RU2018141675A - Анализ относительной активности вирусного вектора, кодирующего изомерогидролазы - Google Patents
Анализ относительной активности вирусного вектора, кодирующего изомерогидролазы Download PDFInfo
- Publication number
- RU2018141675A RU2018141675A RU2018141675A RU2018141675A RU2018141675A RU 2018141675 A RU2018141675 A RU 2018141675A RU 2018141675 A RU2018141675 A RU 2018141675A RU 2018141675 A RU2018141675 A RU 2018141675A RU 2018141675 A RU2018141675 A RU 2018141675A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- paragraphs
- protein
- cells
- isomerohydrolase
- reaction product
- Prior art date
Links
- 230000000694 effects Effects 0.000 title claims 4
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 title claims 2
- 239000013603 viral vector Substances 0.000 title 1
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 56
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims 22
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 20
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 20
- 239000007795 chemical reaction product Substances 0.000 claims 10
- 239000000758 substrate Substances 0.000 claims 8
- FPIPGXGPPPQFEQ-UHFFFAOYSA-N 13-cis retinol Natural products OCC=C(C)C=CC=C(C)C=CC1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 7
- 239000002243 precursor Substances 0.000 claims 7
- 238000004440 column chromatography Methods 0.000 claims 6
- 239000013598 vector Substances 0.000 claims 6
- 230000005526 G1 to G0 transition Effects 0.000 claims 5
- 102100028001 Retinaldehyde-binding protein 1 Human genes 0.000 claims 5
- 101710101931 Retinaldehyde-binding protein 1 Proteins 0.000 claims 5
- 210000003583 retinal pigment epithelium Anatomy 0.000 claims 5
- FPIPGXGPPPQFEQ-OVSJKPMPSA-N all-trans-retinol Chemical compound OC\C=C(/C)\C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-OVSJKPMPSA-N 0.000 claims 4
- FPIPGXGPPPQFEQ-HPNHMNAASA-N 11-cis-retinol Natural products OCC=C(C)C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-HPNHMNAASA-N 0.000 claims 3
- 108090000565 Capsid Proteins Proteins 0.000 claims 3
- 102100023321 Ceruloplasmin Human genes 0.000 claims 3
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 claims 3
- 238000006243 chemical reaction Methods 0.000 claims 3
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 claims 3
- 238000011534 incubation Methods 0.000 claims 3
- VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N n-Hexane Chemical compound CCCCCC VLKZOEOYAKHREP-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 3
- 239000002245 particle Substances 0.000 claims 3
- 230000003612 virological effect Effects 0.000 claims 3
- 241001655883 Adeno-associated virus - 1 Species 0.000 claims 2
- 241000702423 Adeno-associated virus - 2 Species 0.000 claims 2
- 241000202702 Adeno-associated virus - 3 Species 0.000 claims 2
- 241000580270 Adeno-associated virus - 4 Species 0.000 claims 2
- 241001634120 Adeno-associated virus - 5 Species 0.000 claims 2
- 241000972680 Adeno-associated virus - 6 Species 0.000 claims 2
- 241001164823 Adeno-associated virus - 7 Species 0.000 claims 2
- 241001164825 Adeno-associated virus - 8 Species 0.000 claims 2
- 241000649045 Adeno-associated virus 10 Species 0.000 claims 2
- KXDHJXZQYSOELW-UHFFFAOYSA-N Carbamic acid Chemical group NC(O)=O KXDHJXZQYSOELW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical group [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 claims 2
- 239000011717 all-trans-retinol Substances 0.000 claims 2
- 229940100609 all-trans-retinol Drugs 0.000 claims 2
- 235000019169 all-trans-retinol Nutrition 0.000 claims 2
- IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 1-palmitoyl-2-arachidonoyl-sn-glycero-3-phosphocholine Chemical compound CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)OC[C@H](COP([O-])(=O)OCC[N+](C)(C)C)OC(=O)CCC\C=C/C\C=C/C\C=C/C\C=C/CCCCC IIZPXYDJLKNOIY-JXPKJXOSSA-N 0.000 claims 1
- FPIPGXGPPPQFEQ-HWCYFHEPSA-N 13-cis-retinol Chemical compound OC/C=C(/C)\C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-HWCYFHEPSA-N 0.000 claims 1
- FPIPGXGPPPQFEQ-MKOSUFFBSA-N 9-cis-retinol Chemical compound OC\C=C(/C)\C=C\C=C(\C)/C=C/C1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-MKOSUFFBSA-N 0.000 claims 1
- 239000013607 AAV vector Substances 0.000 claims 1
- LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N Ethanol Chemical compound CCO LFQSCWFLJHTTHZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 102000004157 Hydrolases Human genes 0.000 claims 1
- 108090000604 Hydrolases Proteins 0.000 claims 1
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 claims 1
- FPIPGXGPPPQFEQ-DPZDGVIMSA-N dihydroretinol Natural products CC(=CCO)C=CC=C(C)/C=C/C1=C(C)CCCC1(C)C FPIPGXGPPPQFEQ-DPZDGVIMSA-N 0.000 claims 1
- 238000000605 extraction Methods 0.000 claims 1
- 210000005260 human cell Anatomy 0.000 claims 1
- 210000003292 kidney cell Anatomy 0.000 claims 1
- 229940067606 lecithin Drugs 0.000 claims 1
- 235000010445 lecithin Nutrition 0.000 claims 1
- 239000000787 lecithin Substances 0.000 claims 1
- 230000002934 lysing effect Effects 0.000 claims 1
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 claims 1
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 claims 1
- 239000003960 organic solvent Substances 0.000 claims 1
- 239000000047 product Substances 0.000 claims 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 claims 1
- GREHPZMOJNYZIO-QXBAZQDESA-N retinoyl coa Chemical compound C([C@@H]1[C@H]([C@@H](O)[C@@H](O1)N1C2=NC=NC(N)=C2N=C1)OP(O)(O)=O)OP(O)(=O)OP(O)(=O)OCC(C)(C)C(O)C(=O)NCCC(=O)NCCSC(=O)\C=C(/C)\C=C\C=C(/C)\C=C\C1=C(C)CCCC1(C)C GREHPZMOJNYZIO-QXBAZQDESA-N 0.000 claims 1
- 238000004366 reverse phase liquid chromatography Methods 0.000 claims 1
- 150000003839 salts Chemical group 0.000 claims 1
- DRNXZGJGRSUXHW-UHFFFAOYSA-N silyl carbamate Chemical group NC(=O)O[SiH3] DRNXZGJGRSUXHW-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 claims 1
- 238000000527 sonication Methods 0.000 claims 1
- 238000010257 thawing Methods 0.000 claims 1
- 230000026683 transduction Effects 0.000 claims 1
- 238000010361 transduction Methods 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/34—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
-
- A—HUMAN NECESSITIES
- A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
- A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
- A61K31/00—Medicinal preparations containing organic active ingredients
- A61K31/045—Hydroxy compounds, e.g. alcohols; Salts thereof, e.g. alcoholates
- A61K31/07—Retinol compounds, e.g. vitamin A
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01D—SEPARATION
- B01D15/00—Separating processes involving the treatment of liquids with solid sorbents; Apparatus therefor
- B01D15/08—Selective adsorption, e.g. chromatography
- B01D15/26—Selective adsorption, e.g. chromatography characterised by the separation mechanism
- B01D15/32—Bonded phase chromatography
- B01D15/325—Reversed phase
-
- B—PERFORMING OPERATIONS; TRANSPORTING
- B01—PHYSICAL OR CHEMICAL PROCESSES OR APPARATUS IN GENERAL
- B01D—SEPARATION
- B01D15/00—Separating processes involving the treatment of liquids with solid sorbents; Apparatus therefor
- B01D15/08—Selective adsorption, e.g. chromatography
- B01D15/26—Selective adsorption, e.g. chromatography characterised by the separation mechanism
- B01D15/38—Selective adsorption, e.g. chromatography characterised by the separation mechanism involving specific interaction not covered by one or more of groups B01D15/265 - B01D15/36
- B01D15/3804—Affinity chromatography
- B01D15/3819—Affinity chromatography of the nucleic acid-nucleic acid binding protein type
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N9/00—Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
- C12N9/14—Hydrolases (3)
- C12N9/16—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1)
- C12N9/18—Carboxylic ester hydrolases (3.1.1)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/34—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase
- C12Q1/44—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving hydrolase involving esterase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/533—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving isomerase
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y301/00—Hydrolases acting on ester bonds (3.1)
- C12Y301/01—Carboxylic ester hydrolases (3.1.1)
- C12Y301/01064—Retinoid isomerohydrolase (3.1.1.64)
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
- C12N15/09—Recombinant DNA-technology
- C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
- C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
- C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
- C12N15/86—Viral vectors
