RU2016139490A - Высокопроизводительная и высокомультиплексная визуализация при помощи программируемых зондов на основе нуклеиновых кислот - Google Patents
Высокопроизводительная и высокомультиплексная визуализация при помощи программируемых зондов на основе нуклеиновых кислот Download PDFInfo
- Publication number
- RU2016139490A RU2016139490A RU2016139490A RU2016139490A RU2016139490A RU 2016139490 A RU2016139490 A RU 2016139490A RU 2016139490 A RU2016139490 A RU 2016139490A RU 2016139490 A RU2016139490 A RU 2016139490A RU 2016139490 A RU2016139490 A RU 2016139490A
- Authority
- RU
- Russia
- Prior art keywords
- nucleic acids
- labeled
- specific binding
- nucleic acid
- imaging
- Prior art date
Links
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 title claims 48
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 title claims 48
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 title claims 48
- 238000012800 visualization Methods 0.000 title claims 5
- 239000000523 sample Substances 0.000 title 1
- 238000000034 method Methods 0.000 claims 50
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 claims 39
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 claims 21
- 238000003032 molecular docking Methods 0.000 claims 18
- 239000002773 nucleotide Substances 0.000 claims 6
- 125000003729 nucleotide group Chemical group 0.000 claims 6
- IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N Dimethylsulphoxide Chemical compound CS(C)=O IAZDPXIOMUYVGZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 3
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 claims 3
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 claims 3
- 239000013592 cell lysate Substances 0.000 claims 3
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 claims 3
- 238000001218 confocal laser scanning microscopy Methods 0.000 claims 3
- 238000001317 epifluorescence microscopy Methods 0.000 claims 3
- 239000006166 lysate Substances 0.000 claims 3
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 claims 3
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 claims 3
- 238000010791 quenching Methods 0.000 claims 3
- 150000003839 salts Chemical class 0.000 claims 3
- 108091023037 Aptamer Proteins 0.000 claims 2
- ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N Formamide Chemical group NC=O ZHNUHDYFZUAESO-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 2
- 108091034117 Oligonucleotide Proteins 0.000 claims 2
- 239000000412 dendrimer Substances 0.000 claims 2
- 229920000736 dendritic polymer Polymers 0.000 claims 2
- 239000003446 ligand Substances 0.000 claims 2
- 229920000642 polymer Polymers 0.000 claims 2
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims 2
- 230000000171 quenching effect Effects 0.000 claims 2
- 150000003384 small molecules Chemical class 0.000 claims 2
- XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N Urea Chemical compound NC(N)=O XSQUKJJJFZCRTK-UHFFFAOYSA-N 0.000 claims 1
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims 1
- 239000004202 carbamide Substances 0.000 claims 1
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 claims 1
- 239000003398 denaturant Substances 0.000 claims 1
- 230000002779 inactivation Effects 0.000 claims 1
Classifications
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6804—Nucleic acid analysis using immunogens
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
- C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
- C12Q1/6813—Hybridisation assays
- C12Q1/6816—Hybridisation assays characterised by the detection means
- C12Q1/6818—Hybridisation assays characterised by the detection means involving interaction of two or more labels, e.g. resonant energy transfer
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2537/00—Reactions characterised by the reaction format or use of a specific feature
- C12Q2537/10—Reactions characterised by the reaction format or use of a specific feature the purpose or use of
- C12Q2537/143—Multiplexing, i.e. use of multiple primers or probes in a single reaction, usually for simultaneously analyse of multiple analysis
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2563/00—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties
- C12Q2563/179—Nucleic acid detection characterized by the use of physical, structural and functional properties the label being a nucleic acid
-
- C—CHEMISTRY; METALLURGY
- C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
- C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
- C12Q2565/00—Nucleic acid analysis characterised by mode or means of detection
- C12Q2565/60—Detection means characterised by use of a special device
- C12Q2565/601—Detection means characterised by use of a special device being a microscope, e.g. atomic force microscopy [AFM]
Landscapes
- Chemical & Material Sciences (AREA)
- Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
- Organic Chemistry (AREA)
- Health & Medical Sciences (AREA)
- Zoology (AREA)
- Wood Science & Technology (AREA)
- Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
- Engineering & Computer Science (AREA)
- Analytical Chemistry (AREA)
- Immunology (AREA)
- Molecular Biology (AREA)
- Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
- Biotechnology (AREA)
- Biophysics (AREA)
- Physics & Mathematics (AREA)
- Genetics & Genomics (AREA)
- Biochemistry (AREA)
- Microbiology (AREA)
- General Engineering & Computer Science (AREA)
- General Health & Medical Sciences (AREA)
- Pathology (AREA)
- Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
- Investigating, Analyzing Materials By Fluorescence Or Luminescence (AREA)
- Investigating Or Analysing Biological Materials (AREA)
- Investigating Or Analysing Materials By The Use Of Chemical Reactions (AREA)
Claims (74)
1. Способ, включающий
приведение образца, тестируемого на наличие одной или нескольких мишеней, в контакт с одним или несколькими специфичными для мишени партнерами по связыванию, где каждый специфичный для мишени партнер по связыванию соединен с докинг-цепью и где специфичные для мишени партнеры по связыванию с разной специфичностью соединены с разными докинг-цепями,
необязательно удаление несвязанных специфичных для мишени партнеров по связыванию,
приведение образца в контакт с мечеными визуализирующими цепями с нуклеотидной последовательностью, которая комплементарна докинг-цепи,
необязательно удаление несвязанных меченых визуализирующих цепей,
визуализацию образца с целью выявления расположения и количества связанных меченых визуализирующих цепей,
тушение сигнала от связанной меченой визуализирующей цепи и
повторение стадий (3)-(6) каждый раз с меченой визуализирующей цепью с уникальной нуклеотидной последовательностью по отношению ко всем остальным меченым визуализирующим цепям.
