TW201121566A

TW201121566A - Anti-hepsin antibodies and methods using same

Info

Publication number: TW201121566A
Application number: TW099135993A
Authority: TW
Inventors: Rajkumar Ganesan; Daniel Kirchhofer; Paul M Moran; ying-nan Zhang
Original assignee: Genentech Inc
Priority date: 2009-10-22
Filing date: 2010-10-21
Publication date: 2011-07-01
Also published as: CN102648211A; US8435511B2; CN102648211B; JP2013507966A; MX2012004647A; KR20120105447A; BR112012009412A2; AU2010310585A1; RU2012120864A; WO2011050188A8; NZ599337A; US20110262452A1; ZA201202704B; RU2559533C2; IL219136A0; JP5814925B2; WO2011050188A1; EP2491059A1; HK1171032A1; EP2491059B1

Description

201121566 六、發明說明：【發明所屬之技術領域】本發明大體係關於分子生物學領域。更特定言之，本發明係關於抗亥普辛抗體及其用途。本案主張2009年10月22曰申請之美國臨時申請案第 61/253,953號之權利，其内容以引用方式併入本文中。【先前技術】亥普辛為在上皮細胞表面上表現之II型跨膜絲胺酸蛋白酶（TTSP)。417胺基酸蛋白由短N末端細胞質域、跨膜結構域及緊靠C末端蛋白酶結構域排列之單個清道夫受體半胱胺酸富集域構成（Somoza等人，（2003) 11(9), 1123-1131)。亥普辛之生理功能尚不清楚。儘管其在胚胎發生之極早階段中表現（Vu等人，（1997) / 5沁/ CAem 272 (50)，31315-31320)’但缺乏亥普辛之小鼠通常仍可生存及生長（Yu 等人，（2000) 77jr〇mi) /faemosi 84(5), 865-870 ; Wu等人 ’（1998)«/ C7z« /«veW 101(2), 321_326)。發現亥普辛對肝臟再生及凝血相關之生理功能必不可少（同上）。近代研九表明亥普辛基因剔除小鼠聽力受損。Guipponi等人，（2007) dw «/ ΡαίΑο/ 171:608-616。然而，亥普辛已涉及卵巢癌[(Tanimoto 等人（1997) Λα 57(14), 2884- 2887) ; WO 2001/62271]及前列腺癌。若干基因表現研究已將亥普辛確定為前列腺癌中之一種最高度誘導基因 (Dhanasekaran 等人 ’（2001) 412，822-826; Luo 等人，（2001) Cawcer Λα 61(12)，4683-4688 ; Magee等人， 151637.doc 201121566 (2001) Cancer 61(15)，5692-5696 ; Stamey 等人， (2001) *7 t/ro/ 166(6)，2171-2177 ; Stephan等人，（2004) ·/ Urol 171(1), 1 87-1 9 1 ; Welsh 等人，（2001 0) 61(16)，5974-5978)。發現亥普辛RNA含量在正常前列腺及良性增生中低，但在前列腺癌瘤中，尤其在晚期前列腺癌瘤中會猛增（Dhanasekaran等人，（2001) 412，822- 826 ; Luo 等人（2001) 61(12)，4683-4688 ;

Magee 等人，（2001) Cancer 61(15)，5692-5696 ; Stamey等人，（2001) J C/ro/ 166(6)，2171-2177 ; Stephan等人，（2004) «/ C/ro/ 171(1)，187-191 ; Welsh等人，（20010) Cancer Λα 61(16)，5974-5978)。用單株抗亥普辛抗體染色之亥普辛蛋白展示亥普辛表現在骨轉移處及晚期原發性腫瘤中最高（Xuan 等人，（2006) 66(7)，3611- 3619)，其與以下發現一致：亥普辛RNA含量增加與 Gleason等級較高及腫瘤進展相關（Luo等人，（2001) 61(12)，4683-4688 ; Magee等人，（2001) Cancer 61(15)， 5692-5696 ; Stamey 等人，（2001) «/ C/r〇/ 166(6)，2171-2177 ; Stephan 等人，（2004) C/rc?/ 171(1)，187-191 ; Chen 等人， (2003) / Oo/ 169(4)，1316-1319)。亥普辛在前列腺癌中之作用的實驗證據來自Klezovitch 等人之研究（Klezovitch等人，（2004) Cflwcer Ce// 6(2), 185-195)，表明在非轉移前列腺癌之小鼠模型中，亥普辛之過度表現導致原發性腫瘤進展及轉移《有趣的是，亥普辛過度表現與基底膜破環相關（同上），預示亥普辛活性可 151637.doc -4- 201121566 能以某種方式與基底膜組分之降解關聯。亥普辛能夠活體外使潛伏生長因子肝細胞生長因子前體（pro-HGF)轉化成其活性雙鏈形式（HGF)，其誘導Met受體信號傳導（Herter等人，（2005) 5zoc/2em / 390 (第 1 部分），125-136 ; Kirchhofer等人，（2005) F五Ze" 579(9)，1945-1950 ; WO 2006/014928)。亥普辛亦能使pro-uPA轉化成其活性形式（Moran等人， (2006) C/zew_ 281(41):30439-46)且活體外裂解核板蛋白（Tripathi等人，（2008) 爪〇/ C；ze/w· 283:30576)。因為 HGF/Met路徑已涉及侵襲性腫瘤生長及轉移，所以前列腺癌中亥普辛之過度表現有可能活化HGF/Met通道（Herter等人，(2005)价J 390 (第 1 部分），125-136 ; Kirchhofer 等人，（2005) FEBSLeii 579(9)，1945-1950 ; WO 2006/014928)。亦展示亥普辛可活體外裂解其他受質，主要為凝血相關蛋白（Herter 等人，同上 / Kazama等人，（1995) «/ 5/〇/ C/zem 270(1)，66-72)。然而，已知其在腫瘤形成中之作用。顯然，仍需要具有臨床特徵、最佳作為治療劑開發的藥劑。本文所述之本發明符合該需要且提供其他益處。本文中引用之包括專利申請案及公開案的所有參考文獻均以全文引用的方式併入本文中。【發明内容】本發明部分地係基於鑑別多種亥普辛結合劑（諸如抗體及其片段）。亥普辛呈現重要及有利治療性標靶，且本發明提供基於結合亥普辛之藥劑之組合物及方法。如本文所述，本發明之亥普辛結合劑提供重要的治療劑及診斷劑， 151637.doc 201121566 其用於靶向與亥普辛信號傳導路徑之表現及/或活性關聯之病理性病況。因此，本發明提供與亥普辛結合相關之方法、組合物、套組及製品。諸如亥普辛之胰蛋白酶樣絲胺酸蛋白酶之活性位點由若干固有可移動環（『活化域』）形成（Huber^ B〇de，1978)。洋吕之’ 220環形成S1 口袋之一部分，且在一些絲胺酸蛋白轉中可採用各種構形狀態（j〇hns〇n等人，2005 ; Shia等人，2005 ; Spraggon等人，2009 ; Wilken等人，2004)。然而’最可能由於抑制劑所施加之穩定力’故絲胺酸蛋白酶與活性位點抑制劑之共晶結構展示適當形成之活性位點 (Arni 等人 ’ 1994 ; Shia 等人，2005 ; Spraggon 等人， 2009)。據推理’絲胺酸蛋白酶抑制劑佔據s丨口袋可對絲胺酸蛋白酶活性位點環柔韌性施加穩定力，從而有助於抗體識別絲胺酸蛋白酶活性位點。因此，為鑑別阻斷亥普辛酶活性之抗亥普辛抗體，獲得結合亥普辛之抗體與佔據s i 口袋之絲胺酸蛋白酶抑制劑（3,4-二氯-異香豆素（DCI))之複合物。本發明提供結合至亥普辛之抗體《在一態樣中，本發明特徵為結合亥普辛之分離之抗體。在一態樣中’本發明提供分離之抗亥普辛抗體，其中單價形式（諸如Fab形式）之抗體以約10 nM或更佳之結合親和力特異性結合人類亥普辛。在一些實施例中，抗體以約6 πΜ或更佳之結合親和力特異性結合人類亥普辛。如此項技術中所公認’配位體對其受體之結合親和力可使用多種 151637.doc 201121566 檢測法中之任一者來測定且以多種數值表示。因此，在一實施例中，結合親和力可表示為Kd值且反映固有結合親和力（例如最小親合力結果）。通常且較佳在活體外在無細胞環境或細胞相關環境下量測結合親和力。可使用此項技術中已知之多種檢測法（包括本文所述之彼等檢測法）中之任一者獲得結合親和力量測，包括例如Biacore、放射免疫檢測法（RIA)及 ELISA。在另一態樣中，本發明提供抗亥普辛抗體，其結合亥普辛之Kunitz域結合區。在一態樣中，本發明提供一種與 Kunitz域競爭結合至亥普辛之分離之抗亥普辛抗體。在一實施例中，該Kunitz域序列為HAI-1或HAI-1B之Kunitz域 1(KD1)。在一實施例中，Kunitz域序列為變異體KD1序列，其與人類HAI-1之野生型KD1具有至少約70%、75%、 80%、85%、90%、95%、97%、98%、99%之序列一致性，其中該變異體序列抑制亥普辛活性之能力至少與野生型KD1相當。在一實施例中，該Kunitz域序列為HAI-2之 Kunitz域之一或兩者。在一實施例中，變異體HAI-2 Kunitz域序列與野生型人類HAI-2之相應Kunitz域的序列一致性介於約70°/。與99°/❶之間、約75%與98%之間、約80%與 97%之間、約85%與95%之間’其中該序列抑制亥普辛活性之能力至少與野生型HAI-2相當。在一態樣中，本發明提供結合亥普辛催化位點之抗亥普辛抗體。在一態樣中’本發明提供在s 1亞位點外結合亥普辛之抗 I51637.doc 201121566 亥普辛抗體。在一些實施例中，抗體結合亥普辛s2及/或33 亞位點。在—態樣中’本發明提供結合催化性失活亥普辛之抗亥普辛抗體。 I—態樣中’本發明提供具有亥普辛蛋白水解抗性之抗亥普辛抗體。在一些實施例中，在允許對亥普辛受質進行亥普辛裂解之條件下將抗體暴露於亥普辛24小時。在態樣中’本發明提供結合存在於複合物中之亥普辛的抗亥普辛抗體’該複合物包含亥普辛及結合亥普辛S1亞位點之絲胺酸蛋白酶抑制劑。在一些實施例中，使存在於複合物中之亥普辛失活。在一些實施例中，絲胺酸蛋白酶抑制劑為3,4-二氣-異香豆素（DCI)。在一些實施例中，絲胺酸蛋白酶抑制劑結合亥普辛催化性胺基酸殘基Serl95及 His 57，藉此使亥普辛失活。在一態樣中’本發明提供特異性結合至人類亥普辛且實質上活體内及/或活體外抑制亥普辛酶活性之抗亥普辛抗體。在一實施例中’酶活性包含亥普辛多肽受質之裂解。在一實施例中’亥普辛多肽受質為巨噬細胞刺激蛋白前體 (pro-MSP)、pro-uPA、因子 VII(Factor VII)及 pro-HGF 中之一或多者。pro-MSP之亥普辛活化描述於同在申請中共同擁有之美國臨時專利申請案第61/253,990號（2009年1〇月22 曰申請）中。在一實施例中，酶活性包含亥普辛合成性受質之裂解。在一些實施例中，亥普辛合成性受質為表1中所示之受質。 151637.doc 201121566 在態樣中，本發明提供抗亥普辛抗體，其中該等抗體實質上抑制人類及/或小鼠亥普辛催化活性。在一些實施例中，單價形式之抗亥普辛抗體抑制人類亥普辛催化活性的Ki為約（在一些實施例中小於或等於）4 nM。在一些實施例中，單價形式之抗亥普辛抗體抑制小鼠亥普辛催化活性的Ki為約（在一些實施例中小於或等於）33〇 nM。在一態樣中，本發明提供抗亥普辛抗體，其中該等抗體貫質上抑制亥普辛裂解pro_uPA。在一些實施例中，抗亥普辛抗體抑制亥普辛裂解pro_uPA的IC50為約3 nM或更強。在一態樣中，本發明提供抗亥普辛抗體，其中該等抗體貫質上抑制層黏連蛋白依賴性細胞遷移。在一態樣中，本發明提供抗亥普辛抗體，其中該等抗體藉由一種包含選擇結合複合物之抗體的方法產生，該複合物包含（a)亥普辛及（b)結合亥普辛si亞位點之絲胺酸蛋白酶抑制劑。在一些實施例中，使存在於複合物中之亥普辛失活*在一些實施例中’絲胺酸蛋白酶抑制劑為3,4_二氣_ 異香豆素（DCI)。在一些實施例_，絲胺酸蛋白酶抑制劑結合亥普辛催化性胺基酸殘基Serl95及His 57，藉此使亥普辛失活。在一些實施例中，在選擇抗體之前，該抗體與亥普辛及絲胺酸蛋白酶抑制劑一起培育。在—些實施例中’該方法另外包含選擇與Kunitz域競爭結合亥普辛之抗體的步驟。在一些實施例中，Kunitz域為KD1 〇在一態樣中，本發明提供抗亥普辛抗體，其中該等抗體 151637.doc 201121566 藉由一種包含選擇（鑑別）與Kunitz域競爭結合亥普辛之抗體的方法產生。在一些實施例中，Kunitz域為KD1。在一態樣中，本發明提供實質上不會被亥普辛裂解之抗亥普辛抗體。在一些實施例中，抗亥普辛抗體實質上抗亥普辛裂解。一般而言，本發明之抗亥普辛抗體為拮抗抗體。在一態樣中，本發明提供一種抗亥普辛抗體，其包含：至少一個、兩個、三個、四個、五個及/或六個選自由以下組成之群的高變區（HVR)序列： (a) 包含序列 RASQSVSSAVA(SEQIDNO:l)之HVR-L1 ; (b) 包含序列 SASSLYS(SEQ ID NO:2)之 HVR-L2 ; (c) 包含序列 QQYYSSYYLLT(SEQ ID NO:3)之HVR-L3 ; (d) 包含序列 GFNFSYSYMH(SEQIDNO:4)之HVR-H1 ; (e) 包含序列 ASIYSYYGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:5)之 HVR-H2 ;及 (f) 包含序列 ARSDSWSYKSGYTQKIYSKGLDY(SEQ ID NO:6)之HVR-H3。在一態樣中，本發明提供抗亥普辛抗體，其包含：（a)包含以下之輕鏈：（i)包含序列RASQSVSSAVA(SEQ ID ΝΟ:1) 之 HVR-L1 ; (ii)包含序列 SASSLYS(SEQ ID NO:2)之 HVR-L2 ;及（iii)包含序列 QQYYSSYYLLT(SEQ ID NO:3)之 HVR-L3 ；及/或（b)包含以下之重鏈：（i)包含序列 GFNFSYSYMH(SEQ ID NO:4)之 HVR-H1 ; (ii)包含序列 ASIYSYYGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:5)之 HVR-H2 ;及 151637.doc -10- 201121566 (iii)包含序列 ARSDSWSYKSGYTQKIYSKGLDY(SEQ ID NO:6) 之 HVR-H3。在一態樣中，本發明提供包含含有序列SEQ ID NO: 1之 HVR-L 1的抗亥普辛抗體。在一態樣中，本發明提供包含含有序列SEQ ID ΝΟ··2之HVR-L2的抗亥普辛抗體。在一態樣中，本發明提供包含含有序列SEQ ID ΝΟ:3之HVR-L3的抗亥普辛抗體。在一態樣中，本發明提供包含含有序列 SEQ ID ΝΟ:4之HVR-H1區域的抗亥普辛抗體。在一態樣中，本發明提供包含含有序列SEQ ID ΝΟ:5之HVR-H2區域的抗亥普辛抗體。在一態樣中，本發明提供包含含有序列 SEQ ID ΝΟ:6之HVR-H3區域的抗亥普辛抗體。在一態樣中，抗亥普辛抗體包含：包含HVR-L1、HVR-L2、HVR-L3之輕鏈可變區，其中各者依序包含序列 RASQDVN/STAVA(SEQ ID NO:7)、SEQ ID NO:2、SEQ ID ΝΟ··3 ;及/或包含HVR-H1、HVR-H2及HVR-H3之重鏈可變區，其中各者依序含有SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6。在一態樣中，抗亥普辛抗體包含：包含HVR-L 1、HVR-L2、HVR-L3之輕鏈可變區，其中各者依序包含序列 RASQDVN/STAVA(SEQ ID NO:7)、SEQ ID ΝΟ··1、序列 SASFLYS(SEQ ID NO:8)、SEQ ID NO:3 ;及/或包含 HVR-HI、HVR-H2及HVR-H3之重鏈可變區，其中各者依序含有 SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6。在一態樣中，抗亥普辛抗體包含：包含HVR-L 1、HVR- 151637.doc -11 - 201121566 L2、HVR-L3之輕鏈可變區，其中各者依序包含序列SEQ ID NO:7、SEQ ID NO:8、SEQ ID NO:3 ;及/或包含 HVR-H1、HVR-H2及HVR-H3之重鏈可變區，其中各者依序含有 SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5、SEQ ID NO:6。單個 HVR(亦即 HI、H2 或 H3)之 SEQ ID NO:l-SEQ ID NO:6之胺基酸序列編號如圖1中所示，編號與如下所述之 Kabat編號系統一致。若實質上保持與亥普辛之結合活性，則本發明之抗體可包含任何適合的構架可變域序列。舉例而言，在一些實施例中，本發明之抗體包含人類亞群III重鏈構架共同序列。在此等抗體之一實施例中，構架共同序列包含位置7 1、73 及/或78之取代。在此等抗體之一些實施例中，位置7 1為 A，73為T及/或78為A。在一實施例中，此等抗體包含 huMAb4D5-8(HERCEPTIN®, Genentech, Inc., South San Francisco, CA，USA)(亦參見美國專利第6,407,213號及第 5,821,337號，及Lee等人，J. Mol. Biol. (2004)，340(5):1073-1093)之重鏈可變域構架序列。在一實施例中，此等抗體另外包含人類κΐ輕鏈構架共同序列。在一些實施例中，構架包含位置66之取代。在一些實施例中，位置66為G。在一特定實施例中，此等抗體包含huMAb4D5-8之輕鏈HVR序列（如美國專利第6,407,213號及第5,821，337號所述）。在一實施例中，此等抗體包含huMAb4D5-8(HERCEPTIN®, Genentech，Inc.，South San Francisco，CA，USA)(亦參見美國專利第6,407,213號及第5,821，337，及Lee等人，J. Mol. 151637.doc 12 201121566

Biol. (2004)，340(5): 1073-1093)之輕鏈可變域構架序列。在一實施例中，本發明之抗體包含重鏈可變域，其中構架序列包含圖2A-圖2B中所示之序列，且HVR HI、HVR H2及 HVR H3 序列分別為 SEQ ID NO:4、SEQ ID NO:5 及/或 SEQ ID NO: 6。在一實施例中，本發明之抗體包含重鏈可變域，其中構架序列包含序列SEQ ID NO 14-15、48及/或16，且HVR HI、HVR H2及HVR H3序列分別為SEQ ID NO 4、5及/或 6。在另一實施例中，構架序列包含序列SEQ ID NO 14-15、43及/或 16，且 HVR HI、HVR H2 及 HVR H3序列分別為 SEQ ID NO 4、5及/或 6。在一特定實施例中，本發明之抗體包含輕鏈可變域，其中構架序列分別包含序列SEQ ID NO:17-20 ; 49-51及20 ; 52-54 & 20 ;及/或 55-57及 20，且 HVR LI、HVR L2及 HVR L3序列分別為SEQ ID NO 1、2及/或3。在一實施例中，本發明之抗體包含輕鏈可變域，其中構架序列包含序列SEQ ID NO 17、18、58及 /或 20，且 HVR LI、HVR L2及 HVR L3序列分別為SEQ ID NO 1、2及/或3。在一實施例中，本發明之抗體包含輕鏈可變域，其中構架序列包含序列SEQ ID NO 17、18、19及 / 或 20，且 HVR LI、HVR L2及 HVR L3序列分別為SEQ ID NO 1、2及/或3。在一實施例中，本發明之抗體包含重鏈可變域，其中構架序列包含序列SEQ ID NO 14-15、43及/或16，且HVR HI、HVR H2及HVR H3序列分別為SEQ ID NO 4、5及/或 151637.doc -13- 201121566 6;及輕鏈可變域，其中構架序列包含序列SEQ ID NO 17-18、58及/或 20，且 HVR LI、HVR L2及 HVR L3序列分別為 SEQ ID NO 1、2及/或 3。在另一態樣中，本發明之抗體包含含有序列SEQ ID NO:10之重鏈可變域及含有序列SEQ ID NO:9之輕鏈可變域。在另一態樣中，本發明之抗體包含含有序列SEQ ID NO: 10之重鏈可變域及輕鏈可變域。在另一態樣中，本發明之抗體包含含有序列SEQ ID NO:9之輕鏈可變域及重鏈可變域。本發明抗體之一些實施例包含人類化4D5抗體 (huMAb4D5-8)(HERCEPTIN®, Genentech, Inc., South San Francisco, CA，USA)(亦參見美國專利第6,407,213號及Lee 等人，J. Mol. Biol. (2004)，340 (5):1073-93)之輕鏈可變域，如以下SEQ ID NO: 11中所描繪。 1 Asp lie Gin Met Thr Gin Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr lie Thr Cys Are Ala Ser Gin Asp Val Asn Thr Ala Val Ala Trp Tyr Gin Gin Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu lie Tyr Ser Ala Ser Phe Leu Tvr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Arg Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr lie Ser Ser Leu Gin Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gin Gin His Tvr Thr Thr Pro Pro Thr Phe Gly Gin Gly Thr Lys Val Glu He Lys 107(SEQ ID NO:ll)(HVR殘基加有下劃線）。在一實施例中，huMAb4D5-8輕鏈可變域序列在位置 151637.doc • 14. 201121566 30、66及91(分別為入311、八^及1^3，如上文中以粗體/斜體所示）中之一或多個位置處經修飾。在一實施例中，經修飾huMAb4D5-8序列包含位置30之Ser、位置66之Gly及/或位置91之Ser。因此，在一實施例中，本發明之抗體包含含有以下SEQIDNO:45所描繪之序列之輕鏈可變域： 1 Asp lie Gin Met Thr Gin Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly Asp Arg Val Thr lie Thr Cys Are Ala Ser Gin Asp Val Ser Thr Ala Val Ala Trp Tyr Gin Gin Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu lie Tyr Ser Ala Ser Phe Leu Tvr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr lie Ser Ser Leu Gin Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gin Gin Ser Tvr Thr Thr Pro Pro Thr Phe Gly Gin Gly Thr Lys Val Glu lie Lys 107(SEQ ID NO:45)(HVR 殘基加有下劃線）。在一態樣中，本發明提供一種與上述任一抗體競爭結合亥普辛的抗亥普辛抗體。在一態樣中，本發明提供一種抗亥普辛抗體，其結合的亥普辛抗原決定基與上述任一種抗體相同或類似。如此項技術中已知，且如下文中更詳描述，界定抗體高變區之胺基酸位置/邊界可視本上下文及此項技術中已知之各種定義（如下所述）而變。可變域内之一些位置可視為雜交高變位置，其中此等位置依據一組準則可視為處於高變區内，而依據一組不同準則可視為處於高變區之外。此等位置中之一或多者亦可見於延長高變區内（如下文進一步定義）。 151637.doc 15 201121566 在一些實施例中，該抗體為單株抗體。在其他實施例中’該抗體為多株抗體。在一些實施例中，該抗體係選自由嵌合抗體、親和力成熟抗體、人類化抗體及人類抗體組成之群。在某些實施例中，該抗體為抗體片段。在一些實施例中，該抗體為Fab、Fab，、Fab，-SH、F(ab，）24SCFv。在一實施例中’該抗體為嵌合抗體，例如包含移植至異源非人類、人類或人類化序列（例如構架及/或恆定域序列）之來源於非人類供體之抗原結合序列的抗體。在一實施例中’非人類供體為小鼠。在另一實施例中，抗原結合序列為合成的’例如藉由突變誘發所獲得（例如噬菌體呈現篩

檢等）。在一特定實施例中，本發明之嵌合抗體具有鼠類V 區及人類C區。在一實施例中’使鼠類輕鏈V區融合至人類K輕鏈。在另一實施例中，使鼠類重鏈V區融合至人類 IgGl C區。本發明之人類化抗體包括在構架區（FR)申具有胺基酸取代之彼等抗體及在所移植之CDR中具有改變之親和力成熟變異體。CDR或FR中經取代之胺基酸不限於供體或受體抗體中所存在的彼等胺基酸。在其他實施例中，本發明之抗體另外包含Fc區中之胺基酸殘基改變，其可使效應功能改良，包括增強CDC及/或ADCC功能及殺死B細胞。本發明之其他抗體包括具有可改良穩定性之特定改變的彼等抗體。在其他實施例中，本發明之抗體包含Fc區中之胺基酸殘基改變’其可使效應功能減弱，例如減弱CDC及/或 ADCC功能及/或減少B細胞殺死。在一些實施例中，本發 151637.doc •16· 201121566 明之抗體的特徵為針對自然殺手（NK)細胞上之人類互補因子Clq及/或人類以受體之結合減少（諸如不結合）。在一些實細•例中’本發明之抗體的特徵為針對人類FqRI、 FqRIIA及/或FcryRIIlA之結合減少（諸如不結合）。在一些實施例中，本發明之抗體屬於IgG類（例如IgG1或1§(}4)且在 E233、L234、G236、D265、D270、N297、E318 ' K320、K322、A327、A330、P331 及/或 P329(根據 EU 索引編號）中包含至少一個突變。在一些實施例中，該等抗體包含突變 L234A/L235A 或 D265A/N297A。在一態樣中，本發明提供亥普辛結合多肽，其包含本文提供之任一抗原結合序列，其中該等亥普辛結合多肽特異性結合至亥普辛，例如人類及/或犬及/或小鼠亥普辛。本發明之抗體結合（諸如特異性結合）亥普辛，且在一些實施例中可調卽（例如抑制）亥普辛活性之一或多個態樣（諸如亥普辛酶活性）及/或破環任何生物學上相關之亥普辛及/ 或亥普辛多肽受質生物路徑，及/或治療及/或預防腫瘤、細胞增殖性病症或癌症；及/或治療或預防與亥普辛表現及/或活性（諸如亥普辛表現及/或活性增加）相關之病症。在一些實施例中，亥普辛抗體特異性結合至由或基本上由亥普辛（例如人類及/或小鼠亥普辛）組成之多肽。在一實施例中’亥普辛酶活性包含裂解亥普辛多肽受質。在一實施例中’亥普辛多肽受質為巨噬細胞刺激蛋白前體（pr〇_ MSP)、pro_upA、因子 vii及 pr〇_HGF 中之一或多者。在一實施例中，本發明之抗體不為2006年出版之Cancer 151637.doc •17· 201121566

Research，第66卷，第3611-3619頁中所述之抗亥普辛抗體 (例如如圖4所例示之抗體1A12、85B11、94A7、A6、 A174、A21 及/或 A24)，或 PCT 公開案 WO 2004/033630 中所揭示之分離之亥普辛抗體（例如第93頁及圖15A-15D所提及之抗體 47A5、14C7、46D12、38E2 ' 37G10 ' 31C1、11C1 及/或 72H6)，或 Xuan等人（2006) Cawcer 66(7)，3611 所揭示之分離之亥普辛抗體或WO 2007/149932中所揭示之亥普辛抗體。在一實施例中，本發明之抗體不與以下抗體競爭結合至人類亥普辛：2006年出版之Cancer Research，第66卷，第 36 11-36 19頁中所述之抗亥普辛抗體（例如如圖4所例示之抗體 1A12、85B11、94A7、A6、A174、A21 及 / 或 A24)，或 PCT公開案WO 2004/033630中所揭示之分離之亥普辛抗體 (例如第93頁及圖15A-圖15D所提及之抗體47A5、14C7、 46D12、38E2、37G10、31C1、11C1 及 /或 72H6)，或 Xuan 等人（2006) Cawcer 66(7)，3611所揭示之分離之亥普辛抗體或WO 2007/149932中所揭示之亥普辛抗體。在一實施例中，本發明之抗體所結合之人類亥普辛之抗原決定基與以下抗體不同：2006年出版之Cancer Research，第66卷，第3611-3619頁中所述之抗亥普辛抗體 (例如如圖4所例示之抗體1A12、85B11、94A7、A6、 A174、A21 及/或 A24)、或 PCT公開案 WO 2004/033630 中揭所示之分離之亥普辛抗體（例如第93頁及圖15A-圖15D所提及之抗體 47A5、14C7、46D12、38E2、37G10、31C1、 151637.doc -18· 201121566 11C1 及 / 或 72H6)、或 Xuan 等人（2006) Λβί 66(7)， 3611所揭示之分離之亥普辛抗體或WO 2007/149932中所揭示之亥普辛抗體。在態樣令’本發明提供包含本發明之一或多種抗體及载劑的組合物。在一實施例中，該載劑為醫藥學上可接受之載劑。在另一態樣中，本發明提供編碼本發明亥普辛抗體之核酸。在另一態樣中’本發明提供包含本發明核酸之載體。在另一態樣中’本發明提供包含本發明之一或多種核酸及載劑的組合物。在一實施例中，該載劑為醫藥學上可接受之載劑。在一態樣t ’本發明提供包含本發明之核酸或載體的宿主細胞。載體可為任何類型之載體，例如重組載體，諸如表現載體。可使用多種宿主細胞中的任一種。在一實施例中，宿主細胞為原核細胞，例如大腸桿菌。在另一實施例中，宿主細胞為真核細胞’例如哺乳動物細胞，諸如中國倉鼠卵巢（CHO)細胞。在另一態樣中’本發明提供製備本發明之抗體的方法。舉例而言，本發明提供製造抗亥普辛抗體（如本文所定義’其包括全長抗體及其片段）之方法，該方法包含培養包含編碼人類化抗體之核酸之宿主細胞，以便表現核酸。在一些實施例中’該方法另外包含自宿主細胞培養物回收抗體。在一些實施例中’該抗體係自宿主細胞培養基回 151637.doc •19· 201121566 收。在一些實施例中’該方法另外包含組合回收之抗體與醫藥學上可接受之載劑、賦形劑或載劑來製備包含人類化抗體之醫藥調配物。在一些實施例中，本發明提供製造抗亥普辛抗體之方法，該方法包含選擇結合包含（3)亥普辛及 (b)結合亥普辛S1亞位點之絲胺酸蛋白酶抑制劑之複合物的抗體。在一些實施例中，使存在於複合物中之亥普辛失活。在一些實施例中，絲胺酸蛋白酶抑制劑為3,4_二氣·異香旦素（DCI)。在一些實施例中，絲胺酸蛋白酶抑制劑結合亥普辛催化性胺基酸殘基Serl95及His 57，藉此使亥普辛失活。在一些實施例中，在選擇抗體之前，該抗體與亥普辛及絲胺酸蛋白酶抑制劑一起培育。在一些實施例中，該方法另外包含選擇與Kunitz域競爭結合亥普辛之抗體的步驟。在一些實施例中，Kunitz域為KD1 〇在態樣中本發明提供一種包含容器之製品；及該容器内所含之組合物，其中該組合物包含本發明之一或多種抗亥普辛抗體。在-實施例中，該組合物包含本發明之核酸。在另-實施例中’包含抗體之組合物另外包含載劑，該載劑在-些實施例中為醫藥學上可接受之載劑。在一實施例中’本發明之製品另外包含將組合物（例如抗體）投與個體的說明書(諸如本文中所述任一方法的說明書)。在態樣中，本發明提供一種包含第一容器及第二容器 ^套、且β第合器包含含有—或多種本發明之抗亥普辛柷體之組合物，且該第二容器包含緩衝劑。在一實施例中’該緩衝劑為醫藥學上可接受之緩衝劑。在-實施例 151637.doc 201121566 中，包含抗體之組合物另外包含載劑，該載劑在一些實施例中為醫藥學上可接受之載劑。在另一實施例中，套組另外包含將組合物（例如抗體）投與個體之說明書。亥普辛路徑涉及多個生物及生理功能，包括例如HGF/C· met路徑之活化、MSP/R〇n路徑之活化、基底膜之破環/降解、基質降解等。在諸如癌症之病症中此等功能通常又會受到異常調節。因此，在另一態樣中，本發明提供一種抑制基底膜之破環/降解及/或基質降解之方法，該方法包含使細胞或組織與本發明拮抗劑接觸，藉此抑制基底膜之破環/降解及/或基質降解。在另一態樣_，本發明提供一種抑制基底膜之破環/降解及/或基質降解之方法，該方法包含向有與基底膜之異常破環/降解及/或基質降解相關之病狀之細胞、組織及/或個體投與本發明之拮抗劑，藉此抑制基底膜之破環/降解及/或基質降解。在一態樣中，本發明提供一種治療或預防與亥普辛活性增加相關之病症的方法，該方法包含向需要該治療之個體才又與有效里之本發明拮抗劑，藉此有效治療或預防該病症。在一實施例中，該病症為癌症。在另一態樣中，本發明提供本發明之抗亥普辛抗體用於製備^ /C*療性及/或預防性處理諸如癌症、腫瘤及/或細胞增殖性病症之病症的藥劑之用途。在—些實施例中，癌症、腫瘤及/或細胞增殖性病症為前列腺癌。在—些實施例令’癌纟 '腫瘤及/或細胞增殖性病症為#巢癌或腎臟癌。 I51637.doc -21 · 201121566 在另一態樣中’本發明提供本發明之核酸用於製備供治療〖生及/或預防性處理諸如癌、腫瘤及/或細胞增殖性病症之病症的藥劑之用途。在一些實施例中，癌症、腫瘤及/ 或、胞增殖性病症為前列腺癌。在一些實施例中癌症、腫瘤及/或細胞增殖性病症為卵巢癌或腎臟癌。在另一態樣中，本發明提供本發明之表現載體用於製備供療性及/或預防性處理諸如癌、腫瘤及/或細胞增殖性病症之病症的藥劑之用途。在一些實施例中，癌症、腫瘤及/或、田胞增殖性病症為前列腺癌。在一些實施例中，癌症、腫瘤及/或細胞增殖性病症為卵巢癌或腎臟癌。在另一態樣中，本發明提供本發明之宿主細胞用於製備供治療性及/或預防性處理諸如癌、腫瘤及/或細胞增殖性病症之病症的藥劑之用途。在一些實施例中，癌症、腫瘤及/或細胞增殖性病症為前列腺癌。在一些實施例中，癌症、腫瘤及/或細胞增殖性病症為卵巢癌或腎臟癌。在另一態樣中’本發明提供本發明之製品用於製備供治療性及/或預防性處理諸如癌、腫瘤及/或細胞增殖性病症之病症的藥劑之用途。在一些實施例中，癌症、腫瘤及/ 或細胞增殖性病症為前列腺癌。在一些實施例中，癌症、腫瘤及/或細胞增殖性病症為卵巢癌或腎臟癌。在一態樣中’本發明亦提供本發明之套組用於製備供治療性及/或預防性處理諸如癌、腫瘤及/或細胞增殖性病症之病症的藥劑之用途。在一些實施例中，癌症、腫瘤及/ 或細胞增殖性病症為前列腺癌。在一些實施例中，癌症、 I51637.doc -22- 201121566 腫瘤及/或細胞增殖性病症為卵巢癌或腎臟癌。本發明提供適㈣調節與亥t辛之表現及/或信號傳導 (諸如增加之表現及/或信號傳導或不需要之表現及/或信號傳導）相關之病症的方法及組合物。可使用本發明之方法來影響任何合適之病理狀態。例示性病症描述於本文中，x包括選自由以下組成之群的癌症：非小細胞肺癌、卵巢癌、甲狀腺癌、睪丸癌、子宮内膜癌症、頭頸癌（例如頭頸鱗狀細胞癌）、腦癌（例如神經母細胞瘤或腦膜瘤）、皮膚癌（例如黑素瘤、基底細胞癌或鱗狀細胞癌）、膀胱癌（例如轉移細胞癌）、乳房癌、胃癌、結腸直腸癌（CRC)、肝細胞癌、子宮頸癌、肺癌、胰臟癌、前列腺癌及腎臟癌及子宮内膜癌。在一實施例中，本發明之方法中靶向的細胞為癌細胞。舉例而§ ’癌細胞可為選自由以下組成之群的癌細胞：乳癌細胞、結腸直腸癌細胞、肺癌細胞（例如非小細胞肺癌細胞）、曱狀腺癌細胞、多發性骨髓瘤細胞、睪丸癌細胞、乳頭狀癌細胞、結腸癌細胞、胰臟癌細胞、卵巢癌細胞、子宮頸癌細胞、中樞神經系統癌細胞、骨原性肉瘤細胞、腎臟癌細胞、肝細胞癌細胞、膀胱癌細胞（例如轉移細胞癌細胞）、胃癌細胞、頭頸鱗狀癌細胞、黑素瘤細胞、白血病細胞、子宮内膜癌細胞及結腸腺瘤細胞。在一實施例中，本發明之方法中乾向的細胞為高度增殖性及/ 或增生性細胞。在另一實施例中，本發明之方法令靶向的細胞為發育異常細胞。在另一實施例中，本發明之方法中 151637.doc -23- 201121566 挺向的細胞為轉移性細胞。一 j發月之方法另外可包含其他治療步驟。舉例而言，在 =貫施例中’―方法另外包含使絶細胞及/絲組織（例如癌細胞）暴露於輻射處理或化學治療劑的步驟。在一態樣中’本發明提供包含投與有效量之抗亥普辛抗體與有效量之另一箱、、A麻鈿"也，，力種/〇療劑（堵如抗血管生成劑、另一種抗體、化學治療劑、細胎表杰丨縻削...田胞f性劑、免疫抑制劑、前藥、細胞激素、細胞毒性放射線療法、皮質類_、止吐劑、癌 :疫苗、鎮痛劑或生長抑制劑)之組合的方法。舉例而。使用抗亥普辛抗體與抗癌劑或抗血管生成劑組合以治療各種贅生性或非贅生性病狀。視待治療之特；t癌症適應症而^，可將本發明之組合療法與諸如化學治療劑之其他治療劑或諸如放射線療法或手術之其他療法組合。許多已知化學治療劑可用於本發明之 ..且口療法。#佳使用作為治療特定適應症之標準物的彼等化學治療劑、组合使用之各治療劑的劑量或頻率較佳與無其他藥_所使用之對應_之劑量或頻率相同，或^ 該對應藥劑之劑量或頻率。在另一態樣中，本發明提供本文令所述之任一種抗亥普辛抗體，其中抗亥普辛抗體包含可偵測標記。在另一態樣中，本發明提供本文中所述之任一種抗亥普辛抗體與亥普辛的複合H些實施例中，該複合物為活體内或活體外複合物。在_些實施例中，該複合物包含癌細胞《在一些實施例中，抗亥普辛抗體經可偵測地標 I51637.doc -24- 201121566 記。【實施方式】本發明於本文中提供適用於例如治療或預防與亥普辛之表現及/或活性相關之疾病（諸如表現及/或活性增強或不需要之表現及/或活性）的抗亥普辛抗體。在一些實施例中，本發明之抗體用於治療腫瘤、癌症及/或細胞增殖性病症。在另一態樣中，本發明之抗亥普辛抗體用作偵測及/或分離亥普辛（諸如偵測各種組織及細胞類型中之亥普辛）之試劑。本發明另外提供製造及使用抗亥普辛抗體及編碼抗亥普辛抗體之聚核苷酸之方法。通用技術本文所述或所參考之技術及程序使用熟習此項技術者習知之方法，諸如以下文獻中所述之廣泛使用方法可大體上充分瞭解並普遍使用：Sambrook等人，Molecular Cloning: A Laboratory Manual 第 3版（2001) Cold Spring Harbor Laboratory

