WO2006057341A1 - 工業的に有用な微生物 - Google Patents

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WO2006057341A1
WO2006057341A1 PCT/JP2005/021691 JP2005021691W WO2006057341A1 WO 2006057341 A1 WO2006057341 A1 WO 2006057341A1 JP 2005021691 W JP2005021691 W JP 2005021691W WO 2006057341 A1 WO2006057341 A1 WO 2006057341A1
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child
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nucleotide sequence
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Hiroshi Mizoguchi
Kiyotaka Hara
Hideo Mori
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Kyowa Hakko Kogyo Co., Ltd.
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    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12P—FERMENTATION OR ENZYME-USING PROCESSES TO SYNTHESISE A DESIRED CHEMICAL COMPOUND OR COMPOSITION OR TO SEPARATE OPTICAL ISOMERS FROM A RACEMIC MIXTURE
    • C12P13/00—Preparation of nitrogen-containing organic compounds
    • C12P13/04—Alpha- or beta- amino acids
    • C12P13/08—Lysine; Diaminopimelic acid; Threonine; Valine
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N1/00—Microorganisms, e.g. protozoa; Compositions thereof; Processes of propagating, maintaining or preserving microorganisms or compositions thereof; Processes of preparing or isolating a composition containing a microorganism; Culture media therefor
    • C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
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    • C12N1/20—Bacteria; Culture media therefor
    • C12N1/205—Bacterial isolates
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12R—INDEXING SCHEME ASSOCIATED WITH SUBCLASSES C12C - C12Q, RELATING TO MICROORGANISMS
    • C12R2001/00—Microorganisms ; Processes using microorganisms
    • C12R2001/01—Bacteria or Actinomycetales ; using bacteria or Actinomycetales
    • C12R2001/185—Escherichia

Definitions

  • the present invention relates to a mutant of E. coli having a chromosomal DNA shorter than that of wild-type E. coli, and a method for producing a useful substance using the mutant.
  • Non-patent Documents 1 and 2 The entire base sequence of chromosomal DNA of E. coli has been clarified (Non-patent Documents 1 and 2).
  • a method is known in which any gene existing on the chromosomal DNA of E. coli or any region on the chromosomal DNA is deleted as intended using homologous recombination techniques (Non-patent Document 3).
  • Non-patent Document 3 a mutant library in which each gene on the chromosomal DNA of Escherichia coli is comprehensively destroyed using the information on the entire nucleotide sequence of the chromosomal DNA and homologous recombination methods, and a region on the chromosomal DNA that can be deleted of about 20 kbp.
  • Mutant strain libraries that have been exhaustively deleted have also been prepared (Non-Patent Documents 4 and 5)
  • Examples of E. coli mutant strains lacking multiple regions on chromosomal DNA include mutant strains that lack 376kbp! / Non-patent literature (Non-patent Document 6), and mutant strains that lack 262kbp (see Patent Literature 6).
  • Non-patent literature 7 the ability of mutant strains lacking 313kbp (non-patent literature 5) to be reported. It is only described that there is no description of how the deletion affects the growth of Escherichia coli when a deletion of 400 kbp or more is introduced into the chromosomal DNA.
  • Non-Patent Document 1 Science, 277, 1453 (1997)
  • Non-Patent Document 3 J. BacterioL, 180, 2063 (1998)
  • Non-Patent Document 4 Protein Nucleic Acid Enzyme 46, 2386, 2001
  • Non-Patent Document 5 Nature BiotechnoL, 20, 1018 (2002)
  • Non-Patent Document 6 Genome Research, 12, 640 (2002)
  • Non-Patent Document 7 Genome Research, 13, 644 (2003)
  • An object of the present invention is to provide a mutant of Escherichia coli lacking a plurality of regions on chromosomal DNA, and a method for producing a useful substance using the mutant.
  • the present invention relates to the following (1) to (47).
  • a mutant of E. coli comprising the gene according to [1] and [2] below or a homologous gene thereof and having a chromosomal DNA shorter than wild-type E. coli by 470 kbp or more.
  • an NC gene a gene that is not originally possessed by a wild-type Escherichia coli in the following genes [1] and [2] or a homologous gene thereof.
  • the above-mentioned mutant of E. coli derived from Escherichia coli may or may not have the NC gene.
  • C remnant 1zs child pdxA3 ⁇ 4fc, surA, imp3 ⁇ 4fc, djlA3 ⁇ 4, rluA3 ⁇ 4, hepA, polB3 ⁇ 4, araD is is, araAjAfe, araB genes, araC3 ⁇ 4fc, tbpA1ZS, leuD3 ⁇ 4, leuC3 ⁇ 4fc, leuB, leuA, leuL, leuO, ilvl, ilvH, fruR, ftsL3 ⁇ 4fc, ftsl, murE, murF3 ⁇ 4fc, mraY3 ⁇ 4fe, murD, ftsW, murG gene, murC gene, ddlB gene, ftsQ gene, ftsA gene na, ftsZ3 ⁇ 4fc na, lpxC3 ⁇ 4 gene, secA gene, mutT3 ⁇ 4fc n
  • Gene hoffi gene, ppdD gene, nadC gene, ampD gene, ampE gene, aroP gene, pdhR gene, aceE gene, aceF gene, lpdA gene, acnB gene, speD gene, speE gene, gcd gene 10, hpt, yadF, panD, pan C, panB, htrE, ecpD, folK, pcnB, dksA, sfsA, ligT, hrpB, ponB, hemL Gene, pfs gene, dgt residue, htrA gene, dapD gene, glnD gene, map gene, rpsB gene, t sf gene, smb ⁇ to child, rrf residue, dxr3 ⁇ 4fe ⁇ , rth ⁇ to child, cdsA Gene, yaeL gene, hlpA gene,
  • Gene, cyoC gene, cyoB gene, cyoA gene, ampG gene is child, bolA gene, tig gene, clpP gene, clpX gene, Ion gene, hupB gene, cofil: gene, mdlA gene, mdlB3 ⁇ 4fc gene, glnK gene is AmtB3 ⁇ 4fc, tesB, maa3 ⁇ 4fc, hha gene, acrB3 ⁇ 4 transmission, acrA, acrR is, aefA3 ⁇ 4fe, priC, apt3 ⁇ 4fc, dnaXnana, recR3 ⁇ 4fe ⁇ , htpG3 ⁇ 4fe ⁇ , adk ⁇ hemH, aes3 ⁇ 4fc, gsk, fsr, ushA, cueR, gel, gip3 ⁇ 4fc, purK3 ⁇ 4fc,
  • UmA is, manA gene, uidC, uidB, uidA, uidR, hdhAjAfe, mall3 ⁇ 4fc, malX, malY is, add, blnife, ntn is, gst Is is, pdxY is, tyrS3 ⁇ 4fe, pdxH3 ⁇ 4fc, sly B, sly, sodC fc, nemA3 ⁇ 4fe, gloA is, rnt, lhr, sodB3 ⁇ 4, araj Children, purR3 ⁇ 4fc children, cfa3 ⁇ 4fc children, ribE3 ⁇ 4fc children, ag43 children are children, phsCjAizs children, nrfC3 ⁇ 4fc children, pykF3 ⁇ 4fc children, lppjAizs children, suS genes, aroD children, pp
  • Child inaA fc child, glpQ child fc child, glpT3 ⁇ 4fc child, glpA3 ⁇ 4 child, glpB child, glpC child, ais, pmrD, menE, menB +, menB, menD, menF, nuoN, nuoM, nuoL, nuoK, 1zs +, nuoJ3 ⁇ 4fe, nuol Child, nuoH gene, nuoG3 ⁇ 4fc, nuoF3 ⁇ 4fc, nuoEM, nuoD3 ⁇ 4fc, nuoB3 ⁇ 4, nuoA is, lrhA, ackA is, pta, ubiX, purF3 ⁇ 4fc, dedE, dedE Is is, folC is is, accD3 ⁇ 4fc, dedA, truA, usgl3 ⁇ 4, pdxB gene, div is is, fabB is, dd pX,
  • Child, eft is child, ecnB3 ⁇ 4 gene, sugE gene is, blc gene is, ampC gene, frdD gene, frdC gene is, frdB3 ⁇ 4fc gene, frdA gene, genX3 ⁇ 4fc gene, psd gene, yjeQ gene Child, yje E3 ⁇ 4fc child, amiB survivor, mutL survivor, miaA3 ⁇ 4fc child, hfq3 ⁇ 4fc child, hflX3 ⁇ 4fc child, hflKM child, hflC fc child, purA survivor, vacB3 ⁇ 4fe child, sga survivor, rpsF3 ⁇ 4 transmission, priB3 ⁇ 4 transmission Child, rpsR child, rpll3 ⁇ 4fc child, fldB3 ⁇ 4 gene, cyc residue is child, cpdB3 ⁇ 4fc child, cy
  • idnD is is child, idnK gene, fecE3 ⁇ 4izs child, fecD gene, fecC residue 1ZS child, fecB gene, fecA residue 1ZS child, fe cR3 ⁇ 4fc child, feci residue is child, dnaC residue is child, dnaT3 ⁇ 4fe child, bglj residue is Child, i uF fc child, rsmC ⁇ fc child, holD remnant is child, riml3 ⁇ 4fe child, prfC remnant is child, osmY remnant is child, deoC3 ⁇ 4fc child, deoAM child, deoB3 ⁇ 4 remnant, deoD remnant, lplA gene, smp remnant Child, serB is is child, radAMfe child, nadR3 ⁇ 4fe child, sit bean is child, trpR
  • acrE is child, arg chome gene, artl gene, artj gene, artM gene, artP gene, ar tQ gene, bfr gene, chiA gene, chpA gene, dacC gene, deoR gene, dinG gene, elaA gene, elaB Gene, elaC gene, elaD gene, envD gene, envD gene, envR gene, IhuA gene, IhuB gene, IhuC gene, IhuD gene, folX gene, glnH gene, glnP gene, glnQ gene, gltj gene, gltK gene , GltL gene, gspA gene, gspC3 ⁇ 4 gene, gspD3 ⁇ 4fzs child, gspE gene isson, gsppl3 ⁇ 4 gene, gsp_J gene isson, gspK gene 1zs gene,
  • JW0249 gene is5B gene, yi51 gene, mmuP Gene, mmuM gene, alUC gene, JW0255 gene, insB gene, insA gene, JW0258 gene, yagB gene, yagA ⁇ fe child, yagE3 ⁇ 4fc child, yagF child, yagG child, yagH3 ⁇ 4 child, yagl child, argrjA fc, yfjl, yagj fc, yagK3 ⁇ 4fc, yagL, yagM3 ⁇ 4, yagN, intF3 ⁇ 4fc, yagP3 ⁇ 4fc, yagQ, yagR to, yag jftizs, yagTfcs, yagU3 ⁇ 4 , Ykgj3 ⁇ 4, yagV3 ⁇ 4fe
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 3110110 to 3134341 [12] nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 3110110 to 3134341
  • yecT gene, flhE gene, flhA gene, flhB gene, cheZ gene, cheY gene, cheB gene, cheR gene, tap gene, tar gene, cheW residue 1ZS child, cheA3 ⁇ 4fe child, mot B gene, motA gene, flhC gene , FlhD gene, JW1882 gene, JW1883 gene, yecG gene, otsA3 ⁇ 4fc, otsB gene is, araH gene is, araG3 ⁇ 4is, araF3 ⁇ 4fzs, ye cl gene, yecj gene, JW1892 gene, ftn gene, yecH gene, tyrP gene, uvrC ⁇ na, uvrY3 ⁇ 4fc na, yecF3 ⁇ 4fe tens, sdiAjA gene, yecC ⁇
  • V one of E. coli mutants according to (1) to (6) above, which has chromosomal DNA.
  • DNA having the following base sequence described in [1] or [2] in the base sequence represented by SEQ ID NO: 1 or DNA corresponding to such DNA is not included! /, Having chromosomal DNA 1) A mutant of E. coli according to any one of (17).
  • DNA having a nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 728821 to 739593 in the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 1 or DNA not corresponding to the DNA! /, Having chromosomal DNA ( 1) A mutant of E. coli according to any one of (19).
  • yjfl gene yjfj gene, yj! K gene, yj! L gene, yj! M gene, yjfC gene, aid The above-mentioned chromosomal DNA, including B gene, yjlN gene, yjfO gene, yjlP gene, yjlQ gene, yjlR gene, sgaT gene, sgaB gene, sgaA gene, sgaH gene and sgaU gene, or their homologous genes (1 ) To (20), one of E. coli mutants.
  • B gene yjlN gene, yjfO gene, yjlP gene, yjlQ gene, yjlR gene, sgaT gene, sgaB gene, sgaA gene, sgaH gene and sgaU gene, or their homologous genes (1 ) To (20), one of E. coli mutants.
  • a mutation in E. coli comprising the gene of (1) [1] above, spr gene, bcr gene and rsuA gene, or a homologous gene thereof, and having a chromosomal DNA shorter than the chromosomal DNA of wild-type E. coli by 933 kbp or more body.
  • nmpC gene vly S gene, ybcS gene, y bcT3 ⁇ 4fc, vboR, ybcV, is ybcW, is nohB3 ⁇ 4fc, ybcX3 ⁇ 4, ybcY, JW0552, appY, ompT, envY, ybcH, nfrA3 ⁇ 4fe, nfrB gene, cusS3 ⁇ 4fc, cusR3 ⁇ 4 gene, cusC3 ⁇ 4 gene, ylcCjAizs, cu sB3 ⁇ 4fc, cusA gene, pheP3 ⁇ 4fc, ybdG3 ⁇ 4fe, nfnB, ybdF3 ⁇ 4, ybdJ, ybdJ , HokE gene, yi81 gene, yi82 gene, ymcC gene, ymcD ⁇ na, c
  • M gene yagR gene, ygf 0 gene, yg! P gene, ygfQ gene, yg! R gene, ygS gene, ygfT gene, pbuX gene, idi gene, epsM gene, exeL gene, exeC gene, JW2938 gene, JW29 39 gene, JW2940 gene, JW2941 gene, yghK gene, glcB gene, glcG gene, glcF gene, glcD gene, glcC gene, JW2948 gene, yghQ gene, yghR gene, yghS gene, yghT gene, yihL gene, yihM gene, yihN gene, yshA gene, yihO gene Gene, yihP gene is, yihQ gene, yihR gene, yihS3 ⁇ 4fc gene, yih
  • Child, yjiW gene, hsdS fe gene, hsdM3 ⁇ 4 gene, hsdR gene is, mrr gene, yjiA gene is, yjiX gene, yjiY gene, tsr gene, yjjL gene, _JW4320 gene, yjjM gene, yjjN gene, mdoB gene , YjjA gene, kdpF gene, ybfA gene, rhsC gene, JW069 0 gene, ybffi gene, rhsA gene, yb! Gene, yb! L gene, yb!
  • R gene sgaT gene, sgaB gene, sgaA gene, sgaH Gene, sgaU gene, rhsB gene, JW344 8 gene, yhhH gene, yibA gene, yhhl gene, yhhj gene, yhiH gene, yhil gene, yhij gene, yhiK gene, yhiL gene, yhiM gene, yhiN gene, JW0782 gene , YbiA fc child, dinG child, ybiB3 ⁇ 4 fc, ybiC3 ⁇ 4fe, ybij, ybil, ybiX, ybiL, ybiM, ybiN, ybiO, glnQ, gl nP, glnH, yliA, yliB , YliC gene, yli
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 1996662 to 2028209
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 2069149 to 2081926
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 2255895 to 2263491
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 2755677 to 2789480
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 2795174 to 2800890
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 2804308 to 2810147
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 2985362 to 3033128
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 3077085 to 3078916 [28] nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 3077085 to 3078916
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 3360737 to 3370547 [30] nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 3360737 to 3370547
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 3618576 to 3636916 [31] nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 3618576 to 3636916
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 3854662 to 3865831 [32] nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 3854662 to 3865831
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 4313318 to 4329721 [40] nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 4313318 to 4329721
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 4409533 to 4423151 [41] nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 4409533 to 4423151
  • Useful substance strength The production method according to any one of the above (43) to (46), which is a useful substance selected from the group consisting of protein, peptide, amino acid, nucleic acid, vitamin, sugar, organic acid and lipid strength.
  • the present invention it is possible to provide a mutant of Escherichia coli in which the amount of cells after culturing for a certain period of time is larger than that of wild-type Escherichia coli, and a method for producing a useful substance using the mutant.
  • FIG. 1 is a view showing the structure of a DNA fragment in which a sacB gene and a cat gene are linked.
  • E. coli W3110 (ATCC27325) belonging to E. coli K-12 and E. coli MG1655 ( ATCC47076), ATCC11303 strain belonging to E. coli B strain, ATCC9637 strain belonging to E. coli W strain, and the like.
  • the number with the power “JW” that describes the base sequence of the stipulated gene is the gene number registered in Japan DNA Data Bank.
  • the base sequence represented by SEQ ID NO: 1 is the chromosomal DNA base sequence of Escherichia coli W3110 strain registered on the above-mentioned Internet site on October 29, 2004.
  • a chromosomal DNA containing a gene refers to a chromosomal DNA containing a region having a specific control function such as a structural gene of a specific gene, a promoter and an operator. Does not contain genes! /, Chromosomal DNA is a chromosomal DNA that does not include part or all of the structural gene of a specific gene, or has a specific regulatory function such as the promoter and Z or operator of the gene Do not include region! /, Chromosomal DNA.
  • the chromosomal DNA that does not include a part of the structural gene is a chromosomal DNA that does not include a part of the structural gene and that does not transcribe or express a functional protein from the structural gene.
  • the 5 'end region of the structural gene is missing! /, So there is no start codon, most of the 3' end region, for example, 10% or more of the whole, preferably 20% or more, more preferably 30% or more More preferably, chromosome DNA lacking 40% or more is exemplified.
  • the chromosome DNA that does not include both of the adjacent genes on the chromosomal DNA may be DNA that includes a base sequence existing between both genes.
  • a homologous gene refers to a gene in which sequence homology is found in the base sequence of the gene in E. coli species, or a gene in which sequence homology is found in the amino acid sequence of the protein encoded by the gene.
  • sequence homology is observed is 85% or more, preferably 90% or more, more preferably 95% or more, still more preferably 98% or more, particularly preferably in the base sequence.
  • sequence similarity 80% or more, preferably 90% or more, more preferably 95% or more, more preferably 98% or more, particularly preferably 99% or more of amino acid sequence. There is something.
  • DNA corresponding to the DNA having the base sequence represented by the specific base number in the base sequence represented by SEQ ID NO: 1 refers to the base sequence represented by the specific base number in E. coli species.
  • the term “DNA” includes DNA having substantially the same constitution and position on chromosomal DNA. The gene structure contained in DNA is substantially the same. If the genes contained in the DNA are the same or a homologous gene and the arrangement order of the genes is the same, the nucleotide sequences between the genes are different. You may do it. However, if there is an insertion sequence in the DNA having the base sequence represented by the specific base number, the insertion sequence may not be present in the DNA corresponding to the DNA. The position on the chromosomal DNA is substantially the same.
  • the base sequence of the chromosomal DNA was assigned along the coding strand of the ThrA gene, with the adenine of the start codon of ThrA gene on the chromosomal DNA of E. coli being number 1.
  • it is DNA having a base number difference of 50 or less, preferably 30 or less, more preferably 10 or less, and still more preferably 5 or less with respect to the specific base number.
  • the insertion sequence may not be present in the DNA corresponding to the DNA.
  • the base number is different!
  • the DNA corresponding to the DNA having the base sequence represented by the specific base number in the base sequence represented by SEQ ID NO: 1 is, for example, 80% or more, preferably, the base sequence represented by the specific base number
  • a DNA having a sequence similarity of 90% or more, more preferably 95% or more, further preferably 98% or more, particularly preferably 99% or more can be mentioned.
  • nhaR is, rpsT, ri bF, ileS genes , IspA gene, IkpB gene, lytB gene, dapB gene, carA gene 1zs +, carB3 ⁇ 4fc na, caiF gene, caiE3 ⁇ 4 gene, caiD gene, caiC3 ⁇ 4fc na, caiB gene, caiA gene, caiT gene, fixA gene, fixB Gene, fixC gene, fixX gene, ke!
  • Gene, cyoC gene, cyoB gene, cyoA gene, ampG gene is child, bolA gene, tig gene, clpP gene, clpX gene, Ion gene, hupB gene, cofil: gene, mdlA gene, mdlB3 ⁇ 4fc gene, glnK gene is AmtB3 ⁇ 4fc, tesB, maa3 ⁇ 4fc, hha gene, acrB3 ⁇ 4 transmission, acrA, acrR is, aefA3 ⁇ 4fe, priC, apt3 ⁇ 4fc, dnaXnana, recR3 ⁇ 4fe ⁇ , htpG3 ⁇ 4fe ⁇ , adk ⁇ hemH, aes3 ⁇ 4fc, gsk, fsr, ushA, cueR, gel, gip3 ⁇ 4fc, purK3 ⁇ 4fc,
  • V gene, yc! W gene, cobB gene, potD gene, potC gene, potB gene, potA gene, pep gene 1S child, phoQ is is, phoP3 ⁇ 4fc, purB gene, trmUM 1zs +, icdA3 ⁇ 4fe tens, minE3 ⁇ 4fe tens, minD3 ⁇ 4fc na, minC3 ⁇ 4fe3 ⁇ 4, clyA3 ⁇ 4 gene, umuD gene, umuC gene, dsbB gene, nhaB gene, fadR gene, dadA gene DadX Gene, WcA gene, mltE gene, tagl gene, treA gene, dhaR gene, pth gene, prsA fe child, ychB is is child, hemM3 ⁇ 4 gene, hemA3 ⁇ 4fc child, prfA3 ⁇ 4fc child, hemKjAfe child, kdsA gene, chaA3 ⁇
  • paaH is is child, paal bean to child, paaj3 ⁇ 4fc child, paaK3 ⁇ 4fc child, paaK3 ⁇ 4fc child, paaK3 ⁇ 4fc child, PaaY3 ⁇ 4fc child, acpD3 ⁇ 4 aldA child, gapCjl: Denko, gapC ⁇ to child, cybB child, trg3 ⁇ 4fe, rimL 1zs child, , TehB3 ⁇ 4fc child, prtC child is child, potA3 ⁇ 4 child, potC child is child, an
  • Child inaA fc child, glpQ child fc child, glpT3 ⁇ 4fc child, glpA3 ⁇ 4 child, glpB child, glpC child, ais, pmrD, menE, menB +, menB, menD, menF, nuoN, nuoM, nuoL, nuoK, 1zs +, nuoJ3 ⁇ 4fe, nuol Child, nuoH gene, nuoG3 ⁇ 4fc, nuoF3 ⁇ 4fc, nuoEM, nuoD3 ⁇ 4fc, nuoB3 ⁇ 4, nuoA is, lrhA, ackA is, pta, ubiX, purF3 ⁇ 4fc, dedE, dedE Is is, folC is is, accD3 ⁇ 4fc, dedA, truA, usgl3 ⁇ 4, pdxB gene, div is is, fabB is, dd pX,
  • nriD gene nrffi gene, nriF gene, nrfG gene, gltP gene, fdhF Fc na, alsR ten, rpiB ten, proP gene, basS gene to child, basR gene, adiY gene, adi gene, melR gene, melA gene, melB gene, fumB gene, dcuB gene, dcuR3 ⁇ 4fc, dcuS, lysU, is cadAjAfe, cadB3 ⁇ 4, cadC, is cutA3, cutA2, cutA, dcuA, aspA, fesA, groES3 ⁇ 4fc, groELM
  • Child, eft) child, ecnB3 ⁇ 4 child, sugE child, blc child is, ampC child is, frdD child, frdC child, frdB3 ⁇ 4fc child, frdA3 ⁇ 4 child, genX3 ⁇ 4fc child, psd child, yjeQ Gene, yje E3 ⁇ 4fe, amiB gene, mutL gene, miaA3 ⁇ 4fc, hfq3 ⁇ 4fe, hflX3 ⁇ 4fc, hflKM, hflC fc, purA is, vacB, sga, isp, rpsF3 ⁇ 4, priB3 ⁇ 4 , RpsR, rpll3 ⁇ 4fc, fldB3 ⁇ 4, cpdB3 ⁇ 4fc, cysQ3 ⁇ 4, msrA is, chpS3 ⁇ 4fe, chpB3 ⁇ 4fe, pp
  • 3 ⁇ 4fc child idnD residue is child, idnK gene, fecEjAizs child, fecD gene, fecC residue 1ZS child, fecB residue 1ZS child, fe cR3 ⁇ 4fc child, feci residue is child, dnaC residue is child, dnaT3 ⁇ 4fc child, bglj gene, l uF3 ⁇ 4fe child, rsmC , DeoAM child, deoB3 ⁇ 4 child, deoD child is child, lplA child is child, smp member is child, serB member is child, radAMfc child, nadR3 ⁇ 4fe child, sit member to child, trpR3 ⁇ 4 child, gpmG3 ⁇ 4fc child, rob child is child , CreA gene, creB3 ⁇ 4 gene, creC residue 1ZS child, creD3 ⁇ 4 gene, arc
  • acr remains is child, argT3 ⁇ 4fc child, artl residue 1ZS child, artj3 ⁇ 4fc child, artM residue 1ZS child, artP residue 1ZS child, artQ gene, bfr gene, chiA gene, chpA gene, dacC gene, deoR gene, dinG fc child, elaA gene is child, elaB gene is child, elaC gene is child, elaD3 ⁇ 4 gene, envD gene is child, envRM gene, IhuA gene, IhuB gene, IhuC gene, IhuD gene, folX gene, glnH gene, glnP, glnQ, gltj, gltK, gltL, gspA, gspC3 ⁇ 4, gspD3 ⁇ 4fzs, gspE, gspl3 ⁇ 4, gsp_J is, gln
  • the above genes [1] and [2] present on the chromosomal DNA of wild-type Escherichia coli and the homologous genes of these genes are excluded! Don't include the gene for a sleet! Specifically, it may be a mutant of Escherichia coli having a chromosome DNA. Specifically, it may be a gene other than the genes [1] and [2] in the genes shown in Table 1 or a homologous gene of the gene. A mutant of E. coli having a chromosomal DNA that does not contain the selected gene (provided that the wild-type E.
  • the Escherichia coli mutant of the present invention preferably includes the above [1] and [2] or homologous genes thereof)
  • NC gene a gene (hereinafter referred to as NC gene)
  • the aforementioned E. coli mutant derived from the wild-type E. coli may not have the NC gene.
  • the Escherichia coli mutant of the present invention preferably includes the above [1] and [2] or homologous genes thereof)
  • Gene, JW0249 gene, is5B gene, yi51 gene, mmuP gene, mmuM gene, alUC gene, JW0255 gene, insB gene, insA gene, JW0258 gene , YagB gene, yagA ⁇ fe child, yagE3 ⁇ 4fc child, yagF remnant child, yagG remnant, yagH3 ⁇ 4 child, yagl child, argrjA fc child, yfjl child, yagj fc child, yagK3 ⁇ 4fc child, yagL gene, yagM3 ⁇ 4 , YagN gene, intF3 ⁇ 4fc child, yagP3 ⁇ 4fc child, yagQ child, yagR child, yag jftizs , YagTfcs, yagU3 ⁇ 4, ykgj3 ⁇ 4, ya
  • K gene, ymS3 ⁇ 4fe child, ycfA3 ⁇ 4fc child, ycffi isis child, pin residue is child, mcrA3 ⁇ 4fe child, JW1 146 is child, ycgW is is child, ycgX is is child, ycgE child, JW11503 ⁇ 4fc child, ycgZ3 ⁇ 4fc child , YmgA gene, JW1153 gene, ymgC gene, yahA gene, JW1156 gene, JW1157 gene, aidA gene, ymgD gene, JW1160 gene, JW1161 gene, JW1162 gene, yd!
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 3110110 to 3134341,
  • yecT gene, flhE gene, flhA gene, flhB gene, cheZ gene, cheY gene, cheB gene, cheR gene, tap gene, tar gene, cheW residue 1ZS child, cheA3 ⁇ 4fe child, mot B gene, motA gene, flhC gene , FlhD gene, JW1882 gene, JW1883 gene, yecG gene, otsA3 ⁇ 4fc, otsB gene is, araH gene, child, araG3 ⁇ 4is, araF3 ⁇ 4fzs, ye cl gene, yecj gene, JW1892 gene, ftn gene, yecH gene, tyrP gene, uvrC ⁇ na, uvrY3 ⁇ 4fc na, yecF3 ⁇ 4fe tens, sdiAjA gene, yecC
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 2755677 to 2789480 [2] nucleotide sequences represented by nucleotide numbers 2795174 to 2800890,
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 2825314 to 2830262,
  • yegE gene alkA gene, yegD gene, JW2055 gene, JW2056 gene, JW2057 gene, JW2058 gene, yegM gene, yegN gene, yegO gene, yegB gene, baeS gene, baeR gene, JW2065 gene, yegQ gene , OgrK gene, JW20 68 gene, JW2069 gene, yegS gene, gatR gene, JW2072 gene, JW2073 gene, gatR, gatD, gatC, gatB, gatA, gatZ
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 2146264 to 2187855 [1] a nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 2146264 to 2187855, [2] a nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 2200669 to 2229850,
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 2270440 to 2286588, and
  • the mutant having the chromosomal DNA More preferably, the mutant having a chromosomal DNA not containing a gene other than the gene contained in the ⁇ 43 region in Table 1, more preferably corresponding to the ⁇ 43 region in Table 1. DNA containing a base sequence or DNA other than DNA corresponding to the DNA is not included!
  • K gene YmS gene, ycfA gene Ycffi gene, pin gene, mcrA gene, JW1146 gene, ycgW gene, ycgX gene, ycgE gene, JW1150 gene, ycgZ gene, ymgA gene, JW1153 gene, ymgC gene, yahA gene, JW1156 gene, JW1157 gene , AidA gene, ymgD gene, JW1160 gene, JW1161 gene, JW1162 gene, yd! H gene, ydfZ gene, ydfl gene, shiA gene, JW1537 gene, tnpR gene, yd!
  • 3 ⁇ 4 transfer yehP3 ⁇ 4fc, yehQ, yehR, yehS, yehT3 ⁇ 4, yehU, yehV is, yehW is, yehX3 ⁇ 4fc, yehZ3 ⁇ 4, yehZ, bglX3 ⁇ 4fc, dld3 ⁇ 4fc, pbpG3 ⁇ 4fe, yohC3 ⁇ 4, yeil is is, yeiJiK, yeiK, yeiL, yeiM, yeiN, yeiC, cmtA, cmtB, intB, _JW4228, yjgW gene, yjgX gene, yjgY gene fc, yjgZ gene, yi413 ⁇ 4 gene, yi42 gene, yjhB gene, yjhC gene, yjh
  • Child, yjiW gene, hsdS fe gene, hsdM3 ⁇ 4 gene, hsdR gene is, mrr gene, yjiA gene is, yjiX gene, yjiY gene, tsr gene, yjjL gene, _JW4320 gene, yjjM gene, yjjN gene, mdoB gene , YjjA gene, kdpF gene, ybfA gene, rhsC gene, JW069 0 gene, ybffi gene, rhsA gene, yb! Gene, yb! L gene, yb!
  • R gene sgaT gene, sgaB gene, sgaA gene, sgaH Gene, sgaU gene, rhsB gene, JW344 8 gene, yhhH gene, yibA gene, yhhl gene, yhhj gene, yhiH gene, yhil gene, yhij gene, yhiK gene, yhiL gene, yhiM gene, yhiN gene, JW0782 gene , YbiA fc child, dinG child, ybiB3 ⁇ 4 fc, ybiC3 ⁇ 4fe, ybij, ybil, ybiX, ybiL, ybiM, ybiN, ybiO, glnQ, gl nP, glnH, yliA, yliB , YliC, yliD
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 243965 to 253410 [2] Base sequences represented by nucleotide numbers 261964 to 387531, [3] Base sequences represented by nucleotide numbers 389139 to 403703, [4] Base sequences represented by nucleotide numbers 518030 to 532711 [5] Base sequences represented by base numbers 535505 to 550215, [6] Base sequences represented by base numbers 563941 to 608118, [7] Bases represented by base numbers 728821 to 739593 Sequence, [8] nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 832552 to 848089, [9] nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 867638 to 883473, [10] nucleotide sequences represented by nucleotide numbers 890998 to 909379 [11] nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 1048888 to 1097019, [12]
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 3618576 to 3636916
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 3867102 to 3877010
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 2423365 to 2434098
  • nucleotide sequence represented by nucleotide numbers 2472852 to 2482482, and
  • the chpA gene or its homologous gene is not included! / (2) to (38) !, which has a chromosome DNA, or any one mutant of E. coli,
  • Start gene number in SEQ ID NO: 1 Termination gene name in SEQ ID NO: 1 "Chain number" (Coupled to complementary strand number (stop number if copied to complementary strand) Start number)
  • Termination gene in SEQ ID NO: 1) K chain number (co-linked number to complementary strand (stop number if co-linked to complementary strand) start number)
  • JW0540 (is5B) Complementary strand 573624 574640
  • JW0566 (ybdG) Complementary strand 602303 603550
  • JW0575 (fepA) Complementary strand 609141 61 1441
  • Termination gene name in SEQ ID NO: 1 "Chain number" (the start number in the case where the number is the same as the complementary strand)
  • JW0614 (is5B) 653909 654925
  • Termination gene name in SEQ ID NO: 1 “Chain number” (the number that is assigned to the complementary strand (the stop number if it is the same as the complementary strand))
  • JW0628 (rlpA) Complementary strand 664 188 665 276
  • JW0632 (ybeB) Complementary strand 668805 669014
  • JW0633 (phpB) Complementary strand 669382 669993
  • JW0640 (ybeR) 676797 677504
  • JW0642 (ybeT) complementary strand 678938 679492
  • JW0645 (ybeW) Complementary strand 681809 683479
  • Termination gene name in SEQ ID NO: 1) “Chain number” (Start number if it is the same as the complementary strand and the number is the same as the complementary strand)
  • JW0656 (ybeY) complementary strand 691960 692427
  • Termination gene in SEQ ID NO: 1) K chain number (co-linked number to complementary strand (stop number if co-linked to complementary strand) start number)
  • JW0680 (speF) Complementary strand 718348 720546
  • JW0682 (kdpE) Complementary strand 721142 721744
  • JW0684 (kdpC) Complementary strand 724493 725065
  • Termination gene name in SEQ ID NO: 1) “Chain number” (Co-wasawa number on complementary strand (end number if co-stranded on complementary strand))
  • Termination gene name in SEQ ID NO: 1 “Chain number” (the number that is assigned to the complementary strand (the stop number if it is the same as the complementary strand))
  • Termination gene name in SEQ ID NO: 1 "Chain number" (the start number in the case where the number is the same as the complementary strand)
  • Terminating gene name in SEQ ID NO: 1 Terminating gene in SEQ ID NO: 1 Cohesion number (copied number in complementary strand (starting number in case of cooperating in complementary strand))
  • JW0954 (hyaA) 1032224 1033342
  • JW0968 (ymcB) Complementary strand 1048030 1048776

Landscapes

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Abstract

　本発明によれば、野生型の大腸菌の染色体ＤＮＡより470kbp以上短い染色体ＤＮＡを有する該大腸菌の変異体は、一定時間培養後の菌体数が野生型株よりも多く、よって該変異体を培地に培養し、培養物中に有用物質を生成、蓄積させることにより、効率よく有用物質、例えばタンパク質、ペプチド、アミノ酸、核酸、ビタミン、糖、有機酸および脂質などを製造することができる。

Description

明 細 書
工業的に有用な微生物
技術分野
[0001] 本発明は、野生型の大腸菌より染色体 DNAが短い大腸菌の変異体、および該変 異体を用いた有用物質の製造法に関する。
背景技術
[0002] 大腸菌は、その染色体 DNAの全塩基配列が明らかになつている（非特許文献 1お よび 2)。また、相同組換え手法を用いて、大腸菌の染色体 DNA上に存在している 任意の遺伝子または染色体 DNA上の任意の領域を意図した通りに欠損させる方法 は知られている（非特許文献 3)。また染色体 DNAの全塩基配列情報および相同組 換え手法を利用して大腸菌の染色体 DNA上の各遺伝子を網羅的に破壊した変異 株ライブラリー、および 20kbp程度の削除可能な染色体 DNA上の領域のそれぞれを 網羅的に欠損させた変異株ライブラリーなども作製されている（非特許文献 4および 5
) o
[0003] 染色体 DNA上の複数の領域が欠損している大腸菌の変異株としては、 376kbpを 欠損して!/ヽる変異株 (非特許文献 6)、 262kbpを欠損して ヽる変異株 (非特許文献 7) 、 313kbpを欠損している変異株 (非特許文献 5)が報告されている力 いずれの株も その生育 (菌体量または生育速度）は親株である野生型株と同等であると記載されて いるのみで、染色体 DNAに 400kbp以上の欠損を導入した場合、当該欠損が大腸菌 の生育にどのような影響を及ぼすかにつ 、ての記載はな 、。
[0004] すなわち、染色体 DNA上の複数の領域が欠損しており、かつ生育が野生型の大 腸菌より向上した大腸菌の変異体、および該変異体を用いた有用物質の製造法に ついては知られていない。
非特許文献 1 : Science, 277, 1453(1997)
非特許文献 2 :日本 DNAデータバンク、 "Escherichia coli K12 W3110，，、 [online], [ 平成 16年 10月 29日]、インターネット〈URL:http：〃 gib.genes.nig.ac.jp/single/index. php?spid=Ecol_K12_W3110〉 非特許文献 3 : J. BacterioL, 180, 2063(1998)
非特許文献 4:蛋白質 核酸 酵素、第 46卷、 2386頁、 2001年
非特許文献 5 :Nature BiotechnoL, 20, 1018(2002)
非特許文献 6 : Genome Research, 12, 640(2002)
非特許文献 7 : Genome Research, 13, 644(2003)
発明の開示
発明が解決しょうとする課題
[0005] 本発明の目的は、染色体 DNA上の複数の領域が欠損している大腸菌の変異体、 および該変異体を用いた有用物質の製造法を提供することにある。
課題を解決するための手段
[0006] 本発明は、以下の（1)〜 (47)に関する。
(1)以下の [1]および [2]記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子を含み、かつ野 生型の大腸菌より 470kbp以上短 、染色体 DNAを有する大腸菌の変異体。ただし、 以下の [1]および [2]記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子中に、野生型の大腸 菌が元来有していない遺伝子 (以下、 NC遺伝子という）がある場合は、該野生型の大 腸菌に由来する上記大腸菌の変異体は、 NC遺伝子を有して 、なくてもよ 、。
[l]thrA遺伝子、 thrB遺伝子、 thrC遺伝子、 talB遺伝子、 mog遺伝子、 htgA遺伝子、 dnaK遺 子、 dnaj遺 子、 hokC遺伝子、 nhaAjAfe子、 nhaR¾伝子、 rpsT¾fc子、 ri bF遺伝子、 ileS遺伝子、 IspA遺伝子、 IkpB遺伝子、 lytB遺伝子、 dapB遺伝子、 carA遺 十、 carB遺 1zs子、 caiF¾fcナ、 caiEjAizs子、 caiD¾fcナ、 caiC遺伝子、 caiB¾fe卞 、 caiA遺伝子、 caiT遺伝子、 fixA遺伝子、 fixB遺伝子、 fixC遺伝子、 fixX遺伝子、 ke!C 遺 1zs子、
Figure imgf000003_0001
pdxA¾fc子、 surA 遺 子、 imp¾fc子、 djlA¾伝子、 rluA¾伝子、 hepA遺お子、 polB¾伝子、 araD遺 is 子、 araAjAfe子、 araB遺伝子、 araC¾fc子、 tbpA遺 1ZS子、 leuD¾伝子、 leuC¾fc子 、 leuB遺伝子、 leuA遺伝子、 leuL遺伝子、 leuO遺伝子、 ilvl遺伝子、 ilvH遺伝子、 fruR 逾 十、 ftsL¾fcナ、 ftsl遺 to子、 murE遺伝子、 murF¾fcナ、 mraY¾feナ、 murD遺 伝子、 ftsW遺伝子、 murG遺伝子、 murC遺伝子、 ddlB遺伝子、 ftsQ遺伝子、 ftsA遺伝 ナ、 ftsZ¾fcナ、 lpxC¾伝子、 secA遺伝子、 mutT¾fcナ、 yacE¾伝十、 guaC¾fcナ 、 ho! 遺伝子、 hoffi遺 ナ、 ppdD遺 十、 nadC遺伝子、 ampD遺伝子、 ampE遺伝子 、 aroP遺伝子、 pdhR遺伝子、 aceE遺伝子、 aceF遺伝子、 lpdA遺伝子、 acnB遺伝子、 speD遺 ナ、 speE遺 ナ、 gcd遺伝十、 hpt遺 子、 yadF遺 子、 panD遺 to子、 pan C遺伝子、 panB遺伝子、 htrE遺伝子、 ecpD遺伝子、 folK遺伝子、 pcnB遺伝子、 dksA 遺伝子、 sfsA遺伝子、 ligT遺伝子、 hrpB遺伝子、 ponB遺伝子、 hemL遺伝子、 pfs遺伝 子、 dgt遺 to子、 htrA遺伝子、 dapD遺 子、 glnD遺伝子、 map遺伝子、 rpsB遺伝子、 t sf遺伝子、 smb遑 to子、 rrf遺 to子、 dxr¾fe卞、 rth逾 to子、 cdsA遺 子、 yaeL遺 子 、 hlpA遺伝子、 IpxD遺伝子、 fabZ遺伝子、 IpxA遺伝子、 IpxB遺伝子、 rnhB遺伝子、 dn aE遺 卞、 accA遺 卞、 ldcC遺伝十、 mesj遺伝子、 rofiftfe十、 cutF遺 1zs子、 proS遺 伝子、 rcsF遺伝子、 abc遺伝子、 dniR遺伝子、 gloB遺伝子、 rnhA遺伝子、 dnaQ遺 子、 upl8¾伝子、 gmhA fc子、 pepD¾伝子、 gpt¾fc子、 crl¾伝子、 pho 遺伝子、 proB¾fcナ、 proA¾fcナ、 hemB遺 子、 proC遺 子、 aroL¾feナ、 aroM遣 is 、 a raj遺 is子、 sbcC fe子、 sbcD遺 is子、 phoB遺 is子、 phoR¾fe子、 brnQ遺 is子、 pr oY遺 子、 malZ¾feナ、 queA遺 is子、 tgt遺 to子、 secD遺 to子、 secF遺 子、 tsxM 子、 ribD遺 is子、 ribH遺 is子、 nusB¾fc子、 thiL¾fc子、 pgpA遺伝子、 dxs¾fc子 、 ispA遺 is子、 xseB遺伝子、 thil遺伝子、 thij遺伝子、 apbA遺 is子、 cyoE遺伝子、 cyo 。遺伝子、 cyoC遺伝子、 cyoB遺伝子、 cyoA遺伝子、 ampG遺 is子、 bolA遺伝子、 tig 遺伝子、 clpP遺伝子、 clpX遺伝子、 Ion遺伝子、 hupB遺伝子、 cofil:伝子、 mdlA遺伝 子、 mdlB¾fc子、 glnK遺 is子、 amtB¾fc子、 tesB遺 子、 maa¾fc子、 hha遺伝子、 acrB¾伝十、 acrA遺 子、 acrR遺 is子、 aefA¾fe十、 priC遺 子、 apt¾fcナ、 dnaX 逾 ナ、 recR¾fe十、 htpG¾fe十、 adk遺伝子、 hemH遺 子、 aes¾fcナ、 gsk遺 子、 fsr遺 子、 ushA遺 子、 cueR遺 子、 gel遺 子、 gip¾fcナ、 purK¾fcナ、 pur E¾fe子、 ybbF¾伝子、 ppiB¾fc子、 cysS遺 is子、 folD¾fe子、 sftnA遺伝子、 sftnC 逾 fc子、 sftnD遺 子、 s&iH遺 子、 sfoiF¾伝子、 fimZ¾伝子、 entD遺 is子、 fepA遺 子、 fes¾fzs子、 ent 遺伝子、 fepE遺 to子、 fepC¾fc子、 fepG遺 is子、 fepD遺 is子 、 fepB遺伝子、 entC遺 子、 entE遺 to子、 entB¾fc子、 entA遺伝子、 cstA¾伝子、 d sbG遺 is子、 ahpCjAizs子、 ahpFjA伝子、 rnk¾fcナ、 rna遺伝子、 citT¾fcナ、 citGjl: 伝子、 citX遺伝子、 citF遺伝子、 citE遺伝子、 citD遺伝子、 citC遺伝子、 citA遺伝子、 citB遺伝子、 dcuC遺 to子、 dcuC遺伝子、 crcA遺 to子、 cspE遺伝子、 crcB遺伝子、 lip A遺伝子、 lipB遺伝子、 dacA遺伝子、 rlpA遺伝子、 mrdB遺伝子、 mrdA遺伝子、 phpB 遺伝子、 nadD遺伝子、 holA遺伝子、 rlpB遺伝子、 leuS遺伝子、 lnt遺伝子、 phoL遺 is 子、 ubiF遺 十、 asnB遺伝子、 nagD遺伝十、 nagC遺 ナ、 nagA遺 ナ、 nagB遺伝 子、 nagE遺 is 、 glnS遺 to子、 fur遺伝子、 fldA遺 ナ、 seqA遺 ナ、 pgm遺 is子、 po tE遺伝子、 speF遺伝子、 kdpE遺伝子、 kdpD遺伝子、 kdpC遺伝子、 kdpB遺伝子、 kd pA遺伝子、 phrB遺伝子、 end8遺伝子、 abrB遺伝子、 gltA遺伝子、 sdhC遺伝子、 sdh D遺 子、 sdhA遺伝子、 sdhB遺 1ZS子、 sucA遺伝子、 sucB遺伝子、 sucC遺伝子、 sue D遺伝子、 farR遺伝子、 hrsA遺伝子、 cydA遺伝子、 cydB遺伝子、 tolQ遺伝子、 tolR 遺伝子、 tolA遺伝子、 tolB遺伝子、 pal遺伝子、 nadA遺伝子、 pnuC遺 子、 czcD遺 伝子、 aroG遺伝子、 gpmA遺伝子、 galM遺伝子、 galK遺伝子、 galT遺 to子、 galE遺 子、 modF遺 izs十、 modE遺 fc 、
Figure imgf000005_0001
modB遺 子、 modC遺伝ナ、 bioA遺 子、 bioB遺伝子、 bioF遺 子、 bioC¾fc子、 bioD遺 is子、 uvrB¾伝子、 moaAMfe 子、 moaB遺 十、 moaし遺 子、 moaD遺 十、 moaE遺 +、 rhlE遺 子、 dps遺伝 子、 ompX¾fe十、 mipB¾fe十、 moeB遺 子、 moeA¾fe十、 mdfA¾fcナ、 grxAM 子、 poxB¾伝子、 aqpZ遺 子、 cspD¾fc子、 clpA遺 is子、 infA¾fc子、 aat遺 is子 、 cydC遺伝子、 cydD遺伝子、 trxB遺伝子、 lrp遺伝子、 ftsK遺伝子、 lolA遺伝子、 serS 遺伝子、 dmsA遺伝子、 dmsB遺伝子、 dmsC遺伝子、 pflA遺伝子、 pflB遺伝子、 focA 逾 ナ、 serC¾fcナ、 aroA¾伝十、 cmk¾fcナ、 rpsA¾伝十、 himD¾fcナ、 msbajl: 1zS子、 ΙρχΚ遺伝子、 kdsB遺伝子、 smtAjAizs子、 mukF¾izs子、 kicA¾izs子、 mukBM 1zs +、 aspC遺 is 、 ompF遺伝子、 asnS遺 子、 pncB遺 子、 pepN遺 to子、 ssuB遺 1zs +、 ssuC¾fe卞、 ssuD¾fcナ、 ssuA¾fcナ、 ssuE遺伝子、 pyrD遺 子、 uup遺 1zs 子、 pqiA遺 is子、 pqiB¾fe子、 rmf¾fe子、
Figure imgf000005_0002
ompA遺 is子、 sulA遺伝子、 helD遺お子、 mgsA遺 is子、 acyP¾fc子、 hyaA遺 子、 hyaB遺 子、 hyaC¾fe子、 h yaDjAizs 、 hyaE¾izs +、 hyaF¾fe卞、 appC遺 子、 appB遺 子、 appAjfczs子、 cs gG遺 is卞、 csgF遺 1zs子、 csgE¾fcナ、 csgD遺 to子、 csgB¾fcナ、 csgA遺 to子、 csg C遺伝子、 sfaA遺伝子、 mdoG遺伝子、 mdoH遺伝子、 msyB遺伝子、 htrB遺伝子、 sol A遺伝子、 dinl遺伝子、 pyrC遺伝子、 grxB遺伝子、 rimj遺伝子、 mviM遺 is子、 mviN 遺伝子、 flgN遺伝子、 flgM遺伝子、 flgA遺伝子、 flgB遺伝子、 flgC遺伝子、 flgD遺伝子 、 flgE遺伝子、 flgF遺伝子、 flgG遺伝子、 flgH遺伝子、 flgl遺伝子、 flgj遺伝子、 flgK遺 伝子、 flgL遺伝子、 rne遺伝子、 rluC遺伝子、 rpmF遺伝子、 plsX遺伝子、 fabH遺 is子 、 fabD¾伝子、 fabG fe子、 acpP遺 to子、 fabF遺伝子、 pabC遺 is子、 tmk¾fe子、 ho IB遺 is子、 ptsG fc子、 I uE遺 is子、 nagZ¾伝子、 ndh遺 is子、 mfd¾伝子、 yciUM 伝子、 yc!V遺伝子、 yc!W遺伝子、 cobB遺伝子、 potD遺伝子、 potC遺伝子、 potB遺 子、 potA遺伝子、 pep 遺 子、 phoQ遺 子、 phoP¾fc子、 purB遺伝子、 trmUM 1zs +、 icdA¾fe十、 minE¾fe十、 minD¾fcナ、 minC¾fe卞、 clyA¾伝子、 umuD遺 伝子、 umuC遺伝子、 dsbB遺伝子、 nhaB遺伝子、 fadR遺伝子、 dadA遺伝子、 dadX遺 伝子、 WcA遺伝子、 mltE遺伝子、 tagl遺伝子、 treA遺伝子、 dhaR遺伝子、 pth遺伝子 、 prsA fe子、 ychB遺 子、 hemM¾伝子、 hemA¾fc子、 prfA¾fc子、 hemKjAfe子 、 kdsA遺伝子、 chaA¾fe子、 chaB遺 子、 chaC¾fe子、
Figure imgf000006_0001
narX遺 1ZS子、 narK¾fcナ、 narG¾fc十、 narH¾fe十、 nar」ji:izs^ narl遺 is子、 tpr遺伝子、 purU 逾 fc子、 sprE遺 is子、 galU遺 is子、 hns¾fc子、 tdk遺 is子、 adhE¾伝子、 oppA遺お 子、 oppB遺伝子、 oppC遺伝子、 oppD¾fcナ、 oppF¾fcナ、
Figure imgf000006_0002
kch¾fcナ、 tonB遺伝子、 trpA fc子、 trpB遺 子、 trpC遺 is子、 trpD¾伝子、 trpE¾fc子、 trp L¾fe子、 btuR遺 is子、 sohB¾fc子、 topA遺 子、 cysB¾fc子、 acnA遺伝子、 ribA 逾 ナ、 pgpB¾izs +、 pyrF¾fcナ、 osmB遺 子、 rnb¾fcナ、 envM遺 子、 sapFM 1zs +、 sapDjAizs 、 sapC遺 is 、 sapB¾feナ、 sapA¾fcナ、 aldH¾伝十、 ordL遺
+、 goaG遺 子、 pspF遺 子、 pspA遺 子、 pspB遺 is子、 pspC遺 子、 pspD遺
+、 pspE¾feナ、 sucP¾fcナ、 ompGr遑 子、 tyrR¾fcナ、 tpx遺伝子、 mppA遺 is 子、 ihr遺 子、 ogt遺伝子、 dbpA遺 子、 intR¾fe子、 lar¾fe子、 recT遺 is子、 recE 逾 ナ、 racC¾fcナ、 kil¾fcナ、 sieB遺 子、 racR¾fcナ、 dnaC¾izs +、 enpPM zS 子、 trkG遺伝子、 VMTH丄 AMBD遺伝子、 VLOM丄 AMBD遺伝子、 tnpO遺伝子、 upo 3遺伝子、 ompN遺伝子、 nilj遺伝子、 hslj遺伝子、 ldhA遺伝子、 feaR遺伝子、 feaB遺
+、 tynA¾fcナ、 paaZ¾fcナ、 paaA¾fcナ、 paaB¾fe十、 paaC¾fcナ、 paaDM 1zs +、 paaE¾feナ、 paaF¾fcナ、 paaG¾feナ、 paaH遺 is子、 paal遺 to子、 paaj¾fc 子、 paaK¾fc子、 paaX遺お子、 paaY¾fc子、 acpD¾伝子、
Figure imgf000006_0003
aldA遺お 子、 gapC遺伝子、 gapC遺 to子、 cybB遺 to子、 trg遺 十、 rimL遺 1zs子、 tehA遺伝子 、 tehB遺伝子、 prtC遺伝子、 potA遺伝子、 potC遺伝子、 ansP遺 is子、 nhoA遺伝子、 narV遺 izs子、 narW遺 is十、 narY遺 is子、 narZ遺 ナ、 narU遺伝ナ、 fdnG遺 izs子、 fd nH遺 is子、 fdnl¾fc子、 adhP遺 is子、 sfcA遺 to子、 rpsV¾fc子、 osmC¾fc子、 dos 遺伝子、 xasA遺 is子、 gadB遺伝子、 pqqL遺伝子、 chuR遺伝子、 hipA遺伝子、 hipB遺 1ZS子、 tam遺 fc 、 uxaB遺 ナ、 marC遺 子、 marR遺 is子、 marA遺 is子、 marB遺 子、 dcp遺伝子、 lycV¾fc子、 dicA fe子、 dicB遺 is子、 rspB遺 1zs子、 rspA¾fc子 、 spe 遺 子、 dmsB遺 izs子、 dmsC遺 ナ、 bioD遺 is子、 mlc遺 子、 asr遺 is子、 eb r¾伝子、 pntB遺 fzs子、 pntA遺伝子、 arcD¾fzs子、 rstA遺 is子、 rstB遺 is子、 tus遺 1zs子、 lUmC¾fe子、！UmA遺 is子、 manA遺伝子、 uidC遺 子、 uidB遺伝子、 uidA遺 子、 uidR遺 子、 hdhAjAfe子、 mall¾fc子、 malX遺伝子、 malY遺 is子、 add遺伝 子、 blnife子、 ntn遺 is子、 gst遺 is子、 pdxY遺 is子、 tyrS¾fe子、 pdxH¾fc子、 sly B遺 子、 sly 遺 子、 sodC fc子、 nemA¾fe子、 gloA遺 is子、 rnt遺伝子、 lhr遺 子、 sodB¾伝子、 araj遺 1zs子、 purR¾fc子、 cfa¾fc子、 ribE¾fc子、 ag43遺 is子 、 phsCjAizs子、 nrfC¾fcナ、 pykF¾fcナ、 lppjAizs子、 suS遺伝子、 aroD遺 子、 pp sA¾fc子、 aroH遺 子、 nlpC¾fc子、 btuD遺 is子、 btuE¾fc子、 btuC遺 is子、 him A遺 is子、 pheT¾fc子、 pheS遺 is子、 pheM遺 is子、 rpl 遺 1S子、 rpml遺 子、 infC ¾fc子、 thrS fc子、 arp遺 is子、 plkB遺 is子、 cedAjAfe子、 katt遺 is子、 celt1遺 is 子、 celD遺お子、 celC¾伝子、 celB¾fc子、 celAjAfe子、 osmE¾fc子、 nadE遺 is子 、 spy¾fe子、 astE¾fc子、 astB遺 fzs子、 astD遺 is子、 astA¾伝子、 cstC¾fzs子、 xth A遺伝子、 gdhA遺伝子、 topB遺伝子、 selD遺伝子、 sppA遺伝子、 ansA遺伝子、 tdh 逾 fc子、 gapA遺伝子、 ttuC fc子、 caiT¾fc子、 rnd遺 is子、 fadD¾伝子、 sip遺 is 子、 pabB遺 子、 sdaA遺 、 manX遺 子、 manY遺云ナ、 manZ遺 子、 rrmA遺 子、 cspC¾伝子、 kdgR遺伝子、 tcmA遺 子、 htpX¾伝子、 prc¾fc子、 pqiB遺 is 子、 pphA fe子、 holE遺 子、 exoX¾fc子、 ptrB遺 子、 purT遺 is子、 eda¾fc子 、 edd遺 is 、 zwf¾伝十、 pykA¾fcナ、 mlt遺 子、 znuA遺 1zs子、 znuC¾伝十、 ruv B遺 fzs子、 ruvA遺伝子、 ruvC遺 is子、 ntpA¾伝子、 aspS¾f 子、 bisZ¾fc子、 torY 逾 ナ、 cutC¾fcナ、 arg jAto子、 pgsA遺 to子、 amn¾伝子、 cbl¾fe卞、 nacMfc 子、 er!K遺伝子、 cobT遺 ナ、 cobS遺伝子、 cobU遺伝子、 gyrl遺 ナ、 phsE遺伝子 、 sbcB遺 1ZS子、 hisL遺伝子、 hisG遺 1ZS子、 hisD遺 1ZS子、 hisC遺 1ZS子、 hisB遺伝子、 his H遺伝子、 hisA遺 is子、 hisF遺 to子、 hisl遺伝子、 wzz遺 子、 ugd遺伝子、 gnd遺 子、 galF遺伝子、 wcaM遺 is 、 wcaL遺 子、 wcaK遺 to子、 wzxC遺 ナ、 wcaj遺 1zs 子、 cpsG遺 子、 cpsB遺 is 、 wcal¾伝子、 wcaH¾feナ、 wcaGjAizs子、 gmd遺伝 子、 wcaF遺 izsナ、 wcaii遺 izs子、 wcaD遺 子、 wcaC遺ィ云ナ、 wcaB遣 izs十、 wcaA遺 子、 wzb¾伝子、 wza遺伝子、