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
- C12N2750/00011—Details
- C12N2750/14011—Parvoviridae
- C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
- C12N2750/14141—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
- C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
- C12N2750/00011—Details
- C12N2750/14011—Parvoviridae
- C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
- C12N2750/14141—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
- C12N2750/14143—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Y—ENZYMES
- C12Y203/00—Acyltransferases (2.3)
- C12Y203/01—Acyltransferases (2.3) transferring groups other than amino-acyl groups (2.3.1)
- C12Y203/01135—Phosphatidylcholine--retinol O-acyltransferase (2.3.1.135)
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2333/00—Assays involving biological materials from specific organisms or of a specific nature
- G01N2333/90—Enzymes; Proenzymes
- G01N2333/914—Hydrolases (3)
- G01N2333/916—Hydrolases (3) acting on ester bonds (3.1), e.g. phosphatases (3.1.3), phospholipases C or phospholipases D (3.1.4)
- G01N2333/918—Carboxylic ester hydrolases (3.1.1)
-
- G—PHYSICS
- G01—MEASURING; TESTING
- G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
- G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
- G01N2800/16—Ophthalmology
- G01N2800/164—Retinal disorders, e.g. retinopathy
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Microbiology (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Medicinal Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Biomedical Technology (AREA)
- Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
- Public Health (AREA)
- Animal Behavior & Ethology (AREA)
- Epidemiology (AREA)
- Veterinary Medicine (AREA)
- Pharmacology & Pharmacy (AREA)
- Virology (AREA)
- Plant Pathology (AREA)
- Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Enzymes And Modification Thereof (AREA)
- Medicines Containing Material From Animals Or Micro-Organisms (AREA)
- Information Retrieval, Db Structures And Fs Structures Therefor (AREA)
Claims (61)
1. Способ измерения активности изомерoгидролазы, включающий:
(a) приведение клеток, экспрессирующих лецитин:ретинол-ацилтрансферазу (LRAT), в контакт с аденоассоциированным вирусным (AAV) вектором, содержащим трансген, кодирующий белок изомерoгидролазу, в условиях, позволяющих трансдукцию клеток;
(b) инкубацию трансдуцированных клеток в условиях, позволяющих экспрессию кодированного белка изомерoгидролазы;
(c) сбор и лизис трансдуцированных клеток для получения экстракта, содержащего кодированный белок изомерoгидролазу;
(d) инкубацию указанного экстракта с субстратом в течение периода времени и в условиях, позволяющих превращение субстрата посредством белка изомерoгидролазы в продукт реакции;
(e) подвергание указанного продукта реакции колоночной хроматографии, таким образом, получая очищенный колоночной хроматографией продукт реакции; и
(f) подвергание указанного очищенного колоночной хроматографией продукта реакции масс-спектрометрии, таким образом, количественная оценка продукта реакции, где количество продукта реакции отражает активность изомерoгидролазы, таким образом, измерение активности изомерoгидролазы.
2. Способ по п.1, где белок изомерoгидролаза содержит специфический для пигментного эпителия сетчатки белок, 65-кДа (RPE65).
3. Способ по п.1, где белок изомерoгидролаза содержит специфический для пигментного эпителия сетчатки белок дикого типа, 65-кДа (RPE65).
4. Способ по п.1, где белок изомерoгидролаза содержит вариант или мутант специфического для пигментного эпителия сетчатки белка, 65-кДа (RPE65).
5. Способ по любому из пп. 1-4, где белок изомерoгидролаза содержит специфический для пигментного эпителия сетчатки белок млекопитающего, 65-кДа (RPE65).
6. Способ по любому из пп. 1-5, где белок изомерoгидролаза содержит специфический для пигментного эпителия сетчатки белок человека, 65-кДа (RPE65).
7. Способ по любому из пп. 1-6, где клетки содержат клетки млекопитающих.
8. Способ по любому из пп. 1-7, где клетки содержат клетки человека.
9. Способ по любому из пп. 1-8, где клетки содержат клетки эмбриональной почки человека (HEK) 293.
10. Способ по любому из пп. 1-9, где клетки экспрессируют LRAT, стабильно или временно.
11. Способ по любому из пп. 1-10, где субстрат содержит полностью-транс-ретиниловый сложный эфир.
