TW200524606A - Nucleoside compounds for treating viral infections - Google Patents

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TW200524606A
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alkyl
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Jesse D Keicher
Christopher Don Roberts
Natalia B Dyatkina
Original Assignee
Genelabs Tech Inc
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    • C07HSUGARS; DERIVATIVES THEREOF; NUCLEOSIDES; NUCLEOTIDES; NUCLEIC ACIDS
    • C07H19/00Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof
    • C07H19/02Compounds containing a hetero ring sharing one ring hetero atom with a saccharide radical; Nucleosides; Mononucleotides; Anhydro-derivatives thereof sharing nitrogen
    • C07H19/04Heterocyclic radicals containing only nitrogen atoms as ring hetero atom
    • C07H19/14Pyrrolo-pyrimidine radicals
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    • C07ORGANIC CHEMISTRY
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    • C07D487/00Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, not provided for by groups C07D451/00 - C07D477/00
    • C07D487/02Heterocyclic compounds containing nitrogen atoms as the only ring hetero atoms in the condensed system, not provided for by groups C07D451/00 - C07D477/00 in which the condensed system contains two hetero rings
    • C07D487/04Ortho-condensed systems

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Description

200524606 九、發明說明: 有關申請案之前後參照 本案為2004年6月4曰申請之美國專利申請案序列號碼 10/861,090之部份連續申請案,該申請案根據35 U.S.C.§ 119(e)主張2003年10月27曰申請之美國臨時專利申請案序 列號碼60/5 15,153之利益。本案亦根據35 U.S.C.§119(e)主 張2004年8月1 8曰申請之美國臨時專利申請案序列號碼 60/602,815之利益。這些申請案全部併入本文供參考。 【發明所屬之技術領域】 本發明係關於製備用於治療哺乳類至少部份涉及一種黃 病毒科病毒感染之特定化合物之方法。本發明亦關於這些 方法中所用之新穎中間物。 【先前技術】 參考資料 下列公開係以寫在右上角之號碼引據於本案中。 1. Giangaspero, et al.5 Arch. Virol. Suppl., 7:53-62(1993); 2. Giangaspero, et al., Int. J. STD. AIDS, 4(5):300-302 (1993); 3. Yolken, et al., Lancet, 1(8637):517-20(1989); 4. Wilks,et al·,Lancet,1(8629):107(1989); 5. Giangaspero, et al., Lancet, 2:1 10(1988); 6. Potts, et al., Lancet, 1(8539):972-973(1987); 7. Cornberg,et al·,’’Hepatitis C: therapeutic perspectives,’’ Forum (Genova), 11(2):154-62(2001); 96973.doc 200524606 8. Dymock, et al.5 Antivir. Chem. Chemother. 11 (2):79-96 (2000); 9. Devos等人之國際專利案公開案WO 02/18404 A2,2002 年3月7曰公開; 10. Sommadossi等人之國際專利案公開案WO 01/90121, 2001年5月23曰公開; 11· Carroll,S.S·等人之國際專利案公開案WO 02057287, 2002年7月25日公開; 12. Carroll,S.S_等人之國際專利案公開案WO 02057425, 2002年7月25曰公開; 13. Roberts等人之美國專利申請案序列號碼10/861,090, 2004年6月4曰申請; 14. Roberts等人之美國專利申請案序列號碼10/861,311, 2〇〇4年6月4曰申請。 上述公開及申請案全部併入本文供參考如同各公開或申 請案特定及獨立顯示全部併入供參考之程度。 此技藝之狀態 黃病毒科病毒包含三屬:瘦病毒,黃病毒,及C肝炎病毒 (hepacivirus)。在這些屬中,黃病毒及C肝炎病毒為人類重 要的病原,流行於全世界。有38種黃病毒與人類疾病有關, 包括登革熱病毒,黃熱病病毒,及日本腦炎病毒。黃病毒 引起一範圍之急性熱病及腦炎及出血疾病。C肝炎病毒目前 感染約2至3%之世界人口,引起持續性感染,導致慢性肝 病,肝硬變,肝細胞癌,及肝衰竭。人類瘟病毒不如動物 96973.doc 200524606 痕病毒具有廣泛特徵。然而’血清學研究顯示人類相當大 暴露於瘟病毒。人類瘟病毒感染顯示於幾種疾病,包括, 但不限於’先天性腦傷害,嬰兒胃腸炎,及人類免疫不全 病毒(HIV)陽性病人之慢性腹萬。I-6 目前無抗病毒藥物用於預防或治療瘟病毒或黃病毒感 染。對於c肝炎病毒(即HCV)感染,干擾素a(IFN)目前在美 國為唯一核准之藥物。HCV為輸血後及散發性非A#B肝炎 之主要病因。HCV感染潛在於高比例可能多年無臨床徵候 群之慢性感染(及傳染性)帶原者。 目前唯一可接受之慢性HCV之治療為干擾素(IFN-a),其 需要至少6個月之治療,及/或利巴維靈(ribavirin),其可抑 制感染細胞中病毒複製’亦可使一些人之肝功能增強。 IFN-α屬於一種天然小蛋白質,具有特別之生物學作用, 如抗病毒,免疫調節,及抗腫瘤活性,係由大部份動物之 有核細胞對於幾種疾病,特別是病毒感染,反應所產生及 分泌。IFN-a為生長及分化之一種重要調節劑,影響細胞聯 絡及免疫控制。然而,HCV以干擾素治療具有有限之長期 功效,反應率為約25%。此外,HCV以干擾素治療通常具有 不良副作用’如疲勞’發燒’發冷,頭痛,肌痛,關節痛, 略微禿髮’精神影響及有關疾病,自體免疫現象及有關疾 病,及曱狀腺功能不良。 利巴維靈(Ribavirin)(l-p_D-呋喃核糖基-1h_i,2,4-三唾 -3-羧醯胺)為一種肉苷5’-單磷酸去氫酶(IMpdh)之抑制 劑,可增強IFN-α治療HCV之功效。儘管利巴維靈加入,以 96973.doc 200524606 目前干擾素-a(IFN)及利巴維靈之標準治療,大於5〇%之病 人並未去除該病毒。迄今,慢性C肝炎之標準治療已變為 PEG-IFN合併利巴維靈。然而,許多病人仍有顯著副作用, 主要與利巴維靈有關。利巴維靈引起1 〇_2〇%以目前推薦劑 量治療之病人顯著溶血,且該藥物形成畸形及具有胚胎毒 性。 使用其他方法對抗病毒。包括例如使用反意(antisense) 寡核苷酸或核糖酶(ribozymes)以抑制HCV複製。此外,直 接抑制HCV蛋白質及干擾病毒複製之低分子量化合物被視 為吸引人之控制HCV感染之方法。NS3/4A絲胺酸蛋白酶, 核糖核酸(RNA)螺旋酶,RNA-依賴性RNA聚合酶被視為新 藥之潛在目標。7,8
Devos等人9述及嘌呤及嘧啶核苷衍生物及其作為HCv RNA複製之抑制劑之用途。Sommadossi等人10述及1,,2,或 3’-經修釋之核苷及其用於治療感染HCV之宿主之用途。 Carroll等人u,12述及核苷作為rnA-依賴性RNA病毒聚合酶 之抑制劑。 最近,Roberts等人13,“揭示某些7_(2,經取代呋喃核 糖基)-4-胺基-5-(選擇性經取代之乙炔基)_吡咯并[2,3_y 嘧啶化合物具有對抗HCV之有效活性。這些參考資料全部 併入本文供參考。 【發明内容】
本發明係關於可用於治療哺乳類至少部份涉及—種黃病 毒科病毒之病毒感染之新穎化合物。本發明特別關於下式I 96973.doc 200524606 之化合物
其中 Y係選自一鍵’ -CH2-或; W,W1及W2各獨立選自氫及一種醫藥可接受之前藥;及 其醫藥可接受鹽或部份鹽。 在一個較佳具體實施例中,γ為氧。 在另一個較佳具體實施例中,w,W1及W2各獨立為氫或 一種醫藥可接受之前藥,選自醯基,氧基醯基,膦酸基, 填酸基’碟酸S旨’胺基膦酸基(phosphonamidate),二胺基 磷酸基(phosphorodiamidate),胺基磷酸(phosphoramidate) 單酯,環狀胺基磷酸基,環狀二胺基磷酸基,胺基磷酸二 酉旨’及-C(0)CHR2NH2 ’其中R2係選自氫,炫基,經取代之 烷基,芳基,經取代之芳基,環烷基,經取代之環烷基, 雜芳基,經取代之雜芳基,雜環基,及經取代之雜環基。 R2較佳為一種胺基酸之支鏈。較佳W為氫,或W1為氫,或 W為氫。更佳w及W1為氫,或W及W2為氫,或w1及W2為 氫。甚至更佳w,W1及W2為氫。 96973.doc -10- 200524606 在另一個較佳具體實施例中,W1及W2為氫,W為氫或一 種醫藥可接受之前藥,選自醯基,氧基醯基,膦酸基,磷 酸酯,磷酸基,胺基膦酸基,二胺基磷酸基,胺基磷酸單 酯,環狀胺基磷酸基,環狀二胺基鱗酸基,胺基磷酸二酯, 及-c(o)chr2nh2。 在一個特佳具體實施例中,W1及W2為氫,W係以下式表 不 · R3
0 R2
H OR1 其中r2如上述定義,R3為氫或烷基,R1係選自烷基,經取 代之烧基,芳基,經取代之芳基,環烷基,經取代之環烷 基’雜芳基,經取代之雜芳基,雜環,及經取代之雜環。 在一個較佳具體實施例中,R2係由L_胺基酸衍生。 在另一個特佳具體實施例中,W及W2為氫,W1係以下式 表示 R2 h2n
0 其中R2如上述定義。 本發明之一個特佳方面係關於下式π之化合物: 96973.doc -11- 200524606
其中 w係選自氫及一種醫藥可接受之前藥; 或其醫藥可接受鹽或部份鹽。 本發明之較佳化合物包括下表I所述者:
表I
96973.doc -12- 200524606
96973.doc 13- 200524606
7·(2’-甲基-3,-〇-L-丙胺酸酯 -β-D-吱喃核糖基)-4-胺基- 5-(乙 炔_1_基)-吡咯并[2,3_d]嘧啶 (22b) 本發明化合物作為抗病毒劑有效,或可用作製備抗病毒 劑之中間物,如本文中所述。 本發明亦關於醫藥組合物,包含一種醫藥可接受之稀釋 劑及治療有效量之一種本文中所述之化合物或一或多種該 化合物之混合物。 本發明另關於治療哺乳類至少部份涉及一種黃病毒科病 毒(如HCV)之病毒感染之方法,該方法包含對於已診斷具有 該病毒感染或有發展該病毒感染危險之哺乳類施用一種醫 藥組合物,包含一種醫藥可接受之稀釋劑及治療有效量之 一種本文中所述之化合物或一或多種該化合物之混合物。 在本發明之另一具體實施例中,提供治療或預防哺乳類 病毒感染之方法,其中本發明化合物係與治療有效量之一 或多種有效對抗HCV之劑合併施用。對抗HCV之有效劑包 括利巴、隹1 (ribavirin),來福維靈(iev〇virin),維拉米定 (viramidine),胸腺素(thymosin)a-l,NS3絲胺酸蛋白酶之 抑制劑,及肉苷單磷酸去氫酶,干擾素义,或聚乙二醇化 (pegylated)干擾素〜之抑制劑,單獨或合併利巴維靈或來福 維靈。對抗HCV有效之其他劑較佳為干擾素_α或聚乙二醇 96973.doc -14 - 200524606 化干擾素-α單獨或合併利巴維靈或來福維靈。 【實施方式】 本發明係關於用於治療黃病毒科病毒,如c肝炎病毒,减 染之化合物,組合物,及方法。然而,在詳細說明本發明 前,先定義下列術語: 定義 本文中所用之術語”烷基”表具有1至6個碳原子,更佳 2個碳原子之烷基。此術語之實例為甲基,乙基,正丙基, 異丙基,正丁基,第三丁基,正戊基等。 ”經取代之烷基”表烷基具有1至3個,較佳1至2個,取代 基選自烷氧基,經取代之烷氧基,醯基,醯基胺基,酸基 氧基,氧基醯基,胺基,經取代之胺基,胺基醯基,芳基, 經取代之芳基,芳基氧基,經取代之芳基氧基,氰基,鹵 素,羥基,硝基,羧基,羧基酯,環烷基,經取代之環烷 基,雜芳基,經取代之雜芳基,雜環,及經取代之雜環。 π烷氧基”表’’烷基-0-M,其包括例如甲氧基,乙氧基,正 丙氧基,異丙氧基,正丁氧基,第三丁氧基,第二丁氧基, 正戊氧基等。 π經取代之烧氧基π表π經取代之烧基 ’’醯基’’表烧基- C(O)- ’經取代之烧基<(0)-,烯基_c(〇)-, 經取代之烯基-C(O)-,炔基-c(0)·,經取代之炔基_c(〇)_, 環统基-c(o)-,經取代之環烷基_C(0)·,芳基_c(〇)_,經取 代之芳基-C(O)-,雜芳基-c(0)-,經取代之雜芳基_〇(〇)_, 雜環-C(O)-,及經取代之雜環_(^(〇)_。 96973.doc -15- 200524606 π醯基胺*’j-C(0)NR4R4,其中各R4獨立選自氫,烷基, 經取代之烷基,烯基,經取代之烯基,炔基,經取代之炔 基,芳基,經取代之芳基,環烷基,經取代之環烷基,雜 芳基,經取代之雜芳基,雜環,經取代之雜環,及其中各 R4與氮原子連接在一起形成一個雜環或經取代之雜環。 π醯基氧基”表烷基-C(0)0-,經取代之烷基-C(0)0-,烯 基-C(0)0-,經取代之烯基-C(0)0-,炔基-C(0)0-,經取代 之炔基-C(0)0-,芳基-C(0)0-,經取代之芳基-c(o)o-,環 烷基-c(o)o-,經取代之環烷基-c(o)o-,雜芳基-c(o)o-, 經取代之雜芳基-c(o)o-,雜環-c(o)o-,及經取代之雜環 -C(0)0- 〇 ”氧基醯基’’表烷基-oc(o)_,經取代之烷基_oc(o)-,烯 基-oc(o)-,經取代之烯基-oc(o)-,炔基-oc(o)-,經取代 之炔基-oc(o)-,芳基-oc(o)-,經取代之芳基_oc(o)-,環 烷基-oc(o)-,經取代之環烷基-oc(o)·,雜芳基-oc(o)_, 經取代之雜芳基-oc(o)-,雜環-oc(o)-,及經取代之雜環 -OC(O)- 〇 π烯基”表具有2至6個碳原子,較佳2至4個碳原子,及具 有至少1個,較佳1-2個位置烯基不飽和之烯基。該基之實 例為乙烯基(乙烯-1-基),烯丙基,丁-3-烯-1-基等。 π經取代之烯基”表烯基具有1至3個,較佳1至2個,取代 基選自烷氧基,經取代之烷氧基,醯基,醯基胺基,醯基 氧基,胺基,經取代之胺基,胺基醯基,芳基,經取代之 芳基,芳基氧基,經取代之芳基氧基,氰基,齒素,羥基, 96973.doc •16- 200524606 硝基,緩基,祕_,環㈣,經取代之環縣,雜芳基, 經取代之雜芳基,雜環,及經取代之雜環,但是任何羥基 取代基不連接於乙烯基(不飽和)之碳原子。較佳之經取代之 烯基係選自,但不限於,2,2-二氣乙烯_丨·基,2_甲氧基乙烯 -1 -基等。 應明瞭,術語,,經取代之烯基”包括E(順式)及2(反式)異構 物,如適合。該異構物可為純異構化合物或£及2成份之混 合物。 ’’炔基”表具有至少1個位置之炔基不飽和,且具有2至6個 石反原子,更佳2至4個碳原子之不飽和烴。較佳之炔基係選 自,但不限於,乙炔_1_基,丙炔基,丙炔基,卜甲基 丙-2-快_1_基,丁炔_ι_基,丁炔_2_基,丁炔基等。 經取代之快基”表炔基具有1至3個,較佳1至2個,取代 基選自烧氧基,經取代之烷氧基,醯基,醯基胺基,醯基 氧基,胺基,經取代之胺基,胺基醯基,芳基,經取代之 芳基,芳基氧基,經取代之芳基氧基,氰基,鹵素,羥基, 硝基,羧基,羧基酯,環烷基,經取代之環烷基,雜芳基, 經取代之雜芳基,雜環,及經取代之雜環。較佳之經取代 之炔基係選自,但不限於,2-氟乙炔-1-基,3,3,3_三氟丙炔 -1-基,3-胺基丙炔-1-基,3-羥基丙炔-1-基等。 ’’胺基"表-NH2。 ’’經取代之胺基,,表-NR,R”,其中R’及R”獨立選自氫,烷 基,經取代之烧基,烯基,經取代之烯基,炔基,經取代 之炔基,芳基,經取代之芳基,環烷基,經取代之環烷基, 96973.doc -17- 200524606 雜芳基,經取代之雜芳基,雜環,經取代之雜環,及其中 R’及R”與相接之氮連接在一起形成一個雜環或經取代之雜 環基,但是R’及R”不均為氫。當R’為氫及R”為烷基時,經 取代之胺基在本文中有時稱為烷基胺基。當R’及R"為烷基 時,經取代之胺基在本文中有時稱為二烷基胺基。 ”胺基醯基’’表-NR5C(0)烷基,-NR5C(0)經取代之烷基, -NR5C(0)環烷基,-NR5C(0)經取代之環烷基,-NR5C(〇)婦 基,-nr5c(o)經取代之烯基,-NR5C(0)炔基,-NR5C(〇)經 取代之炔基,_NR5C(0)芳基,-NR5C(0)經取代之芳基, -NR5c(〇)雜芳基,_NR5C(0)經取代之雜芳基,-NR5c(〇)雜 環’及-NR5C(〇)經取代之雜環,其中R5為氫或烷基。 "芳基’’或”Ar”表6至14個碳原子之一價芳族碳環基,具有 單環(例如笨基)或多個縮合環(例如萘基或蒽基),該縮合環 可為或可不為芳族(例如2-苯并吟唑啉酮,2H-1,4-苯并 基等),但是連接點係在一個芳族碳原子。較佳 之芳基包括笨基及萘基。 ’’經取代之芳基”,包括,,經取代之苯基",表芳基或笨基經 1至3個取代基,較佳1至2個取代基,選自羥基,醯基,隨 基胺基’醯基氧基,烧基,經取代之烧基,烧氧基,經取 代之燒氧基,烯基,經取代之烯基,炔基,經取代之炔基, 胺基’經取代之胺基,胺基醯基,芳基,經取代之芳基, 芳基氧基,經取代之芳基氧基,環烷氧基,經取代之環燒 氧基,羧基,羧基酯,氰基,硫醇,硫烷基,經取代之琉 烧基’琉芳基,經取代之硫芳基,硫雜芳基,經取代之琉 96973.doc -18- 200524606 雜芳基,硫環烷基,經取代之硫環烷基,硫雜環,經取代 之硫雜環取代,環烷基,經取代之環烷基,鹵,硝基,雜 芳基,經取代之雜芳基,雜環,經取代之雜環,雜芳基氧 基,經取代之雜芳基氧基,雜環氧基,及經取代之雜環氧 基取代。 π芳基氧基”表芳基-0-,其包括例如苯氧基,萘氧基等。 ’’經取代之芳基氧基"表經取代之芳基·〇·。 叛基表-COOH或其鹽。 羧基酯’’表_c(0)0-烷基,-c(0)0-經取代之烷基,-c(〇)〇· 芳基,及-c(0)0-經取代之芳基,其中烷基,經取代之烷基, 芳基,及經取代之芳基如本文中定義。 π環烷基"表3至10個碳原子具有單或多環之環狀烷基,其 中一或多個環可為芳族或雜芳族,但是連接點係經由環烷 基之環原子。該基包括例如金剛烷基,環丙基,環丁基, 環戊基,環辛基等。 經取代之辕烧基"表飽和或不飽和(但非芳族)環烧基具 有1至5個取代基選自酮基(=0),硫基(=s),烷基,經取代 之烷基,烷氧基,經取代之烷氧基,醯基,醯基胺基,醯 基氧基,胺基,經取代之胺基,胺基醯基,芳基,經取代 之芳基,芳基氧基,經取代之芳基氧基,氰基,鹵素,羥 基,硝基,竣基,緩基醋,環烧基,經取代之環烧基,雜 芳基,經取代之雜芳基,雜環,及經取代之雜環。 ”環烷氧基"表-0-環烷基。 ’’經取代之環烷氧基”表-ο-經取代之環烷基。 96973.doc -19- 200524606 π 甲醯基。 ”鹵”或n鹵素"表說,氣,漠,及峨,較佳為氣或氣。 雜芳基”表1至10個碳原子及丨至4個雜原子選自氧,氮, 及硫於環中之芳族基。硫及氮雜原子亦可以氧化形式存 在,如>Ν(〇),>8(0)及>S(〇)2。該雜芳基可具有一個單環(例 如吨啶基或呋喃基)或多個縮合環(例如峭畊基或苯并嘧吩 基),其中縮合環可為或可不為芳族及/或含有一個雜原子, 但是連接點係經由芳族雜芳基之一個原子。較佳之雜芳基 包括吡啶基,吡咯基,,塞吩基,啕哚基,硫苯基,及呋喃 基。 ’’經取代之雜芳基”表雜芳基經1至3個選自相同於經取代 之芳基所定義之取代基取代。 ’·雜芳基氧基”表_〇_雜芳基,”經取代之雜芳基氧基,,表七· 經取代之雜芳基。 ’’雜環”或”雜環基”或,,雜環烷基,,表具有—個單環或多個 縮合環,1至10個碳原子,及丨至4個雜原子選自氮,氧,硫, >S(0),及>s(〇)2於環中之飽和或不飽和基(但非雜芳基), 其中,在稠合環系統中,一或多個環可為環烷基,芳基, 或雜芳基,但是連接點係經由雜環。 ’’經取代之雜環"或"經取代之雜環烷基,,表雜環經丨至3個 相同於經取代之環烷基所定義之取代基取代。 雜環及雜芳基之實例包括,但不限於,氮咀,吡咯,咪 坐,。比唑,吡啶,π比畊,嘧啶,嗒啩,吲啩,異吲哚,吲 木,一氫吲嗓,吲唑,嘌呤,喹淋畊,異喹琳,喹啦,吹 96973.doc -20- 200524606 畊,萘基吡啶,喹喏啉,喹唑啉,唑啉,喋啶,咔唑,咔 啉,菲啶,吖啶,啡啉,異嘍唑,啡畊,異呤唑,啡啰啩, 啡嘍畊,咪唑啶,咪唑啉,哌啶,哌畊,吲哚啉,酞醯亞 胺’ 1,2,3,4_四氫異啥琳’ 4,5,6,7•四氫苯并间噻吩,噻唾, 嘍唑啶,嘧吩,苯并[b]噻吩,嗎啉基’硫嗎啉基(亦稱為嘧 嗎琳基)’喊唆基,ϋ比略咬,四氫σ夫喃基等。 ’·雜環氧基”表-0-雜環,”經取代之雜環氧基”表_〇_經取代 之雜環。 π磷酸基"表_0Ρ(0)(0Η)2(單磷酸基或磷醯基), -0Ρ(0)(0Η)0Ρ(0)(0Η)2(二磷酸基或二磷醯基),及 (三磷酸基或三磷酿 基),或其鹽,包括其部份鹽。當然,應明瞭,一 _,二_, 及三磷酸基(磷醯基,二磷醯基,及三磷醯基)之初氧包括在 例如核糖5位置之氧原子。 ’’磷酸酯’’表上述一-,二_,及三磷酸基之一或多個羥基以 一個烷氧基#代。 ’’膦酸基’’表 _〇P(〇)(R6)(〇H)或 〇p(〇)(r6)(〇r6)或其鹽, 包括其部份鹽,其中各R6獨立選自氫,烧基,經取代之院 基,緩酸,及叛基醋。當然,應明瞭,鱗酸基之初氧包括 在例如核糖5位置之氧原子。 一胺基麟酸基(PhosPhorodiamidate)n表下列基: 〇