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dcd¾伝子、 udk遺 is子、 thiD遺 is子、 thiM¾伝子、 mrp¾fe十、 metG¾izs +、 cdd¾fcナ、 sanA¾fcナ、 mglC¾feナ、 mgl A遺 is子、 mglB¾伝子、 galS¾伝子、 fol 遺伝子、 cirA遺 is子、 lysP遺 is子、 nfo遺 is 子、 fruA遺伝子、 fruK遺 is子、 fruB遺 is子、 rplY遺 is子、 narP¾伝子、 ccmH¾fc子、 asbE遺 子、 ccmF遺云ナ、 ccmE遺 子、 ccmD遺 十、 ccmし遺 子、 ccmB遺 子 、 ccmA¾伝十、 napC¾fcナ、 napB¾fcナ、 napH遺 1ZS子、 napGjAizs子、 napA遺 1zs子 、 napD遺 to子、 napr1逾 to子、 eco遺 子、 alkB¾fe十、 ada遺 1zs子、 apb 遺 1zs子、 res B遺 1ZS子、 rcsC遺伝子、 atoS遺 子、 atoC¾fc子、
Figure imgf000008_0002
atoE 逾 fc子、 atoB遺 is子、 gyrA¾伝子、 ubiG遺 is子、 nrdA¾伝子、 nrdB遺
子、 inaA fc子、 glpQ遺 fc子、 glpT¾fc子、 glpA¾伝子、 glpB遺 子、 glpC遺 子、
Figure imgf000008_0003
ais遺 十、 pmrD遺 、 menE遺 子、 menし遺 +、 menB遺 子、 menD遺伝ナ、 menF遺 子、 nuoN遺 子、 nuoM遺伝ナ、 nuoL遺 十、 nuoK遺 1zs +、 nuoJ¾fe十、 nuol遺 子、 nuoH遺伝子、 nuoG¾fcナ、 nuoF¾fcナ、 nuoEM 子、 nuoD¾fc子、 nuoB¾伝子、 nuoA遺 is子、 lrhA遺 子、 ackA遺 is子、 pta遺伝 子、 ubiX遺 子、 purF¾fc子、 dedE遺伝子、 dedD遺 is子、 folC遺 is子、 accD¾fc子 、 dedA遺 子、 truA遺 子、 usgl¾伝子、 pdxB遺伝子、 div遺 is子、 fabB遺 is子、 dd pX遺 子、 mepA¾fe十、 aroC fc十、 sixA遺 is子、 fadL¾fe十、 vacj遺 is子、 dsd C遺 is子、 dsdX¾fc子、 dsdA遺お子、 emrY遺 is子、 emrK遺 is子、 evgA¾fe子、 evg S遺伝子、 bilF遺伝子、 ddg遺伝子、 glk遺伝子、 mntH遺伝子、 nupC遺伝子、 gltX遺伝 子、 xapR遺 、 xapB¾izs +、 xapA遺 is子、 lig¾fe卞、 zipA¾伝子、 cysZ遺 子、 cysK¾fcナ、 ptsH¾fe十、 ptsl¾fcナ、 gsr遺 is子、 pdxK遺 is子、 cysM遺伝子、 cys A遺 is子、 cysW遺 子、 cysU¾伝子、 cysP¾fc子、 ucpA¾伝子、 ptb 遺 is子、 ami A遺伝子、 hemF遺伝子、 cchA遺 十、 eutC遺伝子、 eutB遺伝子、 eutH遺伝子、 eut G遺伝子、 eu 遺伝子、 eutE遺伝子、 cchB遺伝子、 eutl遺伝子、 talA遺伝子、 tktB遺 1zs +、 aegA遺 is 、 narQ遺 is子、 acrD遺 ナ、 dapE遺 ナ、 purC遺 卞、 nlpB遺 伝子、 dapA遺伝子、 gcvR遺伝子、 bcp遺伝子、 hyfA遺伝子、 hyffl遺伝子、 hy! 遺伝 子、 hy!D遺伝子、 hyffi遺伝子、 hy!F遺伝子、 hyfG遺伝子、 hy!H遺伝子、 hyfl遺伝子、 hyfj¾fc子、 hyfR遺 is子、 focB遺 is子、 perMjAfe子、 yfgE遺 is子、 uraA¾伝子、 upp 逾 ナ、 purM遺 子、 purN遺 子、
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ppx¾fcナ、 guaA¾fe卞、 guaBM 1zs +、 xseA¾fe卞、 hisS遺 子、 gcpE遺 子、 ndk遺 is子、 pbpC逾 to子、 sseA遺 子、 sseB遺伝子、 pepB遺 子、 fdx遺 is子、 hscA¾fc子、 hscB遺 is子、 iscU遺お子、 iscS遺 子、 iscR遺 1zs子、 suhB遺 子、 csiE¾fcナ、 dgxA¾fcナ、 dgxB¾fcナ、 hca C遺 is子、 hcaB¾fe子、 hcaD遺お子、 glyA¾伝子、 hmpA¾fc子、 glnB遺 子、 purL 逾 ナ、 acpS¾fe十、 pdxj遺 子、 recO遺 子、 era¾fcナ、 rnc遺 子、 lepB遺 is 子、 lepA¾fcナ、 rseC遺伝子、 rseB遺 子、 rseA¾fe卞、 rpoE¾fcナ、 nadB¾fcナ ゝ srmB遺 子、 ung遺伝子、 trx2遺 to子、 pssA¾fc子、 kgtP遺 is子、 clpB遺 is子、 rlu D遺 is子、 pheL¾fe子、 pheA遺 is子、 tyrA¾fe子、 aroF遺 is子、 rplS¾fc子、 trmD 逾 fc子、 rimM¾伝子、 rpsP¾fc子、 ffh遺 to子、 grpE¾fc子、 recN遺 is子、 smpA遺 子、 smpB¾fe子、 gabD¾伝子、 gab 遺 子、 gabP¾fe子、 nrdF遺 is子、 emrRM 1zs +、 emrA遺 子、 emrB遺伝子、 gshA遺伝子、 cs jl:伝子、 alaS遺 子、 oraA遺 子、 recA¾伝子、 mltB¾fc子、 hypF¾伝子、 hydN遺 is子、 ascG¾fc子、 ascitis 子、 ascB¾伝子、 hycl¾伝子、 hycH遺 is子、 hycG遺 is子、 hycF¾伝子、 hyc 遺伝 子、 hycD遺伝子、 hycC遺 子、 hycB遺 子、 hycA遺 子、 hypA¾fc子、 hypB遺 子、 hypC fe子、 hypD¾fc子、 hypE遺 to子、 I lA遺伝子、 mutS¾fc子、 prpB遺 is 、 rpoS遺 子、 pcmj fe子、 surE¾伝子、 ygbB遺 子、 ygbP¾伝子、 ygbQ¾伝子 、 cysC遺 子、 cysN遺 子、 cysD遺 is子、 iap遺 1zs子、 cysH遺 子、 cysl¾fe十、 cy sj遺 子、 ptpS遺 is子、 eno¾fe卞、 pyrG¾fe卞、 mazG遺 子、 chpR遺伝子、 relA 逾 fc子、 barA遺 is子、 gud2¾fc子、 gudT遺 子、 mioC遺 is子、 syd¾伝子、 sdaB遺 子、 exo遺 子、 fucO fc子、
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lUcP遺 is子、 fucl¾fc子、 lUcK遺 is子 、 iUcU¾伝子、 fucR¾fc子、 gcvA遺お子、 ηίβ遺 子、 mltA遺お子、 amiC遺 is子、 ar gA遺 ナ、 thyA遺 1zs子、 lgt遺伝子、 ptsP遺 is子、 mutH遺 is子、 tas遺 to子、 aas遺伝 子、 galR遺伝子、 lysA遺 is子、 lysR遺 is子、 araE遺伝子、 kduD遺 to子、 kdul遺 is子、 lysS遺伝子、 prffi遺伝子、 recj遺伝子、 dsbC遺伝子、 xerD遺伝子、 fldB遺伝子、 upl4 遺伝子、 bglA遺伝子、 gcvP遺伝子、 gcvH遺 is子、 gcvT遺伝子、 visC遺伝子、 ubiH遺 1zs +、 pepP遺 卞、 serA遺 ナ、 rpiA遺 子、 iciA遺 子、 sbm遺 子、 argK遺 子 、 iba遺 is子、 pgk遺伝子、 epd遺 is子、 tktA遺伝子、 speB遺伝子、 speA遺伝子、 metK 遺伝子、 galP遺伝子、 sprT遺伝子、 endA遺伝子、 gshB遺 to子、 yqgF遺伝子、 ansB遺 伝子、 mutY遺伝子、 mltC遺 is子、 nupG遺伝子、 speC遺伝子、 pitB遺伝子、 gsp遺伝 子、 hybG遺伝子、 hybF遺伝子、 hybE遺伝子、 hybD遺伝子、 hybC遺伝子、 hybB遺伝 子、 hybA¾fe子、 hoxK遺 子、 exbD¾fc子、 exbB遺 1ZS子、 metC¾izs子、 exsA遺 1ZS 子、 sufl¾feナ、 plsC遺伝子、 parC遺伝子、 parEjA伝子、 ice遺伝子、 tolC¾izs +、 ri bB¾fc子、 glgS fc子、 rfaE¾fe子、 glnE¾fc子、 cca遺 is子、 bacA¾fc子、 folBM 伝子、 ttdA遺伝子、 ttdB遺伝子、 ygjD遺伝子、 rpsU遺伝子、 dnaG遺伝子、 rpoD遺伝 子、 aer遺 子、 ebgR¾fc子、 ebgA¾伝子、 ebgC遺 is子、 fadH¾fe子、 uxaA遺 is子 、 uxaC遺 子、 exuT¾伝子、 exuR遺 is子、 tdcE遺伝子、 tdcD遺 is子、 tdcC¾伝子、 tdcB遺 子、 tdcA fc子、 tdcR遺伝子、 sohA¾fc子、 agaR遺 is子、 agaZ¾fe子、 ag aV遺 is子、 agaW遺 子、 agaA遺 1zs子、 agaS遺 子、 agaY¾izs +、 agaB¾fcナ、 aga CJAIZS子、 agaD遺 子、 agal¾伝子、 mtr逾 to子、 deaD遺 子、 mpl遺 子、 pnpj¾ 子、 rpsO¾伝子、 truB¾fc子、 rbfA¾fc子、 inffi¾伝子、 nusA遺 is子、 argGMfe 子、 secG fc子、 mrsA遺伝子、 folP遺 is子、 ftsH遺 is子、 ftsj¾伝子、 greA遺 is子、 aacB¾fcナ、 yhbZ¾fcナ、 rpmA遺 子、 rplU¾fe十、 ispB遺 子、 nlp¾伝子、 mur A遺 is子、 yrbl¾fzs子、 yrbK遺 to子、 rpoN¾fzs子、 ptsN遺 is子、 ptsO¾f 子、 mtgA 逾 fc子、 arcB遺 子、 gltB遺 is子、 nanT¾fe子、 npl¾fc子、 nanR遺 to子、 dcuD遺 子、 sspB遺お子、 sspA fc子、 rpsl¾伝子、 rplM¾fc子、 hhoA¾fe子、 hhoB遺お 子、 mdn遺 1zs子、 argR遺 子、 tldD¾伝子、 rng遺 子、 mreD遺伝子、 mreC¾feナ、 mreB遺 子、 accB¾izs +、 accC遺 is 、 panF遺 is 、 prmA遺 子、 fis遺 子、 aro E¾fe子、 smg¾fe子、 smf遺 is子、 defile子、 felt遺 is子、 sun¾fe子、 trkA¾fe子 、 mscL遑 子、 zntR遺 子、 rplQ fcナ、 rpoA¾fe十、 rpsD遺伝子、 rpsK逾 to子、 r psM遺伝子、 rpmj遺伝子、 secY遺 ナ、 rplO遺伝子、 rpmD遺伝子、 rpsE遺伝十、 rpl R遺伝子、 rplF遺伝子、 rpsH遺 to子、 rpsN遺伝子、 rplE遺伝子、 rplX遺伝子、 rplN遺 1zs +、 rpsQ遺 is +、 rpmC遺 1zs子、 rplP遺伝十、 rpsC遺伝子、 rplV遺 is +、 rpsS遺 子、 rplB遺伝子、 rplW遺伝子、 rplD遺伝子、 rpに遺伝子、 rpsj遺伝子、 tufA遺伝子、 f usA¾fc子、 rpsG遺伝子、 rpsL遺伝子、 IkpA fc子、 slyX¾fc子、 slyD遺 is子、 keffi 遺伝子、 prkB遺 is子、 crp遺伝子、 argD遺伝子、 pabA遺伝子、 fic遺伝子、 ppiA遺伝 子、 nirB遺 子、 nirD遺 卞、 nirC遺伝子、 cysG遺伝子、 php遺 子、 trpS遺 ナ、 g ph¾fcナ、 遺伝子、 dam¾fcナ、 damX遺 子、 aroB¾izs +、 aroK¾fcナ、 ho!Q 逾 ナ、 mrcAjl:伝子、 pckA遺 to子、 envZ遺 子、 ompR¾fcナ、 greB遺伝子、 feoA 逾 fc子、 feoB遺 is子、 bioH遺 is子、 gntT¾fc子、 malQ fe子、 malP遺 is子、 malTM 伝子、 rtcA遺伝子、 rtcB遺伝子、 rtcR遺伝子、 glpR遺伝子、 glpG遺伝子、 glpE遺伝 子、 glpD fc子、 glgP遺 子、 glgA¾伝子、 glgC遺 is子、 glgX fc子、 glgB遺 is子、 asd遺 子、 gntU遺 子、 gntU遺伝子、 gntK¾伝子、 gntR¾伝子、 ggt遺 子、 ugpQ 逾 fcナ、 ugpC fe子、 ugp j zs子、 ugpA遺 isナ、 ugpB¾fc子、 livr遑 is子、 livGjA 伝子、 livM遺伝子、 livH遺伝子、 livK遺伝子、 livj遺伝子、 rpoH遺伝子、 ftsX遺伝子、 ftsE遺伝子、 ftsY遺伝子、 atzN遺伝子、 nikA遺伝子、 nikB遺伝子、 nikC遺伝子、 nikD 逾 fc子、 nikE遺 子、 pitA遺 子、 uspB¾伝子、 uspA遺伝子、 prlC遺お子、 gor¾伝 子、 arsR遺 1ZS子、 arsB¾伝子、 arsC¾fc子、 slp¾fc子、 hdeB遺伝子、 hdeA遺伝子、 hdeD遺伝子、 gadA遺伝子、 treF遺伝子、 kdgK遺伝子、 dctA遺伝子、 dppF遺伝子、 d ppD遺 子、 dppC遺 子、 dppB¾伝子、 dppA¾fcナ、 tagjAizs子、 bisC¾feナ、 csp A遺伝子、 glyS遺伝子、 glyQ遺伝子、 xylB遺伝子、 xylA遺伝子、 xylF遺伝子、 xy 遺 子、 xylH遺 is子、 xylR遺 子、 bax¾fc子、 malS遺 is子、 avtA¾伝子、 lyx遺伝子、 sgbH¾fc子、 sgbU遺お子、 sgbE¾fc子、 aldB遺 子、 selB遺 is子、 sel 遺 is子、 mtl A遺伝子、 mtlD遺伝子、 mtlR遺伝子、 1WP遺伝子、 1WR遺伝子、 1WD遺伝子、 cysE遺 子、 gpsA¾伝子、 secB遺 子、 grxC¾伝子、 tdh¾fc子、 kbl¾fc子、 htrL遺 is子 、 rfaD¾fe子、 rfaF遺伝子、 rfaC遺 1ZS子、 rfaLjAizs子、 rfaK¾fe子、 rfaZ遺伝子、 rfaY 逾 fc子、 rfaj遺 to子、 rfal¾fe子、 rfaB¾伝子、 rfaS遺 is子、 rfaP遺 is子、 rfaG遺 is子 、 rfaQ遺伝子、 kdtA遺伝子、 kdtB遺伝子、 mutM遺伝子、 rpmG遺伝子、 rpmB遺伝子 、 radC遺 f ナ、 dft)遺 fzsナ、 dut遺伝子、 ttk遺伝子、 pyrE遺伝子、 rph遺 fzsナ、 dinD遺 1S +、 gmk遺 子、 rpoZ遺 is 、 spoT遺 is +、 spoU遺 is子、 recG遺 is +、 gltS遺伝 子、 nlpA遺 is子、 uhpT遺伝子、 uhpC遺伝子、 uhpB遺伝子、 uhpA遺伝子、 ilvN遺 is 子、 ilvB遺伝子、 ivbL遺伝子、 emrD遺伝子、 ibpB遺伝子、 ibpA遺 is子、 gyrB遺伝子 、 recF遺伝子、 dnaN遺 is子、 dnaA遺伝子、 rpmH遺伝子、 rnpA遺伝子、 yidC遺伝子 、 thdF遺伝子、 tnaL遺伝子、 tnaA遺伝子、 tnaB遺伝子、 bglB遺伝子、 bglF遺伝子、 b glG遺伝子、 phoU遺 is子、 pstB遺伝子、 pstA遺伝子、 pstC遺 to子、 pstS遺 is子、 glm S遺伝子、 glmU遺 is子、 atpC遺伝子、 uncD遺伝子、 atpG遺伝子、 atpA遺伝子、 atpH 遺伝子、 atpF遺伝子、 atpE遺 is子、 atpB遺伝子、 atpl遺伝子、 gidB遺伝子、 gidA遺 伝子、 mioC遺伝子、 asnC遺 is子、 pssR遺伝子、 ilvL遺 to子、 ilvG遺伝子、 ilvM遺 is 子、 ilvE遺伝子、 ilvD遺伝子、 ilvA遺 is子、 ilvY遺伝子、 ilvC遺伝子、 ppiC遺 1zs子、 re p遺伝子、 gppA遺伝子、 rhlB遺伝子、 trxA遺伝子、 rhoL遺伝子、 rho遺 子、 rfe遺伝 子、 wzzE遺伝子、 nfrC遺伝子、 rl!D遺伝子、 rffG遺伝子、 rl!H遺伝子、 rffA遺伝子、 wz xE遺伝子、 rffT遺伝子、 wecG遺 1ZS子、 aslB遺 1ZS子、 aslA¾fe子、 hemY¾fe子、 hemX 遺 ナ、 hemD遺伝子、 hemC遺 子、 cyaA遺 子、 cyaY遺 is子、 dapF遺 is子、 xerC 遺伝子、 uvrD遺 to子、 corA遺伝子、 radD遺 to子、 pldA遺伝子、 recQ遺 is子、 pldB遺 伝子、 metR遺伝子、 metE遺 is子、 udp遺伝子、 ubiE遺伝子、 aarF遺 is子、 tatC遺伝 子、 tatD遺伝子、 rfaH遺伝子、 ubiD遺伝子、 ubiB遺伝子、 fadA遺伝子、 fadB遺伝子、 pepQjAfe子、 trkH遺 is子、 trkH¾fe子、 hemG¾fe子、 mobB遺 is子、
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、 dsbA遺伝子、 polA遺伝子、 yihA遺伝子、 hemN遺伝子、 ntrC遺伝子、 ntrB遺伝子、 glnA遺伝子、 fdhE遺伝子、 fdol遺伝子、 fdoH遺伝子、 fdoG遺伝子、 fdhD遺伝子、 sod A遺 is子、 kdgT¾fe子、 cpxA遺お子、 cpxR¾fe子、 cpxP遺 子、 plkA fc子、 sbp 逾云子、 cdhjifc子、 tpiA¾伝子、 ftr遺 子、 glpX遺 子、 glpKjifc子、 glpF¾fe子 、 menG遺伝子、 menA遺伝子、 hslU遺伝子、 hslV遺伝子、 ftsN遺伝子、 cytR遺伝子、 priA遺 is子、 rpmE¾伝子、 metj遺 is子、 metB遺 1ZS子、 metL¾伝子、 metF¾fcナ、 k atG¾fe子、 gldA fc子、 talC fe子、 ppc遺 1zs子、 argE¾fe子、 argC遺 is子、 argB ¾fc子、 argH遺 is子、 oxyR¾fe子、 udhA¾fe子、 trmA遺 to子、 btuB¾fc子、 murl 逾 ナ、 murB遺 子、 birA¾fe十、 coaA¾fe十、 tuffi遺 1ZS子、 secE¾fcナ、 nusGM ナ、 rplK遺伝子、 rplA遺伝子、 rplj遺伝子、 rplL遺伝子、 rpoB遺伝子、 rpoC遺伝子 、 htrC遺伝子、 thiH遺伝子、 thiG遺伝子、 thiS遺伝子、 thiF遺伝子、 thiE遺伝子、 thiC 遺伝子、 rsd遺伝子、 hemE遺伝子、 nfi遺伝子、 hupA遺 to子、 hydH遺伝子、 hydG遺 卞、 purD遺 is +、 purH遺 is 、 metA遺 子、 aceB遺伝子、 aceA遺伝子、 aceK遺 伝子、 arp遺伝子、 iclR遺伝子、 metH遺伝子、 pepE遺 1zs子、 lysC遺伝子、 pgi遺伝子、 ubiC遺 子、 ubiA fe子、 plsB¾fc子、 dgkA¾伝子、 lexA¾fe子、 dinF¾fe子、 qor ¾fc子、 dnaB遺 子、 air遺 is子、 tyrB遺 is子、 napA遺 is子、 hobH¾fe子、 uvrA遺 子、 ssb遺 子、 soxS遺伝子、 soxR¾fe子、 acs遺 is子、 nrfA遺 is子、 nrffi遺 is子、 nr! 遺伝子、 nriD遺伝子、 nrffi遺伝子、 nriF遺伝子、 nrfG遺伝子、 gltP遺伝子、 fdhF 逾 fc子、 alsR¾fc子、 rpiB¾fc子、 proP遺 is子、 basS遺 is子、 basR¾fc子、 adiYM 子、 adi¾fe子、 melR遺伝子、 mel 遺 is子、 melB¾fe子、 fumB遺 is子、 dcuB遺 子、 dcuR¾fe子、 dcuS遺 is子、 lysU遺 is子、 cadA¾fe子、 cadB遺伝子、 cadC遺伝 子、 cutA3遺伝子、 cutA2遺伝子、 cutA遺伝子、 dcuA遺伝子、 aspA遺伝子、 fesA遺伝 、 groES¾fcナ、 groELM
子、 eft)遺 is子、 ecnB¾伝子、 sugE遺 is子、 blc遺 is子、 ampC遺伝子、 frdD遺お子 、 frdC遺 is子、 frdB¾fc子、 frdA遺伝子、 genX¾fc子、 psd遺 子、 yjeQ遺 子、 yje E¾fc子、 amiB遺 is子、 mutL遺 is子、 miaA¾fc子、 hfq¾fc子、 hflX¾fc子、 hflKM 子、 hflC fc子、 purA遺 子、 vacB¾fe子、 sga 遺 is子、 rpsF¾伝子、 priB¾伝 子、 rpsR遺お子、 rpll¾fc子、 fldB¾伝子、 cyc 遺 is子、 cpdB¾fc子、 cysQ遺伝子、 msrAjAizs 、 chpS¾fcナ、 chpB¾feナ、 ppa¾fcナ、 i pjl:伝子、 mpl遺 is 、 pmbA 遺伝子、 cybC遺伝子、 nrdG遺伝子、 nrdD遺伝子、 treC遺伝子、 treB遺伝子、 treR遺 ナ、 mgtA fc十、 pyrl¾伝子、 pyrB遺 is卞、 pyrBI遺 ナ、 argl¾fe十、 valS¾伝 子、 holC遺伝子、 xerB¾fc子、 idnR遺 is子、 idnT遺 is子、 idn。¾fc子、 idnD遺 is子 、 idnK遺伝子、 fecE¾izs子、 fecD遺伝子、 fecC遺 1ZS子、 fecB遺伝子、 fecA遺 1ZS子、 fe cR¾fc子、 feci遺 is子、 dnaC遺 is子、 dnaT¾fe子、 bglj遺 is子、 i uF fc子、 rsmC 逾 fc子、 holD遺 is子、 riml¾fe子、 prfC遺 is子、 osmY遺 is子、 deoC¾fc子、 deoAM 子、 deoB¾伝子、 deoD遺 子、 lplA遺伝子、 smp遺 is子、 serB遺 is子、 radAMfe 子、 nadR¾fe子、 sit遺 is子、 trpR遺伝子、 gpmG¾fe子、 rob遺 is子、 creA遺 is子、 c reB遺伝子、 creC遺伝子、 creD遺伝子、 arcA遺 ナ、 lasT遺 ナ、 thrL遺伝子
[2]acrE遺 is子、 arg丁遺伝子、 artl遺伝子、 artj遺伝子、 artM遺伝子、 artP遺伝子、 ar tQ遺伝子、 bfr遺伝子、 chiA遺伝子、 chpA遺伝子、 dacC遺伝子、 deoR遺伝子、 dinG 遺伝子、 elaA遺伝子、 elaB遺伝子、 elaC遺 is子、 elaD遺伝子、 envD遺 is子、 envR遺 伝子、 IhuA遺伝子、 IhuB遺伝子、 IhuC遺伝子、 IhuD遺伝子、 folX遺伝子、 glnH遺伝 子、 glnP遺伝子、 glnQ遺伝子、 gltj遺伝子、 gltK遺伝子、 gltL遺伝子、 gspA遺伝子、 g spC¾伝子、 gspD¾fzs子、 gspE遺 is子、 gspl¾伝子、 gsp_J遺 is子、 gspK遺 1zs子、 gsp L遺伝子、 hisj遺伝子、 hisM遺伝子、 hisP遺伝子、 hisQ遺伝子、 ho!D遺伝子、 ho!F遺 伝子、 ho!G遺伝子、 ho!H遺伝子、 ItaA遺伝子、 mdaA遺伝子、 mdaB遺伝子、 pinO遺 fzs子、 potF遺 to子、 potG遺 fzs子、 potH¾伝子、 potl遺 is子、 pshM遺 is子、 ptwBM 子、 ptwC fc子、 rhsB遺 is子、 rimK¾伝子、 xylU¾fc子
(2)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜 [69]記載の塩基配列を有す る DNA、またはそれら DNAに相当する DNAを含む染色体 DNAを有する上記（1) の大腸菌の変異体。
[I] 1番〜 167064番目で表される塩基配列
[2] 172980番〜 243964番目で表される塩基配列
[3] 253411番〜 261963番目で表される塩基配列
[4] 387532番〜 389138番目で表される塩基配列
[5]403704番〜 518029番目で表される塩基配列
[6] 532712番〜 535504番目で表される塩基配列
[7] 550216番〜 563940番目で表される塩基配列
[8] 608119番〜 675103番目で表される塩基配列
[9] 689375番〜 728820番目で表される塩基配列
[10] 739594番〜 832551番目で表される塩基配列
[I I] 848090番〜 867637番目で表される塩基配列
[12] 883474番〜 890997番目で表される塩基配列
[13] 909380番〜 1048887番目で表される塩基配列
[14] 1097020番〜 1198105番目で表される塩基配列 [15] 1225147番ハ 1630911番目で表される塩基配列
[16] 1641039番ハ 1642631番目で表される塩基配列
[17] 1650223番ハ 1964523番目で表される塩基配列
[18] 1993076番ハ 1996661番目で表される塩基配列
[19]2028210番ハ 2033448番目で表される塩基配列
[20] 2044377番ハ 2069148番目で表される塩基配列
[21]2081927番ハ 2104392番目で表される塩基配列
[22]2116065番ハ 2146263番目で表される塩基配列
[23]2187856番ハ 2200668番目で表される塩基配列
[24]2229851番ハ 2255894番目で表される塩基配列
[25] 2263492番ハ 2270439番目で表される塩基配列
[26] 2286589番ハ 2386261番目で表される塩基配列
[27] 2395472番ハ 2423364番目で表される塩基配列
[28] 2434099番ハ 2472851番目で表される塩基配列
[29] 2482483番ハ 2505074番目で表される塩基配列
[30]2514558番ハ 2755676番目で表される塩基配列
[31]2789481番ハ 2795173番目で表される塩基配列
[32]2800891番ハ 2804307番目で表される塩基配列
[33]2810148番ハ 2825313番目で表される塩基配列
[34] 2830263番ハ 2910273番目で表される塩基配列
[35]2910574 - 2985361番目で表される塩基配列
[36]3033129番ハ 3077084番目で表される塩基配列
[37]3078917番ハ 3110109番目で表される塩基配列
[38]3134342番ハ 3165627番目で表される塩基配列
[39]3172941番ハ 3360736番目で表される塩基配列
[40] 3370548番ハ -3411159番目で表される塩基配列
[41]3420879番ハ 3453020番目で表される塩基配列
[42] 3469367番ハ 3618575番目で表される塩基配列 [43] 3636917番〜 3854661番目で表される塩基配列
[44] 3865832番〜 3867101番目で表される塩基配列
[45] 3877011番〜 3926658番目で表される塩基配列
[46] 3938879番〜 4059897番目で表される塩基配列
[47] 4079660番〜 4086450番目で表される塩基配列
[48]4099983番〜 4139231番目で表される塩基配列
[49] 4149710番〜 4235358番目で表される塩基配列
[50]4251736番〜 4298976番目で表される塩基配列
[ 51 ] 4311512番〜 4313317番目で表される塩基配列
[52] 4329722番〜 4409532番目で表される塩基配列
[53]4423152番〜 4496201番目で表される塩基配列
[54]4509535番〜 4517875番目で表される塩基配列
[55] 4599638番〜 4641433番目で表される塩基配列
[56] 167065番〜 172979番目で表される塩基配列
[57] 675104番〜 689374番目で表される塩基配列
[58] 832552番〜 848089番目で表される塩基配列
[59] 867638番〜 883473番目で表される塩基配列
[60] 890998番〜 909379番目で表される塩基配列
[61] 2386262番〜 2395471番目で表される塩基配列
[62] 2423365番〜 2434098番目で表される塩基配列
[63] 2472852番〜 2482482番目で表される塩基配列
[64] 2505075番〜 2514557番目で表される塩基配列
[65] 2910274番〜 2910573番目で表される塩基配列
[66 ] 3165628番〜 3172940番目で表される塩基配列
[67] 3411160番〜 3420878番目で表される塩基配列
[68] 3453021番〜 3469366番目で表される塩基配列
[69] 3618576番〜 3636916番目で表される塩基配列
(3) yafJ遺伝子、 yalK遺伝子、 yafQ遺伝子、 dinj遺伝子、 yalL遺伝子、 yalM遺伝子、 f WA遺伝子、 lalU遺伝子、 dinP遺伝子、 ya!N遺伝子、 yafO遺伝子、 ya!P遺伝子、 JW02 25遺伝子、 priH遺伝子、 ykfl遺伝子、 ya!W遺伝子、 yeeT遺伝子、 yk!G遺伝子、 ya!X 遺伝子、 yk!F遺伝子、 ykffi遺伝子、 ya!Y遺伝子、 ypjK遺伝子、 yafZ遺伝子、 ykfA遺 伝子、 perR遺伝子、 JW0245遺伝子、 JW0246遺伝子、 JW0247遺伝子、 yk! 遺伝子、 JW0249遺伝子、 is5B遺伝子、 yi51遺伝子、 mmuP遺伝子、 mmuM遺伝子、 alUC遺伝 子、 JW0255遺伝子、 insB遺伝子、 insA遺伝子、 JW0258遺伝子、 yagB遺伝子、 yagA 逾 fe子、 yagE¾fc子、 yagF遺 is子、 yagG遺 子、 yagH¾伝子、 yagl遺 子、 argrjA fc子、 yfjl遺 子、 yagj fc子、 yagK¾fc子、 yagL遺伝子、 yagM¾伝子、 yagN遺伝 子、 intF¾fc子、 yagP¾fc子、 yagQ遺 子、 yagR遺 to子、 yag jftizs子、 yagTfcs子 、 yagU¾伝子、 ykgj¾伝子、 yagV¾fe子、 yagW遺 子、 yagX¾伝子、 yagY¾fe子 、 yagZ遺伝子、 ykgK遺伝子、 ykgL遺伝子、 ykgM遺伝子、 eaeH遺伝子、 _JW0292遺伝 子、 JW0293遺伝子、 ykgA遺伝子、 ykgB遺伝子、 ykgl遺伝子、 merA遺伝子、 ykgD遺 子、 ykgt遺 子、 ykgF遺 子、 ykgG¾fc子、 ykgH遺 子、 betA遺伝子、 betB遺 fzs子、 betl¾fc子、 bet 遺 子、 yahA¾f 子、 yahB遺 1zs子、 yahC遺 is子、 yahDM zS 子、 yahE¾fe子、 yahr1遺伝子、 yahG遺 子、 yahH¾fc子、 arcM遺お子、 yahj¾伝 子、 yahK¾fc子、 yahL遺 is子、 yahM遺伝子、 yahN¾fc子、 yahO¾fc子、 prpR遺 is 子、 bcpAjl:伝子、 prpCjAizs子、 prpD遺 子、 prpE遺 is子、 codB遺 子、 codajftizs 子、 cynR¾fe子、 cynT遺 子、 cynS¾fe子、 cynX遺お子、 lacA¾伝子、 lacY¾伝子 、 lacZ遺 子、 lacl¾fe子、 mhpR¾fc子、 mhpA¾fe子、 mhpB遺 is子、 mhpC遺 is子 、 mhpD¾fcナ、 mhprjAizs子、 mhpE¾fcナ、 mhpl JAIZS子、 yaiL¾fcナ、 yaiM遺伝 子、 adhC遺伝子、 yaiN遺伝子、 yaiO遺伝子、 JW0350遺伝子、 yi2A遺伝子、 yi22遺伝 子、 yi24遺伝子、 yi23遺伝子、 yaiP遺伝子、 yaiS遺伝子、 tauA遺伝子、 tauB遺伝子、 t auC遺伝子、 ssiD遺伝子、 yaiT遺伝子、 JW0363遺伝子、 JW0364遺伝子、 yaiU遺伝子 、 yaiV¾fcナ、 ampH遺 子、 sbmA¾fcナ、 yaiW¾fcナ、 yaiY遺 子、 yaiZ¾fe十、 ddlA遺 to子、 yaiB遺伝子、 phoA遺 is子、 psir1遺 is子、 yaiC¾伝子、 ybbO遺伝子、 tes A遺伝子、 ybbA遺伝子、 ybbP遺伝子、 rhsD遺伝子、 ybbC遺伝子、 rhsE遺伝子、 ybb D遺伝子、 _1\^0490遺伝子、 ybbB遺伝子、 ybbS遺伝子、 ybbT遺伝子、 ybbU遺伝子、 y bbQ遺伝子、 ybbV遺伝子、 allP遺伝子、 allA遺伝子、 ybbY遺伝子、 ybbZ遺伝子、 ylb A遺伝子、 aUC遺伝子、 ylbC遺伝子、 fdrA遺伝子、 ylbE遺伝子、 ylbF遺伝子、 arcC遺 伝子、 intD遺伝子、 EXCLLAMBD遺伝子、 VRPP— LAMBD遺伝子、 JW0528遺伝子、 J W0529遺伝子、 VREN丄 AMBD遺伝子、 emrE遺伝子、 ybcK遺伝子、 ybcL遺伝子、 yb cM遺 is子、 ybcN¾fc子、 ninE遺 is子、 ybcO¾fe子、 rus遺 is子、 ybcQjAfe子、 JWO 539.5遺伝子、 nmpC遺伝子、 vlyS遺伝子、 ybcS遺伝子、 ybcT遺伝子、 vboR遺伝子、 y bcV遺伝子、 ybcW遺伝子、 nohB遺伝子、 ybcX遺伝子、 ybcY遺伝子、 _JW0552遺伝子 、 appY遺伝子、 ompT遺伝子、 envY遺伝子、 ybcH遺 子、 nfrA遺伝子、 nfrB遺伝子、 cusS遺 is子、 cusR遺 fc 、 cusC遺 、 ylcC遺 is子、 cusB遺 is子、 cusA遺 is子、 ph eP遺伝子、 ybdG遺伝子、 nftiB遺伝子、 ybdF遺伝子、 ybcU遺伝子、 ybdK遺伝子、 hok E遺伝子、 yi81遺伝子、 yi82遺伝子、 ymcC遺伝子、 ymcD遺伝子、 cspH遺伝子、 cspG 遺伝子、 sfa遺伝子、 yccL遺伝子、 yccM遺伝子、 torS遺伝子、 torT遺伝子、 torR遺 to 子、 torC遺伝子、 torA遺伝子、 torD遺伝子、 yccD遺伝子、 cbpA遺 is子、 yccE遺伝子 、 agp遺伝子、 yccj遺伝子、 wrbA遺伝子、 yciG遺伝子、 ycdG遺伝子、 _JW0992遺伝子 、 JW0993遺伝子、 _JW0994遺伝子、 ycdK遺伝子、 _JW0996遺伝子、 _JW0997遺伝子、 y cdC遺伝子、 putA遺伝子、 yzpU遺伝子、 putP遺伝子、 JW1002遺伝子、 ycdO遺伝子 、 ycdB遺伝子、 phoH遺伝子、 ycdP遺伝子、 ycdQ遺伝子、 ycdR遺伝子、 ycdS遺伝子 、 ycdT遺伝子、 JW1012遺伝子、 JW1013遺伝子、 JW1014遺伝子、 ycdU遺伝子、 ymf D遺伝子、 ymffi遺伝子、 lit遺伝子、 intE遺伝子、 VXIS— BPP21遺伝子、 ym!H遺伝子、 ymfl遺伝子、 ymfj遺伝子、 RPC2— BPP22遺伝子、 JW1132遺伝子、 ym!L遺伝子、 ymlM 遺伝子、 ym!N遺伝子、 ym!R遺伝子、 ymfO遺伝子、 JW1138遺伝子、 JW1139遺伝子、 yc!K遺 子、 ymS¾fe子、 ycfA¾fc子、 ycffi遺 is子、 pin遺 is子、 mcrA¾fe子、 JW1 146遺 is子、 ycgW遺 is子、 ycgX遺 is子、 ycgE遺 子、 JW1150¾fc子、 ycgZ¾fc子 、 ymgA遺伝子、 JW1153遺伝子、 ymgC遺伝子、 yahA遺伝子、 JW1156遺伝子、 JW11 57遺伝子、 aidA遺伝子、 ymgD遺伝子、 JW1160遺伝子、 JW1161遺伝子、 JW1162遺 伝子、 yd!H遺伝子、 ydfZ遺伝子、 ydfl遺伝子、 shiA遺伝子、 _JW1537遺伝子、 tnpR遺 伝子、 yd!M遺伝子、 Y314丄 AMBD遺伝子、 nohA遺伝子、 ydfO遺伝子、 yccL遺伝子、 cspl遺伝子、 yd!R遺伝子、 vlyS遺伝子、 cspB遺伝子、 cspF遺伝子、 regQ丄 AMBD遺 伝子、 _JW1552遺伝子、 rem遺伝子、 hokD遺伝子、 relE遺伝子、 relB遺伝子、 ydiVjf 伝子、 flxA遺伝子、 yd!W遺伝子、 yd!X遺伝子、 dicC遺伝子、 sdaC遺伝子、 yqeH遺伝 子、 yqel¾fc子、 yqej¾伝子、 yqeK遺 子、 ygerjlfe子、 ygeG¾伝子、 ygeH¾fc子 、 ygel遺伝子、 JW2822遺伝子、 ygeK遺伝子、 JW2824遺伝子、 JW2825遺伝子、 JW28 30遺伝子、 ygeP遺伝子、 JW2832遺伝子、 nlpD遺伝子、 yagR遺伝子、 ygeT遺伝子、 J W2836¾fc子、 ygeV遺 is子、 ygeW¾fc子、 dpaL遺 is子、 ygeY遺 is子、 ygeZ遺伝子 、 arcL遺伝子、 yqeB遺伝子、 JW2844遺伝子、 ygfj遺伝子、 gltD遺伝子、 JW2847遺伝 子、 yglM遺 子、 yagR fc子、 ygfO遺伝子、 ygff¾fc子、 ygfQ 伝子、 yg!R遺 子 ゝ ygiS遺伝子、 yg! 遺 子、 pbuX遺 子、 idi遺 子、 epsM遺 子、 exeL逾 to子、 exe C遺伝子、 JW2938遺伝子、 JW2939遺伝子、 JW2940遺伝子、 JW2941遺伝子、 yghK 遺伝子、 glcB遺伝子、 glcG遺伝子、 glcF遺伝子、 glcD遺伝子、 glcC遺伝子、 JW2948 逾伝子、 yghQ fc子、 yghR¾伝子、 yghS遺 子、 yghT遺 子、 yihL¾伝子、 yihM 遺伝子、 yihN遺伝子、 yshA遺伝子、 yihO遺伝子、 yihP遺伝子、 yihQ遺伝子、 yihR遺 子、 yihS¾伝子、 yihT遺 is子、 yihU遺 子、 yihV遺 子、 yihW¾伝子、 yihX遺 子、 rbn¾fcナ、 yihZ遺伝子、 yiiD遺 子、 yiiE遺伝子、 yiiF遺伝子、 yiiG¾fcナ、 frvR 逾 fc子、 frvX¾fc子、 frvB¾fc子、 frvA fc子、 yiiL¾伝子、 rhaD遺 is子、 rhaA¾伝 子、 rhaB遺伝子、 rhaS遺伝子、 rhaR遺伝子、 rhaT遺伝子、 ptsA遺伝子、 JW3920遺伝 子、 frwC遺伝子、 frwB遺伝子、 pflD遺伝子、 pflC遺伝子、 frwD遺伝子、 yijO遺伝子、 y ijP遺伝子、 _JW3986遺伝子、 yjbF遺伝子、 yjbG遺伝子、 yjbH遺伝子、 JW3989.5遺伝 子、 yjbA遺 子、 xylE遺伝子、 malG遺 is子、 malF¾fe子、 malE遺 is子、 malK fc子 、 lamB遺 子、 malM遺 子、 yjbl遺 子、 yjcP¾伝子、 yjcQ遺 子、 yjcR¾fc子、 yj cS¾伝子、 alsK¾fe子、 alsE¾fe子、 alsC¾fc子、 alsA¾fc子、 alsB¾fc子、 phnQ 逾 fc子、 phnP遺 is子、 phnO遺 子、 phnN遺伝子、 phnM遺 is子、 phnL¾fc子、 phn K遺 is子、 phnj遺 is子、 phnl遺 is子、 phnH遺 is子、 phnG遺伝子、 phnF¾fc子、 phnE 遺伝子、 phnD遺伝子、 phnC遺伝子、 phnB遺伝子、 phnA遺伝子、 yjdA遺伝子および yjcZ遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体 DNAを有する上記（1)ま たは（2)の大腸菌の変異体。
(4)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜[18]記載の塩基配列を有す る DNA、またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する上記 (1)〜（3)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
[I]塩基番号 243965番〜 253410番目で表される塩基配列
[2]塩基番号 261964番〜 387531番目で表される塩基配列
[3]塩基番号 389139番〜 403703番目で表される塩基配列
[4]塩基番号 518030番〜 532711番目で表される塩基配列
[5]塩基番号 535505番〜 550215番目で表される塩基配列
[6]塩基番号 563941番〜 608118番目で表される塩基配列
[7]塩基番号 1048888番〜 1097019番目で表される塩基配列
[8]塩基番号 1198106番〜 1225146番目で表される塩基配列
[9]塩基番号 1630912番〜 1641038番目で表される塩基配列
[10]塩基番号 1642632番〜 1650222番目で表される塩基配列
[I I]塩基番号 2985362番〜 3033128番目で表される塩基配列
[ 12]塩基番号 3110110番〜 3134341番目で表される塩基配列
[13]塩基番号 4059898番〜 4079659番目で表される塩基配列
[14]塩基番号 4086451番〜 4099982番目で表される塩基配列
[15]塩基番号 4139232番〜 4149709番目で表される塩基配列
[16]塩基番号 4235359番〜 4251735番目で表される塩基配列
[ 17]塩基番号 4298977番〜 4311511番目で表される塩基配列
[18]塩基番号 4313318番〜 4329721番目で表される塩基配列
(5) yidF¾fc子、 yidG¾fc子、 yidH¾fc子、 yidl遺 子、 yidj遺伝子、 yidK遺 子、 y idL遺伝子、 _JW3657遺伝子、 glvG遺伝子、 glvB遺伝子、 glvC遺伝子、 yidP遺伝子、 yi dE¾伝子、 yidQ fc子、 yidR¾伝子、 yidS遺 子、 dgoT遺 子、 dgoA¾fc子、 dgo K遺伝子、 dgoR遺伝子、 yidW遺伝子、 yidX遺伝子、 yidA遺伝子、 yidB遺伝子、 asnA 遺伝子、 yieM遺伝子、 JW3724遺伝子、 yieN遺伝子、 kup遺伝子、 rbsD遺伝子、 rbsA 遺伝子、 rbsC遺伝子、 rbsB遺伝子、 rbsK遺伝子、 rbsR遺伝子および yieO遺伝子、ま たはそれらの相同遺伝子を含まな 、染色体 DNAを有する上記（1)〜 (4)の 、ずれ か 1つの大腸菌の変異体。
(6)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜 [3]記載の塩基配列を有する DNA、またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する上記（1
)〜（5)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
[1]塩基番号 3854662番〜 3865831番目で表される塩基配列
[2]塩基番号 3867102番〜 3877010番目で表される塩基配列
[3]塩基番号 3926659番〜 3938878番目で表される塩基配列
(7) yecT遺伝子、 flhE遺伝子、 flhA遺伝子、 flhB遺伝子、 cheZ遺伝子、 cheY遺伝子、 cheB遺伝子、 cheR遺伝子、 tap遺伝子、 tar遺伝子、 cheW遺 1ZS子、 cheA¾fe子、 mot B遺伝子、 motA遺伝子、 flhC遺伝子、 flhD遺伝子、 JW1882遺伝子、 JW1883遺伝子、 yecG遺 、 otsA¾fcナ、 otsB遺 is子、 araH遺 is子、 araG遺 is子、 araF¾fzsナ、 ye cl遺伝子、 yecj遺伝子、 JW1892遺伝子、 ftn遺伝子、 yecH遺伝子、 tyrP遺伝子、 uvrC 逾 ナ、 uvrY¾fcナ、 yecF¾fe十、 sdiAjA伝子、 yecC逾 to子、 yecS遺 1ZS子、 yedO 遺伝子、 fliY遺伝子、 fliZ遺伝子、 fliA遺伝子、 fliC遺伝子、 fliD遺伝子、 fliS遺伝子、 Hi T遺 子、 amyA¾伝十、 yedD¾fcナ、 yedE¾fcナ、 yedF¾fcナ、 yedK¾fcナ、 yed L遺伝子、 yedN遺伝子、 yedM遺伝子、 fliE遺伝子、 fliF遺伝子、 fliG遺伝子、 fliH遺伝 子、 flil遺伝子、 11U遺伝子、 fliK遺伝子、 fliL遺伝子、 fliM遺伝子、 fliN遺伝子、 fliO遺 伝子、 fliP遺伝子、 fliQ遺伝子、 fliR遺伝子、 rcsA遺伝子、 dsrB遺伝子、 JW1937遺伝 子、 yedA fc子、 vsr¾fe子、 dcm¾fc子、 yedj遺 is子、 JW1946¾fc子、 ompC遺 is 子、 JW1948遺伝子、 yedS遺伝子、 yedU遺伝子、 yedV遺伝子、 copR遺伝子、 yedX遺 伝子、 JW1954遺伝子、 JW1955遺伝子、 JW1956遺伝子、 JW1974遺伝子、 JW1979遺 伝子、 JW1980遺伝子、 yeeP遺伝子、 flu遺伝子、 JW1983遺伝子、 yeeS遺伝子、 yeeU 遺伝子、 yeeV遺伝子、 yeeW遺伝子、 yelj遺伝子、 JW2013遺伝子、 yelj遺伝子、 yefl 遺伝子、 wbb_J遺伝子、 ye!G遺伝子、 rfc遺伝子、 glf遺伝子、 rlbX遺伝子、 rlbC遺伝子 、 ri A遺伝子、 ri D遺伝子および ri B遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まな
V、染色体 DNAを有する上記（1)〜（6)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
(8)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜 [5]記載の塩基配列を有する DNA、またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する上記（1 )〜（7)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
[1]塩基番号 1964524番〜 1993075番目で表される塩基配列 [2]塩基番号 1996662番〜 2028209番目で表される塩基配列
[3]塩基番号 2033449番〜 2044376番目で表される塩基配列
[4]塩基番号 2069149番〜 2081926番目で表される塩基配列
[5]塩基番号 2104393番〜 2116064番目で表される塩基配列
(9) intA遺伝子、 yfjH遺伝子、 alpA遺伝子、 yfll遺伝子、 _JW2606遺伝子、 yftj遺伝子、 yfj'K遺伝子、 yflL遺伝子、 yflM遺伝子、 yflN遺伝子、 yflO遺伝子、 yflP遺伝子、 yflQ遺 伝子、 yfjR遺伝子、 ypjK遺伝子、 yfjS遺伝子、 yfjT遺伝子、 yfjU遺伝子、 yfjV遺伝子、 J W2622遺伝子、 yfjW遺伝子、 JW2623.5遺伝子、 yflX遺伝子、 yfjY遺伝子、 yfjZ遺伝子 、 ypjF遺伝子、 ypjA遺伝子、 JW2629遺伝子、 JW2630遺伝子、 JW2631遺伝子、 JW26 32遺伝子、 JW2633遺伝子、 JW2634遺伝子、 ygaE遺伝子、 yzzM遺伝子、 yqaE遺伝 子、 JW2642遺伝子、 ygaP遺伝子、 stpA遺伝子、 _JW2645遺伝子、 ygaC遺伝子、 ygaM 逾 fc子、 nrdH遺伝子、 nrdl遺 is子、 nrdE¾fc子、 proV遺 is子、 pro W遺伝子、 proX 遺伝子、 JW2655遺伝子、 JW2656遺伝子、 ygaZ遺伝子、 ygaH遺伝子、 srlA遺伝子、 s rlB遺伝子、 srlD遺伝子、 gutM遺伝子、 srlR遺伝子および gutQ遺伝子、またはそれら の相同遺伝子を含まない染色体 DNAを有する上記（1)〜（8)のいずれか 1つの大 腸菌の変異体。
(10)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜[4]記載の塩基配列を有す る DNA、またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する上記 (1)〜（9)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
[1]塩基番号 2755677番〜 2789480番目で表される塩基配列
[2]塩基番号 2795174番〜 2800890番目で表される塩基配列
[3]塩基番号 2804308番〜 2810147番目で表される塩基配列
[4]塩基番号 2825314番〜 2830262番目で表される塩基配列
(11) gltF遺伝子、 yhcA遺伝子、 yhcD遺伝子、 yhcE遺伝子、 yhcF遺伝子、 yhcG遺伝 子、 yhcH遺伝子、 nanK遺伝子および nanE遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含 まない染色体 DN Aを有する上記（1)〜（10)のいずれか 1つの大腸菌の変異体。
(12)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 3360737番〜 3370547番目で表 される塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな 、染色体 DNAを有する上記（1)〜（11)のいずれか 1つの大腸菌の変異体。
(13) yegE遺伝子、 alkA遺伝子、 yegD遺伝子、 JW2055遺伝子、 JW2056遺伝子、 JW2 057遺伝子、 JW2058遺伝子、 yegM遺伝子、 yegN遺伝子、 yegO遺伝子、 yegB遺伝子 、 baeS遺伝子、 baeR遺伝子、 JW2065遺伝子、 yegQ遺伝子、 ogrK遺伝子、 JW2068遺 伝子、 JW2069遺伝子、 yegS遺伝子、 gatR遺伝子、 JW2072遺伝子、 JW2073遺伝子、 gatR遺 子、 gatD遺 子、 gatC遺伝子、 gatB遺 子、 gatA遺 子、 gatZ遺 子、 gat Y遺 ナ、 I aB遺 子、 xegT¾fe十、 yegU遺 1zs子、 yegV遺 is +、 yegW遺 is 、 yeg X遺 子、 molR¾伝子、 yehl¾伝子、 yehK遺 is子、 yehL¾fc子、 yehO¾fc子、 yehP 逾 fe子、 yehQ遺伝子、 yehR遺 子、 yehS遺伝子、 yehT¾fc子、 yehU遺 子、 yehV 逾 fc子、 yehW¾fe子、 yehX¾伝子、 yehY遺伝子、 yehZ¾fc子、 bglX遺 is子、 did遺 ナ、 pbpG fcナ、 yohC fe子、 yeiQ遺 is +、 yeiR遺 子、 yeiU遺 子、 spr¾伝 子、 rtn¾伝子、 yejA遺 子、 yejB¾伝子、 yej 遺 子、 yejF遺 子、 yejG遺 子、 b cr遺 is子、 rsuA fc十、 yejH遺 is +、 yeil¾伝子、 yeij遺 is子、 yeiK¾伝子、 yeiLM 伝子、 yeiM遺伝子、 yeiN遺伝子および yeiC遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含 まない染色体 DNAを有する上記（1)〜（12)のいずれか 1つの大腸菌の変異体。
(14)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜[4]記載の塩基配列を有す る DNA、またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する上記 (1)〜（13)のいずれか 1つの大腸菌の変異体。
[1]塩基番号 2146264番〜 2187855番目で表される塩基配列
[2]塩基番号 2200669番〜 2229850番目で表される塩基配列
[3]塩基番号 2270440番〜 2286588番目で表される塩基配列
[4]塩基番号 2255895番〜 2263491番目で表される塩基配列
( 15) cmtA遺伝子および cmtB遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まな!/、染色体 DNAを有する上記（1)〜（14)のいずれか 1つの大腸菌の変異体。
(16)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 3077085番〜 3078916番目で表 される塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな 、染色体 DNAを有する上記（1)〜（15)のいずれか 1つの大腸菌の変異体。
(17) intB遺伝子、 JW4228遺伝子、 yjgW遺伝子、 yjgX遺伝子、 yjgY遺伝子、 yjgZ遺 伝子、 yi41遺伝子、 yi42遺伝子、 yjhB遺伝子、 yjhC遺伝子、 yjhD遺伝子、 yjhE遺伝子 、 yi91遺伝子、 _JW4244遺伝子、 _JW4245遺伝子、 _JW4246遺伝子、 yjhU遺伝子、 yjhF 逾伝子、 yjhG遺 is子、 yjhH遺 子、 yjhl遺 子、 sgcR¾伝子、 sgcE遺 子、 sgcA遺 伝子、 sgcQ遺伝子、 sgcC遺伝子、 JW4266.5遺伝子、 sgcX遺伝子、 yjhP遺伝子、 yjh Q遺伝子、 JW4269.5遺伝子、 JW4270遺伝子、 JW4270.5遺伝子、 yjhR遺伝子、 yjhS 逾 fc子、 yjhT遺 is子、 yjhA遺 is子、 fimB遺 is子、 fimE¾伝子、 fimA¾fc子、 fiml遺 is 子、 fimC遺伝子、 fimD遺伝子、 fimF遺伝子、 fimG遺伝子、 fimH遺伝子、 gntP遺伝子、 uxuA¾伝子、 uxuB¾fc子、 uxuR遺 子、 yjiC¾伝子、 yjiD遺 子、 yjiE遺 子、 iad A遺伝子、 yjiG遺伝子、 yjiH遺伝子、 yjil遺伝子、 yjij遺伝子、 yjiK遺伝子、 JW4296.5 逾伝子、 yjiLiK伝子、 yjiM遺 子、 yjiN遺 子、 yjiO遺 is子、 yjiP遺 is子、 yjiQ 伝子 、 yjiR遺 ナ、 yjiS遺 is子、 yjil JAIZS子、 yjiV遺 ナ、 mcrD¾fcナ、 mcrC¾fcナ、 mcr B遺伝子、 yjiW遺伝子、 hsdS遺伝子、 hsdM遺伝子、 hsdR遺伝子、 mrr遺伝子、 yjiA遺 伝子、 yjiX遺伝子、 yjiY遺伝子、 tsr遺伝子、 yjjL遺伝子、 _JW4320遺伝子、 yjjM遺伝子 、 yjjN遺伝子、 mdoB遺伝子および yjjA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まな い染色体 DNAを有する上記（1)〜（16)のいずれか 1つの大腸菌の変異体。
(18)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]または [2]記載の塩基配列を 有する DNA、またはそれら DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNAを有する 上記（1)〜（17)のいずれか 1つの大腸菌の変異体。
[1]塩基番号 4496202番〜 4509534番目で表される塩基配列
[2]塩基番号 4517876番〜 4599637番目で表される塩基配列
(19) kdpF遺伝子、 ybfA遺伝子、 rhsC遺伝子、 JW0690遺伝子、 ybffi遺伝子、 rhsA遺 伝子、 ybfC遺伝子、 yb!D遺伝子、 yb!L遺伝子、 yb!D遺伝子および ybgA遺伝子、また はそれらの相同遺伝子を含まな 、染色体 DNAを有する上記（1)〜（18)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
(20)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 728821番〜 739593番目で表され る塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNA を有する上記（1)〜（19)のいずれか 1つの大腸菌の変異体。
(21) yjfl遺伝子、 yjfj遺伝子、 yj!K遺伝子、 yj!L遺伝子、 yj!M遺伝子、 yjfC遺伝子、 aid B遺伝子、 yjlN遺伝子、 yjfO遺伝子、 yjlP遺伝子、 yjlQ遺伝子、 yjlR遺伝子、 sgaT遺伝 子、 sgaB遺伝子、 sgaA遺伝子、 sgaH遺伝子および sgaU遺伝子、またはそれらの相同 遺伝子を含まな 、染色体 DNAを有する上記（1)〜（20)の 、ずれか 1つの大腸菌の 変異体。
(22)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 4409533番〜 4423151番目で表 される塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな 、染色体 DNAを有する上記（1)〜（21)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
(23)上記（1) [1]の遺伝子、 spr遺伝子、 bcr遺伝子および rsuA遺伝子、またはそれ らの相同遺伝子を含み、かつ野生型の大腸菌の染色体 DNAより 933kbp以上短い 染色体 DNAを有する大腸菌の変異体。
(24)上記（2)の [1]〜 [55]の塩基配列を有する DNAおよび配列番号 1で表される 塩基配列中の塩基番号 2270440番〜 2286588番目で表される塩基配列を有する DN A、またはそれら DNAに相当する DNAを含む染色体 DNAを有する上記（23)の大 腸菌の変異体。
(25) yafJ遺伝子、 ya!K遺伝子、 ya!Q遺伝子、 dinj遺伝子、 ya!L遺伝子、 ya!M遺伝子 、 IhiA遺伝子、 la!U遺伝子、 dinP遺伝子、 ya!N遺伝子、 yafO遺伝子、 ya!P遺伝子、 JW 0225遺伝子、 priH遺伝子、 ykfl遺伝子、 ya!W遺伝子、 yeeT遺伝子、 yk!G遺伝子、 yaf X遺伝子、 yk!F遺伝子、 ykffi遺伝子、 ya!Y遺伝子、 ypjK遺伝子、 ya!Z遺伝子、 ykfA遺 伝子、 perR遺伝子、 _JW0245遺伝子、 _JW0246遺伝子、 _JW0247遺伝子、 yk! 遺伝子、 JW0249遺伝子、 is5B遺伝子、 yi51遺伝子、 mmuP遺伝子、 mmuM遺伝子、 alUC遺伝 子、 JW0255遺伝子、 insB遺伝子、 insA遺伝子、 JW0258遺伝子、 yagB遺伝子、 yagA 逾 fe子、 yagE¾fc子、 yagF遺 is子、 yagG遺 子、 yagH¾伝子、 yagl遺 子、 argrjA fc子、 yfjl遺 子、 yagj fc子、 yagK¾fc子、 yagL遺伝子、 yagM¾伝子、 yagN遺伝 子、 intF¾fc子、 yagP¾fc子、 yagQ遺 子、 yagR遺 to子、 yag jftizs子、 yagTfcs子 、 yagU¾伝子、 ykgj¾伝子、 yagV¾fe子、 yagW遺 子、 yagX¾伝子、 yagY¾fe子
、 yagZ遺伝子、 ykgK遺伝子、 ykgL遺伝子、 ykgM遺伝子、 eaeH遺伝子、 _JW0292遺伝 子、 JW0293遺伝子、 ykgA遺伝子、 ykgB遺伝子、 ykgl遺伝子、 merA遺伝子、 ykgD遺 子、 ykgt遺 子、 ykgF遺 子、 ykgG¾fc子、 ykgH遺 子、 betA遺伝子、 betB遺 fzsナ、 betl遺 十、 betT遺伝子、 yahA遺 f ナ、 yahB遺 1zs子、 yahC遺伝子、 yahD遺伝 子、 yahE遺伝子、 yahF遺伝子、 yahG遺伝子、 yahH遺伝子、 arcM遺 to子、 yahj遺伝 子、 yahK遺伝子、 yahL遺 is子、 yahM遺伝子、 yahN遺伝子、 yahO遺伝子、 prpR遺伝 子、 bcpAjl:伝子、 prpCjAizs子、 prpD遺 子、 prpE遺 is子、 codB遺 子、 codajftizs 子、 cynR¾fe子、 cynT遺 子、 cynS¾fe子、 cynX遺お子、 lacA¾伝子、 lacY¾伝子 、 lacZ遺 子、 lacl¾fe子、 mhpR¾fc子、 mhpA¾fe子、 mhpB遺 is子、 mhpC遺 is子 、 mhpD¾fcナ、 mhprjAizs子、 mhpE¾fcナ、 mhpl JAIZS子、 yaiL¾fcナ、 yaiM遺伝 子、 adhC遺伝子、 yaiN遺伝子、 yaiO遺伝子、 JW0350遺伝子、 yi2A遺伝子、 yi22遺伝 子、 yi24遺伝子、 yi23遺伝子、 yaiP遺伝子、 yaiS遺伝子、 tauA遺伝子、 tauB遺伝子、 t auC遺伝子、 ssiD遺伝子、 yaiT遺伝子、 JW0363遺伝子、 JW0364遺伝子、 yaiU遺伝子 、 yaiV¾fcナ、 ampH遺 子、 sbmA¾fcナ、 yaiW¾fcナ、 yaiY遺 子、 yaiZ¾fe十、 ddlA遺 to子、 yaiB遺伝子、 phoA遺 is子、 psir1遺 is子、 yaiC¾伝子、 ybbO遺伝子、 tes A遺伝子、 ybbA遺伝子、 ybbP遺伝子、 rhsD遺伝子、 ybbC遺伝子、 rhsE遺伝子、 ybb D遺伝子、 _1\^0490遺伝子、 ybbB遺伝子、 ybbS遺伝子、 ybbT遺伝子、 ybbU遺伝子、 y bbQ遺伝子、 ybbV遺伝子、 allP遺伝子、 allA遺伝子、 ybbY遺伝子、 ybbZ遺伝子、 ylb A遺伝子、 aUC遺伝子、 ylbC遺伝子、 fdrA遺伝子、 ylbE遺伝子、 ylbE遺伝子、 ylbE遺 伝子、 ylbF遺伝子、 arcC遺伝子、 intD遺伝子、 EXO— LAMBD遺伝子、 VRPP— LAMBD 遺伝子、 JW0528遺伝子、 JW0529遺伝子、 VREN丄 AMBD遺伝子、 emrE遺伝子、 ybc K遺 is子、 ybcL¾伝子、 ybcM¾伝子、 ybcN遺伝子、 ninE遺 子、 ybcO遺 is子、 rus 遺伝子、 ybcQ遺伝子、 JW0539.5遺伝子、 nmpC遺伝子、 vlyS遺伝子、 ybcS遺伝子、 y bcT¾fc子、 vboR遺 子、 ybcV遺 is子、 ybcW遺 is子、 nohB¾fc子、 ybcX¾伝子、 y bcY遺伝子、 JW0552遺伝子、 appY遺伝子、 ompT遺伝子、 envY遺伝子、 ybcH遺伝子 、 nfrA¾fe十、 nfrB遺 is 、 cusS¾fcナ、 cusR¾伝子、 cusC¾伝十、 ylcCjAizs子、 cu sB¾fc子、 cusA遺 is子、 pheP¾fc子、 ybdG¾fe子、 nfnB遺 子、 ybdF¾伝子、 ybd J遺伝子、 ybdK遺伝子、 hokE遺伝子、 yi81遺伝子、 yi82遺伝子、 ymcC遺伝子、 ymcD 逾 ナ、 cspH遺 is 、 cspG遺 is子、 sfajAizs子、 yccL遺 子、 yccM遺 子、 torSM fzs子、 tori遺 is子、 torR遺 is子、 torC¾fc子、 torA¾fzs子、 torD遺 is子、 yccDM zs 、 cbpA fcナ、 ycc 遑 to子、 agp¾fc十、 yccj¾fcナ、 wrbA¾伝子、 yciG¾feナ 、 ycdG遺伝子、 JW0992遺伝子、 JW0993遺伝子、 JW0994遺伝子、 ycdK遺伝子、 JW0 996遺伝子、 JW0997遺伝子、 ycdC遺伝子、 putA遺伝子、 yzpU遺伝子、 putP遺伝子、 JW1002遺伝子、 ycdO遺伝子、 ycdB遺伝子、 phoH遺伝子、 ycdP遺伝子、 ycdQ遺伝 子、 ycdR遺伝子、 ycdR遺伝子、 ycdS遺伝子、 ycdT遺伝子、 JW1012遺伝子、 JW1013 遺伝子、 JW1014遺伝子、 ycdU遺伝子、 ym!D遺伝子、 ymffi遺伝子、 lit遺伝子、 intE 遺伝子、 VXIS— BPP21遺伝子、 ym!H遺伝子、 ymfl遺伝子、 ymlj遺伝子、 RPC2— BPP22 遺伝子、 _JW1132遺伝子、 ymlL遺伝子、 ymlM遺伝子、 ymlN遺伝子、 ymlR遺伝子、 ym fO遺伝子、 JW1138遺伝子、 JW1139遺伝子、 yc!K遺伝子、 ymS遺伝子、 ycfA遺伝子 、 ycffi遺お子、 pin遺伝子、 mcrA遺 is子、 JW114り遺 is子、 ycgW遺 is子、 ycgX¾fc子 、 ycgE遺伝子、 JW1150遺伝子、 ycgZ遺伝子、 ymgA遺伝子、 JW1153遺伝子、 ymgC 遺伝子、 yahA遺伝子、 JW1156遺伝子、 JW1157遺伝子、 aidA遺伝子、 ymgD遺伝子、 JW1160遺伝子、 JW1161遺伝子、 JW1162遺伝子、 yd!H遺伝子、 ydfZ遺伝子、 ydfl遺 伝子、 shiA遺伝子、 JW1537遺伝子、 tnpR遺伝子、 yd!M遺伝子、 Y314丄 AMBD遺伝 子、 nohA fe子、 ydfO遺 子、 yccL¾fc子、 cspl¾fc子、 ydfR¾fe子、 vlyS¾fc子 、 cspB遺伝子、 cspF遺伝子、 regQ丄 AMBD遺伝子、 JW1552遺伝子、 rem遺伝子、 ho kD遺伝子、 relE遺伝子、 relB遺伝子、 yd!V遺伝子、 flxA遺伝子、 yd!W遺伝子、 yd!X ¾fcナ、 dicCjAizs子、 sdaC fc十、 yqeH¾伝子、 yqel¾伝子、 yqej¾fc十、 yqeK遺 fc子、 ygeF fc子、 ygeG fc子、 ygeH¾fc子、 ygel遺 子、 JW2822遺 子、 ygeK 遺伝子、 JW2824遺伝子、 JW2825遺伝子、 JW2830遺伝子、 ygeP遺伝子、 JW2832遺 伝子、 nlpD遺伝子、 yagR遺伝子、 ygeT遺伝子、 JW2836遺伝子、 ygeV遺伝子、 ygeW ¾fc子、 dpaL遺 子、 ygeY遺 is子、 ygeZ遺伝子、 arcL遺 is子、 yqeB遺 is子、 JW284 4遺伝子、 yglj遺伝子、 gltD遺伝子、 _JW2847遺伝子、 yg!M遺伝子、 yagR遺伝子、 ygf 0遺伝子、 yg!P遺伝子、 ygfQ遺伝子、 yg!R遺伝子、 ygS遺伝子、 ygfT遺伝子、 pbuX 遺伝子、 idi遺伝子、 epsM遺伝子、 exeL遺伝子、 exeC遺伝子、 JW2938遺伝子、 JW29 39遺伝子、 JW2940遺伝子、 JW2941遺伝子、 yghK遺伝子、 glcB遺伝子、 glcG遺伝子 、 glcF遺伝子、 glcD遺伝子、 glcC遺伝子、 JW2948遺伝子、 yghQ遺伝子、 yghR遺伝 子、 yghS遺 is子、 yghT遺 is子、 yihL遺伝子、 yihM遺 子、 yihN遺 子、 yshA遺伝子 、 yihO遺伝子、 yihP遺 is子、 yihQ遺 子、 yihR遺 子、 yihS¾fc子、 yihT遺伝子、 yi hU遺伝子、 yihV遺伝子、 yihW遺 ナ、 yihX遺伝子、 rbn遺伝子、 yihZ遺伝子、 yiiD遺 伝子、 yiiE遺伝子、 yiiF遺 is子、 yiiG遺伝子、 frvR遺伝子、 frvX遺伝子、 frvB遺伝子、 f rvA¾izs子、 yiiL遺 1ZS子、 rhaD¾fc子、 rhaA遺伝子、 rhaB遺 1ZS子、 rhaS遺 1ZS子、 rhaR 遺伝子、 rhaT遺伝子、 ptsA遺伝子、 JW3920遺伝子、 frwC遺伝子、 frwB遺伝子、 pflD 遺伝子、 pflC遺伝子、 frwD遺伝子、 yijO遺伝子、 yijP遺伝子、 _JW3986遺伝子、 yjbF遺 伝子、 yjbG遺伝子、 yjbH遺伝子、 _JW3989.5遺伝子、 yjbA遺伝子、 xylE遺伝子、 malG 逾 fc子、 mal 遺 子、 malE¾fc子、 malK遺 子、 lamB¾fe子、 malM¾fc子、 yjbl遺 fc子、 yjcP遺 子、 yjcQ遺 子、 yjcR遺 子、 yjcS¾伝子、 alsK遺 子、 alsE遺 子 、 alsC遺 子、 alsA遺伝子、 alsB遺伝子、 phnQ遺 is子、 phnP遺 is子、 phnO遺 is子、 phnN¾fc子、 phnM¾fc子、 phnL¾伝子、 phnK遺 is子、 phnj¾伝子、 phnl¾fe子、 p hnH遺 is子、 phnG fc子、 phnF¾伝子、 phn 遺伝子、 phnD遺 is子、 phnC¾fe子、 phnB遺伝子、 phnA遺 子、 yjdA¾fc子、 yjcZ遺伝子、 yidF遺 子、 yidG遺 子、 yid H遺伝子、 yidl遺伝子、 yidj遺伝子、 yidK遺伝子、 yidL遺伝子、 JW3657遺伝子、 glvG ¾fe子、 glvB遺伝子、 glvC遺 is子、 yidP遺 is子、 yidE遺 子、 yidQ遺 is子、 yidRM 子、 yidS遺 子、 dgoT¾伝子、 dgoA遺 to子、 dgoK遺 is子、 dgoR¾fc子、 yidW遺 伝子、 yidX遺伝子、 yidA遺伝子、 yidB遺伝子、 asnA遺伝子、 yieM遺伝子、 JW3724遺 子、 yieN遺 is子、 kup¾fc子、 rbsD遺 is子、 rbsA¾伝子、 rbsC遺 is子、 rbsB遺 is 子、 rbsK遺伝子、 rbsR遺伝子、 yieO遺伝子、 yecT遺伝子、 flhE遺伝子、 flhA遺伝子、 flhB¾fc子、 cheZ遺 is子、 cheY¾fe子、 cheB¾伝子、 cheR遺 is子、 tap遺 is子、 tar 遺伝子、 cheW遺伝子、 cheA遺伝子、 motB遺伝子、 motA遺伝子、 flhC遺伝子、 HhD 遺伝子、 JW1882遺伝子、 JW1883遺伝子、 yecG遺伝子、 otsA遺伝子、 otsB遺伝子、 a raH遺伝子、 araG遺伝子、 araF遺伝子、 yecl遺伝子、 yecj遺伝子、 JW1892遺伝子、 ft n¾fcナ、 yecH遺 is 、 tyrP遺伝子、 uvrC遺 子、 uvrY遺 子、 yecF遺 子、 sdiA 遺伝子、 yecC遺伝子、 yecS遺伝子、 yedO遺伝子、 fliY遺伝子、 fliZ遺伝子、 fliA遺伝 子、 fliC遺伝子、 fliD遺伝子、 fliS遺伝子、 fliT遺伝子、 amyA遺伝子、 yedD遺伝子、 ye dE¾fc子、 yedF遺 is子、 yed 遺 is子、 yedL¾fe子、 yedN遺 子、 yedM遺 is子、 Hi E遺伝子、 fliF遺伝子、 fliG遺伝子、 fliH遺伝子、 flil遺伝子、 HU遺伝子、 fliK遺伝子、 Hi L遺伝子、 fliM遺伝子、 fliN遺伝子、 fliO遺伝子、 fliP遺伝子、 fliQ遺伝子、 fliR遺伝子、 res A遺 to子、 dsrB遺伝子、 J Wl 937遺伝子、 yedA遺伝子、 vsr遺伝子、 dcm遺伝子、 y edj遺伝子、 JW1946遺伝子、 ompC遺伝子、 JW1948遺伝子、 yedS遺伝子、 yedU遺伝 子、 yedV遺伝子、 copR遺伝子、 yedX遺伝子、 JW1954遺伝子、 JW1955遺伝子、 JW1 956遺伝子、 JW1974遺伝子、 JW1979遺伝子、 JW1980遺伝子、 yeeP遺伝子、 flu遺伝 子、 JW1983遺 子、 yeeS遺 子、 yeeT¾fc子、 yeeU¾伝子、 yeeV遺伝子、 yeeW遺 伝子、 yelj遺伝子、 _JW2013遺伝子、 yelj遺伝子、 yefl遺伝子、 wbb_J遺伝子、 yefG遺伝 子、 rfc遺伝子、 glf遺伝子、 ri X遺伝子、 ri C遺伝子、 ri A遺伝子、 ri D遺伝子、 rlbB 遺伝子、 intA遺伝子、 yflH遺伝子、 alpA遺伝子、 yfll遺伝子、 _JW2606遺伝子、 yfjj遺 伝子、 yfjK遺伝子、 yflL遺伝子、 yfjM遺伝子、 yflN遺伝子、 yflO遺伝子、 yfjP遺伝子、 yfjQ遺伝子、 yfjR遺伝子、 ypjK遺伝子、 yfjS遺伝子、 yfjT遺伝子、 yfjU遺伝子、 yfjV遺 伝子、 JW2622遺伝子、 遺伝子、 JW2623.5遺伝子、 yfjX遺伝子、 yfjY遺伝子、 yfjZ 遺伝子、 ypjF遺伝子、 ypjA遺伝子、 JW2629遺伝子、 JW2630遺伝子、 JW2631遺伝子 、 JW2632遺伝子、 JW2633遺伝子、 JW2634遺伝子、 ygaE遺伝子、 yzzM遺伝子、 yqa E遺伝子、 _JW2642遺伝子、 ygaP遺伝子、 stpA遺伝子、 _JW2645遺伝子、 ygaC遺伝子 、 ygaM遺 is子、 nrdH¾fc子、 nrdl¾fe子、 nrdE遺 is子、 proV¾伝子、 proW¾伝子、 proX遺伝子、 JW2655遺伝子、 JW2656遺伝子、 ygaZ遺伝子、 ygaH遺伝子、 srlA遺伝 子、 srlB遺伝子、 srlD遺伝子、 gutM遺伝子、 srlR遺伝子、 gutQ遺伝子、 gltF遺伝子、 yhcA遺伝子、 yhcD¾fc子、 yhc 遺 子、 yhct遺伝子、 yhcF遺 子、 yhcG¾fc子、 y hcH遺 子、 nanK¾fe子、 nan 遺 is子、 yegE¾fc子、 alkA遺 is子、 yegD¾fe子、 J W2055遺伝子、 JW2056遺伝子、 JW2057遺伝子、 JW2058遺伝子、 yegM遺伝子、 yeg N遺伝子、 yegO遺伝子、 yegB遺伝子、 baeS遺伝子、 baeR遺伝子、 JW2065遺伝子、 y egQ遺伝子、 ogrK遺伝子、 JW2068遺伝子、 JW2069遺伝子、 yegS遺伝子、 gatR遺伝 子、 JW2072遺伝子、 JW2073遺伝子、 gatR遺伝子、 gatD遺伝子、 gatC遺伝子、 gatB 逾 fe子、 gatA fc子、 gatZ¾伝子、 gat Y遺伝子、 I aB遺 子、 xegT遺伝子、 yegUM 子、 yegV遺伝子、 yegW¾fc子、 yegX遺 is子、 molR遺 is子、 yehl遺 is子、 yehK遺 子、 yehL遺 is子、 yeh。¾伝子、 yehP¾fc子、 yehQ遺 子、 yehR遺伝子、 yehS遺 子、 yehT¾伝子、 yehU遺お子、 yehV遺 is子、 yehW遺 is子、 yehX¾fc子、 yehY遺 子、 yehZ遺伝子、 bglX¾fc子、 dld¾fc子、 pbpG¾fe子、 yohC¾伝子、 yeil遺 is 子、 yeij遺伝子、 yeiK遺 子、 yeiL遺伝子、 yeiM遺伝子、 yeiN遺 isナ、 yeiC遺 isナ、 cmtA遺伝子、 cmtB遺伝子、 intB遺伝子、 _JW4228遺伝子、 yjgW遺伝子、 yjgX遺伝子 、 yjgY遺 fc子、 yjgZ遺 is子、 yi41¾伝子、 yi42遺 子、 yjhB遺 is子、 yjhC遺 子、 yjh D遺伝子、 yjhE遺伝子、 yi91遺伝子、 _JW4244遺伝子、 _JW4245遺伝子、 _JW4246遺伝 子、 yjhU fc子、 yjhF遺 is子、 yjhG遺 子、 yjhH¾伝子、 yjhl¾伝子、 sgcR遺 子、 sgcE遺 子、 sgcAjAfe子、 sgcQ fe子、 sgcC遺 子、 JW4266.5 伝子、 sgcX遺 is 子、 yjhP遺伝子、 yjhQ遺伝子、 JW4269.5遺伝子、 JW4270遺伝子、 JW4270.5遺伝子 、 yjhR遺 is子、 yjhS fc子、 yjhT¾伝子、 yjhA¾伝子、 fimB遺 子、 finrn遺 子、 fim A遺 is子、 fiml¾伝子、 fimC fc子、 fimD遺 is子、 fimr1遺 is子、 fimG¾伝子、 fimH遺 子、 gntP遺 子、 uxuA遺 子、 uxuB¾fe子、 uxuR遺 is子、 yjiC遺 is子、 yjiDjA zS 子、 yjiE遺 is子、 iadA fc子、 yjiG遺 子、 yjiH遺 子、 yjil¾伝子、 yjij遺 子、 yjiK 遺伝子、 JW4296.5遺伝子、 yjiL遺伝子、 yjiM遺伝子、 yjiN遺伝子、 yjiO遺伝子、 yjiP 逾伝子、 yjiQ遺 子、 yjiR遺 子、 yjiS fc子、 yjiT遺 子、 yjiV遺 子、 mcrD遺 子、 mcrし遺 1zs子、 mcrBMfe
子、 yjiW遺 子、 hsdS fe子、 hsdM¾伝子、 hsdR遺 is子、 mrr遺伝子、 yjiA遺 is子、 yjiX遺伝子、 yjiY遺伝子、 tsr遺伝子、 yjjL遺伝子、 _JW4320遺伝子、 yjjM遺伝子、 yjjN 遺伝子、 mdoB遺伝子、 yjjA遺伝子、 kdpF遺伝子、 ybfA遺伝子、 rhsC遺伝子、 JW069 0遺伝子、 ybffi遺伝子、 rhsA遺伝子、 yb! 遺伝子、 yb!L遺伝子、 yb!D遺伝子、 ybgA 遺伝子、 yjfl遺伝子、 yjlj遺伝子、 yj!K遺伝子、 yj!L遺伝子、 yj!M遺伝子、 yjfC遺伝子、 aidB遺伝子、 yj!N遺伝子、 yjfO遺伝子、 yj!P遺伝子、 yj!Q遺伝子、 yj!R遺伝子、 sgaT 遺伝子、 sgaB遺伝子、 sgaA遺伝子、 sgaH遺伝子、 sgaU遺伝子、 rhsB遺伝子、 JW344 8遺伝子、 yhhH遺伝子、 yibA遺伝子、 yhhl遺伝子、 yhhj遺伝子、 yhiH遺伝子、 yhil遺 伝子、 yhij遺伝子、 yhiK遺伝子、 yhiL遺伝子、 yhiM遺伝子、 yhiN遺伝子、 JW0782遺 子、 ybiA fc子、 dinG遺 子、 ybiB¾fc子、 ybiC¾fe子、 ybij遺 子、 ybil遺 子 、 ybiX遺 子、 ybiL遺 子、 ybiM遺 子、 ybiN遺 子、 ybiO遺 子、 glnQ遺 子、 gl nP遺伝子、 glnH遺伝子、 yliA遺伝子、 yliB遺伝子、 yliC遺伝子、 yliD遺伝子、 JW0817 遺伝子、 JW0818遺伝子、 yliG遺伝子、 yliH遺伝子、 ylil遺伝子、 ylij遺伝子、 dacC遺 子、 deoR遺 is子、 ybjG遺 is子、 ybjC遺 is子、 mdaA¾fc子、 rimK遺 子、 ybjNM ナ、 potF遺 isナ、 potG遺伝子、 potH¾izs子、 potl遺 ナ、 ybjO遺 isナ、 ybjF遺伝 子、 artj遺伝子、 artM遺伝子、 artQ遺伝子、 artl遺伝子、 artP遺伝子、 ybjP遺伝子、 J W0850遺伝子、 JW0851遺伝子、 JW0852遺伝子、 ybjT遺伝子および ItaA遺伝子、ま たはそれらの相同遺伝子を含まな！/ヽ染色体 DNAを有する上記（23)または（24)の 大腸菌の変異体。
(26)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜 [43]記載の塩基配列を有す る DNA、またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する上記 (23)〜（25)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
[I]塩基番号 243965番〜 253410番目で表される塩基配列
[2]塩基番号 261964番〜 387531番目で表される塩基配列
[3]塩基番号 389139番〜 403703番目で表される塩基配列
[4]塩基番号 518030番〜 532711番目で表される塩基配列
[5]塩基番号 535505番〜 550215番目で表される塩基配列
[6]塩基番号 563941番〜 608118番目で表される塩基配列
[7]塩基番号 728821番〜 739593番目で表される塩基配列
[8]塩基番号 832552番〜 848089番目で表される塩基配列
[9]塩基番号 867638番〜 883473番目で表される塩基配列
[10]塩基番号 890998番〜 909379番目で表される塩基配列
[I I]塩基番号 1048888番〜 1097019番目で表される塩基配列
[12]塩基番号 1198106番〜 1225146番目で表される塩基配列
[13]塩基番号 1630912番〜 1641038番目で表される塩基配列
[14]塩基番号 1642632番〜 1650222番目で表される塩基配列
[15]塩基番号 1964524番〜 1993075番目で表される塩基配列
[16]塩基番号 1996662番〜 2028209番目で表される塩基配列
[17]塩基番号 2033449番〜 2044376番目で表される塩基配列
[18]塩基番号 2069149番〜 2081926番目で表される塩基配列
[19]塩基番号 2104393番〜 2116064番目で表される塩基配列
[20]塩基番号 2146264番〜 2187855番目で表される塩基配列 [21]塩基番号 2200669番〜 2229850番目で表される塩基配列
[22]塩基番号 2255895番〜 2263491番目で表される塩基配列
[23]塩基番号 2755677番〜 2789480番目で表される塩基配列
[24]塩基番号 2795174番〜 2800890番目で表される塩基配列
[25]塩基番号 2804308番〜 2810147番目で表される塩基配列
[26]塩基番号 2825314番〜 2830262番目で表される塩基配列
[27]塩基番号 2985362番〜 3033128番目で表される塩基配列
[28]塩基番号 3077085番〜 3078916番目で表される塩基配列
[29]塩基番号 3110110番〜 3134341番目で表される塩基配列
[30]塩基番号 3360737番〜 3370547番目で表される塩基配列
[31]塩基番号 3618576番〜 3636916番目で表される塩基配列
[32]塩基番号 3854662番〜 3865831番目で表される塩基配列
[33]塩基番号 3867102番〜 3877010番目で表される塩基配列
[34]塩基番号 3926659番〜 3938878番目で表される塩基配列
[35]塩基番号 4059898番〜 4079659番目で表される塩基配列
[36]塩基番号 4086451番〜 4099982番目で表される塩基配列
[37]塩基番号 4139232番〜 4149709番目で表される塩基配列
[38]塩基番号 4235359番〜 4251735番目で表される塩基配列
[39]塩基番号 4298977番〜 4311511番目で表される塩基配列
[40]塩基番号 4313318番〜 4329721番目で表される塩基配列
[41]塩基番号 4409533番〜 4423151番目で表される塩基配列
[42]塩基番号 4496202番〜 4509534番目で表される塩基配列
[43]塩基番号 4517876番〜 4599637番目で表される塩基配列
(27) ygiS遺伝子、 ygiT遺伝子、 ygiU遺伝子、 JW2991遺伝子、 ygiW遺伝子、 ygiX遺 伝子、 ygiY遺伝子、 ygiZ遺伝子、 mdaB遺伝子および ygiN遺伝子、またはそれらの相 同遺伝子を含まな ヽ染色体 DNAを有する上記（23)〜（26)の ヽずれか 1つの大腸 菌の変異体。
(28)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 3165628番〜 3172940番目で表 される塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな 、染色体 DNAを有する上記（23)〜（27)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
(29) ybeL遺伝子、 ybeQ遺伝子、 ybeR遺伝子、 ybeS遺伝子、 ybeT遺伝子、 ybeU遺 伝子、 ybeV遺伝子、 ybeW遺伝子、 ybeK遺伝子、 gltL遺伝子、 gltK遺伝子、 glU遺伝 子、 ybej遺伝子および JW0651遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色 体 DNAを有する上記（23)〜（28)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
(30)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 675104番〜 689374番目で表され る塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNA を有する上記（23)〜（29)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
(31) yfcC遺伝子、 JW2296遺伝子、 yfcE遺伝子、 yfcF遺伝子、 yfcG遺伝子、 folX遺伝 子、 JW2301遺伝子、 yfcl遺伝子、 hisP遺伝子、 hisM遺伝子、 hisQ遺伝子、 hisj遺伝子 、 argT遺伝子、 yfdB遺伝子、 JW2346遺伝子、 yfdH遺伝子、 JW2348遺伝子、 yfdK遺 伝子、 yfdL遺伝子、 yfdM遺伝子、 xylU遺伝子、 yfdN遺伝子、 yfdO遺伝子、 _JW2356遺 伝子、 JW2357遺伝子、 JW2358遺伝子、 JW2359遺伝子、 JW2360遺伝子、 JW2378遺 伝子、 yqhT遺伝子、 ptwC遺伝子および ptwB遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を 含まな 、染色体 DNAを有する上記（23)〜（30)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体
(32)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [ 1]〜 [3]記載の塩基配列を有す る DNA、またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する上記 (23)〜（31)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
[1]塩基番号 2423365番〜 2434098番目で表される塩基配列
[2]塩基番号 2472852番〜 2482482番目で表される塩基配列
[3]塩基番号 2505075番〜 2514557番目で表される塩基配列
(33) pinO遺 子、 gspA遺伝子、 gspC¾fc子、 gspD遺 子、 gsp 遺 子、 hofF遺 子、 ho!G遺 子、 hofH遺 子、 gspl¾fc子、 gspj遺伝子、 gspK¾fc子、 gspL¾fc子 、 pshM遺伝子、 ho!D遺伝子、 bfr遺伝子、 yheA遺伝子および chiA遺伝子、またはそ れらの相同遺伝子を含まな！/ヽ染色体 DNAを有する上記（23)〜（32)の ヽずれか 1 つの大腸菌の変異体。 (34)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 3453021番〜 3469366番目で表 される塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな 、染色体 DNAを有する上記（23)〜（33)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
(35) elaB遺伝子、 elaA遺伝子、 elaC遺伝子、 elaD遺伝子、 ylbK遺伝子、 ylbL遺伝子 、 yl M遺伝子、 yl N遺伝子、 JW2269遺伝子および JW2270遺伝子、またはそれらの 相同遺伝子を含まな ヽ染色体 DNAを有する上記（23)〜（34)の!ヽずれか 1つの大 腸菌の変異体。
(36)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 2386262番〜 2395471番目で表 される塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな 、染色体 DNAを有する上記（23)〜（35)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
(37) yhdJ遺伝子、 yhdU遺伝子、 envR遺伝子、 acrE遺伝子、 envD遺伝子、 yhdV遺伝 子、 yhdW遺伝子、 yhdX遺伝子および yhdY遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含 まな 、染色体 DNAを有する上記（23)〜（36)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
(38)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 3411160番〜 3420878番目で表 される塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな 、染色体 DNAを有する上記（23)〜（37)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
