RU2700929C2 - Пептидная вакцина, включающая пептид ras, содержащий мутации, и химиотерапевтический агент - Google Patents
Пептидная вакцина, включающая пептид ras, содержащий мутации, и химиотерапевтический агент Download PDFInfo
- Publication number
- RU2700929C2 RU2700929C2 RU2016147527A RU2016147527A RU2700929C2 RU 2700929 C2 RU2700929 C2 RU 2700929C2 RU 2016147527 A RU2016147527 A RU 2016147527A RU 2016147527 A RU2016147527 A RU 2016147527A RU 2700929 C2 RU2700929 C2 RU 2700929C2
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- peptide
- seq
- sequence represented
- chemotherapeutic agent
- amino acid
- Prior art date
Links
- 108010014186 ras Proteins Proteins 0.000 title claims abstract description 99
- 239000002246 antineoplastic agent Substances 0.000 title claims abstract description 87
- 229940127089 cytotoxic agent Drugs 0.000 title claims abstract description 83
- 230000035772 mutation Effects 0.000 title description 176
- 229940023041 peptide vaccine Drugs 0.000 title description 7
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims abstract description 492
- 102000016914 ras Proteins Human genes 0.000 claims abstract description 139
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 claims abstract description 106
- 230000001399 anti-metabolic effect Effects 0.000 claims abstract description 80
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims abstract description 69
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 claims abstract description 60
- 230000028993 immune response Effects 0.000 claims abstract description 42
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 claims abstract description 34
- 102200006532 rs112445441 Human genes 0.000 claims abstract description 28
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims abstract description 25
- 102200006540 rs121913530 Human genes 0.000 claims abstract description 22
- 102200006531 rs121913529 Human genes 0.000 claims abstract description 21
- 102200006537 rs121913529 Human genes 0.000 claims abstract description 21
- 102200006539 rs121913529 Human genes 0.000 claims abstract description 21
- 102200006538 rs121913530 Human genes 0.000 claims abstract description 21
- 102200006541 rs121913530 Human genes 0.000 claims abstract description 21
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims abstract description 21
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 claims abstract description 17
- 239000012634 fragment Substances 0.000 claims abstract description 15
- 238000000034 method Methods 0.000 claims abstract description 15
- 102220014333 rs112445441 Human genes 0.000 claims abstract description 14
- 102200006533 rs121913535 Human genes 0.000 claims abstract description 14
- 102220197834 rs121913535 Human genes 0.000 claims abstract description 10
- 102220014328 rs121913535 Human genes 0.000 claims abstract 5
- 102220197833 rs112445441 Human genes 0.000 claims abstract 3
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 112
- SDUQYLNIPVEERB-QPPQHZFASA-N gemcitabine Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@H]1C(F)(F)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 SDUQYLNIPVEERB-QPPQHZFASA-N 0.000 claims description 44
- 229960005277 gemcitabine Drugs 0.000 claims description 44
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 42
- 206010061902 Pancreatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 19
- 208000015486 malignant pancreatic neoplasm Diseases 0.000 claims description 19
- 201000002528 pancreatic cancer Diseases 0.000 claims description 19
- 208000008443 pancreatic carcinoma Diseases 0.000 claims description 19
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims description 18
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 13
- 238000001356 surgical procedure Methods 0.000 claims description 10
- 238000002347 injection Methods 0.000 claims description 9
- 239000007924 injection Substances 0.000 claims description 9
- 230000000977 initiatory effect Effects 0.000 claims description 6
- CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N Pyrimidine Chemical compound C1=CN=CN=C1 CZPWVGJYEJSRLH-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims description 3
- 150000003230 pyrimidines Chemical class 0.000 claims description 3
- 125000000714 pyrimidinyl group Chemical group 0.000 claims description 2
- 239000003814 drug Substances 0.000 abstract description 9
- 230000000694 effects Effects 0.000 abstract description 7
- 239000000126 substance Substances 0.000 abstract description 2
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 59
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 34
- 102200006657 rs104894228 Human genes 0.000 description 19
- 102000004457 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Human genes 0.000 description 16
- 108010017213 Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor Proteins 0.000 description 16
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 15
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 13
- -1 inorganic acid salts Chemical class 0.000 description 12
- 231100000371 dose-limiting toxicity Toxicity 0.000 description 10
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 9
- 108700018351 Major Histocompatibility Complex Proteins 0.000 description 9
- 239000000427 antigen Substances 0.000 description 9
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 description 9
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 description 9
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 9
- 230000020382 suppression by virus of host antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class I Effects 0.000 description 9
- 102220197780 rs121434596 Human genes 0.000 description 8
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 7
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 7
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 7
- 108700020796 Oncogene Proteins 0.000 description 6
- 102000043276 Oncogene Human genes 0.000 description 6
- 238000002512 chemotherapy Methods 0.000 description 6
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Chemical compound O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 5
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 5
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 5
- 229960005486 vaccine Drugs 0.000 description 5
- 206010052747 Adenocarcinoma pancreas Diseases 0.000 description 4
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 4
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 description 4
- 230000007246 mechanism Effects 0.000 description 4
- 201000002094 pancreatic adenocarcinoma Diseases 0.000 description 4
- 108700020978 Proto-Oncogene Proteins 0.000 description 3
- 102000052575 Proto-Oncogene Human genes 0.000 description 3
- 150000007513 acids Chemical class 0.000 description 3
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 3
- 229940044683 chemotherapy drug Drugs 0.000 description 3
- 229940029030 dendritic cell vaccine Drugs 0.000 description 3
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 3
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 3
- 230000003834 intracellular effect Effects 0.000 description 3
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 description 3
- 230000004044 response Effects 0.000 description 3
- 239000008227 sterile water for injection Substances 0.000 description 3
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 3
- 239000008215 water for injection Substances 0.000 description 3
- 206010005003 Bladder cancer Diseases 0.000 description 2
- 206010006187 Breast cancer Diseases 0.000 description 2
- 208000026310 Breast neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 230000006820 DNA synthesis Effects 0.000 description 2
- 102000016928 DNA-directed DNA polymerase Human genes 0.000 description 2
- 108010014303 DNA-directed DNA polymerase Proteins 0.000 description 2
- 102000013446 GTP Phosphohydrolases Human genes 0.000 description 2
- 102100029974 GTPase HRas Human genes 0.000 description 2
- 102100030708 GTPase KRas Human genes 0.000 description 2
- 102100039788 GTPase NRas Human genes 0.000 description 2
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 2
- 101000584633 Homo sapiens GTPase HRas Proteins 0.000 description 2
- 101000584612 Homo sapiens GTPase KRas Proteins 0.000 description 2
- 101000744505 Homo sapiens GTPase NRas Proteins 0.000 description 2
- 206010028813 Nausea Diseases 0.000 description 2
- 208000007097 Urinary Bladder Neoplasms Diseases 0.000 description 2
- 230000002159 abnormal effect Effects 0.000 description 2
- 230000009471 action Effects 0.000 description 2
- 239000002585 base Substances 0.000 description 2
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 2
- 238000009566 cancer vaccine Methods 0.000 description 2
- 229940022399 cancer vaccine Drugs 0.000 description 2
- 238000002648 combination therapy Methods 0.000 description 2
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 2
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 230000003111 delayed effect Effects 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 2
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 description 2
- 230000002708 enhancing effect Effects 0.000 description 2
- 150000002333 glycines Chemical class 0.000 description 2
- 150000003840 hydrochlorides Chemical class 0.000 description 2
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 2
- 230000036039 immunity Effects 0.000 description 2
- 238000010253 intravenous injection Methods 0.000 description 2
- 210000003810 lymphokine-activated killer cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000008693 nausea Effects 0.000 description 2
- 208000002154 non-small cell lung carcinoma Diseases 0.000 description 2
- 102000027450 oncoproteins Human genes 0.000 description 2
- 108091008819 oncoproteins Proteins 0.000 description 2
- 239000000825 pharmaceutical preparation Substances 0.000 description 2
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 description 2
- 238000002271 resection Methods 0.000 description 2
- 102200006520 rs121913240 Human genes 0.000 description 2
- 102200006525 rs121913240 Human genes 0.000 description 2
- 102200007373 rs17851045 Human genes 0.000 description 2
- 102200006648 rs28933406 Human genes 0.000 description 2
- 230000004936 stimulating effect Effects 0.000 description 2
- 238000012360 testing method Methods 0.000 description 2
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 2
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 2
- 238000011269 treatment regimen Methods 0.000 description 2
- 208000029729 tumor suppressor gene on chromosome 11 Diseases 0.000 description 2
- 201000005112 urinary bladder cancer Diseases 0.000 description 2
- UHDGCWIWMRVCDJ-UHFFFAOYSA-N 1-beta-D-Xylofuranosyl-NH-Cytosine Natural products O=C1N=C(N)C=CN1C1C(O)C(O)C(CO)O1 UHDGCWIWMRVCDJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QIJIUJYANDSEKG-UHFFFAOYSA-N 2,4,4-trimethylpentan-2-amine Chemical class CC(C)(C)CC(C)(C)N QIJIUJYANDSEKG-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 description 1
- 108020004705 Codon Proteins 0.000 description 1
- UHDGCWIWMRVCDJ-PSQAKQOGSA-N Cytidine Natural products O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O1 UHDGCWIWMRVCDJ-PSQAKQOGSA-N 0.000 description 1
- 102000053602 DNA Human genes 0.000 description 1
- 108020004414 DNA Proteins 0.000 description 1
- 230000004543 DNA replication Effects 0.000 description 1
- 102000016911 Deoxyribonucleases Human genes 0.000 description 1
- 108010053770 Deoxyribonucleases Proteins 0.000 description 1
- BWLUMTFWVZZZND-UHFFFAOYSA-N Dibenzylamine Chemical class C=1C=CC=CC=1CNCC1=CC=CC=C1 BWLUMTFWVZZZND-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XBPCUCUWBYBCDP-UHFFFAOYSA-N Dicyclohexylamine Chemical class C1CCCCC1NC1CCCCC1 XBPCUCUWBYBCDP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010061819 Disease recurrence Diseases 0.000 description 1
- PIICEJLVQHRZGT-UHFFFAOYSA-N Ethylenediamine Chemical class NCCN PIICEJLVQHRZGT-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- KRHYYFGTRYWZRS-UHFFFAOYSA-N Fluorane Chemical class F KRHYYFGTRYWZRS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108010026288 GTP Phosphohydrolases Proteins 0.000 description 1
- 108091006109 GTPases Proteins 0.000 description 1
- NYHBQMYGNKIUIF-UUOKFMHZSA-N Guanosine Chemical compound C1=NC=2C(=O)NC(N)=NC=2N1[C@@H]1O[C@H](CO)[C@@H](O)[C@H]1O NYHBQMYGNKIUIF-UUOKFMHZSA-N 0.000 description 1
- 102000018713 Histocompatibility Antigens Class II Human genes 0.000 description 1
- 108010027412 Histocompatibility Antigens Class II Proteins 0.000 description 1
- 101000686246 Homo sapiens Ras-related protein R-Ras Proteins 0.000 description 1
- CPELXLSAUQHCOX-UHFFFAOYSA-N Hydrogen bromide Chemical class Br CPELXLSAUQHCOX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010022004 Influenza like illness Diseases 0.000 description 1
- 101100193693 Kirsten murine sarcoma virus K-RAS gene Proteins 0.000 description 1
- AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N L-Ornithine Chemical class NCCC[C@H](N)C(O)=O AHLPHDHHMVZTML-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical class NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N L-valine Chemical compound CC(C)[C@H](N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 description 1
- MBBZMMPHUWSWHV-BDVNFPICSA-N N-methylglucamine Chemical class CNC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO MBBZMMPHUWSWHV-BDVNFPICSA-N 0.000 description 1
- 206010033128 Ovarian cancer Diseases 0.000 description 1
- 206010061535 Ovarian neoplasm Diseases 0.000 description 1
- 102000004316 Oxidoreductases Human genes 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 102000007079 Peptide Fragments Human genes 0.000 description 1
- 108010033276 Peptide Fragments Proteins 0.000 description 1
- 206010037660 Pyrexia Diseases 0.000 description 1
- 102100024683 Ras-related protein R-Ras Human genes 0.000 description 1
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 230000005867 T cell response Effects 0.000 description 1
- ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N Triethylamine Chemical class CCN(CC)CC ZMANZCXQSJIPKH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 102000044209 Tumor Suppressor Genes Human genes 0.000 description 1
- 108700025716 Tumor Suppressor Genes Proteins 0.000 description 1
- KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N Valine Natural products CC(C)C(N)C(O)=O KZSNJWFQEVHDMF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010047700 Vomiting Diseases 0.000 description 1
- 150000001242 acetic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 1
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 1
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 1
- 229910052783 alkali metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 229910052784 alkaline earth metal Inorganic materials 0.000 description 1
- AZDRQVAHHNSJOQ-UHFFFAOYSA-N alumane Chemical class [AlH3] AZDRQVAHHNSJOQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000003863 ammonium salts Chemical class 0.000 description 1
- 230000005875 antibody response Effects 0.000 description 1
- 125000000637 arginyl group Chemical class N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(=O)* 0.000 description 1
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 description 1
- 125000003289 ascorbyl group Chemical class [H]O[C@@]([H])(C([H])([H])O*)[C@@]1([H])OC(=O)C(O*)=C1O* 0.000 description 1
- CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-L aspartate group Chemical class N[C@@H](CC(=O)[O-])C(=O)[O-] CKLJMWTZIZZHCS-REOHCLBHSA-L 0.000 description 1
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- UPABQMWFWCMOFV-UHFFFAOYSA-N benethamine Chemical class C=1C=CC=CC=1CNCCC1=CC=CC=C1 UPABQMWFWCMOFV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- SRSXLGNVWSONIS-UHFFFAOYSA-N benzenesulfonic acid Chemical class OS(=O)(=O)C1=CC=CC=C1 SRSXLGNVWSONIS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 159000000007 calcium salts Chemical class 0.000 description 1
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 1
- VDANGULDQQJODZ-UHFFFAOYSA-N chloroprocaine Chemical class CCN(CC)CCOC(=O)C1=CC=C(N)C=C1Cl VDANGULDQQJODZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000001860 citric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 238000011260 co-administration Methods 0.000 description 1
- 229940001442 combination vaccine Drugs 0.000 description 1
- UHDGCWIWMRVCDJ-ZAKLUEHWSA-N cytidine Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](CO)O1 UHDGCWIWMRVCDJ-ZAKLUEHWSA-N 0.000 description 1
- RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-N dCTP Chemical compound O=C1N=C(N)C=CN1[C@@H]1O[C@H](CO[P@](O)(=O)O[P@](O)(=O)OP(O)(O)=O)[C@@H](O)C1 RGWHQCVHVJXOKC-SHYZEUOFSA-N 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 230000034994 death Effects 0.000 description 1
- 230000001934 delay Effects 0.000 description 1
- ZBCBWPMODOFKDW-UHFFFAOYSA-N diethanolamine Chemical class OCCNCCO ZBCBWPMODOFKDW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 150000005332 diethylamines Chemical class 0.000 description 1
- 239000003085 diluting agent Substances 0.000 description 1
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 1
- 239000000890 drug combination Substances 0.000 description 1
- CCIVGXIOQKPBKL-UHFFFAOYSA-N ethanesulfonic acid Chemical class CCS(O)(=O)=O CCIVGXIOQKPBKL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000001747 exhibiting effect Effects 0.000 description 1
- PJZDLZXMGBOJRF-CXOZILEQSA-L folfirinox Chemical compound [Pt+4].[O-]C(=O)C([O-])=O.[NH-][C@H]1CCCC[C@@H]1[NH-].FC1=CNC(=O)NC1=O.C1NC=2NC(N)=NC(=O)C=2N(C=O)C1CNC1=CC=C(C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C=C1.C1=C2C(CC)=C3CN(C(C4=C([C@@](C(=O)OC4)(O)CC)C=4)=O)C=4C3=NC2=CC=C1OC(=O)N(CC1)CCC1N1CCCCC1 PJZDLZXMGBOJRF-CXOZILEQSA-L 0.000 description 1
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 1
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 1
- VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-L fumarate(2-) Chemical class [O-]C(=O)\C=C\C([O-])=O VZCYOOQTPOCHFL-OWOJBTEDSA-L 0.000 description 1
- 230000006870 function Effects 0.000 description 1
- 229960005144 gemcitabine hydrochloride Drugs 0.000 description 1
- 230000002068 genetic effect Effects 0.000 description 1
- 239000011521 glass Substances 0.000 description 1
- 150000002301 glucosamine derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 150000002306 glutamic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 150000002357 guanidines Chemical class 0.000 description 1
- 210000002443 helper t lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- XMBWDFGMSWQBCA-UHFFFAOYSA-N hydrogen iodide Chemical class I XMBWDFGMSWQBCA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000002163 immunogen Effects 0.000 description 1
- 239000002955 immunomodulating agent Substances 0.000 description 1
- 230000002584 immunomodulator Effects 0.000 description 1
- 229940121354 immunomodulator Drugs 0.000 description 1
- 238000010348 incorporation Methods 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 239000003112 inhibitor Substances 0.000 description 1
- 230000002401 inhibitory effect Effects 0.000 description 1
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 description 1
- 150000007529 inorganic bases Chemical class 0.000 description 1
- 159000000014 iron salts Chemical class 0.000 description 1
- 230000002147 killing effect Effects 0.000 description 1
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 229910003002 lithium salt Inorganic materials 0.000 description 1
- 159000000002 lithium salts Chemical class 0.000 description 1
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 1
- 159000000003 magnesium salts Chemical class 0.000 description 1
- 150000002688 maleic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 150000004701 malic acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 239000000463 material Substances 0.000 description 1
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Substances 0.000 description 1
- 230000001394 metastastic effect Effects 0.000 description 1
- 206010061289 metastatic neoplasm Diseases 0.000 description 1
- AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-M methanesulfonate group Chemical class CS(=O)(=O)[O-] AFVFQIVMOAPDHO-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 238000012544 monitoring process Methods 0.000 description 1
- 150000002780 morpholines Chemical class 0.000 description 1
- 230000017074 necrotic cell death Effects 0.000 description 1
- 208000004235 neutropenia Diseases 0.000 description 1
- 150000002823 nitrates Chemical class 0.000 description 1
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 1
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 1
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 1
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 description 1
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 description 1
- 231100000590 oncogenic Toxicity 0.000 description 1
- 230000002246 oncogenic effect Effects 0.000 description 1
- 150000003891 oxalate salts Chemical class 0.000 description 1
- 210000000496 pancreas Anatomy 0.000 description 1
- 239000002245 particle Substances 0.000 description 1
- VLTRZXGMWDSKGL-UHFFFAOYSA-N perchloric acid Chemical class OCl(=O)(=O)=O VLTRZXGMWDSKGL-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000002093 peripheral effect Effects 0.000 description 1
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 1
- 235000021317 phosphate Nutrition 0.000 description 1
- 150000003013 phosphoric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 150000004885 piperazines Chemical class 0.000 description 1
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 description 1
- 230000002980 postoperative effect Effects 0.000 description 1
- 159000000001 potassium salts Chemical class 0.000 description 1
- MFDFERRIHVXMIY-UHFFFAOYSA-N procaine Chemical class CCN(CC)CCOC(=O)C1=CC=C(N)C=C1 MFDFERRIHVXMIY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000017854 proteolysis Effects 0.000 description 1
- 230000002797 proteolythic effect Effects 0.000 description 1
- 230000002685 pulmonary effect Effects 0.000 description 1
- VTGOHKSTWXHQJK-UHFFFAOYSA-N pyrimidin-2-ol Chemical compound OC1=NC=CC=N1 VTGOHKSTWXHQJK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108700042226 ras Genes Proteins 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 238000012552 review Methods 0.000 description 1
- 239000002342 ribonucleoside Substances 0.000 description 1
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 1
- 230000011664 signaling Effects 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 159000000000 sodium salts Chemical class 0.000 description 1
- 230000000638 stimulation Effects 0.000 description 1
- 150000003890 succinate salts Chemical class 0.000 description 1
- 150000003467 sulfuric acid derivatives Chemical class 0.000 description 1
- 230000004083 survival effect Effects 0.000 description 1
- 230000002195 synergetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000003786 synthesis reaction Methods 0.000 description 1
- 238000007910 systemic administration Methods 0.000 description 1
- 230000009885 systemic effect Effects 0.000 description 1
- 150000003892 tartrate salts Chemical class 0.000 description 1
- QEMXHQIAXOOASZ-UHFFFAOYSA-N tetramethylammonium Chemical class C[N+](C)(C)C QEMXHQIAXOOASZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 1
- JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N toluene-4-sulfonic acid Chemical class CC1=CC=C(S(O)(=O)=O)C=C1 JOXIMZWYDAKGHI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000009466 transformation Effects 0.000 description 1
- 230000005945 translocation Effects 0.000 description 1
- 125000002827 triflate group Chemical class FC(S(=O)(=O)O*)(F)F 0.000 description 1
- UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-N triphosphoric acid Chemical class OP(O)(=O)OP(O)(=O)OP(O)(O)=O UNXRWKVEANCORM-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N tris Chemical class OCC(N)(CO)CO LENZDBCJOHFCAS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000002255 vaccination Methods 0.000 description 1
- 239000004474 valine Substances 0.000 description 1
- 230000008673 vomiting Effects 0.000 description 1
Images
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C07—ORGANIC CHEMISTRY
- C07K—PEPTIDES
- C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
- C07K14/82—Translation products from oncogenes
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/0005—Vertebrate antigens
- A61K39/0011—Cancer antigens
- A61K39/001154—Enzymes
- A61K39/001164—GTPases, e.g. Ras or Rho
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/70—Carbohydrates; Sugars; Derivatives thereof
- A61K31/7042—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings
- A61K31/7052—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides
- A61K31/706—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom
- A61K31/7064—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines
- A61K31/7068—Compounds having saccharide radicals and heterocyclic rings having nitrogen as a ring hetero atom, e.g. nucleosides, nucleotides containing six-membered rings with nitrogen as a ring hetero atom containing condensed or non-condensed pyrimidines having oxo groups directly attached to the pyrimidine ring, e.g. cytidine, cytidylic acid
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K35/00—Medicinal preparations containing materials or reaction products thereof with undetermined constitution
- A61K35/12—Materials from mammals; Compositions comprising non-specified tissues or cells; Compositions comprising non-embryonic stem cells; Genetically modified cells
- A61K35/14—Blood; Artificial blood
- A61K35/17—Lymphocytes; B-cells; T-cells; Natural killer cells; Interferon-activated or cytokine-activated lymphocytes
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K38/00—Medicinal preparations containing peptides
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K39/0005—Vertebrate antigens
- A61K39/0011—Cancer antigens
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K45/00—Medicinal preparations containing active ingredients not provided for in groups A61K31/00 - A61K41/00
- A61K45/06—Mixtures of active ingredients without chemical characterisation, e.g. antiphlogistics and cardiaca
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P35/00—Antineoplastic agents
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P37/00—Drugs for immunological or allergic disorders
- A61P37/02—Immunomodulators
- A61P37/04—Immunostimulants
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
- A61P43/00—Drugs for specific purposes, not provided for in groups A61P1/00-A61P41/00
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/51—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising whole cells, viruses or DNA/RNA
- A61K2039/515—Animal cells
- A61K2039/5158—Antigen-pulsed cells, e.g. T-cells
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/545—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the dose, timing or administration schedule
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/555—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by a specific combination antigen/adjuvant
- A61K2039/55511—Organic adjuvants
- A61K2039/55522—Cytokines; Lymphokines; Interferons
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
- A61K2039/58—Medicinal preparations containing antigens or antibodies raising an immune response against a target which is not the antigen used for immunisation
- A61K2039/585—Medicinal preparations containing antigens or antibodies raising an immune response against a target which is not the antigen used for immunisation wherein the target is cancer
Landscapes
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Public Health (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Immunology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Oncology (AREA)
- Cell Biology (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Mycology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- General Chemical & Material Sciences (AREA)
- Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
- Zoology (AREA)
- Virology (AREA)
- Developmental Biology & Embryology (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Hematology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Gastroenterology & Hepatology (AREA)
- Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
- Pharmaceuticals Containing Other Organic And Inorganic Compounds (AREA)
- Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
- Peptides Or Proteins (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
Abstract
Группа изобретений относится к медицине, а именно к иммунологии, и может быть использована для применения пептида, соответствующего фрагменту белка RAS, для лечения рака. Пептид подходит для инициирования иммунного ответа и соответствует фрагменту белка RAS, но включает одну аминокислотную замену, пептид включает область из по крайней мере 8 аминокислот, которая содержит положение 12 или 13 белка RAS, и аминокислотная замена пептида находится в указанном положении 12 или 13, соответственно, и выбрана из замен G13A, G13C, G13D, G13R, G13S, G13V, G12A, G12C, G12D, G12R, G12S или G12V. Пептид вводят одновременно или последовательно с антиметаболическим химиотерапевтическим агентом. Группа изобретений относится также к применению ex vivo Т-клетки, специфичной в отношении указанного пептида, и включает способы лечения рака. Использование данной группы изобретений позволяет индуцировать стойкий иммунный ответ при лечении рака путем введения комбинации указанного пептида и антиметаболического химиотерапевтического агента. 5 н. и 16 з.п. ф-лы, 2 ил., 4 табл., 1 пр.
Description
ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ, К КОТОРОЙ ОТНОСИТСЯ ИЗОБРЕТЕНИЕ
Настоящее изобретение относится к как минимум одному пептиду белка RAS для применения в лечении рака. Кроме того, изобретение относится к фармацевтическому препарату этого как минимум одного пептида для указанного применения.
ПРЕДПОСЫЛКИ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Генетической предпосылкой начала рака являются изменения в прото-онкогенах, онкогенах и генах супрессорах опухолей. Прото-онкогены являются нормальными генами клеток, которые имеют потенциал превращения в онкогены. Все онкогены кодируют белки и действуют через белки. В большинстве случаев эти белки, как было показано, являются компонентами путей передачи сигнала. В природе онкогены возникают из прото-онкогенов в результате точечных мутаций или транслокаций что приводит к трансформации состояния клетки, несущей такую мутацию. Рак развивается в результате многостадийного процесса, включающего несколько событий мутации в онкогенах и онкосупрессорных клетках.
В простейшей форме, замена одного основания в протоонкогене может приводить к тому, что закодированный белок будет отличаться одной аминокислотой.
В экспериментальных моделях, в т.ч. мышиных опухолях, было показано, что точечные мутации во внутриклеточных «собственных» белках, могут давать начало антигенам отторжения опухоли, состоящих из пептидов, которые отличаются от нормальных пептидов одной аминокислотой. T-клетки, распознающие эти пептиды, в контексте молекул главного комплекса гистосовместимости (MHC) на поверхности опухолевых клеток, способны уничтожать опухолевые клетки и таким образом вызывать отторжение опухоли из организма хозяина (Boon, T et al., Cell 1989, Vol.58, p.293-303).
В течение трех последних десятилетий особое внимание уделялось анализу антител к антигенам человеческих опухолей. Предполагалось, что такие антитела могли бы применяться, как для диагностических, так и для терапевтических целей, например, в связи с противораковыми агентами. Одна из проблем заключается в том, что антитела могут связываться только с опухолевыми антигенами, которые экспонированы на поверхности опухолевых клеток. Поэтому усилия, направленные на разработку способов лечения рака, опирающихся на иммунную систему организма, оказались менее успешными, чем ожидалось.
Антитела обычно распознают свободные антигены в нативной конформации и потенциально способны распознавать практически любой сайт, экспонированный на поверхности антигена. В противоположность антителам, которые продуцируются B-клетками, T-клетки у людей распознают антигены, только при участии молекул MHC, именуемых HLA (лейкоцитарными антигенами человека), и только после соответствующего процессирования антигенов, которое обычно заключается в протеолитической фрагментации белка, которая приводит к образованию пептидов, соответствующих полостям в молекулах MHC. Это позволяет T-клеткам распознавать пептиды, образовавшиеся из внутриклеточных белков. Поэтому T-клетки могут распознавать аномальные пептиды, образовавшиеся в опухолевых клетках в любом месте, если они появляются на поверхности опухолевых клеток, с помощью молекул MHC. Следовательно, T-клетки могут быть активированы для удаления опухолевых клеток, в которых имеются аномальные пептиды.
