SI9520073A - Novi celični sistemi, ki imajo specifično interakcijo peptidnih veznih parov - Google Patents

Novi celični sistemi, ki imajo specifično interakcijo peptidnih veznih parov Download PDF

Info

Publication number
SI9520073A
SI9520073A SI9520073A SI9520073A SI9520073A SI 9520073 A SI9520073 A SI 9520073A SI 9520073 A SI9520073 A SI 9520073A SI 9520073 A SI9520073 A SI 9520073A SI 9520073 A SI9520073 A SI 9520073A
Authority
SI
Slovenia
Prior art keywords
host cell
peptide
modified host
protein
receptor
Prior art date
Application number
SI9520073A
Other languages
English (en)
Other versions
SI9520073B (sl
Inventor
Kathleen H. Young
Bradley A. Ozenberger
Original Assignee
American Cyanamid Company
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by American Cyanamid Company filed Critical American Cyanamid Company
Publication of SI9520073A publication Critical patent/SI9520073A/sl
Publication of SI9520073B publication Critical patent/SI9520073B/sl

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/72Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants for hormones
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/575Hormones
    • C07K14/61Growth hormone [GH], i.e. somatotropin
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6897Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids involving reporter genes operably linked to promoters
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K2319/00Fusion polypeptide

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Endocrinology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Mobile Radio Communication Systems (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)

Abstract

Izum se nanaša na nove gostiteljske celice, ki izražajo heterologne zlite beljakovine in na presejalne postopke za testne vzorce, ki imajo peptidne vezne aktivnosti; kjer modificirana gostiteljska celica vsebuje: (a) gensko sekvenco, ki kodira heterologno fuzijsko beljakovino; omenjena fuzijska beljakovina pa vsebuje prvi peptid peptidnega veznega para, ali segment omenjenega prvega peptida, ki je združen bodisi z veznim področjem DNA ali njegovim ustreznim transkripcijskim aktivacijskim področjem transkripcijske aktivacijske beljakovine; (b) gensko sekvenco, ki kodira heterologno fuzijsko beljakovino, omenjena fuzijska beljakovina pa vsebuje drugi peptid peptidnega veznega para v (a), ali njegov segment, ki je zlit bodisi z veznim področjem DNA ali z njegovim ustreznim transkripcijskim aktivacijskim področjem, katerimkoli, ki ni uporabljen v (a); (c) reporterski gen, ki je operativno združen z transkripcijsko aktivacijsko beljakovino, ali z njenim delom; (d) opcijsko, izbris ali mutacijo v kromosomski DNA gostiteljske celice za transkripcijsko aktivacijsko beljakovino, če je navzoča v izbrani gostiteljski celici.ŕ