(Rt)2n —I (R7)2N /、中各R可相同或不同,各為氫,烷基,經取代之烷基, 96973.doc -21- 200524606 環烷基,或經取代之環烷基。特佳之二胺基磷酸基為下列 基··
’’胺基填酸(phosphoramidate)單酯,,表下列之基,其中R2 及R3如上述定義。在一個較佳具體實施例中,R2係由卩胺 基酸衍生。 R3 < /2 y~(M §,
〇 m OH ••胺基磷酸二酯”表下列之基,其中R1,R2及R3如上述定 義。在一個較佳具體實施例中,R2係由L-胺基酸衍生。 R3
OR1 ,,環狀胺基磷酸基’’表下列之基,其中n為1至3,較佳η為1
η ,,環狀二胺基磷酸基”表下列之基’其中η為1至3 ’較佳η 為1至2。 -22- 96973.doc 200524606 Η If . 产π π n胺基膦酸基(phosphonamidate)”表下列之基,其中R"為 氫,烧基,經取代之烧基,環烧基,或經取代之環烧基。
CHjRH ”硫醇”表-SH基。 ”硫烷基’’或”烷基硫醚’’或’’硫烷氧基’’表-S-烷基。 ”經取代之硫烷基”或π經取代之烷基硫醚”或”經取代之硫 烷氧基”表-S-經取代之烷基。 ”硫環烷基’’表-S-環烷基,f’經取代之硫環烷基’’表經取 代之環烧基。 ”硫芳基’’表-S-芳基,”經取代之硫芳基’’表-S-經取代之芳 基。 ”硫雜芳基”表-s-雜芳基,”經取代之硫雜芳基n表-S-經取 代之雜芳基。 ”硫雜環’’表-S-雜環,”經取代之硫雜環π表經取代之雜 環。 術語”胺基酸支鏈π表式R13NHCH(R12)COOH之α-胺基酸 之R12取代基,其中R12係選自氫,烷基,經取代之烷基,及 芳基,R13為氫或與R12及連接之氮及碳原子分別一起形成一 個雜環。α·胺基酸支鏈較佳為20種天然L胺基酸之一之支 鏈。 96973.doc -23- 200524606 術語”醫藥可接受之前藥”表此技藝認可之一或多個官能 基之修釋’该官能基在活體内可代謝以提供一種本發明化 合物或其活性代謝物。該官能基在此技藝中眾所周知,包 括用於·基及/或胺基取代之醯基,一-,二_,及三碟酸之 酉旨,其中一或多個側羥基轉化為烷氧基,經取代之烷氧基, 芳基氧基,或經取代之芳基氧基等。 術5吾醫藥可接受鹽"表一種化合物之醫藥可接受鹽,該 鹽係由此技藝中眾所周知之各種有機及無機相對離子所衍 生,包括例如鈉,鉀,鈣,鎂,銨,四烷基銨等;當該分 子含有一個鹼官能基時,有機或無機酸之鹽為例如鹽酸 鹽,氫溴酸鹽,酒石酸鹽,甲磺酸鹽,醋酸鹽,順丁烯二 酸鹽,草酸鹽等。 術語”醫藥可接受之部份鹽,,表化合物具有一個取代基有 多於一個基可形成鹽,但是少於最大量之基實際上形成 鹽。例如,一個二磷酸基可形成多種鹽,若僅部份離子化, 生成之基在本文中有時稱為一種部份鹽。 應明瞭,在上述定義之所有取代基中,以彼等之其他取 代基定義之取代基(例如經取代之芳基具有一個經取代之 芳基作為取代基,而該取代基本身經一個經取代之芳基取 代等)所達成之聚合物不包括在本發明中。在該等情況中, 最大數目之該等取代基為三個。亦即,上述各定義係以一 個限制約束,例如經取代之芳基係限於經取代之芳基-(經 取代之芳基)·經取代之芳基。 相似地,應明瞭,上彼定τ > 嚟上迷疋義不包括不許可之取代型式(例 96973.doc -24 - 200524606 如甲基經5個氟取代,或羥基在烯或炔不飽和基2 α位卜該 不許可之取代型式為熟習技藝人士所周知。 一般合成方法 本發明化合物可由輕易可得之起始物質使用下列一般方 法及程序製備。應明瞭’其中顯示典型或較佳方法條件(即 反應溫度,時間,反應物之莫耳比例,溶劑,壓力等),其 他方法條件亦可使用’除非另外說明。最佳反應條件可隨 所用之特定反應物或溶劑而變化,但是該等條件可由熟習 技藝人士以一般最佳程序決定。 另外,本發明方法使用需要之保護基以防止某些官能基 進行不欲之反應。各種官能基之適合保護基及用以保= 去保護特$ 之適合條件為此技#中眾所周知。例 如,許多保護基述於T. w. Greene and G M Wuts,
Protecting Groups in Organic Synthesis, Third Edition, Wiley, NewYork,1999,及其中所引據之參考資料。 , 此外,本發明化合物含有一或多個對掌中心,該等化合 物可製備或分離呈純立體異構物,即各對映體或非對映 體’或富含立體異構物之混合物。所有該等立體異構物(及 富含之混合物)均包括在本發明之範圍内,除非另外說明。 純立體異構物(或富含之混合物)可使用例如此技藝中眾所 周知之光學活性起始物質或立體選擇性試劑製備。或者, 該等化合物之消旋混合物可使用例如對掌管柱層析,對掌 解析劑等分離。 用於下列反應之起始物質為一般已知之化合物,或可以 96973.doc -25- 200524606 已知程序或其顯而易知之修釋製備。例如,許多起始物質 可得自商業上供應者,如Aldrich Chemical Co. (Milwaukee, Wisconsin,USA),Bachem (Torrance,California,USA), Emka-Chemce or Sigma (St· Louis,Missouri,USA)。其他可 以標準參考書中所述之程序或其顯而易知之修釋製備,如 Fieser and Fieserfs Reagents for Organic Synthesis, Volumes 1 -15(John Wiley and Sons, 1991),Rodd’s Chemistry of Carbon Compounds, Volumes 1-5 and Supplementals (Elsevier Science Publishers, 1989),Organic Reactions, Volumes 1-40 (John Wiley and Sons, 1991), March’s Advanced Organic Chemistry,(John Wiley and Sons, 4 Edition) , 及 Larock’s Comprehensive Organic Transformations(VCH Publishers Inc·,1989)。特定言之,本 發明化合物可以一般有機化學及特別核苷及核苷酸類似物 合成技藝中已知之各種方法製備。製備核苷及核苷酸類似 物之一般回讀包括 1) Michelson Α·Μ· "The Chemistry of Nucleosides and Nucleotides,’’ Academic Press, New York, 1963; 2) Goodman L. ’’Basic Principles in Nucleic Acid Chemistry,’’ Academic Press,New York,1974,vol· 1,Ch· 2 ;及3)"Synthetic Procedures in Nucleic Acid Chemistry,’’
Eds. Zorbach W. & Tipson R., Wiley, New York, 1973, vol. 1 & 2。 本發明化合物之合成一般依據一種會聚性(convergent) 或線性合成途徑,如下述。下列概圖1例示製備7-(2f-甲基 96973.doc •26- 200524606 -β-D-呋喃核糖基)-4-胺基-5-(乙炔·1-基)-吡咯并[2,3-d]嘧 唆之二種不同方法。 概囷1
; ; i ϊ HO OH HO OH 7 10 96973.doc -27- 200524606 特定言之,在概圖1中,商業上可得之心氯_吡咯并 嘧啶,化合物2,與略微過量,較佳約1〇5至2當量之沐碘_ 琥㈣亞胺在一種適合惰性稀釋劑(如DMF,乙猜等)中接 觸,轉化為4-氯-5-碘-吼咯并[2,3_d]l^,化合物3。反應 典型在約0至約4(TC,較佳在周圍條件進行,直到反應實質 亡完成為止。反應較佳在黑暗中(例如在一個落覆蓋之反應 室中)進行,典型在約6至24小時内完成。4•氣-5•碘“比咯并 [2,3-小密淀,化合物3,可以習知方法如過遽,蒸發等分離。 純化較佳以結晶完成,化合物3之產率大於。 4氣5-碘-吼咯并[2,3-d]喊啶,化合物3,在周圍條件併 入-種適合惰性溶劑(如乙腈’ DMF#)中。略微過量之氯 化鈉,典型約^丨至M,較佳約1〇4當量,相對於化合物3, 逐份加入溶液中。生成之系統在周圍條件以攪拌維持約〇 5 至4小時,較佳約2小時。在反應實質上完成時,任何不溶 f生粒子以過遽由反應混合物移❺。此遽液中化合物3之納鹽 (未顯示)不進一步純化而用於下一步驟。 息 另外1-甲氧基-2-甲基-3,5-二-0-(2,4-二氣苯甲基;n咬 南核糖,化合物8 (述於下),溶於一種適合之惰性稀釋劑(如 虱仿,二氣甲烷,四氫呋喃等)中,生成之系統冷卻至約〇 至10°C。當場製備對應之卜漠_2_甲基_3,5_二_〇_(2,心二氣苯 曱基)-D-呋喃核糖(未顯示),由與冒泡通入反應系統之溴化 虱氣體反應至反應實質上完A,典型在0.1至1小時内發 生生成之產物以蒸發獲得,較佳在不超過2〇°c之溫度, 殘餘之微量溴化氫在真空中(較佳在少於約15 torr之壓力) 96973.doc -28- 200524606 移除。 過量 ,化合物3 典型約1β〇1至約2當量(更佳1β5至2當量) 之鈉鹽與1-溴-2-甲基_3,5·二-〇_(2,4- -翕芏田甘、,+ 一虱本甲基)-D_呋喃 核糖在一種適合溶劑(如乙腈,DMF等)中合併。反應典型 維持在周圍條件至實質上完成,典型在約6至約24小時内發 生。生成之產物7-(2,-甲基·3,,5,_二_〇_(2,4_二氯苯甲 ,化合物 基)-β-D-呋喃核糖基)-4·氯-5-碘-吡咯并[2,3_d]嘧啶 4’以習知程序分離。較佳反應溶液中和,溶劑蒸發。然後 化合物4以一種適合溶劑(例如曱苯,二甲苯等)碾製。產物 以急驟層析’然後結晶純化。 然後二氣苯曱基保護基以習知程序移除,如甲基 二-0-(2,4_二氯苯甲基)-β·0_呋喃核糖基)_4_氣_5-碘_ 吡咯并[2,3-d]嘧啶,化合物4,與Bel;接觸,獲得7_(2,_甲基 -β-D-呋喃核糖基)-4-胺基-5-碘-吡咯并[2,3-d]嘧啶,化合物 5。反應較佳在一種惰性稀釋劑(如氣仿,二氣甲烷等)中進 行。反應混合物最初維持在約_60至約-8〇〇c約丨至約4小時, 然後溫熱至-40至〇°C直到反應實質上完成為止,典型在is 24小時後發生。然後反應以甲醇淬火,然後以一種鹼,較 佳以氫氧化銨,使pH升高至約7中和。生成之7-(2匕曱基 卬呋喃核糖基)-4-氯-5-碘-吡咯并[2,3-d]嘧啶,化合物 5 ’以習知方法如過濾,蒸發,層析,沉澱等分離。 然後化合物5之4_氯與過量液態氨接觸而胺化。反應較佳 在約75至約90 °C於一個壓力反應器中典型維持在約1〇〇至 約500 psi進行。反應繼續至實質上完成,典型在約12至48 96973.doc -29- 200524606 J夺内冬生。生成之7-(2、甲基呋喃核糖基)-4_胺基 埃比17各并[2,3_d]哺啶,化合物6,以習知方法如過濾,蒸 發,層析,沉澱等分離。 如圖1所示,7_(2,-甲基呋喃核糖基)_4_氯-5_碘-吡咯 并[2,3_d]’咬’化合物5,或7_(2,·甲基·p_D-呋喃核糖基)_4_ 胺土 比略并〇d]嘴唆,化合物6,之埃基轉化為對 應之(三甲基)矽烷基乙炔基。轉化係由化合物5或6先溶於一 種適合惰性稀釋劑(如DMF,THF,或DMF/THF 3 : 7比例之 此曰物)中而完成。然後催化量之碘化亞銅(Cul)及四(三苯 膦)鈀(〇)與過量,典型U至2當量,(三甲基石夕烷基)乙炔加 反應/% a物中。反應較佳在一種驗(如三乙胺)存在下進 行,較佳在一種惰性氣壓下進行。反應典型在約1〇至約3〇 c進行至實質上完成,典型在約12至48小時内發生。 化合物5所衍生之產物,即7-(2,_甲基呋喃核糖基)_4· 氣-5-(三甲基矽烷基乙炔基p比咯并[2,3·_啶,化合物 10,以t知方法如過濾,蒸發,層析,沉澱等分離。 化合物6所衍生之產物,即7_(2,_甲基-卜仏呋喃核糖基)_4· 胺基-5-(三甲基矽烷基_乙炔基)_吡咯并[2,3_d]嘧啶,化合物 7,以!知方法如過濾,蒸發,層析,沉澱等分離。 然後化合物7可以去矽烷基化轉化為乙炔衍生物(·^ξ CH),其係經由習知方法使用氫氧化銨,碳酸鉀,或氣陰離 子發生。例如,7-(2,-甲基呋喃核糖基)_4_胺基_5_(三 曱基矽烷基-乙炔基)-吡咯并[2,3_d]嘧啶,化合物7,與氫氧 化銨在甲醇中反應,產生化合物1。 96973.doc -30 - 200524606 或者,去矽烷基化及胺化可使用化合物10與濃氨反應, 產生化合物1。 ’ 在另一具體實施例中,化合物3先如上述以三f基矽烷基 乙炔處理,形成化合物5a。化合物化可如上述偶合於2,_尹 基-3,5-一 -〇-(2,4-二氣苯甲基)_D_呋喃核糖,形成化合物 7a。最後由該糖移除2,4_二氣苯甲基保護基,產生化合物1〇。 下列概圖2例示製備7_(2,-甲基呋喃核糖基)-4-胺基 -5-(乙快小基)料并[2,3_d]_,化合物卜之合成變異。 概圖2
