TW496873B - Bispecific chimeric molecule, nucleic acid sequence thereof, and in vitro expression system containing the same - Google Patents

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496873 A7 B7 五、發明説明（1 ) 本發明係關於一種基因表現用之新穎條件性系統◦其亦 關於此系統在基因或是細胞治療中之用途，以高度選擇地 導向所欲基因之表現。 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 基因以及細胞治療涉及了缺陷以及異常之校正（突變、 異常表現等等），或是藉著於受影響之細胞或器官中引入 基因訊息而確保所欲治療性蛋白質之表現。該等基因訊息 可在活體外引入由該器官抽出之細胞中，再將經修飾之細 胞引入體内（細胞治療），亦可直接於活體中引入適當之組 織中（基因治療）。已有各種技術可被用來進行基因之轉移 ，其中包括許多轉感染之技術，其涉及天然或是合成之化 學或生化載體，例如，DNA及DEAE-葡聚糖之複合體（Pagano et al.，J· Virol. 1 (1967) 891)、DNA及核蛋白之複合體（Kaneda et al.， Science 243 (1989) 375)或是 DNA及脂質之複合體（Feigner et al.5 PNAS 84 (1987) 7413)，以及脂質體（Fraley et al.5 J· Biol. Chem· 255 (1980) 10431)或是陽離子脂質之使用。另一種技術係基於以 病毒之使用作爲載體而轉移基因。在這方面，許多種不同 的病毒已接受了其感染某些細胞種群之能力的試驗。特別 是逆轉錄病毒（例如，RSV、HMS、MMS)、HSV病毒、腺聯病 毒以及腺病毒。然而，在此等基因以及細胞治療之發展上 ，最大的困難便在於治療的選擇性。根據應用方式之不同 ，且根據被轉移基因之不同，很重要的一點便是要能夠僅 將其導向某些特定組織或是體内某些特定部分，以濃縮治 療效果，並限制散播及副作用。此等目標之導向可藉由具 有特定細胞專一性之載體的使用而達成。另外一種方式則 -4- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210 X 297公釐） 496873 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A7 B7 五、發明説明（2 ) ~ ^ 涉及對於某些細胞種類具有專一性之表現信號的使用。在 延方面，某些被稱作專一性啓動子者已述於文獻之中，例 如編碼丙酮酸激酶、絨毛蛋白以及GFAP之基因啓動予、脂 肪酸結合腸蛋白啓動子、平滑肌α-肌動蛋白啓動子、叩〇_^ 、apo-AII以及人類白蛋白基因啓動子。然而，這些啓動子 皆具有某些缺點，特別是它們會製造某些轉錄背景雜訊， 其可能會因爲毒性基因之表現而產生破壞性。同時，其亦 局限於某些特定細胞，因此便無法適用於每一種應用方式 之中。 本發明提供了 一種基因表現用之新穎條件性系統，其係 特別具有選擇性以及有效率者。本發明系統之優點特性之 一便在於，其表現基因之能力並不是取決於某一細胞之類 型’而是根據某一特定細胞元素或某一特定生理狀況之存 在而定。本發明系統涉及雙專一性嵌合分子，其包含一個 能夠選擇性結合特定DNA序列之區域，以及一個能夠專一 性結合反式激活蛋白或反式激活複合體之偵測區域。 因此，更特定言之，本發明係關於雙專一性嵌合分子之 創造以及表現，其包含一個能夠選擇性結合特定（或目標 )DNA序列之區域（亦稱爲結合區域或是DNA'结合區域），以 及一個能夠專一性結合反式激活蛋白或反式抑制蛋白或反 式激活或反式抑制複合體之區域（亦稱爲偵測區域或是反 式激活蛋白-偵測區域）。 本發明的一類態樣係編碼如上定義雙專一性嵌合分子之 核酸序列，以及含有該核酸序列之表現載體。 -5- ^氏張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X297公釐) '^

A7 B7 五 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 、發明説明（ 本發明之另一態樣係基因表現用之條件性表現系統，其 包含（i)如上定義之雙專一性嵌合分子以及（li)表現基因盒 (cassette)，包含調節序列以及該基因之極限啓動子（其活2 取決於反式激活蛋白之存在）。 本發明之另一態樣係表現載體，其包含 -編碼本發明後合分子之核酸序列以及 -該表現基因盒。 本發明之條件性表現系統特別適用於基因或細胞治療， 以以高度選擇地導向所欲基因之表現。 因此，本發明系統之組成份之一便包含了 一或多個特定 之本發明雙專一性嵌合分子，其包含一個能夠選擇性結合 特定DNA序列之區域，以及一個能夠專一性結合反式激活 蛋白或反式激活複合體之區域。本發明分子之雙專一性， 在一方面，係在於其結合特定DNA序列（一般稱作操縱子或 是調節基因）之能力，同時，在另一方面，係在於其專一 ^生徵集反式激活或反式抑制蛋白域之能力，該能力使其可 以謗發或抑制基因之表現。 更特定T之，本發明係關於得以徵集任何轉譯因子之雙 專一性嵌合分子，該等因子之活化或是去活化能夠導致某 種生理病理狀況。本發明之雙專一性嵌合分子因此得以選 擇性地徵集對於某一生理病理狀態具有專一性之轉錄性反 式激活蛋白，使該等轉錄因子藉著該等分子與位於啓動子 附近之特定DNA序列（操縱子或是調節序列）的結合而與啓 動子連結，而因此條件性地表現基因（圖1 )。 • 6 - 本紙張尺度適财晒家標準（CNS ) A4規格（210x1^57 I 丨丨S-------、玎-----·#. (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 496873 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A7 五、發明説明（4 本發明亦關於非得以徵集帶有反式激活區域，但得以徵 集轉綠性反式激活複合體之分子之雙專一性嵌合分子，換 言 <，該轉錄性反式激活複合體即是在細胞中之目標分子 以及帶有反式激活區域之分子中間所形成之複合體（圖2: 。在此種情形下，該反式激活複合體較佳係藉由第二雙專 一性嵌合分子形成，該分子包含一反式激活區域以及一用 來與該細胞目標分子結合之偵測區域。此一第二分子的連 結使得該轉錄性反式激活二元複合體得以形成，然後，該 複合體再經由本發明雙專一性嵌合分子之偵測區域徵集。 此一三元複合體與啓動子附近之連結因此得以調節基因表 現。此種類型之建構使得本發明之用途得以有利地擴張至 任何缺乏反式激活區域之胞内分子，不論其係内生性分子 或例如係具有感染性來源之分子。 本發明I系統因此得以，藉由高度選擇性之偵測系統（ 「感應蛋白」），僅在目標蛋白存在的情形下活化所欲基 因之表現。該等目標蛋白可爲，舉例而言，在生理或生理 病理狀況中出現之轉錄因子、内生性分子或具有感染性來 源之分子。本發明之系統包含了一個非常敏感且具有高度 選擇性之偵測元件’其得以將基因之表現與細胞中任何分 子之存在、出現或消失產生連結。 於此’反式激活蛋白一詞係指轉綠性反式激活因子或是 含有轉錄性反式激活區域之蛋白質。反式激活複合體一詞 係指在細胞中存在之分子以及包含反式激活區域以及專一 性結合該分子之區域的本發明雙專一性嵌合分子中間所形 成之複合體。本發明之表現系統可用以徵集任何反式激活

本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格(21〇^^^T —-------------訂-----. (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 496873 A7 B7 五、發明説明（5 ) 蛋白或是任何帶有反式激活區域之蛋白質^特別是任何具 有病毒、寄生蟲、分枝桿菌或細胞來源，並帶有轉錄性反 式激活活性之蛋白質。具有病毒來源之較佳轉錄因子包括 HIV病毒之Tat蛋白質、乳頭狀瘤病毒（papilloma virus)之E6/E7蛋 白質以及埃普斯坦-巴爾病毒（Epstein-Barr virus)之EBNA蛋白 質。這些蛋白質皆具有一轉錄性反式激活區域，並且僅存 在於經該等病毒感染之細胞中，換言之，僅存在於某些特 定之生理病理狀況之下。本發明之條件性表現系統得以偵 測此生理病理狀況（藉由該等對於病毒感染具有特定性之 反式激活蛋白之存在的偵測），然後得以謗發一或多個特 定基因之選擇性表現。較佳之細胞反式激活蛋白包括突變 型或野生型之p53蛋白質。p53蛋白質含有393個胺基酸。在 野生型形式中，其係一種腫瘤抑制因子，能夠負向調控細 胞之分裂以及生長。該活性係與p53蛋白質結構中轉錄性反 式激活區域的存在相關，其位於該蛋白質之N端區域（約 爲殘基1-100)。在某些情形下，野生型之P53蛋白質亦可以 引發編程性細胞死亡（Yonish-Rouach et al·，Nature，352, 345_347)。 因爲這些特性皆是在細胞性DNA之原本狀態受到威脅的壓 力狀況下而受到操縱，已有人推測認爲P53是「基因組的護 衛」。突變之p53在大約40%之各式人類腫瘤中存在的事實 更加強了此一假設.，同時也爲此基因之突變在腫瘤發展中 所扮演的可能要角增加了份量（回顧報告見Montenarh， Oncogene，7, 1673-1680, 1992; Oren，FASEB J·，6, 3169-3175, 1992; Zambetti and Levine, FASEB J.，7, 855-865,1993)。根據本發明，便得以選擇 性地徵集p53蛋白質之反式激活區域，並因此僅於含有此一 蛋白質之細胞中謗發一或多個基因之受控表現。較佳者係 -8- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X297公釐） J-I^ -------、玎-----·— (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 4观73 A7 B7 五、發明説明（6 ) 專一性地徵集p53蛋白質之突變形式，其如上所指明者，僅 出現於細胞過度增生（癌症型）之生理病理狀況中。較佳者 ’此種導向作用係藉由對p53蛋白質突變形式具有專一性之 接$區域而達成。同時，在許多情形之下，亦存在有一種 事實上之專一性；這是因爲P53之突變形式具有遠大於野生 型形式之半生期，這使得它們發生累積。因此，含有P53突 變形式之細胞通常含有高度之p53總含量。 本發明之系統亦可藉著存在於細胞中之目標分子的偵測 而被用來謗發一或多著基因之選擇性表現。受偵測之分子 ，一般係爲蛋白質，較佳係爲一於不正常之狀況下（例如 ^感染或是過度增生）出現於細胞内的蛋白質。較佳之目 ，蛋白質包括特別、的病毒蛋白質，例如病毒之結構或是功 能蛋白質，舉例而言，如mv、肝炎或是疱疹病毒之蛋白 質。其亦可爲對於細胞過度增生之狀態而言具有專一性之 蛋白質，例如myC、f0S以及Jun蛋白或是細胞週期蛋白。 本發月丧"子的特性之—係在於其結合特定dna區域（ t縱子或調節區域）之能力。此種結合使其得以將徵集而 來<反式激活區域帶至啓動子附近，並且，如其結 活 化了置於該啓動子調控下之基因的表現。 、 ^在於本發明分子中，可選擇性結合一特定疆序列之 £域（斫稱爲「結合區域」或是厂DNA•結 般而言，本質上具有蛋白質來源者。」）係 醜序列交互作用之原核或眞核蛋白質衍生而來者 列、隹/ :同的基因以及結構研究現已使得在與雙股DNA序 互作用之蛋白質内明確定義出負責該等交互作用 < 域的工作成爲可能。 -9-

