RU2016110827A - Эффективная немейотическая интрогрессия аллелей - Google Patents

Эффективная немейотическая интрогрессия аллелей Download PDF

Info

Publication number
RU2016110827A
RU2016110827A RU2016110827A RU2016110827A RU2016110827A RU 2016110827 A RU2016110827 A RU 2016110827A RU 2016110827 A RU2016110827 A RU 2016110827A RU 2016110827 A RU2016110827 A RU 2016110827A RU 2016110827 A RU2016110827 A RU 2016110827A
Authority
RU
Russia
Prior art keywords
sequence
matrix
ngr
cell
dna
Prior art date
Application number
RU2016110827A
Other languages
English (en)
Other versions
RU2016110827A3 (ru
Inventor
Дэниел Ф. Карлсон
Скотт К. Фаренкруг
Original Assignee
Рекомбинетикс, Инк.
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Рекомбинетикс, Инк. filed Critical Рекомбинетикс, Инк.
Publication of RU2016110827A publication Critical patent/RU2016110827A/ru
Publication of RU2016110827A3 publication Critical patent/RU2016110827A3/ru

Links

Classifications

    • A—HUMAN NECESSITIES
    • A01—AGRICULTURE; FORESTRY; ANIMAL HUSBANDRY; HUNTING; TRAPPING; FISHING
    • A01K—ANIMAL HUSBANDRY; AVICULTURE; APICULTURE; PISCICULTURE; FISHING; REARING OR BREEDING ANIMALS, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR; NEW BREEDS OF ANIMALS
    • A01K67/00—Rearing or breeding animals, not otherwise provided for; New or modified breeds of animals
    • A01K67/027—New or modified breeds of vertebrates
    • A01K67/0275—Genetically modified vertebrates, e.g. transgenic
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/46—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates
    • C07K14/47—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans from vertebrates from mammals
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C07—ORGANIC CHEMISTRY
    • C07K—PEPTIDES
    • C07K14/00—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/435—Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof from animals; from humans
    • C07K14/705—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants
    • C07K14/715—Receptors; Cell surface antigens; Cell surface determinants for cytokines; for lymphokines; for interferons
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63—Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • C12N15/85—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells
    • C12N15/8509—Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts for animal cells for producing genetically modified animals, e.g. transgenic
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/873—Techniques for producing new embryos, e.g. nuclear transfer, manipulation of totipotent cells or production of chimeric embryos
    • C12N15/877—Techniques for producing new mammalian cloned embryos
    • C12N15/8771—Bovine embryos
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/873—Techniques for producing new embryos, e.g. nuclear transfer, manipulation of totipotent cells or production of chimeric embryos
    • C12N15/877—Techniques for producing new mammalian cloned embryos
    • C12N15/8778—Swine embryos
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00—Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09—Recombinant DNA-technology
    • C12N15/87—Introduction of foreign genetic material using processes not otherwise provided for, e.g. co-transformation
    • C12N15/90—Stable introduction of foreign DNA into chromosome
    • C12N15/902—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination
    • C12N15/907—Stable introduction of foreign DNA into chromosome using homologous recombination in mammalian cells
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2750/00—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA ssDNA viruses
    • C12N2750/00011—Details
    • C12N2750/14011—Parvoviridae
    • C12N2750/14111—Dependovirus, e.g. adenoassociated viruses
    • C12N2750/14141—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector
    • C12N2750/14143—Use of virus, viral particle or viral elements as a vector viral genome or elements thereof as genetic vector
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2800/00—Nucleic acids vectors
    • C12N2800/30—Vector systems comprising sequences for excision in presence of a recombinase, e.g. loxP or FRT
    • C—CHEMISTRY; METALLURGY
    • C12—BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12N—MICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N2800/00—Nucleic acids vectors
    • C12N2800/90—Vectors containing a transposable element

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • Zoology (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Wood Science & Technology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • General Engineering & Computer Science (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Developmental Biology & Embryology (AREA)
  • Plant Pathology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Environmental Sciences (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Toxicology (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Mycology (AREA)
  • Animal Husbandry (AREA)
  • Biodiversity & Conservation Biology (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Enzymes And Modification Thereof (AREA)

Claims (31)

