RU2016131207A - Детерминанты ответа раковой опухоли на иммунотерапию - Google Patents

Детерминанты ответа раковой опухоли на иммунотерапию Download PDF

Info

Publication number
RU2016131207A
RU2016131207A RU2016131207A RU2016131207A RU2016131207A RU 2016131207 A RU2016131207 A RU 2016131207A RU 2016131207 A RU2016131207 A RU 2016131207A RU 2016131207 A RU2016131207 A RU 2016131207A RU 2016131207 A RU2016131207 A RU 2016131207A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
cancer
subject
neoepitope
modulator
cell
Prior art date
Application number
RU2016131207A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2707530C2 (ru
RU2016131207A3 (ru
Inventor
Тимоти ЧАН
Джедд ВОЛЧОК
ЧАРЕН Александра СНАЙДЕР
Владимир МАКАРОВ
Original Assignee
Мемориал Слоан Кеттеринг Кэнсер Сентер
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Мемориал Слоан Кеттеринг Кэнсер Сентер filed Critical Мемориал Слоан Кеттеринг Кэнсер Сентер
Publication of RU2016131207A publication Critical patent/RU2016131207A/ru
Publication of RU2016131207A3 publication Critical patent/RU2016131207A3/ru
Application granted granted Critical
Publication of RU2707530C2 publication Critical patent/RU2707530C2/ru

Links

Classifications

    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61P—SPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00—Antineoplastic agents
    • A61P35/02—Antineoplastic agents specific for leukemia
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2803—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily
    • C07K16/2818—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against the immunoglobulin superfamily against CD28 or CD152
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K16/00—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies
    • C07K16/18—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans
    • C07K16/28—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants
    • C07K16/2896—Immunoglobulins [IGs], e.g. monoclonal or polyclonal antibodies against material from animals or humans against receptors, cell surface antigens or cell surface determinants against molecules with a "CD"-designation, not provided for elsewhere
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6806—Preparing nucleic acids for analysis, e.g. for polymerase chain reaction [PCR] assay
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68—Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6881—Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for tissue or cell typing, e.g. human leukocyte antigen [HLA] probes
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407—Specifically defined cancers
    • G01N33/57423—Specifically defined cancers of lung
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/53—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor
    • G01N33/574—Immunoassay; Biospecific binding assay; Materials therefor for cancer
    • G01N33/57407—Specifically defined cancers
    • G01N33/5743—Specifically defined cancers of skin, e.g. melanoma
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/505—Medicinal preparations containing antigens or antibodies comprising antibodies
    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A61—MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61K—PREPARATIONS FOR MEDICAL, DENTAL OR TOILETRY PURPOSES
    • A61K39/00—Medicinal preparations containing antigens or antibodies
    • A61K2039/55—Medicinal preparations containing antigens or antibodies characterised by the host/recipient, e.g. newborn with maternal antibodies
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/20—Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin
    • C07K2317/21—Immunoglobulins specific features characterized by taxonomic origin from primates, e.g. man
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K2317/00—Immunoglobulins specific features
    • C07K2317/70—Immunoglobulins specific features characterized by effect upon binding to a cell or to an antigen
    • C07K2317/76—Antagonist effect on antigen, e.g. neutralization or inhibition of binding
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/106—Pharmacogenomics, i.e. genetic variability in individual responses to drugs and drug metabolism
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12Q—MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q2600/00—Oligonucleotides characterized by their use
    • C12Q2600/156—Polymorphic or mutational markers
    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N2800/00—Detection or diagnosis of diseases
    • G01N2800/52—Predicting or monitoring the response to treatment, e.g. for selection of therapy based on assay results in personalised medicine; Prognosis

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Hospice & Palliative Care (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Medicines That Contain Protein Lipid Enzymes And Other Medicines (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)

Claims (58)