2. Способ по п. 1, где на стадии (1) образец приводят в контакт с несколькими специфичными для мишени партнерами по связыванию.
3. Способ по п. 1, где специфичный для мишени партнер по связыванию представляет собой антитело или фрагмент антитела.
4. Способ по п. 1, где меченые визуализирующие цепи мечены идентично.
5. Способ по п. 1, где каждая из меченых визуализирующих цепей содержит отличную от других метку.
6. Способ по п. 1, где меченые визуализирующие цепи представляют собой флуоресцентно меченные визуализирующие цепи.
7. Способ по п. 1, где одна или несколько мишеней представляют собой белки.
8. Способ по п. 1, где образец представляет собой клетку, клеточный лизат или тканевой лизат.
9. Способ по п. 1, где образец визуализируют на стадии (5) с применением конфокальной или эпифлуоресцентной микроскопии.
10. Способ по п. 1, где тушение сигнала на стадии (6) предусматривает фотообесцвечивание.
11. Композиция, содержащая
образец, связанный с несколькими специфичными для мишени партнерами по связыванию, при этом каждый партнер по связыванию связан с докинг-цепью, и
по меньшей мере одну докинг-цепь, стабильно связанную с меченой визуализирующей цепью.
12. Способ, включающий
приведение образца, тестируемого на наличие одной или нескольких мишеней, в контакт с одним или несколькими специфичными для мишени партнерами по связыванию, где каждый специфичный для мишени партнер по связыванию соединен с нуклеиновой кислотой для докинга, и где специфичные для мишени партнеры по связыванию с разной специфичностью соединены с разными нуклеиновыми кислотами для докинга,
необязательно удаление несвязанных специфичных для мишени партнеров по связыванию,
приведение образца в контакт с мечеными визуализирующими нуклеиновыми кислотами с нуклеотидной последовательностью, которая комплементарна нуклеиновой кислоте для докинга,
необязательно удаление несвязанных меченых визуализирующих нуклеиновых кислот,
визуализацию образца с целью выявления расположения и количества связанных меченых визуализирующих нуклеиновых кислот,
удаление связанных меченых визуализирующих нуклеиновых кислот от нуклеиновых кислот для докинга путем изменения температуры и/или условий буфера и
повторение стадий (3)-(6) каждый раз с меченой визуализирующей нуклеиновой кислотой с уникальной нуклеотидной последовательностью по отношению ко всем остальным меченым визуализирующим нуклеиновым кислотам.
13. Способ по п. 12, где на стадии (1) образец приводят в контакт с несколькими специфичными для мишени партнерами по связыванию.
14. Способ по п. 12, где специфичный для мишени партнер по связыванию представляет собой антитело или фрагмент антитела.
15. Способ по п. 12, где специфичный для мишени партнер по связыванию представляет собой природный или сконструированный лиганд, малую молекулу, аптамер, пептид или олигонуклеотид.
16. Способ по п. 12, где меченые визуализирующие нуклеиновые кислоты мечены идентично.
17. Способ по п. 12, где каждая из меченых визуализирующих нуклеиновых кислот содержит отличную от других метку.
18. Способ по п. 12, где меченые визуализирующие нуклеиновые кислоты представляют собой флуоресцентно меченные визуализирующие нуклеиновые кислоты.
19. Способ по п. 12, где одна или несколько мишеней представляют собой белки.
20. Способ по п. 12, где образец представляет собой клетку, клеточный лизат или тканевой лизат.
21. Способ по п. 12, где образец визуализируют на стадии (5) с применением конфокальной или эпифлуоресцентной микроскопии.