1. Способ направляемой гомологией репарации для интрогрессии экзогенного аллеля в хромосомную ДНК клетки, включающий введение нацеленной системы эндонуклеаз и матрицы для направляемой гомологией репарации (НГР-матрицы), которая содержит экзогенный аллель, в клетку, с нацеленной системой нуклеаз, содержащей ДНК-связывающий член для специфического связывания эндогенной родственной последовательности в хромосомной ДНК, где нацеленная система нуклеаз и НГР-матрица действуют с целью внесения изменений в хромосомную ДНК для ее идентичности последовательности НГР-матрицы, чтобы провести интрогрессию экзогенного аллеля в хромосомную ДНК вместо эндогенного аллеля, с нацеленной системой эндонуклеаз и/или НГР-матрицей, содержащей признак, снижающий специфическое связывание нацеленной системы эндонуклеаз с ДНК.
2. Способ по п. 1, отличающийся тем, что признак, снижающий специфическое связывание, включает несовпадение в последовательности ДНК-связывающего члена относительно эндогенной родственной последовательности и/или несовпадение в последовательности ДНК-связывающего члена относительно последовательности НГР-матрицы.
3. Способ по п. 2, отличающийся тем, что нацеленная система эндонуклеаз содержит множество последовательностей TAL-эффекторных повторов, которые слиты с нуклеазой (TALEN-нуклеаза), с TALEN-нуклеазой, содержащей последовательность вариабельных диостатков в повторе (ВДП), и несовпадения в последовательности ВДП относительно эндогенной родственной последовательности.
4. Способ по п. 2, отличающийся тем, что нацеленная система нуклеаз содержит Cas9-нуклеазу и руководящую РНК, с несовпадением, существующим в последовательности руководящей РНК относительно эндогенной родственной последовательности.
5. Способ по п. 2, отличающийся тем, что нацеленная система эндонуклеаз содержит множество последовательностей TAL-эффекторных повторов, которые слиты с нуклеазой (TALEN-нуклеаза), с TALEN-нуклеазой, содержащей последовательность вариабельных диостатков в повторе (ВДП), и несовпадения в последовательности ВДП относительно последовательности НГР-матрицы.
6. Способ по п. 2, отличающийся тем, что нацеленная система нуклеаз содержит Cas9-нуклеазу и руководящую РНК, с несовпадением, существующим в последовательности руководящей РНК, относительно последовательности НГР-матрицы.
7. Способ по п. 2, отличающийся тем, что экзогенный аллель является природным аллелем и НГР-матрица содержит несовпадение, с несовпадением, создающим последовательность, которая не встречается в природе.
8. Способ по п. 2, отличающийся тем, что экзогенный аллель не содержит несовпадений и содержит ДНК, экспрессируемую клеткой.
9. Способ по п. 2, отличающийся тем, что экзогенный аллель содержит несовпадение и содержит ДНК, экспрессируемую клеткой.
10. Способ по п. 2, включающий выбор последовательности ДНК-связывающего члена и эндогенной родственной последовательности, так что внесение изменений в хромосомную ДНК для ее идентичности последовательности НГР-матрицы создает несовпадение в последовательности ДНК-связывающего члена относительно измененной последовательности хромосомной ДНК.
11. Способ по п. 10, отличающийся тем, что экзогенный аллель является природным аллелем и НГР-матрица состоит из природного аллеля и ДНК, которая идентична последовательности хромосомной ДНК.
12. Способ по п. 10, отличающийся тем, что выбор последовательности ДНК-связывающего члена и эндогенной родственной последовательности дополнительно включает размещение второго несовпадения в эндогенной родственной последовательности, которое не изменяется, когда вносят изменения в хромосомную ДНК для ее идентичности НГР-матрице.
13. Способ по п. 2, включающий выбор последовательности ДНК-связывающего члена и эндогенной родственной последовательности, чтобы разместить несовпадение в эндогенной родственной последовательности относительно ДНК-связывающей последовательности, и внесение изменений в хромосомную ДНК для ее идентичности последовательности НГР-матрицы не убирало данное несовпадение.
14. Способ по п. 2, отличающийся тем, что несовпадение включает вставку, делецию или замену.
15. Способ по п. 14, отличающийся тем, что вставка, делеция или замена имеет длину от 1 до 20 остатков.
16. Способ по п. 14, отличающийся тем, что вставка, делеция или замена имеет длину от 1 до 20 остатков.
17. Способ по п. 2, отличающийся тем, что несовпадение является одним однонуклеотидным полиморфизмом.
18. Способ по п. 2 включающий множество несовпадений.
19. Способ по п. 1, отличающийся тем, что нацеленная система эндонуклеаз содержит пару TALEN-нуклеаз, которые локализуют хромосомную ДНК посредством спейсерной последовательности между парой нуклеаз, отличающийся тем, что признак включает выбор НГР-матрицы для получения изменения в длине спейсерной последовательности, чтобы блокировать расщепление ДНК парой TALEN-нуклеаз.
20. Способ по п. 19, отличающийся тем, что длина спейсера уменьшается путем делеции или увеличивается путем вставки.
21. Способ по любому из пп. 1-20, отличающийся тем, что клетка выбрана из группы, состоящей из первичной клетки, первичной соматической клетки, зиготы, половой клетки, стволовой клетки, ооцита, сперматозоида и эмбриона.
22. Способ по любому из пп. 1-20, отличающийся тем, что систему нуклеаз вводят в клетку в виде мРНК.
23. Способ по любому из пп. 1-20, отличающийся тем, что клетка является клеткой домашнего скота.
24. Способ по любому из пп. 1-20, отличающийся тем, что клетка является клеткой позвоночного, отличного от человека, примата, свиньи, крупного рогатого скота, лошади, овцы, козы, курицы, кролика, рыбы, собаки, мыши, кошки, крысы или лабораторного животного.
25. Способ по любому из пп. 1-20, отличающийся тем, что клетка является гомозиготной по экзогенному аллелю.
26. Клетка, полученная способом по любому из пп. 1-25.
27. Набор, содержащий нацеленную систему нуклеаз и НГР-матрицу по любому из пп. 1-26.
28. Генетически модифицированное животное, полученное методами генной инженерии с изменениями в месте однонуклеотидного полиморфизма, животное, относящееся к породе, имеющей эндогенный аллель в хромосомной ДНК животного, животное, содержащее
экзогенный аллель, обнаруживаемый у другого вида или другой породы животного, с экзогенным аллелем, содержащим изменение в месте однонуклеотидного полиморфизма относительно эндогенного аллеля.
29. Животное по п. 28, содержащее множество однонуклеотидных полиморфизмов относительно эндогенного аллеля.
30. Способ получения «посадочной площадки» в хромосомной ДНК клетки, включающий введение нацеленной системы нуклеаз и НГР-матрицы в клетку, с нацеленной системой нуклеаз, содержащей ДНК-связывающий член для специфического связывания эндогенной родственной последовательности в хромосомной ДНК, где нацеленная система нуклеаз и НГР-матрица действуют с целью внесения изменений в хромосомную ДНК для ее идентичности последовательности НГР-матрицы, где последовательность НГР-матрицы содержит «посадочную площадку».
RU2016110827A 2013-08-27 2014-04-29 Эффективная немейотическая интрогрессия аллелей RU2016110827A (ru)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US201361870401P 2013-08-27 2013-08-27
US61/870,401 2013-08-27
PCT/US2014/035854 WO2015030881A1 (en) 2013-08-27 2014-04-29 Efficient non-meiotic allele introgression