T-клетки могут препятствовать развитию и росту раковой опухоли посредством целого ряда механизмов. Цитотоксичные T-клетки, как HLA класса I, ограниченные CD8+, так и HLA класса II, ограниченные CD4+, могут непосредственно уничтожать опухолевые клетки, несущие соответствующие опухолевые антигены. CD4+ хелперные T-клетки необходимы для инициирования и поддержания ответов цитотоксичных T-клеток и ответов антител, а также для инициирования уничтожения макрофагов и лимфокин-активированных клеток-киллеров (клеток LAK).
Были выявлены многие онкогены и их белковые продукты. Кроме того, было показано, что ассортимент T-клеток здорового человека включает T-клетки, обладающие специфичностью против синтетического пептидного фрагмента, образовавшегося из одного онкогенного продукта p21 RAS, если они презентируются на соответствующих молекулах HLA. Кроме того, предполагается, что примерно 20% всех раковых заболеваний связаны с мутацией онкогена RAS.
В заявке WO 92/14756 раскрыты синтетические пептиды и фрагменты онкогенных белковых продуктов, которые вызывают T-клеточный иммунитет, для применения в вакцинах против раковых опухолей, связанных с RAS, и композиции для лечения рака. Эти пептиды соответствую активному фрагменту онкогена, представленному раковой клеткой, и включают мутацию в одном или нескольких положениях, соответствующих мутации онкогена. В этом документе раскрыты мутации в положениях 12, 13 и 61 белка RAS и конкретно раскрыты мутации G12A, G12V, G12C, G12S, G12K, G12D, G12R, Q61R, Q61K, Q61L, Q61H, G13V и G13D. Хотя в этом документе упомянуто, что вакцины могут включать набор пептидов, имеющих наиболее распространенные мутации, обнаруженные в онкогенных белках, в заявке не предлагаются какие-либо конкретные комбинации пептидов.
В заявке WO 00/66153 обсуждаются смеси синтетических пептидов, которые инициируют T-клеточный иммунитет для применения в вакцинах против рака. Пептидные смеси состоят из RAS p21 пептидов, включающих мутации, и в документе конкретно раскрыты мутации G12A, G12C, G12D, G12R, G12S, G12V, Q61H, Q61K, Q61L, Q61R и G13D. В документе указано также, что иммунный ответ, вызванный смесью пептидов, значительно превышал эффект, вызванный индивидуальным пептидом. Однако в данной заявке не предлагается применение пептидной вакцины в комбинированном лечении рака вместе с другими формами терапии.
Gjertsen et al. (Int.J.Cancer 2001, 92, p.441-450) описали клиническое исследование фазы I/II, в которое были включены пациенты с аденокарциномой поджелудочной железы, которых вакцинировали синтетическими пептидами RAS, включающими мутации, в комбинации с гранулоцитарно-макрофагальным колониестимулирующим фактором. В этом исследовании применялась вакцина, включающая единственный пептид или смесь четырех пептидов с мутациями. Комбинированная вакцина состояла из четырех наиболее распространенных K-RAS мутаций, обнаруженных в аденокарциноме поджелудочной железы, а именно пептидов с мутациями G12V, G12D, G12C или G12R. В этом документе не предполагается, что комбинированная терапия с антиметаболическим химиотерапевтическим агентом может оказаться эффективной.
Weden et al. (Int.J.Cancer 2010, 128(5), p.1120-1128) сообщают о продолжительном наблюдении за пациентами с аденокарциномой поджелудочной железы, которых вакцинировали синтетическими пептидами RAS, содержащими мутации. Вакцина состояла либо из индивидуального пептида RAS, либо из смеси семи пептидов RAS. Конкретно, семь пептидов RAS, использованных в этом исследовании, включали мутации G12A, G12C, G12D, G12R, G12S, G12V или G13D. Отсутствует упоминание о комбинированной терапии с применением антиметаболических химиотерапевтических агентов.
Prior et al. (Cancer Res. 2012, 72(10), p.2457-2467) установили, что различные типы рака сопряжены с мутацией конкретной изоформы RAS, и что каждая изоформа имеет собственный набор мутаций кодонов. Кроме того, Prior et al. установили, что в положениях 12, 13 и 61 белка RAS возникает в общей сложности 18 мутаций, причем в каждом положении проявляется по шесть мутаций. В данном обзоре также обсуждается влияние этих мутаций на функции RAS и потенциальные механизмы, ведущие к различным моделям мутаций изоформ RAS.
Системное введение химиотерапевтического агента гемцитабина ранее считалось отдельным способом лечения раковых больных. В настоящее время введение гемцитабина является часто применяемым способом лечения пациентов с различными видами рака, например, немелкоклеточным раком легких, раком поджелудочной железы, раком мочевого пузыря и раком груди. В частности, гемцитабин часто применяется для лечения рака поджелудочной железы на поздних стадиях.
Гемцитабин представляет собой антиметаболический химиотерапевтический агент, и конкретно является аналогом пиримидина. Трифосфатное производное гемцитабина замещает цитидин при репликации ДНК, и его включение в растущую нить ДНК останавливает дальнейший синтез ДНК после присоединения еще одного нуклеотида, поскольку ДНК полимераза неспособна продолжать синтез цепи. Другие механизмы действия, как полагают, включают ингибирование рибонуклеозид редуктазы, ведущее к истощению запасов дезоксирибонуклеазы, необходимых для синтеза ДНК, и конкуренцию с дезоксицитидин трифосфатом в качестве ингибитора ДНК полимеразы. Эти механизмы приводят к некрозу, который влечет за собой остановку роста опухоли. Кроме того, указанное действие означает, что антиметаболические химиотерапевтические агенты являются токсичными для других активно делящихся клеток, например, T-клеток. Предпочтительная схема лечения включает применение химиотерапии на первом этапе с последующим введением вакцины для усиления стимулирования иммунного ответа, вызванного уничтоженными раковыми клетками.
Хотя было показано, что некоторые комбинации лекарственных средств, например, FOLFIRINOX, являются более эффективными, чем гемцитабин у пациентов с метастатической аденокарциномой поджелудочной железы, лечение этими комбинациями связано с высокой частотой появления побочных эффектов (Conroy et al., N Engl J Med 2011, vol. 364(19), p.1817-1825). Поэтому желательно разработать новые стратегии лечения рака.
Oettle et al. (JAMA 2007, 297(3), p.267-277) описали исследование, посвященное применению гемцитабина в качестве вспомогательной химиотерапии при операбельном раке поджелудочной железы и установили, что влияние гемцитабина на срок выживаемости без признаков заболевания было статистически достоверным у пациентов с резекцией R0 (радикальной) или R1. В частности, в этом исследовании было обнаружено, что послеоперационное применение гемцитабина достоверно отсрочивает развитие рецидива заболевания после полной резекции рака поджелудочной железы, по сравнению с пациентами, которым не вводили гемцитабин после проведения операции. Однако в этом исследовании не предполагалось, что гемцитабин мог бы применяться в комбинации с другими способами лекарственного лечения рака.
Bauer et al. (Cancer Immunol.Immunother. 2014, 63, p.321-333) установили, что гемцитабин оказывает отрицательное влияние на пролиферацию T-клеток, инициированную вакциной на основе дендритных клеток (DC). В частности, это исследование показало, что отсроченное введение гемцитабина по сравнению с DC вакциной не улучшало иммунный ответ пациента, тогда как одновременное введение гемцитабина и DC вакцины значительно ослабляло иммунный ответ, вызванный вакциной.
Таким образом, существует потребность в дополнительных и более эффективных способах лечения рака.
СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Основой для настоящего изобретения послужило неожиданное обнаружение того, что введение вакцины на основе пептидов RAS в комбинации с антиметаболическим химиотерапевтическим агентом (гемцитабином) значительно улучшало иммунный ответ пациентов по сравнению с введением только вакцины на основе пептидов RAS. Это стало неожиданным, поскольку раньше считалось, что введение пациенту антиметаболического химиотерапевтического агента, такого как гемцитабин, вызывает смерть пролиферирующих иммунных клеток, в т.ч. пролиферирующих T-клеток, что снижает активность иммунной системы пациента и за счет этого ослабляет иммунный ответ пациента на пептидную вакцину, которую вводят одновременно или последовательно. Не желая ограничиваться каким-либо объяснением, можно предположить, что фактически гибель клеток, вызванная антиметаболическим химиотерапевтическим агентом, может приводить к высвобождению сигнальных молекул, которые создают системную иммуногенную среду, тем самым, способствуя уже вызванному иммунному ответу и усиливая дополнительно инициированные иммунные ответы. Таким образом, под действием антиметаболического химиотерапевтического агента иммунный ответ на пептидную вакцину в действительности усиливается, а не ослабляется.
В первом аспекте настоящее изобретение относится к как минимум одному пептиду, подходящему для инициирования иммунного ответа, где этот один пептид или каждый из пептидов соответствует фрагменту белка RAS, но включает от одной до трех точечных мутаций этого фрагмента, для применения в лечении рака при одновременном или последовательном введении антиметаболического химиотерапевтического агента.
Преимущественно, указанный один или каждый из пептидов содержит область как минимум из 8 аминокислотных остатков, которая включает положения 12 или 13 белка RAS, где указанная область содержит как минимум 6 аминокислотных остатков, помимо остатков в положениях 12 или 13 соответственно, которые идентичны соответствующей области белка RAS, и где один или каждый из пептидов содержит точечную мутацию по аминокислотному остатку, соответствующему указанным положениям 12 или 13 соответственно.
Одна из указанных точечных мутаций, которые подходят для применения по настоящему изобретению, выбрана из мутаций G13A, G13C, G13D, G13R, G13C, G13V, G12A, G12C, G12D, G12R, G12S или G12V.
Предпочтительно, указанный как минимум один пептид включает два или несколько пептидов, причем каждый из этих пептидов содержит различные точечные мутации.
Преимущественно, указанный как минимум один пептид включает:
пептид, содержащий мутацию G13D
пептид, содержащий мутацию G12A
пептид, содержащий мутацию G12C
пептид, содержащий мутацию G12D
пептид, содержащий мутацию G12R
пептид, содержащий мутацию G12S, и
пептид, содержащий мутацию G12V,
предпочтительно, где указанный как минимум один пептид включает пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO:13, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO:14, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO:15, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO:16, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO:17, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO:18, и пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO:19.
Как минимум один пептид, подходящий для применения в настоящем изобретении, включает:
пептид, содержащий мутацию G13D
пептид, содержащий мутацию G13C
пептид, содержащий мутацию G12A
пептид, содержащий мутацию G12C
пептид, содержащий мутацию G12D
пептид, содержащий мутацию G12R
пептид, содержащий мутацию G12S, и
пептид, содержащий мутацию G12V,
предпочтительно, где указанный как минимум один пептид включает пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO:13, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO:14, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO:15, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO:16, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO:17, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO:18, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO:19 и пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO:20.
Предпочтительно, антиметаболический химиотерапевтический агент представляет собой аналог пиримидина или его фармацевтически приемлемую соль.
Преимущественно, аналог пиримидина является гемцитабином или его фармацевтически приемлемой солью.
Согласно настоящему изобретению, рак включает клетки, которые экспрессируют мутировавший белок RAS.
Предпочтительно, рак представляет собой рак поджелудочной железы.
Согласно настоящему изобретению, рак поджелудочной железы представляет собой рак резецированной поджелудочной железы.
Преимущественно, антиметаболический химиотерапевтический агент впервые вводят как минимум через три недели после первой дозы как минимум одного пептида.
Согласно настоящему изобретению, первое введение антиметаболического химиотерапевтического агента осуществляют через 12 недель или менее после хирургического удаления раковой опухоли поджелудочной железы.
Предпочтительно, антиметаболический химиотерапевтический агент вводят в течение 24 часов относительно времени введения как минимум одного пептида.
Преимущественно, антиметаболический химиотерапевтический агент вводят после того, как был введен как минимум один пептид.
Согласно настоящему изобретению, указанный как минимум один пептид вводят в дозировке 0,01-10 мг, предпочтительно 0,1-2 мг и более предпочтительно 0,7 мг за одно введение.
Предпочтительно, антиметаболический химиотерапевтический агент вводят в дозировке 100-10000 мг/м2, предпочтительно 500-2000 мг/м2 и более предпочтительно 1000 мг/м2.
Преимущественно, упомянутый как минимум один пептид и упомянутый антиметаболический химиотерапевтический агент вводят одновременно или последовательно, как минимум в два введения и, более предпочтительно, как минимум в три введения, где каждый случай введения отделен от другого как минимум одной неделей и более предпочтительно как минимум 2 неделями.
Во втором аспекте настоящее изобретение относится как минимум к одной T-клетке, специфичной в отношении как минимум одного пептида по описанному выше первому аспекту изобретения, или препарату T-клеток, включающему T-клетки, специфичные в отношении как минимум одного пептида по описанному выше первому аспекту изобретения, в случае их присутствия на молекуле MHC, для применения в лечении рака, путем одновременного или последовательного введения с антиметаболическим химиотерапевтическим агентом.
В третьем аспекте настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, включающей как минимум один пептид по изложенному выше первому аспекту, или по крайней мере одну T-клетку или препарат T-клеток по изложенному выше второму аспекту, для применения в лечении рака путем комбинированного или последовательного введения с антиметаболическим химиотерапевтическим агентом.
В четвертом аспекте настоящее изобретение относится к набору, включающему первый продукт, содержащий по крайней мере один пептид, T-клетку или фармацевтическую композицию по первому, второму или третьему аспекту, которые описаны выше, соответственно, а также второй продукт, включающий определенное количество антиметаболического химиотерапевтического агента, соответствующего описанным выше аспектам.
В пятом аспекте настоящее изобретение относится к способу лечения рака, включающему введение пациенту, которому это необходимо, по крайней мере одного пептида, T-клетки или фармацевтической композиции, согласно описанным выше первому, второму или третьему аспекту, соответственно, а также антиметаболического химиотерапевтического агента, соответствующего описанным выше аспектам.