22. Способ по п. 12, где меченые визуализирующие нуклеиновые кислоты удаляют от нуклеиновых кислот для докинга путем снижения концентрации соли, добавления денатуранта или повышения температуры.
23. Способ по п. 22, где соль представляет собой соль Mg++.
24. Способ по п. 22, где денатурант представляет собой формамид, мочевину или DMSO.
25. Способ по п. 12, где меченые визуализирующие нуклеиновые кислоты не удаляют от нуклеиновых кислот для докинга путем замещения цепи в присутствии конкурирующей нуклеиновой кислоты.
26. Способ по п. 12, где несвязанная нуклеиновая кислота для докинга является частично двухцепочечной.
27. Способ по п. 12, где несвязанная визуализирующая нуклеиновая кислота является частично двухцепочечной.
28. Способ по п. 12, где визуализирующая нуклеиновая кислота представляет собой молекулярный маяк или имеет вторичную структуру со шпильками.
29. Способ по п. 12, где визуализирующая нуклеиновая кислота представляет собой молекулярный маяк или имеет вторичную структуру со шпильками, которая обладает свойством самогашения.
30. Способ по п. 12, где визуализирующая нуклеиновая кислота представляет собой полудуплекс.
31. Способ по п. 30, где полудуплекс обладает свойством самогашения.
32. Способ по п. 12, где нуклеиновая кислота для докинга имеет вторичную структуру со шпильками.
33. Способ по п. 12, где визуализирующая нуклеиновая кислота связана с несколькими испускающими сигнал компонентами посредством дендримерной структуры или полимерной структуры.
34. Способ, включающий
приведение образца, тестируемого на наличие одной или нескольких мишеней, в контакт с одним или несколькими специфичными для мишени партнерами по связыванию, где каждый специфичный для мишени партнер по связыванию соединен с нуклеиновой кислотой для докинга, и где специфичные для мишени партнеры по связыванию с разной специфичностью соединены с разными нуклеиновыми кислотами для докинга,
необязательно удаление несвязанных специфичных для мишени партнеров по связыванию,
приведение образца в контакт с мечеными визуализирующими нуклеиновыми кислотами с нуклеотидной последовательностью, которая комплементарна нуклеиновой кислоте для докинга,
необязательно удаление несвязанных меченых визуализирующих нуклеиновых кислот,
визуализацию образца с целью выявления расположения и количества связанных меченых визуализирующих нуклеиновых кислот,
инактивацию связанных меченых визуализирующих нуклеиновых кислот путем удаления или модификации их испускающих сигнал компонентов без полного удаления визуализирующей нуклеиновой кислоты и
повторение стадий (3)-(6) каждый раз с мечеными визуализирующими нуклеиновыми кислотами с уникальной нуклеотидной последовательностью по отношению ко всем остальным меченым визуализирующим нуклеиновым кислотам.
35. Способ по п. 34, где на стадии (1) образец приводят в контакт с несколькими специфичными для мишени партнерами по связыванию.
36. Способ по п. 34, где специфичный для мишени партнер по связыванию представляет собой антитело или фрагмент антитела.
37. Способ по п. 34, где специфичный для мишени партнер по связыванию представляет собой природный или сконструированный лиганд, малую молекулу, аптамер, пептид или олигонуклеотид.
38. Способ по п. 34, где меченые визуализирующие нуклеиновые кислоты мечены идентично.
39. Способ по п. 34, где каждая из меченых визуализирующих нуклеиновых кислот содержит отличную от других метку.
40. Способ по п. 34, где меченые визуализирующие нуклеиновые кислоты представляют собой флуоресцентно меченные визуализирующие нуклеиновые кислоты.
41. Способ по п. 34, где одна или несколько мишеней представляют собой белки.
42. Способ по п. 34, где образец представляет собой клетку, клеточный лизат или тканевой лизат.
43. Способ по п. 34, где образец визуализируют на стадии (5) с применением конфокальной или эпифлуоресцентной микроскопии.
44. Способ по п. 34, где несвязанная нуклеиновая кислота для докинга является частично двухцепочечной.
45. Способ по п. 34, где несвязанная визуализирующая нуклеиновая кислота является частично двухцепочечной.
46. Способ по п. 34, где визуализирующая нуклеиновая кислота представляет собой молекулярный маяк или имеет вторичную структуру со шпильками.
47. Способ по п. 34, где визуализирующая нуклеиновая кислота представляет собой молекулярный маяк или имеет вторичную структуру со шпильками, которая обладает свойством самогашения.
48. Способ по п. 34, где визуализирующая нуклеиновая кислота представляет собой полудуплекс.
49. Способ по п. 48, где полудуплекс обладает свойством самогашения.
50. Способ по п. 34, где нуклеиновая кислота для докинга имеет вторичную структуру со шпильками.
