WO2004046996A1 - 塩基配列関連情報を用いた情報処理システム - Google Patents

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WO2004046996A1
WO2004046996A1 PCT/JP2003/014653 JP0314653W WO2004046996A1 WO 2004046996 A1 WO2004046996 A1 WO 2004046996A1 JP 0314653 W JP0314653 W JP 0314653W WO 2004046996 A1 WO2004046996 A1 WO 2004046996A1
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polymorphism
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flag information
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PCT/JP2003/014653
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Takamasa Kato
Takeo Morimoto
Original Assignee
Hitachi, Ltd.
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    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B20/00ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B20/00ICT specially adapted for functional genomics or proteomics, e.g. genotype-phenotype associations
    • G16B20/20Allele or variant detection, e.g. single nucleotide polymorphism [SNP] detection
    • GPHYSICS
    • G16INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR SPECIFIC APPLICATION FIELDS
    • G16BBIOINFORMATICS, i.e. INFORMATION AND COMMUNICATION TECHNOLOGY [ICT] SPECIALLY ADAPTED FOR GENETIC OR PROTEIN-RELATED DATA PROCESSING IN COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY
    • G16B30/00ICT specially adapted for sequence analysis involving nucleotides or amino acids

Definitions

  • the present invention relates to, for example, an information processing system for providing information via a communication network.
  • genomic nucleotide sequences of various organisms including humans are being rapidly determined, and genomic nucleotide sequence information is accumulated in various databases.
  • a system is being constructed that allows various research institutions and researchers to use genomic base sequence information stored in a database via an information communication network such as the Internet.
  • genomic drug discovery research and analysis of genetic information have been actively conducted using the nucleotide sequences contained in such genomic nucleotide sequence information. Attention has been paid to differences in base sequences.
  • differences in the nucleotide sequence between individuals are defined as polymorphisms defined as having a given base difference at a frequency of 1% or more in an individual species, and having a given base difference of 1% in an individual species.
  • a polymorphism is a single base difference between individuals—SNP (Single Nucleotide Polymorphism), a deletion or insertion of one to several tens of bases (sometimes thousands of bases). VNTR (Variable Number of Tandem Repeat) or microsatellite polymorphism (repeated sequence of about 2 to 4 bases) ) are known.
  • Such polymorphisms may affect the amino acid sequence of a protein between individuals or the expression efficiency of a given gene between individuals. -Due to such effects, for example, it is known that the susceptibility to a given disease differs between individuals, and that the sensitivity to a given drug differs between individuals.
  • the present invention can provide useful semantic information for each individual and / or information related to the semantic information by effectively utilizing differences in base sequence information between individuals,
  • the goal is to build a highly secure information processing system.
  • the propriety of transmission of the base sequence-related information corresponding to the position information is determined based on the flag information associated with the position information. That is, the flag information is associated with the position information, and means whether or not the transmission of the base sequence-related information corresponding to the position information is appropriate.
  • the position information corresponding to the base sequence related information determined to be inappropriate for transmission based on the flag information includes the position information and the base sequence related to the position information. It is preferable to stop processing using information.
  • the flag information and / or the information related to the flag information is acquired, and the base is determined based on the acquired flag information and / or the information related to the flag information. The determination as to whether or not the transmission of the sequence-related information is appropriate may be made.
  • the flag information may be set stepwise according to the destination of the base sequence information. Further, the flag information may be associated with individual pieces of position information, or may be associated with a plurality of combined pieces of position information. Note that the flag information is rewritable information, and is preferably updated as appropriate.
  • the information processing method for a base sequence according to the present invention can be realized as a program that causes a computer including hardware such as a control device, a transmission / reception device, and a storage device to execute each step.
  • the nucleotide sequence according to the present invention can also be realized as a recording medium that records a program for causing a computer including hardware such as a control device, a transmission / reception device, and a storage device to execute each step.
  • the information processing method relating to a base sequence according to the present invention can be realized as an information processing device including hardware such as a control device that executes each step, a transmitting / receiving device, and a storage device.
  • FIG. 1 is a schematic configuration diagram schematically showing the configuration of an information providing system to which the present invention is applied.
  • FIG. 2 is a schematic configuration diagram schematically showing the configuration of a shared computer.
  • FIG. 3 is a configuration diagram showing an example of data recorded in the main DB.
  • FIG. 4 is a schematic configuration diagram schematically showing the configuration of a personal computer.
  • FIG. 5 is a configuration diagram showing an example of data recorded on a genome-related information recording medium.
  • FIG. 6 is a flowchart for setting the flag information on the genome-related information recording medium.
  • FIG. 7 is a configuration diagram illustrating an example of data recorded in the IC table.
  • FIG. 8 is a configuration diagram showing an example of data recorded in the polymorphism address-item correlation table.
  • FIG. 9 is a flowchart showing a process performed by a shared computer and a personal computer in a system for providing morbidity for a predetermined disease.
  • FIG. 10 is a continuation of FIG. 9 and is a flow chart showing processing on a shared computer and a personal computer in a system for providing morbidity for a predetermined disease.
  • FIG. 12 is a flowchart illustrating another process performed by the personal computer and the personal computer.
  • FIG. 12 is a schematic configuration diagram schematically illustrating a configuration of an information providing system according to the second embodiment.
  • FIG. 13 is a configuration diagram showing an example of data recorded in a database in which a polymorphism address and flag information are associated with each other and which is included in the flag information providing computer.
  • FIG. 14 is a flowchart showing the processing performed by the shared computer, the personal computer, and the flag information providing computer in the system according to the second embodiment.
  • FIG. 15 is a continuation of FIG. 14 and is a flowchart showing processing by the shared computer, the personal computer, and the flag information providing computer in the system shown in the second embodiment.
  • FIG. 16 is a flowchart showing other processes performed by the shared computer, the personal computer, and the flag information providing computer in the system according to the second embodiment. Explanation of reference numerals
  • an information processing system for providing a user with a possibility of a predetermined disease will be described. That is, an example will be described in which a user requests, as a “request for goods and / or services”, for example, his / her morbidity regarding a predetermined disease.
  • an information processing system that uses flag information for judging whether or not transmission of nucleotide sequence-related information is appropriate and in which a user has the flag information will be described.
  • flag information for judging whether or not transmission of nucleotide sequence-related information is appropriate and in which a user has the flag information.
  • the “goods and services or services” are not limited to these. For example, medicines, foods, luxury goods, etc. that match the constitution of the individual (individual), and the constitution and properties of the individual (individual) This includes services such as adapted information.
  • the information processing system includes a communication network 1 such as the Internet, a shared computer 2 connected to the communication network 1, and at least one or more individuals connected to the communication network 1. And a personal computer 3 through the communication network 1.
  • the shared computer 2 includes a CPU 4 for controlling all operations of the shared computer 2, an input device 5 such as a keyboard and a mouse for inputting information and an instruction to execute a program, and a display device.
  • a transmission / reception device 17 for transmitting / receiving information to / from the personal computer 3 via the communication network 1.
  • the memory 7 in the shared computer 2 includes a memory section A 10 and a memory section B 11 1 for recording different types of information, and a screen memory 1 for recording image data to be displayed on, for example, the personal computer 3 or the display device 6. 2 and a processing program 13 for operating the present system.
  • the shared computer 2 does not have the screen memory 12 and the processing program 13 etc. in the internal memory 7, but has an external storage device (not shown) connected to the shared computer 2 via the communication network 1. Zu) may be included.
  • the database 8 in the shared computer 2 includes a main DB 14 in which polymorphism addresses, polymorphism patterns, and semantic information are recorded, a storage DB-A 15 in which information recorded in the memory unit A 10 is stored, A storage DB-B16 for storing information recorded in the memory section B11.
  • the main DB 14 associates the polymorphism address, a plurality of polymorphism patterns that can be taken at the polymorphism address, and semantic information that means each of the plurality of polymorphism patterns. Recorded.
  • the main DB 14 may record semantic information indicating a combination of polymorphism patterns at a plurality of polymorphism addresses (for example, a haplotype).
  • polymorphism address positional information
  • a polymorphism is, for example, a so-called polymorphism.
  • SNP single nucleotide polymoi-phism
  • RFLP RFLP vrestriction fragment length of polymorphism
  • VNTR variable number of tandem repeat
  • the “polymorphism address” indicates a position indicating a polymorphism or the like by combining numerical values, characters, symbols, and the like.
  • the polymorphism address is not particularly limited.
  • the polymorphism address can be represented by a combination of a chromosome number, a symbol indicating the gene in which the polymorphism exists, and a numerical value indicating the location of the polymorphism in the gene. It may be a combination of a symbol indicating the gene in which the type exists and a numerical value indicating the location of the polymorphism in the gene.
  • the polymorphism address may be a polymorphism-specific notation assigned to each polymorphism.
  • a polymorphism-specific notation is used as the polymorphism address, the polymorphism address does not directly indicate the position in the nucleotide sequence, but the position can be indirectly known based on the polymorphism-specific notation. Therefore, "polymorphism address" is meant to include notations specific to polymorphism.
  • Polymorphism pattern is information on a base sequence that differs between individuals, and includes at least the base or base sequence pattern in the polymorphism. Further, the term “polymorphism pattern” is meant to include not only polymorphisms but also patterns of bases and nucleotide sequences that are present at a frequency of less than 1% in an individual species. For example, at a polymorphism address known to take A or G, the “polymorphism pattern” is represented by either “A” or “G”.
  • the “polymorphism pattern” may indicate a heterozygote or a homozygote in a homologous chromosome.
  • the “polymorphism pattern” can be expressed by any of “A AJ,“ G G ”, and“ A G J ”.
  • the “polymorphism pattern” directly indicates the pattern that can be taken at a given polymorphism address. Instead of using notation, it may be used indirectly.
  • a “polymorphism pattern” is, for example, “allele 1” when taking “A” at a polymorphism address known to take A or G, and “allele 2” when taking “G”. May be written as Also, when the “polymorphism pattern” can be expressed by any of “AA”, “GG” and “AG” as described above, for example, when it can be expressed by “AA”, it can be expressed by “” and “GG” Sometimes it can be expressed as "T /" when it can be expressed by "i3" or "AG”.
  • polymorphism pattern examples are numerical values representing the number of repetitions when the polymorphism is microsatellite, and “presence / absence” when the polymorphism is deletion or deletion. It may be represented by a symbol.
  • the “polymorphism pattern” at each polymorphism address may be described as, for example, “polymorphism 1”, “polymorphism 2”, or “polymorphism 3” according to a predetermined rule or agreement.
  • polymorphism 1”, “polymorphism 2”, and “polymorphism 3” can be described in descending order of the possible frequency of “polymorphism pattern”.
  • each “polymorphism 1” at each polymorphism address does not necessarily represent the same content. That is, for example, “Polymorphism 1” at one polymorphism address represents “ ⁇ ⁇ ”, which is most likely to occur, and “Polymorphism 1” at another polymorphism address is “GG”, which is most likely. Will be represented.
  • the “semantic information” is information associated with the “polymorphism pattern”, and includes, for example, responsiveness to a drug, side effects to a drug, risk to a disease or a disorder, constitution, traits, traits, etc. It refers to various types of information resulting from differences in “polymorphism patterns”, such as lifestyle advice based on interactions and protein interactions. As the “meaning information”, various information resulting from the difference in the “polymorphism pattern” may be directly represented, or may be indirectly represented by using a symbol or the like indicating the information. “Semantic information” is information of a type that will increase as the research on genomes and genes progresses and will be corrected. It is preferable to always upgrade the version. In other words, “semantic information” becomes more accurate by increasing / decreasing the amount of accumulation by updating the database using the results of genomic / gene research.
  • semantic information Although it is not directly related to “polymorphism pattern”, it is updated from “semantic information”.
  • the information derived from is the “information related to semantic information”. If the “semantic information” is “risk for disease”, when the risk exceeds a certain level, for example, a specific “medical examination item” is derived. This specific “medical checkup item” is “information related to semantic information”.
  • the semantic information is, as shown in FIG. 3, at least the main DB 14 as “annotation information for the polymorphism pattern” associated with the predetermined “polymorphism address” and “polymorphism pattern”. It is recorded in.
  • the semantic information is associated with “polymorphism classification” and “classification (disease name)” corresponding to a predetermined “polymorphism address”. That is, when the predetermined “polymorphism address” is the predetermined “polymorphism pattern”, it is possible to obtain annotation information (semantic information) indicating the type of the disease name and the likelihood of being affected by the disease.
  • semantic information can also be associated with each polymorphism pattern combination (eg, haplotype) corresponding to multiple polymorphism addresses. That is, for each combination of polymorphism patterns at a plurality of polymorphism addresses, it is possible to associate annotation information (semantic information) indicating a different morbidity of a predetermined disease. In this case, when a plurality of polymorphism addresses are a combination of predetermined polymorphism patterns, it is possible to obtain annotation information (semantic information) indicating the possibility of illness for a predetermined disease.
  • the “public level” determined based on a predetermined standard can be associated with the semantic information.
  • the criteria for determining the “disclosure level” consider semantic information, that is, the unexpected disadvantage to an individual by disclosing the likelihood of “classification (disease name)” here. Can be determined.
  • the public computer 2 determines the ⁇ disclosure level '' so that semantic information that is not appropriate to be disclosed is not disclosed in view of laws, regulations, own standards of conduct, contracts with users, etc. can do.
  • the system does not disclose to the user the annotation information that indicates the likelihood of morbidity that is associated with the “disclosure level,” which means that disclosure is not possible.
  • the user sets the prescribed “public level” through informed consent, etc.
  • the system may disclose the meaning information associated with the predetermined “public level” to the user. Can be set as three or more steps such as "1, 2, 3,! Or "a, b, c,".
  • the shared computer 2 can set the level according to the type of the user, such as the user's age, qualification, and whether or not there is a contract with the user.
  • the informed consent, etc. allows the user to disclose only the annotation information that indicates the likelihood of morbidity that is associated with a disclosure level that is higher (or lower) than the predetermined disclosure level. You can also choose the level.
  • the storage DB-B16 for example, data such as base sequence-related information that is genetic information of a requester who uses the present system can be recorded. Further, the storage DB-A 15 can record data such as, for example, information for identifying a requester who uses the system. In this way, by recording the genetic information of the individual and the information identifying the individual separately in the storage DB-A 15 and the storage DB-B 16, the genetic information of the requester and the requester are recorded. It is difficult to associate with the data that specifies
  • the shared computer 2 is not limited to the one having the database 8 therein, but may be an external database connected to the shared computer 2 via the communication network 1.
  • the shared computer 2 may have a plurality of databases 8 therein, or may have the internal database 8 and an external database connected to the shared computer 2 via the communication network 1. May be.
  • the personal computer 3 includes a CPU 20 for controlling all the operations of the personal computer 3 and an input such as a keyboard and a mouse for inputting information and an instruction to execute a program.
  • Device 21 display device 22 such as a display device; memory 23 for storing temporary information and rewritable information; and reading device 25 for reading data from genome-related information recording medium 24
  • a transmission / reception device 29 for transmitting / receiving information to / from the shared computer 2 via the communication network 1.
  • the personal computer 3 is not limited to a normal computer, For example, it may take any form such as a mobile phone, a personal portable terminal, and other mobile communication devices.
  • the memory 23 of the personal computer 3 has a memory unit 26 for recording information and the like from the genome-related information recording medium 24, and a processing program 27 for operating the information processing system is recorded.
  • the genome-related information recording medium 24 stores the genome-related information 28 of an individual.
  • Examples of the genome-related information recording medium 24 include a magnetic recording medium such as a magnetic disk and a magnetic card, an optical recording medium to which a magneto-optical recording method and a phase change recording method are applied, a semiconductor memory, and the like.
  • the genome-related information recording medium 24 may be in any form such as a card, a disk, a stick, a tape, or a drum. Further, the genome-related information recording medium 24 may be a recording of the genome-related information 28 of a single individual (individual), but may be a plurality of genome-related information 2 of a plurality of individuals (individuals). 8 may be recorded.
  • the genome-related information 28 included in the genome-related information recording medium 24 includes at least a “polymorphism address” and a “polymorphism pattern” at a predetermined polymorphism address obtained as a result of analyzing the base sequence of an individual (individual). And “flag information” set for each polymorphism address in order to determine whether or not the transmission of the polymorphism pattern is appropriate. That is, the polymorphism pattern and the flag information are associated with the polymorphism address.
  • the genome-related information 28 may include various kinds of information such as a history of a patient, characteristics, medical record information, and a result of a health check.
  • an individual number ⁇ Gno In the genome-related information recording medium 24, as the genome-related information 28, for example, as shown in FIG. 5, an individual number ⁇ Gno.
  • a genome-related information recording medium 24 in which “flag information” is recorded in data II is used.
  • “Flag information” is information indicating whether or not it is appropriate to transmit a polymorphism pattern corresponding to a predetermined polymorphism address to shared computer 2 via communication network 1.
  • the flag information may include information that sets “on / off” or “1 or 0” for a predetermined polymorphism address.
  • a polymorphism address for which flag information is set to "on” means that transmission of a polymorphism pattern to shared computer 2 is inappropriate, and "offJ is set as flag information.
  • the polymorphism address it means that the transmission of the polymorphism pattern is appropriate for the shared computer 2.
  • the flag information is not limited to one in which one of two values such as “on / off” is associated with a predetermined polymorphism address, and may be set to three or more stepwise values. it can. That is, as the flag information, for example, values of five levels such as level 1 to level 5 can be set. For example, when setting flag information as values of five levels such as level 1 to level 5, ranks are set for various shared computers 2 in advance. In this case, it is assumed that the level 1 to 5 flag information corresponds to the rank set for the shared computer 2 as the transmission destination. That is, a rule is set such that, for example, only flag information of a predetermined level or lower can be transmitted to the shared computer 2 of a predetermined rank. As a result, when using this system, the range of polymorphism addresses and polymorphism patterns that can be transmitted for each shared computer 2 can be changed.
  • the flag information for example, it is preferable to set a polymorphism address whose disclosure is publicly restricted or a polymorphism address whose disclosure is restricted from the viewpoint of ethical considerations.
  • the flag information includes, for example, ability judgment such as incurable disease, life expectancy, IQ, It is set at a polymorphism address related to physical discrimination.
  • the flag information may be information that can be updated. In other words, even if the polymorphism address has flag information, it is appropriate to transmit the polymorphism pattern of the polymorphism address to the shared computer 2 at a later date.
  • the flag information set on the ground may be released. Such a case is, for example, a case where a disease regarded as an incurable disease has become a curable disease at a later date, and the flag information set at the polymorphism address related to the incurable disease will be released at a later date. be able to. Further, even if the polymorphism address has no flag information, it is determined that it is inappropriate to transmit the polymorphism address to the shared computer 2 at a later date. You may set up a new one.
  • An example of such a case is a case where flag information is set at the polymorphism address because it has been found that a predetermined polymorphism address is associated with an incurable disease at a later date.
  • the flag information can be updated, the genome-related information recording medium 24 is updated at an appropriate time, so that the genome-related information recording medium 24 has new flag information.
  • the flag information can be set by an institution that produces the genome-related information recording medium 24 or an institution that analyzes polymorphism patterns, or can be set by another institution different from these institutes. That is, the flag information may be set at the same time when the genome-related information recording medium 24 is produced by the institution that produces the genome-related information recording medium 24, and may be set at the institution that analyzes the polymorphism pattern. It may be set at the same time as analyzing the polymorphism pattern, or may be set at another institution after preparing the genome-related information recording medium 24.
