC遺伝子、bioD遺伝子、uvrB遺伝子、moaA遺伝子、moaB遺伝子、moaC遺伝子、moaD遺伝子、moaE遺伝子、rhlE遺伝子、dps遺伝子、rhtA遺伝子、ompX遺伝子、rybA遺伝子、mntR遺伝子、fsaA遺伝子、moeB遺伝子、moeA遺伝子、iaaA遺伝子、cmr遺伝子、rybB遺伝子、grxA遺伝子、poxB遺伝子、hcr遺伝子、hcp遺伝子、aqpZ遺伝子、macA遺伝子、macB遺伝子、cspD遺伝子、clpS遺伝子、clpA遺伝子、serW遺伝子、infA遺伝子、aat遺伝子、cydC遺伝子、cydD遺伝子、trxB遺伝子、lrp遺伝子、ftsK遺伝子、lolA遺伝子、serS遺伝子、dmsA遺伝子、dmsB遺伝子、dmsC遺伝子、pflA遺伝子、pflB遺伝子、focA遺伝子、serC遺伝子、aroA遺伝子、cmk遺伝子、rpsA遺伝子、ihfB遺伝子、msbA遺伝子、lpxK遺伝子、kdsB遺伝子、smtA遺伝子、mukF遺伝子、mukE遺伝子、mukB遺伝子、aspC遺伝子、ompF遺伝子、asnS遺伝子、pncB遺伝子、pepN遺伝子、ssuB遺伝子、ssuC遺伝子、ssuD遺伝子、ssuA遺伝子、ssuE遺伝子、pyrD遺伝子、uup遺伝子、pqiA遺伝子、pqiB遺伝子、rmf遺伝子、fabA遺伝子、ompA遺伝子、sulA遺伝子、helD遺伝子、mgsA遺伝子、serT遺伝子、hyaA遺伝子、hyaB遺伝子、hyaC遺伝子、hyaD遺伝子、hyaE遺伝子、hyaF遺伝子、appC遺伝子、appB遺伝子、appA遺伝子、etp遺伝子、serX遺伝子、csgG遺伝子、csgF遺伝子、csgE遺伝子、csgD遺伝子、csgB遺伝子、csgA遺伝子、csgC遺伝子、mdoC遺伝子、mdoG遺伝子、mdoH遺伝子、msyB遺伝子、mdtG遺伝子、lpxL遺伝子、solA遺伝子、dinI遺伝子、pyrC遺伝子、grxB遺伝子、mdtH遺伝子、rimJ遺伝子、mviM遺伝子、mviN遺伝子、flgN遺伝子、flgM遺伝子、flgA遺伝子、flgB遺伝子、flgC遺伝子、flgD遺伝子、flgE遺伝子、flgF遺伝子、flgG遺伝子、flgH遺伝子、flgI遺伝子、flgJ遺伝子、flgK遺伝子、flgL遺伝子、rne遺伝子、rluC遺伝子、sraB遺伝子、rpmF遺伝子、plsX遺伝子、fabH遺伝子、fabD遺伝子、fabG遺伝子、acpP遺伝子、fabF遺伝子、pabC遺伝子、tmk遺伝子、holB遺伝子、ptsG遺伝子、fhuE遺伝子、hinT遺伝子、nagZ遺伝子、ndh遺伝子、mfd遺伝子、lolC遺伝子、lolD遺伝子、lolE遺伝子、cobB遺伝子、potD遺伝子、potC遺伝子、potB遺伝子、potA遺伝子、pepT遺伝子、phoQ遺伝子、phoP遺伝子、purB遺伝子、hflD遺伝子、trmU遺伝子、minE遺伝子、minD遺伝子、minC遺伝子、hlyE遺伝子、umuD遺伝子、umuC遺伝子、dsbB遺伝子、nhaB遺伝子、fadR遺伝子、dadA遺伝子、dadX遺伝子、cvrA遺伝子、ldcA遺伝子、emtA遺伝子、treA遺伝子、dhaH遺伝子、dhaL遺伝子、dhaK遺伝子、dhaR遺伝子、pth遺伝子、prsA遺伝子、ispE遺伝子、lolB遺伝子、hemA遺伝子、prfA遺伝子、prmC遺伝子、kdsA遺伝子、ldrA遺伝子、rdlA遺伝子、ldrB遺伝子、rdlB遺伝子、ldrC遺伝子、rdlC遺伝子、chaA遺伝子、chaB遺伝子、chaC遺伝子、narL遺伝子、narX遺伝子、narK遺伝子、narG遺伝子、narH遺伝子、narJ遺伝子、narI遺伝子、rttR遺伝子、tpr遺伝子、tyrV遺伝子、tyrT遺伝子、purU遺伝子、rssA遺伝子、rssB遺伝子、galU遺伝子、hns遺伝子、tdk遺伝子、adhE遺伝子、oppA遺伝子、oppB遺伝子、oppC遺伝子、oppD遺伝子、oppF遺伝子、cls遺伝子、kch遺伝子、tonB遺伝子、ompW遺伝子、trpA遺伝子、trpB遺伝子、trpC遺伝子、trpD遺伝子、trpE遺伝子、trpL遺伝子、rluB遺伝子、btuR遺伝子、sohB遺伝子、topA遺伝子、cysB遺伝子、acnA遺伝子、ribA遺伝子、pgpB遺伝子、pyrF遺伝子、osmB遺伝子、gmr遺伝子、rnb遺伝子、fabI遺伝子、sapF遺伝子、sapD遺伝子、sapC遺伝子、sapB遺伝子、sapA遺伝子、puuP遺伝子、puuA遺伝子、puuD遺伝子、puuR遺伝子、puuC遺伝子、puuB遺伝子、puuE遺伝子、pspF遺伝子、pspA遺伝子、pspB遺伝子、pspC遺伝子、pspD遺伝子、pspE遺伝子、ompG遺伝子、tyrR遺伝子、tpx遺伝子、mpaA遺伝子、mppA遺伝子、uspE遺伝子、fnr遺伝子、ogt遺伝子、abgT遺伝子、abgB遺伝子、abgA遺伝子、abgR遺伝子、isrA遺伝子、dbpA遺伝子、uspF遺伝子、ompN遺伝子、micC遺伝子、hslJ遺伝子、ldhA遺伝子、feaR遺伝子、feaB遺伝子、tynA遺伝子、maoC遺伝子、paaA遺伝子、paaB遺伝子、paaC遺伝子、paaD遺伝子、paaE遺伝子、paaF遺伝子、paaG遺伝子、paaH遺伝子、paaI遺伝子、paaJ遺伝子、paaK遺伝子、paaX遺伝子、paaY遺伝子、azoR遺伝子、hrpA遺伝子、aldA遺伝子、gapC_2遺伝子、gapC_1遺伝子、cybB遺伝子、hokB遺伝子、mokB遺伝子、sokB遺伝子、trg遺伝子、mdoD遺伝子、rimL遺伝子、tehA遺伝子、tehB遺伝子、ansP遺伝子、nhoA遺伝子、narV遺伝子、narW遺伝子、narY遺伝子、narZ遺伝子、narU遺伝子、fdnG遺伝子、fdnH遺伝子、fdnI遺伝子、adhP遺伝子、sfcA遺伝子、sra遺伝子、bdm遺伝子、osmC遺伝子、ddpF遺伝子、ddpD遺伝子、ddpC遺伝子、ddpB遺伝子、ddpA遺伝子、ddpX遺伝子、dos遺伝子、gadC遺伝子、gadB遺伝子、pqqL遺伝子、hipA遺伝子、hipB遺伝子、ego遺伝子、lsrC遺伝子、lsrD遺伝子、lsrB遺伝子、lsrF遺伝子、lsrG遺伝子、tam遺伝子、uxaB遺伝子、marC遺伝子、marR遺伝子、marA遺伝子、marB遺伝子、eamA遺伝子、dcp遺伝子、rspB遺伝子、rspA遺伝子、speG遺伝子、dmsD遺伝子、clcB遺伝子、dgsA遺伝子、asr遺伝子、mdtI遺伝子、mdtJ遺伝子、pntB遺伝子、pntA遺伝子、folM遺伝子、rstA遺伝子、rstB遺伝子、tus遺伝子、fumC遺伝子、fumA遺伝子、manA遺伝子、uidC遺伝子、uidB遺伝子、uidA遺伝子、uidR遺伝子、hdhA遺伝子、malI遺伝子、malX遺伝子、malY遺伝子、add遺伝子、blr遺伝子、rsxA遺伝子、rsxB遺伝子、rsxC遺伝子、rsxD遺伝子、rsxG遺伝子、rsxE遺伝子、nth遺伝子、gst遺伝子、pdxY遺伝子、tyrS遺伝子、pdxH遺伝子、slyB遺伝子、slyA遺伝子、sodC遺伝子、nemA遺伝子、gloA遺伝子、rnt遺伝子、lhr遺伝子、sodB遺伝子、purR遺伝子、cfa遺伝子、ribC遺伝子、mdtK遺伝子、valV遺伝子、valW遺伝子、pykF遺伝子、lpp遺伝子、sufE遺伝子、sufS遺伝子、sufD遺伝子、sufC遺伝子、sufB遺伝子、sufA遺伝子、rydB遺伝子、rprA遺伝子、aroD遺伝子、pps遺伝子、aroH遺伝子、nlpC遺伝子、btuD遺伝子、btuE遺伝子、btuC遺伝子、ihfA遺伝子、pheT遺伝子、pheS遺伝子、pheM遺伝子、rplT遺伝子、rpmI遺伝子、infC遺伝子、thrS遺伝子、arpB_1遺伝子、arpB_2遺伝子、pfkB遺伝子、cedA遺伝子、katE遺伝子、chbG遺伝子、chbF遺伝子、chbR遺伝子、chbA遺伝子、chbC遺伝子、chbB遺伝子、osmE遺伝子、nadE遺伝子、spy遺伝子、astE遺伝子、astB遺伝子、astD遺伝子、astA遺伝子、astC遺伝子、xthA遺伝子、nudG遺伝子、gdhA遺伝子、topB遺伝子、selD遺伝子、sppA遺伝子、ansA遺伝子、gapA遺伝子、mipA遺伝子、rnd遺伝子、fadD遺伝子、pabB遺伝子、sdaA遺伝子、manX遺伝子、manY遺伝子、manZ遺伝子、rrmA遺伝子、cspC遺伝子、kdgR遺伝子、htpX遺伝子、prc遺伝子、proQ遺伝子、pphA遺伝子、ryeA遺伝子、ryeB遺伝子、holE遺伝子、exoX遺伝子、ptrB遺伝子、purT遺伝子、eda遺伝子、edd遺伝子、zwf遺伝子、pykA遺伝子、lpxM遺伝子、znuA遺伝子、znuC遺伝子、znuB遺伝子、ruvB遺伝子、ruvA遺伝子、ruvC遺伝子、nudB遺伝子、aspS遺伝子、torZ遺伝子、torY遺伝子、cutC遺伝子、argS遺伝子、leuZ遺伝子、cysT遺伝子、glyW遺伝子、pgsA遺伝子、dsrA遺伝子、serU遺伝子、asnT遺伝子、shiA遺伝子、amn遺伝子、asnW遺伝子、asnU遺伝子、cbl遺伝子、nac遺伝子、asnV遺伝子、erfK遺伝子、cobT遺伝子、
cobS遺伝子、cobU遺伝子、sbmC遺伝子、dacD遺伝子、sbcB遺伝子、hisL遺伝子、hisG遺伝子、hisD遺伝子、hisC遺伝子、hisB遺伝子、hisH遺伝子、hisA遺伝子、hisF遺伝子、hisI遺伝子、cld遺伝子、ugd遺伝子、gnd遺伝子、galF遺伝子、wcaM遺伝子、wcaL遺伝子、wcaK遺伝子、wzxC遺伝子、wcaJ遺伝子、cpsG遺伝子、cpsB遺伝子、wcaI遺伝子、nudD遺伝子、fcl遺伝子、gmd遺伝子、wcaF遺伝子、wcaE遺伝子、wcaD遺伝子、wcaC遺伝子、wcaB遺伝子、wcaA遺伝子、wzc遺伝子、wzb遺伝子、wza遺伝子、asmA遺伝子、dcd遺伝子、udk遺伝子、thiD遺伝子、thiM遺伝子、mrp遺伝子、metG遺伝子、dusC遺伝子、cdd遺伝子、sanA遺伝子、mglC遺伝子、mglA遺伝子、mglB遺伝子、galS遺伝子、folE遺伝子、cirA遺伝子、lysP遺伝子、nfo遺伝子、fruA遺伝子、fruK遺伝子、fruB遺伝子、setB遺伝子、spr遺伝子、rtn遺伝子、bcr遺伝子、rsuA遺伝子、rplY遺伝子、proL遺伝子、narP遺伝子、ccmH遺伝子、ccmG遺伝子、ccmF遺伝子、ccmE遺伝子、ccmD遺伝子、ccmC遺伝子、ccmB遺伝子、ccmA遺伝子、napC遺伝子、napB遺伝子、napH遺伝子、napG遺伝子、napA遺伝子、napD遺伝子、napF遺伝子、eco遺伝子、mqo遺伝子、alkB遺伝子、ada遺伝子、ompC遺伝子、micF遺伝子、rcsD遺伝子、rcsB遺伝子、rcsC遺伝子、atoS遺伝子、atoC遺伝子、atoD遺伝子、atoA遺伝子、atoE遺伝子、atoB遺伝子、gyrA遺伝子、ubiG遺伝子、nrdA遺伝子、nrdB遺伝子、inaA遺伝子、glpQ遺伝子、glpT遺伝子、glpA遺伝子、glpB遺伝子、glpC遺伝子、ais遺伝子、arnT遺伝子、pmrD遺伝子、menE遺伝子、menC遺伝子、menB遺伝子、menD遺伝子、menF遺伝子、nuoN遺伝子、nuoM遺伝子、nuoL遺伝子、nuoK遺伝子、nuoJ遺伝子、nuoI遺伝子、nuoH遺伝子、nuoG遺伝子、nuoF遺伝子、nuoE遺伝子、nuoC遺伝子、nuoB遺伝子、nuoA遺伝子、lrhA遺伝子、ackA遺伝子、pta遺伝子、ubiX遺伝子、purF遺伝子、cvpA遺伝子、dedD遺伝子、folC遺伝子、accD遺伝子、dedA遺伝子、truA遺伝子、usg遺伝子、pdxB遺伝子、flk遺伝子、fabB遺伝子、trmC遺伝子、mepA遺伝子、aroC遺伝子、prmB遺伝子、sixA遺伝子、fadL遺伝子、vacJ遺伝子、argW遺伝子、dsdC遺伝子、dsdX遺伝子、dsdA遺伝子、emrY遺伝子、emrK遺伝子、evgA遺伝子、evgS遺伝子、oxc遺伝子、frc遺伝子、ddg遺伝子、glk遺伝子、mntH遺伝子、nupC遺伝子、alaX遺伝子、alaW遺伝子、gltX遺伝子、valU遺伝子、valX遺伝子、valY遺伝子、lysV遺伝子、xapR遺伝子、xapB遺伝子、xapA遺伝子、ligA遺伝子、zipA遺伝子、cysZ遺伝子、cysK遺伝子、ptsH遺伝子、ptsI遺伝子、crr遺伝子、pdxK遺伝子、cysM遺伝子、cysA遺伝子、cysW遺伝子、cysU遺伝子、cysP遺伝子、ucpA遺伝子、murP遺伝子、amiA遺伝子、hemF遺伝子、eutL遺伝子、eutC遺伝子、eutB遺伝子、eutA遺伝子、eutH遺伝子、eutG遺伝子、eutJ遺伝子、eutE遺伝子、cchB遺伝子、cchA遺伝子、eutI遺伝子、eutT遺伝子、eutQ遺伝子、eutP遺伝子、maeB遺伝子、talA遺伝子、tktB遺伝子、aegA遺伝子、narQ遺伝子、acrD遺伝子、dapE遺伝子、purC遺伝子、nlpB遺伝子、dapA遺伝子、gcvR遺伝子、bcp遺伝子、hda遺伝子、uraA遺伝子、upp遺伝子、purM遺伝子、purN遺伝子、ppk遺伝子、ppx遺伝子、guaA遺伝子、guaB遺伝子、xseA遺伝子、der遺伝子、hisS遺伝子、ispG遺伝子、ndk遺伝子、pbpC遺伝子、sseA遺伝子、ryfA遺伝子、sseB遺伝子、pepB遺伝子、fdx遺伝子、hscA遺伝子、hscB遺伝子、iscA遺伝子、iscU遺伝子、iscS遺伝子、iscR遺伝子、suhB遺伝子、csiE遺伝子、hcaT遺伝子、hcaR遺伝子、hcaE遺伝子、hcaF遺伝子、hcaC遺伝子、hcaB遺伝子、hcaD遺伝子、glyA遺伝子、hmp遺伝子、glnB遺伝子、sroF遺伝子、purL遺伝子、tadA遺伝子、acpS遺伝子、pdxJ遺伝子、recO遺伝子、era遺伝子、rnc遺伝子、lepB遺伝子、lepA遺伝子、rseC遺伝子、rseB遺伝子、rseA遺伝子、rpoE遺伝子、nadB遺伝子、srmB遺伝子、ung遺伝子、trxC遺伝子、pssA遺伝子、kgtP遺伝子、rrfG遺伝子、rrlG遺伝子、gltW遺伝子、rrsG遺伝子、clpB遺伝子、rluD遺伝子、pheL遺伝子、pheA遺伝子、tyrA遺伝子、aroF遺伝子、rplS遺伝子、trmD遺伝子、rimM遺伝子、rpsP遺伝子、ffh遺伝子、grpE遺伝子、recN遺伝子、smpA遺伝子、smpB遺伝子、ssrA遺伝子、gabD遺伝子、gabT遺伝子、gabP遺伝子、nrdF遺伝子、mprA遺伝子、emrA遺伝子、emrB遺伝子、luxS遺伝子、sraD遺伝子、gshA遺伝子、argQ遺伝子、argZ遺伝子、argY遺伝子、argV遺伝子、serV遺伝子、csrA遺伝子、alaS遺伝子、recX遺伝子、recA遺伝子、mltB遺伝子、norR遺伝子、norV遺伝子、norW遺伝子、hypF遺伝子、hydN遺伝子、ascG遺伝子、ascF遺伝子、ascB遺伝子、hycI遺伝子、hycH遺伝子、hycG遺伝子、hycF遺伝子、hycE遺伝子、hycD遺伝子、hycC遺伝子、hycB遺伝子、hycA遺伝子、hypA遺伝子、hypB遺伝子、hypC遺伝子、hypD遺伝子、hypE遺伝子、fhlA遺伝子、mutS遺伝子、pphB遺伝子、rpoS遺伝子、nlpD遺伝子、pcm遺伝子、surE遺伝子、truD遺伝子、ispF遺伝子、ispD遺伝子、ftsB遺伝子、cysC遺伝子、cysN遺伝子、cysD遺伝子、iap遺伝子、cysH遺伝子、cysI遺伝子、cysJ遺伝子、eno遺伝子、pyrG遺伝子、mazG遺伝子、chpR遺伝子、relA遺伝子、rumA遺伝子、barA遺伝子、gudD遺伝子、gudX遺伝子、gudP遺伝子、mltA遺伝子、metZ遺伝子、metW遺伝子、metV遺伝子、amiC遺伝子、argA遺伝子、recD遺伝子、recB遺伝子、ptr遺伝子、recC遺伝子、ppdC遺伝子、ppdB遺伝子、ppdA遺伝子、thyA遺伝子、lgt遺伝子、ptsP遺伝子、nudH遺伝子、mutH遺伝子、tas遺伝子、aas遺伝子、rygA遺伝子、rygB遺伝子、galR遺伝子、lysA遺伝子、lysR遺伝子、araE遺伝子、kduD遺伝子、kduI遺伝子、lysS遺伝子、prfB遺伝子、recJ遺伝子、dsbC遺伝子、xerD遺伝子、fldB遺伝子、bglA遺伝子、gcvP遺伝子、gcvH遺伝子、gcvT遺伝子、visC遺伝子、ubiH遺伝子、pepP遺伝子、zapA遺伝子、ssrS遺伝子、rygC遺伝子、serA遺伝子、rpiA遺伝子、argP遺伝子、argK遺伝子、argO遺伝子、mscS遺伝子、fbaA遺伝子、pgk遺伝子、epd遺伝子、tktA遺伝子、speB遺伝子、speA遺伝子、metK遺伝子、galP遺伝子、sprT遺伝子、endA遺伝子、gshB遺伝子、ansB遺伝子、mutY遺伝子、mltC遺伝子、nupG遺伝子、speC遺伝子、pheV遺伝子、pitB遺伝子、gss遺伝子、hybG遺伝子、hybF遺伝子、hybE遺伝子、hybD遺伝子、hybC遺伝子、hybB遺伝子、hybA遺伝子、hybO遺伝子、exbD遺伝子、exbB遺伝子、metC遺伝子、dkgA遺伝子、sufI遺伝子、plsC遺伝子、parC遺伝子、parE遺伝子、cpdA遺伝子、nudF遺伝子、tolC遺伝子、zupT遺伝子、ribB遺伝子、glgS遺伝子、rygD遺伝子、rfaE遺伝子、glnE遺伝子、htrG遺伝子、cca遺伝子、bacA遺伝子、folB遺伝子、ttdA遺伝子、ttdB遺伝子、rpsU遺伝子、dnaG遺伝子、rpoD遺伝子、ileX遺伝子、aer遺伝子、ebgR遺伝子、ebgA遺伝子、ebgC遺伝子、uxaA遺伝子、uxaC遺伝子、exuT遺伝子、exuR遺伝子、tdcG遺伝子、tdcF遺伝子、tdcE遺伝子、tdcD遺伝子、tdcC遺伝子、tdcB遺伝子、tdcA遺伝子、tdcR遺伝子、rnpB遺伝子、garK遺伝子、garR遺伝子、garL遺伝子、garP遺伝子、garD遺伝子、sohA遺伝子、agaR遺伝子、kbaZ遺伝子、agaV遺伝子、agaW遺伝子、agaA遺伝子、agaS遺伝子、kbaY遺伝子、agaB遺伝子、agaC遺伝子、agaD遺伝子、agaI遺伝子、mtr遺伝子、deaD遺伝子、nlpI遺伝子、pnp遺伝子、sraG遺伝子、rpsO遺伝子、truB遺伝子、rbfA遺伝子、infB遺伝子、nusA遺伝子、metY遺伝子、argG遺伝子、leuU遺伝子、secG遺伝子、glmM遺伝子、folP遺伝子、ftsH遺伝子、rrmJ遺伝子、greA遺伝子、dacB遺伝子、obgE遺伝子、rpmA遺伝子、rplU遺伝子、ispB遺伝子、sfsB遺伝子、murA遺伝子、kdsD遺伝子、kdsC遺伝子、rpoN遺伝子、ptsN遺伝子、npr遺伝子、mtgA遺伝子、elbB遺伝子、ryhA遺伝子、arcB遺伝子、gltB遺伝子、gltD遺伝子、nanT遺伝子、nanA遺伝子、nanR遺伝子、dcuD遺伝子、sspB遺伝子、sspA遺伝子、rpsI遺伝子、rplM遺伝子、degQ遺伝子、degS遺伝子、mdh遺伝子、argR遺伝子、aaeB遺伝子、aaeA遺伝子、aaeX遺伝子、aaeR遺伝子、tldD遺伝子、rng遺伝子、mreD遺伝子、mreC遺伝子、mreB遺伝子、accB遺伝子、accC遺伝子、panF遺伝子、prmA遺伝子、dusB遺伝子、fis遺伝子、rrfF遺伝子、thrV遺伝子、rrfD遺伝子、rrlD遺伝子、gltV遺伝子、rrsD遺伝子、purH遺伝子、purD遺伝子、zraR遺伝子、zraS遺伝子、zraP遺伝子、hupA遺伝子、nfi遺伝子、hemE遺伝子、nudC遺伝子、rsd遺伝子、thiC遺伝子、thiE遺伝子、thiF遺伝子、thiS遺伝子、thiG遺伝子、thiH遺伝子、htrC遺伝子、rpoC遺伝子、rpoB遺伝子、rplL遺伝子、rplJ遺伝子、rplA遺伝子、rplK遺伝子、nusG遺伝子、secE遺伝子、tufB遺伝子、thrT遺伝子、glyT遺伝子、tyrU遺伝子、thrU遺伝子、coaA遺伝子、birA遺伝子、murB遺伝子、rrfB遺伝子、rrlB遺伝子、gltT遺伝子、rrsB遺伝子、murI遺伝子、btuB遺伝子、trmA遺伝子、fabR遺伝子、sthA遺伝子、oxyR遺伝子、oxyS遺伝子、argH遺伝子、argB遺伝子、argC遺伝子、argE遺伝子、ppc遺伝子、fsaB遺伝子、gldA遺伝子、katG遺伝子、metF遺伝子、metL遺伝子、metB遺伝子、metJ遺伝子、rpmE遺伝子、priA遺伝子、cytR遺伝子、ftsN遺伝子、hslV遺伝子、hslU遺伝子、menA遺伝子、rraA遺伝子、glpF遺伝子、glpK遺伝子、glpX遺伝子、fpr遺伝子、tpiA遺伝子、cdh遺伝子、sbp遺伝子、pfkA遺伝子、fieF遺伝子、cpxP遺伝子、cpxR遺伝子、cpxA遺伝子、kdgT遺伝子、sodA遺伝子、fdhD遺伝子、fdoG遺伝子、fdoH遺伝子、fdoI遺伝子、fdhE遺伝子、bipA遺伝子、glnA遺伝子、glnL遺伝子、glnG遺伝子、hemN遺伝子、csrC遺伝子、spf遺伝子、polA遺伝子、dsbA遺伝子、mobA遺伝子、mobB遺伝子、rrfA遺伝子、rrlA遺伝子、alaT遺伝子、ileT遺伝子、rrsA遺伝子、hemG遺伝子、trkH遺伝子、pepQ遺伝子、fadB遺伝子、fadA遺伝子、fre遺伝子、ubiD遺伝子、rfaH遺伝子、tatD遺伝子、tatC遺伝子、tatB遺伝子、tatA遺伝子、ubiB遺伝子、ubiE遺伝子、rmuC遺伝子、udp遺伝子、metE遺伝子、metR遺伝子、pldB遺伝子、rhtB遺伝子、rhtC遺伝子、recQ遺伝子、pldA遺伝子、rarD遺伝子、corA遺伝子、uvrD遺伝子、xerC遺伝子、dapF遺伝子、cyaY遺伝子、cyaA遺伝子、hemC遺伝子、hemD遺伝子、hemX遺伝子、hemY遺伝子、ryiA遺伝子、aslA遺伝子、aslB遺伝子、proM遺伝子、leuT遺伝子、hisR遺伝子、argX遺伝子、rffM遺伝子、wzyE遺伝子、rffT遺伝子、wzxE遺伝子、rffA遺伝子、rffC遺伝子、rffH遺伝子、rffG遺伝子、rffD遺伝子、rffE遺伝子、wzzE遺伝子、rfe遺伝子、rho遺伝子、rhoL遺伝子、trxA遺伝子、rhlB遺伝子、gpp遺伝子、rep遺伝子、ppiC遺伝子、ilvC遺伝子、ilvY遺伝子、ilvA遺伝子、ilvD遺伝子、ilvE遺伝子、ilvM遺伝子、ilvG_2遺伝子、ilvG_1遺伝子、ilvL遺伝子、hdfR遺伝子、trpT遺伝子、aspT遺伝子、rrfC遺伝子、rrlC遺伝子、gltU遺伝子、rrsC遺伝子、asnC遺伝子、mioC遺伝子、oriC遺伝子、gidA遺伝子、gidB遺伝子、atpI遺伝子、atpB遺伝子、atpE遺伝子、atpF遺伝子、atpH遺伝子、atpA遺伝子、atpG遺伝子、atpD遺伝子、atpC遺伝子、glmU遺伝子、glmS遺伝子、pstS遺伝子、pstC遺伝子、pstA遺伝子、pstB遺伝子、phoU遺伝子、bglG遺伝子、bglF遺伝子、bglB遺伝子、bglH遺伝子、cbrC遺伝子、mdtL遺伝子、tnaB遺伝子、tnaA遺伝子、tnaC遺伝子、trmE遺伝子、rnpA遺伝子、rpmH遺伝子、dnaA遺伝子、dnaN遺伝子、recF遺伝子、gyrB遺伝子、ibpA遺伝子、ibpB遺伝子、emrD遺伝子、ivbL遺伝子、ilvB遺伝子、ilvN遺伝子、uhpA遺伝子、uhpB遺伝子、uhpC遺伝子、uhpT遺伝子、selC遺伝子、gltS遺伝子、recG遺伝子、trmH遺伝子、spoT遺伝子、rpoZ遺伝子、gmk遺伝子、ligB遺伝子、dinD遺伝子、rph遺伝子、pyrE遺伝子、ttk遺伝子、dut遺伝子、dfp遺伝子、rpmB遺伝子、rpmG遺伝子、mutM遺伝子、coaD遺伝子、kdtA遺伝子、rfaQ遺伝子、rfaG遺伝子、rfaP遺伝子、rfaS遺伝子、rfaB遺伝子、rfaI遺伝子、rfaJ遺伝子、rfaY遺伝子、rfaZ遺伝子、rfaK遺伝子、rfaL遺伝子、rfaC遺伝子、rfaF遺伝子、rfaD遺伝子、htrL遺伝子、kbl遺伝子、tdh遺伝子、envC遺伝子、gpmI遺伝子、grxC遺伝子、secB遺伝子、gpsA遺伝子、cysE遺伝子、lldD遺伝子、lldR遺伝子、lldP遺伝子、mtlR遺伝子、mtlD遺伝子、mtlA遺伝子、selA遺伝子、selB遺伝子、aldB遺伝子、sgbE遺伝子、sgbU遺伝子、sgbH遺伝子、lyxK遺伝子、avtA遺伝子、malS遺伝子、bax遺伝子、xylR遺伝子、xylH遺伝子、xylG遺伝子、xylF遺伝子、xylA遺伝子、xylB遺伝子、glyQ遺伝子
、glyS遺伝子、hokA遺伝子、cspA遺伝子、tiaE遺伝子、bisC遺伝子、tag遺伝子、eptB遺伝子、proK遺伝子、dppA遺伝子、dppB遺伝子、dppC遺伝子、dppD遺伝子、dppF遺伝子、rdlD遺伝子、ldrD遺伝子、bcsG遺伝子、bcsF遺伝子、bcsE遺伝子、bcsA遺伝子、bcsB遺伝子、bcsZ遺伝子、bcsC遺伝子、dctA遺伝子、kdgK遺伝子、treF遺伝子、gadA遺伝子、gadX遺伝子、gadY遺伝子、gadW遺伝子、mdtF遺伝子、mdtE遺伝子、gadE遺伝子、hdeD遺伝子、hdeA遺伝子、hdeB遺伝子、slp遺伝子、arsC遺伝子、arsB遺伝子、arsR遺伝子、gor遺伝子、prlC遺伝子、uspA遺伝子、pitA遺伝子、nikR遺伝子、nikE遺伝子、nikD遺伝子、nikC遺伝子、nikB遺伝子、nikA遺伝子、acpT遺伝子、dcrB遺伝子、zntA遺伝子、ftsY遺伝子、ftsE遺伝子、ftsX遺伝子、rpoH遺伝子、livJ遺伝子、livK遺伝子、livH遺伝子、livM遺伝子、livG遺伝子、livF遺伝子、ugpB遺伝子、ugpA遺伝子、ugpE遺伝子、ugpC遺伝子、ugpQ遺伝子、ggt遺伝子、gntR遺伝子、gntK遺伝子、gntU遺伝子、asd遺伝子、glgB遺伝子、glgX遺伝子、glgC遺伝子、glgA遺伝子、glgP遺伝子、glpD遺伝子、glpE遺伝子、glpG遺伝子、glpR遺伝子、rtcR遺伝子、rtcB遺伝子、rtcA遺伝子、malT遺伝子、malP遺伝子、malQ遺伝子、gntT遺伝子、gntY遺伝子、gntX遺伝子、bioH遺伝子、feoB遺伝子、feoA遺伝子、greB遺伝子、ompR遺伝子、envZ遺伝子、pck遺伝子、hslO遺伝子、hslR遺伝子、nudE遺伝子、mrcA遺伝子、hofQ遺伝子、aroK遺伝子、aroB遺伝子、damX遺伝子、dam遺伝子、rpe遺伝子、gph遺伝子、trpS遺伝子、cysG遺伝子、nirC遺伝子、nirD遺伝子、nirB遺伝子、tsgA遺伝子、ppiA遺伝子、fic遺伝子、pabA遺伝子、argD遺伝子、crp遺伝子、prkB遺伝子、kefG遺伝子、kefB遺伝子、slyD遺伝子、slyX遺伝子、fkpA遺伝子、rpsL遺伝子、rpsG遺伝子、fusA遺伝子、tufA遺伝子、rpsJ遺伝子、rplC遺伝子、rplD遺伝子、rplW遺伝子、rplB遺伝子、rpsS遺伝子、rplV遺伝子、rpsC遺伝子、rplP遺伝子、rpmC遺伝子、rpsQ遺伝子、rplN遺伝子、rplX遺伝子、rplE遺伝子、rpsN遺伝子、rpsH遺伝子、rplF遺伝子、rplR遺伝子、rpsE遺伝子、rpmD遺伝子、rplO遺伝子、secY遺伝子、rpmJ遺伝子、rpsM遺伝子、rpsK遺伝子、rpsD遺伝子、rpoA遺伝子、rplQ遺伝子、zntR遺伝子、mscL遺伝子、trkA遺伝子、rsmB遺伝子、fmt遺伝子、def遺伝子、smf遺伝子、smg遺伝子、aroE遺伝子、rrsE遺伝子、ileU遺伝子、alaU遺伝子、rrlE遺伝子、rrfE遺伝子、metA遺伝子、aceB遺伝子、aceA遺伝子、aceK遺伝子、arpA遺伝子、iclR遺伝子、metH遺伝子、pepE遺伝子、lysC遺伝子、pgi遺伝子、ubiC遺伝子、ubiA遺伝子、plsB遺伝子、dgkA遺伝子、lexA遺伝子、dinF遺伝子、zur遺伝子、qor遺伝子、dnaB遺伝子、alr遺伝子、tyrB遺伝子、aphA遺伝子、uvrA遺伝子、ssb遺伝子、soxS遺伝子、soxR遺伝子、ryjA遺伝子、actP遺伝子、acs遺伝子、nrfA遺伝子、nrfB遺伝子、nrfC遺伝子、nrfD遺伝子、nrfE遺伝子、nrfF遺伝子、nrfG遺伝子、gltP遺伝子、fdhF遺伝子、rpiR遺伝子、rpiB遺伝子、proP遺伝子、basS遺伝子、basR遺伝子、eptA遺伝子、adiC遺伝子、adiY遺伝子、adiA遺伝子、melR遺伝子、melA遺伝子、melB遺伝子、fumB遺伝子、dcuB遺伝子、dcuR遺伝子、dcuS遺伝子、lysU遺伝子、cadA遺伝子、cadB遺伝子、cadC遺伝子、pheU遺伝子、dipZ遺伝子、cutA遺伝子、dcuA遺伝子、aspA遺伝子、fxsA遺伝子、groS遺伝子、groL遺伝子、efp遺伝子、ecnA遺伝子、ecnB遺伝子、sugE遺伝子、blc遺伝子、ampC遺伝子、frdD遺伝子、frdC遺伝子、frdB遺伝子、frdA遺伝子、poxA遺伝子、psd遺伝子、rsgA遺伝子、orn遺伝子、glyV遺伝子、glyX遺伝子、glyY遺伝子、amiB遺伝子、mutL遺伝子、miaA遺伝子、hfq遺伝子、hflX遺伝子、hflK遺伝子、hflC遺伝子、purA遺伝子、rnr遺伝子、rlmB遺伝子、ulaF遺伝子、rpsF遺伝子、priB遺伝子、rpsR遺伝子、rplI遺伝子、fklB遺伝子、cycA遺伝子、cpdB遺伝子、cysQ遺伝子、msrA遺伝子、chpS遺伝子、chpB遺伝子、ppa遺伝子、fbp遺伝子、mpl遺伝子、pmbA遺伝子、cybC遺伝子、nrdG遺伝子、nrdD遺伝子、treC遺伝子、treB遺伝子、treR遺伝子、mgtA遺伝子、pyrI遺伝子、pyrB遺伝子、pyrL遺伝子、argI遺伝子、valS遺伝子、holC遺伝子、pepA遺伝子、idnR遺伝子、idnT遺伝子、idnO遺伝子、idnD遺伝子、idnK遺伝子、leuX遺伝子、dnaC遺伝子、dnaT遺伝子、bglJ遺伝子、fhuF遺伝子、leuV遺伝子、leuP遺伝子、leuQ遺伝子、rsmC遺伝子、holD遺伝子、rimI遺伝子、prfC遺伝子、osmY遺伝子、deoC遺伝子、deoA遺伝子、deoB遺伝子、deoD遺伝子、lplA遺伝子、serB遺伝子、radA遺伝子、nadR遺伝子、slt遺伝子、trpR遺伝子、rob遺伝子、creA遺伝子、creB遺伝子、creC遺伝子、creD遺伝子、arcA遺伝子
［２］fhuA遺伝子、fhuC遺伝子、fhuD遺伝子、fhuB遺伝子、yafJ遺伝子、yafK遺伝子、yafQ遺伝子、dinJ遺伝子、yafL遺伝子、yafM遺伝子、fhiA遺伝子、mbhA遺伝子、dinB遺伝子、yafN遺伝子、yafO遺伝子、yafP遺伝子、ykfJ遺伝子、prfH遺伝子、yagP遺伝子、yagQ遺伝子、yagR遺伝子、yagS遺伝子、yagT遺伝子、yagU遺伝子、ykgJ遺伝子、yagV遺伝子、yagW遺伝子、yagX遺伝子、yagY遺伝子、yagZ遺伝子、ykgK遺伝子、ykgL遺伝子、ykgM(JW5034)遺伝子、ykgM(JW5035)遺伝子、eaeH遺伝子、ykgA遺伝子、ykgB遺伝子、ykgI遺伝子、ykgC遺伝子、ykgD遺伝子、ykgE遺伝子、ykgF遺伝子、ykgG遺伝子、ykgH遺伝子、betA遺伝子、betB遺伝子、betI遺伝子、betT遺伝子、yahA遺伝子、yahB遺伝子、yahC遺伝子、yahD遺伝子、yahE遺伝子、yahF遺伝子、yahG遺伝子、yahH遺伝子、yahI遺伝子、yahJ遺伝子、yahK遺伝子、yahL遺伝子、yahM遺伝子、yahN遺伝子、yahO遺伝子、prpR遺伝子、prpB遺伝子、prpC遺伝子、prpD遺伝子、prpE遺伝子、codB遺伝子、codA遺伝子、cynR遺伝子、cynT遺伝子、cynS遺伝子、cynX遺伝子、lacA遺伝子、lacY遺伝子、lacZ遺伝子、lacI遺伝子、mhpR遺伝子、mhpA遺伝子、mhpB遺伝子、mhpC遺伝子、mhpD遺伝子、mhpF遺伝子、mhpE遺伝子、mhpT遺伝子、yaiL遺伝子、frmB遺伝子、frmA遺伝子、frmR遺伝子、yaiO遺伝子、yaiX遺伝子、yaiF遺伝子、yaiP遺伝子、yaiS遺伝子、tauA遺伝子、tauB遺伝子、tauC遺伝子、tauD遺伝子、yaiT遺伝子、yaiU遺伝子、yaiV遺伝子、ampH遺伝子、sbmA遺伝子、yaiW遺伝子、yaiY遺伝子、yaiZ遺伝子、ddlA遺伝子、yaiB遺伝子、phoA遺伝子、psiF遺伝子、yaiC遺伝子、ybbO遺伝子、tesA遺伝子、ybbA遺伝子、ybbP遺伝子、ylbG遺伝子、ybbB遺伝子、ybbS遺伝子、allA遺伝子、allR遺伝子、glxR遺伝子、ybbV遺伝子、ybbW遺伝子、allB遺伝子、ybbY遺伝子、glxK遺伝子、ylbA遺伝子、allC遺伝子、allD遺伝子、fdrA遺伝子、ylbE_1遺伝子、ylbE_2遺伝子、ylbF遺伝子、ybcF遺伝子、envY遺伝子、ybcH遺伝子、nfrA遺伝子、nfrB遺伝子、cusS遺伝子、cusR遺伝子、cusC遺伝子、cusF遺伝子、cusB遺伝子、cusA遺伝子、pheP遺伝子、ybdG遺伝子、nfnB遺伝子、ybdF遺伝子、ybdJ遺伝子、ybdK遺伝子、hokE遺伝子、ybeL遺伝子、ybeQ遺伝子、ybeR遺伝子、djlB遺伝子、ybeT遺伝子、ybeU遺伝子、djlC遺伝子、hscC遺伝子、rihA遺伝子、gltL遺伝子、gltK遺伝子、gltJ遺伝子、gltI遺伝子、kdpF遺伝子、ybfA遺伝子、ybgA遺伝子、phr遺伝子、ybiA遺伝子、dinG遺伝子、ybiB遺伝子、ybiC遺伝子、ybiJ遺伝子、ybiI遺伝子、ybiX遺伝子、fiu遺伝子、ybiM遺伝子、ybiN遺伝子、ybiO遺伝子、glnQ遺伝子、glnP遺伝子、glnH遺伝子、yliA遺伝子、yliB遺伝子、yliC遺伝子、yliD遺伝子、yliE遺伝子、yliF遺伝子、yliG遺伝子、yliH遺伝子、yliI遺伝子、yliJ遺伝子、dacC遺伝子、deoR遺伝子、ybjG遺伝子、ybjC遺伝子、nfsA遺伝子、rimK遺伝子、ybjN遺伝子、potF遺伝子、potG遺伝子、potH遺伝子、potI遺伝子、ybjO遺伝子、rumB遺伝子、artJ遺伝子、artM遺伝子、artQ遺伝子、artI遺伝子、artP遺伝子、ybjP遺伝子、ybjQ遺伝子、ybjR遺伝子、ybjS遺伝子、ybjT遺伝子、ltaE遺伝子、ymcC遺伝子、ymcD遺伝子、cspH遺伝子、cspG遺伝子、ymcE遺伝子、gnsA遺伝子、yccM遺伝子、torS遺伝子、torT遺伝子、torR遺伝子、torC遺伝子、torA遺伝子、torD遺伝子、cbpM遺伝子、cbpA遺伝子、yccE遺伝子、agp遺伝子、yccJ遺伝子、wrbA遺伝子、ymdF遺伝子、ycdG遺伝子、ycdH遺伝子、ycdI遺伝子、rarA遺伝子、ycdK遺伝子、ycdL遺伝子、ycdM遺伝子、ycdC遺伝子、putA遺伝子、putP遺伝子、ycdN_1遺伝子、ycdN_2遺伝子、ycdO遺伝子、ycdB遺伝子、phoH遺伝子、ycdP遺伝子、ycdQ遺伝子、ycdR遺伝子、ycdS遺伝子、ycdT遺伝子、ymdE遺伝子、ycdU遺伝子、elbA遺伝子、ycgX遺伝子、ycgE遺伝子、ycgF遺伝子、ycgZ遺伝子、ymgA遺伝子、ymgB遺伝子、ymgC遺伝子、ycgG遺伝子、ymgF遺伝子、ycgH_1遺伝子、ycgH_2遺伝子、ymgD遺伝子、ymgG遺伝子、ymgH遺伝子、ycgI遺伝子、ydfH遺伝子、ydfZ遺伝子、ydfI遺伝子、ydfJ遺伝子、yecT遺伝子、flhE遺伝子、flhA遺伝子、flhB遺伝子、cheZ遺伝子、cheY遺伝子、cheB遺伝子、cheR遺伝子、tap遺伝子、tar遺伝子、cheW遺伝子、cheA遺伝子、motB遺伝子、motA遺伝子、flhC遺伝子、flhD遺伝子、yecG遺伝子、otsA遺伝子、otsB遺伝子、araH遺伝子、araG遺伝子、araF遺伝子、yecI遺伝子、yecJ遺伝子、isrB遺伝子、yecR遺伝子、ftn遺伝子、yecH遺伝子、tyrP遺伝子、uvrC遺伝子、uvrY遺伝子、yecF遺伝子、sdiA遺伝子、yecC遺伝子、yecS遺伝子、yedO遺伝子、fliY遺伝子、fliZ遺伝子、fliA遺伝子、fliC遺伝子、fliD遺伝子、fliS遺伝子、fliT遺伝子、amyA遺伝子、yedD遺伝子、yedE遺伝子、yedF遺伝子、yedK遺伝子、yedL遺伝子、yedN_2遺伝子、yedN_1遺伝子、yedM遺伝子、intG遺伝子、fliE遺伝子、fliF遺伝子、fliG遺伝子、fliH遺伝子、fliI遺伝子、fliJ遺伝子、fliK遺伝子、fliL遺伝子、fliM遺伝子、fliN遺伝子、fliO遺伝子、fliP遺伝子、fliQ遺伝子、fliR遺伝子、rcsA遺伝子、dsrB遺伝子、yodD遺伝子、yedA遺伝子、vsr遺伝子、dcm遺伝子、yedJ遺伝子、yedR遺伝子、yedS_1遺伝子、yedS_2遺伝子、yedS_3遺伝子、hchA遺伝子、yedV遺伝子、yedW遺伝子、yedX遺伝子、yedY遺伝子、yedZ遺伝子、yodA遺伝子、wbbL_2遺伝子、wbbL_1遺伝子、wbbK遺伝子、wbbJ遺伝子、wbbI遺伝子、wbbH遺伝子、glf遺伝子、rfbX遺伝子、rfbC遺伝子、rfbA遺伝子、rfbD遺伝子、rfbB遺伝子、yegE遺伝子、alkA遺伝子、yegD遺伝子、yegI遺伝子、yegJ遺伝子、yegK遺伝子、yegL遺伝子、ryeC遺伝子、ryeD遺伝子、mdtA遺伝子、mdtB遺伝子、mdtC遺伝子、mdtD遺伝子、baeS遺伝子、baeR遺伝子、yegP遺伝子、yegQ遺伝子、ryeE遺伝子、ogrK遺伝子、yegZ遺伝子、yegR遺伝子、yegS遺伝子、gatR_1遺伝子、gatR_2遺伝子、gatD遺伝子、gatC遺伝子、gatB遺伝子、gatA遺伝子、gatZ遺伝子、gatY遺伝子、fbaB遺伝子、yegT遺伝子、yegU遺伝子、yegV遺伝子、yegW遺伝子、yegX遺伝子、molR_1遺伝子、molR_2遺伝子、molR_3遺伝子、yehI遺伝子、yehK遺伝子、yehL遺伝子、yehM遺伝子、yehP遺伝子、yehQ遺伝子、yehR遺伝子、yehS遺伝子、yehT遺伝子、yehU遺伝子、mlrA遺伝子、yohO遺伝子、yehW遺伝子、yehX遺伝子、yehY遺伝子、yehZ遺伝子、bglX遺伝子、dld遺伝子、pbpG遺伝子、yohC遺伝子、yeiI遺伝子、yeiJ遺伝子、rihB遺伝子、yeiL遺伝子、yeiM遺伝子、yeiN遺伝子、yeiC遺伝子、elaB遺伝子、elaA遺伝子、elaC遺伝子、elaD遺伝子、yfbK遺伝子、yfbL遺伝子、yfbM遺伝子、yfbN遺伝子、yfbO遺伝子、yfbP遺伝子、yfcC遺伝子、yfcD遺伝子、yfcE遺伝子、yfcF遺伝子、yfcG遺伝子、folX遺伝子、yfcH遺伝子、yfcI遺伝子、hisP遺伝子、hisM遺伝子、hisQ遺伝子、hisJ遺伝子、argT遺伝子、ypdA遺伝子、ypdB遺伝子、ypdC遺伝子、ypdD遺伝子、ypdE遺伝子、ypdF遺伝子、ypdG遺伝子、ypdH遺伝子、pinH遺伝子、ypjB遺伝子、ypjC遺伝子、ileY遺伝子、ygaQ遺伝子、ygaR遺伝子、yqaC遺伝子、yqaD遺伝子、ygaT遺伝子、csiR遺伝子、ygaU遺伝子、yqaE遺伝子、ygaV遺伝子、ygaP遺伝子、stpA遺伝子、ygaW遺伝子、ygaC遺伝子、ygaM遺伝子、nrdH遺伝子、nrdI遺伝子、nrdE遺伝子、proV遺伝子、proW遺伝子、proX遺伝子、ygaX遺伝子、ygaY遺伝子、ygaZ遺伝子、ygaH遺伝子、srlA遺伝子、srlE遺伝子、srlB遺伝子、srlD遺伝子、gutM遺伝子、srlR遺伝子、gutQ遺伝子、yqeG遺伝子、yqeH遺伝子、yqeI遺伝子、yqeJ遺伝子、yqeK遺伝子、ygeF遺伝子、ygeG遺伝子、ygeH遺伝子、ygeI遺伝子、pbl遺伝子、ygeK遺伝子、ygeL遺伝子、ygeM遺伝子、ygeN遺伝子、ygeO遺伝子、ygeP遺伝子、ygeQ遺伝子、glyU遺伝子、ygeR遺伝子、xdhA遺伝子、xdhB遺伝子、xdhC遺伝子、ygeV遺伝子、ygeW遺伝子、ygeX遺伝子、ygeY遺伝子、hyuA遺伝子、yqeA遺伝子、yqeB遺伝子、yqeC遺伝子、ygfJ遺伝子、ygfK遺伝子、ssnA遺伝子、ygfM遺伝子、xdhD遺伝子、ygfO遺伝子、guaD遺伝子、ygfQ遺伝子、ygfS遺伝子、ygfT遺伝子、ygfU遺伝子、idi遺伝子、cmtA遺伝子、cmtB遺伝子、yghD遺伝子、yghE遺伝子、yghF遺伝子、yghG遺伝子、pppA遺伝子、yghJ遺伝子、yghK遺伝子、glcB遺伝子、glcG遺伝子、glcF遺伝子、glcE遺伝子、glcD遺伝子、glcC遺伝子、yghO遺伝子、yghQ遺伝子、yghR遺伝子、yghS遺伝子、yghT遺伝子、ygiS遺伝子、ygiT遺伝子、ygiU遺伝子、ygiV遺伝子、ygiW遺伝子、qseB遺伝子、qseC遺伝子、ygiZ遺伝子、mdaB遺伝子、ygiN遺伝子、gltF遺伝子、yhcA遺伝子、yhcD遺伝子、yhcE遺伝子、yhcF遺伝子、yhcG遺伝子、yhcH遺伝子、nanK遺伝子、nanE遺伝子、yhdJ遺伝子、yhdU遺伝子、envR遺伝子、acrE遺伝子、acrF遺伝子、yhdV遺伝子、yhdW遺伝子、yhdX遺伝子、yhdY遺伝子、yijP遺伝子、yijO遺伝子、frwD遺伝子、pflC遺伝子、pflD遺伝子、frwB遺伝子、frwC遺伝子、ptsA遺伝子、rhaT遺伝子、rhaR遺伝子、rhaS遺伝子、rhaB遺伝子、rhaA遺伝子、rhaD遺伝子、yiiL遺伝子、frvA遺伝子、frvB遺伝子、frvX遺伝子、frvR遺伝子、yiiG遺伝子、yiiF遺伝子、yiiE遺伝子、yiiD遺伝子、dtd遺伝子、rbn遺伝子、yihX遺伝子、yihW遺伝子、yihV遺伝子、yihU遺伝子、yihT遺伝子、yihS遺伝子、yihR遺伝子、yihQ遺伝子、yihP遺伝子、yihO遺伝子、ompL遺伝子、yihN遺伝子、yihM遺伝子、yihL遺伝子、hsrA遺伝子、rbsR遺伝子、rbsK遺伝子、rbsB遺伝子、rbsC遺伝子、rbsA遺伝子、rbsD遺伝子、trkD遺伝子、yieN遺伝子、yieM遺伝子、asnA遺伝子、yidB遺伝子、yidA遺伝子、yidX遺伝子、dgoR遺伝子、dgoK遺伝子、dgoA遺伝子、dgoD遺伝子、dgoT遺伝子、cbrA遺伝子、yidR遺伝子、yidQ遺伝子、yidE遺伝子、yidP遺伝子、glvC遺伝子、glvB遺伝子、glvG遺伝子、ysdC遺伝子、yidL遺伝子、yidK遺伝子、yidJ遺伝子、yidI遺伝子、yidH遺伝子、yidG遺伝子、yidF遺伝子、yhiN遺伝子、yhiM遺伝子、yhiL遺伝子、yhiK遺伝子、yhiJ遺伝子、yhiI遺伝子、rbbA遺伝子、yhhJ遺伝子、chiA遺伝子、bfd遺伝子、bfr遺伝子、gspO遺伝子、gspM遺伝子、gspL遺伝子、gspK遺伝子、gspJ遺伝子、gspI遺伝子、gspH遺伝子、gspG遺伝子、gspF遺伝子、gspE遺伝子、gspD遺伝子、gspC遺伝子、gspA遺伝子、pioO遺伝子、yjbE遺伝子、yjbF遺伝子、yjbG遺伝子、yjbH遺伝子、yjbA遺伝子、xylE遺伝子、malG遺伝子、malF遺伝子、malE遺伝子、malK遺伝子、lamB遺伝子、malM遺伝子、yjbI遺伝子、yjcP遺伝子、yjcQ遺伝子、yjcR遺伝子、yjcS遺伝子、alsK遺伝子、alsE遺伝子、alsC遺伝子、alsA遺伝子、alsB遺伝子、yjdP遺伝子、phnP遺伝子、phnO遺伝子、phnN遺伝子、phnM遺伝子、phnL遺伝子、phnK遺伝子、phnJ遺伝子、phnI遺伝子、phnH遺伝子、phnG遺伝子、phnF遺伝子、phnE(JW4064)遺伝子、phnE(JW4065)遺伝子、phnD遺伝子、phnC遺伝子、phnB遺伝子、phnA遺伝子、yjdA遺伝子、yjcZ遺伝子、yjfI遺伝子、yjfJ遺伝子、yjfK遺伝子、yjfL遺伝子、yjfM遺伝子、yjfC遺伝子、aidB遺伝子、yjfN遺伝子、yjfO遺伝子、yjfP遺伝子、ulaR遺伝子、ulaG遺伝子、ulaA遺伝子、ulaB遺伝子、ulaC遺伝子、ulaD遺伝子、ulaE遺伝子、yjhS遺伝子、yjhT遺伝子、yjhA遺伝子、fimB遺伝子、fimE遺伝子、fimA遺伝子、fimI遺伝子、fimC遺伝子、fimD遺伝子、fimF遺伝子、fimG遺伝子、fimH遺伝子、gntP遺伝子、uxuA遺伝子、uxuB遺伝子、uxuR遺伝子、yjiC遺伝子、yjiD遺伝子、yjiE遺伝子、iadA遺伝子、yjiG遺伝子、yjiH遺伝子、kptA遺伝子、yjiJ遺伝子、yjiK遺伝子、yjiL遺伝子、yjiM遺伝子、yjiN遺伝子、yjiO遺伝子、yjiP遺伝子、yjiQ遺伝子、yjiR遺伝子、yjiS遺伝子、yjiT遺伝子、yjiV遺伝子、mcrC遺伝子、mcrB遺伝子、yjiW遺伝子、hsdS遺伝子、hsdM遺伝子、hsdR遺伝子、mrr遺伝子、yjiA遺伝子、yjiX遺伝子、yjiY遺伝子、tsr遺伝子、yjiZ遺伝子、yjjM遺伝子、yjjN遺伝子、mdoB遺伝子、yjjA遺伝子