Publications (2)

Publication Number Publication Date
RU2016110827A true RU2016110827A (ru) 2017-10-03
RU2016110827A3 RU2016110827A3 (ru) 2018-03-19

Family

ID=52585270

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
RU2016110827A RU2016110827A (ru) 2013-08-27 2014-04-29 Эффективная немейотическая интрогрессия аллелей

Country Status (14)

Country Link
US (6) US9528124B2 (ru)
EP (1) EP3039145B1 (ru)
JP (2) JP2016529904A (ru)
KR (1) KR20160048179A (ru)
CN (2) CN105960461B (ru)
AP (1) AP2016009113A0 (ru)
AR (1) AR096143A1 (ru)
AU (2) AU2014311855A1 (ru)
BR (1) BR112016004020B1 (ru)
CA (1) CA2922084C (ru)
MX (1) MX2016002564A (ru)
PH (1) PH12016500378A1 (ru)
RU (1) RU2016110827A (ru)
WO (1) WO2015030881A1 (ru)

Families Citing this family (58)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US9528124B2 (en) * 2013-08-27 2016-12-27 Recombinetics, Inc. Efficient non-meiotic allele introgression
US10920242B2 (en) 2011-02-25 2021-02-16 Recombinetics, Inc. Non-meiotic allele introgression
EP3613852A3 (en) 2011-07-22 2020-04-22 President and Fellows of Harvard College Evaluation and improvement of nuclease cleavage specificity
US9163284B2 (en) 2013-08-09 2015-10-20 President And Fellows Of Harvard College Methods for identifying a target site of a Cas9 nuclease
US9359599B2 (en) 2013-08-22 2016-06-07 President And Fellows Of Harvard College Engineered transcription activator-like effector (TALE) domains and uses thereof
US9388430B2 (en) 2013-09-06 2016-07-12 President And Fellows Of Harvard College Cas9-recombinase fusion proteins and uses thereof
US9340800B2 (en) 2013-09-06 2016-05-17 President And Fellows Of Harvard College Extended DNA-sensing GRNAS
US9737604B2 (en) 2013-09-06 2017-08-22 President And Fellows Of Harvard College Use of cationic lipids to deliver CAS9
ES2962492T3 (es) 2013-10-25 2024-03-19 Livestock Improvement Corporation Ltd Marcadores genéticos y usos de los mismos
CN106459995B (zh) 2013-11-07 2020-02-21 爱迪塔斯医药有限公司 使用统治型gRNA的CRISPR相关方法和组合物
CN105980568B (zh) 2013-12-11 2019-12-03 瑞泽恩制药公司 用于靶向修饰基因组的方法和组合物
US20150166984A1 (en) 2013-12-12 2015-06-18 President And Fellows Of Harvard College Methods for correcting alpha-antitrypsin point mutations
JP6815986B2 (ja) * 2014-03-26 2021-01-20 ユニバーシティ オブ メリーランド， カレッジ パーク 大型家畜の接合体における標的化ゲノム編集
WO2016022363A2 (en) 2014-07-30 2016-02-11 President And Fellows Of Harvard College Cas9 proteins including ligand-dependent inteins
MX2017003770A (es) 2014-09-23 2017-06-30 Aggenetics Inc Materiales y metodos para la produccion de animales con pelo corto.
CA2963820A1 (en) 2014-11-07 2016-05-12 Editas Medicine, Inc. Methods for improving crispr/cas-mediated genome-editing
CA2969619A1 (en) 2014-12-03 2016-06-09 Agilent Technologies, Inc. Guide rna with chemical modifications
EP3280803B1 (en) 2015-04-06 2021-05-26 The Board of Trustees of the Leland Stanford Junior University Chemically modified guide rnas for crispr/cas-mediated gene regulation
CN108368502B (zh) 2015-06-03 2022-03-18 内布拉斯加大学董事委员会 使用单链dna的dna编辑
CN108472314A (zh) 2015-07-31 2018-08-31 明尼苏达大学董事会 修饰的细胞和治疗方法
CN108474007A (zh) * 2015-08-07 2018-08-31 联邦科学技术研究组织 产生包含种系遗传修饰的动物的方法
JP2018529377A (ja) * 2015-09-01 2018-10-11 リコンビネティクス・インコーポレイテッドＲｅｃｏｍｂｉｎｅｔｉｃｓ，Ｉｎｃ． 所望のハプロタイプ中の外来対立遺伝子の存在を同定する方法
EP3352567A4 (en) * 2015-09-21 2019-02-27 Recombinetics, Inc. GENETICALLY MODIFIED ANIMALS WITH INCREASED HEAT TOLERANCE
EP3786294A1 (en) 2015-09-24 2021-03-03 Editas Medicine, Inc. Use of exonucleases to improve crispr/cas-mediated genome editing
GB201517227D0 (en) * 2015-09-29 2015-11-11 Univ Edinburgh Genetically-edited swine
IL258821B (en) 2015-10-23 2022-07-01 Harvard College Nucleobase editors and their uses
WO2017096041A1 (en) 2015-12-02 2017-06-08 The Regents Of The University Of California Compositions and methods for modifying a target nucleic acid