12. Способ по любому из пп. 1-11, где стадия (d) включает добавление предшественника субстрата в экстракт, где предшественник превращается в указанный субстрат посредством экспрессированной LRAT.
13. Способ по любому из пп. 1-12, где стадия (d) включает добавление клеточного связывающего ретинальдегид белка (CRALBP) и предшественника субстрата в экстракт, где предшественник превращается в указанный субстрат посредством экспрессированной LRAT.
14. Способ по п.13, где количество добавленного CRALBP составляет между приблизительно 50 и приблизительно 500 мкг.
15. Способ по любому из пп. 1-12, где клетки также стабильно или временно экспрессируют клеточный связывающий ретинальдегид белок (CRALBP).
16. Способ по любому из пп. 12-15, где предшественник содержит полностью-транс-ретинол или состоит из него.
17. Способ по п.16, где полностью-транс-ретинол добавляют таким образом, что конечная концентрация составляет от приблизительно 1 до приблизительно 20 мМ.
18. Способ по любому из пп. 1-17, где продукт реакции содержит 11-цис-ретинол или состоит из него.
19. Способ по любому из пп. 1-17, где стадию (d), (e) и/или (f) проводят в темноте, при тусклом свете или при тусклом желтом свете.
20. Способ по любому из пп. 1-19, где субстрат, предшественник или продукт реакции является нерадиоактивным.
21. Способ по любому из пп. 1-20, где период времени на стадии (d) составляет от приблизительно 30 минут до приблизительно 240 минут.
22. Способ по любому из пп. 1-21, где после стадии (d), но до стадии (e), реакцию останавливают или гасят.
23. Способ по любому из пп. 1-22, где после стадии (d), но до стадии (e), добавляют спирт.
24. Способ по любому из пп. 1-23, где стадия (d) дополнительно включает экстракцию указанного продукта реакции.
25. Способ по п.24 где указанный продукт реакции экстрагируют органическим растворителем.
26. Способ по п.24, где указанный продукт реакции экстрагируют гексаном.
27. Способ по любому из пп. 1-26, где любую из стадий (a)-(d) осуществляют, как указано в примере 1.
28. Способ по любому из пп. 1-26, где любую из стадий (e)-(f) осуществляют, как указано в примере 2.
29. Способ по любому из пп. 1-28, где аденоассоциированный вирусный (AAV) вектор содержит белковую последовательность капсида или последовательность инвертированного концевого повтора, имеющие 70% или более идентичности последовательности с белковой последовательностью капсида или с последовательностью инвертированного концевого повтора любого серотипа, выбранного из AAV1, AAV2, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9 и AAV10.
30. Способ по любому из пп. 1-28, где аденоассоциированный вирусный (AAV) вектор содержит белок капсида или инвертированный концевой повтор из любого серотипа, выбранного из AAV1, AAV2, AAV3, AAV4, AAV5, AAV6, AAV7, AAV8, AAV9, AAV10.
31. Способ по любому из пп. 1-30, где (a) приведение клеток в контакт проводят с количеством от приблизительно 500 до приблизительно 5 миллионов частиц вектора AAV/клетку.
32. Способ по любому из пп. 1-30, где (a) приведение клеток в контакт проводят с количеством от приблизительно 1000 до приблизительно 1000000 частиц вектора AAV/клетку.
33. Способ по любому из пп. 1-30, где (a) приведение клеток в контакт проводят с количеством от приблизительно 2000 до приблизительно 500000 частиц вектора AAV/клетку.
34. Способ по любому из пп. 1-30, где (b) инкубация трансдуцированных клеток происходит в течение периода времени от приблизительно 6 часов до приблизительно 96 часов.
35. Способ по любому из пп. 1-30, где лизис трансдуцированных клеток из (c) проводят посредством замораживания-размораживания, обработки ультразвуком или их комбинации.
36. Способ по любому из пп. 1-30, где определяют общее количество клеточного белка, полученного после стадии (c).
37. Способ по любому из пп. 1-30, где общее количество клеточного белка, полученного после стадии (c), определяют посредством анализа Бредфорд.
38. Способ по любому из пп. 1-30, где предшественник смешивают с 10-100% раствором DMF.
39. Способ по любому из пп. 1-30, где после сбора клеток, но до лизиса (c), собранные клетки ресуспендируют в буфере.
40. Способ по любому из пп. 1-30, где после лизиса (c) трансдуцированных клеток для получения экстракта, экстракт разводят в буфере.