  • flag information may be set after performing informed consent to the side having the genome-related information recording medium 24 to check whether or not to set the flag information at a predetermined polymorphism address.
  • the flag information may be set for a plurality of combined polymorphism addresses. Specifically, for example, flag information is set for a combination of polymorphism address a, polymorphism address b, and polymorphism address c (where a, b, and c indicate positions in the nucleotide sequence). Can be.
  • polymorphism address a, polymorphism address b and polymorphism address c This means that it is inappropriate to send the data to the shared computer 2 at once. Also, in this case, it is appropriate to transmit to the shared computer 2 a polymorphism pattern of any one of the polymorphism addresses a, b, and c and a combination of two polymorphism patterns. It means that
  • step 1 informed consent (hereinafter, referred to as IC) is given to the holder of the genome-related information recording medium 24, and the result is recorded in the IC table shown in FIG.
  • the IC means, for example, confirmation of a will to disclose a polymorphism address and its polymorphism pattern that can determine the morbidity of a disease that cannot be cured by modern medical care to the shared computer 2 side.
  • the holder of the genome-related information recording medium 24 of a predetermined “Gno.” Is associated with items such as “IQ”, “life span”, “incurable disease” and the like. This indicates the correspondence with the intention to refuse to disclose the polymorphism address and polymorphism pattern. If there is an intention to refuse to disclose the polymorphism address and polymorphism pattern related to the specified item, "N" is recorded in the optional item.
  • the compulsory setting is forcibly set for items that are not permitted to disclose the polymorphism address and polymorphism pattern to the shared computer 2 based on laws and other regulations regardless of the result of the IC.
  • Step 1 as a result of the IC, by setting “N” in the prescribed item as the compulsory setting, and by setting “N” in the item indicating that the holder has indicated the intention to reject the disclosure, Create an IC table specific to the holder.
  • step 2 items for which “N” is set are extracted based on the prepared IC table.
  • step 3 a polymorphism address associated with the item extracted in step 2 is extracted from the polymorphism address-item correlation table shown in FIG.
  • Polymorphism address - item correlation table based on the results of functional analysis of genetic polymorphisms, the c specifically shows the correlation between the respective items and polymorphism addresses in the IC table, polymorphism addresses - item correlation
  • the table records the polymorphism addresses in association with the items (“IQ”, “life span”, “incurable disease”, etc.) related to the polymorphism addresses.
  • step 3 when multiple polymorphism addresses are associated with the item extracted in step 2 (for the item “incurable disease” in Fig. 8, If “666666”, “777777”, and “888888” are associated), in step 3, all polymorphism addresses associated with the item are extracted.
  • step 4 access is made to the genome-related information recording medium 24, and flag information is recorded for the polymorphism address extracted in step 3. That is, in step 4, for example, “on” is recorded from the genome-related information recording medium 24 to the polymorphism address that matches the polymorphism address extracted in step 3, and the polymorphism address extracted in step 3 is recorded in the polymorphism address. Set flag information for it. Further, in step 3, for example, when a plurality of polymorphism addresses associated with one item are extracted, flag information is set for all the extracted polymorphism addresses.
  • a genome-related information recording medium 24 having flag information can be produced.
  • the above-described flowchart can be applied to the case where the flag information is recorded after the genome-related information recording medium 24 is produced, but the flag information is recorded at the same time when the genome-related information recording medium 24 is produced. Is also good.
  • the personal computer 3 and the genome-related information recording medium 24 are not limited to the configurations shown in FIGS. 4 and 5, respectively.
  • the genome-related information recording medium may be a memory having a processing program.
  • the personal computer may be configured to mount the genome-related information recording medium and operate the processing program. In this case, the personal computer can operate in accordance with the processing program recorded in a part of the memory of the genome-related information recording medium.
  • the processing program 13 recorded in the memory 7 of the shared computer 2 and the processing program 27 recorded in the memory 23 of the personal computer 3 are, for example, shown in FIG.
  • the information processing operation is performed according to the flowchart shown in FIG. 9 and FIG.
  • the steps described as “(shared)” mean processing in the shared computer 2, and the steps described as “(unit)” are performed in the personal computer 3. Means the process in
  • each individual possessing the genome-related information recording medium 24 accesses the shared computer 2 through the communication network 1 using the personal computer 3 and records the information in the main DB 14 of the shared computer 2 System that uses the semantic information Stem.
  • the information processing system uses a genome-related information recording medium 24 on which genome-related information 28 of a plurality of persons is recorded, and each individual accesses the genome-related information recording medium 24. It may be.
  • An individual who uses this system is a person who has a genome-related information recording medium 24 having flag information.
  • the individual using the system (hereinafter referred to as “requester”) first activates the processing program 27 recorded in the memory 23 in step Al (SA1), and reads the reading device 2 of the personal computer 3 5 is accessed to access the genome-related information recording medium 24, and “Gno.” Recorded as data I on the genome-related information recording medium 24 is read. The read "Gno. J" is stored in the memory unit 26.
  • step A2 based on the screen image displayed on the display device 22 by the processing program 27, the information requested by the requester, for example,
  • step A3 the shared computer 2 receives the “possibility of colon cancer” and “Gno.”.
  • the received “colorectal cancer morbidity” and “Gno. J” are stored as request information in the memory unit A10.
  • step A4 when the request information is received, the processing program 13 recorded in the memory 7 is started to access the main DB 14.
  • the processing program 13 performs processing in the shared computer 2.
  • step A5 the “classification (disease name)” recorded in the main DB14 is searched according to the processing program 13 and the requested “possibility of colorectal cancer” ( Cancer).
  • step A6 the data associated with “Classification (disease name)” (colorectal cancer) consistent with “possibility of colorectal cancer” from the data recorded in the main DB14 Read the “polymorphism address”.
  • the read “polymorphism address” is stored in memory A10. Store as location information associated with the request information. That is, in the memory unit A10, “possibility of colon cancer” (colorectal cancer) and “polymorphism address” for the predetermined “Gno.” Are recorded.
  • step A7 the “Gno.” And “polymorphism address” recorded in the memory section A10 are transmitted to the personal computer 3 and transmitted to the “polymorphism address”.
  • the instruction information for submitting the corresponding “polymorphism pattern” is transmitted to the personal computer 3. At this time, depending on the type of request information, it may be necessary to order the submission of additional information such as pre-existing illnesses and characteristics as needed.
  • step A8 “Gno.”. “Polymorphism address” and instruction information transmitted from shared computer 2 are received. The received “Gno.” And “polymorphism address” are recorded in the memory unit 26.
  • step A9 the personal computer 3 checks whether the “polymorphism address” included in the received instruction information has “flag information” set thereon.
  • Access 2 4 the personal computer 3 checks whether the “polymorphism address” included in the received instruction information has “flag information” set thereon.
  • step A10 a search is made for a polymorphism address recorded in the genome-related information recording medium 24 that matches the received "polymorphism address", and the received "polymorphism address” is retrieved. It is determined whether or not flag information is set. If a plurality of polymorphism addresses are received in step A8, it is determined whether flag information is set for all polymorphism addresses. In step A10, if flag information is present at the received polymorphism address, it is determined as "yes”. If flag information is not at the received polymorphism address, it is determined as "no". .
  • the flag information when the flag information is set for a combination of a plurality of polymorphism addresses, for example, when the flag information is set for all polymorphism addresses constituting the combination, it is determined as "yesj, If no flag information is set for at least one polymorphism address among the polymorphism addresses making up the combination, it is judged as “noJ”.
  • step A10 If “yes” is determined in step A10, the process proceeds to step A11 (SA11) . If “no” is determined in step A10, step A1 2 (SA21) is performed. Proceed to.
  • step A10 Is determined as “no” when flag information is not set at all polymorphism addresses (decision 1), and only the polymorphism address with flag information set among multiple polymorphism addresses is set to “yes” Either of the polymorphism addresses for which no flag information is set and “noJ” (judgment 2) may be used.
  • step A8 when a plurality of polymorphism addresses are received in step A8 and a decision 1 is made in step A10, the flag information is obtained for at least one of the received polymorphism addresses. If yes, judge "yes” and proceed to step All. In this case, no flag information is set for all received polymorphism addresses! /, If only go to step A 1 2
  • step A8 when a plurality of polymorphism addresses are received in step A8 and the judgment 2 is performed in step A10, if the flag information is set in the received plurality of polymorphism addresses, "yes""No" for polymorphic addresses for which flag information is not set among the received polymorphic addresses. Then, the process proceeds to step A11 only for the polymorphism address determined to be "y eS ", and proceeds to step A12 only for the polymorphism address determined to be "noJ".
  • step A11 the shared computer 2 is notified that the submission of the polymorphism address contained in the instruction information is refused. If judgment 1 is made in step A10, in step A11, the common computer 2 will refuse to submit the polymorphism pattern corresponding to any polymorphism address and will stop using this system. Send to On the other hand, if decision 2 is made in step A 10, in step A 1, the submission of the corresponding polymorphism pattern is refused for the polymorphism address where the flag information is set. Notify that use will continue.
  • step A 1 2 the genome-related information storage medium 24 is accessed according to the processing program 27, the data II is searched, the polymorphism pattern of the polymorphism address where no flag information is set is read, and the polymorphism address and the polymorphism are read. The pattern and the pattern are stored in the memory unit 26.
  • step A12 the polymorphism pattern is read out and recorded only for the polymorphism address where the flag information is not set among the received polymorphism addresses.
  • step A 1 and 2 data I is accessed and included in the instruction information. It is preferable to confirm whether "Gno.” Is correct.
  • step A12 in addition to the polymorphism pattern, additional information recorded in data III, data IV, and data V may be read at the same time, and may be recorded in the memory unit 26 as necessary. Les ,.
  • step A1 3 (SA13) the polymorphism pattern associated with the polymorphism address temporarily recorded in the memory unit 26 and the additional information recorded as necessary are
  • step A14 the shared computer 2 receives the polymorphism pattern associated with the polymorphism address and additional information recorded as necessary together with the ⁇ Gno. '' It is recorded in the memory section A10 in association with the polymorphism address.
  • step A7 the shared computer 2 sends instruction information for instructing the submission of the “polymorphism pattern”, and in step A10, the personal computer 3 sends the It has been determined whether or not flag information is set at the model number.
  • the present system may be a system that does not transmit the command information in step A7.
  • step A10 the personal computer 3 searches the data 11 based on the polymorphism address received in step A8 according to the processing program 27, and sets flag information at the received polymorphism address. Judge whether or not it is.
  • step A15 the main DB 14 is accessed, and the received polymorphism address and the one that matches the polymorphism pattern are searched. More specifically, in the main DB 14, a plurality of polymorphism patterns are recorded for one polymorphism address, and the received polymorphism address and the polymorphism pattern are stored in the main DB 14. Search for a match to the pattern.
  • step A16 the morbidity (semantic information) for colorectal cancer associated with the received polymorphism pattern is read. That is, in step A16, the likelihood of the requester having colon cancer can be read in accordance with the polymorphism address and polymorphism pattern submitted by the requester.
  • the read morbidity is stored in the memory unit A10 in association with the requester's "Gno.”, "Polymorphism address” and "polymorphism pattern”.
  • the possibility of colorectal cancer was corrected with additional information. It may be stored, or other information obtained from the additional information may be stored in association with the requester's "Gno.”
  • step A16 when only some polymorphism addresses and polymorphism patterns among the polymorphism addresses included in the instruction information are received, in step A16, some received polymorphism addresses and polymorphism patterns are received. The morbidity can be read out using the pattern.
  • step A17 (SA17) the requester stored in memory
  • step A 18 the personal computer
  • the 3 receives the requester's “Gno.” And morbidity (semantic information). The received semantic information is recorded in the memory unit 26.
  • step A 19 the possibility of colon cancer is displayed on the display device 22 based on the semantic information recorded in the memory unit 26 in accordance with the processing program 27. Note that a shared computer is used instead of steps A17 to A19.
  • the requester can read out (create) a screen displaying semantic information according to the processing program 13 and display it on the display device 22 of the personal computer 3 via the communication network 1. Also in this case, it is assumed that semantic information has been transmitted from the shared computer 2 to the personal computer 3. As a result, the requester can obtain the possibility of morbidity for colorectal cancer using the genome-related information 28 recorded on the genome-related information recording medium 24.
  • the “information related to the semantic information” is further derived from the “semantic information” read out in step A 16, and the relevant information is extracted together with the “semantic information” in step A 17.
  • step A 19 When the “information related to semantic information” is transmitted in association with the polymorphism address, and they are received in step A 18, similarly, in step A 19, the “semantic information” is transmitted in association with the polymorphism address, and they are received in step A 18, similarly, in step A 19, the “semantic information” is transmitted in association with the polymorphism address, and they are received in step A 18, similarly, in step A 19, the “semantic information” is
  • step A3 in addition to the “possibility of colorectal cancer” desired by the requester, for example, when the possibility exceeds a predetermined level,
  • Steps A3 to A7 and steps A14 and steps A14 to A17 in shared computer 2 may be performed by different organizations. In this case, the steps in the shared computer 2 are divided into two.
  • the polymorphism pattern may be encrypted or not.
  • the semantic information recorded in the main DB 14 is recorded by using the genome-related information recording medium 24 in which the polymorphism pattern is recorded in association with the polymorphism address and the flag information is recorded.
  • it can be used by individuals through polymorphism addresses. Individuals who use this system do not need to record semantic information on the genome-related information recording medium 24, but only possess the genome-related information 28 that associates polymorphism addresses with polymorphism patterns.
  • various semantic information can be obtained.
  • the flag information is associated with the polymorphism address, and the polymorphism pattern to be transmitted corresponds to the polymorphism address where the flag information is set, or the flag information is not set. Judge whether it corresponds to the model number. Therefore, in the present system, it is possible to prevent outflow of polymorphism addresses and polymorphism patterns that should not be transmitted through the communication network 1.
  • the polymorphism address and the number of types are determined according to the type of the shared computer 2 (including the type of business, the presence or absence of public approval, etc.).
  • the transmission of the pattern can be controlled.
  • stepwise values of 3 or more as flag information in this system it is possible to judge whether or not the transmission of a polymorphism address and a polymorphism pattern is appropriate for each shared computer 2 that is the transmission destination. It is possible to prevent inappropriate outflow of polymorphism addresses and polymorphism patterns.
  • the processing program 13 recorded in the memory 7 of the shared computer 2 and the processing program 27 recorded in the memory 23 of the personal computer 3 are, for example, as shown in FIG.
  • the information processing operation may be performed according to a simple flowchart.
  • the steps described as “(shared)” mean the processing in the shared computer 2
  • the steps described as “()” are the processing in the personal computer 3.
  • step CI when the requester uses this system, the processing program 27 recorded in the memory 23 is started.
  • the reading device 25 of the personal computer 3 is driven to access the genome-related information recording medium 24, and the flag information of all the “polymorphism addresses” recorded as data II is Search for polymorphism addresses that are not standing.
  • the polymorphism address without flag information obtained as a result of the search is stored in the memory unit 26.
  • step C2 the polymorphism address searched in step C1 and the polymorphism pattern corresponding to the polymorphism address and “Gno, J” are read by the reader 25.
  • the read “Gno , "Polymorphism address” and "polymorphism pattern” are stored in the memory unit 26.
  • Step C3 according to the processing program 27, based on the screen image displayed on the display device 22, the requester receives the information to be provided, for example, "Possibility of colorectal cancer.
  • Request information is input to the personal computer 3, and from the personal computer 3 to the shared computer 2 via the communication network 1, the “possibility of colorectal cancer” is stored in the memory 26.
  • the recorded “Gno.”, "Polymorphism address” and “polymorphism pattern” are transmitted.
  • Step C4 the shared computer 2 receives “Possibility of colon cancer”, “Gno. J”, “Polymorphism address”, and “Polymorphism pattern”.
  • the received “colorectal cancer morbidity” is recorded in the memory part A 10 as request information, and “Gno.”, “Polymorphism address” and “polymorphism pattern” are also stored in the memory part A 10. Is stored.
  • the shared computer 2 starts the processing program 13.
  • step C5 SC5
  • the main DB 14 is accessed according to the processing program 13.
  • step C 6 the “classification (disease name)” recorded in the main DB 14 is searched according to the processing program 13, and the requested “colorectal cancer susceptibility” is requested.
  • Colorectal cancer 'In step C 7 (SC7), according to processing program 13 from main DB 14
  • Polymorphism address classified as “colorectal cancer” and all “polymorphism addresses” for the polymorphism address Read “turn” and “morbidity” for the polymorphism pattern.
  • the read “polymorphism address”, “polymorphism pattern”, and “possibility of disease” are stored in the memory unit A10.
  • step C8 based on the “polymorphism address” and “polymorphism pattern” received in step C4, the data stored in the memory unit A10 in step C7 is searched, The morbidity associated with the received polymorphism pattern corresponding to the “polymorphism pattern” is extracted from the memory unit A 10.
  • step C9 the disease level extracted based on the result of step C8, that is, which polymorphism pattern in the main DB 14 matches the polymorphism pattern included in the information received in step C4
  • the possibility is transmitted to the personal computer 3 via the communication network 1.
  • the shared computer 2 transmits the extracted morbidity together with the requester's "Gno.”
  • step C10 (SC10)
  • step CI 1 (SC 11) the possibility of colon cancer is displayed on the display device 22 based on the semantic information recorded in the memory unit 26 in accordance with the processing program 27.
  • the shared computer instead of Step C9 to Step CI1, the shared computer
  • the requester can read out (create) a screen displaying semantic information according to the processing program 13 and display it on the display device 22 of the personal computer 3 via the communication network 1. Also in this case, it is assumed that semantic information has been transmitted from the shared computer 2 to the personal computer 3. As a result, the requester can obtain the possibility of morbidity for colorectal cancer using the genome-related information 28 recorded on the genome-related information recording medium 24.
  • the type of the shared computer 2 (including the type of business, whether or not there is public approval, etc.) is set.
  • transmission of the polymorphism address and the polymorphism pattern can be controlled. Therefore, even if the flowchart shown in FIG. 11 is followed, by setting a stepwise value of 3 or more as the flag information, it is possible to determine whether or not the transmission of the polymorphism address and the polymorphism pattern is appropriate on the shared computer 2 which is the transmission destination. The determination can be made for each case, and inappropriate outflow of polymorphism addresses and polymorphism patterns can be prevented.
  • a recording medium obtained by removing information included in data II from a genome-related information recording medium that is, a recording medium having only data I and additionally data III to V may be used.
  • the information contained in the data II is recorded in an external database (genome-related information recording medium) connected to the personal computer 3 via the communication network 1.
  • an external database is accessed via the communication network 1 and the polymorphism pattern of the instructed polymorphism address is accessed.
  • the pattern information and the flag information can be read out, and the polymorphism address, the polymorphism pattern, and the flag information can be stored in the memory unit 26 in association with each other.
  • step C1 of the flowchart shown in FIG. 11 an external database is accessed via the communication network 1, and polymorphism patterns and flag information of all polymorphism addresses are read out.
  • the polymorphism address, polymorphism pattern, and flag information are stored in the memory section 26 in association with each other. Can be recorded. Therefore, even in such a system, the requester can obtain semantic information in the same manner as the flow charts shown in FIGS. 9 and 10 and the flow chart shown in FIG.
  • the requester has neither the genome-related information recording medium 24 nor the recording medium except for the information included in the data II from the genome-related information recording medium, and the communication network 1 It may be provided with a genomic-related information recording medium 24 connected to the personal computer 3 via a personal computer.
  • the requester accesses the genome-related information recording medium 24 via the communication network 1 and obtains the “polymorphism address” and “polymorphism pattern” recorded on the genome-related information recording medium 24.