96973.doc •31- 200524606 在概圖2中,7_(2,-甲其r v - η , 1 Y 基·3,5-一-〇·(2,4-二氣笨甲基)-β-Ιχ 呋喃核糖基)-4-氯-5_碘-吡咯并[2,3_d]嘧啶,化合物4,以上 述方法胺化,產生7-(2,-甲基-3,,5,-二-〇_(2,4_二氣笨甲 基)-β如夫喃核糖基)_4.胺基·5_‘㈣并[2,3__淀,化合 物12。此化合物用作各反應概圖之焦點,可用以製備'(2、 甲基-β-D十南核糖基)_4•胺基·5•(乙块小基)“比哈并[2知 嘴咬,化合物1。 ’ ] /第-個具體實施例中,化合物12之祕保護基使用三 虱化硼以上述概圖i中所述之方式移除,獲得甲茂 -β-D-呋喃核糖基)_4_胺基,·5·碘·吡咯并[2,3_d]嘧啶化入二 6。然後化合物6使用催化量之蛾化亞銅(CuI)及四(三笨 纪(〇)與過量’典型U至2當量’(三甲基石夕统基)乙快—起 在-種上述驗存在下轉化為對應之7_(2,甲基仙“夫喃核 糖基)-4·胺基·5_(三f基魏基乙炔基)“比4并[2,3_d]嘴 咬,化合物7。 在-個具體實施例中,7_(2._甲基仙十南核糖基)·4·胺 基-5-(三甲基矽烷基乙炔基)·吡咯并[2,3_d]嘧啶化合物7, 如上述去矽烷基化,產生化合物1。 在另一具體實施例中,化合物12使用催化量之碘化亞銅 (Cul)及四(三苯膦)鈀(〇)與過量,典型hl至2當量,(三甲基 矽烷基)乙炔一起在一種上述鹼存在下轉化為對應之7_(2·_ 甲基3,5 一-0-(2,4-一氣苯甲基)_p_D_呋喃核糖基胺基 -5-(三甲基矽烷基乙炔基)·吡咯并[2,3 d]嘧啶化合物Μ。 化合物13進行去矽烷基化及移除羥基保護基,產生化合 96973.doc -32· 200524606 物1。如概圖2中所示,這二個步驟之次序不重要,在一個 具體實施例中,去矽烷基化先以上述方式進行,獲得7_(2f_ 甲基3,5 _一-〇_(2,4-二氣笨甲基呋喃核糖基)_4-胺基 -5-乙炔基-吡咯并[2,3_d]嘧啶,化合物14,然後亦如上述移 除羥基保護基,獲得化合物1。在另一具體實施例中,羥基 保護基之移除先進行,獲得7_(2, 甲基糖基^ 胺基-5-(三甲基矽烷基_乙炔基)_吡咯并[2,3_d]嘧啶,化合物 7 ’然後進行去矽烷基化,產生化合物1。 或者,化合物7a可由化合物4與三曱基矽烷基乙炔如上述 反應而製備。化合物7a之三甲基矽烷基可如上述移除獲 得化合物15。化合物16係由化合物15之苯甲基保護基移除 而製備。化合物1 5使用上述技術胺化,產生化合物i。 在另一替代方法中,化合物7a可以液態氨胺化而直接轉 化為化合物14。 上述概圖1及2中所用之2_經取代之核糖可以此技藝中眾 所周知之方法製備。例如,這些化合物之一種起㈣質為 一種經適當取代之糖,具有2,_〇H及2,_H。該糖可購買,或 可以任何已知方法製備,包括標準表異構,取代,氧化及/ 或還原技術。例如,可使用商業上可得之i,3,5_三_〇·苯甲 醯基-a-D-呋咕核糖(Pfanstiel Lab〇rat〇ries,—·)。然後該經 取代之糖可以適當氧化劑在一種相纟溶劑中於適合溫度氧 化,產生2 -經修釋之糖。可能之氧化劑為例如戴斯·馬丁 (Dess-Martin)過破試劑,Ac2〇+DCC於DMS〇中史溫 氧化劑(DMS〇,草醯氣,三乙胺),瓊斯(Jones)試劑(鉻酸 96973.doc •33· 200524606 及硫酸之混合物),柯琳斯(Collins’s)試劑(二σ比σ定氧化 Cr(VI)),柯瑞(Corey丨s)試劑(氣鉻酸吡錠),二鉻酸吡錠,g曼 式二鉻酸鹽,過猛酸鉀,Mn〇2,四氧化釕,相轉移催化劑, 如鉻酸或過猛酸鹽載於一種聚合物上,Cl2-^咬,H2〇2-l目 酸銨,NaBr02-CAN,NaOCl於HOAc中,亞鉻酸銅,氧化 銅,雷氏(Raney)鎳,醋酸鈀,梅蘊-龐哚夫-維利 (Meerwin-Pondorf-Verley)試劑(第三丁醪鋁與另一種酮),及 N-溴琥拍醯亞胺。 一種有機金屬碳親核劑,如一種格納(Grignard)試劑,一 種有機鋰,二烷基銅鋰,或CH3-SiMe4於TBAF中,與該酮 及適合非質子溶劑在適合溫度偶合,產生2’-甲基糖。例如, 可使用 CH3MgBr/TiCl4 或 CH3MgBi7CeCl3,如 Wolfe et al. 1997,J· Org· Chem· 62:1754-1759中所述。甲基化糖可選擇 性以一種適合保護基,較佳為醯基,經取代之烷基,或矽 烧基,以熟習技藝人士周知之方法保護,如Greene et al., Protective Groups in Organic Synthesis, John Wiley and Sons,Second Edition,1991教導。 除上述外,本文中所述合成方法中所用之2’-C-經取代之 糖為此技藝中眾所周知,述於例如Sommadossi,et al.1G及 Carrol,et al·11’12,全部併入本文供參考。 下列概圖3述及一種經保護之糖之另一種合成,該糖可用 於偶合於本文中所述之驗基。 96973.doc -34- 200524606
概囷3
其中Ph為苯基,X’為一個適合離去基,如鹵。 上述概圖3中糖a之形成係如Mandal,S.B·,et al·,Synth· Commun. 1993,9,ρ· 1239所述由商業上可得之D-核糖開始 而完成。經基經保護形成糖b述於界出>%0.:^.61&1.,丁61:· Lett· 1990,31,ρ·4787。糖 c 及 d係使用 Ning,J. et al., Carbohy dr. Res. 2001,330,ρ.165之方法及本文中戶斤述之方 法製備。糖e係使用格納(Grignard)反應之一種修釋方法, 以CH3MgBr或其他適合有機金屬,如本文中所述(不需要鈦 /鈽)製備。最後,其後偶合反應中所用之鹵化糖(X=鹵)係使 用上述製造糖b中所用之相同保護方法製備。該鹵化係述於 Seela之美國專利6,211,158。 然後,任何所述之核苷可以熟習技藝人士周知之方法去 保護,如 Greene et al·,Protective Groups in Organic Synthesis,John Wiley and Sons,Second Edition,1991教導。 另一種製造可用於偶合雜環鹼基之經保護之糖之方法述 96973.doc -35- 200524606 於下列概圖4。 概囷4
在概圖4中’化合物g之羥基之甲基化係以習知方法進 行,獲得化合物h。化合物h之2, 3及5經基各以2,4·二氣苯 曱基保遵,獲得化合物i。化合物i之2-(2,,4,-二氣笨甲基)之 選擇性去保護係經由與氣化亞錫在一種適合溶劑(如二氣 甲烧’氯仿等)中於低溫(例如約〇至5。〇)接觸而進行,直到 反應完成為止,例如24-72小時,獲得化合物j。2-經基之氧 96973.doc -36- 200524606 化係如本文中所述進行,獲得化合物k。亦如本文中所述進 行甲基化,獲得化合物1。 W,W1或W2非氫之化合物使用上述製備之化合物作為起 始物質之製備可使用下列前藥製備之回顧中所述之方法完 成: 1) Cooperwood,J. S. et al·,’’Nucleoside and Nucleotide prodrugs,1’ in Ed(s) Chu,C. K. Recent Advances in Nucleosides (2002),92-147 ° 2) Zemlicka,J· et al·,Biochimica et Biophysica Acta (2002), 158(2-3),276-286。 3) Wagner, C. et al.5 Medicinal Research Reviews (2002), 20(6),417-451 〇 4) Meier,C. et al·,Synlett (1998),(3),233-242。 例如,l-[5-(炔基)-4-胺基^比咯并[2,3-d]嘧啶]-2’-C-甲基 -β-D-呋喃核糖苷化合物之5’-羥基轉化為一種磷酸基,二磷 酸基,或三填酸基類似物可使用D.W. Hutchinson,(Ed· Leroy b. Townsend) ffThe Synthesis, reaction and Properties of Nucleoside Mono-,Di-,Tri-, and tertaphosphate and Nucleosides with Changes in the Phosphoryl Residue,’’ Chemistry of Nucleosides and Nucleotides,Plenum Press, (1991) 2中所述之方法製備。 呋喃核糖苷之胺基酸酯之製備可如下列概圖5中所示完 成: 概圊5 96973.doc -37- 200524606
所欲Boc-保護之胺基酸(較佳為L_胺基酸)及n,n,_羰基二 咪唑溶於一種惰性溶劑(如THF)中。反應混合物保持在約2〇 至約40C之間約〇·5至24小時。含有略微過量之所欲核苷於 一種惰性溶劑(如DMF)中之溶液加入B〇c-保護之胺基酸混 合物中,在約40至約8〇°C加熱約2至約24小時。結構異構物 之混合物使用習知技術如蒸發,沉澱,過濾,結晶,層析 等分離。 然後所欲酯使用例如i :丨體積/體積丁]?八/1:)(:]^溶液在約2〇 及約40°C酸化約〇·ι至約i小時及蒸發。殘餘物溶於水中, 在力0至約30 C保持約2至約24小時。混合物可以 使用標準技術及條件分離所欲產物。 雖然上述概圖證明去氮雜嘌呤前藥之產生,但是此方法 可用於任何所欲核苷化合物。同樣地,胺基酸可以對於反 應條件適合之任何保護基保護。這些保護基在此技藝中眾 96973.doc -38- 200524606 所周知。 圖6中所示 吱喃核糖苷之其他烷基酯之製備可如下列概 完成: 概囷6