諸、 先 閱 讀_ 背 I 項 再 填 寫 本 頁 訂

本紙張尺準(CNS) Α4Μ^ 210X297公釐） 496873 A7 B7 五、發明説明（7 ) 與雙股DNA序列進行交互作用之較佳原核蛋白質包括細 菌抑制蛋白以及，較佳者，大腸桿菌四環徽素抑制蛋白以 及λ嗟菌體之Cro抑制蛋白。 大腸桿菌之四環黴素抑制蛋白（tetR)係一大約210胺基酸 之蛋白質。在大腸桿菌中，tetR負向控制著包含於tet操縱組 内，中介四環黴素抗性之基因的轉錄。在無四環黴素存在 的情形下，tetR抑制蛋白於一特定序列（其係稱作操縱子序 列或是Tetop)與DNA結合，並抑制了該抗性基因的轉錄。相 反的，在有四環黴素存在的情形下，tetR抑制蛋白不再與 tetop操縱子結合而容許該基因進行組成型轉錄（Hillen，W. and Wissman, A. (1989) in Protein-Nucleic Acid Interaction. Topics in Molecular and Structural Biology, eds，Saenger，W. and Heinemann，U. (Macmillan， London)，VoL 10, pp· 143-162)。tetR序列已被公開（見，舉例而言 ，WO94/04682)。tetR結合至（tetop) DNA之特定雙股DNA序列含 有下列單元： TCTCTATCACTGATAGGGA (序列編號 No. 1) 此單元可以重複多次以增加此系統之親合力以及效率。 因此，調節基因可，舉例而言，包含至多10個此種單元。 較佳者，其包含2個單元（Tetop2)或7個單元（Tetop7)(見圖3 ) 經濟部中央標隼局員工消費合作社印製 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 〇

Cro蛋白起初被定·義爲CI抑制蛋白表現之調節基因（Eisen, H. et al (1970) PNAS 66, pp 855)。cro 基因之選殖造成了 一具有 66 胺 基酸之蛋白質的辨識（序列編號No. 21; Roberts, T. et al (1977) Nature 270, pp 274) 〇 Cro藉由優先與λ OR3操縱子之結合而發揮 其生理角色。 -10- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X 297公釐） 經濟部中央標隼局員工消費合作社印製 496873 A7 B7 五、發明説明（8 )

Cro結合至DNA(區域稱作0R3)之特定雙股DNA序列含有下 列鹼基： TATCACCGCAAGGGATA (序列編號 No· 2) 此單元可以重複多次以增加此系統之親合力以及效率（見 圖4)。 可用於本發明分子之建構，與雙股ONA區域交互作用之 較佳眞核蛋白質包括衍生自STAT、p53或NFkB蛋白之蛋白質 或區域（InoueetaL，PNAS89(1992)4333)。就p53蛋白質而言，其 DNA-結合區域係位於該蛋白質之中央區域，而，更特定言 之，係在介於胺基酸102及292之間的區域（Pavletich et al.，Genes & Dev· 7 (1993) 2556)。 如上所指明者，存在於本發明分子中，可選擇性結合一 特定DNA序列之區域較佳係衍生自能夠與雙股DNA區域交 互作用之原核或眞核蛋白質。用於本發明分子建構之區域 可包含，例如，含有與DNA行交互作用之區域的完整蛋白 質或是其片段。此區域已在許多不同之蛋白質之中被辨識 出來，特別是 TetR(見，舉例而言，Berens et al· J· Biol· Chem. 267 (1992) 1945)。其亦可包含此等蛋白質或片段之衍生物，該 衍生物仍保有該蛋白質或片段之DNA-結合特性。此等衍生 物，例如，可爲具有一或多個胺基酸修飾之蛋白質，如爲 了使其得以與本發明分子之其他區域融合；此等衍生物可 根據習知之分子生物技術製備而成。TetR以及Cro蛋白之衍 生物，舉例而言，已述於文獻之中，其具有點突變及/或 缺失（Hecht et al，J. Bact 175 (1993) ρ· 1206; Altschmied et al·，EMBO J, 7 (1988) 4011； Baumeister et al.3 Proteins 1 (1992) 168; Hansen et al.5 J. Biol -11 - 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) M規格（210X297公釐） ~- J -------、玎----- (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 496873 A7 B7 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 五、發明説明（9

Chem. 262 (1987) 14030)。然後，該等衍生物結合特定dna序列 之能力可先接種以調節序列製備出之衍生物，在偵測形成 之複合體而加以試驗。除此之外，該等衍生物亦可爲具有 增強之DNA-結合特性的蛋白質（例如，改自夕* 二^ 民心寻一性或是 親合力）。一般而言，此等衍生物與天然蛋白質或其片段 之間具有高度的一致性；例如至少70%、至少8〇%、至= 90%、至少95%或至少99%之一致性。 根據一較佳之具體實例，存在於本發明分子内之結合區 域係衍生自一原核蛋白質。此種類型之架構係特別 ，因爲這些非人類來源之蛋白質可以辨識長度至少爲14核 棼酸之雙股DNA位點。在人類基因組中發現相同序列之^ =性幾乎爲零，因此，所得到之表現系統對於本發明之調 節基因而言，相對於宿主細胞基因組中的序列來説，是具 有高度選擇性的。 ^ 在一較佳的具體實例中，存在於本發明分子内之結合區 域係衍生自tetR或Cm蛋白質。較佳者係使用完整的tetR=Cr〇 蛋白質（序列編號No. 21)。 存在於本發明分子内，可專—性結合轉錄性反式激活蛋 白或是反式激活複合體之區域（亦稱作偵測區域）可以是任 何合適的類型。其可特別爲—個低聚化區域，纟中該反式 激活蛋白或是反式激活複合體亦含有一個這樣的區域。其 亦可以是任何合成的或是天然的區域，其可與反式激活蛋 白或是反式激活複合體進行交互作用。或者，其可爲抗體 或是片段或其衍生物，其可直接對抗反式激活蛋白或是反 本紙張尺度itW關家縣（CNS ) J ^ 、玎 _臂 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) -12· 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 496873 A7 B7 五、發明説明（10 ) 式激活複合體。 本發明較佳之低聚區域包括，舉例而言，白胺酸拉鍊 (leucine zipper)、SH2區域以及SH3區域。白胺酸拉鍊係兩親性 α螺旋，其包含每7胺基酸中4或5白胺酸之週期性安排。 此種週期性使得白胺酸的位置大約皆在α螺旋之相同位置 ，因此而使兩個拉鍊域間得以進行二聚化作用。二聚化作 用係由兩鄰接拉鍊域之白胺酸侧鏈間的疏水作用維持（Vogt et al.，Trends in Bioch. Science 14 (1989) 172)。SH2 區域已知可與特 定肽序列進行交互作用，該等肽序列於酪胺酸上經過磷酸 化。SH3區域可用來與任何含有一相當富含脯胺酸之肽的 反式激活蛋白或是反式激活複合體形成低聚物（Pawson et al.， Current Biology 3 (1993) 434)。亦可使用能夠謗發低聚作用之蛋 白質域，例如p53蛋白質之C-端區域。此一區域的使用可以 選擇性地徵集存在於細胞中之p53蛋白質。含有胺基酸320_ 393(序列編號No· 3)、302-360或302-390之p53區域爲較佳者。 較佳之合成或天然區域，其可以與含有目標反式激活組 成份之分子進行交互作用者包括與p53蛋白質進行交互作用 之MDM2蛋白質區域。此種結構使其可以徵集野生型或是 突變之p53蛋白質作爲反式激活蛋白。 本發明專一性結合轉錄性反式激活蛋白之較佳區域包含 抗體或是抗體片段或其衍生物。合適之抗體片段或其衍生 物係，例如，Fab或F(ab)'2片段、抗體之VH或VL區域以及單 鏈抗體（ScFv)，其含有藉由一臂與VL區域連接之VH區域。 此種類型之區域是特別有利的，因爲其可以直接對抗任何 -13 _ 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X 297公釐） (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) $ ϋ—·— ait m· ·ϋϋ in··——y miMmMm §1 -in·— -111 >ϋϋ— 責 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 496873 A7 B7 五、發明説明（11) 分子。 抗體是免疫球蛋白超家族的分子，其包含各式之鏈（2重 鏈（H)以及2輕鏈(L))，該等鏈之本身是由許多不同的區域組 成（例如可變區域（V)以及連接區域（J))。存在於本發明分子 中，用來結合反式激活蛋白或是反式激活複合體之偵測區 域較有利地包含抗體片段或者是其衍生物，其至少含有抗 原結合位點。此片段可以是輕鏈之可變區域（VL)或是重鏈 之可變區域（VH)，選擇性地以Fab或F(ab)’2片段的形式存在或 是，較佳者，以單鏈抗體（ScFv)的形式存在。用於建構本發 明分子之單鏈抗體包含相當於抗體輕鏈可變區域結合位點 之肽，其藉由一肽臂，與相當於抗體重鏈可變區域結合位點 之肽連接。編碼根據本發明此種經修飾抗體之核酸序列的建 構已述於，例如，US 4,946J78、W094/02610 以及 W094/29446。 其亦在實施例中説明。 根據本發明之較佳後合性架構包含一結合p53蛋白質之區 域，更佳者爲直接對抗p53蛋白質之抗體或抗體衍生物。一 特定具體實例包含了直接對抗p53蛋白質之單鏈抗體。根據 特定實施例的方法，具有序列編號No. 4序列之ScFv爲較佳者 (其建構述於實施例中）。 DNA結合區域與反式激活蛋白結合（偵測）區域一般係以一 臂互相連接。此臂一般含有一肽，其爲本發明分子之兩個區 域提供了足夠的彈性，使其能夠獨立作用。該肽一般係，大 部分或是全部，由無電荷之胺基酸組成，其不會干擾本發明 分子的活性，像是，如甘胺酸、絲胺酸、色胺酸、離胺酸或 -14- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) Α4規格（210Χ297公釐） (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) ϋϋ- —ϋ —ϋ -^ϋ ·ϋϋ ϋ^—·-·—r —Μϋ ϋ_ϋ ϋϋ ϋϋ 、τ 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 496873 A7 _ B7 五、發明説明（12 ) 脯胺酸。該臂一般包含自5至30胺基酸而較佳者，自5至20胺 基酸。可用於本發明分子建構之肽如： -GGGGSGGGGSGGGGS (序列編號 No. 5) -PKPSTPPGSS (序列編號No. 6)，其編碼序列係CCCAAGCCC AGTACCCCCCCAGGTTCTTCA(序列編號 No. 6)。 根據本發明之分子的較佳實例係如下（a) _(j)所述者。 a ) ScFv-標記(tag)-鉸鏈(Hinge)-TET或 Cro(圖 5A) 此類型之分子包括： -結合反式激活蛋白之區域，該區域包含一單鏈抗體； -可被單純系抗體辨識之標記肽序列，其使該分子得以接 受免疫偵測。該序列可爲，例如，MNRLGK序列之VSV抗原表 位（序列編號No. 7)，其編碼序列爲ATGAACCGGCTGGGCAAG( 序列編號No. 7)或序列EQKLISEEDLN之myc抗原表位（序列編號 No_ 8)，其編碼序列爲 GAACAAAAACTCATCTCAGAAGAGGATCT GAAT(序列編號No. 8)，其可以由抗體9E10辨識； -具有序列編號No. 6之肽臂（鉸鏈）；以及 -含有TET或Cro蛋白質之DNA-結合區域。較佳者，直接對 抗p53蛋白質之ScFv。 b ) ScFv-鉸鏈-TET或 Cro(圖 5B) 此種類型之分子包含與分子a)相同之元件，除了其缺乏 標記序列。 c ) ScFv-TET或 Cro(圖 5C) 此種類型之分子包含一結合反式激活蛋白之偵測區域， 該偵測區域包含一單鏈抗體；以及一含有TET或Cro蛋白質 -15· 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X297公釐） J ^««、玎 ··! (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 4观73 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A7 五、發明説明（13 ) 之DNA結合區域。其並不含有臂或是標記序列。在此種建構 之中’反式激活蛋白結合區域係位於該分子的N _端部份， 而DNA結合區域係位於c -端部份。 d ) TET或 Cro-ScFv(圖 5D) 此種類型之分子與上述類型c)相似。不同之處在於區域 <排列：反式激活蛋白結合區域係位於該分子的c-端部份 ，而DNA結合區域係位於N-端部份。 e ) TET或 Cro-鉸鏈-ScFv(圖 5E) 此種類型之分子含有與上述類型b)相同的元件。不同之 處在於區域t排列：反式激活蛋白結合區域係位於該分子 的C - #伤，而DNA結合區域係位於n _端部份。 f)低聚序列（Oligom)-標記(tag)-鉸鏈(Hinge)-TET 或 Cr〇(圖 5A) 此種類型之分子與上述類型a)相似，除外該反式激活蛋 白結合區域係以可與P53蛋白質（序列編號N〇 3)進行低聚作 用t區域取代。此分子得以徵集出現於許多腫瘤細胞中的 突變p53蛋白質。 g )低聚序列-鉸鏈-TET或Cro(圖5B) 此種類型之分子與上述類型b)相似，除外該反式激活蛋 白結合區域係以可與p53蛋白質（序列編號N〇3)進行低聚作 用之區域取代。 h )低聚序列_TET或Cro(圖5C) 此種類型之分子與上述類型e)相似，除外該反式激活蛋 白結合區域係以可與p53蛋白質（序列編號N〇3)進行低聚作 用之區域取代。 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 、11