(39) chpA遺伝子、またはその相同遺伝子を含まな!/ヽ染色体 DNAを有する上記（2 3)〜（38)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
(40)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 2910274番〜 2910573番目で表 される塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな 、染色体 DNAを有する上記（23)〜（39)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
(41) lhuA遺伝子、 IhuC遺伝子、 IhuD遺伝子および I uB遺伝子、またはそれらの相 同遺伝子を含まな ヽ染色体 DNAを有する上記（23)〜（40)の ヽずれか 1つの大腸 菌の変異体。
(42)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 167065番〜 172979番目で表され る塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNA を有する上記（23)〜 (41)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体。
(43)以下の [1]〜 [5]力 選ばれる方法によって改変して得られる上記（1)〜 (42) のいずれか 1つの大腸菌の変異体の変異体。
[1]有用物質の生合成を制御する機構の少なくとも 1つを緩和または解除する方法 [2]有用物質の生合成に関与する酵素の少なくとも 1つを発現強化する方法
[3]有用物質の生合成に関与する酵素遺伝子の少なくとも 1つのコピー数を増加さ せる方法
[4]有用物質の生合成経路から該有用物質以外の代謝産物へ分岐する代謝経路 の少なくとも 1つを弱化または遮断する方法
[5]野生型の大腸菌に比べ、有用物質のアナログに対する耐性度が高い細胞株を 選択する方法
(44)大腸菌が大腸菌 K-12株、大腸菌 B株または大腸菌 W株である、上記（1)〜(43 )のいずれか 1つの大腸菌の変異体。
(45)大腸菌 K-12株が大腸菌 W3110株（ATCC27325)または大腸菌 MG1655株 (AT CC47076)である、上記 (44)の大腸菌の変異体。
(46)上記（1)〜 (45)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体を培地に培養し、培養物中 に有用物質を生成、蓄積させ、該培養物から該有用物質を採取することを特徴とす る有用物質の製造法。
(47)有用物質力タンパク質、ペプチド、アミノ酸、核酸、ビタミン、糖、有機酸および 脂質力 なる群より選ばれる有用物質である上記 (43)〜 (46)の 、ずれか 1つの製 造法。
発明の効果
[0007] 本発明により、一定時間培養後の菌体量が野生型の大腸菌より多い大腸菌の変異 体、および該変異体を用いた有用物質の製造法を提供することができる。
図面の簡単な説明
[0008] [図 1]図 1は、 sacB遺伝子および cat遺伝子を連結した DNA断片の構造を示す図で ある。
符号の説明
[0009] sacBJま sacB遺伝子、 catは cat遺伝子を表す。 発明を実施するための最良の形態
[0010] 野生型の大腸菌としては、自然集団中で最も高頻度にみられる型の大腸菌であれ ばいずれでもよぐ例えば大腸菌 K-12株に属する大腸菌 W3110株 (ATCC27325)お よび大腸菌 MG1655株（ATCC47076)、大腸菌 B株に属する ATCC11303株、大腸菌 W株に属する ATCC9637株などをあげることができる。
本明細書の表 1、表 2、配列番号 1、およびインターネットサイト、 URL::http://gib.ge nes.nig.ac.jp/single/index.php?spid=Ecol_K12_W3110には JW番号で規定される遺伝 子の塩基配列が記載されている力 「JW」を付した番号は日本 DNAデータバンク〖こ 登録されて!ゝる遺伝子番号である。
[0011] また、配列番号 1で表される塩基配列は、上記インターネットサイトに平成 16年 10 月 29日付けで登録されている大腸菌 W3110株の染色体 DNAの塩基配列である。 遺伝子を含む染色体 DNAとは、特定の遺伝子の構造遺伝子、プロモーターおよ びオペレーターなどの特定の制御機能を有する領域を含む染色体 DNAをいう。 遺伝子を含まな!/、染色体 DNAとは、特定の遺伝子の構造遺伝子の一部または全 部を含まな 、染色体 DNA、または該遺伝子のプロモーターおよび Zまたはォペレ 一ターなどの特定の制御機能を有する領域を含まな!/、染色体 DNAを 、う。
[0012] 構造遺伝子の一部を含まない染色体 DNAとは、該構造遺伝子の一部を含まず、 かつ該構造遺伝子から機能的な蛋白質が転写、発現されない染色体 DNAであれ ば 、ずれでもよぐ例えば構造遺伝子の 5 '末端領域が欠損して!/、るため開始コドン が存在しない DNA、 3'末端領域の大半、例えば全体の 10%以上、好ましくは 20% 以上、より好ましくは 30%以上、さらに好ましくは 40%以上欠損している染色体 DN Aがあげられる。また、染色体 DNA上で隣り合う遺伝子の両方を含まない染色体 D NAは、両遺伝子の間に存在する塩基配列からなる DNAを含まな!/ヽ染色体 DNAで あってもよい。
[0013] 相同遺伝子とは、大腸菌種内で遺伝子の塩基配列に配列相同性が認められる遺 伝子、または該遺伝子がコードする蛋白質のアミノ酸配列に配列相同性が認められ る遺伝子をいう。配列相同性が認められるとは、塩基配列においては 85%以上、好 ましくは 90%以上、より好ましくは 95%以上、さらに好ましくは 98%以上、特に好まし くは 99%以上の配列類似性、アミノ酸配列においては 80%以上、好ましくは 90%以 上、より好ましくは 95%以上、さらに好ましくは 98%以上、特に好ましくは 99%以上 の配列類似性があることを 、う。
[0014] 配列番号 1で表される塩基配列中の特定の塩基番号で表される塩基配列を有する DNAに相当する DNAとは、大腸菌種内で該特定の塩基番号で表される塩基配列 を有する DNAと含まれて 、る遺伝子の構成、および染色体 DNA上の位置が実質 的に同一の DNAをいう。 DNAに含まれる遺伝子の構成が実質的に同一とは、該 D NAに含まれる遺伝子が同一かまたは相同遺伝子であり、かつ該遺伝子の並び順が 同じであれば、遺伝子間の塩基配列は相違していてもよい。ただし、該特定の塩基 番号で表される塩基配列を有する DNA中に挿入配列がある場合は、該 DNAに相 当する DNA中には該挿入配列はなくてもよ 、。染色体 DNA上の位置が実質的に 同一とは、大腸菌の染色体 DNA上の ThrA遺伝子の開始コドンのアデニンを 1番とし て ThrA遺伝子のコーディング鎖に沿って染色体 DNAの塩基配列に塩基番号を付 けたとき、該特定の塩基番号との塩基番号の相違が 50以下、好ましくは 30以下、より 好ましくは 10以下、さらに好ましくは 5以下の DNAである。ただし、該特定の塩基番 号で表される塩基配列を有する DNA中に挿入配列がある場合は、該 DNAに相当 する DNA中には該挿入配列はなくてもよいので、該挿入配列分、さらに塩基番号が 相違して!/、てもよ 、。配列番号 1で表される塩基配列中の特定の塩基番号で表され る塩基配列を有する DNAに相当する DNAとしては、例えば該特定の塩基番号で表 される塩基配列と 80%以上、好ましくは 90%以上、より好ましくは 95%以上、さらに 好ましくは 98%以上、特に好ましくは 99%以上の配列類似性を有する DNAをあげ ることがでさる。
[0015] アミノ酸配列や塩基配列の配列類似性は、 Karlin and Altschulによるアルゴリズム B LAST[Pro. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 5873(1993)]や FASTA[Methods EnzymoL, 183 , 63 (1990)]を用いて決定することができる。このアルゴリズム BLASTに基づいて、 BL ASTNや BLASTXとよばれるプログラムが開発されている [J. Mol. Biol, 215, 403(199 0)]。 BLASTに基づいて BLASTNによって塩基配列を解析する場合には、パラメータ は例えば Score= 100、 wordlength= 12とする。また、 BLASTに基づいて BLASTXによ つてアミノ酸配列を解析する場合には、パラメータは例えば score=50、 wordlength= 3とする。 BLASTと Gapped BLASTプログラムを用いる場合には、各プログラムのデフ オルトパラメータを用いる。これらの解析方法の具体的な手法は公知である (http：〃 w ww.ncbi.nlm.nih.gov)。
1.本発明の大腸菌の変異体
本発明の大腸菌の変異体としては、
(1)以下の [1]および [2]記載の遺伝子、
[l]thrA遺伝子、 thrB遺伝子、 thrC遺伝子、 talB遺伝子、 mog遺伝子、 htgA遺伝子、 dnaK¾fc子、 dnaj遺 子、 hokC¾fc子、 nhaA¾伝子、 nhaR遺 is子、 rpsT遺 子、 ri bF遺伝子、 ileS遺伝子、 IspA遺伝子、 IkpB遺伝子、 lytB遺伝子、 dapB遺伝子、 carA遺 1zs +、 carB¾fcナ、 caiF遺 子、 caiE¾伝子、 caiD遺 子、 caiC¾fcナ、 caiB遺 子 、 caiA遺伝子、 caiT遺伝子、 fixA遺伝子、 fixB遺伝子、 fixC遺伝子、 fixX遺伝子、 ke!C 逾 fc子、 folA fe子、 apaH遺 子、 apaG遺 is子、 ksgA¾fe子、 pdxA遺 is子、 surA 逾 fc子、 imp遺 子、 djl 遺 子、 rluA遺 子、 hepA¾fe子、 polB遺 is子、 araD¾伝 子、 araA¾伝子、 araB¾fc子、 araC遺伝子、 tbpA¾fc子、 leuD遺 1ZS子、 leuC遺 子 、 leuB遺伝子、 leuA遺伝子、 leuL遺伝子、 leuO遺伝子、 ilvl遺伝子、 ilvH遺伝子、 fruR 逾 ナ、 ftsL遺 is子、 ftsl¾fe十、 murE¾fcナ、 murF遺 is子、 mraY遺伝子、 murDM 伝子、 ftsW遺伝子、 murG遺伝子、 murC遺伝子、 ddlB遺伝子、 ftsQ遺伝子、 ftsA遺伝 子、 ftsZ遺 子、 lpxC¾fcナ、 secA¾fcナ、 mutT遺 is子、 yacE¾feナ、 guaC遺 is子 、 ho! fe子、 ho!B fe子、 ppdD¾fc子、 nadC¾伝子、 ampD¾fe子、 ampE¾伝子 、 aroP¾伝子、 pdhR遺伝子、 aceE¾fe子、 aceト遺 is子、 lpdA遺伝子、 acnB遺 is子、 speD¾feナ、 speE¾fcナ、 gcd¾伝十、 hpt遺 子、 yadF遺 子、 panD遺 子、 pan C遺 is子、 panB¾fc子、 htrE¾fc子、 ecpD¾伝子、 folK遺伝子、 pcnB遺 is子、 dksA 逾 fc子、 sfsA fc子、 ligT¾伝子、 hrpB遺 子、 ponB¾fc子、 hemL¾fe子、 pfsMfe 子、 dgt遺お子、 htrA¾伝子、 dapD遺 子、 glnD¾fe子、 map¾伝子、 rpsB¾fc子、 t sf遺伝子、 smb遑 子、 rrf遺 to子、 dxr¾fe卞、 rth逾 to子、 cdsA遺 子、 yaeL遺 子 、 hlpA遺伝子、 IpxD遺伝子、 fabZ遺伝子、 IpxA遺伝子、 IpxB遺伝子、 rnhB遺伝子、 dn aE¾fe卞、 accA¾fe卞、 ldcC¾fe十、 mesj遺伝子、 ro ftfe十、 cut 遺 1zs子、 proS遺 ナ、 rcsF遺伝子、 abc遺伝子、 dniR遺 十、 gloB遺 ナ、 rnhA遺伝子、 dnaQ遺 子、 up 18遺伝子、 gmhA遺伝子、 pepD遺伝子、 gpt遺伝子、 crl遺伝子、 phoE遺伝子、 proB遺 ナ、 proA遺 ナ、 hemB遺 子、 proC遺 子、 aroL遺 ナ、 aroM遺 is 、 a raj遺伝子、 sbcC遺伝子、 sbcD遺 is子、 phoB遺伝子、 phoR遺伝子、 brnQ遺 is子、 pr oY遺 子、 malZ遺 ナ、 queA遺 is子、 tgt遺 to子、 secD遺 to子、 secF遺 子、 tsx遺 伝子、 ribD遺伝子、 ribH遺伝子、 nusB遺伝子、 thiL遺伝子、 pgpA遺伝子、 dxs遺伝子 、 ispA遺 is子、 xseB遺伝子、 thil遺伝子、 thij遺伝子、 apbA遺 is子、 cyoE遺伝子、 cyo 。遺伝子、 cyoC遺伝子、 cyoB遺伝子、 cyoA遺伝子、 ampG遺 is子、 bolA遺伝子、 tig 遺伝子、 clpP遺伝子、 clpX遺伝子、 Ion遺伝子、 hupB遺伝子、 cofil:伝子、 mdlA遺伝 子、 mdlB¾fc子、 glnK遺 is子、 amtB¾fc子、 tesB遺 子、 maa¾fc子、 hha遺伝子、 acrB¾伝十、 acrA遺 子、 acrR遺 is子、 aefA¾fe十、 priC遺 子、 apt¾fcナ、 dnaX 逾 ナ、 recR¾fe十、 htpG¾fe十、 adk遺伝子、 hemH遺 子、 aes¾fcナ、 gsk遺 子、 fsr遺 子、 ushA遺 子、 cueR遺 子、 gel遺 子、 gip¾fcナ、 purK¾fcナ、 pur E¾fe子、 ybbF¾伝子、 ppiB¾fc子、 cysS遺 is子、 folD¾fe子、 sftnA遺伝子、 sftnC 逾 fc子、 sftnD遺 子、 s&iH遺 子、 sfoiF¾伝子、 fimZ¾伝子、 entD遺 is子、 fepA遺 子、 fes¾fzs子、 ent 遺伝子、 fepE遺 to子、 fepC¾fc子、 fepG遺 is子、 fepD遺 is子 、 fepB遺伝子、 entC遺 子、 entE遺 to子、 entB¾fc子、 entA遺伝子、 cstA¾伝子、 d sbG遺 is子、 ahpCjAizs子、 ahpFjA伝子、 rnk¾fcナ、 rna遺伝子、 citT¾fcナ、 citGjl: 伝子、 citX遺伝子、 citF遺伝子、 citE遺伝子、 citD遺伝子、 citC遺伝子、 citA遺伝子、 citB遺 is子、 dcuC遑 is子、 dcuC¾伝子、 crcA遺 is子、 cspEjAizs子、 crcB¾izs +、 lip A遺伝子、 lipB遺伝子、 dacA遺伝子、 rlpA遺伝子、 mrdB遺伝子、 mrdA遺伝子、 phpB 逾 fc子、 nadD¾伝子、 holA¾fc子、 rlpB¾fc子、 leuS¾fc子、 lnt¾fe子、 phoLjftte 子、 ubiF¾fe十、 asnB遺伝子、 nagD¾fe十、 nagC¾fcナ、 nagA¾fcナ、 nagB¾fc 子、 nagEjAizs 、 gln jftzs子、 fur¾伝子、 fldA¾fcナ、 seqA¾fcナ、 pgm遺 is子、 po tE遺伝子、 speF遺伝子、 kdpE遺伝子、 kdpD遺伝子、 kdpC遺伝子、 kdpB遺伝子、 kd pA遺伝子、 phrB遺伝子、 end8遺伝子、 abrB遺伝子、 gltA遺伝子、 sdhC遺伝子、 sdh D遺 子、 sdhA¾fe子、 sdhB遺 1ZS子、 sucA¾fc子、 SUCB¾1ZS子、 sucC遺伝子、 sue D遺伝子、 farR遺伝子、 hrsA遺伝子、 cydA遺伝子、 cydB遺伝子、 tolQ遺伝子、 tolR 遺 fcナ、 tolA遺 ナ、 tolB遺 ナ、 pal遺 ナ、 nadA遺伝子、 pnuC遺 子、 czcD遺 子、 aroG¾伝子、 gpmA¾伝子、 galM遺 is子、 galK遺 is子、 galT遺お子、 galE遺 子、 modF遺 十、 modE遺 fc 、
Figure imgf000040_0001
modB遺 子、 modC遺伝ナ、 bioA遺 子、 bioB遺伝子、 bioF遺 子、 bioC¾fc子、 bioD遺 is子、 uvrB¾伝子、 moaAMfe 子、 moaB遺 十、 moaし遺 子、 moaD遺 十、 moaE遺 +、 rhlE遺 子、 dps遺伝 子、 ompX¾fe十、 mipB¾fe十、 moeB遺 子、 moeA¾fe十、 mdfA¾fcナ、 grxAM 子、 poxB¾伝子、 aqpZ遺 子、 cspD¾fc子、 clpA遺 is子、 infA¾fc子、 aat遺 is子 、 cydC遺伝子、 cydD遺伝子、 trxB遺伝子、 lrp遺伝子、 ftsK遺伝子、 lolA遺伝子、 serS 遺伝子、 dmsA遺伝子、 dmsB遺伝子、 dmsC遺伝子、 pflA遺伝子、 pflB遺伝子、 focA 逾 ナ、 serC¾fcナ、 aroA¾伝十、 cmk¾fcナ、 rpsA¾伝十、 himD¾fcナ、 msbajl: 1zS子、 ΙρχΚ遺伝子、 kdsB遺伝子、 smtAjAizs子、 mukF¾izs子、 kicA¾izs子、 mukBM 1zs +、 aspC遺 is 、 ompF遺伝子、 asnS遺 子、 pncB遺 子、 pepN遺 to子、 ssuB遺 1zs +、 ssuC¾fe卞、 ssuD¾fcナ、 ssuA¾fcナ、 ssuE遺伝子、 pyrD遺 子、 uup遺 1zs 子、 pqiA遺 is子、 pqiB¾fe子、 rmf¾fe子、
Figure imgf000040_0002
ompA遺 is子、 sulA遺伝子、 helD遺お子、 mgsA遺 is子、 acyP¾fc子、 hyaA遺 子、 hyaB遺 子、 hyaC¾fe子、 h yaDjAizs 、 hyaE¾izs +、 hyaF¾fe卞、 appC遺 子、 appB遺 子、 appAjfczs子、 cs gG遺 is卞、 csgF遺 1zs子、 csgE¾fcナ、 csgD遺 to子、 csgB¾fcナ、 csgA遺 to子、 csg C遺伝子、 sfaA遺伝子、 mdoG遺伝子、 mdoH遺伝子、 msyB遺伝子、 htrB遺伝子、 sol A遺伝子、 dinl遺伝子、 pyrC遺伝子、 grxB遺伝子、 rimj遺伝子、 mviM遺 is子、 mviN 遺伝子、 flgN遺伝子、 flgM遺伝子、 flgA遺伝子、 flgB遺伝子、 flgC遺伝子、 flgD遺伝子 、 flgE遺伝子、 flgF遺伝子、 flgG遺伝子、 flgH遺伝子、 flgl遺伝子、 flgj遺伝子、 flgK遺 伝子、 flgL遺伝子、 rne遺伝子、 rluC遺伝子、 rpmF遺伝子、 plsX遺伝子、 fabH遺 is子 、 fabD遺伝子、 fabG遺伝子、 acpP遺 to子、 fabF遺伝子、 pabC遺伝子、 tmk遺伝子、 ho IB遺 is子、 ptsG遺伝子、 I uE遺伝子、 nagZ遺伝子、 ndh遺伝子、 mfd遺伝子、 yclU遺 伝子、 yc!V遺伝子、 yc!W遺伝子、 cobB遺伝子、 potD遺伝子、 potC遺伝子、 potB遺 子、 potA遺伝子、 pep 遺 1S子、 phoQ遺 is子、 phoP¾fc子、 purB遺伝子、 trmUM 1zs +、 icdA¾fe十、 minE¾fe十、 minD¾fcナ、 minC¾fe卞、 clyA¾伝子、 umuD遺 伝子、 umuC遺伝子、 dsbB遺伝子、 nhaB遺伝子、 fadR遺伝子、 dadA遺伝子、 dadX遺 伝子、 WcA遺伝子、 mltE遺伝子、 tagl遺伝子、 treA遺伝子、 dhaR遺伝子、 pth遺伝子 、 prsA fe子、 ychB遺 is子、 hemM¾伝子、 hemA¾fc子、 prfA¾fc子、 hemKjAfe子 、 kdsA遺伝子、 chaA¾fe子、 chaB遺 子、 chaC¾fe子、
Figure imgf000041_0001
narX遺 1ZS子、 narK¾fcナ、 narG¾fc十、 narH¾fe十、 nar」ji:izs^ narl遺 is子、 tpr遺伝子、 purU 逾 fc子、 sprE遺 is子、 galU遺 is子、 hns¾fc子、 tdk遺 is子、 adhE¾伝子、 oppA遺お 子、 oppB遺伝子、 oppC遺伝子、 oppD¾fcナ、 oppF¾fcナ、
Figure imgf000041_0002
kch¾fcナ、 tonB遺伝子、 trpA fc子、 trpB遺 子、 trpC遺 is子、 trpD¾伝子、 trpE¾fc子、 trp L¾fe子、 btuR遺 is子、 sohB¾fc子、 topA遺 子、 cysB¾fc子、 acnA遺伝子、 ribA 逾 ナ、 pgpB¾izs +、 pyrF¾fcナ、 osmB遺 子、 rnb¾fcナ、 envM遺 子、 sapFM 1zs +、 sapDjAizs 、 sapC遺 is 、 sapB¾feナ、 sapA¾fcナ、 aldH¾伝十、 ordL遺
+、 goaG遺 子、 pspF遺 子、 pspA遺 子、 pspB遺 is子、 pspC遺 子、 pspD遺
+、 pspE¾feナ、 sucP¾fcナ、 ompGr遑 子、 tyrR¾fcナ、 tpx遺伝子、 mppA遺 is 子、 ihr遺 子、 ogt遺伝子、 dbpA遺 子、 intR¾fe子、 lar¾fe子、 recT遺 is子、 recE 逾 ナ、 racC¾fcナ、 kil¾fcナ、 sieB遺 子、 racR¾fcナ、 dnaC¾izs +、 enpPM zS 子、 trkG遺伝子、 VMTH丄 AMBD遺伝子、 VLOM丄 AMBD遺伝子、 tnpO遺伝子、 upo 3遺伝子、 ompN遺伝子、 nilj遺伝子、 hslj遺伝子、 ldhA遺伝子、 feaR遺伝子、 feaB遺
+、 tynA¾fcナ、 paaZ¾fcナ、 paaA¾fcナ、 paaB¾fe十、 paaC¾fcナ、 paaDM 1zs +、 paaE¾feナ、 paaF¾fcナ、 paaG¾feナ、 paaH遺 is子、 paal遺 to子、 paaj¾fc 子、 paaK¾fc子、 paaX遺お子、 paaY¾fc子、 acpD¾伝子、
Figure imgf000041_0003
aldA遺お 子、 gapCjl:伝子、 gapC逾 to子、 cybB遺 子、 trg¾fe十、 rimL遺 1zs子、
Figure imgf000041_0004
、 tehB¾fc子、 prtC遺 is子、 potA¾伝子、 potC遺 is子、 ansP遺 is子、 nhoA遺 is子、 narV遺 子、 narW遺 十、 narYjAizs子、 narZ遺 ナ、 narU遺伝ナ、 fdnG遺 子、 fd nH遺 is子、 fdnl¾fc子、 adhP遺 is子、 sfcA遺 to子、 rpsV¾fc子、 osmC¾fc子、 dos 逾 fc子、 xasA遺 is子、 gadB¾fc子、 pqqL¾伝子、 chuR遺 is子、 hipA遺伝子、 hipBM 1ZS子、 tam遺 fc 、 uxaB遺 ナ、 marし遺 子、 marR遺 is子、 marA遺 is子、 marB遺 子、 dcp遺伝子、 lycV¾fc子、 dicA fe子、 dicB遺 is子、 rspB遺 1zs子、 rspA¾fc子 、 spe 遺 子、 dmsB遺 子、 dmsC遺 ナ、 bioD遺 子、 mlc遺 子、 asr遺 子、 eb r¾伝子、 pntB遺 fzs子、 pntA遺伝子、 arcD¾fzs子、 rstA遺 is子、 rstB遺 is子、 tus遺 伝子、 lUmC遺 ナ、！UmA遺伝子、 manA遺伝子、 uidC遺 子、 uidB遺伝十、 uidA遺 子、 uidR遺 子、 hdhAjAfe子、 mall¾fc子、 malX遺伝子、 malY遺 is子、 add遺伝 子、 blnife子、 ntn遺 is子、 gst遺 is子、 pdxY遺 is子、 tyrS¾fe子、 pdxH¾fc子、 sly B遺 子、 sly 遺 子、 sodC fc子、 nemA¾fe子、 gloA遺 is子、 rnt遺伝子、 lhr遺 子、 sodB¾伝子、 araj遺 1zs子、 purR¾fc子、 cfa¾fc子、 ribE¾fc子、 ag43遺 is子 、 phsCjAizs子、 nrfC¾fcナ、 pykF¾fcナ、 lppjAizs子、 suS遺伝子、 aroD遺 子、 pp sA¾fc子、 aroH遺 子、 nlpC¾fc子、 btuD遺 is子、 btuE¾fc子、 btuC遺 is子、 him A遺 is子、 pheT¾fc子、 pheS遺 is子、 pheM遺 is子、 rpl 遺 1S子、 rpml遺 子、 infC ¾fc子、 thrS fc子、 arp遺 is子、 plkB遺 is子、 cedAjAfe子、 katt遺 is子、 celt1遺 is 子、 celD遺お子、 celC¾伝子、 celB¾fc子、 celAjAfe子、 osmE¾fc子、 nadE遺 is子 、 spy¾fe子、 astE¾fc子、 astB遺 fzs子、 astD遺 is子、 astA¾伝子、 cstC¾fzs子、 xth A遺伝子、 gdhA遺伝子、 topB遺伝子、 selD遺伝子、 sppA遺伝子、 ansA遺伝子、 tdh 逾 fc子、 gapA遺伝子、 ttuC fc子、 caiT¾fc子、 rnd遺 is子、 fadD¾伝子、 sip遺 is 子、 pabB遺 子、 sdaA遺 、 manX遺 子、 manY遺云ナ、 manZ遺 子、 rrmA遺 子、 cspC¾伝子、 kdgR遺伝子、 tcmA遺 子、 htpX¾伝子、 prc¾fc子、 pqiB遺 is 子、 pphA fe子、 holE遺 子、 exoX¾fc子、 ptrB遺 子、 purT遺 is子、 eda¾fc子 、 edd遺 is 、 zwf¾伝十、 pykA¾fcナ、 mlt遺 子、 znuA遺 1zs子、 znuC¾伝十、 ruv B遺 fzs子、 ruvA遺伝子、 ruvC遺 is子、 ntpA¾伝子、 aspS¾f 子、 bisZ¾fc子、 torY 逾 ナ、 cutC¾fcナ、 arg jAto子、 pgsA遺 to子、 amn¾伝子、 cbl¾fe卞、 nacMfc 子、 er! 遺 子、 cobT¾fc子、 cobS遺 is子、 cobU遺 is子、 gyrl¾fc子、 phst遺 is子 、 sbcB遺 子、 hisL遺伝子、 hisG遺 1ZS子、 hisD遺 1ZS子、 hisC遺 1ZS子、 hisB遺伝子、 his H遺 is子、 hisA遺 is子、 hisF遺お子、 hisl¾fc子、 wzz遺 子、 ugd¾fe子、 gnd遺 子、 galF遺伝子、 wcaM遣 、 wcaL遺 子、 wcaK遺 子、 wzxC¾fcナ、 wcaj遺 1zs 子、 cpsG遺 子、 cpsB遺 、 wcal¾伝子、 wcaH¾feナ、 wcaGjAizs子、 gmd遺伝 子、 wcaF遺 izsナ、 wcaii遺 izs子、 wcaD遺 子、 wcaC遺ィ云ナ、 wcaB遣 izs十、 wcaA遺 子、 wzb¾伝子、 wza遺伝子、
Figure imgf000042_0001
dcd¾伝子、 udk遺 is子、 thiD遺 is子、 thiM¾伝子、 mrp¾fe十、 metG¾izs +、 cdd¾fcナ、 sanA¾fcナ、 mglC¾feナ、 mgl A遺 is子、 mglB¾伝子、 galS¾伝子、 fol 遺伝子、 cirA遺 is子、 lysP遺 is子、 nfo遺 is 子、 fruA遺伝子、 fruK遺 is子、 fruB遺 is子、 rplY遺 is子、 narP遺伝子、 ccmH遺 十、 dsbE遺 is子、 ccmF遺云ナ、 ccmE遺 子、 ccmD遺 is十、 ccmC遺 子、 ccmB遺 is子 、 ccmA¾伝十、 napC¾fcナ、 napB¾fcナ、 napH遺 1ZS子、 napGjAizs子、 napA遺 1zs子 、 napD遺 to子、 napr1逾 to子、 eco遺 子、 alkB¾fe十、 ada遺 1zs子、 apb 遺 1zs子、 res B遺 1ZS子、 rcsC遺伝子、 atoS遺 子、 atoC¾fc子、
Figure imgf000043_0001
atoE 逾 fc子、 atoB遺 is子、 gyrA¾伝子、 ubiG遺 is子、 nrdA¾伝子、 nrdB遺
子、 inaA fc子、 glpQ遺 fc子、 glpT¾fc子、 glpA¾伝子、 glpB遺 子、 glpC遺 子、
Figure imgf000043_0002
ais遺 十、 pmrD遺 、 menE遺 子、 menし遺 +、 menB遺 子、 menD遺伝ナ、 menF遺 子、 nuoN遺 子、 nuoM遺伝ナ、 nuoL遺 十、 nuoK遺 1zs +、 nuoJ¾fe十、 nuol遺 子、 nuoH遺伝子、 nuoG¾fcナ、 nuoF¾fcナ、 nuoEM 子、 nuoD¾fc子、 nuoB¾伝子、 nuoA遺 is子、 lrhA遺 子、 ackA遺 is子、 pta遺伝 子、 ubiX遺 子、 purF¾fc子、 dedE遺伝子、 dedD遺 is子、 folC遺 is子、 accD¾fc子 、 dedA遺 子、 truA遺 子、 usgl¾伝子、 pdxB遺伝子、 div遺 is子、 fabB遺 is子、 dd pX遺 子、 mepA¾fe十、 aroC fc十、 sixA遺 is子、 fadL¾fe十、 vacj遺 is子、 dsd C遺 is子、 dsdX¾fc子、 dsdA遺お子、 emrY遺 is子、 emrK遺 is子、 evgA¾fe子、 evg S遺伝子、 bilF遺伝子、 ddg遺伝子、 glk遺伝子、 mntH遺伝子、 nupC遺伝子、 gltX遺伝 子、 xapR遺 、 xapB¾izs +、 xapA遺 is子、 lig¾fe卞、 zipA¾伝子、 cysZ遺 子、 cysK¾fcナ、 ptsH¾fe十、 ptsl¾fcナ、 gsr遺 is子、 pdxK遺 is子、 cysM遺伝子、 cys A遺 is子、 cysW遺 子、 cysU¾伝子、 cysP¾fc子、 ucpA¾伝子、 ptb 遺 is子、 ami A遺 is子、 hemF遺 is子、 cchA¾fe子、 eutC遺 is子、 eutB¾fe子、 eutH遺伝子、 eut G遺伝子、 eu 遺伝子、 eutE遺伝子、 cchB遺伝子、 eutl遺伝子、 talA遺伝子、 tktB遺 1zs +、 aegAjAizs 、 narQ遺 is子、 acrD¾feナ、 aapE¾feナ、 purC¾fe卞、 nlpBM 伝子、 dapA遺伝子、 gcvR遺伝子、 bcp遺伝子、 hyfA遺伝子、 hyffl遺伝子、 hy! 遺伝 子、 hy!D遺伝子、 hyffi遺伝子、 hy!F遺伝子、 hyfG遺伝子、 hy!H遺伝子、 hyfl遺伝子、 hyfj¾fc子、 hyfR遺 is子、 focB遺 is子、 perMjAfe子、 yfgE遺 is子、 uraA¾伝子、 upp 逾 ナ、 purM遺 子、 purN遺 子、
Figure imgf000043_0003
ppx¾fcナ、 guaA¾fe卞、 guaBM 1zs +、 xseA¾fe卞、 hisS遺 子、 gcpE遺 子、 ndk遺 is子、 pbpC逾 to子、 sseA遺 子、 sseB遺伝子、 pepB遺 子、 fdx遺 is子、 hscA¾fc子、 hscB遺 is子、 iscU遺お子、 iscS遺伝子、 iscR遺 to子、 suhB遺 to子、 csiE遺 十、 dgxA遺 ナ、 dgxB遺 ナ、 hca C遺伝子、 hcaB遺伝子、 hcaD遺 is子、 glyA遺伝子、 hmpA遺伝子、 glnB遺伝子、 purL 遺 fcナ、 acpS遺伝十、 pdxj遺 子、 recO遺 子、 era遺 ナ、 rnc遺 1zs子、 lepB遺伝 子、 lepA遺 ナ、 rseC遺伝子、 rseB遺 子、 rseA遺 ナ、 rpoE遺 ナ、 nadB遺 ナ ゝ srmB遺伝子、 ung遺 is子、 trx2遺 is子、 pssA遺伝子、 kgtP遺伝子、 clpB遺伝子、 rlu D遺 is子、 pheL¾fe子、 pheA遺 1zs子、 tyrA¾伝子、 aroF遺 子、 rplS¾fc子、 trmD 逾 fc子、 rimM遺伝子、 rpsP¾fe子、 ffh遺 to子、 grpE¾fe子、 recN遺 is子、 smp 遺 子、 smpB¾fc子、 gabD¾伝子、 gab 遺 1S子、 gabP¾伝子、 nrdF遺 is子、 emrRM 卞、 em 遺 子、 emrB遺 子、 gshA遺 子、 cs 遺 子、 ala¾遺 1zs子、 oraAj¾izs 子、 recA¾伝子、 mltB¾fc子、 hypF遺伝子、 hydN遺伝子、 ascG¾fc子、 ascト遺 is 子、 ascB遺伝子、 hycl遺伝子、 hycH遺 is子、 hycG遺 is子、 hycF¾伝子、 hyc 遺 is 子、 hycD遺伝子、 hycC fc子、 hycB遺 子、 hycA遺 子、 hypA¾fc子、 hypB遺 子、 hypC fc子、 hypD¾fe子、 hypt遺 is子、 I lA遺 is子、 mutS¾fc子、 prpB遺 is +、 rpo jito子、 pcmjAizs子、 surE遺伝子、 ygbB遺 is 、 ygbP¾伝子、 ygbQ遺伝子 、 cysC遺 子、 cysN遺 子、
Figure imgf000044_0001
iap遑 子、 cysH遺 1zs子、 cysl¾fe十、 cy sj遺 1zs子、 ptpS遺 is 、 eno¾feナ、 pyrG¾feナ、 maz 遺 1zs子、 chpR遺 子、 relA 逾 fc子、 barA遺 子、 gud2¾fe子、 gudT遺お子、 mioC遺 is子、 syd遺伝子、 sdaB遺 子、 exo遺 子、 fucO fc子、 fuc 遺 子、 lUcP遺伝子、 fucl¾fc子、 lUcK遺 is子 、 iUcU¾伝子、 fucR¾fe子、 gcvA遺 is子、 niS¾fe子、 mltA遺 is子、 amiC遺 is子、 ar gA¾fc子、 thyA遺 to子、 lgt遺 is子、 ptsP遺 is子、 mutH遺 is子、 tas遺 is子、 aas¾伝 子、 galR遺 子、 lysA遺 子、 lysR遺 is子、 araE¾伝子、 kduD遺 is子、 kdul遺 1zs子、 lysS遺伝子、 prffi遺伝子、 recj遺伝子、 dsbC遺伝子、 xerD遺伝子、 fldB遺伝子、 upl4 逾 fc子、 bglA遺 子、 gcvP¾伝子、 gcvH遺 子、 gcvT¾fc子、 visC遺 is子、 ubiH遺 卞、 pepP¾feナ、 serA¾fe十、 rpiA遺 子、
Figure imgf000044_0002
sbm遺 1zs子、 arg jAizs子 、 iba遺 子、 pgk¾fc子、 epd遺 子、 tktA遺伝子、 speB遺 is子、 speA¾伝子、 metK 逾 fc子、 galP fc子、 sprT遺 子、 endA¾fc子、 gshB遺 is子、 yqgF¾fe子、 ansB遺 子、 mutY¾fc子、 mltC遺 子、 nupG遺 is子、 speC¾fc子、 pitB¾fc子、 gsp遺 is 子、 hybG遺伝子、 hybF遺伝子、 hybE遺伝子、 hybD遺伝子、 hybC遺伝子、 hybB遺伝 子、 hybA遺 ナ、 hoxK遺伝子、 exbD遺伝子、 exbB遺伝子、 metC遺伝子、 exsA遺 1ZS 子、 sufl遺 ナ、 plsC遺伝子、 parC遺伝子、 parE遺伝子、 ice遺伝子、 tolC遺 is +、 ri bB遺伝子、 glgS遺伝子、 rfaE遺伝子、 glnE遺伝子、 cca遺伝子、 bacA遺伝子、 folB遺 伝子、 ttdA遺伝子、 ttdB遺伝子、 ygjD遺伝子、 rpsU遺伝子、 dnaG遺伝子、 rpoD遺伝 子、 aer遺 is子、 ebgR¾fc子、 ebgA¾伝子、 ebgC遺 is子、 fadH¾fe子、 uxaA遺 is子 、 uxaC遺 子、 exuT¾伝子、 exuR遺 is子、 tdcE遺伝子、 tdcD遺 is子、 tdcC¾伝子、 tdcB遺 子、 tdcA fc子、 tdcR遺伝子、 sohA¾fc子、 agaR遺 is子、 agaZ¾fe子、 ag aV遺 is子、 agaW遺 子、 agaA遺 1zs子、 agaS遺 子、 agaY¾izs +、 agaB¾fcナ、 aga CJAIZS子、 agaD遺 子、 agal¾伝子、 mtr逾 to子、 deaD遺 子、 mpl遺 子、 pnpj¾ 子、 rpsO¾伝子、 truB¾fc子、 rbfA¾fc子、 inffi¾伝子、 nusA遺 is子、 argGMfe 子、 secG fc子、 mrsA遺伝子、 folP遺 is子、 ftsH遺 is子、 ftsj¾伝子、 greA遺 is子、 aacB¾fcナ、 yhbZ¾fcナ、 rpmA遺 子、 rplU¾fe十、 ispB遺 子、 nlp¾伝子、 mur A遺 is子、 yrbl¾fzs子、 yrbK遺 to子、 rpoN¾fzs子、 ptsN遺 is子、 ptsO¾f 子、 mtgA 逾 fc子、 arcB遺 子、 gltB遺 is子、 nanT¾fe子、 npl¾fc子、 nanR遺 to子、 dcuD遺 子、 sspB遺お子、 sspA fc子、 rpsl¾伝子、 rplM¾fc子、 hhoA¾fe子、 hhoB遺お 子、 mdn遺 1zs子、 argR遺 子、 tldD¾伝子、 rng遺 子、 mreD遺伝子、 mreC¾feナ、 mreB遺 子、 accB¾izs +、 accC遺 is 、 panF遺 is 、 prmA遺 子、 fis遺 子、 aro E¾fe子、 smg¾fe子、 smf遺 is子、 defile子、 felt遺 is子、 sun¾fe子、 trkA¾fe子 、 mscL遑 子、 zntR遺 子、 rplQ fcナ、 rpoA¾fe十、 rpsD遺伝子、 rpsK逾 to子、 r psM遺伝子、 rpmj遺 is 、 secY¾fcナ、 rplO遺伝子、 rpmD¾fe卞、 rpsE¾伝十、 rpl R遺 子、 rplF¾fc子、 rpsH遺 to子、 rpsN¾fc子、 rplE¾fe子、 rplX¾fc子、 rplNM 1zs +、 rpsQ izs +、 rpmし遺 1zs子、 rplP¾fe十、 rpsC遺伝子、 rplV¾izs +、 rpsS遺 子、 rplB遺伝子、 rplW遺伝子、 rplD遺伝子、 rpに遺伝子、 rpsj遺伝子、 tufA遺伝子、 f usA¾fc子、 rpsG遺伝子、 rpsL遺伝子、 IkpA fc子、 slyX¾fc子、 slyD遺 is子、 keffi 逾 fc子、 prkB遺 is子、 crp¾伝子、 argD遺 is子、 pabA¾fe子、 fic遺 is子、 ppiA¾伝 子、 nirB遺 子、 nirD¾fe卞、 nirC遺伝子、 cysG遺伝子、 php遺 子、 trpS¾fcナ、 g ph¾fcナ、 遺伝子、 dam¾fcナ、 damX遺 子、 aroB¾izs +、 aroK¾fcナ、 ho!Q 逾 ナ、 mrcAjl:伝子、 pckA遺 to子、 envZ遺 子、 ompR¾fcナ、 greB遺伝子、 feoA 遺 fcナ、 feoB遺伝子、 bioH遺 is子、 gntT遺 ナ、 malQ遺伝子、 malP遺伝子、 malT遺 伝子、 rtcA遺伝子、 rtcB遺伝子、 rtcR遺伝子、 glpR遺伝子、 glpG遺伝子、 glpE遺伝 子、 glpD fc子、 glgP遺 子、 glgA¾伝子、 glgC遺 is子、 glgX fc子、 glgB遺 is子、 asd遺 子、 gntU遺 子、 gntU遺伝子、 gntK¾伝子、 gntR¾伝子、 ggt遺 子、 ugpQ 逾 fcナ、 ugpC fe子、 ugp j zs子、 ugpA遺 isナ、 ugpB¾fc子、 livr遑 is子、 livGjA 伝子、 livM遺伝子、 livH遺伝子、 livK遺伝子、 livj遺伝子、 rpoH遺伝子、 ftsX遺伝子、 ftsE遺伝子、 ftsY遺伝子、 atzN遺伝子、 nikA遺伝子、 nikB遺伝子、 nikC遺伝子、 nikD 逾 fc子、 nikE遺 子、 pitA遺 子、 uspB¾伝子、 uspA遺伝子、 prlC遺お子、 gor¾伝 子、 arsR遺 1ZS子、 arsB¾伝子、 arsC¾fc子、 slp¾fc子、 hdeB遺伝子、 hdeA遺伝子、 hdeD遺伝子、 gadA遺伝子、 treF遺伝子、 kdgK遺伝子、 dctA遺伝子、 dppF遺伝子、 d ppD遺 子、 dppC遺 子、 dppB¾伝子、 dppA¾fcナ、 tagjAizs子、 bisC¾feナ、 csp A遺伝子、 glyS遺伝子、 glyQ遺伝子、 xylB遺伝子、 xylA遺伝子、 xylF遺伝子、 xy 遺 子、 xylH遺 is子、 xylR遺 子、 bax¾fc子、 malS遺 is子、 avtA¾伝子、 lyx遺伝子、 sgbH¾fc子、 sgbU遺お子、 sgbE¾fc子、 aldB遺 子、 selB遺 is子、 sel 遺 is子、 mtl A遺伝子、 mtlD遺伝子、 mtlR遺伝子、 1WP遺伝子、 1WR遺伝子、 1WD遺伝子、 cysE遺 子、 gpsA¾伝子、 secB遺 子、 grxC¾伝子、 tdh¾fc子、 kbl¾fc子、 htrL遺 is子 、 rfaD¾fe子、 rfaF遺伝子、 rfaC遺 1ZS子、 rfaLjAizs子、 rfaK¾fe子、 rfaZ遺伝子、 rfaY 逾 fc子、 rfaj遺 to子、 rfal¾fe子、 rfaB¾伝子、 rfaS遺 is子、 rfaP遺 is子、 rfaG遺 is子 、 rfaQ遺伝子、 kdtA遺伝子、 kdtB遺伝子、 mutM遺伝子、 rpmG遺伝子、 rpmB遺伝子 、 radC¾f 子、 dft)¾fzs子、 dut遺 is子、 ttk遺 is子、 pyrE¾伝子、 rph¾fzs子、 dinD遺
+、 gmkjAizs子、 rpoZjAizs 、 spoT¾izs +、 spoU遺 is子、 recG¾izs +、 gltS遺 is 子、 nlpA遺 is子、 uhp 遺 is子、 uhpC遺 is子、 uhpB¾fc子、 uhpA¾伝子、 ilvN遺 is 子、 ilvB¾fc子、 ivbLjAfe子、 emrD¾fc子、 ibpB遺 is子、 ibpA遺 is子、 gyrB¾fc子 、 recF¾伝子、 dnaN遺 子、 dnaA遺 is子、 rpmH遺 is子、 rnpA¾伝子、 yidC¾fe子 、 thdF遺伝子、 tnaL遺伝子、 tnaA遺伝子、 tnaB遺伝子、 bglB遺伝子、 bglF遺伝子、 b glG遺伝子、 phoU遺 is子、 pstB¾伝子、 pstAjifzs子、 pstC遺 to子、 pstS遺 is子、 glm S¾fc子、 glmU遺 is子、 atpC遺 fzs子、 uncD¾fc子、 atpG遺 is子、 atpA¾fc子、 atpH ¾fc子、 atpト遺 is子、 atpE遺 is子、 atpB¾fc子、 atpl¾伝子、 gidB¾fe子、 gidA遺 ナ、 mioC遺 十、 asnC遺 is子、 pssR遺 十、 ilvL遺 to子、 ilvG遺伝子、 ilvM遺伝 子、 ilvE遺伝子、 ilvD遺伝子、 ilvA遺 is子、 ilvY遺伝子、 ilvC遺伝子、 ppiC遺 1zs子、 re p遺伝子、 gppA遺伝子、 rhlB遺伝子、 trxA遺伝子、 rhoL遺伝子、 rho遺 子、 rfe遺伝 子、 wzzE遺伝子、 nfrC遺伝子、 rl!D遺伝子、 rffG遺伝子、 rl!H遺伝子、 rffA遺伝子、 wz xE遺伝子、 rffT遺伝子、 wecG遺 1ZS子、 aslB遺 1ZS子、 aslA¾fe子、 hemY¾fe子、 hemX 遺 ナ、 hemD遺伝子、 hemC遺 子、 cyaA遺 子、 cyaY遺 is子、 dapF遺 is子、 xerC 遺伝子、 uvrD遺 to子、 corA遺伝子、 radD遺 to子、 pldA遺伝子、 recQ遺 is子、 pldB遺 伝子、 metR遺伝子、 metE遺 is子、 udp遺伝子、 ubiE遺伝子、 aarF遺 is子、 tatC遺伝 子、 tatD遺伝子、 rfaH遺伝子、 ubiD遺伝子、 ubiB遺伝子、 fadA遺伝子、 fadB遺伝子、 pepQjAfe子、 trkH遺 is子、 trkH¾fe子、 hemG¾fe子、 mobB遺 is子、
Figure imgf000047_0001
、 dsbA遺伝子、 polA遺伝子、 yihA遺伝子、 hemN遺伝子、 ntrC遺伝子、 ntrB遺伝子、 glnA遺伝子、 fdhE遺伝子、 fdol遺伝子、 fdoH遺伝子、 fdoG遺伝子、 fdhD遺伝子、 sod A遺 is子、 kdgT¾fe子、 cpxA遺お子、 cpxR¾fe子、 cpxP遺 子、 plkA fc子、 sbp 逾云子、 cdhjifc子、 tpiA¾伝子、 ftr遺 子、 glpX遺 子、 glpKjifc子、 glpF¾fe子 、 menG遺伝子、 menA遺伝子、 hslU遺伝子、 hslV遺伝子、 ftsN遺伝子、 cytR遺伝子、 priA遺 is子、 rpmE¾伝子、 metj遺 is子、 metB遺 1ZS子、 metL¾伝子、 metF¾fcナ、 k atG¾fe子、 gldA fc子、 talC fe子、 ppc遺 1zs子、 argE¾fe子、 argC遺 is子、 argB ¾fc子、 argH遺 is子、 oxyR¾fe子、 udhA¾fe子、 trmA遺 to子、 btuB¾fc子、 murl 逾 ナ、 murB遺 子、 birA¾fe十、 coaA¾fe十、 tuffi遺 1ZS子、 secE¾fcナ、 nusGM 子、 rplK遺 is子、 rpl 遺 is子、 rplj¾fe子、 rplL¾伝子、 rpoB遺 is子、 rpoC¾fe子 、 htrC遺伝子、 thiH遺伝子、 thiG遺伝子、 thiS遺伝子、 thiF遺伝子、 thiE遺伝子、 thiC 逾 fc子、 rsd遺 is子、 hemE遺 is子、 nfi¾伝子、 hupA遺 子、 hydH遺 is子、 hydG遺
+、 purDjAizs 、 purH遺 子、 metA遺 to子、 aceB遺 子、
Figure imgf000047_0002
aceKjA 子、 arp遺伝子、 iclR¾fc子、 metH¾fc子、 pepE遺 is子、 lysC¾fe子、 pgi¾fe子、 ubiC遺 is子、 ubiA fc子、 plsB¾fc子、 dgkA¾伝子、 le A¾fc子、 dinF遺 子、 qor ¾fc子、 dnaB遺 is子、 air遺伝子、 tyrB遺 to子、 nap iAizs子、 hobH遺 子、 uvrA遺 子、 ssb遺伝子、 soxS¾伝子、 soxR遺 子、 acs遺伝子、 nrfA遺 is子、 nrffi遺 is子、 nr! 遺伝子、 nriD遺伝子、 nrffi遺伝子、 nriF遺伝子、 nrfG遺伝子、 gltP遺伝子、 fdhF 遺 fcナ、 alsR遺 十、 rpiB遺 十、 proP遺伝子、 basS遺 to子、 basR遺 ナ、 adiY遺 伝子、 adi遺伝子、 melR遺伝子、 melA遺伝子、 melB遺伝子、 fumB遺 is子、 dcuB遺伝 子、 dcuR¾fc子、 dcuS遺 子、 lysU遺 is子、 cadAjAfe子、 cadB¾伝子、 cadC遺 is 子、 cutA3遺伝子、 cutA2遺伝子、 cutA遺伝子、 dcuA遺伝子、 aspA遺伝子、 fesA遺伝 子、 groES¾fcナ、 groELM
子、 eft)遺 is子、 ecnB¾伝子、 sugE遺 is子、 blc遺 is子、 ampC遺 is子、 frdD遺 子 、 frdC遺 子、 frdB¾fc子、 frdA¾伝子、 genX¾fc子、 psd遺 子、 yjeQ遺 子、 yje E¾fe子、 amiB遺伝子、 mutL遺伝子、 miaA¾fc子、 hfq¾fe子、 hflX¾fc子、 hflKM 子、 hflC fc子、 purA遺 is子、 vacB遺 子、 sga 遺 is子、 rpsF¾伝子、 priB¾伝 子、 rpsR遺 子、 rpll¾fc子、 fldB¾伝子、
Figure imgf000048_0001
cpdB¾fc子、 cysQ¾伝子、 msrA遺 is子、 chpS¾feナ、 chpB¾fe卞、 ppa¾fcナ、 I pjAizs子、 mpl遺 is子、 pmoA 遺伝子、 cybC遺伝子、 nrdG遺伝子、 nrdD遺伝子、 treC遺伝子、 treB遺伝子、 treR遺 ナ、 mgtA fcナ、 pyrl¾伝子、 pyrB遺 is +、 pyrBI遺 isナ、 argl¾fc十、 valSMfe 子、 holC¾伝子、 xerB¾fc子、 idnR遺 is子、 idnT遺 is子、 idn。¾fc子、 idnD遺 is子 、 idnK遺伝子、 fecEjAizs子、 fecD遺伝子、 fecC遺 1ZS子、 fecB遺 1ZS子、
Figure imgf000048_0002
fe cR¾fc子、 feci遺 is子、 dnaC遺 is子、 dnaT¾fc子、 bglj遺伝子、 l uF¾fe子、 rsmC 逾 fc子、 holD遺 is子、 riml遺 子、 prfC遺 is子、 osmY遺 is子、 deoC¾fc子、 deoAM 子、 deoB¾伝子、 deoD遺 is子、 lplA遺 is子、 smp遺 is子、 serB遺 is子、 radAMfc 子、 nadR¾fe子、 sit遺 to子、 trpR¾伝子、 gpmG¾fc子、 rob遺 is子、 creA遺伝子、 c reB¾伝子、 creC遺 1ZS子、 creD¾伝子、 arcA¾fe子、 lasT¾fc子、 thrL遺 1ZS子、およ び
[2]acr 遺 is子、 argT¾fc子、 artl遺 1ZS子、 artj¾fc子、 artM遺 1ZS子、 artP遺 1ZS子、 ar tQ遺伝子、 bfr遺伝子、 chiA遺伝子、 chpA遺伝子、 dacC遺伝子、 deoR遺伝子、 dinG 逾 fc子、 elaA遺 is子、 elaB遺 is子、 elaC遺 is子、 elaD¾伝子、 envD遺 is子、 envRM 伝子、 IhuA遺伝子、 IhuB遺伝子、 IhuC遺伝子、 IhuD遺伝子、 folX遺伝子、 glnH遺伝 子、 glnP遺伝子、 glnQ遺伝子、 gltj遺伝子、 gltK遺伝子、 gltL遺伝子、 gspA遺伝子、 g spC¾伝子、 gspD¾fzs子、 gspE遺 子、 gspl¾伝子、 gsp_J遺 is子、 gspK遺 1zs子、 gsp L遺伝子、 hisj遺伝子、 hisM遺伝子、 hisP遺伝子、 hisQ遺伝子、 ho!D遺伝子、 ho!F遺 伝子、 ho!G遺伝子、 ho!H遺伝子、 ItaA遺伝子、 mdaA遺伝子、 mdaB遺伝子、 pinO遺 fzs子、 potr1遺 is子、 potG fzs子、 potH¾伝子、 potl遺 1zs子、 pshM遺 is子、 ptwBM 子、 ptwC fe子、 rhsB遺 is子、 rimK遺伝子、 xylU¾fc子、
またはそれらの相同遺伝子を含み、かつ野生型の大腸菌より 470kbp以上短 、染色 体 DNAを有する大腸菌の変異体、
であれば、野生型の大腸菌の染色体 DNA上に存在する上記 [1]および [2]の遺伝 子および該遺伝子の相同遺伝子を除く！ヽずれの遺伝子を含まな！/ヽ染色体 DNAを有 する大腸菌の変異体であってもよぐ具体的には、表 1記載の遺伝子中の上記 [1]お よび [2]の遺伝子を除く遺伝子または該遺伝子の相同遺伝子から選ばれる遺伝子を 含まな ヽ染色体 DNAを有する大腸菌の変異体〔ただし、上記 [ 1]および [2]の遺伝 子またはそれらの相同遺伝子中に、野生型の大腸菌が元来有して 、な 、遺伝子 (以 下、 NC遺伝子という）がある場合は、該野生型の大腸菌に由来する上記大腸菌の変 異体は、 NC遺伝子を有していなくてもよい〕をあげることがでる。本発明の大腸菌の 変異体としては、より好ましくは表 1および配列番号 1で表される塩基配列中の上記 [
1]および [2]の遺伝子の塩基配列を除く DNAまたは該 DNAに相当する DNAを含 まない染色体 DNAを有する大腸菌の変異体、さらに好ましくは、
(2)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜 [69]記載の塩基配列を有す る DNA、
[1] 1番〜 167064番目で表される塩基配列
[2] 172980番〜 243964番目で表される塩基配列
[3] 253411番〜 261963番目で表される塩基配列
[4] 387532番〜 389138番目で表される塩基配列
[5]403704番〜 518029番目で表される塩基配列
[6] 532712番〜 535504番目で表される塩基配列
[7] 550216番〜 563940番目で表される塩基配列
[8] 608119番〜 675103番目で表される塩基配列
[9] 689375番〜 728820番目で表される塩基配列
[10] 739594番〜 832551番目で表される塩基配列 [11： 848090番へ '867637番目で表される塩基配列
[12； 883474番へ '890997番目で表される塩基配列
[13； 909380番へ '1048887番目で表される塩基配列
[14； 1097020番 ^ 1198105番目で表される塩基配列
[15； 1225147番' ^1630911番目で表される塩基配列
[16； 1641039番' ^1642631番目で表される塩基配列
[17； 1650223番' ^ 1964523番目で表される塩基配列
[18； 1993076番 ^1996661番目で表される塩基配列
[19； 2028210番 ^2033448番目で表される塩基配列
[20； 2044377番 ^2069148番目で表される塩基配列
[21； 2081927番 2104392番目で表される塩基配列
[22； 2116065番' 2146263番目で表される塩基配列
[23； 2187856番 ^2200668番目で表される塩基配列
[24； 2229851番 -2255894 目で表される塩基配列
[25； 2263492番 ^2270439番目で表される塩基配列
[26； 2286589番 ^2386261番目で表される塩基配列
[27； 2395472番 -2423364 目で表される塩基配列
[28； 2434099番 ^2472851番目で表される塩基配列
[29； 2482483番 -2505074 目で表される塩基配列
[30； 2514558番' ^2755676番目で表される塩基配列
[31； 2789481番 ^2795173番目で表される塩基配列
[32； 2800891番 ^2804307番目で表される塩基配列
[33； 2810148番 ^2825313番目で表される塩基配列
[34； 2830263番 ^2910273番目で表される塩基配列
[35； 2910574番' ^2985361番目で表される塩基配列
[36； 3033129番' -3077084 目で表される塩基配列
[37； 3078917番' 3110109番目で表される塩基配列
[38； 3134342番' ^3165627番目で表される塩基配列 [39] 3172941番〜 3360736番目で表される塩基配列 [40] 3370548番〜 3411159番目で表される塩基配列 [41 ] 3420879番〜 3453020番目で表される塩基配列 [42] 3469367番〜 3618575番目で表される塩基配列 [43] 3636917番〜 3854661番目で表される塩基配列 [44] 3865832番〜 3867101番目で表される塩基配列 [45] 3877011番〜 3926658番目で表される塩基配列 [46] 3938879番〜 4059897番目で表される塩基配列 [47] 4079660番〜 4086450番目で表される塩基配列 [48]4099983番〜 4139231番目で表される塩基配列 [49] 4149710番〜 4235358番目で表される塩基配列 [50]4251736番〜 4298976番目で表される塩基配列 [ 51 ] 4311512番〜 4313317番目で表される塩基配列 [52] 4329722番〜 4409532番目で表される塩基配列 [53]4423152番〜 4496201番目で表される塩基配列 [54]4509535番〜 4517875番目で表される塩基配列 [55] 4599638番〜 4641433番目で表される塩基配列 [56] 167065番〜 172979番目で表される塩基配列 [57] 675104番〜 689374番目で表される塩基配列 [58] 832552番〜 848089番目で表される塩基配列 [59] 867638番〜 883473番目で表される塩基配列 [60] 890998番〜 909379番目で表される塩基配列 [61] 2386262番〜 2395471番目で表される塩基配列 [62] 2423365番〜 2434098番目で表される塩基配列 [63] 2472852番〜 2482482番目で表される塩基配列 [64] 2505075番〜 2514557番目で表される塩基配列 [65] 2910274番〜 2910573番目で表される塩基配列 [66 ] 3165628番〜 3172940番目で表される塩基配列 [67] 3411160番〜 3420878番目で表される塩基配列
[68] 3453021番〜 3469366番目で表される塩基配列
[69] 3618576番〜 3636916番目で表される塩基配列
またはそれら DNAに相当する DNAを含む染色体 DNAを有する上記（1)の大腸菌 の変異体、
(3) yafJ遺伝子、 ya!K遺伝子、 yafQ遺伝子、 dinj遺伝子、 ya!L遺伝子、 ya!M遺伝子、 f WA遺伝子、 la!U遺伝子、 dinP遺伝子、 ya!N遺伝子、 yafO遺伝子、 ya!P遺伝子、 JW02 25遺伝子、 priH遺伝子、 ykfl遺伝子、 ya!W遺伝子、 yeeT遺伝子、 yk!G遺伝子、 ya!X 遺伝子、 yk!F遺伝子、 ykffi遺伝子、 ya!Y遺伝子、 ypjK遺伝子、 yafZ遺伝子、 ykfA遺 伝子、 perR遺伝子、 JW0245遺伝子、 JW0246遺伝子、 JW0247遺伝子、 yk! 遺伝子、 JW0249遺伝子、 is5B遺伝子、 yi51遺伝子、 mmuP遺伝子、 mmuM遺伝子、 alUC遺伝 子、 JW0255遺伝子、 insB遺伝子、 insA遺伝子、 JW0258遺伝子、 yagB遺伝子、 yagA 逾 fe子、 yagE¾fc子、 yagF遺 is子、 yagG遺 子、 yagH¾伝子、 yagl遺 子、 argrjA fc子、 yfjl遺 子、 yagj fc子、 yagK¾fc子、 yagL遺伝子、 yagM¾伝子、 yagN遺伝 子、 intF¾fc子、 yagP¾fc子、 yagQ遺 子、 yagR遺 to子、 yag jftizs子、 yagTfcs子 、 yagU¾伝子、 ykgj¾伝子、 yagV¾fe子、 yagW遺 子、 yagX¾伝子、 yagY¾fe子 、 yagZ遺伝子、 ykgK遺伝子、 ykgL遺伝子、 ykgM遺伝子、 eaeH遺伝子、 _JW0292遺伝 子、 JW0293遺伝子、 ykgA遺伝子、 ykgB遺伝子、 ykgl遺伝子、 merA遺伝子、 ykgD遺 子、 ykgt遺 子、 ykgF遺 子、 ykgG¾fc子、 ykgH遺 子、 betA遺伝子、 betB遺 fzs子、 betl¾fc子、 bet 遺 子、 yahA¾f 子、 yahB遺 1zs子、 yahC遺 is子、 yahDM zS 子、 yahE¾fe子、 yahr1遺伝子、 yahG遺 子、 yahH¾fc子、 arcM遺お子、 yahj¾伝 子、 yahK¾fc子、 yahL遺 is子、 yahM遺伝子、 yahN¾fc子、 yahO¾fc子、 prpR遺 is 子、 bcpAjl:伝子、 prpCjAizs子、 prpD遺 子、 prpE遺 is子、 codB遺 子、 codajftizs 子、 cynR¾fe子、 cynT遺 子、 cynS¾fe子、 cynX遺お子、 lacA¾伝子、 lacY¾伝子 、 lacZ遺 子、 lacl¾fe子、 mhpR¾fc子、 mhpA¾fe子、 mhpB遺 is子、 mhpC遺 is子 、 mhpD¾fcナ、 mhprjAizs子、 mhpE¾fcナ、 mhpl JAIZS子、 yaiL¾fcナ、 yaiM遺伝 子、 adhC遺伝子、 yaiN遺伝子、 yaiO遺伝子、 JW0350遺伝子、 yi2A遺伝子、 yi22遺伝 子、 yi24遺伝子、 yi23遺伝子、 yaiP遺伝子、 yaiS遺伝子、 tauA遺伝子、 tauB遺伝子、 t auC遺伝子、 ssiD遺伝子、 yaiT遺伝子、 JW0363遺伝子、 JW0364遺伝子、 yaiU遺伝子 、 yaiV¾fcナ、 ampH遺 子、 sbmA¾fcナ、 yaiW¾fcナ、 yaiY遺 子、 yaiZ¾fe十、 ddlA遺 to子、 yaiB遺伝子、 phoA遺 is子、 psir1遺 is子、 yaiC¾伝子、 ybbO遺伝子、 tes A遺伝子、 ybbA遺伝子、 ybbP遺伝子、 rhsD遺伝子、 ybbC遺伝子、 rhsE遺伝子、 ybb D遺伝子、 _1\^0490遺伝子、 ybbB遺伝子、 ybbS遺伝子、 ybbT遺伝子、 ybbU遺伝子、 y bbQ遺伝子、 ybbV遺伝子、 allP遺伝子、 allA遺伝子、 ybbY遺伝子、 ybbZ遺伝子、 ylb A遺伝子、 aUC遺伝子、 ylbC遺伝子、 fdrA遺伝子、 ylbE遺伝子、 ylbF遺伝子、 arcC遺 伝子、 intD遺伝子、 EXCLLAMBD遺伝子、 VRPP— LAMBD遺伝子、 JW0528遺伝子、 J W0529遺伝子、 VREN丄 AMBD遺伝子、 emrE遺伝子、 ybcK遺伝子、 ybcL遺伝子、 yb cM遺 is子、 ybcN¾fc子、 ninE遺 is子、 ybcO¾fe子、 rus遺 is子、 ybcQjAfe子、 JW0 539.5遺伝子、 nmpC遺伝子、 vlyS遺伝子、 ybcS遺伝子、 ybcT遺伝子、 vboR遺伝子、 y bcV遺伝子、 ybcW遺伝子、 nohB遺伝子、 ybcX遺伝子、 ybcY遺伝子、 _JW0552遺伝子 、 appY¾fe子、 ompT遺 is子、 envY¾伝子、 ybcH遺 子、 nfrA¾伝子、 nfrB¾伝子、 cusS遺 子、 cusR遺 fc 、 cusし遺 、 ylcC遺 子、 cusB遺 子、 cusA遺 子、 ph eP遺伝子、 ybdG遺伝子、 nftiB遺伝子、 ybdF遺伝子、 ybcU遺伝子、 ybdK遺伝子、 hok E¾fe子、 yi81¾fc子、 yi82¾fc子、 ymcC遺 is子、 ymcD遺 is子、 cspH¾fc子、 cspG 逾 fc子、 sfa¾fe子、 yccL遺 is子、 yccM遺 is子、 torS遺 is子、 torT遺伝子、 torR遺 to 子、 torC遺伝子、 torA fc子、 torD遺 is子、 yccD¾fc子、 cbpA遺 is子、 yccEjAfzs子 、 agp遺伝子、 yccj遺伝子、 wrbA遺伝子、 yciG遺伝子、 ycdG遺伝子、 _JW0992遺伝子 、 JW0993遺伝子、 _JW0994遺伝子、 ycdK遺伝子、 _JW0996遺伝子、 _JW0997遺伝子、 y cdC遺伝子、 putA遺伝子、 yzpU遺伝子、 putP遺伝子、 JW1002遺伝子、 ycdO遺伝子 、 ycdB¾伝子、 phoH遺 子、 ycdP遺 子、 ycdQ fc子、 ycdR遺 子、 ycdS遺 子 、 ycdT遺伝子、 JW1012遺伝子、 JW1013遺伝子、 JW1014遺伝子、 ycdU遺伝子、 ymf D遺伝子、 ymffi遺伝子、 lit遺伝子、 intE遺伝子、 VXIS— BPP21遺伝子、 ym!H遺伝子、 ymfl遺伝子、 ymfj遺伝子、 RPC2— BPP22遺伝子、 JW1132遺伝子、 ym!L遺伝子、 ymlM 遺伝子、 ym!N遺伝子、 ym!R遺伝子、 ymfO遺伝子、 JW1138遺伝子、 JW1139遺伝子、 yc!K遺 子、 ymS¾fe子、 ycfA¾fc子、 ycffi遺 is子、 pin遺 is子、 mcrA¾fe子、 JW1 146遺 is子、 ycgW遺 is子、 ycgX遺 is子、 ycgE遺 子、 JW1150¾fc子、 ycgZ¾fc子 、 ymgA遺伝子、 JW1153遺伝子、 ymgC遺伝子、 yahA遺伝子、 JW1156遺伝子、 JW11 57遺伝子、 aidA遺伝子、 ymgD遺伝子、 JW1160遺伝子、 JW1161遺伝子、 JW1162遺 伝子、 yd!H遺伝子、 ydfZ遺伝子、 ydfl遺伝子、 shiA遺伝子、 _JW1537遺伝子、 tnpR遺 伝子、 yd!M遺伝子、 Y314丄 AMBD遺伝子、 nohA遺伝子、 ydfO遺伝子、 yccL遺伝子、 cspl遺伝子、 yd!R遺伝子、 vlyS遺伝子、 cspB遺伝子、 cspF遺伝子、 regQ丄 AMBD遺 伝子、 _JW1552遺伝子、 rem遺伝子、 hokD遺伝子、 relE遺伝子、 relB遺伝子、 ydiVjf 伝子、 flxA遺伝子、 yd!W遺伝子、 yd!X遺伝子、 dicC遺伝子、 sdaC遺伝子、 yqeH遺伝 子、 yqel¾fc子、 yqej¾伝子、 yqeK遺 子、 ygerjlfe子、 ygeG¾伝子、 ygeH¾fc子 、 ygel遺伝子、 JW2822遺伝子、 ygeK遺伝子、 JW2824遺伝子、 JW2825遺伝子、 JW28 30遺伝子、 ygeP遺伝子、 JW2832遺伝子、 nlpD遺伝子、 yagR遺伝子、 ygeT遺伝子、 J W2836¾fc子、 ygeV遺 is子、 ygeW¾fc子、 dpaL遺 is子、 ygeY遺 is子、 ygeZ遺伝子 、 arcL遺伝子、 yqeB遺伝子、 JW2844遺伝子、 ygfj遺伝子、 gltD遺伝子、 JW2847遺伝 子、 yglM遺 子、 yagR fc子、 ygfO遺伝子、 ygff¾fc子、 ygfQ 伝子、 yg!R遺 子 ゝ ygiS遺伝子、 yg! 遺 子、 pbuX遺 子、 idi遺 子、 epsM遺 子、 exeL逾 to子、 exe C遺伝子、 JW2938遺伝子、 JW2939遺伝子、 JW2940遺伝子、 JW2941遺伝子、 yghK 遺伝子、 glcB遺伝子、 glcG遺伝子、 glcF遺伝子、 glcD遺伝子、 glcC遺伝子、 JW2948 逾伝子、 yghQ fc子、 yghR¾伝子、 yghS遺 子、 yghT遺 子、 yihL¾伝子、 yihM 遺伝子、 yihN遺伝子、 yshA遺伝子、 yihO遺伝子、 yihP遺伝子、 yihQ遺伝子、 yihR遺 子、 yihS¾伝子、 yihT遺 is子、 yihU遺 子、 yihV遺 子、 yihW¾伝子、 yihX遺 子、 rbn¾fcナ、 yihZ遺伝子、 yiiD遺 子、 yiiE遺伝子、 yiiF遺伝子、 yiiG¾fcナ、 frvR 逾 fc子、 frvX¾fc子、 frvB¾fc子、 frvA fc子、 yiiL¾伝子、 rhaD遺 is子、 rhaA¾伝 子、 rhaB遺伝子、 rhaS遺伝子、 rhaR遺伝子、 rhaT遺伝子、 ptsA遺伝子、 JW3920遺伝 子、 frwC遺伝子、 frwB遺伝子、 pflD遺伝子、 pflC遺伝子、 frwD遺伝子、 yijO遺伝子、 y ijP遺伝子、 _JW3986遺伝子、 yjbF遺伝子、 yjbG遺伝子、 yjbH遺伝子、 JW3989.5遺伝 子、 yjbA遺 子、 xylE遺伝子、 malG遺 is子、 malF¾fe子、 malE遺 is子、 malK fc子 、 lamB遺 子、 malM遺 子、 yjbl遺 子、 yjcP¾伝子、 yjcQ遺 子、 yjcR¾fc子、 yj cS¾伝子、 alsK¾fe子、 alsE¾fe子、 alsC¾fc子、 alsA¾fc子、 alsB¾fc子、 phnQ 逾 fc子、 phnP遺 is子、 phnO遺 子、 phnN遺伝子、 phnM遺 is子、 phnL¾fc子、 phn K遺伝子、 phnj遺 is子、 phnl遺 is子、 phnH遺 is子、 phnG遺伝子、 phnF遺 ナ、 phnE 遺伝子、 phnD遺伝子、 phnC遺伝子、 phnB遺伝子、 phnA遺伝子、 yjdA遺伝子および yjcZ遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体 DNAを有する上記（1)ま たは（2)の大腸菌の変異体、
(4)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜[18]記載の塩基配列を有す る DNA、
[I]塩基番号 243965番〜 253410番目で表される塩基配列、
[2]塩基番号 261964番〜 387531番目で表される塩基配列、
[3]塩基番号 389139番〜 403703番目で表される塩基配列、
[4]塩基番号 518030番〜 532711番目で表される塩基配列、
[5]塩基番号 535505番〜 550215番目で表される塩基配列、
[6]塩基番号 563941番〜 608118番目で表される塩基配列、
[7]塩基番号 1048888番〜 1097019番目で表される塩基配列、
[8]塩基番号 1198106番〜 1225146番目で表される塩基配列、
[9]塩基番号 1630912番〜 1641038番目で表される塩基配列、
[10]塩基番号 1642632番〜 1650222番目で表される塩基配列、
[I I]塩基番号 2985362番〜 3033128番目で表される塩基配列、
[ 12]塩基番号 3110110番〜 3134341番目で表される塩基配列、
[13]塩基番号 4059898番〜 4079659番目で表される塩基配列、
[14]塩基番号 4086451番〜 4099982番目で表される塩基配列、
[15]塩基番号 4139232番〜 4149709番目で表される塩基配列、
[16]塩基番号 4235359番〜 4251735番目で表される塩基配列、
[17]塩基番号 4298977番〜 4311511番目で表される塩基配列、および
[18]塩基番号 4313318番〜 4329721番目で表される塩基配列、
またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する上記（1)〜（3) のいずれか 1つの大腸菌の変異体、
(5) yidF¾fc子、 yidG¾fc子、 yidH¾fc子、 yidl遺 子、 yidj遺伝子、 yidK遺 子、 y idL遺伝子、 _JW3657遺伝子、 glvG遺伝子、 glvB遺伝子、 glvC遺伝子、 yidP遺伝子、 yi dE遺伝子、 yidQ遺 十、 yidR遺伝子、 yidS遺伝子、 dgoT遺伝子、 dgoA遺 十、 dgo K遺伝子、 dgoR遺伝子、 yidW遺伝子、 yidX遺伝子、 yidA遺伝子、 yidB遺伝子、 asnA 遺伝子、 yieM遺伝子、 JW3724遺伝子、 yieN遺伝子、 kup遺伝子、 rbsD遺伝子、 rbsA 遺伝子、 rbsC遺伝子、 rbsB遺伝子、 rbsK遺伝子、 rbsR遺伝子および yieO遺伝子、ま たはそれらの相同遺伝子を含まな 、染色体 DNAを有する上記（1)〜 (4)の 、ずれ か 1つの大腸菌の変異体、
(6)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜 [3]記載の塩基配列を有する DNA、
[1]塩基番号 3854662番〜 3865831番目で表される塩基配列、
[2]塩基番号 3867102番〜 3877010番目で表される塩基配列、および
[3]塩基番号 3926659番〜 3938878番目で表される塩基配列、
またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する上記（1)〜（5) のいずれか 1つの大腸菌の変異体、
(7) yecT遺伝子、 flhE遺伝子、 flhA遺伝子、 flhB遺伝子、 cheZ遺伝子、 cheY遺伝子、 cheB遺伝子、 cheR遺伝子、 tap遺伝子、 tar遺伝子、 cheW遺 1ZS子、 cheA¾fe子、 mot B遺伝子、 motA遺伝子、 flhC遺伝子、 flhD遺伝子、 JW1882遺伝子、 JW1883遺伝子、 yecG遺 、 otsA¾fcナ、 otsB遺 is子、 araH遺 is子、 araG遺 is子、 araF¾fzsナ、 ye cl遺伝子、 yecj遺伝子、 JW1892遺伝子、 ftn遺伝子、 yecH遺伝子、 tyrP遺伝子、 uvrC 逾 ナ、 uvrY¾fcナ、 yecF¾fe十、 sdiAjA伝子、 yecC逾 to子、 yecS遺 1ZS子、 yedO 遺伝子、 fliY遺伝子、 fliZ遺伝子、 fliA遺伝子、 fliC遺伝子、 fliD遺伝子、 fliS遺伝子、 Hi T遺 子、 amyA¾伝十、 yedD¾fcナ、 yedE¾fcナ、 yedF¾fcナ、 yedK¾fcナ、 yed L遺伝子、 yedN遺伝子、 yedM遺伝子、 fliE遺伝子、 fliF遺伝子、 fliG遺伝子、 fliH遺伝 子、 flil遺伝子、 11U遺伝子、 fliK遺伝子、 fliL遺伝子、 fliM遺伝子、 fliN遺伝子、 fliO遺 伝子、 fliP遺伝子、 fliQ遺伝子、 fliR遺伝子、 rcsA遺伝子、 dsrB遺伝子、 JW1937遺伝 子、 yedA fc子、 vsr¾fe子、 dcm¾fc子、 yedj遺 is子、 JW1946¾fc子、 ompC遺 is 子、 JW1948遺伝子、 yedS遺伝子、 yedU遺伝子、 yedV遺伝子、 copR遺伝子、 yedX遺 伝子、 JW1954遺伝子、 JW1955遺伝子、 JW1956遺伝子、 JW1974遺伝子、 JW1979遺 伝子、 JW1980遺伝子、 yeeP遺伝子、 flu遺伝子、 JW1983遺伝子、 yeeS遺伝子、 yeeU 遺伝子、 yeeV遺伝子、 yeeW遺伝子、 yelj遺伝子、 JW2013遺伝子、 yelj遺伝子、 yefl 遺伝子、 wbb_J遺伝子、 ye!G遺伝子、 rfc遺伝子、 glf遺伝子、 rlbX遺伝子、 rlbC遺伝子 、 ri A遺伝子、 ri D遺伝子および ri B遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まな V、染色体 DNAを有する上記（1)〜（6)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体、
(8)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜 [5]記載の塩基配列を有する DNA、
[1]塩基番号 1964524番〜 1993075番目で表される塩基配列、
[2]塩基番号 1996662番〜 2028209番目で表される塩基配列、
[3]塩基番号 2033449番〜 2044376番目で表される塩基配列、
[4]塩基番号 2069149番〜 2081926番目で表される塩基配列、および
[5]塩基番号 2104393番〜 2116064番目で表される塩基配列、
またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する上記（1)〜（7) のいずれか 1つの大腸菌の変異体、
(9) intA遺伝子、 yfjH遺伝子、 alpA遺伝子、 yfll遺伝子、 _JW2606遺伝子、 yftj遺伝子、 yfj'K遺伝子、 yflL遺伝子、 yflM遺伝子、 yflN遺伝子、 yflO遺伝子、 yflP遺伝子、 yflQ遺 fc子、 yfjR遺 子、 ypjK¾伝子、 yfjS遺 子、 yfjT遺伝子、 yfjU¾伝子、 yfjV fc子、 y fjV遺伝子、 JW2622遺伝子、 遺伝子、 JW2623.5遺伝子、 yfjX遺伝子、 yfjY遺伝子 、 yfjZ遺伝子、 ypjF遺伝子、 ypjA遺伝子、 JW2629遺伝子、 JW2630遺伝子、 JW2631 遺伝子、 JW2632遺伝子、 JW2633遺伝子、 JW2634遺伝子、 ygaE遺伝子、 yzzM遺伝 子、 yqaE遺伝子、 JW2642遺伝子、 ygaP遺伝子、 stpA遺伝子、 JW2645遺伝子、 ygaC 逾 fc子、 ygaM¾fe子、 nrdH遺 is子、 nrdl遺伝子、 nrdE¾伝子、 proV遺 is子、 proW 遺伝子、 proX遺伝子、 _JW2655遺伝子、 _JW2656遺伝子、 ygaZ遺伝子、 ygaH遺伝子、 srlA遺伝子、 srlB遺伝子、 srlD遺伝子、 gutM遺伝子、 srlR遺伝子および gutQ遺伝子
、またはそれらの相同遺伝子を含まな！/ヽ染色体 DNAを有する上記（ 1)〜（8)の ヽず れか 1つの大腸菌の変異体、
(10)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜[4]記載の塩基配列を有す る DNA、
[1]塩基番号 2755677番〜 2789480番目で表される塩基配列、 [2]塩基番号 2795174番〜 2800890番目で表される塩基配列、
[3]塩基番号 2804308番〜 2810147番目で表される塩基配列、および
[4]塩基番号 2825314番〜 2830262番目で表される塩基配列、
またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する上記（1)〜（9) のいずれか 1つの大腸菌の変異体、
(11) gltF遺伝子、 yhcA遺伝子、 yhcD遺伝子、 yhcE遺伝子、 yhcF遺伝子、 yhcG遺伝 子、 yhcH遺伝子、 nanK遺伝子および nanE遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含 まない染色体 DN Aを有する上記（1)〜（10)のいずれか 1つの大腸菌の変異体、
(12) 配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 3360737番〜 3370547番目で表 される塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな 、染色体 DNAを有する上記（1)〜（11)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体、
(13) yegE遺伝子、 alkA遺伝子、 yegD遺伝子、 JW2055遺伝子、 JW2056遺伝子、 J W2057遺伝子、 JW2058遺伝子、 yegM遺伝子、 yegN遺伝子、 yegO遺伝子、 yegB遺 伝子、 baeS遺伝子、 baeR遺伝子、 JW2065遺伝子、 yegQ遺伝子、 ogrK遺伝子、 JW20 68遺伝子、 JW2069遺伝子、 yegS遺伝子、 gatR遺伝子、 JW2072遺伝子、 JW2073遺伝 子、 gatR遺 子、 gatD遺 子、 gatC遺 子、 gatB遺 子、 gatA遺 子、 gatZ遺 子
、 gatY遺 子、 I aB遺 子、 xegT遺 子、 yegU¾伝子、 yegV遺 子、 yegW¾伝子、 yegX遺 子、 molR¾伝子、 yehl遺 子、 yehK¾伝子、 yehL¾fc子、 yehO遺 子、 y ehP¾fe子、 yehQ¾伝子、 yehR遺 is子、 yehS¾伝子、 yeh 遺 子、 yehU¾fe子、 ye hV遺伝子、 yehW遺伝子、 yehX遺伝子、 yehY遺伝子、 yehZ遺伝子、 bglX遺伝子、 did 逾 fcナ、 pbpG fe十、 yohC¾伝子、 yeiQ feナ、 yeiR遺 is卞、 yeiU遺 子、 spr遺 fc子、 rtn遺 子、 yejA遺 子、 yejB遺 子、 yejE¾fc子、 yej jftis子、 yejG¾fc子 、 bcr¾伝子、 rsuA feナ、 yejH遺 is子、 yeil¾fc十、 yeij遺伝子、 yeiK¾fe十、 yeiL 遺伝子、 yeiM遺伝子、 yeiN遺伝子および yeiC遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を 含まない染色体 DNAを有する上記（1)〜（12)のいずれか 1つの大腸菌の変異体、
(14)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜[4]記載の塩基配列を有す る DNA、
[1]塩基番号 2146264番〜 2187855番目で表される塩基配列、 [2]塩基番号 2200669番〜 2229850番目で表される塩基配列、
[3]塩基番号 2270440番〜 2286588番目で表される塩基配列、および
[4]塩基番号 2255895番〜 2263491番目で表される塩基配列、
またはそれら DNAに相当する DNAを含まな ヽ染色体 DNAを有する上記（ 1)〜（ 1
3)のいずれか 1つの大腸菌の変異体、
( 15) cmtA遺伝子および cmtB遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まな!/、染色体 DNAを有する上記（1)〜（14)のいずれか 1つの大腸菌の変異体、
(16)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 3077085番〜 3078916番目で表 される塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな 、染色体 DNAを有する上記（1)〜（15)のいずれか 1つの大腸菌の変異体、
(17) intB遺伝子、 JW4228遺伝子、 yjgW遺伝子、 yjgX遺伝子、 yjgY遺伝子、 yjgZ遺 伝子、 yi41遺伝子、 yi42遺伝子、 yjhB遺伝子、 yjhC遺伝子、 yjhD遺伝子、 yjhE遺伝子 、 yi91遺伝子、 JW4244遺伝子、 JW4245遺伝子、 JW4246遺伝子、 yjhU遺伝子、 yjhF 逾伝子、 yjhG遺 is子、 yjhH遺 子、 yjhl遺 子、 sgcR¾伝子、 sgcE遺 子、 sgcA遺 伝子、 sgcQ遺伝子、 sgcC遺伝子、 JW4266.5遺伝子、 sgcX遺伝子、 yjhP遺伝子、 yjh Q遺伝子、 JW4269.5遺伝子、 JW4270遺伝子、 JW4270.5遺伝子、 yjhR遺伝子、 yjhS 逾 fc子、 yjhT遺 is子、 yjhA遺 is子、 fimB遺 is子、 fimE¾伝子、 fimA¾fc子、 fiml遺 is 子、 fimC遺伝子、 fimD遺伝子、 fimF遺伝子、 fimG遺伝子、 fimH遺伝子、 gntP遺伝子、 uxuA¾伝子、 uxuB¾fc子、 uxuR遺 子、 yjiC¾伝子、 yjiD遺 子、 yjiE遺 子、 iad A遺伝子、 yjiG遺伝子、 yjiH遺伝子、 yjil遺伝子、 yjij遺伝子、 yjiK遺伝子、 JW4296.5 逾伝子、 yjiLiK伝子、 yjiM遺 子、 yjiN遺 子、 yjiO遺 is子、 yjiP遺 is子、 yjiQ 伝子 、 yjiR遺 ナ、 yjiS遺 is子、 yjil JAIZS子、 yjiV遺 ナ、 mcrD¾fcナ、 mcrC¾fcナ、 mcr B遺伝子、 yjiW遺伝子、 hsdS遺伝子、 hsdM遺伝子、 hsdR遺伝子、 mrr遺伝子、 yjiA遺 伝子、 yjiX遺伝子、 yjiY遺伝子、 tsr遺伝子、 yjjL遺伝子、 _JW4320遺伝子、 yjjM遺伝子 、 yjjN遺伝子、 mdoB遺伝子および yjjA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まな
V、染色体 DNAを有する上記（1)〜（16)の!、ずれか 1つの変異体、
(18)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]または [2]記載の塩基配列を 有する DNA、 [1]塩基番号 4496202番〜 4509534番目で表される塩基配列、および
[2]塩基番号 4517876番〜 4599637番目で表される塩基配列、
またはそれら DNAに相当する DNAを含まな ヽ染色体 DNAを有する上記（ 1)〜（ 1
7)のいずれか 1つの大腸菌の変異体、
(19) kdpF遺伝子、 ybfA遺伝子、 rhsC遺伝子、 JW0690遺伝子、 ybffi遺伝子、 rhsA遺 伝子、 ybfC遺伝子、 yb!D遺伝子、 yb!L遺伝子、 yb!D遺伝子および ybgA遺伝子、また はそれらの相同遺伝子を含まな 、染色体 DNAを有する上記（1)〜（18)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体、
(20)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 728821番〜 739593番目で表され る塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNA を有する上記（1)〜（19)のいずれか 1つの大腸菌の変異体、
(21) yjfl遺伝子、 yjfj遺伝子、 yj!K遺伝子、 yj!L遺伝子、 yj!M遺伝子、 yjfC遺伝子、 aid B遺伝子、 yjlN遺伝子、 yjfO遺伝子、 yjlP遺伝子、 yjlQ遺伝子、 yjlR遺伝子、 sgaT遺伝 子、 sgaB遺伝子、 sgaA遺伝子、 sgaH遺伝子および sgaU遺伝子、またはそれらの相同 遺伝子を含まな 、染色体 DNAを有する上記（1)〜（20)の 、ずれか 1つの大腸菌の 変異体、
(22)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 4409533番〜 4423151番目で表 される塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな 、染色体 DNAを有する上記（1)〜（21)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体、
をあげることができる。
また、本発明の大腸菌の変異体としては、
(23)上記（1) [1]記載の遺伝子、 spr遺伝子、 bcr遺伝子および rsuA遺伝子、または それらの相同遺伝子を含み、かつ野生型の大腸菌の染色体 DNAより 933kbp以上 短 、染色体 DNAを有する大腸菌の変異体、
であれば、野生型の大腸菌の染色体 DNA上に存在する上記遺伝子または該遺伝 子の相同遺伝子以外の!/ヽずれの遺伝子を含まな!/ヽ染色体 DNAを有する該変異体 であってもよぐ好ましくは、表 1中の Δ43領域に含まれる遺伝子以外の遺伝子を含 まない染色体 DNAを有する該変異体、より好ましくは表 1中の Δ43領域に対応する 塩基配列からなる DNAまたは該 DNAに相当する DNA以外の DNAを含まな!/ヽ染 色体 DNAを有する該変異体、さらに好ましくは、
(24)上記（2)の [1]〜 [55]記載の塩基配列を有する DNAおよび配列番号 1で表さ れる塩基配列中の塩基番号 2270440番〜 2286588番目で表される塩基配列を有する DNA、またはそれら DNAに相当する DNAを含む染色体 DNAを有する上記（23) の大腸菌の変異体、
(25) yafJ遺伝子、 ya!K遺伝子、 ya!Q遺伝子、 dinj遺伝子、 ya!L遺伝子、 ya!M遺伝子 、 IhiA遺伝子、 la!U遺伝子、 dinP遺伝子、 ya!N遺伝子、 yafO遺伝子、 ya!P遺伝子、 JW 0225遺伝子、 priH遺伝子、 ykfl遺伝子、 ya!W遺伝子、 yeeT遺伝子、 yk!G遺伝子、 yaf X遺伝子、 yk!F遺伝子、 ykffi遺伝子、 ya!Y遺伝子、 ypjK遺伝子、 ya!Z遺伝子、 ykfA遺 伝子、 perR遺伝子、 JW0245遺伝子、 JW0246遺伝子、 JW0247遺伝子、 yk! 遺伝子、 JW0249遺伝子、 is5B遺伝子、 yi51遺伝子、 mmuP遺伝子、 mmuM遺伝子、 alUC遺伝 子、 JW0255遺伝子、 insB遺伝子、 insA遺伝子、 JW0258遺伝子、 yagB遺伝子、 yagA 逾 fe子、 yagE¾fc子、 yagF遺 is子、 yagG遺 子、 yagH¾伝子、 yagl遺 子、 argrjA fc子、 yfjl遺 子、 yagj fc子、 yagK¾fc子、 yagL遺伝子、 yagM¾伝子、 yagN遺伝 子、 intF¾fc子、 yagP¾fc子、 yagQ遺 子、 yagR遺 to子、 yag jftizs子、 yagTfcs子 、 yagU¾伝子、 ykgj¾伝子、 yagV¾fe子、 yagW遺 子、 yagX¾伝子、 yagY¾fe子
