RU2670543C1 - РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pAL2-T-ExP, ИСПОЛЬЗУЕМАЯ ДЛЯ СОЗДАНИЯ ДНК-КАЛИБРАТОРОВ ПРИ ОЦЕНКЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ ТЕРАПИИ У ПАЦИЕНТОВ С ОСТРЫМ МИЕЛОИДНЫМ ЛЕЙКОЗОМ - Google Patents

РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pAL2-T-ExP, ИСПОЛЬЗУЕМАЯ ДЛЯ СОЗДАНИЯ ДНК-КАЛИБРАТОРОВ ПРИ ОЦЕНКЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ ТЕРАПИИ У ПАЦИЕНТОВ С ОСТРЫМ МИЕЛОИДНЫМ ЛЕЙКОЗОМ Download PDF

Info

Publication number
RU2670543C1
RU2670543C1 RU2017126667A RU2017126667A RU2670543C1 RU 2670543 C1 RU2670543 C1 RU 2670543C1 RU 2017126667 A RU2017126667 A RU 2017126667A RU 2017126667 A RU2017126667 A RU 2017126667A RU 2670543 C1 RU2670543 C1 RU 2670543C1
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
patients
gene
dna
pal2
plasmid dna
Prior art date
Application number
RU2017126667A
Other languages
English (en)
Inventor
Алиса Яновна Поттер
Ильдар Мунерович Бархатов
Екатерина Андреевна Измайлова
Original Assignee
Общество с ограниченной ответственностью "Иноген"
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Общество с ограниченной ответственностью "Иноген" filed Critical Общество с ограниченной ответственностью "Иноген"
Priority to RU2017126667A priority Critical patent/RU2670543C1/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2670543C1 publication Critical patent/RU2670543C1/ru

Links

Images

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)

Abstract

Изобретение относится к биотехнологии и медицине, в частности к рекомбинантной плазмидной ДНК pAL2-T-ExP. Плазмидная ДНК pAL2-T-ExP предназначена для создания ДНК-калибраторов при оценке эффективности терапии у пациентов с острым миелоидным лейкозом. Указанная плазмидная ДНК содержит вставку последовательно сшитых в реакции лигирования участков кДНК генов PRAME, WT1, BAALC, ABL1, GUSB. Изобретение позволяет получать ДНК-калибраторы для оценки эффективности терапии с повышенной точностью у пациентов с острым миелоидным лейкозом. 3 ил.