41. Способ по пп. 39 или 40, где буфер представляет собой солевой буфер.
42. Способ по пп. 39 или 40, где буфер представляет собой буфер NaCl.
43. Способ по любому из пп. 1-30, где указанный экстракт, полученный на стадии (c), включает от приблизительно 10 мкг до приблизительно 2000 мкг общего клеточного белка, или его доводят до от приблизительно 10 мкг до приблизительно 2000 мкг общего белка.
44. Способ по любому из пп. 1-30, где указанный экстракт, полученный на стадии (c), включает от приблизительно 50 мкг до приблизительно 750 мкг общего клеточного белка, или его доводят до от приблизительно 50 мкг до приблизительно 750 мкг общего белка.
45. Способ по любому из пп. 1-30, где указанная инкубация (d) происходит при температуре от приблизительно 30 до приблизительно 40°C.
46. Способ по любому из пп. 1-30, где колоночная хроматография отделяет 11-цис-ретинол от 9-цис-ретинола и/или отделяет 11-цис-ретинол от 13-цис-ретинола.
47. Способ по любому из пп. 1-30, где колоночная хроматография включает обращеннофазовую хроматографию.
48. Способ по любому из пп. 1-30, где колоночная хроматография включает обращеннофазовую стационарную фазу.
49. Способ по п.48, где стационарная фаза содержит цепь C18.
50. Способ по п.48, где стационарная фаза содержит гидрофильную группу.
51. Способ по п.48, где гидрофильная группа содержит карбаматную группу.
52. Способ по п.48, где стационарная фаза содержит гидрофильную карбаматную группу в цепи C18.
53. Способ по п.48, где стационарная фаза содержит силилкарбаматную группу.
54. Способ по любому из пп. 1-53, где способ является линейным от приблизительно 1×104 до приблизительно 2×106 геномов вектора AAV на клетку.
55. Способ по любому из пп. 1-54, где коэффициент детерминации (R2) составляет более, чем приблизительно 0,85.
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US201662328916P | 2016-04-28 | 2016-04-28 | |
US62/328,916 | 2016-04-28 | ||
PCT/US2017/030254 WO2017190081A1 (en) | 2016-04-28 | 2017-04-28 | Relative potency assay for viral vector encoding isomerhydrolases |
Publications (3)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
RU2018141675A true RU2018141675A (ru) | 2020-05-29 |
RU2018141675A3 RU2018141675A3 (ru) | 2020-09-14 |
RU2756403C2 RU2756403C2 (ru) | 2021-09-30 |
Family
ID=60161213
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
RU2018141675A RU2756403C2 (ru) | 2016-04-28 | 2017-04-28 | Анализ относительной активности вирусного вектора, кодирующего изомерогидролазы |
Country Status (18)
Country | Link |
---|---|
US (1) | US20210348210A1 (ru) |
EP (1) | EP3448371A4 (ru) |
JP (1) | JP7067843B2 (ru) |
KR (1) | KR20190020661A (ru) |
CN (1) | CN109689033A (ru) |
AU (2) | AU2017258776B2 (ru) |
BR (1) | BR112018072268A2 (ru) |
CA (1) | CA3022386A1 (ru) |
CL (1) | CL2018003079A1 (ru) |
CO (1) | CO2018012509A2 (ru) |
IL (1) | IL262583B2 (ru) |
MX (1) | MX2018013205A (ru) |
MY (1) | MY194096A (ru) |
PE (1) | PE20190393A1 (ru) |
PH (1) | PH12018502291A1 (ru) |
RU (1) | RU2756403C2 (ru) |
SG (1) | SG11201809388SA (ru) |
WO (1) | WO2017190081A1 (ru) |
Families Citing this family (3)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US20240060989A1 (en) | 2019-10-04 | 2024-02-22 | Novartis Ag | Methods for measuring cralbp activity |
WO2023099793A1 (en) * | 2021-12-03 | 2023-06-08 | Dsm Ip Assets B.V. | Novel compositions comprising retinoids |
WO2023099791A1 (en) * | 2021-12-03 | 2023-06-08 | Dsm Ip Assets B.V. | Novel compositions comprising trans retinol |