［３］chpA遺伝子、uspG遺伝子、ybdR遺伝子、rnk遺伝子、rna遺伝子、citT遺伝子、citG遺伝子、citX遺伝子、citF遺伝子、citE遺伝子、citD遺伝子、citC遺伝子、citA遺伝子、citB遺伝子、dcuC遺伝子、crcA遺伝子、cspE遺伝子、crcB遺伝子、ybeH遺伝子、ybeM遺伝子、yqcA遺伝子、yqcB遺伝子、yqcC遺伝子、syd遺伝子、yqcD遺伝子、ygdH遺伝子、sdaC遺伝子、sdaB遺伝子、exo遺伝子、fucO遺伝子、fucA遺伝子、fucP遺伝子、fucI遺伝子、fucK遺伝子、fucU遺伝子、fucR遺伝子、ygdE遺伝子、ygdD遺伝子、gcvA遺伝子、ygdI遺伝子、csdA遺伝子、ygdK遺伝子、araD遺伝子、araA遺伝子、araB遺伝子、araC遺伝子、yabI遺伝子、thiQ遺伝子、thiP遺伝子、tbpA遺伝子、sgrR遺伝子、setA遺伝子、yhfZ遺伝子、yhfY遺伝子、yhfX遺伝子、yhfW遺伝子、php遺伝子、yhfU遺伝子、yhfT遺伝子、yhfS遺伝子、frlR遺伝子、frlD遺伝子、frlC遺伝子、frlB遺伝子、frlA遺伝子、yhfL遺伝子、pncA遺伝子、ydjE遺伝子、ydjF遺伝子、ydjG遺伝子、ydjH遺伝子、ydjI遺伝子、ydjJ遺伝子、ydjK遺伝子、ydjL遺伝子、yeaC遺伝子、yeaA遺伝子、ade遺伝子、yicO遺伝子、yicN遺伝子、yicM遺伝子、yicS遺伝子、nlpA遺伝子、yicL遺伝子、setC遺伝子、ygjI遺伝子、ygjJ遺伝子、ygjK遺伝子、fadH遺伝子、ygjM遺伝子、ygjN遺伝子、ygjO遺伝子、ygjP遺伝子、ygjQ遺伝子、ygjR遺伝子、alx遺伝子、sstT遺伝子、ygjV遺伝子、yrhB遺伝子、yrhA遺伝子、yhhZ遺伝子、yhhY遺伝子、yhhX遺伝子、yhhW遺伝子、yeaK遺伝子、yoaI遺伝子、yeaL遺伝子、yeaM遺伝子、yeaN遺伝子、yeaO遺伝子、yoaF遺伝子、yeaP遺伝子、yeaQ遺伝子、yoaG遺伝子、yeaR遺伝子、yeaS遺伝子、yeaT遺伝子、yeaU遺伝子、yeaV遺伝子、yeaW遺伝子、yeaX遺伝子、hyfA遺伝子、hyfB遺伝子、hyfC遺伝子、hyfD遺伝子、hyfE遺伝子、hyfF遺伝子、hyfG遺伝子、hyfH遺伝子、hyfI遺伝子、hyfJ遺伝子、hyfR遺伝子、focB遺伝子
（２４）（１）～（２３）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体を、以下の［１］～［５］から選ばれる方法によって改変して得られる大腸菌の変異体。
［１］有用物質の生合成を制御する機構の少なくとも１つを緩和または解除する方法、
［２］有用物質の生合成に関与する酵素の少なくとも１つを発現強化する方法
［３］有用物質の生合成に関与する酵素遺伝子の少なくとも１つのコピー数を増加させる方法
［４］有用物質の生合成経路から該有用物質以外の代謝産物へ分岐する代謝経路の少なくとも１つを弱化または遮断する方法
［５］野生型の大腸菌に比べ、有用物質のアナログに対する耐性度が高い細胞株を選択する方法
（２５）大腸菌が大腸菌K-12株、大腸菌B株または大腸菌Ｗ株である、（１）～（２４）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体。
（２６）大腸菌K-12株が大腸菌W3110株（ATCC27325）または大腸菌MG1655株（ATCC47076）である、（２５）記載の大腸菌の変異体。
（２７）（１）～（２６）のいずれか１つに記載の大腸菌の変異体を培地に培養し、該培養物中に有用物質を生成、蓄積させ、該培養物から該有用物質を採取することを特徴とする有用物質の製造法。
（２８）有用物質がタンパク質、アミノ酸、核酸、ビタミン、糖、有機酸および脂質からなる群より選ばれる有用物質である（２４）～（２７）のいずれか１つに記載の製造法。
　本発明により、一定時間培養後の菌体量が野生型の大腸菌より多い大腸菌の変異体、および該変異体を用いた有用物質の製造法を提供することができる。
　本願明細書中では、野生型の大腸菌とは、自然集団中で最も高頻度にみられる型の大腸菌であればいずれでもよく、例えば大腸菌K-12株に属する大腸菌W3110株(ATCC27325）および大腸菌MG1655株（ATCC47076）、大腸菌B株に属するATCC11303株、大腸菌W株に属するATCC9637株などをあげることができる。
　本願明細書中の配列番号１で表される塩基配列は、インターネットサイト、URL::http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/viewer.fcgi?db=nuccore&id=89106884に2007年8月16日付けで登録されている大腸菌W3110株の染色体DNAの全塩基配列である。上記インターネットサイトで表示される塩基配列は、NCBI（National Center for Biothechnology Information） GenBankのAccession No. AC_000091で表される塩基配列である。
　また、本願明細書中の第１表および第２表においては、上記インターネットサイトで用いられる大腸菌染色体上の各遺伝子名を用いている。
　第１表において遺伝子名ykgM(JW5034)で示される遺伝子は、配列番号１の塩基番号311598番から311738番で表される塩基配列からなる遺伝子を、遺伝子名ykgM(JW5035)で示される遺伝子は、配列番号１の塩基番号311738番から312001番で表される塩基配列からなる遺伝子をいい、遺伝子名phnE(JW4064)で示される遺伝子は、塩基番号4327121番から4327489番で表される塩基配列からなる遺伝子を、遺伝子名phnE(JW4065)で示される遺伝子は、配列番号１の塩基番号4327339番から4327959番で表される塩基配列からなる遺伝子をいう。
　遺伝子を含む染色体ＤＮＡとは、特定の構造遺伝子、プロモーターおよびオペレーターなどの特定の制御機能を有する領域を含む染色体ＤＮＡをいう。
　本明細書では、遺伝子を含まない染色体ＤＮＡとは、特定の遺伝子の構造遺伝子の一部または全部を含まない染色体ＤＮＡ、または該遺伝子のプロモーターおよび／またはオペレーターなどの特定の制御機能を有する領域を含まない染色体ＤＮＡをいう。
　構造遺伝子の一部を含まない染色体ＤＮＡとは、該構造遺伝子の一部を含まず、かつ該構造遺伝子から機能的な蛋白質が転写、発現されないＤＮＡであり、例えば構造遺伝子の５’末端領域が欠損しているため開始コドンが存在しないＤＮＡ、３’末端領域の大半、例えば全体の１０％以上、好ましくは２０％以上、より好ましくは３０％以上、さらに好ましくは４０％以上欠損しているＤＮＡのことである。また、染色体ＤＮＡ上で隣り合う遺伝子の両方を含まない染色体ＤＮＡは、両遺伝子の間に存在する塩基配列からなるＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡであってもよい。
　相同遺伝子とは、大腸菌種内で遺伝子の塩基配列に配列相同性が認められる遺伝子、または該遺伝子がコードする蛋白質のアミノ酸配列に配列相同性が認められる遺伝子をいう。配列相同性が認められるとは、塩基配列においては８５％以上、好ましくは９０％以上、より好ましくは９５％以上、さらに好ましくは９８％以上、特に好ましくは９９％以上の配列類似性、アミノ酸配列においては８０％以上、好ましくは９０％以上、より好ましくは９５％以上、さらに好ましくは９８％以上、特に好ましくは９９％以上の配列類似性があることをいう。
　ある特定の一群の遺伝子群またはその相同遺伝子の１０％以下を含む染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体とは、ある一群の遺伝子群より選ばれる遺伝子またはその相同遺伝子の９０％以上を欠失した染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体をいい、好ましくは９５％以上、より好ましくは９８％以上、さらに好ましくは９９％以上を欠失した染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体をいう。
　配列番号１で表される塩基配列中の特定の塩基番号で表される塩基配列を有するＤＮＡに相当するＤＮＡとしては、大腸菌種内で該特定の塩基番号で表される塩基配列を有するＤＮＡと含まれている遺伝子の構成、および染色体ＤＮＡ上の位置が実質的に同一のＤＮＡであれば、いずれのＤＮＡであってもよい。ＤＮＡに含まれる遺伝子の構成が実質的に同一とは、該ＤＮＡに含まれる遺伝子が同一かまたは相同遺伝子で構成され、かつ該遺伝子の並びとが同じであることをいい、遺伝子間の塩基配列は相違していてもよい。ただし、該特定の塩基番号で表される塩基配列を有するＤＮＡ中に挿入配列がある場合は、該ＤＮＡに相当するＤＮＡ中には該挿入配列はなくてもよい。
　染色体ＤＮＡ上の位置が実質的に同一とは、大腸菌の染色体ＤＮＡ上のｔｈｒＬ遺伝子の開始コドンのアデニンを１９０番としてｔｈｒＬ遺伝子のコーディング鎖に沿って染色体ＤＮＡの塩基配列に塩基番号を付けたとき、該特定の塩基番号との塩基番号の相違が５０以下、好ましくは３０以下、より好ましくは１０以下、さらに好ましくは５以下であることをいう。ただし、該特定の塩基番号で表される塩基配列を有するＤＮＡ中に挿入配列がある場合は、該ＤＮＡに相当するＤＮＡ中には該挿入配列はなくてもよいので、該挿入配列分、さらに塩基番号が相違していてもよい。配列番号１で表される塩基配列中の特定の塩基番号で表される塩基配列を有するＤＮＡに相当するＤＮＡとしては、例えば該特定の塩基番号で表される塩基配列と８０％以上、好ましくは９０％以上、より好ましくは９５％以上、さらに好ましくは９８％以上、特に好ましくは９９％以上の配列類似性を有するＤＮＡをあげることができる。
　アミノ酸配列や塩基配列の配列類似性は、Karlin and AltschulによるアルゴリズムBLAST[Pro. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 5873(1993)]やFASTA[Methods Enzymol., 183, 63 (1990)]を用いて決定することができる。このアルゴリズムBLASTに基づいて、BLASTNやBLASTXとよばれるプログラムが開発されている［J. Mol. Biol., 215, 403(1990)］。BLASTに基づいてBLASTNによって塩基配列を解析する場合には、パラメータは例えばScore＝100、wordlength＝12とする。また、BLASTに基づいてBLASTXによってアミノ酸配列を解析する場合には、パラメータは例えばscore＝50、wordlength＝3とする。BLASTとGapped BLASTプログラムを用いる場合には、各プログラムのデフォルトパラメータを用いる。これらの解析方法の具体的な手法は公知である（http://www.ncbi.nlm.nih.gov.）。
１．本発明の大腸菌の変異体
　本発明の大腸菌の変異体としては、
（１）［１］thrL遺伝子、thrA遺伝子、thrB遺伝子、thrC遺伝子、talB遺伝子、mog遺伝子、htgA遺伝子、dnaK遺伝子、dnaJ遺伝子、hokC遺伝子、mokC遺伝子、sokC遺伝子、nhaA遺伝子、nhaR遺伝子、rpsT遺伝子、ribF遺伝子、ileS遺伝子、lspA遺伝子、fkpB遺伝子、ispH遺伝子、rihC遺伝子、dapB遺伝子、carA遺伝子、carB遺伝子、caiF遺伝子、caiE遺伝子、caiD遺伝子、caiC遺伝子、caiB遺伝子、caiA遺伝子、caiT遺伝子、fixA遺伝子、fixB遺伝子、fixC遺伝子、fixX遺伝子、kefF遺伝子、kefC遺伝子、folA遺伝子、apaH遺伝子、apaG遺伝子、ksgA遺伝子、pdxA遺伝子、surA遺伝子、imp遺伝子、djlA遺伝子、rluA遺伝子、hepA遺伝子、polB遺伝子、leuD遺伝子、leuC遺伝子、leuB遺伝子、leuA遺伝子、leuL遺伝子、leuO遺伝子、ilvI遺伝子、ilvH遺伝子、fruR遺伝子、mraZ遺伝子、mraW遺伝子、ftsL遺伝子、ftsI遺伝子、murE遺伝子、murF遺伝子、mraY遺伝子、murD遺伝子、ftsW遺伝子、murG遺伝子、murC遺伝子、ddlB遺伝子、ftsQ遺伝子、ftsA遺伝子、ftsZ遺伝子、lpxC遺伝子、secM遺伝子、secA遺伝子、mutT遺伝子、coaE遺伝子、guaC遺伝子、hofC遺伝子、hofB遺伝子、ppdD遺伝子、nadC遺伝子、ampD遺伝子、ampE遺伝子、aroP遺伝子、pdhR遺伝子、aceE遺伝子、aceF遺伝子、lpd遺伝子、acnB遺伝子、speD遺伝子、speE遺伝子、cueO遺伝子、gcd遺伝子、hpt遺伝子、can遺伝子、panD遺伝子、panC遺伝子、panB遺伝子、htrE遺伝子、ecpD遺伝子、folK遺伝子、pcnB遺伝子、dksA遺伝子、sfsA遺伝子、ligT遺伝子、hrpB遺伝子、mrcB遺伝子、hemL遺伝子、clcA遺伝子、btuF遺伝子、pfs遺伝子、dgt遺伝子、degP遺伝子、cdaR遺伝子、dapD遺伝子、glnD遺伝子、map遺伝子、tff遺伝子、rpsB遺伝子、tsf遺伝子、pyrH遺伝子、frr遺伝子、dxr遺伝子、ispU遺伝子、cdsA遺伝子、hlpA遺伝子、lpxD遺伝子、fabZ遺伝子、lpxA遺伝子、lpxB遺伝子、rnhB遺伝子、dnaE遺伝子、accA遺伝子、ldcC遺伝子、tilS遺伝子、rof遺伝子、nlpE遺伝子、proS遺伝子、rcsF遺伝子、metQ遺伝子、metI遺伝子、metN遺伝子、gmhB遺伝子、rrsH遺伝子、ileV遺伝子、alaV遺伝子、rrlH遺伝子、rrfH遺伝子、aspU遺伝子、dkgB遺伝子、mltD遺伝子、gloB遺伝子、rnhA遺伝子、dnaQ遺伝子、aspV遺伝子、ivy遺伝子、fadE遺伝子、lpcA遺伝子、pepD遺伝子、gpt遺伝子、frsA遺伝子、crl遺伝子、phoE遺伝子、proB遺伝子、proA遺伝子、thrW遺伝子、hemB遺伝子、proC遺伝子、aroL遺伝子、aroM遺伝子、rdgC遺伝子、mak遺伝子、araJ遺伝子、sbcC遺伝子、sbcD遺伝子、phoB遺伝子、phoR遺伝子、brnQ遺伝子、proY遺伝子、malZ遺伝子、queA遺伝子、tgt遺伝子、secD遺伝子、secF遺伝子、tsx遺伝子、ribD遺伝子、ribE遺伝子、nusB遺伝子、thiL遺伝子、pgpA遺伝子、dxs遺伝子、ispA遺伝子、xseB遺伝子、thiI遺伝子、panE遺伝子、cyoE遺伝子、cyoD遺伝子、cyoC遺伝子、cyoB遺伝子、cyoA遺伝子、ampG遺伝子、bolA遺伝子、tig遺伝子、clpP遺伝子、clpX遺伝子、lon遺伝子、hupB遺伝子、ppiD遺伝子、cof遺伝子、mdlA遺伝子、mdlB遺伝子、glnK遺伝子、amtB遺伝子、tesB遺伝子、ffs遺伝子、maa遺伝子、hha遺伝子、acrB遺伝子、acrA遺伝子、acrR遺伝子、kefA遺伝子、priC遺伝子、apt遺伝子、dnaX遺伝子、recR遺伝子、htpG遺伝子、adk遺伝子、hemH遺伝子、aes遺伝子、gsk遺伝子、fsr遺伝子、ushA遺伝子、copA遺伝子、cueR遺伝子、gcl遺伝子、hyi遺伝子、purK遺伝子、purE遺伝子、lpxH遺伝子、ppiB遺伝子、cysS遺伝子、folD遺伝子、sfmA遺伝子、sfmC遺伝子、sfmD遺伝子、sfmH遺伝子、sfmF遺伝子、fimZ遺伝子、argU遺伝子、entD遺伝子、fepA遺伝子、fes遺伝子、entF遺伝子、fepE遺伝子、fepC遺伝子、fepG遺伝子、fepD遺伝子、fepB遺伝子、entC遺伝子、entE遺伝子、entB遺伝子、entA遺伝子、cstA遺伝子、dsbG遺伝子、ahpC遺伝子、ahpF遺伝子、tatE遺伝子、lipA遺伝子、lipB遺伝子、dacA遺伝子、rlpA遺伝子、mrdB遺伝子、mrdA遺伝子、cobC遺伝子、nadD遺伝子、holA遺伝子、rlpB遺伝子、leuS遺伝子、lnt遺伝子、miaB遺伝子、ubiF遺伝子、glnX遺伝子、glnV遺伝子、metU遺伝子、glnW遺伝子、glnU遺伝子、leuW遺伝子、metT遺伝子、asnB遺伝子、nagD遺伝子、nagC遺伝子、nagA遺伝子、nagB遺伝子、nagE遺伝子、glnS遺伝子、fur遺伝子、fldA遺伝子、seqA遺伝子、pgm遺伝子、potE遺伝子、speF遺伝子、kdpE遺伝子、kdpD遺伝子、kdpC遺伝子、kdpB遺伝子、kdpA遺伝子、nei遺伝子、abrB遺伝子、gltA遺伝子、sdhC遺伝子、sdhD遺伝子、sdhA遺伝子、sdhB遺伝子、sucA遺伝子、sucB遺伝子、sucC遺伝子、sucD遺伝子、mngR遺伝子、mngA遺伝子、mngB遺伝子、cydA遺伝子、cydB遺伝子、tolQ遺伝子、tolR遺伝子、tolA遺伝子、tolB遺伝子、pal遺伝子、lysT遺伝子、valT遺伝子、lysW遺伝子、valZ遺伝子、lysY遺伝子、lysZ遺伝子、lysQ遺伝子、nadA遺伝子、pnuC遺伝子、zitB遺伝子、aroG遺伝子、gpmA遺伝子、galM遺伝子、galK遺伝子、galT遺伝子、galE遺伝子、modF遺伝子、modE遺伝子、modA遺伝子、modB遺伝子、modC遺伝子、bioA遺伝子、bioB遺伝子、bioF遺伝子、bioC遺伝子、bioD遺伝子、uvrB遺伝子、moaA遺伝子、moaB遺伝子、moaC遺伝子、moaD遺伝子、moaE遺伝子、rhlE遺伝子、dps遺伝子、rhtA遺伝子、ompX遺伝子、rybA遺伝子、mntR遺伝子、fsaA遺伝子、moeB遺伝子、moeA遺伝子、iaaA遺伝子、cmr遺伝子、rybB遺伝子、grxA遺伝子、poxB遺伝子、hcr遺伝子、hcp遺伝子、aqpZ遺伝子、macA遺伝子、macB遺伝子、cspD遺伝子、clpS遺伝子、clpA遺伝子、serW遺伝子、infA遺伝子、aat遺伝子、cydC遺伝子、cydD遺伝子、trxB遺伝子、lrp遺伝子、ftsK遺伝子、lolA遺伝子、serS遺伝子、dmsA遺伝子、dmsB遺伝子、dmsC遺伝子、pflA遺伝子、pflB遺伝子、focA遺伝子、serC遺伝子、aroA遺伝子、cmk遺伝子、rpsA遺伝子、ihfB遺伝子、msbA遺伝子、lpxK遺伝子、kdsB遺伝子、smtA遺伝子、mukF遺伝子、mukE遺伝子、mukB遺伝子、aspC遺伝子、ompF遺伝子、asnS遺伝子、pncB遺伝子、pepN遺伝子、ssuB遺伝子、ssuC遺伝子、ssuD遺伝子、ssuA遺伝子、ssuE遺伝子、pyrD遺伝子、uup遺伝子、pqiA遺伝子、pqiB遺伝子、rmf遺伝子、fabA遺伝子、ompA遺伝子、sulA遺伝子、helD遺伝子、mgsA遺伝子、serT遺伝子、hyaA遺伝子、hyaB遺伝子、hyaC遺伝子、hyaD遺伝子、hyaE遺伝子、hyaF遺伝子、appC遺伝子、appB遺伝子、appA遺伝子、etp遺伝子、serX遺伝子、csgG遺伝子、csgF遺伝子、csgE遺伝子、csgD遺伝子、csgB遺伝子、csgA遺伝子、csgC遺伝子、mdoC遺伝子、mdoG遺伝子、mdoH遺伝子、msyB遺伝子、mdtG遺伝子、lpxL遺伝子、solA遺伝子、dinI遺伝子、pyrC遺伝子、grxB遺伝子、mdtH遺伝子、rimJ遺伝子、mviM遺伝子、mviN遺伝子、flgN遺伝子、flgM遺伝子、flgA遺伝子、flgB遺伝子、flgC遺伝子、flgD遺伝子、flgE遺伝子、flgF遺伝子、flgG遺伝子、flgH遺伝子、flgI遺伝子、flgJ遺伝子、flgK遺伝子、flgL遺伝子、rne遺伝子、rluC遺伝子、sraB遺伝子、rpmF遺伝子、plsX遺伝子、fabH遺伝子、fabD遺伝子、fabG遺伝子、acpP遺伝子、fabF遺伝子、pabC遺伝子、tmk遺伝子、holB遺伝子、ptsG遺伝子、fhuE遺伝子、hinT遺伝子、nagZ遺伝子、ndh遺伝子、mfd遺伝子、lolC遺伝子、lolD遺伝子、lolE遺伝子、cobB遺伝子、potD遺伝子、potC遺伝子、potB遺伝子、potA遺伝子、pepT遺伝子、phoQ遺伝子、phoP遺伝子、purB遺伝子、hflD遺伝子、trmU遺伝子、minE遺伝子、minD遺伝子、minC遺伝子、hlyE遺伝子、umuD遺伝子、umuC遺伝子、dsbB遺伝子、nhaB遺伝子、fadR遺伝子、dadA遺伝子、dadX遺伝子、cvrA遺伝子、ldcA遺伝子、emtA遺伝子、treA遺伝子、dhaH遺伝子、dhaL遺伝子、dhaK遺伝子、dhaR遺伝子、pth遺伝子、prsA遺伝子、ispE遺伝子、lolB遺伝子、hemA遺伝子、prfA遺伝子、prmC遺伝子、kdsA遺伝子、ldrA遺伝子、rdlA遺伝子、ldrB遺伝子、rdlB遺伝子、ldrC遺伝子、rdlC遺伝子、chaA遺伝子、chaB遺伝子、chaC遺伝子、narL遺伝子、narX遺伝子、narK遺伝子、narG遺伝子、narH遺伝子、narJ遺伝子、narI遺伝子、rttR遺伝子、tpr遺伝子、tyrV遺伝子、tyrT遺伝子、purU遺伝子、rssA遺伝子、rssB遺伝子、galU遺伝子、hns遺伝子、tdk遺伝子、adhE遺伝子、oppA遺伝子、oppB遺伝子、oppC遺伝子、oppD遺伝子、oppF遺伝子、cls遺伝子、kch遺伝子、tonB遺伝子、ompW遺伝子、trpA遺伝子、trpB遺伝子、trpC遺伝子、trpD遺伝子、trpE遺伝子、trpL遺伝子、rluB遺伝子、btuR遺伝子、sohB遺伝子、topA遺伝子、cysB遺伝子、acnA遺伝子、ribA遺伝子、pgpB遺伝子、pyrF遺伝子、osmB遺伝子、gmr遺伝子、rnb遺伝子、fabI遺伝子、sapF遺伝子、sapD遺伝子、sapC遺伝子、sapB遺伝子、sapA遺伝子、puuP遺伝子、puuA遺伝子、puuD遺伝子、puuR遺伝子、puuC遺伝子、puuB遺伝子、puuE遺伝子、pspF遺伝子、pspA遺伝子、pspB遺伝子、pspC遺伝子、pspD遺伝子、pspE遺伝子、ompG遺伝子、tyrR遺伝子、tpx遺伝子、mpaA遺伝子、mppA遺伝子、uspE遺伝子、fnr遺伝子、ogt遺伝子、abgT遺伝子、abgB遺伝子、abgA遺伝子、abgR遺伝子、isrA遺伝子、dbpA遺伝子、uspF遺伝子、ompN遺伝子、micC遺伝子、hslJ遺伝子、ldhA遺伝子、feaR遺伝子、feaB遺伝子、tynA遺伝子、maoC遺伝子、paaA遺伝子、paaB遺伝子、paaC遺伝子、paaD遺伝子、paaE遺伝子、paaF遺伝子、paaG遺伝子、paaH遺伝子、paaI遺伝子、paaJ遺伝子、paaK遺伝子、paaX遺伝子、paaY遺伝子、azoR遺伝子、hrpA遺伝子、aldA遺伝子、gapC_2遺伝子、gapC_1遺伝子、cybB遺伝子、hokB遺伝子、mokB遺伝子、sokB遺伝子、trg遺伝子、mdoD遺伝子、rimL遺伝子、tehA遺伝子、tehB遺伝子、ansP遺伝子、nhoA遺伝子、narV遺伝子、narW遺伝子、narY遺伝子、narZ遺伝子、narU遺伝子、fdnG遺伝子、fdnH遺伝子、fdnI遺伝子、adhP遺伝子、sfcA遺伝子、sra遺伝子、bdm遺伝子、osmC遺伝子、ddpF遺伝子、ddpD遺伝子、ddpC遺伝子、ddpB遺伝子、ddpA遺伝子、ddpX遺伝子、dos遺伝子、gadC遺伝子、gadB遺伝子、pqqL遺伝子、hipA遺伝子、hipB遺伝子、ego遺伝子、lsrC遺伝子、lsrD遺伝子、lsrB遺伝子、lsrF遺伝子、lsrG遺伝子、tam遺伝子、uxaB遺伝子、marC遺伝子、marR遺伝子、marA遺伝子、marB遺伝子、eamA遺伝子、dcp遺伝子、rspB遺伝子、rspA遺伝子、speG遺伝子、dmsD遺伝子、clcB遺伝子、dgsA遺伝子、asr遺伝子、mdtI遺伝子、mdtJ遺伝子、pntB遺伝子、pntA遺伝子、folM遺伝子、rstA遺伝子、rstB遺伝子、tus遺伝子、fumC遺伝子、fumA遺伝子、manA遺伝子、uidC遺伝子、uidB遺伝子、uidA遺伝子、uidR遺伝子、hdhA遺伝子、malI遺伝子、malX遺伝子、malY遺伝子、add遺伝子、blr遺伝子、rsxA遺伝子、rsxB遺伝子、rsxC遺伝子、rsxD遺伝子、rsxG遺伝子、rsxE遺伝子、nth遺伝子、gst遺伝子、pdxY遺伝子、tyrS遺伝子、pdxH遺伝子、slyB遺伝子、slyA遺伝子、sodC遺伝子、nemA遺伝子、gloA遺伝子、rnt遺伝子、lhr遺伝子、sodB遺伝子、purR遺伝子、cfa遺伝子、ribC遺伝子、mdtK遺伝子、valV遺伝子、valW遺伝子、pykF遺伝子、lpp遺伝子、sufE遺伝子、sufS遺伝子、sufD遺伝子、sufC遺伝子、sufB遺伝子、sufA遺伝子、rydB遺伝子、rprA遺伝子、aroD遺伝子、pps遺伝子、aroH遺伝子、nlpC遺伝子、btuD遺伝子、btuE遺伝子、btuC遺伝子、ihfA遺伝子、pheT遺伝子、pheS遺伝子、pheM遺伝子、rplT遺伝子、rpmI遺伝子、infC遺伝子、thrS遺伝子、arpB_1遺伝子、arpB_2遺伝子、pfkB遺伝子、cedA遺伝子、katE遺伝子、chbG遺伝子、chbF遺伝子、chbR遺伝子、chbA遺伝子、chbC遺伝子、chbB遺伝子、osmE遺伝子、nadE遺伝子、spy遺伝子、astE遺伝子、astB遺伝子、astD遺伝子、astA遺伝子、astC遺伝子、xthA遺伝子、nudG遺伝子、gdhA遺伝子、topB遺伝子、selD遺伝子、sppA遺伝子、ansA遺伝子、gapA遺伝子、mipA遺伝子、rnd遺伝子、fadD遺伝子、pabB遺伝子、sdaA遺伝子、manX遺伝子、manY遺伝子、manZ遺伝子、rrmA遺伝子、cspC遺伝子、kdgR遺伝子、htpX遺伝子、prc遺伝子、proQ遺伝子、pphA遺伝子、ryeA遺伝子、ryeB遺伝子、holE遺伝子、exoX遺伝子、ptrB遺伝子、purT遺伝子、eda遺伝子、edd遺伝子、zwf遺伝子、pykA遺伝子、lpxM遺伝子、znuA遺伝子、znuC遺伝子、znuB遺伝子、ruvB遺伝子、ruvA遺伝子、ruvC遺伝子、nudB遺伝子、aspS遺伝子、torZ遺伝子、torY遺伝子、cutC遺伝子、argS遺伝子、leuZ遺伝子、cysT遺伝子、glyW遺伝子、pgsA遺伝子、dsrA遺伝子、serU遺伝子、asnT遺伝子、shiA遺伝子、amn遺伝子、asnW遺伝子、asnU遺伝子、cbl遺伝子、nac遺伝子、asnV遺伝子、erfK遺伝子、cobT遺
伝子、cobS遺伝子、cobU遺伝子、sbmC遺伝子、dacD遺伝子、sbcB遺伝子、hisL遺伝子、hisG遺伝子、hisD遺伝子、hisC遺伝子、hisB遺伝子、hisH遺伝子、hisA遺伝子、hisF遺伝子、hisI遺伝子、cld遺伝子、ugd遺伝子、gnd遺伝子、galF遺伝子、wcaM遺伝子、wcaL遺伝子、wcaK遺伝子、wzxC遺伝子、wcaJ遺伝子、cpsG遺伝子、cpsB遺伝子、wcaI遺伝子、nudD遺伝子、fcl遺伝子、gmd遺伝子、wcaF遺伝子、wcaE遺伝子、wcaD遺伝子、wcaC遺伝子、wcaB遺伝子、wcaA遺伝子、wzc遺伝子、wzb遺伝子、wza遺伝子、asmA遺伝子、dcd遺伝子、udk遺伝子、thiD遺伝子、thiM遺伝子、mrp遺伝子、metG遺伝子、dusC遺伝子、cdd遺伝子、sanA遺伝子、mglC遺伝子、mglA遺伝子、mglB遺伝子、galS遺伝子、folE遺伝子、cirA遺伝子、lysP遺伝子、nfo遺伝子、fruA遺伝子、fruK遺伝子、fruB遺伝子、setB遺伝子、spr遺伝子、rtn遺伝子、bcr遺伝子、rsuA遺伝子、rplY遺伝子、proL遺伝子、narP遺伝子、ccmH遺伝子、ccmG遺伝子、ccmF遺伝子、ccmE遺伝子、ccmD遺伝子、ccmC遺伝子、ccmB遺伝子、ccmA遺伝子、napC遺伝子、napB遺伝子、napH遺伝子、napG遺伝子、napA遺伝子、napD遺伝子、napF遺伝子、eco遺伝子、mqo遺伝子、alkB遺伝子、ada遺伝子、ompC遺伝子、micF遺伝子、rcsD遺伝子、rcsB遺伝子、rcsC遺伝子、atoS遺伝子、atoC遺伝子、atoD遺伝子、atoA遺伝子、atoE遺伝子、atoB遺伝子、gyrA遺伝子、ubiG遺伝子、nrdA遺伝子、nrdB遺伝子、inaA遺伝子、glpQ遺伝子、glpT遺伝子、glpA遺伝子、glpB遺伝子、glpC遺伝子、ais遺伝子、arnT遺伝子、pmrD遺伝子、menE遺伝子、menC遺伝子、menB遺伝子、menD遺伝子、menF遺伝子、nuoN遺伝子、nuoM遺伝子、nuoL遺伝子、nuoK遺伝子、nuoJ遺伝子、nuoI遺伝子、nuoH遺伝子、nuoG遺伝子、nuoF遺伝子、nuoE遺伝子、nuoC遺伝子、nuoB遺伝子、nuoA遺伝子、lrhA遺伝子、ackA遺伝子、pta遺伝子、ubiX遺伝子、purF遺伝子、cvpA遺伝子、dedD遺伝子、folC遺伝子、accD遺伝子、dedA遺伝子、truA遺伝子、usg遺伝子、pdxB遺伝子、flk遺伝子、fabB遺伝子、trmC遺伝子、mepA遺伝子、aroC遺伝子、prmB遺伝子、sixA遺伝子、fadL遺伝子、vacJ遺伝子、argW遺伝子、dsdC遺伝子、dsdX遺伝子、dsdA遺伝子、emrY遺伝子、emrK遺伝子、evgA遺伝子、evgS遺伝子、oxc遺伝子、frc遺伝子、ddg遺伝子、glk遺伝子、mntH遺伝子、nupC遺伝子、alaX遺伝子、alaW遺伝子、gltX遺伝子、valU遺伝子、valX遺伝子、valY遺伝子、lysV遺伝子、xapR遺伝子、xapB遺伝子、xapA遺伝子、ligA遺伝子、zipA遺伝子、cysZ遺伝子、cysK遺伝子、ptsH遺伝子、ptsI遺伝子、crr遺伝子、pdxK遺伝子、cysM遺伝子、cysA遺伝子、cysW遺伝子、cysU遺伝子、cysP遺伝子、ucpA遺伝子、murP遺伝子、amiA遺伝子、hemF遺伝子、eutL遺伝子、eutC遺伝子、eutB遺伝子、eutA遺伝子、eutH遺伝子、eutG遺伝子、eutJ遺伝子、eutE遺伝子、cchB遺伝子、cchA遺伝子、eutI遺伝子、eutT遺伝子、eutQ遺伝子、eutP遺伝子、maeB遺伝子、talA遺伝子、tktB遺伝子、aegA遺伝子、narQ遺伝子、acrD遺伝子、dapE遺伝子、purC遺伝子、nlpB遺伝子、dapA遺伝子、gcvR遺伝子、bcp遺伝子、hda遺伝子、uraA遺伝子、upp遺伝子、purM遺伝子、purN遺伝子、ppk遺伝子、ppx遺伝子、guaA遺伝子、guaB遺伝子、xseA遺伝子、der遺伝子、hisS遺伝子、ispG遺伝子、ndk遺伝子、pbpC遺伝子、sseA遺伝子、ryfA遺伝子、sseB遺伝子、pepB遺伝子、fdx遺伝子、hscA遺伝子、hscB遺伝子、iscA遺伝子、iscU遺伝子、iscS遺伝子、iscR遺伝子、suhB遺伝子、csiE遺伝子、hcaT遺伝子、hcaR遺伝子、hcaE遺伝子、hcaF遺伝子、hcaC遺伝子、hcaB遺伝子、hcaD遺伝子、glyA遺伝子、hmp遺伝子、glnB遺伝子、sroF遺伝子、purL遺伝子、tadA遺伝子、acpS遺伝子、pdxJ遺伝子、recO遺伝子、era遺伝子、rnc遺伝子、lepB遺伝子、lepA遺伝子、rseC遺伝子、rseB遺伝子、rseA遺伝子、rpoE遺伝子、nadB遺伝子、srmB遺伝子、ung遺伝子、trxC遺伝子、pssA遺伝子、kgtP遺伝子、rrfG遺伝子、rrlG遺伝子、gltW遺伝子、rrsG遺伝子、clpB遺伝子、rluD遺伝子、pheL遺伝子、pheA遺伝子、tyrA遺伝子、aroF遺伝子、rplS遺伝子、trmD遺伝子、rimM遺伝子、rpsP遺伝子、ffh遺伝子、grpE遺伝子、recN遺伝子、smpA遺伝子、smpB遺伝子、ssrA遺伝子、gabD遺伝子、gabT遺伝子、gabP遺伝子、nrdF遺伝子、mprA遺伝子、emrA遺伝子、emrB遺伝子、luxS遺伝子、sraD遺伝子、gshA遺伝子、argQ遺伝子、argZ遺伝子、argY遺伝子、argV遺伝子、serV遺伝子、csrA遺伝子、alaS遺伝子、recX遺伝子、recA遺伝子、mltB遺伝子、norR遺伝子、norV遺伝子、norW遺伝子、hypF遺伝子、hydN遺伝子、ascG遺伝子、ascF遺伝子、ascB遺伝子、hycI遺伝子、hycH遺伝子、hycG遺伝子、hycF遺伝子、hycE遺伝子、hycD遺伝子、hycC遺伝子、hycB遺伝子、hycA遺伝子、hypA遺伝子、hypB遺伝子、hypC遺伝子、hypD遺伝子、hypE遺伝子、fhlA遺伝子、mutS遺伝子、pphB遺伝子、rpoS遺伝子、nlpD遺伝子、pcm遺伝子、surE遺伝子、truD遺伝子、ispF遺伝子、ispD遺伝子、ftsB遺伝子、cysC遺伝子、cysN遺伝子、cysD遺伝子、iap遺伝子、cysH遺伝子、cysI遺伝子、cysJ遺伝子、eno遺伝子、pyrG遺伝子、mazG遺伝子、chpR遺伝子、relA遺伝子、rumA遺伝子、barA遺伝子、gudD遺伝子、gudX遺伝子、gudP遺伝子、mltA遺伝子、metZ遺伝子、metW遺伝子、metV遺伝子、amiC遺伝子、argA遺伝子、recD遺伝子、recB遺伝子、ptr遺伝子、recC遺伝子、ppdC遺伝子、ppdB遺伝子、ppdA遺伝子、thyA遺伝子、lgt遺伝子、ptsP遺伝子、nudH遺伝子、mutH遺伝子、tas遺伝子、aas遺伝子、rygA遺伝子、rygB遺伝子、galR遺伝子、lysA遺伝子、lysR遺伝子、araE遺伝子、kduD遺伝子、kduI遺伝子、lysS遺伝子、prfB遺伝子、recJ遺伝子、dsbC遺伝子、xerD遺伝子、fldB遺伝子、bglA遺伝子、gcvP遺伝子、gcvH遺伝子、gcvT遺伝子、visC遺伝子、ubiH遺伝子、pepP遺伝子、zapA遺伝子、ssrS遺伝子、rygC遺伝子、serA遺伝子、rpiA遺伝子、argP遺伝子、argK遺伝子、argO遺伝子、mscS遺伝子、fbaA遺伝子、pgk遺伝子、epd遺伝子、tktA遺伝子、speB遺伝子、speA遺伝子、metK遺伝子、galP遺伝子、sprT遺伝子、endA遺伝子、gshB遺伝子、ansB遺伝子、mutY遺伝子、mltC遺伝子、nupG遺伝子、speC遺伝子、pheV遺伝子、pitB遺伝子、gss遺伝子、hybG遺伝子、hybF遺伝子、hybE遺伝子、hybD遺伝子、hybC遺伝子、hybB遺伝子、hybA遺伝子、hybO遺伝子、exbD遺伝子、exbB遺伝子、metC遺伝子、dkgA遺伝子、sufI遺伝子、plsC遺伝子、parC遺伝子、parE遺伝子、cpdA遺伝子、nudF遺伝子、tolC遺伝子、zupT遺伝子、ribB遺伝子、glgS遺伝子、rygD遺伝子、rfaE遺伝子、glnE遺伝子、htrG遺伝子、cca遺伝子、bacA遺伝子、folB遺伝子、ttdA遺伝子、ttdB遺伝子、rpsU遺伝子、dnaG遺伝子、rpoD遺伝子、ileX遺伝子、aer遺伝子、ebgR遺伝子、ebgA遺伝子、ebgC遺伝子、uxaA遺伝子、uxaC遺伝子、exuT遺伝子、exuR遺伝子、tdcG遺伝子、tdcF遺伝子、tdcE遺伝子、tdcD遺伝子、tdcC遺伝子、tdcB遺伝子、tdcA遺伝子、tdcR遺伝子、rnpB遺伝子、garK遺伝子、garR遺伝子、garL遺伝子、garP遺伝子、garD遺伝子、sohA遺伝子、agaR遺伝子、kbaZ遺伝子、agaV遺伝子、agaW遺伝子、agaA遺伝子、agaS遺伝子、kbaY遺伝子、agaB遺伝子、agaC遺伝子、agaD遺伝子、agaI遺伝子、mtr遺伝子、deaD遺伝子、nlpI遺伝子、pnp遺伝子、sraG遺伝子、rpsO遺伝子、truB遺伝子、rbfA遺伝子、infB遺伝子、nusA遺伝子、metY遺伝子、argG遺伝子、leuU遺伝子、secG遺伝子、glmM遺伝子、folP遺伝子、ftsH遺伝子、rrmJ遺伝子、greA遺伝子、dacB遺伝子、obgE遺伝子、rpmA遺伝子、rplU遺伝子、ispB遺伝子、sfsB遺伝子、murA遺伝子、kdsD遺伝子、kdsC遺伝子、rpoN遺伝子、ptsN遺伝子、npr遺伝子、mtgA遺伝子、elbB遺伝子、ryhA遺伝子、arcB遺伝子、gltB遺伝子、gltD遺伝子、nanT遺伝子、nanA遺伝子、nanR遺伝子、dcuD遺伝子、sspB遺伝子、sspA遺伝子、rpsI遺伝子、rplM遺伝子、degQ遺伝子、degS遺伝子、mdh遺伝子、argR遺伝子、aaeB遺伝子、aaeA遺伝子、aaeX遺伝子、aaeR遺伝子、tldD遺伝子、rng遺伝子、mreD遺伝子、mreC遺伝子、mreB遺伝子、accB遺伝子、accC遺伝子、panF遺伝子、prmA遺伝子、dusB遺伝子、fis遺伝子、rrfF遺伝子、thrV遺伝子、rrfD遺伝子、rrlD遺伝子、gltV遺伝子、rrsD遺伝子、purH遺伝子、purD遺伝子、zraR遺伝子、zraS遺伝子、zraP遺伝子、hupA遺伝子、nfi遺伝子、hemE遺伝子、nudC遺伝子、rsd遺伝子、thiC遺伝子、thiE遺伝子、thiF遺伝子、thiS遺伝子、thiG遺伝子、thiH遺伝子、htrC遺伝子、rpoC遺伝子、rpoB遺伝子、rplL遺伝子、rplJ遺伝子、rplA遺伝子、rplK遺伝子、nusG遺伝子、secE遺伝子、tufB遺伝子、thrT遺伝子、glyT遺伝子、tyrU遺伝子、thrU遺伝子、coaA遺伝子、birA遺伝子、murB遺伝子、rrfB遺伝子、rrlB遺伝子、gltT遺伝子、rrsB遺伝子、murI遺伝子、btuB遺伝子、trmA遺伝子、fabR遺伝子、sthA遺伝子、oxyR遺伝子、oxyS遺伝子、argH遺伝子、argB遺伝子、argC遺伝子、argE遺伝子、ppc遺伝子、fsaB遺伝子、gldA遺伝子、katG遺伝子、metF遺伝子、metL遺伝子、metB遺伝子、metJ遺伝子、rpmE遺伝子、priA遺伝子、cytR遺伝子、ftsN遺伝子、hslV遺伝子、hslU遺伝子、menA遺伝子、rraA遺伝子、glpF遺伝子、glpK遺伝子、glpX遺伝子、fpr遺伝子、tpiA遺伝子、cdh遺伝子、sbp遺伝子、pfkA遺伝子、fieF遺伝子、cpxP遺伝子、cpxR遺伝子、cpxA遺伝子、kdgT遺伝子、sodA遺伝子、fdhD遺伝子、fdoG遺伝子、fdoH遺伝子、fdoI遺伝子、fdhE遺伝子、bipA遺伝子、glnA遺伝子、glnL遺伝子、glnG遺伝子、hemN遺伝子、csrC遺伝子、spf遺伝子、polA遺伝子、dsbA遺伝子、mobA遺伝子、mobB遺伝子、rrfA遺伝子、rrlA遺伝子、alaT遺伝子、ileT遺伝子、rrsA遺伝子、hemG遺伝子、trkH遺伝子、pepQ遺伝子、fadB遺伝子、fadA遺伝子、fre遺伝子、ubiD遺伝子、rfaH遺伝子、tatD遺伝子、tatC遺伝子、tatB遺伝子、tatA遺伝子、ubiB遺伝子、ubiE遺伝子、rmuC遺伝子、udp遺伝子、metE遺伝子、metR遺伝子、pldB遺伝子、rhtB遺伝子、rhtC遺伝子、recQ遺伝子、pldA遺伝子、rarD遺伝子、corA遺伝子、uvrD遺伝子、xerC遺伝子、dapF遺伝子、cyaY遺伝子、cyaA遺伝子、hemC遺伝子、hemD遺伝子、hemX遺伝子、hemY遺伝子、ryiA遺伝子、aslA遺伝子、aslB遺伝子、proM遺伝子、leuT遺伝子、hisR遺伝子、argX遺伝子、rffM遺伝子、wzyE遺伝子、rffT遺伝子、wzxE遺伝子、rffA遺伝子、rffC遺伝子、rffH遺伝子、rffG遺伝子、rffD遺伝子、rffE遺伝子、wzzE遺伝子、rfe遺伝子、rho遺伝子、rhoL遺伝子、trxA遺伝子、rhlB遺伝子、gpp遺伝子、rep遺伝子、ppiC遺伝子、ilvC遺伝子、ilvY遺伝子、ilvA遺伝子、ilvD遺伝子、ilvE遺伝子、ilvM遺伝子、ilvG_2遺伝子、ilvG_1遺伝子、ilvL遺伝子、hdfR遺伝子、trpT遺伝子、aspT遺伝子、rrfC遺伝子、rrlC遺伝子、gltU遺伝子、rrsC遺伝子、asnC遺伝子、mioC遺伝子、oriC遺伝子、gidA遺伝子、gidB遺伝子、atpI遺伝子、atpB遺伝子、atpE遺伝子、atpF遺伝子、atpH遺伝子、atpA遺伝子、atpG遺伝子、atpD遺伝子、atpC遺伝子、glmU遺伝子、glmS遺伝子、pstS遺伝子、pstC遺伝子、pstA遺伝子、pstB遺伝子、phoU遺伝子、bglG遺伝子、bglF遺伝子、bglB遺伝子、bglH遺伝子、cbrC遺伝子、mdtL遺伝子、tnaB遺伝子、tnaA遺伝子、tnaC遺伝子、trmE遺伝子、rnpA遺伝子、rpmH遺伝子、dnaA遺伝子、dnaN遺伝子、recF遺伝子、gyrB遺伝子、ibpA遺伝子、ibpB遺伝子、emrD遺伝子、ivbL遺伝子、ilvB遺伝子、ilvN遺伝子、uhpA遺伝子、uhpB遺伝子、uhpC遺伝子、uhpT遺伝子、selC遺伝子、gltS遺伝子、recG遺伝子、trmH遺伝子、spoT遺伝子、rpoZ遺伝子、gmk遺伝子、ligB遺伝子、dinD遺伝子、rph遺伝子、pyrE遺伝子、ttk遺伝子、dut遺伝子、dfp遺伝子、rpmB遺伝子、rpmG遺伝子、mutM遺伝子、coaD遺伝子、kdtA遺伝子、rfaQ遺伝子、rfaG遺伝子、rfaP遺伝子、rfaS遺伝子、rfaB遺伝子、rfaI遺伝子、rfaJ遺伝子、rfaY遺伝子、rfaZ遺伝子、rfaK遺伝子、rfaL遺伝子、rfaC遺伝子、rfaF遺伝子、rfaD遺伝子、htrL遺伝子、kbl遺伝子、tdh遺伝子、envC遺伝子、gpmI遺伝子、grxC遺伝子、secB遺伝子、gpsA遺伝子、cysE遺伝子、lldD遺伝子、lldR遺伝子、lldP遺伝子、mtlR遺伝子、mtlD遺伝子、mtlA遺伝子、selA遺伝子、selB遺伝子、aldB遺伝子、sgbE遺伝子、sgbU遺伝子、sgbH遺伝子、lyxK遺伝子、avtA遺伝子、malS遺伝子、bax遺伝子、xylR遺伝子、xylH遺伝子、xylG遺伝子、xylF遺伝子、xylA遺伝子、xylB遺伝子、gly