Description

NOVI CELIČNI SISTEMI, KI IMAJO SPECIFIČNO INTERAKCIJO PEPTIDNIH VEZNIH PAROV
POLJE IZUMA
Predloženi izum se nanaša na nove celice, ki izražajo heterologne fuzijske beljakovine in na presejalne postopke za spojine, ki imajo peptidne vezne aktivnosti; kjer postopki uporabljajo nove celice v smislu tega izuma.
STROKOVNO OZADJE
Specifična vezava para peptidov drugega z drugim sproži veliko število funkcij v živi celici. Na primer, specifična vezava nekega liganda na površinski receptor služi kot sprožilec za celične odzive na mnoge zunanje signale. Pri sesalcih se celice odzivajo na veliko različnih peptidnih hormonov v obtoku, pogosto preko posameznih transmembranskih področnih receptorjev. Z gotovostjo je ugotovljeno, da receptorska superdružina citokinov obrazloži razne vidike celičnih funkcij in fizioloških odzivov. Novejše preiskave receptorskih funkcij citokinov so odkrile različne stehiometrije ligand-receptor beljakovin, ki vključujejo tako 2-beljakovinske (ligand/receptor) (Cunnigham in ostali, 1991; Staten in ostali, 1993) kot 3-beljakovinske (ligand/receptor/receptor ali ligand/receptor/transducer) interakcije (Young, 1992; Taga and Kishimoto, 1992; Mui and Miyajima, 1994). Zapletenost takih beljakovinskih združb so raziskovali z uporabo in vitro metod, mnogokrat mučnih (Fuh in ostali, 1992; 1993; Davis in ostali, 1993), ker niso bili dostopni genetično prilagodljivi izrazni sistemi. Predloženi izum je usmerjen k novim modificiranim gostiteljskim sistemom, ki jih lahko uporabimo za proučevanje takih beljakovin, ki pa so vendarle znatno manj težavni.
-2Nedavno so poročali o sistemih iz te stroke, ki se nanašajo na 2-hibridni sistem, kot o njih govorijo Fields in Song, 1989 in tudi Chein in ostali, 1991. 2-hibridni sistemi zajemajo diferencialne interakcije med ločljivimi veznimi in aktivacijskimi področij DNA transkripcijskega aktivatorja kvasovk, Gal4. Heterologne beljakovine se izražajo kot hibridne beljakovine zlite z obema polovicama Gal4 (glej Sl. 1; Fields in Song, 1989; Chein in ostali, 1991 za razpravo o 2-hibridnem sistemu). Produktivna interakcija heterolognih beljakovin privede obe polovici beljakovine Gal4 v tesno bližino, aktivirajoč izražanje označijivega reporterskega gena. Do tega datuma, so take 2-hibridne sisteme razglasili kot koristne za ugotavljanje, ali ima prva dana testna peptidna sekvenca vezne aktivnosti za znano sekvenco drugega peptida; pri tem ni znana afiniteta testnega peptida do znanega peptida. Študij z uporabo takega sistema je bil usmerjen k analizi intracelularnih beljakovin kot prepisovalni faktorji in kinazne- tarčne beljakovinske interakcije (Yang in ostali, 1992; Durfee in ostali, 1993; Li in ostali, 1994).
Nove modificirane celice v smislu izuma in nove metode za vključitev teh celic prinašajo pomemben napredek pri študiju in odkrivanju peptidne mimikrije, vključno z mimikrijo ligandov in mimikrijo receptorjev. Trenotno še nihče ni razvil učinkovitega in specifičnega presejalnega sistema za raziskavo teh področij. Z uporabo peptičnega veznega para, za katerega je znana vezna afiniteta, v celici, predloženi izum omogoča proučevanje peptičnih veznih parov, kot sta ligand in receptor, kjer se peptidi vežejo preko izvenceličnih interakcij. Predloženi izum ustvarja eksponencialne prednosti za odkrivanje spojin, ki lahko delujejo kot ligandi za specifične receptorje ali transducerje. Potencialni ligandi vključujejo, vendar pa niso vezani na to, sesalske hormone, kjer so receptorji sorodni izvencelični peptid, ki veže
-3ligande. Poleg tega, predloženi izum opisuje uporabo celičnega sistema, ki izraža mnogokratne heterologne beljakovine, vključno z dvema heterolognima fuzijskima beljakovinama, za določevanje specifične in povratne vezave liganda in receptorja. Specifično interakcijo zgoraj opisane vezave lahko brez težav detektiramo z merljivo spremembo v celičnem fenotipu, na primer rast na selektivnem mediju.
POVZETEK IZUMA
En vidik predloženega izuma se nanaša na nove modificirane gostiteljske celice za izražanje heterolognih fuzijskih beljakovin. Nove modificirane gostiteljske celice obsegajo:
a) gensko sekvenco za kodiranje heterologne fuzijske beljakovine; omenjeno fuzijsko beljakovino, obsegajočo prvi peptid peptidnega veznega para, ali segment omenjenega prvega peptida, ki je vezan bodisi na vezno področje DNA ali na njegovo ustrezno transkripcijsko aktivacijsko področje transkripcijske aktivacijske beljakovine.
b) gensko sekvenco, ki kodira heterologno fuzijsko beljakovino, omenjena fuzijska beljakovina pa vsebuje drugi peptid peptidnega veznega para v (a), ali segment omenjenega drugega peptida, zlitega bodisi z veznim področjem DNA ali z njegovim ustreznim transkripcijskim področjem, katerimkoli, ki ni bil uporabljen v (a) ;
c) reporterski gen, ki je operativno združen z transkripcijskim aktivacijskim proteinom, ali z njegovim delom;
d) opcijsko, izbris ali mutacijo v kromosomski DNA v gostiteljski celici kvasovke za transkripcjsko aktivacijsko beljakovino, če je navzoča v gostiteljski celici.
Te nove modificirane gostiteljske celice predloženega izuma se lahko uporabljajo za ugotavljanje interakcije testnega vzorca z
-4izbranim peptidom peptidnega veznega para; na primer, celica se lahko uporablja za ugotavljanje interakcije testnega vzorca z izbranim ligandom ali receptorjem.
Drugi vidik predloženega izuma se nanaša na nove modificirane celice in na presejalne metode, ki prikazujejo interakcijo testnega vzorca z izbranim peptidom in receptorjem z razpoznavno spremembo v fenotipu. Celica kaže spremembo v fenotipu samo v navzočnosti testne spojine, ki ima vezno afiniteto za peptid ali peptidni vezni par, na primer, vezno afiniteto za ligand ali njegov receptor.
Tretji vidik predloženega izuma se nanaša na nove celice in presejalne postopke, ki omogočajo razpoznati, na kateri peptid ali peptidni vezni par se veže testni vzorec.
Četrti vidik predloženega izuma se nanaša na nove celice, ki izražajo tri ali več heterolognih komponent za proučevanje multi-beljakovinskih združitev višjega reda med tremi ali več peptidi (na primer, tako kot proučevanje dimerizacije odvisne od liganda).
Definirani izrazi:
Izraz peptidni vezni par se nanaša na katerikoli peptidni par z znano vezno afiniteto, za katerega je znana sekvenca DNA, ali pa jo lahko izpeljemo. Peptidi peptidnega veznega para morajo pokazati vzajemno preferencialno vezavo po katerikoli komponenti modificirane celice.
Izraz peptid, kot se uporablja v gornjem povzetku in tu, pomeni katerikoli peptid, polipeptid ali beljakovino, če drugače ni določeno. Kot je bilo omenjeno zgoraj, peptida peptidnega veznega
-5para sta lahko ligand in njegov ustrezni receptor, ali ligand in katerikoli peptid z znano vezno afiniteto za ligand.
Heterologni, kot se uporablja v gornjem povzetku in tu, pomeni peptide, ki (1) se ne izražajo v naravno nastopajočih gostiteljskih celicah ali (2), se izražajo v modificiranih gostiteljskih celicah po metodi izražanja drugačni od metode izražanja, s katero bi gostiteljska celica normalno izrazila peptid.
Če ni specificirano drugače, izraz receptor, kot se uporablja tukaj, zajema izraze receptor, topni receptor, transducer in vezno beljakovino. Pri prednostnem uresničevanju izuma je uporabljeni receptor receptor ali topni receptor, ki mu dajemo prednost.
Receptor, kot ga uporabljamo tukaj, pomeni plazemske membranske beljakovine, ki vežejo specifične molekule, kot faktorje rasti, hormone ali nevrotransmiterje, ki prenašajo signale v notranjost celic, kar povzroča, da se celica odzove na specifičen način. To vključuje posamezne transmembranske beljakovine.
Topni receptor pomeni netransmembransko obliko receptorja, ki ima sposobnost vezanja liganda. To so receptorji, ki jih izloča celica bodisi s proteolizo ali alternativno zvito mRNA.
Vezna beljakovina pomeni beljakovine, ki kažejo vezno afiniteto do specifičnega liganda. Vezne beljakovine lahko proizvajajo ločeni in razločni geni. Za dani ligand, se vezne beljakovine, ki jih proizvajamo iz specifičnih genov, razlikujejo od ligandnega veznega področja receptorja ali njegovega topnega receptorja.
Transducer pomeni molekulo, ki omogoča konverzijo enega signalnega načina v drugega, molekula pa je brez težav spoznana kot
-6transducer za enega ali več peptidov peptidnega veznega para, na primer transducer za skupino ligand/receptor.
KRATEK OPIS RISB
Slika 1 je shematski diagram celice, ki izraža iz dveh ločenih plazmidov dve heterologni zliti beljakovini (ena je ligand zlit z aktivacijskim področjem transkripcijske aktivacijske beljakovine, druga zlita beljakovina pa je receptor zlit z veznim področjem DNA transkripcijske aktivacijske beljakovine). Slika prikazuje izražanje obeh zlitih beljakovin in vezavo liganda in receptorja, ki privede skupaj vezno področje in aktivacijsko področje, obnavljajoč transkripcijsko aktivacijsko beljakovino. Ko je prepisovalna aktivacijska beljakovina obnovljena in zasidrana prek veznega področja DNA na položaj Upstream aktivacijske sekvence (UAS), se začne prepisovanje reporterskega gena (HIS3).
Slika 2 vsebuje fotografije plošč, ki prikazujejo rezultate rastnih eksperimentov vodenih v vzorcu 1 za verige CY722, CY723, CY724, in CY781 na neselektivnem mediju in na selektivnem mediju, to so fotografije A oziroma B.
Slika 3 je shematski diagram dimernega modela, v katerem se ligand veže na dvojni receptorski sistem. Shematski diagram prikazuje celico, ki izraža beljakovine iz treh ločenih plazmidov. Dve heterologni zliti beljakovini (prva zlita beljakovina je prvi receptor zlit z aktivacijskim področjem transkripcijske aktivacijske beljakovine, druga zlita beljakovina pa je drugi receptor zlit z DNA-veznim področjem transkripcijske aktivacijske beljakovine) sta izraženi in prosti ligand (to je ligand, ki ni zlit z nobeno od dveh področij transkripcijske aktivacijske beljakovine) se izraža iz tretjega plazmida. Slika prikazuje izražanje obeh zlitih beljakovin in vezavo prostega liganda in dva
-7receptorska zlitja, ki privedeta skupaj vezno področje in aktivacijsko področje, obnavljajoč transkripcijsko aktivacijsko beljakovino. Ko je transkripcijska aktivacijska beljakovina obnovljena in zasidrana prek DNA-veznega področja na položaj Upstream aktivacijske sekvence (UAS), se začne prepisovanje reporterskega gena (HIS3).
Slika 4 je fotografija plošče rasti, dobljena za verige CY846 in CY847 iz vzorca 3, ki prikazuje stimulacijo receptorske dimerizacije v odvisnosti od liganda.
DETAJLNI OPIS IZUMA
Modificirana celica v smislu tega izuma uporablja gostiteljsko celico. Učinkovita gostiteljska celica za uporabo v predloženem izumu enostavno zahteva, da je genetsko definirana, da bi lahko gradila primerno izražanje heterolognih zlitih beljakovin, reporterja(jev) in katerokoli drugo želeno genetsko manipulacijo. Gostiteljska celica je lahko katerakoli evkariotska celica, vretenčarska ali nevretenčarska. Gostiteljska celica je lahko sesalska kot tudi amfibijska, na primer jajčna celica Ksenopusa. Prednostno je, da je gostiteljska celica glivična celica, na primer Aspergilla ali Neuropora. V prednostnih izvedbah je gostiteljska celica celica kvasovk. V alternativnih prednostnih izvedbah je celica kvasovke Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe ali Pichia pastoris.
Modificirana celica uporablja vsaj dva gena za ločeno izražanje dveh heterolognih fuzijskih beljakovin. Ena izmed teh fuzijskih beljakovin obsega prvi peptid peptidnega veznega para, ali segment omenjenega prvega peptida, ki je združen bodisi z DNA-veznim
-8področjem ali njegovim ustreznim transkripcijskim aktivacijskim področjem transkripcijske aktivacijske beljakovine. Druga fuzijska beljakovina obsega drugi peptid peptidnega veznega para ali njegov segment. Drugi peptid je zlit bodisi z veznim področjem DNA ali njegovim ustreznim transkripcijskim aktivacijskim področjem, od katerih nobeden ni uporabljen v prvi heterologni fuzijski beljakovini. Aktivnost vezave med peptidi peptidnega veznega para kontroliramo z uporabo reporterskega gena, ki je operativno združen s transkripcijsko aktivacijsko beljakovino uporabljeno v dveh fuzijskih beljakovinah.
Transkripcijska aktivacijska beljakovina se lahko toliko časa močno spreminja, dokler so znana vezna področja DNA in aktivacijska področja, ali pa jih lahko izpeljemo s pomočjo razpoložljivih znanstvenih metod. Transkripcijska aktivacijska beljakovina je lahko katerakoli beljakovina, ki ima dve komponenti, DNA-vezno komponento in aktivacijsko komponento, kjer transkripcijska aktivacijska beljakovina vsebuje kislinski alfa heliks za aktivacijo prepisovanja. Prednostno je, da izberemo prepisovalno aktivacijsko beljakovino iz Gal4, Gcn4, Hapl, Adrl, Swi5, Stel2, Mcml, Yapl, Acel, Pprl, Arg81, Lac9, QalF, VP16, LexA, nesesalskih jedrskih receptorjev (na primer ekdison) ali sesalskih jedrskih receptorjev (na primer estrogen, androgeni, glukokortikoidi, mineralo-kortikoidi, retinojska kislina in progesteron; glej tudi Picard in ostali, 1990). Prednostno je, da je transkripcijska aktivacijska beljakovina beljakovina kvasovk, še bolj prednostno pa je, da izberemo transkripcijsko beljakovino kvasovk izmed Gal4, Gcn4 ali Adrl. Pripominjamo, da lahko uporabimo katerokoli vezno beljakovino DNA, ki deluje z aktivacijskim področjem. Vezno beljakovino DNA lahko zamenjamo za DNA-vezno področje transkripcijske aktivacijske beljakovine, če so ustrezno zgrajene razpoznavne sekvence, ki so operativno združene
