RU2017127990A - Обнаружение посредством нанопоры полинуклеотидов-мишеней из фона образца - Google Patents

Обнаружение посредством нанопоры полинуклеотидов-мишеней из фона образца Download PDF

Info

Publication number
RU2017127990A
RU2017127990A RU2017127990A RU2017127990A RU2017127990A RU 2017127990 A RU2017127990 A RU 2017127990A RU 2017127990 A RU2017127990 A RU 2017127990A RU 2017127990 A RU2017127990 A RU 2017127990A RU 2017127990 A RU2017127990 A RU 2017127990A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
specified
paragraphs
amplification
sample
nanopore
Prior art date
Application number
RU2017127990A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2017127990A3 (ru
Inventor
Тревор Дж. МОРИН
Тайлер ШРОПШИР
Уильям Б. ДАНБАР
Дэниел А. ХЕЛЛЕР
Хонюнь ВАН
Original Assignee
Ту Пор Гайс, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ту Пор Гайс, Инк. filed Critical Ту Пор Гайс, Инк.
Publication of RU2017127990A publication Critical patent/RU2017127990A/ru
Publication of RU2017127990A3 publication Critical patent/RU2017127990A3/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/686—Polymerase chain reaction [PCR]
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6813—Hybridisation assays
    • C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6848—Nucleic acid amplification reactions characterised by the means for preventing contamination or increasing the specificity or sensitivity of an amplification reaction
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6844—Nucleic acid amplification reactions
    • C12Q1/6851—Quantitative amplification
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2531/00—Reactions of nucleic acids characterised by
    • C12Q2531/10—Reactions of nucleic acids characterised by the purpose being amplify/increase the copy number of target nucleic acid
    • C12Q2531/113—PCR
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2563/00—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties
    • C12Q2563/131—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties the label being a member of a cognate binding pair, i.e. extends to antibodies, haptens, avidin
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2565/00—Nucleic acid analysis characterised by mode or means of detection
    • C12Q2565/60—Detection means characterised by use of a special device
    • C12Q2565/631—Detection means characterised by use of a special device being a biochannel or pore

Landscapes

  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Investigating Or Analyzing Materials By The Use Of Electric Means (AREA)
  • Apparatus Associated With Microorganisms And Enzymes (AREA)

Claims (135)