496873 Α7 Β7 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 五、發明説明（14 i ) TET或Cro-低聚序列（圖5D) 此種類型之分子與上述類型c)相似，除外該反式激活蛋 白結合區域係以可與p5 3蛋白質（序列編號N〇 3)進行低聚作 用之區域取代。 j ) TET或Cro-鉸鏈-低聚序列（圖5D) 此種類型t分子與上述類型❹）相似，除外該反式激活蛋 白結合區域係以可與p53蛋白質（序列編號N〇 3)進行低聚作 用之區域取代。 在每個該等分子中’肽臂’存在時，可選擇性地經序列 (G4S)3(序列編號Νο·5)取代。 本發明（另一態樣係編碼本發明嵌合分子之核酸序列。 其較佳者爲DNA序列，特別是_Α。其亦可爲_。本發 明之序列一般係在選殖載體中，根據習知之分子生物技術 ，組合編料區域之序列而㈣。本發明之核酸序列可選 擇性地受到修飾，例如，化學性修飾、酶修飾或是基因修 飾，以產生區域，其爲穩定者，及/或多功能者，及/或 尺寸較小者，及/或帶有促進該等分子存在於某特定胞内 區隔中的目標。因此，本發明核酸序列可包含編碼核定位 肽之（NLS)序列。特定言之，可將本發明序列與編碼卿病 毒（NLS序列融合，該则之肤序列爲pKKKRKv(序列編號·9) ( Kalderon et al·，Cell 39 (1984) 499)。 根據本發明之核酸序列較佳者係包含在—表現载體中， 其可爲，例如，質體或病毒。 a 本發明之另-標的係一融合蛋白，其包含轉錄性反式激 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) $ -訂

-17- 本紙張尺度適财_ 2丨0 X 297公釐_Γ 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 496873 A7 B7 五、發明説明（15 ) 活蛋白區域以及專一性結合特定分子之區域，其選擇性地 以肽臂連結，以及任何編碼該等融合蛋白之核酸序列。該 反式激活蛋白區域可衍生自任何轉綠性反式激活蛋白，例 如 p53、VP16、EBNA、Et/E7或 Tat。 本發明之另一態樣係基因之條件性表現用之系統，其包 含： -如上所述之本發明後合分子以及 -表現基因盒，包含調節序列、該基因之極限啓動子以 及所欲表現之基因。 該表現基因盒包含了以反式激活蛋白或是反式激活複合 體（其係由該雙專一性嵌合分子所徵集而來者）活化該基因 表現之所有必要元件。因此，該調節序列係爲所表現之嵌 合分子的DNA結合區域。當該嵌合分子之DNA結合區域係 TetR之全部或部分之時，該調節序列便包含序列編號No. 1之 序列或其衍生物，其選擇性地重複一或多次。其較佳者爲一 op2(含有2重複之Tetop單元）或是op7序列（含有7重複之Tetop單 元，其述於，例如，Weinmann et al.，The Plant Journal 5 (1994) 559) 。同樣地，當該嵌合分子之DNA結合區域係Cro之全部或部分 之時，該調節序列使包含序列編號No.2之序列或其衍生物， 其選擇性地重複一或多次。其較佳者爲序列0R3。序列編號 No. 1或序列編號No. 2之序列衍生物可爲藉由基因修飾取得之 序列（例如，藉由突變、缺失、附加或重複而取得者），並保 留專一性結合某蛋白質之能力。此等衍生物已述於文獻中 (Baumeister et al·，於上引述者，Tovar et al.5 Mol. Gen· Genet· 215 (1988) 76, -18- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X 297公釐） (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)

經濟部中央標準局員工消費合作社印製 496873 Α7 Β7 五、發明説明（16) WO94/04672) 〇 極限轉錄啓動子係爲一啓動子，其活性係取決於反式激活 蛋白之存在。因爲如此，在缺乏嵌合分子之時，該啓動子係 非活化的，而該基因也不會表現，或是幾乎不表現。相反的 ，在嵌合分子存在之時，其所徵集之反式激活蛋白或是反式 激活複合體得以謗發極限啓動子的活性，而因此謗發所欲基 因之表現。極限啓動子通常包含一 INR或是TATA框（box)。該 等組成份係在反式激活蛋白的存在下表現基因的基本組成份 。極限啓動子可以基因修飾而自任何啓動子製得。此種啓動 子之較佳實例係衍生自胸甞激酶（TK)基因啓動子之極限啓動 子。因此，衍生自TK啓動子之極限啓動子可包含，例如，核 甞酸-37至+19。該極限啓動子亦可衍生自人類CMV啓動子。 特定言之，其可包含CMV啓動子之核茹酸-53至+75或-31至+75 。然而，任何適宜之啓動子皆可被用來提供極限啓動子，例 如編碼氯黴素乙醯轉移酶、β -半乳糖甞酶或是螢光素酶之基 因的啓動子。 該表現基因盒較佳者含有下列元件： -作爲調節序列，一含有序列編號No. 1或序列編號Νο.2之 序列或其衍生物的序列，其選擇性地重複一或多次， -作爲極限啓動子.，一衍生自胸苷激酶（ΤΚ)基因啓動子之 極限啓動子，以及 -所欲表現之編碼序列。 更佳者，該極限啓動子包含胸甞激酶基因啓動子之核甞酸-37至+19 〇 -19- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X 297公釐） ^ϋ· Hal n 111 -: ml -- n^i In nn In ml^"J- - ---- In - - HI i^—· In · •w .«* (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 496873 A7 _ B7 五、發明説明（17 ) 較佳者，該表現基因盒具有Tetop2.TK-基因；Tetop7.TK-基因 或OR3.TK-基因之結構。 本發明之另一態樣係一表現載體，其包含編碼本發明嵌 合分子之核酸序列以及一如上所述之本發明表現基因盒。 在本發明之載體中，編碼該嵌合分子以及該表現基因盒之 核酸序列可以同向或是反向出現。該載體可爲，例如，質 體或病毒。 較佳之病毒載體包括腺病毒、逆轉錄病毒、疱疹病毒以 及腺相關病毒（AAV)。根據本發明之病毒係缺陷的，亦即 ，其無法在目標細胞中進行自主複製。一般而言，用於本 發明之缺陷病毒基因組因此缺乏至少一段序列，其爲該病 毒於受感染細胞中進行複製所需者。該等區域可以被除（ 全部或部分）或止去功能，或者可以被其他序列取代，特 別是本發明之序列。然而，較佳者，該缺陷病毒仍保留其 基因組中，病毒顆粒衣殼化作用（encapsidation)所需之序列 〇 各種血清型腺病毒已被辨識出來，其結構或是特性皆有 某部分之不同。在這些類型之中，人類腺病毒之類型2及 5 ( Ad 2或Ad 5)或動物性來源之腺病毒（W094/26914)爲較佳者 。較佳之動物性來源腺病毒包括源自犬、牛、鼠（例如： MAVI，Beard etal.，Virology 75 (1990) 81)、羊、豬、鳥類以及猿 類（例如：SAV)之腺病毒。較佳者，該動物性來源之腺病 毒爲犬腺病毒，更佳者爲CAV2腺病毒[例如曼哈頓菌種 (manhattan strain)或 A26/61( ATCC VR-800)]。較佳者，以本發明 -20- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X297公釐） (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)

496873 A7 B7 五、發明説明（18 ) 之目的而使用人類或犬或混合來源之腺病毒。 較佳者，本發明之重組腺病毒基因組至少包含一腺病毒 之ITRs及衣殼化作用區域，以及編碼本發明嵌合分子以及 表現基因盒之核酸序列。更佳者，在本發明之腺病毒基因 經中，至少該E1區域係無功能的。該病毒基因，包括E1， 可以由熟習此技藝之人士所知之任何技術去功能，特別是 藉由全抑制（total suppression)、一或多個驗基之取代（例如以 本發明之序列取代）、部分缺失或是添加。此等修飾可於 ，例如，活體外（在分離出來之DNA上）或是在原位，以基 因工程技術，或者，以致突變劑處理而獲得。其他區域亦 可已被修飾，例如 E3(WO95/02697)、E2(W094/28938)、 E3( W094/12649, WO95/02697)以及 E5( WO95/02697)區域。根據一 較佳之具體實例，根據本發明之腺病毒包含在El及E4區域 之缺失。根據其他之較佳實例，其包含一E1區域之缺失， 而在該缺失中插入了 E4區域以及本發明之序列（參見FR 94 13355或對應之南非申請案No. 95/9086)。 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 根據本發明之缺陷重組腺病毒可以由熟習此技藝之人士 所知之任何技術製備（Levrero et al，Gene 101 (1991) 195, EP 185 573; Graham, EMBO J. 3 (1984) 2917)。特定言之，其可以腺病毒以及 帶有，特別是，本發明序列（編碼嵌合分子以及表現基因 盒之序列）之質體之間的同源重組製備。同源重组發生於 該腺病毒與質體共轉染而進入適當之細胞系中之後。所用 之細胞系較佳者應爲（i )可被該等元件轉形者，且（i i )包含 可補足該缺陷腺病毒基因組部分之序列，較佳者爲以整合 -21 - 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X297公釐） 496873 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A7 B7 五、發明説明（19 ) 形式存在’以避免產生重組的風險。較佳之細胞系包括人 類胚胎腎臟細胞系 293( Graham et al·，J· Gen. Virol· 36 (1977) 59)，其 包含整合於其基因組中之Ad5腺病毒基因組左半部分（12%) ，·以及可補足E1及E4功能之細胞系，例如述於W0 94/26914 或 W0 95/02697 中者。 接下來’根據習知之分子生物技術回收並純化經複製之 腺病毒’例如實施例中所例示之技術。 腺相關病毒（AAV)係相對而言較小的DNA病毒，其以穩定 且具有位點專一性的方式整合進入其所感染之細胞基因組 中。其可感染許多種類之細胞，卻不會對細胞之生長、形 態或是分化造成任何之影響。同時，其似乎與人體中之病 理狀況無闕。AAV基因組已被選殖、定序及定性。其包含 大約4700鹼基，並於每一端包含一約145鹼基之反向重複區 域（inverted repeat region, ITR)，其係作爲該病毒之複製起點。 該基因組剩餘的部分則被分成2帶有衣殼化功能之基本區 域：該基因組的左半部分，包含涉及病毒複製以及病毒基 因表現之rep基因；該基因組的右半部分，包含編碼病毒衣 殼（capsid)蛋白之cap基因。 AAV-衍生載體在活體外以及活體内之基因轉移用途以述 於文獻之中（特別參見 WO91/18088, WO93/09329, US 4,797,368, US 5,139,941，EP 488 528)。該等應用述及各式之AAV-衍生建構， 於其中，rep及/或cap基因被除去，並以所欲基因取代，以 及其在活體外（於培養物中的細胞上）以及活體内（直接在 生物體内）轉移所欲基因用途。根據本發明之缺陷重組 AAVs的製備可以（i) 一質體’其含有以兩AAV反向重複區域 -22- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（21〇X297公釐） (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) -------訂----

