TW294722B - - Google Patents
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Description
^ : m 82100463 致專利电謗案中文説明菩修正頁轉%2§1咳 294722 R3- >X U. 補充 . 民园83年9乃彦正 五、發明説明(1 ) 本發明是核酸雜交分析之領域。特言之,其係有關用 於偵測人類免疫缺失病毒(Η I V )之新穎的核酸探針。 技藝背景 A I DS及ARC之病因物先前稱之爲LAV、 HTLV — I I I、ARV,及HIV。於文後稱爲 Η I V。經由各種探針序列及雜交型式,則此病毒rNa 或DNA之偵測是可行的。 PCT W 0 88/01302,公告於 1987 年8月1 1日,揭示用於充作HIV DNA或RNA偵 測用探針的13種HIV寡核苷酸。PCT W Ο 87 /07906 ,公告於1987年6月22日,揭示, Η I V病毒之變種,及使用其DNA診斷A I DS之用法 ° E P 0 3 2 6 3 9 5 A2,公告於 1989 年 1月2 7日,揭示111¥ DNA探針展延之核替酸 2 4 3 8 _ 2 4 5 7,以偵測與多發性硬化有關之序列。 由於聚合酶鏈反應之出現,刺激利用主要來自p〇l 及gag基因區探針之各種分析法。Spector et al. C 1 i ~ π. Chem. 35/8:1581-1587. 1989)及 Kellog et al.( Analytical Biochem 189:202-208,1990)揭示利用聚合 十 ^ 酶鏈反應之Η I V原病毒DNA之定量分析法,其中之引 »> 二 子來自1^1\^莒&叾基因。1^〇11161161:.&1.( Clin. Chem. ι_ ' ' I 35/9:1 8 26 - 1 83 1 )揭示一種互補於HIV pol基因 mR'N A 保留區(conserved region)之可擴大之 RNA 探 ::.............:·:一:…::....................{......................':裝:·一…:訂................(琛 |請先νΊΐδ背面之注¾亊項再>irct本頁) 294722
A6 B6 五、發明説明(“) 針。Coutlee et al.(Anal. Bin r.bPrn 1 8 1:96 - 1 05, 1 989 )揭示利用聚合酶鏈反應之Η I V DNA免疫偵測法, 其中使用的引子組互補於Η I V p〇l及gag基因之序列 ° E P 0 2 7 2 098,公告於 1987 年 12 月 1 5日,揭示利用寡核苷酸探針展延核苷酸8 5 3 8 — 8547 及 8658 — 8677 之 HIV RNA 序列之 PCR擴大作用及偵測。EP 〇 229 701,公 告於‘1 9 8 7年1月9日,揭示經由HIV gag Μ DNA之擴大作用來偵測Η I V之方法。P C T W Ο 8 9/1 0 9 7 9揭示一種混合擴大作用及核酸雜交之核 酸探針分析法,其中使用捕獲及告知探針,再固化於固相 載體上。以此技術擴大Η IV gag p 17面域內。 另一策略稱之爲|可逆的標的捕獲〃。如,Thomp.so-n et a 1 . (C 1 i π . Chem . 35/9 :1 78 - 1 88 1. 1 989 )揭示 HIV RNA之'"可逆的標的捕獲# ,其中所提出之商 品化的d A_加尾之合成的寡核苷酸,可選擇性純化分析 物核酸,互補於Η IV pal基因之經標記之反意Unu-sense) RN A 探針可提供訊號。 Gillespie el: al. (Molecularand Cellular Probes 3:73-86, 1989)揭示用 於Η I V RNA可逆式標的捕獲之探針,其中探針係互 補於HIV pol基因之2 0 9 4 — 4 6 8 2核苷酸序列 Ο Kumar et al.揭示一種用於Η I V DNA之、探 針替換# (probe shift)分析法,利用互補於Η IV (請先閱讀背面之注意事項再蜞ftT本頁) .乐又中J』孓以苹丨CNS)甲4)AhV(2U)x 297公筌1 9^4122 A6 ______ B6_ 3 五、發明説明( ) gag及pol基因之D N A序列。探針替換分析法依據經檫 記之寡核苷酸與溶液中P C R擴大片段之雜交作用。如此 形成之雜雙體(heiniduplex)被偵測,再於未變性凝膠上 分級分離。 Keller et al.(Anal. Bine hem. 177:27-32. 1 989 ) 揭示一種微滴定爲基礎之三明治式分析法,以偵測展延在 gag編碼區Pst I位置之Η IV DNA。 Viscidi et al( J, Clin. Micro. 27:120-125, 1 989 )揭示一種Η I V R N A之雜交分析法,利用固相 抗一生物素抗體及與DNA- R ΝΑ雜交體具特異性之酵 素標記的單株抗體,其中探針幾乎展延在所有的聚合酶基 因及gag基因之3 /端。 歐洲專利案(EPA) 89311862 ,公告於 1 9 8 9年1 1月1 6日,揭示一種利用固相捕獲工具以 偵測核酸之診斷套組及方法,並描述使用互補於Η I V gag基因之D Ν Α序列以偵測Η I V D Ν Α之用法。 共有的美國專利案No . 4 ,868 ,105中描述 一種溶液相之核酸三明治式雜交分析法,其中欲分析之核 酸先於第一容器中,先與溶液中之經標記探針組及捕獲探 針組雜交。之後探針-分析物複合物再轉移至第二容器中 ,其中含有固化在固相上之探針,其實質上與捕獏探針之 片段互補。片段與經固化之探針雜交,因此自溶液中移去 複合物。令分析物呈經固化複合物之型式後可助於分析中 接下來之分離步驟。最後,經過標記探針組之單股片段與 (請先閃讀背面之注意事項再填寫本頁} 汰义中3 3孕丨C\Si中4悅At‘21(lx297公垃1 294722 A6 . B6_ 4 五、發明説明( ) 經標.記探針雜·交後,可經由直接或間接得自檩記物之訊號 偵測含有分析物之複合物。 共有的歐洲專利案(EPA) 883096976揭 示與美國專利案4,8 6 8,1 0 5中所述分析法不同之 變化法。擴大作用中係使用核酸多體。這些核酸多體是分 支之聚核苷酸,其經構築具有一段片段係可專一地與分析 物核酸雜交,或與結合至分析物上之核酸(分支或線型的 )雜交,並與專一雜交地經標記探針之第二片段交互作用 。於應用多體之分析中,係依循於第一容器中分析物與標 記物或擴大探針組及捕獲探針組之雜交之第一步驟,再將 複合物轉移至另一含有經固化核酸之容器,其係可與捕獲 探針之片段雜交。多體再與經固化之複合物雜交,且經標 記之探針再依序與多體上之第二片段交互作用雜交。由於 多體可提供許多供標記探針粘附之位置,由是擴大訊號。 所揭示之擴大子及捕獲探針序列有B型肝炎病原、淋病奈 瑟氏球菌、於淋病奈瑟氏球菌中之青徽素及四環徽素抗性 、及砂眼衣原體。 於1 9 9 0年7月2 7日公告之共有的美國專利案 No . 5 5 8 ,8 9 7,描述可用於上述溶液相分析中之 ; 大的梳狀分支型多核苷酸多體之製備。此梳狀物於分析法 中比分子較小的多體提供更多之訊號增强作用。 於美國專利案No . 5 ,030 ,557中( 1 9 87年11月24日公告),揭示一種、輔助子,寡 | 核1&酸’經選擇可結合至分析物核酸,且在標的上置入不 一…:-…:Γ.,ί..............................(.....................-…裝:·:........./.........訂...............(線 (U先閱讀背面之:'^意事項再堉寫衣頁)
.Ν 认伥 mtl 中 2 BTiU? 41-1 CXS I 〒 4 規格· I 2 U)X 297公垃 I 294722 A6 ______ B6____ 5 五、發明説明( ) 同的二級及三級結構,以助探針與標的之結合。 發明...之揭示 本發明一方面是用於三明治式雜交分析中充作擴大探 針之合成的寡核苷酸,其包括 第一片段,其具有實質上與Η I V核酸片段互補的核 苷酸序列;及 第二片段,其具有實質上與核苷酸多體之寡核苷酸單 位互補的核苷酸序列。 本發明另一方面是於偵測Η I V之三明治式雜交分析 中充作捕獲探針之合成的寡核苷酸,其包括第一片段,.其 具有寅質上核酸片段互補的核苷酸序列;及 第二片段,其具有實質上與被結合在固相上之寡核苷 酸互補的核苷酸序列。 本發明另一方面是一種可甩於Η I V三明治式雜交法 中之空間子寡核替酸。 本發明另一方面是用於偵測樣品中有Η I V存在之溶 液相三明治式分析法,其包括: (a )於雜交條件下,將樣品與過量的下列物質接觸 :(i )—種擴大探針寡核苷酸,其包括第一片段,其具 \ 有實質上與111乂核酸片段互補的核苷酸序列,以及第二 1' y 片段,其具有實質上與核酸多體之寡核苷酸單位互補的核 ^ 苷酸序列,及(i i )—種捕獲探針寡核苷酸,其包括第 一片段,其具有實質上與Η I V核酸片段互補之核苷酸序 (請先閱讀背面之注总事項再填寫本頁) .·裝 •、1Τ A6 ____*_B6_ ,6 五、發明説明( ) 列,與寅質上與被結合在固相上之寡核苷酸互補之第二片 段; (b )在雜交條件下,令(a )步驟之產物與上述被 結合至固相上之寡核苷酸接觸反應; (c )然後分出未結合至固相之物質; (d )在雜交條件下,令(c )步驟之經結合產物與 核酸多體接觸,該多體包括至少一種寡核苷酸單位,其寅 質上互補於擴大探針多核苷酸之第二片段,及至少一個第 二寡核苷酸單位,其實質上互補於經標記寡核苷酸; (e )移去未結合之多體; (f )在雜交條件下將(e )步驟之固相複合物產物 與經標記之寡核苷酸接觸; (g )移去未結合之經標記之寡核苷酸; 及 (h )於(g )步驟之固相複合物產物中偵測標記物 之存在。 本發明另一方面是用於偵測Η I V之套組,包括用於 偵測樣品中Η I V之套組,包括混合 (i ) 一組擴大探針寡核苢酸,其中擴大探針寡核苷 酸包括其核苷酸序列實質上與Η I V核酸片段互補之第一 片段·,及其核苷酸序列實質上與核酸多體之寡核笹酸單位 互補之第二片段; (i i ) 一組捕獲探針寡核苷酸,其中捕獲探針寡核 苷酸包括其核苷酸序列實質上與Η I V核酸互補之第一片 .........................................................--......................穿....................*- (請先閱-背面之注意事項再填寫本頁)
UUk 又戊迗:丨丨中 Bi 孓 MU*- < CXS i 甲 4 % IS·; 211) X 297 公货 I 294722 系 82100463 B7 費舞二(A) 經濟部中央標準局貝工消費合作社印製
號專利申請案中文说明嘗,f正员 -民1〇月甚 五、發明说明(7 ) 段,及實質上與結合至固相之寡核替酸互補之第二片段: (ί i ί )核酸多體,該多體包括實質上互補於擴大 探針多核苷酸第二片段之至少一種寡核苷酸單位,及實質 上互補於經標記寡核苷酸之許多的第二寡核苷酸單位;及 (i ν )—種經標記之寡核μ酸。 基於此中所揭示的,這些及其他的具體實例對一般精 藝者應是淺顯的。 圖式簡單說明 附圖·三明治雜交分析法,利用多個分析物特定之捕獲探 針及擴大探針。 如下所示序列表中符號之意義: (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) -裝· (Ί - i In»11 i - - - I - - - ...... - -I— - 1^1 : —J. 1 I - - · ---. 丁 符 號 代 表 意 義 R… A 或 G W ... … A 或 T / U S… … C 或 G Y… … C 或 T / U K… … G 或 T / U v ... … A 或 C 或 G 非 T / U Η… … A 或 C 或 T / U : 非 G D " * A 或 G 或 T / U : 非 C Β… C 或 G 或 T / U : 非 A Ν ··· … ( A 或 C 或 G 或 T / U )或 (未知或其它) 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS ) A4規格(210X297公釐) 85.年 7 Ϊ 五、發明説明(7-1) 實行本發明之方法 定義 ^溶液相核酸雜交分析'意指於共有的美國專利案 No ·4 ,868,105 及 EPA883096976 中所述及申請專利範園之分析技術。 '經修飾之核苷酸'意指可穩定地納入多核苷酸中之 核苷酸單體,且其具有額外的官能基。較好,經修飾之核 苷酸是5 < -胞嘧啶核苷,其中Ν4 _位置經修飾以提供 官能性羥基。 '擴大子多體"意指一種分支之多核苷酸,其可同時 直接或間接地雜交至分析物核酸及許多多核苷酸交互作用 上(即是另一多體之交互作用或經標記探針之交互作用) 。多體上之分支可由共價鍵結達成,且多體由二型寡核苷 酸單位組成,其可分別雜交至分析物核酸或雜交至分析物 核酸及許多經標記探針上。此種多體之組合物及製備,描 述於ΕΡΑ 883096976及美國系列No· --i.Ί丨-丨裝丨— (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部中央搮準局負工消费合作社印製 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)A4規格(210x297公釐)-9-1 A6 B6 五、發明説明(〇 ) 558,897 (公告於1990年7月27日),其揭 示均列爲本案參考。 ''空間子寡核苷酸#是指一種寡核苷酸,其結合至分 析物RNA,但不含可與固相粘附之任何序列,或可爲擴 大探針偵測之工具。 '擴大探針# 一語意表分支或線型之多核苷酸,其經 構築可具有與分析物核酸可專一性雜交之片段,且可與專 一雜交至擴大多體之第二片段交互作用。 1捕獲探針〃意指一種寡核苷酸,其具有可實質上與 標的DN A之核苷酸序列互補之片段,及實質上與因此固 化在固相之探針核苷酸序列互補之片段。 ~大#於此中所用的係描述本發明之梳狀分支多核苷 酸,意指具有至少約1 5個分支位置及至少約2 0個經標 記探針結合序列之交互作用之分子。 '梳狀#於此中所用的是描述本發明分支多核苷酸之 結構,意指具有線型架構之多核苷酸,並自骨架中伸出許 側鏈。 ^可解離之鏈結子分子|意指可穩定納入多核苷酸鏈 中之分子,且其包括可爲化學處理或物理處理打斷或解離 之共價鏈,如經由照射。 此中所揭示的所有核酸片段均以5 /至3 >方向書寫 出來。核苷酸之設計依I UPAC — I UB生化命名協會 之核Μ酸符須而定。 ..........:: ................................{....................一裝::::訂 {請先聞請背面之注意事項再項寫本頁) 木/人ik八中d彐iU'M*-丨C.VS ) 蚍疥丨210 X 29 7公兑I 10 A6 'B6 五、發明説明( ) 溶液相雜交分析 以下爲溶液相三明治式雜交法之一般策略。分析物核 酸與過量的二種單股核酸探針組,共置於微滴定孔洞中: (1 ) 一組捕獲探針,各自具有實質上互補於分析物之第 1結合序列及實質上互補於結合至固相載體上之核酸之第 2結合序列,如孔洞表面或珠粒,及(2 )—組擴大探針 (分支或線型的),各自具有可專一地結合至分析物之第 —結合序列,及可專一地結合至多體片段之第二結合序列 。生成的產物是含有三種組份的核酸複合物,其係由二種 探針藉其第一結合序列雜交至分析物所組成者。探針之第 二結合序列因未同時互補至分析物,故保留呈單股片段。 此複合物經由捕獲探針之第二結合序列而雜交至固化在固 相表面之探針上。生成之產物包括經由雙體結合至固相表 面之複合物,此雙體係由結合至固相表面之寡核苷酸及捕 獲探針之第二結合序列所形成的。未結合之物質再自表面 中除去,如利用洗滌。 之後再於雜交條件下,將擴大作用多體加至經結合之 複合物上,使多體可雜交至複合物擴大探針中可應用之第 2結合序列上。再自任何未結合多體中以洗滌分出所生成 之複合物。於條件下再加入經標記之寡核苷酸,以雜交至 多體之實質上互補的寡核苷酸單位上。再洗滌所生成之經 固化經標記核酸複合物,以除去未結合之經標記寡核苷酸 〇 .分析物核酸可得自各種來源,如生物流體或固體粒子 :::.·::::.....……:·.....................< ....................:*裝.::”..::訂 <請先閒讀背面之注意事項再堉寫本頁) 汰尺/2_返川中彐a家漂苹(CXS丨甲4吡洛I 210X 297公垃i -.11 - A6 __B6_ 10 五、發明説明( ) ,且可製備以用於各種方法之雜交分析中,如蛋白酶K/ SDS、離液序列高之塩類,等。同時,減小分析核酸平 均大小是有益的,可採用酵素性、物理性或化學方法,如 限制酶、音波震盪、化學降解(如金屬離子)等。片段可 小至0 . lkb,通常至少約0 . 5kb,且可大於1 k b。於分析時分析物片段呈單股型式。當片段以單股型 式自然存在,則變性將不需要。然而,當片段呈雙股型式 ,序列應予以變性。變性可以各種技術來進行,如鹼,通 常爲由約0 . 0 5至0 . 2M之氫氧化物、甲醯胺、塩類 、熱、酵素、或其混合。 實質上互補於分析物序列之捕獲探針及擴大探針之第 一結合序列,各自至少1 5個核苷酸,通常至少2 5個核 苷酸,且不多過約5 k b,通常不多過約1 k b,較好不 多過約1 0 0個核苷酸。其通常約3 0個核苷酸。其通常 經選擇以結合至分析物之不同序列上。第一結合序列可基 於各種考慮來選擇。依據分析物之本質,將可著眼於一致 序列、與多型性有關之片段、特殊之表現型或基因型、特 殊之品系、或其他。 所使用之不同擴大及捕獲探針之數目會影響分析之® 敏性,因爲使用愈多的序列,由分析系統提供之訊號愈大 。再者,使用愈多之探針片段可使用更爲迫切之雜交條件 ,由是減少僞陽性結果之發生。因此一組中探針之數目, 爲至少一種捕獲探針及至少一種擴大探針,更好是二種捕 獲及二種擴大探針,且最好5 — 1 0 0種捕獲探針及5 - ^ ~ . - - · - ....................................·、.·.....................< ......................^......................-叮 I請先¾¾背面之注意事項再填寫本頁)
;'! t ^ r4iH.tfi-(2inx 297^>^· I A6 ____ B6 __ 五、發明説明(11) 1 0 0種擴大探針。用於Η IV之寡核苷酸探針序列之設 計,係將來自GenBank的18種HIV DNA序列排 列。選出pol基因內有最大同質性之區域爲捕獲探針, 而同質性少之區域爲擴大探針。選出異質區爲空間探針。 因此,若有更奪的Η I V種被鑑知及定序,則可設計更多 之探針,或者提出更好的探針組,係將新種序列或分離物 序列與上文1 8種排列,且類似地鑑定出有最大同質性及 較少同質性之區域。 設計空間寡核苷酸,係欲加入雜交摻合物中,使 RNA不致被降解。設計捕獲探針序列及標記探針序列, 如此捕獲探針序列與標記探針序列散佈,或捕獲探針序列 與標記探針序列聚集在一起。 目前較佳之探針組及其捕獲或擴大區,即可與Η I V 核酸專一地雜交之區,示於實例2中。 選擇捕獲探針及擴大探針之第二結合序列,使其實質 上分別互補於結合至固相表面之寡核苷酸,及多體之片段 ,且如此不爲樣品/分析物中之內源序列遇到。第二結合 序列可接於第一結合序列,或由中間之非互補序列隔開。 若必要時探針可包括其他的非互補序列。這些非互補序列 必須不可阻礙結合序列之結合,或造成非專一性結合。 捕獲探針及擴大探針可以寡核苷酸合成步驟,或以選 殖法製備,較好是前者。 要了解,結合序列未必要完全的互補,以生成同二體 。在許多狀況下,雜二體已足夠,其中忽略不計算由5個 {請先閱讀背面之注意事項再填Κ本頁) S A & K m'M miU? ΐ (CNS 丨-f 4悅格 I 21(1 X 297公兌 I 13 - 294722 A6 B6 < 五、發明説明(12) (請先閱讀背面之注意事項再"寫本頁) 以上.核苷酸形成之環,有少於1 〇 %之鹸基是配對錯誤。 因此,於此中所用的 ' 互補'意指確.實之互補,其中在結 合區中的每一鹼基確實地相當,且寅質上互補^意指 9 0 %以上同質。 經標記之寡核苷可包括實質上互補於多體重覆寡核苷 酸單位之序列。經標記之寡核苷酸包括一種以上之分子( '標記物'),其直接或間接地提供可偵測之訊號。檩記 物可結合至實質上互補序列之個別成員,或可呈末端成員 或具許多標記物之末端尾部型式存在。將標記物結合至寡 核苷酸序列之各種方法,文獻中已有述。如見,Leary e t al., Proc. Natl. Acad. S c i . USA ( 1 983 ) 80:4045: Renz and Kurz, Nucl. Acids Res. (1984) 12:3435;
Richardson and Guraport, Nucl. Acids Res. ( 1983 ) 1 1 :616 7; Smith e t al., Nucl. Acids. Res. ( 1 985 ) 1 3 : 2399; Meinkoth and Wahl, Anal. Biochem. (1984) 138 :267。標記物可共價或非共價地結合至實質上互補序列上 。可應用之標記物包括放射核種、螢光劑、化學發光劑、 染料、酵素、酵素受質、酵素輔因子、酵素抑制劑、酵素 亞單位、金屬離子及其他。舉例而言,特殊標記物包括: 螢光素、若丹明、德州紅、藻紅朊、辙形酮、魯米諾、 NADPH、α —半乳糖苷酶、璋菜過氧化酶、鹼性 磷酸酶等。 捕獲探針及擴大探針對預期莫耳分析物之比率,各自 至少爲化學計量,且較好過量。此比率較好至少約1 . 5 -14: A6_ ,_ B6__ 13 五、發明説明( ) :1,且更好至少2:1。通常在由2:1至106 : 1 之範圍中。各個探針之濃度通常由約1 〇 -5至1 〇 , 樣品核酸濃度由1 〇-21變化至1 〇_12 Μ。分析中雜交 步驟通常花費1 0分至2 0小時,較好可在1小時內完成 。雜交在略升高之溫度下進行,通常由約2 0°C至8 0°C ,更常是由約3 5°C至7 0°C,特別是6 5°C。 雜交反應通常於水性介質中進行,特別是經緩衝之水 性介質,其中包括有各種添加物。可應用之添加物包括低 濃度之去污劑(0 . 0 1_1%)、塩類、如檸檬酸鈉( 0 . 0 1 7至0 . 1 7M) 、Ficoll'聚乙烯吡咯啶酮、 載體.核酸、載體蛋白質等。非水性溶劑可加至水性介質中 ,如二甲替甲醯胺、二甲亞硪、醇類·、及甲醯胺。這些其 他溶劑之含量通常由2至5 0 %。 可以溫度、埴濃度、溶劑系統及其他,控制雜交介質 之嚴格度(stringency)。因此,依據重點序列之長度及 本質,可變化嚴格度。· 依據本發明,進行經擴大核酸雜交分析之套組,包括 下列試劑之包裝組合:擴大探針或探針組;捕獲探針或探 針組;擴大多體;及適當的經檩記寡核苷酸。這些試劑通 常於套組之分別容器之中。套組中也可包括將分析物變性 之變性試劑、雜交緩衝溶液、洗液、酵素受質、陰性及陽 性控制組、及進行分析之書寫指示。 以下實例說明本發明。這些實例不欲以任何方式限制 本發明。 -15 -
本坟汰凡川t彐a •diUCXSi _.Ρ·(规疥(21(Jx297公垃I **··-' ...:…一…::」................................................{ ......................^.......................玎 (請先閲^背面之注意事項再蜞寫本頁}
五、發明説明I 14 A6 B6 KM. 實例 梳狀分方多核符酸之合成 此實例說明具有15個分支位置及三個經標記探針結 合位置之側鏈伸展之梳狀分支多核苷酸之合成。此多核替 酸經設計可用於EPA 8 8 3 0 9 6 9 7 6所述之溶液 相雜交方法中。 寡核奋酸的所有化學合成,均於自動DNA合成儀上 進行(A p p 1 i e d B i 〇 s y s t e m s,I n c . , ( A B 1 ) 3 8 Ο B 機型 )。使用/? -氰基乙基型之胺基磷酸酯化學,包括應用 PhostelTM試劑(ABN )之5 < —磷醯化作用。除了另 有所.示,使用標準的AB I策略。當指示使用許多循環時 (如1 2個循環),於所示循環中應用由AB I提議之許 多標準量之胺基磷酸酯。此中所附加的是於Applied Biosystems 3 8 0B 型 DNA 合成儀上進行 1 . 2 及 6 . 4 循環之程式。 先製備以下結構之梳體: 3 -Tn g(TTX- )15GTTTGTGG- 51 (RGTCAGTp-5,)l5 其中X >是分支的單體,且R是高碘酸塩可解離之鏈結子 。以1 · 2循環策略,使用3 3 · 8毫克之胺丙基一衍生 化之胸苷控制孔玻璃(CPG) ( 2 0 0 0A,每克載 體 • - --Γ ~ ..............)................一.....................{......................裝......................訂 (請先閏讀背云之注意"項再項寫本頁) .Κ η : { ;I] t zi 'ύΐ % ί.Ά (CNS i 'p 4 ti- ( 210 X 297^ -16 - .