Description

Изобретение относится к биотехнологии и медицине, а именно к онкогематологии, и касается рекомбинантной плазмидной ДНК для использования в качестве калибраторов при проведении ПЦР с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР) и детекцией геноспецифических продуктов в режиме реального времени с целью оценки эффективности проводимой терапии у пациентов с острым миелоидным лейкозом (ОМЛ).
Использование молекулярно-генетических методов исследования, благодаря их специфичности и чувствительности, является ключевым подходом в контроле полной излеченности пациента. Тем не менее, у половины пациентов с ОМЛ не удается идентифицировать информативный генетический маркер. Именно для этой группы пациентов внедрение альтернативных подходов контроля элиминации представляется наиболее актуальным в оценке эффективности терапии.
Гиперэкспрессия гена WT1 была обнаружена при ряде заболеваний крови опухолевой природы, в том числе и при ОМЛ. Высокая экспрессия WT1 встречается у более половины пациентов с ОМЛ и является фактором неблагоприятного прогноза заболевания и высокого риска развития рецидива [Liu-Yin, J. et al. Predictive value of minimal residual disease (MRD) monitoring by RQ-PCR in WT1 positive patients entered in the UK MRC AML-15 Trial. Blood 2008 112, 259.]. Поскольку методом ОТ-ПЦР можно выявить четкие различия в уровне транскрипта WT1 в нормальных и лейкемических клетках, экспрессия WT1 является эффективным маркером в оценке минимальной остаточной болезни у пациентов при отсутствии крупных хромосомных аномалий или других мутаций, характерных для клеток опухолевого клона.
Экспрессия BAALC в зрелых клетках костного мозга и в периферической крови здоровых людей не обнаруживается. Согласно данным литературы, при ОМЛ гиперэкспрессия BAALC встречается у более 50% больных с нормальным кариотипом [Damiani D, Tiribelli М, Franzoni A et al. BAALC overexpression retains its negative prognostic role across all cytogenetic risk groups in acute myeloid leukemia patients. Am J Hematol. 2013 Oct; 88(10): 848-52]. Чрезмерная экспрессия BAALC связана с низкими показателями общей выживаемости и повышенным кумулятивным риском развития рецидива заболевания в ходе терапии.
Гиперэкспрессия гена PRAME была обнаружена у 35-64% пациентов с ОМЛ. На достаточно большой выборке пациентов [Qin YZ, Zhu НН, Liu YR, Wang YZ et al. PRAME and WT1 transcripts constitute a good molecular marker combination for monitoring minimal residual disease in myelodysplastic syndromes. Leuk Lymphoma. 2013 Jul; 54(7): 1442-9] было показано, что уровень транскрипта гена PRAME уменьшается в ходе ремиссии и увеличивается при рецидиве. Интересно, что, в отличие от гена WT1, экспрессия которого ассоциирована с различными генетическими поломками, гиперэкспрессия гена PRAME встречается у пациентов с ОМЛ без крупных транслокаций и с нормальным кариотипом.
Для перечисленных маркеров опухолевого роста подсчет абсолютных количеств копий осуществляется с использованием раздельных наборов калибраторов для анализируемого и референсного генов. Учитывая возможность неравномерной деградации плазмидной ДНК в калибраторах, существует вероятность искажения результатов исследования относительной экспрессии. Вместе с тем, при наличии вероятностных отклонений в оценке копийности плазмидной ДНК методом спетрофотометрии при создании калибраторов на основе последовательных разведений, наличие в последовательности целевого и референсного генов может повысить точность расчетов абсолютных значений относительной экспрессии генов.
Техническим результатом заявленного изобретения является создание плазмидной ДНК, содержащей три последовательности калибраторов, включающих в себя копии целевого и референсного генов, что позволяет нивелировать возникновение возможных погрешностей и оценивать эффективность проводимой терапии в большинстве случаев ОМЛ, в том числе у пациентов без выявленных хромосомных аберраций.
Указанный технический результат обеспечивается тем, что рекомбинантная плазмидная ДНК pAL2-T-ExP, используемая для создания ДНК-калибраторов при оценке эффективности терапии у пациентов с острым миелоидным лейкозом, содержит вставку последовательно сшитых в реакции лигирования участков кДНК генов PRAME, WT1, BAALC, ABL1, GUSB, амплифицируемых в ПЦР-РВ.