1. Способ, включающий этапы:
обнаружения соматической мутации в раковом образце от субъекта; и
определения субъекта как кандидата на лечение модулятором иммунной контрольной точки.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что этап обнаружения включает секвенирование одного или более экзомов из ракового образца.
3. Способ по п. 1, отличающийся тем, что соматическая мутация включает неоэпитоп, распознаваемый Т-клеткой.
4. Способ по п. 2, отличающийся тем, что неоэпитоп обладает большей аффинностью связывания с молекулой главного комплекса гистосовместимости (МНС) по сравнению с соответствующим эпитопом, который не имеет мутации.
5. Способ по п. 1, отличающийся тем, что соматическая мутация включает неоэпитоп, содержащий тетрамер, который не экспрессируется в том же типе клеток, которые не имеют соматической мутации.
6. Способ по п. 5, отличающийся тем, что неоэпитоп имеет общую консенсусную последовательность с инфекционным агентом.
7. Способ по п. 5, отличающийся тем, что тетрамер представляет собой последовательность, выбранную из представленных в Таблице 1.
8. Способ по п. 1, отличающийся тем, что рак представляет собой или включает меланому.
9. Способ по п. 1, отличающийся тем, что модулятор иммунной контрольной точки взаимодействует с цитотоксическим Т-лимфоцитарным антигеном 4 (CTLA4), программирующим гибель 1 (PD-1), или его лигандами, геном активации лимфоцитов-3 (LAG3), В7-гомологом 3 (В7-Н3), В7-гомологом 4 (В7-Н4), индоламин (2,3)-диоксигеназой (IDO), аденозиновым рецептором А2а, неуритином, аттенюатором В- и Т-лимфоцита (BTLA), иммуноглобулиноподобным рецептором-киллером (KIR), Т-клеточным иммуноглобулином и содержащим муциновый домен белком 3 (TIM-3), индуцируемым Т-клеточным костимулятором (ICOS), CD27, CD28, CD40, CD137 или их комбинациями.
10. Способ по п. 1, отличающийся тем, что модулятор иммунной контрольной точки представляет собой антительный агент.
11. Способ по п. 10, отличающийся тем, что антительный агент представляет собой или содержит моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент.
12. Способ по п. 11, отличающийся тем, что антитело представляет собой ипилумимаб.
13. Способ по п. 1, отличающийся тем, что субъект ранее не получал терапию против рака.
14. Способ по п. 1, отличающийся тем, что субъект ранее не получал иммунотерапию против рака.
15. Способ по п. 12, дополнительно включающий этап введения субъекту ипилумимаба.
16. Способ, включающий этапы:
обнаружения соматической мутации в раковом образце от субъекта; и
определения субъекта как несоответствующего кандидата на лечение модулятором иммунной контрольной точки.
17. Способ по п. 16, отличающийся тем, что субъект определяется как таковой, у которого может развиться одно или более аутоиммунных осложнений при лечении модулятором иммунной контрольной точки.
18. Способ по п. 17, отличающийся тем, что аутоиммунное осложнение представляет собой гипотиреоз.
19. Способ, включающий этапы:
определения того, имеет ли субъект рак, содержащий соматическую мутацию, причем такую соматическую мутацию, которая включает неоэпитоп, содержащий тетрамер согласно Таблице 1, и
выбора для субъекта способа лечения рака с применением модулятора иммунной контрольной точки.
20. Способ по п. 19, отличающийся тем, что рак включает меланому.
21. Способ по п. 19, отличающийся тем, что модулятор иммунной контрольной точки взаимодействует с цитотоксическим Т-лимфоцитарным антигеном 4 (CTLA4), программирующим гибель 1 (PD-1), или его лигандами, геном активации лимфоцитов-3 (LAG3), В7-гомологом 3 (В7-Н3), В7-гомологом 4 (В7-Н4), индоламин (2,3)-диоксигеназой (IDO), аденозиновым рецептором А2а, неуритином, аттенюатором В- и Т-лимфоцита (BTLA), иммуноглобулиноподобным рецептором-киллером (KIR), Т-клеточным иммуноглобулином и содержащим муциновымй домен белком 3 (TIM-3), индуцируемым Т-клеточным костимулятором (ICOS), CD27, CD28, CD40, CD137 или их комбинациями.
22. Способ по п. 21, отличающийся тем, что модулятор иммунной контрольной точки представляет собой антительный агент.
23. Способ по п. 22, отличающийся тем, что антительный агент представляет собой или содержит моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент.
24. Способ по п. 23, отличающийся тем, что антитело представляет собой ипилумимаб.
25. Способ по п. 19, отличающийся тем, что субъект ранее не получал терапию против рака.
26. Способ по п. 19, отличающийся тем, что субъект ранее не получал иммунотерапию против рака.