A6 __. _B6___ 15 五、發明説明( ) 有7 . 4微莫耳胸苷),先合成經由15 (ΤΤχβ)重 覆子之梳體部份。分支位置之核苷酸具下式: X,j4-OR: 骨架_〇 骨架 其中R 2代表
於合成梳體(不包括側鏈)時,々-氰基乙基胺基磷 酸酯單體於A、C、G及T時之濃度爲0 . 1M,於分支 位置單體E爲0 . 1 5M,及Phost:elTM試劑爲0 . 2M 。於去保護作用過程中,利用逐步之流過以3 %三氯醋酸 /二氯甲烷進行去三苯甲基化作用。結論爲5 — DMT以 乙醯基取代。 如下於每一分支單體位置處合成化式3 — — ii.· 4 RGTCAGTp (SEQ ID NO:1)之可解離 ir :ί 鏈結子R及六鹼基側鏈伸展作用。手工進行鹸基保護基之 | 去除(於上式中之R2 ),同時保留於合成梳體相同管柱 广 中之CPG載體。於R2 =乙醯丙酿基之例子時,引入 t ^ CNSi 210X297* ' -17- ..............-....丨 ........................{ ......................^ t請先閱讀背面之注意亊項再填筇本頁| A6 B6 1 c 五、發明説明( ) 0 · 5M水合胼於吡啶/冰醋酸(1 : 1 v/v )之溶液 ,並保持與CPG載體接觸9 0分鐘,並每1 5分鐘更新 液體,再以吡啶/冰醋酸(1 : 1 v/v )及後的乙睛 充份洗滌。一旦將可解離鏈結子R去保護後,可利用 6 . 4循環加入六鹸基側鏈之伸展。 於這些合成中,胺基磷酸酯之濃度爲0 .1M(除了 0 . 2 M R 及PhostelTM 試劑;R 爲 2,3 —二(苄醯 氧基)丁氧基)苯基)乙基一 2 -氰乙基一N,N —二異 丙基胺基磷酸2 — (4 —(4— (2 —二甲氧基三苯甲基 氧基)乙基)苯氧基酯 以3 %三氯醋酸/二氯甲烷之溶液,利用連續流過以 達成去三苯甲基作用,之後以甲苯/氯甲烷(1 : 1 v / v )溶液潤濕。於3 8 0及中利用、C E N Η 3 #循 環,自動地將分支之多核苷酸鏈自固相載體上除去。氫氧 化銨溶液收集於4毫升有螺蓋之Wheaton小瓶中,並在 6 〇 °C下加熱1 2小時以除去所有的鹸基保護基。冷卻至 室溫後,溶劑於高速眞空蒸發器中除去,殘留物則溶於 1 0 0微升水中。 也利用自動合成儀,進行以下結構之3 >骨架伸展( 片段A)、側鏈伸展及連接摸板/鏈結子: 3 >架構 伸展 S^TCCGTATCCTGGGCACAGAGGTGCp-S’ (SEQ ID N0:2) :;*:...........:::....................................................< .....................一裝…:::::訂 (請先閔讀背面之注意事項再塡苟本頁) 八川 t 3 by 孓j.nuCNS丨1P4从格1210X297公兑 1 -18 - A6 B6 17 五、發明説明( > 側鏈 伸展 3,-GATGCG(TTCATGCTGTTGGTGTAG)3-5,(SEQ ID NO: 3) 用於鏈結 3 ^架構伸 展之連接 模板 3, -AAAA/UAAiUGCACCTp-5,(SEQ ID N0:4) 用於鏈結 側鏈伸展 之連接模 板 3,-CGCATCACTGAC-5,(SEQ ID N〇 : 5) 粗製的梳體以標準的聚丙烯醯胺凝膠(7 %加上7M 尿素,及IX TBE操作緩衝溶液)方法純化。 如下將3 β架構伸展及側鏈伸展連接至梳體上。梳體 ,, (4微微莫耳/微升)、3 /架構伸展(6 . 2 5微微莫 .Γ.· 耳/微升)、側鏈伸展(9 3 · 7 5微微莫耳/微升)、 ^ 側鏈鏈結模板(7 5微微莫耳/微升)及架構鏈結模板(
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\ 5微微莫耳/微升)混合於ImM ATP/5mM i: 'I' D τ T / 5 0 m Μ Tris— HCI,PH8.0/ ;i. u 1 0 .m M MgCl2/2mM亞精胺中,並加上0. 5 1---1-. ..............一::::-L...............................................{ ......................^......................-玎 (請先閱^背面之注意事項再4¾本頁一 巡川中3γ掊半(CNS MP 4 WJV丨210 X 29 7公竑| -19 - 294722 A6 B6 18 五、發明説明( ) 單位/微升之T 4多核苷核激酶。混合物於3 7 °C下培育 2小時,再於水浴中加熱至9 5 °C,之後緩慢冷卻至3 5 eC以下歷1小時。加入2mM ATP、1 OmM DTT、14%聚乙二醇,及〇.21單位/微升T4連 接酶,混合物在2 3 °C下培育1 6 — 2 4小時。DNA沈 澱於N a C 乙醇中,懸浮於水中,再接受如下之第二 次連接作用。混合物調整至ImM ATP ' 5 m Μ D Τ.Τ、14% 聚乙二醇、50mM Tris— HC 芡 、pH7 . 5、1 OmM MgCj?_2 、2mM 亞精胺、 Ο . 5單位/微升T4多核苷酸激酶且加入〇 . 2 1單位 /微升T 4連接酶,·且混合物於2 3 °C下培育1 6〜2 4 小時。連接產物以聚丙烯醯胺凝膠電泳純化。 經過鏈接及純化後,部份產物標以32P,並在R位置 接受解離,係以N a I 0 4水溶液氧化1小時而達成。樣 品有以P A G E分析以決定所納入之側鏈伸展數目,係定 量凝膠中帶上之放射活性標記物。發現產物共有4 5個經 標記之探針結合位置。 實例2 Η I V D Ν Α利用多體之三明治式雜交分析 此實例說明於Η I V DNA分析中,本發明之用法 Ο 於此分析中使用5X3#擴大之溶液相核酸三明 治式雜交分析型式。、15X3^2設計衍生自此型式應 .........................{ .....................:裝:.::(……訂.................(-f {請先5?讀背面之注意事項再填寫本頁) .卜 A tk Λ 4:i! t a ta 1 CNS )甲·4 規格(2 U) X 297 公,兑丨 -20 - A6 ,_B6__ 19 五、發明説明( ) 用二種多體之事實:(1)擴大探針具有可結合至Η IV 之第一片段(Α),及可雜交至(2 )擴大多體之第二片 段(B),此擴大多體具有可雜交至片段(B)之第一片 段(B' ),及15個片段(C)之交互作用,其中片段 (C )雜交至三個經標記之寡核苷酸。 擴大及捕獲探針片段,及其個別於本分析法中之名稱 如下。 Η I V擴大探針 HIV. 104 (SEQ ID N0:5) TTCCTGGCAAAYYYATKTCTYCTAMTACTGTAT HIV. 105 (SEQ ID N0:6) CTCCAATTCCYCCTATCATTTTTGGYTTCCATY HIV. 106 (SEQ ID N0:7) KTATYTGATCRTAYTGTCYYACTTTGATAAAAC HIV. 108 (SEQ ID N0:8) GTTGACAGGYGTAGGTCCTACYAATAYTGTACC HIV.'110 (SEQ ID NO:9) YTCAATAGGRCTAATKGGRAAATTTAAAGTRCA HIV. 112 (SEQ ID N0:10) YTCTGTCAATGGCCATTGYTTRACYYTTGGGCC Η I V . 1 13 (SEQ ID NO : 1 1) TKTACAWATYTCTRYTAATGCTTTTATTTTYTC HIV.114 (SEQ ID NO: 12) ..::...:::-:…….....................(.....................:'.裝;:.........^…訂................碌 <請先閱讀背面之;±.意事項再項寫本頁> 21 A6 B6 20 五、發明説明( ) AAYTYTTGAAATYTTYCCTTCCTTTTCCATHTC HIV.115 (SEQ ID NO : 13) AAATAYKGGAGTATTRTATGGATTYTCAGGCCC HI V.116 (SEQ ID NO: 14) TCTCCAYTTRGTRCTGTCY.TTTTTCTTTATRGC HIV.117 (SEQ ID NO: 15) TYTYYTATTAAGYTCYCTGAAATCTACTARTTT HIV.120 (.SEQ ID N0:16) TKTTYTAAARGGYTCYAAGATTTTTGTCATRCT Η I V.121 (SEQ ID NO : 17) CATGTATTGATADATRAYYATKTCTGGATTTTG Η I V.122 (SEQ ID NO :18) TATYTCTAARTCAGAYCCTACATACAAATCATC Η I V.123 (SEQ ID NO : 19 ) TCTYARYTCCTCTATTTTTGYTCTATGCTGYYC Η I V.125 (SEQ ID NO : 20 ) AAGRAATGGRGGTTCTTTCTGATGYTTYTTRTC Η I V. 128 (SEQ ID NO : 21 ) TRGCTGCYCCATCTACATAGAAVGTTTCTGCWC Η I V.130 (SEQ ID NO :22) GACAACYTTYTGTCTTCCAYTGTYAGTWASATA HIV.132 (SEQ ID N0:23) YGAATCCTGYAAVGCTARRTDAATTGCTTGTAA HIV.133 (SEQ ID N0:24) 各丨丨中a a孓战4^CNSl甲4规格丨210x297公i - <請先閲^背面之注意亊項再堉窍衣頁) .裝
.*1T A6 B6 五、發明説明( ) YTGTGARTCTGTYACTATRTTTACTTCTRRTCC Η I V . 135 (SEQ ID NO : 25) TATTATTTGAYTRACWAWCTCTGATTCACTYTK HI V.136 (SEQ ID NO : 26) CAGRTARACYTTTTCCTTTTTTATTARYTGYTC Η I V.137 (SEQ ID NO : 27 ) TCCTCCAATYCCTTTRTGTGCTGGTACCCATGM Η I V.138 (SEQ ID NO :28 ) TCCHBBACTGACTAATYTATCTACTTGTTCATT Η I V.139 (SEQ ID NO :29) ATCTATTCCATYYAAAAATAGYAYYTTYCTGAT HIV.141 (SEQ ID N0:30) GTGGYAGRTTAAARTCAYTAGCCATTGCTYTCC HIV .142(SEQ ID NO : 31) CACAGCTRGCTACTATTTCYTTYGCTACYAYRG HIV.144 (SEQ ID N0:32) RYTGCCATATYCCKGGRCTACARTCTACTTGTC Η I V.145 (SEQ ID NO : 33 ) DGATWAYTTTTCCTTCYARATGTGTACAATCTA HIV.146 (SEQ ID N0:34) CTATRTAKCCACTRGCYACATGRACTGCTACYA HIV.147 (SEQ ID N0:35) CYTGYCCTGTYTCTGCTGGRATDACTTCTGCTT Η I V.149 (SEQ ID NO : 36 ) ,::...…..:::.....................(.....................:-裝.:…..:::::訂 (熗先間*:ί5背面之注意事項再"寫本頁) 卞Ά汰八砍:4川中4囚孓f’A參(CN’S丨Υ 4从心10 X 297公垃I -23 - A6 . B6 22 五、發明説明( ) TGSKGCCATTGTCTGTATGTAYTRYTKTTACTG HIV.151 (SEQ ID N0:37) GAATKCCAAATTCCTGYTTRATHCCHGCCCACC Η I V.152 (SEQ ID NO : 38) ATTCYAYTACYCCTTGACTTTGGGGRTTGTAGG HIV.153 (SEQ ID N0:39) GBCCTATRATTTKCTTTAATTCHTTATTCATAG Η I V.154 (SEQ ID NO : 40 ) CTSTCTTAAGRTGYTCAGCYTGMTCTCTTACYT HIV.155 (SEQ ID N0:41) TAAAATTGTGRATRAAYACTGCCATTTGTACWG Η I V. 156 (SEQ ID NO : 42) CTGCACTGTAYCCCCCAATCCCCCYTYTTCTTT HIV.157 (SEQ ID N0:43) TGTCTGTWGCTATYATRYCTAYTATTCTYTCCC Η I V.158 (SEQ ID NO : 44)
TTRTRATTTGYTTTTGTARTTCTYTARTTTGTA Η I V捕獲探針 HIV.103 (SEQ ID N0:45) CATCTGCTCCTGTRTCTAATAGAGCTTCYTTTA HIV.Ill (SEQ ID N0:46) ATCCATYCCTGGCTTTAATTTTACTGGTACAGT HI V.118 (SEQ ID NO : 47) /-i/'l ;Λ ^ ΐ f;-'1-(CXSl'|Μ^^ι210χ 297^Αί 24 ........................·.....................{ ........................^.......................玎...............z {請先閲讀背面之注意丰項再4寫本頁} A6 B6 23 五、發明説明( ) TATTCCTAAYTGRACTTCCCARAARTCYTGAGT HIV.119 (SEQ ID N0:48) ACWYTGGAATATYGCYGGTGATCCTTTCCAYCC HIV. 126 (SEQ ID N0:49) CCATTTRTCAGGRTGGAGTTCATAMCCCATCCA HIV.127 (SEQ ID N0:50) CTAYTATGGGKTCYKTYTCTAACTGGTACCAYA HIV.134 (SEQ ID N0:51) ATCTGGTTGTGCTTGAATRATYCCYARTGCATA HIV . 143 (SEQ ID NO : 52) CATGCATGGCTTCYCCTTTTAGYTGRCATTTAT HIV.150 (SEQ ID N0:53) AACAGGCDGCYTTAACYGYAGYACTGGTGAAAT Η I V . 159 (SEQ ID NO : 54 ) TGTCYCTGTAATAAACCCGAAAATTTTGAATTT 每一擴大探針除了寅質上互補於Η I V序列之序列外 ,尙含有互補於擴大多體片段之下列5伸展 AGGCATAGGACCCGTGTCTT(SEQ ID N0:55)° 每一捕獲探針,除了實質上互補於Η I V DNA之 序列外,尙含有互補於結合至固相之DNA (ΧΤ1·) 之下游序列: <請先閃^背面之注意亊項再堉驾本頁) .裝 訂 人乂八 Α 占 $ 丨.:6^- ( C.\S ) Υ .1 觇格(21() X 297公兌 I 25 - 294722 A6 B6 五、發明説明(~ ) CTTCTTTGGAGAAAGTGGTG (SEQ ID N0:56)。 除了擴大及捕獲探針。以下的Η I V空間寡核苷酸組 也包括在雜交混合物中。 Η I V空間子寡核g酸 Η I V . N0X107 (SEQ ID NO : 57) TATAGCTTTHTDTCCRCAGATTTCTAYRR, HIV.N0X109 (SEQ ID N0:58) VCCAAKCTGRGTCAACADATTTCKTCCRATTAT, Η I V.N0X124 (SEQ ID NO :59) TGGTGTGGTAARYCCCCACYTYAAYAGATGYYS, HIV..N0X129 (SEQ ID N0:60) TCCTGCTTTTCCYWDTYTAGTYTCYCTRY, Η I V.N0X131 (SEQ ID NO : 61 ) YTCAGTYTTCTGATTTGTYGTDTBHKTNADRGD, HIV.N0X140 (SEQ ID N0:62) AATTRYTGTGATATTTYTCATGDTCHTCTTGRGCCTT, Η I V . N0X148 (SEQ ID NO : 63) GCCATCTKCCTGCTAATTTTARDAKRAARTATGCTGTYT. 微滴定盤之製備如下。自Dynatech Inc.購得White Microlite 1 Removawel丨長條(聚苯乙烯微滴定盤,9 6 {請先閱讀背面之注意事項再珥寫本頁) .裝 *ΐτ -26 - A6 B6 五、發明説明( ) 孔洞/盤)。各個孔洞充填 並在室溫下培育1 5 — 2 0