化合物U容於-種無水溶劑(如„比咬)中,一種石夕烧基^如 第三丁基氣二苯基傾)加人,在糖之5,_位置形成—個保護 基。可使用任何可至5,·位置且可以移除生成最終所欲之3,-酯之保護基。此反應係在約10至40。。之溫度進行約4至24小 時。所欲醯基氣加人經保護之核苦化合物3()中,攪摔約4至 約24小時’形成化合物3 1。盆可使用# 八」便用^準技術如分離,結 晶,萃取,過濾、,層析等分離及純化。化合物32係由移除 5’-位置之保護基而製備。其可由化合物%與氟化四丁敍於 96973.doc -39· 200524606 THF中之1M溶液反應而完成。最終產物係使用標準技術如 分離,結晶,萃取,過濾,層析等分離及純化。 雖然上述概圖證明去氮雜嘌呤前藥之產生,但是此方法 可用於任何所欲核苷化合物。 利用性,測試,及施用 利用性 本發明提供具有抗病毒(包括C肝炎病毒)活性之新穎化 合物。本發明化合物係由抑制涉及複製之酶(包括RNA依賴 性RNA聚合酶)而抑制病毒複製。彼等亦可抑制黃病毒科病 毒(如HCV)之活性或增生中所用之其他酶。 本發明化合物亦可用作核苷前藥。因此,彼等吸收入細 胞内,在細胞内可由激酶磷酸化成三磷酸鹽,然後為聚合 酶(NS5b)之抑制劑及/或用作鏈終止劑。 本發明化合物可單獨或與其他治療病毒之化合物合併使 用。 醫藥組合物之施用 本發明化合物一般以治療有效量以相似用途之劑之任何 T接义之;?也用方式施用。本發明化合物(即活性成份)之實際 量依許夕因素而定,如所治療疾病之嚴重性,個體之年齡 及有關健康,所用化合物之效力,施用途徑及形式,及其 他因素。該藥物可一天施用多於一次,較佳一天施用一或 二次。 式1化合物之治療有效量範圍可由約〇·〇5至50毫克/接受 者每公斤體重/天;較佳約〇·〇1·25毫克/公斤/天,更佳約〇5 96973.doc 200524606 至ι〇毫克/公斤/天。因此,施用於一位70公斤之人,劑量範 圍最佳為每天約35-70毫克。 本發明化合物一般以醫藥組合物以下列任一途徑施用·· 經口,全身(例如經皮,經鼻内,或以栓劑),或非經腸(例 如經肌肉内,經靜脈内,或經皮下)施用。較佳施用方式為 口服,使用習知每天劑量,其可根據疾患程度而調整。組 合物可呈錠,藥丸,膠囊,半固體,粉末,持續釋放調配 物,溶液,懸浮液,醜劑,氣溶膠,或任何其他適合組合 物。施用本發明化合物之另一較佳方式為吸入。 調配物之選擇依各種因素而定,如藥物施用之方式及藥 物,生物可利用性。對於經由吸入輸送,化合物可調配呈 液態溶液,懸浮液,氣溶膠,或乾燥粉末,裝人_種適合 之,用分配器中。有幾種藥劑吸人裝置:霧化器吸入器, 計量,入器(MDI),及乾燥粉末吸入器(Dpi)。霧化器裝置 產生高速度空氣流,使得治療劑(其調配呈液體形式)噴灌呈 霧’進入病人之啤吸道。讀典型為以一種壓縮氣體包裝 之调配物。在開動時’該裝置以壓縮氣體釋出一測量量之 治療劑,因此提供_插A m . ^
’、種如用一疋置藥劑之可信賴方法。DPI 为配冶療劑之自由流動粉 杨末^/式,其可在呼吸期間由裝置 分散於病人吸入之空 乳机為獲得自由流動之粉末,治療 劑與一種賦形劑如乳糖調旦 ’、 劂里里之治療劑以膠囊形式 貝丁存,並以開動分配。
最近,已特別針對顯示 調配物,基於生物可利 不良生物可利用性之藥物發展醫 用性可由增加表面積(即減少粒子 96973.doc -41 - 200524606 大小)而增加之原理。例如,美國專利4,m,288述及一種醫 藥調配物具有粒子大小範圍由1G至IGOOnm,其中活性物質 載於大分子之交聯基質上。美國專利5,145,684述及一種醫 藥調配物之製造中藥物在一種表面修釋劑存在下粉碎 成奈米粒子(平均粒子大小_叫,然後分散於—種液體介 質中’獲得-種具有顯著高生物可利用性之醫藥調配物。 該組合物一般包含一種式I化合物合併至少一種醫藥可 接受之賦形劑。可接受之賦形劑無毒性,協助施用,不會 不利地衫響式I化合物之治療利益。該賦形劑可為任何固 體液體半固體,或在氣溶膠組合物之情況,氣體賦开》 劑,一般為熟習技藝人士可得。 固體醫藥賦形劑包括澱粉,纖維素,滑石,葡萄糖,乳 糖,嚴糖,明膠,麥芽糖,米,麵粉m夕膠,硬脂 酸鎮,硬脂酸納’ n硬脂酸s旨,氣钱,乾燥脫脂牛 奶等。液體及半固體賦形劑可選自甘油,丙二醇,水,乙 醇,及各種油’包括石》’動物,植物,或合成來源,例 如化生油,大旦油,礦油,麻油等。較佳之液體載劑,特 別用於注射溶液,包括水,食鹽水,右旋糖水溶液,及二 醇0 可使用壓縮氣體以分散本發明化合物之氣溶膠形式。適 合此目的之惰性氣體為氮,二氧化碳等。其他適合醫藥賦 形劑及其調配物述於 Remingt〇n,s pharmaceutical Sciences, E.W. Martin (Mack Publishing Company,18th ed·,1990)。 調配物中化合物之量可在熟習技藝人士所用之全部範圍 96973.doc -42- 200524606 内變化。調配物典型含有,基於重量百分比(重量°/❶),約 0 · 0 1 - 9 9 · 9 9重量%之一種式I化合物,基於總調配物計,其 餘為一或多種適合之醫藥賦形劑。化合物較佳以約1-80重 量%之量存在。含有一種式I化合物之代表性醫藥調配物述 於下文。 此外,本發明係關於一種醫藥組合物,包含治療有效量 之一種本發明化合物合併治療有效量之另一種對抗RNA依 賴性RNA病毒(特別是對抗HCV)之有效劑。對抗HCV之有效 劑包括,但不限於,利巴維靈(ribavirin),來福維靈 (levovirin),維拉米定(viramidine),胸腺素(thymosin) α -1, HCV NS3絲胺酸蛋白酶之抑制劑,或肉苷單磷酸去氫,干 擾素-α,聚乙二醇化(pegylated)干擾素-a(peginterferon-a) 之抑制劑,干擾素-a及利巴維靈之合併物,聚乙二醇化干 擾素-a及利巴維靈之合併物,干擾素-a及來福維靈之合併 物,及聚乙二醇化干擾素-a及來福維靈之合併物。干擾素-a 包括,但不限於,重組之干擾素-a2a(如ROFERON干擾素, 可得自 Hoffman-LaRoche,Nutley,NJ),干擾素-a2b(如 Intron-A干擾素,可得自 Schering Corp·,Kenilworth,New Jersey,US A),一種同意(consensus)干擾素,及一種純化之 干擾素-a產物。利巴維靈及其對抗HCV之活性之討論參見 J.O. Saunders and S.A. Raybuck,’’Inosine Monophosphate Dehydrogenase: Consideration of Structure, Kinetics and Therapeutic Potential,Ann. Rep. Med, Chem., 35:201-210 (2000) 〇 96973.doc -43- 200524606 實例 下列實例及本文中下列簡寫具有下列意義。若無定義 則該術語具有一般所接受之意義。
AcOH或 HOAc =醋酸 Ac2〇 =醋酸酐 Ar =芳基氫 atm =氣壓 CAN =石肖酸鏔飾 bs =寬單線 cm =公分 d =二重線 dd =雙二重線 dt =雙三重線 DBU =1,8-二氮雜雙環[5.4.0]十一-7-烯 DCB =2,4-二氣苯甲基 DCM =二氣甲烧 DCC =二環己基碳化二醯亞胺 DMEM =戴貝可(Delbecco’s)最小伊格 (eagles)培養基 DMF =二曱基甲醯胺 DMSO =二曱亞石風 DTT =二硫蘇糖醇(threitol) EDTA =乙二胺四醋酸 Fmoc =9-第基甲基氯甲酸酯 96973.doc -44- 200524606 eq.或 eq =當量 g =克 h或hr =小時 HCV =c肝炎病毒 HPLC =高性能液態層析 IC50 ==抑制5 0%之抑制濃度 IPTG ==異丙基β-D-l-硫半乳哌喃糖苷 IU =國際單位 Kg =公斤 L =升 m =多重線 M =莫耳濃度 Me =甲基 mg =毫克 min =分鐘 mL mm =毫升 =毫米 mM =毫莫耳濃度 mmol =毫莫耳 MS =質譜 mp =溶點 ng nm =奈克 =奈米 nM =奈莫耳濃度 96973.doc -45- 200524606 NMR =核磁共振 NTA ==氮基三醋酸 NTP =核苷三磷酸 RP HPLC =逆相高性能液態層析 S =單線 t =三重線 TBAF =氟化四丁基錄 TC50 = 50%細胞毒性之毒性濃度 TEA =三乙胺 TFA =三氟醋酸 THF =四氫σ夫喃 Tic 或 TLC =薄層層析 UTP =尿普三碟酸 uv =紫外線 μL =微升 Mg =微克 μΜ =微莫耳濃度 v/v =體積比體積 wt% =重量百分比 此外,所有反應及熔解溫度為攝氏度,除非另外說明, 及所有百分率為莫耳百分率,除非另外說明。 在下列實例及本文中其他部份,所請求之化合物使用下 列編碼系統: 96973.doc -46- 200524606
實例1 糖中間物1-甲氧基-2 -曱基-3,5_二- 0-(2,4 -二氣苯甲基)-D-呋喃核糖(化合物8)之合成 標題化合物係使用 Martin,P·,Helv. Chim. Acta,1995,78, 486及Carroll等人之國際專利申請案WO 02/057287 A2中 所述之方法製備。 實例2 7-(2’-甲基-p-D-呋喃核糖基)-4-胺基-5-(乙炔-1-基)_吡咯并 [2,3-d]嘧啶(化合物1)之製備
HO ΟΗ 步驟1· 4_氣_5_碘-7H-吡咯并[2,3-d]嘧啶(化合物3) 4-氯-7H-。比咯并[2,3_d]嘧啶 10.75 克(70 毫莫耳)(TororTto Research Chemicals,Inc)及 N-峨琥 ίό 醯亞胺(16.8 克,75 毫 莫耳)溶於400毫升無水DMF中,在周圍溫度於黑暗中過 96973.doc -47- 200524606 夜。溶劑蒸發。黃色殘餘物懸浮於熱Na2S03之10%溶液中, 過濾,以熱水洗二次,由乙醇中結晶,獲得14.6克(74.6%) 標題化合物,呈灰白色結晶。母液蒸發至1/3體積,再由乙 醇中結晶,獲得2.47克(12.3%)標題產物。 總產率接近100%。 熔點 212-214(分解) UV Xmax : 307, 266, 230, 227 nm (甲醇) MS : 277.93 (M-H),313 (M+C1) lH-NMR (DMSO-d6) : 12.94 (s, 1H, NH), 8.58 (s, 1H, H-2),7.94 (s,1H,H-8) 步驟 2· 7-(2,-甲基-3,,5,-二-〇-(2,4-二氣苯曱基)_p-D-呋喃 核糖基)-4•氣-5-碘-吡咯并[2,3-d】嘧啶(化合物4) 上述所獲得之鹼(化合物3)(33.5克,120毫莫耳)懸浮於 1000毫升CH^CN中。NaH(5克,125毫莫耳60%於油中)逐份 加入,反應混合物在室溫攪拌至NaH溶解(約2小時)。1 -甲 氧基-2-甲基-3,5-二-0-(2,4-二氣苯甲基)-β-〇-呋喃核糖(化 合物8,參見上述實例1)(33克,60毫莫耳)溶於1〇〇〇毫升DCM 中’在冰/水浴中冷卻至4°C。HBr氣體冒泡通入DCM溶液約 30分鐘。反應以TLC偵測至起始之糖消失為止(醚/己烷丨:9 體積/體積)。在反應完成時,溶劑以不高於2〇它之浴溫蒸 發’在真空中保持30分鐘以移除微量之HBr。預先形成之鹼 3之Na鹽溶液快速過濾,濾液加入糖成份中。反應混合物保 持在周圍溫度過夜’然後以HC1/二氧六圜中和,蒸發。曱 苯(3 00毫升)加入,形成未反應之雜環鹼之淡黃褐色沉澱 96973.doc -48 - 200524606 物’過慮移除。遽液濃縮至約1 5 0毫升體積,褒載於具有石夕 膠之2升玻璃渡器上。濾、器以1升曱苯洗,產物以1 〇 %醋酸 乙酯於甲苯中(約9升溶劑)溶離。