1. Способ обнаружения наличия или отсутствия полинуклеотидной последовательности-мишени, предположительно присутствующей в образце, включающий
предоставление набора праймеров, причем по меньшей мере один из указанных праймеров гибридизуется с полинуклеотидом, содержащим указанную полинуклеотидную последовательность-мишень, и причем по меньшей мере один из указанных праймеров модифицирован таким образом, чтобы содержать сайт конъюгации, способный специфически связываться с молекулярным грузом;
осуществление реакции амплификации на указанном образце, причем указанный образец содержит указанный набор праймеров и реагенты для амплификации, так что ампликон, содержащий указанную полинуклеотидную последовательность-мишень, производимую указанной реакцией амплификации, будет содержать указанный сайт конъюгации;
связывание указанного молекулярного груза с указанным сайтом конъюгации;
загрузку указанного образца в устройство, содержащее нанопору, причем указанная нанопора разделяет внутреннее пространство устройства на два объема, и выполненное с возможностью пропускания нуклеиновой кислоты через одну или более пор, причем устройство содержит датчик для каждой поры, который выполнен с возможностью идентификации объектов, проходящих через нанопору; а также
обнаружение наличия или отсутствия указанной полинуклеотидной последовательности-мишени в указанном образце путем определения того, прошел ли связанный с молекулярным грузом полинуклеотид-мишень через нанопору, с использованием данных от указанного датчика.
2. Способ по п. 1, при котором указанный образец загружают в указанное устройство перед указанной амплификацией.
3. Способ по п. 1, при котором указанный образец загружают в указанное устройство после указанной амплификации.
4. Способ по п. 1, при котором указанный молекулярный груз связан с указанным сайтом конъюгации указанного ампликона после указанной амплификации.
5. Способ по п. 1, при котором указанный молекулярный груз связан с указанным сайтом конъюгации указанного праймера перед указанной амплификацией.
6. Способ по любому из пп. 1-5, при котором указанный образец не подвергается стадии очистки между указанной амплификацией и указанным обнаружением в нанопоре.
7. Способ по любому из пп. 1-5, при котором указанный образец загружают в указанное нанопоровое устройство при разведении, составляющем по меньшей мере 1:20000, 1:10000, 1:5000, 1:2000, 1:1000, 1:500, 1:200, 1:100, 1:50, 1:20, 1:10, 1:5, 1:2, 1:1,5,1:1,2,1:1,1 или 1:1,05.
8. Способ по любому из пп. 1-5, при котором указанный образец загружают в указанное нанопоровое устройство без разведения.
9. Способ по любому из пп. 1-5, при котором указанный образец содержит полинуклеотиды-немишени и реагенты реакции амплификации.
10. Способ по любому из пп. 1-5, при котором диаметр указанной нанопоры составляет по меньшей мере 5 нм, 10 нм, 20 нм, 30 нм, 40 нм или 50 нм.
11. Способ по любому из пп. 1-5, при котором указанную реакцию амплификации выбирают из группы, состоящей из: полимеразной цепной реакции (ПЦР), ПЦР с обратной транскрипцией, опосредованной лигированием ПЦР, петлевой амплификации (LAMP), изотермической амплификации, амплификации с замещением цепей (SDA), амплификации с множественным вытеснением цепи, амплификации с замещением цепей, зависимой от геликазы амплификации, амплификации с использованием никующей эндонуклеазы или амплификации с рекомбинантной полимеразой.
12. Способ по любому из пп. 1-5, при котором указанную реакцию амплификации выполняют во внутреннем пространстве устройства.
13. Способ по любому из пп. 1-5, при котором полинуклеотид-мишень содержит двухцепочечную дезоксирибонуклеиновую кислоту (дцДНК), одноцепочечную ДНК (оцДНК), пептидную нуклеиновую кислоту (ПНК), одноцепочечную рибонуклеиновую кислоту (оцРНК), гибрид ДНК/РНК или двухцепочечную рибонуклеиновую кислоту (дцРНК).
14. Способ по любому из пп. 1-5, при котором полинуклеотид-мишень представляет собой природный полинуклеотид.
15. Способ по любому из пп. 1-5, при котором полинуклеотид-мишень представляет собой искусственно синтезированный полинуклеотид.
16. Способ по любому из пп. 1-5, при котором полинуклеотид-мишень представляет собой рекомбинантный полинуклеотид.
17. Способ по любому из пп. 1-5, при котором молекулярный груз выбирают из группы, состоящей из: дендримера, двухцепочечной ДНК, одноцепочечной ДНК, ДНК-аптамера, флуорофора, белка, антитела, полипептида, наногранулы, наностержня, нанотрубки, наночастицы, фуллерена, молекулы ПЭГ, липосомы или гибрида холестерина-ДНК.
18. Способ по любому из пп. 1-5, при котором указанный молекулярный груз содержит электрический заряд.
19. Способ по п. 18, при котором указанный заряженный молекулярный груз выбирают из группы, состоящей из пептида, аминокислоты, заряженной наночастицы, синтетической молекулы, нуклеотида, полинуклеотида, металла или иона.
20. Способ по п. 18, при котором чувствительность или специфичность обнаружения наличия или отсутствия полинуклеотида-мишени увеличивается, когда указанный полинуклеотид-мишень связан с указанным заряженным молекулярным грузом, по сравнению с несвязанным полинуклеотидом-мишенью.
21. Способ по любому из пп. 1-5, при котором чувствительность или специфичность обнаружения наличия или отсутствия полинуклеотида-мишени увеличивается, когда указанный полинуклеотид-мишень связан с указанным молекулярным грузом, по сравнению с несвязанным полинуклеотидом-мишенью.
22. Способ по любому из пп. 1-5, при котором датчик содержит электродную пару, выполненную с возможностью приложения разности напряжений между двумя объемами и для измерения тока через нанопору, разделяющую два объема, производя сигнатуру токового события.
23. Способ по п. 22, при котором сигнатура токового события, производимая, когда полинуклеотид-мишень, связанный с молекулярным грузом, проходит через нанопору, отличается от сигнатуры токового события фоновых молекул средней глубиной, максимальной глубиной, продолжительностью, количеством уровней глубины, площадью глубины и продолжительности или уровнем шума.
24. Способ по любому из пп. 1-5, при котором сайт конъюгации и молекулярный груз связаны через ковалентную связь.
25. Способ по п. 24, при котором указанная ковалентная связь образована клик-химией.
26. Способ по п. 25, при котором клик-химия представляет собой медь-катализируемую.
27. Способ по п. 25, при котором клик-химия не содержит меди.
28. Способ по любому из пп. 1-5, при котором сайт конъюгации и молекулярный груз связаны через нековалентную связь.
29. Способ по п. 28, при котором указанная нековалентная связь представляет собой водородную связь, ионную связь, ван-дер-ваальсово взаимодействие, гидрофобное взаимодействие, полярную связь, катион-пи-взаимодействие, плоскостное стэкинг-взаимодействие или металлическую связь.