WO2017142923A1 (en) * 2016-02-16 2017-08-24 Emendobio Inc. Compositions and methods for promoting homology directed repair mediated gene editing
US11597924B2 (en) 2016-03-25 2023-03-07 Editas Medicine, Inc. Genome editing systems comprising repair-modulating enzyme molecules and methods of their use
EP3443086B1 (en) 2016-04-13 2021-11-24 Editas Medicine, Inc. Cas9 fusion molecules, gene editing systems, and methods of use thereof
US10767175B2 (en) 2016-06-08 2020-09-08 Agilent Technologies, Inc. High specificity genome editing using chemically modified guide RNAs
SG11201900907YA (en) 2016-08-03 2019-02-27 Harvard College Adenosine nucleobase editors and uses thereof
US11661590B2 (en) 2016-08-09 2023-05-30 President And Fellows Of Harvard College Programmable CAS9-recombinase fusion proteins and uses thereof
US11542509B2 (en) 2016-08-24 2023-01-03 President And Fellows Of Harvard College Incorporation of unnatural amino acids into proteins using base editing
GB2573062A (en) 2016-10-14 2019-10-23 Harvard College AAV delivery of nucleobase editors
EP4338799A3 (en) 2016-10-18 2024-06-05 Regents of the University of Minnesota Tumor infiltrating lymphocytes and methods of therapy
WO2018119359A1 (en) 2016-12-23 2018-06-28 President And Fellows Of Harvard College Editing of ccr5 receptor gene to protect against hiv infection
EP3592853A1 (en) 2017-03-09 2020-01-15 President and Fellows of Harvard College Suppression of pain by gene editing
WO2018165629A1 (en) 2017-03-10 2018-09-13 President And Fellows Of Harvard College Cytosine to guanine base editor
CA3057192A1 (en) 2017-03-23 2018-09-27 President And Fellows Of Harvard College Nucleobase editors comprising nucleic acid programmable dna binding proteins
US11560566B2 (en) 2017-05-12 2023-01-24 President And Fellows Of Harvard College Aptazyme-embedded guide RNAs for use with CRISPR-Cas9 in genome editing and transcriptional activation
WO2019006418A2 (en) 2017-06-30 2019-01-03 Intima Bioscience, Inc. ADENO-ASSOCIATED VIRAL VECTORS FOR GENE THERAPY
EP3652312A1 (en) 2017-07-14 2020-05-20 Editas Medicine, Inc. Systems and methods for targeted integration and genome editing and detection thereof using integrated priming sites
JP2020534795A (ja) 2017-07-28 2020-12-03 プレジデント アンド フェローズ オブ ハーバード カレッジ ファージによって支援される連続的進化（ｐａｃｅ）を用いて塩基編集因子を進化させるための方法および組成物
US11319532B2 (en) 2017-08-30 2022-05-03 President And Fellows Of Harvard College High efficiency base editors comprising Gam
US11795443B2 (en) 2017-10-16 2023-10-24 The Broad Institute, Inc. Uses of adenosine base editors
JP2021523745A (ja) 2018-05-16 2021-09-09 シンテゴ コーポレイション ガイドｒｎａ設計および使用のための方法およびシステム
WO2020191153A2 (en) 2019-03-19 2020-09-24 The Broad Institute, Inc. Methods and compositions for editing nucleotide sequences
CN110211635B (zh) * 2019-06-12 2020-07-21 北京康普森农业科技有限公司 用于畜禽基因组选择分析的方法及畜禽育种方法
EP3986928A1 (en) * 2019-06-19 2022-04-27 F. Hoffmann-La Roche AG Method for the generation of a protein expressing cell by targeted integration using cre mrna
CN112889744B (zh) * 2019-12-04 2022-11-11 广西贵港秀博基因科技股份有限公司 育种方法和育种系统
KR20230019843A (ko) 2020-05-08 2023-02-09 더 브로드 인스티튜트, 인코퍼레이티드 표적 이중 가닥 뉴클레오티드 서열의 두 가닥의 동시 편집을 위한 방법 및 조성물
CN112725468B (zh) * 2021-03-04 2022-06-07 华南农业大学 肉鸡腹脂率分子标记APOB c.246及检测方法
CN112941108B (zh) * 2021-05-13 2021-10-15 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 一种具有无角Pc位点纯合基因型的荷斯坦牛的制备方法
CN113416780A (zh) * 2021-07-30 2021-09-21 丽水市中心医院 一种诊治缺血性脑卒中的分子标志物
US11884915B2 (en) 2021-09-10 2024-01-30 Agilent Technologies, Inc. Guide RNAs with chemical modification for prime editing
CN114262708A (zh) * 2021-12-21 2022-04-01 西北农林科技大学 一种生产FecB基因g.A746G定点突变绵羊的试剂盒及其方法
CN114752686B (zh) * 2022-04-25 2023-05-16 四川省畜牧科学研究院 一种与兔肌肉品质性状相关的snp分子标记及其应用