Термин «пептид» в настоящем описании относится к полимеру, состоящему из аминокислотных остатков, который является фрагментом более длинного белка (или имеет последовательность, которая соответствует такому фрагменту). Этот термин применяется также к аминокислотным полимерам, в которых один или несколько аминокислотных остатков являются модифицированными остатками, или остатками, которые не встречаются в природе, например, искусственными химическими миметиками соответствующих природных аминокислот, а также к природным аминокислотным полимерам.
«Идентичность» в процентах между двумя последовательностями можно определить с помощью программы BLASTP версии 2.2.2 (Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer, Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997), "Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402), используя параметры по умолчанию. В частности, программу BLAST можно получить по интернету, по электронному адресу URL http://www.ncbi.nlm.nih.gov/blast/.
Термин «иммунный ответ» в настоящем описании, в некоторых вариантах осуществления, относится к опосредованному T-клетками иммунному ответу, развивающемуся после презентации пептида молекулами главного комплекса гистосовместимости (MHC) на поверхности клеток и, в частности, относится к активации T-клеток после презентации пептида.
Термин «белок RAS» в настоящем описании относится к классу малых белковых ГТФаз (гуанозинтрифосфатаз), кодируемых прото-онкогеном ras, который включает три изоформы белка RAS: HRAS, KRAS и NRAS. В некоторых вариантах осуществления, термин «белок RAS» относится к белку, соответствующему UniProtKB/Swiss-Prot учетный номер P01112.1, последовательность которого представлена SEQ ID NO:23.
Термин «положение 13 белка RAS», в настоящем описании относится к тринадцатому остатку в аминокислотной цепи, формирующей первичную структуру белка RAS дикого типа, считая от N-конца.
Термин «положение 12 белка RAS», в настоящем описании относится к двенадцатому остатку в аминокислотной цепи, формирующей первичную структуру белка RAS дикого типа, считая от N-конца.
Термин «аминокислота, соответствующая положению 13» в настоящем описании означает аминокислоту в пептиде, который является производным белка RAS, расположенную в аминокислотной цепи пептида в положении, соответствующей тринадцатому остатку аминокислотной последовательности белка RAS, считая от N-конца. Аналогичный смысл придается термину «аминокислота, соответствующая положению 12».
Термин «мутации белка RAS» в настоящем описании относится к одной или нескольким точечным мутациям, имеющимся в белках RAS, которые присутствуют в образце, отобранном у субъекта.
Термин «точечная мутация» в настоящем описании относится к замене одного аминокислотного остатка в полипептидной цепи белкового продукта другим аминокислотным остатком.
Термин «от одной до трех точечных мутаций» в настоящем описании означает одну точечную мутацию или две точечные мутации, или три точечные мутации.
Термин, например, «G12V» в настоящем описании относится к точечной мутации, которая возникает при замене глицина (G) в положении 12 белка RAS дикого типа, валином (V). Аналогичные определения применимы к похожим терминам, таким как G13C, G13R и т.д.
Термин «фармацевтическая композиция» в настоящем описании означает фармацевтический препарат, который подходит для введения намеченному пациенту из числа людей или животных с терапевтическими целями.
Термин «антиметаболический химиотерапевтический агент» в настоящем описании означает продукт, оказывающий ингибирующее действие на рост или деление клеток пациента и применяется для терапевтического лечения рака.
Термин «гемцитабин» в настоящем описании означает соединение, имеющее наименование по IUPAC 4-амино-1-(2-дезокси-2,2-дезокси-2,2-дифтор-β-D-эритро-пентофуранозил)пиримидин-2(1H)-он и представленное следующей структурной формулой:
Термин «его фармацевтически приемлемая соль» в настоящем описании означает соль, сформированную при взаимодействии соединения в свободной форме с кислотой или основанием. Примеры фармацевтически приемлемых солей включают соли галогеноводородных кислот, такие как гидрофториды, гидрохлориды, гидробромиды и гидройодиды; соли неорганических кислот, такие как гидрохлориды, нитраты, перхлораты, сульфаты и фосфаты; соли низших алкансульфоновых кислот, такие как метансульфонаты, трифторметансульфонаты и этансульфонаты; соли арилсульфоновых кислот, такие как бензолсульфонаты и п-толуолсульфонаты; соли органических кислот, такие как ацетаты, малаты, фумараты, сукцинаты, цитраты, аскорбаты, тартраты, оксалаты и малеаты; соли щелочных металлов, например, соли натрия, соли калия и соли лития; соли щелочноземельных металлов, например, соли кальция и соли магния; соли металлов, например, соли алюминия и соли железа; соли неорганических оснований, например, соли аммония; соли аминов, в т.ч. органические соли, например, соли т-октиламина, соли дибензиламина, соли морфолина, соли глюкозамина, соли алкилового эфира фенилглицина, соли этилендиамина, соли N-метилглюкамина, соли гуанидина, соли диэтиламина, соли триэтиламина, соли дициклогексиламина, соли N,Nʹ-дибензилэтилендиамина, соли хлорпрокаина, соли прокаина, соли диэтаноламина, соли N-бензилфенэтиламина, соли пиперазина, соли тетраметиламмония и соли трис(гидроксиметил)аминометана; а также соли аминокислот, например, соли глицина, соли лизина, соли аргинина, соли орнитина, глутаматы и аспартаты.
Термин «последовательное введение» в настоящем описании означает введение двух продуктов пациенту, где эти два продукта не вводятся одновременно. В некоторых вариантах осуществления, каждое событие «последовательного введения» означает, что два продукта вводят с промежутком менее 5 дней, 4 дней, 3 дней, 2 дней или 1 дня друг относительно друга.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ИЛЛЮСТРАТИВНОГО МАТЕРИАЛА
Фиг.1 представляет собой таблицу, демонстрирующую момент времени, в который была зафиксирована положительная реакция DTH у каждого пациента. 1DTH не была достигнута; 2NT: введение не осуществлялось.
Фиг.2 представляет собой график, демонстрирующий синергетическое усиливающее действие при стимулировании иммунного ответа на DTH реакцию после начала введения гемцитабина.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ СПИСКА ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
SEQ ID NO:1 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS, включающего мутацию G13C.
SEQ ID NO:2 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS, включающего мутацию G13R.
SEQ ID NO:3 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS, включающего мутацию G13D.
SEQ ID NO:4 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS, включающего мутацию G13V.
SEQ ID NO:5 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS, включающего мутацию G13A.
SEQ ID NO:6 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS, включающего мутацию G13S.
SEQ ID NO:7 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS, включающего мутацию G12A.
SEQ ID NO:8 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS, включающего мутацию G12C.
SEQ ID NO:9 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS, включающего мутацию G12D.
SEQ ID NO:10 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS, включающего мутацию G12R.
SEQ ID NO:11 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS, включающего мутацию G12S.
SEQ ID NO:12 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS, включающего мутацию G12V.
SEQ ID NO:13 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS TG01 и TG02, включающего мутацию G13D.
SEQ ID NO:14 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS комбинаций пептидов TG01 и TG02, включающего мутацию G12A.
SEQ ID NO:15 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS комбинаций пептидов TG01 и TG02, включающего мутацию G12C.
SEQ ID NO:16 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS комбинаций пептидов TG01 и TG02, включающего мутацию G12D.
SEQ ID NO:17 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS комбинаций пептидов TG01 и TG02, включающего мутацию G12R.
SEQ ID NO:18 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS комбинаций пептидов TG01 и TG02, включающего мутацию G12S.
SEQ ID NO:19 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS комбинаций пептидов TG01 и TG02, включающего мутацию G12V.
SEQ ID NO:20 показывает аминокислотную последовательность пептида RAS комбинации пептидов TG02, включающего мутацию G13C.
SEQ ID NO:21 показывает альтернативную аминокислотную последовательность пептида RAS комбинации пептидов, включающего мутацию G13R.
SEQ ID NO:22 показывает альтернативную аминокислотную последовательность пептида RAS, включающего мутацию G13V.
SEQ ID NO:23 показывает полноразмерную аминокислотную последовательность белка RAS дикого типа.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Настоящее изобретение, говоря обобщенно, относится к как минимум одному пептиду белка RAS для применения в лечении рака путем одновременного или последовательного введения с антиметаболическим химиотерапевтическим агентом. Каждый пептид из как минимум одного пептида включает от одной до трех точечных мутаций белка RAS.
Один или каждый из пептидов для применения согласно настоящему изобретению может являться пептидом, соответствующим любому из белков HRAS, KRAS или NRAS. Все три указанные изоформы RAS обладают идентичной последовательностью во всех областях, ответственных за связывание с GDP/GTP, т.е. областей, подвергающихся мутациям при раке.
В предпочтительных вариантах осуществления, по крайней мере одна из указанных от одной до трех мутаций, является точечной мутацией, которая соответствует мутации, закодированной онкогеном RAS, например, в положениях 12, 13 или 61 белка RAS.
В некоторых вариантах осуществления, один или каждый из пептидов включает как минимум 8, как минимум 9, как минимум 10, как минимум 12, как минимум 16, как минимум 17, как минимум 18, как минимум 20, как минимум 24 или как минимум 30 аминокислотных остатков. В предпочтительных вариантах осуществления, один или каждый из как минимум одного пептида включает как минимум 8 аминокислотных остатков. В других предпочтительных вариантах осуществления, один или каждый из как минимум одного пептида включает по крайней мере 17 аминокислотных остатков.
В некоторых вариантах осуществления, один или каждый из пептидов по настоящему изобретению содержит область из как минимум 8 аминокислотных остатков, которая включает положения 12 или 13 белка RAS. В предпочтительных вариантах осуществления, точечная мутация одного или каждого из пептидов происходит по аминокислотному остатку в указанном положении 12 или 13.
В некоторых вариантах осуществления, один или каждый из пептидов имеет как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 37%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность последовательности по положениям, которые не входят в область, включающую положение 13 в белке RAS. В некоторых вариантах осуществления, один или каждый из пептидов имеет как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, которые не входят в область, включающую положение 13, одной из последовательностей SEQ ID Nos 1-6. В предпочтительных вариантах осуществления, один или каждый из пептидов имеет как минимум 95% идентичность по положениям, которые не входят в область, включающую положение 13, одной из последовательностей SEQ ID Nos 1-6. В других вариантах осуществления, один или каждый из пептидов имеет 100% идентичность по положениям, которые не входят в область, включающую положение 13, одной из последовательностей SEQ ID Nos 1-6.
В некоторых вариантах осуществления, указанный как минимум один пептид включает первый пептид, имеющий определенную процентную идентичность по положениям, которые не входят в область, включающую положение 13, одной из последовательностей SEQ ID Nos 1-6, и второй пептид, имеющий другую процентную идентичность по положениям, которые не входят в область, включающую положение 13, одной из последовательностей SEQ ID Nos 1-6. В других вариантах осуществления, первый пептид имеет определенную процентную идентичность по положениям, которые не входят в область, включающую положение 13, одной из последовательностей SEQ ID Nos 1-6, и второй пептид имеет ту же самую процентную идентичность по положениям, которые не входят в область, включающую положение 13, одной из последовательностей SEQ ID Nos 1-6. Во всех вариантах осуществления, один или каждый из пептидов способен вызывать иммунный ответ.
Каждый из первого и второго пептида из числа как минимум одного пептида по описанному выше варианту осуществления, содержит точечную мутацию в положении 13 белка RAS, где эта точечная мутация в первом пептиде отличается от точечной мутации во втором пептиде. Белок RAS дикого типа содержит глицин (G) в положении 13. Таким образом, мутация в положении 13 может быть точечной заменой глицина на любую другую аминокислоту. Тем не менее, было обнаружено, что с раком конкретно связаны мутации G13A, G13C, G13D, G13R, G13S и G13V. Таким образом, в предпочтительных вариантах осуществления, точечная мутация одного или каждого из пептидов независимо является одной из мутаций G13A, G13C, G13D, G13R, G13S или G13V. В более предпочтительных вариантах осуществления, точечная мутация в положении 13 одного из первого и второго пептидов независимо является мутацией G13C или G13D. В особенно предпочтительных вариантах осуществления, точечная мутация в положении 13 одного из первого или второго пептидов является мутацией G13C. В других особенно предпочтительных вариантах осуществления, точечная мутация в положении 13 одного из первого или второго пептидов является мутацией G13D.
В некоторых вариантах осуществления, точечная мутация в положении 13 первого или второго пептида представляет собой мутацию G13C, и точечная мутация в положении 13 другого пептида представляет собой мутацию G13D.
В других вариантах осуществления, точечная мутация в положении 13 первого или второго пептида представляет собой мутацию G13R, и точечная мутация в положении 13 другого пептида представляет собой мутацию G13V.
В некоторых вариантах осуществления, изобретение относится к двум или нескольким пептидам белка RAS, включающим от одной до трех точечных мутаций, для применения в способе лечения рака путем одновременного или последовательного введения вместе с антиметаболическим химиотерапевтическим агентом. Каждый из второго или остальных пептидов независимо включает как минимум 8, как минимум 9, как минимум 10, как минимум 12, как минимум 16, как минимум 17, как минимум 18, как минимум 20, как минимум 24 или как минимум 30 аминокислотных остатков. В предпочтительных вариантах осуществления, каждый из пептидов включает как минимум 8 аминокислотных остатков. В других предпочтительных вариантах осуществления, каждый из пептидов включает как минимум 17 аминокислотных остатков. В других вариантах осуществления, каждый из пептидов включает как минимум 18 аминокислотных остатков. Как правило, каждый пептид в смеси пептидов может включать отличающееся число аминокислотных остатков по сравнению с одним или несколькими другими пептидами. Каждый из пептидов включает как минимум одну точечную мутацию, которая отличается от точечной мутации другого пептида(ов).
В альтернативных вариантах осуществления изобретения, указанный как минимум один пептид может включать как минимум третий пептид белка RAS, содержащий фрагмент из как минимум 8 аминокислот, включающий положение 13 белка RAS. Этот как минимум третий пептид может иметь точечную мутацию по аминокислотному остатку, соответствующему положению 13 белка RAS, которая отличается от мутаций по положению 13 первого и второго пептидов. Эта точечная мутация может быть одной из мутаций G13A, G13C, G13D, G13R, G13S или G13V, независимо от точечных мутаций первого и второго пептидов.