、 yagZ遺伝子、 ykgK遺伝子、 ykgL遺伝子、 ykgM遺伝子、 eaeH遺伝子、 _JW0292遺伝 子、 JW0293遺伝子、 ykgA遺伝子、 ykgB遺伝子、 ykgl遺伝子、 merA遺伝子、 ykgD遺 子、 ykgt遺 子、 ykgF遺 子、 ykgG¾fc子、 ykgH遺 子、 betA遺伝子、 betB遺 fzs子、 betl¾fc子、 bet 遺 子、 yahA¾f 子、 yahB遺 1zs子、 yahC遺 is子、 yahDM zS 子、 yahE¾fe子、 yahr1遺伝子、 yahG遺 子、 yahH¾fc子、 arcM遺お子、 yahj¾伝 子、 yahK¾fc子、 yahL遺 is子、 yahM遺伝子、 yahN¾fc子、 yahO¾fc子、 prpR遺 is 子、 bcpAjl:伝子、 prpCjAizs子、 prpD遺 子、 prpE遺 is子、 codB遺 子、 codajftizs 子、 cynR¾fe子、 cynT遺 子、 cynS¾fe子、 cynX遺お子、 lacA¾伝子、 lacY¾伝子 、 lacZ遺 子、 lacl¾fe子、 mhpR¾fc子、 mhpA¾fe子、 mhpB遺 is子、 mhpC遺 is子 、 mhpD¾fcナ、 mhprjAizs子、 mhpE¾fcナ、 mhpl JAIZS子、 yaiL¾fcナ、 yaiM遺伝 子、 adhC遺伝子、 yaiN遺伝子、 yaiO遺伝子、 JW0350遺伝子、 yi2A遺伝子、 yi22遺伝 子、 yi24遺伝子、 yi23遺伝子、 yaiP遺伝子、 yaiS遺伝子、 tauA遺伝子、 tauB遺伝子、 t auC遺伝子、 ssiD遺伝子、 yaiT遺伝子、 JW0363遺伝子、 JW0364遺伝子、 yaiU遺伝子 、 yaiV¾fcナ、 ampH遺 子、 sbmA¾fcナ、 yaiW¾fcナ、 yaiY遺 子、 yaiZ¾fe十、 ddlA遺 to子、 yaiB遺伝子、 phoA遺 is子、 psir1遺 is子、 yaiC¾伝子、 ybbO遺伝子、 tes A遺伝子、 ybbA遺伝子、 ybbP遺伝子、 rhsD遺伝子、 ybbC遺伝子、 rhsE遺伝子、 ybb D遺伝子、 _1\^0490遺伝子、 ybbB遺伝子、 ybbS遺伝子、 ybbT遺伝子、 ybbU遺伝子、 y bbQ遺伝子、 ybbV遺伝子、 allP遺伝子、 allA遺伝子、 ybbY遺伝子、 ybbZ遺伝子、 ylb A遺伝子、 aUC遺伝子、 ylbC遺伝子、 fdrA遺伝子、 ylbE遺伝子、 ylbE遺伝子、 ylbE遺 伝子、 ylbF遺伝子、 arcC遺伝子、 intD遺伝子、 EXO— LAMBD遺伝子、 VRPP— LAMBD 遺伝子、 JW0528遺伝子、 JW0529遺伝子、 VREN丄 AMBD遺伝子、 emrE遺伝子、 ybc K遺 is子、 ybcL¾伝子、 ybcM¾伝子、 ybcN遺伝子、 ninE遺 子、 ybcO遺 is子、 rus 遺伝子、 ybcQ遺伝子、 JW0539.5遺伝子、 nmpC遺伝子、 vlyS遺伝子、 ybcS遺伝子、 y bcT¾fc子、 vboR遺 子、 ybcV遺 is子、 ybcW遺 is子、 nohB¾fc子、 ybcX¾伝子、 y bcY遺伝子、 JW0552遺伝子、 appY遺伝子、 ompT遺伝子、 envY遺伝子、 ybcH遺伝子 、 nfrA¾fe十、 nfrB遺 is 、 cusS¾fcナ、 cusR¾伝子、 cusC¾伝十、 ylcCjAizs子、 cu sB¾fc子、 cusA遺 is子、 pheP¾fc子、 ybdG¾fe子、 nfnB遺 子、 ybdF¾伝子、 ybd J遺伝子、 ybdK遺伝子、 hokE遺伝子、 yi81遺伝子、 yi82遺伝子、 ymcC遺伝子、 ymcD 逾 ナ、 cspH遺 is 、 cspG遺 is子、 sfajAizs子、 yccL遺 子、 yccM遺 子、 torSM fzs子、 tori遺 is子、 torR遺 is子、 torC¾fc子、 torA¾fzs子、 torD遺 is子、 yccDM zs 、 cbpA fcナ、 ycc 遑 to子、 agp¾fc十、 yccj¾fcナ、 wrbA¾伝子、 yciG¾feナ 、 ycdG遺伝子、 JW0992遺伝子、 JW0993遺伝子、 JW0994遺伝子、 ycdK遺伝子、 JW0 996遺伝子、 JW0997遺伝子、 ycdC遺伝子、 putA遺伝子、 yzpU遺伝子、 putP遺伝子、 JW1002遺伝子、 ycdO遺伝子、 ycdB遺伝子、 phoH遺伝子、 ycdP遺伝子、 ycdQ遺伝 子、 ycdR遺伝子、 ycdR遺伝子、 ycdS遺伝子、 ycdT遺伝子、 JW1012遺伝子、 JW1013 遺伝子、 JW1014遺伝子、 ycdU遺伝子、 ym!D遺伝子、 ymffi遺伝子、 lit遺伝子、 intE 遺伝子、 VXIS— BPP21遺伝子、 ym!H遺伝子、 ymfl遺伝子、 ymfj遺伝子、 RPC2— BPP22 遺伝子、 JW1132遺伝子、 ym!L遺伝子、 ym!M遺伝子、 ym!N遺伝子、 ymlR遺伝子、 ym fO遺伝子、 JW1138遺伝子、 JW1139遺伝子、 yc!K遺伝子、 ymS遺伝子、 ycfA遺伝子 、 ycffi遺 to子、 pin遺伝子、 mcrA遺 is子、 JW1146遺伝子、 ycgW遺伝子、 ycgX遺 十 、 ycgE遺伝子、 JW1150遺伝子、 ycgZ遺伝子、 ymgA遺伝子、 JW1153遺伝子、 ymgC 遺伝子、 yahA遺伝子、 JW1156遺伝子、 JW1157遺伝子、 aidA遺伝子、 ymgD遺伝子、 JW1160遺伝子、 JW1161遺伝子、 JW1162遺伝子、 yd!H遺伝子、 ydfZ遺伝子、 ydfl遺 伝子、 shiA遺伝子、 JW1537遺伝子、 tnpR遺伝子、 yd!M遺伝子、 Y314丄 AMBD遺伝 子、 nohA fe子、 ydfO遺 子、 yccL¾fc子、 cspl¾fc子、 ydfR¾fe子、 vlyS¾fc子 、 cspB遺伝子、 cspF遺伝子、 regQ丄 AMBD遺伝子、 JW1552遺伝子、 rem遺伝子、 ho kD遺伝子、 relE遺伝子、 relB遺伝子、 yd!V遺伝子、 flxA遺伝子、 yd!W遺伝子、 yd!X ¾fcナ、 dicCjAizs子、 sdaC fc十、 yqeH¾伝子、 yqel¾伝子、 yqej¾fc十、 yqeK遺 fc子、 ygeF fc子、 ygeG fc子、 ygeH¾fc子、 ygel遺 子、 JW2822遺 子、 ygeK 遺伝子、 JW2824遺伝子、 JW2825遺伝子、 JW2830遺伝子、 ygeP遺伝子、 JW2832遺 伝子、 nlpD遺伝子、 yagR遺伝子、 ygeT遺伝子、 JW2836遺伝子、 ygeV遺伝子、 ygeW ¾fc子、 dpaL遺 子、 ygeY遺 is子、 ygeZ遺伝子、 arcL遺 is子、 yqeB遺 is子、 JW284 4遺伝子、 yglj遺伝子、 gltD遺伝子、 _JW2847遺伝子、 yg!M遺伝子、 yagR遺伝子、 ygf 0遺伝子、 yg!P遺伝子、 ygfQ遺伝子、 yg!R遺伝子、 ygS遺伝子、 ygfT遺伝子、 pbuX 遺伝子、 idi遺伝子、 epsM遺伝子、 exeL遺伝子、 exeC遺伝子、 JW2938遺伝子、 JW29 39遺伝子、 JW2940遺伝子、 JW2941遺伝子、 yghK遺伝子、 glcB遺伝子、 glcG遺伝子 、 glcF遺伝子、 glcD遺伝子、 glcC遺伝子、 JW2948遺伝子、 yghQ遺伝子、 yghR遺伝 子、 yghS遺 is子、 yghT遺 is子、 yihL遺伝子、 yihM遺 子、 yihN遺 子、 yshA遺伝子 、 yihO遺伝子、 yihP遺 is子、 yihQ遺 子、 yihR遺 子、 yihS¾fc子、 yihT遺伝子、 yi hU遺 is子、 yihV遺 is子、 yihW遺 子、 yihX遺伝子、 rbn¾伝子、 yihZ¾fe子、 yiiD遺 子、 yiiE¾fe子、 yii 遺 to子、 yiiG遺伝子、 frvR遺 is子、 frvX遺 is子、 frvB遺 is子、 f rvA¾izs子、 yiiL遺 1ZS子、 rhaD¾fc子、 rhaA遺伝子、 rhaB遺 1ZS子、 rhaS遺 1ZS子、 rhaR 遺伝子、 rhaT遺伝子、 ptsA遺伝子、 JW3920遺伝子、 frwC遺伝子、 frwB遺伝子、 pflD 遺伝子、 pflC遺伝子、 frwD遺伝子、 yijO遺伝子、 yijP遺伝子、 _JW3986遺伝子、 yjbF遺 伝子、 yjbG遺伝子、 yjbH遺伝子、 _JW3989.5遺伝子、 yjbA遺伝子、 xylE遺伝子、 malG 逾 fc子、 mal 遺 子、 malE¾fc子、 malK遺 子、 lamB¾fe子、 malM¾fc子、 yjbl遺 fc子、 yjcP遺 子、 yjcQ遺 子、 yjcR遺 子、 yjcS¾伝子、 alsK遺 子、 alsE遺 子 、 alsC遺 子、 alsA遺伝子、 alsB遺伝子、 phnQ遺 is子、 phnP遺伝子、 phnO遺伝子、 phnN遺伝子、 phnM遺伝子、 phnL遺伝子、 phnK遺 is子、 phnj遺伝子、 phnl遺伝子、 p hnH遺伝子、 phnG遺伝子、 phnF遺伝子、 phnE遺伝子、 phnD遺伝子、 phnC遺伝子、 phnB遺伝子、 phnA遺伝子、 yjdA遺伝子、 yjcZ遺伝子、 yidF遺伝子、 yidG遺伝子、 yid H遺伝子、 yidl遺伝子、 yidj遺伝子、 yidK遺伝子、 yidL遺伝子、 JW3657遺伝子、 glvG 遺伝子、 glvB遺伝子、 glvC遺 is子、 yidP遺伝子、 yidE遺伝子、 yidQ遺伝子、 yidR遺 伝子、 yidS遺伝子、 dgoT遺伝子、 dgoA遺 to子、 dgoK遺伝子、 dgoR遺伝子、 yidW遺 伝子、 yidX遺伝子、 yidA遺伝子、 yidB遺伝子、 asnA遺伝子、 yieM遺伝子、 JW3724遺 子、 yieN遺 is子、 kup¾fc子、 rbsD遺 is子、 rbsA¾伝子、 rbsC遺 is子、 rbsB遺 is 子、 rbsK遺伝子、 rbsR遺伝子、 yieO遺伝子、 yecT遺伝子、 flhE遺伝子、 flhA遺伝子、 flhB¾fc子、 cheZ遺 is子、 cheY¾fe子、 cheB¾伝子、 cheR遺 is子、 tap遺 is子、 tar 遺伝子、 cheW遺伝子、 cheA遺伝子、 motB遺伝子、 motA遺伝子、 flhC遺伝子、 HhD 遺伝子、 JW1882遺伝子、 JW1883遺伝子、 yecG遺伝子、 otsA遺伝子、 otsB遺伝子、 a raH遺伝子、 araG遺伝子、 araF遺伝子、 yecl遺伝子、 yecj遺伝子、 JW1892遺伝子、 ft n¾fcナ、 yecH遺 is 、 tyrP遺伝子、 uvrC遺 子、 uvrY遺 子、 yecF遺 子、 sdiA 遺伝子、 yecC遺伝子、 yecS遺伝子、 yedO遺伝子、 fliY遺伝子、 fliZ遺伝子、 fliA遺伝 子、 fliC遺伝子、 fliD遺伝子、 fliS遺伝子、 fliT遺伝子、 amyA遺伝子、 yedD遺伝子、 ye dE¾fc子、 yedF遺 is子、 yed 遺 is子、 yedL¾fe子、 yedN遺 子、 yedM遺 is子、 Hi E遺伝子、 fliF遺伝子、 fliG遺伝子、 fliH遺伝子、 flil遺伝子、 HU遺伝子、 fliK遺伝子、 Hi L遺伝子、 fliM遺伝子、 fliN遺伝子、 fliO遺伝子、 fliP遺伝子、 fliQ遺伝子、 fliR遺伝子、 res A遺 to子、 dsrB¾fc子、 J W1937遺伝子、 yedA遺 1ZS子、 vsr遺 1ZS子、 dcm遺 1ZS子、 y edj遺伝子、 JW1946遺伝子、 ompC遺伝子、 JW1948遺伝子、 yedS遺伝子、 yedU遺伝 子、 yedV遺伝子、 copR遺伝子、 yedX遺伝子、 JW1954遺伝子、 JW1955遺伝子、 JW1 956遺伝子、 JW1974遺伝子、 JW1979遺伝子、 JW1980遺伝子、 yeeP遺伝子、 flu遺伝 子、 JW1983遺 子、 yeeS遺 子、 yeeT¾fc子、 yeeU¾伝子、 yeeV遺伝子、 yeeW遺 伝子、 yelj遺伝子、 _JW2013遺伝子、 yelj遺伝子、 yefl遺伝子、 wbb_J遺伝子、 yefG遺伝 子、 rfc遺伝子、 glf遺伝子、 ri X遺伝子、 ri C遺伝子、 ri A遺伝子、 ri D遺伝子、 rlbB 遺伝子、 intA遺伝子、 yflH遺伝子、 alpA遺伝子、 yfll遺伝子、 _JW2606遺伝子、 yfjj遺 伝子、 yfjK遺伝子、 yflL遺伝子、 yfjM遺伝子、 yflN遺伝子、 yflO遺伝子、 yfjP遺伝子、 yfjQ遺伝子、 yfjR遺伝子、 ypjK遺伝子、 yfjS遺伝子、 yfjT遺伝子、 yfjU遺伝子、 yfjV遺 伝子、 JW2622遺伝子、 遺伝子、 JW2623.5遺伝子、 yfjX遺伝子、 yfjY遺伝子、 yfjZ 遺伝子、 ypjF遺伝子、 ypjA遺伝子、 JW2629遺伝子、 JW2630遺伝子、 JW2631遺伝子 、 JW2632遺伝子、 JW2633遺伝子、 JW2634遺伝子、 ygaE遺伝子、 yzzM遺伝子、 yqa E遺伝子、 _JW2642遺伝子、 ygaP遺伝子、 stpA遺伝子、 _JW2645遺伝子、 ygaC遺伝子 、 ygaM遺 is子、 nrdH¾fc子、 nrdl¾fe子、 nrdE遺 is子、 proV¾伝子、 proW¾伝子、 proX遺伝子、 JW2655遺伝子、 JW2656遺伝子、 ygaZ遺伝子、 ygaH遺伝子、 srlA遺伝 子、 srlB遺伝子、 srlD遺伝子、 gutM遺伝子、 srlR遺伝子、 gutQ遺伝子、 gltF遺伝子、 yhcA遺伝子、 yhcD¾fc子、 yhc 遺 子、 yhct遺伝子、 yhcF遺 子、 yhcG¾fc子、 y hcH遺 子、 nanK¾fe子、 nan 遺 is子、 yegE¾fc子、 alkA遺 is子、 yegD¾fe子、 J W2055遺伝子、 JW2056遺伝子、 JW2057遺伝子、 JW2058遺伝子、 yegM遺伝子、 yeg N遺伝子、 yegO遺伝子、 yegB遺伝子、 baeS遺伝子、 baeR遺伝子、 JW2065遺伝子、 y egQ遺伝子、 ogrK遺伝子、 JW2068遺伝子、 JW2069遺伝子、 yegS遺伝子、 gatR遺伝 子、 JW2072遺伝子、 JW2073遺伝子、 gatR遺伝子、 gatD遺伝子、 gatC遺伝子、 gatB 逾 fe子、 gatA fc子、 gatZ¾伝子、 gat Y遺伝子、 I aB遺 子、 xegT遺伝子、 yegUM 子、 yegV遺伝子、 yegW¾fc子、 yegX遺 is子、 molR遺 is子、 yehl遺 is子、 yehK遺 子、 yehL遺 is子、 yeh。¾伝子、 yehP¾fc子、 yehQ遺 子、 yehR遺伝子、 yehS遺 子、 yehT¾伝子、 yehU遺お子、 yehV遺 is子、 yehW遺 is子、 yehX¾fc子、 yehY遺 子、 yehZ遺伝子、 bglX¾fc子、 dld¾fc子、 pbpG¾fe子、 yohC¾伝子、 yeil遺 is 子、 yeiJiK伝子、 yeiK遺 子、 yeiL遺 子、 yeiM遺伝子、 yeiN遺 子、 yeiC遺 子、 cmtA遺伝子、 cmtB遺伝子、 intB遺伝子、 _JW4228遺伝子、 yjgW遺伝子、 yjgX遺伝子 、 yjgY遺 fc子、 yjgZ遺 子、 yi41¾伝子、 yi42遺 子、 yjhB遺 子、 yjhC遺 子、 yjh D遺伝子、 yjhE遺伝子、 yi91遺伝子、 _JW4244遺伝子、 _JW4245遺伝子、 _JW4246遺伝 子、 yjhU fc子、 yjhF遺 is子、 yjhG遺 子、 yjhH¾伝子、 yjhl¾伝子、 sgcR遺 子、 sgcE遺 子、 sgcAjAfe子、 sgcQ fe子、 sgcC遺 子、 JW4266.5 伝子、 sgcX遺 is 子、 yjhP遺伝子、 yjhQ遺伝子、 JW4269.5遺伝子、 JW4270遺伝子、 JW4270.5遺伝子 、 yjhR遺 is子、 yjhS fc子、 yjhT¾伝子、 yjhA¾伝子、 fimB遺 子、 finrn遺 子、 fim A遺伝子、 fiml遺伝子、 fimC遺 ナ、 fimD遺伝子、 fimF遺伝子、 fimG遺伝子、 fimH遺 伝子、 gntP遺伝子、 uxuA遺伝子、 uxuB遺伝子、 uxuR遺伝子、 yjiC遺伝子、 yjiD遺伝 子、 yjiE遺 is子、 iadA fc子、 yjiG遺 子、 yjiH遺 子、 yjil¾伝子、 yjij遺 子、 yjiK 遺伝子、 JW4296.5遺伝子、 yjiL遺伝子、 yjiM遺伝子、 yjiN遺伝子、 yjiO遺伝子、 yjiP 逾伝子、 yjiQ遺 子、 yjiR遺 子、 yjiS fc子、 yjiT遺 子、 yjiV遺 子、 mcrD遺 子、 mcrし遺 1zs子、 mcrBMfe
子、 yjiW遺 子、 hsdS fe子、 hsdM¾伝子、 hsdR遺 is子、 mrr遺伝子、 yjiA遺 is子、 yjiX遺伝子、 yjiY遺伝子、 tsr遺伝子、 yjjL遺伝子、 _JW4320遺伝子、 yjjM遺伝子、 yjjN 遺伝子、 mdoB遺伝子、 yjjA遺伝子、 kdpF遺伝子、 ybfA遺伝子、 rhsC遺伝子、 JW069 0遺伝子、 ybffi遺伝子、 rhsA遺伝子、 yb! 遺伝子、 yb!L遺伝子、 yb!D遺伝子、 ybgA 遺伝子、 yjfl遺伝子、 yjlj遺伝子、 yj!K遺伝子、 yj!L遺伝子、 yj!M遺伝子、 yjfC遺伝子、 aidB遺伝子、 yj!N遺伝子、 yjfO遺伝子、 yj!P遺伝子、 yj!Q遺伝子、 yj!R遺伝子、 sgaT 遺伝子、 sgaB遺伝子、 sgaA遺伝子、 sgaH遺伝子、 sgaU遺伝子、 rhsB遺伝子、 JW344 8遺伝子、 yhhH遺伝子、 yibA遺伝子、 yhhl遺伝子、 yhhj遺伝子、 yhiH遺伝子、 yhil遺 伝子、 yhij遺伝子、 yhiK遺伝子、 yhiL遺伝子、 yhiM遺伝子、 yhiN遺伝子、 JW0782遺 子、 ybiA fc子、 dinG遺 子、 ybiB¾fc子、 ybiC¾fe子、 ybij遺 子、 ybil遺 子 、 ybiX遺 子、 ybiL遺 子、 ybiM遺 子、 ybiN遺 子、 ybiO遺 子、 glnQ遺 子、 gl nP遺伝子、 glnH遺伝子、 yliA遺伝子、 yliB遺伝子、 yliC遺伝子、 yliD遺伝子、 JW0817 遺伝子、 JW0818遺伝子、 yliG遺伝子、 yliH遺伝子、 ylil遺伝子、 ylij遺伝子、 dacC遺 子、 deoR遺 is子、 ybjG遺 is子、 ybjC遺 is子、 mdaA¾fc子、 rimK遺 子、 ybjNM 子、 potF遺 is子、 potG遺 is子、 potH遺 is子、 potl遺 子、 ybjO遺 is子、 ybjFMfc 子、 artj¾fc子、 artM遺伝子、 artQ¾伝子、 artl遺 is子、 artP遺 is子、 ybjP遺 is子、 J W0850遺伝子、 JW0851遺伝子、 JW0852遺伝子、 ybjT遺伝子および ItaA遺伝子、ま たはそれらの相同遺伝子を含まな！/ヽ染色体 DNAを有する上記（23)または（24)の いずれか 1つの大腸菌の変異体、
(26)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜 [43]記載の塩基配列を有す る DNA、
[1]塩基番号 243965番〜 253410番目で表される塩基配列、 [2]塩基番号 261964番〜 387531番目で表される塩基配列、 [3]塩基番号 389139番〜 403703番目で表される塩基配列、 [4]塩基番号 518030番〜 532711番目で表される塩基配列、 [5]塩基番号 535505番〜 550215番目で表される塩基配列、 [6]塩基番号 563941番〜 608118番目で表される塩基配列、 [7]塩基番号 728821番〜 739593番目で表される塩基配列、 [8]塩基番号 832552番〜 848089番目で表される塩基配列、 [9]塩基番号 867638番〜 883473番目で表される塩基配列、 [10]塩基番号 890998番〜 909379番目で表される塩基配列、 [11]塩基番号 1048888番〜 1097019番目で表される塩基配列、 [12]塩基番号 1198106番〜 1225146番目で表される塩基配列、 [13]塩基番号 1630912番〜 1641038番目で表される塩基配列、 [14]塩基番号 1642632番〜 1650222番目で表される塩基配列、 [15]塩基番号 1964524番〜 1993075番目で表される塩基配列、 [16]塩基番号 1996662番〜 2028209番目で表される塩基配列、 [17]塩基番号 2033449番〜 2044376番目で表される塩基配列、 [18]塩基番号 2069149番〜 2081926番目で表される塩基配列、 [19]塩基番号 2104393番〜 2116064番目で表される塩基配列、 [20]塩基番号 2146264番〜 2187855番目で表される塩基配列、 [21]塩基番号 2200669番〜 2229850番目で表される塩基配列、 [22]塩基番号 2255895番〜 2263491番目で表される塩基配列、 [23]塩基番号 2755677番〜 2789480番目で表される塩基配列、 [24]塩基番号 2795174番〜 2800890番目で表される塩基配列、 [25]塩基番号 2804308番〜 2810147番目で表される塩基配列、 [26]塩基番号 2825314番〜 2830262番目で表される塩基配列、 [27]塩基番号 2985362番〜 3033128番目で表される塩基配列、 [28]塩基番号 3077085番〜 3078916番目で表される塩基配列、 [29]塩基番号 3110110番〜 3134341番目で表される塩基配列、 [30]塩基番号 3360737番〜 3370547番目で表される塩基配列、
[31]塩基番号 3618576番〜 3636916番目で表される塩基配列、
[32]塩基番号 3854662番〜 3865831番目で表される塩基配列、
[33]塩基番号 3867102番〜 3877010番目で表される塩基配列、
[34]塩基番号 3926659番〜 3938878番目で表される塩基配列、
[35]塩基番号 4059898番〜 4079659番目で表される塩基配列、
[36]塩基番号 4086451番〜 4099982番目で表される塩基配列、
[37]塩基番号 4139232番〜 4149709番目で表される塩基配列、
[38]塩基番号 4235359番〜 4251735番目で表される塩基配列、
[39]塩基番号 4298977番〜 4311511番目で表される塩基配列、
[40]塩基番号 4313318番〜 4329721番目で表される塩基配列、
[41]塩基番号 4409533番〜 4423151番目で表される塩基配列、
[42]塩基番号 4496202番〜 4509534番目で表される塩基配列、および
[43]塩基番号 4517876番〜 4599637番目で表される塩基配列、
またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する上記（23)〜（
25)のいずれか 1つの大腸菌の変異体、
(27) ygiS遺伝子、 ygiT遺伝子、 ygiU遺伝子、 JW2991遺伝子、 ygiW遺伝子、 ygiX遺 伝子、 ygiY遺伝子、 ygiZ遺伝子、 mdaB遺伝子および ygiN遺伝子、またはそれらの相 同遺伝子を含まな ヽ染色体 DNAを有する上記（23)〜（26)の ヽずれか 1つの大腸 菌の変異体、
(28)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 3165628番〜 3172940番目で表 される塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな 、染色体 DNAを有する上記（23)〜（27)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体、
(29) ybeL遺伝子、 ybeQ遺伝子、 ybeR遺伝子、 ybeS遺伝子、 ybeT遺伝子、 ybeU遺 伝子、 ybeV遺伝子、 ybeW遺伝子、 ybeK遺伝子、 gltL遺伝子、 gltK遺伝子、 glU遺伝 子、 ybej遺伝子および JW0651遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色 体 DNAを有する上記（23)〜（28)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体、
(30)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 675104番〜 689374番目で表され る塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNA を有する上記（23)〜（29)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体、
(31) yfcC遺伝子、 JW2296遺伝子、 yfcE遺伝子、 yfcF遺伝子、 yfcG遺伝子、 folX遺伝 子、 JW2301遺伝子、 yfcl遺伝子、 hisP遺伝子、 hisM遺伝子、 hisQ遺伝子、 hisj遺伝子 、 argT遺伝子、 yfdB遺伝子、 JW2346遺伝子、 yfdH遺伝子、 JW2348遺伝子、 yfdK遺 伝子、 yfdL遺伝子、 yfdM遺伝子、 xylU遺伝子、 yfdN遺伝子、 yfdO遺伝子、 _JW2356遺 伝子、 JW2357遺伝子、 JW2358遺伝子、 JW2359遺伝子、 JW2360遺伝子、 JW2378遺 伝子、 yqhT遺伝子、 ptwC遺伝子および ptwB遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を 含まな 、染色体 DNAを有する上記（23)〜（30)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体
(32)配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [ 1]〜 [3]記載の塩基配列を有す る DNA、
[1]塩基番号 2423365番〜 2434098番目で表される塩基配列、
[2]塩基番号 2472852番〜 2482482番目で表される塩基配列、および
[3]塩基番号 2505075番〜 2514557番目で表される塩基配列、
またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する上記（23)〜（
31)のいずれか 1つの大腸菌の変異体、
(33) pinO遺 子、 gspA遺伝子、 gspC¾fc子、 gspD遺 子、 gsp 遺 子、 hofF遺 子、 ho!G遺 子、 hofH遺 子、 gspl¾fc子、 gspj遺伝子、 gspK¾fc子、 gspL¾fc子 、 pshM遺伝子、 ho!D遺伝子、 bfr遺伝子、 yheA遺伝子および chiA遺伝子、またはそ れらの相同遺伝子を含まな！/ヽ染色体 DNAを有する上記（23)〜（32)の ヽずれか 1 つの大腸菌の変異体、
(34)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 3453021番〜 3469366番目で表 される塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな 、染色体 DNAを有する上記（23)〜（33)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体、
(35) elaB遺伝子、 elaA遺伝子、 elaC遺伝子、 elaD遺伝子、 ylbK遺伝子、 ylbL遺伝子 、 yl M遺伝子、 yl N遺伝子、 JW2269遺伝子および JW2270遺伝子、またはそれらの 相同遺伝子を含まな ヽ染色体 DNAを有する上記（23)〜（34)の!ヽずれか 1つの大 腸菌の変異体、
(36)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 2386262番〜 2395471番目で表 される塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな 、染色体 DNAを有する上記（23)〜（35)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体、
(37) yhdJ遺伝子、 yhdU遺伝子、 envR遺伝子、 acrE遺伝子、 envD遺伝子、 yhdV遺伝 子、 yhdW遺伝子、 yhdX遺伝子および yhdY遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含 まな 、染色体 DNAを有する上記（23)〜（36)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体、
(38)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 3411160番〜 3420878番目で表 される塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな 、染色体 DNAを有する上記（23)〜（37)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体、
(39) chpA遺伝子、またはその相同遺伝子を含まな!/ヽ染色体 DNAを有する上記（2 3)〜（38)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体、
(40)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 2910274番〜 2910573番目で表 される塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな 、染色体 DNAを有する上記（23)〜（39)の!、ずれか 1つの大腸菌の変異体、
(41) lhuA遺伝子、 IhuC遺伝子、 IhuD遺伝子および I uB遺伝子、またはそれらの相 同遺伝子を含まな ヽ染色体 DNAを有する上記（23)〜（40)の ヽずれか 1つの大腸 菌の変異体、
(42)配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 167065番〜 172979番目で表され る塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNA を有する上記（23)〜 (41)の 、ずれか 1つの大腸菌の変異体、
をあげることができる。
[表 1] 表 1
Figure imgf000071_0001
1-1] 表 1 (続き)
Figure imgf000072_0001
1-2] 表 1 〔続き)
Figure imgf000073_0001
1-3] 表 1 〔続き)
Figure imgf000074_0001
ト4] 表 1 (続き)
Figure imgf000075_0001
1-5] 表 1 〔続き)
Figure imgf000076_0001
1-6] 表 1 (続き)
Figure imgf000077_0001
1-7] 表 1 (続き)
Figure imgf000078_0001
1-8] 表 1 (続き)
Figure imgf000079_0001
1-9] 表 1 〔続き)
Figure imgf000080_0001
1-10] 表 1 (続き)
Figure imgf000081_0001
1-11] 表 1 (続き）
Figure imgf000082_0001
1-12] 表 1 〔続き)
Figure imgf000083_0001
1-13] 表 1 (続き)
Figure imgf000084_0001
1-14] 表 1 (続き)
Figure imgf000085_0001
1-15] 表 1 (続き
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号〔相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0464(hemH) 496943 497905
JW0465(aes) 相補鎖 497902 498861
JW0466(gsk) 499013 500317
JW0467(ybaL) 相補鎖 500450 502126
JW0468(fsr) 相補鎖 502364 503584
JW0469(ushA) 503802 505454
JW0470(ybaK) 相補鎖 505491 505970
JW0471 (ybaP) 相補鎖 506174 506968
JW0472(ybaQ) 507106 507447
JW0473(ybaR) 相補鎖 507763 510267
JW0474(ybaS) 510529 511461
JW0475(ybaT) 51 1464 512756
JW0476(cueR) 512881 513288
JW0477(ybbJ) 相補鎖 513289 513747
JW0478(ybbK) 相補鎖 513744 514661
JW0479(ybbL) 514807 515484
JW0480(ybbM) 515444 516250
JW0481 (ybbN) 相補鎖 516313 517203
JW0482(ybbO) 相補鎖 517228 518037
JW0483(tesA) 相補鎖 518027 518653
JW0484(ybbA) 518621 519307
JW0485(ybbP) 519304 521718
JW0486(rhsD) 522149 526429
JW0487(ybbC) 526469 526837
JW0488(rhsE) 526837 527547
JW0489(ybbD) 527528 527788
JW0490(156#1 ) 相補鎖 528533 528904
JW0491 (ybbB) 相補鎖 529020 530114
JW0492(ybbS) 相補鎖 530183 531109
JW0493(ybbT) 531339 531821
JW0494(ybbU) 531899 532714 1-16] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kさわ番号（相補鎖にコ ~ さわ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0495(gcl) 532804 534585
JW0496(gip) 534598 535374
JW0497(ybbQ) 535474 536352
JW0498(ybbV) 536384 536662
JW0499(allP) 536521 537975
JW0500(allA) 538035 539396
JW0501 (ybbY) 539453 540754
JW0502(ybbZ) 540776 541921
JW0503(ylbA) 相補鎖 542149 542934
JW0504(allC) 相補鎖 542945 544180
JW0505(ylbC) 相補鎖 544202 545251
JW0506(fdrA) 545568 547235
JW0507(ylbE) 547245 547505
JW0508(ylbE) 547502 548503
JW0509(ylbF) 54851 549329
JW0510(arcC) 549326 550219
JW0511 (purK) 相補鎖 550414 551481
JW0512(purE) 相補鎖 551478 551987
JW0513(ybbF) 相補鎖 552105 552827
JW0514(ppiB) 相補鎖 552830 553324
JW0515(cysS) 553498 554883
JW0516(ybcI) 相補鎖 55491 9 555440
JW0517(ybcJ) 相補鎖 555548 555814
JW0518(folD) 相補鎖 555762 556628
JW0519(sfmA) 557099 557641
JW0520(sfmC) 557861 558553
JW0521 (sfmD) 558584 561 187
JW0522(sfmH) 561076 562206
JW0523(sfmF) 562091 562732
JW0524(fimZ) 相補鎖 562735 563430
JW0525(intD) 相補鎖 563702 564865 1-17] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0526(EXO.LAMBD) 相補鎖 564985 565248
JW0527(VRPP_LAMBD) 565338 565574
JW0528(159#4) 565729 566028
JW0529(159#5) 566025 566891
JW0530(VREN.LAMBD) 566949 567134
JW0531 (emrE) 567202 567534
JW0532(ybcK) 567789 56931 5
JW0533(ybcL) 569780 570331
JW0534(ybcM) 570341 571 138
JW0535(ybcN) 571353 571808
JW0536(ninE) 571808 571978
JW0537(ybcO) 571971 572261
JW0538(rus) 572258 572620
JW0539(ybcQ) 572843 573226
JW0539.5(1 60#10) 573368 573586
JW0540(is5B) 相補鎖 573624 574640
JW0541 (yi51 ) 573960 574328
JW0542(nmpC) 相補鎖 574645 57571 2
JW0543(vlyS) 576285 576500 漏 544(ybcS) 576500 576997
JW0545(ybcT) 576982 577455
JW0546(vboR) 相補鎖 577487 577780 漏 547(ybcV) 相補鎖 578071 578604
JW0548(ybcW) 578767 578973
JW0549(nohB) 579721 580266
JW0550(ybcX) 580241 580984
JW0551 (ybcY) 相補鎖 581039 581623
JW0552(161 #0.2) 581762 581947
JW0553(appY) 582568 58331 7
JW0554(ompT) 相補鎖 583567 584520
JW0555(envY) 相補鎖 585034 585795 1-18] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0556(ybcH) 相補鎖 585978 586868
JW0557(nfrA) 相補鎖 586869 589841
JW0558(nfrB) 相補鎖 589828 592065
JW0559(cusS) 相補鎖 59221 5 593669
JW0560(cusR) 相補鎖 593647 594330
JW0561 (cusC) 594487 595860
JW0562(ylcC) 596018 596350
JW0563(cusB) 596366 597589
JW0564(cusA) 597601 600744
JW0565(pheP) 600846 602222
JW0566(ybdG) 相補鎖 602303 603550
JW0567(nfnB) 相補鎖 603658 60431 1
JW0568(ybdF) 相補鎖 604405 604884
JW0569(ybdJ) 相補鎖 604838 605086
JW0570(ybdK) 相補鎖 605152 606270
JW0571 (hokE) 606624 606875
JW0572(yi81 ) 606952 608064
JW0573(yi82) 相補鎖 607376 607684
JW0574(entD) 相補鎖 608346 6091 1 6
JW0575(fepA) 相補鎖 609141 61 1441
JW0576(fes) 61 1702 612826
JW0577(164#9) 612829 613047
JW0578(entF) 613044 616925
JW0579(fepE) 617141 618274
JW0580(fepC) 相補鎖 618271 619086
JW0581 (fepG) 相補鎖 619083 620075
JW0582(fepD) 相補鎖 620072 621076
JW0583(ybdA) 621 187 622437
JW0584(fepB) 相補鎖 622441 623397
JW0584.5(1 65#7) 相補鎖 623401 623607
JW0585(entC) 623772 624947 1-19] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0586(entE) 624957 626567
JW0587(entB) 626581 627438
JW0588(entA) 627438 628184
JW0589(ybdB) 628187 628600
JW0590(cstA) 628781 630886
JW0591 (ybdD) 631069 631266
JW0592(ybdH) 相補鎖 631276 632364
JW0593(ybdL) 632473 633633
JW0594(ybdm) 相補鎖 633634 634263
JW0595(ybdN) 相補鎖 634236 635456
JW0596(ybdO) 相補鎖 635603 636505
JW0597(dsbG) 相補鎖 636714 637460
JW0598(ahpC) 637832 638395
JW0599(ahpF) 638640 640205
JW0600(ybdQ) 相補鎖 640326 640754
JW0601 (ybdR) 640975 642213
JW0602(rnk) 相補鎖 642444 642854
JW0603(rna) 相補鎖 643084 643890
JW0604(citT) 相補鎖 644004 645467
JW0605(citG) 相補鎖 645518 646396
JW0606(citX) 相補鎖 646371 646922
JW0607(citF) 相補鎖 646926 648500
JW0608(citE) 相補鎖 648469 649377
JW0609(citD) 相補鎖 649374 649670
JW0610(citC) 相補鎖 649685 650743
JW0611 (citA) 651122 652780
JW0612(citB) 652749 653429
JW0613(dcuC) 相補鎖 653470 653946
JW0614(is5B) 653909 654925
JW0615(yi51 ) 相補鎖 654221 654589
JW0616(dcuC) 相補鎖 654963 656054 1-20] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κさ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0617(crcA) 656643 657203
JW0618(cspE) 657378 657587
JW0619(crcB) 相補鎖 657641 658024
JW0620(ybeH) 658117 658344
JW0621 (ybeM) 658341 658904
JW0622(ybeC) 659033 659236
JW0623(lipA) 相補鎖 659337 660302
JW0624(ybeF) 相補鎖 66051 1 661464
JW0625(lipB) 相補鎖 661723 662298
JW0626(ybeD) 相補鎖 662465 662728
JW0627(dacA) 相補鎖 662838 664049
JW0628(rlpA) 相補鎖 664188 665276
JW0629(mrdB) 相補鎖 665287 666399
JW0630(mrdA) 相補鎖 666402 668303
JW0631 (ybeA) 相補鎖 668334 668801
JW0632(ybeB) 相補鎖 668805 669014
JW0633(phpB) 相補鎖 669382 669993
JW0634(nadD) 相補鎖 670017 670658
JW0635(holA) 相補鎖 670660 671691
JW0636(rlpB) 相補鎖 671691 672272
JW0637(leuS) 相補鎖 672287 674869
JW0638(ybeL) 675104 675586
JW0639(ybeQ) 相補鎖 675656 676639
JW0640(ybeR) 676797 677504
JW0641 (ybeS) 677501 678928
JW0642(ybeT) 相補鎖 678938 679492
JW0643(ybeU) 679594 680301
JW0644(ybeV) 680298 681749
JW0645(ybeW) 相補鎖 681809 683479
JW0646(ybeK) 相補鎖 683563 684498
JW0647(gltL) 相補鎖 684616 685341 1-21] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κさ； h る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0648(gltK) 相補鎖 685341 686015
JW0649(gltJ) 相補鎖 686015 686755
JW0650(ybeJ) 相補鎖 686925 687908
JW0651 (171 #0.1 ) 687884 688045
JW0652(is5B) 相補鎖 688083 689099
JW0653(yi51 ) 688419 688787
JW0654(lnt) 相補鎖 689429 690967
JW0655(ybeX) 相補鎖 690992 691870
JW0656(ybeY) 相補鎖 691960 692427
JW0657(phoL) 相補鎖 692424 693503
JW0658(yleA) 相補鎖 693617 695041
JW0659(ubiF) 695187 696362
JW0660(asnB) 相補鎖 697599 699263
JW0661 (nagD) 相補鎖 699660 700412
JW0662(nagC) 相補鎖 700460 701680
JW0663(nagA) 相補鎖 701689 702837
JW0664(nagB) 相補鎖 702897 703697
JW0665(nagE) 704030 705976
JW0666(glnS) 706179 707843
JW0667(ybfM) 708420 709826
JW0668(ybf ) 709876 710202
JW0669(fur) 相補鎖 710286 710732
JW0670(ybfJ) 710777 711031
JW0671 (fldA) 相補鎖 711021 711551
JW0672(ybfE) 相補鎖 711691 712053
JW0673(ybfF) 相補鎖 712124 712888
JW0674(seqA) 713073 713618
JW0675(pgm) 713644 715284
JW0676(ybfP) 715498 715992
JW0677(ybfG) 相補鎖 716033 716395
JW0678(ybfH) 相補鎖 716474 716791 1-22] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0679(potE) 相補鎖 717032 718351
JW0680(speF) 相補鎖 718348 720546
JW0681 (ybfK) 720669 720926
JW0682(kdpE) 相補鎖 721142 721744
JW0683(kdpD) 相補鎖 721816 724500
JW0684(kdpC) 相補鎖 724493 725065
JW0685(kdpB) 相補鎖 725074 727122
JW0686(kdpA) 相補鎖 727145 728818
JW0687(kdpF) 相補鎖 728818 728907
JW0688(ybfA) 729220 729426
JW0689(rhsC) 729669 733862
JW0690(174#4.1 ) 相補鎖 732195 732614
JW0691 (ybfB) 733862 734188
JW0692(rhsA) 734306 735739
JW0693(ybfC) 735736 736305
JW0694(ybfD) 736531 736785
JW0695(ybfL) 736986 738047
JW0696(ybfD) 738178 738939
JW0697(ybgA) 739087 739596
JW0698(phrB) 739593 74101 1
JW0699(ybgH) 相補鎖 741161 742642
JW0700(ybgI) 742913 743656
JW0701 (ybgJ) 743679 744335
JW0702(ybgK) 744329 745261
JW0703(ybgL) 745251 745985
JW0704(end8) 746021 746812
JW0705(abrB) 相補鎖 746809 747900
JW0706(ybgO) 相補鎖 748007 749095
JW0707(ybgP) 相補鎖 749065 749793
JW0708(ybgQ) 相補鎖 749808 752306
JW0709(ybgD) 相補鎖 752315 752881 1-23] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0710(gltA) 相補鎖 753271 754554
JW071 1 (sdhC) 755263 755652
JW0712(sdhD) 755646 755993
JW0713(sdhA) 755993 757759
JW0714(sdhB) 757775 758491
JW0715(sucA) 758792 761593
JW0716(sucB) 761608 762825
JW0717(sucC) 763100 764266
JW0718(sucD) 764266 765135
JW0719(farR) 相補鎖 765239 765961
JW0720(hrsA) 766070 768046
JW0721 (ybgB) 768064 770697
JW0722(cydA) 771544 7731 1 2
JW0723(cydB) 773128 774267
JW0724(ybgT) 774282 774395
JW0725(ybgE) 774395 774688
JW0726(ybgC) 774838 775242
JW0727(tolQ) 775239 775931
JW0728(tolR) 775935 776363
JW0729(tolA) 776428 777693
JW0730(tolB) 777823 7791 18
JW0731 (pal) 779153 779674
JW0732(ybgF) 779684 780475
JW0733(nadA) 782171 783214
JW0734(pnuC) 783252 783971
JW0735(czcD) 相補鎖 783968 784909
JW0736(ybgS) 相補鎖 785023 785403
JW0737(aroG) 78571 9 786771
JW0738(gpmA) 相補鎖 786929 787681
JW0739(galM) 相補鎖 787883 788923
JW0740(galK) 相補鎖 78891 7 790065 1-24] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号〔相補鎖にコ ~ され番号〔相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0741 (galT) 相補鎖 790069 791 1 1 5
JW0742(galE) 相補鎖 791 125 792141
JW0743(modF) 相補鎖 792402 793874
JW0744(modE) 相補鎖 793942 794730
JW0745(180#2) 794853 795008
JW0746(modA) 795175 795948
JW0747(modB) 795948 796637
JW0748(modC) 796640 797698
JW0749(ybhA) 相補鎖 797699 79851 7
JW0750(ybhE) 798672 799667
JW0751 (ybhD) 相補鎖 799708 800724
JW0752(ybhH) 800845 801897
JW0753(ybhI) 801973 803406
JW0754(ybhJ) 803586 805850
JW0755(ybhC) 相補鎖 806084 807367
JW0756(ybhB) 相補鎖 80751 9 807995
JW0757(bioA) 相補鎖 808054 809343
JW0758(bioB) 809430 810470
JW0759(bioF) 810467 81 1621
JW0760(bioC) 81 1608 812363
JW0761 (bioD) 812356 813033
JW0762(uvrB) 81361 2 815633
JW0763(ybhK) 相補鎖 815825 816733
JW0764(moaA) 817130 8181 1 9
JW0765(moaB) 818141 818653
JW0766(moaC) 818656 819141
JW0767(moaD) 819134 819379
JW0768(moaE) 819381 819833
JW0769(ybhL) 819970 820674
JW0770(ybhM) 820879 821592
JW0771 (ybhN) 相補鎖 821628 822584 1-25] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ さわ番号（相補鎖にコ ~Κさ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0772(ybhO) 相補鎖 822584 823825
JW0773(ybhP) 相補鎖 823822 824583
JW0774(ybhQ) 824716 825126
JW0775(ybhR) 相補鎖 825088 825900
JW0776(ybhR) 相補鎖 825837 826193
JW0777(ybhS) 相補鎖 826204 827337
JW0778(yhiG) 相補鎖 827330 829081
JW0779(yhiI) 相補鎖 829059 830057
JW0780(ybiH) 相補鎖 830057 830728
JW0781 (rhlE) 830957 832321
JW0782(204#3.1 ) 832420 832566
JW0783(ybiA) 相補鎖 832553 833035
JW0784(dinG) 833155 835305
JW0785(ybiB) 835333 836295
JW0786(ybiC) 836436 837521
JW0787(ybiJ) 相補鎖 837750 838010
JW0788(ybiI) 相補鎖 838275 838541
JW0789(ybiX) 相補鎖 838615 839328
JW0790(ybiL) 相補鎖 839334 841616
JW0791 (ybiM) 相補鎖 841881 842285
JW0792(ybiN) 842336 843343
JW0793(ybiO) 相補鎖 843340 845700
JW0794(glnQ) 相補鎖 845826 846548
JW0795(glnP) 相補鎖 846545 847204
JW0796(glnH) 相補鎖 847343 848089
JW0797(dps) 相補鎖 848493 848996
JW0798(ybiF) 相補鎖 849295 850182
JW0799(ompX) 850535 851050
JW0800(ybiP) 相補鎖 851099 852682
JW0801 (206#8) 853268 853735
JW0802(ybiR) 853732 854850 1-26] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κさ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0803(yibS) 相補鎖 854909 855829
JW0804(ybiT) 856048 857640
JW0805(ybiU) 相補鎖 857881 859146
JW0806(ybiV) 相補鎖 859298 860113
JW0807(ybiW) 相補鎖 860259 862691
JW0808(ybiY) 相補鎖 862697 863623
JW0809(mipB) 863655 864389
JW0810(moeB) 相補鎖 864465 865214
JW0811 (moeA) 相補鎖 865214 866449
JW0812(ybiK) 866653 867618
JW0813(yliA) 867497 869476
JW0814(yl旧） 869241 871034
JW0815(yliC) 871052 871972
JW0816(yliD) 871975 872886
JW0817(209#3) 873064 875412
JW0818(209#4) 875420 876748
JW0819(yliG) 相補鎖 876795 878120
JW0820(yliH) 878333 878716
JW0821 (yliI) 878827 879942
JW0822(yliJ) 相補鎖 879939 880565
JW0823(dacC) 880812 882014
JW0824(deoR) 相補鎖 882061 882819
JW0825(ybjG) 相補鎖 882877 883488
JW0826(mdfA) 883758 884990
JW0827(ybjH) 相補鎖 885031 885315
JW0828(210#3) 相補鎖 885401 886219
JW0829(210#4) 相補鎖 886216 887424
JW0830(210#5) 887478 888044
JW0831 (210#6) 相補鎖 888219 889904
JW0832(ybjM) 890174 890551
JW0833(grxA) 相補鎖 890581 890838 1-27] 表 l (続き）
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0834(ybjC) 890998 891285
JW0835(mdaA) 891269 891991
JW0836(rimK) 892052 892954
JW0837(ybjN) 893042 893518
JW0838(potF) 893869 894981
JW0839(potG) 894995 896209
JW0840(potH) 89621 9 897172
JW0841 (potI) 897169 898014
JW0842(ybjO) 898074 898562
J画 43(ybjF) 898603 899730
JW0844(artJ) 相補鎖 899929 900660
JW0845(ar M) 相補鎖 900951 901619
JW0846(artQ) 相補鎖 90161 9 902335
JW0847(ar I) 相補鎖 902342 903073
JW0848(artP) 相補鎖 903091 903819
JW0849(ybjP) 相補鎖 904037 904552
J画 50(211 #9) 904678 905001
JW0851 (211 #10) 904998 905828
J画 52(211 #11 ) 相補鎖 905825 906874
JW0853(ybjT) 相補鎖 906937 908442
JW0854(ltaA) 相補鎖 908378 909379
JW0855(poxB) 相補鎖 90941 6 911134
JW0856(ybjV) 相補鎖 911267 912241
JW0857(ybjW) 相補鎖 912247 913899
JW0858(ybjE) 相補鎖 91 043 914942
JW0859(aqpZ) 相補鎖 915437 916132
JW0860(ybjD) 916558 918216
JW0861 (ybjX) 相補鎖 918213 919205
JW0862(213#3) 919320 920435
J画 63(ybjZ) 920432 922378
JW0864(cspD) 相補鎖 922451 922675 1-28] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ さ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0865(ylaJ) 922998 923318
JW0866(clpA) 923349 925625
JW0867(infA) 相補鎖 926310 926528
JW0868(aat) 相補鎖 926813 927517
JW0869(cydC) 相補鎖 927559 929280
JW0870(cydD) 相補鎖 929281 931047
JW0871 (trxB) 相補鎖 931170 932135
JW0872(lrp) 932680 933174
JW0873(ftsK) 933309 937298
JW0874(lolA) 937454 938068
JW0875(ycaJ) 938079 939422
JW0876(serS) 939513 940805
JW0877(dmsA) 941131 943488
JW0878(dmsB) 943499 944116
JW0879(dmsC) 944118 944981
JW0880(ycaC) 相補鎖 945016 945642
JW0881 (ycaD) 945956 947104
JW0882(yjeM) 947122 948744
JW0883(ycaN) 相補鎖 948745 949653
JW0884(ycaK) 949753 950343
JW0885(pflA) 相補鎖 950425 951165
JW0886(pflB) 相補鎖 951357 953639
JW0887(focA) 相補鎖 953694 954551
JW0888(ycaO) 相補鎖 954957 956717
JW0889(ycaP) 956847 957539
JW0890(serC) 957738 958826
JW0891 (aroA) 958897 960180
JW0892(ycaL) 960349 961113
JW0893(cmk) 961286 961969
JW0894(rpsA) 962080 963753
JW0895(himD) 963913 964197 1-29] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0896(ycaI) 964327 966669
JW0897(msbA) 966706 968454
JW0898(lpxK) 968451 969437
JW0899(ycaQ) 969474 970706
JW0900(ycaR) 970758 970940
JW0901 (kdsB) 970937 971683
JW0902(218#5) 971837 972730
JW0903(ycbC) 相補鎖 972707 973486
JW0904(smtA) 973622 974407
JW0905(mukF) 974404 975726
JW0906(kicA) 975734 97641 1
JW0907(mukB) 97641 1 980871
JW0908(ycbB) 981 132 982979
JW0909(ycbK) 983160 983708
JW0910(ycbL) 983735 984382
JW091 1 (aspC) 相補鎖 984604 985794
JW0912(ompF) 相補鎖 985979 987067
JW0913(asnS) 相補鎖 987670 989070
JW0914(pncB) 相補鎖 989239 990441
JW0915(pepN) 990707 99331 9
JW0916(ssuB) 相補鎖 993362 994129
JW0917(ssuC) 相補鎖 994126 994962
JW0918(ssuD) 相補鎖 994928 996073
JW0919(ssuA) 相補鎖 996070 997029
JW0920(ssuE) 相補鎖 997022 997597
JW0921 (ycbQ) 997944 998492
JW0922(ycbR) 998575 999276
JW0923(ycbS) 999301 1001901
JW0924(ycbT) 1001892 1002962
JW0925(221 #10) 1002974 1003516
JW0926(221 #1 1 ) 1003476 1004039 1-30] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0927(ycbF) 1004005 1004742
JW0928(pyrD) 1004853 1005863
JW0929(ycbW) 1006001 1006579
JW0930(221 #15) 相補鎖 1006576 1007643
JW0931 (ycbY) 1007929 1010037
JW0932(uup) 1010049 101 1956
JW0933(pqiA) 1012086 1013339
JW0934(pqiB) 1013344 1014984
JW0935(ymbA) 1014981 1015544
JW0936(rmf) 1015800 1015967
JW0937(fabA) 相補鎖 1016037 1016555
JW0938(222#8) 相補鎖 1016624 1018384
JW0939(ycbG) 1018570 1019022
JW0940(ompA) 相補鎖 1019098 1020138
JW0941 (sulA) 相補鎖 1020495 1021004
JW0942(yccR) 1021223 1021852
JW0943(yccS) 相補鎖 1021815 1023977
JW0944(yccF) 相補鎖 1023987 1024433
JW0945(helD) 1024556 1026610
JW0946(mgsA) 相補鎖 1026642 1027109
JW0947(223#9) 相補鎖 10271 96 1027858
JW0948(223#10) 1027977 1028444
JW0949(yccV) 相補鎖 1028489 1028857
JW0950(yccW) 相補鎖 1028864 1030054
JW0951 (acyP) 1029936 1030427
JW0952(yccK) 相補鎖 1030424 1030753
JW0953(yccA) 相補鎖 1030844 1031503
JW0953.5(224#4) 相補鎖 1031705 1031881
JW0954(hyaA) 1032224 1033342
JW0955(hyaB) 1033339 1035132
JW0956(hyaC) 10351 51 1035858 1-31] 表 l (続き
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kさわ番号（相補鎖にコ ~ さわ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0957(hyaD) 1035855 1036442
JW0958(hyaE) 1036439 1036837
JW0959(hyaF) 1036834 1037691
JW0960(appC) 1037825 1039369
JW0961 (appB) 1039381 1040517
JW0962(yccB) 1040530 1040622
JW0963(appA) 1040702 1042000
JW0964(yccC) 相補鎖 10421 15 1044295
JW0965(yccY) 相補鎖 1044315 1044773
JW0966(yccZ) 相補鎖 1044749 1045888
JW0967(ymcA) 相補鎖 1045934 1048030
JW0968(ymcB) 相補鎖 1048030 1048776
JW0969(ymcC) 相補鎖 1048773 1049417
JW0970(ymcD) 相補鎖 1049524 1049847
JW0971 (insA) 1049918 1050193
JW0972(insB) 10501 12 1050615
JW0973(cspH) 相補鎖 1051048 1051248
JW0974(cspG) 1051546 1051758
JW0975(sfa) 1051932 1052162
JW0976(yccL) 1052152 1052325
JW0977(yccM) 相補鎖 1052374 1053447
JW0978(torS) 相補鎖 1053519 1056233
JW0979(torT) 1056346 1057374
JW0980(torR) 相補鎖 1057347 1058039
JW0981 (torC) 1058169 1059341
JW0982(torA) 1059341 1061887
JW0983(torD) 1061884 1062483
JW0984(yccD) 相補鎖 1062635 1062940
JW0985(cbpA) 相補鎖 1062940 1063860
JW0986(yccE) 1064121 1065377
JW0987(agp) 1065670 1066911 1-32] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kさわ番号（相補鎖にコ ~ さわ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW0988(yccJ) 相補鎖 1066949 10671 76
JW0989(wrbA) 相補鎖 10671 97 1067793
JW0990(yciG) 1068136 1068339
JW0991 (ycdG) 相補鎖 1068596 1069990
JW0992(228#5) 相補鎖 1069945 1070520
JW0993(228#6) 相補鎖 1070450 1071040
JW0994(228#7) 相補鎖 1071050 1071850
JW0995(ycdK) 相補鎖 1071858 1072244
JW0996(228#9) 相補鎖 1072256 1072951
JW0997(228#10) 相補鎖 1072948 1074096
JW0998(ycdC) 1074327 1074965
JW0999(putA) 相補鎖 1075005 1078967
JW1000(yzpU) 相補鎖 10791 19 1079310
JW1001 (putP) 1079390 1080898
JW1002(229#1 ) 1081539 1082270
JW1003(ycdO) 1082328 1083455
JW1004(ycdB) 1083461 1084732
JW1005(phoH) 1085077 1086141
JW1006(ycdP) 相補鎖 10861 91 1086604
JW1007(ycdQ) 相補鎖 1086606 1087931
JW1008(ycdR) 相補鎖 1087924 1088235
JW1009(ycdR) 相補鎖 1088400 1089941
JW1010(ycdS) 相補鎖 1089950 1092373
JW101 1 (ycdT) 1092888 1094318
JW1012(230#3) 相補鎖 1094359 1095225
JW1013(230#3.1 ) 相補鎖 1095222 1095521
JW1014(230#4) 1095607 1095930
JW1015(ycdU) 1095927 1096913
JW1016(ycdW) 1097789 1098727
JW1017(ycdX) 1098782 1099519
JW1018(ycdY) 1099543 1 100097 1-33] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ さ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW1019(ycdZ) 1100151 1100690
JW1020(csgG) 相補鎖 1100754 1101587
JW1021(csgF) 相補鎖 1101614 1102030
JW1022(csgE) 相補鎖 1102055 1102444
JW1023(csgD) 相補鎖 1102449 1103099
JW1024(csgB) 1103854 1104309
JW1025(csgA) 1104350 1104805
JW1026(csgC) 1104864 1105196
JW1027(yi22) 相補鎖 1105295 1106200
JW1028(yi24) 1105724 1106155
JW1029(yi23) 相補鎖 1105834 1106127
JW1030(yi2A) 相補鎖 1106158 1106568
JW1031(sfaA) 1106653 1106964
JW1032(232#3) 1107059 1107592
JW1033(ymdC) 1107534 1109015
JW1034(ymdD) 相補鎖 1109023 1110180
JW1035(mdoG) 1110574 1112109
JW1036(232#7) 相補鎖 1110676 1110933
JW1037(mdoH) 1112102 1114645
JW1038(yceK) 1114842 1115045
JW1039(msyB) 相補鎖 1115046 1115420
JW1040(yceE) 相補鎖 1115503 1116729
JW1041(htrB) 相補鎖 1116901 1117821
JW1042(yceA) 1118046 1119098
JW1043(yceI) 相補鎖 1119140 1119715
JW1044(233#6) 相補鎖 1119719 1120285
JW1045(233#6.1) 相補鎖 1120546 1120686
JW1046(solA) 相補鎖 1120707 1121825
JW1047(yceP) 相補鎖 1121940 1122197
JW1048(dinI) 相補鎖 1122481 1122726
JW1049(pyrC) 相補鎖 1122800 1123846 1-34] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ さわ番号（相補鎖にコ ~ さ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW1050(yceB) 相補鎖 1123952 1124512
JW1051(grxB) 相補鎖 1124646 1125293
JW1052(yqjV) 相補鎖 1125357 1126565
JW1053(rimJ) 1126801 1127385
JW1054(yceH) 1127396 1128043
JW1055(mviM) 1128045 1128968
JW1056(mviN) 1129078 1130613
JW1057(flgN) 相補鎖 1130653 1131069
JW1058(flgM) 相補鎖 1131074 1131367
JW1059(flgA) 相補鎖 1131443 1132102
JW1060(flgB) 1132257 1132673
JW1061(flgC) 1132677 1133081
JW1062(flgD) 1133093 1133788
JW1063(flgE) 1133813 1135021
JW1064(flgF) 1135041 1135796
JW1065(flgG) 1135968 1136750
JW1066(flgH) 1136794 1137501
JW1067(flgI) 1137513 1138610
JW1068(flgJ) 1138610 1139551
JW1069(flgK) 1139617 1141260
JW1070(flgL) 1141272 1142225
JW1071(rne) 相補鎖 1142421 1145606
JW1072(rluC) 1146179 1147138
JW1073(yceF) 相補鎖 1147250 1147873
JW1074(yceD) 1148033 1148554
JW1075(rpmF) 1148606 1148779
JW1076(plsX) 1148890 1149930
JW1077(fabH) 1149998 1150951
JW1078(fabD) 1150967 1151896
JW1079(fabG) 1151909 1152643
JW1080(acpP) 1152854 1153090 1-35] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号〔相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κさ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW1081(fabF) 1153178 1154419
JW1082(pabC) 1154539 1155348
JW1083(yceG) 1155351 1156373
JW1084(tmk) 1156363 1157004
JW1085(holB) 1157001 1158005
JW1086(ycfH) 1158016 1158813
JW1087(ptsG) 1159108 1160541
JW1088(f uE) 相補鎖 1160601 1162790
JW1089(ycfF) 1163124 1163483
JW1090(ycfL) 1163486 1163863
JW1091(ycfM) 1163874 1164518
JW1092(ycf ) 1164499 1165323
JW1093(nagZ) 1165334 1166359
JW1094(ycfP) 1166325 1166924
JW1095(ndh) 1167324 1168628
JW1096(ycfJ) 1168838 1169377
JW1097(ycfQ) 相補鎖 1169439 1170149
JW1098(ycfR) 1170312 1170569
JW1099(ycfS) 相補鎖 1170651 1171613
JW1100(mfd) 相補鎖 1171757 1175203
JW1101(ycfT) 相補鎖 1175331 1176404
JW1102(ycfU) 1176615 1177865
JW1103(ycfV) 1177720 1178559
JW1104(ycfW) 1178559 1179803
JW1105(ycfX) 1179832 1180743
JW1106(23騰） 1180759 1181598
JW1107(cobB) 相補鎖 1181718 1182506
JW1108(ymfA) 相補鎖 1182503 1182973
JW1109(potD) 相補鎖 1183022 1184068
JW1110(potC) 相補鎖 1184065 1184859 jwnn(potB) 相補鎖 1184856 1185683 1-36] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW1112(potA) 相補鎖 1185697 1186833
JW1113(pepT) 1187083 1188309
JW1114(ycfD) 相補鎖 1188358 1189479
JW1115(phoQ) 相補鎖 1189555 1191015
JW1116(phoP) 相補鎖 1191015 1191686
JW1117(purB) 相補鎖 1191855 1193225
JW1118(ycfC) 相補鎖 1193229 1193876
JW1119(tmiU) 相補鎖 1193906 1195012
JW1120(ymfB) 相補鎖 1195066 1195527
JW1121(ymfC) 相補鎖 1195537 1196190
JW1122(icdA) 1196362 1197612
JW1123(ymfD) 相補鎖 1198106 1198771
JW1124(ymfE) 相補鎖 1198772 1199485
JW1125(lit) 1199934 1200827
JW1126(intE) 相補鎖 1200918 1202045
JW1127(VXIS_BPP21) 相補鎖 1202026 1202271
JW1128(ymfH) 相補鎖 1202308 1202619
JW1129(ymfI) 1202691 1203077
JW1130(ymfJ) 相補鎖 1203015 1203323
JW1131(RPC2_BPP22) 相補鎖 1203498 1204172
JW1132(241 #2) 1203960 1204463
JW1133(ymfL) 1204495 1205064
JW1134(ymfM) 1205061 1205399
JW1135(ymf ) 1205409 1206776
JW1136(ymfR) 1206788 1206970
JW1137(ymfO) 1206970 1207443
JW1138(241 #8) 1207331 1208161
JW1139(241 #9) 1208152 1208736
JW1140(ycf ) 1208740 1209369
JW1141(ymfS) 1209152 1209784
JW1142(ycfA) 相補鎖 1209756 1210358 1-37] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW1143(ycfE) 相補鎖 1210358 1210897
JW1144(pin) 1210924 1211478
JW1145(mcrA) 1211585 1212418
JW1146(241 #16) 1212652 1212816
JW1147(ycgW) 相補鎖 1212919 1213242
JW1148(ycgX) 相補鎖 1213942 1214346
JW1149(ycgE) 相補鎖 1214567 1215298
JW1150(242#1) 相補鎖 1215503 1216714
JW1151(ycgZ) 1217028 1217264
JW1152(ymgA) 1217307 1217579
JW1153(242#1.4) 1217608 1217874
JW1154(ymgC) 1217987 1218235
JW1155(yahA) 1218525 1220090
JW1156(243#0.1) 1220222 1220440
JW1157(243#1) 1220840 1222360
JW1158(aidA) 1222427 1223461
JW1159(ymgD) 相補鎖 1223544 1223879
JW1160(243#4) 相補鎖 1223883 1224227
JW1161(243#5) 1224737 1224925
JW1162(243#5.1) 1224934 1225146
JW1163(minE) 相補鎖 1225518 1225784
JW1164(minD) 相補鎖 1225788 1226600
JW1165(minC) 相補鎖 1226624 1227319
JW1166(ycgJ) 1227839 1228207
JW1167(ycgK) 相補鎖 1228310 1228711
JW1168(ycgL) 1228920 1229246
JW1169(243#12) 1229318 1229977
JW1170(ycgN) 1230039 1230515
JW1171(clyA) 相補鎖 1230722 1231639
JW1172(umuD) 1232006 1232425
JW1173(umuC) 1232425 1233693 1-38] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κさ； h る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW1174(dsbB) 相補鎖 1233739 1234275
JW1175(nhaB) 相補鎖 1234415 1235956
JW1176(fadR) 1236177 1236896
JW1177(ycgB) 相補鎖 1236948 1238480
JW1178(dadA) 1238810 1240108
JW1179(dadX) 1240118 1241188
JW1180(ycgO) 相補鎖 1241574 1243184
JW1181(ldcA) 相補鎖 1243405 1244319
JW1182(mltE) 1244305 1245030
JW1183(ycgR) 相補鎖 1245032 1245766
JW1184(tag1) 1245967 1246221
JW1185(ycgY) 1246399 1246839
JW1186(treA) 相補鎖 1246918 1248615
JW1187(is5B) 相補鎖 1248821 1249837
JW1188(yi51) 1249157 1249525
JW1189(ycgC) 相補鎖 1250134 1251555
JW1190(ycgS) 相補鎖 1251563 1252270
JW1191(ycgT) 相補鎖 1252206 1253306
JW1192(dhaR) 1253495 1255423
JW1193(246#4) 相補鎖 1255523 1258390
JW1194(ychF) 相補鎖 1259159 1260250
JW1195(pth) 相補鎖 1260367 1260951
JW1196(ychH) 1261229 1261507
JW1197(ychM) 相補鎖 1261562 1262887
JW1198(prsA) 相補鎖 1263366 1264313
JW1199(ychB) 相補鎖 1264464 1265315
JW1200(hemM) 相補鎖 1265315 1265938
JW1201(hemA) 1266152 1267408
JW1202(prfA) 1267450 1268532
JW1203(hemK) 1268532 1269365
JW1204(248#3) 1269362 1269754 1-39] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW1205(ychA) 1269758 1270567
JW1206(kdsA) 1270603 1271457
JW1207(chaA) 相補鎖 1273187 1274287
JW1208(chaB) 1274557 1274787
JW1209(chaC) 1274924 1275640
JW1210(ychN) 相補鎖 1275684 1276037
JW1211(ychO) 1276363 1277616
JW1212(narL) 相補鎖 1277617 1278267
JW1213(narX) 相補鎖 1278260 1280056
JW121 (narK) 1280395 1281786
JW1215(narG) 1282302 1286045
JW1216(narH) 1286042 1287580
JW1217(narJ) 1287577 1288287
JW1218(narI) 1288287 1288964
JW1219(tpr) 相補鎖 1289525 1289626
JW1220(purU) 相補鎖 1290220 1291062
JW1221(ychJ) 相補鎖 1291112 1291570
JW1222(ychK) 1291644 1292588
JW1223(sprE) 1292680 1293693
JW1224(galU) 1293895 1294803
JW1225(hns) 相補鎖 1294947 1295360
JW1226(tdk) 1295965 1296582
JW1227(ychG) 相補鎖 1296864 1297454
JW1227.5(251 #6) 相補鎖 1297406 1297636
JW1228(adhE) 相補鎖 1297884 1300559
JW1229(ychE) 1301036 1301683
JW1230(yi2A) 1301946 1302356
JW1231(yi22) 1302314 1303219
JW1232(yi24) 相補鎖 1302359 1302790
JW1233(yi23) 1302387 1302680
JW1234(251 #8.5) 相補鎖 1303144 1303491 1—40] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW1235(oppA) 1303757 1305388
JW1236(oppB) 1305474 1306394
JW1237(oppC) 1306409 1307317
JW1238(oppD) 1307329 1308342
JW1239(oppF) 1308339 1309343
JW1240(yciU) 相補鎖 1309396 1309725
JW1241 (cls) 相補鎖 1309760 1311220
JW1242(kch) 相補鎖 1311591 1312844