Family Cites Families (88)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US4873191A (en) 1981-06-12 1989-10-10 Ohio University Genetic transformation of zygotes
ATE171185T1 (de) 1985-03-15 1998-10-15 Antivirals Inc Immunotestmittel für polynukleotid und verfahren
US5185444A (en) 1985-03-15 1993-02-09 Anti-Gene Deveopment Group Uncharged morpolino-based polymers having phosphorous containing chiral intersubunit linkages
US5731178A (en) 1990-03-21 1998-03-24 Behringwerke Aktiengesellschaft Attachment-elements for stimulation of eukaryotic expression systems
US5763240A (en) 1992-04-24 1998-06-09 Sri International In vivo homologous sequence targeting in eukaryotic cells
FR2737497B1 (fr) 1995-08-02 1997-10-03 Agronomique Inst Nat Rech Utilisation du domaine intra-cytoplasmique du recepteur de la prolactine ou du recepteur de l'hormone de croissance pour obtenir la secretion de proteines
EP0821070A1 (en) 1996-07-22 1998-01-28 Carelli, Claude Marcel Henri Pit-1 gene polymorphism and trait selection in animals
US5830698A (en) 1997-03-14 1998-11-03 Idec Pharmaceuticals Corporation Method for integrating genes at specific sites in mammalian cells via homologous recombination and vectors for accomplishing the same
US5948653A (en) 1997-03-21 1999-09-07 Pati; Sushma Sequence alterations using homologous recombination
EP1002068B1 (en) 1997-07-14 2009-09-09 University of Liège Mutations in the myostatin gene cause double-muscling in mammals
WO2000011155A1 (en) 1998-08-19 2000-03-02 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Methods and compositions for genomic modification
AU6218899A (en) 1998-10-12 2000-05-01 Geron Bio-Med Limited Porcine oocytes with improved developmental competence
WO2001030965A2 (en) 1999-10-28 2001-05-03 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Methods of in vivo gene transfer using a sleeping beauty transposon system
US6686515B1 (en) 1999-11-23 2004-02-03 Maxygen, Inc. Homologous recombination in plants
WO2001061049A1 (en) 2000-02-18 2001-08-23 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Altered recombinases for genome modification
CN1291010C (zh) 2000-02-24 2006-12-20 马萨诸塞大学 只生育单一性别后代的哺乳动物的生产
US6534299B2 (en) 2000-05-17 2003-03-18 Applera Corporation Isolated human kinase proteins, nucleic acid molecules encoding human kinase proteins, and uses thereof
AU8470301A (en) 2000-08-03 2002-02-18 Wim-Van Schooten Production of humanized antibodies in transgenic animals
AU8337701A (en) 2000-08-14 2002-02-25 Us Health Enhanced homologous recombination mediated by lambda recombination proteins
US7645441B2 (en) 2000-12-22 2010-01-12 Sagres Discovery Inc. Compositions and methods in cancer associated with altered expression of PRLR
AU2002324941A1 (en) 2001-09-07 2003-03-24 The Regents Of The University Of California Method of generating a transgenic livestock animal
EP1325930A1 (en) 2002-01-08 2003-07-09 Institut National De La Sante Et De La Recherche Medicale (Inserm) Mammal prolactin variants
CN100575485C (zh) 2002-01-23 2009-12-30 犹他大学研究基金会 使用锌指核酸酶的定向染色体诱变
EP2368982A3 (en) 2002-03-21 2011-10-12 Sangamo BioSciences, Inc. Methods and compositions for using zinc finger endonucleases to enhance homologous recombination
AU2003290689A1 (en) 2002-11-08 2004-06-03 Kyowa Hakko Kirin Co., Ltd. Transgenic ungulates having reduced prion protein activity and uses thereof
EP1563069B1 (en) 2002-11-22 2012-06-06 Institut Clayton De La Recherche Compositions and systems for the regulation of genes
US7176007B2 (en) 2002-12-12 2007-02-13 Wisconsin Alumni Research Foundation RecA mutants