經濟部中央檩準局員工消費合作衽印製 496873 A7 B7 五、發明説明（20 ) (ITR)加寬之本發明核酸序列（編碼嵌合分子以及表現基因 盒之序列），以及（ii) 一質體，其帶有AAV衣殼化作用基因 ，共轉染進入一受到人類疱疹病毒（例如腺病毒）感染之細 胞系中進行。再以習知技術回收並選擇性純化製備出之重 組 AAVs 〇 重組痕療病毒以及逆轉錄病毒載體之建構已廣泛述於文 獻之中··特別參見 Breakfield et al.5 New Biologist 3 (1991) 203; EP 453242, EP 178220, Bernstein et al.? Genet. Eng. 7 (1985) 235; McCormick, BioTechnology 3,（1985) 689。 逆轉綠病毒係整合型病毒，其選擇性地感染分裂之細胞 。因此，其對於癌症之應用特別有價値。逆轉錄病毒之基 因組基本上包含兩LTRs、一衣殼化作用序列以及三編碼區 域（gag、pol以及env)。在衍生自逆轉錄病毒之重組載體中， gag、pol以及env基因一般皆被移除，全部或部分，並以一所 欲之異源核酸序列取代。該等載體可由各種類型之逆轉錄 病毒製備而來，例如MoMuLV(「莫隆尼鼠白血病病毒 (murine moloney leukaemia virus)；亦稱爲 MoMLV」）、MSV(「莫 隆尼鼠肉瘤病毒（murine moloney sarcoma vims)」）、HaSV(「哈 維肉瘤病毒（harvey sarcoma vims) J )、SNV(「脾壞死病毒 (spleen necrosis virus)」）、RSV(「茹斯肉瘤病毒（Rous sarcoma virus)」）以及弗蘭德病毒（Friend’s virus)。 爲建構根據本發明之重組逆轉綠病毒，通常先建構一含 有LTRs、衣殼化作用序列以及本發明序列（編碼嵌合分子以 及表現基因盒之序列）之質體，再以其轉染稱爲衣殼化作 用細胞系（encapsidation cell line)之細胞系，其可以提供該質體 所缺陷之逆轉錄病毒功能。一般而言，該衣殼化作用細胞 -23- 本^尺度適用中國國家標準（〇奶）人4規格（210乂297公釐） ^ (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂

經濟部中央標準局員工消費合作社印製 496873 A7 B7 五、發明説明（21 ) 系因此能夠表現gag、po丨以及env基因。適合之衣殼化作用細 胞系爲 PA317細胞系（US4,861J19)、PsiCRIP細胞系（W090/02806) 以及GP+envAm-12細胞系（W089/07150)。同時，該重組逆轉綠 病毒可包含LTRs中之修飾以抑制其轉錄活性，以及延伸之 衣殼化作用序列，其包含部分之gag基因（Bender et al·，J· Virol. 61 (1987) 1639)。再以習知技術回收並選擇性純化製備出之 重組逆轉錄病毒。 建構根據本發明之缺陷重組病毒（逆轉錄病毒）的實例之 一示於圖8。此益加強調了根據本發明之建構物的優點， 亦即在該衣殼化作用細胞系中並無所欲基因之表現。因爲 這些細胞系中並無爲本發明系統徵集而來之反式激活蛋白 或是反式激活複合體，啓動子便是未活化的，而該基因便 不會在該生產細胞中表現（圖8A)。僅有在病毒有效感染一 目標細胞之時，其係指一於其中存在有由本發明系統徵集 而來之反式激活蛋白或是反式激活複合體之細胞，該基因 始會有效地進行表現（圖8B)。這對於含有某些基因之病毒 建構而言特別有利，該等基因之表現係對細胞而言具有毒 性者（例如，Grb3-3、ΠΧ2及白喉毒素基因）。 對於本發明之目的而言，較佳者係使用一缺陷重組逆轉 綠病毒或腺病毒，因爲該等病毒具有特別利於將基因轉移 至腫瘤細胞中之特性。 各式類型之非病毒載體亦可以爲本發明之目的而使用。 本發明之條件性表現系統可被插入一非病毒體中，其可以 促進核酸在眞核細胞中的轉移以及表現。化學性以及生化 性載體可爲較病毒載體爲佳者，特別是因爲其方面性及安 -24- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X297公釐） (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂

經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A7 ~~ ----~ -- —_—B7 五、發明説明（22 ) 全性’亦因爲其於被轉染之DNA的大小並沒有理論上之限 制。 該等5成載體具有兩基本功能：（丨）集中欲轉染之核酸； 以及（1 1 )促進其細胞性連結以及其對於細胞膜之穿透以及 ’在適當之處，對兩核膜之穿透。爲了克服核酸多陰離子 之天然性質，此等合成載體一般皆具有多陽離子之電荷。 較佳之合成載體包括聚離胺酸之陽離子聚合物、①KLKh 、（LKKL)n、聚（氮丙啶）以及葡聚糖類型，以及陽離子脂質 或脂轉染物（lipofactant)。其具有濃縮DNA以及增進其與細胞 膜之連結的特性。較佳之陽離子脂質/脂轉染物包括脂多 胺（例如’脂轉染胺、轉染胺（等等）以及各式陽 離子或中性脂質（例如，D0TMA、D0GS、D〇PE)。近來，以 受體中介之導向轉染的概念已被建立，其包含使用，例如 ，陽離子聚合物濃縮DN A，同時以該陽離子聚合物與膜受 體配位體間的化學性偶合引導該複合體與細胞膜之連結， 該受體系存在於所欲導向之細胞種類的表面。舉例而言， 以此種方式進行得以導向至鐵傳遞蛋白（transferrin)及胰島素 义體’以及肝細胞脱唾液酸糖蛋白（aSial〇glyc〇pr〇tej[n)受體。 本發明亦提供一種醫藥組合物，其包含本發明載體。該 等組合物可爲任何投藥形式而調配，例如，局部、口服、 腸外、鼻内、靜脈内、肌内、皮下或眼内投藥。較佳者， 根據本發明之醫藥組合物包含一種醫藥上可接受之载劑、 、輔劑或賦形劑，更佳者爲可注射製劑之醫藥上可接受者 。其可爲等滲鹽溶液，一般爲無菌者（例如，磷酸二氫納 -25- 本紙張尺度適财關家縣（CNS ) A4規格（21GX297公董) — (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂

496873 A7 B7 五、發明説明（23 ) 或磷酸氫二鈉、氯化鈉鉀、氯化鈣或氯化鎂或其混合物） ，或是乾燥，特別是冷凍乾燥組合物，其在添加，取決於 不同之情形，無菌水或生理食鹽水之時，得製備出可注射 溶液。當本發明載體爲逆轉錄病毒時，其較佳係直接使用 衣殼化作用細胞或是於活體外接受感染並設計重新植入活 體中之細胞，其選擇性地可爲新器官之形式（W094/24298) 〇 用於注射之劑量可根據各式之參數調整，特別是根據所 用之投藥方式、相關之病狀或是所欲之治療期間。一般而 言，根據本發明之重組病毒皆係以介於104及1〇14Ρ_1之劑 量形式調配及投藥。對於AAVs以及腺病毒，106及1010 piU/ml 之劑量亦可使用。pfU—詞（「溶菌斑形成單位（plague forming unit) J )相當於病毒顆粒懸浮一之感染能力，其測定係藉著 對於適當細胞培養物之感染，再量測，通常在48小時之後 ，受感染細胞之溶菌斑數量而進行。檢驗病毒溶液P&效價 之技術已明白記載於文獻之中。 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)

本發明之表現系統及載體對於細胞或基因治療期間，所 欲基因表現之調控而言特別有用。因此，其可被用於控制 任何所欲編碼序列之表現，特別是編碼治療用產物之序列 ，該等產物可爲，.例如，肽、多肽、蛋白質或核糖核酸。 較佳者，該基因係核酸序列，更佳者，其係DNA序列（例如 ，cDNA、gDNA或合成DNA，其可以是，例如，人類、動物 或植物來源者），該核酸序列編碼蛋白質產物，例如，酶 ;血液衍生物；荷爾蒙；淋巴因子，如白血球間素、干擾 -26- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X 297公釐） 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 496873 A7 __B7 五、發明説明（24 ) 素或TNF( FR 9,203，120);生長因子；神經傳導素或其前體， 或其合成用之酶；營養因子，如BDNF、CNTF、NF、IGF、aFGF 、bFGF、NT3 或 NT5 ;載脂蛋白，如 ΑροΑΙ、ApoAIV 或 ApoE( FR 93 05125);營養不良蛋白或小營養不良蛋白（[119，111，947);腫瘤 抑制基因物產物，如 p53、Rb、RaplA、DCC或 k-rev(FR 93 04745) ，·編碼涉及凝血之因子的基因產物，如因子νπ、vm或IX ;天 然或人造免疫球蛋白之全部或部分（例如Fab ScFv);或RNA配 位體（W091/19813)。 在此，包含於本發明表現基因盒中之本發明基因係以許多 適當之等位詞描述。其包括「基因J 、 「所欲基因J 、 「核 酸序列」、「所欲核酸序列J以及「所欲編碼序列」。熟習 此技藝之讀者皆可明白此等詞彙，以及其他類似之詞，皆爲 相互等位者。 所欲基因亦可爲一反義序列，其於目標細胞中之表現使其 得以控制控制基因之表現或是細胞mRNA之轉錄。舉例而言 ，此等序列可在目標細胞中，轉綠成與細胞mRNAs互補之 RNAs，因此阻礙了其轉譯爲蛋白質之過程（EP 140308)。 在適當之時，特別是在所欲基因係利用逆轉錄病毒載體 傳送之時，所欲基因可包含RNA。 本發明特別適用於編碼毒性產物之序列的表現。特定言 之，其可爲細胞毒物（例如白喉毒素、假單胞菌毒素、蓖 麻毒蛋白A )、造成對外界物之敏感性的產物（例如自殺基 因產物，如胸苷激酶以及胞嘧啶去胺酶基因）或者可造成 細胞死亡之殺手基因（例如Grb3-3 (PCT/FR94/00542)或ScFv抗-ras -27- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X 297公釐） (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)