  • information such as "flag information” can be downloaded to the personal computer 3.
  • the genome-related information recording medium 24 may be a medium in which genome-related information on a plurality of individuals is recorded for each individual (for each “ Gno .”).
  • the present invention is not limited to a configuration in which the shared computer 2 has the main DB 14 as described above.
  • the main DB 14 connected to the shared computer 2 via the communication network 1
  • the shared computer 2 accesses the main DB 14 via the communication network 1 in the flowcharts shown in FIGS. 9 and 10 and the flowchart shown in FIG.
  • the requester can obtain the desired semantic information according to the flowchart shown in FIGS. 9 and 10 or the flowchart shown in FIG. 11. .
  • the shared computer 2 accesses a plurality of main DBs 14 of different organizations or organizations via the communication network 1 and uses the semantic information included in the plurality of main DBs 14.
  • information can be provided to the requestor. That is, in the present information processing system, in step A4 in the flow chart shown in FIGS. 9 and 10, or in step C5 in the flowchart shown in FIG. Access various main DBs 14 that have information about the likelihood of illness as semantic information.
  • the requester can obtain information on the possibility of colorectal cancer based on the information contained in the various main DBs 14.
  • the shared computer 2 transmits at least the request information received from the personal computer 3 to the so-called agent.
  • semantic information in this example, “possibility of colon cancer”
  • semantic information in this example, “possibility of colon cancer”
  • an information providing system for providing a user with a possibility of suffering a predetermined disease, wherein a third party other than the user and the information provider is provided.
  • An information providing system having flag information will be described.
  • the same configurations and terms as those of the information processing system according to the first embodiment described above use the same names, reference numerals, and definitions, and a description of the configurations, operations, and terms is omitted. .
  • a simplified model will be described for convenience of explanation.
  • the information providing system includes a communication network 1 such as the Internet, a shared computer 2 connected to the communication network 1, and at least one or more individuals connected to the communication network 1.
  • a computer 3 and a flag information providing computer W having flag information are provided, and data communication between the shared computer 2, the personal computer 3 and the flag information providing computer W via the communication network 1 is enabled.
  • the shared computer 2 has the same configuration as that of the first embodiment described above.
  • the personal computer 3 records flag information on the genome-related information recording medium 24. Except for this, the configuration is the same as that of the first embodiment described above.
  • the flag information providing computer W has, for example, a database as shown in FIG. 13 in which a polymorphism address and flag information are associated with each other.
  • the flag information described in the first embodiment and the polymorphism addresses are recorded in association with each other.
  • so-called semantic information such as a disease associated with a polymorphism address, a characteristic, a property, and a life expectancy IQ may or may not be associated.
  • the database can be set so that the content of the flag information is different depending on each genome-related information recording medium 24.
  • the database may be common to a plurality of genome-related information recording media 24 or all genome-related information recording media 24.
  • the information providing system performs an information processing operation according to, for example, the flowcharts shown in FIGS. 14 and 15.
  • the steps described as “(shared)” mean the processing in the shared computer 2
  • the steps described as ⁇ (pieces) ” are the processing in the personal computer 3
  • the steps described as “(F)” mean processing in the flag information providing computer W.
  • step Dl the requester starts the processing program 27 recorded in the memory 23, drives the reading device 25 of the personal computer 3, and drives the genomic-related information recording medium 2 Access 4 and read “Gno.” Recorded as data I on genome-related information recording medium 24.
  • the read “Gno.” Is stored in the memory unit 26.
  • step D2 based on the screen image displayed on the display device 22 by the processing program 27, information that the requester wants to provide, for example,
  • Step D3 the shared computer 2 receives “Possibility of colon cancer” and “Gno.”.
  • the received “colorectal cancer morbidity” and “Gno.” are stored as request information in the memory unit A10.
  • step D4 when the request information is received, the processing program 13 recorded in the memory 7 is started to access the main DB 14. The processing program 13 performs processing in the shared computer 2.
  • step D5 according to the processing program 13, the main DB 14 Search the recorded “Classification (disease name)” and extract those that match the required “Possibility of colorectal cancer” (Colorectal cancer).
  • Step D6 the data associated with “Classification (disease name)” (colorectal cancer) consistent with “possibility of colorectal cancer” from the data recorded in the main DB14 Read the “polymorphism address”.
  • the read “polymorphism address” is stored in the memory unit A 10 as position information associated with the request information. That is, in the part of the memory A10, the “possibility of colon cancer” and the “polymorphism address” are recorded for the predetermined “Gno.”.
  • step D7 (SD7), the "Gno.” And “polymorphism address” recorded in the memory section A10 are transmitted to the personal computer 3 and the "polymorphism address" to be transmitted is corresponded. Yes Send the instruction information to submit the “polymorphism pattern” to the personal computer 3. At this time, depending on the type of request information, it may be necessary to order the submission of additional information such as pre-existing illnesses and characteristics as needed.
  • step D8 “Gno.” “Polymorphism address” and instruction information transmitted from shared computer 2 are received. The received “Gno.” And “polymorphism address” are recorded in the memory unit 26.
  • step D9 the received polymorphism address is determined via the communication network 1 in order to determine whether or not flag information is set at the “polymorphism address” received in step D8. Sent to flag information providing computer W. If the database shown in Fig. 13 is created with different settings for each Gno., In step D9, "Gno.” Is transmitted along with the polymorphism address.
  • step D10 the flag information providing computer W receives the polymorphism address transmitted from the personal computer 3, accesses the database shown in FIG. Search for flag information. Specifically, the flag information providing computer W searches the database shown in Fig. 13 for a polymorphism address that matches the received polymorphism address, and when the flag information is set at the received polymorphism address. For example, the flag information is associated with the polymorphism address.
  • step D11 the search result performed in step D10 is flagged. Sent from the information providing computer W to the personal computer 3.
  • the search result may be transmitted by associating the flag information with the polymorphism address received in step D10.
  • the search result indicates whether the polymorphism address received in step D10 includes a polymorphism address with flag information, that is, the instruction information includes a polymorphism address with flag information. Information indicating whether or not it has been transmitted may be transmitted. Further, as a search result, when the polymorphism address received in step D10 includes a polymorphism address with flag information, the polymorphism address with flag information is included in the instruction information. The polymorphism address in which the information indicating that it is included and the flag information may be transmitted.
  • step D10 If flag information is set for a combination of a plurality of polymorphism addresses in the database of Fig. 13, all the polymorphism addresses constituting the combination are stored in the polymorphism address received in step D10. If it is included, it is determined that ⁇ the polymorphism address for which the flag information is set is included in the instruction information '', and the polymorphism address received in step D10 contains at least one of the polymorphism addresses constituting the combination. When one polymorphism address is not included, it is determined that “the polymorphism address where the flag information is set is not included in the instruction information”.
  • step D12 the search result transmitted from the flag information providing computer W is received by the personal computer 3, and the search result is confirmed, whereby the polymorphism address included in the instruction information is received. It is determined whether or not flag information is set in.
  • flag information is set at the polymorphism address included in the instruction information, it is determined as "yes”. If the flag information is not set at the polymorphism address included in the instruction information, "yes" is determined. no ”.
  • step D12 If “yes” is determined in step D12, the process proceeds to step D13 (SD13) . If “no” is determined in step D12, the process proceeds to step D14 (SD14). move on. In particular, when a plurality of polymorphism addresses are received in step D8, in step D12, if no flag information is set for all polymorphism addresses, the determination is “no” (determination
  • Judgment of polymorphism address with no flag information as "y es " and "noJ” (judgement 2) Either of the above may be determined.
  • step D8 if a plurality of polymorphism addresses are received in step D8 and a decision 1 is made in step D12, the flag information for at least one of the received polymorphism addresses is determined. If yes, judge "yes” and proceed to step D13. In this case, the process proceeds to step D14 only when the flag information is not set for all the received polymorphism addresses.
  • step D8 if a plurality of polymorphism addresses are received in step D8 and judgment 2 is performed in step D12, the polymorphism addresses for which flag information is set among the received polymorphism addresses are indicated by ⁇ "yes", and among the received polymorphism addresses, the polymorphism address for which no flag information is set is "noJ". Then, only for the polymorphism address determined to be "yes”, the process proceeds to step D13. Proceed to step D 14 only for the polymorphism address determined to be “no”.
  • step D13 the shared computer 2 is notified that the submission of the polymorphism address included in the instruction information is refused. If the judgment 1 is made in step D12, in step D13, the submission of the polymorphism pattern corresponding to any polymorphism address is refused, and the shared computer 2 is notified that the use of this system is to be stopped. Send to On the other hand, if judgment 2 is made in step D12, in step D13, the submission of the corresponding polymorphism pattern is refused for the polymorphism address where the flag information is set. Notify that use will continue. In step D 14, according to the processing program 27, the genome-related information recording medium 2
  • step D12 the polymorphism pattern is read out and recorded only for the polymorphism address in which the flag information is not set among the received polymorphism addresses.
  • step D14 data I is accessed and included in the instruction information.
  • step D14 in addition to the polymorphism pattern, additional information recorded in data 111, data IV, and data ⁇ ⁇ may be read out simultaneously, and may be recorded in the memory unit 26 as necessary.
  • step D15 the polymorphism pattern associated with the polymorphism address temporarily recorded in the memory unit 26 and the additional information recorded as necessary are
  • step D 16 the shared combo-vider 2 receives the polymorphism pattern associated with the polymorphism address and additional information recorded as necessary together with “Gno.”, And receives the received polymorphism pattern. Is recorded in the memory section A 10 in association with the polymorphism address.
  • step D7 the shared computer 2 sends instruction information for instructing the submission of the “polymorphism pattern”
  • step D9 the personal computer 3 sends the polymorphism number included in the instruction information.
  • the polymorphism address is transmitted to the flag information providing computer to determine whether or not the flag information is standing on the ground.
  • the present system may be a system that does not transmit the command information in step D7. In this case, in Step D 9
  • Step 3 searches the data II based on the polymorphism address received in step D8 in accordance with the processing program 27, and determines whether the received polymorphism address has flag information. The location is transmitted to the flag information providing computer.
  • step D17 the main DB 14 is accessed, and a search is made for one that matches the received polymorphism address and polymorphism pattern. Specifically, in the main DB 14, a plurality of polymorphism patterns are recorded for one polymorphism address, and the received polymorphism address and its polymorphism pattern are stored in the main DB 14. Search for a match.
  • step D18 the morbidity (semantic information) for colorectal cancer associated with the received polymorphism pattern is read. That is, in step D18, the requester's morbidity for colon cancer can be read out according to the polymorphism address and polymorphism pattern submitted by the requester. The read morbidity is stored in the memory unit A10 in association with the requester's "Gno.” And "polymorphism address" and "polymorphism pattern”. At this time, the morbidity for colorectal cancer may be stored in a form corrected with the additional information, or other information obtained from the additional information may be associated with the requester's "Gno. It may be stored.
  • step D16 when only some polymorphism addresses and polymorphism patterns among the polymorphism addresses included in the instruction information are received, in step D18, some of the received polymorphism addresses and polymorphism patterns are received. The possibility of morbidity can be read out.
  • step D19 uses the personal computer
  • the 3 receives the requester's “Gno.” And morbidity (semantic information). The received semantic information is recorded in the memory unit 26.
  • step D21 (SD21), the possibility of colon cancer is displayed on the display device 22 from the semantic information recorded in the memory unit 26 in accordance with the processing program 27.
  • a shared computer is used instead of Step D 19 to Step D 21
  • the requester reads out (creates) a screen displaying semantic information according to the processing program 13, and can display the screen on the display device 22 of the personal computer 3 via the communication network 1. Also in this case, it is assumed that semantic information has been transmitted from the shared computer 2 to the personal computer 3. As a result, the requester can obtain the possibility of morbidity for colorectal cancer using the genome-related information 28 recorded on the genome-related information recording medium 24.
  • step D 18 the “information related to semantic information” is further derived.
  • step D 19 the information related to the “semantic information” is related.
  • the semantic information is transmitted in association with the polymorphism address, and they are received in step D20, similarly, in step D21, the semantic information is
  • step D3 in addition to the “possibility of colorectal cancer” desired by the requester, for example, if the probability of occurrence exceeds ⁇ Functional foods to prevent '' is received as further request information, and information on the likelihood of colorectal cancer of the requester, as well as the requested functionality if the morbidity exceeds a predetermined level It is also possible to provide food.
  • Step D3 on shared computer 2! 7) and steps D16 to D16 and steps D16 to D19 may be performed by different organizations. In this case, This means that the steps in the shared computer 2 are divided into two.
  • the polymorphism pattern may be encrypted or not.
  • the flag information providing computer W having a database in which the flag information is recorded is used by using the genome-related information recording medium 24 in which the polymorphism pattern is recorded in association with the polymorphism address.
  • the semantic information recorded in the main DB 14 can be used by the individual via the polymorphism address.
  • Individuals using this system do not need to record semantic information in the genome-related information recording medium 24, but only possess the genome-related information 28 that associates polymorphism addresses with polymorphism patterns. Important semantic information can be obtained.
  • the computer prior to transmitting the polymorphism address and the polymorphism pattern to the shared computer 2 via the communication network 1, the computer accesses the flag information providing computer W, and It can be determined whether or not flag information is set at a polymorphism address. Therefore, according to the present system, outflow of polymorphism addresses and polymorphism patterns that should not be transmitted via the communication network 1 can be prevented.
  • the flag information recorded in the database of the flag information providing computer W since the flag information recorded in the database of the flag information providing computer W is used, it is not necessary to record the flag information on the genome-related information recording medium 24. For example, if the latest flag information is updated on the flag information providing computer W side, the requester does not need to update the genome-related information recording medium 24 and can use this system based on the latest flag information. Can be.
  • the polymorphism address and polymorphism are determined according to the type of the shared computer 2 (including the type of business, the presence or absence of public approval, etc.).
  • the transmission of the pattern can be controlled.
  • the personal computer 3 transmits information on the shared computer 2 together with the "polymorphism address", for example, information such as a preset rank to the shared computer 2 and the name of the shared computer 2. Is preferred.
  • the flag information providing computer W searches the database for flag information corresponding to the rank and name of the shared computer 2 in step D10 (SD10). be able to.
  • the processing program 13 recorded in the memory 7 of the shared computer 2 and the processing program 27 recorded in the memory 23 of the personal computer 3 are, for example, as shown in FIG.
  • the information processing operation may be performed according to a simple flowchart.
  • steps described as “(shared)” mean processing on the shared computer 2
  • steps described as “(unit)” mean processing on the personal computer 3
  • the step described as “(F)” means the processing in the flag information providing computer W.
  • the processing program 27 recorded in the memory 23 is started, and the flag information providing computer W is executed in step Fl (SF1) according to the processing program 27. Requesting the presentation of flag information.
  • the flag information providing computer “W” has the database shown in FIG. 13 for each Gno., “Gno.” Is transmitted from the personal computer 3 together with the flag information presentation request. I do.
  • step F1 the reader 25 is driven to access the genome-related information recording medium 24, and all “polymorphism addresses” recorded as data II are transmitted to the flag information providing computer W. You may request to show flag information on the transmitted polymorphism address.
  • step F2 the flag information providing computer W receives the flag information presentation request and searches for flag information included in the database. Specifically, when the flag information providing computer W has a different database for each “Gno.”, The flag information included in the database that matches the received “Gno.” Is searched. '
  • step F2 when a polymorphism address is received together with the flag information presentation request, the database is searched based on the received polymorphism address, and the flag information associated with the received polymorphism address is searched.
  • step F3 the search result performed in step F2 is transmitted from the flag information providing computer W to the personal computer 3. More specifically, the flag information providing computer W associates the polymorphism address and the flag information included in the database and transmits them to the personal computer 3.
  • step F2 when a polymorphism address is received together with the request for presenting the flag information, the received polymorphism address is associated with the flag information and transmitted to the personal computer 3.
  • step F 4 the search result transmitted from the flag information providing computer W is received by the personal computer 3, and the search result is confirmed to be recorded on the genome-related information recording medium 24. Out of all the polymorphism addresses that have no flag information can be extracted. Polymorphism addresses for which no flag information is set are stored in memory part 26.
  • step F5 the polymorphism address extracted in step F4, the polymorphism pattern corresponding to the polymorphism address, and "Gno.” are read out by the reader 25.
  • the read “Gno.”, “Polymorphism address” and “polymorphism pattern” are stored in the memory 26.
  • step F6 according to the processing program 27, based on the screen image displayed on the display device 22, the requester receives the information to be provided, for example, "Possibility of colorectal cancer.
  • Request information is input to the personal computer 3, and from the personal computer 3 to the shared computer 2 via the communication network 1, the “possibility of colorectal cancer” is stored in the memory 26.
  • the recorded “Gno.”, "Polymorphism address” and “polymorphism pattern” are transmitted.
  • Step F7 the shared computer 2 receives “Possibility of colon cancer”, “Gno.”, “Polymorphism address”, and “polymorphism pattern”.
  • the received “Possibility of colorectal cancer” is recorded in the memory section A10 as request information, and “Gno.”, “Polymorphism address” and “polymorphism pattern” are also stored in the memory section A10. Is done.
  • the shared computer 2 starts the processing program 13.
  • step F8 SF8
  • step F9 the “classification (disease name)” recorded in the main DB 14 is searched according to the processing program 13, and the requested “colorectal cancer morbidity” is requested.
  • Colorectal cancer Colorectal cancer
  • step F10 the main DB 14 is accessed according to the processing program 13, and the “polymorphism address” classified as “colorectal cancer” from the main DB 14
  • the “polymorphism pattern” and the “morbidity” for the polymorphism pattern are read.
  • the read “polymorphism address”, “polymorphism pattern”, and “possibility of disease” are stored in the memory unit A10.
  • step F11 based on the "polymorphism address" and "polymorphism pattern" received in step F7, the data stored in the memory unit A10 in step F10 is stored. A search is performed and the morbidity associated with the received polymorphism pattern that matches the “polymorphism pattern” is extracted from the memory part A 10.
  • step F1 2 (SF12), extraction is performed based on the result of step Fl1, that is, which polymorphism pattern in the main DB 14 matches the polymorphism pattern included in the information received in step F7.
  • the possibility of morbidity is transmitted to the personal computer 3 via the communication network 1.
  • shared computer 2 transmits the extracted morbidity together with “Gno. J” of the requester.
  • step F1 3 (SF13)
  • step F14 the likelihood of developing colon cancer is displayed on the display device 22 from the semantic information recorded in the memory unit 26 in accordance with the processing program 27.
  • the shared computer 2 reads out (creates) a screen displaying semantic information in accordance with the processing program 13 and sends it to the personal computer 3 via the communication network 1. It can also be displayed on the display device 22. Also in this case, it is assumed that the semantic information has been transmitted from the shared computer 2 to the personal computer 3. This allows the requestor to Using the genome-related information 28 recorded on the computer-related information recording medium 24, the possibility of morbidity for colorectal cancer can be obtained.
  • the flag information recorded in the database of the flag information providing computer W since the flag information recorded in the database of the flag information providing computer W is used, the flag is stored in the genome-related information recording medium 24. There is no need to record information. For example, if the latest flag information is updated on the flag information providing computer W side, the requester does not need to update the genome-related information recording medium 24 and can use this system based on the latest flag information. it can.
  • the polymorphism address and polymorphism are determined according to the type of the shared computer 2 (including the type of business, the presence or absence of public approval, etc.).
  • the transmission of the pattern can be controlled.