-9z reporterskim genom. Ilustrativni za DNA-vezne beljakovine nekvasovk so receptorji sesalskih steroidov in bakterijelni LexA (glej Wilson in ostali, 1996).
Na splošno izberemo reporterski gen tako, da lahko kontroliramo vezavo področij transkripcijske aktivacijske beljakovine s pomočjo znanih in naprednih tehnik. Prednostno je, da izberemo reporterski gen glede na njegovo ceno, na enostavnost merjenja njegove aktivnosti in nizko ozadje (to je, aktivnost lahko določimo pri sorazmerno nizkih nivojih izražanja reporterskega gena zaradi visokega razmerja signala proti ozadju in/ali nizke ali nobene inducirane aktivnosti). Reporter je lahko katerikoli reporter, za katerega lahko merimo aktivnost s pomočjo katerihkoli razpoložljivih sredstev. Ilustrativni za reporterje, ki jih lahko uporabimo v predloženem izumu, so reporterski geni, izbrani iz naslednjih skupin:
a) lacZ, gen luciferaze, beljakovinski zeleno fluorescenčni gen, CAT
b) geni, ki komplementirajo aukstrofije, kot HIS, URA, LEU, ARG, MET, ADE, LYS, TRP.
c) geni, ki podelijo antibiotično odpornost, kot neo, KAN,
d) geni, ki podelijo občutljivost na kemikalije, kot CYH2, CAN1 (odpornost na kanavin). V mnogih izvedbah je lahko primerno za reporterski gen, da preprečuje rast (CYH2). Prednostno je, da določimo aktivnost reporterskega gena s kolorimetričnimi ali fluorescenčnimi metodami in/ali z merjenjem rasti kvasne celice.
Kot smo predhodno omenili, je peptid, ki ga uporabljamo v modificirani celici, peptid peptidnega veznega para, za katerega poznamo tako sekvenco DNA kot tudi sekvenco drugega peptida veznega para. Peptidi so lahko tudi peptidi peptidnega veznega kompleksa, ki vsebujejo dva ali več peptidov, ki drug drugega vežejo in tvorijo vezni kompleks. Peptida peptidnega veznega para
-10sta lahko specifični ligand in ustrezni receptor ali katerikoli drugi peptidi, ki se preferencialno vežejo drug na drugega, kot podenote nekega encima.
Ena od pomembnih prednosti tega izuma je odkritje, da lahko uporabimo modificirane celice, ki uporabljajo DNA-vezno in aktivacijsko področje transkripcijske beljakovine, za kontrolo vezave peptidov peptidnega veznega para, ki vežejo s pomočjo izvencelične interakcije. Vsekakor pa, če želimo, lahko uporabimo tudi peptide, ki vežejo s pomočjo intracelularne interakcije, v katerikoli od novih modificiranih celic in postopkih v smislu izuma. Peptidi so lahko iz celic sesalcev ali iz celic nesesalcev. Ena od najvažnejših izvedb v smislu predloženega izuma se nanaša na aplikacijo novih modificiranih celic in ustreznih presejalnih metod v smislu izuma za proučevanje številnih interakcij sesalskih peptidov. Sesalski peptidi vključujejo interakcije sesalskih ligand/receptorjev, kot interakcije hormon/receptor. Ilustrativni za peptidne hormone, ki jih lahko uporabimo v predloženem izumu, so peptidi, ki jih izberemo, vendar pa nas to ne omejuje, iz ene od naslednjih skupin: (a) skupina, ki jo sestavljajo citokini, interleukini, hematopoetski faktorji rasti, inzulin, faktorji rasti podobni inzulinu, hormoni rasti, prolaktin, interferoni in faktorji rasti; (b) ligandi za receptorje združene z G-proteinom; (c) ligandi za nevretenčarske receptorje; (d) ligandi za guanilil ciklazne receptorje; (e) ligandi za tirozin fosfatazne receptorje.
V alternativnih izvedbah je peptid faktor rasti, ki je izbran iz epidermne GF, GF živcev, faktorjev za inhibicijo leukemije, fibroblasta GF, GF izvirajoče iz krvnih ploščic, vaskularne endotelialne GF, tumornega nekrotizirajočega faktorja, onkostatina M, ciliarnega nevrotrofičnega faktorja, eritropoetina, Steel faktorja, laktogena placente in transformirajoče GF β.
-11V raznih prednostnih izvedbah je peptidni hormon ligand za z G-proteinom združeni receptor, kot faktor, ki izloča hormon rasti, sekretin, vazoaktivni inhibitorski peptid, glukagon, tirotropin, interleukin-8, luteinizirajoči hormon (LH) in hormon, ki stimulira folikel (FSH).
V dodatnih alternativnih izvedbah je uporabljeni peptid nevretenčarski peptid, kot tisti izbrani iz skupine, ki jo sestavljajo rastlinski sistemin in razločevalni peptidi žuželk. Vendar, v prednostnih izvedbah izberemo peptid iz skupine sestoječe iz sesalskih peptidov, in še bolje, iz sesalskih peptidnih hormonov.
Opomnili smo tudi, da so specifične vrste receptorjev peptidi peptidnega veznega para ali peptidnega veznega kompleksa. Ilustrativni za razne receptorje so tisti, ki so izbrani iz ene od naslednjih skupin: (a) celična adhezijska molekula; (b) imunomodulatoma, antigensko razpoznavna ali demonstracijska molekula ali drugi sorodni peptidi. Ilustrativni za celične adhezijeske molekule so ICAM, VCAM, ECAM, fibronektin, integrin, selektin in fibrinogen. Ilustrativni za imunomodulatorno, antigensko razpoznavno ali demonstracijsko molekulo so T celični receptorski kompleks, B celični receptorski kompleks, Fc receptorji, kompleks I z večjo histokompatibilnostjo, kompleks II z večjo histokompatibilnostjo, CD4, CD8, CD27, CD30, MAC kompleks.
Pripominjamo tudi, da lahko uporabljamo tudi specifične vrste transducerjev, kot peptide peptidnega veznega para ali peptidnega veznega kompleksa. Uporabljeni transducerski protein je lahko katerikoli protein, ki veže vsaj enega od peptidov peptidnega veznega para ali peptidnega veznega kompleksa. Transducerske beljakovine vključujejo gp 130, kh97, AIC2A, AIC2B.
-12Prednostno, heterologne zlite beljakovine se izražajo s spremembo celice kvasovke z neodvisno-replicirajočim plazmidom, ki je sposoben izražanja fuzijske beljakovine, čeprav se lahko slednje izražajo s kromosomsko modifikacijo.
Kot smo zapisali, so presejalni postopki v smislu izuma načrtovani tako, da ugotavljajo, ali je testni vzorec sposoben vplivati na vezavo peptidnega veznega para, na primer na interakcijo liganda z receptorjem. V osnovi, metoda obsega določevanje aktivnosti reporterskega gena pri dodajanju testnega vzorca modificirani gostiteljski celici predloženega izuma pod pogoji, ki so primerni za določevanje aktivnosti v prisotnosti vzorca ali pod pogoji, pri katerih modificirana gostiteljska celica pokaže tako aktivnost samo v prisotnosti vzorca, ki ima vezno interakcijo s peptidnim veznim parom. Prednostno, aktivnost reporterskega gena določimo z merjenjem spremembe v izbranem fenotipu, ki je v direktnem sorazmerju z aktivnostjo reporterja.
Nove modificirane celice v smislu izuma se z lahkoto uporabljajo v raznih presejalnih postopkih za določevanje vezne aktivnosti nekega testnega vzorca. Testni vzorec je lahko peptid, ki ima, prednostno, dolžino dveh aminokislin, ali kemijska spojina, ki ni peptid. Nepeptidni testni vzorec vsebuje spojine, komplekse in soli, kot tudi vzorce naravnih produktov, kot rastlinski ekstrakti in materiali, dobljeni iz fermentacijskih brozg. Modificirane gostiteljske celice gojimo v primernih rastnih pogojih za proučevanje interakcije testnega vzorca z vezno interakcijo peptidnega veznega para. Modificirane gostiteljske celice vnesemo v rastno okolje, ki prednostno vsebuje agar, tako da položimo testni vzorec na površino rastnega medija. Rastno okolje je, prednostno, konvencionalni tekoči medij rastnih reagentov in vode, kot kvasni sintetični medij (YSM, ki ga dobimo iz BIO101) (glej tudi Rose in ostali, Metode v genetiki kvasovk, 1990).
-13Ena od izvedb predloženega izuma je usmerjena k novi modificirani gostiteljski celici in presejalnemu postopku, ki prikaže interakcijo testnega vzorca z izbranim peptidnim veznim parom s pomočjo razpoznavne spremembe v fenotipu. Taka modificirana gostiteljska celica pokaže spremembo v fenotipu samo v prisotnosti testne spojine, ki ima vezno afiniteto do enega od peptidov peptidnega veznega para. Tako gostiteljsko celico navajamo tu kot rešilni sistem. Normalno se pokaže celični odziv, ko medsebojno delujeta oba področja transkripcijske aktivacijske beljakovine. Vendar, v rešilnem sistemu ni pozitivne indikacije spremembe v fenotipu, ko medsebojno delujeta oba področja transkripcijske aktivacijske beljakovine. Pozitivna indikacija spremembe v fenotipu nastane samo v primeru, da testni vzorec prekine interakcijo dveh področij transkripcijske aktivacijske beljakovine. V rešilnem sistemu je modificirana gostiteljska celica sposobna izraziti vsaj dve heterologni fuzijski beljakovini. Poleg tega, gostiteljska celica vsebuje: reporterski gen operativno združen z transkripcijskim aktivacijskim proteinom; kjer omenjeni reporterski gen preprečuje ekshibicijo specifičnega fenotipa na selektivni medij zaradi izražanja transkripcijskega aktivacijskega proteina, ali njegovega dela. Mutacija v kromosomski DNA gostiteljske celice omogoča popolno spremembo določljivega fenotipa, na selektivnem mediju, v odsotnosti izražanja reporterskega gena. Če je potrebno, obstaja izbris ali mutacija v kromosomski DNA gostiteljske celice za transkripcijski aktivacijski protein, tako da se transkripcijska aktivacija dogaja samo na produktivni interakciji izbranega veznega para. Samo če testni vzorec prekine interakcijo dveh področij transkripcijske aktivacijske beljakovine, bo modificirana celica rasla ali preživela ali prikazala drug izbrani fenotip. Prednostno, fenotip ustreza rasti celice.
-14Ko uporabimo presejalni postopek, kot smo razpravljali zgoraj, za ugotavljanje, ali testni vzorec medsebojno deluje z, ali raje pretrga, vezavo peptida opaženo v odsotnosti testnega vzorca, uporabimo drugo presejanje za ugotavljanje specifične vezne afinitete testnega vzorca, to je, na kateri peptid peptidnega veznega para se veže testni vzorec. Sekundarna sita uporabljajo nove celice tega izuma, kjer so celice prilagojene za prikaz fenotipa, ali spremembo v fenotipu, samo v navzočnosti testnega vzorca, ki veže enega od peptidov peptidnega veznega para. Eden od prednostnih postopkov za določevanje specifičnih veznih značilnosti testnega vzorca obsega uporabo celic, ki vsebujejo učinkovito (sorazmerno visoko) število kopij enega od obeh fuzijskih proteinov, ki vsebuje enega od peptidov. Učinkovito število kopij je katerokoli zadostno število kopij, ki omogoča določevanje specifične vezave testnega vzorca. Prednostno je število kopij genov vsaj okoli 5, prednostno pa sega od okoli 5 do okoli 50, pri čemer so višja števila kopij najbolj zaželena. Drugi fuzijski protein se zadržuje pri sorazmernem nizkem (1 do 2 kopij na celico) bodisi z intergracijo v celični kromosom ali z uporabo kromosomske centromerne sekvence na ekspresijskem plazmidu. Če uporabljamo visoko število kopij prvega peptida v celici v smislu izuma, bo celica bolj občutljiva na prisotnost testnega vzorca, ki veže drugi peptid peptidnega veznega para, ker omejujoča količina drugega peptida določa stopnjo aktivnosti reporterskega gena (to je, opaženo spremembo v fenotipu). Obratno, če uporabimo visoko število kopij gena, ki kodira drugi peptid peptidnega veznega para, bo celica bolj občutljiva na prisotnost testnega vzorca, ki veže prvi peptid, ker omejujoča količina drugega peptida določa stopnjo aktivnosti reporterskega gena (to je, opaženo spremembo v fenotipu). Direktna primerjava učinkov testnega vzorca na fenotipe obeh vrst (receptor >>>> ligand proti ligand receptor) pokaže na specifično proteinsko interakcijo spojine. Kot smo obravnavali
-15zgoraj, se geni, ki izražajo peptide, kot tudi reporterski geni izražajo prednostno s pomočjo transformacije celice kvasovk z neodvisno replicirajočim plazmidom.
Dodatna modificirana gostiteljska celica v smislu izuma je usmerjena k celicam, ki jih lahko uporabimo za proučevanje peptidnih ligandov, ki uporabljajo dvojne receptorje ali en receptor in en transducer za aktivacijo ali transmisijo signala iz vezave mnogokratnih peptidnih veznih komponent, to je, tri ali več peptidnih veznih komponent.
Receptorska dimerizacija je prvi kritični korak za transdukcijo signala za nekatere razrede receptorjev. Dimerne receptorske strukture so lahko sestavljene iz enakih receptorskih enot (primeri: inzulinski receptor, IGF-I receptor, PDGF receptor, insertni področni receptor kinaze (KDR), ali faktor stimuliranja kolonije (CSF)-I receptor), ali neenake receptorske enote (primeri: IL-6R + gpl30; inzulin-IGF-I hibridni receptor; LIF + gpl30; CNTF + gpl30; razni interferonski receptorji).
Sestavine modificirane gostiteljske celice za kontrolo vezne aktivnosti peptida, ki ima dvojni receptorski sistem so naslednje: genska sekvenca (a) je genska sekvenca, ki kodira heterologno fuzijsko beljakovino; omenjena fuzijska beljakovina vsebuje en peptid mnogokratnega peptidnega veznega kompleksa, ali segment omenjenega peptida, ki je združen z bodisi veznim področjem DNA ali njegovim ustreznim transkripcijskim aktivacijskim področjem transkripcijske aktivacijske beljakovine; in genska sekvenca (b) je genska sekvenca, ki kodira heterologno fuzijsko beljakovino; omenjena fuzijska beljakovina vsebuje drugi peptid omenjenega mnogokratnega peptidnega veznega kompleksa, ali segment omenjenega receptorja, ki je zlit z bodisi DNA-veznim
-16področjem ali z njegovim ustreznim transkripcijskim aktivacijskim področjem, katerimkoli, ki ni bil uporabljen v (a). Modificirana gostiteljska celica za proučevanje mnogokratnega peptidnega veznega kompleksa, kot dvojni receptorski sistem, vsebuje tudi primeren reporterski gen in kromosomske mutacije za specifično analizo peptidne ligand/receptor interakcije, kot je bilo dalje obravnavano. Lahko izrazimo tretji peptid (na primer ligand) za vpeljavo kontrole za primerjalno ali konkurenčno testiranje.