JW1243(yciI) 相補鎖 1313144 1313440
JW1244(tonB) 1313649 1314383
JW1245(yciA) 相補鎖 1314423 1314821
JW1246(yciB) 相補鎖 1314926 1315465
JW1247(yciC) 相補鎖 1315495 1316238
JW1248(yciD) 1316595 1317233
JW1249(yciE) 相補鎖 1317293 1317799
JW1250(yciF) 相補鎖 1317845 1318345
JW1251 (yciG) 相補鎖 1318431 1318610
JW1252(trpA) 相補鎖 1318991 1319797
JW1253(trpB) 相補鎖 1319797 1320990
JW1254(trpC) 相補鎖 1321002 1322360
JW1255(trpD) 相補鎖 1322364 1323959
JW1256(trpE) 相補鎖 1323959 1325521
JW1257(trpL) 相補鎖 1325613 1325657
JW1258(yciV) 1325795 1326676
JW1259(yciO) 1326637 1327293
JW1260(yciQ) 1327465 1329216
JW1261 (yciL) 1329427 1330302
JW1262(btuR) 相補鎖 1330342 1330932
JW1263(yciK) 相補鎖 1330929 1331687
JW1264(sohB) 1331907 1332956
JW1265(yciN) 相補鎖 1332992 1333243 1-41] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kさわ番号（相補鎖にコ ~ さわ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW1266(topA) 1333623 1336220
JW1267(cysB) 1336430 1337404
JW1268(acnA) 1338406 1341081
JW1269(ribA) 相補鎖 1341145 1341735
JW1270(pgpB) 1341905 1342669
JW1271 (yciS) 1342818 1343126
JW1272(yciM) 1343133 1344302
JW1273(pyrF) 1344496 1345233
JW1274(yciH) 1345233 1345559
JW1275(osmB) 相補鎖 1345685 1345903
JW1276(yciT) 相補鎖 13461 72 1346921
JW1277(256#1 ) 相補鎖 1347011 1347193
JW1278(yciR) 相補鎖 1347332 1349317
JW1279(rnb) 相補鎖 1349553 1351487
JW1280(yciW) 相補鎖 1351555 1352760
JW1281 (envM) 相補鎖 1352826 1353614
JW1282(ycjD) 相補鎖 1353982 1354335
JW1283(sapF) 相補鎖 1354403 1355209
JW1284(sapD) 相補鎖 1355211 1356203
JW1285(sapC) 相補鎖 1356203 1357093
JW1286(sapB) 相補鎖 1357080 1358045
JW1287(sapA) 相補鎖 1358042 1359685
JW1288(ymjA) 相補鎖 1359998 1360243
JW1289(yeeF) 相補鎖 1360377 1361762
JW1290(ycjK) 相補鎖 1362065 1363561
JW1291 (ycjL) 1363695 1364459
JW1292(ycjC) 1364486 1365043
JW1293(aldH) 1365318 1366805
JW1294(ordL) 1366807 1368087
JW1295(goaG) 13681 25 1369390
JW1296(pspF) 相補鎖 1369510 1370487 1-42] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号〔相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW1297(pspA) 1370654 1371322
JW1298(pspB) 1371376 1371600
JW1299(pspC) 1371600 1371959
JW1300(pspD) 1371968 1372189
JW1301 (pspE) 1372264 1372578
JW1302(sucP) 1372791 1374470
JW1303(258#8) 1374484 1375776
JW1304(ycjO) 1375797 1376678
JW1305(ycjP) 1376665 1377507
JW1306(ycjQ) 1377538 1378590
JW1307(259#3) 1378600 1379397
JW1308(ycjS) 1379407 1380462
JW1309(ycjT) 1380459 1382726
JW1310(ycjU) 1382723 1383382
JW131 1 (ycjV) 1383396 1384364
JW1312(ompG) 1384522 1385427
JW1313(ycjW) 相補鎖 1385538 1386536
JW1314(ycjX) 1386692 1388089
JW1315(ycjF) 1388086 1389147
JW1316(tyrR) 1389295 1390836
JW1317(tpx) 相補鎖 1390880 1391386
JW1318(ycjG) 1391505 1392470
JW1319(ycj[) 相補鎖 1392445 1393233
JW1319.5(260#10) 相補鎖 1393255 1393437
JW1320(ycjY) 相補鎖 1393508 1394440
JW1321 (ycjZ) 1394566 1395465
JW1321 .5(261 #1.1 ) 1395554 1395679
JW1322(mppA) 1395802 1397415
JW1323(ynaI) 相補鎖 1397466 1398497
JW1324(is5B) 1398651 1399667
JW1325(yi51 ) 相補鎖 1398963 1399331 1-43] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κさ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW1326(ynaJ) 1399940 14001 97
JW1327(ydaA) 相補鎖 1400247 1401 1 97
JW1328(fnr) 相補鎖 1401349 1402101
JW1329(ogt) 相補鎖 1402296 140281 1
JW1330(ydaH) 相補鎖 1402822 1404354
JW1331 (261 #9) 相補鎖 1404385 1405830
JW1332(ydaJ) 相補鎖 1405830 14071 55
JW1333(262#1 ) 1407316 1408224
JW1334(ydaL) 1408554 14091 17
JW1335(262#3) 相補鎖 1409138 1410430
JW1336(262#4) 1410625 141 1608
JW1336.5(262#5) 141 1883 1412056
JW1337(dbpA) 1412086 1413459
JW1338(ydaO) 相補鎖 1413588 1414523
JW1339(intR) 相補鎖 1414575 1415810
JW1340(ydaQ) 相補鎖 1415812 1416051
JW1341 (ydaC) 相補鎖 1416106 1416315
JW1342(lar) 相補鎖 1416308 1416541
JW1343(recT) 相補鎖 1416559 1417368
JW1344(recE) 相補鎖 1417361 1419961
JW1345(racC) 相補鎖 1420063 1420338
JW1346(ydaE) 相補鎖 1420413 1420583
JW1347(kil) 相補鎖 1420583 1420804
JW1348(sieB) 1421 1 23 1421734
JW1349(ydaF) 相補鎖 1421731 1421886
JW1350(263#6.1 ) 相補鎖 1421897 1422076
JW1351 (racR) 相補鎖 1422340 1422816
JW1352(263#6.3) 1422940 1423236
JW1353(ydaT) 1423259 1423681
JW1354(ydaU) 1423694 1424551
JW1355(dnaC) 1424558 1425304 1-44] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW1356(ydaW) 1425276 1425887
JW1357(enpP) 1425914 1426219
JW1358(trkG) 1426357 1427814
JW1359(ynaK) 1427952 1428215
JW1360(ydaY) 1428196 1428555
JW1361 (VMTH_LAMBD) 1429029 1430057
JW1362(VLOM.LAMBD) 1430033 1430188
JW1363(is5B) 相補鎖 1430321 1431301
JW1364(yi51 ) 1430657 1431025
JW1365(VLOM.LAMBD) 1431098 1431559
JW1366(Y401_LAMBD) 1431624 1434986
JW1367(yzzL) 1434986 1435561
JW1368(tnpO) 相補鎖 1435659 1436249
JW1369(ynaE) 相補鎖 1436566 1436832
JW1370(upo3) 相補鎖 1437760 1438194
JW1371 (ompN) 相補鎖 1438335 1439468
JW1372(nifJ) 相補鎖 1439835 1443359
JW1373(ydbJ) 1443744 1443899
JW1374(hslJ) 相補鎖 1443896 1444318
JW1375(1 dhA) 相補鎖 1444429 1445418
JW1376(ydbH) 1445626 1448265
JW1377(ynbE) 1448262 1448447
JW1378(ydbL) 1448374 1448781
JW1379(feaR) 相補鎖 1448953 1449858
JW1380(feaB) 1450094 1451593
JW1381 (tynA) 相補鎖 1451651 1453924
JW1382(paaZ) 相補鎖 1454172 1456217
JW1383(paaA) 1456502 1457431
JW1384(paaB) 1457443 1457730
JW1385(paaC) 1457739 1458485
JW1386(paaD) 1458494 1458997 1-45] 表 l (続き
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kさわ番号（相補鎖にコ ~ さわ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW1387(paaE) 1459005 1460075
JW1388(paaF) 1460072 1460839
JW1389(paaG) 1460839 1461627
JW1390(paaH) 1461629 1463056
JW1391 (paaI) 1463046 1463468
JW1392(paaJ) 1463468 1464673
JW1393(paaK) 1464670 1466013
JW1394(paaX) 14661 14 1467064
JW1395(paaY) 1467046 1467636
JW1396(ydbA) 1467967 1470525
JW1397(yi22) 相補鎖 1470496 1 71401
JW1398(yi24) 1470925 1471356
JW1399(yi23) 相補鎖 1471035 1 71328
JW1400(yi2A) 相補鎖 1471359 1471769
JW1401 (268#0.5) 1471933 1 73084
JW1402(ydbB) 1473265 1476588
JW1403(ydbC) 1476796 1 77656
JW1404(ydbD) 1477713 1480025
JW1405(269#1 ) 14801 96 1 80801
JW1406(ynbB) 1480801 1481697
JW1407(269#3) 1481713 1483470
JW1408(ynbD) 1483484 1484776
JW1409(acpD) 相補鎖 1484830 1485435
JW1410(hrpA) 1485693 1489538
JW141 1 (ydcF) 1489810 1490610
JW1412(aldA) 1490807 1492246
JW1413(gapC) 相補鎖 1492288 1492539
JW1414(gapC) 相補鎖 1492536 1492940
JW1415(cybB) 1493441 1494007
JW1416(ydcA) 1494252 1 94425
JW1416.5(271 #2) 1494569 1494721 1-46] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κさ； h る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW1417(trg) 1495045 1496685
JW1418(ydcI) 相補鎖 1496723 1497787
JW1419(271 #5) 1497863 1499206
JW1420(ydcG) 1499461 1501086
JW1421 (271 #7) 相補鎖 1501007 1501198
JW1422(ydcH) 1501283 1501450
JW1423(rimL) 1501513 1502052
JW1424(271 #10) 相補鎖 1502044 1503024
JW1425(tehA) 1503148 1504140
JW1426(tehB) 1504137 1504730
JW1427(272#1 ) 1505032 1505700
JW1427.5(272#2) 相補鎖 1505937 1506224
JW1428(272#3) 1506292 1507440
JW1429(272#4) 相補鎖 1507480 1508778
JW1430(272#5) 1508747 1509283
JW1431 (prtC) 1509356 1511317
JW1432(yncJ) 相補鎖 1511409 1511639
JW1433(ydcQ) 1512062 1512499
JW1434(yjiR) 1512578 1513984
JW1435(273#4) 1514229 1515374
JW1436(potA) 1515392 1516405
JW1437(273#6) 1516406 1517347
JW1438(potC) 1517337 1518131
JW1439(ydcW) 1518153 1519577
JW1440(ydcX) 1519889 1520137
JW1441 (ydcY) 1520223 1520456
JW1442(ydcZ) 相補鎖 1520457 1520906
JW1443(274#1 ) 相補鎖 1520903 1521655
JW1444(yncB) 1521578 1522639
JW1445(yncC) 1522837 1523502
JW1446(yncD) 相補鎖 1523538 1525640 1-47] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW1447(274#5) 1525882 1526943
JW1448(ansP) 相補鎖 1527056 1528606
JW1449(275#2) 1528822 1529439
JW1450(275#2.1) 1529602 1529727
JW1451(rhsE) 1530465 1532513
JW1452(ydcD) 1532497 1532979
JW1453(yhhI) 1533161 1533907
JW1454(276#2.1) 1534026 1534151
JW1455(ydcC) 1534391 1535527
JW1456(ydcE) 1535627 1535860
JW1457(yddH) 相補鎖 1535857 1536426
JW1458(nhoA) 1536599 1537444
JW1459(yddE) 相補鎖 1537540 1538433
JW1460(narV) 相補鎖 1538512 1539192
JW1461(narW) 相補鎖 1539189 1539884
JW1462(narY) 相補鎖 1539884 1541428
JW1463(narZ) 相補鎖 1541425 1545165
JW1464(narU) 相補鎖 1545247 1546635
JW1465(277#1.1) 1545457 1545627
JW1466(yddJ) 相補鎖 1546959 1547294
JW1467(yddK) 相補鎖 1547333 1548289
JW1468(277#2) 相補鎖 1548313 1548603
JW1469(yddG) 相補鎖 1548863 1549687
JW1470(fdnG) 1549976 1553023
JW1471(fdnH) 1553036 1553920
JW1472(fdnI) 1553913 1554566
JW1473(yddM) 相補鎖 1554973 1555335
JW1474(adhP) 相補鎖 1555403 1556413
JW1475(sfcA) 相補鎖 1556547 1558271
JW1475.1(rpsV) 相補鎖 1558401 1558538
JW1476(yddX) 相補鎖 1558640 1558918 [0065] [表 1-48] 表 l (続き）
Figure imgf000119_0001
[0066] [表 1-49] 表 1 〔続き)
Figure imgf000120_0001
1-50] 表 1 (続き)
Figure imgf000121_0001
1-51] 表 1 (続き)
Figure imgf000122_0001
1-52] 表 1 〔続き)
Figure imgf000123_0001
1-53] 表 1 (続き)
Figure imgf000124_0001
1-54] 表 1 (続き)
Figure imgf000125_0001
1-55] 表 1 (続き)
Figure imgf000126_0001
1-56] 表 1 (続き)
Figure imgf000127_0001
1-57] 表 1 (続き)
Figure imgf000128_0001
1-58] 表 1 (続き)
Figure imgf000129_0001
1-59] 表 1 (続き)
Figure imgf000130_0001
1-60] 表 1 (続き)
Figure imgf000131_0001
1-61] 表 1 (続き)
Figure imgf000132_0001
1-62] 表 1 (続き)
Figure imgf000133_0001
1-63] 表 1 〔続き)
Figure imgf000134_0001
1-64] 表 1 (続き)
Figure imgf000135_0001
1-65] 表 1 (続き)
Figure imgf000136_0001
1-66] 表 1 (続き)
Figure imgf000137_0001
1-67] 表 1 (続き)
Figure imgf000138_0001
1-68] 表 1 (続き)
Figure imgf000139_0001
1-69] 表 1 (続き)
Figure imgf000140_0001
1-70] 表 1 (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号〔相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2158(369#3.1 ) 相補鎖 2269236 2269622
JW2159(yeiP) 2269684 2270217
JW2160(yeiQ) 2270440 2271906
JW2161 (yeiR) 2272024 2273010
JW2162(yeiU) 2273049 2273762
JW2163(spr) 2274174 2274740
JW2164(rtn) 2274921 2276477
JW2165(yejA) 2276559 2278373
JW2166(yejB) 2278374 2279468
JW2167(yejE) 2279468 2280493
JW2168(yejF) 2280495 2282084
JW2169(yejG) 相補鎖 2282088 2282432
JW2170(bcr) 相補鎖 2282765 2283898
JW2171 (rsuA) 相補鎖 2283983 2284678
JW2172(yejH) 2284827 2286587
JW2173(rplY) 2286712 2286996
JW2174(yejK) 相補鎖 2287135 2288142
JW2175(yejL) 2288324 2288551
JW2176(yejM) 2288571 2290331
JW2177(yejO) 相補鎖 2290585 2292807
JW2178(371 #9) 2293100 2293222
JW2179(is5B) 相補鎖 2293260 2294276
JW2180(yi51 ) 2293596 2293964
JW2181 (narP) 2294695 2295342
JW2182(ccmH) 相補鎖 2295553 2296605
JW2183(dsbE) 相補鎖 2296602 2297159
JW2184(ccmF) 相補鎖 2297156 2299099
JW2185(ccmE) 相補鎖 2299096 2299575
JW2186(ccmD) 相補鎖 2299572 2299781
JW2187(ccmC) 相補鎖 2299778 2300515
JW2188(ccmB) 相補鎖 2300557 2301219 1-71] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2189(ccmA) 相補鎖 2301216 2301833
JW2190(napC) 相補鎖 2301852 2302454
JW2191 (napB) 相補鎖 2302464 2302934
JW2192(napH) 相補鎖 2302910 2303773
JW2193(napG) 相補鎖 2303760 2304455
JW2194(napA) 相補鎖 2304462 2306948
JW2195(napD) 相補鎖 2306945 2307208
JW2196(napF) 相補鎖 2307198 2307692
JW2197(eco) 2308100 2308588
JW2198(yojH) 相補鎖 2309303 2310949
JW2199(yojI) 相補鎖 2311167 2312810
JW2200(alkB) 相補鎖 2312886 2313536
JW2201 (ada) 相補鎖 2313536 2314600
JW2202(apbE) 相補鎖 2314674 2315276
JW2203(ompC) 相補鎖 2315841 2316944
JW2204(yojN) 2317683 2320355
JW2205(rcsB) 2320372 2321022
JW2206(rcsC) 相補鎖 2321222 2321599
JW2207(374#2.1 ) 2321622 2321741
JW2208(yi22) 相補鎖 2321666 2322571
JW2209(yi24) 2322095 2322526
JW2210(yi23) 相補鎖 2322205 2322498
JW2211 (yi2A) 相補鎖 2322529 2322939
JW2212(rcsC) 相補鎖 2322936 2325359
JW2213(atoS) 2325574 2327400
JW2214(atoC) 2327397 2328782
JW2215(atoD) 2328978 2329640
JW2216(atoA) 2329640 2330290
JW2217(atoE) 2330287 2331609
JW2218(atoB) 2331640 2332824
JW2219(376#1 ) 相補鎖 2332898 2333674 1-72] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2220(376#2) 相補鎖 2333679 2335328
JW2221 (376#3) 相補鎖 2335329 2335814
JW2222(376#4) 相補鎖 2335830 2339933
JW2223(376#5) 相補鎖 2339867 2340490
JW2224(yfaA) 相補鎖 2340487 23421 75
JW2225(gyrA) 相補鎖 2342324 2344951
JW2226(ubiG) 2345098 2345820
JW2227(yfaL) 相補鎖 2345948 2349700
JW2228(nrdA) 2350396 2352681
JW2229(nrdB) 2352915 2354045
JW2230(yfaE) 2354045 2354299
JW2231 (inaA) 相補鎖 2354353 2355003
JW2232(yfaH) 2355218 2355424
JW2233(glpQ) 相補鎖 2355466 2356542
JW2234(glpT) 相補鎖 2356547 2357905
JW2235(glpA) 23581 78 2359806
JW2236(glpB) 2359796 2361055
JW2237(glpC) 2361052 2362242
JW2238(yfaD) 2362435 2363334
JW2238.5(379#2) 2363347 2363532
JW2239(yhaF) 相補鎖 2363573 2364376
JW2240(379#4) 相補鎖 2364394 2365683
JW2241 (379#5) 相補鎖 2365740 2366957
JW2242(yjhI) 相補鎖 2366960 2367742
JW2243(cinA) 相補鎖 2367962 23691 64
JW2244(379#8) 相補鎖 2369264 2369773
JW2245(yfaO) 2370085 2370510
JW2246(ais) 相補鎖 2370549 2371 1 51
JW2247(ybfE) 2371426 2372598
JW2248(yfbF) 2372602 2373570
JW2249(yfbG) 2373570 2375552 1-73] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号〔相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2250(380#2) 2375549 2376439
JW2251 (380#3) 2376439 2378091
JW2252(380#4) 2378088 2378423
JW2253(380#5) 2378141 2378809
JW2254(pmrD) 相補鎖 2378803 2379069
JW2255(menE) 相補鎖 23791 79 2380534
JW2256(menC) 相補鎖 2380531 2381493
JW2257(menB) 相補鎖 2381493 2382350
JW2258(yfbB) 相補鎖 2382365 23831 23
JW2259(menD) 相補鎖 23831 20 2384994
JW2260(menF) 相補鎖 2384879 23861 74
JW2261 (elaB) 相補鎖 2386253 2386558
JW2262(elaA) 相補鎖 2386613 2387074
JW2263(elaC) 2387139 2388056
JW2264(elaD) 2388247 2389455
JW2265(yfbK) 相補鎖 2389526 2391253
JW2266(yfbL) 2391391 2392362
JW2267(yfbM) 2392465 2392968
JW2268(yfbN) 相補鎖 2393241 2393957
JW2269(403#0.1 ) 23941 12 2394588
JW2270(403#1 ) 2394644 2395495
JW2271 (nuoN) 相補鎖 2395579 2396856
JW2272(nuoM) 相補鎖 2397043 2398572
JW2273(nuoL) 相補鎖 2398736 2400577
JW2274(nuoK) 相補鎖 2400574 2400876
JW2275(nuoJ) 相補鎖 2400873 2401427
JW2276(nuoI) 相補鎖 2401439 2401981
JW2277(nuoH) 相補鎖 2401996 2402973
JW2278(nuoG) 相補鎖 2402970 2405702
JW2279(nuoF) 相補鎖 2405749 2407086
JW2280(nuoE) 相補鎖 2407083 2407583 1-74] 表 l (続き
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kさわ番号（相補鎖にコ ~ さわ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2281 (nuoD) 相補鎖 2407586 2408809
JW2282(nuoB) 相補鎖 2409482 2410144
JW2283(nuoA) 相補鎖 2410160 2410603
JW2284(lrhA) 相補鎖 2411234 2412172
JW2285(insB) 相補鎖 2412334 2412837
JW2286(insA) 相補鎖 2412756 2413031
JW2287(yfbQ) 2413868 2415085
JW2288(404#8) 2415169 2415768
JW2289(yfbS) 相補鎖 2415827 2417659
JW2290(yfbT) 相補鎖 2417746 2418414
JW2291 (yfbU) 相補鎖 2418407 2418901
JW2292(405#4) 相補鎖 2418984 2419439
JW2293(ackA) 2419777 2420979
JW2294(pta) 2421054 2423198
JW2295(yfcC) 2423388 2424908
JW2296(406#2) 相補鎖 2424941 2425483
JW2297(yfcE) 相補鎖 2425541 2426092
JW2298(yfcF) 相補鎖 2426148 2426792
JW2299(yfcG) 2426928 2427575
JW2300(folX) 2427632 2427994
JW2301 (406#7) 2428015 2428908
JW2302(yfc[) 相補鎖 2428956 2429846
JW2303(hisP) 相補鎖 2430043 2430816
JW2304(hisM) 相補鎖 2430824 2431540
JW2305(hisQ) 相補鎖 2431537 2432223
JW2306(hisJ) 相補鎖 2432313 2433095
JW2307(argT) 相補鎖 2433316 2434098
JW2308(ubiX) 相補鎖 2434364 2434933
JW2309(purF) 相補鎖 2435028 2436545
JW2310(dedE) 相補鎖 2436582 2437070
JW2311 (dedD) 相補鎖 2437329 2437964 1-75] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ さ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2312(folC) 相補鎖 2437981 2439249
JW2313(accD) 相補鎖 2439319 2440233
JW2314(dedA) 相補鎖 2440389 2441048
JW2315(truA) 相補鎖 2441131 2441943
JW2316(usg1 ) 相補鎖 2441943 2442956
JW2317(pdxB) 相補鎖 2443022 2444158
JW2318(div) 2444257 2445252
JW2319(yhhS) 相補鎖 2445249 2446427
JW2320(fabB) 相補鎖 2446692 2447912
JW2321 (ddpX) 2448011 2450077
JW2322(408#3) 相補鎖 2450198 2450476
JW2323(yfcM) 相補鎖 2450510 2451244
JW2324(yfcA) 相補鎖 2451058 2451867
JW2325(mepA) 相補鎖 2451867 2452691
JW2326(aroC) 相補鎖 2452695 2453780
JW2327(yfcB) 相補鎖 2453815 2455080
JW2328(yfcN) 2454913 2455464
JW2329(409#4) 相補鎖 2455535 2456356
JW2330(409#5) 相補鎖 2456358 2456897
JW2331 (409#6) 相補鎖 2456894 2457382
JW2332(409#7) 相補鎖 2457379 2457891
JW2333(yfcS) 相補鎖 2457891 2458643
JW2334(yfcU) 相補鎖 2458663 2459559
JW2335(yfcU) 相補鎖 2459572 2461308
JW2336(409#10) 相補鎖 2461390 2461953
JW2337(sixA) 相補鎖 2462634 24631 19
JW2338(yfcX) 相補鎖 2463322 2465466
JW2339(yfcY) 相補鎖 2465466 2466776
JW2340(yfcZ) 相補鎖 2466957 2467241
JW2341 (fadL) 2467607 2468953
JW2342(410#5.1 ) 2469319 2470377 1-76] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号〔相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2343(vacJ) 相補鎖 2470559 2471314
JW2344(yfdC) 2471608 2472540
JW2345(yfdB) 2472852 2474009
JW2346(411 #1 ) 2474162 2474524
JW2347(yfdH) 2474521 2475441
JW2348(411 #2.1 ) 相補鎖 2475431 2475565
JW2349(ycfA) 2477068 2477412
JW2350(yfdK) 相補鎖 2477384 2477824
JW2351 (yfdL) 相補鎖 2477851 2478543
JW2352(yfdM) 相補鎖 2478419 2478694
JW2353(xylU) 2478738 2478923
JW2354(yfdN) 相補鎖 2478694 2479182
JW2355(yfdO) 相補鎖 2479185 2479553
JW2356(411 #10) 2479827 2480273
JW2357(411 #11 ) 2480339 2481163
JW2358(411 #12) 2481291 2481827
JW2359(411 #13) 2481818 2482180
JW2360(411 #14) 2482180 2482485
JW2361 (dsdC) 相補鎖 2483001 2483936
JW2362(dsdX) 2484154 2485491
JW2363(dsdA) 2485509 2486837
JW2364(emrY) 相補鎖 2486945 2488483
JW2365(emrK) 相補鎖 2488483 2489646
JW2366(evgA) 2490062 2490676
JW2367(evgS) 2490681 2494274
JW2368(bifF) 相補鎖 2494330 2495475
JW2369(413#2.1 ) 相補鎖 2495549 2496493
JW2370(yfdU) 相補鎖 2496563 2498257
JW2371 (41 #1 ) 相補鎖 2498311 2499561
JW2372(414#2) 相補鎖 2500074 2500709
JW2373(ypdI) 2501005 2501280 1-77] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2374(414#3) 相補鎖 2501357 2501599
JW2375(ddg) 2501952 2502872
JW2376(yfdZ) 相補鎖 2503364 2504602
JW2377(yehU) 2504996 2506675
JW2378(414#7) 2506690 2507424
JW2379(yijO) 2507437 2508294
JW2380(ptsA) 相補鎖 2508297 2510792
JW2381 (frvX) 相補鎖 2510817 251 1854
JW2382(yqhT) 相補鎖 251 1854 2512939
JW2383(ptwC) 相補鎖 2512954 2514201
JW2384(ptwB) 相補鎖 2514223 2514600
JW2385(glk) 相補鎖 2514768 2515733
JW2386(416#3) 2515937 25171 93
JW2387(416#4) 2517308 2517634
JW2388(mntH) 相補鎖 2517775 2519013
JW2389(nupC) 2519349 2520551
JW2390(yi81 ) 2520638 2521750
JW2391 (yi82) 相補鎖 2521062 2521370
JW2392(yffA) 相補鎖 2521950 25241 99
JW2393(yfeC) 2524774 25251 18
JW2394(yfeD) 25251 20 2525512
JW2395(gltX) 相補鎖 2525564 2526979
JW2396(xapR) 相補鎖 2527900 2528784
JW2397(xapB) 相補鎖 2529036 2530292
JW2398(xapA) 相補鎖 2530352 2531 185
JW2399(yfeN) 2531434 25321 98
JW2400(yfeR) 相補鎖 2532237 25331 63
JW2401 (yfeH) 2533253 2534299
JW2402(417#10) 相補鎖 2534318 2534557
JW2403(lig) 相補鎖 2534466 2536481
JW2404(zipA) 相補鎖 2536552 2537538 1-78] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2405(417#12.1 ) 2537070 2537312
JW2406(cysZ) 2537769 2538530
JW2407(cysK) 2538715 2539686
JW2408(ptsH) 2540070 2540327
JW2409(ptsI) 2540372 2542099
JW2410(gsr) 2542140 2542649
JW241 1 (pdxK) 相補鎖 2542692 2543543
JW2412(yfeK) 2543648 2544022
JW2413(419#2) 2544055 2544789
JW2414(cysM) 相補鎖 2544978 2545889
JW2415(cysA) 相補鎖 2546023 25471 20
JW2416(cysW) 相補鎖 25471 10 2547985
JW2417(cysU) 相補鎖 2547985 2548818
JW2418(cysP) 相補鎖 2548818 2549834
JW2419(ucpA) 相補鎖 2550138 2550995
JW2420(yfeT) 相補鎖 2551058 2551915
JW2421 (yfeU) 2552079 2552975
JW2422(ptbA) 2552979 2554403
JW2423(yfeW) 2554321 2555712
JW2424(420#4) 相補鎖 2555952 2556851
JW2425(420#5) 相補鎖 2556947 2557522
JW2426(yfeZ) 相補鎖 2557583 2558032
JW2427(420#7) 相補鎖 2558019 2558444
JW2428(amiA) 2558658 2559527
JW2429(hemF) 2559531 2560430
JW2430(yfeG) 相補鎖 2560436 2561488
JW2431 (cchA) 相補鎖 2561534 2562034
JW2432(421 #4) 相補鎖 2562047 2562706
JW2433(eutC) 相補鎖 2562716 2563603
JW2434(eutB) 相補鎖 2563624 2564985
JW2435(421 #7) 相補鎖 2564997 2566400 1-79] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ さ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2436(eutH) 相補鎖 2566397 2567623
JW2437(eutG) 相補鎖 2567840 2569027
JW2438(eutJ) 相補鎖 2569017 2569853
JW2439(eutE) 相補鎖 2569864 2571267
JW2440(cchB) 相補鎖 2571279 2571566
JW2441 (cchA) 相補鎖 2571673 2571966
JW2442(eutI) 相補鎖 2572005 2573021
JW2443(421 #15) 相補鎖 2573018 2573821
JW2444(421 #16) 相補鎖 2573818 2574519
JW2445(421 #17) 相補鎖 2574494 2574973
JW2446(ypfE) 相補鎖 2574986 2575321
JW2447(421 #19) 相補鎖 2575614 2577893
JW2448(talA) 2578182 2579132
JW2449(tktB) 2579152 2581 1 55
JW2450(ypfG) 相補鎖 2581250 2582293
JW2451 (yffH) 相補鎖 2582419 2582994
JW2452(aegA) 相補鎖 2583062 2585041
JW2453(narQ) 2585247 2586947
JW2454(acrD) 25871 1 1 2590224
JW2455(yffB) 2590763 2591 1 19
JW2456(dapE) 2591 123 2592250
JW2457(423#3) 2592278 2592478
JW2458(ypfH) 相補鎖 2592588 2593310
JW2459(ypfI) 相補鎖 2593360 2595375
JW2460(423#6) 相補鎖 2595390 2596253
JW2461 (purC) 相補鎖 2596421 2597134
JW2462(nlpB) 相補鎖 2597347 2598381
JW2463(dapA) 相補鎖 2598398 2599276
JW2464(gcvR) 2599422 2599994
JW2465(bcp) 2599994 2600464
JW2466(hyfA) 2600717 2601334 1-80] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κさ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2467(hyfB) 2601334 2603352
JW2468(hyfC) 2603363 2604310
JW2469(hyfD) 2604327 2605766
JW2470(hyfE) 2605778 2606428
JW2471 (hyfF) 2606433 2608013
JW2472(hyfG) 2608003 2609670
JW2473(hyfH) 2609680 2610225
JW2474(hyfI) 2610222 2610977
JW2475(hyfJ) 2610974 2611387
JW2476(hyfR) 2611417 2613429
JW2477(focB) 2613451 2614299
JW2478(perM) 相補鎖 2614337 2615398
JW2479(426#2.1 ) 2615611 2617074
JW2480(yfgD) 2617095 2617454
JW2481 (yfgE) 相補鎖 2617592 2618185
JW2482(uraA) 相補鎖 2618388 2619677
JW2483(upp) 相補鎖 2619763 2620389
JW2484(purM) 2620714 2621751
JW2485(purN) 2621751 2622389
JW2486(ppk) 2622561 2624627
JW2487(ppx) 2624632 2626173
JW2488(427#1 ) 相補鎖 2626212 2628455
JW2489(427#2) 2629312 2629827
JW2490(427#3) 2629843 2630382
JW2491 (guaA) 相補鎖 2630475 2632052
JW2492(guaB) 相補鎖 2632121 2633656
JW2493(xseA) 2633749 26351 19
JW2494(yfgJ) 相補鎖 26351 16 2635367
JW2495(yfgK) 相補鎖 2635401 2636912
JW2496(yfgL) 相補鎖 2636991 2638169
JW2497(yfgM) 相補鎖 2638180 2638800 1-81] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κさ； h る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2498(hisS) 相補鎖 2638818 2640092
JW2499(gcpE) 相補鎖 2640203 2641321
JW2500(yfgA) 相補鎖 2641348 2642361
JW2501 (yfgB) 相補鎖 2642646 2643800
JW2502(ndk) 相補鎖 2643950 2644381
JW2503(pbpC) 相補鎖 2644530 2646842
JW2504(429#5) 相補鎖 2646843 2651804
JW2505(sseA) 265201 1 2652856
JW2506(sseB) 相補鎖 2653674 2654315
JW2507(pepB) 相補鎖 2654592 2655875
JW2508(yfhJ) 相補鎖 2656053 2656253
JW2509(fdx) 相補鎖 2656265 2656600
JW2510(hscA) 相補鎖 2656602 2658452
JW251 1 (hscB) 相補鎖 2658469 2658984
JW2512(yfhF) 相補鎖 2659080 2659403
JW2513(iscU) 相補鎖 2659420 2659806
JW2514(iscS) 相補鎖 2659834 2661048
JW2515(iscR) 相補鎖 2661 1 60 2661648
JW2516(yfhQ) 相補鎖 2662100 2662840
JW2517(suhB) 2662959 2663762
JW2518(431 #2) 2663880 2664761
JW2519(csiE) 2664952 2666343
JW2520(yfhS) 相補鎖 2666225 2667364
JW2521 (yfhT) 相補鎖 2667524 2668414
JW2522(dgxA) 2668550 266991 1
JW2523(dgxB) 2669908 2670426
JW2524(hcaC) 2670426 2670746
JW2525(hcaB) 2670743 2671555
JW2526(hcaD) 2671565 2672767
JW2527(yphA) 2672792 2673286
JW2528(yphB) 相補鎖 2673334 2674206 1-82] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κさ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2529(yphC) 相補鎖 2674218 2675312
JW2530(yphD) 相補鎖 2675345 2676343
JW2531 (yphE) 相補鎖 2676368 2677879
JW2532(yphF) 相補鎖 2677902 2678885
JW2533(yphG) 相補鎖 2678982 2682356
JW2534(yphH) 2682375 2683574
JW2535(glyA) 相補鎖 2683772 2685025
JW2536(hmpA) 2685353 2686543
JW2537(glnB) 相補鎖 2686588 2686926
JW2538(yfhA) 相補鎖 2686987 2688321
JW2539(yf G) 相補鎖 268831 1 2689024
JW2540(yfhK) 相補鎖 2689189 2690571
JW2541 (purL) 相補鎖 2691 1 74 2695061
JW2542(yfhD) 2695457 2696875
JW2543(yfhC) 相補鎖 2696872 2697408
JW2544(yfhB) 相補鎖 2697433 2698005
JW2545(yfhH) 2698277 26991 25
JW2546(yfhL) 2699181 2699441
JW2547(acpS) 相補鎖 2700136 2700516
JW2548(pdxJ) 相補鎖 2700516 2701247
JW2549(recO) 相補鎖 2701259 2701987
JW2550(era) 相補鎖 2701999 2702904
JW2551 (rnc) 相補鎖 2702901 2703581
JW2552(lepB) 相補鎖 2703853 2704827
JW2553(lepA) 相補鎖 2704843 2706642
JW2554(rseC) 相補鎖 2706840 2707319
JW2555(rseB) 相補鎖 2707316 2708272
JW2556(rseA) 相補鎖 2708272 2708922
JW2557(rpoE) 相補鎖 2708955 2709530
JW2558(nadB) 2709938 271 1560
JW2559(yfiC) 相補鎖 271 1545 2712282 1-83] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2560(srmB) 2712414 2713748
JW2561 (yfiE) 相補鎖 2713957 2714838
JW2562(yfiK) 2714941 2715528
JW2563(yfiD) 相補鎖 2715584 2715967
JW2564(ung) 2716272 2716961
JW2565(yfiF) 相補鎖 2717009 2718046
JW2566(trx2) 2718253 2718672
JW2567(yfiP) 2718717 2719439
JW2568(yfiQ) 2719471 2722131
JW2569(pssA) 2722245 2723600
JW2570(yfiM) 2723697 2723969
JW2571 (kgtP) 相補鎖 2723966 2725264
JW2572(437#4) 2725443 2725505
JW2573(clpB) 相補鎖 27311 18 2733691
JW2574(437#6.1 ) 2733777 2733875
JW2575(yfiH) 相補鎖 2733821 2734552
JW2576(rluD) 相補鎖 2734549 2735529
JW2577(yfiO) 2735664 2736401
JW2578(yfiA) 2736672 2737013
JW2579(pheL) 27371 17 27371 64
JW2580(pheA) 2737263 2738423
JW2581 (tyrA) 相補鎖 2738466 2739587
JW2582(aroF) 相補鎖 2739598 2740668
JW2583(yfiL) 2740839 2741243
JW2584(yfiR) 2741393 2741911
JW2585(yfiN) 2741901 27431 27
JW2586(yfiB) 2743143 2743625
JW2587(rplS) 相補鎖 2743701 2744048
JW2588(trrriD) 相補鎖 2744090 2744857
JW2589(rimM) 相補鎖 2744888 2745445
JW2590(rpsP) 相補鎖 2745455 2745703 1-84] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2591 (ff ) 相補鎖 2745952 2747058
JW2592(439#12) 2747405 2748271
JW2593(yfjD) 2748337 2749578
JW2594(grpE) 相補鎖 2749633 2750226
JW2595(439#15) 相補鎖 2750223 2750396
JW2596(yfjB) 2750349 2751227
JW2597(recN) 2751313 2752974
JW2598(smpA) 27531 23 2753464
JW2599(yfjF) 相補鎖 2753526 2753816
JW2600(yfjG) 相補鎖 2753806 2754282
JW2601 (smpB) 2754414 2754896
JW2602(intA) 2755677 2756918
JW2603(yfjH) 相補鎖 27571 62 27581 18
JW2604(alpA) 27581 62 2758374
JW2605(yfjI) 2758503 2759912
JW2606(440#5.1 ) 相補鎖 2759865 2760071
JW2607(yfjJ) 2760065 2760691
JW2608(yfjK) 相補鎖 2760869 2763058
JW2609(yfjL) 相補鎖 2763055 2764671
JW2610(yfjM) 相補鎖 2765031 2765294
JW261 1 (yfjN) 2765436 2766509
JW2612(yfjO) 2766553 2766873
JW2613(yfjP) 2767222 2768091
JW2614(yfjQ) 2768183 2769004
JW2615(yfjR) 2769221 2769922
JW2616(ypjK) 2769807 27701 99
JW2617(yfjS) 2769950 2770642
JW2618(yfjT) 2770666 2771 133
JW2619(yfjU) 相補鎖 2771358 2771672
JW2620(yfjV) 相補鎖 2771685 2772278
JW2621 (y(jV) 相補鎖 2772354 2772554 1-85] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kさわ番号（相補鎖にコ ~ さわ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2622(442#2.2) 相補鎖 2772494 2772610
JW2623(yfjW) 2772836 2774539
JW2623.5(442#4) 2775237 2775440
JW2624(yfjX) 2775437 2775895
JW2625(yfjY) 2775904 2776386
JW2626(yfjZ) 2776633 2776950
JW2627(ypjF) 2776971 2777300
JW2628(ypjA) 相補鎖 2777664 2782373
JW2629(443#1 .1 ) 相補鎖 27831 56 2783947
JW2630(443#1 .2) 相補鎖 2784047 2784445
JW2631 (443#2) 2786266 2786952
JW2632(443#2.1 ) 2787343 2787756
JW2633(443#2.2) 2787895 27881 67
JW2634(443#3) 2788398 2789480
JW2635(ygaF) 2789500 2790768
JW2636(gabD) 2790791 2792239
JW2637(gabT) 2792253 2793533
JW2638(gabP) 2793771 27951 71
JW2639(ygaE) 27951 92 2795854
JW2640(yzzM) 相補鎖 2795855 2796304
JW2641 (yqaE) 相補鎖 2796388 2796546
JW2642(445#2) 2796729 2797028
JW2643(ygaP) 2797038 2797562
JW2644(stpA) 相補鎖 2797609 2798013
JW2645(445#5) 2798682 2799131
JW2646(ygaC) 相補鎖 27991 68 2799512
JW2647(ygaM) 2799652 2799993
JW2648(nrdH) 2800241 2800486
JW2649(nrdI) 2800483 2800893
JW2650(nrdE) 2800866 2803010
JW2651 (nrdF) 2803020 2803979 1-86] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2652(proV) 2804333 2805535
JW2653(proW) 2805528 2806592
JW2654(proX) 2806650 2807642
JW2655(445#15) 2807834 2808100
JW2656(445#17) 2808094 2809011
JW2657(ygaZ) 2809135 2809872
JW2658(ygaH) 2809862 2810197
JW2659(emrR) 2810288 2810818
JW2660(emrA) 2810945 28121 17
JW2661 (emrB) 2812134 2813672
JW2662(ygaG) 相補鎖 2813736 2814251
JW2663(gshA) 相補鎖 2814401 2815957
JW2664(yqaA) 相補鎖 2816030 2816458
JW2665(yqaB) 相補鎖 2816455 2817021
JW2666(csrA) 相補鎖 2818479 2818664
JW2667(alaS) 相補鎖 2818899 2821529
JW2668(oraA) 相補鎖 2821657 2822157
JW2669(recA) 相補鎖 2822226 2823287
JW2670(ygaD) 相補鎖 2823367 2823864
JW2671 (mltB) 相補鎖 2824009 2825094
JW2672(srlA) 2825350 2826870
JW2673(srlB) 2826881 2827252
JW2674(srlD) 2827256 2828035
JW2675(gutM) 2828141 2828500
JW2676(srlR) 2828567 2829340
JW2677(gutQ) 2829372 2830298
JW2678(ygaA) 相補鎖 2830295 2830807
JW2679(ygaA) 相補鎖 2830827 2831885
JW2680(448#2) 2831997 2833436
JW2681 (ygbD) 2833433 2834566
JW2682(hypF) 相補鎖 2834694 2836946 1-87] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ さ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2683(hydN) 相補鎖 2837099 2837626
JW2684(ascG) 相補鎖 2837775 2838785
JW2685(ascF) 2839045 2840502
JW2686(ascB) 284051 1 2841935
JW2687(hycI) 相補鎖 2842094 2842564
JW2688(hycH) 相補鎖 2842557 2842967
JW2689(hycG) 相補鎖 2842964 2843731
JW2690(hycF) 相補鎖 2843731 2844273
JW2691 (hycE) 相補鎖 2844283 2845992
JW2692( ycD) 相補鎖 2846010 2846933
JW2693(hycC) 相補鎖 2846936 2848762
JW2694(hycB) 相補鎖 2848759 2849370
JW2695(hycA) 相補鎖 2849495 2849956
JW2696(hypA) 28501 68 2850518
JW2697(hypB) 2850522 2851394
JW2698(hypC) 2851385 2851657
JW2699(hypD) 2851657 2852778
JW2700(hypE) 2852817 2853785
JW2701 (fhlA) 2853859 2855937
JW2702(ygbA) 相補鎖 2855974 2856327
JW2703(mutS) 2856614 28591 75
JW2704(prpB) 2859281 2859937
JW2705(ygbI) 相補鎖 2859988 2860785
JW2706(ygbJ) 2860952 2861860
JW2707(ygbK) 2861857 2863023
JW2708(ygbL) 28631 15 2863753
JW2709(ygbM) 2863758 2864534
JW2710(ygbN) 2864623 2865987
JW271 1 (rpoS) 相補鎖 2866081 2867073
JW2712(nlpD) 相補鎖 2867136 2868275
JW2713(pcm) 相補鎖 2868415 2869041 1-88] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ さ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2714(surE) 相補鎖 2869035 2869796
JW2715(ygbO) 相補鎖 2869777 2870826
JW2716(ygbB) 相補鎖 2870823 2871302
JW2717(ygbP) 相補鎖 2871302 2872012
JW2718(ygbQ) 相補鎖 2872031 2872342
JW2719(ygbE) 相補鎖 2872534 2872857
JW2720(cysC) 相補鎖 2872907 2873512
JW2721 (cysN) 相補鎖 2873512 2874939
JW2722(cysD) 相補鎖 2874941 2875849
JW2723(iap) 2876101 2877138
JW2724(ygbF) 相補鎖 2878089 2878439
JW2725(452#12) 相補鎖 2878375 2879292
JW2726(ygcH) 相補鎖 2879308 2879907
JW2727(452#14) 相補鎖 2879894 2880568
JW2728(ygcJ) 相補鎖 2880571 2881662
JW2729(ygcK) 相補鎖 2881675 28821 57
JW2730(453#2) 相補鎖 28821 50 2883658
JW2731 (ygcB) 相補鎖 2884073 2886739
JW2732(cysH) 相補鎖 2887098 2887832
JW2733(cysI) 相補鎖 2887907 2889619
JW2734(cysJ) 相補鎖 2889619 2891418
JW2735(ptpS) 2891734 2892099
JW2736(ygcN) 28921 77 2893448
JW2737(ygcO) 2893439 2893699
JW2738(ygcP) 2893716 2894291
JW2739(ygcQ) 相補鎖 2894439 2895332
JW2740(ygcR) 相補鎖 2895366 2896076
JW2741 (ygcS) 相補鎖 2896054 2897463
JW2742(454#9) 相補鎖 2897485 2898279
JW2743(ygcU) 相補鎖 2898282 2898647
JW2744(ygcU) 相補鎖 2898656 2898937 1-89] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κさ; h る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2745(ygcW) 相補鎖 2899007 2899867
JW2746(yqcE) 29001 1 1 2901388
JW2747(ygcE) 2901769 2902893
JW2748(ygcF) 相補鎖 2904267 2904938
JW2749(ygcG) 29051 62 2906103
JW2750(eno) 相補鎖 29061 63 2907461
JW2751 (pyrG) 相補鎖 2907549 2909186
JW2752(mazG) 相補鎖 2909414 2910205
JW2753(chpA) 相補鎖 2910276 291061 1
JW2754(chpR) 相補鎖 291061 1 2910859
JW2755(relA) 相補鎖 2910937 29131 71
JW2756(ygcA) 相補鎖 2913219 2914520
JW2757(barA) 2914577 2917333
JW2758(ygcX) 相補鎖 2917565 2918905
JW2759(gud2) 相補鎖 2918926 2920266
JW2760(gudT) 相補鎖 2920268 2921620
JW2761 (mioC) 相補鎖 2922055 2922504
JW2762(yqcB) 相補鎖 2922522 2923304
JW2763(yqcC) 相補鎖 2923304 2923633
JW2764(syd) 相補鎖 2924255 2924800
JW2765(yqcD) 2924868 2925716
JW2766(ygdH) 2925828 29271 92
JW2767(sdaC) 2927749 2929038
JW2768(sdaB) 2929096 2930463
JW2769(exo) 2930575 2931330
JW2770(fucO) 相補鎖 2931385 2932536
JW2771 (fucA) 相補鎖 2932561 2933208
JW2772(fucP) 2933755 2935071
JW2773(fucI) 2935104 2936879
JW2774(fucK) 2936958 2938406
JW2775(fucU) 2938408 2938830 1-90] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2776(fucR) 2938888 2939619
JW2777(ygdE) 相補鎖 2939663 2940763
JW2778(ygdD) 相補鎖 2940756 2941 1 51
JW2779(gcvA) 相補鎖 2941 1 70 2942087
JW2780(ygdI) 相補鎖 2942438 2942668
JW2781 (nifS) 2942857 2944062
JW2782(ygdK) 2944062 2944505
JW2783(ygdL) 相補鎖 2944556 2945362
JW2784(mltA) 相補鎖 2945601 2946698
JW2785(amiC) 相補鎖 2947277 2948620
JW2786(argA) 2948762 2950093
JW2787(recD) 相補鎖 29501 55 2951981
JW2788(recB) 相補鎖 2951981 2955523
JW2789(ptr) 相補鎖 2955516 2958404
JW2790(recC) 相補鎖 2958580 2961948
JW2791 (ppdC) 相補鎖 2961961 2962284
JW2792(ygdB) 相補鎖 2962269 2962634
JW2793(ppdB) 相補鎖 2962673 2963476
JW2794(ppdA) 相補鎖 2963227 2963697
JW2795(thyA) 相補鎖 2963881 2964675
JW2796(lg ) 相補鎖 2964682 2965557
JW2797(ptsP) 相補鎖 2965708 2967954
JW2798(ygdP) 相補鎖 2967967 2968497
JW2799(mutH) 2969182 2969871
JW2800(ygdQ) 2969940 2970653
JW2801 (ygdR) 2970791 2971009
JW2802(tas) 2971 1 17 29721 57
JW2803(ygeD) 相補鎖 2972189 2973382
JW2804(aas) 相補鎖 2973375 2975534
JW2805(galR) 29761 19 29771 50
JW2806(lysA) 相補鎖 29771 57 2978419 1-91] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ さ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2807(lysR) 2978541 2979476
JW2808(ygeA) 相補鎖 2979463 29801 55
JW2809(araE) 相補鎖 2980284 2981702
JW2810(kduD) 相補鎖 2982017 2982778
JW281 1 (kduI) 相補鎖 2982808 2983644
JW2812(yqeF) 相補鎖 2983931 29851 15
JW2813(sdaC) 2985367 2986596
JW2814(yqeH) 2987023 2987688
JW2815(yqel) 2988022 2988831
JW2816(yqeJ) 2988992 2989306
JW2817(yqeK) 相補鎖 2989455 2989880
JW2818(ygeF) 2990074 2990520
JW2819(ygeG) 2990788 2991279
JW2820(ygeH) 2991614 2992990
JW2821 (ygeI) 29931 28 2993376
JW2822(x) 2993520 2993936
JW2823(ygeK) 相補鎖 2993981 2994427
JW2824(464#6) 相補鎖 2994458 2994613
JW2825(464#7) 相補鎖 2995269 2995523
JW2826(yi22) 相補鎖 2995893 2996798
JW2827(yi24) 2996322 2996753
JW2828(yi23) 相補鎖 2996432 2996725
JW2829(yi2A) 相補鎖 2996756 29971 66
JW2830(465#0.1 ) 2997078 2997245
JW2831 (ygeP) 相補鎖 2997210 2997509
JW2832(465#1 ) 相補鎖 2997555 2998391
JW2833(nlpD) 相補鎖 2998657 2999412
JW2834(yagR) 2999827 30021 24
JW2835(ygeT) 3002135 3003013
JW2836(465#5) 3003010 3003489
JW2837(ygeV) 相補鎖 3003529 3005307 1-92] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遣伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号〔相補鎖にコ ~ さ l る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2838(ygeW) 3005854 3006945
JW2839(dpaL) 3007029 3008225
JW2840(ygeY) 3008283 3009494
JW2841 (ygeZ) 3009547 3010932
JW2842(arcL) 3010980 301 1912
JW2843(yqeB) 相補鎖 3012133 3013758
JW2844(466#6) 相補鎖 3013806 3014477
JW2845(ygfJ) 3014679 3015257
JW2846(gltD) 3015579 3018677
JW2847(467#1 ) 3018680 3020008
JW2848(ygfM) 3020059 3020838
JW2849(yagR) 3020835 3023705
JW2850(ygfO) 3023870 3025270
JW2851 (ygfP) 30251 65 3026604
JW2852(ygfQ) 3026640 3027209
JW2853(ygfR) 30271 76 3028006
JW2854(ygfS) 相補鎖 3028042 3028533
JW2855(ygfT) 相補鎖 3028530 3030464
JW2856(pbuX) 3030816 3032333
JW2857(idi) 3032583 3033131
JW2858(lysS) 相補鎖 30331 75 3034692
JW2859(prfB) 相補鎖 3034702 3035367
JW2860(recJ) 相補鎖 3035891 3037624
JW2861 (dsbC) 相補鎖 3037630 3038340
JW2862(xerD) 相補鎖 3038365 3039261
JW2863(fldB) 3039373 3039894
JW2864(ygfX) 相補鎖 3039934 3040341
JW2865(ygfY) 相補鎖 3040322 3040588
JW2866(up14) 3040831 304181 1
JW2867(yqfA) 相補鎖 3042007 3042666
JW2868(yqfB) 相補鎖 3042830 3043141 1-93] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kさわ番号（相補鎖にコ ~ さわ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2869(bglA) 3043180 3044619
JW2870(ygfF) 相補鎖 3044676 3045419
JW2871 (gcvP) 相補鎖 3045686 3048559
JW2872(gcvH) 相補鎖 3048678 3049067
JW2873(gcvT) 相補鎖 3049091 3050185
JW2874(visC) 相補鎖 3050633 3051835
JW2875(ubiH) 相補鎖 3051858 3053036
JW2876(pepP) 相補鎖 3053033 3054358
JW2877(ygfB) 相補鎖 3054384 3054968
JW2878(ygfE) 3055130 3055459
JW2879(ygfA) 3055759 3056307
JW2880(serA) 相補鎖 3056696 3057928
JW2881 (rpiA) 相補鎖 3058184 3058879
JW2882(yqfE) 相補鎖 3058899 3059129
JW2883(iciA) 3059271 3060164
JW2884(sbm) 3060368 3062512
JW2885(argK) 3062505 3063500
JW2886(ygfG) 3063511 3064296
JW2887(ygfH) 3064320 3065798
JW2888(ygfl) 相補鎖 3065795 3066706
JW2889(yggE) 相補鎖 3066858 3067598
JW2890(yggA) 相補鎖 3067691 3068326
JW2891 (yggB) 相補鎖 3068465 3069325
JW2892(fba) 相補鎖 3069683 3070762
JW2893(pgk) 相補鎖 3070977 3072140
JW2894(epd) 相補鎖 30721 90 3073209
JW2895(yggC) 相補鎖 3073494 3074207
JW2896(yggD) 相補鎖 3074204 3074713
JW2897(yggF) 相補鎖 3074735 3075700
JW2898(yggP) 相補鎖 3075697 3076686
JW2899(yggP) 相補鎖 3076617 3076973 1-94] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2900(cmtA) 相補鎖 3076988 3078376
JW2901 (cmtB) 相補鎖 3078404 3078847
JW2902(tktA) 相補鎖 3079161 3081155
JW2903(yggG) 3081435 3082193
JW2904(speB) 相補鎖 3082399 3083319
JW2905(speA) 相補鎖 3083457 3085433
JW2906(yqgB) 相補鎖 3085442 3085588
JW2907(yqgC) 3085709 3085924
JW2908(yqgD) 相補鎖 3085921 3086172
JW2909(metK) 3086228 3087382
JW2910(galP) 3087805 3089199
JW2911 (sprT) 3089276 3089773
JW2912(endA) 3089868 3090575
JW2913(yggJ) 3090655 3091386
JW2914(gshB) 3091399 3092349
JW2915(yqgE) 3092458 3093021
JW2916(yqgF) 3093021 3093437
JW2917(yggR) 相補鎖 3093621 3094601
JW2918(yggS) 3094619 3095323
JW2919(yggT) 3095341 3095907
JW2920(yggU) 3095892 3096194
JW2921 (yggV) 3096202 3096795
JW2922(yggW) 3096788 3097924
JW2923(yggM) 相補鎖 3098079 3099086
JW2924(ansB) 相補鎖 3099203 3100249
JW2925(yggN) 相補鎖 3100425 3101144
JW2926(yggL) 相補鎖 3101327 3101653
JW2927(yggH) 相補鎖 3101653 3102372
JW2928(mutY) 3102533 3103585
JW2929(yggX) 3103613 3103888
JW2930(mltC) 3103950 3104489 1-95] 表 l (続き
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kさわ番号（相補鎖にコ ~ さわ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2931 (mltC) 3104536 3105033
JW2932(nupG) 3105235 3106491
JW2933(speC) 相補鎖 3106541 3108736
JW2934(yqgA) 3109073 3109780
JW2935(epsM) 相補鎖 31101 10 3110646
JW2936(exeL) 相補鎖 3110648 3111490
JW2937(exeC) 相補鎖 3111574 3112569
JW2938(477#5) 相補鎖 3112587 3112997
JW2939(477#6) 相補鎖 3113063 3113872
JW2940(477#7) 相補鎖 3114070 3116616
JW2941 (478#1 ) 相補鎖 3116604 3118631
JW2942(yghK) 相補鎖 31191 16 3120798
JW2943(glcB) 相補鎖 3121153 3123324
JW2944(glcG) 相補鎖 3123346 3123750
JW2945(glcF) 相補鎖 3123755 3126040
JW2946(glcD) 相補鎖 3126040 3127539
JW2947(glcC) 3127790 3128554
JW2948(502#6) 相補鎖 3128561 3129733
JW2949(is5B) 3129696 3130712
JW2950(yi51 ) 相補鎖 3130008 3130376
JW2951 (yghQ) 相補鎖 3130859 3131788
JW2952(yghR) 相補鎖 3131972 3132730
JW2953(yghS) 相補鎖 3132762 3133460
JW2954(yghT) 3133649 3134341
JW2955(pitB) 相補鎖 3134390 3135889
JW2956(gsp) 相補鎖 3136181 3138040
JW2957(yghU) 3138197 31391 11
JW2958(hybG) 相補鎖 3139234 3139482
JW2959(hybF) 相補鎖 3139519 3139836
JW2960(hybE) 相補鎖 3139829 3140317
JW2961 (hybD) 相補鎖 3140310 31 0804 1-96] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2962(hybC) 相補鎖 3140804 3142507
JW2963(hybB) 相補鎖 3142504 3143679
JW2964(hybA) 相補鎖 3143669 3144655
JW2965(hoxK) 相補鎖 3144658 3145776
JW2966(yghW) 相補鎖 3145965 3146252
JW2967(504#1 1 ) 相補鎖 3146371 3146781
JW2968(504#12) 相補鎖 3146781 3147206
JW2969(504#13) 相補鎖 31471 12 3147300
JW2970(yajO) 3147412 3148452
JW2971 (yqhA) 相補鎖 3148492 3148986
JW2972(yghA) 3149177 3150061
JW2973(exbD) 相補鎖 3150333 3150758
JW2974(exbB) 相補鎖 3150765 3151499
JW2975(metC) 3151751 3152938
JW2976(yghB) 3153078 3153737
JW2977(exsA) 相補鎖 3153776 3154903
JW2978(yqhD) 3154869 3156032
JW2979(yghE) 3156370 3156963
JW2980(yqhG) 3157163 3157456
JW2981 (yqhG) 3157414 3158091
JW2982(yqhH) 3158142 3158399
JW2983(ygiQ) 相補鎖 3158442 3159683
JW2984(ygiR) 相補鎖 3159683 3160660
JW2985(sufI) 相補鎖 3160771 3162183
JW2986(plsC) 相補鎖 3162258 3162995
JW2987(parC) 相補鎖 3163229 3165487
JW2988(ygiS) 相補鎖 3165625 3167232
JW2989(ygiT) 相補鎖 3167365 3167760
JW2990(ygiU) 相補鎖 3167762 3168058
JW2991 (506#5) 相補鎖 3168263 3168745
JW2992(ygiW) 相補鎖 3168798 3169190 1-97] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ さ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW2993(ygiX) 3169342 3170001
JW2994(ygiY) 3169998 3171347
JW2995(ygiZ) 相補鎖 3171393 3171725
JW2996(mdaB) 3172045 3172626
JW2997(ygiN) 3172657 3172971
JW2998(parE) 相補鎖 3173019 3174911
JW2999(yqiA) 相補鎖 3174940 3175521
JW3000(icc) 相補鎖 3175521 3176348
JW3001 (yqiB) 相補鎖 3176373 3176795
JW3002(yqiE) 相補鎖 3176796 3177425
JW3003(tolC) 3177624 31791 11
JW3004(507#7) 31791 11 3179371
JW3005(ygiB) 3179226 3179930
JW3006(ygiC) 3179936 3181096
JW3007(ygiD) 相補鎖 3181134 3181949
JW3008(ygiE) 3182065 3182838
JW3009(ribB) 相補鎖 3183328 3183981
JW3010(yqiC) 3184295 3184645
JW3011 (ygiL) 3184929 3185480
JW3012(yi2A) 3185657 3186067
JW3013(yi22) 3186025 3186930
JW3014(yi24) 相補鎖 3186070 3186501
JW3015(yi23) 3186098 3186391
JW3016(yqiG) 3186915 3187859
JW3017(yqiG) 3187684 3189381
JW3018(yqiH) 3189388 3190146
JW3019(yqiI) 3190148 3190855
JW3020(yqiI) 3190791 3191213
JW3021 (glgS) 相補鎖 3191256 3191456
JW3022(508#6) 3191725 3192354
JW3023(508#7) 3192381 3194042 -98] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κさ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3024(rfaE) 相補鎖 3194837 3196270
JW3025(glnE) 相補鎖 3196318 31991 58
JW3026(ygiF) 相補鎖 3199181 3200482
JW3027(ygiM) 3200724 3201344
JW3028(cca) 3201408 3202646
JW3029(bacA) 相補鎖 3202827 3203648
JW3030(folB) 相補鎖 3203738 3204106
JW3031 (ygiH) 320421 1 3204828
JW3032(ygiP) 相補鎖 3204841 3205773
JW3033(ttdA) 3205980 3206891
JW3034(ttdB) 3206888 3207493
JW3035(ygjE) 3207541 3209004
JW3036(ygjD) 相補鎖 3209047 3210060
JW3037(rpsU) 3210298 3210513
JW3038(dnaG) 3210624 3212369