US20050260603A1 (en) 2002-12-31 2005-11-24 Mmi Genomics, Inc. Compositions for inferring bovine traits
WO2004065581A2 (en) 2003-01-15 2004-08-05 Discovery Genomics, Inc. Transposon-insulator element delivery systems
US7985739B2 (en) 2003-06-04 2011-07-26 The Board Of Trustees Of The Leland Stanford Junior University Enhanced sleeping beauty transposon system and methods for using the same
US20120196370A1 (en) 2010-12-03 2012-08-02 Fyodor Urnov Methods and compositions for targeted genomic deletion
WO2005040400A2 (en) 2003-10-24 2005-05-06 Mmi Genomics, Inc. Methods and systems for inferring traits to manage non-beef livestock
US7972783B2 (en) 2003-11-24 2011-07-05 Branhaven LLC Method and markers for determining the genotype of horned/polled cattle
JP2008539241A (ja) 2005-04-25 2008-11-13 ファイザー インコーポレイティッド ミオスタチンに対する抗体
RU2008102646A (ru) 2005-06-24 2009-07-27 Риджентс Оф Дзе Юниверсити Оф Миннесота (Us) Применение цитозиндезаминаз для уменьшения переноса ретроэлементов от свиней человеку
AU2007335195B2 (en) 2006-12-21 2013-12-19 Agriculture Victoria Services Pty Ltd Artificial selection method and reagents
EP2134847B1 (en) 2007-03-07 2015-06-24 Aarhus Universitet Pig model for atherosclerosis
BRPI0818300A2 (pt) 2007-10-03 2017-05-09 Pfizer marcadores genéticos para gado com chifres e sem chifres e processos relacionados
WO2010008562A2 (en) 2008-07-16 2010-01-21 Recombinetics Methods and materials for producing transgenic animals
US20100105140A1 (en) 2008-07-16 2010-04-29 Fahrenkrug Scott C Plaice dna transposon system
US20110023140A1 (en) 2008-12-04 2011-01-27 Sigma-Aldrich Co. Rabbit genome editing with zinc finger nucleases
US20110023159A1 (en) 2008-12-04 2011-01-27 Sigma-Aldrich Co. Ovine genome editing with zinc finger nucleases
US20110023158A1 (en) 2008-12-04 2011-01-27 Sigma-Aldrich Co. Bovine genome editing with zinc finger nucleases
US20120030778A1 (en) 2008-12-04 2012-02-02 Sigma-Aldrich Co., Llc. Genomic editing of genes involved with parkinsons disease
KR20100080068A (ko) 2008-12-31 2010-07-08 주식회사 툴젠 신규한 징크 핑거 뉴클레아제 및 이의 용도
EP2206723A1 (en) 2009-01-12 2010-07-14 Bonas, Ulla Modular DNA-binding domains
US20120149115A1 (en) 2009-06-11 2012-06-14 Snu R&Db Foundation Targeted genomic rearrangements using site-specific nucleases
EP2449112A1 (en) 2009-07-01 2012-05-09 Transposagen Biopharmaceuticals, Inc. Genetically modified rat models for severe combined immunodeficiency (scid)
US20120192298A1 (en) 2009-07-24 2012-07-26 Sigma Aldrich Co. Llc Method for genome editing
CA2767377A1 (en) 2009-07-24 2011-01-27 Sigma-Aldrich Co. Llc Method for genome editing
NZ598457A (en) 2009-08-03 2014-06-27 Recombinetics Inc Methods and compositions for targeted gene modification
CA2770312A1 (en) 2009-08-11 2011-02-17 Sangamo Biosciences, Inc. Organisms homozygous for targeted modification
EP2510096B2 (en) 2009-12-10 2018-02-07 Regents of the University of Minnesota Tal effector-mediated dna modification
EP2516652B1 (en) 2009-12-21 2014-11-05 Keygene N.V. Improved techniques for transfecting protoplasts
JP6137596B2 (ja) 2010-02-08 2017-05-31 サンガモ セラピューティクス， インコーポレイテッド 遺伝子操作された切断ハーフドメイン
WO2011100058A1 (en) 2010-02-09 2011-08-18 Sangamo Biosciences, Inc. Targeted genomic modification with partially single-stranded donor molecules
BR112012020257A8 (pt) 2010-02-11 2018-02-14 Recombinetics Inc métodos e aparelhos para produzir artiodátilos transgênicos
CA2798988C (en) 2010-05-17 2020-03-10 Sangamo Biosciences, Inc. Tal-effector (tale) dna-binding polypeptides and uses thereof