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發明説明（ 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 (W094/29446))。本發明之系統使其得以製備載體，特別是 病毒載體，其含有該等基因但不會對用於製備該等載體之 細胞造成毒性之問題，然後再選擇性地於具有所需反式激 活蛋白或是反式激活複合體之目標細胞中，謗發該等毒性 分子之表現。因此’本發明之載體特別適用於治療，特別 是其目標爲選擇性地破壞受感染之細胞時。本發明之系統 亦對於細胞因子的表現特別有利（例如干擾素、TNF* TGF) ，其於非調控情形之下的生成具有顯著的副作用。 本發明以下列實施例説明。 圖式説明 圖1 :根據本發明之條件性表現系統代表圖，其得藉由 低聚化區域（A)或ScFv(B)選擇性徵集反式激活蛋白。 圖2 :根據本發明之條件性表現系統代表圖，其得以選 擇性徵集反式激活複合體。 ' 圖3 :根據本發明之表現基因盒代表圖，其包含調節序 列Tetop7、極限啓動子（TATA框）以及基因（CAT)。 圖4 ··根據本發明之表現基因盒代表圖，其包含調節序 極限啓動子（TATA框）以及基因（CAT)。 根據本發明之雙專一性喪合分子代表圖。 編碼根據本發明雙專一性嵌合分子之DNA的建構。 調控嵌合建構物之代表圖。 圖8 :根據本發明之病毒載體（逆轉錄病毒）的結構以及 功能。 列OR3 圖5 圖6 圖7 二般分子生物技術 -28 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210 X 297公釐） (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁} -訂

經濟部中央標準局員工消費合作社印製 496873 A7 ____B7 _ 五、發明説明（26 ) 一般之分子生物技術已述於文獻之中（Maniatis et al.，1989) ’ 例如質體DNA在氣化铯-溴化乙錠梯度中之離心、核酸之限 制酶切割、凝膠電泳、大腸桿菌中之轉形以及沈澱。 酶係由 New-England Biolabs (Beverly，MA)提供。爲進行連結’ 在0.8至1.5%之瓊脂凝膠上根據其大小分離DNA片段，以 GeneClean (BIO101，LaJolla CA)純化，並於 50 mM之 tris HC1缓衝液 (pH7.4，包含 10 mM MgCl2, 10 mM DTT，2 mM ATP)中，在 T4噬菌 體連結酶的存在下，於14°C隔夜放置。 PCR(聚合酶連鎖反應）複製亦根據進行，其具有下列條 件限定·· -MgCl2之濃度調整至8 mM。 -變性溫度95°C，雜交溫度55°C，延伸溫度72°C。於PE9600 熱循環器（Perkin Elmer，Norwalk CO)中重覆此循環25次。 寡核甞酸之合成係利用β位經氰乙基保護之磷醯胺化學 (Sinha et al” 1984, Giles 1985)，以 applied biosystem model 394 自動 DNA 合成器（Applied Biosystem，Froster City CA)，根據製造商之建議進 行。 核酸之定序係於雙股樣板上，以鏈中止法，使用螢光引 子進行。吾等使用購自Applied Biosystem之定序Taq Dye Primer Kit (Applied Biosystem，Froster City CA)，根據製造商之説明使用。 實施例 實施例1 :表現基因盒之建構，其包含調節基因、極限轉 錄啓動子以及基因 U.質體 pTETop7/CAT建構 -29- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X 297公釐） (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)

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496873 A7 B7 五、發明説明（27 ) 質體pTETop7/CAT含有下列組成物（圖3 ): -調節基因，其係由一可與四環黴素抑制蛋白TetR作用之 序列組成，該抑制蛋白係由7重覆之Tetop基序組成（序列編 號 No. 1); -極限啓動子，其係衍生自胸甞激酶基因之啓動子（帶有 TATA框之-37至+19區域）； -編碼氯黴素乙醯轉移酶（CAT)之序列，其受到該極限啓動 子之控制。 此質體之建構係藉由將質體pUHD10-7(WO94/29442)之Smal-Bglll 片段選殖進入事先以Smal及BamHI切割之質體pKK232-8( Pharmacia)進行。 1.2.質體pOR3/CAT建構 質體p〇R3/CAT含有下列組成物（圖4 ): -調節基因，其係由一可與Cro抑制蛋白作用之OR3序列組 成（序列編號No. 2); -極限啓動子，其係衍生自胸甞激酶基因之啓動子（帶有 TATA框之-37至+19區域）； 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) -編碼氯黴素乙醯轉移酶（CAT)之序列，其受到該極限啓動 子之控制。 此質體係以下列方式建構而成··以人工合成與Cro抑制蛋 白作用之OR3序列。爲進行之，下列兩寡核苷酸被合成：

Oligo 5533 (序列編號 No· 22): 5 ' - GATCCTATCACCGCAAGGGATAA- 3 '

Oligo 5534 (序列編號 No. 23) ’· -30- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X 297公釐） 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 496873 A7 B7 五、發明説明（28 ) 5 1 - GATAGTGGCGTTCCCTATTTCGA- 3 f

再將此兩寡核苷酸雜交以重新建構雙股0R3序列，其爲 使其得以下列方式進行導向選殖之序列加寬： GATCCTATCACCGCAAGGGATAA GATAG TGGCGT TCCCTAT T TCGA 1.3.表現毒性基因之基因盒建構 表現毒性基因之基因盒係取自上述之質體（1.1及1.2)，以 編碼毒性產物之序列取代CAT序列，較佳爲Grb3-3基因 (PCT/FR94/00542)、胸苷激酶基因或編碼白喉毒素或假單胞 菌毒素之基因。 實施例2 :對p53具有專一性之單鏈抗體建構 此單鏈抗體係根據下列步驟建構： -自產生抗-p53抗體之融合瘤pAb421取得編碼VH及VL區域 之cDNA。爲進行之，自該融合瘤萃取出整體RNA，再以隨 機六元體作爲引子對其進行逆轉錄反應。此種類型之引子 的使用得以避免對於免疫球蛋白專具有專一性之引子的使 用。所得之cDNA純系具有足夠之長度以選殖該V區域。然 而，因爲其僅爲整體RNA所代表之一小部分，應先進行初 級放大反應以製備足夠之DNA供選殖之用。爲進行之，分 別放大編碼VH及VL區域之cDNA。所用之引子爲寡核苷酸， 其在每條鏈（Η及L)之可變區域相反的兩端與其雜交。使用 對於重鏈具有專一性之引子所得之放大產物係一約340鹼基 對之片段。使用對於輕鏈具有專一性之引子所得之放大產 物係一約340鹼基對之片段。 -31 - 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) Α4規格（210Χ297公釐） (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)

496873 A7 __ B7 五、發明説明（29 ) -在純化編碼VH及VL區域之CDNA後，以一核甞酸臂（L)將 該抗體組合成單鏈。建構該核苷酸臂以使其端點之一與編 碼VH區域之cDNA的3 ’端連結，而另一端與編碼VL區域之 cDNA的5 ’端連結。該臂之序列編碼序列編號No· 5之肽。所 組合成之約700 bp序列包含VH-L-VL鏈，其以Ncol-Notl片段之 形式存在，其序列爲序列編號No. 4(胺基酸9至241)。該序列 亦在其C-端包括myc之標記序列（殘基256至266)。 實施例3 :編碼雙專一性嵌合分子之核酸序列建構， 子包含一結合由單鏈抗體(ScFv)組成之反式激活蛋白的區 域 3.1.包含序列ScFv-myo鉸鏈(Hinge)-TetR或Cro(圖5A及6)之質 體建構 先將含有編碼抗-p53 ScFv之cDNA選殖進入一 pUC19類型之 質體中。將編碼VSV抗原表位（序列編號No. 7)或是myc抗原 表位（序列編號No. 8)之序列插入該片段之下游（圖6)。 再以下列方式取得編碼TetR或Cro蛋白之序列： -自一帶有TetR序列之樣板質體，藉由下列寡核苷酸放大之 取得編碼TetR之序列： 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁)

Oligo 5474 (序列編號 No· 10) ·· GGCTCTAGACCCAAGCCCAGTACCCCCCCAGGTTCTTCAACGCGTG GATCCATGTCCAGATTAGATAAAAGTAAAG Oligo 5475 (序列編號 No_ 11);

CGTACGGAATTCGGGCCCTTACTCGAGGGACCCACTTTCACATTTA AGTTG -32- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X 297公釐） " 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 496873 A7 B7 五、發明説明（30 ) 該等寡核甞酸亦提供編碼該鉸鏈肽臂之序列，其連接該分 子之兩功能域。 因此，該放大之片段含有編碼該肽臂以及結合tetRDNA之區 域的序列。將此片段選殖進入如上所得之質體的Xbal-EcoRI位 點中，以生成含有編碼分子ScFv-myc-鉸鏈-TetR(圖6)之序列之 質體。 在λ噬菌體之DNA樣板上，藉由下列寡核苷酸放大取得編 碼Cro之序列：

Oligo 5531 (序列編號 No· 12) ·· GGCTCTAGACCCAAGCCCAGTACCCCCCCAGGTTCTTCAACGCGTG GATCCATGGAACAACGCATAACCCTGAAAG Oligo 5532 (序列編號 No· 13);

CGTACGGAATTCGGGCCCTTACTCGAGTGCTGTTGTTTTTTTGTTAC

TCGG 該等寡核甞酸亦提供編碼該鉸鏈肽臂之序列，其連接該分 子之兩功能域。 因此，該放大之片段含有編碼該肽臂以及結合CroDNA之區 域的序列。將此片段選殖進入如上所得之質體的Xbal-EcoRI位 點中，以生成含有編碼分子ScFv-myc-鉸鏈-Cro(圖6)之序列之 質體。 3.2.包含序列ScFv-鉸鏈-TetR或Cro(圖5B)之質體建構 此實施例描述帶有編碼根據本發明雙專一性嵌合分子序列 之質體建構，該序列缺少一標記序列。 該等質體係藉由酶Notl及Xbal之切割，自上述於3.1.之質體取 -33- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210 X 297公釐） (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) i··—^ emmmi tmmmmMB mi —Bn·' in^i l 、 ml tmammMtt Hal 111.