次, N a 再次 。此 均分 酸之 肽溶 /毫 至各 育一 液體 XT 毫克 甲醯 至1 7 . 以磁 m Μ D S 且吸取孔 Ο Η 2 Ο 以1 X Ρ 聚(苯丙 多肽具1 子量爲每 平均長度 液與2 Μ 升(Ρ Η 孔洞。盤 夜。之後 洞以移 0微升 B S洗 胺酸一 :1莫 莫耳4 ,且含 N a 6 . 0 再覆以 盤以1 去液體 ,並於 4次, 賴胺酸 耳濃度 7 , 9 1 5 5 C又/ )之終 塑膠膜 X Ρ Β 使用以下步驟以偶合寡 1 '之合成述於Ε Ρ A 的辛二酸二琥珀醯亞胺 胺(D M F )中。2 6 〇 〇微升的偶合緩衝溶 8)。再將偶合混合物 性搅拌器攪拌3 0分鐘 WIN HCJ2200 微升, 分。之後以1XPBS洗盤4 。孔洞再充塡以1 N 室溫下培育1 5 — 2 0分。盤 且吸取孔洞以移去液體。 )購自 S i g in a C h e m i c a 1,I π c . 比率之phe : 1 ys,且平 0 0克。其具有3 0 9個胺基 胺/莫耳。1毫克/毫升之多 1XPBS混合至0.1毫克 濃度。取此溶液1 0 0微升加 以避免乾燥,並於3 0°C下培 S洗4次,並吸取孔洞以除去 核苷酸XT 1 ·至盤中。 883096976°20 基酯溶於3 0 0微升的二甲替 OD260單位之XT 1 '加 液中(5 OmM磷酸鈉,pH 加至DSS— DMF溶液,並 。NAP— 2 5 管柱,以 1 〇 .........................一........一....................i ........................t......................•玎.................ί·%. {汁先"請背面之:;ί意事項再填寫本頁) 磷酸鈉ρ Η 平衡 於4 °C下,將偶合混合物 S — DMF溶液加至2毫升1 〇mM磷酸鈉,pH 5中。旋轉攪拌混合物至其混合,並塡料至已平衡之 木认怅尺/1遇;丨1中囚四家戍準(〇化)甲4規格(210><297公发1 -27 - 咬濟部中央一ϊ毕/.jn工消伢合作社印¾ Α6 Β6 五、發明說明( NAP~~2 5管柱中。以DSS —活化之XT1-DNA以3 . 5毫升1 酸鈉,pH6 . 5溶離出 管柱。5 . 6 0 D 2 6。單位之經溶離的D .S S -活化之 XT1_DNA加至1 5 0 0毫升5 OmM磷酸鈉,pH 7 . 8中。此溶液取50微升加至各孔洞,且盤培育—夜 。盤再以1 XPBS洗4次,且吸取孔洞以除去液體。 盤最終之洗條完成如下。含0.5%(w/v) SDS之2 0 0微升0 . 2N NaOH加至各孔洞。盤 再覆以塑膠膜並於6 5。(:下培育6 0分。之後以1 X P B S洗盤4次,再吸取孔洞以除去液體。經洗滌之盤加 上乾燥劑小珠貯於2 — 8 Ό下。 Η I V DNA之標準曲線製備,係將經選殖之 Η I V DNA稀釋於Η I V陰性人類血清中,再將相當 於 1 0 至 2 0 0 tmο 1 e = ( 1 0 2 分子或 1 〇_21莫耳)之稀釋液加至如上製備之微滴定皿孔洞中 Ο 樣品之製備包括將1 2 . 5微升之P_K緩衝溶液( 2毫克/毫升蛋白酶Κ於1 OmM Tr i s— HCi?, p Η 8 . 0/0 . 1 5 M NaCi2/10mM EDTA,pH8 . 0/1% SDS/4 0 微克/毫升 經音波震盪之鮭魚精子DNA )遞送至各孔洞。盤加蓋, 且搅動以混合樣品,並於6 5 °C下培育以釋出核酸,再於 桌上冷卻5分鐘。 將Η I V專一性擴大及捕獲探針(上述)之摻合液加 本纸張尺度適用+因S家標準(CNS)T4规格(210x297公釐> .....................................................................................裝......................訂.....................線 f請先閱讀背面之注意事項再埸寫本頁) -28 - A6 _. B6 27 五、發明説明( ) 至各孔洞(5 0毫微微莫耳/孔洞,於IN NaOH中 )。盤加蓋,緩和搅動以混合試劑,再於6 5 eC下培育 3 0分。 再加中和作用緩衝溶液至各孔洞(0 . 7 7M的3 — (N —嗎福啉基)丙烷磺酸/1.8 4 5M N a C / 〇 1 8 5M檸檬酸鈉)。盤加盖,並於6 5°C下培育 1 2 - 1 8小時。 攪動各孔洞之內容物,以移去所有流體,孔洞再以洗 滌緩衝溶液(〇.l%SDS/0.015M NaCi /0 . 0 0 1 5M檸檬酸鈉)洗滌2次。 再加擴大多體至各孔洞(4 0微升的2 . 5毫微微莫 耳/微升溶液,於5 0%馬血清/0 . 0 6M NaC又 /0 . 0 6M檸檬酸鈉/0 . 1%SDS以1 : 1混以4 X .SSC/0 . l%SDS/0 · 5%、阻斷試劑 V ( Boehringer Mannheim, Cat No. 1096176))。盤子加盖 後攪動以混合孔洞之內容物,盤再於6 5 °C下培育1 5分 鐘0 經室溫下再5-10分鐘後,孔洞如上述般洗滌。 之後將揭示於EP 8 8 3 0 9 6 9 7 6中之鹸性磷 酸酶標記探針加至各孔洞(2 · 5毫微微莫耳於4 0微升
/孔洞)°經5 5°C下培育15分鐘後及室溫下5 — 10 分鐘後,孔洞如上述地洗二次,再以0 .015M
NaCp/Ο . 0 0 1 5M檸檬酸鈉洗3次。 應用得自L u m i g e η , I n c之酵素啓動之d i ο X e t a π e ( .......................................................{ ........................^........................玎................《# ί;ί先'""·"面之:;xt事項再4寫本頁} : :tl 中;y d 苯敁 4l-1 CNS 丨 r 4 规格(211) X 297 公兑 I -29 - .A6 __.___B6_ 28 五、發明説明( )
Schaap e t a 1 . , Tet. Lett. ( 1 9 8 7 ) 2 8 : 1159-1162 及 EPA Pub. No. 〇 2 5 4 0 5 1 )。偵測步驟如下。力卩2 0微升之1^1!11?-h〇s 5 3 0 ( Lumigen )至各孔洞。孔洞輕拍使試劑落 至底部,再緩和旋轉以將試劑均勻分佈於底部。孔洞加蓋 ,並在3 7 °C下培育4 0分鐘。 盤於Dynatech ML 1 0 0 0發光計中讀取。於反 應中當產生之光完全稹分則示出產量。 結果示於下表。以陰性控制組之平均加2個標準偏差 及樣品之平均減2個標準偏差(^)間之差異來表示各檫 準樣品之結果。若β大於0 ,樣品被視爲陽性。 Η I V探針標準曲線結果示於表I。結果顯示這些探 針組偵測5 0 Ttino 1 e HIV DNA標準品之能力。 30 - :.:-!:......................{ ......................裝.:'::訂................< π ~請先¾¾背面之注意亊項再堉寫本頁} A6 B6 五、發明説明(
表I 分析物Η I V t m ο 1 e /孔洞 Ο 1 Ο 2 Ο 5 Ο 10 0 2 Ο Ο -Ο 5 5 6 5 1 3 9 9 3 4 8 <ifr先閲ΪΑ背面之注意事項再填窍本頁一 .裝 實例 Η I V病毒RNA之偵測 利用基本上和上文相同之步驟,但有以下變化來偵測 Η I V R N A ° 製備HIV RNA之標準曲線,係將HIV病毒貯 品連續稀釋於正常人類血清中,使達1 2 5至5 0 0 0 TC I d5〇 /毫升之範圍(TC I D5〇是5 0 %組織培養 @染劑量之終點)。製備蛋白酶K溶液,係將10毫克蛋 白酶匕加至5毫升111¥捕獲稀釋劑中(5 3〇1^4 1^3 〜HC 芡,pH8/l〇 . 6mM EDTA/1 . 3% SdS/1 6微克/毫升音波震盪之鮭魚精子DNA/ Ί 14川中彐d m丨CNS ί f 4柷仏(2 U) X 297公垃 -31 - 30 A6 B6 五、發明説明( 5 . 3XSSC/1毫克/毫升蛋白酶K),於甲醢胺中 製成7 %溶液,再貯於—2 0°C下。等莫耳澳度之捕獲探 針、標記探針及空間寡核苷酸之混合物加至蛋白酶上溶液 中,如此各探針之終濃度爲1 6 7 0毫微微莫耳/毫升。 加3 0微升探針/蛋白酶K溶液至上述製備之微滴定盤各 孔洞後,加1 0微升適當的病毒稀釋液至各孔洞。盤加蓋 ,窠盪混合再於6 5 °C下培育1 6小時。 盤自培育箱中移出,置桌上冷卻10分鐘。孔洞如上 實例2般洗2次。15X3多體稀釋於Amp/標記物稀 釋劑中(其製備是混合2 . 2 2毫升DEPC處理過的 H2〇 (DEPC是焦碳酸二乙酯),1 . 3 5毫升1 0 %SDS,2 4 0 微升 1M Tris, pH8 . 0,2 0 微升 馬血清混合,於蛋白酶K中調至2毫克/毫升,並於6 5 °C下加熱2小時,再加至2 4 0微升〇 . 1 Μ P M S F 中,3 7°C下加熱1小時,此中再加入4毫升經DEPC 處理之水,4毫升1 0%SDS及8毫升2 0XSSC) 使達1毫微微莫耳/微升。經稀釋之1 5X3多體以4 0 微升/孔洞加入,封盤震盪,再於5 5 °C下培育3 0分鐘 盤於室溫下冷卻10分鐘,再如上洗滌。鹼性磷酸酶 檫記探針,於Amp/檫記物稀釋劑中稀釋至2 .5毫微 微莫耳/微升,再加4 0微升至各孔洞。封盤,MM,再 於5 5°C下培育1 5分。 盤於室溫下冷卻1 0分鐘,如上洗滌兩次,再以 - - - , Γ -.........................................................{ .......................I......................玎................ί ^ {請先閉ii背面之)±意苹碩再堉寫本頁一 • 屮 d y 孓G4UCXS1 甲4規 ίΜ21()χ 297公兌 -32 A6 __. B6 31 五、發明説明( ) 0..15M NaCi/〇.〇15M檸檬酸鈉洗滌三次 。加入受質並如上偵測發光。分析之靈敏度爲約1 · 2 5 TC I Ds◦,如下表所示。.
表I I
T C I D 5 〇 S (請先聞詁背面之注意事項再4寫大Μ貝一
實例4 比較聚集的及散佈的探針紺 利用基本上和實例3相同之步驟偵測Η I V R N A ,除了以下變化。R N A標準品之製備,係利用T 7 RNA聚合酶將9 . OKB HIV轉錄子自質體 pBHBKl 0 S 中轉錄(chang, P.S., et al Clin. Biotech. 2:23, 1990)。此 HIV RNA 以 gag 及 pol探針雜交而定量,並由HAP層析法捕獲。RNA標 準品如上述般連續稀釋於蛋白酶K稀釋劑中,使達每毫升 -33 - 294722 A6 B6 32 五、發明説明( ) 約2 . 5至1 0 0 土 raole之間。並將等莫耳濃度之捕獲 探針,標記探針,及空間寡核苻酸之混合物加入,如此各 探針的澳度爲約1 6 7 0毫微微莫耳/毫升。試驗捕獲及 標記探針的二種安排:散開式捕獲探針,如此捕獲探針與 標記探針散置,及聚集之捕獲探針,如此捕獲探針與標記 探針排列於連續群中。成群聚集之探針組示於下。 成群聚集之捕獲探針 HIV.116 (SEQ ID NO: 14) TCTCCAYTTRGTRCTGTCYTTTTTCTTTATRGC HIV.117 (SEQ ID NO: 15) TYTYYTATTAAGYTCYCTGAAATCTACTARTTT Η I V . 118 (SEQ ID NO : 47) TATTCCTAAYTGRACTTCCCARAARTCYTGAGT HIV.119 (SEQ ID N0:48) ACWYTGGAATATYGCYGGTGATCCTTTCCAYCC HIV. 120 (SEQ ID NO: 16) .if. (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁一 TKTTYTAAARGGYTCYAAGATTTTTGTCATRCT Η I V . 155 (SEQ ID NO : 41) TAAAATTGTGRATRAAYACTGCCATTTGTACWG Η I V . 156 (SEQ ID NO : 42 ) CTGCACTGTAYCCCCCAATCCCCCYTYTTCTTT HIV. 157 (SEQ ID N0:43) N -;k rl ;tl S by 'ic 4'-1 CNS I ψ 4 hi i,v ( 2 Π) X 297 ^ ) -34 * 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A6 B6 五、發明説明(33 TGTCTGTWGCTATYATRYCTAYTATTCTYTCCC HI V.158 (SEQ ID NO:44) TTRTRATTTGYTTTTGTARTTCTYTARTTTGTA HIV.159 (SEQ ID NO:54)
TGTCYCTGTAATAAACCCGAAAATTTTGAATTT 成群聚集之Η I V擴大探針 HIV .103 (SEQ ID NO :45) CATCTGCTCCTGTRTCTAATAGAGCTTCYTTTA HIV.104 (SEQ ID N0:5) TTCCTGGCAAAYYYATKTCTYCTAMTACTGTAT HIV.105 (SEQ ID N0:6) CTCCAATTCCYCCTATCATTTTTGGYTTCCATY HIV.106 (SEQ ID NO:7) KTATYTGATCRTAYTGTCYYACTTTGATAAAAC HIV.108 (SEQ ID N0:8) GTTGACAGGYGTAGGTCCTACYAATAYTGTACC HIV.110 (SEQ ID NO:9) YTCAATAGGRCTAATKGGRAAATTTAAAGTRCA HIV.Ill (SEQ ID N0:46) ATCCATYCCTGGCTTTAATTTTACTGGTACAGT HIV.112 (SEQ ID N0:10) YTCTGTCAATGGCCATTGYTTRACYYTTGGGCC HIV.113 (SEQ ID NO : 11 ) 一 本紙張尺度通用中國國家標準(CNS)甲4规格(210 X 297公發) _ 35 — (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁)
A6 B6 五、發明説明(34) TKTACAWATYTCTRYTAATGCTTTTATTTTYTC HIV.114 (SEQ ID NO:12) AAYTYTTGAAATYTTYCCTTCCTTTTCCATHTC HIV .115 (SEQ ID NO:13) AAATAYKGGAGTATTRTATGGATTYTCAGGCCC HI V.121 (SEQ ID NO:17) CATGTATTGATADATRAYYATKTCTGGATTTTG HIV.122 (SEQ ID NO:18) TATYTCTAARTCAGAYCCTACATACAAATCATC HIV.123 (SEQ ID NO:19) TCTYARYTCCTCTATTTTTGYTCTATGCTGYYC HIV.125 (SEQ ID N0:20) AAGRAATGGRGGTTCTTTCTGATGYTTYTTRTC HIV .126 (SEQ ID NO:49) CCATTTRTCAGGRTGGAGTTCATAMCCCATCCA HIV.127 (SEQ ID N0:50) CTAYTATGGGKTCYKTYTCTAACTGGTACCAYA HIV.128 (SEQ ID NO : 21 ) 經滴部中央標準局員工消費合作社印製 (請先閲讀背面之注意事項再塡寫本頁) TRGCTGCYCCATCTACATAGAAVGTTTCTGCWC HIV.130 (SEQ ID N0:22) GACAACYTTYTGTCTTCCAYTGTYAGTWASATA HIV.132 (SEQ ID N0:23) YGAATCCTGYAAVGCTARRTDAATTGCTTGTAA HIV . 133 (SEQ ID NO:24) 一 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公釐) -36 - A6 B6 五、發明説明(35) YTGTGARTCTGTYACTATRTTTACTTCTRRTCC HIV.134 (SEQ ID NO:51) ATCTGGTTGTGCTTGAATRATYCCYARTGCATA HIV .135 (SEQ ID NO : 25) TATTATTTGAYTRACWAWCTCTGATTCACTYTK HIV .136 (SEQ ID NO : 26) CAGRTARACYTTTTCCTTTTTTATTARYTGYTC HIV.137 (SEQ ID NO:27) TCCTCCAATYCCTTTRTGTGCTGGTACCCATGM HIV.138 (SEQ ID NO:28) TCCHBBACTGACTAATYTATCTACTTGTTCATT HIV.139 (SEQ ID N0:29) ATCTATTCCATYYAAAAATAGYAYYTTYCTGAT HIV .141 (SEQ ID NO:30) GTGGYAGRTTAAARTCAYTAGCCATTGCTYTCC HIV.142(SEQ ID NO : 31) CACAGCTRGCTACTATTTCYTTYGCTACYAYRG HIV .143 (SEQ ID NO : 52) 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) -裝_ CATGCATGGCTTCYCCTTTTAGYTGRCATTTAT HIV.144 (SEQ ID NO:32) RYTGCCATATYCCKGGRCTACARTCTACTTGTC HIV.145 (SEQ ID N0:33) DGATWAYTTTTCCTTCYARATGTGTACAATCTA HIV.146 (SEQ ID N0:34)— 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公釐) -37 - A6 B6 五、發明説明(36) CTATRTAKCCACTRGCYACATGRACTGCTACYA HIV.147 (SEQ ID N0:35) CYTGYCCTGTYTCTGCTGGRATDACTTCTGCTT HIV.149 (SEQ ID N0:36) TGSKGCCATTGTCTGTATGTAYTRYTKTTACTG HIV.150 (SEQ ID N0:53) AACAGGCDGCYTTAACYGYAGYACTGGTGAAAT HIV.151 (SEQ ID N0:37) GAATKCCAAATTCCTGYTTRATHCCHGCCCACC HIV.152 (SEQ ID N0:38) ATTCYAYTACYCCTTGACTTTGGGGRTTGTAGG HIV.153 (SEQ ID N0:39) GBCCTATRATTTKCTTTAATTCHTTATTCATAG HIV.154 (SEQ ID N0:40)
CTSTCTTAAGRTGYTCAGCYTGMTCTCTTACYT 於加3 0微升分析物/探針/蛋白酶K溶液至各孔洞 後,加入1 ◦微升正常人類血清,且如實例3酸進行分析 。如表I I I所示,以散佈及成群之捕獲排列所得分析物 之靈敏度是相似的。使用散佈式捕獲添加物之靈敏度為 5 0至1 0 0 tmole,而成群聚集之捕獲添加物,靈敏 度為 1 0 0 — 5 0 0 tmole。 張尺度適用中國國家標毕(CNS〉甲4規格(210 X 297公货) (請先閲讀背面之注意事項再塡寫本頁) •丨裝_ 訂· 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 -38 - A6 B6 五、發明説明(37) ^_3 探針安排 分析物t m ο 1 e δ 成群聚集 0 ― - ― 2 5 -0 . 16 5〇 〇. 3 6 10 0 0 . 6 5 5 0 0 4 . 4 5 10 0 0 6 . 2 4 散置的 〇 _. ― 2 5 -0 . 2 4 5〇 0 . 2 5 1 0 0 -0 . 11 5 0 0 2 . 5 2 10 0 0 4 . 7 9 (請先閲讀背面之注意事項再塡寫本頁) —裝. '17. 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 上述進行本發明模式之變化,對精於生化學、核酸雜 交分析及相關領域之人士是淺顯的,且意欲在以下的申請 專利範圍之内。 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公釐) -39 -
—q附件二A : 第82100463號專利申請案中文說明書修正頁 71 A7 B7 民國84年4月修正 五、發明説明(w-/) 如下所示序列表中符號之意義. (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 裝_ R. W S. V. K. V. H. D. B. N.