Press，Cold Spring Harbor, N.Y. CURRENT PROTOCOLS IN MOLECULAR BIOLOGY(F. M. Ausubel，等人編，（2003)); METHODS IN ENZYMOLOGY系列（Academic Press，Inc·): PCR 2: A PRACTICAL APPROACH(M. J. MacPherson，B. D. Hames及 G. R. Taylor編（1995))，Harlow及Lane編，（1988) ANTIBODIES， A LABORATORY MANUAL，及 ANIMAL CELL CULTURE(R. I. Freshney編，（1987))。 151637.doc -25- 201121566 定義「分離」之抗體為已經鑑別且與其天然環境之組分分離及/或自其天然環境之組分中回收的抗體。其天然環境之污染組分為將干擾抗體之診斷或治療用途之物質Y且=包括酶、激素及其他蛋白質或非蛋白質溶解物。在較佳實施例中，將抗體（1)純化至如藉由例如勞立（L〇wry)方法所測定，95重量％以上之抗體，且最佳純化至的重量％以上； (2)純化至藉由使用旋杯式序列分析儀足以獲得n末端或内部胺基酸序列之至少15個殘基的程度，或（3)純化至使用考馬斯藍（Coomassie blue)或較佳銀染在非還原或還原條件下由SDS-PAGE(十二烷基硫酸鈉聚丙烯醯胺凝膠電泳）鑑定為均質。由於抗體之天然環境之至少一種組分將不存在，所以分離之抗體包括原位處於重組細胞内之抗體。然而，經分離抗體通常將由至少一個純化步驟來製備。「分離」之核酸分子為經鑑別且與在該核酸之天然來源中通常與其結合之至少一種污染核酸分子分離的核酸分子。分離之核酸分子不同於自然界中所發現之形式或環境。因此，分離之核酸分子不同於其存在於天然細胞中之核酸分子。然而，分離之核酸分子包括通常表現核酸（例如編碼抗體之核酸）之細胞中所含之核酸分子，例如，其中該核酸分子在染色體中位置不同於天然細胞。術語「根據Kabat編號之可變域殘基」或「根據Kabat編號之胺基酸位置」或其變化形式係指Kabat等人， Sequences of Proteins of Immunological Interest，第 5版Public 151637.doc -26- 201121566

Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD. (1991)中用於抗體編碼之重鏈可變域或輕鏈可變域之編號系統。使用此編號系統，實際線性胺基酸序列可含有更少或額外的胺基酸，相當於縮短可變域之FR或CDR或在其中進行插入。舉例而言，重鏈可變域可包括H2之殘基52之後的單一胺基酸插入物（根據Kabat之殘基52a)及重鏈FR殘基 82之後的插入殘基（例如根據Kabat之殘基82a、82b及82c 等）。可藉由將既定抗體之序列同源區與「標準」Kabat編號序列比對來確定該抗體殘基的Kabat編號》如本文所用之片語「實質上類似」或「實質上相同」表示兩個數值（一般一數值與本發明抗體相關且另一數值與參考/比較抗體相關）之間具有足夠高之相似度，以致熟習此項技術者認為兩個值之間的差異在該等值（例如Kd值）所量測之生物學特徵範圍内具有極小或不具有生物及/或統計學顯著性。該等兩個值之間的差異作為參考/比較抗體之值的函數較佳小於約5〇%、較佳小於約4〇%、較佳小於約30%、較佳小於約20%、較佳小於約1〇%。結合親和力」一般係指分子（例如抗體）之單一結合位點與其結合搭配物（例如抗原）間之非共價相互作用的總強度。除非另作指示，否則如本文所用之「結合親和力」係指反映結合對（例如抗體與抗原）成員之間Η相互作用之固有結合親和力。分子χ對其搭配物γ之親和力—般可由解離常數⑽）表示。Kd理想地4ΐχΐ()·7、ΐχΐ〇8、5_8、 ^。，'一或甚至…^或更強”親和力可 15J637.doc •27- 201121566 =此項技術中已知之常用方法（包括本文所述之彼等方法罝測。低親和力抗體一般緩慢地結合抗原且傾向於容易地解離，而高親和力抗體一般較快地結合抗原且傾向於長時間保持結合。此項技術中已知多種量測結合親和力之方違等方法中之任—者均可用於達成本發明之目的。特疋例示性實施例描述於下文申。貫施例中由放射性標記抗原結合檢測法（rIa)量測本發明之「Kd」4「Kd值」，該檢測法用相關抗體之 Fab形式與其抗原如以下如以下檢測法所述執行：藉由在系列用於滴定之未標記抗原存在下以最低濃度之經（12$1) 標記抗原平衡Fab、接著以塗有&Fab抗體之板捕捉獲結合抗原來量測Fab對抗原之溶液結合親和力（Chen等人， (1999) J. Mol Biol 293:865_881)。為建立檢測條件，將微量滴定板（Dynex)以50 mM碳酸鈉（pH 9 6)令之5 pg/mi捕捉抗Fab抗體（Cappel Lab)塗佈隔夜，且隨後在室溫下（約 23 C )以含2% (w/v)牛血清白蛋白之PBS阻斷2至5小時。在非吸附劑板（Nunc #269620)中，將10〇 pM或26 pM [丨25；[]抗原與相關Fab之連續稀釋液混合（例如與抗VEGF抗體Fab_12 之 6平估一致 ’ Presta專人 ’（1997) Cancer Res. 57:4593- 4599)。接者培育相關Fab隔夜；然而，培育可持續一段較長之時間（例如65小時）以確保達到平衡。此後，將混合物轉移至捕捉板中’在室溫下培育1小時。接著移除溶液並用含0.1% Tween-20之PBS洗滌板8次。當乾燥板時，每孔添加 150 μΐ閃爍體（MicroScint-20; packard)，且在 Topcount I5I637.doc -28- 201121566 γ計數器（Packard)上對板計數10分鐘《選擇提供小於或等於20°/。最大結合之各Fab濃度用於競爭性結合檢測法。根據另一實施例’使用表面電漿共振檢測法，使用 BIAcore™-2000 或 BIAcoreTM-3000(BIAcore，Inc., Piscataway， NJ)，在25°C下，以約10個反應單位（RU)之固定抗原CM5 晶片量測Kd或Kd值。簡言之，根據供應商之說明書用N_ 乙基-N'-(3-二曱基胺基丙基）碳化二亞胺鹽酸鹽（edC)及N-羥基丁二醯亞胺（NHS)活化羧甲基化葡聚糖生物感應器晶片（CM5 ’ BIAcore Inc)。用 10 mM 乙酸鈉（pH 4.8)稀釋抗原至5 pg/ml(約0.2 μΜ) ’之後以5 μΐ/ml之流速注射，以獲得約10個反應單位（RU)之偶合蛋白。注射抗原後，注射1 μ 乙醇胺以阻斷未反應之基團。為進行動力學量測，在2 5 下以約25 μΐ/min之流速注射Fab於有0.05% Tween 2〇(PBST)之PBS中之兩倍連續稀釋液（〇·78 nM至500 nM)。在一些實施例中，將以下修改用於表面電漿共振檢測方法中：將抗體固定於CM5生物感測器晶片上以達到約4〇〇 RU，且為進行動力學量測，在25。(：下以約30 μΐ/min之流速注射標靶蛋白質（例如亥普辛-Illb或亥普辛_IIIc)於PBST 緩衝液中之連續稀釋液（由67 nM起始）。使用簡單的一對一朗谬爾結合模型（Langmuir binding model)(BIAcore評估軟體3 _2版）藉由同時擬合結合與解離感測器圖譜計算結合速率（k〇n)及解離速率（koff)。根據koff/kont th*率來計算平衡解離常數（Kd)。參見例如Chen，Y.，等人，（1999) J. Mol. Biol. 293:865-881。若由上述表面電漿共振檢測法測定 151637.doc -29· 201121566 時，結合速率超過l〇6 NT1 S_1，則結合速率藉由使用螢光淬滅技術測定，該技術係如分光計（諸如具有攪拌式光析管之止流裝備型分光光度計（Aviv Instruments)或8000系列 SLM-Aminco分光光度計（ThermoSpectronic))中所量測，在遞增濃度之抗原存在下，在25°C下量測PBS(pH 7.2)中之20 nM抗抗原抗體（Fab形式）之螢光發射強度（激發=295 nm ; 發射=340 nm，16 nm帶通）之增或減。本發明之「結合速率」或「」亦可在25°C下，使用 BIAcoreTM-2000 或 BIAcoreTM-3000(BIAcore, Inc.，Piscataway， NJ)，以約1 0個反應單位（RU)之固定抗原CM5晶片，利用上述相同的表面電漿共振技藝測定。簡言之，根據供應商之說明書用N-乙基-N'-(3-二曱基胺基丙基）碳化二亞胺鹽酸鹽（EDC)及N-羥基丁二醯亞胺（NHS)活化羧曱基化葡聚糖生物感應器晶片（CM5，BIAcore Inc)。用10 mM乙酸納 (pH 4.8)稀釋抗原至5 pg/ml(約0.2 μΜ)，之後以5 μΐ/min流速注射，獲得約1〇個反應單位（RU)之偶合蛋白。注射抗原後，注射1 Μ乙醇胺以阻斷未反應基團。為進行動力學量測，在25°C下以約25 μΐ/min之流速注射Fab於有0.05% Tween 20(PBST)之PBS中之兩倍連續稀釋液（0.78 nM至500 ηΜ)。在一些實施例中，將以下修改用於表面電漿共振檢測方法中：將抗體固定於CM5生物感測器晶片上以達到約 400 RU，且為進行動力學量測，在25°C下以約30 μΐ/min之流速注射標靶蛋白質（例如亥普辛-Illb或亥普辛-IIIc)於 PBST緩衝液中之連續稀釋液（由67 ηΜ起始）》使用簡單的 151637.doc •30· 201121566 一對一朗谬爾結合模型（Langmuir binding model)(BlAcore 評估軟體3.2版）藉由同時擬合結合與解離感測器圖譜計算結合速率（kon)及解離速率（kw)。根據kcjff/k。。之比率來計算平衡解離常數（Kd)。參見例如Chen，Y.,等人，（1999) J. Mol. Biol. 293:865-881。然而，若由上述表面電聚共振檢測法測定時，結合速率超過1〇6 M·1 S·1，則結合速率較佳使用螢光淬滅技術測定，該技術係如分光計（諸如具有授拌式光析管之止流裝備型分光光度計（Aviv Instruments)或 8000 系列 SLM-Aminco 分光光度計（ThermoSpectronic))中所量測’在遞增濃度之抗原存在下，在25°c 丁量測 PBS(pH 7.2)中之20 nM抗抗原抗體（Fab形式）之螢光發射強度（激發=295 nm，發射=3 40 nm，16 nm帶通）之增戍減。如本文所用之術語「載體」意指能夠轉運所連接之另一核酸分子之核酸分子。一類型載體為「質體」，其係指可接合其他DNA區段之環形雙鏈DNA環《另一類型載體為嗔菌體載體。另一種類型載體為病毒載體，其中可將其他 DNA區段接合至病毒基因組。某些載體能夠在引入該等載體之宿主細胞中自主複製（例如具有細菌複製起點之細菌載體及游離型哺乳動物載體）。其他載體（例如非游離型哺乳動物載體）可在引入宿主細胞之後整合至宿主細胞基因組中，且從而與宿主基因組一起複製。此外，某些載體能夠引導其操作性連接之基因之表現。本文中將此等載體稱為「重組表現載體」（或簡稱為「重組載體」）。一般而 151637.doc •31 · 201121566 言，適用於重組DNA技術中之表現載體通常呈質體形式。在本說明書中，由於質體為最常用之載體形式，故「質體」與「載體」可互換使用》如本文中可互換使用之「聚核苷酸」或「核酸」係指任何長度之核苷酸的聚合物，且包括DNA及RNA。核苷酸可為去氧核糖核苷酸、核糖核苷酸、經修飾之核苷酸或鹼基及/或其類似物，或可藉由DNA或RNA聚合酶或合成反應併入聚合物中之任何受質。聚核苷酸可包含經修飾之核苷酸’諸如甲基化核苷酸及其類似物。若存在，則可在裝配聚合物之前或之後對核苷酸結構進行修飾。核苷酸之序列可由非核苷酸組分中斷。可在合成後諸如藉由與標記結合對聚核苷酸進行進一步修飾^其他類型之修飾包括：例如一或多種天然存在之核苦酸經類似物之「帽」取代；核普西文間修飾’諸如具有不荷電鍵之彼等物（例如鱗酸甲醋、磷酸二酯、構醯胺酸、胺基甲酸酯等）及具有荷電鍵之彼等物（例如硫代磷酸酯、二硫代磷酸酯等）、含有側位部分之彼等物（諸如蛋白質（例如核酸酶、毒素、抗體、信號肽、ply-L-離胺酸等））、具有嵌入劑之彼等物（例如。丫咬 (acridine) '補骨脂素（psoraien)等）、含有螯合劑之彼等物 (例如金屬、放射性金屬、硼、氧化性金屬等）、含有烷化劑之彼等物、具有經修飾鍵之彼等物（例如α變旋異構體核酸等）以及聚核苷酸之未修飾形式。另外，通常存在於糖中之任何羥基均可例如經膦酸酯基、磷酸酯基置換，經標準保護基保護或經活化以製備與其他核苷酸之其他鍵結； 151637.doc -32- 201121566 或可與固體或半固體支撐物結合。5，及3，末端〇H可經磷酸化或經1至20個碳原子之胺或有機帶帽基部分取代。其他羥基亦可衍生成標準保護基。聚核苷酸亦可含有此項技術中一般已知之核糖或去氧核糖之類似形式，包括例如2，_〇_ 甲基-、2·-0-烯丙基、2，_氟_或2，·疊氮基_核糖；碳環糖類似物，α-變旋異構糖；差向異構糖，諸如阿拉伯糖木糖或來蘇糖，哌喃糖；呋喃糖；景天庚酮糖；非環狀類似物，及基本核苷類似物，諸如曱基核糖苷。一或多個磷酸二酯鍵可經替代性鍵聯基置換。此等替代性連接基團包括 (但不限於）峨酸酯經P(〇)S(「硫醇酯」）、p(s)s(「二硫醇酯」）、（0)NR2(「醯胺化物」）、p(〇)R、p(〇)〇R,、c〇或 CH2(「甲縮醛」）置換之實施例，其中各尺或R，獨立地為H 或視情況含有醚（-〇-)鍵之經取代或未經取代之烷基（U0 個C)、芳基、烯基、環烷基、環烯基或芳烷基。聚核苷酸中之所有鍵結無需相同。上述描述適用於本文中所提及之所有聚核苷酸，包括RNA及DNA。如本文所用之「寡核苷酸」一般係指長度一般（但非必需）小於約200個核苷酸之短的、一般為單鏈、一般為合成之聚核苷酸。術語「寡核苷酸」及「聚核苷酸」並不相互排除。上文有關聚核苷酸之描述同樣且完全適用於寡核苷酸0 肽或多狀序列之「胺基酸序列一致性百分比（％)」係定義為.在對比序列及（若需要）導入缺口以獲得最大序列一致性百分比’且不將任何保守性取代視為序列一致性之部 151637.doc -33- 201121566 分之後，候選序列中與特定肽或多肽序列中胺基酸殘基相同之胺基酸殘基的百分比。為測定胺基酸序列一致性百分比而進行之比對可以此項技術中熟知之多種方式來實現，例如使用公開可用之電腦軟體，諸如BLAST、BLAST-2、 ALIGN或Megalign(DNASTAR)軟體》熟習此項技術者可確定用於量測比對之適當參數，包括為獲得與所比較序列全長範圍内之最大比對所需之任何算法。然而’出於本文之目的，使用序列比較電腦程式ALIGN-2產生胺基酸序列一致性百分比值，其中用於ALIGN-2程式之全部原始碼提供於以下表A中。ALIGN-2序列比較電腦程式係由Genentech， Inc.創作且原始碼已以使用者文件備案於美國版權局（U.S. Copyright Office，Washington D.C., 20559) ’ 其中其以美國版權註冊號TXU5 10087註冊。ALIGN-2程式可自Genentech, Inc.，South San Francisco，California公開獲付或可自例如 WO 2007/001851中提供之原始碼編譯。ALIGN_2程式應編譯以用於UNIX操作系統，較佳數位UNIX V4.0D中。所有序列比較參數由ALIGN-2程式設定且不改變。在使用ALIGN-2進行胺基酸序列比較之情況下’既定胺基酸序列A與既定胺基酸序列B之胺基酸序列一致性百分比（或者其可表述成與既定胺基酸序列B具有或包含某胺基酸序列一致性百分比之既定胺基酸序列A)如下計算·

100乘以分數X/Y 其中X為由序列比對程式ALIGN-2在該程式之A及B比對中評分為一致匹配的胺基酸殘基之數目，且其中Y為B中胺 151637.doc -34- 201121566 基酸殘基之總數。應瞭解，若胺基酸序^之長度不同於胺基酸序列Β之長度，則八對8之胺基酸序列一致性百分比將不等於Β對Α之胺基酸序列一致性百分比。在-些實施例中’兩種或兩種以上胺基酸序列至少鳩、嶋、鳩、8G%或魏—致。在_些實施例中，兩種或兩種以上胺基酸序列至少95%、97%、98%、99%或甚至100°/。-致。除非另外明確規定，㈣本文所用之所有胺基酸序列-致性百分比值係如先前段落使用ALIGN_M 腦程式所述獲得。除非另外特定指示或上下文中加以指示，否則如本文所用之術語「亥普辛」係指任何天然或變異體亥普辛多狀。術語「天然序列」4寺定涵蓋天然存在之截斷形式(例如胞外域序列或跨膜次單元序列）、天然存在之變異體形式(例如替代性剪接形式）及天然存在之對偶基因變異體。術語「野生型亥普辛」通常係指包含天然存在之亥普辛蛋白質之胺基酸序列的多肽。術語「野生型亥普辛序列」一般係指於天然存在之亥普辛中發現之胺基酸序列。在一實施例中，天然序列亥普辛多肽包含胺基酸序列SEQ ID N〇:46(參見圖7)。在一實施例中，天然序列亥普辛多肽包含胺基酸序列SEQ ID ΝΟ··47(參見圖8)。「亥普辛多肽變異體」或其變體意謂亥普辛多肽，一般為如本文所定義與如本文所揭示之任一天然序列亥普辛多肽序列具有至少約80%胺基酸序列一致性的活性亥普辛多肽。該等亥普辛多肽變異體包括例如在天然胺基酸序列之 151637.doc •35· 201121566 N末端或C末端添加或缺失一或多個胺基酸殘基的亥普辛多肽。通常，亥普辛多肽變異體與如本文所揭示之天然序列亥普辛多肽序列具有至少約80%之胺基酸序列一致性，或者至少約 81%、82% ' 83%、84%、85%、86%、87%、 88%、89%、90%、91〇/〇、92%、930/〇、94%、95%、96%、 97°/。、98%或99°/。之胺基酸序列一致性。通常，亥普辛變異體多肽長度為至少約10個胺基酸，或者長度為至少約 20、30、40、50、60、70、80、90、100、110 ' 120、 130 ' 140 、 150 ' 160 ' 170 ' 180 、 190 、 200 、 210 、 220 、 230 、 240 、 250 、 260 、 270 、 280 、 290 、 300 、 310 、 320 、 330 、 340 、 350 、 360 、 370 、 380 、 390 、 400 、 410 、 420 、 430 、 440 、 450 、 460 、 470 、 480 、 490 、 500 、 510 、 520 、 530 ' 540、550 ' 560、570、580、590、600個胺基酸或更長。視情況亥普辛變異體多肽與天然亥普辛多肽序列相比將具有不超過一個保守胺基酸取代，或者與天然亥普辛多狀序列相比具有不超過2、3、4、5、6、7、卜9或1〇個保守胺基酸取代。「_酸㈣抑_」為在—定程度上抑制路胺酸激酶之酪胺酸激酶活性的分子，諸如亥普辛受體。「抑制j係與參考值相比胳你+ a , 相比降低或減少活性、功能及/或量。蛋白質「表現」係指基因中祕& β 中所編碼之資訊轉化為信息 RNA(mRNA)且隨後轉化為蛋白質。本文中’表現」相關蛋白暂ίΆ , 贫白質（诸如亥普辛）之樣品或細 151637.doc -36- 201121566 胞為編碼蛋白質的mRNA$蛋白質（包括其片段）經測定存在於樣品或細胞中之樣品或細胞。「免疫結合物」（可互換地稱為「抗體藥物結合物」或「ADC」）意謂與一或多種細胞毒性劑結合之抗體，該或該等細胞毒性劑為諸如化學治療劑、藥物、生長抑制劑、毒素（例如蛋白質毒素，細菌、真菌、植物或動物來源之酶促活性毒素或其片段）或放射性同位素（亦即放射結合物）。「阻斷」抗體或「拮抗」抗體為抑制或降低所結合之抗原之生物活性的抗體。較佳阻斷抗體或拮抗抗體完全抑制抗原之生物活性。「裸抗體」為未與諸如細胞毒性部分或放射性標記之異源分子結合之抗體。具有指定抗體之「生物學特徵」之抗體為具有彼抗體之一或多個生物學特徵的抗體，該等生物學特徵將其與結合相同抗原之其他抗體相區分。為筛檢與相關抗體所結合的抗原上之抗原決定基結合之抗體’可進行常規交叉阻斷檢測法，諸如描述於 Antibodies, A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory, Harlow及David Lane 編（1988)中之檢測法。為使含有本發明胺基酸序列之抗體或多肽半衰期增加，可如例如美國專利5,739,277中所述，在抗體（尤其抗體片段）上連接一個補救受體結合抗原決定基。舉例而言，編碼補救受體結合抗原決定基之核酸分子可在架構中連接至 151637.doc -37· 201121566 編碼本發明多肽序列的核酸，以便由經過工程改造之核酸分子表現之融合蛋白包含該補救受體結合抗原決定基及本發明之多肽序列。如本文所用，術語「補救受體結合抗原決定基」係指IgG分子（例如IgG,、IgG2、IgG3或IgG4)之Fc 區之抗原決定基，其負責增加IgG分子之活體内血清半衰期（例如 Ghetie 等人，/wmwwo厂 18:739-766 (2000)，表1)。在Fc區經取代且延長血清半衰期之抗體亦描述於 WO 00/42072、WO 02/060919 ; Shields等人，《/. Biol. Chem. 276:6591-6604 (2001) ； Hinton, J. Biol. Chem. 279:6213-6216 (2004)中。在另一實施例中，亦可例如藉由連接其他多肽序列來增加血清半衰期。舉例而言，可使適用於本發明方法之抗體或其他多肽連接至血清白蛋白或血清白蛋白中與FcRn受體或血清白蛋白結合肽結合之一部分，以便血清白蛋白結合至抗體或多肽，例如該等多肽序列揭示於WO 01/45746中。在一較佳實施例中，待連接之血清白蛋白肽包含胺基酸序列DICLPRWGCLW(SEQ ID NO·· 1 3)。在另一實施例中，藉由此等方法增加Fab之半衰期。關於血清白蛋白結合肽序列亦參見之Dennis等人，J". 方ίο/. C/zem. 277:35035-35043 (2002) ° 「片段」意謂較佳含有參考核酸分子或多肽之整體長度的至少 10%、20%、30%、40%、50%、60% ' 70%、80%、 90%、95%或95%以上之多肽或核酸分子之一部分。片段可含有 10、20、30、40、50、60、70、80、90 或 100、 200、300、400、500、600或600個以上之核苷酸或10、 151637.doc -38 - 201121566 20 ' 30、40、50、60、70 ' 80 ' 90、100 ' 120、140、 160、180、190、200或200個以上之胺基酸。術語「抗體」及「免疫球蛋白」在廣義上可互換使用，且包括單株抗體（例如全長或完整單株抗體）、多株抗體、多價抗體、多特異性抗體（例如雙特異性抗體，只要其展現出所需之生物活性即可）’且亦可包括某些抗體片段（如本文更詳細地描述）。抗體可為人類抗體、人類化抗體及/ 或親和力成熟抗體。術語「可變」係指抗體中可變域之某些部分的序列廣泛不同且該等部分用於各特定抗體對其特定抗原之結合及特異性的事實。然而，可變性並非均勻分佈於整個抗體可變域中。其集中於輕鏈可變域與重鏈可變域中稱為互補判定區（CDR)或高變區之三個區段。可變域之較高保守部分稱為構架（FR)。天然重鏈及輕鏈之可變域各包含四個主要採用β片構型之FR區，該等FR區由三個CDR連接，該等CDR 形成連接β片結構的環，且在一些情況下，該等環形成β片結構之一部分。各鏈中之CDR與另一鏈中之CDR藉由FR區緊密結合在一起，促使形成抗體之抗原結合位點（參見專 k，Sequences of Proteins of Immunological Interes，赛五版，National Institute of Health，Bethesda，MD (1991))。雖然恆定域並不直接參與抗體與抗原之結合，但展現各種效應功能，諸如使抗體參與抗體依賴性細胞毒性。木瓜蛋白酶消化抗體產生以下片段：兩個稱為「Fab」片段之相同抗原結合片段，各具有單一抗原結合位點；及 151637.doc •39- 201121566 一剩餘「Fc」片段，該名稱反映容易地結晶之能力。胃蛋白酶處理產生具有兩個抗原結合位點且仍能夠交聯抗原之 F(ab’）2片段。「Fv」為含有完全抗原識別位點及結合位點之最小抗體片段。在雙鏈Fv種類中，此區域係由緊密、非共價結合之一個重鏈可變域與一個輕鏈可變域之二聚體組成。在單鏈

Fv種類中，一個重鏈可變域與一個輕鏈可變域可經彈性肽連接子共價連接’從而使輕鏈與重鏈可以與兩鏈Fv種類中之結構類似之「二聚」結構結合。在此構型中各可變域之 3個CDR相互作用以界定VH_VL二聚物表面上之抗原結合位點。總體而言，6個CDR賦予抗體以抗原結合特異性。 ,、、；而即使單個可變域（或包含僅3個對抗原具有特異性之 CDR的一半Fv)能夠識別及結合抗原，但親和力比整個結合位點低。

Fab片段亦含有輕鏈恆定域及重鏈第一恆定域（chi)。 Fab，片段與Fab片段之不同之處在於在包括—或多個來自抗體鉸鏈區之半胱胺酸的重鏈域之祕末端添加有少量殘基。在本文中為惶定域之半胱胺酸殘基帶有游離硫醇基之Fab，的名稱。最初F(ab，)2^體片段以其間具有錄鏈半胱胺酸之㈣，片段對形式產生。亦已知抗體片段之其他化學偶合。基於其值定域之胺基酸序列，任何脊椎動物種之抗體 (免疫球蛋白)之「輕鏈」可歸為兩個明顯不 κ及λ)之一。 151637.doc 201121566 視重鏈之恆定域之胺基酸序列而定，免疫球蛋白可歸為不同類別中。免疫球蛋白有五種主要類別：IgA、IgD、 IgE、IgG及IgM，且此等類別之數種可進一步細分成亞類 (同型）：例如IgG 丨、IgG2、IgG3、IgG4、IgAjIgA2。對應於不同類別之免疫球蛋白之重鏈恆定域分別稱為α、§、 ε、γ及μ。熟知免疫球蛋白之不同類別之次單元結構及三維構型。「抗體片段」僅包含完整抗體之一部分，其中該部分較佳保留至少一種，較佳大部分或所有當存在於完整抗體中時通常與該部分相關之功能。抗體片段之實例包括 Fab、Fab，、F(ab，）2及Fv片段；雙功能抗體；線性抗體；單鏈抗體分子及由抗體片段形成之多特異性抗體。在一實施例中，抗體片段包含完整抗體之抗原結合位點且因此保留結合抗原之能力。在另一實施例中，抗體片段（例如包含Fc區域者）保留當存在於完整抗體中時通常與Fc區域相關的至少一個生物學功能，諸如FcRn結合、抗體半衰期調節、ADCC功能及補體結合。在一實施例中，抗體片段為具有實質上類似於完整抗體的活體内半衰期之單價抗體。舉例而δ ’該抗體片段可包含與F c序列連接之抗原結合臂’ Fc序列能夠使該片段具有活體内穩定性。術語「高變區」、「HVR」或「HV」在本文中使用時係才曰序列咼變及/或形成結構確定之環之抗體可變域的區。一般而言，抗體包含6個高變區；3個位於VH*(H1、H2、 H3)，且3個位於VL中（L1、L2、L3)。本文中使用且包含許多有關高變區之描繪。Kabat互補決定區（CDR)係基於序 151637.doc -41 - 201121566 列可變性且最常用（Kabat等人，Sequences of Proteins of Immunological Interest，第 5 版，Public Health Service， National Institutes of Health, Bethesda，MD. (1991))。 Chothia另外指出結構環之位置（Chothia及Lesk J. Mol. Biol. 196:90卜917(1987))。AbM高變區代表Kabat CDR與 Chothia結構環之間的折衷，且為Oxford Molecular之AbM 抗體模型化軟體所用。「接觸」高變區係基於對可用複晶體結構之分析。此等高變區中之每一者的殘基如下所說明。環 Kabat AbM Chothia 接觸 L1 L24-L34 L24-L34 L26-L32 L30-L36 L2 L50-L56 L50-L56 L50-L52 L46-L55 L3 L89-L97 L89-L97 L91-L96 L89-L96 HI H31-H35B H26-H35B H26-H32 H30-H35B (Kabat 編號） HI H31-H35 H26-H35 H26-H32 H30-H35 (Chothia編號） H2 H50-H65 H50-H58 H53-H55 H47-H58 H3 H95-H102 H95-H102 H96-H101 H93-H101 可包含如下「延長高變區」：VL中之24-36或24- 34(L1)、46-56 或 50-56(L2)及 89-97(L3)以及 VH 中之 26-35(H1)、50-65 或 49-65(H2)及 93-102、94-102 或 95-102(H3)。可變域殘基係根據Kabat等人（同上）關於此等定 151637.doc •42· 201121566 義中之每一者所述編號。「構架」或「FR」殘基為除如本文所定義之高變區殘基外的彼等可變域殘基。「人類化」形式之非人類（例如鼠類）抗體為含有衍生自非人類免疫球蛋白之最小序列的嵌合抗體❶人類化抗體一般為來自接受者之高變區的殘基經來自諸如小鼠、大鼠、兔或非人類靈長類動物之非人類物種（供體抗體）之高變區的具有所需特異性、親和力及能力之殘基置換的人類免疫球蛋白（接受者抗體）。在一些情況下，人類免疫球蛋白之構架區（FR)殘基經相應非人類殘基置換。此外，人類化抗體可包含接受者抗體或供者抗體中皆未見之殘基。進行此等修飾以進一步改善抗體效能。一般而言，人類化抗體將包含實質上所有至少一個且通常兩個可變域，其中所有或實質上所有高變環對應於非人類免疫球蛋白之彼等高變環，且所有或實質上所有FR為人類免疫球蛋白序列之彼等 FR。人類化抗體視情況亦將包含至少一部分免疫球蛋白恆定區（Fc)，通常為人類免疫球蛋白之恆定區。欲知詳情，參見 Jones等人，Nature 321:522-525 (1986) ; Riechmann等人， Nature 332:323-329 (1988) ； APresta, Curr. Op. Struct. Biol.2:593-596 (1992)。亦參見以下綜述及其中引用之參考文獻： Vaswani and Hamilton, Ann. Allergy, Asthma & Immunol. 1:105-115 (1998) ; Harris, Biochem. Soc. Transactions 23:1035-1038 (1995); Hurle and Gross，Curr· Op. Biotech. 5:428-433 (1994)。「嵌合」抗體（免疫球蛋白）之重鏈及/或輕鏈中之一部分 151637.doc -43- 201121566 與衍生自特定物種或屬於特定抗體類別或亞類之抗體中之相應序列相同或同源’而該（該等）鍵中之其餘部分與衍生自另一物種或屬於另一抗體類別或亞類之抗體中之相應序列相同或同源；只要其展現所需生物活性即可（美國專利第 4,816,567號；及 Morrison 等人，iVoc. Jcat/· Scz·. USA 81:6851-6855(1984))。如本文所用之人類化抗體為嵌合抗體之子集。「單鏈Fv」或「SCFv」抗體片段包含抗體之VH及VL 域’其中此專結構域存在於單一多狀鍵中。一般而言， scFv多肽另外包含VH與VL域之間使scFv能夠形成抗原結合所需結構之多狀連接子。對於SCFV之評述，參見 Pluckthun, The Pharmacology of Monoclonal Antibodies » 第 113 卷中，Rosenburg 及 Moore 編，Springer-Verlag, New York，第 269-315頁（1994)。「抗原」為抗體可選擇性結合之預定抗原。標靶抗原可為多肽、醣、核酸、脂質、半抗原或其他天然存在或合成之化合物。標靶抗原較佳為多肽。術語「雙功能抗體」係指具有兩個抗原結合位點之小抗體片段’該等片段包含與相同多肽鏈（VH-VL)中之輕鏈可變域（VL)連接之重鏈可變域（VH)。藉由使用過短而無法使同一鏈上兩個結構域之間配對的連接子，該等結構域被迫與另一鏈之互補域配對且產生兩個抗原結合位點。雙功能抗體更詳細地描述於例如EP 404,097 ; WO 93/11161 ;及 Hollinger等人，dead. 5W. 90:6444-6448 I51637.doc -44 - 201121566 (1993) 中。「人類抗體」為具有對應於人類所產生之抗體之胺基酸序列的胺基酸序列的抗體及/或已使用本文所揭示之用於製造人類抗體之技術中之任一種製成的抗體。人類抗體之此定義特定排除包含非人類抗原結合殘基之人類化抗體。「親和力成熟」抗體為在其一或多個CDR中具有一或多處可使得抗體對抗原之親和力改良之變化的抗體（與不具有彼等變化之親本抗體相比）。較佳之親和力成熟抗體將對標靶抗原具有奈莫耳或甚至皮莫耳之親和力。親和力成熟抗體由此項技術中已知之程序產生。Marks等人，

Bio/Technology 10:779-783 (1992)描述藉由 VH 及 VL域改組親和力成熟。以下文獻描述CDR及/或構架殘基之隨機突變誘發：Barbas等人 ’ ProcNat_Acad_Sci,USA 91:3809-3813 (1994) ; Schier等人，Gene 169:147-155 (1995) ; Yelton等人， J. Immunol. 155:1994-2004 (1995) ; Jackson等人，J. Immunol. 154(7):3310-9 (1995);及Hawkins等人，J. Mol. Biol. 226:889- 896 (1992)。抗體「效應功能」係指可歸因於抗體之Fc區（天然序列 Fc區或胺基酸序列變異Fc區）之彼等生物活性，且其隨抗體同型而變化。抗體效應功能之實例包括：C1 q結合及補體依賴性細胞毒性；F c受體結合；抗體依賴性細胞介導之細胞毒性（ADCC);吞噬作用；細胞表面受體（例如b細胞受體）下調；及B細胞活化。「抗體依賴性細胞介導之細胞毒性」或「ADCC」係指 151637.doc -45· 201121566 一種細胞毒性形式，其中結合於某些細胞毒性細胞（例如自然殺手（NK)細胞、嗜中性白血球及巨噬細胞）上存在之 Fc受體（FcR)上的經分泌之lg使此等細胞毒性效應細胞能夠特異性結合攜有抗原之標靶細胞且隨後以細胞毒素殺傷標靶細胞。抗體「配備」細胞毒性細胞且絕對為此殺死作用所需。介導ADCC之初級細胞（NK細胞）僅表現FcyRIII，而單核細胞表現FcYRI、FcyRII及FcyRIII。FcR在造血細胞上之表現係概述於 Ravetch 及 Kinet，Rev. Immunol 9:457-92 (1991)之第464頁上的表3中。為評定相關分子之 ADCC活性’可進行活體外ADCC檢測法，諸如美國專利第5,500,362號或第5,821，337號或Presta美國專利第 6,737,056號中所述之檢測法。適用於該等檢測法之效應細胞包括周邊血液單核細胞（PBMC)及自然殺手（NK)細胞。或者或另外’可在活體内，例如在動物模型中（諸如Clynes 等人’ PAMS「tAS為）95:652-656 (1998)中所揭示）評定相關分子之ADCC活性。「人類效應細胞」為表現一或多個FcR且執行效應功能之白血球。該等細胞較佳至少表現FcyRIII且執行ADCC效應功能。介導ADCC之人類白血球之實例包括周邊血液單核細胞（PBMC)、自然殺手（NK)細胞、單核細胞、細胞毒性T細胞及嗜中性白血球；其中PBMC及NK細胞較佳。效應細胞可自天然來源（例如血液）分離。

「Fc受體」或「FcR」描述與抗體Fc區結合之受體。較佳FcR為天然序列人類FcR ^此外，較佳之FcR為結合IgG 151637.doc -46- 201121566 抗體之FcR(Y受體）且包括FcyRI、FcyRII及FcyRIII子類之受體，包括此等受體之對偶基因變異體及替代性剪接形式。FcyRII受體包括FcyRIIA(「活性受體」）及 FcYRIIB(「抑制受體」），該兩者具有類似胺基酸序列且主要不同之處在於其細胞質域。活性受體FcyRIIA在其細胞質域中含有基於免疫受體酪胺酸之活化基元（ITAM)。抑制受體FcyRIIB在其細胞質域中含有基於免疫受體酪胺酸之抑制基元（ITIM)。（參見評述M.inDaέron，yί««w./?ev· Immunol. 15:203-234 (1997))。FcR係於以下文獻中評述： Ravetch及 Kinet，i?ev. immwno/ 9:457-92 (1991); Capel 事乂，4:25-34 (1994);及 de Haas 等人，《/. ΖαΖ?. Mei/· 126:330-41 (1995)。本文之術語「FcR」涵蓋其他FcR，包括有待將來鑑別之彼等FcR。該術語亦包括新生兒受體FcRn，其負責將母本IgG轉移至胎兒（Guyer等人，J. 117:587 (1976)及 Kim 等人，*/.