  • the personal computer 3 transmits information on the shared computer 2 together with the "request for flag information presentation", for example, information such as a preset rank of the shared computer 2 and the name of the shared computer 2. Is preferred.
  • the flag information providing computer W searches the database for flag information corresponding to the rank and name of the shared computer 2 in step F2.
  • a recording medium obtained by removing information included in data II from a genome-related information recording medium that is, a recording medium having only data I and additionally data III to V may be used.
  • the information included in the data II is recorded in an external database (genome-related information recording medium) connected to the personal computer 3 'via the communication network 1.
  • an external database is accessed via the communication network 1 and flag information is not set.
  • the polymorphism pattern of the model address is read out, and the polymorphism address and the polymorphism pattern can be associated with each other and recorded in the memory 26.
  • step F4 in the flowchart shown in FIG. 16 an external database is accessed via the communication network 1 and the polymorphism patterns of all polymorphism addresses for which no flag information is set are set. Can be read, and the polymorphism address and the polymorphism pattern can be stored in the memory 26 in association with each other. Therefore, even with such a system, the requester can obtain semantic information in the same manner as the flow charts shown in FIGS. 14 and 15 and the flow chart shown in FIG. '
  • the requester does not have any of the genome-related information recording medium 24 and the recording medium except for the information included in the data II from the genome-related information recording medium, and It may also include a genomic-related information recording medium 24 connected to the personal computer 3 via 1.
  • the requester accesses the genome-related information recording medium 24 via the communication network 1 and obtains the “polymorphism address” and “polymorphism pattern” recorded on the genome-related information recording medium 24. Can be downloaded to the personal computer 3.
  • the genome-related information recording medium 24 stores genome-related information on a plurality of individuals for each individual.
  • the present invention is not limited to the configuration in which the shared computer 2 has the main DB 14 as described above.
  • the shared computer 2 and the communication network 1 The present invention is also applied to an information processing system including a main DB 14 connected via the PC.
  • the shared computer 2 accesses the main DB 14 via the communication network 1 in the flowcharts shown in FIGS. 14 and 15 and the flowchart shown in FIG.
  • the requester can obtain desired semantic information according to the flowchart shown in FIGS. 14 and 15 or the flowchart shown in FIG.
  • the shared computer 2 accesses a plurality of main DBs 14 of different organizations or organizations via the communication network 1 and uses the semantic information included in the plurality of main DBs 14.
  • information can be provided to the requestor. That is, in the present information processing system, the common computer is connected to the large intestine in step D4 in the flowcharts shown in FIGS. 14 and 15 or in step F8 in the flowchart shown in FIG. Access various main DBs 14 that have information about cancer susceptibility as semantic information.
  • the requester can obtain information on the possibility of colon cancer based on the information included in various main DBs 14.
  • the shared computer 2 transmits at least the request information received from the personal computer 3 to the so-called agent.
  • the transmitted semantic information in this example, “possibility of colon cancer”

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Abstract

個体間における塩基配列情報の相違を有効に利用して各個体にとって有益な意味情報及び/又は当該意味情報に関連する情報を提供でき、且つ安全性の高い情報処理システムを構築する。 物品及び/又はサービスの要求に応じた、塩基配列における位置を意味する位置情報を取得するステップaと、塩基配列における位置を意味する位置情報に関連付けられた塩基配列関連情報の送出について適否を判定するための、位置情報に関連付けられたフラグ情報に基づいて、前記ステップaで取得した位置情報に対応する塩基配列関連情報の送出について適否を判定するステップbとを有する。

Description

明 細 書 塩基配列関連情報を用いた情報処理システム 技術分野
本発明は、 例えば通信回線網を介して情報を提供する情報処理システムに関す る。 背景技術
現在、 ヒ トを始めとする各種生物のゲノム塩基配列が急速に決定されており、 様々なデータベースにゲノム塩基配列情報が蓄積されている。 例えば、 インター ネット等の情報通信網を介して、 各種研究機関や研究者がデータベースに蓄積さ れたゲノム塩基配列情報を利用できるようなシステムの構築がなされつつある。 同時に、 このようなゲノム塩基配列情報に含まれる塩基配列を用いて、 ゲノム 創薬の研究や遺伝情報の解析等が盛んに行われており、 一塩基多型に代表される ような個体間における塩基配列の相違が注目されている。 一般に、 個体間におけ る塩基配列の相違とは、 所定の塩基の相違が個体種中 1 %以上の頻度で存在する と定義される多型と、 所定の塩基の相違が個体種中 1 %未満であるパリエーショ ンとを意味している。 特に、 多型には、 個体間における 1個の塩基の相違である —塩基多型 (SNP; Single Nucleotide Polymorphism) 、 1力 ら数十塩基 (数千 塩基の場合もある) が欠失又は挿入している挿入/欠失多型、 2から数十塩基を 1単位とする配列の繰り返し回数が相違する VNTR (Variable Number of Tandem Repeat) やマイクロサテライト多型 (繰り返し配列が 2〜 4塩基程度のもの) が 知られている。
このような多型は、 個体間におけるタンパク質のアミノ酸配列の相違や、 個体 間における所定の遺伝子に関する発現効率の相違等に影響を及ぼすことがある。- このような影響により、 例えば、 所定の疾病に対する罹患可能性が個体間で異な つたり、 所定の薬剤に対する感受性が個体間で異なることが知られている。
ところが、 多型等の個体間における塩基配列情報の相違を有効に利用して、 各 個体にとって有益な意味情報を提供するようなシステムは構築されていないのが 現状である。 発明の開示
そこで、 本発明は、 このような現状に鑑み、 個体間における塩基配列情報の相 違を有効に利用して各個体にとって有益な意味情報及び/又は当該意味情報に関 連する情報を提供でき、 且つ安全性の高い情報処理システムを構築することを目 的とする。
上述した目的を達成した本発明に係る塩基配列に関する情報処理方法では、 位 置情報に関連付けられたフラグ情報によって、 位置情報に対応する塩基配列関連 情報の送出についての適否を判定する。 すなわち、 フラグ情報は、 位置情報に関 連付けられ、 当該位置情報に対応する塩基配列関連情報の送出についての適否を 意味している。
また、 本発明に係る塩基配列に関する情報処理方法では、 フラグ情報に基づい て送出について不適と判断した塩基配列関連情報に対応する位置情報については、 当該位置情報及び当該位置情報に対応する塩基配列関連情報を用いた処理を中止 することが好ましい。
さらに、 本発明に係る塩基配列に関する情報処理方法では、 フラグ情報及び/ 又は当該フラグ情報に関連する情報を取得し、 取得したフラグ情報及び/又は当 該フラグ情報に関連する情報に基づいて、 塩基配列関連情報の送出に関して適否 を判定するものであっても良い。
本発明に係る塩基配列に関する情報処理方法において、 フラグ情報は、 塩基配 列情報の送信先に応じて段階的に設定されたものであってもよい。 また、 フラグ 情報は、 個々の位置情報に関連付けられたものであってもよいし、 組み合わされ た複数の位置情報に関連付けられたものであってもよい。 なお、 フラグ情報は、 書き換え可能な情報であり、 適宜更新されることが好ましい。
なお、 本発明に係る塩基配列に関する情報処理方法は、 制御装置、 送受信装置 及び記憶装置等のハードウエアを備えるコンピュータに、 各ステップを実行させ るプログラムとして実現することができる。 また、 本発明に係る塩基配列に関す る情報処理方法は、 制御装置、 送受信装置及び記憶装置等のハードウェアを備え るコンピュータに、 各ステップを実行させるプログラムを記録した記録媒体とし て実現することもできる。 さらに、 本発明に係る塩基配列に関する情報処理方法 は、 各ステップを実行する制御装置、 送受信装置及び記憶装置等のハードウェア を備える情報処理装置として実現することもできる。
その他、 本発明は、 特許請求の範囲の各請求項に記載されている通りの構成を 有するものである。
本明細書は本願の優先権の基礎である日本国特許出願 2002- 334161号の明細書 および/または図面に記載される内容を包含する。 図面の簡単な説明
図 1は、 本発明を適用した情報提供システムの構成を概略的に示す概略構成図 である。
図 2は、 共用コンピュータの構成を概略的に示す概略構成図である。
図 3は、 メイン DBに記録されたデータの一例を示す構成図である。
図 4は、 個人用コンピュータの構成を概略的に示す概略構成図である。
図 5は、 ゲノム関連情報記録媒体に記録されたデータの一例を示す構成図であ る。
図 6は、 ゲノム関連情報記録媒体にフラグ情報を設定する際のフローチャート である。
図 7は、 ICテーブルに記録されたデータの一例を示す構成図である。
図 8は、 多型番地-項目相関テーブルに記録されたデータの一例を示す構成図 である。
図 9は、 所定の疾病に対する罹患可能性を提供するシステムにおいて、 共用コ ンピュータ及ぴ個人用コンピュータでの処理を示すフローチヤ一トである。
図 1 0は、 図 9の続きであり、 所定の疾病に対する罹患可能性を提供するシス テムにおいて、 共用コンピュータ及び個人用コンピュータでの処理を示すフロー チヤ一トである。
図 1 1は、 所定の疾病に対する罹患可能性を提供するシステムにおいて、 共用 コンビユータ及ぴ個人用コンピュータでの他の処理を示すフローチャートである 図 1 2は、 第 2の実施の形態として示す情報提供システムの構成を概略的に示 す概略構成図である。
図 1 3は、 フラグ情報提供コンピュータが有する、 多型番地とフラグ情報とが 関連付けられたデータベースに記録されたデータの一例を示す構成図である。 図 1 4は、 第 2の実施の形態に示すシステムにおいて、 共用コンピュータ、 個 人用コンピュータ及ぴフラグ情報提供コンピュータでの処理を示すフローチャー トである。
図 1 5は、 図 1 4の続きであり、 第 2の実施の形態に示すシステムにおいて、 共用コンピュータ、 個人用コンピュータ及ぴフラグ情報提供コンピュータでの処 理を示すフローチヤ一トである。
図 1 6は、 第 2の実施の形態に示すシステムにおいて、 共用コンピュータ、 個 人用コンピュータ及びフラグ情報提供コンピュータでの他の処理を示すフローチ ヤートである。 符号の説明
1…通信回線網、 2…共用コンピュータ、 3…個人用コンピュータ、 W…フラグ 情報提供コンピュータ 発明を開示するための最良の形態
以下、 図面を参照して本発明を詳細に説明する。
1 . 第 1の実施の形態
先ず、 本発明を適用した第 1の実施の形態として、 利用者に対して所定の疾病 の罹患可能性を提供する情報処理システムを説明する。 すなわち、 利用者が 「物 品及び/又はサービスの要求」 として、 例えば、 所定の疾病に関する自分の罹患 可能性を教えて欲しいと要求する場合を例示して説明する。 特に、 本実施の形態 においては、 塩基配列関連情報に関して送信の適否を判断するためのフラグ情報 を用いる情報処理システムであって、 利用者側が当該フラグ情報を有する情報処 理システムについて説明するが、 説明の都合上、 簡略化したモデルとして説明す る。 なお、 「物品及びノ又はサービス」 としては、 これに限定されず、 例えば、 個人 (個体) の体質に適合した医薬品、 食品及び嗜好品等の物品や、 個人 (個 体) の体質 ·性質に適合した情報等のサービスを含む意味である。
情報処理システムは、 図 1に示すように、 インターネッ ト等の通信回線網 1と 通信回線網 1に接続された共用コンピュータ 2.と、 通信回線網 1に接続された少 なくとも 1以上の個人用コンピュータ 3とを備え、 通信回線網 1を介して共用コ ンピュータ 2と個人用コンピュータ 3との間のデータ通信を可能としている。 共用コンピュータ 2は、 図 2に示すように、 当該共用コンピュータ 2の動作を 全て制御する CPU 4と、 情報及ぴプログラムの実行指示等を入力できるキーポー ド及びマウス等の入力装置 5と、 ディスプレイ装置等の表示装置 6と、 一時的な 情報及び書き換え不可能な情報等が記録されるメモリー 7と、 各種データを格納 しているデータベース 8と、 これらメモリ一 7及びデータベース 8に対して所定 の情報を書き込む記録装置 9と、 通信回線網 1を介して個人用コンピュータ 3と の間で情報の送受信を行う送受信装置 1 7とから構成されている。
共用コンピュータ 2におけるメモリー 7は、 それぞれ異なる種類の情報を記録 するメモリー部 A 1 0及ぴメモリー部 B 1 1と、 例えば個人用コンピュータ 3や 表示装置 6に表示させる画像データを記録した画面メモリー 1 2と、 本システム を動作させるための処理プログラム 1 3とから構成されている。 なお、 共用コン ピュータ 2においては、 画面メモリー 1 2及び処理プログラム 1 3等を内部のメ モリー 7に有さず、 通信回線網 1を介して共用コンピュータ 2と接続された外部 記憶装置 (図示せず) に有するものであってもよい。
共用コンピュータ 2におけるデータベース 8は、 多型番地、 多型パターン及び 意味情報が記録されたメイン DB 1 4と、 メモリー部 A 1 0に記録された情報を保 存する保管用 DB-A 1 5と、 メモリー部 B 1 1に記録された情報を保存する保管用 DB - B 1 6とから構成されている。 メイン DB 1 4は、 図 3に示すように、 多型番地 と、 当該多型番地で取りうる複数の多型パターンと、 当該複数の多型パターンそ れぞれを意味づける意味情報とが関連付けられて記録されている。
また、 メイン DB 1 4には、 複数の多型番地における多型パターンの組合せ (例え ば、 ハプロタイプ) を意味づける意味情報が記録されていても良い。 ここで、 「多型番地 (位置情報) 」 とは、 少なくとも、 塩基配列における多型 が存在する位置を意味する。 なお、 一般的に多型とは、 例えば、 いわゆる
SNP (single nucleotide polymoi-phism)、 RFLP vrestriction fragment length of polymorphism) VNTR (variable number of tandem repeat) ^ マイクロサァフィ ト等を含んでいる。 しかし、 本明細書において使用する 「多型」 は、 これらに限 ' 定されず、 個体種中 1 %未満の頻度でしか存在しない塩基及ぴ塩基配列の変化 (バリエーション) も含む意味とする。 したがって、 「多型番地」 は、 個体種中 1 %未満の頻度でしか存在しない塩基及び塩基配列の変化を示す、 塩基配列にお ける位置も含む意味である。 すなわち、 「多型番地」 とは、 数値、 文字及び記号 等を組み合わせて、 多型等を示す位置を表すものである。 多型番地は、 特に限定 されないが、 例えば、 染色体番号と多型が存在する遺伝子を表す記号と当該遺伝 子における多型の存在位置を示す数値との組み合わせにより表記することもでき るし、 多型が存在する遺伝子を示す記号と当該遺伝子における多型の存在位置を 示す数値との組み合わせであってもよい。
また、 多型番地は、 多型毎に付与される多型固有の表記であっても良い。 多型 番地として多型固有の表記を使用する場合、 多型番地は塩基配列中の位置を直接 的には示さないが、 多型固有の表記に基づいて間接的に位置を知ることができる。 したがって、 「多型番地」 は、 多型固有の表記も含む意味である。