30. Способ по любому из пп. 1-5, при котором сайт конъюгации расположен на 3'- или 5'-конце указанного праймера.
31. Способ по любому из пп. 1-5, при котором сайт конъюгации расположен на 3'- или 5'-конце указанного ампликона.
32. Способ по любому из пп. 1-5, при котором сайт конъюгации содержит химическую группу, реакционноспособную группу, небольшую молекулу или пептид.
33. Способ по п. 32, при котором небольшая молекула содержит биотин.
34. Способ по п. 32, при котором реакционноспособная группа содержит дибензоциклооктил (DBCO) или азид.
35. Способ по любому из пп. 1-5, при котором два или более молекулярных груза связаны с указанным ампликоном.
36. Способ по любому из пп. 1-5, при котором указанное устройство содержит по меньшей мере две нанопоры последовательно, и причем указанный ампликон, связанный с указанным молекулярным грузом, одновременно находится в указанных по меньшей мере двух нанопорах во время транслокации.
37. Способ обнаружения наличия или отсутствия полинуклеотидной последовательности-мишени, предположительно присутствующей в образце, включающий:
предоставление набора праймеров, причем по меньшей мере один из указанных праймеров гибридизуется с полинуклеотидом, содержащим указанную полинуклеотидную последовательность-мишень, и причем по меньшей мере один из указанных праймеров связывается с молекулярным грузом;
осуществление реакции амплификации на указанном образце, причем указанный образец содержит указанный набор праймеров и реагенты для амплификации, так что ампликон, содержащий указанную полинуклеотидную последовательность-мишеньпроизводимую указанной реакцией амплификации, будет связан с указанным молекулярным грузом;
загрузку указанного образца в устройство, содержащее нанопору, причем указанная нанопора разделяет внутреннее пространство устройства на два объема, и выполненное с возможностью пропускания нуклеиновой кислоты через одну или более пор, причем устройство содержит датчик для каждой поры, который выполнен с возможностью идентификации объектов, проходящих через нанопору; а также
обнаружение наличия или отсутствия указанной полинуклеотидной последовательности-мишени в указанном образце путем определения того, прошел ли связанный с молекулярным грузом полинуклеотид-мишень через нанопору, с использованием данных от указанного датчика.
38. Способ по п. 37, при котором указанный образец загружают в указанное устройство перед указанной амплификацией.
39. Способ по п. 37, при котором указанный образец загружают в указанное устройство после указанной амплификации.
40. Способ по любому из пп. 37-39, при котором указанный образец не подвергается стадии очистки между указанной амплификацией и указанным обнаружением в нанопоре.
41. Способ по любому из пп. 37-39, при котором указанный образец загружают в указанное нанопоровое устройство при разведении 1:10000, 1:1000, 1:500, 1:200, 1:100, 1:50, 1:20,1:10, 1:5,1:2,1:1,5, 1:1,2, 1:1,1 или 1:1,05.
42. Способ по любому из пп. 37-39, при котором указанный образец загружают в указанное нанопоровое устройство без разведения.
43. Способ по любому из пп. 37-39, при котором указанный образец содержит полинуклеотиды-немишени и реагенты для реакции амплификации.
44. Способ по любому из пп. 37-39, при котором диаметр указанной нанопоры составляет по меньшей мере 5 нм, 10 нм, 20 нм, 30 нм, 40 нм или 50 нм.
45. Способ по любому из пп. 37-39, при котором указанную реакцию амплификации выбирают из группы, состоящей из полимеразной цепной реакции (ПЦР), ПЦР с обратной транскрипцией, опосредованной лигированием ПЦР, петлевой амплификации (LAMP), изотермической амплификации, амплификации с замещением цепей (SDA), амплификации с множественным вытеснением цепи, амплификации с замещением цепей, зависимой от геликазы амплификации, амплификации с использованием никующей эндонуклеазы или амплификации с рекомбинантной полимеразой.
46. Способ по любому из пп. 37-39, при котором указанную реакцию амплификации выполняют во внутреннем пространстве устройства.
47. Способ по любому из пп. 37-39, при котором полинуклеотид-мишень содержит двухцепочечную дезоксирибонуклеиновую кислоту (дцДНК), одноцепочечную ДНК (оцДНК), пептидную нуклеиновую кислоту (ПНК), одноцепочечную рибонуклеиновую кислоту (оцРНК), гибрид ДНК/РНК или двухцепочечную рибонуклеиновую кислоту (дцРНК).
48. Способ по любому из пп. 37-39, при котором полинуклеотид-мишень представляет собой природный полинуклеотид.
49. Способ по любому из пп. 37-39, при котором полинуклеотид-мишень представляет собой искусственно синтезированный полинуклеотид.
50. Способ по любому из пп. 37-39, при котором полинуклеотид-мишень представляет собой рекомбинантный полинуклеотид.
51. Способ по любому из пп. 37-39, при котором молекулярный груз выбирают из группы, состоящей из: дендримера, двухцепочечной ДНК, одноцепочечной ДНК, ДНК-аптамера, флуорофора, белка, антитела, полипептида, наногранулы, наностержня, нанотрубки, наночастицы, фуллерена, молекулы ПЭГ, липосомы или гибрида холестерина-ДНК.
52. Способ по любому из пп. 37-39, при котором указанный молекулярный груз содержит ионный заряд.
53. Способ по п. 52, при котором указанный заряженный молекулярный груз выбирают из группы, состоящей из пептида, аминокислоты, заряженной наночастицы, синтетической молекулы, нуклеотида, полинуклеотида, металла или иона.
54. Способ по п. 52, при котором чувствительность или специфичность обнаружения наличия или отсутствия полинуклеотида-мишени увеличивается, когда указанный полинуклеотид-мишень связан с указанным заряженным молекулярным грузом, по сравнению с несвязанным полинуклеотидом-мишенью.
55. Способ по любому из пп. 37-39, при котором чувствительность или специфичность обнаружения наличия или отсутствия полинуклеотида-мишени увеличивается, когда указанный полинуклеотид-мишень связан с указанным молекулярным грузом, по сравнению с несвязанным полинуклеотидом-мишенью.
56. Способ по любому из пп. 37-39, при котором датчик содержит электродную пару, выполненную с возможностью приложения разности напряжений между двумя объемами и для измерения тока через нанопору, разделяющую два объема, производя сигнатуру токового события.
57. Способ по п. 56, при котором сигнатура токового события, производимая, когда полинуклеотид-мишень, связанный с молекулярным грузом, проходит через нанопору, отличается от сигнатуры токового события фоновых молекул своей средней глубиной, максимальной глубиной, продолжительностью, количеством уровней глубины, площадью глубины и продолжительностью или уровнем шума.
58. Способ по любому из пп. 37-39, при котором праймер и молекулярный груз связаны через ковалентную связь.
59. Способ по любому из пп. 37-39, при котором праймер и молекулярный груз связаны посредством нековалентной связи.