A 或.G A 或 T/U -
C或G C 或 T/U '
G 或 T7U A或C或G:「非T/U A或C摄T/U::非G A 截 G. iT/U: :非 C . C,^G^T/U:#A — (A或C或G或T/i〇或(赤知或其杉
、1T 經濟部中央標準局員工消費合作社印装 本紙張尺度適用中國國家橾準(CNS ) A4規格(210X297公釐) 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A6 B6 五、發明説明(38) 序列表 (1 ) 一般資料 (i )串請人'Irvine,Bruce D. Horn, Thomas Chang,Chu-An (i i )發明標題:用於溶液相三明治式雜交分析内之 Η I V探針 (i i i)序列數目:6 3 (iv)通訊住址 (A )收信人 *· Morrison & Foerster (B )街:755 Page Mill Road (C)市:Palo Alto (D )州:加州 (E )國家:U S A (F ) ZIP : 94304-1018 (v )電腦可讀型式 (A)介質型式:Floppy disk (B )電腦:I B Μ P C可相容 (C) 操作糸統:PC — DOS/MS — DOS (D) 軟骨豊:Patent In Release #1.0, Vers ion #1·25 (v i)目前申請資料 (A)申請编號—:0 7/ 813,583 (請先閲讀背面之注意事項再塡寫本頁) .裝. 訂. .4, 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS〉甲4規格(210 X 297公釐〉 -40 - A6 B6 294722 五、發明説明(39) (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) (B) 立檔日期:23 — DEC — 1991 (C )分類: (vi Π)法律事務資料 (A)名稱:Thomas E. Ciotti (B )註冊號:2 1 , ◦ 1 3 (C) 參考/索引:22300— 2 0 1 5 0.〇〇 (ix)電傳資料: (A) 電話:415 — 813-56 0 0 (B) 電報:415— 494-0 792 (C) 電傳:7 0 6141 (2 ) S E Q, ID N〇:l之資料 (i )序列特性 (A)長度:24鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 U i)序列說明:S E Q ID N 0 : 1 經濟部中央標準局員工消費合作社印製
CGTGGAGACA CGGGTCCTAT GCCT (2 ) S E Q ID N〇:2 之資料 (i )序列待性 (A)長度:6_0鹼基對 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公釐) -41 - A6 _B6_ 五、發明説明(40) (請先閲讀背面之注意事項再塡寫本頁) (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (Xi)序列説明:SEQ ID Ν Ο : 2 :
GATGTGGTTG TCGTACTTGA TGTGGTTGTC GTACTTGATG TGGTTGTCGT ACTTGCGTAG (2 ) S E a ID N0:3 之資料 (i )序列特性 (A )長度:1 6鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (X i)序列説明:S E Q ID N〇:3 :
TCCACGAAAA AAAAAA 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公釐) -42 - 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A6 B6_ 五、發明説明(41) (2) SEQ ID N〇:4之資料 (i )序列特性 (A )長度:1 2鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
(xi)序列說明:SEQ ID N 0 : 4 : CAGTCACTAC GC (2) SEQ ID N〇:5之資料 (i )序列待性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
(χ〇 序列說明:SEQ ID N 0 : 5 : TTCCTGGCAA AYYYATKTCT YCTAMTACTG TAT (2 ) S E Q ID N〇:6 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核i (請先閲讀背面之注意事項再場寫本頁) i .裝. 訂. 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公釐) -43 - 經濟部中央標準局員工消費合作社印制衣 A6 B6 五、發明説明(42) (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (X i)序列説明:S E Q ID N 0 : 6 :
CTCCAATTCC YCCTATCATT TTTGGYTTCC ATY (2 ) S E Q ID N〇:7 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (X i)序列説明:S E Q ID N 0 : 7 :
KTATYTGATC RTAYTGTCYY ACTTTGATAA AAC (2 ) S E Q ID N0:8 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
Ui)序列說明:SEQ ID N 0 : 8 : ----------*---------------裝------.玎------^ (請先閲讀背面之注意事項再塡本頁) 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公釐) 一44 — 經濟邡中央標準居員工消費合作社印製 A6 _B6 _ 五、發明説明(43)
GTTGACAGGY GTAGGTCCTA CYAATAYTGT ACC (2 ) S E Q ID N0:9 之資料 (i )序列特性 (A)長度:’33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
(xi)序列說明:SEQ ID N 0 : 9 : YTCAATAGGR CTAATKGGRA AATTTAAAGT RCA (2 ) S E Q ID N0:10 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
(X i)序列說明:S E Q ID NO: 10* YTCTGTCAAT GGCCATTGYT TRACYYTTGG GCC (2 ) S E Q. ID NO:ll 之資料 (i )序列特性 _ (請先閲讀背面之注意事項再塡寫本頁) 裝· 、可, 本紙張尺度適用中囷國家標準(CNS〉甲4規格(210 X 297公釐) -45 — 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A6 B6 五、發明説明( (Α)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (xi)序列說明:SEQ ID NO: 11:
.TKTACAWATY TCTRYTAATG CTTTTATTTT YTC (2 ) S E Q ID N 0 : 1 2 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (xi)序列說明:SEQ ID NO: 12:
AAYTYTTGAA ATYTTYCCTT CCTTTTCCAT HTC (2 ) S E Q ID NO:13 之資料 (i )序列待性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:高型 (請先閲讀背面之注意事項再塡寫本頁) 丨裝· 訂. 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公* ) -46 - 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A6 B6 五、發明説明(45)
(X i)序列說明:S E Q ID NO: 13: AAATAYKGGA GTATTRTATG GATTYTCAGG CCC (2 ) S E Q ID NO: 14之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
(X i)序列說明:S E Q ID NO: 14: TCTCCAYTTR GTRCTGTCYT TTTTCTTTAT RGC (2 ) S E Q ID N O : 1 5 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
U ί)序列説明:S E Q ID NO: 15: TYTYYTATTA AGYTCYCTGA AATCTACTAR TTT (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) _裝· *π. 本紙張尺度通用中國國家標準(CNS)甲4规格(210 X 297公;¢) —47 - A6 B6 五、發明説明(46) (2) SEQ ID N0:16之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (xi)序列説明:SEQ ID NO: 16:
TKTTYTAAAR GGYTCYAAGA TTTTTGTCAT RCT (2 ) SEQ ID N〇:17 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (xi)序列說明:SEQ ID NO: 17: 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 (請先閲讀背面之注意事項再塡寫本頁)
CATGTATTGA TADATRAYYA TKTCTGGATT TTG (2 ) SEQ ID N〇:18 之資料 (i )序列特性
(A)長度:33鹼基對 (B )型式:核S 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公坌) -48 - 294722 A6 B6 五、發明説明(47) (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (χί)序列說明:SEQ ID NO: 18:
TATYTCTAAR TCAGAYCCTA CATACAAATC ATC (2 ) S E Q ID NO:19 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (xi)序列說明:SEQ ID NO: 19:
TCTYARYTCC TCTATTTTTG YTCTATGCTG YYC (2 ) S E Q. ID N0:20 之資料 (i )序列特性 經濟部中央標準局負工消費合作社印製 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 U i)序列説明:S E Q ID Ν Ο : 2 0 : -49 - (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) —裝· 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS〉甲4規格(210 X 297公釐) A6 B6 五、發明説明(48)
AAGRAATGGR GGTTCTTTCT GATGYTTYTT RTC (2 ) S E Q ID N0:21 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
(X i)序列說明:S E Q ID N 0 : 2 1 : TRGCTGCYCC ATCTACATAG AAVGTTTCTG CWC (2) SEQ ID N0:22之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D)拓撲學:線型 經濟部中央標準局員工消费合作社印製 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) (xi)序列説明:SEQ ID N 0 : 2 2 : GACAACYTTY TGTCTTCCAY TGTYAGTWAS ΑΤΑ (2 ) SEQ ID N0:23 之資料 (i )序列特性 — 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公釐) -50 - 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A6 _B6_ 五、發明説明(49) (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (xi)序列説明:SEQ ID N 0 : 2 3 :
YGAATCCTGY AAVGCTARRT DAATTGCTTG TAA (2) SEQ ID N0:24之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (xi)序列說明:SEQ ID N 0 : 2 4 :
YTGTGARTCT GTYACTATRT TTACTTCTRR TCC (2 ) S E Q ID N0:25 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:备型 (請先閲讀背面之注意事項再塡寫本頁) —裝. 訂. 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4规格(210 X 297公釐) -51 - A6 B6 五、發明説明(50 ) (請先閲讀背面之注意事項再塡寫本頁)
(xi)序列説明:SEQ ID Ν Ο : 2 5 : TATTATTTGA YTRACWAWCT CTGATTCACT YTK (2 ) S E Q ID N0:26 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
(xi)序列説明:SEQ ID Ν Ο : 2 6 : CAGRTATACY TTTTCCTTTT TTATTARYTG YTC (2 ) S E Q ID N0:27 之資料 (i )序列特性 經濟部中央標準局8工消費合作社印3衣 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
Ui)序列說明:SEQ ID Ν Ο : 2 7 :
TCCTCCAAYT CCTTTRTGTG CTGGTACCCA TGM 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4规格(210 X 297公坌) -52 - 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A6 B6 五、發明説明(51 ) (2 ) S E Q ID N0:28 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (X i)序列説明:S E Q ID N 0 : 2 8 : TCCHBBACTG ACTAATYTAT CTACTTGTTC ATT (2 ) S E Q. ID N0:29 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (xi)序列説明:SEQ ID N 0 : 2 9 : ATCTATTCCA TYYAAAAATA GYAYYTTYCT GAT (2 ) S E a ID N0:33 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公釐) 一 53 - A6 B6 294722 五、發明説明(52 ) (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (X i)序列説明:S E Q ID N 0 : 3 0 :
GTGGYAGRTT AAARTCAYTA GCCATTGCTY TCC (2 ) S E Q ID NO :31 之資料 (i )序列特性 (A)長度:3 3驗基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D)拓撲學:線型 (X i)序列説明:S E Q ID Ν Ο : 3 1 :
CACAGCTRGC TACTATTTCY TTYGCTACYA YRG (2 ) S E Q ID NO:32 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (X i)序列説明:3£(^ ID Ν Ο : 3 2 : 本紙張尺度通用中國國家標华(CNS>甲4規格(210 X 297公货〉 _ ρ-Λ _ ------;---·'·-------^-----裝------訂------'"1 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 經濟部中央標準居員工消費合作社印製 A6 B6 五、發明説明(53 )
RYTGCCATAT YCCKGGRCTA CARTCTACTT GTC (2 ) S E Q ID N0:33 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹸基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (X i)序列説明·· S E Q ID Ν Ο : 3 3 ··