「多型パターン (塩基配列関連情報) 」 とは、 個体間において相違する塩基配 列の情報であり、 少なくとも、 多型における塩基又は塩基配列のパターンを含む 意味である。 さらに 「多型パターン」 は、 多型に限らず、 個体種中 1 %未満の頻 度でしか存在しない塩基及ぴ塩基配列のパターンも含む意味である。 例えば、 A 又は Gを取ることが知られている多型番地において、 「多型パターン」 は、 「A」 及ぴ 「G」 のいずれかで表される。
また、 「多型パターン」 は、 相同染色体におけるヘテロ接合体又はホモ接合体 を示すものであってもよい。 この場合、 例えば、 A又は Gを取ることが知られて いる多型番地において、 「多型パターン」 は、 「A AJ 、 「G G」 及ぴ 「A G J のいずれかで表現できる。
さらに、 「多型パターン」 は、 所定の多型番地で取りうるパターンを直接的に 表記するものではなく、 間接的に表記するものであっても良い。 すなわち、 「多 型パターン」 は、 例えば、 A又は Gを取ることが知られている多型番地において 「A」 を取る場合に 「アレル 1」 とし、 「G」 を取る場合に 「アレル 2」 と表記 してもよい。 また、 「多型パターン」 が上述したように 「A A」 、 「G G」 及び 「A G」 のいずれかで表現できる場合、 例えば、 「A A」 で表現できるときに 「 」 、 「G G」 で表現できるときに 「i3」 、 「A G」 で表現できるときに 「T/」 と表記してもよレ、。
その他 「多型パターン」 の表記例としては、 多型がマイクロサテライ トの場合 には 「繰り返し数」 を表す数値で、 多型が揷入、 欠失型の場合には 「有/無」 を 表す記号で表記してもよい。 また更に、 各多型番地における 「多型パターン」 は、 所定の規則や取り決めに従って、 例えば、 「多型 1」 、 「多型 2」 、 「多型 3」 と表記されても良い。 例えば、 各多型番地において、 「多型パターン」 がとり得 る頻度の高い順に、 「多型 1」 、 「多型 2」 、 「多型 3」 と表記できる。 この場 合、 例えば、 各多型番地におけるそれぞれの 「多型 1」 は必ずしも同じ内容を表 すものではない。 すなわち、 例えば、 ある多型番地の 「多型 1」 は最もとり得る 頻度が高い 「Α Α」 を表し、 別の多型番地の 「多型 1」 は最もとり得る頻度が高 い 「G G」 を表すことになる。
ここで、 「意味情報」 とは、 「多型パターン」 に関連づけられた情報であり、 例えば、 薬剤に対する応答性、 薬剤に対する副作用、 疾患及び障害に対するリス ク、 体質 '性質、 体質 ·性質等に基づく生活習慣アドバイス、 タンパク質相互作 用など、 「多型パターン」 の相違に起因する様々な情報を意味する。 なお、 「意 味情報」 としては、 「多型パターン」 の相違に起因する様々な情報を直接表して も良く、 また、 当該情報を意味する記号などを用いて間接的に表しても良い。 「意味情報」 は、 ゲノム ·遺伝子に関する研究が進むことにより種類が増加する とともに訂正が行われる種類の情報であり、 常にバージョンアップすることが好 ましい。 すなわち、 「意味情報」 は、 ゲノム ·遺伝子の研究成果を用いてデータ ベースを更新することによって、 蓄積量が増加 ·減少してより精度の高いものと なる。
なお、 直接 「多型パターン」 には関連づけられていないが 「意味情報」 から更 に導き出される情報は、 「意味情報に関連する情報」 である。 「意味情報」 が 「疾患に対するリスク」 である場合、 当該リスクがある一定の水準を超えたとき に、 例えば特定の 「健康診断検査項目」 が導き出される。 この特定の 「健康診断 検查項目」 が 「意味情報に関連する情報」 である。
本実施の形態において意味情報は、 図 3に示すように、 少なく とも、 所定の 「多型番地」 及び 「多型パターン」 に関連づけられた 「多型パターンに対する注 釈情報」 としてメイン DB 1 4に記録されている。 また、 意味情報には、 所定の 「多型番地」 に対応する 「多型分類」 及び 「分類 (疾患名) 」 等が関連づけられ ている。 すなわち、 所定の 「多型番地」 が所定の 「多型パターン」 である場合、 疾患名の種類と当該疾患に対する罹患可能性を示す注釈情報 (意味情報) を得る ことができる。 したがって、 例えば、 意味情報は、 複数の多型番地に対応するそ れぞれの多型パターンの組み合わせ (例えば、 ハプロタイプ) に対して関連付け ることもできる。 すなわち、 複数の多型番地における多型パターンの組み合わせ 毎に、 所定の疾患に対する異なる罹患可能性を示す注釈情報 (意味情報) を関連 付けることができる。 この場合、 複数の多型番地が所定の多型パターンの組み合 わせである場合、 所定の疾患に対する罹患可能性を示す注釈情報 (意味情報) を 得ることができる。
また、 意味情報には、 所定の基準で決定した 「公開レベル」 を関連づけること もできる。 例えば、 「公開レベル」 を決定する際の基準としては、 意味情報、 す なわちここでは 「分類 (疾患名) 」 の罹患可能性を公開することによる個人に対 する不測の不利益等を考慮して定めることができる。 詳細には、 共用コンビユー タ 2において、 法律、 規則又は自らの行動基準若しくは利用者との契約等に鑑み て、 公開することが相応しくない意味情報については、 公開しないような 「公開 レベル」 を決定することができる。 この場合、 本システムでは、 公開不可を意味 する 「公開レベル」 に関連付けられた罹患可能性を示す注釈情報については、 利 用者に対して開示することはない。 これにより、 利用者に対して不測の不利益と なりうる意味情報を与えることや、 契約者以外に意味情報が開示されることを防 止できる。
なお、 利用者がインフォームドコンセント等により、 所定の 「公開レベル」 を 関連付けた意味情報の開示を容認することにより、 利用者に対して、 所定の 「公 開レベル」 が関連づけられた意眛情報を公開するようなシステムであってもよい, また、 「公開レベル」 は、 例えば 「1 , 2 , 3, ■··」 又は 「a , b , c, ·■■」 といった 3以上の複数の段階として設定することができる。 この場合、 共用コン ピュータ 2側では、 利用者の年齢、 資格及び利用者との契約の有無等、 利用者の 種類に応じてレベルを設定することができる。 なお、 インフォームドコンセント 等によって、 所定の公開レベル以上 (又は未満) の公開レベルに関連付けられた 罹患可能性を示す注釈情報のみが利用者側に対して提供されるように、 当該利用 者側が公開レベルを選択することもできる。
なお、 データベース 8において、 保管用 DB-B 1 6には、 例えば、 本システムを 利用する要求者個人の遺伝情報である塩基配列関連情報といったデータを記録す ることができる。 また、 保管用 DB- A 1 5には、 例えば、 本システムを利用する要 求者を特定する情報といったデータを記録することができる。 このように、 保管 用 DB - A 1 5及び保管用 DB - B 1 6に、 個人の遺伝情報と個人を特定する情報とを分 けて記録することによって、 要求者の遺伝情報と、 要求者を特定するデータとを 関連付け難くなる。
なお、 共用コンピュータ 2は、 データベース 8を内部に有するものに限定され ず、 通信回線網 1を介して共用コンピュータ 2に接続された外部データベース
(図示せず) を有するものであってもよい。 また、 共用コンピュータ 2は、 内部 に複数のデータベース 8を有するものであってもよいし、 内部のデータベース 8 と通信回線網 1を介して共用コンピュータ 2に接続された外部データベースとを 有するものであっても良い。
個人用コンピュータ 3は、 図 4に示すように、 当該個人用コンピュータ 3の動 作を全て制御する CPU 2 0と、 情報及ぴプログラムの実行指示等を入力できるキ 一ボード及ぴマウス等の入力装置 2 1と、 ディスプレイ装置等の表示装置 2 2と、 一時的な情報及び書き換え可能な情報等が記録されるメモリー 2 3と、 ゲノム関 連情報記録媒体 2 4からデータを読み取る読取り装置 2 5と、 通信回線網 1を介 して共用コンピュータ 2との間で情報の送受信を行う送受信装置 2 9とから構成 されている。 なお、 個人用コンピュータ 3は、 通常のコンピュータに限定されず、 例えば、 携帯電話、 個人携帯端末及びその他の移動体通信機器等、 いかなる形態 であってもよい。
個人用コンピュータ 3におけるメモリー 2 3は、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4 からの情報等を記録するメモリー部 2 6を有し、 本情報処理システムを動作させ る処理プログラム 2 7が記録されている。
ゲノム関連情報記録媒体 2 4には、 個人のゲノム関連情報 2 8が記録されてい る。 ゲノム関連情報記録媒体 2 4としては、 例えば、 磁気ディスクや磁気カード 等の磁気記録媒体、 光磁気記録方式や相変化記録方式等を適用した光学式記録媒 体、 半導体メモリー等を挙げることができる。 また、 このゲノム関連情報記録媒 体 2 4は、 カード状、 ディスク状、 スティック状、 テープ状又はドラム状等いか なる形態であってもよい。 さらに、 このゲノム関連情報記録媒体 2 4は、 単一の 個人 (個体) のゲノム関連情報 2 8を記録したものであってもよいが、 複数の個 人 (個体) に関する複数のゲノム関連情報 2 8を記録したものであってもよい。 ゲノム関連情報記録媒体 2 4に含まれるゲノム関連情報 2 8とは、 少なくとも、 「多型番地」 、 個人 (個体) の塩基配列を解析した結果として得られる所定の多 型番地における 「多型パターン」 及び多型パターンの送信適否を判定するために 多型番地毎に設定された 「フラグ情報」 を意味する。 すなわち、 多型パターン及 びフラグ情報は、 多型番地に関連付けられている。 また、 ゲノム関連情報 2 8に は、 既往症、 特徴、 カルテ情報、 健康診断結果といった各種情報を含んでいても よい。
ゲノム関連情報記録媒体 2 4には、 ゲノム関連情報 2 8として、 例えば、 図 5 に示すように、 データ Iとしてゲノム関連情報 2 8に固有の個別番号 「Gno.」
(ジーナンパ一) 及ぴ生年月日等の個人情報を記録し、 データ IIとして多型番地、 多型パターン及ぴフラグ情報を記録し、 データ IIIとして既往症を記録し、 デー タ IVとして特徴を記録し、 データ Vとしてカルテ情報等を記録する。 すなわち、 ゲノム関連情報 2 8は、 データ I、 データ II、 データ III、 データ IV及ぴデータ V から構成されている。 データ I及びデータ IIには必須の情報が含まれており、 デ ータ III、 データ IV及ぴデータ Vには付加的な情報から構成されている。 また、 デ ータ IIには、 所定の多型番地における付加的な情報を 「コメント」 として、 「多 型番地」 にリンクさせて記録しても良い。
本例においては、 特に、 データ IIに 「フラグ情報」 が記録されたゲノム関連情 報記録媒体 2 4を使用している。 「フラグ情報」 とは、 所定の多型番地に対応す る多型パターンを、 通信回線網 1を介して共用コンピュータ 2に対して送信する ことの適否を示す情報である。 例えば、 フラグ情報としては、 所定の多型番地に 対して 「on/off」 や 「1又は 0」 を設定するようなものを挙げることができる。 例 えば、 フラグ情報として 「on」 が設定された多型番地に関しては、 共用コンビュ ータ 2に対して多型パターンの送信が不適であることを意味し、 フラグ情報とし て 「offJ が設定された多型番地に関しては、 共用コンピュータ 2に対して多型 パターンの送信が適当であることを意味する。 所定の多型番地及び多型パターン の送信が不適であるとして、 当該多型番地に例えば、 「on」 が関連付けられてい る場合、 本明細書においては、 「フラグ情報が立てられた」 又は 「フラグ情報が 立った」 と表現する。 また、 フラグ情報として 「on」 が関連付けられた多型番地 は、 本明細書において 「フラグ情報が立てられた多型番地」 又は 「フラグ情報が 立った多型番地」 と表現する。
また、 フラグ情報としては、 所定の多型番地に対して 「on/off」 等の二値のい ずれか一方が関連付けられるものに限定されず、 3以上の段階的な値を設定する こともできる。 すなわち、 フラグ情報としては、 例えば、 レベル 1〜レベル 5と いった 5段階の値を設定することもできる。 例えば、 レベル 1〜レベル 5といつ た 5段階の値としてフラグ情報を設定する場合、 様々な共用コンピュータ 2に対 してランクを予め設定しておく。 この場合、 レベル 1〜 5のフラグ情報は、 送信 先である共用コンピュータ 2に設定したランクに対応するものとする。 すなわち、 所定のランクの共用コンピュータ 2に対しては、 例えば、 所定のレベル以下のフ ラグ情報しか送信できないといった規則を設定する。 これにより、 本システムを 利用するにあたり、 共用コンピュータ 2毎に送信できる多型番地及び多型パター ンの範囲を変更することができる。
フラグ情報としては、 例えば、 公的に開示が制限されているような多型番地や、 倫理的配慮の観点から開示が制限されているような多型番地等に立てられること が好ましい。 具体的にフラグ情報は、 例えば、 不治の病、 寿命、 IQ等の能力判断、 身体的差別等に関係する多型番地に立てられる。
また、 フラグ情報は、 更新可能な情報であってもよい。 すなわち、 一旦、 フラ グ情報が立てられた多型番地であっても、 後日において当該多型番地の多型パタ ーンを共用コンピュータ 2に対して送信することが適当であるとし、 当該多型番 地に立てられたフラグ情報を解除してもよい。 このような場合としては、 例えば、 不治の病とされた疾病が後日において治癒可能な疾病となったため、 当該不治の 病に関係する多型番地に立てられたフラグ情報が後日において解除される場合を 挙げることができる。 また、 一旦、 フラグ情報が立てられていない多型番地であ つても、 後日において当該多型番地を共用コンピュータ 2に対して送信すること が不適当であるとし、 当該多型番地にフラグ情報を新たに立ててもよい。 このよ うな場合としては、 例えば、 所定の多型番地が後日において不治の病に関係する ことが判明したため、 当該多型番地にフラグ情報が立てられる場合を挙げること ができる。 このように、 フラグ情報を更新可能とする場合には、 ゲノム関連情報 記録媒体 2 4を適当な時期に更新することで、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4が新 しいフラグ情報を有することとなる。
フラグ情報は、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4を作製する機関又は多型パターン を解析する機関等で設定することもでき、 若しくは、 これら機関とは異なる他の 機関で設定することもできる。 すなわち、 フラグ情報は、 ゲノム関連情報記録媒 体 2 4を作製する機関において当該ゲノム関連情報記録媒体 2 4を作製する際に 同時に設定してもよく、 また、 多型パターンを解析する機関において当該多型パ ターンを解析する際に同時に設定してもよく、 若しくは、 ゲノム関連情報記録媒 体 2 4を作製した後にその他の機関において設定してもよい。
また、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4を有する側に対して、 所定の多型番地にフ ラグ情報を立てるか否かを確認するィンフォームドコンセント行った後に、 フラ グ情報を立てても良い。
さらに、 フラグ情報は、 組み合わせた複数の多型番地に対して立てたものであ つてもよい。 具体的には、 例えば、 多型番地 a、 多型番地 b及ぴ多型番地 c (ここ で、 a,b及び cは塩基配列における位置を意味する) の組み合わせに対してフラグ 情報を立てることができる。 この場合、 多型番地 a、 多型番地 b及ぴ多型番地 cを まとめて共用コンピュータ 2に対して送信することが不適当であることを意味す る。 また、 この場合、 多型番地 a、 多型番地 b及び多型番地 cのいずれか 1つの多 型パターン及ぴ 2つの多型パターンの組み合わせに関しては、 共用コンピュータ 2に対して送信することが適当であることを意味する。
フラグ情報の設定は、 例えば、 図 6に示すようなフローチャートに従って行う ことができる。 先ず、 ステップ 1 (S1) では、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4の保 有者に対してインフォームドコンセント (以下 ICと称する) を行い、 その結果を 図 7に示す ICテーブルに記録する。 ここで、 ICは、 例えば現代医療では治癒困難 な疾患に対する罹患可能性を判断できる多型番地及ぴその多型パターン等を共用 コンピュータ 2側に開示する意志の確認を意味している。
ICテーブルは、 図 7に示すように、 所定の 「Gno.」 のゲノム関連情報記録媒体 2 4の保有者が、 「IQ」 、 「寿命」 、 「不治の病」 等の項目と、 各項目に関係す る多型番地及び多型パターンの開示を拒否する意志との対応を示している。 所定 の項目に関係する多型番地及び多型パターンの開示を拒否する意志がある場合に は、 任意設定の項目に 「N」 が記録されている。 なお、 強制設定は、 ICの結果に 拘わらず法律やその他規制に基づき、 共用コンピュータ 2側への多型番地及ぴ多 型パターンの開示を許可しない項目に対して強制的に設定される。
ステップ 1においては、 ICの結果、 強制設定として所定の項目に 「N」 を設定 するとともに、 上記保有者が開示を拒否する意志を示した項目に対して 「N」 を 設定することによって、 上記保有者に特有の ICテーブルを作製する。
次に、 ステップ 2 (S2) では、 作製した ICテーブルに基づいて、 「N」 が設定 されている項目を抽出する。 次に、 ステップ 3 (S3) では、 図 8に示す多型番 地-項目相関テーブルから、 ステップ 2で抽出した項目に関連付けられた多型番 地を抽出する。 多型番地-項目相関テーブルは、 遺伝子多型の機能解析の結果に 基づいて、 上記 ICテーブルにおける各項目と多型番地との相関関係を示している c 具体的に、 多型番地-項目相関テーブルは、 多型番地と、 当該多型番地が関係す る項目 ( 「IQ」 、 「寿命」 、 「不治の病」 等) とを関連付けて記録している。 多 型番地-項目相関テーブルにおいて、 ステップ 2で抽出した項目に対して複数の 多型番地が関連付けられている場合 (図 8において、 項目 「不治の病」 に対して 「666666」 「777777」 及び 「888888」 が関連付けられている場合) には、 ステツ プ 3において、 当該項目に関連付けられた全ての多型番地を抽出する。
次に、 ステップ 4 (S4) では、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4にアクセスし、 ス テツプ 3で抽出した多型番地に対してフラグ情報を記録する。 すなわち、 ステツ プ 4では、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4からステップ 3で抽出した多型番地と一 致する多型番地に対して例えば 「on」 を記録し、 ステップ 3で抽出した多型番地 に対してフラグ情報を立てる。 また、 ステップ 3において、 例えば、 1つの項目 に対して関連付けられた複数の多型番地を抽出した場合には、 抽出した全ての多 型番地の全てに対してフラグ情報を立てる。
このようにしてフラグ情報を有するゲノム関連情報記録媒体 2 4を作製するこ とができる。 なお、 上述したフローチャートは、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4を 作製した後にフラグ情報を記録する際に適用できるが、 フラグ情報は、 ゲノム関 連情報記録媒体 2 4を作製する際に同時に記録してもよい。
なお、 本発明において、 個人用コンピュータ 3及びゲノム関連情報記録媒体 2 4は、 それぞれ図 4及び図 5に示したような構成に限定されず、 例えば、 ゲノム 関連情報記録媒体が処理プログラムを有するメモリー部を備え、 個人用コンビュ ータが当該ゲノム関連情報記録媒体を装着して処理プログラムを動作させるよう な構成であってもよい。 この場合、 個人用コンピュータは、 ゲノム関連情報記録 媒体のメモリ一部に記録された処理プログラムに従って動作できる。
以上のように構成された情報処理システムにおいては、 共用コンピュータ 2の メモリー 7に記録された処理プログラム 1 3及ぴ個人用コンピュータ 3のメモリ 一 2 3に記録された処理プログラム 2 7が例えば、 図 9及ぴ図 1 0に示すような フローチャートに従って情報処理動作する。 なお、 図 9及ぴ図 1 0に示すフロー チャートにおいて、 「 (共) 」 と記載したステップは共用コンピュータ 2におけ る処理を意味し、 「 (個) 」 と記載したステップは個人用コンピュータ 3におけ る処理を意味している。