Так как совокупная частота выявляемости гиперэкспрессии генов PRAME, WT1, BAALC у пациентов с ОМЛ составляет более 90%, создание унифицированной системы на основе комплексного анализа позволяет оценивать эффективность проводимой терапии практически у всех пациентов с ОМЛ. Вместе с тем, комплексная оценка нескольких опухолевых маркеров представляется целесообразной и в связи с наблюдающимся в ряде случаев изменением профиля экспрессии генов в опухолевой популяции.
Гены PRAME, WT1 и BAALC выступают в качестве маркеров опухолевой прогрессии, а гены ABL1 и GUSB - в качестве нормализаторов экспрессии. Сущность изобретения поясняется фигурами 1-3.
На фиг. 1 представлена физическая карта рекомбинантной плазмиды pAL2-T-ExP со следующими обозначениями: f1 origin - сайт инициации транскрипции одноцепочечного нитевидного фага f1; Т7 - ранний промотор фага Т7 для РНК-полимеразы E. coli; LacZ - ген β-галактозидазы; AmpR - ген устойчивости к антибиотику ампициллину; PRAME - последовательность участка кДНК гена PRAME; WT1 - последовательность участка кДНК гена WT1; BAALC - последовательность участка кДНК гена BAALC; ABL - последовательность участка кДНК гена ABL; GUSB - последовательность участка кДНК GUSb; NotH, ClaI, EcoRI, HindIII - сайты расщепления эндонуклеазами рестрикции;
на фиг. 2 - уровни относительной экспрессии гена WT1 у здоровых доноров в костном мозге и периферической крови;
на фиг. 3 - кумулятивный риск развития рецидива в посттрансплантационном периоде на фоне гиперэкспрессии генов WT1, BAALC;
Рекомбинаную плазмидную ДНК pAL2-T-ExP, которая кодирует участки кДНК генов человека PRAME, WT1, BAALC, ABL1, GUSB, получают генно-инженерным методом: путем встраивания ДНК-фрагмента, состоящего из последовательно сшитых в реакции лигирования нуклеотидных последовательностей участков кДНК генов PRAME, WT1, BAALC, ABL1, GUSB, амплифицированных с использованием клинического материала пациентов и здоровых доноров, в вектор pAL2-T.
Исходным генетическим материалом для конструирования плазмиды служат следующие генно-инженерные конструкции:
- плазмидный вектор pAL2-T (Евроген, кат. номер ТА002);
- консервативный участок кДНК гена PRAME, амплифицированного с кДНК, полученной в реакции обратной транскрипции из РНК, выделенной из клинического материала пациентов с ОМЛ;
- консервативный участок кДНК гена WT1, амплифицированного с кДНК, полученной в реакции обратной транскрипции из РНК, выделенной из клинического материала пациентов с ОМЛ;
- консервативный участок кДНК гена BAALC, амплифицированного с кДНК, полученной в реакции обратной транскрипции из РНК, выделенной из клинического материала пациентов с ОМЛ;
- консервативный участок кДНК гена ABL1, амплифицированного с кДНК, полученной в реакции обратной транскрипции из РНК, выделенной из клинического материала здоровых доноров;
- консервативный участок кДНК гена GUSb, амплифицированного с кДНК, полученной в реакции обратной транскрипции из РНК, выделенной из клинического материала здоровых доноров;
- синтетические олигонуклеотиды
Figure 00000001
Полученная плазмида pAL2-T-ExP, кодирующая участки последовательностей кДНК генов PRAME, WT1, BAALC, ABL1, GUSB, имеет молекулярную массу 1,32 МДа и размер 4275 п.н. и содержит следующие элементы:
- участок плазмиды pAL2-T, размером 3005 п.н., включающий сайт инициации транскрипции одноцепочечного нитевидного фага fl, ранний промотор фага Т7 для РНК-полимеразы Е. coli, запускающий экспрессию рекомбинантного гена, ген устойчивости к ампициллину AmpR для селекции трансформированных плазмидой клеток Е. coli и лактозноый оперон, позволяющий проводить отбор трансформированных бактерий методом сине-белой селекции;
- фрагмент кДНК гена PRAME, амплифицированного с кДНК, полученной в реакции обратной транскрипции из РНК, выделенной из клинического материала пациентов с ОМЛ;
- ClaI/EcoRI фрагмент кДНК гена WT1, амплифицированного с кДНК, полученной в реакции обратной транскрипции из РНК, выделенной из клинического материала пациентов с ОМЛ;
- ClaI/EcoRI фрагмент кДНК гена BAALC, амплифицированного с кДНК, полученной в реакции обратной транскрипции из РНК, выделенной из клинического материала пациентов с ОМЛ;
- EcoRI/HindIII фрагмент кДНК гена ABL1, амплифицированного с кДНК, полученной в реакции обратной транскрипции из РНК, выделенной из клинического материала здоровых доноров;
- EcoRI/HindIII фрагмент кДНК гена GUSb, амплифицированного с кДНК, полученной в реакции обратной транскрипции из РНК, выделенной из клинического материала здоровых доноров;
- уникальный сайт узнавания рестриктазой NotI для линеаризации плазмидной ДНК, имеющий следующие координаты - 2991.
Синтез плазмидной ДНК проводят следующим образом.