EP2392208B1 (en) 2010-06-07 2016-05-04 Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) Fusion proteins comprising a DNA-binding domain of a Tal effector protein and a non-specific cleavage domain of a restriction nuclease and their use
JP2013534417A (ja) 2010-06-14 2013-09-05 アイオワ ステート ユニバーシティ リサーチ ファウンデーション，インコーポレーティッド Ｔａｌエフェクターとｆｏｋｉの融合タンパク質のヌクレアーゼ活性
EP3489359A1 (en) 2010-07-23 2019-05-29 Sigma Aldrich Co. LLC Genome editing using targeting endonucleases and single-stranded nucleic acids
GB201014169D0 (en) 2010-08-25 2010-10-06 Cambridge Entpr Ltd In vitro hepatic differentiation
KR101556359B1 (ko) 2011-01-03 2015-10-01 주식회사 툴젠 디자인된 tal 이펙터 뉴클레아제를 통한 게놈 엔지니어링
WO2012094132A1 (en) 2011-01-05 2012-07-12 Sangamo Biosciences, Inc. Methods and compositions for gene correction
US9528124B2 (en) 2013-08-27 2016-12-27 Recombinetics, Inc. Efficient non-meiotic allele introgression
US10920242B2 (en) 2011-02-25 2021-02-16 Recombinetics, Inc. Non-meiotic allele introgression
EP3450563A1 (en) 2011-02-25 2019-03-06 Recombinetics, Inc. Genetically modified animals and methods for making the same
WO2012152912A1 (en) 2011-05-12 2012-11-15 Newvectys Genetically modified pig as a cancer prone model
WO2012168307A2 (en) 2011-06-07 2012-12-13 Helmholtz Zentrum München - Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) Improved recombination efficiency by inhibition of nhej dna repair
EP2718440B1 (en) 2011-06-07 2018-10-10 Helmholtz Zentrum München Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt (GmbH) Protein having nuclease activity, fusion proteins and uses thereof
IN2014MN00974A (ru) 2011-12-16 2015-04-24 Targetgene Biotechnologies Ltd
AU2013221342B2 (en) 2012-02-15 2018-10-04 Aggenetics, Inc. Transgenic animals with customizable traits
WO2013169802A1 (en) 2012-05-07 2013-11-14 Sangamo Biosciences, Inc. Methods and compositions for nuclease-mediated targeted integration of transgenes
AR091482A1 (es) * 2012-06-21 2015-02-04 Recombinetics Inc Celulas modificadas geneticamente y metodos par su obtencion
WO2013191769A1 (en) 2012-06-22 2013-12-27 Mayo Foundation For Medical Education And Research Genome editing
US10058078B2 (en) 2012-07-31 2018-08-28 Recombinetics, Inc. Production of FMDV-resistant livestock by allele substitution
GB201216564D0 (en) 2012-09-17 2012-10-31 Univ Edinburgh Genetically edited animal
US8697359B1 (en) * 2012-12-12 2014-04-15 The Broad Institute, Inc. CRISPR-Cas systems and methods for altering expression of gene products
EP3252160B1 (en) 2012-12-12 2020-10-28 The Broad Institute, Inc. Crispr-cas component systems, methods and compositions for sequence manipulation
WO2014110552A1 (en) * 2013-01-14 2014-07-17 Recombinetics, Inc. Hornless livestock
JP6346266B2 (ja) * 2013-03-21 2018-06-20 サンガモ セラピューティクス， インコーポレイテッド 操作されたジンクフィンガータンパク質ヌクレアーゼを使用するｔ細胞受容体遺伝子の標的化された破壊
WO2014165825A2 (en) 2013-04-04 2014-10-09 President And Fellows Of Harvard College Therapeutic uses of genome editing with crispr/cas systems
US20150013025A1 (en) 2013-05-19 2015-01-08 Mice With Horns, Llc Transgenic animals with customizable traits
ES2962492T3 (es) 2013-10-25 2024-03-19 Livestock Improvement Corporation Ltd Marcadores genéticos y usos de los mismos
CN106535630B (zh) 2014-04-28 2020-04-24 重组股份有限公司 多重基因编辑
MX2017003770A (es) 2014-09-23 2017-06-30 Aggenetics Inc Materiales y metodos para la produccion de animales con pelo corto.
EP3352567A4 (en) 2015-09-21 2019-02-27 Recombinetics, Inc. GENETICALLY MODIFIED ANIMALS WITH INCREASED HEAT TOLERANCE
WO2017062756A1 (en) * 2015-10-07 2017-04-13 Recombinetics, Inc. Method of generating sterile terminal sires in livestock and animals produced thereby