溶劑蒸發,殘餘物由乙醇 結晶,獲得27.5克(55·6°/〇)標題核苷。 熔點67-70° iH-NMR (DMSO-d6): 8.66 (s,1H,H-2),8.07 (s,1H,Η-8), 7.62-7.34 (m,6Η,一 氟苯基),6.22 (s,1H,Η-Γ),5.64 (s 1Η,Η-3’),4.78-4.55 (m,4Η,CH2-苯甲基,2、〇Η,Η-4,), 4.20(8,211,(:112-苯甲基),3.97-3。93及 3.78-3.75 ((1〇1,111, Η·5’),0·92 (s,3Η,2·-甲基) MS : 743.99 (Μ+Η) 〇 步驟3· 7-(2’·曱基-p-D-呋喃核糖基)_4•氣_5·碘-吡咯并 [2,3-d]嘧啶(化合物5) 在上述步驟之化合物4 (27·5克)於DCM(800毫升)中在-70 °C之溶液内逐滴加入三氯化硼(1M於DCM中,400毫升)。混 合物在-70°C攪拌2.5小時,在-20°C攪拌過夜。反應由加入 甲醇/001\4(500毫升,1:1)淬火,生成之混合物在-2〇。〇攪 拌30分鐘,然後在相同溫度以氨水溶液中和。固體過渡, 以甲醇/DCM(1 : 1,體積/體積)洗3次。濾液與2〇〇毫升矽膠 合併’蒸發至乾。乾燥殘餘物分布於1 5〇〇毫升乙腈及3〇〇毫 升己烧之間。收集乙腈,以己烷萃取3次,蒸發。殘餘物溶 於醋酸乙醋(600毫升)中,以水,鹽水洗5次,以硫酸鈉乾燥, 洛發。殘餘物以急驟層析在矽膠上以甲醇/丙酮1 ·· 2體積/ 體積(約3升)由小量未反應之鹼純化。溶劑蒸發,殘餘物由 96973.doc -49- 200524606 丙酮/己烷結晶,獲得12.9克(82%)標題核苦5。 iH-NMR (DMSO-d6): 8.84 (s,1H,Η-2),8·20 (s,1H,H-8), 6.21 (s,1Η,Η-Γ),4·00·3·60 (m,糖),〇·84 (s,3Η,2’-曱基) MS ·· 426.26 (M+H) 0 熔點 182-185 步称4· 7_(2匕甲基_p-D-吱味核糖基)_4_胺基·5_破-n比洛并 [2,3-d]嘧啶(化合物6) 上述製備之核苦5(1.5克’ 3.5¾莫耳)在金屬壓力反應器 中以液態氨在85°C處理24小時。在氨蒸發後,殘餘物溶於 曱醇中,與矽膠(約20毫升)加入,濃縮至乾。然後攜帶產物 之矽膠裝入一個矽膠管柱(5x10公分)上於丙酮中,然後溶 離,收集50毫升溶離份。溶離份2-8含有標題化合物。丙_ 蒸發,殘餘物由甲醇/乙腈結晶,獲得1.2克(84%)標題核苦。 熔點220-222(分解) W-NMR (DMSO-d6): 8.20 (s,1H,H-2),7.80 (s,1H,H-8), 6.80-6.50 (bs,2H,NH2),6·09 (s,1H,Η-Γ),5.19 (t,1H,糖), 5.13-5.11(m,2H,糖),4.00-3.70 (m,3H,糖),3.60-3.20 (m, 1H,糖),0.84 (s,3H,2’-甲基)。 MS 407.32 (M+H)。 步驟5· 7-(2’-甲基-p-D-呋喃核糖基)_‘胺基_5-(三甲基矽烷 基乙炔-1-基)-。比咯并[2,3-d】嘧啶(化合物7) 上述步驟中合成之胺基核芽6(1.7克,4.2毫莫耳)溶於12 毫升無水DMF及28毫升無水THF之混合物中。三乙胺(3.6 毫莫耳,0.5毫升)及Cul(l毫莫耳,8〇毫克)加入,燒瓶中裝 96973.doc -50 - 200524606 入氬。四(三苯膦)鈀(0)(0.04毫莫耳,46毫克),然後(三曱 基矽烷基)乙炔(1.5當量)加入,混合物在氬下攪拌2〇小時。 然後溶劑蒸發,殘餘物溶於丙酮中,然後經一個玻璃濾器 漏斗上之矽膠(5x10公分)過濾。丙酮蒸發,殘餘物溶於乙腈 中,再經相同大小之矽膠管柱過濾,以乙腈溶離。乙腈濃 縮至小體積,然後約10體積之醚加入,溶液以聲波處理5分 鐘。形成標題化合物之白色結晶,獲得〇·8克化合物7(71。/〇)。 熔點188-191(分解) iH-NMR (DMSO-d6): 8.17 (s,1H,H-2),7.92 (s,1H,H-8), 7.20-6.80 (t,2H,NH2),5.83 (s,1H,H-l,),3.75-3.20 (m, 糖),0·45 (s,3H,2’·甲基),〇 (s,9H,Si(CH3)3)。 步驟6·標題化合物7-(2,_甲基-p_D-呋喃核糖基卜‘胺基 _5_(乙炔-1-基)-吡咯并[2,3_d]嘧啶(化合物u之製備 矽烷基化核苷7(1克,2.6毫莫耳)溶於1〇毫升甲醇中,1〇 宅升NH4〇H加入,混合物在周圍溫度1小時。溶劑蒸發,殘 餘物溶於甲醇中,與矽膠(30毫升)共蒸發。乾燥矽石裝載於 具有矽膠(4x6公分)之玻璃濾器上,化合物以丙酮溶離。溶 劑蒸發,殘餘物由甲醇/乙腈結晶,獲得〇5克(62%); 熔點209-219 (分解); MS 305.13 (M+H); ^-NMR (DMSO-d6): 8.10 (s, iH, H-2), 7.94 (s, 1H, H-8), 6.08 (s, 1H,H-l'),5.32-5.13 (m, 3H,糖),3 96_3 62 (m,4H, 糖),0·68 (s,3H,甲基)。 實例3 96973.doc -51 - 200524606 7-(2f•甲基-3’_0-L-纈胺酸酯-p_D-呋喃核糖基)_4胺基 胃5_(乙炔-1-基)_〇比洛并[2,3_d]鳴咬(22a)之製備 此化合物之合成概要示於概圖5。
ΒοΜ呆護之L-纈胺酸(271毫克,丨.25毫莫耳)及N,N、羰基 二咪唑(203毫克,1.25毫莫耳)溶於5毫升THF中,保持在^ 圍溫度2小時。化合物1(3〇〇毫克,}毫莫耳)於5毫升DMF中 之溶液加入,混合物在65°C加熱過夜。反應混合物之HPlc 分析證明起始之核苷及5,-一醯基化產物(化合物21a)存 在。目標之B 〇c顯胺酸衍生物(化合物2 1 a)以製備性Rp HPLC 由 0至 100% B,A-0.1% TFA於水中,B-0.1% TFA於 CH3CN 中分離。產率為40%(二種異構物之混合物i : 5)。 主要異構物·· MS 504 (M+1); NMR (CD3OD) : δ 8.11 & 7.93 (s,1H,鹼),6.23 (s,1H, Η-Γ),5.44 (d,1Η,Η-3’),4·27 (dt,1Η,Η-4,),4.02-3.96 & 3.75-3.70 (dd,1H,H-54及 H-5,b),3.42 (d,1H,cx_H),2.21 (m,1H,β-Η),0.9 (m,9H,Boc),0·89 (s,3H,2,-CH3)。 次要異構物: MS 504 (M+1); NMR (CD3OD) : δ 8·92 & 8.10 (s,1H,鹼),6.28 (s,1H, H-l’),5.53 (d,1H,H-3,),4.32 (dt,1H,H-4,),4·10-4·05 & 3·80-3·74 (dd,1H,H-5*a及 H-5fb),3.43 (d,1H,α-Η),2.21 (m,1H,β-Η),1.3-0.9 (m,15H,Boc & Val-CH3),0.89 (s,3H, 2,-CH3) 〇 96973.doc -52- 200524606 上述步驟之酯以TFA/DCM 1 : 1體積/體積在室溫處理2〇 为鐘’蒸發。殘餘物溶於水中,在丨〇過夜。混合物以Rp HPLC由0至100% B分離,緩衝液如上述。收集最長滯留時 間之化合物,蒸發,鑑定為核苷22&之3,·異構物。 MS 404.14 (M+1); UV (pHl) : 251 nm5 282 nm ; NMR (CD3OD) : δ 8·17 & 7·87 (s,1H,鹼),6.21 (s,1H, H-l’),4·72 (d,1H,α·Η),4·12-3·82 (m,4H,糖),2.28 (m,1H, β·Η),1·08 (dd,6H,Val-CH3),0.84 (s,3H,2,-CH3)。 在乾燥條件中貯存3天或在溶液中貯存幾小時後,化合物 轉變為二種異構物之混合物。 實例4 7_(2’_甲基-3,_0-L-丙胺酸酯_p_D_呋喃核糖基)·‘胺基 -5_(乙炔-1-基)-«比洛并[2,3_d],咬(之2…之合成 化合物22b如上述22a使用B0C保護之L_丙胺酸合成; MS 376.17 (M+1); NMR (CD3〇D) : δ 8.61 & 8.28 (s,1H,鹼),6 38 (s,1H, H-l ),4.12 (m,5H,α-Η & 糖),1 71 (d,3H,Ala CH3),i (m,1H,β·Η),0.85 (s,3H,2、CH3)。 在乾燥條件中貯存3小時或在溶液中貯存3〇分鐘後,化合 物22b轉變為二種異構物之混合物。 實例5 M2’·甲基-3,-〇-三甲基乙醯基呋喃核糖基>4_胺基 -5-(乙炔-1-基)_,比咯并[2,3_d]嘧啶(32 ,其中烷基為第三丁 96973.doc -53- 200524606 基)之合成 化合物1 (150毫克,〇·5毫莫耳)溶於1〇毫升無水吨咬中。 然後第二丁基氯二苯基矽烷(274毫升,丨毫莫耳)加入,反應 混合物在室溫維持16小時。三甲基乙醯基氣(9〇微升,〇.75 笔莫耳)加入反應混合物中,混合物攪拌丨6小時。混合物溶 於70毫升氣仿中,以水(3〇毫升),1〇% NaHC〇3(3〇毫升)萃 取,以NaeCU乾燥,蒸發,與甲苯共蒸發以移除微量吡啶。 生成之油〉谷於20耄升THF中,氟化四丁基錢於THF中之1M 溶液2毫升加入。在16小時内,溶劑蒸發,生成之油溶於1〇 毫升DMF中,以製備性RPHPLC由0至100% B分離20分鐘, F=10毫升/分鐘。管柱Phenominex 250x20毫米,Synergi 4μ, Hydro ΡΡ 80Α。緩衝液Α-水,緩衝液B-CH3CN。目標化合 物之滯留時間為15分鐘。收集對應溶離份,蒸發,獲得淡 黃褐色泡沫。 MS 389.10 (M+1); 4 NMR (DMSO-d6): 8.20 & 7.80 (s,1H,鹼),6·04 (s,IH, Η-Γ),3.92-3.80 (m,6Η,糖),3.40 (s,9H,CH3-乙醯基), 0.65 (s,3H,CH3-2丨)。 實例6 7-(2f-甲基-p_D·呋喃核糖基)_4_胺基-5-(乙炔_1_基)·吡咯并 [2,3-d]嘧啶5’-三磷酸鹽之合成 7-(2’ -甲基- β- D-0夫喃核糖基)-4 -胺基- 5- (乙快-1-基)-。比口各 并[2,3-d]嘧啶(0.1毫莫耳)與無水DMF共蒸發3次,溶於2毫 升PO(OMe)3中,冷卻至5°C,P0C13(35微升)及質子海綿(64 96973.doc -54- 200524606
毫克)加入。混合物在5 °C攪拌3小時,然後焦磷酸四丁銨(2 宅莫耳,4毫升’於DMF中之〇 · 5 Μ溶液)加入,混合物在相 同溫度再保持2小時。反應以(Et3N)HC03緩衝液(pH 7.5), 然後以水淬火。溶劑蒸發,殘餘物溶於甲醇毫升)中,以 醚(30毫升)沉澱。固體殘餘物以離子交換(ie)hplC在Vydac 管柱(250x10毫米)上以〇至loo% b純化。緩衝液A為25 mM NaH2P04/Na2HP04,PH 3,緩衝液 B 為 310 mM