Family Cites Families (12)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
SU873121A1 (ru) * | 1979-08-20 | 1981-10-15 | Институт биохимии АН ЛитССР | Способ определени активности гидролаз |
AU714271B2 (en) * | 1996-09-27 | 1999-12-23 | Unilever Plc | Skin care compositions containing combinations of compounds for mimicking the effect on skin of retinoic acid |
US6071410A (en) * | 1998-11-16 | 2000-06-06 | Varian, Inc. | Recovery of organic solutes from aqueous solutions |
CN1997359A (zh) * | 2004-02-17 | 2007-07-11 | 哈佛大学校长及研究员协会 | 包括黄斑变性在内的眼科疾病的处理 |
KR20140140616A (ko) * | 2004-06-18 | 2014-12-09 | 유니버시티 오브 워싱톤 스루 이츠 센터 포 커머셜리제이션 | 시각 이상 치료를 위한 레티날 유도체 및 이를 이용하기 위한 방법 |
JP2008518586A (ja) * | 2004-09-09 | 2008-06-05 | ユニバーシティ オブ ワシントン | オールトランスレチノールすなわちオールトランス13,14−ジヒドロレチノールサチュラーゼ及びその使用方法 |
MX2012003220A (es) * | 2009-09-15 | 2012-08-03 | Quadra Logic Tech Inc | Formulaciones farmaceuticas que comprenden 9-cis-retinil esteres en un vehiculo de lipido. |
US20140357611A1 (en) * | 2009-12-08 | 2014-12-04 | Case Western Reserve University | Compounds and methods of treating ocular disorders |
JP6600624B2 (ja) * | 2013-05-31 | 2019-10-30 | ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ カリフォルニア | アデノ随伴ウイルス変異体及びその使用方法 |
WO2015184453A1 (en) | 2014-05-30 | 2015-12-03 | Case Western Reserve University | Retinylamine derivitives for treatment of ocular disorders |
JP2017522895A (ja) * | 2014-07-31 | 2017-08-17 | ザ ボード オブ リージェンツ オブ ザ ユニヴァーシティ オブ オクラホマ | 哺乳類rpe65の高イソメロヒドロラーゼ活性突然変異体 |
GB201502137D0 (en) * | 2015-02-09 | 2015-03-25 | Ucl Business Plc | Treatment |
-
2017
- 2017-04-28 SG SG11201809388SA patent/SG11201809388SA/en unknown
- 2017-04-28 RU RU2018141675A patent/RU2756403C2/ru active
- 2017-04-28 IL IL262583A patent/IL262583B2/en unknown
- 2017-04-28 JP JP2018555878A patent/JP7067843B2/ja active Active
- 2017-04-28 US US16/096,673 patent/US20210348210A1/en active Pending
- 2017-04-28 MX MX2018013205A patent/MX2018013205A/es unknown
- 2017-04-28 AU AU2017258776A patent/AU2017258776B2/en active Active
- 2017-04-28 EP EP17790597.3A patent/EP3448371A4/en active Pending
- 2017-04-28 CA CA3022386A patent/CA3022386A1/en active Pending
- 2017-04-28 BR BR112018072268-5A patent/BR112018072268A2/pt active Search and Examination
- 2017-04-28 PE PE2018002238A patent/PE20190393A1/es unknown
- 2017-04-28 MY MYPI2018001807A patent/MY194096A/en unknown
- 2017-04-28 CN CN201780040688.8A patent/CN109689033A/zh active Pending
- 2017-04-28 KR KR1020187034586A patent/KR20190020661A/ko not_active IP Right Cessation
- 2017-04-28 WO PCT/US2017/030254 patent/WO2017190081A1/en active Application Filing
-
2018
- 2018-10-26 PH PH12018502291A patent/PH12018502291A1/en unknown
- 2018-10-29 CL CL2018003079A patent/CL2018003079A1/es unknown
- 2018-11-22 CO CONC2018/0012509A patent/CO2018012509A2/es unknown
-
2023
- 2023-06-22 AU AU2023203939A patent/AU2023203939A1/en active Pending
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
MY194096A (en) | 2022-11-11 |
RU2756403C2 (ru) | 2021-09-30 |
CA3022386A1 (en) | 2017-11-02 |
CO2018012509A2 (es) | 2019-04-30 |
JP2019514375A (ja) | 2019-06-06 |
WO2017190081A1 (en) | 2017-11-02 |
JP7067843B2 (ja) | 2022-05-16 |
PE20190393A1 (es) | 2019-03-13 |
US20210348210A1 (en) | 2021-11-11 |
IL262583B2 (en) | 2023-10-01 |
AU2023203939A1 (en) | 2023-09-14 |
SG11201809388SA (en) | 2018-11-29 |
AU2017258776B2 (en) | 2023-07-13 |
RU2018141675A3 (ru) | 2020-09-14 |
EP3448371A1 (en) | 2019-03-06 |