JW3039(rpoD) 3212564 3214405
JW3040(ygjF) 相補鎖 3214484 3214990
JW3041 (yqjH) 相補鎖 3215244 3216008
JW3042(yqj[) 3216296 3216919
JW3043(aer) 相補鎖 3217073 3218593
JW3044(ygjG) 3219101 3220390
JW3045(ygjH) 相補鎖 3220432 3220764
JW3046(ebgR) 3220983 3221966
JW3047(ebgA) 32221 50 3225242
JW3048(ebgC) 3225239 3225688
JW3049(ygjI) 3225751 3227184
JW3050(ygjJ) 3227318 3228388
JW3051 (ygjK) 3228405 3230756
JW3052(fadH) 3231 182 3233200
JW3053(ygjM) 相補鎖 3233245 3233661
JW3054(ygjN) 相補鎖 3233658 3233972 1-99] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3055(ygjO) 相補鎖 3234256 3235422
JW3056(ygjP) 3235441 3235980
JW3057(ygjQ) 3236057 3236749
JW3058(ygjR) 3236810 3237814
JW3059(ygjT) 3238098 3239063
JW3060(ygjU) 3239460 3240704
JW3061 (ygjV) 相補鎖 3240709 3241260
JW3062(uxaA) 相補鎖 3241343 3242830
JW3063(uxaC) 相補鎖 3242845 3244257
JW3064(exuT) 3244620 3246038
JW3065(exuR) 3246168 3246944
JW3066(yqjA) 3247289 3247951
JW3067(yqjB) 3247955 3248338
JW3068(yqjC) 3248470 3248853
JW3069(yqjD) 3248891 32491 96
JW3070(yqjE) 3249199 3249603
JW3071 (yqjK) 3249593 3249892
JW3072(yqjF) 3249988 3250470
JW3073(yqjG) 3250540 3251526
JW3074(yhaH) 3251820 3252185
JW3075(yhaI) 3252427 3252783
JW3076(yhaJ) 相補鎖 3252834 3253730
JW3077(yhaK) 3253835 3254536
JW3078(yhaL) 3254553 3254723
JW3079(yhaM) 相補鎖 3254857 3255423
JW3080(yhaN) 相補鎖 3255605 32561 68
JW3081 (yhaO) 相補鎖 3256196 3257473
JW3082(yhaP) 相補鎖 3257804 3258631
JW3083(yhaQ) 相補鎖 3258751 32591 73
JW3084(yhaR) 相補鎖 3259239 3259691
JW3085(tdcE) 相補鎖 3259695 3261935 1-100] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3086(tdcD) 相補鎖 3261969 3263177
JW3087(tdcC) 相補鎖 3263203 3264534
JW3088(tdcB) 相補鎖 3264556 3265545
JW3089(tdcA) 相補鎖 3265644 3266582
JW3090(tdcR) 3266816 32671 15
JW3091 (yhaB) 3267371 3267910
JW3092(yhaC) 3267932 32691 19
JW3093(yhaD) 相補鎖 3270142 3271368
JW3094(yhaE) 相補鎖 3271384 3272283
JW3095(yhaF) 相補鎖 3272304 3273074
JW3096(yhaU) 相補鎖 3273090 3274424
JW3097(yhaG) 3274799 3276370
JW3098(sohA) 3276519 3276854
JW3099(yhaV) 3276854 3277318
JW3100(agaR) 相補鎖 3277373 3278182
JW3101 (agaZ) 3278431 3279711
JW3102(agaV) 3279734 3280207
JW3103(agaW) 3280218 3280619
JW3104(agaA) 3280639 3281142
JW3105(agaS) 3281493 3282647
JW3106(agaY) 3282660 3283520
JW3107(agaB) 3283687 3284163
JW3108(agaC) 3284202 3285005
JW3109(agaD) 3284995 3285786
JW3110(agaI) 3285787 3286542
JW3111 (yraH) 3286943 3287527
JW3112(yraI) 3287607 3288302
JW3113(yraJ) 3288331 3290847
JW311 (yraK) 3290858 3291949
JW3115(yraL) 相補鎖 3291992 3292852
JW3116(yraM) 3292917 3294953 1-101] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kさわ番号（相補鎖にコ ~ さわ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3117(yraN) 3294911 3295306
JW3118(yraO) 3295326 3295916
JW3119(yraP) 3295926 3296501
JW3120(yraQ) 相補鎖 3296615 3297655
JW3121 (yraR) 相補鎖 3297728 3298408
JW3122(yhbO) 3298449 3299009
JW3123(yhbP) 相補鎖 3298989 3299432
JW3124(yhbQ) 3299483 3299785
JW3125(yhbS) 相補鎖 3299772 3300275
JW3126(yhbT) 相補鎖 3300269 3300793
JW3127(yhbU) 3301002 3301997
JW3128(yhbV) 3301988 3302884
JW3129(yhbW) 3302965 3303972
JW3130(mtr) 相補鎖 3304090 3305334
JW3131 (deaD) 相補鎖 3305488 3307428
JW3132(nlpI) 相補鎖 3307557 3308441
JW3133(pnp) 相補鎖 3308550 3310685
JW3134(rpsO) 相補鎖 3310932 3311201
JW3135(truB) 相補鎖 3311350 3312294
JW3136(rbfA) 相補鎖 3312294 3312695
JW3137(infB) 相補鎖 3312859 3315531
JW3138(nusA) 相補鎖 3315556 3317043
JW3139(yhbC) 相補鎖 3317071 3317493
JW3140(argG) 33181 54 3319497
JW3141 (yhbX) 相補鎖 3319505 3321 148
JW3142(secG) 相補鎖 3321690 3322022
JW3143(mrsA) 相補鎖 3322250 3323587
JW3144(folP) 相補鎖 3323580 3324428
JW3145(ftsH) 相補鎖 3324518 3326452
JW3146(ftsJ) 相補鎖 3326552 3327181
JW3147(yhbY) 3327307 3327600 1-102] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3148(greA) 相補鎖 3327756 3328232
JW3149(dacB) 3328480 3329913
JW3150(yhbZ) 相補鎖 3330099 3331271
JW3151 (yhbE) 相補鎖 3331287 3332252
JW3152(rpmA) 相補鎖 3332379 3332636
JW3153(rplU) 相補鎖 3332657 3332968
JW3154(ispB) 3333227 33341 98
JW3155(nlp) 3334426 3334704
JW3156(murA) 相補鎖 3334752 3336011
JW3157(yrbA) 相補鎖 3336066 3336320
JW3158(yrbB) 相補鎖 3336480 3336869
JW3159(yrbC) 相補鎖 3336773 3337408
JW3160(yrbD) 相補鎖 3337427 3337978
JW3161 (yrbE) 相補鎖 3337983 3338765
JW3162(yrbF) 相補鎖 3338773 3339582
JW3163(yrbG) 3339792 3340769
JW3164(yrbH) 3340783 3341769
JW3165(yrbI) 3341790 3342356
JW3166(yrbK) 3342353 3342928
JW3167(yhbN) 3342897 3343454
JW3168(yhbG) 3343461 3344186
JW3169(rpoN) 3344234 3345667
JW3170(yhbH) 3345690 3345977
JW3171 (ptsN) 3346095 3346586
JW3172(yhbJ) 3346632 3347486
JW3173(ptsO) 3347483 3347755
JW3174(yrbL) 3347969 3348601
JW3175(mtgA) 相補鎖 3348598 3349326
JW3176(yhbL) 相補鎖 3349323 3349976
JW3177(arcB) 相補鎖 3350206 3352536
JW3178(yhcC) 相補鎖 3352632 3353561 1-103] 表 1 (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~ さ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3179(gltB) 3354143 3358696
JW3180(gltD) 3358709 3360127
JW3181 (gltF) 3360687 3361451
JW3182(yhcA) 3361623 3362297
JW3183(yhcD) 3362318 3364699
JW3184(yhcE) 3364696 3365175
JW3185(is5B) 相補鎖 3365213 3366229
JW3186(yi51 ) 3365549 3365917
JW3187(yhcE) 3366192 3366440
JW3188(yhcF) 3366437 3367153
JW3189(yhcG) 3367338 3368465
JW3190(yhcH) 相補鎖 3368525 3368989
JW3191 (nanK) 相補鎖 3368986 3369894
JW3192(nanE) 相補鎖 3369858 3370547
JW3193(nanT) 相補鎖 3370595 3372085
JW3194(npl) 相補鎖 3372194 3373087
JW3195(nanR) 相補鎖 3373209 3374000
JW3196(dcuD) 3374380 3375747
JW3197(sspB) 相補鎖 3375790 3376287
JW3198(sspA) 相補鎖 3376293 3376931
JW3199(rpsI) 相補鎖 3377326 3377718
JW3200(rplM) 相補鎖 3377734 3378162
JW3201 (yhcM) 相補鎖 3378381 3379508
JW3202(yhcB) 3379696 3380100
JW3203(hhoA) 3380254 3381621
JW3204(hhoB) 3381711 3382778
JW3205(mdh) 相補鎖 3382841 3383779
JW3206(argR) 3384214 3384684
JW3207(yhcN) 3384998 3385312
JW3208(yhcO) 相補鎖 3385368 3385640
JW3209(yhcP) 相補鎖 3385732 3387699 1-104] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3210(yhcQ) 相補鎖 3387705 3388637
JW3211 (yhcR) 相補鎖 3388645 3388917
JW3212(yhcS) 3389031 3389960
JW3213(tldD) 相補鎖 3390094 3391539
JW3214(yhdP) 相補鎖 3391970 3394930
JW3215(yhdR) 相補鎖 3394923 3395771
JW3216(rng) 相補鎖 3395839 3397308
JW3217(yhdE) 相補鎖 3397298 3397891
JW3218(mreD) 相補鎖 3397900 3398388
JW3219(mreC) 相補鎖 3398388 3399491
JW3220(mreB) 相補鎖 3399557 3400600
JW3221 (yhdA) 相補鎖 3400905 3402845
JW3222(yhdH) 3402997 3403971
JW3222.5(529#3) 3404788 3404976
JW3223(accB) 3404949 3405419
JW3224(accC) 3405430 3406779
JW3225(yhdT) 3406888 3407130
JW3226(panF) 3407120 3408571
JW3227(prmA) 3408583 3409464
JW3228(yhdG) 3409793 3410758
JW3229(fis) 3410784 3411080
JW3230(yhdJ) 3411160 3412050
JW3231 (yhdU) 3412134 3412313
JW3232(envR) 相補鎖 3412316 3412978
JW3233(acrE) 3413377 3414534
JW3234(envD) 3414546 3417650
JW3235(yhdV) 3417903 3418124
JW3236(yhdW) 3418662 3419579
JW3237(yhdX) 3419629 3420735
JW3238(yhdY) 3420834 3421940
JW3239(yhdZ) 3421948 3422706 [0122] [表 1-105] 表 l (続き)
Figure imgf000176_0001
[0123] [表 1-106] 表 1 (続き
Figure imgf000177_0001
1-107] 表 1 (続き)
Figure imgf000178_0001
1-108] 表 1 (続き)
Figure imgf000179_0001
1-109] 表 1 (続き)
Figure imgf000180_0001
1-110] 表 1 (続き)
Figure imgf000181_0001
1-111] 表 1 (続き)
Figure imgf000182_0001
1-112] 表 1 〔続き)
Figure imgf000183_0001
1-113] 表 1 (続き)
Figure imgf000184_0001
1-114] 表 1 (続き)
Figure imgf000185_0001
1-115] 表 1 (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3549(yiaM) 3743833 3744306
JW3550(yiaN) 3744309 3745583
JW3551 (yiaO) 3745600 3746586
JW3552(lyx) 3746590 3748086
JW3553(sgbH) 3748083 3748745
JW3554(sgbU) 3748705 3749598
JW3555(sgbE) 3749592 3750287
JW3556(yiaT) 相補鎖 3750634 3751374
JW3557(yiaU) 3751498 3752472
JW3558(yiaV) 相補鎖 3752469 3753605
JW3559(yiaW) 相補鎖 375361 1 3753934
JW3560(577#1.1 ) 3754048 3754260
JW3561 (aldB) 相補鎖 3754479 3756017
JW3562(yiaY) 相補鎖 3756182 3757330
JW3563(selB) 相補鎖 3757520 3759364
JW3564(selA) 相補鎖 3759361 3760752
JW3565(yibF) 相補鎖 3760850 3761458
JW3566(rhsA) 3761686 3765819
JW3567(576#2.1 ) 相補鎖 3764212 3764631
JW3568(yibA) 3765840 3766682
JW3569(yibJ) 3766724 3767425
JW3570(yibG) 3767680 3768141
JW3570.5(576#7) 3769491 3769649
JW3571 (yibH) 相補鎖 3769746 3770882
JW3572(yibI) 相補鎖 3770885 3771247
JW3573(mtlA) 3771784 3773697
JW3574(mtlD) 3773927 3775075
JW3575(mtlR) 3775075 3775662
JW3576(576#14) 相補鎖 3775674 3775883
JW3577(yibL) 3776168 3776530
JW3578(lldP) 3776902 3778557 1-116] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3579(lldR) 3778557 3779333
JW3580(lldD) 3779330 3780520
JW3581 (yibK) 3780718 3781191
JW3582(cysE) 相補鎖 3781244 3782065
JW3583(gpsA) 相補鎖 3782145 3783164
JW3584(secB) 相補鎖 3783164 3783631
JW3585(grxC) 相補鎖 3783694 3783945
JW3586(yibN) 相補鎖 3784087 3784518
JW3587(yibO) 3784763 3786307
JW3588(yibP) 3786317 3787600
JW3589(yibQ) 3787730 3788563
JW3590(yibD) 相補鎖 3788550 3789584
JW3591 (tdh) 相補鎖 3789823 3790848
JW3592(kbl) 相補鎖 3790858 3792054
JW3593(htrL) 相補鎖 3792329 3793201
JW3594(rfaD) 3793490 3794422
JW3595(rfaF) 3794432 3795478
JW3596(rfaC) 3795482 3796441
JW3597(rfaL) 3796451 3797710
JW3598(rfaK) 相補鎖 3797742 3798815
JW3599(rfaZ) 相補鎖 3798848 3799699
JW3600(rfaY) 相補鎖 3799770 3800468
JW3601 (rfaJ) 相補鎖 3800486 3801502
JW3602(rfaI) 相補鎖 3801542 3802561
JW3603(rfaB) 相補鎖 3802561 3803670
JW3604(rfaS) 相補鎖 3803684 3804619
JW3605(rfaP) 相補鎖 3804656 3805453
JW3606(rfaG) 相補鎖 3805446 3806570
JW3607(rfaQ) 相補鎖 3806567 3807601
JW3608(kdtA) 3808043 3809320
JW3609(kdtB) 3809328 3809807 1-117] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3610(mutM) 相補鎖 3809846 3810655
JW3611 (rpmG) 相補鎖 3810753 3810920
JW3612(rpmB) 相補鎖 3810941 3811177
JW3613(radC) 相補鎖 3811394 3812068
JW3614(dfp) 3812162 3813454
JW3615(dut) 3813435 3813890
JW3616(ttk) 3813955 3814593
JW3617(pyrE) 相補鎖 3814630 3815271
JW3618(rph) 相補鎖 3815366 3816052
JW3619(yicC) 3816179 3817042
JW3620(dinD) 3817263 3818087
JW3621 (yicG) 3818377 3818994
JW3622(yicF) 相補鎖 3818991 3820673
JW3623(gmk) 3820931 3821554
JW3624(rpoZ) 3821609 3821884
JW3625(spoT) 3821903 3824011
JW3626(spoU) 3824018 3824707
JW3627(recG) 3824713 3826794
JW3628(gltS) 相補鎖 3826963 3828168
JW3629(yicE) 3828448 3829839
JW3630(yicH) 3829960 3831669
JW3631 (yicI) 相補鎖 3831722 3834040
JW3632(yicJ) 相補鎖 3834050 3835432
JW3633(yicK) 3836456 3837640
JW3634(yicL) 3837751 3838674
JW3635(nlpA) 相補鎖 3838678 3839496
JW3636.1 (569#3.2) 3839718 3840011
JW3637(yicM) 相補鎖 3840052 3841290
JW3638(yicN) 相補鎖 3841453 3841932
JW3639(yicO) 相補鎖 3841958 3843370
JW3640(yicP) 3843467 3845233 1-118] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号〔相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κさ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3641 (uhpT) 相補鎖 3845279 3846670
JW3642(uhpC) 相補鎖 3846808 3848127
JW3643(uhpB) 相補鎖 3848137 3849639
JW3644(uhpA) 相補鎖 3849639 3850229
JW3645(ilvN) 相補鎖 3850305 3850595
JW3646(ilvB) 相補鎖 3850599 3852287
JW3647(ivbL) 相補鎖 3852393 3852491
JW3648(567#1 ) 3853056 3853145
JW3649(emrD) 3853419 3854609
JW3650(yidF) 相補鎖 3854617 38551 14
JW3651 (yidG) 相補鎖 38551 11 3855473
JW3652(yidH) 相補鎖 3855463 3855810
JW3653(yidI) 3855918 3856367
JW3654(yidJ) 相補鎖 3856414 3857907
JW3655(yidK) 相補鎖 3857904 3859619
JW3656(yidL) 3859756 3860679
JW3657(567#9.1 ) 相補鎖 3860676 3860888
JW3658(glvG) 相補鎖 3860852 3861490
JW3659(glvB) 相補鎖 3861490 3861975
JW3660(glvC) 相補鎖 3862000 3863106
JW3661 (yidP) 3863402 38641 18
JW3662(yidE) 相補鎖 38641 15 3865776
JW3663(ibpB) 相補鎖 3865972 3866400
JW3664(ibpA) 相補鎖 3866512 3866925
JW3665(yidQ) 3867156 3867563
JW3666(yidR) 相補鎖 3867565 3868815
JW3667(yidS) 3868859 3869944
JW3668(dgoT) 相補鎖 3869941 3871278
JW3669(dgoA) 相補鎖 3871353 38731 16
JW3670(dgoK) 相補鎖 3873100 3873978
JW3671 (dgoR) 相補鎖 3873975 3874271 1-119] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3672(yidW) 相補鎖 3874277 3874663
JW3673(yidX) 3874998 3875669
JW3674(yidA) 相補鎖 3875644 3876456
JW3675(yidB) 相補鎖 3876571 3876969
JW3676(gyrB) 相補鎖 3877209 3879623
JW3677(recF) 相補鎖 3879652 3880725
JW3678(dnaN) 相補鎖 3880725 3881825
JW3679(dnaA) 相補鎖 3881830 3883233
JW3680(rpmH) 3883841 3883981
JW3681 (rnpA) 3883998 3884357
JW3682(yidD) 3884321 3884578
JW3683(yidC) 3884581 3886227
JW3684(thdF) 3886333 3887697
JW3685(tnaL) 3887940 3888014
JW3686(tnaA) 3888235 3889650
JW3687(tnaB) 3889741 3890988
JW3688(yidY) 3891 120 3892295
JW3689(yidZ) 3892270 3893229
JW3690(yieE) 3893374 3894135
JW3691 (yieF) 3894157 3894723
JW3692(yieG) 相補鎖 3894777 38961 14
JW3693(yieH) 3896279 3896944
JW3694(yieI) 389701 1 3897478
JW3695(yieJ) 3897527 38981 14
JW3696(yieK) 相補鎖 3898187 3898828
JW3697(yieL) 相補鎖 3898912 39001 14
JW3698(yieC) 相補鎖 3900108 3901724
JW3699(bglB) 相補鎖 3901793 3903205
JW3700(bglF) 相補鎖 3903224 3905101
JW3701 (bglG) 相補鎖 3905235 3906071
JW3702(phoU) 相補鎖 3906357 3907082 1-120] 表 l (続き
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3703(pstB) 相補鎖 3907097 3907870
JW3704(pstA) 相補鎖 3908053 3908943
JW3705(pstC) 相補鎖 3908943 3909902
JW3706(pstS) 相補鎖 3909989 3911029
JW3707(glmS) 相補鎖 3911343 3913172
JW3708(glmU) 相補鎖 3913334 3914704
JW3709(atpC) 相補鎖 3915057 3915476
JW3710(uncD) 相補鎖 3915497 3916879
JW3711 (atpG) 相補鎖 3916906 3917769
JW3712(atpA) 相補鎖 3917820 3919361
JW3713(atpH) 相補鎖 3919374 3919907
JW3714(atpF) 相補鎖 3919922 3920392
JW3715(atpE) 相補鎖 3920454 3920693
JW3716(atpB) 相補鎖 3920740 3921555
JW3717(atpI) 相補鎖 3921564 3921956
JW3718(gidB) 相補鎖 3922561 3923184
JW3719(gidA) 相補鎖 3923248 3925137
JW3720(mioC) 相補鎖 3925516 3925959
JW3721 (asnC) 相補鎖 3926049 3926507
JW3722(asnA) 3926659 3927651
JW3723(yieM) 相補鎖 3927656 3928939
JW3724(559#4) 相補鎖 3928924 3929106
JW3725(yieN) 相補鎖 3929100 3930596
JW3726(kup) 3930819 3932378
JW3727(rbsD) 3932817 3933272
JW3728(rbsA) 3933280 3934785
JW3729(rbsC) 3934790 3935755
JW3730(rbsB) 3935780 3936670
JW3731 (rbsK) 3936796 3937725
JW3732(rbsR) 3937729 3938721
JW3733(yieO) 相補鎖 3938687 39401 14 1-121] 表 l (続き
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kさわ番号（相補鎖にコ ~ さわ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3734(yieP) 相補鎖 3940137 3940682
JW3735(yifA) 相補鎖 3946628 3947224
JW3736(pssR) 相補鎖 3947065 3947466
JW3737(yifE) 3947585 3947923
JW3738(yifB) 相補鎖 3947948 3949498
JW3739(ilvL) 3949821 3949919
JW3740(ilvG) 3950059 3951042
JW3741 (ilvG) 3951122 3951703
JW3742(ilvM) 3951700 3951963
JW3743(ilvE) 3951983 3952912
JW3744(ilvD) 3953008 3954825
JW3745(ilvA) 3954828 3956372
JW3746(ilvY) 相補鎖 3956424 3957317
JW3747(ilvC) 3957467 3958942
JW3748(ppiC) 相補鎖 3959026 3959307
JW3749(yif ) 相補鎖 3959503 3959778
JW3750(yifN) 相補鎖 3959733 3959951
JW3751 (rep) 3960168 3962189
JW3752(gppA) 相補鎖 3962236 3963720
JW3753(rhlB) 相補鎖 3963856 3965121
JW3754(trxA) 3965252 3965581
JW3755(rhoL) 3965722 3965823
JW3756(rho) 3965908 3967167
JW3757(555#2.1 ) 3967177 3967395
JW3758(rfe) 3967407 3968510
JW3759(wzzE) 3968519 3969568
JW3760(nfrC) 3969624 3970751
JW3761 (rffD) 3970748 3972010
JW3762(rffG) 3972010 3973077
JW3763(rffH) 3973096 3973977
JW3764(yifH) 3974084 3974629 1-122] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3765(rfTA) 3974634 3975764
JW3766(wzxE) 3975766 3977016
JW3767(554#5.1 ) 3977013 3977237
JW3768(rffT) 39771 52 3978093
JW3769(rffT) 3978090 3979442
JW3770(wecG) 3979445 3980185
JW3771 (yifK) 3980376 3981761
JW3772(aslB) 3982447 3983682
JW3773(aslA) 相補鎖 3983841 3985496
JW3774(hemY) 相補鎖 39861 75 3987371
JW3775(hemX) 相補鎖 3987374 3988555
JW3776(hemD) 相補鎖 3988577 3989317
JW3777(hemC) 相補鎖 3989314 3990255
JW3778(cyaA) 3990642 3993188
JW3779(cyaY) 相補鎖 3993228 3993548
JW3780(yzcX) 3993339 3993824
JW3781 (yifL) 399401 1 3994214
JW3782(dapF) 3994248 3995075
JW3783(yigA) 3995072 3995779
JW3784(xerC) 3995776 3996672
JW3785(yigB) 3996672 3997388
JW3786(uvrD) 3997472 3999634
JW3787(yigE) 相補鎖 3999781 40001 58
JW3788(yigE) 相補鎖 4000059 4000544
JW3789(corA) 4000914 4001864
JW3790(yigF) 相補鎖 4001907 4002287
JW3791 (yigG) 相補鎖 4002301 4002717
JW3792(radD) 相補鎖 4002776 4003678
JW3793(yigH) 相補鎖 4003717 4004202
JW3794(pldA) 4004349 4005218
JW3795(recQ) 4005345 40071 77 1-123] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3796(yigJ) 4007355 4007522
JW3797(yigJ) 4007393 4007860
JW3798(yigK) 相補鎖 4007922 4008338
JW3799(551 #4) 相補鎖 4008335 4008541
JW3800(pldB) 4008652 4009674
JW3801 (yigL) 4009556 4009822
JW3802(yigL) 4009794 4010309
JW3803(yigM) 4010542 4011441
JW3804(metR) 相補鎖 4011329 4012282
JW3805(metE) 4012519 4014780
JW3806(ysgA) 相補鎖 4014609 4015433
JW3807(551 #11.1 ) 相補鎖 4014820 4014993
JW3808(udp) 4015894 4016655
JW3809(yigN) 4016796 4018223
JW3810(ubiE) 4018318 4019073
JW3811 (yigP) 4019087 4019692
JW3812(aarF) 4019689 4021329
JW3813(yigT) 4021408 4021677
JW3814(yigT) 4021761 4022198
JW3815(tatC) 4022201 4022977
JW3816(tatD) 4023007 4023627
JW3817(yigW) 4023554 4023802
JW3818(rfaH) 相補鎖 4023799 4024287
JW3819(ubiD) 4024454 4025947
JW3820(ubiB) 4025993 4026694
JW3821 (fadA) 相補鎖 4027075 4028238
JW3822(fadB) 相補鎖 4028248 4030437
JW3823(pepQ) 4030627 4031958
JW3824(yigZ) 4031955 4032572
JW3825(trkH) 4032611 4033909
JW3826(trkH) 4033867 4034061 1-124] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κさ； h る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3827(hemG) 4034073 4034618
JW3828(mobB) 相補鎖 4040362 4040889
JW3829(mobA) 相補鎖 4040871 4041455
JW3830(yihD) 4041525 4041794
JW3831 (yihE) 4041872 4042858
JW3832(dsbA) 4042875 4043501
JW3833(yihF) 4043613 4045085
JW3834(yihG) 相補鎖 4045126 4046058
JW3835(polA) 4046422 4049208
JW3836(yihA) 相補鎖 4049589 4050188
JW3837(yihI) 4050803 4051312
JW3838(hemN) 4051501 4052874
JW3839(ntrC) 相補鎖 4053325 4054734
JW3840(ntrB) 相補鎖 4054746 4055795
JW3841 (glnA) 相補鎖 4056081 4057490
JW3842(yihK) 4057863 4059638
JW3843(yihL) 4059902 4060612
JW3844(yihM) 4060620 4061600
JW3845(yihN) 4061702 4062967
JW3846(yshA) 相補鎖 4063058 4063750
JW3847(yihO) 相補鎖 4063765 4065228
JW3848(yihP) 相補鎖 4065265 4066671
JW3849(yihQ) 相補鎖 4066696 4068732
JW3850(yihR) 相補鎖 4068931 4069857
JW3851 (yihS) 相補鎖 4069971 4071227
JW3852(yihT) 相補鎖 4071229 4072107
JW3853(yihU) 相補鎖 4072131 4073027
JW3854(yihV) 4073189 4074091
JW3855(yihW) 4074101 4074910
JW3856(yihX) 4074988 4075608
JW3857(rbn) 4075602 4076474 1-125] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κさ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3858(yihZ) 4076471 4076908
JW3859(yiiD) 4076905 4077894
JW3860(yiiE) 4078720 4078965
JW3861 (yiiF) 4079183 4079425
JW3862(fdhE) 相補鎖 4079755 4080684
JW3863(fdoI) 相補鎖 4080681 4081316
JW3864(fdoH) 相補鎖 4081313 4082215
JW3865(fdoG) 相補鎖 4082228 4085278
JW3866(fdhD) 4085472 4086305
JW3867(yiiG) 4086458 4087513
JW3868(frvR) 相補鎖 4087564 4089312
JW3869(frvX) 相補鎖 4089312 4090382
JW3870(frvB) 相補鎖 4090372 4091829
JW3871 (frvA) 相補鎖 4091834 4092280
JW3872(yiiL) 相補鎖 4092581 4092895
JW3873(rhaD) 相補鎖 4092905 4093729
JW3874(rhaA) 相補鎖 4094180 4095439
JW3875(rhaB) 相補鎖 4095436 4096905
JW3876(rhaS) 4097193 4098029
JW3877(rhaR) 4098013 4098951
JW3878(rhaT) 相補鎖 4098948 4099982
JW3879(sodA) 4100267 4100887
JW3880(kdgT) 4101138 4102130
JW3881 (yiiM) 4102249 4102953
JW3882(cpxA) 相補鎖 4103059 4104432
JW3883(cpxR) 相補鎖 4104429 4105127
JW3884(540#3.1 ) 4105274 4105423
JW3885(cpxP) 4105408 4105776
JW3886(yiiP) 4105925 4106827
JW3887(pfkA) 4107008 4107970
JW3888(sbp) 4108290 4109279 1-126] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号〔相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3889(cdh) 4109386 4110141
JW3890(tpiA) 相補鎖 4110196 4110963
JW3891 (yiiQ) 相補鎖 4111071 4111670
JW3892(yiiR) 4111771 4112211
JW3893(yiiS) 4112423 4112722
JW3894(yiiT) 4112749 4113177
JW3895(fpr) 相補鎖 4113182 4113928
JW3896(glpX) 相補鎖 4114025 4115035
JW3897(glpK) 相補鎖 4115170 4116678
JW3898(glpF) 相補鎖 4116701 4117546
JW3899(yiiU) 4117971 4118216
JW3900(menG) 相補鎖 4118301 4118786
JW3901 (menA) 相補鎖 4118879 4119805
JW3902(hslU) 相補鎖 4119872 4121203
JW3903(hslV) 相補鎖 4121213 4121743
JW3904(ftsN) 相補鎖 4121836 4122795
JW3905(cytR) 相補鎖 4122887 4123912
JW3906(priA) 相補鎖 4124068 4126266
JW3907(rpmE) 4126469 4126681
JW3908(yiiX) 相補鎖 4126742 4127350
JW3909(metJ) 相補鎖 4127534 4127851
JW3910(metB) 4128128 4129288
JW3911 (metL) 4129291 4131723
JW3912(537#1.1 ) 相補鎖 4131862 4132410
JW3913(metF) 4132072 4132962
JW3914(katG) 4133291 4135471
JW3915(yijE) 4135531 4136469
JW3916(yijF) 相補鎖 4136496 41371 13
JW3917(gldA) 相補鎖 4137388 4138530
JW3918(talC) 相補鎖 4138502 4139164
JW3919(ptsA) 相補鎖 4139176 4141311 1-127] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ さ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3920(536#1 ) 4141169 4141642
JW3921 (frwC) 4141985 4143064
JW3922(frwB) 4143079 4143399
JW3923(pflD) 4143450 4145747
JW3924(pflC) 4145713 4146591
JW3925(frwD) 4146593 4146934
JW3926(yijO) 相補鎖 4146921 4147772
JW3927(yijP) 相補鎖 4147987 4149720
JW3928(ppc) 相補鎖 4149902 4152553
JW3929(argE) 相補鎖 4153151 4154302
JW3930(argC) 4154456 4155460
JW3931 (argB) 4155468 4156244
JW3932(argH) 4156305 4157678
JW3933(oxyR) 4157945 4158862
JW3934(udhA) 相補鎖 4158845 4160179
JW3935(yijC) 4160522 4161226
JW3936(yijD) 4161226 4161585
JW3937(trmA) 相補鎖 4161625 4162725
JW3938(btuB) 4163094 4164938
JW3939(murI) 4164871 4165740
JW3940(murB) 4171512 4172540
JW3941 (birA) 4172537 4173502
JW3942(coaA) 相補鎖 4173531 4174481
JW3943(tufB) 4175399 4176583
JW3944(secE) 4176813 4177196
JW3945(nusG) 4177198 4177743
JW3946(rplK) 4177901 4178329
JW3947(rplA) 4178333 4179037
JW3948(rplJ) 4179450 4179947
JW3949(rplL) 4180014 4180379
JW3950(rpoB) 4180699 4184727 1-128] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3951 (rpoC) 4184804 4189027
JW3952(htrC) 4189240 4189779
JW3953(thiH) 相補鎖 4190189 4191322
JW3954(thiG) 相補鎖 4191319 41921 64
JW3955(thiS) 相補鎖 4192091 4192291
JW3956(thiF) 相補鎖 4192275 4193030
JW3957(thiE) 相補鎖 4193023 4193658
JW3958(thiC) 相補鎖 4193658 4195553
JW3959(rsd) 相補鎖 4195786 4196262
JW3960(yjaD) 4196357 4197130
JW3961 (hemE) 4197170 4198234
JW3962(nfi) 4198238 4198915
JW3963(yjaG) 4198958 4199548
JW3964(hupA) 4199735 4200007
JW3965(yjaH) 4200020 4200715
JW3966(yjaI) 相補鎖 4200717 4201283
JW3967(hydH) 4201380 4202777
JW3968(hydG) 4202774 4204099
JW3969(purD) 相補鎖 4204096 4205385
JW3970(purH) 相補鎖 4205397 4206986
JW3971 (yjaA) 4212689 4213072
JW3972(yjaB) 相補鎖 4213135 4213578
JW3973(metA) 4213735 4214664
JW3974(aceB) 4214933 4216534
JW3975(aceA) 4216564 4217868
JW3976(aceK) 4218051 4219787
JW3977(arp) 相補鎖 4219756 4221942
JW3978(iclR) 相補鎖 4222259 4223083
JW3979(metH) 4223283 4226966
JW3980(yjbB) 4227186 4228817
JW3981 (pepE) 相補鎖 4228908 4229597 1-129] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW3982(yjbC) 4229809 4230681
JW3983(yjbD) 相補鎖 4230814 4231086
JW3984(lysC) 相補鎖 4231339 4232688
JW3985(pgi) 4233213 4234862
JW3986(633#6) 4235361 4235603
JW3987(yjbF) 4235687 4236355
JW3988(yjbG) 4236352 4237089
JW3989(yjbH) 4237089 4239185
JW3989.5(633#10) 相補鎖 4239232 4239510
JW3990(yjbA) 4239780 4240190
JW3991 (xylE) 相補鎖 4240234 4241709
JW3992(malG) 相補鎖 4242081 4242971
JW3993(malF) 相補鎖 4242986 4244530
JW3994(malE) 相補鎖 4244684 4245874
JW3995(malK) 4246239 4247354
JW3996(lamB) 4247426 4248766
JW3997(malM) 4249009 4249929
JW3998(yjbI) 4250410 4251738
JW3999(ubiC) 4251850 4252458
JW4000(ubiA) 4252471 4253343
JW4001 (plsB) 相補鎖 4253498 4255921
JW4002(dgkA) 4256092 4256460
JW4003(lexA) 4256570 4257178
JW4004(dinF) 4257197 4258576
JW4005(yjbJ) 4258692 4258901
JW4006(yjbK) 相補鎖 4258943 4259518
JW4007(yjbL) 4259776 4260030
JW4008(yjbM) 4260054 4260761
JW4009(yjbN) 4261124 4262161
JW4010(yjbO) 4262085 4262537
JW4011 (qor) 相補鎖 4262703 4263686 1-130] 表 l (続き
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kさわ番号（相補鎖にコ ~ さわ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW4012(dnaB) 4263769 4265184
JW4013(alr) 4265237 4266316
JW4014(tyrB) 4266569 4267762
JW4015(napA) 4268869 4269582
JW4016(hobH) 相補鎖 4269310 4269537
JW4017(yjbQ) 4269693 4270109
JW4018(yjbR) 42701 13 4270469
JW4019(uvrA) 相補鎖 4270504 4273326
JW4020(ssb) 4273580 42741 16
JW4021 (yjcB) 相補鎖 4274215 4274565
JW4022(yjcC) 4274926 4276512
JW4023(soxS) 相補鎖 4276515 4276838
JW4024(soxR) 4276924 4277388
JW4025(yjcD) 4277934 4279283
JW4026(yjcE) 4279435 4281084
JW4027(yjcF) 相補鎖 4281238 4282530
JW4028(yjcG) 相補鎖 4282708 4284357
JW4029(yjcH) 相補鎖 4284354 4284668
JW4030(acs) 相補鎖 4284868 4286826
JW4031 (nrfA) 4287219 4288655
JW4032(nrfB) 4288700 4289266
JW4033(nrfC) 4289263 4289934
JW4034(nrfD) 4289931 4290887
JW4035(nrfE) 4290967 4292625
JW4036(nrfF) 4292618 4293001
JW4037(nrfG) 4292998 4293594
JW4038(gltP) 4293936 4295249
JW4039(yjcO) 相補鎖 4295891 4296580
JW4040(fdhF) 相補鎖 4296674 4298821
JW4041 (yjcP) 相補鎖 4299019 4300485
JW4042(yjcQ) 相補鎖 4300482 4302533 1-131] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW4043(yjcR) 相補鎖 4302533 4303564
JW4044(yjcS) 相補鎖 4304067 4306064
JW4045(alsK) 相補鎖 4306325 4307254
JW4046(alsE) 相補鎖 4307238 4307933
JW4047(alsC) 相補鎖 4307944 4308924
JW4048(alsA) 相補鎖 4308903 4310435
JW4049(alsB) 相補鎖 4310562 4311497
JW4050(alsR) 相補鎖 4311556 4312446
JW4051 (rpiB) 4312805 4313254
JW4052(phnQ) 相補鎖 4313265 4313672
JW4053(phnP) 相補鎖 4313798 4314556
JW4054(phnO) 相補鎖 4314558 4314992
JW4055(phnN) 相補鎖 4314979 4315536
JW4056(phnM) 相補鎖 4315536 4316672
JW4057(phnL) 相補鎖 4316669 4317349
JW4058(phnK) 相補鎖 4317460 4318218
JW4059(phnJ) 相補鎖 4318215 4319060
JW4060(phnI) 相補鎖 4319053 43201 17
JW4061 (phnH) 相補鎖 43201 17 4320701
JW4062(phnG) 相補鎖 4320698 4321150
JW4063(phnF) 相補鎖 4321151 4321876
JW4064(phnE) 相補鎖 4321897 4322265
JW4065(phnE) 相補鎖 43221 15 4322735
JW4066(phnD) 相補鎖 4322790 4323806
JW4067(phnC) 相補鎖 4323831 4324619
JW4068(phnB) 相補鎖 4324752 4325195
JW4069(phnA) 相補鎖 4325853 4326188
JW4070(yjdA) 4326589 4328817
JW4071 (yjcZ) 4328847 4329692
JW4072(proP) 4329956 4331458
JW4073(basS) 相補鎖 4331635 4332726 1-132] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW4074(basR) 相補鎖 4332736 4333404
JW4075(yjdB) 相補鎖 4333401 4335074
JW4076(yjdE) 相補鎖 4335148 4336485
JW4077(adiY) 相補鎖 4336622 4337383
JW4078(adi) 相補鎖 4337708 4339975
JW4079(melR) 相補鎖 4340174 4341082
JW4080(melA) 4341365 4342720
JW4081 (melB) 4342835 4344244
JW4082(yjdF) 相補鎖 4344383 4345012
JW4083(fumB) 相補鎖 4345134 4346780
JW4084(dcuB) 相補鎖 4346858 4348198
JW4085(dcuR) 相補鎖 4348769 4349488
JW4086(dcuS) 相補鎖 4349485 43511 16
JW4087(yjdI) 4351297 4351527
JW4088(yjdJ) 4351539 4351811
JW4089(yjdK) 4352038 4352334
JW4090(lysU) 相補鎖 4352654 4354171
JW4091 (yjdL) 相補鎖 4354408 4355865
JW4092(cadA) 相補鎖 4355924 4358071
JW4093(cadB) 相補鎖 4358151 4359485
JW4094(cadC) 相補鎖 4359850 4361388
JW4095(cutA3) 相補鎖 4362187 4362786
JW4096(cutA2) 相補鎖 4362799 4364268
JW4097(cutA) 相補鎖 4364472 4364810
JW4098(dcuA) 相補鎖 4364926 4366227
JW4099(aspA) 相補鎖 4366345 4367781
JW4100(fxsA) 43681 18 4368594
JW4101 (yjeH) 相補鎖 4368610 4369866
JW4102(groES) 4370142 4370435
JW4103(groEL) 4370479 4372125
JW4104(yjeI) 4372230 4372616 1-133] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW4105(yjeJ) 相補鎖 4372819 4373688
JW4106(yjeK) 相補鎖 4374083 43751 11
JW4107(efp) 4375153 4375719
JW4108(ecnB) 4376007 43761 53
JW4109(sugE) 4376179 4376646
JW41 10(blc) 相補鎖 4376643 43771 76
JW41 1 1 (ampC) 相補鎖 4377265 4378398
JW41 12(frdD) 相補鎖 4378461 4378820
JW41 13(frdC) 相補鎖 4378831 4379226
JW41 14(frdB) 相補鎖 4379237 4379971
JW41 15(frdA) 相補鎖 4379964 4381772
JW41 16(genX) 4382097 4383074
JW41 17(yjeM) 4383251 4384795
JW41 18(yjeN) 4384847 43851 61
JW41 19(yjeO) 4385158 4385472
JW4120(yjeP) 相補鎖 4385501 4388824
JW4121 (psd) 相補鎖 4388846 4389814
JW4122(yjeQ) 相補鎖 438991 1 4390963
JW4123(yjeR) 4390989 4391603
JW4124(yjeS) 相補鎖 4392382 4393521
JW4125(yjeF) 4393520 4395067
JW4126(yjeE) 4395039 4395500
JW4127(amiB) 4395519 4396856
JW4128(mutL) 4396866 4398713
JW4129(miaA) 4398706 4399656
JW4130(hfq) 4399742 4400050
JW4131 (hflX) 4400126 4401406
JW4132(hflK) 4401492 4402751
JW4133(hflC) 4402754 4403758
JW4134(yjeT) 4403840 4404037
JW4135(purA) 4404141 4405439 1-134] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW4136(yjeB) 4405644 4406069
JW4137(vacB) 4406066 4408549
JW4138(yjfH) 4408729 4409460
JW4139(yjfI) 4409587 4409988
JW4140(yjfJ) 4410007 4410705
JW4141 (yjfK) 4410756 441 1415
JW4142(yjfL) 4411433 441 1831
JW4143(yjfM) 4411841 4412479
JW4144(yjfC) 4412482 4413645
JW4145(aidB) 4413714 4415354
JW4146(yjf ) 相補鎖 4415471 4415773
JW4147(yjfO) 相補鎖 4415895 4416323
JW4148(yjfP) 4416406 44171 55
JW4149(yjfQ) 相補鎖 4417152 4417907
JW4150(yjfR) 相補鎖 4418015 4419085
JW4151 (sgaT) 4419377 4420831
JW4152(sgaB) 4420847 4421 1 52
JW4153(sgaA) 4421162 4421626
JW4154(sgaH) 4421640 4422290
JW4155(sgaU) 4422300 44231 54
JW4156(sgaE) 4423154 4423840
JW4157(yjfY) 相補鎖 4423970 4424245
JW4158(rpsF) 4424572 4424967
JW4159(priB) 4424974 4425288
JW4160(rpsR) 4425293 4425520
JW4161 (rplI) 4425562 4426011
JW4162(yjfZ) 相補鎖 4426082 4426876
JW4163(ytfA) 4427223 4427549
JW4164(ytfB) 相補鎖 4427533 4428207
JW4165(fklB) 4428230 4429009
JW4166(cycA) 4429318 4430730 1-135] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~Κさ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW4167(ytfE) 相補鎖 4430775 4431437
JW4168(ytfF) 相補鎖 4431545 4432519
JW4169(ytfG) 相補鎖 4432618 4433478
JW4170(ytfH) 4433477 4433947
JW4171 (cpdB) 相補鎖 4434076 4436019
JW4172(cysQ) 4436209 4436949
JW4173(ytfI) 4437161 4437661
JW4174.1 (657#1.2) 4437652 4438098
JW4175(ytfJ) 相補鎖 4438161 4438715
JW4176(ytfK) 4439001 4439246
JW4177(ytfL) 相補鎖 4439325 4440668
JW4178(msrA) 相補鎖 4440991 4441629
JW4179(ytfM) 4441835 4443568
JW4180(ytf ) 4443565 4447344
JW4181 (ytfP) 4447347 4447688
JW4182(yzfA) 相補鎖 4447429 4447698
JW4183(chpS) 4447894 4448151
JW4184(chpB) 4448145 4448495
JW4185(ppa) 相補鎖 4448575 4449105
JW4186(ytfQ) 4449415 4450371
JW4187(ytfR) 4450509 4451762
JW4188(ytfS) 4451738 4452010
JW4189(ytfT) 4452021 4453046
JW4190(yjfF) 4453057 4454028
JW4191 (fbp) 相補鎖 4454061 4455059
JW4192(mpl) 4455235 4456608
JW4193(yjgA) 相補鎖 4456764 4457315
JW4194(pmbA) 4457409 4458761
JW4195(cybC) 4459003 4459305
JW4196(nrdG) 相補鎖 4459350 445981
JW4197(nrdD) 相補鎖 4459972 44621 10 1-136] 表 l (続き）
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ さ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW4198(treC) 相補鎖 4462504 4464159
JW4199(treB) 相補鎖 4464209 4465630
JW4200(treR) 相補鎖 4465749 4466696
JW4201 (mgtA) 4467075 4469771
JW4202(yjgF) 相補鎖 4469977 4470402
JW4203(pyrI) 相補鎖 4470436 4470897
JW4204(pyrB) 相補鎖 4470910 4471845
JW4205(pyrBI) 相補鎖 4471849 4471983
JW4206(yjgH) 相補鎖 4472264 4472659
JW4207(yjg[) 相補鎖 4472790 4473503
JW4208(yjgJ) 4473574 4474167
JW4209(yjgK) 4474303 4474764
JW4210(yjgL) 4474851 4476701
JW4211 (arg[) 相補鎖 4476746 4477750
JW4212(yjgD) 4477912 4478328
JW4213(yjgM) 相補鎖 4478473 4478766
JW4214(yjgN) 4479186 4480367
JW4215(valS) 相補鎖 4480426 4483281
JW4216(holC) 相補鎖 4483281 4483724
JW4217(xerB) 相補鎖 4483884 4485395
JW4218(yjgP) 4485662 4486762
JW4219(yjgQ) 4486759 4487844
JW4220(yjgR) 相補鎖 4488005 4489507
JW4221 (idnR) 相補鎖 4489585 4490583
JW4222(idnT) 相補鎖 4490650 4491969
JW4223(idnO) 相補鎖 4492031 4492795
JW4224(idnD) 相補鎖 4492819 4493850
JW4225(idnK) 4494067 4494630
JW4226(yjgB) 相補鎖 4494634 4495695
JW4227(intB) 4496194 4497384
JW4228(660#10.1 ) 相補鎖 4497565 4497705 1-137] 表 l (続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ 鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~ さ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW4229(yi2A) 4497671 4498081
JW4230(yi22) 4498039 4498944
JW4231 (yi24) 相補鎖 4498084 4498515
JW4232(yi23) 44981 12 4498405
JW4233(yjgW) 4499043 4499378
JW4234(yjgX) 相補鎖 4499487 4499933
JW4235(yjgY) 相補鎖 4499876 4500325
JW4236(yjgZ) 4500704 4501033
JW4237(yi41 ) 相補鎖 4501547 4502893
JW4238(yi42) 4502279 4502746
JW4239(yjhB) 4503442 4504719
JW4240(yjhC) 4504716 4505849
JW4241 (yjhD) 相補鎖 4506070 4506444
JW4242(yjhE) 4506305 4506553
JW4243(yi91 ) 4506605 4506907
JW4244(662#3.2) 相補鎖 4506910 4508061
JW4245(662#4) 4508402 4508998
JW4246(662#5) 4509164 4509577
JW4247(fecE) 相補鎖 4510134 4510901
JW4248(fecD) 相補鎖 4510902 4511858
JW4249(fecC) 相補鎖 4511855 4512853
JW4250(fecB) 相補鎖 4512850 4513752
JW4251 (fecA) 相補鎖 4513797 4516121
JW4252(fecR) 相補鎖 4516208 4517161
JW4253(fecI) 相補鎖 4517158 4517679
JW4254(insA) 4517971 4518246
JW4255(insB) 4518165 4518458
JW4256(insB) 4518459 4518668
JW4257(yjhU) 相補鎖 4518782 4519582
JW4258(yjhF) 相補鎖 45201 15 4521464
JW4259(yjhG) 相補鎖 4521571 4523538 1-138] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" 鎖 番号（相補鎖にコ ~Kされ番号（相補鎖にコ ~ され る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW4260(yjhH) 相補鎖 4523549 4524508
JW4261 (yjhI) 相補鎖 4524459 4525247
JW4262(sgcR) 相補鎖 4525550 4526332
JW4263(sgcE) 相補鎖 4526349 4526981
JW4264(sgcA) 相補鎖 4526993 4527424
JW4265(sgcQ) 相補鎖 4527555 4528361
JW4266(sgcC) 相補鎖 4528374 4529687
JW4266.5(664#6) 相補鎖 4529699 4529977
JW4267(sgcX) 相補鎖 4529974 4531125
JW4268(yjhP) 相補鎖 4531881 4532627
JW4269(yjhQ) 相補鎖 4532683 4533228
JW4269.5(664#1 1 ) 相補鎖 4533240 4533497
JW4270(664#12) 相補鎖 4533988 45341 19
JW4270.5(664#13) 4534283 4534492
JW4271 (yjhR) 4534459 4535475
JW4272(yjhS) 相補鎖 4536058 4537038
JW4273(yjhT) 相補鎖 4537103 4538317
JW4274(yjhA) 相補鎖 4538229 4538954
JW4275(fimB) 4540401 4541003
JW4276(fimE) 4541481 4542077
JW4277(fimA) 4542559 4543107
JW4278(fimI) 4543064 4543711
JW4279(fimC) 4543748 4544473
JW4280(fimD) 4544541 4547177
JW4281 (fimF) 4547187 4547717
JW4282(fimG) 4547730 4548233
JW4283(fimH) 4548253 4549155
JW4284(gntP) 相補鎖 4549398 4550741
JW4285(uxuA) 4551081 4552265
JW4286(uxuB) 4552346 4553806
JW4287(uxuR) 4554021 4554794 1-139] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW4288(yjiC) 相補鎖 4554935 4555765
JW4289(yjiD) 4556429 4556830
JW4290(yjiE) 相補鎖 4556823 4557734
JW4291 (iadA) 相補鎖 4557799 4558971
JW4292(yjiG) 相補鎖 4558984 4559445
JW4293(yjiH) 相補鎖 4559442 4560137
JW4294(yjiI) 4560273 4560929
JW4295(yjiJ) 相補鎖 4560942 4562120
JW4296(yjiK) 相補鎖 4562188 4563159
JW4296.5(668#5) 相補鎖 45631 13 4563370
JW4297(yjiL) 相補鎖 4563367 4564140
JW4298(yjiM) 相補鎖 4564144 4565316
JW4299(yjiN) 相補鎖 4565411 4566691
JW4300(yjiO) 相補鎖 4566732 4567964
JW4301 (yjiP) 4568443 4568754
JW4302(yjiQ) 4568803 4569363
JW4303(yjiR) 相補鎖 4569607 4571019
JW4304(yjiS) 4571196 4571360
JW4305(yjiT) 4571811 4573376
JW4306(yjiV) 4573580 4575121
JW4307(mcrD) 4575072 4576301
JW4308(mcrC) 相補鎖 4576358 4577434
JW4309(mcrB) 相補鎖 4577404 4578801
JW4310(yjiW) 相補鎖 4578945 4579343
JW4311 (hsdS) 相補鎖 4579514 4580908
JW4312(hsdM) 相補鎖 4580905 4582494
JW4313(hsdR) 相補鎖 4582695 4586261
JW4314(mrr) 4586395 4587309
JW4315(yjiA) 相補鎖 4587355 4588209
JW4316(yjiX) 相補鎖 4588322 4588525
JW4317(yjiY) 相補鎖 4588575 4590740 1-140] 表 l 〔続き)
配列番号 1 における開始配列番号 1 における終止 遺伝子名 コ" K鎖 番号（相補鎖にコ ~ され番号（相補鎖にコ ~Κされ る場合は終止番号） る場合は開始番号）
JW4318(tsr) 4591103 4592758
JW4319(yjjL) 相補鎖 4592807 4594168
JW4320(671 #8) 4592916 4593062
JW4321 (yjjM) 相補鎖 4594383 4595189
JW4322(yjjN) 4595420 4596457
JW4323(mdoB) 相補鎖 4596595 4598847
JW4324(yjjA) 相補鎖 4599140 4599637
JW4325(dnaC) 相補鎖 4599683 4600420
JW4326(dnaT) 相補鎖 4600423 4600962
JW4327(yjjB) 相補鎖 4601069 4601395
JW4328(yjjP) 相補鎖 4601533 4602366
JW4329(yjjQ) 4602922 4603647
JW4330(bglJ) 4603605 4604282
JW4331 (fhuF) 相補鎖 4604320 4605108
JW4332(yjjZ) 4605210 4605485
JW4333(rsmC) 相補鎖 46061 14 4607145
JW4334(holD) 4607248 4607661
JW4335(rimI) 4607630 4608076
JW4336(yjjG) 4608091 4608768
JW4337(prfC) 4608859 4610448
JW4338(osmY) 4610841 4611446
JW4339(674#2) 4611555 4611734
JW4340(yjjU) 4611856 4612929
JW4341 (yjjV) 4612926 4613705
JW4342(yjjW) 相補鎖 4614125 4614988
JW4343(yjjI) 相補鎖 4614960 4616510
JW4344(deoC) 4616768 4617547
JW4345(deoA) 4617674 4618996
JW4346(deoB) 4619048 4620271
JW4347(deoD) 4620328 4621047
JW4348(yjjJ) 4621214 4622545 [0158] [表 1-141] 表 1 (続き
Figure imgf000212_0001
[0159] さらに本発明の大腸菌の変異体としては、
(43) 以下の [1]〜[4]から選ばれる方法、
[1]有用物質の生合成に関与する酵素の少なくとも 1つを発現強化する方法、 [2]有用物質の生合成に関与する酵素遺伝子の少なくとも 1つのコピー数を増加さ せる方法、
[3]有用物質の生合成経路から該有用物質以外の代謝産物へ分岐する代謝経路 の少なくとも 1つを弱化または遮断する方法、および
[4]野生型の大腸菌に比べ、有用物質のアナログに対する耐性度が高い細胞株を 選択する方法、 によって改変して得られる上記（1)〜 (42)の 、ずれ力 1項に記載の大腸菌の変異体 をあげることができる。
[0160] 上記（1)〜 (42)の大腸菌の変異体は、有用物質の生合成に直接関与はしないが 間接的に該有用物質の生成を抑制している蛋白質をコードする遺伝子の一部また は全部が欠損していると考えられ、該変異体、および上記 (43)の変異体は有用物 質を生産する変異体として有用である。
本発明の大腸菌の変異体は、大腸菌に属して 、れば 、ずれの大腸菌の変異体で あってもよぐ好ましくは、大腸菌 K-12株、大腸菌 B株および大腸菌 W株の変異体、よ り好ましくは大腸菌 K-12株の変異体、さらに好ましくは大腸菌 W3110株 (ATCC27325 )および大腸菌 MG1655株（ATCC47076)の変異体、特に好ましくは大腸菌 W3110株 (ATCC27325)の変異体をあげることができる。
2.本発明の大腸菌の変異体の製造方法
本発明の大腸菌の変異体は、該変異体を取得できる方法であれば、その取得方法 に制限はな 、が、例えば以下に示す大腸菌の染色体 DNA上の特定の遺伝子また は DNAを欠損させる方法により取得することができる。
[0161] 大腸菌の染色体 DNA上の遺伝子または DNAを欠損させる方法としては、相同組 換えを利用した方法をあげることができる。一般的な相同組換えを利用した方法とし ては、大腸菌の染色体 DNA上にぉ 、て欠損させた 、遺伝子または DNAの両外側 に存在する DNA断片を、該大腸菌内では自立複製できない薬剤耐性遺伝子を有 するプラスミド DNAと連結して作製できる相同組換え用プラスミドを用いる方法をあ げることができる。
[0162] 該相同組換え用プラスミドを常法により大腸菌内に導入した後、薬剤耐性を指標に して相同組換えによって染色体 DNA上に該相同組換え用プラスミドが組込まれた形 質転換株を選択する。得られた形質転換株を該薬剤を含有しな!ヽ培地で数時間〜 1 日間培養した後、該薬剤含有寒天培地、および該薬剤非含有寒天培地に塗布し、 前者の培地で生育せず、後者の培地で生育できる株を選択することで、染色体 DN A上において 2回目の相同組換えが生じた株を取得することができる。染色体 DNA 上の欠損させた 、遺伝子または DNAが存在して ヽた領域の塩基配列を決定するこ とで、染色体 DNA上の目的遺伝子または DNAが欠損したことを確認することができ る。
[0163] また、複数の遺伝子に効率よく塩基の欠失、置換または付加を導入する相同組換 えを利用した方法としては、直鎖 DNAを用いた方法をあげることができる。
具体的には、染色体 DNA上にぉ 、て欠損させた 、遺伝子または DNAの両外側 に存在する DNA断片を含有する直鎖 DNAを細胞内に取り込ませ、染色体 DNAと 導入した直鎖 DNAとの間で相同組換えを起こさせる方法である。本方法は、直鎖 D NAを効率よく取り込む大腸菌であれば、いずれの微生物にも適用でき、好ましくは λファージ由来の組換えタンパク質群 (Red組換え系）を発現して ヽる大腸菌をあげ ることがでさる。
[0164] λ Red組換え系を発現している大腸菌としては、 λ Red組換え系遺伝子を有する プラスミド DNAである pKD46 [ェシエリヒア'コリジェネティックストックセンター（米国 エール大学)より入手可能]を保有する大腸菌 JM101株等をあげることができる。 相同組換えに用いられる DNAとしては、
(a)塩基の欠失、置換または付加の導入対象である染色体 DNA上の領域の両外側 に存在する DNAまたは該 DNAと相同性を有する DNAを、薬剤耐性遺伝子の両端 に有する直鎖 DNA、
(b)塩基の欠失、置換または付加の導入対象である染色体 DNA上の領域の両外側 に存在する DNAまたは該 DNAと相同性を有する DNAを直接連結した直鎖 DNA、
(c)塩基の欠失、置換または付加の導入対象である染色体 DNA上の領域の両外側 に存在する DNAまたは該 DNAと相同性を有する DNAを、薬剤耐性遺伝子および ネガティブセレクションに用いることができる遺伝子の両端に有する直鎖 DNA、およ び
(d)上記 (a)の直鎖 DNAにお 、て、薬剤耐性遺伝子と染色体 DNA上の領域の両 外側に存在する DN Aまたは該 DNAと相同性を有する DN Aの間に、さらに酵母由 来の Flp recombinase[Proc. Natl. Acad. Sci. USA., 82, 5875 (1985)]が認識する塩 基配列を有する DNA、
をあげることができる。 [0165] 薬剤耐性遺伝子としては、大腸菌が感受性を示す薬剤に対し、薬剤耐性を付与す る薬剤耐性遺伝子であれば、いずれの薬剤耐性遺伝子も使用することができる。該 薬剤耐性遺伝子としては、例えば、カナマイシン耐性遺伝子、クロラムフエニコーノレ 耐性遺伝子、ゲンタマイシン耐性遺伝子、スぺクチノマイシン耐性遺伝子、テトラサイ クリン耐性遺伝子およびアンピシリン耐性遺伝子等をあげることができる。
[0166] ネガティブセレクションに用いることができる遺伝子とは、大腸菌で該遺伝子を発現 させたとき、一定培養条件下においては、該大腸菌に致死的である遺伝子のことを いい、該遺伝子としては例えば、バチルス属に属する微生物由来の sacB遺伝子 [Ap pi. Environ. Microbiol., 59, 1361-1366 (1993) ]、およびェシエリヒア属に属する微生 物由来の rpsL遺伝子 [Genomics, 72, 99-104(2001)]等をあげることができる。
[0167] 上記の直鎖 DNAの両末端に存在する、染色体 DNA上の置換または欠失の導入 対象となる領域の両端の外側に位置する DNAまたは該 DNAと相同性を有する DN Aは、直鎖 DNAにおいて、染色体 DNA上の方向と同じ方向に配置され、その長さ は 10bp〜： LOObp程度が好ましぐ 20bp〜50bp程度がより好ましぐ 30〜40bp程度 力 Sさらに好ましい。
[0168] 酵母由来の Flp recombinaseが認識する塩基配列は、該蛋白質が認識し、相同組 換えを触媒する塩基配列であれば、酵母由来の Hp recombinaseが認識し、相同組 換えを触媒する塩基配列を有する塩基配列でもよ ヽ。
相同性を有する DNAとは、上記直鎖 DNAが、染色体 DNA上の目的とする領域 において、相同組換えが起こる程度の同一性を有する DNAのことをいい、具体的な 相同性としては、 80%以上、好ましくは 90%以上、より好ましくは 95%以上、さらに 好ましくは 100%の相同性を有する DNAをあげることができる。
[0169] 上記塩基配列の相同性は、上記した BLASTや FASTA等のプログラムを用いて決定 することができる。
上記直鎖 DNA断片は、 PCRにより作製することができる。また上記直鎖 DNAを含 む DNAをプラスミド上にて構築した後、制限酵素処理にて目的の直鎖 DNAを得る ことちでさる。
[0170] 大腸菌の染色体 DNAに塩基の欠失、置換または付加を導入する方法としては、 以下の方法 1〜4があげられる。
方法 1：上記 (a)または (d)の直鎖 DNAを宿主微生物に導入し、薬剤耐性を指標に 該直鎖 DNAが染色体 DNA上に相同組換えにより挿入された形質転換株を選択す る方法。
方法 2 :上記方法 1により取得された形質転換株に、塩基の欠失、置換または付加の 導入対象である染色体 DNA上の領域の両外側に存在する DNAまたは該 DNAと 相同性を有する DNAを直接連結した DNAを導入し、該方法により染色体 DNA上 に挿入された薬剤遺伝子を削除することにより、微生物の染色体 DNA上の領域を置 換または欠失させる方法。
方法 3 :
[ 1 ]上記 (c)の直鎖 DNAを宿主微生物に導入し、薬剤耐性を指標に該直鎖 DNA が染色体 DNA上に相同組換えにより挿入された形質転換株を選択する、
[2]染色体 DNA上の置換または欠失の対象領域の両端の外側に位置する DNAと 相同性を有する DNAを、染色体 DNA上における方向と同一の方向で連結した DN Aを合成し、上記 [1]で得られた形質転換株に導入する、
[3]ネガティブセレクションに用いることができる遺伝子が発現する条件下において、 上記 [2]の操作を行った形質転換株を培養し、該培養において生育可能な株を、薬 剤耐性遺伝子およびネガティブセレクションに用いることができる遺伝子が染色体 D NA上から削除された株として選択する方法。
方法 4 :
[ 1 ]上記 (d)の直鎖 DNAを宿主微生物に導入し、薬剤耐性を指標に該直鎖 DNA が染色体 DNA上に相同組換えにより挿入された形質転換株を選択する、
[2]上記 [ 1 ]で得られた形質転^ に Hp recombinase遺伝子発現プラスミドを導入 し、該遺伝子を発現させた後、上記 [1]で用いた薬剤に感受性である株を取得する 方法。
上記方法で用いられる、直鎖 DNAを宿主微生物に導入する方法としては、該微生 物へ DNAを導入する方法であればいずれも用いることができ、例えば、カルシウムィ オンを用いる方法 [Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 69, 2110 (1972)]、プロトプラスト法（ 特開昭 63- 248394)、エレクト口ポレーシヨン法 [Nucleic Acids Res., 16, 6127 (1988)] 等をあげることができる。
[0172] 方法 2または方法 3 [2]で用いられる DNAにおいて、該 DNAの中央部付近に、染 色体 DNA上に挿入した 、任意の遺伝子を組み込んだ DNAを用いることにより、薬 剤耐性遺伝子等を削除するのと同時に、任意の遺伝子を染色体 DNA上に挿入する ことができる。
上記方法 2〜4では、最終的に得られる形質転換株の染色体 DNA上には薬剤耐 性遺伝子およびネガティブセレクションに用いることができる遺伝子等の外来遺伝子 を残さない方法であるため、該方法を用いることにより、同一の薬剤耐性遺伝子およ びネガティブセレクションに用いることができる遺伝子を用いて、該方法の操作を繰り 返すことにより、容易に染色体 DNA上の位置の異なる 2以上の領域に遺伝子または DNAの欠損を有する大腸菌を製造することができる。
[0173] 上記方法により取得された大腸菌の変異体が、一定時間培養後の菌体量が野生 型の大腸菌より多いことは、例えば 1%グルコース、 0.6%リン酸ニナトリウム、 0.3% リン酸二水素カリウム、 0.05%塩化ナトリウム、 0.1%塩化アンモ-ゥム、 2mmol/l硫 酸マグネ
シゥム '七水和物、 10mg/l 硫酸鉄、 100 mol/1塩化カルシウムの組成からなる M9 最小培地、または 3%グルコースを含む LB液体培地 [lOg/1バタトトリプトン (ディフコ 社製）、 5g/lバクトイーストエキストラタト（ディフコ社製）、 5g/l塩ィ匕ナトリウム、 lml/1の lmol/1水酸ィ匕ナトリウム]などを用い、親株に用いた野生型の大腸菌および該変異 体をそれぞれ培養し、一定時間毎に培養物の 660nmまたは 590nmの吸収を測定する こと、または培地あたりの ATP量を常法により測定することなどにより確認することが できる。