Q遺伝子、glyS遺伝子、hokA遺伝子、cspA遺伝子、tiaE遺伝子、bisC遺伝子、tag遺伝子、eptB遺伝子、proK遺伝子、dppA遺伝子、dppB遺伝子、dppC遺伝子、dppD遺伝子、dppF遺伝子、rdlD遺伝子、ldrD遺伝子、bcsG遺伝子、bcsF遺伝子、bcsE遺伝子、bcsA遺伝子、bcsB遺伝子、bcsZ遺伝子、bcsC遺伝子、dctA遺伝子、kdgK遺伝子、treF遺伝子、gadA遺伝子、gadX遺伝子、gadY遺伝子、gadW遺伝子、mdtF遺伝子、mdtE遺伝子、gadE遺伝子、hdeD遺伝子、hdeA遺伝子、hdeB遺伝子、slp遺伝子、arsC遺伝子、arsB遺伝子、arsR遺伝子、gor遺伝子、prlC遺伝子、uspA遺伝子、pitA遺伝子、nikR遺伝子、nikE遺伝子、nikD遺伝子、nikC遺伝子、nikB遺伝子、nikA遺伝子、acpT遺伝子、dcrB遺伝子、zntA遺伝子、ftsY遺伝子、ftsE遺伝子、ftsX遺伝子、rpoH遺伝子、livJ遺伝子、livK遺伝子、livH遺伝子、livM遺伝子、livG遺伝子、livF遺伝子、ugpB遺伝子、ugpA遺伝子、ugpE遺伝子、ugpC遺伝子、ugpQ遺伝子、ggt遺伝子、gntR遺伝子、gntK遺伝子、gntU遺伝子、asd遺伝子、glgB遺伝子、glgX遺伝子、glgC遺伝子、glgA遺伝子、glgP遺伝子、glpD遺伝子、glpE遺伝子、glpG遺伝子、glpR遺伝子、rtcR遺伝子、rtcB遺伝子、rtcA遺伝子、malT遺伝子、malP遺伝子、malQ遺伝子、gntT遺伝子、gntY遺伝子、gntX遺伝子、bioH遺伝子、feoB遺伝子、feoA遺伝子、greB遺伝子、ompR遺伝子、envZ遺伝子、pck遺伝子、hslO遺伝子、hslR遺伝子、nudE遺伝子、mrcA遺伝子、hofQ遺伝子、aroK遺伝子、aroB遺伝子、damX遺伝子、dam遺伝子、rpe遺伝子、gph遺伝子、trpS遺伝子、cysG遺伝子、nirC遺伝子、nirD遺伝子、nirB遺伝子、tsgA遺伝子、ppiA遺伝子、fic遺伝子、pabA遺伝子、argD遺伝子、crp遺伝子、prkB遺伝子、kefG遺伝子、kefB遺伝子、slyD遺伝子、slyX遺伝子、fkpA遺伝子、rpsL遺伝子、rpsG遺伝子、fusA遺伝子、tufA遺伝子、rpsJ遺伝子、rplC遺伝子、rplD遺伝子、rplW遺伝子、rplB遺伝子、rpsS遺伝子、rplV遺伝子、rpsC遺伝子、rplP遺伝子、rpmC遺伝子、rpsQ遺伝子、rplN遺伝子、rplX遺伝子、rplE遺伝子、rpsN遺伝子、rpsH遺伝子、rplF遺伝子、rplR遺伝子、rpsE遺伝子、rpmD遺伝子、rplO遺伝子、secY遺伝子、rpmJ遺伝子、rpsM遺伝子、rpsK遺伝子、rpsD遺伝子、rpoA遺伝子、rplQ遺伝子、zntR遺伝子、mscL遺伝子、trkA遺伝子、rsmB遺伝子、fmt遺伝子、def遺伝子、smf遺伝子、smg遺伝子、aroE遺伝子、rrsE遺伝子、ileU遺伝子、alaU遺伝子、rrlE遺伝子、rrfE遺伝子、metA遺伝子、aceB遺伝子、aceA遺伝子、aceK遺伝子、arpA遺伝子、iclR遺伝子、metH遺伝子、pepE遺伝子、lysC遺伝子、pgi遺伝子、ubiC遺伝子、ubiA遺伝子、plsB遺伝子、dgkA遺伝子、lexA遺伝子、dinF遺伝子、zur遺伝子、qor遺伝子、dnaB遺伝子、alr遺伝子、tyrB遺伝子、aphA遺伝子、uvrA遺伝子、ssb遺伝子、soxS遺伝子、soxR遺伝子、ryjA遺伝子、actP遺伝子、acs遺伝子、nrfA遺伝子、nrfB遺伝子、nrfC遺伝子、nrfD遺伝子、nrfE遺伝子、nrfF遺伝子、nrfG遺伝子、gltP遺伝子、fdhF遺伝子、rpiR遺伝子、rpiB遺伝子、proP遺伝子、basS遺伝子、basR遺伝子、eptA遺伝子、adiC遺伝子、adiY遺伝子、adiA遺伝子、melR遺伝子、melA遺伝子、melB遺伝子、fumB遺伝子、dcuB遺伝子、dcuR遺伝子、dcuS遺伝子、lysU遺伝子、cadA遺伝子、cadB遺伝子、cadC遺伝子、pheU遺伝子、dipZ遺伝子、cutA遺伝子、dcuA遺伝子、aspA遺伝子、fxsA遺伝子、groS遺伝子、groL遺伝子、efp遺伝子、ecnA遺伝子、ecnB遺伝子、sugE遺伝子、blc遺伝子、ampC遺伝子、frdD遺伝子、frdC遺伝子、frdB遺伝子、frdA遺伝子、poxA遺伝子、psd遺伝子、rsgA遺伝子、orn遺伝子、glyV遺伝子、glyX遺伝子、glyY遺伝子、amiB遺伝子、mutL遺伝子、miaA遺伝子、hfq遺伝子、hflX遺伝子、hflK遺伝子、hflC遺伝子、purA遺伝子、rnr遺伝子、rlmB遺伝子、ulaF遺伝子、rpsF遺伝子、priB遺伝子、rpsR遺伝子、rplI遺伝子、fklB遺伝子、cycA遺伝子、cpdB遺伝子、cysQ遺伝子、msrA遺伝子、chpS遺伝子、chpB遺伝子、ppa遺伝子、fbp遺伝子、mpl遺伝子、pmbA遺伝子、cybC遺伝子、nrdG遺伝子、nrdD遺伝子、treC遺伝子、treB遺伝子、treR遺伝子、mgtA遺伝子、pyrI遺伝子、pyrB遺伝子、pyrL遺伝子、argI遺伝子、valS遺伝子、holC遺伝子、pepA遺伝子、idnR遺伝子、idnT遺伝子、idnO遺伝子、idnD遺伝子、idnK遺伝子、leuX遺伝子、dnaC遺伝子、dnaT遺伝子、bglJ遺伝子、fhuF遺伝子、leuV遺伝子、leuP遺伝子、leuQ遺伝子、rsmC遺伝子、holD遺伝子、rimI遺伝子、prfC遺伝子、osmY遺伝子、deoC遺伝子、deoA遺伝子、deoB遺伝子、deoD遺伝子、lplA遺伝子、serB遺伝子、radA遺伝子、nadR遺伝子、slt遺伝子、trpR遺伝子、rob遺伝子、creA遺伝子、creB遺伝子、creC遺伝子、creD遺伝子、arcA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子
を含み、かつ
［２］fhuA遺伝子、fhuC遺伝子、fhuD遺伝子、fhuB遺伝子、yafJ遺伝子、yafK遺伝子、yafQ遺伝子、dinJ遺伝子、yafL遺伝子、yafM遺伝子、fhiA遺伝子、mbhA遺伝子、dinB遺伝子、yafN遺伝子、yafO遺伝子、yafP遺伝子、ykfJ遺伝子、prfH遺伝子、yagP遺伝子、yagQ遺伝子、yagR遺伝子、yagS遺伝子、yagT遺伝子、yagU遺伝子、ykgJ遺伝子、yagV遺伝子、yagW遺伝子、yagX遺伝子、yagY遺伝子、yagZ遺伝子、ykgK遺伝子、ykgL遺伝子、ykgM(JW5034)遺伝子、ykgM(JW5035)遺伝子、eaeH遺伝子、ykgA遺伝子、ykgB遺伝子、ykgI遺伝子、ykgC遺伝子、ykgD遺伝子、ykgE遺伝子、ykgF遺伝子、ykgG遺伝子、ykgH遺伝子、betA遺伝子、betB遺伝子、betI遺伝子、betT遺伝子、yahA遺伝子、yahB遺伝子、yahC遺伝子、yahD遺伝子、yahE遺伝子、yahF遺伝子、yahG遺伝子、yahH遺伝子、yahI遺伝子、yahJ遺伝子、yahK遺伝子、yahL遺伝子、yahM遺伝子、yahN遺伝子、yahO遺伝子、prpR遺伝子、prpB遺伝子、prpC遺伝子、prpD遺伝子、prpE遺伝子、codB遺伝子、codA遺伝子、cynR遺伝子、cynT遺伝子、cynS遺伝子、cynX遺伝子、lacA遺伝子、lacY遺伝子、lacZ遺伝子、lacI遺伝子、mhpR遺伝子、mhpA遺伝子、mhpB遺伝子、mhpC遺伝子、mhpD遺伝子、mhpF遺伝子、mhpE遺伝子、mhpT遺伝子、yaiL遺伝子、frmB遺伝子、frmA遺伝子、frmR遺伝子、yaiO遺伝子、yaiX遺伝子、yaiF遺伝子、yaiP遺伝子、yaiS遺伝子、tauA遺伝子、tauB遺伝子、tauC遺伝子、tauD遺伝子、yaiT遺伝子、yaiU遺伝子、yaiV遺伝子、ampH遺伝子、sbmA遺伝子、yaiW遺伝子、yaiY遺伝子、yaiZ遺伝子、ddlA遺伝子、yaiB遺伝子、phoA遺伝子、psiF遺伝子、yaiC遺伝子、ybbO遺伝子、tesA遺伝子、ybbA遺伝子、ybbP遺伝子、ylbG遺伝子、ybbB遺伝子、ybbS遺伝子、allA遺伝子、allR遺伝子、glxR遺伝子、ybbV遺伝子、ybbW遺伝子、allB遺伝子、ybbY遺伝子、glxK遺伝子、ylbA遺伝子、allC遺伝子、allD遺伝子、fdrA遺伝子、ylbE_1遺伝子、ylbE_2遺伝子、ylbF遺伝子、ybcF遺伝子、envY遺伝子、ybcH遺伝子、nfrA遺伝子、nfrB遺伝子、cusS遺伝子、cusR遺伝子、cusC遺伝子、cusF遺伝子、cusB遺伝子、cusA遺伝子、pheP遺伝子、ybdG遺伝子、nfnB遺伝子、ybdF遺伝子、ybdJ遺伝子、ybdK遺伝子、hokE遺伝子、ybeL遺伝子、ybeQ遺伝子、ybeR遺伝子、djlB遺伝子、ybeT遺伝子、ybeU遺伝子、djlC遺伝子、hscC遺伝子、rihA遺伝子、gltL遺伝子、gltK遺伝子、gltJ遺伝子、gltI遺伝子、kdpF遺伝子、ybfA遺伝子、ybgA遺伝子、phr遺伝子、ybiA遺伝子、dinG遺伝子、ybiB遺伝子、ybiC遺伝子、ybiJ遺伝子、ybiI遺伝子、ybiX遺伝子、fiu遺伝子、ybiM遺伝子、ybiN遺伝子、ybiO遺伝子、glnQ遺伝子、glnP遺伝子、glnH遺伝子、yliA遺伝子、yliB遺伝子、yliC遺伝子、yliD遺伝子、yliE遺伝子、yliF遺伝子、yliG遺伝子、yliH遺伝子、yliI遺伝子、yliJ遺伝子、dacC遺伝子、deoR遺伝子、ybjG遺伝子、ybjC遺伝子、nfsA遺伝子、rimK遺伝子、ybjN遺伝子、potF遺伝子、potG遺伝子、potH遺伝子、potI遺伝子、ybjO遺伝子、rumB遺伝子、artJ遺伝子、artM遺伝子、artQ遺伝子、artI遺伝子、artP遺伝子、ybjP遺伝子、ybjQ遺伝子、ybjR遺伝子、ybjS遺伝子、ybjT遺伝子、ltaE遺伝子、ymcC遺伝子、ymcD遺伝子、cspH遺伝子、cspG遺伝子、ymcE遺伝子、gnsA遺伝子、yccM遺伝子、torS遺伝子、torT遺伝子、torR遺伝子、torC遺伝子、torA遺伝子、torD遺伝子、cbpM遺伝子、cbpA遺伝子、yccE遺伝子、agp遺伝子、yccJ遺伝子、wrbA遺伝子、ymdF遺伝子、ycdG遺伝子、ycdH遺伝子、ycdI遺伝子、rarA遺伝子、ycdK遺伝子、ycdL遺伝子、ycdM遺伝子、ycdC遺伝子、putA遺伝子、putP遺伝子、ycdN_1遺伝子、ycdN_2遺伝子、ycdO遺伝子、ycdB遺伝子、phoH遺伝子、ycdP遺伝子、ycdQ遺伝子、ycdR遺伝子、ycdS遺伝子、ycdT遺伝子、ymdE遺伝子、ycdU遺伝子、elbA遺伝子、ycgX遺伝子、ycgE遺伝子、ycgF遺伝子、ycgZ遺伝子、ymgA遺伝子、ymgB遺伝子、ymgC遺伝子、ycgG遺伝子、ymgF遺伝子、ycgH_1遺伝子、ycgH_2遺伝子、ymgD遺伝子、ymgG遺伝子、ymgH遺伝子、ycgI遺伝子、ydfH遺伝子、ydfZ遺伝子、ydfI遺伝子、ydfJ遺伝子、yecT遺伝子、flhE遺伝子、flhA遺伝子、flhB遺伝子、cheZ遺伝子、cheY遺伝子、cheB遺伝子、cheR遺伝子、tap遺伝子、tar遺伝子、cheW遺伝子、cheA遺伝子、motB遺伝子、motA遺伝子、flhC遺伝子、flhD遺伝子、yecG遺伝子、otsA遺伝子、otsB遺伝子、araH遺伝子、araG遺伝子、araF遺伝子、yecI遺伝子、yecJ遺伝子、isrB遺伝子、yecR遺伝子、ftn遺伝子、yecH遺伝子、tyrP遺伝子、uvrC遺伝子、uvrY遺伝子、yecF遺伝子、sdiA遺伝子、yecC遺伝子、yecS遺伝子、yedO遺伝子、fliY遺伝子、fliZ遺伝子、fliA遺伝子、fliC遺伝子、fliD遺伝子、fliS遺伝子、fliT遺伝子、amyA遺伝子、yedD遺伝子、yedE遺伝子、yedF遺伝子、yedK遺伝子、yedL遺伝子、yedN_2遺伝子、yedN_1遺伝子、yedM遺伝子、intG遺伝子、fliE遺伝子、fliF遺伝子、fliG遺伝子、fliH遺伝子、fliI遺伝子、fliJ遺伝子、fliK遺伝子、fliL遺伝子、fliM遺伝子、fliN遺伝子、fliO遺伝子、fliP遺伝子、fliQ遺伝子、fliR遺伝子、rcsA遺伝子、dsrB遺伝子、yodD遺伝子、yedA遺伝子、vsr遺伝子、dcm遺伝子、yedJ遺伝子、yedR遺伝子、yedS_1遺伝子、yedS_2遺伝子、yedS_3遺伝子、hchA遺伝子、yedV遺伝子、yedW遺伝子、yedX遺伝子、yedY遺伝子、yedZ遺伝子、yodA遺伝子、wbbL_2遺伝子、wbbL_1遺伝子、wbbK遺伝子、wbbJ遺伝子、wbbI遺伝子、wbbH遺伝子、glf遺伝子、rfbX遺伝子、rfbC遺伝子、rfbA遺伝子、rfbD遺伝子、rfbB遺伝子、yegE遺伝子、alkA遺伝子、yegD遺伝子、yegI遺伝子、yegJ遺伝子、yegK遺伝子、yegL遺伝子、ryeC遺伝子、ryeD遺伝子、mdtA遺伝子、mdtB遺伝子、mdtC遺伝子、mdtD遺伝子、baeS遺伝子、baeR遺伝子、yegP遺伝子、yegQ遺伝子、ryeE遺伝子、ogrK遺伝子、yegZ遺伝子、yegR遺伝子、yegS遺伝子、gatR_1遺伝子、gatR_2遺伝子、gatD遺伝子、gatC遺伝子、gatB遺伝子、gatA遺伝子、gatZ遺伝子、gatY遺伝子、fbaB遺伝子、yegT遺伝子、yegU遺伝子、yegV遺伝子、yegW遺伝子、yegX遺伝子、molR_1遺伝子、molR_2遺伝子、molR_3遺伝子、yehI遺伝子、yehK遺伝子、yehL遺伝子、yehM遺伝子、yehP遺伝子、yehQ遺伝子、yehR遺伝子、yehS遺伝子、yehT遺伝子、yehU遺伝子、mlrA遺伝子、yohO遺伝子、yehW遺伝子、yehX遺伝子、yehY遺伝子、yehZ遺伝子、bglX遺伝子、dld遺伝子、pbpG遺伝子、yohC遺伝子、yeiI遺伝子、yeiJ遺伝子、rihB遺伝子、yeiL遺伝子、yeiM遺伝子、yeiN遺伝子、yeiC遺伝子、elaB遺伝子、elaA遺伝子、elaC遺伝子、elaD遺伝子、yfbK遺伝子、yfbL遺伝子、yfbM遺伝子、yfbN遺伝子、yfbO遺伝子、yfbP遺伝子、yfcC遺伝子、yfcD遺伝子、yfcE遺伝子、yfcF遺伝子、yfcG遺伝子、folX遺伝子、yfcH遺伝子、yfcI遺伝子、hisP遺伝子、hisM遺伝子、hisQ遺伝子、hisJ遺伝子、argT遺伝子、ypdA遺伝子、ypdB遺伝子、ypdC遺伝子、ypdD遺伝子、ypdE遺伝子、ypdF遺伝子、ypdG遺伝子、ypdH遺伝子、pinH遺伝子、ypjB遺伝子、ypjC遺伝子、ileY遺伝子、ygaQ遺伝子、ygaR遺伝子、yqaC遺伝子、yqaD遺伝子、ygaT遺伝子、csiR遺伝子、ygaU遺伝子、yqaE遺伝子、ygaV遺伝子、ygaP遺伝子、stpA遺伝子、ygaW遺伝子、ygaC遺伝子、ygaM遺伝子、nrdH遺伝子、nrdI遺伝子、nrdE遺伝子、proV遺伝子、proW遺伝子、proX遺伝子、ygaX遺伝子、ygaY遺伝子、ygaZ遺伝子、ygaH遺伝子、srlA遺伝子、srlE遺伝子、srlB遺伝子、srlD遺伝子、gutM遺伝子、srlR遺伝子、gutQ遺伝子、yqeG遺伝子、yqeH遺伝子、yqeI遺伝子、yqeJ遺伝子、yqeK遺伝子、ygeF遺伝子、ygeG遺伝子、ygeH遺伝子、ygeI遺伝子、pbl遺伝子、ygeK遺伝子、ygeL遺伝子、ygeM遺伝子、ygeN遺伝子、ygeO遺伝子、ygeP遺伝子、ygeQ遺伝子、glyU遺伝子、ygeR遺伝子、xdhA遺伝子、xdhB遺伝子、xdhC遺伝子、ygeV遺伝子、ygeW遺伝子、ygeX遺伝子、ygeY遺伝子、hyuA遺伝子、yqeA遺伝子、yqeB遺伝子、yqeC遺伝子、ygfJ遺伝子、ygfK遺伝子、ssnA遺伝子、ygfM遺伝子、xdhD遺伝子、ygfO遺伝子、guaD遺伝子、ygfQ遺伝子、ygfS遺伝子、ygfT遺伝子、ygfU遺伝子、idi遺伝子、cmtA遺伝子、cmtB遺伝子、yghD遺伝子、yghE遺伝子、yghF遺伝子、yghG遺伝子、pppA遺伝子、yghJ遺伝子、yghK遺伝子、glcB遺伝子、glcG遺伝子、glcF遺伝子、glcE遺伝子、glcD遺伝子、glcC遺伝子、yghO遺伝子、yghQ遺伝子、yghR遺伝子、yghS遺伝子、yghT遺伝子、ygiS遺伝子、ygiT遺伝子、ygiU遺伝子、ygiV遺伝子、ygiW遺伝子、qseB遺伝子、qseC遺伝子、ygiZ遺伝子、mdaB遺伝子、ygiN遺伝子、gltF遺伝子、yhcA遺伝子、yhcD遺伝子、yhcE遺伝子、yhcF遺伝子、yhcG遺伝子、yhcH遺伝子、nanK遺伝子、nanE遺伝子、yhdJ遺伝子、yhdU遺伝子、envR遺伝子、acrE遺伝子、acrF遺伝子、yhdV遺伝子、yhdW遺伝子、yhdX遺伝子、yhdY遺伝子、yijP遺伝子、yijO遺伝子、frwD遺伝子、pflC遺伝子、pflD遺伝子、frwB遺伝子、frwC遺伝子、ptsA遺伝子、rhaT遺伝子、rhaR遺伝子、rhaS遺伝子、rhaB遺伝子、rhaA遺伝子、rhaD遺伝子、yiiL遺伝子、frvA遺伝子、frvB遺伝子、frvX遺伝子、frvR遺伝子、yiiG遺伝子、yiiF遺伝子、yiiE遺伝子、yiiD遺伝子、dtd遺伝子、rbn遺伝子、yihX遺伝子、yihW遺伝子、yihV遺伝子、yihU遺伝子、yihT遺伝子、yihS遺伝子、yihR遺伝子、yihQ遺伝子、yihP遺伝子、yihO遺伝子、ompL遺伝子、yihN遺伝子、yihM遺伝子、yihL遺伝子、hsrA遺伝子、rbsR遺伝子、rbsK遺伝子、rbsB遺伝子、rbsC遺伝子、rbsA遺伝子、rbsD遺伝子、trkD遺伝子、yieN遺伝子、yieM遺伝子、asnA遺伝子、yidB遺伝子、yidA遺伝子、yidX遺伝子、dgoR遺伝子、dgoK遺伝子、dgoA遺伝子、dgoD遺伝子、dgoT遺伝子、cbrA遺伝子、yidR遺伝子、yidQ遺伝子、yidE遺伝子、yidP遺伝子、glvC遺伝子、glvB遺伝子、glvG遺伝子、ysdC遺伝子、yidL遺伝子、yidK遺伝子、yidJ遺伝子、yidI遺伝子、yidH遺伝子、yidG遺伝子、yidF遺伝子、yhiN遺伝子、yhiM遺伝子、yhiL遺伝子、yhiK遺伝子、yhiJ遺伝子、yhiI遺伝子、rbbA遺伝子、yhhJ遺伝子、chiA遺伝子、bfd遺伝子、bfr遺伝子、gspO遺伝子、gspM遺伝子、gspL遺伝子、gspK遺伝子、gspJ遺伝子、gspI遺伝子、gspH遺伝子、gspG遺伝子、gspF遺伝子、gspE遺伝子、gspD遺伝子、gspC遺伝子、gspA遺伝子、pioO遺伝子、yjbE遺伝子、yjbF遺伝子、yjbG遺伝子、yjbH遺伝子、yjbA遺伝子、xylE遺伝子、malG遺伝子、malF遺伝子、malE遺伝子、malK遺伝子、lamB遺伝子、malM遺伝子、yjbI遺伝子、yjcP遺伝子、yjcQ遺伝子、yjcR遺伝子、yjcS遺伝子、alsK遺伝子、alsE遺伝子、alsC遺伝子、alsA遺伝子、alsB遺伝子、yjdP遺伝子、phnP遺伝子、phnO遺伝子、phnN遺伝子、phnM遺伝子、phnL遺伝子、phnK遺伝子、phnJ遺伝子、phnI遺伝子、phnH遺伝子、phnG遺伝子、phnF遺伝子、phnE(JW4064)遺伝子、phnE(JW4065)遺伝子、phnD遺伝子、phnC遺伝子、phnB遺伝子、phnA遺伝子、yjdA遺伝子、yjcZ遺伝子、yjfI遺伝子、yjfJ遺伝子、yjfK遺伝子、yjfL遺伝子、yjfM遺伝子、yjfC遺伝子、aidB遺伝子、yjfN遺伝子、yjfO遺伝子、yjfP遺伝子、ulaR遺伝子、ulaG遺伝子、ulaA遺伝子、ulaB遺伝子、ulaC遺伝子、ulaD遺伝子、ulaE遺伝子、yjhS遺伝子、yjhT遺伝子、yjhA遺伝子、fimB遺伝子、fimE遺伝子、fimA遺伝子、fimI遺伝子、fimC遺伝子、fimD遺伝子、fimF遺伝子、fimG遺伝子、fimH遺伝子、gntP遺伝子、uxuA遺伝子、uxuB遺伝子、uxuR遺伝子、yjiC遺伝子、yjiD遺伝子、yjiE遺伝子、iadA遺伝子、yjiG遺伝子、yjiH遺伝子、kptA遺伝子、yjiJ遺伝子、yjiK遺伝子、yjiL遺伝子、yjiM遺伝子、yjiN遺伝子、yjiO遺伝子、yjiP遺伝子、yjiQ遺伝子、yjiR遺伝子、yjiS遺伝子、yjiT遺伝子、yjiV遺伝子、mcrC遺伝子、mcrB遺伝子、yjiW遺伝子、hsdS遺伝子、hsdM遺伝子、hsdR遺伝子、mrr遺伝子、yjiA遺伝子、yjiX遺伝子、yjiY遺伝子、tsr遺伝子、yjiZ遺伝子、yjjM遺伝子、yjjN遺伝子、mdoB遺伝子、yjjA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子
を含まず、かつ野生型の大腸菌より１０４０ｋｂｐ以上短い染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体、であれば野生型の大腸菌の染色体ＤＮＡ上に存在する上記[２]以外のいずれの遺伝子を含む染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体でもよく、上記［１］以外のいずれの遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体でもよい。ただし、上記［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子中に、野生型の大腸菌が元来有していない遺伝子（以下、ＮＣ遺伝子という）がある場合は、該野生型の大腸菌に由来する上記大腸菌の変異体の染色体ＤＮＡはＮＣ遺伝子を含まなくてもよい。
　本発明の大腸菌の変異体としては、好ましくは表１および配列番号１で表される塩基配列中の上記［１］の遺伝子の塩基配列からなるＤＮＡまたは該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含み、かつchpA遺伝子の塩基配列からなるＤＮＡまたは該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まず、さらに
［３］chpA遺伝子、uspG遺伝子、ybdR遺伝子、rnk遺伝子、rna遺伝子、citT遺伝子、citG遺伝子、citX遺伝子、citF遺伝子、citE遺伝子、citD遺伝子、citC遺伝子、citA遺伝子、citB遺伝子、dcuC遺伝子、crcA遺伝子、cspE遺伝子、crcB遺伝子、ybeH遺伝子、ybeM遺伝子、yqcA遺伝子、yqcB遺伝子、yqcC遺伝子、syd遺伝子、yqcD遺伝子、ygdH遺伝子、sdaC遺伝子、sdaB遺伝子、exo遺伝子、fucO遺伝子、fucA遺伝子、fucP遺伝子、fucI遺伝子、fucK遺伝子、fucU遺伝子、fucR遺伝子、ygdE遺伝子、ygdD遺伝子、gcvA遺伝子、ygdI遺伝子、csdA遺伝子、ygdK遺伝子、araD遺伝子、araA遺伝子、araB遺伝子、araC遺伝子、yabI遺伝子、thiQ遺伝子、thiP遺伝子、tbpA遺伝子、sgrR遺伝子、setA遺伝子、yhfZ遺伝子、yhfY遺伝子、yhfX遺伝子、yhfW遺伝子、php遺伝子、yhfU遺伝子、yhfT遺伝子、yhfS遺伝子、frlR遺伝子、frlD遺伝子、frlC遺伝子、frlB遺伝子、frlA遺伝子、yhfL遺伝子、pncA遺伝子、ydjE遺伝子、ydjF遺伝子、ydjG遺伝子、ydjH遺伝子、ydjI遺伝子、ydjJ遺伝子、ydjK遺伝子、ydjL遺伝子、yeaC遺伝子、yeaA遺伝子、ade遺伝子、yicO遺伝子、yicN遺伝子、yicM遺伝子、yicS遺伝子、nlpA遺伝子、yicL遺伝子、setC遺伝子、ygjI遺伝子、ygjJ遺伝子、ygjK遺伝子、fadH遺伝子、ygjM遺伝子、ygjN遺伝子、ygjO遺伝子、ygjP遺伝子、ygjQ遺伝子、ygjR遺伝子、alx遺伝子、sstT遺伝子、ygjV遺伝子、yrhB遺伝子、yrhA遺伝子、yhhZ遺伝子、yhhY遺伝子、yhhX遺伝子、yhhW遺伝子、yeaK遺伝子、yoaI遺伝子、yeaL遺伝子、yeaM遺伝子、yeaN遺伝子、yeaO遺伝子、yoaF遺伝子、yeaP遺伝子、yeaQ遺伝子、yoaG遺伝子、yeaR遺伝子、yeaS遺伝子、yeaT遺伝子、yeaU遺伝子、yeaV遺伝子、yeaW遺伝子、yeaX遺伝子、hyfA遺伝子、hyfB遺伝子、hyfC遺伝子、hyfD遺伝子、hyfE遺伝子、hyfF遺伝子、hyfG遺伝子、hyfH遺伝子、hyfI遺伝子、hyfJ遺伝子、hyfR遺伝子、focB遺伝子、またはそれらの相同遺伝子
の遺伝子の塩基配列からなるＤＮＡまたは該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体、さらに好ましくは、
（２）配列番号１で表される塩基配列中の以下の［１］～［８３］記載の塩基配列からなるＤＮＡ、
［１］1番～15298番目で表される塩基配列
［２］16751番～19620番目で表される塩基配列
［３］20815番～65857番目で表される塩基配列
［４］78797番～167400番目で表される塩基配列
［５］173316番～244300番目で表される塩基配列
［６］253747番～262299番目で表される塩基配列
［７］387868番～389474番目で表される塩基配列
［８］404040番～518365番目で表される塩基配列
［９］533048番～535840番目で表される塩基配列
［１０］550552番～564276番目で表される塩基配列
［１１］608455番～640668番目で表される塩基配列
［１２］659193番～675439番目で表される塩基配列
［１３］689711番～729156番目で表される塩基配列
［１４］739930番～832888番目で表される塩基配列
［１５］848427番～867974番目で表される塩基配列
［１６］883811番～891334番目で表される塩基配列
［１７］909717番～1049224番目で表される塩基配列
［１８］1097358番～1105534番目で表される塩基配列
［１９］1106991番～1196528番目で表される塩基配列
［２０］1225485番～1295721番目で表される塩基配列
［２１］1297023番～1300822番目で表される塩基配列
［２２］1302896番～1397636番目で表される塩基配列
［２３］1399079番～1413662番目で表される塩基配列
［２４］1436899番～1469664番目で表される塩基配列
［２５］1472404番～1504839番目で表される塩基配列
［２６］1506619番～1528866番目で表される塩基配列
［２７］1534766番～1630050番目で表される塩基配列
［２８］1654610番～1853604番目で表される塩基配列
［２９］1864144番～1875287番目で表される塩基配列
［３０］1888500番～1963662番目で表される塩基配列
［３１］1992215番～1995800番目で表される塩基配列
［３２］2027349番～2032587番目で表される塩基配列
［３３］2043516番～2068287番目で表される塩基配列
［３４］2081066番～2103531番目で表される塩基配列
［３５］2115204番～2145402番目で表される塩基配列
［３６］2186995番～2199807番目で表される塩基配列
［３７］2228990番～2255033番目で表される塩基配列
［３８］2262631番～2292234番目で表される塩基配列
［３９］2293834番～2324498番目で表される塩基配列
［４０］2322075番～2411311番目で表される塩基配列
［４１］2413007番～2422503番目で表される塩基配列
［４２］2433238番～2471990番目で表される塩基配列
［４３］2482140番～2504213番目で表される塩基配列
［４４］2513697番～2519690番目で表される塩基配列
［４５］2521089番～2599856番目で表される塩基配列
［４６］2613439番～2754814番目で表される塩基配列
［４７］2788619番～2794311番目で表される塩基配列
［４８］2800029番～2803445番目で表される塩基配列
［４９］2809286番～2824451番目で表される塩基配列
［５０］2829399番～2909409番目で表される塩基配列
［５１］2909710番～2921193番目で表される塩基配列
［５２］2943639番～2984497番目で表される塩基配列
［５３］3032267番～3076223番目で表される塩基配列
［５４］3078056番～3109245番目で表される塩基配列
［５５］3133480番～3164769番目で表される塩基配列
［５６］3172082番～3184621番目で表される塩基配列
［５７］3186056番～3224889番目で表される塩基配列
［５８］3240401番～3261074番目で表される塩基配列
［５９］3262220番～3361080番目で表される塩基配列
［６０］3370892番～3411501番目で表される塩基配列
［６１］3421222番～3486426番目で表される塩基配列
［６２］3496906番～3536155番目で表される塩基配列
［６３］3549687番～3556477番目で表される塩基配列
［６４］3576239番～3697304番目で表される塩基配列
［６５］3709527番～3742812番目で表される塩基配列
［６６］3744293番～3748980番目で表される塩基配列
［６７］3747997番～3750486番目で表される塩基配列
［６８］3751906番～3762908番目で表される塩基配列
［６９］3772817番～3774086番目で表される塩基配列
［７０］3785257番～3794687番目で表される塩基配列
［７１］3803459番～3868134番目で表される塩基配列
［７２］3878460番～3918087番目で表される塩基配列
［７３］3919815番～3986454番目で表される塩基配列
［７４］3988342番～4003004番目で表される塩基配列
［７５］4021347番～4055371番目で表される塩基配列
［７６］4061466番～4128290番目で表される塩基配列
［７７］4141016番～4170562番目で表される塩基配列
［７８］4186909番～4239493番目で表される塩基配列
［７９］4255871番～4303000番目で表される塩基配列
［８０］4316735番～4318540番目で表される塩基配列
［８１］4334946番～4414758番目で表される塩基配列
［８２］4428378番～4501437番目で表される塩基配列
［８３］4604873番～4646332番目で表される塩基配列
またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含む染色体ＤＮＡを有する上記（１）の大腸菌の変異体、
（３）uspG遺伝子、ybdR遺伝子、rnk遺伝子、rna遺伝子、citT遺伝子、citG遺伝子、citX遺伝子、citF遺伝子、citE遺伝子、citD遺伝子、citC遺伝子、citA遺伝子、citB遺伝子、dcuC遺伝子、crcA遺伝子、cspE遺伝子、crcB遺伝子、ybeH遺伝子、およびybeM遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まず、かつchpA遺伝子またはその相同遺伝子を含む染色体ＤＮＡを有する上記（１）または（２）の大腸菌の変異体、
（４）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号640669番～659192番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（３）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（５）yqcA遺伝子、yqcB遺伝子、yqcC遺伝子、syd遺伝子、yqcD遺伝子、ygdH遺伝子、sdaC遺伝子、sdaB遺伝子、exo遺伝子、fucO遺伝子、fucA遺伝子、fucP遺伝子、fucI遺伝子、fucK遺伝子、fucU遺伝子、fucR遺伝子、ygdE遺伝子、ygdD遺伝子、gcvA遺伝子、ygdI遺伝子、csdA遺伝子、およびygdK遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（４）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（６）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号2921194番～2943638番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（５）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（７）araD遺伝子、araA遺伝子、araB遺伝子、araC遺伝子、yabI遺伝子、thiQ遺伝子、thiP遺伝子、tbpA遺伝子、sgrR遺伝子、およびsetA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（６）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（８）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号65858番～78796番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（７）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（９）yhfZ遺伝子、yhfY遺伝子、yhfX遺伝子、yhfW遺伝子、php遺伝子、yhfU遺伝子、yhfT遺伝子、yhfS遺伝子、frlR遺伝子、frlD遺伝子、frlC遺伝子、frlB遺伝子、frlA遺伝子、およびyhfL遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（８）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１０）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号4128291番～4141015番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（９）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１１）pncA遺伝子、ydjE遺伝子、ydjF遺伝子、ydjG遺伝子、ydjH遺伝子、ydjI遺伝子、ydjJ遺伝子、ydjK遺伝子、ydjL遺伝子、yeaC遺伝子、およびyeaA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（１０）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１２）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号1853605番～1864143番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（１１）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１３）ade遺伝子、yicO遺伝子、yicN遺伝子、yicM遺伝子、yicS遺伝子、nlpA遺伝子、yicL遺伝子、およびsetC遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（１２）のいずれか１つ大腸菌の変異体、
（１４）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号3794688番～3803458番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（１３）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１５）ygjI遺伝子、ygjJ遺伝子、ygjK遺伝子、fadH遺伝子、ygjM遺伝子、ygjN遺伝子、ygjO遺伝子、ygjP遺伝子、ygjQ遺伝子、ygjR遺伝子、alx遺伝子、sstT遺伝子、およびygjV遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（１４）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１６）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号3224890番～3240400番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（１５）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１７）yrhB遺伝子、yrhA遺伝子、yhhZ遺伝子、yhhY遺伝子、yhhX遺伝子、およびyhhW遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（１６）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１８）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号4055372番～4061465番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（１７）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（１９）yeaK遺伝子、yoaI遺伝子、yeaL遺伝子、yeaM遺伝子、yeaN遺伝子、yeaO遺伝子、yoaF遺伝子、yeaP遺伝子、yeaQ遺伝子、yoaG遺伝子、yeaR遺伝子、yeaS遺伝子、yeaT遺伝子、yeaU遺伝子、yeaV遺伝子、yeaW遺伝子、およびyeaX遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（１８）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（２０）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号1875288番～1888499番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（１９）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（２１）hyfA遺伝子、hyfB遺伝子、hyfC遺伝子、hyfD遺伝子、hyfE遺伝子、hyfF遺伝子、hyfG遺伝子、hyfH遺伝子、hyfI遺伝子、hyfJ遺伝子、hyfR遺伝子、およびfocB遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（２０）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
（２２）配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号2599857番～2613438番目で表される塩基配列からなるＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する上記（１）～（２１）のいずれか１つの大腸菌の変異体、
をあげることができる。　　
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000001
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000002
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000003
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000004
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000005
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000006
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000007
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000008
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000009
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000010
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000011