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經濟部中央標準局員工消費合作社印製 得。該切割使其得以去除帶有編碼myc標記區域之片段。 3.3.包含序列ScFv-TetR或Cro(圖5C)之質體建構 此實施例描迷帶有編碼根據本發明雙專一性嵌合分子序列 之質體建構’該序列缺少一臂以及一標記序列。 該等免體係藉由酶Notl及BamHI之切割，自上逑於3.1.之質體 取得。該切割使其得以去除帶有編碼myc標記以及鉸鏈肽臂 區域之片段。 實雄例-4丄.％愚雙專一性嵌合分子之核酸序列建構，盡 免座低聚化區域組成之反式激活蛋白的區域^ 4.1· p53蛋白低聚化區域（片段32仏393)之選殖 編碼P53蛋白低聚化區域（序列編號No. 3)之cDNA係在帶有 人類野生型p53蛋白CDNA之質體上，藉由下列寡核甞酸之協 助，以PCR放大取得：

Oligo 5535 (序列編號 No. 14): CAGGCCATGGCATGAAGAAACCACTGGATGGAGAA (畫線部分代表Ncol位點）

Oligo 5536 (序列編號 No. 15); CGTCGGATCCTCTAGATGCGGCCGCGTCTGAGTCAGGCCCTTC (畫線部分：BamHI位點；畫雙線部分：Xbal位點；粗體·· Notl位點） 4.2. 將於上放大之片段以Ncol-Notl片段形式選殖進入實施 例3丄所述質體之對應位點中，以製得質體p53 320/393-myc-鉸 鏈-TetR或 Cro(圖 5A)。 4.3. 將4.1.放大之片段以Ncol-Xbal片段形式選殖進入實施 -34- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) Α4規格（210X297公釐） (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 緊·

496873 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A7 B7 五、發明説明（32 ) 例3丄所述質體之對應位點中，取代編碼ScFv及標記之區域 ，以製得質體p53 320/393-鉸鏈-TetR或Cro(圖5B)。 4.4. 將4.1.放大之片段以NcoI_BamHI片段形式選殖進入實施 例3.1.所述質體之對應位點中，取代編碼ScFv、標記及鉸鏈 之區域，以製得質體P53 320/393-TetR或Cro(圖5C)。 4.5. 質體 TetR 或 Cro-p53 320/393(圖 5D)或 TetR 或 Cro-鉸鏈 _p53 320/393(圖5E)係將經xh〇I/EcoRI切割之片段選殖進入先以 XhoI/EcoRI切割之實施例3丄所述質體中製得，該片段係在帶 有人類野生型p53蛋白CDNA之質體上，藉由Oligos 5537/5539或 5538/5539之協助，以PCR放大而得。

Oligo 5537 (序列編號 No. 16) ·· CAGGCTCGAGAAGAAACCACTGGATGGAGA Oligo 5538 (序列編號 No. 17);

CAGGCTCGAGCCCAAGCCCAGTACCCCCCCAGGTTCTTCAAAGAA ACCACTGGATGGAGAA Oligo 5539 (序列編號 No· 18) ·· GGTCGAATTCGGGCCCTCAGTCTGAGTCAGGCCCTTC 實施例5 :帶有編碼嵌合分子序列之調控質體建構， 子包含一 DNA結合區域（TetR或Cro)以及p53蛋白之反式 蛋白區域 質體p53 Ι/73-TetR或Cro有或無標記（myc或VSV)以及鉸鏈（圖 7A、B及 C)係將經 Ncol/Notl、Ncol/Xbal、NcoI/BamHI切割之片段選 殖進入先以Ncol/Notl、Ncol/Xbal或Ncol/Bamffl切割之3.1.所述質體 中製得，該片段係在帶有人類野生型P53蛋白cDNA之質體上 -35- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210><297公釐） (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂

496873 A7 B7 五、發明説明（ 33

，藉由Oligos 5661/5662之協助，以PCR放大而得。 Oligo 5661 (序列編號 No. 19): CAGGCCATGGAGGAGCCGCAGTCAGATCC Oligo 5662 (序列編號 No· 20); CGTCGGATCCTCTAGATGCGGCCGCCACGGGGGGAGCAGCCTC TGG (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 訂

經濟部中央標準局員工消費合作社印製 -36- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X297公釐） 496873 A7 B7 五、發明説明（34) 序列資料序列編號No. 1 : TCTCTATCACTGATAGGGA序列編號N〇. 2 ·· TATCACCGCAAGGGATA序列編號No. 3 ·· KKPIiDGEYFTLQIRGRERFEMFRELNEALELKDAQAGKEPGGSRAHSSHIiKSKKG QSTSRHKKLMFKTEGPDSD序列編號N〇. 4:

VH 1/1 ?£L^ sr/T AX r 31/11 &士： CTC GCQ GCCjCAG^CCC GCC ATC^GCC CAG GTG AAA CTO^CXG GAG TCA GGG CCA GAG CTT GTG leu ala alo. gin pro ala" Iglr. val lys lau gin glu aer gly ala glu leu val SI/21 ^ 91/3： c T)^-£ GAG TCA GGG GCC TCA GTC XAG TTG TCC TGC ACA GCT TCT CCC TTC AAC ATT 一 glu eer gly 5.1jl ser vzl lys leu eer eye thr fila aer gly phe a^n ile lye 121/41 151/Si ΑΤΟ— CACj TGG GTG AAG CAG AGG CCT CAA CAC CCC CTG CAG TGG λΤΤ GGA aij trp val lys gin arg pro giu gin gly leu glu crp iie giy : C^>Rt 211/71

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361/121 ACC GTC TCC TC^ thr ve.1 ser ser 421/141 -- 4517131 CTT TTC ATG ACC CAA ACT CCA CTC ACT TTG TCG CTT ACC ATT CCA CAA CCA GCC TCC ATC val leu rnec chr gin thr pro leu thr leu eer vdl chr iie gly gin pro ala eer ile 481/161 511/171 TCT TGC gly giy crly gly 9^-y g^y gly g^»y ser gly gly giy gly &er 訂 \

經濟部中央標準局員工消費合作社印製 ser cya Sil/lBl

AAG TCA AGT CAG AGC CTC TTG GAT AQT GAT GGA AAO ACA TAT TTG AAT

Ivs 3er eer gin ger Ιβυ leu asp 3er asp qly lya thr cvr Ιου asn 571/1S1 TGO TTG trp leu

TTA CAG ACC CCA GCC CAG TCT CCA AAG CCC CTA ATC ΤλΤ ICTO GTG TCT AAA leu gin arc pro gly crln eer pro lye nrg leu ile tyr [leu val aer lys" 601/201 621/211 GGA CTC CCT GAC AGG TTC λΧΤΓ GOC ACT GOA TCA CCG ACA CAT TTC ACA CTG AAA ATC AAC gly val pro «ap pbe thr gly ser gly eer gly thr acp phe thr leu lyc lie asn 661/221 691/231 rOd^L AQA GTG CAC GCT GAC GAT TTC CCA 721/241 CTG Teu

GAC TCT 忒fip scr TA.T TAT TGC TGG tyr cyr eye. crp :ΛΑ OCT ACA CAT TCT CCG CTC a In glv thr his eer oro leu 751/251 /VW CTC AAA CGC CCC CCC CCA /fyc C；AA CAA AAA CTC K'tt leu lys arg ala ala αΙδ glu σΐη lvs leu t1« 811/271 781/261 TCT cJXA ~6αΖΓ (ΙΛΤ ΤΤϋ" IvATl TnA ΤλΑ GM TTC ACT GOC ser σΐ υ σΐα aop 1 eu acnjOCH OCH alu pho thr gly -37 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X297公釐） 496873 A7 B7 五、發明説明（35 序列編號No. 5 :

GGGGS GGGGS GGGGS 序列編號N〇. 6 : CCC AAG CCC AGT ACC CCC CCA GGT TCT TCA PKPSTPPGSS 序列編號1^0.7:

ATG.AAC CGG CTG GGC AAG Μ N R L G K 序列編號No. 8:

GAA CAA AAA CTC ATC TCA GAA GAG GAT CTG AAT

-EQKLISEEDLN 序列編號No. 9: 訂

PKKKRKV 序列编號No. 10··

GGCTCTAGACCCAAGCCCAGTACCCCCCCAGGTTCTTCAACGCGTGGATCCATGT

CCAGATTAGATAAAAGTAAAG

序列編號N〇. 11 ··

CGTACGGAATTCGGGCCCTTACTCGAGGACCCACTTTCACATTTAAGTTG 序列編號N〇. 12:

GGCTCTAGACCCAAGCCCAGTACCCCCCCAGGTTCTTCAACGCGTGGATCCATG 經濟部中央標準局員工消費合作社印裂

GAACAACGCATAACCCTGAAAG 序列編號NO. 13 :

CGTACGGAATTCGGGCCCTTACTCGAGTGCTGTTGTTTTTTTGTTACTCGG 序列編號N〇. 14 ··

CAGGCCATGGCATGAAGAAACCACTGGATGGAGAA 序列編號N〇. 15 :

CGTCGGATCCTCTAGATGCGGCCGCGTCTGAGTCAGGCCCTTC -38- 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X297公釐） 496873 A7 B7 五、發明説明（36 ) 序列編號No. 16:

CAGGCTCGAGAAGAAACCACTGGATGGAGAA 序列編號N〇. 17:

CAGGCTCGAGCCCAAGCCCAGTACCCCCCCAGGTTCTTCAAAGAAACCACTGGA

TGGAGAA 序列編號No. 18 :

GGTCGAATTCGGGCCCTCAGTCTGAGTCAGGCCCTTC 序列編號NO. 19:

CAGGCCATGGAGGAGCCGCAGTCAGATCC 序列編號No. 20:

CGTCGGATCCTCTAGATGCGGCCGCCACGGGGGGAGCAGCCTCTGG 序列編號Να 21:

Met Glu Gin Arg lie Thr Leu Lys Asp Tyr Ala Met Arg Phe

Gly Gin Thr Lys Thr Ala Lys Asp Leu Gly Val Tyr Gin Ser

Ala 工le Asn Lys Ala lie His Ala Gly Arg Lys 工le Phe Leu

Thr lie Asn Ala Asp Gly Ser Val Tyr Ala Glu Glu Val Lys

Pro Phe Pro Ser Asn Lys Lys Thr Thr Ala 序列編號No. 22 :

GATCCTATCACCGCAAGGGATAA 序列编號NO. 23 : 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 3 r-GATAGTGGCGTTCCCTATTTCGA-5 x -39 本紙張尺度適用中國國家標準（CNS ) A4規格（210X297公釐） 年月曰、” 1、 胳代….補充 第85103937^虎專利申請案 中文補充說明書ΙΓ89年10用、 實例6 ··建構表現本發明各種雜交分子之質骨曹 用於表現雜交分子之質體係將含有編碼此等分子之cDNA之片段選 殖進入真核表現載體pcDNA3 (Invitrogen)之NcoI/EcoRI位點中而取 得。如此製備之各種建構體如下所列： -ScFv421 :序列編號No. 27。 -TET19 :雜交蛋白，含有根據實例3.1述於圖6之鏈ScFv421-VSV-鉸 鏈-TetR 〇 -TET02 :雜交蛋白，含有根據實例4.3述於圖5A之鏈p53(320/393)-VSV-鉸鏈-TetR。 -TET03 ··雜交蛋白，含有根據實例4.4述於圖5B之鏈p53(320/393)-鉸 鏈-TetR 〇 -TET04 :雜交蛋白，含有根據實例4.4述於圖5C之鏈p53(320/393)-TetR ° -TET07 :雜交蛋白，含有根據實例5述於圖7A之鏈p53(l/73)-VSV-鉸 鏈-TetR 〇 實例7 :以本發明之雜交分子辨識特定之雙股DNA庠列 7.1製備雜交分子 用於此實驗中之各種分子係使用TNT偶合網織紅細胞裂解物系統 套組(Promega)，根據供應商所述之實驗流程，在網織紅細胞裂解物 中，以50微升之總反應體積，在試管中轉譯實例6所述之分子而取 UATYPE\EN\RF\ATYPE\B\2463B-F.DOC\4\en 496873 得。 7·2建構特定之雙股DNA序列 用於本實驗之特定雙股DNA序列係由兩條合成寡核甞酸構成，其 序列如下所列：