Immunol. 24:249 (1 994))且調控免疫球蛋白之穩定。WO 00/42072(Presta)描述與FcR之結合改良或降低之抗體變異體。彼專利公開案之内容係特別以引用的方式併入本文中。亦參見 Shields 等人，J. 5/〇/· Chem. 9(2): 6591-6604 (2001)。量測與FcRn之結合的方法為已知的（參見例如Ghetie 1997，Hinton 2004)。人類FcRn高親和力結合多肽活體内與人類FcRn之活體内結合及血清半衰期可例如在表現人類 FcRn之轉殖基因小鼠或經轉染之人類細胞株中，或在經投 151637.doc •47· 201121566 與Fc變異體多肽投藥之靈長類動物中加以檢測。「補體依賴性細胞毒性」或「CDC」係指在補體存在下溶解標靶細胞。藉由補體系統之第一組分（Clq)與結合至同源抗原之抗體（屬於適當子類）結合來引發經典補體路徑之活化。為評定補體活化，可進行例如如等人，·/· /mmwno厂 Mei/zocTs 202:1 63 (1996)中所述之 CDC檢測法。

Fc區胺基酸序列經改變且C1 q結合能力增強或降低之多肽變異體係於美國專利第6，194,551 B1號及WO 99/51642中描述。彼等專利公開案之内容係特別以引用的方式併入本文中。亦參見 Idusogie 等人 ’《/· //wmwwo/· 164:4 1 78-4 1 84 (2000)。術語「包含Fc區之多肽」係指諸如抗體或免疫黏附素之包含Fc區之多肽。可例如在多肽純化期間，或藉由重組工程改造編碼多肽之核酸來移除Fc區之C末端離胺酸（根據 EU編號系統，為殘基447)。因此，包含本發明之具有Fc區之多肽的組合物可包含具有K447之多肽、所有K447皆移除之多肽或有及無K447殘基之多肽的混合物。出於本文之目的，「受體人類構架」為包含源自人類免疫球蛋白構架或人類共同構架之VL或VH構架之胺基酸序列的構架。「源自」人類免疫球蛋白構架或人類共同構架之受體人類構架可包含其相同胺基酸序列或可含有預先存在之胺基酸序列變化。若存在預先存在之胺基酸變化，則較佳存在不超過5處’且較佳4處或4處以下或3處或3處以 151637.doc •48· 201121566 下預先存在之胺基酸變化。當預先存在之胺基酸變化存在於VH中時，較佳彼等變化僅在位置71H、73H及78H中之三者、兩者或一者處；舉例而言，彼等位置處之胺基酸殘基可為71A ' 73T及/或78A。在一實施例中，VL受體人類構架之序列與VL人類免疫球蛋白構架序列或人類共同構架序列一致。「人類共同構架」為代表所選人類免疫球蛋白VL或VH 構架序列中最常出現之胺基酸殘基的構架。一般而言，人類免疫球蛋白VL或VH序列係選自可變域序列之亞群。一般而言，該序列亞群為如Kabat等人中之亞群。在一實施例中，對於VL，亞群為如Kabat等人中之亞群κΐ。在一實施例中，對於VH，亞群為如Kabat等人中之亞群III。「VH亞群III共同構架」包含自Kabat等人之可變重鏈亞群III中之胺基酸序列獲得的共同序列。在一實施例中， VH亞群III共同構架胺基酸序列包含以下各序列中之至少一部分或全部：EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAAS(SEQ ID NO:14)-Hl-WVRQAPGKGLEWV(SEQ ID NO:15)-H2-RFTISRDNS KNTLYLQMNSLRAEDTAVYYC(SEQ ID NO:43)-H3-WGQGTLV TVSS(SEQIDNO:16)。「VL亞群I共同構架」包含自Kabat等人之可變輕鏈κ亞群I中之胺基酸序列獲得的共同序列。在一實施例中，VH 亞群I共同構架胺基酸序列包含以下各序列中之至少一部分或全部：

DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITC(SEQ ID NO:17)-Ll-WYQQKP 151637.doc • 49· 201121566 GKAPKLLIY(SEQ ID NO:18)-L2-GVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQ PEDFATYYC(SEQ ID NO:19)-L3-FGQGTKVEIK(SEQ ID NO:20)。如本文所用之「抗體突變體」或「抗體變異體」係指物種依賴性抗體之一或多個胺基酸殘基已經修飾之抗體胺基酸序列變異體。此等突變體必需與物種依賴性抗體具有小於100%序列一致性或類似性。在一實施例中，抗體突變體將具有與物種依賴性抗體之重鍵或輕鏈可變域之胺基酸序列具有至少75%，更佳至少80%、更佳至少85%、更佳至少90%且最佳至少95%胺基酸序列一致性或類似性的胺基酸序列。相對於此序列之一致性或類似性在本文中定義為在比對序列且必要時引入間隙達成最大序列一致性百分比後，候選序列中與物種依賴性抗體殘基一致（亦即相同殘基）或類似（亦即來自基於共同側鏈特性之同一組的胺基酸殘基，參見下文）之胺基酸殘基的百分比。N末端、C末端或内部擴展、刪除、或向可變域以外之抗體序列中插入中均不應視作影響序列一致性或類似性。「病症」或「疾病」為將自以本發明之物質/分子或方法治療獲益的任何病狀。此包括慢性及急性病症或疾病，包括使哺乳動物易患所述病症之彼等病理病狀。本文中待治療之病症的非限制性實例包括惡性及良性腫瘤、癌瘤、母細胞瘤及肉瘤。「治療」係指治療性處理及預防性或預防措施。需要治療者包括已罹患良性、癌前期或非轉移性腫瘤者，以及需預防癌症發生或復發者。 151637.doc -50· 201121566 病:之Γ有效5」係指治療或預防哺乳動物之疾病或劑二：的量。在癌症之情況下，治療有效量之治療 …細胞數目；％低原發腫瘤尺寸；抑制(亦即在、又上減緩且較佳終止）癌細胞浸潤至周邊器官中； 1 (亦ρ在某種程度上減緩且較佳終止）腫瘤轉移；在某種程度上抑制腫瘤生長；及/或在某種程度上減輕一或多 =與病症相關之症狀。藥物達到可防止癌細胞生長及/或殺死：有癌細胞之程度，則其可為細胞生長抑制劑及/或胞毋性幻。對於癌症治療，可例如藉由評估存活持續時間、疾病進展時間（ττρ)、反應率（RR)、反應持續時間及/ 或生活品質來量測活體内功效。術语「癌症」及「癌性」係指或描述通常特徵在於細胞生長調節異常的哺乳動物生理病狀。此定義包括良性及惡性癌症。「早期癌症」或「早期腫瘤」意謂不具侵襲性或轉移性或歸類為〇、〗或π期癌症之癌症。癌症之實例包括 (但不限於）癌瘤、淋巴瘤、母細胞瘤（包括髄母細胞瘤及視網膜母細胞瘤）' 肉瘤（包括脂肪肉瘤及滑膜細胞肉瘤）、神經内分泌腫瘤（包括類癌、胃泌素瘤及胰島細胞癌）、間皮瘤、神經鞘瘤（包括聽神經瘤）、腦膜瘤、腺癌、黑素瘤及白血病或淋巴惡性病。此等癌症之更特定實例包括鱗狀細胞癌（例如上皮鱗狀細胞癌）；包括小細胞肺癌（SCLC)、非小細胞肺癌（NSCLC)、肺腺癌及肺鱗狀癌之肺癌；腹膜癌；肝細胞癌；包括胃腸癌之胃癌；胰臟癌；神經膠母細胞瘤；子宮頸癌；卵巢癌；肝癌（liver cancer);膀胱癌； 151637.doc 51 201121566 肝腫瘤（hepatoma);乳癌（包括轉移性乳癌）；結腸癌；直腸癌；結腸直腸癌；子宮内膜癌或子宮癌；唾液腺癌；腎癌，刖列腺癌’陰門癌；甲狀腺癌；肝癌 ―);肛門癌；陰莖癌；晕丸癌；食道癌；膽道腫瘤以及頭頸部癌及多發性骨髓瘤。術語「癌前期」係指通常在癌症之前或發展成癌症之病狀或生長。「癌前期」生長將具有特徵在於異常細胞週期調控、增殖或分化之細胞，其可藉由細胞週期調控、細胞增殖或分化之標記物來確定。「發育不良」意、謂組冑、器冑或細胞之任何異常生長或發育。發育不良較佳為高級或癌前期。「轉移」意、謂癌，症自其原發部位擴散至身體之其他位置。癌細胞可離開原發遁瘤’渗透至淋巴管及血管中，通過血流循環且在體内其他位置處之正常組織遠處病灶中生長（轉移）°轉移可為局部或遠位轉移。轉移為連續過程，隨腫瘤細胞自原發腫瘤離開、通過金流行進且停留在遠端部位而定。在新部位處，細胞建立血液供應且可生長以形成危急生命之腫塊。腫瘤細胞中之刺激性與抑制性分子路經皆調控此行為，且腫瘤細胞與遠端部位中宿主細胞之間的相互作用亦為顯著的。「非轉移性」意謂癌症為良性的或保持於原發部位處且尚未滲透至淋巴管或血管系統中或除原發部位以外之組織中。-般而言’非轉移性癌症為任何〇、邮期癌症且 151637.doc •52· 201121566 有時為III期癌症。「原發腫瘤」或「原發癌症」意謂初始癌症而非位於個體體内之另一組織、器官或位置處之轉移病灶。「良性腫瘤」或「良性癌症」意謂保持侷限於初始部位處且不具有浸潤、侵襲或轉移至遠端部位之能力的腫瘤。「腫瘤負荷J意謂體内癌細胞之數目、腫瘤尺寸或癌症之量。腫瘤負荷亦稱為腫瘤負載。「腫瘤數目」意謂腫瘤之數目。「個體」意謂哺乳動物，包括（但不限於）人類或非人類哺乳動物，諸如牛、馬、犬、綿羊或貓。較佳，個體為人類。術語「抗癌療法」係指適用於治療癌症之療法。抗癌治療劑之實例包括（但不限於）例如化學治療劑；生長抑制劑；細胞毒性劑；用於放射治療之藥劑；抗血管生成劑；細胞凋亡劑；抗微管蛋白劑及其他治療癌症之藥劑；抗 CD20抗體；企小板衍生生長因子抑制劑（例如GieevecTM(甲磺酸伊馬替尼（Imatinib Mesylate)) ; COX-2抑制劑（例如塞内昔布（celecoxib));干擾素；細胞激素；結合一或多種以下標靶之拮抗劑（例如中和抗體）：ErbB2、ErbB3、 ErbB4、PDGFR-β、BlyS、APRIL、BCMA 或 VEGF 受體； TRAIL/Apo2 ;及其他生物活性及有機化學劑等。其組合亦包括於本發明中。如本文所用之術語「細胞毒性劑」係指抑制或防止細胞發揮功能及/或引起細胞破壞之物質。該術語意欲包括放 151637.doc • 53- 201121566 射性同位素（例如I131、I125、Y90及Re186)、化學治療劑及毒素’諸如細菌、真菌、植物或動物來源之酶促活性毒素或其片段。「化學治療劑」為適用於治療癌症之化合物。化學治療劑之實例包括適用於治療癌症之化合物。化學治療劑之實例包括：烷化劑’諸如塞替派（thiotepa)及CYTOXAN®環構醯胺；烧基橫酸鹽，諸如白消安（busulfan)、英丙舒凡 (1111卩1>05111£&11)及娘泊舒凡（pip0Suifan);氮丙咬，諸如苯〇坐多巴（benzodopa)、卡波醌（carb〇quone)、米特多巴 (meturedopa)及尤利多巴（uredopa);伸乙基亞胺及甲基三聚氰胺，包括六甲蜜胺（altretamine)、曲他胺 (triethylenemelamine)、三伸乙基磷醯胺、三伸乙基硫代磷酿胺及三經甲基三聚氰胺；乙醯精寧（acetogenin)(尤其布拉他辛（bullatacin)及布拉他辛酮（bullatacinone));喜樹驗 (camptothecin)(包括合成類似物拓朴替康（topotecan));苔蘚抑素（bryostatin);卡利斯塔叮（callystatin); CC-1065(包括其阿多來新（adozelesin)、卡折來新（carzelesin)及比折來新（bizelesin)合成類似物）；念珠藻環肽（cryptophycin)(尤其念珠藻環肽1及念珠藻環肽8);海兔毒素（dolastatin);多卡米辛（duocarmycin)(包括合成類似物KW-2189及CB1-TM1); 艾權素（eleutherobin);盤克斯塔叮（pancratistatin);沙考的汀（sarcodictyin);海綿抑素（spongistatin);氮茶 (nitrogen mustard)，諸如苯丁酸氮芥（chlorambucil)、萘氮芬（chlornaphazine)、氣鱗酿胺、雌莫司、;丁（estramustine)、 151637.doc -54- 201121566 異環構醯胺（ifosfamide)、二氯曱基二乙胺 (mechlorethamine)、鹽酸二氣甲基二乙胺氧化物 (mechlorethamine oxide hydrochloride)、美法舍 (melphalan)、新IL芬（novembichin)、膽固醇對苯乙酸氮芬 (phenesterine)、松龍苯芥（prednimustine)、曲洛填胺 (trofosfamide)、尿°密。定氮芥（uracil mustard);亞硝基脲，諸如卡莫司汀（carmustine)、氣脲黴素（chlorozotocin)、福莫司汀（fotemustine)、洛莫司汀（i〇mustine)、尼莫司丁脲 (nimustine)及雷莫司汀（ranimnustine);抗生素，諸如稀二快抗生素（例如刺孢黴素（calicheamicin)，尤其刺抱黴素及刺抱徽素coil (參見例如Agnew，C/zew /«ί/·, 33: 183-186 (1994));達米辛（dynemicin)，包括達米辛 a ; 雙膦酸鹽類’諸如氣屈膦酸鹽（clodronate);艾斯帕米辛 (esperamicin);以及新制癌菌素（neocarzinostatin)發色團及相關色蛋白烯二炔抗生素發色團）、克拉斯米辛 (aclacinomysins)、放線菌素（actin〇mycin)、奥斯拉米辛 (authramycin)、偶氮絲胺酸（azaserine) '博萊黴素 (bleomycins)、放線菌素 c(cactinomycin)、卡拉比辛 (carabicin)、洋紅黴素（carnlinomycin)、嗜癌黴素 (carzinophilin)、色黴素（chromomycinis)、放線菌素 D(dactinomycin)、道諾黴素（daunorubicin) ' 地托比星 (detorubicin)、6-重氮基-5-側氧基（0X0)_L-正白胺酸、 ADRIAMYCIN®小紅莓（包括Ν·嗎啉基_小紅莓、氰基n嗎啉基-小紅莓、2-Ν-吡咯啉基-小紅莓及去氧小紅莓）、表 151637.doc -55· 201121566 比星（epirubicin)、依索比星（esorubicin)、伊達比星 (idarubicin)、麻西羅黴素（marcellomycin)、絲裂黴素 (mitomycin)(諸如絲裂黴素〇、黴酚酸（mycophen〇lic acid)、諾拉黴素（nogalamycin)、撖欖黴素（〇liv〇mycins)、培洛黴素（peplomycin)、泊非黴素（p〇tfiromycin)、嗓呤黴素、三鐵阿黴素（quelamycin)、羅多比星（r〇dorubicin)、鏈黑菌素（streptonigrin)、鏈佐星（streptozocin)、殺結核菌素 (tubercidin)、烏苯美司（ubenimex)、淨司他丁（zinostatin) ' 佐柔比星（zorubicin);抗代謝物，諸如甲胺喋呤及5-氟尿嘧啶（5-FU);葉酸類似物，諸如迪諾特寧（den〇pterin)、甲胺0篥吟、蝶羅吟（pteropterin)、三甲曲沙（trimetrexate);嗓呤類似物’諸如氟達拉濱（fludarabine)、6-疏基嗓吟（6-mercaptopurine)、硫咪嘌呤（thiamiprine)、硫鳥嘌呤 (thioguanine);嘧啶類似物，諸如安西他濱（ancitabine)、阿紮胞苷（azacitidine)、6-氮雜尿苷（6-azauridine)、卡莫氟 (carmofur)、阿糖胞苷（cytarabine) '雙脫氧尿苷 (dideoxyuridine)、脫氧氟尿苷（doxifiuridine)、依諾他濱 (enocitabine)、氟尿苷（fl〇xuridine);雄激素，諸如卡普睾酮（calusterone)、屈他雄酮丙酸醋（dromostanolone propionate)、環硫雄醇（epiti〇stanol)、美雄烷 (mepitiostane)、睾内酯（test〇lact〇ne);抗腎上腺劑，諸如胺魯米特（aminoglutethimide)、米托坦（mitotane)、曲洛司坦（trilostane);葉酸補充劑，諸如夫羅林酸（fr〇linic acid)，乙醯葡路醋（aceglatone);酸雄酿胺膽苦 151637.doc -56- 201121566 (aldophosphamide glycoside)；胺基乙醯丙酸 (aminolevulinic acid);恩尿嘧咬（eniluracil);安吖。定 (amsacrine);倍思塔布（bestrabucil);比生群（bisantrene); 艾達曲克（edatraxate);得弗伐胺（defofamine);秋水仙胺 (demecolcine)；地吖酿（diaziquone)；艾弗鳥胺酸 (elfornithine);依利醋銨（elliptinium acetate);埃坡黴素 (epothilone);依託格魯（etoglucid);硝酸鎵；羥基脲；香蒜多糖（lentinan);羅尼達寧（lonidainine);類美登素 (maytansinoid)，諸如美登素（maytansine)及胺沙托辛 (ansamitocins)；米托胍腙（mitoguazone);米托蒽醌 (mitoxantrone)；莫比達摩（mopidanmol);硝拉維林 (nitraerine);喷司他丁（pentostatin);凡那明（phenamet); 0比柔比星（pirarubicin);洛索蒽醌（losoxantrone);足葉草酸（podophyllinic acid) ; 2-乙基醯肼；丙卡巴肼 (procarbazine); PSK® 多醣複合物（JHS Natural Products， Eugene，OR);雷佐生（razoxane);根瘤菌素（rhizoxin); 西佐0南（sizofiran);鍺螺胺（spirogermanium);細交鏈抱菌酮酸〇61111&201^。3(^(1);三亞胺醌（^丨32丨9110116);2,2，，2，'-三氯三乙基胺；單端抱黴稀族毒素（trichothecenes)(尤其T-2 毒素、弗納庫林A(verracurin A)、桿孢菌素A(roridin A)及蛇形菌毒素（anguidine));烏拉坦（urethan);長春地辛 (vindesine);達卡巴嗪（dacarbazine);甘露莫司汀 (mannomustine);二溴甘露醇（mitobronitol);二溴衛矛醇 (mitolactol) ; 〇底泊漠烧(pipobroman);曱托辛 151637.doc -57- 201121566 (gacytosine);阿拉伯糖苷（arabinoside ;「Ara-C」）；環填醯胺；塞替派；紫杉烷類（taxoids)，例如TAXOL®太平洋紫杉醇（Bristol-Myers Squibb Oncology，Princeton， N.J.)、ABRAXANETM無克列莫佛（Cremophor)經白蛋白工程改造之太平洋紫杉醇奈米顆相l調配物（American Pharmaceutical Partners，Schaumberg，Illinois)及 TAXOTERE® 多西他賽（doxetaxel)(Rh6ne-Poulenc Rorer，Antony， France);苯丁酸氮芥（chloranbucil) ; GEMZAR® 吉西他濱；6-硫代烏嘌呤；巯嘌呤；曱胺喋呤；鉑類似物，諸如順銘及卡翻；長春驗；翻；依託泊苦（etoposide)(VP-16); 異環磷醯胺；米托蒽醌；長春新鹼；NAVELBINE®長春瑞濱；諾凡特龍（novantrone);替尼泊苦（teniposide);依達曲沙（edatrexate);道諾黴素（daunomycin);胺基蝶0令 (am in op ter in); 希羅達（xeloda); 伊班膦酸鹽 (ibandronate);伊立替康（Camptosar、CPT-11)(包括伊立替康及5-FU及甲醯四氫葉酸之治療方案）；拓撲異構酶抑制劑 RFS 2000 ;二氟曱基鳥胺酸（difluorometlhylornithine， DMFO):類視黃素，諸如視黃酸；卡培他濱 (capecitabine);考布他汀（combretastatin) ; VELCADE蝴替佐米；RE VLIMID來那度胺；甲醯四氫葉酸（LV);奥沙利翻（oxaliplatin)，包括奥沙利 16 治療方案（FOLFOX) ; PKC-α、 Raf、H-Ras、EGFR之降低細胞增殖之抑制劑（例如埃羅替尼（erlotinib)(TarcevaTM))及VEGF-A之降低細胞增殖之抑制劑，以及以上任一者之醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生 -58- 151637.doc 201121566 物。此定義亦包括用以調控或抑制激素對腫瘤之作用的抗激素劑，諸如抗雌激素及選擇性雌激素受體調節劑 (SERM)，包括例如他莫西芬（包括NOLVADEX®他莫西 ' 芬）、雷洛昔芬（raloxifene)、曲洛昔芬（droloxifene)、4-經 • 基他莫西芬、曲沃昔芬（trioxifene)、雷洛昔芬鹽酸鹽 (keoxifene)、LY117018、奥那司酮（onapristone)及FARESTON 托瑞米芬（FARESTON-toremifene);抑制調控腎上腺中雌激素產生之芳香酶之芳香酶抑制劑，諸如4(5)-咪唑、胺魯米特、MEGASE® 乙酸甲地孕酮（megestrol acetate)、 AROMASIN®^^西美坦、弗米斯坦（formestanie)、法屈。全 (fadrozole)、RIVISOR®伏羅。坐（vorozole)、FEMARA® 來曲唑及ARIMIDEX®安美達錠；及抗雄激素劑，諸如氟他胺 (flutamide)、尼魯胺（nilutamide)、比卡魯胺（bicalutamide)、亮丙瑞林（leuprolide)及戈舍瑞林（goserelin);以及曲沙他濱（troxacitabine)(l，3-二氧雜環戊院核苷胞嘴咬類似物）；反義募核苷酸，尤其抑制異常細胞增殖中所涉及之信號傳導路徑中之基因（諸如PKC-α、Raf及H-Ras)表現的反義寡 " 核苷酸；核糖核酸酶，諸如VEGF表現抑制劑（例如 ANGIOZYME®核糖核酸酶）及HER2表現抑制劑；疫苗，諸如基因治療疫苗，例如ALLOVECTIN®疫苗、 LEUVECTIN® 疫苗及 VAXID® 疫苗；PROLEUKIN® rlL-2 ; LURTOTECAN®拓撲異構酶1抑制劑；ABARELIX® rmRH ;長春瑞濱及艾斯帕米辛（參見美國專利第4,675，187 151637.doc -59- 201121566 號）；及上述任一者之醫藥學上可接受之鹽、酸或衍生物。如本案所用之術語「前藥」係指醫藥活性物質之前驅體或衍生形式，其與母體藥物相比對腫瘤細胞之細胞毒性較小且能夠酶促活化或轉化為更具活性之母體形式。參見例如 Wilman，「Prodrugs in Cancer Chemotherapy」 Biochemical Society Transactions, 14 ，第 375-382 頁，第 615 次會議 Belfast (1986)及 Stella 等人，「pr〇drugs: A Chemical Approach to Targeted Drug Delivery，」 Directed Drw犮 DWzvery，Borchardt 等人（編），第 247-267 頁，Humana

Press (1985)。本發明之前藥包括（但不限於）含磷酸酯基之前藥、含硫代磷酸酯基之前藥、含硫酸酯基之前藥、含肽之前藥、經D-胺基酸修飾之前藥、糖基化前藥、含有卜内酿胺之前藥、含有視情況經取代之苯氧基乙醯胺之前藥或含有視情況經取代之苯乙醯胺之前藥、5·氟胞嘧啶及其他 5-氟尿苷前藥，其可轉化為更具活性之無細胞毒性藥物。可衍生成用於本發明之前藥形式的細胞毒性藥物之實例包括（但不限於）上文所述之彼等化學治療劑。「放射治療」意謂使用定向γ射線或β射線對細胞誘導足夠之損害以限制細胞正常發揮功能之能力或完全破壞細胞。應瞭解此項技術中已知多種測定治療劑量及持續時間的方式。典型治療以單次投藥形式提供且典型劑量範圍為每天10至200單位（Grayp 「生物樣品」（可互換地稱作「樣品j或「組織或細胞 151637.doc -60- 201121566 2品」）涵蓋自個體獲得之多種樣品類型且可用於診斷或 Μ檢測去中。該定義涵蓋血液及生物來源之其他液態樣〇 ’固態組織樣品’諸如活組織檢查試樣或組織培養物或自其獲得之細胞，及其子代。該定義亦包括在獲得後已以曲可方式加以處理之樣品，諸如藉由試劑處理、溶解或增很某些組分（諸如蛋白質或聚核苷酸）或出於切片目的嵌埋 j半固體或固體基質中。術語「生物樣品」涵蓋臨床樣且亦包括培養物中之細胞、細胞上清液、細胞溶胞、'h 、十 / _ tjff n血聚生物流體及組織樣品。生物樣品之來源 ^為如來自新鮮、冷束及/或保存之器官或组織樣品或活組織檢查或抽出物之固體組織；血液或任何血液組分；體液’諸如腦脊髓液、羊水、腹膜液或間f液；纟自個體之紅娠或發育中之任何時間的細胞。在—些實施例中，生物樣品係獲自原發或轉移性腫瘤。生物樣品可含有不與自然界中之組織天然混雜之化合物，諸如防腐劑'抗凝劑、緩衝液、固定劑、營養素、抗生素或其類似物。出於本文之目的，組織樣品之「切片」意謂單—部分或單片組織樣品，例如自組織樣品切割之組織或細胞薄片：應瞭解，可獲取多個組織樣品切片且根據本發明對盆進行分析。在-些實施例中，對同一組織樣品切片進行形離風，分子層面上之分析，或關於蛋白質及核酸對其進：：析0 一詞係指直接或間接結合試劑且促成對所結合或融當在本文中使用時「標記物」或融合至諸如核酸探針或抗體之 151637.doc •61 · 201121566 &之π式劑之彳貞測的化合物或組合物。標記物可為自身可偵測（例如放射性同位素標記或螢光標記）或在酶標記之情況下’可催化發生可偵測之受質化合物或組合物化學變化。冬發明之組合物及其製造及使用方法本發明涵蓋組合物，包括醫藥組合物，其包含抗亥普辛抗體’及包含編碼抗亥普辛抗體之序列的聚核苷酸。如本文所用之組合物包含一或多種結合至亥普辛之抗體及/或一或多種包含編碼一或多種結合至亥普辛之抗體之序列的聚核皆酸°此等組合物可進一步包含此項技術中熟知之適合載劑’諸如醫藥學上可接受之賦形劑（包括緩衝液）。本發明亦涵蓋分離抗體及聚核苦酸實施例。本發明亦涵蓋實質上純的抗體及聚核苷酸實施例。本發明亦涵蓋使用抗亥普辛抗體（如本文所述或如此項技術中所知）治療例如前列腺癌之病症的方法。組合物本發明之抗亥普辛抗體較佳為單株抗體。本發明之範鳴内亦涵蓋本文所提供之抗亥普辛抗體之Fab、Fab·、Fab1-SH及F(ab·)2片段。此等抗體片段可藉由諸如酶促消化之傳統方式產生，或可藉由重組技術產生。此等抗體片段可為嵌合或人類化抗體片段。此等片段適用於達成下文所述之診斷及治療目的。單株抗體可自實質上均質之抗體群體（亦即除可少量存在之可能天然存在之突變外’構成該群體之個別抗體相同）獲得。因此，修飾語「單株」指示抗體不為離散抗體 I51637.doc -62· 201121566 之混合物的特徵。本發明之抗亥普辛單株抗體可使用首先由K〇hler等人， , 256:495 (1 975)描述之融合瘤方法製得或可藉由重組DNA方法（美國專利第4,816,567號）製得。在融合瘤方法中，使小鼠或其他適合宿主動物（諸如倉鼠）免疫以誘發產生或能夠產生特異性結合至用於免疫之蛋白質之抗體的淋巴細胞。針對亥普辛之抗體可藉由多次皮下（sc)或腹膜内（lp)注射亥普辛及佐劑而於動物體內產生。可使用此項技術中熟知之方法製備亥普辛，其中一些方法於本文中進一步描述。舉例而言，下文描述人類及小鼠亥普辛之重組產生。在一實施例中，用融合至免疫球蛋白重鏈Fc部分之亥普辛使動物免疫。在一較佳實施例中，用亥普辛-IgGl融合蛋白使動物免疫。通常針對亥普辛與單磷醯基脂質A(MPL)/海藻糖二柯諾黴菌酸酯（trehai〇se dicrynomyco丨ate ’ TDM)之免疫原性結合物或衍生物 Immunochem. Research，Inc” Hamilt〇n，Μτ)使動物免除，且在多個部位處皮内注射溶液。兩週後使動物增強免疫。 7至1 4天後，對動物進行取血且檢測血清之抗亥普辛力價。使動物增強免疫直至力價達到平穩階段。或者，可使淋巴細胞活體外免疫q著使用適合融合劑 (諸如聚乙二醇）將淋巴細胞與骨髓瘤細胞融合以形成融合瘤細陁（Goding，Mcmocbna! Antibodies: principhs and practice , 第 59-103 頁（Academic Press，1986))。接種由此製備之融合瘤細胞，並使其在較佳含有一或多 151637.doc • 63 - 201121566 種抑制未融合之親本骨髓瘤細胞生長或存活之物質的適合培養基中生長《舉例而言，若親本骨髓瘤細胞缺乏次黃嘌吟鳥嗓呤磷酸核糖轉移酶（HGPRT或hprt)，則用於融合瘤之培養基通常將包括次黃嘌呤、胺基喋呤及胸苷（HAT培養基）’該等物質阻止缺乏HGPRT之細胞生長。較佳骨髓瘤細胞為有效融合，支持所選產生抗體之細胞穩定高量產生抗體且對諸如HAT培養基之培養基敏感之骨髓瘤細胞》其中’較佳骨髓瘤細胞株為鼠類骨髓瘤株，諸如源自可自沙克生物研究所細胞分配中心（Salk Institute

Cell Distribution Center, San Diego, California USA)獲得之MOPC-21及MPC-11小鼠腫瘤之彼等細胞株及可自美國菌種保存中心（American Type Culture Collection，

Rockville，Maryland USA)獲得之 SP-2 或 X63-Ag8-653 細胞。亦已描述產生人類單株抗體之人類骨髓瘤及小鼠-人類異源骨髓瘤細胞株（Kozbor, J. 133:3001 (1984)，Brodeur 專人，办 "•⑽ rec/m/gMa ⑽¢/ Jpp/icanow，第 51-63 頁（Marcel Dekker，

Inc.，New York, 1987)) ° 在培養融合瘤細胞之培養基中檢測針對亥普辛之單株抗體的產生。較佳藉由免疫沈澱或藉由活體外結合檢測法 (諸如放射免疫檢測法（RIA)或酶聯結免疫吸附劑檢測法 (ELISA))測定由融合瘤細胞產生之單株抗體之結合特異性。单株抗體之結合親和力可例如由Munson等人， 151637.doc -64- 201121566 仉％hm_，l〇7:220 (1980)之史卡查分析來測定β 在鑑別出產生具有所需特異性、親和力及/或活性之抗體的融合瘤細胞後，純系可藉由限制稀釋程序次選殖且藉由標準方法培養（Goding, Monocbna! Antibodies.· Principles am/Pracizce’ 第 59-103 頁（Academic Press，1986))。適用於此目的之培養基包括例如D-MEM或RPMI-1640培養基。另外，融合瘤細胞可在活體内在動物中以腹水腫瘤形式生長。次純系所分泌之單株抗體宜藉由習知免疫球蛋白純化程序自培養基、腹水或血清分離，諸如蛋白質A瓊脂糖、羥磷灰石層析、凝膠電泳、透析或親和層析。本發明之抗亥普辛抗體可藉由使用組合庫篩檢具有所需活性之合成抗體純系製得。原則上，藉由篩檢含有呈現與噬菌體鞘蛋白融合之抗體可變區（Fv)之各種片段的噬菌體之噬菌體庫來選擇合成抗體純系。針對所需抗原藉由親和層析來淘選該等噬菌體庫。表現能夠結合所需抗原之以片段之純系吸附至抗原且由此與庫中之非結合性純系分離。接著自抗原溶離結合性純系，且可藉由額外幾輪抗原吸附 /溶離進一步增濃。本發明之任何抗亥普辛抗體可如下獲得：設計適合之抗原篩檢程序以選擇相關噬菌體純系，隨後使用來自相關噬菌體純系之Fv序列及以下文獻中所述之適合恆定區（Fc)序列建構全長抗亥普辛抗體純系；尺讣“等 k，Sequences of Proteins of Immunological Interest，第 $ 版，NIH Publication 91-3242, Bethesda MD (1991)，第卜3 151637.doc -65- 201121566 卷。產生抗亥普辛抗體之例示性方法揭示於實例中β 抗體之抗原結合域係由兩個具有約π 〇個胺基酸之可變 (V)區形成，該兩個可變區各來自輕（VL)鏈及重（VH)鏈，兩者皆提供三個高變環或互補決定區（CDR)。可變域可以 VH與VL經由柔性短肽共價連接之單片段形式或以各自與恒定域融合且非共價相互作用之Fab片段形式’在噬菌體上功能性呈現，如Winter等人，心„.及ev. /讲则⑽/·，12: 433-455 (1994)中所述。如本文所用，scFv 編碼噬菌體純系以及Fab編碼噬菌體純系統稱為「Fv噬菌體純系」或「Fv純系」。 VH及VL基因譜系可分別藉由聚合酶鏈反應（pcR)選殖且在嗟菌體庫中隨機重組，接著可搜尋結合抗原之純系，如

Winter 等人，/wwwwo/，12: 433-455 (1994)中所述。免疫來源之庫提供針對免疫原之高親和力抗體而無需建構融合瘤。或者，天然譜系可經選殖以提供針對廣泛範圍之非自體抗原以及自體抗原的單一來源之人類抗體而不經任何免疫作用，如Griffiths等人，五乂 12: 725-734 (1993)所述。最後，天然庫亦可以合成方式如下形成：自幹細胞選殖未經重排之V基因區段，且使用含有隨機序列之PCR引子編碼高變CDR3區且實現活體外重排，如 HoogenboomA Winter « J. Mol. Biol. > 227： 381-388 (1992) 所述。使用絲狀噬菌體’藉由使抗體片段與次要鞘蛋白ρΙΠ融合來呈現抗體片段。抗體片段可以單鏈以片段形式呈現， I51637.doc -66 · 201121566 其中VH域與VL域藉由柔性多肽間隔子連接於同一多肽鏈上’例如如Marks#乂，乂 Mo/. 5ζ·ο/.，222: 581-597 (1991) 中所述；或以Fab片段形式呈現，其中一個鏈與pin融合而另一個分泌至細菌宿主細胞周質内，其中藉由置換一些野生型鞘蛋白而組裝呈現於噬菌體表面上之Fab-鞘蛋白結構，例如如Hoogenboom等人，Wmc/· 心 Λα., 19: 4133-4137 (1991)中所述。一般而言，編碼抗體基因片段之核酸係獲自由人類或動物採集之免疫細胞。若需要偏重於抗亥普辛純系之庫，則以亥普辛使個體免疫以產生抗體反應，且回收脾細胞及/ 或循環Β細胞、其他周邊血淋巴細胞（PBL)以用於建構庫。在一較佳實施例中’偏重於抗亥普辛純系之人類抗體基因片段庫可如下獲得：在攜有功能性人類免疫球蛋白基因陣列（且缺乏功能性内源性抗體產生系統）之轉殖基因小鼠中產生抗亥普辛抗體反應以使得亥普辛免疫引起Β細胞產生針對亥普辛之人類抗體。下文描述產生人類抗體之轉殖基因小鼠的產生。可藉由使用適合篩檢程序分離表現亥普辛特異性膜纟士八抗體之Β細胞，例如藉由亥普辛親和層析進行細胞分離，或使細胞吸附至螢光染料標記之亥普辛，隨後進行流動式活化細胞分選（FACS)來獲得抗亥普辛反應性細胞群之額外增濃。或者，使用來自未免疫供體之脾細胞及/或3細胞或其他 pBL提供可能抗體譜系之較好呈現，且亦允許使用亥普辛 15I637.doc -67· 201121566 不具抗原性之任何動物（人類或非人類）物種來建構抗體庫。對於合併活體外抗體基因建構之庫而言，自個體採集幹細胞以提供編碼未重排抗體基因區段的核酸。相關免疫細胞可自多種動物物種獲得’諸如人類、小鼠、大鼠、兔類、狼、犬、貓、豬、牛、馬及鳥類物種等。編碼抗體可變基因區段（包括VH及VL區段）之核酸自相關細胞中回收且擴增。在重排VH及VL基因庫之情況下，可如 Orlandi等人 3 837 (1989)中所述’藉由自淋巴細胞分離基因組DNA或 mRNA，隨後用與重排VH及VL基因之5’及3’末端匹配之引子進行聚合酶鏈反應（PCR)來獲得所需DNA，從而製得用於表現之不同V基因譜系。可自cDNA及基因組DNA擴增V 基因，其中反向引子位於編碼成熟V域之外顯子之5'末端處且正向引子基於J-區段内，如Or landi等人，（1989)及 Ward等人 ’ 341: 544-546 (1989)中所述。然而，為了自 cDNA 擴增，如 Jones 等人，B/oiec/mo/.，9: 88-89 (1991)中所述，反向引子亦可基於前導外顯子中，且如