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000012
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000013
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000014
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000015
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000016
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000017
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000018
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000019
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000020
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000021
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000022
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000023
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000024
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000025
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000026
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000027
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000028
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000029
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000030
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000031
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000032
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000033
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000034
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000035
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000036
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000037
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000038
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000039
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000040
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000041
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000042
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000043
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000044
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000045
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000046
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000047
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000048
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000049
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000050
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000051
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000052
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000053
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000054
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000055
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000056
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000057
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000058
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000059
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000060
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000061
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000062
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000063
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000064
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000065
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000066
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000067
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000068
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000069
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000070
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000071
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000072
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000073
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000074
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000075
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000076
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000077
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000078
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000079
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000080
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000081
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000082
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000083
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000084
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000085
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000086
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000087
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000088
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000089
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000090
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000091
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000092
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000093
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000094
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000095
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000096
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000097
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000098
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000099
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000100
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000101
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000102
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000103
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000104
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000105
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000106
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000107
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000108
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000109
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000110
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000111
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000112
　また、
（２３）（１）の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子を含み、かつ（１）の［２］記載の遺伝子および以下の［３］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子の１０％以下を含む染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体、
［３］chpA遺伝子、uspG遺伝子、ybdR遺伝子、rnk遺伝子、rna遺伝子、citT遺伝子、citG遺伝子、citX遺伝子、citF遺伝子、citE遺伝子、citD遺伝子、citC遺伝子、citA遺伝子、citB遺伝子、dcuC遺伝子、crcA遺伝子、cspE遺伝子、crcB遺伝子、ybeH遺伝子、ybeM遺伝子、yqcA遺伝子、yqcB遺伝子、yqcC遺伝子、syd遺伝子、yqcD遺伝子、ygdH遺伝子、sdaC遺伝子、sdaB遺伝子、exo遺伝子、fucO遺伝子、fucA遺伝子、fucP遺伝子、fucI遺伝子、fucK遺伝子、fucU遺伝子、fucR遺伝子、ygdE遺伝子、ygdD遺伝子、gcvA遺伝子、ygdI遺伝子、csdA遺伝子、ygdK遺伝子、araD遺伝子、araA遺伝子、araB遺伝子、araC遺伝子、yabI遺伝子、thiQ遺伝子、thiP遺伝子、tbpA遺伝子、sgrR遺伝子、setA遺伝子、yhfZ遺伝子、yhfY遺伝子、yhfX遺伝子、yhfW遺伝子、php遺伝子、yhfU遺伝子、yhfT遺伝子、yhfS遺伝子、frlR遺伝子、frlD遺伝子、frlC遺伝子、frlB遺伝子、frlA遺伝子、yhfL遺伝子、pncA遺伝子、ydjE遺伝子、ydjF遺伝子、ydjG遺伝子、ydjH遺伝子、ydjI遺伝子、ydjJ遺伝子、ydjK遺伝子、ydjL遺伝子、yeaC遺伝子、yeaA遺伝子、ade遺伝子、yicO遺伝子、yicN遺伝子、yicM遺伝子、yicS遺伝子、nlpA遺伝子、yicL遺伝子、setC遺伝子、ygjI遺伝子、ygjJ遺伝子、ygjK遺伝子、fadH遺伝子、ygjM遺伝子、ygjN遺伝子、ygjO遺伝子、ygjP遺伝子、ygjQ遺伝子、ygjR遺伝子、alx遺伝子、sstT遺伝子、ygjV遺伝子、yrhB遺伝子、yrhA遺伝子、yhhZ遺伝子、yhhY遺伝子、yhhX遺伝子、yhhW遺伝子、yeaK遺伝子、yoaI遺伝子、yeaL遺伝子、yeaM遺伝子、yeaN遺伝子、yeaO遺伝子、yoaF遺伝子、yeaP遺伝子、yeaQ遺伝子、yoaG遺伝子、yeaR遺伝子、yeaS遺伝子、yeaT遺伝子、yeaU遺伝子、yeaV遺伝子、yeaW遺伝子、yeaX遺伝子、hyfA遺伝子、hyfB遺伝子、hyfC遺伝子、hyfD遺伝子、hyfE遺伝子、hyfF遺伝子、hyfG遺伝子、hyfH遺伝子、hyfI遺伝子、hyfJ遺伝子、hyfR遺伝子、focB遺伝子
もまた、本発明の大腸菌の変異体である。
　さらに、本発明の大腸菌の変異体としては、
（２４）以下の［１］～［５］から選ばれる方法によって改変して得られる上記（１）～（２３）のいずれか１つの大腸菌の変異体を、以下の［１］～［５］から選ばれる方法によって改変して得られる大腸菌の変異体、
［１］有用物質の生合成を制御する機構の少なくとも１つを緩和または解除する方法
［２］有用物質の生合成に関与する酵素の少なくとも１つを発現強化する方法
［３］有用物質の生合成に関与する酵素遺伝子の少なくとも１つのコピー数を増加させる方法
［４］有用物質の生合成経路から該有用物質以外の代謝産物へ分岐する代謝経路の少なくとも１つを弱化または遮断する方法
［５］野生型の大腸菌に比べ、有用物質のアナログに対する耐性度が高い細胞株を選択する方法
をあげることができる。
　上記（１）～（２３）の大腸菌の変異体は、有用物質の生合成に直接関与はしないが間接的に該有用物質の生成を抑制している蛋白質をコードする遺伝子の一部または全部が欠損していると考えられる。該変異体および上記（２４）の変異体は有用物質を生産する大腸菌の変異体として有用である。
　本発明の大腸菌の変異体は、大腸菌に属していればいずれの大腸菌の変異体であってもよく、好ましくは、大腸菌K-12株、大腸菌Ｂ株および大腸菌Ｗ株の変異体、より好ましくは大腸菌K-12株の変異体、さらに好ましくは大腸菌W3110株（ATCC27325）および大腸菌MG1655株（ATCC47076）の変異体、特に好ましくは大腸菌W3110株（ATCC27325）をあげることができる。
２．本発明の大腸菌の変異体の製造方法
　本発明の大腸菌の変異体は、該変異体を取得できる方法であれば、その取得方法に制限はないが、例えば以下に示す大腸菌の染色体ＤＮＡ上の特定の遺伝子またはＤＮＡを欠損させる方法により取得することができる。
　大腸菌の染色体ＤＮＡ上の遺伝子またはＤＮＡを欠損させる方法としては、相同組換えを利用した方法をあげることができる。一般的な相同組換えを利用した方法としては、大腸菌の染色体ＤＮＡ上において欠損させたい遺伝子またはＤＮＡの両外側に存在するＤＮＡ断片を、該大腸菌内では自律複製できない薬剤耐性遺伝子を有するプラスミドＤＮＡと連結して作製できる相同組換え用プラスミドを用いる方法をあげることができる。
　該相同組換え用プラスミドを常法により大腸菌内に導入した後、薬剤耐性を指標にして相同組換えによって染色体ＤＮＡ上に該相同組換え用プラスミドが組込まれた形質転換株を選択する。得られた形質転換株を該薬剤を含有しない培地で数時間～1日間培養した後、該薬剤含有寒天培地、および該薬剤非含有寒天培地に塗布し、前者の培地で生育せず、後者の培地で生育できる株を選択することで、染色体ＤＮＡ上において２回目の相同組換えが生じた株を取得することができる。染色体ＤＮＡ上の欠損させたい遺伝子またはＤＮＡが存在していた領域の塩基配列を決定することで、染色体ＤＮＡ上の目的遺伝子またはＤＮＡが欠損したことを確認することができる。
　また、複数の遺伝子に効率よく塩基の欠失、置換または付加を導入する相同組換えを利用した方法としては、直鎖ＤＮＡを用いた方法をあげることができる。
　具体的には、染色体ＤＮＡ上において欠損させたい遺伝子またはＤＮＡの両外側に存在するＤＮＡ断片を含有する直鎖ＤＮＡを細胞内に取り込ませ、染色体ＤＮＡと導入した直鎖ＤＮＡとの間で相同組換えを起こさせる方法である。本方法は、直鎖ＤＮＡを効率よく取り込む大腸菌であれば、いずれの微生物にも適用でき、好ましくはλファージ由来の組換えタンパク質群（Ｒｅｄ組換え系）を発現している大腸菌をあげることができる。
　λＲｅｄ組換え系を発現している大腸菌としては、λＲｅｄ組換え系遺伝子を有するプラスミドＤＮＡであるpKD46［エシェリヒア・コリ ジェネティック ストック センター（米国エール大学）より入手可能］を保有する大腸菌 JM101株等をあげることができる。
　相同組換えに用いられるＤＮＡとしては、
（ａ）塩基の欠失、置換または付加の導入対象である染色体ＤＮＡ上の領域の両外側に存在するＤＮＡまたは該ＤＮＡと相同性を有するＤＮＡを、薬剤耐性遺伝子の両端に有する直鎖ＤＮＡ、
（ｂ）塩基の欠失、置換または付加の導入対象である染色体ＤＮＡ上の領域の両外側に存在するＤＮＡまたは該ＤＮＡと相同性を有するＤＮＡを直接連結した直鎖ＤＮＡ、
（ｃ）塩基の欠失、置換または付加の導入対象である染色体ＤＮＡ上の領域の両外側に存在するＤＮＡまたは該ＤＮＡと相同性を有するＤＮＡを、薬剤耐性遺伝子およびネガティブセレクションに用いることができる遺伝子の両端に有する直鎖ＤＮＡ、
（ｄ）上記（ａ）の直鎖ＤＮＡにおいて、薬剤耐性遺伝子と染色体ＤＮＡ上の領域の両外側に存在するＤＮＡまたは該ＤＮＡと相同性を有するＤＮＡの間に、さらに酵母由来のFlp recombinase［Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 82, 5875 (1985)］が認識する塩基配列を有するＤＮＡ、
をあげることができる。
　薬剤耐性遺伝子としては、大腸菌が感受性を示す薬剤に対し、薬剤耐性を付与する薬剤耐性遺伝子であれば、いずれの薬剤耐性遺伝子も使用することができる。該薬剤耐性遺伝子としては、例えば、カナマイシン耐性遺伝子、クロラムフェニコール耐性遺伝子、ゲンタマイシン耐性遺伝子、スペクチノマイシン耐性遺伝子、テトラサイクリン耐性遺伝子およびアンピシリン耐性遺伝子等をあげることができる。
　ネガティブセレクションに用いることができる遺伝子とは、大腸菌で該遺伝子を発現させたとき、一定培養条件下においては、該大腸菌に致死的である遺伝子のことをいい、該遺伝子としては例えば、バチルス属に属する微生物由来のsacB遺伝子［Appl. Environ. Microbiol., 59, 1361-1366（1993）］、およびエシェリヒア属に属する微生物由来のrpsL遺伝子［Genomics, 72, 99-104(2001)］等をあげることができる。
　上記の直鎖ＤＮＡの両末端に存在する、染色体ＤＮＡ上の置換または欠失の導入対象となる領域の両端の外側に位置するＤＮＡまたは該ＤＮＡと相同性を有するＤＮＡは、直鎖ＤＮＡにおいて、染色体ＤＮＡ上の方向と同じ方向に配置され、その長さは１０ｂｐ～１００ｂｐ程度が好ましく、２０ｂｐ～５０ｂｐ程度がより好ましく、３０～４０ｂｐ程度がさらに好ましい。
　酵母由来のFlp recombinaseが認識する塩基配列は、該蛋白質が認識し、相同組換えを触媒する塩基配列であれば、酵母由来のFlp recombinaseが認識し、相同組換えを触媒する塩基配列を有する塩基配列でもよい。
　相同性を有するＤＮＡとは、上記直鎖ＤＮＡが、染色体ＤＮＡ上の目的とする領域において、相同組換えが起こる程度の同一性を有するＤＮＡのことであり、具体的な相同性としては、８０％以上、好ましくは９０％以上、より好ましくは９５％以上、さらに好ましくは１００％の相同性を有するＤＮＡをあげることができる。
　上記塩基配列の相同性は、上記したBLASTやFASTA等のプログラムを用いて決定することができる。
　上記直鎖ＤＮＡ断片は、ＰＣＲにより作製することができる。また上記直鎖ＤＮＡを含むＤＮＡをプラスミド上にて構築した後、制限酵素処理にて目的の直鎖ＤＮＡを得ることもできる。
　大腸菌の染色体ＤＮＡに塩基の欠失、置換または付加を導入する方法としては、以下の方法１～４があげられる。
方法１：上記（ａ）または（ｄ）の直鎖ＤＮＡを宿主微生物に導入し、薬剤耐性を指標に該直鎖ＤＮＡが染色体ＤＮＡ上に相同組換えにより挿入された形質転換株を選択する方法。
方法２：上記方法１により取得された形質転換株に、塩基の欠失、置換または付加の導入対象である染色体ＤＮＡ上の領域の両外側に存在するＤＮＡまたは該ＤＮＡと相同性を有するＤＮＡを直接連結したＤＮＡを導入し、該方法により染色体ＤＮＡ上に挿入された薬剤遺伝子を削除することにより、微生物の染色体ＤＮＡ上の領域を置換または欠失させる方法。
方法３：　
［１］上記（ｃ）の直鎖ＤＮＡを宿主微生物に導入し、薬剤耐性を指標に該直鎖ＤＮＡが染色体ＤＮＡ上に相同組換えにより挿入された形質転換株を選択する、
［２］染色体ＤＮＡ上の置換または欠失の対象領域の両端の外側に位置するＤＮＡと相同性を有するＤＮＡを、染色体ＤＮＡ上における方向と同一の方向で連結したＤＮＡを合成し、上記［１］で得られた形質転換株に導入する、
［３］ネガティブセレクションに用いることができる遺伝子が発現する条件下において、上記［２］の操作を行った形質転換株を培養し、該培養において生育可能な株を、薬剤耐性遺伝子およびネガティブセレクションに用いることができる遺伝子が染色体ＤＮＡ上から削除された株として選択する方法。
方法４：
［１］上記（ｄ）の直鎖ＤＮＡを宿主微生物に導入し、薬剤耐性を指標に該直鎖ＤＮＡが染色体ＤＮＡ上に相同組換えにより挿入された形質転換株を選択する、
［２］上記［１］で得られた形質転換株にFlp recombinase遺伝子発現プラスミドを導入し、該遺伝子を発現させた後、上記［１］で用いた薬剤に感受性である株を取得する方法。
　上記方法で用いられる、直鎖ＤＮＡを宿主微生物に導入する方法としては、該微生物へＤＮＡを導入する方法であればいずれも用いることができ、例えば、カルシウムイオンを用いる方法［Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 69, 2110 (1972)］、プロトプラスト法（特開昭63-248394）、エレクトロポレーション法［Nucleic Acids Res., 16, 6127 (1988)］等をあげることができる。
　方法２または方法３［２］で用いられるＤＮＡにおいて、該ＤＮＡの中央部付近に、染色体ＤＮＡ上に挿入したい任意の遺伝子を組み込こんだＤＮＡを用いることにより、薬剤耐性遺伝子等を削除するのと同時に、任意の遺伝子を染色体ＤＮＡ上に挿入することができる。
　上記方法２～４では、最終的に得られる形質転換株の染色体ＤＮＡ上には薬剤耐性遺伝子およびネガティブセレクションに用いることができる遺伝子等の外来遺伝子を残さない方法であるため、該方法を用いることにより、同一の薬剤耐性遺伝子およびネガティブセレクションに用いることができる遺伝子を用いて、方法２、方法３［１］～［３］、および方法４［１］［２］の操作を繰り返すことにより、容易に染色体ＤＮＡ上の位置の異なる２以上の領域に遺伝子またはＤＮＡの欠損を有する大腸菌を製造することができる。
　上記方法により取得された大腸菌の変異体が、一定時間培養後の菌体量が野生型の大腸菌より多いことは、例えば１％ グルコース、０．６％ リン酸二ナトリウム、０．３％ リン酸二水素カリウム、０．０５％ 塩化ナトリウム、０．１％ 塩化アンモニウム、２ｍｍｏｌ／ｌ 硫酸マグネシウム・七水和物、１０ｍｇ／ｌ　硫酸鉄、１００μｍｏｌ／ｌ 塩化カルシウムの組成からなるＭ９最少培地に、親株に用いた野生型の大腸菌および該変異体をそれぞれ培養し、一定時間毎に培養物の６６０nmの吸収を測定すること、または培地あたりのＡＴＰ量を常法にしたがって測定することなどにより確認することができる。
　また、本発明の大腸菌の変異体は、有用物質を生産する能力を有する大腸菌の染色体ＤＮＡ上の遺伝子またはＤＮＡを欠損させる方法、または染色体ＤＮＡ上の遺伝子またはＤＮＡを欠損させた大腸菌に、有用物質の生産性を付与する方法により製造することができる。
　有用物質を生産する能力を有する大腸菌は、１種以上の有用物質を生産する能力を有する大腸菌であればいずれの大腸菌であってもよく、該大腸菌としては自然界から分離された株自身が該能力を有する場合は該株そのもの、公知の方法により所望の有用物質を生産する能力を人為的に付与した大腸菌などをあげることができる。
　当該公知の方法としては、
（ａ）有用物質の生合成を制御する機構の少なくとも１つを緩和または解除する方法、
（ｂ）有用物質の生合成に関与する酵素の少なくとも１つを発現強化する方法、
（ｃ）有用物質の生合成に関与する酵素遺伝子の少なくとも１つのコピー数を増加させる方法、
（ｄ）有用物質の生合成経路から該有用物質以外の代謝産物へ分岐する代謝経路の少なくとも１つを弱化または遮断する方法、および
（ｅ）野生型株に比べ、有用物質のアナログに対する耐性度が高い細胞株を選択する方法、
などをあげることができ、上記公知の方法は単独または組み合わせて用いることができる。
　上記（ａ）～（ｅ）の具体的な方法は、例えば有用物質がアミノ酸である場合については、上記（ａ）の方法に関してはAgric. Biol. Chem., 43, 105-111(1979)、J. Bacteriol.遺伝子、110, 761-763(1972)およびAppl. Microbiol. Biotechnol., 39, 318-323(1993)などに記載されている。上記（ｂ）の方法に関しては、Agric. Biol. Chem., 43, 105-111(1979)およびJ. Bacteriol., 110, 761-763(1972)などに記載されている。上記（ｃ）の方法に関しては、Appl. Microbiol. Biotechnol., 39, 318-323(1993)およびAgric. Biol. Chem., 39, 371-377(1987)などに記載されている。上記（ｄ）の方法に関しては、Appl. Environ. Micribiol., 38, 181-190(1979)およびAgric. Biol. Chem., 42, 1773-1778(1978)などに記載されている。上記（ｅ）の方法に関しては、Agric. Biol. Chem., 36, 1675-1684(1972)、Agric. Biol. Chem., 41, 109-116(1977)、Agric. Biol. Chem. , 37, 2013-2023(1973)およびAgric. Biol. Chem., 51, 2089-2094(1987)などに記載されている。上記文献等を参考に各種アミノ酸を生成、蓄積する能力を有する微生物を調製することができる。
　さらに上記（ａ）～（ｅ）のいずれかまたは組み合わせた方法によるアミノ酸を生成、蓄積する能力を有する微生物の調製方法については、Biotechnology 2nd ed., Vol.6, Products of Primary Metabolism (VCH Verlagsgesellschaft mbH, Weinheim, 1996)　section 14a, 14bやAdvances in Biochemical Engineering/ Biotechnology 79, 1-35 (2003)、アミノ酸発酵、学会出版センター、相田　浩ら（1986）に多くの例が記載されており、また上記以外にも具体的なアミノ酸を生成、蓄積する能力を有する微生物の調製方法は、特開2003-164297、Agric. Biol. Chem., 39, 153-160 (1975)、Agric. Biol. Chem., 39, 1149-1153(1975)、特開昭58-13599、J. Gen. Appl. Microbiol., 4, 272-283(1958)、特開昭63-94985、Agric. Biol. Chem., 37, 2013-2023(1973)、WO97/15673、特開昭56-18596、特開昭56-144092および特表2003-511086など数多くの報告があり、上記文献等を参照することにより１種以上のアミノ酸を生産する能力を有する大腸菌の変異体を調製することができる。その他の有用物質を生産する能力を有する大腸菌もまたアミノ酸を生産する能力を有する大腸菌の変異体の調製方法と同様に、該有用物質の生合成酵素の強化、生合成調節機構および排出機構などの改変により調製することができる。
３．本発明の有用物質の製造方法
　本発明の有用物質の製造方法は、本発明の大腸菌の変異体を培地に培養し、培養物中に有用物質を生成、蓄積させ、該培養物から該有用物質を採取することを特徴とする有用物質の製造方法に関する。
　該有用物質としては、本発明の大腸菌の変異体を用いて製造できる有用物質であれば特に限定されないが、例えばタンパク質、アミノ酸、核酸、ビタミン、糖、有機酸、脂質などあげることができ、タンパク質としては、イノシンキナーゼ、Glutamate 5-kinase (EC 2.7.2.11)、Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase (EC 1.2.1.41)、Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2)、ヒト顆粒球コロニー刺激因子など、ペプチドとしてはグルタチオンなど、アミノ酸としては、Ｌ－アラニン、グリシン、Ｌ－グルタミン、Ｌ－グルタミン酸、Ｌ－アスパラギン、Ｌ－アスパラギン酸、Ｌ－リジン、Ｌ－メチオニン、Ｌ－スレオニン、Ｌ－ロイシン、Ｌ－バリン、Ｌ－イソロイシン、Ｌ－プロリン、Ｌ－ヒスチジン、Ｌ－アルギニン、Ｌ－チロシン、Ｌ－トリプトファン、Ｌ－フェニルアラニン、Ｌ－セリン、Ｌ－システイン、Ｌ－３－ヒドロキシプロリン、Ｌ－４－ヒドロキシプロリンなど、核酸としては、アデノシン三リン酸、イノシン、グアノシン、イノシン酸、グアニル酸など、ビタミンとしては、リボフラビン、チアミン、アスコルビン酸など、糖としては、キシロース、キシリトールなど、脂質としては、EPA(エイコサペンタエン酸)やDHA（ドコサヘキサエン酸）などをあげることができる。
　本発明の有用物質の製造方法には、ＡＴＰを必要とする酵素反応を用いた有用物質の製造方法であって、該酵素反応を触媒する酵素タンパク質を本発明の大腸菌の変異体に産生させ、酵素タンパク質が触媒する反応の進行を維持するためのＡＴＰを本発明の大腸菌の変異体から供給する製造方法も含まれる。
　本発明の製造法に用いられる大腸菌の変異体の培養は、以下に記載した通常の方法に従って行うことができる。
　本発明の製造法に用いられる大腸菌の変異体を培養する培地は、該微生物が資化し得る炭素源、窒素源、無機塩類等を含有し、該微生物の培養を効率的に行える培地であれば天然培地、合成培地のいずれを用いてもよい。
　炭素源としては、該微生物が資化し得るものであればよく、グルコース、フラクトース、スクロース、これらを含有する糖蜜、デンプンあるいはデンプン加水分解物等の炭水化物、酢酸、プロピオン酸等の有機酸、エタノール、プロパノール等のアルコール類等を用いることができる。
　窒素源としては、アンモニア、塩化アンモニウム、硫酸アンモニウム、酢酸アンモニウム、リン酸アンモニウム等の無機酸または有機酸のアンモニウム塩、ペプトン、肉エキス、酵母エキス、コーンスチープリカー、カゼイン加水分解物、大豆粕、大豆粕加水分解物、各種発酵菌体、およびその消化物等を用いることができる。
　無機塩としては、リン酸第一カリウム、リン酸第二カリウム、リン酸マグネシウム、硫酸マグネシウム、塩化ナトリウム、硫酸第一鉄、硫酸マンガン、硫酸銅、炭酸カルシウム等を用いることができる。
　培養は、振盪培養または深部通気攪拌培養などの好気的条件下で行う。培養温度は15～40℃がよく、培養時間は、通常 16時間～7日間である。培養中のpHは3. 0～9.0に保持することが好ましい。pHの調整は、無機または有機の酸、アルカリ溶液、尿素、炭酸カルシウム、アンモニアなどを用いて行う。
　有用物質が菌体外に生成、蓄積した場合には、培養終了後、培養物から菌体などの沈殿物を除去し、イオン交換処理法、濃縮法、塩析法などを併用することにより、培養物から目的する有用物質を単離、精製することができる。
　有用物質が、菌体内に生成、蓄積される場合には、培養終了後、培養物から菌体を回収した後、機械的または化学的方法等の適切な方法で破砕する。該菌体破砕液から、イオン交換処理法、濃縮法、塩析法などを併用することにより、該菌体破砕液から目的とする有用物質を単離、精製することができる。
（１）染色体縮小化株の作製方法
　特開2004-166576およびWO2006/57341に記載の染色体加工方法、すなわちバチルス・サチルス由来のレバンシュークラーゼをコードするsacB遺伝子を用いる方法により、大腸菌K-12系統株W3110株の組換え系がλファージ由来のRed組換え系に置き換わった株であるW3110red株（WO2006/57341）の染色体上の1026.7kbpの領域が欠損したStep28株（WO2006/57341）をもとに、大腸菌W3110株において染色体上の以下の表２に示す遺伝子を含む領域を欠損した染色体縮小化株S1～S10株を作製した。当該方法では、欠損させたい染色体ＤＮＡ上の領域の両端にある塩基配列に基づきプライマーＤＮＡを設計し、これらのプライマーＤＮＡを用いて染色体ＤＮＡを鋳型としてＰＣＲ反応を利用し増幅されるＤＮＡ断片を用いることにより、染色体ＤＮＡ上の任意の領域を欠損させることができる。
（２）生育試験
　次に、W3110red株、染色体縮小化株S28株(WO2006/57341)およびS1～S10株の生育を比較した。Step28株が染色体ＤＮＡ上で欠失しいる遺伝子群は第２表に示した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000113
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000114
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000115
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000116
　第２表に記した菌株を使用して生育試験を行った。生育試験は、30mg/lのカナマイシンを含むＬＢ寒天培地(ＬＢ培地［バクトトリプトン（ディフコ社製）１０ｇ／ｌ、酵母エキス（ディフコ社製）１０ｇ／ｌ、塩化ナトリウム５ｇ／ｌ］にバクトアガー（ディフコ社製）15g/lを加えて平板化したもの)上に各菌株を塗布し、37℃にて一晩培養して菌体を得た。ＬＢ寒天培地上に生育した菌体を各少量30mg/lのカナマイシンを含む5mlのＬＢ培地に植菌して37℃にて一晩培養し、培養物を得た。300μlの該培養物を30mlの生育試験培地（11.28g/l　5×M9プレミックス塩、100mM　MOPSバッファー、６％　グルコース、１％　酵母エキス、2mM　MgSO4、0.1mM CaCl2、5mg/l　FeSO4、pH6.8、30mg/lカナマイシン）に植菌し、24時間30℃で振とう培養した。培養後の各染色体縮小化株の濁度を660nmの吸収で測定した。W3110red株の濁度を100としたときの各染色体縮小化株の濁度および各染色体縮小化株の染色体ＤＮＡの総欠失長を第３表に記す。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000117
（３）ATP生産活性
　　W3110red株、Step28株およびS10株のATP生産活性をそれぞれ以下の方法で測定した。各菌株をＬＢ寒天培地に塗布し、30℃にて一晩培養した。ＬＢ寒天培地上に生育した菌体を少量かきとり、3％グルコースを含むＬＢ培地1mlを入れた96穴ディープウェルプレートに植菌し、30℃で24時間培養した。培養後の濁度を590nmの吸収で測定した。また、J. Biomol. Screen., 11, 310 (2006)に記載の方法により、培養液あたりのATP生産活性を測定した。W3110red株の培養液あたりのATP生産活性を100としたときのStep28株およびS10株の培養液あたりのATP生産活性を第４表に示した。S10株では、培養液あたりのATP生産活性が顕著に向上した。
Figure JPOXMLDOC01-appb-T000118
キシリトール生産性株の作製
　Step28株ならびにS10株が保持するλRed組換え系を野生型recBCD組換え系に置換した株を以下のように作製した。
　λRed系遺伝子群が存在する染色体近傍に位置するygdB遺伝子を特開2004-166576に記載の方法を用いてクロラムフェニコール耐性遺伝子とレバンシュークラーゼ遺伝子を含むDNA断片と置換する。作製した菌株に対して、野生型株から取得したP1ファージでの形質導入を行い、シュークロース耐性株を取得することで、ygdB遺伝子近傍が野生型の染色体断片（recBCD遺伝子群を含む）に置換した株を取得する。Step28株ならびにS10株から作製したrecBCD株をそれぞれS28W株、S10W株と命名した。
　次にS28W株ならびにS10W株のlacI遺伝子を以下の方法にて復帰させた。まず特開2004-166576に記載の方法を用いてクロラムフェニコール耐性遺伝子とレバンシュークラーゼ遺伝子を含むDNA断片をW3110red株染色体に挿入すると同時に表１に記載のyafW遺伝子からyahM遺伝子までの領域を欠失させた。この菌株からＰ１ファージを調製し、S28W株ならびにS10W株への形質導入を行い、クロラムフェニコール耐性株を取得することで該マーカー遺伝子近傍のlacI遺伝子が形質導入されたlacI復帰株を取得した。取得したlacI遺伝子復帰株のクロラムフェニコール耐性遺伝子とレバンシュークラーゼ遺伝子を含むマーカー部分を特開2004-166576に記載の方法を用いて除去した。最終的に作製したS28W株およびS10W株由来のlacI遺伝子復帰株を、S28W_lacI株およびS10W_lacI株と命名した。　
　次にAppl. Environ. Microbiol., 73, 7657 (2007)に記載の方法を用いて、Ｗ3110株、S28W_lacI株ならびにS10W_lacI株の各菌株にキシリトール生産性遺伝子群を導入し、キシロースからキシリトールへの変換能力を付与した菌株を作製した。作製した各菌株をM9最小培地に、6％グルコース、8％キシロース、１％酵母エキス、0.1mM　IPTG、100mM MOPSバッファーを添加したもの）を含む培地30mlに接種し、300mlバッフル付フラスコで30℃、250rpmで振盪培養した。培養46時間目の培養液中のキシリトール量を測定したところ、W3110株、S28W_lacI株ならびにS10W_lacI株をそれぞれ親株とするキシリトール生産株の培養において、培養液中に14.3、13.5、20.6 g/lのキシリトールが生産されており、S10株由来の株において最もキシリトールの生産性が高かった。
　本発明の大腸菌の変異体を宿主細胞として用いることにより、有用物質を効率よく製造することができる。