Also Published As

Publication number Publication date
NZ718194A (en) 2021-10-29
AU2014311855A1 (en) 2016-04-14
BR112016004020B1 (pt) 2022-08-30
AR096143A1 (es) 2015-12-09
CN105960461B (zh) 2020-03-17
BR112016004020A2 (pt) 2017-12-05
CN105960461A (zh) 2016-09-21
CA2922084A1 (en) 2015-03-05
JP2016529904A (ja) 2016-09-29
AU2020286315A1 (en) 2021-01-21
CN111471719A (zh) 2020-07-31
EP3039145A4 (en) 2017-06-07
EP3039145A1 (en) 2016-07-06
JP2020089386A (ja) 2020-06-11
AP2016009113A0 (en) 2016-03-31
MX2016002564A (es) 2016-10-13
US20190106708A1 (en) 2019-04-11
US20240057570A1 (en) 2024-02-22
PH12016500378A1 (en) 2016-05-02
EP3039145B1 (en) 2019-12-18
US20180051298A1 (en) 2018-02-22
WO2015030881A1 (en) 2015-03-05
US20150156996A1 (en) 2015-06-11
KR20160048179A (ko) 2016-05-03
US11477969B2 (en) 2022-10-25
US9528124B2 (en) 2016-12-27
US10959414B2 (en) 2021-03-30
CA2922084C (en) 2023-08-29
US20150067898A1 (en) 2015-03-05
AU2020286315B2 (en) 2022-02-17
US20190194687A1 (en) 2019-06-27
RU2016110827A3 (ru) 2018-03-19

Similar Documents

Publication Publication Date Title
RU2016110827A (ru) Эффективная немейотическая интрогрессия аллелей
Ruan et al. Genome editing in livestock: Are we ready for a revolution in animal breeding industry?
ES2694629T3 (es) Métodos y composiciones para modificaciones genéticas objetivo y métodos de uso
Jenko et al. Potential of promotion of alleles by genome editing to improve quantitative traits in livestock breeding programs
Ivics et al. Germline transgenesis in rabbits by pronuclear microinjection of Sleeping Beauty transposons
Phelps et al. Transforming ecology and conservation biology through genome editing
Tsai et al. The relationship between mitochondrial DNA haplotype and the reproductive capacity of domestic pigs (Sus scrofa domesticus)
RU2017124909A (ru) Способы и композиции для нацеленной генетической модификации посредством одноэтапного множественного нацеливания
RU2018107842A (ru) Устойчивые к патогенам животные, имеющие модифицированные гены cd163
O’Doherty et al. Genomic imprinting effects on complex traits in domesticated animal species
JP6868615B2 (ja) 繁殖可能なｘｙ雌マウスを生成するための多能性細胞の選択
Tizard et al. Potential benefits of gene editing for the future of poultry farming
Magee et al. Imprinted loci in domestic livestock species as epigenomic targets for artificial selection of complex traits
US20190223416A1 (en) Canine genome editing
Srirattana et al. Cattle phenotypes can disguise their maternal ancestry
Loi et al. Synergies between assisted reproduction technologies and functional genomics
Mendonça et al. DNA methylation and functional characterization of the XIST gene during in vitro early embryo development in cattle
Kumar et al. SNPs at exonic region of aquaporin-7 (AQP7) gene may affect semen quality parameters among crossbred bulls
Fan et al. The Pig genome project has plenty to squeal about
Zhang et al. Parameters and efficiency of direct gene disruption by zinc finger nucleases in medaka embryos
Casellas et al. Accuracy and expected genetic gain under genetic or genomic evaluation in sheep flocks with different amounts of pedigree, genomic and phenotypic data
Gurgul et al. Transcriptome analysis of rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) eggs subjected to the high hydrostatic pressure treatment
Pollet et al. Insights from Xenopus genomes
Niemann et al. The evolution of farm animal biotechnology
Ponce de León et al. Genómica y producción animal

Legal Events

Date Code Title Description
FA92 Acknowledgement of application withdrawn (lack of supplementary materials submitted)

Effective date: 20180723