Sastry等人 ’ iVoc· dead· 5W.「/7以人 86: 5728-5732 (1989)中所述’正向引子亦可處於恆定區内。為使互補性最大化，可如Orlandi等人，（1989)或Sastry等人，（1989)中所述，可合併引子中的簡併性《庫多樣性較佳可藉由使用靶向各V-基因家族之PCR引子以擴增免疫細胞核酸樣品中存在之所有可用之VH及VL配置來最大化，例如如Marks等人，J. Mo/. 5/0/·，222: 581-597 (1991)之方法中所述或如 151637.doc -68- 201121566

Orumf A » Nucleic Acids Res., 21: 4491-4498 (1993)^ 法中所述。為將擴增之DNA選殖至表現載體中，可將稀有限制性位點以標籤形式、在一端引入PCR引子内，如 Orlandi等人，（1989)中所述；或使用標記引子、藉由進一步PCR擴增引入PCR引子内，如Clackson等人，iVaiwre， 352: 624-628 (1991)中所述。以合成方式重排之V基因譜系可於活體外自V基因區段獲得。大部分人類VH基因區段已選殖且測序（報導於

Tomlinson 等人，《/. Μσ/. 5ζ·〇/·’ 227: 776-798 (1992)中），且已定位（報導於 Matsuda等人，3: 88-94 (1993)*);WHoogenboom&Winter，《/.Mo/.5,o/_,227: 381-388 (1992)中所述，可使用此等經選殖之區段（包括HI 及H2環之所有主要構形），利用編碼具有不同序列及長度之H3環的PCR引子產生不同VH基因譜系。如Barbas等人， Proc. Natl. Acad. Sci. tASd，89: 4457-4461 (1 992)中戶斤述，亦可製得所有序列多樣性集中於具有單一長度之長H3環中的VH譜系。人類Vk及νλ區段已選殖且測序（報導於

Williams及 Winter，五wr «/. /mmwwo/.，23: 1456-1461 (1993) 中）且可用於製得合成性輕鏈譜系。基於一系列VH及VL摺疊以及L3及H3長度的合成V基因譜系將編碼具有顯著結構多樣性之抗體。擴增編碼V_基因之DNA後，可根據

Hoogenboom及 Winter，《/· 5ζ·0/·，227: 381-388(1992) 之方法活體外重排生殖系V基因區段。可藉由以若干方式將VH與VL基因譜系組合於一起來建 151637.doc -69- 201121566 構抗體片段之讀系。各譜系可形成於不同載體中，且例如如 Hogrefe 等人，，128:119_126 (1993)中所述將載體重.且或藉由組合感染在活體内（例如Waterhouse等人， #mc/· Jci 心及以.，21:2265-2260 (1993)中所述之 ΙοχΡ系統）進行°活體内重組方法利用Fab片段之雙鏈性質來克服大腸桿菌轉型效率對庫規模所造成之限制。天然VH及VL譜系係分別選殖’將一者選殖至噬菌體質體中且將另一者選殖至嗟菌體載體中。兩個庫接著藉由噬菌體感染含有噬菌體質體之細菌來組合，以使得各細胞含有不同組合且使庫規模僅受所存在之細胞數目（約1〇i2個純系）限制。兩個載體皆含有活體内重組信號，以使得VH及VL基因重組於單一複製子上且共封裝於噬菌體病毒粒子中。此等大型庫提供大量具有良好親和力（K/1為約1 ο·8 M)之不同抗體。或者，該等譜系可依序選殖至同一載體中，例如如

Barbas等人，Proc· Λ^ί/. Scz·· ί/α, 88:7978-7982 (1991) 中所述；或可藉由PCR組裝在一起且接著選殖，例如如 Clackson等人，ATaiwre，352: 624-628 (1991)中所述。亦可使用PCR組裝、用編碼柔性肽間隔子之DNA將VH DNA與VL DNA接合在一起以形成單鏈Fv(scFv)譜系。在另一種技術中，使用「細胞内PCR組裝」藉由PCR將VH基因與VL基因在淋巴細胞内組合且接著選殖已連接基因之譜系，如Embleton等人，iVwc/. jcz·心 Λα.，20:3831-3837 (1992) 中所述。由天然庫產生之抗體（天然或合成）可具有中等親和力 151637.doc • 70· 201121566 (κν1為約ίο6至ίο7 Μ·1)，但亦可藉由建構次級庫及自次級庫中再選擇來活體外模擬親和力成熟，如winter等人 (1994)(同上）中所述。舉例而言，可以Hawkins等人，j. Mo/.出〇/·，226: 889-896 (1992)之方法或以Gram等人，户roc：. iVai/· Jcad. Sc/ t/M，89: 3576-3580 (1992)之方法，使用易錯聚合酶（Leung等人，7>£；/2則·分we，ι:ιι_ΐ5 (1989)中所報導）在活體外隨機引入突變。另外，可如下進行親和力成熟：使所選個體Fv純系中之一或多個CDR隨機突變 (例如使用PCR，其中引子攜有跨相關CDR之隨機序列），且篩檢較高親和力純系。WO 96/07754( 1996年3月14日公開）描述在免疫球蛋白輕鏈之互補決定區中誘導突變以形成輕鏈基因庫的方法。另一有效方法係將噬菌體呈現所選擇之VH域或VL域與自未免疫供體獲得之天然存在之v域變異體譜系重組且以多輪鏈改組針對較高親和力來篩檢，如 Marks等人 ’ Aoiec/zwo/·, 10:779-783 (1992)中所述。此技術允5午產生親和力在1 〇_9 Μ範圍内之抗體及抗體片段。亥普辛核酸及胺基酸序列在此項技術中為已知的。編碼亥普辛之核酸序列可使用亥普辛之所需區域之胺基酸序列來設計。如此項技術中所熟知，亥普辛有兩種主要之剪接同功異型物：亥普辛mb及亥普辛„1(^亥普辛序列在此項技術中為熟知的且可包括圖7及圖8中所示之序列。編碼亥普辛之核酸可藉由此項技術中已知之多種方法製備°此等方法包括（但不限於）藉由Engels等人，々似从 C；ZeW. 7价H以，28: 716-734 (1989)中所述之任何方法 151637.doc 71 201121566 (諸如二酯、亞磷酸酯、胺基磷酸酯及Η·膦酸酯方法）進行化干σ成。在一實施例中’使用表現宿主細胞較佳之密碼子來設計編碼亥普辛之DNA。或者，可將編碼亥普辛之 DNA自基因組或cDNA庫中分離。在建構編碼亥普辛之DNA分子後，將DNA分子可操作地連接於表現載體（諸如質體）中之表現控制序列，其中經載體轉型之宿主細胞可識別該控制序列。一般而言，質體載體含有獲自可與宿主細胞相容之物種之複製及控制序列。載體通常攜有複製位點以及編碼能夠在經轉型細胞中提供表型選擇之蛋白質的序列。適用於在原核及真核宿主細胞中表現之載體在此項技術中為已知，且一些載體將在本文中進一步描述。可使用真核生物體（諸如酵母）或獲自多細胞生物體（諸如哺乳動物）之細胞。視情況將編碼亥普辛之DNA可操作地連接於分泌性前導序列’從而使宿主細胞分泌表現產物至培養基中。分泌性前導序列之實例包括stll、大腸桿菌素（ecotin)、】amB、疮疹GD、lpp、鹼性磷酸酶、轉化酶及α因子。蛋白質A之3 6 個胺基酸前導序列亦適用於本文中（Abrahmsen等人， £(9 乂，4: 3901 (1985))。宿主細胞用本發明之上述表現或選殖載體轉染且較佳轉型，並於習知營養培養基中培養，若適宜，該營養培養基經修飾以誘導啟動子、選擇轉型體或擴增編碼所需序列之基因。轉染係指宿主細胞吸收表現載體，而無論是否實際上表 15l637.doc •72· 201121566 現任何編碼序列。多種轉染方法（例如CaP〇4沈澱及電穿孔）為一般技術者所知。一般當在宿主細胞中出現任何有關此載體運作之指示時，認為轉染成功β轉染方法在此項技術中為熟知’且一些方法將於本文中進一步描述。轉型意謂將DNA引入生物體中使得dnA可作為染色體外元件或染色體成分複製。視所用之宿主細胞而定，使用適於此等細胞之標準技術進行轉型。轉型方法在此項技術中為熟知’且一些方法將於本文中進一步描述。用於產生亥普辛之原核宿主細胞可如Sambrook等人（同上）中一般描述培養。用於產生亥普辛之哺乳動物宿主細胞可於多種培養基中培養’該培養基在此項技術中為熟知的且其中一些培養基在本文中描述。本發明中所提及之宿主細胞涵蓋活體外培養物中之細胞以及宿主動物體内之細胞。亥普辛之純化可使用此項技術公認之方法完成，其中一些方法在本文中描述。可將純化之亥普辛連接於適合基質上，諸如瓊脂糖珠粒、丙烯醯胺珠粒、玻璃珠粒' 纖維素、各種丙稀酸系共聚物、羥基甲基丙烯酸酯凝膠、聚丙烯酸及聚曱基丙稀酸系共聚物、耐綸（nylon)、中性及離子性載體及其類似物，以用於噬菌體呈現純系之親和層析分離。亥普辛蛋白連接至基質可藉由第 44卷（1976)中所述之方法完成。使蛋白配位體連接於多醣基質（例如違脂 151637.doc -73· 201121566 糖、聚葡萄糖或纖維素）上之常用技術包括用_化氰活化載體及隨後使肽配位體之一級脂族或芳族胺與活化基質偶合0 或者’亥普辛可用於塗佈吸附板之孔，表現於附著於吸附板之宿主細胞上或用於細胞分選，或可與生物素結合以便用塗有抗生蛋白鏈菌素之珠粒捕捉，或可用於此項技術中已知之淘選噬菌體呈現庫之任何其他方法中。在適於使噬菌體顆粒之至少一部分與吸附劑結合之條件下’使嗟菌體庫樣品與固定之亥普辛接觸。通常，選擇包括pH值、離子強度、溫度及其類似條件之條件以模擬生理條件。洗務結合至固相之噬菌體且接著例如如Barbas等人，iVoc. iVai/· 5CZ· ^/以，88: 7978_7982 (1991)中所述藉由酸洛離，或例如如Marks等人，Afo/.价〇/.，222: 581-597 (1991)中所述藉由鹼溶離；或例如以類似於 Clackson等人，352: 624-628 (1991)之抗原競爭方法之程序藉由亥普辛抗原競爭來溶離。在單輪選擇中噬菌體可增濃20-1，〇〇〇倍。此外，增濃之噬菌體可在細菌培養物中生長且再進行數輪選擇。選擇效率視多種因素而定，包括洗滌期間之解離動力學及單個嗤菌體上之多個抗體片段可否同時與抗原接合。可藉由使用短時間洗滌、多價噬菌體呈現及抗原在固相中較问塗佈密度來保留具有快速解離動力學（及較弱結合親和力）之抗體。高密度不僅經由多價相互作用使噬菌體穩疋’且亦有利於使已解離之噬菌體再結合。使用長時間洗 15I637.doc -74. 201121566 務及早價嗤菌體呈現（如Bass等人，8: 309-3 14 (1990)及WO 92/09690中所述）及低抗原塗佈密度（如Marks 等人 ’ 1〇: 779-783 (1992)中所述）可有利於選擇具有緩慢解離動力學（及優良結合親和力）之抗體。可在對亥普辛具有不同親和力，甚至略有不同之親和力之嗟菌體抗體之間進行選擇。然而’所選抗體之隨機突變 (例如，如上文所述之一些親和力成熟技術中所進行）可能會產生許多突變體，大部分結合於抗原，而有一些具有較咼親和力。限制亥普辛可淘汰極少之高親和力噬菌體。為保留所有較高親和力突變體，可將噬菌體與過量結合生物素之亥普辛一起培育，但結合生物素之亥普辛的莫耳濃度低於亥普辛之標靶莫耳親和力常數。接著可用塗有抗生蛋白鏈菌素之順磁珠粒捕捉高親和力結合噬菌體。此「平衡捕捉」允許根據抗體之結合親和力來選擇抗體，其靈敏度允許自極大過量之具有較低親和力之噬菌體分離出親二僅同兩倍之犬變體純系。亦可操縱在洗務結合至固相之噬菌體中所使用之條件以基於解離動力學進行區分。巫可基於活性選擇玄並I^ 擇X㈢辛純系。可藉由以下來選擇對應該等抗亥普辛抗體之F純系 " ^ (1)如上文所述自噬菌體康中分離亥普辛純系，且葙袢、p丄早且視清況藉由使經分離噬菌體純體在適合細菌宿主中生長來擴增該群體；⑺ 阻斷活性及不需要阻斷活性之亥普辛及第二蛋白：抗亥普辛噬菌體純系吸R 1 )將尔及附至固定之亥普辛；（4) 第二蛋白質溶離識職f辛結合決定子的任何不當純2， 151637.doc •75· 201121566 該等亥普辛結合決定子與第二蛋白質之結合決定子重叠或共享；及（5)將步驟（4)後仍吸附之純系溶離。視情況可藉由將本文所述之選擇程序重複一或多次進—步增濃具有所需阻斷/非阻斷特性之純系。使用習知程序（例如藉由使用經設計以自融合瘤或嗟菌體DNA模板特異性擴增相關重鏈及輕鏈編碼區之寡核普酸引子）可輕易地分離編碼本發明之源自融合瘤之單株抗體或嗔菌體呈現F v純系的DN A且進行測序。分離後，即可將 DNA置於表現載體中，接著轉染至在其他情況下不會產生免疫球蛋白之宿主細胞（諸如大腸桿菌細胞、猿COS細胞、中國倉鼠卵巢（CH0)細胞或骨髓瘤細胞）中，以在重組宿主細胞中獲得所需單株抗體之合成。關於在細菌中重組表現編碼抗體之DNA的評述文章包括Skerra等人，Cwrr. /历則„0/_，5: 256 (1993)及 Pluckthun，/mw⑽〇/. 及，，130:15 1 (1992)。可將編碼本發明F v純系之DNA與編碼重鍵及/或輕鏈恆定區之已知DNA序列（例如適當DNA序列可由Kabat等人（同上）獲得）組合以形成編碼全長或部分長度重鏈及/或輕鏈之純系。應瞭解’任何同型之恆定區均可用於此目的，包括 IgG、IgM、IgA、IgD及IgE恆定區’且該等恆定區可自任何人類或動物物種獲得。如本文所用之r嵌合」抗體及「雜交」抗體之定義中包括源自一種動物（諸如人類）物種之可變域DNA且接著與另一動物物種之恆定區dnA融合以形成「雜交」全長重鏈及/或輕鏈之編碼序列的Fv純系。 15I637.doc •76· 201121566 在一較佳實施例中，源自人類可變DNA之Fv純系與人類悝定區DNA融合以形成全長或部分長度之所有人類重鏈及/ 或輕鏈之編碼序列。亦可例如藉由以人類重鏈及輕鏈恆定域之編碼序列代替源自融合瘤純系之同源鼠類序列’來修飾編碼本發明之源自融合瘤之抗亥普辛抗體的DNA(例如Morrison等人， &ζ·. tASyl，81:6851-6855 (1984)之方法）。可藉由使非免疫球蛋白多肽之所有或部分編碼序列共價接合至免疫球蛋白編碼序列來進一步修飾編碼源自融合瘤或 Fv純系之抗體或片段的〇ΝΑ。以此方式製備具有本發明之源自Fv純系或融合瘤純系之抗體之結合特異性的「嵌合」或「雜交」抗體。抗體片段本發明涵蓋抗體片段。在某些情況下，使用抗體片段而非整個抗體具有優勢。較小尺寸之片段允許快速清除且使得接近實體腫瘤可更容易。已開發出各種用於產生抗體片段之技術。傳統上，此等片段可經由完整抗體之蛋白水解消化來獲得（參見，例如

Morimoto等人，Journal 〇f Biochemical and Biophysical Methods 24:107-117 (1992);及 Brennan 等人，Science 229:81 (1985))。然而，此等片段現在可由重組宿主細胞直接產生。Fab、Fv及ScFv抗體片段皆可在大腸桿菌中表現且自大腸桿菌分泌，從而允許輕易地產生大量此等片段。可自上文所論述之抗體噬菌體庫中分離抗體片段。或者， 151637.doc -77- 201121566 可直接自大腸桿菌回收Fab，_SH片段且以化學方式偶合以形成 F(ab')2 片段（Carter 等人，Bi〇/Techn〇1〇gy i⑴i63 i67 (1992))。根據另一方法，F(ab，)2片段可直接自重組宿主細胞培養物中分離。活體内半衰期增加之包含補救受體結合抗原決定基殘基之Fab及F(ab，）2片段描述於美國專利第 5,869,046號中。產生抗體片段之其他技術為熟習此項技術者所顯而易見。在其他實施例中，所選之抗體為單鏈以片段（scFv)(參見例如W0 93/16185 ;美國專利第5,571，894號及第5,5 87,458號）。Fv及sFv為唯一具有完整組合位點而缺乏恆定區之物質；因此，其適用於在活體内使用期間減少非特異性結合。可建構sFv融合蛋白以使效應蛋白於sFv之胺基或緩基末端處融合。參見Antibody Engineering， Borrebaeck編（同上）》抗體片段亦可為「線性抗體」，例如如美國專利第5,641,870號中所述。此等線性抗體片段可為單特異性或雙特異性抗體。人類化抗體本發明涵蓋人類化抗體。在此項技術中已知各種用於使非人類抗體人類化之方法。舉例而言，人類化抗體中可引入一或多個來自非人類來源之胺基酸殘基。此等非人類胺基酸殘基常稱為「輸入」殘基，其通常獲自「輸入」可變域。人類化基本上可遵循Winter及同事之方法（Jones等人，（1986) 321:522-525 ; Riechmann 等人，（1988) iVaiwre 332:323-327 ; Verhoeyen等人，（1988) 239:1534- 1536)藉由用高變區序列取代人類抗體之相應序列來進行。 151637.doc •78- 201121566 因此此·# 人類化」抗體為嵌合抗體（美國專利第 4’816’567號），其中實質上小於完整之人類可變域已經來自非人類物種之相應序列所取代。實務上，人類化抗體通常為一些高變區殘基及可能一些F R殘基經齧齒動物抗體中類似位點之殘基所取代的人類抗體。選擇欲用於製備人類化抗體之人類可變域（輕鏈及重鏈）對於降低抗原性而言極為重要。根據所謂之「最佳擬合」方法’針對已知人類可變域序列之整個庫篩檢齧齒動物二體之可變域序列。接著將最接近齧齒動物序列的人類序列當作人類化抗體之人類構架（Sims等人，（1993) 7 151:2296 ; Chothia等人，（1987) j 施/ 5从 196:901卜另-方法使用源自所有人類抗體特定輕鍵或重鍵亞群之共同序列的特定構架。同一構架可用於若干不同人類化抗體（Carter等人，（1992) 89:4285 ; Presta等人，（1993)J /wwww〇/，151:2623)。，另外重要的是，使抗體在保留對抗原之高親和力及其他適宜生物特性下人類化。為達成此目#，根據—種方法，藉由使用親本序列及人類化序列之三維模型&分析親本序列及各種概念上之人類化產物的方法來製備人類化抗體。三維免疫球蛋白模型通常可用且為熟習此項技術者所熟悉。可用說明及呈現所選候選免疫球蛋白序列之可能三維構形結構的電腦程式。對此等呈現進行檢查允許分析殘基在候選免疫球蛋白序列發揮功能過程中可能起到的作用亦即分析影響候選免疫球蛋白結合其抗原之能力的殘基： 151637.doc -79· 201121566 以此方式，可自受體及輸入序列選擇FR殘基並將其組合，以便達成所需抗體特徵，諸如增加對標靶抗原之親和力。一般而言，高變區殘基直接且最實質性地涉及對抗原結合的影響。人類抗趙可藉由將選自源自人類之噬菌體呈現庫之Fv純系可變域序列與如上文所述之已知人類恆定域序列組合來建構本發明之人類抗亥普辛抗體。或者，可藉由融合瘤方法製得本發明之人類單株抗亥普辛抗體。用於產生人類單株抗體之人類骨髓瘤及小鼠-人類異源骨髓瘤細胞株已由例如Kozbor J. /wwwwo/., 133:3001 (1984) ; Brodeur 等人，

Antibody Production Techniques and Applications，第 51-63 頁 (Marcel Dekker，Inc·，New York, 1987);及 Boerner等人，J. /wmwwo/·, 147:86 (1991)描述。目前可產生能夠在免疫後在不產生内源性免疫球蛋白的情況下產生完全人類抗體譜系之轉殖基因動物（例如小鼠）。舉例而言，已描述嵌合及生殖系突變小鼠中抗體重鏈接合區（JH)基因之同種接合子缺失會使得内源性抗體產生被完全抑制。將人類生殖系免疫球蛋白基因陣列轉移至此生殖系突變小鼠中將會使得在抗原攻毒後產生人類抗體。參見例如 Jakobovits等人，ZVoc. 90: 2551 (1993) ; Jakobovits 等人，iWziww, 362: 255 (1993); Bruggermann等人，7:33 (1993) 〇亦可使用基因改組以自非人類（例如齧齒動物）抗體獲得 151637.doc -80- 201121566 人類抗體，其中人類抗體與初始非人類抗體具有類似之親和力及特異性。根據此方法（其亦稱作「抗原決定基印記法（epitope imprinting)」），用人類v域基因譜系置換如上文所述由噬菌體呈現技術獲得之非人類抗體片段之重鏈或輕鏈可變區，形成非人類鏈/人類鏈scFv或嵌合體之群體。用抗原進行選擇引起非人類鏈/人類鏈嵌合scFv或Fab 分離，其中人類鏈使在移除初始噬菌體呈現純系中之相應非人類鏈後遭破壞之抗原結合位點得以恢復，亦即抗原決定基決定（印記）對人類鏈搭配物之選擇。當重複此過程以置換其餘非人類鏈時，獲得人類抗體（參見〗993年4月j曰公開之PCT W0 93/06213)。不同於傳統上藉由CDR移植來使非人類抗體人類化，此技術提供不具有非人類來源之FR 或CDR殘基的完全人類抗體。雙特異性抗體雙特異性抗體為對至少兩種不同抗原具有結合特異性之單株抗體，較佳為人類或人類化抗體，在本發明之情況下，一種結合特異性係針對亥普辛而另一種係針對任何其他抗原《例示性雙特異性抗體可結合亥普辛之兩個不同抗原決定基。雙特異性抗體亦可用於使細胞毒性劑定位於表現亥普辛之細胞。此等抗體具有亥普辛結合臂及結合細胞毒性劑（例如沙伯甯（saporin)、抗干擾素…、長春花屬生物驗（vinca alkaloid)、蓖麻毒素a鏈（ricin a chain)、曱胺嗓呤或放射性同位素半抗原）之臂。雙特異性抗體可以全長抗體或抗體片段（例如F(abl)2雙特異性抗體）形式製備。 151637.doc 201121566 在此項技術中已知製備雙特異性抗體之方法。傳統上，雙特異性抗體之重組產生係基於兩對免疫球蛋白重鏈_輕鍵共表現’其申兩個重鏈具有不同特異性（Milstein及

Cuello, 305: 537 (1983))。歸因於免疫球蛋白重鏈及輕鍵之隨機分配，故此等融合瘤（四源雜交瘤 (quadroma))產生1〇種不同抗體分子之潛在混合物，其中僅一者具有正確之雙特異性結構。通常藉由親和層析步驟進行之正確分子之純化相當繁瑣，且產物產率較低。類似程序係揭示於1993年5月13日公開之WO 93/08829及 Traunecker 等人，ΕΜβΟ*/·，1〇: 3655 (1991)中。根據一種不同但更佳之方法，使具有所需結合特異性之抗體可變域（抗體·抗原結合位點）與免疫球蛋白恆定域序列融合。融合較佳為與包含鉸鏈區、CH2及CH3區之至少一部分之免疫球蛋白重鏈恆定域融合。含有輕鏈結合所必需之位點的第一重鏈恆定區（CH1)較佳存在於至少一種融合體中。將編碼免疫球蛋白重鏈融合體及（若需要）免疫球蛋白輕鏈之DNA插入各別表現載體令且共轉染至適合宿主生物體中。在建構中所用之3個多肽鏈之不等比率提供最佳產率之實施例中，此將為調整3個多肽片段之相互比例提供較大靈活性。然而，當等比率之至少兩個多肽鏈之表現引起高產率時’或當該等比率不具有特定意義日夺，可將兩個或所有三個多肽鏈之編碼序列插入一種表現載體中。在此方法之一較佳實施例中，雙特異性抗體係由在一個臂中具有第-結合特異性之雜交免疫球蛋白线及另一個 151637.doc -82- 201121566 臂中之雜交免疫球蛋白重鏈_輕鏈對(提供第二結合特異性) 構成。已發現由於免疫球蛋白輕鏈僅於一半雙特異性分子中存在提供一種簡便之分離方+，从 Π使之刀離方式，故此不對稱結構有助於所需雙特異性化合物盘不合愛里夕A , 柳，、小σ而要之免疫球蛋白鏈組合分離。此方法係、揭示於w〇 94/()469()中。關於產生雙特異性抗體之其他細節，#見例如Suresh f A , Meth〇ds in 少，121:210 (1986)。根據另法，彳將-對抗體分子之間的界面進行工程改造以使自重組細胞培養物中回收之雜二聚體的百分比最大化。較佳界面包含抗體恆定域之ch3域之至少一部分。在此方法中，一或多個來自第一抗體分子之界面的小胺基酸側鏈經較大側鏈（例如酪胺酸或色胺酸）置換。藉由將大胺基酸側鏈置換為較小胺基酸側鏈（例如丙胺酸或蘇胺酸）可在第二抗體分子之界面上產生與大側鏈尺寸相同或類似之補償性「空腔」。此提供一種使雜二聚體之產率增加超過其他不合需要之最終產物（諸如均二聚體）的機制。雙特異性抗體包括交聯或「異源結合」抗體。舉例而言’異源結合物中之一種抗體可與抗生物素蛋白偶合，另一者與生物素偶合。已提出此等抗體例如可使免疫系統細胞靶向不合需要之細胞（美國專利第4,676,980號）且可用於治療 HIV感染（WO 91/00360、WO 92/00373及 EP 03089)。異源結合抗體可使用任何適合之交聯方法製得。適合之交聯劑及多種交聯技術在此項技術中為熟知的且係揭示於美國專利第4,676,980號中。 151637.doc •83· 201121566 自抗體片段產生雙特異性抗體之技術亦已描述於文獻中。舉例而言，可使用化學鍵聯製備雙特異性抗體。 Brennan等人’《Sc化《ce，229: 81 (1985)描述將完整抗體蛋白質裂解產生F(ab·)2片段之程序。在二硫醇錯合劑亞石申酸鈉存在下還原此等片段以穩定鄰近二硫醇且防止分子間形成二硫鍵。接著將所產生之Fab'片段轉化為硫代硝基苯甲酸酯（TNB)衍生物。接著藉由用酼基乙胺還原將一種Fab，_ TNB衍生物再轉化為Fab’-硫醇，且將其與等莫耳量之另一 Fab'-TNB衍生物混合以形成雙特異性抗體。所產生之雙特異性抗體可用作選擇性固定酶之試劑。新近發展已促成自大腸桿菌直接回收Fab’-SH片段，可將該等片段化學偶合形成雙特異性抗體。Shalaby等人，乂 MeA，175: 217-225 (1992)描述完全人類化雙特異性抗體F(ab')2分子之產生。各Fab，片段係分別由大腸桿菌分泌且進行活體外定向化學偶合以形成雙特異性抗體。由此形成之雙特異性抗體能夠結合至過度表現HER2受體之細胞及正常人類T細胞’並且觸發人類細胞毒性淋巴細胞針對人類乳房腫瘤標靶之溶解活性。亦已描述各種直接自重組細胞培養物製造且分離雙特異性抗體片段之技術。舉例而言，已使用白胺酸拉鏈產生雙特異性抗體（Kostelny等人，《/· 148(5):1547-1553 (1992))。藉由基因融合將來自f〇s及jun蛋白之白胺酸拉鏈肽連接於兩種不同抗體之Fab，部分。在鉸鏈區還原抗體均二聚體以形成單體’且接著將其再氧化以形成抗體雜二聚 151637.doc -84- 201121566 體。此方法亦可用於產生抗體均二聚體。H〇iiinger等人， Proc. ya，90:6444-6448 (1993)所述之「雙功能抗體」技術提供製造雙特異性抗體片段之替代機制。該等片段包含重鏈可變域（VH)經連接子連接至輕鏈可變域（VL) ’該連接子過短而使同一鏈上之兩個結構域之間無法配對。因此，迫使一個片段之VH及VL域與另一個片段之互補VL及VH域配對，從而形成兩個抗原結合位點。亦已報導藉由使用單鏈Fv(sFv)二聚體來製造雙特異性抗體片4又之另一朿略。參見Gruber等人，·/_ , 1 5 2:5 368 (1994)。涵蓋具有兩價以上之抗體。舉例而言，可製備三特異性抗體。Tutt專人，/w/ww/70/· 147: 60 (1991) 〇多價抗艘多價抗體可比二價抗體更快地由表現抗體所結合之抗原的細胞内化（及/或分解代謝）。本發明之抗體可為具有三個或三個以上抗原結合位點之多價抗體（不為IgM類別例如四價抗體）’其可藉由重組表現編碼抗體多肽鏈之核酸而輕易地製造。多價抗體可包含二聚域及三個或三個以上抗原結合位點。較佳二聚域包含F c區或絞鏈區（或由其組成）。在此情形下，抗體將包含Fc區及三個或三個以上處於Fe區胺基末端之抗原結合位點。本文中之較佳多價抗體包含三個至約八個，但較佳四個抗原結合位點（或由其組成）。多價抗體包含至少一個多肽鏈（且較佳兩個多肽鏈），其中多肽鏈包含兩個或兩個以上可變域。舉例而言，多肽 151637.doc -85- 201121566 鏈可包含VDl-(Xl)n-VD2-(X2)n-FC，其中VD1為第一可變域，VD2為第二可變域，F(^Fc區之一個多肽鏈，χι&χ2 表示胺基酸或多肽’且η為〇或1。舉例而言，多肽鍵可包含：VH-CH1-柔性連接子_vh-CH1-Fc區鏈；或VH_CH1_ VH-CHl-Fc區鏈。本文之多價抗體較佳進一步包含至少兩個（且較佳四個）輕鏈可變域多肽。本文之多價抗體可例如包含約兩個至約八個輕鏈可變域多肽。本文所涵蓋之輕鍵可變域多肽包含輕鏈可變域且視情形進一步包含（^域。抗體變異艘在一些實施例中，涵蓋本文所述抗體之胺基酸序列修飾。舉例而言，可能需要改良抗體之結合親和力及/或其他生物學特性。抗體之胺基酸序列變異體係藉由將適合核苦酸變化引入抗體核酸中或藉由肽合成來製備。此等修飾包括例如抗體之胺基酸序列内殘基缺失及/或插入及/或取代。進行缺失、插入及取代之任何組合以獲得最終構築體，其限制條件為最終構築體具有所需之特徵。可在製造序列時將胺基酸變化引入本發明之抗體胺基酸序列中。適用於鑑別抗體之較佳突變誘發位置之某些殘基或區域的方法稱作「丙胺酸掃描突變誘發」，如Cunningham及

We 11s (1989) 244:1081-1085所述。此處，鍟別一個殘基或一組標靶殘基（例如帶電殘基，諸如arg、asp、 his、lys及glu)且置換為中性或帶負電之胺基酸（最佳為丙胺酸或聚丙胺酸）以影響胺基酸與抗原之相互作用。接著藉由在取代位點處或針對取代位點引入另外或其他變異體 151637.doc -86 - 201121566 來改進對取代表現功能敏感性之彼等胺基酸位置。因此，雖然引入胺基酸序列變異之位點預先確定，但突變本身之性質無需預先確定。舉例而言，為分析既定位點處突變之效能，在標輕密碼子或區域處進行ala掃描或隨機突變誘發，且針對所需活性篩檢所表現之免疫球蛋白。胺基酸序列插入物包括長度範圍為1個殘基至含有1 〇〇個或100個以上殘基之多肽之胺基及/或羧基末端融合體，以及單個或多個胺基酸殘基之序列内插入物。未端插入物之實例包括具有N末端甲硫胺酿基殘基之抗體或與細胞毒素多肽融合之抗體。抗體分子之其他插入變異體包括抗體之 N末端或C末端與酶（例如，對於ADEPT)或增加抗體之血清半衰期之多肽的融合體。多肽之糖基化通常為N-連接型或〇-連接型。N—連接型係指碳水化合物部分連接至天冬醯胺殘基之側鏈。三肽序列天冬醯胺-X-絲胺酸及天冬醯胺_χ_蘇胺酸（其中χ為除脯胺酸以外之任何胺基酸）為使碳水化合物部分酶促連接至天冬醯胺側鏈之識別序列。因此，多肽中此等三肽序列中任一者之存在產生潛在糖基化位點。〇·連接之糖基化係指糖 Ν-乙醯基半乳糖胺、半乳糖或木糖中之一者連接至羥基胺基酸，最常連接至絲胺酸或蘇胺酸，然而亦可使用5_羥基脯胺酸或5 -經基離胺酸。向抗體中添加糖基化位點宜藉由改變胺基酸序列，以使其含有一或多個上述三肽序列來實現（針對Ν•連接型糖基化位點）。該改變亦可藉由在初始抗體之序列中進行一或 151637.doc -87- 201121566 多個絲胺酸或蘇胺酸殘基之添加或取代而產生（針對〇-連接型糖基化位點）。當抗體包含Fc區時，可改變與其連接之碳水化合物。舉例而言，成熟碳水化合物結構缺乏連接於抗體F c區之岩藻糖的抗體描述於美國專利申請案第US 2003/0157108號 (Presta，L.)中。亦參見 US 2004/0093621(Kyowa Hakko Kogyo Co.，Ltd)。在連接於抗體Fc區之碳水化合物中具有平分型N-乙醯葡糖胺（GlcNAc)之抗體在WO 2003/01 1878 (Jean-Mairet等人）及美國專利第6,602,684號（Umana等人）中提及。在連接於抗體Fc區之寡醣中具有至少一個半乳糖殘基之抗體報導於WO 1997/30087(Patel等人）中。關於連接於抗體Fc區之碳水化合物經改變之抗體，亦參見WO 1998/58964(Raju, S.)及 WO 1999/22764(Raju，S.)。關於具有經修飾之糖基化的抗原結合分子，亦參見US 2005/0123546(Umana等人）。

本文之較佳糖基化變異體包含Fc區，其中連接於Fc區之碳水化合物結構缺乏岩藻糖。此等變異體具有改良之 ADCC功能。Fc區視情況進一步包含一或多處進一步改良 ADCC之胺基酸取代，例如Fc區之位置298、333及/或 334(殘基之EU編號）之取代。與「脫岩藻糖化」或「岩藻糖缺乏」抗體有關之公開案的實例包括：US 2003/0157108 ； WO 2000/61739 ； WO 2001/29246 ； US 2003/0115614 ； US 2002/0164328 ； US 2004/0093621 ； US 2004/0132140 ； US 2004/0110704 ； US 2004/0110282 ； US 151637.doc •88- 201121566 2004/0109865 ； WO 2003/0851 19 ; WO 2003/084570 ； WO 2005/035586 ； WO 2005/035778 ； WO 2005/053742 ； Okazaki 等人，乂 Mo/·仏<?/· 336:1239-1249 (2004);