Claims (28)

  1. 　以下の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子を含み、かつ［２］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子を含まず、かつ野生型の大腸菌より１０４０kbp以上短い染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体。ただし、以下の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子中に、野生型の大腸菌が元来有していない遺伝子（以下、ＮＣ遺伝子という）がある場合には、該野生型の大腸菌に由来する上記大腸菌の変異体は、ＮＣ遺伝子を有していなくてもよい。
    ［１］thrL遺伝子、thrA遺伝子、thrB遺伝子、thrC遺伝子、talB遺伝子、mog遺伝子、htgA遺伝子、dnaK遺伝子、dnaJ遺伝子、mokC遺伝子、hokC遺伝子、sokC遺伝子、nhaA遺伝子、nhaR遺伝子、rpsT遺伝子、ribF遺伝子、ileS遺伝子、lspA遺伝子、fkpB遺伝子、ispH遺伝子、rihC遺伝子、dapB遺伝子、carA遺伝子、carB遺伝子、caiF遺伝子、caiE遺伝子、caiD遺伝子、caiC遺伝子、caiB遺伝子、caiA遺伝子、caiT遺伝子、fixA遺伝子、fixB遺伝子、fixC遺伝子、fixX遺伝子、kefF遺伝子、kefC遺伝子、folA遺伝子、apaH遺伝子、apaG遺伝子、ksgA遺伝子、pdxA遺伝子、surA遺伝子、imp遺伝子、djlA遺伝子、rluA遺伝子、hepA遺伝子、polB遺伝子、leuD遺伝子、leuC遺伝子、leuB遺伝子、leuA遺伝子、leuL遺伝子、leuO遺伝子、ilvI遺伝子、ilvH遺伝子、fruR遺伝子、mraZ遺伝子、mraW遺伝子、ftsL遺伝子、ftsI遺伝子、murE遺伝子、murF遺伝子、mraY遺伝子、murD遺伝子、ftsW遺伝子、murG遺伝子、murC遺伝子、ddlB遺伝子、ftsQ遺伝子、ftsA遺伝子、ftsZ遺伝子、lpxC遺伝子、secM遺伝子、secA遺伝子、mutT遺伝子、coaE遺伝子、guaC遺伝子、hofC遺伝子、hofB遺伝子、ppdD遺伝子、nadC遺伝子、ampD遺伝子、ampE遺伝子、aroP遺伝子、pdhR遺伝子、aceE遺伝子、aceF遺伝子、lpd遺伝子、acnB遺伝子、speD遺伝子、speE遺伝子、cueO遺伝子、gcd遺伝子、hpt遺伝子、can遺伝子、panD遺伝子、panC遺伝子、panB遺伝子、htrE遺伝子、ecpD遺伝子、folK遺伝子、pcnB遺伝子、dksA遺伝子、sfsA遺伝子、ligT遺伝子、hrpB遺伝子、mrcB遺伝子、hemL遺伝子、clcA遺伝子、btuF遺伝子、pfs遺伝子、dgt遺伝子、degP遺伝子、cdaR遺伝子、dapD遺伝子、glnD遺伝子、map遺伝子、tff遺伝子、rpsB遺伝子、tsf遺伝子、pyrH遺伝子、frr遺伝子、dxr遺伝子、ispU遺伝子、cdsA遺伝子、hlpA遺伝子、lpxD遺伝子、fabZ遺伝子、lpxA遺伝子、lpxB遺伝子、rnhB遺伝子、dnaE遺伝子、accA遺伝子、ldcC遺伝子、tilS遺伝子、rof遺伝子、nlpE遺伝子、proS遺伝子、rcsF遺伝子、metQ遺伝子、metI遺伝子、metN遺伝子、gmhB遺伝子、rrsH遺伝子、ileV遺伝子、alaV遺伝子、rrlH遺伝子、rrfH遺伝子、aspU遺伝子、dkgB遺伝子、mltD遺伝子、gloB遺伝子、rnhA遺伝子、dnaQ遺伝子、aspV遺伝子、ivy遺伝子、fadE遺伝子、lpcA遺伝子、pepD遺伝子、gpt遺伝子、frsA遺伝子、crl遺伝子、phoE遺伝子、proB遺伝子、proA遺伝子、thrW遺伝子、hemB遺伝子、proC遺伝子、aroL遺伝子、aroM遺伝子、rdgC遺伝子、mak遺伝子、araJ遺伝子、sbcC遺伝子、sbcD遺伝子、phoB遺伝子、phoR遺伝子、brnQ遺伝子、proY遺伝子、malZ遺伝子、queA遺伝子、tgt遺伝子、secD遺伝子、secF遺伝子、tsx遺伝子、ribD遺伝子、ribE遺伝子、nusB遺伝子、thiL遺伝子、pgpA遺伝子、dxs遺伝子、ispA遺伝子、xseB遺伝子、thiI遺伝子、panE遺伝子、cyoE遺伝子、cyoD遺伝子、cyoC遺伝子、cyoB遺伝子、cyoA遺伝子、ampG遺伝子、bolA遺伝子、tig遺伝子、clpP遺伝子、clpX遺伝子、lon遺伝子、hupB遺伝子、ppiD遺伝子、cof遺伝子、mdlA遺伝子、mdlB遺伝子、glnK遺伝子、amtB遺伝子、tesB遺伝子、ffs遺伝子、maa遺伝子、hha遺伝子、acrB遺伝子、acrA遺伝子、acrR遺伝子、kefA遺伝子、priC遺伝子、apt遺伝子、dnaX遺伝子、recR遺伝子、htpG遺伝子、adk遺伝子、hemH遺伝子、aes遺伝子、gsk遺伝子、fsr遺伝子、ushA遺伝子、copA遺伝子、cueR遺伝子、gcl遺伝子、hyi遺伝子、purK遺伝子、purE遺伝子、lpxH遺伝子、ppiB遺伝子、cysS遺伝子、folD遺伝子、sfmA遺伝子、sfmC遺伝子、sfmD遺伝子、sfmH遺伝子、sfmF遺伝子、fimZ遺伝子、argU遺伝子、entD遺伝子、fepA遺伝子、fes遺伝子、entF遺伝子、fepE遺伝子、fepC遺伝子、fepG遺伝子、fepD遺伝子、fepB遺伝子、entC遺伝子、entE遺伝子、entB遺伝子、entA遺伝子、cstA遺伝子、dsbG遺伝子、ahpC遺伝子、ahpF遺伝子、tatE遺伝子、lipA遺伝子、lipB遺伝子、dacA遺伝子、rlpA遺伝子、mrdB遺伝子、mrdA遺伝子、cobC遺伝子、nadD遺伝子、holA遺伝子、rlpB遺伝子、leuS遺伝子、lnt遺伝子、miaB遺伝子、ubiF遺伝子、glnX遺伝子、glnV遺伝子、metU遺伝子、glnW遺伝子、glnU遺伝子、leuW遺伝子、metT遺伝子、asnB遺伝子、nagD遺伝子、nagC遺伝子、nagA遺伝子、nagB遺伝子、nagE遺伝子、glnS遺伝子、fur遺伝子、fldA遺伝子、seqA遺伝子、pgm遺伝子、potE遺伝子、speF遺伝子、kdpE遺伝子、kdpD遺伝子、kdpC遺伝子、kdpB遺伝子、kdpA遺伝子、nei遺伝子、abrB遺伝子、gltA遺伝子、sdhC遺伝子、sdhD遺伝子、sdhA遺伝子、sdhB遺伝子、sucA遺伝子、sucB遺伝子、sucC遺伝子、sucD遺伝子、mngR遺伝子、mngA遺伝子、mngB遺伝子、cydA遺伝子、cydB遺伝子、tolQ遺伝子、tolR遺伝子、tolA遺伝子、tolB遺伝子、pal遺伝子、lysT遺伝子、valT遺伝子、lysW遺伝子、valZ遺伝子、lysY遺伝子、lysZ遺伝子、lysQ遺伝子、nadA遺伝子、pnuC遺伝子、zitB遺伝子、aroG遺伝子、gpmA遺伝子、galM遺伝子、galK遺伝子、galT遺伝子、galE遺伝子、modF遺伝子、modE遺伝子、modA遺伝子、modB遺伝子、modC遺伝子、bioA遺伝子、bioB遺伝子、bioF遺伝子、bioC遺伝子、bioD遺伝子、uvrB遺伝子、moaA遺伝子、moaB遺伝子、moaC遺伝子、moaD遺伝子、moaE遺伝子、rhlE遺伝子、dps遺伝子、rhtA遺伝子、ompX遺伝子、rybA遺伝子、mntR遺伝子、fsaA遺伝子、moeB遺伝子、moeA遺伝子、iaaA遺伝子、cmr遺伝子、rybB遺伝子、grxA遺伝子、poxB遺伝子、hcr遺伝子、hcp遺伝子、aqpZ遺伝子、macA遺伝子、macB遺伝子、cspD遺伝子、clpS遺伝子、clpA遺伝子、serW遺伝子、infA遺伝子、aat遺伝子、cydC遺伝子、cydD遺伝子、trxB遺伝子、lrp遺伝子、ftsK遺伝子、lolA遺伝子、serS遺伝子、dmsA遺伝子、dmsB遺伝子、dmsC遺伝子、pflA遺伝子、pflB遺伝子、focA遺伝子、serC遺伝子、aroA遺伝子、cmk遺伝子、rpsA遺伝子、ihfB遺伝子、msbA遺伝子、lpxK遺伝子、kdsB遺伝子、smtA遺伝子、mukF遺伝子、mukE遺伝子、mukB遺伝子、aspC遺伝子、ompF遺伝子、asnS遺伝子、pncB遺伝子、pepN遺伝子、ssuB遺伝子、ssuC遺伝子、ssuD遺伝子、ssuA遺伝子、ssuE遺伝子、pyrD遺伝子、uup遺伝子、pqiA遺伝子、pqiB遺伝子、rmf遺伝子、fabA遺伝子、ompA遺伝子、sulA遺伝子、helD遺伝子、mgsA遺伝子、serT遺伝子、hyaA遺伝子、hyaB遺伝子、hyaC遺伝子、hyaD遺伝子、hyaE遺伝子、hyaF遺伝子、appC遺伝子、appB遺伝子、appA遺伝子、etp遺伝子、serX遺伝子、csgG遺伝子、csgF遺伝子、csgE遺伝子、csgD遺伝子、csgB遺伝子、csgA遺伝子、csgC遺伝子、mdoC遺伝子、mdoG遺伝子、mdoH遺伝子、msyB遺伝子、mdtG遺伝子、lpxL遺伝子、solA遺伝子、dinI遺伝子、pyrC遺伝子、grxB遺伝子、mdtH遺伝子、rimJ遺伝子、mviM遺伝子、mviN遺伝子、flgN遺伝子、flgM遺伝子、flgA遺伝子、flgB遺伝子、flgC遺伝子、flgD遺伝子、flgE遺伝子、flgF遺伝子、flgG遺伝子、flgH遺伝子、flgI遺伝子、flgJ遺伝子、flgK遺伝子、flgL遺伝子、rne遺伝子、rluC遺伝子、sraB遺伝子、rpmF遺伝子、plsX遺伝子、fabH遺伝子、fabD遺伝子、fabG遺伝子、acpP遺伝子、fabF遺伝子、pabC遺伝子、tmk遺伝子、holB遺伝子、ptsG遺伝子、fhuE遺伝子、hinT遺伝子、nagZ遺伝子、ndh遺伝子、mfd遺伝子、lolC遺伝子、lolD遺伝子、lolE遺伝子、cobB遺伝子、potD遺伝子、potC遺伝子、potB遺伝子、potA遺伝子、pepT遺伝子、phoQ遺伝子、phoP遺伝子、purB遺伝子、hflD遺伝子、trmU遺伝子、minE遺伝子、minD遺伝子、minC遺伝子、hlyE遺伝子、umuD遺伝子、umuC遺伝子、dsbB遺伝子、nhaB遺伝子、fadR遺伝子、dadA遺伝子、dadX遺伝子、cvrA遺伝子、ldcA遺伝子、emtA遺伝子、treA遺伝子、dhaH遺伝子、dhaL遺伝子、dhaK遺伝子、dhaR遺伝子、pth遺伝子、prsA遺伝子、ispE遺伝子、lolB遺伝子、hemA遺伝子、prfA遺伝子、prmC遺伝子、kdsA遺伝子、ldrA遺伝子、rdlA遺伝子、ldrB遺伝子、rdlB遺伝子、ldrC遺伝子、rdlC遺伝子、chaA遺伝子、chaB遺伝子、chaC遺伝子、narL遺伝子、narX遺伝子、narK遺伝子、narG遺伝子、narH遺伝子、narJ遺伝子、narI遺伝子、rttR遺伝子、tpr遺伝子、tyrV遺伝子、tyrT遺伝子、purU遺伝子、rssA遺伝子、rssB遺伝子、galU遺伝子、hns遺伝子、tdk遺伝子、adhE遺伝子、oppA遺伝子、oppB遺伝子、oppC遺伝子、oppD遺伝子、oppF遺伝子、cls遺伝子、kch遺伝子、tonB遺伝子、ompW遺伝子、trpA遺伝子、trpB遺伝子、trpC遺伝子、trpD遺伝子、trpE遺伝子、trpL遺伝子、rluB遺伝子、btuR遺伝子、sohB遺伝子、topA遺伝子、cysB遺伝子、acnA遺伝子、ribA遺伝子、pgpB遺伝子、pyrF遺伝子、osmB遺伝子、gmr遺伝子、rnb遺伝子、fabI遺伝子、sapF遺伝子、sapD遺伝子、sapC遺伝子、sapB遺伝子、sapA遺伝子、puuP遺伝子、puuA遺伝子、puuD遺伝子、puuR遺伝子、puuC遺伝子、puuB遺伝子、puuE遺伝子、pspF遺伝子、pspA遺伝子、pspB遺伝子、pspC遺伝子、pspD遺伝子、pspE遺伝子、ompG遺伝子、tyrR遺伝子、tpx遺伝子、mpaA遺伝子、mppA遺伝子、uspE遺伝子、fnr遺伝子、ogt遺伝子、abgT遺伝子、abgB遺伝子、abgA遺伝子、abgR遺伝子、isrA遺伝子、dbpA遺伝子、uspF遺伝子、ompN遺伝子、micC遺伝子、hslJ遺伝子、ldhA遺伝子、feaR遺伝子、feaB遺伝子、tynA遺伝子、maoC遺伝子、paaA遺伝子、paaB遺伝子、paaC遺伝子、paaD遺伝子、paaE遺伝子、paaF遺伝子、paaG遺伝子、paaH遺伝子、paaI遺伝子、paaJ遺伝子、paaK遺伝子、paaX遺伝子、paaY遺伝子、azoR遺伝子、hrpA遺伝子、aldA遺伝子、gapC_2遺伝子、gapC_1遺伝子、cybB遺伝子、hokB遺伝子、mokB遺伝子、sokB遺伝子、trg遺伝子、mdoD遺伝子、rimL遺伝子、tehA遺伝子、tehB遺伝子、ansP遺伝子、nhoA遺伝子、narV遺伝子、narW遺伝子、narY遺伝子、narZ遺伝子、narU遺伝子、fdnG遺伝子、fdnH遺伝子、fdnI遺伝子、adhP遺伝子、sfcA遺伝子、sra遺伝子、bdm遺伝子、osmC遺伝子、ddpF遺伝子、ddpD遺伝子、ddpC遺伝子、ddpB遺伝子、ddpA遺伝子、ddpX遺伝子、dos遺伝子、gadC遺伝子、gadB遺伝子、pqqL遺伝子、hipA遺伝子、hipB遺伝子、ego遺伝子、lsrC遺伝子、lsrD遺伝子、lsrB遺伝子、lsrF遺伝子、lsrG遺伝子、tam遺伝子、uxaB遺伝子、marC遺伝子、marR遺伝子、marA遺伝子、marB遺伝子、eamA遺伝子、dcp遺伝子、rspB遺伝子、rspA遺伝子、speG遺伝子、dmsD遺伝子、clcB遺伝子、dgsA遺伝子、asr遺伝子、mdtI遺伝子、mdtJ遺伝子、pntB遺伝子、pntA遺伝子、folM遺伝子、rstA遺伝子、rstB遺伝子、tus遺伝子、fumC遺伝子、fumA遺伝子、manA遺伝子、uidC遺伝子、uidB遺伝子、uidA遺伝子、uidR遺伝子、hdhA遺伝子、malI遺伝子、malX遺伝子、malY遺伝子、add遺伝子、blr遺伝子、rsxA遺伝子、rsxB遺伝子、rsxC遺伝子、rsxD遺伝子、rsxG遺伝子、rsxE遺伝子、nth遺伝子、gst遺伝子、pdxY遺伝子、tyrS遺伝子、pdxH遺伝子、slyB遺伝子、slyA遺伝子、sodC遺伝子、nemA遺伝子、gloA遺伝子、rnt遺伝子、lhr遺伝子、sodB遺伝子、purR遺伝子、cfa遺伝子、ribC遺伝子、mdtK遺伝子、valV遺伝子、valW遺伝子、pykF遺伝子、lpp遺伝子、sufE遺伝子、sufS遺伝子、sufD遺伝子、sufC遺伝子、sufB遺伝子、sufA遺伝子、rydB遺伝子、rprA遺伝子、aroD遺伝子、pps遺伝子、aroH遺伝子、nlpC遺伝子、btuD遺伝子、btuE遺伝子、btuC遺伝子、ihfA遺伝子、pheT遺伝子、pheS遺伝子、pheM遺伝子、rplT遺伝子、rpmI遺伝子、infC遺伝子、thrS遺伝子、arpB_1遺伝子、arpB_2遺伝子、pfkB遺伝子、cedA遺伝子、katE遺伝子、chbG遺伝子、chbF遺伝子、chbR遺伝子、chbA遺伝子、chbC遺伝子、chbB遺伝子、osmE遺伝子、nadE遺伝子、spy遺伝子、astE遺伝子、astB遺伝子、astD遺伝子、astA遺伝子、astC遺伝子、xthA遺伝子、nudG遺伝子、gdhA遺伝子、topB遺伝子、selD遺伝子、sppA遺伝子、ansA遺伝子、gapA遺伝子、mipA遺伝子、rnd遺伝子、fadD遺伝子、pabB遺伝子、sdaA遺伝子、manX遺伝子、manY遺伝子、manZ遺伝子、rrmA遺伝子、cspC遺伝子、kdgR遺伝子、htpX遺伝子、prc遺伝子、proQ遺伝子、pphA遺伝子、ryeA遺伝子、ryeB遺伝子、holE遺伝子、exoX遺伝子、ptrB遺伝子、purT遺伝子、eda遺伝子、edd遺伝子、zwf遺伝子、pykA遺伝子、lpxM遺伝子、znuA遺伝子、znuC遺伝子、znuB遺伝子、ruvB遺伝子、ruvA遺伝子、ruvC遺伝子、nudB遺伝子、aspS遺伝子、torZ遺伝子、torY遺伝子、cutC遺伝子、argS遺伝子、leuZ遺伝子、cysT遺伝子、glyW遺伝子、pgsA遺伝子、dsrA遺伝子、serU遺伝子、asnT遺伝子、shiA遺伝子、amn遺伝子、asnW遺伝子、asnU遺伝子、cbl遺伝子、nac遺伝子、asnV遺伝子、erfK遺伝子、cobT遺伝子、
    cobS遺伝子、cobU遺伝子、sbmC遺伝子、dacD遺伝子、sbcB遺伝子、hisL遺伝子、hisG遺伝子、hisD遺伝子、hisC遺伝子、hisB遺伝子、hisH遺伝子、hisA遺伝子、hisF遺伝子、hisI遺伝子、cld遺伝子、ugd遺伝子、gnd遺伝子、galF遺伝子、wcaM遺伝子、wcaL遺伝子、wcaK遺伝子、wzxC遺伝子、wcaJ遺伝子、cpsG遺伝子、cpsB遺伝子、wcaI遺伝子、nudD遺伝子、fcl遺伝子、gmd遺伝子、wcaF遺伝子、wcaE遺伝子、wcaD遺伝子、wcaC遺伝子、wcaB遺伝子、wcaA遺伝子、wzc遺伝子、wzb遺伝子、wza遺伝子、asmA遺伝子、dcd遺伝子、udk遺伝子、thiD遺伝子、thiM遺伝子、mrp遺伝子、metG遺伝子、dusC遺伝子、cdd遺伝子、sanA遺伝子、mglC遺伝子、mglA遺伝子、mglB遺伝子、galS遺伝子、folE遺伝子、cirA遺伝子、lysP遺伝子、nfo遺伝子、fruA遺伝子、fruK遺伝子、fruB遺伝子、setB遺伝子、spr遺伝子、rtn遺伝子、bcr遺伝子、rsuA遺伝子、rplY遺伝子、proL遺伝子、narP遺伝子、ccmH遺伝子、ccmG遺伝子、ccmF遺伝子、ccmE遺伝子、ccmD遺伝子、ccmC遺伝子、ccmB遺伝子、ccmA遺伝子、napC遺伝子、napB遺伝子、napH遺伝子、napG遺伝子、napA遺伝子、napD遺伝子、napF遺伝子、eco遺伝子、mqo遺伝子、alkB遺伝子、ada遺伝子、ompC遺伝子、micF遺伝子、rcsD遺伝子、rcsB遺伝子、rcsC遺伝子、atoS遺伝子、atoC遺伝子、atoD遺伝子、atoA遺伝子、atoE遺伝子、atoB遺伝子、gyrA遺伝子、ubiG遺伝子、nrdA遺伝子、nrdB遺伝子、inaA遺伝子、glpQ遺伝子、glpT遺伝子、glpA遺伝子、glpB遺伝子、glpC遺伝子、ais遺伝子、arnT遺伝子、pmrD遺伝子、menE遺伝子、menC遺伝子、menB遺伝子、menD遺伝子、menF遺伝子、nuoN遺伝子、nuoM遺伝子、nuoL遺伝子、nuoK遺伝子、nuoJ遺伝子、nuoI遺伝子、nuoH遺伝子、nuoG遺伝子、nuoF遺伝子、nuoE遺伝子、nuoC遺伝子、nuoB遺伝子、nuoA遺伝子、lrhA遺伝子、ackA遺伝子、pta遺伝子、ubiX遺伝子、purF遺伝子、cvpA遺伝子、dedD遺伝子、folC遺伝子、accD遺伝子、dedA遺伝子、truA遺伝子、usg遺伝子、pdxB遺伝子、flk遺伝子、fabB遺伝子、trmC遺伝子、mepA遺伝子、aroC遺伝子、prmB遺伝子、sixA遺伝子、fadL遺伝子、vacJ遺伝子、argW遺伝子、dsdC遺伝子、dsdX遺伝子、dsdA遺伝子、emrY遺伝子、emrK遺伝子、evgA遺伝子、evgS遺伝子、oxc遺伝子、frc遺伝子、ddg遺伝子、glk遺伝子、mntH遺伝子、nupC遺伝子、alaX遺伝子、alaW遺伝子、gltX遺伝子、valU遺伝子、valX遺伝子、valY遺伝子、lysV遺伝子、xapR遺伝子、xapB遺伝子、xapA遺伝子、ligA遺伝子、zipA遺伝子、cysZ遺伝子、cysK遺伝子、ptsH遺伝子、ptsI遺伝子、crr遺伝子、pdxK遺伝子、cysM遺伝子、cysA遺伝子、cysW遺伝子、cysU遺伝子、cysP遺伝子、ucpA遺伝子、murP遺伝子、amiA遺伝子、hemF遺伝子、eutL遺伝子、eutC遺伝子、eutB遺伝子、eutA遺伝子、eutH遺伝子、eutG遺伝子、eutJ遺伝子、eutE遺伝子、cchB遺伝子、cchA遺伝子、eutI遺伝子、eutT遺伝子、eutQ遺伝子、eutP遺伝子、maeB遺伝子、talA遺伝子、tktB遺伝子、aegA遺伝子、narQ遺伝子、acrD遺伝子、dapE遺伝子、purC遺伝子、nlpB遺伝子、dapA遺伝子、gcvR遺伝子、bcp遺伝子、hda遺伝子、uraA遺伝子、upp遺伝子、purM遺伝子、purN遺伝子、ppk遺伝子、ppx遺伝子、guaA遺伝子、guaB遺伝子、xseA遺伝子、der遺伝子、hisS遺伝子、ispG遺伝子、ndk遺伝子、pbpC遺伝子、sseA遺伝子、ryfA遺伝子、sseB遺伝子、pepB遺伝子、fdx遺伝子、hscA遺伝子、hscB遺伝子、iscA遺伝子、iscU遺伝子、iscS遺伝子、iscR遺伝子、suhB遺伝子、csiE遺伝子、hcaT遺伝子、hcaR遺伝子、hcaE遺伝子、hcaF遺伝子、hcaC遺伝子、hcaB遺伝子、hcaD遺伝子、glyA遺伝子、hmp遺伝子、glnB遺伝子、sroF遺伝子、purL遺伝子、tadA遺伝子、acpS遺伝子、pdxJ遺伝子、recO遺伝子、era遺伝子、rnc遺伝子、lepB遺伝子、lepA遺伝子、rseC遺伝子、rseB遺伝子、rseA遺伝子、rpoE遺伝子、nadB遺伝子、srmB遺伝子、ung遺伝子、trxC遺伝子、pssA遺伝子、kgtP遺伝子、rrfG遺伝子、rrlG遺伝子、gltW遺伝子、rrsG遺伝子、clpB遺伝子、rluD遺伝子、pheL遺伝子、pheA遺伝子、tyrA遺伝子、aroF遺伝子、rplS遺伝子、trmD遺伝子、rimM遺伝子、rpsP遺伝子、ffh遺伝子、grpE遺伝子、recN遺伝子、smpA遺伝子、smpB遺伝子、ssrA遺伝子、gabD遺伝子、gabT遺伝子、gabP遺伝子、nrdF遺伝子、mprA遺伝子、emrA遺伝子、emrB遺伝子、luxS遺伝子、sraD遺伝子、gshA遺伝子、argQ遺伝子、argZ遺伝子、argY遺伝子、argV遺伝子、serV遺伝子、csrA遺伝子、alaS遺伝子、recX遺伝子、recA遺伝子、mltB遺伝子、norR遺伝子、norV遺伝子、norW遺伝子、hypF遺伝子、hydN遺伝子、ascG遺伝子、ascF遺伝子、ascB遺伝子、hycI遺伝子、hycH遺伝子、hycG遺伝子、hycF遺伝子、hycE遺伝子、hycD遺伝子、hycC遺伝子、hycB遺伝子、hycA遺伝子、hypA遺伝子、hypB遺伝子、hypC遺伝子、hypD遺伝子、hypE遺伝子、fhlA遺伝子、mutS遺伝子、pphB遺伝子、rpoS遺伝子、nlpD遺伝子、pcm遺伝子、surE遺伝子、truD遺伝子、ispF遺伝子、ispD遺伝子、ftsB遺伝子、cysC遺伝子、cysN遺伝子、cysD遺伝子、iap遺伝子、cysH遺伝子、cysI遺伝子、cysJ遺伝子、eno遺伝子、pyrG遺伝子、mazG遺伝子、chpR遺伝子、relA遺伝子、rumA遺伝子、barA遺伝子、gudD遺伝子、gudX遺伝子、gudP遺伝子、mltA遺伝子、metZ遺伝子、metW遺伝子、metV遺伝子、amiC遺伝子、argA遺伝子、recD遺伝子、recB遺伝子、ptr遺伝子、recC遺伝子、ppdC遺伝子、ppdB遺伝子、ppdA遺伝子、thyA遺伝子、lgt遺伝子、ptsP遺伝子、nudH遺伝子、mutH遺伝子、tas遺伝子、aas遺伝子、rygA遺伝子、rygB遺伝子、galR遺伝子、lysA遺伝子、lysR遺伝子、araE遺伝子、kduD遺伝子、kduI遺伝子、lysS遺伝子、prfB遺伝子、recJ遺伝子、dsbC遺伝子、xerD遺伝子、fldB遺伝子、bglA遺伝子、gcvP遺伝子、gcvH遺伝子、gcvT遺伝子、visC遺伝子、ubiH遺伝子、pepP遺伝子、zapA遺伝子、ssrS遺伝子、rygC遺伝子、serA遺伝子、rpiA遺伝子、argP遺伝子、argK遺伝子、argO遺伝子、mscS遺伝子、fbaA遺伝子、pgk遺伝子、epd遺伝子、tktA遺伝子、speB遺伝子、speA遺伝子、metK遺伝子、galP遺伝子、sprT遺伝子、endA遺伝子、gshB遺伝子、ansB遺伝子、mutY遺伝子、mltC遺伝子、nupG遺伝子、speC遺伝子、pheV遺伝子、pitB遺伝子、gss遺伝子、hybG遺伝子、hybF遺伝子、hybE遺伝子、hybD遺伝子、hybC遺伝子、hybB遺伝子、hybA遺伝子、hybO遺伝子、exbD遺伝子、exbB遺伝子、metC遺伝子、dkgA遺伝子、sufI遺伝子、plsC遺伝子、parC遺伝子、parE遺伝子、cpdA遺伝子、nudF遺伝子、tolC遺伝子、zupT遺伝子、ribB遺伝子、glgS遺伝子、rygD遺伝子、rfaE遺伝子、glnE遺伝子、htrG遺伝子、cca遺伝子、bacA遺伝子、folB遺伝子、ttdA遺伝子、ttdB遺伝子、rpsU遺伝子、dnaG遺伝子、rpoD遺伝子、ileX遺伝子、aer遺伝子、ebgR遺伝子、ebgA遺伝子、ebgC遺伝子、uxaA遺伝子、uxaC遺伝子、exuT遺伝子、exuR遺伝子、tdcG遺伝子、tdcF遺伝子、tdcE遺伝子、tdcD遺伝子、tdcC遺伝子、tdcB遺伝子、tdcA遺伝子、tdcR遺伝子、rnpB遺伝子、garK遺伝子、garR遺伝子、garL遺伝子、garP遺伝子、garD遺伝子、sohA遺伝子、agaR遺伝子、kbaZ遺伝子、agaV遺伝子、agaW遺伝子、agaA遺伝子、agaS遺伝子、kbaY遺伝子、agaB遺伝子、agaC遺伝子、agaD遺伝子、agaI遺伝子、mtr遺伝子、deaD遺伝子、nlpI遺伝子、pnp遺伝子、sraG遺伝子、rpsO遺伝子、truB遺伝子、rbfA遺伝子、infB遺伝子、nusA遺伝子、metY遺伝子、argG遺伝子、leuU遺伝子、secG遺伝子、glmM遺伝子、folP遺伝子、ftsH遺伝子、rrmJ遺伝子、greA遺伝子、dacB遺伝子、obgE遺伝子、rpmA遺伝子、rplU遺伝子、ispB遺伝子、sfsB遺伝子、murA遺伝子、kdsD遺伝子、kdsC遺伝子、rpoN遺伝子、ptsN遺伝子、npr遺伝子、mtgA遺伝子、elbB遺伝子、ryhA遺伝子、arcB遺伝子、gltB遺伝子、gltD遺伝子、nanT遺伝子、nanA遺伝子、nanR遺伝子、dcuD遺伝子、sspB遺伝子、sspA遺伝子、rpsI遺伝子、rplM遺伝子、degQ遺伝子、degS遺伝子、mdh遺伝子、argR遺伝子、aaeB遺伝子、aaeA遺伝子、aaeX遺伝子、aaeR遺伝子、tldD遺伝子、rng遺伝子、mreD遺伝子、mreC遺伝子、mreB遺伝子、accB遺伝子、accC遺伝子、panF遺伝子、prmA遺伝子、dusB遺伝子、fis遺伝子、rrfF遺伝子、thrV遺伝子、rrfD遺伝子、rrlD遺伝子、gltV遺伝子、rrsD遺伝子、purH遺伝子、purD遺伝子、zraR遺伝子、zraS遺伝子、zraP遺伝子、hupA遺伝子、nfi遺伝子、hemE遺伝子、nudC遺伝子、rsd遺伝子、thiC遺伝子、thiE遺伝子、thiF遺伝子、thiS遺伝子、thiG遺伝子、thiH遺伝子、htrC遺伝子、rpoC遺伝子、rpoB遺伝子、rplL遺伝子、rplJ遺伝子、rplA遺伝子、rplK遺伝子、nusG遺伝子、secE遺伝子、tufB遺伝子、thrT遺伝子、glyT遺伝子、tyrU遺伝子、thrU遺伝子、coaA遺伝子、birA遺伝子、murB遺伝子、rrfB遺伝子、rrlB遺伝子、gltT遺伝子、rrsB遺伝子、murI遺伝子、btuB遺伝子、trmA遺伝子、fabR遺伝子、sthA遺伝子、oxyR遺伝子、oxyS遺伝子、argH遺伝子、argB遺伝子、argC遺伝子、argE遺伝子、ppc遺伝子、fsaB遺伝子、gldA遺伝子、katG遺伝子、metF遺伝子、metL遺伝子、metB遺伝子、metJ遺伝子、rpmE遺伝子、priA遺伝子、cytR遺伝子、ftsN遺伝子、hslV遺伝子、hslU遺伝子、menA遺伝子、rraA遺伝子、glpF遺伝子、glpK遺伝子、glpX遺伝子、fpr遺伝子、tpiA遺伝子、cdh遺伝子、sbp遺伝子、pfkA遺伝子、fieF遺伝子、cpxP遺伝子、cpxR遺伝子、cpxA遺伝子、kdgT遺伝子、sodA遺伝子、fdhD遺伝子、fdoG遺伝子、fdoH遺伝子、fdoI遺伝子、fdhE遺伝子、bipA遺伝子、glnA遺伝子、glnL遺伝子、glnG遺伝子、hemN遺伝子、csrC遺伝子、spf遺伝子、polA遺伝子、dsbA遺伝子、mobA遺伝子、mobB遺伝子、rrfA遺伝子、rrlA遺伝子、alaT遺伝子、ileT遺伝子、rrsA遺伝子、hemG遺伝子、trkH遺伝子、pepQ遺伝子、fadB遺伝子、fadA遺伝子、fre遺伝子、ubiD遺伝子、rfaH遺伝子、tatD遺伝子、tatC遺伝子、tatB遺伝子、tatA遺伝子、ubiB遺伝子、ubiE遺伝子、rmuC遺伝子、udp遺伝子、metE遺伝子、metR遺伝子、pldB遺伝子、rhtB遺伝子、rhtC遺伝子、recQ遺伝子、pldA遺伝子、rarD遺伝子、corA遺伝子、uvrD遺伝子、xerC遺伝子、dapF遺伝子、cyaY遺伝子、cyaA遺伝子、hemC遺伝子、hemD遺伝子、hemX遺伝子、hemY遺伝子、ryiA遺伝子、aslA遺伝子、aslB遺伝子、proM遺伝子、leuT遺伝子、hisR遺伝子、argX遺伝子、rffM遺伝子、wzyE遺伝子、rffT遺伝子、wzxE遺伝子、rffA遺伝子、rffC遺伝子、rffH遺伝子、rffG遺伝子、rffD遺伝子、rffE遺伝子、wzzE遺伝子、rfe遺伝子、rho遺伝子、rhoL遺伝子、trxA遺伝子、rhlB遺伝子、gpp遺伝子、rep遺伝子、ppiC遺伝子、ilvC遺伝子、ilvY遺伝子、ilvA遺伝子、ilvD遺伝子、ilvE遺伝子、ilvM遺伝子、ilvG_2遺伝子、ilvG_1遺伝子、ilvL遺伝子、hdfR遺伝子、trpT遺伝子、aspT遺伝子、rrfC遺伝子、rrlC遺伝子、gltU遺伝子、rrsC遺伝子、asnC遺伝子、mioC遺伝子、oriC遺伝子、gidA遺伝子、gidB遺伝子、atpI遺伝子、atpB遺伝子、atpE遺伝子、atpF遺伝子、atpH遺伝子、atpA遺伝子、atpG遺伝子、atpD遺伝子、atpC遺伝子、glmU遺伝子、glmS遺伝子、pstS遺伝子、pstC遺伝子、pstA遺伝子、pstB遺伝子、phoU遺伝子、bglG遺伝子、bglF遺伝子、bglB遺伝子、bglH遺伝子、cbrC遺伝子、mdtL遺伝子、tnaB遺伝子、tnaA遺伝子、tnaC遺伝子、trmE遺伝子、rnpA遺伝子、rpmH遺伝子、dnaA遺伝子、dnaN遺伝子、recF遺伝子、gyrB遺伝子、ibpA遺伝子、ibpB遺伝子、emrD遺伝子、ivbL遺伝子、ilvB遺伝子、ilvN遺伝子、uhpA遺伝子、uhpB遺伝子、uhpC遺伝子、uhpT遺伝子、selC遺伝子、gltS遺伝子、recG遺伝子、trmH遺伝子、spoT遺伝子、rpoZ遺伝子、gmk遺伝子、ligB遺伝子、dinD遺伝子、rph遺伝子、pyrE遺伝子、ttk遺伝子、dut遺伝子、dfp遺伝子、rpmB遺伝子、rpmG遺伝子、mutM遺伝子、coaD遺伝子、kdtA遺伝子、rfaQ遺伝子、rfaG遺伝子、rfaP遺伝子、rfaS遺伝子、rfaB遺伝子、rfaI遺伝子、rfaJ遺伝子、rfaY遺伝子、rfaZ遺伝子、rfaK遺伝子、rfaL遺伝子、rfaC遺伝子、rfaF遺伝子、rfaD遺伝子、htrL遺伝子、kbl遺伝子、tdh遺伝子、envC遺伝子、gpmI遺伝子、grxC遺伝子、secB遺伝子、gpsA遺伝子、cysE遺伝子、lldD遺伝子、lldR遺伝子、lldP遺伝子、mtlR遺伝子、mtlD遺伝子、mtlA遺伝子、selA遺伝子、selB遺伝子、aldB遺伝子、sgbE遺伝子、sgbU遺伝子、sgbH遺伝子、lyxK遺伝子、avtA遺伝子、malS遺伝子、bax遺伝子、xylR遺伝子、xylH遺伝子、xylG遺伝子、xylF遺伝子、xylA遺伝子、xylB遺伝子、glyQ遺伝子
    、glyS遺伝子、hokA遺伝子、cspA遺伝子、tiaE遺伝子、bisC遺伝子、tag遺伝子、eptB遺伝子、proK遺伝子、dppA遺伝子、dppB遺伝子、dppC遺伝子、dppD遺伝子、dppF遺伝子、rdlD遺伝子、ldrD遺伝子、bcsG遺伝子、bcsF遺伝子、bcsE遺伝子、bcsA遺伝子、bcsB遺伝子、bcsZ遺伝子、bcsC遺伝子、dctA遺伝子、kdgK遺伝子、treF遺伝子、gadA遺伝子、gadX遺伝子、gadY遺伝子、gadW遺伝子、mdtF遺伝子、mdtE遺伝子、gadE遺伝子、hdeD遺伝子、hdeA遺伝子、hdeB遺伝子、slp遺伝子、arsC遺伝子、arsB遺伝子、arsR遺伝子、gor遺伝子、prlC遺伝子、uspA遺伝子、pitA遺伝子、nikR遺伝子、nikE遺伝子、nikD遺伝子、nikC遺伝子、nikB遺伝子、nikA遺伝子、acpT遺伝子、dcrB遺伝子、zntA遺伝子、ftsY遺伝子、ftsE遺伝子、ftsX遺伝子、rpoH遺伝子、livJ遺伝子、livK遺伝子、livH遺伝子、livM遺伝子、livG遺伝子、livF遺伝子、ugpB遺伝子、ugpA遺伝子、ugpE遺伝子、ugpC遺伝子、ugpQ遺伝子、ggt遺伝子、gntR遺伝子、gntK遺伝子、gntU遺伝子、asd遺伝子、glgB遺伝子、glgX遺伝子、glgC遺伝子、glgA遺伝子、glgP遺伝子、glpD遺伝子、glpE遺伝子、glpG遺伝子、glpR遺伝子、rtcR遺伝子、rtcB遺伝子、rtcA遺伝子、malT遺伝子、malP遺伝子、malQ遺伝子、gntT遺伝子、gntY遺伝子、gntX遺伝子、bioH遺伝子、feoB遺伝子、feoA遺伝子、greB遺伝子、ompR遺伝子、envZ遺伝子、pck遺伝子、hslO遺伝子、hslR遺伝子、nudE遺伝子、mrcA遺伝子、hofQ遺伝子、aroK遺伝子、aroB遺伝子、damX遺伝子、dam遺伝子、rpe遺伝子、gph遺伝子、trpS遺伝子、cysG遺伝子、nirC遺伝子、nirD遺伝子、nirB遺伝子、tsgA遺伝子、ppiA遺伝子、fic遺伝子、pabA遺伝子、argD遺伝子、crp遺伝子、prkB遺伝子、kefG遺伝子、kefB遺伝子、slyD遺伝子、slyX遺伝子、fkpA遺伝子、rpsL遺伝子、rpsG遺伝子、fusA遺伝子、tufA遺伝子、rpsJ遺伝子、rplC遺伝子、rplD遺伝子、rplW遺伝子、rplB遺伝子、rpsS遺伝子、rplV遺伝子、rpsC遺伝子、rplP遺伝子、rpmC遺伝子、rpsQ遺伝子、rplN遺伝子、rplX遺伝子、rplE遺伝子、rpsN遺伝子、rpsH遺伝子、rplF遺伝子、rplR遺伝子、rpsE遺伝子、rpmD遺伝子、rplO遺伝子、secY遺伝子、rpmJ遺伝子、rpsM遺伝子、rpsK遺伝子、rpsD遺伝子、rpoA遺伝子、rplQ遺伝子、zntR遺伝子、mscL遺伝子、trkA遺伝子、rsmB遺伝子、fmt遺伝子、def遺伝子、smf遺伝子、smg遺伝子、aroE遺伝子、rrsE遺伝子、ileU遺伝子、alaU遺伝子、rrlE遺伝子、rrfE遺伝子、metA遺伝子、aceB遺伝子、aceA遺伝子、aceK遺伝子、arpA遺伝子、iclR遺伝子、metH遺伝子、pepE遺伝子、lysC遺伝子、pgi遺伝子、ubiC遺伝子、ubiA遺伝子、plsB遺伝子、dgkA遺伝子、lexA遺伝子、dinF遺伝子、zur遺伝子、qor遺伝子、dnaB遺伝子、alr遺伝子、tyrB遺伝子、aphA遺伝子、uvrA遺伝子、ssb遺伝子、soxS遺伝子、soxR遺伝子、ryjA遺伝子、actP遺伝子、acs遺伝子、nrfA遺伝子、nrfB遺伝子、nrfC遺伝子、nrfD遺伝子、nrfE遺伝子、nrfF遺伝子、nrfG遺伝子、gltP遺伝子、fdhF遺伝子、rpiR遺伝子、rpiB遺伝子、proP遺伝子、basS遺伝子、basR遺伝子、eptA遺伝子、adiC遺伝子、adiY遺伝子、adiA遺伝子、melR遺伝子、melA遺伝子、melB遺伝子、fumB遺伝子、dcuB遺伝子、dcuR遺伝子、dcuS遺伝子、lysU遺伝子、cadA遺伝子、cadB遺伝子、cadC遺伝子、pheU遺伝子、dipZ遺伝子、cutA遺伝子、dcuA遺伝子、aspA遺伝子、fxsA遺伝子、groS遺伝子、groL遺伝子、efp遺伝子、ecnA遺伝子、ecnB遺伝子、sugE遺伝子、blc遺伝子、ampC遺伝子、frdD遺伝子、frdC遺伝子、frdB遺伝子、frdA遺伝子、poxA遺伝子、psd遺伝子、rsgA遺伝子、orn遺伝子、glyV遺伝子、glyX遺伝子、glyY遺伝子、amiB遺伝子、mutL遺伝子、miaA遺伝子、hfq遺伝子、hflX遺伝子、hflK遺伝子、hflC遺伝子、purA遺伝子、rnr遺伝子、rlmB遺伝子、ulaF遺伝子、rpsF遺伝子、priB遺伝子、rpsR遺伝子、rplI遺伝子、fklB遺伝子、cycA遺伝子、cpdB遺伝子、cysQ遺伝子、msrA遺伝子、chpS遺伝子、chpB遺伝子、ppa遺伝子、fbp遺伝子、mpl遺伝子、pmbA遺伝子、cybC遺伝子、nrdG遺伝子、nrdD遺伝子、treC遺伝子、treB遺伝子、treR遺伝子、mgtA遺伝子、pyrI遺伝子、pyrB遺伝子、pyrL遺伝子、argI遺伝子、valS遺伝子、holC遺伝子、pepA遺伝子、idnR遺伝子、idnT遺伝子、idnO遺伝子、idnD遺伝子、idnK遺伝子、leuX遺伝子、dnaC遺伝子、dnaT遺伝子、bglJ遺伝子、fhuF遺伝子、leuV遺伝子、leuP遺伝子、leuQ遺伝子、rsmC遺伝子、holD遺伝子、rimI遺伝子、prfC遺伝子、osmY遺伝子、deoC遺伝子、deoA遺伝子、deoB遺伝子、deoD遺伝子、lplA遺伝子、serB遺伝子、radA遺伝子、nadR遺伝子、slt遺伝子、trpR遺伝子、rob遺伝子、creA遺伝子、creB遺伝子、creC遺伝子、creD遺伝子、arcA遺伝子