Участки кДНК, кодирующие анализируемые методом ОТ-ПЦР последовательности транскриптов, амплифицируют с помощью синтетических олигонуклеотидов, подобранных таким образом, что амплифицируемый в ОТ-ПЦР участок находится внутри клонируемого фрагмента:
Figure 00000002
ПЦР проводят в объеме 25 мкл с использованием реакционной смеси для ПЦР HF Master Mix (Dialat), содержащей высокоточную Pfu-полимеразу. Концентрация праймеров в реакционной смеси составляет 300 мМ (прямой и обратный), концентрация ионов магния 2,5 мМ, кДНК добавляют в объеме 5 мкл.
Амплифицированные последовательности подвергают электрофоретическому разделению в 1,5% агарозном геле, фрагменты ДНК, размер которых совпадает с теоретическим, вырезают из геля и очищают с помощью набора для очистки фрагментов двухцепочечной ДНК из геля Cleanup Standard (Евроген).
Полученные фрагменты амплифицируют в реакции ПЦР с помощью пар синтетических олигонуклеотидов, подбиранных таким образом, что каждый праймер одним концом комплементарен последовательности одного гена, а другим концом - гену, который будет расположен рядом с ним в генно-инженерной конструкции.
Figure 00000003
Амплификацию продуктов для клонирования осуществляют методом ПЦР. ПЦР проводят в объеме 25 мкл с использованием реакционной смеси для ПЦР HF Master Mix (Dialat), содержащей высокоточную Pfu-полимеразу. Реакционная смесь содержит праймеры в концентрации 300 мМ (прямой и обратный), ионы магния в концентрации 2,5 мМ. Очищенный из геля фрагмент ДНК добавляют в реакционную смесь в количестве 20-30 нг.
Протокол амплификации:
- первичная денатурация - 2 минуты при 98°С
- амплификационный цикл (×30)
- денатурация - 20 секунд при 98°С
- отжиг праймеров - 30 секунд при 60°С
- элонгация - 20 секунд при 72°С
- финальная элонгация - 2 минуты при 72°С.
Амплифицированные нуклеотидные последовательности подвергают электрофоретическому разделению в 1,5% агарозном геле, очищают с помощью набора для очистки фрагментов двухцепочечной ДНК из геля Cleanup Standard (Евроген) и сшивают в один фрагмент длиной 1505 п.н. с помощью набора для лигирования фрагментов ДНК NEBuilder® HiFi DNA Assembly (NEB). Для этого в одной пробирке смешивают 100 нг целевых фрагменов ДНК и 50 нг вектора pAL2-T, 10 мкл смеси NEB Master Mix и доводят дедионизованной водой до объема 20 мкл. Реакционную смесь инкубируют в течение 60 минут при 50°С и трансформируют при помощи нее химически компетентные клетки и высеивают их на агаризованную ампициллин-содержащую среду LB. Образовавшиеся через сутки колонии тестируют на предмет наличия генно-инженерной вставки с помощью метода скрининговой ПЦР с праймерами WT1_OL_F и ABL-GUSB_OL_R и секвенирования по Сенгеру с помощью универсальных плазмидных праймеров М13. Бактериальные клетки, несущие в себе вектор pAL2-T со вставкой участков кДНК генов ABL1, GUSB, PRAME, WT1, BAALC, инокулируют в 0.5 л жидкой питательной среды LB, содержащей ампициллин в концентрации 100 мкг/мл, и культивируют при 37°С на шейкере в течение 8-12 часов. Затем выделяют плазмидную ДНК из массы бактериальных клеток с помощью набора для выделения плазмидной ДНК Maxiprep Purification Kit (Qiagen). Выделенную плазмидную ДНК pAL2-T-ExP анализируют с помощью рестрикционного анализа по сайтам NotI и HindIII, секвенируют вставки генов ABL1, GUSB, PRAME, WT1, BAALC и хранят при -20°С.
Для использования в качестве ДНК-калибраторов плазмидную ДНК pAL2-T-ExP линеализируют по сайту узнавания рестриктазой NotI, измеряют концентрацию ДНК с помощью спектрофотометра NanoDrop, рассчитывают количество копий плазмидной ДНК по формуле:
N=(С*6.022×1023)/(L*650*1×109),
где N - количество копий ДНК в 1 мкл исходного раствора, С - концентрация плазмидной ДНК в исходном растворе (нг/мкл), L - длина плазмидной ДНК (п.н), и готовят десятичные разведения плазмидной ДНК, содержащие от 10 до 1 ООО 000 копий плазмидной ДНК в 5 микролитрах буфера.
Для амплификации участка гена BAALC используют праймеры:
Figure 00000004
Для амплификации участка гена WT1 используют олигонуклеотидные последовательности:
Figure 00000005
Figure 00000006
Для амплификации участка гена PRAME используют олигонуклеотидные последовательности:
Figure 00000007
Для амплификации участка гена ABL1 используют олигонуклеотидные последовательности:
Figure 00000008
Для амплификации участка гена GUSB используют олигонуклеотидные последовательности:
Figure 00000009