27. Способ лечения субъекта модулятором иммунной контрольной точки, отличающийся тем, что у субъекта ранее был диагностирован рак с одной или более соматическими мутациями, при этом одна или более соматических мутаций содержат неоэпитоп, распознаваемый Т-клеткой.
28. Способ по п. 27, отличающийся тем, что рак включает меланому.
29. Способ по п. 27, отличающийся тем, что модулятор иммунной контрольной точки взаимодействует с цитотоксическим Т-лимфоцитарным антигеном 4 (CTLA4), программирующим гибель 1 (PD-1), или его лигандами, геном активации лимфоцитов-3 (LAG3), В7-гомологом 3 (В7-Н3), В7-гомологом 4 (В7-Н4), индоламин (2,3)-диоксигеназой (IDO), аденозиновым рецептором А2а, неуритином, аттенюатором В- и Т-лимфоцита (BTLA), иммуноглобулиноподобным рецептором-киллером (KIR), Т-клеточным иммуноглобулином и одержащим муциновый домен белком 3 (TIM-3), индуцируемым Т-клеточным костимулятором (ICOS), CD27, CD28, CD40, CD137 или их комбинациями.
30. Способ по п. 27, отличающийся тем, что модулятор иммунной контрольной точки представляет собой антительный агент.
31. Способ по п. 30, отличающийся тем, что антительный агент представляет собой или содержит моноклональное антитело или его антигенсвязывающий фрагмент.
32. Способ по п. 31, отличающийся тем, что антитело представляет собой ипилумимаб.
33. Способ по п. 27, отличающийся тем, что субъект ранее не получал терапию против рака.
34. Способ по п. 27, отличающийся тем, что субъект ранее не получал иммунотерапию против рака.
35. Способ повышения эффективности лечения рака с применением модулятора иммунной контрольной точки, включающий этап:
выбора реципиента для получения терапии, у которого диагностирован рак с одной или более соматическими мутациями, включающими неоэпитоп, распознаваемый Т-клеткой.
36. Способ лечения рака с применением модулятора иммунной контрольной точки, при этом усовершенствование включает:
назначение терапии субъекту, у которого диагностирован рак с одной или более соматическими мутациями, включающими неоэпитоп, распознаваемый Т-клеткой.
37. Способ лечения рака, выбранного из группы, состоящей из карциномы, саркомы, миеломы, лейкоза или лимфомы, причем указанный способ включает этап:
назначения терапии с применением модулятора иммунной контрольной точки субъекту, у которого диагностирован рак с одной или более соматическими мутациями, включающими неоэпитоп, распознаваемый Т-клеткой.
38. Способ по п. 37, отличающийся тем, что рак представляет собой или включает меланому.
39. Способ определения профиля ответа на терапию модулятором иммунной контрольной точки, причем указанный способ включает этапы:
сравнения информации о генетической последовательности из первого множества опухолевых образцов, при этом первое множество содержит образцы, которые имеют общие характеристики ответа на терапию модулятором иммунной контрольной точки, с полученной информацией из второго множества опухолевых образцов, при этом второе множество содержит образцы, которые не имеют общих характеристик ответа, но в остальном сопоставимы с таковыми из первого набора, вследствие чего сравнение определяет элементы генетической последовательности, присутствие которых ассоциировано или коррелирует с общей характеристикой ответа; и
определения того, какие из указанных генетических элементов последовательности формируют неоэпитоп; а также
определения наличия неоэпитопа в качестве профиля для общей характеристики ответа.
40. Способ по п. 39, дополнительно включающий этап:
определения того, какие из неоэпитопов изменяют силу связывания пептида с молекулами МНС,
при этом этап определения наличия неоэпитопа в качестве профиля для общей характеристики ответа включает определение в качестве профиля по меньшей мере одного из неоэпитопов, определенного таким, что он изменеют силу связывания пептида с молекулами МНС.
41. Способ по п. 40, отличающийся тем, что этап определения наличия неоэпитопа в качестве профиля для общей характеристики ответа включает определение в качестве профиля набора неоэпитопов, определенных такими, что они изменяют силу связывания пептида с молекулами МНС.
42. Способ по любому из пп. 39-41, отличающийся тем, что неоэпитоп представляет собой или содержит тетрамер.
43. Способ по п. 42, отличающийся тем, что неоэпитоп представляет собой или содержит тетрамер, указанный в Таблице 1.
44. Способ по п. 42, отличающийся тем, что набор неоэпитопов содержит или состоит из множества неоэпитопов, указанных в Таблице 1.
RU2016131207A 2014-01-02 2014-12-23 Детерминанты ответа раковой опухоли на иммунотерапию RU2707530C2 (ru)