本情報処理システムは、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4を所持する各個人が個人 用コンピュータ 3を用いて通信回線網 1を介して共用コンピュータ 2にアクセス し、 共用コンピュータ 2のメイン DB 1 4に記録されている意味情報を利用するシ ステムである。 なお、 本情報処理システムは、 複数人のゲノム関連情報 2 8がそ れぞれ記録されたゲノム関連情報記録媒体 2 4を用い、 各個人がゲノム関連情報 記録媒体 2 4にアクセスするようなシステムであってもよい。
本システムを利用する個人は、 フラグ情報を有するゲノム関連情報記録媒体 2 4を保有する者である。 本システムを利用する個人 (以下、 要求者と称する) は、 先ず、 ステップ A l (SA1) で、 メモリー 2 3に記録されている処理プログラム 2 7を起動し、 個人用コンピュータ 3の読取り装置 2 5を駆動してゲノム関連情報 記録媒体 2 4にアクセスし、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4においてデータ Iと して記録されている 「Gno.」 を読み出す。 読み出した 「Gno. J は、 メモリー部 2 6に格納する。
次に、 ステップ A 2 (SA2) では、 処理プログラム 2 7によって表示装置 2 2に 表示された画面イメージに基づいて、 要求者が提供を受けたい情報、 例えば、
「大腸がんの罹患可能性」 (要求情報) を個人用コンピュータ 3に入力するとと もに、 個人用コンピュータ 3から通信回線網 1を経由して共用コンピュータ 2に 「大腸がんの罹患可能性」 及び 「Gno.」 を送信する。 或いは、 個人用コンビユー タ 3から通信回線網 1を経由して共用コンピュータ 2に対して、 「大腸がんの罹 患可能性」 及び 「Gno.」 を書き込む。
次に、 ステップ A 3 (SA3) では、 共用コンピュータ 2が 「大腸がんの罹患可能 性」 及ぴ 「Gno.」 を受信する。 受信した 「大腸がんの罹患可能性」 及ぴ 「Gno. J は、 メモリー部 A 1 0に要求情報として格納する。
次に、 ステップ A 4 (SA4) では、 要求情報を受信すると、 メモリー 7に記録さ れている処理プログラム 1 3を起動してメイン DB14にアクセスする。 なお、 この 処理プログラム 1 3は、 共用コンピュータ 2における処理を行うものである。 次に、 ステップ A 5 (SA5) では、 処理プログラム 1 3に従って、.メイン DB14に 記録されている 「分類 (疾患名) 」 を検索し、 要求された 「大腸がんの罹患可能 性」 (大腸がん) と一致するものを抽出する。
ステップ A 6 (SA6) では、 メイン DB14に記録されているデータのなかから 「大 腸がんの罹患可能性」 と一致した 「分類 (疾患名) 」 (大腸がん) に関連づけら れた 「多型番地」 を読み出す。 読み出した 「多型番地」 は、 メモリー部 A 1 0に 要求情報に関連づけた位置情報として格納する。 すなわち、 メモリー部 A 1 0に は、 所定の 「Gno.」 に対して 「大腸がんの罹患可能性」 (大腸がん) 及ぴ 「多型 番地」 が記録されることとなる。
次に、 ステップ A 7 (SA7) では、 メモリー部 A 1 0に記録されている 「Gno.」 及ぴ 「多型番地」 を個人用コンピュータ 3に送信するとともに、 送信する 「多型 番地」 に対応する 「多型パターン」 を提出する命令情報を個人用コンピュータ 3 に送信する。 また、 このとき、 要求情報の種類によっては、 必要に応じて既往症 や特徴等の付加的な情報の提出を命令してもよい。
次に、 ステップ A 8 (SA8) では、 共用コンピュータ 2から送信された 「Gno.」 . 「多型番地」 及ぴ命令情報を受信する。 受信した 「Gno.」 及び 「多型番地」 は、 メモリー部 2 6に記録される。
次に、 ステップ A 9 (SA9) では、 受信した命令情報に含まれる 「多型番地」 に 「フラグ情報」 が立っているか否かを確認するため、 個人用コンピュータ 3は、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4にアクセスする。
次に、 ステップ A 1 0 (SA10) では、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4に記録され ている多型番地で受信した 「多型番地」 と一致するものを検索し、 受信した 「多 型番地」 に対してフラグ情報が立っているか否かを判断する。 ここで、 ステップ A 8で複数の多型番地を受信した場合には、 '全ての多型番地についてフラグ情報 が立っているか否かを判断する。 ステップ A 1 0では、 受信した多型番地にフラ グ情報が立っている場合には 「yes」 と判断し、 受信した多型番地にフラグ情報 が立っていない場合には 「no」 と判断する。 特に、 複数の多型番地の組み合わせ に対してフラグ情報が立っている場合、 例えば、 当該組み合わせを構成する全て の多型番地に対してフラグ情報が立っている場合には 「yesj と判断し、 当該組 み合わせを構成する多型番地のうち少なく とも 1つの多型番地に対してフラグ情 報が立っていない場合には 「noJ と判断する。
ステップ A 1 0で 「yes」 と判断した場合には次にステップ A 1 1 (SA11) へ進 み、 ステップ A 1 0で 「no」 と判断した場合には次にステップ A 1 2 (SA21) へ進 む。
特に、 ステップ A 8で複数の多型番地を受信した場合、 ステップ A 1 0において は、 全ての多型番地にフラグ情報が立っていない場合に 「no」 とする判断 (判断 1 ) と、 複数の多型番地のなかでフラグ情報が立っている多型番地のみを 「yes」 としフラグ情報が立っていない多型番地を 「noJ とする判断 (判断 2 ) とのうちいずれの判断を行っても良い。
すなわち、 ステップ A 8で複数の多型番地を受信し、 ステップ A 1 0において判 断 1を行った場合、 受信した複数の多型番地のうち少なく とも 1つの多型番地に 関してフラグ情報が立っていると 「yes」 と判断してステップ Allに進む。 また、 この場合、 受信した全ての多型番地に関してフラグ情報が立っていな!/、場合のみ ステップ A 1 2に進む。
一方、 ステップ A 8で複数の多型番地を受信し、 ステップ A 1 0において判断 2 を行った場合、 受信した複数の多型番地のなかでフラグ情報が立っている多型番 地に関しては 「yes」 とし、 受信した複数の多型番地のなかでフラグ情報が立つ ていない多型番地に関しては 「no」 とする。 そして、 「yeS」 と判断した多型番 地に関してのみステップ A l 1に進み、 「noJ と判断した多型番地に関してのみ ステップ A 1 2に進む。
ステップ A 1 1では、 共用コンピュータ 2に対して命令情報に含まれる多型番 地の提出を拒否する旨を通知する。 ステップ A 1 0において判断 1を行った場合 には、 ステップ A l 1においては、 いかなる多型番地に対応する多型パターンの 提出も拒否するとともに、 本システムの利用を中止する旨を共用コンピュータ 2 に対して送信する。 一方、 ステップ A 1 0において判断 2を行った場合には、 ス テツプ A l 1においては、 フラグ情報が立っている多型番地に関しては対応する 多型パターンの提出を拒否するが、 本システムの利用は続行する旨を通知する。 ステップ A 1 2では、 処理プログラム 2 7に従ってゲノム関連情報記録媒体 2 4にアクセスし、 データ IIを検索し、 フラグ情報が立っていない多型番地の多型 パターンを読み出し、 多型番地と多型パターンとを関連づけてメモリー部 2 6に 記録する。 ステップ A 1 0において判断 2を行った場合、 ステップ A 1 2において は、 受信した複数の多型番地のうちフラグ情報が立っていない多型番地に関して のみ、 多型パターンを読み出して記録する。
ステップ A 1 2では、 データ Iに対してアクセスし、 命令情報に含まれる 「Gno.」 が正しいか否かを確認することが好ましい。 また、 ステップ A 1 2では、 多型パターンのほかにデータ III、 データ IV及ぴデータ Vに記録されている付加的 な情報も同時に読み出し、 必要に応じてメモリー部 2 6に記録してもよレ、。
次に、 ステップ A 1 3 (SA13) では、 メモリー部 2 6に一時的に記録した多型 番地に関連付けられた多型パターン及び必要に応じて記録された付加的な情報を、
Γθηο. J とともに通信回線網 1を介して共用コンピュータ 2に対して出力する。 ステップ A 1 4 (SA14) では、 多型番地に関連付けられた多型パターン及び必要 に応じて記録された付加的な情報を 「Gno.」 とともに共用コンピュータ 2で受信 し、 受信した多型パターンを多型番地と関連付けてメモリー部 A 1 0に記録する。 また、 本例では、 ステップ A 7において、 共用コンピュータ 2が 「多型パター ン」 の提出を命令する命令情報を送出し、 ステップ A 1 0において、 個人用コン ピュータ 3は命令情報に含まれる多型番地にフラグ情報が立っているか否かを判 断している。 しかしながら、 本システムは、 ステップ A 7において当該命令情報 を送出しないシステムであってもよい。 この場合、 ステップ A 1 0において、 個 人用コンピュータ 3は、 処理プログラム 2 7に従って、 ステップ A 8で受信した 多型番地に基づいてデータ 11を検索し、 受信した多型番地にフラグ情報が立って いるか否かを判断する。
次に、 ステップ A 1 5 (SA15) では、 メイン DB 1 4にアクセスし、 受信した多 型番地及び多型パターンと一致するものを検索する。 具体的には、 メイン DB 1 4 において、 一つの多型番地に対して複数の多型パターンが記録されており、 受信 した多型番地及ぴその多型パターンがメイン DB 1 4においてどの多型パターンに 一致しているのかを検索する。
次に、 ステップ A 1 6 (SA16) では、 処理プログラム 1 3に従って、 受信した 多型パターンが一致した多型パターンに関連づけられている大腸がんに対する罹 患可能性 (意味情報) を読み出す。 すなわち、 ステップ A 1 6では、 要求者が提 出した多型番地及ぴ多型パターンに従って、 要求者の大腸がんに対する罹患可能 性を読み出すことができる。 読み出した罹患可能性は、 要求者の 「Gno.」 と 「多 型番地」 及び 「多型パターン」 とに関連づけてメモリー部 A 1 0に格納する。 こ のとき、 大腸がんに対する罹患可能性を、 付加的な情報により補正したかたちで 格納してもよいし、 付加的な情報から得られるその他の情報を要求者の 「Gno.」 に関連づけて格納しても良い。
なお、 ステップ A 1 4において、 命令情報に含まれる多型番地のうち一部の多 型番地及ぴ多型パターンのみ受信した場合、 ステップ A 1 6では受信した一部の 多型番地及び多型パターンを用いて罹患可能性を読み出すことができる。
次に、 ステップ A 1 7 (SA17) では、 メモリー部 A 1 0に格納した要求者の
「Gno.」 及び罹患可能性を意味情報として、 通信回線網 1を介して個人用コンビ ユータ 3に対して送信する。 ステップ A 1 8 (SA18) では、 個人用コンピュータ
3が要求者の 「Gno.」 及び罹患可能性 (意味情報) を受信する。 受信した意味情 報は、 メモリー部 2 6に記録される。
次に、 ステップ A 1 9 (SA19) では、 処理プログラム 2 7に従って、 メモリー 部 2 6に記録された意味情報から大腸がんに対する罹患可能性を表示装置 2 2に 表示する。 なお、 ステップ A 1 7からステップ A 1 9の代わりに共用コンピュータ
2が処理プログラム 1 3に従って意味情報を表示する画面を読み出し (作成し) 、 通信回線網 1を経由して個人用コンピュータ 3の表示装置 2 2に表示させること もできる。 この場合においても、 共用コンピュータ 2から個人用コンピュータ 3 に対して意味情報が送信されたものとする。 これにより、 要求者は、 ゲノム関連 情報記録媒体 2 4に記録したゲノム関連情報 2 8を用いて大腸がんに対する罹患 可能性を得ることができる。
なお、 ステップ A 1 6で読み出された 「意味情報」 から、 更に、 当該 「意味情 報に関連する情報」 が導き出され、 ステップ A 1 7で 「意味情報」 とともに当該
「意味情報に関連する情報」 を多型番地と関連付けて送信し、 ステップ A 1 8で それらを受信した場合においても、 同様にステップ A 1 9で 「意味情報」 と当該
「意味情報に関違する情報」 が表示される。
また、 本システムにおいては、 ステップ A 3において、 要求者が所望する 「大 腸がんの罹患可能性」 の他に、 例えば、 罹患可能性が所定の水準を超えた場合に
「大腸がんを予防する機能性食品」 の提供を更なる要求情報として受信し、 要求 者の大腸がんの罹患可能性に関する情報とともに、 罹患可能性が所定の水準を超 えていた場合に、 要求された機能性食品を提供することも可能である。 なお、 共用コンピュータ 2におけるステップ A 3〜A 7及びステップ A 1 4まで と、 ステップ A l 4〜A 1 7までとを異なる機関で行ってもよい。 この場合には、 共用コンピュータ 2におけるステップが 2分割されていることになる。
ところで、 本システムにおいては、 多型パターンは、 暗号化されていても喑号 化されていなくても差し支えない。
以上のように、 本システムにおいては、 多型パターンを多型番地と関連づけて 記録するとともにフラグ情報を記録したゲノム関連情報記録媒体 2 4を用いるこ とによって、 メイン DB14に記録された意味情報を、 多型番地を介在させて個人が 利用することができる。 本システムを利用する個人は、 意味情報をゲノム関連情 報記録媒体 2 4に記録しておく必要はなく、 多型番地と多型パターンとを関連づ けたゲノム関連情報 2 8を所有するだけで、 様々な意味情報を得ることができる。 特に、 本システムにおいては、 多型番地に対してフラグ情報が関連付けられて おり、 送信対象の多型パターンについてフラグ情報が立っている多型番地に対応 するのか、 或いはフラグ情報が立っていない多型番地に対応するのかを判断する。 したがって、 本システムにおいては、 通信回線網 1を介して送信すべきではない 多型番地及び多型パターンの流出を防止することができる。
また、 本システムにおいては、 フラグ情報として 3以上の段階的な値を設定す ることによって、 共用コンピュータ 2の種別 (業種、 公的認可の有無等を含む) 等に応じて多型番地及び多型パターンの送信を制御することができる。 言い換え ると、 本システムにおいてフラグ情報として 3以上の段階的な値を設定すること によって、 多型番地及ぴ多型パターンの送信に関する適否を送信先である共用コ ンピュータ 2毎に判断することができ、 多型番地及ぴ多型パターンの不適当な流 出を防止することができる。
ところで、 本情報処理システムにおいては、 共用コンピュータ 2のメモリー 7 に記録された処理プログラム 1 3及び個人用コンピュータ 3のメモリー 2 3に記 録された処理プログラム 2 7が例えば、 図 1 1に示すようなフローチヤ一トに従 つて情報処理動作するものであってもよい。 なお、 図 1 1に示すフローチャート においても、 「 (共) 」 と記載したステップは共用コンピュータ 2における処理 を意味し、 「 (個) 」 と記載したステップは個人用コンピュータ 3における処理 を意味している。
ここでは、 先ず、 ステップ C I (SC1) で、 要求者が本システムを利用するにあ たり、 メモリー 2 3に記録されている処理プログラム 2 7を起動する。 処理プロ グラム 2 7に従って、 個人用コンピュータ 3の読取り装置 2 5を駆動してゲノム 関連情報記録媒体 2 4にアクセスし、 データ IIとして記録されている全ての 「多 型番地」 のうちフラグ情報が立っていない多型番地を検索する。 検索の結果とし て得られた、 フラグ情報が立っていない多型番地をメモリー部 2 6に格納する。 次に、 ステップ C 2 (SC2) で、 ステップ C 1で検索された多型番地及び当該多 型番地に対応する多型パターンと 「Gno, J を読取り装置 2 5で読み出す。 読み出 した 「Gno.」 、 「多型番地」 及び 「多型パターン」 は、 メモリー部 2 6に格納す る。
次に、 ステップ C 3 (SC3) では、 処理プログラム 2 7に従い、 表示装置 2 2に 表示された画面イメージに基づいて、 要求者が提供を受けたい情報、 例えば、 「大腸がんの罹患可能性」 (要求情報) を個人用コンピュータ 3に入力するとと もに、 個人用コンピュータ 3から通信回線網 1を経由して共用コンピュータ 2に 「大腸がんの罹患可能性」 と、 メモリー部 2 6に記録されている 「Gno.」 、 「多 型番地」 及び 「多型パターン」 とを送信する。
次に、 ステップ C 4 (SC4) では、 共用コンピュータ 2が 「大腸がんの罹患可能 性」 、 「Gno. J 、 「多型番地」 及び 「多型パターン」 を受信する。 受信した 「大 腸がんの罹患可能性」 は要求情報としてメモリ一部 A 1 0に記録され、 「Gno.」 、 「多型番地」 及び 「多型パターン」 も、 メモリー部 A 1 0に格納される。 共用コ ンピュータ 2は、 要求情報を受信すると処理プログラム 1 3を起動する。 そして、 ステップ C 5 (SC5) では、 処理プログラム 1 3に従って、 メイン DB 1 4にァクセ スする。
次に、 ステップ C 6 (SC6) では、 処理プログラム 1 3に従って、 メイン DB 1 4 に記録されている 「分類 (疾患名) 」 を検索し、 要求された 「大腸がんの罹患可 能性」 (大腸がん) と一致するものを抽出する。 ' ステップ C 7 (SC7) では、 処理プログラム 1 3に従って、 メイン DB 1 4から
「大腸がん」 に分類された 「多型番地」 、 当該多型番地に対する全ての 「多型パ ターン」 、 及び当該多型パターンに対する 「罹患可能性」 を読み出す。 読み出し た 「多型番地」 、 「多型パターン」 及び 「罹患可能性」 は、 メモリー部 A 1 0に 格納される。
次に、 ステップ C 8 (SC8) では、 ステップ C 4で受信した 「多型番地」 及び 「多型パターン」 に基づいて、 ステップ C 7でメモリー部 A 1 0に格納したデー タを検索し、 受信した 「多型パターン」 と一致した多型パターンに関連付けられ た罹患可能性をメモリー部 A 1 0から抽出する。
ステップ C 9 (SC9) では、 ステップ C 8の結果、 すなわち、 ステップ C 4で受信 した情報に含まれる多型パターンがメイン DB 1 4のいずれの多型パターンと一致 するかに基づいて抽出した罹患可能性を、 通信回線網 1を介して個人用コンビュ ータ 3に対して送信する。 このとき、 共用コンピュータ 2は、 抽出した罹患可能 性を要求者の 「Gno.」 とともに送信する。
次に、 ステップ C 1 0 ( SC10 ) で、 共用コンピュータ 2から送信された
Γθηο. j 及び 「罹患可能性」 (意味情報) を受信する。 受信した 「Gno.」 及び 「罹患可能性」 は、 メモリー部 2 6に記録される。 このとき、 ゲノム関連情報記 録媒体 2 4に記録されているデータ Iにアクセスし、 受信した 「Gno.」 が正しい か否かを確認することができる。
次に、 ステップ C I 1 (SC11) では、 処理プログラム 2 7に従って、 メモリー 部 2 6に記録された意味情報から大腸がんに対する罹患可能性を表示装置 2 2に 表示する。 なお、 ステップ C 9からステップ C I 1の代わりに、 共用コンピュータ
2が処理プログラム 1 3に従って意味情報を表示する画面を読み出し (作成し) 、 通信回線網 1を経由して個人用コンピュータ 3の表示装置 2 2に表示させること もできる。 この場合においても、 共用コンピュータ 2から個人用コンピュータ 3 に対して意味情報が送信されたものとする。 これにより、 要求者は、 ゲノム関連 情報記録媒体 2 4に記録したゲノム関連情報 2 8を用いて大腸がんに対する罹患 可能性を得ることができる。
以上のように、 図 1 1に示したフローチャートに従えば、 フラグ情報が立って いない多型番地及び多型パターンの全てを共用コンピュータ 2に対して出力し、 共用コンピュータ 2において要求者に提供する意味情報を得ている。 このため、 図 1 1に示したフローチャートに従えば、 個人用コンピュータ 3と共用コンビュ ータ 2との間での情報の授受が比較的少ない回数で、 要求者が意味情報を得るこ とができる。 したがって、 この図 1 1に示したフローチャートに従えば、 個人用 コンピュータ 3の情報処理能力が比較的低くても、 十分に所望の意味情報を得る ことができるとともに、 要求者にとっては非常に簡便に意味情報を得ることがで さる。
さらに、 図 1 1に示したフローチャートに従って本システムを利用した場合で も、 フラグ情報が立っていない多型番地の多型パターンを用いているため、 通信 回線網 1を介して送信すべきではない多型番地及ぴ多型パターンの流出を防止す ることができる。