Yamane-Ohnuki等人，87: 614 (2004)。產生脫岩藻糖化抗體之細胞株的實例包括缺乏蛋白質岩藻糖化之Lecl3 CHO細胞（Ripka等人，Jrc/j. Bioc/iew· 249:533-545 (1986);美國專利申請案第 US 2003/0 1 571 08 A1 號，Presta，L ;及WO 2004/056312 Al, Adams等人，尤其實例11)，及基因剔除細胞株，諸如α-1,6-岩藻糖基轉移酶基因Ft/rS基因剔除CHO細胞（Yamane-Ohnuki等人， Biotech. Bioeng. 87: 614 (2004)) ° 另一類型變異體為胺基酸取代變異體。在此等變異體中，抗體分子中之至少一個胺基酸（至少2個、至少3個、至少4個或4個以上）殘基經不同殘基置換。雖然最為關注之用於取代突變誘發之位點包括高變區，但亦涵蓋FR變化。表A中在標題「較佳取代」下展示保守性取代。若此等取代引起生物活性改變，則可引入表A中命名為「例示性取代」或如下文關於胺基酸類別所進一步描述之更多實質性變化且篩檢產物。

表A 原始殘基例示性取代較佳取代 Ala (A) Val ; Leu ; lie Val Arg(R) Lys ； Gin ； Asn Lys Asn (N) Gin ; His ; Asp，Lys ; Arg Gin Asp (D) Glu ; Asn Glu Cys(C) Ser ； Ala Ser Gln(Q) Asn ； Glu Asn 151637.doc •89· 201121566

Glu (E) Asp ; Gin Asp Gly(G) Ala Ala His (Η) Asn ; Gin ; Lys ; Arg Arg He (I) Leu ； Val ； Met ； Ala ； Phe ;正白胺酸 Leu Leu (L) 正白胺酸；He ; Val ; Met ; Ala ; Phe lie Lys (K) Arg ； Gin ； Asn Arg Met (M) Leu ; Phe ; Ile Leu Phe(F) Trp ； Leu ； Val ； Ile ； Ala ； Tyr Tyr Pro (P) Ala Ala Ser(S) Thr Thr Thr(T) Val ； Ser Ser Trp(W) Tyr ； Phe Tyr Tyr⑺ Trp ; Phe ; Thr ; Ser Phe Val (V) Ile ； Leu ； Met ； Phe ； Ala ;正白胺酸 Leu 可藉由選擇在以下方面作用顯著不同之取代來實現對抗體之生物特性之實質修飾：維持（a)取代區域中多肽主鏈之結構，例如摺疊或螺旋構形；（b)分子在靶點處之電荷或疏水性；或（c)側鏈體積。可根據共同側鏈特性將天然存在之殘基分組： (1) 疏水性：正白胺酸、met、ala、val、leu、ile ; (2) 中性親水性：Cys、Ser、Thr、Asn、Gin ; (3) 酸性：asp、glu ; (4) 驗性：his、lys、arg ; (5) 影響鏈取向之殘基：gly、pro ;及 (6) 芳族：trp、tyr、phe。非保守性取代需要將此等類別中之一者之成員更換成另一類別。一種類型之取代變異體涉及取代親本抗體（例如人類化 151637.doc -90- 201121566 或人類抗體)之一或多個高變區殘基。一般而t，選用於進-步開發之所得變異體相對於產生其之親本抗體而言生物特性有所改良。產生此等取代變異體之適宜方式涉及使用嗟菌體呈現進行親和力成熟。簡言<，使若干高變區位點（例如6-7個位點）突變以在各位點處產±所有可能之胺基酸取代。自絲狀噬菌體顆粒以與各顆粒内所封裝之Μπ之基因m產物之融合體形式呈現由此產生之抗體。接著如本文所揭不針對生物活性（例如結合親和力）筛檢噬菌體呈現之變異體。為鑑別供修飾之候選高變區位點，可進行丙胺酸掃描突變誘發以鑑別顯著有助於抗原結合之高變區殘基。或者或另外，可有益地分析抗原_抗體複合物之晶體結構來鑑別抗體與抗原之間的接觸點。此等接觸殘基及鄰近殘基為根據本文詳述之技術進行取代的候選者。在產生此等變異體後，即如本文所述對變異體組進行篩檢，且可選擇在一或多個相關檢測法中具有優良特性之抗體用於進一步開發。編碼抗體之胺基酸序列變異體的核酸分子係藉由此項技術中已知之多種方法來製備。此等方法包括（但不限於）自天然來源分離（在天然存在之胺基酸序列變異體之情況下）’或藉由對早期製備之抗體變異體或非變異體形式進行养核苷酸介導（或定點）之突變誘發、PCR突變誘發及匣式突變誘發來製備。可能需要在本發明之免疫球蛋白多肽之Fc區中引入一或多處胺基酸修飾’從而產生Fc區變異體。Fc區變異體可包 151637.doc -91. 201121566 含在一或多個胺基酸位置（包括鉸鏈半胱胺酸位置）包含胺基酸修飾（例如取代）的人類Fc區序列（例如人類IgGl、 IgG2、IgG3 或 IgG4 Fc 區）。根據本說明書及此項技術之教示，預期在一些實施例中，本發明之方法中所用之抗體相較於野生型對應物抗體可在例如F c區中包含一或多處變化。然而，此等抗體與其野生型對應物相比仍保留實質上相同之為治療效用所需之特徵。舉例而言，咸信可在Fc區中產生引起Clq結合及/或補體依賴性細胞毒性（CDC)變化（亦即增強或減弱）之某些改變’例如如WO 99/51642中所述。關於Fc區變異體之其他實例，亦參見Duncan & Winter 322:738-40 (1988); 美國專利第5,648,260號；美國專利第5,624,821號；及WO 94/29351。WO 00/42072(Presta)及 WO 2004/056312(Lowman) 描述與FcR之結合增強或減弱之抗體變異體。此等專利公開案之内容係以引用的方式特此併入本文中。亦參見

Shields等人，/. 5z.〇/· C/zem. 9(2): 6591-6604 (2001)。US 2005/0014934 Al(Hinton等人）中描述半衰期增加且與新生兒Fc受體（FcRn)之結合增強之抗體，其中FcRri負責將母體 IgG轉移至胎兒體内（Guyer等人，J. immun〇i. u7:587 (1976)及 Kim等人，J. lmmun〇i. 24:249 (1994))。此等抗體包含具有一或多處增強Fc區與FcRn結合之取代的Fc區。Fc 區胺基酸序列改變且Clq結合能力增加或降低之多肽變異體係描述於美國專利第6，194,551 81號、臂〇 99/51642中。彼等專利公開案之内容係以引用的方式特此併入本文中。 151637.doc •92· 201121566 亦參見Idusogie 等人，j· — 164: 4178德（2咖）。抗體衍生物本發明之抗體可經進一步修飾以含有此項技術中已知且易於得到之額外非蛋白質部分。適於衍生抗體之部分較佳為水溶性聚合物。水溶性聚合物之非限制性實例包括（但不限於)聚乙二醇(PEG)、乙二醇/丙二醇共聚物、敌甲基纖維素、聚葡萄糖、聚乙烯醇、聚乙烯吡咯啶酮、聚—^―二氧雜環戊烷、聚-1，3,6-三噁烷 '乙烯/順丁烯二酸酐共聚物、聚胺基酸（均聚物或無規共聚物）及聚葡萄糖或聚（n_乙烯吡咯啶酮）聚乙二醇、聚丙二醇均聚物、聚氧化丙烯/氧化乙烯共聚物、聚氧乙基化多元醇（例如甘油）、聚乙烯醇及其混合物。聚乙二醇丙醛可因其在水中之穩定性而在製造方面具有優勢。聚合物可具有任何分子量，且可為分支鏈或非分支鏈。連接至抗體之聚合物之數目可不同，且若連接一個以上聚合物，則其可為相同或不同分子。一般而言’用於衍生之聚合物之數目及/或類型可基於包括（但不限於）以下之考慮來確定：待改良之抗體之特定特性或功能、抗體衍生物是否可在指定條件下用於治療等。 _檢具有所需特性之抗體可藉由此項技術中已知之各種檢測法（其中一些於本文中揭示）對本發明抗體之物理/化學特性及生物功能進行表徵。在一些實施例中’抗體特徵在於以下任何一或多者. 降低或阻斷亥普辛結合、降低或阻斷亥普辛活化、降低或阻斷亥普辛及/或亥普辛受質（例如pro-MSP、pr〇-uPA、因 15I637.doc •93- 201121566 子VI1、pr〇-HGF)下游分子信號傳導、及/或治療及/或預防腫瘤、細胞增殖性病症或癌症；及/或治療或預防與亥普辛表現及/或活性（諸如亥普辛表現及/或活性增強）相關: 病症。在-些實施例中，亥普辛活性為亥普辛酶活性。在一實施例中’酶活性包含裂解亥普辛多肽受質。在-實施例中’亥普辛多肽受f為—或多種巨嗟細胞刺激蛋白前體 (pro-MSP)、pr〇-uPA、因子 VII&pr〇 HGF。pr〇 Msp 之^ 普辛活化描述於同在申請中共同擁有之美國臨時專利申4 案第61/253’990號（2009年1〇月22曰申請）中。在一實施例中，酶活性包含裂解亥普辛合成性受質。在一些實施例中’亥普辛合成性受質為表1中所示之受質。可進一步藉由一系列檢測對經純化之抗體進行表徵，包括（但不限於）N末端測序、胺基酸分析、未變性尺寸排除高壓液相層析（HPLC)、質譜、離子交換層析及番木瓜蛋白酶消化。在本發明之某些實施例中，分析本文所產生之抗體的生物活性。在一些實施例中，測試本發明抗體之抗原結合活性。此項技術中已知且可用於本文中之抗原結合檢測法包括（但不限於）使用堵如西方墨點法之技術之任何直接或競爭性結合檢測法、放射免疫檢測法、elisa(酶聯免疫吸附檢測法）、「夾心」免疫檢測法、免疫沈澱檢測法、螢光免疫檢測法及蛋白質A免疫檢測法。以下實例部分中提供說明性抗原結合及其他檢測法。若需要抑制細胞生長之抗亥普辛抗體，則可採用量測對 151637.doc •94· 201121566 細胞生長之抑制的活體外及/或活體内檢測法測試候選抗體。用於分析癌細胞生長及/或增殖之方法在此項技術中熟知。測定細胞生長及/或增殖及/或細胞凋亡之例示性方法包括例如BrdU合併檢測法、ΜΤΤ、[3H]-胸苷合併（例如 TopCoimt檢測法（PerkinE〗mer))、細胞存活率檢測法（例如 CellTiter-Glo(Promega))及其類似檢測法。在一貫施例中’本發明涵蓋具有效應功能之抗體。在某些實施例中，量測抗體之Fc活性。進行活體外及/或活體内細胞毒性檢測法可確定CDC及/或ADCc活性降低/缺乏。舉例而言，進行Fc受體（FcR)結合檢測法可確保抗體缺乏 FcyR結合能力（從而可能缺之ADCC活性），但保留FcRn結合能力。介導ADCC之初級細胞（NK細胞）僅表現FcyRIII，而單核細胞表現FcyRI、FcyRII及Fqiun。FcR於造血細胞上之表現係概述於 Ravetch 及 Kinet，Annu. Rev. Immunol 9:45 7-92 (1991)之第464頁上之表3中。評估相關分子之 ADCC活性之活體外檢測法之實例係描述於美國專利第 5,500,362號或第5,821，337號中。偵測ADCC活性之檢測法亦例示於本文中。適用於此等檢測法之效應細胞包括周邊血液單核細胞（PBMC)及自然殺手（Νκ)細胞。或者或另外，可評估相關分子在活體内（例如在諸如Clynes等人， PNAS (USA) 95:652-656 (1998)中所揭示之動物模型中）之 ADCC活性。亦可進行C 1 q結合檢測法以確定抗體不能結合C1 q且因此缺乏C D C活性。為評估補體活化，可進行例如如 Gazzano-Santoro等人 ’ J. Immunol. Methods 202:163 151637.doc -95- 201121566 (1996)中所述之CDC檢測法。亦可使用此項技術中已知之方法進行FcRn結合測定及活體内清除率/半衰期測定。载體、宿主細胞及重組方法為重組產生本發明之抗體，分離編碼該抗體之核酸且將其插入可複製之載體中以便進一步選殖（擴增DNA)或表現。可使用習知程序（例如使用能夠特異性結合編碼抗體重鏈及輕鏈之基因的寡核苷酸探針）輕易地分離編碼抗體之DNA且測序。可利用多種載體。對載體之選擇部分視欲使用之宿主細胞而定。一般而言，較佳宿主細胞具有原核或真核（一般為哺乳動物）來源。應瞭解任何同型之恆定區均可用於此目的’包括IgG、IgM、IgA、IgD及IgE恆定區，且此·#恆定區可自任何人類或動物物種獲得。 a.使用原核宿主細胞產生抗體： i·載體建構可使用標準重組技術獲得編碼本發明抗體之多肽組分的聚核苷酸序列。可自抗體產生細胞（諸如融合瘤細胞）中分離所需聚核苷酸序列且進行測序。或者，可使用核苷酸合成器或PCR技術合成聚核苷酸。編碼多肽之序列獲得後即插入在原核宿主中能夠複製並表現異源聚核苷酸之重組載體中。此項技術中可供利用且已知之許多載體均可用於本發明目的。選擇適合載體將主要視插入載體中之核酸之尺寸及欲經載體轉型之特定宿主細胞而定。各載體含有多種組分’此視其功能（異源聚核苷酸擴增或表現，或兩者）及其與存在其之特定宿主細胞的相容性而定。載體組分一般 I51637.doc •96· 201121566 包括（但不限於）··複製起點、選擇標記基因、啟動子、核糖體結合位點（RBS)、L 5虎序列、異源核酸插入物及轉錄终止序列。一般而言’與此等宿主聯合使用含有源自與宿主細胞相容之物種之複製子及控制序列的質體載體。載體通常搆有複製位點以及能夠於經轉型細胞中提供表型選擇之標力己序列。舉例而言，通常使用pBR322(源自大腸桿菌物種之質體）轉型大腸桿菌。PBR322含有編碼安比西林（ampici出n， Amp)及四環素（tetracycline，Tet)抗性之基因，且因此提供鑑別經轉型細胞之簡便方式^ pBR322、其衍生物或其他 Μ生物質體或嗟菌體亦可含有或經修飾含有可由微生物體用以表現内源性蛋白之啟動子。用於表現特定抗體之 PBR322衍生物之實例詳細描述於Carter等人之美國專利第 5,648,237號中。此外，可與此等宿主聯合使用含有與宿主微生物相容之複製子及控制序列的噬菌體載體作為轉型載體。舉例而言，可利用諸如λΟΕΜ_ΤΜ··Π之噬菌體製得可用於轉型諸如大腸桿菌LE392之易感染宿主細胞之重組載體。本發明之表現載體可包含兩種或兩種以上編碼各多狀組分之啟動子·順反子對。啟動子為位於順反子上游⑺調節其表現之未轉譯調控序列。原核啟動子通常分為兩類：誘導型及組成型。誘導型啟動子為在其控制下回應於培養條件之變化（例如有或無營養素存在，或溫度變化）引發順反子之轉錄水準增加的啟動子。 I51637.doc -97- 201121566 大里可由多種潛在宿主細胞識別之啟動子為熟知的。所選啟動子可藉由限制酶消化將該啟動子自源DNA移除且將所分離之啟動子序列插入本發明之載體中而可操作地連接至編碼輕鏈或重鏈之順反子DNA。天然啟動子序列與多種異源啟動子均可用於引導標靶基因擴增及/或表現。在一些實施例中，由於與天然標靶多肽啟動子相比，異源啟動子一般允許所表現之標靶基因達成較大程度轉錄及較高產率’故而使用異源啟動子。適於與原核宿主一起使用之啟動子包括ph〇A啟動子、p_ 聚半乳糖酶及乳糖啟動子系統、色胺酸（trp)啟動子系統及雜交啟動子（諸如tac或trc啟動子）。然而，在細菌中具有功能性之其他啟動子（諸如其他已知之細菌或噬菌體啟動子）亦適用。其核苷酸序列已公開，從而使得熟習此項技術者能夠使用連接子或接附蛋白將其可操作地接合至編碼標乾輕鏈及重鏈之順反子（Siebenlist等人，（1980) Cell 20. 269) 以提供任何所需之限制性位點。在本發明之一態樣中，重組載體内之各順反子皆包含引導所表現之多肽跨膜易位之分泌信號序列組分。一般而言，信號序列可為載體之組分’或其可為插入載體中之標靶多肽DNA之一部分。出於本發明之目的所選擇之信號序列應為可由宿主細胞識別及加工（亦即由信號肽酶分解）之信號序列。對於不識別及加工異源多肽之天然信號序列的原核宿主細胞而言’信號序列係經選自例如由以下組成之群的原核信號序列取代：驗性磷酸酶、青黴素酶、1叩或 151637.doc -98· 201121566 熱穩定性腸毒素II(STII)前導序列、LamB、ph〇E、PelB、 OmpA及MBP。在本發明之一實施例中，表現系統之兩種順反子中所用之信號序列為STII信號序列或其變異體。在另一態樣中’本發明之免疫球蛋白的產生可於宿主細胞之細胞質中進行’且因此無需在各順反子内均存在分泌 h號序列。就此而言’免疫球蛋白輕鏈及重鏈在細胞質内表現、摺疊且組裝形成功能性免疫球蛋白。某些宿主菌株 (例如大腸桿菌trxB-菌株）提供有利於二硫鍵形成之細胞質條件’從而允許所表現之蛋白質次單位適當摺疊及組裝。

Proba及 Pluckthun Gene，159:203 (1995)。適於表現本發明抗體之原核宿主細胞包括古細菌類 (Archaebacteria)及真細菌類（Eubacteria)，諸如革蘭氏陰性 (Gram-negative)或革蘭氏陽性（(}ram_p〇sitive)生物體。適用細菌之貫例包括埃希氏桿菌屬（Escherichia)(例如大腸桿菌）、桿菌屬（Bacilli)(例如枯草桿菌（5. ^如/⑷）、腸内菌屬（Enterobacteria)、假單胞菌屬（Pseud〇m〇nas)(例如綠膿桿菌（尸· 、鼠傷寒沙門氏桿菌（心/w〇⑽//fl typhimurium)、質沙雷氏菌（Serratia marcescans)、免雷伯氏菌屬（Klebsiella)、變形桿菌屬（Pr〇teus)、志賀桿菌屬 (Shigella)、根瘤菌屬（Rhizobia)、透明顫菌（Vitreoscilla)或副球菌屬（Parac〇ccus)。在一實施例中，使用革蘭氏陰性細胞。在一實施例中，使用大腸桿菌細胞作為本發明之宿主。大腸桿菌菌株之實例包括菌株W311〇(Bachmann,

Cellular and Molecular Biol〇gy，第 2卷（Washingt〇n, D.c·: I5I637.doc -99· 201121566

American Society for Microbiology, 1987)，第 1190-1219 頁；ATCC寄存編號：27,325)及其衍生物，包括具有基因型 W3110 MhuA (MonA) ptr3 lac Iq lacL8 ΔοηιρΤΑ (nmpc-fepE) degPW kanR之菌株 33D3(美國專利第 5,639,635號）。其他菌株及其衍生物（諸如大腸桿菌294(ATCC 31，446)、大腸桿菌B、大腸桿菌U776(ATCC 3 1,537)及大腸桿菌 RV3 08(ATCC 31，608))亦適用。此等實例為說明性的而不具限制性。用於建構具有確定基因型之任何上述細菌之衍生物的方法在此項技術中為已知的且係描述於例如Bass等人，Proteins，8:309-314 (1990)中。一般需要考慮複製子在細菌細胞中之可複製性來選擇適合細菌。舉例而言，當使用熟知之質體（諸如pBR322、pBR325、pACYC177或 PKN410)提供複製子時，大腸桿菌、沙雷氏菌屬（Serratia) 或沙門氏桿菌屬（Salmonella)可適用作宿主。宿主細胞通常應分泌最少量之蛋白水解酶，且可能需要將額外蛋白酶抑制劑併入細胞培養物中。抗體產生用上述表現載體使宿主細胞轉型，且將其於習知營養培養基中培養，若適且，該營養培養基經修飾以誘導啟動子、選擇轉型體或擴增編碼所需序列之基因。轉型意謂將DNA引入原核宿主中使得DNA可作為染色體外元件或由染色體成分複製。視所用之宿主細胞而定，使用適於此等細胞之標準技術進行轉型。使用氯化辑之弼處理一般用於含有實質細胞壁障壁之細菌細胞。另一轉型方 I5I637.doc -100- 201121566 法使用聚乙二醇/DMS0。所使用之另一技術為電穿孔。用於產生本發明多肽之原核細胞在此項技術中已知且適於培養所選宿主細胞之培養基中生長。適合培養基之實例包括加有必需營養補充劑之Luria肉湯（LB)。在一些實施例中’培養基亦含有基於表現載體之建構所選之選擇劑以選擇性地允許含有表現載體之原核細胞生長。舉例而言，將安比西林添加至培養基中以使表現安比西林抗性基因之細胞生長。亦可包括除碳、氮及無機磷酸鹽來源外之任何必需補充劑，其以適合濃度單獨或以與另一補充劑或培養基（諸如複合氮源）之混合物形式引入。培養基視情況可含有一或多種選自由以下組成之群的還原劑：麩胱甘肽、半胱胺酸、胱胺、巯乙酸鹽、二硫赤藻糖醇及二硫蘇糖醇。將原核宿主細胞在適合溫度下培養。舉例而言，對於大腸桿菌生長，較佳溫度在約20°c至約3yc、更佳約25它至約37X：之範圍内，甚至更佳為約3Qt。培養基之阳值可為約5至約9之範圍内的任何？11值，主要視宿主生物體而定。對於大腸桿菌，pH值較佳為約6.8至約7 4，且更佳為約 7.0。若本發明之表現載體中使用誘導型啟動子，則在適於活化該啟動子之條件下誘導蛋白質表現。在本發明之一態樣中，使用PhoA啟動子控制多肽轉錄。因此，在磷酸鹽限制性培養基中培養經轉型之宿主細胞以供誘導。⑽鹽限制性培養基較佳為C.R.A.P培養基（參見例如Simm〇ns等人， 151637.doc -101 - 201121566

Immunol· Methods (2002)，263:133-147)。如此項技術中所知，可根據所用之載體構築體使用多種其他誘導劑。在一實施例中，本發明之所表現之多肽係分泌至宿主細胞之周質中且自其中回收。蛋白質回收通常包括使微生物碎裂，一般藉由諸如滲透壓衝擊、音波處理或溶解之方式使微生物碎裂。細胞碎裂後，則可藉由離心或過濾來移除細胞碎片或整個細胞。蛋白質可例如藉由親和樹脂層析進一步純化。或者，可將蛋白質轉運至培養基中且在其中分離。可將細胞自培養物中移除，且將培養物上清液過遽且濃縮以進一步純化所產生之蛋白質。可使用諸如聚丙稀醯胺凝膠電泳（PAGE)及西方墨點檢測法之通常已知之方法進一步分離且鑑別所表現之多狀。在本發明之-態樣中’藉由醱酵製程大量生產抗體。各種大規模分批饋料醱酵程序可用於產生重組蛋白。大規模醋酵具有至少画公升之生產量，較佳具有約ι〇〇〇至 100,000公升之生產量。此等潑酵器使用葉輪授拌器來分配氧氣及營養素’尤其葡萄糖(較佳之碳/能量來源)。小規模醱酵一般係指在容量不超過約100公升且可在約丨公升至約100公升範圍内之醱酵器中進行的醱酵。 «酵製程中’通常在細胞已於適合條件下生長至所需密度(例如約⑽-220之OD550，在此階段細胞處於早期生長停滯期)後開始誘導蛋白質表現。如此項技術中已知且如上文所述，可根據所用之載體構築體使用多種誘導劑。可在誘導前使細胞生長較短之時段。通常誘導細胞約12_ 151637.doc 102- 201121566 50小時，不過可使用較長或較短之誘導時間。為改良本發明多肽之產率及品質，可改變各種醱酵條件。舉例而言’為改良所分泌之抗體多肽之適當組裝及指疊’可使用過度表現伴隨蛋白之額外載體共轉型宿主原核細胞’該等伴隨蛋白諸如Dsb蛋白（DsbA、DsbB、DsbC、 DsbD及/或DsbG)或FkpA(具有伴隨蛋白活性之肽基脯胺醯基順，反異構酶）。已證實伴隨蛋白有助於細菌宿主細胞中所產生之異源蛋白質之適當摺疊及溶解度。Chen等人， (1999) J. Biol. Chem· 274:19601-19605 ; Georgiou等人，美國專利第6,083,715號；Georgiou等人，美國專利第6,〇27,888 號；Bothmann及 Pluckthun (2000) J· Biol. Chem. 275:17100- 17105 ; Ramm及 Pluckthun，（2000) J. Biol. Chem. 275:17106-17113 ; Arie等人，（2001) Mol. Microbiol. 39:199-210。為使所表現之異源蛋白質（尤其對蛋白水解敏感之蛋白質）之蛋白水解降至最低’某些缺乏蛋白水解酶之宿主菌株可用於本發明。舉例而言，宿主細胞株可經修飾以實現編碼已知細菌蛋白酶之基因的基因突變，該等細胞蛋白酶諸如蛋白酶III、〇mpT、DegP、Tsp、蛋白酶J、蛋白酶 Mi、蛋白酶V、蛋白酶…及其組合。可使用一些大腸桿菌蛋白酶缺之性菌株且其描述於例如j〇ly等人，（1998)，同上’ Georgiou等人’美國專利第5 264 365號；Ge〇rgi〇u等人，美國專利第 5,508，192號；Hara等人，Microbial Drug Resistance，2:63-72 (1996)中。在一實施例中，使用缺乏蛋白水解酶且經過度表現一或 151637.doc 201121566 多種伴隨蛋白之質體轉型的大腸桿菌菌株作為本發明之表現系統中之宿主細胞。

Hi.抗體純化可使用此項技術中已知之標準蛋白純化方法。以下程序為例示性適合純化程序：免疫親和管柱或離子交換管柱部分分離、乙醇沈澱、逆相HPLC、矽石或陽離子交換樹脂 (諸如DEAE)層析、聚焦層析、SDS_PAGE、硫酸銨沈澱及使用例如SephadexG-75之凝膠過濾。在一態樣中，使用固定於固相上之蛋白質八對本發明之全長抗體產物進行免疫親和純化。蛋白質A為來自金黃色葡萄球菌izwreai)之41 kD細胞壁蛋白，其以高親和力結合至抗體之Fc區。Lindmark等人，（DM)夂

Immunol_ Meth· 62:1_13。固定蛋白質A之固相較佳為包含 f璃或矽石表面之管柱，更佳為可控微孔玻璃管柱或矽酸管柱。在一些應用巾，管柱已塗有諸如甘油之試劑以試圖防止污染物之非特異性黏附。作為純化之第一步，驟，將如上所述源自細胞培養物之製 :塗覆至固定蛋白質八之固相上以使得相關抗體特異性結蛋白質A。接著洗蘇固相以移除未與固相特異性結合之污染物。最後，藉由溶離自固相回收相關抗體。 b·使用真核宿主細胞產生抗體：載體組分一般包括（但不限於）以下一或多者：信號序列、複製起點、-或多個標記基因、強化子元件、啟動子及轉錄終止序列。 151637.doc -104- 201121566 ⑴信號序列組分用於真核宿主細胞之載體亦可含有信號序列或其他在相關成熟蛋白或多肽之N末端具有特異性裂解位點之多肽。所選擇之異源信號序列較佳為由宿主細胞識別及加工（亦即由信號肽酶分解）之信號序列。在哺乳動物細胞表現中’可用哺乳動物信號序列以及病毒分泌前導序列，例如單純性疱疹gD信號。此前驅區域之DNA在閱讀框架中接合至編碼抗體之 DNA。 (U)複製起點一般而言，哺乳動物表現載體無需複製起點組分。舉例而言，通常可使用SV40起點僅係因為其含有早期啟動子。 (iii)選擇基因組分表現及選殖載體可含有選擇基因，亦稱為可選標記物。典型之選擇基因編碼滿足以下之蛋白質：（a)賦予針對抗生素或其他毒素（例如安比西林、新黴素（ne〇myCin)、甲胺喋呤或四環素）之抗性；（b)補充營養缺陷（必要時）；或供應不能自複合培養基獲得之關鍵營養素。選擇方案之一實例利用使宿主細胞生長停滯之藥物。經異源基因成功轉型之彼等細胞會產生賦予抗藥性之蛋白質且因此在選擇方案中倖存。此顯性選擇之實例使用藥物新黴素 '黴酚酸及潮黴素（hygromycin)。適用於哺乳動物細胞之可選擇標記物的另一實例為能夠鑑別細胞吸收抗體核酸之能力的彼等標記二缚如 151637.doc 201121566 DHFR胸苦激酶、金屬硫蛋白·ι及金屬硫蛋白-π(較佳靈長類動物金屬硫蛋自基因）、腺普脫胺酶、鳥胺酸脫叛酶等。舉例而5，首先藉由在含有甲胺喋呤（Mtx)(DHFR之競爭I·生结k #丨）之培養基巾培養所有轉型體來鑑別經DHFR選擇基因轉型之細胞。在使用野生型DHFR時，適合之宿主細胞為缺乏DHFR活性之中國倉鼠卵巢（CH〇)細胞株（例如 ATCC CRL-9096)。或者，可藉由使細胞在含有可選擇標記物之選擇劑（諸如胺基醣苷抗生素，例如卡那黴素（kanamycin)、新黴素或 G418)之培養基中生長來選擇經編碼抗體之dna序列、野生型DHFR蛋白及另一可選擇標記物（諸如胺基醣苷3，磷酸轉移酶（ΑΡΗ))轉型或共轉型之宿主細胞（尤其為含有内源性DHFR之野生型宿主）。參見美國專利第4,965，199號。 (b)啟動子組分表現及選殖載體通常含有由宿主生物體識別且可操作地連接於抗體多肽核酸之啟動子。已知用於真核生物之啟動子序列。實際上所有真核基因皆具有位於轉錄起始位點上游約25至30個鹼基處之富含AT區。在多種基因之轉錄閧始上游70至80個驗基處發現的另一序列為CNCAAT區，其中 N可為任何核苷酸。在大多數真核基因之3,末端處為 AATAAA序列，該序列可為向編碼序列之3,末端添加p〇ly A尾的信號。所有此等序列皆宜插入真核表現載體中。可例如藉由獲自以下之啟動子來控制哺乳動物宿主細胞 151637.doc -106- 201121566 中自載體之抗體多肽轉錄：病毒（諸如多形瘤病毒 '禽痘病毒、腺病毒（諸如腺病毒2)、牛乳頭狀瘤病毒、禽肉瘤病毒、細胞巨大病毒、反轉錄病毒、B型肝炎病毒及猿病毒 40(SV40))基因組；異源哺乳動物啟動子（例如肌動蛋白啟動子或免疫球蛋白啟動子）；熱休克啟動子，其限制條件為此等啟動子與宿主細胞系統相容。宜以亦含有SV40病毒複製起點之sV4〇限制片段形式獲得SV40病毒之早期及晚期啟動子。宜以HindlnEw制片段形式獲得人類細胞巨大病毒之即刻早期啟動子。美國專利第4,419,446號中揭示使用牛乳頭狀瘤病毒作為載體於咕乳動物宿主中表現DNA之系統。美國專利第4，術，978號中描述此系統之改良。或者，可使用勞氏肉廇病# (r_ Sarcoma Virus)長末端重複序列作為啟動子。 (^)強化子元件組分較同等真核生物轉錄編碼本發明抗體多肽之dna通常可藉由將強化子序列插人载體中來増強。現已知多種來自哺乳動物基因(血球蛋白、彈性蛋白酶、白蛋白、α·胎蛋白及：島素)之強化子序列 '然而’通常使用來自真核細胞病毋之強化子|例包括複製起點後側上之SV4〇強化子㈨刚⑽）、細胞巨大病毒早期啟動子強化子、複製起點後側上之多形瘤強化子及腺病毒強化子。關於用於活化真核啟動子之強化元件，亦參見YanW，Nature 297:17·18 ()彳將強化子剪接至载體中位於抗體多肽編碼序列之5或3位置處，但較佳位於啟動子之5,位點處。 151637.doc •107· 201121566 (vi) 轉錄終止組分真核宿主細胞中使用之表現載體通常亦含有為終止轉錄及穩定mRNA所必需之序列。此等序列通常可自真核或病毒DNA或cDNA之5'及偶而3'未轉譯區域獲得。此等區域含有在編碼抗體之mRNA之未轉譯部分中以聚腺苷酸化片段形式轉錄的核苷酸區段。一種適用之轉錄終止組分為牛生長激素聚腺苷酸化區域。參見WO 94/11026及其中所揭示之表現載體。 (vii) 選擇及轉型宿主細胞

適用於選殖或表現本文載體中之DNA之宿主細胞包括本文所述之較高級真核生物細胞，包括脊椎動物宿主細胞。使脊椎動物細胞在培養物（組織培養物）中繁殖已成為一種常規程序。適用哺乳動物宿主細胞株之實例為經SV40轉型之猴腎CV1細胞株（COS-7，ATCC CRL 1651);人類胚腎細胞株（在懸浮培養物中生長而經次選殖之293或293細胞， Graham等人，J. Gen. Virol. 36:59 (1977));幼倉鼠腎細胞 (BHK，ATCC CCL 10);中國倉鼠卵巢細胞 /-DHFR(CHO， Urlaub等人，Proc· Natl. Acad. Sci. USA 77:4216 (1980)); 小鼠塞特利細胞（mouse sertoli cell)(TM4，Mather, Biol. Reprod. 23:243-25 1 (1980));猴腎細胞（CV1，ATCC CCL 70);非洲綠猴腎細胞（VERO-76，ATCC CRL-1587);人類子宮頸癌細胞（HELA，ATCC CCL 2);犬腎細胞（MDCK， ATCC CCL 34);水牛鼠肝細胞（buffalo rat liver cell)(BRL 3A，ATCC CRL 1442);人類肺細胞（W138，ATCC CCL 15l637.doc -108 · 201121566 75);人類肝細胞（HeP G2，HB 8065);小鼠乳腺腫瘤 (MMT 060562，ATCC CCL51) ; TRI 細胞（Mather 等人’ Annals Ν·Υ· Acad. Sci. 383:44-68 (1982)) ; MRC 5細胞； FS4細胞；及人類肝癌細胞株（Hep G2)。宿主細胞用上述用於產生抗體之表現或選殖載體轉型，且於習知營養培養基中培養，若適宜，該營養培養基經修飾以便誘導啟動子、選擇轉型子或擴增編碼所需序列之基因的。 (viii)培養宿主細胞用於產生本發明抗體之宿主細胞可在多種培養基中培養。市售培養基，諸如漢姆氏F10(Ham's F10)(Sigma)、最低必需培養基（MEM)(Sigma)、RPMI-1 640(Sigma)及杜貝卡氏經改良伊格氏培養基（Dulbecco’s Modified Eagle's Medium，DMEM)(Sigma)適用於培養宿主細胞。另外，可使用 Ham等人 ’ Meth. Enz. 58:44 (1979) ; Barnes等人， Anal. Biochem. 102:255 (1980);美國專利第 4,767,704號；第 4,657,866 號；第 4,927,762 號；第 4,560,655 號；或第 5,122,469號；WO 90/0343 0 ; WO 87/00195 ;或美國專利

Re· 30,985中所述之任何培養基作為宿主細胞之培養基。任何此等培養基皆可視需要補充有激素及/或其他生長因子（諸如胰島素、轉鐵蛋白或表皮生長因子）、鹽（諸如氣化納、每、鎮及磷酸鹽）、緩衝液（諸如HEPES)、核苦酸（諸如腺苷及胸苷）、抗生素（諸如GENTAMYCIN™藥物）、微置疋素（定義為通常以在微莫耳濃度範圍内之最終濃度存 151637.doc -109- 201121566 在之無機化合物）及葡萄糖或等效能源。亦可包括熟習此項技術者已知之適合濃度的任何其他必需補充劑。培養條件（諸如溫度、pH值及其類似條件）為先前選擇用於表現之宿主細胞所用的條件，且為一般技術者所顯而易見的。 (汰）抗體純化當使用重組技術時，抗體可於細胞内產生或直接分泌至培養基中。若抗體於細胞内產生，則作為第一步驟，例如藉由離心或超濾移除微粒碎片（宿主細胞或已溶解之片 •k )。在抗體分泌至培養基中時’一般首先使用市售蛋白質濃縮過濾器（例如Amicon或Millipore Pellicon超遽單元）濃縮來自此等表現系統之上清液。在任何先前步驟中可包括諸如PMSF之蛋白酶抑制劑以抑制蛋白質水解，且可包括抗生素以防止外來污染物生長。可使用例如羥磷灰石層析、凝膠電泳、透析及親和層析來純化自細胞製備之抗體組合物’其中親和層析為較佳純化技術。蛋白質A作為親和配位體之適用性視存在於抗體中之任何免疫球蛋白Fc域之種類及同型而定。蛋白質八可用於純化基於人類γΐ、γ2或γ4重鏈之抗體（Lindmark等人， J. Immunol. Meth. 62:1-13 (1983))。推薦蛋白質G用於所有小鼠同型及人類y3(Guss等人，EMBO J. 5:15671575 (1986))。雖然親和配位體所附接之基質最常為瓊脂糖，但亦可利用其他基質。與瓊脂糖相比，機械穩定性基質（諸如可控微孔玻璃或聚（苯乙烯二乙烯基）苯）允許達成較快流動速率及較短處理時間。當抗體包含CH3域時，Bakerbond 151637.doc •110· 201121566 ABXtm樹脂（j T Bakei>, phuUpsbuq，Nj)適用於純化。視待回收之抗體而定，亦可利用其他蛋白質純化技術，諸如離子交換官柱部分分離、乙醇沈澱、逆相HPLC、矽石層析、陰離子或陽離子交換樹脂（諸如聚天冬胺酸管柱）上進行之肝素sephar0se™層析、聚焦層析、SDS_pAGE及硫酸銨沈澱。在任何初步純化步驟之後，可使用1311值介於約25_45之間的溶離緩衝液對包含相關抗體及污染物之混合物進行低 pH值疏水性相互作用層析，較佳在低鹽濃度（例如約㈣a Μ鹽）下進行。免疫結合物本卷明亦提供免疫結合物（可互換地稱作「抗體_藥物結合物」或「ADC」）’#包含本文所述之任何抗亥普辛抗體與細胞毒性劑(諸如化學治療劑、藥物、生長抑制劑、毒素(例如細菌、真菌、植物或動物來源之酶促活性毒素或其片段））或放射性同位素（亦即放射性結合物）結合。使用抗體·藥物結合物以在治療癌症中局部傳遞細胞毒性劑或細胞生長抑制劑(亦即殺&或抑㈣瘤細胞之藥 ^KSyrigos^Epenetos (1999) Anticancer Research 19:605-614 ; Niculescu_Duvaz&Springer (1997) Adv Drg By