Указанный как минимум один пептид по настоящему изобретению может дополнительно включать по крайней мере один другой пептид белка RAS, включающий область из как минимум 8 аминокислот. В некоторых вариантах осуществления, указанная область этого как минимум одного другого пептида включает положение 12 белка RAS.
В тех вариантах осуществления, где как минимум один пептид включает как минимум третий пептид, каждый из пептидов независимо включает как минимум 8, как минимум 9, как минимум 10, как минимум 12, как минимум 16, как минимум 17, как минимум 18, как минимум 20, как минимум 24 или как минимум 30 аминокислотных остатков. В предпочтительных вариантах осуществления, каждый из пептидов включает как минимум 8 аминокислотных остатков. В других предпочтительных вариантах осуществления, каждый из пептидов включает как минимум 17 аминокислотных остатков. В других вариантах осуществления, каждый из пептидов включает как минимум 18 аминокислотных остатков. В основном, каждый пептид из как минимум одного пептида может включать отличающееся число аминокислотных остатков по сравнению с одним или несколькими другими пептидами из числа как минимум одного пептида.
В тех вариантах осуществления, где как минимум один пептид включает как минимум один пептид, содержащий область, включающую положение 12 белка RAS, аминокислотный остаток, соответствующий положению 12 белка RAS, имеет точечную мутацию. В белке RAS дикого типа, аминокислотный остаток в положении 12 представляет собой глицин (G). Таким образом, в некоторых вариантах осуществления, точечная мутация в положении 12 может являться аминокислотой, отличной от глицина. В некоторых вариантах осуществления, каждая из мутаций независимо представляет собой мутацию G12A, G12C, G12D, G12R, G12S или G12V. В других вариантах осуществления, этот как минимум один другой пептид имеет как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, находящимся за пределами области, включающей положение 12, с белком RAS. В некоторых вариантах осуществления, как минимум один пептид имеет как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, находящимся за пределами области, включающей положение 12, с одной из последовательностей SEQ ID NO:7-12. В некоторых вариантах осуществления, имеется более, чем один пептид белка RAS, включающий область, состоящую из как минимум 8 аминокислотных остатков, включающую положение 12 белка RAS, и содержащая точечную мутацию по аминокислоте, соответствующей положению 12 белка RAS. В таких вариантах осуществления, каждый из пептидов, содержащих мутацию в положении 12, имеет отличающуюся от других точечную мутацию.
В некоторых вариантах осуществления, указанный как минимум один пептид включает как минимум два пептида белка RAS, каждый из которых содержит область по крайней мере из 8 аминокислотных остатков, включающую положение 12 белка RAS. Точечная мутация в положении 12 может являться одной из мутаций G12A, G12C, G12D, G12R, G12S или G12V. Эти как минимум два пептида, включающие положение 12 белка RAS, могут иметь как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, которые находятся за пределами области, включающей положение 12, с белком RAS. В некоторых вариантах осуществления, эти как минимум два пептида, включающие область из как минимум 8 аминокислот, содержащую положение 12, имеют как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, которые находятся за пределами области, включающей положение 12, с одной из последовательностей SEQ ID Nos: 7-12 и 14-19. В как минимум одном пептиде, предназначенном для применения согласно настоящему изобретению, предусмотрены любые комбинации указанных выше мутаций и последовательностей SEQ ID Nos.
В некоторых вариантах осуществления, указанный как минимум один пептид состоит из пептида, включающего мутацию G13D, пептида, включающего мутацию G12A, пептида, включающего мутацию G12C, пептида, включающего мутацию G12D, пептида, включающего мутацию G12R, пептида, включающего мутацию G12S, и пептида, включающего мутацию G12V. В этих вариантах осуществления, пептиды, входящие в упомянутый как минимум один пептид, независимо имеют как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, которые находятся за пределами области, включающей положения 12 или 13, соответственно, последовательностям SEQ ID Nos: 3, 7, 8, 9, 10, 11 и 12. В некоторых вариантах осуществления, пептидная смесь состоит из пептидов, независимо имеющих как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, которые находятся за пределами области, включающей положения 12 или 13, соответственно, последовательностям SEQ ID Nos:13-19. Этот вариант осуществления изобретения в настоящем описании именуется TG01 в случае, если имеется 100% идентичность последовательностям SEQ ID Nos:13-19. В таблице 3 показаны пептиды, которые предпочтительно присутствуют в TG01.
В некоторых вариантах осуществления, указанный как минимум один пептид состоит из пептида, включающего мутацию G13C, пептида, включающего мутацию G13D, пептида, включающего мутацию G12A, пептида, включающего мутацию G12C, пептида, включающего мутацию G12D, пептида, включающего мутацию G12R, пептида, включающего мутацию G12S, и пептида, включающего мутацию G12V. В этих вариантах осуществления, пептиды, входящие в упомянутый как минимум один пептид, независимо имеют как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, которые находятся за пределами области, включающей положения 12 или 13, соответственно, последовательностям SEQ ID Nos: 1, 3, 7, 8, 9, 10, 11 и 12. В некоторых вариантах осуществления, пептидная смесь состоит из пептидов, независимо имеющих как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, которые находятся за пределами области, включающей положения 12 или 13, соответственно, последовательностям SEQ ID Nos:13-20. Этот вариант осуществления изобретения в настоящем описании именуется TG02 в случае, если имеется 100% идентичность последовательностям SEQ ID Nos:13-20. В таблице 4 показаны пептиды, которые предпочтительно присутствуют в TG02.
В основном, один или каждый из как минимум одного пептида, предназначенного для применения согласно настоящему изобретению, в области из 8 аминокислотных остатков, включающей положения 12 или 13, содержит как минимум 6 аминокислотных остатков помимо остатков в положениях 12 и 13, соответственно, которые идентичны соответствующей области белка RAS. Кроме того, в основном, один или каждый из как минимум одного пептида, предназначенного для применения согласно настоящему изобретению, в положениях, которые находятся за пределами области, включающей положения 12 или 13 белка RAS, имеют как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность одной из последовательностей SEQ ID Nos:1-20, соответственно.
В некоторых вариантах осуществления, указанный как минимум один пептид состоит из первого, второго, третьего и четвертого пептида. Каждый из первого и второго пептида содержит точечную мутацию в положении 13 белка RAS, где точечная мутация в первом пептиде отличается от точечной мутации во втором пептиде. Точечная мутация каждого из первого и второго пептидов независимо является одной из мутаций G13A, G13C, G13D, G13R, G13S или G13V. Каждый из третьего и четвертого пептидов включает область из как минимум 8 аминокислотных остатков, содержащую положение 13 белка RAS, и каждый из третьего или четвертого пептидов независимо имеет как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, которые находятся за пределами области, включающей положение 13, с белком RAS. Каждый из третьего или четвертого пептидов может независимо иметь как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, которые находятся за пределами области, включающей положение 13, с одной из последовательностей SEQ ID NOs: 1-6, 20, 13, 21 или 22. Каждый из третьего или четвертого пептида включает точечную мутацию по аминокислотному остатку, соответствующему положению 13 пептида RAS, и каждый из первого, второго, третьего и четвертого пептидов содержит точечную мутацию, которая отличается от точечных мутаций других пептидов. В одном из вариантов осуществления, первый пептид является пептидом, включающим мутацию G13R, второй пептид является пептидом, включающим мутацию G13A, третий пептид является пептидом, включающим мутацию G13S, и четвертый пептид является пептидом, включающим мутацию G13V.
В некоторых вариантах осуществления, указанный как минимум один пептид состоит из максимум 8 различных пептидов. В других вариантах осуществления, как минимум один пептид включает максимум 10, 12, 14 или 16 различных пептидов. В вариантах осуществления, включающих более одного пептида, указанный как минимум один пептид может включать 1, 2, 3, 4, 5 или 6 пептидов, содержащих область из как минимум 8 аминокислотных остатков, включающую положение 12 белка RAS. В других вариантах осуществления, включающих более одного пептида, указанный как минимум один пептид может включать 1, 2, 3, 4, 5 или 6 пептидов, содержащих область из как минимум 8 аминокислотных остатков, включающую положение 13 белка RAS. В еще одной группе вариантов осуществления, указанный как минимум один пептид включает 1, 2, 3, 4, 5 или 6 пептидов, независимо содержащих область из как минимум 8 аминокислотных остатков, включающих положение 12 или 13 белка RAS.
В некоторых вариантах осуществления, один или каждый из пептидов, содержащих область из как минимум 8 аминокислотных остатков, включающую положение 13 белка RAS, включают положения 1-30 белка RAS. В альтернативных вариантах осуществления, один или каждый из пептидов, содержащих область из как минимум 8 аминокислотных остатков, включающую положение 13 белка RAS, включает положения 5-21 белка RAS. В другой группе вариантов осуществления, аминокислотный остаток, соответствующий положению 13 белка RAS, находится на C-конце каждого из пептидов. В следующей группе вариантов осуществления, аминокислотный остаток, соответствующий положению 13 белка RAS, находится на N-конце каждого из пептидов. Как правило, область, содержащая как минимум 8 аминокислотных остатков, включающая положение 13 белка RAS, может состоять из 8-и положений белка RAS, включающих положение 13. Например, область, содержащая как минимум 8 аминокислотных остатков, включающая положение 13, может состоять из аминокислотных остатков от положения 6 до положения 13, от положения 7 до положения 14, от положения 8 до положения 15, от положения 9 до положения 16, от положения 10 до положения 17, от положения 11 до положения 18, от положения 12 до положения 19 или от положения 13 до положения 20 белка RAS.
В некоторых вариантах осуществления, пептиды, содержащие область из как минимум 8 аминокислотных остатков, включающую положение 12 белка RAS, включают положения 1-30 белка RAS. В других вариантах осуществления, пептиды, содержащие область из как минимум 8 аминокислотных остатков, включающую положение 12 белка RAS, включает положения 5-21 белка RAS. В альтернативных вариантах осуществления, аминокислотный остаток, соответствующий положению 12 белка RAS, находится на C-конце пептида. В другой группе вариантов осуществления, аминокислотный остаток, соответствующий положению 12 белка RAS, находится на N-конце пептида. Как правило, область, содержащая как минимум 8 аминокислотных остатков, включающая положение 12 белка RAS, может состоять из 8-и положений белка RAS, включающих положение 12. Например, область, содержащая как минимум 8 аминокислотных остатков, включающая положение 12, может состоять из аминокислотных остатков от положения 5 до положения 12, от положения 6 до положения 13, от положения 7 до положения 14, от положения 8 до положения 15, от положения 9 до положения 16, от положения 10 до положения 17, от положения 11 до положения 18, или от положения 12 до положения 19 белка RAS.
В вариантах осуществления, включающих более одного пептида, этот более чем один пептид может включать различные пептиды в равных или отличающихся долях. Например, в вариантах осуществления, состоящих из первого и второго пептида, эти первый и второй пептид применяются в равных долях, т.е. каждый из пептидов составляет 50% от общего количества применяемых пептидов. В других вариантах осуществления, применяется более высокая доля первого пептида по сравнению со вторым. Например, первый пептид может составлять не менее 55%, не менее 60%, не менее 70%, не менее 80% или не менее 90% от общего количества применяемых пептидов. В альтернативных вариантах осуществления применяется более высокая доля второго пептида по сравнению с первым. Например, второй пептид может составлять не менее 55%, не менее 60%, не менее 70%, не менее 80% или не менее 90% от общего количества применяемых пептидов. В вариантах осуществления, где применяется более двух пептидов, эти пептиды могут применяться в равных или различных долях по отношению друг к другу. Например, каждый из пептидов может независимо составлять не менее 1%, не менее 5%, не менее 10%, не менее 20%, не менее 30%, не менее 40%, не менее 50%, не менее 60%, не менее 70%, не менее 80% или не менее 90% от общего количества применяемых пептидов.
Альтернативные варианты осуществления включают указанный как минимум один пептид, включающий по крайней мере пять пептидов белка RAS, где каждый из этих пяти пептидов содержит область из как минимум 8 аминокислотных остатков, включающую положение 13 белка RAS. Каждый из этих по крайней мере пяти пептидов независимо имеет как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, которые находятся за пределами области, включающей положение 13, с белком RAS, и/или независимо имеет как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, которые находятся за пределами области, включающей положение 13, с одной из последовательностей SEQ ID NOs: 1-6, 13, 20, 21 и 22. Каждый из упомянутых по крайней мере пяти пептидов содержит точечную мутацию в аминокислотном остатке, соответствующем положению 13 белка RAS, независимо выбранную из мутации G13A, G13C, G13D, G13R, G13S или G13V, и точечная мутация каждого пептида отличается от точечных мутаций остальных пептидов.
В другом варианте осуществления, указанный как минимум один пептид, подходящий для инициирования иммунного ответа, состоит из шести пептидов белка RAS, где каждый пептид содержит область из как минимум 8 аминокислотных остатков, включающую положение 12 белка RAS. Каждый из этих пептидов независимо имеет как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, которые находятся за пределами области, включающей положение 12, с белком RAS, и/или независимо имеет как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, которые находятся за пределами области, включающей положение 12, с одной из последовательностей SEQ ID NOs: 7-12 и 14-19. Каждый из этих пептидов содержит точечную мутацию в аминокислотном остатке, соответствующем положению 12 белка RAS, независимо выбранную из мутации G12A, G12C, G12D, G12R, G12S или G12V, и точечная мутация каждого пептида отличается от точечных мутаций остальных пептидов.
В следующем варианте осуществления, указанный как минимум один пептид, подходящий для инициирования иммунного ответа, состоит из первого, второго, третьего и четвертого пептида белка RAS, где каждый из первого, второго и третьего пептида включает область из по крайней мере 8 аминокислотных остатков, включающую положение 12 белка RAS, и четвертый пептид белка RAS содержит область из по крайней мере 8 аминокислотных остатков, включающую положение 13 белка RAS. Каждый из первого, второго, третьего и четвертого пептидов независимо имеет как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, которые находятся за пределами области, включающей положение 12 или 13 соответственно, с белком RAS, и/или независимо имеет как минимум 20%, как минимум 25%, как минимум 30%, как минимум 40%, как минимум 50%, как минимум 60%, как минимум 66%, как минимум 75%, как минимум 85%, как минимум 95%, как минимум 99% или 100% идентичность по положениям, которые находятся за пределами области, включающей положение 12 или 13 соответственно, с одной из последовательностей SEQ ID NOs: 7-12, 14-19, 1-6, 13, 20, 21 и 22, соответственно. Каждый из упомянутых первого, второго, третьего и четвертого пептида содержит точечную мутацию по аминокислотному остатку, соответствующему указанному положению 12 или 13 белка RAS, соответственно. В некоторых вариантах осуществления, первый пептид является пептидом, имеющим мутацию G12A, второй пептид является пептидом, имеющим мутацию G12R, третий пептид является пептидом, имеющим мутацию G12S, и четвертый пептид является пептидом, имеющим мутацию G13C.