Applications Claiming Priority (7)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201461923183P 2014-01-02 2014-01-02
US61/923,183 2014-01-02
US201462066034P 2014-10-20 2014-10-20
US62/066,034 2014-10-20
US201462072893P 2014-10-30 2014-10-30
US62/072,893 2014-10-30
PCT/US2014/072125 WO2015103037A2 (en) 2014-01-02 2014-12-23 Determinants of cancer response to immunotherapy

Publications (3)

Publication Number Publication Date
RU2016131207A true RU2016131207A (ru) 2018-02-07
RU2016131207A3 RU2016131207A3 (ru) 2018-06-22
RU2707530C2 RU2707530C2 (ru) 2019-11-27

Family

ID=53494217

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016131207A RU2707530C2 (ru) 2014-01-02 2014-12-23 Детерминанты ответа раковой опухоли на иммунотерапию

Country Status (15)

Country Link
US (1) US20160326597A1 (ru)
EP (1) EP3090066A4 (ru)
JP (1) JP2017504324A (ru)
KR (1) KR20160102314A (ru)
CN (1) CN106164289A (ru)
AU (1) AU2014374020A1 (ru)
BR (1) BR112016015399A2 (ru)
CA (1) CA2935214A1 (ru)
CL (1) CL2016001708A1 (ru)
MX (1) MX2016008771A (ru)
PE (1) PE20161344A1 (ru)
PH (1) PH12016501329A1 (ru)
RU (1) RU2707530C2 (ru)
SG (2) SG11201605432RA (ru)
WO (1) WO2015103037A2 (ru)