С использованием заявленной рекомбинантной плазмидной ДНК pAL2-T-ExP была проанализирована экспрессия исследуемых генов от 108 пациентов в возрасте от 2 до 60 лет (медиана - 27 лет). Период наблюдения составил в среднем 6 месяцев (от 1 до 47 месяцев). Оценка экспрессии проводилась преимущественно в посттрансплантационном периоде (19 пациентов после родственной аллогенной трансплантациии гемопоэтических стволовых клеток (аллоТГСК), 73 пациента после неродственной аллоТГСК и 16 пациентов после гаплоидентичной аллоТГСК). Помимо этого был обследован материал здоровых доноров (n=10).
Относительную экспрессию генов PRAME, WT1 и BAALC в анализируемых образцах определяли исходя из уравнений калибровочных кривых для соответствующих генов. Для этого в каждую амплификацию включали 5 последовательных убывающих десятичных разведений плазмидной ДНК известной концентрации, содержащей амплифицируемые участки анализируемых генов. Эффективность амплификации определяли как угол наклона калибровочной кривой. Для всех пар праймеров эффективность амплификации составила от 90% до 100%, коэффициент корреляции
Figure 00000010
был больше или равен 0,990. Для оценки воспроизводимости значений порогового цикла (Ct) все анализируемые образцы с каждой парой праймеров амплифицировались в двойном повторе. В анализ включались образцы, для которых разница значений Ct между повторами была не более 0,3 цикла.
Абсолютное количество кДНК каждого гена определяли исходя из уравнения калибровочной кривой при помощи программного обеспечения iQ5 (Bio-Rad). В анализ включали образцы, для которых рассчитанное относительно калибровочной кривой количество кДНК гена ABL1 превышало 10000 копий на реакцию. Уровень относительной экспрессии гена WT1, составляющий более 250 копий гена WT1 на 10000 копий гена ABL рассматривали как гиперэкспрессию маркера. Для гена BAALC под гиперэкспресией понимали выявление более 10 копий транскрипта данного гена на 100 копий гена ABL, для гена PRAME - 500 копий транскрипта на 100 гена ABL.
При оценке уровня относительной экспрессии было выявлено наличие достоверных различий в уровне экспрессии гена WT1 у здоровых доноров в костном мозге и периферической крови, что совпадает с результатами других исследователей [К Inoue, Н Ogawa, Т Yamagami, Т Soma, Y Tani, Т Tatekawa, Y Oji, H Tamaki, T Kyo, H Dohy, A Hiraoka, T Masaoka, T Kishimoto and H Sugiyama. Long-term follow-up of minimal residual disease in leukemia patients by monitoring WT1 (Wilms tumor gene) expression levels. Blood, 1996, 88, 2267-2278].
Исследование информативности предложенной системы анализа указывает на то, что у 95% пациентов обладали хотя бы одним информативным маркером (фиг. 2).
При анализе данных пациентов в посттрансплантационном периоде обращает на себя внимание наличие прямой корреляционной связи между уровнем экспрессии исследуемых генов и выявляемых химерных транскриптов. Для гена WT1 коэффициент корреляции (критерий Спирмена) составил 0,26 (р=0.01), для гена BAALC - 0.27 (р=0.0001), а для гена PRAME - 0.312 (р=0.001). Сопоставимые результаты были получены и при анализе корреляционной зависимости изменения количества клеток опухолевой популяции (бластных клеток). При сопоставлении полученных данных экспрессии с результатами исследования донорского химеризма (приживления клеток донора после аллоТГСК) наблюдалась обратная зависимость, выражающаяся в обратной корреляции - коэффициент корреляции для WT1 составил -0,20 для гена WT1 (р=0.0006), -0.21 для гена BAALC (р=0.00001) и -0,14 для гена PRAME (р-0.002).
При анализе прогностического значения гена PRAME не было выявлено достоверного увеличения развития рецидивов в посттрансплантационном периоде (р=0,14). Вместе с тем нами было показано, что при наличии гиперэкспресии генов WT1 и BAALC достоверно возникает риск развития рецидива у пациентов в посттрансплантационном периоде - р=0,009 и р=0,027 соответственно. При оценке куммулятивного риска развития рецидива после аллоТГСК были получены данные, указывающие на высокую вероятность развития рецидива заболевания на фоне гиперэкспрессии любого из исследуемых генов были получены результаты, указывающие на неблагоприятный прогноз на фоне детекции гиперэкспрессии (фиг. 3).
Таким образом, данное изобретение позволяет повысить точность оценки относительной экспрессии данных генов благодаря конструкции ДНК-калибраторов, совмещающих последовательности всех маркеров. Комплексный анализ генов PRAME, WT1 и BAALC позволяет оценивать эффективность проводимой терапии в большинстве случаев ОМЛ, в том числе у пациентов без выявленных хромосомных аберраций.
Перечень последовательностей
Figure 00000011
Figure 00000012
Figure 00000013