60. Способ по любому из пп. 37-39, при котором молекулярный груз связан с 3'-или 5'-концом указанного праймера.
61. Способ по любому из пп. 37-39, при котором два или более молекулярных груза связаны с указанным праймером.
62. Способ по любому из пп. 37-39, при котором ампликон и молекулярный груз связаны через ковалентную связь.
63. Способ по любому из пп. 37-39, при котором ампликон и молекулярный груз связаны через нековалентную связь.
64. Способ по любому из пп. 37-39, при котором два или более молекулярных груза связаны с указанным ампликоном.
65. Способ по любому из пп. 37-39, при котором указанное устройство содержит по меньшей мере две нанопоры последовательно, и причем указанный ампликон, связанный с указанным молекулярным грузом, одновременно находится в указанных по меньшей мере двух нанопорах во время транслокации.
66. Способ обнаружения наличия или отсутствия полинуклеотидной последовательности-мишени, предположительно присутствующей в образце, включающий:
предоставление набора праймеров, причем по меньшей мере один из указанных праймеров гибридизуется с полинуклеотидом, содержащим указанную полинуклеотидную последовательность-мишень;
осуществление реакции амплификации на указанном образце, причем указанный образец содержит указанный набор праймеров и реагенты для амплификации, так что ампликон, содержащий указанную полинуклеотидную последовательность-мишень, производимую указанной реакцией амплификации, составляет по меньшей мере 100 п.н. в длину;
загрузку указанного образца в устройство, содержащее нанопору, причем указанная нанопора разделяет внутреннее пространство устройства на два объема, и выполненное с возможностью пропускания нуклеиновой кислоты через одну или более пор, причем устройство содержит датчик для каждой поры, который выполнен с возможностью идентификации объектов, проходящих через нанопору; а также
обнаружение наличия или отсутствия указанной полинуклеотидной последовательности-мишени в указанном образце путем определения того, прошел ли связанный с молекулярным грузом полинуклеотид-мишень через нанопору, с использованием данных от указанного датчика, причем указанный амплифицированный образец не был очищен.
67. Способ по п. 66, при котором указанный образец загружают в указанное устройство перед указанной амплификацией.
68. Способ по п. 66, при котором указанный образец загружают в указанное устройство после указанной амплификации.
69. Способ по п. 66, при котором указанный ампликон составляет по меньшей мере 200, 500, 1000, 2000, 5000 или 10000 п. н. в длину.
70. Способ по любому из пп. 66-69, при котором указанный образец не подвергается стадии очистки между указанной амплификацией и указанным обнаружением в нанопоре.
71. Способ по любому из пп. 66-69, при котором указанный образец загружают в указанное нанопоровое устройство при разведении 1:10000, 1:1000, 1:500, 1:200, 1:100, 1:50,1:20, 1:10, 1:5,1:2,1:1,5, 1:1,2, 1:1,1 или 1:1,05.
72. Способ по любому из пп. 66-69, при котором указанный образец загружают в указанное нанопоровое устройство без разведения.
73. Способ по любому из пп. 66-69, при котором указанный образец содержит полинуклеотиды-немишени и реагенты для реакции амплификации.
74. Способ по любому из пп. 66-69, при котором диаметр указанной нанопоры составляет по меньшей мере 2 нм, 3 нм, 5 нм, 10 нм, 20 нм, 30 нм, 40 нм или 50 нм.
75. Способ по любому из пп. 66-69, при котором указанную реакцию амплификации выбирают из группы, состоящей из: полимеразной цепной реакции (ПЦР), ПЦР с обратной транскрипцией, опосредованной лигированием ПЦР, петлевой амплификации (LAMP), изотермической амплификации, амплификации с замещением цепей (SDA), амплификации с множественным вытеснением цепи, амплификации с замещением цепей, зависимой от геликазы амплификации, амплификации с использованием никующей эндонуклеазы, амплификации с рекомбинантной полимеразой, петлевой изотермической амплификации (LAMP), самоподдерживающейся репликации последовательностей, амплификации целого генома или опосредованной лигазой ПЦР.
76. Способ по любому из пп. 66-69, при котором указанную реакцию амплификации выполняют во внутреннем пространстве устройства.
77. Способ по любому из пп. 66-69, при котором полинуклеотид-мишень содержит двухцепочечную дезоксирибонуклеиновую кислоту (дцДНК), одноцепочечную ДНК (оцДНК), гибрид ДНК/РНК, пептидную нуклеиновую кислоту (ПНК), одноцепочечную рибонуклеиновую кислоту (оцРНК) или двухцепочечную рибонуклеиновую кислоту (дцРНК).
78. Способ по любому из пп. 66-69, при котором полинуклеотид-мишень представляет собой природный полинуклеотид.
79. Способ по любому из пп. 66-69, при котором полинуклеотид-мишень представляет собой искусственно синтезированный полинуклеотид.
80. Способ по любому из пп. 66-69, при котором полинуклеотид-мишень представляет собой рекомбинантный полинуклеотид.
81. Способ по любому из пп. 66-69, при котором датчик содержит электродную пару, выполненную с возможностью приложения разности напряжений между двумя объемами и для измерения тока через нанопору, разделяющую два объема, производя сигнатуру токового события.
82. Способ по п. 81, при котором сигнатура токового события, производимая, когда полинуклеотид-мишень проходит через нанопору, отличается от сигнатуры токового события фоновых молекул своей средней глубиной, максимальной глубиной, продолжительностью, количеством уровней глубины, площадью глубины и продолжительностью или уровнем шума.
83. Способ по любому из пп. 66-69, при котором указанное устройство содержит по меньшей мере две нанопоры последовательно, и причем указанный ампликон одновременно находится в указанных по меньшей мере двух нанопорах во время транслокации.
84. Набор, содержащий
устройство, содержащее нанопору, причем указанная нанопора разделяет внутреннее пространство устройства на два объема, и выполненное с возможностью пропускания нуклеиновой кислоты через одну или более пор, причем устройство содержит датчик для каждой поры, который выполнен с возможностью идентификации объектов, проходящих через нанопору;
набор праймеров, причем по меньшей мере один из указанных праймеров гибридизуется с полинуклеотидом, содержащим указанную полинуклеотидную последовательность-мишень, и причем по меньшей мере один из указанных праймеров модифицирован таким образом, чтобы содержать сайт конъюгации, способный специфически связываться с молекулярным грузом;
молекулярный груз для связывания с указанным сайтом конъюгации до, во время или после амплификации;
инструкции по применению для обнаружения наличия или отсутствия указанного полинуклеотида-мишени в образце.
85. Набор, содержащий
устройство, содержащее нанопору, причем указанная нанопора разделяет внутреннее пространство устройства на два объема, и выполненное с возможностью пропускания нуклеиновой кислоты через одну или более пор, причем устройство содержит датчик для каждой поры, который выполнен с возможностью идентификации объектов, проходящих через нанопору;