Families Citing this family (59)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US9732131B2 (en) 2006-02-27 2017-08-15 Calviri, Inc. Identification and use of novopeptides for the treatment of cancer
KR20220054710A (ko) 2014-11-13 2022-05-03 더 존스 홉킨스 유니버시티 관문 차단 및 미소부수체 불안정성
MA40737A (fr) * 2014-11-21 2017-07-04 Memorial Sloan Kettering Cancer Center Déterminants de la réponse d'un cancer à une immunothérapie par blocage de pd-1
US20180133327A1 (en) * 2015-03-16 2018-05-17 Amal Therapeutics Sa Cell Penetrating Peptides and Complexes Comprising the Same
CA2987730C (en) 2015-04-08 2020-02-18 Nantomics, Llc Cancer neoepitopes
CN108513593A (zh) * 2015-04-23 2018-09-07 南托米克斯有限责任公司 癌症新表位
MA42420A (fr) 2015-05-13 2018-05-23 Agenus Inc Vaccins pour le traitement et la prévention du cancer
GB201516047D0 (en) * 2015-09-10 2015-10-28 Cancer Rec Tech Ltd Method
CN108604257B (zh) * 2015-10-12 2022-12-13 南托米克斯有限责任公司 产生特异性免疫治疗组合物及其相关核酸构建体的方法
US11623001B2 (en) * 2015-10-12 2023-04-11 Nantomics, Llc Compositions and methods for viral cancer neoepitopes
US11626187B2 (en) 2015-10-12 2023-04-11 Nantomics Llc Systems, compositions, and methods for discovery of MSI and neoepitopes that predict sensitivity to checkpoint inhibitors
EP3719143B1 (en) * 2015-10-23 2023-07-26 Novartis AG Method of deriving a value for percent biomarker positivity for selected cells present in a field of view
TWI733719B (zh) 2015-12-07 2021-07-21 美商河谷控股Ｉｐ有限責任公司 改善的組合物及用於新表位之病毒遞送的方法及其應用
SG11201804957VA (en) 2015-12-16 2018-07-30 Gritstone Oncology Inc Neoantigen identification, manufacture, and use
WO2017118702A1 (en) * 2016-01-08 2017-07-13 Vaccibody As Neoepitope rna cancer vaccine
KR20180107257A (ko) 2016-02-19 2018-10-01 난트 홀딩스 아이피, 엘엘씨 면역원 조절 방법 (methods of immunogenic modulation)
CN114395624A (zh) 2016-02-29 2022-04-26 基因泰克公司 用于癌症的治疗和诊断方法
WO2017151517A1 (en) * 2016-02-29 2017-09-08 Foundation Medicine, Inc. Methods of treating cancer
CN109072227A (zh) * 2016-03-15 2018-12-21 组库创世纪株式会社 用于免疫治疗的监测和诊断及治疗剂的设计
HRP20240510T1 (hr) * 2016-03-16 2024-07-05 Amal Therapeutics Sa Kombinacija modulatora imunosne kontrolne točke i kompleksa koji sadrži peptid koji prodire u stanicu, teretni i tlr peptidni agonist za uporabu u medicini
EP3468600A4 (en) * 2016-06-10 2019-11-13 IO Therapeutics, Inc. RETINOID COMPOUNDS AND RELECTIVE REXINOIDS OF THE RECEPTOR AND IMMUNE MODULATORS FOR IMMUNOTHERAPY OF CANCER
US20190247435A1 (en) * 2016-06-29 2019-08-15 The Johns Hopkins University Neoantigens as targets for immunotherapy
CA3031170A1 (en) 2016-09-21 2018-03-29 Amal Therapeutics Sa Fusion comprising a cell penetrating peptide, a multi epitope and a tlr peptide agonist for treatment of cancer
EP3516081A4 (en) * 2016-09-23 2020-07-29 Memorial Sloan Kettering Cancer Center DETERMINANTS OF CANCER REACTION TO IMMUNOTHERAPY
CA3038712A1 (en) * 2016-10-06 2018-04-12 Genentech, Inc. Therapeutic and diagnostic methods for cancer
AU2017367696A1 (en) 2016-12-01 2019-06-20 Nant Holdings Ip, Llc Tumor antigenicity processing and presentation
WO2018112449A2 (en) 2016-12-16 2018-06-21 Nant Holdings Ip, Llc Live cell imaging systems and methods to validate triggering of immune response
WO2018132753A1 (en) * 2017-01-13 2018-07-19 Nantbio, Inc. Validation of neoepitope-based treatment
US20200232040A1 (en) 2017-01-18 2020-07-23 Vinod P. Balachandran Neoantigens and uses thereof for treating cancer