51. Способ по п. 34, где визуализирующая нуклеиновая кислота связана с несколькими испускающими сигнал компонентами посредством дендримерной структуры или полимерной структуры.
Applications Claiming Priority (3)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| US201461951461P | 2014-03-11 | 2014-03-11 | |
| US61/951,461 | 2014-03-11 | ||
| PCT/US2015/020034 WO2015138653A1 (en) | 2014-03-11 | 2015-03-11 | High-throughput and highly multiplexed imaging with programmable nucleic acid probes |
Publications (2)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| RU2016139490A true RU2016139490A (ru) | 2018-04-11 |
| RU2662969C2 RU2662969C2 (ru) | 2018-07-31 |
Family
ID=54072381
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| RU2016139490A RU2662969C2 (ru) | 2014-03-11 | 2015-03-11 | Высокопроизводительная и высокомультиплексная визуализация при помощи программируемых зондов на основе нуклеиновых кислот |
Country Status (11)
| Country | Link |
|---|---|
| US (5) | US10294510B2 (ru) |
| EP (4) | EP4245859A3 (ru) |
| JP (3) | JP6757255B2 (ru) |
| KR (2) | KR102313982B1 (ru) |
| CN (2) | CN110004208A (ru) |
| AU (2) | AU2015229406C1 (ru) |
| BR (1) | BR112016018314A2 (ru) |
| CA (1) | CA2932943C (ru) |
| IL (1) | IL246962B (ru) |
| RU (1) | RU2662969C2 (ru) |
| WO (1) | WO2015138653A1 (ru) |
Families Citing this family (35)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| WO2012058638A2 (en) | 2010-10-29 | 2012-05-03 | President And Fellows Of Harvard College | Nucleic acid nanostructure barcode probes |
| CA2919833A1 (en) | 2013-07-30 | 2015-02-05 | President And Fellows Of Harvard College | Quantitative dna-based imaging and super-resolution imaging |
| AU2015229406C1 (en) | 2014-03-11 | 2021-01-07 | President And Fellows Of Harvard College | High-throughput and highly multiplexed imaging with programmable nucleic acid probes |
| US9909167B2 (en) | 2014-06-23 | 2018-03-06 | The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University | On-slide staining by primer extension |
| EP4328322A3 (en) | 2014-07-30 | 2024-05-22 | President and Fellows of Harvard College | Probe library construction |
| US11092606B2 (en) | 2015-08-07 | 2021-08-17 | President And Fellows Of Harvard College | Super resolution imaging of protein-protein interactions |
| WO2017189498A1 (en) * | 2016-04-26 | 2017-11-02 | Ultivue, Inc. | Super-resolution immunofluorescence with diffraction-limited preview |
| WO2017197147A2 (en) * | 2016-05-11 | 2017-11-16 | Atkinson Robert G | Molecular beacon comprising prefabricated components and associated products, processes, and methods of use |
| EP3460474B1 (en) * | 2016-05-19 | 2022-04-06 | Toppan Printing Co., Ltd. | Method and kit for target molecule detection |
| CN109891218A (zh) * | 2016-06-02 | 2019-06-14 | 乌尔蒂维尤股份有限公司 | 促进基于抗体的交换成像的组合物和方法 |
| JP7017554B2 (ja) * | 2016-07-27 | 2022-02-08 | ザ ボード オブ トラスティーズ オブ ザ レランド スタンフォード ジュニア ユニバーシティー | 高度に多重化された蛍光イメージング |
| TW201821609A (zh) * | 2016-08-22 | 2018-06-16 | Nissan Chemical Ind Ltd | 使用ｅ－鈣黏蛋白結合型核酸適體之細胞貼附材料 |
| EP3551765A4 (en) * | 2016-12-09 | 2020-11-11 | Ultivue, Inc. | IMPROVED METHODS FOR MULTIPLEX IMAGING USING LABELED NUCLEIC ACID CONTRAST AGENTS |
| CN117551741A (zh) | 2017-03-31 | 2024-02-13 | 乌尔蒂维尤股份有限公司 | Dna-抗原交换和扩增 |
| WO2018218150A1 (en) | 2017-05-26 | 2018-11-29 | President And Fellows Of Harvard College | Systems and methods for high-throughput image-based screening |
| US11935240B2 (en) | 2017-12-08 | 2024-03-19 | Ultivue, Inc. | Validation methods for multiplexed imaging method |
| US10871485B2 (en) | 2018-04-13 | 2020-12-22 | Rarecyte, Inc. | Kits for labeling of biomarkers and methods of using the same |