KR20190020661A (ko) | 2019-03-04 |
IL262583B1 (en) | 2023-06-01 |
PH12018502291A1 (en) | 2019-07-08 |
MX2018013205A (es) | 2019-06-24 |
EP3448371A4 (en) | 2019-09-11 |
BR112018072268A2 (pt) | 2019-02-12 |
CN109689033A (zh) | 2019-04-26 |
CL2018003079A1 (es) | 2019-03-29 |
AU2017258776A1 (en) | 2018-11-29 |
IL262583A (en) | 2018-12-31 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
RU2018141675A (ru) | Анализ относительной активности вирусного вектора, кодирующего изомерогидролазы | |
EP2660325A3 (en) | AAV vectors and corresponding nucleotide sequences and methods | |
RU2018123502A (ru) | Масштабируемые способы получения рекомбинантного вектора на основе аденоассоциированного вируса (aav) в системе бессывороточной суспензионной культуры клеток, подходящего для клинического применения | |
JP2019514375A5 (ru) | ||
WO2013173512A3 (en) | High-transduction-efficiency raav vectors, compositions, and methods of use | |
WO2007148971A8 (en) | Vectors with modified initiation codon for the translation of aav-rep78 useful for production of aav in insect cells | |
AR082925A1 (es) | Proteinas estructurales mutadas por parvovirus con epitopo de celulas b de proteccion cruzada, producto y metodos relacionados | |
WO2007046703A3 (en) | Improved aav vectors produced in insect cells | |
Jaakkola et al. | Closely related archaeal Haloarcula hispanica icosahedral viruses HHIV-2 and SH1 have nonhomologous genes encoding host recognition functions | |
MX2016011585A (es) | Vectores aav mejorados adicionales producidos en celulas de insecto. | |
HRP20211170T1 (hr) | Pripravci i postupci koji se odnose na mutantni toksin iz bakterije clostridium difficile | |
PL404537A1 (pl) | Wirusy stowarzyszone z adenowirusem, kompozycje, wyizolowane bialko kapsydu, wyizolowana lub syntetyczna czasteczka kwasu nukleinowego, sposób wytwarzania rekombinowanych wirusów, komórki gospodarza, bialka obejmujace fragment bialka kapsydu AAV, sztuczne bialka, rekombinowane wirusy, czasteczki, sposoby dostarczania transgenu do komórki, sposób identyfikacji serotypu sekwencji wirusa (AAV), zestaw diagnostyczny, sposób izolacji nowych wirusów, nowe serotypy wirusa, wyizolowane wirusy, rekombinowana komórka, zastosowanie wirusa | |
ATE420212T1 (de) | Produktion von adenoassoziiertem virus in insektenzellen | |
MX2022010388A (es) | Polipéptidos de la cápside y vectores de virus adenoasociado. | |
JP2018505695A5 (ru) | ||
PL351277A1 (en) | Nucleic acid sequence, dna fragments, recombined dna molecules, live recombined carriers, host cells, proteins and their application, vaccines against lawsonia intracellularis and methods of obtaining them as well as relevant diagnostic tests | |
CN106755089B (zh) | 表达山羊淋巴细胞活化分子的细胞系及其构建方法与应用 | |
Šebela et al. | Intact cell MALDI-TOF mass spectrometric analysis of Chroococcidiopsis cyanobacteria for classification purposes and identification of possible marker proteins | |
WO2007032817A3 (en) | Pure mirna sample preparation method | |
MX2020002809A (es) | Genes rep de aav inducibles. | |
Yinda et al. | A single bat species in Cameroon harbors multiple highly divergent papillomaviruses in stool identified by metagenomics analysis | |
CN102645357A (zh) | 一种制备螺旋藻双向电泳分析蛋白的方法 | |
CN107384957B (zh) | 一种表达miRNA的AAV辅助包装载体及该载体的构建方法、筛选方法和应用 | |
Wu et al. | First report on Enterobacter sp. causing soft rot of Amorphophallus konjac in China | |
BR112022012813A2 (pt) | Métodos para analisar proteínas do capsídeo de aav |