また、 図 1 1に示したフローチャートに従った場合でも、 フラグ情報として 3 以上の段階的な値を設定することによって、 共用コンピュータ 2の種別 (業種、 公的認可の有無等を含む) に応じて多型番地及び多型パターンの送信を制御する ことができる。 したがって図 1 1に示したフローチャートに従った場合でも、 フ ラグ情報として 3以上の段階的な値を設定することによって、 多型番地及び多型 パターンの送信に関する適否を送信先である共用コンピュータ 2毎に判断するこ とができ、 多型番地及び多型パターンの不適当な流出を防止することができる。 なお、 本情報処理システムにおいては、 ゲノム関連情報記録媒体からデータ II に含まれる情報を除いたもの、 すなわちデータ I及び付加的にデータ III〜Vのみ を有する記録媒体を用いても良い。 この場合、 データ IIに含まれる情報は、 通信 回線網 1を介して個人用コンピュータ 3と接続された外部のデータベース (ゲノ ム関連情報記録媒体) に記録しておく。 このようなシステムの場合、 例えば、 図 9及ぴ図 1 0に示したフローチャートにおけるステップ Α 9において、 通信回線 網 1を介して外部のデータベースにアクセスし、 命令された多型番地の多型パタ ーン及ぴフラグ情報を読み出し、 多型番地と多型パターンとフラグ情報とを関連 づけてメモリー部 2 6に記録することができる。 また、 例えば、 図 1 1に示した フローチヤ一トにおけるステップ C 1において、 通信回線網 1を介して外部のデ ータベースにアクセスし、 全ての多型番地の多型パターン及ぴフラグ情報を読み 出し、 多型番地と多型パターンとフラグ情報とを関連づけてメモリー部 2 6に記 録することができる。 したがって、 このようなシステムであっても、 図 9及び図 1 0に示したフローチヤ一ト及び図 1 1に示したフローチヤ一トと同様に、 要求 者は意味情報を得ることができる。
さらに、 本情報処理システムにおいては、 要求者がゲノム関連情報記録媒体 2 4及び前記ゲノム関連情報記録媒体からデータ IIに含まれる情報を除いた記録媒 体のいずれも有さず、 通信回線網 1を介して個人用コンピュータ 3と接続したゲ ノム関連情報記録媒体 2 4を備えるものであっても良い。 このようなシステムの 場合、 要求者は、 通信回線網 1を介してゲノム関連情報記録媒体 2 4にアクセス し、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4に記録された 「多型番地」 、 「多型パターン」 及び 「フラグ情報」 等の情報を個人用コンピュータ 3にダウンロードできる。 な お、 この場合、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4は、 複数の個人に関するゲノム関連 • 情報を個人毎 ( 「Gno.」 毎) に記録したものであっても良い。
さらにまた、 本発明は、 上述したような共用コンピュータ 2がメイン DB 1 4を 有するような構成に限定されず、 例えば、 共用コンピュータ 2と通信回線網 1を 介して接続されたメイン DB 1 4を備える情報処理システムにも適用される。 この 場合、 共用コンピュータ 2は、 図 9及び図 1 0に示したフローチャート及び図 1 1に示したフローチヤ一トにおいて、 メイン DB 1 4に対して通信回線網 1を介し てアクセスする。 この場合でも、 本情報処理システムによれば、 図 9及び図 1 0 に示したフロ一チヤ一ト或いは図 1 1に示したフローチヤ一ト従って要求者が所 望の意味情報を得ることができる。
特に、 この場合、 共用コンピュータ 2は、 異なる機関又は団体が有する複数の メイン DB 1 4に対して通信回線網 1を介してアクセスし、 これら複数のメイン DB 1 4に含まれる意味情報を使用して、 要求者に対する情報提供を行うことが可能 となる。 すなわち、 本情報処理システムにおいては、 図 9及び図 1 0に示したフ 口一チャートにおけるステップ A 4で、 或いは図 1 1に示したフローチャートに おけるステップ C 5で、 共用コンピュータ 2が大腸がんの罹患可能性に関する情 報を意味情報として有する様々なメイン DB 1 4にアクセスする。 これにより、 本 情報処理システムによれば、 要求者は、 様々なメイン DB 1 4に含まれる情報に基 づいて、 大腸がんの罹患可能性に関する情報を得ることができる。 また、 本システムは、 図 9及び図 1 0に示したフローチャート或いは図 1 1に 示したフローチャートにおいて、 共用コンピュータ 2が、 いわゆるエージェント に対して、 少なくとも個人用コンピュータ 3から受け取った要求情報を送信し、 意味情報 (本例においては、 「大腸がんに関する罹患可能性」 ) を、 当該エージ ェントを介して得るものであってもよい。
2 . 第 2の実施の形態
次に、 本発明を適用した第 2の実施の形態として、 利用者に対して所定の疾病 の罹患可能性を提供する情報提供システムであって、 利用者及び情報提供者以外 の第 3者がフラグ情報を有する情報提供システムについて説明する。 以下の説明 において、 上述した第 1の実施の形態における情報処理システムと同様な構成及 び用語については、 同じ名称、 符号及び定義を使用することによって、 その構成、 動作及び用語の説明を省略する。 なお、 第 2の実施の形態においても、 説明の都 合上、 簡略化したモデルとして説明する。
情報提供システムは、 図 1 2に示すように、 ィンターネット等の通信回線網 1 と、 通信回線網 1に接続された共用コンピュータ 2と、 通信回線網 1に接続され た少なくとも 1以上の個人用コンピュータ 3と、 フラグ情報を有するフラグ情報 提供コンピュータ Wを備え、 通信回線網 1を介して共用コンピュータ 2と個人用 コンピュータ 3とフラグ情報提供コンピュータ Wとの間のデータ通信を可能とし ている。
本実施の形態において、 共用コンピュータ 2は、 上述した第 1の実施の形態と 同様な構成となっている、 また、 個人用コンピュータ 3は、 ゲノム関連情報記録 媒体 2 4にフラグ情報を記録していない以外は、 上述した第 1の実施の形態と同 様な構成となっている。
また、 フラグ情報提供コンピュータ Wは、 例えば、 図 1 3に示すような、 多型 番地とフラグ情報とが関連付けられたデータベースを有している。 データベース には、 第 1の実施の形態で説明したフラグ情報と多型番地とが関連付けて記録さ れている。 なお、 このデータベースにおいては、 多型番地が関係する疾患や、 特 徴、 性質、 寿命 IQ等の、 いわゆる意味情報は関連付けられていても、 関連付けら れていなくてもよい。 また、 データベースは、 個々のゲノム関連情報記録媒体 2 4に応じて、 フラグ 情報の内容が異なるように設定できることが好ましい。 なお、 データベースは、 複数のゲノム関連情報記録媒体 2 4又は全てのゲノム関連情報記録媒体 2 4に共 通するものであっても良い。
本情報提供システムは、 例えば、 図 1 4及ぴ図 1 5に示すフローチャートに従 つて情報処理動作する。 なお、 図 1 4及ぴ図 1 5に示すフローチャートにおいて. 「 (共) 」 と記載したステップは共用コンピュータ 2における処理を意味し、 Γ (個) 」 と記載したステップは個人用コンピュータ 3における処理を意味し、 「 (フ) 」 と記載したステップはフラグ情報提供コンピュータ Wにおける処理を 意味している。
要求者は、 先ず、 ステップ D l (SD1) で、 メモリー 2 3に記録されている処理 プログラム 2 7を起動し、 個人用コンピュータ 3の読取り装置 2 5を駆動してゲ ノム関連情報記録媒体 2 4にアクセスし、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4において データ Iとして記録されている 「Gno.」 を読み出す。 読み出した 「Gno.」 は、 メ モリー部 2 6に格納する。
次に、 ステップ D 2 (SD2) では、 処理プログラム 2 7によって表示装置 2 2に 表示された画面イメージに基づいて、 要求者が提供を受けたい情報、 例えば、
「大腸がんの罹患可能性」 (要求情報) を個人用コンピュータ 3に入力するとと もに、 個人用コンピュータ 3から通信回線網 1を経由して共用コンピュータ 2に 「大腸がんの罹患可能性」 及び 「Gno.」 を送信する。 或いは、 個人用コンビユー タ 3から通信回線網 1を経由して共用コンピュータ 2に対して、 「大腸がんの罹 患可能性」 及ぴ 「Gno.」 を書き込む。
次に、 ステップ D 3 (SD3) では、 共用コンピュータ 2が 「大腸がんの罹患可能 性」 及び 「Gno.」 を受信する。 受信した 「大腸がんの罹患可能性」 及ぴ 「Gno.」 は、 メモリー部 A 1 0に要求情報として格納する。
次に、 ステップ D 4 (SD4) では、 要求情報を受信すると、 メモリー 7に記録さ れている処理プログラム 1 3を起動してメイン DB14にアクセスする。 なお、 この 処理プログラム 1 3は、 共用コンピュータ 2における処理を行うものである。
次に、 ステップ D 5 (SD5) では、 処理プログラム 1 3に従って、 メイン DB14に 記録されている 「分類 (疾患名) 」 を検索し、 要求された 「大腸がんの罹患可能 性」 (大腸がん) と一致するものを抽出する。
ステップ D 6 (SD6) では、 メイン DB14に記録されているデータのなかから 「大 腸がんの罹患可能性」 と一致した 「分類 (疾患名) 」 (大腸がん) に関連づけら れた 「多型番地」 を読み出す。 読み出した 「多型番地」 は、 メモリー部 A 1 0に 要求情報に関連づけた位置情報として格納する。 すなわち、 メモリ一部 A 1 0に は、 所定の 「Gno.」 に対して 「大腸がんの罹患可能性」 及ぴ 「多型番地」 が記録 されることとなる。
次に、 ステップ D 7 (SD7) では、 メモリー部 A 1 0に記録されている 「Gno.」 及び 「多型番地」 を個人用コンピュータ 3に送信するとともに、 送信する 「多型 番地」 に対応する 「多型パターン」 を提出する命令情報を個人用コンピュータ 3 に送信する。 また、 このとき、 要求情報の種類によっては、 必要に応じて既往症 や特徴等の付加的な情報の提出を命令してもよい。
次に、 ステップ D 8 (SD8) では、 共用コンピュータ 2から送信された 「Gno.」 . 「多型番地」 及び命令情報を受信する。 受信した 「Gno.」 及ぴ 「多型番地」 は、 メモリー部 2 6に記録される。
次に、 ステップ D 9 (SD9) では、 ステップ D 8で受信した 「多型番地」 にフラ グ情報が立っているか否かを判断するため、 受信した多型番地を通信回線網 1を 介してフラグ情報提供コンピュータ Wに対して送信する。 また、 図 1 3に示した データベースが Gno.毎に異なる設定で作製されたものである場合、 ステップ D9で は、 多型番地とともに 「Gno.」 を送信する。
次に、 ステップ D 1 0 (SD10) では、 フラグ情報提供コンピュータ Wで個人用 コンピュータ 3から送信された多型番地を受信し、 図 1 3に示したデータベース にアクセスし、 受信した多型番地にフラグ情報が立っているかを検索する。 具体 的には、 フラグ情報提供コンピュータ Wは、 受信した多型番地と一致する多型番 地を、 図 1 3に示したデータベースから検索し、 受信した多型番地にフラグ情報 が立っている場合には、 例えば、 当該多型番地に当該フラグ情報を関連付けてお 次に、 ステップ D l 1 (SD11) では、 ステップ D 1 0で行った検索結果をフラグ 情報提供コンピュータ Wから個人用コンピュータ 3に対して送信する。 ここで、 検索結果としては、 ステップ D 1 0で受信した多型番地にフラグ情報を関連付け て送信してもよい。 また、 検索結果としては、 ステップ D 1 0で受信した多型番 地にフラグ情報が立っている多型番地が含まれているか否か、 すなわち命令情報 にフラグ情報が立っている多型番地が含まれているか否かを示す情報を送信して もよい。 さらに、 検索結果としては、 ステップ D 1 0で受信した多型番地にフラ グ情報が立っている多型番地が含まれている場合には、 フラグ情報が立っている 多型番地が命令情報に含まれていることを示す情報及ぴフラグ情報が立っている 多型番地を送信してもよい。
なお、 図 1 3のデータベースにおいて複数の多型番地の組み合わせに対してフ ラグ情報が立っている場合、 ステップ D 1 0で受信した多型番地に当該組み合わ せを構成する全ての多型番地が含まれるときに 「フラグ情報が立っている多型番 地が命令情報に含まれている」 と判断し、 ステップ D 1 0で受信した多型番地に 当該組み合わせを構成する多型番地の.うち少なくとも 1つの多型番地が含まれて いないときに 「フラグ情報が立っている多型番地が命令情報に含まれていない」 と判断する。
次に、 ステップ D 1 2 (SD12) では、 フラグ情報提供コンピュータ Wから送信 された検索結果を個人用コンピュータ 3で受信し、 検索結果を確認することによ つて、 命令情報に含まれる多型番地にフラグ情報が立っているか否かを判断する。 ここで、 ステップ D 8で複数の多型番地を受信した場合には、 全ての多型番地に ついてフラグ情報が立っているか否か判断する。 ステップ D 1 2では、 命令情報 に含まれる多型番地にフラグ情報が立っている場合には 「yes」 と判断し、 命令 情報に含まれる多型番地にフラグ情報が立っていない場合には 「no」 と判断する。 ステップ D 1 2で 「yes」 と判断した場合には次にステップ D 1 3 (SD13) へ進み、 ステップ D 1 2で 「no」 と判断した場合には次にステップ D 1 4 (SD14) へ進む。 特に、 ステップ D 8で複数の多型番地を受信した場合、 ステップ D 1 2において は、 全ての多型番地にフラグ情報が立っていない場合に 「no」 とする判断 (判断
1 ) と、 複数の多型番地のなかでフラグ情報が立っている多型番地のみを
「yes」 としフラグ情報が立っていない多型番地を 「noJ とする判断 (判断 2 ) とのうちいずれの判断を行っても良い。
すなわち、 ステップ D 8で複数の多型番地を受信し、 ステップ D 1 2において判 断 1を行った場合、 受信した複数の多型番地のうち少なく とも 1つの多型番地に 関してフラグ情報が立っていると 「yes」 と判断してステップ D 1 3に進む。 また この場合、 受信した全ての多型番地に関してフラグ情報が立っていない場合のみ ステップ D 1 4に進む。
一方、 ステップ D 8で複数.の多型番地を受信し、 ステップ D 1 2において判断 2 を行った場合、 受信した複数の多型番地のなかでフラグ情報が立っている多型番 地に関しては 「yes」 とし、 受信した複数の多型番地のなかでフラグ情報が立つ ていない多型番地に関しては 「noJ とする。 そして、 「yes」 と判断した多型番 地に関してのみステップ D 1 3に進み、 「no」 と判断した多型番地に関してのみ ステップ D 1 4に進む。
ステップ D 1 3では、 共用コンピュータ 2に対して命令情報に含まれる多型番 地の提出を拒否する旨を通知する。 ステップ D 1 2において判断 1を行った場合 には、 ステップ D 1 3においては、 いかなる多型番地に対応する多型パターンの 提出も拒否するとともに、 本システムの利用を中止する旨を共用コンピュータ 2 に対して送信する。 一方、 ステップ D 1 2において判断 2を行った場合には、 ス テツプ D 1 3においては、 フラグ情報が立っている多型番地に関しては対応する 多型パターンの提出を拒否するが、 本システムの利用は続行する旨を通知する。 ステップ D 1 4では、 処理プログラム 2 7に従ってゲノム関連情報記録媒体 2
4にアクセスし、 データ IIを検索し、 フラグ情報が立っていない多型番地の多型 パターンを読み出し、 多型番地と多型パターンとを関連づけてメモリー部 2 6に 記録する。 ステップ D 1 2において判断 2を行った場合、 ステップ D 1 4において は、 受信した複数の多型番地のうちフラグ情報が立っていない多型番地に関して のみ、 多型パターンを読み出して記録する。
ステップ D 1 4では、 データ Iに対してアクセスし、 命令情報に含まれる
「Gno.」 が正しいか否かを確認することが好ましい。 また、 ステップ D 1 4では. 多型パターンのほかにデータ 111、 データ IV及びデータ Ϋに記録されている付加的 な情報も同時に読み出し、 必要に応じてメモリー部 2 6に記録してもよい。 次に、 ステップ D l 5 (SD15) では、 メモリー部 2 6に一時的に記録した多型 番地に関連付けられた多型パターン及び必要に応じて記録された付加的な情報を、
「Gno.」 とともに通信回線網 1を介して共用コンピュータ 2に対して出力する。 ステップ D 1 6 (SD16) では、 多型番地に関連付けられた多型パターン及ぴ必要 に応じて記録された付加的な情報を 「Gno.」 とともに共用コンビユーダ 2で受信 し、 受信した多型パターンを多型番地と関連付けてメモリー部 A 1 0に記録する。 また、 本例では、 ステップ D 7において、 共用コンピュータ 2が 「多型パター ン」 の提出を命令する命令情報を送出し、 ステップ D 9において、 個人用コンビ ユータ 3は命令情報に含まれる多型番地にフラグ情報が立っているか否かを判断 するために、 フラグ情報提供コンピュータに対して多型番地を送信している。 し かしながら、 本システムは、 ステップ D 7において当該命令情報を送出しないシ ステムであってもよい。 この場合、 ステップ D 9において、 個人用コンピュータ
3は、 処理プログラム 2 7に従って、 ステップ D 8で受信した多型番地に基づい てデータ IIを検索し、 受信した多型番地にフラグ情報が立っているか否かを判断 するため、 受信した多型番地をフラグ情報提供コンピュータに対して送信する。 次に、 ステップ D 1 7 (SD17) では、 メイン DB 1 4にアクセスし、 受信した多 型番地及ぴ多型パターンと一致するものを検索する。 具体的には、 メイン DB 1 4 において、 一つの多型番地に対して複数の多型パターンが記録されており、 受信 した多型番地及びその多型パターンがメイン DB 1 4においてどの多型パターンに 一致しているのかを検索する。
次に、 ステップ D 1 8 (SD18) では、 処理プログラム 1 3に従って、 受信した 多型パターンが一致した多型パターンに関連づけられている大腸がんに対する罹 患可能性 (意味情報) を読み出す。 すなわち、 ステップ D 1 8では、 要求者が提 出した多型番地及ぴ多型パターンに従って、 要求者の大腸がんに対する罹患可能 性を読み出すことができる。 読み出した罹患可能性は、 要求者の 「Gno.」 と 「多 型番地」 及ぴ 「多型パターン」 とに関連づけてメモリー部 A 1 0に格納する。 こ のとき、 大腸がんに対する罹患可能性を、 付加的な情報により補正したかたちで 格納してもよいし、 付加的な情報から得られるその他の情報を要求者の 「Gno. J に関連づけて格納しても良い。 なお、 ステップ D l 6において、 命令情報に含まれる多型番地のうち一部の多 型番地及び多型パターンのみ受信した場合、 ステップ D 1 8では受信した一部の 多型番地及び多型パターンを用レ、て罹患可能性を読み出すことができる。
次に、 ステップ D 1 9 ( SD19) では、 メモリー部 A 1 0に格納した要求者の 「Gno.」 及ぴ罹患可能性を意味情報として、 通信回線網 1を介して個人用コンビ ユータ 3に対して送信する。 ステップ D 2 0 (SD20) では、 個人用コンピュータ
3が要求者の 「Gno.」 及び罹患可能性 (意味情報) を受信する。 受信した意味情 報は、 メモリー部 2 6に記録される。
次に、 ステップ D 2 1 (SD21 ) では、 処理プログラム 2 7に従って、 メモリー 部 2 6に記録された意味情報から大腸がんに対する罹患可能性を表示装置 2 2に 表示する。 なお、 ステップ D 1 9からステップ D 2 1の代わりに共用コンピュータ
2が処理プログラム 1 3に従って意味情報を表示する画面を読み出し (作成し) 通信回線網 1を経由して個人用コンピュータ 3の表示装置 2 2に表示させること もできる。 この場合においても、 共用コンピュータ 2から個人用コンピュータ 3 に対して意味情報が送信されたものとする。 これにより、 要求者は、 ゲノム関連 情報記録媒体 2 4に記録したゲノム関連情報 2 8を用いて大腸がんに対する罹患 可能性を得ることができる。
なお、 ステップ D 1 8で読み出された 「意味情報」 から、 更に、 当該 「意味情 報に関連する情報」 が導き出され、 ステップ D 1 9で 「意味情報」 とともに当該 「意味情報に関連する情報」 を多型番地と関連付けて送信し、 ステップ D 2 0で それらを受信した場合においても、 同様にステップ D 2 1で 「意味情報」 と当該
「意味情報に関連する情報」 が表示される。
また、 本システムにおいては、 ステップ D 3において、 要求者が所望する 「大 腸がんの罹患可能性」 の他に、 例えば、 罹患可能性が所定の水準を超えた場合に 「大腸がんを予防する機能性食品」 の提供を更なる要求情報として受信し、 要求 者の大腸がんの罹患可能性に関する情報とともに、 罹患可能性が所定の水準を超 えていた場合に、 要求された機能性食品を提供することも可能である。