[0174] また、本発明の大腸菌の変異体は、有用物質を生産する能力を有する大腸菌の染 色体 DNA上の遺伝子または DNAを欠損させる方法、または染色体 DNA上の遺伝 子または DNAを欠損させた大腸菌に、有用物質の生産性を付与する方法により製 造することができる。
有用物質を生産する能力を有する大腸菌は、 1種以上の有用物質を生産する能力 を有する大腸菌であればいずれの大腸菌であってもよぐ該大腸菌としては自然界 から分離された株自身が該能力を有する場合は該株そのもの、公知の方法により所 望の有用物質を生産する能力を人為的に付与した大腸菌などをあげることができる。
[0175] 当該公知の方法としては、
(a)有用物質の生合成を制御する機構の少なくとも 1つを緩和または解除する方法、
(b)有用物質の生合成に関与する酵素の少なくとも 1つを発現強化する方法、
(c)有用物質の生合成に関与する酵素遺伝子の少なくとも 1つのコピー数を増加さ せる方法、
(d)有用物質の生合成経路から該有用物質以外の代謝産物へ分岐する代謝経路の 少なくとも 1つを弱化または遮断する方法、および
(e)野生型株に比べ、有用物質のアナログに対する耐性度が高い細胞株を選択する 方法、
などをあげることができ、上記公知の方法は単独または組み合わせて用いることがで きる。
[0176] 上記 (a)〜（e)の具体的な方法は、例えば有用物質がアミノ酸である場合について は、上記（a)の方法に関しては Agric. Biol. Chem., 43, 105-111(1979)、 J. BacterioL, 110. 761- 763(1972)および Appl. Microbiol. BiotechnoL, 39, 318- 323(1993)など に記載されている。上記（b)の方法に関しては、 Agric. Biol. Chem., 43, 105-111(19 79)および J. BacterioL, U0, 761-763(1972)などに記載されている。上記（c)の方法 に関しては、 Appl. Microbiol. BiotechnoL, 39, 318- 323(1993)および Agric. Biol. Che m.， 39, 371-377(1987)などに記載されている。上記（d)の方法に関しては、 Appl. Env iron. MicribioL, 38, 181- 190(1979)および Agric. Biol. Chem., 42, 1773-1778(1978) などに記載されている。上記（e)の方法に関しては、 Agric. Biol. Chem., 36, 1675-16 84(1972)、 Agric. Biol. Chem., 41, 109—116(1977)、 Agric. Biol. Chem. , 37, 2013-20 23(1973)および Agric. Biol. Chem., 51, 2089- 2094(1987)などに記載されている。上 記文献等を参考に各種アミノ酸を生成、蓄積する能力を有する微生物を調製するこ とがでさる。
[0177] さらに上記 (a)〜（e)のいずれかまたは組み合わせた方法によるアミノ酸を生成、蓄 積する能力を有する微生物の調製方法については、 Biotechnology 2nd ed., Vol.6, Products of Primary Metabolism (Vし H Verlagsgesellschaft mbH, Weinneim, 1996) s ection 14a, 14bや Advances in Biochemical Engineering/ Biotechnology, 79, 1-35 (2 003)、アミノ酸発酵、学会出版センター、相田 浩ら（1986)に多くの例が記載されて おり、また上記以外にも具体的なアミノ酸を生成、蓄積する能力を有する微生物の調 製方法は、特開 2003- 164297、 Agric. Biol. Chem., 39, 153-160 (1975)、 Agric. Biol. Chem., 39,1149-1153(1975),特開昭 58- 13599、 J. Gen. Appl. Microbiol, 4, 272-28 3(1958)、特開昭 63- 94985、 Agric. Biol. Chem., 37, 2013-2023(1973)、 W097/15673 、特開昭 56-18596、特開昭 56-144092および特表 2003-511086など数多くの報告が あり、上記文献等を参照することにより 1種以上のアミノ酸を生産する能力を有する大 腸菌の変異体を調製することができる。その他の有用物質を生産する能力を有する 大腸菌もまたアミノ酸を生産する能力を有する大腸菌の変異体の調製方法と同様に 、該有用物質の生合成酵素の強化、生合成調節機構および排出機構などの改変に より調製することができる。
3.本発明の有用物質の製造方法
本発明の有用物質の製造方法は、本発明の大腸菌の変異体を培地に培養し、培 養物中に有用物質を生成、蓄積させ、該培養物から該有用物質を採取することを特 徴とする有用物質の製造方法に関する。
該有用物質としては、本発明の大腸菌の変異体を用いて製造できる有用物質であ れば特に限定されないが、例えばタンパク質、ペプチド、アミノ酸、核酸、ビタミン、糖 、有機酸、脂質などあげることができ、タンパク質としては、イノシンキナーゼ、 Glutam ate 5— kinase ( し 2.7.2.11)、 Glutamate— 5— semialdehyde dehydrogenase (Eし 1.2.1.41) 、 Pyrroline-5-carboxylate reductase (EC 1.5.1.2)、ヒト顆粒球コロニー刺激因子など 、ペプチドとしては、ダルタチオンなど、アミノ酸としては、 L—ァラニン、グリシン、 L- グルタミン、 L—グルタミン酸、 L—ァスパラギン、 L—ァスパラギン酸、 L—リジン、 L- メチォニン、 Lースレオニン、 L一口イシン、 L—パリン、 L—イソロイシン、 L—プロリン、 L—ヒスチジン、 L—アルギニン、 L—チロシン、 L—トリプトファン、 L—フエ二ルァラ二 ン、 Lーセリン、 L—システィン、 L— 3—ヒドロキシプロリン、 L— 4ーヒドロキシプロリン など、核酸としては、イノシン、グアノシン、イノシン酸、グァ-ル酸など、ビタミンとして は、リボフラビン、チアミン、ァスコルビン酸など、糖としては、キシロース、キシリトール など、脂質としては、 EPA (エイコサペンタエン酸)や DHA (ドコサへキサェン酸）などを あげることができる。
[0179] 本発明の製造法に用いられる大腸菌の変異体の培養は、以下に記載した通常の 方法に従って行うことができる。
本発明の製造法に用いられる大腸菌の変異体を培養する培地は、該微生物が資 化し得る炭素源、窒素源、無機塩類等を含有し、該微生物の培養を効率的に行える 培地であれば天然培地、合成培地の!/、ずれを用いてもょ 、。
[0180] 炭素源としては、該微生物が資化し得るものであればよぐグルコース、フラクトース
、スクロース、これらを含有する糖蜜、デンプンあるいはデンプン加水分解物等の炭 水化物、酢酸、プロピオン酸等の有機酸、エタノール、プロパノールなどのアルコー ル類等を用いることができる。
窒素源としては、アンモニア、塩化アンモ-ゥム、硫酸アンモ-ゥム、酢酸アンモ- ゥム、リン酸アンモ-ゥム等の無機酸または有機酸のアンモ-ゥム塩、ペプトン、肉ェ キス、酵母エキス、コーンスチープリカー、カゼイン加水分解物、大豆粕、大豆粕加 水分解物、各種発酵菌体、およびその消化物等を用いることができる。
[0181] 無機塩としては、リン酸第一カリウム、リン酸第二カリウム、リン酸マグネシウム、硫酸 マグネシウム、塩ィ匕ナトリウム、硫酸第一鉄、硫酸マンガン、硫酸銅、炭酸カルシウム 等を用いることができる。
培養は、振盪培養または深部通気攪拌培養などの好気的条件下で行う。培養温度 は 15〜40°Cがよぐ培養時間は、通常 16時間〜 7日間である。培養中の pHは 3. 0〜
9.0に保持することが好ましい。 pHの調整は、無機または有機の酸、アルカリ溶液、尿 素、炭酸カルシウム、アンモニアなどを用いて行う。
[0182] 有用物質が菌体外に生成、蓄積した場合には、培養終了後、培養物から菌体など の沈殿物を除去し、イオン交換処理法、濃縮法、塩析法などを併用することにより、 培養物から目的する有用物質を単離、精製することができる。
有用物質が、菌体内に生成、蓄積される場合には、培養終了後、培養物から菌体 を回収した後、機械的または化学的方法等の適切な方法で破砕する。該菌体破砕 液から、イオン交換処理法、濃縮法、塩析法などを併用することにより、該菌体破砕 液から目的とする有用物質を単離、精製することができる。
実施例 1
[0183] 染色体 DNAが部分的に欠損した大腸菌の変異体ライブラリーの作製
(1)直鎖 DNAによる染色体 DNA上の相同組換えが可能な大腸菌の作製
直鎖 DNAによる染色体 DNA上の相同組換えが可能な大腸菌 KM22株 [Gene, 24 6, 321-330 (2000)]より PIファージを以下の方法により調製した。
大腸菌 KM22株を 20mg/lのカナマイシンを含む LB液体培地 [lOg/1バタトトリプトン（ ディフコ社製)、 5g/lバクトイーストエキストラタト (ディフコ社製)、 5g/l塩ィ匕ナトリウム、 lml/1の lmol/1水酸化ナトリウム]を用いて 30°Cにてー晚培養した後、 0.5mlの培養液 、 1.4mlの新しい LB液体培地および 100 μ 1の 0. lmol/1の塩化カルシウム溶液を混合し た。
[0184] 該混合溶液を 30°Cで 5〜6時間振とう培養した後、 400 μ 1の該混合液を滅菌したチ ユーブに移した。そこに 2 1の P1ファージストック溶液を添カ卩し、 37°Cで 10分間保温 した後、 50°Cに保温したソフトァガー溶液（lOg/1バタトトリプトン、 5g/lバクトイースト エキストラタト、 5mmol/l塩化カルシウム、 lml/1の lmol/1水酸化ナトリウム、 3g/l寒天） を 3ml添加して、よく攪拌し、 Ca— LB寒天培地プレート（lOg/1バタトトリプトン、 5g/l バクトイーストエキストラタト、 5mmol/l塩化カルシウム、 lml/1の lmol/1水酸化ナトリウ ム、 15g/l寒天、プレートの直径は 15cm)上に重層した。
[0185] 該プレートを 37°Cで 7時間培養した後、スプレッダ一でソフトァガ一部分を細力べ砕 いて回収し、 1500g、 4°C、 10分間遠心分離した。上清 1.5mlに対し 100 1のクロ口ホル ムを添加し、 4°Cにて一晩保存した。翌日、溶液を 15000gにて 2分間遠心分離し、上 清をファージストックとして 4°Cで保存した。
次に、取得したファージを用いて大腸菌 W3110株を形質転換した。 Ca— LB液体培 地で 30°C、 4時間培養した大腸菌 W3110株の培養液を 200 μ 1分取し、ファージストツ クを 1 μ 1添カ卩した。 37°Cで 10分間保温した後、 5mlの LB液体培地と 200 μ 1の lmol/1の クェン酸ナトリウム溶液を添加し、攪拌した。 1500g、 25°C、 10分間遠心分離した後、 上清を捨て、沈殿した細胞に lmlの LB液体培地と 10 1の lmol/1のクェン酸ナトリウム 溶液をカ卩ぇ 30°Cで 2時間保温した。 100 1の該溶液を 20mg/lのカナマイシンを含む アンチバイオティックメディウム 3寒天平板培地に塗布し、 30°Cで一晩培養した。出現 したコロニー数個をそれぞれ、 20mg/lのカナマイシンを含むアンチバイオティックメデ ィゥム 3寒天平板培地（0.15%肉エキス、 0.15%酵母エキス、 0.5%ペプトン、 0.1%グル コース、 0.35%塩化ナトリウム、 0.132%リン酸水素二カリウム、 1.5%寒天、 pH7.0)に塗 布し、その薬剤感受性を確認し、カナマイシン耐性株を選抜することにより、直鎖 DN Aによる染色体 DNA上の相同組換えを可能とする染色体 DNA領域 [ A (recC ptr re cB recD)::Plac-red kan]が形質導入された大腸菌 W3110red株を取得した。
(2)染色体 DNAが部分的に欠損した大腸菌の変異体ライブラリーの作製
(i)コンビテントセルの作製
上記（1)で取得した大腸菌 W3110red株を、 lmmol/1の IPTG (Isopropyl-Thio- β - D -Galactopyranoside)を添カ卩した 100mlの LB液体培地を用いて、 30°Cにて OD660nm が 0.1に達するまで培養した。なお、以下の操作は 4°C、または氷冷した溶液を用いて 行った。
[0186] 得られた培養物を遠心分離し、沈殿した菌体を 50mlの 20%グリセロール溶液に懸 濁した。該グリセロール溶液を遠心分離し、沈殿した菌体を再び 20%グリセロール溶 液に懸濁する操作を 3回以上繰り返すことで菌体を洗浄した後、 50 1の 10%グリセ口 ール溶液に懸濁することでエレクト口ポレーシヨン用のコンビテントセル溶液を取得し た。
(ii)染色体 DNAへの欠損導入用 DNA断片の作製
配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 4489585番〜 4535472番目の塩基配 列を有する約 46kbpの DNAの欠損を染色体 DNAへ導入するための DNA断片を以 下の方法で作製した。
[0187] 配列番号 2で表される塩基配列を有する DNA (配列番号 1で表される塩基配列中 の塩基番号 4487585番〜 4487605番目の塩基配列からなる DNA。以下、プライマー Aという)、配列番号 3で表される塩基配列を有する DNA (25merのリンカ一配列の 3' 側に、配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 4489584番〜 4489561番目の塩 基配列を付加した塩基配列からなる DNA。以下、プライマー Bという)、配列番号 4で 表される塩基配列を有する DNA (配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 453 7475番〜 4537451番目の塩基配列からなる DNA。以下、プライマー Cという)、配列 番号 5で表される塩基配列を有する DNA (22merのリンカ一配列の 3'側に、配列番 号 1で表される塩基配列中の塩基番号 4535473番〜 4535496番目の塩基配列を付加 した塩基配列力もなる DNA。以下、プライマー Dという)を合成した。
[0188] 大腸菌 W3110red株の染色体 DNAを铸型にし、プライマー Aと B、およびプライマ 一 Cと Dをそれぞれプライマーセットとして用い PCRを行った。 PCRには LA-Taq (タ カラバイオ製)を用い、添付の指示書に従い反応液を作製した。該反応液に lOOngの 精製した染色体 DNAまたは爪楊枝の先で拾った少量の大腸菌 W3110red株の菌体 、および各々 20pmolのプライマー DNAを添カ卩し PCRを行った。 PCRは、 94°Cで 3分 間保温した後、 94°Cで 15秒間、 55°Cで 20秒間、 68°Cで 1分 30秒間のサイクルを 30回 繰り返し、 72°Cで 10分間保温する条件で行った。
[0189] 上記 PCRで増幅した DNA断片は、 PCR purification Kit (QIAGEN社製）を用いて 精製し、それぞれ 50 1の水に溶解した。該 DNA断片は、それぞれ染色体 DNA上 の欠損対象領域の両端の塩基配列と相同な lkbの DNAであることを確認した。以下 、プライマー Aおよび Bをプライマーセットとして増幅された DNA断片を上流アーム、 プライマー Cおよび Dをプライマーセットとして増幅された DNA断片を下流アームと いう。
[0190] 次に、バチルス'サチルス (Bacillus subtilis) 168株（ATCC23857)の染色体 DNAを 铸型にし、配列番号 6で表される塩基配列を有する DNAと配列番号 7で表される塩 基配列を有する DNAをプライマーセットに用いて PCRを行った。 PCRは、铸型 DN Aおよびプライマー DNAの種類が異なる以外は上記と同じ組成の反応液を用い、同 じ反応条件で行った。
[0191] 上記 PCRで増幅した DNA断片を上記と同様の方法で精製し、 50 μ 1の水に溶解し た。該 DNA断片は、ネガティブセレクションに用いることができるバチルス ·サチルス 由来の sacB遺伝子（Genbank accession no. X02730)であ o と *ar確認し 7こ。
次に、 pHSG399プラスミド DNA (タカラバイオ社製)を錄型にし、配列番号 8で表さ れる塩基配列を有する DNAと配列番号 9で表される塩基配列を有する DNAをブラ イマ一セットに用い PCRを行った。 PCRは、铸型 DNAおよびプライマー DNAの種 類が異なる以外は上記と同じ組成の反応液を用い、同じ反応条件で行った。
[0192] 上記 PCRで増幅した DNA断片はァガロースゲル電気泳動により分離し、 QIA quic k Gel Extraction Kit (QIAGEN社製）を用いて精製した後、 50 μ 1の水に溶解した。該 DNA断片は、クロラムフエ-コール耐性遺伝子 (cat遺伝子）を含む DNA断片である ことを確認した。
次に、上記で取得した sacB遺伝子を含む DNA断片および cat遺伝子を含む DNA 断片を铸型にし、配列番号 10で表される塩基配列からなる DNA、および配列番号 1 1で表される塩基配列からなる DNAをプライマーセットに用いた PCRを行った。 PCR は、铸型 DNAおよびプライマー DNAの種類が異なる以外は上記と同じ組成の反応 液を用い、同じ反応条件で行った。
[0193] 上記 PCRで増幅した DNA断片はァガロースゲル電気泳動により分離し、 QIA quic k Gel Extraction Kitを用いて精製した後、 50 μ 1の水に溶解した。該 DNA断片は、 sa cB遺伝子および cat遺伝子が同一方向に連結した DNA断片であることを確認した。 次に、上記で取得した上流アーム、下流アーム、および sacB遺伝子と cat遺伝子が 連結した DNA断片の 3つの DNA断片を混合したものを铸型 DNAに、配列番号 12 で表される塩基配列カゝらなる DNA (配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 4 488585番〜 4488610番目の塩基配列力 なる DNA)、配列番号 13で表される塩基 配列からなる DNA (配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 4536475番〜 4536 451番目の塩基配列からなる DNA)をプライマーセットに用いた PCRを行った。 PCR は、铸型 DNAとして 1 μ 1の上流アーム DNA溶液、 1 μ 1の下流アーム DNA溶液、お よび 1.5 1の sacB遺伝子および cat遺伝子が連結した DNA断片を用い、配列番号 1 2および 13で表される塩基配列からなる DNAをプライマーセットとして用いる以外は 上記と同じ組成の反応液を用い、同じ反応条件で行った。
[0194] 上記 PCRで増幅した DNA断片はァガロースゲル電気泳動により分離し、 QIA quic k Gel Extraction Kitを用いて精製した後、 50 μ 1の水に溶解した。該 DNA断片は、 sa cB遺伝子および cat遺伝子が結合した DNAの両端に、欠損対象領域の両端と相同 な DNA断片がそれぞれ付加した DNA断片（以下、領域欠損用 DNA断片と 、う）が 取得できて!/ヽることを確認した。
(iii)染色体 DNAが部分的に欠損した大腸菌の変異体の作製
上記で取得した領域欠損用 DNA断片 0.1 gを、上記で取得した大腸菌 W3110re d株のコンビテントセル溶液 50 μ 1に添加し、 0.1cmのキュベット (BioRad社製)を用いて 、 1.8KV、 25 Fの条件でエレクト口ポレーシヨンを行った。該領域欠損用 DNA断片 が大腸菌 W3110red株の染色体上に組み込まれた形質転換株を、 LBcmプレート（10 g/1バタトトリプトン (Difco社製）、 5g/lバクトイーストエキストラタト（Difco社製）、 20mg/l カナマイシン、 15mg/lクロラムフエ-コール、 lml/1の lmol/1 NaOH)上で選択した。 選択された形質転^ のコロニーを suLB寒天培地〔10g/lバタトトリプトン (Difco社 製）、 5g/lバクトイーストエキストラタト（Difco社製）、 10%シユークロース、 20mg/lカナ マイシン、 15mg/lクロラムフエ-コール、 lml/1の lmol/1 NaOH〕プレートにレプリカし、 シユークロース感受性を示す株を選択した。
[0195] 選択された株の染色体 DNA上において欠損対象領域である配列番号 1で表され る塩基配列中の 4489585番〜 4535472番目の塩基配列力 sacB遺伝子および cat遺 伝子が連結した DNAと置換していることを以下の方法により確認した。
形質転換に用いた直鎖 DNAのアーム配列末端力 さらに上流および下流にそれ ぞれ lkb離れた領域に相同な塩基配列を有する配列番号 2で表される塩基配列から なる DNA (プライマー A)および配列番号 4で表される塩基配列力 なる DNA (プラ イマ一 C)をプライマーセットに用い、上記で選択された株の染色体 DNAを铸型とし た PCRを行った。 PCRは、铸型として上記で選択された株の少量の菌体 (爪楊枝の 先でコロニー力 拾った程度）を用い、プライマーセットとして配列番号 3および 5で表 される塩基配列を有する DNAを用いた以外は、上記と同じ組成の反応液、反応条 件で行った。
[0196] 上記 PCRにより、約 6.7kbの DNA断片が増幅した。 sacB遺伝子と cat遺伝子が連結 した DNA断片（2.7kb)の両端にそれぞれ約 2kbの DNAが付加された DNA断片は、 約 6.7kbであることから、プライマー Aおよび Cをプライマーセットに用いた PCRにより 約 6.7kbの増幅断片が得られた形質転換株は目的とする形質転換株である。よって、 該形質転換株を Δ E_suc株 (欠損領域 4489585〜4535472bp)と命名した。
(iv)染色体 DNAの部分的な領域が欠損した大腸菌の変異体の作製
Δ E_suc株の製造法と同様の方法により、大腸菌 W3110red株の染色体 DNA上の 様々な領域が欠損して ヽる変異体を作製した。
[0197] Δ E_suc株から cat遺伝子および sucB遺伝子が連結した DNAが削除された大腸菌 の変異体を、以下の方法により製造した。配列番号 14で表される塩基配列力もなる DNA (配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 4535496番〜 4535476番目およ び塩基番号 4489584番〜 4489561番目の塩基配列を結合した塩基配列からなる DN A。以下、プライマー Eという)、配列番号 15で表される塩基配列力もなる DNA (配列 番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 4489561番〜 4489584番目と 4535476番〜 4 535496番目の塩基配列を結合した塩基配列からなる DNA。以下、プライマー Fとい う)を合成した。大腸菌 W3110株の染色体 DNAを铸型にし、プライマー Aおよびブラ イマ一 E、並びにプライマー Cおよびプライマー Fをそれぞれプライマーセットに用い て PCRを行った。 PCRは、铸型およびプライマーセットの種類が異なる以外、上記と 同じ組成の反応液、反応条件で行った。
[0198] 上記 PCRで増幅した DNA断片は PCR purification Kitを用いて精製した後、 50 μ 1 の水に溶解した。該 DNA断片が欠損対象領域の両端の染色体 DNAの塩基配列と それぞれ相同な 2kbの塩基配列を有する DNAであることを確認した。以下、プライマ 一 Aおよび Eをプライマーセットに用いて増幅された DNAを上流アーム、プライマー Cおよび Fをプライマーセットに用いて増幅された DNAを下流アームと呼ぶ。
[0199] 次に上記で得られた上流アームおよび下流アームを混合したものを铸型とし、配列 番号 12および 13で表される塩基配列力もなる DNAをプライマーセットとして用いた PCRを行った。 PCRは、铸型として上記で取得した上流アーム DNA溶液を 1 1、下 流アーム DNA溶液を 1 μ 1用い、プライマーセットとして配列番号 12および 13で表さ れる DNAを用いた以外は、上記と同じ組成の反応液、反応条件で行った。
[0200] 上記 PCRで増幅した DNA断片はァガロースゲル電気泳動により分離し、 QIA quic k Gel Extraction Kitを用いて精製した後、 50 μ 1の水に溶解した。上記両アームの欠 損領域側のそれぞれ lkbの領域同士が結合した 2kbの断片を増幅 DNA断片（以下、 sacB-cat遺伝子削除用 DNA断片と ヽぅ）が取得できて ヽることを確認した。
上記（2) (i)の方法で、 A E_suc株のコンビテントセル溶液を作製し、遺伝子削除用 DNA断片を添加し、エレクト口ポレーシヨンにより該 DNA断片を Δ E_suc株に導入し た。選択培地には、 SuLB寒天培地を用いた。選択された形質転換株のコロニーを L Bern寒天プレートにレプリカし、クロラムフエ-コール感受性を示す株を選択した。
[0201] 次に、上記で選択されたシユークロース耐性かつクロラムフエ-コール感受性株の 染色体 DNAを铸型にし、プライマー Aおよび Cをプライマーセットとして用いた PCR を行った。 PCRは、铸型 DNAおよびプライマーセットが異なる以外、上記と同様の組 成の反応液、反応条件で行った。
上記 PCRにより、約 4.0kbの増幅断片が得られた。 目的とする置換が導入され、 sue 遺伝子および cat遺伝子が削除されたシユークロース耐性かつクロラムフエ-コール 感受性株の染色体 DNAを铸型にした PCRによって取得される増幅 DNA断片は、 欠損領域に近接する上流と下流それぞれ 2kbpが結合している領域が増幅されること 力も約 4kbのバンドが増幅する。よって、上記方法によりマーカー遺伝子が残らないよ うに染色体 DNA上の特定領域を欠損した染色体 DNAの部分欠損株 ( Δ E株)が作 製できたことが確認された。
(V)染色体 DNAが部分的に欠損した大腸菌の変異体ライブラリーの作製
欠損させたい染色体 DNA上の領域の両端にある塩基配列に基づき設計すること ができる DNAを、上記プライマー A〜Dの代わりに用いることにより、上記と同様の方 法によって大腸菌 W3110red株の染色体 DNA上の任意の領域が欠損した大腸菌の 変異体を作製した。
実施例 2
[0202] 最小培地を用いた生育試験
LB寒天培地 (LB培地の組成に 15g/lの寒天をカ卩えて平板ィ匕したもの)上に上記実 施例 1で取得した各種変異体を塗布し、 37°Cにて一晩培養して菌体を得た。少量の 該菌体を 50mg/lのカナマイシンを含む 5mlの LB培地に植菌してー晚培養し、培養物 を得た。 50 1の該培養物を 1%グルコースと 10mg/lの硫酸鉄を含む 5mlの M9最小培 地に植菌し、 37°Cで振とう培養し、 0、 6、 10、 13、 16、 19、 32時間培養後の濁度を 660η mの吸収で測定した。上記変異体と親株である大腸菌 W31 lOred株との生育を比較し て、親株とほぼ同等の生育曲線を示した変異体を選抜した。
[0203] 選抜された変異体が有する染色体 DNAの欠損領域と該領域に含まれる遺伝子を
^： ^した ο
[0204] [表 2] 表 2
欠損領域名 欠損領域に含まれる遺伝子
Δ 101 Β JW0020(insB), JW0021 (insA)
Δ 102 JW0065(yabJ), JW0066(yabK), JW0067(tbpA), JW0068(yabN)
Λ 103 JW0146(fhuA), JW0147(fhuC), JW0148(f uD), JW0149(fhuB)
JW0213(yafJ), JW0214(yafK), JW0215(yafQ), JW0216(dinJ), JW0217(yafL),
Δ001 JW0218(yafM), JW0219(fhiA), JW0220(lafU), JW0221 (dinP), JW0222(yaf ),
JW0223(yafO), JW0224(yafP), JW0225(127#12), JW0226(prfH)
JW0234(ykfI), JW0235(yafW), JW0235.5(yeeT), JW0236(ykfG), JW0237(yafX), JW0238(ykfF), JW0239(ykfB), JW0240(yafY), JW0241 (ypjK), JW0242(yafZ), JW0243(ykfA), JW0244(perR), JW0245(129#3.1 ), JW0246(129#3.2), JW0247(129#5), JW0248(ykfC), JW0249(130#0.1 ), JW0250(is5B), JW0251 (yi51 ), JW0252(mmuP), JW0253(mmuM), JW0254(afuC), JW0255(130#4), JW0256(insB), JW0257(insA), JW0258(130#5), JW0259(yagB), JW0260(yagA), JW0261 (yagE), JW0262(yagF), JW0263(yagG), JW0264(yagH), JW0265(yag[), JW0266(argF), JW0267(yfjI), JW0268(insB), JW0269(insA), JW0270(yagJ), JW0271 (yagK), JW0272(yagL), JW0273(yagM), JW0274(yagN), JW0275(intF), JW0276(yagP), JW0277(yagQ), JW0278(yagR), JW0279(yagS), JW0280(yagT), JW0281 (yagU), JW0282(ykgJ), JW0283(yagV), JW0284(yagW), JW0285(yagX), JW0286(yagY), JW0287(yagZ), JW0288(ykgK), JW0289(ykgL), JW0290(ykgM), JW0291 (eaeH), JW0292(134#4.1 ), JW0293(134#4.2), JW0294(ykgA), JW0295(ykgB), JW0296(ykgI), JW0297(merA),
Λ002
JW0298(ykgD), JW0299(ykgE), JW0300(ykgF), JW0301 (ykgG), JW0302(ykgH), JW0303(betA), JW0304(betB), JW0305(betI), JW0306(betT), JW0307(yahA), JW0308(yahB), JW0309(yahC), JW0310(yahD), JW031 KyahE), JW0312(yahF), JW0313(yahG), JW0314(yahH), JW0315(arcM), JW0316(yahJ), JW031 7(yahK), JW0318(yahL), JW031 9(ya M), JW0320(yahN), JW0321 (yahO), JW0322(prpR), JW0323(bcpA), JW0324(prpC), JW0325(prpD), JW0326(prpE), JW0327(codB), JW0328(codA), JW0329(cynR), JW0330(cynT), JW0331 (cynS), JW0332(cynX), JW0333(lacA), JW0334(lacY), JW0335(lacZ), JW0336(lacI), JW0337(mhpR), JW0338(mhpA), JW0339(mhpB), JW0340(mhpC), JW0341 (mhpD), JW0342(mhpF), JW0343(mhpE), JW0344(m pT), JW0345(yaiL), JW0346(yaiM), JW0347(adhC), JW0348(yaiN), JW0349(yaiO), JW0350(140#9), JW0351 (yi2A), JW0352(yi22), JW0353(yi24), JW0354(yi23), JW0355(yaiP), JW0356(yaiS), JW0357(tauA), JW0358(tauB), JW0359(tauC), JW0360(ssiD)
Figure imgf000229_0001
Figure imgf000229_0002
縛）
T69lZ0/S00Zdf/X3d 833 ^ 0/900Z OAV
Figure imgf000230_0001
Figure imgf000230_0002
魏）
T69lZ0/S00Zdf/X3d 633 ^ 0/900Z OAV
Figure imgf000231_0001
T69lZ0/S00Zdf/X3d OSS ^ 0/900Z OAV
Figure imgf000232_0001
T69lZ0/S00Zdf/X3d ^ 0/900Z OAV
Figure imgf000233_0001
Figure imgf000233_0002
T69lZ0/S00Zdf/X3d ^ 0/900Z OAV
Figure imgf000234_0001
Figure imgf000234_0002
T69lZ0/S00Zdf/X3d ^ 0/900Z OAV
Figure imgf000235_0001
( W) z
T69lZ0/S00Zdf/X3d 1783 ^ 0/900Z OAV
Figure imgf000236_0001
Figure imgf000236_0002
T69lZ0/S00Zdf/X3d 983 ^ 0/900Z OAV
Figure imgf000237_0001
Figure imgf000237_0002
T69lZ0/S00Zdf/X3d 983 ^ 0/900Z OAV 表 2 (続き)
Figure imgf000238_0001
実施例 3
[0215] 複数の部分的な欠損がある染色体 DNAを有する大腸菌の変異体の作製
複数の部分的な欠損がある染色体 DNAを有する大腸菌の変異体は、大腸菌 W31 lOred株を用いて、上記実施例 2で同定された生育に影響を与えない欠損領域を、 上記実施例 1の方法を繰り返すことにより大腸菌 W311 Ored株に集積することにより作 製した。表 3に作製した複数の部分的な欠損がある染色体 DNAを有する大腸菌の 変異体が有する欠損領域を示した。
実施例 4
[0216] 複数の部分的な欠損がある染色体 DNAを有する大腸菌の変異体の培養評価（1) 実施例 3で取得した複数の部分的な欠損がある染色体 DNAを有する大腸菌の各 種変異体を LB寒天培地上にを塗布し、 30°Cにて一晩培養して菌体を得た。少量の 該菌体を lmlのグルコースを 3%含む LB培地に植菌してー晚培養し培養物を得た。 5 0 μ 1の該培養物を 3%のグルコース含む 5mlの LB培地に植菌し、 30°Cで 24時間培養 した。培養終了時の濁度を 590nmの吸収で測定した。結果を表 3に示す。
[表 3]
表 3
Figure imgf000239_0001
表 3に示すように、染色体 DNAの全欠損領域力 70kbp以上の、複数の部分的な 欠損がある染色体 DNAを有する大腸菌の変異体は、その欠損総量にほぼ相関して 、培養 24時間後の濁度の上昇がみられた。いずれの大腸菌の変異体の細胞の形態 は、野生型の大腸菌の細胞と同じであり、染色体 DNAの全欠損領域が 470kbp以上 の、複数の部分的な欠損がある染色体 DNAを有する大腸菌の変異体は、野生型の 大腸菌より、培養して得られる菌体数が多いことがわ力つた。
実施例 5
[0219] 複数の部分的な欠損がある染色体 DNAを有する大腸菌の変異体の培養評価（2) 実施例 4で確認された菌体量の増大が、各変異体に新たに付加された欠損領域群 のみによる効果でないことを確認するため、表 3に示したそれぞれの変異体に新たに 付加された欠損のみを持つ変異体を実施例 1および 3記載の方法で作製し、実施例 4と同様の方法にて培養して、培養開始力も 24時間後の濁度を測定した。結果を表 4 に示す。
[0220] [表 4] 表 4
総欠損長 最終到達 菌株名 欠損領域
(k b ρ) 濁度 （％)
W3110red なし 0.0 100
Unitl Δ018 48.1 102
Unit2 Δ055 24.2 107
Unit3 Δ 081、 Δ 082、 Δ083 45.3 93
Unit4 Δ019 27.0 108
UnitS Δ 029Β, Δ030 17.7 99
Unit6 Δ009Βヽ Δ010、 Δ011 73.6 100
Unit7 Δ078、 Δ079、 Δ 080 43.8 101
Unit8 Δ054 47.8 108
Unit9 Δ001、 Δ002、 Δ007 149.6 101
UnitlO Δ 074、 Δ 075、 Δ 077 33.3 94
Unitll Δ 036、 Δ 037、 Δ 038、 Δ 039、 Δ 040 95.5 110
Unitl2 Δ 050、 Δ 051、 Δ 096、 Δ 097 50.3 96
Unitl3 Δ062 9.8 100
Unitl4 Δ041、 Δ042、 Δ043、 Δ 088 78.4 109
Unitl5 Δ098 1.8 98
Unitl6 Δ 085、 Δ 086 95.1 94
Unitl7 Δ013 10.8 102
Unitl8 Δ084 13.6 93 [0221] 表 4に示したように、新たに付加された欠損のみでは、濁度の上昇がみられないこと から、実施例 4で見いだされた菌体量の上昇は、菌体量の上昇に効果がある欠損の 積み重ねで得られたものではなく、単独では生育に影響しな 、染色体 DNA上の欠 損を、多重かつ同時に欠失させた結果であることが示された。
実施例 6
[0222] 複数の部分的な欠損がある染色体 DNAを有する大腸菌の変異体の作製 (2)
表 3に示した Stepl8株を親株とし、表 2に示す Δ 043領域の欠損を復帰させた株を 以下の方法で作製した。
実施例 3記載の方法を用い、大腸菌 W3110red株の Δ 041および Δ 042領域を欠損 させた株を取得した。次に、 Δ 043領域に隣接する Δ 88領域に sacB遺伝子と cat遺伝 子を連結したカセット（以下、 sacB_catと表記する。図 1参照）を挿入した株 (以下、大 腸菌 W3110red A 041、 Δ 042、 A 088::sacB_cat株という)を作製した。
[0223] 大腸菌 W3110red A 041、 Δ 042、 A 088::sacB_cat株より実施例 1 (1)記載の方法に より P1形質導入ファージを調製し、実施例 1 (1)記載の方法により St印 18株を P1ファ ージで形質転換し、クロラムフエ-コール耐性株を取得することで、 Δ 088領域へ sacB _catカセットが挿入された株を選択した。
選択された St印 18株の形質転換株うち、 Δ 043領域が復帰している株を実施例 1 (2 ) (iii)記載の欠損の確認方法を用いて選択した。選択した株の染色体 DNA上にある SaCB_Catを実施例 1 (2) (iv)記載の方法を用いて削除することにより、表 5に示す領域 が欠損した染色体 DNAを有する Stepl8 y株を取得した。
[0224] 次に実施例 1および 3記載の方法を用いて Stepl8 y株の染色体 DNAにさらに欠損 を導入した大腸菌を作製した。作製した複数の部分的な欠損がある染色体 DNAを 有する大腸菌の変異体を表 5に示す。
[0225] [表 5] 表 5
培養物の濁度 総欠損長
菌株名 欠損領域 (絶対値）
(kbp)
19時間後 36時間後
Δ001、 Δ 002、 Δ007、 Δ009Β,
Δ010、 Δ011、 Δ013、 Δ018、
Δ019、 Δ 029Β、 Δ 030、 △ 036、
Δ 037、 Δ038、 Δ039、 Δ040、
Δ041、 Δ042、 Δ088、 Δ050、
Stepl8 y 865.7 5.54
Δ051、 Δ0%、 Δ097、 Δ054、
Δ098、 Δ 055、 Δ062、 Δ074、
Δ075、 Δ077、 Δ078、 Δ079、
Δ080、 Δ081、 Δ082、 Δ083、
Δ084、 Δ 085、 Δ 086
884.1 5.49
933.8 5.27
Figure imgf000242_0001
Step21 Step20が有する欠損領域. 941.1 5.25
Δ 056Β
Step22 Step21が有する欠損領域. 955.4 5.50
Δ012
Step23 Step22が有する欠損領域. 985.2 5.35
Δ046、 Λ047, Λ 094
1001.6 5.61
1010.8 5.43
Figure imgf000242_0002
1020.5 5.62
1020.8 5.52
Figure imgf000242_0003
Step28 Step27が有する欠損領域. 1026.7 5.36
Δ 103 実施例 7
実施例 6で得られた変異体の培養評価
実施例 6で得られた各種変異体を LB寒天培地上に塗布し、 37°Cで一晩培養して 菌体を得た。少量の該菌体を 50mg/lのカナマイシンを含む 5mlの LB培地に植菌して 一晩培養して培養物を得た。 50 1の該培養物を 1%グルコース、 5mg/l硫酸鉄、 20g /1炭酸カルシウムを含む 5mlの M9培地に植菌して、 37°Cにて振とう培養し、 0、 6、 10 、 13、 16、 19、 32時間培養後の濁度を 660nmの吸収で測定した。
[0227] 培養開始後 19時間目と 32時間目の濁度を表 5に示した。総欠損領域が 933kbpを超 えた変異体は、親株の濁度上昇が止まり定常期に入ったと思われる 19時間目以降も 、濁度上昇が続いた。すなわち総欠損領域が 933kbp以上ある、複数の部分的な欠 損がある染色体 DNAを有する大腸菌の変異体は、野生型の大腸菌より、培養して 得られる菌体数が多 、ことがわ力つた。
実施例 8
[0228] 複数の部分的な欠損がある染色体 DNAを有する大腸菌の変異体を用いた物質生 産 1
( 1)スレオニン要求性変異株の造成
実施例 1の方法に従い、大腸菌 W3110red株の染色体 DNA上のスレオニン生合成 系オペロン (thrABC遺伝子。配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 36〜517 5番目で表される塩基配列力 なる）が欠損したスレオニン要求性変異株を造成し、 大腸菌 W31 lOred Δ T株と命名した。
(2) metA遺伝子が欠損し、スレオニン生合成系遺伝子が導入された変異株の造成 (i) metA遺伝子欠損、 thrABC遺伝子導入用 DNA断片の作製
大腸菌 W31 lOred株の染色体 DNAを铸型にし、配列番号 16で表される塩基配列 力もなる DNAおよび配列番号 17で表される塩基配列からなる DNAをプライマーセ ットとして用いた PCRにより、 metA遺伝子の 5'側上流域の塩基配列を有する DNA断 片を増幅した。
[0229] PCRには、 LA-Taqを用い添付の指示書に従 、反応液を作製した。該反応液に 10 ngの精製した染色体 DNA、各々 20pmolのプライマー DNAを添カ卩し PCRを行った。 PCRは、 94°Cで 2分間保温後、 94°Cで 15秒間、 55°Cで 20秒間、 68°Cで 90秒間のサイ クルを 25回繰り返した後、 72°Cで 10分間保温する条件で行なった。
上記 PCRにより、目的とする DNA断片（断片 1)が取得できたことを確認し、同様の 方法で、プライマー DNAとして配列番号 18で表される塩基配列からなる DNAおよ び配列番号 19で表される塩基配列力もなる DNAを用いて、 metA遺伝子の 3'側下 流域の塩基配列を有する DNA断片（断片 2)を取得した。
[0230] 次に、大腸菌 W3110red株の染色体 DNAを铸型にし、配列番号 20で表される塩基 配列からなる DNAおよび配列番号 21で表される塩基配列からなる DNAをプライマ 一セットとして用いた PCRによりスレオニンオペロン (thrABC遺伝子）を含む DNA断 片を増幅した。
PCRには、 LA-Taqを用い、添付の指示書に従い反応液を作製した。該反応液に 1 Ongの精製した染色体 DNA、各々 20pmolのプライマー DNAを添カ卩し PCRを行った
[0231] PCRは、 94°Cで 2分間保温後、 94°Cで 15秒間、 55°Cで 20秒間、 68°Cで 5分間のサイ クルを 25回繰り返した後、 72°Cで 10分間保温する条件で行なった。
上記 PCRにより thrABC遺伝子を含む DNA断片（断片 3)が取得できたことを確認 した。
また、 pHSG399プラスミド DNA (タカラバイオ社製)を铸型にし、配列番号 22で表さ れる塩基配列からなる DNAおよび配列番号 23で表される塩基配列からなる DNAを プライマーセットとして用いた PCRにより、クロラムフエ-コール耐性遺伝子 (cat遺 伝子)を含む DNA断片を増幅した。
[0232] PCRには LA-Taqを用い、添付の指示書に従!、反応液を作製した。該反応液に 40 ngのプラスミド DNA、各々 20pmolのプライマー DNAを添カ卩し PCRを行った。
PCRは、 94°Cで 2分間保温後、 94°Cで 15秒間、 55°Cで 20秒間、 68°Cで 1分間のサイ クルを 25回繰り返した後、 72°Cで 10分間保温する条件で行なった。
上記 PCRにより、クロラムフエ-コール耐性遺伝子を含む DNA断片（断片 4)が取 得できて ヽることを確認した。
[0233] 上記 PCRで取得した断片 1〜4は、 QIA quick Gel Extraction Kit (QIAGEN社製） を用いて精製した後、それぞれ 50 1の水に溶解し、 DNA溶液を得た。なお上記 PC Rのプライマー DNAとして用いた配列番号 17で表される DNAと塩基配列 22で表さ れる DNA、配列番号 19で表される DNAと配列番号 21で表される DNA、配列番号 20で表される DNAと配列番号 23で表される DNAは、それぞれが付着可能な配列 、すなわち相補的な配列を有している。
[0234] 上記で取得した断片 1〜4を铸型とし、配列番号 24で表される塩基配列力もなる D NA、配列番号 25で表される塩基配列からなる DNAをプライマーセットとして用いた PCRにより、スレオニンオペロン遺伝子およびクロラムフエ二コール耐性遺伝子が同 一の転写方向になるように連結し、その両端に metA遺伝子の 5 '側上流域および 3 ' 側下流域の塩基配列を有する DNAがさらに連結した DNA断片を増幅した。
[0235] PCRには LA-Taqを用い、添付の指示書に従!、反応液を作製した。該反応液に上 記 DNA溶液各 1 μ 1、各々 20pmolのプライマー DNAを添カ卩し PCRを行った。
PCRは、 94°Cで 2分間保温後、 94°Cで 15秒間、 55°Cで 20秒間、 68°Cで 7分間のサイ クルを 25回繰り返した後、 72°Cで 10分間保温する条件で行なった。
上記 PCRにより、 目的とする DNA断片（以下、スレオニンオペロン遺伝子導入用 D NA断片という）が取得できていることを確認し、該 DNA断片を QIA quick Gel Extrac tion Kitを用いて精製した後、 50 1の水に溶解し、 DNA溶液を得た。
(ii)大腸菌 W31 lOred Δ T株の形質転換
上記（1)で作製した大腸菌 W3110red A T株のコンビテントセルを、実施例 1 (2) (i) 記載の方法に準じて作製した。
[0236] 上記（2) (i)で取得したスレオニンオペロン遺伝子導入用 DNA断片 0.1 μ gを、 50 μ 1の大腸菌 W3110red A T株のコンビテントセル溶液に添カ卩し、 0.1cmのキュベットを用 いて、 1.8KV、 25 μ Fの条件でエレクト口ポレーシヨンを行った。
染色体 DNA上の metA遺伝子領域とスレオニンオペロン遺伝子導入用 DNA断片 が置換した株を、 LBcmプレート上で選択した。ここで上記（2) (i)で取得したスレオ ニンオペロン遺伝子導入用 DNA断片のうち、 PCRの際に変異が導入され、不活性 なスレオニン生合成系蛋白質をコードしているスレオニンオペロン遺伝子が導入され ている株を選択するため、 LBcmプレート上で選択された形質転換株の中から、 LB 寒天培地上で生育し、 M9met寒天最小培地（1%グルコース、 0. 6%リン酸ナトリ ゥム、 0. 3%リン酸二水素カリウム、 0. 05%塩ィ匕ナトリウム、 0. 1%塩化アンモ-ゥ ム、 2mmolZl硫酸マグネシウム '七水和物、 100 μ mol/1塩化カルシウム、 lOmg Zl硫酸第二鉄、 lOOmgZlメチォニン）上で生育できない株、すなわちスレオニン要 求性を示す株を選抜した。該株は染色体 DNA上の metA遺伝子に不活性型スレオ ニン生合成系遺伝子が挿入された株であることを確認し、大腸菌 Thrl株 (W3110red Δ Τ、 Δ metA:： thrABC)と命名した。
(iii)脱感作変異とァテニユエ一ター変異を有するスレオニンオペロンの作製 大腸菌 W31 lOred株の染色体 DNAを铸型とし、配列番号 26で表される塩基配列か らなる DNAおよび配列番号 27で表される塩基配列からなる DNAをプライマーセット に用いた PCRにより、脱感作型 thrA遺伝子の一部を含む、スレオニンオペロンの上 流領域の塩基配列を有する DNA断片を増幅した。すなわち、配列番号 27で表され る DNAは、 J.BacterioL, 185, 5442-5461(2003)記載の脱感作型変異を有している。
[0237] PCRには LA-Taqを用い、添付の指示書に従!、反応液を作製した。該反応液に 10 ngの染色体 DNA、各々 20pmolのプライマー DNAを添カ卩し PCRを行った。
PCRは、 94°Cで 2分間保温後、 94°Cで 15秒間、 55°Cで 20秒間、 68°Cで 2分 30秒間 のサイクルを 25回繰り返した後、 72°Cで 10分間保温する条件で行なった。
上記 PCRにより、目的とする DNA断片が取得できていることを確認し、該 DNA断 片を QIA quick Gel Extraction Kitを用いて精製した後、 50 μ 1の水に溶解し、 DNA 溶液を得た。
[0238] 次に、大腸菌 W3110red株の染色体 DNAを铸型とし、配列番号 20で表される塩基 配列からなる DNAおよび配列番号 28で表される塩基配列からなる DNAをプライマ 一セットに用いた PCRにより、脱感作型 thrA遺伝子の一部を含む、スレオニンオペ口 ンの下流領域の塩基配列を有する DNA断片を増幅した。すなわち、配列番号 28で 表される DNAは、 J.BacterioL, 185, 5442-5461(2003)記載の脱感作型変異を有して いる。
[0239] PCRには LA-Taqを用い、添付の指示書に従!、反応液を作製した。該反応液に 10 ngの染色体 DNA、各々 20pmolのプライマー DNAを添カ卩し PCRを行った。
PCRは、 94°Cで 2分間保温後、 94°Cで 15秒間、 55°Cで 20秒間、 68°Cで 3分 30秒間 のサイクルを 25回繰り返した後、 72°Cで 10分間保温する条件で行なった。
上記 PCRにより、目的とする DNA断片が取得できていることを確認し、該 DNA断 片を QIA quick Gel Extraction Kitを用いて精製した後、 50 μ 1の水に溶解し、 DNA 溶液を得た。
[0240] 上記 PCRで取得した脱感作型 thrA遺伝子の一部を含むスレオニンオペロンの上 流域および下流域の塩基配列を有する DNA断片を铸型とし、配列番号 20で表され る塩基配列からなる DNAおよび配列番号 29で表される塩基配列からなる DNAをプ ライマーセットに用いた PCRにより、脱感作型 thrA遺伝子を含むスレオニンオペロン DNA断片を増幅した。
[0241] PCRには LA-Taqを用い、添付の指示書に従!、反応液を作製した。該反応液に上 記 DNA溶液各 1 μ 1、各々 20pmolのプライマー DNAを添カ卩し PCRを行った。
PCRは、 94°Cで 2分間保温後、 94°Cで 15秒間、 55°Cで 20秒間、 68°Cで 5分間のサイ クルを 25回繰り返した後、 72°Cで 10分間保温する条件で行なった。
上記 PCRにより、目的とする DNA断片が取得できていることを確認し、該 DNA断 片を QIA quick Gel Extraction Kitを用いて精製した後、 50 μ 1の水に溶解し、 DNA 溶液を得た。
[0242] 次に、上記で取得した脱感作型 thrA遺伝子を含むスレオニンオペロン DNA断片を 铸型とし、配列番号 29で表される塩基配列からなる DNAおよび配列番号 30で表さ れる塩基配列からなる DNAをプライマーセットに用いた PCRにより、了テニユエータ 一変異を含むスレオニンオペロン上流領域の塩基配列を有する DNA断片を増幅し た。すなわち、配列番号 30で表される塩基配列力もなる DNAは、 J. Mol. Biol, 183. 529-541(1985)に記載されて 、るスレオニンオペロンのァテ-ユエ一ター変異を含ん でいる。
[0243] PCRには LA-Taqを用い、添付の指示書に従!、反応液を作製した。該反応液に铸 型 DNA断片の DNA溶液を 1 μ 1、各々 20pmolのプライマー DNAを添カ卩し PCRを行 つた o
PCRは、 94°Cで 2分間保温後、 94°Cで 15秒間、 55°Cで 20秒間、 68°Cで 5分間のサイ クルを 25回繰り返した後、 72°Cで 10分間保温する条件で行なった。
上記 PCRにより、目的とする DNA断片（断片 5)が取得できていることを確認した。
[0244] 次に、上記で取得した脱感作型 thrA遺伝子を含むスレオニンオペロン DNA断片を 铸型とし、配列番号 31で表される塩基配列からなる DNAおよび配列番号 20で表さ れる塩基配列からなる DNAをプライマーセットに用いた PCRにより、了テニユエータ 一変異を含むスレオニンオペロン下流領域の塩基配列を有する DNA断片を増幅し た。すなわち、配列番号 31で表される塩基配列力もなる DNAは、 J. Mol. Biol, 183. 529-541(1985)に記載されて 、るスレオニンオペロンのァテ-ユエ一ター変異を含ん でいる。
[0245] PCRには LA-Taqを用い、添付の指示書に従!、反応液を作製した。該反応液に铸 型 DNA断片の DNA溶液 1 μ 1、各々 20pmolのプライマー DNAを添カ卩し PCRを行つ た。
PCRは、 94°Cで 2分間保温後、 94°Cで 15秒間、 55°Cで 20秒間、 68°Cで 4分 30秒間 のサイクルを 25回繰り返した後、 72°Cで 10分間保温する条件で行なった。
上記 PCRにより、目的とする DNA断片（断片 6)が取得できていることを確認した。
[0246] 上記 PCRで取得した断片 5および 6は、 QIA quick Gel Extraction Kitを用いて精製 した後、それぞれ 50 1の水に溶解し、 DNA溶液を得た。
上記で取得した断片 5および 6を铸型とし、配列番号 20で表される塩基配列力もな る DNAおよび配列番号 21で表される塩基配列力もなる DNAをプライマーセットに 用いた PCRにより、脱感作型 thrA遺伝子と発現量を上昇させるァテ-ユエ一ター変 異とを併せ持つ高活性スレオニンオペロンを有する DNA断片を増幅した。
[0247] PCRには LA-Taqを用い、添付の指示書に従!、反応液を作製した。該反応液に上 記断片 5および 6を含有する DNA溶液を各々 1 1、各々 20pmolのプライマー DNA を添カ卩し PCRを行った。
PCRは、 94°Cで 2分間保温後、 94°Cで 15秒間、 55°Cで 20秒間、 68°Cで 5分間のサイ クルを 25回繰り返した後、 72°Cで 10分間保温する条件で行なった。
[0248] 上記 PCRにより、目的とする DNA断片が取得できて ヽることを確認し、該 DNA断 片を QIA quick Gel Extraction Kitを用いて精製した後、 50 μ 1の水に溶解し、 DNA 溶液を得た。
(iv)脱感作型 thrA遺伝子とァテ-ユエ一ター変異を有する高活性スレオニンオペ口 ンを保有する大腸菌の造成 上記 (ii)で作製した大腸菌 Thrl株のコンビテントセルを、実施例 1 (2) (i)記載の方 法に準じて作製した。
[0249] 上記 (iii)で取得した脱感作型 thrA遺伝子とァテ-ユエ一ター変異を有する高活性 スレオニンオペロンを有する DNA断片 0.1 μ gを、 50 μ 1の大腸菌 Thrl株のコンビテン トセル溶液に添カ卩し、 0.1cmのキュベットを用いて、 1.8KV、 25 μ Fの条件でエレクト口 ポレーシヨンを行った。
染色体 DNA上の不活性型スレオニンオペロンと、脱感作型 thrA遺伝子とァテ-ュ エーター変異とを有する高活性スレオニンオペロンが置換した形質転^ ¾を、 M9m et寒天最小培地を用いて、スレオニン要求性を示さず生育する株として選択した。該 株は染色体 DNA上の metA遺伝子に脱感作型 thrA遺伝子とァテ-ユエ一ター変異 を有する高活性スレオニンオペロンが挿入された株であることを確認し、大腸菌 Thr2 株と命名した。
(3)スレオニンの発酵生産
実施例 1 (1)記載の方法に従い、大腸菌 Thr2株より P1形質導入ファージを調製し た。該ファージを用いて大腸菌 W31 lOred株および実施例 3ならびに実施例 6で作製 した複数の部分的な欠損がある染色体 DNAを有する大腸菌の変異体 (Step2、 Step 4、 Step6、 Step8、 Step 10, Stepl2、 Stepl4、 Step 16, Stepl8 y , Step20、 Step22、 Step2 4、 Step26および Step28)を実施例 1 (1)記載の方法で PIファージによる形質導入を 行 ヽ、各変異体の metA遺伝子に大腸菌 Thr2株由来の脱感作型 thrA遺伝子および ァテ-ユエ一ター変異を有する高活性スレオニンオペロンが挿入された株をクロラム フエ-コール而性株として選択し、それぞれ W3110redT、 Step2T、 Step4T、 Step6T、 S tep8T、 SteplOT、 Stepl2T、 Stepl4T、 Stepl6T、 Stepl8 y T、 Step20T、 Step22T、 Step 24T、 Step26Tおよび Step28Tと命名した。
[0250] 上記形質転換株を実施例 1記載の LBcmプレート上に塗布し、 37°Cにて一晩培養 した。該プレート上力 少量の菌体をかきとり、 25mlのスレオニン生産培地（50 g/1グ ルコース、 20 g/1硫酸アンモ-ゥム、 1 g/1リン酸一カリウム、 2 g/1バクトイーストェクス トラタト、 0.5 g/1硫酸マグネシウム七水和物、 5 mg/1硫酸鉄、 5 mg/1硫酸マンガン、 3 0 g/1炭酸カルシウム、 120 mg/1メチォニン）が入ったバッフル付 300ml三角フラスコ に植菌し、 30°C、 250rpmの条件でロータリーシェーカーで 48時間培養した。培養中、 培養開始力も 24時間後に 20g/lの濃度になるようにグルコースを添カ卩し、 SteplOT、 St epl2T、 Stepl4T、 Stepl6T、 Stepl8 y T、 Step20T、 Step22T、 Step24T、 Step26Tおよ び Step28Tの培養液には、 36時間後にも 20 g/1の濃度になるようにグルコースを添カロ した。
[0251] 培養終了後、ダイオネタス社製アミノ酸分析装置を用いて培養液中に蓄積したスレ ォニンを定量した。また培養液中のグルコース濃度の定量は、協和メデッタス社製の グルコース定量試薬を用いて測定した。結果を表 6に示す。
[0252] [表 6] 表 6
Figure imgf000250_0001
[0253] 表 6力ら、染色体 DNAの総欠損長力 70kbを超える SteplO株以降の株のスレオ- ンの生合成系遺伝子を強化した株は、欠損がな ヽ染色体 DNAを有する株のスレオ ニンの生合成系遺伝子を強化した株 (W3110redT)に比べ、有意にスレオニンの蓄 積量が上昇しており、かっこの上昇割合は菌体量の上昇割合以上の値であることか ら、野生型の大腸菌より染色体 DNAが 470kb以上短 、染色体 DNAを有する大腸 菌の変異体は、物質生産の宿主細胞として有用であることが明らかになった。
実施例 9
[0254] 複数の部分的な欠損がある染色体 DNAを有する大腸菌の変異体を用いた物質生 産 2
ダルタチオンは、 3種類のアミノ酸 (グルタミン酸、システィン、グリシン)力もなるぺプ チド性物質である。 γ—ダルタミルシスティン合成酵素とダルタチオン合成酵素の働 きにより、前述の 3つのアミノ酸が縮合しダルタチオンが生合成される。 ΑΤΡは、この 縮合反応に必須な補酵素である。以下では、本願発明の大腸菌の変異体を ΑΤΡ供 給源として用い、ダルタチオンの生産を行った。
(1)ダルタチオン合成酵素遺伝子の取得
以下の実験で用いたダルタチオン合成酵素遺伝子を含むプラスミド DNAは、 FER Μ ΒΡ-337 (特開平 2-31690号)力 抽出したものを用いた。
[0255] またダルタチオン合成酵素遺伝子を含むプラスミド DNAは、以下の方法によっても 取得することができる。
すなわち、特開昭 58- 20196号および J. Gen. Microbiol, 128, 1047-1052(1982)に 記載の方法に従い、大腸菌 B株に対し N—メチルー N' —-トロソグァ-ジンによる変 異処理を行い、ダルタチオン合成が弱化した変異株を取得し、次に C912に同様の変 異処理を行い、ダルタチオン合成が回復した株を取得し、その中力ゝらグルタチオンに よる γ —ダルタミルシスティン合成酵素の阻害が解除された変異株 (以下、阻害解除 株という）を選択する。
[0256] 次に、特開平 2- 31690号および Appl. Environ. Microbiol, 44, 1444-1448 (1982)に 記載の方法に従い、前述の方法で得られた阻害解除株の染色体上の γ —ダルタミ ルシスティン合成酵素遺伝子を、プラスミド pBR322上にクローユングし、さらに特開平 2— 31690号および Agric. Biol. Chem., 47, 1381-1383 (1983)に記載の方法に従い 、阻害解除株の染色体上のダルタチオン合成酵素遺伝子を、プラスミド PBR322上に クロー-ングする。
[0257] 次に特開平 2-31690号および Bioprocess Technol., 19. 159-183(1994)に記載の方 法に従い、上記の二つのクローンィ匕断片をベクタープラスミド pBR325に集めることに より、特開平 2-31690号記載の pBR325-gshI' nまたは該プラスミド DNAと同等のグル タチオン合成酵素遺伝子を有するプラスミド DNAを構築することができる。
上記方法により得られた pBR325-gshI'II (以下、 pGS600という）を用いて、大腸菌 C6 00株を、塩ィ匕カルシウム法により形質転換した。形質転 ·は 20 g/mlのクロラムフ 工-コールを含む LBcmプレートを用いて選択し、大腸菌 C600/pGS600と命名した。
[0258] 大腸菌 C600/pGS600株を、 5mlの 3%グルコースを含む LB液体培地（LBG培地）を 用いて、 30°Cで 24時間、振盪培養した。次に得られた培養物 4mlを 400mlの新しい LB G培地が入った三角フラスコに植菌し、 30°Cで 24時間、振盪培養した。得られた培養 物を遠心分離して菌体を沈殿させ、 100mlの lOOmmol/1トリス塩酸バッファー（0°C、 pH 7.4)を用いて該菌体を 2回洗浄した。
[0259] 該洗浄菌体は- 80°Cで保存し、使用直前に 10mlの lOOmmol/1トリス塩酸バッファー（ PH7.4)を加えて溶解したものを、酵素溶液として用いた。
(2)大腸菌 W3110red株および Step28株の菌体の取得
W31 lOred株および Step28株を、それぞれ 2.5mlの 3%グルコースを含む LB液体培 地（LBG培地）を用いて、 30°Cで 24時間、振盪培養し、得られた培養物 200 1を 20ml の新しい LBG培地が入った三角フラスコに植菌し、 30°Cで 24時間、振盪培養した。 培養終了時に測定した濁度 (OD 660nm)を表 7に記載した。
[0260] 得られた培養物はそれぞれ遠心分離して菌体を沈殿させ、 5mlの lOOmmol/1トリス塩 酸バッファー（0°C、 pH7.4)を用いて該菌体を 2回洗浄した。
得られた洗浄菌体に 200 μ 1の GT溶液（20%グルコース、 0.4%トライトン X- 100)を 加えて得られた菌体溶液を、 ΑΤΡ供給源として使用した。
(3)ダルタチオンの生産
900 1の反応液（2%グルコース、 20mmol/l硫酸マグネシウム、 20mmol/l硫酸二カリ ゥム、 0.22mmol/l酸化型ニコチンアミドアデニンジヌクレオチド、 0.14mmol/lフラビンモ ノヌクレオチド、 5mmol/lグルタミン酸、 5mmol/lシスティン、 5mmol/lグリシン、 0.4%トラ ィトン X- 100、 15mmol/lリン酸一カリウム、 200 mmol/lMOPSバッファー、 pH7.8)に、上 記（1)で取得した酵素液を 100 μ 1、および上記（2)で取得した大腸菌 W3110red株ま たは Step28株の菌体溶液を 100 μ 1添カ卩して 30°Cで 90分間振盪しながら反応を行った
[0261] 反応液中に蓄積したダルタチオンの定量は、ダルタチオン定量キット（同仁ィ匕学研 究所社製)を用いて行った。結果を表 7に示す。
[0262] [表 7] 表 7
Figure imgf000253_0001
[0263] 表 7にあるとおり、 ATP供給源として反応に供した、複数の部分的な欠損がある染 色体 DNAを有する大腸菌の変異体である Step28株の菌体量は、欠損がな!ヽ染色体 DNAを有する大腸菌 W3110red株の菌体量に比べ、 1.6倍（ = 3.6/2.2)である力 グ ルタチオンの蓄積量は 6.6倍（ = 1.19/0.18)であった。
すなわち、本発明の大腸菌の変異体は、細胞当たりの ATP生産活性、すなわち A TP再生活性力 親株である染色体 DNAに欠損がない大腸菌 W3110red株より高い ことを示唆しており、よって本発明の大腸菌の変異体は、その生合成経路において A TPを必要とする有用物質の生産に有用であることがわ力つた。
産業上の利用可能性
[0264] 本発明の大腸菌の変異体を宿主細胞として用いることにより、有用物質を効率よく 製造することができる。
配列表フリーテキスト
[0265] 配列番号 2 人工配列の説明；合成 DNA
配列番号 3—人工配列の説明；合成 DNA
配列番号 4 人工配列の説明；合成 DNA
配列番号 5—人工配列の説明；合成 DNA
配列番号 6—人工配列の説明；合成 DNA
配列番号 7—人工配列の説明；合成 DNA 配列番号 8—人工配列の説明；合成 DNA 配列番号 9 人工配列の説明；合成 DNA 配列番号 10- -人工配列の説明 合成 DNA 配列番号 11 - -人工配列の説明 合成 DNA 配列番号 12- -人工配列の説明 合成 DNA 配列番号 13 - -人工配列の説明 ，合成 DNA 配列番号 14- -人工配列の説明 ，合成 DNA 配列番号 15 - -人工配列の説明 ，合成 DNA 配列番号 16 - -人工配列の説明 ，合成 DNA 配列番号 17- -人工配列の説明 ，合成 DNA 配列番号 18 - -人工配列の説明 ，合成 DNA 配列番号 19 - -人工配列の説明 ；合成 DNA 配列番号 20- -人工配列の説明 ；合成 DNA 配列番号 21 - -人工配列の説明 ；合成 DNA 配列番号 22- -人工配列の説明 ；合成 DNA 配列番号 23 - -人工配列の説明 ；合成 DNA 配列番号 24- -人工配列の説明 ；合成 DNA 配列番号 25 -人工配列の説明 ；合成 DNA 配列番号 26 -人工配列の説明 ；合成 DNA 配列番号 27 -人工配列の説明 ；合成 DNA 配列番号 28 -人工配列の説明 ；合成 DNA 配列番号 29 -人工配列の説明 ；合成 DNA 配列番号 30 -人工配列の説明 ；合成 DNA 配列番号 31 -人工配列の説明 ；合成 DNA

Claims

請求の範囲
以下の [1]および [2]記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子を含み、かつ野生型 の大腸菌より 470kbp以上短い染色体 DNAを有する大腸菌の変異体。ただし、以下 の [1]および [2]記載の遺伝子またはそれらの相同遺伝子中に、野生型の大腸菌が 元来有していない遺伝子（以下、 NC遺伝子という）がある場合は、該野生型の大腸 菌に由来する上記大腸菌の変異体は、 NC遺伝子を有して 、なくてもよ 、。
[l]thrA遺伝子、 thrB遺伝子、 thrC遺伝子、 talB遺伝子、 mog遺伝子、 htgA遺伝子、 dnaK¾fe子、 dnaj¾fe子、 hokC¾fc子、 nhaA遺伝子、 nhaR遺 is子、 rpsT遺お子、 ri bF遺伝子、 ileS遺伝子、 IspA遺伝子、 IkpB遺伝子、 lytB遺伝子、 dapB遺伝子、 carA遺 卞、 carB¾fe十、 caiF遺 子、 caiE遺伝子、 caiD遺 子、 caiC¾fcナ、 caiB遺伝子 、 caiA遺伝子、 caiT遺伝子、 fixA遺伝子、 fixB遺伝子、 fixC遺伝子、 fixX遺伝子、 ke!C 逾 fc子、 folA fe子、 apaH遺お子、 apaG遺 is子、 ksgA¾fe子、 pdxA遺 子、 surA 逾 fc子、 imp遺 子、
Figure imgf000255_0001
hepA¾fc子、 polB遺 is子、 araD¾伝 子、 araA遺伝子、 araB¾fc子、 araC遺 1ZS子、 tbpA¾fe子、 leuD遺 1ZS子、 leuC遺 to子 、 leuB遺伝子、 leuA遺伝子、 leuL遺伝子、 leuO遺伝子、 ilvl遺伝子、 ilvH遺伝子、 fruR 逾 fcナ、 ftsLjAizs 、 ftsl¾伝十、 murE¾fcナ、 murF遺 is 、 mraY遺 子、 murDM 伝子、 ftsW遺伝子、 murG遺伝子、 murC遺伝子、 ddlB遺伝子、 ftsQ遺伝子、 ftsA遺伝 、 ftsZ遺 子、 lpxC¾fcナ、 secA¾fcナ、 mutT遺 is 、 yacE¾fcナ、 guaC遺 1ZS 、 hoiC¾伝子、 ho!B fc子、 ppdD¾fc子、 nadC¾伝子、 ampD¾伝子、 ampE¾伝子 、 aroP¾伝子、 pdhR遺 子、 aceE¾fe子、 aceF遺 is子、 lpdA遺 is子、 acnB遺 is子、 speD¾fcナ、 speE¾fcナ、 gcd¾伝子、 hpt遺伝子、 yadF遺 子、 panD遺 to子、 pan C遺 is子、 panB¾fe子、 htrE¾fc子、 ecpD¾伝子、 folK遺 is子、 pcnB遺 is子、 dksA 逾 fc子、 sfsA fc子、 ligT¾伝子、 hrpB遺 is子、 ponB¾fe子、 hemL¾fe子、 pfs¾伝 子、 dgt遺 is子、 htrA¾伝子、 dapD遺お子、 glnD¾fe子、 map¾伝子、 rpsB¾fc子、 t sf遺 子、 smb逾 to子、 rrf遺 子、 dxr¾feナ、 rthjAizs子、 cdsAjfczs子、 yaeL遺 子 、 hlpA遺伝子、 IpxD遺伝子、 fabZ遺伝子、 IpxA遺伝子、 IpxB遺伝子、 rnhB遺伝子、 dn aE¾feナ、 accA¾feナ、 ldcC¾伝十、 mesj遺 子、 ro ftfe十、 cut 遑 子、 proS遺 子、 resト遺 子、 abc¾伝子、 dniR¾fc子、 gloB¾fe子、 rnhA遺伝子、 dnaQ遺お 子、 up 18遺伝子、 gmhA遺 十、 pepD遺伝子、 gpt遺 十、 crl遺伝子、 phoE遺伝子、 proB遺 ナ、 proA遺 ナ、 hemB遺 子、 proC遺 子、 aroL遺 ナ、 aroM遺 is 、 a raj遺伝子、 sbcC遺伝子、 sbcD遺 is子、 phoB遺伝子、 phoR遺伝子、 brnQ遺 is子、 pr oY遺 子、 malZ遺 ナ、 queA遺 is子、 tgt遺 to子、 secD遺 to子、 secF遺 子、 tsx遺 伝子、 ribD遺伝子、 ribH遺伝子、 nusB遺伝子、 thiL遺伝子、 pgpA遺伝子、 dxs遺伝子 、 ispA遺 is子、 xseB遺伝子、 thil遺伝子、 thij遺伝子、 apbA遺 is子、 cyoE遺伝子、 cyo 。遺伝子、 cyoC遺伝子、 cyoB遺伝子、 cyoA遺伝子、 ampG遺 is子、 bolA遺伝子、 tig 遺伝子、 clpP遺伝子、 clpX遺伝子、 Ion遺伝子、 hupB遺伝子、 cofil:伝子、 mdlA遺伝 子、 mdlB¾fc子、 glnK遺 is子、 amtB¾fc子、 tesB遺 子、 maa¾fc子、 hha遺伝子、 acrB¾伝十、 acrA遺 子、 acrR遺 is子、 aefA¾fe十、 priC遺 子、 apt¾fcナ、 dnaX 逾 ナ、 recR¾fe十、 htpG¾fe十、 adk遺伝子、 hemH遺 子、 aes¾fcナ、 gsk遺 子、 fsr遺 子、 ushA遺 子、 cueR遺 子、 gel遺 子、 gip¾fcナ、 purK¾fcナ、 pur E¾fe子、 ybbF¾伝子、 ppiB¾fc子、 cysS遺 is子、 folD¾fe子、 sftnA遺伝子、 sftnC 逾 fc子、 sftnD遺 子、 s&iH遺 子、 sfoiF¾伝子、 fimZ¾伝子、 entD遺 is子、 fepA遺 子、 fes¾fzs子、 ent 遺伝子、 fepE遺 to子、 fepC¾fc子、 fepG遺 is子、 fepD遺 is子 、 fepB遺伝子、 entC遺 子、 entE遺 to子、 entB¾fc子、 entA遺伝子、 cstA¾伝子、 d sbG遺 is子、 ahpCjAizs子、 ahpFjA伝子、 rnk¾fcナ、 rna遺伝子、 citT¾fcナ、 citGjl: 伝子、 citX遺伝子、 citF遺伝子、 citE遺伝子、 citD遺伝子、 citC遺伝子、 citA遺伝子、 citB遺 is子、 dcuC遑 is子、 dcuC¾伝子、 crcA遺 is子、 cspEjAizs子、 crcB¾izs +、 lip A遺伝子、 lipB遺伝子、 dacA遺伝子、 rlpA遺伝子、 mrdB遺伝子、 mrdA遺伝子、 phpB 逾 fc子、 nadD¾伝子、 holA¾fc子、 rlpB¾fc子、 leuS¾fc子、 lnt¾fe子、 phoLjftte 子、 ubiF¾fe十、 asnB遺伝子、 nagD¾fe十、 nagC¾fcナ、 nagA¾fcナ、 nagB¾fc 子、 nagEjAizs 、 gln jftzs子、 fur¾伝子、 fldA¾fcナ、 seqA¾fcナ、 pgm遺 is子、 po tE遺伝子、 speF遺伝子、 kdpE遺伝子、 kdpD遺伝子、 kdpC遺伝子、 kdpB遺伝子、 kd pA遺伝子、 phrB遺伝子、 end8遺伝子、 abrB遺伝子、 gltA遺伝子、 sdhC遺伝子、 sdh D遺 子、 sdhA¾fe子、 sdhB遺 1ZS子、 sucA¾fc子、 SUCB¾1ZS子、 sucC遺伝子、 sue D遺伝子、 farR遺伝子、 hrsA遺伝子、 cydA遺伝子、 cydB遺伝子、 tolQ遺伝子、 tolR 遺伝子、 tolA遺伝子、 tolB遺伝子、 pal遺伝子、 nadA遺伝子、 pnuC遺 子、 czcD遺 ナ、 aroG遺伝子、 gpmA遺伝子、 galM遺伝子、 galK遺伝子、 galT遺 to子、 galE遺 子、 modF遺 izs十、 modE遺 fc 、 modA遺 is十、 modB遺 子、 modC遺伝ナ、 bioA遺 子、 bioB遺伝子、 bioF遺 子、 bioC¾fc子、 bioD遺 is子、 uvrB¾伝子、 moaAMfe 子、 moaB遺 十、 moaし遺 子、 moaD遺 十、 moaE遺 +、 rhlE遺 子、 dps遺伝 子、 ompX¾fe十、 mipB¾fe十、 moeB遺 子、 moeA¾fe十、 mdfA¾fcナ、 grxAM 子、 poxB¾伝子、 aqpZ遺 子、 cspD¾fc子、 clpA遺 is子、 infA¾fc子、 aat遺 is子 、 cydC遺伝子、 cydD遺伝子、 trxB遺伝子、 lrp遺伝子、 ftsK遺伝子、 lolA遺伝子、 serS 遺伝子、 dmsA遺伝子、 dmsB遺伝子、 dmsC遺伝子、 pflA遺伝子、 pflB遺伝子、 focA 逾 ナ、 serC¾fcナ、 aroA¾伝十、 cmk¾fcナ、 rpsA¾伝十、 himD¾fcナ、 msbajl: 1zS子、 ΙρχΚ遺伝子、 kdsB遺伝子、 smtAjAizs子、 mukF¾izs子、 kicA¾izs子、 mukBM 1zs +、 aspC遺 is 、 ompF遺伝子、 asnS遺 子、 pncB遺 子、 pepN遺 to子、 ssuB遺 1zs +、 ssuC¾fe卞、 ssuD¾fcナ、 ssuA¾fcナ、 ssuE遺伝子、 pyrD遺 子、 uup遺 1zs 子、 pqiA遺 is子、 pqiB¾fe子、 rmf¾fe子、
Figure imgf000257_0001
ompA遺 is子、 sulA遺伝子、 helD遺お子、 mgsA遺 is子、 acyP¾fc子、 hyaA遺 子、 hyaB遺 子、 hyaC¾fe子、 h yaDjAizs 、 hyaE¾izs +、 hyaF¾fe卞、 appC遺 子、 appB遺 子、 appAjfczs子、 cs gG遺 is卞、 csgF遺 1zs子、 csgE¾fcナ、 csgD遺 to子、 csgB¾fcナ、 csgA遺 to子、 csg C遺伝子、 sfaA遺伝子、 mdoG遺伝子、 mdoH遺伝子、 msyB遺伝子、 htrB遺伝子、 sol A遺伝子、 dinl遺伝子、 pyrC遺伝子、 grxB遺伝子、 rimj遺伝子、 mviM遺 is子、 mviN 遺伝子、 flgN遺伝子、 flgM遺伝子、 flgA遺伝子、 flgB遺伝子、 flgC遺伝子、 flgD遺伝子 、 flgE遺伝子、 flgF遺伝子、 flgG遺伝子、 flgH遺伝子、 flgl遺伝子、 flgj遺伝子、 flgK遺 伝子、 flgL遺伝子、 rne遺伝子、 rluC遺伝子、 rpmF遺伝子、 plsX遺伝子、 fabH遺 is子 、 fabD遺伝子、 fabG遺伝子、 acpP遺 to子、 fabF遺伝子、 pabC遺伝子、 tmk遺伝子、 ho IB遺 is子、 ptsG遺伝子、 I uE遺伝子、 nagZ遺伝子、 ndh遺伝子、 mfd遺伝子、 yclU遺 伝子、 yc!V遺伝子、 yc!W遺伝子、 cobB遺伝子、 potD遺伝子、 potC遺伝子、 potB遺 子、 potA遺伝子、 pep 遺 1S子、 phoQ遺 is子、 phoP¾fc子、 purB遺伝子、 trmUM 1zs +、 icdA¾fe十、 minE¾fe十、 minD¾fcナ、 minC¾fe卞、 clyA¾伝子、 umuD遺 伝子、 umuC遺伝子、 dsbB遺伝子、 nhaB遺伝子、 fadR遺伝子、 dadA遺伝子、 dadX遺 伝子、 WcA遺伝子、 mltE遺伝子、 tagl遺伝子、 treA遺伝子、 dhaR遺伝子、 pth遺伝子 、 prsA遺伝子、 ychB遺伝子、 hemM遺伝子、 hemA遺 十、 prfA遺 ナ、 hemK遺 ナ 、 kdsA遺伝子、 chaA遺伝子、 chaB遺 子、 chaC遺伝子、 narL遺伝子、 narX遺 1ZS子、 narK遺 ナ、 narG遺 十、 narH遺 十、 nar_J遺 izs^t narl遺 is子、 tpr遺伝子、 purU 遺伝子、 sprE遺伝子、 galU遺 is子、 hns遺伝子、 tdk遺伝子、 adhE遺伝子、 oppA遺 to 子、 oppB遺伝子、 oppC遺伝子、 oppD遺 ナ、 oppF遺 ナ、 cls遺 is 、 kch遺 ナ、 tonB遺伝子、 trpA遺伝子、 trpB遺伝子、 trpC遺 is子、 trpD遺伝子、 trpE遺伝子、 trp L遺伝子、 btuR遺 is子、 sohB遺伝子、 topA遺 子、 cysB遺伝子、 acnA遺伝子、 ribA 遺 ナ、 pgpB遺 is +、 pyrF遺 ナ、 osmB遺 子、 rnb遺 ナ、 envM遺 子、 sapF遺 1zs +、 sapD遺 is 、 sapC遺 is 、 sapB遺 ナ、 sapA遺 ナ、 aldH遺伝十、 ordL遺
+、 goaG遺 子、 pspF遺 is子、 pspA遺 子、 pspB遺 is子、 pspC遺 子、 pspD遺 1zs +、 pspE遺 ナ、 sucP遺 ナ、 ompG遺 to子、 tyrR遺 ナ、 tpx遺伝子、 mppA遺伝 子、 ihr遺伝子、 ogt遺伝子、 dbpA遺伝子、 intR遺伝子、 lar遺伝子、 recT遺伝子、 recE 逾 ナ、 racC¾fcナ、 kil¾fcナ、 sieB遺 子、 racR¾fcナ、 dnaC¾izs +、 enpPM zS 子、 trkG遺伝子、 VMTH丄 AMBD遺伝子、 VLOM丄 AMBD遺伝子、 tnpO遺伝子、 upo 3遺伝子、 ompN遺伝子、 nilj遺伝子、 hslj遺伝子、 ldhA遺伝子、 feaR遺伝子、 feaB遺 1zs +、 tynA¾fcナ、 paaZ¾fcナ、 paaA¾fcナ、 paaB¾fe十、 paaC¾fcナ、 paaDM 1zs +、 paaE¾feナ、 paaF¾fcナ、 paaG¾feナ、 paaH遺 is子、 paal遺 to子、 paaj¾fc 子、 paaK遺伝子、 paaX遺 to子、 paaY遺伝子、 acpD遺伝子、 hrpA遺伝子、 aldA遺 to 子、 gapC遺伝子、 gapC遺 to子、 cybB遺 to子、 trg遺 十、 rimL遺 1zs子、 tehA遺 子 、 tehB遺伝子、 prtC遺伝子、 potA遺伝子、 potC遺伝子、 ansP遺 is子、 nhoA遺伝子、 narV遺 izs子、 narW遺 is十、 narY遺 is子、 narZ遺 ナ、 narU遺伝ナ、 fdnG遺 izs子、 fd nH遺 is子、 fdnl¾fc子、 adhP遺 is子、 sfcA遺 to子、 rpsV¾fc子、 osmC¾fc子、 dos 遺伝子、 xasA遺 is子、 gadB遺伝子、 pqqL遺伝子、 chuR遺伝子、 hipA遺伝子、 hipB遺 1ZS子、 tam遺 fc 、 uxaB遺 ナ、 marC遺 子、 marR遺 is子、 marA遺 is子、 marB遺 子、 dcp遺伝子、 lycV¾fc子、 dicA fe子、 dicB遺 is子、 rspB遺 1zs子、 rspA¾fc子 、 spe 遺 子、 dmsB遺 izs子、 dmsC遺 ナ、 bioD遺 is子、 mlc遺 子、 asr遺 is子、 eb r¾伝子、 pntB遺 fzs子、 pntA遺伝子、 arcD¾fzs子、 rstA遺 is子、 rstB遺 is子、 tus遺 1zs子、 lUmC¾fe子、！UmA遺 is子、 manA遺伝子、 uidC遺 子、 uidB遺伝子、 uidA遺 ナ、 uidR遺伝子、 hdhA遺 ナ、 mall遺 ナ、 malX遺伝子、 malY遺 isナ、 add遺伝 子、 blr遺伝子、 nth遺伝子、 gst遺 is子、 pdxY遺伝子、 tyrS遺伝子、 pdxH遺伝子、 sly B遺伝子、 slyA遺伝子、 sodC遺伝子、 nemA遺伝子、 gloA遺伝子、 rnt遺伝子、 lhr遺 伝子、 sodB遺伝子、 araj遺 1zs子、 purR遺伝子、 cfa遺伝子、 ribE遺伝子、 ag43遺伝子 、 phsCjAizs子、 nrfC¾fcナ、 pykF¾fcナ、 lppjAizs子、 suS遺伝子、 aroD遺 子、 pp sA¾fc子、 aroH遺 子、 nlpC¾fc子、 btuD遺 is子、 btuE¾fc子、 btuC遺 is子、 him A遺 is子、 pheT¾fc子、 pheS遺 is子、 pheM遺 is子、 rpl 遺 1S子、 rpml遺 子、 infC ¾fc子、 thrS fc子、 arp遺 is子、 plkB遺 is子、 cedAjAfe子、 katt遺 is子、 celt1遺 is 子、 celD遺 to子、 celC遺伝子、 celB遺伝子、 celA遺伝子、 osmE遺伝子、 nadE遺 is子 、 spy遺伝子、 astE遺伝子、 astB遺伝子、 astD遺 is子、 astA遺伝子、 cstC遺伝子、 xth A遺伝子、 gdhA遺伝子、 topB遺伝子、 selD遺伝子、 sppA遺伝子、 ansA遺伝子、 tdh 遺伝子、 gapA遺伝子、 ttuC遺伝子、 caiT遺伝子、 rnd遺伝子、 fadD遺伝子、 sip遺 is 子、 pabB遺 子、 sdaA遺 、 manX遺 is子、 manY遺云ナ、 manZ遺 子、 rrmA遺 子、 cspC¾伝子、 kdgR遺伝子、 tcmA遺 is子、 htpX¾伝子、 prc¾fc子、 pqiB遺 is 子、 pphA fe子、 holE遺 子、 exoX¾fc子、 ptrB遺 子、 purT遺 is子、 eda¾fc子 、 edd遺 is 、 zwf¾伝十、 pykA¾fcナ、 mlt遺 子、 znuA遺 1zs子、 znuC¾伝十、 ruv B遺 fzs子、 ruvA遺伝子、 ruvC遺 is子、 ntpA¾伝子、 aspS¾f 子、 bisZ¾fc子、 torY 逾 ナ、 cutC¾fcナ、 arg jAto子、 pgsA遺 to子、 amn¾伝子、 cbl¾fe卞、 nacMfc 子、 er! 遺 子、 cobT¾fc子、 cobS遺 is子、 cobU遺 is子、 gyrl¾fc子、 phst遺 is子 、 sbcB遺 子、 hisL遺伝子、 hisG遺 1ZS子、 hisD遺 1ZS子、 hisC遺 1ZS子、 hisB遺伝子、 his H遺 is子、 hisA遺 is子、 hisF遺お子、 hisl¾fc子、 wzz遺 子、 ugd¾fe子、 gnd遺 子、 galF遺伝子、 wcaM遣 、 wcaL遺 子、 wcaK遺 子、 wzxC¾fcナ、 wcaj遺 1zs 子、 cpsG遺 子、 cpsB遺 、 wcal¾伝子、 wcaH¾feナ、 wcaGjAizs子、 gmd遺伝 子、 wcaF遺 izsナ、 wcaii遺 izs子、 wcaD遺 子、 wcaC遺ィ云ナ、 wcaB遣 izs十、 wcaA遺 子、 wzb¾伝子、 wza遺伝子、
Figure imgf000259_0001
dcd¾伝子、 udk遺 is子、 thiD遺 is子、 thiM¾伝子、 mrp¾fe十、 metG¾izs +、 cdd¾fcナ、 sanA¾fcナ、 mglC¾feナ、 mgl A遺 is子、 mglB¾伝子、 galS¾伝子、 fol 遺伝子、 cirA遺 is子、 lysP遺 is子、 nfo遺 is 子、 fruA遺伝子、 fruK遺 is子、 fruB遺 is子、 rplY遺 is子、 narP¾伝子、 ccmH¾fc子、 dsbE遺伝子、 ccmF遺云ナ、 ccmE遺伝子、 ccmD遺 is十、 ccmC遺伝子、 ccmB遺伝子 、 ccmA¾伝十、 napC¾fcナ、 napB¾fcナ、 napH遺 1ZS子、 napGjAizs子、 napA遺 1zs子 、 napD遺 to子、 napr1逾 to子、 eco遺 子、 alkB¾fe十、 ada遺 1zs子、 apb 遺 1zs子、 res B遺 1ZS子、 rcsC遺伝子、 atoS遺 1ZS子、 atoC¾fc子、
Figure imgf000260_0001
atoE 逾 fc子、 atoB遺 is子、 gyrA¾伝子、 ubiG遺 is子、 nrdA¾伝子、 nrdB遺
子、 inaA fc子、 glpQ遺 fc子、 glpT¾fc子、 glpA¾伝子、 glpB遺 子、 glpC遺 子、
Figure imgf000260_0002