| AT521238B1 (de) | 2018-05-09 | 2020-02-15 | Lifetaq Analytics Gmbh | In-situ zellanalyse im zellkultursystem |
| WO2020014036A1 (en) * | 2018-07-09 | 2020-01-16 | Ultivue, Inc. | Methods for multicolor multiplex imaging |
| CN109628556A (zh) * | 2018-11-27 | 2019-04-16 | 山东师范大学 | 基于自催化复制介导的循环信号放大检测人8-羟基鸟嘌呤dna糖基化酶活性的方法 |
| EP3894584A2 (en) * | 2018-12-14 | 2021-10-20 | Ultivue, Inc. | Methods and compositions for sequentially detecting targets |
| EP3903104A4 (en) * | 2018-12-27 | 2022-09-21 | Bio-Rad Laboratories, Inc. | SEQUENCE MULTIPLEX WESTERN BLOT |
| CN111004622B (zh) * | 2019-11-28 | 2023-08-15 | 郑州轻工业大学 | 一种检测多巴胺的高灵敏荧光探针的制备方法及其应用 |
| WO2021138312A1 (en) * | 2019-12-30 | 2021-07-08 | Ultivue, Inc. | Methods for reducing nonspecific interactions on biological samples |
| US20220064698A1 (en) * | 2020-08-26 | 2022-03-03 | Akoya Biosciences, Inc. | Multiplexed imaging reagent compositions and kits |
| CN112014563B (zh) * | 2020-08-27 | 2022-02-15 | 武汉大学 | 直接检测血液中循环肿瘤细胞的分子信标传递纳米探针、其制备方法及应用 |
| JP2023541657A (ja) * | 2020-09-16 | 2023-10-03 | ナノストリング テクノロジーズ，インコーポレイティド | 化学組成物およびその使用方法 |
| GB2603935B (en) | 2021-02-19 | 2023-11-01 | Micrographia Bio Ltd | Method and kits for multiplex fluorescent microscopy |
| US20240255497A1 (en) * | 2021-05-19 | 2024-08-01 | Leica Microsystems Cms Gmbh | Method for analyzing a biological sample or a chemical compound or a chemical element |
| CN113368899B (zh) * | 2021-07-03 | 2022-05-10 | 太原理工大学 | 一种高酸密度拟纤维素酶树脂固体酸催化剂的制备方法 |
| CN113584133B (zh) * | 2021-08-30 | 2024-03-26 | 中国药科大学 | 基于颜色编码与可编程性荧光探针的多重靶标原位检测方法 |
| WO2023235284A1 (en) | 2022-05-31 | 2023-12-07 | Ultivue, Inc. | Methods and systems for removing a histological stain from a sample |
| GB202212055D0 (en) | 2022-08-18 | 2022-10-05 | Micrographia Bio Ltd | Method and kits |
| EP4450971A1 (en) * | 2023-04-21 | 2024-10-23 | Leica Microsystems CMS GmbH | Marker for analysing a biological sample |
| CN117347621B (zh) * | 2023-08-25 | 2024-03-12 | 广东省农业科学院农业生物基因研究中心 | 一种用蛋白模拟抗原-纳米抗体检测黄曲霉毒素b1的方法 |
Family Cites Families (66)
| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| DE4421891C2 (de) | 1994-06-23 | 1996-05-15 | Helmut Prof Dr Med Feucht | Verfahren zum Nachweis von komplementaktivierenden IgG-Antikörpern gegen HLA-DR-Antigene |
| US5491063A (en) * | 1994-09-01 | 1996-02-13 | Hoffmann-La Roche Inc. | Methods for in-solution quenching of fluorescently labeled oligonucleotide probes |
| DE19709348C2 (de) | 1996-05-29 | 1999-07-01 | Schubert Walter Dr Md | Automatisches Multi-Epitop-Ligand-Kartierungsverfahren |
| DE19717904A1 (de) | 1997-04-23 | 1998-10-29 | Diagnostikforschung Inst | Säurelabile und enzymatisch spaltbare Farbstoffkonstrukte zur Diagnostik mit Nahinfrarotlicht und zur Therapie |
| US20100081134A1 (en) | 1997-07-21 | 2010-04-01 | Mirkin Chad A | Bio-barcode based detection of target analytes |
| US6083486A (en) | 1998-05-14 | 2000-07-04 | The General Hospital Corporation | Intramolecularly-quenched near infrared fluorescent probes |
| WO2000003034A2 (en) | 1998-07-10 | 2000-01-20 | Chromagen, Inc. | Novel polycyclic aromatic fluorogenic substrates for hydrolases |
| US6573043B1 (en) | 1998-10-07 | 2003-06-03 | Genentech, Inc. | Tissue analysis and kits therefor |
| US6465193B2 (en) | 1998-12-11 | 2002-10-15 | The Regents Of The University Of California | Targeted molecular bar codes and methods for using the same |
| AU3567900A (en) | 1999-03-30 | 2000-10-16 | Solexa Ltd. | Polynucleotide sequencing |
| CA2382436C (en) | 1999-08-30 | 2011-05-17 | Illumina, Inc. | Methods for improving signal detection from an array |
| AU7537200A (en) | 1999-09-29 | 2001-04-30 | Solexa Ltd. | Polynucleotide sequencing |