Kot je bilo omenjeno zgoraj, za proučevanje mnogokratnih peptidnih veznih kompleksov, to so beljakovine višjega reda, ki vsebujejo tri ali več peptidov, se lahko dejansko poslužujemo modificirane celice predloženega izuma za izražanje treh ali več peptidov. V primeru tripeptidnega veznega kompleksa lahko zlijemo kateregakoli od dveh peptidov z dvema komponentama transkripcijske aktivacijske beljakovine. Na primer, za proučevanje interakcije liganda, ki je aktiven prek receptorske dimerizacije, lahko izražamo receptorje kot zlite proteine, pri čemer je ligand izražen kot nefuzijski protein. Tak sistem gostiteljske celice lahko uporabimo tudi za proučevanje večproteinskih encimskih kompleksov. Za vsak večpeptidni vezni kompleks lahko identificiramo nove peptide, ki vzajemno delujejo s kompleksom, tako da izražajo nove proteine iz slučajnih komplementarnih sekvenc DNA (na primer cDNA knjižnice), ki so zlite z enim od področij transkripcijske aktivacijske beljakovine. V takem sistemu je eden od znanih peptidov peptidnega veznega kompleksa zlit z drugim področjem transkripcijske aktivacijske beljakovine, medtem ko so druge enote peptidnega veznega kompleksa izražene kot nefuzijski peptidi. Nadalje pripominjamo, da naj bi bilo število peptidov, ki jih izraža gostiteljska celica omejeno samo glede na razpoložljiva sredstva detekcije in na zmogljivost gostiteljske celice.
-17Novi presejalni postopki se lahko uporabljajo za identifikacijo spojin, ki medsebojno delujejo s katerimkoli peptidnim veznim parom, na primer, katerimkoli receptorjem in/ali ligandom. Poleg tega, ta modificirani celični sistem z reporterskim genom za tvorbo sita lahko uporabimo za vsako medsebojno delovanje proteina s proteinom, da bi odkrili nove spojine, ki prekinejo to interakcijo. Kot specifični primeri: a) proteinske kinaze vpletene v raku lahko vnesemo v sistem za hitro prešejanje novih spojin, ki blokirajo kinazno-tarčno interakcijo in bi tako lahko služile kot edinstvena terapija za rak; b) proteini virusne ovojnice, kot glikoproteini človeškega virusa imunske pomanjkljivosti in ustrezni proteini receptorske površinske celice, kot CD4, se lahko vnesejo v sistem za hitro presejanje spojin, ki prekinejo to interakcijo in lahko služijo kot protivirusni agensi; c) dve podenoti za plazmodijski ribonukleotidni reduktazni encim se lahko izražajo v sistemu za presejanje spojin, ki preprečujejo to specifično proteinsko združbo in tako lahko služijo kot novi protimalarijski agensi.
Naslednje primere navajamo v nadaljnjo ilustracijo raznih vidikov predloženega izuma. Ne smemo jih pa tolmačiti kot omejujoče za izum.
Primer 1: Specifična in povratna interakcija ligand-receptor
Fuzijske proteine, ki kodirajo gene, proizvajamo s kloniranjem rastnega hormona (GH) in receptorskih (GHR) cDNA- sekvenc rastnega hormona v plazmide, ki vsebujejo kodirno področje za področja Gal4. Zlitja (Gal4) DNA-veznega področja se naredijo v pAS2, kar je opisano v Wade Harper in ostalih. Zlitja genskih aktivacijskih področij (Gal4) se naredijo v pACT-II, kar je enako pACT (opisano v Durfee in ostalih, 1993) razen z modifikacijo polilinkerskega
-18področja. Naslednja sekvenca se doda v Bgl II položaj: Bgl II hemaglutinin epitop - Ndel - Ncol - Smal - BamHI - EcoRI - Xhol Bgl II, kot je prirejeno iz polilinkerske sekvence pAS2 (Wade Harper in ostali, 1993). cDNA-kodiranje starejših peptidov za prašičji GH izvajamo z uporabo tehnike standardne verižne reakcije s polimerazo (PCR) (glej Finney, 1993).
Oligonukleotide preparirane na ABI oligosintetizerju načrtujemo v skladu s publicirano sekvenco cDNA za prašičji GH (glej Su in El-Gewely, 1988). 30 bazni 5' oligonukleotid poseduje Ncol položaj (5 '-CATGCCATGGAGGCCTTCCCAGCCATGCCC 3') in 27 bazni 3'oligonukleotid poseduje BamHI - mesto (5' CGGATCCGCAACTAGAAGGCACAGCT -3'). GH cDNA proizvedemo z uporabo knjižnice prašičje hipofize lambda gtll kot vira matrice. Dobimo fragment 540 bp vezan v vektor pCR II (Invitrogen Corp.), rekombinante potrjuje cepitev z restrikcijskim encimom, in DNA proizvedemo kot opisano v Maniatusu in ostalih, 1982. cDNA-sekvenco potrjuje barvna deoksi- terminalna reakcija, ki uporablja reagente in zapisnike Perkin-Elmer Cetus korporacije in avtomatizirani sekvenčnik ABI 373A. GH DNA direktno kloniramo v pACT-II preko položajev Ncol in BamHI. cDNA, ki kodira izvencelično področje GHR, proizvajamo z uporabo standardnih postopkov PCR. Za proizvodnjo fragmenta 742 bp za kodiranje aminokislin 1-247 podganjega GHR (Baumbach in ostali, 1989) uporabljamo 33 bazni 5' oligonukleotid, ki vsebuje položaj Ncol (5'- CATGCCATGGAGATGTTTCCTGGAAGTGGGGCT-3') in 39 bazni 3'-oligonukleotid, ki vsebuje terminatorski kodon, ki mu sledi Ncol- mesto (5'-CATGCCATGGCCTACCGGAAATCTTCTTCACATGCTGCC-3 ' ) . To GHR cDNA kloniramo v pCRII vektor, kot predhodno opisano zgoraj, in nato subkloniramo v Ncol-mesto vektorja pAS2. DNA končnih rekombinantnih vektorjev spremenimo v verige kvasovk s pomočjo postopka litijevega acetata (Rose in ostali, 1990).
-19Gostitelja iz kvasovk (Υ190), ki vsebuje reporterski gen UASgal - HIS, pripravimo v skladu s postopkom opisanim v Wade Harper in ostali, 1993. Genotip verige Υ190 je MATa leu2-3, 112 ura3-52 trpl-901 his3d200 ade2-101 gal4 gal80 URA3:;GAL-lacZ LYS2::GAL-HIS3 cyhr. Verigo Υ190 transformiramo z obema fuzijskima konstruktoma ali z enim samim fuzijskim konstruktom plus nasprotni vektor, ki ne vsebuje heterolognih sekvenc. Za vse verige je bilo ugotovljeno, da pokažejo enako rast v neselektivnem okolju (Slika 2A). Te verige nato preskusimo na rast v selektivnem okolju (to je, rastno okolje, ki mu manjka aminokislina, ki jo sintetiziramo z aktivacijo reporterskega gena). Samo veriga, ki vsebuje oba hibridna proteina (CY722), je sposobna za rast, medtem ko verige, ki vsebujejo bodisi samo ligandno ali receptorsko zlitje, ne rastejo (CY724 oziroma CY723; Slika 2B). Dva neodvisna vzorca vsake verige izravnamo na sintetičnem mediju, ki vsebuje 2% glukoze, dušično bazo kvasovk, amonijev sulfat, 0,1 mM adenina in 60 mM 3-amino-triazola (plošča B) ali na istem mediju z dodatkom histidina (plošča A). Ploščo A postavimo v inkubator pri 30° C za tri dni; ploščo B pa za pet dni. Ti rezultati pokažejo, da GH in GHR lahko posredujeta pri aktivaciji reporterskega gena odvisni od Gal4 v interakciji, ki je vzpodbudna za vezavo ligand-receptor.
Primer IA: Konkurenčni izraženi prosti ligand (GH) v navzočnosti fuzijskih GH in GHR-proteinov.
Da bi utemeljili navidezno vezavo GH z njegovim receptorjem v tujem okolju jedra kvasovke, modificiramo sistem z dodatkom tretjega plazmida, ki posreduje pri izražanju prostega liganda, da bi pokazal, da peptid GH konkurira s fuzijskim proteinom GH-Gal4, pri čemer obrne 2-hibridno interakcijo prikazano na primeru 1. Starševsko verigo Υ190 (Wade Harper in ostali, 1993) gojimo na mediju, ki vsebuje 5-fluoro-orotično kislino za
-20selekcijo derivatov, ki spontano izgubijo gene URA3 (glej Rose in ostali, 1990). Rezultirajočo verigo, označeno s CY770, uporabljamo za vse eksperimente, ki preiskujejo učinke proteina konkurenčno izraženega iz tretje komponente ( to je tretji plazmid). cDNA, ki kodira GH, proizvajamo s postopkom PCR z uporabo 38 baznega 5' oligonukleotida, ki vsebuje položaj EcoRI (5' -CCGAATTCAAAATGGCCTTCCCAGCCATGCCCTTGTCC-3') in 26 bazni 3' oligonukleotid, ki vsebuje mesto Hindlll (5'CCAAGCTTCAACTAGAAGGCACAGCT-3') za sledeče subkloniranje v vektor pCUP. pCUP je inducibilni ekspresijski vektor kvasovke, ki izhaja iz pRS316 (Hill in ostali, 1986). Na kratko, vektor zgradimo z insercijo 3' konca PGK-gena kvasovke (iz pPGK: Kang in ostali, 1990) v pRS316regijo za kloniranje kot fragment BamHI-Sall, ki služi kot transkripcijski terminator. V zvezi s tem plazmidom, PCR razširi področje CUP1 promotorja (Butt in ostali,1984) kot fragment SacI-EcoRI in ga vgradi v ustrezne položaje plazmida, da tvori pCUP. GH-ekspresijski plazmid (GH-pCUP) nato so-trans formiramo s fuzijskimi konstrukti GH in GHR v verigo CY770 za tvorbo CY781. Konkurenčno izražanje prostega GH s fuzijskimi proteini GH in GHR (CY781) se izkaže z blokiranjem od GH-GHR odvisne celične rasti na selektivnem mediju (Slika 2B). Ta poskus tipizira konkurenčni poskus in vivo in dokazuje povratnost opazovane interakcije ligand-receptor.
Primer IB: Vezava peptidnega hormona prolaktina (PRL) in njegov receptor
Da bi razširili in potrdili to tehnologijo, smo razvili podobni sistem z uporabo peptidnega hormona prolaktina (PRL) in njegovega receptorja. Prolaktin je strukturno soroden GH in prolaktinov receptor (PRLR) je tudi član receptorske superdružine citokinov. V nasprotju z človeškim GH, GH sub-primatov ne veže PRLR brez
-21težav (Young and Bazer, 1989); PRL ne veže z lahkoto niti GHR-a (Leung in ostali, 1987). Zreli prašičji PRL se tvori s fuzijo z aktivacijskim področjem GaL4. Oligonukleotidi so določeni za prašičji PRL (dobljen od Genbank Χ14068) in jih uporabljamo za proizvodnjo zrelega prašičjega PRL proteinskega hormona iz knjižnice prašičje hipofize lambda gtll z uporabo standardnih postopkov PCR. 31 bazni 5' oligonukleotid ima mesto EcoRI (5'-CGGAATTCTGCCCATCTGCCCCAGCGGGCCT-3') in ustreza sekvencam, ki kodirajo aminokisline 1-7. 30 bazni 3' oligonukleotid vsebuje mesto EcoRI (5'-GAATTCACGTGGGCTTAGCAGTTGCTGTCG-3') in ustreza področju cDNA 3' k endogenemu končnemu kodonu. Dobimo fragment 600 bp, ki je vezan v vektor pCR II in je potrjen s cepitvijo z restrikcijskim encimom in sekvenčno analizo. Preko mesta EcoRI kloniramo PRL cDNA v pACT-II.
Izvencelično področje prašičjega (PRL) receptorja (PRLR) proizvajamo z zlitjem z GAL4-DNA-veznim področjem. Oligonukleotide načrtujemo na osnovi mišje sekvence PRLR (Davis and Linzer, 1989). 31 bazni 5Oligonukleotid vsebuje mesto Smal (5'-TCCCCCGGGGATGTCATCTGCACTTGCTTAC-3'), medtem ko 31 bazni 3' oligonukleotid vsebuje končni kodon, ki mu sledi mesto Sall (5'-TCCGTCGACGGTCTTTCAAGGTGAAGTCATT-3'). Ti oligonukleotidi se nahajajo ob boku izvenceličnega področja PRLR in kodirajo aminokisline 1-229. Uporabljamo knjižnico prašičje hipofize lambda gtll kot vir matrice. Z uporabo standardnega postopka PCR proizvajamo fragment 687 bp vezan v pCRII in potrdimo nukleotidno sekvenco. PRLR cDNA kloniramo v pAS2 vektor preko restrikcijskih mest Smal in Sall.
Verigo Υ190 smo pretvorili s fuzijskim ekspresijskimi plazmidi PRL ali PRLR bodisi samo (CY727 oziroma CY728) ali skupaj (CY726). Celice, ki izražajo oba PRL in PRLR-zlitja so sposobne rasti na
-22selektivnem gojišču, verige, ki vsebujejo bodisi fuzijski ligand ali receptor pa tega ne zmorejo. Ti rezultati zrcalijo tiste, ki smo jih opazovali v sistemu GH-GHR v zgornjih primerih ter ugotavljajo splošno uporabnost 2-hibridnega sistema za preiskavo vezave liganda na člane te receptorske superdružine.
Primer 1C: Dodatna potrditev ligandno-receptorske specifičnosti novega celičnega sistema kvasovk
Razvili smo dodatne verige za oceno ligandno-receptorske specifičnosti. URA minus verige, ki izražajo fuzijske proteine GH in GHR, pretvorimo s pCUP ali PRL-pCUP; verige, ki izražajo fuzijske proteine PRL in PRLR pa pretvorimo s pCUP ali PRL-pCUP. Na kratko, PRL-pCUP zgradimo v obliki podobni tisti, ki smo jo opisali za GH-pCUP. PRL cDNA proizvedemo s PCR z uporabo 33 baznega 5' oligonukleotida z mestom EcoRI (5'-GAATTCAAAATGCTGCCCATCTGCCCCAGCGGG-3') in 3' oligonukleotida iz primera IB. Rezultirajoči fragment vnesemo v pCUP preko EcoRI mesta. Kot smo pokazali v gornjih primerih, veriga, ki izraža fuzijske proteine GH in GHR brez nobenega konkurenta raste na selektivnem mediju in to rast ukinemo s soizražanjem prostega GH. Preskus s prolaktinom proizvede podobne rezultatef, ki potrjujejo specifičnost vezave ligand-receptor v celici kvasovke. Veriga, ki nosi zlitja PRL in PRLR (CY787) lahko raste na selektivnem mediju, to rast pa ukinja izražanje prostega PRL (CY786; Tabela 1).
Za preskus selektivnosti GHR, verigo, ki vsebuje GH in GHR zlitja, pretvorimo s PRL-pCUP. Ta veriga raste na selektivnem mediju (CY785; tabela 1). Ti podatki pokažejo, da vezavi GH na njegov receptor v tem sistemu lahko učinkovito konkurira vezava prebitnega GH (CY751), ne pa sorodni peptid PRL (CY755). Rezultati gornjih preskusov, ki izražajo tri heterologne proteine,
-23ponazarjajo specifičnost interakcije(ij) ligand-receptor v sistemu v smislu tega izuma.
Tabela 1: Seznam verig in rezultati biopreskusov
Oznaka AD zlitje BD zlitje pCUP Rast
CY700 - - - 0
CY722 GH GHR - +
CY723 vektor GHR - 0
CY724 GH vektor - 0
CY726 PRL PRLR - +
CY770 - - - 0
CY781 GH GHR GH 0
CY784 GH GHR vektor +
CY785 GH GHR PRL +
CY786 PRL PRLR PRL 0
CY787 PRL PRLR vektor +
Vse verige kvasovk so dobljene iz verig Υ190 (Wade Harper in
ostali, 1993). Genotip je MATa ga!4 gal80 his3 trpl-901 ade2-101
ura3-52 leu2-3,112 URA3::GAL-lacZ LYS2::GAL-HIS3 cyh. Verige z isto številčno oznako ali z večjo od 770 nimajo URA3::GAL-lacZ gena. Pomišljaj pomeni, da veriga ne vsebuje označenega plazmida. AD zlitja so pACT izpeljanke; GH ali PRL so zlite z aktivacijskim področjem Gal4.
BD zlitja so derivati pAS2; izvencelična področja receptorjev GH ali PRL so zlite z DNA-veznim področjem Gal4. pCUP pomeni peptid izražen iz plazmida pCUP.
Izvleček iz rezultatov biopreskusov. Vsaka veriga je zrasla na selektivnem mediju v času 3 do 5 dni pri 30 C, nato smo beležili
-24celično rast, ki je označena s plusom.
Primer 2: Prešejanje za spojine , ki prekinejo interakcijo ligand-receptor