Claims (33)

  1. Рекомбинантная плазмидная ДНК pAL2-T-ExP, используемая для создания ДНК-калибраторов при оценке эффективности терапии у пациентов с острым миелоидным лейкозом, содержащая вставку последовательно сшитых в реакции лигирования участков кДНК генов PRAME, WT1, BAALC, ABL1, GUSB, амплифицируемых в ПЦР-РВ,
  2. atgtctgaat tcgacctgca ggtcgaccat atgggagagc tcccaacgcg ttggatgcat 60
  3. agcttgagta ttctatagtg tcacctaaat agcttggcgt aatcatggtc atagctgttt 120
  4. cctgtgtgaa attgttatcc gctcacaatt ccacacaaca tacgagccgg aagcataaag 180
  5. tgtaaagcct ggggtgccta atgagtgagc taactcacat taattgcgtt gcgctcactg 240
  6. cccgctttcc agtcgggaaa cctgtcgtgc cagctgcatt aatgaatcgg ccaacgcgcg 300 gggagaggcg gtttgcgtat tgggcgctct tccgcttcct cgctcactga ctcgctgcgc 360 tcggtcgttc ggctgcggcg agcggtatca gctcactcaa aggcggtaat acggttatcc 420 acagaatcag gggataacgc aggaaagaac atgtgagcaa aaggccagca aaaggccagg 480 aaccgtaaaa aggccgcgtt gctggcgttt ttccataggc tccgcccccc tgacgagcat 540 cacaaaaatc gacgctcaag tcagaggtgg cgaaacccga caggactata aagataccag 600
  7. gcgtttcccc ctggaagctc cctcgtgcgc tctcctgttc cgaccctgcc gcttaccgga 660 tacctgtccg cctttctccc ttcgggaagc gtggcgcttt ctcatagctc acgctgtagg 720 tatctcagtt cggtgtaggt cgttcgctcc aagctgggct gtgtgcacga accccccgtt 780
  8. cagcccgacc gctgcgcctt atccggtaac tatcgtcttg agtccaaccc ggtaagacac 840 gacttatcgc cactggcagc agccactggt aacaggatta gcagagcgag gtatgtaggc 900
  9. ggtgctacag agttcttgaa gtggtggcct aactacggct acactagaag aacagtattt 960 ggtatctgcg ctctgctgaa gccagttacc ttcggaaaaa gagttggtag ctcttgatcc 1020
  10. ggcaaacaaa ccaccgctgg tagcggtggt ttttttgttt gcaagcagca gattacgcgc 1080
  11. agaaaaaaag gatctcaaga agatcctttg atcttttcta cggggtctga cgctcagtgg 1140 aacgaaaact cacgttaagg gattttggtc atgagattat caaaaaggat cttcacctag 1200 atccttttaa attaaaaatg aagttttaaa tcaatctaaa gtatatatga gtaaacttgg 1260 tctgacagtt accaatgctt aatcagtgag gcacctatct cagcgatctg tctatttcgt 1320 tcatccatag ttgcctgact ccccgtcgtg tagataacta cgatacggga gggcttacca 1380
  12. tctggcccca gtgctgcaat gataccgcga gacccacgct caccggctcc agatttatca 1440 gcaataaacc agccagccgg aagggccgag cgcagaagtg gtcctgcaac tttatccgcc 1500
  13. tccatccagt ctattaattg ttgccgggaa gctagagtaa gtagttcgcc agttaatagt 1560 ttgcgcaacg ttgttgccat tgctacaggc atcgtggtgt cacgctcgtc gtttggtatg 1620 gcttcattca gctccggttc ccaacgatca aggcgagtta catgatcccc catgttgtgc 1680
  14. aaaaaagcgg ttagctcctt cggtcctccg atcgttgtca gaagtaagtt ggccgcagtg 1740
  15. ttatcactca tggttatggc agcactgcat aattctctta ctgtcatgcc atccgtaaga 1800 tgcttttctg tgactggtga gtactcaacc aagtcattct gagaatagtg tatgcggcga 1860
  16. ccgagttgct cttgcccggc gtcaatacgg gataataccg cgccacatag cagaacttta 1920
  17. aaagtgctca tcattggaaa acgttcttcg gggcgaaaac tctcaaggat cttaccgctg 1980 ttgagatcca gttcgatgta acccactcgt gcacccaact gatcttcagc atcttttact 2040
  18. ttcaccagcg tttctgggtg agcaaaaaca ggaaggcaaa atgccgcaaa aaagggaata 2100
  19. agggcgacac ggaaatgttg aatactcata ctcttccttt ttcaatatta ttgaagcatt 2160 tatcagggtt attgtctcat gagcggatac atatttgaat gtatttagaa aaataaacaa 2220
  20. ataggggttc cgcgcacatt tccccgaaaa gtgccacctg atgcggtgtg aaataccgca 2280