набор праймеров, причем по меньшей мере один из указанных праймеров гибридизуется с полинуклеотидом, содержащим указанную полинуклеотидную последовательность-мишень, и причем по меньшей мере один из указанных праймеров связывается с молекулярным грузом;
инструкции по применению для обнаружения наличия или отсутствия указанного полинуклеотида-мишени в образце.
86. Набор, содержащий
устройство, содержащее нанопору, причем указанная нанопора разделяет внутреннее пространство устройства на два объема, и выполненное с возможностью пропускания нуклеиновой кислоты через одну или более пор, причем устройство содержит датчик для каждой поры, который выполнен с возможностью идентификации объектов, проходящих через нанопору;
набор праймеров, причем по меньшей мере один из указанных праймеров гибридизуется с полинуклеотидом, содержащим указанную полинуклеотидную последовательность-мишень, где указанные праймеры производят ампликон, содержащий указанную полинуклеотидную последовательность-мишень длиной по меньшей мере 100, 200, 500, 1000, 2000, 5000 или 10000 пар оснований во время реакции амплификации; а также
инструкции по применению для обнаружения наличия или отсутствия указанного полинуклеотида-мишени в образце.
87. Способ определения количества полинуклеотидной последовательности-мишени, присутствующей в образце, включающий
предоставление контрольного образца, содержащего известное количество контрольного полинуклеотида, и экспериментального образца, содержащего неизвестное количество полинуклеотида-мишени;
амплификацию указанного контрольного образца для получения первого ампликона, содержащего указанный контрольный полинуклеотид, и амплификацию указанного экспериментального образца для получения второго ампликона, содержащего указанный полинуклеотид мишень;
загрузку указанного контрольного образца и указанного экспериментального образца отдельно в устройство, содержащее нанопору, причем указанная нанопора разделяет внутреннее пространство устройства на два объема, и выполненное с возможностью пропускания первого или второго ампликона через одну или более пор, причем устройство содержит датчик для каждой поры, который выполнен с возможностью идентификации объектов, проходящих через нанопору; а также
сравнение частоты захвата указанного первого ампликона в нанопоре с частотой захвата второго ампликона в нанопоре для определения количества полинуклеотидной последовательности-мишени в указанном экспериментальном образце.
88. Способ по п. 87, при котором указанная амплификация выполняется после загрузки указанного контрольного образца или экспериментального образца в указанное устройство.
89. Способ по п. 87, при котором указанный контрольный образец и указанный экспериментальный образец амплифицируют в идентичных условиях.
90. Способ по п. 87, при котором указанный контрольный полинуклеотид и указанный полинуклеотид-мишень характеризуются одинаковой длиной или последовательностью.
91. Способ по п. 87, при котором частота захвата первого и второго ампликона определяется с использованием одной и той же нанопоры в одних и тех же условиях.
92. Способ по п. 87, при котором частота захвата первого и второго ампликона определяется с использованием нанопор аналогичного размера.
93. Способ по п. 87, при котором оценка концентрации полинуклеотида-мишени в экспериментальной образце производится математически путем объединения набора измерений датчиков, записанных с течением времени для указанного контрольного образца и указанного экспериментального образца, и сравнения двух наборов данных для преобразования частоты захвата в концентрацию.
94. Способ по п. 87, при котором после каждого цикла в реакции амплификации оценка концентрации полинуклеотида-мишени производится математически путем объединения набора измерений датчиков, записанных с течением времени для указанного контрольного образца и указанного экспериментального образца, и сравнения двух наборов данных для преобразования частоты захвата в концентрацию.
95. Способ по п. 94, дополнительно включающий определение количества полинуклеотида-мишени в указанном экспериментальном образце перед амплификацией из указанного сравнения измерений датчиков.
96. Способ определения количества полинуклеотидной последовательности-мишени, присутствующей в образце, включающий
предоставление контрольного образца, содержащего известное количество контрольного полинуклеотида, и экспериментального образца, содержащего неизвестное количество полинуклеотида-мишени;
разбавление указанного контрольного образца с образованием по меньшей мере двух различных известных концентраций указанного контрольного полинуклеотида;
загрузку указанного контрольного образца в устройство, содержащее нанопору в указанных по меньшей мере двух различных известных концентрациях указанного контрольного полинуклеотида, причем указанная нанопора разделяет внутреннее пространство устройства на два объема, и выполненное с возможностью пропускания контрольного полинуклеотида через одну или более пор, причем устройство содержит датчик для каждой поры, который выполнен с возможностью идентификации объектов, проходящих через нанопору;
обнаружение частоты захвата в указанной нанопоре контрольного полинуклеотида в каждой из указанных по меньшей мере двух известных концентрациях;
амплификацию указанного экспериментального образца с получением ампликона, содержащего указанный полинуклеотид-мишень; а также
загрузку экспериментального образца в указанное устройство, содержащее нанопору;
определение частоты захвата полинуклеотида-мишени в указанной нанопоре;
сравнение частоты захвата указанного первого ампликона в нанопоре с частотой захвата указанного второго ампликона в нанопоре для определения количества полинуклеотидной последовательности-мишени в указанном экспериментальном образце.
97. Способ по п. 96, при котором указанное разведение представляет собой серийное разведение.
98. Способ по п. 96, дополнительно включающий амплификацию указанного контрольного полинуклеотида.
99. Способ по п. 96, при котором указанное разведение проводят после загрузки указанного контрольного образца в указанное устройство.
100. Способ по п. 96, при котором указанную амплификацию проводят после загрузки указанного экспериментального образца в указанное устройство.
RU2017127990A 2015-02-02 2016-02-02 Обнаружение посредством нанопоры полинуклеотидов-мишеней из фона образца RU2017127990A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201562111075P 2015-02-02 2015-02-02
US62/111,075 2015-02-02
PCT/US2016/016233 WO2016126746A1 (en) 2015-02-02 2016-02-02 Nanopore detection of target polynucleotides from sample background