Plazmidi z nizkim številom kopij, ki izražajo fuzijske proteine GHR- ali GH-Gal4 (pOZ153 in, oziroma, pOZ152) so zgrajeni za zmanjšanje izražanja teh proteinov. Poleg tega smo zgradili novi reporterski gen, ki preprečuje razmnoževanje celic v selektivnem okolju, razen če ni prekinjeno izražanje. Za izgradnjo fuzijskega ekspresijskega plazmida GHR, izoliramo restrikcijski fragment SacI-BamHI, ki vsebuje kot sestavino promotor in sekvence GAL4 iz pASl (Durfee in ostali, 1993) in ga kloniramo v pUN30 (Elledge and Davis,1988). Izvencelično področje GHR-a nato zlijemo z GAL4 z vezavo kot fragment Ncol, kot je opisano v primeru 1, da bi se tvoril pOZ153. Da bi zgradili GH-fuzijski ekspresijski konstrukt, izoliramo celotno področje GH-Gal4 s? promotorskimi in končnimi sekvencami iz plazmida opisanega v primeru 1 kot fragment Pvul-Sall. Ta segment DNA kloniramo v pUNIOO (Elledge in Davis, 1988), tako da se tvori pOZ152. Reporterski gen zgradimo tako, da izoliramo kodirno področje kvasovke CYH2 in ga operativno povežemo z promotorjem GAL v ekspresijskem plazmidu kvasovke. Na kratko, promotorsko področje GALI vstavimo v YEp352 (Hill in ostali, 1986) kot fragment EcoRI-BamHI. PCR poveča sekvence CYH2 s pomočjo začetnih oligonukleotidov (5'-GGATCCAATCAAGAATGCCTTCCAGAT-3' in 5'-GCATGCGTCATAGAAATAATACAG-3') in pAS2 kot matrico. PCR-pridelke cepimo z BamHI plus Sphl in kloniramo v ustrezna mesta v vektorju YEp352-GAL. Ti plazmidi se pretvorijo v verige kvasovk CY770, ki nosijo mutacijo pri kromosomskem genu cyh2, pri čemer naredijo verigo odporno na inhibitor proteinske sinteze cikloheksimid. Prisotnost vseh treh plazmidov je potrebna za podelitev občutljivosti (cyh) na cikloheksimid.
-25Veriga (CY857), ki vsebuje fuzijske plazmide liganda in receptorja in plazmid reporterja, tvori osnovo za enostavno primarno sito za spojine, ki prekinejo vezavo GH z njegovim receptorjem. Verigo CY857 vložimo v standardno rastno okolje kvasovke, ki vsebuje 10.0 ^g/ml cikloheksimida. Zaradi interakcije ligand/receptor, ki vodi izražanje reporterskega gena CYH2, je veriga cyh in tako nezmožna rasti. Na to testno okolje položimo kemične spojine. Spojine, ki škodijo vezavi GH-GHR, identificiramo po rasti celic okoli spojine, ker v odsotnosti izražanja CYH2 postanejo celice odporne na cikloheksimid, ki je prisoten v mediju.
Sekundarno presejanje za določevanje tarče vzorca
Prekinitev vezave ligand-receptor v tem preskusu je lahko rezultat reakcije spojine bodisi s fuzijsko komponento receptorja ali liganda. Specifično tarčo nove spojine določimo z enostavnim sekundarnim preskusom, ki uporablja verige, ki presežno izražajo eno od fuzijskih beljakovin. Veriga CY858 izraža zlitje GHR-GAL4 v velikem presežku, ker se konstrukt zadržuje znotraj celice pri visokem številu kopij (pOZ149), GH-zlitje (pOZ152) pa zadržimo na ravni podobni osnovni verigi (CY857). Obratno, veriga CY859 izraža zlitje GH-GAL4 v velikem presežku, ker se ta konstrukt zadržuje znotraj celice pri visokem številu kopij (pKY14), medtem ko zadržujemo zlitje GHR (pOZ153) na ravni podobni osnovni verigi (CY857). Spojine, ki rešujejo rast v primarnem presejanju z uporabo CY857 (zlitja GH in GHR so izražena na plazmidih nizkih števil kopij) nato preskušamo na isti način z uporabo CY858 (GHR^GH) ali CY859 (GH^>>GHR) kot testne verige. Na primer, če vezavo ligand-receptor inhibira spojina, ki reagira z GHR, bo sekundarno presejanje pokazalo določljivo spremembo v merjenem fenotipu. Sekundarno testiranje rešilne spojine na verigi CY858, ki presežno izraža zlitje GHR, povzroča manjšo rast v prisotnosti
-26spojine kot tisto, ki smo jo opazili pri CY859. Določljiva sprememba v merjenem fenotipu se dogaja, ker presežna količina GHR titrira spojino, pri čemer se poveča izražanje CYH2 in inhibira celična rast. CY859 povzroča podobno spremembo kot CY857, ker je fuzijski protein GHR omejevalen. Spojina, ki vzajemno deluje z zlitjem liganda, pokaže v tem sekundarnem preskusu obratno spremembo v merjenem fenotipu.
Primer 3: Prikaz dimerizacije receptorja v odvisnosti od liganda
Mnogokratno proteinsko interakcijo (na primer, ligand-receptor-receptor) raziskujemo z razširjenim sistemom, ki izraža tretji protein z uporabo naslednje sheme.
Eno enoto dimera receptorja proizvedemo kot fuzijsko beljakovino z bodisi Gal4 DNA - veznim ali aktivacijskim področjem. Drugo enoto dimera receptorja proizvedemo kot fuzijsko beljakovino z Gal DNA-ustreznim veznim ali aktivacijskim področjem, katerimkoli, ki ni bil uporabljen pri prvem zlitju. Gen, ki kodira ligand, se izraža iz tretjega plazmida in ga proizvedemo kot prosti (nefuzijski) ligand. Interakcija fuzijskih beljakovin se dogaja samo v prisotnosti liganda (glej Sliko 3).
Interakcijo faktorja rasti vaskularnih endotelialnih celic (VEGF) z veznim področjem liganda njegovega sorodnega receptorja (KDR, receptor, ki vsebuje insertno področje kinaze) opisujemo tu kot primer za ta sistem. KDR je tirozinski kinazni receptor in predlagamo oblikovanje dimera (1 ligand - 2 receptorja) kot pomembnega za receptorsko funkcijo, ki jo inducira hormon. cDNA, ki kodira področje liganda KDR-a (Terman in ostali, 1991) izoliramo kot fragment Nco I - BamHI in ga kloniramo v oba vektorja pACT-II in pAS2. cDNA, ki kodira zrelo beljakovino za
-27VEGF, proizvedemo z uporabo standardnih tehnik PCR. Oligonukleotide konstruiramo iz publiciranih sekvenc (glej Tischer in ostali, 1991). Uporabljamo 34 bazni 5' oligonukleotid, ki vsebuje mesto EcoRI (5' -CGGAATTCGAAGTATGGCACCCATGGCAGAAGGA-3 ' ) in 28 bazni 3' oligonukleotid, ki vsebuje mesto EcoRI (5 '-CGGAATTCGGATCCTCATTCATTCATCA-3 ' ) za proizvodnjo fragmenta 450 bp, ki kodira zreli protein in ga kloniramo v EcoRI-mesto pCUP-a. DNA končnih rekombinantnih vektorjev pretvorimo v kvasovke s postopkom litijevega acetata, da bi proizvedli primerne verige.
Gostiteljsko verigo kvasovk (CY770) transformiramo s KDR-pACT-II, KDR-pAS2 in VEGF-pCUP za proizvodnjo verige CY846; ali pa jo transfrmiramo z obema receptorskima zlitjema in pCUP za proizvodnjo verige CY847. Poleg tega, oba KDR-pACT-II in KDR-pAS2 transformiramo skupaj (CY845) ali ločeno (CY843 ali CY844) ali samo VEGF-pCUP (CY841) kot kontrolne verige. Verige testiramo na rast na selektivnem mediju. Veriga (CY846), ki izraža ligand VEGF in dve receptorski fuzijski beljakovini, pokaže obilno rast na selektivnem mediju v primerjavi z verigo CY847, ki ne izraža liganda VEGF (glej Sliko 4). Ti rezultati kažejo, da učinkovite celice v smislu izuma lahko uporabljamo za proučevanje dimerizacije receptorja v odvisnosti od liganda.
Primer 4: Presejanje za spojine, ki delujejo kot ligandi v dimernem receptorskem sistemu.
Dimerizacija (oligodimerizacija) receptorskih enot je pogosto prvi pomemben korak pri aktivaciji receptorjev, kot so receptorji za rastne faktorje, citokini in tisti opisani zgoraj. Novi celični sistem, ki smo ga opisali v primeru 3, lahko uporabimo za odkrivanje novih spojin, ki promovirajo (ali zaustavijo) dimerizacijo receptorja. Take nove vzajemno delujoče spojine bi
-28lahko služile kot učinkoviti terapevtski agensi za patologije v zvezi s temi receptorji.
Plazmide, ki izražajo dimerno receptorsko enoto(e) kot fuzijske beljakovine, proizvajamo kot je bilo obravnavano v primeru 3. Veriga (CY845), ki vsebuje zlitja KDR-pACT-II in KDR-pAS2 služi za primer enostavnega primarnega sita za receptorje, ki kažejo dimerno strukturo. Verigo CY845 vložimo v medij sintetičnega agarja, ki mu primanjkuje histidin (Rose in ostali, 1990). Testne spojine položimo na vrh testnega medija. Rezultat kemičnih spojin, ki povzročijo interakcijo dveh receptorskih zlitij (v odsotnosti liganda) je obnovitev endogenega transkripcijskega aktivatorja, ki ga vodimo k reporterskemu genu kot HIS3. Obnovitev identificiramo s pomočjo celic, ki zrastejo okoli spojine.
Zgoraj referirane publikacije:
Baumbach WR, Horner D. in JS Logan. (1989) The growth hormons binding protein in rat serum is an alternatively spliced form of the rat growth hormone receptor. Genes & Devel. 3:1199-1205.
Butt TR, Sternberg EJ, Gorman JA, Clark P, Hamer D, Rosenberg M in ST Crooke. (1984) Copper metallothionein of yeast, structure of the gene and regulation of expression. Proč. Natn. Acad. Sci., USA 81:3332-3336.
Chein, C-T., Bartel, PL., Sternglanz R. and S. Fields (1991) The two hybrid system: A method to identify and clone genes for proteins that interact with a protein of interest. Proč. Natl. Acad. Sci., USA 88:9578-9582.
Cunnigham BC, Ultsch M, De Vos AM, Mulkerrin MG, Clauser KR and JA
-29Wells. (1991) Dimerization of the extracellular domain of the human growth hormone receptor by a single hormone molecule. Science 254: 821-825.
Davis J and DIH Linzer. (1989) Expression of multiple form of prolactin receptor in the mouse liver. Mol. Endocrinol. 3:674-680.
Davis S, Aldrich TH, Stahl N, Pan L, Taga T, Kishimoto T, Ip NY and G Yancopoulos. (1993) LIFR and gp 130 as heterodimerizing signal transducers of the tripartate CNTF receptor. Science 260: 1805-1808.
Durfee T., Becherer K., Chen P-L., Yeh, S-H., Yang Y., Kilburn AE., Lee W-H. and SJ Elledge. (1993) The retinoblastoma protein associated with the protein phosphatase type 1 catalytic subunit. Genes and Devel. 7: 555-569.
Elledge SJ and RW Davis. (1988) A family of versatile centrometric vectors designed for use in the sectering-shuffle mutagenesis assay in Saccharomyces cerevisiae. Gene 70: 303-312.
Fiels S and 0. Song. (1989) A novel genetic system to detect protein-protein interactionsa. Nature 340:245-246.
Finny M. (1992) Tha polymerase chain reaction. In Current Protocols in Molecular biology. Chapter 15 Eds (FM Ausubel, R. Brent, RE Kingston, DD Moore, JG Seidman, J Smith and K. Struhl) John Wiley & Sons, NY.
Fuh G., Cunningham BC, Fukunaga R, Nagata S, Goeddel DV and JA Wells. (1992) Rational design of potent antagonists to the human
-30growth hormone receptor. Science 256:1677-1680.
Fuh G, Colosi P, Wood WI and JA Wells. (1993) Mechanism - based design of prolactin receptor antagonists. J. Biol. Chem. 8:5376-5381.
Hill JE, Myers AM, Koerner TJ and A Tzagoloff. (1986) Yeast / E. Coli shuttle vectors with multiple unique restriction sites. Yeast 2:163-167.
Kang Y-S, Kane J, Kur jan J, Stadel JM and DJ Tipper. ( 1990) Effects pf expression of mammalian G and Hybrid mammalian-yeast G proteins on the yeast pheromone response signal transduction pathway. Mol. Celi. Biol. 10:2582-2590.
Kondo M, Takeshita T, Ishii N, Nakamura M, Watenabe S, Arai K-i and K Sugamura. (1993) Sharing of the interleukin-2 (IL-2) receptor shain between receptors for IL-2 and IL-4. Science 262:1874-1877.
Leung DW, Spencer SA, Cachianes G, Hammonds G, Collins C, Henzel WJ, Barnard R, Waters MJ and WI Wood. (1987) Growth hormone receptor and serum binding protein: purification, cloning and expression. Nature 330:537-543.
Li, JJ and I. Herskowitz (1993) Isolation of ORC6, a component of the yeast origin recognition complex by a one-hybrid system. Science 262:1870-1874.
Maniatus T, Fritsch EF and J Sambrook. (1982) Molecular cloning.
Cold Spring Harbor Laboratory Press.
-31Mui A and A Miyajima (1994) Cytokine receptors and signal transduction. In: Progress in Growth Factor Research, pp 15 - 35. Pergamon Press. NY
Noguchi M, Nakamura Y, Russel SM, Zeigler SF, Tsang M, Cao X and WJ Leonard. (1993) Interleukin-2 receptor chain: A functional component of the interleukin-7 receptor. Science 262:1877-1880.
Picard D, Schena M and KR Yamamoto. (1990) An inducible expression vector for both fission and budding yeast. Gene 86:257-261.
Rose MD, Winston F, and P Hieter. ( 1990) Methods in yeast genetics. Cold Spring Harbor Laboratory Press
Staten NR, Byatt JC and GG Krivi. (1993) Ligand specific dimerization of the extracellular domain of the bovine growth hormone receptor. J. Biol. Chem, 268:18467-18473.
Su T-Z and MR El-Gewely . (1988) A multisite- directed mutagenesis using T7 DNA polymerase: application for reconstructing a mammalian gene. Gene 69:81-89.
Taga T and T Kishimoto (1993) Cytokine receptors and signal transduction. FASEB J. 7:3387-3396.
Taga T, Hibi M. Matsuda T, Hirano T and T. Kishimoto. (1993) IL-6-induced homodimerization of gpl30 and associated activation of a tyrosine kinase. Science 260:1808-1810.
Terman BI, Dougher-Vermanzen M, Carrion ME, Dimitrov D. Armellina DC, Gospodarowicz D and P. Bohlen (1992) Identification of the KDR tyrosine kinase as a receptor for vascular endothelial celi growth factor. Biochem. Biophys. Res. Comm. 187:1579.1586
-32Terman BI, Carrion ME, Kovach E., Rasmussen BA, Eddy RL and Shaws B. (1991). Idnetification of a new endothelial celi growth factor receptor tyrosine kinase. Oncogene 6:1677-1683.
Tischer E, Mitchell R, Hartman T, Silva T. Gospodarowicz D, Fiddes JC, and JA Abraham. (1991) The human gene for vascular endothelial growth factor. Multiple protein forms are encoded through alternative exon splicing. J. Biol. Chem. 266:11947-11954.
Yang X, Hubbard JA, and M Carlson (1992) A protein kinase substrate identified by the two-hybrid system. Science 257:31-33.
Young KH and FW Bazer (1989) Porcine endometrial prolactin receptors detected by homologous radioreceptor assay. Mol. and Celi. Endocrinol. 64:145-154.
Young PR (1992) Protein hormones and their receptors. Curr. Opin. Biotech. 3:408-421.
Wade Harper J, Adami GR, Wei N, Keyomarsk K and SJ Elledge. (1993) The p21 Cdk-interaction protein Cipi is a potent inhibitor of Gl Cyclin-dependent kinases. Celi 75:805-816.
Wilson TE, Fahrner TJ, Johnston M and J Milbrandt. (1991) Identification of the DNA binding site for NGFI-B by genetic selection in yeast. Science 252:1296-1300.