Указанный как минимум один пептид, применяемый согласно настоящему изобретению, является пептидом, который соответствует фрагменту белка RAS, экспонируемому молекулами MHC II на поверхности клеток. Таким образом, этот как минимум один пептид, применяемый согласно настоящему изобретению, является пептидом, который соответствует белковым фрагментам, которые возникают в результате внутриклеточного протеолитического разрушения белков RAS, которые затем могут быть экспонированы на молекулах HLA, и для которых у индивидуумов в ассортименте T-клеток обычно имеются реактивные T-клетки.
В другом аспекте настоящего изобретения разработана как минимум одна T-клетка или препарат T-клеток, включающий T-клетки, специфичные в отношении как минимум одного пептида, описанного выше по тексту заявки, когда он презентируется на молекуле MHC, для применения в лечении рака путем одновременного или последовательного введения с антиметаболическим химиотерапевтическим агентом. Эту как минимум одну T-клетку можно получить стимулированием как минимум одной реактивной T-клетки как минимум одним пептидом белка RAS. Например, в одном из вариантов осуществления, указанная как минимум одна T-клетка включает множество T-клеток, в котором первые и вторые T-клетки специфичны в отношении первого и второго пептида, соответственно, соответствующих фрагменту белка RAS, где каждый пептид содержит область из как минимум 8 аминокислотных остатков, включающую положение 13 белка RAS, и где каждая из первой и второй T-клеток специфична в отношении точечной мутации по аминокислотному остатку пептида, соответствующему указанному положению 13, причем точечная мутация, в отношении которой специфична первая T-клетка, отличается от точечной мутации, в отношении которой специфична вторая T-клетка. В другом варианте осуществления, например, указанная T-клетка включает множество T-клеток, специфичных в отношении пептида, соответствующего фрагменту белка RAS, где этот пептид содержит область как минимум из 8 аминокислотных остатков, включающую положение 13 белка RAS, где каждая T-клетка специфична в отношении точечной мутации по аминокислотному остатку пептида, соответствующему указанному положению 13.
Описанные выше как минимум один пептид, как минимум одна T-клетка и препараты T-клеток предназначены для применения в лечении рака и вводятся одновременно или последовательно с антиметаболическим химиотерапевтическим агентом. В некоторых вариантах осуществления, этот антиметаболический химиотерапевтический агент является аналогом пиримидина или его фармацевтически приемлемой солью. В предпочтительных вариантах осуществления, антиметаболический химиотерапевтический агент представляет собой гемцитабин или его фармацевтически приемлемую соль. В некоторых вариантах осуществления, фармацевтически приемлемая соль гемцитабина представляет собой гемцитабина гидрохлорид.
Как минимум один пептид, как минимум одна T-клетка или препарат T-клеток, предназначенные для применения по настоящему изобретению, применяются для лечения рака. В некоторых вариантах осуществления, этот рак является раковым заболеванием, которое возникает из-за мутации белка RAS, в частности мутации, которая соответствует точечной мутации во вводимом пептиде или пептидах. В некоторых вариантах осуществления, рак является одним или несколькими раковыми заболеваниями из числа немелкоклеточного рака легких, рака поджелудочной железы, рака мочевого пузыря, рака яичников и рака груди. В предпочтительных вариантах осуществления, рак является раком поджелудочной железы. В более предпочтительных вариантах осуществления, рак является раком резецированной поджелудочной железы. В некоторых вариантах осуществления, указанный как минимум один пептид включает точечную мутацию G13C, как минимум одна T-клетка специфична в отношении пептида, имеющего мутацию G13C, или T-клеточный препарат включает T-клетки, специфичные в отношении пептида, имеющего мутацию G13C, и они предназначены для применения в лечении рака путем одновременного или последовательного введения с антиметаболическим химиотерапевтическим агентом. В таких вариантах осуществления предпочтительно, чтобы рак был раком поджелудочной железы. В другом варианте осуществления, указанный как минимум один пептид включает пептид, имеющий мутацию G13D, как минимум одна T-клетка специфична в отношении пептида, имеющего мутацию G13D, или T-клеточный препарат включает T-клетки, специфичные в отношении пептида, имеющего мутацию G13D, и они предназначены для применения в лечении рака путем одновременного или последовательного введения с антиметаболическим химиотерапевтическим агентом. В частности было обнаружено, что лечение рака путем одновременного или последовательного введения как минимум одного пептида статистически достоверно улучшает иммунный ответ на как минимум один пептид по сравнению с введением только пептидной вакцины после реализации следующей схемы введения: неделя 1 - только пептид; неделя 2 - только пептид; неделя 3 - только пептид; неделя 4 - пептид и антиметаболический химиотерапевтический агент; неделя 5 - только антиметаболический химиотерапевтический агент; неделя 6 - пептид и антиметаболический химиотерапевтический агент; неделя 7 - введение не производится; и неделя 8 - пептид и антиметаболический химиотерапевтический агент.
Фармацевтические композиции, включающие как минимум один пептид, как минимум одну T-клетку или T-клеточный препарат, которые описаны выше, также предназначены для применения по настоящему изобретению. Такие фармацевтические композиции могут также включать как минимум один фармацевтически приемлемый носитель, разбавитель и/или эксципиент. В некоторых вариантах осуществления, фармацевтическая композиция кроме того включает один или несколько дополнительных действующих ингредиентов и/или адъювантов. В некоторых вариантах осуществления, фармацевтическая композиция может дополнительно включать один или несколько ингредиентов, терапевтически эффективных для лечения проявлений того же самого заболевания. В некоторых вариантах осуществления, фармацевтическая композиция также включает гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор (GM-CSF).
В некоторых вариантах осуществления, антиметаболический химиотерапевтический агент вводят одновременно с как минимум одним пептидом, как минимум одной T-клеткой, препаратом T-клеток или фармацевтической композицией. Так, например, в этих вариантах осуществления, антиметаболический химиотерапевтический агент вводят в то же время, что и как минимум один пептид, как минимум одну T-клетку, препарат T-клеток или фармацевтическую композицию.
В других вариантах осуществления, антиметаболический химиотерапевтический агент вводят последовательно с как минимум одним пептидом, как минимум одной T-клеткой, препаратом T-клеток или фармацевтической композиций. В некоторых вариантах осуществления, вводят как минимум один пептид, как минимум одну T-клетку, препарат T-клеток или фармацевтическую композицию, после чего осуществляют введение антиметаболического химиотерапевтического агента. В некоторых вариантах осуществления, в каждом случае последовательного введения антиметаболический химиотерапевтический агент вводят в течение 6 часов относительно введения как минимум одного пептида, как минимум одной T-клетки, препарата T-клеток или фармацевтической композиции. В других вариантах осуществления, в каждом случае последовательного введения антиметаболический химиотерапевтический агент вводят в течение 12 часов относительно времени введения как минимум одного пептида, как минимум одной T-клетки, препарата T-клеток или фармацевтической композиции. В других вариантах осуществления, в каждом случае последовательного введения антиметаболический химиотерапевтический агент вводят в течение 18 часов относительно времени введения как минимум одного пептида, как минимум одной T-клетки, препарата T-клеток или фармацевтической композиции. В следующей группе вариантов осуществления, в каждом случае последовательного введения антиметаболический химиотерапевтический агент вводят в течение 24 часов относительно времени введения как минимум одного пептида, как минимум одной T-клетки, препарата T-клеток или фармацевтической композиции. В предпочтительных вариантах осуществления, в каждом случае последовательного введения, антиметаболический химиотерапевтический агент вводят в течение 24 часов непосредственно после введения как минимум одного пептида, как минимум одной T-клетки, препарата T-клеток или фармацевтической композиции.
В некоторых вариантах осуществления, как минимум один пептид, как минимум одну T-клетку, препарат T-клеток или фармацевтическую композицию, и антиметаболический химиотерапевтический агент вводят одновременно и последовательно более, чем один раз одному и тому же пациенту. В некоторых вариантах осуществления, как минимум один пептид и антиметаболический химиотерапевтический агент вводят по крайней мере дважды (т.е. имеет место как минимум два случая введения). В других вариантах осуществления, как минимум один пептид и антиметаболический химиотерапевтический агент вводят по крайней мере три раза (т.е. три случая введения). В следующей группе вариантов осуществления, как минимум один пептид, как минимум одну T-клетку, препарат T-клеток или фармацевтическую композицию и антиметаболический химиотерапевтический агент вводят более чем три раза (т.е. более трех случаев введения). В некоторых вариантах осуществления, в каждом случае введение как минимум одного пептида, как минимум одной T-клетки, препарата T-клеток или фармацевтической композиции с одной стороны и антиметаболического химиотерапевтического агента с другой стороны разделено сроком как минимум одна неделя. В других вариантах осуществления, в каждом случае введение как минимум одного пептида, как минимум одной T-клетки, препарата T-клеток или фармацевтической композиции с одной стороны и антиметаболического химиотерапевтического агента с другой стороны разделено сроком как минимум две недели. В некоторых вариантах осуществления, каждый случай введения отделен от других более чем двумя неделями.
В некоторых вариантах осуществления, антиметаболический химиотерапевтический агент вводят индивидуально один или несколько раз, до или после одновременного или последовательного введения с как минимум одним пептидом, как минимум одной T-клеткой, препаратом T-клеток или фармацевтической композиции по настоящему изобретению. В других вариантах осуществления, как минимум один пептид, как минимум одну T-клетку, препарат T-клеток или фармацевтическую композицию вводят индивидуально один или несколько раз, до или после одновременного или последовательного введения с антиметаболическим химиотерапевтическим агентом.
Так, например, в некоторых вариантах осуществления, первое введение антиметаболического химиотерапевтического агента отсрочивается по отношению к первому введению как минимум одного пептида, как минимум одной T-клетки, препарата T-клеток или фармацевтической композиции. В некоторых вариантах осуществления, первое введение антиметаболического химиотерапевтического агента осуществляют как минимум через одну неделю после первого введения как минимум одного пептида, как минимум одной T-клетки, препарата T-клеток или фармацевтической композиции. В других вариантах осуществления, первое введение антиметаболического химиотерапевтического агента осуществляют как минимум через две недели после первого введения как минимум одного пептида, как минимум одной T-клетки, препарата T-клеток или фармацевтической композиции. В следующей группе вариантов осуществления, первое введение антиметаболического химиотерапевтического агента осуществляют как минимум через три недели после первого введения как минимум одного пептида, как минимум одной T-клетки, препарата T-клеток или фармацевтической композиции. В особенно предпочтительных вариантах осуществления, независимо от промежутка времени между первым введением каждого из как минимум одного пептида, как минимум одной T-клетки, препарата T-клеток или фармацевтической композиции и антиметаболического химиотерапевтического агента, антиметаболический химиотерапевтический агент вводят в течение 24 часов относительно времени введения как минимум одного пептида, как минимум одной T-клетки, препарата T-клеток или фармацевтической композиции. В частности, было установлено, что задержка в три недели между первым введением как минимум одного пептида, как минимум одной T-клетки, препарата T-клеток или фармацевтической композиции, и первым антиметаболического химиотерапевтического агента, оказывает статистически достоверное влияние на зафиксированный иммунный ответ.
В некоторых вариантах осуществления, где рак представляет собой рак резецированной поджелудочной железы, первое введение антиметаболического химиотерапевтического агента производится через 12 недель или менее после хирургического удаления раковой опухоли поджелудочной железы. В некоторых вариантах осуществления, первое введение производится через 10 недель или менее после хирургического удаления раковой опухоли поджелудочной железы. В других вариантах осуществления, первое введение антиметаболического химиотерапевтического агента производится через 8 недель или менее после хирургического удаления раковой опухоли поджелудочной железы.
Указанный как минимум один пептид, как минимум одна T-клетка, препарат T-клеток или фармацевтическая композиция для применения в настоящем изобретении могут вводиться субъекту с помощью любой подходящей методики доставки, известной специалисту в данной области техники. Например, среди прочих методик, минимум один пептид, как минимум одна T-клетка, препарат T-клеток или фармацевтическая композиция могут вводиться субъекту инъекцией в форме раствора, в форме липосом или в сухой форме (например, в форме частиц с покрытием и т.д.). В некоторых вариантах осуществления, как минимум один пептид или фармацевтическую композицию вводят в количестве от 0,01 мг до 10 мг как минимум одного пептида за одно введение. В других вариантах осуществления, как минимум один пептид или фармацевтическую композицию вводят в количестве от 0,1 мг до 2 мг как минимум одного пептида за одно введение. В некоторых вариантах осуществления, как минимум один пептид или фармацевтическую композицию вводят в количестве 0,1 мг как минимум одного пептида за одно введение. В другом варианте осуществления, как минимум один пептид или фармацевтическую композицию вводят в количестве 0,7 мг как минимум одного пептида за одно введение. Дозировка зависит от числа различных пептидов, вводимых пациенту. Например, если как минимум один пептид состоит из пептида с одним типом точечной мутации, как минимум один пептид или фармацевтическую композицию предпочтительно вводят в количестве 0,1 мг как минимум одного пептида за одно введение. В другом примере, если указанный как минимум один пептид включает семь или более типов точечных мутаций, этот как минимум один пептид или фармацевтическую композицию предпочтительно вводят в количестве 0,7 мг как минимум одного пептида за одно введение.
В некоторых вариантах осуществления, как минимум одну T-клетку или препарат T-клеток вводят внутривенной инъекцией и/или инфузией, и введение осуществляется в количестве, например, от 106 до 1012 каждой из T-клеток, специфичных в отношении пептида по настоящему изобретению.