| US7534568B2 (en) * | 1999-10-29 | 2009-05-19 | Hologic Inc. | Methods for detection of a target nucleic acid by forming a cleavage structure with a cleavage resistant probe |
| GB0002389D0 (en) | 2000-02-02 | 2000-03-22 | Solexa Ltd | Molecular arrays |
| DE10014685B4 (de) | 2000-03-24 | 2004-07-01 | Schubert, Walter, Dr. | Verfahren zur Identifizierung von zellspezifischen Zielstrukturen |
| US20020142310A1 (en) | 2000-04-07 | 2002-10-03 | Leif Andersson | Variants of the human AMP-activated protein kinase gamma 3 subunit |
| WO2001086296A2 (en) | 2000-05-05 | 2001-11-15 | Agilix Corporation | Highly multiplexed reporter carrier systems |
| WO2001094625A2 (en) | 2000-06-06 | 2001-12-13 | Tm Bioscience Corporation | Capture moieties for nucleic acids and uses thereof |
| US20030044353A1 (en) | 2001-01-05 | 2003-03-06 | Ralph Weissleder | Activatable imaging probes |
| US20050230255A1 (en) | 2001-03-30 | 2005-10-20 | Sumner Lloyd W | Silver destaining method |
| US7219016B2 (en) | 2001-04-20 | 2007-05-15 | Yale University | Systems and methods for automated analysis of cells and tissues |
| US20020173053A1 (en) | 2001-04-27 | 2002-11-21 | Bassam Damaj | Multiple simultaneous antigen detection by immunohistochemistry |
| US20040241688A1 (en) | 2001-07-19 | 2004-12-02 | Cuneyt Bukusoglu | Human tissue specific drug screening procedure |
| US8323903B2 (en) | 2001-10-12 | 2012-12-04 | Life Technologies Corporation | Antibody complexes and methods for immunolabeling |
| WO2003061711A2 (en) | 2002-01-16 | 2003-07-31 | Visen Medical, Inc. | Chromophore probes for optical imaging |
| JP4061401B2 (ja) | 2002-03-07 | 2008-03-19 | 国立大学法人九州大学 | Ｄｎａの自己組織化によるｄｎａナノケージ及びその製造方法、並びにそれを用いたｄｎａナノチューブ、分子キャリアー |
| EP1546380A4 (en) | 2002-05-28 | 2007-02-14 | Us Genomics Inc | METHODS AND APPARATUSES FOR ANALYZING SIMPLE POLYMERS |
| US7122319B2 (en) | 2002-12-18 | 2006-10-17 | Monogram Biosciences, Inc | Multiplexed immunohistochemical assays using molecular tags |
| US20040241776A1 (en) | 2003-05-22 | 2004-12-02 | Agdia, Inc. | Multiplex enzyme-linked immunosorbent assay for detecting multiple analytes |
| US20050064435A1 (en) | 2003-09-24 | 2005-03-24 | Xing Su | Programmable molecular barcodes |
| US20050074781A1 (en) | 2003-10-02 | 2005-04-07 | Herbert von Schroeder | Nucleic acid braided J-probes |
| WO2006012302A2 (en) | 2004-06-28 | 2006-02-02 | Exagen Diagnostics, Inc. | Methods for rna fluorescence in situ hybridization |
| US20060024678A1 (en) | 2004-07-28 | 2006-02-02 | Helicos Biosciences Corporation | Use of single-stranded nucleic acid binding proteins in sequencing |
| JP2008541055A (ja) | 2005-05-03 | 2008-11-20 | アプレラ コーポレイション | 蛍光検出システムおよびそれとともに使用するための色素セット |
| AU2006341607B2 (en) | 2005-05-31 | 2011-03-17 | Applied Biosystems, Llc. | Multiplexed amplification of short nucleic acids |
| US20070048759A1 (en) | 2005-06-10 | 2007-03-01 | Dan Luo | Detection of target molecules with labeled nucleic acid detection molecules |
| US7842793B2 (en) | 2005-06-14 | 2010-11-30 | The California Institute Of Technology | Methods of making nucleic acid nanostructures |
| US20060292616A1 (en) | 2005-06-23 | 2006-12-28 | U.S. Genomics, Inc. | Single molecule miRNA-based disease diagnostic methods |
| US7494776B2 (en) * | 2005-07-07 | 2009-02-24 | Beckman Coulter, Inc. | Labeled complementary oligonucleotides to detect oligonucleotide-linked ligands |
| CA2640385C (en) | 2005-12-23 | 2014-07-15 | Nanostring Technologies, Inc. | Nanoreporters and methods of manufacturing and use thereof |
| WO2007092538A2 (en) | 2006-02-07 | 2007-08-16 | President And Fellows Of Harvard College | Methods for making nucleotide probes for sequencing and synthesis |