Claims (41)

  1. PATENTNI ZAHTEVKI
    1. Modificirana gostiteljska celica, ki vsebuje:
    a) gensko sekvenco, ki kodira heterologno fuzijsko beljakovino; omenjena fuzijska beljakovina vsebuje prvi peptid peptidnega veznega para, ali segment omenjenega prvega peptida, ki je združen bodisi z veznim področjem DNA ali z njegovim ustreznim transkripcijskim aktivacijskim področjem transkripcijske aktivacijske beljakovine;
    b) gensko sekvenco, ki kodira heterologno fuzijsko beljakovino, omenjena fuzijska beljakovina pa vsebuje drugi peptid peptidnega veznega para v (a), ali njegov segment, ki je zlit bodisi z veznim področjem DNA ali z njegovim ustreznim transkripcijskim aktivacijskim področjem, katerimkoli, ki ni bil uporabljen v (a);
    c) reporterski gen, ki je operativno združen s transkripcijsko aktivacijsko beljakovino, ali z njenim delom;
    d) opcijsko, izbris ali mutacijo v kromosomski DNA gostiteljske celice za transkripcijsko aktivacijsko beljakovino, če je navzoča v izbrani gostiteljski celici; kjer je modificirani gostitelj sposoben izražanja vsaj dveh heterolognih fuzijskih beljakovin in vsaj enega reporterskega gena.
  2. 2. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer je omenjena gostiteljska celica evkariotska celica.
  3. 3. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer je omenjena gostiteljska celica sesalska ali amfibijska celica.
    -344. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer je gostiteljska celica celica glive.
  4. 5. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 4, kjer je omenjena gostiteljska celica glive Aspergilla ali Neuropora.
  5. 6. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 4, kjer je omenjena celica glive celica kvasovke.
  6. 7. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 6, kjer je omenjena celica kvasovke izbrana iz Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomices pombe ali Pichia pastoris.
  7. 8. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer peptidi peptidnega veznega para vzajemno delujejo drug z drugim prek izvenceličnih aktivnosti v svojem naravnem okolju.
  8. 9. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer peptidi peptidnega veznega para vzajemno delujejo drug z drugim prek intracelularne aktivnosti v svojem naravnem okolju.
  9. 10. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer je peptidni vezni par izbran iz skupine, ki sestoji iz sesalskih peptidov.
  10. 11. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer je peptidni vezni par izbran iz skupine, ki sestoji iz nesesalskih peptidov.
    -3512. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer je peptidni vezni par izbran iz skupine, ki sestoji iz ligandov in ustreznega receptorja.
  11. 13. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer je en peptid peptidnega veznega para hormon.
  12. 14. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 13, kjer je eden od peptidov peptidnega veznega para izbran iz skupine, ki sestoji iz sesalskih peptidnih hormonov.
  13. 15. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer je omenjena transkripcijska aktivacijska beljakovina izbrana iz (a) Gal4, Gcn4, Hapl, Adrl, Swi5, Stel2, Mcml, Yapl, Acel, Pprl, Arg81, Lac9, QalF, VP16, LexA ali (b) sesalskih receptorjev jedra.
  14. 16. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 15, kjer je omenjena transkripcijska aktivacijska beljakovina transkripcijska aktivacijska beljakovina kvasovke.
  15. 17. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 16, kjer je omenjena transkripcijska aktivacijska beljakovina kvasovke GAL4 ali lac9.
  16. 18. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer je reporterski gen izbran iz skupine:
    a) lacZ, gena luciferaze, zeleno fluorescenčnega beljakovinskega gena, kloron fenicol acetil transferaze;
    b) genov, ki komplementirajo aukstrofije
    c) genov, ki podelijo odpornost na antibiotike; in
    d) genov, ki podelijo občutljivost na kemikalije
    -3619. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer se vsaj ena od heterolognih zlitih beljakovin izraža s pretvorbo celice kvasovke z autonomno replicirajočim plazmidom, ki je zmožen izražanja omenjene zlite beljakovine.
  17. 20. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 19, kjer so heterologne zlite beljakovine izražene prek transformacije celice kvasovke z autonomno replicirajočim plazmidom, ki je zmožen izražanja omenjene zlite beljakovine.
  18. 21. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 19, kjer je vsaj en peptid peptidnega veznega para izbran iz ene od naslednjih skupin:
    (a) iz skupine, ki sestoji iz citokinov, interleukinov, hematopoetičnih rastnih faktorjev, inzulina, rastnih faktorjev podobnih inzulinu, rastnega hormona, prolaktina, interferonov, in rastnih faktorjev;
    (b) ligandov za z G-proteinom povezane receptorje (c) ligandov za nevretenčarske receptorje;
    (d) ligandov za guanilil ciklazne receptorje;
    (e) ligandov za tirozin-fosfatazne receptorje;
  19. 22. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 21, kjer je peptid rastni faktor izbran iz epidermnih GF, živčnih GF, faktorjev za inhibicijo leukemije, fibroblasta GF, GF, ki izvira iz krvnih ploščic, vaskularnega endotelialnega GF, tumor nekrotizirajočega faktorja, onkostatina M, ciliarnega nevrotrofičnega faktorja, eritropoetina, Steel faktorja, laktogena placente in TGF.
  20. 23. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 21, kjer je vsaj eden od peptidov peptidnega veznega para transducer.
    -3724. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 23, kjer je transducer izbran iz skupine transducerskih proteinov gpl30, kh97, AIC2A in AIC2B.
  21. 25. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer je vsaj eden od peptidov peptidnega veznega para receptor, ki je izbran iz ene od naslednjih skupin:
    (a) iz celične adhezijske molekule; in (b) iz imunomodulatorne, antigenske razpoznavne ali demonstracijske molekule.
  22. 26. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 25, kjer je receptor celična adhezijska molekula izbrana iz ICAM, VCAM, ECAM, fibronektina, integrina, selektina in fibrinogena.
  23. 27. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 25, kjer je receptor imunomodulatorna, antigenska razpoznavna ali demonstracijska molekula izbrana iz kompleksa T celičnih receptorjev, kompleksa B celičnih receptorjev, receptorjev Fc, kompleksa 1 z večjo histokompatibilnostjo, kompleksa 2 z večjo histokompatibilnostjo, CD4, CD8, CD27, CD30, kompleksa MAC.
  24. 28. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 21, kjer je eden od peptidov peptidnega veznega para ligand za z G-proteinom združene receptorje.
  25. 29. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 28, kjer je ligand za z G-proteinom združene receptorje izbran iz faktorja, ki izloča rastni hormon, sekretina, vazoaktivnega inhibitornega peptida, glukagona, interleukina-8, luteinizirajočega hormona (LH), stimulirajočega hormona folikla (FSH) in tirotropina.
    -3830. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 11, kjer so nevretenčarski peptidi izbrani iz skupine, ki sestoji iz rastlinskega sistemina in diferencijacijskih peptidov žuželk.
  26. 31. Postopek za detekcijo sposobnosti testnega vzorca, da vpliva na vezno interakcijo peptidnega veznega para; omenjeni postopek obsega:
    določevanje aktivnosti reporterskega gena pri dodatku testnega vzorca modificirani gostiteljski celici v skladu z zahtevkom 1, pod pogoji, ki so primerni za detekcijo omenjene aktivnosti v prisotnosti omenjenega vzorca ali pod pogoji, pri katerih modificirana gostiteljska celica pokaže omenjene aktivnosti samo v prisotnosti vzorca, ki ima vezno interakcijo peptidnega veznega para.
  27. 32. Postopek v skladu z zahtevkom 31, kjer se aktivnost reporterskega gena določa z merjenjem izbranega fenotipa, ki je odvisen od aktivnosti reporterja.
  28. 33. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer je reporterski gen (c) operativno združen z transkripcijsko aktivacijsko beljakovino kvasovke; kjer omenjeni reporterski gen v selektivnem okolju preprečuje prikazovanje določljivega fenotipa v prisotnosti izražanja transkripcijske aktivacijske beljakovine kvasovke ali njenega dela; in kjer je gostiteljska celica dalje označena s tem, da obsega:
    (e) opcijsko, izbris ali mutacijo v kromosomski DNA gostiteljske celice, kar dopušča prikazovanje izbranega fenotipa na izbranem mediju v odsotnosti izražanja reporterskega gena plazmida (c), če je potrebno, da je za reporterski gen (c) edini vir merjene aktivnosti.
    -3934. Postopek za detekcijo sposobnosti testnega vzorca za vplivanje na interakcijo peptidnega veznega para; omenjeni postopek obsega:
    opazovanje spremembe v merjenem fenotipu modificiranega gostitelja v skladu z zahtevkom 33 pri dodatku testnega vzorca omenjeni modificirani gostiteljski celici; omenjena celica pa je gojena pod pogoji, ki so primerni za detekcijo izbranega fenotipa v prisotnosti testnega vzorca ali pa gojena pod pogoji, zaradi katerih omenjena celica kaže fenotip samo v prisotnosti testnega vzorca, ki ima interakcijo s peptidnim veznim parom.
  29. 35. Postopek za ugotavljanje ali testni vzorec pokaže interakcijo s peptidom peptidnega veznega para; omenjeni postopek obsega:
    (a) dodajanje testnega vzorca modificirani gostiteljski celici in primerjava prikazovanja izbranega fenotipa v prisotnosti in odsotnosti testnega vzorca;
    kjer je omenjena modificirana gostiteljska celica prilagojena za prikazovanje spremembe v fenotipu samo v prisotnosti testnega vzorca, ki se veže samo z enim peptidom peptidnega veznega para.
  30. 36. Postopek v skladu z zahtevkom 35, kjer omenjeni postopek uporablja modificirano gostiteljsko celico, ki vsebuje:
    a) gensko sekvenco, ki kodira heterologno fuzijsko beljakovino; omenjena fuzijska beljakovina pa vsebuje prvi peptid peptidnega veznega para, ali segment omenjenega prvega peptida, ki je združen bodisi z veznim področjem DNA ali z njegovim ustreznim transkripcijskim aktivacijskim področjem transkripcijske aktivacijske beljakovine; kjer je gen, ki kodira omenjeni prvi
    -40peptid, navzoč v učinkovitem številu kopij.
    b) gensko sekvenco, ki kodira heterologno fuzijsko beljakovino, omenjena fuzijska beljakovina pa vsebuje drugi peptid peptidnega veznega para v (a), ali segment omenjenega drugega peptida, ki je zlit z bodisi veznim področjem DNA ali z njegovim ustreznim transkripcijskim aktivacijskim področjem, katerimkoli, ki ni uporabljen v (a);
    c) reporterski gen, ki je operativno združen z transkripcijsko aktivacijsko beljakovino kvasovke, ali z njenim delom.
    d) izbris ali mutacijo v kromosomski DNA gostiteljske celice kvasovke za transkripcijsko aktivacijsko beljakovino.
  31. 37. Postopek v skladu z zahtevkom 36, kjer se vsaj ena od heterolognih zlitih beljakovin izraža s transformacijo modificirane gostiteljske celice z avtonomno-replicirajočim plazmidom, ki je zmožen izražanja omenjene fuzijske beljakovine.
  32. 38. Postopek v skladu z zahtevkom 36, kjer se reporterski gen izraža s transformacijo modificirane gostiteljske celice s plazmidom, ki je zmožen izražanja omenjenega reporterskega gena.
  33. 39. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer je genska sekvenca (a) genska sekvenca, ki kodira heterologno fuzijsko beljakovino; omenjena fuzijska beljakovina pa vsebuje eno ali dve receptorski molekuli za peptid, ali segment omenjenega receptorja, ki je vezan bodisi na vezno področje DNA ali njegovo ustrezano transkripcijsko aktivacijsko področje transkripcijske aktivacijske beljakovine; in genska sekvenca (b), ki je genska sekvenca, ki kodira heterologno fuzijsko beljakovino; omenjena fuzijska beljakovina pa vsebuje drugi receptor za peptid, ali del
    -41omenjenega receptorja, ki je zlit bodisi z veznim področjem DNA ali njegovim ustreznim transkripcijskim aktivacijskim področjem, s katerimkoli, ki ni uporabljen v (a); ,
  34. 40. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 39, kjer gen v (a) kodira heterologno fuzijsko beljakovino; omenjena fuzijska beljakovina pa vsebuje transducer za peptid, ali del omenjenega transducerja, ki je združen bodisi z veznim področjem DNA ali njegovim ustreznim transkripcijskim aktivacijskim področjem transkripcijske aktivacijske beljakovine.
  35. 41. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 40, kjer je protein transducerja izbran iz pgl30, KH97, AIC2A in AIC2B.
  36. 42. Postopek za detekcijo zmožnosti testnega vzorca za delovanje kot ligand za receptor, ki obsega:
    ugotavljanje stopnje aktivnosti reporterskega gena modificirane gostiteljske celice v skladu z zahtevkom 40 pri dodatku testnega vzorca omenjeni celici pod pogoji, ki so primerni za omenjeno delovanje.
  37. 43. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer je genska sekvenca (a) genska sekvenca, ki kodira heterologno fuzijsko beljakovino; omenjena fuzijska beljakovina pa vsebuje en peptid mnogokratnega peptidnega veznega kompleksa, ali segment omenjenega peptida, ki je združen bodisi z veznim področjem DNA ali njegovim ustreznim transkripcijskim aktivacijskim področjem transkripcijske aktivacijske beljakovine; in genska sekvenca (b),ki je genska sekvenca, ki kodira heterologno fuzijsko beljakovino; omenjena fuzijska beljakovina pa vsebuje drugi peptid omenjenega mnogokratnega peptidnega veznega kompleksa, ali segment
    -42omenjenega receptorja, ki je zlit bodisi z veznim področjem DNA ali z njegovim ustreznim transkripcijskim aktivacijskim področjem, s katerimkoli, ki ni uporabljen v (a).
  38. 44. Postopek za detekcijo zmožnosti testnega vzorca, da deluje kot peptidna sestavina mnogokratnega peptidnega veznega kompleksa; omenjeni postopek, ki obsega:
    ugotavljanje stopnje aktivnosti reporterskega gena modificirane gostiteljske celice v skladu z zahtevkom 43 pri dodatku testnega vzorca omenjeni celici pod pogoji, ki so primerni za detekcijo omenjene aktivnosti.
  39. 45. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 1, kjer je genska sekvenca (a) genska sekvenca, ki kodira heterologno fuzijsko beljakovino; omenjena fuzijska beljakovina pa vsebuje en peptid mnogokratnega peptidnega veznega kompleksa, ali segment omenjenega peptida, ki je združen bodisi z veznim področjem DNA ali z njegovim ustreznim transkripcijskim aktivacijskim področjem transkripcijske aktivacijske beljakovine; in gensko sekvenco (b), ki je genska sekvenca, ki kodira heterologno fuzijsko beljakovino; omenjena fuzijska beljakovina pa vsebuje drugi peptid omenjenega mnogokratnega peptidnega veznega kompleksa, ali segment omenjenega receptorja, ki je zlit bodisi z veznim področjem DNA ali z njegovim ustreznim transkripcijskim aktivacijskim področjem, s katerimkoli, ki ni uporabljen v (a);
    kjer omenjena gostiteljska celica dalje vsebuje kot (e) vsaj eno gensko sekvenco, ki kodira peptid; kjer je omenjeni gostitelj zmožen izražanja omenjenih peptidov.
  40. 46. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 45, kjer je vsaj ena od komponent (a), (b) ali (e) genska sekvenca, ki ustreza komplementarni DNA-knjižnici.
    -4347. Modificirana gostiteljska celica v skladu z zahtevkom 46, kjer je (b) genska sekvenca, ki ustreza komplementarni DNA-knjižnici.
  41. 48. Postopek za določevanje zmožnosti slučajnega proteina za delovanje kot sestavina mnogokratnega peptidnega veznega kompleksa; omenjeni postopek obsega:
    določevanje stopnje aktivnosti reporterskega gena modificirane gostiteljske celice v skladu z zahtevkom 47 pri izražanju slučajnega proteina iz DNA-knjižnice pod pogoji, ki so primerni za detekcijo te aktivnosti.
SI9520073A 1994-06-14 1995-05-31 Novi celični sistemi, ki imajo specifično interakcijo peptidnih veznih parov SI9520073B (sl)