  21. cagatgcgta aggagaaaat accgcatcag gaaattgtaa gcgttaatat tttgttaaaa 2340 ttcgcgttaa atttttgtta aatcagctca ttttttaacc aataggccga aatcggcaaa 2400 atcccttata aatcaaaaga atagaccgag atagggttga gtgttgttcc agtttggaac 2460
  22. aagagtccac tattaaagaa cgtggactcc aacgtcaaag ggcgaaaaac cgtctatcag 2520 ggcgatggcc cactacgtga accatcaccc taatcaagtt ttttggggtc gaggtgccgt 2580 aaagcactaa atcggaaccc taaagggagc ccccgattta gagcttgacg gggaaagccg 2640 gcgaacgtgg cgagaaagga agggaagaaa gcgaaaggag cgggcgctag ggcgctggca 2700 agtgtagcgg tcacgctgcg cgtaaccacc acacccgccg cgcttaatgc gccgctacag 2760 ggcgcgtcca ttcgccattc aggctgcgca actgttggga agggcgatcg gtgcgggcct 2820 cttcgctatt acgccagctg gcgaaagggg gatgtgctgc aaggcgatta agttgggtaa 2880 cgccagggtt ttcccagtca cgacgttgta aaacgacggc cagtgaattg taatacgact 2940 cactataggg cgaattgggc ccgacgtcgc atgctcccgg ccgccatggc ggccgcggag 3000
  23. acattagtga cttgtacctg gaagctaccc accttggcga aattttctcc ttacctgggc 3060 cagatgatta atctgcgtag actcctcctc tcccacatcc atgcatcttc ctacatttcc 3120
  24. ccggagaagg aagagcagta tatcgcccag ttcacctctc agttcctcag tctgcagtgc 3180
  25. ctgcaggctc tctatgtgga ctctttattt ttccttagag gccgcctaaa acgacggcca 3240
  26. gtgccaatat cgattacctg cccagctgcc tcgagagcca gcccgctatt cgcaatcagg 3300 gttacagcac ggtcaccttc gacgggacgc ccagctacgg tcacacgccc tcgcaccatg 3360 cggcgcagtt ccccaaccac tcattcaagc atgaggatcc catgggccag cagggctcgc 3420 tgggtgagca gcagtactcg gtggaattca aaaatcgata ctcgggcatg ctggaagatg 3480 gactgccctc caatggtgtg ccccgatcta cagccccagg tggaataccc aacccagaga 3540 agaagacgaa ctgtgagacc cagtgcccaa atccccagag cctcagctca ggccctctga 3600 cccagaaaca gaatggcctt cagaccacag aggctaaaag agatgctaag agaatgcctg 3660 caaaagaagt caccattaat gtaacagata gcatccaaca gatggacaga aggaattcta 3720
  27. aagaattcag gaaaaccttc tcgctggacc cagtgaaaat gaccccaacc ttttcgttgc 3780 actgtatgat tttgtggcca gtggagataa cactctaagc ataactaaag gtgaaaagct 3840
  28. ccgggtctta ggctataatc acaatgggga atggtgtgaa gcccaaacca aaaatggcca 3900 aggctgggtc ccaagcaact acatcacgcc agtcaacagt ctggagaaac actcctggta 3960
  29. ccatgggcct gtgtcccgca atgccgctga gtatcttaaa gcttttaagc ttgcagaaac 4020 gattgcaggg tttcaccagg atccacctct gatgttcact gaagagtacc agaaaagtct 4080
  30. gctagagcag taccatctgg gtctggatca aaaacgcaga aaatacgtgg ttggagagct 4140
  31. catttggaat tttgccgatt tcatgactga acagtcaccg acgagagtgc tggggaataa 4200
  32. aaaggggatc ttcactcggc agagacaacc aaaaagtgca gcgttccgtc gactacgtaa 4260
  33. tcatggtcat agctg 4275
RU2017126667A 2017-07-26 2017-07-26 РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pAL2-T-ExP, ИСПОЛЬЗУЕМАЯ ДЛЯ СОЗДАНИЯ ДНК-КАЛИБРАТОРОВ ПРИ ОЦЕНКЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ ТЕРАПИИ У ПАЦИЕНТОВ С ОСТРЫМ МИЕЛОИДНЫМ ЛЕЙКОЗОМ RU2670543C1 (ru)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2017126667A RU2670543C1 (ru) 2017-07-26 2017-07-26 РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pAL2-T-ExP, ИСПОЛЬЗУЕМАЯ ДЛЯ СОЗДАНИЯ ДНК-КАЛИБРАТОРОВ ПРИ ОЦЕНКЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ ТЕРАПИИ У ПАЦИЕНТОВ С ОСТРЫМ МИЕЛОИДНЫМ ЛЕЙКОЗОМ