| US7838302B2 (en) | 2006-08-07 | 2010-11-23 | President And Fellows Of Harvard College | Sub-diffraction limit image resolution and other imaging techniques |
| US7741045B2 (en) * | 2006-11-16 | 2010-06-22 | General Electric Company | Sequential analysis of biological samples |
| US8305579B2 (en) | 2006-11-16 | 2012-11-06 | Thomas Pirrie Treynor | Sequential analysis of biological samples |
| US20100216978A1 (en) | 2007-04-17 | 2010-08-26 | Dsna-Farber Cancer Institute Inc. | Wireframe nanostructures |
| US20080287668A1 (en) | 2007-05-14 | 2008-11-20 | Tihamer Thomas Toth-Fejel | Nanostructures and methods of making |
| US9217151B2 (en) | 2007-05-16 | 2015-12-22 | California Institute Of Technology | Versatile nucleic acid hairpin motif for programming biomolecular self-assembly pathways |
| EP2216338B1 (en) | 2007-11-19 | 2013-03-20 | Japan Advanced Institute of Science and Technology | Light-responsive artificial nucleotide having photo-crosslinking ability |
| EP4060327A1 (en) | 2007-12-21 | 2022-09-21 | President and Fellows of Harvard College | Sub-diffraction limit image resolution in three dimensions |
| US9340416B2 (en) | 2008-08-13 | 2016-05-17 | California Institute Of Technology | Polynucleotides and related nanoassemblies, structures, arrangements, methods and systems |
| US9677125B2 (en) * | 2009-10-21 | 2017-06-13 | General Electric Company | Detection of plurality of targets in biological samples |
| DE102010049607A1 (de) * | 2009-10-26 | 2011-06-30 | Becker, Claus, Prof., 76470 | Konjugate von Nukleotiden und Methoden zu deren Anwendung |
| US20120004132A1 (en) * | 2010-07-02 | 2012-01-05 | Affymetrix, Inc. | Detection of Nucleic Acids and Proteins |
| US8877438B2 (en) | 2010-07-20 | 2014-11-04 | California Institute Of Technology | Self-assembled polynucleotide structure |
| EP4300100A3 (en) * | 2010-10-14 | 2024-09-04 | Meso Scale Technologies, LLC | Reagent storage in an assay device |
| WO2012058638A2 (en) * | 2010-10-29 | 2012-05-03 | President And Fellows Of Harvard College | Nucleic acid nanostructure barcode probes |
| US20120258881A1 (en) | 2010-11-22 | 2012-10-11 | The University Of Chicago | Methods and/or Use of Oligonucleotide Conjugates for Assays and Microscopy/Imaging Detections |
| US20120178081A1 (en) | 2010-12-31 | 2012-07-12 | Affymetrix. Inc. | Methods of Labeling Cells, Labeled Cells, and uses Thereof |
| US8759036B2 (en) | 2011-03-21 | 2014-06-24 | Affymetrix, Inc. | Methods for synthesizing pools of probes |
| AU2013202354A1 (en) | 2012-06-18 | 2014-01-16 | Speedx Pty Ltd | Target detection and signal amplification |
| WO2014028538A2 (en) * | 2012-08-13 | 2014-02-20 | William Marsh Rice University | Multiplexed in situ molecular analyses and programmable molecular probes for regulated signal amplification |
| CA2889862C (en) | 2012-11-05 | 2021-02-16 | Rubicon Genomics, Inc. | Barcoding nucleic acids |
| AU2014219180A1 (en) | 2013-02-20 | 2015-10-08 | Emory University | Methods of sequencing nucleic acids in mixtures and compositions related thereto |
| CA2901545C (en) | 2013-03-08 | 2019-10-08 | Oxford Nanopore Technologies Limited | Use of spacer elements in a nucleic acid to control movement of a helicase |
| EP3080301A4 (en) | 2013-12-15 | 2017-06-07 | President and Fellows of Harvard College | Methods and compositions relating to optical super-resolution patterning |
| AU2015229406C1 (en) | 2014-03-11 | 2021-01-07 | President And Fellows Of Harvard College | High-throughput and highly multiplexed imaging with programmable nucleic acid probes |
-
2015
- 2015-03-11 AU AU2015229406A patent/AU2015229406C1/en active Active