WO2018146128A1 (en) * 2017-02-07 2018-08-16 INSERM (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale) Detection of kit polymorphism for predicting the response to checkpoint blockade cancer immunotherapy
CN110431238A (zh) * 2017-03-17 2019-11-08 南托米克斯有限责任公司 cfRNA的液体活检
JP7458188B2 (ja) * 2017-03-31 2024-03-29 ブリストル－マイヤーズ スクイブ カンパニー 腫瘍を処置する方法
EP3631471A4 (en) 2017-05-30 2021-06-30 Nant Holdings IP, LLC ENRICHMENT OF CIRCULATING TUMOR CELLS USING NEO-EPITOPIA
WO2018223092A1 (en) 2017-06-02 2018-12-06 Arizona Board Of Regents On Behalf Of Arizona State University A method to create personalized cancer vaccines
GB201710815D0 (en) * 2017-07-05 2017-08-16 Francis Crick Inst Ltd Method
US12025615B2 (en) 2017-09-15 2024-07-02 Arizona Board Of Regents On Behalf Of Arizona State University Methods of classifying response to immunotherapy for cancer
CN111432837A (zh) * 2017-09-25 2020-07-17 纪念斯隆凯特琳癌症中心 肿瘤突变负荷和检查点免疫疗法
JP7227237B2 (ja) 2017-10-10 2023-02-21 グリットストーン バイオ インコーポレイテッド ホットスポットを利用した新生抗原の特定
CN111247169A (zh) 2017-10-15 2020-06-05 百时美施贵宝公司 治疗肿瘤的方法
WO2019090156A1 (en) 2017-11-03 2019-05-09 Guardant Health, Inc. Normalizing tumor mutation burden
WO2019094692A2 (en) * 2017-11-09 2019-05-16 The Trustees Of The University Of Pennsylvania Extracellular vesicle proteins and their use for cancer diagnosis, predicting response to therapy, and treatment
CN111630602A (zh) 2017-11-22 2020-09-04 磨石肿瘤生物技术公司 减少新抗原的接合表位呈递
CA3067229A1 (en) * 2017-12-01 2019-06-06 Illumina, Inc. Methods and systems for determining somatic mutation clonality
CN108009400B (zh) * 2018-01-11 2018-07-06 至本医疗科技（上海）有限公司 全基因组肿瘤突变负荷预测方法、设备以及存储介质
US11414698B2 (en) * 2018-03-22 2022-08-16 Chang Gung Medical Foundation Chang Gung Memorial Hospital At Chiayi Method of quantifying mutant allele burden of target gene
MA52363A (fr) 2018-04-26 2021-03-03 Agenus Inc Compositions peptidiques de liaison à une protéine de choc thermique (hsp) et leurs méthodes d'utilisation
KR20210038577A (ko) 2018-07-23 2021-04-07 가던트 헬쓰, 인크. 종양 분율 및 커버리지에 의해 종양 돌연변이 부담을 조정하기 위한 방법 및 시스템
AU2019328344A1 (en) 2018-08-31 2021-04-08 Guardant Health, Inc. Microsatellite instability detection in cell-free DNA
CN109371005B (zh) * 2018-11-12 2022-09-30 上海市东方医院（同济大学附属东方医院） 一种hla-0201限制性padi4表位多肽及其应用
JP2022514218A (ja) * 2018-12-12 2022-02-10 メディミューン，エルエルシー 血液に基づく腫瘍遺伝子変異量が、非小細胞肺がんの全生存期間の予測に役立つ
JP2022515416A (ja) * 2018-12-21 2022-02-18 エージェンシー フォー サイエンス，テクノロジー アンド リサーチ 免疫チェックポイント阻害療法からの利益を予測する方法
EP3947739A1 (en) * 2019-04-05 2022-02-09 Illumina, Inc. Quantitative score of hla diversity
WO2021067550A1 (en) 2019-10-02 2021-04-08 Arizona Board Of Regents On Behalf Of Arizona State University Methods and compositions for identifying neoantigens for use in treating and preventing cancer
NL2024107B1 (en) * 2019-10-26 2021-07-19 Vitroscan B V Compositions for Patient Specific Immunotherapy
CN111088349B (zh) * 2020-02-14 2023-04-28 深圳市宝安区妇幼保健院 Kir3dl1基因分型引物组及其应用
GB202007099D0 (en) 2020-05-14 2020-07-01 Kymab Ltd Tumour biomarkers for immunotherapy
US20240192195A1 (en) * 2021-04-10 2024-06-13 H. Lee Moffitt Cancer Center And Research Institute, Inc. A multiomic approach to modeling of gene regulatory networks in multiple myeloma
WO2023025404A1 (en) 2021-08-24 2023-03-02 BioNTech SE In vitro transcription technologies
WO2024083345A1 (en) 2022-10-21 2024-04-25 BioNTech SE Methods and uses associated with liquid compositions