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2017127990A true RU2017127990A (ru) 2019-03-04
RU2017127990A3 RU2017127990A3 (ru) 2019-03-04

Family

ID=56564617

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2017127990A RU2017127990A (ru) 2015-02-02 2016-02-02 Обнаружение посредством нанопоры полинуклеотидов-мишеней из фона образца

Country Status (12)

Country Link
US (1) US11098348B2 (ru)
EP (1) EP3253889A4 (ru)
JP (2) JP2018505414A (ru)
KR (2) KR20170106487A (ru)
CN (1) CN107250380A (ru)
AU (3) AU2016215453A1 (ru)
CA (1) CA2973753A1 (ru)
HK (1) HK1245348A1 (ru)
IL (1) IL253272B (ru)
MX (1) MX2017009766A (ru)
RU (1) RU2017127990A (ru)
WO (1) WO2016126746A1 (ru)

Families Citing this family (25)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US8870950B2 (en) 2009-12-08 2014-10-28 Mitral Tech Ltd. Rotation-based anchoring of an implant
US11653910B2 (en) 2010-07-21 2023-05-23 Cardiovalve Ltd. Helical anchor implantation
ES2934670T3 (es) 2013-01-24 2023-02-23 Cardiovalve Ltd Válvulas protésicas ancladas de forma ventricular
EP2994751B1 (en) 2013-05-06 2018-10-10 Two Pore Guys, Inc. A method of biological target detection using a nanopore and a fusion protein binding agent
KR102245192B1 (ko) 2013-05-06 2021-04-29 온테라 인크. 나노포어를 이용한 표적 검출
CN110141399B (zh) 2015-02-05 2021-07-27 卡迪尔维尔福股份有限公司 带有轴向滑动框架的人工瓣膜
MX2018006146A (es) * 2015-11-23 2019-05-27 Two Pore Guys Inc Modificación de diana para seguimiento y detección.
US10531866B2 (en) 2016-02-16 2020-01-14 Cardiovalve Ltd. Techniques for providing a replacement valve and transseptal communication
US10859562B2 (en) 2016-02-29 2020-12-08 Iridia, Inc. Methods, compositions, and devices for information storage
US10640822B2 (en) 2016-02-29 2020-05-05 Iridia, Inc. Systems and methods for writing, reading, and controlling data stored in a polymer
US10438662B2 (en) * 2016-02-29 2019-10-08 Iridia, Inc. Methods, compositions, and devices for information storage
US11486873B2 (en) 2016-03-31 2022-11-01 Ontera Inc. Multipore determination of fractional abundance of polynucleotide sequences in a sample
CN114587712A (zh) 2016-08-10 2022-06-07 卡迪尔维尔福股份有限公司 具有同轴框架的人工瓣膜
JP6664011B2 (ja) 2016-10-24 2020-03-13 オンテラ インコーポレイテッド サンプル中のポリヌクレオチド配列のための存在量パラメータの決定
KR102076592B1 (ko) * 2017-05-25 2020-02-13 가천대학교 산학협력단 나노기공 센서를 사용한 dna 농도 측정 장치 및 방법
US10888421B2 (en) 2017-09-19 2021-01-12 Cardiovalve Ltd. Prosthetic heart valve with pouch
CN108181358B (zh) * 2017-11-15 2020-02-11 华东理工大学 基于气单胞菌溶素纳米通道检测氨基酸的方法
CN109239140B (zh) * 2018-08-16 2021-04-13 广东第二师范学院 一种纳米孔功能性控制方法及系统
WO2020219011A1 (en) * 2019-04-22 2020-10-29 Ontera Inc. Multipore determination of fractional abundance of polynucleotide sequences in a sample
US20200340943A1 (en) * 2019-04-26 2020-10-29 The University Of Ottawa Calibrating Nanopore Capture Rates Using Controlled Counting
CN110438203B (zh) * 2019-08-19 2023-11-28 上海纳米技术及应用国家工程研究中心有限公司 一种提高环介导等温扩增反应效率的方法及应用
JP7344786B2 (ja) * 2019-12-19 2023-09-14 株式会社日立製作所 溶液中の任意のｄｎａ配列を同定する方法
KR102358418B1 (ko) * 2019-12-31 2022-02-04 주식회사 제노헬릭스 스몰 rna 검출 방법
WO2021156370A1 (en) * 2020-02-06 2021-08-12 F. Hoffmann-La Roche Ag Compositions that reduce template threading into a nanopore
US11837302B1 (en) 2020-08-07 2023-12-05 Iridia, Inc. Systems and methods for writing and reading data stored in a polymer using nano-channels