Rev. 26:151-172;美國專利第4,975,278號）可允許將藥物部分乾向傳遞至腫瘤巾，且細胞内㈣於其巾，而全身性投與此等未結合之藥劑可能會對正常細胞以及設法消除之腫瘤細胞產生不可接受之毒性程度（Baldwin等人，（ι㈣） 151637.doc 201121566

Lancet (1986 年 3 月 15 曰）第 603-05 頁；Thorpe，（1985) 「Antibody Carriers Of Cytotoxic Agents In Cancer Therapy: A Review，」Monoclonal Antibodies '84: Biological And Clinical Applications, A. Pinchera等人（編），第 475-5 06 頁）。從而應設法在最小毒性下達到最大功效。多株抗體及單株抗體已報導皆適用於此等策略（Rowland等人，（1986) Cancer Immunol. Immunother.，21:1 83-87)。此等方法中所用之藥物包括道諾徽素、小紅莓、曱胺°禁°令及長春地辛（Rowland 等人，（1986)同上）。抗體-毒素結合物中所用之毒素包括細菌毒素（諸如白喉毒素）；植物毒素（諸如蓖麻毒素）；小分子毒素（諸如格爾德黴素（geldanamycin))(Mandler等人， (2000) Jour, of the Nat. Cancer Inst. 92(19):1573-1581 ； Mandler 等人，（2000) Bioorganic & Med· Chem. Letters 10:1025-1028 ; Mandler等人，（2002) Bioconjugate Chem. 13:786-791)、類美登素（EP 1391213 ; Liu 等人，（1996) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93:8618-8623)及刺孢黴素（Lode 等人，（1998) Cancer Res. 58:2928 ; Hinman等人，（1993) Cancer Res. 53:3336-3342)。該等毒素可藉由包括微管蛋白結合、DNA結合或拓撲異構酶抑制之機制來實現其細胞毒性及細胞生長抑制作用。有些細胞毒性藥物在與大抗體或蛋白質受體配位體結合時趨於變得無活性或具較低活性。 ZEVALIN®(替伊莫單抗替烏克坦（ibritumomab tiuxetan)， Biogen/Idec)為抗體-放射性同位素結合物，其係由針對見 151637.doc 112 201121566 於正常及惡性B淋巴細胞表面上之CD20抗原之鼠類IgG 1 κ 單株抗體與mIn或9GY放射性同位素藉由硫脲連接子-螯合劑結合而組成（Wiseman等人，（2000) Eur. Jour· Nucl. Med. 27(7):766-77 ; Wiseman等人，（2002) Blood 99(12):4336-42 ; Witzig等人，（2002) J. Clin. Oncol. 20(10):2453-63 ； Witzig等人，（2002) J. Clin. Oncol. 20(15):3262-69)。儘管 ZEVALIN具有針對B細胞非霍奇金氏淋巴瘤（NHL)之活性，但在大多數患者中投藥會導致嚴重及長期血細胞減少症。MYLOTARG™(吉妥珠單抗奥唑米星（gemtuzumab ozogamicin)，Wyeth Pharmaceuticals)為一種由 hu CD33 抗體連接至刺孢黴素而組成之抗體藥物結合物，其於2000年批准用於注射治療急性骨髓性白血病（Drugs of the Future (2000) 25(7):686 ;美國專利第 4,970,198號；第 5,079,233 號；第 5,585,089 號；第 5,606,040號；第 5,6937,62號；第 5,739,1 16號；第 5,767,285號；第 5,773,001 號）。康圖單抗美坦辛（Cantuzumab mertansine)(Immunogen, Inc·)是一種由huC242抗體經由二硫化物連接子SPP連接至類美登素藥物部分DM1而組成的抗體藥物結合物，其正進入治療表現 CanAg之癌症（諸如結腸癌、胰臟癌、胃癌及其他癌症）之II 期試驗。MLN-2704(Millennium Pharm·，BZL Biologies, Immunogen Inc.)為一種由抗前列腺特異性膜抗原（PSMA) 單株抗體連接至類美登素藥物部分DM 1.而組成之抗體藥物結合物，其正開發作為前列腺腫瘤之可能療法。奥瑞他汀 (auristatin)肽、奥瑞他汀E(AE)及單甲基奥瑞他汀 151637.doc -113- 201121566 (monomethylauristatin ; MMAE)(海兔毒素之合成類似物）與嵌·合單株抗體cBR96(對癌瘤之Lewis Y具有特異性）及 cAC 1 0(對血液惡性病之CD30具有特異性）結合（Doronina等人 ’（2003) Nature Biotechnology 21(7):778-784)且正在治療開發中。適用於產生免疫結合物之化學治療劑係描述於本文中 (例如上文）。可用之酶促活性毒素及其片段包括：白喉A 鏈、白喉毒素之無結合活性片段、外毒素A鏈（來自綠膿桿菌（Piewdomona·? aerwgkosa))、蓖麻毒素A鏈、相思子驗毒素A鏈（abrin A chain)、莫迪素 A鍵（modeccin A chain)、α-带麴菌素（alpha-sarcin)、油桐蛋白 /bMh· protein)、康乃馨蛋白、洋商陸蛋白此a 仙 protein)(PAPI ' PAPII 及 PAP-S)、苦瓜抑制劑（momordica charantia inhibitor)、麻瘋樹毒蛋白（curcin)、巴豆毒素 (crotin)、肥皁草抑制劑（sapaonaria officinalis inhibitor)、白樹素（gelonin)、有絲分裂素（mitogellin)、偈限麴菌素 (restrictocin)、酚黴素（phenomycin)、伊諾黴素（enomycin) 及黴菌毒素（tricothecene)。參見例如1993年10月28日公開之WO 93/21232。可使用多種放射性核種產生放射性結合抗體。實例包括2丨2Bi、丨3丨I、丨3丨In、90Y及】86Re。可使用多種雙功能蛋白偶合劑製造抗體與細胞毒性劑之結合物，該等蛋白偶合劑諸如3-(2-吡啶基二硫醇）丙酸N-丁二醯亞胺酯（SPDP)、亞胺基硫雜環戊烷（IT)、醯亞胺酯之雙官能衍生物（諸如己二醯亞胺酸二曱酯鹽酸鹽）、活性酯（諸如辛二 151637.doc 201121566 酸二丁二醯亞㈣）、駿（諸如戊D、雙疊氮基化合物 (諸如雙（對疊氮基苯甲醢基）己二胺）、冑重氮鹽衍生物（諸如雙-(對重氮苯甲ϋ基）·乙二胺）、二異氰酸醋（諸如甲苯 2,6_二異氰酸酯）及雙活性氟化合物（諸如1，5-二氟-2,4-二硝基苯）。舉例而言，蓖麻毒素免疫毒素可如vitetta等人，

Science’ 238: 1098 (1987)中所述製備。碳14標記之卜異硫氰基苯曱基-3-甲基二伸乙基三胺五乙酸（MX_DTpA)為用於使放射性核苷酸與抗體結合之例示性螯合劑。參見w〇 94/11026 。本文亦涵蓋抗體與一或多種小分子毒素（諸如刺孢黴素類美登素、海兔毒素、奥羅他：；丁（aurostatin)、單端抱徽烯族毒素及CC1 065以及此等毒素之具有毒素活性之衍生物）之結合物。 i.美登素及類美登素在一些實施例中’免疫結合物包含本發明抗體（全長或片段）與一或多個類美登素分子之結合物。類美登素為藉由抑制微管蛋白聚合起作用之有絲分裂抑制劑。美登素最先係自東非灌木齒葉美登木 wrrWa)分離（美國專利第3,896，η1號）。隨後，發現某些微生物亦產生類美登素，諸如美登醇及C-3美登醇酯（美國專利第4,151，042號）。合成美登醇及其衍生物及類似物係揭示於例如美國專利第4，137,230號；第4,248,870號；第 4,256,746 號；第 4,26〇,6〇8 號；第 4,265,814 號；第 4,294,757 號；第 4,307,016 號；第 4,308,268 號；第 151637.doc -115- 201121566 4,308’269 號；第 4 309 428 號；第 4 313 946 號；第 4’315’929 號；帛 4,317,821 號；第 4,322,348 號；第 4,331，598 號；第 4 361 65〇號；第 4,364 866 號：第 4,424,219 就；第 4,45〇,254 號；第 4,362,663 號；及第 4,371，533號中。類美登素藥物部分為抗體藥物結合物中具有吸引力之藥物部分’原因在於：⑴其相對易於藉由醱酵或對醱酵產物進行化學修飾、衍生化來製備；（Π)其易於用適合經由非一硫化物連接子與抗體結合之官能基衍生化；（iii)其在血漿中穩定；及（iv)其對多種腫瘤細胞株皆有效。含有類美登素之免疫結合物、製備其之方法及其治療用途係揭不於例如美國專利第5,2〇8,〇2〇號、第5,416 〇64號及歐洲專利EP 〇 425 235 B1中’其揭示内容係以引用的方式明確併入本文中。Liu等人，proc· Natl. Acad. Sci. USA 93·8618-8623 (1996)描述包含類美登素（命名為DMl)連接至針對人類結腸直腸癌之單株抗體C242的免疫結合物。已發現該結合物對所培養之結腸癌細胞具有高度細胞毒性且在活體内腫瘤生長檢測法中展示出抗腫瘤活性。ChaH等人 ’ Cancer Research 52:127-131 (1992)描述類美登素經由二硫化物連接子與結合人類結腸癌細胞株上之抗原之鼠類抗體A7結合，或與結合HER2/neu致癌基因之另一鼠類單株抗體TA.1結合之免疫結合物。在活體外’測試丁八卜類美登素結合物對每個細胞表現3xl〇5個HER-2表面抗原之人類乳癌細胞株SK-BR-3之細胞毒性。藥物結合物達成與游 151637.doc -116- 201121566 離類美登素藥物類似之細胞毒性程度，該細胞毒性程度可隨每個抗體分子類美登素分子之數目增加而增加。A7_類美登素結合物在小鼠中展示出低全身細胞毒性。可藉由以化學方式使抗體連接於類美登素分子而不顯著降低抗體或類美登素分子之生物活性來製備抗體類美登素結合物。參見例如美國專利第5,2〇8,〇2〇號（其揭示内容係以引用的方式明確併入本文中）。平均每個抗體分子結合3-4個類美登素分子已展示出增強對標靶細胞之細胞毒性而對抗體功能或溶解度無不利影響的功效，但預期甚至 1個毒素/抗體分子即可使細胞毒性増強超過使用裸抗體。類美登素在此項技術中為熟知的，且可藉由已知技術合成或自天然來源分離。適合類美登素係揭示於例如美國專利第5,208,020號及上文提及之其他專利及非專利出版物中。較佳之類美登素為美登醇及在美登醇分子之芳環中或其他位置處經修飾之美登醇類似物（諸如各種美登醇酯）。此項技術中已知用於製造抗體-類美登素結合物的多種連接基團’包括例如美國專利第5,2〇8,〇2〇號或Ep專利〇 425 235 Bl ’ Chari等人，Cancer Research 52:127-131 (1992); 及美國專利申請案第10/960,602號（2004年10月8曰申請）中所揭不之彼等連接基團，其揭示内容係以引用的方式明確併入本文中。包含連接子組分SMCC之抗體-類美登素結合物可如美國專利申請案第10/960,602號（2004年10月8曰申清）中所揭示製備。連接基團包括二硫基、硫醚基、酸不穩疋性基團、光不穩定性基團、肽酶不穩定性基團或酯酶 151637.doc -117- 201121566 不穩定性基團，如上文所鑑別之專利中所揭示，二硫基及硫醚基較佳。其他連接基團描述及舉例說明於本文中。抗體與類美登素之結合物可使用多種雙官能蛋白偶合劑製得，該等蛋白偶合劑諸如3-(2-吡啶基二硫基）丙酸N_ 丁二醢亞胺酯（SPDP)、4-(N-順丁烯二醯亞胺基曱基）環己烷_ 1-甲酸丁二醯亞胺酯（SMCC)、亞胺基硫雜環戊烷（IT)、醯亞胺酯之雙官能衍生物（諸如己二醯亞胺酸二曱酯鹽酸鹽）、活性醋（諸如辛二酸二丁二醯亞胺酯）、醛（諸如戊二醛）、雙疊氮基化合物（諸如雙（對疊氮基苯甲醯基）己二胺）、雙重氮衍生物（諸如雙（對重氮苯曱醯基）_乙二胺）、二異氰酸酯（諸如甲苯2,6-二異氰酸酯）及雙活性氟化合物（諸如1’5_ —氟>-2,4- 一確基本）。尤其較佳之偶合劑包括提供二硫鍵之3-(2- °比。定基二硫基）丙酸丁二醯亞胺酯 (SPDP)(Carlsson等人，Biochem. J. 173:723-737 (1978))及 4-(2-°比咬基硫基）戊酸N-丁二酿亞胺酯（spp)。視連接類型而定，連接子可連接於類美登素分子之各個位置。舉例而言，可藉由使用習知偶合技術與羥基反應形成醋鍵。反應可發生於具有羥基之C_3位置、經羥基甲基修倚之C-14位置、經經基修飾之C-15位置及具有經基之c· 20位置處。在一較佳實施例中，鍵聯係形成於美登醇或美登醇類似物之C-3位置處。奥瑞他汀及海兔毒素在一些實施例中，免疫結合物包含本發明抗體與海兔毒素或海兔毒素之肽類似物及衍生物奥瑞他江之結合物（美 I51637.doc •118· 201121566 國專利第5,635,483號及第5,780,588號）。已展示海兔毒素及奥瑞他汀干擾微管動力學、GTP水解以及核及細胞分裂 (Woyke等人，（2001) Antimicrob. Agents and Chemother. 45( 12):3580-3584)且具有抗癌活性（美國專利第5,663,149 號）及抗真菌活性（Pettit等人，（1998) Antimicrob. Agents Chemother. 42:2961-2965)。海兔毒素或奧瑞他汀藥物部分可經由肽藥物部分之N(胺基）末端或C(羧基）末端連接至抗體（WO 02/088172)。例示性奥瑞他汀實施例包括N末端連接之單曱基奥瑞他汀藥物部分DE及DF，其揭示於美國專利第10/983,340號 r Monomethylvaline Compounds Capable of Conjugation to Ligands」（2004年11月5日申請，其揭示内容係以全文引用的方式明確併入本文中）中。通常，基於肽之藥物部分可藉由在兩個或兩個以上胺基酸及/或肽片段之間形成肽鍵來製備。可例如根據肽化學領域中熟知之液相合成方法（參見E. Schr6der及K. Liibke，「The Peptides,」第 1 卷，第 76-1 36 頁，1965，Academic Press)來製備此等肽鍵。奥瑞他汀/海兔毒素藥物部分可根據以下文獻之方法來製備：美國專利第5,635,483號及第 5,780,588號；Pettit等人，（1989) J. Am. Chem. Soc. 111:5463-5465 ; Pettit等人，（1998)八111;1-€阻11〇61〇1'11§〇651§11 13:243-277 ; Pettit，G.R.等人，Synthesis，1996，719-725 ;及Pettit等人，（1996) J. Chem. Soc. Perkin Trans· 1 5:859-863。亦參見 Doronina (2003) Nat. Biotechnol. 21(7):778-784 ； 151637.doc -119- 201121566 r Monomethylvaline Compounds Capable of Conjugation to Ligands，」美國第10/983,340號（2004年11月5日申請），其係以全文引用的方式併入本文中（揭示例如連接子及製備單甲基纈胺酸化合物（諸如MMAE及MMAF)與連接子之結合物的方法）。 iii. 刺孢黴素在其他實施例中，免疫結合物包含本發明抗體與一或多個刺孢黴素分子之結合物。刺孢黴素家族之抗生素能夠在次皮莫耳濃度下使雙股DNA斷裂。關於刺孢黴素家族之結合物的製備，參見美國專利第5,712,374號、第5,714,586 號、第 5,739,1 16號、第 5,767,285 號、第 5,770,701 號、第 5,770,710 號、第 5,773,001 號、及第 5,877,296 號（皆頒予 American Cyanamid Company)。可使用之刺抱黴素之結構類似物包括（但不限於）γι1、a/、a/、N-乙醯基-γ〗1、PSAG 及 G^Hinman等人，Cancer Research 53:3336-3342 (1993); Lode等人，Cancer Research 58:2925-2928 (1998);及American Cyanamid之上述美國專利）。可結合抗體之另一抗腫瘤藥物為QFA，其為抗葉酸劑。刺孢黴素與QFA皆具有細胞内作用位點且不易於跨越質膜。因此，細胞經由抗體介導之内化作用吸收此等藥劑會極大增強其細胞毒性作用。 iv. 其他細胞毒性劑可與本發明抗體結合之其他抗腫瘤劑包括BCNU、鏈脲佐菌素（streptozoicin)、長春新驗及5-敗尿嘴咬’美國專利第5,053,394號及第5,770,710號中所述之統稱為LL-E33288 151637.doc -120· 201121566 :合物之藥劑家族以及艾斯帕米辛(美國專利第一可用之酶促活性毒素及其片段包括：白喉續、白喉毒素之非結合活性片段、外毒素錢（來自綠毒素A鏈、相田δ主各困J昆麻 …. 莫迪素A鏈、°•帚麴菌素、油桐蛋：、康乃馨蛋白、洋商陸蛋白(PM、—及ΡΑΡ- S)、古瓜抑制劑、麻瘋樹毒蛋白、巴豆毒素、肥皂草抑制劑、白樹素、有絲分裂素、侷限麴菌f、酚黴素、伊諾黴素及黴菌毒素。參見例如㈣年1〇月28日公開之卵 93/21232 。本發明進-步涵蓋抗體與具有核分解活性之化合物（例如核糖核酸酶或DNA核酸内切酶’諸如去氧核糖核酸酶 DNase)之間所形成的免疫結合物。為選擇性破壞腫瘤，抗體可包含高度放射性原子。可使用多種放射性同位素產生放射性結合抗體。

At=、〜25、〜〜

Pt>及匕之放射性同位素。當結合物用於偵測時，其可包含用於閃爍攝影研究之放射性原子，例如“"^或广23 ;或用於核磁共振（NMR)成像（亦稱為磁共振成像，mri)之自旋標記，又諸如碘_123、碘-131 '銦·lu、氟_19、碳_13 氮-15、氧-17、釓、錳或鐵。可以已知方式將放射性標記或其他標記併入結合物令。舉例而言，肽可經生物合成，或可藉由使用適合之胺基酸前驅物進行化學联基酸合成（例如涉及以氟_丨9代替氫）來合 15I637.doc .121 - 201121566 成。諸如纪99〇1或I123、Re186、Re188及In111之標記可經由肽中之半胱胺酸殘基連接。可經由離胺酸殘基連接釔-90。可使用 IODOGEN方法（Fraker等人，（1978) Biochem. Biophys. Res. Commun. 80: 49-57)併入碘-123。「Monoclonal Antibodies in Immunoscintigraphy」（Chatal，CRC Press 1989)詳細描述其他方法。抗體與細胞毒性劑之結合物可使用多種雙官能蛋白偶合劑製得，該等蛋白偶合劑諸如3-(2-吡啶基二硫基）丙酸N-丁二醯亞胺酯（SPDP)、4-(N-順丁烯二醯亞胺基曱基）環己烷-1-甲酸丁二醯亞胺酯（SMCC)、亞胺基硫雜環戊烷 (IT)、醯亞胺酯之雙官能衍生物（諸如己二醯亞胺酸二甲酯鹽酸鹽）、活性酯（諸如辛二酸二丁二醯亞胺酯）、醛（諸如戊二醛）、雙疊氮基化合物（諸如雙（對疊氮基苯曱醯基）己二胺）、雙重氮衍生物（諸如雙-(對重氮苯甲醯基）-乙二胺）、二異氰酸酯（諸如甲苯2,6-二異氰酸酯）及雙活性氟化合物（諸如1，5-二氟-2,4-二硝基苯）。舉例而言，蓖麻毒素免疫毒素可如Vitetta等人，Science 238:1098 (1987)中所述製備。碳14標記之1-異硫氰基苯曱基-3-甲基二伸乙基三胺五乙酸（MX-DTPA)為用於使放射性核苷酸與抗體結合之例示性螯合劑。參見WO 94/11026。連接子可為促成細胞毒性藥物在細胞十釋放之「可裂解連接子」。舉例而言，可使用酸不穩定性連接子、肽酶敏感性連接子、光不穩定性連接子、二曱基連接子或含二硫化物之連接子（Chari等人，Cancer Research 52:127-131 (1992)，美國專利第 151637.doc -122· 201121566 5,208,020^) ° 本發明之化合物明確涵蓋（但不限於）用以下交聯試劑製備的 ADC :市售（例如購自 Pierce Biotechnology，Inc.， Rockford, IL·，U.S.A)iBMPS、EMCS、GMBS、HBVS、LC-SMCC、MBS、MPBH、SBAP、SIA、SIAB、SMCC、SMPB、 SMPH ' sulfo-EMCS、sulfo-GMBS、sulfo-KMUS、sulfo-MBS、sulfo-SIAB、sulfo-SMCC及 sulfo-SMPB及 SVSB((4-乙稀基砜）苯曱酸丁二醯亞胺酯）。參見2003-2004 Applications Handbook and Catalog 第 467-498 頁。 v.製備抗體藥物結合物在本發明之抗體藥物結合物（ADC)中，抗體（Ab)經由連接子（L)與一或多個藥物部分（D)結合，例如每個抗體結合約1至約20個藥物部分。式I之ADC可藉由若干途徑，使用熟習此項技術者已知之有機化學反應、條件或試劑來製備，包括：（1)使抗體之親核基團與二價連接試劑反應，經由共價鍵形成Ab-L，隨後與藥物部分D反應；及（2)使藥物部分之親核基團與二價連接試劑反應，經由共價鍵形成D-L ’接著與抗體之親核基團反應。其他製備ADC之方法係描述於本文中。

Ab-(L-D)p I 連接子可由一或多種連接組分構成。例示性連接組分包括6-順丁烯二醯亞胺基己醯基（「MC」）、順丁烯二醯亞胺基丙醯基（「MP」）、纈胺酸-瓜胺酸（「vai-cit」）、丙胺酸-苯丙胺酸（「ala-phe」）、對胺基苯甲氧基羰基 151637.doc -123 - 201121566 (PAB」）、4-(2_ °比咬基硫基）戊酸N- 丁二醯亞胺酯 (「SPP」）、4·(Ν-順丁烯二醯亞胺基甲基）環己烷甲酸 N-丁二醯亞胺酯（「SMCC」）及（4_碘_乙醯基）胺基苯曱酸 N-丁二醯亞胺酯（r SIAB」）。其他連接組分在此項技術中已知且一些係描述於本文中。亦參見美國專利第 10/983,340 ^ Monomethylvaline Compounds Capable of

Conjugation to Ligands，」（2004年 11 月 5 日申請），其内容係以全文引用的方式併入本文中。在一些實施例中，連接子可包含胺基酸殘基。例示性胺基酸連接組分包括二肽、三肽、四肽或五肽。例示性二肽包括：纈胺酸-瓜胺酸（vc或vahcit)、丙胺酸_苯丙胺酸（af 或ala-phe)。例示性三肽包括：甘胺酸_纈胺酸_瓜胺酸（gly_ val-cit)及甘胺酸-甘胺酸-甘胺酸（gly_gly_gly)。構成胺基酸連接組分之胺基酸殘基包括天然存在之彼等胺基酸殘基以及次要胺基酸及非天然存在之胺基酸類似物（諸如瓜胺酸）。胺基酸連接組分可在其針對特定酶（例如腫瘤相關蛋白酶；組織蛋白酶B、C及D;或纖維蛋白溶酶蛋白酶）之酶促裂解的選擇性方面加以設計且最佳化。抗體上之親核基團包括（但不限於）：（i)N末端胺基；（π) 側鏈胺基’例如離胺酸；（iii)側鏈硫醇基，例如半胱胺酸；及（iv)糖羥基或胺基’其中抗體經糖基化。胺、硫醇及羥基具有親核性且能夠與包括以下之連接部分及連接試劑上之親電子基團反應形成共價鍵：⑴活性酯，諸如NHS 酯、HOBt酯、鹵甲酸酯及酸鹵化物；（ii)烧基鹵化物及苯 151637.doc •124· 201121566 甲基ii化物，諸如豳乙醯胺；（iiim、綱、緩基二醯亞胺基。某些抗體具有可還原之鏈間二硫鍵，亦即半胱胺酸橋。可藉由用諸如DTT(二硫蘇糖醇)之還原劑進行處理而使抗體具有與連接試劑結合之反應性。因此，各半 - 胱胺酸橋在理論上將形成兩個反應性硫醇親核體。可經由 • 使離胺酸與2-亞胺基硫雜環戊烷（陶特氏試劑（Traut,s reagent))反應，使胺轉化為硫醇而將其他親核基團引入抗體中。可藉由引入一個、兩個、三個、四個或四個以上半胱胺酸殘基（例如製備包含一或多個非天然半胱胺酸胺基酸殘基之突變型抗體）而將反應性硫醇基引入抗體中。本發明之抗體藥物結合物亦可藉由修飾抗體以引入可與連接S式劑或藥物上之親核取代基反應之親電子部分而產生。糖基化抗體之糖可以例如過蛾酸鹽氧化試劑氧化，形成可與連接試劑或藥物部分之胺基反應的醛或酮基。所得亞胺希夫鹼（Schiff base)基團可形成穩定鍵聯，或可經例如硼氫化物試劑還原形成穩定胺鍵。在一實施例中，糖基化抗體之碳水化合物部分與半乳糖氧化酶或偏過碘酸鈉反應可於蛋白質中產生可與藥物上之適合基團反應之羰基 (醛及酮）（Hermanson，Bioconjugate Techniques)。在另一實 • 施例中’含有N末端絲胺酸或蘇胺酸殘基之蛋白質可與偏過填酸納反應’產生酸而非第一胺基酸（Geo gh eg an及 Stroh，（1992) Bioconjugate Chem. 3:138-146;美國專利第 5,362,852號）。此醛可與藥物部分或連接親核試劑反應。同樣，藥物部分上能夠與連接部分及連接試劑上之親電 151637.doc • 125 - 201121566 子基團反應形成共價鍵之親核基團包括（但不限於）：胺、硫醇、經基、醯肼、肟、肼、硫代半卡巴腙、肼羧酸酯及芳基醢肼基團，該等連接部分及連接試劑包括：⑴活性酯，諸如NHS酯、HOBt酯、鹵甲酸酯及酸鹵化物；（ii)烷基i化物及苯甲基鹵化物’諸如鹵乙醯胺；（丨丨丨）醛酮、羧基及順丁烯二醯亞胺基團。或者，可例如藉由重組技術或肽合成製成包含抗體及細胞毒性劑之融合蛋白。DNA之長度可包含編碼結合物之兩個部分的各別區域，該等區域可彼此相鄰或由編碼不破壞結合物之所需特性之連接肽之區域分開。 ▲在另一實施例中，抗體可與「受體」（諸如抗生蛋白鍵菌素）結合以用於腫瘤預靶向，其中向個體投與抗體-受體結合物，隨後使用清除劑將未結合之結合物自循環系統中移除’且接著投與與細胞毒性劑（例如放射性核㈣）結合之「配位體」（例如抗生物素蛋白）。使用抗亥普辛抗體之方法本發明特徵在於使用以辛抗时為特定療法之_部分以便利用此治療劑活性提供有益作用。本發明尤其適用二治療各期之各類型癌症。術b癌症涵蓋多種增生性病〇仍V但个隈於)癌育生長、良性腫瘤及惡性腫瘤。良性腫瘤保持純於㈣位處且不具有浸潤、侵襲或轉移至遠端部位之能力。亞腫瘤會侵W損傷其周圍的其他組織。其亦可獲得_ 始部位且通常經由血流或經由淋巴系統(淋巴結位於其 15I637.doc •126· 201121566 擴散至身體其他部分（轉移）之能力。原發腫瘤根據其所來源之組織類型分類；轉移性腫瘤根據癌細胞所來源之組織類型分類。惡性腫瘤之細胞隨時間推移變得更加異常且表現得更不像正常細胞。癌細胞外觀方面之此變化係稱作腫瘤分級’且癌細胞係描述為良好分化（低級）、中度分化、不良分化或未分化（高級）。良好分化細胞表現相當正常且類似於產生其之正常細胞。未分化細胞為其已變得如此異常以致其不再可能確定細胞起源的細胞。癌症分期系統描述癌症在解剖學上已擴散之程度且試圖將具有類似預後及治療之患者歸為同期組。可進行若干測喊以幫助對癌症進行分期，包括活組織檢查及某些成像測 "式諸如胸部X射線、乳房X射線攝像（mammogram)、骨路知也CT掃描及MRI掃描。亦使用血液測試及臨床評估來。平估患者之總體健康狀況且债測癌症是否已擴散至某些器官。 μ — 為對癌症進行分期，美國癌症聯合委員會（American

Joint C〇mmittee 〇n Cancer)首先使用TNM分類系統以字母分類排列癌症，尤其實體腫瘤。癌症係表示為字母T(腫瘤尺寸）、N(可觸知淋巴結）及(轉移）。τι、η、丁3及丁4 把述遞增之原發性病灶尺寸；_、ni、N2 '叫旨示進行性發展之淋巴結受累；以及刚及Ml反映有或無遠位轉移存在》在亦稱為總體分期分組或羅馬數字分期之第c分期方法中將癌症分成〇至1V期，合併考慮原發性病灶尺寸以及 151637.doc •127- 201121566 淋巴結擴散及遠位轉移之存在^在此系統中，將病例分為由羅馬數子I至IV表示之四期或歸類為「復發型」。對於某些癌症，0期係稱為「原位」或「Tis」，諸如對於乳癌，稱為礼腺管原位癌或小葉原位癌。高級腺瘤亦可分類為0 期。一般而言，I期癌症為通常可治癒之小局部癌症，而 IV期通常表示不可施行手術之癌症或轉移性癌症。n期及 III期癌症通常局部發展及/或展現局部淋巴結受累。一般而δ，分期數字愈高則指示疾病愈嚴重包括腫瘤尺寸愈大及/或癌症擴散至附近淋巴結及/或鄰近原發腫瘤之器 Β。雖然明確定義此等分期，但各類癌症之定義不同且為熟習此項技術者所知。許夕癌症登記處’諸如美國國家癌症機構監管、流行病學與最終結果計畫（NCI's Surveillance，Epidemiology，and

End Results program，SEER)使用總結分期。此系統係用於所有類型之癌症。其將癌症病例分成五個主要類別：及位為早期癌症，其僅存在於其開始之細胞層中。湯部為侷限於其開始之器官，而無擴散跡象之癌症。厘域沒為已擴散超出初始（原發）部位到達附近淋巴結或器官及組織之癌症。 i# &為已自原發性部位擴散至遠位器官或遠位淋巴結之癌症。 4知係用於描述無足夠資訊來指示分期之病例。另外’癌症在原發腫瘤已移除之後數月或數年復發係常見的。在所有可見腫瘤已根除後復發之癌症係稱作復發型 15I637.doc -128· 201121566 疾病。在原發腫瘤區域内復發之疾病為局部復發，而以轉移形式復發之疾病係稱為遠位復發。腫瘤可為實體腫瘤或非實體腫瘤或軟組織腫瘤。軟組織腫瘤之實例包括白血病（例如慢性骨髓性白血病、急性骨髓性白血病、成人急性淋巴母細胞白血病、急性骨髓性白血病、成熟B細胞急性淋巴母細胞白血病、慢性淋巴細胞性白血病、幼淋巴細胞性白血病或毛細胞白血病）或淋巴瘤（例如非霍奇金氏淋巴瘤、皮膚丁細胞淋巴瘤或霍奇金氏病）。實體腫瘤包括任何除血液、骨髓或淋巴系統以外之身體組織的癌症。實體腫瘤可進一步分成上皮細胞起源之實體腫瘤及非上皮細胞起源之實體腫瘤。上皮細胞實體腫瘤之實例包括胃腸道、結腸、乳房、前列腺、肺、腎、肝、騰臟' _巢、頭頸部、口腔、胃、十二指腸、小腸、大腸、肛門、膽囊、唇、鼻咽、皮膚、子宮、雄性生殖态、泌尿器、膀胱及皮膚之腫瘤。非上皮起源之實體腫瘤包括肉瘤、腦腫瘤及骨腫瘤。腫瘤之其他實例係描述於定義部分中。 ' 在些實施例中，例如在治療之前及/或治療期間及/或 …療之後對本文之患者進行診斷性測試。一般而言，若進 Μ斷性測試’則可自需要治療之患者獲得樣品。若個體心有癌症，則樣品可為腫瘤樣品或其他生物樣品，諸如生物流體，/ Μ I括（仁不限於）企液、尿、唾液、腹水或諸如血 ’月及血漿之衍生物，及其類似物。本文之生物樣品可為經固定之樣品’例如經福馬林 151637.doc •129· 201121566 (formalin)固定、經石蠟包埋（FFPE)之樣品，或冷凍樣品。各種用於測定mRNA或蛋白質表現之方法包括（但不限於）基因表現分析、包括定量即時PCR(qRT-PCR)之聚合酶鏈反應（PCR)、微陣列分析、基因表現連續分析（SAGE)、 MassARRAY、藉由大規模平行信號測序（MPSS)進行之基因表現分析、蛋白質組研究、免疫組織化學（IHC)等。較佳定量mRNA。較佳使用聚合酶鏈反應（PCR)技術或藉由微陣列分析進行此mRNA分析。若使用PCR，則較佳PCR 形式為定量即時PCR(qRT-PCR)。在一實施例中，若一或多種上述基因之表現處於中值或中值以上（例如與同類腫瘤之其他樣品相比），則認為其為陽性表現。中值表現量可基本上在量測基因表現的同時測定，或可預先測定。使用經固定、經石蠟包埋之組織作為RNA來源分析基因表現之代表性方案之步驟（包括mRNA分離、純化、引子延長及擴增）係提供於各種已出版之期刊文章中（例如Godfrey 等人，*/. Mo/ec. Dz’izgwos"·。·? 2: 84-91 (2000) ; Specht 等人，>/. Ραί/ζοΛ 158: 419-29 (2001))。簡言之，代表性方法開始為切割約10微克厚之經石蠟包埋之腫瘤組織樣品的切片。接著提取RNA且移除蛋白質及DNA。必要時可在分析RNA濃度之後包括RNA修復及/或擴增步驟，且使用基因特異性啟動子來逆轉錄RNA，隨後進行PCR。最後，依據在所檢查之腫瘤樣品中所鑑別的特徵基因表現模式分析資料，鑑別可用於患者之最佳治療選項。可直接或間接確定對基因或蛋白質表現之偵測。 151637.doc -130- 201121566 可（直接或間接）測定癌症中亥普辛之表現或擴增。各種診斷/預後檢測法皆可用於此目的。在一實施例中，可藉由IHC分析亥普辛過度表現。可對來自腫瘤活組織檢查之經石蠟包埋之組織切片進行IHC檢測法，且符合如下之亥普辛蛋白染色強度準則：得分0 :未觀測到染色或在少於10%之腫瘤細胞中觀測到膜染色。付分1+ :在超過10%之腫瘤細胞中偵測到模糊/勉強可感知之膜染色。該等細胞之僅部分細胞膜經染色。得分2+ :在超過1 〇〇/〇之腫瘤細胞中觀測到弱至中度完全膜染色。得分3+ :在超過1 〇〇/〇之腫瘤細胞中觀測到中度至強完全膜染色。在一些實施例中，亥普辛過度表現評分為〇或1 +之彼等腫瘤可表徵為不過度表現亥普辛’而得分為2 +或3 +之彼等腫瘤可表徵為過度表現亥普辛。或者或另外，可對經福馬林固定、經石蠟包埋之腫瘤組織進行FISH檢測法以確定腫瘤中亥普辛擴增或易位之存在及/或程度（若存在）。可直接（例如藉由磷酸化E L丨s A測試或其他偵測磷酸化受體之方式）或間接（例如藉由偵測活化之下游信號傳導路徑、’且刀、偵測受體二聚體（例如均二聚體、雜二聚體”偵測基因表現概況及其類似者）測定亥普辛活化。用於積測核酸突變之方法在此項技術中為熟知的。通常 15I637.doc -131 - 201121566 (但不一定）擴增樣品中之標靶核酸以提供所需量之物質以確定是否存在突變。擴增技術在此項技術中為熟知的。舉例而言，擴增產物可能涵蓋或可能不涵蓋編碼相關蛋白5 之所有核酸序列，只要經擴增產物包含疑似具有突變之特疋胺基酸/核酸序列位置即可。可藉由此項技術中熟知且適於腫瘤之特定類型及位置之方法獲得包含標乾核酸之樣品。活組織檢查常用於獲得— 片代表性腫瘤組織。戌去，可丨、7 ρ Δ斗、i 飞次香可以已知或涊為含有相關腫瘤細胞之組織/流體形式間接獲得腫瘤細胞。舉例而言，可藉由切除、支氣管鏡檢查、細針抽吸、支氣管刷檢或自痰液、胸膜液或血液獲得肺癌病灶之樣品。可自腫瘤或諸2 尿、痰液或血清之其他身體樣品偵測突變基因或基因產物。可將上述用於偵測腫瘤樣品中之突變標靶基因或基因產物之相同技術應用於其他身體樣品。癌細胞自腫瘤：落且出現於此等身體樣品中。藉由篩檢此等身體樣品，可達成對諸如癌症之疾病的簡單早期診斷。另外，藉由測試此等身體樣品之突變標乾基因或基因產物可更輕易地監測治療之進展。增濃組織製劑中之腫瘤細胞之方式在此項技術中為已知的。舉例而言，可自石峨或冷;東切片分離組織。亦可藉由流動式細胞測量術或雷射捕捉顯微解剖來分離癌細胞與正常細胞。此等技術以及其他分離腫瘤與正常細胞之技術在此項技術中為熟知的。若腫瘤組織受到正常細胞高度污染’則可能較難於偵測突變’但已知使污染及/或假陽性/ 151637.doc -132- 201121566 陰性結果降至最低之技術，其中一些係描述於下文中。舉例而言，亦可評估樣品中生物標記（包括突變）之存在，該標記已知與相關腫瘤細胞有關，而與相應正常細胞無關，或反之亦然。在一些情況下，癌症過度表現或不過度表現亥普辛。可在#斷性或預後性檢測法中，藉由評估細胞上存在之亥普辛含量增加（例如經由免疫組織化學檢測法IHC)來測定受體過度表現。或者或另外，可例如經由螢光原位雜交 (FISH ;參見1998年1〇月公開之w〇 98/45479)、南方墨點法或聚合酶鏈反應（PCR)技術（諸如即時定量pCR(RT_pcR)) 來量測細胞中編碼亥普辛之核酸含量。除上述檢測法以外，熱習此項技術者亦可利用各種活體内檢測法。舉例而 S，可使患者體内之細胞暴露於視情況經可偵測標記（例放射f生同位素）標記之抗體，且可例如藉由外部掃描放射月b或藉由分析獲自先前暴露於該抗體之患者的活組織檢查來評估患者體内抗體與細胞之結合。化學治療劑本發明之組合療法可進一步包含一或多種化學治療劑。組合投藥包括使用各別調配物或單一醫藥調配物進行共投藥或同時投藥’以及以任一次序連續投藥，其中較佳有— &時間兩種（或所有）活性劑同時發揮其生物活性。化學治療劑（若投與）通常以其已知劑量投與，或其劑量由於藥物之組合作用或可歸因於投與抗代謝物化學治療劑之不利副作用而視情況有所降低。可根據製造商之說明蚩曰 15I637.doc •133- 201121566 治療劑之或如熟習&項技術者憑經驗確定來使用此等化學製劑及給藥時程。干可組合之各種化學治療劑係揭示於本文中。調配物、劑量及投藥本發明所用之治療劑將以符合優良醫藥實務之方式調配、給予及投與。在此上下文中老卜又τ所考慮之因素包括所治瘰之特定病症、所治療之特定個體、個別患者之臨床病狀、病症之誘因、藥劑傳遞部位、投藥方法、投藥時程、欲组合之藥劑的藥物-藥物相互作用，及從醫者已知之其他因素。使用此項技術中已知之標準方法，藉由將具有所需純度之活性成分與視情況選用之生理學上可接受之載劑、賦：劑或穩定劑混合來製備治療調配物（Reming_,s