NaH2P04/Na2HP04,pH 3。收集最後之峰,濃縮至5毫升體 積,以RP HPLC在Phenominex管柱(250x20毫米)上以〇至 100%緩衝液B於緩衝液A中之濃度梯度再純化。緩衝液八為 醋酸三乙基銨之0.5 Μ水溶液,緩衝液b為醋酸三乙基銨之 0 · 5 Μ乙腈溶液。含有標題化合物之溶離份合併,蒸發,與 水共蒸發3次,由水冰凍乾燥; MS : 542.99 (Μ-Η),270.99 (1/2 Μ-Η); UV (0.1% TFA) Xmax : 212.24,235.62,277.98 ; iH-NMR : 8.01 & 7.59 (s,各 1H,鹼),6.00 (s,1H,H-1*), 4.32-4.00 (m,4H,糖),3.55 (s,1H,乙炔基),〇·65 (s,3H, 曱基-2’); 31P-NMR ·· -8·60 (d,1P,Ρ-α),-10.12 (d,1P,Ρ·γ),_21.42 (t,1Ρ,Ρ-β)。 實例7 7-(2甲基-β-D-呋喃核糖基)_4_胺基-5-(乙炔-1-基)_吡咯并 [2,3-d】嘧啶5’-磷酸鹽之合成 7-(2*-甲基-β-D-呋喃核糖基)-4-胺基-5-(乙炔-1-基)-吡咯 96973.doc -55- 200524606 并[2,3-d]嘧啶(〇·1毫莫耳)與無水DMF共蒸發3次,溶於2毫 升PO(OMe)3中,冷卻至5°C,P〇ci3(35微升)及質子海綿(64 毫克)加入。混合物在5°C攪拌3小時。反應以(以以用匸…緩 衝液(pH 7.5),然後以水淬火。溶劑蒸發,殘餘物溶於甲醇 (3毫升)中,以醚(30毫升)沉澱。固體殘餘物以離子交換 HPLC在Vydac管柱(250x10毫米)上以〇至1〇〇% b純化。緩衝 液 A為 25 mM NaH2P04/Na2HP04,pH 3,緩衝液 b 為 310 mN1 NaH2P04/Na2HP04,pH 3。收集最後之峰,濃縮至5毫升體 積,以RP HPLC在Phenominex管柱(250x20毫米)上以〇至 100%緩衝液B於緩衝液A中之濃度梯度再純化。緩衝液八為 醋酸二乙基鏔之0.5 Μ水溶液,緩衝液b為醋酸三乙基錢之 〇 · 5 Μ乙腈溶液。含有標題化合物之溶離份合併,蒸發,與 水共蒸發3次,由水冰凍乾燥; MS : 384.12 (M-H); H-NMR · 7.97 & 7.67 (s,各 1H,驗),6·12 (s,1H,Η_Γ), 4.10-3.85 (m,4Η,糖),3.15 (s,1Η,乙炔基),〇·87 (s,3Η, 甲基-2J ; 31P_NMR : 5·02 (s,IP)。
比較實例A 7-(2’_C_甲基_p_Dj喊核糖基)_4·胺基_5-(丙块小基)比略 并[2,3-d]嘧啶之製備 96973.doc -56- 200524606
在實例2步驟4之產物(5〇。〇毫克,〇·123毫莫耳)於3 2毫升 THF-DMF(2 : 1體積/體積)中之溶液内加入CuI(9 2毫克, 〇·〇48毫莫耳),TEA(16微升,〇.113毫莫耳),四(三苯膊)把 (0)(14.0毫克,0·012毫莫耳),溶液以氬脫氣。溶液冷卻至 〇°C,丙炔氣體冒泡通入溶液丨分鐘。然後反應混合物緩慢 溫熱至室溫歷4小時。丙炔加入反應混合物之程序再重複2 次,直到TLC顯示無起始物質為止。反應混合物在真空中 濃縮’吸收入DMF中,以RP HPLC在?11如0111111以管柱 (250x20毫米)上使用乙腈於水中之濃度梯度〇至5〇%以丨❹毫 升/分鐘純化30分鐘,獲得26毫克(66%)標題化合物; iH-NMR (CD3OD) : 8_07 (s,1H),7.67 (s,1H),6.19 (s, 1H),4.11-3.84 (m,4H,糖),2.09 (s,3H),〇·82 (s,3H); MS 319.11 (Μ+Η)。
比較實例B 7-(2’_C·甲基-β-D-咬喃核糖基)-4-胺基-5-( 丁炔-1-基)比洛 并[2,3-d]嘧啶之製備 96973.doc -57- 200524606
在實例2步驟4之產物(50·0毫克,〇123毫莫耳)於3·2毫升 THF-DMF (2 : 1體積/體積)中之溶液内加入CuI (9·2毫克, 0.048 cfe莫耳),TEA (16微升,〇·ιΐ3毫莫耳),四(三苯膦) 把(0)(14 ·0毫克,0.012毫莫耳),溶液以氬脫氣 。溶液冷卻 至〇°C ’ 丁炔氣體冒泡通入溶液1分鐘。然後反應混合物緩 慢溫熱至室溫歷4小時。反應混合物在真空中濃縮,吸收入 DMF中,以RP HPLC在Phenominex管柱(250x20毫米)上使用 乙腈於水中之濃度梯度〇至50%以10毫升/分鐘純化30分 鐘,獲得13毫克(32%)標題化合物; !H-NMR (CD3OD) : 8.08 (s, 1H), 7.67 (s, 1H), 6.19 (s, 1H),4.11-3.80 (m,4H,糖),2.48 (q,2H),1·26 (t,3H),0.83 (s,3H); MS 333.13 (M+H)。
比較實例C 7_(2f_C-甲基-β-D-呋喃核糖基)-4-胺基-5-(3-羥基丙炔-1 -基)·吡咯并[2,3-d]嘧啶之製備 96973.doc -58 - 200524606
、古液由實例2步驟4之產物(50·0毫克,0el231毫莫耳) /笔升甲基甲醯胺中製造。溶液以氬冒泡脫氣,並以聲 :处刀鐘。在此溶液中加入三乙胺(16.0微升,0.1145毫 莫耳)/、化鋼(9·4毫克,0.0492毫莫耳),及四(三苯膦)鈀 (0)(14.2¾克’ 0 0123毫莫耳然後炔丙基氧基三甲基矽 烷(113.7微升,〇·7386毫莫耳)加入。混合物在氬下攪拌4小 時。在完成時,混合物在真空中濃縮。反應粗物質溶於 升一甲基甲醯胺中,以去離子水稀釋至5〇毫升,然後經嘧 里(celite)墊洗。溶液再濃縮至乾,然後再溶於1〇毫升二甲 基曱醯胺及3.5毫升水中。標題化合物WHpLC純化; !H-NMR (CD3OD) : 8.10 (s5 1H), 7.80 (s, 1H), 6.21 (s, 1H),4.44 (d,2H),4.11-3.82 (m,4H),〇·83 (s,3H)。MS ·· 335.13 (m/z) 0
比較實例D 7_(2’-C-甲基_P-D-呋味核糖基)-4_胺基_5_(3-胺基丙炔小 基)-吡咯并[2,3-d】嘧啶之製備 96973.doc -59- 200524606
步称1·丙·2·炔基胺基甲酸9H-苐-9_基甲酯 在炔丙基胺(250微升,3.645毫莫耳)於二異丙基乙基胺 (1·273毫升,7.290毫莫耳)中之溶液内加入9-苐基甲基氣甲 酸酯(Fmoc),溶於7毫升二甲基甲醯胺中。混合物在氬下於 室溫攪拌過夜。在完成後,溶液在真空中減少。進行醋酸 乙酯/水萃取程序以分離產物;MS : 278.10 (m/z)。 步驟2· 7-(2f-C-甲基核糖基)_4_胺基-5-(3_胺基丙 炔-1-基)-吡咯并[2,3-d]嘧啶 一種溶液由實例2步驟4之產物(124.5毫克,0.3065毫莫耳) 於10毫升二甲基甲醯胺中製造,以氬冒泡脫氣,並以聲波 處理5分鐘。在此溶液中加入三乙胺(39· 7微升,〇285〇毫莫 耳)’峨化銅(23.5毫克’ 〇·ΐ 226毫莫耳),及四(三苯膦)把 (〇)(35.4毫克,0.0307毫莫耳)。步驟1之Fmoc_炔丙基胺 (465.9毫克,0.1680毫莫耳)加入,混合物在氬下擾拌4小 時。在完成時,混合物在真空中濃縮。反應粗物質溶於1毫 升DMF中,然後以去離子水稀釋至5〇毫升,然後經p塞里 (celite)墊洗。溶液蒸發至乾,再溶於ι·〇毫升dmf及3·5毫升 水中。標題化合物以HPLC純化; 96973.doc -60- 200524606 iH-NMR (DMF-d7) : 8.17 (s,1H),8.08 (s5 1H),6.28 (s, 1H),5,80-5.32 (m,3H),4.19-3.82 (m,4H),3.37-3.30 (m, 2H),0·83 (s,3H) 〇 MS : 334.15 (m/z)。 生物學實例 實例1.抗C肝炎活性 化合物可由抑制HCV聚合酶,抑制複製循環中所需之其 他酶,或其他途徑而顯示抗C肝炎活性。許多分析已公開以 評估這些活性。一種評估HCV病毒於培養中總體增加之一 般方法揭示於Miles等人之美國專利5,738,985。活體外分析 已報告於 Ferrari et al·,Jnl. of Vir·,73 : 1649-1654,1999 ; Ishii et al·,Hepatology,29 : 1227-1235, 1999; Lohmann et al·,Jnl。of Bio. Chem·,274:10807-10815,1999 ;及
Yamashita et al·,Jnl. of Bio. Chem·,273:15479-15486, 1998。
Emory University 1996年 9 月 27 日申請之 WO 97/12033, 發明人為C. Hagedorn及A· Reinoldus,主張1995年9月申請 之美國臨時專利申請案序列號碼60/004,3 83之優先權,述及 一種HCV聚合酶分析方法,可用以評估本文中所述化合物 之活性。另一種HCV聚合酶分析方法已報告於
Bartholomeusz,et al·,Hepatitis C Virus (HCV) RNA polymerase assay using cloned HCV non-structural proteins ; Antiviral Therapy 1996 : 1 (Supp 4) 1 8-24 o 測量激酶之活性由HCV藥物減少之篩檢方法揭示於 Katze等人之美國專利6,030,785,Delvecchio等人之美國專 96973.doc -61 - 200524606 利6,228,576,及Jubin等人之美國專利5,759,795。測量所提 HCV藥物之蛋白酶抑制活性之篩檢方法揭示於Su等人之美 國專利5,861,267 ,De Francesco等人之美國專利 5,739,002,及 Houghton等人之美國專利 5,597,691。 實例2.複製子分析 使用一種細胞株ET(Huh-lucubineo-ET)以篩檢本發明化 合物對於HCV RNA依賴性RNA聚合酶之活性。ET細胞株以 窩藏I389luc-ubi_neo/NS3-37ET之RNA轉錄產物轉感染;複 製子具有螢火蟲螢光素酶(luciferase)-泛有素(ubiquitin)-新 黴素(neomycin)填酸轉移酶融合蛋白質及EMCV-IRES驅動 之NS3-5B聚合蛋白質,含有細胞培養適應突變(E1202G ; T1280I ; K1846T)(Krieger et al·,2001,未公開)。ET細胞生 長於DMEM,補充10%胎牛血清,2 mM麩醯胺,青黴素(1〇〇 IU/毫升)/鏈黴素(100微克/毫升),lx非必需胺基酸,及250 微克/毫升G418("Geneticinn)。彼等均可得自Life Technologies (Bethesda,MD)。細胞在 96 p井平板中以 0.5-1.OxlO4個細胞/畊平板培養,在加入核苷類似物之前培 育24小時。然後化合物加入細胞中以達成最終濃度5或50 μΜ。螢光素酶活性係在48-72小時後由加入一種溶解緩衝液 及基質(型錄號碼Glo-溶解緩衝液Ε2661及Bright-Glo螢光 素酶系統E2620 Promega,Madison,WI)測量。在分析期間 細胞不應太匯合。複製之抑制百分比相對於無化合物之對 照作圖。在相同條件下,化合物之細胞毒性使用細胞增生 試劑WST-1 (Roche,Germany)測定。選擇顯示抗病毒活性’ 96973.doc -62- 200524606 但無顯著細胞毒性之化合物以測定IC5G及TC5〇。對於這些測 定’使用各化合物之6個稀釋液。化合物典型稀釋3倍以達 25〇倍之濃度範圍。IC50&tc5()值係由各濃度之抑制%配合 下列方程式計算: 抑制 % = 100°/〇/[(IC50/[I】)b+l】 其中b為希爾(Hill,s)係數。 本發明化合物及一些同系物及類似物之數據示於下表Η 及 III 〇