- 2015-03-11 EP EP23176015.8A patent/EP4245859A3/en active Pending
- 2015-03-11 EP EP22151320.3A patent/EP4030166B1/en active Active
- 2015-03-11 JP JP2016551812A patent/JP6757255B2/ja active Active
- 2015-03-11 EP EP20157624.6A patent/EP3686599B1/en active Active
- 2015-03-11 WO PCT/US2015/020034 patent/WO2015138653A1/en active Application Filing
- 2015-03-11 RU RU2016139490A patent/RU2662969C2/ru active
- 2015-03-11 US US15/108,911 patent/US10294510B2/en active Active
- 2015-03-11 KR KR1020167021588A patent/KR102313982B1/ko active IP Right Grant
- 2015-03-11 CN CN201910186444.1A patent/CN110004208A/zh active Pending
- 2015-03-11 KR KR1020217032767A patent/KR102382892B1/ko active IP Right Grant
- 2015-03-11 EP EP15762370.3A patent/EP3117214B1/en active Active
- 2015-03-11 CN CN201580006969.2A patent/CN105980855B/zh active Active
- 2015-03-11 BR BR112016018314A patent/BR112016018314A2/pt not_active Application Discontinuation
- 2015-03-11 CA CA2932943A patent/CA2932943C/en active Active
-
2016
- 2016-07-26 IL IL246962A patent/IL246962B/en active IP Right Grant
-
2017
- 2017-01-19 US US15/410,700 patent/US9944972B2/en active Active
-
2018
- 2018-03-23 US US15/934,031 patent/US10190151B2/en active Active
-
2019
- 2019-03-18 US US16/357,099 patent/US20190323061A1/en not_active Abandoned
-
2020
- 2020-08-28 JP JP2020144012A patent/JP7264856B2/ja active Active
- 2020-09-24 AU AU2020239730A patent/AU2020239730B2/en active Active
-
2022
- 2022-07-08 US US17/811,486 patent/US20230027974A1/en active Pending
-
2023
- 2023-02-24 JP JP2023027120A patent/JP7520172B2/ja active Active
Also Published As
Similar Documents
| Publication | Publication Date | Title |
|---|---|---|
| RU2016139490A (ru) | Высокопроизводительная и высокомультиплексная визуализация при помощи программируемых зондов на основе нуклеиновых кислот | |
| JP2017509872A5 (ru) | ||
| CA2994958C (en) | Nanoscale imaging of proteins and nucleic acids via expansion microscopy | |
| CN106834295B (zh) | 一种特异识别细菌脂多糖的广谱核酸适配体及其定向筛选方法 | |
| ES2891085T3 (es) | Obtención de imágenes sin microscopio | |
| WO2021051011A1 (en) | Methods and compositions for protein and peptide sequencing | |
| MX2010003724A (es) | Secuenciacion de polimeros de acido nucleico con microscopia electronica. | |
| US20200209229A1 (en) | Sequential multiplex western blotting | |
| RU2013121000A (ru) | Способ идентификации нативных пар фрагментов днк или рнк, присутствующих в одних и тех же живых клетках | |
| CN105122063A (zh) | 通过单分子操作来检测dna修饰和蛋白结合的方法 | |
| BR112022003546A2 (pt) | Método de isolar nucleossomos circulantes | |
| RU2016145448A (ru) | Способ амплификации днк на основе внедрения в цепь | |
| BR112014014307A2 (pt) | métodos e kits para detecção in situ à temperatura ambiente de um ácido nucleico alvo em uma amostra biológica | |
| US11926820B2 (en) | Methods and compositions for protein and peptide sequencing | |
| US20240209378A1 (en) | Methods and compositions for protein and peptide sequencing | |
| US11834756B2 (en) | Methods and compositions for protein and peptide sequencing | |
| US20210102248A1 (en) | Methods and compositions for protein and peptide sequencing | |
| CL2022000126A1 (es) | Polinucleótidos para la amplificación y detección de neisseria gonorrhoeae | |
| JP2017536556A (ja) | 組織タンパク質の高分解画像化 | |
| US10655162B1 (en) | Identification of biomolecular interactions | |
| JP2020516232A (ja) | ライゲーション増幅を使用する分子検出 | |
| WO2014077167A1 (ja) | サルモネラに結合する核酸分子およびその用途 | |
| JP6642859B2 (ja) | コルチゾール分析用センサ、コルチゾール分析方法、ストレス評価試薬、ストレス評価方法、コルチゾール関連疾患の試験試薬、およびコルチゾール関連疾患の罹患可能性を試験する方法 | |
| JP6414907B2 (ja) | そばアレルゲンに結合する核酸分子およびその用途 | |
| JP6347498B2 (ja) | 卵アレルゲンに結合する核酸分子およびその用途 |