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US08/259,609 US5989808A (en) 1994-06-14 1994-06-14 Identification of compounds affecting specific interaction of peptide binding pairs
PCT/US1995/006895 WO1995034646A1 (en) 1994-06-14 1995-05-31 Novel cell systems having specific interaction of peptide binding pairs

Publications (2)

Publication Number Publication Date
SI9520073A true SI9520073A (sl) 1998-02-28
SI9520073B SI9520073B (sl) 2004-06-30

Family

ID=22985626

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
SI9520073A SI9520073B (sl) 1994-06-14 1995-05-31 Novi celični sistemi, ki imajo specifično interakcijo peptidnih veznih parov

Country Status (18)

Country Link
US (3) US5989808A (sl)
EP (1) EP0765389B1 (sl)
AT (1) ATE245189T1 (sl)
AU (1) AU706173B2 (sl)
CA (1) CA2195083A1 (sl)
DE (1) DE69531302T2 (sl)
DK (1) DK0765389T3 (sl)
ES (1) ES2202366T3 (sl)
GE (1) GEP20022619B (sl)
IL (1) IL114118A0 (sl)
LT (1) LT4230B (sl)
LV (1) LV11906B (sl)
NZ (1) NZ287372A (sl)
PT (1) PT765389E (sl)
RU (1) RU2208646C2 (sl)
SI (1) SI9520073B (sl)
WO (1) WO1995034646A1 (sl)
ZA (1) ZA954892B (sl)