Family Cites Families (38)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPH05273209A (ja) * 1992-03-25 1993-10-22 Takara Shuzo Co Ltd Ｄｎａ検出用キット
JPH11346798A (ja) * 1998-06-04 1999-12-21 Makoto Tsuruoka 核酸の測定方法およびＶｅｒｏ毒素生産菌の検出方法
US20020197618A1 (en) * 2001-01-20 2002-12-26 Sampson Jeffrey R. Synthesis and amplification of unstructured nucleic acids for rapid sequencing
WO2003048769A1 (en) * 2001-11-30 2003-06-12 Nanosphere, Inc. Real-time monitoring of pcr amplification using nanoparticle probes
US6952651B2 (en) 2002-06-17 2005-10-04 Intel Corporation Methods and apparatus for nucleic acid sequencing by signal stretching and data integration
US7270956B2 (en) * 2002-08-26 2007-09-18 The Regents Of The University Of California Methods and compositions for detection and analysis of polynucleotides using light harvesting multichromophores
CA2489922C (en) * 2002-06-20 2016-08-16 The Regents Of The University Of California Methods and compositions for detection and analysis of polynucleotides using light harvesting multichromophores
US20040022764A1 (en) * 2002-07-31 2004-02-05 Hanan Polansky Inhibition of microcompetition with a foreign polynucleotide as treatment of chronic disease
CN1894423A (zh) 2003-05-20 2007-01-10 因维斯蒂恩有限公司 检测多核苷酸的系统
US20050186576A1 (en) 2004-02-19 2005-08-25 Intel Corporation Polymer sequencing using selectively labeled monomers and data integration
TWI291416B (en) * 2005-07-19 2007-12-21 Benq Corp Business equipment
KR100691806B1 (ko) 2005-08-04 2007-03-12 삼성전자주식회사 비드 및 나노포어를 이용한 핵산 검출방법 및 검출장치
US20070048745A1 (en) * 2005-08-30 2007-03-01 Joyce Timothy H Systems and methods for partitioned nanopore analysis of polymers
EP1954838B1 (en) * 2005-11-14 2014-02-26 Life Technologies Corporation Coded molecules for detecting target analytes
WO2007117832A2 (en) * 2006-03-12 2007-10-18 Applera Corporation Methods of detecting target nucleic acids
CN101495656B (zh) 2006-06-07 2017-02-08 纽约哥伦比亚大学理事会 采用带修饰的核苷酸通过纳米通道进行dna序列测定
CA2684801C (en) 2007-04-04 2017-10-10 The Regents Of The University Of California Compositions, devices, systems, and methods for using a nanopore
US20080268440A1 (en) * 2007-04-26 2008-10-30 Liu Timothy Z Biomolecule immobilization on surface via hydrophobic interactions
GB0717150D0 (en) * 2007-09-04 2007-10-17 Univ Warwick Apparatus and method
EP2321647B1 (en) * 2008-07-17 2013-09-04 IKFE Institut für klinische Forschung und Entwicklung GmbH Biomarkers for insulin resistance and beta-cell dysfunction
US8262879B2 (en) 2008-09-03 2012-09-11 Nabsys, Inc. Devices and methods for determining the length of biopolymers and distances between probes bound thereto
CA2808576A1 (en) * 2009-09-30 2011-04-07 Quantapore, Inc. Ultrafast sequencing of biological polymers using a labeled nanopore
KR101267789B1 (ko) 2010-06-25 2013-06-04 서울대학교산학협력단 나노 포어 구조를 이용한 ｄｎａ 분석용 장치, 분석 방법 및 ｐｃｒ 정량 검출 장치
US9121059B2 (en) 2010-12-22 2015-09-01 Genia Technologies, Inc. Nanopore-based single molecule characterization
US20120316075A1 (en) 2011-03-30 2012-12-13 Noblegen Biosciences, Inc. Sequence preserved dna conversion for optical nanopore sequencing
US9926596B2 (en) * 2011-05-27 2018-03-27 Genapsys, Inc. Systems and methods for genetic and biological analysis
ES2659343T3 (es) 2011-07-20 2018-03-14 The Regents Of The University Of California Dispositivo de poro dual
AU2012288629B2 (en) * 2011-07-25 2017-02-02 Oxford Nanopore Technologies Limited Hairpin loop method for double strand polynucleotide sequencing using transmembrane pores
US20130040827A1 (en) * 2011-08-14 2013-02-14 Stephen C. Macevicz Method and compositions for detecting and sequencing nucleic acids
US20150119259A1 (en) * 2012-06-20 2015-04-30 Jingyue Ju Nucleic acid sequencing by nanopore detection of tag molecules
JP2015528282A (ja) * 2012-08-06 2015-09-28 クワンタムディーエックス・グループ・リミテッド 核酸シークエンシングのための方法およびキット
US20140099726A1 (en) 2012-10-10 2014-04-10 Two Pore Guys, Inc. Device for characterizing polymers
EP2971118B1 (en) 2013-03-15 2019-10-02 The Curators of the University of Missouri Encoded nanopore sensor for multiplex nucleic acids detection
EP2994751B1 (en) 2013-05-06 2018-10-10 Two Pore Guys, Inc. A method of biological target detection using a nanopore and a fusion protein binding agent
US20150011925A1 (en) * 2013-07-08 2015-01-08 Robert F. Buckman, Jr. Method and device for temporary emergency vessel anastomoses
CN107110817B (zh) * 2014-12-31 2019-09-24 卡尤迪生物科技（北京）有限公司 使用纳米孔和标签的核酸分子检测
AU2016271384A1 (en) 2015-06-02 2018-01-18 Nanopore Diagnostics, Llc Nucleic acid detection
WO2018093976A1 (en) 2016-11-16 2018-05-24 Nanopore Diagnostics, Llc Analysis of nucleic acids using probe with non-linear tag