Oligo 5997 (序列編號No· 24):

GATCCGACTTTCACTTTTCTCTATCACTGATAGTGAGTGGTAAA

CTCA

Oligo 5"8 (序列編號No· M):

AGCTTGAGTTTACCACTCCCTATCAGTGATAGAGAAAAGTGAA

AGTCG 將10皮莫耳之各寡核苷酸在37°c下置於10微升之下列反應培養基 中30分鐘，而以磷-33標記此兩合成寡核苷酸：

Tris-HCl pH 7.6 50mM

MgC12 5mM

亞精胺 100//Μ EDTA 100 βΜ [r -33p]ATP (Amersham) 50 β Ci (1000-3000 Ci/mmol)

T4 激酶(Boehringer) 1 〇U 再在400 mM NaCl之存在下雜交如此標記之兩寡核甞酸，以重構 下列之雙股序列TetO (序列編號No. 26):

GATCCGACTTTCACTTTTCTCTATCACTGATAGTGAGTGGTA

AACTCA

CTAGGCTCAAAGTGAAAAGAGATAGTGACTATCACTCACCA U:\TYPE\EN\RRATYPE\B\2463B-F.DOa4\en -2-

TTTGAGT

7·3以各種本發明之雜交分子辨識雙股序列丁 et〇 DNA結合反應系在50微升之反應培養基中（1〇 ^ Tris_HCi pH 7·4，10 mM MgCl2，10 mM KC1，6 mM /5-鏡基乙醇，〇·ι 禮 EDTA，0·5毫克/毫升BSA)，添加根據實例7·2製備之序列TetO(10- 10 Μ)、10微升根據實例7.1製備之轉譯產物、及用以消除非專一性 結合之10-8 Μ冷競爭劑寡核苷酸ΑΡ2 (Promega)而進行。反應之專一 性係藉著在反應培養基中添加1 〇 # M之四環黴素(Sigma)改變平衡而 檢驗。將反應混合物置於2〇°C下15分鐘，接著添加1〇微升之5〇%甘 油，並對終混合物以5%之非變性聚丙烯醯胺凝膠進行電泳，在 200V及16°C下移動。再乾燥該凝膠，並進行自體放射顯影。 以雜交分子TET19、TET02、及TET07進行之此實驗結果示於圖 9。在此等條件下，此三分子與特定雙股DNA序列Tet〇之結合可由 後者移動h形之延遲而觀祭得見，而此種作用之專一性則可由添加 四環黴素而抑制此種延遲之情形而證明。 此種結果因此確認本發明之雜交分子可專一結合核苷酸序列 TetO 〇 雜交分予對於耳有轉錄性反式激活埤之分子之春 一性缚金 8·1製備本發明之雜交分子以及有或無轉錄性反式激活域之分子 為進行此實驗，使用根據實例7‘丨之實驗流程，以試管中之轉譯作 用氣備本發明之雜交分子ScFv似、TET19、及tet〇2，製備過程 -3- U：\TYPEXEMRF\ATYPE\BV2463B-F.D〇a4\en 並係在44//Ci 35S_甲硫胺酸(Amersham)(1175 α/毫莫耳)之存在下 進行，以產生此等經放射活性標記之雜交分子。 將有或無轉錄性反式激活域之分子之cDNA選殖進入載體 pBhieBacIII (Invitrogen)之BamHI位點。使用此等載體，根據製造商 之指示製備並純化重組桿狀病毒。根據製造商之實驗流程，以此等 重組桿狀病毒感染s©昆蟲細胞而製備該等分子。根據K. Ory et al. 所述之流程(Κ· Ory，EMBO J·，13, 3496-3504, 1994)，製備終蛋白濃 度10毫克/毫升之蛋白萃取物。此等分子係如下所列： -p53 (1/393):野生型p53蛋白。 -p53 (1/320):限制至其胺基酸序列^32〇之野生型p53蛋白，其因 此缺乏其寡聚作用域及由單株抗體pAb42i辨識之蛋白域。 8.2本發明之雜交分子對於有或無轉錄性反式激活域之分子之結合 將5微升根據實例8j製備之各試管中轉譯產物，與5微升根據實例 8·1製備之桿狀病毒萃取物，及2微克可辨識p53蛋白N-端終端之單株 抗體D〇1 (〇nc〇gene Sciences)，在100微升經修飾RIPA緩衝溶液(〖· 〇ry，EMBO J·，π，3496-3504, 1994)中，於4°C下共置 16小時。如K. Ory et al.所述(κ· 〇ry，EMB〇 J·，13, 3496-3504, 1994)進行免疫沈 澱。在30微升移動緩衝溶液(Laemmli U.K.，Nature，227, 680-685, 1970)之存在下’於g〇c下共置10分鐘，並根據前述(Laemmii υ.κ.， Nature，227, 680-685, 1970)之流程，在變性培養基中，以200 V在 10%之聚丙烯醯胺凝膠上進行電泳，以溶析出由抗體保留之複合 物。之後’乾燥該凝膠，並在即時顯像儀(packard Instmments)之協 助下進行顯影，此可定量與有或無轉錄性反式激活域之分子結合之 U:\TYPE\E>ARIAATYPE\B\2463B-F.D〇C\4\en -4- 496873 雜交分子量。此實驗之結果示於圖10。 在此等條件下，其明確顯示具有ScFc 421之雜交分子(TET19)確實 可以相當於僅有ScFc 421時之方式辨識p53分子(1/393)，而具有 320/393域之雜交分子(TET02)有相同之特性，但具有高出許多之p53 (1/393)保留能力。同時，在與p53 (1/32〇)分子進行共置時缺乏可見 信號之情形則顯示此等作用如預期般具有相當之專一性，且係由 p53蛋白之C-端終端(胺基酸320至393)中介。 此等結果因而確認本發明之雜交分子具有相當之能力可徵集由其 專一性配對分子攜帶之轉錄性反式激活域。 宜查12丄本發明雜交分子對於棘辞枨反式激活域之功能性徵焦 本發明雜交分子對於轉錄性反式激活域之功能性徵集係在活體内 之反式激活系統中’在缺乏p53蛋白兩等位基因之SAOS-2細胞(人類 骨肉瘤）、缺乏p53蛋白兩等位基因之腫瘤細胞系H358 (Maxwell &

Roth，Oncogene 8, 3421，1993)、以及缺乏P53蛋白兩等位基因中之一 者’且具有一突變等位基因之腫瘤細胞系町29 (H273突變）中進行 評估。此系統係根據一報導基因之使用，該基因可以酶分析，且其 係置於含有由Tet抑制子專一辨識之核苷酸單元之啟動子(Tet操作子) 之控制下。 在此試驗中’置於Tet操作子控制下之LUC (螢光素酶)報導基因係 S 在貝體pUHC 13-3 (Gossen M. & Bujard H·，Proc· Natl· Acad· Sci· USA，89, 5547-5551，1992)中。 9· 1所用細胞系及培養條件 U:\TYPE\E1^RF\ATYPE\B\2463B-F.DO〇4\« -5- 用於此等實驗中之細胞系、其與P53蛋白相關之基因型、以及其 生長用之培養基皆述於下表： 表：細胞| 細胞系 p53 5Ϊ1 ATCC No. SAOS-2 -A DMEM培養基(Gibco BRL) 添加10%胎牛血清(Gibco BRL) HTB85 H358 -Λ RPMI 1640培養基(Gibco BRL) 添加10%胎牛血清(Gibco BRL) HT29 -/Η273 DMEM 培養基(Gibco BRL) 添加10%胎牛血清(Gibco BRL) 9.2用於表現具有轉錄性反式激活域之分子之質體 用於此實驗中之具有轉錄性反式激活域之分子係野生型(加)?53蛋 白’以及此蛋白之突變體G281及H175。將編碼此三種蛋白質之 cDNA插入載體pCDNA3 (Invitrogen)之BamHI位點。 9·3本發明雜交分子之胞内表現 使用下列流程，以瞬時轉染在培養細胞中表現本發明之雜交分 子： 將細胞(3·5 X 1〇5)接種至含有2毫升培養基之6-孔培養盤中，並於 C〇2 (5°/〇)培養箱中，在37°C下隔夜培養。再使用lipofectAMINE (Gibco BRL)作為轉染劑，以下述方法轉染各種建構物：將1.5微克 之總質體（包括0.25微克之報導質體)與5微升之lipofectAMINE和2毫 升之無血清培養基(轉染混合物)共置30分鐘。在此期間，以PBS沖 洗細胞兩次，再在37°C下，與轉染混合物共置4小時，之後，蒸發 U:\TYPE\EN\RF\ATYPE\B\2463B-F.DOC\4\en -6- 轉染混合物，並以2毫升添加10%熱去活性胎牛血清之培養基取代， 再使細胞在37°C下生長48小時。 9·4轉錄活化之偵測 與轉錄性反式激活子之功能性徵集相關之轉錄活化係使用榮光素 酶分析系統套組(promega)，根據製造商之實驗流程，測量 因編碼之螢光素酶活性而進行偵測及定量。 9.5本發明分子之轉錄性反式激活域功能性徵集 此實驗係使用根據實例6之分子TET02、TET03、及TET〇7進行。 在此實驗中，分子TET07係作為陽性控制組，因其具有本身之轉錄 性反式激活域。 在SAOS-2細胞中取得並示於圖1丨中之結果顯示，TET〇7分子本身 具有相當之能力，可活化置於Tet操作子控制下之LUC基因之轉錄活 化，不同於建構物TET02。此一結果符合此細胞系不含内源性p53蛋 白，因而無法由TET02分子徵集之事實。相反的，野生型p53蛋白或 其G281突變體之引入(其本身不會產生任何信號)則可在丁&1〇2分子 存在之情形下產生轉錄活性。此種結果無法在使用H175突變體時得 見，該突變體在文獻中所述係含有一非功能性之轉錄性反式激活 域。 此一以TET02分子在SAOS-2細胞中取得之結果可在一亦不含内源 性p53蛋白之腫瘤細胞系(H358細胞）中重現，且可衍伸至1]£丁〇3及 TET04分子(圖 12)。 為在不同之細胞内容中確認此兩種結果，使TET〇2分子及陽性控 制組TET07在HT29細胞中進行表現，該細胞具有突變之内源性p53 U:\TYPE\ENMlRATYPE\B\2463B.F.D〇a4\en 蛋白(H273)，此-實驗之陰性控制組係轉染空白之pcDNA3載體。 此-實驗之結果(其示於下表)顯示，TET〇2分子具有相當之能力， 可徵集該内源性P53蛋白之轉錄性反式激活域。 PCDNA3 TET07 _59_ --- Linr^ 因此，此等實驗整體顯示，本發明之雜交分子具有相當之能力 可結合特定之雙股DNA序列，以及具有轉錄性反式激活域之蛋白 且此等分子可條件性誘發目標基因之表現。 U:\TYPE\EimFUTYPE\B\2463B-F.DOC\4\en -8- 496873 第85103937號專利申請案 土文補充說明書ΙΠ89年10凡1_ < 3a 1ft ifi SEQ ID NO: 27