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
RU2017126667A RU2670543C1 (ru) 2017-07-26 2017-07-26 РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pAL2-T-ExP, ИСПОЛЬЗУЕМАЯ ДЛЯ СОЗДАНИЯ ДНК-КАЛИБРАТОРОВ ПРИ ОЦЕНКЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ ТЕРАПИИ У ПАЦИЕНТОВ С ОСТРЫМ МИЕЛОИДНЫМ ЛЕЙКОЗОМ

Publications (1)

Publication Number Publication Date
RU2670543C1 true RU2670543C1 (ru) 2018-10-23

Family

ID=63923542

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2017126667A RU2670543C1 (ru) 2017-07-26 2017-07-26 РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pAL2-T-ExP, ИСПОЛЬЗУЕМАЯ ДЛЯ СОЗДАНИЯ ДНК-КАЛИБРАТОРОВ ПРИ ОЦЕНКЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ ТЕРАПИИ У ПАЦИЕНТОВ С ОСТРЫМ МИЕЛОИДНЫМ ЛЕЙКОЗОМ

Country Status (1)

Country Link
RU (1) RU2670543C1 (ru)

Non-Patent Citations (4)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Title
MINETTO P. et al. Combined assessment of WT1 and BAALC gene expression at diagnosis may improve leukemia-free survival prediction in patients with myelodysplastic syndromes. Leukemia research, 2015. *
SANTAMARIA C. et al. BAALC is an important predictor of refractoriness to chemotherapy and poor survival in intermediate-risk acute myeloid leukemia (AML). Annals of hematology, 2010. *
ШАКИРОВА А.И. и др. Оценка вероятности развития рецидива острого миелоидного лейкоза в пострансплантационном периоде у пациентов с использованием панели экспрессионных маркеров. Клеточная терапия и трансплантация, 2016. *
ШАКИРОВА А.И. и др. Оценка вероятности развития рецидива острого миелоидного лейкоза в пострансплантационном периоде у пациентов с использованием панели экспрессионных маркеров. Клеточная терапия и трансплантация, 2016. MINETTO P. et al. Combined assessment of WT1 and BAALC gene expression at diagnosis may improve leukemia-free survival prediction in patients with myelodysplastic syndromes. Leukemia research, 2015. SANTAMARIA C. et al. BAALC is an important predictor of refractoriness to chemotherapy and poor survival in intermediate-risk acute myeloid leukemia (AML). Annals of hematology, 2010. *

Similar Documents

Publication Publication Date Title
CN107686848A (zh) 转座子协同CRISPR/Cas9系统的稳定敲除单质粒载体及其应用
CN110079551B (zh) 一种环状rna表达载体及其构建方法和应用
CN109735480B (zh) 一种合成乳酰-n-新四糖的重组枯草芽孢杆菌及其构建方法与应用
CN111378785A (zh) 用于核酸诊断新型冠状病毒2019-nCov的假病毒标准品及其应用
CN109825465A (zh) 基于平衡udp-糖供给合成乳酰-n-新四糖的重组枯草芽孢杆菌及其构建方法与应用
CN110257403B (zh) 一种表达传染性喉气管炎病毒gB基因、其重组鸡痘病毒及构建方法和应用
CN110042117B (zh) 弓形虫α淀粉酶基因敲除虫株的构建方法及用途
CN103320507A (zh) 利用dpo-pcr方法检测沙门氏菌的dpo引物序列及其检测试剂盒
CN109913535A (zh) 荧光定量检测核基因组拷贝数及人线粒体基因组拷贝数的方法
RU2670543C1 (ru) РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pAL2-T-ExP, ИСПОЛЬЗУЕМАЯ ДЛЯ СОЗДАНИЯ ДНК-КАЛИБРАТОРОВ ПРИ ОЦЕНКЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ ТЕРАПИИ У ПАЦИЕНТОВ С ОСТРЫМ МИЕЛОИДНЫМ ЛЕЙКОЗОМ
US6365344B1 (en) Methods for screening for transdominant effector peptides and RNA molecules
CN100591771C (zh) 缺氧反应元件基因治疗质粒及其构建方法
RU2642315C1 (ru) РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК pAL2-T-WBMAG, ИСПОЛЬЗУЕМАЯ ДЛЯ СОЗДАНИЯ ДНК-КАЛИБРАТОРОВ ПРИ ОЦЕНКЕ ЭФФЕКТИВНОСТИ ТЕРАПИИ У ПАЦИЕНТОВ С ОСТРЫМ МИЕЛОИДНЫМ ЛЕЙКОЗОМ
CN111149730A (zh) 一种快速培育多能干细胞荧光标记斑马鱼纯合个体的方法
CN113754783B (zh) 重组rlk在植物免疫调节中的应用
Maeda et al. Molecular genetic characterization of Fusarium graminearum genes identified as encoding a precocene II-binding protein
CN101397570B (zh) 一种基因打靶用中间载体及其制备方法和用途
CN107400679A (zh) 基于转座酶建立过表达稳定系的质粒载体及其应用
KR101578441B1 (ko) 구제역 o형 팬아시아-2 유전형의 방어항원이 발현되는 재조합 바이러스 및 그의 제조방법
CN114196702A (zh) 一种利用单碱基编辑器构建长qt疾病干细胞的方法
KR102096282B1 (ko) 재조합 베큘로바이러스를 이용한 인간 trem2 세포막 단백질의 효율적인 정제방법
CN113354718A (zh) 一种哌尼生素前体、表达盒及其制备方法
CN110079530A (zh) 一种源自布氏乳杆菌的基因编辑工具及其制备方法和应用
CN109371058A (zh) 一种杨树质体表达系统的建立方法
CN116536353A (zh) 一种复制型高效引导编辑系统

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20190727