DGATWAYTTT TCCTTCYARA TGTGTACAAT CTA (2 ) S E Q ID N〇:34之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹸基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (xi)序列說明:SEQ ID N 0 : 3 4 :
CTATRTAKCC ACTRGCYACA TGRACTGCTA CYA (2 ) S E Q, ID N〇:35 之資料 (i )序列特性__ 本紙張尺度適用中园國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公;^ _ !·ιι-ι·ι-ιν·ι·-------人-----裝.——-ί-訂------線 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) A6 B6 五、發明説明(54 ) (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
(xi)序列説明:SEQ ID N 0 : 3 5 : CYTGYCCTGT YTCTGCTGGB ATDACTTCTG CTT (2 ) S E Q ID NO :36 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33齡基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
(χί)序列説明:SEQ ID Ν Ο : 3 6 : TGSKGCCATT GTCTGTATGT AYTRYTKTTA CTG 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 (2 ) S E Q ID N〇:37 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:S型 本紙張又度適用中國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公釐) 一 56 - 經濟部中央標準局®:工消費合作社印¾
A6 B6_ 五、發明説明(55 ) (Xi)序列說明:SEQ ID N 0 : 3 7 : GAATKCCAAA TTCCTGYTTR ATHCCHGCCC ACC (2 ) S E Q. ID N0:38 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (Xi)序列說明:SEQ ID N 0 : 3 8 : ATTCYAYTAC YCCTTGACTT TGGGGRTTGT AGG (2 ) S E Q ID N0:39 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (xi)序列説明:SEQ ID N 0 : 3 9 : GBCCTATRAT TTKCTTTAAT TCHTTATTCA TAG (請先閲讀背面之注意事項再^寫本頁) -4 i裝. 訂. .丨線 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4规格(210 X 297公藿) 經濟部中央標準局8工消費合作社印製 A6 B6 五、發明説明(56 ) (2 ) S E Q ID N〇:40 之資料 (i )序列待性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
(xi)序列說明:SEQ ID N 0 : 4 0 : CTSTCTTAAG RTGYTCAGCY TGMTCTCTTA CYT (2 ) S E Q ID N〇:41 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
(xi)序列說明:SEQ ID N 0 : 4 1 : TAAAATTGTG RATRAAYACT GCCATTTGTA CWG (2) S E Q ID N0:42 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 本纸張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 2耵公釐) 一 58 一 _ — _|*— — ! —-----(-----裝! ’矿------S ’ (請先閲讀背面之注意事項再場寫本頁) A6 B6 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 五、發明説明(57) (C )股性:單股 (D )拓撲學··線型 (xi)序列説明:SEQ ID N 0 : 4 2 : CTGCACTGTA YCCCCCAATCCCCCYTYTTC TTT (2 ) S E Q ID NO :43 之資料 (i )序列待性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (X i)序列說明:S E Q ID N 0 : 4 3 : TGTCTGTWGC TATYATRYCT AYTATTCTYT CCC (2 ) S E Q ID N0:44之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性··單股 (D )拓撲學:線型 (X i)序列說明:S E Q ID Ν Ο : 4 4 : (請先閲讀背面之注意事項再塡寫本頁) 本紙張又度適用中國國家標準(CNS)甲4规格(210 X 297公釐> _ -59- 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A6 B6 五、發明説明(58)
TTRTRATTTG YTTTTGTART TCTYTARTTT GTA (2 ) S E Q ID N0:45 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
(xi)序列說明:SEQ ID N 0 : 4 5 : CATCTGCTCC TGTRTCTAAT AGAGCTTCYT TTA (2 ) S E Q ID N〇:46 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33齡基對 (B )型式:核酸 : (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
(X i)序列說明:S E Q ID N 0 : 4 6 : ATCCATYCCT GGCTTTAATT TTACTGGTAC AGT (2) SEQ ID N0:47之資料 (i )序列特性 — (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) .丨裝- 訂 本紙張尺度通用中國國家標準(CNS)甲4规格(210 X 297公釐> 一 60 — 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 294722 A6 B6 五、發明説明(59) (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (xi)序列説明:SEQ ID N 0 : 4 7 : TATTCCTAAY TGRACTTCCC ARAARTCYTG AGT (2) SEQ ID N0:48之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 Ui)序列說明:SEQ ID N 0 : 4 8 : ACWYTGGAAT ATYGCYGGTG ATCCTTTCCA YCC (2) SEQ ID N0:49之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:療"型 ------J----·--------------裝------訂------#1 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 本紙張尺度適用中國园家標準(CNS>甲4規格(210 X 297公蔆) -61 - Α6 Β6 五、發明説明(6())
(xi)序列説明:SEQ ID N 0 : 4 9 : CCATTTRTCA GGRTGGAGTT CATAMCCCAT CCA (2 ) S E Q ID N〇:50之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
(Xi)序列説明:SEQ ID N 0 : 5 0 : CTAYTATGGG KTCYKTYTCT AACTGGTACC AYA (2 ) S E Q ID N〇:51 之資料 (ί )序列特性 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 (請先閲讀背面之注意事項再寫本頁) 丨裝· (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (xi)序列說明:SEQ ID N 0 : 5 1 : ATCTGGTTGT GCTTGAATRA TYCCYARTGC ΑΤΑ 本紙張尺度適用中國®家標準(CNS>甲4規格(210 X 297公* > 一 62 _ 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A6 B6 五、發明説明(61 ) (2) SEQ ID N〇:52之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
(xi)序列說明:SEQ ID N 0 : 5 2 : CATGCATGGC TTCYCCTTTT AGYTGRCATT TAT (2 ) SEQ ID N〇:53 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學··線型
(xi)序列説明:SEQ ID N 0 : 5 3 : AACAGGCDGC YTTAACYGYA GYACTGGTGA AAT (2) SEQ ID N〇:54之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核, ------J---' -I ----------^-----裝------、订------% 1 (諳先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 本紙張尺度適用申國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公釐) 一 63 - 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A6 B6 五、發明説明(62 ) (C )股性:單股 (D )拓撲學··線型
Ui)序列説明:SEQ ID N 0 : 5 4 :
TGTCYCTGTA ATAAACCCGA AAATTTTGAA TTT (2 ) S E Q ID N〇:55 之資料 (i )序列特性 (A)長度:2◦鹸基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
Ui)序列說明:SEQ ID N 0 : 5 5 :
AGGCATAGGA CCCGTGTCTT (2 ) S E Q ID NO :56 之資料 (i )序列待性 (A)長度:20鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (xi)序列說明:SEQ ID Ν Ο : 5 6 : ——rlllll.LI!------~-----裝^---Ι:!:ΤΓ·------線' , I* (請先閲讀背面之注意事項再塡寫本頁) 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公釐) -β4 ~ 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 A6 B6 五、發明説明(63)
CTTCTTTGGA GAAAGTGGTG (2) SEQ ID N0:57之資料 (i )序列特性 (A)長度:29鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
Ui)序列說明:SEQ ID N 0 : 5 7 : TATAGCTTTH TDTCCRCAGA TTTCTAYRR (2 ) S E Q ID N〇:58 之資料 (i )序列特性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
(X i)序列說明:S E Q ID N 0 : 5 8 : VCCAAKCTGR GTCAACADAT TTCKTCCRAT TAT (2 ) S E Q ID N0:59 之資料 (i )序列待性 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公釐) ~ 65 ~ ------·---^---------S -----裝------訂·ίΑ (請先閲讀背面之注意事項再塡寫本頁) 經濟部中央標準局R工消費合作社印製 A6 _B6_ 五、發明説明(64) (A )長度:3 3鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (X i)序列說明:S E Q ID N 0 : 5 9 :
TGGTGTGGTA ARYCCCCACY TYAAYAGATG YYS (2 ) S E Q ID N0:60 之資料 (i )序列持性 (A)長度:29鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型 (X i)序列說明:S E Q ID N〇:6〇:
TCCTGCTTTT CCYWDTYTAG TYTCYCTRY (2 ) S E Q ID N〇:61 之資料 (i )序列待性 (A)長度:33鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:^型 -------,---'--------* ------装------訂------%1 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4規格(210 X 297公釐) -66 - A6 B6 五 '發明説明(65)
Ui)序列說明:SEQ ID N 0 : 6 1 : YTCAGTYTTC TGATTTGTYG TDTBHKTNAD RGD (2 ) S E Q. ID N0:62 之資料 (i )序列特性 (A)長度:37鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:·單股 (D )拓撲學:線型
(xi)序列說明:SEQ ID N 0 : 6 2 : AATTRYTGTG ATATTTYTCA TGDTCHTCTTGRGCCTT (2) SEQ ID N0:63之資料 (i )序列恃性 經濟部中央標準局S工消費合作社印5衣 (A)長度:39鹼基對 (B )型式:核酸 (C )股性:單股 (D )拓撲學:線型
U i)序列說明:S E Q ID N 0 : 6 3 : GCCATCTKCC TGCTAATTTT ARDAKRAART ATGCTGTYT 本纸張尺度適用中國國家標準(CNS)甲4规格(210 X 297公釐) -67 -
Claims (1)