Family Cites Families (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
GB9826143D0 (en) * 1998-11-27 1999-01-20 Ludwig Inst Cancer Res Tumour rejection antigens
US9222938B2 (en) * 2001-12-04 2015-12-29 Michael Tainsky Neoepitope detection of disease using protein arrays
CN101072578A (zh) * 2004-10-29 2007-11-14 南加州大学 用共刺激分子的联合癌症免疫疗法
WO2008109075A2 (en) * 2007-03-05 2008-09-12 Bristol-Myers Squibb Company Biomarkers and methods for determining sensitivity to ctla-4 antagonists
CN103180730B (zh) * 2010-05-14 2016-03-02 综合医院公司 鉴定肿瘤特异性新抗原的组合物和方法
GB201103955D0 (en) * 2011-03-09 2011-04-20 Antitope Ltd Antibodies
WO2012159643A1 (en) * 2011-05-24 2012-11-29 Biontech Ag Individualized vaccines for cancer

Also Published As

Publication number Publication date
SG11201605432RA (en) 2016-07-28
EP3090066A4 (en) 2017-08-30
RU2707530C2 (ru) 2019-11-27
AU2014374020A1 (en) 2016-08-18
BR112016015399A2 (pt) 2017-10-24
SG10201805674YA (en) 2018-08-30
PH12016501329A1 (en) 2016-10-03
PE20161344A1 (es) 2016-12-23
KR20160102314A (ko) 2016-08-29
WO2015103037A3 (en) 2015-11-05
CL2016001708A1 (es) 2017-03-17
CA2935214A1 (en) 2015-07-09
CN106164289A (zh) 2016-11-23
EP3090066A2 (en) 2016-11-09
US20160326597A1 (en) 2016-11-10
MX2016008771A (es) 2016-12-20
JP2017504324A (ja) 2017-02-09
WO2015103037A2 (en) 2015-07-09
RU2016131207A3 (ru) 2018-06-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2016131207A (ru) Детерминанты ответа раковой опухоли на иммунотерапию
JP2017504324A5 (ru)
Topalian et al. Mechanism-driven biomarkers to guide immune checkpoint blockade in cancer therapy
WO2019005641A1 (en) GUIDING AND NAVIGATION CONTROL PROTEINS AND METHODS OF PRODUCTION AND USE THEREOF
WO2016081947A4 (en) Determinants of cancer response to immunotherapy by pd-1 blockade
US12029761B2 (en) Guidance and Navigation Control proteins and method of making and using thereof
JP2018502828A5 (ru)
Yang et al. Advancing CAR T cell therapy through the use of multidimensional omics data
RU2018107802A (ru) Полностью человеческие антитела к мезотелину и иммунные эффекторные клетки, нацеленные на мезотелин
JP2018522564A5 (ru)
Chen et al. Characterization of a soluble B7-H3 (sB7-H3) spliced from the intron and analysis of sB7-H3 in the sera of patients with hepatocellular carcinoma
Munhoz et al. Recent advances in understanding antitumor immunity
RU2018140694A (ru) ХИМЕРНЫЙ АНТИГЕННЫЙ РЕЦЕПТОР (CAR) С АНТИГЕНСВЯЗЫВАЮЩИМИ ДОМЕНАМИ К КОНСТАНТНОЙ ОБЛАСТИ β Т-КЛЕТОЧНОГО РЕЦЕПТОРА
JP2018524973A5 (ru)
Marotte et al. Increased antitumor efficacy of PD-1-deficient melanoma-specific human lymphocytes
Ye et al. High-throughput sequencing of the immune repertoire in oncology: applications for clinical diagnosis, monitoring, and immunotherapies
de Silva et al. CD40 enhances type I interferon responses downstream of CD47 blockade, bridging innate and adaptive immunity
CA2990520C (en) Methods for detecting tissue infiltrating nk cells
WO2019224385A2 (en) Combined bispecific antibody and immuno-oncology therapies
JP2021520209A (ja) 癌患者における腫瘍抗原を検出するための診断アッセイ
Bockorny et al. The emerging role of immunotherapy in gastric and esophageal adenocarcinoma
Lipinski et al. NKp46‐specific single domain antibodies enable facile engineering of various potent NK cell engager formats
Kurosawa et al. High throughput development of TCR-mimic antibody that targets survivin-2B80-88/HLA-A* A24 and its application in a bispecific T-cell engager
Goebeler et al. Bispecific and multispecific antibodies in oncology: opportunities and challenges
JP7307424B2 (ja) 腫瘍浸潤ｔ細胞受容体レパトアの解析方法および該解析方法を用いたがん治療処置の有効性の判定方法

Legal Events

Date Code Title Description
MM4A The patent is invalid due to non-payment of fees

Effective date: 20201224