Pharmaceutical Sciences (第 2〇版），A 仏抓咖編，2咖， Lippincott，Winiams & Wilkins，philadelphia，pA)。可接受之載劑包括生理食鹽水或緩衝劑，諸如磷酸鹽、檸檬酸鹽及其他有機酸；抗氧化劑，包括抗壞血酸；低分子量（小於約10個殘基）多肽；蛋白質，諸如血清白蛋白、明膠或免疫球蛋白，親水性聚合物，諸如聚乙晞。比嘻啶酮；胺基酸，諸如甘胺酸、麩醯胺酸、天冬醯胺、精胺酸或離胺酸；單醣、二醣及其他碳水化合物，包括葡萄糖、甘露糖或糊精；螯合劑，諸如EDTA ;糖醇，諸如甘露糖醇或山梨糖醇；成鹽相對離子，諸如鈉；及/或非離子型界面活性劑’諸如TWEENTM、pluR0NICStm4PEG。 151637.doc •134· 201121566 調配物視情況但較佳含有醫藥學上可接受之鹽，較佳為氣化納較佳約生理濃度。本發明之調配物視情況可含有醫藥學上可接受之防腐劑。在一些實施例中，防腐劑濃度 ϋ1°/@2·0%(ϋ常為v/v)之範圍内。適合之防腐劑包括醫藥技術中已知之防腐劑。笨甲醇、苯酚、間曱酚、對羥基苯曱酸甲S旨及對經基笨甲g《丙s|為較佳防腐劑。本發明之凋配物視情況可包括濃度為〇〇〇5。/。至〇〇2%之醫藥學上可接受之界面活性劑。視所治療之特定適應症之需要，本文之調配物亦可含有一種以上活性化合物，較佳為具有互補活性，且彼此無不利影響之彼等活性化合物。此等分子宜以有效達成預期目的之量組合存在。亦可將活性成分截留於例如藉由凝聚技術或藉由界面聚合製備之微膠囊（分別為例如羥基甲基纖維素或明膠微膠囊及聚-(甲基丙烯酸甲酯）微膠囊）中，截留於膠狀藥物傳遞系統（例如脂質體、白蛋白微球體、微乳液、奈米粒子及奈米膠囊）中，或截留於巨乳液中。此等技術係揭示於

Remington’s Pharmaceutical Sciences(同上）中。可製備持續釋放製劑。持續釋放製劑之適合實例包括含有抗體之固體疏水性聚合物之半透性基質，該等基質呈成形物品之形式，例如薄膜或微膠囊。持續釋放基質之實例包括聚酯、水減膠（例如聚（甲基丙稀酸2 _經基乙醋）或聚 (乙烯醇））、聚乳酸交酯（美國專利第3,773,919號）、L_麵胺酸與γ乙基-L-麩胺酸之共聚物、不可降解之乙烯·乙酸乙稀 15I637.doc -135- 201121566 酯、可降解之乳酸-乙醇酸共聚物（諸如LUpR〇N DEPOTS，由㈣·乙醇酸共聚物與乙酸亮丙瑞林構成之可注射微球體）及聚_D_㈠_3_羥基丁酸。雖然諸如乙烯-乙酸乙烯S旨及乳酸·乙醇酸之聚合物使分子能夠釋放超過⑽ 天，但某些水凝膠釋放蛋白質的時段較短。當囊封之抗體長時間保留於體㈣，其可能由於在m暴露於水分而變性或聚集’從而導致生物活性損失及可能之免疫原性變化。視所涉及之機制而定，可設計合理策略以達成穩定化。舉例而言，若發現聚集機制為經由硫基·二硫化物互換形成分子間S-S鍵，則可藉由修飾氫硫基殘基、由酸性溶液;東乾、控制水分含量、使用適合添加劑及開發特定聚合物基質組合物來達成穩定化。本發明之治療劑根據已知方法向人類患者投與，諸如以快速給藥形式或藉由在一段時間内連續輸液而靜脈内投與，藉由肌肉内、腹膜内、腦脊髓内、皮下、關節内、滑膜内、鞘内、經口、局部或吸入途徑。治療應用中亦可使用離體策略。離體策略涉及以編碼亥普辛拮抗劑之聚核苷酸轉染或轉導自個體獲得之細胞。接著，使經轉染或轉導之細胞返回至個體體内。該等細胞可為多種類型中之任一種，包括（但不限於）造血細胞（例如骨髓細胞、巨噬細胞、單核細胞、樹突狀細胞、T細胞或B細胞）' 纖維母細胞、上皮細胞、内皮細胞、角質細胞或肌細胞。舉例而言’若亥普辛结抗劑為抗體’則該抗體藉由包括非經腸、皮下、腹膜内、肺内及鼻内之任何適合方式投 151637.doc •136- 201121566 與，且若需要局部免疫抑制治療，則藉由病灶内投藥來投與。非㈣輸注包括肌肉内、靜脈内、動脈内、腹膜内或皮下投藥…卜抗體宜藉由脈衝輸注、尤其以遞減之抗體劑量投與。給藥較佳藉由注射進行，最佳靜脈内或皮下注射，部分視投藥為短期投藥或長期投藥而定。在另—貫例中，當病症或腫瘤位置允許時，亥普辛拮抗劑化合物可局部投與，例如藉由直接注射局部投與且可疋期重複/主射。亥普辛拮抗劑亦可向個體全身性傳遞或直接向腫瘤細胞傳遞，例如傳遞至腫瘤或在手術切除腫瘤之後傳遞至腫瘤床，以避免或降低局部復發或轉移。治療劑之組合投與通常在限定時段内（通常為數分鐘、數小時、數天或數週，視所選擇之組合而定）進行。組合療法意欲包含依序投與此等治療劑（亦即，其中各治療劑在不同時間投與）以及實質上同時投與此等治療劑或至少兩種治療劑。治療劑可由相同途徑或由不同途徑投與。舉例而言，組合中之抗亥普辛抗體可藉由靜脈内注射投與，而組合中之化學治療劑可經口投與。或者，例如，視特定治療劑而定’可經口投與兩種治療劑或可藉由靜脈内注射投與兩種治療劑。投與治療劑之次序亦視特定藥劑而有所不同。視疾病類型及嚴重度而定，無論例如藉由一或多次各別才又與或藉由連續輸注，約1 pg/kg至100 mg/kg之各治療劑皆為向患者投藥之初始候選劑量。視上述因素而定，典型曰劑量可能在約1 pg/kg至約1〇〇 mg/kg或1〇〇 mg/kg以上之 151637.doc -137- 201121566 \ 冑於在數天或更長時段中重複投藥而言，視病狀夺續療，直至如上述方法所量測癌症得以治療。二而’其他給藥方案可適用。 -函蓋藉由基因療法投與亥普辛抗體。關於使用基因療法產生細胞内抗體，參見例如⑼⑷心日公開之㈣ 96/07321 。製品在本發明之另—態樣中，提供—種含有適用n療、預防及/或診斷上述病症之物質的製品。該製品包含容器及在該容器上或與該容器相聯之標籤或藥品說明書。適合容器包括例如瓶子、小瓶、注射器等。纟器可由諸如玻璃或塑膠之多種材料形成。容器容納單獨組合物或與有效治療、預防及/或診斷病狀之其他組合物組合之組合物，且可具有無菌接取口（例如容器可為靜脈内溶液袋或具有可由皮下注射針刺穿之塞子的小瓶）。組合物中之至少一種活性劑為本發明之抗體。標籤或藥品說明書指示該組合物用於治療諸如癌症之所選病狀。此外，製品可包含（a)内含組合物之第一容器，其中該組合物包含本發明之抗體；及 (b)内含組合物之第一容器，其中該組合物包含另一種細胞毒性劑。本發明之此實施例中之製品可進一步包含指示第一及第二抗體組合物可用於治療特定病狀（例如癌症）之藥品說明書。或者或另外，該製品可進一步包含第二（或第二）容器，其包含醫藥學上可接受之緩衝液，諸如抑菌性注射用水（BWFI)、磷酸鹽緩衝生理食鹽水、林格氏溶液 151637.doc •138- 201121566 (Ringer's solution)及右旋糖溶液。其可進一步包括就商業及使用者觀點而言所需之其他物質，包括其他緩衝液、稀釋劑、過濾器、針及注射器。以下為本發明之方法及組合物之實例。應暸解，鑒於上文提供之一般性說明，可實施各種其他實施例。實例物質及方法試劑及蛋白質：合成性對硝基苯胺受質S2765 (=DiaPharma FXa受質）、S2266、S2288、S2366、S2444係購自 DiaPharma(Westchester, OH)，Chromozym TH係購自 Roche Diagnostics(Indianapolis, IN)，Spectrozyme fIXa® (#299)及 Spectrozyme® FVIIa係購自 American Diagnostica (Greenwich, CT)。3,4-二氯-異香豆素、BSA及 Tween-20係購自 Sigma-Aldrich。纖維蛋白溶酶及因子XIa係購自Haematologic Technologies Inc. (Essex Junction, VT)，血聚激肽釋放酶係購自Calbiochem(La Jolla，CA)，因子VII及因子Xlla係購自 Enzyme Research(South Bend, IN)，尿激酶型血纖維蛋白溶酶原活化劑（uPA)係購自American Diagnostica，pro-uPA係購自 Fitzgerald Industries Int.(Concord，ΜΑ)。大鼠層黏連蛋白係講自Millipore(Temecula, CA)。使亥普辛（人類）、間質蛋白酶（matriptase)、馬拉蛋白酶（marapsin)-、肝細胞生長因子活化劑（HGFA)、肝細胞生長因子前體（pro-HGF)、自HGFA抑制劑- l(HAI-l)衍生之Kunitz域抑制劑- 151637.doc -139- 201121566 1(KD1)及HAI-2重組表現且如先前所述純化（Kirchhofer等人，2003 ; Kirchhofer等人，2005 ; Li等人，2009 ; Moran 等人’ 2006 ; Peek等人，2002 ; Shia等人，2005)。使用由抗體噬菌體呈現所產生之抗HGFA Fab或IgG(Fab40、 Fab58、Fab75、IgG75)作為對照抗體（Ganesan 等人， 2009 ; Wu等人，2007)。 M13-K07 輔助噬菌體係購自 New England Biolabs。 Maxisorp 免疫板係購自 Nalgen NUNC International (Naperville，IL)。Dynabeads® MyOne抗生蛋白鏈菌素係購自 Invitrogen(Carlsbad，CA)。3,3'，5,5'-四甲基-聯苯胺 /H2〇2(TMB)過氧化酶受質係購自 Kirkegaard and Perry Laboratories, Inc。中性鏈親和素及抗生蛋白鏈菌素係購自 Pierce Biotechnology， Inc 。選殖、表現及純化前列腺蛋白酶（Pros tasi η):使用桿狀病毒表現系統與粉紋夜蛾（T. ni)細胞表現含有C末端Flag標籤之人類前列腺蛋白酶（Ala33-Leu321)之細胞外域。培育72 小時之後，收集上清液且將清澈培養基裝載於抗Flag M2 抗體壤脂糖管柱（Sigma)上。所結合之蛋白質用1〇〇 mM甘胺酸（pH 3·0)溶離且立即用1 μ Tris(pH 8_0)中和。所得呈酶原形式之前列腺蛋白酶在室溫下用重組間質蛋白酶活化 16小時。此後，藉由Ni-NTA管柱移除標記（His)8(「His8」揭示為SEQ ID NO:59)之間質蛋白酶來純化活化之二鏈前列腺蛋白酶。使用S-200管柱藉由尺寸排阻層析（size_ exclusion chromatography)進一步純化前列腺蛋白酶。 151637.doc -140- 201121566 選殖、表現及純化小鼠亥普辛：在與人類亥普辛相似之條件下使用桿狀病毒表現系統與粉紋夜蛾細胞表現含有c 末端His標籤之小鼠亥普辛（Ser45-Pro416)之細胞外域（Moran 等人，2006)。培育72小時之後，收集上清液且將清澈培養基裝載於Ni-NTA管柱（Qiagen)上，該Ni-NTA管柱已用含有 50 mM Tris-HCl(pH 8.0)、300 mM NaCl之緩衝液預先平衡。所結合之蛋白質用含有50 mM Tris-HCl(pH 8.0)、300 mM NaCl及250 β坐之緩衝液溶離。選殖、表現及純化重組MSP及KD1 :如（Wahl等人， 1997)所述，於中國倉鼠卵巢細胞中表現重組MSP。如 (Shia等人，2005)所述，表現及純化KD1。建構用於呈現Fab噬菌體之庫：如先前所述使用用於呈現Fab噬菌體之噬菌體質體（pF 1359)建構命名為YSGxi之庫（(Fellouse等人，2007)中之Lib D)。庫之多樣性為約 2χ 1010。呈現抗亥普辛Fab之噬菌體之選擇及鑑別特徵：噬菌體呈現實驗係使用生物素標記亥普辛（=生物素_亥普辛）及生物素標記亥普辛與3,4_二氣_異香豆素（dci)之複合物卜生物素-亥普辛：DCI)。藉由使用Sulf〇_NHS_LC•生物素套組 (Pierce，產品目錄號2Π27)根據製造商之說明書對亥普辛進行生物素標記。生物素標記亥普辛中有些藉由與1〇〇 _ ⑽培育且藉由在後續淘選實驗期間維持此⑽濃度，而用於形成生物H普辛：DCI複合物4前❹Da之實驗展示，在使用受質之酶檢測法中，亥普辛暴露於25· 151637.doc • 141 - 201121566 50 μΜ DCI 40分鐘時，會完全抑制亥普辛活性。對於第一輪淘選’分別在無或有100 μΜ DCI存在下，在4°C下，將 1〇 με生物素-亥普辛或生物素_亥普辛：1)(：：1與1><1013 pfu/ml 濃度之1 ml YSGX庫一起培育1.5小時。用100 μΐ Dynabeads® My〇ne抗生蛋白鏈菌素捕捉結合至標靶之噬菌體15分鐘。用〇.1 μ HC1溶離所結合之噬菌體，立即中和且接著依循標準方案擴增（Sidhu等人，2000)。第二輪之後’分別在無或有1〇〇 μΜ DCI之情況下，在4〇C下將2 生物素-亥普辛或生物素-亥普辛：0(：1與4〇〇 μ1擴增之噬菌體一起培育1.5小時❶結合至生物素-亥普辛或生物素-亥普辛.DCI之嗤菌體用塗有中性鏈親和素（NeutrAvidin)或抗生蛋白鏈菌素之Maxisorp免疫分析板（NUNC)捕捉15分鐘（或者在各輪之間）且用阻斷緩衝液（PBS，0.5% (w/v)BSA)阻斷。5輪選擇之後，自96孔格式中生長之個別純系產生噬菌體’且用 PBS、〇.5%(w/v)BSA、0.1% (Wv)Tween 20 (PBT緩衝液）稀釋培養液上清液三倍。所稀釋之噬菌體上清液與固定於塗佈中性鏈親和素之“々孔河狀丨⑽叩免疫分析板（NUNC)上之生物素-亥普辛或生物素_亥普辛：DCI 一起培育1小時。用PBS、0.05% (Wv)Tween 20(PT緩衝液）洗滌 «亥專板6次且與辣根過氧化酶/抗μ 13抗體結合物（於ρβτ緩衝液中稀釋l:5000)(Pharmacia) —起培育30分鐘。該等分析板用PT緩衝液洗滌6次且用PBS洗滌2次，用3,3，，5,5，-四甲基-聯苯胺/H2〇2過氧化酶受質（Kirkegaard & perry Lab〇ratories)顯色15分鐘，用丨〇 M h3P〇4淬滅且以分光光 151637.doc -142· 201121566 度量測術量測450 nm下之吸光度。使用單點噬菌體競爭ELISA鑑別噬菌體所呈現之Fab，該等F ab所結合的亥普辛抗原決定基與kd 1所結合之亥普辛抗原決定基相同。使個別純系於96孔格式中生長且用有或無200 nM KD1之PBT緩衝液稀釋培養液上清液五倍，且與固火於塗佈中性鍵親和素之384孔Maxi sorp免疫分析板 (NUNC)上之生物素-亥普辛一起培育〗小時。洗滌分析板且如上所述’由抗Μ1 3 -HRP偵測所結合之喧菌體。對各純系計算200 nM KD1不存在下相對於2〇〇 nM KD1存在下之 Ac。比率。比率大於2之任何純系視為無向與kd 1類似之抗原決定基。使用KD 1對該等純系進行詳細噬菌體競爭 ELISA ’其中使用一系列濃度之KD 1 (自1 〇 μΜ開始，1:3連續稀釋）與噬菌體所呈現之Fab競爭結合至亥普辛。抗亥普辛Fab25及IgG25表現及純化：一般而言，在整篇本案中，IgG形式之抗體25以字首Ab表示且Fab形式之抗體25以字首Fab表示。將終止密碼子引入編碼Fab25之噬菌體質體上之重鏈與基因3之間。使所得嗟菌體質體轉型至大腸桿菌株34B8中。單個菌落在37。(：下在30 ml補充有50 pg/ml羧苄青黴素（Carbenicilin)之LB培養基中生長隔夜。將5 ml培養物接種至500 ml補充有羧苄青黴素（5〇 gg/ml)之元全C.R.A.P.培養基（如下達成1公升：3.57 g (NH4)2S〇4、〇·71 g檸檬酸鈉-2H20、1.07 g KCM、5.36 g酵母萃取物、 5.3 6 g Hycase SF。添加至多872 ml去離子水。用KOH調整 pH至7.3。高壓釜。冷卻至55〇C且添加11〇 mi 1 Μ 151637.doc -143- 201121566 MOPS(pH 7.3)、11 ml 50%葡萄糖及 7 ml 1 M MgS04)中且在30°C下生長24小時。使用蛋白質A瓊脂糖樹脂純化Fab25 蛋白質。將所選Fab之輕鏈及重鏈可變域選殖至具有人類輕鏈或重鏈（人類IgGl)恆定域的基於pRK5之質體中，以於中國倉鼠卵巢（CHO)細胞中短暫表現。藉由使用蛋白質A瓊脂糖層析來純化IgG25蛋白質。使用合成性受質之酶檢測法：在室溫下，Fab25、 IgG25、對照Fab或對照IgG40在Hepes緩衝液（20 mM Hepes(pH 7.5) ' 150 mM NaCl ' 5 mM CaCl2 ' 0.01% Triton X-100)中與亥普辛（人類亥普辛為1 nM且小鼠亥普辛為2 nM) —起培育40分鐘。對於使用3,4-二氯-異香豆素（DCI)進行之實驗，亥普辛（1 nM)在含有0.5% DMSO之Hepes緩衝液中與DCI—起培育40分鐘。添加S2765(最終濃度為0.2 mM)且經動力學微定量板式讀取器（Versamax，Molecular Devices，Sunnyvale, CA)量測405 nm下吸光度之線性增加速率。數據以分率酶活性（Vj/V。）表示且擬合至四參數回歸曲線擬合程式（Kaleidagraph 3.6版 ’ Synergy Software)以測定IC5〇值。數值為三個獨立實驗之平均值士SD。藉由將數據擬合至緊密結合抑制系統之方程來計算Fab25及IgG25之 ^iapp值（Morrison，1969 ; Olivero等人，2005)。為研究Fab25特異性，將一組9種胰蛋白酶樣絲胺酸蛋白酶在Hepes緩衝液中與1 μΜ Fab25—起培育40分鐘。添加適當發色受質且經動力學微定量板式讀取器量測405 nm下 151637.doc -144- 201121566 吸光度之線性增加速率。所用各酶及發色受質之濃度如下：1 nM亥普辛-0.5 mM S2765、0.5 nM間質蛋白酶-0.5 mM S2765、5 nM前列腺蛋白酶-0.5 mM S2765、2 nM纖維蛋白溶酶-0.5 mM S2366、2 nM血漿激肽釋放酶-0.5 mM S2366 ' 0.5 nM 因子 XIa-0.5 mM S2366、5 nM FXIIa-0.5 mM S2288、5 nM uPA-0.5 mM S2444、50 nM馬拉蛋白酶-0.2 mM Spectrozyme® FVIIa、10 nM HGFA-0.2 mM Spectrozyme® FVIIa。數據以分率酶活性（Vj/V。）表示且為3 個獨立實驗之平均值±SD。使用一組市售pNA受質（皆具有PI Arg殘基）研究Fab25對亥普辛之抑制作用。8種受質為S2765、S2266、S2288、 S2366、S2444、Chromozym TH、Spectrozyme fIXa 及 Spectrozyme FVIIa。如上所述進行檢測，例外為將Fab25 及對照Fab之濃度固定為100 nM。受質之濃度為0.5 mM。數據以未抑制活性（非Fab)的抑制百分數表示且為4個獨立實驗之平均值±SD。使用大分子受質之酶檢測法：為量測亥普辛介導之pro-uPA活化，用 HBSA緩衝液（20 mM Hepes(pH 7.5)、150 nM NaCl、5 mM CaCh、0.5 mg/ml BSA)連續稀釋 Fab25 且在室溫下與亥普辛一起培育35分鐘。藉由添加pro-uPA起始酶促反應。反應混合物中亥普辛及pro-uPA之濃度分別為 0.5 nM及100 nM。相隔45秒，將50 μΐ等分試樣轉移至每孔含有150 μΐ中止試劑HAI-2(667 nM)之96孔板中。添加 S2444(0.5 mM)之後，經動力學微定量板式讀取器量測405 151637.doc -145- 201121566 nm下吸光度之線性增加速率。數據以分率酶活性（Vi/v。）表示且擬&至四參數回歸曲線擬合程式（Kaieidagraph)以測定 IC5〇值。對於因子VII活化檢測法，亥普辛在Hepes緩衝液中與 Fab25或對照Fab—起培育5分鐘’之後添加因子νπ ^反應混合物中之濃度為：50 nM亥普辛、500 nM Fab及8 μΜ因子VII。在37°C下培育0.5小時及2小時之後，獲取等分試樣且在還原條件下藉由SDS-PAGE(4-20%梯度凝膠， InVitrogen)分析。凝膠用 simpiyBlueTM(InVitrogen)染色。亥普辛對Fab25之活體外蛋白水解處理：在室溫下，

Fab25(3 μΜ)在低 pH 值緩衝液（1〇〇 mM Mes(pH 6.0)、150 mM NaCl)中或在高 pH 值緩衝液（5〇 mM Tris-HCl(pH 8.0)、 150 mM NaCl)中與l〇 nM亥普辛一起培育24小時。藉由添加20 μί 2Χ樣品緩衝液（有/無|3_巯基乙醇）中止反應且在 95 C下煮彿5分鐘。藉由考馬斯亮藍（c〇〇massie brilliant blue)染色之4%至20% (w/v)聚丙烯醯胺梯度凝膠上之凝膠遷移率變動監測蛋白水解。細胞遷移檢測法：如先前所述（Tripathi等人，2008)使用 24孔8.0 μιη孔徑FluoroBlok™通透性支樓物（BD Biosciences，Bedford，MA)進行細胞遷移檢測法。過濾、器内側塗有未處理或經處理之大鼠層黏連蛋白（1 pg/ml)。在 4°C下使層黏連蛋白與亥普辛或亥普辛-Fab25複合物或填酸鹽緩衝生理食鹽水溶液（PBS)共同培育隔夜。接著用超阻斷緩衝液阻斷插入系統1小時。使DU145人類前列腺癌 151637.doc • 146 - 201121566 細胞受胰蛋白酶作用，再懸浮於無血清之培養基中，用無血清之培養基洗滌兩次，且將細胞（20,000個）接種於插入系統之上腔室中。在5% c〇2中及37〇c下培育5小時之後，使用棉棒輕輕刮去保留於上部過濾器上之細胞且用PBS輕輕洗滌插入系統。遷移至下腔室之彼等細胞用甲醇固定30 刀鐘’空乳乾燥20分鐘且用500 μΐ 1〇 μΜ Y〇-PR〇_ I(Invitrogen，Carlsbad，CA)染色 10分鐘。用 pbs洗滌板且由板讀取器（Spectramax M5，Molecular Devices, Sunnyvale, CA)使用485 nm之激發波長及555 nm之發射波長量測螢光。隨後’該板用連至CCD相機之具有1 〇倍物鏡之倒裝顯微鏡（1X81，Olympus)成像。結合至亥普辛之Fab25 :裝備有抗生蛋白鏈菌素SBc生物感測益it而頭之Octet-RED系統係賭自ForteBio(Menlo Park, CA)。在實驗開始之前，感測器端頭在25〇c下在含有 50 mM Hepes(pH 7.5)、150 mM NaCl及 0.05% tween-20之緩衝液中預濕潤1 5分鐘。在1 〇〇〇 rpm之授拌下，生物素標記亥普辛（7.5 pg/ml)捕捉至抗生蛋白鏈菌素感測器上歷時5 分鐘。該等感測器於緩衝液中短暫洗蘇，隨後將其浸於含有Fab25(自200 nM開始2倍連續稀釋）及緩衝液對照物之樣品孔中。監測結合10分鐘且隨後監測解離30分鐘。使用 Octet-RED分析軟體將數據擬合至1:1結合模型。

LnCap細胞之細胞表面所表現之亥普辛活化Pro-MSP : 如（Moran等人，2006)所述產生可穩定地過度表現亥普辛的LnCaP-34細胞，使增強之亥普辛細胞表面表現為LnCaP- 151637.doc -147· 201121566 1 7細胞的5倍及增強之亥普辛酶活性為LnCaP-1 7細胞的3 倍，與親本LnCaP細胞類似，LnCaP-1 7細胞僅在相對低的程度下表現内源性亥普辛。24孔板中所培養之匯合LnCaP-17及LnCap-34細胞用無血清RPMI-1640培養基洗滌，且在 37°C下單獨或與不同抗亥普辛抑制劑（1 μΜ抗亥普辛抗體 Fab25/1 μΜ KD1/1 μΜ Ac-KQLR-cmk(「KQLR」揭示為 SEQ ID NO:12))—起於無血清RPMI-1640培養基中培育15 分鐘，之後添加125I標記之pro-MSP(25 pg /ml)。在37°C下培育3小時之後，移除等分試樣且藉由SDS-PAGE(4%-20°/〇梯度凝膠）（Invitrogen，Carlsbad, CA)分析，隨後暴露於X 光膠片。

LnCap細胞之細胞表面所表現亥普辛之細胞活化Pro- HGF : 24孔板中所培養之匯合LnCap-34細胞用無血清 RPMI-1640培養基洗滌，且在37°C下單獨或與重組亥普辛 (10 nM)—起或與不同濃度之Fab25(20 ηΜ-0·15 nM)—起於無血清RPMI-1640培養基中培育15分鐘，之後添加1251標記之pro-HGF(25 pg/ml)。在37°C下培育3小時之後，移除等分試樣且藉由 SDS-PAGE(4°/〇-20°/〇梯度凝膠）(Invitrogen， Carlsbad, CA)分析，隨後暴露於X光膠片。藉由表面電漿共振測定Ab25與亥普辛之結合：經 BIAcore™-3000 儀（GE Health Care，NJ)進行表面電漿共振量測以測定Ab25之結合親和力。使兔抗人類IgG化學固定 (胺偶合）於CM5生物感測器晶片上且捕捉Ab25以得到約 350個反應單位（RU)。對於動力學量測而言，在25°C下以 151637.doc -148- 201121566 30 μΐ/min之流速注射活性亥普辛於HBS-Ρ緩衝液中之兩伴連續稀釋液（1 nM至500 nM)。使用簡單的一對—朗谬爾結合模型（Langmui!· binding m〇del)(BIA-EValuati〇n)獲得結合速率（h)及解離速率（Ard)，且計算平衡解離常數 (尺D)(A：d/A:a)。由於快速動力學，使用穩態測量測定亥普辛前體與Ab25之親和力。將亥普辛前體之兩倍連續稀釋液 (195 nM至100 mM)注射於捕捉有抗體（Ab25)之感測器晶片上以達成最大結合（Rmax)且達到穩態平衡。計算Rq之值且使用BIA-Evaluation、針對C(亥普辛前體之濃度）個別缯·圖以測定尺D。等溫滴定熱量測定：經ITC2〇〇儀（GE healthcare)進行TC 實驗。經尺寸排除層析柱（Superdex S200，GE healthcare)) 使用含有5〇111]^1^?丑8(口117.5)及15〇111]^他(：1之緩衝液分別純化Fab25及亥普辛。樣品細胞（2〇4 μΐ)載有亥普辛（14 μΜ) ’且注射器中之Fab25濃度為138 μΜ。滴定實驗通常由20次注射組成，各次注射2 體積且持續18〇秒，添加之間有3分鐘間隔時間。攪拌速度為1〇〇〇 Γριη。將原始數據整合’針對非特定熱量加以修正，針對濃度加以校正且根據1:1結合模型、假定一組相同結合位點進行分析。記錄等溫滴定曲線且使用隨ITC儀器配備之〇尺1(}1：^軟體來分析。整合數據得到滴定曲線；且使用非線性最小二乘法擬合’自曲線求得結合常數KA、結合熱（△//)及結合之化學計量。結果/論述 151637.doc -149- 201121566 為鑑別阻斷亥普辛酶活性之抗亥普辛抗體，針對無抑制劑之生物素標記亥普辛（生物素-亥普辛）及針對生物素標記亥普辛與DCI之複合物（生物素·亥普辛：Da)利用溶液分選。DCI為基於機制之絲胺酸蛋白酶抑制劑，其藉由與催化性5^195及出357(胰凝乳蛋白酶原編號）形成共價單醯基或二醯基加合物佔據S1 口袋（圖9A)(Powers等人，1989)。基於因子D:DCI複合物之晶體結構的亥普辛：DCI複合物分子模型（PDB代碼1DIC)(C〇ie等人，1998)指示Da抑制劑之芳族環佔據S1 口袋。先前之發現（Wu等人，2〇〇7)指示，自吾人之Fab噬菌體呈現庫衍生之功能阻斷性抗hgfa抗體不佔據S1口袋。因此，結合亥普辛之〇(：1可能不會干擾抗體結合，但可能對活性位點構形發揮有利影響，從而有利於與抗體之相互作用。胰蛋白酶樣絲胺酸蛋白酶之活性位點由若干固有可移動環（『活化域』）形成（Huber及B〇de， 1978)。詳言之，220環形成S1 口袋之一部分，且在一些絲胺酸蛋白酶中可採用各種構形狀態（J〇hns〇n等人，2〇〇5 ;

Shia 等人，2005 ; Spraggon 等人，2009 ; Wilken 等人， 2004)。僅載脂蛋白結構顯示該等罕見環構形，而與活性位點抑制劑形成之共晶結構很可能由於抑制劑所施加之穩定力而展示適當形成之活性位點（Ami等人，1994 ; shia等人，2005; Spraggon等人，2〇〇9)。亥普辛載脂蛋白結構未知且所有公開之亥普辛結構均為與活性位點抑制劑形成之共晶結構（Herter等人，2〇〇5 ; s_za等人，2〇〇3)。因此，推斷DCI佔據81口袋可對潛在環柔順性施加穩定力， 15l637.doc 150· 201121566 從而有利於抗體識別。酶檢測法展示，高於2〇 μΜ之DCI 濃度在40分鐘培育期之後會引起完全亥普辛抑制（圖9)。因此’在100 μΜ DCI存在下針對生物素標記亥普辛：DCI複合物進行噬菌體分選實驗。使用互補決定區（CDR)具有有限化學多樣性之最低必需合成抗體庫（命名為YSGX庫（Fellhouse等人，2〇〇7))、藉由溶液分選搜尋針對亥普辛之抑制抗體，其中生物素亥普辛或生物素-亥普辛：DCI複合物與噬菌體所呈現之Fab庫一起培育。針對生物素_亥普辛：DCI2淘選產生一個亥普辛結合純系，命名為HpSFab25(亦稱為「Fab25」），其在5輪選擇之後變得顯著。Fab25之HVR序列顯示於圖1中。

HpsFab25之CDR-H3極長（21個殘基）且HpsFab25含有三個

Lys殘基。進行Elisa實驗以測試KD1(結合至亥普辛活性位點之亥普辛抑制劑）是否抑制Fab25結合。如圖10所示，KD1以濃度依賴性方式抑制Fab25_噬菌體結合至亥普辛，表明