- ABCD 294722 六、申請專利範圍 |年月曰修正 附件一(A ) (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) 第82100463號專利申請案 中文申請專利範圍修正本 民國85年11月呈 1 . 一種合成的寡核苷酸,其係充作Η I V三明治雜 交分析中之擴大探針,其中該寡核苷酸係由下列片段所組 成: 第一片段,其核苷酸序列係至少9 0%同質於Η I V 核酸片段;及 第二片段,其係由至少9 0%同質於一核酸多體之寡 核苷酸片段的核苷酸序列所組成’其中該第二片段係不與 Η I V核酸互補; 其中該至少9 0%同質於Η I V核酸片段之核苷酸序 列係選自: ·* .-··. 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 CATCTGCTCCIXJTRTCTAATAGAGCTTCYTTTA (SEQ ID NO : 45), TTCCTGGCAAAYYYATKTCTYCTAMTACTCTAT (SEQ ID NO : 5 ), CTCCAATTCCYCCTATCATTTTTGGYTTC'1A.TY (SEQ ID NO: 6), m.riTGATCRTAYTGTCYYACTTTGATAAAAC (SEQ ID NO: 7), GTTGACAGGYGTAGGTCCTACYAATAYTGTACC (SEQ ID ffO:8), YTCAATAGGP.CTAj\TKCGPJVAATrTAAAGTRCA (SEQ ID MO :9), Λ 丁 f:CM-YCCrcGCTn7UVrrrn\CTGGTA':AGT (SEQ ID HO:‘16 I, YTCTGTCAATGGCavrrGYTTRAC.rfTTTGGGCC (SEQ ID NO :10), TKTACAWATTTCTRrrAATGCTTrnvmTYTC (SEQ ID NO: 11), AA‘n’’nTGAA/VrnTTYCCTTCCTTTTCC八·ΠΓΠ: (SEQ ID UO : 12), AAAWiKGC;AGTATTRTVVTGG;yrj:(T,CAGGCCC (SEQ ID NO: 13), 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS ) A4規格(210X297公釐) -1 - 六、申請專利祀圍 CATGTATTGATADATRAYYATKTCTGGATnTG (SEQ TTATTTCTAARTCAGAYCCTACATACAAATCATC (SEQ TCTTAR'rrCCTCTATTTTTGYTCTATGCTGYYC (SEQ AAGRAATGGRGGTTCTTTCTGATGYTTYTTRTC (SEQ CCATTTRTCAGGRTGCAGTTCATAMCCCATCCA (SEQ CTAYT ATGGG KTC Y KTYTCTAACTGGTACCAYA (SEQ TRG CTG C YCGATCTACATAG AAyGTTTCTGCWC (SEQ GACAACYTTYTGTCTTCCAYTGTYAGTWASATA (S EQ ♦ ♦ YGAATCCTGYAAVGCTARRTDAATTGCTTGTAA. (SEQ YTGTGAilTCTGTYACTATRTTTACTTCTRRTCC · (SEQ ATCTGGTTGTGCTTGAATRATYCCYARTGCATA (SEQ ID NO :17); ID NO: 18)*, 工D NO:19), 工D NO :20), ID NO :49), 工D NO:50), ID NO :21), ID NO :22), ID NO :23), ID NO : 2.4), ID NO :51), (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) > 經濟部中央梯準局男工消費合作社印袈 TATTATTfGAYTRACWAWCTCTGATTCACTYTK (SEQ ID NO :25), CAGRTAilACYTTTTCCTTTTTTATTARYTGYTC (SEQ ID NO:2S), TCCTCCAATYCCTTTRTGTGCTGGTACCCATGM (SEQ ID NO:27), TCCH3曰ACTGACTAATYTATCTACTTGTTCATT (SEQ ID MO : 28 ), ATCTATTCCATYYAAAAATAGYAYYTTYCTGAT (SEQ ID NO : 29 > , GTGGYAGRTTAAARTCAYTAGCCATTGCTYTCC (SEQ ID NO :30), CACAGCTRGCTACTATTTCYTTYGCTACYAYRG (SEQ ID NO :31), CATGCATGOCTTCYCCTTTTAGYTGRCATTTAT (SEQ ID NO ·· 52), RYTGCCATATYCCKGGRCTACARTCTACTTGTC (SEQ ID NO:32), DGATWA^TTTTCCTTCYARATGTGTACAATCTA (SEQ ID NO : 33 ), CTATRTAJ:CGACTRGCYACATGRACTGCTACYA (SEQ ID NO :34), CYTGYCCTGTYTCTGCTGGRATDACTTCTGCTT (SEQ ID HO: 3 5), TGSKGCCATTGTCTGT^TGTAYTRYTKTTACTG (SEQ ID NO :36), A-A.CAG<3CDGCYTTAACYGYAGYACTGGTGAAAT (SEQ ID NO:53), GAATKCCAAATTCCTGYTTRATHCCHGCCCACC (SEQ ID NO :37), ATTCYAYTACYCCTrGACTTTGGGGRTrGTAGG (SEQ ID NO : 3 8 ), GaCCTATPJVrTTKCrrTAATTCHTTATTCA.TAG (SEQ ID HO :39),及 CTSTCTTAAGRTGYTCAGCYTGMTCTCTTA.CYT (SEQ ID MO :40) 〇 本紙法尺度適用中《國家楳準(CNS > A4現格(210X297公釐) 六、申請專利範圍 2 ·如申請專利範圍第1項之合成的寡核苷酸,其中 該第二片段係 AGGCATAGGACCCGTGTCTT ((SEQ ID N0:55)。 3 ·—種合成的寡核苷酸,其係充作Η I V三明治雜 交分析中之捕獲探針,其中該合成的寡核苷酸係由下列片 段所組成:' , 第一片段,其核苷酸序列係至少9 0 %同質於Η I V 核酸片段;及 第二片段,其係由至少9 0%同質於經結合在固相上 之寡核苷酸的核苷酸序列所組成,其中該第二片段係不與 Η I V核酸互補; 其中該至少9 0%同質於Η I V核酸片段之核苷酸序 列係選自: TCTCCAYTTRGTRCTGTCYTTTTTCTTTATRGC (SEQ ID NO:14), TYTjrrTAITAAGYTCYCTGAAATCTACTARTTT (SEQ ID NO : 15 ), 經濟部中央梂率局身工消費合作社印袈 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) TATTCCTAA'YTGRACTTCCCAilAARTCYTGAGT (SEQ ID HO :47) # ACVfYTGGAATATYGCYGGTGATCCTTTCCAYCC (S EQ ID fiO : 4 日), TXrrrrAAARGGYTCYAAGATTTTTGTCATRCT (SEQ ID NO: IS), TAAAATTGTGPJVTRAAYACTGCCATTTGTACWG (SEQ ID MO : 4 1), CTGCAC.rGTA.jfCCCCCAATCCCCCYTYTTCTTT (SEQ ID ff〇 : 4 2 ), TTrrCTGTT/GCr/VT丫ATP/iCTAYTATTCTYTCCC (SEQ ID NO : 4 3 ), TTRTPJ\rrTGrTrrrGT/VRTTCTYTARTTI'GTA (SEQ ID HO : 4‘t),及 TGTCYCTGTAATAAACCCGAAAATmGAATTT (SEQ ID tfO : 5〇 4 ·如申請專利範圍第3項之合成的寡核苷酸,其中 該第二片段係 本紙张尺度逋用中國國家標羋(CNS ) A4現格(210 X 297公釐) A8 B8 C8 D8 經濟部中央標隼局員工汫費合作社印裝 申請專利範圍 CTTCTTTGGAGAAAGTGGTG (SEQ ID NO:56)。 5 . —種合成的寡核苷酸,其係充作Η I V三明治雜 交分析中之擴大探針,其中該寡核苷酸係由下列片段所組 成: 第一片段,其核苷酸序列係至少9 0%同質於Η I V 核酸片段;及 第二片段,其係由至少9 0%同質於一核'酸多體之寡 核苷酸片段的核苷酸序列·所組成,其中該第二片段係不與 Η I V核酸互補; 其中.該至少9 0%同質於Η I V核酸片段之核苷酸序 列係選自: TCTCCAYTTRGTRCTGTCYrrrrrCTrrATRGC (SEQ ID ; TYTYYTA.rrAAGYTCYCTGAAATCTACTARTrr (SEQ ID MO-lS), TAAAArrGTGP^TR^YACTGCCATITGTACWG (SEQ ID NO: 41), CTGCACTGTAYCCCCCAATCCCCCYTYTTCnT (SEQ ID ^ ^ ) TGTCTC-r^CCTATYATR-imYTATTCTYTCCC (SEQ ID MO : 4 3 ) , M TTRTRATTTGVTnTGTAilTrCTYTMiriTGTA (SliQ ID ) ° 6 .如申請專利範圍第5項之合成的寡核苷酸,其中 該第二片段係 AGGCATAGGACCCGTGTCTT (SEQ ID NO:55) 1--ΊΗ--;----^袈-------.訂 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 本紙伕尺度適用中國國家梯準(CNS ) A4規格(210X297公釐厂4 經濟部中央標準局属工消资合作社印*. Β8 C8 D8 六'申請專利範圍 7 .—種合成的寡核苷酸,其係充作Η I V三明治 雜交分析中之捕獲探針,其中該合成的寡核苷酸係由下列 片段所組成: 第一片段,其核苷酸序列係至少9 〇%同質於Η I V 核酸片段;及 第二片段,其係由至少9 0 %同質於經結合在固相上 之寡核苷酸的核苷酸序列所組成,其中該第二片段係不與 H I V核酸互補: 其中該至少9 0%同質於Η I V核酸片段之核苷酸序 列係選自: CATCTGCTCCTGTRTCTAATAGAGCTTCmTA (Sp:Q ID NO:4S) , j ATCCATYCCTGGCTTTAATTTTACTGGTACAGT (SEQ ID NO: 46). | CCATTTRTCAGGRTGGAGTTCATAJMCCCATCCA (SEQ ID NO :49), CTAYTATGGGKTCYKTYTCTAACTGGTACCAY^ (SEQ ID WO :50), ATCTGGTTCTGCTTGAATRATYCCYARTGCATA (SEQ ID ffO: 51), CATGCATGGCTTC丫CCTTTTAGYTGRCATITAT (S EQ ID fiO : 5 2 ) y 及 AACAGGCDGCYTTAAC.iGYAGYACTGGTGAAAT (SEQ ID f’〇:5]) 〇 8 .如申請專利範圍第7項之合成的寡核苷酸,其中 該第二片段係 CTTCTTTGGAGAAAGTGGTG (SEQ ID NO : 56 ) · 9 .—種合成的寡核苷酸,其係充作Η I V三明治雜 交分析中之空間子寡核苷酸,其中該合成的寡核苷酸係由 至少9 0%同質於Η I V核酸片段之核苷酸序列所組成. 本紙浪尺度適用中國國家梯準(CNS ) Α4規格(2丨0X297公釐厂^ ~ J. Ί.--Γ---^、'、裟-------^訂 (請先閲讀背*.之注意事項再填窝本頁) 294722 A8 B8 C8 D8 六、申請專利範圍 且其中該至少9 0%同質於Η 係選自 V核酸片段的核苷酸序列 TATAGCTTTHTDTCCRCAGATTTCTAYRR (SEQ ID NO :57), VCCAAKCTGRGTCAACADATTTCKTCCPATTAT (SEQ 工D : 50 }, • * · —. · · >a · ··« * TGGTGTGGTAARYCCCCACYTYAAYAGATGYYS (SEQ ID NO :59), TCCTGCTTTTCCYWDTYTAGTYTCYCTRY (SEQ ID NO:60), YTCAGTYTTCTGATTTGTYGTDTBHKTNADRGD (SEQ ID NO:SI), AATTRYTGTGATATTTYTCATGDTCHTCTTGRGCCTT (SEQ ID NO: 62) ,El. GCCATCTKCCTGCTAATTTTARDAKRAARTATCCTGTYT (SEQ ID NO: 63) « (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 1 0 · —種合成的寡核苷酸組,其係充作H I V三明 治雜交分析中之擴大探針,包含至少二種不同的寡核; 探針,其中組內各成員係由下列片段所組成: 第一片段,其核苷酸序列係至少9 〇%同質於η I V 核酸片段;及 第二片段,其係由至少9 0%同質於一核酸多體之寡 核苷酸片段的核苷酸序列所組成,其中該第二片段係不與 Η I V核酸互補;及 其中該至少9 0%同質於Η I V核酸片段之核苷酸序 列係選自: 本紙張尺度適用中國國家棣準(CNS ) Α4规格(210Χ297公釐) A8 B3 C8 D8 經濟部中夬標窣局只工消费合作社印装 七、申請專利範圍 CATCTGCTCCTGTRTCTAATAGAGCTTC'rrrTA (SEQ ID K〇:4S), TTCCTGGCAAAYYYATKTCTYCTAMTACTGTAT (SEQ ID NO:S), CTCCΑΛΤΤCCΫcCTATCATTTTTGGYTTCf:ATY (SEQ ID NO: 6), KTATYTGATCRTAYTGTCrfACTITGATAiVAAC (SEQ ID NO :7), GTTGACAGGYGTAGGTCCTACYAATAYTGTACC (SEQ ID ΝΟ:'θ), YTCAAIAGGRCTAATKGGRAAATTTAAAGTRCA (SEQ ID NO:9), ATCCATYCCTGGCTTTAATnTACTGGTACAGT (SEQ ID NO :45), ,YTCTGTCj\ATGGCCAITGY1TRACYYTTG(;GCC (SEQ ID NO :10), j TKTAt^WATrTCTRYTAATGClTTTATTrrYTC (SEQ ID NO :11),; AAYTYTl^AAATYTrYCCTrCCTTTTCCATHTC (SEQ ID NO :12),: AAATA'^K:GGAGTATTRTATGGATTYTCAGi3CCC (SEQ ID NO :13),: CATGTATTGATADATRAYYATKTCTGGATrTTG (SEQ ID NO :17), TATYTCTAARTCAGAjfCCTACATACAAA.TCATC (SEQ ID NO :18), TCTYAR'rrcCTCTATTTTTGYTCTATGCTGYYC (S£Q ID NO :19 ), ;.AAGRAATGGRGGTTCnTCTGATGrrTYTrRTC (SEQ ID NO :20), · CCATTTRTCAGGRTGGAGTTCATAMCCCATCCA (SEQ ID NO :49 ), CTAYTATGGGKTCYKTYTCTAACTGGTAC'ZAYA (SEQ ID NO :50)-, ' TRGCTGCrCCATCTACATAGAAVGTTTCTGCrfC (SEQ ID NO :21),: '. . · 1 · · - - · 1 -J * GACAACTTTYTGTCTTCCAYTGTYAGTWASATA (SEQ ID NO: 22), YGAATCCTGYAAVGCTAJIRTDAATTGCTTCTAA (SEQ ID HO :23), YTGTGAin-CTGTYACTWnmTACTTCTRRTCC (SEQ ID NO :24), ATCTGOTTGTGCTrrGAATRATYCCYARTGC:ATA (SEQ ID ifO: Si), TA'ITATTTGAYTRAa-iAWCTCTGATTCACTYTK (SEQ ID NO : 25), CAGRTAJLA.CYTrrTCCTTTTTTATTARYT(;YTC (SEQ ID NO : 26), TCCTCCAATYCCTTTRTGTGCTGGTACCCATGM (SEQ ID NO:27), TCCHBB7\CTGACTAATYTATCTACrTGTTCATT (SEQ ID NO :28 ), ATCTA-rrCCATYYAAAAATAGYAYYTTYCTGAT (SEQ ID NO : 29), GTGGYAGRTTAAAJVTCAYTAGCCATTGCTrrCC (SEQ ID NO : 30), CACAGCTRGCTACTATTTCrrTYGCTACY八YRG (SEQ ID NO:31), CATGCATGCCTTCYC CTTTTAG YTG R CATTTAT (SEQ ID.NO :52), RYTGCCATATYGCfCGGRCTACARTCTACTTGTC (SEQ ID' ff〇 : 3 2 ), DGATWAYTTTTCCTTCYARATGTGTACAATCTA (SEQ ID NO :33),: CTATRTAJCCCACTRGCYACATGRACTGCT八CYA (SEQ ID NO :34 ), | CYTGYCCTGTfTCTGCTGGPJVTDACTTCTCJCTT (SEQ ID WO: 35), | TGSKGCCA'ITGTCTtJTATGTAYTRYTKTTJVCTG (SEQ ID NO : 3 6 ) , | AACACJGCDGC.iTTrAACYGYAGYACrGGTG/VAAT (SEQ ID NO : 5 3 ), GAATKCCAAATrCCTGrtTfUVTHCCHGCCCACC (SEQ ID ^0:37), ATTC ΪΛ ΥΤΛΟ YCfrn'G ΛΟΤΙΤσΟ^ RTTGTAGG (SEQ ID NO: 3Θ ), GBCCrATilATrm:TTTAATTCHTT/VTTCiVrAG (SEQ ID NO: 39),及 CTSTCTrAAGRTG'iTCAGCYTGMTCTCTTACYT (SEQ ID MO: 40) 〇 ^--.J---i----^ 裝--------•-訂 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) 本紙浪尺度適用t國國家標準(CNS ) A4规格(21 〇 X 297公釐) 經濟部中央橾準局員工消費合作社印製 A8 B8 C8 _ D8 六、申請專利範圍 1 1 ·如申請專利範圍第1 〇項之合成的寡核苷酸組 ,其中各成員之第二片段係: AGGCATAGGACCCGTGTCTT (SEQ ID NO:55)。 1 2 . —種合成的寡核苷酸組,其係充作η i V三明 治雜交分析法中之捕獲探針,包含至少二種不同的寡核替 酸探針’其中組內各成員係由下列片段所組成: 第一片段,其核苷酸序列係至少9 0%同質於η I V 核酸片段:及 第二片段,其係由至少9 0%同質於經結合在固相上 之寡核替酸的核苷酸序列所組成,其中該第二片段係不與 Η I V核酸互補;及 其中該至少9 0%同質於Η I V核酸片段之核;g:酸序 列係選自: TCTCCAYTTRGTRCTGTCYTTTTTCTTTATRGC (SEQ ID NO: 14), TYTYYTATTAAGYTCYCTGAAATCTACTARTTT (SEQ ID NO: 15), TATTCCTAAYTGPJVCTTCCCAPJVAilTCYTGAGT (SEQ ID NO :47), ACKYTGGAATWTYGCYGGTGATCCTTTCCAYCC (SEQ 工D ΜΟ:4θ},! TKrrrTAAARGGYTCYAAGATI'TTTGTCATRCT (SEQ ID NO: 16),; I TAAAAlTGTGRATRAAYACTGCCATTrGTACWG (SEQ ID NO: 41) , ! CTGCACTGTAYCGCCCAATCCCCCYTYTTCTTT (SEQ ID NO :42}, TGTCTGTWGCTATYATRYCTAYT/aTCTYTCCC (SEQ ID NO :43), ITRTRATri'GYTTTTGTARTTCTYTARTTTGTA (SEQ ID NO : 44 ) , ^ TGTCYCTGTAATAAACCCGAAAATTTTGAATTT (SEQ ID NO: 54) ·* 本紙張尺度適用中國國家標準(CNS) M規格(210 X 297公釐) (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) -裝. ’訂 -8 - A8 B8 C8 D8 六、申請專利範圍 1 3 .