Families Citing this family (44)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7226761B2 (en) * 1992-11-05 2007-06-05 Danisco Sweeteners Oy Manufacture of five-carbon sugars and sugar alcohols
US6972193B1 (en) * 1993-02-12 2005-12-06 Board Of Trustees Of Leland Stanford Junior University Regulated transcription of targeted genes and other biological events
US6891021B2 (en) 1993-02-12 2005-05-10 Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Regulated apoptosis
US6770446B1 (en) * 1994-06-14 2004-08-03 Wyeth Cell systems having specific interaction of peptide binding pairs
US5610015A (en) * 1995-03-23 1997-03-11 Wisconsin Alumni Research Foundation System to detect protein-RNA interactions
DE69636866D1 (en) * 1995-04-11 2007-03-15 Gen Hospital Corp Reverse "two-hybrid"-systeme
US5837844A (en) * 1995-06-07 1998-11-17 Biogen, Inc. CAIP-like gene family
US6423824B1 (en) 1995-06-07 2002-07-23 Biogen, Inc. CAIP-like gene family
US6171800B1 (en) 1995-06-07 2001-01-09 Biogen, Inc. Method of making and binding CAIP polypeptides
DE29724617U1 (de) * 1996-04-26 2002-06-13 Massachusetts Inst Technology Drei-Hybrid-Kit zur Molekülauswahl
DE69715621T2 (de) * 1996-04-26 2003-05-22 Massachusetts Inst Technology Drei hybriden screening test
US6696251B1 (en) 1996-05-31 2004-02-24 Board Of Trustees Of The University Of Illinois Yeast cell surface display of proteins and uses thereof
AU6342696A (en) * 1996-06-27 1998-01-14 Biogen, Inc. The caip-like gene family
FR2761697B1 (fr) * 1997-04-03 1999-05-28 Inst Nat Sante Rech Med Methodes de detection d'interactions entre plusieurs proteines
DE19715683C2 (de) * 1997-04-15 1999-11-11 Max Planck Gesellschaft Neue Reportervektoren für One-Hybrid und Two-Hybrid Systeme
US7005295B1 (en) 1997-04-16 2006-02-28 Wyeth β-amyloid peptide-binding proteins and polynucleotides encoding the same
US6787319B2 (en) 1997-04-16 2004-09-07 American Home Products Corp. β-amyloid peptide-binding proteins and polynucleotides encoding the same
AU6969998A (en) 1997-04-25 1998-11-24 American Home Products Corporation Neuronal mort1 isoforms
US6479653B1 (en) 1997-08-26 2002-11-12 Ariad Gene Therapeutics, Inc. Compositions and method for regulation of transcription
JP4296608B2 (ja) * 1997-08-27 2009-07-15 田辺三菱製薬株式会社 Pparのアゴニスト及びアンタゴニストのスクリーニング方法
EP1149920A1 (en) * 1997-10-15 2001-10-31 Diversa, Inc. Screening for novel compounds which regulate biological interactions
EP1029076A4 (en) * 1997-10-15 2002-03-06 Diversa Inc SCREENING FOR NEW CONNECTIONS THAT REGULATE BIOLOGICAL INTERACTIONS
US6261842B1 (en) 1997-10-23 2001-07-17 Wisconsin Alumni Research Foundation Microorganism genomics, compositions and methods related thereto
CA2309763A1 (en) * 1997-11-14 1999-05-27 Roche Diagnostics Corporation Variable region fusion peptides that form effector complexes in the presence of antigen
CA2317816C (en) 1998-01-09 2009-02-17 Tvw Telethon Institute For Child Health Research Peptide detection method
EP0974649A1 (en) * 1998-06-22 2000-01-26 Universität Zürich Screening system
US7166475B2 (en) 1999-02-26 2007-01-23 Cyclacel Ltd. Compositions and methods for monitoring the modification state of a pair of polypeptides
GB9907687D0 (en) * 1999-04-01 1999-05-26 Kudos Pharm Ltd Assays methods and means
JP2002541863A (ja) 1999-04-21 2002-12-10 ワイス N−型イオンチャンネル不活性化のモジュレーターを同定する方法
BR0110214A (pt) * 2000-04-24 2003-01-21 Wyeth Corp Célula de levedura e métodos de detecção da interação de um primeiro peptìdio com um segundo peptìdio de um par de ligação de peptìdios, de determinação da interação de uma amostra de teste com um primeiro ou um segundo peptìdios de um par de ligação de peptìdios e de detecção simultânea da interação de dois pares de ligação de peptìdios diferentes
CN1564869A (zh) 2000-08-25 2005-01-12 巴斯福种植科学有限公司 编码新型异戊二烯基蛋白酶的植物多核苷酸
WO2002046400A2 (en) * 2000-12-08 2002-06-13 The Board Of Trustees Of The University Of Illinois Mutated class ii major histocompatibility proteins
EP1534819B1 (en) 2002-08-21 2009-12-09 Revivicor, Inc. Porcine animals lacking any expression of functional alpha 1,3 galactosyltransferase
US9453251B2 (en) 2002-10-08 2016-09-27 Pfenex Inc. Expression of mammalian proteins in Pseudomonas fluorescens
US7285269B2 (en) 2002-12-02 2007-10-23 Amgen Fremont, Inc. Antibodies directed to tumor necrosis factor
WO2005049804A2 (en) * 2003-11-17 2005-06-02 Georgia Tech Research Corporation Engineering enzymes through genetic selection
EP1544307A1 (en) * 2003-12-18 2005-06-22 AXXAM S.r.l. LAC9 chimeric receptor and uses thereof
EP2412816B1 (en) 2004-07-26 2014-12-03 Pfenex Inc. Process for improved protein expression by strain engineering
EP3138403A1 (en) 2005-08-09 2017-03-08 Revivicor, Inc. Transgenic ungulates expressing ctla4-ig and uses thereof
CN101365945A (zh) * 2006-02-07 2009-02-11 惠氏公司 用于鉴别调节诺里蛋白、诺里蛋白模拟物的药剂的物质和方法以及由此鉴别出的药剂
US9580719B2 (en) 2007-04-27 2017-02-28 Pfenex, Inc. Method for rapidly screening microbial hosts to identify certain strains with improved yield and/or quality in the expression of heterologous proteins
MX2009011523A (es) 2007-04-27 2009-11-09 Dow Global Technologies Inc Metodo para clasificar rapidamente huespedes microbianos para identificar ciertas cepas con rendimiento y/o calidad mejorados en la expresion de proteinas heterologas.
CN101131363B (zh) * 2007-09-30 2010-12-01 南京大学 一种基于酵母三杂交的小分子化合物检测方法
CA2980316A1 (en) 2015-03-24 2016-09-29 Osiris Therapeutics, Inc. Compositions comprising meniscal tissues and uses thereof

Family Cites Families (9)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5283173A (en) * 1990-01-24 1994-02-01 The Research Foundation Of State University Of New York System to detect protein-protein interactions
US5322801A (en) * 1990-04-19 1994-06-21 The General Hospital Corporation Protein partner screening assays and uses thereof
JP3537141B2 (ja) * 1992-10-30 2004-06-14 ザ ゼネラル ホスピタル コーポレーション 新種蛋白質分離のための相互作用を用いる補捉システム
US5512473A (en) * 1993-01-29 1996-04-30 Brent; Roger Max-interacting proteins and related molecules and methods
US5582995A (en) * 1993-06-11 1996-12-10 The General Hospital Corporation Methods of screening for compounds which inhibit the direct binding of Ras to Raf
CA2180271A1 (en) * 1993-12-30 1995-07-06 Ronald M. Evans Novel uses for gal4-receptor constructs
ES2146749T3 (es) * 1994-01-21 2000-08-16 Icos Corp Materiales y metodos en relacion con proteinas que interaccionan con la caseina quinasa i.
US5525490A (en) * 1994-03-29 1996-06-11 Onyx Pharmaceuticals, Inc. Reverse two-hybrid method
US5691147A (en) * 1994-06-02 1997-11-25 Mitotix, Inc. CDK4 binding assay

Also Published As

Publication number Publication date
ES2202366T3 (es) 2004-04-01
DE69531302D1 (de) 2003-08-21
IL114118A0 (en) 1995-10-31
EP0765389B1 (en) 2003-07-16
LV11906B (en) 1998-06-20
RU2208646C2 (ru) 2003-07-20
LT97004A (en) 1997-07-25
DE69531302T2 (de) 2004-04-22
SI9520073B (sl) 2004-06-30
AU706173B2 (en) 1999-06-10
US6284519B1 (en) 2001-09-04
GEP20022619B (en) 2002-01-25
LV11906A (lv) 1997-12-20
US6251602B1 (en) 2001-06-26
NZ287372A (en) 1997-11-24
PT765389E (pt) 2003-11-28
ZA954892B (en) 1996-01-30
CA2195083A1 (en) 1995-12-21
WO1995034646A1 (en) 1995-12-21
AU2606695A (en) 1996-01-05
US5989808A (en) 1999-11-23
EP0765389A1 (en) 1997-04-02
ATE245189T1 (de) 2003-08-15
LT4230B (en) 1997-10-27
DK0765389T3 (da) 2003-10-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
SI9520073A (sl) Novi celični sistemi, ki imajo specifično interakcijo peptidnih veznih parov
Young Yeast two-hybrid: so many interactions,(in) so little time…
EP0371820B1 (en) Novel receptors: their identification, characterization, preparation and use
Bergers et al. Transcriptional activation of the fra-1 gene by AP-1 is mediated by regulatory sequences in the first intron
Galsgaard et al. Identification of a growth hormone-responsive STAT5-binding element in the rat insulin 1 gene.
US7319009B2 (en) Methods and compositions for identifying receptor effectors
US20010026926A1 (en) Methods and compositions for identifying receptor effectors
Ozenberger et al. Functional interaction of ligands and receptors of the hematopoietic superfamily in yeast.
EP0862614A1 (en) Yeast receptor and g-protein fusion protein
EP0752477A2 (en) Expression vectors that produce steroid receptors, steroid receptor chimera, screening assays for steroid receptors and clinical assays using synthesized receptors and receptor vectors
EP1347052B1 (en) A method for screening compouneds using the guanosine triphosphate (gtp) binding protein-coupled receptor protein, bg37
US6673540B1 (en) Cell systems having specific interaction of peptide binding pairs
Uppaluri et al. Genetic dissection of thyroid hormone receptor β: identification of mutations that separate hormone binding and transcriptional activation
Kaisaki et al. Localization of tub and uncoupling proteins (Ucp) 2 and 3 to a region of rat chromosome 1 linked to glucose intolerance and adiposity in the Goto-Kakizaki (GK) type 2 diabetic rat
US7250263B2 (en) Methods and compositions for identifying receptor effectors
WO2001081548A1 (en) Novel cell systems having specific interaction of peptide binding pairs
JPH08510643A (ja) インターロイキン‐5受容体を介した細胞シグナル伝達経路に対する変調作用を有する物質のスクリーニング法
Yamaguchi et al. Functional analysis of aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator interactions with aryl hydrocarbon receptor in the yeast two-hybrid system
US20030009022A1 (en) Methods and compositions for identifying receptor effectors
AU2003260308B2 (en) Method for identifying substances
Ozenberger et al. Investigation of Ligand/Receptor Interactions and the Formation of Tertiary Complexes
Richter et al. Neuropeptide Hormone Rece Ptors: Strategies for Identification
Eisenmann Genetic and molecular analysis of mutations in spt15, the gene encoding the yeast TATA-binding factor TFIID
Cormack The TATA-binding protein: a mutational analysis
PAUSCH et al. HETEROLOGOUS G PROTEIN-COUPLED RECEPTORS EXPRESSED IN SACCHAROMYCES CEREVISIAE: METHODS FOR GENETIC ANALYSIS AND

Legal Events

Date Code Title Description
IF Valid on the event date
KO00 Lapse of patent

Effective date: 20120104