ais遺 十、 pmrD遺 、 menE遺 子、 menし遺 +、 menB遺 子、 menD遺伝ナ、 menF遺 子、 nuoN遺 子、 nuoM遺伝ナ、 nuoL遺 十、 nuoK遺 1zs +、 nuoJ¾fe十、 nuol遺 子、 nuoH遺伝子、 nuoG¾fcナ、 nuoF¾fcナ、 nuoEM 子、 nuoD¾fc子、 nuoB¾伝子、 nuoA遺 is子、 lrhA遺 子、 ackA遺 is子、 pta遺伝 子、 ubiX遺 子、 purF¾fc子、 dedE遺伝子、 dedD遺 is子、 folC遺 is子、 accD¾fc子 、 dedA遺 子、 truA遺 子、 usgl¾伝子、 pdxB遺伝子、 div遺 is子、 fabB遺 is子、 dd pX遺 子、 mepA¾fe十、 aroC fc十、 sixA遺 is子、 fadL¾fe十、 vacj遺 is子、 dsd C遺 is子、 dsdX¾fc子、 dsdA遺お子、 emrY遺 is子、 emrK遺 is子、 evgA¾fe子、 evg S遺伝子、 bilF遺伝子、 ddg遺伝子、 glk遺伝子、 mntH遺伝子、 nupC遺伝子、 gltX遺伝 子、 xapR遺 、 xapB¾izs +、 xapA遺 is子、 lig¾fe卞、 zipA¾伝子、 cysZ遺 子、 cysK¾fcナ、 ptsH¾fe十、 ptsl¾fcナ、 gsr遺 is子、 pdxK遺 is子、 cysM遺伝子、 cys A遺 is子、 cysW遺 子、 cysU¾伝子、 cysP¾fc子、 ucpA¾伝子、 ptb 遺 is子、 ami A遺 is子、 hemF遺 is子、 cchA¾fe子、 eutC遺 is子、 eutB¾fe子、 eutH遺伝子、 eut G遺伝子、 eu 遺伝子、 eutE遺伝子、 cchB遺伝子、 eutl遺伝子、 talA遺伝子、 tktB遺 1zs +、 aegAjAizs 、 narQ遺 is子、 acrD¾feナ、 aapE¾feナ、 purC¾fe卞、 nlpBM 伝子、 dapA遺伝子、 gcvR遺伝子、 bcp遺伝子、 hyfA遺伝子、 hyffl遺伝子、 hy! 遺伝 子、 hy!D遺伝子、 hyffi遺伝子、 hy!F遺伝子、 hyfG遺伝子、 hy!H遺伝子、 hyfl遺伝子、 hyfj¾fc子、 hyfR遺 is子、 focB遺 is子、 perMjAfe子、 yfgE遺 is子、 uraA¾伝子、 upp 逾 ナ、 purM遺 子、 purN遺 子、
Figure imgf000260_0003
ppx¾fcナ、 guaA¾fe卞、 guaBM 1zs +、 xseA¾fe卞、 hisS遺 子、 gcpE遺 子、 ndk遺 is子、 pbpC逾 to子、 sseA遺 子、 sseB遺伝子、 pepB遺 子、 fdx遺 is子、 hscA¾fc子、 hscB遺 is子、 iscU遺お子、 iscS遺 子、 iscR遺 1zs子、 suhB遺 子、 csiE¾fcナ、 dgxA¾fcナ、 dgxB¾fcナ、 hca C遺伝子、 hcaB遺伝子、 hcaD遺 is子、 glyA遺伝子、 hmpA遺 十、 glnB遺 ナ、 purL 遺 fcナ、 acpS遺伝十、 pdxj遺 子、 recO遺 子、 era遺 ナ、 rnc遺 1zs子、 lepB遺伝 子、 lepA遺 ナ、 rseC遺伝子、 rseB遺 子、 rseA遺 ナ、 rpoE遺 ナ、 nadB遺 ナ ゝ srmB¾fe子、 ung遺 is子、 trx2遺 is子、 pssA¾fc子、 kgtP遺 is子、 clpB遺 is子、 rlu D遺 is子、 pheL¾fe子、 pheA遺 1zs子、 tyrA¾伝子、 aroF遺 子、 rplS¾fc子、 trmD 逾 fc子、 rimM遺伝子、 rpsP¾fe子、 ffh遺 to子、 grpE¾fe子、 recN遺 is子、 smp 遺 子、 smpB¾fc子、 gabD¾伝子、 gab 遺 子、 gabP¾伝子、 nrdF遺 is子、 emrRM 卞、 em 遺 子、 emrB遺 子、 gshA遺 子、 cs 遺 子、 ala¾遺 1zs子、 oraAj¾izs 子、 recA¾伝子、 mltB¾fc子、 hypF遺伝子、 hydN遺伝子、 ascG¾fc子、 ascト遺 is 子、 ascB遺伝子、 hycl遺伝子、 hycH遺 is子、 hycG遺 is子、 hycF¾伝子、 hyc 遺 is 子、 hycD遺伝子、 hycC fc子、 hycB遺 子、 hycA遺 子、 hypA¾fc子、 hypB遺 子、 hypC fc子、 hypD¾fe子、 hypt遺 is子、 I lA遺 is子、 mutS¾fc子、 prpB遺 is +、 rpo jito子、 pcmjAizs子、 surE遺伝子、 ygbB遺 is 、 ygbP¾伝子、 ygbQ遺伝子 、 cysC遺 子、 cysN遺 子、
Figure imgf000261_0001
iap遑 子、 cysH遺 1zs子、 cysl¾fe十、 cy sj遺 1zs子、 ptpS遺 is 、 eno¾feナ、 pyrG¾feナ、 maz 遺 1zs子、 chpR遺 子、 relA 逾 fc子、 barA遺 子、 gud2¾fe子、 gudT遺お子、 mioC遺 is子、 syd遺伝子、 sdaB遺 子、 exo遺 子、 fucO fc子、 fuc 遺 子、 lUcP遺伝子、 fucl¾fc子、 lUcK遺 is子 、 iUcU¾伝子、 fucR¾fe子、 gcvA遺 is子、 niS¾fe子、 mltA遺 is子、 amiC遺 is子、 ar gA¾fc子、 thyA遺 to子、 lgt遺 is子、 ptsP遺 is子、 mutH遺 is子、 tas遺 is子、 aas¾伝 子、 galR遺 子、 lysA遺 子、 lysR遺 is子、 araE¾伝子、 kduD遺 is子、 kdul遺 1zs子、 lysS遺伝子、 prffi遺伝子、 recj遺伝子、 dsbC遺伝子、 xerD遺伝子、 fldB遺伝子、 upl4 逾 fc子、 bglA遺 子、 gcvP¾伝子、 gcvH遺 子、 gcvT¾fc子、 visC遺 is子、 ubiH遺 卞、 pepP¾feナ、 serA¾fe十、 rpiA遺 子、
Figure imgf000261_0002
sbm遺 1zs子、 arg jAizs子 、 iba遺 子、 pgk¾fc子、 epd遺 子、 tktA遺伝子、 speB遺 is子、 speA¾伝子、 metK 逾 fc子、 galP fc子、 sprT遺 子、 endA¾fc子、 gshB遺 is子、 yqgF¾fe子、 ansB遺 子、 mutY¾fc子、 mltC遺 子、 nupG遺 is子、 speC¾fc子、 pitB¾fc子、 gsp遺 is 子、 hybG遺伝子、 hybF遺伝子、 hybE遺伝子、 hybD遺伝子、 hybC遺伝子、 hybB遺伝 子、 hybA遺伝子、 hoxK遺伝子、 exbD¾fc子、 exbB遺 1ZS子、 metC¾izs子、 exsAj¾1zS 子、 sufl遺 ナ、 plsC遺伝子、 parC遺伝子、 parE遺伝子、 ice遺伝子、 tolC遺伝子、 ri bB遺伝子、 glgS遺伝子、 rfaE遺伝子、 glnE遺伝子、 cca遺伝子、 bacA遺伝子、 folB遺 伝子、 ttdA遺伝子、 ttdB遺伝子、 ygjD遺伝子、 rpsU遺伝子、 dnaG遺伝子、 rpoD遺伝 子、 aer遺 is子、 ebgR¾fc子、 ebgA¾伝子、 ebgC遺 is子、 fadH¾fe子、 uxaA遺 is子 、 uxaC遺 子、 exuT¾伝子、 exuR遺 is子、 tdcE遺伝子、 tdcD遺 is子、 tdcC¾伝子、 tdcB遺 子、 tdcA fc子、 tdcR遺伝子、 sohA¾fc子、 agaR遺 is子、 agaZ¾fe子、 ag aV遺 is子、 agaW遺 子、 agaA遺 1zs子、 agaS遺 子、 agaY¾izs +、 agaB¾fcナ、 aga CJAIZS子、 agaD遺 子、 agal¾伝子、 mtr逾 to子、 deaD遺 子、 mpl遺 子、 pnpj¾ 子、 rpsO¾伝子、 truB¾fc子、 rbfA¾fc子、 inffi¾伝子、 nusA遺 is子、 argGMfe 子、 secG fc子、 mrsA遺伝子、 folP遺 is子、 ftsH遺 is子、 ftsj¾伝子、 greA遺 is子、 aacB¾fcナ、 yhbZ¾fcナ、 rpmA遺 子、 rplU¾fe十、 ispB遺 子、 nlp¾伝子、 mur A遺 is子、 yrbl¾fzs子、 yrbK遺 to子、 rpoN¾fzs子、 ptsN遺 is子、 ptsO¾f 子、 mtgA 逾 fc子、 arcB遺 子、 gltB遺 is子、 nanT¾fe子、 npl¾fc子、 nanR遺 to子、 dcuD遺 子、 sspB遺お子、 sspA fc子、 rpsl¾伝子、 rplM¾fc子、 hhoA¾fe子、 hhoB遺お 子、 mdn遺 1zs子、 argR遺 子、 tldD¾伝子、 rng遺 子、 mreD遺伝子、 mreC¾feナ、 mreB遺 子、 accB¾izs +、 accC遺 is 、 panF遺 is 、 prmA遺 子、 fis遺 子、 aro E¾fe子、 smg¾fe子、 smf遺 is子、 defile子、 felt遺 is子、 sun¾fe子、 trkA¾fe子 、 mscL遑 子、 zntR遺 子、 rplQ fcナ、 rpoA¾fe十、 rpsD遺伝子、 rpsK逾 to子、 r psM遺伝子、 rpmj遺 is 、 secY¾fcナ、 rplO遺伝子、 rpmD¾fe卞、 rpsE¾伝十、 rpl R遺 子、 rplF¾fc子、 rpsH遺 to子、 rpsN¾fc子、 rplE¾fe子、 rplX¾fc子、 rplNM 1zs +、 rpsQ izs +、 rpmし遺 1zs子、 rplP¾fe十、 rpsC遺伝子、 rplV¾izs +、 rpsS遺 子、 rplB遺伝子、 rplW遺伝子、 rplD遺伝子、 rpに遺伝子、 rpsj遺伝子、 tufA遺伝子、 f usA¾fc子、 rpsG遺伝子、 rpsL遺伝子、 IkpA fc子、 slyX¾fc子、 slyD遺 is子、 keffi 逾 fc子、 prkB遺 is子、 crp¾伝子、 argD遺 is子、 pabA¾fe子、 fic遺 is子、 ppiA¾伝 子、 nirB遺 子、 nirD¾fe卞、 nirC遺伝子、 cysG遺伝子、 php遺 子、 trpS¾fcナ、 g ph¾fcナ、 遺伝子、 dam¾fcナ、 damX遺 子、 aroB¾izs +、 aroK¾fcナ、 ho!Q 逾 ナ、 mrcAjl:伝子、 pckA遺 to子、 envZ遺 子、 ompR¾fcナ、 greB遺伝子、 feoA 逾 fc子、 feoB遺 子、 bioH遺 子、 gntT¾fc子、 malQ fe子、 malP遺 is子、 malTM 伝子、 rtcA遺伝子、 rtcB遺伝子、 rtcR遺伝子、 glpR遺伝子、 glpG遺伝子、 glpE遺伝 子、 glpD fc子、 glgP遺 子、 glgA¾伝子、 glgC遺 is子、 glgX fc子、 glgB遺 is子、 asd遺 子、 gntU遺 子、 gntU遺伝子、 gntK¾伝子、 gntR¾伝子、 ggt遺 子、 ugpQ 逾 fcナ、 ugpC fe子、 ugp j zs子、 ugpA遺 isナ、 ugpB¾fc子、 livr遑 is子、 livGjA 伝子、 livM遺伝子、 livH遺伝子、 livK遺伝子、 livj遺伝子、 rpoH遺伝子、 ftsX遺伝子、 ftsE遺伝子、 ftsY遺伝子、 atzN遺伝子、 nikA遺伝子、 nikB遺伝子、 nikC遺伝子、 nikD 逾 fc子、 nikE遺 子、 pitA遺 子、 uspB¾伝子、 uspA遺伝子、 prlC遺お子、 gor¾伝 子、 arsR遺 1ZS子、 arsB¾伝子、 arsC¾fc子、 slp¾fc子、 hdeB遺伝子、 hdeA遺伝子、 hdeD遺伝子、 gadA遺伝子、 treF遺伝子、 kdgK遺伝子、 dctA遺伝子、 dppF遺伝子、 d ppD遺 子、 dppC遺 子、 dppB¾伝子、 dppA¾fcナ、 tagjAizs子、 bisC¾feナ、 csp A遺伝子、 glyS遺伝子、 glyQ遺伝子、 xylB遺伝子、 xylA遺伝子、 xylF遺伝子、 xy 遺 子、 xylH遺 is子、 xylR遺 子、 bax¾fc子、 malS遺 is子、 avtA¾伝子、 lyx遺伝子、 sgbH¾fc子、 sgbU遺お子、 sgbE¾fc子、 aldB遺 子、 selB遺 is子、 sel 遺 is子、 mtl A遺伝子、 mtlD遺伝子、 mtlR遺伝子、 1WP遺伝子、 1WR遺伝子、 1WD遺伝子、 cysE遺 子、 gpsA¾伝子、 secB遺 子、 grxC¾伝子、 tdh¾fc子、 kbl¾fc子、 htrL遺 is子 、 rfaD¾fe子、 rfaF遺伝子、 rfaC遺 1ZS子、 rfaLjAizs子、 rfaK¾fe子、 rfaZ遺伝子、 rfaY 逾 fc子、 rfaj遺 to子、 rfal¾fe子、 rfaB¾伝子、 rfaS遺 is子、 rfaP遺 is子、 rfaG遺 is子 、 rfaQ遺伝子、 kdtA遺伝子、 kdtB遺伝子、 mutM遺伝子、 rpmG遺伝子、 rpmB遺伝子 、 radC¾f 子、 dft)¾fzs子、 dut遺 is子、 ttk遺 is子、 pyrE¾伝子、 rph¾fzs子、 dinD遺
+、 gmkjAizs子、 rpoZjAizs 、 spoT¾izs +、 spoU遺 is子、 recG¾izs +、 gltS遺 is 子、 nlpA遺 is子、 uhp 遺 is子、 uhpC遺 is子、 uhpB¾fc子、 uhpA¾伝子、 ilvN遺 is 子、 ilvB¾fc子、 ivbLjAfe子、 emrD¾fc子、 ibpB遺 is子、 ibpA遺 is子、 gyrB¾fc子 、 recF¾伝子、 dnaN遺 子、 dnaA遺 is子、 rpmH遺 is子、 rnpA¾伝子、 yidC¾fe子 、 thdF遺伝子、 tnaL遺伝子、 tnaA遺伝子、 tnaB遺伝子、 bglB遺伝子、 bglF遺伝子、 b glG遺伝子、 phoU遺 is子、 pstB¾伝子、 pstAjifzs子、 pstC遺 to子、 pstS遺 is子、 glm S¾fc子、 glmU遺 is子、 atpC遺 fzs子、 uncD¾fc子、 atpG遺 is子、 atpA¾fc子、 atpH ¾fc子、 atpト遺 is子、 atpE遺 is子、 atpB¾fc子、 atpl¾伝子、 gidB¾fe子、 gidA遺 子、 mioC fc子、 asnC遺 is子、 pssR¾fe子、 ilvL遺 to子、 ilvG遺伝子、 ilvM遺 is 子、 ilvE遺 ナ、 ilvD遺伝子、 ilvA遺 is子、 ilvY遺伝子、 ilvC遺伝子、 ppiC遺 1zs子、 re p遺伝子、 gppA遺伝子、 rhlB遺伝子、 trxA遺伝子、 rhoL遺伝子、 rho遺 子、 rfe遺伝 子、 wzzE遺伝子、 nfrC遺伝子、 rl!D遺伝子、 rffG遺伝子、 rl!H遺伝子、 rffA遺伝子、 wz xE遺伝子、 rffT遺伝子、 wecG遺 1ZS子、 aslB遺 1ZS子、 aslA¾fe子、 hemY¾fe子、 hemX 遺 ナ、 hemD遺伝子、 hemC遺 子、 cyaA遺 子、 cyaY遺 is子、 dapF遺 is子、 xerC 遺伝子、 uvrD遺 to子、 corA遺伝子、 radD遺 to子、 pldA遺伝子、 recQ遺 is子、 pldB遺 伝子、 metR遺伝子、 metE遺 is子、 udp遺伝子、 ubiE遺伝子、 aarF遺 is子、 tatC遺伝 子、 tatD遺伝子、 rfaH遺伝子、 ubiD遺伝子、 ubiB遺伝子、 fadA遺伝子、 fadB遺伝子、 pepQjAfe子、 trkH遺 is子、 trkH¾fe子、 hemG¾fe子、 mobB遺 is子、
Figure imgf000264_0001
、 dsbA遺伝子、 polA遺伝子、 yihA遺伝子、 hemN遺伝子、 ntrC遺伝子、 ntrB遺伝子、 glnA遺伝子、 fdhE遺伝子、 fdol遺伝子、 fdoH遺伝子、 fdoG遺伝子、 fdhD遺伝子、 sod A遺 is子、 kdgT¾fe子、 cpxA遺お子、 cpxR¾fe子、 cpxP遺 子、 plkA fc子、 sbp 逾云子、 cdhjifc子、 tpiA¾伝子、 ftr遺 子、 glpX遺 子、 glpKjifc子、 glpF¾fe子 、 menG遺伝子、 menA遺伝子、 hslU遺伝子、 hslV遺伝子、 ftsN遺伝子、 cytR遺伝子、 priA遺 is子、 rpmE¾伝子、 metj遺 is子、 metB遺 1ZS子、 metL¾伝子、 metF¾fcナ、 k atG¾fe子、 gldA fc子、 talC fe子、 ppc遺 1zs子、 argE¾fe子、 argC遺 is子、 argB ¾fc子、 argH遺 is子、 oxyR¾fe子、 udhA¾fe子、 trmA遺 to子、 btuB¾fc子、 murl 逾 ナ、 murB遺 子、 birA¾fe十、 coaA¾fe十、 tuffi遺 1ZS子、 secE¾fcナ、 nusGM 子、 rplK遺 is子、 rpl 遺 is子、 rplj¾fe子、 rplL¾伝子、 rpoB遺 is子、 rpoC¾fe子 、 htrC遺伝子、 thiH遺伝子、 thiG遺伝子、 thiS遺伝子、 thiF遺伝子、 thiE遺伝子、 thiC 逾 fc子、 rsd遺 is子、 hemE遺 is子、 nfi¾伝子、 hupA遺 子、 hydH遺 is子、 hydG遺
+、 purDjAizs 、 purH遺 子、 metA遺 to子、 aceB遺 子、
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aceKjA 子、 arp遺伝子、 iclR¾fc子、 metH¾fc子、 pepE遺 is子、 lysC¾fe子、 pgi¾fe子、 ubiC遺 is子、 ubiA fc子、 plsB¾fc子、 dgkA¾伝子、 le A¾fc子、 dinF遺 子、 qor ¾fc子、 dnaB遺 is子、 air遺伝子、 tyrB遺 to子、 nap iAizs子、 hobH遺 子、 uvrA遺 子、 ssb遺伝子、 soxS¾伝子、 soxR遺 子、 acs遺伝子、 nrfA遺 is子、 nrffi遺 is子、 nr! 遺伝子、 nriD遺伝子、 nrffi遺伝子、 nriF遺伝子、 nrfG遺伝子、 gltP遺伝子、 fdhF 逾 fc子、 alsR¾fc子、 rpiB¾fc子、 proP遺 is子、 basS遺 to子、 basR¾fc子、 adiY遺 ナ、 adi遺 ナ、 melR遺伝子、 melA遺伝子、 melB遺 十、 fumB遺 is子、 dcuB遺伝 子、 dcuR遺伝子、 dcuS遺伝子、 lysU遺 is子、 cadA遺伝子、 cadB遺伝子、 cadC遺伝 子、 cutA3遺伝子、 cutA2遺伝子、 cutA遺伝子、 dcuA遺伝子、 aspA遺伝子、 fesA遺伝 子、 groES¾fcナ、 groELM
子、 eft)遺 is子、 ecnB¾伝子、 sugE遺 is子、 blc遺 is子、 ampC遺 is子、 frdD遺 子 、 frdC遺 子、 frdB¾fc子、 frdA¾伝子、 genX¾fc子、 psd遺 子、 yjeQ遺 子、 yje E¾fe子、 amiB遺伝子、 mutL遺伝子、 miaA¾fc子、 hfq¾fe子、 hflX¾fc子、 hflKM 子、 hflC fc子、 purA遺 is子、 vacB遺 子、 sga 遺 is子、 rpsF¾伝子、 priB¾伝 子、 rpsR遺 子、 rpll¾fc子、 fldB¾伝子、
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cpdB¾fc子、 cysQ¾伝子、 msrA遺 is子、 chpS¾feナ、 chpB¾fe卞、 ppa¾fcナ、 I pjAizs子、 mpl遺 is子、 pmoA 遺伝子、 cybC遺伝子、 nrdG遺伝子、 nrdD遺伝子、 treC遺伝子、 treB遺伝子、 treR遺 ナ、 mgtA fcナ、 pyrl¾伝子、 pyrB遺 is +、 pyrBI遺 isナ、 argl¾fc十、 valSMfe 子、 holC¾伝子、 xerB¾fc子、 idnR遺 is子、 idnT遺 is子、 idn。¾fc子、 idnD遺 is子 、 idnK遺伝子、 fecEjAizs子、 fecD遺伝子、 fecC遺 1ZS子、 fecB遺 1ZS子、
Figure imgf000265_0002
fe cR¾fc子、 feci遺 is子、 dnaC遺 is子、 dnaT¾fc子、 bglj遺伝子、 l uF¾fe子、 rsmC 逾 fc子、 holD遺 is子、 riml遺 子、 prfC遺 is子、 osmY遺 is子、 deoC¾fc子、 deoAM 子、 deoB¾伝子、 deoD遺 is子、 lplA遺 is子、 smp遺 is子、 serB遺 is子、 radAMfc 子、 nadR¾fe子、 sit遺 to子、 trpR¾伝子、 gpmG¾fc子、 rob遺 is子、 creA遺伝子、 c reB¾伝子、 creC遺 1 子、 creD¾伝子、 arcA¾fe子、 lasT¾fc子、 thrL遺 1 子
[2]acr 遺 is子、 argT¾fc子、 artl遺 1ZS子、 artj¾fc子、 artM遺 1ZS子、 artP遺 1ZS子、 ar tQ遺伝子、 bfr遺伝子、 chiA遺伝子、 chpA遺伝子、 dacC遺伝子、 deoR遺伝子、 dinG 逾 fc子、 elaA遺 is子、 elaB遺 is子、 elaC遺 is子、 elaD¾伝子、 envD遺 is子、 envRM 伝子、 IhuA遺伝子、 IhuB遺伝子、 IhuC遺伝子、 IhuD遺伝子、 folX遺伝子、 glnH遺伝 子、 glnP遺伝子、 glnQ遺伝子、 gltj遺伝子、 gltK遺伝子、 gltL遺伝子、 gspA遺伝子、 g spC¾伝子、 gspD¾fzs子、 gspE遺 子、 gspl¾伝子、 gsp_J遺 is子、 gspK遺 1zs子、 gsp L遺伝子、 hisj遺伝子、 hisM遺伝子、 hisP遺伝子、 hisQ遺伝子、 ho!D遺伝子、 ho!F遺 伝子、 ho!G遺伝子、 ho!H遺伝子、 ItaA遺伝子、 mdaA遺伝子、 mdaB遺伝子、 pinO遺 fzs子、 potF遺 to子、 potG遺 fzs子、 potH¾伝子、 potl遺 is子、 pshM遺 is子、 ptwBM ナ、 ptwC遺 十、 rhsB遺伝子、 rimK遺伝子、 xylU遺 十
配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜 [69]記載の塩基配列を有する D NA、またはそれら DNAに相当する DNAを含む染色体 DNAを有する請求項 1記載 の大腸菌の変異体。
[I] 1番〜 167064番目で表される塩基配列
[2] 172980番〜 243964番目で表される塩基配列
[3] 253411番〜 261963番目で表される塩基配列
[4] 387532番〜 389138番目で表される塩基配列
[5]403704番〜 518029番目で表される塩基配列
[6] 532712番〜 535504番目で表される塩基配列
[7] 550216番〜 563940番目で表される塩基配列
[8] 608119番〜 675103番目で表される塩基配列
[9] 689375番〜 728820番目で表される塩基配列
[10] 739594番〜 832551番目で表される塩基配列
[I I] 848090番〜 867637番目で表される塩基配列
[12] 883474番〜 890997番目で表される塩基配列
[13] 909380番〜 1048887番目で表される塩基配列
[14] 1097020番〜 1198105番目で表される塩基配列
[15] 1225147番〜 1630911番目で表される塩基配列
[16] 1641039番〜 1642631番目で表される塩基配列
[17] 1650223番〜 1964523番目で表される塩基配列
[18] 1993076番〜 1996661番目で表される塩基配列
[19] 2028210番〜 2033448番目で表される塩基配列
[20] 2044377番〜 2069148番目で表される塩基配列
[21]2081927番〜 2104392番目で表される塩基配列
[22] 2116065番〜 2146263番目で表される塩基配列
[23] 2187856番〜 2200668番目で表される塩基配列
[24] 2229851番〜 2255894番目で表される塩基配列
[25] 2263492番ハ 2270439番目で表される塩基配列
[26] 2286589番ハ 2386261番目で表される塩基配列
[27] 2395472番ハ 2423364番目で表される塩基配列
[28] 2434099番ハ 2472851番目で表される塩基配列
[29] 2482483番ハ 2505074番目で表される塩基配列
[30]2514558番ハ 2755676番目で表される塩基配列
[31]2789481番ハ 2795173番目で表される塩基配列
[32]2800891番ハ 2804307番目で表される塩基配列
[33]2810148番ハ 2825313番目で表される塩基配列
[34] 2830263番ハ 2910273番目で表される塩基配列
[35]2910574 - 2985361番目で表される塩基配列
[36]3033129番ハ 3077084番目で表される塩基配列
[37]3078917番ハ 3110109番目で表される塩基配列
[38]3134342番ハ 3165627番目で表される塩基配列
[39]3172941番ハ 3360736番目で表される塩基配列
[40] 3370548番ハ -3411159番目で表される塩基配列
[41]3420879番ハ 3453020番目で表される塩基配列
[42] 3469367番ハ 3618575番目で表される塩基配列
[43]3636917番ハ 3854661番目で表される塩基配列
[44] 3865832番ハ 3867101番目で表される塩基配列
[45]3877011番ハ 3926658番目で表される塩基配列
[46] 3938879番ハ 4059897番目で表される塩基配列
[47] 4079660番ハ 4086450番目で表される塩基配列
[48] 4099983番ハ 4139231番目で表される塩基配列
[49]4149710番ハ 4235358番目で表される塩基配列
[50]4251736番ハ 4298976番目で表される塩基配列
[51]4311512番ハ 4313317番目で表される塩基配列
[52]4329722番ハ 4409532番目で表される塩基配列
[53]4423152番〜 4496201番目で表される塩基配列
[54]4509535番〜 4517875番目で表される塩基配列
[55] 4599638番〜 4641433番目で表される塩基配列
[56] 167065番〜 172979番目で表される塩基配列
[57] 675104番〜 689374番目で表される塩基配列
[58] 832552番〜 848089番目で表される塩基配列
[59] 867638番〜 883473番目で表される塩基配列
[60] 890998番〜 909379番目で表される塩基配列
[61] 2386262番〜 2395471番目で表される塩基配列
[62] 2423365番〜 2434098番目で表される塩基配列
[63] 2472852番〜 2482482番目で表される塩基配列
[64] 2505075番〜 2514557番目で表される塩基配列
[65] 2910274番〜 2910573番目で表される塩基配列
[66 ] 3165628番〜 3172940番目で表される塩基配列
[67] 3411160番〜 3420878番目で表される塩基配列
[68] 3453021番〜 3469366番目で表される塩基配列
[69] 3618576番〜 3636916番目で表される塩基配列
yafj¾伝子、 ya! 遺 is子、 yafQ遺 子、 dinj¾fc子、 ya!L¾伝子、 ya!M¾伝子、 I iA 遺伝子、 la!U遺伝子、 dinP遺伝子、 ya!N遺伝子、 yafO遺伝子、 ya!P遺伝子、 JW0225 遺伝子、 priH遺伝子、 ykfl遺伝子、 ya!W遺伝子、 yeeT遺伝子、 yk!G遺伝子、 ya!X遺 伝子、 yk!F遺伝子、 ykffi遺伝子、 ya!Y遺伝子、 ypjK遺伝子、 yafZ遺伝子、 ykfA遺伝 子、 perR遺伝子、 JW0245遺伝子、 JW0246遺伝子、 JW0247遺伝子、 ykl 遺伝子、 JW 0249遺伝子、 is5B遺伝子、 yi51遺伝子、 mmuP遺伝子、 mmuM遺伝子、 alUC遺伝子、 J W0255遺伝子、 insB遺伝子、 insA遺伝子、 JW0258遺伝子、 yagB遺伝子、 yagA遺伝 子、 yagE遺 子、 yagF遺 1zs子、 yagG¾fc子、 yagH遺 子、 yagl¾伝子、 argF¾伝子 、 yfjl遺 子、 yagj遺 fc子、 yagK遺 is子、 yagLjftizs子、 yagM¾fc子、 yagN遺 子、 in tF¾izs子、 yagP¾伝子、 yagQ遺 子、 yagR遺 子、 yagS遺 子、 yagT遺 子、 yag U遺 is子、 ykgj¾fc子、 yagV遺 is子、 yagW¾伝子、 yagX¾fc子、 yagY遺 子、 yagZ 遺伝子、 ykgK遺伝子、 ykgL遺伝子、 ykgM遺伝子、 eaeH遺伝子、 _JW0292遺伝子、 J W0293遺伝子、 ykgA遺伝子、 ykgB遺伝子、 ykgl遺伝子、 merA遺伝子、 ykgD遺伝子 、 ykgE遺伝子、 ykgF遺伝子、 ykgG遺伝子、 ykgH遺伝子、 betA遺伝子、 betB遺伝子 、 betl遺伝子、 betT遺 is子、 yahA遺伝子、 yahB遺伝子、 yahC遺 1zs子、 yahD遺伝子、 yahE遺 is子、 yahF遺伝子、 yahG遺伝子、 yahH遺伝子、 arcM遺伝子、 yahj遺 is子、 y ahK遺伝子、 yahL遺 is子、 yahM遺伝子、 yahN遺伝子、 yahO遺伝子、 prpR遺伝子、 b cpA遺 is子、 prpC遺 is子、 prpD遺 子、 prpE遺 ナ、 codB遺 卞、 codA遺 子、 cy nR遺伝子、 cynT遺伝子、 cynS遺伝子、 cynX遺伝子、 lacA遺伝子、 lacY遺伝子、 lacZ 遺 ナ、 lacl遺 ナ、 mhpR遺 子、 mhpA遺 ナ、 mhpB遺 to子、 mhpC遺 is 、 mhp D遺伝子、 mhpF遺伝子、 mhpE遺伝子、 mhpT遺 is子、 yaiL遺 is子、 yaiM遺伝子、 adh C遺伝子、 yaiN遺伝子、 yaiO遺伝子、 JW0350遺伝子、 yi2A遺伝子、 yi22遺伝子、 yi2 4遺伝子、 yi23遺伝子、 yaiP遺伝子、 yaiS遺伝子、 tauA遺伝子、 tauB遺伝子、 tauC遺 伝子、 ssiD遺伝子、 yaiT遺伝子、 JW0363遺伝子、 JW0364遺伝子、 yaiU遺伝子、 yaiV 逾 fc子、 ampH遺 子、 sbmA遺 is子、 yaiW¾伝子、 yaiY¾fe子、 yaiZ¾fe子、 ddlA 逾 fc子、 yaiB¾fe子、 phoA¾fc子、 psiF¾fc子、 yaiC遺 is子、 ybbOjAfe子、 tesA遺 伝子、 ybbA遺伝子、 ybbP遺伝子、 rhsD遺伝子、 ybbC遺伝子、 rhsE遺伝子、 ybbD遺 伝子、 _JW0490遺伝子、 ybbB遺伝子、 ybbS遺伝子、 ybbT遺伝子、 ybbU遺伝子、 ybbQ 遺伝子、 ybbV遺伝子、 allP遺伝子、 allA遺伝子、 ybbY遺伝子、 ybbZ遺伝子、 ylbA遺 伝子、 aUC遺伝子、 ylbC遺伝子、 fdrA遺伝子、 ylbE遺伝子、 ylbF遺伝子、 arcC遺伝子 、 intD遺伝子、 EXCLLAMBD遺伝子、 VRPP— LAMBD遺伝子、 JW0528遺伝子、 JW052 9遺伝子、 VREN丄 AMBD遺伝子、 emrE遺伝子、 ybcK遺伝子、 ybcL遺伝子、 ybcM遺 伝子、 ybcN遺伝子、 ninE遺伝子、 ybcO遺伝子、 rus遺伝子、 ybcQ遺伝子、 JW0539.5 逾 fc子、 nmpC遺 子、 vlyS遺 子、 ybcS遺お子、 ybcT遺 is子、 vboR¾伝子、 ybcV 遺伝子、 ybcW遺伝子、 nohB遺伝子、 ybcX遺伝子、 ybcY遺伝子、 JW0552遺伝子、 ap pY¾fe子、 ompT遺 is子、 envY¾伝子、 ybcH遺 is子、 nfrA¾伝子、 nfrB¾伝子、 cus S¾feナ、 cusR¾fcナ、 cusC¾fcナ、 ylcC遺 子、 cusB遺 to子、 cusA遺 to子、 pheP 遺伝子、 ybdG遺伝子、 nftiB遺伝子、 ybdF遺伝子、 ybcU遺伝子、 ybdK遺伝子、 hokE 逾 fc子、 yi81¾fc子、 yi82¾fc子、 ymcC¾fc子、 ymcD遺 is子、 cspH¾fe子、 cspG 遺 fcナ、 sfa遺 十、 yccL遺伝子、 yccM遺伝子、 torS遺 isナ、 torT遺伝子、 torR遺 to 子、 torC遺伝子、 torA遺伝子、 torD遺伝子、 yccD遺伝子、 cbpA遺 is子、 yccE遺伝子 、 agp遺伝子、 yccj遺伝子、 wrbA遺伝子、 yciG遺伝子、 ycdG遺伝子、 _JW0992遺伝子 、 JW0993遺伝子、 _JW0994遺伝子、 ycdK遺伝子、 _JW0996遺伝子、 _JW0997遺伝子、 y cdC遺伝子、 putA遺伝子、 yzpU遺伝子、 putP遺伝子、 JW1002遺伝子、 ycdO遺伝子 、 ycdB¾伝子、 phoH遺 is子、 ycdP遺 is子、 ycdQ fc子、 ycdR遺 子、 ycdS遺 子 、 ycdT遺伝子、 JW1012遺伝子、 JW1013遺伝子、 JW1014遺伝子、 ycdU遺伝子、 ymf D遺伝子、 ymffi遺伝子、 lit遺伝子、 intE遺伝子、 VXIS— BPP21遺伝子、 ym!H遺伝子、 ymfl遺伝子、 ymfj遺伝子、 RPC2— BPP22遺伝子、 JW1132遺伝子、 ym!L遺伝子、 ymlM 遺伝子、 ym!N遺伝子、 ym!R遺伝子、 ymfO遺伝子、 JW1138遺伝子、 JW1139遺伝子、 yc!K遺 子、 ymS¾fe子、 ycfA¾fc子、 ycffi遺 is子、 pin遺 is子、 mcrA¾fe子、 JW1 146遺 is子、 ycgW遺 is子、 ycgX遺 is子、 ycgE遺 子、 JW1150¾fc子、 ycgZ¾fc子 、 ymgA遺伝子、 JW1153遺伝子、 ymgC遺伝子、 yahA遺伝子、 JW1156遺伝子、 JW11 57遺伝子、 aidA遺伝子、 ymgD遺伝子、 JW1160遺伝子、 JW1161遺伝子、 JW1162遺 伝子、 yd!H遺伝子、 ydfZ遺伝子、 ydfl遺伝子、 shiA遺伝子、 _JW1537遺伝子、 tnpR遺 伝子、 yd!M遺伝子、 Y314丄 AMBD遺伝子、 nohA遺伝子、 ydfO遺伝子、 yccL遺伝子、 cspl遺伝子、 yd!R遺伝子、 vlyS遺伝子、 cspB遺伝子、 cspF遺伝子、 regQ丄 AMBD遺 伝子、 _JW1552遺伝子、 rem遺伝子、 hokD遺伝子、 relE遺伝子、 relB遺伝子、 ydiVjf 伝子、 flxA遺伝子、 yd!W遺伝子、 yd!X遺伝子、 dicC遺伝子、 sdaC遺伝子、 yqeH遺伝 子、 yqel¾fc子、 yqej¾伝子、 yqeK遺 子、 ygerjlfe子、 ygeG¾伝子、 ygeH¾fc子 、 ygel遺伝子、 JW2822遺伝子、 ygeK遺伝子、 JW2824遺伝子、 JW2825遺伝子、 JW28 30遺伝子、 ygeP遺伝子、 JW2832遺伝子、 nlpD遺伝子、 yagR遺伝子、 ygeT遺伝子、 J W2836¾fc子、 ygeV遺 is子、 ygeW¾fc子、 dpaL遺 is子、 ygeY遺 is子、 ygeZ遺伝子 、 arcL遺伝子、 yqeB遺伝子、 JW2844遺伝子、 ygfj遺伝子、 gltD遺伝子、 JW2847遺伝 子、 yglM遺 子、 yagR fc子、 ygfO遺伝子、 ygff¾fc子、 ygfQ 伝子、 yg!R遺 子 ゝ ygiS遺伝子、 yg! 遺 子、 pbuX遺 子、 idi遺 子、 epsM遺 子、 exeL逾 to子、 exe C遺伝子、 JW2938遺伝子、 JW2939遺伝子、 JW2940遺伝子、 JW2941遺伝子、 yghK 遺伝子、 glcB遺伝子、 glcG遺伝子、 glcF遺伝子、 glcD遺伝子、 glcC遺伝子、 JW2948 遺伝子、 yghQ遺伝子、 yghR遺伝子、 yghS遺 is子、 yghT遺 is子、 yihL遺伝子、 yihM 遺伝子、 yihN遺伝子、 yshA遺伝子、 yihO遺伝子、 yihP遺伝子、 yihQ遺伝子、 yihR遺 伝子、 yihS遺伝子、 yihT遺 is子、 yihU遺 is子、 yihV遺伝子、 yihW遺伝子、 yihX遺 is 子、 rbn¾fcナ、 yihZ遺伝子、 yiiD遺 子、 yiiE遺伝子、 yiiF遺伝子、 yiiG¾fcナ、 frvR 逾 fc子、 frvX¾fc子、 frvB¾fc子、 frvA fc子、 yiiL¾伝子、 rhaD遺 is子、 rhaA¾伝 子、 rhaB遺伝子、 rhaS遺伝子、 rhaR遺伝子、 rhaT遺伝子、 ptsA遺伝子、 JW3920遺伝 子、 frwC遺伝子、 frwB遺伝子、 pflD遺伝子、 pflC遺伝子、 frwD遺伝子、 yijO遺伝子、 y ijP遺伝子、 _JW3986遺伝子、 yjbF遺伝子、 yjbG遺伝子、 yjbH遺伝子、 JW3989.5遺伝 子、 yjbA遺 子、 xylE遺伝子、 malG遺 is子、 malF¾fe子、 malE遺 is子、 malK fc子 、 lamB遺 子、 malM遺 子、 yjbl遺 子、 yjcP¾伝子、 yjcQ遺 子、 yjcR¾fc子、 yj cS¾伝子、 alsK¾fe子、 alsE¾fe子、 alsC¾fc子、 alsA¾fc子、 alsB¾fc子、 phnQ 逾 fc子、 phnP遺 is子、 phnO遺 子、 phnN遺伝子、 phnM遺 is子、 phnL¾fc子、 phn K遺 is子、 phnj遺 is子、 phnl遺 is子、 phnH遺 is子、 phnG遺伝子、 phnF¾fc子、 phnE 遺伝子、 phnD遺伝子、 phnC遺伝子、 phnB遺伝子、 phnA遺伝子、 yjdA遺伝子および yjcZ遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まな！/ヽ染色体 DNAを有する請求項 1ま たは 2記載の大腸菌の変異体。
配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜 [18]記載の塩基配列を有する D
NA、またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する請求項 1
〜3の 、ずれか 1項に記載の大腸菌の変異体。
[1]塩基番号 243965番〜 253410番目で表される塩基配列
[2]塩基番号 261964番〜 387531番目で表される塩基配列
[3]塩基番号 389139番〜 403703番目で表される塩基配列
[4]塩基番号 518030番〜 532711番目で表される塩基配列
[5]塩基番号 535505番〜 550215番目で表される塩基配列
[6]塩基番号 563941番〜 608118番目で表される塩基配列
[7]塩基番号 1048888番〜 1097019番目で表される塩基配列
[8]塩基番号 1198106番〜 1225146番目で表される塩基配列
[9]塩基番号 1630912番〜 1641038番目で表される塩基配列 [10]塩基番号 1642632番〜 1650222番目で表される塩基配列
[11]塩基番号 2985362番〜 3033128番目で表される塩基配列
[ 12]塩基番号 3110110番〜 3134341番目で表される塩基配列
[13]塩基番号 4059898番〜 4079659番目で表される塩基配列
[14]塩基番号 4086451番〜 4099982番目で表される塩基配列
[15]塩基番号 4139232番〜 4149709番目で表される塩基配列
[16]塩基番号 4235359番〜 4251735番目で表される塩基配列
[ 17]塩基番号 4298977番〜 4311511番目で表される塩基配列
[18]塩基番号 4313318番〜 4329721番目で表される塩基配列
[5] yid 遺 is子、 yidG遺 is子、 yidH遺 子、 yidl遺 子、 yidj¾fc子、 yidK¾fc子、 yidL 遺伝子、 JW3657遺伝子、 glvG遺伝子、 glvB遺伝子、 glvC遺伝子、 yidP遺伝子、 yidE 遺伝子、 yidQ遺 子、 yidR¾fc子、 yidS遺 子、 dgoT¾fc子、 dgoA遺 子、 dgoK遺 子、 dgoR遺 is子、 yidW¾fe子、 yidXjife子、 yidA遺伝子、 yidB遺 is子、 asnAjife 子、 yieM遺伝子、 JW3724遺伝子、 yieN遺伝子、 kup遺伝子、 rbsD遺伝子、 rbsA遺伝 子、 rbsC遺伝子、 rbsB遺伝子、 rbsK遺伝子、 rbsR遺伝子および yieO遺伝子、または それらの相同遺伝子を含まない染色体 DNAを有する請求項 1〜4のいずれか 1項に 記載の大腸菌の変異体。
[6] 配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜 [3]記載の塩基配列を有する DN A、またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する請求項 1〜 5の 、ずれか 1項に記載の大腸菌の変異体。
[1]塩基番号 3854662番〜 3865831番目で表される塩基配列
[2]塩基番号 3867102番〜 3877010番目で表される塩基配列
[3]塩基番号 3926659番〜 3938878番目で表される塩基配列
[7] yecT遺伝子、 flhE遺伝子、 flhA遺伝子、 flhB遺伝子、 cheZ遺伝子、 cheY遺伝子、 che B遺 1zs子、 cheR遺 子、 tap遺 is子、 tar遺 is子、 cheW遺伝子、 cheA¾fzs子、 motBM 伝子、 motA遺伝子、 flhC遺伝子、 flhD遺伝子、 JW1882遺伝子、 JW1883遺伝子、 yec G¾1ZS +、 otsA¾fcナ、 otsB遺 1zs子、 araH遺 is子、 araG遺 is子、 araF¾f ナ、 yecl 遺伝子、 yecj遺伝子、 JW1892遺伝子、 ftn遺伝子、 yecH遺伝子、 tyrP遺伝子、 uvrC 遺伝十、 uvrY遺 子、 yecF遺 子、 sdiA遺 ナ、 yecC遺伝子、 yecS遺 ナ、 yedO 遺伝子、 fliY遺伝子、 fliZ遺伝子、 fliA遺伝子、 fliC遺伝子、 fliD遺伝子、 fliS遺伝子、 Hi T¾fcナ、 amyA遺 子、 yedD遺 子、 yedE遺 子、 yedr遺 1zs子、 yedK遺伝子、 yed L遺伝子、 yedN遺伝子、 yedM遺伝子、 fliE遺伝子、 fliF遺伝子、 fliG遺伝子、 fliH遺伝 子、 flil遺伝子、 flij遺伝子、 fliK遺伝子、 fliL遺伝子、 fliM遺伝子、 fliN遺伝子、 fliO遺 伝子、 fliP遺伝子、 fliQ遺伝子、 fliR遺伝子、 rcsA遺伝子、 dsrB遺伝子、 JW1937遺伝 子、 yedA遺 子、 vsr遺お子、 dcm遺 is子、 yedj遺 is子、 JW194り遺 is子、 ompC遺伝 子、 JW1948遺伝子、 yedS遺伝子、 yedU遺伝子、 yedV遺伝子、 copR遺伝子、 yedX遺 伝子、 JW1954遺伝子、 JW1955遺伝子、 JW1956遺伝子、 JW1974遺伝子、 JW1979遺 伝子、 JW1980遺伝子、 yeeP遺伝子、 flu遺伝子、 JW1983遺伝子、 yeeS遺伝子、 yeeU 遺伝子、 yeeV遺伝子、 yeeW遺伝子、 yelj遺伝子、 JW2013遺伝子、 yelj遺伝子、 yefl 遺伝子、 wbb_J遺伝子、 ye!G遺伝子、 rfc遺伝子、 glf遺伝子、 rlbX遺伝子、 rlbC遺伝子 、 ri A遺伝子、 ri D遺伝子および ri B遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まな い染色体 DNAを有する請求項 1〜6のいずれ力 1項に記載の大腸菌の変異体。
[8] 配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜 [5]記載の塩基配列を有する DN A、またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する請求項 1〜 7の 、ずれか 1項に記載の大腸菌の変異体。
[1]塩基番号 1964524番〜 1993075番目で表される塩基配列
[2]塩基番号 1996662番〜 2028209番目で表される塩基配列
[3]塩基番号 2033449番〜 2044376番目で表される塩基配列
[4]塩基番号 2069149番〜 2081926番目で表される塩基配列
[5]塩基番号 2104393番〜 2116064番目で表される塩基配列
[9] intA遺伝子、 yfjH遺伝子、 alpA遺伝子、 yfll遺伝子、 _JW2606遺伝子、 yftj遺伝子、 yfjK 遺伝子、 yfjL遺伝子、 yflM遺伝子、 yfjN遺伝子、 yflO遺伝子、 yflP遺伝子、 yflQ遺伝子 、 yfjR遺伝子、 ypjK遺伝子、 yfjS遺伝子、 yfjT遺伝子、 yfjU遺伝子、 yfjV遺伝子、 JW26 22遺伝子、 yfjW遺伝子、 JW2623.5遺伝子、 yfjX遺伝子、 yfjY遺伝子、 yfjZ遺伝子、 ypj F遺伝子、 ypjA遺伝子、 JW2629遺伝子、 JW2630遺伝子、 JW2631遺伝子、 JW2632遺 伝子、 JW2633遺伝子、 _JW2634遺伝子、 ygaE遺伝子、 yzzM遺伝子、 yqaE遺伝子、 J W2642遺伝子、 ygaP遺伝子、 stpA遺伝子、 JW2645遺伝子、 ygaC遺伝子、 ygaM遺伝 子、 nrdH遺伝子、 nrdl遺 is子、 nrdE¾伝子、 proV遺 is子、 proW遺 子、 proX¾伝 子、 JW2655遺伝子、 _JW2656遺伝子、 ygaZ遺伝子、 ygaH遺伝子、 srlA遺伝子、 srlB遺 伝子、 srlD遺伝子、 gutM遺伝子、 srlR遺伝子および gutQ遺伝子、またはそれらの相 同遺伝子を含まない染色体 DNAを有する請求項 1〜8のいずれか 1項に記載の大 腸菌の変異体。
[10] 配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜 [4]記載の塩基配列を有する DN A、またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する請求項 1〜 9の 、ずれか 1項に記載の大腸菌の変異体。
[1]塩基番号 2755677番〜 2789480番目で表される塩基配列
[2]塩基番号 2795174番〜 2800890番目で表される塩基配列
[3]塩基番号 2804308番〜 2810147番目で表される塩基配列
[4]塩基番号 2825314番〜 2830262番目で表される塩基配列
[11] gltF遺 子、 yhcA遺伝子、 yhcD¾伝子、 yhcE¾fc子、 yhcF遺 子、 yhcG遺 子、 y hcH遺伝子、 nanK遺伝子および nanE遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない 染色体 DNAを有する請求項 1〜： L0のいずれか 1項に記載の大腸菌の変異体。
[12] 配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 3360737番〜 3370547番目で表される 塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNAを 有する請求項 1〜11のいずれ力 1項に記載の大腸菌の変異体。
[13] yegE遺伝子、 alkA遺伝子、 yegD遺伝子、 JW2055遺伝子、 JW2056遺伝子、 JW2057 遺伝子、 JW2058遺伝子、 yegM遺伝子、 yegN遺伝子、 yegO遺伝子、 yegB遺伝子、 ba eS遺伝子、 baeR遺伝子、 JW2065遺伝子、 yegQ遺伝子、 ogrK遺伝子、 JW2068遺伝 子、 JW2069遺伝子、 yegS遺伝子、 gatR遺伝子、 JW2072遺伝子、 JW2073遺伝子、 gat R遺伝子、 gatD遺伝子、 gatC遺伝子、 gatB遺伝子、 gatA遺伝子、 gatZ遺伝子、 gatY 遺伝子、 lbaB¾fc子、 xegT遺 子、 yegU遺 子、 yegV¾伝子、 yegW遺 子、 yegX 遺 子、 molR¾fc子、 yehl¾fc子、 yehK¾伝子、 yehL遺 is子、 yehO遺 is子、 yehP 遺伝子、 yehQ遺 子、 yehR¾伝子、 yehS¾fe子、 yehT遺 子、 yehU遺 子、 yehV 遺 子、 yehW遺お子、 yehX遺 子、 yehY¾fe子、 yehZ遺 is子、 bglX遺 is子、 dldM 伝子、 pbpG遺伝子、 yohC遺伝子、 yeiQ遺伝子、 yeiR遺伝子、 yeiU遺 ナ、 spr遺伝 子、 rtn¾伝子、 yejA遺 子、 yejB¾伝子、 yej 遺 子、 yejF遺 子、 yejG遺 子、 b cr¾fcナ、 rsuA遺 is子、 yejH¾伝子、 yeil遺 is +、 yeij¾fc十、 yeiK遺 isナ、 yeiL遺 伝子、 yeiM遺伝子、 yeiN遺伝子および yeiC遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含 まない染色体 DNAを有する請求項 1〜12のいずれか 1項に記載の大腸菌の変異体
[14] 配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜 [4]記載の塩基配列を有する DN A、またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する請求項 1〜 13のいずれか 1項に記載の大腸菌の変異体。
[1]塩基番号 2146264番〜 2187855番目で表される塩基配列
[2]塩基番号 2200669番〜 2229850番目で表される塩基配列
[3]塩基番号 2270440番〜 2286588番目で表される塩基配列
[4]塩基番号 2255895番〜 2263491番目で表される塩基配列
[15] cmtA遺伝子および cmtB遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体 DN Aを有する請求項 1〜14のいずれ力 1項に記載の大腸菌の変異体。
[16] 配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 3077085番〜 3078916番目で表される 塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNAを 有する請求項 1〜15のいずれ力 1項に記載の大腸菌の変異体。
[17] intB遺伝子、 JW4228遺伝子、 yjgW遺伝子、 yjgX遺伝子、 yjgY遺伝子、 yjgZ遺伝子、 y i41遺伝子、 yi42遺伝子、 yjhB遺伝子、 yjhC遺伝子、 yjhD遺伝子、 yjhE遺伝子、 yi91 遺伝子、 _JW4244遺伝子、 _JW4245遺伝子、 _JW4246遺伝子、 yjhU遺伝子、 yjhF遺伝子 、 yjhG遺 is子、 yjhH fc子、 yjhl¾fc子、 sgcR遺 子、 sgct遺 子、 sgcA遺 子、 sg cQ遺伝子、 sgcC遺伝子、 JW4266.5遺伝子、 sgcX遺伝子、 yjhP遺伝子、 yjhQ遺伝子 、 JW4269.5遺伝子、 JW4270遺伝子、 JW4270.5遺伝子、 yjhR遺伝子、 yjhS遺伝子、 yj hT遺 to子、 yjhA¾伝子、 fimB¾fc子、 fimE¾fc子、 fim 遺 is子、 fiml¾fe子、 fimC遺 1zs子、 fimD¾fe子、 fimF¾fc子、 fimG遺 is子、 fimH遺伝子、 gntP¾fc子、 uxuA¾伝 子、 uxuB¾伝子、 uxuR遺 子、 yjiC遺 is子、 yjiDjifc子、 yjit遺伝子、 iadA遺 子、 yjiG遺伝子、 yjiH遺伝子、 yjil遺伝子、 yjij遺伝子、 yjiK遺伝子、 JW4296.5遺伝子、 yji L遺伝子、 yjiM遺伝子、 yjiN遺伝子、 yjiO遺 is子、 yjiP遺 子、 yjiQ遺伝子、 yjiR遺伝 子、 yjiS遺伝子、 yjiT遺伝子、 yjiV遺 is子、 mcrD遺伝子、 mcrC遺 is子、 mcrB遺伝子、 yjiW遺伝子、 hsdS遺伝子、 hsdM遺伝子、 hsdR遺 子、 mrr遺伝子、 yjiA遺伝子、 yjiX 遺伝子、 yjiY遺伝子、 tsr遺伝子、 yjjL遺伝子、 _JW4320遺伝子、 yjjM遺伝子、 yjjN遺伝 子、 mdoB遺伝子および yjjA遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まない染色体 D NAを有する請求項 1〜16のいずれか 1項に記載の大腸菌の変異体。
[18] 配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]または [2]記載の塩基配列を有する DNA、またはそれら DNAに相当する DNAを含まない染色体 DNAを有する請求項 1〜17のいずれか 1項に記載の大腸菌の変異体。
[1]塩基番号 4496202番〜 4509534番目で表される塩基配列
[2]塩基番号 4517876番〜 4599637番目で表される塩基配列
[19] kdpF遺伝子、 ybfA遺伝子、 rhsC遺伝子、 JW0690遺伝子、 ybffi遺伝子、 rhsA遺伝子 、 ybfC遺伝子、 yb!D遺伝子、 yb!L遺伝子、 yb!D遺伝子および ybgA遺伝子、またはそ れらの相同遺伝子を含まない染色体 DNAを有する請求項 1〜18のいずれか 1項に 記載の大腸菌の変異体。
[20] 配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 728821番〜 739593番目で表される塩 基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNAを有 する請求項 1〜19のいずれか 1項に記載の大腸菌の変異体。
[21] yjfl遺伝子、 yjfj遺伝子、 yj!K遺伝子、 yj!L遺伝子、 yj!M遺伝子、 yjfC遺伝子、 aidB遺 伝子、 yj!N遺伝子、 yjfO遺伝子、 yj!P遺伝子、 yj!Q遺伝子、 yj!R遺伝子、 sgaT遺伝子、 sgaB遺伝子、 sgaA遺伝子、 sgaH遺伝子および sgaU遺伝子、またはそれらの相同遺 伝子を含まな 、染色体 DNAを有する請求項 1〜20の 、ずれか 1項に記載の大腸菌 の変異体。
[22] 配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 4409533番〜 4423151番目で表される 塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNAを 有する請求項 1〜21のいずれ力 1項に記載の大腸菌の変異体。
[23] 請求項 1 [ 1 ]記載の遺伝子、 spr遺伝子、 bcr遺伝子および rsuA遺伝子、またはそれら の相同遺伝子を含み、かつ野生型の大腸菌の染色体 DNAより 933kbp以上短い染 色体 DNAを有する大腸菌の変異体。ただし、上記遺伝子またはそれらの相同遺伝 子中に、野生型の大腸菌が元来有していない遺伝子 (以下、 NC遺伝子という）がある 場合は、該野生型の大腸菌に由来する上記大腸菌の変異体は、 NC遺伝子を有して いなくてもよい。
[24] 請求項 2の [1]〜[55]記載の塩基配列を有する DNAおよび配列番号 1で表される 塩基配列中の塩基番号 2270440番〜 2286588番目で表される塩基配列を有する DN A、またはそれら DNAに相当する DNAを含む染色体 DNAを有する請求項 23記載 の大腸菌の変異体。
[25] yafj遺伝子、 ya!K遺伝子、 yafQ遺伝子、 dinj遺伝子、 ya!L遺伝子、 ya!M遺伝子、 I iA 遺伝子、 la!U遺伝子、 dinP遺伝子、 ya!N遺伝子、 yafO遺伝子、 ya!P遺伝子、 JW0225 遺伝子、 priH遺伝子、 ykfl遺伝子、 ya!W遺伝子、 yeeT遺伝子、 yk!G遺伝子、 ya!X遺 伝子、 yk!F遺伝子、 ykffi遺伝子、 ya!Y遺伝子、 ypjK遺伝子、 yafZ遺伝子、 ykfA遺伝 子、 perR遺伝子、 JW0245遺伝子、 JW0246遺伝子、 JW0247遺伝子、 ykl 遺伝子、 JW 0249遺伝子、 is5B遺伝子、 yi51遺伝子、 mmuP遺伝子、 mmuM遺伝子、 alUC遺伝子、 J W0255遺伝子、 insB遺伝子、 insA遺伝子、 JW0258遺伝子、 yagB遺伝子、 yagA遺伝 子、 yagE¾伝子、 yagF¾伝子、 yagG遺 子、 yagH遺 子、 yagl¾fc子、 argF¾fc子 、 yfjl遺 子、 yagj遺 子、 yagK遺 子、 yagL¾伝子、 yagM遺 子、 yagN遺 子、 in tF¾伝子、 yagP¾fe子、 yagQ遺 子、 yagR遺 子、 yag¾; izs子、 yagT遺 to子、 yag U遺 子、 ykgj遺 is子、 yagV遺 子、 yagW¾fc子、 yagX遺 子、 yagY遺 子、 yagZ 遺伝子、 ykgK遺伝子、 ykgL遺伝子、 ykgM遺伝子、 eaeH遺伝子、 _JW0292遺伝子、 J W0293遺伝子、 ykgA遺伝子、 ykgB遺伝子、 ykgl遺伝子、 merA遺伝子、 ykgD遺伝子 、 ykgE¾fc子、 ykgF遺 is子、 ykgG遺 子、 ykgH¾fc子、 betA¾fc子、 betB¾fc子 、 betl遺伝子、 betT¾fzs子、 yahA¾伝子、 yahB遺 is子、 yahC¾fzs子、 yahD¾伝子、 yahE¾伝子、 yahF¾fc子、 yahG遺 子、 yahH遺伝子、 arcM¾fc子、 yahj¾伝子、 y ahK遺 is子、 yahL¾fc子、 yahM¾fe子、 yahN遺 to子、 yahO遺伝子、 prpR¾fe子、 b cpA¾fcナ、 prpC¾fcナ、 prpD¾fcナ、 prpE¾伝十、 codB¾fe十、 codA¾fcナ、 cy nR遺 is子、 cynT¾fe子、 cynS遺 is子、 cynX遺 is子、
Figure imgf000277_0001
lacY遺伝子、 lacZ 逾 十、 lacl遺 子、 mhpR¾fe卞、 mhpA遺伝子、 mhpB遺 is子、 mnpC¾fcナ、 mhp D遺伝子、 mhpF遺伝子、 mhpE遺伝子、 mhpT遺伝子、 yaiL遺 is子、 yaiM遺 十、 adh C遺伝子、 yaiN遺伝子、 yaiO遺伝子、 JW0350遺伝子、 yi2A遺伝子、 yi22遺伝子、 yi2 4遺伝子、 yi23遺伝子、 yaiP遺伝子、 yaiS遺伝子、 tauA遺伝子、 tauB遺伝子、 tauC遺 伝子、 ssiD遺伝子、 yaiT遺伝子、 JW0363遺伝子、 JW0364遺伝子、 yaiU遺伝子、 yaiV 逾 fc子、 ampH遺 子、 sbmA遺 is子、 yaiW¾伝子、 yaiY¾fe子、 yaiZ¾fe子、 ddlA 逾 fc子、 yaiB¾fe子、 phoA¾fc子、 psiF¾fc子、 yaiC遺 is子、 ybbOjAfe子、 tesA遺 伝子、 ybbA遺伝子、 ybbP遺伝子、 rhsD遺伝子、 ybbC遺伝子、 rhsE遺伝子、 ybbD遺 伝子、 _JW0490遺伝子、 ybbB遺伝子、 ybbS遺伝子、 ybbT遺伝子、 ybbU遺伝子、 ybbQ 遺伝子、 ybbV遺伝子、 allP遺伝子、 allA遺伝子、 ybbY遺伝子、 ybbZ遺伝子、 ylbA遺 伝子、 aUC遺伝子、 ylbC遺伝子、 fdrA遺伝子、 ylbE遺伝子、 ylbE遺伝子、 ylbE遺伝子 、 ylbF遺伝子、 arcC遺伝子、 intD遺伝子、 EXO— LAMBD遺伝子、 VRPP— LAMBD遺伝 子、 JW0528遺伝子、 JW0529遺伝子、 VREN— LAMBD遺伝子、 emrE遺伝子、 ybcK遺 子、 ybcL¾伝子、 ybcM遺 is子、 ybcN遺 is子、 nin 遺 is子、 ybcO遺伝子、 rus遺お 子、 ybcQ遺伝子、 JW0539.5遺伝子、 nmpC遺伝子、 vlyS遺伝子、 ybcS遺伝子、 ybcT 逾 fc子、 vboR遺伝子、 ybcV遺 is子、 ybcW遺伝子、 nohB¾fe子、 ybcX¾伝子、 ybcY 逾 fc子、 JW0552¾fe子、 appY遺 is子、 ompT遺お子、 envY遺 is子、 ybcH¾fc子、 nf rA遺 is子、 nfrB遺伝ナ、 cusS遺 子、 cusR遺 子、 cusし遺 fc 、 ylcC遺 is十、 cusB 逾 fc子、 cusA遺 子、 pheP遺 子、 ybdG¾fc子、 nlhB遺 is子、 ybdF¾fe子、 ybdj 逾 fc子、 ybdK¾伝子、 hok 遺 is子、 yi8l遺伝子、 yi82遺 is子、 ymcC遺 is子、 ymcD 逾 ナ、 cspH遺 is 、 cspG遺 is子、 sfajAizs子、 yccL遺 子、 yccM遺 子、 torSM fzs子、 tori遺 is子、 torR遺 is子、 torC¾fc子、 torA¾fzs子、 torD遺 is子、 yccDM zs 、 cbpA fcナ、 ycc 遑 to子、 agp¾fc十、 yccj¾fcナ、 wrbA¾伝子、 yciG¾feナ 、 ycdG遺伝子、 JW0992遺伝子、 JW0993遺伝子、 JW0994遺伝子、 ycdK遺伝子、 JW0 996遺伝子、 JW0997遺伝子、 ycdC遺伝子、 putA遺伝子、 yzpU遺伝子、 putP遺伝子、 JW1002遺伝子、 ycdO遺伝子、 ycdB遺伝子、 phoH遺伝子、 ycdP遺伝子、 ycdQ遺伝 子、 ycdR遺伝子、 ycdR遺伝子、 ycdS遺伝子、 ycdT遺伝子、 JW1012遺伝子、 JW1013 遺伝子、 JW1014遺伝子、 ycdU遺伝子、 ym!D遺伝子、 ymffi遺伝子、 lit遺伝子、 intE 遺伝子、 VXIS— BPP21遺伝子、 ym!H遺伝子、 ymfl遺伝子、 ymlj遺伝子、 RPC2— BPP22 遺伝子、 JW1132遺伝子、 ym!L遺伝子、 ym!M遺伝子、 ym!N遺伝子、 ymlR遺伝子、 ym fO遺伝子、 JW1138遺伝子、 JW1139遺伝子、 yc!K遺伝子、 ymS遺伝子、 ycfA遺伝子 、 ycffi遺 to子、 pin遺伝子、 mcrA遺 is子、 JW114り遺 is子、 ycgW遺 is子、 ycgX¾fc子 、 ycgE遺伝子、 JW1150遺伝子、 ycgZ遺伝子、 ymgA遺伝子、 JW1153遺伝子、 ymgC 遺伝子、 yahA遺伝子、 JW1156遺伝子、 JW1157遺伝子、 aidA遺伝子、 ymgD遺伝子、 JW1160遺伝子、 JW1161遺伝子、 JW1162遺伝子、 yd!H遺伝子、 ydfZ遺伝子、 ydfl遺 伝子、 shiA遺伝子、 JW1537遺伝子、 tnpR遺伝子、 yd!M遺伝子、 Y314丄 AMBD遺伝 子、 nohA fe子、 ydfO遺 子、 yccL¾fc子、 cspl¾fc子、 ydfR¾fe子、 vlyS¾fc子 、 cspB遺伝子、 cspF遺伝子、 regQ丄 AMBD遺伝子、 JW1552遺伝子、 rem遺伝子、 ho kD遺伝子、 relE遺伝子、 relB遺伝子、 yd!V遺伝子、 flxA遺伝子、 yd!W遺伝子、 yd!X ¾fcナ、 dicCjAizs子、 sdaC fc十、 yqeH¾伝子、 yqel¾伝子、 yqej¾fc十、 yqeK遺 fc子、 ygeF fc子、 ygeG fc子、 ygeH¾fc子、 ygel遺 子、 JW2822遺 子、 ygeK 遺伝子、 JW2824遺伝子、 JW2825遺伝子、 JW2830遺伝子、 ygeP遺伝子、 JW2832遺 伝子、 nlpD遺伝子、 yagR遺伝子、 ygeT遺伝子、 JW2836遺伝子、 ygeV遺伝子、 ygeW ¾fc子、 dpaL遺 子、 ygeY遺 is子、 ygeZ遺伝子、 arcL遺 is子、 yqeB遺 is子、 JW284 4遺伝子、 yglj遺伝子、 gltD遺伝子、 _JW2847遺伝子、 yg!M遺伝子、 yagR遺伝子、 ygf 0遺伝子、 yg!P遺伝子、 ygfQ遺伝子、 yg!R遺伝子、 ygS遺伝子、 ygfT遺伝子、 pbuX 遺伝子、 idi遺伝子、 epsM遺伝子、 exeL遺伝子、 exeC遺伝子、 JW2938遺伝子、 JW29 39遺伝子、 JW2940遺伝子、 JW2941遺伝子、 yghK遺伝子、 glcB遺伝子、 glcG遺伝子 、 glcF遺伝子、 glcD遺伝子、 glcC遺伝子、 JW2948遺伝子、 yghQ遺伝子、 yghR遺伝 子、 yghS遺 is子、 yghT遺 is子、 yihL遺伝子、 yihM遺 子、 yihN遺 子、 yshA遺伝子 、 yihO遺伝子、 yihP遺 is子、 yihQ遺 子、 yihR遺 子、 yihS¾fc子、 yihT遺伝子、 yi hU遺 is子、 yihV遺 is子、 yihW遺 子、 yihX遺伝子、 rbn¾伝子、 yihZ¾fe子、 yiiD遺 子、 yiiE¾fe子、 yii 遺 to子、 yiiG遺伝子、 frvR遺 is子、 frvX遺 is子、 frvB遺 is子、 f rvA¾izs子、 yiiL遺 1ZS子、 rhaD¾fc子、 rhaA遺伝子、 rhaB遺 1ZS子、 rhaS遺 1ZS子、 rhaR 遺伝子、 rhaT遺伝子、 ptsA遺伝子、 JW3920遺伝子、 frwC遺伝子、 frwB遺伝子、 pflD 遺伝子、 pflC遺伝子、 frwD遺伝子、 yijO遺伝子、 yijP遺伝子、 _JW3986遺伝子、 yjbF遺 伝子、 yjbG遺伝子、 yjbH遺伝子、 _JW3989.5遺伝子、 yjbA遺伝子、 xylE遺伝子、 malG 遺 fcナ、 malF遺伝子、 malE遺 十、 malK遺 子、 lamB遺 ナ、 malM遺 十、 yjbl遺 fc子、 yjcP遺 is子、 yjcQ遺 子、 yjcR遺 is子、 yjcS¾伝子、 alsK遺 子、 alsE遺 is子 、 alsC遺 子、 alsA遺伝子、 alsB遺伝子、 phnQ遺 is子、 phnP遺 is子、 phnO遺 is子、 phnN¾fc子、 phnM¾fc子、 phnL¾伝子、 phnK遺 is子、 phnj¾伝子、 phnl¾fe子、 p hnH遺 is子、 phnG fc子、 phnF¾伝子、 phn 遺伝子、 phnD遺 is子、 phnC¾fe子、 phnB遺伝子、 phnA遺 子、 yjdA¾fc子、 yjcZ遺伝子、 yidF遺 子、 yidG遺 子、 yid H遺伝子、 yidl遺伝子、 yidj遺伝子、 yidK遺伝子、 yidL遺伝子、 JW3657遺伝子、 glvG ¾fe子、 glvB遺伝子、 glvC遺 is子、 yidP遺 is子、 yidE遺 子、 yidQ遺 is子、 yidRM 子、 yidS遺 子、 dgoT¾伝子、 dgoA遺 to子、 dgoK遺 is子、 dgoR¾fc子、 yidW遺 伝子、 yidX遺伝子、 yidA遺伝子、 yidB遺伝子、 asnA遺伝子、 yieM遺伝子、 JW3724遺 子、 yieN遺 is子、 kup¾fc子、 rbsD遺 is子、 rbsA¾伝子、 rbsC遺 is子、 rbsB遺 is 子、 rbsK遺伝子、 rbsR遺伝子、 yieO遺伝子、 yecT遺伝子、 flhE遺伝子、 flhA遺伝子、 flhB¾fc子、 cheZ遺 is子、 cheY¾fe子、 cheB¾伝子、 cheR遺 is子、 tap遺 is子、 tar 遺伝子、 cheW遺伝子、 cheA遺伝子、 motB遺伝子、 motA遺伝子、 flhC遺伝子、 HhD 遺伝子、 JW1882遺伝子、 JW1883遺伝子、 yecG遺伝子、 otsA遺伝子、 otsB遺伝子、 a raH遺伝子、 araG遺伝子、 araF遺伝子、 yecl遺伝子、 yecj遺伝子、 JW1892遺伝子、 ft n¾fcナ、 yecH遺 is 、 tyrP遺伝子、 uvrC遺 子、 uvrY遺 子、 yecF遺 子、 sdiA 遺伝子、 yecC遺伝子、 yecS遺伝子、 yedO遺伝子、 fliY遺伝子、 fliZ遺伝子、 fliA遺伝 子、 fliC遺伝子、 fliD遺伝子、 fliS遺伝子、 fliT遺伝子、 amyA遺伝子、 yedD遺伝子、 ye dE¾fc子、 yedF遺 is子、 yed 遺 is子、 yedL¾fe子、 yedN遺 子、 yedM遺 is子、 Hi E遺伝子、 fliF遺伝子、 fliG遺伝子、 fliH遺伝子、 flil遺伝子、 HU遺伝子、 fliK遺伝子、 Hi L遺伝子、 fliM遺伝子、 fliN遺伝子、 fliO遺伝子、 fliP遺伝子、 fliQ遺伝子、 fliR遺伝子、 res A遺 to子、 dsrB¾fc子、 J W1937遺伝子、 yedA遺 1ZS子、 vsr遺 1ZS子、 dcm遺 1ZS子、 y edj遺伝子、 JW1946遺伝子、 ompC遺伝子、 JW1948遺伝子、 yedS遺伝子、 yedU遺伝 子、 yedV遺伝子、 copR遺伝子、 yedX遺伝子、 JW1954遺伝子、 JW1955遺伝子、 JW1 956遺伝子、 JW1974遺伝子、 JW1979遺伝子、 JW1980遺伝子、 yeeP遺伝子、 flu遺伝 子、 JW1983遺 子、 yeeS遺 子、 yeeT¾fc子、 yeeU¾伝子、 yeeV遺伝子、 yeeW遺 伝子、 yelj遺伝子、 _JW2013遺伝子、 yelj遺伝子、 yefl遺伝子、 wbb_J遺伝子、 yefG遺伝 子、 rfc遺伝子、 glf遺伝子、 ri X遺伝子、 ri C遺伝子、 ri A遺伝子、 ri D遺伝子、 rlbB 遺伝子、 intA遺伝子、 yflH遺伝子、 alpA遺伝子、 yfll遺伝子、 _JW2606遺伝子、 yfjj遺 伝子、 yfjK遺伝子、 yflL遺伝子、 yfjM遺伝子、 yflN遺伝子、 yflO遺伝子、 yfjP遺伝子、 yfjQ遺伝子、 yfjR遺伝子、 ypjK遺伝子、 yfjS遺伝子、 yfjT遺伝子、 yfjU遺伝子、 yfjV遺 伝子、 JW2622遺伝子、 遺伝子、 JW2623.5遺伝子、 yfjX遺伝子、 yfjY遺伝子、 yfjZ 遺伝子、 ypjF遺伝子、 ypjA遺伝子、 JW2629遺伝子、 JW2630遺伝子、 JW2631遺伝子 、 JW2632遺伝子、 JW2633遺伝子、 JW2634遺伝子、 ygaE遺伝子、 yzzM遺伝子、 yqa E遺伝子、 _JW2642遺伝子、 ygaP遺伝子、 stpA遺伝子、 _JW2645遺伝子、 ygaC遺伝子 、 ygaM遺 is子、 nrdH¾fc子、 nrdl¾fe子、 nrdE遺 is子、 proV¾伝子、 proW¾伝子、 proX遺伝子、 JW2655遺伝子、 JW2656遺伝子、 ygaZ遺伝子、 ygaH遺伝子、 srlA遺伝 子、 srlB遺伝子、 srlD遺伝子、 gutM遺伝子、 srlR遺伝子、 gutQ遺伝子、 gltF遺伝子、 yhcA遺伝子、 yhcD¾fc子、 yhc 遺 子、 yhct遺伝子、 yhcF遺 子、 yhcG¾fc子、 y hcH遺 子、 nanK¾fe子、 nan 遺 is子、 yegE¾fc子、 alkA遺 is子、 yegD¾fe子、 J W2055遺伝子、 JW2056遺伝子、 JW2057遺伝子、 JW2058遺伝子、 yegM遺伝子、 yeg N遺伝子、 yegO遺伝子、 yegB遺伝子、 baeS遺伝子、 baeR遺伝子、 JW2065遺伝子、 y egQ遺伝子、 ogrK遺伝子、 JW2068遺伝子、 JW2069遺伝子、 yegS遺伝子、 gatR遺伝 子、 JW2072遺伝子、 JW2073遺伝子、 gatR遺伝子、 gatD遺伝子、 gatC遺伝子、 gatB 逾 fe子、 gatA fc子、 gatZ¾伝子、 gat Y遺伝子、 I aB遺 子、 xegT遺伝子、 yegUM 子、 yegV遺伝子、 yegW¾fc子、 yegX遺 is子、 molR遺 is子、 yehl遺 is子、 yehK遺 子、 yehL遺 is子、 yeh。¾伝子、 yehP¾fc子、 yehQ遺 子、 yehR遺伝子、 yehS遺 子、 yehT¾伝子、 yehU遺お子、 yehV遺 is子、 yehW遺 is子、 yehX¾fc子、 yehY遺 子、 yehZ遺伝子、 bglX¾fc子、 dld¾fc子、 pbpG¾fe子、 yohC¾伝子、 yeil遺 is 子、 yeiJiK伝子、 yeiK遺 子、 yeiL遺 子、 yeiM遺伝子、 yeiN遺 子、 yeiC遺 子、 cmtA遺伝子、 cmtB遺伝子、 intB遺伝子、 _JW4228遺伝子、 yjgW遺伝子、 yjgX遺伝子 、 yjgY遺 fc子、 yjgZ遺 子、 yi41¾伝子、 yi42遺 子、 yjhB遺 子、 yjhC遺 子、 yjh D遺伝子、 yjhE遺伝子、 yi91遺伝子、 _JW4244遺伝子、 _JW4245遺伝子、 _JW4246遺伝 子、 yjhU fc子、 yjhF遺 is子、 yjhG遺 子、 yjhH¾伝子、 yjhl¾伝子、 sgcR遺 子、 sgcE遺 子、 sgcAjAfe子、 sgcQ fe子、 sgcC遺 子、 JW4266.5 伝子、 sgcX遺 is 子、 yjhP遺伝子、 yjhQ遺伝子、 JW4269.5遺伝子、 JW4270遺伝子、 JW4270.5遺伝子 、 yjhR遺 is子、 yjhS fc子、 yjhT¾伝子、 yjhA¾伝子、 fimB遺 子、 finrn遺 子、 fim A遺 is子、 fiml¾伝子、 fimC fc子、 fimD遺 is子、 fimr1遺 is子、 fimG¾伝子、 fimH遺 子、 gntP遺 子、 uxuA遺 子、 uxuB¾fe子、 uxuR遺 is子、 yjiC遺 is子、 yjiDjA zS 子、 yjiE遺 is子、 iadA fc子、 yjiG遺 子、 yjiH遺 子、 yjil¾伝子、 yjij遺 子、 yjiK 遺伝子、 JW4296.5遺伝子、 yjiL遺伝子、 yjiM遺伝子、 yjiN遺伝子、 yjiO遺伝子、 yjiP 逾伝子、 yjiQ遺 子、 yjiR遺 子、 yjiS fc子、 yjiT遺 子、 yjiV遺 子、 mcrD遺 子、 mcrC遺 子、 mcrB遺 十、 yjiW
逾 fc子、 hsdS遺 子、 hsdM遺 子、 hsdR¾伝子、 mrr遺 is子、 yjiA¾fc子、 yjiX¾伝 子、 yjiY遺伝子、 tsr遺伝子、 yjjL遺伝子、 JW4320遺伝子、 yjjM遺伝子、 yjjN遺伝子、 mdoB遺伝子、 yjjA遺伝子、 kdpF遺伝子、 ybfA遺伝子、 rhsC遺伝子、 JW0690遺伝子 、 ybffi遺伝子、 rhsA遺伝子、 ybl 遺伝子、 yblL遺伝子、 yblD遺伝子、 ybgA遺伝子、 yj fl遺伝子、 yj!J遺伝子、 yjiK遺伝子、 yj!L遺伝子、 yj!M遺伝子、 yjfC遺伝子、 aidB遺伝 子、 yjiN遺 is子、 yjiO¾伝子、 yjiPiK伝子、 yj!Q遺 子、 yjfR遺 1S子、 sgaT¾伝子、 sg aB遺伝子、 sgaA遺伝子、 sgaH遺伝子、 sgaU遺伝子、 rhsB遺伝子、 JW3448遺伝子、 y hhH遺伝子、 yibA遺伝子、 yhhl遺伝子、 yhhj遺伝子、 yhiH遺伝子、 yhil遺伝子、 yhij 遺伝子、 yhiK遺伝子、 yhiL遺伝子、 yhiM遺伝子、 yhiN遺伝子、 JW0782遺伝子、 ybiA ¾fc子、 dinG fc子、 ybiB¾伝子、 ybiC¾伝子、 ybij遺 子、 ybil遺伝子、 ybiX遺 子、 ybiL遺伝子、 ybiM遺伝子、 ybiN遺伝子、 ybiO遺伝子、 glnQ遺伝子、 glnP遺伝子 、 glnH遺伝子、 yliA遺伝子、 yliB遺伝子、 yliC遺伝子、 yliD遺伝子、 JW0817遺伝子、 J W0818遺伝子、 yliG遺伝子、 yliH遺伝子、 ylil遺伝子、 ylij遺伝子、 dacC遺伝子、 deo R遺伝子、 ybjG遺伝子、 ybjC遺伝子、 mdaA遺伝子、 rimK遺伝子、 ybjN遺伝子、 potF 逾云子、 potG遺 子、 potH遺伝子、 potI¾fe子、 ybjO fc子、 ybjF¾伝子、 artjM 伝子、 artM遺伝子、 artQ遺伝子、 artl遺伝子、 artP遺伝子、 ybjP遺伝子、 _JW0850遺 伝子、 JW0851遺伝子、 JW0852遺伝子、 ybjT遺伝子および ItaA遺伝子、またはそれら の相同遺伝子を含まな 、染色体 DNAを有する請求項 23または 24記載の大腸菌の 変異体。
配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜 [43]記載の塩基配列を有する D NA、またはそれら DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNAを有する 3〜25の 、ずれか 1項に記載の大腸菌の変異体。
[I]塩基番号 243965番〜 253410番目で表される塩基配列
[2]塩基番号 261964番〜 387531番目で表される塩基配列
[3]塩基番号 389139番〜 403703番目で表される塩基配列
[4]塩基番号 518030番〜 532711番目で表される塩基配列
[5]塩基番号 535505番〜 550215番目で表される塩基配列
[6]塩基番号 563941番〜 608118番目で表される塩基配列
[7]塩基番号 728821番〜 739593番目で表される塩基配列
[8]塩基番号 832552番〜 848089番目で表される塩基配列
[9]塩基番号 867638番〜 883473番目で表される塩基配列
[10]塩基番号 890998番〜 909379番目で表される塩基配列
[I I]塩基番号 1048888番〜 1097019番目で表される塩基配列
[12]塩基番号 1198106番〜 1225146番目で表される塩基配列
[13]塩基番号 1630912番〜 1641038番目で表される塩基配列
[14]塩基番号 1642632番〜 1650222番目で表される塩基配列
[15]塩基番号 1964524番〜 1993075番目で表される塩基配列
[16]塩基番号 1996662番〜 2028209番目で表される塩基配列
[17]塩基番号 2033449番〜 2044376番目で表される塩基配列
[18]塩基番号 2069149番〜 2081926番目で表される塩基配列
[19]塩基番号 2104393番〜 2116064番目で表される塩基配列
[20]塩基番号 2146264番〜 2187855番目で表される塩基配列
[21]塩基番号 2200669番〜 2229850番目で表される塩基配列
[22]塩基番号 2255895番〜 2263491番目で表される塩基配列
[23]塩基番号 2755677番〜 2789480番目で表される塩基配列
[24]塩基番号 2795174番〜 2800890番目で表される塩基配列
[25]塩基番号 2804308番〜 2810147番目で表される塩基配列
[26]塩基番号 2825314番〜 2830262番目で表される塩基配列 [27]塩基番号 2985362番〜 3033128番目で表される塩基配列
[28]塩基番号 3077085番〜 3078916番目で表される塩基配列
[29]塩基番号 3110110番〜 3134341番目で表される塩基配列
[30]塩基番号 3360737番〜 3370547番目で表される塩基配列
[31]塩基番号 3618576番〜 3636916番目で表される塩基配列
[32]塩基番号 3854662番〜 3865831番目で表される塩基配列
[33]塩基番号 3867102番〜 3877010番目で表される塩基配列
[34]塩基番号 3926659番〜 3938878番目で表される塩基配列
[35]塩基番号 4059898番〜 4079659番目で表される塩基配列
[36]塩基番号 4086451番〜 4099982番目で表される塩基配列
[37]塩基番号 4139232番〜 4149709番目で表される塩基配列
[38]塩基番号 4235359番〜 4251735番目で表される塩基配列
[39]塩基番号 4298977番〜 4311511番目で表される塩基配列
[40]塩基番号 4313318番〜 4329721番目で表される塩基配列
[41]塩基番号 4409533番〜 4423151番目で表される塩基配列
[42]塩基番号 4496202番〜 4509534番目で表される塩基配列
[43]塩基番号 4517876番〜 4599637番目で表される塩基配列
[27] ygiS遺伝子、 ygiT遺伝子、 ygiU遺伝子、 JW2991遺伝子、 ygiW遺伝子、 ygiX遺伝子、 ygiY遺伝子、 ygiZ遺伝子、 mdaB遺伝子および ygiN遺伝子、またはそれらの相同遺伝 子を含まな 、染色体 DNAを有する請求項 23〜26の 、ずれか 1項に記載の大腸菌 の変異体。
[28] 配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 3165628番〜 3172940番目で表される 塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNAを 有する請求項 23〜27のいずれ力 1項に記載の大腸菌の変異体。
[29] ybeL¾伝子、 ybeQ遺 子、 ybeR遺 子、 ybeS遺 子、 ybeT¾伝子、 ybeU遺 子、 y beV遺伝子、 ybeW遺伝子、 ybeK遺伝子、 gltL遺伝子、 gltK遺伝子、 glU遺伝子、 ybej 遺伝子および JW0651遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まな!/ヽ染色体 DNAを 有する請求項 23〜28のいずれ力 1項に記載の大腸菌の変異体。 [30] 配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 675104番〜 689374番目で表される塩 基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNAを有 する請求項 23〜29のいずれ力 1項に記載の大腸菌の変異体。
[31] yfcC遺伝子、 JW2296遺伝子、 yfcE遺伝子、 yfcF遺伝子、 yfcG遺伝子、 folX遺伝子、 J W2301遺伝子、 yfcl遺伝子、 hisP遺伝子、 hisM遺伝子、 hisQ遺伝子、 hisj遺伝子、 arg T遺伝子、 yfdB遺伝子、 _JW2346遺伝子、 yfdH遺伝子、 _JW2348遺伝子、 yfdK遺伝子、 yfdL遺伝子、 yfdM遺伝子、 xylU遺伝子、 yfdN遺伝子、 yfdO遺伝子、 _JW2356遺伝子、 JW2357遺伝子、 JW2358遺伝子、 JW2359遺伝子、 JW2360遺伝子、 JW2378遺伝子、 yqhT遺伝子、 ptwC遺伝子および ptwB遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まな V、染色体 DNAを有する請求項 23〜30の 、ずれか 1項に記載の大腸菌の変異体。
[32] 配列番号 1で表される塩基配列中の以下の [1]〜 [3]記載の塩基配列を有する DN A、またはそれら DNAに相当する DNAを含まな ヽ染色体 DNAを有する請求項 23 〜31のいずれか 1項に記載の大腸菌の変異体。
[1]塩基番号 2423365番〜 2434098番目で表される塩基配列
[2]塩基番号 2472852番〜 2482482番目で表される塩基配列
[3]塩基番号 2505075番〜 2514557番目で表される塩基配列
[33] pinO¾伝子、 gspA fc子、 gspC遺 子、 gspD遺 子、 gspE遺 子、 hofH遺 子、 h ofG遺 isナ、 hofH遺 is子、 gspl遺 is子、 gspj遺 1zs子、 gspK遺 isナ、 gspL遺 1zs子、 psh M遺伝子、 ho!D遺伝子、 bfr遺伝子、 yheA遺伝子および chiA遺伝子、またはそれらの 相同遺伝子を含まない染色体 DNAを有する請求項 23〜32のいずれか 1項に記載 の大腸菌の変異体。
[34] 配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 3453021番〜 3469366番目で表される 塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNAを 有する請求項 23〜33のいずれ力 1項に記載の大腸菌の変異体。
[35] elaB遺伝子、 elaA遺伝子、 elaC遺伝子、 elaD遺伝子、 yl K遺伝子、 ylbL遺伝子、 ylb M遺伝子、 ylbN遺伝子、 JW2269遺伝子および JW2270遺伝子、またはそれらの相同 遺伝子を含まな 、染色体 DNAを有する請求項 23〜34の 、ずれか 1項に記載の大 腸菌の変異体。 [36] 配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 2386262番〜 2395471番目で表される 塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNAを 有する請求項 23〜35のいずれ力 1項に記載の大腸菌の変異体。
[37] yhdj遺伝子、 yhdU遺伝子、 envR遺伝子、 acrE遺伝子、 envD遺伝子、 yhdV遺伝子、 y hdW遺伝子、 yhdX遺伝子および yhdY遺伝子、またはそれらの相同遺伝子を含まな V、染色体 DNAを有する請求項 23〜36の 、ずれか 1項に記載の大腸菌の変異体。
[38] 配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 3411160番〜 3420878番目で表される 塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNAを 有する請求項 23〜37のいずれ力 1項に記載の大腸菌の変異体。
[39] chpA遺伝子、またはその相同遺伝子を含まない染色体 DNAを有する請求項 23〜3 8の 、ずれか 1項に記載の大腸菌の変異体。
[40] 配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 2910274番〜 2910573番目で表される 塩基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNAを 有する請求項 23〜39のいずれ力 1項に記載の大腸菌の変異体。
[41] I uA遺伝子、 IhuC遺伝子、 I uD遺伝子および I uB遺伝子、またはそれらの相同遺伝 子を含まな 、染色体 DNAを有する請求項 23〜40の 、ずれか 1項に記載の大腸菌 の変異体。
[42] 配列番号 1で表される塩基配列中の塩基番号 167065番〜 172979番目で表される塩 基配列を有する DNA、または該 DNAに相当する DNAを含まな!/、染色体 DNAを有 する請求項 23〜41のいずれ力 1項に記載の大腸菌の変異体。
[43] 以下の [1]〜[5]から選ばれる方法によって改変して得られる請求項 1〜42のいず れか 1項に記載の大腸菌の変異体。
[1]有用物質の生合成を制御する機構の少なくとも 1つを緩和または解除する方法 [2]有用物質の生合成に関与する酵素の少なくとも 1つを発現強化する方法
[3]有用物質の生合成に関与する酵素遺伝子の少なくとも 1つのコピー数を増加さ せる方法
[4]有用物質の生合成経路から該有用物質以外の代謝産物へ分岐する代謝経路 の少なくとも 1つを弱化または遮断する方法 [5]野生型の大腸菌に比べ、有用物質のアナログに対する耐性度が高い細胞株を 選択する方法
[44] 大腸菌が大腸菌 K-12株、大腸菌 B株または大腸菌 W株である、請求項 1〜43のい ずれ力 1項に記載の大腸菌の変異体。
[45] 大腸菌 K-12株が大腸菌 W3110株（ATCC27325)または大腸菌 MG1655株 (ATCC47
076)である、請求項 44記載の大腸菌の変異体。
[46] 請求項 1〜45のいずれか 1項に記載の大腸菌の変異体を培地に培養し、培養物中 に有用物質を生成、蓄積させ、該培養物から該有用物質を採取することを特徴とす る有用物質の製造法。
[47] 有用物質がタンパク質、ペプチド、アミノ酸、核酸、ビタミン、糖、有機酸および脂質か らなる群より選ばれる有用物質である請求項 43〜46のいずれか 1項に記載の製造 法。
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