如申請專利範圍第1 2項之合成的寡核苷酸組 ,其中各成員之該第二片段係 CTTCTTTGGAGAAAGTGGTG (SEQ ID NO:56)。 1 4 · 一種合成的寡核苷酸組,其係充作Η I V三明 治雜交分析中之擴大探針,包含至少二種不同的寡核苷酸 探針,其中組內各成員係由下列片段所組成: 第一片段,其核苷酸序列係至少9 0%同質於Η I V 核酸片段;及 第二片段,其係由至少9 0%同質於一核酸多體之寡 核苷酸片段的核苷酸序列所組成,其中該第二片段係不與 Η I V核酸互補;及 其中該至少9 0%同質於Η I V核酸片段之核苷酸序 列係選自: 經濟部中央標準局員工消費合作社印製 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) TCTCCAYTTRGTRCTGTCYTTnTCTTTATRGC (SEQ ID NO:14), TYTYYTATTAAGYTCYCTGAAA.TCTACTAJITTT (SEQ ID NO :15), TAAAATTGTGRATRAAYACTCCCATTTGTACWG (SEQ ID NO:41)' CTGCACTGTAYCCCCCAATCCCCCYTYTTCTTT (SEQ ID NO :42), TGTCTGTWGCTATYATRYCTAYTATTCTYTCCC (SEQ 工D NO :43),及 TTRTRATTTGrmTGT/ViVrrCTYTAilTTTGTA .(SEQ ID HQ:44) 〇 本紙張尺度適用中國國家榇準(CNS ) A4規格(210X297公釐) -9 - 經濟部中央標準局員工消资合作社印製 A8 BS C8 D8六、申請專利範圍 1 5 .如申請專利範圍第1 4項之合成的寡核苷酸組 ,其中各成員之第二片段係 AGGCATAGGACCCGTGTCTT (SEQ ID N0:55)。 1 6 .—種合成的寡核苷酸組,其係充作Η I V三明 治雜交分析中之捕獲探針,包含至少二種不同的寡核苷 酸探針,其中組內各成員係由下列片段所組成: 第一片段,其核苷酸序列係至少9 0%同質於Η I V 核酸片段:及 _ 第二片段,其係由至少9 0%同質於經結合在固相上 之寡核苷酸的核苷酸序列所組成,其中該第二片段係不與 Η I V核酸互補;及 其中該至少9 0%同質於Η I V核酸片段之核苷酸序 列係選自: CATCTGCTCCTGTRTCTAATAGAGCTTCYTTTA (SEQ ID NO :45), ! ( ATCCATYCCTGOCl'l'TAATTrTACTGGTACAGT · (SEQ ID NO :46), CCATTTRTCAGGRTGOAGTTCATAMCCCATCCA (SEQ ID NO :49), CTAYTATGGGKTCYRTTifTCTAACTGGTACCAYA (SEQ ID NO :50), ATCTGGlTGTGClTGAATPJVTjfCCYARTGCATA (SEQ ID NO :51), CATGCATGGCTrCYCCTTTTAGYTGRCATTTAT (SEQ ID NO :52),及 AACAGGCDGCYTTAACYGYAGYACTGGTGAAAT (SEQ ID NO :53) 〇 (請先閱讀背面之注意事項再填寫本頁) •裝. 訂 泉 本紙張尺度適用中國國家梂準(CNS ) A4规格(210X297公釐) -10- C8 D8 六、申請專利範圍 1 7 .如申請專利範圔第1 6項之寡核苷酸組,其中 名成負之第二片段係 CTTCTTTGGAGAAAGTGGTG (SEQ ID N0:56) 1 8 .—種合成的寡核苷酸組,其係充作η I V三明 治雜交分析中之空間子寡核苷酸,包含至少二種不同的寡 核替酸,其中組內各成員係由至少9 〇%同質I V核 酸片段之核苷酸序列所組成,且其中該至少9 0%同質於 Η I V核酸片段之核苷酸序列係選自: (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) • I - ί 1' IJ· - :-1— - J·— I , 訂 TATAGCTTTHTDTCCRCAGATTTCTAYRR (SEQ ID NO :57), VCCAAKCTGRGTCAACAJDATTTCKTCCRATrAT (SEQ ID NO : 58 ), TGGTGTGGTAARYCCCCACYTYAAYAGATGYYS (SEQ ID NO :59), TCCTGCTTITCCYWDTYTAGTYTCYCTRY (SEQ ID NO:60), YTCAGTYTrCTGATTTGTYGTDTBHKTNADRGD (SEQ ID NO : 61), AATTRYTGl'GATATTTYTCATGDTCHTCTTGRGCCTT (SEQ 工DNO:S2},及- GCCATCTKCCTGCTAAnTTARDAKRAARTATGCTGTTr (SEQ ID N0:S3) ° 1 9 .—種於樣品中偵測Η I V存在之溶液相三明治 式雜交分析法,此方法包括 (a )於雜交條件下,將樣品與下列接觸:(1 )擴 大探針,其係如申請專利範圍第1 0項之合成的寡核奋酸 組,及(i i )捕獲探針,其係如申請專利範困第1 2項 本紙伕尺度逋州中困困家標华(CNS > Λ4洗格(210X297公釐Γ 11 - 1.. 經濟部中央揉準局貝工消費合作社印x 經濟部中夬梂準局負工消費合作杜印11 A8?S · D8六、申請專利範圍 ~ 之合成的寡核苷酸組’其中擴大探針與捕獏探針之濃度·均 超過樣品中分析物核酸1莫耳濃度; (b )在雜交條件下,將(a )步驟產物與結合至固 相之寡核苷酸接觸; (c)然後分出未結合在固相上之物質; (d )在雜交條件下將(c )步驟之結合產物與核 酸多镫接觸,該多體包括至少一種寡核奋酸片段,其至少 9 0 %同質於該擴大探針多核苷酸之第二片段,以及至少 —個第二寡核苷酸片段,其至少9 〇%同質於經標記之寡 核苷酸; (e).移去未結合之多體; (f )在雜交條件下,將(e )步驟之固相複合物產 物與經檫記之寡核苷酸接觸; (g )移去未結合之經標.記寡核苷酸: 及 (h )偵測存在於(g )步疑[之固相複合物產物中的 標記物· 2 0 . —種於樣品中偵測Η I V存在之溶液相三明治 式雜交分析法,此方法包括 (a )在雜交條件下,將樣品與下列接觭·· ( 1 )擴 大探針,其係如申請專利範圍第1 4項之合成的寡核苷酸 組*及(i i )捕獲探針•其係如申請專利範圍第1 2項 之合成的寡核苷酸組,其中擴大探針與捕獲探針之滇度均 超過樣品中分析物核酸1莫耳滇度: :i I Ϊ- ί * - 1 111 4— I fci-i 1 I— ——--I I--I : - - n I (請先M讀背面之注意事項再填寫本頁) l·訂 本紙浪尺度適用_國國家梯準(CNS ) Λ4说格(210X297公釐厂i:i B8 CS 08 294722 、申請專利範圍 (b )在雜交條件下,將(3 )步思[產物與結合至固 相之寡核苷酸接觸: (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) (c )然後分出未結合在固相上之物質; (d )在雜交條件下,將(c )步驟之結合產物與核 酸多體接觸,該多體包掊至少一種寡核苷酸片段,其至少 9 〇%同質於該擴大探針多核苷酸之第二片段,以及至少 一個第二寡核苷酸片段,其至少9 0%同質於經檫記之寡 核苷酸: (e )移去未結合之多體: (f )在雜交條件下,將(e )步驟之固相複合物產 物與經標記之寡核苷酸接觸; (g)移去未結合之經檫記寡核替酸; 及 的 h )偵測存在於(g ).步驟之固相複合物產 1 rv :交 r:' 標記物· 翅濟部t夬棣準局®:工消費合作社印装 2 1 .如'申請專利範圍第1 9項之溶液相三明 分析法,其中(a )步驟進一步包含將樣品與充作Η I V 之三明治雜交分析中之空間子寡核苷酸的合成之寡核苷酸 組接觸,該組包含至少二種不同的寡核苷酸’其中每一個 合成的寡核苷酸係由至少9 0%於Η I V核酸片段之核替 酸序列所組成,.且其中該至少9 〇 %同質於Η 1 ν核酸片 段之核苷酸序列係選自 本紙張尺度逋用t國國家標準(CNS ) 格(210Χ29?公聲Γ TT 申請專利範圍 AS B8 C8 08 TATAGCTTTHTDTCCRCAGATTTCTAYRR (SEQ ID NO :57), VCCAAKCTGRGTCAACADATTTCKTCCRATTAT (SEQ ID NO :58), TGGTGTGGTAARYCCCCACYTYAAYAGATGYYS (SEQ ID MO :59 ), TCCTGCTrrrCC'fWDTYTAGTYTCYCTR'iT (SEQ ID NO: 6〇) / YTCAGTYTTCTGiVrTTGTYGTDTBKKTTf/VjDElGD (SEQ ID NO: SI) , _ /UVTTRYTG'rGATArmTCATGDTCHTCTTGRGCCTT (SEQ ID MO: 62) , S. GCCATCTPCCCTGCTAATTTTARDAK:RAAJITATGCT<3TYT (SEQ ID MO:2 2 .如申請專利範圍第2 〇項之溶液相三明_交 分析法,其中(a )步驟進一步包含將樣品與茺作3 I v 之三明治雜交分析中之空間子寡核苷酸的合成之寡核苷酸 組接觸’該組包含至少二種不同的寡;^苷酸,其中毎一個 合成的寡核替酸係由至少9 0 %於Η I V核酸片段之核苷 酸序列所組成,且其中該至少9 〇%同質於Η I V核酸片 段之核苷酸序列係選自 J ^ ^ ^^-- (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) -訂 經濟部中央揉準局員工消费合作社印«. TATAGCTTTHTDTCCRCAGATTTCTAYRR (SEQ ID NO: 57), VCCAAJCCTGRGTCAACAJDATTTCKTCCRATTAT (SEQ ID NO : 58 ), TGGTGTGGTAARYCCCCACYTYAAYAGATGYYS (SEQ ID NO:59), TCCTGCTTTTCCYWDTYTAGTYTCYCTRY (SEQ 工D NO:SO), YTCAGTYTTCTGATTTGTYGTDTBHFITNADRGD (SEQ ID N〇>: 61))及 AATTRYTGTGATATTTYTCATGDTCHTCTTGRGCCTT (SEQ 1° N〇 * J ~ 〇 GCCATCTKCCTGCTAATTTTARDAJCRAARTATGCTGTYT (SEQ 丄 2 3 ·—種於樣品中偵測Η I V存在之溶液相 式雜交分析法,此方法包括 明治 本紙浪尺度適用t國國家梯準(CNS ) Λ4規格(210X297公釐f 1 經濟部中夬標隼局員X消費合作社印S- C8 D8 六、申請專利範圍 (a )在雜交條件下,將樣品與下列接觸:(i )擴 大探針,其係如申請專利範圍第1 〇項之合成的寡核一酸 組’及(i i)捕獏探針,其係如申請專利範圍第16項 之合成的寡核苷酸組:其中擴大探針與捕獲探針之濃度均 超過樣品中分析物核酸1莫耳澳度; (b )在雜交條件下,將(a )步驟產物與結合至固 相之寡核苷酸接觸: (c)然後分出未結合在固相上之物質;、 (d )在雜交條件下,將(c )步驟之結合產物與核 酸多體接觸,該多體包括至少一種寡核苷酸片段,其至少 9 0 %同質於該擴大探針多核苷酸之第二片段,以及至少 一個第二寡核苷酸片段,其至少9 〇%同質於經標記之寡 核苷酸; (e )·移去未結合之多體.; (ί )在雜交條件下,將(e )步驟之固相複合物產 物與經標記之‘寡核苷酸接觸; (g)移去未結合之經標記寡核苷酸; 及 (h )偵測存在於(g )步驟之固相複合物產物中的 標記物* 2 4 . —種於樣品中偵測Η I V存在之溶液相三明治 式雜交分析法,此方法包括 (a )在雜交條件下,將樣品與下列接觸:(i )擴 大探針•其係如申請專利範困第14項之合成的寡核苷酸 本祇浪尺度逋用中國a家標準^ ( CNS ) A4*iue· ( 210X297公廣):1:1 (請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) V裝. 訂 C8 D8 六、申請專利範園 組’及(i i)捕獲探針,其係如申請專利範困第16項 之合成的寡核替酸組;其中擴大探針與捕獲探針之濃度均 超過樣品中分析物核酸1莫耳濃度: (b )在雜交條件下,將(a )步驟產物與結合至固 相之寡核苷酸接觸: (c )然後分出未結合在固相上之物質; (d )在雜交條件下,將(c)步驟之結合產物與核 酸多體接觸,該多體包括至少一種寡核苷酸片其至少 9 0 %同質於該擴大探針多核苷酸之第二片段,以及至少 一個第二寡核苷酸片段,其至少9 〇 %同質於經標記之寡 核奋酸;. (e) 移去未結合之多證; (f) 在雜交條件下,將(e)步驟之固相複合物產 物與經穰記之寡核苷酸接觸;- (g )移去未結合之經標記寡核苷酸; 及· (h )偵測存在於(g )步驟之固相複合物產的 標記物。 t ; I ^ 2 5 ·如申請專利範圍第2 3項之溶液相三明交 分析法,其中(a )步驟進一步包含將樣品與充作® V 之三明治雜交分析中之空間子寡核替酸的合成之寡核替酸 組接觭•該組包含至少二種不同的寡核苷酸,其中每一個 合成的寡核苷酸係由至少9 0%於Η I V核酸片段之核苷 酸序列所組成,且其中該至少9 〇%同質於Η I V核酸片 本紙浪尺度通用+國國家梯準(CNS > Λ4現格(2丨0Χ297公釐) J ΤΜ--1---1·' '袈-- (請先Μ讀背面之注意事項再填寫本頁) 订 S·. 經濟部中央標準局負工消资合作社印«. 294722 B8 C8 D8 、申請專利範圍 段之核苷酸序列係選自 TATAGCTTTHTDTCCRCAGATTTCTAYRR (SEQ ID NO :57), VCCAAKCTGRGTCAACADATTTCKTCCRJVTTAT (SEQ ID NO : 5 3 ), TGGTGTGOTAARYCCCCACYTYAAYAGATGYYS· (SEQ ID NO:S9), TCCTGCTTn'CC'fWDTYTAGTYTCYCTRY (SEQ ID NO: 60) , ·(請先閲讀背面之注意事項再填寫本頁) rrCAGT’ifTTCrGATTTGTYGTDTBHKTNADRGD (SEQ ID :61)., AATTRYTGTGATArrTYTCATGDTCHTCTTGRGCCTT (SEQ ID NO: GCCATCTKCCTGC丁AATTTTAiUDA^RAAimvrGCrGTYT (SEQ ID ff, 2 6 .如申請專利範圍第2 4項之溶液相三明治 分析法’其中(a )步驟進一步包含將樣品與充作Η 之三明治雜交分析中之空間子寡核苷酸的合成之寡核苷酸 組接觸,該組包含至少二種不同的寡核苷酸,其中每一個 合成的寡核苷酸係由至少9 0%於Η I V核酸片段之核苷 酸序列所組成,且其中該至少9 0%同質於Η I V核酸片 段之核苷酸序列係選自 TATAGqTTTHTDTCCRCAGATTTCTAYRR (SEQ ID NO: 57),· VCCAA^CTGRGTCAACADATTTCKTCCRATTAT (SEQ 工D NO: 58)’ TGGTGTGGTAAkYCCCCACYTYAAYAGATGYYS (SEQ ID·NO :59)' TCCTGCTTTTCCYWDTYTAGTYTCYCTRY· (SEQ ID NO :60), 經濟部辛央標孳局月工消費合作社印袈 YT*tAGTmCTGATTTGTYGTDTBHKTNADRGD (SEQ ID N〇-6l) f _ rn N〇:/ AATTRYTGTGATAnTYTCATGDTCHTCTTGRGCCTT (SEQ ^ ^〇·63)? GCCATCTKCCTGCTAATTTTARDAJCRAAilTATGCTGTYT (SEQ I〇 I V之套組,其包含下 2 7 .—種用於偵測樣品中H 列之組合: (i )擴大探針,其係如申請專利範豳第1 項之合成的寡核Μ酸組: 本紙法尺度適用t國國家梂準(CNS ) Α4規格(2丨0Χ297公釐) 4 294722 A8 BS C8 D8 、申請專利範圍 (11)捕獲探針’其係如申請專利範圔第12或工 6項之合成的寡核替酸組: (1 i i )—種核酸多體,該多體包括至少一種寡核 替酸片段’其至少9 0%同質於擴大探針多核苷酸之第二 片段’以及一個以上的第二寡核苷酸片段,其至少9 〇% 同質於經標記的寡核苷酸_;及 (iv)經標記之寡核苷酸· 2 8 .如申請專利範圍第2 7項之套組,資係進一步 包含一組空間子寡核苷酸’該組包含至少兩種不同的空間 子寡核苷酸,其中該空間子寡核苷酸係選自: TATAGCTTTKTDTCCRCAGATTTCTAYR-R. (SEQ ID NO:57), VCCAAJCCTGRGTCAACADATTTCKTCCRATTAT (S EQ ID NO : 5 8), TGGTGTGGTAARYCCCCACYTYAAYAGATGYYS (SEQ ID NO :59), TCCTGCTTTTCCTWDTYTAGTYTCYCTRY (SEQ II〕NO: SO) , | YTCAGTYTTCTGATTTGTYGTDT曰HKTNADRGD (SEQ ID NO : Si), . AATTRYTCTGATAriTYTCATGDTCHTCTTGRGCCTT (SEQ ID NO: 62) , & GCCATCTKCCTGCTAAnTTARDAKRAARTATGCTGTYT (SEQ ID NO: S3) p: 2 9 .如申請專利範圍第2 7項之套組,其中該擴大 探針寡核苷酸組是申請專利範圍第1〇項之組, 3 0 .如申請專利範圍第2 7項之套組,其中該擴大 探針寡核苷酸組是申請專利範圍第1 4項之組· 3 1 .如申請專利範圔第2 7項之套組,其中該捕獲 探針寡核苷酸組是申請專利範圍第12項之組· 3 2 .如申請專利範圍第2 7項之套組,其中該捕獲 探針寡核苷酸組爲申請專利範圈第16項之組· 本紙法尺度適用中國國家標準(CNS ) A4規格(210X297公廣厂
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