    ［２]fhuA遺伝子、fhuC遺伝子、fhuD遺伝子、fhuB遺伝子、yafJ遺伝子、yafK遺伝子、yafQ遺伝子、dinJ遺伝子、yafL遺伝子、yafM遺伝子、fhiA遺伝子、mbhA遺伝子、dinB遺伝子、yafN遺伝子、yafO遺伝子、yafP遺伝子、ykfJ遺伝子、prfH遺伝子、yagP遺伝子、yagQ遺伝子、yagR遺伝子、yagS遺伝子、yagT遺伝子、yagU遺伝子、ykgJ遺伝子、yagV遺伝子、yagW遺伝子、yagX遺伝子、yagY遺伝子、yagZ遺伝子、ykgK遺伝子、ykgL遺伝子、ykgM(JW5034)遺伝子、ykgM(JW5035)遺伝子、eaeH遺伝子、ykgA遺伝子、ykgB遺伝子、ykgI遺伝子、ykgC遺伝子、ykgD遺伝子、ykgE遺伝子、ykgF遺伝子、ykgG遺伝子、ykgH遺伝子、betA遺伝子、betB遺伝子、betI遺伝子、betT遺伝子、yahA遺伝子、yahB遺伝子、yahC遺伝子、yahD遺伝子、yahE遺伝子、yahF遺伝子、yahG遺伝子、yahH遺伝子、yahI遺伝子、yahJ遺伝子、yahK遺伝子、yahL遺伝子、yahM遺伝子、yahN遺伝子、yahO遺伝子、prpR遺伝子、prpB遺伝子、prpC遺伝子、prpD遺伝子、prpE遺伝子、codB遺伝子、codA遺伝子、cynR遺伝子、cynT遺伝子、cynS遺伝子、cynX遺伝子、lacA遺伝子、lacY遺伝子、lacZ遺伝子、lacI遺伝子、mhpR遺伝子、mhpA遺伝子、mhpB遺伝子、mhpC遺伝子、mhpD遺伝子、mhpF遺伝子、mhpE遺伝子、mhpT遺伝子、yaiL遺伝子、frmB遺伝子、frmA遺伝子、frmR遺伝子、yaiO遺伝子、yaiX遺伝子、yaiF遺伝子、yaiP遺伝子、yaiS遺伝子、tauA遺伝子、tauB遺伝子、tauC遺伝子、tauD遺伝子、yaiT遺伝子、yaiU遺伝子、yaiV遺伝子、ampH遺伝子、sbmA遺伝子、yaiW遺伝子、yaiY遺伝子、yaiZ遺伝子、ddlA遺伝子、yaiB遺伝子、phoA遺伝子、psiF遺伝子、yaiC遺伝子、ybbO遺伝子、tesA遺伝子、ybbA遺伝子、ybbP遺伝子、ylbG遺伝子、ybbB遺伝子、ybbS遺伝子、allA遺伝子、allR遺伝子、glxR遺伝子、ybbV遺伝子、ybbW遺伝子、allB遺伝子、ybbY遺伝子、glxK遺伝子、ylbA遺伝子、allC遺伝子、allD遺伝子、fdrA遺伝子、ylbE_1遺伝子、ylbE_2遺伝子、ylbF遺伝子、ybcF遺伝子、envY遺伝子、ybcH遺伝子、nfrA遺伝子、nfrB遺伝子、cusS遺伝子、cusR遺伝子、cusC遺伝子、cusF遺伝子、cusB遺伝子、cusA遺伝子、pheP遺伝子、ybdG遺伝子、nfnB遺伝子、ybdF遺伝子、ybdJ遺伝子、ybdK遺伝子、hokE遺伝子、ybeL遺伝子、ybeQ遺伝子、ybeR遺伝子、djlB遺伝子、ybeT遺伝子、ybeU遺伝子、djlC遺伝子、hscC遺伝子、rihA遺伝子、gltL遺伝子、gltK遺伝子、gltJ遺伝子、gltI遺伝子、kdpF遺伝子、ybfA遺伝子、ybgA遺伝子、phr遺伝子、ybiA遺伝子、dinG遺伝子、ybiB遺伝子、ybiC遺伝子、ybiJ遺伝子、ybiI遺伝子、ybiX遺伝子、fiu遺伝子、ybiM遺伝子、ybiN遺伝子、ybiO遺伝子、glnQ遺伝子、glnP遺伝子、glnH遺伝子、yliA遺伝子、yliB遺伝子、yliC遺伝子、yliD遺伝子、yliE遺伝子、yliF遺伝子、yliG遺伝子、yliH遺伝子、yliI遺伝子、yliJ遺伝子、dacC遺伝子、deoR遺伝子、ybjG遺伝子、ybjC遺伝子、nfsA遺伝子、rimK遺伝子、ybjN遺伝子、potF遺伝子、potG遺伝子、potH遺伝子、potI遺伝子、ybjO遺伝子、rumB遺伝子、artJ遺伝子、artM遺伝子、artQ遺伝子、artI遺伝子、artP遺伝子、ybjP遺伝子、ybjQ遺伝子、ybjR遺伝子、ybjS遺伝子、ybjT遺伝子、ltaE遺伝子、ymcC遺伝子、ymcD遺伝子、cspH遺伝子、cspG遺伝子、ymcE遺伝子、gnsA遺伝子、yccM遺伝子、torS遺伝子、torT遺伝子、torR遺伝子、torC遺伝子、torA遺伝子、torD遺伝子、cbpM遺伝子、cbpA遺伝子、yccE遺伝子、agp遺伝子、yccJ遺伝子、wrbA遺伝子、ymdF遺伝子、ycdG遺伝子、ycdH遺伝子、ycdI遺伝子、rarA遺伝子、ycdK遺伝子、ycdL遺伝子、ycdM遺伝子、ycdC遺伝子、putA遺伝子、putP遺伝子、ycdN_1遺伝子、ycdN_2遺伝子、ycdO遺伝子、ycdB遺伝子、phoH遺伝子、ycdP遺伝子、ycdQ遺伝子、ycdR遺伝子、ycdS遺伝子、ycdT遺伝子、ymdE遺伝子、ycdU遺伝子、elbA遺伝子、ycgX遺伝子、ycgE遺伝子、ycgF遺伝子、ycgZ遺伝子、ymgA遺伝子、ymgB遺伝子、ymgC遺伝子、ycgG遺伝子、ymgF遺伝子、ycgH_1遺伝子、ycgH_2遺伝子、ymgD遺伝子、ymgG遺伝子、ymgH遺伝子、ycgI遺伝子、ydfH遺伝子、ydfZ遺伝子、ydfI遺伝子、ydfJ遺伝子、yecT遺伝子、flhE遺伝子、flhA遺伝子、flhB遺伝子、cheZ遺伝子、cheY遺伝子、cheB遺伝子、cheR遺伝子、tap遺伝子、tar遺伝子、cheW遺伝子、cheA遺伝子、motB遺伝子、motA遺伝子、flhC遺伝子、flhD遺伝子、yecG遺伝子、otsA遺伝子、otsB遺伝子、araH遺伝子、araG遺伝子、araF遺伝子、yecI遺伝子、yecJ遺伝子、isrB遺伝子、yecR遺伝子、ftn遺伝子、yecH遺伝子、tyrP遺伝子、uvrC遺伝子、uvrY遺伝子、yecF遺伝子、sdiA遺伝子、yecC遺伝子、yecS遺伝子、yedO遺伝子、fliY遺伝子、fliZ遺伝子、fliA遺伝子、fliC遺伝子、fliD遺伝子、fliS遺伝子、fliT遺伝子、amyA遺伝子、yedD遺伝子、yedE遺伝子、yedF遺伝子、yedK遺伝子、yedL遺伝子、yedN_2遺伝子、yedN_1遺伝子、yedM遺伝子、intG遺伝子、fliE遺伝子、fliF遺伝子、fliG遺伝子、fliH遺伝子、fliI遺伝子、fliJ遺伝子、fliK遺伝子、fliL遺伝子、fliM遺伝子、fliN遺伝子、fliO遺伝子、fliP遺伝子、fliQ遺伝子、fliR遺伝子、rcsA遺伝子、dsrB遺伝子、yodD遺伝子、yedA遺伝子、vsr遺伝子、dcm遺伝子、yedJ遺伝子、yedR遺伝子、yedS_1遺伝子、yedS_2遺伝子、yedS_3遺伝子、hchA遺伝子、yedV遺伝子、yedW遺伝子、yedX遺伝子、yedY遺伝子、yedZ遺伝子、yodA遺伝子、wbbL_2遺伝子、wbbL_1遺伝子、wbbK遺伝子、wbbJ遺伝子、wbbI遺伝子、wbbH遺伝子、glf遺伝子、rfbX遺伝子、rfbC遺伝子、rfbA遺伝子、rfbD遺伝子、rfbB遺伝子、yegE遺伝子、alkA遺伝子、yegD遺伝子、yegI遺伝子、yegJ遺伝子、yegK遺伝子、yegL遺伝子、ryeC遺伝子、ryeD遺伝子、mdtA遺伝子、mdtB遺伝子、mdtC遺伝子、mdtD遺伝子、baeS遺伝子、baeR遺伝子、yegP遺伝子、yegQ遺伝子、ryeE遺伝子、ogrK遺伝子、yegZ遺伝子、yegR遺伝子、yegS遺伝子、gatR_1遺伝子、gatR_2遺伝子、gatD遺伝子、gatC遺伝子、gatB遺伝子、gatA遺伝子、gatZ遺伝子、gatY遺伝子、fbaB遺伝子、yegT遺伝子、yegU遺伝子、yegV遺伝子、yegW遺伝子、yegX遺伝子、molR_1遺伝子、molR_2遺伝子、molR_3遺伝子、yehI遺伝子、yehK遺伝子、yehL遺伝子、yehM遺伝子、yehP遺伝子、yehQ遺伝子、yehR遺伝子、yehS遺伝子、yehT遺伝子、yehU遺伝子、mlrA遺伝子、yohO遺伝子、yehW遺伝子、yehX遺伝子、yehY遺伝子、yehZ遺伝子、bglX遺伝子、dld遺伝子、pbpG遺伝子、yohC遺伝子、yeiI遺伝子、yeiJ遺伝子、rihB遺伝子、yeiL遺伝子、yeiM遺伝子、yeiN遺伝子、yeiC遺伝子、elaB遺伝子、elaA遺伝子、elaC遺伝子、elaD遺伝子、yfbK遺伝子、yfbL遺伝子、yfbM遺伝子、yfbN遺伝子、yfbO遺伝子、yfbP遺伝子、yfcC遺伝子、yfcD遺伝子、yfcE遺伝子、yfcF遺伝子、yfcG遺伝子、folX遺伝子、yfcH遺伝子、yfcI遺伝子、hisP遺伝子、hisM遺伝子、hisQ遺伝子、hisJ遺伝子、argT遺伝子、ypdA遺伝子、ypdB遺伝子、ypdC遺伝子、ypdD遺伝子、ypdE遺伝子、ypdF遺伝子、ypdG遺伝子、ypdH遺伝子、pinH遺伝子、ypjB遺伝子、ypjC遺伝子、ileY遺伝子、ygaQ遺伝子、ygaR遺伝子、yqaC遺伝子、yqaD遺伝子、ygaT遺伝子、csiR遺伝子、ygaU遺伝子、yqaE遺伝子、ygaV遺伝子、ygaP遺伝子、stpA遺伝子、ygaW遺伝子、ygaC遺伝子、ygaM遺伝子、nrdH遺伝子、nrdI遺伝子、nrdE遺伝子、proV遺伝子、proW遺伝子、proX遺伝子、ygaX遺伝子、ygaY遺伝子、ygaZ遺伝子、ygaH遺伝子、srlA遺伝子、srlE遺伝子、srlB遺伝子、srlD遺伝子、gutM遺伝子、srlR遺伝子、gutQ遺伝子、yqeG遺伝子、yqeH遺伝子、yqeI遺伝子、yqeJ遺伝子、yqeK遺伝子、ygeF遺伝子、ygeG遺伝子、ygeH遺伝子、ygeI遺伝子、pbl遺伝子、ygeK遺伝子、ygeL遺伝子、ygeM遺伝子、ygeN遺伝子、ygeO遺伝子、ygeP遺伝子、ygeQ遺伝子、glyU遺伝子、ygeR遺伝子、xdhA遺伝子、xdhB遺伝子、xdhC遺伝子、ygeV遺伝子、ygeW遺伝子、ygeX遺伝子、ygeY遺伝子、hyuA遺伝子、yqeA遺伝子、yqeB遺伝子、yqeC遺伝子、ygfJ遺伝子、ygfK遺伝子、ssnA遺伝子、ygfM遺伝子、xdhD遺伝子、ygfO遺伝子、guaD遺伝子、ygfQ遺伝子、ygfS遺伝子、ygfT遺伝子、ygfU遺伝子、idi遺伝子、cmtA遺伝子、cmtB遺伝子、yghD遺伝子、yghE遺伝子、yghF遺伝子、yghG遺伝子、pppA遺伝子、yghJ遺伝子、yghK遺伝子、glcB遺伝子、glcG遺伝子、glcF遺伝子、glcE遺伝子、glcD遺伝子、glcC遺伝子、yghO遺伝子、yghQ遺伝子、yghR遺伝子、yghS遺伝子、yghT遺伝子、ygiS遺伝子、ygiT遺伝子、ygiU遺伝子、ygiV遺伝子、ygiW遺伝子、qseB遺伝子、qseC遺伝子、ygiZ遺伝子、mdaB遺伝子、ygiN遺伝子、gltF遺伝子、yhcA遺伝子、yhcD遺伝子、yhcE遺伝子、yhcF遺伝子、yhcG遺伝子、yhcH遺伝子、nanK遺伝子、nanE遺伝子、yhdJ遺伝子、yhdU遺伝子、envR遺伝子、acrE遺伝子、acrF遺伝子、yhdV遺伝子、yhdW遺伝子、yhdX遺伝子、yhdY遺伝子、yijP遺伝子、yijO遺伝子、frwD遺伝子、pflC遺伝子、pflD遺伝子、frwB遺伝子、frwC遺伝子、ptsA遺伝子、rhaT遺伝子、rhaR遺伝子、rhaS遺伝子、rhaB遺伝子、rhaA遺伝子、rhaD遺伝子、yiiL遺伝子、frvA遺伝子、frvB遺伝子、frvX遺伝子、frvR遺伝子、yiiG遺伝子、yiiF遺伝子、yiiE遺伝子、yiiD遺伝子、dtd遺伝子、rbn遺伝子、yihX遺伝子、yihW遺伝子、yihV遺伝子、yihU遺伝子、yihT遺伝子、yihS遺伝子、yihR遺伝子、yihQ遺伝子、yihP遺伝子、yihO遺伝子、ompL遺伝子、yihN遺伝子、yihM遺伝子、yihL遺伝子、hsrA遺伝子、rbsR遺伝子、rbsK遺伝子、rbsB遺伝子、rbsC遺伝子、rbsA遺伝子、rbsD遺伝子、trkD遺伝子、yieN遺伝子、yieM遺伝子、asnA遺伝子、yidB遺伝子、yidA遺伝子、yidX遺伝子、dgoR遺伝子、dgoK遺伝子、dgoA遺伝子、dgoD遺伝子、dgoT遺伝子、cbrA遺伝子、yidR遺伝子、yidQ遺伝子、yidE遺伝子、yidP遺伝子、glvC遺伝子、glvB遺伝子、glvG遺伝子、ysdC遺伝子、yidL遺伝子、yidK遺伝子、yidJ遺伝子、yidI遺伝子、yidH遺伝子、yidG遺伝子、yidF遺伝子、yhiN遺伝子、yhiM遺伝子、yhiL遺伝子、yhiK遺伝子、yhiJ遺伝子、yhiI遺伝子、rbbA遺伝子、yhhJ遺伝子、chiA遺伝子、bfd遺伝子、bfr遺伝子、gspO遺伝子、gspM遺伝子、gspL遺伝子、gspK遺伝子、gspJ遺伝子、gspI遺伝子、gspH遺伝子、gspG遺伝子、gspF遺伝子、gspE遺伝子、gspD遺伝子、gspC遺伝子、gspA遺伝子、pioO遺伝子、yjbE遺伝子、yjbF遺伝子、yjbG遺伝子、yjbH遺伝子、yjbA遺伝子、xylE遺伝子、malG遺伝子、malF遺伝子、malE遺伝子、malK遺伝子、lamB遺伝子、malM遺伝子、yjbI遺伝子、yjcP遺伝子、yjcQ遺伝子、yjcR遺伝子、yjcS遺伝子、alsK遺伝子、alsE遺伝子、alsC遺伝子、alsA遺伝子、alsB遺伝子、yjdP遺伝子、phnP遺伝子、phnO遺伝子、phnN遺伝子、phnM遺伝子、phnL遺伝子、phnK遺伝子、phnJ遺伝子、phnI遺伝子、phnH遺伝子、phnG遺伝子、phnF遺伝子、phnE(JW4064)遺伝子、phnE(JW4065)遺伝子、phnD遺伝子、phnC遺伝子、phnB遺伝子、phnA遺伝子、yjdA遺伝子、yjcZ遺伝子、yjfI遺伝子、yjfJ遺伝子、yjfK遺伝子、yjfL遺伝子、yjfM遺伝子、yjfC遺伝子、aidB遺伝子、yjfN遺伝子、yjfO遺伝子、yjfP遺伝子、ulaR遺伝子、ulaG遺伝子、ulaA遺伝子、ulaB遺伝子、ulaC遺伝子、ulaD遺伝子、ulaE遺伝子、yjhS遺伝子、yjhT遺伝子、yjhA遺伝子、fimB遺伝子、fimE遺伝子、fimA遺伝子、fimI遺伝子、fimC遺伝子、fimD遺伝子、fimF遺伝子、fimG遺伝子、fimH遺伝子、gntP遺伝子、uxuA遺伝子、uxuB遺伝子、uxuR遺伝子、yjiC遺伝子、yjiD遺伝子、yjiE遺伝子、iadA遺伝子、yjiG遺伝子、yjiH遺伝子、kptA遺伝子、yjiJ遺伝子、yjiK遺伝子、yjiL遺伝子、yjiM遺伝子、yjiN遺伝子、yjiO遺伝子、yjiP遺伝子、yjiQ遺伝子、yjiR遺伝子、yjiS遺伝子、yjiT遺伝子、yjiV遺伝子、mcrC遺伝子、mcrB遺伝子、yjiW遺伝子、hsdS遺伝子、hsdM遺伝子、hsdR遺伝子、mrr遺伝子、yjiA遺伝子、yjiX遺伝子、yjiY遺伝子、tsr遺伝子、yjiZ遺伝子、yjjM遺伝子、yjjN遺伝子、mdoB遺伝子、yjjA遺伝子
  2. 　配列番号１で表される塩基配列中の以下の［１］～［８３］記載の塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含む染色体ＤＮＡを有する請求項１記載の大腸菌の変異体。
    ［１］1番～15298番目で表される塩基配列
    ［２］16751番～19620番目で表される塩基配列
    ［３］20815番～65857番目で表される塩基配列
    ［４］78797番～167400番目で表される塩基配列
    ［５］173316番～244300番目で表される塩基配列
    ［６］253747番～262299番目で表される塩基配列
    ［７］387868番～389474番目で表される塩基配列
    ［８］404040番～518365番目で表される塩基配列
    ［９］533048番～535840番目で表される塩基配列
    ［１０］550552番～564276番目で表される塩基配列
    ［１１］608455番～640668番目で表される塩基配列
    ［１２］659193番～675439番目で表される塩基配列
    ［１３］689711番～729156番目で表される塩基配列
    ［１４］739930番～832888番目で表される塩基配列
    ［１５］848427番～867974番目で表される塩基配列
    ［１６］883811番～891334番目で表される塩基配列
    ［１７］909717番～1049224番目で表される塩基配列
    ［１８］1097358番～1105534番目で表される塩基配列
    ［１９］1106991番～1196528番目で表される塩基配列
    ［２０］1225485番～1295721番目で表される塩基配列
    ［２１］1297023番～1300822番目で表される塩基配列
    ［２２］1302896番～1397636番目で表される塩基配列
    ［２３］1399079番～1413662番目で表される塩基配列
    ［２４］1436899番～1469664番目で表される塩基配列
    ［２５］1472404番～1504839番目で表される塩基配列
    ［２６］1506619番～1528866番目で表される塩基配列
    ［２７］1534766番～1630050番目で表される塩基配列
    ［２８］1654610番～1853604番目で表される塩基配列
    ［２９］1864144番～1875287番目で表される塩基配列
    ［３０］1888500番～1963662番目で表される塩基配列
    ［３１］1992215番～1995800番目で表される塩基配列
    ［３２］2027349番～2032587番目で表される塩基配列
    ［３３］2043516番～2068287番目で表される塩基配列
    ［３４］2081066番～2103531番目で表される塩基配列
    ［３５］2115204番～2145402番目で表される塩基配列
    ［３６］2186995番～2199807番目で表される塩基配列
    ［３７］2228990番～2255033番目で表される塩基配列
    ［３８］2262631番～2292234番目で表される塩基配列
    ［３９］2293834番～2324498番目で表される塩基配列
    ［４０］2322075番～2411311番目で表される塩基配列
    ［４１］2413007番～2422503番目で表される塩基配列
    ［４２］2433238番～2471990番目で表される塩基配列
    ［４３］2482140番～2504213番目で表される塩基配列
    ［４４］2513697番～2519690番目で表される塩基配列
    ［４５］2521089番～2599856番目で表される塩基配列
    ［４６］2613439番～2754814番目で表される塩基配列
    ［４７］2788619番～2794311番目で表される塩基配列
    ［４８］2800029番～2803445番目で表される塩基配列
    ［４９］2809286番～2824451番目で表される塩基配列
    ［５０］2829399番～2909409番目で表される塩基配列
    ［５１］2909710番～2921193番目で表される塩基配列
    ［５２］2943639番～2984497番目で表される塩基配列
    ［５３］3032267番～3076223番目で表される塩基配列
    ［５４］3078056番～3109245番目で表される塩基配列
    ［５５］3133480番～3164769番目で表される塩基配列
    ［５６］3172082番～3184621番目で表される塩基配列
    ［５７］3186056番～3224889番目で表される塩基配列
    ［５８］3240401番～3261074番目で表される塩基配列
    ［５９］3262220番～3361080番目で表される塩基配列
    ［６０］3370892番～3411501番目で表される塩基配列
    ［６１］3421222番～3486426番目で表される塩基配列
    ［６２］3496906番～3536155番目で表される塩基配列
    ［６３］3549687番～3556477番目で表される塩基配列
    ［６４］3576239番～3697304番目で表される塩基配列
    ［６５］3709527番～3742812番目で表される塩基配列
    ［６６］3744293番～3748980番目で表される塩基配列
    ［６７］3747997番～3750486番目で表される塩基配列
    ［６８］3751906番～3762908番目で表される塩基配列
    ［６９］3772817番～3774086番目で表される塩基配列
    ［７０］3785257番～3794687番目で表される塩基配列
    ［７１］3803459番～3868134番目で表される塩基配列
    ［７２］3878460番～3918087番目で表される塩基配列
    ［７３］3919815番～3986454番目で表される塩基配列
    ［７４］3988342番～4003004番目で表される塩基配列
    ［７５］4021347番～4055371番目で表される塩基配列
    ［７６］4061466番～4128290番目で表される塩基配列
    ［７７］4141016番～4170562番目で表される塩基配列
    ［７８］4186909番～4239493番目で表される塩基配列
    ［７９］4255871番～4303000番目で表される塩基配列
    ［８０］4316735番～4318540番目で表される塩基配列
    ［８１］4334946番～4414758番目で表される塩基配列
    ［８２］4428378番～4501437番目で表される塩基配列
    ［８３］4604873番～4646332番目で表される塩基配列
  3. 　uspG遺伝子、ybdR遺伝子、rnk遺伝子、rna遺伝子、citT遺伝子、citG遺伝子、citX遺伝子、citF遺伝子、citE遺伝子、citD遺伝子、citC遺伝子、citA遺伝子、citB遺伝子、dcuC遺伝子、crcA遺伝子、cspE遺伝子、crcB遺伝子、ybeH遺伝子、およびybeM遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１または２記載の大腸菌の変異体。
  4. 　配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号塩基番号640669番～659192番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～３のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  5. 　yqcA遺伝子、yqcB遺伝子、yqcC遺伝子、syd遺伝子、yqcD遺伝子、ygdH遺伝子、sdaC遺伝子、sdaB遺伝子、exo遺伝子、fucO遺伝子、fucA遺伝子、fucP遺伝子、fucI遺伝子、fucK遺伝子、fucU遺伝子、fucR遺伝子、ygdE遺伝子、ygdD遺伝子、gcvA遺伝子、ygdI遺伝子、csdA遺伝子、およびygdK遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まず、かつchpA遺伝子またはその相同遺伝子を含む染色体ＤＮＡを有する請求項１～４のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  6. 　配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号2921194番～2943638番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～５のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  7. 　araD遺伝子、araA遺伝子、araB遺伝子、araC遺伝子、yabI遺伝子、thiQ遺伝子、thiP遺伝子、tbpA遺伝子、sgrR遺伝子、およびsetA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～６のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  8. 　配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号65858番～78796番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～７のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  9. 　yhfZ遺伝子、yhfY遺伝子、yhfX遺伝子、yhfW遺伝子、php遺伝子、yhfU遺伝子、yhfT遺伝子、yhfS遺伝子、frlR遺伝子、frlD遺伝子、frlC遺伝子、frlB遺伝子、frlA遺伝子、およびyhfL遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～８のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  10. 　配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号4128291番～4141015番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～９のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  11. 　pncA遺伝子、ydjE遺伝子、ydjF遺伝子、ydjG遺伝子、ydjH遺伝子、ydjI遺伝子、ydjJ遺伝子、ydjK遺伝子、ydjL遺伝子、yeaC遺伝子、およびyeaA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～１０のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  12. 　配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号1853605番～1864143番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～１１のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  13. 　ade遺伝子、yicO遺伝子、yicN遺伝子、yicM遺伝子、yicS遺伝子、nlpA遺伝子、yicL遺伝子、およびsetC遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～１２のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  14. 　配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号3794688番～3803458番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～１３のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  15. 　ygjI遺伝子、ygjJ遺伝子、ygjK遺伝子、fadH遺伝子、ygjM遺伝子、ygjN遺伝子、ygjO遺伝子、ygjP遺伝子、ygjQ遺伝子、ygjR遺伝子、alx遺伝子、sstT遺伝子、およびygjV遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～１４のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  16. 　配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号3224890番～3240400番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～１５のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  17. 　yrhB遺伝子、yrhA遺伝子、yhhZ遺伝子、yhhY遺伝子、yhhX遺伝子、およびyhhW遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～１６のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  18. 　配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号4055372番～4061465番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～１７のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  19. 　yeaK遺伝子、yoaI遺伝子、yeaL遺伝子、yeaM遺伝子、yeaN遺伝子、yeaO遺伝子、yoaF遺伝子、yeaP遺伝子、yeaQ遺伝子、yoaG遺伝子、yeaR遺伝子、yeaS遺伝子、yeaT遺伝子、yeaU遺伝子、yeaV遺伝子、yeaW遺伝子、およびyeaX遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～１８のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  20. 　配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号1875288番～1888499番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、またはそれらＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～１９のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  21. 　hyfA遺伝子、hyfB遺伝子、hyfC遺伝子、hyfD遺伝子、hyfE遺伝子、hyfF遺伝子、hyfG遺伝子、hyfH遺伝子、hyfI遺伝子、hyfJ遺伝子、hyfR遺伝子、およびfocB遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～２０のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  22. 　配列番号１で表される塩基配列中の塩基番号2599857番～2613438番目で表される塩基配列を有するＤＮＡ、または該ＤＮＡに相当するＤＮＡを含まない染色体ＤＮＡを有する請求項１～２１のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  23. 　以下の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子を含み、かつ［２］および［３］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子の１０％以下を含み、かつ野生型の大腸菌より１０４０kbp以上短い染色体ＤＮＡを有する大腸菌の変異体。ただし、以下の［１］記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子中に、ＮＣ遺伝子がある場合には、該野生型の大腸菌に由来する上記大腸菌の変異体は、ＮＣ遺伝子を有していなくてもよい。
    ［１］thrL遺伝子、thrA遺伝子、thrB遺伝子、thrC遺伝子、talB遺伝子、mog遺伝子、htgA遺伝子、dnaK遺伝子、dnaJ遺伝子、mokC遺伝子、hokC遺伝子、sokC遺伝子、nhaA遺伝子、nhaR遺伝子、rpsT遺伝子、ribF遺伝子、ileS遺伝子、lspA遺伝子、fkpB遺伝子、ispH遺伝子、rihC遺伝子、dapB遺伝子、carA遺伝子、carB遺伝子、caiF遺伝子、caiE遺伝子、caiD遺伝子、caiC遺伝子、caiB遺伝子、caiA遺伝子、caiT遺伝子、fixA遺伝子、fixB遺伝子、fixC遺伝子、fixX遺伝子、kefF遺伝子、kefC遺伝子、folA遺伝子、apaH遺伝子、apaG遺伝子、ksgA遺伝子、pdxA遺伝子、surA遺伝子、imp遺伝子、djlA遺伝子、rluA遺伝子、hepA遺伝子、polB遺伝子、leuD遺伝子、leuC遺伝子、leuB遺伝子、leuA遺伝子、leuL遺伝子、leuO遺伝子、ilvI遺伝子、ilvH遺伝子、fruR遺伝子、mraZ遺伝子、mraW遺伝子、ftsL遺伝子、ftsI遺伝子、murE遺伝子、murF遺伝子、mraY遺伝子、murD遺伝子、ftsW遺伝子、murG遺伝子、murC遺伝子、ddlB遺伝子、ftsQ遺伝子、ftsA遺伝子、ftsZ遺伝子、lpxC遺伝子、secM遺伝子、secA遺伝子、mutT遺伝子、coaE遺伝子、guaC遺伝子、hofC遺伝子、hofB遺伝子、ppdD遺伝子、nadC遺伝子、ampD遺伝子、ampE遺伝子、aroP遺伝子、pdhR遺伝子、aceE遺伝子、aceF遺伝子、lpd遺伝子、acnB遺伝子、speD遺伝子、speE遺伝子、cueO遺伝子、gcd遺伝子、hpt遺伝子、can遺伝子、panD遺伝子、panC遺伝子、panB遺伝子、htrE遺伝子、ecpD遺伝子、folK遺伝子、pcnB遺伝子、dksA遺伝子、sfsA遺伝子、ligT遺伝子、hrpB遺伝子、mrcB遺伝子、hemL遺伝子、clcA遺伝子、btuF遺伝子、pfs遺伝子、dgt遺伝子、degP遺伝子、cdaR遺伝子、dapD遺伝子、glnD遺伝子、map遺伝子、tff遺伝子、rpsB遺伝子、tsf遺伝子、pyrH遺伝子、frr遺伝子、dxr遺伝子、ispU遺伝子、cdsA遺伝子、hlpA遺伝子、lpxD遺伝子、fabZ遺伝子、lpxA遺伝子、lpxB遺伝子、rnhB遺伝子、dnaE遺伝子、accA遺伝子、ldcC遺伝子、tilS遺伝子、rof遺伝子、nlpE遺伝子、proS遺伝子、rcsF遺伝子、metQ遺伝子、metI遺伝子、metN遺伝子、gmhB遺伝子、rrsH遺伝子、ileV遺伝子、alaV遺伝子、rrlH遺伝子、rrfH遺伝子、aspU遺伝子、dkgB遺伝子、mltD遺伝子、gloB遺伝子、rnhA遺伝子、dnaQ遺伝子、aspV遺伝子、ivy遺伝子、fadE遺伝子、lpcA遺伝子、pepD遺伝子、gpt遺伝子、frsA遺伝子、crl遺伝子、phoE遺伝子、proB遺伝子、proA遺伝子、thrW遺伝子、hemB遺伝子、proC遺伝子、aroL遺伝子、aroM遺伝子、rdgC遺伝子、mak遺伝子、araJ遺伝子、sbcC遺伝子、sbcD遺伝子、phoB遺伝子、phoR遺伝子、brnQ遺伝子、proY遺伝子、malZ遺伝子、queA遺伝子、tgt遺伝子、secD遺伝子、secF遺伝子、tsx遺伝子、ribD遺伝子、ribE遺伝子、nusB遺伝子、thiL遺伝子、pgpA遺伝子、dxs遺伝子、ispA遺伝子、xseB遺伝子、thiI遺伝子、panE遺伝子、cyoE遺伝子、cyoD遺伝子、cyoC遺伝子、cyoB遺伝子、cyoA遺伝子、ampG遺伝子、bolA遺伝子、tig遺伝子、clpP遺伝子、clpX遺伝子、lon遺伝子、hupB遺伝子、ppiD遺伝子、cof遺伝子、mdlA遺伝子、mdlB遺伝子、glnK遺伝子、amtB遺伝子、tesB遺伝子、ffs遺伝子、maa遺伝子、hha遺伝子、acrB遺伝子、acrA遺伝子、acrR遺伝子、kefA遺伝子、priC遺伝子、apt遺伝子、dnaX遺伝子、recR遺伝子、htpG遺伝子、adk遺伝子、hemH遺伝子、aes遺伝子、gsk遺伝子、fsr遺伝子、ushA遺伝子、copA遺伝子、cueR遺伝子、gcl遺伝子、hyi遺伝子、purK遺伝子、purE遺伝子、lpxH遺伝子、ppiB遺伝子、cysS遺伝子、folD遺伝子、sfmA遺伝子、sfmC遺伝子、sfmD遺伝子、sfmH遺伝子、sfmF遺伝子、fimZ遺伝子、argU遺伝子、entD遺伝子、fepA遺伝子、fes遺伝子、entF遺伝子、fepE遺伝子、fepC遺伝子、fepG遺伝子、fepD遺伝子、fepB遺伝子、entC遺伝子、entE遺伝子、entB遺伝子、entA遺伝子、cstA遺伝子、dsbG遺伝子、ahpC遺伝子、ahpF遺伝子、tatE遺伝子、lipA遺伝子、lipB遺伝子、dacA遺伝子、rlpA遺伝子、mrdB遺伝子、mrdA遺伝子、cobC遺伝子、nadD遺伝子、holA遺伝子、rlpB遺伝子、leuS遺伝子、lnt遺伝子、miaB遺伝子、ubiF遺伝子、glnX遺伝子、glnV遺伝子、metU遺伝子、glnW遺伝子、glnU遺伝子、leuW遺伝子、metT遺伝子、asnB遺伝子、nagD遺伝子、nagC遺伝子、nagA遺伝子、nagB遺伝子、nagE遺伝子、glnS遺伝子、fur遺伝子、fldA遺伝子、seqA遺伝子、pgm遺伝子、potE遺伝子、speF遺伝子、kdpE遺伝子、kdpD遺伝子、kdpC遺伝子、kdpB遺伝子、kdpA遺伝子、nei遺伝子、abrB遺伝子、gltA遺伝子、sdhC遺伝子、sdhD遺伝子、sdhA遺伝子、sdhB遺伝子、sucA遺伝子、sucB遺伝子、sucC遺伝子、sucD遺伝子、mngR遺伝子、mngA遺伝子、mngB遺伝子、cydA遺伝子、cydB遺伝子、tolQ遺伝子、tolR遺伝子、tolA遺伝子、tolB遺伝子、pal遺伝子、lysT遺伝子、valT遺伝子、lysW遺伝子、valZ遺伝子、lysY遺伝子、lysZ遺伝子、lysQ遺伝子、nadA遺伝子、pnuC遺伝子、zitB遺伝子、aroG遺伝子、gpmA遺伝子、galM遺伝子、galK遺伝子、galT遺伝子、galE遺伝子、modF遺伝子、modE遺伝子、modA遺伝子、modB遺伝子、modC遺伝子、bioA遺伝子、bioB遺伝子、bioF遺伝子、bioC遺伝子、bioD遺伝子、uvrB遺伝子、moaA遺伝子、moaB遺伝子、moaC遺伝子、moaD遺伝子、moaE遺伝子、rhlE遺伝子、dps遺伝子、rhtA遺伝子、ompX遺伝子、rybA遺伝子、mntR遺伝子、fsaA遺伝子、moeB遺伝子、moeA遺伝子、iaaA遺伝子、cmr遺伝子、rybB遺伝子、grxA遺伝子、poxB遺伝子、hcr遺伝子、hcp遺伝子、aqpZ遺伝子、macA遺伝子、macB遺伝子、cspD遺伝子、clpS遺伝子、clpA遺伝子、serW遺伝子、infA遺伝子、aat遺伝子、cydC遺伝子、cydD遺伝子、trxB遺伝子、lrp遺伝子、ftsK遺伝子、lolA遺伝子、serS遺伝子、dmsA遺伝子、dmsB遺伝子、dmsC遺伝子、pflA遺伝子、pflB遺伝子、focA遺伝子、serC遺伝子、aroA遺伝子、cmk遺伝子、rpsA遺伝子、ihfB遺伝子、msbA遺伝子、lpxK遺伝子、kdsB遺伝子、smtA遺伝子、mukF遺伝子、mukE遺伝子、mukB遺伝子、aspC遺伝子、ompF遺伝子、asnS遺伝子、pncB遺伝子、pepN遺伝子、ssuB遺伝子、ssuC遺伝子、ssuD遺伝子、ssuA遺伝子、ssuE遺伝子、pyrD遺伝子、uup遺伝子、pqiA遺伝子、pqiB遺伝子、rmf遺伝子、fabA遺伝子、ompA遺伝子、sulA遺伝子、helD遺伝子、mgsA遺伝子、serT遺伝子、hyaA遺伝子、hyaB遺伝子、hyaC遺伝子、hyaD遺伝子、hyaE遺伝子、hyaF遺伝子、appC遺伝子、appB遺伝子、appA遺伝子、etp遺伝子、serX遺伝子、csgG遺伝子、csgF遺伝子、csgE遺伝子、csgD遺伝子、csgB遺伝子、csgA遺伝子、csgC遺伝子、mdoC遺伝子、mdoG遺伝子、mdoH遺伝子、msyB遺伝子、mdtG遺伝子、lpxL遺伝子、solA遺伝子、dinI遺伝子、pyrC遺伝子、grxB遺伝子、mdtH遺伝子、rimJ遺伝子、mviM遺伝子、mviN遺伝子、flgN遺伝子、flgM遺伝子、flgA遺伝子、flgB遺伝子、flgC遺伝子、flgD遺伝子、flgE遺伝子、flgF遺伝子、flgG遺伝子、flgH遺伝子、flgI遺伝子、flgJ遺伝子、flgK遺伝子、flgL遺伝子、rne遺伝子、rluC遺伝子、sraB遺伝子、rpmF遺伝子、plsX遺伝子、fabH遺伝子、fabD遺伝子、fabG遺伝子、acpP遺伝子、fabF遺伝子、pabC遺伝子、tmk遺伝子、holB遺伝子、ptsG遺伝子、fhuE遺伝子、hinT遺伝子、nagZ遺伝子、ndh遺伝子、mfd遺伝子、lolC遺伝子、lolD遺伝子、lolE遺伝子、cobB遺伝子、potD遺伝子、potC遺伝子、potB遺伝子、potA遺伝子、pepT遺伝子、phoQ遺伝子、phoP遺伝子、purB遺伝子、hflD遺伝子、trmU遺伝子、minE遺伝子、minD遺伝子、minC遺伝子、hlyE遺伝子、umuD遺伝子、umuC遺伝子、dsbB遺伝子、nhaB遺伝子、fadR遺伝子、dadA遺伝子、dadX遺伝子、cvrA遺伝子、ldcA遺伝子、emtA遺伝子、treA遺伝子、dhaH遺伝子、dhaL遺伝子、dhaK遺伝子、dhaR遺伝子、pth遺伝子、prsA遺伝子、ispE遺伝子、lolB遺伝子、hemA遺伝子、prfA遺伝子、prmC遺伝子、kdsA遺伝子、ldrA遺伝子、rdlA遺伝子、ldrB遺伝子、rdlB遺伝子、ldrC遺伝子、rdlC遺伝子、chaA遺伝子、chaB遺伝子、chaC遺伝子、narL遺伝子、narX遺伝子、narK遺伝子、narG遺伝子、narH遺伝子、narJ遺伝子、narI遺伝子、rttR遺伝子、tpr遺伝子、tyrV遺伝子、tyrT遺伝子、purU遺伝子、rssA遺伝子、rssB遺伝子、galU遺伝子、hns遺伝子、tdk遺伝子、adhE遺伝子、oppA遺伝子、oppB遺伝子、oppC遺伝子、oppD遺伝子、oppF遺伝子、cls遺伝子、kch遺伝子、tonB遺伝子、ompW遺伝子、trpA遺伝子、trpB遺伝子、trpC遺伝子、trpD遺伝子、trpE遺伝子、trpL遺伝子、rluB遺伝子、btuR遺伝子、sohB遺伝子、topA遺伝子、cysB遺伝子、acnA遺伝子、ribA遺伝子、pgpB遺伝子、pyrF遺伝子、osmB遺伝子、gmr遺伝子、rnb遺伝子、fabI遺伝子、sapF遺伝子、sapD遺伝子、sapC遺伝子、sapB遺伝子、sapA遺伝子、puuP遺伝子、puuA遺伝子、puuD遺伝子、puuR遺伝子、puuC遺伝子、puuB遺伝子、puuE遺伝子、pspF遺伝子、pspA遺伝子、pspB遺伝子、pspC遺伝子、pspD遺伝子、pspE遺伝子、ompG遺伝子、tyrR遺伝子、tpx遺伝子、mpaA遺伝子、mppA遺伝子、uspE遺伝子、fnr遺伝子、ogt遺伝子、abgT遺伝子、abgB遺伝子、abgA遺伝子、abgR遺伝子、isrA遺伝子、dbpA遺伝子、uspF遺伝子、ompN遺伝子、micC遺伝子、hslJ遺伝子、ldhA遺伝子、feaR遺伝子、feaB遺伝子、tynA遺伝子、maoC遺伝子、paaA遺伝子、paaB遺伝子、paaC遺伝子、paaD遺伝子、paaE遺伝子、paaF遺伝子、paaG遺伝子、paaH遺伝子、paaI遺伝子、paaJ遺伝子、paaK遺伝子、paaX遺伝子、paaY遺伝子、azoR遺伝子、hrpA遺伝子、aldA遺伝子、gapC_2遺伝子、gapC_1遺伝子、cybB遺伝子、hokB遺伝子、mokB遺伝子、sokB遺伝子、trg遺伝子、mdoD遺伝子、rimL遺伝子、tehA遺伝子、tehB遺伝子、ansP遺伝子、nhoA遺伝子、narV遺伝子、narW遺伝子、narY遺伝子、narZ遺伝子、narU遺伝子、fdnG遺伝子、fdnH遺伝子、fdnI遺伝子、adhP遺伝子、sfcA遺伝子、sra遺伝子、bdm遺伝子、osmC遺伝子、ddpF遺伝子、ddpD遺伝子、ddpC遺伝子、ddpB遺伝子、ddpA遺伝子、ddpX遺伝子、dos遺伝子、gadC遺伝子、gadB遺伝子、pqqL遺伝子、hipA遺伝子、hipB遺伝子、ego遺伝子、lsrC遺伝子、lsrD遺伝子、lsrB遺伝子、lsrF遺伝子、lsrG遺伝子、tam遺伝子、uxaB遺伝子、marC遺伝子、marR遺伝子、marA遺伝子、marB遺伝子、eamA遺伝子、dcp遺伝子、rspB遺伝子、rspA遺伝子、speG遺伝子、dmsD遺伝子、clcB遺伝子、dgsA遺伝子、asr遺伝子、mdtI遺伝子、mdtJ遺伝子、pntB遺伝子、pntA遺伝子、folM遺伝子、rstA遺伝子、rstB遺伝子、tus遺伝子、fumC遺伝子、fumA遺伝子、manA遺伝子、uidC遺伝子、uidB遺伝子、uidA遺伝子、uidR遺伝子、hdhA遺伝子、malI遺伝子、malX遺伝子、malY遺伝子、add遺伝子、blr遺伝子、rsxA遺伝子、rsxB遺伝子、rsxC遺伝子、rsxD遺伝子、rsxG遺伝子、rsxE遺伝子、nth遺伝子、gst遺伝子、pdxY遺伝子、tyrS遺伝子、pdxH遺伝子、slyB遺伝子、slyA遺伝子、sodC遺伝子、nemA遺伝子、gloA遺伝子、rnt遺伝子、lhr遺伝子、sodB遺伝子、purR遺伝子、cfa遺伝子、ribC遺伝子、mdtK遺伝子、valV遺伝子、valW遺伝子、pykF遺伝子、lpp遺伝子、sufE遺伝子、sufS遺伝子、sufD遺伝子、sufC遺伝子、sufB遺伝子、sufA遺伝子、rydB遺伝子、rprA遺伝子、aroD遺伝子、pps遺伝子、aroH遺伝子、nlpC遺伝子、btuD遺伝子、btuE遺伝子、btuC遺伝子、ihfA遺伝子、pheT遺伝子、pheS遺伝子、pheM遺伝子、rplT遺伝子、rpmI遺伝子、infC遺伝子、thrS遺伝子、arpB_1遺伝子、arpB_2遺伝子、pfkB遺伝子、cedA遺伝子、katE遺伝子、chbG遺伝子、chbF遺伝子、chbR遺伝子、chbA遺伝子、chbC遺伝子、chbB遺伝子、osmE遺伝子、nadE遺伝子、spy遺伝子、astE遺伝子、astB遺伝子、astD遺伝子、astA遺伝子、astC遺伝子、xthA遺伝子、nudG遺伝子、gdhA遺伝子、topB遺伝子、selD遺伝子、sppA遺伝子、ansA遺伝子、gapA遺伝子、mipA遺伝子、rnd遺伝子、fadD遺伝子、pabB遺伝子、sdaA遺伝子、manX遺伝子、manY遺伝子、manZ遺伝子、rrmA遺伝子、cspC遺伝子、kdgR遺伝子、htpX遺伝子、prc遺伝子、proQ遺伝子、pphA遺伝子、ryeA遺伝子、ryeB遺伝子、holE遺伝子、exoX遺伝子、ptrB遺伝子、purT遺伝子、eda遺伝子、edd遺伝子、zwf遺伝子、pykA遺伝子、lpxM遺伝子、znuA遺伝子、znuC遺伝子、znuB遺伝子、ruvB遺伝子、ruvA遺伝子、ruvC遺伝子、nudB遺伝子、aspS遺伝子、torZ遺伝子、torY遺伝子、cutC遺伝子、argS遺伝子、leuZ遺伝子、cysT遺伝子、glyW遺伝子、pgsA遺伝子、dsrA遺伝子、serU遺伝子、asnT遺伝子、shiA遺伝子、amn遺伝子、asnW遺伝子、asnU遺伝子、cbl遺伝子、nac遺伝子、asnV遺伝子、erfK遺伝子、cobT遺伝子、