TTACTCQCGG CCCAGCCQGC CATGGCCCAGi GTGCXGCTGC AGCAGTCTGG GGCAGAGCTT GTAAGGTCXG GGGCCTCAGT： CAAGTTGTCC TGCACAGCTT CTGGCTTCAA CATTAJJUSAC 12 0 TACTATATGC XCTGGQTQXJl OCAGXGCCCT GAACXGGQCC TGGAGTQQAT TGGATOGATT ISO GATCCTAAGA XTGGTGATXC TGAATATGCC CCGAAGTTCC AGQOCAAGGC CACTATGACT 240 GCAGACACAT CCTCCAAXAC AGCCTACCTG CAGCTCAGCX GCCTGaCXTC TGAGCXCACT 300 (3CCGXGTATT ΑττστΑΑΓττ TTACGGGGAT GCTTTaGACT ATTGGGGCCX XGGGXCCJiCG 350 GTCXCCGTCT CCTCAGGTGO AGGCGOTTCA GGCQC3AGGTG GCTCTGOCGO TGOCOOATCG 420 GATGTTTTGA TGACCCAAAC TCCXCTCACT TTGTCGGTTX ccattog^ca ACCA.GCCTCC 480 ATCTCTTOGX agtcaagtca GAGCCTGTTG GXTXOTGXTG OAAAAACA.TA TTTGAATTGG 540 TTGTTXCAOA GGCCAGGCCX GTGTCCXAAG CGCCTAATCT ATCTGQTQTC TAAACTGGAC 600 TCTGG久GTCC CTGACAGGTT CACTGGCAGT GGATCAGGGX CAGATTTCA.C ACTCAAAATC S€0 AACXGXGTGG AGGCTGAGGA TTTGGGAGTT TXTTATTGCT GGCAAGOTAC ACXTTCTCCG 7*20 CTTACGTTCQ GTGCTOGCAC CAAGCTGGAA ATTAAACGCO CGGCC3CA 768

〜 —αι：間尤I 弟851〇3937號專利申請案一〜^ 土主說明書ITT⑽年10月、 圖9:本發明雜交分子與幢相間作用之研究。 圖10:本發明雜交分子與各種形式P53蛋白間作用之研究 圖11 : Tet-Luc基因盒在SAOS-2細胞中活化之說明。 圖12 : Tet-Luc基因盒在H358細胞中活化之說明。 U:\TYPE\EN\RF\ATYPE\B\2463B-F.D〇a5\en

Claims (1)

1. 496873 8 8 8 ABC 4： /

   第085103937號專利申請案 中文申請專利範圍修正#(»1今5月)

   •、申請專利範圍 1 . 一種雙專一性嵌合分子，其係由下列區域所組成： (i)結合區域，其係為tetR或Cro蛋白質，該結合區域能 夠選擇性結合目標DNA序列；以及 (i i)偵測區域，其係來自·ρ 5 3或為對p 5 3具專一性之抗 體，其能夠專一性結合反式激活蛋白、反式抑制蛋白或 反式激活或反式抑制複合體。 2 .根據申請專利範圍第1項之分子，其中該結合區域包含 完整之蛋白質。 3. 根據申請專利範圍第2項之分子，其中該結合區域包含 tetR蛋白。 4. 根據申請專利範圍第2項之分子，其中該結合區域包含 Cro蛋白。 5. 根據申請專利範圍第1項之分子，其中該偵測區域包含 p53蛋白質之C-端部分。 6. 根據申請專利範圍第5項之分子，其中該偵測區域包含 該C-端區域之殘基320-393(序列編號No· 3) 序列编號No.3·· •QSTSRHKXIoHFICrEiSPDSD 、 302-360或 302-390。 7. 根據申請專利範圍第1項之分子，其中該對P 5 3具專一 性之抗體包含Fab或F(ab)f2片段或VH或VL區域。 8. 根據申請專利範圍第1項之分子，其中該對p 5 3具專一 性之抗體包含單鏈抗體（ScFv)，其包含藉由一臂與VL區域 連接之VH區域。 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格（210 X 297公釐） 496873 A B c D 六、申請專利範圍 9. 根據申請專利範圍第1項之分子，其中該DNA結合區域與 偵測區域係以一臂互相連接。 10. 根據申請專利範圍第9項之分子，其中該臂包含肽，其 包含自5至30胺基酸。 11. 根據申請專利範圍第1 5項之分子，其中該肽包含自5至 20胺基酸。 12·根據申請專利範圍第1 1項之分子，其中該臂包含具有序 列編號No. 5或序列編號No. 6序列之肽， 序列編號No. 5 : GGGGSGGGGSGGGGS 序列編號No. 6 : CCC AAG CCC AGT ACC CCC CCA GGT TCT TCA PKPSTPPGSS 13·根據申請專利範圍第1項之分子，其中該結合區域係位 於N -端，而偵測區域係位於C -端。 14·根據申請專利範圍第1項之分子，其中該結合區域係位 於C -端，而偵測區域係位於N -端。 15·根據申請專利範圍第1項之雙專一性嵌合分子，並具有 結構： ScFv-VSV/myc-鉸鏈（Hinge) -TET 或 Cro ; 03N-T X il X ί n i n P53 320/393 VH"迷接臂 VSV/myc CH3 TetR 或 C「o -2- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格（210 x 297公釐） IcrsLJJ— Ied< —

   496873 8 8 8 8 A B c D 六、申請專利範圍 ScFv-鉸鏈-TET 或 Cro ; ISN丄 I5X — II mL·―I IHEeg — I —

   Icrsu— JEdc:— OMX p53 320/393 楚运 CH3 TetR -¾. Cro 或 Vf連接臂-义 ScFv-TET或 Cro ; 1Φ I- 1Η8Ψ I-SLCC丄 OMX TetR 或 Cro p53 320/393 Vp連接臂 TET或 Cro-ScFv ; OMX- 丁etR或 Cro p53 320/393 或 Vp遂接臂· ΤΕΤ或 Cro-鉸鏈-ScFv ; JHEeg. OMX- Γ1 TetR A Cro CH3 p53 320/393 Vp連接臂-Vl -3- 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格（210 X 297公釐） 外观73 8 8 8 8 A B c D 申請專利範圍 低聚序列（Oligom) -VSV/myc-鼓鍵-TET 或 Cro ; JSN- leqx —Ϊ IHi丄 1丨 IdsLJ- ledcc-i· p53 320/393 VSV/myc 鉸鰱 CH3 ‘ TetR 成 Cro 或 Vh·連接臂 低聚序列-鉸鏈-ΤΕΤ或Cro ; isNl I5X. ION. Is Ia_i inlz 丨 13- l€d\/.OMXJ 39-vl / 臂 20% 3或連 53V p 3 3 H c 鏈 鉸 o Γ c 或 R Lc 0 T 或低聚序列-TET或Cro looN — ΙΗ£5— mqx—

   13 —Ied\/ — 1 p53 320/393 TetR 或 〇〇 成 ， Vf連接臂％ ，其中Cro為調節C I抑制子表現之蛋白質，鉸鏈為連接 臂，且低聚序列為寡聚區域。 -4 - 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210X297公釐） 496873 8 8 8 8 A BCD 、申請專利範圍 16· —種核酸序列，其編碼申請專利範圍第1項所定義之嵌 合分子。 17·根據申請專利範圍第1 6項之核酸序列，其係DNA。 18· —種用於治療感染或細胞增殖疾病之醫藥組合物，其包 含至少一種根據申請專利範圍第1 6或1 7項之核酸，以 及醫藥上可接受之載劑。 19· 一種編碼對p 5 3具專一性單鏈抗體之核酸序列，其具有 序列編號No. 4之序列， 序列編號No.4 : i 1/1 CTC GCG leu ala 61/21 GAG TCA glu ser 121/41 TAT ATG tyr met 181/61 CCT GAG pro glu 241/81 GAC ACA asp thr 301/101 GTC TAT val tyr 361/121 ACC GTC thr val 421/141 GTT TTG val leu 481/161 TCT TGC ser cys 541/181 TTA CAG leu gin 601/201 GCC CAG ala gin GGG GCC gly ala CAC TGG his trp AAT GGT asn gly TCC TCC ser ser TAT TGT tyr cys TCC TCA ser ser ATG ACC met thr AAG TCA lys ser AGG CCA arg pro CCG GCC pro ala TCA GTC ser val GTG AAG val lys GAT ACT asp thr AAT ACA asn thr AAT TTT asn phe LINKER ATG GCC met ala AAG TTG lys leu CAG AGG gin arg GAA TAT glu tyr GCC TAC ala tyr TAC GGG tyr gly CAG GTG gin val TCC TGC ser cys CCT GAA pro glu GCC CCG ala pro CTG CAG leu gin GAT GCT asp ala 31/11 AAA CTG lys leu 91/31 ACA GCT thr ala 151/51 CAG GGC gin gly 211/71 AAG TTC lys phe 271/91 CTC AGC leu ser 331/111 TTG GAC leu asp 391/131 CAG GAG TCA GGG GCA GAG CTT GTG gin glu ser gly ala glu leu val TCT GGC TTC AAC ATT AAA GAC TAC ser gly phe asn ile lys asp tyr CTG GAG TGG ATT GGA TGG ATT GAT leu glu trp ile gly trp ile asp CAG GGC AAG GCC ACT ATG ACT GCA gin gly lys ala thr met thr ala AGC CTG GCA TCT GAG GAC ACT GCC ser leu ala ser glu asp thr ala TAC TGG GGC CAA GGG ACC ACG GTC tyr trp gly gin gly thr thr val GGT GGA GGC GGT TCA GGC GGA GGT GGC TCT GGC GGT GGC GGA TCG gly gly gly gly ser gly gly gly gly ser gly gly gly gly ser CAA ACT gin thr AGT CAG ser gin GGC'CAG gly gin CCA CTC pro leu AGC CTC ser leu TCT CCA ser pro ACT TTG thr leu TTG GAT leu asp AAG CGC lys arg 451/151 TCG GTT ser val 511/171 AGT GAT ser asp 571/191 CTA ATC leu ile 631/211 GAT asp ^K~* ACC ATT GGA CAA CCA GCC TCC ATC thr ile gly gin pro ala ser ile GGA AAG ACA TAT TTG AAT TGG TTG gly lys thr tyr leu asn trp leu TAT CTG GTG TCT AAA CTG GAC TCT tyr leu val ser lys leu asp ser 裝

   -5 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格（210 X 297公f) 496873 8 8 8 8 A B c D 申請專利範圍 GGA GTC CCT gly val pro 661/221 AGA GTG GAG arg val glu 721/241 ACG TTC GGT thr phe gly 781/261 GAC asp GCT ala GCT ala AGG TTC ACT arg phe thr GAG GAT TTG glu asp leu GGG ACC AAG gly thr lys TCA GAA GAG ser glu glu GAT asp CTG AAT leu asn TAA OCH GGC AGT gly ser GGA GTT gly val CTG GAG leu glu TAA GAA OCH glu GGA TCA GGG gly ser gly 691/231 TAT TAT TGC tyr tyr cys 751/251 CTG AAA CGG leu lys arg 811/271 TTC ACT GGC phe thr gly ACA GAT TTC ACA CTG AAA ATC AAC thr asp phe thr leu lys ile asn TGG CAA GGT ACA CAT TCT CCG CTC trp gin gly thr his ser pro leu GCG GCC GCA ala ala ala GAA CAA AAA glu gin lys CTC ATC leu ile myc-tag 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) A4規格(210 x 297公釐）