なお、 共用コンピュータ 2におけるステップ D 3〜!) 7及びステップ D 1 6まで と、 ステップ D l 6 〜D 1 9までとを異なる機関で行ってもよい。 この場合には、 共用コンピュータ 2におけるステップが 2分割されていることになる。
ところで、 本システムにおいては、 多型パターンは、 暗号化されていても暗号 化されていなくても差し支えない。
以上のように、 本システムにおいては、 多型パターンを多型番地と関連づけて 記録したゲノム関連情報記録媒体 2 4を用い、 フラグ情報を記録したデータべ一 スを有するフラグ情報提供コンピュータ Wを利用することによって、 メイン DB14 に記録された意味情報を多型番地を介在させて個人が利用することができる。 本 システムを利用する個人は、 意味情報をゲノム関連情報記録媒体 2 4に記録して おく必要はなく、 多型番地と多型パターンとを関連づけたゲノム関連情報 2 8を 所有するだけで、 様々な意味情報を得ることができる。
特に、 本システムにおいては、 通信回線網 1を介して多型番地及び多型パター ンを共用コンピュータ 2に対して送信するに先立って、 フラグ情報提供コンビュ ータ Wにアクセスして、 送信対象となる多型番地にフラグ情報が立っているか否 かを判断することができる。 したがって、 本システムによれば、 通信回線網 1を 介して送信すベきではない多型番地及ぴ多型パターンの流出を防止することがで さる。
また、 本システムでは、 フラグ情報提供コンピュータ Wのデータベースに記録 されたフラグ情報を用いているため、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4にフラグ情報 を記録する必要がない。 例えば、 最新のフラグ情報をフラグ情報提供コンビユー タ W側で更新すれば、 要求者は、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4を更新する必要が なく、 最新のフラグ情報に基づいて本システムを利用することができる。
また、 本システムにおいては、 フラグ情報として 3以上の段階的な値を設定す ることによって、 共用コンピュータ 2の種別 (業種、 公的認可の有無等を含む) に応じて多型番地及び多型パターンの送信を制御することができる。 この場合、 ステップ D 9において、 個人用コンピュータ 3からは 「多型番地」 とともに共用 コンピュータ 2に関する情報、 例えば共用コンピュータ 2に予め設定されたラン クゃ共用コンピュータ 2の名称等の情報を送信することが好ましい。 これにより、 フラグ情報提供コンピュータ Wでは、 ステップ D 1 0 (SD10) において、 共用コ ンピュータ 2のランクや名称等に応じたフラグ情報をデータベースから検索する ことができる。 したがって、 本システムにおいても、 多型番地及び多型パターン の送信に関する適否を送信先である共用コンピュータ 2毎に判断することができ、 多型番地及ぴ多型パターンの不適当な流出を防止することができる。
ところで、 本情報処理システムにおいては、 共用コンピュータ 2のメモリー 7 に記録された処理プログラム 1 3及び個人用コンピュータ 3のメモリー 2 3に記 録された処理プログラム 2 7が例えば、 図 1 6に示すようなフローチャートに従 つて情報処理動作するものであってもよい。 なお、 図 1 6に示すフローチャート においても、 「 (共) 」 と記載したステップは共用コンピュータ 2における処理 を意味し、 「 (個) 」 と記載したステップは個人用コンピュータ 3における処理 を意味し、 「 (フ) 」 と記載したステップはフラグ情報提供コンピュータ Wにお ける処理を意味している。
ここでは、 先ず要求者が本システムを利用するにあたり、 メモリー 2 3に記録 されている処理プログラム 2 7を起動し、 処理プログラム 2 7に従って、 ステツ プ F l (SF1) で、 フラグ情報提供コンピュータ Wにフラグ情報の提示を要求する。 例えば、 フラグ情報提供コンピュータ" Wが図 1 3に示したデータベースを Gno.毎 に有している場合には、 個人用コンピュータ 3からはフラグ情報の提示要求とと もに 「Gno.」 を送信する。
また、 ステップ F 1では、 読取り装置 2 5を駆動してゲノム関連情報記録媒体 2 4にアクセスし、 データ IIとして記録されている全ての 「多型番地」 をフラグ 情報提供コンピュータ Wに送信し、 送信した多型番地に関するフラグ情報の提示 を要求してもよい。
次に、 ステップ F 2 (SF2) では、 フラグ情報提供コンピュータ Wがフラグ情報 の提示要求を受信し、 データベースに含まれるフラグ情報を検索する。 具体的に、 フラグ情報提供コンピュータ Wが 「Gno.」 毎に異なるデータベースを有する場合 には、 受信した 「Gno.」 と一致するデータベースに含まれるフラグ情報を検索す る。'
また、 ステップ F 2では、 フラグ情報の提示要求とともに多型番地を受信した 場合、 受信した多型番地に基づいてデータベースを検索し、 受信した多型番地に 関連付けられたフラグ情報を検索する。 次に、 ステップ F 3 (SF3) では、 ステップ F 2で行った検索結果をフラグ情報 提供コンピュータ Wから個人用コンピュータ 3に対して送信する。 具体的には、 フラグ情報提供コンピュータ Wは、 データベースに含まれる、 多型番地とフラグ 情報とを関連付けて個人用コンピュータ 3に送信する。
また、 ステップ F 2において、 フラグ情報の提示要求とともに多型番地を受信 した場合、 受信した多型番地にフラグ情報を関連付けて個人用コンピュータ 3に 送信する。
次に、 ステップ F 4 (SF4) では、 フラグ情報提供コンピュータ Wから送信され た検索結果を個人用コンピュータ 3で受信し、 検索結果を確認することによって、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4に記録されている全ての多型番地のうちでフラグ情 報が立っていない多型番地を抽出することができる。 フラグ情報が立っていない 多型番地は、 メモリ一部 2 6に格納する。
次に、 ステップ F 5 (SF5) で、 ステップ F 4で抽出された多型番地及び当該多 型番地に対応する多型パターンと 「Gno.」 を読取り装置 2 5で読み出す。 読み出 した 「Gno.」 、 「多型番地」 及ぴ 「多型パターン」 は、 メモリー部 2 6に格納す る。
次に、 ステップ F 6 (SF6) では、 処理プログラム 2 7に従い、 表示装置 2 2に 表示された画面イメージに基づいて、 要求者が提供を受けたい情報、 例えば、 「大腸がんの罹患可能性」 (要求情報) を個人用コンピュータ 3に入力するとと もに、 個人用コンピュータ 3から通信回線網 1を経由して共用コンピュータ 2に 「大腸がんの罹患可能性」 と、 メモリー部 2 6に記録されている 「Gno.」 、 「多 型番地」 及ぴ 「多型パターン」 とを送信する。
次に、 ステップ F 7 (SF7) では、 共用コンピュータ 2が 「大腸がんの罹患可能 性」 、 「Gno.」 、 「多型番地」 及ぴ 「多型パターン」 を受信する。 受信した 「大 腸がんの罹患可能性」 は要求情報としてメモリー部 A 1 0に記録され、 「Gno.」 、 「多型番地」 及び 「多型パターン」 も、 メモリー部 A 1 0に格納される。 共用コ ンピュータ 2は、 要求情報を受信すると処理プログラム 1 3を起動する。 そして、 ステップ F 8 (SF8) では、 処理プログラム 1 3に従って、 メイン DB 1 4にァクセ スする。 次に、 ステップ F 9 (SF9) では、 処理プログラム 1 3に従って、 メイン DB 1 4 に記録されている 「分類 (疾患名) 」 を検索し、 要求された 「大腸がんの罹患可 能性」 (大腸がん) と一致するものを抽出する。
ステップ F 1 0 (SF10) では、 処理プログラム 1 3に従って、 メイン DB 1 4に アクセスし、 メイン DB 1 4から 「大腸がん」 に分類された 「多型番地」 、 当該多 型番地に対する全ての 「多型パターン」 、 及び当該多型パターンに対する 「罹患 可能性」 を読み出す。 読み出した 「多型番地」 、 「多型パターン」 及び 「罹患可 能性」 は、 メモリー部 A 1 0に格納される。
次に、 ステップ F l 1 (SF11) では、 ステップ F 7で受信した 「多型番地」 及び 「多型パターン」 に基づいて、 ステップ F 1 0でメモリー部 A 1 0に格納したデ ータを検索し、 受信した 「多型パターン」 と一致した多型パターンに関連付けら れた罹患可能性をメモリ一部 A 1 0から抽出する。
ステップ F 1 2 (SF12) では、 ステップ F l 1の結果、 すなわち、 ステップ F 7 で受信した情報に含まれる多型パターンがメイン DB 1 4のいずれの多型パターン と一致するかに基づいて抽出した罹患可能性を、 通信回線網 1を介して個人用コ ンピュータ 3に対して送信する。 このとき、 共用コンピュータ 2は、 抽出した罹 患可能性を要求者の 「Gno. J とともに送信する。
次に、 ステップ F 1 3 ( SF13 ) で、 共用コンピュータ 2から送信された
「Gno.」 及び 「罹患可能性」 (意味情報) を受信する。 受信した 「Gno. J 及び 「罹患可能性」 は、 メモリー部 2 6に記録される。 このとき、 ゲノム関連情報記 録媒体 2 4に記録されているデータ Iにアクセスし、 受信した 「Gno.」 が正しい か否かを確認することができる。
次に、 ステップ F 1 4 (SF14) では、 処理プログラム 2 7に従って、 メモリー 部 2 6に記録された意味情報から大腸がんに対する罹患可能性を表示装置 2 2に 表示する。 なお、 ステップ F 1 2からステップ F 1 4の代わりに、 共用コンビユー タ 2が処理プログラム 1 3に従って意味情報を表示する画面を読み出し (作成 し) 、 通信回線網 1を経由して個人用コンピュータ 3の表示装置 2 2に表示させ ることもできる。 この場合においても、 共用コンピュータ 2から個人用コンビュ ータ 3に対して意味情報が送信されたものとする。 これにより、 要求者は、 ゲノ ム関連情報記録媒体 2 4に記録したゲノム関連情報 2 8を用いて大腸ガンに対す る罹患可能性を得ることができる。
以上のように、 図 1 6に示したフローチャートに従えば、 フラグ情報が立って いない多型番地及ぴ多型パターンの全てを共用コンピュータ 2に対して出力し、 共用コンピュータ 2において要求者に提供する意味情報を得ている。 このため、 図 1 6に示したフローチヤ一トに従えば、 個人用コンピュータ 3と共用コンビュ ータ 2との間での情報の授受が比較的少ない回数で、 要求者が意味情報を得るこ とができる。 したがって、 この図 1 6に示したフローチャートに従えば、 個人用 コンピュータ 3の情報処理能力が比較的低くても、 十分に所望の意味情報を得る ことができるとともに、 要求者にとっては非常に簡便に意味情報を得ることがで きる。
さらに、 図 1 6に示したフローチヤ一トに従って本システムを利用した場合で も、 フラグ情報が立っていない多型番地の多型パターンを用いているため、 通信 回線網 1を介して送信すベきではない多型番地及び多型パターンの流出を防止す ることができる。
特に、 図 1 6に示したフローチヤ一トに従えば、 本システムによれば、 フラグ 情報提供コンピュータ Wのデータベースに記録されたフラグ情報を用いているた め、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4にフラグ情報を記録する必要がない。 例えば、 最新のフラグ情報をフラグ情報提供コンピュータ W側で更新すれば、 要求者は、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4を更新する必要がなく、 最新のフラグ情報に基づい て本システムを利用することができる。
また、 本システムにおいては、 フラグ情報として 3以上の段階的な値を設定す ることによって、 共用コンピュータ 2の種別 (業種、 公的認可の有無等を含む) に応じて多型番地及び多型パターンの送信を制御することができる。 この場合、 ステップ F 1において、 個人用コンピュータ 3からは 「フラグ情報の提示要求」 とともに共用コンピュータ 2に関する情報、 例えば共用コンピュータ 2に予め設 定されたランクや共用コンピュータ 2の名称等の情報を送信することが好ましい。 これにより、 フラグ情報提供コンピュータ Wでは、 ステップ F 2において、 共用 コンピュータ 2のランクや名称等に応じたフラグ情報をデータベースから検索す ることができる。 したがって、 本システムにおいても、 多型番地及び多型パター ンの送信に関する適否を送信先である共用コンピュータ 2毎に判断することがで き、 多型番地及び多型パターンの不適当な流出を防止することができる。
なお、 本情報処理システムにおいては、 ゲノム関連情報記録媒体からデータ II に含まれる情報を除いたもの、 すなわちデータ I及び付加的にデータ III〜Vのみ を有する記録媒体を用いても良い。 この場合、 データ IIに含まれる情報は、 通信 回線網 1を介して個人用コンピュータ 3'と接続された外部のデータベース (ゲノ ム関連情報記録媒体) に記録しておく。 このようなシステムの場合、 例えば、 図 1 4及び図 1 5に示したフローチヤ一トにおけるステップ D 1 4において、 通信 回線網 1を介して外部のデータベースにアクセスし、 フラグ情報が立っていない 多型番地の多型パターンを読み出し、 多型番地と多型パターンとを関連づけてメ モリー部 2 6に記録することができる。 また、 例えば、 図 1 6に示したフローチ ヤートにおけるステップ F 4において、 通信回線網 1を介して外部のデータべ一 スにアクセスし、 フラグ情報が立っていない全ての多型番地の多型パターンを読 み出し、 多型番地と多型パターンとを関連づけてメモリー部 2 6に記録すること ができる。 したがって、 このようなシステムであっても、 図 1 4及ぴ図 1 5に示 したフローチヤ一ト及び図 1 6に示したフローチヤ一トと同様に、 要求者は意味 情報を得ることができる。 '
さらに、 本情報処理システムにおいては、 要求者がゲノム関連情報記録媒体 2 4及ぴ前記ゲノム関連情報記録媒体からデータ IIに含まれる情報を除いた記録媒 体のいずれも有さず、 通信回線網 1を介して個人用コンピュータ 3と接続したゲ ノム関連情報記録媒体 2 4を備えるものであっても良い。 このようなシステムの 場合、 要求者は、 通信回線網 1を介してゲノム関連情報記録媒体 2 4にアクセス し、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4に記録された 「多型番地」 及び 「多型パター ン」 等の情報を個人用コンピュータ 3にダウンロードできる。 なお、 この場合、 ゲノム関連情報記録媒体 2 4は、 複数の個人に関するゲノム関連情報を個人毎
( 「Gno.」 毎) に記録したものであっても良い。
さらにまた、 本発明は、 上述したような共用コンピュータ 2がメイン DB 1 4を 有するような構成に限定されず、 例えば、 共用コンピュータ 2と通信回線網 1を 介して接続されたメイン DB 1 4を備える情報処理システムにも適用される。 この 場合、 共用コンピュータ 2は、 図 1 4及ぴ図 1 5に示したフローチャート及ぴ図 1 6に示したフローチャートにおいて、 メイン DB 1 4に対して通信回線網 1を介 してアクセスする。 この場合でも、 本情報処理システムによれば、 図 1 4及び図 1 5に示したフローチヤ一ト或いは図 1 6に示したフローチヤ一ト従って要求者 が所望の意味情報を得ることができる。
特に、 この場合、 共用コンピュータ 2は、 異なる機関又は団体が有する複数の メイン DB 1 4に対して通信回線網 1を介してアクセスし、 これら複数のメイン DB 1 4に含まれる意味情報を使用して、 要求者に対する情報提供を行うことが可能 となる。 すなわち、 本情報処理システムにおいては、 図 1 4及び図 1 5に示した フローチャートにおけるステップ D 4で、 或いは図 1 6に示したフロ一チヤ一ト におけるステップ F 8で、 共用コンピュータ 2が大腸がんの罹患可能性に関する 情報を意味情報として有する様々なメイン DB 1 4にアクセスする。 これにより、 本情報処理システムによれば、 要求者は、 様々なメイン DB 1 4に含まれる情報に 基づいて、 大腸がんの罹患可能性に関する情報を得ることができる。
また、 本システムは、 図 1 4及び図 1 5に示したフローチャート或いは図 1 6 に示したフローチャートにおいて、 共用コンピュータ 2が、 いわゆるエージェン トに対して、 少なくとも個人用コンピュータ 3から受け取った要求情報を送信し. 意味情報 (本例においては、 「大腸がんに関する罹患可能性」 ) を、 当該エージ 工ントを介して得るものであってもよい。
本明細書で引用した全ての刊行物、 特許および特許出願をそのまま参考として 本明細書にとり入れるものとする。 産業上の利用の可能性
以上、 詳細に説明したように、 本発明によれば、 個体間における塩基配列情報 の相違を有効に利用して各個体にとって有益な意味情報を提供できる情報提供シ ステムにおいて、 これら塩基配列情報の好ましくない流出を確実に防止すること ができ、 安全性の高い情報提供システムを提供することができる。

Claims

請求の範囲
1 . 物品及び/又はサービスの要求に応じた、 塩基配列における位置を意味 する位置情報を取得するステップ aと、 ·
塩基配列における位置を意味する位置情報に関連付けられた塩基配列関連情報 の送出について適否を判定するための、 位置情報に関連付けられたフラグ情報に 基づいて、 前記ステップ aで取得した位置情報に対応する塩基配列関連情報の送 出について適否を判定するステップ bと
を有する塩基配列に関する情報処理方法。
2 . 塩基配列関連情報のなかから、 前記ステップ bで送出について適当であ ると判定した塩基配列関連情報を取得するステツプ cと、
前記ステップ cで取得した塩基配列関連情報を送出するステップ dと を有することを特徴とする請求項 1記載の塩基配列に関する情報処理方法。
3 . 前記ステップ aで取得した位置情報のなかに、 前記ステップ bで送出に ついて不適であると判定した塩基配列関連情報に対応するものが含まれている場 合には処理を中止することを特徴とする請求項 1記載の塩基配列に関する情報処 理方法。
4 . 物品及び/又はサービスの要求に応じた、 塩基配列における位置を意味 する位置情報を取得するステップ aと、
塩基配列における位置を意味する位置情報に関連付けられた塩基配列関連情報 の送出についての適否を判定するための、 位置情報に関連付けられたフラグ情報 及び/又は当該フラグ情報に関する情報を取得するステップ bと、
前記ステップ bで取得したブラグ情報及び/又は当該フラグ情報に関する情報 に基づいて、 前記ステップ aで取得した位置情報に対応する塩基配列関連情報の 送出について適否を判定するステップ cと
を有する塩基配列に関する情報処理方法。
5 . 塩基配列関連情報のなかから、 前記ステップ cで送出について適当であ ると判定した塩基配列関連情報を取得するステツプ dと、
前記ステツプ dで取得した塩基配列関連情報を送出するステツプ eと を有することを特徴とする請求項 4記載の塩基配列に関する情報処理方法。
6 . 前記ステップ aで取得した位置情報のなかに、 前記ステップ cで送出に ついて不適であると判定した塩基配列関連情報に対応するものが含まれている場 合には処理を中止することを特徴とする請求項 4記載の塩基配列に関する情報処 理方法。
7 . 塩基配列における位置を意味する位置情報に関連付けられた塩基配列関 連情報の送出について適否を判定するための、 位置情報に関連付けられたフラグ 情報に基づいて、 塩基配列関連情報の送出について適否を判定するステップ aと. 塩基配列関連情報のなかから、 前記ステップ aで送出について適当であると判 定した塩基配列関連情報を取得するステップ bと、
前記ステツプ bで取得した塩基配列関連情報を送出するステップ cと、 物品及び/又はサービスの要求情報を送出するステップ dと
を有する塩基配列に関する情報処理方法。
8 . 塩基配列における位置を意味する位置情報に関連付けられた塩基配列関 連情報の送出についての適否を判定するための、 位置情報に関連付けられたフラ グ情報及び/又は当該フラグ情報に関する情報を取得するステツプ aと、
前記ステップ aで取得したフラグ情報及び/又は当該フラグ情報に関する情報 に基づいて、 塩基配列関連情報の送出について適否を判定するステップ bと、 塩基配列関連情報のなかから、 前記ステップ bで送出について適当であると判 定した塩基配列関連情報を取得するステップ cと、
前記ステツプ cで取得した塩基配列関連情報を送出するステツプ dと、 物品及び/又はサービスの要求情報を送出するステップ eと
を有する塩基配列に関する情報処理方法。
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