Also Published As

Publication number Publication date
EP3253889A1 (en) 2017-12-13
CN107250380A (zh) 2017-10-13
KR20190127983A (ko) 2019-11-13
RU2017127990A3 (ru) 2019-03-04
WO2016126746A1 (en) 2016-08-11
AU2016215453A1 (en) 2017-08-10
JP2018505414A (ja) 2018-02-22
IL253272A0 (en) 2017-09-03
AU2018208656A1 (en) 2018-08-09
US11098348B2 (en) 2021-08-24
MX2017009766A (es) 2017-12-11
HK1245348A1 (zh) 2018-08-24
AU2020239812A1 (en) 2020-10-29
US20180023115A1 (en) 2018-01-25
CA2973753A1 (en) 2016-08-11
KR20170106487A (ko) 2017-09-20
IL253272B (en) 2018-08-30
JP2019092509A (ja) 2019-06-20
EP3253889A4 (en) 2018-09-26

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2017127990A (ru) Обнаружение посредством нанопоры полинуклеотидов-мишеней из фона образца
JP2019092509A5 (ru)
AU2011279083B2 (en) Nanopore-facilitated single molecule detection of nucleic acids
US20170096704A1 (en) Dna sequencing by nanopore using modified nucleotides
US11274341B2 (en) Assay methods using DNA binding proteins
US10975370B2 (en) Methods for screening nucleic acid aptamers
JP2013540423A5 (ru)
CN107002130A (zh) 多程测序
JPWO2012002541A1 (ja) 標的分子の検出法
US10633698B2 (en) Composition for PCR containing a polyethylene glycol-engrafted nano-sized graphene oxide
Qin et al. Netlike hybridization chain reaction assembly of DNA nanostructures enables exceptional signal amplification for sensing trace cytokines
JP2017500046A (ja) 複製ポリメラーゼおよびヘリカーゼの使用によるナノポア配列決定
CN108753789B (zh) 核酸适配体的筛选方法及特异性结合铜绿假单胞菌的核酸适配体
AU2021202823A1 (en) A method of detecting small rna
Lee et al. A biosensor for the detection of single base mismatches in microRNA
Lee et al. A simple and sensitive detection of small molecule–protein interactions based on terminal protection-mediated exponential strand displacement amplification
KR101438531B1 (ko) 대장균에 특이적으로 결합하는 단일가닥핵산 앱타머 및 이를 이용한 대장균 검출방법
US20150315637A1 (en) Bow tie dna compositions and methods
Schopf et al. Mycobacterium tuberculosis detection via rolling circle amplification
WO2018089978A1 (en) Nucleic acid quantification compositions and methods
WO2016160877A1 (en) Non-enzymatic nucleic acid detection using an oligonucleotide linker with a large cell gap
JP2010517556A5 (ru)
US10934581B2 (en) Bow tie DNA compositions and methods
AU2021107694A4 (en) A method of detecting small rna
WO2021215989A1 (en) Rapid detection of specific genetic sequences using a multi-labelled dna hybrid comprising a reporter strand and an anchor strand

Legal Events

Date Code Title Description
HZ9A Changing address for correspondence with an applicant