表II
R
R HCV複製子 IC50 (μΜ) HCV複製子 TC5〇 (μΜ) -H 0.09 >50 >50 >50 -ch2ch^ >50 >50 -ch2oh >50 >50 -ch2nh2 >50 >50 為形成下表III中所示之5-乙基核苷,5-乙炔核皆,化合 物1 ’使用Pd/C在氫存在下於高壓,較佳在一種溶劑(如甲 醇)中氫化。 96973.doc -63 - 200524606 表in R NH2
OH OH R HCV複製子 IC50 (μΜ) HCV複製子 TC50 (μΜ) Hv % 0.09 >50 >50 >50 實例3·重組HCV-NS5b之選殖及表現 NS5b蛋白質之密碼序列係以PCR由pFKI389luc/NS3-3f/ET 如 Lohmann,V·,et al. (1999) Science 285, 1 10-1 13 所述使用 下列引子(primers)選殖: aggacatggatccgcggggtcgggcacgagacag (SEQ. ID. NO. 1) aaggctggcatgcactcaatgtcctacacatggac (SEQ. ID. NO. 2) 選殖片段喪失C端第21個胺基酸殘基。選殖片段插入一個 IPTG可誘發之表現質體,其提供一個抗原決定部位(epitope) 標記(tag)(His)6於蛋白質之羧基端。 重組酶表現於XL-1細胞’在誘發表現後’該蛋白質在一 個鎳-NTA管柱上使用親和力層析純化。貯存條件為1 〇 mM Tris-HCl pH 7.5,50 mM NaC卜 0_1 mM EDTA,1 mM DTT, 96973.doc -64- 200524606 20%甘油,於-20°C。 實例4· HCV-NS5b酶分析 聚合酶活性係由測量放射標示之UTP使用一種生物素化 雜聚物模板(其包括一部份HCV基因組)併入一種RNA產物 中而分析。分析混合物(50微升)典型含有10 mM Tris-HCl (pH 7.5),5 mM MgCl2,0·2 mM EDTA,10 mM KCn,1單 位 /微升 RNAsin,1 mM DTT,10 μΜ 各 NTP,包括[3H]-UTP, 及10奈克(ng)/微升雜聚物模板。試驗化合物最初溶於100% DMSO中,再於含有5% DMSO之緩衝水溶液中稀釋。化合 物典型以1 riM至100 μΜ間之濃度試驗。反應由加入酶開 始,在37°C繼續2小時。反應以8微升100 mM EDTA淬火, 反應混合物(30微升)移入抗生蛋白鏈菌素(streptavidin)塗 覆之閃爍親近微滴定板(FlashPlates),在4°C培育過夜。併 入之放射活性以閃燦計數測定。 調配物實例 下列為含有一種本發明化合物之代表性醫藥調配物 實例1 :錠調配物 下列成份密切地混合,壓成單一刻痕錠。 成份 每錠之量 本發明化合物 400 玉米澱粉 50 交聯羧曱基纖維素鈉 25 乳糖 120 硬脂酸鎂 5 96973.doc -65- 200524606 實例2 ··膝囊調配物 下列成份密切地混合,裝入一個硬殼明膠膠囊。 成份 每膠囊之量(毫克) 本發明化合物 200 乳糖,喷乾 148 硬脂酸鎂 2 實例3 :懸浮液調配物 列成份混合形成一種經口施用之懸浮液。 成份 量 本發明化合物 1.0克 反丁烯二酸 0.5克 氣化納 2·0克 對羥基苯曱酸甲酯 0.15 克 對羥基苯甲酸丙酯 0.05 克 糖顆粒 25.0 克 山梨糖醇(70%溶液) 13.00克 Veegum K (Vanderbilt Co.) 1.0克 調味劑 0.035毫升 著色劑 0.5宅克 蒸餾水 適量至100毫升 實例4 :注射調配物 列成份混合形成一種注射調配物 0 成份 量 本發明化合物 0.2毫克_20毫克 96973.doc -66 - 200524606 醋酸鈉緩衝液溶液,0.4 Μ 2.0毫升
HC1(1N)或NaOH(lN) 適量至適合之pH 水(蒸餾,滅菌) 適量至20毫升 實例5 :栓劑調配物 總重量2.5克之栓劑係由本發明化合物與Witepsol® H-15(飽和植物脂肪酸之三酸甘油g旨;Riches-Nelson,Inc·, New York)混合而製備,具有下列組成: 成份 量 本發明化合物 500毫克
Witepsol® H-15 剩餘量 96973.doc -67

Claims (1)

  1. 200524606 十、申請專利範圍: 1 ·下式I之化合物:
    其中 γ係選自由一鍵,_ch2-或_〇_所組成之群; w,W1及W2各獨立選自由氫及一種醫藥可接受之前藥 所組成之群;及 其醫藥可接受鹽或部份鹽。 2. 如請求項1之化合物,其中Y為氧。 3. 如請求項1之化合物,其中w,wi及w2各獨立為氫或一種 醫藥可接受之前藥,選自醯基,氧基醯基,膦酸基,磷酸 基’鱗酸醋’胺基膦酸基(phosphonamidate),二胺基鱗酸 基(phosphor*odiamidate),胺基磷酸(phosph〇rarnidate)單 酯’環狀胺基磷酸基,環狀二胺基磷酸基,胺基磷酸二酯, 及-C(0)CHR2NH2所組成之群,其中R2係選自由氫,烷基, Ik取代之烧基’ ^基’經取代之芳基,環烧基,經取代之 環烷基,雜芳基,經取代之雜芳基,雜環,經取代之雜環, 及一種胺基酸之支鏈所組成之群。 4. 如請求項3之化合物,其中W為氫,或Wi為氫,或W2為氮。 96973.doc 200524606 5·如請求項3之化合物,其中w及W1為氫,或W及W2為氫, 或W1及W2為氫。 6.如請求項3之化合物,其中w,W1及W2為氫。 7·如請求項5之化合物,其中w1及W2為氫,W為氫或一種醫 藥可接受之前藥,選自由醯基,氧基醯基,膦酸基,磷酸 西曰’碟酸基,胺基膦酸基(ph〇Sph〇namidate),二胺基填酸 基(Phosphorodiamidate),胺基磷酸(phosphoramidate)單 醋’環狀胺基磷酸基,環狀二胺基磷酸基,胺基磷酸二酯, 及-C(〇)CHR2NH2所組成之群,其中R2係選自由氫,烷基, 經取代之烷基,芳基,經取代之芳基,環烷基,經取代之 環烧基’雜芳基,經取代之雜芳基,雜環,經取代之雜環, 及一種胺基酸之支鏈所組成之群。 8·如請求項7之化合物,其中w1及W2為氫,W係以下式表示:
    其中R2係選自由氫,烷基,經取代之烷基,芳基,經取 代之芳基,環烷基,經取代之環烷基,雜芳基,經取代 之雜芳基,雜環,經取代之雜環,及一種胺基酸之支鏈 所組成之群; R3為氫或烷基;及 R1係選自由烷基,經取代之烷基,芳基,經取代之芳 基,環烷基,經取代之環烷基,雜芳基,經取代之雜芳 96973.doc 200524606 基’雜環,及經取代之雜環所組成之群。 9·如睛求項5之化合物,其中w&w2為氫,w1係以下式表 不 · R2 H2N
    Ο 其中R2係選自由氫,烷基,經取代之烷基,芳基,經取 代之芳基,環烷基,經取代之環烷基,雜芳基,經取代 之雜芳基,雜環,經取代之雜環,及一種胺基酸之支鏈 所組成之群。 10· 一種下式II之化合物:
    其中 W係選自由氫及一種醫藥可接受之前藥所組成之群; 或其醫藥可接受鹽或部份鹽。 11·如請求項10之化合物,其中w單獨為氮或一種醫藥可接 受之前藥,it自由醯基,氧基酿基,鱗酸基,鱗酸基, 鱗酸醋1基膦酸基(phosphonamidate),^基^基 96973.doc 200524606 (phosphorodiamidate),胺基填酸(phosphoramidate)單 酯,環狀胺基磷酸基,環狀二胺基磷酸基,胺基磷酸二 酯,及_C(0)CHR2NH2所組成之群,其中R2係選自由氫, 烷基,經取代之烷基,芳基,經取代之芳基,環烷基, 經取代之環烷基,雜芳基,經取代之雜芳基,雜環,經 取代之雜環,及一種胺基酸之支鏈所組成之群。 12·如請求項丨丨之化合物,其中w係以下式表示:
    OR1 其中R2係選自由氫,烷基,經取代之烷基,芳基,經取 代之芳基,環烷基,經取代之環烷基’雜芳基,經取代 之雜芳基’雜環’經取代之雜環,及—種胺基酸之支鍵 所組成之群; r3為氫或烷基;及 R1係選自g基,絲代之絲,芳基,經取代之 基,環院基,經取代之環院基,料基,經取代之雜 基,雜環,及經取代之雜環所組成之群。 13. 14, 一種甲基·β·Β·Μ核糖基)_4_胺基·5·(乙伊 基^各并[2,3_d]㈣或其醫藥可接受鹽或部份越。、 一種7似_甲基鱗酸基如夫喃核糖基)1胺 Η 乙炔-iW各并[2,3_d]M 部份鹽。 西杀』接叉鹽 96973.doc -4- 200524606 15. 16. 17. 18. 19. 20. 21. 22. 一種7-(2,-C_甲基巧,·二磷酸 乙炔-i-基]十各并[2 3 d;^D“夫喃核糖基)-4-胺基 部份鹽。 彳[’3_d]〇^或其㈣可接受鹽或 二7 = 部份鹽。…各开[2’3_d]嘧啶或其醫藥可接受鹽或 甲基-5,-(笨氧基七丙胺酿基)磷 D· 喃核糖基)_4_胺基(乙炔 基)·°比略并[2,3_d]喷咬 其醫樂可接受鹽或部份鹽。 -種7·(2’.甲基_3’_〇_L•绳胺酸醋仙“夫喃核糖基)冰胺 基_5-(乙炔·i-基)·吡咯并[2,3_d]嘧啶或其醫藥可接受鹽 或部份鹽。 (2甲基3-0-L-丙胺酸酯呋喃核糖基)_4_胺 基巧-(乙炔-1-基)“比咯并啶或其醫藥可接受鹽 或部份鹽。 一種醫藥組合物,包含一種醫藥可接受之稀釋劑及治療 有效量之一種如請求項1至丨9中任何一項之化合物或一 或多種該等化合物之混合物。 如請求項20之醫藥組合物,其中該組合物另包含治療有 效量之一或多種對抗HCV之有效劑。 如明求項21之醫藥組合物,其中該一或多種劑係選自由 利巴維靈(ribavirin),來福維靈(levovirin),胸腺素 (thymosin)a-l,NS3絲胺酸蛋白酶,及肉苷單磷酸去氫 酶之抑制劑,干擾素-a之抑制劑所組成之群,或聚乙二 96973.doc -5- 200524606 醇化(pegylated)干擾素-α,單獨或合併利巴維靈或來福 維靈。 23. 如請求項22之醫藥組合物,其中該一或多種劑為干擾素 -α或聚乙二醇化(pegylated)干擾素-α,單獨或合併利巴 維靈或來福維靈。 24. 一種治療及/或抑制哺乳類病毒感染之方法,該感染至少 部份涉及一種黃病毒科(flaviviridae)病毒,該方法包含 對於已診斷具有該病毒感染或有發展該病毒感染危險 之哺乳類施用一種如請求項20之醫藥組合物。 25·如請求項24之方法,其中該病毒為C肝炎病毒。 26. 如請求項25之方法,其中該醫藥組合物另包含治療有效 量之一或多種有效對抗HCV之劑。 27. 如請求項26之方法,其中該一或多種劑係選自由利巴維 靈(ribavirin),來福維靈(levovirin),維拉米定 (viramidine),胸腺素(thymosin)a-1,NS3 絲胺酸蛋白酶 之抑制劑,及肉苷單磷酸去氫酶,干擾素-a,聚乙二醇 化(pegylated)干擾素_a之抑制劑所組成之群,單獨或合 併利巴維靈或來福維靈。 28. 如請求項27之方法,其中該一或多種劑為干擾素-α或聚 乙二醇化(pegylated)干擾素-a,單獨或合併利巴維靈或 來福維靈。 96973.doc 200524606 七、指定代表圖: (一) 本案指定代表圖為:(無) (二) 本代表圖之元件符號簡單說明: 八、本案若有化學式時,請揭示最能顯示發明特徵的化學式:
    96973.doc
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