Fab25結合至或接近亥普辛之活性位點區且因此可能干擾酶活性。使用合成亥普辛受質S2765測試Fab25抑制人類及小鼠活性之能力。如圖1丨所示，Fab25以濃度依賴性方式抑制人類及小鼠亥普辛活性，在最高測試濃度達到完全抑制。人類亥普辛之尺/ΡΡ計算值為4·1±1.0 nM(n=3) ’且鼠類亥普辛之尺/ΡΡ計算值為329±51 nM(n=3)。使用IgG25進行之其他實驗展示’其抑制人類亥普辛的&app為11.3±1.7 151637.doc -151 - 201121566 (3)而對照IgG沒有影響(數據 ⑽對人類亥普辛的有；），，。果展不倍。此表明，在】智玄m 鼠類亥普辛的約8〇因為小抗體結合位點不Μ保守。 Λ f 苒A與人類亥普辛相比既無插入亦無缺失，所以Fab25之效能 ^ ^ m ^ 低可此係由於對與Fab25 之相互作用重要的胺基酸改變。使用^咖分析敎Fab25與人類㈣辛之結合親和力 Kd為 2·55 +/- 〇·45 ηΜ 〇問其是否抑制-組胰蛋白酶樣絲胺酸蛋白酶之酶 =性來測試Fab25之特異性。該組姨蛋白酶樣絲胺酸蛋白酶包括亥普辛之-些最接近之蛋白酶結構域同系物，諸如血衆激肽釋㈣、前列腺蛋㈣、馬拉蛋㈣及纖維蛋白溶酶》結果⑽2)表明’ Fab25對亥普辛具有完全特異性，此係因為其在為亥普辛之…測定值25〇倍之濃度下不影響所研究之絲胺酸蛋白酶之酶活性。測定腕5對亥普辛介導之pr〇_uPA及因子彻處理的作用。如圖13A所示，Fab25抑㈣f辛對pr〇_upA之活性， κ：5〇值為3.3±0·4 nM(n=3)，與其在pNA檢測法中之效能相當(表1)。在Fab濃度高於100 _下，抑制作用完全且與因子vii活化檢測法中之強抑制作用相當（圖ΐ3Β)。因子為相對不良之亥普辛受質’在檢測法中需要高亥普辛濃度 (5〇福）。因此，儘管Fab25係在500 nM下使用，但與pr〇_ uPA活化實驗相比（比率至多6〇〇:1) ’此產生相對低之 Fab25:亥普辛比率（10:1)，說明延長之2小時實驗期間之抑 151637.doc -152- 201121566 制作用不完全。亥普辛使受質優先在Pi Arg之後裂解（Herter等人， 2005) ，而且亦識別具有pi Lys之受質（M〇ran等人， 2006) 。因此，考慮到以下可能性：亥普辛可裂解含有三個Lys殘基且異常長2Fab 〇〇^3環。優先性得自最近關於抗間質蛋白酶抗體E2之研究，其在長CDR_H3環中之卩卜 Arg殘基之後經歷間質蛋白酶之裂解作用等人， 2〇〇8)。因此，Fab25在不同pH條件下長時間暴露於亥普辛。Fab25在非還原條件下以5〇 kDa色帶形式遷移，且在還原條件下以25 kDa色帶形式遷移，且不可鑑別低分子量降解產物（圖14)。因此，Fab25長時間暴露於亥普辛時對亥普辛蛋白水解有抗性。此結論與本發明假定一致：生物素-亥普辛：DCI複合物有利於選擇噬菌體所呈現之在“口袋外結合之Fab。 *近來確疋層黏連蛋白為亥普辛之受質（Tripathi等人）。研 '、表月藉由亥普辛裂解層黏連蛋白在生理學上可增強前列腺，細胞株則45之遷移。已研究Fab25抑制則45細胞、多是否依賴於層黏連蛋白。此實驗之結果（圖Μ)表明有政抑制亥普辛之蛋白水解活性且因此阻斷其受質層黏連蛋白之處理。力亦測4 Fab25抑制亥普辛針對—組合成受f之活性之能所示結果表明Fab25將亥普辛介導之所有pNA受質解抑制9〇%以上。因為PNA受質佔據亥普辛上之S1-S3亞所以可推斷抗體會強烈干擾此等亞位點之受質相互 151637.doc -153- 201121566 作用。儘管pNA受質之P2及P3位置有化學多樣性，但對所有受質之抑制>90%的發現表明，抗體在S2及/或S3位置的影響強，而非在此等位置具有微弱影響。此等影響是否具有變構性或直接位阻均有待闡明。此外，因為針對DCI抑制之亥普辛選擇Fab25，所以Fab不可能藉由直接佔據S1 口袋抑制亥普辛。表1. Fab25抑制亥普辛針對一組合成受質之活性。亥普辛與100 nM Fab25或對照Fab —起培育40分鐘，之後添加8 種不同pNA受質。經動力學微定量板式讀取器量測初始線速度且酶活性以F ab不存在下之亥普辛活性百分比表示。表1 受質 Fab25a (對照物百分比)b 對照Faba (對照物百分比)b S2765 2.2±0.7 100.4±2.3 S2266 3.0±1.3 97.3±3.9 S2288 2.5±0.8 98.5±1.9 S2366 3.4±0.5 99.9±2.7 S2444 1.7±0.9 99.5±1.8 Chromozyme ΤΗ 8_4±1_2 99.0±4.6 Spectrozyme FIXa -1.6±2.1 112.1±8.5 Spectrozyme FVIIa 3.4±0.8 101.8 士 4.8 a含於反應混合物中之100 nM Fab ^子照物為無Fab之亥普辛酶使用多種合成及大分子受質之所有功能檢測法中均展示 Fab25始終如一地將亥普辛活性抑制>90%。在LnCap-34細胞株上監測細胞表面上天然表現之亥普辛對pro-MSP進行之蛋白水解處理（Moran等人，2006)。表現亥普辛之LnCap-34細胞能夠處理125I-pro-MSP(圖16)。pro-MSP處理之蛋白水解活性主要歸因於亥普辛，此係因為所 151637.doc -154- 201121566 有三種亥普辛（Ac-KQLR-氣甲基酮（「KQLR」揭示為SEQ IDNO: 12)、KD1及Fab25)均有效阻斷蛋白水解裂解。部分參考文獻清單

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Cancer Res. 66:3611-9. 雖然上述本發明已出於清楚理解之目的藉助於說明及實例較詳細地描述，但該等描述及實例不應解釋為限制本發明之範疇。【圖式簡單說明】圖1 :抗亥普辛抗體之重鏈及輕鏈HVR環序列。該圖展示重鏈HVR序列HI、H2及H3及輕鏈HVR序列LI、L2及 L3。序列編號係如下：

純系 25(HVR-H1 為 SEQ ID NO:4 ; HVR-H2 為 SEQ ID NO:5 ; HVR-H3 為 SEQ ID NO:6 ; HVR-L1 為 SEQ ID

NO:l ； HVR-L2 為 SEQ ID NO:2 ； HVR-L3 為 SEQ ID NO:3)；胺基酸位置根據如下所述之Kabat編號系統編號。圖2A、圖2B及圖3 :描繪用於實施本發明之例示性受體人類共同構架序列，序列識別符係如下： 151637.doc -159- 201121566 可變重鏈（VH)共同構架（囷2A、圈2B) 人類VH亞群I共同構架減去Rabat CDR(分別為SEQ ID NO 21-23及 16) 人類VH亞群I共同構架減去延長高變區（分別為沾卩m NO 24-25、23及 16 ; 24-26及 16 ;及 24-25、27及 16) 人類VH亞群II共同構架減去Kabat CDR(分別為SEQ ID NO 28-30及 16) 人類VH亞群II共同構架減去延長高變區（分別為SEq NO 31-32、30及 16 ; 31-33及 16 ;及 31-32、34及 16) 人類VH亞群II共同構架減去延長人類VH亞群III共同構架減去Kabat CDR(分別為冗卩① NO:35-37 及 16) 人類VH亞群III共同構架減去延長高變區（分別為冗〇 ΐ]〇 NO 14-15、37及 16 ; 14-15、38及 16 ;及 14-15、43及 16) 人類VH受體構架減去Kabat CDR(分別為SEq id N〇 39 、 36 、 40及16) 人類VH受體構架減去延長高變區（分別ι〇 n〇 i4_ 15、40及 16 ;及 14_15、41 及 16) 人類VH党體2構架減去Kabat CDR(分別為SEQ ID N〇 39、36、42及 16) 人類VH受體2構架減去延長高變區（分別為SEq ID N〇 14-15 、 42及16 ; 14-15 、 44及16 ;及14-15 、 48及16) 可變輕鏈（VL)共同構架（圓3) 人類VL κ亞群I共同構架（分別為SEQ ID N〇 17_2〇) 151637.doc 201121566 人類VL κ亞群II共同構架（分別為SEQ ID NOS 49-51及 20) 人類VL κ亞群III共同構架（分別為SEQ ID NOS 52-54及 20) 人類VL κ亞群IV共同構架（分別為SEQ ID NOS 55-57及 20) 圖4 ··描繪huMAb4D5-8輕鏈（依出現次序，分別為SEQ ID NOS 17-18、58及20)及重鏈（依出現次序，分別為SEQ ID NO 14-15、48及16)之構架區序列。上標/粗體數字指示根據Kabat之胺基酸位置。圖5 :描繪huMAb5D5-8輕鏈（依出現次序，分別為SEQ ID NOS 17-20)及重鏈（依出現次序，分別為SEQ ID NO 14-15、43及16)之經修飾/變異體構架區序列。上標/粗體數字指示根據Kabat之胺基酸位置。圖6 :描繪抗亥普辛抗體mab 25重鏈可變區（SEQ ID NO:10)及輕鏈可變區（SEQ ID NO:9)。圖7 :天然人類亥普辛之胺基酸序列之一實施例。圖8A及圖8B :天然人類亥普辛之胺基酸序列之另一實施例。圖9 : 3,4-二氯-異香豆素（DCI)使亥普辛失活。A.用遞增之DCI濃度培育亥普辛40分鐘之後，針對S2765受質之酶活性受到濃度依賴性抑制。B. DCI之化學結構及其與亥普辛的可能加合物，根據（Powers等人，1989)。圖10 : KD1與抗亥普辛Fab噬菌體競爭結合至亥普辛。 151637.doc -161 - 201121566 在遞增濃度之KD1存在下Fab25-噬菌體結合至亥普辛。圖11 : Fab25抑制人類及鼠類亥普辛酶活性。人類（hu)及鼠類（mu)亥普辛與Fab25或對照Fab(ctrl Fab)—起培育40分鐘，之後添加S2765受質。經動力學微定量板式讀取器量測初始線速度且酶活性以分率活性（Vj/V。）表示。圖12 : Fab25之特異性。Fab25(l μΜ)與亥普辛及9種胰蛋白酶樣絲胺酸蛋白酶一起培育40分鐘，之後添加合成對硝基苯胺（ρΝΑ)受質。經動力學微定量板式讀取器量測初始線速度且酶活性以分率活性（Vj/V。）表示。圖13 : Fab25抑制亥普辛介導之大分子受質處理。A. Fab25抑制pro-uPA活化。在二階段酶檢測法中測定Fab25 對亥普辛介導之pro-uPA處理的影線。經動力學微定量板式讀取器量測初始線速度且酶活性以分率活性（Vj/V。）表示。使用uPA標準曲線，測定未抑制之亥普辛介導之uPA 形成速率為〇.81±0.22 μΜ uPA/min(n=3)°Fab25針對 3種已知受質抑制亥普辛受質處理：B·因子VII(FVII) ; C. pro-HGF;及 D. pro-MSP。在 Fab25及對照 Fab(ctrl Fab)存在或不存在下，亥普辛裂解因子VII 0.5小時及2.0小時，而pro-HGF及pro-MSP裂解實驗執行30分鐘。藉由SDS-PAGE(還原條件）分析反應等分試樣且將凝膠染色。圖14 :長期暴露於亥普辛之後，對Fab25完整性之影響。Fab25中之CDR-H3環含有可能被亥普辛裂解之3個離胺酸及1個精胺酸殘基，但在pH 6.0或pH 8.0下培育24小時時未觀測到亥普辛蛋白對Fab25之水解處理。藉由考馬斯 151637.doc -162- 201121566 亮藍染色之4%至2〇%(〜幻聚丙烯酿胺梯度凝膠上之凝膠遷移率變動監測蛋白水解。 ’ 圖15 · Fab25抑制DU145細胞之層黏連蛋白依賴性遷移。A.將含DU145細胞（2xl〇4)之無血清達爾伯克氏改良之伊格氏培養基（Dulbecco’s modified Eagie，s medium)添加至預處理之fluoroblok插入式系統上腔室中且允許在37t下遷移5小時《培育之後，洗滌非遷移細胞及培養基，且固疋遷移至過遽器底部之彼等細胞，用γθ-PRO-I染色且使用倒裝顯微鏡成像。獲取預處理之過濾器（層黏連蛋白、與亥普辛共同培育之層黏連蛋白 '與亥普辛：Fab25複合物或PBS對照物共同培育之層黏連蛋白）與固定細胞之代表性影像。B.自用Y〇-PR〇受質染色之細胞量測相對螢光單位（R.F.U)，減去PBS孔之參考值。與用單獨層黏連蛋白處理細胞相比，用經亥普辛處理之層黏連蛋白處理之Du 145 細胞遷移明顯增加《在Fab25存在下缺乏亥普辛介導之層黏連蛋白處理使DU145遷移減少。圖16 : A.在LnCap-34細胞中，細胞表面表現之亥普辛活化pro-MSP。使穩定過度表現亥普辛之LnC：ap_34細胞血清饑餓且用單獨或與不同抑制劑組合之125i_pro_MSP處理3 小時。重組亥普辛（10 nM)用作陽性對照。3小時之後觀測到與實驗起始時相比’ pro-MSP處理顯著增加。抑制劑 KQLR(SEQ ID NO:12)、KD1及抗亥普辛抗體Fab25有效阻斷pro-MSP之活化。B.在LnCap-34細胞中，細胞表面表現之亥普辛活化pro-HGF。在各種濃度（20 nM-0.15 nM)Fab25 151637.doc -163- 201121566 存在下用125I-pro-HGF處理LnCap-34細胞且培育3小時。重組亥普辛（10 nM)用作陽性對照。在3小時之後觀測到與實驗起始時相比’ pro-HGF處理顯著增加。抗亥普辛抗體 Fab25以濃度依賴性方式有效阻斷pr〇_HGF之活化。圖17 : A.使用表面電漿共振量測Ab25與活性人類亥普辛之結合親和力。將亥普辛之連續稀釋液（0.39 nM至200 nM)注射至捕捉有Ab25的CM5生物感測器晶片中歷時3分鐘且監測解離15分鐘。擬合實驗數據得到平衡解離速率 (尺D)10.6 nM。B.當Ab25與亥普辛前體之結合呈現快速動力學時，藉由穩態親和力量測法來量測結合親和力。將亥普辛前體之連續稀釋液（195 nM至80 μΜ)注射至捕捉有 Ab25的CM5生物感測器晶片中歷時2分鐘。藉由穩態分析、利用Req對亥普辛前體濃度之曲線測定平衡解離速率 (尺D=5.52 μΜ)。圖1 8 : Fab25結合至活性亥普辛之等溫滴定量熱實驗。結合反應為放熱反應且正如所料，結合之化學計量為 1:1。自ITC得到之解離常數（尺D)為6.1 nM，與先前來自 BIAcore之數據具有極佳相關性。結合之焓（δη)及熵（TAS) 為-27.5 kcal/mol及-16.3 kcal/mol，屐示結合就給而言係由逆熵驅動。 15l637.doc -164- 201121566 序列表 <11〇>美商建南德克公司 <120>抗亥普辛(HEPSIN)抗體及其使用方法

<130> P4366R1 WO <140> 099135993 <141> 2010-10-21 <150> 61/253,953 <151> 2009-10-22 <160> 59 <17Q> Patentln version 3.5 <210> 1 <211> 11 <212> PRT <213>人工序列 <220〉 <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 1

Arg Ala Ser Gin Ser Val Ser Ser Ala Val Ala 1 5 10 <210> 2 <211> 7 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 2

Ser Ala Ser Ser Leu Tyr Ser <210> 3 <211> 11 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 3

Gin Gin Tyr Tyr Ser Ser Tyr Tyr Leu Leu Thr 1 5 10 <210> 4 <211> 10 <212> PRT <213>人工序列 <220> ^ <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 4

Gly Phe Asn Phe Ser Tyr Ser Tyr Met His 151637-序列表.doc 10 10201121566 <210> 5 <2Π> 18 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223> /附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 5

Ala Ser lie Tyr Ser Tyr Tyr Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Val 15 10 15

Lys Gly <210> 6 <211> 23 <212> PRT <21人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成狀」 <400> 6

Ala Arg Ser Asp Ser Trp Ser Tyr Lys Ser Gly Tyr Thr Gin Lys lie 15 10 15

Tyr Ser Lys Gly Leu Asp Tyr 20 <210> 7 <211> 11 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成肽」 <220> <221〉 VARIANT <222> (7)..(7) <223> /差备=「Ser」 <220> “ <221>其他特色 <222> (7).. (7) <223>/附註=「序列中列示之殘基相對於註釋中該位置之殘基而言無優先性」 <400> 7

Arg Ala Ser Gin Asp Val Asn Thr Ala Val Ala 1 5 10 <210> 8 <211> 7 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 151637-序列表.doc 201121566 <223> /附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 8

Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser <210> 9 <211> 107 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 9

Asp lie Gin Met Thr Gin Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 15 10 15

Asp Arg Val Thr He Thr Cys Arg Ala Ser Gin Ser Val Ser Ser Ala 20 25 30

Val Ala Trp Tyr Gin Gin Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu lie 35 40 45

Tyr Ser Ala Ser Ser Lys Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Arg 50 55 60

Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr lie Ser Ser Leu Gin Pro Glu Asp 65 70 75 80

Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gin Gin Tyr Tyr Ser Ser Tyr Tyr Leu Leu 85 90 95

Thr Phe Gly Gin Gly Thr Lys Val Glu lie Lys 100 105 <210> 10 <2H> 130 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 10

Glu Val Gin Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Pro Gly Gly 15 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Asn Phe Ser Tyr Ser 20 25 30

Tyr Met His Trp Val Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 35 40 45

Ala Ser lie Tyr Ser Tyr Tyr Gly Ser Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser Va] 50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr lie Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr 151637-序列表.doc 201121566 65 70 75 80

Leu Gin Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 85 90 95

Ala Arg Ser Asp Ser Trp Ser Tyr Lys Ser Gly Tyr Thr Gin Lys lie 100 105 110

Tyr Ser Lys Gly Leu Asp Tyr Trp Gly Gin Gly Thr Leu Val Thr Val 115 120 125

Ser Ser 130 <210〉 11 <211> 107 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 11

Asp lie Gin Met Thr Gin Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 15 10 15

Asp Arg Val Thr lie Thr Cys Arg Ala Ser Gin Asp Val Asn Thr Ala 20 25 30

Val Ala Trp Tyr Gin Gin Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu lie 35 40 45

Tyr Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60

Ser Arg Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr lie Ser Ser Leu Gin Pro 65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gin Gin His Tyr Thr Thr Pro Pro 85 90 95

Thr Phe Gly Gin Gly Thr Lys Val Glu lie Lys 100 105 <210> 12 <211> 4 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>v附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 12 Lys Gin Leu Arg <210> 13 <211> 11 -4 151637-序列表.doc 201121566 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223> /附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 13

Asp He Cys Leu Pro Arg Trp Gly Cys Leu Trp 1 5 10 <210> 14 <211> 25 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 ./附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400〉 14

Glu Val Gin Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Pro Gly Gly 15 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser 20 25 <210> 15 <211> 13 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223> /附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 15

Trp Val Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val 1 5 10 <210> 16 <211> 11 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223> /附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 16

Trp Gly Gin Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser 1 5 10 <210> 17 <211> 23 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 /附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 17

Asp lie Gin Met Thr Gin Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 15 10 15 151637·序列表.doc 201121566

Asp Arg Val Thr lie Thr Cys 20 <210〉 18 <211> 15 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=r人工序列之描述：合成肽」 <400> 18

Trp Tyr Gin Gin Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu lie Tyr 15 10 15 <210> 19 <211> 32 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 19

Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr 15 10 15

Leu Thr lie Ser Ser Leu Gin Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys 20 25 30 <210> 20 <211> 10 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 ^23〉/附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 20

Phe Gly Gin Gly Thr Lys Val Glu lie Lys 1 5 10 <210> 21 <211> 30 <212> PRT <213>人工序列 <220> '人工序列之描述：合成多肽. <221>來源 <223>/附註= <400> 21

Gin Val Gin Leu Val Gin Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala 15 10 15

Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Tyr Thr Phe Thr 20 25 30 <210> 22 151637-序列表.doc 201121566 <211> 14 <212> PRT <213>人工序列 <220> <22i>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 22

Trp Val Arg Gin Ala Pro Gly Gin Gly Leu Glu Trp Met Gly 1 5 10 <210> 23 <211> 32 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 23

Arg Val Thr lie Thr Ala Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr Met Glu 15 10 15

Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg 20 25 30 <210> 24 <211> 25 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>./附註「人工序列之描述：合成肽」 <400> 24

Gin Val Gin Leu Val Gin Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ala 15 10 15

Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser 20 25 <210> 25 <211> 13 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223> /附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 25

Trp Val Arg Gin Ala Pro Gly Gin Gly Leu Glu Trp Met 1 5 10 <210> 26 <211> 31 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223> /附註=「人工序列之描述：合成多肽」 151637-序列表.doc 201121566 <400> 26

Arg Val Thr lie Thr Ala Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr Met Glu 15 10 15

Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala 20 25 30 <210> 27 <211> 30 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223> /附註= 「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 27

Arg Val Thr lie Thr Ala Asp Thr Ser Thr Ser Thr Ala Tyr Met Glu 15 10 15

Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 20 25 30 <210> 28 <211> 30 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 28

Gin Val Gin Leu Gin Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gin 15 10 15

Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Gly Ser Val Ser 20 25 30 <210> 29 <211> 14 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 29

Trp lie Arg Gin Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp lie Gly 1 5 10 <210> 30 <211> 32 <212> PRT <213>人工序列 '人工序列之描述：合成多肽」 <220> ^ <221>來源 <223〉/附註= <400> 30 151637·序列表.doc 201121566

Arg Val Thr lie Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gin Phe Ser Leu Lys 15 10 15

Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg 20 25 30 <210> 31 <211> 25 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>，/附註==「人工序列之描述•合成肽」 <400> 31

Gin Val Gin Leu Gin Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gin 15 10 】5

Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser 20 25 <210〉 32 <211> 13 <212> PRT <213>人工序列 <220〉 <221>來源 <223>,/附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 32

Trp lie Arg Gin Pro Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp lie 1 5 10 <210> 33 <211> 31 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 33 Arg Val Thr lie Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gin Phe Ser Leu Lys 10 15

Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala 20 25 30 <210> 34 <211> 30 <212> PRT <213>人工序列人工序列之描述：合成多肽」 <220> ^ <221>來源 <223>/附註= <400> 34

Arg Val Thr lie Ser Val Asp Thr Ser Lys Asn Gin Phe Ser Leu Lys 15 】0 15 151637-序列表.doc 201121566

Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 20 25 30 <210> 35 <211> 30 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 35

Glu Val Gin Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Pro Gly Gly 15 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser 20 25 30 <210> 36 <211> 14 <212> PRT <213>人工序列 <220〉 <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400〉 36

Trp Val Arg Gin Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val Ser 1 5 10 <210> 37 <211> 32 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 37

Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gin 15 10 15

Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg 20 25 30 <210> 38 <211> 31 <212> PRT <213>人工序列 '人工序列之描述：合成多肽. <220> ^ <221>來源 <223> /附註= <400> 38

Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gin 15 10 15

Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala 20 25 30 •10- 151637-序列表.doc 201121566 <210> 39 <2Π> 30 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述*·合成多肽」 <400> 39

Glu Val Gin Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gin Pro Gly Gly 15 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Asn lie Lys 20 25 30 <210> 40 <211> 32 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 40

Arg Phe Thr lie Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyx Leu Gin 15 10 15

Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ser Arg 20 25 30 <210> 41 <211> 31 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223> /附註=「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 41

Arg Phe Thr lie Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr Leu Gin 15 10 15

Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ma Val Tyr Tyr Cys Ser 20 25 30 <210> 42 <211> 32 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223> /附註=「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 42

Arg Phe Thr lie Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr Leu Gin 15 10 15

Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala Arg -11 - 151637-序列表.doc 201121566 20 25 30 <210> 43 <211> 30 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 43

Arg Phe Thr lie Ser Arg Asp Asn Ser Lys Asn Thr Leu Tyr Leu Gin 15 10 15

Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 20 25 30 <210> 44 <211> 31 <212> PRT <213>人工序列 <220〉 <2气> 來源 ^23〉/附註=「人工序列之描述：合成多肽 j <400> 44

Arg Phe Thr lie Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr Leu Gin 15 10 15

Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys Ala 20 25 30 <210> 45 <211> 107 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 45

Asp lie Gin Met Thr Gin Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly 15 10 15

Asp Arg Val Thr lie Thr Cys Arg Ala Ser Gin Asp Val Ser Thr Ala 20 25 30

Val Ala Trp Tyr Gin Gin Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys Leu Leu lie 35 40 45

Tyr Ser Ala Ser Phe Leu Tyr Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly 50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr lie Ser Ser Leu Gin Pro 65 70 75 80

Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Gin Gin Ser Tyr Thr Thr Pro Pro 85 90 95 -12· 151637-序列表.doc 201121566

Thr Phe Gly Gin Gly Thr Lys Val Glu lie Lys 100 105 <210> 46 <211> 417 <212> PRT <213>智人 <400> 46

Met Ala Gin Lys Glu Gly Gly Arg Thr Val Pro Cys Cys Ser Arg Pro 15 10 15

Lys Val Ala Ala Leu Thr Ala Gly Thr Leu Leu Leu Leu Thr Ala lie 20 25 30

Gly Ala Ala Ser Trp Ala lie Val Ala Val Leu Leu Arg Ser Asp Gin 35 40 45

Glu Pro Leu Tyr Pro Val Gin Val Ser Ser Ala Asp Ala Arg Leu Met 50 55 60

Val Phe Asp Lys Thr Glu Gly Thr Trp Arg Leu Leu Cys Ser Ser Arg 65 70 75 80

Ser Asn Ala Arg Val Ala Gly Leu Ser Cys Glu Glu Met Gly Phe Leu 85 90 95

Arg Ala Leu Thr His Ser Glu Leu Asp Val Arg Thr Ala Gly Ala Asn 100 105 110

Gly Thr Ser Gly Phe Phe Cys Val Asp Glu Gly Arg Leu Pro His Thr 115 120 125

Gin Arg Leu Leu Glu Val lie Ser Val Cys Asp Cys Pro Arg Gly Arg 130 135 140

Phe Leu Ala Ala lie Cys Gin Asp Cys Gly Arg Arg Lys Leu Pro Val 145 150 155 160

Asp Arg lie Val Gly Gly Arg Asp Thr Ser Leu Gly Arg Trp Pro Trp 165 170 175

Gin Val Ser Leu Arg Tyr Asp Gly Ala His Leu Cys Gly Gly Ser Leu 180 185 190

Leu Ser Gly Asp Trp Val Leu Thr Ala Ala His Cys Phe Pro Glu Arg 195 200 205

Asn Arg Val Leu Ser Arg Trp Arg Val Phe Ala Gly Ala Val Ala Gin 210 215 220

Ala Ser Pro His Gly Leu Gin Leu Gly Val Gin Ala Val Val Tyr His 225 230 235 240

Gly Gly Tyr Leu Pro Phe Arg Asp Pro Asn Ser Glu Glu Asn Ser Asn 245 250 255 13· 151637-序列表.doc 201121566

Asp lie Ala Leu Val His Leu Ser Ser Pro Leu Pro Leu Thr Glu Tyr 260 265 270 lie Gin Pro Val Cys Leu Pro Ala Ala Gly Gin Ala Leu Val Asp Gly 275 280 285

Lys lie Cys Thr Val Thr Gly Trp Gly Asn Thr Gin Tyr Tyr Gly Gin 290 295 300

Gin Ala Gly Val Leu Gin Glu Ala Arg Val Pro lie lie Ser Asn Asp 305 310 315 320

Val Cys Asn Gly Ala Asp Phe Tyr Gly Asn Gin lie Lys Pro Lys Met 325 330 335

Phe Cys Ala Gly Tyr Pro G!u Gly Gly lie Asp Ala Cys Gin Gly Asp 340 345 350

Ser Gly Gly Pro Phe Val Cys Glu Asp Ser lie Ser Arg Thr Pro Arg 355 360 365

Trp Arg Leu Cys Gly lie Val Ser Trp Gly Thr Gly Cys Ala Leu Ala 370 375 380

Gin Lys Pro Gly Val Tyr Thr Lys Val Ser Asp Phe Arg Glu Trp lie 385 390 395 400

Phe Gin Ala lie Lys Thr His Ser Glu Ala Ser Gly Met Val Thr Gin 405 410 415

Leu <210> 47 <211> 236 <212> PRT <213>智人 <400> 47

Tyr Asp Gly Ala His Leu Cys Gly Gly Ser Leu Leu Ser Gly Asp Trp 15 10 15

Val Leu Thr Ala Ala His Cys Phe Pro Glu Arg Asn Arg Val Leu Ser 20 25 30

Arg Trp Arg Val Phe Ala Gly Ala Val Ala Gin Ala Ser Pro His Gly 35 40 45

Leu Gin Leu Gly Val Gin Ala Vai Val Tyr His Gly Gly Tyr Leu Pro 50 55 60

Phe Arg Asp Pro Asn Ser Glu Glu Asn Ser Asn Asp lie Ala Leu Val 65 70 75 80

His Leu Ser Ser Pro Leu Pro Leu Thr Glu Tyr lie Gin Pro Val Cys 85 90 95

Leu Pro Ala Ala Gly Gin Ala Leu Val Asp Gly Lys lie Cys Thr Val -14· 151637-序列表.doc 201121566 100 105 110

Thr Gly Trp Gly Asn Thr Gin Tyr Tyr Gly Gin Gin Ala Gly Val Leu 115 120 125

Gin Glu Ala Arg Val Pro lie lie Ser Asn Asp Val Cys Asn Gly Ala 130 135 140

Asp Phe Tyr Gly Asn Gin lie Lys Pro Lys Met Phe Cys Ala Gly Tyr 145 150 155 160

Pro Glu Gly Gly lie Asp Ala Cys Gin Gly Asp Ser Gly Gly Pro Phe 165 170 175

Val Cys Glu Asp Ser lie Ser Arg Thr Pro Arg Trp Arg Leu Cys Gly 180 185 190 lie Val Ser Trp Gly Thr Gly Cys Ala Leu Ala Gin Lys Pro Gly Val 195 200 205

Tyr Thr Lys Val Ser Asp Phe Arg Glu Trp lie Phe Gin Ala lie Lys 210 215 220

Thr His Ser Glu Ala Ser Gly Met Val Thr Gin Leu 225 230 235 <210〉 48 <211> 30 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註==「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 48

Arg Phe Thr lie Ser Ala Asp Thr Ser Lys Asn Thr Ala Tyr Leu Gin 15 10 15

Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys 20 25 30 <210> 49 <211> 23 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 49

Asp lie Val Met Thr Gin Ser Pro Leu Ser Leu Pro Val Thr Pro Gly 15 10 15

Glu Pro Ala Ser lie Ser Cys 20 <210> 50 <211> 15 -15- 151637-序列表.doc 201121566 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>./附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 50

Trp Tyr Leu Gin Lys Pro Gly Gin Ser Pro Gin Leu Leu lie Tyr 15 10 15 <210> 51 <211> 32 <212> PRT <213>人工序列人工序列之描述：合成多肽. <220> ^ <221>來源 <223> /附註= <400> 51

Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr 15 10 15

Leu Lys lie Ser Arg Val Glu Ala Glu Asp Val Gly Val Tyr Tyr Cys 20 25 30 <210> 52 <211> 23 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 52 ^

Glu lie Val Leu Thr Gin Ser Pro Gly Thr Leu Ser Leu Ser Pro Gly 15 10 15

Glu Arg Ala Thr Leu Ser Cys 20 <210> 53 <211> 15 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 53

Trp Tyr Gin Gin Lys Pro Gly Gin Ala Pro Arg Leu Leu lie Tyr 15 10 15 <210〉 54 <211> 32 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成多肽」 -16· 151637-序列表.doc 201121566 <400> 54

Gly lie Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr 15 10 15

Leu Thr He Ser Arg Leu Glu Pro Glu Asp Phe Ala Val Tyr Tyr Cys 20 25 30 <210> 55 <211> 23 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>./附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 55

Asp lie Val Met Thr Gin Ser Pro Asp Ser Leu Ala Val Ser Leu Gly 15 10 15

Glu Arg Ala Thr lie Asn Cys 20 <210> 56 <211> 15 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>v附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 56

Trp Tyr Gin Gin Lys Pro Gly Gin Pro Pro Lys Leu Leu lie Tyr 15 10 15 <210> 57 <211> 32 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223> /附註=「人工序列之描述：合成肽」 <400> 57

Gly Val Pro Asp Arg Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr 15 10 15

Leu Thr lie Ser Ser Leu Gin Ala Glu Asp Val Ala Val Tyr Tyr Cys 20 25 30 <210> 58 <211> 32 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>,/附註=「人工序列之描述：合成多肽」 <400> 58

Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly Ser Arg Ser Gly Thr Asp Phe Thr -17- 151637·序列表.doc 201121566 15 10 15

Leu Thr lie Ser Ser Leu Gin Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys 20 25 30 <210> 59 <211> 8 <212> PRT <213>人工序列 <220> <221>來源 <223>/附註=「人工序列之描述：合成8xHis標籤」 <400> 59

His His His His His His His His 1 5 18- 151637-序列表.doc

Claims

201121566 七、申請專利範圍： 1. 一種分離之抗亥普辛（anti-hepsin)抗體’其中呈單價形式之該抗體以小於或等於10 nM或更佳之親和力結合人類亥普辛，其中呈單價形式之該抗體以小於或等於330 nM 之親和力結合小鼠亥普辛，且其中該抗體與存在於複合物中之亥普辛結合，該複合物包含亥普辛及結合人類亥普辛S 1亞位點之絲胺酸蛋白酶抑制劑。 2. 如請求項1之抗體，其中該絲胺酸蛋白酶抑制劑為3,4-二氯-異香豆素（DCI)。 3. 如請求項1之抗體，其中該抗體結合亥普辛之Kunitz域結合區。 4. 如請求項1之抗體，其中該抗體阻斷受質與亥普辛亞位點2及/或亥普辛亞位點3結合。 5. 如請求項1之抗體，其中該抗體抑制亥普辛介導之巨噬細胞刺激蛋白（MSP)活化。 6. 如請求項1之抗體，其中該抗體抑制層黏連蛋白依賴性細胞遷移。 7. 如請求項1之抗體，其中該抗體包含：至少一個、兩個、三個、四個、五個及/或六個選自由以下組成之群的高變區（HVR)序列： (a) 包含序列RASQSVSSAVA(SEQIDNO:l)之HVR-L1 ; (b) 包含序列 SASSLYS(SEQ ID NO:2)之HVR-L2 ; (c) 包含序列 QQYYSSYYLLT(SEQ ID NO:3)之HVR-L3 ; (d) 包含序列 GFNFSYSYMH(SEQ ID NO:4)之HVR-H1 ; 151637.doc 201121566 (e) 包含序列 ASIYSYYGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:5)之 HVR-H2 ;及 (f) 包含序列 ARSDSWSYKSGYTQKIYSKGLDY(SEQ ID NO:6)之HVR-H3。 8. 如請求項7之抗體，其中該抗體包含：（a)包含序列 ARSDSWSYKSGYTQKIYSKGLDY(SEQ ID NO:6)之 HVR-H3 ; (b)包含序列 QQYYSSYYLLT(SEQ ID NO:3)之 HVR-L3 ;及（c)包含序列 ASIYSYYGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:5)之HVR-H2。 9. 如請求項7之抗體，其中該抗體包含：（a)包含序列 GFNFSYSYMH(SEQ ID NO:4)之 HVR-H1 ; (b)包含序列 ASIYSYYGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:5)之HVR-H2 ;及 (c)包含序列 ARSDSWSYKSGYTQKIYSKGLDY(SEQ ID NO:6)之HVR-H3。 10. 如請求項9之抗體，其另外包含：（a)包含序列 RASQSVSSAVA(SEQ ID ΝΟ:1)之 HVR-L1 ; (b)包含序列 SASSLYS(SEQ ID NO:2)之 HVR-L2 ;及（c)包含序列 QQYYSSYYLLT(SEQ ID NO:3)之HVR-L3。 11. 如請求項7之抗體，其中該抗體包含：（a)包含序列 RASQSVSSAVA(SEQ ID ΝΟ:1)之 HVR-L1 ; (b)包含序列 SASSLYS(SEQ ID NO:2)之 HVR-L2 ;及（c)包含序列 QQYYSSYYLLT(SEQ ID NO:3)之HVR-L3。 12. 如請求項9或11之抗體，其另外包含圖3、圖4、圖5或圖 6中所示之重鏈可變域或輕鏈可變域構架序列。 151637.doc 201121566 13.如請求項i之抗體，其包含：（a)與胺基酸序列seq id N〇:10具有至少95%序列一致性的VH序列；或（b)與胺基酸序列SEQ ID NO:9具有至少95%序列一致性的Vl序列；或（c)如（a)中之VH序列及如（b)中之VL序列。 - 14.如請求項13之抗體，其包含vh序列SEQ ID NO:1〇。 . 15_如請求項13之抗體’其包含VL序列SEQ ID NO:9。 16. 如請求項13之抗體，其包含vh序列SEQ ID NO:1〇及VL 序列 SEQ ID ΝΟ·.9。 17. 如前述請求項中任一項之抗體，其為全長IgG1抗體。 1 8.如則述請求項中任一項之抗體，其中該抗體包含人類κ 亞群共同構架序列。 19_如則述請求項中任一項之抗體，其中該抗體包含重鏈人類亞群III共同構架序列。 20. —種分離之核酸，其編碼如前述請求項中任一項之抗體。 21 · —種宿主細胞’其包含如請求項2〇之核酸。 22_ —種製造抗體之方法，其包含培養如請求項21之宿主細胞以便產生該抗體。 23.如請求項22之方法’其另外包含自宿主細胞培養物回收 • 該抗體。 - 24. 一種免疫結合物，其包含如請求項1之抗體及細胞毒性劑。 25. —種醫藥調配物，其包含如請求項1之抗體及醫藥上可接受之載劑。 2 6.如請求項2 5之醫藥調配物，其另外包含另一種治療劑。 27.如請求項1之抗體’其係用作藥劑。 151637.doc 201121566 28. 如請求項丨之抗體，其係用於治療癌症。 29. 如請求们之抗體，其係用於治療免疫病症。 30. 如請求項丨之抗體，其係用於抑制細胞遷移。 31·如請求項！之抗體，其係用於抑制亥普辛酶活性。 32. —種如請求項丨之抗體用於製造藥劑的用途。 33. 如請求項32之用途，其中該藥劑係用於治療癌症。 34. 如請求項32之用途，其中該藥劑係用於治療免疫病症。 35. 如請求項32之用途，其中該藥劑係用於抑制細胞遷移或抑制亥普辛酶活性。 36. —種製造抗絲胺酸蛋白酶抗體之方法，其包含選擇可與存在於複合物中之絲胺酸蛋白酶結合的抗體，該複合物包含（a)絲胺酸蛋白酶；及（b)結合S1亞位點之絲胺酸蛋白酶抑制劑。 37. 如請求項36之方法，其中該絲胺酸蛋白酶為亥普辛。 38. 如請求項36之方法，其中該絲胺酸蛋白酶抑制劑為3,4_ 二氯-異香互素。 3 9. 士吻求項3 6之方法，其中該絲胺酸蛋白酶抑制劑與亥普辛催化性胺基酸殘基Serl95及His57結合，藉此使亥普辛失活。 40. 如請求項36之方法，其中在選擇該抗體之前，將該抗體與絲胺酸蛋白酶及絲胺酸蛋白酶抑制劑一起培育。 41. 如請求項37之方法，其另外包含選擇與Kunhz域競爭結合亥普辛之抗體。 42. 如請求項41之方法，其中該Kunitz域為KD1。 I51637.doc