Антиметаболический химиотерапевтический агент можно вводить субъекту с помощью любой методики доставки, известной специалисту в данной области техники. Например, в некоторых вариантах осуществления, антиметаболический химиотерапевтический агент вводят с помощью канюли, центрального катетера или центрального катетера, введенного периферийно. В некоторых вариантах осуществления, антиметаболический химиотерапевтический агент вводят в количестве от примерно 100 до примерно 10 000 мг/м2 площади поверхности тела. В некоторых вариантах осуществления, антиметаболический химиотерапевтический агент вводят в количестве от 500 до 2000 мг/м2 площади поверхности тела. В других вариантах осуществления, антиметаболический химиотерапевтический агент вводят в количестве 1000 мг/м2 площади поверхности тела.
В других вариантах осуществления, настоящее изобретение относится к набору, включающему первый продукт, содержащий как минимум один пептид, T-клетку или фармацевтическую композицию, которые описаны выше, и второй продукт включающий источник антиметаболического химиотерапевтического агента, который описан выше. Первый и второй продукты поставляются в отдельных флаконах или отсеках. В некоторых вариантах осуществления, этот набор дополнительно включает инструкции по введению первого и второго продуктов.
Таблицы
Таблица 1: Пептиды RAS, включающие мутацию в положении 13, последовательности SEQ ID NOs: 1-6
1 13 30
MTEYKLVVVGAGCVGKSALTIQLIQNHFVD
MTEYKLVVVGAGRVGKSALTIQLIQNHFVD
MTEYKLVVVGAGDVGKSALTIQLIQNHFVD
MTEYKLVVVGAGVVGKSALTIQLIQNHFVD
MTEYKLVVVGAGAVGKSALTIQLIQNHFVD
MTEYKLVVVGAGSVGKSALTIQLIQNHFVD
Таблица 2: Пептиды RAS, включающие мутацию в положении 12, последовательности SEQ ID NOs: 7-12
1 12 30
MTEYKLVVVGAAGVGKSALTIQLIQNHFVD
MTEYKLVVVGACGVGKSALTIQLIQNHFVD
MTEYKLVVVGADGVGKSALTIQLIQNHFVD
MTEYKLVVVGARGVGKSALTIQLIQNHFVD
MTEYKLVVVGASGVGKSALTIQLIQNHFVD
MTEYKLVVVGAVGVGKSALTIQLIQNHFVD
Таблица 3: Пептиды, входящие в вариант осуществления TG01, последовательности SEQ ID NOs:13-19
5 21
KLVVVGAGDVGKSALTI
KLVVVGAAGVGKSALTI
KLVVVGACGVGKSALTI
KLVVVGADGVGKSALTI
KLVVVGARGVGKSALTI
KLVVVGASGVGKSALTI
KLVVVGAVGVGKSALTI
Таблица 4: Пептиды, входящие в вариант осуществления TG02, последовательности SEQ ID NOs:13-20
5 21
KLVVVGAGCVGKSALTI
KLVVVGAGDVGKSALTI
KLVVVGAAGVGKSALTI
KLVVVGACGVGKSALTI
KLVVVGADGVGKSALTI
KLVVVGARGVGKSALTI
KLVVVGASGVGKSALTI
KLVVVGAVGVGKSALTI
ПРИМЕРЫ
Пример 1
Проводили клинические исследования фазы I/II для определения безопасности и иммунологической реакции при вспомогательном лечении рака резецированной поджелудочной железы вакцинацией пептидом RAS (TG01) индивидуально и затем в комбинации с дополнительной химиотерапией гемцитабином.
Пациенты получали TG01 вместе с иммуномодулятором, а именно GM-CSF, в течение 1-8 недель после хирургического вмешательства. В период 3-7 недель после начала введения TG01/GM-CSF, пациенты также получали гемцитабин. Пациентов обследовали с целью определения безопасности и иммунной реакции на 11 неделе после получения по крайней мере одного цикла гемцитабина.
В начале исследования, шести пациентам вводили TG01 и GM-CSF, и на 11 неделе использовали критерии безопасности и иммунной реакции, для оценки того, как можно было бы продолжать исследование, где возможные варианты показаны ниже.
Если на 11 неделе:
- 0 из 6 пациентов продемонстрируют иммунный ответ и/или 3 из 6 пациентов продемонстрируют токсичность, ограничивающую дозировку (DLT), исследование можно будет прекратить,
- 1-3 из 6 пациентов продемонстрируют иммунный ответ и/или 3 из 6 пациентов продемонстрируют DLT, тогда в исследование можно будет включить еще 6 пациентов,
-4 или более из 6 пациентов продемонстрируют иммунный ответ и/или 2 или менее из 6 пациентов продемонстрируют DLT, тогда будет начато исследование стадии II.
Было принято решение, что если список участников фазы I расширится до 12 пациентов, тогда на 11 неделе, если:
- менее 4 пациентов из 12 продемонстрируют иммунный ответ и/или более 4 из 12 пациентов продемонстрируют DLT, то исследование можно будет прекратить,
- 4 или более пациентов из 12 продемонстрируют иммунный ответ и/или 4 или менее пациентов из 12 продемонстрируют DLT, могут быть инициированы исследования фазы II.
Таким образом, исследования фазы II могли бы начаться, если:
a) 4 или более пациентов из 6 продемонстрируют иммунный ответ и 2 или менее пациентов из 6 продемонстрируют DLT на 11 неделе, или
b) 4 или более пациентов из 12 продемонстрируют иммунный ответ и 4 или менее пациентов из 12 продемонстрируют DLT на 11 неделе.
Получение препаратов для исследования
TG01 готовили в 2R стеклянных флаконах, содержащих 2,1 мг TG01, и содержимое одного флакона TG01 растворяли в 0,3 мл стерильной воды для инъекций (7 мг/мл). Раствор использовали в течение 6 часов после разбавления.
GM-CSF готовили во флаконах, содержавших 0,1 мг препарата, и содержимое флакона растворяли в 0,33 мл стерильной воды для инъекций (0,30 мг/мл). Раствор использовали в течение 6 часов после разбавления.
Гемцитабин вводили в дозировке 1000 мг/м2. Препарат поставлялся во флаконах 200 мг и 1 г для разбавления солевым раствором с целью введения путем внутривенной инъекции.
Для инициирования DTH, содержимое флакона с TG01 растворяли в 0,3 мл стерильной воды для инъекций. Полученный раствор использовали в течение 6 часов после приготовления.
Дозировки и введение TG01 и GM-CSF
TG01 и GM-CSF вводили в дни 1, 3, 5, 8, 15, 22 и один раз в две недели до окончания химиотерапии (причем день 1 определяли как первый день введения TG01, которое начинали через 1-8 недель после хирургического вмешательства). После окончания химиотерапии, пациенты, у которых не обнаруживался рецидив и/или у которых имелся позитивный иммунный ответ в период введения в рамках исследования, получали усиленные инъекции, которые проводили один раз в 4 недели до 52 недели и затем один раз в 12 недель вплоть до 2 лет или до отзыва согласия на участие в исследовании, или до проявления токсического действия, смотря по тому, что наступит раньше.
Дозировка TG01 составляла 0,70 мг (инъекция 0,10 мл раствора TG01 в концентрации 7 мг/мл, восстановленного с использованием воды для инъекций). Дозировка GM-CSF составляла 0,03 мг (инъекция 0,10 мл раствора GM-CSF в концентрации 0,3 мг/мл, восстановленного с использованием воды для инъекций).
Оба исследуемых препарата вводили интрадермальной инъекцией в заднюю поверхность плеча, причем GM-CSF вводили за 10-15 минут до инъекции TG01.
Дозировка и введение химиотерапевтических препаратов
Введение пациентам гемцитабина начинали как минимум через 3 недели после начала введения TG01 и GM-CSF (день 22, 36 или 50 начального периода введения), но не позднее 12 недель с даты хирургического вмешательства. День первого введения TG01 и GM-CSF считали днем 1 периода введения химиотерапевтических препаратов. Гемцитабин вводили в дозировке 1000 мг/м2 внутривенно, в течение 30 минут в дни 1, 8 и 15 четырехнедельного цикла, осуществляя в общей сложности шесть циклов введения.
Дозировка и введение препаратов для инициирования DTH
TG01 вводили в дни 1, 8, 15, 22, 36, 50 и 64 в нижнюю часть другой руки.
Тестовую дозу для DTH готовили в день введения для интрадермальной инъекции в стерильном шприце, и она составляла 0,10 мл раствора TG01 в воде для инъекций в концентрации 7 мг/мл.
Критерии введения химиотерапевтических препаратов
Гемцитабин:
Перед введением гемцитабина в начале каждого нового цикла введения, оценивали состояние пациентов, чтобы гарантировать, что оно соответствует предписаниям производителя гемцитабина.
Результаты и обсуждение
Исследование было расширено с 6 до 9 пациентов, и ниже приведено обсуждение полученных результатов.
TG01-специфичный иммунный ответ был обнаружен у всех 9 субъектов на 11 неделе, причем сообщений о DLTs не поступало.
Профиль безопасности соответствовал ожидаемому для пациентов после операции на поджелудочной железе, которые получали химиотерапию. Отмечалось одно нежелательное явление, которое, как можно предположить, относится только к TG01/GM-CSF, и которое представляло собой реакцию в месте введения. У одного пациента наблюдалось три явления, которые были отнесены к TG01/GM-CSF и гемцитабину (тошнота, рвота и симптомы, напоминающие грипп). Нежелательные явления, связанные с гемцитабином, соответствовали ожидаемым для нейтропении степени 3/4 и являлись основными нежелательными явлениями, связанными с применением препаратов. В этих случаях требовался перерыв во введении гемцитабина или уменьшение дозировки.
Сообщалось о четырех серьезных нежелательных явлениях у двух пациентов. У одного пациента наблюдалась легочная инфекция и два эпизода лихорадки, причем все указанные эпизоды, как считалось, связаны с гемцитабином. У одного пациента была зафиксирована тошнота, которая также, как полагали, не была связана с введением TG01 и гемцитабина.
При том, что в начале исследования (неделя 1) имело место отсутствие реакции DTH, у четырех пациентов (44%) реакция DTH развилась перед началом введения гемцитабина в конце недели 3 (Фиг.1 и 2). Это число выросло до семи пациентов (77%) с положительной реакцией DTH после первого цикла введения гемцитабина (неделя 6) и до всех девяти пациентов (100%) после введения первой дозы гемцитабина во втором цикле (неделя 8) (Фиг. 1 и 2). Это демонстрирует, что Th1 поляризованная реакция на TG01 была инициирована у всех пациентов после совместного введения TG01 и гемцитабина на 8-й неделе.
Кроме того, было обнаружено отсутствие ослабления или прекращения достигнутой иммунной реакции, т.е. инициированные иммунные ответы являлись устойчивыми (Фиг.2). Фактически, число пациентов, демонстрирующих иммунную реакцию после совместного введения TG01 и гемцитабина во втором цикле (неделя 8), было достоверно выше, чем при индивидуальном введении TG01 (Фиг.2).
Полученные данные демонстрируют неожиданный результат, который заключается в том, что комбинация TG01 и гемцитабина эффективна для инициирования иммунного ответа у раковых пациентов, и что вызванный иммунный ответ является устойчивым. В частности, алгоритм продолжения исследования в фазе II (т.е. если на 11 неделе 4 или более из 6 пациентов продемонстрировали иммунный ответ и/или 2 или менее из 6 пациентов продемонстрировали DLT, то будут инициированы исследования фазы II) демонстрирует ожидание того, что по крайней мере у 50% пациентов мог бы проявиться иммунный ответ на 11 неделе. Таким образом, тот факт, что иммунный ответ на 11 неделе проявился у всех пациентов, оказался крайне неожиданным для специалистов, которые планировали исследование.
Claims (55)
1. Применение пептида для лечения рака, где пептид подходит для инициирования иммунного ответа, пептид соответствует фрагменту белка RAS, но включает одну аминокислотную замену, пептид включает область из по крайней мере 8 аминокислот, которая содержит положение 12 или 13 белка RAS, и аминокислотная замена пептида находится в указанном положении 12 или 13, соответственно, и выбрана из замен G13A, G13C, G13D, G13R, G13S, G13V, G12A, G12C, G12D, G12R, G12S или G12V, и где пептид вводят одновременно или последовательно с антиметаболическим химиотерапевтическим агентом.
2. Применение пептида по п.1, где пептид включает два или более пептида, причем каждый пептид содержит отличную от других аминокислотную замену.
3. Применение пептида по п.1, где пептид включает:
пептид, содержащий замену G13D
пептид, содержащий замену G12A
пептид, содержащий замену G12C
пептид, содержащий замену G12D
пептид, содержащий замену G12R
пептид, содержащий замену G12S, и
пептид, содержащий замену G12V,
предпочтительно, где указанный пептид включает пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 13, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 14, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 15, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 16, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 17, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 18, и пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 19.
4. Применение пептида по. п.1, где пептид включает:
пептид, содержащий замену G13D
пептид, содержащий замену G13C
пептид, содержащий замену G12A
пептид, содержащий замену G12C
пептид, содержащий замену G12D
пептид, содержащий замену G12R
пептид, содержащий замену G12S, и
пептид, содержащий замену G12V,
предпочтительно, где указанный пептид включает пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 13, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 14, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 15, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 16, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 17, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 18, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 19, и пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO:20.
5. Применение пептида по п.1, где антиметаболический химиотерапевтический агент является аналогом пиримидина или его фармацевтически приемлемой солью, предпочтительно, где аналог пиримидина представляет собой гемцитабин или его фармацевтически приемлемую соль.
6. Применение пептида по п. 1, где пептид включает пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 13, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 14, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 15, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 16, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 17, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 18, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 19, и пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 20, и где антиметаболический химиотерапевтический агент представляет собой гемцитабин.
7. Применение пептида по п. 1, где рак включает клетки, которые экспрессируют мутировавший белок RAS, предпочтительно, где рак является раком поджелудочной железы.
8. Применение пептида по п.1, где антиметаболический химиотерапевтический агент впервые вводят как минимум через три недели после первого введения как минимум одного пептида.