    cobS遺伝子、cobU遺伝子、sbmC遺伝子、dacD遺伝子、sbcB遺伝子、hisL遺伝子、hisG遺伝子、hisD遺伝子、hisC遺伝子、hisB遺伝子、hisH遺伝子、hisA遺伝子、hisF遺伝子、hisI遺伝子、cld遺伝子、ugd遺伝子、gnd遺伝子、galF遺伝子、wcaM遺伝子、wcaL遺伝子、wcaK遺伝子、wzxC遺伝子、wcaJ遺伝子、cpsG遺伝子、cpsB遺伝子、wcaI遺伝子、nudD遺伝子、fcl遺伝子、gmd遺伝子、wcaF遺伝子、wcaE遺伝子、wcaD遺伝子、wcaC遺伝子、wcaB遺伝子、wcaA遺伝子、wzc遺伝子、wzb遺伝子、wza遺伝子、asmA遺伝子、dcd遺伝子、udk遺伝子、thiD遺伝子、thiM遺伝子、mrp遺伝子、metG遺伝子、dusC遺伝子、cdd遺伝子、sanA遺伝子、mglC遺伝子、mglA遺伝子、mglB遺伝子、galS遺伝子、folE遺伝子、cirA遺伝子、lysP遺伝子、nfo遺伝子、fruA遺伝子、fruK遺伝子、fruB遺伝子、setB遺伝子、spr遺伝子、rtn遺伝子、bcr遺伝子、rsuA遺伝子、rplY遺伝子、proL遺伝子、narP遺伝子、ccmH遺伝子、ccmG遺伝子、ccmF遺伝子、ccmE遺伝子、ccmD遺伝子、ccmC遺伝子、ccmB遺伝子、ccmA遺伝子、napC遺伝子、napB遺伝子、napH遺伝子、napG遺伝子、napA遺伝子、napD遺伝子、napF遺伝子、eco遺伝子、mqo遺伝子、alkB遺伝子、ada遺伝子、ompC遺伝子、micF遺伝子、rcsD遺伝子、rcsB遺伝子、rcsC遺伝子、atoS遺伝子、atoC遺伝子、atoD遺伝子、atoA遺伝子、atoE遺伝子、atoB遺伝子、gyrA遺伝子、ubiG遺伝子、nrdA遺伝子、nrdB遺伝子、inaA遺伝子、glpQ遺伝子、glpT遺伝子、glpA遺伝子、glpB遺伝子、glpC遺伝子、ais遺伝子、arnT遺伝子、pmrD遺伝子、menE遺伝子、menC遺伝子、menB遺伝子、menD遺伝子、menF遺伝子、nuoN遺伝子、nuoM遺伝子、nuoL遺伝子、nuoK遺伝子、nuoJ遺伝子、nuoI遺伝子、nuoH遺伝子、nuoG遺伝子、nuoF遺伝子、nuoE遺伝子、nuoC遺伝子、nuoB遺伝子、nuoA遺伝子、lrhA遺伝子、ackA遺伝子、pta遺伝子、ubiX遺伝子、purF遺伝子、cvpA遺伝子、dedD遺伝子、folC遺伝子、accD遺伝子、dedA遺伝子、truA遺伝子、usg遺伝子、pdxB遺伝子、flk遺伝子、fabB遺伝子、trmC遺伝子、mepA遺伝子、aroC遺伝子、prmB遺伝子、sixA遺伝子、fadL遺伝子、vacJ遺伝子、argW遺伝子、dsdC遺伝子、dsdX遺伝子、dsdA遺伝子、emrY遺伝子、emrK遺伝子、evgA遺伝子、evgS遺伝子、oxc遺伝子、frc遺伝子、ddg遺伝子、glk遺伝子、mntH遺伝子、nupC遺伝子、alaX遺伝子、alaW遺伝子、gltX遺伝子、valU遺伝子、valX遺伝子、valY遺伝子、lysV遺伝子、xapR遺伝子、xapB遺伝子、xapA遺伝子、ligA遺伝子、zipA遺伝子、cysZ遺伝子、cysK遺伝子、ptsH遺伝子、ptsI遺伝子、crr遺伝子、pdxK遺伝子、cysM遺伝子、cysA遺伝子、cysW遺伝子、cysU遺伝子、cysP遺伝子、ucpA遺伝子、murP遺伝子、amiA遺伝子、hemF遺伝子、eutL遺伝子、eutC遺伝子、eutB遺伝子、eutA遺伝子、eutH遺伝子、eutG遺伝子、eutJ遺伝子、eutE遺伝子、cchB遺伝子、cchA遺伝子、eutI遺伝子、eutT遺伝子、eutQ遺伝子、eutP遺伝子、maeB遺伝子、talA遺伝子、tktB遺伝子、aegA遺伝子、narQ遺伝子、acrD遺伝子、dapE遺伝子、purC遺伝子、nlpB遺伝子、dapA遺伝子、gcvR遺伝子、bcp遺伝子、hda遺伝子、uraA遺伝子、upp遺伝子、purM遺伝子、purN遺伝子、ppk遺伝子、ppx遺伝子、guaA遺伝子、guaB遺伝子、xseA遺伝子、der遺伝子、hisS遺伝子、ispG遺伝子、ndk遺伝子、pbpC遺伝子、sseA遺伝子、ryfA遺伝子、sseB遺伝子、pepB遺伝子、fdx遺伝子、hscA遺伝子、hscB遺伝子、iscA遺伝子、iscU遺伝子、iscS遺伝子、iscR遺伝子、suhB遺伝子、csiE遺伝子、hcaT遺伝子、hcaR遺伝子、hcaE遺伝子、hcaF遺伝子、hcaC遺伝子、hcaB遺伝子、hcaD遺伝子、glyA遺伝子、hmp遺伝子、glnB遺伝子、sroF遺伝子、purL遺伝子、tadA遺伝子、acpS遺伝子、pdxJ遺伝子、recO遺伝子、era遺伝子、rnc遺伝子、lepB遺伝子、lepA遺伝子、rseC遺伝子、rseB遺伝子、rseA遺伝子、rpoE遺伝子、nadB遺伝子、srmB遺伝子、ung遺伝子、trxC遺伝子、pssA遺伝子、kgtP遺伝子、rrfG遺伝子、rrlG遺伝子、gltW遺伝子、rrsG遺伝子、clpB遺伝子、rluD遺伝子、pheL遺伝子、pheA遺伝子、tyrA遺伝子、aroF遺伝子、rplS遺伝子、trmD遺伝子、rimM遺伝子、rpsP遺伝子、ffh遺伝子、grpE遺伝子、recN遺伝子、smpA遺伝子、smpB遺伝子、ssrA遺伝子、gabD遺伝子、gabT遺伝子、gabP遺伝子、nrdF遺伝子、mprA遺伝子、emrA遺伝子、emrB遺伝子、luxS遺伝子、sraD遺伝子、gshA遺伝子、argQ遺伝子、argZ遺伝子、argY遺伝子、argV遺伝子、serV遺伝子、csrA遺伝子、alaS遺伝子、recX遺伝子、recA遺伝子、mltB遺伝子、norR遺伝子、norV遺伝子、norW遺伝子、hypF遺伝子、hydN遺伝子、ascG遺伝子、ascF遺伝子、ascB遺伝子、hycI遺伝子、hycH遺伝子、hycG遺伝子、hycF遺伝子、hycE遺伝子、hycD遺伝子、hycC遺伝子、hycB遺伝子、hycA遺伝子、hypA遺伝子、hypB遺伝子、hypC遺伝子、hypD遺伝子、hypE遺伝子、fhlA遺伝子、mutS遺伝子、pphB遺伝子、rpoS遺伝子、nlpD遺伝子、pcm遺伝子、surE遺伝子、truD遺伝子、ispF遺伝子、ispD遺伝子、ftsB遺伝子、cysC遺伝子、cysN遺伝子、cysD遺伝子、iap遺伝子、cysH遺伝子、cysI遺伝子、cysJ遺伝子、eno遺伝子、pyrG遺伝子、mazG遺伝子、chpR遺伝子、relA遺伝子、rumA遺伝子、barA遺伝子、gudD遺伝子、gudX遺伝子、gudP遺伝子、mltA遺伝子、metZ遺伝子、metW遺伝子、metV遺伝子、amiC遺伝子、argA遺伝子、recD遺伝子、recB遺伝子、ptr遺伝子、recC遺伝子、ppdC遺伝子、ppdB遺伝子、ppdA遺伝子、thyA遺伝子、lgt遺伝子、ptsP遺伝子、nudH遺伝子、mutH遺伝子、tas遺伝子、aas遺伝子、rygA遺伝子、rygB遺伝子、galR遺伝子、lysA遺伝子、lysR遺伝子、araE遺伝子、kduD遺伝子、kduI遺伝子、lysS遺伝子、prfB遺伝子、recJ遺伝子、dsbC遺伝子、xerD遺伝子、fldB遺伝子、bglA遺伝子、gcvP遺伝子、gcvH遺伝子、gcvT遺伝子、visC遺伝子、ubiH遺伝子、pepP遺伝子、zapA遺伝子、ssrS遺伝子、rygC遺伝子、serA遺伝子、rpiA遺伝子、argP遺伝子、argK遺伝子、argO遺伝子、mscS遺伝子、fbaA遺伝子、pgk遺伝子、epd遺伝子、tktA遺伝子、speB遺伝子、speA遺伝子、metK遺伝子、galP遺伝子、sprT遺伝子、endA遺伝子、gshB遺伝子、ansB遺伝子、mutY遺伝子、mltC遺伝子、nupG遺伝子、speC遺伝子、pheV遺伝子、pitB遺伝子、gss遺伝子、hybG遺伝子、hybF遺伝子、hybE遺伝子、hybD遺伝子、hybC遺伝子、hybB遺伝子、hybA遺伝子、hybO遺伝子、exbD遺伝子、exbB遺伝子、metC遺伝子、dkgA遺伝子、sufI遺伝子、plsC遺伝子、parC遺伝子、parE遺伝子、cpdA遺伝子、nudF遺伝子、tolC遺伝子、zupT遺伝子、ribB遺伝子、glgS遺伝子、rygD遺伝子、rfaE遺伝子、glnE遺伝子、htrG遺伝子、cca遺伝子、bacA遺伝子、folB遺伝子、ttdA遺伝子、ttdB遺伝子、rpsU遺伝子、dnaG遺伝子、rpoD遺伝子、ileX遺伝子、aer遺伝子、ebgR遺伝子、ebgA遺伝子、ebgC遺伝子、uxaA遺伝子、uxaC遺伝子、exuT遺伝子、exuR遺伝子、tdcG遺伝子、tdcF遺伝子、tdcE遺伝子、tdcD遺伝子、tdcC遺伝子、tdcB遺伝子、tdcA遺伝子、tdcR遺伝子、rnpB遺伝子、garK遺伝子、garR遺伝子、garL遺伝子、garP遺伝子、garD遺伝子、sohA遺伝子、agaR遺伝子、kbaZ遺伝子、agaV遺伝子、agaW遺伝子、agaA遺伝子、agaS遺伝子、kbaY遺伝子、agaB遺伝子、agaC遺伝子、agaD遺伝子、agaI遺伝子、mtr遺伝子、deaD遺伝子、nlpI遺伝子、pnp遺伝子、sraG遺伝子、rpsO遺伝子、truB遺伝子、rbfA遺伝子、infB遺伝子、nusA遺伝子、metY遺伝子、argG遺伝子、leuU遺伝子、secG遺伝子、glmM遺伝子、folP遺伝子、ftsH遺伝子、rrmJ遺伝子、greA遺伝子、dacB遺伝子、obgE遺伝子、rpmA遺伝子、rplU遺伝子、ispB遺伝子、sfsB遺伝子、murA遺伝子、kdsD遺伝子、kdsC遺伝子、rpoN遺伝子、ptsN遺伝子、npr遺伝子、mtgA遺伝子、elbB遺伝子、ryhA遺伝子、arcB遺伝子、gltB遺伝子、gltD遺伝子、nanT遺伝子、nanA遺伝子、nanR遺伝子、dcuD遺伝子、sspB遺伝子、sspA遺伝子、rpsI遺伝子、rplM遺伝子、degQ遺伝子、degS遺伝子、mdh遺伝子、argR遺伝子、aaeB遺伝子、aaeA遺伝子、aaeX遺伝子、aaeR遺伝子、tldD遺伝子、rng遺伝子、mreD遺伝子、mreC遺伝子、mreB遺伝子、accB遺伝子、accC遺伝子、panF遺伝子、prmA遺伝子、dusB遺伝子、fis遺伝子、rrfF遺伝子、thrV遺伝子、rrfD遺伝子、rrlD遺伝子、gltV遺伝子、rrsD遺伝子、purH遺伝子、purD遺伝子、zraR遺伝子、zraS遺伝子、zraP遺伝子、hupA遺伝子、nfi遺伝子、hemE遺伝子、nudC遺伝子、rsd遺伝子、thiC遺伝子、thiE遺伝子、thiF遺伝子、thiS遺伝子、thiG遺伝子、thiH遺伝子、htrC遺伝子、rpoC遺伝子、rpoB遺伝子、rplL遺伝子、rplJ遺伝子、rplA遺伝子、rplK遺伝子、nusG遺伝子、secE遺伝子、tufB遺伝子、thrT遺伝子、glyT遺伝子、tyrU遺伝子、thrU遺伝子、coaA遺伝子、birA遺伝子、murB遺伝子、rrfB遺伝子、rrlB遺伝子、gltT遺伝子、rrsB遺伝子、murI遺伝子、btuB遺伝子、trmA遺伝子、fabR遺伝子、sthA遺伝子、oxyR遺伝子、oxyS遺伝子、argH遺伝子、argB遺伝子、argC遺伝子、argE遺伝子、ppc遺伝子、fsaB遺伝子、gldA遺伝子、katG遺伝子、metF遺伝子、metL遺伝子、metB遺伝子、metJ遺伝子、rpmE遺伝子、priA遺伝子、cytR遺伝子、ftsN遺伝子、hslV遺伝子、hslU遺伝子、menA遺伝子、rraA遺伝子、glpF遺伝子、glpK遺伝子、glpX遺伝子、fpr遺伝子、tpiA遺伝子、cdh遺伝子、sbp遺伝子、pfkA遺伝子、fieF遺伝子、cpxP遺伝子、cpxR遺伝子、cpxA遺伝子、kdgT遺伝子、sodA遺伝子、fdhD遺伝子、fdoG遺伝子、fdoH遺伝子、fdoI遺伝子、fdhE遺伝子、bipA遺伝子、glnA遺伝子、glnL遺伝子、glnG遺伝子、hemN遺伝子、csrC遺伝子、spf遺伝子、polA遺伝子、dsbA遺伝子、mobA遺伝子、mobB遺伝子、rrfA遺伝子、rrlA遺伝子、alaT遺伝子、ileT遺伝子、rrsA遺伝子、hemG遺伝子、trkH遺伝子、pepQ遺伝子、fadB遺伝子、fadA遺伝子、fre遺伝子、ubiD遺伝子、rfaH遺伝子、tatD遺伝子、tatC遺伝子、tatB遺伝子、tatA遺伝子、ubiB遺伝子、ubiE遺伝子、rmuC遺伝子、udp遺伝子、metE遺伝子、metR遺伝子、pldB遺伝子、rhtB遺伝子、rhtC遺伝子、recQ遺伝子、pldA遺伝子、rarD遺伝子、corA遺伝子、uvrD遺伝子、xerC遺伝子、dapF遺伝子、cyaY遺伝子、cyaA遺伝子、hemC遺伝子、hemD遺伝子、hemX遺伝子、hemY遺伝子、ryiA遺伝子、aslA遺伝子、aslB遺伝子、proM遺伝子、leuT遺伝子、hisR遺伝子、argX遺伝子、rffM遺伝子、wzyE遺伝子、rffT遺伝子、wzxE遺伝子、rffA遺伝子、rffC遺伝子、rffH遺伝子、rffG遺伝子、rffD遺伝子、rffE遺伝子、wzzE遺伝子、rfe遺伝子、rho遺伝子、rhoL遺伝子、trxA遺伝子、rhlB遺伝子、gpp遺伝子、rep遺伝子、ppiC遺伝子、ilvC遺伝子、ilvY遺伝子、ilvA遺伝子、ilvD遺伝子、ilvE遺伝子、ilvM遺伝子、ilvG_2遺伝子、ilvG_1遺伝子、ilvL遺伝子、hdfR遺伝子、trpT遺伝子、aspT遺伝子、rrfC遺伝子、rrlC遺伝子、gltU遺伝子、rrsC遺伝子、asnC遺伝子、mioC遺伝子、oriC遺伝子、gidA遺伝子、gidB遺伝子、atpI遺伝子、atpB遺伝子、atpE遺伝子、atpF遺伝子、atpH遺伝子、atpA遺伝子、atpG遺伝子、atpD遺伝子、atpC遺伝子、glmU遺伝子、glmS遺伝子、pstS遺伝子、pstC遺伝子、pstA遺伝子、pstB遺伝子、phoU遺伝子、bglG遺伝子、bglF遺伝子、bglB遺伝子、bglH遺伝子、cbrC遺伝子、mdtL遺伝子、tnaB遺伝子、tnaA遺伝子、tnaC遺伝子、trmE遺伝子、rnpA遺伝子、rpmH遺伝子、dnaA遺伝子、dnaN遺伝子、recF遺伝子、gyrB遺伝子、ibpA遺伝子、ibpB遺伝子、emrD遺伝子、ivbL遺伝子、ilvB遺伝子、ilvN遺伝子、uhpA遺伝子、uhpB遺伝子、uhpC遺伝子、uhpT遺伝子、selC遺伝子、gltS遺伝子、recG遺伝子、trmH遺伝子、spoT遺伝子、rpoZ遺伝子、gmk遺伝子、ligB遺伝子、dinD遺伝子、rph遺伝子、pyrE遺伝子、ttk遺伝子、dut遺伝子、dfp遺伝子、rpmB遺伝子、rpmG遺伝子、mutM遺伝子、coaD遺伝子、kdtA遺伝子、rfaQ遺伝子、rfaG遺伝子、rfaP遺伝子、rfaS遺伝子、rfaB遺伝子、rfaI遺伝子、rfaJ遺伝子、rfaY遺伝子、rfaZ遺伝子、rfaK遺伝子、rfaL遺伝子、rfaC遺伝子、rfaF遺伝子、rfaD遺伝子、htrL遺伝子、kbl遺伝子、tdh遺伝子、envC遺伝子、gpmI遺伝子、grxC遺伝子、secB遺伝子、gpsA遺伝子、cysE遺伝子、lldD遺伝子、lldR遺伝子、lldP遺伝子、mtlR遺伝子、mtlD遺伝子、mtlA遺伝子、selA遺伝子、selB遺伝子、aldB遺伝子、sgbE遺伝子、sgbU遺伝子、sgbH遺伝子、lyxK遺伝子、avtA遺伝子、malS遺伝子、bax遺伝子、xylR遺伝子、xylH遺伝子、xylG遺伝子、xylF遺伝子、xylA遺伝子、xylB遺伝子、glyQ遺伝子
    、glyS遺伝子、hokA遺伝子、cspA遺伝子、tiaE遺伝子、bisC遺伝子、tag遺伝子、eptB遺伝子、proK遺伝子、dppA遺伝子、dppB遺伝子、dppC遺伝子、dppD遺伝子、dppF遺伝子、rdlD遺伝子、ldrD遺伝子、bcsG遺伝子、bcsF遺伝子、bcsE遺伝子、bcsA遺伝子、bcsB遺伝子、bcsZ遺伝子、bcsC遺伝子、dctA遺伝子、kdgK遺伝子、treF遺伝子、gadA遺伝子、gadX遺伝子、gadY遺伝子、gadW遺伝子、mdtF遺伝子、mdtE遺伝子、gadE遺伝子、hdeD遺伝子、hdeA遺伝子、hdeB遺伝子、slp遺伝子、arsC遺伝子、arsB遺伝子、arsR遺伝子、gor遺伝子、prlC遺伝子、uspA遺伝子、pitA遺伝子、nikR遺伝子、nikE遺伝子、nikD遺伝子、nikC遺伝子、nikB遺伝子、nikA遺伝子、acpT遺伝子、dcrB遺伝子、zntA遺伝子、ftsY遺伝子、ftsE遺伝子、ftsX遺伝子、rpoH遺伝子、livJ遺伝子、livK遺伝子、livH遺伝子、livM遺伝子、livG遺伝子、livF遺伝子、ugpB遺伝子、ugpA遺伝子、ugpE遺伝子、ugpC遺伝子、ugpQ遺伝子、ggt遺伝子、gntR遺伝子、gntK遺伝子、gntU遺伝子、asd遺伝子、glgB遺伝子、glgX遺伝子、glgC遺伝子、glgA遺伝子、glgP遺伝子、glpD遺伝子、glpE遺伝子、glpG遺伝子、glpR遺伝子、rtcR遺伝子、rtcB遺伝子、rtcA遺伝子、malT遺伝子、malP遺伝子、malQ遺伝子、gntT遺伝子、gntY遺伝子、gntX遺伝子、bioH遺伝子、feoB遺伝子、feoA遺伝子、greB遺伝子、ompR遺伝子、envZ遺伝子、pck遺伝子、hslO遺伝子、hslR遺伝子、nudE遺伝子、mrcA遺伝子、hofQ遺伝子、aroK遺伝子、aroB遺伝子、damX遺伝子、dam遺伝子、rpe遺伝子、gph遺伝子、trpS遺伝子、cysG遺伝子、nirC遺伝子、nirD遺伝子、nirB遺伝子、tsgA遺伝子、ppiA遺伝子、fic遺伝子、pabA遺伝子、argD遺伝子、crp遺伝子、prkB遺伝子、kefG遺伝子、kefB遺伝子、slyD遺伝子、slyX遺伝子、fkpA遺伝子、rpsL遺伝子、rpsG遺伝子、fusA遺伝子、tufA遺伝子、rpsJ遺伝子、rplC遺伝子、rplD遺伝子、rplW遺伝子、rplB遺伝子、rpsS遺伝子、rplV遺伝子、rpsC遺伝子、rplP遺伝子、rpmC遺伝子、rpsQ遺伝子、rplN遺伝子、rplX遺伝子、rplE遺伝子、rpsN遺伝子、rpsH遺伝子、rplF遺伝子、rplR遺伝子、rpsE遺伝子、rpmD遺伝子、rplO遺伝子、secY遺伝子、rpmJ遺伝子、rpsM遺伝子、rpsK遺伝子、rpsD遺伝子、rpoA遺伝子、rplQ遺伝子、zntR遺伝子、mscL遺伝子、trkA遺伝子、rsmB遺伝子、fmt遺伝子、def遺伝子、smf遺伝子、smg遺伝子、aroE遺伝子、rrsE遺伝子、ileU遺伝子、alaU遺伝子、rrlE遺伝子、rrfE遺伝子、metA遺伝子、aceB遺伝子、aceA遺伝子、aceK遺伝子、arpA遺伝子、iclR遺伝子、metH遺伝子、pepE遺伝子、lysC遺伝子、pgi遺伝子、ubiC遺伝子、ubiA遺伝子、plsB遺伝子、dgkA遺伝子、lexA遺伝子、dinF遺伝子、zur遺伝子、qor遺伝子、dnaB遺伝子、alr遺伝子、tyrB遺伝子、aphA遺伝子、uvrA遺伝子、ssb遺伝子、soxS遺伝子、soxR遺伝子、ryjA遺伝子、actP遺伝子、acs遺伝子、nrfA遺伝子、nrfB遺伝子、nrfC遺伝子、nrfD遺伝子、nrfE遺伝子、nrfF遺伝子、nrfG遺伝子、gltP遺伝子、fdhF遺伝子、rpiR遺伝子、rpiB遺伝子、proP遺伝子、basS遺伝子、basR遺伝子、eptA遺伝子、adiC遺伝子、adiY遺伝子、adiA遺伝子、melR遺伝子、melA遺伝子、melB遺伝子、fumB遺伝子、dcuB遺伝子、dcuR遺伝子、dcuS遺伝子、lysU遺伝子、cadA遺伝子、cadB遺伝子、cadC遺伝子、pheU遺伝子、dipZ遺伝子、cutA遺伝子、dcuA遺伝子、aspA遺伝子、fxsA遺伝子、groS遺伝子、groL遺伝子、efp遺伝子、ecnA遺伝子、ecnB遺伝子、sugE遺伝子、blc遺伝子、ampC遺伝子、frdD遺伝子、frdC遺伝子、frdB遺伝子、frdA遺伝子、poxA遺伝子、psd遺伝子、rsgA遺伝子、orn遺伝子、glyV遺伝子、glyX遺伝子、glyY遺伝子、amiB遺伝子、mutL遺伝子、miaA遺伝子、hfq遺伝子、hflX遺伝子、hflK遺伝子、hflC遺伝子、purA遺伝子、rnr遺伝子、rlmB遺伝子、ulaF遺伝子、rpsF遺伝子、priB遺伝子、rpsR遺伝子、rplI遺伝子、fklB遺伝子、cycA遺伝子、cpdB遺伝子、cysQ遺伝子、msrA遺伝子、chpS遺伝子、chpB遺伝子、ppa遺伝子、fbp遺伝子、mpl遺伝子、pmbA遺伝子、cybC遺伝子、nrdG遺伝子、nrdD遺伝子、treC遺伝子、treB遺伝子、treR遺伝子、mgtA遺伝子、pyrI遺伝子、pyrB遺伝子、pyrL遺伝子、argI遺伝子、valS遺伝子、holC遺伝子、pepA遺伝子、idnR遺伝子、idnT遺伝子、idnO遺伝子、idnD遺伝子、idnK遺伝子、leuX遺伝子、dnaC遺伝子、dnaT遺伝子、bglJ遺伝子、fhuF遺伝子、leuV遺伝子、leuP遺伝子、leuQ遺伝子、rsmC遺伝子、holD遺伝子、rimI遺伝子、prfC遺伝子、osmY遺伝子、deoC遺伝子、deoA遺伝子、deoB遺伝子、deoD遺伝子、lplA遺伝子、serB遺伝子、radA遺伝子、nadR遺伝子、slt遺伝子、trpR遺伝子、rob遺伝子、creA遺伝子、creB遺伝子、creC遺伝子、creD遺伝子、arcA遺伝子
    ［２］fhuA遺伝子、fhuC遺伝子、fhuD遺伝子、fhuB遺伝子、yafJ遺伝子、yafK遺伝子、yafQ遺伝子、dinJ遺伝子、yafL遺伝子、yafM遺伝子、fhiA遺伝子、mbhA遺伝子、dinB遺伝子、yafN遺伝子、yafO遺伝子、yafP遺伝子、ykfJ遺伝子、prfH遺伝子、yagP遺伝子、yagQ遺伝子、yagR遺伝子、yagS遺伝子、yagT遺伝子、yagU遺伝子、ykgJ遺伝子、yagV遺伝子、yagW遺伝子、yagX遺伝子、yagY遺伝子、yagZ遺伝子、ykgK遺伝子、ykgL遺伝子、ykgM(JW5034)遺伝子、ykgM(JW5035)遺伝子、eaeH遺伝子、ykgA遺伝子、ykgB遺伝子、ykgI遺伝子、ykgC遺伝子、ykgD遺伝子、ykgE遺伝子、ykgF遺伝子、ykgG遺伝子、ykgH遺伝子、betA遺伝子、betB遺伝子、betI遺伝子、betT遺伝子、yahA遺伝子、yahB遺伝子、yahC遺伝子、yahD遺伝子、yahE遺伝子、yahF遺伝子、yahG遺伝子、yahH遺伝子、yahI遺伝子、yahJ遺伝子、yahK遺伝子、yahL遺伝子、yahM遺伝子、yahN遺伝子、yahO遺伝子、prpR遺伝子、prpB遺伝子、prpC遺伝子、prpD遺伝子、prpE遺伝子、codB遺伝子、codA遺伝子、cynR遺伝子、cynT遺伝子、cynS遺伝子、cynX遺伝子、lacA遺伝子、lacY遺伝子、lacZ遺伝子、lacI遺伝子、mhpR遺伝子、mhpA遺伝子、mhpB遺伝子、mhpC遺伝子、mhpD遺伝子、mhpF遺伝子、mhpE遺伝子、mhpT遺伝子、yaiL遺伝子、frmB遺伝子、frmA遺伝子、frmR遺伝子、yaiO遺伝子、yaiX遺伝子、yaiF遺伝子、yaiP遺伝子、yaiS遺伝子、tauA遺伝子、tauB遺伝子、tauC遺伝子、tauD遺伝子、yaiT遺伝子、yaiU遺伝子、yaiV遺伝子、ampH遺伝子、sbmA遺伝子、yaiW遺伝子、yaiY遺伝子、yaiZ遺伝子、ddlA遺伝子、yaiB遺伝子、phoA遺伝子、psiF遺伝子、yaiC遺伝子、ybbO遺伝子、tesA遺伝子、ybbA遺伝子、ybbP遺伝子、ylbG遺伝子、ybbB遺伝子、ybbS遺伝子、allA遺伝子、allR遺伝子、glxR遺伝子、ybbV遺伝子、ybbW遺伝子、allB遺伝子、ybbY遺伝子、glxK遺伝子、ylbA遺伝子、allC遺伝子、allD遺伝子、fdrA遺伝子、ylbE_1遺伝子、ylbE_2遺伝子、ylbF遺伝子、ybcF遺伝子、envY遺伝子、ybcH遺伝子、nfrA遺伝子、nfrB遺伝子、cusS遺伝子、cusR遺伝子、cusC遺伝子、cusF遺伝子、cusB遺伝子、cusA遺伝子、pheP遺伝子、ybdG遺伝子、nfnB遺伝子、ybdF遺伝子、ybdJ遺伝子、ybdK遺伝子、hokE遺伝子、ybeL遺伝子、ybeQ遺伝子、ybeR遺伝子、djlB遺伝子、ybeT遺伝子、ybeU遺伝子、djlC遺伝子、hscC遺伝子、rihA遺伝子、gltL遺伝子、gltK遺伝子、gltJ遺伝子、gltI遺伝子、kdpF遺伝子、ybfA遺伝子、ybgA遺伝子、phr遺伝子、ybiA遺伝子、dinG遺伝子、ybiB遺伝子、ybiC遺伝子、ybiJ遺伝子、ybiI遺伝子、ybiX遺伝子、fiu遺伝子、ybiM遺伝子、ybiN遺伝子、ybiO遺伝子、glnQ遺伝子、glnP遺伝子、glnH遺伝子、yliA遺伝子、yliB遺伝子、yliC遺伝子、yliD遺伝子、yliE遺伝子、yliF遺伝子、yliG遺伝子、yliH遺伝子、yliI遺伝子、yliJ遺伝子、dacC遺伝子、deoR遺伝子、ybjG遺伝子、ybjC遺伝子、nfsA遺伝子、rimK遺伝子、ybjN遺伝子、potF遺伝子、potG遺伝子、potH遺伝子、potI遺伝子、ybjO遺伝子、rumB遺伝子、artJ遺伝子、artM遺伝子、artQ遺伝子、artI遺伝子、artP遺伝子、ybjP遺伝子、ybjQ遺伝子、ybjR遺伝子、ybjS遺伝子、ybjT遺伝子、ltaE遺伝子、ymcC遺伝子、ymcD遺伝子、cspH遺伝子、cspG遺伝子、ymcE遺伝子、gnsA遺伝子、yccM遺伝子、torS遺伝子、torT遺伝子、torR遺伝子、torC遺伝子、torA遺伝子、torD遺伝子、cbpM遺伝子、cbpA遺伝子、yccE遺伝子、agp遺伝子、yccJ遺伝子、wrbA遺伝子、ymdF遺伝子、ycdG遺伝子、ycdH遺伝子、ycdI遺伝子、rarA遺伝子、ycdK遺伝子、ycdL遺伝子、ycdM遺伝子、ycdC遺伝子、putA遺伝子、putP遺伝子、ycdN_1遺伝子、ycdN_2遺伝子、ycdO遺伝子、ycdB遺伝子、phoH遺伝子、ycdP遺伝子、ycdQ遺伝子、ycdR遺伝子、ycdS遺伝子、ycdT遺伝子、ymdE遺伝子、ycdU遺伝子、elbA遺伝子、ycgX遺伝子、ycgE遺伝子、ycgF遺伝子、ycgZ遺伝子、ymgA遺伝子、ymgB遺伝子、ymgC遺伝子、ycgG遺伝子、ymgF遺伝子、ycgH_1遺伝子、ycgH_2遺伝子、ymgD遺伝子、ymgG遺伝子、ymgH遺伝子、ycgI遺伝子、ydfH遺伝子、ydfZ遺伝子、ydfI遺伝子、ydfJ遺伝子、yecT遺伝子、flhE遺伝子、flhA遺伝子、flhB遺伝子、cheZ遺伝子、cheY遺伝子、cheB遺伝子、cheR遺伝子、tap遺伝子、tar遺伝子、cheW遺伝子、cheA遺伝子、motB遺伝子、motA遺伝子、flhC遺伝子、flhD遺伝子、yecG遺伝子、otsA遺伝子、otsB遺伝子、araH遺伝子、araG遺伝子、araF遺伝子、yecI遺伝子、yecJ遺伝子、isrB遺伝子、yecR遺伝子、ftn遺伝子、yecH遺伝子、tyrP遺伝子、uvrC遺伝子、uvrY遺伝子、yecF遺伝子、sdiA遺伝子、yecC遺伝子、yecS遺伝子、yedO遺伝子、fliY遺伝子、fliZ遺伝子、fliA遺伝子、fliC遺伝子、fliD遺伝子、fliS遺伝子、fliT遺伝子、amyA遺伝子、yedD遺伝子、yedE遺伝子、yedF遺伝子、yedK遺伝子、yedL遺伝子、yedN_2遺伝子、yedN_1遺伝子、yedM遺伝子、intG遺伝子、fliE遺伝子、fliF遺伝子、fliG遺伝子、fliH遺伝子、fliI遺伝子、fliJ遺伝子、fliK遺伝子、fliL遺伝子、fliM遺伝子、fliN遺伝子、fliO遺伝子、fliP遺伝子、fliQ遺伝子、fliR遺伝子、rcsA遺伝子、dsrB遺伝子、yodD遺伝子、yedA遺伝子、vsr遺伝子、dcm遺伝子、yedJ遺伝子、yedR遺伝子、yedS_1遺伝子、yedS_2遺伝子、yedS_3遺伝子、hchA遺伝子、yedV遺伝子、yedW遺伝子、yedX遺伝子、yedY遺伝子、yedZ遺伝子、yodA遺伝子、wbbL_2遺伝子、wbbL_1遺伝子、wbbK遺伝子、wbbJ遺伝子、wbbI遺伝子、wbbH遺伝子、glf遺伝子、rfbX遺伝子、rfbC遺伝子、rfbA遺伝子、rfbD遺伝子、rfbB遺伝子、yegE遺伝子、alkA遺伝子、yegD遺伝子、yegI遺伝子、yegJ遺伝子、yegK遺伝子、yegL遺伝子、ryeC遺伝子、ryeD遺伝子、mdtA遺伝子、mdtB遺伝子、mdtC遺伝子、mdtD遺伝子、baeS遺伝子、baeR遺伝子、yegP遺伝子、yegQ遺伝子、ryeE遺伝子、ogrK遺伝子、yegZ遺伝子、yegR遺伝子、yegS遺伝子、gatR_1遺伝子、gatR_2遺伝子、gatD遺伝子、gatC遺伝子、gatB遺伝子、gatA遺伝子、gatZ遺伝子、gatY遺伝子、fbaB遺伝子、yegT遺伝子、yegU遺伝子、yegV遺伝子、yegW遺伝子、yegX遺伝子、molR_1遺伝子、molR_2遺伝子、molR_3遺伝子、yehI遺伝子、yehK遺伝子、yehL遺伝子、yehM遺伝子、yehP遺伝子、yehQ遺伝子、yehR遺伝子、yehS遺伝子、yehT遺伝子、yehU遺伝子、mlrA遺伝子、yohO遺伝子、yehW遺伝子、yehX遺伝子、yehY遺伝子、yehZ遺伝子、bglX遺伝子、dld遺伝子、pbpG遺伝子、yohC遺伝子、yeiI遺伝子、yeiJ遺伝子、rihB遺伝子、yeiL遺伝子、yeiM遺伝子、yeiN遺伝子、yeiC遺伝子、elaB遺伝子、elaA遺伝子、elaC遺伝子、elaD遺伝子、yfbK遺伝子、yfbL遺伝子、yfbM遺伝子、yfbN遺伝子、yfbO遺伝子、yfbP遺伝子、yfcC遺伝子、yfcD遺伝子、yfcE遺伝子、yfcF遺伝子、yfcG遺伝子、folX遺伝子、yfcH遺伝子、yfcI遺伝子、hisP遺伝子、hisM遺伝子、hisQ遺伝子、hisJ遺伝子、argT遺伝子、ypdA遺伝子、ypdB遺伝子、ypdC遺伝子、ypdD遺伝子、ypdE遺伝子、ypdF遺伝子、ypdG遺伝子、ypdH遺伝子、pinH遺伝子、ypjB遺伝子、ypjC遺伝子、ileY遺伝子、ygaQ遺伝子、ygaR遺伝子、yqaC遺伝子、yqaD遺伝子、ygaT遺伝子、csiR遺伝子、ygaU遺伝子、yqaE遺伝子、ygaV遺伝子、ygaP遺伝子、stpA遺伝子、ygaW遺伝子、ygaC遺伝子、ygaM遺伝子、nrdH遺伝子、nrdI遺伝子、nrdE遺伝子、proV遺伝子、proW遺伝子、proX遺伝子、ygaX遺伝子、ygaY遺伝子、ygaZ遺伝子、ygaH遺伝子、srlA遺伝子、srlE遺伝子、srlB遺伝子、srlD遺伝子、gutM遺伝子、srlR遺伝子、gutQ遺伝子、yqeG遺伝子、yqeH遺伝子、yqeI遺伝子、yqeJ遺伝子、yqeK遺伝子、ygeF遺伝子、ygeG遺伝子、ygeH遺伝子、ygeI遺伝子、pbl遺伝子、ygeK遺伝子、ygeL遺伝子、ygeM遺伝子、ygeN遺伝子、ygeO遺伝子、ygeP遺伝子、ygeQ遺伝子、glyU遺伝子、ygeR遺伝子、xdhA遺伝子、xdhB遺伝子、xdhC遺伝子、ygeV遺伝子、ygeW遺伝子、ygeX遺伝子、ygeY遺伝子、hyuA遺伝子、yqeA遺伝子、yqeB遺伝子、yqeC遺伝子、ygfJ遺伝子、ygfK遺伝子、ssnA遺伝子、ygfM遺伝子、xdhD遺伝子、ygfO遺伝子、guaD遺伝子、ygfQ遺伝子、ygfS遺伝子、ygfT遺伝子、ygfU遺伝子、idi遺伝子、cmtA遺伝子、cmtB遺伝子、yghD遺伝子、yghE遺伝子、yghF遺伝子、yghG遺伝子、pppA遺伝子、yghJ遺伝子、yghK遺伝子、glcB遺伝子、glcG遺伝子、glcF遺伝子、glcE遺伝子、glcD遺伝子、glcC遺伝子、yghO遺伝子、yghQ遺伝子、yghR遺伝子、yghS遺伝子、yghT遺伝子、ygiS遺伝子、ygiT遺伝子、ygiU遺伝子、ygiV遺伝子、ygiW遺伝子、qseB遺伝子、qseC遺伝子、ygiZ遺伝子、mdaB遺伝子、ygiN遺伝子、gltF遺伝子、yhcA遺伝子、yhcD遺伝子、yhcE遺伝子、yhcF遺伝子、yhcG遺伝子、yhcH遺伝子、nanK遺伝子、nanE遺伝子、yhdJ遺伝子、yhdU遺伝子、envR遺伝子、acrE遺伝子、acrF遺伝子、yhdV遺伝子、yhdW遺伝子、yhdX遺伝子、yhdY遺伝子、yijP遺伝子、yijO遺伝子、frwD遺伝子、pflC遺伝子、pflD遺伝子、frwB遺伝子、frwC遺伝子、ptsA遺伝子、rhaT遺伝子、rhaR遺伝子、rhaS遺伝子、rhaB遺伝子、rhaA遺伝子、rhaD遺伝子、yiiL遺伝子、frvA遺伝子、frvB遺伝子、frvX遺伝子、frvR遺伝子、yiiG遺伝子、yiiF遺伝子、yiiE遺伝子、yiiD遺伝子、dtd遺伝子、rbn遺伝子、yihX遺伝子、yihW遺伝子、yihV遺伝子、yihU遺伝子、yihT遺伝子、yihS遺伝子、yihR遺伝子、yihQ遺伝子、yihP遺伝子、yihO遺伝子、ompL遺伝子、yihN遺伝子、yihM遺伝子、yihL遺伝子、hsrA遺伝子、rbsR遺伝子、rbsK遺伝子、rbsB遺伝子、rbsC遺伝子、rbsA遺伝子、rbsD遺伝子、trkD遺伝子、yieN遺伝子、yieM遺伝子、asnA遺伝子、yidB遺伝子、yidA遺伝子、yidX遺伝子、dgoR遺伝子、dgoK遺伝子、dgoA遺伝子、dgoD遺伝子、dgoT遺伝子、cbrA遺伝子、yidR遺伝子、yidQ遺伝子、yidE遺伝子、yidP遺伝子、glvC遺伝子、glvB遺伝子、glvG遺伝子、ysdC遺伝子、yidL遺伝子、yidK遺伝子、yidJ遺伝子、yidI遺伝子、yidH遺伝子、yidG遺伝子、yidF遺伝子、yhiN遺伝子、yhiM遺伝子、yhiL遺伝子、yhiK遺伝子、yhiJ遺伝子、yhiI遺伝子、rbbA遺伝子、yhhJ遺伝子、chiA遺伝子、bfd遺伝子、bfr遺伝子、gspO遺伝子、gspM遺伝子、gspL遺伝子、gspK遺伝子、gspJ遺伝子、gspI遺伝子、gspH遺伝子、gspG遺伝子、gspF遺伝子、gspE遺伝子、gspD遺伝子、gspC遺伝子、gspA遺伝子、pioO遺伝子、yjbE遺伝子、yjbF遺伝子、yjbG遺伝子、yjbH遺伝子、yjbA遺伝子、xylE遺伝子、malG遺伝子、malF遺伝子、malE遺伝子、malK遺伝子、lamB遺伝子、malM遺伝子、yjbI遺伝子、yjcP遺伝子、yjcQ遺伝子、yjcR遺伝子、yjcS遺伝子、alsK遺伝子、alsE遺伝子、alsC遺伝子、alsA遺伝子、alsB遺伝子、yjdP遺伝子、phnP遺伝子、phnO遺伝子、phnN遺伝子、phnM遺伝子、phnL遺伝子、phnK遺伝子、phnJ遺伝子、phnI遺伝子、phnH遺伝子、phnG遺伝子、phnF遺伝子、phnE(JW4064)遺伝子、phnE(JW4065)遺伝子、phnD遺伝子、phnC遺伝子、phnB遺伝子、phnA遺伝子、yjdA遺伝子、yjcZ遺伝子、yjfI遺伝子、yjfJ遺伝子、yjfK遺伝子、yjfL遺伝子、yjfM遺伝子、yjfC遺伝子、aidB遺伝子、yjfN遺伝子、yjfO遺伝子、yjfP遺伝子、ulaR遺伝子、ulaG遺伝子、ulaA遺伝子、ulaB遺伝子、ulaC遺伝子、ulaD遺伝子、ulaE遺伝子、yjhS遺伝子、yjhT遺伝子、yjhA遺伝子、fimB遺伝子、fimE遺伝子、fimA遺伝子、fimI遺伝子、fimC遺伝子、fimD遺伝子、fimF遺伝子、fimG遺伝子、fimH遺伝子、gntP遺伝子、uxuA遺伝子、uxuB遺伝子、uxuR遺伝子、yjiC遺伝子、yjiD遺伝子、yjiE遺伝子、iadA遺伝子、yjiG遺伝子、yjiH遺伝子、kptA遺伝子、yjiJ遺伝子、yjiK遺伝子、yjiL遺伝子、yjiM遺伝子、yjiN遺伝子、yjiO遺伝子、yjiP遺伝子、yjiQ遺伝子、yjiR遺伝子、yjiS遺伝子、yjiT遺伝子、yjiV遺伝子、mcrC遺伝子、mcrB遺伝子、yjiW遺伝子、hsdS遺伝子、hsdM遺伝子、hsdR遺伝子、mrr遺伝子、yjiA遺伝子、yjiX遺伝子、yjiY遺伝子、tsr遺伝子、yjiZ遺伝子、yjjM遺伝子、yjjN遺伝子、mdoB遺伝子、yjjA遺伝子
    ［３］chpA遺伝子、uspG遺伝子、ybdR遺伝子、rnk遺伝子、rna遺伝子、citT遺伝子、citG遺伝子、citX遺伝子、citF遺伝子、citE遺伝子、citD遺伝子、citC遺伝子、citA遺伝子、citB遺伝子、dcuC遺伝子、crcA遺伝子、cspE遺伝子、crcB遺伝子、ybeH遺伝子、ybeM遺伝子、yqcA遺伝子、yqcB遺伝子、yqcC遺伝子、syd遺伝子、yqcD遺伝子、ygdH遺伝子、sdaC遺伝子、sdaB遺伝子、exo遺伝子、fucO遺伝子、fucA遺伝子、fucP遺伝子、fucI遺伝子、fucK遺伝子、fucU遺伝子、fucR遺伝子、ygdE遺伝子、ygdD遺伝子、gcvA遺伝子、ygdI遺伝子、csdA遺伝子、ygdK遺伝子、araD遺伝子、araA遺伝子、araB遺伝子、araC遺伝子、yabI遺伝子、thiQ遺伝子、thiP遺伝子、tbpA遺伝子、sgrR遺伝子、setA遺伝子、yhfZ遺伝子、yhfY遺伝子、yhfX遺伝子、yhfW遺伝子、php遺伝子、yhfU遺伝子、yhfT遺伝子、yhfS遺伝子、frlR遺伝子、frlD遺伝子、frlC遺伝子、frlB遺伝子、frlA遺伝子、yhfL遺伝子、pncA遺伝子、ydjE遺伝子、ydjF遺伝子、ydjG遺伝子、ydjH遺伝子、ydjI遺伝子、ydjJ遺伝子、ydjK遺伝子、ydjL遺伝子、yeaC遺伝子、yeaA遺伝子、ade遺伝子、yicO遺伝子、yicN遺伝子、yicM遺伝子、yicS遺伝子、nlpA遺伝子、yicL遺伝子、setC遺伝子、ygjI遺伝子、ygjJ遺伝子、ygjK遺伝子、fadH遺伝子、ygjM遺伝子、ygjN遺伝子、ygjO遺伝子、ygjP遺伝子、ygjQ遺伝子、ygjR遺伝子、alx遺伝子、sstT遺伝子、ygjV遺伝子、yrhB遺伝子、yrhA遺伝子、yhhZ遺伝子、yhhY遺伝子、yhhX遺伝子、yhhW遺伝子、yeaK遺伝子、yoaI遺伝子、yeaL遺伝子、yeaM遺伝子、yeaN遺伝子、yeaO遺伝子、yoaF遺伝子、yeaP遺伝子、yeaQ遺伝子、yoaG遺伝子、yeaR遺伝子、yeaS遺伝子、yeaT遺伝子、yeaU遺伝子、yeaV遺伝子、yeaW遺伝子、yeaX遺伝子、hyfA遺伝子、hyfB遺伝子、hyfC遺伝子、hyfD遺伝子、hyfE遺伝子、hyfF遺伝子、hyfG遺伝子、hyfH遺伝子、hyfI遺伝子、hyfJ遺伝子、hyfR遺伝子、focB遺伝子
  24. 　請求項１～２３のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体を、以下の［１］～［５］から選ばれる方法によって改変して得られる大腸菌の変異体。
    ［１］有用物質の生合成を制御する機構の少なくとも１つを緩和または解除する方法
    ［２］有用物質の生合成に関与する酵素の少なくとも１つを発現強化する方法
    ［３］有用物質の生合成に関与する酵素遺伝子の少なくとも１つのコピー数を増加させる方法
    ［４］有用物質の生合成経路から該有用物質以外の代謝産物へ分岐する代謝経路の少なくとも１つを弱化または遮断する方法
    ［５］野生型の大腸菌に比べ、有用物質のアナログに対する耐性度が高い細胞株を選択する方法
  25. 　大腸菌が大腸菌K-12株、大腸菌B株または大腸菌Ｗ株である、請求項１～２４のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体。
  26. 　大腸菌K-12株が大腸菌W3110株（ATCC27325）または大腸菌MG1655株（ATCC47076）である、請求項２５記載の大腸菌の変異体。
  27. 　請求項１～２６のいずれか１項に記載の大腸菌の変異体を培地に培養し、該培養物中に有用物質を生成、蓄積させ、該培養物から該有用物質を採取することを特徴とする有用物質の製造法。
  28. 　有用物質がタンパク質、アミノ酸、核酸、ビタミン、糖、有機酸および脂質からなる群より選ばれる有用物質である請求項２７に記載の製造法。
PCT/JP2009/055267 2008-03-18 2009-03-18 工業的に有用な微生物 WO2009116566A1 (ja)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
EP09722714A EP2298880A4 (en) 2008-03-18 2009-03-18 INDUSTRIALLY USEFUL MICROORGANISM
US12/933,022 US20110111458A1 (en) 2008-03-18 2009-03-18 Industrially useful microorganism