9. Применение пептида по п.7, где рак представляет собой рак резецированной поджелудочной железы, и антиметаболический химиотерапевтический агент впервые вводят через 12 или менее недель после хирургического удаления раковой опухоли поджелудочной железы.
10. Применение пептида по п. 1, где антиметаболический химиотерапевтический агент вводят в течение 24 часов относительно времени введения как минимум одного пептида.
11. Применение пептида по п. 10, где антиметаболический химиотерапевтический агент вводят после того, как был введен один пептид.
12. Применение пептида по п. 1, где этот пептид вводят в дозировке 0,01-10 мг, предпочтительно, 0,1-2 мг и более предпочтительно 0,7 мг за одно введение.
13. Применение пептида по п. 1, где антиметаболический химиотерапевтический агент вводят в дозировке 100-10000 мг/м2, предпочтительно 500-2000 мг/м2 и более предпочтительно 1000 мг/м2.
14. Применение пептида по п. 1, где пептид и антиметаболический химиотерапевтический агент вводят одновременно или последовательно, осуществляя как минимум два введения, и более предпочтительно как минимум три введения, где каждое введение отделено от остальных как минимум одной неделей и предпочтительно как минимум 2 неделями.
15. Применение ex vivo T-клетки, специфичной в отношении пептида, раскрытого в предшествующих пунктах, если он презентирован на молекуле MHC, для лечения рака, где Т-клетку вводят одновременно или последовательно с антиметаболическим химиотерапевтическим агентом.
16. Применение фармацевтической композиции, включающей пептид, раскрытый в любом из пп.1-14, или ex vivo T-клетку, раскрытую в п.15, для лечения рака путем комбинированного или последовательного введения с антиметаболическим химиотерапевтическим агентом.
17. Способ лечения рака, где способ включает стадию одновременного или последовательного введения пептида, подходящего для инициирования иммунного ответа, с антиметаболическим химиотерапевтическим агентом, где пептид соответствует фрагменту белка RAS, но включает одну аминокислотную замену, пептид включает область из по меньшей мере 8 аминокислот, которая включает положение 12 или 13 белка RAS, где аминокислотная замена пептида находится в указанном положении 12 или 13, соответственно, и выбрана из замен G13A, G13C, G13D, G13R, G13S, G13V, G12A, G12C, G12D, G12R, G12S или G12V.
18. Способ лечения рака по п. 17, где пептид включает:
пептид, содержащий замену G13D
пептид, содержащий замену G12A
пептид, содержащий замену G12C
пептид, содержащий замену G12D
пептид, содержащий замену G12R
пептид, содержащий замену G12S, и
пептид, содержащий замену G12V пептид, содержащий замену,
предпочтительно, где пептид включает пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 13, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 14, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 15, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 16, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 17, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 18, и пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 19.
19. Способ лечения рака по п. 17, где пептид включает:
пептид, содержащий замену G13D
пептид, содержащий замену G13C
пептид, содержащий замену G12A
пептид, содержащий замену G12C
пептид, содержащий замену G12D
пептид, содержащий замену G12R
пептид, содержащий замену G12S, и
пептид, содержащий замену G12V пептид, содержащий замену,
предпочтительно, где пептид включает пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 13, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 14, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 15, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 16, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 17, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 18, пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 19, и пептид, состоящий из последовательности, представленной SEQ ID NO: 20.
20. Способ лечения рака по любому из пп. 17-19, где антиметаболический химиотерапевтический агент представляет собой аналог пиримидина или его фармацевтически приемлемую соль, предпочтительно, где аналог пиримидина представляет собой гемцитабин или его фармацевтически приемлемую соль.
21. Способ лечения рака, где способ включает стадию введения в комбинации или последовательно фармацевтической композиции, включающей пептид, раскрытый в любом из пп. 1-14, или ex vivo T-клетки, раскрытой в п. 15, и антиметаболический химиотерапевтический агент.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
EP14167265.9 | 2014-05-06 | ||
EP14167265 | 2014-05-06 | ||
PCT/EP2015/059861 WO2015169804A1 (en) | 2014-05-06 | 2015-05-05 | Peptide vaccine comprising mutant ras peptide and chemotherapeutic agent |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2016147527A RU2016147527A (ru) | 2018-06-08 |
RU2016147527A3 RU2016147527A3 (ru) | 2019-01-21 |
RU2700929C2 true RU2700929C2 (ru) | 2019-09-24 |
Family
ID=50679896
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2016147527A RU2700929C2 (ru) | 2014-05-06 | 2015-05-05 | Пептидная вакцина, включающая пептид ras, содержащий мутации, и химиотерапевтический агент |
Country Status (16)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US9757439B2 (ru) |
EP (1) | EP3140320B1 (ru) |
JP (2) | JP2017514847A (ru) |
KR (1) | KR20170002563A (ru) |
CN (1) | CN106414493A (ru) |
AU (1) | AU2015257774B2 (ru) |
BR (1) | BR112016025764A2 (ru) |
CA (1) | CA2947963A1 (ru) |
CL (1) | CL2016002794A1 (ru) |
DK (1) | DK3140320T3 (ru) |
ES (1) | ES2716923T3 (ru) |
IL (1) | IL248671B (ru) |
MX (1) | MX2016014414A (ru) |
RU (1) | RU2700929C2 (ru) |
SG (2) | SG11201608712PA (ru) |
WO (1) | WO2015169804A1 (ru) |
Families Citing this family (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
BR112016013138A2 (pt) | 2013-12-09 | 2018-01-16 | Targovax Asa | mistura de peptídeos |
CA3042015A1 (en) | 2016-10-26 | 2018-05-03 | Modernatx, Inc. | Messenger ribonucleic acids for enhancing immune responses and methods of use thereof |
CN110430894A (zh) * | 2017-02-01 | 2019-11-08 | 莫得纳特斯公司 | 编码活化致癌基因突变肽的免疫调节治疗性mrna组合物 |
EP3576764A4 (en) * | 2017-02-03 | 2020-12-16 | The Medical College of Wisconsin, Inc. | KRAS PEPTIDE VACCINE COMPOSITIONS AND METHOD OF USE |
WO2020002650A1 (en) | 2018-06-29 | 2020-01-02 | Targovax Asa | A formulation |
CN114573688A (zh) * | 2018-10-19 | 2022-06-03 | 杭州纽安津生物科技有限公司 | 通用性多肽疫苗及其在制备治疗/预防胰腺癌药物中的应用 |
KR20220062488A (ko) * | 2019-06-12 | 2022-05-17 | 바이오엔테크 유에스 인크. | 신생항원 조성물 및 이의 용도 |
CN113416241B (zh) * | 2020-04-09 | 2022-04-08 | 北京臻知医学科技有限责任公司 | 一种用于诱导肿瘤特异性免疫响应的通用型抗原肽库及试剂盒 |
EP4188428A1 (en) * | 2020-07-29 | 2023-06-07 | SQZ Biotechnologies Company | Methods to stimulate immune responses to mutant ras using nucleated cells |
JP2023535982A (ja) * | 2020-07-29 | 2023-08-22 | スクイーズ バイオテクノロジーズ カンパニー | 無核細胞を使用して変異型Rasに対する免疫応答を刺激する方法 |
US20240000834A1 (en) * | 2020-11-24 | 2024-01-04 | Shanghai GenBase Biotechnology Co., Ltd. | Ras mutant epitope peptide and t cell receptor recognizing ras mutant |
WO2023220434A2 (en) * | 2022-05-12 | 2023-11-16 | The Johns Hopkins University | Neoantigen vaccines for cancer prevention |
Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1992014756A1 (en) * | 1991-02-26 | 1992-09-03 | Norsk Hydro A.S | Therapeutically useful peptides and peptides fragments |
WO2000066153A1 (en) * | 1999-04-30 | 2000-11-09 | Norsk Hydro Asa | RAS ONCOGEN p21 PEPTIDE VACCINES |
Family Cites Families (4)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
GB2328689A (en) | 1997-08-27 | 1999-03-03 | Norsk Hydro As | Peptides based on the p21 ras proto-oncogene protein for the treatment of cancer |
CN102370974B (zh) | 2002-12-16 | 2014-09-17 | 全球免疫股份有限公司 | 用于免疫治疗的基于酵母的疫苗 |
US20140199405A1 (en) * | 2013-01-11 | 2014-07-17 | Abraxis Bioscience, Llc | Method for treating cancer based on mutation status of k-ras |
BR112016013138A2 (pt) | 2013-12-09 | 2018-01-16 | Targovax Asa | mistura de peptídeos |
-
2015
- 2015-05-05 SG SG11201608712PA patent/SG11201608712PA/en unknown
- 2015-05-05 EP EP15720986.7A patent/EP3140320B1/en not_active Revoked
- 2015-05-05 MX MX2016014414A patent/MX2016014414A/es unknown
- 2015-05-05 CN CN201580023165.3A patent/CN106414493A/zh active Pending
- 2015-05-05 CA CA2947963A patent/CA2947963A1/en not_active Abandoned
- 2015-05-05 BR BR112016025764-2A patent/BR112016025764A2/pt not_active IP Right Cessation
- 2015-05-05 JP JP2016565676A patent/JP2017514847A/ja active Pending
- 2015-05-05 US US15/308,917 patent/US9757439B2/en active Active
- 2015-05-05 RU RU2016147527A patent/RU2700929C2/ru active
- 2015-05-05 ES ES15720986T patent/ES2716923T3/es active Active
- 2015-05-05 SG SG10201809701TA patent/SG10201809701TA/en unknown
- 2015-05-05 AU AU2015257774A patent/AU2015257774B2/en active Active
- 2015-05-05 WO PCT/EP2015/059861 patent/WO2015169804A1/en active Application Filing
- 2015-05-05 DK DK15720986.7T patent/DK3140320T3/en active
- 2015-05-05 KR KR1020167034070A patent/KR20170002563A/ko unknown
-
2016
- 2016-11-01 IL IL248671A patent/IL248671B/en unknown
- 2016-11-04 CL CL2016002794A patent/CL2016002794A1/es unknown
-
2020
- 2020-02-27 JP JP2020032081A patent/JP7304629B2/ja active Active
Patent Citations (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO1992014756A1 (en) * | 1991-02-26 | 1992-09-03 | Norsk Hydro A.S | Therapeutically useful peptides and peptides fragments |
WO2000066153A1 (en) * | 1999-04-30 | 2000-11-09 | Norsk Hydro Asa | RAS ONCOGEN p21 PEPTIDE VACCINES |
Non-Patent Citations (2)
Title |
---|
Réjiba S. et al. K-ras oncogene silencing strategy reduces tumor growth and enhances gemcitabine chemotherapy efficacy for pancreatic cancer treatment // Cancer Sci. 2007 Jul;98(7):1128-36. Strimpakos AS. et al. Update on phase I studies in advanced pancreatic adenocarcinoma. Hunting in darkness? // JOP. 2013 Jul 10;14(4):354-8. * |
Réjiba S. et al. K-ras oncogene silencing strategy reduces tumor growth and enhances gemcitabine chemotherapy efficacy for pancreatic cancer treatment // Cancer Sci. 2007 Jul;98(7):1128-36. Strimpakos AS. et al. Update on phase I studies in advanced pancreatic adenocarcinoma. Hunting in darkness? // JOP. 2013 Jul 10;14(4):354-8. * |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
RU2016147527A (ru) | 2018-06-08 |
US20170065694A1 (en) | 2017-03-09 |
WO2015169804A1 (en) | 2015-11-12 |
CL2016002794A1 (es) | 2017-06-09 |
SG10201809701TA (en) | 2018-12-28 |
CN106414493A (zh) | 2017-02-15 |
SG11201608712PA (en) | 2016-11-29 |
IL248671B (en) | 2021-08-31 |
US9757439B2 (en) | 2017-09-12 |
JP2017514847A (ja) | 2017-06-08 |
JP7304629B2 (ja) | 2023-07-07 |
RU2016147527A3 (ru) | 2019-01-21 |
AU2015257774A1 (en) | 2016-12-22 |
BR112016025764A2 (pt) | 2018-01-16 |
CA2947963A1 (en) | 2015-11-12 |
DK3140320T3 (en) | 2019-04-15 |
MX2016014414A (es) | 2017-02-23 |
ES2716923T3 (es) | 2019-06-18 |
AU2015257774B2 (en) | 2018-12-20 |
KR20170002563A (ko) | 2017-01-06 |
EP3140320B1 (en) | 2018-12-26 |
IL248671A0 (en) | 2017-01-31 |
EP3140320A1 (en) | 2017-03-15 |
JP2020100650A (ja) | 2020-07-02 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2700929C2 (ru) | Пептидная вакцина, включающая пептид ras, содержащий мутации, и химиотерапевтический агент | |
JP7491965B2 (ja) | ネオ抗原およびその使用方法 | |
JP6759402B2 (ja) | Flt3変異を有する急性骨髄性白血病の治療用の医薬組成物 | |
KR20220044480A (ko) | 암 면역요법의 피하 투여를 위한 조성물 및 방법 | |
JP6294459B2 (ja) | 骨髄性白血病の処置方法 | |
JP5435938B2 (ja) | ワクチン接種のための天然ペプチド及びそれらの最適化された誘導体の使用 | |
WO2008147482A2 (en) | Methods and compositions for improving immune responses | |
ES2566011T3 (es) | Péptido de epítopo HIG2 y URLC10 y vacunas que contienen el mismo | |
CN105939723A (zh) | 前列腺癌治疗用组合物 | |
Cayssials et al. | Beyond tyrosine kinase inhibitors: Combinations and other agents | |
US20230181633A1 (en) | Methods of treating cancer using a combination of tumor membrane vesicles and metformin | |
CN113966227A (zh) | 疫苗佐剂以及制剂 | |
WO2018088933A1 (en) | Anti-tumor effects of a viral vector encoding a toll-like receptor and a toll-like receptor agonist | |
RU2773273C2 (ru) | Неоантигены и способы их использования | |
TWI837869B (zh) | 新抗原及其使用方法 | |
Zheng et al. | A novel enemy of cancer: recent investigations into protozoan anti-tumor properties | |
WO2023056337A1 (en) | Tlr8 agonist for modulating immune response | |
TW201545754A (zh) | 用於抑制骨髓衍生抑制細胞之組成物 |