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2008-068793 2008-03-18
JP2008068793 2008-03-18

Publications (1)

Publication Number Publication Date
WO2009116566A1 true WO2009116566A1 (ja) 2009-09-24

Family

ID=41090965

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
PCT/JP2009/055267 WO2009116566A1 (ja) 2008-03-18 2009-03-18 工業的に有用な微生物

Country Status (4)

Country Link
US (1) US20110111458A1 (ja)
EP (1) EP2298880A4 (ja)
JP (1) JPWO2009116566A1 (ja)
WO (1) WO2009116566A1 (ja)

Cited By (11)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20100112647A1 (en) * 2007-04-17 2010-05-06 Yoshihiko Hara Method for producing an acidic substance having a carboxyl group
WO2013019053A2 (ko) * 2011-07-29 2013-02-07 경상대학교산학협력단 ＥｕｔＥ 유전자 또는 ＰｕｕＣ 유전자가 결실된 에세리키아 속 미생물 및 그를 이용한 레티노이드 생산 방법
WO2013019052A2 (ko) * 2011-07-29 2013-02-07 경상대학교산학협력단 ＹｂｂＯ 유전자가 결실 또는 증폭된 에세리키아 속 미생물 및 그를 이용한 레티노이드의 생산 방법
KR101359484B1 (ko) 2011-07-29 2014-02-13 경상대학교산학협력단 ＥｕｔＥ 유전자 또는 ＰｕｕＣ 유전자가 결실된 에세리키아 속 미생물 및 그를 이용한 레티노이드 생산 방법
WO2014163176A1 (ja) * 2013-04-05 2014-10-09 株式会社イミュノフロンティア Ｎｙ－ｅｓｏ－１タンパク質の製造方法
KR20150134996A (ko) * 2014-05-23 2015-12-02 씨제이제일제당 (주) 세포내 에너지 수준이 향상된 미생물 및 이를 이용하여 l-아미노산을 생산하는 방법
JPWO2015050184A1 (ja) * 2013-10-02 2017-03-09 味の素株式会社 ヘパロサン生産細菌及びヘパロサンの製造法
KR101781294B1 (ko) 2015-05-26 2017-09-26 동국대학교 산학협력단 글리세롤을 탄소원으로 이용하는 고생장성 대장균
JP2022515496A (ja) * 2018-12-26 2022-02-18 デサン・コーポレイション Ｌ－アミノ酸を生産する大腸菌変異株またはコリネバクテリウムグルタミカム変異株、およびそれを用いたｌ－アミノ酸の生産方法
WO2022158649A1 (ko) * 2021-01-25 2022-07-28 씨제이제일제당 (주) 신규한 h(+)/cl(-) 익스체인지 트랜스포터 변이체 및 이를 이용한 l-트립토판 생산 방법
WO2022260215A1 (ko) * 2021-06-11 2022-12-15 씨제이제일제당 (주) 신규한 mdth 변이체 및 이를 이용한 o-포스포세린, 시스테인 및 이의 유도체의 생산방법

Families Citing this family (24)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8647642B2 (en) 2008-09-18 2014-02-11 Aviex Technologies, Llc Live bacterial vaccines resistant to carbon dioxide (CO2), acidic PH and/or osmolarity for viral infection prophylaxis or treatment
US9434771B2 (en) * 2008-12-17 2016-09-06 The Johns Hopkins University Compositions and methods for diagnosing and treating inflammatory bowel disease and related disorders
EP2479279A1 (de) 2011-01-20 2012-07-25 Evonik Degussa GmbH Verfahren zur fermentativen Herstellung schwefelhaltiger Aminosäuren
EP2628792A1 (de) * 2012-02-17 2013-08-21 Evonik Industries AG Zelle mit verringerter ppGppase-Aktivität
WO2013152051A2 (en) 2012-04-02 2013-10-10 Ls9, Inc. Improved production of fatty acid derivatives
CN103484471B (zh) * 2013-09-30 2015-07-08 王悦 人表皮细胞生长因子核酸序列及大肠杆菌表达载体
WO2015073720A1 (en) * 2013-11-14 2015-05-21 Scarab Genomics, Llc Bacteria with improved metabolic capacity
KR101565770B1 (ko) 2013-12-13 2015-11-04 씨제이제일제당 주식회사 L-라이신 생산능이 향상된 코리네박테리움 속 미생물 및 이를 이용한 l-라이신을 생산하는 방법
WO2015095298A2 (en) * 2013-12-17 2015-06-25 University Of Florida Research Foundation, Incorporated Use of polyamines and polyamine transporters to provide furfural tolerance
KR101608734B1 (ko) * 2014-03-21 2016-04-04 씨제이제일제당 주식회사 L-아미노산을 생산하는 미생물 및 이를 이용하여 l-아미노산을 생산하는 방법
CA2948896A1 (en) * 2014-05-08 2015-11-12 Scfm Ventures, Llc Method for optimizing production of eicosapentaenoic acid (epa) in a recombinant host
WO2016011021A1 (en) * 2014-07-15 2016-01-21 The Regents Of The University Of California Performance enhancing genetic variants of e. coli
KR101677328B1 (ko) * 2014-08-12 2016-11-18 씨제이제일제당 (주) O-포스포세린 생산 미생물 및 이를 이용한 o-포스포세린 또는 l-시스테인 생산 방법
US11129906B1 (en) 2016-12-07 2021-09-28 David Gordon Bermudes Chimeric protein toxins for expression by therapeutic bacteria
US11180535B1 (en) 2016-12-07 2021-11-23 David Gordon Bermudes Saccharide binding, tumor penetration, and cytotoxic antitumor chimeric peptides from therapeutic bacteria
CA3051463A1 (en) * 2017-02-03 2018-08-09 Manus Bio, Inc. Metabolic engineering for microbial production of terpenoid products
MX2020002382A (es) * 2017-09-05 2021-01-20 Scarab Genomics Llc Métodos y composiciones para mejorar la expresión de proteínas recombinantes.
WO2019104518A1 (en) * 2017-11-29 2019-06-06 Cathay R & D Center Co., Ltd. Reducing the accumulation of imines/enamines for the production of amino acids or amino acid-derived products
CN111727253A (zh) * 2017-12-21 2020-09-29 格礼卡姆股份公司 用于体外和体内基因表达的核酸构建体
CN110591997B (zh) * 2019-10-29 2023-07-07 南京工业大学 一种提高木糖酸脱水酶活性的基因工程菌及其构建方法与应用
CN111019877B (zh) * 2019-12-31 2022-04-19 浙江工业大学 一种产l-半胱氨酸的基因工程菌、构建方法及应用
EP4237540A1 (en) * 2020-11-02 2023-09-06 University of Stuttgart Genome-modified bacterial strains for large scale bioprocesses
WO2023182970A1 (en) * 2021-02-19 2023-09-28 The Regents Of The University Of California Methods for production of fucosylated oligosaccharides in recombinant cell culture
CN113462619B (zh) * 2021-08-25 2022-08-09 湖南科技学院 一种产胞外多糖培养基及其应用

Citations (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS5618596A (en) 1979-07-23 1981-02-21 Ajinomoto Co Inc Production of l-lysine through fermentation process
JPS56144092A (en) 1980-04-14 1981-11-10 Ajinomoto Co Inc Preparation of l-methionine by fermentation
JPS5813599A (ja) 1981-07-08 1983-01-26 シエ−リング・アクチエンゲゼルシヤフト プラスミド、その製法、ｅ・コリ−突然変異体、ｌ−プロリンの製法及び新規菌株物の製法
JPS6394985A (ja) 1986-10-09 1988-04-26 Kyowa Hakko Kogyo Co Ltd Ｌ−チロシンの製造法
WO1997015673A1 (de) 1995-10-26 1997-05-01 Consortium für elektrochemische Industrie GmbH Verfahren zur herstellung von o-acetylserin, l-cystein und l-cystein-verwandten produkten
JP2003511086A (ja) 1999-10-14 2003-03-25 コンゾルテイウム フユール エレクトロケミツシエ インヅストリー ゲゼルシヤフト ミツト ベシユレンクテル ハフツング Ｌ−システイン又はｌ−システイン誘導体を発酵により製造する方法
JP2003164297A (ja) 2001-11-30 2003-06-10 Ajinomoto Co Inc 新規変異型グルタミンシンテターゼ、およびアミノ酸の生産方法
JP2004166576A (ja) 2002-11-19 2004-06-17 Kyowa Hakko Kogyo Co Ltd 遺伝子が置換または欠損した微生物の製造法
WO2006057341A1 (ja) 2004-11-26 2006-06-01 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. 工業的に有用な微生物

Patent Citations (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS5618596A (en) 1979-07-23 1981-02-21 Ajinomoto Co Inc Production of l-lysine through fermentation process
JPS56144092A (en) 1980-04-14 1981-11-10 Ajinomoto Co Inc Preparation of l-methionine by fermentation
JPS5813599A (ja) 1981-07-08 1983-01-26 シエ−リング・アクチエンゲゼルシヤフト プラスミド、その製法、ｅ・コリ−突然変異体、ｌ−プロリンの製法及び新規菌株物の製法
JPS6394985A (ja) 1986-10-09 1988-04-26 Kyowa Hakko Kogyo Co Ltd Ｌ−チロシンの製造法
WO1997015673A1 (de) 1995-10-26 1997-05-01 Consortium für elektrochemische Industrie GmbH Verfahren zur herstellung von o-acetylserin, l-cystein und l-cystein-verwandten produkten
JP2003511086A (ja) 1999-10-14 2003-03-25 コンゾルテイウム フユール エレクトロケミツシエ インヅストリー ゲゼルシヤフト ミツト ベシユレンクテル ハフツング Ｌ−システイン又はｌ−システイン誘導体を発酵により製造する方法
JP2003164297A (ja) 2001-11-30 2003-06-10 Ajinomoto Co Inc 新規変異型グルタミンシンテターゼ、およびアミノ酸の生産方法
JP2004166576A (ja) 2002-11-19 2004-06-17 Kyowa Hakko Kogyo Co Ltd 遺伝子が置換または欠損した微生物の製造法
WO2006057341A1 (ja) 2004-11-26 2006-06-01 Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd. 工業的に有用な微生物

Non-Patent Citations (35)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
"Biotechnology", vol. 6, 1996, VCH VERLAGSGESELLSCHAFT MBH
AGRIC. BIOL. CHEM., vol. 36, 1972, pages 1675 - 1684
AGRIC. BIOL. CHEM., vol. 37, 1973, pages 2013 - 2023
AGRIC. BIOL. CHEM., vol. 39, 1975, pages 1149 - 1153
AGRIC. BIOL. CHEM., vol. 39, 1975, pages 153 - 160
AGRIC. BIOL. CHEM., vol. 39, 1987, pages 371 - 377
AGRIC. BIOL. CHEM., vol. 41, 1977, pages 109 - 116
AGRIC. BIOL. CHEM., vol. 42, 1978, pages 1773 - 1778
AGRIC. BIOL. CHEM., vol. 43, 1979, pages 105 - 111
AGRIC. BIOL. CHEM., vol. 51, 1987, pages 2089 - 2094
AMINO; HAKKO, BIOCHEMICAL ENGINEERING/BIOTECHNOLOGY, vol. 79, 2003, pages 1 - 35
APPL. ENVIRON. MICROBIOL., vol. 38, 1979, pages 181 - 190
APPL. ENVIRON. MICROBIOL., vol. 59, 1993, pages 1361 - 1366
APPL. ENVIRON. MICROBIOL., vol. 73, 2007, pages 7657
APPL. MICROBIOL. BIOTECHNOL., vol. 39, 1993, pages 318 - 323
GENOMICS, vol. 72, 2001, pages 99 - 104
HIROSHI AIDA ET AL.: "Amino acid fermentation", 1986, JAPAN SCIENTIFIC SOCIETIES PRESS
J. BACTERIOL., vol. 110, 1972, pages 761 - 763
J. BACTERIOL., vol. 180, 1998, pages 2063
J. BIOMOL. SCREEN., vol. 11, 2006, pages 310
J. GEN. APPL. MICROBIOL., vol. 4, 1958, pages 272 - 283
J. MOL. BIOL., vol. 215, 1990, pages 403
KARLIN; ALTSCHUL, PRO. NATL. ACAD. SCI., U.S.A., vol. 90, 1993, pages 5873
KATO J. ET AL.: "Daichokin no Senshokutai Daikibo Kesshitsu Hen'ikabu no Sakusei to sono Seishitsu", JOURNAL OF JAPANESE BIOCHEMICAL SOCIETY, 2007, pages 3P-1280, XP008144942 *
KATO, J. ET AL.: "Construction of consecutive deletions of the Escherichia coli chromosome", MOL.SYST.BIOL., vol. 3, no. 132, 2007, XP002491202 *
METHODS ENZYMOL., vol. 183, 1990, pages 63
MIZOGUCHI, H. ET AL.: "Escherichia coli minimum genome factory", BIOTECHNOL.APPL.BIOCHEM., vol. 46, no. 3-4, April 2007 (2007-04-01), pages 157 - 167, XP008083177 *
MOL. MICROBIOL., vol. 55, 2005, pages 137
NUCLEIC ACIDS RES., vol. 16, 1988, pages 6127
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, vol. 34, 2006, pages 1
PROC. NATL. ACAD. SCI., vol. 69, 1972, pages 2110
PROC. NATL. ACAD. SCI., vol. 82, 1985, pages 5875
SCIENCE, vol. 277, 1997, pages 1453
SCIENCE, vol. 312, 2006, pages 1044
See also references of EP2298880A4

Cited By (18)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US20100112647A1 (en) * 2007-04-17 2010-05-06 Yoshihiko Hara Method for producing an acidic substance having a carboxyl group
US9822385B2 (en) 2007-04-17 2017-11-21 Ajinomoto Co., Inc. Method for producing an L-glutamic acid and L-aspartic acid using a recombinant microorganism having enhanced expression of a ybjL protein
WO2013019053A2 (ko) * 2011-07-29 2013-02-07 경상대학교산학협력단 ＥｕｔＥ 유전자 또는 ＰｕｕＣ 유전자가 결실된 에세리키아 속 미생물 및 그를 이용한 레티노이드 생산 방법
WO2013019052A2 (ko) * 2011-07-29 2013-02-07 경상대학교산학협력단 ＹｂｂＯ 유전자가 결실 또는 증폭된 에세리키아 속 미생물 및 그를 이용한 레티노이드의 생산 방법
WO2013019052A3 (ko) * 2011-07-29 2013-07-04 경상대학교산학협력단 ＹｂｂＯ 유전자가 결실 또는 증폭된 에세리키아 속 미생물 및 그를 이용한 레티노이드의 생산 방법
WO2013019053A3 (ko) * 2011-07-29 2013-07-04 경상대학교산학협력단 ＥｕｔＥ 유전자 또는 ＰｕｕＣ 유전자가 결실된 에세리키아 속 미생물 및 그를 이용한 레티노이드 생산 방법
KR101359484B1 (ko) 2011-07-29 2014-02-13 경상대학교산학협력단 ＥｕｔＥ 유전자 또는 ＰｕｕＣ 유전자가 결실된 에세리키아 속 미생물 및 그를 이용한 레티노이드 생산 방법
KR101440922B1 (ko) 2011-07-29 2014-09-18 경상대학교산학협력단 ＹｂｂＯ 유전자가 결실 또는 증폭된 에세리키아 속 미생물 및 그를 이용한 레티노이드의 생산 방법
WO2014163176A1 (ja) * 2013-04-05 2014-10-09 株式会社イミュノフロンティア Ｎｙ－ｅｓｏ－１タンパク質の製造方法
JPWO2014163176A1 (ja) * 2013-04-05 2017-02-16 株式会社イミュノフロンティア Ｎｙ−ｅｓｏ−１タンパク質の製造方法
JPWO2015050184A1 (ja) * 2013-10-02 2017-03-09 味の素株式会社 ヘパロサン生産細菌及びヘパロサンの製造法
KR20150134996A (ko) * 2014-05-23 2015-12-02 씨제이제일제당 (주) 세포내 에너지 수준이 향상된 미생물 및 이를 이용하여 l-아미노산을 생산하는 방법
KR101599802B1 (ko) 2014-05-23 2016-03-04 씨제이제일제당 주식회사 세포내 에너지 수준이 향상된 미생물 및 이를 이용하여 l-아미노산을 생산하는 방법
KR101781294B1 (ko) 2015-05-26 2017-09-26 동국대학교 산학협력단 글리세롤을 탄소원으로 이용하는 고생장성 대장균
JP2022515496A (ja) * 2018-12-26 2022-02-18 デサン・コーポレイション Ｌ－アミノ酸を生産する大腸菌変異株またはコリネバクテリウムグルタミカム変異株、およびそれを用いたｌ－アミノ酸の生産方法
JP7304953B2 (ja) 2018-12-26 2023-07-07 デサン・コーポレイション Ｌ－アミノ酸を生産する大腸菌変異株またはコリネバクテリウムグルタミカム変異株、およびそれを用いたｌ－アミノ酸の生産方法
WO2022158649A1 (ko) * 2021-01-25 2022-07-28 씨제이제일제당 (주) 신규한 h(+)/cl(-) 익스체인지 트랜스포터 변이체 및 이를 이용한 l-트립토판 생산 방법
WO2022260215A1 (ko) * 2021-06-11 2022-12-15 씨제이제일제당 (주) 신규한 mdth 변이체 및 이를 이용한 o-포스포세린, 시스테인 및 이의 유도체의 생산방법

Also Published As

Publication number Publication date
US20110111458A1 (en) 2011-05-12
EP2298880A4 (en) 2012-02-08
JPWO2009116566A1 (ja) 2011-07-21
EP2298880A1 (en) 2011-03-23

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20110111458A1 (en) Industrially useful microorganism
US9085765B2 (en) Reduced genome E. coli
EP1829965A1 (en) Industrially useful microorganism
CN101115832A (zh) 工业上有用的微生物
Cruveiller et al. Chemical Evolution of a Bacterium s Genome
Sanderson et al. Genetic map of Salmonella typhimurium, edition VIII
US7041814B1 (en) Nucleic acid and amino acid sequences relating to Enterobacter cloacae for diagnostics and therapeutics
Berlyn Linkage map of Escherichia coli K-10: the traditional map
Sanderson et al. Linkage map of Salmonella typhimurium, edition VII
EP3113800B1 (en) Enhanced production of recombinant crm197 in e. coli
US8119365B2 (en) Insertion sequence-free bacteria
Haddadin et al. Transcriptome profiles for high‐cell‐density recombinant and wild‐type Escherichia coli
WO2005087940A1 (en) Genetically altered microorganisms with modified metabolism
KR102050870B1 (ko) 무항생제 플라스미드 유지 시스템에서 플라스미드 카피 수의 정량적 조절 방법
Kosmidis et al. The E. coli transcriptional regulatory network and its spatial embedding
Guziolowski et al. Checking consistency between expression data and large scale regulatory networks: A case study
WO2018119540A1 (es) Composicion de acido delta-aminolevulinico, oxianiones y teluro o sus derivados, util en el control de patogenos
Bryant Functional genomics, analysis of adaptation in and applications of models to the metabolism of engineered Escherichia coli
EpC_00080 et al. budA budB rbsD rbsA rbsC rbsB rbsK rbsR
Le et al. Checking Consistency Between Expression Data and Large Scale Regulatory Networks: A Case Study
Uyar Studies on the genome-wide localization of StpA and H-NS in Escherichia coli using ChIP-chip analysis
Ho et al. Modeling the evolution of gene regulatory networks
Taghipour et al. Reconstructing a high-confidence protein-protein interaction network of Escherichia coli from different physical interaction data sources improves protein complex predictions
CN115572717A (zh) L-苏氨酸生产菌株及其构建方法与应用
US20240200108A1 (en) Method for quantitatively controlling plasmid copy number in antibiotic-free plasmid maintenance system

Legal Events

Date Code Title Description
121 Ep: the epo has been informed by wipo that ep was designated in this application

Ref document number: 09722714

Country of ref document: EP

Kind code of ref document: A1

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2010503901

Country of ref document: JP

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 12933022

Country of ref document: US

NENP Non-entry into the national phase

Ref country code: DE

WWE Wipo information: entry into national phase

Ref document number: 2009722714

Country of ref document: EP